WO2011012809A2 - Nouveaux substrats de peptidase - Google Patents

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WO2011012809A2
WO2011012809A2 PCT/FR2010/051597 FR2010051597W WO2011012809A2 WO 2011012809 A2 WO2011012809 A2 WO 2011012809A2 FR 2010051597 W FR2010051597 W FR 2010051597W WO 2011012809 A2 WO2011012809 A2 WO 2011012809A2
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quinolinium
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alanyl
alkyl
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Arthur James
Sylvain Orenga
John Perry
Vindhya Lakshika Salwatura
Stephen Stanforth
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Biomerieux SA
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    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/84—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving inorganic compounds or pH
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
    • C12Q1/04—Determining presence or kind of microorganism; Use of selective media for testing antibiotics or bacteriocides; Compositions containing a chemical indicator therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/34—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
    • C12Q1/37—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase involving peptidase or proteinase

Definitions

  • the present invention relates to novel compounds useful as pH indicators and / or enzyme substrates for the detection of peptidase activity. These substrates can be used in applications comprising an enzymatic hydrolysis step producing a physico-chemical signal, especially in microbiology, biochemistry, immunology, molecular biology, histology, etc.
  • the invention also relates to reaction media containing such substrates, the use of substrates or media for the detection of peptidase activities and / or the differentiation of gram-positive bacteria from Gram-negative bacteria and methods of 'use.
  • the synthetic enzyme substrates are constituted in such a way that the substrate and the product of its metabolism by the target enzyme have different physicochemical properties, making it possible to distinguish them and to evaluate whether all or part of the substrate was converted into product by the enzyme.
  • the hydrolase substrates generally consist of a first specific part of the enzymatic activity to be revealed, and a second part serving as a marker, generally chromogenic or fluorescent.
  • a peptidase activity can in particular be used to reveal a group, a genus or a species of bacteria.
  • alanine aminopeptidase activity makes it possible to differentiate Gram-negative bacteria from Gram-positive bacteria.
  • Enzymatic chromogenic substrates for the detection of peptidase activity are known from the state of the art. Mention may in particular be made of the Manafi publication (Manafi et al., Microbiol Rev 55 (3): 335-348, 1991), which is a review of enzymatic substrates used in microbiology.
  • the aminopeptidase substrates described release by hydrolysis compounds diffusing in the medium (beta-naphthylamine, 7-amino-4-methylcoumarin). Therefore, in a reaction medium heterogeneous (colonies on petri dishes, histological section ...), it is not possible to precisely locate the site of hydrolysis.
  • the present invention therefore proposes the use of new compounds, either as pH indicators or as peptidase substrates, allowing the detection of microorganisms.
  • these new compounds are easy to synthesize, and can be used especially in gelled media for the detection of microorganisms because they produce a color that does not diffuse little or no in the reaction medium.
  • this makes it possible to identify a colony or organelle expressing a peptidase activity among others that does not express it.
  • enzymatic substrate a substrate that can be hydrolyzed by an enzyme into a product allowing the direct or indirect detection of a microorganism, a cell or an organelle.
  • This substrate comprises in particular a first specific part of the enzymatic activity to be revealed and a second part serving as a marker.
  • the compounds according to the invention used as substrates are suitable for use in flow cytometry, because the product of the hydrolysis remaining mainly located in the cell expressing the enzymatic activity, it is possible to count specifically the cells expressing this activity, even to separate them from the rest of the sample.
  • the compounds according to the invention used as substrates are also well suited for use in histoenzymology because, since the hydrolysis product remains mainly located at the site of the hydrolysis, it is possible to specifically identify the cells or organelles expressing this activity. within a fabric. Because of their low toxicity, the compounds according to the invention are well suited, respectively as pH indicators, or for the monitoring of peptidase activity in cell culture.
  • the compounds according to the invention are particularly well suited for use in detection and / or identification medium because they produce a staining or fluorescence that does not diffuse into the reaction medium.
  • the term "coloration” is used to cover a coloration, absorption of light in the visible spectrum, or fluorescence, absorption at a wavelength ( ⁇ ex ) and emission at a higher wavelength ( ⁇ em , ⁇ em > ⁇ ex ).
  • the compounds of the invention may be salified, that is to say in the form of salt such as chloride, bromide, iodide or trifluoroacetate.
  • pH indicator is meant a chemical substance whose color and / or fluorescence varies as a function of the pH changes of the medium, said changes being related or not to the metabolism of the growing microorganism (s) on said medium.
  • peptidase an enzyme capable of cleaving, by hydrolysis, the amide group formed between the acyl residue of a peptide and a primary amine.
  • aminopeptidase an enzyme capable of hydrolytically cleaving the amide group formed between an amino acid acyl and a primary amine.
  • peptidase may designate, as the case may be, both a peptidase and an aminopeptidase as defined above.
  • peptide is meant a peptide chain comprising from 1 to 10 amino acids, preferably from 1 to 4 amino acids.
  • the peptide is a di-alanine or tri-alanine.
  • amino acid is meant any amino acid known to those skilled in the art, natural or not.
  • the amino acid is a beta-alanine or L-alanine or D-alanine, or a glycine, pyrroglutamyl, ...
  • Said peptide may comprise a blocking agent at its N-terminus.
  • the blocking agents according to the invention comprise any blocking agent known to those skilled in the art which is capable of protecting amines.
  • Blocking agents are not systematically present in the compounds of the invention.
  • Alkyl group means a chain of saturated hydrocarbon groups, such as in particular a C 1 -C 6 alkyl, that is to say a straight or branched alkyl having 1 to 6 carbon atoms.
  • a C 1 -C 6 alkyl that is to say a straight or branched alkyl having 1 to 6 carbon atoms.
  • Aryl group means a functional group (or substituent) derived from an aromatic ring such as in particular a C 6 -C 10 aromatic ring, especially phenyl, benzyl, 1-naphthyl or 2-naphthyl.
  • carboxyl group is meant in particular a functional group consisting of a carbon atom, bonded by a double bond to a first oxygen atom, and by a single bond to a second oxygen atom, itself negatively charged or connected to a hydrogen atom.
  • the carboxyl group may be in ionized form, ie without H bonded to the second oxygen atom, which is then negatively charged.
  • reaction medium is meant a medium comprising all the elements necessary for the expression of a metabolism and / or the growth of microorganisms, a cell or an organelle. This reaction medium can be used in flow cytometry, histoenzymology, cell culture ... or as a medium for the detection and / or identification of microorganisms.
  • the reaction medium may comprise one or more elements in combination, such as amino acids, peptones, carbohydrates, nucleotides, minerals, vitamins, antibiotics, surfactants, buffers, phosphate salts, ammonium, sodium, metals.
  • the medium may also include a dye.
  • a dye of Evans blue, neutral red, sheep blood, horse blood, an opacifier such as titanium oxide, nitroaniline, malachite green, brilliant green ...
  • the reaction medium may be solid, semi-solid or liquid.
  • solid medium is meant for example a gelled medium.
  • Agar is the traditional gelling agent in microbiology for growing microorganisms, but it is possible to use gelatin or agarose.
  • a number of preparations are commercially available, such as Columbia agar, Trypcase-soy agar, Mac Conkey agar, Sabouraud agar or more generally those described in the Handbook of Microbiological Media (CRC Press).
  • the reaction medium may be a detection and / or identification medium, ie a revealing medium or a culture and revelation medium.
  • a detection and / or identification medium ie a revealing medium or a culture and revelation medium.
  • the culture of the microorganisms is carried out before seeding, and in the second case, the detection and / or identification medium also constitutes the culture medium.
  • biological sample is meant a clinical sample, from a sample of biological fluid or a food sample, from any type of food or a cosmetic or pharmaceutical sample from any cosmetic or pharmaceutical preparation.
  • This sample may thus be liquid or solid and may be mentioned in a nonlimiting manner, a clinical sample of blood, plasma, urine, faeces, nose samples, throats, skin, wounds, cerebrospinal fluid, a food sample of water, beverages such as milk, fruit juice; yogurt, meat, eggs, vegetables, mayonnaise, cheese; fish ..., a food sample from a feed intended for animals, such as in particular a sample from animal meal.
  • the sample may also come from a collection of the clinical environment, livestock or food production, cosmetic or pharmaceutical.
  • sampling environment means in particular a sample of surface, liquid, raw material or product.
  • sample we mean the collection itself (swab, stool, food, ...) as well as colonies of microorganisms from said sample (for example after isolation on a gelled culture medium, or in a broth of enrichment seeded with said sample).
  • microorganism covers bacteria, yeasts, molds and more generally, generally unicellular organisms, invisible to the naked eye, which can be multiplied and manipulated in the laboratory.
  • Gram-negative bacteria mention may be made of the following genera: Pseudomonas, Escherichia, Salmonella, Shigella, Enterobacter, Klebsiella, Serratia, Proteus, Ca ⁇ tpylobacter, Haemophilus, Morganella, Vibrio, Yersinia, Acinetobacter,
  • Moraxella Pasteurella, Providencia, Actinobacillus, Alcaligenes, Bordetella, Cedecea,
  • bacteria of the following types there may be mentioned bacteria of the following types:
  • Aerococcus Enterococcus, Streptococcus, Staphylococcus, Bacillus, Lactobacillus,
  • yeast As yeast, mention may be made of yeasts of the following genera: Candida,
  • the microorganisms are chosen from Escherichia coli, Serratia marcescens, Enterobacter cloacae, Salmonella typhimurium, Providencia rettgeri,
  • Yersinia enter ocolitica enter ocolitica, Pseudomonas aeruginosa, Bacillus subtilis, Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Enterococcus faecalis.
  • the invention relates to the use of a compound of the following formula (I) as an enzymatic substrate for the detection of a peptidase activity and / or a pH variation:
  • Y is a peptide, H or an alkyl • Wi, W 2 , W 3 and W 4 are independently H, Br, Cl, F, I, alkyl, alkoxy, thiomethyl, perfluoroalkyl, nitro, cyano, carboxyl (including its esters or amides) or any combination thereof
  • R is H, alkyl, aralkyl, aryl, alkanoic or alkylsulfonic
  • Z 1, Z 2 , Z 3 , Z 4 , Z 2 and Z 6 are independently H, Br, Cl, F, I, alkyl, aryl, alkoxy, perfluoroalkyl, nitro, cyano, carboxyl, sulfonyl, including esters or carboxyl or sulfonyl amides
  • Yi is H or an alkyl.
  • Yi is a peptide.
  • U or V is N.
  • Yi is a peptide.
  • U or V is N.
  • Yi is a peptide, preferably chosen from alanine, asparagine, glutamine, tyrosine and tri-alanyl.
  • n 1
  • W 1 , W 2 , W 3 and W 4 are independently H
  • U is CH and V is N or N + R, preferentially N + CH3
  • V is CH and U is N or N + R, preferentially N + CH3
  • Z 1 , Z 2 , Z 3 , Z 4> Z 5 , and Z 6 are independently H
  • L-Alanyl-4- (4'-amidophenyl) -2-methyl-quinoline L-Alanyl-4- (4'-amidostyryl) -N-benzyl-quinolinium TFA, L-
  • the invention also relates to a method for the detection in microorganisms of a peptidase activity and / or of a pH variation, characterized in that it comprises, or consists of the following stages:
  • W 2 , W 3 and W 4 are independently H, Br, Cl, F, I, alkyl, alkoxy, thiomethyl, perfluoroalkyl, nitro, cyano, carboxyl (including its esters or amides) or any combination thereof
  • U is N or N + R and V is CZ 6 N or N + R or V is N or N + R and U is CZ 6 ,
  • R is H, alkyl, aralkyl, aryl, alkanoic or alkylsulfonic
  • Z 1 , Z 2 , Z 3 , Z 4 and Z 5 are independently H, Br, Cl, F, I, alkyl, aryl, alkoxy, perfluoroalkyl, nitro, cyano, carboxyl, sulfonyl, including esters or carboxyl amides or sulfonyl
  • Yj is H or an alkyl.
  • Yi is a peptide.
  • U or V is N.
  • Yi is a peptide.
  • U or V is N.
  • Y 1 is a peptide, preferably chosen from alanine, asparagine, glutamine and tyrosine.
  • n 1
  • Wi, W 2 , W 3 and W 4 are independently H
  • U is CH and V is N or N + R, preferentially N + CH3
  • V is CH and U is N or N + R, preferentially N + CH3
  • Z], Z 2, Z 3 and Z 4j Z 5, and Z 6 are independently H
  • the seeding of the microorganisms can be carried out by all the seeding techniques known to those skilled in the art.
