WO2007090967A2 - Domaine peptidique necessaire a l'interaction entre l'enveloppe d'un virus appartenant au groupe d'interference de herv-w et un recepteur hasct - Google Patents

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Definitions

  • the present invention relates to a polypeptide domain responsible for interactions between a retroviral envelope of the HERV-W interference group and hASCT family receptors.
  • Endogenous human retroviruses make up 8% of the human genome and are involved in both pathologies and non-pathological phenomena.
  • HERV-W human endogenous retrovirus family W
  • HERV-W envelope protein also called syncytin
  • syncytin is a fusogenic glycoprotein involved in the formation of the syncytiotrophoblastic layer of the placenta. It is encoded by the env gene of the ERVW1 proviral locus and synthesized as a gPr73 precursor that is specifically cleaved into two mature proteins, a gp50 (TM) subunit gp50 (SU) and a transmembrane subunit.
  • syncytin In vitro, the syncytin of the HERV-W family induces a cell-to-cell fusion dependent on its interaction with an amino acid receptor-transporter of the ASCT family (h-ASCT2, hASCT1). Phylogenic studies have shown that syncytin is related to a group of retroviruses, including the endogenous RDI 14 cat virus, the endogenous BaEV monkey virus, simian retroviruses and avian retroviruses: avian reticuloendotheliosis virus REV-A and SNV 3 spleen necrosis virus all having in common neutral 2-type sodium or hASCT2 neutral amino acid receptor-transporter (Rasko et al., 1999, Proc Natl Acad Sci USA Vol 96, pp.
  • envelope / ASCT receptor and / or cell fusion that may be involved in tumor formation, metastatic cell proliferation or drug resistance phenomena (see for illustration the publication "This Fusion: A hidden enemy ?, Cancer CeIl: May 2003 Vol.3), to block the envelope / receptor interaction phenomenon ASCT and / or cell fusion that may be involved in diseases of the nervous system or even to inhibit the cell-cell fusion involved in the differentiation trophoblastic (contraceptive vaccination).
  • inhibition of hASCT envelope / receptor interaction could prevent tumor propagation by opposing local immunosuppression that may result from hASCT envelope / receptor interaction.
  • the binding of the Env-HERV-W protein to receptors normally expected to carry the amino acids required for the synthesis of neuromediators may affect the ability of neurons to synthesize neuromediators by reducing the entry of physiological agonists such as amino acids. via the ASCT receivers.
  • the inventors have identified the polypeptide region responsible for interactions between the envelope of a virus belonging to the HERV-W interference group and a hASCT receptor.
  • the present invention relates to a peptide domain required for the interaction between the envelope of a virus belonging to the HERV-W interference group and a hASCT receptor, defined as starting with an N-terminus. terminates and terminates at a C-terminus, and in that: the N-terminus is defined by a motif consisting of amino acids (Z) ⁇ -Proline-Cysteine-X-Cysteine in which
  • Z is any amino acid ⁇ is an integer between 2 and 30
  • X is any amino acid, said pattern being selected from SEQ ID No. 1 to SEQ ID No. 29 and SEQ ID No.
  • the C-terminus is defined by a pattern, consisting of amino acids Serine-Aspartic Acid-X a -X b -X c -X d -X e Acide-Aspartic -Xg- X f (Z) p in which
  • X 3 , Xb, X 0 , Xd, Xe, Xf 5 Xg 5 are any amino acids
  • Z is any amino acid ⁇ is an integer between 15 and 25, preferentially said unit being selected from SEQ ID No. 30 at SEQ ID NO: 40, and in that said peptide domain comprises, between the N-terminus and the C-terminus, at least one of the following motifs:
  • X 6 -Cysteine wherein X 2 , X 3 , X 4 , X 5 , X 6 are any amino acids, said unit corresponding to SEQ ID No. 41
  • peptide domain is understood to mean a minimum zone of the envelope of a HERV-W interference group virus required for recognition of a hASCT receptor
  • the peptide domains of the invention may be obtained by the genetic engineering technique which comprises the steps of:
  • interference group is meant all viruses whose infection (expression) of a cell by one of its members prevents infection by another member of the group by receptor interference.
  • any amino acid is meant in particular an amino acid selected from arginine, histidine, lysine, aspartic acid, glutamic acid, asparagine, glutamine, serine, threonine, asparagine, threonine, alanine, isoleucine, leucine, methionine, phenylalanine, tryptophan, tyrosine, valine, cysteine, glycine, proline.
  • hASCT receptor is meant any neutral sodium-dependent amino acid transporter.
  • ⁇ is an integer between 3 and 18.
  • X or Xaa of the Pro Cys Xaa Cys motif in SEQ ID No. 1 to SEQ ID No. 29 is an amino acid selected from aspartic acid, glutamic acid, arginine: these sequences are preferably selected from SEQ ID NO: 44 to SEQ ID NO: 72.
  • X a, X b, X c or the amino acids in position 3, 4 and 5 of SEQ ID NOS: 30-40 are glycine, or X d amino acid Xaa at position 6 of SEQ ID Nos. 30 to 40 is an amino acid selected from proline and valine; Xe or amino acid Xaa at position 7 of SEQ ID Nos.
  • 30 to 40 is an amino acid selected from glutamine, leucine and threonine; X f or the amino acid Xaa at position 9 of SEQ ID Nos. 30 to 40 is an amino acid chosen from lysine, threonine and methionine. and glutamine, X g or the amino acid at position 10 of SEQ ID Nos. 30 to 40 is an amino acid selected from alanine, lysine, isoleucine, threonine and valine.
  • ⁇ is an integer equal to 20.
  • X 2 or amino acid Xaa in position 3 of SEQ ID No. 41 is an amino acid selected from asparagine, threonine, glutamic acid, histidine, X 3 or amino acid Xaa in position 4 of SEQ ID NO: 41 is an amino acid selected from histidine, alanine, serine, lysine, glutamic acid; X 4 or amino acid Xaa at position 5 of SEQ ID NO : 41 is an amino acid selected from tyrosine, threonine, alanine, X 5 or amino acid Xaa at position 6 of SEQ ID No. 41 is an amino acid selected from glutamine, arginine, threonine, X 6 or the amino acid Xaa at position 7 of SEQ ID NO: 41 is an amino acid selected from leucine, glutamine, glutamic acid.
  • X 7 or the amino acid Xaa in position 2 of SEQ ID No. 42 is an amino acid selected from proline, threonine, arginine and asparagine;
  • X 11 or amino acid Xaa at position 6 of SEQ ID NO: 42 is an amino acid selected from lysine, valine, isoleucine, leucine, X 12 or amino acid Xaa at position 7 of SEQ ID No.
  • SEQ ID NO: 42 is an amino acid selected from glycine, asparagine; X 13 or amino acid Xaa at position 8 of SEQ ID NO: 42 is an amino acid selected from glutamine, lysine, valine, X 14 or amino acid Xaa at position 9 of SEQ ID NO: 42 an amino acid selected from valine, proline, serine, threonine, X 15 or the amino acid Xaa at position 10 of SEQ ID No. 42 is an amino acid selected from valine, isoleucine.
  • the amino acid Xaa at position 2 of SEQ ID NO: 73 is chosen from Proline, Threonine, Arginine and Asparagine.
  • the amino acid Xaa at position 3 of SEQ ID NO: 73 is chosen from glycine, glutamic acid, asparagine amino acid Xaa at position 4 of SEQ ID NO: 73 is selected from glycine,
  • Pasparagine, isoleucine, threonine, serine amino acid Xaa at position 5 of SEQ ID NO: 73 is selected from lysine, valine, isoleucine, leucine amino acid Xaa at position 6 of SEQ ID NO : 73 is selected from glycine, asparagine amino acid Xaa at position 7 of SEQ ID NO: 73 is selected from glutamine, lysine, valine amino acid Xaa at position 8 of SEQ ID NO: 73 is selected from valine, proline, serine, threonine amino acid Xaa at position 9 of SEQ ID NO: 73 is selected from valine, isoleucine
  • the invention also relates to a nucleotide sequence coding for a peptide domain according to the invention above.
  • sequences can be prepared by chemical synthesis and genetic engineering using techniques well known to those skilled in the art and described for example in Sambrook J. et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 1989.
  • the invention also relates to an epitope derived from the peptide domain according to the invention, characterized in that it induces an immune response against a virus belonging to the interference group of HERV-W
  • epitope all or part of the peptide domain according to the invention recognized by a receptor on the surface of a B or T lymphocyte or a circulating antibody.
  • immune response is meant the set of biological mechanisms that allow a multicellular organism to maintain the coherence of the cells and tissues that constitute it and to ensure its integrity in response to any aggression that modifies the molecular structures of its constituents or introducing foreign molecules into the body.
  • the invention also relates to a nucleotide sequence encoding an epitope as defined above.
  • sequences can be prepared by chemical synthesis and genetic engineering using techniques well known to those skilled in the art and described for example in Sambrook J. et al.,
  • the invention also relates to an expression vector characterized in that it comprises a nucleotide sequence according to the invention, as well as the means necessary for its expression.
  • Exemplary expression vectors include, for example, plasmids, vaccinia virus type viral vectors, adenovirus, baculovirus, poxvirus, retrovirus, bacterial vectors of salmonella type, BCG.
  • any means which makes it possible to obtain a peptide from a nucleotide sequence such as in particular a promoter, a transcription terminator, an origin of replication and preferably a selection marker.
  • the vectors of the invention may also include sequences necessary for targeting the peptides to particular cell compartments.
  • the invention also relates to a microorganism or host cell transformed with at least one expression vector according to the invention.
  • microorganisms which are suitable for the purposes of the invention include yeasts, such as those of the following families: Saccharomyces,
  • Kluveromyces lactis being preferred; and bacteria, such as E. coli and those of the following families: Lactobacillus, Lactococcus, Salmonella, Streptococcus, Bacillus and Streptomyces.
  • transformed host cells include cells from animals such as mammals, reptiles, insects and the like.
  • the preferred eukaryotic cells are cells from the Chinese hamster (cells CHO), monkey (COS and Vero cells), young hamster kidney (BHK cells), pig kidney (PK 15 cells) and rabbit kidney (RK1 3 cells, human osteosac- cells 143B), HeLa human cell lines and human hepatoma cell lines (Hep G2 cell type), as well as insect cell lines (for example from Spodoptera frugiperda), a human embryonic kidney cell line.
  • the host cells can be provided in suspension or vial cultures, in tissue cultures, organ cultures, and the like.
  • the invention also relates to an antibody directed against a peptide domain according to the invention. or against an epitope according to the invention.
  • antibody By antibody is meant both an entire antibody and an antibody fragment.
  • the recombinant antibodies can be obtained according to standard methods known to those skilled in the art, from prokaryotic organisms, such as bacteria, or from eukaryotic organisms, such as yeasts, mammalian cells, plant cells, insects or animals, or by extracellular production systems.
  • the monoclonal antibodies can be prepared according to conventional techniques known to those skilled in the art, such as the hybridoma technique, the general principle of which is recalled below. Firstly, an animal, usually a mouse (or cells cultured in the context of in vitro immunizations) is immunized with a target antigen of interest, whose B lymphocytes are then capable of producing antibodies against the said antigen. antigen.
  • lymphocytes are then fused with "immortal" myeloma cells (murine in the example) to give rise to hybridomas.
  • the cells capable of producing a particular antibody and of multiplying indefinitely are then selected.
  • Each hybridoma is multiplied in the clone form, each leading to the production of a monoclonal antibody whose recognition properties with respect to the antigen of interest can be tested, for example by ELISA, by immunoblotting in one or two-dimensional, in immunofluorescence, or with a biosensor.
  • Monoclonal antibodies as well selected, are subsequently purified especially according to the affinity chromatography technique.
  • antibody fragment any antibody fragment resulting from an immune response against a virus belonging to the HERV-W interference group.
  • These antibody fragments may for example be obtained by proteolysis. Thus, they can be obtained by enzymatic digestion, resulting in Fab-type fragments (papain treatment, Porter RR, 1959, Biochem J., 73: 119-126) or F (ab) ' 2 type (treatment pepsin, Nisonoff A. et al, 1960, Science, 132: 1770-1771). They can also be prepared recombinantly (Skerra A., 1993, Curr Opin Immunol., 5: 256-262).
  • Another antibody fragment which is suitable for the purposes of the invention comprises a fragment Fv which is a dimer consisting of the non-covalent association of the light variable domain (VL) and the heavy variable domain (VH) of the Fab fragment, therefore of the association of two polypeptide chains.
  • this Fv fragment can be modified by genetic engineering by inserting a suitable peptide link between the VL domain and the VH domain (Huston P. et al., 1988 Proc Natl.Acad Sci.USA 85: 5879-5883).
  • fragment scFv single chain Fragment variable
  • the use of a peptide bond preferably composed of 15 to 25 amino acids makes it possible to connect the C-terminal end of one domain to the N-terminus of the other domain, thus constituting a monomeric molecule with properties similar to those of the antibody in its complete form.
  • the two orientations of the VL and VH domains are suitable (VL-link-VH and VH-link-VL) because they have identical functional properties.
  • VL-link-VH and VH-link-VL any fragment known to those skilled in the art and having the immunological characteristics defined above are suitable for the purposes of the invention.
  • the invention also relates to the use of at least one peptide domain according to the invention, of at least one epitope according to the invention, of at least one antibody according to the invention or of at least one nucleotide sequence according to the invention.
  • the invention for the preparation of a medicament for inhibiting, preventing or treating an infection caused by a virus belonging to the HERV-W in an animal, preferably the man.
  • the peptide domain according to the invention can in particular be used to target cells expressing a receptor of the hASCT family in order to transduce a signal, modulate the flow of amino acids (cancer treatments).
  • elements necessary for a constitutive expression of the peptides is meant a ubiquitous or specific promoter of eukaryotic cells.
  • elements necessary for inducible expression of peptides mention may be made of the regulatory elements of the E. coli operon for tetracycline resistance (Gossen M. et al., Proc Natl Acad Sci USA, 89: 5547 5551 (1992).
  • the use of at least one peptide domain according to the invention, at least one epitope according to the invention, or at least one nucleotide sequence according to the invention is particularly suitable for the preparation of a medicament intended to preventing an infection caused by a virus belonging to the interference group of HERV-W in an animal, preferably the human.
  • the use of at least one antibody according to the invention is particularly suitable for the preparation of a medicament intended for the inhibition or the treatment of an infection or a pathology induced by a virus belonging to the interference group of HERV-W in an animal, preferably man.
  • the invention also relates to a pharmaceutical composition
  • a pharmaceutical composition comprising, as active substance, at least one peptide domain according to the invention, at least one epitope according to the invention, or at least one of the nucleotide sequences according to the invention, in particular placed under the control of elements necessary for constitutive and / or inducible expression of said peptide domains or epitopes, in association with a pharmaceutically appropriate vehicle.
  • the invention also relates to a pharmaceutical composition comprising as active substance, at least one antibody according to the invention, in combination with a pharmaceutically suitable vehicle.
  • the active substance for oral, sublingual, subcutaneous, intramuscular, intravenous, topical, intratracheal, rectal, transdermal administration, can be administered in unit dosage forms or in admixture with conventional pharmaceutical carriers, and intended for oral administration, for example in the form of a tablet, capsule, oral solution, etc., or rectally, in the form of a suppository parenterally, in particular in the form of an injectable solution, especially intravenously, intradermally, subcutaneously, etc., according to standard protocols well known to those skilled in the art.
  • the active substance can be used in creams, ointments, lotions, eye drops.
  • the active substance is mixed with a pharmaceutically acceptable excipient also called a pharmaceutical vehicle, such as gelatin, starch, lactose, magnesium stearate, talc, gum arabic. or the like.
