JPH09506261A - Bmp−12、bmp−13およびそれらの腱誘導組成物 - Google Patents

Bmp−12、bmp−13およびそれらの腱誘導組成物

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Abstract

(57)【要約】 骨形態形成蛋白BMP−12およびBMP−13をクローンした。腱/靭帯様組織誘導活性を有するこれらの蛋白の組成物を開示する。該組成物は、腱炎または他の腱もしくは靭帯の欠損の治療および関連組織の修復において有用である。

Description

【発明の詳細な説明】 発明の名称 BMP−12、BMP−13およびそれらの腱誘導組成物 関連出願 本願は、1994年3月25日出願の第08/217,780号、1993年1 2月7日出願の第08/164,103号および1994年11月2日出願の0 8/333,576号の一部継続出願である。 発明の分野 本発明は、精製蛋白の新規ファミリー、およびかかる蛋白を含有する組成物に 関し、該組成物は腱/靭帯様組織の形成、傷の治癒および靭帯ならびに他の組織 の修復に有用である。骨形態形成蛋白の活性を増大させるための組成物中にこれ らの蛋白を用いてもよい。 発明の背景 骨、軟骨、腱、および骨ならびに他の組織抽出物に存在する他の組織の形成の に関与する分子の検索は、骨形態形成蛋白(BMPs)と呼ばれる新規なセット の分子の発見につながった。BMP−1ないしBMP−11と命名されたいくつ かの蛋白の構造はすでに調べられている。これらの蛋白のユニークな誘導活性な らびにそれらの骨における存在は、それらが骨修復プロセスにおける重要なレギ ュレーターであり、骨組織の通常の維持に必要とされうるということを示唆する 。他の生組織の形成において役割を果たすさらなる蛋白を同定する必要がある。 本発明は、腱/靭帯様組織誘導活性を有し、腱/靭帯様組織の形成および修復を 誘導するための組成物において有用である蛋白のファミリーの同定に関する。 発明の概要 1の具体例において、本発明は、発明者らがVL−1と命名した腱/靭帯様組 織誘導蛋白をコードするDNA分子からなる。この新規蛋白は、現在BMP−1 2と呼ばれている。さらに本発明は、BMP−12関連蛋白をコードするDNA 分子を包含する。 BMP−12関連蛋白は、BMP−12およびVL−1を含むBMP/TGF −β/Vg−1ファミリーの蛋白の部分集合であり、例えば、厳密性を減じた条 件下で、下記プラーイマー#6および#7のごときBMP−12特異的プライマ ーを用いるPCRを用いてクローン化され同定されるDNA配列によりコードさ れる腱/靭帯様組織誘導蛋白として定義される。BMP−12関連蛋白をコード するDNA配列が、アミノ酸レベルにおいて、配列番号:1のアミノ酸#3から #103までと少なくとも80%の相同性を有することが好ましい。 好ましくは、DNA分子は、配列番号:1に示すBMP−12、またはさらに 本明細書において説明するBMP−12関連蛋白をコードするDNA配列を有す る。BMP−12蛋白およびBMP−12関連蛋白はともに、実施例において説 明するアッセイにおいて腱/靭帯様組織の形成を誘導する能力により特徴づけら れる。 本発明DNA分子は、好ましくは、配列番号:1に記載されたDNA配列、よ り好ましくは、配列番号:1のヌクレオチド#496から#882まで、#57 1から#882までもしくは#577から#882まで;あるいは厳密条件下で 上記のものにハイブリダイゼーションし、腱/靭帯様組織を形成する能力を示す 蛋白をコードしているDNA配列からなる。本発明DNA分子は、配列番号:2 5に記載したDNA配列;より好ましくは配列番号:25のヌクレオチド#60 4もしくは#658から#964までからなっていてもよい。 さらに本発明DNA分子は、配列番号:2または配列番号:26に示すアミノ 酸配列を有するBMP−12関連蛋白をコードするDNA配列、ならびに天然に 存在する対立遺伝子および配列番号:2もしくは配列番号:26の等価な縮重コ ドン配列からなるDNA分子を包含する。好ましくは、本発明DNA配列は、配 列番号:2のアミノ酸#25から#104まで、#1から#104までもしくは #3から#103まで;あるいは配列番号:26のアミノ酸#1から#120ま でもしくは#19から#120までをコードする。DNA配列は、5'から3'方 向において、プロペプチドをコードするヌクレオチド、および配列番号:2のア ミノ酸#25から#104まで、#1から#104までもしくは#3から#10 3まで;あるいは配列番号:26のアミノ酸#1から#120までもしくは#1 9から#120までをコードするヌクレオチドからなっていてもよい。好ましく は、上記具体例において有用なプロペプチドは、ネイティブ(native)なBMP −12プロペプチドおよびTGF−βスーパーファミリーまたはBMPファミリ ーの異なるメンバー由来の蛋白プロペプチドからなる群より選択される。さらに 本発明は、厳密条件下で上記DNA配列にハイブリダイゼーションし、腱/靭帯 様組織を形成する能力を示す蛋白をコードしているDNA配列からなる。 他の具体例において、本発明は、BMP−12蛋白またはBMP−12関連蛋 白をコードしているDNA分子を含んでいる宿主細胞およびベクターからなる。 宿主細胞およびベクターは、さらに発現調節配列に作動可能に結合したコーディ ング配列からなっていてもよい。 もう1つの具体例において、本発明は、精製BMP−12関連蛋白の製造方法 であって、(a)BMP−12関連蛋白をコードするヌクレオチド配列からなる 上記DNA分子またはベクターで形質転換した宿主細胞を培養し;次いで、(b )培地より該BMP−12関連蛋白を回収し精製する工程からなる方法よりなる 。好ましい具体例において、該方法は、(a)配列番号:1に示すヌクレオチド 配列#496、#571もしくは#577から#879もしくは#882まで; あるいは配列番号:25のヌクレオチド配列#604もしくは#658から#9 63までからなるDNA分子で形質転換した細胞を培養し;次いで、 (b)配列番号:2に示すアミノ酸#−25、#1もしくは#3からアミノ酸 #103もしくは104まで;あるいは配列番号:26に示すアミノ酸#1もし くは#19からアミノ酸#120までのアミノ酸配列からなる蛋白を該培地から 回収し精製することからなる。また、本発明は上記方法により製造される精製蛋 白を包含する。 さらに本発明は、腱/靭帯様組織の形成を誘導する能力によって特徴づけられ る精製BMP−12関連蛋白からなる。好ましくは、BMP−12関連蛋白は配 列番号:2に示すアミノ酸配列からなる。好ましくは、ポリペプチドは配列番号 :2に示すアミノ酸−25、#1もしくは#3から#103もしくは#104ま で;あるいは配列番号:26に示すアミノ酸#1もしくは#19から#120ま でからなる。好ましい具体例において、精製ポリペプチドは、それぞれが配列番 号:2のアミノ酸配列とともに形成される、2つのサブユニットからなるダイマ ーの形態であってもよい。 もう1つの具体例において、本発明は、有効量の上記BMP−12関連蛋白か らなる組成物よりなる。該組成物において蛋白は医薬上許容される担体と混合さ れていてもよい。 また、本発明は、腱炎、または他の腱もしくは靭帯の欠損の治療のための、お よび腱/靭帯様組織の形成を必要とする患者における腱/靭帯様組織の形成のた めの、腱/靭帯様組織の治癒および組織の修復方法であって、該患者に有効量の 上記組成物を投与することからなる方法を包含する。 他の具体例は、BMP−12をコードするDNA配列に正しい読み取り枠で結 合したTGF−βスーパーファミリーのメンバー由来のプロペプチドをコードし ているDNA配列からなるキメラDNA分子を包含する。1の適当なプロペプチ ドはBMP−2由来のプロペプチドである。また、本発明は、配列番号:2に示 すアミノ酸配列有する1のモノマー、およびTGF−βサブファミリーの別の蛋 白のアミノ酸配列を有する1のモノマーからなるヘテロダイマー蛋白分子を包含 する。 最後に、本発明は、腱/靭帯様組織の形成を必要とする患者における腱/靭帯 様組織の形成の誘導方法であって、腱/靭帯様組織の形成を誘導する能力を示す 蛋白であって配列番号:2または配列番号:4または配列番号:26に示すアミ ノ酸配列を有する蛋白からなる有効量の組成物を該患者に投与することからなる 方法よりなる。より好ましくは、アミノ酸配列は、(a)配列番号:2のアミノ 酸#25、#1もしくは#3から#103もしくは#104;(b)配列番号: 4のアミノ酸#1もしくは#19から#120まで;(c)配列番号:26のア ミノ酸#1もしくは#19から#119もしくは#120まで;(d)腱/靭帯 形成能を示す(a)、(b)または(c)の変異体および/または変種のうちの 1つである。上記方法の他の具体例において、蛋白は、配列番号:1、配列番号 :3または配列番号:25のDNA配列によりコードされ、より好ましくは、( a)配列番号:1のヌクレオチド#496、#571もしくは#577から#8 79もしくは#882まで;(b)配列番号:3のヌクレオチド#845もしく は#899から#1201もしくは#1204まで;(c)配列番号:25のヌ クレオチド#605もしくは#659から#961もしくは#964まで;およ び(d)厳密条件下で(a)または(b)とハイブリダイゼーションし、腱/靭 帯様組織の形成能を示す蛋白をコードしている配列のうちの1つによりコードさ れる。配列の説明 配列番号:1はヒト・BMP−12をコードするヌクレオチド配列である。 配列番号:2は成熟ヒト・BMP−12ポリペプチドからなるアミノ酸配列で ある。 配列番号:3は蛋白MP52をコードするヌクレオチド配列である。 配列番号:4は成熟MP52ポリペプチドからなるアミノ酸配列である。 配列番号:5はヒト・BMP−12をコードする配列の特異的に増幅された部 分のヌクレオチド配列である。 配列番号:6は配列番号:5のヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸 配列である。 配列番号:7はヒト・VL−1をコードする配列の特異的に増幅された部分の ヌクレオチド配列である。 配列番号:8は配列番号:7のヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸 配列である。 配列番号:9はイー・コリにおけるBMP−12の発現に使用されるプラスミ ドpALV1−781のヌクレオチド配列である。 配列番号:10はネズミ・クローンmV1のフラグメントのヌクレオチド配列 である。 配列番号:11はmV1によりコードされるネズミ・蛋白のフラグメントのア ミノ酸配列である。 配列番号:12はネズミ・クローンmV2のフラグメントのヌクレオチド配列 である。 配列番号:13はmV2によりコードされるネズミ・蛋白のフラグメントのア ミノ酸配列である。 配列番号:14はネズミ・クローンmV9のフラグメントのヌクレオチド配列 である。 配列番号:15はmV9によりコードされるネズミ・蛋白のフラグメントのア ミノ酸配列である。 配列番号:16はBMP/TGF−β/Vg−1蛋白のコンセンサス配列のア ミノ酸配列である。最初のXaaはGlnまたはAsnのいずれかを示し;2番 目のXaaはValまたはIleのいずれかを表す。 配列番号:17はオリゴヌクレオチド#1のヌクレオチド配列である。 配列番号:18はBMP/TGF−β/Vg−1蛋白のコンセンサス配列のア ミノ酸配列である。XaaはValまたはLeuのいずれかを示す。 配列番号:19はオリゴヌクレオチド#2のヌクレオチド配列である。 配列番号:20はオリゴヌクレオチド#3のヌクレオチド配列である。 配列番号:21はオリゴヌクレオチド#4のヌクレオチド配列である。 配列番号:22はオリゴヌクレオチド#5のヌクレオチド配列である。 配列番号:23はオリゴヌクレオチド#6のヌクレオチド配列である。 配列番号:24はオリゴヌクレオチド#7のヌクレオチド配列である。 配列番号:25はヒト・VL−1(BMP−13)をコードする配列のヌクレ オチド配列である。 配列番号:26は配列番号:25のヌクレオチド配列によりコードされるアミ ノ酸配列である。 配列番号:27はBMP−1プロペプチドとBMP−12の成熟コーディング 配列との融合物をコードするヌクレオチド配列ある。 配列番号:28は配列番号:27のヌクレオチド配列によりコードされるアミ ノ酸配列である。 配列番号:29はネズミ・mV1蛋白をコードするヌクレオチド配列である。 X01はVal、Ala、GluまたはGly;X02はSer、Pro、Th rまたはAla;X03はSerまたはArg;X04はLeu、Pro、Gl nまたはArg;X05はCysまたはTrp;X06はVal、Ala、As pまたはGly;X07はVal、Ala、GluまたはGly;X08はGl n、LysまたはGluである。 配列番号:30は配列番号:29のヌクレオチド配列によりコードされるアミ ノ酸配列である。 配列番号:31はネズミ・mV2蛋白をコードするヌクレオチド配列である。 X01はProまたはThr;X02はValである。 配列番号:32は配列番号:31のヌクレオチド配列によりコードされるアミ ノ酸配列である。X01およびX02は配列番号:31と同じである。 配列番号:33はヒト・BMP−12蛋白をコードするヌクレオチド配列であ る。 配列番号:34は配列番号:33のヌクレオチド配列によりコードされるアミ ノ酸配列である。 配列番号:35はオリゴヌクレオチド#8のヌクレオチド配列である。図面の簡単な説明 図1はヒト・BMP−12とヒト・MP52配列の比較である。発明の詳細な説明 本発明DNA配列は、さらに後に説明するように、腱/靭帯様組織の形成を誘 導する蛋白の製造にとり有用である。さらに本発明DNA配列は、同様の活性を 有するBMP−12関連蛋白をコードするさらなるDNA配列の単位およびクロ ーニングにとり有用である。これらのBMP−12関連蛋白は他の種由来の同族 体であってもよく、あるいは同一種内の関連蛋白であってもよい。 さらに、本発明のさらなる態様は、腱/靭帯様組織誘導蛋白の発現をコードす るDNA配列である。かかる配列は、配列番号:1または配列番号:25に示す 5'から3'の方向のヌクレオチド配列、遺伝コードの縮重を除いては配列番号: 1または配列番号:25と同じであって配列番号:2または配列番号:26の蛋 白をコードしているDNA配列を包含する。さらに、厳密条件下で配列番号:1 または配列番号:25とハイブリダイゼーションし、腱または靭帯の形成を誘導 する能力を有する蛋白をコードしているDNA配列は本発明に包含される。好ま しいDNA配列は、マニアティス(Maniatis)ら,モレキュラー・クローニング (ア・ラボラトリー・マニュアル)(Molecular Cloning(A Laboratory Manual)) ,コールド・スプリング・ハーバー・ラボラトリー(Cold Spring Harbor Labora tory)(1982年),387〜389頁に記載の厳密条件下でハイブリダイゼ ーションするものを包含する。結局、配列番号:1または25の配列の対立遺伝 子または他の変種は、かかるヌクレオチド変化がペプチド配列の変化を引き起こ しても、引き起こさなくても、そのペプチド配列がやはり腱/靭帯様組織誘導活 性を有する場合には本発明に包含される。 ヒト・BMP−12のDNA配列(配列番号:1)およびアミノ酸配列(配列 番号:2)を配列表に示す。本発明組成物および方法にとり有用な別の蛋白はV L−1である。