WO2015004107A1 - Anordnung zur lichtblattmikroskopie - Google Patents

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Jörg SIEBENMORGEN
Thomas Kalkbrenner
Helmut Lippert
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Definitions

  • the invention relates to an arrangement for light-sheet microscopy.
  • Such an arrangement comprises a sample vessel for receiving a sample contained in a medium, wherein the sample vessel is aligned with respect to a flat, usually horizontal reference surface.
  • the assembly also includes an illumination optic having an illumination objective for illuminating the specimen with a light sheet, the optical axis of the illumination objective and the light sheet lying in a plane including a non-zero illumination angle ⁇ with the reference plane normal.
  • the arrangement for light-sheet microscopy also includes a detection lens with a detection lens whose optical axis with the normal of the reference surface includes a non-zero detection angle ⁇ .
  • the illumination objective and the detection objective can also be configured as a so-called double objective, as described for example in EP 0 866 993 B1. Both lenses are then combined in a common unit, the respective optics - i. Lenses with associated beam paths and optical elements arranged therein - then share some elements.
  • Such an arrangement is used in particular in the examination of biological samples, in which the illumination of the sample with a light sheet whose plane intersects the optical axis of the detection at a non-zero angle occurs.
  • the light sheet encloses a right angle with the detection direction, which generally corresponds to the optical axis of the detection objective.
  • SPIM Selective Plane Illumination Microscopy
  • the SPIM technique is preferably used in fluorescence microscopy, where it is also referred to as LSFM (Light Sheet Fluorescence Microscopy).
  • LSFM Light Sheet Fluorescence Microscopy
  • confocal laser scanning microscopy or two-photon Microscopy has the LSFM technique more advantages: Since the detection can be done in the far field, larger sample areas can be detected. Although the resolution is somewhat lower than with confocal laser scanning microscopy, the LSFM technique allows thicker samples to be analyzed, since the penetration depth is higher. In addition, the light load of the samples in this method is the lowest, which among other things reduces the risk of bleaching a sample, since the sample is illuminated only by a thin light sheet at a non-zero angle to the detection direction.
  • a quasi-static light sheet can also be generated by quickly scanning the sample with a light beam.
  • the light sheet-like illumination is created by the light beam is subjected to a very fast relative movement to the observed sample and this time successively multiple strung together.
  • the integration time of the camera, on the sensor of which the sample is finally imaged is selected such that the scanning is completed within the integration time.
  • a line sensor in combination with a rescan in the detection optics can also be used.
  • the detection can also be confocal.
  • One of the main applications of light sheet microscopy is in the imaging of medium sized organisms ranging in size from a few hundred microns to a few mm.
  • these organisms are embedded in an agarose gel, which in turn is located in a glass capillary.
  • the glass capillary is introduced from above or from below into a sample chamber filled with water and the sample is pressed out of the capillary a bit.
  • the sample in the agarose is illuminated with a light sheet and the fluorescence is imaged onto a camera with a detection objective which is perpendicular to the light sheet and thus also perpendicular to the light sheet optics.
  • This method of light sheet microscopy has three major disadvantages.
  • the samples to be examined are relatively large, they come from developmental biology.
  • the sample preparation and the dimensions of the sample chamber the light sheet is relatively thick and thus limits the achievable axial resolution.
  • the sample preparation is complex and not compatible with standard sample preparations and Standard sample holders, as commonly used in fluorescence microscopy for single cells.
  • the sample is, for example, on the bottom of a Petri dish.
  • the Petri dish is filled with water, the lighting lens and detection lens are immersed in the liquid, which also performs the function of an immersion medium.
  • This approach offers the advantage of higher resolution in the axial direction as a thinner sheet of light can be generated. Due to the higher resolution, even smaller samples can be examined. Also, the sample preparation tone has become much easier.
  • the major disadvantage continues to be that both the sample preparation and the sample holder do not yet meet the standard mentioned.
  • the Petri dish must be relatively large, so that the two lenses can be immersed in the shell, without hitting the edge of the shell.
  • this method has the disadvantage that an analysis of many samples in a very short time (high-throughput screening) is not readily possible because the lenses must be cleaned when changing the sample in order to avoid contamination of the various samples.
  • the object of the invention is to further develop a light sheet microscopy arrangement of the kind set forth in such a way that analysis of samples with a high throughput is facilitated by the use of microtiter plates, i. of sample holders that can accommodate a variety of samples is simplified.
  • This object is achieved for an arrangement for light sheet microscopy as described above, characterized in that on the cover at least one at least partially transparent for illumination and detection light bulge for receiving the sample is formed, wherein the bulge has an inner and an outer boundary surface.
  • the access of the lenses to the sample is greatly simplified, in particular Microplates - even rotatable microtitre plates - can be used whose wells can then be configured with smaller lateral dimensions than when the sample is located at the bottom of the vessel, especially if an upright microscope configuration is used for the analysis.
  • the tuning is done in such a way that the optical axes of the illumination and the detection lens with the normal of the inner and the outer interfaces at least in the region of the passage of the optical axes through the interfaces include a minimum angle, i. an angle that is zero or deviates only a few, for example, up to 5 degrees. If optical axes and the boundary surfaces are perpendicular to one another, only spherical aberrations occur, which can be corrected as in the case of known microscope objectives adapted to coverslips.
  • the shape of the bulge is basically arbitrary, provided that the condition is met.
  • the bulge may take the form of a half-ton or hemisphere, and then in the tuned configuration, in the best possible configuration, the optical axes of the two objectives coincide with normals of tangents on the surface of the Hajbtonne.
  • the at least one bulge comprises two protruding from the cover and the sample vessel plate-shaped elements with parallel interfaces, which at the point of the bulge with the greatest distance to the rest of the sample vessel - in a trained as a depression bulge is the lowest point of Valley, with a bulge designed as a survey the highest point of the survey - in contact at least one point and close at this point the sink or the survey or the sample vessel or the vessel lid down or up.
  • the normals of the interfaces of a first plate-shaped element coincide therewith in the region of the passage of the optical axis of the illumination objective in the sense that the normal and the optical axis are parallel to the optical axis of the illumination objective at any point of the boundary surfaces of the plate-shaped element.
  • the normals of the interfaces of a second plate-shaped element coincide with the optical axis of the Detekttons Anlagenivs, so are at any point of the boundary surfaces of the second plate-shaped element parallel to this. This allows greater flexibility in tuning the position of the bulge with respect to the two lenses.
  • the plate shape which is a parallel position of the inner and outer interface
  • this area can be provided on the inside with a small curvature, so that for example in a sink at a lowest point in their Strength is strengthened and on the other hand also a stubborn adhesion of impurities is prevented, as would be the case with two angularly colliding, flat plates, ie a depression with at least a partial V-shaped cross-section.
  • the sum of the illumination angle ⁇ and the detection angle ⁇ is preferably 90 °, which facilitates the arrangement of a detector in the beam path. At other angles, care must be taken that the image plane, i. the plane in which the detector is located, the object plane, i. the plane which is irradiated by the light sheet and the object-side main plane of the detection lens intersect in a straight line.
  • the at least one bulge can be configured in the shape of a channel, wherein a plurality of grooves can be arranged one behind the other in the sample vessel, for example in the bottom of the vessel.
  • the bulge is pyramid-shaped, so that the two plate-shaped elements have a triangular shape and are supplemented by two further plate-shaped elements. This allows analysis of a sample located in the bulge from four different sides, which can be advantageous when the sample is attached to one side.
  • pyramidal bulges can be arranged in a grid pattern on the vessel bottom or in the vessel lid, so that the sample vessel can also be designed as a microtiter plate with a variety of such pyramidal Auswötbonne.
  • the channel-shaped configuration can also be used for the design of a microtiter plate if the individual channels are divided into individual sections by separating elements such as struts.
  • a sample vessel with such a depression can be made of glass, but preferably in a cheaper variant made of plastic, for example by deep-drawing, when the sink is channel-shaped.
  • the inner interface of the protrusion is functionalized to grow cells on that interface, ie, coated with a specific structure to which the surface structures of the cells bind and become anchored.
  • the growth conditions can be better adapted to a natural growth environment in which the at least one bulge, such as a gutter or pyramid-shaped depression, is filled with a gel or alginate is, with which a spatial matrix can be modeled.
  • the cover is designed as a vessel bottom and the bulge as a depression in the vessel bottom.
  • the access of the lenses to the sample is greatly simplified, in particular, it is also possible to use microtiter plates with a large number of depressions, with a depression for each sample being formed on each of these depressions.
  • the use of a sink or sinks for examining many cell samples makes it possible to increase the number of wells in a sample vessel because the lateral expansions - in the plane of the reference surface - can be reduced.
  • the bottom of the vessel can for an upright configuration of the light sheet microscope - so for a top view - described as a cover and the vessel lid in an analogous manner as for the vessel bottom, adapted and carried out the analysis of the cells with an upright Lrchtblattmikroskopie arrangement.
  • illumination and detection objective are arranged above the sample vessel.
  • the vessel lid at least one elevation is then formed instead of a sink.
