WO2016136441A1 - 画像処理装置、画像処理方法、及び画像処理プログラム - Google Patents
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Definitions
- the present invention relates to an image processing apparatus, an image processing method, and an image processing program, and more particularly to image processing used for pathological diagnosis.
- pathological diagnosis in which tissue sections collected from living organisms such as humans and animals are observed with a microscope to diagnose the presence or type of lesions, has been actively performed.
- the collected tissue is first dehydrated to fix it, and then treated with paraffin blocking, then cut into thin slices with a thickness of 2 to 8 ⁇ m, the paraffin removed, stained, and observed with a microscope.
- Diagnosis is performed by generating data (cell image) and analyzing morphological information and staining information such as changes in the size and shape of the cell nucleus and changes in the pattern of the tissue.
- image processing for extracting a region of interest for example, a cell region
- a region of interest for example, a cell region
- Patent Document 1 describes a technique capable of individually extracting cell shapes even when a plurality of cells are superimposed on a cell image (see paragraph 0018). Specifically, paying attention to the staining density (density gradient) of the cell, this technique is to determine the sign of the inner product value of the density gradient vector of the cell contour forming pixel and the displacement vector from the pixel to the cell center position. (See paragraphs 0027 to 0028, FIG. 10, paragraphs 0084 to 0088, FIGS. 13 to 16, etc.).
- Patent Document 2 a constricted portion is recognized as a boundary between individual cells on a contour where a plurality of cells overlap by the Watershed method, and each divided by the boundary is detected as a single cell. It is described.
- Patent Document 3 describes a technique for automatically identifying a region of interest in an image by evaluating an attribute value for each pixel of the image based on the feature amount of the observation object in the cell. Yes.
- JP 2000-321031 A Japanese Patent Laid-Open No. 2006-079196 Special table 2008-527546
- the feature amount of each cell often differs depending on the state of the cell and the type of cell, so the cell region is extracted with high accuracy for all cells in the image.
- a main object of the present invention is to provide an image processing apparatus, an image processing method, and an image processing program capable of easily correcting a part of an image created by automatically performing image processing. .
- an image processing apparatus that creates an image of interest from an image of cells in a specimen, Cell image input means for inputting the image; Setting means for setting one or a plurality of target images in the image; Creating means for creating a plurality of candidate images by performing image processing using predetermined parameters for each of the target images; Display means for displaying the plurality of candidate images created by the creating means;
- An image processing apparatus comprising:
- a determination means for quantitatively determining a bias of a predetermined feature amount in the image The setting unit sets a plurality of the target images based on the feature amount when the determination unit determines that the deviation of the feature amount is larger than a predetermined reference.
- Image processing apparatus for quantitatively determining a bias of a predetermined feature amount in the image.
- the creation unit performs image processing using at least one of the luminance, chromaticity, and edge of the target image as the parameter. 5. Image processing apparatus.
- the creating means performs image processing on the target image using a plurality of parameters
- the display means sets different parameters for each dimension axis, and arranges and displays the candidate images at positions corresponding to the set parameter values.
- Evaluation means for calculating and evaluating an evaluation value for evaluating whether or not the candidate image is the image of interest based on at least one of the area, perimeter, circularity, and ellipticity of the candidate image Prepared, From the first aspect, the display unit determines and displays an arrangement of the plurality of candidate images based on the evaluation value when displaying the plurality of candidate images having different parameter values.
- the image processing apparatus according to claim 6.
- Display candidate image selection means for selecting, as a plurality of candidate images to be displayed on the display means, candidate images whose parameter values used for image processing are within a predetermined range by a user operation.
- the image processing apparatus according to any one of claims 1 to 6.
- the creation means performs image processing using parameters having the same value for the target images designated in the same group by the designation means.
- the image processing apparatus according to item.
- the specimen is a specimen in which a specific biological substance is stained with fluorescent particles in which fluorescent substances are accumulated, Fluorescent image input means for inputting a fluorescent image in the same visual field range as the image, the position of the specific biological material being represented by a fluorescent bright spot based on the fluorescence of the fluorescent particles, A fluorescent luminescent spot extracting means for extracting the position of the fluorescent luminescent spot in the fluorescent image;
- the image processing apparatus according to any one of claims 1 to 9, wherein the creation unit performs image processing using the parameter based on the position of the candidate image and the fluorescent bright spot.
- the image processing apparatus according to claim 10, wherein the display unit displays an image in the same range as the target image of the fluorescent image so as to overlap the candidate image.
- the image processing apparatus further comprising a confirmation unit that confirms the candidate image selected by the selection unit as an image of interest.
- an image processing method for creating an image of interest from an image of cells in a specimen A cell image input step of inputting the image; A setting step of setting one or a plurality of target images in the image; A creation step of creating a plurality of candidate images by performing image processing using predetermined parameters for each of the target images; A display step of displaying the plurality of candidate images created by the creation step; A selection step of selecting one of the plurality of candidate images through a user operation; An image processing method comprising: a confirmation step of confirming one candidate image selected in the selection step as an interest image.
- a computer that creates images of interest from images of cells in the specimen, Cell image input means for inputting the image; Setting means for setting one or a plurality of target images in the image; Creating means for creating a plurality of candidate images by performing image processing using predetermined parameters for each of the target images; Display means for displaying the plurality of candidate images created by the creating means; Selection means for selecting one of the plurality of candidate images through a user operation; Confirming means for confirming one candidate image selected by the selecting means as an image of interest; An image processing program that functions as an image processing program.
- an image processing apparatus an image processing method, and an image processing program capable of easily correcting a part of an image created by automatically performing image processing.
- FIG. 1 is a diagram schematically showing a configuration of a pathological diagnosis support system. It is a block diagram which shows roughly the functional structure of an image processing apparatus. It is a flowchart which shows the flow of the image analysis process in an Example roughly. It is a flowchart which shows roughly the flow of the extraction process of a fluorescent luminescent spot. It is a flowchart which shows the flow of the extraction process of a cell roughly. It is a schematic diagram which shows the example of the display method of a candidate image. It is a schematic diagram which shows the example of the display method of a candidate image. It is a schematic diagram which shows the example of the display method of a candidate image. It is a schematic diagram which shows the example of the display method of a candidate image. It is a schematic diagram which shows the example of the display method of a candidate image.
- 10 is a flowchart schematically showing a flow of image analysis processing in Modification 2.
- 10 is a schematic diagram illustrating an example of a candidate image display method according to Modification 2.
- FIG. 10 is a schematic diagram illustrating an example of a candidate image display method in Modification 3.
- FIG. 10 is a schematic diagram illustrating an example of a candidate image display method in Modification 4.
- FIG. 10 is a schematic diagram illustrating an example of a candidate image display method in Modification 4.
- FIG. 1 shows an example of the overall configuration of a pathological diagnosis support system 10 provided with the image processing apparatus of the present invention.
- the pathological diagnosis support system 10 acquires a microscopic image of a tissue section of a human body stained with a predetermined staining reagent, and analyzes the acquired microscopic image, thereby expressing the expression of a specific biological material in the tissue section to be observed. This is a system that outputs feature quantities quantitatively.
- the pathological diagnosis support system 10 is configured by connecting a microscope image acquisition device 1A and an image processing device 2A so as to be able to transmit and receive data via an interface such as a cable 3A.
- the connection method between the microscope image acquisition apparatus 1A and the image processing apparatus 2A is not particularly limited.
- the microscope image acquisition device 1A and the image processing device 2A may be connected via a LAN (Local Area Network) or may be connected wirelessly.
- LAN Local Area Network
- the microscope image acquisition apparatus 1A is a known optical microscope with a camera, and acquires a microscope image of a tissue section on a slide placed on a slide fixing stage and transmits it to the image processing apparatus 2A.
- the microscope image acquisition apparatus 1A includes an irradiation unit, an imaging unit, an imaging unit, a communication I / F, and the like.
- the irradiating means includes a light source, a filter, and the like, and irradiates the tissue section on the slide placed on the slide fixing stage with light.
- the image forming means is composed of an eyepiece lens, an objective lens, and the like, and forms an image of transmitted light, reflected light, or fluorescence emitted from the tissue section on the slide by the irradiated light.
- the image pickup means is a microscope-installed camera that includes a CCD (Charge Coupled Device) sensor and the like, picks up an image formed on the image forming surface by the image forming means, and generates digital image data of the microscope image.
- the communication I / F transmits image data of the generated microscope image to the image processing apparatus 2A.
- the microscope image acquisition apparatus 1A includes a bright field unit that combines an irradiation unit and an imaging unit suitable for bright field observation, and a fluorescence unit that combines an irradiation unit and an imaging unit suitable for fluorescence observation. It is possible to switch between bright field / fluorescence by switching.
- the microscope image acquisition apparatus 1A is not limited to a microscope with a camera.
- a virtual microscope slide creation apparatus for example, a special microscope scan apparatus that acquires a microscope image of an entire tissue section by scanning a slide on a microscope slide fixing stage). Table 2002-514319
- the virtual microscope slide creation device it is possible to acquire image data that allows a display unit to view a whole tissue section on a slide at a time.
- the image processing apparatus 2A calculates the expression distribution of a specific biological material in the tissue section to be observed by analyzing the microscope image transmitted from the microscope image acquisition apparatus 1A.
- FIG. 2 shows a functional configuration example of the image processing apparatus 2A.
- the image processing apparatus 2 ⁇ / b> A includes a control unit 21, an operation unit 22, a display unit 23, a communication I / F 24, a storage unit 25, and the like, and each unit is connected via a bus 26. Yes.
- the control unit 21 includes a CPU (Central Processing Unit), a RAM (Random Access Memory), and the like, executes various processes in cooperation with various programs stored in the storage unit 25, and performs image processing 2A. Overall control of the operation. For example, the control unit 21 executes image analysis processing (see FIG. 3) in cooperation with the image processing program stored in the storage unit 25, and sets, creates, selects, confirms, determines, Functions as an evaluation unit, a display candidate image selection unit, a designation unit, and a fluorescent bright spot extraction unit are realized.