VL−1は、BMP−12由来の配列を用いてクローン化された BMP−12関連蛋白である。本発明者らはここにVL−1をBMP−13と命 名した。VL−1の部分DNA配列(配列番号:7)およびコードされるアミノ 酸配列(配列番号:8);ならびに成熟VL−1をコードするDNA配列(配列 番号:25)およびコードされるアミノ酸配列(配列番号:26)を配列表に示 す。配列番号:1および2のBMP−12配列に関してさらなる説明をするが、 本発明は、配列番号:25および26に示すVL−1配列のごとき他のBMP− 12関連配列について行われてもよい同様の改変および改良を包含することが認 識されよう。 配列番号:1に示すBMP−12配列は、全成熟配列およびプロペプチドの約 190個のアミノ酸を含む。成熟ヒト・BMP−12蛋白のコーディング配列は 配列番号:1のヌクレオチド#496または#571から開始してヌクレオチド #882まで続くと思われる。TGF−β蛋白に特徴的な7個のシステインの構 造のうち最初のシステインは#577において始まる。最後のシステインは#8 79において終了する。よって、活性BMP−12種をコードするDNA配列は 配列番号:1のヌクレオチド#577から#879までからなるであろうと考え られる。 CHO細胞のごとき哺乳動物細胞により発現されるようなBMP−12は、異 なるN末端を有するBMP−12蛋白の活性種の異種集団として存在すると考え られる。すべての活性種は、配列番号:2のアミノ酸#3におけるシステイン残 基から始まりアミノ酸103における最後のシステイン残基もしくはアミノ酸1 04以降のストップコドンまで続くアミノ酸配列を含む。他の活性種は、N末端 方向におけるさらなるアミノ酸を含む。さらに本明細書に記載したように、哺乳 動物細胞により産生される活性種のN末端は、ペプチド配列Arg−X−X−A rgをコードしているコンセンサス開裂部位の後ろから始まると考えられる。よ って、活性BMP−12蛋白をコードするDNA配列は、配列番号:1のヌクレ オチド#196、199、208、217、361、388、493、496も しくは571からヌクレオチド#879もしくは#882までのいずれかにおい て開始するヌクレオチド配列からなるヌクレオチド配列を有しているであろうと 考えられる。 ヒト・BMP−12の1の活性種のN末端を、イー・コリ(E.coli)における 発現により実験的に決定したところ、以下のようであった:[M]SRXSRKP LHVDF(ここにXは明確でないシグナルのアミノ酸残基を示し、その位置の システイン残基と矛盾しない)。よって、このBMP−12種のN末端は配列番 号:1のアミノ酸#1におけるものであり、該BMP−12種をコードするDN A配列は配列番号:1のヌクレオチド#571において開始するであろうと 思われる。このヒト・BMP−12種のダイマーの見かけの分子量をSDS−P AGEにより決定したところ、ノベックス(Novex)16%トリシンゲル上で約 20〜22kdであった。ヒト・BMP−12蛋白は、0.1%トリフルオロ酢 酸中で無色透明溶液として存在する。 先に説明したように、BMP−12関連蛋白は蛋白のBMP/TGF−β/V g−1ファミリーの部分集合であり、例えば、厳密性を減じた条件下で下記プラ イマー#6および#7のごときBMP−12特異的プライマーを用いるPCRを 用いてクローン化され同定されうるDNA配列によりコードされる腱/靭帯様組 織誘導蛋白として定義されうる。本発明DNA配列が、アミノ酸レベルにおいて 、配列番号:1のアミノ酸#3から#103までをコードするDNAに関して少 なくとも80%の相同性を有することが好ましい。本発明の目的からすると、用 語BMP−12関連蛋白はヒト・MP52蛋白を包含しない。配列番号:1およ び配列番号:3の配列の情報および図1に示す比較を用いると、BMP−12関 連蛋白をコードする遺伝子のクローニングを可能にするBMP−12配列に対す るプライマーを設計することは当業者の範囲内である。 本発明BMP−12関連蛋白の一例は、現在BMP−13と呼ばれるVL−1 である。全成熟BMP−13の配列およびBMP−13のプロペプチドの少なく とも一部の配列を配列番号:25に示す。BMP−12と同様、CHO細胞のご とき哺乳動物細胞により発現されるようなBMP−13は、異なるN末端を有す るBMP−13蛋白の活性種の異種集団として存在すると考えられる。すべての 活性種は、配列番号:26のアミノ酸#19におけるシステイン残基から始まり アミノ酸119における最後のシステイン残基もしくはアミノ酸120以降のス トップコドンまで続くアミノ酸配列を含む。他の活性種は、N末端方向における さらなるアミノ酸を含む。さらに本明細書に記載したように、哺乳動物細胞によ り産生される活性種のN末端は、ペプチド配列Arg−X−X−Argをコード しているコンセンサス開裂部位の後ろから始まると考えられる。よって、活性B MP−13蛋白をコードするDNA配列は、配列番号:25のヌクレオチド#4 10、458、602、605もしくは659からヌクレオチド#961も しくは#964までのいずれかにおいて開始するヌクレオチド配列からなるヌク レオチド配列を有しているであろうと考えられる。 本発明において有用な精製腱/靭帯様組織誘導蛋白を製造するためには、適当 なコーディング配列、特に配列番号:1のヌクレオチド#496、#571もし くは#577から#879もしくは#882までの配列をコードするDNAから なるDNA配列で形質転換された宿主細胞を培養し;次いで、配列番号:2のア ミノ酸#−25、#1もしくは#3から#103もしくは#104までにより表 される配列のアミノ酸配列または実質的にこれと相同的な配列を含む蛋白を培地 から回収し精製することからなる方法を用いる。もう1つの具体例において、該 方法は、適当なコーディング配列、特に配列番号:25のヌクレオチド#605 もしくは#659から#961もしくは#964までの配列をコードするDNA からなるDNA配列で形質転換された宿主細胞を培養し;次いで、配列番号:2 6のアミノ酸#1もしくは#19から#119もしくは#120までにより表さ れる配列のアミノ酸配列または実質的にこれと相同的な配列を含む蛋白を培地か ら回収し精製することからなる。 ヒト・MP52のDNAはWO93/16099に記載されており、その開示 を参照により本明細書に取り入れる。しかしながら、この文書は該蛋白の腱/靭 帯様組織形成能、または腱/靭帯様組織誘導のための組成物におけるその使用を 開示していない。もともと、ヒト・MP52はヒト・胚組織由来のRNAを用い て単離された。ヒト・MP52ヌクレオチド配列(配列番号:3)およびコード されるアミノ酸配列(配列番号:4)を配列表に示す。MP52蛋白は配列番号 :3のヌクレオチド#845から始まり配列番号:3のヌクレオチド#1204 をまで続くと思われる。TGF−β蛋白に特徴的な7個のシステインの構造のう ち最初のシステインは#899において始まる。最後のシステインは#1201 において終了する。MP52蛋白の他の活性種は配列番号:3のヌクレオチド# 845からN末端方向においてさらなるヌクレオチドを有していてもよい。 本発明精製ヒト・MP52蛋白は、配列番号:3のヌクレオチド#845から #1204までの配列をコードするDNAからなるDNA配列で形質転換された 宿主細胞を培養し;次いで、配列番号:4のアミノ酸#1から#120までによ り表される配列のアミノ酸配列または実質的にこれと相同的な配列を含む蛋白を 培地から回収し精製することにより製造されうる。さらに配列番号:4のアミノ 酸#17もしくは#19から#119もしくは#120までのアミノ酸配列は活 性を保持しているであろうと考えられる。よって、ヌクレオチド#845、#8 93もしくは#899から#1201もしくは#1204までのDNA配列は活 性蛋白をコードすると考えられる。 哺乳動物宿主細胞における蛋白発現のためには、成熟蛋白に関するコーディン グ配列に正しい読み取り枠において結合している、宿主細胞による蛋白分泌に適 するプロペプチドをコードするコーディング配列で宿主細胞を形質転換する。例 えば、BMP−2以外の哺乳動物蛋白の前駆体部分をコードするDNAが成熟B MP−2蛋白をコードするDNAに融合されている米国特許第5,168,05 0号参照(その開示を参照により本明細書に取り入れる)。よって、本発明は、 腱/靭帯様組織誘導ポリペプチドをコードするDNA配列に正しい読み取り枠に おいて結合している、蛋白のTGF−βスーパーファミリーのメンバー由来のプ ロペプチドをコードするDNA配列からなるキメラDNA分子を包含する。用語 「キメラ」は、プロペプチドが、コードされる成熟ポリペプチド以外の異なるポ リペプチドに由来することを意味するために用いられる。もちろん、配列番号: 2、配列番号:4または配列番号:26に示す成熟蛋白をコードしているコーデ ィング配列に正しい読み取り枠において結合しているネイティブなプロペプチド をコードする配列をコードしているDNA配列を用いて宿主細胞を形質転換して もよい。ネイティブなプロペプチドの全配列を、当該分野において知られた方法 により、配列番号:1、配列番号:3または配列番号:25に開示された配列を 用いて決定して、クローン全体を同定し単離するのに適したプローブを設計して もよい。 また本発明は、他の蛋白性物質をコードしているDNA配列が結合しておらず 、蛋白を含む腱/靭帯様組織の発現をコードしている新規DNA配列を包含する 。これらのDNA配列は、配列番号:1に示す5'から3'方向の配列、および厳 密 条件下[例えば、65℃において、0.1X SSC、0.1% SDS;ティ ー・マニアティスら,モレキュラー・クローニング(ア・ラボラトリーマニュア ル),コールド・スプリング・ハーバー・ラボラトリー(1982年),387 〜389頁参照]においてそれにハイブリダイゼーションし、腱/靭帯様組織誘 導活性を有する蛋白をコードしている配列を包含する。 同様に、配列番号:1または配列番号:25の配列によりコードされる蛋白、 あるいは配列番号:2または配列番号:26のアミノ酸配列からなる蛋白をコー ドするが、遺伝コードの縮重または対立遺伝子変異(アミノ酸変化を引き起こし ても、引き起こさなくてもよい種の集団における天然に存在する塩基変化)のた めにコドン配列が異なっているDNA配列も、本明細書記載の腱/靭帯様組織誘 導蛋白をコードする。コードされるポリペプチドの活性、半減期または生産を増 大させるために点突然変異または誘導された修飾(挿入、欠失、および置換を含 む)により生じた配列番号:1または配列番号:25のDNA配列のバリエーシ ョンも、本発明に包含される。 本発明のもう1つの態様は、腱/靭帯様組織誘導蛋白の新規製造方法を提供す る。本発明方法は、調節配列の調節下にある本発明蛋白をコードしているDNA 配列で形質転換された適当な細胞系を培養しすることからなる。形質転換された 宿主細胞を培養し、培地から蛋白を回収し精製する。精製蛋白は、同時生成され る他の蛋白ならびに他の汚染物質を実質的に含まない。 適当な細胞または細胞系は、チャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO)のご とき哺乳動物細胞であってもよい。上記のごとく、哺乳動物細胞における蛋白発 現は蛋白の分泌を保証する適当なプロペプチドを必要とする。適当な哺乳動物宿 主細胞および形質転換、培養、増幅、スクリーニング、生成物の生産および精製 のための方法は当該分野において知られている。例えば、ゲシング(Gething) およびサムブルック(Sambrook),ネイチャー(Nature),第293巻:620 〜625頁(1981年)、あるいは、例えば、カウフマン(Kaufman)ら,モ レキュラー・アンド・セルラー・バイオロジー(Moll.Cell.Biol.),第5巻( 7):1750〜1759頁(1985年)またはホウリー(Howley)ら,米国 特許第 4,419,446号参照。付記した実施例において説明されるもう1つの適当な 哺乳動物細胞系はサル・COS−1細胞系である。哺乳動物細胞CV−1も適当 である。 細菌細胞も適当な宿主でありうる。例えば、種々のイー・コリ(E.coli)株( 例えば、HB101、MC1061)はバイオテクノロジーの分野において宿主 細胞としてよく知られている。ビー・スブチリス(B.subtilis)、シュードモナ ス(Pseudomonas)、他の枯草菌等を本発明方法に用いてもよい。細菌細胞にお いて蛋白を発現させるには、プロペプチドをコードするDNAは必要ない。 TGF−βファミリーを含む哺乳動物細胞の細菌での発現は、グリコシレーシ ョンされていない形態、および封入体として知られる不溶性ペレット形態の蛋白 を生じることが知られている。これらの封入体を可溶化し、カオトロピック(ch aotropic)試薬を用いて蛋白を変性させ、次いで、その可溶性形態を製造するた めに十分に正しく再生させるための方法は、当該分野において記載されている。 例えば、EP0433225(参照によりその開示を本明細書に取り入れる)参 照。 別法として、所望蛋白が融合パートーを伴った融合蛋白として発現される、遺 伝子融合蛋白の発現のごとき封入体形成を回避する方法が工夫されてきた。融合 蛋白は、後で開裂されて所望蛋白を生じる。イー・コリに関するかかる遺伝子融 合発現系の一例は、融合パートナーとしてのイー・コリ・チオレドキシン遺伝子 の使用に基づいている。ラバリエ(LaVallie)ら,バイオ/テクノロジー(Bio/ Technology)第11巻:187〜193頁(1993年)(その開示を参照によ り本明細書に取り入れる)。 当業者に知られた酵母細胞の多くの株も、本発明ポリペプチド発現のための宿 主細胞として使用されうる。さらに、所望ならば、本発明方法における宿主細胞 として昆虫細胞を用いてもよい。例えば、ミラー(Miller)ら,ジェネティック ・エンジニアリング(Genetic Engineering)第8巻:277〜298頁(プレ ナム・プレス(Plenum Press,1986年)およびそこに引用された文献参照。 本発明のもう1つの態様は、これらの腱/靭帯様組織誘導蛋白の発現方法に用 いるベクターを提供する。好ましくは、ベクターは、本発明新規因子をコードす る上記新規DNAの全配列を含んでいる。別法として、上記修飾配列を含んでい るベクターも本発明の具体例である。さらに、配列番号:1または配列番号:3 または配列番号:25の配列を操作して、プロペプチド配列を欠失させ、それら をBMP蛋白もしくはTGF−βスーパーファミリーのメンバーをコードする配 列と置換することにより成熟蛋白を発現させることができよう。よって、本発明 は、配列番号:2または配列番号:4または配列番号:26のアミノ酸配列を有 する蛋白をコードするDNA配列に正しい読み取り枠において結合しているTG F−βスーパーファミリーのメンバー由来のプロペプチドをコードしているキメ ラDNA分子を包含する。該ベクターを細胞系の形質転換法に用いてもよく、該 ベクターは、選択宿主中で複製および発現を指令しうる本発明DNAコーディン グ配列に作動可能に結合した選択調節配列を含んでいる。かかるベクター用の調 節配列は当業者に知られており、宿主細胞に応じて選択することができる。かか る選択は日常的なものであり、本発明の一部を形成しない。 組織が不正常に形成されている環境において腱/靭帯様組織または他の組織の 形成を誘導する本発明蛋白は、ヒトおよび他の動物における腱または靭帯の裂傷 、形成不全および他の腱または靭帯の損傷の治療に応用される。