  • a pharmaceutically acceptable excipient also called a pharmaceutical vehicle, such as gelatin, starch, lactose, magnesium stearate, talc, gum arabic. or the like.
  • the tablets may be coated with sucrose, a cellulose derivative, or other suitable materials. They can also be treated in such a way that they have prolonged or delayed activity and that they continuously release a predetermined quantity of the active substance.
  • a preparation in capsules can also be obtained by mixing the active substance with a diluent and pouring the mixture into soft or hard gelatin capsules.
  • a preparation in the form of a syrup or for administration in the form of drops in which the active substance is present together with a sweetening agent, an antiseptic, such as, in particular, methylparaben and propylparaben, and a reducing agent. taste or a suitable color.
  • the water-dispersible powders or granules may contain the active substance in admixture with dispersants or wetting agents, or suspending agents, well known to those skilled in the art.
  • dispersants or wetting agents or suspending agents, well known to those skilled in the art.
  • aqueous suspensions, isotonic saline solutions or sterile and injectable solutions which contain dispersing agents, pharmacologically compatible wetting agents, such as in particular propylene glycol or butylene glycol.
  • the drug or pharmaceutical composition according to the invention may further comprise an activating agent which induces the effects of a medication or enhances or supplements the effects of the main medication, in particular by increasing the bioavailability of the main medication.
  • the dosage depends on the severity of the condition, and will be adapted according to a conventional protocol.
  • the weekly dose is 1 to 10 mg / kg, in combination with a pharmaceutically acceptable excipient.
  • the invention also relates to a diagnostic composition for the detection and / or quantification of a virus belonging to the HERV-W interference group or the detection and / or quantification of an immune response against said virus, comprising at least a peptide domain according to the invention, at least one epitope according to the invention, at least one of the nucleotide sequences according to the invention, or at least one antibody according to the invention.
  • a diagnostic composition comprising at least one peptide domain according to the invention, at least one epitope according to the invention, at least one of the nucleotide sequences according to the invention, is particularly suitable if it is desired to determine whether a patient presents an immune response against a virus belonging to the interference group of HERV-W whereas a diagnostic composition comprising at least one antibody according to the invention is particularly suitable for the detection and / or quantification of a virus belonging to the HERV-interference group. W.
  • the invention also relates to a method for detecting and / or quantifying a virus belonging to the interference group of HERV-W in a biological sample taken from an individual likely to be infected with said virus, characterized in that includes the steps of: contacting said biological sample with at least one antiproton according to the invention under conditions allowing the formation of a complex between the virus and the antibody, and
  • biological sample is meant a biological sample of human or animal origin likely to contain said virus such as a sample of blood, plasma, serum, urine, cephalo-spinal fluid, or tissues such as placenta, testicles, prostate, breast.
  • the contacting step is a step conventionally known to those skilled in the art.
  • the detection / quantification step may be carried out by any detection means known in the field of immunological assays for very small molecules, such as direct detection, that is to say without the intermediary of partner (s) of binding, and indirect detection, ie via link partner (s).
  • detection means known in the field of immunological assays for very small molecules, such as direct detection, that is to say without the intermediary of partner (s) of binding, and indirect detection, ie via link partner (s).
  • the direct detection of the binding between the antibody or antibody fragment of the invention and the virus can be carried out for example by surface plasmon resonance or by cyclic voltammetry on an electrode carrying a conductive polymer.
  • the antibody of the invention serves to immunocapture all or part of the virus, which is then eluted. Elution can be carried out by any elution method known to those skilled in the art, such as a pH shock.
  • the second step of the process of the invention can be carried out according to the conventional competitive ELISA technique.
  • the antibody of the invention then serves as a binding partner for the capture of all or part of the virus in the sample.
  • the detection can then be implemented by competition between all or part of the virus that may be contained in the test sample and a known amount of previously labeled virus.
  • Marking means the fixing of a marker capable of directly or indirectly generating a detectable signal.
  • a non-limiting list of these markers consists of:
  • enzymes that produce a detectable signal for example by colorimetry, fluorescence, luminescence, such as horseradish peroxidase, alkaline phosphatase, acetylcholine esterase, ⁇ -galactosidase, glucose-6-phosphate dehydrogenase,
  • chromophores such as luminescent compounds, dyes
  • radioactive molecules such as 32P, 35 S or 1251
  • fluorescent molecules such as fluorescein, rhodomine,
  • ligand / anti-ligand pairs are well known to those skilled in the art, and there may be mentioned, for example, the following pairs: biotin / streptavidin, biotin / avidin, hapten / antibody, antigen / antibody, peptide / antibody, sugar / In this case, it is the ligand which is bound to the binding partner, the anti-ligand can be detectable directly by the markers described in the preceding paragraph or can itself be detectable by a ligand.
  • reagents allowing the visualization of the marking.
  • Such reagents are widely known to those skilled in the art and are described in particular in Principles and Practice of Immunoessay, 2nd Edition, Edited by C. Price, DJ. Newman Stockton Press, 1997, 345 South Park Avenue, New York.
  • the invention also relates to the use of the above composition for the in vitro diagnosis of a virus belonging to the HERV-W interference group in a biological sample or sample.
  • the early diagnosis of a virus such as SRV1 and SRV2, viruses involved in immunodeficiency mechanisms in monkeys makes it possible to propose a treatment adapted to the host before the appearance of an immunodeficiency.
  • the early diagnosis of HERV-W which is involved in placental pathologies, makes it possible to modulate its expression, for example during preeclampsia.
  • the invention also relates to the use of a peptide domain according to the invention or of an epitope according to the invention, or of an antibody according to the invention for inhibiting the interaction between the envelope of a virus belonging to to the interference group of HERV-W and an ASCT receiver. This makes it possible to obtain a contraceptive immunotherapy.
  • the invention also relates to the use of a peptide domain according to the invention for identifying chemical or biological molecules whose interaction with all or part of this peptide domain, blocks the interaction between the envelope of a virus belonging to to the interference group of HERV-W and an ASCT receiver.
  • a peptide domain according to the invention of HERV-W is used, this makes it possible to obtain in particular chemical or biological molecules that are very suitable for obtaining a contraceptive treatment.
  • the use of such chemical molecules to inhibit the interaction between the envelope of a virus belonging to the HERV-W interference group and an ASCT receptor is of therapeutic interest.
  • two generic methods for screening chemical or biological molecules capable of inhibiting the env / receptor interaction are described below.
  • a chemical or biological molecule alters the env / receptor interaction according to an ELISA type method using cells expressing at least one hASCT receptor during the capture phase.
  • cells expressing a hASCT receptor of interest are cultured or adsorbed, and interaction env / receiver is detected via the use of a labeled soluble envelope (histidine tag, GPF fusion) 5 and therefore capable of generating a measurable reference signal. If after preincubation of said soluble envelope with a chemical or biological molecule, a reduction of the signal is observed, it means that the chemical or biological molecule alters the env / receptor interaction.
  • a retroviral vector pseudotyped by the envelope of interest and expressing a detectable marker (LacZ) and proceed to the same test. It is also possible to select molecules of interest via a melt inhibition measurement.
  • Cells expressing the receptor of interest (cell-recept), for example HeLa or XC-RDR cells as well as cells constitutively expressing a marker (for example lacZ) as well as transiently or stably the envelope of interest ( cell-env-LacZ) are used; the envelope of interest was previously modified at its intracytoplasmic tail by exchange with the intracytoplasmic domain of env HERV-W in order to make it constitutively fusogenic (Cheynet et al., 79 (9): 5586-5593, 2005) .
  • the invention also relates to the use of a peptide domain according to the invention for generating antibodies blocking the interaction between the envelope of a virus belonging to the HERV-W interference group and a hASCT receptor.
  • the invention also relates to a method for determining a polypeptide region necessary for the interaction between the envelope of a virus belonging to the HERV-W interference group and a hASCT receptor characterized in that: * the nucleotide sequence is identified and / or peptide of the precursor envelope of said virus "We exclude the signal part
  • a serum-Aspartic acid-X domain is detected at -X b -X c -X d -X e -Aspartic acid-X f -X g in which X a , Xb, Xc, Xd, Xe, Xf, Xg, are any amino acids that corresponds to SED ID No. 43
  • X a , Xb 5 X c is an amino acid which is glycine
  • X d is an amino acid selected from proline and valine
  • X e is an amino acid selected from glutamine, leucine, threonine
  • X f is an amino acid selected from lysine, threonine, methionine, glutamine
  • X g is an amino acid selected from alanine, lysine, isoleucine, threonine, valine.
  • nucleotide sequence and / or peptide sequence of the precursor envelope of said virus is identified by any means known to those skilled in the art, which may notably refer to Maniatis (Ed 1989).
  • the signal part is excluded by any means known to those skilled in the art as described in particular in "Improved Prediction of Signal Peptide: Signal P 3.0" Jannick Dyrlerv Bendtsen, Henrik Nielsen, Gunnar von Heijne and S0ren Brunak. Mol. Biol., 340: 783-795, 2004.
  • Said domain is detected by any means known to those skilled in the art, that is to say by using software of the Blast or Fasta type (see in particular Altschul SF, Gish W, Miller W, EW Myers, Lipman DJ., Local Basic alignment search tool J Mol Biol 1990 Oct 5, 215 (3): 403-10).
  • the invention also relates to a peptide domain that can be obtained by the above method.
  • FIG. 1 illustrates the phenotypic characteristics and properties of soluble recombinant proteins derived from Env-W.
  • FIG. 1a illustrates the largest soluble recombinant protein encompassing all or part of the SU and TM subunits (Env-Gp60) and the soluble recombinant protein corresponding to the SU subunit (EnvSU).
  • FIG. 1b represents the flow cytometric analysis of the test for binding the recombinant EnvSU protein to the hASCT2 and XC hASCT1 XC cells respectively expressing the hASCT2 and hASCT1 receptors.
  • FIG. 2 illustrates the definition of the minimum domain for binding the ERV-W envelope to the receptor binding domain receptor (hASCT2).
  • Figure 2a describes the set of deletion mutants designed from EnvSU.
  • FIG. 2b shows the flow cytometric analysis of the test of binding of the recombinant proteins derived from EnvSU on the hASCT2-expressing hASCT2-expressing XC cells, in particular the binding of the Env1 97, Env168 and Env144 mutants and the lack of mutant binding.
  • Figure 3a illustrates the definition of an immunogenic peptide within the domain of the invention (RBD) corresponding to the 21-144 region of the HERV-W envelope protein precursor.
  • Figure 3b shows the inhibition of RBD binding to its receptor using an antibody produced from the immunogenic peptide (antiSU-EnvW) and the absence of inhibition of the RBD-receptor binding in the presence of a nonspecific antibody (antiTM-EnvW).
  • FIG. 4 shows the alignment of the retroviral sequences of envelopes belonging to the same interference group and presents the signal peptide, the SU (surface unit) and the TM (Trans membrane) subunit terminals as well as than the receptor binding site.
  • the sequences are HERV-W (Human Endogenous Retroviral Family W), RDI 14 (Cat Endogenous retrovirus), REV (Avian Reticuloendotheliosis Virus), BAEV (Baboon endogenous virus (strain M7)), SRV1 (Simian retrovirus SRV-I), SRV2 (Simian retrovirus SRV-2) and MPMV (Simian Mason-Pfizer virus).
  • HERV-W Human Endogenous Retroviral Family W
  • RDI 14 Cat Endogenous retrovirus
  • REV Avian Reticuloendotheliosis Virus
  • BAEV Baboon endogenous virus (strain M7)
  • SRV1 Simian retrovirus SRV-I
  • Example 1 Molecular and Phenotypic Characterization of Recombinant Envelopes Construction and Production of the HERV-W Envelope SU Subunit
  • transmembrane (tm) and intracytoplasmic (CYT) regions corresponding to amino acids 436 to 538 have been deleted in order to obtain a soluble protein.
  • composition spacer arm (GGGS) 3 followed by a polyhistidine tail (RGS-HHHHHH) was added at the C-terminal position to allow purification of this protein by IMAC and detection by an anti-monoclonal antibody.
  • GGGS composition spacer arm
  • RGS-HHHHHH polyhistidine tail
  • Soluble SU is a C-terminal polyhistidine tail fusion protein of sequence RGS-HHHHHH immediately downstream of the AAAR sequence, to allow purification of this protein by IMAC and detection by an anti-histidine monoclonal antibody (Qiagen , RGS H6).
  • the schematic structure of the different proteins produced from the phCMV-Env-W, phCMV-EnvGp60 and phCMV-EnvSU vectors is illustrated in FIG.
  • the expression plasmid phCMV-EnvGp ⁇ O or phCMV-EnvSU is transfected into HEK293T cells by calcium phosphate precipitation.
  • the supernatant containing the GP60 or SU envelope is collected after 48 hours of production in serum-free medium and filtered through 0.45 ⁇ m membranes to remove cell debris. 20 .mu.l of supernatant are directly analyzed on polyacrylamide gel and western blot with an anti-histidine monoclonal antibody (Qiagen, RGS H6).
  • the GP60 and SU proteins are correctly expressed in soluble form.
  • Stable XChASCT2 and XChASCT1 lines constitutively expressing the hASCT2 (XChASCT2) or hASCT1 (XChASCT1) receptors were established after transfection of XC (rat sarcoma) cells by vectors expressing either human hASCT receptor and then selection of a clone as previously described (Frendo et al., Mol CeIl Biol, Vol 23 (10): 3566-3574, 2003). The following human cells are described in Blond J Virol, Vol 74 (7): 3321-3329, 2000. TE671 cells express hASCT2.
  • the TE671RD cells constitutively express the RDI envelope 14 (endogenous cat retro-virus) belonging to the same interference group and thus recognizing the hASCT2 receptor.
  • TE671galv constitutively express the GALV (gibbon ape leukemia virus) envelope belonging to another interference group and recognizing the PiT1 receptor.
  • the cells were washed in PBS and peeled with 0.02% versene in PBS. A total of 10 6 cells were incubated with 1 ml of filtered supernatant containing the soluble envelope (Gp60 or SU) for 1 hour at 37 ° C. The cells were washed with PBA (PBS and 0.5% sodium azide) containing 2% fetal calf serum and were labeled for 1 hour at 4 ° C. with an anti-histidine monoclonal antibody (RGSH6, Qiagen). The cells were washed once with PBA and incubated with a secondary antibody coupled to fluorescein isothiocyanate for 1 hour at 40 ° C. The cells were washed twice with PBA and analyzed by flow cytometry.
  • PBA PBS and 0.5% sodium azide
  • RGSH6, Qiagen an anti-histidine monoclonal antibody
  • the inventors have demonstrated that the recombinant Gp60 protein corresponding to a soluble form of the envelope has a phenotypic characteristic identical to that of the wild envelope, namely that it is capable of binding on XC cells expressing the CT2 hAS receptor.
  • the inventors Using the XChASCT2, XChASCT1, TE671, TE671RD, and TE671 galv target cells, the inventors have demonstrated that the recombinant protein corresponding to the SU subunit of the envelope has phenotypic characteristics identical to those of the wild envelope. Firstly, the SU subunit is able to bind to both hASCT1 and hASCT2 receptors ( Figure Ib). In addition, this protein was tested against human TE671 cells and TE671RD and TE671galv derived cells.
  • Soluble SU protein was bound to TE671 cells expressing the hASCT2 receptor and TE671galv cells blocked for the PiT1 receptor, but did not bind to the blocked TE671RD cells for the hASCT2 receptor ( Figurelc).
  • the recombinant SU protein and the RDI retrovirus envelope 14 specifically interfered.
  • Example 2 Identification of the Interaction Fields of the SU Part of the W Envelope with Its hASCT2 Receptor
  • the SU subunit domains were obtained by PCR and subcloned into the expression vector pHCMV-EnvSU and sequenced.
