WO2013045737A1 - Péptido inmunogénico del gluten y sus aplicaciones - Google Patents
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Definitions
- the present invention falls within the field of health and food, specifically within the immunogenic gluten peptides useful for the diagnosis, monitoring and / or therapeutic treatment of celiac disease in individuals, as well as for the detection of gluten in foods.
- Celiac disease is an enteropathy induced by gliadin (wheat prolamin) and other related cereal prolamines such as secalin (rye), hordein (barley) and some types of avenins (oats) in genetically predisposed individuals (HLA-DQ2 / DQ8).
- gliadin wheat prolamin
- other related cereal prolamines such as secalin (rye), hordein (barley) and some types of avenins (oats) in genetically predisposed individuals (HLA-DQ2 / DQ8).
- gliadin peptides that would be generated during gastrointestinal digestion, such as 19-mer, play a fundamental role in the development of celiac disease by triggering an innate immune response (Jabri B. and Sollid LD., 2006 , Nat Clin Pract Gastroenterol Hepatol .; 3 (9): 516-525) through independent DQ2 mechanisms that lead to the production of IL-15 in epithelial cells.
- the result is the interruption of the epithelial barrier and the induction of apoptosis in enterocytes.
- immunodominant peptides such as 33-mer (Shan L., et al., 2002, Science; 297 (5590): 2275-2279), convert some of their glutamine (deamination) residues into glutamate by action of tissue transglutaminase (tTG) and can reach the lamina intestinal where they are presented by dendritic cells to certain specific T lymphocytes restricted to HLA-DQ2 / DQ8 molecules. The inflammation that occurs is then adjusted to a type I cytokine profile, mediated by IFNy, and the lesion is characterized by a massive infiltration of intraepithelial lymphocytes, cryptic hyperplasia and atrophy of the villi.
- tTG tissue transglutaminase
- gluten comprises a set of more than 100 reserve proteins found in wheat seed. According to its level of solubility, gluten is divided into gliadins and glutenins, both involved in celiac disease. There are homologs of these proteins in barley, rye and some varieties of oats, which explains that these cereals can also cause the disease.
- Digestion-resistant gluten peptides are rich in proline and glutamine, since most proteases do not cut into residues adjacent to proline, and glutamine is not a preferred residue for any of the intestine endoproteases. Therefore, peptides of sufficient length to trigger an immune response are able to evade gastrointestinal digestion and reach the epithelium intact. Such is the case of the 33-mer peptide of wheat ⁇ -gliadin, which is resistant to proteases and has been considered as the primary initiator of the inflammatory response to gluten in celiac patients.
- the 33-mer peptide is the most bioactive (immunodominant) gluten peptide that is recognized by T cells from HLA-DQ2 + celiac donors, although it is not the only peptide that shows such activity. .
- the identification of gluten response peptides in intestinal T cells is crucial, among other things, in the search for alternative therapies to the gluten-free diet.
- Toxic gluten peptides are applicable in methods of diagnosis and / or treatment of celiac individuals (WO03066079, EP0905518, US5817523, W09727217, US20080318852, US20090156490 and US20060240475).
- Another application derived from the identification of a gluten peptide with immunotoxic activity is the measurement of the toxic fraction of gluten in food.
- the most implanted techniques for the control of gluten in food are the ELISA assays, the PCR technique, Western Blot, mass spectrometry, chromatography and immunochromatographic strips. Among them, it is the immunoabsorbent enzyme techniques (ELISA), based on monoclonal antibodies against specific epitopes, which have the most desirable characteristics of simplicity, sensitivity and economy. More novel, and still in development, are the techniques that use biosensors or lab-on-chip technology.
- ELISA immunoabsorbent enzyme techniques
- the present invention provides an isolated peptide of eight amino acids, hereafter referred to as "peptide of the invention” or “8-mer peptide", which is naturally generated in the intestine of celiac patients by the action of bacterial proteases present In their intestinal flora they degrade gluten gliadin.
- peptide of the invention or “8-mer peptide”
- the inventors demonstrate that this peptide has immunogenic capacity, being able to stimulate cells of the immune system in culture from both celiac patients and non-celiac individuals. Therefore, and because the peptide of the invention is generated in vivo in the intestine of celiac patients and not in the intestine of healthy individuals or who have other types of pathologies, said peptide is a highly specific marker for diagnosis.
- the peptide of the invention is also useful as a therapeutic agent, preferably prophylactic, complementary or alternative to the gluten-free diet, in individuals suffering from this disease.
- antibodies against this peptide of the invention are useful for the detection and / or quantification of the latter preferably in food, which allows to know the gluten toxicity in them.
- a first aspect of the invention relates to an isolated peptide of sequence SEQ ID NO: 1, "peptide of the invention” or "8-mer peptide".
- this peptide has immunogenic activity and is a product of the proteolysis specifically suffered by gluten gliadin in the intestine of celiac patients although, as the examples of the present invention show, said peptide is part of not only the sequences of gliadins but also of the sequences of other proteins belonging to other species of cereals toxic to celiacs, such as glutenins, secalins and hordeins.
- This peptide of the invention may have variants, which refer to limited variations in its amino acid sequence that allow the maintenance of the functionality of the peptide.
- variants refer to limited variations in its amino acid sequence that allow the maintenance of the functionality of the peptide.
- SEQ ID NO: 1 refers to limited variations in its amino acid sequence that allow the maintenance of the functionality of the peptide.
- SEQ ID NO: 1 refers to limited variations in its amino acid sequence that allow the maintenance of the functionality of the peptide.
- SEQ ID NO: 1 refers, which refer to limited variations in its amino acid sequence that allow the maintenance of the functionality of the peptide.
- SEQ ID NO: 1 refers, which refer to limited variations in its amino acid sequence that allow the maintenance of the functionality of the peptide.
- SEQ ID NO: 1 refers to limited variations in its amino acid sequence that allow the maintenance of the functionality of the peptide.
- SEQ ID NO: 1 refers to limited variations in its amino acid sequence that allow the maintenance of the functionality of the peptide.
- substitutions include, but are not limited to, substitutions between glutamic acid (Glu) and aspartic acid (Asp), between lysine (Lys) and arginine (Arg), between asparagine (Asn) and glutamine (Gln), between serine (Ser) and threonine (Thr), and / or among the amino acids that make up the alanine (Ala), leucine (Leu), valine (Val) and isoleucine group (lie) Variations can be artificially generated variations, such as by mutagenesis or direct synthesis. These variations do not cause essential modifications in the essential characteristics or properties of the peptide. Therefore, peptides or polypeptides whose amino acid sequence is identical or homologous to the sequences described in the present invention are also included within the scope of the present invention.
- the peptide of the invention may have modifications derived from its enzymatic processing.
- gluten immunogenic peptides can undergo in the intestine of celiac individuals a deamination (replacement of glutamine with glutamate) by the action of tissue transglutaminase (tTG), positions 4, 6 and / or 7 of the SEQ ID NO: 1, which in the native form of the peptide are glutamines (Gln), may be substituted by glutamate (Glu).
- the peptide sequence of the invention is SEQ ID NO: 2, a peptide (native) that has been isolated in the examples of the present invention from proteins of various cereal species toxic to celiacs, such as for example, but not limited to barley, rye and wheat.
- SEQ ID NO: 2 corresponds to SEQ ID NO: 1 where positions 4, 6 and 7 are Gln.
- the peptide of the invention is deaminated, more preferably as a result of its processing by tTG, even more preferably, the sequence of the peptide of the invention is SEQ ID NO: 3, sequence corresponding to SEQ ID NO : 1 where positions 4 and 7 are Gln and position 6 is Glu.
- the peptide of the present invention and its variants or derivatives can be synthesized, for example, but not limited to, by chemical synthesis, recombinant DNA techniques, isolation from natural sources or by in vitro proteolysis.
- the peptide of the invention can be produced recombinantly, not only directly but as a polypeptide of fusion together with a heterologous polypeptide, which may contain, for example, but not limited to, a signal sequence, or other polypeptide having a cut-off site for a protease, for example, but not limited to, at the N-terminal end of the mature or polypeptide protein.
- In vitro diagnosis of celiac disease in an individual can be carried out using the peptide of the invention by various methods.
- One of these methods could be, but not limited to, the detection of intestinal proteolytic activity that results in the release of said peptide from gliadin, or other related proteins such as secalins, hordeins or glutenins, which could be done, for example, using the peptide of the invention modified with at least one chromogenic, fluorogenic or luminescent substrate so that, upon contact with a biological sample isolated from the intestine, color is generated only in the case of celiac patients due to presence of specific enzymes associated with its intestinal flora capable of carrying out the release of the peptide by proteolytic hydrolysis.
- the peptide of the invention also has a chemical compound attached to its N- and / or C-terminal end.
- this chemical compound is biotin, a molecule with an affinity for streptavidin.
- Said chemical compound can be added, for example, synthetically to the peptide of the invention by techniques known in the state of the art.
- the chemical compound is a chromogenic, fluorogenic or luminescent compound.
- a "chromogenic compound” is one that produces color or pigment. In the present invention the chromogenic compound is preferably p-nitroanilide.
- a “fluorogenic compound” is one that emits fluorescence when excited at a certain wavelength, such as, but not limited to, derivatives of 4-methylumbelliferils or o- or p-halomethyl phenols.
- a “luminescent compound” is one that emits photons instead of giving visible color, therefore, it is a compound that emits light returning from an electronically excited state to its original state. The latter term includes bioluminescence, photoluminescence and chemiluminescence.
- An example of a luminescent compound is, but not limited to, luciferin-luciferase.
- the peptide of the invention also has another peptide attached to its N- and / or C-terminal end.
- the binding of one peptide to another can be carried out by known techniques of obtaining fusion proteins.
- nucleotide sequence of the invention Another aspect of the invention relates to an isolated nucleotide sequence encoding the peptide of the invention, hereafter referred to as the "nucleotide sequence of the invention". Due to the degeneracy of the genetic code, in which several nucleotide triplets give rise to the same amino acid, there are several nucleotide sequences that give rise to the same amino acid sequence.
- nucleotide sequence refers to a polymeric form of nucleotides of any length that may or may not be chemical or biochemically modified. They refer, therefore, to any polyiribonucleotide or polydeoxyribonucleotide, both single-stranded and double-stranded.
- the nucleotide sequence of the invention can be obtained artificially by conventional cloning and selection methods, or by sequencing.
- Said nucleotide sequence in addition to the coding sequence, may carry other elements, such as, but not limited to, introns, non-coding sequences at the 5 'and / or 3' ends, ribosome binding sites, or stabilizing sequences.
- These polynucleotides may additionally include coding sequences for additional amino acids that may be useful, for example, but not limited, to increase stability. of the peptide generated from them or to allow a better purification thereof.
- the peptide of the invention has antigenic capacity and therefore can be used to develop mono or polyclonal antibodies that specifically bind to it, which can be carried out by various methods known in the state of the art. Therefore, another aspect of the invention relates to an antibody against the peptide of the invention, hereafter referred to as "antibody of the invention".
- One of the methods that could be carried out to obtain the antibody of the invention consists, for example, but not limited to, in the immunization of animals with the peptide of the invention and the subsequent purification, for example from serum, of the specific antibodies generated against it.
- antibody refers to immunoglobulin molecules or immunologically active portions of immunoglobulin molecules, that is, to molecules that contain an antigen binding site that specifically binds (immunoreacts) with the peptide of the invention.
- portions of immunologically active immunoglobulin molecules include F (ab) and F (ab ') 2 fragments, which can be generated, for example, but not limited to, treating the antibody with an enzyme such as pepsin or by techniques of Genetic engineering known in the state of the art.
- the antibody of the invention can be polyclonal (typically includes different antibodies directed against different determinants or epitopes) or monoclonal (directed against a single determinant in the antigen).
- the term "monoclonal antibody” refers to a population of antibody molecules that contain only one species of an antigen binding site capable of immunoreacting with a particular epitope of the antigen.
- the monoclonal antibody may be biochemically altered, by genetic manipulation, or it may be synthetic, possibly lacking the antibody in whole or in part, from portions that are not necessary for recognition of the peptide of the invention, and being substituted by others. which communicate additional advantageous properties to the antibody.
- the antibody of the invention has specificity against the peptide of the invention, so it is useful in several applications, namely: for the detection and / or quantification of the peptide of the invention, preferably in food being part of the protein of the where appropriate, so that it is possible to detect gluten toxicity therein; for the detection and / or quantification of the peptide of the invention in an isolated biological sample of an individual, with the aim of making the diagnosis and / or in vitro monitoring of celiac disease; or to block the peptide of the invention, partially or totally inhibiting its immunogenic activity, in a method of treating said disease.
- the antibody of the invention be a humanized antibody, since in this way an anaphylactic response is not generated by the immune system when the humanized antibody of the invention is administered to a human .
- a humanized monoclonal antibody by attaching a variable or antigen recognition region of the antibody of the invention to a framework of a human antibody.
- humanized antibodies are human immunoglobulins (receptor antibodies) in which the residues of the hypervariable regions of the receptor have been replaced by residues of a hypervariable region of a non-human species (donor antibody) having the specificity , affinity and capacity desired.
- hypervariable region refers to the amino acid residues of an antibody that are responsible for antigen binding.
- the hypervariable region comprises amino acid residues of a "complementarity determining region" or "CDR" and / or those residues of a "hypervariable loop".
- Support residues (in English "framework") or "FR” are those residues of the variable domain different from the residues of the hypervariable region.
- the support residues (FR) of the human immunoglobulin are replaced by the corresponding non-human residues.
- humanized antibodies may comprise residues that are not found in the recipient antibody or in the donor antibody. These modifications are made to further refine the antibody function.
- the humanized antibody will comprise substantially all of at least one, and generally two, variable domains, in which all or virtually all hypervariable loops correspond to those of a non-human immunoglobulin and all or substantially all of the FR regions are of a human immunoglobulin sequence.
- the humanized antibody will also optionally comprise at least a part of a constant region of immunoglobulin (Fe), in general of a human immunoglobulin.
- Fe immunoglobulin
- the antibody of the invention is a monoclonal antibody, more preferably humanized, and can be recombinant, chimeric, synthetic or a combination of any of the foregoing.
- a “recombinant antibody or polypeptide” is an antibody that has been produced in a host cell transformed or transfected with the nucleic acid encoding the antibody of the invention or the peptide of the invention, or that produces the antibody of the invention or the peptide of the invention as a result of homologous recombination.
- Said host cell includes a cell in an "in vitro" cell culture as well as a cell in a host animal.
- the antibody of the invention can be chimeric.
- a region of the heavy and / or light chain is identical or homologous to the corresponding sequences in antibodies from a given species or belonging to a particular class or subclass of antibodies, while the remaining chain (s) ( s) is (are) identical, or homologous (s), to the corresponding sequences in antibodies derived from other species or belonging to another class or subclass of antibodies, as well as to fragments of said antibodies, so as to exhibit the Desired biological activity
- the cell of the invention is preferably a B lymphocyte or a hybridoma, "hybridoma” being understood as the hybrid cell line obtained by the fusion of a B lymphocyte producing the antibody of the invention with a myeloma cell line (cancerous B lymphocyte) that does not produce its own immunoglobulin; thus, it is an immortal cell line capable of producing the monoclonal antibody of the invention, which can be recovered from the medium.
- composition of the invention comprising the peptide, the nucleotide sequence, the antibody or the cell of the invention.
- composition of the invention may further comprise pharmaceutically acceptable adjuvants, excipients and / or vehicles.