  • the shape of the survey, its position in the observation and the position of the optical axis of the illumination and detection lens are then also matched to each other, by the optical axes of the illumination and the detection lens with the normal of the interfaces at least in the region of the passage of the optical axes include a minimum angle through the interfaces.
  • the elevations like the depressions, may be, for example, trough, pyramid or half-barrel or hemispherical.
  • the sample Since in microtiter plates, the sample usually falls in the depth following gravity or is deposited at the lowest point, observation is not readily possible if the illumination and detection objective are arranged above the sample vessel. For this reason, in the sample vessel, when the elevations are formed in the vessel lid, additionally arranged for positioning the sample in the upper region of the sample vessel, based on its depth, within the working distance of the lenses.
  • the means for positioning can also be arranged in the vessel lid, likewise within the working distance of the objectives.
  • the working distance for typical high numerical aperture objectives typically ranges from a few hundred microns to a few millimeters.
  • Depressions such as elevations may be composed of plate-shaped elements, the inner interfaces may be functionalized.
  • Another possibility of the design of the sample vessel is to use a rotatable microtiter plate, initially show the elevations in the lid down.
  • the sample in the Placement position corresponds to a sink, the sample is introduced and fixed there with the means for positioning the sample in the at least one elevation, for example by a stamp.
  • the soil is placed on top of the rotatable microtiter plate from above and sealed. For analysis, this is then rotated when it is to be used with an upright light-sheet microscope. Rotation is not required if it is to be used with an inverted light-sheet microscope.
  • the means for positioning the sample in the upper quarter or in the at least one elevation in the vessel lid suitably comprise a permeable membrane for nutrient solutions, a platform with a plurality of openings, or a web. It is important that the sample in each case has contact with the nutrient solution, but it must not fall into it due to gravity.
  • the membrane, the platform or the bridge can also be made of a gel.
  • the illumination optics and / or detection optics not only comprise correction means for reducing the above-mentioned. Aberrations, but also those arising from the passage of moistening and / or light to be detected at an angle other than 90 ° through the interfaces.
  • special correction lenses are preferably arranged in the illumination objective and / or in the detection objective.
  • the objectives include a nonzero angle with the normals of the interfaces, they may also include cylindrical lenses, tilted lenses or lenses not arranged on the optical axes, and also aspherical correction elements Surfaces or free-form surfaces can be used for correction.
  • correction means in the form of adaptive optical elements for manipulating the phase fronts of the illumination and / or the detection light can be arranged in the illumination beam path. It is preferable to use deformable mirrors, spatial light modulators or phase plates. Another way to reduce the aberrations is the use of specially adapted materials for the cover or the elevations in the vessel lid or the sinks in the vessel bottom.
  • perfluorodioxolane polymers whose refractive index is likewise generally between 1.33 and 1.36.
  • This material is an amorphous polymer, here the glass transition temperature can be adjusted so that the polymer when cold has the refractive index of the medium in which the sample is located.
  • other amorphous polymers with adjustable glass transition temperature can be used.
  • the bulge should be configured as thin as possible and should not be thicker than a few hundred microns. If the cover serves at the same time as the bottom of the sample vessel, as is the case with an inverse arrangement, then of course sufficient stability against the pressure exerted by the medium in which the sample is located must be ensured. This is not required for a cover as a lid of the sample vessel for an upright observation, here, the material can be made significantly thinner with thicknesses of less than 100 microns.
  • immersion objectives can again be used.
  • the same medium as for receiving the sample so for example water and the refractive indices of water and for the elevations / sinks in Gefäßdecket or vessel bottom material is used, which has an almost identical refractive index to water, make so If the interfaces are not noticeable by scattering or refraction, then the objectives need not be further corrected.
  • a material for the elevations or depressions in the vessel lid and in the vessel bottom can also be a nanostructured mixed material of a first and a second component use, wherein the refractive index of the first component is smaller and the refractive index of the second component greater than the refractive index of the medium for receiving the Sample is. Then, if the mean structure size of the material of the first component is smaller than the wavelengths of light used for lighting and the light to be detected, then an effective refractive index results for the mixed material, which also depends on the size of the areas and their number to the refractive index of the medium can be adjusted to be within the range of 5% of the refractive index of the medium for embedding the sample.
  • nanoporous silica may be used, here the first component is air and the second component is silicon dioxide.
  • Nanostructured materials of this kind are described, for example, in the article "Optical thin-film materials with low refractive index for broadband elimination of Fresnel reflection" by J. Q. Xi et al., Published in 2007 in Nahire Photonics, Vol. 176-179 in connection with the production of antireflection coatings.
  • FIG. 1 shows an example of a vessel lid or vessel bottom.
  • FIG. 5 shows the use of a rotatable microtiter plate.
  • the arrangement is configured here as an inverted light-sheet microscope, but can easily be transferred to an upright light-sheet microscope.
  • a sample vessel 1 In a sample vessel 1 is located in a medium 2, a sample 3.
  • the sample vessel 1 is aligned with respect to a flat reference surface, which is defined here by the horizontal surface of a sample stage 4.
  • the arrangement also comprises an illumination optics with a light source 5 and a Illumination objective 6 for illuminating the specimen 3 with a light sheet.
  • the light sheet and the optical axis 7 of the illumination objective 6 lie in a plane which encloses a non-zero illumination angle ⁇ with the normal of the reference surface.
  • Light coming from the sample is imaged on a detector 10 via detection optics with a detection objective 8 whose optical axes 9 include a non-zero detection angle 5 with the reference plane normal, the detector 10 converts the registered intensity into further processable image data.
  • the illumination angle ⁇ and the detection angle ⁇ are the same here, but this is not mandatory. At different apertures of the two lenses, for example, the angle can be set differently due to the space required.
  • Illumination objective 6 and detection objective 8 are arranged below the sample vessel 1.
  • the sample vessel 1 has a vessel bottom 11 which is transparent for illumination and detection light and has an inner boundary surface 12 and an outer boundary surface 13.
  • At the bottom of the vessel 11 at least one transparent for illumination and detection light sink 14 for storing the sample 3 is formed in the sink. It is sufficient if the sample vessel 1 is transparent in the region of the depression 14, but the production of a uniform material such as glass or thermoformed plastic is usually easier.
  • the deposition of the sample 3 in this depression 14 makes the sample 3 for the optical arrangement of the light-sheet microscope, the illumination objective 6 and the detection objective 8 more easily accessible.
  • a sample vessel 1 with a multiplicity of such depressions 14 is therefore better suited for analyzing individual cells with a high throughput than a vessel having a flat bottom, since the deposition of the sample in the sink causes the individual depressions via which such multi-well Plate or microtiter plate, laterally can be designed with smaller dimensions. The microtiter plates then do not have to be changed so often.
  • the shape of the depression 14, its position in the observation and the positions of the optical axes 7 and 9 of the illumination lens 6 and the detection lens 8 are coordinated by these optical axes 7, 9 of the illumination lens 6 and the detection lens 8 with the normal inner boundary surface 12 and the outer interface 13 at least in the region of the passage of the optical axes 7 and 9 through the interfaces 12 and 13 include a minimum angle.
  • the angle is preferably zero.
  • the at least one depression 14 comprises a first and a second plate-like element 15 or 16 projecting from the vessel bottom 11.
  • the inner boundary surface 12 is parallel to the outer one Interface 13 arranged.
  • the two plate-shaped elements 15 and 16 are in contact in at least one punk, the normals of the boundary surfaces 12, 13 of the first plate-shaped element 15 with the optical axis 7 of the illumination objective 6 and the normals of the boundary surfaces 12, 13 of the second plate-shaped element 16 coincide with the optical axis 9 of the detection objective 8.
  • the sum of the illumination angle ⁇ and the detection angle ⁇ is here 90 °, but it can also deviate therefrom.
  • This arrangement has the great advantage that aberrations, as they occur with oblique passage of light through the interfaces 12, 13, can be completely avoided.
  • the illumination objective 6 which usually has a small numerical aperture in the order of 0.3, since the light sheet to be generated should be as thin as possible, further corrections are then no longer absolutely necessary.
  • the detection objective 8 which generally has a high numerical aperture in the order of magnitude of 1.0, however, further corrections are advantageous, in special cases also for the illumination optics.
  • the correction means may comprise, for example, corrective lenses in the illumination objective 6 or in the detection objective 8 or also adaptive optical elements for manipulating the phase fronts of the illumination and / or the detection light, which are arranged in the illumination beam path or in the detection beam path and preferably as deformable mirrors, spatial light modulators or phase plates are designed.
  • the vessel bottom 11 can also be formed from a material which has a refractive index which is less than the refractive index of the medium 2 in which the sample 3 is located 5% differentiates.
  • Particularly suitable here are amorphous polymers, which can be adjusted in their glass transition temperature so that when cooling the material has exactly the desired refractive index.
  • a nanostructured composite material such as nanoporous silica, i. Silicon dioxide having a plurality of cylindrical passages may be used as the material for the vessel bottom 11.
  • the thickness of the vessel bottom 11 should be as thin as possible in order to suppress aberrations as much as possible.
