WO2019127004A1 - 修饰的寡核苷酸和可用于合成修饰的寡核苷酸的化合物 - Google Patents

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    • C12N2330/00—Production
    • C12N2330/30—Production chemically synthesised

Definitions

  • the invention belongs to the field of biomedical technology, and in particular relates to a modified oligonucleotide and a compound which can be used for synthesizing a modified oligonucleotide, and a method for modifying an oligonucleotide.
  • the asialoglycoprotein receptor is an endogenous receptor of abundant heterologous oligomers, mainly present on the surface of the cell membrane of the hepatic parenchymal cells facing the sinusoidal side. Specificity. Since various glycoproteins are hydrolyzed by enzymatic hydrolysis or acid cleavage to remove terminal sialic acid, the exposed terminal end is a galactose residue, so the sugar binding specificity of ASGPR is actually galactosyl, so It is called galactose-specific receptor. ASGPR is mainly distributed in liver parenchyma cells, and other cells are low in content, thus becoming the best receptor for liver-directed transport.
  • Glycoproteins with non-reducing galactose (Gal) or N-acetylgalactosamine (GalNAc) residues can be recognized by ASGPR, and the binding affinity of GalNAc to ASGPR is about 50 times higher than that of Gal (Iobst S T Et al, J Biol Chem, 1996, 271(12): 6686-6693).
  • ASGPR N-acetylgalactosamine residues
  • clustered sugar residues can have a higher affinity than unclustered sugar residues by simultaneously occupying the binding site of the receptor.
  • the order of affinity is: four antennas > three antennas >> two antennas >>One-touch galactoside (Lee Y C, et al, J Biol Chem, 1983, 258(1): 199-202).
  • ASGPR receptor-mediated liver targeting oligonucleotides are a new breakthrough in the field of nucleic acid innovative drug research.
  • Alnylam Pharmaceuticals of the United States covalently linked the three-antennary GalNAc structure previously studied with small interfering RNA (siRNA) to achieve liver-targeted delivery of siRNA in vivo.
  • siRNA small interfering RNA
  • the researchers developed drug development for amyloid lesions, hemophilia, hypercholesterolemia, liver porphyrin, hepatitis B and other diseases, and multiple drug candidates have entered clinical research (http://www. Alnylam.com/product-pipeline/).
  • ISIS Pharmaceuticals of the United States covalently linked the three-antennary GalNAc to antisense nucleic acids to achieve liver targeted drug delivery in animals.
  • the activity of antisense nucleic acids was increased 10-fold after attachment (Prakash, TP et al, Nucleic Acids Res.42). , 8796-807.).
  • the present inventors have obtained a compound with an ASGPR ligand, which can be used to modify an oligonucleotide, thereby obtaining a modified oligo comprising a conjugate group.
  • Nucleotide Nucleotide.
  • the application provides a compound comprising an oligonucleotide and a conjugate group, the Wherein PN is an oligonucleotide, Y is selected from an integer between 1 and 10, X is selected from an integer between 0 and 10, and M T is selected from the group consisting of formula (1), formula (2), formula (3), and a conjugate group represented by the formula (4), when X is not 0, each of X M is independently selected from the group consisting of the condensation represented by the formula (1'), the formula (2'), and the formula (3') Substance group,
  • a x is a ligand
  • linker is a linking arm
  • Q is a hydroxyl group or a modification.
  • a x is each independently a human asialoglycoprotein Ligand of the body (ASGPR).
  • a x is galactose, acetamidogalactose, A polysaccharide of galactose, a polysaccharide containing acetaminogalactose, a derivative of galactose (such as an ester of galactose, such as galactose acetate) or an acetylgalactose derivative (such as an ester of acetamidogalactose, such as acetamido) Galactose acetate).
  • each of A x also independently carries a modifying group, such as a carbonylalkyl or esteralkyl group, preferably a C 1-6 alkyl group or a C 6-12 alkyl group.
  • a x is selected from:
  • the structures of the linkers are each independently as in formula (i), Formula (ii), formula (iii), formula (iv) or formula (v).
  • n is selected from an integer between 1-10. In certain embodiments, n is 1 or 6.
  • n 1 and n 2 are each independently selected from an integer between 1 and 10. In certain embodiments, n 1 is 1. In certain embodiments, n 2 is 4. In certain embodiments, n 1 is 1 and n 2 is 4.
  • n 1 , n 2 , and n 3 are each independently selected from an integer between 1 and 10. In certain embodiments, n 1 is 1. In certain embodiments, n 2 is 3. In certain embodiments, n 3 is 4. In certain embodiments, n 1 is 1, n 2 is 3, and n 3 is 4.
  • n is selected from an integer between 1-10. In certain embodiments, n is one.
  • n is selected from an integer between 1-10. In certain embodiments, n is 4.
  • a x is each independently selected from the group consisting of A 1 , A 2 , A 3 , A 1 ', A 2 ' Or A 3 ', the structure of the linker is as shown in the formula (i). In certain embodiments, n is 1 or 6.
  • a x is each independently selected from A 1 or A 1 ', and the structure of linker is as in formula (ii) Show.
  • n 1 is 1 and n 2 is 4.
  • a x is each independently selected from A 1 or A 1 ', and the structure of linker is as in formula (iii) Show.
  • n 1 is 1, n 2 is 3, and n 3 is 4.
  • a x is each independently selected from A 1 or A 1 ', and the structure of linker is as in formula (iv) Show.
  • n is one.
  • a x is each independently selected from the group consisting of A 1 , A 2 , A 3 , A 1 ', A 2 ' Or A 3 ', the structure of the linker is as shown in the formula (i). In certain embodiments, n is 1 or 6.
  • Ax is each independently selected from A 1 or A 1 ', and the structure of linker is as shown in formula (ii) .
  • n 1 is 1 and n 2 is 4.
  • Ax is each independently selected from the group consisting of A 1 , A 2 , A 3 , A 1 ', A 2 ' Or A 3 ', the structure of the linker is as shown in the formula (i).
  • n is 1 or 6.
  • a x is A 1 or A 1 ', and the structure of linker is as shown in formula (v). In certain embodiments, n is 4.
  • Q is selected from the group consisting of: cholesterol and its derivatives, polyethyl b. Glycols, fluorescent probes, biotin, peptides, vitamins, tissue targeting molecules.
  • the oligonucleotide may be a single-stranded oligonucleotide or a double-stranded oligonucleotide.
  • an oligonucleotide of the invention may comprise one or more modified nucleotides.
  • the one or more modified nucleotides are each independently selected from the group consisting of: 2'-methoxyethyl modified nucleotides, 2'-O-alkyl modified nucleotides ( For example, 2'-O-methyl modified nucleotide), 2'-O-allyl modified nucleotide, 2'-C-allyl modified nucleotide, 2'-fluoro modified nucleotide, 2 '-Deoxy modified nucleotide, 2'-hydroxy modified nucleotide, locked nucleotide, Hexitol nucleic acid (HNA), unlocked nucleic acid (UNA).
  • the modified nucleotide is selected from the group consisting of a 2'-O-alkyl modified nucleotide, a 2'-fluoro modified nucleotide.
  • the oligonucleotide carries a terminal modification, preferably, the terminal modification is selected from the group consisting of: cholesterol, polyethylene glycol, fluorescent probes, biotin, polypeptides, vitamins, tissue targets Directional molecules and any combination thereof.
  • the phosphate-containing backbone of the oligonucleotide is modified, preferably, the modification is a thio modification.
  • the oligonucleotide is an siRNA.
  • the siRNA comprises a sense strand and an anti-sense strand that complement each other to form a double strand.
  • the siRNA comprises the sequence set forth in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, or SEQ ID NO: 4.
  • the conjugate groups can be attached at different positions of the oligonucleotide.
  • Each is independently linked to the 3' end, 5' end or sequence intermediate of any of the oligonucleotides. In certain embodiments, It is linked to the oligonucleotide by a phosphotriester bond. In certain embodiments, the linkage between M and M T or between M and M is via a phosphotriester linkage.
  • the oligonucleotide is a single stranded oligonucleotide.
  • Y is 1, Linked to the 3' end or the 5' end of the oligonucleotide. In certain embodiments, Y is 2, 2 Each is linked to the 3' end and the 5' end of the oligonucleotide.
  • the oligonucleotide is a double stranded oligonucleotide.
  • Y is 1, Linked to the 3' end or the 5' end of any of the oligonucleotides.
  • Y is 2, 2 Each is linked to the 3' end and the 5' end of the same strand in the oligonucleotide.
  • Y is 2, 2 Each is linked to the 3' end of both strands of the oligonucleotide.
  • Y is 2, 2 Each is linked to the 5' end of both strands of the oligonucleotide.
  • Y is 3, 3 Two of them are each linked to the 3' end and the 5' end of the same strand in the oligonucleotide, and the third is linked to the 3' end or the 5' end of the other strand. In certain embodiments, Y is 4, 4 Each is linked to the 3' end and the 5' end of both strands of the oligonucleotide.
  • M T and M or a plurality of M may have the same or different structures.
  • X is not 0 and M T has the same A x and/or linker structure as at least one M.
  • X is greater than 1, and X of M have the same or different structure.
  • Y is greater than 1, Y Have the same or different structure.
  • the modified oligonucleotide of the present invention may comprise one or more And, the structure of M or MT, the number of M or the number of M Make adjustments.
  • Y is 1 and X is 0, and the compound has one of the following characteristics:
  • M T is as shown in the formula (1), A x is A 1 ', A 2 ' or A 3 ', and the structure of the linker is as shown in the formula (i), preferably, n is 1 or 6;
  • M T is as shown in the formula (1), A x is A 1 ', and the structure of the linker is as shown in the formula (ii), preferably, n 1 is 1, and n 2 is 4;
  • M T is as shown in the formula (1), A x is A 1 ', and the structure of the linker is as shown in the formula (iii).
  • n 1 is 1, n 2 is 3, and n 3 is 4;
  • M T is as shown in the formula (1), A x is A 1 ', the structure of the linker is as shown in the formula (iv), preferably, n is 1;
  • M T is as shown in the formula (2), A x is A 1 ', A 2 ' or A 3 ', and the structure of the linker is as shown in the formula (i), preferably, n is 1 or 6;
  • M T is as shown in the formula (2), A x is A 1 ', and the structure of the linker is as shown in the formula (ii), preferably, n 1 is 1, and n 2 is 4;
  • M T is as shown in the formula (3), A x is A 1 ', A 2 ' or A 3 ', the structure of the linker is as shown in the formula (i), preferably, n is 1 or 6;
  • M T is as shown in the formula (4), A x is A 1 ', and the structure of the linker is as shown in the formula (v), preferably n is 1;
  • M T is as shown in the formula (2), A x is A 1 ', and the structure of the linker is as shown in the formula (iii); preferably, n 1 is 1, n 2 is 3, and n 3 is 4.
  • Y is 1, X is 1, 2 or 3, when X is 2 or 3, each M has the same structure, and the compound has one of the following characteristics:
  • M is as shown in the formula (1'), A x is A 1 ', the structure of the linker is as shown in the formula (i), preferably, n is 1 or 6; the structure of M T is as in the formula (1) ), A x is A 1 ', the structure of the linker is as shown in the formula (i), preferably, n is 1 or 6;
  • a x is A 1', such as the structure of the linker of formula (ii) as shown, preferably, n-1 is 1, and n 2 is 4; M T is The structure is as shown in the formula (1), Ax is A1', the structure of the linker is as shown in the formula (ii), preferably, n 1 is 1, and n 2 is 4;
  • M T has a structure as shown in the formula (1), Ax is A1', and the structure of the linker is as shown in the formula (iii), preferably, n 1 is 1, n 2 is 3, and n 3 is 4;
  • M is as shown in the formula (2'), A x is A 1 ', the structure of the linker is as shown in the formula (i), preferably, n is 1 or 6; the structure of M T is as in the formula (2) ), A x is A 1 ', the structure of the linker is as shown in the formula (i), preferably, n is 1 or 6;
  • a x is A 1', such as the structure of the linker of formula (ii) as shown, preferably, n-1 is 1, and n 2 is 4; M T is The structure is as shown in the formula (1), Ax is A1', the structure of the linker is as shown in the formula (ii), preferably, n 1 is 1, and n 2 is 4;
  • a x is A 3', such as the structure of the linker of formula (ii) as shown, preferably, n-1 is 1, and n 2 is 4; M T is The structure is as shown in the formula (1), Ax is A3', and the structure of the linker is as shown in the formula (ii).
  • n 1 is 1, and n 2 is 4.