腱/靭帯様組織 誘導蛋白を用いるかかる標品は、腱または靭帯に対するダメージの防止における 予防的用途、ならびに骨または他の組織への腱または靭帯の改善された固定およ び腱または靭帯組織に対する損傷の修復における用途を有しうる。本発明組成物 により誘導されるデノボ(De novo)腱/靭帯様組織形成は、先天的な、外傷に より誘発される、あるいは別の原因による腱または靭帯の損傷の修復に貢献し、 さらに、腱または靭帯を付着または修復させるための整形外科手術にも有用であ る。また、本発明組成物は、腱炎、手根骨トンネル症候群および他の腱または靭 帯の損傷の治療においても有用でありうる。また、本発明組成物を、腱および/ または靭帯組織を治療または再生することが必要な他の徴候に使用することもで きる。かかる徴候は、腱炎において発生するような歯根膜に対する損傷の再生お よび修復、および骨に対する腱の付着の再生および修復を包含するが、これらに 限定さ れない。本発明組成物は、腱または靭帯形成細胞を引き寄せ、腱または靭帯形成 細胞の増殖を刺激し、あるいは腱または靭帯形成細胞前駆細胞の分化を誘導する ための環境を提供しうる。 BMP−12関連蛋白を培地から回収し、同時生成される他の蛋白性物質およ び存在する他の汚染物質から単離することによりそれらを精製することができる 。本発明蛋白は腱/靭帯様組織の形成能がある。後に説明するラット・異所性移 植物アッセイにおける腱/靭帯様組織形成を示す能力によりこれらの蛋白をさら に特徴づけてもよい。これらの蛋白は、さらに、靭帯のごとき他のタイプの組織 の形成を誘導する能力を有するかもしれないと考えられる。 さらに本発明により提供される腱/靭帯様組織誘導蛋白は、配列番号:1また は配列番号:25の配列と類似の配列によりコードされる因子であるが、その中 において修飾が本来的になされている(例えば、ポリペプチドのアミノ酸変換を 生じても生じなくてもよいヌクレオチド配列における対立遺伝子変異)かまたは 計画的になされている因子を包含する。例えば、合成ポリペプチが配列番号:2 のアミノ酸残基の連続した配列の全体または一部を複製したものであってもよい 。これらの配列は、1次、2次または3次構造およびコンホーメーション的特徴 を配列番号:2の腱/靭帯様組織成長因子ポリペプチドと共有することによって 、それらに共通した腱/靭帯様組織または他の組織成長因子の生物学的特性を有 しうる。よって、天然に存在する腱/靭帯様組織誘導ポリペプチドの生物学的に 活性のある代替物としてそれらを治療組成物および治療プロセスにおいて使用し てもよい。 本明細書記載の腱/靭帯様組織誘導蛋白の配列の他の特異的な変異は、グリコ シレーション部位の修飾を包含する。これらの修飾はO−結合またはN−結合グ リコシレーション部位を包含しうる。例えば、グリコシレーションの不存在また は部分的にのみされたグリコシレーションは、アスパラギン結合グリコシレーシ ョン認識部位におけるアミノ酸置換または欠失から起こる。アスパラギン結合グ リコシレーション認識部位は、適当な細胞のグリコシレーション酵素により特異 的に認識されるトリペプチド配列からなる。これらのトリペプチド配列は、アス パ ラギン−X−スレオニン、アスパラギン−X−セリンまたはアスパラギン−X− システイン(ここに、通常には、Xはプロリン以外のいずれかのアミノ酸)であ ってよい。グリコシレーション認識部位の第1または第3のアミノ酸位置におけ る種々のアミノ酸置換または欠失(および/または第2の位置におけるアミノ酸 欠失)は修飾されたトリペプチド配列における非グリコシレーションを引き起こ す。さらに、蛋白の細菌による発現も、グリコシレーレョンされていない蛋白の 生産を引き起こすであろう。 本発明組成物は、配列番号:1または配列番号:25のDNA配列で形質転換 された細胞を培養し、次いで、配列番号:2または配列番号:26のアミノ酸配 列を有する蛋白を培地から回収し精製することにより製造される精製BMP−1 2関連蛋白からなる。精製された発現蛋白は、同時生成される蛋白性物質、なら びに他の汚染物質を実質的に含まない。回収された精製蛋白は腱/靭帯様組織形 成活性、および靭帯再生のごとき他の組織の成長活性を示すと考えられる。後に 説明するラットにおけるアッセにおける腱/靭帯様組織形成活性を示す能力によ り本発明蛋白をさらに特徴づけてもよい。 腱/靭帯様組織形成を誘導するための本発明組成物は有効量の膿/靭帯様組織 誘導蛋白からなっていてもよく、該蛋白は、配列番号:2、好ましくは、配列番 号:2のアミノ酸−#25、#1もしくは#3から#103もしくは#104; あるいは配列番号:26のアミノ酸#1もしくは#19から#120まで;なら びに腱および/または靭帯様組織の形成能を示す配列番号:2または配列番号: 26の変異体および/または変種からなる。 さらに、発明組成物は、アクチビンのごとき、蛋白のTGF−βスーパーファ ミリーのさらなるメンバーのごときさらなる蛋白からなっていてもよい。本発明 のもう1つの態様は、医薬上許容される賦形剤または担体中の、BMP−12ま たはVL−1のごとき治療上有効量の腱/靭帯誘導蛋白を含有する医薬組成物を 提供する。これらの組成物を用いて腱/靭帯様組織または他の組織の形成を誘導 してもよい。腱および靭帯の修復、傷の治療および皮膚の修復のごとき他の組織 の修復のためにかかる組成物を用いてもよいと考えられる。本発明蛋白は神経の 生存を増加させ、それゆえ、移植および神経の生存の減少を示す症状の治療に有 用でありうるとさらに考えられる。さらに本発明組成物は、米国特許第5,10 8,922号、第5,013,649号、第5,116,738号、第5,106,7 48号、第5,187,076号、および第5,141,905号に開示されたBM P−1、BMP−2、BMP−3、BMP−4、BMP−5、BMP−6および BMP−7;PCT出願WO91/18098に開示のBMP−8;PCT出願 WO93/00432に開示のBMP−9;および1993年5月12に出願の 同時係属特許出願第08/061,695号と第08/061,464号に開示の BMP−10またはBMP−11のごとき少なくとも1種の他の治療上有用な薬 剤を含有していてもよい。上記文書の開示を参照により本明細書に取り入れる。 本発明組成物は、BMP−12またはVL−1(BMP−13)のごとき腱/ 靭帯誘導蛋白のほかに、MP52、表皮増殖因子(EGF)、線維芽細胞増殖因 子(FGF)、血小板由来増殖因子(PDGF)、形質転換増殖因子(TGF− αおよびTGF−β)、および線維芽細胞増殖因子−4(FGF−4)、甲状腺 ホルモン(PTH)、白血球阻害因子(LIF/HILDA/DIA)、インス リン様増殖因子(IGF−IおよびIGF−II)を包含する他の治療上有用な薬 剤からなっていてもよい。これらの薬剤の一部を本発明組成物に使用してもよい 。例えば、一緒に移植されたBMP−2およびBMP−12の両方からなる組成 物は、骨および腱/靭帯様組織を生じさせる。隣接した解剖学的位置において腱 、靭帯、および骨が同時に形成される胚関節の損傷の治療にかかる組成物を用い てもよく、さらに該組成物は、骨への腱付着部位における組織の再生に有用であ りうる。皮膚の治療および関連組織の修復のごとき傷の治療に本発明組成物を用 いてもよいと考えられる。傷のタイプは、熱傷、切り傷および潰瘍を包含するが 、これらに限定されない(傷の治療および関連組織の修復に関しては、例えばP CT出願WO84/01106号参照)。 本発明蛋白は他の関連蛋白および増殖因子と協奏して、あるいはおそらく相乗 的に作用しうると考えられる。それゆえ、本発明のさらなる治療方法および組成 物は、治療量の少なくとも1種の上記BMP蛋白を伴った治療量の少なくとも1 種の本発明蛋白からなる。かかる組成物は、個々のBMP蛋白分子あるいは異な るBMP部分からなるヘテロダイマーからなっていてもよい。例えば、本発明方 法および組成物は、BMP−12関連蛋白のサブユニットと上記「BMP」蛋白 のうちの1つ由来のサブユニットからなるジスルフィド結合したダイマーからな っていてもよい。よって、本発明は、1のサブユニットが配列番号:2のアミノ 酸#1からアミノ酸#104までのアミノ酸配列からなり、もう1つのサブユニ ットがBMP−1、BMP−2、BMP−3、BMP−4、BMP−5、BMP −6、BMP−7、BMP−8、BMP−9、BMP−10およびBMP−11 からなる群より選択される骨形態形成蛋白に関するアミノ酸配列からなるヘテロ ダイマーである精製BMP−12関連ポリペプチドよりなる組成物を包含する。 さらなる具体例は、ジスルフィド結合したBMP−12、VL−1(BMP−1 3)またはMP52のごとき腱/靭帯様組織誘導部分からなるヘテロダイマーよ りなっていてもよい。例えば、ヘテロダイマーは、配列番号:2の#1から#1 04までのアミノ酸配列からなる1のサブユニットおよび配列番号:4の#1か ら#120までもしくは配列番号:26の#1から#120までのアミノ酸配列 からなるもう1つのサブユニットからなっていてもよい。さらに、本発明組成物 は、問題となる組織の損傷、傷害の治療に有益な他の薬剤を配合されていてもよ い。 pH、等張性、安定性等を考慮した、かかる生理学的に許容される蛋白組成物 の調製および処方は当業者の範囲内である。また、目下のところ、治療組成物は 、TGF−β蛋白における種特異性の欠如のため、獣医用途にも価値がある。特 に、ヒトのほかに家畜およびサラブレッドの馬は本発明組成物でのかかる治療の ための望ましい対象である。 治療方法は、組成物を局所的に、全身的に、あるいはインプラントまたはデバ イスのように局部的に投与することを包含する。投与する場合、本発明に使用す る治療組成物は、もちろん、パイロジェン不含の、生理学的に許容される形態で ある。さらに、望ましくは、組成物をカプセル封入するかまたは組織ダメージ部 位への送達用の粘性のある形態で注射してもよい。別法として、あるいはさらに 、 所望により上記組成物に含有されていてもよい蛋白以外の治療上有用な薬剤を、 本発明方法において組成物と同時にあるいは順次投与してもよい。 組成物は適当なマトリックスおよび/または隔離剤(sequestering agent)を 担体として含んでいてもよい。例えば、マトリックスが組成物を支持し、あるい は腱/靭帯様組織形成および/または他の組織の形成のための表面を提供するも のであってもよい。マトリックスが、蛋白および/またはその提供に適した環境 をゆっくりと提供するものであってもよい。キレート剤は、注射または他の手段 による投与を容易にすることにおいて助けとなる物質であってもよく、あるいは 適用部位から蛋白がゆっくりと移動するようにするものであってもよい。 担体材料の選択は、生体適合性、生分解性、機械的特性、美容上の外観および 界面の性質による。組成物の特別な適用は適切な処方を決定するであろう。組成 物に適しうるマトリックスは生分解性で化学的に定義されたものであってもよい 。さらなるマトリックスは純粋蛋白または細胞外マトリックス成分からなる。他 の使用可能なマトリックスは非生分解性で化学的に定義されているものである。 好ましいマトリックスは、ヘリスタット(HelistatR)スポンジ(ニュージャー ジー州プレインズボロのインテグラ・ライフサイエンシズ(Integra LifeScienc es)社製)のごときコラーゲンに基づく材料、または注射可能な形態のコラーゲ ン、ならびに隔離剤を包含するが、それらはやはり生分解性であってもよく、ア ルキルセルロース性材料を包含してもよい。 もう1つの好ましいクラスの担体は多孔性粒子ポリマーマトリックスであり、 ポリ(乳酸)のポリマー、ポリ(グリコール酸)のポリマーおよび乳酸とグリコ ール酸のコポリマーを包含する。さらにこれらのマトリックスが隔離剤を含有し ていもよい。適当なポリマーマトリックスは、例えば、WO93/00050( 参照により本明細書に取り入れる)に記載されている。 隔離剤の好ましいファミリーはアルキルセルロース(ヒドロキシアルキルセル ロースを包含する)のごときセルロース性材料であり、メチルセルロース、エチ ルセルロース、ヒドロキシエチルセルロース、ヒドロキシプロピルセルロース、 ヒドロキシプロピルメチルセルロース、およびカルボキシメチルセルロースを包 含し、カルボキシメチルセルロース(CMC)のカチオン塩が最も好ましい。他 の好ましい隔離剤は、ヒアルロン酸、アルギン酸ナトリウム、ポリ(エチレング リコール)、ポリオキシエチレンオキシド、カルボキシビニルポリマーおよびポ リ(ビニルアルコール)を包含する。本発明に有用な隔離剤の量は、処方重量全 体に対して0.5〜20重量%、好ましくは1〜10重量%であり、ポリマーマ トリックスからの蛋白の脱落を防止し、組成物に適当な扱いやすさを与えるのに 必要な量を提供するが、前駆細胞のマトリックスへの浸潤を妨げるような多量で あってはならず、それゆえ、前駆細胞の活性を援助する機会を蛋白に付与する量 である。 本願の実施において有用なさらなる任意成分は、例えば、マンニトール、シュ クロース、ラクトース、グルコースもしくはグリシンのごとき低温性保護剤(凍 結乾燥の間の分解から蛋白を保護する)、メチルパラベンならびにプロピルパラ ベンおよびベンジルアルコールのごとき抗菌保存料、EDTA、クエン酸および BHT(ブチル化されたヒドロキシトルエン)のごとき抗酸化剤、およびポリ( ソルベート)ならびにポリ(オキシエチレン)のごとき界面活性剤等を包含する 。 上記のごとく、本発明組成物を、腱または靭帯がダメージを受けている部分に おける腱/靭帯様組織の再生のごとき多くの腱損傷に用いて、腱組織の裂傷およ び種々のタイプの組織損傷もしくは傷害の修復を行ってもよい。本発明によれば 、これらの方法は、かかる腱/靭帯様組織または他の組織の修復を必要とする患 者に、配列番号:2、配列番号:4および/または配列番号:26に記載された ような有効量の腱/靭帯様組織誘導蛋白からなる組成物を投与することからなる 。また、これらの方法は少なくとも1種の上記BMP蛋白と混合された腱/靭帯 様組織誘導蛋白の投与からなっていてもよい。 もう1つの具体例において、該方法は、1のモノマーがBMP−12、VL− 1(BMP−13)またはMP52のごとき腱/靭帯様組織誘導ポリペプチドで あり、第2のモノマーが増殖因子のTGF−βスーパーファミリーのメンバーで あるヘテロダイマー蛋白の投与からなっていてもよい。さらに、これらの方法は 、EGF、FGF、TGF−α、TGF−βおよびIGFを包含する他の増殖因 子 とともに腱/靭帯様組織誘導蛋白を投与することを包含してもよい。 よって、本発明のさらなる態様は、腱/靭帯様組織の修復、腱もしくは靭帯の 修復、ならびに腱炎および腱もしくは靭帯の損傷に関連した他の症状の治療のた めの治療方法および組成物である。かかる組成物は、医薬上許容される賦形剤、 担体またはマトリックスと混合されたBMP−12、BMP−12関連蛋白また はMP52のごとき治療上有効量の1種またはそれ以上の腱/靭帯様組織誘導蛋 白からなる。 組成物の作用を変化させる種々の要因、例えば、形成が望まれる腱または靭帯 組織の量、腱または靭帯のダメージ部位、ダメージを受けた腱または靭帯の状態 、傷害のサイズ、ダメージを受けた組織のタイプ、患者の年齢、性別ならびに食 事、感染の程度、投与時期および他の臨床的要因を担当医が考慮することにより 投与規則が決定されるであろう。再構成に使用するマトリックスのタイプおよび 組成物中のさらなる蛋白のタイプに応じて用量を変更してもよい。IGF−I( インスリン様増殖因子I)のごとき知られた増殖因子の最終組成物への添加も用 量に影響しうる。 