  • An incubation step can be carried out at a temperature for which the enzymatic activity that one wishes to detect is optimal, that the person skilled in the art can easily choose according to the enzymatic activity to be detected.
  • Step d) can be carried out by visual examination, colorimetry or fluorimetry.
  • the presence of the peptidase activity or the pH change can be revealed, alone or in combination with at least one other enzymatic activity.
  • the microorganisms are chosen from Escherichia coli, Serratia marcescens, Enterobacter cloacae, Salmonella typhimurium, Providencia rettgeri, Yersinia enterocolitica, Pseudomonas aeruginosa, Bacillus subtilis, Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Enterococcus faecalis.
  • the invention also relates to a method for the differentiation in bacteria of their belonging to Gram-positive or Gram-negative bacteria, characterized in that it comprises the following steps:
  • a) having a detection and / or identification medium comprising the following formula (I) as an enzymatic substrate for the detection of a peptidase activity and / or a pH variation:
  • W 2 , W 3 and W 4 are independently H, Br, Cl, F, I, alkyl, alkoxy, thiomethyl, perfluoroalkyl, nitro, cyano, carboxyl (including its esters or amides) or any combination thereof
  • U is N or N + R and V is CZ 6 N or N + R or V is N or N + R and U is CZ 6 ,
  • R is H, alkyl, aralkyl, aryl, alkanoic or alkylsulfonic
  • Z 1 , Z 2 , Z 3 , Z 4 and Z 5 are independently H, Br, Cl, F, I, alkyl, aryl, alkoxy, perfluoroalkyl, nitro, cyano, carboxyl, sulfonyl, including esters or carboxyl amides or sulfonyl
  • Y] is H or an alkyl
  • Yi is a peptide.
  • U or V is N.
  • Yi is a peptide.
  • U or V is N.
  • the seeding of the microorganisms can be carried out by all the seeding techniques known to those skilled in the art.
  • An incubation step can be carried out at a temperature for which the enzymatic activity that one wishes to detect is optimal, that the person skilled in the art can easily choose according to the enzymatic activity to be detected.
  • Step d) can be carried out by visual examination, colorimetry or fluorimetry.
  • the presence of the peptidase activity can be revealed, alone or in combination with other enzymatic activities.
  • Y 1 is a peptide, preferably chosen from alanine, asparagine, glutamine and tyrosine.
  • n 1
  • W 1, W 2 , W 3 and W 4 are independently H
  • U is CH and V is N or N + R, preferentially N + CH3
  • V is CH and U is N or N + R, preferentially N + CH3
  • Z 1 , Z 2 , Z 3 and Z 4 , Z 5 and Z 6 are independently H
  • said compound is chosen from: ⁇ -Alanyl-2- (4'-amidostyryl) -quinoline ( ⁇ -Ala-ASQ), L-Tyrosyl-4- (4'-amidostyryl) ) -N-methyl-quinolinium dihydrochloride (Tyr-ASQM + ), L-Asparaginyl-4- (4'-amidostyryl) -N-methyl-quinolinium-bis-TFA (ASn-ASQM + X L-gamma-Glutamyl-4 - (4'-amidostyryl) -N-methyl-quinolinium (dichloride) ( ⁇ -Glu-ASQM + ), L-Alanyl-L-alanyl-L-alanyl-4- (4'-amidostyryl) -N-methyl- quinolinium (dichloride) (Tri-AI-ASQM + )
  • the microorganisms are selected from Es
  • the invention also relates to a microorganism detection and / or identification medium comprising a compound of the following formula (I) for detecting a peptidase activity and / or a pH variation:
  • W 1 , W 2 , W 3 and W 4 are independently H, Br, Cl, F, I, alkyl, alkoxy, thiomethyl, perfluoroalkyl, nitro, cyano, carboxyl (including its esters or amides) or any combination thereof.
  • U is N or N + R and V is CZ 6 N or N + R or V is N or N + R and U is CZ 6 ,
  • R is H, alkyl, aralkyl, aryl, alkanoic or alkylsulfonic
  • Z 1 , Z 2 , Z 3 , Z 4 and Z 5 are independently H, Br, Cl, F, I, alkyl, aryl, alkoxy, perfluoroalkyl, nitro, cyano, carboxyl, sulfonyl, including the esters or amides of carboxyl or sulfonyl
  • Yi is a peptide.
  • U or V is N
  • Yj is a peptide, preferably chosen from alanine, pasparagine, glutamine and tyrosine.
  • n 1
  • Wi, W 2 , W 3 and W 4 are independently H
  • U is CH and V is N or N + R, preferentially N + CH3
  • V is CH and U is N or N + R, preferentially N + CH3
  • Z 1 , Z 2 , Z 3 and Z 4, Z 5 and Z 6 are independently H
  • the microorganisms are chosen from Escherichia coli, Serratia marcescens, Enterobacter cloacae, Salmonella typhimurium, Providentiel rettgeri, Yersinia enterocolitica, Pseudomonas aeruginosa, Bacillus subtilis, Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Enterococcus faecalis.
  • said reaction medium is a medium for the detection and / or identification of microorganisms, said medium comprising at least one molecule used as an enzymatic substrate or as a pH indicator as defined above.
  • said compound, enzymatic substrate or pH indicator is at a concentration of between 1 and 1000 mg / l, preferably between 10 and 500 mg / l.
  • said detection and / or identification medium according to the invention further comprises at least one other enzymatic substrate, specific for an enzymatic activity different from the peptidase activity detected by the molecule according to the invention.
  • said detection and / or identification medium according to the invention also comprises at least one substrate specific for an enzymatic activity different from that evidenced by the pH variation. .
  • the enzymatic metabolism of the other substrate (s) generates a detectable signal, different from the signal generated by the compound according to the invention, used as an enzyme substrate or as a pH indicator, for example different colored or fluorescent products, to enable the highlighted as the detection and / or identification and / or quantification of one or more microorganisms.
  • a detectable signal different from the signal generated by the compound according to the invention, used as an enzyme substrate or as a pH indicator, for example different colored or fluorescent products, to enable the highlighted as the detection and / or identification and / or quantification of one or more microorganisms.
  • any other substrate conventionally used in the detection of microorganisms can be used.
  • the concentration of the other specific enzymatic substrate is generally between 0.01 and 1 g / l. Those skilled in the art can easily determine such a concentration depending on the substrate used.
  • the compounds according to the invention with enzymatic substrates of peptidase, osidase, esterase or reductase.
  • a substrate according to the invention for which the peptide is a ⁇ -Alanine with an osidase substrate, such as 5-Bromo-4-chloro-3-indolyl- ⁇ -glucoside, or Alizarin- ⁇ -galactoside.
  • a substrate according to the invention for which the peptide is L-Alanine with an esterase substrate, such as 5-Bromo-6-chloro-3-indoxyl-octanoate or 5-Bromo -3-indoxyl-phosphate.
  • said detection and / or identification medium according to the invention further comprises at least one other enzymatic substrate specific for the peptidase activity or specific for the enzymatic activity detected by a compound according to the invention used as a pH indicator.
  • a compound according to the invention used as a pH indicator.
  • concentration of the other specific enzymatic substrate is generally between 0.01 and 1 g / l. Those skilled in the art can easily determine such a concentration depending on the substrate used.
  • said detection and / or identification medium according to the invention also comprises at least one metabolic indicator, specific for a metabolic activity different from that detected by the compound according to the invention. invention as a substrate or pH indicator.
  • This metabolic indicator may in particular be a source of carbon or nitrogen associated or not with a reagent revealing its metabolism.
  • the source of carbon or nitrogen is associated with a pH indicator different from the compound according to the invention used for this purpose.
  • the source of carbon or nitrogen is associated with a cation.
  • the metabolic indicator makes it possible to detect a tryptophanase activity and associates Tryptophan and a reagent making it possible to detect the production of Indole.
  • aminoacylation of 4- (4'-aminostyryl) -quinoline with t-BOC- ⁇ -alanine is exemplified and the other aminoacylations were performed in the same way with another protected amino acid.
  • t-BOC-amino acid compounds were accomplished either by reaction with FHCl (yielding a hydrochloric acid salt) or by reaction with TFA acid (yielding a trifluoroacetic acid salt).
  • FHCl yielding a hydrochloric acid salt
  • TFA acid yielding a trifluoroacetic acid salt.
  • the deprotection of t-BOC- ⁇ -alanine-4- (4'-aminostyryl) -quinoline with HCl is given by way of example and the other deprotections were carried out in the same way.
  • TFA the compound to be deprotected was placed in a flask equipped with a CaCl 2 trap. Then trifluoroacetic acid was added and the mixture was allowed to stir with magnetic stirring. the night. The TFA was evaporated to give the product as the trifluoroacetic acid salt.
  • ⁇ -Alanyl-2- (4'-amidostyryl) -quinoline compounds ( ⁇ -Ala-ASQ), L-Tyrosyl-4- (4'-amidostyryl) -N-methyl-quinolinium dihydrochloride (Tyr-ASQM + ), L-Asparaginyl-4- (4'-amidostyryl) -N-methyl-quinolinium-bis-TFA L-gamma-Glutamyl-4- (4'-amidostyryl) -N-methyl-quinolinium (dichloride) ( ⁇ -Glu-ASQM + ), L-Alanyl-L-alanyl-L-alanyl-4- (4'- amidostyryl) -N-methyl-quinolinium (dichloride) (Tri-AIa-ASQM + ) were synthesized as described in Example 1
  • each of the substrates were dissolved in 4 ml of dimethylsulfoxide (80 mg for Asn-ASQM + ) and added to 400 ml of Columbia medium previously autoclaved.
  • the 6 media were divided into petri dishes 90mm in diameter at a rate of 20ml per box.
  • 11,176 are seeded on the medium by isolation in quadrants.
  • the media are incubated for 24 hours at 37 ° C., and the colonies formed are examined visually, with or without the addition of acid, and under a UV lamp at 365 nm.
  • NCTC 11 176 2 pale 2 pale 2 - 2 - 2 pale blue pale yellow
  • NCTC Il 047 0,5 - 2 - 1 - - - ToP - -
  • PdC no growth, 0.5: low growth, 1: moderate growth, 2: good growth, -: no color
  • the substrates according to the invention allow the growth of any type of microorganisms: gram-negative bacteria, gram-positive bacteria, yeasts, etc., but some may be toxic to certain groups, such as is the case of ⁇ -Ala-ASQ in this example.
  • the peptidase substrates according to the invention it is possible to distinguish different groups of microorganisms.
  • the staining does not diffuse in the reaction medium, it is possible to distinguish and count the cells or colonies expressing the peptidase activity from those which do not express it.
  • a stock solution containing 50 g / L of pyroglutamyl-4- (4'-amidostyryl) -N-methylquinaldinium iodide was prepared in a DMSO-type solvent and added to a Columbia medium previously autoclaved and kept undercooled, at a rate of 75 mg / ml. L. After homogenization, this medium was divided into square boxes of 120 mm. Growth control medium (Columbia) and noted T was also poured.
  • test spots Twenty-two strains of microorganisms were seeded into test spots: deposition of 1 .mu.l from bacterial suspensions at 0.5 McFarland (15.10 4 CFU / spot) The media were incubated for 48 hours at 37 ° C., and the spots formed were examined visually.
  • a stock solution at 50 g / l for each of the three substrates was prepared in a DMSO-type solvent and added to a Columbia medium previously autoclaved and kept undercooled at a rate of 75 mg / l. After homogenization, the media were divided into square boxes of 120 mm. Growth control medium (Columbia) and noted T was also poured.
  • test spots Twenty-two strains of microorganisms were seeded into test spots: deposition of 1 .mu.l from bacterial suspensions at 0.5 McFarland (15.10 4 CFU / spot).
  • the media were incubated for 48 hours at 37 ° C and then the spots formed were examined visually.
  • L-alanyl-4- (4'-amidostyryl) -N-methylquinolinium (dichloride), L-alanyl-L-alanyl-4- (4'-amidostyryl) -N-methylquinolinium (dichloride) and L-alanyl L-Alanyl-L-alanyl-4- (4'-amidostyryl) -N-methyiquinolinium (dichloride) make it possible to detect a peptidase activity.
  • the number of amino acids allows to foil on the specificity of detection.
  • L-alanyl-4- (4'-amidostyryl) -N-methylquinolinium (dichloride) and L-alanyl-2- (4'-amidostyryl) -N-methylquinolinium (dichloride) compounds were synthesized as described in the example 1.
  • a 50 g / L stock solution for each of the two substrates was prepared in a DMSO-type solvent and added to a Columbia medium previously autoclaved and kept undercooled at a rate of 75 mg / l. After homogenization, the media were divided into Petri dishes 55 mm in diameter. Growth control medium (Columbia) and noted T was also poured.
