JP2001520004A - ミント(Menthapiperita)由来ゲラニル二リン酸シンターゼ - Google Patents
ミント(Menthapiperita)由来ゲラニル二リン酸シンターゼInfo
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Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1085—Transferases (2.) transferring alkyl or aryl groups other than methyl groups (2.5)
-
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- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
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- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
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- C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
- C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
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Abstract
(57)【要約】
ペパーミント由来のゲラニル二リン酸シンターゼをコードするcDNAが、単離および配列決定され、そして対応するアミノ酸配列が決定された。従って、ペパーミント(Mentha piperita)由来のゲラニル二リン酸シンターゼ(配列番号2)の発現をコードする単離されたDNA配列(配列番号1)が提供される。他の局面において、ゲラニル二リン酸シンターゼまたはそれとのハイブリダイゼーションが可能なゲラニル二リン酸シンターゼDNAまたはRNAの少なくとも一部に十分に相補的な塩基配列(例えば、ポリメラーゼ連鎖反応プライマーとして、またはゲラニル二リン酸シンターゼもしくは関連遺伝子についてのプローブとして有用な、アンチセンスゲラニル二リン酸シンターゼRNAもしくは相補的ゲラニル二リン酸シンターゼDNAのフラグメント)をコードする複製可能組換えクローニングビヒクルが提供される。さらに別の局面において、ゲラニル二リン酸シンターゼをコードする組換えクローニングビヒクルおよび/またはDNA配列で、形質転換され、トランスフェクトされ、感染され、ならびに/あるいは注入された、改変宿主細胞が提供される。従って、後の使用のための組換えゲラニル二リン酸シンターゼの有意な量の産生、単離および精製を容易にするため、モノテルペノイドの産生を増強するために、植物においてゲラニル二リン酸シンターゼの発現または増強された発現を得るため、抗癌特性を有するモノテルペノイドの前駆体として癌性細胞においてゲラニル二リン酸を産生するために使用され得るか、あるいは、さもなければ、ゲラニル二リン酸シンターゼの調節もしくは発現またはゲラニル二リン酸の産生のために使用され得る、ゲラニル二リン酸シンターゼの組換え発現のための系および方法が提供される。
Description
【0001】 (発明の分野) 本発明は、ゲラニル二リン酸シンターゼ(例えば、Mentha piper
ita由来のゲラニル二リン酸シンターゼ)をコードする核酸配列、ならびにそ
の配列を含むベクター、その配列を含む宿主細胞、および組換えゲラニル二リン
酸シンターゼおよびそれらの変異体を産生する方法に関する。
ita由来のゲラニル二リン酸シンターゼ)をコードする核酸配列、ならびにそ
の配列を含むベクター、その配列を含む宿主細胞、および組換えゲラニル二リン
酸シンターゼおよびそれらの変異体を産生する方法に関する。
【0002】 (発明の背景) ゲラニル二リン酸シンターゼ(GPPシンターゼ)は、C5伸長反応を触媒し て種々のテルペノイドファミリーの線状(非環式)前駆体を形成する、プレニル
トランスフェラーゼと呼ばれる酵素のファミリーの1つである。GPPシンター
ゼは、ジメチルアリル二リン酸(DMAPP)およびイソペンテニル二リン酸(
IPP)の縮合を触媒して、モノテルペンの中間体C10非環式前駆体であるゲラ
ニル二リン酸(GPP)を形成する(Wise,M.L.およびCroteau
,R、 Cane,D.E.編、「Comprehensive Natura
l Produsts Chemistry:Isoprenoids,第2巻
」、Elsevier Science, Oxford, 1997(印刷中
))(図1)。ファルネシル二リン酸シンターゼ(FPPシンターゼ)(関連プ
レニルトランスフェラーゼ)は、GPPおよびIPPを基質として利用して、フ
ァルネシル二リン酸(FPP)(これは、セスキテルペンテンの中間体C15前駆
体である)を形成する(図1)。別のプレニルトランスフェラーゼであるゲラニ
ルゲラニル二リン酸シンターゼ(GGPPシンターゼ)は、ファルネシル二リン
酸およびIPPの縮合を触媒して、ゲラニルゲラニル二リン酸(GGPP)(こ
れは、ジテルペンファミリーの中間体C20前駆体である)を形成する(図1)。
プレニルトランスフェラーゼのほかのタイプは、GGPPおよびIPPを基質と
して利用して、非常に長鎖の分子(例えば、天然ゴム)を形成し得る。Poul
ter C.D.およびRilling,H.C., Accts.Chem.
Res. 11:307−313(1978);Scolink,P.A.およ
びBartley,G., Plant Mol.Biol.Rep. 14:
305,307(1996)。
トランスフェラーゼと呼ばれる酵素のファミリーの1つである。GPPシンター
ゼは、ジメチルアリル二リン酸(DMAPP)およびイソペンテニル二リン酸(
IPP)の縮合を触媒して、モノテルペンの中間体C10非環式前駆体であるゲラ
ニル二リン酸(GPP)を形成する(Wise,M.L.およびCroteau
,R、 Cane,D.E.編、「Comprehensive Natura
l Produsts Chemistry:Isoprenoids,第2巻
」、Elsevier Science, Oxford, 1997(印刷中
))(図1)。ファルネシル二リン酸シンターゼ(FPPシンターゼ)(関連プ
レニルトランスフェラーゼ)は、GPPおよびIPPを基質として利用して、フ
ァルネシル二リン酸(FPP)(これは、セスキテルペンテンの中間体C15前駆
体である)を形成する(図1)。別のプレニルトランスフェラーゼであるゲラニ
ルゲラニル二リン酸シンターゼ(GGPPシンターゼ)は、ファルネシル二リン
酸およびIPPの縮合を触媒して、ゲラニルゲラニル二リン酸(GGPP)(こ
れは、ジテルペンファミリーの中間体C20前駆体である)を形成する(図1)。
プレニルトランスフェラーゼのほかのタイプは、GGPPおよびIPPを基質と
して利用して、非常に長鎖の分子(例えば、天然ゴム)を形成し得る。Poul
ter C.D.およびRilling,H.C., Accts.Chem.
Res. 11:307−313(1978);Scolink,P.A.およ
びBartley,G., Plant Mol.Biol.Rep. 14:
305,307(1996)。
【0003】 これらのプレニルトランスフェラーゼの全てについての基本的な反応機構は同
じであり、そして3つの工程から構成される(図2を参照のこと。ここで、ゲラ
ニル二リン酸シンターゼによって触媒される反応は、一般的な反応機構の例示と
して示される)。図2を参照して、第1工程では、アリル二リン酸エステル(2
a)は、安定なカルボニウムイオンに(2b)にイオン化される。次いで、この
カルボニウムイオンは、イソペンテニル二リン酸(2c)の二重結合を攻撃して
、別のカルボニウムイオン(2d)を生成する。このサイクルの最終工程では、
プロトンが、新たに形成されたカルボニウムイオン(2d)から排除されて、新
たなアリルの二重結合を含むテルペノイド(2e)を形成する。GPPシンター
ゼによって触媒される反応では、アリル二リン酸エステルは、ジメチルアリル二
リン酸である(図1および図2)。FPPシンターゼおよびGGPPシンターゼ
によって触媒される反応では、アリル二リン酸エステルは、それぞれ、ゲラニル
二リン酸およびファルネシル二リン酸である(図1)。
じであり、そして3つの工程から構成される(図2を参照のこと。ここで、ゲラ
ニル二リン酸シンターゼによって触媒される反応は、一般的な反応機構の例示と
して示される)。図2を参照して、第1工程では、アリル二リン酸エステル(2
a)は、安定なカルボニウムイオンに(2b)にイオン化される。次いで、この
カルボニウムイオンは、イソペンテニル二リン酸(2c)の二重結合を攻撃して
、別のカルボニウムイオン(2d)を生成する。このサイクルの最終工程では、
プロトンが、新たに形成されたカルボニウムイオン(2d)から排除されて、新
たなアリルの二重結合を含むテルペノイド(2e)を形成する。GPPシンター
ゼによって触媒される反応では、アリル二リン酸エステルは、ジメチルアリル二
リン酸である(図1および図2)。FPPシンターゼおよびGGPPシンターゼ
によって触媒される反応では、アリル二リン酸エステルは、それぞれ、ゲラニル
二リン酸およびファルネシル二リン酸である(図1)。
【0004】 FPPシンターゼおよびGGPPシンターゼ(これらは、中間体としてGPP
そ産生し、そしてほぼ編在性である(Qgura,K.およびKoyama,T
., Ogura,K.およびSankawa,U.編、「Dynamic A
spects of Natural Products Chemistry
」 Kodansha/Harwood Academic Publishe
rs, Tokyo,1−23頁、1997)とは異なり、ゲラニル二リン酸シ
ンターゼは、豊富な量のモノテルペンを産生する植物種に大きく制限される。F
PPシンターゼおよびGGPPシンターゼは両方とも、FPPおよびGGPPへ
の経路上での遊離中間体として無視できるレベルのGPPのみを産生する(Og
ura,K.およびKoyama,T.(前出))ので、一次代謝とモノテルペ
ン生合成との間の重大な関係を提供し、そしてモノテルペン生合成の本質的な駆
動者として働くのは、ゲラニル二リン酸シンターゼである(Wise,M.L.
およびCroteau,R.(前出))。
そ産生し、そしてほぼ編在性である(Qgura,K.およびKoyama,T
., Ogura,K.およびSankawa,U.編、「Dynamic A
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」 Kodansha/Harwood Academic Publishe
rs, Tokyo,1−23頁、1997)とは異なり、ゲラニル二リン酸シ
ンターゼは、豊富な量のモノテルペンを産生する植物種に大きく制限される。F
PPシンターゼおよびGGPPシンターゼは両方とも、FPPおよびGGPPへ
の経路上での遊離中間体として無視できるレベルのGPPのみを産生する(Og
ura,K.およびKoyama,T.(前出))ので、一次代謝とモノテルペ
ン生合成との間の重大な関係を提供し、そしてモノテルペン生合成の本質的な駆
動者として働くのは、ゲラニル二リン酸シンターゼである(Wise,M.L.
およびCroteau,R.(前出))。
【0005】 それゆえ、モノテルペン産生(精油)種の収率を増加するか、またはモノテル
ペン生合成経路とを任意の非産生種(例えば、農作物、果実を有する植物種、お
よび動物)に遺伝子操作する組換え方法を開発する任意の試みは、ゲラニル二リ
ン酸シンターゼ遺伝子またはcDNAクローンへの接近を必要とする。選択され
たモノテルペンシンターゼ(例えば、(−)−リモネンシンターゼ(Colby
ら、J.Biol.CHem. 268:23016−23024,1993)
および任意の続く経路の酵素とのゲラニル二リン酸シンターゼの同時発現は、任
意の生存生物における、単純な炭素基質(たとえば、グルコース)からの対応す
るモノテルペン産物の生成を可能にして当然である。
ペン生合成経路とを任意の非産生種(例えば、農作物、果実を有する植物種、お
よび動物)に遺伝子操作する組換え方法を開発する任意の試みは、ゲラニル二リ
ン酸シンターゼ遺伝子またはcDNAクローンへの接近を必要とする。選択され
たモノテルペンシンターゼ(例えば、(−)−リモネンシンターゼ(Colby
ら、J.Biol.CHem. 268:23016−23024,1993)
および任意の続く経路の酵素とのゲラニル二リン酸シンターゼの同時発現は、任
意の生存生物における、単純な炭素基質(たとえば、グルコース)からの対応す
るモノテルペン産物の生成を可能にして当然である。
【0006】 モノテルペンは、食品における香味剤として、および香水における香りとして
利用される(Arctander,S., Perfume and Flav
or Materials of Natural Origin, Arct
ander Publications, Elizabeth, New J
ersey;Bedoukian,P.Z. Perfumery and F
lavoring Materials,第4版、Allured Publi
cations,Wheaton,Illinois,1995;Allure
d,S. Flavor and Fragrance Materials,
Allured Publications,Wheaton,Illino
is,1997)。モノテルペンはまた、種々の工業プロセスにおいて中間体と
して使用される。Dawson,F.A.、The Amazing Terp
enes, Naval Stores Rev., March/April
,6−12,1994。モノテルペンはまた。ペストおよび病原体に対する植物
の天然の防御系に関係する。Francke,W.、Muller,P.M.お
よびLamparsky、D.編、Perfumes:Art,Science
and Technology, Elsevier Applied Sc
ience, NY,NY,61−99,1991;Harborne,J.B
.、Harborne,J.B.およびTomas−Barberan,F.A
.編、Ecological Chemistry and Biochemi
stry of Plant Terpenoids, Clarendon
Press,Oxford,399−426,1991;Gershenzon
,J.およびCroteau,R.、Rosenthal,G.A.およびBe
renbaum,M.R.編、Herbivores:Their Inter
actions with Secondary Plant Metabol
ies, Academic Press, San Diego,168−2
20,1991。
利用される(Arctander,S., Perfume and Flav
or Materials of Natural Origin, Arct
ander Publications, Elizabeth, New J
ersey;Bedoukian,P.Z. Perfumery and F
lavoring Materials,第4版、Allured Publi
cations,Wheaton,Illinois,1995;Allure
d,S. Flavor and Fragrance Materials,
Allured Publications,Wheaton,Illino
is,1997)。モノテルペンはまた、種々の工業プロセスにおいて中間体と
して使用される。Dawson,F.A.、The Amazing Terp
enes, Naval Stores Rev., March/April
,6−12,1994。モノテルペンはまた。ペストおよび病原体に対する植物
の天然の防御系に関係する。Francke,W.、Muller,P.M.お
よびLamparsky、D.編、Perfumes:Art,Science
and Technology, Elsevier Applied Sc
ience, NY,NY,61−99,1991;Harborne,J.B
.、Harborne,J.B.およびTomas−Barberan,F.A
.編、Ecological Chemistry and Biochemi
stry of Plant Terpenoids, Clarendon
Press,Oxford,399−426,1991;Gershenzon
,J.およびCroteau,R.、Rosenthal,G.A.およびBe
renbaum,M.R.編、Herbivores:Their Inter
actions with Secondary Plant Metabol
ies, Academic Press, San Diego,168−2
20,1991。
【0007】 モノテルペンが癌の予防および処置に有効であるという実質的な証拠もまた存
在する(Elson,C.E.およびYu,S.G., J.Nutr.124
:607−614,1994)。従って、例えば、リモネン、ペリリルアルコー
ル(perrilyl alcohol)およびゲラニオールは、各々、非常に
広範な範囲の哺乳動物癌に対する化学治療活性を有することが示されている(例
えば、(1)リモネン、Elegbedeら、Carcinogenesis
5:661−665、1984;Elsonら、Carcinogenesis
9:331−332,1988;Maltzmanら、Carcinogen
esis 10:781−785,1989;Wattenberg,L.W.
およびCoccia,J.B., Carcinogenesis 12:11
5−117,1991;Wattenberg,L.W.およびCoccia,
J.B., Carcinogenesis 12:115−117,1991
;Haagら、Cancer Res 52:4021−4026,1992;
Crowell,P.L.およびGould,M.N., CRC Crit.
Rev.Oncogenesis 5:1−22,1994;(2)ペリリルア
ルコール、Millsら、Cancer Res. 55:979−983,1
995;Haag,J.D.およびGould,M.N., Cancer C
hemother.Pharmacol. 34:477−483,1994;
Starkら、Cancer Lett. 96:15−21,1995、なら
びに(3)ゲラニオール、Shoffら、Cencer Res. 51:37
−42,1991;Yuら、J.Nutr. 125:2763−2767,1
995;Burkeら、Lipids 32:151−156,1997を参照
のこと)。
在する(Elson,C.E.およびYu,S.G., J.Nutr.124
:607−614,1994)。従って、例えば、リモネン、ペリリルアルコー
ル(perrilyl alcohol)およびゲラニオールは、各々、非常に
広範な範囲の哺乳動物癌に対する化学治療活性を有することが示されている(例
えば、(1)リモネン、Elegbedeら、Carcinogenesis
5:661−665、1984;Elsonら、Carcinogenesis
9:331−332,1988;Maltzmanら、Carcinogen
esis 10:781−785,1989;Wattenberg,L.W.
およびCoccia,J.B., Carcinogenesis 12:11
5−117,1991;Wattenberg,L.W.およびCoccia,
J.B., Carcinogenesis 12:115−117,1991
;Haagら、Cancer Res 52:4021−4026,1992;
Crowell,P.L.およびGould,M.N., CRC Crit.
Rev.Oncogenesis 5:1−22,1994;(2)ペリリルア
ルコール、Millsら、Cancer Res. 55:979−983,1
995;Haag,J.D.およびGould,M.N., Cancer C
hemother.Pharmacol. 34:477−483,1994;
Starkら、Cancer Lett. 96:15−21,1995、なら
びに(3)ゲラニオール、Shoffら、Cencer Res. 51:37
−42,1991;Yuら、J.Nutr. 125:2763−2767,1
995;Burkeら、Lipids 32:151−156,1997を参照
のこと)。
【0008】 癌細胞は、同源のモノテルペンシンターゼタンパク質を癌細胞に標的すること
によって、またはモノテルペンシンターゼ遺伝子を癌細胞に導入することによっ
て、抗癌特性を有するモノテルペンの治療的な量を産生するように改変され得る
。しかし、癌治療に対するこのアプローチは、ゲラニル二リン酸シンターゼの自
然分布が、モノテルペンの豊富な量を産生する植物種に非常に制限されるという
事実によって複雑化する。従って、動物細胞は、モノテルペン前駆体ゲラニル二
リン酸を天然には産生しない。結果的に、癌細胞が抗癌特性を有する内在性モノ
テルペンを産生するように遺伝子操作することは、ゲラニル二リン酸シンターゼ
をコードする遺伝子を、抗癌特性を有するモノテルペンを産生するモノテルペン
シンターゼをコードする遺伝子とともに導入する必要がある。同様に、タンパク
質ターゲッティングアプローチが利用される場合、ゲラニル二リン酸シンターゼ
タンパク質およびモノテルペンシンターゼタンパク質の両方が、癌細胞に標的化
されなければならない。
によって、またはモノテルペンシンターゼ遺伝子を癌細胞に導入することによっ
て、抗癌特性を有するモノテルペンの治療的な量を産生するように改変され得る
。しかし、癌治療に対するこのアプローチは、ゲラニル二リン酸シンターゼの自
然分布が、モノテルペンの豊富な量を産生する植物種に非常に制限されるという
事実によって複雑化する。従って、動物細胞は、モノテルペン前駆体ゲラニル二
リン酸を天然には産生しない。結果的に、癌細胞が抗癌特性を有する内在性モノ
テルペンを産生するように遺伝子操作することは、ゲラニル二リン酸シンターゼ
をコードする遺伝子を、抗癌特性を有するモノテルペンを産生するモノテルペン
シンターゼをコードする遺伝子とともに導入する必要がある。同様に、タンパク
質ターゲッティングアプローチが利用される場合、ゲラニル二リン酸シンターゼ
タンパク質およびモノテルペンシンターゼタンパク質の両方が、癌細胞に標的化
されなければならない。
【0009】 標準的なタンパク質ターゲッティング技術は、ゲラニル二リン酸シンターゼを
、モノテルペンシンターゼ(例えば、リモネンシンターゼ)とともに、腫瘍に対
する特異的ターゲッティングを伴って動物細胞に導入するために使用され得る(
Colbyら、J.Biol.Chem. 268:23016−23024,
1993)。例えば、Wearley、L.L., Critical Rev
iews in Therapeutic Drug Carrier Sys
tems,8(4):331−394,1991;Sheldon,Kら、Pr
oc.Nat’l.Acad.Sci.USA,92(6):2056−206
0,1995を参照のこと。さらに、標準的な遺伝子治療技術は、GPPシンタ
ーゼ遺伝子およびモノテルペンシンターゼ遺伝子を、抗癌特性を有するモノテル
ペンの内因性合成のために癌性細胞にターゲッティングするために使用され得る
。遺伝子ターゲッティング技術の概説については、以下を参照のこと;Maha
to R.Iら、Pharmaceutical Research 14(7
):853−859,1997;Rosenthal,F.M.およびMert
elsmann、R.,Onkologie 20(1):26−34,199
7;Buckel,P.,Trends in Pharmacologica
l Science 17(12):450−456,1996;Roth,J
.A.およびCristiano,R.J., J.Nat’l Cancer
Inst. 89(1):21−39,1997;Ledley,F.D.,
Pharmaceutical Research 13(11):1595
−1614,1996。
、モノテルペンシンターゼ(例えば、リモネンシンターゼ)とともに、腫瘍に対
する特異的ターゲッティングを伴って動物細胞に導入するために使用され得る(
Colbyら、J.Biol.Chem. 268:23016−23024,
1993)。例えば、Wearley、L.L., Critical Rev
iews in Therapeutic Drug Carrier Sys
tems,8(4):331−394,1991;Sheldon,Kら、Pr
oc.Nat’l.Acad.Sci.USA,92(6):2056−206
0,1995を参照のこと。さらに、標準的な遺伝子治療技術は、GPPシンタ
ーゼ遺伝子およびモノテルペンシンターゼ遺伝子を、抗癌特性を有するモノテル
ペンの内因性合成のために癌性細胞にターゲッティングするために使用され得る
。遺伝子ターゲッティング技術の概説については、以下を参照のこと;Maha
to R.Iら、Pharmaceutical Research 14(7
):853−859,1997;Rosenthal,F.M.およびMert
elsmann、R.,Onkologie 20(1):26−34,199
7;Buckel,P.,Trends in Pharmacologica
l Science 17(12):450−456,1996;Roth,J
.A.およびCristiano,R.J., J.Nat’l Cancer
Inst. 89(1):21−39,1997;Ledley,F.D.,
Pharmaceutical Research 13(11):1595
−1614,1996。
【0010】 今日までに、ゲラニル二リン酸シンターゼ活性を含む抽出物は、以下を含むい
くつかの植物供給源から単離されている:ブドウ(Clastreら、Plan
t Physiol.102:205−211,1993);ゼラニウム(Su
ga,T.およびEndo,T.,Phytochemistry 30:17
57−1761,1991);セージ(Croteau,R.およびPurke
tt,P.T.,Arch.Biochem.Biophys,271:524
−535,1989)およびLithospermum(Heide,L.およ
びBerger,U.,Arch.Biochem.Biophys.273:
331−338,1989)。ブドウからの酵素のみが、均一に精製されている
(Clastreら(前出))。
くつかの植物供給源から単離されている:ブドウ(Clastreら、Plan
t Physiol.102:205−211,1993);ゼラニウム(Su
ga,T.およびEndo,T.,Phytochemistry 30:17
57−1761,1991);セージ(Croteau,R.およびPurke
tt,P.T.,Arch.Biochem.Biophys,271:524
−535,1989)およびLithospermum(Heide,L.およ
びBerger,U.,Arch.Biochem.Biophys.273:
331−338,1989)。ブドウからの酵素のみが、均一に精製されている
(Clastreら(前出))。
【0011】 表1は、いくつかの種から単離されたゲラニル二リン酸シンターゼの限定され
た利用可能な物理的および化学的特徴を要約する。
た利用可能な物理的および化学的特徴を要約する。
【0012】
【表1】 これらのデータは、ゲラニル二リン酸シンターゼの物理的および化学的特性が
、種間で相当変化することを示す。例えば、分子量は、66kDa(ブドウ)か
ら100kDa(セージ)まで変化する。同様に、Lithospermumか
ら単離されたゲラニル二リン酸シンターゼの等電点は、4.95であるのに対し
て、ミントゲラニル二リン酸シンターゼの「偽成熟(pseudomature
)」形態(すなわち、アミノ末端から最初の48アミノ酸が欠失されているクロ
ーンM13.18のcDNAインサートによってコードされるタンパク質)は、
5.42の等電点を有する。異なる種から単離されたゲラニル二リン酸シンター
ゼの物理的および化学的特性におけるこの変動は、公開された精製プロトコルが
、各々、互いに有意に異なるという事実に反映される。
、種間で相当変化することを示す。例えば、分子量は、66kDa(ブドウ)か
ら100kDa(セージ)まで変化する。同様に、Lithospermumか
ら単離されたゲラニル二リン酸シンターゼの等電点は、4.95であるのに対し
て、ミントゲラニル二リン酸シンターゼの「偽成熟(pseudomature
)」形態(すなわち、アミノ末端から最初の48アミノ酸が欠失されているクロ
ーンM13.18のcDNAインサートによってコードされるタンパク質)は、
5.42の等電点を有する。異なる種から単離されたゲラニル二リン酸シンター
ゼの物理的および化学的特性におけるこの変動は、公開された精製プロトコルが
、各々、互いに有意に異なるという事実に反映される。
【0013】 ゲラニル二リン酸シンターゼについてのアミノ酸配列データは、当該分野では
報告されていない。植物由来のFPPシンターゼおよびGGPPシンターゼをコ
ードするいくつかのDNA配列が利用可能である(Scolnik,P.A.お
よびBartley,G.E.,Plant Mol.Biol.Report
14:305−319,1996)が、ゲラニル二リン酸シンターゼについて
の遺伝子は、これまでに報告されていない。
報告されていない。植物由来のFPPシンターゼおよびGGPPシンターゼをコ
ードするいくつかのDNA配列が利用可能である(Scolnik,P.A.お
よびBartley,G.E.,Plant Mol.Biol.Report
14:305−319,1996)が、ゲラニル二リン酸シンターゼについて
の遺伝子は、これまでに報告されていない。
【0014】 (発明の要旨) 前述に従って、ペパーミント由来のゲラニル二リン酸シンターゼをコードする
cDNAは、単離および配列決定されており、そして対応するアミノ酸配列が推
定されている。従って、本発明は、単離された組換えゲラニル二リン酸シンター
ゼタンパク質、およびその部分、ゲラニル二リン酸シンターゼの発現をコードす
る単離されたDNA配列、およびその部分(例えば、ペパーミント(Menth
a piperita)由来のゲラニル二リン酸シンターゼ(配列番号2)をコ
ードする配列番号1に示される配列)に関する。他の局面において、本発明は、
核酸配列、例えば、ゲラニル二リン酸シンターゼまたはそれとのハイブリダイゼ
ーションが可能なゲラニル二リン酸シンターゼDNAまたはRNAの少なくとも
一部に有意に相補的な塩基配列(例えば、ポリメラーゼ連鎖反応プライマーとし
て、またはゲラニル二リン酸シンターゼもしくは関連遺伝子についてのプローブ
として有用な、アンチセンスゲラニル二リン酸シンターゼRNAもしくは相補的
ゲラニル二リン酸シンターゼDNAのフラグメント)をコードするDNA配列を
含む、複製可能組換えクローニングビヒクルに関する。本発明のさらに他の局面
において、本発明の組換えクローニングビヒクルおよび/もしくはDNA配列で
、形質転換された、トランスフェクトされた、感染された、ならびに/または注
入された、改変宿主細胞が提供される。従って、本発明は、ゲラニル二リン酸シ
ンターゼの組換え発現を提供する。本明細書中に記載される発明性概念(inv
entive concept)は、後の使用のための組換えゲラニル二リン酸
シンターゼの産生、単離、および有意な量の精製を容易にするため、植物、微生
物または動物におけるゲラニル二リン酸シンターゼの発現または増強された発現
を得るために使用され得るか、あるいははさもなければ、ゲラニル二リン酸シン
ターゼの調節または発現が、ゲラニル二リン酸シンターゼの産生または酵素産物
であるゲラニル二リン酸もしくはその誘導体について所望される環境において使
用され得る。
cDNAは、単離および配列決定されており、そして対応するアミノ酸配列が推
定されている。従って、本発明は、単離された組換えゲラニル二リン酸シンター
ゼタンパク質、およびその部分、ゲラニル二リン酸シンターゼの発現をコードす
る単離されたDNA配列、およびその部分(例えば、ペパーミント(Menth
a piperita)由来のゲラニル二リン酸シンターゼ(配列番号2)をコ
ードする配列番号1に示される配列)に関する。他の局面において、本発明は、
核酸配列、例えば、ゲラニル二リン酸シンターゼまたはそれとのハイブリダイゼ
ーションが可能なゲラニル二リン酸シンターゼDNAまたはRNAの少なくとも
一部に有意に相補的な塩基配列(例えば、ポリメラーゼ連鎖反応プライマーとし
て、またはゲラニル二リン酸シンターゼもしくは関連遺伝子についてのプローブ
として有用な、アンチセンスゲラニル二リン酸シンターゼRNAもしくは相補的
ゲラニル二リン酸シンターゼDNAのフラグメント)をコードするDNA配列を
含む、複製可能組換えクローニングビヒクルに関する。本発明のさらに他の局面
において、本発明の組換えクローニングビヒクルおよび/もしくはDNA配列で
、形質転換された、トランスフェクトされた、感染された、ならびに/または注
入された、改変宿主細胞が提供される。従って、本発明は、ゲラニル二リン酸シ
ンターゼの組換え発現を提供する。本明細書中に記載される発明性概念(inv
entive concept)は、後の使用のための組換えゲラニル二リン酸
シンターゼの産生、単離、および有意な量の精製を容易にするため、植物、微生
物または動物におけるゲラニル二リン酸シンターゼの発現または増強された発現
を得るために使用され得るか、あるいははさもなければ、ゲラニル二リン酸シン
ターゼの調節または発現が、ゲラニル二リン酸シンターゼの産生または酵素産物
であるゲラニル二リン酸もしくはその誘導体について所望される環境において使
用され得る。
【0015】 本発明のさらに別の局面において、癌を処置するための方法が提供される。こ
の方法は、ゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質を、ゲラニル二リン酸を抗癌
特性を有するモノテルペンに転換し得るモノテルペンシンターゼタンパク質とと
もに、癌細胞に導入する工程を包含する。あるいは、ゲラニル二リン酸シンター
ゼタンパク質およびモノテルペンシンターゼタンパク質をコードする(すなわち
、ゲラニル二リン酸を抗癌特性を有するモノテルペンに変換し得る)核酸配列が
、癌細胞に導入される。
の方法は、ゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質を、ゲラニル二リン酸を抗癌
特性を有するモノテルペンに転換し得るモノテルペンシンターゼタンパク質とと
もに、癌細胞に導入する工程を包含する。あるいは、ゲラニル二リン酸シンター
ゼタンパク質およびモノテルペンシンターゼタンパク質をコードする(すなわち
、ゲラニル二リン酸を抗癌特性を有するモノテルペンに変換し得る)核酸配列が
、癌細胞に導入される。
【0016】 本発明の前述の局面および多くの付帯する利点は、添付の図面と組み合わせた
場合に、以下の詳細な説明を参照することによって、より理解される。
場合に、以下の詳細な説明を参照することによって、より理解される。
【0017】 (好ましい実施態様の詳細な説明) 本明細書中で使用される用語「アミノ酸」とは、全ての天然に存在するL−α
−アミノ酸またはその残基をいう。このアミノ酸は、一文字表記または三文字表
記のいずれかによって同定される:
−アミノ酸またはその残基をいう。このアミノ酸は、一文字表記または三文字表
記のいずれかによって同定される:
【0018】
【数1】 本明細書中で使用される用語「ヌクレオチド」とは、糖部分(ペントース)、
ホスフェートおよび窒素複素環式塩基を含むDNAまたはRNAのモノマー単位
を意味する。この塩基は、グリコシド炭素(ペントースの1’炭素)を介して糖
部分に結合し、そして塩基と糖の組み合わせは、ヌクレオシドと称される。この
塩基は、アデニン(「A])、グアニン(「G」)、シトシン(「C」)および
チミン(「T」)であるDNAの4つの塩基を用いてヌクレオチドを特徴付ける
。イノシン(「I」)は、4つの天然に存在する塩基(A、C、GまたはT)の
いずれかを置換するために使用され得る合成の塩基である。この4つのRNA塩
基は、A、G、Cおよびウラシル(「U」)である。本明細書中に記載されるヌ
クレオチド配列は、隣接するペントースの3’炭素と5’炭素との間のホスホジ
エステル結合によって接続されるヌクレオチドの線状アレイを含む。
ホスフェートおよび窒素複素環式塩基を含むDNAまたはRNAのモノマー単位
を意味する。この塩基は、グリコシド炭素(ペントースの1’炭素)を介して糖
部分に結合し、そして塩基と糖の組み合わせは、ヌクレオシドと称される。この
塩基は、アデニン(「A])、グアニン(「G」)、シトシン(「C」)および
チミン(「T」)であるDNAの4つの塩基を用いてヌクレオチドを特徴付ける
。イノシン(「I」)は、4つの天然に存在する塩基(A、C、GまたはT)の
いずれかを置換するために使用され得る合成の塩基である。この4つのRNA塩
基は、A、G、Cおよびウラシル(「U」)である。本明細書中に記載されるヌ
クレオチド配列は、隣接するペントースの3’炭素と5’炭素との間のホスホジ
エステル結合によって接続されるヌクレオチドの線状アレイを含む。
【0019】 用語「パーセント同一性」(%I)とは、2つのアミノ酸配列または2つの核
酸配列が並行して整列される場合に、同じ相対位置を占有するアミノ酸またはヌ
クレオチドの割合を意味する。
酸配列が並行して整列される場合に、同じ相対位置を占有するアミノ酸またはヌ
クレオチドの割合を意味する。
【0020】 用語「パーセント類似性」(%S)とは、2つの比較されたタンパク質配列の
関連性の程度の統計学的測定である。パーセント類似性は、化学的類似性(例え
ば、比較されたアミノ酸が、酸性、塩基性、疎水性、芳香族などであるかどうか
)および/または一対の比較されるアミノ酸の1つのメンバーをコードするコド
ンをその対のほかのメンバーをコードするコドンに変換するに必要な塩基対変化
の最小数によって測定される進化的距離に基づいてアミノ酸の各比較される対に
対する数値を割り当てる、コンピュータープログラムによって計算される。計算
は、2つの配列のベストフィットアラインメントが、すべての可能なアラインメ
ントの反復性比較によって経験的になされた後になされる(Henikoff,
S.およびHeinkoff,J.G., Proc.Nat’l.Acad.