腱/靭帯様組織の形成、腱または靭帯の成長および/または修復を定期的に評 価することにより進行状況をモニターすることができる。当該分野において知ら れた方法、例えば、X線、関節鏡検査、組織形態計測的調査およびテトラサイク リン標識により進行状況をモニターすることができる。 以下の実施例は、ヒト・腱/靭帯様組織誘導蛋白の回収ならびに特徴づけおよ び他の腱/靭帯様組織誘導蛋白の回収のためのそれらの使用、ヒト・蛋白の取得 、組み換え法による蛋白発現、およびインビボモデルにおいて腱/靭帯様組織を 形成する本発明組成物の能力を示すことにおける本発明の実施を説明する。実施 例はBMP−12に関して本発明を示すが、当業者の範囲内の少しの変更により 、MP52およびVL−1についても同じ結果が得られると確信する。 実施例1 DNAの単離 BMP−12およびBMP−12関連蛋白をコードするDNA配列を、当業者 に知られた種々の方法により単離することができる。下記のごとく、他のBMP 蛋白、Vg−1関連蛋白および他のTGF−βスーパーファミリーの蛋白に存在 するアミノ酸配列に基づいてオリゴヌクレオチドプライマーを設計することがで きる。BMPファミリーの蛋白内およびTGF−βスーパーファミリーの蛋白の 他のメンバー内において非常に保存的であるアミノ酸配列を含む領域を同定する ことができ、個々のBMP/TGF−β/Vg−1蛋白お対応領域の類似性に基 づいてこれらの非常に保存的な領域のコンセンサスアミノ酸配列を構築すること ができる。かかるコンセンサスアミノ酸配列の例を以下に示す。 コンセンサスアミノ酸配列(I): [式中、X/Yはその位置にいずれかのアミノ酸が存在してもよいことを示す] 上で同定したコンセンサスアミノ酸配列(1)に基づいて以下のオリゴヌクレ オチドを設計する。: このオリゴヌクレオチド配列を自動DNA合成装置により合成する。上で同定 したオリゴヌクレオチドプライマーの標準的なヌクレオチドのシンボルは以下の とおり:A,アデノシン;C,シトシン;G,グアニン;T,チミン;N,アデノシ ンまたはシトシンまたはグアニンまたはチミン;R,アデノシンまたはシトシン ;Y,シトシンまたはチミン;H,アデノシンまたはシトシンまたはチミン;V, アデノシンまたはシトシンまたはグアニン;D,アデノシンまたはグアニンまた はチミン。 オリゴヌクレオチド#1の最初の7個のヌクレオチド(下線)は、BMP−1 2蛋白をコードするDNA配列を特異的に増幅する操作を容易にするために制限 エンドヌクレアーゼBamHIに対する認識部位を含んおり、かくして上記コン センサスアミノ酸配列(1)由来ではない。 第2のコンセンサスアミノ酸配列は、下記BMP/TGF−βVg−1蛋白の もう1つの非常に保存的な領域に由来する: 上で同定されたコンセンサスアミノ酸配列(2)に基づいて以下のオリゴヌク レオチドを設計する: このオリゴヌクレオチド配列を自動DNA合成装置により合成する。オリゴヌ クレオチト#1の最初の7個のヌクレオチド(下線)は、BMP−12蛋白をコ ードするDNA配列を特異的に増幅する操作を容易にするために制限エンドヌク レアーゼXbalに対する認識部位を含んおり、かくして上記コンセンサスアミ ノ酸配列(2)由来ではない。 本発明BMP−12蛋白および他のBMP/TGF−β/Vg−1関連蛋白は 上記コンセンサスアミノ酸配列に類似のアミノ酸配列を含んでいてもよく、BM P−12または他の新規関連蛋白中のそれらの配列の位置はそれらが由来した蛋 白における相対位置に対応しているであろうと考えられる。さらに、他のBMP /TGF−β/Vg−1蛋白の構造から得られるこの位置的情報およびコンセン サスアミノ酸配列(1)ならびに(2)にそれぞれ由来するオリゴヌクレオチド 配列#1ならびに#2を用いて、BMP−12蛋白または他のBMP/TGF− βVg−1関連蛋白の対応アミノ酸をコードするDNA配列を特異的に増幅する ことがでると考えられる。 BMP/TGF−β/Vg−1蛋白の遺伝子構造の知識に基づくと、ヒト・ゲ ノムDNAを鋳型として用いてBMP−12/TGF−β/Vg−1(BMP− 12関連蛋白)をコードする配列の同定となる特異的増幅反応を行うことができ ると考えられる。ヒト・ゲノムDNA鋳型のかかる特異的増幅反応を、先に説明 したオリゴヌクレオチドプライマー#1および#2を用いて開始することができ よう。上で同定したオリゴヌクレオチド#1および#2をプライマーとして用い てヒト・ゲノムDNA由来の特異的ヌクレオチド配列の特異的増幅を可能にする 。増幅反応を以下のように行う: ジェネティックス・インスティチュート(Genetics Institute)のケン・ジャ コブス(Ken Jacobs)により提供されたヒト・ゲノムDNA(起源:末梢血リン パ球)を、25ゲージの注射針中を繰り返し通すことにより剪断力を与え、10 0℃で5分間変性させ、次いで、氷上で冷却してから200μMの各デオキシヌ クレオチドトリホスフェート(dATP、dGTP、dCTPおよびdTTP) 、10mM Tris−HCl pH8.3、50mM KCl、1.5mM M gCl2、0.001%ゼラチン、1.25ユニットのTaqDNAポリメラーゼ 、100pMのオリゴヌクレオチド#1および100pMのオリゴヌクレオチド #2を含有する反応混合物に添加する。この反応混合物を94℃で2分加熱し、 次いで、以下の方法のサーマルサイクリングに供する:94℃1分、40℃1分 、72℃1分を3サイクル;次いで、94℃1分、55℃1分、72℃1分を3 7サイクル行う。次いで、72℃で10分インキュベーションする。 この反応により特異的に増幅されるDNAをエタノール沈殿し、制限エンドヌ クレアーゼBamHIおよびXbaIで消化し、次いで、アガロースゲル電気泳 動に供する。BMP−12または他のBMP/TGF−β/Vg−1をコードす るDNAフラグメントの予想サイズに対応するゲルの領域を切り取り、そこに存 在する特異的に増幅されたDNAフラグメントを電気溶出し、プラスミドベクタ −pGEM−3のポリリンカーのXbalとBamHI部位の間にサブクローン する。得られるBMP−12関連サブクローンの1つに関するDNA配列分析は 、それに含まれている特異的に増幅されたDNA配列生成物が本発明BMP−1 2蛋白の一部をコードしていることを示す。 この特異的に増幅されたBMP−12のDNAフラグメントのDNA配列(配 列番号:5)および誘導されるアミノ酸配列(配列番号:6)を配列表に示す。 配列番号:5のヌクレオチド#1〜#26はオリゴヌクレオチド#1の一部か らなり、ヌクレオチド#103〜#128は特異的増幅反応を行うために用いら れるオリゴヌクレオチド#2のリバース・コンプリメント(reverse compliment )の一部からなる。増幅反応の開始におけるオリゴヌクレオチド#1および#2 の機能のため、それらはBMP−12蛋白をコードする実際の配列に正確に対応 し ていなくてもよく、それゆえ、対応するアミノ酸誘導体(配列番号:6)には翻 訳されない。 もう1つのサブクローンのDNA配列分析は、それに含まれている特異的に増 幅されたDNA生成物が、VL−1と命名された、本発明のもう1つのBMP/ TGF−β/Vg−1(BMP−12関連)をコードしていることを示す。 この特異的に増幅されたDNAフラグメントのDNA配列(配列番号:7)お よび誘導されるアミノ酸配列(配列番号:8)を配列表に示す。 配列番号:7のヌクレオチド#1〜#26はオリゴヌクレオチド#1の一部か らなり、#103〜#128は特異的増幅反応を行うために用いられるオリゴヌ クレオチド#2のリバース・コンプリメントの一部からなる。増幅反応の開始に おけるオリゴヌクレオチド#1および#2の機能のため、それらはVL−1蛋白 をコードする実際の配列に正確に対応していなくてもよく、それゆえ、対応する アミノ酸誘導体(配列番号:8)には翻訳されない。 上に示す特異的に増幅されたBMP−12ヒト・DNA配列(配列番号:5) に基づいて以下のオリゴヌクレオチドプローブを設計し、自動DNA合成装置に より合成する。: このオリゴヌクレオチドプローブを32Pで放射性標識し、ベクターλFIX( ストラタジーン(Stratagene)社カタログ#944201)中に構築されたヒト ・ゲノムライブラリーをスクリーニングする。ヒト・ゲノムライブラリーの50 0000個の組み換え体を、プレート1枚あたり約10000個の組み換え体の 密度で50枚のプレートに撒く。組み換えバクテリオファージプラークを2系の ニトロセルロースにレプリカし、標準的ハイブリダイゼーションバッファー(S HB=5XSSC、0.1%SDS、5Xデンハーツ、100μg/mlサケ・ 精子DNA)中でオリゴヌクレオチドプローブ#3と65℃で一晩ハイブリダイ ゼーションさせる。翌日、放射性標識されたオリゴヌクレオチドを含有するハイ ブリダイゼーション溶液を除去し、フィルターを0.2XSSC、0.1%SDS で、65℃において洗浄する。単一のハイブリダイゼーション陽性組み換 え体を同定し、プラーク精製する。BMP−12オリゴヌクレオチドプローブ# 3にハイブリダイゼーションする、このプラーク精製された組み換えバクテリオ ファージクローンをλHuG−48と命名する。バクテリオファージプレートス トックを作成し、バクテリオファージDNAをλHuG−48ヒト・ゲノムクロ ーンから単離する。バクテリオファージλHuG−48を、アメリカン・タイプ ・カルチャー・コレクション、12301パークローン・ドライブ、ロックビル 、MD(American Type Culture Collection,12301 Parklawn Drive,Rockville,M D)「ATCC」に、1993年12月7日に受託番号#75625の下、寄託さ れている。この寄託は特許手続上の微生物の寄託の国際的承認に関するブダペス ト条約に適合する。この組み換え体λHuG−48のオリゴヌクレオチドハイブ リダイゼーション領域は3.2kbのBamHIフラグメントに局在化している 。このフラグメントをプラスミドベクター(pGEM3)中にサブクローンし、 DNA配列分析を行う。このプラスミドサブクローンをPCR1−1#2と命名 し、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション、12301パークローン ・ドライブ、ロックビル、MD(American Type Culture Collection,12301 Par klawn Drive,Rockville,MD)「ATCC」に、1993年12月7日に受託番号 #69517の下、寄託されている。この寄託は特許手続上の微生物の寄託の国 際的承認に関するブダペスト条約に適合する。クローンλHuG−48由来の、 プラスミドサブクローンPCR1−1#2の3.2kbのDNAインサートの部 分DNA配列(配列番号:1)および誘導されるアミノ酸配列(配列番号:2) を配列表に示す。 配列番号:1のヌクレオチド#639〜#714は、配列番号:5に示す特異 的に増幅されたBMP−12をコードするDNAフラグメントのヌクレオチド# 27〜#102に対応し、かくして、ヒト・ゲノムバクテリオファージクローン λHuG−48および誘導されたサブクローンPCR1−1#2は少なくとも本 発明BMP−12蛋白の一部をコードしている。プラスミドPCR1−1#2の 3.2kbのBamHIインサートの一部分のヌクレオチド配列は、配列番号: 1のヌクレオチド#1〜#882により定義される少なくとも882塩基対の読 み取り枠を含んでいる。この読み取り枠は本発明BMP−12蛋白の少なくとも 294個のアミノ酸をコードしている。コードされた294個のアミノ酸のヒト ・BMP−12蛋白は成熟ヒト・BMP−12蛋白の全体(配列番号:2のアミ ノ酸#1〜#104)、ならびに1次翻訳産物のプロペプチド領域のC末端部分 (配列番号:2のアミノ酸#−190から#−1まで)を含んでいる。 配列番号:33に示すプラスミドPCR1−1#2の3.2kbのBamHI インサートのさらなるDNA配列は、配列番号:33のヌクレオチド#138か ら1301により定義される1164塩基対の読み取り枠の存在を示す[注、配 列番号:1の開示されたすべての配列は配列番号:33に含まれる]。この配列 はゲノムクローンに由来するため、コーディング配列の5'伸長部と介在配列( イントロン/非イントロン配列)の3'限界との間の境界を確定することは困難 である。 他のBMP蛋白およびTGF−βファミリーに属する他の蛋白に関する知識に 基づくと、提案されているコンセンサス蛋白分解プロセッシング配列Arg−X −X−Argと一致して、前駆体ポリペプチドが多塩基性配列Arg−Arg− Gly−Argにおいて開裂されるであろうと予想される。BMP−12前駆体 ポリペプチドの開裂は、配列番号:2の位置#1におけるアミノ酸セリンから始 まる104個のアミノ酸の成熟ペプチドを生じると考えられる。成熟形態へのB MP−12のプロセッシングは、関連蛋白TGF−βのプロセッシング[ジェン トリー(Gentry)ら,モレキュラー・アンド・セルラー・バイオロジー(Molec.& Cell.Biol.)第8巻:4162頁(1988年);デリンク(Derynck)ら, ネイチャー(Nature)第316巻:701頁(1985年)]と類似の様式での ダイマー化およびN末端領域の除去を包含すると考えられる。 それゆえ、BMP−12の成熟活性種は2つのポリペプチドサブユニットのホ モダイマーからなり、各サブユニットは配列番号:2のアミノ酸#1から#10 4までからなり、サブユニットの予想分子量約12000ダルトンである。さら なる活性種は、少なくとも配列番号:2のアミノ酸#3から#103までからな り、それゆえ、最初と最後の保存されたシステイン残基を含んでいると考え られる。蛋白のTGF−β/BMPファミリーの他のメンバーと同様に、BMP −12蛋白のカルボキシ末端部分はアミノ末端部分よりも高い配列保存性を示す 。システインに富むC末端ドメイン(アミノ酸#3〜#104)におけるヒト・ BMP−12蛋白の、ヒト・BMP蛋白およびTGF−βファミリーの他の蛋白 の対応ヒト・BMP領域に対するアミノ酸同一性のパーセンテージは以下のよう である:BMP−2,55%;BMP−3,43%;BMP−4,53%;BMP −5,49%;BMP−6,49%;BMP−7,50%;BMP−8,57%;B MP−9,48%;BMP−10,57%;アクチビンWC(BMP−11),3 8%;Vg1,46%;GDF−1,47%;TGF−β1,36%;TGF−β 2,36%;TGF−β3,39%;インヒビンβ(B),36%;インヒビンβ (A),41%。 ヒト・BMP−12 DNA配列(配列番号:1)、またはその一部をプロー ブとして用いて、BMP−12 mRNAを合成するヒト・細胞系または組織を 同定することができる。簡単に説明すると、RNAを選択細胞または組織源から 抽出し、ホルムアルデヒドアガロースゲルによる電気泳動を行いニトロセルロー スに移すか、あるいはホルムアクデヒドと反応させてニトロセルロース上に直接 スポットする。次いで、ニトロセルロースを、ヒト・BMP−12コーディング 配列由来のプローブとハイブリダイゼーションさせる。 別法として、ヒト・BMP−12配列を用いて、特異的増幅反応を行うために 使用されるプライマー間の領域に存在するBMP−12コーディング配列の一部 を特異的に増幅するオリゴヌクレオチドプライマーを設計する。これらのヒト・ BMP−12由来のプライマーは、mRNA、cDNAまたはゲノムDNA鋳型 由来の対応BMP−12コーディング配列を特異的に増幅することを可能にする であろうと考えられる。