- image analysis processing see FIG. 3
- the operation unit 22 includes a keyboard having character input keys, numeric input keys, various function keys, and the like, and a pointing device such as a mouse and a touch pen. Is output to the control unit 21 as an input signal.
- the display unit 23 includes a monitor such as a CRT (Cathode Ray Tube) or an LCD (Liquid Crystal Display), and displays various screens in accordance with instructions of display signals input from the control unit 21. As a function.
- a monitor such as a CRT (Cathode Ray Tube) or an LCD (Liquid Crystal Display)
- LCD Liquid Crystal Display
- the communication I / F 24 is an interface for transmitting and receiving data to and from external devices such as the microscope image acquisition device 1A.
- the communication I / F 24 functions as a cell image input unit and a fluorescence image input unit.
- the storage unit 25 is configured by, for example, an HDD (Hard Disk Drive), a semiconductor nonvolatile memory, or the like. As described above, the storage unit 25 stores various programs and various data.
- the image processing apparatus 2A may include a LAN adapter, a router, and the like, and be connected to an external device via a communication network such as a LAN.
- the image processing apparatus 2A performs analysis using the bright field image and the fluorescence image transmitted from the microscope image acquisition apparatus 1A.
- “Bright field image” refers to a tissue section stained with a hematoxylin staining reagent (H staining reagent) and a hematoxylin-eosin staining reagent (HE staining reagent) in the bright field in the microscope image acquisition apparatus 1A. It is a microscope image obtained by imaging
- Hematoxylin (H) is a blue-violet pigment that stains cell nuclei, bone tissue, part of cartilage tissue, serous components, etc.
- E is a red to pink pigment that stains cytoplasm, connective tissue of soft tissues, erythrocytes, fibrin, endocrine granules (acidophilic tissues, etc.).
- Fluorescence image means that tissue sections stained with a fluorescent staining reagent are irradiated with excitation light of a predetermined wavelength in the microscope image acquisition apparatus 1A to emit fluorescence, and this fluorescence is enlarged and imaged and photographed. It is the microscope image obtained by this.
- Fluorescent staining reagent is a staining reagent containing fluorescent substance-encapsulating nanoparticles bound with a biological substance recognition site that specifically binds and / or reacts with a specific biological substance.
- fluorescent substance-encapsulating nanoparticles Nanoparticles containing a fluorescent substance (hereinafter referred to as fluorescent particles). Fluorescence that appears in the fluorescence image is emitted when the fluorescent substance-containing nanoparticles (fluorescent substance) of the fluorescent staining reagent are excited, and indicates the expression of a specific biological substance corresponding to the biological substance recognition site in the tissue section It is.
- Fluorescent substance examples include fluorescent organic dyes and quantum dots (semiconductor particles). When excited by ultraviolet to near infrared light having a wavelength in the range of 200 to 700 nm, it preferably emits visible to near infrared light having a wavelength in the range of 400 to 1100 nm.
- Fluorescent organic dyes include fluorescein dye molecules, rhodamine dye molecules, Alexa Fluor (Invitrogen) dye molecules, BODIPY (Invitrogen) dye molecules, cascade dye molecules, coumarin dye molecules, and eosin dyes. Examples include molecules, NBD dye molecules, pyrene dye molecules, Texas Red dye molecules, and cyanine dye molecules.
- Quantum dots include II-VI group compounds, III-V group compounds, or quantum dots containing group IV elements as components ("II-VI group quantum dots”, "III-V group quantum dots”, “ Or “Group IV quantum dots”). These quantum dots may be used alone or in combination of a plurality of types. Specific examples include, but are not limited to, CdSe, CdS, CdTe, ZnSe, ZnS, ZnTe, InP, InN, InAs, InGaP, GaP, GaAs, Si, and Ge.
- a quantum dot having the above quantum dot as a core and a shell provided thereon.
- the core is CdSe and the shell is ZnS
- CdSe / ZnS when the core is CdSe and the shell is ZnS, it is expressed as CdSe / ZnS.
- CdSe / ZnS, CdS / ZnS, InP / ZnS, InGaP / ZnS, Si / SiO 2 , Si / ZnS, Ge / GeO 2 , Ge / ZnS, and the like can be used, but are not limited thereto.
- Quantum dots may be subjected to surface treatment with an organic polymer or the like as necessary.
- organic polymer or the like as necessary. Examples thereof include CdSe / ZnS having a surface carboxy group (manufactured by Invitrogen), CdSe / ZnS having a surface amino group (manufactured by Invitrogen), and the like.
- Fluorescent substance-encapsulated nanoparticles are nanoparticles encapsulating a fluorescent substance as described above, and more specifically, those in which a fluorescent substance is dispersed inside the nanoparticle.
- the substance and the nanoparticle itself may be chemically bonded or may not be bonded.
- the material constituting the nanoparticles is not particularly limited, and examples thereof include silica, polystyrene, polylactic acid, and melamine.
- the fluorescent substance-containing nanoparticles can be produced by a known method.
- silica nanoparticles encapsulating a fluorescent organic dye can be synthesized with reference to the synthesis of FITC-encapsulated silica particles described in Langmuir 8, Vol. 2921 (1992).
- Various fluorescent organic dye-containing silica nanoparticles can be synthesized by using a desired fluorescent organic dye in place of FITC.
- Silica nanoparticles encapsulating quantum dots can be synthesized with reference to the synthesis of CdTe-encapsulated silica nanoparticles described in New Journal of Chemistry, Vol. 33, p. 561 (2009).
- Polystyrene nanoparticles encapsulating a fluorescent organic dye may be copolymerized using an organic dye having a polymerizable functional group described in US Pat. No. 4,326,008 (1982) or polystyrene described in US Pat. No. 5,326,692 (1992). It can be produced using a method of impregnating nanoparticles with a fluorescent organic dye.
- the polymer nanoparticles encapsulating the quantum dots can be prepared by using the method of impregnating the quantum nanoparticles into polystyrene nanoparticles described in Nature Biotechnology, Vol. 19, page 631 (2001).
- the average particle diameter is obtained by taking an electron micrograph using a scanning electron microscope (SEM), measuring the cross-sectional area of a sufficient number of particles, and taking each measured value as the area of the circle. It is the value calculated as. In this embodiment, the arithmetic average of the particle diameters of 1000 particles is defined as the average particle diameter.
- the coefficient of variation is also a value calculated from the particle size distribution of 1000 particles.
- Bio material recognition site is a site that specifically binds and / or reacts with a specific biological material.
- the specific biological substance is not particularly limited as long as a substance that specifically binds to the specific biological substance exists, but typically includes proteins (peptides) and nucleic acids (oligonucleotides, polynucleotides). It is done. Therefore, examples of the biological substance recognition site include an antibody that recognizes the protein as an antigen, another protein that specifically binds to the antibody, and a nucleic acid having a base sequence that hybridizes to the nucleic acid.
- Specific biological substance recognition sites include anti-HER2 antibody that specifically binds to HER2, which is a protein present on the cell surface, anti-ER antibody that specifically binds to estrogen receptor (ER) present in the cell nucleus, cells An anti-actin antibody that specifically binds to actin forming the skeleton is exemplified.
- anti-HER2 antibody and anti-ER antibody combined with fluorescent substance-encapsulating nanoparticles can be used for breast cancer medication selection and are preferable.
- the mode of binding between the biological substance recognition site and the fluorescent substance-encapsulating nanoparticles is not particularly limited, and examples thereof include covalent bonding, ionic bonding, hydrogen bonding, coordination bonding, physical adsorption, and chemical adsorption.
- a bond having a strong bonding force such as a covalent bond is preferable from the viewpoint of bond stability.
- SM PEG 12 manufactured by Thermo Scientific can be used.
- a silane coupling agent that is a compound widely used for bonding an inorganic substance and an organic substance can be used.
- This silane coupling agent is a compound having an alkoxysilyl group that gives a silanol group by hydrolysis at one end of the molecule and a functional group such as a carboxyl group, an amino group, an epoxy group, an aldehyde group at the other end, Bonding with an inorganic substance through an oxygen atom of the silanol group.
- silane coupling agent having a polyethylene glycol chain (for example, PEG-silane no. SIM6492.7 manufactured by Gelest), etc. Is mentioned.
- silane coupling agent you may use 2 or more types together.
- a known procedure can be used for the reaction procedure of the fluorescent organic dye-encapsulated silica nanoparticles and the silane coupling agent.
- the obtained fluorescent organic dye-encapsulated silica nanoparticles are dispersed in pure water, aminopropyltriethoxysilane is added, and the mixture is reacted at room temperature for 12 hours.
- fluorescent organic dye-encapsulated silica nanoparticles whose surface is modified with an aminopropyl group can be obtained by centrifugation or filtration.
- the antibody can be bound to the fluorescent organic dye-encapsulated silica nanoparticles via an amide bond.
- a condensing agent such as EDC (1-Ethyl-3- [3-Dimethylaminopropyl] carbohydrate Hydrochloride: Pierce (registered trademark)
- EDC 1-Ethyl-3- [3-Dimethylaminopropyl] carbohydrate Hydrochloride: Pierce (registered trademark)
- a linker compound having a site that can be directly bonded to the fluorescent organic dye-encapsulated silica nanoparticles modified with organic molecules and a site that can be bonded to the molecular target substance can be used.
