WO2013140103A1 - Procédé de détermination de la susceptibilité aux infections nosocomiales - Google Patents

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WO2013140103A1
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Astrid VILLARS
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Definitions

  • the present invention relates to the medical field in general, and in particular the field of resuscitation.
  • the invention relates to a method for determining the susceptibility to nosocomial infections in a patient hospitalized in intensive care and / or having undergone an aggression, such as surgery, burn, trauma ..., generating a systemic inflammatory response or SIRS, especially in a patient in septic state, particularly severe, and preferably in a patient in septic shock.
  • Nosocomial infections are an important public health problem. Inpatient patients often have, by their nature, diminished or impaired immune defenses, either because of pathologies that directly affect their immune skills, or because of their general condition. These patients, especially those who are malnourished or at extreme ages of life (elderly, infants) are especially susceptible to infections in general, and in particular to the occurrence of nosocomial infections.
  • nosocomial infections The prevalence of nosocomial infections is significantly higher in intensive care units than in other hospital sectors.
  • the significant incidence of nosocomial infections in this sector can be explained by the deleterious conjunction of several endogenous risk factors: patient exposure to invasive procedures (artificial ventilation, urinary catheterization, catheterization), patient severity (as well as associated comorbidities) and therapeutics (multiple transfusions, sedation).
  • patient exposure to invasive procedures artificial ventilation, urinary catheterization, catheterization
  • patient severity as well as associated comorbidities
  • therapeutics multiple transfusions, sedation
  • HLA-DR Human Leukocyte Antigen-DR
  • mHLA-DR Human Leukocyte Antigen-DR
  • flow cytometry requires special equipment (flow cytometer), which is not available on biological trays (used only in specialized hematology or immunology laboratories) and standardization of use is not established. Measurement of mHLA-DR can not be performed routinely.
  • the present invention proposes to provide a new biomarker predictive of an increased risk of nosocomial infections in a patient, and in particular in a patient hospitalized in intensive care and / or having undergone an attack (surgery, burn, trauma ...) generating a systemic inflammatory response (SIRS), especially in a patient in seven state 'tque, particularly severe, and preferably in a patient with septic shock.
  • SIRS systemic inflammatory response
  • the study of the level of expression of this biomarker thus makes it possible to determine, easily and quickly, the susceptibility of a patient to nosocomial infections and to take the necessary preventive measures.
  • the present invention therefore relates to a method for determining the susceptibility to nosocomial infections in a patient, comprising the following steps;
  • the method for determining the susceptibility to nosocomial infections according to the invention is therefore a method implemented in vitro or ex vivo.
  • SCD127 is the soluble or plasma form of CD127, an IL-7 receptor.
  • the CD127 or IL-7 receptor alpha chain is a 75 kDa glycoprotein member of the hematopoietic growth factor receptor superfa thousand. It is expressed at the membrane level in combination with CD 132 (common y chain c) to form the I1L-7 receptor. This receptor plays an important role in differentiation, survival and lymphocyte proliferation.
  • CD 127 consists of an extracellular portion of 219 amino acids (aa), a transmembrane portion of 25 aa and an intracytopiasmic portion of 195 aa.
  • sCD127 a soluble / plasmatic form
  • Nosocomial infection means any infection, mainly bacterial but also viral and fungal, that occurs in a health facility during or after management (diagnostic, therapeutic, palliative, preventive or educational), d. a patient, who was neither present nor incubating at the beginning of management. When the infectious state is not accurately known at the beginning of the treatment, a delay of at least 48 hours or a period longer than the incubation period is commonly accepted to define a nosocomial infection.
  • systemic inflammatory response means a response associating at least two of the following criteria: Temperature> 38 ° C or ⁇ 36 ° C, Heart rate> 90 / minute, Respiratory rate > 20 / minute or paCO2 ⁇ 32 mmHg, Leucocytes> 12,000 / mm3 or ⁇ 4,000 / mm3 (Bone et al., Chest, 1992, 1644-1655.
  • sCD127 means the soluble form or circulating form (also called plasma or serum form) of the IL-7 receptor, also called IL-7 receptor alpha chain or IL7R or IL7R-ALPHA or IL7RA or CDW127, and in particular as described by Goodwin et al, Cell, 1990, 23, 941-951 and assayed by Crawley et al, Journal of Immunology, 2010, 184, 4679-4687,
  • the reference nucleic sequences for sCD127 according to the invention are preferably as follows: Ensembl: ENSG00000168685, HPRD-ID: 00893 Nucleotide sequence: N 002185,2, Vega genes: OTTHUMG00000090791.
  • the reference protein sequences for SCD127 according to the invention are preferably the following: NPJD02176 XPJ542460; version: NP_002176.2 GI: 28610151.
  • the sample to be tested in the context of the method of the invention is a biological sample from the patient in whom it is desired to determine the susceptibility to nosocomial infections.
  • a biological sample is selected from those likely to contain the SCD127 marker.
  • the present invention has a particularly preferred application in patients hospitalized in intensive care and / or having undergone an aggression, such as surgery, burn, trauma ..., generating a systemic inflammatory response or SIRS. Therefore, the biological sample used in the process of the invention is preferably from a patient hospitalized in intensive care and / or having undergone an aggression (surgery, burn, trauma, etc.) generating an answer.
  • Systemic Inflammatory System SIRS
  • the biological sample used in the context of the method of the invention is derived from a septic shock patient.
  • the method of the invention makes it possible to determine the susceptibility of a patient to nosocomial infections, that is to say to conclude that there is an increased risk of developing a nosocomial infection or to an increased susceptibility to infections. nosocomial infections, when overexpression of SCD127 is demonstrated in the test sample with respect to a first reference value.
  • overexpression is meant a statistically significant increase in the level of expression.
  • the first reference value may correspond to the level of expression of sCD127 measured in a biological sample from a patient hospitalized in intensive care and / or having undergone an aggression, such as surgery, burn, trauma.
  • generating a systemic inflammatory response or SIRS that is known to have failed to develop a nosocomial infection including a patient in a septic state who is known to have no nosocomial infection, and preferably a patient with septic shock who is known to have failed to develop a nosocomial infection.
  • this measurement of the expression of sCD127 which constitutes the first reference value is preferably carried out in parallel, that is to say at the same time as the measurement of the expression of sCD127 which is made in the sample from the patient for which susceptibility to nosocomial infections is sought, although the baseline sample was taken prior to the sample to be tested.
  • This first reference value may also correspond to an average value of the level of expression of sCD127 which is measured on a pool of samples from patients hospitalized in intensive care and / or having undergone an aggression, such as surgery, burn, trauma. .., generating a systemic inflammatory response (SIRS) that we know they do not have developed nosocomial infection, including patients in septic state who are known to have not developed a nosocomial infection, and preferably patients in septic shock who are known not to have developed infection nosocomial.
  • SIRS systemic inflammatory response
  • this measurement of the expression of sCD127 which constitutes the first reference value is preferably carried out prior to the measurement of the expression of SCD127 which is made in the sample from the patient in which it is sought to determine the Susceptibility to nosocomial infections, although the collection of reference samples intended to be “pooled” was carried out before that of the sample to be tested.
  • the measurement of the expression of sCD127 in the test sample and, where appropriate, in the biological sample used to to obtain the first reference value, that is to say when the first reference value is obtained from a biological sample is carried out within 10 days or 10 days (D10) after the septic shock, preferably within 7 days or at 7 days (D7) after septic shock, more preferably within 4 days or at 4 days (D4) after septic shock, and in particular within 3 days or at 3 days (D3) after septic shock.
  • the method of the invention makes it possible to determine the susceptibility of a patient to nosocomial infections, that is to say to conclude that there is an increased risk of developing a nosocomial infection or to an increased susceptibility to infections.
  • Nosocomial infections when the expression of sCD127 which is measured in the test sample is not significantly reduced compared to a second reference value.
  • it is concluded that there is an increased risk of developing a nosocomial infection if the expression of sCD127 which is measured in the test sample is not decreased by more than 25%, and in particular not decreased by more than 25%. 20%, compared to this second reference value.
  • This second reference value may correspond to the level of expression of SCD127 measured in a biological sample from the same said patient during an earlier sample, that is to say in a biological sample that has been taken previously compared to the sample to be tested.