Sci.USA 89:10915−10919,1992)。
関連性の程度の統計学的測定である。パーセント類似性は、化学的類似性(例え
ば、比較されたアミノ酸が、酸性、塩基性、疎水性、芳香族などであるかどうか
)および/または一対の比較されるアミノ酸の1つのメンバーをコードするコド
ンをその対のほかのメンバーをコードするコドンに変換するに必要な塩基対変化
の最小数によって測定される進化的距離に基づいてアミノ酸の各比較される対に
対する数値を割り当てる、コンピュータープログラムによって計算される。計算
は、2つの配列のベストフィットアラインメントが、すべての可能なアラインメ
ントの反復性比較によって経験的になされた後になされる(Henikoff,
S.およびHeinkoff,J.G., Proc.Nat’l.Acad.
Sci.USA 89:10915−10919,1992)。
【0021】 本明細書中で示されるように、パーセント同一性およびパーセント類似性の値
は、本明細書中に開示されるMentha GPPシンターゼ(配列番号2)と
GGPPシンターゼとの間のアミノ酸レベルで、本明細書中に開示されるMen
tha GPPシンターゼの推定アミノ酸配列(配列番号2)と表2に示される
GGPPシンターゼとの間でなされた個々の対になった比較から得られる値の平
均である。同様に、本明細書中に示されるように、パーセント同一性およびパー
セント類似性の値は、本明細書中に開示されるMentha GPPシンターゼ
(配列番号2)とFPPシンターゼとの間のアミノ酸レベルで、本明細書中に開
示されるMentha GPPシンターゼの推定アミノ酸配列(配列番号2)と
表2に示されるFPPシンターゼとの間でなされた個々の対になった比較から得
られる値の平均である。表2に示される%Iおよび%S値は、Mentha G
PPシンターゼタンパク質配列(配列番号2)および表2に列挙される配列の各
々の個々の対になった比較から得られた値である。
は、本明細書中に開示されるMentha GPPシンターゼ(配列番号2)と
GGPPシンターゼとの間のアミノ酸レベルで、本明細書中に開示されるMen
tha GPPシンターゼの推定アミノ酸配列(配列番号2)と表2に示される
GGPPシンターゼとの間でなされた個々の対になった比較から得られる値の平
均である。同様に、本明細書中に示されるように、パーセント同一性およびパー
セント類似性の値は、本明細書中に開示されるMentha GPPシンターゼ
(配列番号2)とFPPシンターゼとの間のアミノ酸レベルで、本明細書中に開
示されるMentha GPPシンターゼの推定アミノ酸配列(配列番号2)と
表2に示されるFPPシンターゼとの間でなされた個々の対になった比較から得
られる値の平均である。表2に示される%Iおよび%S値は、Mentha G
PPシンターゼタンパク質配列(配列番号2)および表2に列挙される配列の各
々の個々の対になった比較から得られた値である。
【0022】
【表2】 「オリゴヌクレオチド」は、リン酸ジエステル結合で連結されたデオキシリボ
ヌクレオチドの短い長さの一本鎖または二本鎖の配列をいう。このオリゴヌクレ
オチドは、既知の方法によって化学合成され、そして例えばポリアクリルアミド
ゲル上で精製される。
ヌクレオチドの短い長さの一本鎖または二本鎖の配列をいう。このオリゴヌクレ
オチドは、既知の方法によって化学合成され、そして例えばポリアクリルアミド
ゲル上で精製される。
【0023】 用語「ゲラニル二リン酸シンターゼ」は、本明細書中では、ジメチルアリル二
リン酸(DMAPP)およびイソペンテニル二リン酸(IPP)を縮合させ、ゲ
ラニル二リン酸(これは、本明細書中で記載のようなモノテルペンの中間体非環
式前駆体である)を形成することを触媒し得る酵素を意味するために使用される
。
リン酸(DMAPP)およびイソペンテニル二リン酸(IPP)を縮合させ、ゲ
ラニル二リン酸(これは、本明細書中で記載のようなモノテルペンの中間体非環
式前駆体である)を形成することを触媒し得る酵素を意味するために使用される
。
【0024】 用語「精油植物(単数または複数)」は、高レベルのモノテルペノイドおよび
/またはセスキテルペノイドおよび/またはジテルペノイド油、ならびに/ある
いは高レベルのモノテルペノイドおよび/またはセスキテルペノイドおよび/ま
たはジテルペノイド樹脂を生産する植物種の群をいう。前出の油および/または
樹脂は、それらを生産する精油植物の新鮮重量の約0.005%より多くを占め
る。精油および/樹脂は、例えば、E.Guenther、The Essen
tial Oils,第I−VI巻、R.E.Krieger Publish
ing Co.、Huntington N.Y.、1975(本明細書中に参
考として援用される)において、より十分に記載されている。精油植物は、以下
を包含するが、これらに限定されない: Lamiaceae、以下の種を包含するが、これらに限定されない:Oci
mum(バジル)、Lavandula(ラベンダー)、Origanum(オ
レガノ)、Mentha(ミント)、Salvia(セージ)、Rosmeci
nus(ローズマリー)、Thymus(タイム)、SaturejaおよびM
onarda、 Umbelliferae、以下の種を包含するが、これらに限定されない:
Carum(キャラウェー)、Anethum(デイル)、feniculum
(ウイキョウ)、およびDaucus(ニンジン)、 Asteraceae(Compositae)、以下の種を包含するが、こ
れらに限定されない:Artemisia(タラゴン、ヤマヨモギ)、Tana
cetum(ヨモギギク)、 Rutaceae(例えば、カンキツ植物);Rosaceae(例えば、バ
ラ)、Myrtaceae(例えば、ユーカリ、ブラシノキ);Gramine
ae(例えば、Cymbopogon(コウスイガヤ));Geranacea
e(ゼラニウム);および特定の球果植物(Abies(例えば、カナダバルサ
ム)、Cedrus(ヒマラヤスギ)、およびThujaおよびJuniper
usを含む)。
/またはセスキテルペノイドおよび/またはジテルペノイド油、ならびに/ある
いは高レベルのモノテルペノイドおよび/またはセスキテルペノイドおよび/ま
たはジテルペノイド樹脂を生産する植物種の群をいう。前出の油および/または
樹脂は、それらを生産する精油植物の新鮮重量の約0.005%より多くを占め
る。精油および/樹脂は、例えば、E.Guenther、The Essen
tial Oils,第I−VI巻、R.E.Krieger Publish
ing Co.、Huntington N.Y.、1975(本明細書中に参
考として援用される)において、より十分に記載されている。精油植物は、以下
を包含するが、これらに限定されない: Lamiaceae、以下の種を包含するが、これらに限定されない:Oci
mum(バジル)、Lavandula(ラベンダー)、Origanum(オ
レガノ)、Mentha(ミント)、Salvia(セージ)、Rosmeci
nus(ローズマリー)、Thymus(タイム)、SaturejaおよびM
onarda、 Umbelliferae、以下の種を包含するが、これらに限定されない:
Carum(キャラウェー)、Anethum(デイル)、feniculum
(ウイキョウ)、およびDaucus(ニンジン)、 Asteraceae(Compositae)、以下の種を包含するが、こ
れらに限定されない:Artemisia(タラゴン、ヤマヨモギ)、Tana
cetum(ヨモギギク)、 Rutaceae(例えば、カンキツ植物);Rosaceae(例えば、バ
ラ)、Myrtaceae(例えば、ユーカリ、ブラシノキ);Gramine
ae(例えば、Cymbopogon(コウスイガヤ));Geranacea
e(ゼラニウム);および特定の球果植物(Abies(例えば、カナダバルサ
ム)、Cedrus(ヒマラヤスギ)、およびThujaおよびJuniper
usを含む)。
【0025】 精油植物の範囲は、E.Guenther、The Essential O
ils,第I−VI巻、R.E.Krieger Publishing Co
.、Huntington N.Y.、1975(本明細書中に参考として援用
される)においてより十分に記載される。
ils,第I−VI巻、R.E.Krieger Publishing Co
.、Huntington N.Y.、1975(本明細書中に参考として援用
される)においてより十分に記載される。
【0026】 用語「被子植物」は、子房内に覆われている種子を生産する植物のクラスをい
う。
う。
【0027】 用語「裸子植物」は、子房に覆われていない種子を生産する植物のクラスをい
う。
う。
【0028】 用語「変化」、「アミノ酸配列変化」、「改変体」、および「アミノ酸配列改
変体」は、ネイティブなゲラニル二リン酸シンターゼに比較してアミノ酸配列に
おいていくらかの差異を有するゲラニル二リン酸シンターゼ分子をいう。通常、
改変体は、ネイティブなゲラニル二リン酸シンターゼと少なくとも約70%の相
同性を有し、好ましくは、改変体は、ネイティブなゲラニル二リン酸シンターゼ
と少なくとも約80%相同である。本発明の範囲内にあるゲラニル二リン酸シン
ターゼのアミノ酸配列改変体は、特定の位置での置換、欠失、および/または挿
入を有する。ゲラニル二リン酸シンターゼの配列改変体は、所望の酵素活性増強
または減少、放射化学または立体化学の改変、あるいは基質資化または産物分配
の変化を達成させるために使用され得る。
変体」は、ネイティブなゲラニル二リン酸シンターゼに比較してアミノ酸配列に
おいていくらかの差異を有するゲラニル二リン酸シンターゼ分子をいう。通常、
改変体は、ネイティブなゲラニル二リン酸シンターゼと少なくとも約70%の相
同性を有し、好ましくは、改変体は、ネイティブなゲラニル二リン酸シンターゼ
と少なくとも約80%相同である。本発明の範囲内にあるゲラニル二リン酸シン
ターゼのアミノ酸配列改変体は、特定の位置での置換、欠失、および/または挿
入を有する。ゲラニル二リン酸シンターゼの配列改変体は、所望の酵素活性増強
または減少、放射化学または立体化学の改変、あるいは基質資化または産物分配
の変化を達成させるために使用され得る。
【0029】 置換ゲラニル二リン酸シンターゼ改変体は、ネイティブなゲラニル二リン酸シ
ンターゼ配列において少なくとも1つのアミノ酸残基が除去され、そして同じ位
置にその代わりに異なるアミノ酸が挿入されている改変体である。置換は、単一
であり得る(ここでは、分子中のたった1つのアミノ酸が置換されている)か、
またはそれらは、複数であり得る(ここでは、2つ以上のアミノ酸が、同じ分子
中で置換されている)。ゲラニル二リン酸シンターゼ分子の活性における実質的
な変化は、ネイティブなアミノ酸の電荷および/または構造において有意に異な
る側鎖を有するアミノ酸と置換することにより、得られ得る。このタイプの置換
は、ポリペプチド骨格の構造および/または置換の領域中の分子の電荷もしくは
疎水性に影響することが予期される。
ンターゼ配列において少なくとも1つのアミノ酸残基が除去され、そして同じ位
置にその代わりに異なるアミノ酸が挿入されている改変体である。置換は、単一
であり得る(ここでは、分子中のたった1つのアミノ酸が置換されている)か、
またはそれらは、複数であり得る(ここでは、2つ以上のアミノ酸が、同じ分子
中で置換されている)。ゲラニル二リン酸シンターゼ分子の活性における実質的
な変化は、ネイティブなアミノ酸の電荷および/または構造において有意に異な
る側鎖を有するアミノ酸と置換することにより、得られ得る。このタイプの置換
は、ポリペプチド骨格の構造および/または置換の領域中の分子の電荷もしくは
疎水性に影響することが予期される。
【0030】 ゲラニル二リン酸シンターゼ分子の活性における中程度の変化は、ネイティブ
な分子の電荷および/または構造に類似である側鎖を有するアミノ酸と置換する
ことにより、予期される。このタイプの置換は、保存的置換と呼ばれ、ポリペプ
チド骨格の構造または置換の領域中の分子の電荷もしくは疎水性のいずれも実質
的に変化しないと予期される。
な分子の電荷および/または構造に類似である側鎖を有するアミノ酸と置換する
ことにより、予期される。このタイプの置換は、保存的置換と呼ばれ、ポリペプ
チド骨格の構造または置換の領域中の分子の電荷もしくは疎水性のいずれも実質
的に変化しないと予期される。
【0031】 挿入ゲラニル二リン酸シンターゼ改変体は、ネイティブなゲラニル二リン酸シ
ンターゼ分子における特定の位置のアミノ酸に隣接して、1つ以上のアミノ酸が
挿入された改変体である。アミノ酸に隣接するとは、アミノ酸のα−カルボキシ
官能基またはα−アミノ官能基のいずれかに接続されることを意味する。挿入は
、1つ以上のアミノ酸であり得る。通常、挿入は、1つまたは2つの保存的アミ
ノ酸からなる。挿入部位に近接したアミノ酸に電荷および/または構造が類似す
るアミノ酸は、保存的であると定義される。あるいは、本発明は、挿入部位に近
接したアミノ酸とは実質的に異なる電荷および/または構造を有するアミノ酸の
挿入を包含する。
ンターゼ分子における特定の位置のアミノ酸に隣接して、1つ以上のアミノ酸が
挿入された改変体である。アミノ酸に隣接するとは、アミノ酸のα−カルボキシ
官能基またはα−アミノ官能基のいずれかに接続されることを意味する。挿入は
、1つ以上のアミノ酸であり得る。通常、挿入は、1つまたは2つの保存的アミ
ノ酸からなる。挿入部位に近接したアミノ酸に電荷および/または構造が類似す
るアミノ酸は、保存的であると定義される。あるいは、本発明は、挿入部位に近
接したアミノ酸とは実質的に異なる電荷および/または構造を有するアミノ酸の
挿入を包含する。
【0032】 欠失改変体は、ネイティブなゲラニル二リン酸シンターゼ分子中の1つ以上の
アミノ酸が除去されている改変体である。通常、欠失改変体は、ゲラニル二リン
酸シンターゼ分子の特定の領域において1つまたは2つのアミノ酸の欠失を有す
る。
アミノ酸が除去されている改変体である。通常、欠失改変体は、ゲラニル二リン
酸シンターゼ分子の特定の領域において1つまたは2つのアミノ酸の欠失を有す
る。
【0033】 用語「生物学的活性」、「生物学的に活性である」、「活性」、および「活性
である」は、ゲラニル二リン酸シンターゼに関して使用される場合、酵素活性ア
ッセイ(例えば、以下の実施例1に記載のアッセイ)において測定されるように
、ゲラニル二リン酸シンターゼ分子がジメチルアリル二リン酸(DMAPP)お
よびイソペンテニル二リン酸(IPP)を縮合し、ゲラニル二リン酸を形成させ
る能力をいう。ゲラニル二リン酸シンターゼのアミノ酸配列改変体は、望ましい
生物学的活性の変化(例えば、反応速度論、基質資化、産物分配、または他の特
徴(例えば、放射化学および立体化学)の変化を包含する)を有し得る。
である」は、ゲラニル二リン酸シンターゼに関して使用される場合、酵素活性ア
ッセイ(例えば、以下の実施例1に記載のアッセイ)において測定されるように
、ゲラニル二リン酸シンターゼ分子がジメチルアリル二リン酸(DMAPP)お
よびイソペンテニル二リン酸(IPP)を縮合し、ゲラニル二リン酸を形成させ
る能力をいう。ゲラニル二リン酸シンターゼのアミノ酸配列改変体は、望ましい
生物学的活性の変化(例えば、反応速度論、基質資化、産物分配、または他の特
徴(例えば、放射化学および立体化学)の変化を包含する)を有し得る。
【0034】 用語「コードするDNA配列」、「コードするDNA」、および「コードする
核酸」は、デオキシリボ核酸の鎖に沿ったデオキシリボヌクレオチドの順序また
は配列をいう。これらのデオキシリボヌクレオチドの順序は、翻訳されたポリペ
プチド鎖に沿ったアミノ酸の順序を決定する。従って、DNA配列は、アミノ酸
配列をコードする。
核酸」は、デオキシリボ核酸の鎖に沿ったデオキシリボヌクレオチドの順序また
は配列をいう。これらのデオキシリボヌクレオチドの順序は、翻訳されたポリペ
プチド鎖に沿ったアミノ酸の順序を決定する。従って、DNA配列は、アミノ酸
配列をコードする。
【0035】 用語「複製可能発現ベクター」および「発現ベクター」は、外来DNAの一片
をその中に挿入し得るDNAの一片(通常、二本鎖である)をいう。外来DNA
は、異種DNAとして定義され、これは、宿主において天然には見出されないD
NAである。ベクターは、外来または異種DNAを適切な宿主細胞に輸送するた
めに使用される。いったん宿主細胞内に入ると、ベクターは、宿主染色体DNA
とは独立して、または同時に複製し得、そして数コピーのベクターおよびその挿
入された(外来の)DNAが生成され得る。さらに、ベクターは、外来DNAの
ポリペプチドへの翻訳を可能にする必要なエレメントを含有する。従って、外来
DNAによりコードされたポリペプチドの多くの分子は、迅速に合成され得る。
をその中に挿入し得るDNAの一片(通常、二本鎖である)をいう。外来DNA
は、異種DNAとして定義され、これは、宿主において天然には見出されないD
NAである。ベクターは、外来または異種DNAを適切な宿主細胞に輸送するた
めに使用される。いったん宿主細胞内に入ると、ベクターは、宿主染色体DNA
とは独立して、または同時に複製し得、そして数コピーのベクターおよびその挿
入された(外来の)DNAが生成され得る。さらに、ベクターは、外来DNAの
ポリペプチドへの翻訳を可能にする必要なエレメントを含有する。従って、外来
DNAによりコードされたポリペプチドの多くの分子は、迅速に合成され得る。
【0036】 用語「形質転換された宿主細胞」、「形質転換された」、および「形質転換」
は、細胞へのDNAの導入をいう。この細胞は、「宿主細胞」と称され、そして
これは、原核生物細胞または真核生物細胞であり得る。代表的な原核生物宿主細
胞は、E.coliの種々の株を包含する。代表的な真核生物宿主細胞は、植物
細胞(例えば、トウモロコシ細胞)、酵母細胞、昆虫細胞、または動物細胞であ
る。導入されたDNAは、通常、挿入されたDNA片を含有するベクターの形態
である。導入されたDNA配列は、宿主細胞と同じ種由来であり得るか、または
宿主細胞とは異なる種由来であり得、あるいはこれは、ハイブリッドDNA配列
(いくつかの外来DNAおよび宿主種由来のいくつかのDNAを含有する)であ
り得る。
は、細胞へのDNAの導入をいう。この細胞は、「宿主細胞」と称され、そして
これは、原核生物細胞または真核生物細胞であり得る。代表的な原核生物宿主細
胞は、E.coliの種々の株を包含する。代表的な真核生物宿主細胞は、植物
細胞(例えば、トウモロコシ細胞)、酵母細胞、昆虫細胞、または動物細胞であ
る。導入されたDNAは、通常、挿入されたDNA片を含有するベクターの形態
である。導入されたDNA配列は、宿主細胞と同じ種由来であり得るか、または
宿主細胞とは異なる種由来であり得、あるいはこれは、ハイブリッドDNA配列
(いくつかの外来DNAおよび宿主種由来のいくつかのDNAを含有する)であ
り得る。
【0037】 本発明によれば、ゲラニル二リン酸シンターゼをコードするcDNAが、以下
のようにして単離され、そして配列決定された。ゲラニル二リン酸シンターゼは
、腺毛分泌細胞にもっぱら位置し、そしてこれらの精油種においてゲラニル二リ
ン酸の形成を触媒する。これらの分泌細胞クラスターは、公知の方法によってM
entha spicataから単離され、そしてゲラニル二リン酸シンターゼ
は、新規な精製プロトコル(ダイ−リガンドクロマトグラフィー工程、およびア
ニオン交換クロマトグラフィー、続く分取SDS−PAGEからなる)を利用し
てそれから精製された。限定量の精製ゲラニル二リン酸シンターゼは、9アミノ
酸ペプチドの配列(配列番号3)を生じた。この配列情報は、ゲラニル二リン酸
シンターゼcDNAのクローン化のために逆遺伝学アプローチを可能にするには
不充分であった。すなわち、プローブとして有効であるのに十分に特異的である
縮重オリゴヌクレオチドプローブの構築を可能にするには十分でないアミノ酸し
かなかった。
のようにして単離され、そして配列決定された。ゲラニル二リン酸シンターゼは
、腺毛分泌細胞にもっぱら位置し、そしてこれらの精油種においてゲラニル二リ
ン酸の形成を触媒する。これらの分泌細胞クラスターは、公知の方法によってM
entha spicataから単離され、そしてゲラニル二リン酸シンターゼ
は、新規な精製プロトコル(ダイ−リガンドクロマトグラフィー工程、およびア
ニオン交換クロマトグラフィー、続く分取SDS−PAGEからなる)を利用し
てそれから精製された。限定量の精製ゲラニル二リン酸シンターゼは、9アミノ
酸ペプチドの配列(配列番号3)を生じた。この配列情報は、ゲラニル二リン酸
シンターゼcDNAのクローン化のために逆遺伝学アプローチを可能にするには
不充分であった。すなわち、プローブとして有効であるのに十分に特異的である
縮重オリゴヌクレオチドプローブの構築を可能にするには十分でないアミノ酸し
かなかった。
【0038】 結果、全RNAが、Mentha piperita由来の単離された毛状分
泌細胞から抽出され、そしてmRNAがそこから精製された。この分泌細胞mR
NAは、標準的な手段によるcDNAライブラリーの合成のための基質として作
用した。100の無作為に選択したcDNAクローンが配列決定され、そして1
つのクローンが、植物由来ゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼに対して低い相
同性を示した(約28%同一性;約54%類似性)。この「プレニルトランスフ
ェラーゼ様」cDNA由来の配列情報が、PCRプライマー(配列番号4および
5)を構築するために使用された。続いて、このPCRプライマーは、「プレニ
ルトランスフェラーゼ様」cDNAの113bpフラグメント(配列番号6)を
増幅するために使用された。このフラグメントを、腺毛状分泌細胞ライブラリー
から27のさらなる相同性クローンを単離するためにプローブとして使用された
。配列決定は、27のクローンが3つの対立遺伝子を呈することを明示した。3
つの対立遺伝子群の各々からの1つのクローンの生物学的活性は、3つの代表的
なcDNAの各々を個々に発現するE.coli由来の上清中のゲラニル二リン
酸活性を測定することにより試験された。ゲラニル二リン酸シンターゼ活性の最
高レベルを示すクローン(Mp13.18と称する)が完全に配列決定され(配
列番号1)、そしてそれがゲラニル二リン酸シンターゼクローンであることが、
推定のゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質配列をMentha spica
taから精製されたゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質由来の9アミノ酸ペ
プチド(配列番号3)の配列と比較することによって確認された。
泌細胞から抽出され、そしてmRNAがそこから精製された。この分泌細胞mR
NAは、標準的な手段によるcDNAライブラリーの合成のための基質として作
用した。100の無作為に選択したcDNAクローンが配列決定され、そして1
つのクローンが、植物由来ゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼに対して低い相
同性を示した(約28%同一性;約54%類似性)。この「プレニルトランスフ
ェラーゼ様」cDNA由来の配列情報が、PCRプライマー(配列番号4および
5)を構築するために使用された。続いて、このPCRプライマーは、「プレニ
ルトランスフェラーゼ様」cDNAの113bpフラグメント(配列番号6)を
増幅するために使用された。このフラグメントを、腺毛状分泌細胞ライブラリー
から27のさらなる相同性クローンを単離するためにプローブとして使用された
。配列決定は、27のクローンが3つの対立遺伝子を呈することを明示した。3
つの対立遺伝子群の各々からの1つのクローンの生物学的活性は、3つの代表的
なcDNAの各々を個々に発現するE.coli由来の上清中のゲラニル二リン
酸活性を測定することにより試験された。ゲラニル二リン酸シンターゼ活性の最
高レベルを示すクローン(Mp13.18と称する)が完全に配列決定され(配
列番号1)、そしてそれがゲラニル二リン酸シンターゼクローンであることが、
推定のゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質配列をMentha spica
taから精製されたゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質由来の9アミノ酸ペ
プチド(配列番号3)の配列と比較することによって確認された。
【0039】 さらに、8アミノ酸ペプチド(配列番号7)の配列(Mentha spic
ataから精製されたゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質由来)が、ゲラニ
ル二リン酸シンターゼのクローニングに続いて得られた。9アミノ酸ペプチド(
配列番号3)および8アミノ酸ペプチド(配列番号7)の両方の配列は、クロー
ン化されたゲラニル二リン酸シンターゼcDNAから推定されたタンパク質配列
の対応する領域(それぞれ、配列番号2のアミノ酸254〜262、およびアミ
ノ酸184〜191)に正確に適合した。精製されたMentha spica
taゲラニル二リン酸シンターゼ由来のペプチド配列が、クローン化されたMe
ntha piperitaゲラニル二リン酸シンターゼの対応する領域に完全
に適合したという所見は、この2種の間の遺伝的関係と一致する:ペパーミント
(Mentha piperita)は、Mentha aquaticaを4
倍体Mentha spicataと交雑することにより生産された6倍体種で
ある(HarleyおよびBrighton、Bot.J.Linn.Soc.