  • Y is 1 and X is 2, the structures of the two M are the same, as shown in formula (1'), A x is A 1 ', and the structure of the linker is as shown in formula (iv), preferably Ground, n is 1; the structure of the MT is as shown in the formula (4), A x is A 1 ', and the structure of the linker is as shown in the formula (v), and preferably n is 4.
  • Exemplary compounds of the invention include:
  • n 1 , n 2 , n 3 and n are each independently selected from an integer between 1 and 10.
  • the application provides a compound useful for modifying an oligonucleotide having a ligand and a chemical group reactive with the oligonucleotide strand, and a ligand and the chemical group Connected connecting arm.
  • the present application relates to compounds of the general formula A x -linker-R 1 , A x -linker-R 2 , A x -linker-R 3 and A x -linker-R 4 , wherein A x is a ligand, Linker is the connecting arm,
  • R 2 is Wherein m 1 and m 2 are each independently selected from an integer between 1 and 10,
  • Z is a protecting group for a hydroxyl group, and preferably, each Z is independently 4,4-dimethoxytribenzoyl (DMTr) or 4-methoxytriphenyl chloride.
  • DMTr 4,4-dimethoxytribenzoyl
  • MMT Methyl group
  • a x is a ligand for the human asialoglycoprotein receptor (ASGPR).
  • a x is galactose, acetylgalactose, galactose-containing polysaccharide, acetylaminogalactose-containing polysaccharide, galactose derivative (eg, galactose ester, such as galactose acetate) Or an acetamidogalactose derivative (such as an ester of acetamidogalactose, such as acetamidogalactose acetate).
  • each of A x also independently carries a modifying group, such as a carbonylalkyl or esteralkyl group, preferably a C 1-6 alkyl group or a C 6-12 alkyl group.
  • a x is selected from:
  • the structure of the linker is as shown in formula (i), formula (ii), formula (iii), formula (iv) or formula (v):
  • n is selected from an integer between 1 and 10, preferably n is 1 or 6;
  • n 1 and n 2 are each independently selected from an integer between 1 and 10, preferably, n 1 is 1, preferably n 2 is 4;
  • n 1 , n 2 , and n 3 are each independently selected from an integer between 1 and 10, preferably, n 1 is 1, preferably, n 2 is 3, preferably, n 3 is 4;
  • n is selected from an integer between 1 and 10, preferably n is 1;
  • n is selected from an integer between 1 and 10, preferably n is 4.
  • the compound has one of the following characteristics:
  • a x is A 1 , A 2 or A 3 , and the structure of the linker is as shown in the formula (i), preferably, n is 1 or 6;
  • a x is A 1 , the structure of the linker is as shown in the formula (ii), preferably, n 1 is 1, and n 2 is 4;
  • a x is A 1 , the structure of the linker is as shown in formula (iii), preferably, n 1 is 1, n 2 is 3, and n 3 is 4;
  • a x is A 1 , and the structure of the linker is as shown in the formula (iv), and preferably n is 1.
  • the compound of the formula A x -linker-R 1 is selected from the group consisting of
  • n is selected from an integer between 1 and 10,
  • n 1 and n 2 are each independently selected from an integer between 1 and 10,
  • n 1 , n 2 , and n 3 are each independently selected from an integer between 1 and 10.
  • the compound has one of the following characteristics:
  • a x is A 1 , A 2 or A 3 , and the structure of the linker is as shown in the formula (i), preferably, n is 1 or 6;
  • a x is A 1 , and the structure of the linker is as shown in the formula (ii).
  • n 1 is 1, and n 2 is 4.
  • the compound of the formula A x -linker-R 2 is selected from the group consisting of
  • n, m 1 , m 2 are each independently selected from an integer between 1 and 10,
  • n 1 , n 2 , m 1 , m 2 are each independently selected from an integer between 1 and 10,
  • n 1 , n 2 , n 3 , m 1 , and m 2 are each independently selected from an integer between 1 and 10.
  • a x is A 1 , A 2 or A 3
  • the structure of the linker is as shown in formula (i), preferably n is 1 or 6 .
  • a x is A 1 and the structure of linker is as shown in formula (v), preferably n is 4.
  • the application provides a method of modifying an oligonucleotide comprising one or more compounds (eg, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 or 10) are linked to an oligonucleotide, each of which is independently selected from the group consisting of A x -linker-R 1 , A x -linker-R 2 , A x as defined above a compound of -linker-R 3 or A x -linker-R 4 .
  • the method is for solid phase synthesis.
  • the present application provides another method of modifying an oligonucleotide comprising the following steps:
  • Step (1) providing an oligonucleotide and ligating the first compound to the oligonucleotide to obtain an oligonucleotide comprising the conjugate M, wherein the first compound is selected from the formula A as defined above a compound of x -linker-R 1 , A x -linker-R 2 or A x -linker-R 3 ,
  • Step (2) linking the second compound to the conjugate M formed in the previous step, the second compound being selected from the group consisting of A x -linker-R 1 and A x -linker-R 2 as defined above a compound of A x -linker-R 3 or A x -linker-R 4 .
  • the method further comprises the step (3): repeating the step (2) one or more times (e.g., 2-9 times).
  • the method further comprises the step (4): repeating the steps (1), (2) and (3) one or more times (eg, 2-9 times).
  • the oligonucleotide used in any of the modification methods of the present invention may be a single-stranded oligonucleotide or a double-stranded oligonucleotide.
  • the oligonucleotide may comprise one or more modified nucleotides.
  • the one or more modified nucleotides are each independently selected from the group consisting of: 2'-methoxyethyl modified nucleotides, 2'-O-alkyl modified nucleotides ( For example, 2'-O-methyl modified nucleotide), 2'-O-allyl modified nucleotide, 2'-C-allyl modified nucleotide, 2'-fluoro modified nucleotide, 2 '-Deoxy modified nucleotide, 2'-hydroxy modified nucleotide, locked nucleotide, HNA, UNA.
  • the modified nucleotide is selected from the group consisting of a 2'-O-alkyl modified nucleotide, a 2'-fluoro modified nucleotide.
  • the oligonucleotide carries a terminal modification, preferably, the terminal modification is selected from the group consisting of: cholesterol, polyethylene glycol, fluorescent probes, biotin, polypeptides, vitamins, tissue targets Directional molecules and any combination thereof.
  • the phosphate-containing backbone of the oligonucleotide is modified, preferably, the modification is a thio modification.
  • the oligonucleotide is an siRNA.
  • the siRNA comprises a sense strand and an anti-sense strand that complement each other to form a double strand.
  • the siRNA comprises the sequence set forth in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, or SEQ ID NO: 4.
  • the application also provides the use of a compound of the formula A x -linker-R 1 , A x -linker-R 2 , A x -linker-R 3 or A x -linker-R 4 as defined above, said compound Used to modify oligonucleotides.
  • the present application also provides a kit comprising at least one selected from the group consisting of A x -linker-R 1 , A x -linker-R 2 , A x -linker-R 3 or A x -linker a compound of -R 4 .
  • the kit further comprises reagents for synthesizing and/or modifying oligonucleotides (eg, solid support, DNA monomers, RNA monomers, modifying monomers, activators, oxidizing agents) , deprotection reagent, buffer and any combination thereof).
  • reagents for synthesizing and/or modifying oligonucleotides eg, solid support, DNA monomers, RNA monomers, modifying monomers, activators, oxidizing agents
  • the application provides a pharmaceutical composition
  • a pharmaceutical composition comprising a compound comprising an oligonucleotide and a conjugate group of the invention, and optionally a pharmaceutically acceptable carrier.
  • the pharmaceutical composition is for use in preventing and/or treating a liver-associated disease in a subject.
  • compositions of the invention may be formulated into any of the pharmaceutically acceptable dosage forms.
  • the dosage form is selected from the group consisting of a powder, a tablet, a granule, a capsule, a solution, an emulsion, a suspension, an injection, a spray, an aerosol, a powder.
  • the formulation can be administered to a patient or subject in need of prophylaxis and/or treatment by any suitable mode of administration, such as oral, parenteral, rectal, pulmonary or topical administration.
  • the preparation When used for oral administration, the preparation may be an oral preparation, such as an oral solid preparation such as a tablet, a capsule, a pill, a granule, etc.; or an oral liquid preparation such as an oral solution, an oral suspension, Syrup and the like.
  • the oral preparation may further comprise a suitable filler, binder, disintegrant, lubricant, and the like.
  • the preparation When used for parenteral administration, the preparation may be an injection, including an injection, a sterile powder for injection, and a concentrated solution for injection. For the injection, it can be produced by a conventional method in the existing pharmaceutical field. When the injection is formulated, no additional agent may be added to the preparation, and a suitable additional agent may be added depending on the nature of the drug.
  • the application provides the use of a compound of the invention comprising an oligonucleotide and a conjugate group for use in preventing and/or treating a liver-associated disease in a subject.
  • the application provides a method of preventing and/or treating a liver-associated disease in a subject, comprising administering an effective amount of a compound comprising an oligonucleotide and a conjugate group of the invention Subjects in need.
  • the liver-related disease is selected from the group consisting of: hereditary angioedema, type I familial tyrosinemia, Alagille syndrome, alpha-1-antitrypsin deficiency, bile acid synthesis, and Metabolic defects, biliary atresia, cystic fibrosis liver disease, idiopathic neonatal hepatitis, mitochondrial liver disease, progressive familial intrahepatic cholestasis, primary sclerosing cholangitis, transthyretin amyloidosis, hemophilia Disease, homozygous familial hypercholesterolemia, hyperlipidemia, steatohepatitis, nonalcoholic steatohepatitis (NASH), nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD), hyperglycemia, and involvement with type 2 diabetes Abnormally increased disease of hepatic glucose production, hepatitis, hepatic porphyrin.
  • hereditary angioedema type I familial
  • the subject is a mammal, such as a bovine, equine, ovine, porcine, canine, feline, rodent, primate;
  • the subject is a human.
  • oligonucleotide refers to an oligomeric compound containing a plurality of linked chemically modified or unmodified nucleotides having a length of less than about 100 nucleotides (eg, 1-20) Nucleotide or 1-50 nucleotides).
  • an oligonucleotide can include a non-nucleic acid conjugated group.
  • the oligonucleotide comprises ribonucleic acid (RNA) or deoxyribonucleic acid (DNA).
  • RNA ribonucleic acid
  • DNA deoxyribonucleic acid
  • the oligonucleotide is double stranded or single stranded.
  • the oligonucleotide is an siRNA, a nucleic acid aptamer, or an antisense nucleic acid.
  • conjugate refers to an atom or atomic group that is bound to an oligonucleotide.
  • the conjugate groups alter one or more properties of the oligonucleotide to which they are attached, including but not limited to pharmacodynamics, pharmacokinetics, binding, absorption, cell distribution, cells Ingestion, charge and/or scavenging properties.
  • the term “receptor” refers to a biological macromolecule of glycoproteins or lipoproteins that is present in the cell membrane, cytoplasm or nucleus, and different receptors have specific structures and configurations.
  • the term “ligand” refers to a substance that has the ability to recognize and bind to a receptor. In certain embodiments, the ligand is a ligand that has an affinity for an asialoglycoprotein receptor (ASGPR).
  • ASSGPR asialoglycoprotein receptor
  • the ligand is a carbohydrate, such as a monosaccharide and a polysaccharide, including but not limited to: galactose, N-acetylgalactosamine, mannose, glucose, glucosamine, and fucose.
  • polysaccharide refers to a polymer formed by a plurality of monosaccharide groups linked by glycosidic bonds.
  • the polysaccharide includes oligosaccharides and oligosaccharides.
  • oligosaccharide means a polymer in which 2 to 10 monosaccharide groups are linked by glycosidic bonds
  • oligosaccharide means a polymer in which 20 or less monosaccharide groups are linked by glycosidic bonds.
  • prevention refers to preventing or delaying the onset of a disease.
  • treating refers to curing or at least partially arresting the progression of a disease, or alleviating the symptoms of a disease.
  • an effective amount refers to an amount that is effective to achieve the intended purpose.
  • an effective amount for preventing disease refers to an amount effective to prevent, prevent or delay the occurrence of a disease. Determination of such effective amounts is well within the abilities of those skilled in the art.
  • the present invention has the following beneficial effects:
  • the structure of the present invention is a single ASGPR ligand synthesized by nucleic acid phosphoramidite solid phase chemical multiple coupling with oligonucleic acid to achieve multi-ligand modification.
  • the advantages of multiple solid phase synthesis coupling of single ASGPR ligands are that (1) the synthesis step is shortened and the amplification production is easy to achieve.