  • prior or “prior” is meant earlier in time or prior to sampling of the test sample.
  • the measurement of the expression of sCD127 in the sample to be tested is carried out approximately or at 10 days (D10) after septic shock, preferably about or 7 days (J7) after septic shock, more preferably about or 4 days (34) after septic shock.
  • the previous sample may for example be made within 48 hours after the septic shock and at least 24 hours before that of the sample to be tested, and preferably the previous sample is taken within 48 hours after the septic shock and that of the test sample is made within 48 hours after the previous sample or 48 hours after the previous sample.
  • the method of the invention may comprise the prior obtaining of the reference value, whether it is the first value of reference or the second reference value, at which the level of expression that will be detected in the test sample can be compared to conclude whether there is an increased risk of developing nosocomial infections in the patient from whom the sample originates to test.
  • sample on which the method of the invention is implemented also called sample to be tested, can be of animal or human origin, and preferably human.
  • the sample to be tested may be of different natures.
  • this sample is a biological fluid, for example selected from blood, whole blood (as collected from the venous route, that is to say containing white and red cells, platelets and plasma), serum, plasma and bronchoalveolar lavage fluid.
  • the test sample from said patient is a sample of plasma or serum.
  • the samples from which the reference values can be determined may be of different natures and in particular of a biological nature as mentioned above. above concerning the sample to be tested (biological fluids).
  • these biological samples are of the same nature as that of the biological sample to be tested or at least of a compatible nature to constitute a reference as to the detection and / or quantification of the expression of sCD127.
  • these samples are preferably derived from persons having the same characteristics or a majority of common characteristics, in particular of the same sex and / or of a similar or identical age and / or of the same ethnic origin. , with those of the subject or patient at whom it is desired to determine susceptibility to nosocomial infections.
  • the reference sample may also in this case be constituted by any sample, biological or non-biological, which has been previously calibrated to contain an average value of sCD127 which corresponds to the level that has been measured on a pool of biological samples from patients, hospitalized in intensive care and / or having undergone an aggression, such as surgery, burn, trauma ..., generating a systemic inflammatory response (SIRS) which one knows that they did not develop a nosocomial infection, in particular of patients in state are not known to have developed a nosocomial infection, and preferably patients with septic shock who are known to have failed to develop a nosocomial infection.
  • the reference sample is derived from one or more patients in septic shock who are known to have (have) not developed a nosocomial infection.
  • the reference sample is a biological sample from the same said patient, that is to say the patient in whom it is desired to determine the susceptibility to nosocomial infections and from which is derived the sample to be tested, but obtained from an earlier sample, that is to say from a biological sample that was taken earlier in time relative to the sample to be tested.
  • the term "measure expression” is meant to be an in vitro or ex vivo measure.
  • this term is intended to mean the detection and quantification of SCD127 at the protein level.
  • any method of detection and / or quantification well known to those skilled in the art can be used for the implementation of the invention, whether in connection with the determination of the presence and / or measurement of the expression of the sCD127 protein.
  • a method for measuring the expression of the sCD127 protein mention may be made especially of that described by Crawley et al, Journal of Immunology, 2010, 184, 4679-4687.
  • the measurement of SCD127 expression level is performed using tools or reagents that are sCD127 specific and that allow, directly or indirectly, to determine its presence and / or to quantify its level. expression.
  • tools or reagents those which are specific for the soluble form of the IL-7 receptor, that is to say which do not do not recognize CD127 which is the non-soluble cell / membrane form of this receptor.
  • tools or reagents that recognize both the soluble form or sCD127 and the cellular form of the IL-7 or CD127 receptor can be used, as long as it is possible to distinguish these two forms by other means, such as for example the nature of the sample analyzed (for example, plasma or serum versus biological sample containing cells or whole blood).
  • sCD127 When detection and / or quantification of sCD127 is performed at the protein level, standard techniques such as Western Blot, ELISA, RIA, IRMA, FIA, CLIA, ECL, flow cytometry or immunocytology can be used.
  • the expression of sCD127 is measured at the protein level, and preferably using an ELISA technique.
  • the level of expression of sCD127 is preferably measured using anti-sCD127 antibodies, monoclonal or polyclonal, and in particular anti-sCD127 monoclonal antibodies.
  • anti-sCD127 antibodies monoclonal or polyclonal, and in particular anti-sCD127 monoclonal antibodies.
  • the present invention also relates to the use of the measurement, in vitro or ex vivo, of the expression of sCD127 to determine the susceptibility of a patient to nosocomial infections.
  • this use is particularly advantageous for determining the susceptibility to nosocomial infections of a patient hospitalized in intensive care and / or having undergone an aggression, such as surgery, burn, trauma ..., generating an inflammatory response.
  • systemic or SIRS in particular of a patient in septic state, in particular severe, and preferably of a patient in septic shock.
  • the use according to the invention makes it possible to determine the susceptibility to nosocomial infections of a patient in septic shock.
  • the expression of sCD127 is preferably measured at the protein level, and in particular using an ELISA technique.
  • the expression of sCD127 can be measured using anti-sCD127 antibodies, monoclonal or polyclonal, and preferably anti-sCD127 monoclonal antibodies.
  • anti-sCD127 antibodies monoclonal or polyclonal, and preferably anti-sCD127 monoclonal antibodies.
  • the antibodies mentioned above can also be used for this second aspect of the invention.
  • the present invention also relates to a kit for measuring, in vitro or ex vivo, the expression of sCD127 in a biological sample, comprising:
  • a positive control sample which is a sample calibrated to contain the amount of sCD127 which corresponds to the average amount measured in a pool of patient samples known to have developed a nosocomial infection
  • a negative control sample which is a calibrated sample to contain the amount of sCD127 that corresponds to the average amount measured in a pool of patient samples that are known to have failed to develop a nosocomial infection.
  • the kit according to the invention comprises specific tools or reagents for measuring the expression of SCD127 in said biological sample, and at least one control sample.
  • the kit according to the invention makes it possible in particular to determine the susceptibility to nosocomial infections in a patient, and in particular in a patient in septic shock.
  • the specific tools or reagents making it possible to measure the expression of sCD127 in a biological sample which are present in the kit of the invention make it possible to detect and / or quantify the expression of SCD127, whether at the protein level or at the level of sCD127 activity, and preferably at the protein level.
  • the kit of the invention contains anti-sCD127 antibodies, monoclonal or polyclonal, and in particular monoclonal antibodies.
  • Another positive control sample may also be a sample from a patient known to have developed a nosocomial infection.
  • another negative control sample may also be a sample from a patient known to have no nosocomial infection.
  • this type of control sample is preferably from one or more patient (s) hospitalized (s) in intensive care and / or having undergone an aggression, such as surgery, burn, trauma ..., generating a systemic inflammatory response (SIRS), including one or more patient (s) in septic status, and preferably one or more patient (s) in septic shock.
  • SIRS systemic inflammatory response
  • the kit may contain a negative control sample from one or more patient (s) hospitalized in intensive care and / or having undergone an aggression, such as surgery, burn, trauma ..., generating an answer Systemic Inflammatory Disease (SIRS), which is known to have failed to develop a nosocomial infection, particularly from one or more patients with septic shock who are known to be (s) has not developed a nosocomial infection.
  • SIRS Systemic Inflammatory Disease
  • the kit comprises both a positive control sample and a negative control sample, and in particular each selected from the calibrated samples as defined above.
  • the invention also covers the use of a kit according to the invention for carrying out the method of the invention, and in particular for determining the susceptibility of a patient to nosocomial infections, preferably in a patient hospitalized in intensive care and / or or having undergone an aggression, such as surgery, burn, trauma ..., generating a systemic inflammatory response (SIRS), in particular in a patient in septic state, particularly severe, and preferably a patient in septic shock.
  • SIRS systemic inflammatory response
  • the use of the kit according to the invention makes it possible to determine the susceptibility to nosocomial infections in a patient in septic shock.
  • FIG. 1 represents the concentration of plasma IL-7 in 35 patients in septic shock on days 1-2 (1-2) and 3-4 (3-4) and 30 healthy subjects "HV" (A) and the comparing these results by "NS" or “S” patient groups ( Figure 1B) and "NI” or “No NI” patient groups ( Figure 1C).