上記方法の1つにより使用可能な源が同定されたならば 、オリゴ(dT)セルロースクロマトグラフィーによりmRNAを選択し、cD NAを合成し、次いで、当業者に知られたλgt10または他のλバクテリオフ ァージベクター、例えばλZAP中に確立された方法(トール(Toole)ら,上 記)によってクローンする。上記のオリゴヌクレオチドプライマーにより行わ れる増幅反応を、λバクテリオファージベクター中にクローンされた前以て確立 されている、ヒト・cDNAまたはゲノムライブラリーに対して直接行うことも 可能である。かかる場合には、増幅されたBMP−12をコードするDNAのフ ラグメントをプローブとして用いて、ヒト・BMP−12蛋白の一部をコードす る特異的に増幅されたDNA生成物を生じるライブラリーを直接スクリーニング することができよう。 ヒト・BMP−12ゲノムクローンλHuG−48のDNA配列に基づいて設 計されたオリゴヌクレオチドプライマーを予想して、市販(すなわち、カリフォ ルニア州ラジョラのストラタジーン(Stratagene)社製またはカリフォルニア州 パロ・アルトのクローンテック・ラボラトリーズ,インコーポレイテッド(Clont ech Laboratories,Inc.)製)されている、前以て確立されたヒト・cDNAラ イブラリー由来のヒト・BMP−12をコードするDNA配列の特異的増幅を行 う。配列番号:1に示すDNA配列のヌクレオチド#571から#590までに 基づいて以下のオリゴヌクレオチドプライマーを設計し、自動DNA合成装置に より合成する: プライマー#4の最初の9個のヌクレオチド(下線)は、BMP−12蛋白を コードするDNA配列を特異的に増幅する操作を容易にするために制限エンドヌ クレアーゼBamHIに対する認識部位を含んおり、かくして配列番号:1に示 すDNA配列由来ではない。 配列番号:1に示すDNA配列のヌクレオチド#866から#885までに基 づいて以下のオリゴヌクレオチドプライマーを設計し、自動DNA合成装置によ り合成する: プライマー#5の最初の9個のヌクレオチド(下線)は、BMP−12蛋白を コードするDNA配列を特異的に増幅する操作を容易にするために制限エンドヌ クレアーゼXbaIに対する認識部位を含んでおり、かくして配列番号:1に示 すDNA配列由来ではない。 上で同定された標準的なヌクレオチドシンボルは以下のごとし:A,アデノシ ン;C,シトシン;G,グアニン;T,チミン 上で同定したプライマー#4および#5をプライマーとして用いて、以下のも の: ヒト・胎児脳cDNA/λZAPII(ストラタジーンのカタログ#936206 )、ヒト・肝臓/λUNI−ZAP XR(ストラタジーンのカタログ#937 200)、ヒト・肺/λUNI−ZAP XR(ストラタジーンのカタログ#9 37206)、およびヒト胎児脾臓/UNI−ZAP XR(ストラタジーンの カタログ#937205) を包含してもよい前以て確立されたcDAライブラリー由来の特異的なBMP− 12をコードするヌクレオチド配列の増幅を行う。 上で詳述したヒト・cDNAインサートバクテリオファージライブラリー約1 x108pfu(プラーク形成単位)を95℃で5分間変性させた後、200μ Mの各デオキシヌクレオチドトリホスフェート(dATP、dGTP、dCTP 、dTTP)、10mM Tris−HCl pH8.3、50mMKCl、1. 5mM MgCl2、0.001%ゼラチン、1.25ユニットのTaq DNA ポリメラーゼ、100pMのオリゴヌクレオチドプライマー#4および100p Mのオリゴヌクレオチドプライマー#5を含有する反応混合物に添加する。次い で、反応混合物を以下の方法のサーマルサイクリングに供する:94℃1分、5 0℃1分、72℃1分を39サイクル、次いで、72℃で10分インキュベーシ ョンする。 この反応により特異的に増幅されるDNAは、約333塩基対のBMP−12 をコードする生成物を生じると考えられよう。その内部の315塩基対は配列番 号:1のヌクレオチド#571から#885に対応し、さらにプライマー#4お よび#5のヌクレオチド#1〜#9により定義される制限部位に対応するBMP −12特異的フラグメントの各末端の9塩基対を含んでいる。得られる333塩 基対のDNA生成物を制限エンドヌクレアーゼBamHIおよびXbaIで消化 し、フェノール抽出し、クロロホルム抽出し、対で、エタノール沈殿する。 別法として、エタノール沈殿、バッファー交換、次いで、消化されたDNA生 成物を10mM Tris−HCl pH8.0、1mM EDTA中に希釈し 、その後セントリコン(Centricon)TM30マイクロコンセントレーター(マサ チューセッツ州ビバリーのダブリュ・アール・グレイス・アンド・カンパニー( W.R.Grace & Co.)製;製品番号#4209)により遠心分離することにより、 BamHI/XbaI制限消化により生じるDNAの小フラグメントの除去を行 う。得られるBamHI/XbaI消化された増幅DNA生成物を、プラスミド ベクター(すなわち、pBluescript、pGEM−3等)のポリリンカー領域のB amHI部位とXbaI部位との間にサブクローンする。得られるサブクローン のDNA配列分析は、BMP−12をコードするインサートの完全性を確認する ために必要であろう。この方法において使用可能なcDNA源が同定されたなら ば、333塩基対のBMP−12特異的配列が増幅された対応cDNAライブラ リーを、333塩基対のインサートまたは他のBMP−12特異的プローブを用 いて直接スクリーニングして本発明のBMP−12蛋白の全長をコードするcD NAクローンを同定し単離することができよう。 当業者に知られたさらなる方法を用いてヒト・BMP−12関連蛋白をコード する他のcDNAの全長、あるいはヒト以外、特に他の哺乳動物種由来の本発明 BMP−12関連蛋白をコードするcDNAクローンの全長を単離してもよい。 以下の実施例は、ネズミ・ゲノムDNAライブラリー中のBMP−12関連蛋 白由来の相同体を単離するためのヒト・BMP−12配列の使用を示す。 本発明ヒト・BMP−12蛋白をコードするDNA配列は、ヒト以外の種由来 のBMP−12およびBMP−12関連蛋白の配列に対して有意に相同的である と予想され、ヒトBMP−12配列を用いて、対応するBMP−12関連蛋白を コードするそれらの他の種由来のDNA配列を特異的に増幅することができよう 。特別には、ヒト・BMP−12配列(配列番号:1)に基づいて以下のオリゴ ヌクレオチドを設計し、自動DNA合成装置により合成する: プライマー#6および#7の最初の8個のヌクレオチド(下線)は、それぞれ 制限エンドヌクレアーゼBamHIおよびEcoRIからなる。ヒト以外の種由 来のBMP−12またはBMP−12関連蛋白をコードする特異的に増幅された DNA配列の操作を容易にするためにこれらの配列を用いることができ、よって 、配列番号:1に示すDNA配列由来でない。配列番号:1のヌクレオチド#6 07〜#626に基づいてオリゴヌクレオチドプライマー#6を設計する。配列 番号:1に示すDNA配列のヌクレオチド#846〜#865のリバース・コン プリメント列に基づいて、オリゴヌクレオチドプライマー#7を設計する。 上で同定したオリゴヌクレオチドプライマー#6および#7をプライマーとし て用いて、ヒト以外の種由来のゲノムDNAからの特異的BMP−12関連配列 の増幅を行う。増幅反応を以下のように行う: ネズミ・ゲノムDNA(源:Balb c株)を、25ゲージの注射針中を繰り返し 通すことにより剪断力を与え、100℃で5分間変性させ、次いで、氷上で冷却 してから200μMの各デオキシヌクレオチドトリホスフェート(dATP、d GTP、dCTPおよびdTTP)、10mM Tris−HCl pH8.3 、50mM KCl、1.5mM MgCl2、0.001%ゼラチン、1.25ユ ニットのTaq DNAポリメラーゼ、100pMのオリゴヌクレオチド#6お よび100pMのオリゴヌクレオチド#7を含有する反応混合物に添加する。反 応混合物を以下の方法のサーマルサイクリングに供する:95℃1分、55℃1 分、72℃1分を40サイクル、次いで、72℃で10分インキュベーションす る。 この反応により特異的に増幅されるDNAをエタノール沈殿し、制限エンドヌ クレアーゼBamHIおよびEcoRIで消化し、次いで、アガロースゲル電気 泳動に供する。BMP−12またはBMP−12関連蛋白をコードするDNAフ ラグメントの予想サイズに対応するゲルの領域を切り取り、そこに存在する特異 的に増幅されたDNAフラグメントを溶出し(当業者に知られた電気溶出または 他の方法により)、pGEM−3またはpBluescriptのごときプラスミドベクタ ーのポリリンカーのBamHIとEcoRI部位の間にサブクローンする。得ら れるサブクローンの1つ(mV1と命名)に関するDNA配列分析は、それに含 まれている特異的に増幅されたDNA配列が、本発明BMP−12またはVL− 1配列のいずれかに対するネズミ・相同体であると思われる蛋白の一部をコード していることを示す。この特異的に増幅されたネズミ・DNAフラグメントのD NA配列(配列番号:10)および誘導されるアミノ酸配列(配列番号:11) を配列表に示す。 配列番号:10のヌクレオチド#1〜#26はオリゴヌクレオチド#6からな り、ヌクレオチド#246〜#272は、特異的増幅反応を行うために用いられ るオリゴヌクレオチド#7のリバース・コンプリメントの一部からなる。配列番 号:10のヌクレオチド#27はコドントリプレットの最後のヌクレオチドであ ると思われ、配列番号:10のヌクレオチド#244〜#245はコドントリプ レットの最初の2個のヌクレオチドであるように思われる。それゆえ、配列番号 :10のヌクレオチド#28から#243まではmV1の部分コーディング配列 に対応する。増幅反応を開始させることにおけるオリゴヌクレオチド#6よおび #7の機能のため、それらは、本発明ヒト・BMP−12またはVL−1蛋白に 対するネズミ・相同配列をコードする実際の配列に正確に対応していなくてもよ く、それゆえ、それらは対応するアミノ酸配列誘導体(配列番号:11)に正確 に翻訳されない。 当業者は、配列番号:10に示す特異的に増幅されたネズミ・BMP−12ま たはVL−1 DNA配列に基づいて設計されたオリゴヌクレオチドプローブを 用いて全長のネズミBMP−12またはVL−1をコードするクローン(cDN AまたはゲノムDNAのいずれか)を同定することができよう。 mV2と命名されたもう1つの得られたクローンのDNA配列分析は、特異的 に増幅されたDNA配列はその中に本発明ネズミ・BMP−12関連配列の一部 を含んでいたことを示す。この特異的に増幅されたネズミ・DNAフラグメント のDNA配列(配列番号:12)および誘導されるアミノ酸配列(配列番号:1 3)を配列表に示す。 配列番号:12のヌクレオチド#1〜#26は、オリゴヌクレオチド#6の一 部からなり、ヌクレオチド#246〜#272は特異的増幅反応を行うために用 いられたオリゴヌクレオチド#7のリバース・コンプリメントの一部からなる。 配列番号:12のヌクレオチド#27はコトントリプレットの最後のヌクレオチ ドであると思われ、配列番号:12のヌクレオチド#244〜#245はコドン トリプレットの最初の2つのヌクレオチドであると思われる。それゆえ、配列番 号:12のヌクレオチド#28から#243まではmV2の部分コーディング配 列に対応する。増幅反応開始におけるオリゴヌクレオチド#6および#7の機能 のために、それらは本発明ネズミ・BMP−12関連蛋白をコードする実際の配 列に正確に対応していなくてもよく、それゆえ、対応するアミノ酸配列誘導体( 配列番号:13)に翻訳されない。 ネズミ・BMP−12関連蛋白の全長をコードしているクローン(cDNAま たはゲノムのいずれか)を同定するために、配列番号:12に示す特異的に増幅 されたネズミ・BMP−12関連DNA配列に基づいて設計されたオリゴヌクレ オチドプローブが当業者により用いられうる。 mV9と命名されたもう1つの得られたクローンのDNA配列分析は、特異的 に増幅されたDNA配列はその中に本発明ネズミ・BMP−12関連配列の一部 を含んでいたことを示す。この配列は、配列番号:3に記載されたヒト・MP5 2 DNA配列に対するネズミ・相同体であると思われる。この特異的に増幅さ れたネズミ・DNAフラグメントのDNA配列(配列番号:14)および誘導さ れるアミノ酸配列(配列番号:15)を配列表に示す。 配列番号:14のヌクレオチド#1〜#26はオリゴヌクレオチド#6の一部 からなり、ヌクレオチド#246〜#272は特異的増幅反応を行うために用い られたオリゴヌクレオチド#7のリバース・コンプリメントの一部からなる。配 列番号:14のヌクレオチド#27はコドントリプレットの最後のヌクレオチド であると思われ、配列番号:14のヌクレオチド#244〜#245はコドント リプレットの最初の2つのヌクレオチドであるように思われる。それゆえ、配列 番号:14のヌクレオチド#28から#243まではmV9の部分コーディング 配列に対応する。増幅反応開始におけるオリゴヌクレオチド#6および#7の機 能のために、それらは本発明ネズミ・BMP−12関連蛋白をコードする実際の 配列に正確に対応していなくてもよく、それゆえ、対応するアミノ酸配列誘導体 (配列番号:15)に翻訳されない。 ネズミ・BMP−12関連蛋白の全長をコードしているクローン(cDNAま たはゲノムのいずれか)を同定するために、配列番号:14に示す特異的に増幅 されたネズミ・BMP−12関連DNA配列に基づいて設計されたオリゴヌクレ オチドプローブが当業者により用いられうる。 別法として、上で同定したオリゴヌクレオチドプライマー#6および#7をプ ライマーとして用いて、BMP−12をコードしているプラスミドサブクローン PCR1−1#2由来の275塩基対のDNAプローブの特異的増幅を行う。該 DNAプローブの内部の259塩基対は配列番号:1のオリゴヌクレオチド#6 07から865までに対応している。この275塩基対のDNAプローブを32P で放射性標識し、ベクターλFIXII(ストラタジーン(Stratagene)社カタロ グ#946306)中に構築されたネズミ・ゲノムライブラリーをスクリーニン グするのに用いた。該ネズミ・ゲノム遺伝子ライブラリーの100万個の組み換 え体を、プレート1枚あたり約20000個の組み換え体の密度で50枚のプレ ートに撒く。組み換えバクテリオファージプラークに関する2系のニトロセルロ ースレプリカを、厳密性を減じた条件下において、標準的なハイブリダイゼーシ ョンバッファー(SHB=5XSSC、0.1%、5Xデンハーツ、100μg /mlサケ・精子DNA)中、一晩60℃において特異的に増幅された333塩 基対のプローブとハイブリダイゼーションさせる。翌日、放射性標識されたオリ ゴヌクレオチドを含有するハイブリダイゼーション溶液を除去し、厳密性を減じ た条件下において、2XSSC、0.1%SDSにてフィルターを洗浄する。複 数のハイブリダイゼーション陽性組み換え体を同定し、プラーク精製する。ハイ ブリダイゼーション陽性ネズミ・ゲノム組み換えクローンのフラグメントを標準 的なプラスミドベクター(すなわちpGEM3)中にサブクローンし、DNA配 列分析に供する。 MVR3と命名されたこれらのサブクローンのうちの1つのDNA配列分析は 、 それが上記PCR生成物mV1に対応するマウス・遺伝子の一部をコードしてい ることを示す。このサブクローンの部分DNA配列および対応アミノ酸翻訳物を 、それぞれ、配列番号:29および配列番号:30に示す。 