- sulfo-SMCC Sulfosuccinimidyl 4 [N-maleimidomethyl] -cyclohexane-1-carboxylate: manufactured by Pierce
- sulfo-SMCC Sulfosuccinimidyl 4 [N-maleimidomethyl] -cyclohexane-1-carboxylate: manufactured by Pierce
- fluorescent substance-encapsulated polystyrene nanoparticles When binding a biological material recognition site to fluorescent substance-encapsulated polystyrene nanoparticles, the same procedure can be applied regardless of whether the fluorescent substance is a fluorescent organic dye or a quantum dot. That is, by impregnating a fluorescent organic dye or quantum dot into polystyrene nanoparticles having a functional group such as an amino group, fluorescent substance-containing polystyrene nanoparticles having a functional group can be obtained, and thereafter using EDC or sulfo-SMCC. Thus, antibody-bound fluorescent substance-encapsulated polystyrene nanoparticles can be produced.
- biological substance recognition sites include antibodies that recognize specific antigens: M. actin, MS actin, SM actin, ACTH, Alk-1, ⁇ 1-antichymotrypsin, ⁇ 1-antitrypsin, AFP, bcl-2, bcl -6, ⁇ -catenin, BCA 225, CA19-9, CA125, calcitonin, calretinin, CD1a, CD3, CD4, CD5, CD8, CD10, CD15, CD20, CD21, CD23, CD30, CD31, CD34, CD43, CD45, CD45R, CD56, CD57, CD61, CD68, CD79a, "CD99, MIC2", CD138, chromogranin, c-KIT, c-MET, collagen type IV, Cox-2, cyclin D1, keratin, cytokeratin (high molecular weight), Pankeratin, Pankeratin (high molecular weight), Pankeratin, Pankeratin (high molecular weight
- the following staining method is not limited to a pathological tissue section, but can also be applied to cultured cells.
- the method for preparing the tissue section is not particularly limited, and a tissue slice prepared by a known method can be used.
- a tissue section is immersed in a container containing xylene to remove paraffin.
- the temperature is not particularly limited, but can be performed at room temperature.
- the immersion time is preferably 3 minutes or longer and 30 minutes or shorter. If necessary, xylene may be exchanged during the immersion.
- the tissue section is immersed in a container containing ethanol to remove xylene.
- the temperature is not particularly limited, but can be performed at room temperature.
- the immersion time is preferably 3 minutes or longer and 30 minutes or shorter. If necessary, ethanol may be exchanged during the immersion.
- the tissue section is immersed in a container containing water to remove ethanol.
- the temperature is not particularly limited, but can be performed at room temperature.
- the immersion time is preferably 3 minutes or longer and 30 minutes or shorter. If necessary, water may be exchanged during the immersion.
- the activation process of the biological material of a tissue section is performed according to a known method.
- the activation conditions are not particularly defined, but as the activation liquid, 0.01 M citrate buffer (pH 6.0), 1 mM EDTA solution (pH 8.0), 5% urea, 0.1 M Tris-HCl buffer, etc. are used. be able to.
- An autoclave, a microwave, a pressure cooker, a water bath, etc. can be used for a heating apparatus.
- the temperature is not particularly limited, but can be performed at room temperature. The temperature can be 50-130 ° C. and the time can be 5-30 minutes.
- the tissue section after the activation treatment is immersed in a container containing PBS (Phosphate Buffered Saline) and washed.
- PBS Phosphate Buffered Saline
- the temperature is not particularly limited, but can be performed at room temperature.
- the immersion time is preferably 3 minutes or longer and 30 minutes or shorter. If necessary, PBS may be exchanged during immersion.
- each fluorescent substance-encapsulated nanoparticle PBS dispersion may be mixed in advance, or sequentially separately. It may be placed on a tissue section.
- the temperature is not particularly limited, but can be performed at room temperature.
- the reaction time is preferably 30 minutes or more and 24 hours or less.
- a known blocking agent such as BSA-containing PBS
- a fluorescent staining reagent it is preferable to drop a known blocking agent such as BSA-containing PBS before staining with a fluorescent staining reagent.
- the stained tissue section is immersed in a container containing PBS, and unreacted fluorescent substance-containing nanoparticles are removed.
- the temperature is not particularly limited, but can be performed at room temperature.
- the immersion time is preferably 3 minutes or longer and 30 minutes or shorter.
- PBS may be exchanged during immersion.
- a cover glass is placed on the tissue section and sealed.
- a commercially available encapsulant may be used as necessary. Note that HE staining using an HE staining reagent is performed before sealing with a cover glass.
- a microscope image (fluorescence image) with a wide field of view is acquired from the stained tissue section using the microscope image acquisition device 1A.
- an excitation light source and an optical filter for fluorescence detection corresponding to the absorption maximum wavelength and fluorescence wavelength of the fluorescent material used for the fluorescent staining reagent are selected.
- the visual field of the fluorescent image is preferably 3 mm 2 or more, more preferably 30 mm 2 or more, and further preferably 300 mm 2 or more.
- the step of generating pathological diagnosis information is combined with the operation of acquiring the bright field image and the fluorescence image described above and creating the image of interest using the image processing method of the present invention.
- a tissue section of a breast cancer tissue stained with a HER2 protein as a specific biological material is an observation target, and an image obtained by extracting a cell region as a region of interest is used as an image of interest.
- the operator stains the same tissue section using two types of staining reagents, an HE staining reagent and a fluorescent staining reagent (fluorescent substance-encapsulating nanoparticles bound with an anti-HER2 antibody). Thereafter, the bright field image and the fluorescence image are acquired by the procedure (a1) to (a5) using the microscope image acquisition apparatus 1A.
- A1 The operator places the tissue section stained with the HE staining reagent and the fluorescent staining reagent on the slide, and places the slide on the slide fixing stage of the microscope image acquisition apparatus 1A.
- A2 The unit is set as a bright field unit, the imaging magnification and the focus are adjusted, and the observation target region on the tissue section is placed in the field of view.
- A3 Shooting is performed by the imaging unit to generate bright field image data, and the image data is transmitted to the image processing apparatus 2A.
- A4) Change the unit to a fluorescent unit.
- A5) Shooting is performed by the imaging means without changing the field of view and the shooting magnification to generate image data of the fluorescent image, and the image data is transmitted to the image processing apparatus 2A.
- FIG. 3 shows a flowchart of the image analysis process.
- the image analysis processing shown in FIG. 3 is executed in cooperation with the control unit 21 and the image processing program stored in the storage unit 25, and the control unit 21 executes the following processing according to the image processing program.
- step S1 image input process, fluorescence image input process
- step S2 fluorescent bright spot extracting step
- step S2 a color component corresponding to the wavelength of the fluorescent bright spot is extracted from the fluorescent image
- step S202 a threshold image is applied to the fluorescent image after the color component extraction to generate a binary image.
- step S201 for example, when the emission wavelength of the fluorescent particles is 550 nm, only the fluorescent bright spot having the wavelength component is extracted as an image.
- processing for removing noise such as cell autofluorescence and other unnecessary signal components may be performed.
- a target image to be subjected to image processing for creating an image of interest is set in the bright field image (step S3: setting step). Any known method may be used for setting the target image. However, in the processing after step S4, image processing is performed for each target image to extract an image showing a region of interest. It is preferable that the region of interest (in the present embodiment, individual cells) is set so as not to be divided into different target images. Therefore, for example, it is preferable to create a plurality of target image candidates and use the one with the largest area as the target image. In addition, for example, a target image set using any conventionally known image processing method may be subjected to an expansion process to obtain a target image. The number of target images set in the bright field image is arbitrary.
- step S3 Details of the process of setting the target image (step S3) are shown in the flowchart of FIG. 5, for example.
- the control unit 21 converts the bright field image into a monochrome image (step S301).
- threshold processing is performed on the monochrome image with a predetermined threshold to binarize the value of each pixel (step S302), and image processing such as noise processing and expansion processing is performed on the binary image,
- An image is set (step S303).
- FIG. 8A is an example of a bright field image, and a set target image is shown surrounded by a dotted line.
- the threshold value used in step S302 is arbitrary.
- the threshold value is adjusted so that a region sufficiently larger than the actual cell is indicated by the binary image, and the target image is set without performing the expansion process in step S303. May be.
- the noise process in step S303 can be performed by performing a closing process on the binary image.
- the closing process is a process in which the contraction process is performed the same number of times after the expansion process is performed.
- the expansion process is a process for replacing a pixel of interest with black when at least one pixel in the range of n ⁇ n pixels (n is an integer of 2 or more) from the pixel of interest contains black.
- the contraction process is a process of replacing a target pixel with white when at least one pixel in the range of n ⁇ n pixels from the target pixel includes white.
- a small area such as noise can be removed.
- steps S301 to S303 a target image including cells in the bright field image is set. Note that the order of steps S2 and S3 may be reversed.
- the control unit 21 creates candidate images for each of the target images created in step S3 (step S4: creation step).
- the number of candidate images to be created for each target image is arbitrary, but it is preferable that a plurality of candidate images be created in order to select an image that is likely to be the target image of interest.
- a candidate image can be created by any method.
- the candidate image is created by performing image processing based on the luminance, chromaticity, edge, or the like of the target image.
- the luminance value of each pixel in the target image of the bright field image is calculated, and binarization processing is performed using the threshold value as a parameter to create a candidate image.
- each pixel in the target image of the bright field image is RGB-separated, and binarization processing is performed using a threshold value as a parameter for a predetermined color component
- Create candidate images When image processing based on edges is performed, a plurality of candidate images are created by changing parameters in image processing for extracting cell edges. A plurality of candidate images are created by changing parameter values used in each image processing as described above within a predetermined range.
- the range of the parameter value can be arbitrarily set based on the tissue specimen, the type of the image of interest, the imaging condition of the bright field image, and the like.
- the control unit 21 displays one of the candidate images for each target image created in step S3 (step S5).
- FIG. 8B is an example of the candidate image displayed in step S5. Specifically, the same image processing (contrast and brightness adjustment and binarization processing) is performed on all target regions in FIG. 8A.