  • FIG. 2 represents the expression of CD127 on CD4 + T cells (FIG. 2A) and on CD8 + T cells (FIG. 2B) in 35 septic shock patients on days 1-2 and 3-5 and 30 healthy subjects. " H V ".
  • FIG. 3 represents the concentration of plasma SCD127 in 35 septic shock patients at days 1-2 and 3-4 and 30 healthy subjects (FIG. 3A) and the comparison of these results according to the groups of patients “NS" or “S” ( Figure 3B) and patient groups “NI” or “No NI” ( Figure 3C).
  • FIG. 4 represents the expression of the HLA-DR marker in 35 septic shock patients on days 1-2 and 3-4 and 30 healthy subjects according to the "NI" or "No NI” patient groups.
  • the plasma IL-7 concentration was measured using a kit using the LU INEX TM technique marketed by Bio-Rad (Bio-Plex Pro Cytokine, Chemokine and Growth Factor Assays: BioPlex Pro Reagent kit, Bio-Rad # 171-304070 and SinglePlex IL-7) following the instructions of the supplier.
  • a "coating" buffer was prepared to contain 0.8 g Na 2 CO 3 , 1.4 g NaHCO 3 , 0.1 g NaN 3 in 500 ml of water (pH 9.6).
  • Nonspecific binding was blocked with 150 ⁇ l blocking buffer per well (10% fetal bovine serum (FBS) / PBS-0.05% Tween 20 ), and then the plate was incubated for 1 hr. 37 ° C,
  • sample or control solution of CD127 Fc chimera reconstituted extemporanérnent and aliquoté at concentrations of 60ng / m! iOng / m! were added to each well, and then the plate was incubated for 1h at 37 ° C
  • streptavidin-HRP 8 ⁇ l / ml
  • the contents of the wells were aspirated and the wells were washed 3 times with at least 300 ⁇ l of 0.05% PBS-Tween2O Wash Buffer. All the liquid was carefully removed with each wash. After the last wash, the plate was inverted on paper towels to remove all traces of buffer. At this washing step, the wells were soaked with the wash buffer 1 to 2 min before aspiration.
  • the two bottles of the TMB (3,3 ', 5,5'-tetramethylbenzidine, bioMérieux # XX7LF1UC) color substrate solution were mixed volume-to-volume. 100 ⁇ l of this substrate solution was placed in each well. The plate was then covered to be incubated for 30 min at room temperature. Finally, the reading of the plate was carried out by measuring the absorbance at 450 nm.
  • the measurement was carried out by the flow cytometry technique, using a direct labeling in whole blood taken on EDTA.
  • the red blood cells were then removed: lysis by adding 1 ml of lysis solution (sold by the company Becton Dickinson under the reference 349202) diluted (1/10) (15 minutes at room temperature and in the dark).
  • the cells were then analyzed on a flow cytometer (FC500 - Beckman Coulter).
  • results are expressed in% of positive cells, the threshold of positivity being defined thanks to an isotypic control (Mouse IgG2a PE Becton Dickinson - Ref .: 349053).
  • Various parameters or markers were measured such as plasma IL-7 and sCD127 concentrations, and CD127 expression on CD4 + T cells, and HLA-DR expression on monocytes.
  • NS plasma IL-7 and sCD127 concentrations
  • CD127 expression on CD4 + T cells CD4 + T cells
  • HLA-DR expression on monocytes HLA-DR expression on monocytes.
  • IL-7 receptor (CD127) cell expression is conserved after septic shock ( Figure 2A and 2B), and without any difference between surviving "S” patients or non-survivors "NS” or patients who have developed nosocomial infections "NI” or not "No NI” (results not shown).
  • sCD127 is an immunological marker useful for determining the susceptibility of a patient to nosocomial infections, and in particular patients hospitalized in intensive care and / or who have undergone aggression (surgery, burns, trauma ...) generating a systemic inflammatory response (SIRS), and in particular patients in septic state, particularly severe, and preferably patients in septic shock.
  • SIRS systemic inflammatory response

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Description

PROCEDE DE DETERMINATION DE LA SUSCEPTIBILITE AUX INFECTIONS NOSOCOMIALES
La présente invention concerne îe domaine médical en général, et en particulier le domaine de la réanimation.
Plus précisément, l'invention concerne un procédé de détermination de la susceptibilité aux infections nosocomiaies chez un patient hospitalisé en réanimation et/ou ayant subi une agression, telle que chirurgie, brûlure, traumatisme..., générant une réponse inflammatoire systémique ou SIRS, en particulier chez un patient en état septique, notamment sévère, et de préférence chez un patient en choc septique.
Les infections nosocomiaies sont un problème de santé publique important. Les patients hospitalisés ont souvent, par nature, des défenses immunitaires diminuées ou altérées, du fait de pathologies portant directement atteinte à leurs compétences immunitaires, ou en raison de leur état général. Ces patients, et en particulier les personnes dénutries ou aux âges extrêmes de la vie (personnes âgées, nourrissons) sont spécialement sensibles aux infections en général, et en particulier à la survenue d'infections nosocomiaies.
La prévalence des infections nosocomiaies est nettement plus élevée dans les unités de réanimation que celle observée dans d'autres secteurs hospitaliers. L'incidence importante des infections nosocomiaies dans ce secteur s'explique par la conjonction délétère de plusieurs facteurs de risque endogènes : une exposition du patient à des procédures invasives (ventilation artificielle, sondage urinaire, cathétérisme), la gravité des patients (ainsi que les comorbidités associées) et les thérapeutiques (transfusions multiples, sédation). Néanmoins malgré l'ensemble des mesures d'hygiène et de surveillance (risques exogènes) et la prise en compte de ces facteurs de risque endogènes, l'incidence des infections nosocomiaies reste stable ou diminue modestement. Déterminer la susceptibilité d'un patient aux infections nosocomiales est donc essentiel pour pouvoir proposer une prise en charge personnalisée, et ainsi tenter de minimiser les risques additionnels de décès,
A la connaissance des inventeurs, le seul marqueur immunologique actuellement connu pour être associé à une susceptibilité accrue aux infections nosocomiales est le marqueur HLA-DR (Human Leukocyte Antigen- DR) dont l'expression sur les monocytes (mHLA-DR) est diminuée chez les patients qui développent des infections nosocomiales. Cependant, l'expression de ce marqueur, développée en cytométrie en flux nécessite un équipement particulier (cytomètre en flux), qui est non disponible sur les plateaux de biologie (usage réservé à des laboratoires spécialisés d'hématologie ou d'immunologie) et dont la standardisation d'utilisation n'est pas établie. La mesure de mHLA-DR ne peut donc pas être réalisée en routine.
Ainsi, il existe un réel besoin de disposer d'autres marqueurs immunologiques permettant de prévoir, facilement et rapidement, la susceptibilité d'un patient aux infections nosocomiales. En effet, pouvoir identifier les sujets les plus à risque de contracter des infections nosocomiales permettrait de leur réserver des thérapeutiques préventives plus adaptées et ciblées.
C'est dans ce contexte que la présente invention se propose de fournir un nouveau biomarqueur prédictif d'un risque accru aux infections nosocomiales chez un patient, et notamment chez un patient hospitalisé en réanimation et/ou ayant subi une agression (chirurgie, brûlure, traumatisme...) générant une réponse inflammatoire systémique (SIRS), en particulier chez un patient en état sept'tque, notamment sévère, et de préférence chez un patient en choc septique. L'étude du niveau d'expression de ce biomarqueur permet ainsi de déterminer, facilement et rapidement, la susceptibilité d'un patient aux infections nosocomiales et de prendre les dispositions préventives nécessaires. Se!on un premier aspect, la présente invention a donc pour objet un procédé de détermination de la susceptibilité aux infections nosocomiales chez un patient, comprenant les étapes suivantes ;
- mesurer l'expression de sCD127 dans un échantillon biologique issu dudit patient ou échantillon à tester,
- conclure à une susceptibilité accrue aux infections nosocomiales après comparaison de l'expression de sCD127 par rapport à une valeur de référence.
Le procédé de détermination de la susceptibilité aux infections nosocomiales selon l'invention est donc un procédé mis en oeuvre in vitro ou ex vivo.