MVR32と命名 されたこれらのサブクローンのうちのもう1つのサブクローンのDNA配列分析 は、それが、上記PCR生成物mV2(配列番号:7に示すヒト・VL1配列の ネズミ・相同体)に対応するマウス・遺伝子の一部をコードすることを示す。こ のサブクローンの部分DNA配列および対応アミノ酸翻訳物を、それぞれ、配列 番号:31および配列番号:32に示す。 MVR23と命名されたこれらのサブクローンのうちのもう1つのサブクロー ンのDNA配列分析は、それが、上記PCR生成物mV9(配列番号:3に示す MP52配列のネズミ・相同体)に対応するマウス・遺伝子の一部をコードする ことを示す。 本発明BMP−12蛋白をコードするヒト・ゲノムクローンを同定し単離する ことに関して上で説明したのと同様の方法で、配列番号:7に示すVL−1をコ ードする配列に対応するオリゴヌクレオチドプローブを設計することができ、V L−1(BMP−13)蛋白をコードするヒト・ゲノムまたはcDNA配列を同 定するために用いることができる。これらのオリゴヌクレオチドはVL−1をコ ードする配列に特異的な領域に対して設計されるであろうし、それゆえ、特異的 に増幅されたVL−1をコードする配列(配列番号:7)と特異的に増幅された BMP−12をコードする配列(配列番号:5)との間の最低の程度のヌクレオ チド配列同一性の領域由来である可能性があるだろう。 別法として、上で同定したオリゴヌクレオチド#4および#5をプライマーと して用いて、BMP−12をコードするプラスミドクローンPCR1−1#2由 来の333塩基対のDNAプローブの特異的増幅を行う。該DNAプローブの内 部の315塩基対は配列番号:1のヌクレオチド#571から#885までに対 応している。この333塩基対のDNAプローブを32Pで放射性標識し、ベクタ ーλDASHII(ストラタジーン(Stratagene)社カタログ#945203)中 に構築されたネズミ・ゲノムライブラリーをスクリーニングするのに用いた。該 ネズミ・ゲノム遺伝子ライブラリーの100万個の組み換え体を、プレート1枚 あたり約20000個の組み換え体の密度で50枚のプレートに撒く。組み換え バクテリオファージプラークに関する2系のニトロセルロースレプリカを、厳密 性を減じた条件下において、標準的なハイブリダイゼーションバッファー(SH B=5XSSC、0.1%、5Xデンハーツ、100μg/mlサケ・精子DN A)中、一晩60℃において特異的に増幅された333塩基対のプローブとハイ ブリダイゼーションさせる。翌日、放射性標識されたオリゴヌクレオチドを含有 するハイブリダイゼーション溶液を除去し、厳密性を減じた条件下において、2 XSSC、0.1%SDSにてフィルターを洗浄する。複数(約15個)のハイ ブリダイゼーション陽性組み換え体を同定し、プラーク精製する。 このスクリーニング工程に用いる、BMP−12をコードするプラスミドPC R1−1#2から得られた333塩基対のDNAプローブに陽性ハイブリダイゼ ーションすると予測されるBMP−12および他のBMP−12寒天蛋白をコー ドする組み換え体と、本発明VL−1をコードするハイブリダイゼーション陽性 組み換え体とを区別するために、配列番号:7に示すVL−1に基づく下記オリ ゴヌクレオチドプローブを設計し、自動DNA合成装置により合成する: 配列番号:1に示すBMP−12をコードする配列の対応領域(ヌクレオチド #672から#689まで)に対して5個のヌクレオチド相違を有する、配列番 号:7のヌクレオチド#60から#76までに対応するオリゴヌクレオチド。V L−1オリゴヌクレオチドプローブ#8にハイブリダイゼーションする組み換え バクテリオファージクローンの1つをλJLDc31と命名する。この組み換え バクテリオファージクローンをプラーク精製し、バクテリオファージプレートス トックを作成し、λJLDc31ヒト・ゲノムクローンからバクテリオファージ DNAを単離する。バクテリオファージλJLDc31を、アメリカン・タイプ ・カルチャー・コレクション、12301パークローン・ドライブ、ロックビル 、MD(「ATCC」)に、受託番号75922の下、1994年10月20日 に寄託した。この寄託は特許手続上の微生物の寄託の国際的承認に関するブダ ペスト条約に適合する。この組み換え体λJLDc31のオリゴヌクレオチドハ イブリダイゼーション領域は2.5kbのEcoRIフラグメントに局在化して いる。このフラグメントをプラスミドベクター(pGEM3)中にサブクローン し、DNA配列分析を行う。このプラスミドサブクローンをpGEMJLDc3 1/2.5と命名し、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション、123 01パークローン・ドライブ、ロックビル、MD(「ATCC」)に、受託番号 69710の下、1994年10月20日に寄託した。この寄託は特許手続上の 微生物の寄託の国際的承認に関するブダペスト条約に適合する。 クローンλJLDc31由来のプラスミドサブクローンpGEMJLDc31 /2.5の2.5kbのDNAインサートの部分DNA配列(配列番号:25) および誘導されるアミノ酸配列(配列番号:26)を配列表に示す。 プラスミドpGEMJLDc31/2.5の2.5kbのEcoRIインサート の一部のDNA配列を配列番号:25に示す。配列番号:25のヌクレオチド# 52から#963により定義される912塩基対の読み取り枠を含んでいる。こ の配列がゲノムクローンに由来するため、コーディング配列の5'伸長部と介在 配列(イントロン/非コーディング配列)の3'端との間の境界を決定すること は困難である。全読み取り枠(配列番号:25のヌクレオチド#52から#96 3まで)は、304個のアミノ酸までの本発明VL−1蛋白の一部をコードして いる。 BMP蛋白およびTGF−βファミリーに属する他の蛋白に関する知識に基づ くと、前駆体ポリペプチドは、提案されているコンセンサス蛋白分解配列Arg −X−X−Argと一致した多塩基性配列Arg−Arg−Arg−Argにお いて開裂されるであろうと予測される。VL−1前駆体ポリペプチドの開裂は、 配列番号:26の位置#1におけるアミノ酸Thrから始まる120個のアミノ 酸の成熟ペプチドを生じると考えられる。成熟形態へのVL−1のプロセッシン グは、関連蛋白TGF−βのプロセッシング[ジェントリー(Gentry)ら,モレ キュラー・アンド・セル・バイオロジー(Molec & Cell.Biol.),第8巻:41 62頁(1988年);デリンク(Derynck)ら,ネイチャー(Nature),第 316巻:701頁(1985年)]に類似した様式でのタイマー化およびN末 端領域の除去を包含すると考えられる。 それゆえ、VL−1の成熟活性種は、各サブユニットが配列番号:26のアミ ノ酸#1から#120まで(予想分子量約12000ダルトン)からなる2個の ポリペプチドサブユニットのホモダイマーからなると考えられる。さらなる活性 種は、少なくとも配列番号:26のアミノ酸#19から#119もしくは#12 0までからなり、それゆえ、最初と最後の保存されたシステイン残基を含むと考 えられる。 かかる方法を用いて、成熟ヒト・VL−1(BMP−13)をコードするクロ ーンを得た。このクローンによりコードされるヌクレオチド配列および対応アミ ノ酸配列を、それぞれ、配列番号:25および26において配列表に示す。 実施例2BMP−12の発現 BMP−12蛋白を製造するために、慣用的な遺伝子工学的方法により、それ をコードするDNAを適当な発現ベクター中に移行させ、哺乳動物細胞または他 の好ましい真核もしくは原核宿主の細胞中に導入する。 細菌細胞においてBMP−12蛋白を製造するために、以下の方法を用いる。イー・コリにおけるBMP−12の発現 イー・コリにおいてBMP−12を製造するために、以下の主要な特徴を有す る発現プラスミドpALV1−781を構築した。ヌクレオチド1〜2060は 、宿主イー・コリ株における抗生物質アンピシリン耐性を付与するβ−ラクタマ ーゼに関する遺伝子およびColE1由来の複製開始点を含むプラスミドpUC 18[ノランダー(Norrandar)ら,ジーン(Gene)第26巻:101〜106頁 (1983年)]由来のDNA配列を含む。ヌクレオチド2061〜2221は 、3つのオペレーター配列OL1、OL2、OL3を含むバクテリオファージλ[ サンガー(Sanger)ら,ジャーナル・オブ・モレキュラー・バイオロジー(J.Mol .Biol.)第162巻:729〜773頁(1982年)]の大左方プロモーター (pL)に関するDNA配列を含む。該オペレーターはλcIリプレッサー蛋白 の結合部位であり、該蛋白の細胞内レベルはpLからの転写開始量を調節する。 ヌクレオチド2222〜2723は、サンガー(Sanger)ら,ジャーナル・オブ ・モレキュラー・バイオロジー(J.Mol.Biol.)第162巻:729〜773頁 (1982年)に記載されたバクテリオファージλ由来のヌクレオチド3556 6から35472までおよび38137から38361までに由来する配列上に 含まれる強力なリボゾーム結合配列を含む。ヌクレオチド2724〜3041は 、すべての3'非翻訳配列が除去されている成熟BMP−12蛋白をコードする DNA配列を含む。pALV1−781発現ベクター中に導入されたBMP−1 2 DNA配列を5'末端において修飾してコーディング能力を変化させずにA +T含量を増加させた。これらの変更を行ってイー・コリ中のBMP−12 m RNA上への翻訳効率を上昇させた。ヌクレオチド3042〜3058は、制限 エンドヌクレアーゼ部位を有する「リンカー」DNA配列を提供する。ヌクレオ チド3059〜3127は、イー・コリのaspA遺伝子の転写終結配列[タカ ギ(Takagi)ら,ヌクレイック・アシッズ・リサーチ(Nucl.Acids Res.)第13 巻:2063〜2074頁(1985年)]に基づく転写終結配列を提供する。 ヌクレオチド3128〜3532はpUC18由来のDNA配列である。 ダガート(Dagert)およびエールリッヒ(Ehrlich),ジーン(Gene)第6巻 :23頁(1979年)の手順によりプラスミドpALV1−781をイー・コ リ宿主株GI724(F,laclq,lacpL8,ampC::λcI+)中に形質転換した。GI7 24(ATCC受託番号55151)はampC遺伝子座における染色体中に安 定に組み込まれたλcIリプレッサー遺伝子のコピーを含んでおり、該遺伝子は サルモネラ・チフィムリウム(Salmonella typhimurium)のtrpプロモーター /オペレーター配列の転写調節下に置かれている。最少培地または上記IMCの ごときカサミノ酸を補足した最少培地のようなトリプトファン不含培地中での増 殖の間にのみ、GI724中においてλcI蛋白が生産される。GI724培養 へのトリプトファン添加はtrpプロモーターを抑制し、λcI 合成のスイッチをオフにし、pLプロモーターが細胞中に存在する場合にはpL プロモーターからの転写誘導を徐々に引き起こすであろう。 1mM MgSO4を含有し、0.5%w/vグルコース、0.2%w/vカザ ミノ酸および100μg/mlアンピシリンを補足したM9培地[ミラー(Mill er),「イクスペリメンツ・イン・モレキュラー・ジェネティクス(Experiment s in Molecular Genetics)」コールド・スプリング・ハーバー・ラボラトリー 、ニューヨーク(Cold Spring Harbor Laboratory,New York)(1972年)] からなるIMC培地を含有する1.5%w/v寒天プレート上で形質転換体を選 択した。pALV1−781で形質転換したGI724を、100μgアンピシ リン含有IMC培地中で、A550が0.5になるまで37℃で増殖させた。次いで 、最終濃度100μg/mlとなるようにトリプトファンを添加し、さらに培養 物を4時間インキュベーションした。この間に、BMP−12蛋白は「封入体」 フラクション中に蓄積する。蛋白モノマーの調製 18gの凍結細胞を計量し、60mlの100mM Tris、10mM E DTA、1mM フッ化フェニルメチルスルホニル[PMSF],pH8.3中に 再懸濁した。マイクロフルイダイザー(Microfluidizer)TM[#MCF100T 型]に3回通すことにより細胞を溶解させた。4℃で20分間15000gでの 遠心分離により封入体ペレットを得た。上清を傾斜法で捨て、100mlの10 0mM Tris、1.0M NaCl、10mM EDTA、1mM PMS F,pH8.3で洗浄した。懸濁物を、4℃で10分間15000gで再度遠心分 離し、上清を傾斜法で捨てた。次いで、ペレットを、100mM Tris、1 0mM EDTA、1% Triton X−100、1mM PMSF,pH 8.3で洗浄した。懸濁物を4℃で10分間15000gで再度遠心分離し、上清 を傾斜法で捨てた。ガラス製組織ホモジナイザー中で、1% DTTを含有する 50mlの20mM Tris、1mM EDTA,1mM PMSF,pH8. 3にペレットを再懸濁した。次いで、氷酢酸で酸性にしてpHを2.5にするこ とによりモノマーBMP−12を可溶化した。4℃で20分間 15000gで遠心分離することにより可溶性フラクションを単離した。 この遠心分離により得られた上清を集め、20mlずつSephacrylS −100TMサイズ排除カラム(83cm x 2.6cm;ベッド約440ml )上でクロマトグラフィーを行った。1%酢酸を移動相として流速1.4ml/ 分でSephacrylS−100TMカラムを操作した。コンピューター計算し た吸光係数18200M-1cm-1および分子量(11667ダルトン)を用い、 280nmにおける吸光度によりBMP−12モノマーに対応するフラクション を検出した。このサイズ排除カラムによりプールされた材料を再生反応の出発材 料として用いた。 上記方法の別法として、−80℃に保存された1.0gの細胞を計り取る。溶 液(3.4mlの100mM Tris、10mM EDTA,pH8.5)を添 加する。十分に懸濁するまで溶液をボルテックス撹拌する。40μlのイソプロ パノール中100mM PMSFを添加する。フレンチプレスで細胞を1000 psiにおいて溶解させる。封入体をエッペンドルフーブ中、4℃で20分遠心 分離してペレットを形成する。上清を傾斜法で捨てる。1個のペレット(全部で 4個)に250mM DTTを含有する脱気した1.0mlの8.0Mグアニジン 塩酸、0.5M Tris、5mM EDTA,pH8.5を添加する。ペレット を溶解し、液にアルゴンを30秒間吹き付ける。次に、溶液を37℃で1時間イ ンキュベーションする。エッペンドルフ微量遠心を23℃で2〜3分行って不溶 性物質をペレット化する。0.5〜1.0mlの上清をスペルコ(Supelco)の2 cmガードカートリッジ(LC−304)に注入し、0.1%TFA中アセトニ トリルを35分で1−70%とするグラジエントで溶離する。BMP−12は2 9ないし31分の間に溶離する。フラクションをプールし、アミノ酸組成に基づ く理論吸光係数を用いて、0.1%TFAに対する280ナノメーターの吸光度 により蛋白濃度を決定する。 上記方法の第2の別法として、上記のごとくイー・コリから得た凍結細胞ペレ ットを30mlのTE8.3(100:10)バッファー(100mM Tri s −HCl pH8.3、10mM Na2EDTA、1mM PMSF)中で 融解 する。マイクロフルイダイザー(Microfluidizer)TM[#MCF100T型]に 3回通すことにより細胞を溶解させる。