- excipient refers to a substance that aids the absorption of the elements of the composition of the invention, stabilizes said elements, activates or aids the preparation of the composition in the sense of giving consistency or providing flavors that make it more pleasant.
- the excipients could have the function of keeping the ingredients together, such as, for example, starches, sugars or cellulose, the sweetening function, the coloring function, the protective function of the composition, for example, to isolate it from air and / or moisture, the filling function of a pill, capsule or any other form of presentation, the disintegrating function to facilitate the dissolution of the components and their absorption in the intestine, without excluding other types of excipients. mentioned in this paragraph.
- the "pharmaceutically acceptable carrier”, like the excipient, is a substance that is used in the composition to dilute any of the components of the present invention comprised therein to a certain volume or weight.
- the pharmaceutically acceptable carrier is an inert substance or action analogous to any of the elements of the present invention.
- composition refers to an agent that does not possess an antigenic effect by itself, but which can stimulate the immune system by increasing its response to the composition of the invention.
- adjuvants known in the state of the art, such as, but not limited to, aluminum phosphate, aluminum hydroxide, toll receptor agonists, cytokines, squalene, incomplete Freund's adjuvant or Freund's complete adjuvant. Therefore, the term “composition” also includes a "pharmaceutical composition” and within it what is known as "vaccine.”
- the composition of the invention comprises the peptide, nucleotide sequence, antibody or cell of the invention in a therapeutically effective amount, "therapeutically effective amount” being understood as the amount of peptide, nucleotide sequence, antibody or cell of the invention , to produce the desired effect.
- therapeutically effective amount being understood as the amount of peptide, nucleotide sequence, antibody or cell of the invention , to produce the desired effect.
- the Dosage to obtain a therapeutically effective amount depends on a variety of factors, such as the age, weight, sex or tolerance of the individual.
- the composition of the present invention can be formulated for administration in a variety of ways known in the state of the art. Examples of preparations include any solid composition (tablets, pills, capsules, granules, etc.) or liquid (solutions, suspensions or emulsions) for oral, topical or parenteral administration.
- composition of the present invention can also be formulated in the form of liposomes or nanospheres, sustained release formulations or any other conventional release system.
- a composition and / or its formulations can be administered to an animal, including a mammal and, therefore, to man, in a variety of ways, including, but not limited to, parenteral, intraperitoneal, intravenous, intradermal, intraspinal, intrastromal, intraarticular, intrathecal, intralesional, intraarterial, intramuscular, intranasal, intracranial, subcutaneous, intracapsular, topical, through transdermal patches or rectal, through the administration of a suppository, percutaneous, nasal spray, surgical implant, internal surgical paint, infusion pump or catheter .
- the immunogenic peptide of the invention is naturally generated in the intestine of celiac patients by the action of bacterial proteases present in their intestinal flora that degrade gluten gliadin, or secalin, hordein or glutenin , so its use as a therapeutic target is interesting for the identification of compounds or compositions that serve for the diagnosis, prevention and / or treatment of celiac disease.
- another aspect of the invention relates to the use of the peptide or the Nucleotide sequence of the invention for the identification or design of compounds or compositions for the diagnosis, prevention and / or treatment of celiac disease.
- said compounds or compositions could be classified as useful for the diagnosis of celiac disease when they are capable. to specifically and selectively bind to the peptide of the invention, regardless of whether or not they interfere with its biological activity or whether or not they alter its structure.
- these compounds or compositions could be classified as useful for the prevention and / or treatment of celiac disease when they are capable of altering the biological activity of the peptide of the invention, reducing or completely inhibiting its toxicity or immunogenic capacity
- Another aspect of the invention relates to the use of the antibody or cell of the invention for the detection and / or quantification of the peptide of the invention.
- This application of the antibody and the cell of the invention is useful, not only for the diagnosis and / or in vitro monitoring of celiac disease in an individual, but also to determine the presence and / or amount of gluten in food, thus allowing to select those foods suitable for consumption by patients with celiac disease. Therefore, in a preferred embodiment, the detection and / or quantification of the peptide of the invention is carried out in foods, such as, but not limited to, cereals.
- the advantage of detecting this peptide of the invention against other gluten peptides that have also been identified as immunogenic is that, as shown in the examples of the present invention, the peptide of the invention is widely distributed in several genera of Toxic cereals, including, but not limited to, barley, rye and wheat (both wild and cultivated), and also present not only in prolamines (gliadins, hordeins and secaline) but also in a low molecular weight glutenin.
- Said detection and / or quantification can be carried out by immunological tests, for example, but not limited to, by Western blotting, immunoprecipitation, protein arrays, immunofluorescence, immunohistochemistry, direct, indirect, sandwich or competitive ELISA, to determine the presence and / or amount of isolated peptide in biological samples isolated from individuals (diagnosis and / or in vitro monitoring of celiac disease), or as part of the protein from which it comes in food extracts.
- immunological tests for example, but not limited to, by Western blotting, immunoprecipitation, protein arrays, immunofluorescence, immunohistochemistry, direct, indirect, sandwich or competitive ELISA, to determine the presence and / or amount of isolated peptide in biological samples isolated from individuals (diagnosis and / or in vitro monitoring of celiac disease), or as part of the protein from which it comes in food extracts.
- a preferred method of detecting and quantifying the peptide of the invention by means of the antibody or cell of the invention is a sandwich-type enzyme immunoassay, for example, based on the use of a pair of antibodies of the invention, specific to the peptide of the invention.
- one of the antibodies is fixed to a solid support, for example, but not limited to, a plastic plate or a PDVF membrane, and the second antibody is used as a conjugate marker with an enzyme that catalyzes a colorimetric reaction (or with a fluorochrome in fluorometric techniques); thus, the sample to be studied is incubated with these reagents and the color intensity or fluorescence is measured at the end of the process, this being directly proportional to the amount of peptide of the invention present in the sample.
- Another preferred method of detecting and quantifying the peptide of the invention is a competitive type enzyme immunoassay similar to the above but where the marker antibody is replaced by the peptide of the synthetic invention conjugated to an enzyme or fluorochrome, then incubated with the sample to be analyzed and, in this case the amount of peptide in it will be inversely proportional to the color developed or to the emitted fluorescence.
- Another preferred method of detecting the peptide of the invention consists in carrying out an immunochromatographic technique following a process similar to the first method described in this paragraph, but adsorbing one of the antibodies of the couple in the PDVF and using the second substance as the detection substance. antibody of the partner with the corresponding marker. This last technique allows rapid qualitative determinations.
- isolated biological sample refers to, but is not limited to, tissues and / or biological fluids of an individual obtained by any method known to a person skilled in the art that serves for such finish.
- the biological sample may be a biological tissue or fluid, preferably it is a serum, stool or intestinal aspirate sample, more preferably a duodenal-jejunal fluid.
- the sample may be taken from non-human mammals, such as, but not limited to, rodents, ruminants, felines or canids, or more preferably from a human.
- Another aspect of the invention relates to the use of the peptide, antibody or cell of the invention for in vitro diagnosis and / or monitoring of celiac disease in an individual.
- another aspect of the invention relates to a method of diagnosis and / or in vitro monitoring of celiac disease in an individual comprising:
- detect and / or quantify in an isolated biological sample preferably in a stool or intestinal aspirate sample, more preferably in a sample of duodenal-jejunal fluid, the peptide of the invention (the presence of the peptide of the invention in said sample is indicative of a celiac phenotype); which could be carried out, for example, but not limited to, using the antibody or cell of the invention in the methods described.
- the detection and / or quantification of the peptide of the invention either by electrophoresis gels, NMR or any other diagnostic imaging technique or by chromatographic or mass spectroscopy techniques; or
- b. detect and / or quantify in an isolated biological sample, preferably in a serum sample, immunological activities generated against the peptide of the invention by the humoral immune system (detection and / or quantification of antibodies against the peptide of the invention) or cellular (detection and / or quantification of specific T lymphocytes against the peptide of the invention); which could be carried out using the peptide of the invention, for example, but not limited to, in the methods described below.
- antibodies specific to the peptide of the invention focus on the IgG and IgA isotypes separately, or both IgG + IgA.
- the antibodies against the peptide of the invention constitute a variant of the antigliadin antibodies and provide the specificity that these markers lack.
- Antigliadin antibodies (AAG) have the historical importance of being the first useful serological tool in the diagnosis of celiac disease. The appearance of antibodies against elements of the diet in celiac disease has been known since the sixties of the last century. AAGs are directed against highly conserved and shared antigenic determinants of ⁇ -gliadin with the other fractions (gliadins ⁇ , ⁇ and ⁇ ).
- the antibodies against the peptide of the invention are those antibodies antigliadin, antisecalin, antihordein and antiglutenin with affinity for fragments of gliadin, secalin, hordein and glutenin specifically processed in the intestine of patients celiac Therefore, the detection and / or quantification of these antibodies in an isolated biological sample constitutes an effective method of diagnosis and / or in vitro monitoring of celiac disease.
- the detection and / or quantification of these antibodies against the peptide of the invention preferably against its variants deaminated by tTG, can be carried out using the peptide of the invention in different immunological techniques, such as, but not limited to:
- - Immunochromatographic techniques in which the peptide of the invention is adsorbed to nitrocellulose membrane strips, PVDF or similar materials and, by lateral flow, the biological sample to be analyzed is contacted with said adsorbed peptide, fixing against it the specific antibodies that might exist in it and crawling the rest.
- These antibodies can be visualized by, for example, but not limited to, the reaction with anti-immunoglobulin antibodies (anti-IgA or anti-IgG) or by any other substance capable of specifically binding immunoglobulins (for example, protein A or protein G), which in turn would preferably be conjugated with a colored marker or capable of generating color, such as, but not limited to, colloidal gold.
- the reagents would be fixed in different layers of the strip and would be mobilized by the sample flow itself, so preferably this method is performed in a single step. This technique is qualitative, with the advantage of speed and the lack of instrumentation for its evaluation.
- ELISA - Immunoenzymatic techniques
- the adsorption of the peptide of the invention is carried out on a plastic, preferably in the form of a multi-well plate, on which the reaction proceeds in a manner similar to that described in the previous paragraph, although it is a type technique semi-quantitative anti-lg antibodies conjugated with enzymes are preferably employed.
- Enzymes catalyze a colorimetric reaction by adding a chemical substrate that changes color when modified by the enzyme. The amount of color generated is directly proportional to the amount of specific antibodies that They are found in the biological sample.
- a variant would be competitive techniques that evaluate the ability of the biological sample to inhibit the binding of a known amount of the invention-labeled peptide to antibodies against the peptide of the invention fixed to the solid surface.
- - Immunofluorometric techniques Essentially similar to the ELISA technique, but using a fluorescent substance as a marker for the secondary antibody. In cases where polarization variants are used, it is not necessary to fix the antigen to the solid surface.
- Competitive variants are also used in this type of technique. Fluorochromic tightening increases the sensitivity of the technique against enzyme immunoassay.
- polystyrene microspheres as a support to carry out the antigen-antibody reaction and perform the readings by means of a flow cytometer, which would also allow a multiplex test if there are different microspheres according to the antigen, detecting the presence of other antigens besides peptide of the invention.
- the presence of specific T lymphocytes against the peptide of the invention could be detected and / or quantified in the isolated biological sample, for example, but not limited to biological tests based on mononuclear cells from the individual, and preferably obtained from peripheral blood or isolated from the intestinal mucosa, and stimulated in vitro with the peptide of the invention.
- the response could be quantified by, for example, but not limited to, proliferation assays, blastogenesis, production of soluble substances or expression of cell membrane markers, and the results obtained in the biological sample analyzed with positive controls could be compared, for example, using T mitogen stimuli, such as phytohemagglutinin, and negative controls, such as using basal cultures without stimulation or with an innocuous stimulus.
- T mitogen stimuli such as phytohemagglutinin
- negative controls such as using basal cultures without stimulation or with an innocuous stimulus.
- This method of diagnosis and / or monitoring of celiac disease It could replace the in vivo challenge tests with gluten since, since it consists of an ex vivo stimulation of lymphocytes isolated from the biological sample, it would provide the advantage of not exposing the individual to a substance potentially harmful to their organism when performing the confirmation of the diagnosis and / or follow-up, and on the other hand this method would be more specific when determining a sensitization against a substance that is generated specifically in the intestine of celiac patients and not in other pathologies.
- the presence of an immune, humoral or cellular response against the peptide of the invention is related to the fact that the peptides of gliadin, secalin, hordein or glutenin have passed the epithelial barrier of the intestinal mucosa and have been able to generate an adaptive response of the the patient's immune system (immunological memory), or with the presence of the peptide of the invention in the organism of the individual from which the analyzed sample is derived, which is indicative of a celiac intestinal phenotype in which the activity of a flora would be included Intestinal bowel of celiac patients.
- Another aspect of the invention relates to a method of in vitro diagnosis of celiac disease in an individual comprising:
- the proteolytic activity that results in the formation of the peptide of the invention from gliadin, secalin, hordein or glutenin.
- the presence of said proteolytic activity in the analyzed sample is indicative of a celiac phenotype.
- the peptide of the invention modified with at least one chromogenic, fluorogenic or luminescent substrate could be used.
- Incubation of said modified peptide together with the isolated biological sample, preferably from the intestine produces color only in the case of celiac individuals, due to the presence of specific enzymes associated with its intestinal flora capable of releasing the peptide of the invention by enzymatic digestion.
- diagnosis refers to determining the absence or presence of celiac disease in an individual.
- follow-up refers to analyzing the course or progress of celiac disease in an individual, preferably when said individual has been previously diagnosed for said disease, more preferably when said individual is undergoing therapeutic treatment, and even more preferably when said individual is subjected to a gluten-free diet.
- Another aspect of the invention relates to the use of probiotic compounds that modify the intestinal bacterial flora responsible for the protease activity that hydrolyzes gliadin, secalin, hordein or glutenin generating the peptide of the invention, for the preparation of a medicament for the treatment and / or prevention of celiac disease.
- Another aspect of the invention relates to the use of antibiotics that partially or totally inhibit the proliferation of the intestinal bacterial flora responsible for said protease activity, for the preparation of a medicament for the treatment and / or prevention of celiac disease.
- Another aspect of the invention relates to the use of the peptide, the nucleotide sequence, the antibody, the cell or the composition of the invention for the preparation of a medicament or, alternatively, the peptide, the nucleotide sequence, the antibody, the cell or composition of the invention for use as a medicament, hereafter referred to as "medicament of the invention".
- the “medicament” referred to in the present invention may be for human or veterinary use.
- the "medicine for human use” is any substance or combination of substances that is presented as having properties for the treatment or prevention of diseases in humans or that can be used in humans or administered to humans in order to restore, correct or modify physiological functions by exerting a pharmacological, immunological or metabolic action, or establishing a medical diagnosis.
- veterinary medicinal product is any substance or combination of substances that is presented as having curative or preventive properties with respect to animal diseases or that can be administered to the animal in order to restore, correct or modify its physiological functions by exercising a pharmacological, immunological or metabolic action, or to establish a veterinary diagnosis.
- the medicament of the invention is for the prevention and / or treatment of celiac disease.
- the medicament of the invention can be used both alone and in combination with other medicaments or compositions for the diagnosis, treatment and / or prevention of celiac disease; and can be used as an alternative or complementary treatment to the gluten-free diet normally followed by individuals suffering from this disease.
- treatment refers to combating the effects caused as a result of celiac disease in a subject (preferably mammalian, and more preferably human) that includes:
- prevention is to prevent the onset of the disease, that is, to prevent the disease or pathological condition from occurring in a subject (preferably mammal, and more preferably human), in particular , when said subject has a predisposition for the pathological condition, but has not yet been diagnosed to have it.