- This is a binary image created by The display method of the candidate image is arbitrary. For example, when a binary image as shown in FIG. 8B is displayed as a candidate image, the candidate image obtained by making the portion other than the outline of the black region of the binary image transparent If the bright field image and the bright field image are superimposed and displayed, the bright field image and the candidate image can be easily compared.
- Step S6 Display step
- the plurality of candidate images displayed in step S6 are images obtained by subjecting the same target image as the designated candidate image to image processing using different parameter values.
- FIG. 6A shows an example of a state in which the candidate image 4 displayed in step S5 and a plurality of candidate images 5 in which parameter values are changed in image processing for extracting cell edges are displayed.
- a step of selecting a plurality of candidate images displayed in step S6 from the candidate images created in step S4 may be provided before or after step S5 (display candidate image selection step).
- the control unit 21 performs image processing using parameters within a predetermined range from the candidate images created in step S4 based on, for example, a signal input by the user via the operation unit 22.
- One or more candidate images that have been applied are selected. For example, in FIG. 6A, a plurality of candidate images 4 subjected to image processing for extracting edges using parameter values that further divide the candidate image in step S6 are selected and displayed.
- a slide bar is displayed in the vicinity of the candidate image 4 as illustrated in FIG. 6B, for example.
- the designated candidate image 4 may be changed to another candidate image 5 in accordance with the slider operation of the slide bar by the user.
- the candidate image 5 subjected to image processing for extracting an edge using a parameter value that continuously changes with the slider position is displayed.
- the operation by the user is not limited to the operation of the slider of the slide bar. For example, any known operation method such as mouse scroll operation or keyboard operation may be used.
- the arrangement of the plurality of candidate images is preferably determined based on the values of parameters used for image processing. For example, when a plurality of candidate images 5 are displayed along a straight line as shown in FIG. 6A, the parameters used for image processing of each candidate image 5 are monotonously increased or decreased monotonously along the straight line. Preferably it is displayed. Thereby, the user can easily compare the plurality of candidate images 5.
- the display method of the candidate image 5 is not limited to the above-described example, and is arbitrary.
- a plurality of candidate images 5 are displayed around the candidate image 4 displayed in step S5. May be.
- a plurality of candidate images 5 are arranged so that the value of the parameter used for the image processing monotonously increases or decreases monotonously clockwise or counterclockwise around the candidate image 4 displayed in step S5. It is preferable to be displayed.
- step S6 not only a plurality of candidate images created by performing image processing for changing the value of one type of parameter are displayed, but also image processing for changing the value of each parameter using different types of parameters.
- the candidate image thus obtained may be displayed.
- FIG. 7 shows an example in which a plurality of candidate images subjected to image processing using a parameter X that specifies the degree of expansion and a parameter Y that specifies the degree of circularity are displayed.
- candidate images are displayed at positions corresponding to the values of the parameters used for image processing on two-dimensional coordinates with the parameters X and Y being the horizontal axis and the vertical axis, respectively.
- a plurality of candidate images subjected to image processing for changing the value of any one parameter are displayed in the same manner as in FIG. 6A, for example.
- a plurality of candidate images obtained by performing image processing for changing the value of another parameter on the selected candidate image 5 may be displayed.
- step S7 when the user selects one of the candidate images 5 displayed in step S6 via the operation unit 22 (selection process), the control unit 21 selects the candidate image 4 designated by the user in step S6.
- step S7 the image is changed to the candidate image 5 selected by the user.
- the method for selecting one of the candidate images 5 by the user is arbitrary. For example, when a plurality of candidate images 5 are displayed as shown in FIG. 6A, the user can operate the operation unit 22 (for example, mouse operation or One of the candidate images 5 is selected via the operation of the touch pen. Further, when the candidate image 5 displayed by the slider operation of the slide bar or the like changes as shown in FIG.
- the user can select a predetermined image via the operation unit 22.
- an operation for example, a predetermined key operation or an operation with a mouse or a touch pen
- the candidate image 5 displayed at that time is selected.
- step S8 determination step.
- FIG. 8C is an example of the image of interest created from the bright field image of FIG. 8A, and the region shown in black is the region of interest.
- Step S9 an addition process of the image of interest and the fluorescent luminescent spot image is executed (step S9), and diagnostic information (for example, the density of fluorescent luminescent spots in the region of interest) is generated based on the superimposed image after the addition process. . (Step S10).
- the target image once specified can be changed. Specifically, for example, after the process of step S6 or S7, when the user performs a predetermined operation (for example, key operation on the keyboard), the designation of the target image is reset, and the process returns to step S3. It is preferable that the target image can be redesignated.
- a predetermined operation for example, key operation on the keyboard
- the control unit 21 quantitatively determines whether or not the distribution of the predetermined feature amount is biased in the entire bright field image (determination step). If the bias is less than the predetermined level, the bright field image is determined. The whole may be set as one target image. According to the first modification, when there is no bias in the distribution of feature amounts in the entire bright field image, it can be considered that partial adjustment is not necessary for only a part of the image.
- the same processing as the conventional image processing that performs image processing in a lump is performed.
- the feature amount of the bright-field image for example, any known ones such as contrast, gray scale converted gradation value, optical density average, texture, and color may be used.
- the method of determining the distribution of the feature amount distribution is arbitrary. For example, when the pixel value of the bright-field image obtained by monochrome conversion is used as the feature amount, the bright-field image is divided into a predetermined number of sections. The average value of the pixel values is calculated. Then, the standard deviation of the average value of the pixel values calculated for each section is calculated, and when the standard deviation is larger than a predetermined value, the variation of the pixel value for each section is large, and the distribution of the feature amount is biased. Judge.
- the image processing apparatus of the present invention may include a designation unit that designates a target image group obtained by grouping the target images set in step S3 of the above embodiment.
- a designation unit that designates a target image group obtained by grouping the target images set in step S3 of the above embodiment.
- the image processing of Modification 2 will be specifically described with reference to the flowchart of FIG. Note that the description will focus on the configuration different from the image processing of the above-described embodiment, and the description of the common configuration will be omitted.
- step S104 displays the target image on the display unit 23 (step S104).
- step S105 designates a target image group.
- step S104 for example, if the outline of the target image is displayed on the bright field image, the entire bright field image can be easily compared with the target image, and target images with similar feature quantities can be easily compared. It is preferable because it can be selected and grouped.
- target images to be grouped may be selected and specified one by one, or target images to be grouped may be specified by surrounding them with a mouse operation or the like. Note that the number of target image groups designated for one bright field image is arbitrary. There may also be a target image that is not grouped.
- step S106 the control unit 21 creates a candidate image and displays one of the candidate images in the same manner as steps S4 to S5 in the above embodiment (step S106).
- step S106 the target images designated as one target image group are collectively subjected to image processing to create and display one candidate image.
- FIG. 10 is a schematic diagram illustrating an example in which candidate images (images surrounded by dotted lines) created for each target image group are displayed.
- step S107 when the user designates an image to be corrected among the displayed candidate images through the operation of the operation unit 22, a plurality of candidate images are displayed in the same manner as in step S6 in the above embodiment (step S107).
- the schematic diagram of FIG. 10 shows an example in which a plurality of candidate images 5 created from the candidate images 4 are displayed in the step S107.
- step S108 when the user selects one of the candidate images 5 displayed in step S107 via the operation unit 22 (selection process), the control unit 21 selects the candidate image 4 designated by the user in step S107.
- step S108 the image is changed to the candidate image 5 selected by the user.
- the processing in steps S109 to S111 is the same as the processing in steps S8 to S10 in the embodiment.
- the image processing and user operation performed for each target image in step S4 and subsequent steps of the above embodiment are performed.
- the correction can be performed collectively for each target image group.
- the setting of the target image group in step S105 is not limited to the setting through the user's operation.
- the control unit 21 may calculate the feature amount of each target image set in step S103, and set the features having similar feature amounts to the same target image group.
- the feature amount of the target image any known one such as contrast, gradation value obtained by gray scale conversion, optical density average, texture, and color may be used.
- the step of designating the target image group is not limited to the creation of candidate images as described in FIG.
- the user designates a target image group based on the candidate images and the bright field image, and performs the steps S107 to S111 in FIG. May be.
- the target image group once designated can be changed. Specifically, for example, after the process of step S107 or S108, when the user performs a predetermined operation (for example, key operation on the keyboard), the process returns to the process of step S105 to reset the designation of the target image group. Preferably it can be re-designated.
- a predetermined operation for example, key operation on the keyboard
- the feature quantity used for the evaluation is, for example, the perimeter of each region, area, moment, conformity in elliptical approximation, length of major axis, eccentricity, or ellipticity (ratio of minor axis to major axis), shape, or each Examples include a contrast of a bright field image of a part corresponding to a region, a grayscale converted gradation value, an optical density average, a texture, and a color. If an evaluation value obtained by quantifying the evaluation result is calculated, a candidate image that is likely to be a correct image of interest can be easily selected based on the evaluation value, as described below. Therefore, it is preferable.
- the candidate image having the maximum evaluation value can be displayed. Furthermore, it is preferable that candidate images having an evaluation value equal to or less than a predetermined value are displayed in a different color or with a message indicating that the evaluation value is low.
- the candidate image displayed as usual has a high evaluation value and can be regarded as a correct interest image, the user selectively selects only candidate images with a low evaluation value from step S5 onward. It is possible to execute this process, and there is an advantage that labor is reduced.
- step S6 of the embodiment when a plurality of candidate images are displayed side by side as shown in FIGS. 6A and 7, for example, the candidate image with the highest evaluation value is displayed at the center and the candidate image with the lower evaluation value is displayed at the end. You may do it. Moreover, you may display an evaluation value with a candidate image in step S5 or S6 of an Example. Thereby, the user can easily select a candidate image based on the evaluation value.