  • the example shown in FIG. 1 can also be transferred in an equivalent manner for an upright arrangement of the illumination objective 6 and detection objective 8, instead of a depression 14 in the vessel bottom 11, the vessel lid has a corresponding elevation here.
  • FIG. 2 shows an example of a sample vessel 1 which is suitable for the analysis of cells with high throughput. Shown are two mutually parallel, channel-shaped depressions 14 in a section of a sample vessel 1. Each of these depressions 14 is divided by struts 17 into individual recesses, which make it possible to several Place samples side by side in a sink 14 without any possibility of contamination.
  • FIG. 3 shows a section of a vessel lid 18 on which a multiplicity of pyramid-shaped elevations 19 are arranged, each of these elevations 19 covering a depression in the sample vessel 1. Equivalently, the vessel bottom 1 can be configured in this way.
  • the inner boundary surfaces 13 in the depressions 14 or elevations 19 can be functionalized to grow cells on this interface, so that, for example, cells can accumulate in the elevations 19 even without additional aids.
  • the depression 14 or the elevation 19 can also be filled with a gel or alginate to immobilize the sample.
  • sample vessels intended for upright observation preferably have means for positioning the sample in the upper region of the sample vessel 11 in relation to its depth within the working distance of the illumination and detection objective, or for the corresponding positioning within the working distance in the elevation 19 in the vessel lid 18.
  • Such means are shown in Figures 4 a) - c).
  • the box-shaped element in each case symbolizes a depression 20 of a multi-well plate in a sample vessel 1 for upright observation.
  • a permeable membrane 21 is arranged in the upper region, on which the sample 3 is mounted and which ensures contact with a comparatively large volume of nutrient fluid in order to allow the cells to grow.
  • the membrane 21 allows both the diffusion of nutrients, as well as a support of the sample 3.
  • a membrane 21 can also be used, for example, a flat platform 22 with openings, this is shown in Figure 4 b).
  • the platform can be made of glass, for example, whereby the sample preparation can proceed substantially in accordance with standard protocols.
  • the cell culture may also be immobilized in a matrix gel.
  • FIG. 4 a) an elevation 19 of a vessel lid 18 in the form of a channel or the section of a channel is shown on the depression 20.
  • a flat cover such as a film 23, as shown in Figure 4 b
  • the film 23 can be glued or welded to the sample vessel.
  • Fig. 4c Another configuration is shown in Fig. 4c).
  • a web 24 is shown, which projects into the center of the depression.
  • the elevation 19 here has a Hatbtonnenform.
  • the said support elements membrane 21, platform 22 and web 24 may also be made of gel, provided that this has a sufficient rigidity.
  • the use of rotatable microtiter plates is also conceivable, as shown in FIG. In this case, the sample 3 is initially deposited in a depression 20, which is funnel-shaped in this case, of the microtiter plate.
  • the recess 20 is filled with the medium 2.

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Abstract

Die Erfindung betrifft eine Anordnung zur Lichtblatimikroskopie. Diese umfasst ein Probengefäß (1) zur Aufnahme einer in einem Medium (2) befindlichen Probe (3), wobei das Probengefäß (1) eine Abdeckung aufweist und hinsichtlich einer ebenen Bezugsfläche ausgerichtet ist. Die Anordnung umfasst außerdem eine Beleuchtungsoptik mit einem Beleuchtungsobjektiv (6) zur Beleuchtung der Probe (3) mit einem Lichtblatt, wobei die optische Achse (7) des Beleuchtungsobjektivs (6) und das Lichtblau in einer Ebene liegen, die mit der Normalen der Bezugsfläche einen von Nuil verschiedenen Beleuchtungswinkel ß einschließt. Die Anordnung umfasst weiterhin eine Detektionsoptik mit einem Detektionsobjektiv (8), dessen optische Achse (9) mit der Normalen der Bezugsfläche einen von Null verschiedenen Detektionswinkel δ einschließt. Bei einer solchen Anordnung ist an der Abdeckung - entweder am Gefäßboden (11) oder am Gefäßdeckel (18), mindestens eine für Beleuchtungs- und Detektionslicht transparente Auswölbung zur Aufnahme der Probe (3), mit einer inneren Grenzfläche (12) und einer äußeren Grenzfläche (13), ausgebildet. Die Form der Auswölbung, ihre Position bei der Beobachtung sowie die Lage der optischen Achsen (7, 9) von Beleuchtungsobjektiv (6) und Detektionsobjektiv (8) sind aufeinander abgestimmt, indem die optischen Achsen (7, 9) des Beleuchtungsobjektivs (6) und des Detektionsobjektivs (8) mit den Normalen der Grenzflächen (12, 13) zumindest im Bereich des Durchtritts der optischen Achsen (7, 9) durch die Grenzflächen einen minimalen Winkel einschließen.

Description

Anordnung zur Lichtblattmikroskopie
Die Erfindung betrifft eine Anordnung zur Lichtblattmikroskopie. Eine solche Anordnung umfasst ein Probengefäß zur Aufnahme einer in einem Medium befindliche Probe, wobei das Probengefäß hinsichtlich einer ebenen, meist horizontalen Bezugsfläche ausgerichtet ist. Die Anordnung umfasst außerdem eine Beleuchtungsoptik mit einem Beleuchtungsobjektiv zur Beleuchtung der Probe mit einem Lichtblatt, wobei die optische Achse des Beleuchtungsobjektivs und das Lichtblatt in einer Ebene liegen, die mit der Normalen der Bezugsfläche einen von Null verschiedenen Beleuchtungswinkel ß einschließt. Schließlich umfasst die Anordnung zur Lichtblattmikroskopie auch eine Detektionsoptik mit einem Detektionsobjektiv, dessen optische Achse mit der Normalen der Bezugsfläche einen von Null verschiedenen Detektionswinkel δ einschließt. Beleuchtungsobjektiv und Detektionsobjektiv können dabei auch als sogenanntes Doppelobjektiv ausgestaltet sein, wie es beispielsweise in der EP 0 866 993 B1 beschrieben ist. Beide Objektive sind dann in einer gemeinsamen Baueinheit zusammengefasst, die jeweiligen Optiken - d.h. Objektive mit zugehörigen Strahlengängen und darin angeordneten optischen Elementen - teilen sich dann einige Elemente.
Eine solche Anordnung wird insbesondere bei der Untersuchung von biologischen Proben eingesetzt, bei der die Beleuchtung der Probe mit einem Lichtblatt, dessen Ebene die optische Achse der Detektion in einem von Null verschiedenen Winkel schneidet, erfolgt. Üblicherweise schließt dabei das Lichtblatt mit der Detektionsrichtung, die in der Regel der optischen Achse des Detektionsobjektivs entspricht, einen rechten Winkel ein. Mit dieser auch als SPIM (Selective Plane Illumination Microscopy) bezeichneten Technik lassen sich in relativ kurzer Zeit räumliche Aufnahmen auch dickerer Proben erstellen. Auf der Basis von optischen Schnitten kombiniert mit einer Relativbewegung in einer Richtung senkrecht zur Schnittebene ist eine bildliche, räumlich ausgedehnte Darstellung der Probe möglich.
Die SPIM-Technik wird bevorzugt in der Fluoreszenzmikroskopie eingesetzt, wo sie dann auch als LSFM (Light Sheet Fluorescence Microscopy) bezeichnet wird. Gegenüber anderen etablierten Verfahren, wie der konfokalen Laser-Scanning-Mikroskopie oder der Zwei-Photonen- Mikroskoskopie weist die LSFM-Technik mehrer Vorzüge auf: Da die Detektion im Weitfeld erfolgen kann, lassen sich größere Probenbereiche erfassen. Zwar ist die Auflösung etwas geringer als bei der konfokalen Laser-Scanning-Mikroskopie, jedoch lassen sich mit der LSFM- Technik dickere Proben analysieren, da die Eindringtiefe höher ist. Darüber hinaus ist die Lichtbelastung der Proben bei diesem Verfahren am geringsten, was u.a. die Gefahr des Ausbleichens einer Probe reduziert, da die Probe nur durch ein dünnes Lichtblatt in einem von Null verschiedenen Winkel zur Detektionsrichtung beleuchtet wird.
Statt ein rein statisches Lichtblau zu verwenden, kann auch ein quasi-statisches Lichtblatt erzeugt werden, indem die Probe mit einem Lichtstrahl schnell abgetastet wird. Die lichtblattartige Beleuchtung entsteht, indem der Lichtstrahl einer sehr schnellen Relativbewegung zu der zu beobachteten Probe unterworfen wird und dabei zeitlich aufeinanderfolgend mehrfach aneinandergereiht wird. Dabei wird die Integrationszeit der Kamera, auf deren Sensor die Probe letztendlich abgebildet wird, so gewählt, dass die Abtastung innerhalb der Integrationszeit abgeschlossen wird. Anstelle einer Kamera mit 2D- Array kann auch ein Zeilensensor in Kombination mit einem erneuten Abtasten (Rescan) in der Detektionsoptik verwendet werden. Die Detektion kann außerdem auch konfokal erfolgen.