Le sCD127 est la forme soluble ou plasmatique du CD127, récepteur de l'IL-7. Le CD127 ou chaîne alpha du récepteur de l'IL-7 est une glycoprotéine de 75 kDa membre de la superfa mille des récepteurs aux facteurs de croissance hématopoïétiques. Il est exprimé au niveau membranaire en association avec le CD 132 (chaîne yc commune) pour former le récepteur de I1L-7. Ce récepteur joue un rôle important dans la différenciation, la survie et la prolifération lymphocytaire. Le CD 127 est constitué d'une partie extracellulaire de 219 acides aminés (aa), d'une partie transmembranaire de 25 aa et d'une partie intracytopiasmique de 195 aa. L'existence d'une forme soluble/plasmatique, nommée sCD127, générée par épissage alternatif de l'ARNm codant le CD127 a été décrite en 1990 par Goodwin RG et ai., Ce//, 1990, 23, 941-951, mais sa fonction biologique reste à ce jour mal connue.
On entend par « infection nosocomiale », toute infection, principalement bactérienne mais également virale et fongique, qui survient dans un établissement de santé au cours ou au décours d'une prise en charge (diagnostique, thérapeutique, palliative, préventive ou éducative), d'un patient, et qui n'était ni présente ni en incubation au début de la prise en charge. Lorsque l'état infectieux n'est pas connu avec précision au début de la prise en charge, un délai d'au moins 48 heures ou un délai supérieur à la période d'incubation est couramment accepté pour définir une infection nosocomiale. Au sens de l'invention, on entend par « réponse inflammatoire systémique » ou « SIRS », une réponse associant au moins deux des critères suivants : Température > 38 °C ou < 36 °C, Fréquence cardiaque > 90/minute, Fréquence respiratoire > 20 / minute ou paC02 <32 mmHg, Leucocytes > 12.000/mm3 ou < 4.000/mm3 (Bone ét al., Chest, 1992, 1644- 1655.
Dans le cadre de l'invention, on entend par « sCD127 » la forme soluble ou forme circulante (encore nommée forme plasmatique ou sérique) du récepteur de l'IL-7, encore nommé chaîne alpha du récepteur de i'IL-7 ou IL7R ou IL7R-ALPHA ou IL7RA ou CDW127, et en particulier telle que décrite par Goodwin et al, Cell, 1990, 23, 941-951 et dosée par Crawley et al, Journal of Immunology, 2010, 184, 4679-4687,
En particulier, les séquences nucléiques de référence pour sCD127 selon l'invention sont de préférence les suivantes : Ensembl : ENSG00000168685, HPRD-ID : 00893 Séquence nucléotidique : N 002185,2, Vega gènes : OTTHUMG00000090791.
Par ailleurs, les séquences protéiques de référence pour SCD127 selon l'invention sont de préférence les suivantes : NPJD02176 XPJ542460 ; version : NP_002176.2 GI:28610151.
L'échantillon à tester dans le cadre du procédé de l'invention est un échantillon biologique provenant du patient chez qui on souhaite déterminer la susceptibilité aux infections nosocomiales. En particulier, un tel échantillon biologique est choisi parmi ceux susceptibles de contenir le marqueur SCD127.
La présente invention présente une application particulièrement préférée chez les patients hospitalisés en réanimation et/ou ayant subi une agression, telle que chirurgie, brûlure, traumatisme..., générant une réponse inflammatoire systémique ou SIRS. Par conséquent, l'échantillon biologique mis en œuvre dans le cadre du procédé de l'invention est de préférence issu d'un patient hospitalisé en réanimation et/ou ayant subi une agression (chirurgie, brûlure, traumatisme...) générant une réponse inflammatoire systémique (SIRS), en particulier issu d'un patient en état septique, notamment sévère, et en particulier issu d'un patient en choc septique. De manière particulièrement préférée, l'échantillon biologique mis en œuvre dans le cadre du procédé de l'invention est issu d'un patient en choc septique.
Selon un premier mode de réalisation préféré, le procédé de l'invention permet de déterminer la susceptibilité d'un patient aux infections nosocomiales, c'est-à-dire conclure à un risque accru de développer une infection nosocomiale ou à une suceptibilité accrue aux infections nosocomiales, lorsqu'une surexpression de SCD127 est mise en évidence dans l'échantillon à tester par rapport à une première valeur de référence.
Par « surexpression », on entend une augmentation statistiquement significative du niveau d'expression.
Dans ce mode de réalisation, la première valeur de référence peut correspondre au niveau d'expression de sCD127 mesuré dans un échantillon biologique issu d'un patient hospitalisé en réanimation et/ou ayant subi une agression, telle que chirurgie, brûlure, traumatisme..., générant une réponse inflammatoire systémique ou SIRS dont on sait qu'il n'a pas développé d'infection nosocomiale, notamment d'un patient en état septique dont on sait qu'il n'a pas développé d'infection nosocomiale, et de préférence d'un patient en choc septique dont on sait qu'il n'a pas développé d'infection nosocomiale. Dans ce cas, cette mesure de l'expression de sCD127 qui constitue la première valeur de référence est de préférence effectuée en parallèle, c'est-à-dire en même temps que la mesure de l'expression de sCD127 qui est faite dans l'échantillon issu du patient chez qui on cherche à déterminer la susceptibilité aux infections nosocomiales, bien que le prélèvement de l'échantillon de référence ait été effectuée antérieurement à celui de l'échantillon à tester.
Cette première valeur de référence peut également correspondre à une valeur moyenne du niveau d'expression de sCD127 qui est mesuré sur un pool d'échantillons issu de patients hospitalisés en réanimation et/ou ayant subi une agression, telle que chirurgie, brûlure, traumatisme..., générant une réponse inflammatoire systémique (SIRS) dont on sait qu'ils n'ont pas développé d'infection nosocomiale, notamment de patients en état septique dont on sait qu'ils n'ont pas développé d'infection nosocomiale, et de préférence de patients en choc septique dont on sait qu'ils n'ont pas développé d'infection nosocomiale. Dans ce cas, cette mesure de l'expression de sCD127 qui constitue la première valeur de référence est de préférence effectuée préalablement à la mesure de l'expression de SCD127 qui est faite dans l'échantillon issu du patient chez qui on cherche à déterminer la susceptibilité aux infections nosocomiaies, bien que le prélèvement des échantillons de référence destinés à être « poolés » ait été effectué antérieurement à celui de l'échantillon à tester.
Dans ce premier mode de réalisation préféré, et notamment pour déterminer ia susceptiblité aux infections nosocomiaies d'un patient en choc septique, la mesure de l'expression de sCD127 dans l'échantillon à tester et le cas échéant dans l'échantillon biologique utilisé pour obtenir la première valeur de référence, c'est-à-dire lorsque la première valeur de référence est obtenue à partir d'un échantillon biologique, est réalisée dans les 10 jours ou à 10 jours (J10) après le choc septique, de préférence dans les 7 jours ou à 7 jours (J7) après le choc septique, de manière encore préférée dans les 4 jours ou à 4 jours (J4) après le choc septique, et en particulier dans les 3 jours ou à 3 jours (J3) après le choc septique.
Selon un deuxième mode de réalisation préféré, le procédé de l'invention permet de déterminer la susceptibilité d'un patient aux infections nosocomiaies, c'est-à-dire conclure à un risque accru de développer une infection nosocomiale ou à une susceptibilité accrue aux infections nosocomiaies, lorsque l'expression de sCD127 qui est mesurée dans l'échantillon à tester n'est pas significativement diminuée par rapport à une deuxième valeur de référence. De manière particulièrement préférée, il est conclut à un risque accru de développer une infection nosocomiale si l'expression de sCD127 qui est mesurée dans l'échantillon à tester n'est pas diminuée de plus de 25 %, et en particulier pas diminuée de plus de 20 %, par rapport à cette deuxième valeur de référence. Cette deuxième valeur de référence peut correspondre au niveau d'expression de SCD127 mesuré dans un échantillon biologique issu du même dit patient lors d'un prélèvement antérieur, c'est-à-dire dans un échantillon biologique qui a été prélevé antérieurement par rapport à l'échantillon à tester. Par « antérieurement » ou « antérieur », on entend de manière plus précoce dans le temps ou préalablement au prélèvement de l'échantillon à tester.