  • the efficiency of the coupling reaction of each ligand in the solid phase synthesis connection is greater than 98%, and the efficiency of the three ligands is greater than 94%.
  • the solid phase synthesis can be completed automatically by the equipment, and the connection reaction does not need to be purified. Compared with liquid phase synthesis, the three ligands are combined into a single molecule and then connected, which is more efficient, faster, and easier to scale up.
  • each ASGPR ligand of the present invention is directly linked to an oligonucleic acid, and the spatial distance of the central branch can be easily controlled, the number of ligands can be adjusted, hundreds of combinations can be formed, the oligonucleic acid modification type can be expanded, and the activity can be found to be more active. Medicine molecule.
  • the synthesis method of covalent linkage of ligands with oligonucleic acids is different.
  • Alnylam Pharmaceuticals uses a three-antennary GalNAc ligand linked to a solid support, and the modified solid support is used for oligonucleic acid solid phase synthesis to link the ligand to the 3' end of the oligo.
  • ISIS Pharmaceuticals attempted to link the three-antennary GalNAc ligand to the 5' end by nucleic acid phosphoramidite solid phase synthesis, but due to the large steric hindrance, it was not successfully linked (Efficient Synthesis and Biological Evaluation of 5'-GalNAc).
  • a liquid phase three-antennary GalNAc ligand and a terminal amino-modified oligo-nucleic acid liquid phase connection method the reaction time is 3 hours, and the reaction efficiency is greater than 95%.
  • the method of the invention separates each ligand independently from the oligonucleic acid, has small molecular steric hindrance and high connection efficiency.
  • the oligonucleic acid sites and combinations can be modified.
  • the terminal sites in the oligonucleic acid drug molecule are usually modified with cholesterol, polyethylene glycol (PEG) or the like to improve the pharmacokinetic properties.
  • PEG polyethylene glycol
  • the three-antennary GalNAc ligands designed by Alnylam and ISIS Pharmaceuticals are used only for oligonucleic acid chain end-modification, occupying terminal modification sites, reducing the types of oligonucleic acid modifications that can be applied.
  • the novel compounds of the present invention can modify any position of the oligonucleic acid in solid phase synthesis, and other modifications are not affected by the terminal.
  • the preparation of a novel compound and terminal cholesterol mixed modified oligonucleic acid is described in the examples of the present invention.
  • Figure 1 shows the GalNAc binding curve for each sample in Example 35.
  • Sequence 1 (SEQ ID NO: 1): 19 nt
  • the compound 12 was used as a raw material, and the synthesis of the compound 10 was referred to.
  • the modified oligonucleotide was synthesized according to the theoretical yield of 1 ⁇ mol, and the process was as follows:
  • oligonucleotide concentration was determined by a micro ultraviolet spectrophotometer (KO5500). Mass spectrometric analysis was performed on an Oligo HTCS LC-MS system (Novatia) system. The molecular weight of the nucleic acid was normalized by Promass software after one-stage scanning.
  • the modified oligonucleotide was synthesized according to the theoretical yield of 1 ⁇ mol, and the process was as follows:
  • the CPG was dried by dry nitrogen, transferred to a 5 mL EP tube, and 2 mL of an aqueous ammonia solution was added thereto, and heated at 55 ° C for 16 to 18 hours. The supernatant was centrifuged at 10,000 rpm for 10 min, and concentrated aqueous ammonia/ethanol was drained to obtain a white or yellow gummy solid. 1 mL of 0.1 M TEAA loading solution was added, and the mixed solution was poured into a solid phase extraction column to remove excess salt in the solution.
  • oligonucleotide concentration was determined by a micro ultraviolet spectrophotometer (KO5500). Mass spectrometric analysis was performed on an Oligo HTCS LC-MS system (Novatia) system. The molecular weight of the nucleic acid was normalized by Promass software after one-stage scanning.
  • the procedure is as follows: After the preparation of the modified single-stranded oligonucleotide is completed, the mixture is mixed 1:1 according to the ultraviolet absorption content, heated to 95 ° C for three minutes, and then cooled to room temperature to form a double-strand.
  • Examples 34-36 for modified oligonucleotides with a crude purity of less than 50%, purified by linear gradient of DNAPAc PA-100 ion exchange column, mobile phase A: 20 mM NaOH; mobile phase B: 20 mM NaOH + 2 M NaCl mixed liquid.
  • Modified oligonucleotides for animal experiments were filtered through a 0.22 ⁇ m membrane prior to injection.
  • mice were anesthetized, the skin and muscle layers were cut, the liver was exposed, the perfusion catheter was inserted into the portal vein, and the inferior vena cava was cut open to prepare for liver perfusion.
  • 40 ° C pre-perfusion Solution I (Hank's, 0.5 mM EGTA, pH 8) and perfusion Solution II (Low-glucose DMEM, 100 U / mL Type IV, pH 7.4)
  • the liver was then perfused with 37 ° C perfusion Solution II at a flow rate of 7 mL/min for 7 min.
  • the liver was removed and dissolved in Solution III (10% FBS low-glucose DMEM, 4 ° C).
  • the scorpion was cut through the liver capsule and gently shaken to release the liver cells.
  • the hepatocytes were filtered with a 70 ⁇ m cell strainer, centrifuged at 50 g for 2 min, and the supernatant was discarded.
  • the cells were resuspended in Solution IV (40% percoll low-glucose DMEM, 4 ° C), centrifuged at 100 g for 2 min, and the supernatant was discarded. Resuspend the cells by adding 2% FBS low-glucose DMEM and set aside. Trypan blue staining was used to identify cell viability.
  • GalNAc-siRNA was added to each well. Each GalNAc-siRNA was set to a final concentration of 0.9 nM, 2.7 nM, 8.3 nM, 25 nM, 50 nM or 100 nM. After incubating at 4 ° C for 2 h, centrifugation at 50 g for 2 min, the supernatant was discarded. The cells were resuspended at 10 ⁇ g/mL PI, stained for 10 min, and centrifuged at 50 g for 2 min.
  • the cells were washed with pre-cooled PBS, centrifuged at 50 g for 2 min, and the supernatant was discarded. Resuspend the cells in PBS.
  • the mean fluorescence intensity MFI (Mean Fluorescence Intensity) was determined by flow cytometry, and the nonlinear fitting and dissociation constant K d value were calculated by GraphPad Prism 5 software. The results are shown in Table 2, Table 3, and Figure 1.
  • mice Thirteen male SPF-level Balb/c-nu mice (purchased from Beijing Weitong Lihua Experimental Animal Co., Ltd.) were randomly divided into 4 groups, blank control group and P8G8 control group. Conjugated ligand), P8G8-A3 group, P8G8-B3 group. The number of animals in each group was 2, 3, 4, and 4, respectively, and the tail vein was administered intravenously at a dose of about 10 mg/kg (see Table 4 for experimental design). All animals were in vivo, including white light and X-ray imaging, before, 15 min, 30 min, 1 h, 2 h, 4 h, 6 h after administration. After euthanasia 6 hours after the drug, the brain, salivary gland, heart, spleen, lung, liver, kidney and intestine were taken for imaging of the isolated organs.