Die SPIM-Technik ist in der Literatur inzwischen vielfach beschrieben, beispielsweise in der DE 102 57 423 A1 und der darauf aufbauenden WO 2004/053558 A1 sowie in den Übersichtsartikel „Selective Plane Illumination Microscopy Techniques in Developmental Biology" von J. Huisken et al., erschienen im Jahr 2009 in der Zeitschrift Development Bd. 136, S. 1963.
Eine der Hauptanwendungen der Lichtblattmikroskopie liegt in der Bildgebung mittelgroßer Organismen mit einer Größe von einigen 100 μm bis hin zu wenigen mm. In der Reget werden diese Organismen in ein Agarose-Gel eingebettet, welches sich wiederum in einer Glaskapillare befindet. Die Glaskapillare wird von oben bzw. von unten in eine mit Wasser gefüllte Probenkammer eingebracht und die Probe ein Stück aus der Kapiiiare herausgedrückt. Die Probe in der Agarose wird mit einem Lichtblatt beleuchtet und die Fluoreszenz mit einem Detektionsobjektiv, das senkrecht zum Lichtblatt und damit auch senkrecht zur Lichtblattoptik steht, auf eine Kamera abgebildet.
Diese Methode der Lichtblattmikroskopie hat drei große Nachteile. Zum einen sind die zu untersuchenden Proben relativ groß, sie stammen aus der Entwicklungsbiologie. Außerdem ist aufgrund der Probenpräparation und der Abmessungen der Probenkammer das Lichtblatt relativ dick und somit die erzielbare axiale Auflösung eingeschränkt. Zusätzlich ist die Probenpräparation aufwendig und nicht kompatibel zu Standard-Probenpräparationen und Standard-Probenhalterungen, wie sie in der Fluoreszenzmikroskopie für einzelne Zellen üblicherweise eingesetzt werden.
Um diese Einschränkungen zumindest teilweise umgehen zu können, wurde in den letzten Jahren ein SPIM-Aufbau entwickelt, bei dem das Beleuchtungsobjektiv und das Detektionsobjektiv senkrecht zueinander stehen und jeweils unter einem Winkel von 45° von oben auf die Probe gerichtet sind. Zieht man als Bezugsfläche beispielsweise den Probentisch, auf dem die Probenhalterung fixiert ist, oder eine andere horizontale Ebene heran, so betragen Beleuchtungswinkel ß und Detektionswinkel δ jeweils 45°. Ein solcher Aufbau wird beispielsweise in der WO 2012/110488 A2 und in der WO 2012/122027 A2 beschrieben.
Bei einem solchen Aufbau befindet sich die Probe beispielsweise auf dem Boden einer Petrischale. Die Petrischale ist mit Wasser gefüllt, Beleuchtungsobjektiv und Detektionsobjektiv werden in die Flüssigkeit, die auch die Funktion eines Immersionsmediums übernimmt, eingetaucht. Diese Herangehensweise bietet den Vorteil einer höheren Auflösung in axialer Richtung, da ein dünneres Lichtblatt erzeugt werden kann. Aufgrund der höheren Auflösung können auch kleinere Proben untersucht werden. Auch ist die Probenpräparatton bedeutend einfacher geworden. Der große Nachteil besteht weiterhin darin, dass sowohl die Probenpräparation als auch die Probenhalterung noch nicht dem erwähnten Standard entsprechen. So muss die Petrischale relativ groß sein, damit die beiden Objektive in die Schale eingetaucht werden können, ohne an den Rand der Schale anzustoßen. Mikrotiterplatten - auch als Multi-Well-PIatten bezeichnet -, die Standard in vielen Bereichen der Biologie und bei der fluoreszenzmikroskopischen Analyse einzelner Zellen sind, können mit diesem Verfahren nicht verwendet werden, da die Objektive nicht in die sehr kleinen Vertiefungen der Platte eintauchen können. Außerdem hat dieses Verfahren den Nachteil, dass eine Analyse vieler Proben in kürzester Zeit [High-Throughput-Screening) nicht ohne weiteres möglich ist, da die Objektive beim Wechseln der Probe gereinigt werden müssen, um Kontaminierungen der verschiedenen Proben zu vermeiden.
Die Aufgabe der Erfindung besteht darin, eine Anordnung zur Lichtblattmikroskopie der eingangs beschriebenen Art dahingehend weiterzuentwickeln, dass eine Analyse von Proben mit einem hohen Durchsatz vereinfacht wird, indem die Verwendung von Mikrotiterplatten, d.h. von Probenhalterungen, die eine Vielzahl von Proben aufnehmen können, vereinfacht wird.
Diese Aufgabe wird für eine Anordnung zur Lichtblattmikroskopie wie sie eingangs beschrieben wurde, dadurch gelöst, dass an der Abdeckung mindestens eine mindestens teilweise für Beleuchtungs- und Detektionslicht transparente Auswölbung zur Aufnahme der Probe ausgebildet ist, wobei die Auswölbung eine innere und eine äußere Grenzfläche aufweist. Auf diese Weise wird der Zugang der Objektive zur Probe wesentlich vereinfacht, insbesondere lassen sich Mikrotiterplatten - auch drehbare Mikrotiterplatten - verwenden, deren Vertiefungen dann mit geringeren lateralen Abmessungen konfiguriert werden können, als wenn die Probe am Gefäßboden lokalisiert ist, insbesondere wenn zur Analyse eine aufrechte Mikroskop- Konfiguration verwendet wird.
Dabei ist es wesentlich, die Form der Auswölbung, ihre Position bei der Beobachtung sowie die Lage der optischen Achsen von Beleuchtungs- und Detektionsobjektiv aufeinander abzustimmen, um Aberrationen, wie sie bei einem schräg durch die Grenzflächen verlaufenden Strahlengang und damit schrägen Lichteinfall und Lichtaustritt aus dem Probengefäß verbunden wären, zu vermeiden bzw. zu minimieren. Die Abstimmung erfolgt in der Weise, dass die optischen Achsen des Beleuchtungs- und des Detekttonsobjektivs mit den Normalen der inneren und der äußeren Grenzflächen zumindest im Bereich des Durchtritte der optischen Achsen durch die Grenzflächen einen minimalen Winkel einschließen, d.h. einen Winkel, der Null beträgt oder nur um wenige, etwa bis zu 5° Grad abweicht. Stehen optische Achsen und die Grenzflächen senkrecht aufeinander, so treten nur sphärische Aberrationen auf, die wie bei bekannten, an Deckgläser angepasste Mikroskopobjektiven korrigiert werden können.
Die Form der Auswölbung ist dabei grundsätzlich beliebig, sofern die genannte Bedingung eingehalten wird. Die Auswölbung kann beispielsweise die Form einer Halbtonne oder Halbkugel annehmen, wobei dann in der abgestimmten Anordnung in der bestmöglichen Konfiguration die optischen Achsen der beiden Objektive mit Normalen von Tangenten an der Oberfläche der HaJbtonne zusammenfallen.
In einer besonders bevorzugten Ausgestaltung umfasst die mindestens eine Auswölbung zwei von der Abdeckung und dem Probengefäß abstehende plattenförmige Elemente mit parallelen Grenzflächen, welche an derjenigen Stelle der Auswölbung mit der größten Entfernung zum übrigen Probengefäß - bei einer als Senke ausgebildeten Auswölbung ist das die tiefste Stelle der Senke, bei einer als Erhebung ausgebildeten Auswölbung die höchste Stelle der Erhebung - in mindestens einem Punkt in Kontakt stehen und an diesem Punkt die Senke oder die Erhebung bzw. das Probengefäß oder den Gefäßdeckel nach unten bzw. oben abschließen. Die Normalen der Grenzflächen eines ersten plattenförmigen Elements fallen dabei im Bereich des Durchtritts der optischen Achse des Beleuchtungsobjektivs mit dieser zusammen in dem Sinne, dass die Normalen und die optische Achse an jeder Stelle der Grenzflächen des plattenförmigen Elements parallel zu der optischen Achse des Beleuchtungsobjektivs sind. Entsprechend fallen die Normalen der Grenzflächen eines zweiten plattenförmigen Elements mit der optischen Achse des Detekttonsobjektivs zusammen, sind also an jeder Stelle der Grenzflächen des zweiten plattenförmigen Elements parallel zu dieser. Dies erlaubt eine höhere Flexibilität in der Abstimmung hinsichtlich der Position der Auswölbung in Bezug auf die beiden Objektive. Die Plattenform, die eine parallele Lage der inneren und der äußeren Grenzfläche zueinander impliziert, ist jedoch nicht zwingend und insbesondere in dem Bereich, wo die beiden piattenförmigen Elemente in Kontakt stehen, kann dieser Bereich auf der Innenseite mit einer kleinen Wölbung versehen sein, so dass beispielsweise bei einer Senke zum einen an deren tiefsten Punkt diese in ihrer Festigkeit verstärkt wird und zum anderen auch ein hartnäckiges Anhaften von Verunreinigungen verhindert wird, wie es bei zwei in einem Winkel zusammenstoßenden, ebenen Platten, d.h. bei einer Senke mit zumindest teilweisem V- förmigen Querschnitt der Fall wäre.