  • the expression plasmids phCMV-EnvSU, Env69-317, Env 97, Env 68, Env 69-317, Env 17 and Env144 (FIG. 2a) were transfected into HEK293T cells by calcium phosphate precipitation.
  • the conditions for obtaining and analyzing the proteins are identical to those detailed in Example 1.
  • the EnvSU, Env69-317, Envi 97 proteins were correctly expressed in soluble form.
  • the inventors demonstrated that the Envi 97 protein was able to bind to the receptor expressed on the cell surface as the SU subunit (1-317).
  • the first 176 residues of the mature SU subunit were sufficient to bind to the surface of cells expressing the hASCT2 receptor.
  • Deletion of region 21-68 resulted in loss of receptor binding also indicating its involvement in the receptor binding domain (RBD).
  • the truncated Envi 68 protein showed a lower hASCT2 receptor binding capacity.
  • the inventors fused two smaller domains of the N-terminal region of the SU (Env 17 and Env 44) to the C-terminal region of the subunit.
  • SU unit Envi 69-317
  • the latter domain does not bind to hASCT2.
  • the level of expression of the Env 117 and Env 144 proteins was similar and the proteins were expressed in soluble form.
  • the binding assay showed that only Env 144 protein was able to bind to cells expressing the hASCT2 receptor.
  • the lack of attachment of the Env 17 protein to the cell surface indicated the loss of at least one binding determinant within the 117-144 region.
  • the boundaries of the W envelope interaction domains with its receptor are defined by amino acids 21 to 144.
  • proteins intended for membrane secretion or expression are synthesized at the level of the granular endoplasmic reticulum (ER).
  • ER granular endoplasmic reticulum
  • the translocation of neosynthesized proteins into the ER is conditioned by an N-terminal signal peptide (Walter and Lingappa 1986).
  • the hydrophobic region of the signal peptide initiates penetration into the reticulum membrane, resulting in the remainder of the peptide newly synthesized.
  • the translocation starts at the same time as the synthesis, it is the peptide being translated which crosses the ER membrane.
  • the signal sequence As the protein passes into ER light, the signal sequence is cleaved by a specific cellular enzyme, the signal peptidase (Walter P, Johnson AE: Signal sequence recognition and protein targeting to the endoplasmic reticulum membrane.) Annu Rev CeIl Biol 1994, 10: 87-119).
  • the translocation of Env into the ER is stopped by the transmembrane domain (hydrophobic) of the glycoprotein which is anchored to the phospholipid membranes.
  • the regions (SU and part of TM) destined to become extracytoplasmic are folded (formed disulfide bridges), glycosylated and oligomerized.
  • the proteins being processed are transported into the Golgi apparatus where they undergo new processes of glycan maturation as well as cleavage by furin endoproteases, recognizing an R / KXXR motif leading to the two SU subunits. and TM.
  • the mature protein is directed to the plasma membrane by a pattern on the intracytoplasmic tail containing an aliphatic / aromatic tyrosine (YX-X)
  • a peptide (112-129, TGMSDGGGVQDQAREKHV + C, 19 amino acids) was defined. Cysteine was added C-terminally for KLH coupling (keyhole limpet hemocyanin, see Frendo et al., Mol CeIl Biol, Vol 23 (10): 3566-3574, 2003). This peptide was used to immunize a rabbit and then to affinity purify the polyclonal antibody directed against the region 112-119 contained in the serum of this rabbit.
  • the Env144 protein is pre-incubated at 37 ° C. for one hour with either the anti-SU polyclonal antibody or with an anti-TM.
  • the formation of the Env144-anti-SU protein complex drastically reduced the uptake of the envelope on cells expressing the hASCT2 receptor.
  • the use of a Antibody not directed against rbd did not alter the binding thereof to the hASCT2 receptor.
  • mice Three six week old female BALB / c mice (IFF A-Credo) were immunized by direct injection of naked plasmid DNA (phCMV-env-W) containing the HERV-W envelope gene. The injections were made intradermally using a gun ("gene gun"). Five injections of 2 ⁇ g of DNA were first made for each mouse followed by a booster with two injections of 4 ⁇ g of DNA. The sera were taken and the antibody titre for each serum was determined. The antibody titre being too weak, a cell lysate was prepared. Preparation of the cell lysate.
  • TeICeBo rhabdomyosarcoma cells (ATCC CRL8805) were transfected with plasmid phCMV-env-W. After twenty hours and presence of syncytia, a cell extract was made in PBS 0.5% Triton buffer. Protein extracts were assayed by Bradford. The antigen W concentration corresponded to 9.5 ⁇ g / ⁇ l of total protein. Immunization of mice by cell lysate extract.
  • mice were first injected with 10 ⁇ g of cell lysate intraperitoneally followed by a booster injection of 2 ⁇ 100 ⁇ g of cell lysate intraperitoneally.
  • a new intravenous injection was carried out of 22 ⁇ g of the soluble envelope protein Gp60 obtained from the plasmid phCMV-Env-Gp60 as described in the example 1 previously purified, before injection, on Ni-NTA resin (Qiagen) according to the following conditions: fixation in phosphate buffer pH 8, washing in phosphate buffer pH 8 and in ammonium acetate pH 6, elution in acetate buffer ammonium pH 3.5 and concentration by speed vac.
  • the eukaryotic Gp60 protein thus obtained were reserved for the intravenous injection described above.
  • the supernatants of the hybridomas were tested by immunofluorescence on the transfected and fixed cells (TeLCeb ⁇ ), the antibodies were screened by an ELISA functional test using the Env-W protein at a concentration of 9.2 ⁇ g / ⁇ l of total proteins and an Env AS protein as a negative control at a concentration of 13.3 ⁇ g / ⁇ l of total proteins and the best performing antibodies were selected.
  • the monoclonal antibodies 2H1H8, 12C7A3 and IF1 IB10 were thus obtained.
  • the monoclonal antibodies 2H1 H8 and 12C7A3 are directed against the non-glycosylated N-terminal portion of the SU region of the Env-HERV-W protein. They are directed against the rdb as shown by a Western blot assay using Env 144.
  • the monoclonal antibody IF1 1B10 is directed against the glycosylated C-terminal portion of the SU region of the Env-HERV-W protein as shown by a Western blot test using Env 169-317. He does not recognize Env 144.
  • the envelope glycoprotein expression plasmid is transfected into TELCeBo cells by calcium phosphate precipitation at 100 and 500 ng quantities (Cosset et al, Journal of Virology, 69 (10): 6314-6322 (1995)). .
  • the cells expressing the envelope are detached from the support, 20 hours after tranfection and are pre-incubated at 37 ° C. for one hour, respectively, with the anti-HIV 23 A5 monoclonal antibody, the anti-TM Env-monoclonal antibody.
  • HERV-W 6A2B2 previously obtained
  • monoclonal antibodies anti-SU Env-HERV-W 2HL H8 12C7A3 IFl and 1B10 (dilution l / 50th).
  • HeIa epithelioid carcinoma
  • XGaI 5-bromo-4-chloro-3-indolyl- ⁇ -D-galactopyranoside staining can then be performed to stain the TELCeB ⁇ cell core (Cosset et al., Journal of Virology, 69 (10): 6314-6322 (1995).
  • Example 6 Study of the in vivo interaction between the envelope protein and the hASCT2 receptor and the in vivo formation of syncytia.
  • TeICeBo rhabdomyosarcoma cells ATCC CRL8805
  • DMEM medium Gibco Invitrogen 41966-029
  • serum from South America were respectively transfected with the LipofectAMINE PLUS TM kit (Gibco Invitrogen).
  • the cells transfected with the 409 DNA are able to express the fusogenic envelope W protein, the 410-transfected cells are not capable of expressing envelope protein and LQMV-transfected cells are capable of expressing a non-fusogenic, mutated W envelope protein.
  • IP Injection intraperitoneally
  • SCID mice in a volume of 1 ml
  • anti-protein Env monoclonal antibody 2H1H8, antibody polyclonal 69 (anti-SU) and 71 (anti-TM) 1/100.
  • Reading is immediately performed after plating on grid chamber slides in the presence of Trypan blue (exclusion of dead cells).
  • the number of cells fused together by a grid field with a "large field” objective (40) allows the counting of more than one hundred cells in order to have statistically representative counting series.
  • a cell aliquot of each sample is fixed in the presence of methanol / acetone (y / y) and then stored at -20 ° C. until staining with crystal violet (1%). The colored slides were photographed.
  • the number of fused cells is determined by direct reading on a gridded counting chamber for 100 cells is shown in Table 2 below:
  • Each number represents the number of fused and visualized cells per study field. Because some cells can be overlaid in the optical path, the count of cells appearing merged in the controls is greater than zero.
  • the reality of syncytia and discrimination with cell stacks were then verified by staining the cells on the slide, with visualization of multiple cell nuclei included in a space delimited by the continuity of a single cell membrane. Moreover, photos showing cells being melted have made it possible to objectify the reality of the fusion as early as the phase contrast microscopy analysis and the total absence of an equivalent phenomenon in the controls. To statistically objectify the primary analysis represented by the numbers shown in Table 2, a Chi-2 test was performed to compare the data in Table 2.
  • the controls are therefore statistically equivalent and there is no "real" difference related to the type of control.
  • Example 7 In Vivo Study of the Binding of the HERV-W Env Protein to Cells with or Without HASCT Type 1 and 2 Receptors and the Inhibition of this Binding by Injection of Antibodies Directed to Env HERV-2 W.
  • Soluble protein filtered 0.45 ⁇ m supernatant containing soluble protein
  • Antibody monoclonal antibody 2H1H8 (IgG, 5.50mg / ml).
  • XChASCT2 XChASCT2
  • XC cell clone ATCC CCL-165, rat cells expressing the hASCT2 receptor.
  • DMEM medium Gibco Invitrogen 41966-029
  • South American serum Pre-incubation, incubation, labeling in 1.5 ml Eppendorf tube.
  • the pellet is taken up in 100 .mu.l of anti-RGS His antibody (diluted to 100 th -Qiagen) in PBA buffer (PBS with 2% fetal calf serum and 0.1% sodium azide), kept at + 4 ° vs.
  • PBA buffer PBS with 2% fetal calf serum and 0.1% sodium azide
  • the pellet is taken up with 100 ⁇ l of anti-mouse-FITC antibody (dilution at 20 th -DAKO, reference: F0479) in a PBA buffer), maintained at + 4 ° C.
  • the reality of cells having fixed Env protein on their hASCT1 or hASCT2 receptor was then verified by cytofluorometric analysis. To statistically substantiate the analysis presented in Table 3, a Chi-2 test was performed to compare the data collected under the conditions that (i) the Env protein can bind to a hASCT1 (hASCT1 control) or hASCT2 receptor.
  • hASCT2 control present on the surface of the grafted cells on SCID mice versus the grafted control cells which have no receptor (X control) on which the Env protein injected into the corresponding animals can not bind and does not give any membrane fluorescence.
  • presence of an anti-Env antibody and (ii) the Env protein can bind to a hASCT1 receptor (hASCT1 control) or hASCT2 (hASCT2 control) present on the surface of SCID mouse grafted cells versus the injection of an antibody monoclonal against Env-SU.
  • the cells expressing the hASCT1 or hASCT2 receptors on their surface are thus statistically equivalent and there is no difference in Env binding on the receptor bound to subtype 1 or 2 under the conditions of the experiment.
  • Env + hASCTl grafts control 24 positives counted on average on 77 cells
  • Env + grafts hASCTl + monoclonal antibody 2H1H8 2 positives counted on average on 73 cells.
  • results obtained show a statistically significant effect for the monoclonal antibody (probability of random result (p) less than 0.001).
  • Env + hASCT2 grafts 23 positives counted on average on 57 cells
  • results obtained show a statistically significant effect for the monoclonal antibody (probability of random result (p) overall less than 0.01).
  • the protein sequences of the retrovirus envelopes HERV-W (swiss-prot Q9UQF0), RDI 14 (swiss-prot Q98654), REV (swiss-prot P31796), BAEV (swiss-prot P 10269), SRVl (swiss-prot P04027) , SRV2 (swiss-prot P51515) and MPMV (swiss-prot P07575) were aligned using the MacVector software with the ClustalW procedure.
  • the signal peptide, the SU (surface unit) subunit and the TM (Trans membrane) subunit are indicated.
  • the receptor binding site is underlined.

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Abstract

La présente invention concerne un domaine peptidique nécessaire à l'interaction entre l'enveloppe d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W et un récepteur hASCT, comprenant une extrémité N terminale et une extrémité C terminale, ledit domaine peptidique étant délimitée: à son extrémité N terminale, par un motif, constitué par les acides aminés (Z)α-Proline-Cystéine-X-Cystéine dans lequel Z est un acide aminé quelconque α est un nombre entier compris entre 2 et 30 X est un acide aminé quelconque, à son extrémité C terminale, par un motif, constitué par les acides aminés Serine-Acide Aspartique-Xa-Xb-Xc-Xd-Xe-Acide Aspartique-Xf Xg-(Z)β dans lequel Xa, Xb, Xc, Xd, Xe, Xf Xg sont des acides aminés quelconque Z est un acide aminé quelconque β est un nombre entier compris entre 15 et 25, préférentiellement 20 et comprenant, entre l'extrémité N terminale et l'extrémité C terminale, au moins un motif choisi parmi les motifs suivants ; un motif constitué par les acides aminés Cystéine-Tyrosine-X2-X3-X4-X5- X6-Cystéine, dans lequel X2, X3, X4, X5, X6 sont des acides aminés quelconque un motif constitué par les acides aminés Cystéine-X7-X8-X9-X10-X11- X12- X13-X14-X15-Cystéine-Trytophane, dans lequel X7, X8, X9, X10, X11, X12, X13, X14, X15 sont des acides aminés quelconque

Description

Domaine peptidique nécessaire à l'interaction entre l'enveloppe d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W et un récepteur hASCT
La présente invention concerne un domaine polypeptidique responsable des interactions entre une enveloppe rétro virale du groupe d'interférence de HERV-W et les récepteurs de la famille hASCT.
Les rétrovirus endogènes humains (HERVs) constituent 8% du génome humain et sont impliqués à la fois dans des pathologies et dans des phénomènes non pathologiques.
La famille des rétrovirus endogènes humains W (HERV-W) est dérivée d'un élément rétroviral infectieux intégré dans la lignée germinale il y a 25 à 40 millions d'années. La protéine d'enveloppe de HERV-W, appelée également syncytine, est une glycoprotéine fusogène impliquée dans la formation de la couche syncytiotrophoblastique du placenta. Elle est codée par le gène env du locus proviral ERVWl et synthétisée sous la forme d'un précurseur gPr73 qui est spécifiquement clivé en deux protéines matures, une sous unité de surface gp50 (SU) et une sous unité transmembranaires gp24 (TM). In vitro, la syncytine de la famille HERV-W induit une fusion cellule à cellule dépendante de son interaction avec un récepteur-transporteur d'acides aminés de la famille ASCT (h-ASCT2, hASCTl). Des études phylogéniques ont alors montré que la syncytine est apparentée à un groupe de rétrovirus, comprenant notamment le virus endogène du chat RDI 14, le virus endogène du singe BaEV, des rétrovirus simiens et des rétrovirus aviaires : virus de la réticuloendothéliose aviaire REV-A et virus de la nécrose de la rate SNV3 ayant tous en commun le récepteur-transporteur d'acides aminés neutres sodium dépendant de type 2 ou hASCT2 (Rasko et al, 1999, Proc. Natl. Acad. Sci. USA Vol. 96, pp. 2129-2134; Tailor et al, 1999 JOURNAL OF VIROLOGY, VOL 73(5) May 1999, p. 4470-4474). Ainsi, l'infection de cellules par des virus de ce groupe de rétrovirus conduit à une réduction spécifique du transport des acides aminés (Rasko et al., 1999). L'infection d'une cellule par un de ces rétrovirus (ou l'expression dans la cellule de l'une de ces enveloppes) empêche, par interférence (interaction) vis à vis d'un récepteur de la famille ASCT, l'infection de cette même cellule par un autre de ces rétrovirus ou la fusion avec une autre cellule exprimant une autre enveloppe. Par interférence vis-à-vis d'un récepteur de la famille ASCT, l'infection d'une cellule par un de ces rétrovirus empêche l'infection par un autre de ces rétrovirus. Tous ces rétrovirus appartiennent au même groupe d'interférence du virus HERV-W.