- the peptide of the invention can be used, for example, but not limited to, in a prophylactic method in order to perform an immunological manipulation of the individual, preferably of a celiac individual, thus trying to (re) establish tolerance to gluten. Therefore, in a more preferred embodiment the medicament of the invention is a vaccine, even more preferably when said medicament comprises the peptide or the nucleotide sequence of the invention.
- the term "vaccine” refers to an epitopic or antigen preparation used to elicit an immune system response to one or more antigens. They are prepared of antigens or epitopes that, once inside the organism, provoke the response of the immune system through the production of antibodies and generate immunological memory producing permanent or transient immunity.
- the vaccine of the invention can be administered to the individual once or repeatedly (initial and subsequent administration), depending on the individual's ability to produce an immune response in response to the administration of the vaccine.
- Another aspect of the invention relates to a kit, hereafter “first kit of the invention”, comprising the peptide of the invention.
- kit, hereafter “second kit of the invention” comprising the antibody or cell of the invention.
- the first and second kit of the invention may further comprise, without any limitation, conjugated or unconjugated primary antibodies, peptides, buffers, conjugated secondary antibodies, conjugated streptavidin, standard proteins or peptides, agents to prevent contamination, marker compounds, such as, but not limited to, fluorochromes, etc.
- the first and second kit of the invention can include all the supports and containers necessary for its implementation and optimization.
- the first and second kit of the invention may also contain other proteins or peptides that serve as positive and negative controls.
- these kits further comprise the instructions for carrying out the diagnosis and / or in vitro monitoring of celiac disease in an individual, or for detecting and / or quantifying the peptide of the invention, preferably in food.
- the peptide, antibody or cell of the invention are labeled or immobilized in the kits of the invention.
- these are labeled with a label selected from the list comprising: a radioisotope, a fluorescent or luminescent label, an antibody, an antibody fragment, an affinity tag, an enzyme or an enzyme substrate.
- the peptide, the antibody or the cell of the invention is immobilized in the kits of the invention.
- immobilized refers to the fact that the peptide, the antibody or the cell of the invention can be attached to a support without losing its activity.
- the support may be the surface of a matrix, (by for example, a nylon matrix), a microtiter plate (for example, 96 wells) or similar plastic support, or beads (spheres, for example, agarose spheres or small superparamagnetic microspheres composed of biodegradable matrices).
- a matrix by for example, a nylon matrix
- a microtiter plate for example, 96 wells
- beads spheres, for example, agarose spheres or small superparamagnetic microspheres composed of biodegradable matrices.
- Another aspect of the invention relates to the use of the second kit of the invention for the detection and / or quantification of the peptide of the invention.
- the detection and / or quantification of the peptide is carried out in food.
- Another aspect of the invention relates to the use of the first or second kit of the invention for the diagnosis and / or in vitro monitoring of celiac disease in an individual.
- the word "comprises” and its variants are not intended to exclude other technical characteristics, additives, components or steps.
- other objects, advantages and features of the invention will be derived partly from the description and partly from the practice of the invention.
- the following examples and drawings are provided by way of illustration, and are not intended to be limiting of the present invention.
- FIGURES Fig. 1 Shows the identification of three gliadin peptides by independent zymograms with gliadin of two untreated celiac patients.
- Fig. 2. Shows the histograms representative of the flow cytometry performed on dendritic cells derived from monocytes obtained from ABO compatible peripheral blood samples from healthy donors, stimulated for 48 hours with lipopolysaccharide (LPS, 1 mg / ml), or with gluten peptides 8-mer (SEQ ID NO: 2, 100 Mg / ml), 19-mer (SEQ ID NO: 4, 100 Mg / ml) and 33- mer (SEQ ID NO: 5, 100 Mg / ml), and after the basic conditions (internal control). Shaded histograms represent the expression of co-stimulatory (CD40, CD80, CD86) or activation (CD83) markers in dendritic cells. Empty histograms represent isotype controls. This experiment is representative of three independent experiments, each of which is performed in triplicate, (b) The average fluorescence index (MFI) of a simple triplicate experiment is shown, representative of three independent experiments with similar results.
- LPS lip
- Fig. 3 Shows the expression of RNA, in arbitrary units (AU) of IFNy, IL-4, IL-12p40, TNFa, IL-10, IL-23p19, IL-6, TGF and IL-17 in derived dendritic cells of monocytes obtained from peripheral blood samples, compatible with ABO, from healthy donors, stimulated for 48 hours with lipopolysaccharide (LPS, 1 mg / ml), or with 8-mer gluten peptides (SEQ ID NO: 2, 100 Mg / ml), 19-mer (SEQ ID NO: 4, 100 Mg / ml) and 33-mer (SEQ ID NO: 5, 100 Mg / ml), and after the basic conditions (internal control). The mean and standard deviation of three independent experiments are shown.
- LPS lipopolysaccharide
- SEQ ID NO: 2 8-mer gluten peptides
- SEQ ID NO: 4 100 Mg / ml
- SEQ ID NO: 5 100 M
- Fig. 4 Shows the proliferation index of peripheral blood mononuclear cells, enriched in T cells, after being cultured with dendritic cells from control patients (C) or untreated celiac patients (uCD), previously stimulated with gluten peptides.
- 8-mer SEQ ID NO: 2, 100 Mg / ml, 10 Mg / ml and 1 M9 / ml
- 19-mer SEQ ID NO: 4, 100 Mg / ml
- 33-mer SEQ ID NO: 5, 100 Mg / ml
- Fig. 5 Shows the levels of deaminated anti-peptide 8-mer (a) anti-peptide ⁇ -mer peptide (SEQ ID NO: 6) and (b) native / unmodified anti-peptide 8-mer (SEQ ID) NO: 7), both labeled with biotin, in serum samples from celiac patients and no-celiac controls.
- Fig. 6 Shows the levels of deaminated anti-8-mer IgA antibody in serum samples of active celiac patients (CD), gluten-free diet celiac patients (EC DSG), non-celiac controls, healthy relatives of HLA-DQ2 + celiac patients, healthy relatives HLA-DQ2-, and patients with Inflammatory Bowel Disease (ulcerative or Crohn's colitis).
- Asterisks indicate statistically significant values: ( * ) p ⁇ 0.05; ( ** ) p ⁇ 0.005; ( *** ) p ⁇ 0.0005.
- Fig. 7 Shows the levels of deaminated anti-8-mer IgA antibody in serum samples of patients with Inflammatory Bowel Disease (EN) according to the expression of HLA-DQ2 (HLA-DQ2 +, HLA-DQ2-, and HLA-DQ2- but positive for one of its chains, DQA or DQB).
- EN Inflammatory Bowel Disease
- EXAMPLE 1 Identification of the 8-mer immunogenic peptide in cereals toxic to celiac individuals.
- the immunogenic activity of the 8-mer peptide of gliadin was isolated and determined, and how the sequence of the 8-mer peptide can be found in gluten proteins of immunotoxic cereals.
- ion trap trap mass spectrometry analysis of trypsinized samples from the 26 kDa and 82 kDa degradation bands extracted from the zymogram performed with biopsied samples from untreated celiac patients was analyzed (Fig. 1).
- Three peptides were identified by this method, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9, whose sequence was launched against a non-redundant protein database and, using the NCBI Blastp tool, was found that these three peptides were present in wheat species (wild and cultivated), barley or rye, and within these species, only in families of prolamines (such as gliadins, hordeins and secaline) and glutenins.
- prolamines such as gliadins, hordeins and secaline
- EXAMPLE 2 In vitro diagnostic method of celiac disease by detecting anti-8-mer antibodies in serum.
- the present example illustrates the development of a form of ELISA method that detects the presence of anti-8-mer antibodies in individuals suspected of suffering from celiac disease.
- an indirect ELISA method was developed with the objective of detecting antibodies against the 8-mer peptide of gliadin in serum samples.
- biotinylated antigen / peptide Four variants of the biotinylated antigen / peptide were used (Biomedal SL., Sevilla, Spain), native form FK-9-1 (SEQ ID NO: 7-BIOTINE, SEQ ID NO: 7 corresponds to SEQ ID NO: 2 with a plant at its C-terminal end) and deaminated form FK (BIO) -9-2 (SEQ ID NO: 6-BIOTINE, SEQ ID NO: 6 corresponds to SEQ ID NO: 3 with a lysine at its C-terminal end) due to its possible modification by tTG, with biotinylation at the end N-terminal or C-terminal.
- native form FK-9-1 SEQ ID NO: 7-BIOTINE, SEQ ID NO: 7 corresponds to SEQ ID NO: 2 with a plant at its C-terminal end
- deaminated form FK (BIO) -9-2 SEQ ID NO: 6-BIOTINE, SEQ ID NO: 6 correspond
- the serum of the celiac patients contained antibodies against the 8-mer peptide of gliadin.
- the 4 variants of the peptide used in the standardization of the ELISA technique only optimal results were obtained with the 2 biotinylated peptides at the carboxyl end.
- EXAMPLE 3 In vitro diagnostic method of celiac disease, not detected by other methods, in individuals with inflammatory bowel disease by detecting serum anti-8-mer antibodies.
- This example shows how individuals with inflammatory bowel disease (Eli), who had not previously been diagnosed as celiac by conventional serological tests (tissue anti-transglutaminase antibodies) or by intestinal endoscopy, can be identified as celiac individuals when anti-8 antibodies appear. mer of deaminated gliadin in serum.
- Fig. 7 shows the levels of deaminated anti-8-mer antibodies in Ell patients according to the expression of HLA-DQ2.
- EXAMPLE 4 Immunogenic activity of the 8-mer peptide in the cellular immune system.
- the present example shows how the 8-mer peptide can be used for the diagnosis of celiac disease, by means of stimulation tests in autologous culture of dendritic cells and T lymphocytes belonging to HLA-DQ2 + celiac patients and HLA-DQ2-non-celiac controls.
- Monocyte derived dendritic cells act as antigen presenting cells.
- the stimulation experiments performed in the present invention included a positive proliferation control (T lymphocytes cultured in the presence of dendritic cells derived from previously activated monocytes in the presence of lipolysaccharide, LPS) and two negative controls: CD14 fraction-enriched in cultured T lymphocytes. ) in basal medium and ii) in the presence of dendritic cells derived from unstimulated monocytes.
- ABO-compatible peripheral blood mononucleated cells were isolated by density gradient centrifugation, and magnetic microspheres with anti-CD14 antibodies to separate CD14 + monocytes, which were induced for 6 days to differentiate to immature dendritic cells by IL- 4 and GM-CSF (confirmed by cytometry).
- the cell proliferation index was calculated according to the absorbance ratio of the stimulated dendritic cells / absorbance without stimulation in co-culture with autologous T lymphocytes.
- Culture stimulation of dendritic cells from healthy control samples with the 8-mer peptide induced phenotypic maturation of these cells, which was manifested by an increase in membrane expression of the CD40 and CD80 markers, but not of CD83 or CD86
- peptides 19- and 33-mer did not modify the expression of these molecules (Fig. 2a, 2b).
- Stimulation with gliadin peptides was associated with the expression of a differential profile of cytokine mRNA (Fig.
- Stimulation with 8-mer could follow a differential activation pathway through a Th17 cytokine profile, as indicated by the increase in IL-23p19 (8-mer: x45.3 times; 19-mer: x2.7 times; 33 -mer: x6.2 times), and other related cytokines such as IL-6 (8-mer: x3.6 times; 19-mer: x1, 2 times; 33-mer: x0.7 times), and TGFp ( 8-mer: x4.8 times; 19-mer: x1, 9 times; 33-mer: x0.6 times).
- the co-cultured dendritic cells After stimulation with the 8-mer peptide, the co-cultured dendritic cells induced a proliferative response of autologous T lymphocytes in a dose-dependent manner, both with cells from HLA-DQ2 + celiac patients, and from HLA-DQ2- control individuals.
- non-celiac patients 100 ⁇ g / ml: proliferation rate 2.09 ⁇ 0.029 in celiac patients, and 1.51 ⁇ 0.108 in non-celiac patients; 10 ⁇ g / ml: proliferation rate 1, 69 ⁇ 0.005 in celiac patients, and 1,28 ⁇ 0,034 in non-celiac patients; 1 ⁇ g / ml: proliferation index 1, 27 ⁇ 0,005 in celiac patients, and 1, 04 ⁇ 0,039 in non-celiac patients (Fig. 4).
- EXAMPLE 5 Development of a monoclonal antibody to detect the 8-mer peptide.
- the present example shows a strategy to obtain monoclonal antibodies that recognize the gliadin 8-mer peptide and that can be used to, for example, determine the presence of gluten in foods.
- a 6-copy coding sequence of the tandem 8-mer peptide was fused in an expression vector CASCADE, pALEXI a (Biomedal SL, Seville, Spain), at the 5 'end to a polyhistidine tag (6Xhistag) and at the end 3 'to the DNA encoding an adjuvant protein such as an HSP70 heat shock protein fragment from Trypanosoma cruzi.
- an adjuvant protein such as an HSP70 heat shock protein fragment from Trypanosoma cruzi.
- E. coli REG12 Biomedal S.L.
- the expression of the fusion protein was induced with salicylate and subsequently it was purified by affinity ion chromatography (IMAC) until a degree of purity greater than 95% was obtained.
- Two monoclonal antibodies against the gliadin 8-mer peptide were generated according to the standard method, with some specific modifications.
- two groups of Balb / c mice obtained from IFFA-CREDO (St Germain-sur l'Arbesle, France), were immunized subcutaneously twice with a dose of 0.025 mg of 8-mer-T-HSP70 or recombinant purified protein of 8mer-X2-HSP70 as immunogen.
- Two weeks after the last immunization, a third dose of the fusion protein was inoculated intravenously in the mice of each group. All vaccines were carried out without adjuvant.
- Antibody titers were evaluated by an ELISA against the biotinylated 8-mer peptides described in Example 2, with the use of streptavidin-upholstered plates on day 4 after the last immunization. Immunized mice were sacrificed, and the spleens were removed for use as a source of cells for fusion with SP2 myeloma cells. Only the spleen cells of immunized mice are fused with myeloma cells previously prepared and cultured in RPMI medium supplemented with fetal bovine serum and 20% aminopterin-thymidine containing hypoxanthine, because the hypoxanthine-aminopterin-thymidine medium only allows the fused cells survive in the culture. The fused cells were distributed in 96-well plates with medium supplemented with aminopterin and containing the fed cells derived from mouse peritoneal saline washes.
- Antibodies produced by the selected hybridomas were analyzed for their ability to react with epitopes of wheat, barley and rye gluten, on the one hand, and corn and rice on the other by ELISA in which the gluten of each species covered the wells .
- Hybridomas that produced antibodies that gave reactivity more sensitively with wheat, barley and rye gluten were selected, and none were found with rice or corn.
- direct, blocking or competitive ELISAs can be developed to detect the peptide of the invention, for example, in food samples.
- the direct ELISA assay can be performed by extracting the gluten peptides from the food sample, immobilizing them on the plates and then using one of the antibodies developed in the present invention to react with the 8-mer peptides of the immobilized sample.
- the development can be carried out, for example, by prior conjugation of the antibody to a peroxidase-like enzyme, whose activity can be studied by measuring the amount of colored compound that accumulates after adding the corresponding chromogenic reagent.