  • a mother solution at 50 g / L of 4- (4'-aminostyryl) -quinoline was prepared in a DMSO-type solvent and added in a modified chromlD coli® medium, previously autoclaved and kept undercooled, at a rate of 50 mg / l. After homogenization, this medium was divided into square petri dishes of 120 mm. A growth control medium (modified chromlD coli®) and noted T was also poured.
  • test spots 1 ⁇ L deposit from bacterial suspensions at 0.5 McFarland (15.10 4 CFU / spot)
  • the media were incubated for 24 hours at 37 ° C., and the spots formed were examined visually.
  • a 50 g / L stock solution in 4- (4 "-aminostyryl) -quinoline and a 40 g / L stock solution in Blue-bD-GUR ie 5-bromo-3-indoxyl-bD-glucuronic acid
  • a solvent DMSO type ie 5-bromo-3-indoxyl-bD-glucuronic acid
  • chromlD coli® medium modified before autoclaving and maintained supercooled, at respectively 50 mg / L and 200 mg / L. After homogenization, this medium was divided into square petri dishes of 120 mm A growth control medium (modified chromlD coli®) and noted T was also cast.
  • Agar 12.5 c) Seeding and incubation Forty-three microorganism strains (details in the table below) were seeded into test spots: 1 ⁇ L deposition from bacterial suspensions to
  • the media were incubated for 48 hours at 37 ° C., and the spots formed were examined visually.
  • 4- (4'-aminostyryl) -quinoline combined with Blue-b-GUR allow simultaneous detection of enterobacteria (glucose acidification revealed by the orange color of 4- (4'-aminostyryl) -quinolinium) and E strains.
  • enterobacteria glucose acidification revealed by the orange color of 4- (4'-aminostyryl) -quinolinium
  • E strains coli beta-glucuronidase positive (as well as Shigella - from a genomic point of view, Shigella strains belong to the species E. coli.) by the colony brown coloration, mixture of orange and blue (following hydrolysis of Blue-b-GUR).

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Abstract

La présente invention concerne l'utilisation d'un composé de la formule (I) suivante, comme substrat enzymatique pour la détection d'une activité peptidase ou comme indicateur de pH : selon laquelle : • Y1 est un peptide, H ou un alkyl • W1, W2, W3 et W4 sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, alkoxy, thiométhyle, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle (incluant ses esters ou amides) ou toute combinaison de ceux-ci • n = 0, 1 ou 2 • U est N ou N+R et V est CZ6 N ou N+R ou bien V est N ou N+R et U est CZ6, • R est H, alkyle, aralkyle, aryle, alcanoïque ou alkylsulfonique • Z1, Z2, Z3, Z4 et Z5, sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, aryle, alkoxy, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle, sulfonyle, incluant les esters ou amides de carboxyle ou sulfonyle et leurs sels.

Description

Nouveaux substrats de peptidase
La présente invention concerne de nouveaux composés utilisables à titre d'indicateurs de pH et/ou de substrats enzymatiques pour la détection d'activité peptidase. Ces substrats sont utilisables dans les applications comportant une étape d'hydrolyse enzymatique produisant un signal physico-chimique notamment en microbiologie, biochimie, immunologie, biologie moléculaire, histologie, etc. L'invention concerne également des milieux réactionnels contenant de tels substrats, l'utilisation des substrats ou des milieux pour la détection d'activités peptidases et/ou la différenciation de bactéries à Gram positif par rapport à des bactéries à Gram négatif et des procédés d'utilisation.
Il existe actuellement de très nombreux milieux permettant la détection de microorganismes. Cette détection peut être basée notamment sur l'utilisation de substrats particuliers, spécifiques d'une enzyme du microorganisme que l'on souhaite détecter. D'une manière générale, les substrats synthétiques d'enzymes sont constitués de telle façon que le substrat et le produit de son métabolisme par l'enzyme cible possèdent des propriétés physico-chimiques différentes, permettant de les distinguer et d'évaluer si tout ou partie du substrat a été converti en produit par l'enzyme. Les substrats d'hydrolase, sont généralement constitués d'une première partie spécifique de l'activité enzymatique à révéler, et d'une seconde partie faisant office de marqueur, généralement chromogène ou fluorescent. Ainsi dans le cas des bactéries, par le choix des substrats, selon qu'il y a réaction ou non, il est possible de caractériser la nature d'un microorganisme. Une activité peptidase peut notamment être utilisée pour révéler un groupe, un genre ou une espèce de bactéries. Ainsi, l'activité alanine- aminopeptidase, par exemple, permet de différencier les bactéries à Gram négatif des bactéries à Gram positif.
Des substrats chromogènes enzymatiques pour la détection d'activité peptidase sont connus de l'état de la technique. On peut citer notamment la publication de Manafi (Manafi et al, Microbiol Rev 55(3) : 335-348, 1991), qui est une revue de substrats enzymatiques utilisés en microbiologie. Toutefois, les substrats d'aminopeptidase décrits libèrent par hydrolyse des composés diffusant dans le milieu (beta- naphtylamine, 7-amino-4-methylcoumarine). De ce fait, en milieu réactionnel hétérogène (colonies sur boites de Pétri, coupe histologique...), il n'est pas possible de localiser précisément le lieu de l'hydrolyse. On peut citer également les substrats décrits dans les demandes de brevet WO 98/04735 et WO 99/38995 déposées par la Demanderesse. Toutefois, bien que ces substrats diffusent peu en milieu de culture, ils présentent certains inconvénients : leur synthèse est difficile, la pureté est réduite, les rendements faibles et ils sont toxiques vis-à-vis de certains micro-organismes.
La présente invention propose donc l'utilisation de nouveaux composés, soit à titre d'indicateurs de pH, soit à titre de substrats de peptidase, permettant la détection de microorganismes. Comparativement aux substrats existants, ces nouveaux composés sont de synthèse aisée, et peuvent être utilisés notamment en milieux gélifiés pour la détection de micro-organismes car ils produisent une coloration ne diffusant peu ou pas dans le milieu réactionnel. Dans le cadre d'une utilisation comme substrat enzymatique, cela permet de repérer une colonie ou une organelle exprimant une activité peptidase parmi d'autres ne l'exprimant pas.
Avant d'aller plus avant dans la description de l'invention, les définitions ci dessous sont données afin de faciliter l'exposé de l'invention.
Par substrat enzymatique, on entend un substrat pouvant être hydrolyse par une enzyme en un produit permettant la détection, directe ou indirecte d'un microorganisme, d'une cellule ou d'une organelle. Ce substrat comprend notamment une première partie spécifique de l'activité enzymatique à révéler et une seconde partie faisant office de marqueur.
Les composés selon l'invention utilisés comme substrats sont adaptés à une utilisation en cytométrie en flux, car le produit de l'hydrolyse restant principalement localisé dans la cellule exprimant l'activité enzymatique, il est possible de compter spécifiquement les cellules exprimant cette activité, voire de les séparer du reste de l'échantillon.
Les composés selon l'invention utilisés comme substrats sont également bien adaptés à une utilisation en histoenzymologie, car le produit d'hydrolyse restant principalement localisé sur le lieu de l'hydrolyse, il est possible d'identifier spécifiquement les cellules ou organelles exprimant cette activité au sein d'un tissu. Du fait de leur faible toxicité, les composés selon l'invention sont bien adaptés, respectivement comme indicateurs de pH, ou pour le suivi d'activité peptidase en culture cellulaire.
Les composés selon l'invention sont particulièrement bien adaptés à une utilisation en milieu de détection et/ou d'identification car ils produisent une coloration ou une fluorescence ne diffusant pas dans le milieu réactionnel.
Dans la présente demande, le terme coloration est employé pour couvrir une coloration, absorption de lumière dans le spectre visible, ou une fluorescence, absorption à une longueur d'onde (λex) et émission à une longueur d'onde supérieure (λem, λem > λex). Les composés de l'invention peuvent être salifiés, c'est à dire sous forme de sel tel que chlorure, bromure, iodure ou trifluoroacétate.
Par indicateur de pH, on entend une substance chimique dont la couleur et/ou la fluorescence varie en fonction des modifications de pH du milieu, lesdites modifications étant liées ou non au métabolisme du ou des microorganismes en croissance sur ledit milieu.
Par peptidase, on entend une enzyme capable de cliver par hydrolyse le groupement amide formé entre le reste acyle d'un peptide et une aminé primaire. Par aminopeptidase, on entend une enzyme capable de cliver par hydrolyse le groupement amide formé entre un acyle d'acide aminé et une aminé primaire. Dans la présente demande, le terme « peptidase » peut désigner, selon les cas, tant une peptidase qu'une aminopeptidase telles que définies précédemment.
Par peptide, on entend une chaîne peptidique comprenant de 1 à 10 acides aminés, préférentiellement de 1 à 4 acides aminés. Préférentiel lement, le peptide est un di- Alanine ou tri-Alanine. Par acide aminé, on entend tout acide aminé connu de l'homme du métier, naturel ou non. Selon un mode particulier de réalisation de l'invention, l'acide aminé est une beta-Alanine ou L-Alanine ou D-Alanine, ou une Glycine, Pyrroglutamyl, ...
Ledit peptide peut comprendre un agent de blocage en son extrémité N terminale. Les agents de blocage selon l'invention comprennent tout agent de blocage connu de l'homme du métier qui est capable de protéger les aminés. A titre d'exemple, on peut citer le t-Butoxycarbonyle (N-tBOC), le 9-Fluorenyloxycarbonyle, un agent de solubilisation tel que le Succinyle, ou bien un acide aminé non métabolisable, c'est-à- dire non naturel, tel que l'acide pipécolique ou la forme D d'un acide aminé, tel que la D-Phénylalanine. Les agents de blocage ne sont pas systématiquement présents dans les composés de l'invention.
Par groupement alkyle, on entend une chaîne de groupements hydrocarbonés saturés, tel que notamment un alkyle en C1-C6, c'est a dire un alkyle droit ou ramifié ayant de 1 à 6 atomes de carbone. A titre d'exemple, on peut citer le méthyle, l'éthyle, le propyle, l'iso-propyle, le butyle, le t-butyle, le pentyle, l'iso-pentyle et l'hexyle.
Par groupement aryle, on entend un groupement fonctionnel (ou substituant) qui dérive d'un noyau aromatique tel que notamment un noyau aromatique en C6-Ci0, notamment phényle, benzyle, l-naphtyle ou 2-naphtyle.
Par groupement carboxyle, on entend notamment un groupe fonctionnel composé d'un atome de carbone, lié par une double liaison à un premier atome d'oxygène, et par une liaison simple à un second atome d'oxygène, lui-même chargé négativement ou relié à un atome d'hydrogène. En fonction du pKa de la molécule et du pH du milieu, le groupement carboxyle peut être sous forme ionisée, c'est à dire sans H lié au second atome d'oxygène, qui est alors chargé négativement.
Par milieu réactionnel, on entend un milieu comprenant tous les éléments nécessaires à l'expression d'un métabolisme et/ou à la croissance de microorganismes, d'une cellule ou d'une organelle. Ce milieu réactionnel peut être utilisé en cytométrie en flux, histoenzymologie, culture cellulaire ... ou en tant que milieu de détection et/ou d'identification de microorganismes.
Le milieu réactionnel peut comprendre un ou plusieurs éléments en combinaison, tels que des acides aminés, des peptones, des hydrates de carbone, des nucléotides, des minéraux, des vitamines, des antibiotiques, des tensioactifs, des tampons, des sels de phosphate, d'ammonium, de sodium, de métaux.
Le milieu peut comprendre également un colorant. A titre indicatif, on peut citer comme colorant le bleu d'Evans, du rouge neutre, du sang de mouton, du sang de cheval, un opacifiant tel que l'oxyde de Titane, de la nitroaniline, du vert malachite, du vert brillant ...
Le milieu réactionnel peut être solide, semi-solide ou liquide. Par milieu solide, on entend par exemple un milieu gélifié. L'agar est l'agent gélifiant traditionnel en microbiologie pour la culture des microorganismes, mais il est possible d'utiliser de la gélatine ou de l'agarose. Un certain nombre de préparations sont disponibles dans le commerce, comme par exemple l'agar Columbia, la gélose Trypcase-soja, la gélose Mac Conkey, la gélose Sabouraud ou plus généralement celles décrites dans le Handbook of Microbiological Media (CRC Press).
Le milieu réactionnel peut être un milieu de détection et/ou d'identification, c'est à dire un milieu de révélation ou un milieu de culture et de révélation. Dans le premier cas, la culture des microorganismes est effectuée avant ensemencement et, dans le deuxième cas, le milieu de détection et/ou d'identification constitue également le milieu de culture.