74:71−96[1977])。要するに、6倍体ペパーミントは、4倍体ス
ペアミントの完全ゲノムを含有する。
ataから精製されたゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質由来)が、ゲラニ
ル二リン酸シンターゼのクローニングに続いて得られた。9アミノ酸ペプチド(
配列番号3)および8アミノ酸ペプチド(配列番号7)の両方の配列は、クロー
ン化されたゲラニル二リン酸シンターゼcDNAから推定されたタンパク質配列
の対応する領域(それぞれ、配列番号2のアミノ酸254〜262、およびアミ
ノ酸184〜191)に正確に適合した。精製されたMentha spica
taゲラニル二リン酸シンターゼ由来のペプチド配列が、クローン化されたMe
ntha piperitaゲラニル二リン酸シンターゼの対応する領域に完全
に適合したという所見は、この2種の間の遺伝的関係と一致する:ペパーミント
(Mentha piperita)は、Mentha aquaticaを4
倍体Mentha spicataと交雑することにより生産された6倍体種で
ある(HarleyおよびBrighton、Bot.J.Linn.Soc.
74:71−96[1977])。要するに、6倍体ペパーミントは、4倍体ス
ペアミントの完全ゲノムを含有する。
【0040】 ゲラニル二リン酸シンターゼcDNAの単離は、この機能的な酵素の効率的な
発現系の開発を可能にし;モノテルペン生合成の発達的調節を試験するための有
用なツールを提供し、そして他のゲラニル二リン酸シンターゼの単離を可能にす
る。ゲラニル二リン酸シンターゼcDNAの単離はまた、新規にモノテルペン生
合成を導入するため、または内因性モノテルペン生合成を改変するために、広範
囲の生物の形質転換を可能にする。
発現系の開発を可能にし;モノテルペン生合成の発達的調節を試験するための有
用なツールを提供し、そして他のゲラニル二リン酸シンターゼの単離を可能にす
る。ゲラニル二リン酸シンターゼcDNAの単離はまた、新規にモノテルペン生
合成を導入するため、または内因性モノテルペン生合成を改変するために、広範
囲の生物の形質転換を可能にする。
【0041】 配列番号2に記載のゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質は酵素をプラスチ
ドに指向させるが、推定標的化配列(配列番号2、アミノ酸1〜48)の当該分
野で周知の他の輸送配列(例えば、von Heijne Gら、Eur.J.
Biochem 180:535−545、1989;Stryer、Bioc
hemistry W.H.Freeman and Company、New
York、NY、769頁[1988])との置換は、他の細胞位置または細
胞外位置にゲラニル二リン酸シンターゼを指向させるために用いられ得る。
ドに指向させるが、推定標的化配列(配列番号2、アミノ酸1〜48)の当該分
野で周知の他の輸送配列(例えば、von Heijne Gら、Eur.J.
Biochem 180:535−545、1989;Stryer、Bioc
hemistry W.H.Freeman and Company、New
York、NY、769頁[1988])との置換は、他の細胞位置または細
胞外位置にゲラニル二リン酸シンターゼを指向させるために用いられ得る。
【0042】 プラスミドMp13.18のcDNA挿入片(配列番号1)によりコードされ
た配列番号2のネイティブなゲラニル二リン酸シンターゼアミノ酸配列に加えて
、欠失、置換、変異および/または挿入により生産された配列改変体が、先行技
術により制限される範囲を除いて、本発明の範囲内であると意図される。ゲラニ
ル二リン酸シンターゼアミノ酸配列改変体は、野生型ゲラニル二リン酸シンター
ゼをコードするDNA配列を変異させる(例えば、部位特異的変異誘発と通常呼
ばれる技術を用いることによる)ことにより、構築され得る。現在当該分野で周
知の種々のポリメラーゼ連鎖反応(PCR)法(例えば、Transforme
r Site−Directed Mutagenesisキット(Clont
echから)のような2プライマー系)が、この目的のために使用され得る。
た配列番号2のネイティブなゲラニル二リン酸シンターゼアミノ酸配列に加えて
、欠失、置換、変異および/または挿入により生産された配列改変体が、先行技
術により制限される範囲を除いて、本発明の範囲内であると意図される。ゲラニ
ル二リン酸シンターゼアミノ酸配列改変体は、野生型ゲラニル二リン酸シンター
ゼをコードするDNA配列を変異させる(例えば、部位特異的変異誘発と通常呼
ばれる技術を用いることによる)ことにより、構築され得る。現在当該分野で周
知の種々のポリメラーゼ連鎖反応(PCR)法(例えば、Transforme
r Site−Directed Mutagenesisキット(Clont
echから)のような2プライマー系)が、この目的のために使用され得る。
【0043】 この系における標的プラスミドの変性後、2つのプライマーがこのプラスミド
に同時にアニールされる;これらのプライマーの一方は、所望の部位特異的変異
を含み、他方は、プラスミドにおける別の部位に変異を含み、制限部位の除去を
生じる。次いで、第二の鎖合成が行われ、これらの2つの変異を強く連結し、そ
して得られたプラスミドは、E.coliのmutS株に形質転換される。プラ
スミドDNAは、形質転換細菌から単離され、関連の制限酵素で制限され(それ
により非変異プラスミドを線状化する)、次いでE.coliに再形質転換され
る。この系は、一本鎖ファージミドのサブクローン化または生成の必要性なく、
発現プラスミドにおいて直接的に変異の生成を可能にする。2つの変異の強い連
結および非変異プラスミドの続く線状化は、高変異効率を生じ、そして最少のス
クリーニングを可能にする。出発制限部位プライマーの合成後、この方法は、変
異部位あたりたった1つの新規なプライマータイプの使用を必要とする。各位置
変異を別個に調製するよりむしろ、一セットの「設計された縮重」オリゴヌクレ
オチドプライマーが、所定の部位で所望の変異の全てを同時に導入するために合
成され得る。形質転換体は、変異クローンを同定および選別するために、プラス
ミドDNAを変異誘発領域にわたって配列決定することによりスクリーニングさ
れ得る。次いで、各変異体DNAは、制限され、そしてMutation De
tection Enhancementゲル(J.T.Baker)上の電気
泳動によって分析され、配列において他の変化が生じていないことを確認し得る
(非変異誘発コントロールとのバンドシフト比較による)。
に同時にアニールされる;これらのプライマーの一方は、所望の部位特異的変異
を含み、他方は、プラスミドにおける別の部位に変異を含み、制限部位の除去を
生じる。次いで、第二の鎖合成が行われ、これらの2つの変異を強く連結し、そ
して得られたプラスミドは、E.coliのmutS株に形質転換される。プラ
スミドDNAは、形質転換細菌から単離され、関連の制限酵素で制限され(それ
により非変異プラスミドを線状化する)、次いでE.coliに再形質転換され
る。この系は、一本鎖ファージミドのサブクローン化または生成の必要性なく、
発現プラスミドにおいて直接的に変異の生成を可能にする。2つの変異の強い連
結および非変異プラスミドの続く線状化は、高変異効率を生じ、そして最少のス
クリーニングを可能にする。出発制限部位プライマーの合成後、この方法は、変
異部位あたりたった1つの新規なプライマータイプの使用を必要とする。各位置
変異を別個に調製するよりむしろ、一セットの「設計された縮重」オリゴヌクレ
オチドプライマーが、所定の部位で所望の変異の全てを同時に導入するために合
成され得る。形質転換体は、変異クローンを同定および選別するために、プラス
ミドDNAを変異誘発領域にわたって配列決定することによりスクリーニングさ
れ得る。次いで、各変異体DNAは、制限され、そしてMutation De
tection Enhancementゲル(J.T.Baker)上の電気
泳動によって分析され、配列において他の変化が生じていないことを確認し得る
(非変異誘発コントロールとのバンドシフト比較による)。
【0044】 確証された変異体二重鎖は、(このタイプのベクターにまだクローン化されて
いなければ)複製可能発現ベクターにクローン化され得、そして得られた発現構
築物は、変異体タンパク質の高レベルでの生産および続くそれらの精製のために
、E.coli(例えば、E.coli BL21(DE3)pLysS株)を
形質転換するために使用され得る。FAB−MSマッピングの方法は、変異体発
現の忠実度を迅速に調べるために使用され得る。この技術は、全タンパク質にわ
たってセグメントを配列決定することを提供し、そして配列割り当てにおいて必
要な信頼性を提供する。このタイプのマッピング実験において、タンパク質は、
プロテアーゼで消化される(選択は、改変されるべき特定の領域に依存する。な
ぜなら、このセグメントが主な関心の的であり、残りのマップは、非変異誘発タ
ンパク質のマップに同一であるべきであるため)。切断フラグメントのセットは
、微小孔HPLC(逆相またはイオン交換、これもまた、改変されるべき特定の
領域に依存する)によって分画されて、各画分中にいくつかのペプチドを提供し
、そしてペプチドの分子量はFAB−MSによって決定される。次いで、質量が
、推定配列の消化から予期されるペプチドの分子量と比較され、そして配列の正
しさが即座に確かめられる。タンパク質改変に対してこの変異誘発アプローチは
指向されるので、変化されたペプチドの配列決定は、MSが推定と一致すれば、
必要とされるべきではない。変更残基を確認することが必要であれば、CAD−
タンデムMS/MSが、問題の混合物のペプチド、あるいは改変の位置に依存し
てサブトラクティブEdman分解またはカルボキシペプチダーゼY消化のため
に精製された標的ペプチドを配列決定するために使用され得る。
いなければ)複製可能発現ベクターにクローン化され得、そして得られた発現構
築物は、変異体タンパク質の高レベルでの生産および続くそれらの精製のために
、E.coli(例えば、E.coli BL21(DE3)pLysS株)を
形質転換するために使用され得る。FAB−MSマッピングの方法は、変異体発
現の忠実度を迅速に調べるために使用され得る。この技術は、全タンパク質にわ
たってセグメントを配列決定することを提供し、そして配列割り当てにおいて必
要な信頼性を提供する。このタイプのマッピング実験において、タンパク質は、
プロテアーゼで消化される(選択は、改変されるべき特定の領域に依存する。な
ぜなら、このセグメントが主な関心の的であり、残りのマップは、非変異誘発タ
ンパク質のマップに同一であるべきであるため)。切断フラグメントのセットは
、微小孔HPLC(逆相またはイオン交換、これもまた、改変されるべき特定の
領域に依存する)によって分画されて、各画分中にいくつかのペプチドを提供し
、そしてペプチドの分子量はFAB−MSによって決定される。次いで、質量が
、推定配列の消化から予期されるペプチドの分子量と比較され、そして配列の正
しさが即座に確かめられる。タンパク質改変に対してこの変異誘発アプローチは
指向されるので、変化されたペプチドの配列決定は、MSが推定と一致すれば、
必要とされるべきではない。変更残基を確認することが必要であれば、CAD−
タンデムMS/MSが、問題の混合物のペプチド、あるいは改変の位置に依存し
てサブトラクティブEdman分解またはカルボキシペプチダーゼY消化のため
に精製された標的ペプチドを配列決定するために使用され得る。
【0045】 特定の部位特異的変異体の設計において、一般に、まず非保存的置換(例えば
、Cys、HisまたはGluの代わりにAla)を行い、結果として活性が大
いに損なわれるかどうかを決定することが、望ましい。次いで、変異誘発タンパ
ク質の特性が、機能変化の感度指標としてKmおよびkcatの反応速度論パラメー
ターに対して特に注意して試験される。そこから、結合および/または触媒自体
の変化が、ネイティブな酵素に対する比較によって推定され得る。残基が、この
手段によって、活性を損なうこと、またはノックアウトに重要であることが示さ
れれば、側鎖長を変えるためのGluからAspへ、CysからSerへ、また
はHisからArgへのような保存的置換がなされ得る。疎水性セグメントにつ
いて、主として、変化されるのはサイズであるが、芳香族もまたアルキル側鎖に
ついて置換され得る。通常産物分布における変化は、反応順序のどの段階が変異
によって変化されているかを示し得る。
、Cys、HisまたはGluの代わりにAla)を行い、結果として活性が大
いに損なわれるかどうかを決定することが、望ましい。次いで、変異誘発タンパ
ク質の特性が、機能変化の感度指標としてKmおよびkcatの反応速度論パラメー
ターに対して特に注意して試験される。そこから、結合および/または触媒自体
の変化が、ネイティブな酵素に対する比較によって推定され得る。残基が、この
手段によって、活性を損なうこと、またはノックアウトに重要であることが示さ
れれば、側鎖長を変えるためのGluからAspへ、CysからSerへ、また
はHisからArgへのような保存的置換がなされ得る。疎水性セグメントにつ
いて、主として、変化されるのはサイズであるが、芳香族もまたアルキル側鎖に
ついて置換され得る。通常産物分布における変化は、反応順序のどの段階が変異
によって変化されているかを示し得る。
【0046】 他の部位特異的変異誘発技術はまた、本発明のヌクレオチド配列と共に用いら
れ得る。例えば、DNAの制限エンドヌクレアーゼ消化、続く連結が、Samb
rookら(Molecular Cloning:A Laboratory
Manual 第2版、Cold Spring Harbor Labor
atory Press、New York、NY[1989])のセクション
15.3に記載されるように、ゲラニル二リン酸シンターゼ欠失改変体を生成す
るために使用され得る。類似のストラテジーが、Sambrookら(前出)の
セクション15.3において記載されるように挿入改変体を構築するために使用
され得る。
れ得る。例えば、DNAの制限エンドヌクレアーゼ消化、続く連結が、Samb
rookら(Molecular Cloning:A Laboratory
Manual 第2版、Cold Spring Harbor Labor
atory Press、New York、NY[1989])のセクション
15.3に記載されるように、ゲラニル二リン酸シンターゼ欠失改変体を生成す
るために使用され得る。類似のストラテジーが、Sambrookら(前出)の
セクション15.3において記載されるように挿入改変体を構築するために使用
され得る。
【0047】 オリゴヌクレオチド指向性変異誘発もまた、本発明の置換改変体を調製するた
めに使用され得る。それはまた、本発明の欠失改変体および挿入改変体を便宜的
に調製するために使用され得る。この技術は、Adelmanら(DNA 2:
183[1983])により記載されるように、当該分野において周知である。
一般に、少なくとも25ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドが、ゲラニル二リ
ン酸シンターゼ分子において2つ以上のヌクレオチドを挿入、欠失または置換す
るために使用される。至適なオリゴヌクレオチドは、変異をコードするヌクレオ
チドのいずれかの側に12〜15の完全に適合したヌクレオチドを有する。野生
型ゲラニル二リン酸シンターゼを変異誘発するために、オリゴヌクレオチドは、
適切なハイブリダイゼーション条件下で一本鎖DNAテンプレート分子にアニー
ルされる。次いで、DNA重合酵素(通常、E.coli DNAポリメラーゼ
Iのクレノウフラグメント)が添加される。この酵素は、DNAの変異を有する
鎖の合成を完了するためのプライマーとして、オリゴヌクレオチドを使用する。
従って、ヘテロ二重鎖分子は、DNAの一方の鎖が、ベクターに挿入された野生
型ゲラニル二リン酸シンターゼをコードし、DNAの第二の鎖が、同じベクター
に挿入されたゲラニル二リン酸シンターゼの変異型をコードするように形成され
る。次いで、このヘテロ二重鎖分子は、適切な宿主細胞に形質転換される。
めに使用され得る。それはまた、本発明の欠失改変体および挿入改変体を便宜的
に調製するために使用され得る。この技術は、Adelmanら(DNA 2:
183[1983])により記載されるように、当該分野において周知である。
一般に、少なくとも25ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドが、ゲラニル二リ
ン酸シンターゼ分子において2つ以上のヌクレオチドを挿入、欠失または置換す
るために使用される。至適なオリゴヌクレオチドは、変異をコードするヌクレオ
チドのいずれかの側に12〜15の完全に適合したヌクレオチドを有する。野生
型ゲラニル二リン酸シンターゼを変異誘発するために、オリゴヌクレオチドは、
適切なハイブリダイゼーション条件下で一本鎖DNAテンプレート分子にアニー
ルされる。次いで、DNA重合酵素(通常、E.coli DNAポリメラーゼ
Iのクレノウフラグメント)が添加される。この酵素は、DNAの変異を有する
鎖の合成を完了するためのプライマーとして、オリゴヌクレオチドを使用する。
従って、ヘテロ二重鎖分子は、DNAの一方の鎖が、ベクターに挿入された野生
型ゲラニル二リン酸シンターゼをコードし、DNAの第二の鎖が、同じベクター
に挿入されたゲラニル二リン酸シンターゼの変異型をコードするように形成され
る。次いで、このヘテロ二重鎖分子は、適切な宿主細胞に形質転換される。
【0048】 1つより多くのアミノ酸が置換されている変異体は、いくつかの方法の1つに
おいて生成され得る。アミノ酸がポリペプチド鎖において共に近接して位置すれ
ば、それらは、所望のアミノ酸置換の全てをコードする1つのオリゴヌクレオチ
ドを用いて同時に変異され得る。しかしながら、アミノ酸が互いからある程度の
距離に位置する場合(例えば、10アミノ酸より大きく離れている)、所望の変
更のすべてをコードする単一のオリゴヌクレオチドを生成することはより困難で
ある。代わりに、2つの代替的な方法のうち一方が用いられ得る。第一の方法で
は、別個のオリゴヌクレオチドが、置換されるべき各アミノ酸について生成され
る。次いで、これらのオリゴヌクレオチドは、同時に一本鎖テンプレートDNA
にアニールされ、そしてテンプレートから合成されたDNAの第二の鎖は、所望
のアミノ酸置換の全てをコードする。代替法は、所望の変異体を生産するために
、2ラウンド以上の変異誘発を包含する。第一のラウンドは、単一変異体につい
て記載のとおりである:野生型ゲラニル二リン酸シンターゼDNAがテンプレー
トとして使用され、第一の所望のアミノ酸置換をコードするオリゴヌクレオチド
がこのテンプレートにアニールされ、そして次いで、ヘテロ二重鎖DNA分子が
生成される。第二のラウンドの変異誘発は、テンプレートとして第一のラウンド
の変異誘発において生産された変異DNAを利用する。従って、このテンプレー
トは、すでに1以上の変異を含有する。次いで、さらなる所望のアミノ酸置換を
コードするオリゴヌクレオチドがこのテンプレートにアニールされ、そして得ら
れたDNAの鎖は、いまや第一および第二の両方のラウンドの変異誘発からの変
異をコードする。この得られたDNAは、第三のラウンドなどの変異誘発におい
てテンプレートとして使用され得る。
おいて生成され得る。アミノ酸がポリペプチド鎖において共に近接して位置すれ
ば、それらは、所望のアミノ酸置換の全てをコードする1つのオリゴヌクレオチ
ドを用いて同時に変異され得る。しかしながら、アミノ酸が互いからある程度の
距離に位置する場合(例えば、10アミノ酸より大きく離れている)、所望の変
更のすべてをコードする単一のオリゴヌクレオチドを生成することはより困難で
ある。代わりに、2つの代替的な方法のうち一方が用いられ得る。第一の方法で
は、別個のオリゴヌクレオチドが、置換されるべき各アミノ酸について生成され
る。次いで、これらのオリゴヌクレオチドは、同時に一本鎖テンプレートDNA
にアニールされ、そしてテンプレートから合成されたDNAの第二の鎖は、所望
のアミノ酸置換の全てをコードする。代替法は、所望の変異体を生産するために
、2ラウンド以上の変異誘発を包含する。第一のラウンドは、単一変異体につい
て記載のとおりである:野生型ゲラニル二リン酸シンターゼDNAがテンプレー
トとして使用され、第一の所望のアミノ酸置換をコードするオリゴヌクレオチド
がこのテンプレートにアニールされ、そして次いで、ヘテロ二重鎖DNA分子が
生成される。第二のラウンドの変異誘発は、テンプレートとして第一のラウンド
の変異誘発において生産された変異DNAを利用する。従って、このテンプレー
トは、すでに1以上の変異を含有する。次いで、さらなる所望のアミノ酸置換を
コードするオリゴヌクレオチドがこのテンプレートにアニールされ、そして得ら
れたDNAの鎖は、いまや第一および第二の両方のラウンドの変異誘発からの変
異をコードする。この得られたDNAは、第三のラウンドなどの変異誘発におい
てテンプレートとして使用され得る。
【0049】 ゲラニル二リン酸シンターゼをコードする遺伝子は、任意の生物(無傷植物、
動物、微生物)、またはそれに由来する細胞培養物に組み込まれ得、これは、ジ
メチルアリル二リン酸およびイソペンテニル二リン酸を生産し、生物に依存して
、これらの主要基質のゲラニル二リン酸およびその続く代謝産物への変換を行う
。ゲラニル二リン酸シンターゼ遺伝子は、種々の目的のために任意の生物に組み
込まれ得る。この目的は、以下を包含するが、これらに限定されない:風味特性
および芳香特性の生産または改変;防御能の改善;ゲラニル二リン酸およびその
誘導体により媒介される他の生態学的相互作用の変化;ガン細胞の増殖、分化ま
たは分裂の選択的破壊または阻害;あるいはゲラニル二リン酸およびその誘導体
の生産。
動物、微生物)、またはそれに由来する細胞培養物に組み込まれ得、これは、ジ
メチルアリル二リン酸およびイソペンテニル二リン酸を生産し、生物に依存して
、これらの主要基質のゲラニル二リン酸およびその続く代謝産物への変換を行う
。ゲラニル二リン酸シンターゼ遺伝子は、種々の目的のために任意の生物に組み
込まれ得る。この目的は、以下を包含するが、これらに限定されない:風味特性
および芳香特性の生産または改変;防御能の改善;ゲラニル二リン酸およびその
誘導体により媒介される他の生態学的相互作用の変化;ガン細胞の増殖、分化ま
たは分裂の選択的破壊または阻害;あるいはゲラニル二リン酸およびその誘導体
の生産。
【0050】 真核生物発現系は、ゲラニル二リン酸シンターゼ生産のために利用され得る。
なぜなら、これらは、必要とされる翻訳後修飾を実施し得、そしてこの酵素を適
切な膜位置に指向させ得るからである。この目的のために代表的な真核生物発現
系は、本発明のゲラニル二リン酸シンターゼの発現のために、組換えバキュロウ
イルス、Autographa californica核多角体病ウイルス(
AcNPV;M.D.SummersおよびG.E.Smith、A Manu
al of Methods for Baculovirus Vector
s and Insect Cell Culture Procedures
[1986];Luckowら、Bio−technology 6:47−5
5[1987])を使用する。組換えバキュロウイルスでの昆虫細胞(例えば、
Spodoptera frugiperda種の細胞)の感染は、大量のゲラ
ニル二リン酸シンターゼタンパク質の生産を可能にする。さらに、バキュロウイ
ルス系は、組換えゲラニル二リン酸シンターゼの生産についての他の重要な利点
を有する。例えば、バキュロウイルスは、ヒトに感染せず、従って、大量でも安
全に扱われ得る。バキュロウイルス系において、ゲラニル二リン酸シンターゼを
コードするDNAセグメントおよびベクターを含むDNA構築物が調製される。
このベクターは、バキュロウイルスのポリヘドロン遺伝子プロモーター領域、組
換えの間の適切な交叉に必要なバキュロウイルスフランキング配列(フランキン
グ配列は、プロモーター配列に近接した約200〜300塩基対を含み得る)お
よび細菌複製起点(構築物の細菌での複製を可能にする)を含み得る。このベク
ターは、(i)DNAセグメントが、ポリヘドロン遺伝子プロモーターに近接し
て(または作動可能に連結されて、または「下流に」、または「制御下に」)配
置され、そして(ii)プロモーター/ゲラニル二リン酸シンターゼ組み合わせ
がバキュロウイルスDNAの200から300塩基対(フランキング配列)まで
両側に配置されるように、構築される。
なぜなら、これらは、必要とされる翻訳後修飾を実施し得、そしてこの酵素を適
切な膜位置に指向させ得るからである。この目的のために代表的な真核生物発現
系は、本発明のゲラニル二リン酸シンターゼの発現のために、組換えバキュロウ
イルス、Autographa californica核多角体病ウイルス(
AcNPV;M.D.SummersおよびG.E.Smith、A Manu
al of Methods for Baculovirus Vector
s and Insect Cell Culture Procedures
[1986];Luckowら、Bio−technology 6:47−5
5[1987])を使用する。組換えバキュロウイルスでの昆虫細胞(例えば、
Spodoptera frugiperda種の細胞)の感染は、大量のゲラ
ニル二リン酸シンターゼタンパク質の生産を可能にする。さらに、バキュロウイ
ルス系は、組換えゲラニル二リン酸シンターゼの生産についての他の重要な利点
を有する。例えば、バキュロウイルスは、ヒトに感染せず、従って、大量でも安
全に扱われ得る。バキュロウイルス系において、ゲラニル二リン酸シンターゼを
コードするDNAセグメントおよびベクターを含むDNA構築物が調製される。
このベクターは、バキュロウイルスのポリヘドロン遺伝子プロモーター領域、組
換えの間の適切な交叉に必要なバキュロウイルスフランキング配列(フランキン
グ配列は、プロモーター配列に近接した約200〜300塩基対を含み得る)お
よび細菌複製起点(構築物の細菌での複製を可能にする)を含み得る。このベク
ターは、(i)DNAセグメントが、ポリヘドロン遺伝子プロモーターに近接し
て(または作動可能に連結されて、または「下流に」、または「制御下に」)配
置され、そして(ii)プロモーター/ゲラニル二リン酸シンターゼ組み合わせ
がバキュロウイルスDNAの200から300塩基対(フランキング配列)まで
両側に配置されるように、構築される。
【0051】 ゲラニル二リン酸シンターゼDNA構築物を生産するために、全長ゲラニル二
リン酸シンターゼをコードするcDNAクローンは、本明細書中に記載のような
方法を用いて得られる。DNA構築物は、宿主細胞において、組換えが行われる
ような条件下で、適切なバキュロウイルスの(すなわち、構築物においてコード
されたプロモーターと同じ種のバキュロウイルスの)バキュロウイルスDNAと
接触させられる。得られる組換えバキュロウイルスは、全長ゲラニル二リン酸シ
ンターゼをコードする。例えば、昆虫宿主細胞は、DNA構築物および機能的バ
キュロウイルスと同時トランスフェクトされ得るか、または別個にトランスフェ
クトされ得る。次いで、得られた組換えバキュロウイルスは、単離され得、そし
てゲラニル二リン酸シンターゼの生産を行うように細胞に感染するために使用さ
れ得る。宿主昆虫細胞は、例えば、Spodoptera frugiperd
a細胞を包含する。これは、バキュロウイルス発現ゲラニル二リン酸シンターゼ
を生産し得る。本発明の組換えバキュロウイルスで感染された昆虫宿主細胞は、
次いで、バキュロウイルスコード化ゲラニル二リン酸シンターゼの発現を可能に
する条件下で培養される。このように生産されたゲラニル二リン酸シンターゼは
、次いで、当該分野で公知の方法を用いて細胞から抽出される。
リン酸シンターゼをコードするcDNAクローンは、本明細書中に記載のような
方法を用いて得られる。DNA構築物は、宿主細胞において、組換えが行われる
ような条件下で、適切なバキュロウイルスの(すなわち、構築物においてコード
されたプロモーターと同じ種のバキュロウイルスの)バキュロウイルスDNAと
接触させられる。得られる組換えバキュロウイルスは、全長ゲラニル二リン酸シ
ンターゼをコードする。例えば、昆虫宿主細胞は、DNA構築物および機能的バ
キュロウイルスと同時トランスフェクトされ得るか、または別個にトランスフェ
クトされ得る。次いで、得られた組換えバキュロウイルスは、単離され得、そし
てゲラニル二リン酸シンターゼの生産を行うように細胞に感染するために使用さ
れ得る。宿主昆虫細胞は、例えば、Spodoptera frugiperd
a細胞を包含する。これは、バキュロウイルス発現ゲラニル二リン酸シンターゼ
を生産し得る。本発明の組換えバキュロウイルスで感染された昆虫宿主細胞は、
次いで、バキュロウイルスコード化ゲラニル二リン酸シンターゼの発現を可能に
する条件下で培養される。このように生産されたゲラニル二リン酸シンターゼは
、次いで、当該分野で公知の方法を用いて細胞から抽出される。
【0052】 他の真核生物微生物(例えば、酵母)もまた、本発明を実施するために使用さ
れ得る。パン酵母Saccharomyces cerevisiaeが一般に
用いられる酵母であるが、いくつかの他の株もまた利用可能である。プラスミド
YRp7(Stinchcombら、Nature 282:39[1979]
;Kingsmanら、Gene 7:141[1979];Tschempe
rら、Gene 10:157[1980])は、Saccharomyces
における発現ベクターとして一般に用いられる。このプラスミドは、トリプトフ
ァン中で増殖する能力を欠損する酵母の変異株(例えば、ATCC第44,07
6号およびPEP4−1株(Jones,Genetics 85:12[19
77]))についての選択マーカーを提供するtrp1遺伝子を含む。酵母宿主
細胞ゲノムの特徴としてのtrp1病巣の存在は、次いで、トリプトファン不在
下での増殖により形質転換を検出するための有効な環境を提供する。酵母宿主細
胞は、一般に、Hinnen(Proc.Natl.Acad.Sci.USA
75:1929[1978])に記載のように、ポリエチレングリコール法を
用いて形質転換される。さらなる酵母形質転換プロトコルは、Gietzら、N
.A.R 20(17):1425、1992;Reevesら、FEMS 9
9:193−197、1992に記載される。
れ得る。パン酵母Saccharomyces cerevisiaeが一般に
用いられる酵母であるが、いくつかの他の株もまた利用可能である。プラスミド
YRp7(Stinchcombら、Nature 282:39[1979]
;Kingsmanら、Gene 7:141[1979];Tschempe
rら、Gene 10:157[1980])は、Saccharomyces
における発現ベクターとして一般に用いられる。このプラスミドは、トリプトフ
ァン中で増殖する能力を欠損する酵母の変異株(例えば、ATCC第44,07
6号およびPEP4−1株(Jones,Genetics 85:12[19
77]))についての選択マーカーを提供するtrp1遺伝子を含む。酵母宿主
細胞ゲノムの特徴としてのtrp1病巣の存在は、次いで、トリプトファン不在
下での増殖により形質転換を検出するための有効な環境を提供する。酵母宿主細
胞は、一般に、Hinnen(Proc.Natl.Acad.Sci.USA
75:1929[1978])に記載のように、ポリエチレングリコール法を
用いて形質転換される。さらなる酵母形質転換プロトコルは、Gietzら、N
.A.R 20(17):1425、1992;Reevesら、FEMS 9
9:193−197、1992に記載される。
【0053】 酵母ベクターにおける適切な促進配列は、3−ホスホグリセリン酸キナーゼ(
Hitzemanら、J.Biol.Chem.255:2073[1980]
)または他の糖分解酵素(Hessら、J.Adv.Enzyme Reg.7
:149[1968];Hollandら、Biochemistry 17:
4900[1978])(例えば、エノラーゼ、グリセルアルデヒド−3−リン
酸デヒドロゲナーゼ、ヘキソキナーゼ、ピルビン酸デカルボキシラーゼ、ホスホ
フルクトキナーゼ、グルコース−6−リン酸イソメラーゼ、3−ホスホグリセリ
ン酸ムターゼ、ピルビン酸キナーゼ、トリオース−リン酸イソメラーゼ、ホスホ
グルコースイソメラーゼ、およびグルコキナーゼ)に対するプロモーターを包含
する。適切な発現プラスミドの構築において、これらの遺伝子と関連した終結配
列もまた、発現されることが所望される配列の3’側で発現ベクターに連結され
て、mRNAのポリアデニル化および終結を提供する。増殖条件により制御され
る転写のさらなる利点を有する他のプロモーターは、アルコールデヒドロゲナー
ゼ2、イソシトクロームC、酸性ホスファターゼ、窒素代謝に関連した分解酵素
、および上述のグリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ、およびマル
トースおよびガラクトース資化を担う酵素のプロモーター領域である。酵母適合
性プロモーター、複製起点、および終結配列を含む任意のプラスミドベクターが
適切である。
Hitzemanら、J.Biol.Chem.255:2073[1980]
)または他の糖分解酵素(Hessら、J.Adv.Enzyme Reg.7
:149[1968];Hollandら、Biochemistry 17:
4900[1978])(例えば、エノラーゼ、グリセルアルデヒド−3−リン
酸デヒドロゲナーゼ、ヘキソキナーゼ、ピルビン酸デカルボキシラーゼ、ホスホ
フルクトキナーゼ、グルコース−6−リン酸イソメラーゼ、3−ホスホグリセリ
ン酸ムターゼ、ピルビン酸キナーゼ、トリオース−リン酸イソメラーゼ、ホスホ
グルコースイソメラーゼ、およびグルコキナーゼ)に対するプロモーターを包含
する。適切な発現プラスミドの構築において、これらの遺伝子と関連した終結配
列もまた、発現されることが所望される配列の3’側で発現ベクターに連結され
て、mRNAのポリアデニル化および終結を提供する。増殖条件により制御され
る転写のさらなる利点を有する他のプロモーターは、アルコールデヒドロゲナー
ゼ2、イソシトクロームC、酸性ホスファターゼ、窒素代謝に関連した分解酵素
、および上述のグリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ、およびマル
トースおよびガラクトース資化を担う酵素のプロモーター領域である。酵母適合
性プロモーター、複製起点、および終結配列を含む任意のプラスミドベクターが
適切である。
【0054】 多細胞生物(例えば、植物)由来の細胞培養物が、本発明を実施するために宿
主として使用され得る。トランスジェニック植物は、例えば、Hoeckema
ら、Nature 303:179−181[1983])に記載のように、ゲ
ラニル二リン酸シンターゼおよび選択可能マーカー遺伝子(例えば、カナマイシ
ンに対する耐性をコードするkan遺伝子)をコードするプラスミドを、ヘルパ
ーTiプラスミドを含有するAgrobacterium tumifacie
nsに移入し、そしてAnら、Plant Physiolosy 81:30
1−305[1986]により記載のように、形質転換されるべき植物の葉片を
とともにAgrobacterium細胞を培養することにより得られ得る。培
養植物宿主細胞の形質転換は、通常、上述のような、Agrobacteriu
m tumifaciensによって達成される。哺乳動物宿主細胞、および堅
い細胞膜障壁を有さない他の宿主細胞の培養物は、通常、GrahamおよびV
an der Eb(Virology 52:546[1978])にもとも
と記載されるリン酸カルシウム法を用いて形質転換され、そしてSambroo
kら、前出のセクション16.32−16.37に記載のように改変される。し
かし、DNAを細胞に導入するための他の方法(例えば、ポリブレン(Kawa
iおよびNishizawa、Mol.Cell Biol.4:1172[1
984])、プロトプラスト融合(Schaffner、Proc.Natl.