Les mécanismes de liaisons entre l'enveloppe et le récepteur ASCT restent obscurs, et à ce jour aucun domaine de liaison à un récepteur ASCT n'a été identifié et défini que ce soit dans la SU de la protéine d'enveloppe de HERV-W ou dans les SU de rétrovirus du même groupe d'interférence. Cette thématique est pourtant essentielle puisque l'inhibition de l'interaction enveloppe / récepteur ASCT permettrait en outre d'empêcher l'entrée d'un rétrovirus dans la cellule, et donc de bloquer son cycle de réplication, de bloquer le phénomène d'interaction enveloppe / récepteur ASCT et/ou de fusion cellulaire pouvant être impliqué dans la formation de tumeurs, dans la prolifération de cellules métastasiques ou dans des phénomènes de résistance à des médicaments (voir à titre d'illustration la publication « CeIl fusion : A hidden enemy ?, Cancer CeIl : May 2003 Vol.3), de bloquer le phénomène d'interaction enveloppe / récepteur ASCT et/ou de fusion cellulaire pouvant intervenir dans des maladies du système nerveux voire d'inhiber la fusion cellule-cellule impliquée dans la différenciation trophoblastique (vaccination contraceptive). De plus, Pinhibition de l'interaction enveloppe / récepteur hASCT pourrait empêcher la propagation de tumeur en s'opposant à une immunosuppression locale pouvant découler de l'interaction enveloppe / récepteur hASCT. En effet, il a été montré d'une part que l'infection de cellules par des virus de ce groupe de rétrovirus (notamment ceux induisant des immunodéficiences) conduit à une réduction spécifique du transport des acides aminés (Rasko et aï, PNAS5 Vol. 96, pp 2129-2134 (1999)), et d'autre part il est proposé un lien direct entre l'altération du transport des acides aminés et l'immunosuppression (Espinosa A5 Villarreal LP., T-Ag inhibits implantation by EC cell derived embryoid bodies. Virus Gènes. 2000;20(3):195-200; JE5 Battini JL5 Gottschalk RJ5 Mazo I5 Miller AD., The RDI 14/simian type D rétrovirus receptor is a neutral amino acid transporter. Proc Natl Acad Sci U S A. 1999 Mar 2;96(5):2129- 34.). Ainsi, concernant les maladies du système nerveux, il est connu que les récepteurs hASCT sont impliqués dans le transport spécifique d'acides aminés neutres et que les cellules neuronales, pour la transmission des informations, utilisent de manière prépondérante des neuromédiateurs de nature polypeptique. Ainsi, la liaison de la protéine Env-HERV-W à des récepteurs devant normalement transporter les acides aminés requis pour la synthèse des neuromédiateurs peut affecter la capacité des neurones à synthétiser les neuromédiateurs en réduisant l'entrée des agonistes physiologiques que sont les acides aminés via les récepteurs ASCT. Par ailleurs, si des neurones, dont les réseaux inter-cellulaires forment des connexions indispensables à la transmission des informations circulant dans le cerveau et la moelle épinière, forment des syncytia suite à une fusion de plusieurs neurones induite par la protéine Env-HERV-W, tous les réseaux de transmission des informations se trouvent perturbés etr connectés au même « paquet cellulaire » fusionné et de plus l'activité de production des neuromédiateurs de chaque cellule n'est plus indivisualisée, ni connectée aux voies de conduction amont et aval (dendrites et axones) qui lui sont propres.
D'une manière surprenante, les inventeurs ont identifié la région polypeptidique responsable des interactions entre l'enveloppe d'un virus appartenant au groupe d'interférence HERV-W et un récepteur hASCT.
A cet effet, la présente invention concerne un domaine peptidique nécessaire à l'interaction entre l'enveloppe d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W et un récepteur hASCT, défini en ce qu'il commence par une extrémité N- terminale et se termine par une extrémité C-terminale, et en ce que : " l'extrémité N-terminale est définie par un motif, constitué par les acides aminés (Z)α-Proline-Cystéine-X-Cystéine dans lequel
Z est un acide aminé quelconque α est un nombre entier compris entre 2 et 30 X est un acide aminé quelconque, ledit motif étant choisi parmi SEQ ID N°l à SEQ ID N°29 et SEQ ID
NO : 44 à SEQ ID NO : 72
1 l'extrémité C-terminale est définie par un motif, constitué par les acides aminés Serine-Acide Aspartique-Xa-Xb-Xc-Xd-Xe-Acide Aspartique-Xf-Xg- (Z)p dans lequel
X3, Xb, X0, Xd, Xe, Xf5 Xg5 sont des acides aminés quelconques Z est un acide aminé quelconque β est un nombre entier compris entre 15 et 25, préférentiellement 20 ledit motif étant choisi parmi SEQ ID N°30 à SEQ ID N°40, et en ce que ledit domaine peptidique comprend, entre l'extrémité N terminale et l'extrémité C terminale au moins un motif choisi parmi les motifs suivants :
" un motif constitué par les acides aminés Cystéine-Tyrosine-X^Xs-Xφ-Xs-
X6-Cystéine, dans lequel X2, X3, X4, X5, X6 sont des acides aminés quelconques ledit motif correspondant à la SEQ ID N°41
" un motif constitué par les acides aminés CyStOmC-X7-X8-X9-X10-X11- X12- X13-X- 14-Xi 5-Cystéine-Trytophane, dans lequel X7, Xg, X9, X10, Xn, Xi2, X13, Xi4, X15 sont des acides aminés quelconques ledit motif correspondant à la SEQ ID N°42 ou SEQ ID NO : 73. Par domaine peptidique selon l'invention, on entend une zone minimale de l'enveloppe d'un virus du groupe d'interférence HERV-W nécessaire à la reconnaissance d'un récepteur hASCT. Les domaines peptidiques de l'invention peuvent être obtenus par la technique du génie génétique qui comprend les étapes de :
- culture d'un microorganisme ou de cellules eucaryotes transformé(es) à l'aide d'une séquence nucléotidique selon l'invention et
- récupération du domaine peptidique produit par ledit microorganisme ou lesdites cellules eucaryotes. Cette technique est bien connue de l'homme du métier. Pour plus de détail la concernant, on pourra se référer à l'ouvrage ci-après : Recombinant DNA Technology I, Editors Aies Prokop, Raskesh K Bajpai ; Armais of the New- York Academy of Sciences, Volume 646, 1991. Les domaines peptidiques de l'invention peuvent également être préparés par les synthèses peptidiques classiques bien connues de l'homme du métier.
Par groupe d'interférence, on entend l'ensemble des virus dont l'infection (expression) d'une cellule par un de ses membres empêche l'infection par un autre membre du groupe par interférence de récepteur. Par acide aminé quelconque, on entend notamment un acide aminé choisi parmi l'arginine, Phistidine, la lysine, l'acide aspartique, l'acide glutamique, l'asparagine, la glutamine, la serine, la thréonine, l'asparagine, la thréonine, l'alanine, l'isoleucine, la leucine, la méthionine, la phénylalanine, le tryptophane, la tyrosine, la valine, la cystéine, la glycine, la proline. Par récepteur hASCT, on entend tout transporteur d'acides aminés neutres sodium dépendant.
Par motifs, on entend une succession d'acides aminés correspondant à une région d'intérêt particulière du domaine peptidique selon l'invention, qui est exprimée par l'ensemble des virus du groupe d'interférence du virus HERV-W. Préférentiellement, α est un nombre entier compris entre 3 et 18.
Préférentiellement, X ou Xaa du motif Pro Cys Xaa Cys dans les SEQ ID N°l à SEQ ID N°29 est un acide aminé choisi parmi l'acide aspartique, l'acide glutamique, l'arginine : ces séquences sont ainsi de préférence choisies parmi SEQ ID NO : 44 à SEQ ID NO : 72. Préférentiellement, Xa, Xb, Xc ou les acides aminés en position 3, 4 et 5 des SEQ ID N°s 30 à 40 sont une glycine, Xd ou l'acide aminé Xaa en position 6 des SEQ ID N°s 30 à 40 est un acide aminé choisi parmi la proline et la valine; Xe ou l'acide aminé Xaa en position 7 des des SEQ ID N°s 30 à 40 est un acide aminé choisi parmi la glutamine, la leucine et la thréonine; Xf ou l'acide aminé Xaa en position 9 des SEQ ID N°s 30 à 40 est un acide aminé choisi parmi la lysine, la thréonine, la méthionine et la glutamine, Xg ou l'acide aminé en position 10 des SEQ ID N°s 30 à 40 est un acide aminé choisi parmi l'alanine, la lysine, l'isoleucine, la thréonine et la valine. Préférentiellement, β est un nombre entier égale à 20.
Préférentiellement, X2 ou l'acide aminé Xaa en position 3 de SEQ ID N° 41 est un acide aminé choisi parmi l'asparagine, la thréonine, l'acide glutamique, l'histidine, X3 ou l'acide aminé Xaa en position 4 de SEQ ID N° 41 est un acide aminé choisi parmi l'histidine, l'alanine, la serine, la lysine, l'acide glutamique; X4 ou l'acide aminé Xaa en position 5 de SEQ ID N0 41 est un acide aminé choisi parmi la tyrosine, la thréonine, l'alanine, X5 ou l'acide aminé Xaa en position 6 de SEQ ID N° 41 est un acide aminé choisi parmi la glutamine, l'arginine, la thréonine, X6 ou l'acide aminé Xaa en position 7 de SEQ ID N° 41 est un acide aminé choisi parmi la leucine, la glutamine, l'acide glutamique.
Préférentiellement X7 ou l'acide aminé Xaa en position 2 de SEQ ID N° 42 est un acide aminé choisi parmi la proline, la thréonine, l'arginine et l'asparagine; X8 ou l'acide aminé Xaa en position 3 de SEQ ID N° 42 est un acide aminé choisi parmi la glycine, l'acide glutamique, l'asparagine, X9 ou l'acide aminé Xaa en position 4 de SEQ ID N° 42 est un acide aminé choisi parmi la glycine, l'asparagine, l'isoleucine, la thréonine, la serine, X10 ou l'acide aminé Xaa en position 5 de SEQ ID N° 42 est une lysine ou est délété ; X11 ou l'acide aminé Xaa en position 6 de SEQ ID N° 42 est un acide aminé choisi parmi la lysine, la valine, l'isoleucine, la leucine, X12 ou l'acide aminé Xaa en position 7 de SEQ ID N° 42 est un acide aminé choisi parmi la glycine, l'asparagine; X13 ou l'acide aminé Xaa en position 8 de SEQ ID N° 42 est un acide aminé choisi parmi la glutamine, la lysine, la valine, X14 ou l'acide aminé Xaa en position 9 de SEQ ID N° 42 est un acide aminé choisi parmi la valine, la proline, la serine, la thréonine, X15 ou l'acide aminé Xaa en position 10 de SEQ ED N° 42 est un acide aminé choisi parmi la valine, l'isoleucine. Préférentiellement, l'acide aminé Xaa en position 2 de SEQ ID NO : 73 est choisi parmi la Proline, la Thréonine, l'arginine et l'asparagine l'acide aminé Xaa en position 3 de SEQ ID NO : 73 est choisi parmi la glycine, l'acide glutamique, l'asparagine l'acide aminé Xaa en position 4 de SEQ ID NO : 73 est choisi parmi la glycine,
Pasparagine, Fisoleucine, la thréonine, la serine l'acide aminé Xaa en position 5 de SEQ ID NO : 73 est choisi parmi la lysine, la valine, l'isoleucine, la leucine l'acide aminé Xaa en position 6 de SEQ ID NO : 73 est choisi parmi la glycine, l'asparagine l'acide aminé Xaa en position 7 de SEQ ID NO : 73 est choisi parmi la glutamine, la lysine, la valine l'acide aminé Xaa en position 8 de SEQ ID NO : 73 est choisi parmi la valine, la proline, la serine, la thréonine l'acide aminé Xaa en position 9 de SEQ ID NO : 73 est choisi parmi la valine, l'isoleucine
Des délétions sont possibles dans les domaines selon l'invention indiqués ci dessus. Selon un mode particulier de réalisation de l'invention, X10 est délété.
L'invention concerne également une séquence nucléotidique codant pour un domaine peptidique selon l'invention ci dessus.
De telles séquences peuvent être préparées par synthèse chimique et génie génétique en utilisant les techniques bien connues de l'homme du métier et décrites par exemple dans Sambrook J. et al., Molecular Cloning : A Laboratory Manual, 1989.
L'invention concerne également un épitope issu du domaine peptidique selon l'invention, caractérisé en ce qu'il induit une réponse immune contre un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W
Par épitope, on entend tout ou partie du domaine peptidique selon l'invention reconnue par un récepteur situé à la surface d'un lymphocyte B ou T ou d'un anticorps circulant.
Par réponse immune, on entend l'ensemble des mécanismes biologiques permettant à un organisme pluricellulaire de maintenir la cohérence des cellules et tissus qui le constituent et d'assurer son intégrité en réponse à tout agression qui modifie les structures moléculaires de ses constituants ou qui introduit des molécules étrangères dans l'organisme.
L'invention concerne également une séquence nucléotidique codant pour un épitope tel que défini ci dessus. Comme indiqué précédemment, de telles séquences peuvent être préparées par synthèse chimique et génie génétique en utilisant les techniques bien connues de l'homme du métier et décrites par exemple dans Sambrook J. et al.,
Molecular Cloning : A Laboratory Manual, 1989.
L'invention concerne également un vecteur d'expression caractérisé en ce qu'il comprend une séquence nucléotidique selon l'invention, ainsi que les moyens nécessaires à son expression.
A titre de vecteur d'expression, on peut citer par exemple les plasmides, les vecteurs viraux du type virus de la vaccine, adenovirus, baculovirus, poxvirus, rétrovirus, les vecteurs bactériens du type salmonelle, BCG.
Par moyens nécessaires à son expression, on entend tout moyen qui permet d'obtenir un peptide à partir d'une séquence nucléotidique, tel que notamment un promoteur, un terminateur de transcription, une origine de réplication et de préférence un marqueur de sélection.
Les vecteurs de l'invention peuvent également comprendre des séquences nécessaires au ciblage des peptides vers des compartiments cellulaires particuliers. L'invention concerne également un microorganisme ou cellule hôte transformé par au moins un vecteur d'expression selon l'invention.
A titre d'exemples de microorganismes qui conviennent aux fins de l'invention, on peut citer les levures, telles que celles des familles suivantes : Saccharomyces,
Schizosaccharomyces, Kluveromyces, Pichia, Hanseluna, Yarowia, Schwaniomyces, Zygosaccharomyces, ; Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces carlsbergensis et
Kluveromyces lactis étant préférées ; et les bactéries, telles que E. coli et celles des familles suivantes : Lactobacillus, Lactococcus, Salmonella, Streptococcus, Bacillus et Streptomyces.