Par échantillon biologique, on entend un échantillon clinique, issu d'un prélèvement de liquide biologique ou un échantillon alimentaire, issu de tout type d'aliment ou un échantillon cosmétique ou pharmaceutique issu de toute préparation cosmétique ou pharmaceutique. Cet échantillon peut être ainsi liquide ou solide et on peut citer d'une manière non limitative, un échantillon clinique de sang, de plasma, d'urines, de fécès, de prélèvements de nez, de gorges, de peaux, de plaies, de liquide céphalo-rachidien, un échantillon alimentaire d'eau, de boissons tels que le lait, un jus de fruits; de yaourt, de viande, d'oeufs, de légumes, de mayonnaise, de fromage ; de poisson..., un échantillon alimentaire issu d'une alimentation destinée aux animaux, tel que notamment un échantillon issu de farines animales. L'échantillon peut également être issu d'un prélèvement de l'environnement clinique, d'élevage ou de production alimentaire, cosmétique ou pharmaceutique. Par prélèvement d'environnement, on entend notamment un prélèvement de surface, de liquide, de matière première ou de produit. Par échantillon, on entend donc le prélèvement en lui même (écouvillon, selles, aliments, ...) aussi bien que des colonies de microorganismes issus dudit prélèvement (par exemple après isolement sur un milieu de culture gélifié, ou dans un bouillon d'enrichissement ensemencé avec ledit prélèvement).
Au sens de la présente invention, le terme microorganisme recouvre les bactéries, les levures, les moisissures et plus généralement, les organismes généralement unicellulaires, invisibles à l'œil nu, qui peuvent être multipliés et manipulés en laboratoire.
A titre de bactéries à Gram négatif, on peut citer les bactéries des genres suivants : Pseudomonas, Escherichia, Salmonella, Shigella, Enterobacter, Klebsiella, Serratia, Proteus, Caπtpylobacîer, Haemophilus, Morganella, Vibrio, Yersinia, Acinetobacter,
Branhamella, Neisseήa, Burkholderia, Citrobacter, Hafnia, Edwardsiella, Aeromonas,
Moraxella, Pasteurella, Providencia, Actinobacillus, Alcaligenes, Bordetella, Cedecea,
Erwinia, Pantoea, Ralstonia, Stenotrophomonas, Xanthomonas et Legionella.
A titre de bactéries à Gram positif, on peut citer les bactéries des genres suivants :
Aerococcus, Enterococcus, Streptococcus, Staphylococcus, Bacillus, Lactobacillus,
Listeria, Clostridium, Gardnerella, Kocuria, Lactococcus, Leuconostoc, Micrococcus,
Falkamia, Gemella, Pediococcus, Mycobacterium et Corynebacterium.
A titre de levures, on peut citer les levures des genres suivants : Candida,
Cryptococcus, Saccharomyces et Trichosporon.
Préférentiellement, le microorganismes est choisi parmi Escherichia coli, Serratia marcescens, Enterobacter cloacae, Salmonella typhimurium, Providencia rettgeri,
Yersinia enter ocolitica, Pseudomonas aeruginosa, Bacillus subtilis, Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Enterococcus faecalis.
A ce titre l'invention concerne l'utilisation d'un composé de la formule (I) suivante, comme substrat enzymatique pour la détection d'une activité peptidase et/ou une variation de pH :
Figure imgf000008_0001
(I) selon laquelle :
• Y| est un peptide, H ou un alkyl • Wi, W2, W3 et W4 sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, alkoxy, thiométhyle, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle (incluant ses esters ou amides) ou toute combinaison de ceux-ci
• n = 0, 1 ou 2
• U est N ou N+R et V est CZ6 N ou N+R ou bien V est N ou N+R et U est
CZ6,
• R est H, alkyle, aralkyle, aryle, alcanoïque ou alkylsulfonique
• Z], Z2, Z3, Z4, Zζ et Z6, sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, aryle, alkoxy, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle, sulfonyle, incluant les esters ou amides de carboxyle ou sulfonyle
et leurs sels.
Lorsque ledit composé de formule (I) est utilisé pour détecter uniquement une variation de pH, Yi est H ou un alkyl.
Lorsque ledit composé de formule (I) est utilisé pour la détection d'une activité peptidase, Yi est un peptide. Préférentiellement U ou V est N.
Lorsque ledit composé de formule (I) est utilisé pour la détection d'une activité peptidase et d'une variation de pH, Yi est un peptide. Préférentiellement U ou V est N.
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, Yi est un peptide, préférentiellement choisi parmi l'alanine, l'asparagine, la glutamine, la tyrosine et Tri- alanyl.
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, n = 1
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, W1, W2, W3 et W4 sont indépendamment H
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, U est CH et V est N ou N+R, préférentiellement N+CH3
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, V est CH et U est N ou N+R, préférentiellement N+CH3
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, Zi, Z2, Z3, Z4> Z5, et Z6 sont indépendamment H
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, L-Alanyl-4-(4'-amidophenyl)-2- méthyl-quinoline, L-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-benzyl-quinolinium TFA, L-
Glutamyl-4-(4'-amidostyryl)-N-benzyl-quinolinium TFA, beta-Alanyl-4-(4'- amidostyryl)-N-benzyl-quinolinium TFA, L-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methyl- quinolinium TFA, D-Alanine-N-méthyl-4-(4'-aminostyryl)-quinolinium (dichlorure), L- Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium, Z-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-N- méthyl-quinolinium, L-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), L-Alanyl-L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), L-Alanyl-L- alanyl-L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), γ-
Aminobutyryl-4-(4l-amidostyryl)-N-methylquinolinium di-Cl, L-Asparaginyl-4-(4'- amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium-bis-TFA, α-Aspartyl-4-(4'-amidostyryl)-N- methylquinolinium dichloride, β-Aspartyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium dichloride, Glycyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), L-gamma- Glutamyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), Glycyl-4-(4'- amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium chloride, L-Leucyl-4-(4' -amidostyryl)-N-méthyl- quinolinium dihydrochloride, L-Methionyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methyl-quinolinium di-Cl, Pyroglutamyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium iodide, Sarcosinyl-4-(4'- amidostyryl)-N-methyl-quinolinium dichloride, L-Tryptophanyl-4-(4-amidostyryl)-N- méthyl-quinolinium dihydrochloride, L-Tyrosyl-4-(4' -amidostyryl)-N-méthyl- quinolinium dihydrochloride, beta-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-N-methyl-quinolinium TFA, L-Prolyl-2-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (HBr), Z-Arginyl-2-(4'- amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium, L-Pyroglutamyl -2-(4' -amidostyryl)-N-méthyl- quinolinium, L-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)quinoline TFA, β-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)- quinoline, L-Glutamyl-4-(4'-amidostyryl)quinoline TFA, Glycyl-4-(4'- amidostyryl)quinoline TFA, Pyroglutamyl-4-(4'-amidostyryl) quinoline, L-Alanyl-2- (4'-amidostyryl)-quinoline, β-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-quinoline, Glycyl-2-(4'- amidostyryl)quinoline TFA, L-Alanyl-2-(2'-pyridyl)-4-(4"-amidostyryl)-quinoline Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, ledit composé est choisi parmi : β- Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-quinoline (β-Ala-ASQ), L-Tyrosyl-4-(4'-amidostyryl)-N- méthyl-quinolinium dihydrochloride (Tyr-ASQM+), L-Asparaginyl-4-(4'-amidostyryl)- N-méthyl-quinolinium-bis-TFA (ASn-ASQM+)J L-gamma-Glutamyl-
4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure) (γ-Glu-ASQM+), L-Alanyl- L-alanyl-L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure) (Tri-Ala- ASQM+) L'invention concerne également un procédé pour la détection chez des microorganismes d'une activité peptidase et/ou d'une variation de pH, caractérisé en ce qu'il comprend, ou est constitué par les étapes suivantes :
a) disposer d'un milieu de détection et/ou d'identification comprenant composé de la formule (I) suivante :
Figure imgf000011_0001
selon laquelle :
• Yi est un peptide, H ou un alkyl
• Wi, W2, W3 et W4 sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, alkoxy, thiométhyle, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle (incluant ses esters ou amides) ou toute combinaison de ceux-ci
• n = 0, 1 ou 2
• U est N ou N+R et V est CZ6 N ou N+R ou bien V est N ou N+R et U est CZ6,
• R est H, alkyle, aralkyle, aryle, alcanoïque ou alkylsulfonique
• Zi, Z2, Z3, Z4 et Z5, sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, aryle, alkoxy, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle, sulfonyle, incluant les esters ou amides de carboxyle ou sulfonyle
et leurs sels.
b) ensemencer le milieu avec un échantillon biologique à tester,
c) laisser incuber, et
d) révéler la présence d'au moins une activité peptidase ou une variation de pH Lorsque ledit procédé est un procédé pour détecter uniquement une variation de pH, Yj est H ou un alkyl.
Lorsque ledit procédé est un procédé pour la détection chez des micro-organismes d'une activité peptidase, Yi est un peptide. Préférentiellement U ou V est N.
Lorsque ledit procédé est un procédé pour la détection chez des micro-organismes d'une activité peptidase et d'une variation de pH, Yi est un peptide. Préférentiellement U ou V est N.
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, Y] est un peptide, préférentiellement choisi parmi l'alanine, l'asparagine, la glutamine, la tyrosine
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, n = 1
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, Wi, W2, W3 et W4 sont indépendamment H
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, U est CH et V est N ou N+R, préférentiellement N+CH3
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, V est CH et U est N ou N+R, préférentiellement N+CH3
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, Z], Z2, Z3 et Z4j Z5, et Z6 sont indépendamment H
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, L-Alanyl-4-(4'-amidophenyl)-2- méthyl-quinoline, L-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-benzyl-quinolinium TFA, L- Glutamy l-4-(4'-amidostyryl)-N-benzyl-quinolinium TFA , beta- Alanyl-4-(4'- amidostyryl)-N-benzyl-quinolinium TFA, L-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methyl- quinolinium TFA, D-Alanine-N-méthyl-4-(4'-aminostyryl)-quinolinium (dichlorure), L- Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium, Z-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-N- méthyl-quinolinium, L-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), L-Alanyl-L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), L-Alanyl-L- alanyl-L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), γ-
Ammobutyryl-4-(4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium di-Cl, L-Asparaginyl-4-(4'- amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium-bis-TFA, α-Aspartyl-4-(4'-amidostyryl)-N- methylquinolinium dichloride, β-Aspartyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium dichloride, Glycyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinoliniurn (dichlorure), L-gamma- Glutamyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), Glycyl-4-(4'- amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium chloride, L-Leucyl-4-(4' -amidostyryl)-N-méthyl- quinolinium dihydrochloride, L-Methionyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methyl-quinolinium di-Cl, Pyroglutamyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium iodide, Sarcosinyl-4-(4'- amidostyryl)-N-methyl-quinolinium dichloride, L-Tryptophanyl-4-(4-amidostyryl)-N- méthyl-quinolinium dihydrochloride, L-Tyrosyl-4-(4 ' -amidostyryl)-N-méthyl- quinolinium dihydrochloride, beta-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-N-methyl-quinolinium TFA, L-Prolyl-2-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (HBr), Z-Arginyl-2-(4'- amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium, L-Pyroglutamyl -2-(4 ' -amidostyryl)-N-méthyl- quinolinium, L-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)quinoline TFA, β-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)- quinoline, L-Glutamyl-4-(4'-amidostyryl)quinoline TFA, Glycyl-4-(4'- amidostyryl)quinoline TFA, Pyroglutamyl-4-(4'-amidostyryl) quinoline, L-Alanyl-2- (4'-amidostyryl)-quinoline, β-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-quinoline, Glycyl-2-(4'- amidostyryl)quinoline TFA, L-Alanyl-2-(2'-pyridyl)-4-(4"-amidostyryl)-quinoline Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, ledit composé est choisi parmi : β- Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-quinoline (β-Ala-ASQ), L-Tyrosyl-4-(4'-amidostyryl)-N- méthyl-quinolinium dihydrochloride (Tyr-ASQM+), L-Asparaginyl-4-(4'-amidostyryl)- N-méthyl-quinolinium-bis-TFA (Asn-ASQM+)2 L-gamma-Glutamyl-
4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure) (γ-Glu-ASQM+), L-Alanyl- L-alanyl-L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure) (Tri- AIa- ASQM+)
L'ensemencement des microorganismes peut être réalisé par toutes les techniques d'ensemencement connues de l'homme du métier. Une étape d'incubation peut être réalisée à une température pour laquelle l'activité enzymatique que l'on souhaite détecter est optimale, que l'homme du métier peut choisir aisément selon l'activité enzymatique à détecter. L'étape d) peut s'effectuer par un examen visuel, par colorimétrie ou fluorimétrie. Lors de l'étape d), on peut révéler la présence de l'activité peptidase ou la variation de pH, seule ou en combinaison avec au moins une autre activité enzymatique.