Die Summe von Beleuchtungswinkel ß und Detektionswinkel δ beträgt bevorzugt 90º, was die Anordnung eines Detektors im Strahlengang erleichtert. Bei anderen Winkeln muss darauf geachtet werden, dass sich die Bildebene, d.h. die Ebene, in welcher der Detektor liegt, die Objektebene, d.h. die Ebene, die durch das Lichtblatt bestrahlt wird, und die objektseitige Hauptebene des Detektionsobjektiv in einer Geraden schneiden.
Die mindestens eine Auswölbung kann rinnenförmig ausgestaltet sein, wobei im Probengefäß beispielsweise im Gefäßboden mehrere Rinnen hintereinander angeordnet sein können. In einer besonders bevorzugten Ausgestaltung Ist die Auswölbung pyramidenförmig ausgestaltet, so dass die beiden piattenförmigen Elemente Dreiecksform haben und durch zwei weitere plattenformige Elemente ergänzt werden. Dies ermöglicht eine Analyse einer Probe, die in der Auswölbung lokalisiert ist, von vier verschiedenen Seiten, was von Vorteil sein kann, wenn die Probe an einer Seite angelagert ist Zudem lassen sich pyramidenförmige Auswölbungen rasterförmig am Gefäßboden oder im Gefäßdeckel anordnen, so dass das Probengefäß auch als Mikrotiterplatte mit einer Vielzahl von solchen pyramidenförmigen Auswötbungen ausgestaltet sein kann. Auch die rinnenförmige Ausgestaltung lässt sich für die Gestaltung einer Mikrotiterplatte verwenden, wenn die einzelnen Rinnen jeweils durch Trennelemente wie Streben in einzelne Abschnitte unterteilt werden.
Ein Probengefäß mit einer solchen Senke lässt sich aus Glas, bevorzugt aber in einer preiswerteren Variante aus Kunststoff fertigen, beispielsweise im Tiefziehverfahren, wenn die Senke rinnenförmig ist.
Zweckmäßig ist mindestens ein Teil der inneren Grenzfläche der Auswölbung zum Aufwachsen von Zellen auf dieser Grenzfläche funktionalisiert, d.h. mit einer speziellen Struktur beschichtet, an die sich die Oberflächenstrukturen der Zellen anbinden und sich dort verankern. Für einzelne Zellen, die mit der vorliegenden lichtblattmikroskopischen Anordnung in hohem Durchsatz analysiert werden sollen, lassen sich die Wachstumsbedingungen noch besser an eine natürliche Wachstumsumgebung anpassen, in dem die mindestens eine Auswölbung, also beispielsweise eine Rinne oder pyramidenförmige Senke, mit einem Gel oder Alginat gefüllt ist, mit denen eine räumliche Matrix nachgebildet werden kann. Wie bereits angedeutet, ist in einer bevorzugten Ausgestaltung, bei der Beleuchtungsobjektiv und Detektionsobjektiv in einer inversen Konfiguration unterhalb des Probengefäßes angeordnet sind, die Abdeckung als Gefäßboden und die Auswölbung als Senke im Gefäßboden ausgebildet. Auf diese Weise wird der Zugang der Objektive zur Probe wesentlich vereinfacht, insbesondere lassen sich auch Mikrotiterplatten mit einer Vielzahl von Vertiefungen verwenden, wobei an jeder dieser Vertiefungen eine Senke für eine Probe ausgebildet ist. Die Verwendung einer Senke bzw. von Senken für die Untersuchung vieler Zellproben ermöglicht es, die Anzahl der Vertiefungen in einem Probengefäß zu erhöhen da die lateralen Ausdehnungen - in der Ebene der Bezugsfläche - verringert werden können.
Anstelle des Gefäßbodens kann für eine aufrechte Konfiguration des Lichtblattmikroskops - also für eine Beobachtung von oben - als Abdeckung auch der Gefäßdeckel in analoger Weise wie für den Gefäßboden beschrieben, angepasst und die Analyse der Zellen mit einer aufrechten Lrchtblattmikroskopie-Anordnung vorgenommen werden. Bei dieser Ausgestaltung der Erfindung sind daher Beleuchtungs- und Detektionsobjektiv oberhalb des Probengefäßes angeordnet. Im Gefäßdeckel ist dann anstatt einer Senke mindestens eine Erhebung ausgebildet. Die Form der Erhebung, ihre Position bei der Beobachtung sowie die Lage der optischen Achse von Beleuchtungs- und Detektionsobjektiv sind dann ebenfalls aufeinander abgestimmt, indem die optischen Achsen des Beleuchtungs- und des Detektionsobjektivs mit den Normalen der Grenzflächen zumindest im Bereich des Durchtritts der optischen Achsen durch die Grenzflächen einen minimalen Winkel einschließen. Die Erhebungen können wie die Senken beispielsweise rinnen-, pyramiden- oder halbtonnenförmig oder halbkugelförmig sein.
Da bei Mikrotiterplatten die Probe gewöhnlich der Schwerkraft folgend in die Tiefe absinkt bzw. an der tiefsten Stelle abgelegt wird, ist eine Beobachtung, nicht ohne weiteres möglich, wenn Beleuchtungs- und Detektionsobjektiv oberhalb des Probengefäßes angeordnet sind. Aus diesem Grund sind im Probengefäß, wenn die Erhebungen im Gefäßdeckel ausgebildet sind, zusätzlich Mittel zur Positionierung der Probe im oberen Bereich des Probengefäßes, bezogen auf seine Tiefe, innerhalb des Arbeitsabstandes der Objektive angeordnet. Die Mittel zur Positionierung können auch im Gefäßdeckel angeordnet sein, entsprechend ebenfalls innerhalb des Arbeitsabstandes der Objektive. Der Arbeitsabstand für typische Objektive mit hoher numerischer Apertur liegt üblicherweise in einem Bereich von wenigen 100 μm bis zu einigen mm.
Senken wie Erhebungen können aus plattenförmigen Elementen zusammengesetzt sein, die inneren Grenzflächen können funktionalisiert sein. Eine weitere Möglichkeit der Ausgestaltung des Probengefäßes besteht darin, eine drehbare Mikrotiterplatte zu verwenden, bei der zunächst die Erhebungen im Deckel nach unten zeigen. In diese Erhebung, die in der Bestückungsposition einer Senke entspricht, wird die Probe eingebracht und dort mit den Mitteln zur Positionierung der Probe in der mindestens einen Erhebung fixiert, beispielsweise durch einen Stempel. Anschließend wird von oben der Boden auf die drehbare Mikrotiterplatte gesetzt und diese verschlossen. Zur Analyse wird diese dann gedreht, wenn sie mit einem aufrechten Lichtblattmikroskop verwendet werden soll. Eine Drehung ist nicht erforderlich, wenn sie mit einem inversen Lichtblattmikroskop verwendet werden soll.
Die Mittel zur Positionierung der Probe im oberen Viertel oder in der mindestens einen Erhebung im Gefäßdeckel umfassen zweckmäßig eine für Nährlösungen permeable Membran, eine Plattform mit einer Vielzahl von Öffnungen, oder einen Steg. Wichtig ist, dass die Probe in jedem Fall Kontakt zur Nährlösung hat, wobei sie jedoch nicht aufgrund der Schwerkraft in diese absinken darf. Die Membran, die Plattform oder der Steg können auch aus einem Gel gefertigt sein.
Aufgrund der Tatsache, dass das Licht zwischen jedem Objektiv und der Probe jeweils drei verschiedene Medien durchläuft bzw. zwei Grenzflächen durchtritt, treten auch bei vertikaler Ausrichtung der Objektive in Bezug auf die Grenzflächen sphärische Aberrationen auf. Diese lassen sich bei bekanntem Material für die Auswölbung in Form einer Senke im Gefäßboden bzw. in Form einer Erhebung Im Gefäßdeckel und bei bekannter Dicke zumindest für plattenförmige Elemente mit parallelen Grenzflächen so korrigieren, wie es auch üblicherweise für Mikroskopobjektive realisiert wird. Teilweise sind sie in Bezug auf eine vorgegebene Deckglasdicke aus einem vorgegebenen Material korrigiert. Solche Korrekturen sind besonders bevorzugt beim Detektionsobjektiv ausgeführt, welches in der Regel eine größere numerische Apertur aufweisen wird als das Beleuchtungsobjektiv.
In einer bevorzugten Ausgestaltung umfassen Beleuchtungsoptik und / oder Detektionsoptik nicht nur Korrekturmittel zur Verringerung von den o.g. Aberrationen, sondern auch von solchen, weiche durch den Durchtritt von Befeuchtungs- und / oder zu detektierendem Licht unter einem von 90º verschiedenen Winkel durch die Grenzflächen entstehen.