A titre d'exemples de cellules hôtes transformées, on peut citer les cellules provenant d'animaux tels que les mammifères, les reptiles, les insectes et équivalents. Les cellules eucaryotes préférées sont les cellules provenant du hamster chinois (cellules CHO), du singe (cellules COS et Vero), du rein de jeune hamster (cellules BHK), du rein de cochon (cellules PK 15) et du rein de lapin (cellules RKl 3, les lignées cellulaires humaines de l'ostéosacorme (cellules 143 B), les lignées cellulaires humaines HeLa et les lignées cellulaires humaines de l'hépatome (du type cellules Hep G2), ainsi que les lignées cellulaires d'insecte (par exemple de Spodoptera frugiperda), une lignée cellulaire de rein embryonnaire humaine (par exemple HEK293T). Les cellules hôtes peuvent être fournies dans des cultures en suspension ou en flacon, dans des cultures tissulaires, des cultures d'organe et équivalents. L'invention concerne également un anticorps dirigé contre un domaine peptidique selon l'invention ou contre un épitope selon l'invention.
Par anticorps, on entend tant un anticorps entier qu'un fragment d'anticorps. Les anticorps recombinants peuvent être obtenus selon des procédés classiques connus de l'homme du métier, à partir d'organismes procaryotes, tels que bactéries, ou à partir d'organismes eucaryotes, tels que levures, cellules de mammifères, de plantes, d'insectes ou d'animaux, ou par des systèmes de production extra-cellulaire. Les anticorps monoclonaux peuvent être préparés selon les techniques classiques connues de l'homme du métier telles que la technique des hybridomes dont le principe général est rappelé ci-après. Dans un premier temps, on immunise un animal, généralement une souris, (ou des cellules en culture dans le cadre d'immunisations in vitro) avec un antigène cible d'intérêt, dont les lymphocytes B sont alors capables de produire des anticorps contre ledit antigène. Ces lymphocytes producteurs d'anticorps sont ensuite fusionnés avec des cellules myélomateuses "immortelles" (murines dans l'exemple) pour donner lieu à des hybridomes. A partir du mélange hétérogène des cellules ainsi obtenu, on effectue alors une sélection des cellules capables de produire un anticorps particulier et de se multiplier indéfiniment. Chaque hybridome est multiplié sous la forme de clone, chacun conduisant à la production d'un anticorps monoclonal dont les propriétés de reconnaissance vis-à-vis de l'antigène d'intérêt pourront être testées par exemple en ELISA, par immunotransfert en une ou deux dimensions, en immunofluorescence, ou à l'aide d'un biocapteur. Les anticorps monoclonaux ainsi sélectionnés, sont par la suite purifiés notamment selon la technique de chromatographie d'affinité.
Par fragment d'anticorps, on entend tout fragment d'anticorps consécutif à une réponse immune contre un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W. Ces fragments d'anticorps peuvent par exemple être obtenus par protéolyse. Ainsi, ils peuvent être obtenus par digestion enzymatique, résultant en des fragments de type Fab (traitement à la papaïne ; Porter RR, 1959, Biochem. J., 73 : 119-126) ou de type F(ab)'2 (traitement à la pepsine ; Nisonoff A. et al, 1960, Science, 132 : 1770-1771). Ils peuvent également être préparés par voie recombinante (Skerra A., 1993, Curr. Opin. Immunol., 5 : 256-262). Un autre fragment d'anticorps qui convient aux fins de l'invention comprend un fragment Fv qui est un dimère constitué de l'association non covalente du domaine variable léger (VL) et du domaine variable lourd (VH) du fragment Fab, donc de l'association de deux chaînes polypeptidiques. Afin d'améliorer la stabilité du fragment Fv due à la dissociation des deux chaînes polypeptidiques, ce fragment Fv peut être modifié par génie génétique en insérant un lien peptidique adapté entre le domaine VL et le domaine VH (Huston P. et al., 1988, Proc. Natl.Acad. Sci.USA, 85 : 5879-5883). On parle alors de fragment scFv (« single chain Fragment variable ») car il est constitué d'une seule chaîne polypeptidique. L'utilisation d'un lien peptidique composé préférentiellement de 15 à 25 acides aminés permet de relier l'extrémité C-terminale d'un domaine à l'extrémité N-terminale de l'autre domaine, constituant ainsi une molécule monomérique dotée de propriétés de liaison similaires à celles de l'anticorps sous sa forme complète. Les deux orientations des domaines VL et VH conviennent (VL-lien-VH et VH-lien-VL) car elles présentent des propriétés fonctionnelles identiques. Bien entendu, tout fragment connu de l'homme du métier et présentant les caractéristiques immunologiques définies ci-dessus conviennent aux fins de l'invention. L'invention concerne également l'utilisation d'au moins un domaine peptidique selon l'invention, d'au moins un épitope selon l'invention, d'au moins un anticorps selon l'invention ou d'au moins une séquence nucléotidique selon l'invention pour la préparation d'un médicament destiné à l'inhibition, la prévention ou le traitement d'une infection provoquée par un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W chez un animal, de préférence l'homme. Le domaine peptidique selon l'invention peut notamment être utilisé pour cibler des cellules exprimant un récepteur de la famille hASCT afin de transduire un signal, moduler le flux des acides aminés (traitements du cancer).
Par éléments nécessaires à une expression constitutive des peptides, on entend un promoteur ubiquitaire ou spécifique des cellules eucaryotes. A titre d'éléments nécessaires à une expression inductible des peptides, on peut citer les éléments de régulation de l'opéron de E. coli pour la résistance à la tétracycline (Gossen M. et al, Proc Natl Acad Sci USA, 89 : 5547-5551 (1992).
L'utilisation d'au moins un domaine peptidique selon l'invention, d'au moins un épitope selon l'invention, ou d'au moins une séquence nucléotidique selon l'invention est particulièrement adapté pour la préparation d'un médicament destiné à la prévention d'une infection provoquée par un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W chez un animal, de préférence l'homme. L'utilisation d'au moins un anticorps selon l'invention est particulièrement adapté pour la préparation d'un médicament destiné à l'inhibition ou le traitement d'une infection ou d'une pathologie induite par un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W chez un animal, de préférence l'homme.
L'invention concerne également une composition pharmaceutique, comprenant à titre de substance active, au moins un domaine peptidique selon l'invention, au moins un épitope selon l'invention, ou bien au moins une des séquences nucléotidiques selon l'invention, notamment placée sous le contrôle d'éléments nécessaires à une expression constitutive et/ou inductible desdits domaines peptidiques ou épitopes, en association avec un véhicule pharmaceutiquement approprié. L'invention concerne également une composition pharmaceutique comprenant à titre de substance active, au moins un anticorps selon l'invention, en association avec un véhicule pharmaceutiquement approprié.
Bien entendu, l'homme du métier déterminera facilement le véhicule pharmaceutiquement approprié et la quantité de domaine peptidiques, d'épitopes, d'acides nucléotidiques ou d'anticorps à utiliser en fonction des constituants de la composition pharmaceutique.
Dans les compositions pharmaceutiques selon l'invention, pour l'administration orale, sublingale, sous cutanée, intra musculaire, intra veineuse, topique, intratrachéale, rectale, transdermique, la substance active peut être administrée sous formes unitaires d'administration ou en mélange avec des supports pharmaceutiques classiques, et destinés à une administration par voie orale, par exemple sous la forme d'un comprimé, d'une gélule, d'une solution buvable, etc., ou par voie rectale, sous la forme d'un suppositoire, par voie parentérale, en particulier sous la forme d'une solution injectable, notamment par voie intraveineuse, intradermique, sous cutanée, etc., selon des protocoles classiques bien connus de l'homme du métier. Pour l'application topique, on peut utiliser la substance active dans des crèmes, pommades, lotions, collyres. Lorsqu'on prépare une composition solide sous forme de comprimés, on mélange la substance active avec un excipient pharmaceutiquement acceptable également nommé véhicule pharmaceutique, tel que la gélatine, l'amidon, le lactose, le stéarate de magnésium, le talc, la gomme arabique ou analogues. On peut enrober les comprimés de saccharose, d'un dérivé cellulosique, ou d'autres matières appropriées. On peut également les traiter de telles sortes qu'ils aient une activité prolongée ou retardée et qu'ils libèrent d'une façon continue une quantité prédéterminée de la substance active. On peut également obtenir une préparation en gélules en mélangeant la substance active avec un diluant et en versant le mélange dans des gélules molles ou dures. On peut également obtenir une préparation sous forme de sirop ou pour l'administration sous forme de gouttes, dans laquelle la substance active est présente conjointement avec un édulcorant, un antiseptique, tel que notamment du méthylparaben et du propylparaben, ainsi qu'un agent donnant du goût ou un colorant approprié. Les poudres ou les granules dispersibles dans l'eau peuvent contenir la substance active en mélange avec des agents de dispersion ou des agents mouillants, ou des agents de mise en suspension, bien connus de l'homme du métier. Pour une administration parentérale, on utilise des suspensions aqueuses, des solutions salines isotoniques ou des solutions stériles et injectables qui contiennent des agents de dispersion, des mouillants pharmacologiquement compatibles, tels que notamment le propyléneglycol ou le butylèneglycol.
Le médicament ou la composition pharmaceutique selon l'invention peut comprendre en outre un agent d'activation qui induit les effets d'une médication ou renforce ou complète les effets de la médication principale, en augmentant notamment la biodisponibilité de la médication principale.
La posologie dépend de la gravité de l'affection, et sera adapté selon un protocole classique. A titre indicatif, lorsque la substance active est un anticorps monoclonal, la dose hebdomadaire est de 1 à 10 mg / kg, en combinaison avec un excipient pharmaceutiquement acceptable.
L'invention concerne également une composition diagnostique pour la détection et/ou la quantification d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W ou la détection et/ou la quantification d'une réponse immune contre ledit virus, comprenant au moins un domaine peptidique selon l'invention, au moins un épitope selon l'invention, au moins une des séquences nucléotidiques selon l'invention, ou au moins un anticorps selon l'invention.
Une composition diagnostique comprenant au moins un domaine peptidique selon l'invention, au moins un épitope selon l'invention, au moins une des séquences nucléotidiques selon l'invention, est particulièrement adapté si on souhaite déterminer si un patient présente une réponse immune contre un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W alors qu'une composition diagnostique comprenant au moins un anticorps selon l'invention est particulièrement adapté pour la détection et/ou la quantification d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W.
L'invention concerne également un procédé de détection et/ou de quantification d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W dans un échantillon biologique prélevé chez un individu susceptible d'être infecté par ledit virus caractérisé en ce qu'il comprend les étapes consistant à : - mettre en contact ledit échantillon biologique au moins un anticoprs selon l'invention dans des conditions permettant la formation d'un complexe entre le virus et l' anticorps, et
- détecter et/ou quantifier la formation dudit complexe par tout moyen approprié.
Par échantillon biologique, on entend un échantillon biologique d'origine humaine ou animale susceptible de contenir ledit virus tel qu'un échantillon de sang, de plasma, de sérum, d'urine, de liquide cephalo rachidien, ou de tissus tels que placenta, testicules, prostate, sein. L'étape de mise en contact est une étape classiquement connue de l'homme du métier.
L'étape de détection / quantification peut être réalisée par tout moyen de détection connu dans le domaine des dosages immunologiques de très petites molécules, tel que la détection directe, c'est-à-dire sans l'intermédiaire de partenaire(s) de liaison, et la détection indirecte, c'est-à-dire par l'intermédiaire de partenaire(s) de liaison.
La détection directe de la liaison entre l'anticorps ou fragment d'anticorps de l'invention et le virus peut être mise en œuvre par exemple par résonance plasmonique de surface ou par voltamétrie cyclique sur une électrode portant un polymère conducteur. Dans ce cas, l'anticorps de l'invention sert à immunocapturer tout ou partie du virus, qui est ensuite éluée. L'élution peut être mise en œuvre par tout procédé d'élution connu de l'homme du métier, tel qu'un choc de pH. Dans Ie cas de la détection indirecte, la deuxième étape du procédé de l'invention peut être mise en œuvre selon la technique classique ELISA de dosage par compétition. L'anticorps de l'invention sert alors de partenaire de liaison servant à la capture de tout ou partie du virus dans l'échantillon. La détection peut alors être mise en œuvre par compétition entre tout ou partie du virus susceptible d'être contenue dans l'échantillon à tester et une quantité connue de virus préalablement marquée. Par marquage, on entend la fixation d'un marqueur capable de générer directement ou indirectement un signal détectable. Une liste non limitative de ces marqueurs consiste en :
" les enzymes qui produisent un signal détectable par exemple par colorimétrie, fluorescence, luminescence, comme la peroxydase de raifort, la phosphatase alcaline, Pacétylcholine estérase, la b-galactosidase, la glucose-6-phosphate déshydrogénase,
" les chromophores comme les composés luminescents, colorants, " les molécules radioactives comme le 32P, le 35 S ou le 1251,
* les molécules fluorescentes telles que la fluorescéine, la rhodomine,
Palexa ou les phycocyanines, et " les particules telles que les particules en or, en latex magnétique, les liposomes. Des systèmes indirects de marquage peuvent être aussi utilisés, comme par exemple par l'intermédiaire d'un autre couple ligand/anti-ligand. Les couples ligand/anti- ligand sont bien connus de l'homme du métier, et on peut citer par exemple les couples suivants: biotine/streptavidine, biotine/avidine, haptène/anticorps, antigène/anticorps, peptide/anticorps, sucre/lectine, polynucléotide/complémentaire du polynucléotide. Dans ce cas, c'est le ligand qui est lié au partenaire de liaison. L'anti-ligand peut être détectable directement par les marqueurs décrits au paragraphe précédent ou être lui-même détectable par un ligand/anti-ligand. Ces systèmes indirects peuvent conduire, dans certaines conditions, à une amplification du signal. Cette technique d'amplification du signal est bien connue de l'homme du métier, et l'on pourra se reporter aux demandes de brevet antérieures FR98/10084 ou WO95/08000 de la Demanderesse ou à l'article J. Histochem. Cytochem., (1997), 45 : 481-491.
Le marquage de molécules est largement connu de l'homme du métier et est décrit par exemple par Greg T. Hermanson dans Bioconjugate Techniques, 1996, Académie Press Inc, 525B Street, San Diego, CA92101 USA.
Selon le type de marquage utilisé, comme par exemple en utilisant une enzyme, l'homme du métier ajoutera des réactifs permettant la visualisation du marquage. De tels réactifs sont largement connus de l'homme du métier et sont décrits notamment dans Principles and Practice of Immunoessay, 2nd Edition, Edited by C. Price, DJ. Newman Stockton Press, 1997, 345 Park Avenue South, New York. L'invention concerne également l'utilisation de la composition ci dessus pour le diagnostic in vitro d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W dans un échantillon ou prélèvement biologique. En particulier, le diagnostic précoce d'un virus tel que le SRVl et SRV2, virus impliqués dans des mécanismes d'immunodéfîcience chez le singe, permet de proposer un traitement adapté à l'hôte avant l'apparition d'une immunodéficience. Par ailleurs, le diagnostic précoce de HERV-W, impliqué dans des pathologies placentaires, permet de moduler son expression par exemple lors d'une préeclampsie. L'invention concerne également l'utilisation d'un domaine peptidique selon l'invention ou d'un épitope selon l'invention, ou d'un anticorps selon l'invention pour inhiber l'interaction entre l'enveloppe d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W et un récepteur ASCT. Ceci permet notamment d'obtenir une immunothérapie contraceptive. L'invention concerne également l'utilisation d'un domaine peptidique selon l'invention pour identifier des molécules chimiques ou biologiques dont l'interaction avec tout ou partie de ce domaine peptidique, bloque l'interaction entre l'enveloppe d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W et un récepteur ASCT. Par exemple, lorsqu'on utilise un domaine peptidique selon l'invention de HERV-W, ceci permet d'obtenir notamment des molécules chimiques ou biologiques très adaptées pour obtenir un traitement contraceptif. L'utilisation de telles molécules chimiques pour inhiber l'interaction entre l'enveloppe d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W et un récepteur ASCT présente un intérêt thérapeutique. A titre indicatif, deux procédés génériques permettant le criblage des molécules chimiques ou biologiques susceptibles d'inhiber l'interaction env / récepteur sont décrits ci dessous.