Préférentiellement, le microorganismes est choisi parmi Escherichia coli, Serratia marcescens, Enterobacter cloacae, Salmonella typhimurium, Providencia rettgeri, Yersinia enterocolitica, Pseudomonas aeruginosa, Bacillus subtilis, Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Enterococcus faecalis.
L'invention concerne également un procédé pour la différenciation chez des bactéries de leur appartenance aux bactéries à Gram positif ou aux bactéries à Gram négatif, caractérisé en ce qu'il comprend par les étapes suivantes :
a) disposer d'un milieu de détection et/ou d'identification comprenant composé de la formule (I) suivante, comme substrat enzymatique pour la détection d'une activité peptidase et/ou d'une variation de pH :
Figure imgf000014_0001
(I) selon laquelle :
• Yi est un peptide, H ou un alkyl
• Wi, W2, W3 et W4 sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, alkoxy, thiométhyle, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle (incluant ses esters ou amides) ou toute combinaison de ceux-ci
• n = 0, 1 ou 2
• U est N ou N+R et V est CZ6 N ou N+R ou bien V est N ou N+R et U est CZ6,
• R est H, alkyle, aralkyle, aryle, alcanoïque ou alkylsulfonique
• Zi, Z2, Z3, Z4 et Z5, sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, aryle, alkoxy, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle, sulfonyle, incluant les esters ou amides de carboxyle ou sulfonyle
et leurs sels. b) ensemencer le milieu avec un échantillon biologique à tester, c) laisser incuber, et
d) révéler la présence d'au moins une activité peptidase Lorsque ledit milieu est un milieu pour détecter uniquement une seule variation de pH,
Y] est H ou un alkyl
Lorsque ledit milieu est un milieu pour détecter une activité peptidase, Yi est un peptide. Préférentiellement U ou V est N.
Lorsque ledit milieu est un milieu pour détecter une activité peptidase, et une variation de pH, Yi est un peptide. Préférentiellement U ou V est N.
Comme indiqué précédemment, l'ensemencement des microorganismes peut être réalisé par toutes les techniques d'ensemencement connues de l'homme du métier. Une étape d'incubation peut être réalisée à une température pour laquelle l'activité enzymatique que l'on souhaite détecter est optimale, que l'homme du métier peut choisir aisément selon l'activité enzymatique à détecter. L'étape d) peut s'effectuer par un examen visuel, par colorimétrie ou fluorimétrie. Lors de l'étape d), on peut révéler la présence de l'activité peptidase, seule ou en combinaison avec d'autres activités enzymatiques. Dans certains cas, il peut être avantageux d'effectuer l'étape d) en présence d'un acide, tel que l'acide acétique.
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, Y] est un peptide, préférentiellement choisi parmi l'alanine, l'asparagine, la glutamine, la tyrosine
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, n = 1
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, W], W2, W3 et W4 sont indépendamment H
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, U est CH et V est N ou N+R, préférentiellement N+CH3
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, V est CH et U est N ou N+R, préférentiellement N+CH3
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, Zi, Z2, Z3 et Z4, Z5, et Z6 sont indépendamment H
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, L-Alanyl-4-(4'-amidophenyl)-2- méthyl-quinoline, L-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-benzyl-quinolinium TFA, L- Glutamyl-4-(4'-amidostyryl)-N-benzyl-quinolinium TFA, beta-Alanyl-4-(4'- amidostyryl)-N-benzyl-quinolinium TFA, L-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methyl- quinolinium TFA, D-Alanine-N-méthyl-4-(4'-aminostyryl)-quinolinium (dichlorure), L- Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium, Z-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-N- méthyl-quinolinium, L-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), L-Alanyl-L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), L-Alanyl-L- alanyl-L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), γ-
Aminobutyryl-4-(4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium di-Cl, L-Asparaginyl-4-(4'- amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium-bis-TFA, α-Aspartyl-4-(4'-amidostyryl)-N- methylquinolinium dichloride, β-Aspartyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium dichloride, Glycyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), L-gamma- Glutamyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), Glycyl-4-(4'- amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium chloride, L-Leucyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl- quinolinium dihydrochloride, L-Methionyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methyl-quinolinium di-Cl, Pyroglutamyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium iodide, Sarcosinyl-4-(4'- amidostyryl)-N-methyl-quinolinium dichloride, L-Tryptophanyl-4-(4-amidostyryl)-N- méthyl-quinolinium dihydrochloride, L-Tyrosyl-4-(4' -amidostyryl)-N-méthyl- quinolinium dihydrochloride, beta-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-N-methyl-quinolinium TFA, L-Prolyl-2-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (HBr), Z-Arginyl-2-(4'- amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium, L-Pyroglutamyl -2-(4'-amidostyryl)-N-méthyl- quinolinium, L-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)quinoline TFA, β-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)- quinoline, L-Glutamyl-4-(4'-amidostyryl)quinoline TFA, Glycyl-4-(4'- amidostyryl)quinoline TFA, Pyroglutamyl-4-(4'-amidostyryl) quinoline, L-Alanyl-2- (4'-amidostyryl)-quinoline, β-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-quinoline, Glycyl-2-(4'- amidostyryl)quinoline TFA, L-Alanyl-2-(2'-pyridyl)-4-(4"-amidostyryl)-quinoline
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, ledit composé est choisi parmi : β- Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-quinoline (β-Ala-ASQ), L-Tyrosyl-4-(4'-amidostyryl)-N- méthyl-quinolinium dihydrochloride (Tyr-ASQM+), L-Asparaginyl-4-(4'-amidostyryl)- N-méthyl-quinolinium-bis-TFA (ASn-ASQM+X L-gamma-Glutamyl- 4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure) (γ-Glu-ASQM+), L-Alanyl- L-alanyl-L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure) (Tri- AIa- ASQM+) Préférentiel lement, le microorganismes est choisi parmi Escherichia coli, Serratia marcescens, Enterobacter cloacae, Salmonella typhimurium, Providencia rettgeri, Yersinia enter ocolitica, Pseudomonas aeruginosa, Bacillus subtilis, Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Enterococcus faecalis.
L'invention concerne également un milieu de détection et/ou d'identification de microorganismes comprenant un composé de la formule (I) suivante pour détecter une activité peptidase et/ou une variation de pH :
Figure imgf000017_0001
selon laquelle :
• Yi est un peptide, H ou un alkyl
• W1, W2, W3 et W4 sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, alkoxy, thiométhyle, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle (incluant ses esters ou amides) ou toute combinaison de ceux-ci
• n = 0, 1 ou 2
• U est N ou N+R et V est CZ6 N ou N+R ou bien V est N ou N+R et U est CZ6,
• R est H, alkyle, aralkyle, aryle, alcanoïque ou alkylsulfonique
• Z1, Z2, Z3, Z4 et Z5, sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, aryle, alkoxy, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle, sulfonyle, incluant les esters ou amides de carboxyle ou sulfonyle
et leurs sels. Lorsque ledit milieu est un milieu pour détecter une seule variation de pH , Yi est H ou un alkyl
Lorsque ledit milieu est un milieu pour détecter une activité peptidase, et facultativement d'une variation de pH, Yi est un peptide. Préférentiellement U ou V est N
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, Yj est un peptide, préférentiellement choisi parmi l'alanine, Pasparagine, la glutamine, la tyrosine
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, n = 1
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, Wi, W2, W3 et W4 sont indépendamment H
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, U est CH et V est N ou N+R, préférentiellement N+CH3
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, V est CH et U est N ou N+R, préférentiellement N+CH3
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, Zi, Z2, Z3 et Z4, Z5, et Z6 sont indépendamment H
Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, L-Alanyl-4-(4'-amidophenyl)-2- méthyl-quinoline, L-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-benzyl-quinolinium TFA, L- Glutamyl-4-(4'-amidostyryl)-N-benzyl-quinolinium TFA, beta-Alanyl-4-(4'- amidostyryl)-N-benzyl-quinolinium TFA, L-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methyl- quinolinium TFA, D-Alanine-N-méthyl-4-(4'-aminostyryl)-quinolinium (dichlorure), L- Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium, Z-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-N- méthyl-quinolinium, L-Alanyl-4-(4 ' -amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), L-Alanyl-L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), L-Alanyl-L- alanyl-L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), γ-
Aminobutyryl-4-(4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium di-Cl, L-Asparaginyl-4-(4'- amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium-bis-TFA, α-Aspartyl-4-(4'-amidostyryl)-N- methylquinolinium dichloride, β-Aspartyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium dichloride, Glycyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), L-gamma- Glutamyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), Glycyl-4-(4'- amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium chloride, L-Leucyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl- quinolinium dihydrochloride, L-Methionyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methyl-quinolinium di-Cl, Pyroglutamyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium iodide, Sarcosinyl-4-(4'- amidostyryl)-N-methyl-quinolinium dichloride, L-Tryptophanyl-4-(4-amidostyryl)-N- méthyl-quinolinium dihydrochloride, L-Tyrosyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl- quinolinium dihydrochloride, beta-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-N-methyl-quinolinium TFA, L-Prolyl-2-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (HBr), Z-Arginyl-2-(4'- amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium, L-Pyroglutamyl -2-(4'-amidostyryl)-N-méthyl- quinolinium, L-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)quinoline TFA, β-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)- quinoline, L-Glutamyl-4-(4'-amidostyryl)quinoline TFA, Glycyl-4-(4'- amidostyryl)quinoline TFA, Pyroglutamyl-4-(4'-amidostyryl) quinoline, L-Alanyl-2- (4'-amidostyryl)-quinoline, β-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-quinoline, Glycyl-2-(4'- amidostyryl)quinoline TFA, L-Alanyl-2-(21-pyridyl)-4-(4"-amidostyryl)-quinoline Selon un mode préféré de réalisation de l'invention, ledit composé est choisi parmi : β- Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-quinoline (β- AIa-ASQ), L-Tyrosyl-4-(4'-amidostyryl)-N- méthyl-quinolinium dihydrochloride (Tyr-ASQM+), L-Asparaginyl-4-(4'-amidostyryl)- N-méthyl-quinolinium-bis-TFA (Asn- ASQM+X L-gamma-Glutamyl-
4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure) (γ-Glu-ASQM+), L-Alanyl- L-alanyl-L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure) (Tri-Ala- ASQM+)
Préférentiellement, le microorganismes est choisi parmi Escheήchia coli, Serratia marcescens, Enterobacter cloacae, Salmonella typhimurium, Providentiel rettgeri, Yersinia enterocolitica, Pseudomonas aeruginosa, Bacillus subtilis, Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Enterococcus faecalis.
Préférentiellement, ledit milieu réactionnel est un milieu de détection et/ou d'identification de microorganismes, ledit milieu comprenant au moins une molécule utilisée à titre de substrat enzymatique ou d'indicateur de pH telle que définie ci avant. Préférentiellement, ledit composé, substrat enzymatique ou indicateur de pH, est à une concentration comprise entre 1 et 1000 mg/1, préférentiellement entre 10 et 500 mg/1. Selon un mode particulier de réalisation de l'invention, ledit milieu de détection et/ou d'identification selon l'invention comprend en outre au moins un autre substrat enzymatique, spécifique d'une activité enzymatique différente de l'activité peptidase détectée par la molécule selon l'invention. Selon un autre mode particulier de réalisation de l'invention, ledit milieu de détection et/ou d'identification selon l'invention comprend en outre au moins un substrat spécifique d'une activité enzymatique différente de celle mise en évidence par la variation de pH.
Le métabolisme enzymatique du ou des autres substrats génère un signal détectable, différent du signal généré par le composé selon l'invention utilisé à titre de substrat enzymatique ou d'indicateur de pH, comme par exemple des produits colorés ou fluorescents différents, pour permettre la mise en évidence comme la détection et/ou l'identification et/ou la quantification d'un ou plusieurs microorganismes. A titre d'autre substrat spécifique, on peut utiliser tout autre substrat classiquement utilisé dans la détection des microorganismes. La concentration de l'autre substrat enzymatique spécifique est généralement comprise entre 0,01 et 1 g/1. L'homme du métier pourra déterminer facilement une telle concentration en fonction du substrat utilisé. A titre indicatif, il est possible de combiner les composés selon l'invention avec des substrats enzymatiques de peptidase, d'osidase, d'estérase ou de réductase. En particulier, il est possible d'associer un substrat selon l'invention pour lequel le peptide est une β- Alanine avec un substrat d'osidase, tel que le 5-Bromo-4-chloro-3-indolyl-β-glucoside, ou l'Alizarine-β-galactoside. Il est également possible d'associer un substrat selon l'invention pour lequel le peptide est la L-Alanine avec un substrat d'estérase, tel que le 5-Bromo-6-chloro-3-indoxyl-octanoate ou le 5-Bromo-3-indoxyl-phosphate.