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Abstract
La presente invención proporciona un péptido inmunogénico de ocho aminoácidos que se genera de forma natural en el intestino de los pacientes celiacos por la hidrólisis del gluten ingerido. Por tanto, la invención se refiere al uso de dicho péptido, o de anticuerpos generados frente al mismo, para el diagnóstico y/o seguimiento in vitro de la enfermedad celiaca, así como al uso de tales anticuerpos para la detección de gluten en alimentos. Son también objeto de la presente invención el uso del péptido mencionado como diana terapéutica para el desarrollo de compuestos o composiciones útiles para el diagnóstico, tratamiento y/o prevención de esta condición patológica, así como el uso de este péptido y de los anticuerpos frente al mismo para la prevención y/o tratamiento de la enfermedad celiaca.
Description
Péptido inmunogénico del gluten y sus aplicaciones
La presente invención se encuadra en el campo de la salud y de la alimentación, específicamente dentro de los péptidos inmunogénicos del gluten útiles para el diagnóstico, seguimiento y/o tratamiento terapéutico de la enfermedad celiaca en individuos, así como para la detección de gluten en alimentos.
ESTADO DE LA TÉCNICA ANTERIOR
La enfermedad celiaca es una enteropatía inducida por gliadina (prolamina del trigo) y otras prolaminas de cereales relacionados como secalina (centeno), hordeína (cebada) y algunos tipos de aveninas (avena) en individuos predispuestos genéticamente (HLA-DQ2/DQ8).
Actualmente, la inmunopatogénesis de la enfermedad celiaca se explica mediante un modelo que contempla dos señales diferentes. Por un lado, algunos péptidos de la gliadina que se generarían durante la digestión gastrointestinal, como el 19-mer, juegan un papel fundamental en el desarrollo de la enfermedad celiaca al desencadenar una respuesta inmunológica innata (Jabri B. and Sollid LD., 2006, Nat Clin Pract Gastroenterol Hepatol.; 3(9):516-525) a través de mecanismos independientes de DQ2 que dan lugar a la producción de IL-15 en células epiteliales. El resultado es la interrupción de la barrera epitelial y la inducción de la apoptosis en los enterocitos. Por otro lado, otros péptidos inmunodominantes, como el 33-mer (Shan L., et al., 2002, Science; 297(5590):2275-2279), transforman en glutamato algunos de sus residuos de glutamina (desaminación) por la acción de la transglutaminasa tisular (tTG) y pueden llegar a la lámina propia donde son presentados por células dendríticas a ciertos linfocitos T específicos restringidos a moléculas HLA-DQ2/DQ8. La inflamación que se produce a continuación se ajusta a un perfil de citoquinas tipo I, mediada por IFNy, y la lesión se
caracteriza por una infiltración masiva de linfocitos intraepiteliales, hiperplasia críptica y atrofia de las vellosidades.
Hoy en día, el único tratamiento para la enfermedad celiaca consiste en mantener de por vida una dieta libre de gluten, la cual suele conducir a la completa remisión de la enfermedad. Dicho tratamiento es bien tolerado por los pacientes celiacos y supone una clara mejora en su salud y calidad de vida. Sin embargo, mantener de manera rigurosa una dieta exenta de gluten resulta muy difícil debido, por ejemplo, a la presencia de trazas contaminantes en los alimentos sin gluten, su alto precio o la presión social a la que se ven sometidos estos pacientes, sobre todo los más jóvenes, para consumir gluten y que está ocasionada por las costumbres alimenticias imperantes en Occidente. Por todas estas razones, durante los últimos años se han investigado terapias alternativas a la dieta libre de gluten que tratan de combatir la enfermedad por distintas vías: disminuyendo la exposición al gluten (por ejemplo, mediante la degradación enzimática de las fracciones tóxicas de los cereales), inhibiendo la permeabilidad intestinal o modulando la respuesta inmunitaria (por ejemplo, mediante el desarrollo de vacunas basadas en péptidos del gluten, o la inhibición de la tTG).
La anulación de la actividad tóxica e inmunogénica del gluten mediante degradación enzimática presenta muchos atractivos como terapia oral alternativa. En este sentido, se ha probado la actividad detoxificadora de distintas enzimas como la prolil endopeptidasa o una endoproteasa específica de glutamina. Otra fuente enzimática para la hidrólisis del gluten son las bacterias probióticas. No obstante, es indudable que el éxito de este tipo de terapias está vinculado a una mejor y más completa caracterización de los péptidos que componen la fracción tóxica del gluten.
Otro aspecto de la enfermedad celíaca que está en desarrollo es el del diagnóstico. Actualmente, la única prueba admitida por la comunidad médica para diagnosticar definitivamente a un enfermo celiaco es el análisis histopatológico de biopsias de intestino delgado, las cuales deben mostrar las típicas anomalías morfológicas. No obstante, se han desarrollado diversas pruebas serológicas que, al ser menos agresivas que la biopsia, están indicadas como paso previo en el diagnóstico de la enfermedad. La prueba serológica más sensible y específica es la detección de autoanticuerpos tipo IgA contra el endomisio (EMA) o contra la tTG. El desarrollo de pruebas para detectar la presencia de anticuerpos contra péptidos tóxicos del gluten desaminados se ha demostrado también como herramienta muy útil en el diagnóstico de la enfermedad (Tack GJ., et al., 2010, Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology; 7:204-213).
Para avanzar en el desarrollo de un mejor diagnóstico y tratamiento de la enfermedad celiaca es fundamental el estudio de su patogénesis, en la cual interaccionan de manera muy compleja factores de carácter ambiental, genético e inmunológico. Los determinantes ambientales fundamentales para el desarrollo de la enfermedad son de tipo alimenticio: el gluten del trigo y otras proteínas relacionadas inducen respuestas inmunitarias de tipo innato y adaptativo que provocan el daño en la mucosa del intestino delgado. El gluten comprende un conjunto de más de 100 proteínas de reserva que se encuentran en la semilla del trigo. Según su nivel de solubilidad, el gluten se divide en gliadinas y gluteninas, ambas implicadas en la enfermedad celiaca. Existen homólogos de estas proteínas en la cebada, el centeno y algunas variedades de avena, lo que explica que dichos cereales puedan también provocar la enfermedad. Se ha propuesto que hay péptidos procedentes del gluten, y proteínas relacionadas de la cebada, el centeno y la avena, que no son completamente digeridos por las enzimas gastrointestinales y pancreáticas, lo que provoca que, bajo ciertas condiciones, puedan
penetrar en la lámina propia del intestino delgado. Además, se ha especulado que ciertos factores estresantes, como infecciones de tipo vírico, pueden afectar a la permeabilidad intestinal favoreciendo la aparición de la enfermedad celiaca.
Los péptidos del gluten resistentes a la digestión son ricos en prolina y glutamina, puesto que la mayoría de las proteasas no cortan en residuos adyacentes a la prolina, y la glutamina no es un residuo preferente para ninguna de las endoproteasas del intestino. Por tanto, los péptidos con longitud suficiente como para desencadenar una respuesta inmunitaria son capaces de evadir la digestión gastrointestinal y llegar intactos al epitelio. Tal es el caso del péptido 33-mer de la α-gliadina de trigo, que es resistente a proteasas y que se ha considerado como el iniciador primario de la respuesta inflamatoria al gluten en los enfermos celiacos. Así, se ha demostrado mediante ensayos in vitro que el péptido 33-mer es el péptido del gluten más bioactivo (inmunodominante) que es reconocido por células T procedentes de donantes celiacos HLA-DQ2+, aunque no es el único péptido que muestra tal actividad. La identificación de los péptidos del gluten desencadenantes de respuesta en las células T intestinales es crucial, entre otras cosas, para la búsqueda de terapias alternativas a la dieta exenta de gluten. La bibliografía recoge algunos péptidos del gluten con actividad inmunotóxica demostrada (Tye-Din J., et al. , 2010, Science Translational Medicine; 2(41 ): 1 -14; Camarca A., et al., 2009, The Journal of Immunology; 189:4158-4166; Vader, et al., 2002, Gastroenterology; 122: 1729-1737), la mayoría de los cuales pertenecen a las familias α o γ-gliadinas, seguido por las gluteninas y con menor frecuencia a la ω-gliadina. Los péptidos tóxicos del gluten son de aplicación en métodos de diagnóstico y/o tratamiento de los individuos celiacos (WO03066079, EP0905518, US5817523, W09727217, US20080318852, US20090156490 y US20060240475).
Otra aplicación derivada de la identificación de un péptido del gluten con actividad inmunotóxica consiste en la medición de la fracción tóxica del gluten en alimentos. Las técnicas más implantadas para el control del gluten en los alimentos son los ensayos ELISA, la técnica de PCR, Western Blot, espectrometría de masas, cromatografía y tiras inmunocromatográficas. Entre ellas, son las técnicas enzimáticas inmunoabsorbentes (ELISA), basadas en anticuerpos monoclonales frente a epitopos específicos, las que reúnen las características más deseables de sencillez, sensibilidad y economía. Más novedosas, y aún en desarrollo, son las técnicas que utilizan biosensores o tecnología de lab- on-a-chip.
Para la detección de gluten mediante ELISA se han desarrollado distintos anticuerpos que reconocen diferentes epitopos del gluten. Se ha descrito que no solamente los péptidos de las gliadinas son tóxicos para los celiacos, sino que también lo son los de las gluteninas, razón por la cual es deseable que un método para detectar toxicidad por gluten en alimentos sea capaz de medir péptidos presentes en ambos tipos de proteínas. Los anticuerpos monoclonales R5 (Sorell L., et al., 1998, FEBS Lett; 439:46-50), G12 (Morón B., et al., 2008, PLoS ONE; 3:405-414), 401 .21 (Skerritt J., et al., 1990, J. Agrie. Food Chem.; 38: 1771 -1778) y PN3 (Bermudo Redondo, et al., 2005, Analytica Chimica Acta; 551 : 105- 1 14) son específicos frente a distintas fracciones del gluten y, por tanto, se aplican a la detección del mismo en alimentos. Asimismo, en los documentos de patente WO2006004394, WO2006051 145, ES2142720, GB2207921 y AU61 1921 se proponen procedimientos basados en ELISA para la detección de gluten en alimentos.
Finalmente, en cuanto a la metodología empleada para identificar los péptidos del gluten causantes de la inmunotoxicidad, éstos a menudo incluyen un paso de digestión in vitro con proteasas de una solución de gluten. Otras veces se han empleado algoritmos para predecir patrones
de deamidación del gluten por la tTG, o para generar los posibles epitopos reconocibles por las células T intestinales a partir de secuencias conocidas de prolaminas o gluteninas. Sin embargo, y pese a la idea existente de que los enfermos celiacos digieren el gluten de manera diferenciada a los individuos sanos, hasta ahora no se han destinado esfuerzos a la caracterización de los péptidos generados específicamente en el intestino de los pacientes celiacos como resultado de sus actividades proteolíticas, siendo éstos de especial interés para el diagnóstico y/o tratamiento de la enfermedad celiaca en individuos, debido a que su aplicación en este sentido supondría una clara mejora, en términos de especificidad y eficacia, con respecto a los métodos existentes en la actualidad que se basan en otros péptidos inmunogénicos. DESCRIPCIÓN DE LA INVENCIÓN
La presente invención proporciona un péptido aislado de ocho aminoácidos, de ahora en adelante "péptido de la invención" o "péptido 8- mer", que se genera de forma natural en el intestino de los pacientes celiacos por la acción de las proteasas bacterianas presentes en su flora intestinal que degradan la gliadina del gluten. Los inventores demuestran que este péptido presenta capacidad inmunogénica, siendo capaz de estimular células del sistema inmune en cultivo procedentes tanto de pacientes celiacos como de individuos no celiacos. Por ello, y debido a que el péptido de la invención se genera in vivo en el intestino de los enfermos celiacos y no así en el intestino de individuos sanos o que presentan otro tipo de patologías, dicho péptido es un marcador altamente específico para el diagnóstico y/o seguimiento de esta enfermedad, así como una interesante diana terapéutica para el desarrollo de compuestos o composiciones útiles para el diagnóstico, tratamiento y/o prevención de esta condición patológica. Además, gracias a su capacidad inmunogénica, el péptido de la invención también es de utilidad como agente terapéutico,
preferiblemente profiláctico, complementario o alternativo a la dieta sin gluten, en individuos que sufren esta enfermedad.
Por otro lado, los anticuerpos frente a este péptido de la invención son de utilidad para la detección y/o cuantificación de este último preferiblemente en alimentos, lo que permite conocer la toxicidad por gluten en los mismos.
Por todo ello, un primer aspecto de la invención se refiere a un péptido aislado de secuencia SEQ ID NO: 1 , "péptido de la invención" o "péptido 8-mer". Como se ha mencionado, este péptido presenta actividad inmunogénica y es producto de la proteólisis que específicamente sufre la gliadina del gluten en el intestino de los pacientes celiacos aunque, como muestran los ejemplos de la presente invención, dicho péptido forma parte no solo de las secuencias de las gliadinas sino también de las secuencias de otras proteínas pertenecientes a otras especies de cereales tóxicos para celiacos, como las gluteninas, secalinas y hordeínas.
Este péptido de la invención puede presentar variantes, las cuales se refieren a variaciones limitadas en su secuencia aminoacídica que permiten el mantenimiento de la funcionalidad del péptido. Esto quiere decir que la secuencia de referencia, SEQ ID NO: 1 , y la secuencia de la variante son similares en conjunto, e idénticas en muchas regiones. Estas variaciones se generan por sustituciones, deleciones o adiciones. Dichas sustituciones son por aminoácidos conservados. Los aminoácidos conservados son aminoácidos que tienen cadenas laterales y propiedades similares en cuanto a, por ejemplo, hidrofobicidad o aromaticidad. Estas sustituciones incluyen, aunque sin limitarse, sustituciones entre ácido glutámico (Glu) y ácido aspártico (Asp), entre lisina (Lys) y arginina (Arg), entre asparagina (Asn) y glutamina (Gln), entre serina (Ser) y treonina (Thr), y/o entre los aminoácidos que componen el grupo alanina (Ala), leucina (Leu), valina (Val) e isoleucina
(lie). Las variaciones pueden ser variaciones generadas artificialmente como, por ejemplo, mediante mutagénesis o síntesis directa. Estas variaciones no provocan modificaciones esenciales en las características o propiedades esenciales del péptido. Por ello, dentro del alcance de la presente invención también se incluyen los péptidos o polipéptidos cuya secuencia de aminoácidos sea idéntica u homologa a las secuencias descritas en la presente invención.
El péptido de la invención puede presentar modificaciones derivadas de su procesamiento enzimático. Así, debido a que los péptidos inmunogénicos del gluten pueden sufrir en el intestino de los individuos celiacos una desaminación (sustitución de glutamina por glutamato) por acción de la transglutaminasa tisular (tTG), las posiciones 4, 6 y/o 7 de la SEQ ID NO: 1 , que en la forma nativa del péptido son glutaminas (Gln), pueden estar sustituidas por glutamato (Glu). Por ello, en una realización preferida la secuencia del péptido de la invención es SEQ ID NO: 2, péptido (nativo) que ha sido aislado en los ejemplos de la presente invención a partir de proteínas de varias especies de cereales tóxicos para celiacos, como por ejemplo, pero sin limitarnos, cebada, centeno y trigo. La SEQ ID NO: 2 corresponde a la SEQ ID NO: 1 donde las posiciones 4, 6 y 7 son Gln. En otra realización preferida el péptido de la invención se encuentra desaminado, más preferiblemente como resultado de su procesamiento por la tTG, aun más preferiblemente, la secuencia del péptido de la invención es SEQ ID NO: 3, secuencia que corresponde a la SEQ ID NO: 1 donde las posiciones 4 y 7 son Gln y la posición 6 es Glu.