Acad.Sci.USA 77:2163[1980])、エレクトロポレー
ション(Neumannら、EMBO J.1:841[1982])、および
核への直接微量注入(Capecchi、Cell 22:479[1980]
))もまた、用いられ得る。さらに、動物形質転換ストラテジーは、Monas
tersky G.M.およびRobl、J.M. Strategies i
n Transgenic Animal Science、ASM Pres
s、Washington、D.C.、1995において概説されている。形質
転換植物カルスは、例えば、カナマイシン、および適量の植物ホルモン(例えば
、ナフタレン酢酸およびベンジルアデニン、カルスおよびシュート誘導のため)
を含有する培地上で細胞を増殖させることによって、選択可能マーカーによって
選択され得る。植物細胞は、次いで、再生され得、そして得られた植物は、当業
者に周知の技術を用いて鉢上げされ得る。
主として使用され得る。トランスジェニック植物は、例えば、Hoeckema
ら、Nature 303:179−181[1983])に記載のように、ゲ
ラニル二リン酸シンターゼおよび選択可能マーカー遺伝子(例えば、カナマイシ
ンに対する耐性をコードするkan遺伝子)をコードするプラスミドを、ヘルパ
ーTiプラスミドを含有するAgrobacterium tumifacie
nsに移入し、そしてAnら、Plant Physiolosy 81:30
1−305[1986]により記載のように、形質転換されるべき植物の葉片を
とともにAgrobacterium細胞を培養することにより得られ得る。培
養植物宿主細胞の形質転換は、通常、上述のような、Agrobacteriu
m tumifaciensによって達成される。哺乳動物宿主細胞、および堅
い細胞膜障壁を有さない他の宿主細胞の培養物は、通常、GrahamおよびV
an der Eb(Virology 52:546[1978])にもとも
と記載されるリン酸カルシウム法を用いて形質転換され、そしてSambroo
kら、前出のセクション16.32−16.37に記載のように改変される。し
かし、DNAを細胞に導入するための他の方法(例えば、ポリブレン(Kawa
iおよびNishizawa、Mol.Cell Biol.4:1172[1
984])、プロトプラスト融合(Schaffner、Proc.Natl.
Acad.Sci.USA 77:2163[1980])、エレクトロポレー
ション(Neumannら、EMBO J.1:841[1982])、および
核への直接微量注入(Capecchi、Cell 22:479[1980]
))もまた、用いられ得る。さらに、動物形質転換ストラテジーは、Monas
tersky G.M.およびRobl、J.M. Strategies i
n Transgenic Animal Science、ASM Pres
s、Washington、D.C.、1995において概説されている。形質
転換植物カルスは、例えば、カナマイシン、および適量の植物ホルモン(例えば
、ナフタレン酢酸およびベンジルアデニン、カルスおよびシュート誘導のため)
を含有する培地上で細胞を増殖させることによって、選択可能マーカーによって
選択され得る。植物細胞は、次いで、再生され得、そして得られた植物は、当業
者に周知の技術を用いて鉢上げされ得る。
【0055】 さらに、ゲラニル二リン酸シンターゼ生産を調節する遺伝子が、誘導可能であ
る必要なプロモーターと共に植物に組み込まれ得る。本発明の本実施態様の実施
において、特定の外部刺激または内部刺激にのみ応答するプロモーターが、標的
cDNAに融合される。従って、遺伝子は、特定の刺激に応じることを除いては
転写されない。この遺伝子が転写されない限り、その遺伝子産物は生産されない
。
る必要なプロモーターと共に植物に組み込まれ得る。本発明の本実施態様の実施
において、特定の外部刺激または内部刺激にのみ応答するプロモーターが、標的
cDNAに融合される。従って、遺伝子は、特定の刺激に応じることを除いては
転写されない。この遺伝子が転写されない限り、その遺伝子産物は生産されない
。
【0056】 本発明の実施において用いられ得る応答性プロモーター系の例示的な例は、ト
ウモロコシにおけるグルタチオン−S−トランスフェラーゼ(GST)系である
。GSTは、出芽前除草剤としてしばしば使用される、多数の疎水性求電子性化
合物を解毒し得る酵素ファミリーである(Weigandら、Plant Mo
lecular Biology 7:235−243[1986])。研究は
、GSTが、この増強された除草剤耐性を引き起こすことに直接関与することを
示している。この作用は、特定の1.1kb mRNA転写産物によって主に媒
介される。手短には、トウモロコシは、外部刺激に応答し得、そして遺伝子産物
を生産するように誘導され得る、既存の天然に存在する静止遺伝子を有する。こ
の遺伝子は、以前に同定され、クローン化されている。従って、本発明の1つの
実施態様において、プロモーターは、GST応答性遺伝子から除去され、そして
すでにそのネイティブプロモーターが除去されたゲラニル二リン酸シンターゼ遺
伝子に付着される。この遺伝子操作された遺伝子は、外部化学刺激に応答するプ
ロモーターおよびゲラニル二リン酸シンターゼの首尾よい生産を担う遺伝子の組
み合わせである。
ウモロコシにおけるグルタチオン−S−トランスフェラーゼ(GST)系である
。GSTは、出芽前除草剤としてしばしば使用される、多数の疎水性求電子性化
合物を解毒し得る酵素ファミリーである(Weigandら、Plant Mo
lecular Biology 7:235−243[1986])。研究は
、GSTが、この増強された除草剤耐性を引き起こすことに直接関与することを
示している。この作用は、特定の1.1kb mRNA転写産物によって主に媒
介される。手短には、トウモロコシは、外部刺激に応答し得、そして遺伝子産物
を生産するように誘導され得る、既存の天然に存在する静止遺伝子を有する。こ
の遺伝子は、以前に同定され、クローン化されている。従って、本発明の1つの
実施態様において、プロモーターは、GST応答性遺伝子から除去され、そして
すでにそのネイティブプロモーターが除去されたゲラニル二リン酸シンターゼ遺
伝子に付着される。この遺伝子操作された遺伝子は、外部化学刺激に応答するプ
ロモーターおよびゲラニル二リン酸シンターゼの首尾よい生産を担う遺伝子の組
み合わせである。
【0057】 上述の方法に加えて、クローン化DNAを広範な種々の植物種(裸子植物、被
子植物、単子葉植物、および双子葉植物を含む)に移入する幾つかの方法は当該
分野において公知である(例えば、GlickおよびThompson,編,M
ethods in Plant Molecular Biology, C
RC Press, Boca Raton,Florida[1993]、本
明細書中に参考として援用される)。代表的な例には、電気パルスが細胞膜を一
過性に浸透化処理し、組換えDNAを含む種々の生物学的分子の取り込みを可能
にする、プロトプラストによる電気穿孔促進性DNA取り込み(Rhodesら
,Science,240:204−207[1988]):ポリエチレングリ
コールでのプロトプラストの処理(Lyznikら,Plant Molecu
lar Biology,13:151−161[1989]);ならびに細胞
壁を貫通するための爆発力または圧縮ガスにより推進されるDNAを積んだ微粒
子銃を用いた細胞のボンバードメント(Kleinら,Plant Physi
ol.91:440−444[1989]およびBoyntonら,Scien
ce,240:1534−1538[1988])がある。Taxus種の形質
転換は、例えば本明細書中に参考として援用される、Hanら,Plant S
cience,95:187−196(1994)中に示される方法を使用する
ことにより達成され得る。Rye植物(Secale cereale)に適用
されている方法は選択マーカー遺伝子を含有するプラスミドDNAを発生中の花
の分げつに直接注入することである(de la Penaら,Nature
325:274−276(1987))。さらに植物ウイルスが、遺伝子を植物
細胞に移入するためにベクターとして使用され得る。植物を形質転換するための
ベクターとして使用され得る植物ウイルスの例としては、カリフラワーモザイク
ウイルス(Brissonら,Nature 310:511−514(198
4))が挙げられる。さらに、植物形質転換ストラテジーおよび技術は、Bir
ch,R.G.,Ann Rev Plant Phys Plant Mol
Biol,48:297(1997);Foresterら,Exp.Agr
ic.,33:15−33(1997)に概説される。植物形質転換技術を開示
する上述の刊行物は本明細書中に参考として援用され、かつ少しの変更でこれら
の技術を広範囲の植物種に適用可能にする。
子植物、単子葉植物、および双子葉植物を含む)に移入する幾つかの方法は当該
分野において公知である(例えば、GlickおよびThompson,編,M
ethods in Plant Molecular Biology, C
RC Press, Boca Raton,Florida[1993]、本
明細書中に参考として援用される)。代表的な例には、電気パルスが細胞膜を一
過性に浸透化処理し、組換えDNAを含む種々の生物学的分子の取り込みを可能
にする、プロトプラストによる電気穿孔促進性DNA取り込み(Rhodesら
,Science,240:204−207[1988]):ポリエチレングリ
コールでのプロトプラストの処理(Lyznikら,Plant Molecu
lar Biology,13:151−161[1989]);ならびに細胞
壁を貫通するための爆発力または圧縮ガスにより推進されるDNAを積んだ微粒
子銃を用いた細胞のボンバードメント(Kleinら,Plant Physi
ol.91:440−444[1989]およびBoyntonら,Scien
ce,240:1534−1538[1988])がある。Taxus種の形質
転換は、例えば本明細書中に参考として援用される、Hanら,Plant S
cience,95:187−196(1994)中に示される方法を使用する
ことにより達成され得る。Rye植物(Secale cereale)に適用
されている方法は選択マーカー遺伝子を含有するプラスミドDNAを発生中の花
の分げつに直接注入することである(de la Penaら,Nature
325:274−276(1987))。さらに植物ウイルスが、遺伝子を植物
細胞に移入するためにベクターとして使用され得る。植物を形質転換するための
ベクターとして使用され得る植物ウイルスの例としては、カリフラワーモザイク
ウイルス(Brissonら,Nature 310:511−514(198
4))が挙げられる。さらに、植物形質転換ストラテジーおよび技術は、Bir
ch,R.G.,Ann Rev Plant Phys Plant Mol
Biol,48:297(1997);Foresterら,Exp.Agr
ic.,33:15−33(1997)に概説される。植物形質転換技術を開示
する上述の刊行物は本明細書中に参考として援用され、かつ少しの変更でこれら
の技術を広範囲の植物種に適用可能にする。
【0058】 これらの技術の各々は利点および不利な点を有する。この技術の各々において
、プラスミド由来のDNAは、目的の遺伝子のみならず、選択マーカーおよびス
クリーニングマーカー遺伝子をも含むように遺伝的に操作される。選択マーカー
遺伝子は、このプラスミドのコピーを組込んだ細胞のみを選択するために使用さ
れる(この構築は、目的の遺伝子ならびに選択およびスクリーニング遺伝子が1
ユニットとして移入されるような構築である)。スクリーニング遺伝子は、目的
の遺伝子を有する細胞のみの首尾良い培養に関する別の検査基準を提供する。通
常使用される選択マーカー遺伝子は、ネオマイシンホスホトランスフェラーゼI
I(NPTII)である。この遺伝子は、カナマイシン(細胞が増殖する増殖培
地に直接添加され得る化合物)に対する耐性を伝達する。植物細胞は、通常カナ
マイシンに感受性で、結果として死に至る。NPTII遺伝子の存在はカナマイ
シンの作用を克服し、そしてこの遺伝子を有する各細胞は生存可能なままである
。本発明の実施において使用され得る別の選択マーカー遺伝子は、除草剤グルフ
ォシネート(Basta)に耐性を付与する遺伝子である。通常使用されるスク
リーニング遺伝子は、βグルクロニダーゼ遺伝子(GUS)である。この遺伝子
の存在は、推定の形質転換細胞のサンプルがGUSアッセイ溶液で処理される組
織化学的反応を使用して特徴付けられる。適切なインキュベーション後、GUS
遺伝子を含有する細胞はブルーに変わる。好ましくは、このプラスミドは選択マ
ーカー遺伝子およびスクリーニングマーカー遺伝子を共に含む。
、プラスミド由来のDNAは、目的の遺伝子のみならず、選択マーカーおよびス
クリーニングマーカー遺伝子をも含むように遺伝的に操作される。選択マーカー
遺伝子は、このプラスミドのコピーを組込んだ細胞のみを選択するために使用さ
れる(この構築は、目的の遺伝子ならびに選択およびスクリーニング遺伝子が1
ユニットとして移入されるような構築である)。スクリーニング遺伝子は、目的
の遺伝子を有する細胞のみの首尾良い培養に関する別の検査基準を提供する。通
常使用される選択マーカー遺伝子は、ネオマイシンホスホトランスフェラーゼI
I(NPTII)である。この遺伝子は、カナマイシン(細胞が増殖する増殖培
地に直接添加され得る化合物)に対する耐性を伝達する。植物細胞は、通常カナ
マイシンに感受性で、結果として死に至る。NPTII遺伝子の存在はカナマイ
シンの作用を克服し、そしてこの遺伝子を有する各細胞は生存可能なままである
。本発明の実施において使用され得る別の選択マーカー遺伝子は、除草剤グルフ
ォシネート(Basta)に耐性を付与する遺伝子である。通常使用されるスク
リーニング遺伝子は、βグルクロニダーゼ遺伝子(GUS)である。この遺伝子
の存在は、推定の形質転換細胞のサンプルがGUSアッセイ溶液で処理される組
織化学的反応を使用して特徴付けられる。適切なインキュベーション後、GUS
遺伝子を含有する細胞はブルーに変わる。好ましくは、このプラスミドは選択マ
ーカー遺伝子およびスクリーニングマーカー遺伝子を共に含む。
【0059】 1つ以上のこれらの遺伝子を含有するプラスミドは、上述の技術のいずれかに
より、植物プロトプラストまたはカルス細胞に導入される。マーカー遺伝子が選
択遺伝子である場合、DNAパッケージを組込んだ細胞のみが、適切な植物毒性
薬剤を用いた選択下で生存する。一旦、この適切な細胞が同定および増殖される
と、植物は再生される。この形質転換植物由来の子孫が、DNAパッケージが植
物ゲノムに首尾良く組込まれたことを確実にするために試験されねばならない。
より、植物プロトプラストまたはカルス細胞に導入される。マーカー遺伝子が選
択遺伝子である場合、DNAパッケージを組込んだ細胞のみが、適切な植物毒性
薬剤を用いた選択下で生存する。一旦、この適切な細胞が同定および増殖される
と、植物は再生される。この形質転換植物由来の子孫が、DNAパッケージが植
物ゲノムに首尾良く組込まれたことを確実にするために試験されねばならない。
【0060】 哺乳動物宿主細胞もまた本発明の実施において使用され得る。適切な哺乳動物
細胞株の例としては以下が挙げられる:SV40(COS−7,ATCC CR
L 1651)により形質転換したサル腎臓CVI株;ヒト胎児腎臓株293S
(Grahamら,J.Gen.Virol.36:59[1977]);ベビ
ーハムスター腎臓細胞(BHK,ATCC CCL 10);チャイニーズハム
スター卵巣細胞(UrlabおよびChasin,Proc.Natl.Aca
d.Sci USA 77:4216[1980]);マウスセルトーリ細胞(
TM4,Mather,Biol.Reprod.23:243[1980])
;サル腎臓細胞(CVI−76,ATCC CCL 70);アフリカミドリザ
ル腎臓細胞(VERO−76,ATCC CRL−1587);ヒト頚部癌腫細
胞(HELA,ATCC CCL 2);イヌ腎臓細胞(MDCK,ATCC
CCL 34);バッファローラット肝臓細胞(BRL 3A,ATCC CR
L 1442);ヒト肺細胞(W138,ATCC CCL 75);ヒト肝臓
細胞(Hep G2,HB8065);マウス乳ガン細胞(MMT060562
,ATCC CCL 51);ラット肝細胞ガン細胞(HTC,MI.54,B
aumannら,J.Cell Biol.85:1[1980]);ならびに
TRI細胞(Matherら,Annals N.Y. Acad. Sci.
383:44[1982])。これらの細胞に関する発現ベクターには通常、
(必要であれば)複製起点のDNA配列、発現される遺伝子の前に位置するプロ
モーター、リボソーム結合部位、RNAスプライシング部位、ポリアデニル化部
位、および転写終結部位が含まれる。
細胞株の例としては以下が挙げられる:SV40(COS−7,ATCC CR
L 1651)により形質転換したサル腎臓CVI株;ヒト胎児腎臓株293S
(Grahamら,J.Gen.Virol.36:59[1977]);ベビ
ーハムスター腎臓細胞(BHK,ATCC CCL 10);チャイニーズハム
スター卵巣細胞(UrlabおよびChasin,Proc.Natl.Aca
d.Sci USA 77:4216[1980]);マウスセルトーリ細胞(
TM4,Mather,Biol.Reprod.23:243[1980])
;サル腎臓細胞(CVI−76,ATCC CCL 70);アフリカミドリザ
ル腎臓細胞(VERO−76,ATCC CRL−1587);ヒト頚部癌腫細
胞(HELA,ATCC CCL 2);イヌ腎臓細胞(MDCK,ATCC
CCL 34);バッファローラット肝臓細胞(BRL 3A,ATCC CR
L 1442);ヒト肺細胞(W138,ATCC CCL 75);ヒト肝臓
細胞(Hep G2,HB8065);マウス乳ガン細胞(MMT060562
,ATCC CCL 51);ラット肝細胞ガン細胞(HTC,MI.54,B
aumannら,J.Cell Biol.85:1[1980]);ならびに
TRI細胞(Matherら,Annals N.Y. Acad. Sci.