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Abstract

本发明属于生物医药技术领域，具体涉及修饰的寡核苷酸和可用于合成修饰的寡核苷酸的化合物，以及对寡核苷酸进行修饰的方法。本发明还涉及所述修饰的寡核苷酸的用途，其用于预防和/或治疗受试者中与肝脏相关的疾病。

Description

修饰的寡核苷酸和可用于合成修饰的寡核苷酸的化合物 技术领域
本发明属于生物医药技术领域，具体涉及修饰的寡核苷酸和可用于合成修饰的寡核苷酸的化合物，以及对寡核苷酸进行修饰的方法。
背景技术
去唾液酸糖蛋白受体(asialoglycoprotein receptor，ASGPR)是数量丰富的一种异源低聚物的内吞型受体，主要存在于肝脏实质细胞朝向窦状隙一侧的细胞膜表面，具有对糖的特异性.由于各种糖蛋白在用酶水解或用酸解除去末端唾液酸后，暴露出的次末端是半乳糖残基，所以ASGPR的糖结合特异性实际上在于半乳糖基，故又称半乳糖特异性受体。ASGPR主要分布于肝脏实质细胞，其他细胞含量低，因此成为肝脏定向转运的最佳受体。
末端为非还原性的半乳糖(Gal)或N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)残基的糖蛋白均可以被ASGPR识别，GalNAc与ASGPR结合的亲和性比Gal高约50倍(Iobst S T et al,J Biol Chem,1996,271(12):6686-6693)。体外实验表明，成簇的糖残基可以通过同时占据受体的结合位点而使其亲和性远高于不成簇的糖残基，亲和力的次序为：四触角>三触角>>双触角>>单触角半乳糖苷(Lee Y C,et al，J Biol Chem,1983,258(1):199-202)。
ASGPR受体介导的肝靶向寡核苷酸是核酸创新药物研究领域的新突破。2012年，美国Alnylam制药公司将前人研究的三触角GalNAc结构同小干扰RNA(siRNA)共价连接，实现了体内siRNA的肝靶向递送。应用这项技术，研究人员开展了淀粉样病变、血友病、高胆固醇血证、肝脏卟啉、乙型肝炎等疾病的药物开发，多个候选药物已经进入临床研究中(http://www.alnylam.com/product-pipeline/)。2014年，美国ISIS制药将三触角GalNAc与反义核酸共价连接，实现动物体内肝靶向给药，连接后反义核酸的活性提高了10倍(Prakash,T.P.et al，Nucleic Acids Res.42,8796-807.)。
发明内容
本发明人通过深入的研究和创造性的劳动，得到了一种带有ASGPR配体的化合物，可用于对寡核苷酸进行修饰，由此得到了一种包含缀合物基团的修饰的寡核苷酸。
因此，在一个方面，本申请提供了一种包含寡核苷酸和缀合物基团的化合物，其通式为
Figure PCTCN2017118591-appb-000001
其中，PN为寡核苷酸，Y选自1-10之间的整数，X选自0-10之间的整数，M T选自如式(1)、式(2)、式(3)和式(4)所示的缀合物基团，当X不为0时，X个M各自独立地选自如式(1’)、式(2’)和式(3’)所示的缀合物基团，
Figure PCTCN2017118591-appb-000002
其中，A x为配体，linker为连接臂，Q为羟基或修饰物。
在某些实施方案中，式(1)-式(4)、式(1’)-式(3’)所示的缀合物基团中，A x各自独立地为人去唾液酸糖蛋白受体(ASGPR)的配体。
在某些实施方案中，式(1)-式(4)、式(1’)-式(3’)所示的缀合物基团中，A x为半乳糖、乙酰氨基半乳糖、含半乳糖的多糖、含乙酰氨基半乳糖的多糖、半乳糖衍生物(例如半乳糖的酯，例如半乳糖乙酸酯)或乙酰氨基半乳糖衍生物(例如乙酰氨基半乳糖的酯，例如乙酰氨基半乳糖乙酸酯)。任选地，A x上还各自独立地带有修饰基团，例如羰基烷基或酯基烷基，所述烷基优选为C 1-6烷基或C 6-12烷基。
在某些实施方案中，A x选自：
Figure PCTCN2017118591-appb-000003
在某些实施方案中，式(1)-式(4)、式(1’)-式(3’)所示的缀合物基团中，linker的结构各自独立地如式(i)、式(ii)、式(iii)、式(iv)或式(v)所示。
Figure PCTCN2017118591-appb-000004
其中，n选自1-10之间的整数。在某些实施方案中，n为1或6。
Figure PCTCN2017118591-appb-000005
其中，n 1和n 2各自独立地选自1-10之间的整数。在某些实施方案中，n 1为1。在某些实施方案中，n 2为4。在某些实施方案中，n 1为1且n 2为4。
Figure PCTCN2017118591-appb-000006
其中，n 1、n 2、n 3各自独立地选自1-10之间的整数。在某些实施方案中，n 1为1。在某些实施方案中，n 2为3。在某些实施方案中，n 3为4。在某些实施方案中，n 1为1，n 2为3且n 3为4。
Figure PCTCN2017118591-appb-000007
其中，n选自1-10之间的整数。在某些实施方案中，n为1。
Figure PCTCN2017118591-appb-000008
其中，n选自1-10之间的整数。在某些实施方案中，n为4。
在某些实施方案中，式(1)或式(1’)所示的缀合物基团中，A x各自独立地选自A 1、A 2、A 3、A 1’、A 2’或A 3’，linker的结构如式(i)所示。在某些实施方案中，n为1或6。
在某些实施方案中，式(1)或式(1’)所示的缀合物基团中，A x各自独立地选自A 1或A 1’，linker的结构如式(ii)所示。在某些实施方案中，n 1为1，且n 2为4。
在某些实施方案中，式(1)或式(1’)所示的缀合物基团中，A x各自独立地选自A 1或A 1’，linker的结构如式(iii)所示。在某些实施方案中，n 1为1，n 2为3，且n 3为4。
在某些实施方案中，式(1)或式(1’)所示的缀合物基团中，A x各自独立地选自A 1或A 1’，linker的结构如式(iv)所示。在某些实施方案中，n为1。
在某些实施方案中，式(2)或式(2’)所示的缀合物基团中，A x各自独立地选自A 1、A 2、A 3、A 1’、A 2’或A 3’，linker的结构如式(i)所示。在某些实施方案中，n为1或6。
在某些实施方案中，式(2)或式(2’)所示的缀合物基团中，Ax各自独立地选自A 1或A 1’，linker的结构如式(ii)所示。在某些实施方案中，n 1为1，且n 2为4。
在某些实施方案中，式(3)或式(3’)所示的缀合物基团中，Ax各自独立地选自为A 1、A 2、A 3、A 1’、A 2’或A 3’，linker的结构如式(i)所示。在某些实施方案中，n为1或6。
在某些实施方案中，式(4)所示的缀合物基团中，A x为A 1或A 1’，linker的结构如 式(v)所示。在某些实施方案中，n为4。
在某些实施方案中，式(1)-式(3)、式(1’)-式(3’)所示的缀合物基团中，Q选自：胆固醇及其衍生物、聚乙二醇、荧光探针、生物素、多肽、维生素、组织靶向性分子。
本发明中，寡核苷酸可以为单链寡核苷酸或双链寡核苷酸。任选地，本发明的寡核苷酸可以包含一个或多个经过修饰的核苷酸。在某些实施方案中，所述一个或多个经过修饰的核苷酸各自独立地选自：2′-甲氧基乙基修饰核苷酸、2′-O-烷基修饰核苷酸(例如2′-O-甲基修饰核苷酸)、2′-O-烯丙基修饰核苷酸、2′-C-烯丙基修饰核苷酸、2′-氟修饰核苷酸、2′-脱氧修饰核苷酸、2’-羟基修饰核苷酸、锁核苷酸、己糖醇核酸(Hexitol nucleic acid,HNA)、解锁核酸(unlocked nucleic acid,UNA)。在某些实施方案中，所述经过修饰的核苷酸选自2′-O-烷基修饰核苷酸、2′-氟修饰核苷酸。
在某些实施方案中，所述寡核苷酸带有末端修饰物，优选地，所述末端修饰物选自：胆固醇、聚乙二醇、荧光探针、生物素、多肽、维生素、组织靶向性分子及其任意组合。
在某些实施方案中，所述寡核苷酸的含磷酸骨架经过修饰，优选地，所述修饰为硫代修饰。
在某些实施方案中，所述寡核苷酸为siRNA。在某些实施方案中，所述siRNA包括互补形成双链的正义链和反义链。在某些实施方案中，所述siRNA包含如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4所示的序列。
本发明的修饰的寡核苷酸中，缀合物基团可以连接在寡核苷酸的不同位置。
在某些实施方案中，
Figure PCTCN2017118591-appb-000009
各自独立地与所述寡核苷酸中任一条链的3’末端、5’末端或序列中间相连接。在某些实施方案中，
Figure PCTCN2017118591-appb-000010
通过磷酸三酯键与寡核苷酸相连接。在某些实施方案中，M与M T之间或者M与M之间通过磷酸三酯键相连接。
在某些实施方案中，寡核苷酸为单链寡核苷酸。在某些实施方案中，Y为1，
Figure PCTCN2017118591-appb-000011
与所述寡核苷酸的3’末端或5’末端相连接。在某些实施方案中，Y为2，2个
Figure PCTCN2017118591-appb-000012
各自与所述寡核苷酸的3’末端和5’末端相连接。
在某些实施方案中，寡核苷酸为双链寡核苷酸。在某些实施方案中，Y为1，
Figure PCTCN2017118591-appb-000013
与所述寡核苷酸中的任一条链的3’末端或5’末端相连接。在某些实施方案 中，Y为2，2个
Figure PCTCN2017118591-appb-000014
各自与所述寡核苷酸中的同一条链的3’末端和5’末端相连接。在某些实施方案中，Y为2，2个
Figure PCTCN2017118591-appb-000015
各自与所述寡核苷酸中的两条链的3’末端相连接。在某些实施方案中，Y为2，2个
Figure PCTCN2017118591-appb-000016
各自与所述寡核苷酸中的两条链的5’末端相连接。在某些实施方案中，Y为3，3个
Figure PCTCN2017118591-appb-000017
中，有两个各自与所述寡核苷酸中的同一条链的3’末端和5’末端相连接，第三个与另一条链的3’末端或5’末端相连接。在某些实施方案中，Y为4，4个
Figure PCTCN2017118591-appb-000018
各自与所述寡核苷酸中两条链的3’末端和5’末端相连接。
本发明的修饰的寡核苷酸中，M T与M之间或者多个M之间可以具有相同或不同的结构。在某些实施方案中，X不为0，M T与至少一个M具有相同的A x和/或linker结构。在某些实施方案中，X大于1，X个M具有相同或不同的结构。在某些实施方案中，Y大于1，Y个
Figure PCTCN2017118591-appb-000019
具有相同或不同的结构。
本发明的修饰的寡核苷酸中，可以包含一个或多个
Figure PCTCN2017118591-appb-000020
并且，可以对M或MT的结构、M的个数或者的个数
Figure PCTCN2017118591-appb-000021
进行调节。
在某些实施方案中，Y为1，X为0，并且所述化合物具有以下特征中的一个：
(1)M T的结构如式(1)所示，A x为A 1’、A 2’或A 3’，linker的结构如式(i)所示，优选地，n为1或6；
(2)M T的结构如式(1)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(ii)所示，优选地，n 1为1，且n 2为4；
(3)M T的结构如式(1)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(iii)所示，优选地，n 1为1，n 2为3，且n 3为4；
(4)M T的结构如式(1)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(iv)所示，优选地，n为1；
(5)M T的结构如式(2)所示，A x为A 1’、A 2’或A 3’，linker的结构如式(i)所示，优选地，n为1或6；
(6)M T的结构如式(2)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(ii)所示，优选地，n 1为1，且n 2为4；
(7)M T的结构如式(3)所示，A x为A 1’、A 2’或A 3’，linker的结构如式(i)所示， 优选地，n为1或6；
(8)M T的结构如式(4)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(v)所示，优选地n为1；
(9)M T的结构如式(2)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(iii)所示；优选地，n 1为1，n 2为3，且n 3为4。
在某些实施方案中，Y为1，X为1、2或3，当X为2或3时，各个M具有相同的结构，并且所述化合物具有以下特征中的一个：
(1)M的结构如式(1’)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(i)所示，优选地，n为1或6；M T的结构如式(1)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(i)所示，优选地，n为1或6；
(2)M的结构如式(1’)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(ii)所示，优选地，n 1为1，且n 2为4；M T的结构如式(1)所示，Ax为A1’，linker的结构如式(ii)所示，优选地，n 1为1，且n 2为4；
(3)M的结构如式(1’)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(iii)所示，优选地，n 1为1，n 2为3，且n 3为4；M T的结构如式(1)所示，Ax为A1’，linker的结构如式(iii)所示，优选地，n 1为1，n 2为3，且n 3为4；
(4)M的结构如式(2’)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(i)所示，优选地，n为1或6；M T的结构如式(2)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(i)所示，优选地，n为1或6；
(5)M的结构如式(1’)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(ii)所示，优选地，n 1为1，且n 2为4；M T的结构如式(1)所示，Ax为A1’，linker的结构如式(ii)所示，优选地，n 1为1，且n 2为4；
(6)M的结构如式(1’)所示，A x为A 3’，linker的结构如式(ii)所示，优选地，n 1为1，且n 2为4；M T的结构如式(1)所示，Ax为A3’，linker的结构如式(ii)所示，优选地，n 1为1，且n 2为4。
在某些实施方案中，Y为1，X为2，两个M的结构相同，如式(1’)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(iv)所示，优选地，n为1；MT的结构如式(4)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(v)所示，优选地，n为4。
本发明示例性的化合物包括：
Figure PCTCN2017118591-appb-000022
Figure PCTCN2017118591-appb-000023
Figure PCTCN2017118591-appb-000024
其中，n 1、n 2、n 3和n各自独立地选自1-10之间的整数。
另一方面，本申请提供了可用于修饰寡核苷酸的化合物，所述化合物上带有配体和可与寡核苷酸链反应的化学基团，以及将配体与所述化学基团连接的连接臂。
因此，本申请涉及通式为A x-linker-R 1、A x-linker-R 2、A x-linker-R 3和A x-linker-R 4的化合物，其中，A x为配体，linker为连接臂，
R 1为
Figure PCTCN2017118591-appb-000025
R 2为
Figure PCTCN2017118591-appb-000026
其中，m 1和m 2各自独立地选自1-10之间的整数，
R 3为
Figure PCTCN2017118591-appb-000027
R 4为
Figure PCTCN2017118591-appb-000028
R 1、R 2、R 3中，Z为羟基的保护基，优选地，Z各自独立地为4,4-二甲氧基三苯甲烷基(DMTr)或4-甲氧基三苯基氯甲烷基(MMT)。
在某些实施方案中，A x为人去唾液酸糖蛋白受体(ASGPR)的配体。
在某些实施方案中，A x为半乳糖、乙酰氨基半乳糖、含半乳糖的多糖、含乙酰氨基半乳糖的多糖、半乳糖衍生物(例如半乳糖的酯，例如半乳糖乙酸酯)或乙酰氨基半乳糖衍生物(例如乙酰氨基半乳糖的酯，例如乙酰氨基半乳糖乙酸酯)。任选地，A x上还各自独立地带有修饰基团，例如羰基烷基或酯基烷基，所述烷基优选为C 1-6烷基或C 6-12烷基。