- the display candidate image selection step for selecting the candidate image to be displayed in step S6 of the embodiment may be performed based on the evaluation value. For example, only candidate images having an evaluation value larger than a predetermined value are selected and displayed in step S6. Further, the display candidate image selection step may be performed as follows based on the feature amount of the candidate image and the feature amount of the standard region of interest stored in advance in the storage unit. For example, when the area of the region of interest represented in the candidate image displayed in step S5 is smaller than the area of the standard region of interest (here, the cell region), as shown in FIG. In addition, it is preferable that the candidate image 5 obtained by further performing the integration process or the expansion process on the candidate image 4 displayed in step S5 is displayed in step S6.
- step S5 when the area of the region of interest represented in the candidate image displayed in step S5 is larger than the area of the standard region of interest, the display is performed in step S5 as shown in FIG. 6A. It is preferable to display the candidate image 5 obtained by further dividing or reducing the candidate image 4 in step S6. By selecting the candidate images to be displayed in step S6 in this way, in step S6, only candidate images that are particularly likely to be correct images of interest are displayed, and useless images are not displayed. There is an advantage that is high.
- a fluorescent luminescent spot image is used in the target image setting step in step S3 of the embodiment, for example, an addition process for superimposing the monochrome image and the fluorescent luminescent spot image created in step S301 is performed.
- the target image is set so that all the fluorescent luminescent spots are included in any one of the target images. This is preferable because the risk of setting the target image so that a part of the cells protrudes from the target image is reduced.
- a fluorescent bright spot image in the step of creating a candidate image in step S4 of the embodiment for example, based on the fact that many fluorescent bright spots indicating the expression of the HER2 protein that is a membrane protein are observed near the outline of the cell, If a candidate image in which many fluorescent bright spots are distributed near the contour of the region of interest is created, the image of interest can be created with higher accuracy.
- a fluorescent luminescent spot image in the candidate image display process in step S5 of the embodiment for example, the shortest distance from each fluorescent luminescent spot to the region of interest represented in the candidate image is calculated, and the sum of the distances is the minimum.
- Candidate images can be displayed. Further, for example, the density of fluorescent bright spots in the region of interest represented in the candidate image may be calculated, and the highest density candidate image may be displayed.
- step S6 of the embodiment if the fluorescent luminescent spots (O) are displayed on the candidate images 4 and 5 in an overlapping manner, the user is based on the distribution of the fluorescent luminescent spots.
- Candidate images can be selected.
- a candidate image is displayed on a part of the image by the user. Since it is selectable, the user can easily correct only a part of the image. Thereby, an image of interest can be created with high accuracy and easily, and this can lead to an accurate pathological diagnosis.
- control unit 21 sets a target image group based on the distribution of the feature amount of the target image, thereby determining whether or not it is preferable to perform partial adjustment, and partial adjustment is unnecessary. If it is determined, image processing can be performed collectively on the entire image. Even when partial adjustment of an image is necessary, by specifying a target image group, for example, image processing can be performed collectively on target images having similar feature amounts. Thereby, the labor and cost of image processing can be reduced.
- fine correction can be performed by continuously changing and displaying candidate images through operation of a slide bar or the like.
- a candidate image is created by performing image processing that changes at least one of the brightness, chromaticity, and edge of the target image as a parameter, and when image processing that changes a plurality of parameters is performed, a multidimensional space , Set different parameters for each dimension axis, display candidate images at positions corresponding to the set parameter values, and based on the evaluation results of whether each candidate image is a correct image of interest
- creating a candidate image or displaying the fluorescent luminescent spots together with the candidate image may allow the user to be the correct image of interest. It is easy to select a high candidate image.
- the description content of this embodiment is a suitable example of this invention, and is not limited to this.
- the target image is displayed instead of the candidate image in the step S5, and when the user selects one of the target images, the selected target image is displayed.
- the expression of a biological material stained with a fluorescent material is used.