Im Beleuchtungsobjektiv und / oder im Detektionsobjektiv sind daher bevorzugt spezielle Korrekturlinsen angeordnet, diese können auch - falls die Objektive mit den Normalen der Grenzflächen einen von Null verschiedenen Winkel einschließen - Zylinderlinsen, verkippte oder nicht auf den optischen Achsen angeordnete Linsen umfassen, auch Korrekturelemente mit asphärischen Flächen oder Freiformflächen lassen sich zur Korrektur verwenden. Alternativ oder in Ergänzung können im Beleuchtungsstrahlengang Korrekturmittel in Form von adaptiven optischen Elementen zur Manipulation der Phasenfronten des Beleuchtung- und / oder des Detektionslichts angeordnet sein. Dabei verwendet man bevorzugt verformbare Spiegel, räumliche Lichtmodulatoren oder Phasenplatten. Ein weiterer Weg zur Verminderung der Aberrationen besteht in der Verwendung speziell angepasster Materialien für die Abdeckung bzw. die Erhebungen im Gefäßdeckel oder die Senken im Gefäßboden.
In einer besonders bevorzugten Ausführung werden als Material für die Senke bzw. die Erhebung im Gefäßboden bzw. im Gefäßdeckel solche Stoffe verwendet, die einen Brechungsindex aufweisen, welcher sich von dem Brechungsindex des Mediums, in welchem sich die Probe befindet, um weniger als 5% unterscheidet. Wenn als Medium, in welchem sich die Probe befindet, beispielsweise Wasser verwendet wird, welches eine Brechzahl nd = 1 ,33 bei einer Wellenlänge λd = 578,56 nm hat, so eignet sich als Material für die Abdeckung beispielsweise PTFE (Polytetrafluorethylen, nd = 1,35), CYTOP® (nd = 1,34), oder PFEP (Perfluorethylenpropylen, nd = 1,34) ist. Auch perfluorodioxolane Polymere lassen sich verwenden, deren Brechungsindex ebenfalls in der Regel zwischen 1,33 und 1,36 liegt. Ein besonders gut geeignetes Material ist auch Teflon® AF, welches üblicherweise einen Brechungsindex nd = 1,32 aufweist. Bei diesem Material handelt es sich um ein amorphes Polymer, hier kann die Glasübergangstemperatur so eingestellt werden, dass das Polymer im erkalteten Zustand den Brechungsindex des Mediums, in welchem sich die Probe befindet, aufweist. Auch andere amorphe Polymere mit einstellbarer Glasübergangstemperatur lassen sich selbstverständlich verwenden.
Stimmen die Brechungsindizes nicht exakt überein, so treten weiterhin Aberrationen auf, wenn auch im verringertem Maße. Um diese Aberrationen weiter zu vermindern, sollte die Auswölbung daher so dünn wie möglich konfiguriert werden und nicht dicker als einige hundert μm sein. Dient die Abdeckung gleichzeitig als Boden des Probengefäßes, wie es bei einer inversen Anordnung der Fall ist, so muss selbstverständlich auf eine ausreichende Stabilität gegenüber dem von dem Medium, in welchem sich die Probe befindet, ausgeübten Druck geachtet werden. Dies ist bei einer Abdeckung als Deckel des Probengefäßes für eine aufrechte Beobachtung nicht erforderlich, hier kann das Material noch wesentlich dünner ausgeformt werden mit Dicken von weniger als 100 μm.
In einem weiteren Schritt, welcher insbesondere bei der aufrechten Lichtblattmikroskopie einfach zu realisieren ist, können wieder Immersionsobjektive verwendet werden. Wenn man als Immersionsmedium das gleiche Medium wie für die Aufnahme der Probe verwendet, also beispielsweise Wasser und die Brechungsindizes von Wasser und für die Erhebungen / Senken im Gefäßdecket bzw. Gefäßboden ein Material verwendet wird, was einen fast identischen Brechungsindex zu Wasser aufweist, so machen sich die Grenzflächen nicht durch Streuung oder Brechung bemerkbar, die Objektive müssen dann nicht weiter korrigiert werden. Als Material für die Erhebungen bzw. Senken im Gefäßdeckel und im Gefäßboden lässt sich auch ein nanostrukturiertes Mischmaterial aus einer ersten und einer zweiten Komponente verwenden, wobei der Brechungsindex der ersten Komponente kleiner und der Brechungsindex der zweiten Komponente größer als der Brechungsindex des Mediums zur Aufnahme der Probe ist. Ist dann die mittlere Strukturgröße aus dem Material der ersten Komponente kleiner als die Lichtwellenlängen des zur Beleuchtung verwendeten und des zu delektierenden Lichts, so ergibt sich ein effektiver Brechungsindex für das Mischmaterial, der in Abhängigkeit von der Größe der Bereiche und ihrer Zahl ebenfalls an den Brechungsindex des Mediums angepasst werden kann, so dass er in dem Bereich von 5% um den Brechungsindex des Mediums zur Einbettung der Probe liegt. Beispielsweise kann nanoporöses Siliziumdioxid verwendet werden, hier ist die erste Komponente Luft und die zweite Komponente Siliziumdioxid. Solcherart nanostrukturierte Materialien werden beispielsweise in dem Artikel„Optical thin-film materials with low refractive index for broadband elimination of Fresnel reflection" von J.-Q. Xi et al., erschienen im Jahre 2007 in Nahire Photonics, Vol. 1, S.176-179 im Zusammenhang mit der Herstellung von Antireflexionsschichten beschrieben.
Es versteht sich, dass die vorstehend genannten und die nachstehend noch zu erläuternden Merkmale nicht nur in den angegebenen Kombinationen, sondern auch in anderen Kombinationen oder in Alleinstellung einsetzbar sind, ohne den Rahmen der vorliegenden Erfindung zu verlassen.
Nachfolgend wird die Erfindung beispielsweise anhand der beigefügten Zeichnungen, die auch erfindungswesentliche Merkmale offenbaren, noch näher erläutert. Es zeigen:
Fig.1 eine Anordnung zur Lichtblattmikroskopie,
Fig.2 ein Beispiel für ein Probengefäß mit Senken,
Fig. in Beispiel für einen Gefäßdeckel oder Gefäßboden,
Fig.4 a)-c) verschiedene Möglichkeiten, eine Probe im oberen Bereich einer Vertiefung einer
Mikrotiterplatte anzuordnen, und
Fig.5 die Verwendung einer drehbaren Mikrotiterplatte.
In Fig.1 ist zunächst der grundlegende Aufbau einer Anordnung zur Lichtblattmikroskopie gezeigt, welche einen leichten Zugang zu der zu untersuchenden Probe ermöglicht und damit die Voraussetzung für einen Einsatz bei Analysen einzelner Zellen mit hohem Durchsatz erfüllt. Die Anordnung ist hier als inverses Lichtblattmikroskop konfiguriert, lässt sich jedoch ohne weiteres auf ein aufrechtes Lichtblattmikroskop übertragen. In ein Probengefäß 1 befindet sich in einem Medium 2 eine Probe 3. Das Probengefäß 1 ist hinsichtlich einer ebenen Bezugsfläche ausgerichtet, welche hier durch die horizontale Oberfläche eines Probentisches 4 definiert wird. Die Anordnung umfasst außerdem eine Beleuchtungsoptik mit einer Lichtquelle 5 und einem Beleuchtungsobjektiv 6 zur Beleuchtung der Probe 3 mit einem Lichtblatt. Das Lichtblatt und die optische Achse 7 des Beleuchtungsobjektivs 6 liegen in einer Ebene, welche mit der Normalen der Bezugsfläche einen von Null verschiedenen Beleuchtungswinkel ß einschließt. Von der Probe kommendes Licht wird über eine Detektionsoptik mit einem Detektionsobjektiv 8, dessen optische Achsen 9 mit der Normalen der Bezugsfläche einen von Null verschiedenen Detektionswinkel 5 einschließt, auf einen Detektor 10 abgebildet, der Detektor 10 wandelt die registrierte Intensität in weiterverarbeitbare Bilddaten um. Beleuchtungswinkel ß und Detektionswinkel δ sind hier gleich, was jedoch nicht zwingend ist. Bei verschiedenen Aperturen der beiden Objektive beispielsweise können auch die Winkel aufgrund des räumlichen Platzbedarfs anders eingestellt sein.
Beleuchtungsobjektiv 6 und Detektionsobjektiv 8 sind unterhalb des Probengefäßes 1 angeordnet. Das Probengefäß 1 weist einen für Beleuchtungs- und Detektionslicht transparenten Gefäßboden 11 mit einer inneren Grenzfläche 12 und einer äußeren Grenzfläche 13 auf. Am Gefäßboden 11 ist mindestens eine für Beleuchtungs- und Detektionslicht transparente Senke 14 zur Ablage der Probe 3 in die Senke ausgebildet. Dabei ist es ausreichend, wenn das Probengefäß 1 im Bereich der Senke 14 transparent ist, jedoch ist die Herstellung aus einem einheitlichen Material wie Glas oder tiefgezogenem Kunststoff in der Regel einfacher. Die Ablagerung der Probe 3 in dieser Senke 14 führt dazu, dass die Probe 3 für die optische Anordnung des Lichtblattmikroskops, das Beleuchtungsobjektiv 6 und das Detektionsobjektiv 8 leichter zugänglich wird. Ein Probengefäß 1 mit einer Vielzahl solcher Senken 14 ist daher besser für eine Analyse einzelner Zellen mit hohem Durchsatz geeignet als ein Gefäß mit einem ebenen Boden, da durch die Ablagerung der Probe in der Senke die einzelnen Vertiefungen, über die eine solche Multi-Well-Platte oder Mikrotiterplatte verfügt, lateral mit kleineren Abmessungen konzipiert werden können. Die Mikrotiterplatten müssen dann nicht so oft gewechselt werden.