El péptido de la presente invención y sus variantes o derivados pueden ser sintetizados, por ejemplo, aunque sin limitarnos, mediante síntesis química, técnicas de ADN recombinante, aislamiento de fuentes naturales o por proteólisis in vitro. El péptido de la invención puede producirse recombinantemente, no sólo directamente sino como un polipéptido de
fusión junto con un polipéptido heterologo, el cual puede contener, por ejemplo aunque sin limitarnos, una secuencia señal, u otro polipéptido que tenga un sitio de corte para una proteasa, por ejemplo, aunque sin limitarnos, en el extremo N-terminal de la proteína madura o del polipéptido.
El diagnóstico in vitro de la enfermedad celiaca en un individuo puede llevarse a cabo empleando el péptido de la invención mediante diversos métodos. Uno de estos métodos podría ser, aunque sin limitarnos, la detección de la actividad proteolítica intestinal que da lugar a la liberación de dicho péptido a partir de gliadina, o de otras proteínas relacionadas como las secalinas, hordeínas o gluteninas, lo cual podría realizarse, por ejemplo, utilizando el péptido de la invención modificado con al menos un sustrato cromogénico, fluorigénico o luminiscente de manera que, al ponerlo en contacto con una muestra biológica aislada de intestino, se genera color únicamente en el caso de los enfermos celiacos debido a la presencia de enzimas específicos asociados a su flora intestinal capaces de llevar a cabo la liberación del péptido por hidrólisis proteolítica. Por ello, en una realización más preferida, el péptido de la invención además presenta un compuesto químico unido a su extremo N- y/o C-terminal. Preferiblemente, este compuesto químico es biotina, molécula con afinidad por la estreptavidina. Dicho compuesto químico se puede añadir, por ejemplo, sintéticamente al péptido de la invención mediante técnicas conocidas en el estado de la técnica. En otra realización preferida, el compuesto químico es un compuesto cromogénico, fluorigénico o luminiscente. Un "compuesto cromogénico" es aquel que produce color o pigmento. En la presente invención el compuesto cromogénico es, preferiblemente, la p-nitroanilida. Un "compuesto fluorigénico" es aquel que emite fluorescencia cuando es excitado a una determinada longitud de onda, como por ejemplo, aunque sin limitarnos, derivados 4- metilumbeliferilos u o- ó p-halometil fenoles. Un "compuesto luminiscente" es aquel que emite fotones en lugar de dar color visible, por tanto, es un
compuesto que emite luz regresando desde un estado electrónicamente excitado a su estado original. Dentro de este último término se incluye la bioluminiscencia, fotoluminiscencia y quimioluminiscencia. Un ejemplo de compuesto luminiscente es, aunque sin limitarnos, la luciferina-luciferasa.
En una realización aun más preferida, el péptido de la invención además presenta otro péptido unido a su extremo N- y/o C-terminal. La unión de un péptido a otro puede llevarse a cabo mediante técnicas conocidas de obtención de proteínas de fusión.
Otro aspecto de la invención se refiere a una secuencia nucleotídica aislada que codifica para el péptido de la invención, de ahora en adelante "secuencia nucleotídica de la invención". Debido a la degeneración del código genético, en el cual diversos tripletes de nucleótidos dan lugar a un mismo aminoácido, existen diversas secuencias de nucleótidos que dan lugar a una misma secuencia aminoacídica.
Los términos "secuencia nucleotídica", "secuencia de nucleótidos", "ácido nucleico", "oligonucleótido" y "polinucleótido" se usan aquí de manera intercambiable y se refieren a una forma polimérica de nucleótidos de cualquier longitud que pueden estar o no química o bioquímicamente modificados. Se refieren, por tanto, a cualquier polirribonucleótido o polidesoxirribonucleótido, tanto de cadena sencilla como de doble hebra. La secuencia nucleotídica de la invención puede obtenerse de manera artificial mediante métodos de clonación y selección convencionales, o bien mediante secuenciación. Dicha secuencia nucleotídica, adicionalmente a la secuencia codificante, puede llevar otros elementos, como por ejemplo aunque sin limitarnos, intrones, secuencias no codificantes en los extremos 5' y/o 3', sitios de unión a ribosomas, o secuencias estabilizadoras. Estos polinucleótidos adicionalmente pueden incluir secuencias codificantes para aminoácidos adicionales que puedan ser útiles, por ejemplo, aunque sin limitarse, para aumentar la estabilidad
del péptido generado a partir de ellos o para permitir una mejor purificación del mismo.
El péptido de la invención presenta capacidad antigénica y por tanto puede utilizarse para desarrollar anticuerpos mono o policlonales que se unan específicamente a él, lo cual puede llevarse a cabo mediante diversos métodos conocidos en el estado de la técnica. Por tanto, otro aspecto de la invención se refiere a un anticuerpo frente al péptido de la invención, de ahora en adelante "anticuerpo de la invención".
Uno de los métodos que podría llevarse a cabo para obtener el anticuerpo de la invención consiste, por ejemplo, aunque sin limitarnos, en la inmunización de animales con el péptido de la invención y la posterior purificación, por ejemplo a partir del suero, de los anticuerpos específicos generados frente al mismo.
El término "anticuerpo" se refiere a moléculas de inmunoglobulinas o a porciones inmunológicamente activas de moléculas de inmunoglobulinas, es decir, a moléculas que contienen un sitio de fijación de antígeno que se une específicamente (inmunorreacciona) con el péptido de la invención. Ejemplos de porciones de moléculas de inmunoglobulinas inmunológicamente activas incluyen fragmentos F(ab) y F(ab')2, los cuales pueden ser generados, por ejemplo, aunque sin limitarnos, tratando el anticuerpo con una enzima tal como la pepsina o mediante técnicas de ingeniería genética conocidas en el estado de la técnica.
El anticuerpo de la invención puede ser policlonal (incluye típicamente anticuerpos distintos dirigidos contra determinantes o epítopos distintos) o monoclonal (dirigido contra un único determinante en el antígeno). La expresión "anticuerpo monoclonal" alude a una población de moléculas de anticuerpos que contienen solamente una especie de un sitio de fijación de antígeno capaz de inmunorreaccionar con un epítopo particular del
antígeno. El anticuerpo monoclonal puede ser alterado bioquímicamente, mediante manipulación genética, o puede ser sintético, careciendo, posiblemente, el anticuerpo en su totalidad o en partes, de porciones que no son necesarias para el reconocimiento del péptido de la invención, y estando sustituidas por otras que comunican al anticuerpo propiedades ventajosas adicionales.
El anticuerpo de la invención presenta especificidad frente al péptido de la invención, por lo que es de utilidad en varias aplicaciones, a saber: para la detección y/o cuantificación del péptido de la invención, preferiblemente en alimentos formando parte de la proteína de la que procede, de manera que sea posible detectar toxicidad por gluten en los mismos; para la detección y/o cuantificación del péptido de la invención en una muestra biológica aislada de un individuo, con el objetivo de realizar el diagnóstico y/o seguimiento in vitro de la enfermedad celiaca; o bien para bloquear el péptido de la invención, inhibiendo parcial o totalmente su actividad inmunogénica, en un método de tratamiento de dicha enfermedad.
Para llevar a cabo esta última aplicación en individuos humanos interesa que el anticuerpo de la invención sea un anticuerpo humanizado, ya que de este modo no se genera una respuesta anafiláctica por parte del sistema inmunitario cuando se administra el anticuerpo humanizado de la invención a un humano. Usando la tecnología del ADN recombinante es posible construir un anticuerpo monoclonal humanizado uniendo una región variable o de reconocimiento antigénico del anticuerpo de la invención a un armazón de un anticuerpo humano. En la mayoría de los casos, los anticuerpos humanizados son inmunoglobulinas humanas (anticuerpos receptores) en las que los residuos de las regiones hipervariables del receptor se han sustituido por residuos de una región hipervariable de una especie no humana (anticuerpo donante) que tenga la especificidad, afinidad y capacidad deseadas.
El término "región hipervariable" se refiere a los residuos de aminoácidos de un anticuerpo que son responsables de la unión al antígeno. La región hipervariable comprende residuos de aminoácidos de una "región determinante de complementariedad" o "CDR" y/o aquellos residuos de un "bucle hipervariable". Los residuos de sostén (en inglés "framework") o "FR" son aquellos residuos del dominio variable diferentes de los residuos de la región hipervariable. En algunos casos, los residuos de sostén (FR) de la inmunoglobulina humana se sustituyen por los correspondientes residuos no humanos. Además, los anticuerpos humanizados pueden comprender residuos que no se encuentran en el anticuerpo receptor o en el anticuerpo donante. Estas modificaciones se realizan para refinar más la función del anticuerpo. En general, el anticuerpo humanizado comprenderá sustancialmente todo de por lo menos uno, y generalmente dos, dominios variables, en los que todos o prácticamente todos los bucles hipervariables corresponden a los de una inmunoglobulina no humana y todas o sustancialmente todas las regiones FR son las de una secuencia de inmunoglobulina humana. El anticuerpo humanizado también comprenderá, opcionalmente, por lo menos una parte de una región constante de la inmunoglobulina (Fe), en general de una inmunoglobulina humana. Distintos procedimientos para la obtención de anticuerpos humanizados son conocidos en el estado de la técnica.
Por tanto, en una realización preferida, el anticuerpo de la invención es un anticuerpo monoclonal, más preferiblemente humanizado, y puede ser recombinante, quimérico, sintético o una combinación de cualquiera de los anteriores.
Un "anticuerpo o polipéptido recombinante" (rAC) es un anticuerpo que ha sido producido en una célula hospedadora transformada o transfectada con el ácido nucleico codificante para el anticuerpo de la invención o para el péptido de la invención, o que produce el anticuerpo de la invención o el péptido de la invención como resultado de la recombinación homologa.
Dicha célula hospedadora incluye una célula en un cultivo celular "in vitro" así como una célula en un animal hospedador.
El anticuerpo de la invención puede ser quimérico. Así, una región de la cadena pesada y/o ligera es idéntica u homologa a las secuencias correspondientes en anticuerpos procedentes de una especie determinada o pertenecientes a una clase o subclase de anticuerpos determinados, mientras que la(s) cadena(s) restante(s) es(son) idéntica(s), u homóloga(s), a las secuencias correspondientes en anticuerpos derivados de otras especies o pertenecientes a otra clase o subclase de anticuerpos, así como a fragmentos de dichos anticuerpos, de manera que exhiban la actividad biológica deseada.
Otro aspecto de la invención se refiere a una célula que expresa el anticuerpo de la invención, de ahora en adelante "célula de la invención". La célula de la invención es, preferiblemente, un linfocito B o un hibridoma, entendiéndose por "hibridoma" la línea celular híbrida obtenida mediante la fusión de un linfocito B productor del anticuerpo de la invención con una línea celular de mieloma (linfocito B canceroso) que no produce una inmunoglobulina propia; así, se trata de una línea celular inmortal capaz de producir el anticuerpo monoclonal de la invención, el cual puede recuperarse del medio.
Otro aspecto de la invención se refiere a una composición, de ahora en adelante "composición de la invención", que comprende el péptido, la secuencia nucleotídica, el anticuerpo o la célula de la invención.
La composición de la invención puede comprender además adyuvantes, excipientes y/o vehículos farmacéuticamente aceptables. El término "excipiente" hace referencia a una sustancia que ayuda a la absorción de los elementos de la composición de la invención, estabiliza dichos elementos, activa o ayuda a la preparación de la composición en el
sentido de darle consistencia o aportar sabores que la hagan más agradable. Así pues, los excipientes podrían tener la función de mantener los ingredientes unidos, como por ejemplo es el caso de almidones, azúcares o celulosas, la función de endulzar, la función de colorante, la función de protección de la composición, como por ejemplo, para aislarla del aire y/o la humedad, la función de relleno de una pastilla, cápsula o cualquier otra forma de presentación, la función desintegradora para facilitar la disolución de los componentes y su absorción en el intestino, sin excluir otro tipo de excipientes no mencionados en este párrafo. El "vehículo farmacéuticamente aceptable", al igual que el excipiente, es una sustancia que se emplea en la composición para diluir cualquiera de los componentes de la presente invención comprendidos en ella hasta un volumen o peso determinado. El vehículo farmacéuticamente aceptable es una sustancia inerte o de acción análoga a cualquiera de los elementos de la presente invención. La función del vehículo es facilitar la incorporación de otros elementos, permitir una mejor dosificación y administración o dar consistencia y forma a la composición. El término "adyuvante" se refiere a un agente que no posea un efecto antigénico por sí mismo, pero que puede estimular el sistema inmune incrementando su respuesta a la composición de la invención. Existen multitud de adyuvantes conocidos en el estado de la técnica, como por ejemplo, aunque sin limitarse, fosfato de aluminio, hidróxido de aluminio, agonistas de los receptores tipo toll, citoquinas, escualeno, adyuvante incompleto de Freund o adyuvante completo de Freund. Por tanto, el término "composición" incluye también una "composición farmacéutica" y dentro de ella lo que se conoce como "vacuna".
Preferiblemente, la composición de la invención comprende el péptido, la secuencia nucleotídica, el anticuerpo o la célula de la invención en una cantidad terapéuticamente efectiva, entendiéndose por "cantidad terapéuticamente efectiva" la cantidad de péptido, secuencia nucleotídica, anticuerpo o célula de la invención, que produzca el efecto deseado. La
dosificación para obtener una cantidad terapéuticamente efectiva depende de una variedad de factores, como por ejemplo, la edad, peso, sexo o tolerancia del individuo. La composición de la presente invención puede formularse para su administración en una variedad de formas conocidas en el estado de la técnica. Como ejemplos de preparaciones se incluye cualquier composición sólida (comprimidos, pildoras, cápsulas, gránulos, etc.) o líquida (soluciones, suspensiones o emulsiones) para administración oral, tópica o parenteral. La composición de la presente invención también puede ser formulada en forma de liposomas o nanosferas, de formulaciones de liberación sostenida o de cualquier otro sistema convencional de liberación. Tal composición y/o sus formulaciones pueden administrarse a un animal, incluyendo un mamífero y, por tanto, al hombre, en una variedad de formas, incluyendo, pero sin limitarse, parenteral, intraperitoneal, intravenosa, intradérmica, intraespinal, intraestromal, intraarticular, intratecal, intralesional, intraarterial, intramuscular, intranasal, intracraneal, subcutánea, intracapsular, tópica, mediante parches transdérmicos o vía rectal, mediante la administración de un supositorio, percutánea, espray nasal, implante quirúrgico, pintura quirúrgica interna, bomba de infusión o vía catéter. Como se ha mencionado anteriormente, el péptido inmunogénico de la invención se genera de forma natural en el intestino de los pacientes celiacos por la acción de las proteasas bacterianas presentes en su flora intestinal que degradan la gliadina del gluten, o la secalina, hordeína o glutenina, por lo que su uso como diana terapéutica es interesante para la identificación de compuestos o composiciones que sirvan para el diagnóstico, prevención y/o tratamiento de la enfermedad celiaca. Así, otro aspecto de la invención se refiere al uso del péptido o de la
secuencia nucleotídica de la invención para la identificación o diseño de compuestos o composiciones para el diagnóstico, prevención y/o tratamiento de la enfermedad celiaca. En un método de identificación o diseño de los compuestos o composiciones mencionados en el párrafo anterior mediante el uso del péptido o de la secuencia nucleotídica de la invención, dichos compuestos o composiciones se podrían clasificar como útiles para el diagnóstico de la enfermedad celiaca cuando son capaces de unirse específica y selectivamente al péptido de la invención, independientemente de si interfieren o no con su actividad biológica o de si alteran o no su estructura. De igual modo, en dicho método estos compuestos o composiciones se podrían clasificar como útiles para la prevención y/o el tratamiento de la enfermedad celiaca cuando son capaces de alterar la actividad biológica del péptido de la invención, reduciendo o inhibiendo por completo su toxicidad o capacidad inmunogénica.