在某些实施方案中，A x选自：
Figure PCTCN2017118591-appb-000029
Figure PCTCN2017118591-appb-000030
在某些实施方案中，linker的结构如式(i)、式(ii)、式(iii)、式(iv)或式(v)所示：
Figure PCTCN2017118591-appb-000031
其中，n选自1-10之间的整数，优选地，n为1或6；
Figure PCTCN2017118591-appb-000032
其中，n 1和n 2各自独立地选自1-10之间的整数，优选地，n 1为1，优选地，n 2为4；
Figure PCTCN2017118591-appb-000033
其中，n 1、n 2、n 3各自独立地选自1-10之间的整数，优选地，n 1为1，优选地，n 2为3，优选地，n 3为4；
Figure PCTCN2017118591-appb-000034
其中，n选自1-10之间的整数，优选地，n为1；
Figure PCTCN2017118591-appb-000035
其中，n选自1-10之间的整数，优选地，n为4。
对于通式为A x-linker-R 1的化合物，在某些实施方案中，所述化合物具有以下特征中的一个：
(1)A x为A 1、A 2或A 3，linker的结构如式(i)所示，优选地，n为1或6；
(2)A x为A 1，linker的结构如式(ii)所示，优选地，n 1为1，且n 2为4；
(3)A x为A 1，linker的结构如式(iii)所示，优选地，n 1为1，n 2为3，且n 3为4；
(4)A x为A 1，linker的结构如式(iv)所示，优选地，n为1。
在某些实施方案中，通式为A x-linker-R 1的化合物选自：
Figure PCTCN2017118591-appb-000036
其中，n选自1-10之间的整数，
Figure PCTCN2017118591-appb-000037
其中，n 1和n 2各自独立地选自1-10之间的整数，
Figure PCTCN2017118591-appb-000038
其中，n 1、n 2、n 3各自独立地选自1-10之间的整数。
对于通式为A x-linker-R 2的化合物，在某些实施方案中，所述化合物具有以下特征中的一个：
(1)A x为A 1、A 2或A 3，linker的结构如式(i)所示，优选地，n为1或6；
(2)A x为A 1，linker的结构如式(ii)所示，优选地，n 1为1，且n 2为4。
在某些实施方案中，通式为A x-linker-R 2的化合物选自：
Figure PCTCN2017118591-appb-000039
其中，n、m 1、m 2各自独立地选自1-10之间的整数，
Figure PCTCN2017118591-appb-000040
其中，n 1、n 2、m 1、m 2各自独立地选自1-10之间的整数，
Figure PCTCN2017118591-appb-000041
其中，n 1、n 2、n 3、m 1、m 2各自独立地选自1-10之间的整数。
对于为A x-linker-R 3的化合物，在某些实施方案中，A x为A 1、A 2或A 3，linker的结构如式(i)所示，优选地，n为1或6。
对于为A x-linker-R 4的化合物，在某些实施方案中，A x为A 1，linker的结构如式(v)所示，优选地，n为4。
在一个方面，本申请提供了一种对寡核苷酸进行修饰的方法，包括将一个或多个化合物(例如2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个或10个)连接到寡核苷酸上，所述一个或多个化合物各自独立地选自如上定义的通式为A x-linker-R 1、A x-linker-R 2、A x-linker-R 3或A x-linker-R 4的化合物。优选地，所述方法中，通过所述化合物上的
Figure PCTCN2017118591-appb-000042
发生化学反应实现连接。在某些实施方案中，所述方法用于固相合成。
本申请提供了另一种对寡核苷酸进行修饰的方法，包括以下步骤：
步骤(1)：提供寡核苷酸，并将第一化合物连接到寡核苷酸上，得到包含缀合物M的寡核苷酸，所述第一化合物选自如上定义的通式为A x-linker-R 1、A x-linker-R 2或A x-linker-R 3的化合物，
步骤(2)：将第二化合物连接到前一步骤形成的缀合物M上，所述第二化合物选自如上定义的通式为A x-linker-R 1、A x-linker-R 2、A x-linker-R 3或A x-linker-R 4的化合物。
任选地，所述方法还包括步骤(3)：重复步骤(2)一次或多次(例如2-9次)。
任选地，所述方法还包括步骤(4)：重复步骤(1)、步骤(2)和步骤(3)一次或多次(例如2-9次)。
优选地，所述步骤(1)和(2)中，通过第一化合物或第二化合物上的
Figure PCTCN2017118591-appb-000043
发生化学反应实现连接。
用于本发明的任一项修饰方法中的寡核苷酸可以为单链寡核苷酸或双链寡核苷酸。任选地，所述寡核苷酸可以包含一个或多个经过修饰的核苷酸。在某些实施方案中，所述一个或多个经过修饰的核苷酸各自独立地选自：2′-甲氧基乙基修饰核苷酸、2′-O-烷基修饰核苷酸(例如2′-O-甲基修饰核苷酸)、2′-O-烯丙基修饰核苷酸、2′-C-烯丙基修饰核苷酸、2′-氟修饰核苷酸、2′-脱氧修饰核苷酸、2’-羟基修饰核苷酸、锁核苷酸、HNA、UNA。在某些实施方案中，所述经过修饰的核苷酸选自2′-O-烷基修饰核苷酸、2′-氟修饰核苷酸。
在某些实施方案中，所述寡核苷酸带有末端修饰物，优选地，所述末端修饰物选自：胆固醇、聚乙二醇、荧光探针、生物素、多肽、维生素、组织靶向性分子及其任意组合。
在某些实施方案中，所述寡核苷酸的含磷酸骨架经过修饰，优选地，所述修饰为硫代修饰。
在某些实施方案中，所述寡核苷酸为siRNA。在某些实施方案中，所述siRNA包括互补形成双链的正义链和反义链。在某些实施方案中，所述siRNA包含如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4所示的序列。
本申请还提供了如上定义的通式为A x-linker-R 1、A x-linker-R 2、A x-linker-R 3或A x-linker-R 4的化合物的用途，所述化合物用于对寡核苷酸进行修饰。本申请还提供了一种试剂盒，其包含至少一个选自如上定义的通式为A x-linker-R 1、A x-linker-R 2、A x-linker-R 3或A x-linker-R 4的化合物。在某些实施方案中，所述试剂盒还包含用于合成和/或修饰寡核苷酸的试剂(例如：固相支持物、DNA单体、RNA单体、修饰单体、活化剂、氧化剂、脱保护试剂、缓冲液及其任意组合)。
在一个方面，本申请提供了一种药物组合物，其包含本发明的包含寡核苷酸和缀合物基团的化合物，以及任选的药学上可接受的载体。在某些实施方案中，所述药物组合物用于预防和/或治疗受试者中与肝脏相关的疾病。
本发明的药物组合物可以制成药学上可接受的任一剂型。在某些实施方案中，所述的剂型选自散剂、片剂、颗粒剂、胶囊剂、溶液剂、乳剂、混悬剂、注射剂、喷雾剂、气雾剂、粉雾剂。在某些实施方案中，所述制剂可以以任何合适的给药方式，例如口服、肠胃外、直肠、经肺或局部给药等方式施用于需要预防和/或治疗的患者或受试者。当用于口服给药时，所述制剂可以为口服制剂，例如口服固体制剂，如片剂、胶囊剂、丸剂、颗粒剂等；或，口服液体制剂，如口服溶液剂、口服混悬剂、糖浆剂等。所述口服制剂还可包含适宜的填充剂、粘合剂、崩解剂、润滑剂等。当用于肠胃外给药时，所述制剂可以为注射剂，包括注射液、注射用无菌粉末与注射用浓溶液。对于注射剂，可采用现有制药领域中的常规方法来进行生产。当配制注射剂时，所述制剂中可以不加入附加剂，也可根据药物的性质加入适宜的附加剂。
在一个方面，本申请提供了本发明的包含寡核苷酸和缀合物基团的化合物的用途，所述化合物用于预防和/或治疗受试者中与肝脏相关的疾病。
在一个方面，本申请提供了一种预防和/或治疗受试者中与肝脏相关的疾病的方法，包括将有效量的本发明的包含寡核苷酸和缀合物基团的化合物施予有需要的受试者。
在某些实施方案中，所述与肝脏相关的疾病选自：遗传性血管水肿、I型家族性酪氨酸血症、Alagille综合征、α-1-抗胰蛋白酶缺乏症、胆汁酸合成和代谢缺陷、胆道闭锁、囊性纤维化肝病、特发性新生儿肝炎、线粒体肝病、进行性家族性肝内胆汁郁积、原发性硬化性胆管炎、转甲状腺素蛋白淀粉样变性病、血友病、纯合性家族性高胆固醇血症、高血脂症、脂肪性肝炎、非酒精性脂肪性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、高血糖症和牵涉与II型糖尿病类似的异常增高的肝葡萄糖生成的疾病、肝炎、肝性卟啉。
在某些实施方案中，所述受试者为哺乳动物，例如牛科动物、马科动物、羊科动物、猪科动物、犬科动物、猫科动物、啮齿类动物、灵长类动物；例如，所述受试者为人。
在本发明中，除非另有说明，否则本文中使用的科学和技术名词具有本领域技术人员所通常理解的含义。并且，本文中所涉及的实验室操作步骤均为相应领域内广泛使用的常规步骤。同时，为了更好地理解本发明，下面提供相关术语的定义和解释。
如本文中使用的，术语“寡核苷酸”是指含有多个连接的化学修饰或未修饰核苷酸的寡聚化合物，其具有小于约100个核苷酸的长度(例如1-20个核苷酸或1-50个核苷酸)。在某些实施方案中，寡核苷酸可包括非核酸共轭基团。在某些实施方案中，寡核苷酸包含核糖核酸(RNA)或脱氧核糖核酸(DNA)。在某些实施方案中，寡聚核苷酸是双链的或是 单链的。在某些实施方案中，寡聚核苷酸为siRNA、核酸适体或反义核酸。
如本文中使用的，术语“缀合物”或“缀合物基团”意指结合至寡核苷酸的原子或原子基团。在某些情况下，缀合物基团改变它们所连接至的寡核苷酸的一种或多种性质，包括但不限于药效学、药物代谢动力学、结合、吸收、细胞分布、细胞摄取、电荷和/或清除性质。
如本文中使用的，术语“受体”是指糖蛋白或脂蛋白构成的生物大分子，存在于细胞膜、胞浆或细胞核内，不同的受体有特异的结构和构型。如本文中使用的，术语“配体”是指对受体具有识别能力并能与之结合的物质。在某些实施方案中，所述配体是对去唾液酸糖蛋白受体(asialoglycoprotein receptor，ASGPR)具有亲合力的配体。在某些实施方案中，所述配体为碳水化合物，例如单糖和多糖，包括但不限于：半乳糖、N-乙酰基半乳糖胺、甘露糖、葡萄糖、葡糖胺以及岩藻糖。
如本文中使用的，术语“多糖”是指由多个单糖基以糖苷键相连而成的聚合物。本发明中，多糖包括寡糖和低聚糖。通常，“寡糖”是指由2-10个单糖基以糖苷键相连而成的聚合物，“低聚糖”是指由20个以下单糖基以糖苷键相连而成的聚合物。
如本文中使用的，术语“约”应该被本领域技术人员理解，并将随其所用之处的上下文而有一定程度的变化。如果根据术语应用的上下文，对于本领域技术人员而言，其含义不是清楚的，那么“约”的意思是偏差不超过所述特定数值或范围的正负10％。
如本文中使用的，术语“预防”是指阻止或延迟疾病的发生。
如本文中使用的，术语“治疗”是指治愈或至少部分阻止疾病的进展，或缓解疾病的症状。
如本文中使用的，术语“有效量”是指能够有效实现预期目的的量。例如，预防疾病有效量是指，能够有效预防、阻止或延迟疾病的发生的量。测定这样的有效量在本领域技术人员的能力范围之内。
发明的有益效果
同现有技术相比较，本发明具有以下有益效果：
同Alnylam制药和ISIS制药公司相关发明(US20150119444A1，US20150119445A1，US20150126718A1)相比较，本发明具有以下显著区别：
1.化学结构不同。两家公司设计结构为多触角ASGPR配体与寡核酸一次连接；本发明设计的结构为单ASGPR配体以核酸亚磷酰胺固相化学合成多次与寡核酸偶联，实 现多配体修饰。单ASGPR配体多次固相合成偶联的优势在于(1)缩短了合成步骤，易于实现放大生产。固相合成连接每个配体偶联反应效率大于98％，连接3个配体效率反应大于94％，固相合成可由设备自动完成，连接反应中不必纯化。相比液相合成将3个配体组合为单一分子再进行连接，效率更高，速度更快，更易于放大生产。(2)扩大了寡核酸修饰范围。按照报道(lee et al.,Carbohydrates in Chemistry and Biology；4:549,2000)三触角结构中GalNAc与中心距离分别为
Figure PCTCN2017118591-appb-000044
不等距离更有利于同ASGPR受体结合。因制备方法限制，两家公司应用的三触角结构中GalNAc与中心为等距离(17个原子)。而本项发明每个ASGPR配体单独与寡核酸连接，可以简便控制中心支配体的空间距离，调节配体数量，形成数百种组合，扩大了寡核酸修饰种类，有利于找到活性更高的成药分子。(3)拓展了ASGPR配体类型。在GalNAc的基础上，制备了一系列新ASGPR配体底物，通过对这些新配体的筛选将有利于更多寡核酸创新药物开发。
2.配体同寡核酸共价连接合成方法不同。Alnylam制药公司采用将三触角GalNAc配体与固相支持物连接，修饰后的固相支持物用于寡核酸固相合成，从而将配体连接在寡核酸3’端。ISIS制药尝试了将三触角GalNAc配体用核酸亚磷酰胺固相合成法连接在5’末端，但因空间位阻大，未能成功连接(Efficient Synthesis and Biological Evaluation of5′-GalNAc)，故开发了一种液相三触角GalNAc配体与末端氨基修饰寡核酸液相连接法，该方法实现了反应时间3小时，反应效率大于95％。本发明方法将每个配体独立同寡核酸连接，分子位阻小，连接效率高。
3.可修饰寡核酸位点和组合不同。寡核酸药物分子中末端位点通常以胆固醇、聚乙二醇(PEG)等修饰，提高药代动力学性质。Alnylam和ISIS制药公司设计的三触角GalNAc配体仅用于寡核酸链末端修饰，占据了末端修饰位点，减少了可应用于寡核酸修饰的种类。本发明的新化合物可在固相合成中对寡核酸任意位置进行修饰，其他修饰不受末端影响。本发明实施例中描述了新化合物与末端胆固醇混合修饰寡核酸的制备。
下面将结合附图和实施例对本发明的实施方案进行详细描述，但是，本领域技术人员将理解，下列附图和实施例仅用于说明本发明，而不是对本发明的范围的限定。根据附图和优选实施方案的下列详细描述，本发明的各种目的和有利方面对于本领域技术人员来说将变得显然。
附图说明
图1显示了实施例35中，各样品的GalNAc结合曲线。
序列信息
本发明涉及的序列的信息提供于下表中：
序列号(SEQ ID NO:) 描述
1 人工序列
2 人工序列
3 人工序列
4 人工序列
序列1(SEQ ID NO:1)：19nt
Figure PCTCN2017118591-appb-000045
序列2(SEQ ID NO:2)：25nt
Figure PCTCN2017118591-appb-000046
序列3(SEQ ID NO:3)：19nt
Figure PCTCN2017118591-appb-000047
序列4(SEQ ID NO:4)：21nt
Figure PCTCN2017118591-appb-000048
具体实施方式
下面将结合实施例对本发明的实施方案进行详细描述，但是本领域技术人员将会理解，下列实施例仅用于说明本发明，而不应视为限定本发明的范围。实施例中未注明具体条件者，按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者，均为可以通过市购获得的常规产品。
实施例1化合物R’ 1-H的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000049
以丝胺醇为原料，参考文献(Choi J Y,Borch R F.Highly efficient synthesis of enantiomerically enriched 2-hydroxymethylaziridines by enzymatic desymmetrization.[J].Organic letters,2007,9(2):215-218)制备了化合物1，并进一步制备化合物R’ 1-H，得到白色固体，两步总收率49％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.41-7.37(d,J＝7.2Hz,2H),7.33-7.28(t,J＝6.9Hz,2H),7.27-7.19(m,5H),6.91-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.16(s,2H),4.63-4.58(m,1H),4.05-3.97(m,1H),3.74(s,6H),3.04-2.99(m,2H),2.95-2.90(m,2H).MS(ESI),m/z:416.3([M+Na] +).