Selon un mode particulier de réalisation de l'invention, ledit milieu de détection et/ou d'identification selon l'invention comprend en outre au moins un autre substrat enzymatique spécifique de l'activité peptidase ou spécifique de l'activité enzymatique détectée par un composé selon l'invention utilisé à titre d'indicateur de pH. Par le choix particulier de substrats, il est alors possible d'identifier des groupes de microorganismes exprimant une même activité enzymatique. La concentration de l'autre substrat enzymatique spécifique est généralement comprise entre 0,01 et 1 g/1. L'homme du métier pourra déterminer facilement une telle concentration en fonction du substrat utilisé. En particulier, il est possible d'associer un substrat selon l'invention pour lequel le peptide est une L-Alanine avec un substrat de L-Alanine aminopeptidase décrit dans la demande WO2006030119, tel que la L-Alanine-pentyl-résorufamine. Selon un mode particulier de réalisation de l'invention, ledit milieu de détection et/ou d'identification selon l'invention comprend en outre au moins un indicateur métabolique, spécifique d'une activité métabolique différente de celle détectée par le composé selon l'invention utilisé à titre de substrat ou d'indicateur de pH.
Cet indicateur métabolique peut notamment être une source de Carbone ou d'Azote associée ou non à un réactif révélant son métabolisme. Selon un mode particulier, la source de Carbone ou d'Azote est associée à un indicateur de pH différent du composé selon l'invention utilisé à ce titre. Selon un autre mode particulier, la source de Carbone ou d'Azote est associée à un cation. Selon un autre mode particulier l'indicateur métabolique permet de détecter une activité tryptophanase et associe du Tryptophane et un réactif permettant de détecter la production d'Indole.
Les exemples ci après sont donnés a titre illustratif. Exemple 1 - Synthèse de substrats
La 4-(4'-Aminostyryl)-quinoléine était préparé suivant la méthode de Bahner et al (C. T. Bahner, C. Cook, J. DaIe, J. Fain, F. Hannan, P. Smith and J. Wilson, Journal of Organic Chemistry, 1958, 23, 1060-1062).
L'aminoacylation de la 4-(4'-aminostyryl)-quinoléine avec de la t-BOC-β-alanine est donnée à titre d'exemple et les autres aminoacylations étaient effectuées de la même façon avec un autre acide aminé protégé.
Synthèse de la t-BOC-β-alanine-4-(4'-aminostyryl)-quinoléine à partir de la 4-(4'-aminostyryl)-quinoléine et de la t-BOC-β-alanine suivant la méthode des anhydrides mixés :
On s'est assuré que toute la verrerie utilisée était bien sèche avant toute chose car la présence d'humidité aurait pu empêcher la réaction de se dérouler correctement. On a dissous 0,50g (0,00266 mol) de t-Boc-L-alanine dans 10ml de tétrahydrofuranne (THF) sec et ajouté un piège de CaCl2 sur le col du ballon afin d'assurer Pétanchéité. On a agité magnétiquement et fait descendre la température du milieu réactionnel à -15°C en utilisant un bain de glace congelée mélangée à des sels de NaCl. Une fois cette température atteinte, on a laissé agiter 5 minutes de plus. Puis on a ajouté 0,34g (0,0033 mol) de N-Méthylmorpholine tout en prenant bien soin que la température redescende à -15 0C avant de procéder à la prochaine étape. Ensuite on a ajouté goutte à goutte avec la plus grande précaution 0,36g (0,00266 mol) d'Isochlorobutylformate, le milieu réactionnel s'est troublé comme prévu à chaque goutte ajoutée. Quelques minutes plus tard on a dissous 0,49g (0,002 mol) de 4-(4'-aminostyryl)-quinoléine dans le minimum de THF sec et on l'a ajouté au milieu réactionnel. On a retiré le bain de glace après 2 heures et laissé agiter durant la nuit. On a filtré la solution, rincé le ballon avec du THF normal et conservé le filtrat. Un léger précipité fut présent on est donc passé à la prochaine étape, autrement on aurait du remettre la solution dans un ballon propre et évaporer la quantité adéquate de solvant. On a transféré la solution à l'aide d'une pipette pasteur dans un bêcher de 400 ml contenant de la glace, de l'eau ainsi que du carbonate de sodium (Na2CO3). On a laissé le tout agiter durant une paire d'heure, jusqu'à obtenir une solution limpide. On a filtré la solution dans un petit Buchner puis dissous le précipité dans de Péthanol afin de le recristalliser. On a ainsi obtenu 0,76g de t-BOC-β-alanine-4-(4'-aminostyryl)-quinoléine, un solide jaune avec un rendement de 90%, m.p. 160-162 0C. HRMS (EI) pour C25H25N3O3. Masse théorique de l'ion moléculaire 418,2125 (M+H)+. Masse trouvée: 418,2123. 1H-NMR: (DMSO) δ 1.34 (9H, s, C(CH3)3), 3.19 (2H, q, J=5.94 Hz, >CH2), 3.38 (2H, m, >CH2), 6.88 (1Η, t, J=5.69 Hz, NH), 7.50 (1Η, d, J=16.08 Hz, =CH), 7.61 (1Η, m, Ph-H), 7.64 (2Η, d, J=8.66 Hz, CG-H and CT-H), 7.73 (IH, m, Ph-H), 7.74 (2Η, d, J=8.91 Hz, C5'-H and C3'-H), 7.79 (1Η, d, J=4.70 Hz, Ci-H), 7.96 (IH, d, J=6.33 Hz, =CH), 7.99 (1Η, d, J=8.16 Hz, CS-H), 8.48 (IH, d, J=8.41 Hz, C8-H), 8.82 (1Η, d, J=4.70 Hz, Cl-H), 10.09 (IH, s, NH). IR: υmax cm"1 3380 (CO), 3307 (CONΗ), 1693 (CONΗ), 1673 (CONΗ), 1365 (C(CΗ3)3), 754 (CH2).
La déprotection des composés t-BOC-acide aminé était accomplie soit par réaction avec de FHCl (donnant un sel d'acide chlorhydrique) soit par réaction avec de l'acide TFA (donnant un sel d'acide trifluoroacétique). La déprotection de la t-BOC-β-alanine- 4-(4'-aminostyryl)-quinoléine avec de l'HCl est donnée à titre d'exemple et les autres déprotections étaient effectuées de la même façon. Pour la déprotection avec TFA, on a placé du composé à déprotéger dans un ballon équipé d'un piège à CaCl2. Puis on a ajouté de l'acide trifluoroacétique et laissé le mélange sous agitation magnétique toute la nuit. On a évaporé le TFA afin d'obtenir le produit sous forme de sel d'acide trifluoroacétique.
Synthèse de la β-Alanine-4-(4'-aminostyryl)-quinoléine à partir de la t-BOC-β-alanine- 4-(4'-aminostyryl)-quinoléine :
On a dissout de la t-BOC-β-alanine-4-(4'-aminostyryl)-quinoléine dans le minimum d'acétate d'éthyle dans un ballon équipé d'un piège à CaCl2. Puis, on a ajouté une solution saturée d'HCl dans de l'acétate d'éthyle. On a laissé agiter le mélange pendant la nuit et ensuite on a évaporé le solvant. On a ainsi obtenu de la β-Alanine- 4-(4'-aminostyryl)-quinoléine dichlorique, un solide marron avec un rendement de 77%, m.p. 176-178 0C. HRMS (EI) for C20H19N3O. Masse théorique de l'ion moléculaire 318,1601 (M+H)+. Masse trouvée: 318,1601. 1H-NMR: (DMSO) δ 2.50 (2H, t, J=6.19 Hz, >CH2), 3.15 (2H, m, >CH2), 7.27 (IH, d, J=2.72 Hz, Ph-//), 7.30 (IH, d, J=16.08 Hz, =CH), 7.57 (2H, d, J=8.41 Hz, Ph-H), 7.63 (IH, d, J=I 6.08 Hz, -CH), 7.64 (2Η, d, J=8.91 Hz, Ph-H), 7.74 (2Η, m, Ph-H), 8.12 (1Η, d, J=8.66 Hz, Ph-H), 8.23 (1Η, d, J=7.42 Hz, CS-H), 8.88 (IH, d, J=4.45 Hz, C2-H), 10.43 (1Η, s, NH). IR: υmax cm"1 2852 (NH sait), 1674 (C=O), 1584 (NH), 1379 (NH).
L'alkylation des composés t-BOC-acide aminé était effectuée par réaction avec un alkyle halogène. Les sels que l'on a ainsi obtenus étaient déprotégés soit avec de l'HCl soit avec de l'acide TFA comme mentionné ci-dessus. La méthylation et la déprotection de la t-BOC-β-alanine-4-(4'-aminostyryl)-quinoléine avec de l'iodure de méthyle est donnée à titre d'exemple. Synthèse de Ia β-Alanine-N-méthyl-4-(4'-aminostyryl)-quinoléinium dichlorée à partir de la t-BOC-β-alanine-4-(4'-aminostyryl)-quinoléine :
On a agité un mélange de 0,42g (0,001 mois) de la t-Boc-β-alanyl-4-(4'-aminostyryl)- quinoléine et de 2,21g (0,0155 mois) d'iodure de méthyle dans 10 ml d'acétonitrile pendant la nuit. On a filtré le mélange donnant 0,38g d'un solide orange de t-Boc- β-alanyl-N-méthyl-4-(4'-aminostyryl)-quinoléinium iodé avec un rendement de 70%, 180-182 0C. HRMS (EI) for C26H29N3O3. Masse théorique de l'ion moléculaire 432,2282 (M+H)+. Masse trouvée: 432,2280. 1H-NMR: (DMSO) δ 1.39 (9H, s, - C(CHO3), 3.24 (2H, quartet, J= 6.19 Hz, >CH2), 3.37 (2H5 m, >CH2), 4.54 (3Η, s, - CH3), 6.95 (1Η, t, J=6.19 Hz, NH), 7.75 (2Η, d, J=8.66 Hz, C6'-H and C2'-H), 7.96 (2Η, d, J=8.66 Hz, C5'-H and C3'-H), 8.05 (1Η, t, J=7.42 Hz, Cl-H), 8.08 (IH, d, J=16.08 Hz, =CH), 8.24 (1Η, d, J=16.08 Hz, =CH), 8.27 (1Η, t, J=6.93 Hz, C6-H), 8.44 (1Η, d, J=8.91 Hz, C5-H), 8.48 (1Η, d, J=6.68 Hz, C3-H), 9.05 (1Η, d, J=8.66 Hz, C8- H), 9.32 (1Η, d, J=6.68 Hz, C2-H), 10.26 (1Η, s, NH). IR: υmax cm"' 3368 (NH), 3276 (NH), 1674 (CO), 1617 (CO), 1592 (CONH), 1571 (CONH), 1365 (CCH3)3), 1395 (CH3).
On a déprotégé 0,54g (0,0013 mois) de ce composé avec de l'HCl donnant 0,39g d'un solide marron de β-Alanine-N-méthyl-4-(4'-aminostyryl)-quinoléinium dichlorée avec un rendement de 77%, m.p. 176-178 0C. HRMS (EI) for C2oHi9N30. Masse théorique de l'ion moléculaire 318,1601 (M+H)+. Masse trouvée: 318,1601. 1H-NMR: (DMSO) δ 2.50 (2H, t, J=6.19 Hz, >CH2), 3.15 (2Η, m, >CH2), 7.27 (1Η, d, J=2.72 Hz, Ph-H), 7.30 (1Η, d, J=16.08 Hz, =CH), 7.57 (2Η, d, J=8.41 Hz, Ph-H), 7.63 (1Η, d, J=16.08 Hz, -CH), 7.64 (2Η, d, J=8.91 Hz, Ph-H), 7.74 (2Η, m, Ph-H), 8.12 (1Η, d, J=8.66 Hz, Ph-H), 8.23 (1Η, d, J=7.42 Hz, C8-H), 8.88 (1Η, d, J=4.45 Hz, C2-H), 10.43 (1Η, s, NH). IR: υmax cm"1 2852 (NH sait), 1674 ( C=O), 1584 (NH), 1379 (NH).