Dabei sind die Form der Senke 14, ihre Position bei der Beobachtung sowie die Lagen der optischen Achsen 7 und 9 von Beleuchtungsobjektiv 6 bzw. Detektionsobjektiv 8 aufeinander abgestimmt, indem diese optische Achsen 7, 9 des Beleuchtungsobjektivs 6 und des Detektionsobjektivs 8 mit den Normalen der inneren Grenzfläche 12 und der äußeren Grenzfläche 13 zumindest im Bereich des Durchtritts der optischen Achsen 7 und 9 durch die Grenzflächen 12 und 13 einen minimalen Winkel einschließen. Auf diese Weise kann das Auftreten von Aberrationen durch schrägen Lichteinfall bzw. schrägen Lichtaustritt durch die Grenzflächen minimiert werden. Der Winkel ist dabei bevorzugt Null.
Im in Fig.1 gezeigten Beispiel umfasst die mindestens eine Senke 14 ein erstes und ein zweites vom Gefäßboden 11 abstehendes plattenförmiges Element 15 bzw. 16. Bei jedem der plattenförmigen Elemente 15 und 16 ist die innere Grenzfläche 12 parallel zur äußeren Grenzfläche 13 angeordnet. An der tiefsten Stelle der Senke 14 stehen die beiden plattenförmigen Elemente 15 und 16 in mindestens einem Punk in Kontakt, wobei die Normalen der Grenzflächen 12, 13 des ersten plattenförmigen Elements 15 mit der optischen Achse 7 des Beleuchtungsobjektivs 6 und die Normalen der Grenzflächen 12, 13 des zweiten plattenförmigen Elements 16 mit der optischen Achse 9 des Detektionsobjektivs 8 zusammenfallen. Die Summe von Beleuchtungswinkel ß und Detektionswinkel δ beträgt hier 90°, sie kann aber auch davon abweichen. Diese Anordnung hat den großen Vorteil, dass Aberrationen, wie sie bei schrägem Lichtdurchtritt durch die Grenzflächen 12, 13 auftreten, ganz vermieden werden können. Für das Beleuchtungsobjektiv 6, welches in der Regel eine kleine numerische Apertur in der Größenordnung von 0,3 aufweist, da das zu erzeugende Lichtblatt so dünn wie möglich sein sollte, sind weitere Korrekturen dann nicht mehr unbedingt notwendig. Für das Detektionsobjektiv 8, welches in der Regel eine hohe numerische Apertur in der Größenordnung von 1,0 aufweist, sind jedoch weitere Korrekturen vorteilhaft, in besonderen Fällen auch für die Beleuchtungsoptik. Die Korrekturmittel können beispielsweise Korrekturlinsen im Beleuchtungsobjektiv 6 oder im Detektionsobjektiv 8 umfassen oder auch adaptive optische Elemente zur Manipulation der Phasenfronten des Beleuchtungs- und / oder des Detektionslichtes, die im Beleuchtungsstrahlengang bzw. im Detektionsstrahlengang angeordnet sind und bevorzugt als verformbare Spiegel, räumliche Lichtmodulatoren oder Phasenplatten ausgestaltet sind.
Um Streuung und Brechung an den Grenzflächen 12, 13 ganz zu vermeiden, lässt sich der Gefäßboden 11 auch aus einem Material gestalten, welches einen Brechungsindex aufweist, der sich von dem Brechungsindex des Mediums 2, in welchem sich die Probe 3 befindet, um weniger als 5% unterscheidet. Hier geeignet sind besonders amorphe Polymere, die in ihrer Glasübergangstemperatur so eingestellt werden können, dass beim Erkalten das Material genau den gewünschten Brechungsindex aufweist. Auch ein nanostrukturiertes Mischmaterial, beispielsweise aus nanoporösem Siliziumdioxid, d.h. Siliziumdioxid mit einer Vielzahl von zylinderförmigen Durchlässen kann als Material für den Gefäßboden 11 verwendet werden. In jedem Falle sollte die Dicke des Gefäßbodens 11 so dünn wie möglich gewählt werden, um Aberrationen so gut wie möglich zu unterdrücken. Das in Fig.1 gezeigte Beispiel lässt sich in äquivalenter Weise auch für eine aufrechte Anordnung von Beleuchtungsobjektiv 6 und Detektionsobjektiv 8 übertragen, anstelle einer Senke 14 im Gefäßboden 11, weist hier der Gefäßdeckel eine entsprechende Erhebung auf.
In Fig.2 ist ein Beispiel für ein Probengefäß 1 gezeigt, welches für die Analyse von Zellen mit hohem Durchsatz geeignet ist. Gezeigt sind zwei parallel zu einander angeordnete, rinnenförmige Senken 14 in einem Ausschnitt eines Probengefäßes 1. Jede dieser Senken 14 ist durch Streben 17 in einzelne Vertiefungen unterteilt, die es möglich machen, mehrere Proben nebeneinander in einer Senke 14 anzuordnen, ohne dass eine gegenseitige Möglichkeit zur Kontaminierung besteht.
Anstelle des Gefäßbodens 11 kann auch ein entsprechender Gefäßdeckel auf diese Weise konzipiert werden. In Fig.3 ist ein Ausschnitt aus einem Gefäßdeckel 18 gezeigt, auf dem eine Vielzahl von pyramidenförmigen Erhebungen 19 angeordnet ist, jede dieser Erhebungen 19 deckt eine Vertiefung im Probengefäß 1 ab. Äquivalent kann auch der Gefäßboden 1 auf diese Weise ausgestaltet sein.
Die inneren Grenzflächen 13 in den Senken 14 bzw. Erhebungen 19 können zum Aufwachsen von Zellen auf dieser Grenzfläche funktionalisiert werden, so dass beispielsweise sich Zellen auch ohne weitere Hilfsmittel in den Erhebungen 19 anlagern können. Die Senke 14 oder die Erhebung 19 können auch mit einem Gel oder Alginat zur Immobilisierung der Probe gefüllt sein.
Um die Beobachtung der Proben zu erleichtern und die Vertiefungen einer Mikrotiterplatte möglichst mit geringem lateralen Durchmesser konzipieren zu können, weisen solche Probengefäße, die für die aufrechte Beobachtung vorgesehen sind, bevorzugt Mittel zur Positionierung der Probe im oberen Bereich des Probengefäßes 11, bezogen auf seine Tiefe, innerhalb des Arbeitsabstandes von Beleuchtungs- und Detektionsobjektiv, oder zur entsprechenden Positionierung innerhalb des Arbeitsabstandes in der Erhebung 19 im Gefäßdeckel 18 auf. Solche Mittel sind in den Figuren 4 a) - c) gezeigt. Das kastenförmige Element symbolisiert jeweils eine Vertiefung 20 einer Multi-Well-PIatte in einem Probengefäß 1 für die aufrechte Beobachtung. In Fig.4 a) ist im oberen Bereich eine durchlässige Membran 21 angeordnet, auf der die Probe 3 gelagert ist und die den Kontakt zu einem vergleichsweise großen Volumen an Nährflüssigkeit sicherstellt, um das Wachstum der Zellen zu ermöglichen. Die Membran 21 ermöglicht sowohl die Diffusion von Nährstoffen, als auch eine Stützung der Probe 3. Anstelle einer Membran 21 kann auch eine beispielsweise ebene Plattform 22 mit Öffnungen verwendet werden, dies ist In Fig.4 b) gezeigt. Die Plattform kann beispielsweise aus Glas bestehen, wodurch die Probenpräparation im wesentlichen gemäß Standardprotokollen verlaufen kann. Die Zellkultur kann auch in einem Matrixgel immobilisiert sein. In Fig.4 a) ist auf der Vertiefung 20 eine Erhebung 19 eines Gefäßdeckels 18 in Form einer Rinne oder des Aufschnitts einer Rinne dargestellt. Auch die Verwendung einer flachen Abdeckung, beispielsweise einer Folie 23, wie in Fig.4 b) gezeigt, ist grundsätzlich denkbar. Die Folie 23 kann mit dem Probengefäß verklebt oder verschweißt werden. Eine weitere Konfiguration ist in Fig.4 c) gezeigt. Hier ist ein Steg 24 dargestellt, der in die Mitte der Vertiefung ragt. Die Erhebung 19 weist hier eine Hatbtonnenform auf. Die genannten Stützelemente Membran 21, Plattform 22 und Steg 24 können auch aus Gel gefertigt sein, sofern dieses eine hinreichende Steifigkeit aufweist. Auch die Verwendung von drehbaren Mikrotiterplatten ist denkbar, wie in Fig.5 gezeigt. Dabei wird zunächst die Probe 3 in einer - hier beispielhaft trichterförmigen - Vertiefung 20 der Mikrotiterplatte abgelegt. Die Vertiefung 20 ist mit dem Medium 2 gefüllt. Anschließend wird ein trichterförmiges Element 25, an dessen Ende mit kleinerem Durchmesser eine Membran 21 angeordnet ist, in die trichterförmige Vertiefung 20 eingesetzt. Sodann wird die Mikrotiterplatte mit dem Gefäßboden 11 verschlossen. Anschließend wird die Platte umgedreht, die Probe kann dann mit einer aufrechten Anordnung zur Lichtblattmikroskopie beobachtet werden.