Dans un contexte où il est possible de produire une enveloppe soluble, il convient de déterminer si une molécule chimique ou biologique altère l'interaction env/récepteur selon une méthode de type ELISA utilisant des cellules exprimant au moins un récepteur hASCT en phase de capture. Ainsi, sur une plaque de 96 puits, des cellules exprimant un récepteur hASCT d'intérêt sont cultivées ou adsorbées, et une interaction env / récepteur est détectée via l'utilisation d'une enveloppe soluble marquée (tag histine, fusion GPF)5 et donc capable de générer un signal de référence dosable. Si après préincubation de ladite enveloppe soluble avec une molécule chimique ou biologique, une réduction du signal est observé, cela signifie que la molécule chimique ou biologique altère l'interaction env/récepteur. Alternativement, il est possible d'utiliser un vecteur rétroviral pseudotypé par l'enveloppe d'intérêt et exprimant un marqueur détectable (LacZ) et procéder au même test. Il est également possible de sélectionner des molécules d'intérêts via une mesure d'inhibition de fusion. Des cellules exprimant le récepteur d'intérêt (cell-récept), par exemple des cellules HeLa ou XC-RDR ainsi que des cellules exprimant constitutivement un marqueur (par exemple lacZ) ainsi que transitoirement ou de façon stable l'enveloppe d'intérêt (cell-env-LacZ) sont utilisées; l'enveloppe d'intérêt a été au préalable modifiée au niveau de sa queue intracytoplasmique par échange avec le domaine intracytoplasmique de env HERV-W afin de la rendre constitutivement fusogène (Cheynet et al, 79(9): 5586-5593, 2005). La mise en présence des deux types cellulaires, "cell-récept" en excès et "cell-env-LacZ" en défaut, conduit à la formation de cellules multinuclées gênâtes ou syncytia, contenant 1 ou 2 noyaux bleus venant de"cell-env-LacZ" et des dizaines de noyaux blancs venant de "cell-récept". Une même co-culture réalisée en présence de molécule chimique ou biologique altérant l'interaction env/récepteur conduit à une diminution du nombre de syncytia et à leur contenu en noyau. Une automatisation de telles mesures à l'aide d'une caméra ccd est possible.
L'invention concerne également l'utilisation d'un domaine peptidique selon l'invention pour générer des anticorps bloquant l'interaction entre l'enveloppe d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W et un récepteur hASCT. L'invention concerne également un procédé pour déterminer une région polypeptidique nécessaire à l'interaction entre l'enveloppe d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W et un récepteur hASCT caractérisé en ce que : * on identifie la séquence nucléotidique et/ou peptidique de l'enveloppe précurseur dudit virus « on exclut la partie signal
" on détecte un domaine Serine-Acide Aspartique-Xa-Xb-Xc-Xd-Xe-Acide Aspartique-Xf-Xg dans lequel Xa, Xb, Xc, Xd, Xe, Xf, Xg, sont des acides aminés quelconque qui correspond à la SED ID N°43
• on exclut de l'extrémité C-terminale entre 15 et 25 acides aminés, préférentiellement 20 acides aminés, après ledit domaine Serine-Acide aspartique-Xa-Xb-Xc-Xd-Xe-Acide aspartique -XrXg, qui correspond à la SED ID N°43
Préférentiellement Xa, Xb5 Xc est un acide aminé qui est la glycine, Xd est une acide aminé choisi parmi la proline et la valine; Xe est un acide aminé choisi parmi la glutamine, la leucine, la thréonine ; Xf est un acide aminé choisi parmi la lysine, la thréonine, la méthionine, la glutamine, Xg est un acide aminé choisi parmi l'alanine, la lysine, l'isoleucine, la thréonine, la valine.
Au sens de la présente invention, on identifie la séquence nucléotidique et/ou conséquent peptidique de l'enveloppe précurseur dudit virus par tout moyen connu de l'homme du métier, qui pourra notamment se référer au Maniatis (Ed 1989). On exclut la partie signal par tout moyen connu de l'homme du métier tel que décrit notamment dans « Improved Prédiction of Signal Peptide: SignalP 3.0 » Jannick Dyrlerv Bendtsen, Henrik Nielsen, Gunnar von Heijne and S0ren BrunakJ. Mol. Biol., 340:783-795, 2004.
On détecte ledit domaine par tout moyen connu de l'homme du métier, c'est à dire en utilisant un logiciel de type Blast ou Fasta (voir notamment Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ., Basic local alignment search tool. J Mol Biol. 1990 Oct 5;215(3):403-10).
L'invention concerne également un domaine peptidique susceptible d'être obtenu par le procédé ci dessus.
Les figures ci-jointes sont données à titre d'exemple explicatif et n'ont aucun caractère limitatif. Elles permettront de mieux comprendre l'invention. La figure 1 illustre les caractéristiques et propriétés phénotypiques de protéines recombinantes solubles dérivées de Env-W. Notamment, la figure la illustre la protéine recombinante soluble la plus grande englobant tout ou partie des sous-unités SU et TM (Env-Gp60) et la protéine recombinante soluble correspondant à la sous-unité SU (EnvSU). La figure Ib représente l'analyse par cytométrie de flux du test de fixation de la protéine recombinante EnvSU sur les cellules XC hASCT2 et XC hASCTl exprimant respectivement les récepteurs hASCT2 et hASCTl. La figure Ic illustre le test d'interférence de fixation sur les cellules TE671 (contrôle bASCT2), TE671RD (hASCT2 bloqué) et TE671galv (Pitl bloqué). La figure 2 illustre la définition du domaine minimum de fixation de l'enveloppe ERV-W sur le récepteur hASCT2 (RBD pour receptor binding domain). Notamment, la figure 2a décrit l'ensemble des mutants de délétion conçus à partir de EnvSU. La figure 2b représente l'analyse par cytométrie de flux du test de fixation des protéines recombinantes dérivées de EnvSU sur les cellules XC hASCT2 exprimant le récepteur hASCT2, en particulier la fixation des mutants Envi 97, Envl68 et Envl44 et le défaut de fixation des mutants Env69-317, Envl69-317 et Envi 17.
La figure 3 a illustre la définition d'un peptide immunogène à l'intérieur du domaine selon l'invention (RBD) correspondant à la région 21-144 du précurseur de la protéine d'enveloppe d'HERV-W. La figure 3b montre l'inhibition de la fixation du RBD sur son récepteur à l'aide d'un anticorps produit à partir du peptide immunogène (antiSU-EnvW) et l'absence d'inhibition de la liaison RBD-récepteur en présence d'un anticorps non-spécifique (antiTM-EnvW).
La figure 4 représente l'alignement des séquences rétrovirales d'enveloppes appartenant au même groupe d'interférence et présente les bornes du peptide signal, de la sous-unité SU (surface unit) et de la sous-unité TM (Trans membrane) ainsi que le site de fixation au récepteur. Les séquences sont HERV-W (Human Endogenous Retroviral Family W), RDI 14 (Cat Endogenous retrovirus), REV (Avian Reticuloendotheliosis Virus), BAEV (Baboon endogenous virus (strain M7)), SRVl (Simian retrovirus SRV-I), SRV2 (Simian retrovirus SRV-2) et MPMV (Simian Mason-Pfizer virus). Les exemples suivants sont donnés à titre illustratif et n'ont aucun caractère limitatif. Ils permettront de mieux comprendre l'invention.
Exemple 1: caractérisation moléculaire et phénotypique d'enveloppes recombinantes Construction et production de la sous-unité SU d'enveloppe HERV-W.
A partir du vecteur d'expression phCMV-Env-W (Blond J Virol, Vol 74(7) :3321-3329, 2000) contenant le gène de l'enveloppe HERV-W (538 acides aminés) (clone PH74, Blond et al J Virol Vol 73(2) :1175-1185, 1999), un vecteur phCMVEnv-Gp60 permettant l'expression d'une protéine d'enveloppe recombinante soluble a été conçu. L'enveloppe soluble (Gp60,l-435) a été construite comme décrit ci dessous:
(1) le site de clivage natif RNKR (AA 314 à 317) entre les sous-unités SU et TM a été muté en AAAR, afin de permettre la production d'une protéine de fusion stable et non de deux sous-unités SU-TM clivées puis ré-associées par un pont disulfure.
(2) Les régions transmembranaire (tm) et intracytoplasmique (CYT) correspondant aux acides aminés 436 à 538 on été supprimées afin d'obtenir une protéine soluble.
(3) Un bras espaceur de composition (GGGS)3 suivi d'une queue polyhistidine (RGS-HHHHHH) ont été ajoutés en position C-terminale, afin de permettre la purification de cette protéine par IMAC et la détection par un anticorps monoclonal anti-histidine (Qiagen, RGS H6).
A partir du vecteur phCMVEnv-Gp60 exprimant l'enveloppe soluble, le vecteur phCMV-EnvSU a été construit, permettant la production d'une protéine SU. La SU soluble est une protéine de fusion contenant une queue polyhistidine C-terminale de séquence RGS-HHHHHH immédiatement en aval de la séquence AAAR, afin de permettre la purification de cette protéine par IMAC et la détection par un anticorps monoclonal anti-histidine (Qiagen, RGS H6). La structure schématique des différentes protéines produites à partir des vecteur phCMV-Env-W, phCMV-EnvGp60 et phCMV-EnvSU est illustrée en figure la.
Production de l'enveloppe soluble.
Le plasmide d'expression phCMV-EnvGpόO ou phCMV-EnvSU est transfecté dans les cellules HEK293T par précipitation au phosphate de calcium. Le surnageant contenant l'enveloppe GP60 ou SU est collecté après 48 heures de production dans un milieu sans sérum et filtré sur des membranes 0,45 μm pour éliminer les débris cellulaires. 20μl de surnageant sont directement analysés sur gel de polyacrylamide et par western blot avec un anticorps monoclonal anti-histidine (Qiagen, RGS H6). Les protéines GP60 et SU sont correctement exprimées sous forme soluble.
Test de fixation et analyse par cytométrie en flux
Les lignées stables XChASCT2 et XChASCTl exprimant constitutivement les récepteurs hASCT2 (XChASCT2) ou hASCTl (XChASCTl) ont été établies après transfection des cellules XC (sarcome de rat) par des vecteurs exprimant l'un ou l'autre récepteur humain hASCT puis sélection d'un clone comme précédemment décrit (Frendo et al, Mol CeIl Biol, Vol 23(10) : 3566-3574, 2003). Les cellules humaines suivantes sont décrites dans Blond J Virol, Vol 74(7) :3321-3329, 2000. Les cellules TE671 expriment hASCT2. Les cellules TE671RD expriment constitutivement l'enveloppe RDI 14 (rétro virus endogène de chat) appartenant au même groupe d'interférence et reconnaissant donc le récepteur hASCT2. Les TE671galv expriment constitutivement l'enveloppe GALV (gibbon ape leukemia virus) appartenant à un autre groupe d'interférence et reconnaissant le récepteur PiTl.
Les cellules ont été lavées dans du PBS et récoltées par décollement avec 0,02% de versene en PBS. Un total de 106 cellules a été incubé avec 1 ml de surnageant filtré contenant l'enveloppe soluble (Gp60 ou SU) pendant 1 heure à 370C. Les cellules ont été lavées avec du PBA (PBS et 0,5% de sodium d'azide) contenant 2% de sérum de veau fœtal et ont été marquées pendant 1 heure à 40C avec un anticorps monoclonal anti-histidine (RGSH6, Qiagen). Les cellules ont été lavées une fois avec du PBA et incubées avec un anticorps secondaire couplé à l'isothiocyanate de fluoresceine pendant 1 heure à 40C. Les cellules ont été lavées deux fois avec du PBA et analysées par cytométrie en flux.
En utilisant les cellules cibles XChASCT2, les inventeurs ont mis en évidence que la protéine recombinante Gp60 correspondant à une forme soluble de l'enveloppe présente une caractéristique phénotypique identique à celle de l'enveloppe sauvage, à savoir qu'elle est capable de se fixer sur les cellules XC exprimant le récepteur hAS CT2.
En utilisant les cellules cibles XChASCT2, XChASCTl, TE671, TE671RD, TE671 galv, les inventeurs ont mis en évidence que la protéine recombinante correspondant à la sous-unité SU de l'enveloppe présente des caractéristiques phénotypiques identiques à celles de l'enveloppe sauvage. Tout d'abord, la sous-unité SU est capable de se fixer aux deux récepteurs hASCTl et hASCT2 (Figure Ib). De plus, cette protéine a été testée vis à vis de cellules humaines TE671 et de cellules dérivées TE671RD et TE671galv. La protéine SU soluble se fixait sur les cellules TE671 exprimant le récepteur hASCT2 et les cellules TE671galv bloquées pour le récepteur PiTl, mais ne se fixait pas sur les cellules TE671RD bloquées pour le récepteur hASCT2 (Figurelc). La protéine recombinante SU et l'enveloppe du retrovirus RDI 14 interféraient spécifiquement.
Exemple 2 : Identification des domaines d'interaction de la partie SU de l'enveloppe W avec son récepteur hASCT2 Afin d'identifier les bornes de la région de l'enveloppe se fixant au récepteur hASCT2, les inventeurs ont construit un ensemble de mutants de délétion à partir des extrémités N- et C- terminales. Les domaines de la sous-unité SU ont été obtenus par PCR et sous-clonés dans le vecteur d'expression pHCMV-EnvSU et séquences. Les plasmides d'expression phCMV-EnvSU, Env69-317, Envi 97, Envi 68, Envi 69-317, Envi 17 et Envl44 (Figure 2a) ont été transfectés dans les cellules HEK293T par précipitation au phosphate de calcium. Les conditions d'obtention et d'analyse des protéines sont identiques à celles détaillées dans l'exemple 1.
Les protéines EnvSU, Env69-317, Envi 97 étaient correctement exprimées sous forme soluble. En utilisant les cellules XC exprimant constitutivement hASCT2, les inventeurs ont démontré que la protéine Envi 97 était capable de se fixer au récepteur exprimé à la surface des cellules comme la sous-unité SU (1-317). Ainsi, les 176 premiers résidus de la sous-unité SU mature (donc dépourvue de son peptide signal) étaient suffisants pour se fixer à la surface des cellules exprimant le récepteur hASCT2. La délétion de la région 21-68 entraînait une perte de la fixation au récepteur indiquant aussi son implication dans le domaine de fixation au récepteur (RBD pour receptor binding domain). Par contre, la protéine tronquée Envi 68 montrait une capacité de fixation au récepteur hASCT2 plus faible. Afin d'obtenir des quantités équivalentes dans les surnageants entre les différentes protéines tronquées, les inventeurs ont fusionné deux plus petits domaines de la région N-terminale de la SU (Envi 17 et Envi 44) à la région C-terminale de la sous- unité SU (Envi 69-317), ce dernier domaine ne se fixant pas à hASCT2. Le niveau d'expression des protéines Env 117 et Env 144 était similaire et les protéines étaient exprimées sous forme soluble. Le test de fixation montrait que seule la protéine Env 144 était capable de se fixer sur les cellules exprimant le récepteur hASCT2. L'absence de fixation de la protéine Envi 17 à la surface des cellules indiquait la perte d'au moins un déterminant de fixation à l'intérieur de la région 117-144.