383:44[1982])。これらの細胞に関する発現ベクターには通常、
(必要であれば)複製起点のDNA配列、発現される遺伝子の前に位置するプロ
モーター、リボソーム結合部位、RNAスプライシング部位、ポリアデニル化部
位、および転写終結部位が含まれる。
【0061】 哺乳動物発現ベクターにおいて使用されたプロモーターはしばしばウイルス起
源のプロモーターである。これらのウイルスプロモーターは通常ポリオーマウイ
ルス、アデノウイルス2、および最も頻繁にはシミアンウイルス40(SV40
)由来である。SV40ウイルスは、初期および後期プロモーターと呼ばれる2
つのプロモーターを含む。これらのプロモーターは特に有用であるが、これらは
共に、ウイルスの複製起点をまた含む1つのDNAフラグメントとして、このウ
イルスから容易に得られるからである(Fiersら,Nature 273:
113[1978])。より小さいまたはより大きいSV40 DNAフラグメ
ントもまた、これらがウイルス複製起点に位置するHindIII部位からBg
lI部位に伸長する約250bp配列を含むことを条件に、使用され得る。
源のプロモーターである。これらのウイルスプロモーターは通常ポリオーマウイ
ルス、アデノウイルス2、および最も頻繁にはシミアンウイルス40(SV40
)由来である。SV40ウイルスは、初期および後期プロモーターと呼ばれる2
つのプロモーターを含む。これらのプロモーターは特に有用であるが、これらは
共に、ウイルスの複製起点をまた含む1つのDNAフラグメントとして、このウ
イルスから容易に得られるからである(Fiersら,Nature 273:
113[1978])。より小さいまたはより大きいSV40 DNAフラグメ
ントもまた、これらがウイルス複製起点に位置するHindIII部位からBg
lI部位に伸長する約250bp配列を含むことを条件に、使用され得る。
【0062】 あるいは、外来遺伝子(相同性プロモーター)と自然に結合するプロモーター
は、それらが形質転換のために選択された宿主細胞株と適合性であることを条件
に、使用され得る。
は、それらが形質転換のために選択された宿主細胞株と適合性であることを条件
に、使用され得る。
【0063】 複製起点は、SV40または他のウイルス(例えば、ポリオーマ、アデノ、V
SV、BPV)のような外因性供給源から得られ得、そしてクローニングベクタ
ーに挿入され得る。あるいは、この複製起点は、宿主細胞染色体複製機構により
提供され得る。外来遺伝子を含有するベクターが宿主細胞染色体に組込まれた場
合、しばしば後者で十分である。
SV、BPV)のような外因性供給源から得られ得、そしてクローニングベクタ
ーに挿入され得る。あるいは、この複製起点は、宿主細胞染色体複製機構により
提供され得る。外来遺伝子を含有するベクターが宿主細胞染色体に組込まれた場
合、しばしば後者で十分である。
【0064】 二次的なDNAコード配列の使用は、形質転換細胞株中のゲラニル二リン酸シ
ンターゼの産生レベルを増強し得る。二次コード配列は代表的に、酵素ジヒドロ
葉酸レダクターゼ(DHFR)を含む。DHFRの野生型形態は、化学メトトレ
キセート(MTX)により通常阻害される。細胞中のDHFR発現のレベルは、
培養宿主細胞に添加したMTXの量に依存して変化する。二次配列として特に有
用にするDHFRのさらなる特徴は、形質転換細胞を同定するために選択マーカ
ーとして使用され得ることである。DHFRの2つの形態は、二次配列、野生型
DHFR、およびMTX耐性DHFRとしての使用に利用可能である。特定の宿
主細胞で使用されるDHFRのタイプは、この宿主細胞がDHFR欠損である(
内因的に非常に低いレベルのDHFRを産生するか、または機能的なDHFRを
全く産生しないかということ)か否かによる。UrlaubおよびChasin
、前出により記載されるCHO細胞株のようなDHFR欠損細胞株は、野生型D
HFRコード配列で形質転換される。形質転換後、これらのDHFR欠損細胞株
は、機能的なDHFRを発現し、かつ栄養素ヒポキサンチン、グリシン、および
チミジンを欠く培養培地中で増殖し得る。非形質転換細胞は、この培地中で生存
しない。
ンターゼの産生レベルを増強し得る。二次コード配列は代表的に、酵素ジヒドロ
葉酸レダクターゼ(DHFR)を含む。DHFRの野生型形態は、化学メトトレ
キセート(MTX)により通常阻害される。細胞中のDHFR発現のレベルは、
培養宿主細胞に添加したMTXの量に依存して変化する。二次配列として特に有
用にするDHFRのさらなる特徴は、形質転換細胞を同定するために選択マーカ
ーとして使用され得ることである。DHFRの2つの形態は、二次配列、野生型
DHFR、およびMTX耐性DHFRとしての使用に利用可能である。特定の宿
主細胞で使用されるDHFRのタイプは、この宿主細胞がDHFR欠損である(
内因的に非常に低いレベルのDHFRを産生するか、または機能的なDHFRを
全く産生しないかということ)か否かによる。UrlaubおよびChasin
、前出により記載されるCHO細胞株のようなDHFR欠損細胞株は、野生型D
HFRコード配列で形質転換される。形質転換後、これらのDHFR欠損細胞株
は、機能的なDHFRを発現し、かつ栄養素ヒポキサンチン、グリシン、および
チミジンを欠く培養培地中で増殖し得る。非形質転換細胞は、この培地中で生存
しない。
【0065】 DHFRのMTX耐性形態は、MTX感受性である通常量の機能的なDHFR
を内因的に産生する宿主細胞において、形質転換宿主細胞について選択する手段
として使用され得る。CHO−Kl細胞株(ATCC No.CL61)はこれ
らの特徴を所有し、従って、この目的のために有用な細胞株である。MTXの細
胞培養培地への添加は、MTX耐性DHFRをコードするDNAで形質転換した
これらの細胞のみを増殖可能にする。非形質転換細胞はこの培地中で生存し得な
い。
を内因的に産生する宿主細胞において、形質転換宿主細胞について選択する手段
として使用され得る。CHO−Kl細胞株(ATCC No.CL61)はこれ
らの特徴を所有し、従って、この目的のために有用な細胞株である。MTXの細
胞培養培地への添加は、MTX耐性DHFRをコードするDNAで形質転換した
これらの細胞のみを増殖可能にする。非形質転換細胞はこの培地中で生存し得な
い。
【0066】 原核生物もまた、本発明の最初のクローニング工程のための宿主細胞として使
用され得る。それらは、大量のDNAの迅速な産生について、部位特異的変異誘
発について使用される一本鎖DNA鋳型の産生について、多くの変異体の同時の
スクリーニングについて、および生成された変異体のDNA配列決定について特
に有用である。適切な原核生物宿主細胞には、E.coli K12株 294
(ATCC受託番号31,446)、E.coli株 W3110(ATCC受
託番号27,325)、E.coli X1776(ATCC受託番号31,5
37)、およびE.coli Bが含まれる;しかし多くの他のE.coli株
(例えば、HB101、JM101、NM522、NM538、NM539)、
ならびに原核生物の多くの他の種および属(Bacillus subtili
sのような桿菌、Salmonella typhimuriumまたはSer
ratia marcesansのような他の腸内細菌、および種々のPseu
domonas種を含む)は全て宿主として使用され得る。原核生物宿主細胞ま
たは強固な細胞壁を有する他の宿主細胞は、好ましくは、Sambrookら前
出、の1.82章、中に記載されるとおりの塩化カルシウム法を使用して形質転
換される。あるいは電気穿孔が、これらの細胞の形質転換に使用され得る。原核
生物形質転換技術は、Dower,W.J.,Genetic Enginee
ring,Principles and Methods,12:275−2
96,Plenum Publishing Corp.,1990;Hana
hanら,Meth.Enxymol.204:63,1991に示される。
用され得る。それらは、大量のDNAの迅速な産生について、部位特異的変異誘
発について使用される一本鎖DNA鋳型の産生について、多くの変異体の同時の
スクリーニングについて、および生成された変異体のDNA配列決定について特
に有用である。適切な原核生物宿主細胞には、E.coli K12株 294
(ATCC受託番号31,446)、E.coli株 W3110(ATCC受
託番号27,325)、E.coli X1776(ATCC受託番号31,5
37)、およびE.coli Bが含まれる;しかし多くの他のE.coli株
(例えば、HB101、JM101、NM522、NM538、NM539)、
ならびに原核生物の多くの他の種および属(Bacillus subtili
sのような桿菌、Salmonella typhimuriumまたはSer
ratia marcesansのような他の腸内細菌、および種々のPseu
domonas種を含む)は全て宿主として使用され得る。原核生物宿主細胞ま
たは強固な細胞壁を有する他の宿主細胞は、好ましくは、Sambrookら前
出、の1.82章、中に記載されるとおりの塩化カルシウム法を使用して形質転
換される。あるいは電気穿孔が、これらの細胞の形質転換に使用され得る。原核
生物形質転換技術は、Dower,W.J.,Genetic Enginee
ring,Principles and Methods,12:275−2
96,Plenum Publishing Corp.,1990;Hana
hanら,Meth.Enxymol.204:63,1991に示される。
【0067】 代表的な例として、ゲラニル二リン酸シンターゼをコードするcDNA配列は
、異種宿主としてE.coliにおける過剰発現用に(Novagenから)市
販されている(His)6・Tag pETベクターに移入され得る。このpE T発現プラスミドは高レベルの異種発現系において幾つかの利点を有する。所望
のcDNA挿入片は、インフレームで、6ヒスチジンをコードするプラスミドベ
クター配列に連結後、標的タンパク質のアミノ末端コドンに結合される高度に特
異的なプロテアーゼ認識部位(トロンビン)に連結する。この発現した融合タン
パク質のヒスチジン「ブロック」は、固定化した金属イオンへの非常にタイトな
結合を促進し、そして固定化金属イオンアフィニティークロマトグラフィーによ
る組換えタンパク質の迅速な精製を可能にする。次にヒスチジンリーダー配列は
、トロンビン、および固定化金属イオンアフィニティークロマトグラフィーによ
り再度精製したゲラニル二リン酸シンターゼを用いた精製タンパク質の処理によ
り、特異的なタンパク質分解部位で切断されるが、このときより浅いイミダゾー
ル勾配を使用して組換えシンターゼを溶出する一方で、ヒスチジンブロックをな
お吸着させておく。この過剰発現−精製系は高処理能で、優れた分解能を有し、
かつ速く、類似の結合挙動を示す夾雑E.coliタンパク質の量(トロンビン
タンパク質分解前後)は極めて低い。
、異種宿主としてE.coliにおける過剰発現用に(Novagenから)市
販されている(His)6・Tag pETベクターに移入され得る。このpE T発現プラスミドは高レベルの異種発現系において幾つかの利点を有する。所望
のcDNA挿入片は、インフレームで、6ヒスチジンをコードするプラスミドベ
クター配列に連結後、標的タンパク質のアミノ末端コドンに結合される高度に特
異的なプロテアーゼ認識部位(トロンビン)に連結する。この発現した融合タン
パク質のヒスチジン「ブロック」は、固定化した金属イオンへの非常にタイトな
結合を促進し、そして固定化金属イオンアフィニティークロマトグラフィーによ
る組換えタンパク質の迅速な精製を可能にする。次にヒスチジンリーダー配列は
、トロンビン、および固定化金属イオンアフィニティークロマトグラフィーによ
り再度精製したゲラニル二リン酸シンターゼを用いた精製タンパク質の処理によ
り、特異的なタンパク質分解部位で切断されるが、このときより浅いイミダゾー
ル勾配を使用して組換えシンターゼを溶出する一方で、ヒスチジンブロックをな
お吸着させておく。この過剰発現−精製系は高処理能で、優れた分解能を有し、
かつ速く、類似の結合挙動を示す夾雑E.coliタンパク質の量(トロンビン
タンパク質分解前後)は極めて低い。
【0068】 当業者に明らかであるように、宿主細胞に適合性である種に由来するレプリコ
ンおよび制御配列を含有する任意のプラスミドベクターもまた、本発明の実施に
おいて使用され得る。通常このベクターは、複製部位、形質転換細胞における表
現型選択を提供するマーカー遺伝子、1つ以上のプロモーター、ならびに外来D
NA挿入用の幾つかの制限酵素部位を含むポリリンカー領域を有する。E.co
liの形質転換に代表的に使用されるプラスミドには、pBR322、pUC1
8、pUC19、pUC118、pUC119、およびBluescriptM
13が含まれ、その全てはSambrookら、前出の1.12−1.20章に
記載される。しかし他の多くの適切なベクターは、同様に利用可能である。これ
らのベクターは、アンピシリンおよび/またはテトラサイクリン耐性をコードす
る遺伝子を含有し、これらのベクターで形質転換した細胞が、これらの抗生物質
の存在下で増殖することを可能にする。
ンおよび制御配列を含有する任意のプラスミドベクターもまた、本発明の実施に
おいて使用され得る。通常このベクターは、複製部位、形質転換細胞における表
現型選択を提供するマーカー遺伝子、1つ以上のプロモーター、ならびに外来D
NA挿入用の幾つかの制限酵素部位を含むポリリンカー領域を有する。E.co
liの形質転換に代表的に使用されるプラスミドには、pBR322、pUC1
8、pUC19、pUC118、pUC119、およびBluescriptM
13が含まれ、その全てはSambrookら、前出の1.12−1.20章に
記載される。しかし他の多くの適切なベクターは、同様に利用可能である。これ
らのベクターは、アンピシリンおよび/またはテトラサイクリン耐性をコードす
る遺伝子を含有し、これらのベクターで形質転換した細胞が、これらの抗生物質
の存在下で増殖することを可能にする。
【0069】 原核生物細胞ベクターにおいて最も通常に使用されるプロモーターには、βラ
クタマーゼ(ペニシリナーゼ)およびラクトースプロモーター系(Changら
、Nature 375:615[1978];Itakuraら,Scien
ce 198:1056[1977];Goeddelら,Nature 28
1:544[1979])およびトリプトファン(trp)プロモーター系(G
oeddelら,Nucl.Acids Res. 8:4057[1980]
;EPO特許出願公開第36,776号)、ならびにアルカリフォスファターゼ
系が含まれる。これらが最も通常に使用される一方で、他の微生物プロモーター
は利用されてきた。そしてそれらのヌクレオチド配列に関する詳細は公開されて
おり、当業者がそれらをプラスミドベクターに機能的に連結することを可能にし
ている(Siebenlistら、Cell 20:269[1980]を参照
のこと)。
クタマーゼ(ペニシリナーゼ)およびラクトースプロモーター系(Changら
、Nature 375:615[1978];Itakuraら,Scien
ce 198:1056[1977];Goeddelら,Nature 28
1:544[1979])およびトリプトファン(trp)プロモーター系(G
oeddelら,Nucl.Acids Res. 8:4057[1980]
;EPO特許出願公開第36,776号)、ならびにアルカリフォスファターゼ
系が含まれる。これらが最も通常に使用される一方で、他の微生物プロモーター
は利用されてきた。そしてそれらのヌクレオチド配列に関する詳細は公開されて
おり、当業者がそれらをプラスミドベクターに機能的に連結することを可能にし
ている(Siebenlistら、Cell 20:269[1980]を参照
のこと)。
【0070】 細胞から通常分泌される多くの真核生物タンパク質は、アミノ酸配列の一部と
して内因性分泌シグナル配列を含む。従って、細胞質中に通常見出されるタンパ
ク質は、シグナル配列をタンパク質に連結することにより、分泌について標的化
され得る。これは、シグナル配列をコードするDNAをこのタンパク質をコード
するDNAの5’末端に連結し、次にこの融合タンパク質を適切な宿主細胞中に
発現することにより容易に達成される。このシグナル配列をコードするDNAは
、シグナル配列を有するタンパク質をコードする任意の遺伝子から制限フラグメ
ントとして得られ得る。従って、原核生物、酵母、および真核生物シグナル配列
は、本発明の実施に利用した宿主細胞のタイプに依存して、本明細書中で使用さ
れ得る。例えばヒト成長ホルモン、プロインスリン、およびプロアルブミンを含
む幾つかの真核生物遺伝子のシグナル配列部分をコードするDNAおよびアミノ
酸配列は公知であり(Stryer,Biochemistry W.H.Fr
eeman and Company,New York,NY,p.769[
1988])、適切な真核生物宿主細胞中にシグナル配列として使用され得る。
例えば酸性ホスファターゼ(Arimaら、Nuc.Acids Res.11
:1657[1983])、α因子、アルカリホスファターゼ、およびインベル
ターゼのような酵母シグナル配列は、酵母宿主細胞からの分泌を方向付けるため
に使用され得る。例えば、LamBまたはOmpF(Wongら、Gene 6
8:193[1988])、MalE、PhoA、あるいはβラクタマーゼをコ
ードする遺伝子、ならびに他の遺伝子由来の原核生物シグナル配列は、原核生物
細胞由来のタンパク質を培養培地に標的化するために使用され得る。
して内因性分泌シグナル配列を含む。従って、細胞質中に通常見出されるタンパ
ク質は、シグナル配列をタンパク質に連結することにより、分泌について標的化
され得る。これは、シグナル配列をコードするDNAをこのタンパク質をコード
するDNAの5’末端に連結し、次にこの融合タンパク質を適切な宿主細胞中に
発現することにより容易に達成される。このシグナル配列をコードするDNAは
、シグナル配列を有するタンパク質をコードする任意の遺伝子から制限フラグメ
ントとして得られ得る。従って、原核生物、酵母、および真核生物シグナル配列
は、本発明の実施に利用した宿主細胞のタイプに依存して、本明細書中で使用さ
れ得る。例えばヒト成長ホルモン、プロインスリン、およびプロアルブミンを含
む幾つかの真核生物遺伝子のシグナル配列部分をコードするDNAおよびアミノ
酸配列は公知であり(Stryer,Biochemistry W.H.Fr
eeman and Company,New York,NY,p.769[
1988])、適切な真核生物宿主細胞中にシグナル配列として使用され得る。
例えば酸性ホスファターゼ(Arimaら、Nuc.Acids Res.11
:1657[1983])、α因子、アルカリホスファターゼ、およびインベル
ターゼのような酵母シグナル配列は、酵母宿主細胞からの分泌を方向付けるため
に使用され得る。例えば、LamBまたはOmpF(Wongら、Gene 6
8:193[1988])、MalE、PhoA、あるいはβラクタマーゼをコ
ードする遺伝子、ならびに他の遺伝子由来の原核生物シグナル配列は、原核生物
細胞由来のタンパク質を培養培地に標的化するために使用され得る。
【0071】 配列番号2に示される配列を有するゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質は
、残基1〜48のアミノ末端膜挿入配列を含み、配列番号2に示される実施態様
において、酵素をプラスチドに方向付ける。植物、動物、および微生物由来の代
替的な輸送配列は、本発明の実施に使用され、遺伝子産物を、細胞質、小胞体、
ミトコンドリア、または他の細胞成分に方向付け得るか、またはタンパク質を培
地への排出について標的化する。これらの考慮は、ゲラニル二リン酸シンターゼ
の過剰発現に適し、かつ任意の所望の位置において遺伝子産物機能を可能にする
細胞または無傷生物内の発現の方向付けに適する。
、残基1〜48のアミノ末端膜挿入配列を含み、配列番号2に示される実施態様
において、酵素をプラスチドに方向付ける。植物、動物、および微生物由来の代
替的な輸送配列は、本発明の実施に使用され、遺伝子産物を、細胞質、小胞体、
ミトコンドリア、または他の細胞成分に方向付け得るか、またはタンパク質を培
地への排出について標的化する。これらの考慮は、ゲラニル二リン酸シンターゼ
の過剰発現に適し、かつ任意の所望の位置において遺伝子産物機能を可能にする
細胞または無傷生物内の発現の方向付けに適する。
【0072】 複製配列、調節配列、表現型選択遺伝子、および目的のゲラニル二リン酸シン
ターゼDNAをコードするDNAを含む適切なベクターの構築は、標準の組換え
DNA手順を使用して調製される。単離したプラスミドおよびDNAフラグメン
トは、当該分野において周知のように、切断され、調整され、そして特定の順で
互いに連結されて、所望のベクターを生成する(例えば、Sambrookら、
前出を参照のこと)。
ターゼDNAをコードするDNAを含む適切なベクターの構築は、標準の組換え
DNA手順を使用して調製される。単離したプラスミドおよびDNAフラグメン
トは、当該分野において周知のように、切断され、調整され、そして特定の順で
互いに連結されて、所望のベクターを生成する(例えば、Sambrookら、
前出を参照のこと)。
【0073】 上述のとおり、ゲラニル二リン酸シンターゼ改変体は、好ましくは、部位特異
的変異誘発の方法を使用して生成される変異により産生される。この方法は、所
望の変異の配列およびオリゴヌクレオチドをDNA鋳型に安定にハイブリダイズ
させるために充分な数の近接するヌクレオチドの両方をコードする、特定のオリ
ゴヌクレオチドの合成および使用を必要とする。
的変異誘発の方法を使用して生成される変異により産生される。この方法は、所
望の変異の配列およびオリゴヌクレオチドをDNA鋳型に安定にハイブリダイズ
させるために充分な数の近接するヌクレオチドの両方をコードする、特定のオリ
ゴヌクレオチドの合成および使用を必要とする。
【0074】 本発明の別の局面において、ゲラニル二リン酸シンターゼをコードする遺伝子
は、抗癌特性を有するモノテルペンを産生するモノテルペンシンターゼをコード
する遺伝子と組み合せて癌腫細胞中に導入され得る。抗癌特性を有するモノテル
ペンを産生するモノテルペンシンターゼをコードする遺伝子に加えて、ゲラニル
二リン酸シンターゼ遺伝子は、ガン細胞中に導入されるに違いない。なぜなら動
物細胞は、このモノテルペンの化学的な前駆体であるゲラニル二リン酸を天然で
は産生しないからである。抗癌特性を有するモノテルペンの例は、前出4頁に述
べられたとおり、リモネン、ペリリルアルコールおよびゲラニオールである。モ
ノテルペンシンターゼをコードする核酸配列の例は、以下同時係属特許出願に開
示されるが、この各々は本明細書中に参考として援用される:米国特許出願番号
08/846,526「DNA Encoding Limonene Syn
thase from Mentha spicata」;米国特許出願番号0
8/937,540「Monoterpene Synthases from
Common Sage(Salvia officinalis)」および
PCT特許出願番号PCT/US98/14528「Monoterpene
Synthases from Grand fir(Abies grand
is)」。
は、抗癌特性を有するモノテルペンを産生するモノテルペンシンターゼをコード
する遺伝子と組み合せて癌腫細胞中に導入され得る。抗癌特性を有するモノテル
ペンを産生するモノテルペンシンターゼをコードする遺伝子に加えて、ゲラニル
二リン酸シンターゼ遺伝子は、ガン細胞中に導入されるに違いない。なぜなら動
物細胞は、このモノテルペンの化学的な前駆体であるゲラニル二リン酸を天然で
は産生しないからである。抗癌特性を有するモノテルペンの例は、前出4頁に述
べられたとおり、リモネン、ペリリルアルコールおよびゲラニオールである。モ
ノテルペンシンターゼをコードする核酸配列の例は、以下同時係属特許出願に開
示されるが、この各々は本明細書中に参考として援用される:米国特許出願番号
08/846,526「DNA Encoding Limonene Syn
thase from Mentha spicata」;米国特許出願番号0
8/937,540「Monoterpene Synthases from
Common Sage(Salvia officinalis)」および
PCT特許出願番号PCT/US98/14528「Monoterpene
Synthases from Grand fir(Abies grand
is)」。
【0075】 遺伝子のヒト細胞への導入に関する幾つかの方法は、当該分野において公知で
ある。例えば、細胞が体外にある場合、細胞ベースの療法を使用し、遺伝子を細
胞内に導入し得る。細胞ベースのアプローチは、患者由来の細胞を除去する工程
、治療的タンパク質をコードする遺伝子をこの除去した細胞中に導入する工程、
ならびに細胞移植または輸血によりこの細胞を患者に戻す工程を包含する。この
細胞ベースのアプローチが、重症複合免疫不全(SCID)を処置するために使
用されているが、これは酵素アデノシンデアミナーゼ(ADA)における遺伝的
欠損に起因する。SCIDの遺伝子治療処置は、罹患した個体から抹消血リンパ
球またはの骨髄前駆細胞の取り出し、レトロウイルスベクターを使用する正常A
DA遺伝子のこれらの細胞の染色体への導入、およびこの遺伝的に操作した細胞
のこの患者への再導入を包含した(C.Bordignonら、Science
270:470、474(1995)、R.M.Blaeseら、Scien
ce 270:475−479(1995);D.B.Kohnら、Natur
e Med.1:1017−1023(1995))。初期の結果は、この遺伝
的に操作した細胞は長い期間持続し、ADAの低いレベルの発現が確立され得る
ことを実証した。
ある。例えば、細胞が体外にある場合、細胞ベースの療法を使用し、遺伝子を細
胞内に導入し得る。細胞ベースのアプローチは、患者由来の細胞を除去する工程
、治療的タンパク質をコードする遺伝子をこの除去した細胞中に導入する工程、
ならびに細胞移植または輸血によりこの細胞を患者に戻す工程を包含する。この
細胞ベースのアプローチが、重症複合免疫不全(SCID)を処置するために使
用されているが、これは酵素アデノシンデアミナーゼ(ADA)における遺伝的
欠損に起因する。SCIDの遺伝子治療処置は、罹患した個体から抹消血リンパ
球またはの骨髄前駆細胞の取り出し、レトロウイルスベクターを使用する正常A
DA遺伝子のこれらの細胞の染色体への導入、およびこの遺伝的に操作した細胞
のこの患者への再導入を包含した(C.Bordignonら、Science
270:470、474(1995)、R.M.Blaeseら、Scien
ce 270:475−479(1995);D.B.Kohnら、Natur
e Med.1:1017−1023(1995))。初期の結果は、この遺伝
的に操作した細胞は長い期間持続し、ADAの低いレベルの発現が確立され得る
ことを実証した。
【0076】 アナログ細胞ベースのアプローチは、家族性高コレステロール血(LDL−レ
セプター欠損)(M.Grossmanら、Nature Genetics
6:335 41(1994);M.Grossmanら,Nature Me
d.1:1148−1154(1995))およびゴシュ病(J.A.Nolt
aら,J.Clin.Invest.90:342−348(1992);L.
Xuら,Exptl.Hematol.22:223−230(1994);T
.Ohashiら,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.89:1
1332−11336(1992))を処置するために使用されている。
セプター欠損)(M.Grossmanら、Nature Genetics
6:335 41(1994);M.Grossmanら,Nature Me
d.1:1148−1154(1995))およびゴシュ病(J.A.Nolt
aら,J.Clin.Invest.90:342−348(1992);L.
Xuら,Exptl.Hematol.22:223−230(1994);T
.Ohashiら,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.89:1
1332−11336(1992))を処置するために使用されている。
【0077】 遺伝子は、インサイチュで、または細胞を身体から取り出した後、ウイルスベ
クターにより導入され得る。例えば、レトロウイスは感染後、それらの遺伝子を
宿主細胞染色体中に挿入する能力を有するRNAウイルスである。ウイルスタン
パク質をコードする遺伝子を欠くが、細胞に感染する能力を保持し、それらの遺
伝子を標的細胞の染色体中に挿入するレトロウイルスベクターが開発されてきた
(A.D.Miller,Hum.Gen.Ther.1:5−14(1990
))。レトロウイルスは分裂細胞のみに効率的に感染し、従って、レトロウイル
スが、身体から取り出された細胞に遺伝子を導入するために使用される場合、細
胞分裂は、増殖促進培地または特定の因子で刺激される。レトロウイルスのイン
ビボでの適用は、ウイルス産生細胞の腫瘍への直接の投与により達成されている
。感染した細胞により放出されるウイルス粒子が、近接する腫瘍細胞に感染する
。それ故腫瘍中、相対的に低いパーセントの細胞のみが、この標的化した遺伝子
を、ほとんどのまたは全ての腫瘍細胞中に最終的に導入するために、最初に感染
される必要がある(K.W.Culverら,Science 256:155
0−1552(1992)。
クターにより導入され得る。例えば、レトロウイスは感染後、それらの遺伝子を
宿主細胞染色体中に挿入する能力を有するRNAウイルスである。ウイルスタン
パク質をコードする遺伝子を欠くが、細胞に感染する能力を保持し、それらの遺
伝子を標的細胞の染色体中に挿入するレトロウイルスベクターが開発されてきた
(A.D.Miller,Hum.Gen.Ther.1:5−14(1990
))。レトロウイルスは分裂細胞のみに効率的に感染し、従って、レトロウイル
スが、身体から取り出された細胞に遺伝子を導入するために使用される場合、細
胞分裂は、増殖促進培地または特定の因子で刺激される。レトロウイルスのイン
ビボでの適用は、ウイルス産生細胞の腫瘍への直接の投与により達成されている
。感染した細胞により放出されるウイルス粒子が、近接する腫瘍細胞に感染する
。それ故腫瘍中、相対的に低いパーセントの細胞のみが、この標的化した遺伝子
を、ほとんどのまたは全ての腫瘍細胞中に最終的に導入するために、最初に感染
される必要がある(K.W.Culverら,Science 256:155
0−1552(1992)。
【0078】 アデノウイルスベクターは、直接患者に投与されるように設計される。異なる
レトロウイルスベクターとは異なり、アデノウイルスベクターは、この宿主細胞
の染色体に統合しない。代わりに、アデノウイルスベクターを使用して細胞に導
入された遺伝子は、限られた期間の間持続する染色体外エレメント(エピソーム
)として核に維持される。アデノウイルスベクターは、気道上皮細胞、内皮細胞
、肝細胞および種々の腫瘍を含む多くの異なる組織において、分裂および非分裂
細胞にインビボで感染する(B.C.Trapnell,Adv Drug D
el Rev. 12:185−199(1993))。
レトロウイルスベクターとは異なり、アデノウイルスベクターは、この宿主細胞
の染色体に統合しない。代わりに、アデノウイルスベクターを使用して細胞に導
入された遺伝子は、限られた期間の間持続する染色体外エレメント(エピソーム
)として核に維持される。アデノウイルスベクターは、気道上皮細胞、内皮細胞
、肝細胞および種々の腫瘍を含む多くの異なる組織において、分裂および非分裂
細胞にインビボで感染する(B.C.Trapnell,Adv Drug D
el Rev. 12:185−199(1993))。
【0079】 別のウイルスベクターは、単純ヘルペスウイルスである。このウイルスは、ニ
ューロンに治療遺伝子を送達するために、幾つかの最初の適用において使用され
ており、そして幾つかの形態の脳ガンに治療遺伝子を送達するために、おそらく
使用され得た、大きい二本鎖DNAウイルスである(D.S.Latchman
,Mol.Biotechnol.2:179−95(1994))。ワクシニ
アウイルスの組換え形態は、大きな挿入物に適合し得、そして相同的組み換え体
により生成される。今日まで、このベクターは、インターロイキン(IL)(例
えば、ヒトIL−1β)ならびに補助的刺激分子B7−1およびB7−2を送達
するために使用されている(G.R.Peplinskiら,Ann.Surg
.Oncol.2:151−9(1995);J.W.Hodgeら,Canc
er Res.54:5552−55(1994))。
ューロンに治療遺伝子を送達するために、幾つかの最初の適用において使用され
ており、そして幾つかの形態の脳ガンに治療遺伝子を送達するために、おそらく
使用され得た、大きい二本鎖DNAウイルスである(D.S.Latchman
,Mol.Biotechnol.2:179−95(1994))。ワクシニ
アウイルスの組換え形態は、大きな挿入物に適合し得、そして相同的組み換え体
により生成される。今日まで、このベクターは、インターロイキン(IL)(例
えば、ヒトIL−1β)ならびに補助的刺激分子B7−1およびB7−2を送達
するために使用されている(G.R.Peplinskiら,Ann.Surg
.Oncol.2:151−9(1995);J.W.Hodgeら,Canc
er Res.54:5552−55(1994))。
【0080】 遺伝子治療に対する別のアプローチは、DNAプラスミドの患者への直接導入
を包含する(F.D.Ledley,Hum.Gene Ther.6:112
9−1144(1995))。このプラスミドDNAは、身体内の細胞により取
り込まれ、組換えタンパク質の発現を方向付け得る。代表的なプラスミドDNA
は、このDNAがDOTMA(1,2−ジオレイルオキシプロピル−3−トリメ
チルアンモニウムブロマイド)およびDOPE(ジオレイルホスファチジルエタ
ノールアミン)のような1つ以上の脂質と結合するリポソームの形態で、細胞に
送達される。DOTMAを用いた処方は、動物モデルにおいて肺上皮細胞におけ
る発現を提供することが示されてきた(K.L.Brighamら,Am.J.
Med.Sci,298:278−281(1989);A.B.Canoni
coら,Am.J.Respir.Cell.Mol.Biol.10:24−
29(1994))。さらに、研究は、5%PVP(50,000kDa)で処
方したプラスミドDNAの筋肉注射は、生理食塩水単独中のDNAの注射に見ら
れるレベルのほぼ200倍に、筋肉中のレポーター遺伝子発現のレベルを増加す
る(R.J.Mumperら,Pharm.Res.13:701−709(1
996);R.J.Mumperら,Proc.Intern.Symp.Co
nt.Rol.Bioac.Mater.22:325−326(1995))
。プラスミドDNAの筋肉内投与は、多くの月数を持ちこたえる遺伝子発現をも
たらす(J.A.Wolffら,Hum.Mol.Genet.1:363−3
69(1992);M.Manthorpeら,Hum.Gene Ther.
4:419−431(1993);G.Ascadiら,New Biol.3
:71−81(1991),D.Galら,Lab.Invest.68:18
−25(1993))。
を包含する(F.D.Ledley,Hum.Gene Ther.6:112
9−1144(1995))。このプラスミドDNAは、身体内の細胞により取
り込まれ、組換えタンパク質の発現を方向付け得る。代表的なプラスミドDNA
は、このDNAがDOTMA(1,2−ジオレイルオキシプロピル−3−トリメ
チルアンモニウムブロマイド)およびDOPE(ジオレイルホスファチジルエタ
ノールアミン)のような1つ以上の脂質と結合するリポソームの形態で、細胞に
送達される。DOTMAを用いた処方は、動物モデルにおいて肺上皮細胞におけ
る発現を提供することが示されてきた(K.L.Brighamら,Am.J.
Med.Sci,298:278−281(1989);A.B.Canoni
coら,Am.J.Respir.Cell.Mol.Biol.10:24−
29(1994))。さらに、研究は、5%PVP(50,000kDa)で処
方したプラスミドDNAの筋肉注射は、生理食塩水単独中のDNAの注射に見ら
れるレベルのほぼ200倍に、筋肉中のレポーター遺伝子発現のレベルを増加す
る(R.J.Mumperら,Pharm.Res.13:701−709(1
996);R.J.Mumperら,Proc.Intern.Symp.Co
nt.Rol.Bioac.Mater.22:325−326(1995))
。プラスミドDNAの筋肉内投与は、多くの月数を持ちこたえる遺伝子発現をも
たらす(J.A.Wolffら,Hum.Mol.Genet.1:363−3
69(1992);M.Manthorpeら,Hum.Gene Ther.