Bezugszeichenliste
1 Probengefäß
2 Medium
3 Probe
4 Probentisch
5 Lichtquelle
6 Beleuchtungsobjektiv
7 optische Achse
8 Detektionsobjektiv
9 optische Achse
10 Detektor
11 Gefaßboden
12 innere Grenzfläche
13 äußere Grenzfläche
14 Senke
15 erstes plattenförmiges Element
16 zweites plattenförmiges Element
17 Strebe
18 Gefäßdeckel
19 Erhebung
20 Vertiefung
21 Membran
22 Plattform
23 Folie
24 Steg
25 trichterförmiges Element

Claims

Patentansprüche 1. Anordnung zur Lichtblattmikroskopie, umfassend
ein Probengefäß (1) zur Aufnahme einer in einem Medium (2) befindlichen Probe (3), wobei das Probengefäß (1) eine Abdeckung aufweist und hinsichtlich einer ebenen Bezugsfläche ausgerichtet ist,
eine Beleuchtungsoptik mit einem Beleuchtungsobjektiv (6) zur Beleuchtung der Probe (3) mit einem Lichtblatt, wobei die optische Achse (7) des Beleuchtungsobjektivs (6) und das Lichtblatt in einer Ebene liegen, die mit der Normalen der Bezugsfläche einen von Null verschiedenen Beleuchtungswinkel ß einschließt,
eine Detektionsoptik mit einem Detektionsobjektiv (8), dessen optische Achse (9) mit der Normalen der Bezugsfläche einen von Null verschiedenen Detektionswinkel δ einschließt, dadurch gekennzeichnet, dass
an der Abdeckung mindestens eine für Beleuchtungs- und Detektionslicht transparente Auswölbung mit einer inneren Grenzfläche (12) und einer äußeren Grenzfläche (13) zur Aufnahme der Probe (3) in dieser Auswölbung ausgebildet ist, und
die Form der mindestens einen Auswölbung, ihre Position bei der Beobachtung sowie die Lage der optischen Achsen (7, 9) von Beleuchtungsobjektiv (6) und Detektionsobjektiv (9) aufeinander abgestimmt sind, indem die optischen Achsen (7, 9) mit den Normalen der Grenzflächen (12, 13) zumindest im Bereich des Durchtritts der optischen Achsen (7, 9) durch die Grenzflächen einen minimalen Winkel einschließen.
2. Anordnung zur Lichtblattmikroskopie nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, dass die mindestens eine Auswölbung zwei von der Abdeckung und vom Probengefäß abstehende plattenförmige Elemente (15, 16) mit parallelen Grenzflächen (12, 13) umfasst, welche an derjenigen Stelle der Auswölbung mit der größten Entfernung zum übrigen Probengefäß (1) in mindestens einem Punkt in Kontakt stehen, wobei die Normalen der Grenzflächen (12, 13) eines ersten plattenförmigen Elements (15) mit der optischen Achse (7) des Beleuchtungsobjektivs (6) und die Normalen der Grenzflächen (12, 13) eines zweiten plattenförmigen Elements (16) mit der optischen Achse (9) des Detektionsobjektivs (8) zusammenfallen, und wobei die Summe von Beleuchtungswinkel ß und Detektionswinkel δ bevorzugt 90° beträgt.
3. Anordnung zur Lichtblattmikroskopie nach Anspruch 1 oder 2, dadurch gekennzeichnet, dass die mindestens eine Auswölbung rinnen- oder pyramidenförmig ausgestaltet ist.
4. Anordnung zur Lichtblattmikroskopie nach einem der Ansprüche 1 bis 3, dadurch gekennzeichnet, dass die innere Grenzfläche (12) der mindestens einen Auswölbung zum Aufwachsen von Zellen funktionalisiert ist
5. Anordnung nach einem der Ansprüche 1 bis 4, dadurch gekennzeichnet, dass Beleuchtungsobjektiv (6) und Detektionsobjektiv (8) unterhalb des Probengefäßes (1) angeordnet sind, die Abdeckung als Gefäßboden (11) und die mindestens eine Auswölbung als Senke (14) ausgestaltet ist.
6. Anordnung zur Lichtblattmikroskopie nach Anspruch 5, dadurch gekennzeichnet, dass das Probengefäß (1) als Mikrotiterplatte mit einer Vielzahl von Vertiefungen ausgebildet ist, und an jeder Vertiefung eine pyramidenförmige Senke (14) ausgebildet ist.
7. Anordnung nach einem der Ansprüche 5 oder 6, dadurch gekennzeichnet, dass die mindestens eine Senke (14) mit einem Gel oder Alginat gefüllt ist.
8. Anordnung zur Lichtblattmikroskopie nach einem der Ansprüche 1 bis 4, dadurch gekennzeichnet, dass Beleuchtungsobjektiv (6) und Detektionsobjektiv (8) oberhalb des Probengefäßes (1) angeordnet sind, die Abdeckung als Gefäßdeckel (18) ausgestaltet ist, die mindestens eine Auswölbung als Erhebung (19) ausgestaltet ist, und im Probengefäß (1) Mittel zur Positionierung der Probe (3) im oberen Bereich des Probengefäßes (1), bezogen auf seine Tiefe, innerhalb des Arbeitsabstandes von Beleuchtungsobjektiv (6) und Detektionsobjektiv (8) und / oder zu entsprechender Positionierung In der mindestens einen Erhebung (19) angeordnet sind.
9. Anordnung zur Lichtblattmikroskopie nach Anspruch 8, dadurch gekennzeichnet, dass das Probengefäß (1) als Mikrotiterplatte mit einer Vielzahl von pyramidenförmigen Erhebungen (19) im Gefäßdeckel (18) ausgebildet ist.
10. Anordnung zur Lichtblattmikroskopie nach Anspruch 9, dadurch gekennzeichnet, dass die Mikrotiterplatte drehbar ausgestaltet ist.
11. Anordnung zur Lichtblattmikroskopie nach einem der Ansprüche 8 bis 10, dadurch gekennzeichnet, dass die Mittel zur Positionierung der Probe (1) im oberen Bereich des Probengefäßes oder in der mindestens einen Erhebung (19) eine für Nährlösungen permeable Membran (21), eine Plattform (22) mit einer Vielzahl von Öffnungen, oder einen Steg (24) umfassen.
12. Anordnung zur Lichtblattmikroskopie nach Anspruch 11, dadurch gekennzeichnet, dass die Membran (21), die Plattform (22), oder der Steg (24) aus einem Gel sind.
13. Anordnung zur Lichtblattmikroskopie nach einem der Ansprüche 1 bis 12, dadurch gekennzeichnet, dass Beleuchtungsoptik und / oder die Detektionsopttk Korrekturmittel zur Verringerung von solchen Aberrationen umfasst, welche durch schrägen Durchtritt von Beleuchtungslicht und/oder zu detektierendem Licht durch die Grenzflächen entstehen.
14. Anordnung zur Lichtblattmikroskopie nach Anspruch 13 dadurch gekennzeichnet, dass die Korrekturmittel Korrekturlinsen im Beleuchtungsobjektiv (6) und / oder im Detektionsobjektiv (8), bevorzugt Zylinderlinsen, verkippte oder nicht axial angeordnete Linsen oder Korrekturelemente mit asphärischen Flächen oder mit Freiformflächen, umfassen, oder im Beleuchtungsstrahlengang und / oder im Detektionsstrahlengang angeordnete adaptive optische Elemente zur Manipulation der Phasenfronten des Beleuchtungs- und / oder des Detektionslichts, bevorzugt verformbare Spiegel, räumliche Lichtmodulatoren, oder Phasenplatten, umfassen.
15. Anordnung zur Lichtblattmikroskopie nach einem der Ansprüche 1 bis 14, dadurch gekennzeichnet, dass der Gefäßboden (11) und / oder der Gefäßdeckel (18) aus einem Material besteht, welches einen Brechungsindex aufweist, der sich von dem Brechungsindex des Mediums (2), in welchem sich die Probe (3) befindet, um weniger als 5% unterscheidet.
16. Anordnung zur Lichtblattmikroskopie nach Anspruch 15, dadurch gekennzeichnet, dass das Material ein nanostrukturiertes Mischmaterial aus einer ersten und einer zweiten Komponente ist, wobei der Brechungsindex der ersten Komponente kleiner und der Brechungsindex der zweiten Komponente größer als der Brechungsindex des Mediums (2) ist, und wobei die mittleren Strukturgrößen der Bereiche aus Material der ersten Komponente einen mittleren Durchmesser aufweisen, der geringer als die Lichtwellenlängen des zur Beleuchtung verwendeten und des zu detektierenden Lichts ist.
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