Dans ce deuxième mode de réalisation préféré, et notamment pour déterminer la susceptiblité aux infections nosocomiales d'un patient en choc septique, la mesure de l'expression de sCD127 dans l'échantillon à tester est réalisée environ ou à 10 jours (J10) après le choc septique, de préférence environ ou à 7 jours (J7) après le choc septique, de préférence encore environ ou à 4 jours (34) après le choc septique.
Le prélèvement antérieur peut par exemple être effectué dans les ou à 48h après le choc septique et au moins 24h avant celui de l'échantillon à tester, et de préférence le prélèvement antérieur est effectué dans les ou à 48h après le choc septique et celui de l'échantillon à tester est effectué dans les 48h qui suivent le prélèvement antérieur ou à 48h après le prélèvement antérieur.
Ainsi, dans tous les cas, avant la mesure de l'expression de sCD127 proprement dite dans l'échantillon à tester, le procédé de l'invention peut comprendre l'obtention préalable de la valeur de référence, que ce soit la première valeur de référence ou la deuxième valeur de référence, à laquelle le niveau d'expression qui sera détecté dans l'échantillon à tester pourra être comparé afin de conclure à un risque accru ou non de développer des infections nosocomiales chez le patient duquel est issu l'échantillon à tester.
C'est donc à ces valeurs de référence, que ce soit la première valeur de référence ou la deuxième valeur de référence, obtenues préalablement ou en même temps, que sera comparée la valeur de l'expression de SCD127 qui est mesurée dans l'échantillon à tester. L'échantillon sur lequel le procédé de l'invention est mis en œuvre, encore nommé ici échantillon à tester, peut être d'origine animale ou humaine, et de préférence humaine.
Par conséquent, l'échantillon à tester peut être de différentes natures. En particulier, cet échantillon est un fluide biologique, par exemple choisi parmi le sang, le sang total (tel que collecté de la voie veineuse, c'est-à-dire contenant les cellules blanches et rouges, les plaquettes et le plasma), le sérum, le plasma et le liquide de lavage broncho-alvéolaire.
De préférence, l'échantillon à tester issu dudit patient est un échantillon de plasma ou de sérum.
Les échantillons à partir desquels peuvent être déterminées les valeurs de référence, que ce soit la première valeur de référence ou la deuxième valeur de référence, encore nommés « échantillons de référence », peuvent être de différentes natures et notamment de nature biologique tel que mentionné ci-dessus s'agissant de l'échantillon à tester (fluides biologiques). Avantageusement, ces échantillons biologiques sont de même nature que celle de l'échantillon biologique à tester ou tout du moins d'une nature compatible pour constituer une référence quant à la détection et/ou la quantification de l'expression de sCD127.
Pour obtenir la première valeur de référence en particulier, ces échantillons sont de préférence issus de personnes ayant les mêmes caractéristiques ou une majorité de caractéristiques communes, notamment du même sexe et/ou d'un âge similaire ou identique et/ou de même origine ethnique, avec celles du sujet ou patient chez qui on souhaite déterminer la susceptibilité aux infections nosocomiaies. L'échantillon de référence peut également dans ce cas être constitué par tout échantillon, biologique ou non biologique, qui a été préalablement calibré pour contenir une valeur moyenne de sCD127 qui correspond au niveau qui a été mesuré sur un pool d'échantillons biologiques issus de patients, hospitalisés en réanimation et/ou ayant subi une agression, tell que chirurgie, brûlure, traumatisme..., générant une réponse inflammatoire systémique (SIRS) dont on sait qu'ils n'ont pas développé d'infection nosocomiale, notamment de patients en état septique dont on sait qu'ils n'ont pas développé d'infection nosocomiale, et de préférence de patients en choc septique dont on sait qulls n'ont pas développé d'infection nosocomiale. Dans ce cas, et selon une variante particulièrement préférée, l'échantillon de référence est issu d'un ou de patients en choc septique dont on sait qu'il(s) n'a(ont) pas développé d'infection nosocomiale.
Pour obtenir la deuxième valeur de référence en particulier, l'échantillon de référence est un échantillon biologique issu du même dit patient, c'est-à- dire du patient chez qui on souhaite déterminer la susceptibilité aux infections nosocomiales et dont est issu l'échantillon à tester, mais obtenu à partir d'un prélèvement antérieur, c'est-à-dire d'un échantillon biologique qui a été prélevé antérieurement dans le temps par rapport à l'échantillon à tester.
Au sens de la présente invention, le terme « mesurer l'expression » s'entend être une mesure in vitro ou ex vivo. Par ailleurs, ce terme entend désigner ia détection et la quantification de SCD127 au niveau protéique. A cet effet, toute méthode de détection et/ou de quantification bien connue de l'homme du métier peut être utilisée pour ia mise en œuvre de l'invention, que ce soit en rapport avec la détermination de la présence et/ou la mesure de l'expression de la protéine sCD127. A titre d'exemple de méthode de mesure de l'expression de la protéine sCD127, on peut notamment citer celle décrite par Crawley et al, Journal of Immunoiogy, 2010, 184, 4679-4687.
En particulier, la mesure du niveau d'expression de SCD127 est réalisée à l'aide d'outils ou de réactifs qui sont spécifiques de sCD127 et qui permettent, directement ou indirectement, de déterminer sa présence et/ou de quantifier son niveau d'expression.
Parmi les outils ou réactifs capable(s) de détecter et/ou quantifier sCD127, on peut notamment citer des anticorps spécifiques, polyclonaux ou monoclonaux, de préférence monoclonaux, ou des fragments ou dérivés de ceux-ci, par exemple des anticorps « single chain » Sv.
Parmi ces outils ou réactifs, on préféra notamment ceux qui sont spécifiques de la forme soluble du récepteur de l'IL-7, c'est-à-dire qui ne reconnaissent pas CD127 qui est la forme celiulaire/membranaire non soluble de ce récepteur. On peut néanmoins utiliser des outils ou réactifs qui reconnaissent à la fois la forme soluble ou sCD127 et la forme cellulaire du récepteur de l'IL-7 ou CD127, tant qu'il est possible de distinguer ces deux formes par un autre moyen, comme par exemple la nature de l'échantillon analysé (par exemple, plasma ou sérum versus échantillon biologique contenant des cellules ou sang total).
Lorsque la détection et/ou la quantification de sCD127 est réalisée au niveau protéique, les techniques standards telles que le Western-Blot, ELISA, RIA, IRMA, FIA, CLIA, ECL, cytométrie de flux ou immunocytologie peuvent être utilisées.
De manière particulièrement avantageuse, l'expression de sCD127 est mesurée au niveau protéique, et de préférence à l'aide d'une technique ELISA.
Selon l'invention, et en particulier dans ce mode de réalisation particulier, le niveau d'expression de sCD127 est de préférence mesuré à l'aide d'anticorps anti-sCD127, monoclonaux ou polyclonaux, et notamment d'anticorps monoclonaux anti-sCD127. A titre d'exemple, on peut notamment citer les anticorps monoclonaux anti~CD127 humain R34.34 commercialisés par la société Beckman Coulter® ou les anticorps polyclonaux anti-CD127 commercialisés par la société R&D Systems®.
Toutes les indications et préférences mentionnées ci-dessus s'agissant de la mesure de l'expression de sCD127 s'appliquent indifféremment que ce soit pour la mesure de cette expression dans l'échantillon à tester et dans l'échantillon de référence.
Selon un deuxième aspect, la présente invention a également pour objet l'utilisation de la mesure, in vitro ou ex vivo, de l'expression de sCD127 pour déterminer la susceptibilité d'un patient aux infections nosocomiaies.
De manière préférée, cette utilisation est particulièrement avantageuse pour déterminer la susceptibilité aux infections nosocomiaies d'un patient hospitalisé en réanimation et/ou ayant subi une agression, telle que chirurgie, brûlure, traumatisme..., générant une réponse inflammatoire systémique ou SIRS, en particulier d'un patient en état septique, notamment sévère, et de préférence d'un patient en choc septique. De préférence, l'utilisation selon l'invention permet de déterminer la susceptibilité aux infections nosocomiales d'un patient en choc septique.