最初に得られた封入体ペレットを、10 0mM DTTを含有する8M グアニジン−HCl、TE8.5(100:1 0)バッファー(100mM Tris−HCl pH8.5)、10mM N a2EDTA)中に溶解し、37℃で1時間インキュベーションする。この材料 を室温で15分間12000gで遠心分離する。CHAPS系を用いるBMP−12蛋白の再生 十分な体積のBMP−12プールを凍結乾燥して10μgの蛋白を得る。ガラ ス製装置で蒸留した5μlの水を添加して残渣を再溶解し、次いで、100μl の再生用混合物(50mM Tris、1.0M NaCl、2% 3−(3− クロラミドプロピル)ジメチルアンモニオ−1−プロパン−サルフェート(CH APS)、5mM EDTA、2mM グルタチオン(還元型)、1mM グル タチオン(酸化型);pH約8.5)を添加する。部分試料をノベックス(Novex )の16%トリシンゲル上を125ボルトで2.5時間泳動させ、次いで、クー マシーブルー(Coomasie Blue)染色ならびに脱色することによりダイマー形成 を評価する。 1% Bバッファー(Aバッファー中に希釈)に対して平衡化されたC4分析 用RP−HPLC(逆相高品質液体クロマトグラフィー)カラム(ビダック(Vy dac)214TP54)を用い、流速1ml/分として以下のグラジエント(A バッファー=0.1%トリフルオロ酢酸、Bバッファー=95%アセトニトリル 、0.1%トリフルオロ酢酸)を35分かけて行う間に蛋白を溶離させてBMP −12ダイマーを精製した: 1−5分 20%Bバッファー 5−10分 20−30%Bバッファー 10−30分 30−50%Bバッファー 30−35分 50−100%Bバッファー 蛋白を280nmにおける吸光度によりモニターした。ピークBMP−12フ ラクション(29ないし31分の間に溶離)をプールした。SDS−PAGEに より純度を評価した。上で示したコンピューターにより計算した吸光係数および 分子量を用いて、280nmにおける吸光度により蛋白濃度を決定した。哺乳動物細胞におけるBMP−12の発現 生物学的に活性のある組み換えヒト・BMP−12のためのもう1つの考えら れる好ましい発現系は安定に形質転換された哺乳動物細胞である。 配列番号:1の配列またはBMP−12をコードする他のDNA配列もしくは 他の修飾配列およびpCD[オカヤマ(Okayama)ら,モレキュラー・セル・バイ オロジー(Mol.Cell Biol.),第2巻161〜170頁(1982年)]、pJ L3、pJL4[ゴフ(Gough)ら,EMBO J.,第4巻:645〜653頁( 1985年)]ならびにpMT2 CXMのごとき既知ベクターを用いることに より当業者は哺乳動物発現ベクターを構築することができる。 哺乳動物発現ベクターpMT2 CXMはp91023(b)(ウォング(Wo ng)ら,サイエンス第228巻:810〜815頁,1985年)の誘導体であ るが、それがテトラサイクリン耐性遺伝子のかわりにアンピシリン耐性遺伝子を 含み、さらにcDNAクローン挿入のためのXhoI部位を含んでいるという点 でp91023(b)とは異なる。pMT2 CXMの機能的エレメントは記載 されており(カウフマン,アール・ジェイ(Kaufman,R.J.),1985年,プロシ ーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンシズ・ユーエス エイ(Proc.Natl.Acad.Sci.USA)第82巻;689〜693頁)、アデノウイル スVA遺伝子、72塩基対のエンハンサーを含むSV40複製開始点、5'スプ ライス部位ならびにアデノウイルス後期mRNA上に存在するアデノウイルス三 分節リーダー配列の大部分を含むアデノウイルス大後期プロモーター、3'スプ ライスアクセプター部位、DHFRインサート、SV40初期ポリアデニレーシ ョン部位(SV40)、およびイー・コリ中での増殖に必要なpBR322配列 を含む。 pMT2−VWFのEcoRI消化によりプラスミドpMT2 CXMを得て 、 これを米国メリーランド州ロックビルのアメリカン・タイプ・カルチャー・コレ クションに、受託番号ATCC67122の下で寄託した。EcoRI消化によ りpMT2−VWF中に存在するcDNAインサートを切除し、直鎖状のpMT 2を得て、これを結合してイー・コリHB101またはDH−5をアンピシリン 耐性に形質転換することができる。プラスミドpMT2 DNAを慣用的方法に より調製することができる。次いで、ループアウト/イン突然変異[モリナガ( Morinaga)ら,バイオテクノロジー(Biotechnology)第84巻:636頁(19 84年)]を用いてpMT2 CXMを構築する。これにより、SV40複製開 始点およびpMT2のエンハンサー配列に近いHindIII部位に対する塩基1 075から1145までを除去する。さらに、それは、制限エンドヌクレアーゼ XhoIに関する認識部位を含む配列を挿入する。pMT23と命名したpMT 2CXMの誘導体は制限エンドヌクレアーゼPstI、EcoRI、SalIお よびXhoIに関する認識部位を含んでいる。プラスミドpMT2 CXMおよ びpMT23 DNAを慣用的方法により調製してもよい。 pMT21由来のpEMC2β1も本発明の実施に適する。pMT21は、p MT2−VWF由来のpMT2に由来する。上記のごとく、EcoRI消化によ りpMT−VWF中に存在するcDNAインサートを切除し、直鎖状のpMT2 を得て、これを結合してイー・コリHB101またはDH−5をアンピシリン耐 性に形質転換することができる。プラスミドpMT2 DNAを慣用的方法によ り調製することができる。 pMT21は以下の2つの修飾によりpMT2に由来する。まず、cDNAク ローニングのためのG/Cテイリングからの19個のG残基の伸長を含むDHF R cDNAの76塩基対の5'非翻訳領域を欠失させる。この工程において、 XhoI部位を挿入してDHFRのすぐ上流に続く配列を得る。次に、EcoR VおよびXbaIでの消化、DNAポリメラーゼのクレノウフラクションでの処 理、次いで、ClaIリンカーへの結合により唯一のClaI部位を導入する。 これにより、250塩基対のセグメントがアデノウイルス関連RNA(VAI) 領域から欠失されるが、VAI RNA遺伝子の発現または機能は妨害さ れない。pMT21をEcoRIおよびXhoIで消化し、ベクターpEMC2 B1を誘導するために用いる。 EcoRIおよびPstIでの消化によりpMT2−ECAT1[エス・ケイ ジュング(S.K.Jung)ら,ジャーナル・オブ・ウイロロジー(J.Virol.)第63 巻:1651〜1660頁(1989年)]からEMCVリーダーの一部を得て 、2752塩基対のフラグメントを生じさせる。このフラグメントをTaqIで 消化して、508塩基対のEcoRI−TaqIフラグメントを得て、これを低 融点アガロースゲル上の電気泳動により精製する。68塩基対のアダプターおよ びその相補鎖を、5'TaqI突出末端およびヌクレオチド763から827ま でのEMCウイルスリーダー配列にマッチする配列を有する3'XhoI突出末 端とともに合成する。さらに、EMCウイルスリーダー中の位置10におけるA TGをATTに変更し、XhoI部位に続ける。pMT21 EcoRI−Xh oIフラグメント、EMCウイルスEcoRI−TaqIフラグメント、および 68塩基対のオリゴヌクレオチドアダプターであるTaqI−XhoIアダプタ ーのスリー・ウェイ(three way)結合によりベクターpEMC2β1を得る。 このベクターは、哺乳動物細胞における所望cDNAの高レベル発現を指令す る関係となっているSV40複製開始点ならびにエンハンサー、アデノウイルス 大後期プロモーター、アデノウイルス三分節リーダー配列の大部分のcDNAコ ピー、小型のハイブリッド介在配列、SV40ポリアデニレーションシグナルな らびにアデノウイルスVA I遺伝子、DHFRならびにβ−ラクタマーゼマー カーおよびEMC配列を含んでいる。 ベクター構造はBMP−12 DNA配列の修飾を含んでいてもよい。例えば 、コーディング領域の5'および 3'末端の非コーディングヌクレオチドを除去 することによりBMP−12 cDNAを修飾することができる。欠失された非 コーディングヌクレオチドを、発現に有益であることが知られている他の配列に 置換してもよく、置換しなくてもよい。これらのベクターをBMP−12蛋白発 現に適する宿主細胞中に形質転換する。さらに、配列番号:1のヌクレオチド 571から882までの成熟コーディング配列を単離し、他のBMP蛋白の完全 なプロペプチトをコードする配列5'末端配列を付加することにより、配列番号 :1の配列またはBMP−12蛋白をコードする他の配列を操作してBMP−1 2蛋白を発現させることができる。 例えば、当業者は、BMP−2プロペプチドをコードするDNA配列が正しい 読み取り枠において成熟BMP−12ペプチドをコードする配列に結合している DNAベクターを調製することにより、BMP−2のプロペプチドが作動可能な ように成熟BMP−12ペプチドに結合している融合蛋白を製造することができ る。かかる融合蛋白のDNA配列を配列番号:27に示す。 当業者は、コーディング配列に隣接する哺乳動物の調節配列を除去することに より、配列番号:1の配列を操作して上記のごとく細菌細胞による細胞内または 細胞外発現用の細菌ベクターを作り出すことができる。もう1つの例として、さ らにコーディング配列を操作することもできる(例えば、他の既知リンカーに結 合する、非コーディング配列を欠失させることにより修飾する、あるいは他の既 知方法によりヌクレオチドを変更する)。次いで、ティー・タニグチ(T.Tanigu chi)ら,プロナショナル・アカデミー・オブ・サイエンシズ・ユーエスエイ(Pr oc.Natl.Acad.Sci.USA)第77巻:5230〜5233頁の記載のごとき手順を 用いて、修飾されたBMP−12コーディング配列を既知細菌ベクター中に挿入 することができる。次いで、この代表的な細菌ベクターを細菌宿主細胞中に形質 転換し、それによりBMP−12を発現することができる。細菌細胞でのBMP −12蛋白の細胞外発現生産については、例えば、欧州特許出願EPA 177 ,343参照。 昆虫細胞における発現のための昆虫ベクターの構築を行うために同様の操作を することができる。酵母細胞による本発明因子の細胞内もしくは細胞外発現のた めに、酵母の調節配列を用いて酵母ベクターを構築することもできる[例えば、 公開されたPCT出願WO86/00639および欧州特許出願EPA123, 289参照]。 哺乳動物細胞における高レベルの本発明BMP−12蛋白の製造方法は、多コ ピーの異種BMP−12遺伝子を含む細胞の構築を包含してもよい。異種遺伝子 を増幅可能なマーカー、例えばジヒドロ葉酸レダクターゼ(DHFR)遺伝子に 結合する。ジヒドロ葉酸レダクターゼ遺伝子のために、増加した遺伝子コピーを 含む細胞をメトトレキセート(MTX)濃度を増加させていった場合の増殖につ いて選択できる(カウフマン(Kaufman)およびシャープ(Sharp),ジャーナル ・オブ・モレキュラー・マイオロジー(J.Mol.Biol.),第159巻:601〜6 29頁(1982年)の手順に従う)。このアプローチを多くの異なる細胞タイ プに関して用いることができる。 例えば、リン酸カルシウム共沈およびトランスフェクション、エレクトロポー レーションまたはプロトプラスト融合を包含する種々の方法により、その発現を 可能にする他のプラスミド配列に作動可能に結合した本発明BMP−12に関す るDNA配列を含むプラスミドおよびDHFR発現プラスミドpAdA26SV (A)3[カウフマンおよびシャープ,モレキュラー・セル・バイオロジー第2 巻:1304頁(1982年)]をDHFR欠損CHO細胞DUKX−BII中に 同時導入することができる。透析したウシ・胎児血清を含むアルファ培地での増 殖に関してDHFR発現形質転換体を選択し、次いで、カウフマンら,モレキュ ラー・セル・バイオロジー第5巻:1750頁(1983年)に記載されたよう にMXT濃度を増加させていった場合(例えば、連続的ステップでMXTを0. 02、0.2、1.0次いで、5μMとする)の増殖について選択する。形質転換 体をクローンし、下記実施例5において説明するローゼン−改変サムパス−レデ イラットアッセイ(the Rosen-modified Sampath-Reddi rat assay)により生物 学的に活性のあるBMP−12の発現をモニターする。BMP−12発現はMX T耐性レデイの増加に伴って増加するはずである。[35S]メチオニンもしく はシステインでのパルスラベリングおよびポリアクリルアミドゲル電気泳動のご とき当該分野において知られた標準的方法を用いてBMP−12ポリペプチドを 特徴づける。同様の手順に従って他の関連BMP−12蛋白を製造することがで きる。 実施例3BMP−2プロペプチド/BMP−12成熟ペプチド融合物の調製 BMP−2プロペプチド/BMP−12成熟ペプチド融合物をコードするベク ターを構築するために、以下のクローニング手順を用いて2つの配列を融合させ た。 まず、ヒトBMP−2蛋白のプロペプチドからなるDNA制限酵素フラグメン ト、すなわち、配列番号:27のヌクレオチド1から843からなるフラグメン トをpBMP2ΔEMCから切断する。pBMP2ΔEMCは、ヒト・BMP− 2蛋白に関する全コーディング配列からなるラムダU20S−39(ATCC# 40345)由来のプラスミドであり、BMP−2の非翻訳3'および5'配列を ベクターから欠失してある。使用5'制限酵素はBglIIであり、それはベクタ ー中のpBMP2ΔEMCをヌクレオチド979において切断する。使用3'制 限酵素はMaeIIであり、それはBMP−2プロペプチド中のpBMP2ΔEM Cをカルボキシ末端のわずかに手前のヌクレオチド1925において切断する。 次いで、得られた954塩基対の生成物をゲルにより単離し、遺伝子を精製した 。次に、ヒト・BMP−12成熟ペプチドDNA配列の5'部分からなるDNA 制限酵素フラグメントをpPCR1−1#2 V1−1(ATCC#69517 )から切断する。使用5'制限酵素はEaeIであり、それはヒト・BMP−1 2成熟ペプチド配列のN末端の丁度3'のところでpPCR1−1#2 V1− 1を切断する。得られた259塩基対の生成物をゲルにより精製し、遺伝子を精 製した。次いで、アニーリングした場合にヒト・BMP−2プロペプチドの最先 の3'末端とBMP−12成熟ペプチドの5'末端との融合配列からなる小型のD NAフラグメントを生じるように2つのDNAオリゴを設計し合成した。該DN Aフラグメントは、ヒト・BMP−2プロペプチドからなる3'制限酵素フラグ メントにアニールする5'MaeII相補性粘着末端を有する。アニールしたオリ ゴDNAフラグメントは、ヒト・BMPO−12成熟ペプチドからなる制限酵素 フラグメントの5'にアニールする3'EaeI相補性粘着末端を有する。コーデ ィング鎖オリゴをB2/12と命名し、それは13塩基対の長さである。 次に、BMP−12成熟ペプチドフラグメントの3'末端における123塩基対 をコードするDNAフラグメントを以下のようにして得た。まず、ヒト・BMP −2蛋白のプロペプチドからなるDNAフラグメント、すなわちヌクレオチド1 から846を、pBMP2ΔEMCからPCR増幅する。5'プライマー(オリ ゴ655a)はポリリンカーの丁度5'のところにアニールし、沈黙の変異によ りBglII制限酵素部位を導入する。