4:419−431(1993);G.Ascadiら,New Biol.3
:71−81(1991),D.Galら,Lab.Invest.68:18
−25(1993))。
【0081】 さらに、DNAの取り込みおよび発現はまた、プラスミドの甲状腺(M.Si
kesら,Hum.Gene Ther.5:837−844(1994))お
よび滑膜(J.Yovandichら,Hum.Gene Ther.6:60
3−610(1995))への直接注射後、観察された。より低いレベルの遺伝
子発現が、肝臓(M.A.Hickmanら,Hum.Gene Ther.5
:1477−1483(1994))、皮膚(E.Razら,Proc.Nat
l.Acad.Sci.91:9519−9523(1994))への間隙の注
射,気道への点滴注入(K.B.Meyerら,Gene Therapy 2
:450−460(1995))、内皮への適用(G.D.Chapmanら,
Circulation Res.71:27−33(1992);R.Rie
ssenら,Human Gene Therapy,4:749−758(1
993))後、ならびに静脈内投与後(R.M.Conryら,Cancer
Res.54:1164−1168(1994))観察されている。
kesら,Hum.Gene Ther.5:837−844(1994))お
よび滑膜(J.Yovandichら,Hum.Gene Ther.6:60
3−610(1995))への直接注射後、観察された。より低いレベルの遺伝
子発現が、肝臓(M.A.Hickmanら,Hum.Gene Ther.5
:1477−1483(1994))、皮膚(E.Razら,Proc.Nat
l.Acad.Sci.91:9519−9523(1994))への間隙の注
射,気道への点滴注入(K.B.Meyerら,Gene Therapy 2
:450−460(1995))、内皮への適用(G.D.Chapmanら,
Circulation Res.71:27−33(1992);R.Rie
ssenら,Human Gene Therapy,4:749−758(1
993))後、ならびに静脈内投与後(R.M.Conryら,Cancer
Res.54:1164−1168(1994))観察されている。
【0082】 種々のデバイスが、DNAの標的細胞に対する利用性を増強するように開発さ
れてきた。1つの単純なアプローチは、標的細胞を物理的に、DNAを含むカテ
ーテルまたは移植可能な材料と接触させることである(G.D.Chapman
ら,Circulation Res.71:27−33(1992))。別の
アプローチは、高圧化で液体カラムを直接標的組織に投射するニードルフリーの
ジェット式噴射デバイスを利用することである(P.A.Furthら,Ana
l Biochem.20:365−368(1992));(H.L.Vah
lsingら,J.Immunol.Meth.175:11−22(1994
));(F.D.Ledleyら,Cell Biochem.18A:226
(1994))。
れてきた。1つの単純なアプローチは、標的細胞を物理的に、DNAを含むカテ
ーテルまたは移植可能な材料と接触させることである(G.D.Chapman
ら,Circulation Res.71:27−33(1992))。別の
アプローチは、高圧化で液体カラムを直接標的組織に投射するニードルフリーの
ジェット式噴射デバイスを利用することである(P.A.Furthら,Ana
l Biochem.20:365−368(1992));(H.L.Vah
lsingら,J.Immunol.Meth.175:11−22(1994
));(F.D.Ledleyら,Cell Biochem.18A:226
(1994))。
【0083】 遺伝子送達の別のデバイスは、「遺伝子銃」またはBiolisticTMであ
り、これは、DNAコート微粒子を直接インビボで細胞の核に投射する弾道デバ
イスである。一旦核内に入ると、DNAは、金またはタングステン微粒子から溶
出し、標的細胞により発現され得る。この方法は、遺伝子を直接、皮膚、肝臓、
および筋肉に移入させるために、効果的に使用される(N.S.Yangら,P
roc.Natl.Acad.Sci.87:9568−9572(1990)
;L.Chengら,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.90:
4455−4459(1993);R.S.Williamsら,Proc.N
atl.Acad.Sci.88:2726−2730(1991))。
り、これは、DNAコート微粒子を直接インビボで細胞の核に投射する弾道デバ
イスである。一旦核内に入ると、DNAは、金またはタングステン微粒子から溶
出し、標的細胞により発現され得る。この方法は、遺伝子を直接、皮膚、肝臓、
および筋肉に移入させるために、効果的に使用される(N.S.Yangら,P
roc.Natl.Acad.Sci.87:9568−9572(1990)
;L.Chengら,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.90:
4455−4459(1993);R.S.Williamsら,Proc.N
atl.Acad.Sci.88:2726−2730(1991))。
【0084】 標的化した遺伝子送達に対する別のアプローチは、分子結合体の使用であり、
これは、核酸またはDNA結合剤が、核酸の細胞への特異的標的化に対して結合
されたタンパク質または合成リガンドからなる(R.J.Cristianoら
,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:11548−52(
1993);B.A.Bunnellら,Somat.Call Mol.Ge
net.18:559−69(1992);M.Cottenら,Proc.N
atl.Acad.Sci.USA 89:6094−98(1992))。一
旦DNAがこの分子結合体に結合されると、タンパク質−DNA複合体が生じる
。この遺伝子送達系は、異なるリガンドの使用によって多くの細胞型に標的化送
達し得ることが示されている(R.J.Cristianoら,Proc.Na
tl.Acad.Sci.USA 90:11548−52(1993))。例
えば、葉酸ビタミンは、葉酸レセプターを過剰発現する細胞(例えば、卵巣癌腫
細胞)へのプラスミドDNAの送達を促進するために、リガンドとして使用され
る(S.Gottschalkら,Gene Ther.1:185−91(1
994))。マラリア円形スポロゾイトタンパク質は、肝細胞上のASORレセ
プター発現が低い条件下で(例えば、肝硬変、糖尿病、および肝細胞癌腫におい
て)、遺伝子の肝臓特異的送達のために使用されている(Z.Dingら,J.
Biol.Chem.270:3667−76(1995))。癌細胞における
上皮増殖因子(EGF)のレセプターの過剰発現は、肺ガン細胞によるEGF/
DNA複合体の特異的な取り込みを可能にしている(R.Cristianoら
,Cancer Gene Ther.3:4−10(1996))。
これは、核酸またはDNA結合剤が、核酸の細胞への特異的標的化に対して結合
されたタンパク質または合成リガンドからなる(R.J.Cristianoら
,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:11548−52(
1993);B.A.Bunnellら,Somat.Call Mol.Ge
net.18:559−69(1992);M.Cottenら,Proc.N
atl.Acad.Sci.USA 89:6094−98(1992))。一
旦DNAがこの分子結合体に結合されると、タンパク質−DNA複合体が生じる
。この遺伝子送達系は、異なるリガンドの使用によって多くの細胞型に標的化送
達し得ることが示されている(R.J.Cristianoら,Proc.Na
tl.Acad.Sci.USA 90:11548−52(1993))。例
えば、葉酸ビタミンは、葉酸レセプターを過剰発現する細胞(例えば、卵巣癌腫
細胞)へのプラスミドDNAの送達を促進するために、リガンドとして使用され
る(S.Gottschalkら,Gene Ther.1:185−91(1
994))。マラリア円形スポロゾイトタンパク質は、肝細胞上のASORレセ
プター発現が低い条件下で(例えば、肝硬変、糖尿病、および肝細胞癌腫におい
て)、遺伝子の肝臓特異的送達のために使用されている(Z.Dingら,J.
Biol.Chem.270:3667−76(1995))。癌細胞における
上皮増殖因子(EGF)のレセプターの過剰発現は、肺ガン細胞によるEGF/
DNA複合体の特異的な取り込みを可能にしている(R.Cristianoら
,Cancer Gene Ther.3:4−10(1996))。
【0085】 抗癌活性を有するタンパク質をコードする遺伝子の標的化した発現は、誘導可
能プロモーターの制御下にトランスジーンを配置することにより達成され得る。
例えば、癌胎児性抗原(CEA)遺伝子についてのプロモーターがベクター中に
取りこまれ、これは、膵臓癌腫の細胞特異的発現のような、腫瘍細胞中の得られ
るCEA発現ベクター構築物の細胞特異的発現を方向付けた(J.M.DiMa
ioら,Surgery 116:205−13(1994))。ヒト界面活性
剤タンパク質A遺伝子の調節配列が、このタンパク質を発現する非小細胞肺癌に
おいて細胞特異的発現を生成するために使用されている(M.J.Smithら
,Hum.Gene Ther.5:29−35(1994))。
能プロモーターの制御下にトランスジーンを配置することにより達成され得る。
例えば、癌胎児性抗原(CEA)遺伝子についてのプロモーターがベクター中に
取りこまれ、これは、膵臓癌腫の細胞特異的発現のような、腫瘍細胞中の得られ
るCEA発現ベクター構築物の細胞特異的発現を方向付けた(J.M.DiMa
ioら,Surgery 116:205−13(1994))。ヒト界面活性
剤タンパク質A遺伝子の調節配列が、このタンパク質を発現する非小細胞肺癌に
おいて細胞特異的発現を生成するために使用されている(M.J.Smithら
,Hum.Gene Ther.5:29−35(1994))。
【0086】 ゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質およびモノテルペンシンターゼタンパ
ク質を癌細胞中に導入するための別のアプローチは、この精製したタンパク質を
身体に直接導入することである。代表的には、このタンパク質は、脂質のような
別の分子と結合して導入され、このタンパク質を酵素的分解から保護する。例え
ば、ポリマー、特にポリエチレングリコール(PEG)の共有結合が、身体内で
特定のタンパク質を酵素的加水分解から保護し、従って半減期を延長するために
使用されている(F.Fuertgesら,J.Controlled Rel
ease,11:139(1990))。多くのポリマー系がタンパク質送達系
について報告されている(Y.H.Baeら,J.Controlled Re
lease,9:271(1989);R.Horiら,Pharm.Res.
,6:813(1989);I.Yamakawaら,J.Pharm.Sci
.79:505(1990);I.Yoshihiroら,J.Control
led Release,10:195(1989);M.Asanoら,J.
Controlled Release,9:111(1989);J.Ros
enblattら,J.Controlled Release,9:195(
1989);K.Makino,J.Controlled Release,
12:235(1990);Y.Takakuraら,J.Pharm.Sci
.,78:117(1989);Y.Takakuraら,J.Pharm.S
ci.,78:219(1989))。
ク質を癌細胞中に導入するための別のアプローチは、この精製したタンパク質を
身体に直接導入することである。代表的には、このタンパク質は、脂質のような
別の分子と結合して導入され、このタンパク質を酵素的分解から保護する。例え
ば、ポリマー、特にポリエチレングリコール(PEG)の共有結合が、身体内で
特定のタンパク質を酵素的加水分解から保護し、従って半減期を延長するために
使用されている(F.Fuertgesら,J.Controlled Rel
ease,11:139(1990))。多くのポリマー系がタンパク質送達系
について報告されている(Y.H.Baeら,J.Controlled Re
lease,9:271(1989);R.Horiら,Pharm.Res.
,6:813(1989);I.Yamakawaら,J.Pharm.Sci
.79:505(1990);I.Yoshihiroら,J.Control
led Release,10:195(1989);M.Asanoら,J.
Controlled Release,9:111(1989);J.Ros
enblattら,J.Controlled Release,9:195(
1989);K.Makino,J.Controlled Release,
12:235(1990);Y.Takakuraら,J.Pharm.Sci
.,78:117(1989);Y.Takakuraら,J.Pharm.S
ci.,78:219(1989))。
【0087】 治療的タンパク質は、このタンパク質を吸収し得る身体膜への適用(例えば、
鼻の、胃腸の、および直腸の膜)により身体に導入され得る。このタンパク質は
、代表的には、浸管エンハンサーと併用して吸収性膜に適用される(V.H.L
.Lee,Crit.Rev.Ther.Drug Carrier Syst
.,5:69(1988);V.H.L.Lee,J.Controlled
Release,13:213(1990);V.H.L.Lee編,Pept
ide and Protein Drug Delivery,Marcel
Dekker,New York(1991);A.G.DeBoerら,J
.Controlled Release,13:241(1990))。例え
ば、STDHFは、フシジン酸の合成誘導体(構造上胆汁酸塩に類似であるステ
ロイド界面活性剤)であり、経鼻送達のための浸管エンハンサーとして使用され
ている(W.A.Lee,Biopharm.Nov./Dec.,22,19
90)。
鼻の、胃腸の、および直腸の膜)により身体に導入され得る。このタンパク質は
、代表的には、浸管エンハンサーと併用して吸収性膜に適用される(V.H.L
.Lee,Crit.Rev.Ther.Drug Carrier Syst
.,5:69(1988);V.H.L.Lee,J.Controlled
Release,13:213(1990);V.H.L.Lee編,Pept
ide and Protein Drug Delivery,Marcel
Dekker,New York(1991);A.G.DeBoerら,J
.Controlled Release,13:241(1990))。例え
ば、STDHFは、フシジン酸の合成誘導体(構造上胆汁酸塩に類似であるステ
ロイド界面活性剤)であり、経鼻送達のための浸管エンハンサーとして使用され
ている(W.A.Lee,Biopharm.Nov./Dec.,22,19
90)。
【0088】 さらに、治療タンパク質を持つミクロスフェアは身体に送達され得る。1つの
適用において、生物接着剤が、経鼻の経路に代わりに、タンパク質を有するミク
ロスフェアを保持するために使用された。吸収エンハンサーがこのタンパク質と
共にミクロスフェアー中に取り込まれた場合、バイオアべイラビリティーが増加
した(L.Illumら,Int.J.Pharm.,63:207(1990
);N.F.Farrajら,J.Controlled Release,1
3:253(1990))。
適用において、生物接着剤が、経鼻の経路に代わりに、タンパク質を有するミク
ロスフェアを保持するために使用された。吸収エンハンサーがこのタンパク質と
共にミクロスフェアー中に取り込まれた場合、バイオアべイラビリティーが増加
した(L.Illumら,Int.J.Pharm.,63:207(1990
);N.F.Farrajら,J.Controlled Release,1
3:253(1990))。
【0089】 前述は、以下の代表的な例と関連してより完全に理解され得るが、この例にお
いて「プラスミド」は小文字pの後英数字で示される。本発明で使用される開始
プラスミドは、市販されているか、制限なく公に入手可能であるか、あるいは公
開された手順を使用してこのような利用可能なプラスミドから構築され得るかの
いずれかである。さらに、他の等価なプラスミドは当該分野において公知であり
、当業者に明らかである。
いて「プラスミド」は小文字pの後英数字で示される。本発明で使用される開始
プラスミドは、市販されているか、制限なく公に入手可能であるか、あるいは公
開された手順を使用してこのような利用可能なプラスミドから構築され得るかの
いずれかである。さらに、他の等価なプラスミドは当該分野において公知であり
、当業者に明らかである。
【0090】 DNAの「消化」、「切断」、または「開裂」は、DNA中の特定の位置での
み作用する酵素でのDNAの触媒的開裂を言う。これらの酵素は制限エンドヌク
レアーゼ呼ばれ、そして各酵素が開裂するDNA配列に沿った部位は制限部位と
呼ばれる。本発明において使用される制限酵素は市販されており、製造者により
提供された使用説明書に従って使用される(Sambrookら、前出の1.6
0−1.61章および3.38−3.39章もまた参照のこと)。
み作用する酵素でのDNAの触媒的開裂を言う。これらの酵素は制限エンドヌク
レアーゼ呼ばれ、そして各酵素が開裂するDNA配列に沿った部位は制限部位と
呼ばれる。本発明において使用される制限酵素は市販されており、製造者により
提供された使用説明書に従って使用される(Sambrookら、前出の1.6
0−1.61章および3.38−3.39章もまた参照のこと)。
【0091】 制限消化物からの所与のDNAフラグメントの「回収」または「単離」は、電
気泳動法、既知の分子量のマーカーDNAフラグメントの移動度に対する目的の
フラグメントの移動度との比較による目的のフラグメントの同定、所望のフラグ
メントを含むゲル切片の切り出し、およびDNAからのこのゲルの分離による、
ポリアクリルアミドゲルまたはアガロースゲル上の得られるDNAフラグメント
の分離を意味する。この手順は一般的に公知である。例えば、Lawnら(Nu
cleic Acids Res.9:6103−6114(1982))、お
よびGoeddelら(Nucleic Acids Res.,前出)を参照
のこと。
気泳動法、既知の分子量のマーカーDNAフラグメントの移動度に対する目的の
フラグメントの移動度との比較による目的のフラグメントの同定、所望のフラグ
メントを含むゲル切片の切り出し、およびDNAからのこのゲルの分離による、
ポリアクリルアミドゲルまたはアガロースゲル上の得られるDNAフラグメント
の分離を意味する。この手順は一般的に公知である。例えば、Lawnら(Nu
cleic Acids Res.9:6103−6114(1982))、お
よびGoeddelら(Nucleic Acids Res.,前出)を参照
のこと。
【0092】 以下の実施例は、本発明を実施するために現在意図されている最良の態様を単
に例示するが、本発明を限定すると解釈されるべきでない。本明細書中の全ての
文献引用は、表現上、参考として援用される。
に例示するが、本発明を限定すると解釈されるべきでない。本明細書中の全ての
文献引用は、表現上、参考として援用される。
【0093】 (実施例) (実施例1) (ゲラニル二リン酸シンターゼの単離) Menthaゲラニル二リン酸シンターゼの精製ストラテジーを、経験的に開
発した。先行技術の教示は矛盾しており、そしてMenthaからのゲラニル二
リン酸シンターゼの単離における使用のために適用し得なかった。例えば、Cl
astreら、前出は、完全精製されたゲラニル二リン酸シンターゼ(ブドウ由
来)の当該分野における唯一の例を提供する。Clastreらの精製プロトコ
ールは、以下の工程からなる:硫酸アンモニウム沈殿、陰イオン交換クロマトグ
ラフィー(DEAEおよびMono Q)、ヒドロキシアパタイトクロマトグラ
フィー、疎水性(フェニル置換)クロマトグラフィー、ゲル浸透クロマトグラフ
ィー、および未変性ポリアクリルアミドゲル電気泳動。Clastreらは、硫
酸アンモニウム沈殿が、最も効果的な精製工程であると報告した。対照的に、本
明細書で報告されるようなMenthaゲラニル二リン酸シンターゼの精製にお
いては、硫酸アンモニウム沈殿、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー、疎
水性(フェニル置換)クロマトグラフィー、およびゲル浸透クロマトグラフィー
の技術は、すべて失敗した。特に、硫酸アンモニウム沈殿は、Menthaゲラ
ニル二リン酸シンターゼの単離に適用した場合に非効率的であった。結果として
、以下の精製プロトコールが経験的に開発された。
発した。先行技術の教示は矛盾しており、そしてMenthaからのゲラニル二
リン酸シンターゼの単離における使用のために適用し得なかった。例えば、Cl
astreら、前出は、完全精製されたゲラニル二リン酸シンターゼ(ブドウ由
来)の当該分野における唯一の例を提供する。Clastreらの精製プロトコ
ールは、以下の工程からなる:硫酸アンモニウム沈殿、陰イオン交換クロマトグ
ラフィー(DEAEおよびMono Q)、ヒドロキシアパタイトクロマトグラ
フィー、疎水性(フェニル置換)クロマトグラフィー、ゲル浸透クロマトグラフ
ィー、および未変性ポリアクリルアミドゲル電気泳動。Clastreらは、硫
酸アンモニウム沈殿が、最も効果的な精製工程であると報告した。対照的に、本
明細書で報告されるようなMenthaゲラニル二リン酸シンターゼの精製にお
いては、硫酸アンモニウム沈殿、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー、疎
水性(フェニル置換)クロマトグラフィー、およびゲル浸透クロマトグラフィー
の技術は、すべて失敗した。特に、硫酸アンモニウム沈殿は、Menthaゲラ
ニル二リン酸シンターゼの単離に適用した場合に非効率的であった。結果として
、以下の精製プロトコールが経験的に開発された。
【0094】 植物材料、基質、および試薬。ミント植物(Mentha spicata)
を、以前に記載のように繁殖および成長させた(Alonsoら、J.Biol
.Chem.267:7582−7587、1992)。植物の茎(3〜7週齢
)から新たに出現した、急速に伸長する葉(5〜10mm長)を、酵素精製のた
めの腺毛細胞の調製のために使用した(Gershenzonら、Anal.B
iochem.200:130−138、1992)。[4−14C]イソペンテニ
ル二リン酸(54Ci/mol)を、DuPont/NENから購入した。ジメ
チルアリル二リン酸を、記載されるように合成した(Davissonら、Me
thods Enzymol.110:130−144、1985)。
を、以前に記載のように繁殖および成長させた(Alonsoら、J.Biol
.Chem.267:7582−7587、1992)。植物の茎(3〜7週齢
)から新たに出現した、急速に伸長する葉(5〜10mm長)を、酵素精製のた
めの腺毛細胞の調製のために使用した(Gershenzonら、Anal.B
iochem.200:130−138、1992)。[4−14C]イソペンテニ
ル二リン酸(54Ci/mol)を、DuPont/NENから購入した。ジメ
チルアリル二リン酸を、記載されるように合成した(Davissonら、Me
thods Enzymol.110:130−144、1985)。
【0095】 プレニルトランスフェラーゼ活性のアッセイ。10μlの酵素溶液に、10%
グリセロール、10mM MgCl2、および1mM DTTを含む、90μ l MOPSO緩衝液(25mM、pH 7.0)を添加した。DMAPP(1
0μM)および[4−14C]IPP(7μM)を、反応を開始するために添加し、
そして内容物に1mlヘキサンを重層した。混合液を手短にボルテックスし、次
いで31℃で1時間インキュベートした。インキュベート後、10μlの3N
HClを添加し、内容物をボルテックスおよび遠心分離し、そして生成物の加水
分解を31℃で20分間継続した。加水分解が完了した後、再度反応混合液をボ
ルテックスおよび遠心分離して、その結果、酸に不安定なアリル二リン酸(また
は内在性のホスファターゼによる加水分解に由来するこれらのアルコール)由来
のこの生成物は、ヘキサン層に分配された。このヘキサン層を取り除き、そして
それに含まれる放射性生成物を、液体シンチレーションカウンターによって測定
した。
グリセロール、10mM MgCl2、および1mM DTTを含む、90μ l MOPSO緩衝液(25mM、pH 7.0)を添加した。DMAPP(1
0μM)および[4−14C]IPP(7μM)を、反応を開始するために添加し、
そして内容物に1mlヘキサンを重層した。混合液を手短にボルテックスし、次
いで31℃で1時間インキュベートした。インキュベート後、10μlの3N
HClを添加し、内容物をボルテックスおよび遠心分離し、そして生成物の加水
分解を31℃で20分間継続した。加水分解が完了した後、再度反応混合液をボ
ルテックスおよび遠心分離して、その結果、酸に不安定なアリル二リン酸(また
は内在性のホスファターゼによる加水分解に由来するこれらのアルコール)由来
のこの生成物は、ヘキサン層に分配された。このヘキサン層を取り除き、そして
それに含まれる放射性生成物を、液体シンチレーションカウンターによって測定
した。
【0096】 生成物の同定。反応生成物の同定のために、このアッセイを10倍にスケール
アップし、そして回収を改善するために、ペンタンをヘキサン重層の代わりに置
き換えた。上記のような酸加水分解およびペンタン層の除去の後に、反応混合液
を2×1ml ジエチルエーテルで抽出して、生成物の完全な回収を確実にした
。次いで、組み合わせた有機抽出物を無水Na2SO4で脱水し、そして100μ
lにまで濃縮し、次いで放射性GLC分析のための内部標準の添加およびさらな
る濃縮を行った。探索された生成物は:ファルネシル二リン酸由来の、内在性ホ
スファターゼによって触媒される加水分解からのすべてのtrans−ファルネ
ソール、ならびに酸触媒再構成由来のcis,trans−ファルネソールおよ
びネロリゾール(計C15アルコール);ゲラニル二リン酸由来の、内在性ホスフ
ァターゼによって触媒される加水分解からのゲラニオール、ならびに酸触媒再構
成由来のネロールおよびリナロール(計C10アルコール);ならびに、計C5ア ルコール(ジメチルアリルアルコール、イソペンテノール、およびジメチルビニ
ルカルビノール)である。
アップし、そして回収を改善するために、ペンタンをヘキサン重層の代わりに置
き換えた。上記のような酸加水分解およびペンタン層の除去の後に、反応混合液
を2×1ml ジエチルエーテルで抽出して、生成物の完全な回収を確実にした
。次いで、組み合わせた有機抽出物を無水Na2SO4で脱水し、そして100μ
lにまで濃縮し、次いで放射性GLC分析のための内部標準の添加およびさらな
る濃縮を行った。探索された生成物は:ファルネシル二リン酸由来の、内在性ホ
スファターゼによって触媒される加水分解からのすべてのtrans−ファルネ
ソール、ならびに酸触媒再構成由来のcis,trans−ファルネソールおよ
びネロリゾール(計C15アルコール);ゲラニル二リン酸由来の、内在性ホスフ
ァターゼによって触媒される加水分解からのゲラニオール、ならびに酸触媒再構
成由来のネロールおよびリナロール(計C10アルコール);ならびに、計C5ア ルコール(ジメチルアリルアルコール、イソペンテノール、およびジメチルビニ
ルカルビノール)である。
【0097】 ゲラニル二リン酸シンターゼを含有するミント腺毛抽出物の最初の調製。下記
の以前に記載された手順(Gershenzonら、Anal.Biochem
.200:130−138、1992)に従って、腺毛細胞クラスター(約2×
107)を40gの葉組織から単離した。単離されたその細胞クラスターを、K pi緩衝液(50ml、100mM、pH 7.4、5g XAD、0.5g
PVPP、250mM ショ糖、1mM DTT、1mM PMSFおよび1m
M Na4EDTAを含有する)に懸濁し、そして超音波処理(Braun−s onic 2000、全出力、45秒間の氷中での冷却により分けた、5回の1