Par ailleurs, dans le cadre de l'utilisation selon l'invention, l'expression de sCD127 est de préférence mesurée au niveau protéique, et en particulier à l'aide d'une technique ELISA.
En particulier, l'expression de sCD127 peut être mesurée à l'aide d'anticorps anti-sCD127, monoclonaux ou polyclonaux, et de préférence d'anticorps monoclonaux anti-sCD127. Les anticorps cités ci-dessus peuvent également être utilisés pour ce deuxième aspect de l'invention.
Plus largement, tous les modes de réalisation préférés qui sont mentionnés ci-dessus concernant le procédé et leurs combinaisons constituent également des modes de réalisation préférés s'agissant de l'utilisation.
Selon un troisième aspect, la présente invention a aussi pour objet un kit pour la mesure, in vitro ou ex vivo, de l'expression de sCD127 dans un échantillon biologique, comprenant :
- des outils ou réactifs spécifiques permettant de mesurer l'expression de sCD127 dans ledit échantillon biologique, et
- un échantillon contrôle positif qui est un échantillon calibré pour contenir la quantité de sCD127 qui correspond à la quantité moyenne mesurée dans un pool d'échantillons de patients dont on sait qu'ils ont développé une infection nosocomiale, et/ou un échantillon contrôle négatif qui est un échantillon calibré pour contenir la quantité de sCD127 qui correspond à la quantité moyenne mesurée dans un pool d'échantillons de patients dont on sait qu'ils n'ont pas développé d'infection nosocomiale.
Ainsi, le kit selon l'invention comprend des outils ou réactifs spécifiques permettant de mesurer l'expression de SCD127 dans ledit échantillon biologique, et au moins un échantillon contrôle. Le kit selon l'invention permet en particulier de déterminer la susceptibilité aux infections nosocomiales chez un patient, et notamment chez un patient en choc septique.
De préférence, les outils ou réactifs spécifiques permettant de mesurer l'expression de sCD127 dans un échantillon biologique qui sont présents dans le kit de l'invention permettent de détecter et/ou de quantifier l'expression de SCD127, que ce soit au niveau protéique ou au niveau de l'activité de sCD127, et de préférence au niveau protéique.
Selon un mode de réalisation particulièrement préféré, le kit de l'invention contient des anticorps anti-sCD127, monoclonaux ou polyclonaux, et en particulier des anticorps monoclonaux.
Un autre échantillon contrôle positif peut également être un échantillon issu d'un patient dont on sait qu'il a développé une infection nosocomiale. De même, un autre échantillon contrôle négatif peut également être un échantillon issu d'un patient dont on sait qu'il n'a pas développé d'infection nosocomiale. Que ce soit pour un contrôle positif ou négatif ce type d'échantillon contrôle est de préférence issu d'un ou de plusieurs patient(s) hospitalisé(s) en réanimation et/ou ayant subi une agression, telle que chirurgie, brûlure, traumatisme..., générant une réponse inflammatoire systémique (SIRS), notamment d'un ou de plusieurs patient(s) en état septique, et de préférence d'un ou de plusieurs patient(s) en choc septique. Par exemple, le kit peut contenir un échantillon contrôle négatif issu d'un ou de plusieurs patient(s) hospitalisé(s) en réanimation et/ou ayant subi une agression, telle que chirurgie, brûlure, traumatisme..., générant une réponse inflammatoire systémique (SIRS), dont on sait qu'il(s) n'a(ont) pas développé d'infection nosocomiale, en particulier issu d'un ou de plusieurs patient(s) en choc septique dont on sait qu'il(s) n'a(ont) pas développé d'infection nosocomiale.
De manière préférée, le kit comprend à la fois un échantillon contrôle positif et un échantillon contrôle négatif, et en particulier choisis chacun parmi les échantillons calibrés tels que définis ci-dessus. L'invention couvre également l'utilisation d'un kit selon l'invention pour réaliser le procédé de l'invention, et en particulier pour déterminer la susceptibilité d'un patient aux infections nosocomiales, de préférence chez un patient hospitalisé en réanimation et/ou ayant subi une agression, telle que chirurgie, brûlure, traumatisme..., générant une réponse inflammatoire systémique (SIRS), en particulier chez un patient en état septique, notamment sévère, et de préférence un patient en choc septique. De préférence, l'utilisation du kit selon l'invention permet de déterminer la susceptibilité aux infections nosocomiales chez un patient en choc septique.
Tous les modes de réalisation préférés qui sont mentionnés ci-dessus concernant le procédé et leurs combinaisons constituent également des modes de réalisation préférés s'agissant du kit selon l'invention et de son utilisation.
Diverses autres caractéristiques ressortent de la description faite ci- dessous en référence aux figures annexées qui montrent, à titre d'exemples non limitatifs, des formes de réalisation de l'objet de l'invention et dans lesquelles :
- la figure 1 représente la concentration d'IL-7 plasmatique chez 35 patients en choc septique aux jours 1-2 (1-2) et 3-4 (3-4) et 30 sujets sains « HV » (A) et la comparaison de ces résultats selon les groupes de patients « NS » ou « S » (figure 1B) et les groupes de patients « NI » ou « No NI » (figure 1C).
** p<0,005 vs. « HV » - U-test Mann Whitney ;.
- la figure 2 représente l'expression de CD127 sur les cellules T CD4+ (figure 2A) et sur les cellules T CD8* (figure 2B) chez 35 patients en choc septique aux jours 1-2 et 3-5 et 30 sujets sains « HV ».
* p<0,05 vs « HV » - U-test Mann Whitney ; § p<0,05 - évolution dans le temps dans un même groupe de patients - Wilcoxon paired t- test
- la figure 3 représente la concentration de SCD127 plasmatique chez 35 patients en choc septique aux jours 1-2 et 3-4 et 30 sujets sains (figure 3A) et la comparaison de ces résultats selon les groupes de patients « NS » ou « S » (figure 3B) et les groupes de patients « NI » ou « No NI » (figure 3C).
# p<0,05 ## p<0,005 vs « No NI » - U-test Mann Whitney ; § p<0,05 §§ p<0,005 - évolution dans le temps dans un même groupe de patients - Wilcoxon paired t-test
- la figure 4 représente l'expression du marqueur HLA-DR chez 35 patients en choc septique aux jours 1-2 et 3-4 et 30 sujets sains selon les groupes de patients « NI » ou « No NI ».
METHODES
Mesure de la concentration en IL-7 plasmatique
La concentration d'IL-7 plasmatique a été mesurée grâce à un kit utilisant la technique LU INEX™ commercialisé par la société Bio-Rad (Bio- Plex Pro Cytokine, Chemokine and Growth Factor Assays : BioPlex Pro Reagent kit, Bio-Rad #171-304070 et SinglePlex IL-7) en suivant ies instructions du fournisseur.
Mesure de l'expression cellulaire du récepteur de l'IL-7 (CD 127)
Brièvement, 50μΙ de sang total est incubé en présence de 5μΙ d'Ac anti- CD4 couplé Phycoérythine-TexasRed (ECD) (BeckmanCoulter #6604727) ou de 5μΙ d'Ac anti-CD8 couplé ECD (BeckmanCoulter #737659) ainsi que 10μΙ d'Ac anti-CD127 couplé à la phycoérythrine (PE) (BeckmanCoulter #IM1980U) pendant 15 minutes à température ambiante et à l'obscurité. Les globules rouges sont ensuite lysés grâce à une lyse hypotonique et les cellules fixées grâce à une lyse automatique réalisée sur un automate TQ- Prep (BeckmanCoulter). L'expression membranaire du CD127 à ia surface des lymphocytes T CD4+ ou CD8+ est enfin mesurée par cytométrie en flux. Dosage de la forme soluble du récepteur de l'IL-7 (sCDX27) par ELISA
« Coatina »
Un tampon de « coating » a été préparé pour contenir 0,8 g Na2C03, 1,4 g NaHC03, 0,1 g NaN3 dans 500 ml d'eau (pH 9.6).
100 μΐ d'anticorps (Ac) de capture (anticorps monoclonal de souris anti-CD127 humain R34.34, Beckman Coulter®) dilués dans du tampon de « coating » (ont été déposés par puits dans une plaque ([Ac] = 8 pg/mL). La plaque a ensuite été recouverte pour être incubée à 4°C pendant une nuit.