- the image processing of the present invention may be performed when the user partially modifies the fluorescent image in order to remove the noise or the like due to contamination by using the fluorescent image shown as an interest image.
- the HER2 protein in breast cancer was mentioned as an example of a specific biological material, it is not limited to this.
- the biological material recognition site when acquiring a fluorescent image is different, it is possible to provide the doctor with the expression of the biological material according to the lesion type. Become.
- the target of pathological diagnosis is a tissue section collected from a human body, but the tissue includes a cultured tissue, and instead of the tissue, cells separated from the tissue, cultured cells, blood It is also possible to use cells (for example, red blood cells, white blood cells, platelets, etc.), urinary sediments, and the like.
- an HDD or a semiconductor non-volatile memory is used as a computer-readable medium of the image processing program according to the present invention, but the present invention is not limited to this example.
- a portable recording medium such as a CD-ROM can be applied.
- a carrier wave carrier wave
- the detailed configuration and detailed operation of each device constituting the pathological diagnosis support system 10 can be changed as appropriate without departing from the spirit of the invention.
- the present invention can be suitably used for image processing of images used for pathological diagnosis.
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Abstract
Description
本発明の主な目的は、自動的に画像処理を施して作成された画像の一部を、ユーザーが容易に修正可能な画像処理装置、画像処理方法、及び画像処理プログラムを提供することにある。
1.標本内の細胞を撮影した画像から関心画像を作成する画像処理装置において、
前記画像を入力する細胞画像入力手段と、
前記画像内に一又は複数の対象画像を設定する設定手段と、
前記対象画像のそれぞれに対して、所定のパラメーターを用いた画像処理を施して複数の候補画像を作成する作成手段と、
前記作成手段によって作成された前記複数の候補画像を表示する表示手段と、
を備えることを特徴とする画像処理装置。
前記判断手段により前記特徴量の偏りが所定の基準よりも大きいと判断された場合、前記設定手段は前記特徴量に基づいて複数の前記対象画像を設定する
ことを特徴とする第1項に記載の画像処理装置。
ことを特徴とする第1項又は第2項に記載の画像処理装置。
ことを特徴とする第1項から第3項の何れか一項に記載の画像処理装置。
ことを特徴とする第1項から第4項の何れか一項に記載の画像処理装置。
前記表示手段は、各次元軸に相異なるパラメーターを設定し、設定されたパラメーターの値に対応する位置に前記候補画像を配置して表示する
ことを特徴とする第1項から第5項の何れか一項に記載の画像処理装置。
前記表示手段は、前記パラメーターの値が互いに異なる複数の前記候補画像を表示する際、前記評価値に基づいて複数の前記候補画像の配置を決定して表示する
ことを特徴とする第1項から第6項の何れか一項に記載の画像処理装置。
ことを特徴とする第1項から第6項の何れか一項に記載の画像処理装置。
前記作成手段は、前記指定手段によって同一群に指定された前記対象画像に対して、同一の値のパラメーターを用いた画像処理を施す
ことを特徴とする第1項から第8項の何れか一項に記載の画像処理装置。
前記特定の生体物質の位置を前記蛍光粒子の蛍光に基づく蛍光輝点で表す、前記画像と同一視野範囲の蛍光画像を入力する蛍光画像入力手段を備え、
前記蛍光画像における前記蛍光輝点の位置を抽出する蛍光輝点抽出手段を備え、
前記作成手段は、前記候補画像と前記蛍光輝点の位置に基づいた前記パラメーターを用いて画像処理を施す
ことを特徴とする第1項から第9項の何れか一項に記載の画像処理装置。
ことを特徴とする第10項に記載の画像処理装置。
ことを特徴とする第1項から第11項の何れか一項に記載の画像処理装置。
ことを特徴とする第12項に記載の画像処理装置。
前記画像を入力する細胞画像入力工程と、
前記画像内に一又は複数の対象画像を設定する設定工程と、
前記対象画像のそれぞれに対して、所定のパラメーターを用いた画像処理を施して複数の候補画像を作成する作成工程と、
前記作成工程によって作成された前記複数の候補画像を表示する表示工程と、
ユーザー操作を介して前記複数の候補画像の一つを選択する選択工程と、
前記選択工程により選択された一つの候補画像を関心画像として確定する確定工程を備える
ことを特徴とする画像処理方法。
前記画像を入力する細胞画像入力手段、
前記画像内に一又は複数の対象画像を設定する設定手段、
前記対象画像のそれぞれに対して、所定のパラメーターを用いた画像処理を施して複数の候補画像を作成する作成手段、
前記作成手段によって作成された前記複数の候補画像を表示する表示手段、
ユーザー操作を介して前記複数の候補画像の一つを選択する選択手段、
前記選択手段により選択された一つの候補画像を関心画像として確定する確定手段、
として機能させることを特徴とする画像処理プログラム。
図1に、本発明の画像処理装置を備えた病理診断支援システム10の全体構成例を示す。
病理診断支援システム10は、所定の染色試薬で染色された人体の組織切片の顕微鏡画像を取得し、取得された顕微鏡画像を解析することにより、観察対象の組織切片における特定の生体物質の発現を定量的に表す特徴量を出力するシステムである。
顕微鏡画像取得装置1Aと画像処理装置2Aとの接続方式は特に限定されない。たとえば、顕微鏡画像取得装置1Aと画像処理装置2AはLAN(Local Area Network)により接続されることとしてもよいし、無線により接続される構成としてもよい。
顕微鏡画像取得装置1Aは、照射手段、結像手段、撮像手段、通信I/Fなどを備えて構成されている。照射手段は、光源、フィルターなどにより構成され、スライド固定ステージに載置されたスライド上の組織切片に光を照射する。結像手段は、接眼レンズ、対物レンズなどにより構成され、照射した光によりスライド上の組織切片から発せられる透過光、反射光、または蛍光を結像する。撮像手段は、CCD(Charge Coupled Device)センサーなどを備え、結像手段により結像面に結像される像を撮像して顕微鏡画像のデジタル画像データを生成する顕微鏡設置カメラである。通信I/Fは、生成された顕微鏡画像の画像データを画像処理装置2Aに送信する。
顕微鏡画像取得装置1Aでは、明視野観察に適した照射手段および結像手段を組み合わせた明視野ユニット、蛍光観察に適した照射手段および結像手段を組み合わせた蛍光ユニットが備えられており、ユニットを切り替えることにより明視野/蛍光を切り替えることが可能である。
図2に、画像処理装置2Aの機能構成例を示す。
図2に示すように、画像処理装置2Aは、制御部21、操作部22、表示部23、通信I/F24、記憶部25などを備えて構成され、各部はバス26を介して接続されている。
たとえば、制御部21は、記憶部25に記憶されている画像処理プログラムとの協働により画像解析処理(図3参照)を実行し、設定手段、作成手段、選択手段、確定手段、判断手段、評価手段、表示候補画像選択手段、指定手段、及び蛍光輝点抽出手段としての機能を実現する。
その他、画像処理装置2Aは、LANアダプターやルーターなどを備え、LANなどの通信ネットワークを介して外部機器と接続される構成としてもよい。
「明視野画像」とは、ヘマトキシリン染色試薬(H染色試薬)、ヘマトキシリン-エオジン染色試薬(HE染色試薬)を用いて染色された組織切片を、顕微鏡画像取得装置1Aにおいて明視野で拡大結像および撮影することにより得られる顕微鏡画像であって、当該組織切片における細胞の形態を表す細胞形態画像である。ヘマトキシリン(H)は青紫色の色素であり、細胞核、骨組織、軟骨組織の一部、漿液成分など(好塩基性の組織など)を染色する。エオジン(E)は赤~ピンク色の色素であり、細胞質、軟部組織の結合組織、赤血球、線維素、内分泌顆粒など(好酸性の組織など)を染色する。
「蛍光画像」とは、蛍光染色試薬を用いて染色された組織切片に対し、顕微鏡画像取得装置1Aにおいて所定波長の励起光を照射して蛍光発光させ、この蛍光を拡大結像および撮影することにより得られる顕微鏡画像である。
「蛍光染色試薬」とは、特定の生体物質と特異的に結合および/または反応する生体物質認識部位が結合した蛍光物質内包ナノ粒子を含む染色試薬であり、「蛍光物質内包ナノ粒子」とは蛍光物質を内包したナノ粒子である(以下、蛍光粒子)。
蛍光画像に現れる蛍光は、蛍光染色試薬の蛍光物質内包ナノ粒子(蛍光物質)が励起して発光したものであり、組織切片における、生体物質認識部位に対応する特定の生体物質の発現を示すものである。
蛍光染色試薬や当該蛍光染色試薬を用いた組織切片の染色方法について説明する。
蛍光染色試薬に用いられる蛍光物質としては、蛍光有機色素および量子ドット(半導体粒子)を挙げることができる。200~700nmの範囲内の波長の紫外~近赤外光により励起されたときに、400~1100nmの範囲内の波長の可視~近赤外光の発光を示すことが好ましい。
具体的には、5-カルボキシ-フルオレセイン、6-カルボキシ-フルオレセイン、5,6-ジカルボキシ-フルオレセイン、6-カルボキシ-2’,4,4’,5’,7,7’-ヘキサクロロフルオレセイン、6-カルボキシ-2’,4,7,7’-テトラクロロフルオレセイン、6-カルボキシ-4’,5’-ジクロロ-2’,7’-ジメトキシフルオレセイン、ナフトフルオレセイン、5-カルボキシ-ローダミン、6-カルボキシ-ローダミン、5,6-ジカルボキシ-ローダミン、ローダミン 6G、テトラメチルローダミン、X-ローダミン、およびAlexa Fluor 350、Alexa Fluor 405、Alexa Fluor 430、Alexa Fluor 488、Alexa Fluor 500、Alexa Fluor 514、Alexa Fluor 532、Alexa Fluor 546、Alexa Fluor 555、Alexa Fluor 568、Alexa Fluor 594、Alexa Fluor 610、Alexa Fluor 633、Alexa Fluor 635、Alexa Fluor 647、Alexa Fluor 660、Alexa Fluor 680、Alexa Fluor 700、Alexa Fluor 750、BODIPY FL、BODIPY TMR、BODIPY 493/503、BODIPY 530/550、BODIPY 558/568、BODIPY 564/570、BODIPY 576/589、BODIPY 581/591、BODIPY 630/650、BODIPY 650/665(以上インビトロジェン社製)、メトキシクマリン、エオジン、NBD、ピレン、Cy5、Cy5.5、Cy7などを挙げることができる。これら蛍光有機色素は単独で使用されてもよいし、複数種を混合して使用されてもよい。