Par conséquent, les bornes des domaines d'interaction de l'enveloppe W avec son récepteur sont définies par les acides aminés 21 à 144.
A noter que d'une manière générale, les protéines (y compris les protéines d'enveloppe) destinées à la sécrétion ou à l'expression membranaires sont synthétisées au niveau du réticulum endoplasmique granuleux (RE). La translocation des protéines néosynthétisées dans le RE est conditionnée par un peptide signal N- terminal (Walter et Lingappa 1986). La région hydrophobe du peptide signal initie la pénétration dans la membrane du réticulum, entraînant à sa suite le reste du peptide néosynthétisé. La translocation commençant en même temps que la synthèse, c'est le peptide en cours de traduction qui traverse la membrane du RE. Pendant que la protéine passe dans la lumière du RE, la séquence signal est clivée par une enzyme cellulaire spécifique, la signal peptidase (Walter P, Johnson AE: Signal séquence récognition and protein targeting to the endoplasmic reticulum membrane. Annu Rev CeIl Biol 1994, 10:87-119.). La translocation de Env dans le RE est stoppée par le domaine transmembranaire (hydrophobe) de la glycoprotéine qui s'ancre aux membranes phospolipidiques. Dans la lumière du RE, les régions (SU et partie de TM) destinées à devenir extracytoplasmique sont repliées (les ponts disulfure formés), glycosylées et oligomérisées. Après oligomérisation, les protéines en cours de maturation sont transportées dans l'appareil de Golgi où elles subissent de nouveaux processus de maturation des glycanes ainsi que le clivage par des endoprotéases de type furine reconnaissant un motif R/KXXR conduisant aux deux sous-unités SU et TM. La protéine mature est adressée à la membrane plasmique grâce à un motif présent sur la queue intracytoplasmique contenant une tyrosine (Y-X- X)aliphatique/aromatique)
Exemple 3 : Test d'inhibition in vitro de la fixation de l'enveloppe sur son récepteur (définition d'un peptide et génération d'un anticorps de lapin)
A partir de la région définie dans l'exemple 2 et d'une détermination des régions potentiellement antigéniques de la sous-unité SU, un peptide (112-129, TGMSDGGGVQDQAREKHV+C, 19 acides aminés) a été défini. Une cystéine a été ajoutée en position C-terminale pour le couplage KLH (keyhole limpet hemocyanin, cf Frendo et al, Mol CeIl Biol, Vol 23(10) : 3566-3574, 2003). Ce peptide a été utilisé pour immuniser un lapin puis pour purifier par affinité l'anticorps polyclonal dirigé contre la région 112-119 contenu dans le sérum de ce lapin.
La protéine Envl44 est pré-incubée à 370C pendant une heure avec soit l'anticorps polyclonal anti-SU soit avec un anti-TM. La formation du complexe protéine Envl44-anticorps anti-SU réduisait drastiquement la fixation de l'enveloppe sur les cellules exprimant le récepteur hASCT2. Au contraire, l'utilisation d'un anticorps non dirigé contre le rbd n'altérait pas la fixation de celui-ci sur le récepteur hASCT2.
Exemple 4 : Obtention d'anticorps monoclonaux dirigés contre la protéine d'enveloppe de HERV-W.
Immunisation des souris par ADN.
Trois souris BALB/c femelles de six semaines (IFF A-Credo) ont été immunisées par injection directe d'ADN plasmidique nu (phCMV-env-W) contenant le gène de l'enveloppe HERV-W. Les injections ont été réalisées par voie intra- dermique à l'aide d'un pistolet (« gène gun »). Cinq injections de 2 μg d'ADN ont d'abord été effectuées pour chaque souris suivies d'un rappel avec deux injections de 4 μg d'ADN. Les sérums ont été prélevés et le titre en anticorps pour chaque sérum a été déterminé. Le titre en anticorps étant trop faible, un lysat cellulaire a été préparé.Préparation du lysat cellulaire. Les cellules de rhabdomyosarcome TeICeBo (ATCC CRL8805) ont été transfectées par le plasmide phCMV-env-W. Après une vingtaine d'heures et présence de syncytia, un extrait cellulaire a été réalisé en tampon PBS 0,5% Triton. Les extraits protéiques ont été dosés par Bradford. La concentration en antigène env- W correspondait à 9,5 μg/μl de protéines totales. Immunisation des souris par extrait de lysat cellulaire.
Les mêmes souris ont tout d'abord reçu une injection de 10 μg de lysat cellulaire par voie intrapéritonéale suivie d'une injection de rappel de 2 x 100 μg de lysat cellulaire par voie intrapéritonéale. Trois jours avant la fusion avec les cellules de myélome une nouvelle injection a été effectuée, par voie intra- veineuse, de 22 μg de la protéine d'enveloppe soluble Gp60 obtenue à partir du plasmide phCMV-Env-Gp60 comme décrit à l'exemple 1 préalablement purifiée, avant injection, sur résine Ni-NTA (Qiagen) selon les conditions suivantes : fixation en tampon phosphate pH 8, lavages en tampon phosphate pH 8 et en acétate d'ammonium pH 6, élution en tampon d'acétate d'ammonium pH 3,5 et concentration par speed vac. 47 μg de la protéine Gp60 eucaryote ainsi obtenue ont été réservés pour l'injection par voie intra-veineuse décrite ci-dessus. Après fusion, les surnageants des hybridomes ont été testés par immunofluorescence sur les cellules transfectées et fixées (TeLCebό), les anticorps ont été criblés par un test fonctionnel en ELISA en utilisant la protéine Env-W à une concentration de 9,2 μg/μl de protéines totales et une protéine Env AS comme contrôle négatif à une concentration de 13,3 μg/μl de protéines totales et les anticorps les plus performants ont été sélectionnés.
Les anticorps monoclonaux 2H1H8, 12C7A3 et IFl IBlO ont ainsi été obtenus. Les anticorps monoclonaux 2Hl H8 et 12C7A3 sont dirigés contre la partie N-terminale non glycosylée de la région SU de la protéine Env-HERV-W. Ils sont dirigés contre le rdb comme montré par un essai en Western blot à l'aide de Env 144. L'anticorps monoclonal IFl 1B10 est dirigé contre la partie C-terminale glycosylée de la région SU de la protéine Env-HERV-W comme montré par un essai en Western blot à l'aide de Env 169-317. Il ne reconnaît pas Env 144.
Exemple 5: Test d'inhibition in vitro de la fixation de l'enveloppe sur son récepteur et d'inhibition de la formation de syncytia à l'aide d'anticorps monoclonaux par test de fusion de cellule à cellule (coculture).
Le plasmide d'expression de la glycoprotéine d'enveloppe est transfecté dans les cellules TELCeBo par précipitation au phosphate de calcium à deux quantités 100 et 500ng (Cosset et al, Journal of Virology, 69 (10) : 6314-6322 (1995)). Les cellules exprimant l'enveloppe sont décrochées du support, 20 heures après tranfection et sont pré-incubées à 37°C pendant une heure, respectivement, avec l'anticorps monoclonal anti-HIV 23 A5, l'anticorps monoclonal anti-TM Env-HERV-W 6A2B2 (obtenu antérieurement), les anticorps monoclonaux anti-SU Env-HERV-W 2Hl H8 12C7A3 et IFl 1B10 (dilution l/50ème). Puis, elles sont ré-ensemencées à concentration égale (0,4 x 10^ cellules/puits) en plaques 12 puits. Des cellules humaines indicatrices de carcinome épithélioïde (HeIa, ATCC CCL-2,) sont alors ajoutées aux cellules transfectées à raison de 2 10^ cellules par puits et la co-culture est poursuivie pendant 24 h. Une coloration XGaI (5-bromo-4chloro-3-indolyl-β-D- galactopyranoside peut alors être effectuée pour colorer le noyau des cellules TELCeBÔ (Cosset et al., Journal of Virology, 69 (10) : 6314-6322 (1995)). Elle est suivie d'une coloration par des solutions de May-Grunwald et Giemsa (MERCK) effectuée selon les recommandations du fournisseur. La fusion observée correspond à une fusion " from within ", c'est-à-dire à une fusion de cellule-à-cellule, à partir d'une cellule exprimant l'enveloppe, par opposition à une fusion " from without " qui correspond à une formation de syncytia consécutive à une fusion virion-cellule(s). Les résultats présentés dans le tableau 1 ci-dessous expriment le nombre de cellules fusionnées comptées.
Tableau 1
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ND : non déterminé
Les résultats présentés ci-dessus montrent que la formation du complexe protéique Env-anticorps anti-SU 2H1H8 et 12C7A3 réduisent drastiquement la fixation de l'enveloppe sur les cellules exprimant le récepteur hASCT2 ainsi que la fusion des cellules. Au contraire, l'utilisation d'un anticorps non dirigé contre le rdb (6A2B2 ou IFl IBlO) n'altère pas la fixation de l'enveloppe et la fusion des cellules de manière significative, comme on peut le constater par comparaison aux résultats obtenus avec l'anticorps de contrôle anti-HIV 23 A5.
Exemple 6 : Etude de l'interaction in vivo entre la protéine d'enveloppe et le récepteur hASCT2 et de la formation in vivo de syncytia.
Pour vérifier les résultats obtenus in vitro un modèle animal a été conçu. Des cellules de rhabdomyosarcome TeICeBo (ATCC CRL8805), en culture dans le milieu DMEM (Gibco Invitrogen 41966-029) complémenté avec du sérum d'Amérique du Sud, ont été respectivement transfectées, à l'aide du kit LipofectAMINE PLUS™ (Gibco Invitrogen), avec de l'ADN correspondant au gène env HERV-W clone en sens à la concentration de 2 μg/μl (ADN 409), avec de l'ADN correspondant au gène env HERV-W clone en anti-sens à la concentration de 1,5 μg/μl (ADN 410) et avec de l'ADN correspondant à un gène env HERV-W muté à la concentration de 1,3 μg/μl (ADN LQMV) selon le protocole détaillé ci-dessous. Les cellules transfectées par l'ADN 409 sont capables d'exprimer la protéine d'enveloppe W fusogène, les cellules transfectées par PADN 410 ne sont pas capables d'exprimer la protéine d'enveloppe et les cellules transfectées par PADN LQMV sont capables d'exprimer une protéine d'enveloppe W mutée, non fusogène.
1). Protocole :
1er Jour : Mise en culture des cellules TeICeB 6 :
- Inoculation des boîtes de 100mm de diamètre -^ 50-70% de confluence ;
- Incubation en milieu DMEM complémenté (6 ml par boîte) pendant 24 heures à 37°C sous 5% de CO2. 2ème Jour : Transfection avec le kit LipofectAMINE PLUS™ :
1 Précomplexation de l ADN
- Mélange de 750μl de milieu non-complémenté avec les ADNs précités dans un tube falcon de 15 ml (référence 2096), soit 2μl de 409 ou 3μl de 410 ou 3μl LQMV ;
- Agitation sous Vortex du PLUS Reagent et en ajouter 20μl à la solution d'ADN ; - Agitation sous Vortex immédiatement 10 secondes à 1400 tpm.
- Incubation 15 minutes à T° ambiante.
2 Préparation des cellules
- Remplacement par 5ml de milieu non-complémenté.
3 Dilution de la Lipofectamine Dans un tube et pour une boîte, mélanger 30 μl de LipofectAMINE Reagent avec 750 μl de milieu non-complémenté.
4 Complexation de V ADN
Mélange des 780 μl de Lipofectamine diluée et des 772 μl de solution d'ADN précomplexé (total : 1552 μl) ; Agitation sous Vortex immédiatement 10 sec à 1400 tpm, Incubation 15 minutes à température ambiante. Transfection et obtention d'animaux receveurs greffés avec les cellules cibles, traités ou non par injection d'anticorps anti-Env
Dépose des 1552 μl dans une boîte ; Incubation 2-3 heures à 37°C sous 5% CO2 ; Remplacement du milieu de transfection par 6ml de milieu complémenté ; Incubation lheure à 370C sous 5% CO2 ;
Injection par voie intrapéritonéale (IP) aux souris SCID (sous un volume de 1 ml), l/5ème de chaque boîte à 70% de confluence, avec ou sans injection supplémentaire d'anticorps anti-protéine Env (anticorps monoclonal 2H1H8, anticorps polyclonaux 69 (anti-SU) et 71 (anti-TM) au 1/100).
Obtention d'animaux tolérant la greffe et permettant la dissémination des cellules greffées dans l'organisme, parallèlement à l'établissement d'une pseudo-ascite dans la cavité péritonéale.
3ème Jour :
Prélèvement des cellules de chaque animal par lavage péritonéal: °injection de 2 ml d'air suivie de 2 ml de sérum physiologique puis massage et récupération des 2 ml de liquide péritonéal (protocole mis au point pour la récupération chez l'animal greffé des cellules implantées dans la cavité péritonéale) ; Observation au microscope « phase inverse » avec comptage des syncytia et/ou après coloration sur lame ;
Lecture est immédiate effectuée après étalement sur des lames à chambre quadrillée en présence de bleu Trypan (exclusion des cellules mortes). On dénombre le nombre de cellules ayant fusionnées entre elles par champ quadrillé avec un objectif « grand champ » (40) permettant d'établir le comptage sur plus d'une centaine de cellules afin de disposer de séries de comptage statistiquement représentatives. Un aliquot cellulaire de chaque prélèvement est fixé en présence de méthanol/acétone (y/y) puis conservé à -200C jusqu'à coloration au cristal violet (1%). Les lames colorées ont fait l'objet de prises photographiques.
2) Souris : des lots de 2 souris sont inoculés avec : les cellules transfectées avec les trois types de plasmide (ADNs 409, 410 et LQMV) sans anticorps (3x2=6 souris) les cellules transfectées avec les trois types de plasmide (ADNs 409, 410 et LQMV) avec l'anticorps monoclonal 2H1H8 (3x2=6 souris)
3) Résultats :
Le nombre de cellules fusionnées est déterminé par lecture directe sur chambre de numération quadrillée pour 100 cellules est indiqué dans le tableau 2 ci-dessous :
Tableau 2 Lecture ECP (bleu Tryptan) : lecture directe des syncytia
Figure imgf000031_0001
Sl* et S2* = souris 1 et souris 2
Chaque chiffre représente le nombre de cellules fusionnées et visualisées par champ étudié. Certaines cellules pouvant être superposées dans le trajet optique, le compte des cellules apparaissant fusionnées dans les contrôles est supérieur à zéro. La réalité des syncytia et la discrimination avec des empilements de cellules ont ensuite été vérifiées par coloration des cellules sur lame, avec visualisation de multiples noyaux cellulaires inclus dans un espace délimité par la continuité d'une seule et unique membrane cellulaire. Par ailleurs des photos montrant des cellules en cours de fusion ont permis d'objectiver la réalité de la fusion dès l'analyse en microscopie en contraste de phase et l'absence totale de phénomène équivalent dans les contrôles. Pour objectiver statistiquement l'analyse primaire représentée par les chiffres indiqués dans le tableau 2, un test de Chi-2 a été effectué pour comparer les données du tableau 2.
Les résultats de l'analyse statistique tenant compte du « bruit de fond » de la lecture primaire, sans analyse secondaire après coloration sur lame ou recherche de cellules typiques en cours de fusion qui ne sont jamais vues dans les contrôles sont les suivants : i) Validation statistique de la spécificité de l'effet pathogène in vivo : Env exprimée (409) : 20,5 positifs comptés en moyenne sur 100 cellules, Env anti-sens (410) : 9,5 positifs comptés en moyenne sur 100 cellules, Env mutée (LQMV) : 6,5 positifs comptés en moyenne sur 100 cellules, Moyenne des contrôles (410 et LQMV): 9,5 + 6,5 / 2 = 8%
Env versus contrôle 410 : Chi-2 = 5,89 (p< 0,02) Env versus contrôle LQMV : Chi-2 = 9,83 (p< 0,002)
Env versus les deux contrôles (410 et LQMV) : Chi-2 = 7,69 (p< 0,01)
Contrôle 410 versus contrôle LQMV : Chi-2 = 0,61 (Différence Non Significative).