5秒間のバースト(burst))によって破壊した。超音波処理物を20μm
のナイロンメッシュを通してろ過し、そしてろ過物に、XADまたはPVPPを
含まない50mlのKPi緩衝液を添加して100mlにした。次いで、超音波
処理物を18,000g(30分間)で、次いで195,000g(90分間)
で遠心分離し、そして上清を酵素の供給源として利用した。
の以前に記載された手順(Gershenzonら、Anal.Biochem
.200:130−138、1992)に従って、腺毛細胞クラスター(約2×
107)を40gの葉組織から単離した。単離されたその細胞クラスターを、K pi緩衝液(50ml、100mM、pH 7.4、5g XAD、0.5g
PVPP、250mM ショ糖、1mM DTT、1mM PMSFおよび1m
M Na4EDTAを含有する)に懸濁し、そして超音波処理(Braun−s onic 2000、全出力、45秒間の氷中での冷却により分けた、5回の1
5秒間のバースト(burst))によって破壊した。超音波処理物を20μm
のナイロンメッシュを通してろ過し、そしてろ過物に、XADまたはPVPPを
含まない50mlのKPi緩衝液を添加して100mlにした。次いで、超音波
処理物を18,000g(30分間)で、次いで195,000g(90分間)
で遠心分離し、そして上清を酵素の供給源として利用した。
【0098】 色素−リガンド相互作用クロマトグラフィー。2つの腺調製物(200ml)
から合わせた上清を、10% グリセロール、1mM DTT、および10mM
MgCl2を含むMes緩衝液(4l、25mM、pH 6.2)中で透析し た(2×、4℃、計18時間)。透析した上清を、それぞれのチューブ中で透析
緩衝液で平衡化した5mlのDyeMatrex Red A ゲル(Amic
on)を含む8本のポリプロピレンチューブ(50ml)に等量に分けた。1時
間の穏やかな混合(Labquake)後、内容物を8本の1.5×12cmの
ポリプロピレンカラム(Bio−Rad)に注ぎ、重力によって流し、そして透
析緩衝液の4×容量で洗浄した。次いで、ゲラニル二リン酸シンターゼを、10
% グリセロール、5mM KPi、1mM DTT、および1mM EDTA
を含むBis−Tris緩衝液(240ml、25mM、pH 7.0)で溶出
させた。全体の手順を0〜4℃で行った。
から合わせた上清を、10% グリセロール、1mM DTT、および10mM
MgCl2を含むMes緩衝液(4l、25mM、pH 6.2)中で透析し た(2×、4℃、計18時間)。透析した上清を、それぞれのチューブ中で透析
緩衝液で平衡化した5mlのDyeMatrex Red A ゲル(Amic
on)を含む8本のポリプロピレンチューブ(50ml)に等量に分けた。1時
間の穏やかな混合(Labquake)後、内容物を8本の1.5×12cmの
ポリプロピレンカラム(Bio−Rad)に注ぎ、重力によって流し、そして透
析緩衝液の4×容量で洗浄した。次いで、ゲラニル二リン酸シンターゼを、10
% グリセロール、5mM KPi、1mM DTT、および1mM EDTA
を含むBis−Tris緩衝液(240ml、25mM、pH 7.0)で溶出
させた。全体の手順を0〜4℃で行った。
【0099】 陰イオン交換クロマトグラフィー。色素−リガンド相互作用クロマトグラフィ
ー工程からの溶出物を、10% グリセロールおよび1mM DTTを含むBi
s−Tris緩衝液A(25mM、pH 7.0)で平衡化したSource1
5Q分離メディア(Pharmacia Biotech)を含むHR10/1
0カラムにロードした。ゲラニル二リン酸シンターゼを、グラジエント(緩衝液
A中で0〜400mM KCl;総量400ml)を用いて溶出した。最も活性
の高い画分を収集し(6ml)、そして−80℃で保存した。ファルネシル二リ
ン酸シンターゼは、4〜10mM KClで溶出した;ゲラニル二リン酸シンタ
ーゼを、140〜180mM KClで溶出した;ゲラニルゲラニル二リン酸シ
ンターゼ活性は検出されなかった。陰イオン交換クロマトグラフィーは、ゲラニ
ル二リン酸シンターゼについて最も有意な精製工程を提供した。
ー工程からの溶出物を、10% グリセロールおよび1mM DTTを含むBi
s−Tris緩衝液A(25mM、pH 7.0)で平衡化したSource1
5Q分離メディア(Pharmacia Biotech)を含むHR10/1
0カラムにロードした。ゲラニル二リン酸シンターゼを、グラジエント(緩衝液
A中で0〜400mM KCl;総量400ml)を用いて溶出した。最も活性
の高い画分を収集し(6ml)、そして−80℃で保存した。ファルネシル二リ
ン酸シンターゼは、4〜10mM KClで溶出した;ゲラニル二リン酸シンタ
ーゼを、140〜180mM KClで溶出した;ゲラニルゲラニル二リン酸シ
ンターゼ活性は検出されなかった。陰イオン交換クロマトグラフィーは、ゲラニ
ル二リン酸シンターゼについて最も有意な精製工程を提供した。
【0100】 陰イオン交換クロマトグラフィー画分においてゲラニル二リン酸シンターゼタ
ンパク質を同定するために、ゲラニル二リン酸活性を含むそれぞれの画分からの
等容量をSDS−PAGEゲルにロードし、そしてそこに含まれるタンパク質を
分離および銀染色した。各々の画分におけるタンパク質染色強度とゲラニル二リ
ン酸シンターゼ活性レベルとの相関は、標的酵素として十分に分離された29k
Daバンドの同定を可能にした。さらなる証拠を、較正されたゲル浸透クロマト
グラフィー(Superdex 75)によって提供した。これは、ゲラニル二
リン酸シンターゼが、約70kDa(主ピーク)および約30kDaに一致する
容量で溶出されることを示し、少なくともいくらかの触媒活性を保持する30k
Daサブユニットを生じる70kDaホモダイマーのネイティブ酵素に一致した
。
ンパク質を同定するために、ゲラニル二リン酸活性を含むそれぞれの画分からの
等容量をSDS−PAGEゲルにロードし、そしてそこに含まれるタンパク質を
分離および銀染色した。各々の画分におけるタンパク質染色強度とゲラニル二リ
ン酸シンターゼ活性レベルとの相関は、標的酵素として十分に分離された29k
Daバンドの同定を可能にした。さらなる証拠を、較正されたゲル浸透クロマト
グラフィー(Superdex 75)によって提供した。これは、ゲラニル二
リン酸シンターゼが、約70kDa(主ピーク)および約30kDaに一致する
容量で溶出されることを示し、少なくともいくらかの触媒活性を保持する30k
Daサブユニットを生じる70kDaホモダイマーのネイティブ酵素に一致した
。
【0101】 調製SDS−PAGE。陰イオン交換クロマトグラフィー工程からの部分精製
されたゲラニル二リン酸シンターゼ(60ml)を95℃で15分間加熱し、冷
却し、そして蒸留水中で透析した(2×、4l、18時間、4℃)。次いで、タ
ンパク質溶液を凍結乾燥して粉末にし、そして100μlのSDS緩衝液および
50μlの3×ローディング緩衝液中に懸濁し、そして標準的なプロトコール(
Laemmli,U.K.,Nature 227:680−685,1970
)によって、12.5%のアクリルアミドのSDS−PAGE[15cm×18 cm×1.5mmゲル]により35mAで6時間分離した。クマシーブルー染色 は、10個のタンパク質バンドを示し、最も顕著なバンドは29kDaに相当し
、そして参照としてのカルボニックアンヒドラーゼを用いて較正された染色強度
に基づいて、10μgタンパク質と見積もられた。29kDaタンパク質バンド
(これはイオン交換クロマトグラフィーにおけるゲラニル二リン酸シンターゼ活
性と一致したものである)を、ゲルから切り出し、そして微量遠心チューブ内で
合わせた。
されたゲラニル二リン酸シンターゼ(60ml)を95℃で15分間加熱し、冷
却し、そして蒸留水中で透析した(2×、4l、18時間、4℃)。次いで、タ
ンパク質溶液を凍結乾燥して粉末にし、そして100μlのSDS緩衝液および
50μlの3×ローディング緩衝液中に懸濁し、そして標準的なプロトコール(
Laemmli,U.K.,Nature 227:680−685,1970
)によって、12.5%のアクリルアミドのSDS−PAGE[15cm×18 cm×1.5mmゲル]により35mAで6時間分離した。クマシーブルー染色 は、10個のタンパク質バンドを示し、最も顕著なバンドは29kDaに相当し
、そして参照としてのカルボニックアンヒドラーゼを用いて較正された染色強度
に基づいて、10μgタンパク質と見積もられた。29kDaタンパク質バンド
(これはイオン交換クロマトグラフィーにおけるゲラニル二リン酸シンターゼ活
性と一致したものである)を、ゲルから切り出し、そして微量遠心チューブ内で
合わせた。
【0102】 アミノ酸分析およびタンパク質配列決定。SDS−PAGEゲル切片に含まれ
る推定のゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質(約10μg)を、公表された
プロトコール(Coligan,J.E.,Coliganら編、「Curre
nt Protocols in Protein Science、第1巻」
、John Wiley and Sons,New York,11.3.1
−11.3.13、1996)に従って、トリプシン(Promega V51
1/1,2)で消化した。次いで、ペプチド混合液を、蒸留水/1%トリフルオ
ロ酢酸(TFA)(緩衝液A)で平衡化したApplied Biosyste
ms C18カラム(Aquapure ODS−300)にロードし、そして
70% CH3CN、29% 蒸留水、および1% TFAからなる緩衝液Bを 用いるグラジエント溶出(0〜60分間、0%〜37%緩衝液B/60〜90分
間、37%〜75%緩衝液B/90〜105分間、75%〜100%緩衝液B)
によって分離した。5つの分離可能なペプチドを、Washington St
ate University Laboratory for Biotec
hnology and BioanalysisでのEdman分解によるア
ミノ末端配列分析に供した。5つの消化生成物のうち2つが明白なペプチド配列
を生じた;FGLYQGTLR(配列番号3)およびRVIIEISR(配列番
号7)。他の収集したペプチドは、低収率または混在物の存在のいずれかによっ
て、有用な配列情報を生じなかった。
る推定のゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質(約10μg)を、公表された
プロトコール(Coligan,J.E.,Coliganら編、「Curre
nt Protocols in Protein Science、第1巻」
、John Wiley and Sons,New York,11.3.1
−11.3.13、1996)に従って、トリプシン(Promega V51
1/1,2)で消化した。次いで、ペプチド混合液を、蒸留水/1%トリフルオ
ロ酢酸(TFA)(緩衝液A)で平衡化したApplied Biosyste
ms C18カラム(Aquapure ODS−300)にロードし、そして
70% CH3CN、29% 蒸留水、および1% TFAからなる緩衝液Bを 用いるグラジエント溶出(0〜60分間、0%〜37%緩衝液B/60〜90分
間、37%〜75%緩衝液B/90〜105分間、75%〜100%緩衝液B)
によって分離した。5つの分離可能なペプチドを、Washington St
ate University Laboratory for Biotec
hnology and BioanalysisでのEdman分解によるア
ミノ末端配列分析に供した。5つの消化生成物のうち2つが明白なペプチド配列
を生じた;FGLYQGTLR(配列番号3)およびRVIIEISR(配列番
号7)。他の収集したペプチドは、低収率または混在物の存在のいずれかによっ
て、有用な配列情報を生じなかった。
【0103】 (実施例2) (ゲラニル二リン酸シンターゼcDNAのクローニング) ショットガンクローニングおよび配列決定。ゲラニル二リン酸シンターゼ精製
プロトコルのさらなるスケールアップが実用的でないので、限られたゲラニル二
リン酸シンターゼペプチド配列情報は、配列に基づくクローニングストラテジー
を全く不可能にした。結果として、高度に濃縮された供給源、すなわち、Men
thaにおけるモノテルペン生合成の独占的な供給源を構成する、ペパーミント
油腺細胞から単離されたmRNAから構築されたcDNAライブラリーから、ラ
ンダム配列決定の試みを開始した。
プロトコルのさらなるスケールアップが実用的でないので、限られたゲラニル二
リン酸シンターゼペプチド配列情報は、配列に基づくクローニングストラテジー
を全く不可能にした。結果として、高度に濃縮された供給源、すなわち、Men
thaにおけるモノテルペン生合成の独占的な供給源を構成する、ペパーミント
油腺細胞から単離されたmRNAから構築されたcDNAライブラリーから、ラ
ンダム配列決定の試みを開始した。
【0104】 ミント植物(Mentha piperita)を、以前に記載されたように
(Alonsoら、J.Biol.Chem.267:7582−7587、1
992)繁殖させ、そして生育させた。分泌細胞を5日齢のペパーミント葉から
単離し(Gershenzonら、Anal.Biochem.200:130
−138、1992)、そして全RNAを、単離した分泌細胞から抽出した(L
ogemannら、Anal.Biochem.163:16−20、1987
)。Poly(A)+−RNAをオリゴ(dT)セルロース(Pharmaci a)上のクロマトグラフィーによって精製し、そして得られたmRNAの5μg
を使用して製造者(Stratagene)の説明書に従ってλZAP cDN
Aライブラリーを構築した。プラスミドを、ミント腺λZAPIIファージミド
(Stratagene)の大量の切断物から精製した。プラスミドを、T3プ
ロモータープライマーおよびABI配列決定装置で引き続き得られるデータを使
用して配列決定した(DyeDeoxy Terminator Cycle
Sequencing,Applied Biosystems)。NCBI
BLASTサーバーを、GCG Wisconsin Package(Gen
etics Computer Group,1994 Program Ma
nual for the Wisconsin Package,Versi
on 8,Genetics Computer Group,Madison
、WI)のプログラムを用いて、データベース検索のために使用した。
(Alonsoら、J.Biol.Chem.267:7582−7587、1
992)繁殖させ、そして生育させた。分泌細胞を5日齢のペパーミント葉から
単離し(Gershenzonら、Anal.Biochem.200:130
−138、1992)、そして全RNAを、単離した分泌細胞から抽出した(L
ogemannら、Anal.Biochem.163:16−20、1987
)。Poly(A)+−RNAをオリゴ(dT)セルロース(Pharmaci a)上のクロマトグラフィーによって精製し、そして得られたmRNAの5μg
を使用して製造者(Stratagene)の説明書に従ってλZAP cDN
Aライブラリーを構築した。プラスミドを、ミント腺λZAPIIファージミド
(Stratagene)の大量の切断物から精製した。プラスミドを、T3プ
ロモータープライマーおよびABI配列決定装置で引き続き得られるデータを使
用して配列決定した(DyeDeoxy Terminator Cycle
Sequencing,Applied Biosystems)。NCBI
BLASTサーバーを、GCG Wisconsin Package(Gen
etics Computer Group,1994 Program Ma
nual for the Wisconsin Package,Versi
on 8,Genetics Computer Group,Madison
、WI)のプログラムを用いて、データベース検索のために使用した。
【0105】 最初に配列決定された100クローンの内、1つの見込みのあるクローン(M
p10:13)は、それが植物由来のゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼに対
して低い相同性(約28%の同一性;約50%の類似性)を示すが、植物由来の
ファルネシル二リン酸シンターゼにはほとんど相同性を示さない(約16%の同
一性;約40%の類似性)という点において、配列において「プレニルトランス
フェラーゼ様」であることが見出された。クローンMp10:13の配列に由来
するPCRプライマーpMp13F(配列番号4)およびpMp13R(配列番
号5)を使用して、113bpの5’−フラグメント(配列番号6)を増幅した
。これは同じプライマーおよびα32P−dATPを使用して標識された。得られ
るプローブを使用して、高いストリンジェンシーにおいて3000のミント腺ラ
イブラリーλZAPII cDNAクローンをスクリーニングした。3000の
λZAPII cDNAクローンを有するフィルターを、放射性標識した、11
3bpプローブで一晩、42℃で、30%ホルムアルデヒド、5×SSPE(0
.75M NaCl、0.05M NaH2PO4、0.005M EDTA、p
H 7.4)、5×Denhardt試薬(0.1% フィコール 400、0
.1% ポリビニルピロリドン、0.1% ウシ血清アルブミン)、0.1%
SDSおよび20μg/ml 変性剪断ニシン精子DNA中でハイブリダイズさ
せた。次いでフィルターを、1×SSC(0.15M NaClおよび0.01
65M クエン酸ナトリウム)および0.1% SDS中で65℃で、洗浄1回
当たり30分間、3回洗浄した。27個の陽性クローンを2回目のスクリーニン
グによって精製し、そしてT3およびT7プロモータープライマーを用いて配列
決定した。配列決定は、クローニングされた遺伝子が3つの対立遺伝子を意味す
ることを示した。
p10:13)は、それが植物由来のゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼに対
して低い相同性(約28%の同一性;約50%の類似性)を示すが、植物由来の
ファルネシル二リン酸シンターゼにはほとんど相同性を示さない(約16%の同
一性;約40%の類似性)という点において、配列において「プレニルトランス
フェラーゼ様」であることが見出された。クローンMp10:13の配列に由来
するPCRプライマーpMp13F(配列番号4)およびpMp13R(配列番
号5)を使用して、113bpの5’−フラグメント(配列番号6)を増幅した
。これは同じプライマーおよびα32P−dATPを使用して標識された。得られ
るプローブを使用して、高いストリンジェンシーにおいて3000のミント腺ラ
イブラリーλZAPII cDNAクローンをスクリーニングした。3000の
λZAPII cDNAクローンを有するフィルターを、放射性標識した、11
3bpプローブで一晩、42℃で、30%ホルムアルデヒド、5×SSPE(0
.75M NaCl、0.05M NaH2PO4、0.005M EDTA、p
H 7.4)、5×Denhardt試薬(0.1% フィコール 400、0
.1% ポリビニルピロリドン、0.1% ウシ血清アルブミン)、0.1%
SDSおよび20μg/ml 変性剪断ニシン精子DNA中でハイブリダイズさ
せた。次いでフィルターを、1×SSC(0.15M NaClおよび0.01
65M クエン酸ナトリウム)および0.1% SDS中で65℃で、洗浄1回
当たり30分間、3回洗浄した。27個の陽性クローンを2回目のスクリーニン
グによって精製し、そしてT3およびT7プロモータープライマーを用いて配列
決定した。配列決定は、クローニングされた遺伝子が3つの対立遺伝子を意味す
ることを示した。
【0106】 推定ゲラニル二リン酸シンターゼcDNAによってコードされるタンパク質の
生物学的活性のアッセイ。各々の推定ゲラニル二リン酸シンターゼ対立遺伝子か
らの1つの全長のインフレームのクローンを、E.coli XL1−Blue
に形質転換し、そしてOD600=0.7にまで増殖させ、1mM IPTGで誘 導し、そして6時間20℃で発現させた。細菌を遠心分離によって収集し、アッ
セイ緩衝液に再懸濁し、そして短い超音波処理によって破壊した。遠心分離によ
って破砕物からその抽出物を清澄化し、そして1mM PMSF、1mM ED
TAおよび0.1% Triton X−100がインキュベーション混合液に
含まれる以外は実施例1に記載のように、得られる上清を同時基質として14C−
IPPおよびDMAPPを使用してアッセイした。クローンのうちの1つ、Mp
13.18と称されるものを、最も高いレベルの発現された活性を有することを
示し、そしてcDNA挿入物は両方の鎖で完全に配列決定された(配列番号1)
。
生物学的活性のアッセイ。各々の推定ゲラニル二リン酸シンターゼ対立遺伝子か
らの1つの全長のインフレームのクローンを、E.coli XL1−Blue
に形質転換し、そしてOD600=0.7にまで増殖させ、1mM IPTGで誘 導し、そして6時間20℃で発現させた。細菌を遠心分離によって収集し、アッ
セイ緩衝液に再懸濁し、そして短い超音波処理によって破壊した。遠心分離によ
って破砕物からその抽出物を清澄化し、そして1mM PMSF、1mM ED
TAおよび0.1% Triton X−100がインキュベーション混合液に
含まれる以外は実施例1に記載のように、得られる上清を同時基質として14C−
IPPおよびDMAPPを使用してアッセイした。クローンのうちの1つ、Mp
13.18と称されるものを、最も高いレベルの発現された活性を有することを
示し、そしてcDNA挿入物は両方の鎖で完全に配列決定された(配列番号1)
。
【0107】 E.coliとは異なるコドン使用頻度を利用する植物およびアルギニンコド
ンAGAおよびAGGの存在は、E.coli中で異種発現された場合、真核生
物タンパク質の誤った翻訳または切断に導き得る。クローンMp13.18配列
中の14のアルギニンのうち9個がこれらのまれなE.coli tRNAによ
ってコードされているので、pET3a由来のベクター、pSBETaを発現の
ために選択した。このベクターは、強力なT7lacプロモーター由来のT7
DNAポリメラーゼを有する駆動発現に加えて、まれなアルギニンコドン使用頻
度についてのtRNAをコードする配列を有する(Schenkら、BioTe
chniques 19:196−200、1995)。
ンAGAおよびAGGの存在は、E.coli中で異種発現された場合、真核生
物タンパク質の誤った翻訳または切断に導き得る。クローンMp13.18配列
中の14のアルギニンのうち9個がこれらのまれなE.coli tRNAによ
ってコードされているので、pET3a由来のベクター、pSBETaを発現の
ために選択した。このベクターは、強力なT7lacプロモーター由来のT7
DNAポリメラーゼを有する駆動発現に加えて、まれなアルギニンコドン使用頻
度についてのtRNAをコードする配列を有する(Schenkら、BioTe
chniques 19:196−200、1995)。
【0108】 Mp13.18のオープンリーディングフレームをpSBETaに方向付けて
クローニングするために、部位特異的変異誘発によってNdeI部位(CAT
ATG)を開始メチオニンに添加し(QuickChange、Stratag
ene)、そして都合のよいBamHI部位(停止コドンの8bp下流)を利用
した。ベクターおよびMp13.18の操作した誘導体(Mp13.18Nと称
す)を、BamHIおよびNdeIで二重消化し、そのフラグメントをゲル精製
し、そして一晩連結し、次いでE.coli XL1−Blueコンピテント細
胞に形質転換した。得られるプラスミド(pSB13.18と称す)を、精製し
、配列決定して所望でない変化が変異誘発の間に生じていないことを確認し、そ
してT7発現株、E.coli BL21(DE3)pLysSに形質転換した
。クローンpSB13.18を、E.coliでのゲラニル二リン酸シンターゼ
発現のすべての続く研究において使用した。E.coliにおける発現を上記の
ように行った。
クローニングするために、部位特異的変異誘発によってNdeI部位(CAT
ATG)を開始メチオニンに添加し(QuickChange、Stratag
ene)、そして都合のよいBamHI部位(停止コドンの8bp下流)を利用
した。ベクターおよびMp13.18の操作した誘導体(Mp13.18Nと称
す)を、BamHIおよびNdeIで二重消化し、そのフラグメントをゲル精製
し、そして一晩連結し、次いでE.coli XL1−Blueコンピテント細
胞に形質転換した。得られるプラスミド(pSB13.18と称す)を、精製し
、配列決定して所望でない変化が変異誘発の間に生じていないことを確認し、そ
してT7発現株、E.coli BL21(DE3)pLysSに形質転換した
。クローンpSB13.18を、E.coliでのゲラニル二リン酸シンターゼ
発現のすべての続く研究において使用した。E.coliにおける発現を上記の
ように行った。
【0109】 GPPシンターゼペプチドアミノ酸配列情報を使用する、プラスミドMp13
.18によってコードされる推定GPPシンターゼの同定の確認。推定ゲラニル
二リン酸シンターゼ遺伝子のE.coliにおける機能的発現は、クローン化し
たcDNAがゲラニル二リン酸シンターゼをコードすることを絶対的には証明し
ない。GPPシンターゼの機能的発現は、すべての発現系(植物、微生物、およ
び動物)において使用される宿主細胞が、基質(ジメチルアリル二リン酸および
イソペンテニル二リン酸)およびGPPシンターゼによって触媒される反応の生
成物(ゲラニル二リン酸)の両方を加水分解し得る、競合するホスファターゼを
含むという事実によって複雑化される。結果として、組換え酵素の無細胞抽出物
中に生じる偽陰性の可能性が存在する。
.18によってコードされる推定GPPシンターゼの同定の確認。推定ゲラニル
二リン酸シンターゼ遺伝子のE.coliにおける機能的発現は、クローン化し
たcDNAがゲラニル二リン酸シンターゼをコードすることを絶対的には証明し
ない。GPPシンターゼの機能的発現は、すべての発現系(植物、微生物、およ
び動物)において使用される宿主細胞が、基質(ジメチルアリル二リン酸および
イソペンテニル二リン酸)およびGPPシンターゼによって触媒される反応の生
成物(ゲラニル二リン酸)の両方を加水分解し得る、競合するホスファターゼを
含むという事実によって複雑化される。結果として、組換え酵素の無細胞抽出物
中に生じる偽陰性の可能性が存在する。
【0110】 さらに、機能的発現は、すべての宿主細胞(植物、微生物、および動物)が内
在性のFPPシンターゼを含むという事実によって複雑化される。この酵素は、
C15ホモログファルネシル二リン酸への経路上でGPP(C10)を合成し(図1
を参照のこと)、そしてFPPシンターゼの変異型、改変型、またはさもなくば
分解型(例えば、組換え酵素の無細胞アッセイのプロセスにおいて細胞破損によ
って生成される)が、ゲラニル二リン酸中間体を放出し、従ってGPPシンター
ゼの存在の偽陽性の指示を導くことが、当該分野で公知である(Wise,M.
L.およびCroteau,R.,Cane,D.E.編、「Comprehe
nsive Natural Products Chemistry:Iso
prenoids、第2巻」Elsevier Science、Oxford
、1997(印刷中);Ogura,K.およびKoyama,T.,Ogur
a,K.およびSankawa,U.編、「Dynamic Aspects
of Natural Products Chemistry」Kodans
ha/Harwood Acadamic Publishers Tokyo
、1〜23頁、1997)。このようなアーチファクト的なGPPの形成は、E
.coli抽出物中で観察され、そして各々の場合における極度な注意および再
現性、およびコントロールの使用が組換え酵素活性のモニタリングにおいて必要
とされる。
在性のFPPシンターゼを含むという事実によって複雑化される。この酵素は、
C15ホモログファルネシル二リン酸への経路上でGPP(C10)を合成し(図1
を参照のこと)、そしてFPPシンターゼの変異型、改変型、またはさもなくば
分解型(例えば、組換え酵素の無細胞アッセイのプロセスにおいて細胞破損によ
って生成される)が、ゲラニル二リン酸中間体を放出し、従ってGPPシンター
ゼの存在の偽陽性の指示を導くことが、当該分野で公知である(Wise,M.