Le contenu des puits a ensuite été aspiré et les puits ont été lavés 3 fois avec au moins 300pL de tampon de lavage PBS-Tween2o 0,05%. Tout le liquide a soigneusement été enlevé à chaque lavage. Après le dernier lavage, la plaque a été retournée sur du papier absorbant afin d'éliminer toutes les traces de tampon.
« Blockina »
La fixation non spécifique a été bloquée à l'aide de 150 pL de tampon de blocage par puits (10% sérum de bovin fœtal (FBS)/PBS-Tween200,05%), puis la plaque a été incubée pendant Ih à 37°C,
De nouveau, le contenu des puits a été aspiré et les puits ont été lavés 3 fois avec au moins 300pL de tampon de lavage PBS-Tween20 0,05%. Tout le liquide a soigneusement été enlevé à chaque lavage. Après le dernier lavage, la plaque a été retournée sur du papier absorbant afin d'éliminer toutes les traces de tampon.
échantillons et contrôles
Une gamme étalon a été réalisée avec recombinant human IL-7Ra / CD127 Fc chimera (R&D Systems - Catalog Number: 306-IR) dilué dans du tampon de dilution PBS 5 % FCS, comme décrit dans le tableau 1 ci- dessous et conformément à C. Janot-Sardet et al. Journal of Immunological Methods, 2010, 28, 115-123.
Tableau 1
Figure imgf000016_0001
100 pL d'échantillon ou de contrôle (solution de CD127 Fc chimera reconstitué extemporanérnent et aliquoté à des concentrations de 60ng/m! et iOng/m!) ont été ajoutés dans chaque puits, puis la plaque a été incubée pendant lh à 37°C
De nouveau, le contenu des puits a été aspiré et les puits ont été lavés 3 fois avec au moins 300pL de tampon de lavage PBS-Tween2o 0,05%. Tout le liquide a soigneusement été enlevé à chaque lavage. Après le dernier lavage, la plaque a été retournée sur du papier absorbant afin d'éliminer toutes les traces de tampon.
Anticorps de détection
100 pl. d'anticorps de détection (anticorps de chèvre polyclonal anti- CD127 biotinylé reconstitués avec 1 ml_ de TBS-BSA 1%, R&D Systems®) dilués dans du PBS/5 %FBS ont été ajoutés dans chaque puits ([Ac] = 200 ng/mL), puis la plaque a été incubée pendant lh à 37°C.
A nouveau, ie contenu des puits a été aspiré et les puits ont été lavés 3 fois avec au moins 300μΙ_ de tampon de lavage PBS-Tween2o 0,05%. Tout le liquide a soigneusement été enlevé à chaque lavage. Après le dernier lavage, la plaque a été retournée sur du papier absorbant afin d'éliminer toutes les traces de tampon.
Révélation
100 pL de Streptavidin-HRP ont été ajoutés dans chaque puits ([Streptavidin-HRP] = 8 pL/mL). La plaque a ensuite été recouverte pour être incubée pendant 30 min à température ambiante.
A nouveau, le contenu des puits a été aspiré et les puits ont été lavés 3 fois avec au moins 300pL de tampon de lavage PBS-Tween2o 0,05%. Tout le liquide a soigneusement été enlevé à chaque lavage. Après le dernier lavage, la plaque a été retournée sur du papier absorbant afin d'éliminer toutes les traces de tampon. A cette étape de lavage, les puits ont été imbibés avec le tampon de lavage 1 à 2 min avant aspiration.
Les deux flacons de la solution de substrat colori métrique TMB (3,3',5,5'-tetramethylbenzidine, bioMérieux #XX7LF1UC) ont été mélangés volume à volume. 100 pL de cette solution de substrat ont été déposés dans chaque puits, La plaque a ensuite été recouverte pour être incubée pendant 30 min à température ambiante. Enfin, la lecture de la plaque a été effectuée par mesure de l'absorbance à 450 nm.
Mesure de l'expression monocytaire de H LA- DR
La mesure a été réalisée par la technique de cytométrie en flux, à l'aide d'un marquage direct en sang total prélevé sur EDTA.
Les deux anticorps suivants ont été incubés avec 50 μΐ de sang total (30 minutes à température ambiante et à l'obscurité) :
- 5 μΐ d'anticorps anti-CD14, couplés fluoresceine (Beckman Coulter Immunotech, - Réf. : IM0645), permettant d'identifier les monocytes parmi les leucocytes)
-10 μΐ d'anticorps anti-HLA-DR, couplés phycoérythrine (Becton Dickinson - Réf. : 347401), permettant de quantifier l'expression de HLA-DR à la surface des cellules.
Les globules rouges ont ensuite été éliminés : lyse par ajout de 1 ml de solution de lyse (commercialisée par la société Becton Dickinson sous la référence 349202) diluée (1/10) (15 minutes à température ambiante et à l'obscurité).
Les cellules ont ensuite été analysées sur un cytométre de flux (FC500 - Beckman Coulter).
Les résultats sont exprimés en % de cellules positives, le seuil de positivité étant défini grâce à un contrôle isotypique (Mouse IgG2a PE Becton Dickinson - Réf. : 349053).
RESULTATS
Des échantillons de plasma ont été prélevés sur 35 patients en choc septique aux jours 1-2 (Jl-2) et 3-4 (J3-4) après choc septique, puis ont été stockés (cohorte rétrospective). Différents paramètres ou marqueurs ont été mesurés tels que les concentrations dlL-7 et de sCD127 plasmatiques, et l'expression de CD127 sur les cellules T CD4+, et l'expression de HLA-DR sur les monocytes. A 28 jours après admission en réanimation pour choc septique, 13 patients n'ont pas survécu (« NS ») soit 37 % alors que 22 patients ont survécu (« S ») sur les 35 patients. Par ailleurs, 6 patients ont contracté une infection nosocomiale (« NI ») soit 17 %, alors que 29 patients sont restés exempt de toute épisode nosocomiale (« No NI »).
Les mêmes mesures ont également été effectuées sur 30 sujets sains volontaires (HV).
Les résultats obtenus ont été comparés à l'aide d'un test II Mann
Whitney au sein de ces différentes populations de sujets ou patients et sont regroupés sur les figures 1 à 4 annexées.
Ces résultats montrent que la concentration d'IL-7 plasmatique est significativement diminuée (à Jl-2, mais ce n'est pas significatif à J3-4 chez les patients qui développent une infection secondaire par rapport aux patients qui n'ont rencontré aucun épisode nosocomial (figure 1C), alors qu'elle reste inchangée entre les patients survivants « S » ou non-survivants « NS ».
De plus, l'expression cellulaire du récepteur de l'IL-7 (CD127) est conservée après choc septique (figure 2A et 2B), et sans aucune différence entre les patients survivants « S » ou non-survivants « NS » ou les patients qui ont développé une infections nosocomiale « NI » ou pas « No NI » (résultats non représentés).
La légère augmentation de la concentration plasmatique de la forme soluble du récepteur de l'IL-7 ou sCD127 observée au début du choc septique n'est pas statistiquement significative et revient à des valeurs « normales » avec le temps (figure 3A).
En revanche, alors que la concentration plasmatique de SCD127 reste inchangée entre les patients survivants « S » ou non-survivants « NS » (figure 3B), on observe une augmentation marquée de la concentration plasmatique de sCD127 chez les patients « NI » qui ont présenté une infection nosocomiale par rapport aux patients « No NI » qui n'ont pas contracté d'infection nosocomiale (figure 3C).
Par ailleurs, on observe également que la concentration plasmatique du sCD127 n'évolue pas dans le temps (entre Jl-2 et J3-4) chez les patients « NI » qui ont présenté une infection nosocomiale, contrairement aux patients « No NI » qui n'ont pas contracté d'infection nosocomiale (figure 3C).
A titre de comparaison, l'étude de l'expression du marqueur de l'art antérieur HLA-DR sur la même cohorte de patients n'a pas permis de mettre en évidence la diminution de l'expression de ce marqueur entre les patients « NI » qui ont présenté une infection nosocomiale et les patients « No NI » qui n'ont pas contracté d'infection nosocomiale (figure 4), contrairement à ce qui est clairement établi dans l'art antérieur.