实施例2化合物R’ 2-H的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000050
参照实施例1的方法，制备化合物R’ 2-H，为白色固体，收率55％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.42-7.37(d,J＝7.2Hz,2H),7.35-7.29(t,J＝6.9Hz,2H),7.28-7.19(m,5H),6.92-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.17(s,1H),4.63-4.59(m,1H),3.74(s,6H),3.05-2.99(m,2H),2.96-2.90(m,2H)，2.88-2.81(m,4H).MS(ESI),m/z:430.3([M+Na] +).
实施例3化合物R’ 3-H的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000051
以L-羟脯氨酸甲酯盐酸盐为原料，参照实施例1的方法，制备化合物R’ 3-H，得到白色固体，收率45％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.42-7.37(d,J＝7.2Hz,2H),7.35-7.29(t,J＝6.9Hz,2H),7.28-7.19(m,5H),6.92-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.17(s,1H),4.63-4.59(m,1H),3.74(s,6H),3.05-2.99(m,3H),2.90-2.86(m,2H),2.77-2.71(m,1H),1.88-1.81(m,2H).MS(ESI),m/z:442.5([M+Na] +).
实施例4化合物A 1-I 1的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000052
(1)化合物3的合成
1L圆底烧瓶中，加入δ-戊内脂(100g，1mol)、氢氧化钠(40g，1mol)、去离子水400mL，混合，70℃反应6小时，TLC监控反应完毕，旋干反应液，加入200mL甲苯后旋干，得白色固体140g。
(2)化合物4的合成
1L圆底烧瓶中，加入化合物3(140g，1mol)、无水丙酮500mL、溴化苄(205.2g，1.2mol)、催化剂四丁基溴化铵(16.2g，0.05mol)，加热回流，TLC监测反应，24h后反应完全，反应液冷却至室温后，减压除去丙酮，残渣溶于500mL乙酸乙酯中，依次用饱和硫酸氢钠溶液200mL、饱和碳酸氢钠溶液200mL和饱和食盐水200mL洗涤，有机相用无水硫酸钠干燥，浓缩，经硅胶柱(石油醚：乙酸乙酯V:V＝1：1)分离得到透明油状液体175g，产率84％。
(3)化合物5的合成
1L圆底烧瓶中，加入D-半乳糖盐酸盐(100g，0.46mol)、无水吡啶450mL，冰浴下缓慢加入乙酸酐325mL、三乙胺(64.5mL，0.46mol)、DMAP(2g,0.016mol)。常温反应过夜，析出大量固体，抽滤，滤饼用0.5N HCl溶液200mL淋洗，得白色固体162.5g，产率90％。 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.88(d,J＝9.2Hz,1H),5.63(d,J＝8.8Hz,1H),5.26(d,J＝3.1Hz,1H),5.05(d,J＝11.3,3.3Hz,1H),4.36(m,4H),2.11(s,3H),2.03(s,3H),1.98(s,3H),1.90(s,3H),1.78(s,3H).
(4)化合物6的合成
250mL圆底烧瓶中，加入化合物5(10g,25.7mmol)、无水二氯甲烷100mL,搅拌10分钟后加入三氟甲磺酸三甲基硅酯(7mL,38.7mmol)，室温反应过夜，反应液缓慢倾入碳酸氢钠(7g,79.5mmol)的水溶液(200mL)中搅拌0.5小时，有机相分离，无水硫酸钠干燥，减压浓缩，得淡黄色胶体7.78g，产率92％。
(5)化合物7的合成
100mL圆底烧瓶中，将化合物6(5g,15.2mmol)、化合物4(3.8g,18.25mmol)溶于无水1，2－二氯乙烷50mL中，搅拌10分钟后加入三氟甲磺酸三甲基硅酯(0.55mL,3mmol)，常温过反应过夜，反应液用二氯甲烷萃取，有机相用饱和碳酸氢钠溶液50mL洗涤两遍，无水硫酸钠干燥，减压浓缩，经硅胶柱(石油醚：乙酸乙酯V:V＝3：2)分离得到透明油状液体，6.94g，产率85％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.69(d,J＝9.3Hz,1H),7.33–7.16(m,5H),5.28(d,J＝5.3Hz,1H),4.95(s,2H),4.93(q,J＝4.2Hz,1H),4.40(d,J＝8.6Hz,1H),4.00–3.86(m,3H),3.73–3.56(m,2H),3.36–3.21(m,1H),2.53(t,J＝8.2Hz,2H),2.11(s,3H),1.89(s,3H),1.83(s,3H),1.65(s,3H),1.59–1.36(m,4H).MS(ESI),m/z:560.2([M+Na] +).
(6)化合物A 1-I 1的合成
50mL圆底烧瓶中，化合物7(3.3g，6.1mmmol)、Pd/C(0.33g，10％)溶于5mL甲醇和20mL乙酸乙酯中，接入氢气球，常温反应过夜。反应液硅藻土过滤，硅藻土甲醇淋洗，滤液减压浓缩旋干，得白色固体2.8g，产率95.5％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：11.98(s,1H),7.79-7.75(d,J＝8.9Hz,1H),5.20(s,1H),5.0-4.95(q,J＝4.2Hz,1H),4.46-4.51(d,J＝7.2Hz,1H),4.15-4.07(m,3H),3.89-3.79(m,1H),3.80-3.69(m,1H),3.46-3.36(m,1H)，2.22-2.14(t，J＝7.2Hz，2H)，2.15(s，3H)，2.00(s，3H)，1.95(s，3H)，1.87(s，3H)，1.59-1.42(m，4H).MS(ESI),m/z:470.5([M+Na] +).
实施例5化合物A 1-I 2的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000053
(1)化合物8的合成
100mL圆底烧瓶中，化合物6(5g,15.2mmol)、10-十一烯醇(3.1g,18.24mmol)溶于50mL无水二氯甲烷中，搅拌10分钟后加入三氟甲磺酸三甲基硅酯(0.55mL,3.0mmol)，常温反应过夜，反应液用二氯甲烷萃取，有机相用饱和碳酸氢钠溶液50mL洗涤两遍，无水硫酸钠干燥，减压浓缩，经硅胶柱(石油醚：乙酸乙酯V:V＝3：2)分离得到白色固体6.59g，产率87％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.82(d,J＝3.3Hz,1H),5.86-5.73(m,1H),5.22(s,1H),5.02-4.9(m,3H),4.5-4.98(s,J＝3.5Hz,1H),4.08-3.99(m,3H),3.9-3.88(m,1H),3.73-3.65(m,1H),3.48-3.38(m,1H),2.12(s,3H),2.05-2.01(m,2H),2.00(s,3H),1.88(s,3H),1.66(s,3H),1.5-1.4(m,2H),1.39-1.3(m, 2H),1.29-1.19(m,10H).MS(ESI),m/z:522.4([M+Na] +).
(2)化合物A 1-I 2的合成
100mL圆底烧瓶中，加入化合物8(4g,8.02mmol)、二氯甲烷50mL、乙腈50mL、去离子水70mL，分批加入NaIO 4(6.86g,32.1mmol)，常温反应48h，TLC监控反应完毕。反应液加入去离子水100mL，二氯甲烷萃取三次(50mL×3)，合并有机相，无水硫酸钠干燥，减压浓缩旋干，得淡褐色胶状产物4.1g，产率99％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：11.99(s,1H),7.82(d,J＝3.3Hz,1H),5.22(s,1H),5.02-4.9(m,1H),4.5-4.98(s,J＝3.5Hz,1H),4.08-3.99(m,3H),3.9-3.88(m,1H),3.73-3.65(m,1H),3.48-3.38(m,1H),2.12(s,3H),2.05-2.01(m,2H),2.00(s,3H),1.88(s,3H),1.66(s,3H),1.5-1.4(m,2H),1.39-1.3(m,2H),1.29-1.19(m,10H).MS(ESI),m/z:540.26([M+Na] +).
实施例6化合物A 2-I 1的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000054
(1)化合物9的合成
化合物9参照文献[2]Hudson,C.S.；Johnson,J.J.Am.Chem.Soc.1915,37,1270–1275合成。
H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ：5.20(s,2H),4.95(q,J＝4.2Hz,2H),4.51(d,J＝7.2Hz,1H),4.46(d,J＝7.2Hz,1H)，4.15–3.97(m,6H),3.89–3.79(m,2H),2.23(s,3H)，2.15(s,6H)，2.00(s,6H)，1.95(s,6H)，1.87(s,3H).MS(ESI),m/z:701.6([M+Na] +).
(2)化合物10的合成
500mL圆底烧瓶，化合物9(20g,29.5mmol)、化合物4(9.2g,44.3mmol)溶于200mL无水二氯甲烷中，冰浴下滴加BF 3-OEt 2(14.8mL)，反应保持冰浴反应24h，TLC监控反应完毕。硅藻土过滤，滤液溶于500mL乙酸乙酯，依次用饱和碳酸氢钠溶液200mL和饱和食盐水200mL洗涤。有机相用无水硫酸镁干燥，减压浓缩，经硅胶柱(石油醚：乙酸乙酯V:V＝3：2)分离得白色固体17.06g，产率70％。MS(ESI),m/z:849.26([M+Na] +).
(3)化合物A 2-I 1的合成
100mL圆底烧瓶中，化合物10(10g，12.1mmol)、Pd/C(1g，10％)，溶于10mL甲醇和50mL乙酸乙酯中，氮气置换空气，接入氢气球，常温反应过夜。反应液硅藻土过滤，硅藻土甲醇淋洗，滤液减压旋干，得白色固体8.5g,产率95.5％。H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ：11.98(s,1H),5.20(s,2H),4.95(q,J＝4.2Hz,2H),4.51(d,J＝7.2Hz,1H),4.46(d,J＝7.2Hz,1H),4.15–3.97(m,6H),3.89–3.79(m,2H),3.80–3.69(m,1H),3.46–3.36(m,1H),2.22-2.14(t,J＝7.2Hz,2H),2.15(s,6H),2.00(s,6H),1.95(s,6H),1.87(s,3H),1.59–1.42(m,4H).MS(ESI),m/z:759.26([M+Na] +).
实施例7化合物A 2-I 2的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000055
(1)化合物11的合成
500mL圆底烧瓶中，化合物9(20g,29.5mmol)、10-十一烯醇(6g,35.4mmol)溶于200mL无水DCM中，冰浴下滴加BF 3-OEt 2(14.8mL)，保持冰浴反应24h，TLC监控反应完毕。硅藻土过滤，滤液溶于500mL乙酸乙酯，依次用饱和碳酸氢钠溶液200mL和饱和食盐水200mL洗涤。有机相用无水硫酸镁干燥，减压浓缩，经硅胶柱(石油醚：乙酸乙酯V:V＝3：2)分离得白色固体19.5g，产率83.9％，MS(ESI),m/z:811.25([M+Na] +).
(2)化合物A 2-I 2的合成
以化合物11为原料，参照A 1-I 2合成。产率87％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：11.82(s,1H),5.86-5.73(m,1H),5.22(s,1H),5.2-4.9(m,6H),4.5-4.98(s,J＝3.5Hz,2H),4.08-3.99(m,3H),3.9-3.88(m,2H),3.73-3.65(m,2H),3.48-3.38(m,1H),2.12(s,6H),2.05-2.01(m,2H),2.00(s,6H),1.88(s,6H),1.66(s,3H),1.5-1.4(m,2H),1.39-1.3(m,2H),1.29-1.19(m,8H).MS(ESI),m/z:829.7([M+Na] +).