Autre exemples de substrats typiques obtenus d'une façon similaire à celle mentionné ci-dessus :
L-Alanine-N-méthyl-4-(4'-aminostyryl)-quinoléinium dichlorée, un solide rouge, m.p.
244-246 0C. HRMS(EI) for C21H23N3O. Masse théorique de l'ion moléculaire 332,1757 (M-2HC1+H)+. Masse trouvée: 332,1756. 1H-NMR: (DMSO) δ 1.51 (3H, d, J=6.93 Hz,
-CH3), 4.19 (1Η, q, J=6.93 Hz, ala-H), 4.55 (3Η, s, -CH3), 7.86 (2Η, d, J=8.66 Hz, C6'-
Hand CT-H), 8.01 (2Η, d, J=8.66 Hz, C5'-Hand C3'-H), 8.05 (1Η, m, Ph-H), 8.28 (1Η, m, Ph-H), 8.16 (1Η, d, J=16.08 Hz, =CH), 8.29 (1Η, d, J=16.08 Hz, =CH), 8.44 (1Η, d,
J=8.91 Hz, C5-H), 8.51 (1Η, d, J=6.68 Hz, C3-H), 9.06 (1Η, d, J=8.41 Hz, CS-H), 9.40 (IH, d, J=6.68 Hz, C2-H), 11.49 (1Η, s, NH). IR: υmax cm"1 1693 (C=O), 1597 (NH),
1533 (NH), 1324 (NH), 1369 (CH3).
L-gamma-Glutamyl-N-méthyl-4-(4'-aminostyryl)-quinoléinium dichlorée. 1H-NMR: (DMSO) δ 2.05 (2H, m, >CH2), 2.55 (2Η, m, >CH2), 3.87 (1Η, m, >CH-), 4.49 (3Η, s, N-CH3), 7.70 (2Η, d, J=7 Hz, Ar-H), 7.90 (2Η, d, J=7 Hz, Ar-H), 7.90-8.50 (6Η, m, Ar-H, -CH=), 8.60 (IH, broad s, >NH), 8.97 (1Η, d, J=8 Hz, Ar-H), 9.29 (1Η, d, J=5 Hz, Ar-H).
L-Tyrosyl-N-méthyl-4-(4'-aminostyryl)-quinoléinium dichlorée.
1H-NMR: (DMSO) δ 3.10 (2H, m, >CH2), 4.30 (1Η, m, >CH-), 4.52 (3Η, s, N-CH3), 6.70 (2Η, d, J=7 Hz, Ar-H), 7.12 (2Η, d, J=7 Hz, Ar-H), 7.79 (2Η, d, J=7 Hz, Ar-H), 7.98 (2Η, d, J=7Hz, Ar-H), 8.00-8.60 (6Η, m, Ar-H and -CH=), 9.04 (1Η, d, J=7 Hz, Ar-H), 9.38 (1Η, d, J=5 Hz, Ar-H), 9.46 (1Η, broad s, >OH).
L-Alanine-N-méthyl-4-(4'-aminostyryl)-quinoléinium dichlorée et D-Alanine- N-méthyl-4-(4r-aminostyiyl)-quinoléinium dichlorée.
1H-NMR: (DMSO) δ 1.51 (3H, d, J=6.93 Hz, -CH3), 4.19 (1Η, q, J=6.93 Hz, ala-H), 4.55 (3Η, s, -CH3), 7.86 (2Η, d, J=8.66 Hz, C6'-H and CT-H), 8.01 (2Η, d, J=8.66 Hz, C5'-H and C3'-H), 8.05 (1Η, m, Ph-H), 8.28 (1Η, m, Ph-H), 8.16 (1Η, d, J=16.08 Hz, =CH), 8.29 (1Η, d, J=16.08 Hz, =CH), 8.44 (1Η, d, J=8.91 Hz, C5-H), 8.51 (1Η, d, J=6.68 Hz, C3-H), 9.06 (1Η, d, J=8.41 Hz, C8-H), 9.40 (1Η, d, J=6.68 Hz, C2-H), 11.49 (1Η, s, NH).
Exemple 2 - Utilisation de substrats de formule I selon l'invention pour détecter une activité peptidase
a) Substrats de peptidase
Les composés β-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-quinoline (β-Ala-ASQ), L-Tyrosyl-4-(4'- amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium dihydrochloride (Tyr-ASQM+), L-Asparaginyl- 4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium-bis-TFA
Figure imgf000025_0001
L-gamma-Glutamyl- 4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure) (γ-Glu- ASQM+), L-Alanyl- L-alanyl-L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure) (Tri- AIa- ASQM+), ont été synthétisés comme décrit à l'exemple 1
b) Préparation du milieu
40mg de chacun des substrats ont été dissouts dans 4ml de Diméthylsulfoxide (80mg pour le Asn-ASQM+) et ajouté à 400ml de milieu Columbia préalablement autoclave. Les 6 milieux ont été répartis en boîte de Pétri de 90mm de diamètre à raison de 20ml par boîte.
c) Ensemencement et incubation Dix-sept souches de micro-organismes issues de collections et appartenant à différentes espèces de bactéries et levures sont ensemencées en spot d'environ 10 000 unités formant colonies.
Dix microlitres d'un mélange à parts égales de suspensions à 0,5 McFarland diluées au 20e des souches Escherichia coli NCTC 10 418 et Yersinia enterocolitica NCTC
11 176 sont ensemencés sur le milieu par isolement en quadrants.
Les milieux sont incubés 24 heures à 37°C, puis les colonies formées sont examinées visuellement, avec ou sans ajout d'acide, et sous lampe UV à 365nm.
d) Lecture des résultats
Les résultats obtenus sont présentés dans le tableau 1 ci après
Espèce Tyr-ASQM+ Tri-Ala-ASQM+ Y-GIu-ASQM+ Asn-ASQM+ β-Ala-ASQ
Numéro de collection Crois. Coul. Crois. Coul. Crois. Coul. Crois. Coul. Crois. Fluo. Coul. Coul. post acid.
Escherichia coli Orange
NCTC 10 418 2 Orange 2 Orange 2 Orange 2 pâle 2 Bleu pâle Jaune Pâle
Serratia marcescens Orange
NCTC 10 21 1 2 Orange 2 Orange 2 Orange 2 pâle 2 Vert Orange
Pseudomonas
aeruginosa Orange
NCTC 10 662 2 - 2 Orange 2 Orange 2 pâle 2 Vert Orange
Yersinia enterocolitica Orange Orange
NCTC 11 176 2 pâle 2 pâle 2 - 2 - 2 Bleu pâle Jaune Pâle
Salmonella
typhimurium Orange
NCTC 74 2 pâle 2 Orange 2 Orange 2 - 2 Bleu pâle Jaune Pâle
Enterobacter cloacae Orange κ>
Ul
NCTC 11 936 2 Orange 2 Orange 2 Orange 2 pâle 2 Bleu pâle Jaune Pâle
Providencia rettgeri Orange Orange
NCTC 7 475 2 pâle 2 pâle 2 Orange 2 - 2 Bleu pâle Jaune Pâle
Bacillus subtilis
NCTC 9 372 1 - 2 - 1 - 2 Orange PdC - -
Enterococcus faecalis Orange Orange
NCTC 775 1 pâle 2 pâle 1 - 2 - PdC - -
Enterococcus faecium
NCTC 7 171 1 - 2 - 1 - 2 - PdC - -
Staphylococcus
epidermidis
NCTC Il 047 0,5 - 2 - 1 - - - PdC - -
Staphylococcus aureus
NCTC 6 571 PdC - 2 - 1 - 0,5 - PdC - -
κ>
Figure imgf000028_0001
PdC : pas de croissance, 0,5 : croissance faible, 1 : croissance modérée, 2 : bonne croissance, - : pas de couleur
Sur la boîte ensemencée avec le mélange de 2 souches (E. coli et Y. enterocoliticd), deux types de colonies se développent : des colonies orange de la souche d'E. coli et des colonies incolores de la souches d' Y. enterocolitica. e) Conclusions
Sur les milieux selon l'invention, il est possible de détecter des activités peptidase de microorganismes grâce à la fluorescence ou à la coloration des colonies. Avec certains substrats selon l'invention, la coloration des colonies apparaît en condition acide, comme c'est le cas avec le β-Ala-ASQ dans cet exemple. Avec les autres substrats de cet exemple, l'étape d'acidification n'est pas requise.
Le plus souvent les substrats selon l'invention permettent la croissance de tout type de microorganismes : bactéries à Gram négatif, bactéries à Gram positif, levures, ..., mais certains peuvent être toxiques vis-à-vis de certains groupes, comme c'est le cas du β-Ala- ASQ dans cet exemple.
Par les différentes variations de structure des substrats de peptidase selon l'invention, il est possible de distinguer différents groupes de microorganismes. De plus, la coloration ne diffusant pas dans le milieu réactionnel, il est possible de distinguer et de compter les cellules ou colonies exprimant l'activité peptidase de celles ne l'exprimant pas.
Exemple 3 - Utilisation de substrats de formule I selon l'invention pour détecter une activité peptidase
a) Substrats de peptidase
Le composé pyroglutamyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methylquinaldinium iodide a été synthétisé comme décrit à l'exemple 1
b) Préparation du milieu
Une solution-mère à 50g/L en pyroglutamyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methylquinaldinium iodide a été préparée dans un solvant type DMSO et ajoutée dans un milieu Columbia préalablement autoclave et maintenu en surfusion, à raison de 75mg/L. Après homogénéisation, ce milieu a été réparti en boîtes carrées de 120 mm. Un milieu servant de témoin de croissance (Columbia) et noté T a également été coulé.
c) Ensemencement et incubation
Vingt-deux souches de micro-organismes ont été ensemencées en spots-tests : dépôt de 1 μL à partir de suspensions bactériennes à 0.5McFarland (15.104 CFU/spot) Les milieux ont été incubés 48 heures à 370C, puis les spots formés ont été examinés visuellement.
d) Lecture des résultats
Les résultats obtenus sont présentés dans le tableau ci-après.
Figure imgf000030_0001
Figure imgf000031_0001
Légende :
+++ : bonne croissance/intensité de coloration élevée
++ : moyenne croissance/intensité de coloration moyenne
+ : faible croissance/intensité de coloration faible
- : pas de croissance/pas de coloration
Exemple 4 - Utilisation de substrats de formule I selon l'invention pour détecter une activité peptidase a. Substrats de peptidase
Les composés L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium (dichlorure), L-alanyl-L- alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium (dichlorure), L-alanyl-L-alanyl-L-alanyl-4- (4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium (dichlorure) ont été synthétisés comme décrit à l'exemple 1
b. Préparation du milieu
Une solution-mère à 50g/L pour chacun des trois substrats a été préparée dans un solvant type DMSO et ajoutée dans un milieu Columbia préalablement autoclave et maintenu en surfusion, à raison de 75mg/L. Après homogénéisation, les milieux ont été répartis en boîtes carrées de 120 mm. Un milieu servant de témoin de croissance (Columbia) et noté T a également été coulé.
c. Ensemencement et incubation
Vingt-deux souches de micro-organismes ont été ensemencées en spots-tests: dépôt de 1 μL à partir de suspensions bactériennes à 0.5McFarland (15.104 CFU/spot).
Les milieux ont été incubés 48 heures à 37°C, puis les spots formés ont été examinés visuellement.
d. Résultats
Les résultats obtenus sont consignés dans le tableau ci-après.
Figure imgf000032_0001
lCandida
\glabrata
Figure imgf000033_0001
Nota bene : les références internes des souches sont le mêmes que dans l'exemple 3
Légende :
++ : moyenne croissance/intensité de coloration moyenne
+ : faible croissance/intensité de coloration faible
- : pas de croissance/pas de coloration e. Conclusion
Les trois substrats L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium (dichlorure), L-alanyl-L- alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium (dichlorure) et L-alanyl-L-alanyl-L-alanyl-4- (4'-amidostyryl)-N-methyiquinolinium (dichlorure) permettent de détecter une activité peptidase. Le nombre d'acides aminés permet déjouer sur la spécificité de détection.
Exemple 5 - Utilisation de substrats de formule I selon l'invention pour détecter une activité peptidase a) Substrats de peptidase
Les composés L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium (dichlorure) et L-alanyl-2- (4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium (dichlorure) ont été synthétisés comme décrit à l'exemple 1.
b) Préparation du milieu
Une solution-mère à 50g/L pour chacun des deux substrats a été préparée dans un solvant type DMSO et ajoutée dans un milieu Columbia préalablement autoclave et maintenu en surfusion, à raison de 75mg/L. Après homogénéisation, les milieux ont été répartis en boîtes de Pétri de 55mm de diamètre. Un milieu servant de témoin de croissance (Columbia) et noté T a également été coulé.
c) Ensemencement et incubation
Vingt-deux souches de micro-organismes ont été ensemencées à l'oëse calibrée de lOμL selon la méthode des trois cadrans à partir de suspensions bactériennes à 0.5McFarland.