具体的には、CdSe、CdS、CdTe、ZnSe、ZnS、ZnTe、InP、InN、InAs、InGaP、GaP、GaAs、Si、Geが挙げられるが、これらに限定されない。
たとえば、CdSe/ZnS、CdS/ZnS、InP/ZnS、InGaP/ZnS、Si/SiO2、Si/ZnS、Ge/GeO2、Ge/ZnSなどを用いることができるが、これらに限定されない。
「蛍光物質内包ナノ粒子」とは、上記のとおり蛍光物質を内包したナノ粒子であって、詳しくは蛍光物質をナノ粒子の内部に分散させたものをいい、蛍光物質とナノ粒子自体とが化学的に結合していてもよいし、結合していなくてもよい。
ナノ粒子を構成する素材は特に限定されるものではなく、シリカ、ポリスチレン、ポリ乳酸、メラミンなどを挙げることができる。
たとえば、蛍光有機色素を内包したシリカナノ粒子は、ラングミュア 8巻 2921ページ(1992)に記載されているFITC内包シリカ粒子の合成を参考に合成することができる。FITCの代わりに所望の蛍光有機色素を用いることで種々の蛍光有機色素内包シリカナノ粒子を合成することができる。
量子ドットを内包したシリカナノ粒子は、ニュー・ジャーナル・オブ・ケミストリー 33巻 561ページ(2009)に記載されているCdTe内包シリカナノ粒子の合成を参考に合成することができる。
蛍光有機色素を内包したポリスチレンナノ粒子は、米国特許4326008(1982)に記載されている重合性官能基をもつ有機色素を用いた共重合法や、米国特許5326692(1992)に記載されているポリスチレンナノ粒子への蛍光有機色素の含浸法を用いて作製することができる。
量子ドットを内包したポリマーナノ粒子は、ネイチャー・バイオテクノロジー19巻631ページ(2001)に記載されているポリスチレンナノ粒子への量子ドットの含浸法を用いて作製することができる。
平均粒径は、走査型電子顕微鏡(SEM)を用いて電子顕微鏡写真を撮影し十分な数の粒子について断面積を計測し、各計測値を円の面積としたときの円の直径を粒径として求めた値である。本実施形態では、1000個の粒子の粒径の算術平均を平均粒径とする。変動係数も、1000個の粒子の粒径分布から算出した値とする。
「生体物質認識部位」とは、特定の生体物質と特異的に結合および/または反応する部位である。
特定の生体物質としては、それと特異的に結合する物質が存在するものであれば特に限定されるものではないが、代表的にはタンパク質(ペプチド)および核酸(オリゴヌクレオチド、ポリヌクレオチド)などが挙げられる。
したがって、生体物質認識部位としては、前記タンパク質を抗原として認識する抗体やその抗体に特異的に結合する他のタンパク質など、および前記核酸にハイブリタイズする塩基配列を有する核酸などが挙げられる。
具体的な生体物質認識部位としては、細胞表面に存在するタンパク質であるHER2に特異的に結合する抗HER2抗体、細胞核に存在するエストロゲン受容体(ER)に特異的に結合する抗ER抗体、細胞骨格を形成するアクチンに特異的に結合する抗アクチン抗体などが挙げられる。
中でも、抗HER2抗体および抗ER抗体を蛍光物質内包ナノ粒子に結合させたもの(蛍光染色試薬)は、乳癌の投薬選定に用いることができ、好ましい。
たとえば、無機物と有機物を結合させるために広く用いられている化合物であるシランカップリング剤を用いることができる。このシランカップリング剤は、分子の一端に加水分解でシラノール基を与えるアルコキシシリル基を有し、他端に、カルボキシル基、アミノ基、エポキシ基、アルデヒド基などの官能基を有する化合物であり、上記シラノール基の酸素原子を介して無機物と結合する。
具体的には、メルカプトプロピルトリエトキシシラン、グリシドキシプロピルトリエトキシシラン、アミノプロピルトリエトキシシラン、ポリエチレングリコール鎖をもつシランカップリング剤(たとえば、Gelest社製PEG-silane no.SIM6492.7)などが挙げられる。
シランカップリング剤を用いる場合、2種以上を併用してもよい。
たとえば、得られた蛍光有機色素内包シリカナノ粒子を純水中に分散させ、アミノプロピルトリエトキシシランを添加し、室温で12時間反応させる。反応終了後、遠心分離またはろ過により表面がアミノプロピル基で修飾された蛍光有機色素内包シリカナノ粒子を得ることができる。続いてアミノ基と抗体中のカルボキシル基とを反応させることで、アミド結合を介し抗体を蛍光有機色素内包シリカナノ粒子と結合させることができる。必要に応じて、EDC(1-Ethyl-3-[3-Dimethylaminopropyl]carbodiimide Hydrochloride:Pierce(登録商標)社製)のような縮合剤を用いることもできる。
下記染色方法は病理組織切片に限定せず、培養細胞にも適用可能である。
組織切片の作製方法は特に限定されず、公知の方法により作製されたものを用いることができる。
キシレンを入れた容器に組織切片を浸漬させ、パラフィンを除去する。温度は特に限定されるものではないが、室温で行うことができる。浸漬時間は、3分以上30分以下であることが好ましい。必要により浸漬途中でキシレンを交換してもよい。
次いで、エタノールを入れた容器に組織切片を浸漬させ、キシレンを除去する。温度は特に限定されるものではないが、室温で行うことができる。浸漬時間は、3分以上30分以下であることが好ましい。必要により浸漬途中でエタノールを交換してもよい。
次いで、水を入れた容器に組織切片を浸漬させ、エタノールを除去する。温度は特に限定されるものではないが、室温で行うことができる。浸漬時間は、3分以上30分以下であることが好ましい。必要により浸漬途中で水を交換してもよい。
公知の方法にならい、組織切片の生体物質の賦活化処理を行う。
賦活化条件に特に定めはないが、賦活液としては、0.01Mクエン酸緩衝液(pH6.0)、1mMEDTA溶液(pH8.0)、5%尿素、0.1Mトリス塩酸緩衝液などを用いることができる。加熱機器は、オートクレーブ、マイクロウェーブ、圧力鍋、ウォーターバスなどを用いることができる。温度は特に限定されるものではないが、室温で行うことができる。温度は50-130℃、時間は5-30分で行うことができる。
次いで、PBS(Phosphate Buffered Saline:リン酸緩衝生理食塩水)を入れた容器に、賦活化処理後の組織切片を浸漬させ、洗浄を行う。温度は特に限定されるものではないが、室温で行うことができる。浸漬時間は、3分以上30分以下であることが好ましい。必要により浸漬途中でPBSを交換してもよい。
蛍光染色試薬のPBS分散液を組織切片に載せ、組織切片の生体物質と反応させる。
蛍光染色試薬の生体物質認識部位を変えることにより、さまざまな生体物質に対応した染色が可能となる。蛍光染色試薬として、数種類の生体物質認識部位が結合された蛍光物質内包ナノ粒子を用いる場合には、それぞれの蛍光物質内包ナノ粒子PBS分散液を予め混合しておいてもよいし、別々に順次組織切片に載せてもよい。温度は特に限定されるものではないが、室温で行うことができる。反応時間は、30分以上24時間以下であることが好ましい。
蛍光染色試薬による染色を行う前に、BSA含有PBSなど、公知のブロッキング剤を滴下することが好ましい。
次いで、PBSを入れた容器に、染色後の組織切片を浸漬させ、未反応の蛍光物質内包ナノ粒子の除去を行う。温度は特に限定されるものではないが、室温で行うことができる。浸漬時間は、3分以上30分以下であることが好ましい。必要により浸漬途中でPBSを交換してもよい。カバーガラスを組織切片に載せ、封入する。必要に応じて市販の封入剤を使用してもよい。
なお、HE染色試薬を用いるHE染色はカバーガラスによる封入前に行う。
染色した組織切片に対し顕微鏡画像取得装置1Aを用いて、広視野の顕微鏡画像(蛍光画像)を取得する。顕微鏡画像取得装置1Aにおいて、蛍光染色試薬に用いた蛍光物質の吸収極大波長および蛍光波長に対応した励起光源と蛍光検出用光学フィルターとを選択する。
蛍光画像の視野は、3mm2以上であることが好ましく、30mm2以上であることがさらに好ましく、300mm2以上であることがさらに好ましい。
以下、病理診断支援システム10において、上記説明した明視野画像および蛍光画像からを取得して本発明の画像処理方法を用いて関心画像を作成する動作について、病理診断情報の生成を行う工程を合わせて説明する。ここでは、特定の生体物質としてHER2タンパクが染色された乳癌組織の組織切片を観察対象とし、細胞の領域を関心領域として抽出した画像を関心画像とする。
その後、顕微鏡画像取得装置1Aを用いて、(a1)~(a5)の手順により明視野画像および蛍光画像を取得する。
(a1)操作者は、HE染色試薬と蛍光染色試薬とにより染色された組織切片をスライドに載置し、そのスライドを顕微鏡画像取得装置1Aのスライド固定ステージに設置する。
(a2)ユニットを明視野ユニットに設定し、撮影倍率、及びピントの調整を行い、組織切片上の観察対象の領域を視野に納める。
(a3)撮像手段で撮影を行って明視野画像の画像データを生成し、画像処理装置2Aに画像データを送信する。
(a4)ユニットを蛍光ユニットに変更する。
(a5)視野および撮影倍率を変えずに撮像手段で撮影を行って蛍光画像の画像データを生成し、画像処理装置2Aに画像データを送信する。
図3に、画像解析処理のフローチャートを示す。
図3に示す画像解析処理は、制御部21と記憶部25に記憶されている画像処理プログラムとの協働により実行され、制御部21はその画像処理プログラムにしたがって下記の処理を実行する。
ステップS2では、図4に示されるとおり、蛍光画像から蛍光輝点の波長に応じた色成分を抽出し(ステップS201)、色成分抽出後の蛍光画像に閾値処理を施して二値画像を生成する(ステップS202)。ステップS201~S202により、蛍光画像から蛍光輝点が抽出された画像(蛍光輝点画像)が生成される。
ステップS201では、たとえば、蛍光粒子の発光波長が550nmである場合には、その波長成分を有する蛍光輝点のみが画像として抽出される。ステップS202の閾値処理の前に、細胞自家蛍光や他の不要信号成分などのノイズを除去する処理が施されてもよい。
制御部21は、まず、明視野画像をモノクロ画像に変換する(ステップS301)。次いで、モノクロ画像に対し、予め定められた閾値で閾値処理を施して各画素の値を二値化し(ステップS302)、二値画像にノイズ処理、膨張処理等の画像処理を実行して、対象画像を設定する(ステップS303)。図8Aは明視野画像の一例であり、設定された対象画像が点線に囲まれて示されている。
ステップS303におけるノイズ処理は、具体的には、二値画像にクロージング処理を施すことにより行うことができる。クロージング処理は、膨張処理を行ってから同じ回数分だけ収縮処理を行う処理である。膨張処理は、注目画素からn×n画素(nは2以上の整数)の範囲内にある画素に1つでも黒が含まれている場合に注目画素を黒に置き換える処理である。収縮処理は、注目画素からn×n画素の範囲内にある画素に1つでも白が含まれている場合に注目画素を白に置き換える処理である。クロージング処理により、ノイズ等の小さい領域を除去することができる。
ステップS301~S303により、明視野画像において細胞を包含する対象画像が設定される。
なお、ステップS2とステップS3との処理は、順番を入れ替えてもよい。
候補画像の作成方法は任意であるが、例えば、対象画像の輝度、色度、又はエッジ等に基づく画像処理を施すことにより作成される。輝度に基づく画像処理を行う場合には、例えば、明視野画像の対象画像中の各画素の輝度値を算出して、閾値をパラメーターとして用いて二値化処理を行い、候補画像を作成する。色度に基づく画像処理を行う場合には、例えば、明視野画像の対象画像中の各画素をRGB分解して、所定の色成分に対して閾値をパラメーターとして用いて二値化処理を行い、候補画像を作成する。エッジに基づく画像処理を行う場合には、細胞のエッジを抽出する画像処理におけるパラメーターを変えて複数の候補画像を作成する。
上記のような各画像処理において用いるパラメーターの値を所定の範囲内で変化させることにより、複数の候補画像が作成される。パラメーターの値の範囲は、組織標本や関心画像の種類、明視野画像の撮影条件、などに基づいて任意に設定され得る。