实施例8化合物A 3-I 1的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000056
(1)化合物12的合成
参照化合物5的合成。白色固体，产率91％。 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ： 5.63(d,J＝8.8Hz,1H),5.26(d,J＝3.1Hz,1H),5.05(d,J＝11.3,3.3Hz,1H),4.36(m,4H),2.11(s,3H),2.03(s,3H),1.98(s,3H),1.90(s,3H),1.78(s,3H).MS(ESI),m/z:391.21([M+1] +).
(2)化合物13的合成
以化合物12为原料，参照化合物10的合成。透明油状液体，产率86％。
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.33–7.16(m,5H),5.28(d,J＝5.3Hz,1H),4.95(s,2H),4.93(q,J＝4.2Hz,1H),4.40(d,J＝8.6Hz,1H),4.00–3.86(m,3H),3.73–3.56(m,1H),3.36–3.21(m,2H),2.53(t,J＝8.2Hz,2H),2.11(s,3H),1.89(s,3H),1.83(s,3H),1.65(s,3H),1.59–1.36(m,4H).MS(ESI),m/z:561.2([M+Na] +).
(3)化合物A 3-I 1的合成
以化合物13为原料，参照化合物A 1-I 1的合成。白色固体，产率93.5％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：11.98(s,1H),5.20(s,1H),4.95(q,J＝4.2Hz,1H),4.51(d,J＝7.2Hz,1H),4.15-3.97(m,3H),3.89-3.79(m,1H),3.80-3.69(m,1H),3.46-3.36(m,1H)，2.22-2.14(t,J＝7.2Hz,2H)，2.15(s,3H)，2.00(s,3H)，1.95(s,3H)，1.87(s,3H)，1.59–1.42(m,4H).MS(ESI),m/z:471.5([M+Na] +).
实施例9化合物A 3-I 2的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000057
(1)化合物14的合成
以化合物12为原料，参照化合物11的合成。白色固体，产率88％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：5.86-5.73(m,1H),5.22(s,1H),5.2-4.9(m,3H),4.5-4.98(s,J＝3.5Hz,1H),4.08-3.99(m,3H),3.9-3.88(m,1H),3.73-3.65(m,1H),3.48-3.38(m,1H),2.12(s,3H),2.05-2.01(m,2H),2.00(s,3H),1.88(s,3H),1.66(s,3H),1.5-1.4(m,2H),1.39-1.3(m,2H),1.29-1.19(m,10H).MS(ESI),m/z:523.5([M+Na] +).
(2)化合物A 3-I 2的合成
以化合物14为原料，参照化合物A 1-I 2的合成。淡褐色胶状产物，产率97％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：11.99(s,1H),5.22(s,1H),5.02-4.9(m,1H),4.5-4.98 (s,J＝3.5Hz,1H),4.08-3.99(m,3H),3.9-3.88(m,1H),3.73-3.65(m,1H),3.48-3.38(m,1H),2.12(s,3H),2.05-2.01(m,2H),2.00(s,3H),1.88(s,3H),1.66(s,3H),1.5-1.4(m,2H),1.39-1.3(m,2H),1.29-1.19(m,10H).MS(ESI),m/z:541.3([M+Na] +).
实施例10化合物A 1-IV 1的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000058
(1)化合物15的合成
以化合物6为原料，参照化合物8的合成。MS(ESI),m/z:484.2([M+1] +).
(2)化合物A 1-IV 1的合成
以化合物15为原料，参照化合物A 1-I 2的合成。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：11.88(s,1H),7.77-7.73(d,J＝8.9Hz,1H),5.21(s,1H),5.0-4.96(q,J＝4.2Hz,1H),4.45-4.51(d,J＝7.2Hz,1H),4.12-4.07(m,3H),3.88-3.78(m,1H),3.72-3.68(m，2H)，3.62-3.58(m，2H)，3.56-3.46(m,4H)，2.15(s，3H)，2.00(s，3H)，1.95(s，3H)，1.87(s，3H).MS(ESI),m/z:502.6([M+1] +).
实施例11化合物A 1-I 1-R 1的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000059
(1)化合物16的合成
250mL圆底烧瓶中，加入化合物A 1-I 1(10g，22.35mmol)、1-乙基-(3-二甲基氨基丙基)碳酰二亚胺盐酸盐(EDC.HCL)(5.14g，26.82mmol)、N-羟基琥珀酰亚胺(2.83g，24.59mmol)、二氯甲烷100mL。常温搅拌反应0.5h后加入化合物R 1-H(8.79g，22.35mmol)，TLC监测反应，4h后反应完全。反应液依次用饱和碳酸氢钠溶液50mL和饱和食盐水50mL洗涤，有机相无水硫酸钠干燥，浓缩，经硅胶柱(二氯甲烷：甲醇V:V＝20：1)分离得到白色固体15.8g，产率86％。MS(ESI),m/z:845.2([M+Na] +).
(2)化合物A 1-I 1-R 1的合成
250mL双口瓶中，加入化合物16(5g,6.08mmol)，氮气保护，加入无水乙腈100mL、双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦(3.66g,12.16mmol)，搅拌下缓慢滴加乙硫基四唑的乙腈溶液(2.5M)(1.22mL,3.04mmol)，反应0.5h，TLC监测反应，0.5h后反应完全。减压浓缩除去乙腈，加入二氯甲烷100mL溶解，饱和食盐水100mL洗涤。有机相用无水硫酸钠干燥，浓缩，经硅胶柱(石油醚：乙酸乙酯V:V＝1：3)分离得到白色固体5.16g，产率83％。 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.84-7.79(d,J＝8.9Hz,1H),7.65-7.60(d,J＝8.9Hz,1H),7.41-7.37(d,J＝7.2Hz,2H),7.33-7.28(t,J＝6.9Hz,2H),7.27-7.19(m,5H),6.91-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.20(s,1H),5.0-4.95(q,J＝4.2Hz,1H),4.51-4.46(d,J＝7.2Hz,1H),4.15-4.06(m,3H),4.05-3.96(m,1H),3.84-3.80(m,2H),3.89-3.79(m,1H),3.74(s,6H),3.71-3.69(m,1H),3.46-3.36(m,1H)，3.04-2.99(m,2H),2.95-2.90(m,2H)，2.88-2.84(m,2H),2.59-2.54(m,2H),2.22-2.14(t,J＝7.2Hz，2H)，2.15(s,3H)，2.00(s,3H)，1.95(s,3H)，1.87(s,3H)，1.77(s,12H)，1.59-1.42(m,4H).MS(ESI),m/z:1045.5([M+Na] +).
实施例12化合物A 1-I 1-R 2的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000060
(1)化合物17的合成
以化合物A 1-I 1为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率82.5％。MS(ESI),m/z:859.2([M+Na] +).
(2)化合物A 1-I 1-R 2的合成
以化合物17为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率84.2％。 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.83-7.79(d,J＝8.8Hz,1H),7.42-7.37(d,J＝7.2Hz,2H),7.33-7.28(t,J＝6.9Hz,2H),7.27–7.19(m,5H),6.91-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.20(s,1H),5.0-4.95(q,J＝4.2Hz,1H),4.51-4.46(d,J＝7.2Hz,1H),4.15–3.97(m,3H),4.05–3.96(m,1H),3.84–3.80(m,2H),3.89–3.79(m,1H),3.74(s,6H),3.71–3.69(m,1H),3.46–3.36(m,1H)，3.04–2.99(m,2H),2.98–2.95(m,2H)，2.89–2.93(m,4H)，2.88–2.84(m,2H),2.60–2.55(m,2H),2.22-2.14(t,J＝7.2Hz，2H)，2.15(s,3H)，2.00(s,3H)，1.95(s,3H)， 1.87(s,3H)，1.77(s,12H),1.59–1.42(m,4H).MS(ESI),m/z:1059.6([M+Na] +).
实施例13化合物A 1-I 1-R 3的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000061
(1)化合物18的合成
以化合物A 1-I 1为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率86％。MS(ESI),m/z:871.2([M+Na] +).
(2)化合物A 1-I 1-R 3的合成
以化合物18为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率84.2％。
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.73-7.70(d,J＝7.9Hz,1H),7.42-7.37(d,J＝7.2Hz,2H),7.35-7.29(t,J＝6.9Hz,2H),7.28–7.19(m,5H),6.92-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.20(s,1H),5.0-4.95(q,J＝4.2Hz,1H),4.51-4.46(d,J＝7.2Hz,1H),4.15–3.97(m,3H),3.89–3.79(m,3H),3.74(s,6H),3.70–3.67(m,1H),3.46–3.36(m,1H),3.05–2.99(m,3H),2.90–2.86(m,3H),2.77–2.71(m,1H),2.60–2.55(m,2H),2.22-2.14(t,J＝7.2Hz,2H),2.15(s,3H),2.00(s,3H),1.95(s,3H),1.87(s,3H),1.88–1.81(m,2H)，1.77(s,12H),1.59–1.42(m,4H).MS(ESI),m/z:1071.4([M+Na] +).
实施例14化合物A 1-I 2-R 1的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000062
(1)化合物19的合成
以化合物A 1-I 2为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率85.6％。MS(ESI),m/z:915.5([M+Na] +).
(2)化合物A 1-I 2-R 1的合成
以化合物19为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率82.1％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.82-7.78(d,J＝7.3Hz,1H),7.69-7.63(d,J＝7.3Hz, 1H),7.41-7.37(d,J＝7.2Hz,2H),7.33-7.28(t,J＝6.9Hz,2H),7.27–7.19(m,5H),6.91-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.22(s,1H),5.02-4.9(m,1H),4.5-4.98(s,J＝3.5Hz,1H),4.08-3.99(m,3H),4.05–3.97(m,1H),3.9-3.88(m,1H),3.84–3.80(m,2H),3.74(s,6H),3.73-3.65(m,1H),3.48-3.38(m,1H),3.04–2.99(m,2H),2.95–2.90(m,2H)，2.88–2.84(m,2H),2.61–2.55(m,2H),2.12(s,3H),2.05-2.01(m,2H),2.00(s,3H),1.88(s,3H),1.77(s,12H)，1.66(s,3H),1.5-1.4(m,2H),1.39-1.3(m,2H),1.29-1.19(m,10H).MS(ESI),m/z:1115.2([M+Na] +).
实施例15化合物A 1-I 2-R 2的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000063
(1)化合物20的合成
以化合物A 1-I 2为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率84.2％。MS(ESI),m/z:929.3([M+Na] +).
(2)化合物A 1-I 2-R 2的合成
以化合物20为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率81.1％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.83-7.77(d,J＝7.3Hz,1H),7.41-7.37(d,J＝7.2Hz,2H),7.33-7.28(t,J＝6.9Hz,2H),7.27–7.19(m,5H),6.91-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.22(s,1H),5.02-4.9(m,1H),4.5-4.98(s,J＝3.5Hz,1H),4.08-3.99(m,3H),3.9-3.88(m,1H),3.84–3.80(m,2H),3.74(s,6H),3.73-3.65(m,1H),3.48-3.38(m,1H),3.15–3.11(m,4H),3.04–2.99(m,2H),2.95–2.90(m,2H)，2.88–2.84(m,2H),2.61–2.55(m,2H),2.12(s,3H),2.05-2.01(m,2H),2.00(s,3H),1.88(s,3H),1.77(s,12H)，1.66(s,3H),1.5-1.4(m,2H),1.39-1.3(m,2H),1.29-1.19(m,10H).MS(ESI),m/z:1129.4([M+Na] +).
实施例16化合物A 1-I 2-R 3的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000064
(1)化合物21的合成
以化合物A 1-I 2为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率80.5％。MS(ESI),m/z:941.1([M+Na] +).
(2)化合物A 1-I 2-R 3的合成
以化合物21为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率81.1％
1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.82(d,J＝3.3Hz,1H),7.42-7.37(d,J＝7.2Hz,2H),7.35-7.29(t,J＝6.9Hz,2H),7.28–7.19(m,5H),6.92-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.22(s,1H),5.02-4.9(m,1H),4.5-4.98(s,J＝3.5Hz,1H),4.08-3.99(m,3H),3.9-3.88(m,1H),3.84–3.80(m,2H),3.76(s,6H),3.73-3.65(m,1H),3.48-3.38(m,1H),3.05–2.99(m,3H),2.90–2.84(m,4H),2.77–2.71(m,1H),2.62–2.56(m,2H),2.12(s,3H),2.05-2.01(m,2H),2.00(s,3H),1.88(s,3H),1.87–1.81(m,2H)，1.77(s,12H)，1.66(s,3H),1.5-1.4(m,2H),1.39-1.3(m,2H),1.29-1.19(m,10H).MS(ESI),m/z:1141.2([M+Na] +).