L.およびCroteau,R.,Cane,D.E.編、「Comprehe
nsive Natural Products Chemistry:Iso
prenoids、第2巻」Elsevier Science、Oxford
、1997(印刷中);Ogura,K.およびKoyama,T.,Ogur
a,K.およびSankawa,U.編、「Dynamic Aspects
of Natural Products Chemistry」Kodans
ha/Harwood Acadamic Publishers Tokyo
、1〜23頁、1997)。このようなアーチファクト的なGPPの形成は、E
.coli抽出物中で観察され、そして各々の場合における極度な注意および再
現性、およびコントロールの使用が組換え酵素活性のモニタリングにおいて必要
とされる。
【0111】 最後に、反応の基質の1つ(ジメチルアリル二リン酸)は、FPPシンターゼ
酵素の、結合したゲラニル二リン酸中間体を置換し得、そしてアッセイまたは反
応媒体におけるそのようなマイナーな変化でさえ、GPPシンターゼの存在につ
いての偽陽性の指示を生じ得る。本明細書中に記載されるアッセイは、この複雑
化を最小化するように設計されるが、この反応速度論的効果は、高度に可変性で
ありそして媒体の条件に依存する。従って、GPPシンターゼの機能的異種発現
を伴う厳しい複雑化が存在する。これは主に偽陽性に導き、クローンの同一性を
確認する手段として機能的発現における信頼性を妨害する。この理由のために、
機能的発現による陽性の指示に関わらず、GPPシンターゼクローンは、推定ゲ
ラニル二リン酸シンターゼcDNA由来のアミノ酸配列データに、精製されたタ
ンパク質からの限定されて利用可能なGPPシンターゼアミノ酸配列データを一
致させることによってのみ明白に確認され得る。
酵素の、結合したゲラニル二リン酸中間体を置換し得、そしてアッセイまたは反
応媒体におけるそのようなマイナーな変化でさえ、GPPシンターゼの存在につ
いての偽陽性の指示を生じ得る。本明細書中に記載されるアッセイは、この複雑
化を最小化するように設計されるが、この反応速度論的効果は、高度に可変性で
ありそして媒体の条件に依存する。従って、GPPシンターゼの機能的異種発現
を伴う厳しい複雑化が存在する。これは主に偽陽性に導き、クローンの同一性を
確認する手段として機能的発現における信頼性を妨害する。この理由のために、
機能的発現による陽性の指示に関わらず、GPPシンターゼクローンは、推定ゲ
ラニル二リン酸シンターゼcDNA由来のアミノ酸配列データに、精製されたタ
ンパク質からの限定されて利用可能なGPPシンターゼアミノ酸配列データを一
致させることによってのみ明白に確認され得る。
【0112】 精製されたGPPシンターゼ由来の2つのペプチド配列(配列番号3および配
列番号7)と、推定GPPシンターゼクローンMp13.18(配列番号2)の
推定アミノ酸配列とのアラインメントは、9個のアミノ酸ペプチド(配列番号3
)が、推定GPPシンターゼ配列(配列番号2)のアミノ酸残基254〜262
に正確に一致し、一方8個のアミノ酸ペプチド(配列番号7)は、推定GPPシ
ンターゼ配列(配列番号2)のアミノ酸残基184〜191に正確に一致するこ
とを示した。
列番号7)と、推定GPPシンターゼクローンMp13.18(配列番号2)の
推定アミノ酸配列とのアラインメントは、9個のアミノ酸ペプチド(配列番号3
)が、推定GPPシンターゼ配列(配列番号2)のアミノ酸残基254〜262
に正確に一致し、一方8個のアミノ酸ペプチド(配列番号7)は、推定GPPシ
ンターゼ配列(配列番号2)のアミノ酸残基184〜191に正確に一致するこ
とを示した。
【0113】 (実施例3) (プラスミドMp13.18のゲラニル二リン酸シンターゼcDNAインサー
トの配列分析) Mp13.18(1131nt)のcDNAインサートによってコードされる
ゲラニル二リン酸シンターゼクローン(最も高い発現レベルのシンターゼ活性を
産生する)は、939ヌクレオチドのオープンリーディングフレームを含み、こ
れは計算された分子量33,465を有する313アミノ酸のタンパク質に相当
する。最初の48の推定アミノ酸残基は、色素体の標的配列の予想される特性、
すなわちセリン残基および小さくて疎水的な側鎖を有するアミノ酸残基に富み、
そして酸性残基が少ないことを示す(von Heijneら、Eur.J.B
iochem.180:535−545.1989)。推定の、アミノ末端標的
配列の存在は、植物細胞におけるモノテルペン生合成の色素体起源と一致する(
Wise,M.L.およびCroteau,R.,Cane,D.E.編、「C
omprehensive Natural Products Chemis
try:Isoprenoids、第2巻」Elsevier Science
,Oxford,1997(印刷中))。推定の移行ペプチド残基を除外するこ
とによって、分子量28,485の成熟型のプロセシングされたタンパク質に一
致するアミノ酸配列は、SDS−PAGEによってネイティブな酵素について決
定された約29,000(単量体サブユニットサイズ)の分子量と完全に一致す
る。
トの配列分析) Mp13.18(1131nt)のcDNAインサートによってコードされる
ゲラニル二リン酸シンターゼクローン(最も高い発現レベルのシンターゼ活性を
産生する)は、939ヌクレオチドのオープンリーディングフレームを含み、こ
れは計算された分子量33,465を有する313アミノ酸のタンパク質に相当
する。最初の48の推定アミノ酸残基は、色素体の標的配列の予想される特性、
すなわちセリン残基および小さくて疎水的な側鎖を有するアミノ酸残基に富み、
そして酸性残基が少ないことを示す(von Heijneら、Eur.J.B
iochem.180:535−545.1989)。推定の、アミノ末端標的
配列の存在は、植物細胞におけるモノテルペン生合成の色素体起源と一致する(
Wise,M.L.およびCroteau,R.,Cane,D.E.編、「C
omprehensive Natural Products Chemis
try:Isoprenoids、第2巻」Elsevier Science
,Oxford,1997(印刷中))。推定の移行ペプチド残基を除外するこ
とによって、分子量28,485の成熟型のプロセシングされたタンパク質に一
致するアミノ酸配列は、SDS−PAGEによってネイティブな酵素について決
定された約29,000(単量体サブユニットサイズ)の分子量と完全に一致す
る。
【0114】 翻訳され、植物に由来するプレニルトランスフェラーゼ配列のアラインメント
は、Menthaゲラニル二リン酸シンターゼと植物ファルネシル二リン酸シン
ターゼとの間の関係(約16%同一性、約40%類似性)よりも、Mentha
ゲラニル二リン酸シンターゼと植物ゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼとの間
のより密接な関係(約28%同一性、約54%類似性)を示す。Menthaゲ
ラニル二リン酸シンターゼが、ファルネシル二リン酸シンターゼよりもより密接
にゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼに関連しているという観察は、細胞質に
局在するファルネシル二リン酸シンターゼと異なる、ゲラニル二リン酸シンター
ゼおよびゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼの色素体局在化と一致する。Me
nthaゲラニル二リン酸シンターゼは、ファルネシル二リン酸シンターゼより
もゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼにより密接に関連するが、それにもかか
わらず、Menthaゲラニル二リン酸シンターゼおよびゲラニルゲラニル二リ
ン酸シンターゼまたはファルネシル二リン酸シンターゼのいずれかのとの間の、
低い全体の同一性および類似性が存在することは明らかである。
は、Menthaゲラニル二リン酸シンターゼと植物ファルネシル二リン酸シン
ターゼとの間の関係(約16%同一性、約40%類似性)よりも、Mentha
ゲラニル二リン酸シンターゼと植物ゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼとの間
のより密接な関係(約28%同一性、約54%類似性)を示す。Menthaゲ
ラニル二リン酸シンターゼが、ファルネシル二リン酸シンターゼよりもより密接
にゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼに関連しているという観察は、細胞質に
局在するファルネシル二リン酸シンターゼと異なる、ゲラニル二リン酸シンター
ゼおよびゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼの色素体局在化と一致する。Me
nthaゲラニル二リン酸シンターゼは、ファルネシル二リン酸シンターゼより
もゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼにより密接に関連するが、それにもかか
わらず、Menthaゲラニル二リン酸シンターゼおよびゲラニルゲラニル二リ
ン酸シンターゼまたはファルネシル二リン酸シンターゼのいずれかのとの間の、
低い全体の同一性および類似性が存在することは明らかである。
【0115】 ヌクレオチドレベルにおける同一性パーセントの比較は、Mentha GP
PシンターゼcDNAとファルネシル二リン酸シンターゼcDNAクローンとの
間の最も高いレベルの同一性が、プラスミドMp13.18のcDNAインサー
トとZea mays(受託番号L39789)からのファルネシル二リン酸シ
ンターゼcDNAとの間の38%の同一性パーセントの値であることを示す。同
様に、Mentha GPPシンターゼcDNAとゲラニルゲラニル二リン酸シ
ンターゼcDNAとの間の最も高いレベルの同一性が、Mp13.18のcDN
AインサートとArabidopsis thaliana(受託番号L258
13)からのゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼcDNAとの間の44%の同
一性パーセントである。比較によって、完全に関連していない核酸配列は、約2
5%の同一性パーセントスコアを生じる。従って、Mp13.18のcDNAイ
ンサートのヌクレオチド配列は、ゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼおよびフ
ァルネシル二リン酸シンターゼをコードするcDNAのヌクレオチド配列にわず
かに関連するのみである。
PシンターゼcDNAとファルネシル二リン酸シンターゼcDNAクローンとの
間の最も高いレベルの同一性が、プラスミドMp13.18のcDNAインサー
トとZea mays(受託番号L39789)からのファルネシル二リン酸シ
ンターゼcDNAとの間の38%の同一性パーセントの値であることを示す。同
様に、Mentha GPPシンターゼcDNAとゲラニルゲラニル二リン酸シ
ンターゼcDNAとの間の最も高いレベルの同一性が、Mp13.18のcDN
AインサートとArabidopsis thaliana(受託番号L258
13)からのゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼcDNAとの間の44%の同
一性パーセントである。比較によって、完全に関連していない核酸配列は、約2
5%の同一性パーセントスコアを生じる。従って、Mp13.18のcDNAイ
ンサートのヌクレオチド配列は、ゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼおよびフ
ァルネシル二リン酸シンターゼをコードするcDNAのヌクレオチド配列にわず
かに関連するのみである。
【0116】 (実施例4) (ペパーミントGPPシンターゼcDNA(配列番号1)の、他の植物種から
のGPPシンターゼメッセンジャーRNA分子へのハイブリダイゼーションを実
証するノーザン分析) ノーザンブロット分析を利用して、配列番号1に示されるペパーミントGPP
シンターゼcDNAと、他の植物種由来のGPPシンターゼをコードするmRN
A分子との間のハイブリダイゼーションを実証した。Mentha spica
ta、Mentha candicans、Salvia officinal
is、およびPerilla frutescensからRNAを抽出し、そし
てこれらの種の各々からのRNAのアリコートを、変性アガロースゲル上で分離
し、そしてナイロンメンブレン上にブロットした。そのメンブレンを、以下のハ
イブリダイゼーションおよび洗浄条件を利用して、放射標識したペパーミントG
PPシンターゼcDNA(配列番号1)でプローブした:3×SSC中での、6
5℃、16時間のハイブリダイゼーション、続いて以下の条件下での洗浄:2×
SSC中、18℃〜25℃での、洗浄1回当たり20分間、2回の洗浄、続いて
0.5×SSC中、55℃での、洗浄1回あたり30分間、2回の洗浄。上記の
洗浄条件下で放射標識したペパーミントGPPシンターゼcDNA(配列番号1
)は、試験した植物種の各々由来の相同なGPPシンターゼmRNAにハイブリ
ダイズしたままであった。
のGPPシンターゼメッセンジャーRNA分子へのハイブリダイゼーションを実
証するノーザン分析) ノーザンブロット分析を利用して、配列番号1に示されるペパーミントGPP
シンターゼcDNAと、他の植物種由来のGPPシンターゼをコードするmRN
A分子との間のハイブリダイゼーションを実証した。Mentha spica
ta、Mentha candicans、Salvia officinal
is、およびPerilla frutescensからRNAを抽出し、そし
てこれらの種の各々からのRNAのアリコートを、変性アガロースゲル上で分離
し、そしてナイロンメンブレン上にブロットした。そのメンブレンを、以下のハ
イブリダイゼーションおよび洗浄条件を利用して、放射標識したペパーミントG
PPシンターゼcDNA(配列番号1)でプローブした:3×SSC中での、6
5℃、16時間のハイブリダイゼーション、続いて以下の条件下での洗浄:2×
SSC中、18℃〜25℃での、洗浄1回当たり20分間、2回の洗浄、続いて
0.5×SSC中、55℃での、洗浄1回あたり30分間、2回の洗浄。上記の
洗浄条件下で放射標識したペパーミントGPPシンターゼcDNA(配列番号1
)は、試験した植物種の各々由来の相同なGPPシンターゼmRNAにハイブリ
ダイズしたままであった。
【0117】 (実施例5) (Perilla frutescensおよびSalvia offcin
alisからクローン化された部分長GPPシンターゼcDNA分子) GPPシンターゼタンパク質の一部をコードする部分長cDNAフラグメント
を、Perilla frutescensおよびSalvia offcin
alisから抽出したmRNAから増幅した。配列番号2に示されるゲラニル二
リン酸シンターゼタンパク質のアミノ酸76〜82をコードする、配列番号1に
示される核酸配列の一部に対応する縮重正方向PCRプライマー(配列番号8)
を合成した。配列番号2に示されるゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質のア
ミノ酸124〜129をコードする、配列番号1に示される核酸配列の一部に対
応する縮重逆方向PCRプライマー(配列番号9)を合成した。PCR増幅を以
下の条件下で行った:20mM Tris−HCL(pH8.4)、50mM
KCl、5mM MgCl2、0.5mM 各dNTP、2.5単位のTaq DNAポリメラーゼ、50pmolの配列番号8に示したプライマー、50pm
olの配列番号9に示したプライマー、および鋳型としての1×106λZAP II cDNAライブラリーファージを含む1×PCR緩衝液。以下の温度サイ
クリング条件を利用した:94℃で2分間、続いて、94℃で1分間、45℃で
30秒間、次いで72℃で30秒間の30サイクル。PCR生成物を、製造者(
Invitrogen)の説明書に従って、TOPO−TAを使用してクローニ
ングした。
alisからクローン化された部分長GPPシンターゼcDNA分子) GPPシンターゼタンパク質の一部をコードする部分長cDNAフラグメント
を、Perilla frutescensおよびSalvia offcin
alisから抽出したmRNAから増幅した。配列番号2に示されるゲラニル二
リン酸シンターゼタンパク質のアミノ酸76〜82をコードする、配列番号1に
示される核酸配列の一部に対応する縮重正方向PCRプライマー(配列番号8)
を合成した。配列番号2に示されるゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質のア
ミノ酸124〜129をコードする、配列番号1に示される核酸配列の一部に対
応する縮重逆方向PCRプライマー(配列番号9)を合成した。PCR増幅を以
下の条件下で行った:20mM Tris−HCL(pH8.4)、50mM
KCl、5mM MgCl2、0.5mM 各dNTP、2.5単位のTaq DNAポリメラーゼ、50pmolの配列番号8に示したプライマー、50pm
olの配列番号9に示したプライマー、および鋳型としての1×106λZAP II cDNAライブラリーファージを含む1×PCR緩衝液。以下の温度サイ
クリング条件を利用した:94℃で2分間、続いて、94℃で1分間、45℃で
30秒間、次いで72℃で30秒間の30サイクル。PCR生成物を、製造者(
Invitrogen)の説明書に従って、TOPO−TAを使用してクローニ
ングした。
【0118】 上記のPCR増幅条件を利用して、161bpcDNAフラグメントを、Pe
rilla frutescens(配列番号10)から増幅および精製した。
このフラグメント(配列番号10)は、配列番号1に示されるペパーミントゲラ
ニル二リン酸シンターゼcDNA配列のヌクレオチド231〜392に対応する
。部分長Perilla GPPシンターゼcDNA配列(配列番号10)の、
配列番号1に示されるミントゲラニル二リン酸シンターゼcDNA配列の対応す
る領域との比較は、2つの比較された核酸配列の間の80%の同一性を示す。P
erilla GPPシンターゼ部分長cDNA配列(配列番号10)によって
コードされるGPPシンターゼタンパク質フラグメント(配列番号11)の、ミ
ントGPPシンターゼタンパク質(配列番号2に示されるGPPシンターゼアミ
ノ酸配列のアミノ酸残基76〜129)の対応する領域との比較は、2つの比較
されたアミノ酸配列の間の90%の類似性を示した。
rilla frutescens(配列番号10)から増幅および精製した。
このフラグメント(配列番号10)は、配列番号1に示されるペパーミントゲラ
ニル二リン酸シンターゼcDNA配列のヌクレオチド231〜392に対応する
。部分長Perilla GPPシンターゼcDNA配列(配列番号10)の、
配列番号1に示されるミントゲラニル二リン酸シンターゼcDNA配列の対応す
る領域との比較は、2つの比較された核酸配列の間の80%の同一性を示す。P
erilla GPPシンターゼ部分長cDNA配列(配列番号10)によって
コードされるGPPシンターゼタンパク質フラグメント(配列番号11)の、ミ
ントGPPシンターゼタンパク質(配列番号2に示されるGPPシンターゼアミ
ノ酸配列のアミノ酸残基76〜129)の対応する領域との比較は、2つの比較
されたアミノ酸配列の間の90%の類似性を示した。
【0119】 同様に、上記のPCR増幅条件を利用して、161bpcDNAフラグメント
を、Salvia officinalis(配列番号12)から増幅および精
製した。このフラグメント(配列番号12)は、配列番号1に示されるミントゲ
ラニル二リン酸シンターゼcDNA配列のヌクレオチド231〜392に対応す
る。部分長Salvia officinalis GPPシンターゼcDNA
配列(配列番号12)の、配列番号1に示されるミントゲラニル二リン酸シンタ
ーゼcDNA配列の対応する領域との比較は、2つの比較された核酸配列の間の
77%の同一性を示す。Salvia GPPシンターゼ部分長cDNA配列(
配列番号12)によってコードされるGPPシンターゼタンパク質フラグメント
(配列番号13)の、ミントGPPシンターゼタンパク質の対応する領域(配列
番号2に示されるGPPシンターゼアミノ酸配列のアミノ酸残基76〜129)
との比較は、2つの比較されたアミノ酸配列の間の83%の類似性を示した。
を、Salvia officinalis(配列番号12)から増幅および精
製した。このフラグメント(配列番号12)は、配列番号1に示されるミントゲ
ラニル二リン酸シンターゼcDNA配列のヌクレオチド231〜392に対応す
る。部分長Salvia officinalis GPPシンターゼcDNA
配列(配列番号12)の、配列番号1に示されるミントゲラニル二リン酸シンタ
ーゼcDNA配列の対応する領域との比較は、2つの比較された核酸配列の間の
77%の同一性を示す。Salvia GPPシンターゼ部分長cDNA配列(
配列番号12)によってコードされるGPPシンターゼタンパク質フラグメント
(配列番号13)の、ミントGPPシンターゼタンパク質の対応する領域(配列
番号2に示されるGPPシンターゼアミノ酸配列のアミノ酸残基76〜129)
との比較は、2つの比較されたアミノ酸配列の間の83%の類似性を示した。
【0120】 (実施例6) (ミントGPPシンターゼをコードするさらなる代表的な核酸配列) 前出の実施例2においてより完全に示されるように、配列番号4および配列番
号5に示されるPCRプライマーを使用して、113bp cDNAフラグメン
ト(配列番号6)を増幅した。これは、Mentha piperita腺毛、
分泌細胞cDNAライブラリーからの27の相同なクローンを単離するためにプ
ローブとして使用される。配列決定は、27のクローンが3つの対立遺伝子を意
味することを示した。この3つの対立遺伝子の群の各々由来の1つのクローンの
生物学的活性を、その3つの各々の代表的なcDNAを個々に発現するE.co
li由来の上清中のゲラニル二リン酸活性を測定することによって試験した。最
高レベルのゲラニル二リン酸シンターゼ活性を示すクローンを、Mp13.18
と命名した。Mp13.18のヌクレオチド配列を、配列番号1に示す。
号5に示されるPCRプライマーを使用して、113bp cDNAフラグメン
ト(配列番号6)を増幅した。これは、Mentha piperita腺毛、
分泌細胞cDNAライブラリーからの27の相同なクローンを単離するためにプ
ローブとして使用される。配列決定は、27のクローンが3つの対立遺伝子を意
味することを示した。この3つの対立遺伝子の群の各々由来の1つのクローンの
生物学的活性を、その3つの各々の代表的なcDNAを個々に発現するE.co
li由来の上清中のゲラニル二リン酸活性を測定することによって試験した。最
高レベルのゲラニル二リン酸シンターゼ活性を示すクローンを、Mp13.18
と命名した。Mp13.18のヌクレオチド配列を、配列番号1に示す。
【0121】 さらに、他の2つのGPPシンターゼ対立遺伝子の群のそれぞれからの代表的
なcDNAを配列決定した。1つのGPPシンターゼ対立遺伝子の核酸配列(ク
ローン13.11と命名)は、配列番号14に示し、そして配列番号14に示さ
れる核酸配列によってコードされるGPPシンターゼタンパク質は、配列番号1
5に開示される。他のGPPシンターゼ対立遺伝子の配列(クローン13.25
と命名)は、配列番号16に示され、そして配列番号16に示される核酸配列に
よってコードされるGPPシンターゼタンパク質は、配列番号17において開示
される。
なcDNAを配列決定した。1つのGPPシンターゼ対立遺伝子の核酸配列(ク
ローン13.11と命名)は、配列番号14に示し、そして配列番号14に示さ
れる核酸配列によってコードされるGPPシンターゼタンパク質は、配列番号1
5に開示される。他のGPPシンターゼ対立遺伝子の配列(クローン13.25
と命名)は、配列番号16に示され、そして配列番号16に示される核酸配列に
よってコードされるGPPシンターゼタンパク質は、配列番号17において開示
される。
【0122】 配列番号1、配列番号14、および配列番号16に示される核酸配列に加えて
、ペパーミントゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質をコードする本発明の代
表的な核酸配列の例は、配列番号18;配列番号19;配列番号20;配列番号
21;および配列番号22に示される。配列番号18;配列番号19;配列番号
20;配列番号21;および配列番号22に示される核酸配列は、コンピュータ
を用いて生成された。遺伝コードの縮重を利用することによって、配列番号18
;配列番号19;配列番号20;配列番号21;および配列番号22に示される
核酸配列は各々、異なる配列を有するが、各々が配列番号2に示されるタンパク
質をコードする。従って、配列番号18;配列番号19;配列番号20;配列番
号21;および配列番号22に示される核酸分子の各々のオープンリーディング
フレームは、ヌクレオチド1〜ヌクレオチド939にわたる。
、ペパーミントゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質をコードする本発明の代
表的な核酸配列の例は、配列番号18;配列番号19;配列番号20;配列番号
21;および配列番号22に示される。配列番号18;配列番号19;配列番号
20;配列番号21;および配列番号22に示される核酸配列は、コンピュータ
を用いて生成された。遺伝コードの縮重を利用することによって、配列番号18
;配列番号19;配列番号20;配列番号21;および配列番号22に示される
核酸配列は各々、異なる配列を有するが、各々が配列番号2に示されるタンパク
質をコードする。従って、配列番号18;配列番号19;配列番号20;配列番
号21;および配列番号22に示される核酸分子の各々のオープンリーディング
フレームは、ヌクレオチド1〜ヌクレオチド939にわたる。
【0123】 配列番号2、配列番号15および配列番号17に示されるタンパク質配列に加
えて、本発明の代表的なゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質の例は、配列番
号23;配列番号24;配列番号25;配列番号26;配列番号27に示される
。配列番号23;配列番号24;配列番号25;配列番号26および配列番号2
7に示されるアミノ酸配列は、配列番号2に示されるペパーミントGPPシンタ
ーゼタンパク質配列における保存性アミノ酸置換を作製することによって、コン
ピュータを使用して生成された。
えて、本発明の代表的なゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質の例は、配列番
号23;配列番号24;配列番号25;配列番号26;配列番号27に示される
。配列番号23;配列番号24;配列番号25;配列番号26および配列番号2
7に示されるアミノ酸配列は、配列番号2に示されるペパーミントGPPシンタ
ーゼタンパク質配列における保存性アミノ酸置換を作製することによって、コン
ピュータを使用して生成された。
【0124】 (実施例7) (ペパーミントゲラニル二リン酸シンターゼcDNA(配列番号1)の、本発
明の他の核酸配列へのハイブリダイゼーション) 本発明の核酸分子は、以下のストリンジェントなハイブリダイゼーション条件
下で、配列番号1に示される核酸配列、または配列番号1に示される核酸配列の
相補的配列にハイブリダイズし得る:5×SSC中、65℃での16時間のイン
キュベーション、続いて以下の条件下での洗浄:2×SSC中、18℃〜25℃
での、1洗浄あたり20分間で2回の洗浄;好ましくは、2×SSC中、18℃
〜25℃での、1洗浄あたり20分間で2回の洗浄、続いて0.5×SSC中、
55℃での30分間の1回洗浄;最も好ましくは、2×SSC中、18℃〜25
℃での1洗浄あたり15分間で2回の洗浄、続いて0.2×SSC中、65℃で
の1洗浄あたり20分間の2回洗浄。
明の他の核酸配列へのハイブリダイゼーション) 本発明の核酸分子は、以下のストリンジェントなハイブリダイゼーション条件
下で、配列番号1に示される核酸配列、または配列番号1に示される核酸配列の
相補的配列にハイブリダイズし得る:5×SSC中、65℃での16時間のイン
キュベーション、続いて以下の条件下での洗浄:2×SSC中、18℃〜25℃
での、1洗浄あたり20分間で2回の洗浄;好ましくは、2×SSC中、18℃
〜25℃での、1洗浄あたり20分間で2回の洗浄、続いて0.5×SSC中、
55℃での30分間の1回洗浄;最も好ましくは、2×SSC中、18℃〜25
℃での1洗浄あたり15分間で2回の洗浄、続いて0.2×SSC中、65℃で
の1洗浄あたり20分間の2回洗浄。
【0125】 本発明の核酸分子の、配列番号1に示される核酸配列、または、配列番号1に
示される核酸配列の相補的配列へのハイブリダイズする能力は、例えば、Mol
ecular Cloning,A Laboratory Manual(第
2版),J.Sambrook、E.F.FritschおよびT.Mania
tis編、9.52〜9.55(引用された頁は本明細書中で参考として援用さ
れる)に示されるように、ニトロセルロースフィルターまたはナイロンメンブレ
ン上に固定化された核酸に、放射性標識された核酸プローブをハイブリダイズす
る技術を利用することによって決定され得る。
示される核酸配列の相補的配列へのハイブリダイズする能力は、例えば、Mol
ecular Cloning,A Laboratory Manual(第
2版),J.Sambrook、E.F.FritschおよびT.Mania
tis編、9.52〜9.55(引用された頁は本明細書中で参考として援用さ
れる)に示されるように、ニトロセルロースフィルターまたはナイロンメンブレ
ン上に固定化された核酸に、放射性標識された核酸プローブをハイブリダイズす
る技術を利用することによって決定され得る。
【0126】 (実施例8) (本発明のGPPシンターゼタンパク質の特性) 本発明の代表的なゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質は、好ましくは表3
に示される特性を有する。
に示される特性を有する。
【0127】
【表3】
【配列表】
【図1】 図1は、(a)ゲラニル二リン酸シンターゼ、(b)ファルネシル二リン酸シ
ンターゼ、および(c)ゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼによって触媒され
る縮合反応を示す。
ンターゼ、および(c)ゲラニルゲラニル二リン酸シンターゼによって触媒され
る縮合反応を示す。
【図2】 図2は、全てのフェニルトランスフェラーゼに共通する反応機構を示す。ゲラ
ニル二リン酸シンターゼによって触媒される反応を、ゲラニル機構の図示として
示す。
ニル二リン酸シンターゼによって触媒される反応を、ゲラニル機構の図示として
示す。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,SD,SZ,UG,ZW),EA(AM ,AZ,BY,KG,KZ,MD,RU,TJ,TM) ,AL,AM,AT,AU,AZ,BA,BB,BG, BR,BY,CA,CH,CN,CU,CZ,DE,D K,EE,ES,FI,GB,GE,GH,GM,HR ,HU,ID,IL,IS,JP,KE,KG,KP, KR,KZ,LC,LK,LR,LS,LT,LU,L V,MD,MG,MK,MN,MW,MX,NO,NZ ,PL,PT,RO,RU,SD,SE,SG,SI, SK,SL,TJ,TM,TR,TT,UA,UG,U S,UZ,VN,YU,ZW (72)発明者 ワイルダング, マーク アール. アメリカ合衆国 ワシントン 99111, コルファックス, ベネディクト ロード 2252 (72)発明者 バーク, チャールズ シー. アメリカ合衆国 アイダホ 83843, モ スコウ, エヌ. ヘイズ ストリート 628 (72)発明者 ガーシェンゾン, ジョナサン ドイツ国 ディー−07743 ジェナ, エ バストラッセ 1 Fターム(参考) 4B024 AA01 BA10 CA04 DA01 DA02 EA04 GA11 HA01 4B050 CC03 DD13 LL01 4B065 AA88X AA89Y AA90X AA93X CA29 CA44
Claims (37)
- 【請求項1】 ゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質をコードする、単離
されたヌクレオチド配列。 - 【請求項2】 被子植物ゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質をコードす
る、請求項1に記載の単離されたヌクレオチド配列。 - 【請求項3】 裸子植物ゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質をコードす
る、請求項1に記載の単離されたヌクレオチド配列。 - 【請求項4】 精油植物ゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質をコードす
る、請求項1に記載の単離されたヌクレオチド配列。 - 【請求項5】 Lamiaceaeファミリーのメンバー中に天然に存在す
るゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質をコードする、請求項1に記載の単離
されたヌクレオチド配列。 - 【請求項6】 Menthaゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質をコー
ドする、請求項1に記載の単離されたヌクレオチド配列。 - 【請求項7】 Mentha piperitaゲラニル二リン酸シンター
ゼタンパク質をコードする、請求項6に記載の単離されたヌクレオチド配列。 - 【請求項8】 配列番号1、配列番号14および配列番号16のいずれか1
つに示されるヌクレオチド配列を含む、請求項7に記載の単離されたヌクレオチ
ド配列。 - 【請求項9】 Salviaゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質をコー
ドする、請求項1に記載の単離されたヌクレオチド配列。 - 【請求項10】 Salvia officinalisゲラニル二リン酸
シンターゼタンパク質をコードする、請求項9に記載の単離されたヌクレオチド
配列。 - 【請求項11】 配列番号12に示されるヌクレオチド配列からなる、請求
項10に記載の単離されたヌクレオチド配列。 - 【請求項12】 Perillaゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質を
コードする、請求項1に記載の単離されたヌクレオチド配列。 - 【請求項13】 Perilla frutescensゲラニル二リン酸
シンターゼタンパク質をコードする、請求項12に記載の単離されたヌクレオチ
ド配列。 - 【請求項14】 配列番号10に示されるヌクレオチド配列からなる、請求
項13に記載の単離されたヌクレオチド配列。 - 【請求項15】 単離された組換えゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質
。 - 【請求項16】 請求項15に記載の、単離された組換え被子植物ゲラニル
二リン酸シンターゼタンパク質。 - 【請求項17】 請求項15に記載の、単離された組換え裸子植物ゲラニル
二リン酸シンターゼタンパク質。 - 【請求項18】 請求項15に記載の、単離された組換え精油植物ゲラニル
二リン酸シンターゼタンパク質。 - 【請求項19】 請求項15に記載の、単離された組換えゲラニル二リン酸
シンターゼタンパク質であって、該タンパク質がLamiaceaseファミリ
ーのメンバー中に天然に存在する、単離された組換えゲラニル二リン酸シンター
ゼタンパク質。 - 【請求項20】 請求項15に記載の、単離された組換えMenthaゲラ
ニル二リン酸シンターゼタンパク質。 - 【請求項21】 請求項20に記載の、単離された組換えMentha p
iperitaゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質。 - 【請求項22】 配列番号2、配列番号15および配列番号17のいずれか
1つに示されるアミノ酸配列からなる、単離された組換えMentha pip
eritaゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質。 - 【請求項23】 請求項1〜14のいずれか1つに記載のヌクレオチド配列
を含む、複製可能発現ベクター。 - 【請求項24】 請求項15〜22のいずれか1つに記載のタンパク質をコ
ードするヌクレオチド配列を含む、複製可能発現ベクター。 - 【請求項25】 請求項23または24に記載のベクターを含む、宿主細胞
。 - 【請求項26】 宿主細胞においてゲラニル二リン酸シンターゼの産生を伝
えるかまたは増強する方法であって、該方法は、該宿主細胞において該タンパク
質の発現を可能にする条件下で、請求項23または請求項24に記載の発現ベク
ターを該宿主細胞に導入する工程を包含する、方法。 - 【請求項27】 前記宿主細胞が真核生物細胞である、請求項26に記載の
方法。 - 【請求項28】 前記宿主細胞が植物細胞である、請求項27に記載の方法
。 - 【請求項29】 前記宿主細胞が動物細胞である、請求項27に記載の方法
。 - 【請求項30】 宿主細胞においてゲラニル二リン酸シンターゼの産生を伝
えるかまたは増強する方法であって、該方法は、請求項15、請求項16、請求
項17、請求項18、請求項19、請求項20、請求項21および請求項22の
いずれか1つに記載の単離された組換えタンパク質を該宿主細胞に導入する工程
を包含する、方法。 - 【請求項31】 哺乳動物宿主において癌を処置する方法であって、該方法
は、癌性細胞に、ゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質およびモノテルペンシ
ンターゼタンパク質を導入する工程であって、該モノテルペンシンターゼタンパ
ク質が、ゲラニル二リン酸を抗癌特性を有するモノテルペンに転換し得る、工程
、を包含する方法。 - 【請求項32】 前記ゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質が精油植物種
由来であり、そして前記モノテルペンシンターゼがリモネンシンターゼである、
請求項31に記載の方法。 - 【請求項33】 前記ゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質がMenth
a種由来であり、そして前記モノテルペンシンターゼがリモネンシンターゼであ
る、請求項31に記載の方法。 - 【請求項34】 哺乳動物宿主における癌を処置する方法であって、該方法
は、癌性細胞に、ゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質をコードするヌクレオ
チド配列およびモノテルペンシンターゼタンパク質をコードするヌクレオチド配
列の両方を導入する工程であって、該モノテルペンシンターゼタンパク質が、ゲ
ラニル二リン酸を抗癌特性を有するモノテルペンに変換し得る、工程、を包含す
る方法。 - 【請求項35】 前記ゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質が精油植物種
由来であり、そして前記モノテルペンシンターゼがリモネンシンターゼである、
請求項34に記載の方法。 - 【請求項36】 前記ゲラニル二リン酸シンターゼタンパク質がMenth
a種由来であり、そして前記モノテルペンシンターゼがリモネンシンターゼであ
る、請求項34に記載の方法。 - 【請求項37】 配列番号1に示されるヌクレオチド配列、または配列番号
1に示されるヌクレオチド配列のアンチセンス相補体に、ストリンジェントな条
件下でハイブリダイズし得る、単離されたヌクレオチド配列。
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