図8Bは、ステップS5で表示される候補画像の一例であり、具体的には、図8Aの全対象領域に対して同一の画像処理(コントラストと明度の調整及び二値化処理)が施されて作成された二値画像である。候補画像の表示方法は任意であるが、例えば、図8Bに示されるような二値画像を候補画像として表示する場合には、二値画像の黒い領域の輪郭以外の部分を透明化した候補画像と明視野画像を重ね合わせて表示することとすれば、明視野画像と候補画像の比較が容易となる。
なお、ユーザーによる操作は、スライドバーのスライダの操作に限られるものではなく、例えば、マウスのスクロール操作、キーボード操作等、公知の任意の操作方法を用いてよい。
例えば、図7は、膨張の程度を指定するパラメーターX及び円形度を指定するパラメーターYを用いて画像処理を施した複数の候補画像を表示した例を示す。図7では、パラメーターX及びYをそれぞれ横軸及び縦軸とした二次元座標上の、画像処理に用いた各パラメーターの値に対応する位置に候補画像が表示されている。
また、複数のパラメーターを用いた画像処理を行う場合には、まず、何れか一つのパラメーターの値を変化させる画像処理を施した複数の候補画像を、例えば図6Aと同様に表示し、ユーザーが1つの候補画像5を選択すると、選択された候補画像5に対して、さらに別のパラメーターの値を変化させる画像処理を施した複数の候補画像が表示されることとしてもよい。
ユーザーが候補画像5の一つを選択する方法は任意であるが、例えば、複数の候補画像5が図6Aのように表示されている場合には、ユーザーが操作部22(例えば、マウス操作やタッチペンの操作)を介して候補画像5の一つを選択する。また、図6Bのようにスライドバーのスライダ操作等によって表示される候補画像5が変化する場合には、例えば所望の候補画像5が表示されている時に、ユーザーが操作部22を介して所定の動作(例えば、所定のキー操作又はマウスやタッチペンによる操作)を行うことによって、その時点で表示されている候補画像5を選択する。
図8Cは、図8Aの明視野画像から作成された関心画像の一例であり、黒で示された領域が、関心領域である。
制御部21は、明視野画像の全体において、所定の特徴量の分布に偏りがあるか否かを定量的に判断し(判断工程)、偏りが所定の程度より少ない場合には、明視野画像全体を一つの対象画像として設定してもよい。変形例1によれば、明視野画像の全体において特徴量の分布に偏りがない場合には、画像の一部のみに、部分的な調整を行う必要がないとみなすことができるため、画像全体に一括して画像処理を施す従来の画像処理と同様の処理を行うこととなる。
明視野画像の特徴量としては、例えば、コントラスト、グレースケール変換した諧調値、光学濃度平均、テクスチャ、及び色など、公知の任意のものを用いてよい。
本発明の画像処理装置は、上記実施例のステップS3で設定される対象画像をグループ化した対象画像群を指定する指定手段を備えてもよい。
以下、変形例2の画像処理を、図9のフローチャートを用いて具体的に説明する。なお、上述した実施例の画像処理と異なる構成を中心に説明し、共通する構成については説明を省略する。
なお、ステップS104において、例えば明視野画像上に対象画像の輪郭が表示されていることとすれば、明視野画像全体と対象画像を比較が容易であり、特徴量が似ている対象画像を容易に選択してグループ化できるため好ましい。指定工程では、グループ化したい対象画像を、一つ一つ選択して指定しても良いし、又は、グループ化したい対象画像をマウス操作等により囲むことによって指定しても良い。
なお、1つの明視野画像に対して指定される対象画像群の数は任意である。また、グループ化されない対象画像があっても良い。
ステップS109~S111の処理は、実施例のステップS8~S10の処理と同様である。
上記実施例において、ステップS4の工程で作成された各候補画像が正しい関心画像であるか否かを評価する工程を備えても良い。具体的には、制御部21は、例えば、候補画像の特徴量と、予め記憶部25に記憶されている、標準的な関心領域の特徴量に基づいて、候補画像が正しい関心画像であるか否かを評価する。
評価に用いる特徴量は、例えば、各領域の周囲長、面積、モーメント、楕円近似における適合度、長軸の長さ、離心率、又は楕円率(短径と長径の比)、形状、又は各領域に対応する部位の明視野画像のコントラスト、グレースケール変換した諧調値、光学濃度平均、テクスチャ、色、など任意のものが挙げられる。なお、評価の結果を定量化した評価値が算出されることとすれば、以下に説明するように、評価値に基づいて、正しい関心画像である可能性が高い候補画像を容易に選択可能となるため好ましい。
これにより、ユーザーは評価値に基づいて容易に候補画像を選択することができる。
また、候補画像の特徴量と、予め記憶部に記憶されている標準的な関心領域の特徴量に基づいて、表示候補画像選択工程を以下のように行ってもよい。
例えば、標準的な関心領域(ここでは、細胞の領域)の面積に対して、ステップS5で表示された候補画像に表されている関心領域の面積が小さい場合には、図11に示されるように、ステップS5で表示された候補画像4に、さらに統合処理または膨張処理を施した候補画像5をステップS6において表示することが好ましい。また、例えば、標準的な関心領域の面積に対して、ステップS5で表示された候補画像に表されている関心領域の面積が大きい場合には、図6Aに示されるように、ステップS5で表示された候補画像4に対して、さらに分割処理または縮小処理を施した候補画像5を、ステップS6において表示することが好ましい。
ステップS6で表示する候補画像をこのように選択することにより、ステップS6においては、特に正しい関心画像である可能性が高い候補画像のみが表示され、無駄な画像が表示されないため、画像処理の効率が高いという利点がある。
また、上記実施例において、例えば、細胞当たりのHER2タンパクの発現が癌の悪性度の指標となることを利用して、ステップS2で抽出されたHER2タンパクの発現を表す蛍光輝点画像を用いて画像処理を行っても良い。
実施例のステップS5の候補画像の表示工程において蛍光輝点画像を用いる場合、例えば、各蛍光輝点から候補画像に表される関心領域までの最短距離を算出し、その距離の総和が最小となるような候補画像を表示することができる。また、例えば、候補画像に表される関心領域における蛍光輝点の密度を算出し、最も高密度な候補画像を表示しても良い。
また、対象画像の輝度、色度、及びエッジの少なくとも1つをパラメーターとして変化させる画像処理を施して候補画像を作成し、複数のパラメーターを変化させる画像処理を施した場合には、多次元空間において、各次元軸に相異なるパラメーターを設定し、設定されたパラメーターの値に対応する位置に候補画像を表示したり、また、各候補画像が正しい関心画像であるか否かの評価結果に基づいて、候補画像の表示方法、表示する候補画像、等を変えたりすることにより、ユーザーが正しい関心画像である可能性が高い候補画像を容易に選択できる。
例えば、実施例において、ステップS3の対象画像の設定に続けて、ステップS5の工程において候補画像の代わりに対象画像を表示し、ユーザーが対象画像の1つを選択すると、選択された対象画像に対して実施例のステップS4と同様に候補画像を作成の工程を行うこととしても良い。
特定の生体物質の例として乳癌におけるHER2タンパクを挙げたが、これに限定されない。診断対象となる病変(がん)種に応じて、蛍光画像を取得する際の生体物質認識部位を異なるものとすれば、病変種に応じた生体物質の発現を医師に提供することが可能となる。
その他、病理診断支援システム10を構成する各装置の細部構成および細部動作に関しても、発明の趣旨を逸脱することのない範囲で適宜変更可能である。
2A 画像処理装置
3A ケーブル
10 病理診断支援システム
21 制御部(設定手段、作成手段、表示手段、選択手段、確定手段、判断手段、評価手段、表示候補画像選択手段、指定手段、蛍光輝点抽出手段)
22 操作部
23 表示部
24 通信I/F(細胞画像入力手段、蛍光画像入力手段)
25 記憶部
26 バス
Claims (15)
- 標本内の細胞を撮影した画像から関心画像を作成する画像処理装置において、
前記画像を入力する細胞画像入力手段と、
前記画像内に一又は複数の対象画像を設定する設定手段と、
前記対象画像のそれぞれに対して、所定のパラメーターを用いた画像処理を施して複数の候補画像を作成する作成手段と、
前記作成手段によって作成された前記複数の候補画像を表示する表示手段と、
を備えることを特徴とする画像処理装置。 - 前記画像における所定の特徴量の偏りを定量的に判断する判断手段を備え、
前記判断手段により前記特徴量の偏りが所定の基準よりも大きいと判断された場合、前記設定手段は前記特徴量に基づいて複数の前記対象画像を設定する
ことを特徴とする請求項1に記載の画像処理装置。 - 前記標本において、細胞又は細胞核が染色されている
ことを特徴とする請求項1又は2に記載の画像処理装置。 - 前記作成手段は、ユーザーによる操作を介して前記パラメーターの値を連続的に変化させた前記候補画像を作成する
ことを特徴とする請求項1~3の何れか一項に記載の画像処理装置。 - 前記作成手段は、前記対象画像の輝度、色度、及びエッジのうち少なくとも1つを前記パラメーターとして用いた画像処理を施す
ことを特徴とする請求項1~4の何れか一項に記載の画像処理装置。 - 前記作成手段は、複数のパラメーターを用いて前記対象画像に画像処理を施し、
前記表示手段は、各次元軸に相異なるパラメーターを設定し、設定されたパラメーターの値に対応する位置に前記候補画像を配置して表示する
ことを特徴とする請求項1~5の何れか一項に記載の画像処理装置。 - 前記候補画像の面積、周囲長、円形度、及び楕円率のうち少なくとも1つに基づいて、前記候補画像が前記関心画像であるか否かを評価する評価値を算出して評価する評価手段を備え、
前記表示手段は、前記パラメーターの値が互いに異なる複数の前記候補画像を表示する際、前記評価値に基づいて複数の前記候補画像の配置を決定して表示する
ことを特徴とする請求項1~6の何れか一項に記載の画像処理装置。 - 前記表示手段に表示する前記複数の候補画像として、画像処理に用いられた前記パラメーターの値が所定の範囲内である候補画像をユーザー操作により選択する表示候補画像選択手段を備える
ことを特徴とする請求項1~6の何れか一項に記載の画像処理装置。 - 前記対象画像に群を指定する指定手段を備え、
前記作成手段は、前記指定手段によって同一群に指定された前記対象画像に対して、同一の値のパラメーターを用いた画像処理を施す
ことを特徴とする請求項1~8の何れか一項に記載の画像処理装置。 - 前記標本は、蛍光物質を集積した蛍光粒子によって特定の生体物質が染色された標本であり、
前記特定の生体物質の位置を前記蛍光粒子の蛍光に基づく蛍光輝点で表す、前記画像と同一視野範囲の蛍光画像を入力する蛍光画像入力手段を備え、
前記蛍光画像における前記蛍光輝点の位置を抽出する蛍光輝点抽出手段を備え、
前記作成手段は、前記候補画像と前記蛍光輝点の位置に基づいた前記パラメーターを用いて画像処理を施す
ことを特徴とする請求項1~9の何れか一項に記載の画像処理装置。 - 前記表示手段は、前記蛍光画像の前記対象画像と同一範囲の画像を前記候補画像と重ね合わせて表示する
ことを特徴とする請求項10に記載の画像処理装置。 - ユーザー操作を介して前記複数の候補画像の一つを選択する選択手段を備える
ことを特徴とする請求項1~請求項11の何れか一項に記載の画像処理装置。 - 前記選択手段により選択された候補画像を関心画像として確定する確定手段を備える
ことを特徴とする請求項12に記載の画像処理装置。 - 標本内の細胞を撮影した画像から関心画像を作成する画像処理方法において、
前記画像を入力する細胞画像入力工程と、
前記画像内に一又は複数の対象画像を設定する設定工程と、
前記対象画像のそれぞれに対して、所定のパラメーターを用いた画像処理を施して複数の候補画像を作成する作成工程と、
前記作成工程によって作成された前記複数の候補画像を表示する表示工程を備える
ことを特徴とする画像処理方法。 - 標本内の細胞を撮影した画像から関心画像を作成するコンピュータを、
前記画像を入力する細胞画像入力手段、
前記画像内に一又は複数の対象画像を設定する設定手段、
前記対象画像のそれぞれに対して、所定のパラメーターを用いた画像処理を施して複数の候補画像を作成する作成手段、
前記作成手段によって作成された前記複数の候補画像を表示する表示手段、
として機能させることを特徴とする画像処理プログラム。
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