Otro aspecto de la invención se refiere al uso del anticuerpo o de la célula de la invención para la detección y/o cuantificación del péptido de la invención. Esta aplicación del anticuerpo y de la célula de la invención es de utilidad, no solo para el diagnóstico y/o seguimiento in vitro de la enfermedad celiaca en un individuo, sino también para determinar la presencia y/o cantidad de gluten en los alimentos, permitiendo así seleccionar aquellos alimentos aptos para el consumo por pacientes de enfermedad celiaca. Por ello, en una realización preferida, la detección y/o cuantificación del péptido de la invención se realiza en alimentos, como por ejemplo, aunque sin limitarnos, cereales.
La ventaja de detectar este péptido de la invención frente a otros péptidos del gluten que han sido identificados también como inmunogénicos radica en que, como se muestra en los ejemplos de la presente invención, el péptido de la invención está distribuido ampliamente en varios géneros de
cereales tóxicos, incluyendo, aunque sin limitarnos, cebada, centeno y trigo (tanto silvestre como cultivado), y además está presente no solo en prolaminas (gliadinas, hordeínas y secalinas) sino también en una glutenina de bajo peso molecular. Dicha detección y/o cuantificación se puede llevar a cabo mediante ensayos inmunológicos, por ejemplo, aunque sin limitarnos, por Western blot, inmunoprecipitación, arrays de proteína, inmunofluorescencia, inmunohistoquímica, ELISA directo, indirecto, en sándwich o competitivo, para determinar la presencia y/o cantidad de péptido aislado en muestras biológicas aisladas de individuos (diagnóstico y/o seguimiento in vitro de la enfermedad celiaca), o formando parte de la proteína de la que procede en extractos de alimentos.
Un método preferido de detección y cuantificación del péptido de la invención mediante el anticuerpo o la célula de la invención es un enzimoinmunoensayo tipo sándwich, por ejemplo, basado en el empleo de una pareja de anticuerpos de la invención, específicos frente al péptido de la invención con afinidad por dos epítopos del mismo que se encuentren lo suficientemente separados como para permitir la interacción estérica de las dos moléculas de anticuerpos simultáneamente con el péptido; uno de los anticuerpos se fija a un soporte sólido, por ejemplo, aunque sin limitarnos, a una placa de plástico o a una membrana de PDVF, y el segundo anticuerpo se utiliza como marcador conjugado con un enzima que cataliza una reacción colorimétrica (o con un fluorocromo en técnicas fluorométricas); así la muestra a estudiar se incuba con estos reactivos y se mide la intensidad de color o la fluorescencia al final del proceso, siendo ésta directamente proporcional a la cantidad de péptido de la invención presente en la muestra. Otro método preferido de detección y cuantificación del péptido de la invención es un enzimoinmunoensayo tipo competitivo similar al anterior pero donde el anticuerpo marcador se sustituye por el péptido de la invención sintético conjugado con un enzima o fluorocromo, a continuación se incuba con la
muestra a analizar y, en este caso la cantidad de péptido en la misma será inversamente proporcional al color desarrollado o a la fluorescencia emitida. Otro método preferido de detección del péptido de la invención consiste en llevar a cabo una técnica inmunocromatográfica siguiendo un proceso similar al primer método descrito en este párrafo, pero adsorbiendo uno de los anticuerpos de la pareja en el PDVF y utilizando como sustancia de detección el segundo anticuerpo de la pareja con el marcador correspondiente. Esta última técnica permite hacer determinaciones cualitativas rápidas.
Tal y como se utiliza en la presente invención, el término "muestra biológica aislada" se refiere, pero no se limita, a tejidos y/o fluidos biológicos de un individuo obtenidos mediante cualquier método conocido por un experto en la materia que sirva para tal fin. La muestra biológica puede ser un tejido o un fluido biológico, preferiblemente es una muestra de suero, de heces o de aspirado intestinal, más preferiblemente de fluido duodenal-yeyunal. La muestra puede ser tomada de mamíferos no humanos, como por ejemplo, pero sin limitarse, roedores, rumiantes, felinos o cánidos, o más preferiblemente de un humano.
Otro aspecto de la invención se refiere al uso del péptido, del anticuerpo o de la célula de la invención para el diagnóstico y/o seguimiento in vitro de la enfermedad celiaca en un individuo. En este sentido, otro aspecto de la invención se refiere a un método de diagnóstico y/o seguimiento in vitro de la enfermedad celiaca en un individuo que comprende:
a. detectar y/o cuantificar en una muestra biológica aislada, preferiblemente en una muestra de heces o de aspirado intestinal, más preferiblemente en una muestra de fluido duodenal-yeyunal, el péptido de la invención (la presencia del péptido de la invención en dicha muestra es indicativo de un fenotipo celiaco); lo cual podría llevarse a cabo, por ejemplo aunque sin limitarnos, utilizando el anticuerpo o la célula de la invención en los métodos descritos
anteriormente en esta memoria para la detección y/o cuantificación del péptido de la invención, o bien mediante geles de electroforesis, RMN o cualquier otra técnica de diagnóstico por imagen o mediante técnicas cromatográficas o de espectroscopia de masas; o
b. detectar y/o cuantificar en una muestra biológica aislada, preferiblemente en una muestra de suero, actividades inmunológicas generadas frente al péptido de la invención por parte del sistema inmune humoral (detección y/o cuantificación de anticuerpos frente al péptido de la invención) o celular (detección y/o cuantificación de linfocitos T específicos frente al péptido de la invención); lo cual podría llevarse a cabo utilizando el péptido de la invención, por ejemplo, aunque sin limitarnos, en los métodos que se describen a continuación.
En la enfermedad celiaca los anticuerpos específicos frente al péptido de la invención se centran en los isotipos IgG e IgA por separado, o ambos IgG+lgA. En este caso, los anticuerpos frente al péptido de la invención constituyen una variante de los anticuerpos antigliadina y aportan la especificidad que les falta a estos marcadores. Los anticuerpos antigliadina (AAG) tienen la importancia histórica de ser la primera herramienta serológica útil en el diagnóstico de la enfermedad celiaca. La aparición de anticuerpos contra elementos de la dieta en la enfermedad celiaca es conocida desde los años sesenta del pasado siglo. Los AAG se dirigen contra determinantes antigénicos de la α-gliadina muy conservados y compartidos con las otras fracciones (gliadinas β, γ y ω). Sin embargo, estos anticuerpos no son específicos de la enfermedad celiaca pudiendo encontrarse en otras patologías e incluso en individuos sanos. Por el contrario, los anticuerpos frente al péptido de la invención son aquellos anticuerpos antigliadina, antisecalina, antihordeína y antiglutenina con afinidad por fragmentos de gliadina, secalina, hordeína y glutenina específicamente procesadas en el intestino de pacientes
celiacos. Por tanto, la detección y/o cuantificación de estos anticuerpos en una muestra biológica aislada constituye un eficaz método de diagnóstico y/o seguimiento in vitro de la enfermedad celiaca. La detección y/o cuantificación de estos anticuerpos frente al péptido de la invención, preferiblemente frente a sus variantes desaminadas por la tTG, se puede llevar a cabo utilizando el péptido de la invención en distintas técnicas inmunológicas, como por ejemplo, aunque sin limitarnos:
- Técnicas inmunocromatográficas, en las que se adsorbe el péptido de la invención a tiras de membrana de nitrocelulosa, PVDF o materiales similares y, mediante un flujo lateral, la muestra biológica a analizar se pone en contacto con dicho péptido adsorbido, fijándose contra el mismo los anticuerpos específicos que pudieran existir en ella y arrastrándose el resto. Estos anticuerpos pueden visualizarse mediante, por ejemplo, aunque sin limitarnos, la reacción con anticuerpos antiinmunoglobulinas (anti-lgA o anti-lgG) o mediante cualquier otra sustancia capaz de fijarse específicamente a las inmunoglobulinas (por ejemplo, proteína A o proteína G), que preferiblemente a su vez estaría conjugada con un marcador coloreado o capaz de generar color, como por ejemplo, aunque sin limitarnos, con oro coloidal. Los reactivos se encontrarían fijados en distintas capas de la tira y serían movilizados por el propio flujo de la muestra, por lo que preferiblemente este método se realiza en un solo paso. Esta técnica es cualitativa, con la ventaja de la rapidez y la no necesidad de instrumentación para su evaluación.
- Técnicas inmunoenzimáticas (ELISA). En este caso, la adsorción del péptido de la invención se realiza sobre un plástico, preferiblemente en forma de placa multipocillo, sobre el que se desarrolla la reacción de forma similar a la descrita en el párrafo anterior, aunque por tratarse de una técnica de tipo semicuantitativo se emplean preferiblemente los anticuerpos anti-lg conjugados con enzimas. Las enzimas catalizan una reacción colorimétrica al serles añadido un sustrato químico que cambia de color al ser modificado por la enzima. La cantidad de color generado es directamente proporcional a la cantidad de anticuerpos específicos que
se encuentran en la muestra biológica. Una variante serían las técnicas competitivas que evalúan la capacidad de la muestra biológica de inhibir la unión de una cantidad conocida del péptido de la invención marcado a anticuerpos frente al péptido de la invención fijados a la superficie sólida. - Técnicas inmunofluorométricas. En esencia similares a la técnica ELISA, pero utilizando una sustancia fluorescente como marcador para el anticuerpo secundario. En los casos en que se utilizan variantes de polarización no es necesario fijar el antígeno a la superficie sólida. En este tipo de técnica también se usan variantes competitivas. El mareaje con fluorocromos aumenta la sensibilidad de la técnica frente al enzimoinmunoanálisis. Se pueden así mismo usar microesferas de poliestireno como soporte para realizar la reacción antígeno-anticuerpo y realizar las lecturas mediante un citómetro de flujo, lo que permitiría además un ensayo multiplex si existen distintas microesferas según el antígeno, detectando la presencia de otros antígenos además del péptido de la invención.
Alternativamente, para el diagnóstico y/o seguimiento in vitro de la enfermedad celiaca se podría detectar y/o cuantificar en la muestra biológica aislada la presencia de linfocitos T específicos frente al péptido de la invención mediante, por ejemplo, aunque sin limitarnos, ensayos biológicos basados en células mononucleares procedentes del individuo, y preferiblemente obtenidas de sangre periférica o aisladas de la mucosa intestinal, y estimuladas in vitro con el péptido de la invención. La respuesta podría cuantificarse mediante, por ejemplo, aunque sin limitarnos, ensayos de proliferación, blastogénesis, producción de sustancias solubles o expresión de marcadores de membrana celular, y se podrían comparar los resultados obtenidos en la muestra biológica analizada con controles positivos, por ejemplo, utilizando estímulos de mitógenos T, como la fitohemaglutinina, y controles negativos, como por ejemplo utilizando cultivos básales sin estímulo o con un estímulo inocuo. Este método de diagnóstico y/o seguimiento de la enfermedad celiaca
podría sustituir a las pruebas de provocación in vivo con gluten ya que, al consistir en una estimulación ex vivo de linfocitos aislados de la muestra biológica, aportaría la ventaja de no exponer al individuo a una sustancia potencialmente nociva para su organismo a la hora de realizar la confirmación del diagnóstico y/o seguimiento, y por otra parte este método sería más específico al determinar una sensibilización frente a una sustancia que se genera específicamente en el intestino de pacientes celiacos y no en otras patologías. La presencia de una respuesta inmune, humoral o celular, frente al péptido de la invención se relaciona con que los péptidos de gliadina, secalina, hordeína o glutenina han pasado la barrera epitelial de la mucosa intestinal y han sido capaces de generar una respuesta adaptativa del sistema inmune del paciente (memoria inmunológica), o bien con la presencia del péptido de la invención en el organismo del individuo del cual procede la muestra analizada, lo que es indicativo de un fenotipo intestinal celiaco en el que se incluiría la actividad de una flora intestinal específica de los pacientes celiacos. Otro aspecto de la invención se refiere a un método de diagnóstico in vitro de la enfermedad celiaca en un individuo que comprende:
a. detectar en una muestra biológica aislada, preferiblemente de intestino, la actividad proteolítica que da lugar a la formación del péptido de la invención a partir de gliadina, secalina, hordeína o glutenina. La presencia de dicha actividad proteolítica en la muestra analizada es indicativo de un fenotipo celiaco.
Para ello podría utilizarse, por ejemplo aunque sin limitarnos, el péptido de la invención modificado con al menos un sustrato cromogénico, fluorigénico o luminiscente. La incubación de dicho péptido modificado junto con la muestra biológica aislada, preferiblemente procedente de intestino, produce color únicamente en el caso de los individuos celiacos,
debido a la presencia de enzimas específicos asociados a su flora intestinal capaces de liberar por digestión enzimática el péptido de la invención. El término "diagnóstico" se refiere a determinar la ausencia o presencia de enfermedad celiaca en un individuo. El término "seguimiento" se refiere a analizar el curso o progreso de la enfermedad celiaca en un individuo, preferiblemente cuando dicho individuo ha sido previamente diagnosticado para dicha enfermedad, más preferiblemente cuando dicho individuo está sometido a un tratamiento terapéutico, y aun más preferiblemente cuando dicho individuo está sometido a una dieta libre de gluten.
Otro aspecto de la invención se refiere al uso de compuestos probióticos que modifiquen la flora bacteriana intestinal responsable de la actividad proteasa que hidroliza la gliadina, secalina, hordeína o glutenina generando el péptido de la invención, para la elaboración de un medicamento para el tratamiento y/o prevención de la enfermedad celiaca. Otro aspecto de la invención se refiere al uso de antibióticos que inhiban, parcial o totalmente, la proliferación de la flora bacteriana intestinal responsable de dicha actividad proteasa, para la elaboración de un medicamento para el tratamiento y/o prevención de la enfermedad celiaca. Otro aspecto de la invención se refiere al uso del péptido, de la secuencia nucleotídica, del anticuerpo, de la célula o de la composición de la invención para la elaboración de un medicamento o, alternativamente, al péptido, la secuencia nucleotídica, el anticuerpo, la célula o la composición de la invención para su uso como medicamento, de ahora en adelante "medicamento de la invención".
El "medicamento" al que se refiere la presente invención puede ser de uso humano o veterinario. El "medicamento de uso humano" es toda sustancia o combinación de sustancias que se presente como poseedora de propiedades para el tratamiento o prevención de enfermedades en seres humanos o que pueda usarse en seres humanos o administrarse a seres humanos con el fin de restaurar, corregir o modificar las funciones fisiológicas ejerciendo una acción farmacológica, inmunológica o metabólica, o de establecer un diagnóstico médico. El "medicamento de uso veterinario" es toda sustancia o combinación de sustancias que se presente como poseedora de propiedades curativas o preventivas con respecto a las enfermedades animales o que pueda administrarse al animal con el fin de restablecer, corregir o modificar sus funciones fisiológicas ejerciendo una acción farmacológica, inmunológica o metabólica, o de establecer un diagnóstico veterinario.
En una realización preferida, el medicamento de la invención es para la prevención y/o tratamiento de la enfermedad celiaca.