Les milieux ont été incubés 48 heures à 37°C, puis les colonies formées ont été examinées visuellement. d) Résultats
Les résultats obtenus sont consignés dans le tableau ci-après.
Figure imgf000034_0001
Figure imgf000034_0002
Figure imgf000034_0003
Nota bene : les références internes des souches sont le mêmes que dans l'exemple 3
Légende :
++ : moyenne croissance/intensité de coloration moyenne
+ : faible croissance/intensité de coloration faible
- : pas de croissance/pas de coloration e) Conclusion
Les composés L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium (dichlorure) et L-alanyl-2- (4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium (dichlorure) permettent de détecter une activité alanine-aminopeptidase. Exemple 6 - Utilisation de substrats de formule I selon l'invention pour détecter une variation de pH
a) Indicateurs de pH
Le composé 4-(4'-aminostyryl)-quinoline a été synthétisé comme décrit à l'exemple 1
b) Préparation du milieu
Une solution-mère à 50g/L en 4-(4'-aminostyryl)-quinoline a été préparée dans un solvant type DMSO et ajoutée dans un milieu chromlD coli® modifié préalablement autoclave et maintenu en surfusion, à raison de 50mg/L. Après homogénéisation, ce milieu a été réparti en boîtes de Pétri carrées de 120 mm. Un milieu servant de témoin de croissance (chromlD coli® modifié) et noté T a également été coulé.
* Composition du milieu chromlD coli® modifié (en g/L) :
Peptones : 5.5
Extrait de levure : 8
Chlorure de sodium : 5
Sels biliaires : 0.7
Glucose : 10
Agar : 12.5 c) Ensemencement et incubation
Quarante quatre souches de micro-organismes (détails dans le tableau ci-dessous) ont été ensemencées en spots-tests : dépôt de lμL à partir de suspensions bactériennes à 0.5McFarland (15.104 CFU/spot)
Les milieux ont été incubés 24 heures à 370C, puis les spots formés ont été examinés visuellement.
Figure imgf000035_0001
Figure imgf000036_0001
d) Lecture des résultats
Les résultats obtenus sont résentés dans le tableau ci-après
Figure imgf000037_0001
e) Conclusion
Le 4-(4'-aminostyryl)-quinoline ne présente pas de toxicité particulière.
Son utilisation permet de révéler une acidification via l'apparition d'une coloration orange vif ne diffusant que peu après 24h d'incubation.
Dans les conditions testées, l'utilisation du 4-(4'-aminostyryl)-quinoline permet de détecter les souches capables de fermenter le glucose.
Exemple 7 - Utilisation de substrats de formule I selon l'invention pour détecter une variation de pH
a) Indicateurs de pH
Le composé 4-(4'-aminostyryl)-quinoline a été synthétisé comme décrit à l'exemple 1
b) Préparation du milieu
Une solution-mère à 50g/L en 4-(4"-aminostyryl)-quinoline et une solution-mère à 40g/L en Blue-b-D-GUR (soit le 5-bromo-3-indoxyl-b-D-glucuronic acid) ont été préparées dans un solvant type DMSO et ajoutées dans un milieu chromlD coli® modifié préalablement autoclave et maintenu en surfusion, à raison de, respectivement 50mg/L et 200mg/L. Après homogénéisation, ce milieu a été réparti en boîtes de Pétri carrées de 120 mm. Un milieu servant de témoin de croissance (chromlD coli® modifié) et noté T a également été coulé.
*Composition du milieu chromlD coli® modifié (en g/L) :
Peptones : 5.5
Extrait de levure : 8
Chlorure de sodium : 5
Sels biliaires : 0.7
Glucose : 10
Activateur : 0.2
Agar : 12.5 c) Ensemencement et incubation Quarante trois souches de micro-organismes (détails dans le tableau ci-dessous) ont été ensemencées en spots-tests : dépôt de lμL à partir de suspensions bactériennes à
0.5McFarland (15.104 CFU/spot)
Les milieux ont été incubés 48 heures à 370C, puis les spots formés ont été examinés visuellement.
Figure imgf000039_0001
Figure imgf000040_0001
d) Lecture des résultats
Les résultats obtenus sont présentés dans le tableau ci-après.
Figure imgf000040_0002
Figure imgf000041_0001
e) Conclusion
Le 4-(4'-aminostyryl)-quinoline associé au Blue-b-GUR permettent de détecter simultanément les entérobactéries (acidification du glucose révélée par la coloration orange du 4-(4'-aminostyryl)-quinolinium) et les souches de E. coli beta-glucuronidase positive (ainsi que les Shigella - d'un point de vue génomique, les souches de Shigella appartiennent à l'espèce E. coli.) par la coloration marron des colonies, mélange de orange et de bleu (suite à l'hydrolyse du Blue-b-GUR).

Claims

REVENDICATIONS
1. Utilisation d'un composé de la formule (I) suivante, comme substrat enzymatique pour la détection d'une activité peptidase et/ou une variation de pH :
Figure imgf000042_0001
selon laquelle :
• Y] est un peptide, H ou un alkyl
• W1, W2, W3 et W4 sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, alkoxy, thiométhyle, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle (incluant ses esters ou amides) ou toute combinaison de ceux-ci
• n = 0, 1 ou 2
• U est N ou N+R et V est CZ6 N ou N+R ou bien V est N ou N+R et U est CZ6,
• R est H, alkyle, aralkyle, aryle, alcanoïque ou alkylsulfonique
• Zi, Z2, Z3, Z4 et Z5, sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, aryle, alkoxy, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle, sulfonyle, incluant les esters ou amides de carboxyle ou sulfonyle
et leurs sels
2. Utilisation d'un composé de formule I selon la revendication 1 selon laquelle Yi est un peptide, préférentiellement choisi parmi l'alanine, l'asparagine, la glutamine, la tyrosine
3. Utilisation d'un composé de formule I selon la revendication 1 ou 2 selon laquelle n = 1
4. Utilisation d'un composé de formule I selon l'une quelconque des revendications 1 à 3 selon laquelle W1, W2, W3 et W4 sont indépendamment H
5. Utilisation d'un composé de formule I selon l'une quelconque des revendications 1 à 4 selon laquelle U est CH et V est N ou N+R, préférentiellement N+CHB
6. Utilisation d'un composé de formule I selon l'une quelconque des revendications 1 à 4 selon laquelle V est CH et U est N ou N+R, préférentiellement N+CH3
7. Utilisation d'un composé de formule I selon l'une quelconque des revendications 1 à 6 selon laquelle Zi, Z2, Z3 et Z4 sont indépendamment H
8. Utilisation d'un composé de formule I selon la revendication 1 selon laquelle ledit composé est choisi parmi : L-Alanyl-4-(4'-amidophenyl)-2-méthyl-quinoline, L-Alanyl-4-(4'- amidostyryl)-N-benzyl-quinolinium TFA, L-Glutamyl-4-(4'-amidostyryl)-N-benzyl- quinolinium TFA, beta-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-benzyl-quinolinium TFA, L-Alanyl-4- (4'-amidostyryl)-N-methyl-quinolinium TFA, D-Alanine-N-méthyl-4-(4'-aminostyryl)- quinolinium (dichlorure), L-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium, Z-Alanyl-2- (4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium, L-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), L-Alanyl-L-alanyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), L- Alanyl-L-alanyl-L-alanyl-4-(4 ' -amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), γ- Aminobutyryl-4-(4'-amidostyryl)-N-rnethylquinolinium di-Cl, L-Asparaginyl-4-(4'- amidostyryl)-N-méthyl-quinoliniurn-bis-TFA, α-Aspartyl-4-(4'-amidostyryl)-N- methylquinolinium dichloride, β-Aspartyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methylquinolinium dichloride, Glycyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), L-gamma- Glutamyl-4-(4 ' -amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (dichlorure), Glycyl-4-(4'-amidostyryl)- N-méthyl-quinolinium chloride, L-Leucyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium dihydrochloride, L-Methionyl-4-(4'-amidostyryl)-N-methyl-quinolinium di-Cl, Pyroglutamyl- 4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium iodide, L-Tryptophanyl-4-(4-amidostyryl)-N- méthyl-quinolinium dihydrochloride, L-Tyrosyl-4-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium dihydrochloride, beta-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-N-methyl-quinolinium TFA, L-Prolyl-2-(4'- amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium (HBr), Z-Arginyl-2-(4'-amidostyryl)-N-méthyl- quinolinium, L-Pyroglutamyl -2-(4'-amidostyryl)-N-méthyl-quinolinium, L-Alanyl-4-(4'- amidostyryl)quinoline TFA, β-Alanyl-4-(4'-amidostyryl)-quinoline, L-Glutamyl-4-(4'- amidostyryl)quinoline TFA, Glycyl-4-(4'-amidostyryl)quinoline TFA, Pyroglutamyl-4-(4'- amidostyryl) quinoline, L-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)-quinoline, β-Alanyl-2-(4'-amidostyryl)- quinoline, Glycyl-2-(4'-amidostyryl)quinoline TFA, L-Alanyl-2-(2'-pyridyl)-4-(4"- amidostyryl)-quinoline
9. Procédé pour la détection chez des micro-organismes d'une activité peptidase et/ou d'une variation de pH, caractérisé en ce qu'il comprend les étapes suivantes :
a) Disposer d'un milieu de détection et/ou d'identification comprenant composé de la formule (I) suivante :
Figure imgf000044_0001
selon laquelle :
• Y i est un peptide, H ou un alkyl
• Wi, W2, W3 et W4 sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, alkoxy, thiométhyle, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle (incluant ses esters ou amides) ou toute combinaison de ceux-ci
• n = 0, 1 ou 2
• U est N ou N+R et V est CZ6 N ou N+R ou bien V est N ou N+R et U est CZ6,
• R est H, alkyle, aralkyle, aryle, alcanoïque ou alkylsulfonique
• Zi, Z2, Z3, Z4 et Z5, sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, aryle, alkoxy, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle, sulfonyle, incluant les esters ou amides de carboxyle ou sulfonyle et leurs sels.
b) ensemencer le milieu avec un échantillon biologique à tester,
c) laisser incuber, et
d) révéler la présence d'au moins une activité peptidase ou une variation de pH
10. Procédé pour la différenciation chez des bactéries de leur appartenance aux bactéries à Gram positif ou aux bactéries à Gram négatif, caractérisé en ce qu'il comprend par les étapes suivantes :
a) disposer d'un milieu de détection et/ou d'identification comprenant composé de la formule (I) suivante :
Figure imgf000045_0001
selon laquelle :
• Y] est un peptide, H ou un alkyl
• Wi, W2, W3 et W4 sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, alkoxy, thiométhyle, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle (incluant ses esters ou amides) ou toute combinaison de ceux-ci
• n = 0, 1 ou 2
• U est N ou N+R et V est CZ6 N ou N+R ou bien V est N ou N+R et U est CZ6,
• R est H, alkyle, aralkyle, aryle, alcanoïque ou alkylsulfonique
• Z1, Z2, Z3, Z4 et Z5, sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, aryle, alkoxy, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle, sulfonyle, incluant les esters ou amides de carboxyle ou sulfonyle
et leurs sels.
b) ensemencer le milieu avec un échantillon biologique à tester, c) laisser incuber, et
d) révéler la présence d'au moins une activité peptidase
11. Milieu de détection et/ou d'identification de microorganismes comprenant un composé de la formule (I) suivante pour détecter une activité peptidase et/ou une variation de pH :
Figure imgf000046_0001
selon laquelle :
• Yi est un peptide, H ou un alkyl
• Wi, W2, W3 et W4 sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, alkoxy, thiométhyle, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle (incluant ses esters ou amides) ou toute combinaison de ceux-ci
• n = 0, 1 ou 2
• U est N ou N+R et V est CZ6 N ou N+R ou bien V est N ou N+R et U est CZ6,
• R est H, alkyle, aralkyle, aryle, alcanoïque ou alkylsulfonique
• Zi, Z2, Z3, Z4 et Z5, sont indépendamment H, Br, Cl, F, I, alkyle, aryle, alkoxy, perfluoroalkyle, nitro, cyano, carboxyle, sulfonyle, incluant les esters ou amides de carboxyle ou sulfonyle
et leurs sels.
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