Cette différence, probablement liée à la taille de la cohorte présentement étudiée qui est plus petite par rapport à celle des cohortes analysées dans les études de l'art antérieur, permet de mettre en évidence la pertinence du marqueur sCD127 par rapport à HLA-DR. En effet, malgré la taille de la cohorte qui a été étudiée ici, les résultats montrent que l'étude de l'expression de sCD127 selon l'invention est informative quant à la susceptibilité des patients aux infections nosocomiales.
En conséquence, l'ensemble de ces résultats démontrent que la mesure de l'expression de sCD127 est un marqueur immunologique utile pour déterminer la susceptibilité d'un patient aux infections nosocomiales, et en particulier des patients hospitalisés en réanimation et/ou ayant subi une agression (chirurgie, brûlure, traumatisme...) générant une réponse inflammatoire systémique (SIRS), et en particulier des patients en état septique, notamment sévère, et de préférence des patients en choc septique.
L'invention n'est pas limitée aux exemples décrits et représentés car diverses modifications peuvent y être apportées sans sortir de son cadre.

Claims

REVENDICATIONS
1. Procédé de détermination de la susceptibilité aux infections nosocomiales chez un patient, comprenant les étapes suivantes :
- mesurer l'expression de sCD127 dans un échantillon biologique issu dudit patient ou échantillon à tester,
- conclure à une susceptibilité accrue aux infections nosocomiales après comparaison de l'expression de sCD127 par rapport à une valeur de référence.
2. Procédé selon la revendication 1, caractérisé en ce que l'échantillon biologique est issu d'un patient hospitalisé en réanimation et/ou ayant subi une agression, telle que chirurgie, brûlure, traumatisme..., générant une réponse inflammatoire systemique ou SIRS, en particulier issu d'un patient en état septique, notamment sévère.
3. Procédé selon la revendication 2, caractérisé en ce que l'échantillon biologique est issu d'un patient en choc septique.
4. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, caractérisé en ce qu'il est conclut à une susceptibilité accrue aux infections nosocomiales lorsqu'une surexpression de sCD127 est mise en évidence dans l'échantillon à tester par rapport à une première valeur de référence.
5. Procédé selon la revendication 4, caractérisé en ce que la première valeur de référence correspond au niveau d'expression de sCD127 mesuré dans un échantillon biologique issu d'un patient hospitalisé en réanimation et/ou ayant subi une agression, telle que chirurgie, brûlure, traumatisme..., générant une réponse inflammatoire systemique ou SIRS dont on sait qu'il n'a pas développé d'infection nosocomiale, notamment d'un patient en état septique dont on sait qu'il n'a pas développé d'infection nosocomiale, ou bien correspond à une valeur moyenne du niveau d'expression de sCD127 qui est mesuré sur un pool d'échantillons issu de tels patients.
6. Procédé selon les revendications 4 ou 5, caractérisé en ce que la première valeur de référence correspond au niveau d'expression de sCD127 mesuré dans un échantillon biologique issu d'un patient en choc septique dont on sait qu'il n'a pas développé d'infection nosocomiale, ou bien correspond à une valeur moyenne du niveau d'expression de SCD127 qui est mesuré sur un pool d'échantillons issu de tels patients.
7. Procédé selon l'une quelconque des revendications 3 à 6, caractérisé en ce que la mesure de l'expression de sCD127 dans l'échantillon à tester et le cas échéant dans l'échantillon biologique utilisé pour obtenir la première valeur de référence est réalisée dans les 10 jours ou à 10 jours (J10) après le choc septique, de préférence dans les 7 jours ou à 7 jours (17) après le choc septique, de manière encore préférée dans les 4 jours ou à 4 jours (J4) après le choc septique, et en particulier dans les 3 jours ou à 3 jours (J3) après le choc septique.
8. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, caractérisé en ce qu'il est conclut à une susceptibilité accrue aux infections nosocomiales lorsque l'expression de SCD127 qui est mesurée dans l'échantillon à tester n'est pas significativement diminuée par rapport à une deuxième valeur de référence, de préférence lorsque l'expression de SCD127 qui est mesurée dans l'échantillon à tester n'est pas diminuée de plus de 25 %, et de préférence pas diminuée de plus de 20 %, par rapport à cette deuxième valeur de référence,
9. Procédé selon la revendication 8, caractérisé en ce que la deuxième valeur de référence correspond au niveau d'expression de sCD127 mesuré dans un échantillon biologique issu du même dit patient lors d'un prélèvement antérieur, c'est-à-dire dans un échantillon biologique qui a été prélevé antérieurement par rapport à l'échantillon à tester.
10. Procédé selon l'une quelconque des revendications 3, et 8 ou 9, caractérisé en ce que la mesure de l'expression de sCD127 dans l'échantillon à tester est réalisée à environ ou 10 jours (J10) après le choc septique, de préférence à environ ou 7 jours (J7) après le choc septique, de préférence encore à environ ou 4 jours (34) après le choc septique.
11. Procédé selon la revendication 10, caractérisé en ce que le prélèvement antérieur est effectué dans les ou à 48h après le choc septique et au moins 24h avant celui de l'échantillon à tester.
12, Procédé selon l'une quelconque des revendications 10 et 11, caractérisé en ce que le prélèvement antérieur est effectué dans les ou à 48h après le choc septique et celui de l'échantillon à tester est effectué dans les 48h qui suivent le prélèvement antérieur ou à 48h après le prélèvement antérieur.
13, Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce que l'échantillon à tester issu dudit patient est un échantillon de plasma ou de sérum.
14. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce que l'expression de sCD127 est mesurée au niveau protéique, de préférence à l'aide d'une technique ELISA.
15. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, caractérisé en ce que l'expression de sCD127 est mesurée à l'aide d'anticorps anti-sCD127, et notamment d'anticorps monoclonaux anti-sCD127.
16. Utilisation de la mesure, in vitro ou ex vivo, de l'expression de sCD127 pour déterminer la susceptibilité d'un patient aux infections nosocomiales.
17. Utilisation selon la revendication 16, caractérisée en ce que ledit patient est un patient hospitalisé en réanimation et/ou ayant subi une agression, telle que chirurgie, brûlure, traumatisme..., générant une réponse inflammatoire systémique (SIRS), en particulier d'un patient en état septique, notamment sévère.
18. Utilisation selon la revendication 17, caractérisée en ce que ledit patient est un patient en choc septique.
19. Utilisation selon la revendication 17 ou 18, caractérisée en ce que l'expression de sCD127 est mesurée au niveau protéique, de préférence à l'aide d'une technique ELISA.
20. Utilisation selon l'une quelconque des revendications 16 à 19, caractérisé en ce que l'expression de sCD127 est mesurée à l'aide d'anticorps anti-sCD127, de préférence d'anticorps monoclonaux anti-sCD127.
21. Kit pour la mesure, in vitro ou ex vivo, de l'expression de sCD127 dans un échantillon biologique, comprenant : - des outils ou réactifs spécifiques permettant de mesurer l'expression de sCD127 dans ledit échantillon biologique, et
- un échantillon contrôle positif qui est un échantillon calibré pour contenir la quantité de sCD127 qui correspond à la quantité moyenne mesurée dans un pool d'échantillons de patients dont on sait qu'ils ont développé une infection nosocomiale, et/ou un échantillon contrôle négatif qui est un échantillon calibré pour contenir la quantité de sCD127 qui correspond à la quantité moyenne mesurée dans un pool d'échantillons de patients dont on sait qu'ils n'ont pas développé d'infection nosocomiale.
22. Kit selon la revendication 21, caractérisé en ce que lesdits outils ou réactifs spécifiques permettent de détecter et/ou de quantifier l'expression de sCD127, et de préférence au niveau protéique.
23. Utilisation d'un kit tel que défini à l'une quelconque des revendications 21 à 22 pour déterminer la susceptibilité d'un patient aux infections nosocomiales, ledit patient étant un patient hospitalisé en réanimation et/ou ayant subi une agression, telle que chirurgie, brûlure, traumatisme..., générant une réponse inflammatoire systémique (SIRS).
24. Utilisation d'un kit selon la revendication 23 pour déterminer la susceptibilité aux infections nosocomiales chez un patient en choc septique.
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