Les contrôles sont donc bien statistiquement équivalents et il n'y a pas de différence « réelle » liée au type de contrôle.
Les résultats obtenus dès ce stade de l'analyse (en n'excluant pas le bruit de fond lié aux images artéfactuelles et en comparant entre eux les deux types de contrôles (qui s'avèrent équivalents) est statistiquement très significatif (globalement p<0,01). Les analyses ultérieures, par coloration, de la spécificité des effets ne font donc que confirmer la spécificité de l'effet obtenu in vivo en présence de la protéine Env, validant ainsi le modèle animal l'étude in vivo de syncytia dont la fusion a été induite par Env HERV-W.
ii) Validation statistique de l'activité thérapeutique des anticorps testés sur l'effet pathogène in vivo :
Env exprimée (409) : 20,5 positifs comptés en moyenne sur 100 cellules,
Env exprimée (409) + anticorps monoclonal 2H1H8 : 3,5 positifs comptés en moyenne sur 100 cellules.
Env seule versus injection de l'anticorps 2H1H8 : Chi-2 = 15,38 (p 0,001) Les résultats obtenus montrent un effet statistiquement significatif pour l'anticorps monoclonal (probabilité de résultat dû au hasard (p) inférieure à 0,001). Les analyses ultérieures, par coloration, de la spécificité des effets ne font que confirmer la spécificité de l'effet obtenu in vivo en présence de la protéine Env et d'anticorps, validant ainsi l'effet thérapeutique sur le modèle animal.
Exemple 7 : Etude in vivo de Ia liaison de la protéine Env HERV-W à des cellules possédant ou ne possédant pas des récepteurs hASCT de type 1 ou 2 et de l'inhibition de cette liaison par injection d'anticorps dirigés contre Env HERV- W.
1) Matériel
Protéine soluble : surnageant filtré sur 0,45 μm contenant la protéine soluble
(cellules 293T tranfectées avec le plasmide 460 (enveloppe-espaceur-Hisό). Expression vérifiée par Western blot avec un anticorps anti-RGS-His.
L' anticorps : anticorps monoclonal 2H1H8 (IgG, 5,50mg/ml).
Les cellules : XChASCT2, clone cellulaire XC (ATCC CCL- 165, cellules de rat) exprimant le récepteur hASCT2.
Milieu DMEM (Gibco Invitrogen 41966-029) avec du sérum Amérique du Sud. Pré-incubation, incubation, marquage en tube Eppendorf 1,5ml.
2) Protocole
1 Inoculation IP (intrapéritonéale) des cellules XChASCTl, XChASCT2 et de cellules témoins XChASCT- à des souris SCID. Injection aux souris de l/5eme de flacon à 70% de confluence sous un volume de 2ml.
2 Pré-incubation
Incubation du surnageant protéine soluble (surnageant filtré de la lignée 293T) avec l'anticorps monoclonal 2H1H8 (990 μl de surnageant avec lOμl d'anticorps (dilution au 100ème)) pendant 1 heure à 37°C dans l'incubateur des cellules avec une agitation de temps en temps (toutes les 15 minutes). 3 Inoculation
Inoculation des protéines seules ou avec l'anticorps, en IP (intrapéritonéal) aux souris greffées avec les cellules (1 106 cellules par point, soit 1/5 d'une boîte de 100 mm de diamètre confluente).
Après injection de l'anticorps (200 microlitres), maintien en IP, pendant 6 heures, avec un massage péritonéal de temps en temps (toutes les 30-60 minutes).
4-Récupération des cellules par lavage péritonéal des souris greffées. - Centrifugation 3000 tours pendant 5 minutes à +4°C.
- Récupération du culot cellulaire et dilution dans les milieux de marquage.(maintien à +4°C jusqu'à fixation.)
5 Marquage - Anticorps primaire :
Le culot est repris par 100 μl d'anticorps anti-RGS His (dilution au 100eme-Qiagen) dans un tampon PBA (PBS avec 2% sérum de veau fœtal et 0,1% azide de sodium), maintenu à +4°C.
1 heure dans la glace avec une agitation de temps en temps (toutes les 15minutes). lavage en tampon PBA (1 ml par tube), maintenu à +4°C.
- Anticorps secondaire :
Centrifugation 3000 tours pendant 5 minutes à +4°C.
Le culot est repris par lOOμl d'anticorps anti-souris-FITC (dilution au 20ème-DAKO, référence : F0479) dans un tampon PBA), maintenu à +4°C.
1 heure dans la glace avec une agitation de temps en temps (toutes les 15minutes).
2 lavages en tampon PBA (ImI par tube), ), maintenu à +4°C.
Culot repris par 500 μl de PBA), maintenu à +40C. et analyse par FACS. Alternativement analyse par IF après fixation sur lame en acétone/méthanol (50%/50%) à -20°C et contre-coloration au bleu EVANS. 3) Souris : des lots de 2 souris sont inoculés avec : chaque type de cellules (exprimant les 2 types de récepteurs hASCTl et hASCT2 et un n'exprimant pas de récepteur hASCT- comme contrôle) sans anticorps (3x2=6 souris) les trois types de cellules avec la protéine Env et l'anticorps monoclonal 2H1H8
(3x2=6 souris).
4) Résultats
Les résultats par lecture en immunofluorescence (IF) au microscope sont présentés dans le tableau 3 ci-dessous:
Tableau 3
Lecture IF: nombre de cellules fluorescentes / nombre de cellules totales (NF / NT) dans un même champ
Figure imgf000035_0001
Chaque chiffre représente le nombre de cellules visualisées comme fluorescentes par champ étudié. Certaines cellules pouvant avoir fixé une fluorescence de manière non spécifique, le compte des cellules apparaissant fluorescentes dans les conditions témoins est donc supérieur à zéro dans un des deux champs compté (moyenne des deux champs = 1/28, soit 0,036%, ce qui est tout à fait correct pour le bruit de fond d'une telle technique de lecture). La réalité des cellules ayant fixé de la protéine Env sur leur récepteur hASCTl ou hASCT2 a ensuite été vérifiée par analyse cytofluorométrique. Pour objectiver statistiquement l'analyse présentée dans le tableau 3, un test de Chi-2 a été effectué pour comparer les données relevées dans les conditions selon lesquelles (i) la protéine Env peut se fixer sur un récepteur hASCTl (hASCTl contrôle) ou hASCT2 (hASCT2 contrôle) présent à la surface des cellules greffées sur souris SCID versus les cellules contrôles greffées qui n'ont aucun récepteur (X contrôle) sur lesquelles la protéine Env injectée aux animaux correspondants ne peut se fixer et ne donne pas de fluorescence membranaire en présence d'un anticorps anti-Env et (ii) la protéine Env peut se fixer sur un récepteur hASCTl (hASCTl contrôle) ou hASCT2 (hASCT2 contrôle) présent à la surface des cellules greffées sur souris SCID versus l'injection d'un anticorps monoclonal dirigé contre Env-SU.
Les résultats de l'analyse statistique sont présentés ci-dessous : i) Validation statistique de la spécificité de l'effet pathogène in vivo : hASCTl contrôle : 24 positifs comptés en moyenne sur 77 cellules, hASCT2 contrôle : 23 positifs comptés en moyenne sur 57 cellules, cellules hASCT-: 1 positif compté en moyenne sur 28 cellules.
Env+greffes hASCTl versus hASCT- : Chi-2 = 8,62 (p< 0.01) ENV+greffes hASCT2 versus hASCT- : Chi-2 = 12,53 (p< 0.001)
Env+greffes hASCTl versus Env+greffes hASCT2 : Chi-2 = 1,21 (Différence Non Significative).
Les cellules exprimant les récepteurs hASCTl ou hASCT2 à leur surface sont donc bien statistiquement équivalentes et il n'y a pas de différence de liaison de Env sur le récepteur liée au sous-type 1 ou 2, dans les conditions de l'expérience.
Les résultats obtenus avec les animaux greffés avec les cellules exprimant les récepteurs membranaires hASCTl ou hASCT2 sont statistiquement significatifs au regard des résultats obtenus avec les animaux contrôles greffés avec les cellules n'exprimant aucun de ces récepteurs à leur surface. Ces résultats confirment la spécificité de l'effet obtenu in vivo en présence de la protéine Env dans les modèles animaux.
ii) Validation statistique de l'activité thérapeutique des anticorps testés sur l'effet pathogène in vivo :
Env+greffes hASCTl contrôle : 24 positifs comptés en moyenne sur 77 cellules Env+greffes hASCTl + anticorps monoclonal 2H1H8 : 2 positifs comptés en moyenne sur 73 cellules.
Env+greffes hASCTl seul versus injection anticorps 2H1H8 : Chi-2 = 21,14(p< 0.001)
Les résultats obtenus montrent un effet statistiquement significatif pour l'anticorps monoclonal (probabilité de résultat dû au hasard (p) inférieure à 0,001).
Env+greffes hASCT2: 23 positifs comptés en moyenne sur 57 cellules
Env+greffes hASCT2 + anticorps monoclonal 2H1H8 : 1 positif compté en moyenne sur 45 cellules.
Env+greffes hASCT2 seul versus injection anticorps 2H1H8 : Chi-2 = 20,3 l(p< 0.001).
Les résultats obtenus montrent un effet statistiquement significatif pour l'anticorps monoclonal(probabilité de résultat dû au hasard (p) globalement inférieur à 0,01).
La validation des modèles animaux contre les témoins appropriés permet de démontrer que des anticorps peuvent avoir une activité thérapeutique en inhibant signifïcativernent les effets pathogènes de la protéine Env HERV-W. Exemple 8 : Alignement des séquences du groupe d'interférence
Les séquences protéiques des enveloppes des rétrovirus HERV-W (swiss-prot Q9UQF0), RDI 14 (swiss-prot Q98654), REV (swiss-prot P31796), BAEV (swiss- prot P 10269), SRVl (swiss-prot P04027), SRV2 (swiss-prot P51515) et MPMV (swiss-prot P07575) ont été alignées à l'aide du logiciel MacVector avec la procédure ClustalW. Le peptide signal, la sous-unité SU (surface unit) et la sous- unité TM (Trans membrane) sont indiquées. Le site de fixation au récepteur est souligné.

Claims

REVENDICATIONS
1) Domaine peptidique nécessaire à l'interaction entre l'enveloppe d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W et un récepteur hASCT, défini en ce qu'il commence par une extrémité N terminale et se termine par une extrémité C terminale, et en ce que : l'extrémité N-terminale est définie par un motif choisi parmi SEQ ID N0I à SEQ ID N°29, l'extrémité C terminale est définie par un motif choisi parmi SEQ ID N°30 à SEQ ID N°40, et en ce que ledit domaine peptidique comprend, entre l'extrémité N terminale et l'extrémité C terminale au moins un motif choisi parmi SEQ ID N°41, SEQ ID N°42 et SEQ ID NO : 73.
2) Séquence nucléotidique codant pour un domaine peptidique tel que défini dans la revendication 1.
3) Epitope issu du domaine peptidique tel que défini dans la revendication 1, caractérisé en ce qu'il induit une réponse irnmune contre un viras appartenant au groupe d'interférence de HERV-W.
4) Séquence nucléotidique codant pour un épitope tel que défini dans la revendication 3.
5) Vecteur d'expression caractérisé en ce qu'il comprend une séquence nucléotidique selon l'une des revendications 2 ou 4, ainsi que les moyens nécessaires à son expression.
6) Microorganisme ou cellule hôte transformé par au moins un vecteur d'expression tel que défini dans la revendication 5. 7) Anticorps dirigé contre un domaine peptidique tel que défini dans la revendication 1 ou contre un épitope tel que défini dans la revendication 3
8) Utilisation d'au moins un domaine peptidique tel que défini dans la revendication 1 ou d'au moins un épitope tel que défini dans la revendication 3, ou d'au moins un anticorps tel que défini dans la revendication 7 ou d'au moins une séquence nucléotidique telle que définie dans les revendications 2 ou 4 placée sous le contrôle d'éléments nécessaires à une expression constitutive et/ou inductible desdits domaines peptidiques ou épitopes, pour la préparation d'un médicament destiné à l'inhibition, la prévention "ou le traitement d'une infection provoquée par un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W chez un animal, de préférence l'homme.
9) Composition pharmaceutique comprenant à titre de substance active au moins un domaine peptidique tel que défini dans la revendication 1, ou au moins un épitope tel que défini dans la revendication 3, ou bien au moins une des séquences nucléotidiques telles que définies dans les revendications 2 ou 4 placée sous le contrôle d'éléments nécessaires à une expression constitutive et/ou inductible desdits domaines peptidiques ou épitopes, ou bien au moins un anticorps tel que défini dans la revendication 7, en association avec un véhicule pharmaceutiquement approprié.
10) Composition diagnostique pour la détection et/ou la quantification d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W et/ou la quantification d'une réponse immune contre un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W, comprenant au moins un domaine peptidique tel que défini dans la revendication 1, au moins un épitope tel que défini dans la revendication 3, ou au moins une des séquences nucléotidiques telles que définies dans les revendications 2 ou 4 , ou au moins un anticorps tel que défini dans la revendication 7.
11) Procédé de détection et/ou de quantification d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W dans un échantillon biologique prélevé chez un individu susceptible d'être infecté par ledit virus caractérisé en ce qu'il comprend les étapes consistant à :
- mettre en contact ledit échantillon biologique avec au moins un anticorps selon la revendication 7 dans des conditions permettant la formation d'un complexe entre le virus et l'anticorps, et
- détecter et/ou quantifier la formation dudit complexe par tout moyen approprié.
12). Utilisation de la composition selon la revendication 10 pour le diagnostic in vitro d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W dans un échantillon ou prélèvement biologique.
13). Utilisation d'un domaine. peptidique selon la revendication 1 ou d'un épitope tel que défini dans la revendication 3, ou d'un anticorps tel que défini dans la revendication 7 pour inhiber l'interaction entre l'enveloppe d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W et un récepteur hASCT.
14) Utilisation d'un domaine peptidique selon la revendication 1 pour identifier des molécules chimiques ou biologiques dont l'interaction avec tout ou partie de ce domaine peptidique, bloque l'interaction entre l'enveloppe d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W et un récepteur hASCT.
15) Utilisation d'un domaine peptidique selon la revendication 1 pour générer des anticorps bloquant l'interaction entre l'enveloppe d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W et un récepteur hASCT.
16) Procédé pour déterminer une région polypeptidique nécessaire à l'interaction entre l'enveloppe d'un virus appartenant au groupe d'interférence de HERV-W et un récepteur hASCT caractérisé en ce que :
• on identifie la séquence nucléotidique et/ou peptidique de l'enveloppe précurseur dudit virus
* on exclut la partie signal " on détecte un motif Sérine-Acide aspartique-Xa-Xb-Xc-Xd-Xe- Acide aspartique -Xf-Xg qui correspond à la SED ID N°43 dans lequel Xa, Xb, Xc, Xd, Xe5 Xf5 Xg? s°nt des acides aminés quelconques " on exclut de l'extrémité C-terminale entre 15 et 25 acides aminés après ledit motif Sérine-Acide aspartique-Xa-Xb-Xc-Xd-Xe-Acide aspartique-Xf- Xg> qui correspond à la SED ID N°43.
17) Domaine peptidique susceptible d'être obtenu par le procédé selon la revendication 16.
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