El medicamento de la invención puede utilizarse tanto solo como en combinación con otros medicamentos o composiciones para el diagnóstico, tratamiento y/o prevención de la enfermedad celiaca; y puede utilizarse como tratamiento alternativo o complementario a la dieta sin gluten que normalmente siguen los individuos que padecen esta enfermedad.
El término "tratamiento", tal como se entiende en la presente invención, se refiere a combatir los efectos causados como consecuencia de la enfermedad celiaca en un sujeto (preferiblemente mamífero, y más preferiblemente humano) que incluye:
(i) inhibir la enfermedad o condición patológica, es decir, detener su desarrollo;
(ii) aliviar la enfermedad o la condición patológica, es decir, causar la regresión de la enfermedad o la condición patológica o su sintomatología; o
(iii) estabilizar la enfermedad o la condición patológica.
El término "prevención" tal como se entiende en la presente invención consiste en evitar la aparición de la enfermedad, es decir, evitar que se produzca la enfermedad o la condición patológica en un sujeto (preferiblemente mamífero, y más preferiblemente humano), en particular, cuando dicho sujeto tiene predisposición por la condición patológica, pero aún no se ha diagnosticado que la tenga.
El péptido de la invención puede utilizarse, por ejemplo aunque sin limitarnos, en un método profiláctico con el fin de realizar una manipulación inmunológica del individuo, preferiblemente de un individuo celiaco, tratando así de (re)instaurar la tolerancia frente al gluten. Por ello, en una realización más preferida el medicamento de la invención es una vacuna, aun más preferiblemente cuando dicho medicamento comprende el péptido o la secuencia nucleotídica de la invención.
El término "vacuna" se refiere a una preparación epitópica o antigénica empleada para provocar una respuesta del sistema inmunológico frente a uno o varios antígenos. Son preparados de antígenos o epítopos que, una vez dentro del organismo, provocan la respuesta del sistema inmunitario mediante la producción de anticuerpos y generan memoria inmunológica produciendo inmunidad permanente o transitoria. La vacuna de la invención puede administrarse al individuo una sola vez o en repetidas ocasiones (administración inicial y subsecuentes), dependiendo de la capacidad del individuo para producir una respuesta inmunológica en respuesta a la administración de la vacuna.
Otro aspecto de la invención se refiere a un kit, de ahora en adelante "primer kit de la invención", que comprende el péptido de la invención. Otro aspecto de la invención se refiere a un kit, de ahora en adelante "segundo kit de la invención", que comprende el anticuerpo o la célula de la invención.
El primer y segundo kit de la invención pueden comprender además, sin ningún tipo de limitación, anticuerpos primarios conjugados o no conjugados, péptidos, tampones, anticuerpos secundarios conjugados, estreptavidina conjugada, proteínas o péptidos patrones, agentes para prevenir la contaminación, compuestos marcadores, como por ejemplo, aunque sin limitarnos, fluorocromos, etc. Por otro lado, el primer y segundo kit de la invención pueden incluir todos los soportes y recipientes necesarios para su puesta en marcha y optimización. El primer y segundo kit de la invención pueden contener además otras proteínas o péptidos que sirvan como controles positivos y negativos. Preferiblemente, estos kits comprenden además las instrucciones para llevar a cabo el diagnóstico y/o seguimiento in vitro de la enfermedad celiaca en un individuo, o para detectar y/o cuantificar el péptido de la invención, preferiblemente en alimentos.
Opcionalmente, el péptido, el anticuerpo o la célula de la invención están marcados o inmovilizados en los kits de la invención. Preferiblemente, éstos están marcados con una etiqueta seleccionada de la lista que comprende: un radioisótopo, un marcador fluorescente o luminiscente, un anticuerpo, un fragmento de anticuerpo, una etiqueta de afinidad, una enzima o un substrato de una enzima. Más preferiblemente, el péptido, el anticuerpo o la célula de la invención están inmovilizados en los kits de la invención. El término "inmovilizado", tal y como se utiliza en la presente invención, se refiere a que el péptido, el anticuerpo o la célula de la invención pueden estar unidos a un soporte sin perder su actividad. Preferiblemente, el soporte puede ser la superficie de una matriz, (por
ejemplo, una matriz de nylon), una placa de microvaloración (por ejemplo, de 96 pocilios) o soporte de plástico similar, o bien cuentas (esferas, por ejemplo, esferas de agarosa o microesferas pequeñas superparamagnéticas compuestas de matrices biodegradables).
Otro aspecto de la invención se refiere al uso del segundo kit de la invención para la detección y/o cuantificación del péptido de la invención. En una realización preferida, la detección y/o cuantificación del péptido se realiza en alimentos.
Otro aspecto de la invención se refiere al uso del primer o segundo kit de la invención para el diagnóstico y/o seguimiento in vitro de la enfermedad celiaca en un individuo. A lo largo de la descripción y las reivindicaciones la palabra "comprende" y sus variantes no pretenden excluir otras características técnicas, aditivos, componentes o pasos. Para los expertos en la materia, otros objetos, ventajas y características de la invención se desprenderán en parte de la descripción y en parte de la práctica de la invención. Los siguientes ejemplos y dibujos se proporcionan a modo de ilustración, y no se pretende que sean limitativos de la presente invención.
DESCRIPCIÓN DE LAS FIGURAS Fig. 1. Muestra la identificación de tres péptidos de gliadina mediante zimogramas independientes con gliadina de dos pacientes celiacos no tratados.
Fig. 2. (a) Muestra los histogramas representativos de la citometría de flujo realizada a células dendríticas derivadas de monocitos obtenidos a partir de muestras de sangre periférica, compatibles con ABO, de donantes sanos, estimuladas durante 48 horas con
lipopolisacárido (LPS, 1 mg/ml), o con los péptidos del gluten 8-mer (SEQ ID NO: 2, 100 Mg/ml), 19-mer (SEQ ID NO: 4, 100 Mg/ml) y 33-mer (SEQ ID NO: 5, 100 Mg/ml), y después de las condiciones básales (control interno). Los histogramas sombreados representan la expresión de los marcadores co-estimuladores (CD40, CD80, CD86) o de activación (CD83) en las células dendríticas. Los histogramas vacíos representan los controles del isotipo. Este experimento es representativo de tres experimentos independientes, cada uno de los cuales se realiza por triplicado, (b) Se muestra el índice medio de fluorescencia (MFI) de un experimento simple realizado por triplicado, representativo de tres experimentos independientes con resultados similares.
Fig. 3. Muestra la expresión de RNA, en unidades arbitrarias (AU) de IFNy, IL-4, IL-12p40, TNFa, IL-10, IL-23p19, IL-6, TGF e IL-17 en células dendríticas derivadas de monocitos obtenidos a partir de muestras de sangre periférica, compatibles con ABO, de donantes sanos, estimuladas durante 48 horas con lipopolisacárido (LPS, 1 mg/ml), o con los péptidos del gluten 8-mer (SEQ ID NO: 2, 100 Mg/ml), 19-mer (SEQ ID NO: 4, 100 Mg/ml) y 33-mer (SEQ ID NO: 5, 100 Mg/ml), y después de las condiciones básales (control interno). Se muestran la media y la desviación estándar de tres experimentos independientes.
Fig. 4. Muestra el índice de proliferación de células mononucleares de sangre periférica, enriquecidas en células T, tras ser cultivadas con células dendríticas de pacientes control (C) o de pacientes celiacos sin tratar (uCD), previamente estimuladas con los péptidos del gluten 8-mer (SEQ ID NO: 2, 100 Mg/ml, 10 Mg/ml y 1 M9/ml), 19-mer (SEQ ID NO: 4, 100 Mg/ml) y 33-mer (SEQ ID NO: 5, 100 Mg/ml) referido a la proliferación basal inducida por células dendríticas cultivadas en medio sin estímulo y co-cultivadas con células mononucleares de sangre periférica enriquecidas en células T autólogas. Se muestran la media y la desviación estándar de un experimento realizado por triplicado, y que es
representativo de tres experimentos independientes con resultados similares. Cada experimento se realizó con un paciente celiaco sin tratar de genotipo HLA-DQ2+ y en paralelo con un individuo sano no celiaco HLA-DQ2" como control (C).
Fig. 5. Muestra los niveles de anticuerpos IgA anti-péptido 8-mer (a) anti-péptido δ-mer desaminado (SEQ ID NO: 6) y (b) anti-péptido 8- mer nativo/sin modificar (SEQ ID NO: 7), ambos marcados con biotina, en muestras de suero de pacientes celiacos y controles no- celiacos.
Fig. 6. Muestra los niveles de anticuerpos IgA anti-péptido 8-mer desaminado en muestras de suero de pacientes celiacos (EC) en actividad, de pacientes celiacos en dieta sin gluten (EC DSG), controles no-celiacos, familiares sanos de pacientes celiacos HLA- DQ2+, familiares sanos HLA-DQ2-, y pacientes con Enfermedad Inflamatoria Intestinal (colitis ulcerosa o Crohn). Los asteriscos indican valores estadísticamente significativos: (*) p<0,05; (**) p<0,005; (***) p<0,0005.
Fig. 7. Muestra los niveles de anticuerpos IgA anti-péptido 8-mer desaminado en muestras de suero de pacientes con Enfermedad Inflamatoria Intestinal (EN) de acuerdo a la expresión de HLA-DQ2 (HLA-DQ2+, HLA-DQ2-, y HLA-DQ2- pero positivo para una de sus cadenas, DQA o DQB).
EJEMPLOS
A continuación se ilustrará la invención mediante unos ensayos realizados por los inventores, que ponen de manifiesto la efectividad del péptido de la invención en el diagnóstico y/o seguimiento in vitro de la enfermedad celiaca. Estos ejemplos específicos que se proporcionan sirven para
ilustrar la naturaleza de la presente invención y se incluyen solamente con fines ilustrativos, por lo que no han de ser interpretados como limitaciones a la invención que aquí se reivindica. Por tanto, los ejemplos descritos más adelante ilustran la invención sin limitar el campo de aplicación de la misma.
EJEMPLO 1. Identificación del péptido inmunogénico 8-mer en cereales tóxicos para individuos celiacos. En el presente ejemplo se puede ver cómo se aisló y determinó la actividad inmunogénica del péptido 8-mer de gliadina, y cómo la secuencia del péptido 8-mer puede encontrarse en proteínas del gluten de cereales inmunotóxicos. Dados los precedentes de un patrón exclusivo de metaloproteasas bacterianas capaces de degradar la gliadina en la mucosa duodenal de pacientes celiacos, actividad que era indetectable en individuos sanos (Bernardo et al., 2009, Gut.; 58:886-887), se emprendió la identificación de los productos de dicha degradación. En primer lugar, se abordó el análisis por espectrometría de masas de trampa iónica de muestras tripsinizadas procedentes de las bandas de degradación de 26 kDa y 82 kDa extraídas del zimograma realizado con muestras biopsiadas de pacientes celiacos no tratados (Fig. 1 ). Mediante este método se identificaron tres péptidos, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 8 y SEQ ID NO: 9, cuya secuencia se lanzó contra una base de datos no redundante de proteínas y, utilizando la herramienta Blastp del NCBI, se encontró que estos tres péptidos estaban presentes en especies de trigo (silvestres y cultivados), cebada o centeno, y dentro de estas especies, únicamente en familias de prolaminas (como gliadinas, hordeínas y secalinas) y gluteninas. Puesto que la gliadina utilizada en los zimogramas procedía de trigo, se consideraron las secuencias de prolaminas presentes en especies de trigo y se encontró que solamente uno de los péptidos (denominado 8-mer, de secuencia SEQ ID NO: 2) no era susceptible de haberse generado por tripsinización y, por lo tanto, su presencia se debía
exclusivamente a la acción de las proteasas provenientes del extracto duodenal del paciente enfermo. A continuación, en la Tabla 1 se relacionan las especies y grupos de proteínas que contienen el 8-mer íntegro, que se distribuye ampliamente en varias especies de cereales tóxicos para celiacos (cebada, centeno y trigo).
Tabla 1. Distribución del péptido SEQ ID NO: 2 en secuencias de cereales tóxicos para celiacos: cebada, centeno y varios trigos, estos últimos tanto silvestres como cultivados.
Como se verá más adelante, las pruebas que demuestran la actividad inmunoestimulante del nuevo péptido identificado, 8-mer, consistieron en: activación in vitro de células dendríticas (Fig. 2 y 3), y estimulación de células T autólogas mediada por células dendríticas (Fig. 4). Este péptido resultó ser inmunogénico en todos los individuos ensayados (pacientes celiacos y controles sanos no celiacos). El interés clínico radica en que dicho péptido inmunogénico únicamente se ha demostrado generar por la acción de las proteasas bacterianas aisladas del intestino de los enfermos celiacos. La búsqueda de una actividad proteásica similar en biopsias de duodeno de 1 1 individuos no celiacos fue infructuosa.
Más adelante se proporcionan los resultados que demuestran el efecto inmunogénico de este nuevo péptido del gluten, y se aportan ejemplos de realización en los que se empleó dicho péptido para probar in vitro su actividad inmunogénica a partir de sangre periférica de los controles (Fig. 2, 3 y 4). Las ventajas que aporta el péptido 8-mer sobre el resto de péptidos inmunotóxicos identificados en el gluten en cuanto a sus aplicaciones en el diagnóstico y la terapia de la enfermedad celiaca, radican precisamente en que se trata de un péptido natural, generado in vivo por la acción de proteasas bacterianas presentes en el intestino de los enfermos celiacos que, combinado con su predisposición genética, tiene un papel relevante en la patología celiaca.
EJEMPLO 2. Método de diagnóstico in vitro de la enfermedad celiaca mediante la detección de anticuerpos anti 8-mer en suero.
En el presente ejemplo se ilustra el desarrollo de una forma de método ELISA que detecta la presencia de anticuerpos anti 8-mer en individuos sospechosos de padecer enfermedad celiaca. Para ello, se desarrolló un método de ELISA indirecto con el objetivo de detectar anticuerpos contra el péptido 8-mer de la gliadina en muestras de suero. Se utilizaron cuatro variantes del antígeno/péptido biotinilado (Biomedal S-L., Sevilla,
España), forma nativa FK-9-1 (SEQ ID NO: 7-BIOTINA, la SEQ ID NO: 7 corresponde a la SEQ ID NO: 2 con una Usina en su extremo C-terminal) y forma desaminada FK(BIO)-9-2 (SEQ ID NO: 6-BIOTINA, la SEQ ID NO: 6 corresponde a la SEQ ID NO: 3 con una lisina en su extremo C-terminal) por su posible modificación por la tTG, con biotinilación en el extremo N- terminal o C-terminal. Se fijaron sobre una placa con estreptavidina, a una concentración de ^g/ml (en solución PBS+Tween 0,05%), con una preincubación óptima de 1 hora a temperatura ambiente. Tras añadir las muestras de suero a dilución 1 :25, con incubación de 2 horas a 37° C, se utilizó un anticuerpo secundario (anticuerpo policlonal de conejo anti- IgA/HRP humana de Dako) a una dilución 1 :4000. Los sujetos de estudio de donde procedían las muestras incluían los siguientes grupos: pacientes celíacos en actividad (EC actividad), pacientes celiacos en dieta sin gluten (EC DSG), controles sanos, familiares sanos DQ2- y familiares sanos DQ2+.
Se comprobó así que el suero de los pacientes celiacos contenía anticuerpos frente al péptido 8-mer de gliadina. De las 4 variantes del péptido utilizado en la estandarización de la técnica de ELISA, sólo se obtuvieron resultados óptimos con los 2 péptidos biotinilados en el extremo carboxilo.