得られたPCR生成物を、ポリリンカー中 で開裂するSalI、およびBglIIで切断した。850塩基対の制限酵素フラ グメント(アミノ酸配列REKEで終わる)をゲルにより精製し、遺伝子を精製 した。沈黙の変異によりBglII制限酵素部位をコードしていてアミノ酸配列S RCSから始まる成熟開裂生成物の5'末端にアニーリングする5'プライマー( オリゴ5−1)を用いてBMP−12成熟ペプチドをPCR増幅した。3'プラ イマー(V1−13)はBMP−12成熟ペプチド3'末端にアニーリングし、 ストップコドンの後ろにXbaI制限酵素部位を導入する。得られたPCR生成 物をBglIIおよびXbaIで切断した。321塩基対の制限酵素フラグメント をゲルにより精製し、遺伝子を精製した。 前以てSalIおよびXbaIで切断したベクター中に2つの制限フラグメン トをスリー・ウェイ結合させた。得られた構築物を配列決定してPCRにより誘 発されたエラーをチェックしたところ、沈黙のCからTへの変異がプロペプチド の塩基対185において観察された。このプラスミドをpREKRSRCと命名 した。次いで、pREKRSRCをBglIIおよびNgoMIで切断し、それに よりBMP−12成熟配列の123塩基対を包含するベクターフラグメントを単 離した。その3つの制限フラグメントおよびアニーリングしたオリゴリンカーを フォー・ウェイ(four way)結合して、BMP−12成熟ペプチドの(TAL) 5'末端に融合した3'末端における成熟開裂部位を伴ったBMP−2プロペプチ ドを有するpREKR−TALを得た。得られた結合ベクターのコーディング配 列を配列番号:27に示す。 実施例4発現されたBMP−12の生物学的活性 上記実施例2で得られた発現BMP−12蛋白の生物学的活性を測定するため に、細胞培養物から蛋白を回収し、同時生成される他の蛋白性物質ならびに他の 汚染物質からBMP−12蛋白を単離する。精製蛋白を下記実施例5のアッセイ に従ってアッセイしてもよい。 当業者に知られた標準的方法を用いて精製を行う。 クーマシーブルーまたは銀[オウクリー(Oakley)ら,アナリティカル・バイ オケミストリー(Anal.Biochem.)第105巻:361頁(1980年)]で染 色するSDS−PAGEアクリルアミド[レムリ(Laemmli),ネイチャー(Natu re)第227巻:680頁(1970年)]のごとき標準的方法を用い、さらに イムノブロット[トウビン(Towbin)ら,プロシーディングス・オブ・ナショナ ル・アカデミー・オブ・サイエンシズ・ユーエスエイ(Proc.Natl.Acad.Sci.USA )第76巻:4350頁(1979年)]により、蛋白分析を行う。 実施例5ローゼン改変サムパス−レデイアッセイ サムパス(Sampath)およびレディ(Reddi),プロシーディングス・オブ・ナ ショナル・アカデミー・オブ・サイエンシズ・ユーエスエイ(Proc.Natl.Acad.S ci.USA)第80巻:6591〜6595頁(1983年)記載のラット異所性イ ンプラントアッセイの改変バージョンを用いてBMP−12蛋白の活性を評価す る。この改変アッセイを本明細書においてローゼン−改変サムパス−レディアッ セイと呼ぶ。サムパス−レディ法のエタノール沈殿工程を、アッセイすべきフラ クションを水に対して透析(組成物が溶液の場合)または限界濾過(組成物が懸 濁液の場合)することに置き換える。次いで、溶液または懸濁液を0.1%TF Aに対して平衡化する。得られた溶液を20mgのラット・マトリックスに添加 する。蛋白で処理されない模擬ラット・マトリックス試料は対照として役立つ。 この材料を凍結乾燥し、得られた粉末を#5ゼラチンカプセルに封入する。21 〜49日齢のロング・エバンズ・ラット(Long Evans Rats)の腹胸部位の皮下 にカプセルを移植する。10日後にインプラントを除去する。各インプラントの 切片を固定し、組織学的分析用に処理する。1μmのグリコールメタクリレート 切片をフォン・コッサ(Von Kossa)および酸フクシンで染色して各インプラン トに存在する誘導された腱/靭帯様組織量のスコアをつける。 インプラント1個あたり1、5、25および50μgの用量でBMP−12を 10日間移植した。5μgの用量のBMP−2は陽性対照として役立った。試験 したすべてのBMP−12用量に関して、10日後にインプラントにおいて骨ま たは軟骨の形成は観察されなかった。そのかわり、同じ平面に並んでおり互いに 固く充填されている線維芽細胞の高密度の束の存在により容易に認識される、胚 性の腱に類似した組織でインプラントが満たされていた[腱/靭帯様組織は、例 えば、ハム(Ham)およびコーマック(Cormack),ヒストロジー(Histology) (JB・リッピンコット・カンパニー(JB Lippencott Co.)(1979年), 367〜369頁に記載されており、引用によりその開示を本明細書に記載され ているものとみなす]。腱/靭帯様組織がすべてのBMP−12含有インプラン トに存在していた次のセットのアッセイにおいてこれらの知見が再び得られた。 対照的に、期待されたように、BMP−2インプラントは骨および軟骨の形成を 示したが、腱/靭帯様組織を含んでいなかった。 本発明BMP−12蛋白および関連蛋白をこのアッセイにおける活性に関して 評価してもよい。 実施例6 上記実施例による方法を用い、当業者が行える範囲内のわずかな変更を行って 、ヒトMP52蛋白およびBMP−13のネズミ・相同体を発現し、腱/靭帯様 組織誘導活性に関してアッセイした。すべての蛋白は、BMP−12に関して上 に記載した結果と同等の結果を示した。 上記記載は、本発明の目下好ましい具体例を詳述するものである。これらの記 載を考慮して本発明の実施における多くの改変および変更が当業者により行われ ると考えられる。それらの改変および変更は添付した請求の範囲に包含されると 確信する。本明細書において議論したすべての文献の開示を引用により本明細書 に記載されているものとみなす。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI C12N 5/10 9281−4B C12N 5/00 B C12P 21/02 9051−4C A61K 37/36 ADT //(C12N 1/21 C12R 1:19) (C12P 21/02 C12R 1:91) (C12P 21/02 C12R 1:19) (31)優先権主張番号 08/333,576 (32)優先日 1994年11月2日 (33)優先権主張国 米国(US) (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FR,GB,GR,IE,IT,LU,M C,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF,CG ,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,SN, TD,TG),AU,CA,CN,FI,HU,JP, KP,KR,NO,RU (72)発明者 セレスト,アンソニー・ジェイ アメリカ合衆国マサチューセッツ州01749、 ハドソン、パッカード・ストリート86番 (72)発明者 ウォズニー,ジョン・エム アメリカ合衆国マサチューセッツ州01749、 ハドソン、オールド・ボルトン・ロード59 番 (72)発明者 ローゼン,ビッキー・エイ アメリカ合衆国マサチューセッツ州02146、 ブルックライン、キルシス・ロード・ナン バー7・127番 (72)発明者 ウルフマン,ニール・エム アメリカ合衆国マサチューセッツ州02030、 ドーバー、ローリング・レーン30番 (72)発明者 トムセン,ジェラルド・エイチ アメリカ合衆国ニューヨーク州11777、ポ ート・ジェファーソン、ベイビュー・テラ ス201番 (72)発明者 メルトン,ダグラス・エイ アメリカ合衆国マサチューセッツ州02173、 レキシントン、スローカム・ロード22番

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.BMP−12関連蛋白をコードする単離DNA配列からなるDNA分子。 2.DNA配列が (a)配列番号:1のヌクレオチド#496、#571もしくは#577から #882まで; (b)配列番号:25のヌクレオチド#605もしくは#659から#964 まで;および (c)厳密ハイブリダイゼーション条件下で(a)または(b)にハイブリダ イゼーションし、腱/靭帯様組織を形成する能力を示すBMP−12関連蛋白を コードしている配列 からなる群より選択される請求項1記載のDNA分子。 3.DNA配列が、 (a)配列番号:2のアミノ酸#−25、#1もしくは#3から#104まで をコードするヌクレオチド; (b)5'から3'方向において、ネイティブなBMP−12プロペプチドおよ びBMP蛋白プロペプチドからなる群より選択されるプロペプチドをコードする ヌクレオチド;および配列番号:2のアミノ酸#−25、#1もしくは#3から #104までをコードするヌクレオチド;および (c)配列番号:26のアミノ酸#1もしくは#19から#120までをコー ドするヌクレオチド; (d)5'から3'方向において、ネイティブなBMP−12プロペプチドおよ びBMP蛋白プロペプチドからなる群より選択されるプロペプチドをコードする ヌクレオチド;および配列番号:26のアミノ酸#1もしくは#19から#12 0までをコードするヌクレオチド; (e)厳密ハイブリダイゼーション条件下で(a)から(d)のいずれかにハ イブリダイゼーションし、軟骨および/または骨を形成する能力を示すBMP− 12関連蛋白をコードしている配列 からなる群より選択される、請求項1記載のDNA配列からなるDNA分子。 4.請求項1記載のDNA分子で形質転換された宿主細胞。 5.請求項2のDNA分子で形質転換された宿主細胞。 6.請求項3のDNA分子で形質転換された宿主細胞。 7.腱/靭帯様組織の形成を誘導する能力により特徴づけられるBMP−12 蛋白をコードする配列を有する単離DNA分子であって、 (a)配列番号:1のヌクレオチド#496、#571もしくは#577から #882まで; (b)配列番号:25のヌクレオチド#605もしくは#659から#964 まで;および (c)(a)または(b)の天然に存在する対立遺伝子配列および等価な縮重 コドン配列 からなる群から選択されるDNA配列からなるDNA分子。 8.請求項7のDNA分子で形質転換された宿主細胞。 9.請求項7のDNA分子からなるベクターであって、該DNA分子がそのた めの発現調節配列に作動可能に結合しているベクター。 10.請求項9のベクターで形質転換された宿主細胞。 11.以下の工程: (a)BMP−12関連蛋白をコードするヌクレオチド配列からなる請求項2 記載のDNA分子で形質転換された宿主細胞を培養し;次いで、 (b)培地から該BMP−12関連蛋白を回収し精製する からなる精製BMP−12蛋白の製造方法。 12.以下の工程: (a)BMP−12関連蛋白をコードするヌクレオチド配列からなる請求項3 記載のDNA分子で形質転換された宿主細胞を培養し;次いで、 (b)培地から該BMP−12関連蛋白を回収し精製する からなる精製BMP−12関連蛋白の製造方法。 13.以下の工程: (a)BMP−12関連蛋白をコードするヌクレオチド配列からなる請求項7 記載のDNA分子で形質転換された宿主細胞を培養し;次いで、 (b)培地から該BMP−12関連蛋白を回収し精製する からなる精製BMP−12関連蛋白の製造方法。 14.以下の群: (a)配列番号:2に示すアミノ酸#−25からアミノ酸#104まで; (b)配列番号:2に示すアミノ酸#1からアミノ酸#104まで; (c)配列番号:2に示すアミノ酸#3からアミノ酸#104まで; (d)配列番号:26に示すアミノ酸#1からアミノ酸#120まで;および (d)配列番号:26に示すアミノ酸#19からアミノ酸#120までから選 択されるアミノ酸配列からなる精製ポリペプチド。 15.それぞれが請求項14のアミノ酸配列を有する2つのサブユニットから なるダイマー形態である精製ポリペプチド。 16.(a)配列番号:1に示すヌクレオチド#496、#571もしくは# 577から#882までのヌクレオチド配列からなるDNA分子で形質転換され た細胞を培養し;次いで、 (b)配列番号:2に示すアミノ酸#−25、アミノ酸#1もしくはアミノ酸 #3からアミノ酸#104までのアミノ酸配列からなる蛋白を該培地から回収し 精製する工程により製造される精製蛋白。 17.腱/靭帯様組織の形成を誘導する能力により特徴づけられる精製BMP −12関連蛋白。 18.医薬上許容される担体と混合された有効量の請求項17のBMP−12 関連蛋白からなる医薬組成物。 19.患者に有効量の請求項18の組成物を投与することからなる、腱/靭帯 様組織の形成を必要とする患者における腱/靭帯様組織の形成を誘導する方法。 20.医薬上許容される担体中の有効量のBMP−12関連蛋白の蛋白からな る、腱/靭帯様組織の治癒および組織の修復のための医薬組成物。 21.患者に有効量の請求項20の組成物を投与することからなる、腱炎また は他の腱もしくは靭帯の欠損の治療を必要とする患者における腱炎または他の腱 もしくは靭帯の欠損の治療のための方法。 22.BMP−12関連ポリペプチドをコードするDNA配列に正しい読み取 り枠において結合しているTGF−βスーパーファミリーの蛋白のメンバー由来 のプロペプチドをコードするDNA配列からなるキメラDNA分子。 23.プロペプチドがBMP−2由来のプロペプチドである請求項22記載の キメラDNA分子。 24.請求項14のポリペプチドのアミノ酸配列を有する1つのモノマーと、 TGF−βスーパーファミリーの蛋白のアミノ酸配列を有する1つのモノマーと からなるヘテロダイマー蛋白分子。 25.(a)配列番号:1のヌクレオチド#496、#571もしくは#57 7から#882まで; (b)配列番号:3のヌクレオチド#845もしくは#899から#1204 まで; (c)配列番号:25のヌクレオチド#605もしくは#659から#964 まで;および (d)厳密条件下で(a)、(b)または(c)にハイブリダイゼーションし 、腱/靭帯様組織を形成する能力を示す蛋白をコードしている配列 からなる群より選択されるDNA配列によりコードされる蛋白からなる有効量の 組成物を患者に投与することからなる、腱/靭帯様組織形成の誘導を必要とする 患者における腱/靭帯様組織形成の誘導方法。 26.(a)配列番号:2のアミノ酸#−25、#1もしくは#3から#10 4まで; (b)配列番号:4のアミノ酸#1もしくは#19から#120まで; (c)配列番号:26のアミノ酸#1もしくは#19から#120まで;およ び (d)腱および/または靭帯を形成する能力を示す(a)、(b)または(c )の変異体および/または変種 からなる群より選択されるアミノ酸配列を有する腱/靭帯様組織誘導蛋白からな る有効量の組成物を患者に投与することからなる、腱/靭帯様組織形成を必要と する患者における腱/靭帯様組織形成の誘導方法。 27.医薬上許容される担体中の有効量のBMP−12関連蛋白からなる、腱 /靭帯様組織の修復のための医薬組成物。 28.患者に有効量の請求項27の組成物を投与することからなる、腱炎また は他の腱もしくは靭帯の欠損の治療を必要とする患者における腱炎または他の腱 もしくは靭帯の欠損の治療方法。
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