Los sueros de los pacientes celíacos en actividad presentaron niveles mayores de anticuerpos frente al péptido 8-mer de la gliadina que las muestras del grupo control, aunque solamente se observaron diferencias estadísticamente significativas en el caso del péptido desaminado (p<0,0001 ) (Fig. 5).
En cuanto al péptido desaminado se observan diferencias significativas al comparar los niveles de anticuerpos del grupo de pacientes celiacos en actividad con los detectados en el grupo control (p=0,0003), y entre los
pacientes celiacos en dieta sin gluten (EC DSG) y los familiares sanos (p=0,0006) (Fig. 6).
EJEMPLO 3. Método de diagnóstico in vitro de la enfermedad celiaca, no detectada mediante otros métodos, en individuos con enfermedad inflamatoria intestinal mediante la detección de anticuerpos anti 8- mer en suero.
En este ejemplo se muestra cómo individuos con enfermedad inflamatoria intestinal (Eli), que no habían sido diagnosticados anteriormente como celíacos por las pruebas serológicas convencionales (anticuerpos antitransglutaminasa tisular) o por endoscopia intestinal, pueden ser identificados como individuos celiacos cuando aparecen anticuerpos anti 8-mer de gliadina desaminada en suero.
En un grupo de 56 pacientes con Eli que no dieron positivos en pruebas serológicas ni en biopsias intestinales para la detección de la enfermedad celiaca, se estudió el nivel en suero de anticuerpos que reconocieran el péptido 8-mer mediante el ensayo ELISA descrito en el Ejemplo 2. Se identificaron así 2 muestras de pacientes con colitis ulcerosa y 3 de pacientes con enfermedad de Crohn que presentaron niveles de anticuerpos anti-péptido 8-mer similares a los obtenidos para los pacientes celiacos (Fig. 6). En este grupo de pacientes con Eli con valores elevados de anticuerpos anti 8-mer, se realizó un estudio de marcadores genéticos de la enfermedad celiaca (HLA-DQ2), cuyo resultado fue el de la siguiente tabla:
PACIENTE DIAGNOSTICO DQA DQB
1 COLITIS ULCEROSA - +
2 COLITIS ULCEROSA + +
3 ENFERMEDAD DE CROHN + +
4 ENFERMEDAD DE CROHN + +
5 ENFERMEDAD DE CROHN + +
Tabla 2. Resultado del estudio de los marcadores genéticos de la enfermedad celiaca (HLA-DQ2) en pacientes de EN que presentaron valores elevados de anticuerpos anti 8-mer. A continuación se realizó el mismo estudio de marcadores genéticos de enfermedad celiaca (DQ2) en el resto de los pacientes con Eli en cuyas muestras se hizo la determinación de anticuerpos anti-péptido 8-mer. Los marcadores genéticos de los 56 pacientes diagnosticados con El l que se detectaron fueron los de la siguiente tabla:
Tabla 3. Resultado del estudio de los marcadores genéticos de la enfermedad celiaca (HLA-DQ2) en todos pacientes de Ell en cuyas muestras se realizó la determinación de anticuerpos anti-péptido 8-mer.
En la Fig. 7 se muestran los niveles de anticuerpos anti 8-mer desaminado en pacientes de Ell de acuerdo a la expresión de HLA-DQ2. Estos resultados demuestran que aquellos individuos con Ell y con niveles elevados de anticuerpos anti-péptido 8-mer desaminado presentaban además marcadores genéticos de enfermedad celiaca (HLA- DQ2) positivos, lo que indica una alta probabilidad de que sean individuos celiacos. Por tanto, la detección de anticuerpos anti 8-mer, preferiblemente desaminado, permite identificar grupos de individuos celiacos que no son detectables por otras técnicas diagnósticas.
EJEMPLO 4. Actividad inmunogénica del péptido 8-mer en el sistema inmune celular.
El presente ejemplo muestra cómo puede utilizarse el péptido 8-mer para el diagnóstico de la enfermedad celiaca, mediante ensayos de estimulación en cultivo autólogo de células dendríticas y linfocitos T pertenecientes a pacientes celíacos HLA-DQ2+ y controles HLA-DQ2- no- celiacos.
Las células dendríticas derivadas de monocito actúan como células presentadoras de antígeno. Los experimentos de estimulación realizados en la presente invención incluyeron un control positivo de proliferación (linfocitos T cultivados en presencia de células dendríticas derivadas de monocitos previamente activadas en presencia de lipolisacárido, LPS) y dos controles negativos: fracción CD14- enriquecida en linfocitos T cultivados i) en medio basal y ii) en presencia de células dendríticas derivadas de monocitos sin estimular.
Para este ejemplo de realización se aislaron células mononucleadas de sangre periférica ABO-compatible mediante centrifugación en gradiente de densidad, y microesferas magnéticas con anticuerpos anti-CD14 para separar monocitos CD14+, que fueron inducidos durante 6 días a diferenciarse a células dendríticas inmaduras mediante IL-4 y GM-CSF (confirmado por citometría). Estas células se estimularon primero durante 48 horas con el péptido 8-mer (100 μg/ml, 10 μg/ml, 1 μg/ml) y otros péptidos conocidos de gliadina 19- (100 μg/ml) y 33-mer (100 μg/ml), y después se hizo un co-cultivo con linfocitos T autólogos (población CD14- obtenida arriba), donde las células dendríticas actúan como células presentadoras de antígeno. Como controles negativo y positivo de estimulación, se utilizó un cultivo de células CD14- sin células dendríticas (basal), y de células CD14- estimuladas con lipopolisacárido (LPS), respectivamente. Tras 4 días, se calculó el índice de proliferación celular de acuerdo al ratio absorbancia de las células dendríticas estimuladas / absorbancia sin estimular en co-cultivo con linfocitos T autólogos.
La estimulación en cultivo de células dendríticas procedentes de muestras de controles sanos con el péptido 8-mer indujo la maduración fenotípica de estas células, que se manifestó por un aumento de la expresión en membrana de los marcadores CD40 y CD80, pero no de CD83 o CD86. Por el contrario, los péptidos 19- y 33-mer no modificaron la expresión de estas moléculas (Fig. 2a, 2b). La estimulación con péptidos de gliadina se asoció con la expresión de un perfil diferencial de mRNA de citocinas (Fig. 3), con aumento de la expresión de IFNy (8-mer: x14,2 veces; 19-mer: x22,3 veces; 33-mer: x85,8 veces) y, en mucha menor medida, de TNFa (8-mer: x1 ,45 veces; 19-mer: x1 ,51 veces; 33-mer: x1 ,03 veces). Mayor diferencia se observó respecto a la IL-10, mientras que 19- y 33-mer redujeron su expresión (19-mer: x0, 16 veces; 33-mer: x0,5 veces), el péptido 8-mer tuvo el efecto contrario (aumentó x2,3 veces), y algo similar ocurrió con la IL-4 que aumentó con 8-mer (x79 veces), moderadamente con 19-mer (x7,7 veces), y fue inhibida con 33-mer (x0,001 veces). Por el contrario, la expresión de IL-12p40 disminuyó ligeramente con 8- y 19-mer (x0,4 veces ambos), se inhibió con 33-mer, y en ningún caso se detectó IL-12p35 o IL-21 . La estimulación con 8-mer podría seguir una vía de activación diferencial a través de un perfil Th17 de citocinas, como indica el aumento de IL-23p19 (8-mer: x45,3 veces; 19-mer: x2,7 veces; 33-mer: x6,2 veces), y de otras citocinas relacionadas como IL-6 (8-mer: x3,6 veces; 19-mer: x1 ,2 veces; 33-mer: x0,7 veces), y TGFp (8-mer: x4,8 veces; 19-mer: x1 ,9 veces; 33-mer: x0,6 veces). Tras la estimulación con el péptido 8-mer, las células dendríticas en co- cultivo indujeron una respuesta proliferativa de linfocitos T autólogos de una forma dependiente de dosis, tanto con células de pacientes celiacos HLA-DQ2+, como de individuos control HLA-DQ2- no-celiacos (100 μg/ml: índice de proliferación 2,09 ± 0,029 en celiacos, y 1 ,51 ± 0, 108 en no- celiacos; 10 μg/ml: índice de proliferación 1 ,69 ± 0,005 en celiacos, y 1 ,28 ± 0,034 en no-celiacos; 1 μg/ml: índice de proliferación 1 ,27 ± 0,005 en celiacos, y 1 ,04 ± 0,039 en no-celiacos) (Fig. 4). En todos los casos
estudiados (3 pacientes celiacos DQ2+ y 3 individuos control DQ2- no- celiacos) se observó respuesta al péptido 8-mer, sin embargo, ésta fue más intensa en los celiacos, como indica el aumento de los índices de proliferación en todos los casos para la misma concentración de estímulo. Por el contrario, las células dendríticas estimuladas con los péptidos 19- y 33-mer no indujeron proliferación en los linfocitos T autólogos en ninguna de las muestras (19-mer: índice de proliferación 1 ,06 ± 0,01 1 en celiacos, y 1 ,03 ± 0,039 en no-celiacos; 33-mer: índice de proliferación 1 ,04 ± 0,005 en celiacos, y 1 ,04 ± 0,018 en no-celiacos) (Fig. 4).
EJEMPLO 5. Desarrollo de un anticuerpo monoclonal para detectar el péptido 8-mer.
En el presente ejemplo se muestra una estrategia para obtener anticuerpos monoclonales que reconozcan el péptido de gliadina 8-mer y que puedan usarse para, por ejemplo, determinar la presencia de gluten en alimentos.
Una secuencia codificante de 6 copias del péptido 8-mer en tándem se fusionó en un vector de expresión CASCADE, pALEXI a (Biomedal S.L., Sevilla, España), por el extremo 5' a una etiqueta de polihistidinas (6Xhistag) y por el extremo 3' al DNA codificante de una proteína coadyuvante como es un fragmento de proteína de choque térmico HSP70 de Trypanosoma cruzi. Usando una cepa de E. coli REG12 (Biomedal S.L.) se indujo la expresión de la proteína de fusión con salicilato y posteriormente ésta se purificó mediante cromatografía iónica por afinidad (IMAC) hasta obtener un grado de pureza superior al 95%.
Dos anticuerpos monoclonales contra el péptido de gliadina 8-mer se generaron de acuerdo con el método estándar, con algunas modificaciones específicas. En resumen, dos grupos de ratones Balb / c, obtenidos a partir de IFFA-CREDO (St Germain-sur l'Arbesle, Francia),
fueron inmunizados por vía subcutánea dos veces con una dosis de 0,025 mg de 8-mer-T-HSP70 o de la proteína purificada recombinante de 8mer- X2-HSP70 como inmunógeno. Dos semanas después de la última inmunización, una tercera dosis de la proteína de fusión se inoculó por vía intravenosa en los ratones de cada grupo. Todas las vacunas se llevaron a cabo sin adyuvante. Los títulos de los anticuerpos se evaluaron mediante un ELISA contra los péptidos 8-mer biotinilados descritos en el ejemplo 2, con el uso de unas placas tapizadas con estreptavidina en el día 4 después de la última inmunización. Los ratones inmunizados se sacrificaron, y los bazos se extirparon para su uso como fuente de células para la fusión con células de mieloma SP2. Solo las células del bazo de ratones inmunizados se fusionan con las células de mieloma previamente preparadas y cultivadas en medio RPMI suplementado con suero fetal bovino y 20% de aminopterina-timidina que contenía hipoxantina, porque el medio hipoxantina-aminopterina-timidina sólo permite que las células fusionadas sobrevivan en el cultivo. Las células fusionadas se distribuyeron en placas de 96 pocilios con medio suplementado con aminopterina y que contenía las células alimentadas derivadas de los lavados salinos peritoneales del ratón.
Los anticuerpos producidos por los hibridomas seleccionados se analizaron para su capacidad para reaccionar con epítopos del gluten de trigo, cebada y centeno, por un lado, y de maíz y arroz por otro mediante ensayo ELISA en el que el gluten de cada especie tapizaba los pocilios. Se seleccionaron los hibridomas que produjeron anticuerpos que dieron reactividad de forma más sensible con el gluten de trigo, cebada y centeno, y no dieron ninguna con el de arroz o maíz.
Con dichos anticuerpos se pueden desarrollar ensayos ELISAs directo, de bloqueo o competitivo para detectar el péptido de la invención, por ejemplo, en muestras alimenticias. El ensayo ELISA directo se puede efectuar extrayendo los péptidos del gluten de la muestra alimenticia,
inmovilizándolos en las placas y luego usando uno de los anticuerpos desarrollados en la presente invención para que reaccione con los péptidos 8-mer de la muestra inmovilizada. El revelado se puede efectuar, por ejemplo, por conjugación previa del anticuerpo a un enzima tipo peroxidasa, cuya actividad puede estudiarse midiendo la cantidad de compuesto coloreado que se va acumulando tras añadirle el correspondiente reactivo cromogénico.
Claims
1 . Péptido aislado de secuencia SEQ ID NO: 1 .
2. Péptido según la reivindicación 1 donde la secuencia es SEQ ID NO:
2.
3. Péptido según la reivindicación 1 donde la secuencia es SEQ ID NO:
3.
4. Péptido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3 que además presenta un compuesto químico unido a su extremo N- y/o C- terminal.
5. Péptido según la reivindicación 4 donde el compuesto químico es un compuesto cromogénico, fluorigénico o luminiscente.
6. Péptido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5 que además presenta otro péptido unido a su extremo N- y/o C-terminal.
7. Secuencia nucleotídica aislada que codifica para el péptido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6.
8. Anticuerpo frente al péptido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3.
9. Célula que expresa el anticuerpo según la reivindicación 8.
10. Composición que comprende el péptido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, la secuencia nucleotídica según la reivindicación 7, el anticuerpo según la reivindicación 8 o la célula según la reivindicación 9.
1 1 . Uso del péptido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6 o de la secuencia nucleotídica según la reivindicación 7 para la identificación o diseño de compuestos o composiciones para el diagnóstico, prevención y/o tratamiento de la enfermedad celiaca.
12. Uso del anticuerpo según la reivindicación 8 o de la célula según la reivindicación 9 para la detección y/o cuantificación del péptido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3.
13. Uso del anticuerpo o de la célula según la reivindicación 12 donde la detección y/o cuantificación del péptido se realiza en alimentos.
14. Uso del péptido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, del anticuerpo según la reivindicación 8 o de la célula según la reivindicación 9 para el diagnóstico y/o seguimiento in vitro de la enfermedad celiaca en un individuo.
15. Uso del péptido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, de la secuencia nucleotídica según la reivindicación 7, del anticuerpo según la reivindicación 8, de la célula según la reivindicación 9 o de la composición según la reivindicación 10, para la elaboración de un medicamento.
16. Uso del péptido, de la secuencia nucleotídica, del anticuerpo, de la célula o de la composición según la reivindicación 15, donde el medicamento es para la prevención y/o tratamiento de la enfermedad celiaca.
17. Uso del péptido, de la secuencia nucleotídica, del anticuerpo, de la célula o de la composición según la reivindicación 16, donde el medicamento es una vacuna.
18. Kit que comprende el péptido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6.
19. Kit que comprende el anticuerpo según la reivindicación 8.
. Uso del kit según la reivindicación 19 para la detección y cuantificación del péptido según cualquiera de las reivindicaciones 1
21 . Uso del kit según la reivindicación 20 donde la detección y/o cuantificación del péptido se realiza en alimentos.
22. Uso del kit según cualquiera de las reivindicaciones 18 ó 19 para el diagnóstico y/o seguimiento in vitro de la enfermedad celiaca en un individuo.
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