实施例17化合物A 2-I 1-R 1的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000065
(1)化合物22的合成
以化合物A 2-I 1为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率80.4％。MS(ESI),m/z:1134.7([M+Na] +).
(2)化合物A 2-I 1-R 1的合成
以化合物22为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率81.3％。H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.61-7.57(d,J＝7.2Hz,1H),7.41-7.37(d,J＝7.2Hz,2H),7.33-7.28(t,J＝6.9Hz,2H),7.27–7.19(m,5H),6.91-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.20(s,2H),4.95(q,J＝4.2Hz,2H),4.51(d,J＝7.2Hz,1H),4.46(d,J＝7.2Hz,1H),4.15–3.97(m,6H),4.05–3.97(m,1H),3.89–3.79(m,4H),3.75(s,6H),3.80–3.69(m,1H),3.46–3.36(m,1H),3.04–2.99(m,2H),2.95–2.90(m,2H),2.88–2.84(m,2H),2.61–2.55(m,2H)，2.22-2.14(t,J＝7.2Hz,2H)，2.15(s,6H)，2.00(s,6H)，1.95(s，6H)，1.87(s,3H)，1.77(s,12H)，1.59–1.42(m,4H).MS(ESI),m/z:1334.2([M+Na] +).
实施例18化合物A 2-I 1-R 2的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000066
(1)化合物23的合成
以化合物A 2-Ι 1为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率86.1％。MS(ESI),m/z:1148.3([M+Na] +).
(2)化合物A 2-I 1-R 2的合成
以化合物23为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率82.3％。H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.40-7.36(d,J＝7.2Hz,2H),7.33-7.28(t,J＝6.9Hz,2H),7.27–7.19(m,5H),6.91-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.20(s,2H),4.95(q,J＝4.2Hz,2H),4.51(d,J＝7.2Hz,1H),4.46(d,J＝7.2Hz,1H),4.15–3.97(m,6H),3.89–3.79(m,4H),3.75(s,6H),3.80–3.69(m,1H),3.46–3.41(m,4H),3.46–3.36(m,1H),3.04–2.99(m,2H),2.95–2.90(m,2H),2.88–2.84(m,2H),2.61–2.55(m,2H)，2.22-2.14(t,J＝7.2Hz,2H)，2.15(s,6H)，2.00(s,6H)，1.95(s，6H)，1.87(s,3H)，1.77(s,12H)，1.59–1.42(m,4H).MS(ESI),m/z:1348.2([M+Na] +).
实施例19化合物A 2-I 1-R 3的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000067
(1)化合物24的合成
以化合物A 2-I 1为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率82.9％。MS(ESI),m/z:1160.5([M+Na] +).
(2)化合物A 2-I 1-R 3的合成
以化合物24为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率82.3％。H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.44-7.39(d,J＝7.2Hz,2H),7.36-7.30(t,J＝6.9Hz,2H),7.28-7.19(m,5H),6.92-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.20(s,2H),4.95(q,J＝4.2Hz,2H),4.51(d,J＝7.2Hz,1H),4.46(d,J＝7.2Hz,1H),4.15-3.97(m,6H),3.89-3.82(m,4H), 3.80-3.76(m,1H),3.74(s,6H),3.46-3.36(m,1H)，3.05–2.99(m,3H)，2.90-2.86(m,2H)，2.77-2.71(m,1H),2.61-2.56(m,2H)，2.22-2.14(t,J＝7.2Hz,2H)，2.15(s，6H)，2.00(s，6H)，1.95(s，6H)，1.87(s,3H)，1.86-1.81(m,2H)，1.77(s,12H)，1.59-1.42(m,4H).MS(ESI),m/z:1360.26([M+Na] +).
实施例20化合物A 2-I 2-R 1的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000068
(1)化合物25的合成
以化合物A 2-I 2为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率86.3％。MS(ESI),m/z:1204.6([M+Na] +).
(2)化合物A 2-I 2-R 1的合成
以化合物25为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率80.3％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.71-7.66(d,J＝7.2Hz,1H),7.41-7.37(d,J＝7.2Hz,2H),7.33-7.28(t,J＝6.9Hz,2H),7.27-7.19(m,5H),6.91-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.86-5.73(m,1H),5.22(s,1H),5.2-4.9(m,6H),4.5-4.98(s,J＝3.5Hz,2H),4.08-3.99(m,4H),3.9-3.88(m,2H),3.84-3.80(m,2H)，3.75(s,6H)，3.73-3.65(m,2H),3.48-3.38(m,1H),3.04-2.99(m,2H),2.95-2.90(m,2H)，2.88-2.84(m,2H)，2.59-2.55(m,2H),2.12(s,6H),2.05-2.01(m,2H),2.00(s,6H),1.88(s,6H),1.77(s,12H)，1.66(s,3H),1.5-1.4(m,2H),1.39-1.3(m,2H),1.29-1.19(m,8H).MS(ESI),m/z:1404.7([M+Na] +).
实施例21化合物A 2-I 2-R 2的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000069
(1)化合物26的合成
以化合物A 2-I 2为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率87.3％。MS(ESI),m/z:1218.4([M+Na] +).
(2)化合物A 2-I 2-R 2的合成
以化合物26为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率84.3％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.41-7.37(d,J＝7.2Hz,2H),7.33-7.28(t,J＝6.9Hz,2H),7.27-7.19(m,5H),6.91-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.86-5.73(m,1H),5.22(s,1H),5.2-4.9(m,6H),4.5-4.98(s,J＝3.5Hz,2H),3.9-3.88(m,2H),3.84-3.80(m,2H)，3.75(s,6H)，3.73-3.65(m,2H),3.48-3.38(m,1H),3.3.16-3.12(m,4H),3.04-2.99(m,2H),2.95-2.90(m,2H)，2.88-2.84(m,2H)，2.59-2.55(m,2H),2.12(s,6H),2.05-2.01(m,2H),2.00(s,6H),1.88(s,6H),1.77(s,12H)，1.66(s,3H),1.5-1.4(m,2H),1.39-1.3(m,2H),1.29-1.19(m,8H).MS(ESI),m/z:1418.7([M+Na] +).
实施例22化合物A 2-I 2-R 3的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000070
(1)化合物27的合成
以化合物A 2-I 2为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率88.0％。MS(ESI),m/z:1230.2([M+Na] +).
(2)化合物A 2-I 2-R 3的合成
以化合物27为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率87.0％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.42-7.37(d,J＝7.2Hz,2H),7.35-7.29(t,J＝6.9Hz,2H)，7.28-7.19(m,5H),6.92-6.86(d,J＝8.2Hz,4H)，5.86-5.73(m,1H),5.22(s,1H),5.2-4.9(m,6H),4.5-4.98(s,J＝3.5Hz,2H),4.08-3.99(m,3H),3.9-3.88(m,2H),3.84-3.80(m,2H),3.74(s,6H),3.73-3.65(m,2H),3.48-3.38(m,1H),3.05-2.99(m,3H)，2.90-2.86(m,4H)，2.77-2.71(m,1H)，2.60-2.56(m,2H)，2.12(s,6H),2.05-2.01(m,2H),2.00(s,6H),1.88(s,6H),1.86-1.81(m,2H)，1.77(s,12H)，1.66(s,3H),1.5-1.4(m,2H),1.39-1.3(m,2H),1.29-1.19(m,8H).MS(ESI),m/z:1430.2([M+Na] +).
实施例23化合物A 3-I 1-R 1的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000071
(1)化合物28的合成
以化合物A 3-I 1为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率88.2％。MS(ESI),m/z:846.3([M+Na] +).
(2)化合物A 3-I 1-R 1的合成
以化合物28为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率84.2％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.61-7.56(d,J＝7.2Hz,1H),7.41-7.37(d,J＝7.2Hz,2H),7.33-7.28(t,J＝6.9Hz,2H),7.27-7.19(m,5H),6.91-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.20(s,1H),4.95(q,J＝4.2Hz,1H),4.51(d,J＝7.2Hz,1H),4.15-3.97(m,4H),3.89–3.79(m,3H),3.75(s,6H),3.73–3.69(m,1H),3.46–3.36(m,1H),3.04-2.99(m,2H)，2.95-2.90(m,2H)，2.88-2.84(m,2H)，2.59-2.54(m,2H)，2.22-2.14(t,J＝7.2Hz，2H)，2.15(s,3H)，2.00(s,3H)，1.95(s,3H)，1.87(s,3H)，1.77(s,12H)，1.59-1.42(m,4H).MS(ESI),m/z:1046.5([M+Na] +).
实施例24化合物A 3-I 1-R 2的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000072
(1)化合物29的合成
以化合物A 3-I 1为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率88.9％。MS(ESI),m/z:860.3([M+Na] +).
(2)化合物A 3-I 1-R 2的合成
以化合物29为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率84.7％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.41-7.37(d,J＝7.2Hz,2H),7.33-7.28(t,J＝6.9Hz,2H),7.27-7.19(m,5H),6.91-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.20(s,1H),4.95(q,J＝4.2Hz,1H),4.51(d,J＝7.2Hz,1H),3.89-3.79(m,3H),3.75(s,6H),3.73-3.69(m,1H),3.46-3.36(m,1H),3.04-2.99(m,2H)，2.95-2.90(m,2H)，2.88-2.84(m,2H)，2.82-2.78(m,4H)，2.59-2.54(m,2H)，2.22-2.14(t,J＝7.2Hz,2H)，2.15(s,3H)，2.00(s,3H)，1.95(s,3H)， 1.87(s,3H)，1.77(s,12H)，1.59–1.42(m,4H).MS(ESI),m/z:1060.5([M+Na] +).
实施例25化合物A 3-I 1-R 3的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000073
(1)化合物30的合成
以化合物A 3-I 1为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率84.3％。MS(ESI),m/z:872.7([M+Na] +).
(2)化合物A 3-I 1-R 3的合成
以化合物30为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率86.2％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.46-7.39(d,J＝7.2Hz,2H),7.37-7.31(t,J＝6.9Hz,2H),7.28-7.19(m,5H),6.92-6.86(d,J＝8.2Hz,4H),5.20(s,1H),4.95(q,J＝4.2Hz,1H),4.51(d,J＝7.2Hz,1H),4.15-3.97(m,3H),3.89-3.79(m,3H),3.76(s,6H),3.72-3.68(m,1H),3.46-3.36(m,1H)，3.05-2.99(m,3H),2.90-2.86(m,2H),2.88-2.84(m,2H)，2.77-2.71(m,1H)，2.59-2.54(m,2H)，2.22-2.14(t,J＝7.2Hz,2H)，2.15(s,3H)，2.00(s,3H)，1.95(s,3H)，1.87(s,3H)，1.86-1.81(m,2H)，1.77(s,12H)，1.59–1.42(m,4H).MS(ESI),m/z:1072.8([M+Na] +).
实施例26化合物A 3-I 2-R 1的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000074
(1)化合物31的合成
以化合物A 3-I 2为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率86.2％。MS(ESI),m/z:916.4([M+Na] +).
(2)化合物A 3-I 2-R 1的合成
以化合物31为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率85.1％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.75-7.71(d,J＝7.2Hz,1H),7.42-7.39(d,J＝7.2Hz,2H),7.32-7.28(t,J＝6.9Hz,2H),7.27-7.19(m,5H),6.91-6.86(d,J＝8.2Hz,4H)，5.22(s,1H),5.02-4.9(m,1H),4.5-4.98(s,J＝3.5Hz,1H),4.05-3.99(m,4H),3.9-3.88(m,1H), 3.84-3.80(m,2H)，3.76(s,6H),3.73-3.65(m,1H),3.48-3.38(m,1H),3.04-2.99(m,2H)，2.95-2.90(m,2H)，2.87-2.84(m,2H)，2.58-2.54(m,2H)，2.12(s,3H),2.05-2.01(m,2H),2.00(s,3H),1.88(s,3H),1.77(s,12H)，1.66(s,3H),1.5-1.4(m,2H),1.39-1.3(m,2H)，1.29-1.19(m,10H).MS(ESI),m/z:1116.6([M+Na] +).
实施例27化合物A 3-I 2-R 2的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000075
(1)化合物32的合成
以化合物A 3-I 2为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率82.9％。MS(ESI),m/z:930.7([M+Na] +).
(2)化合物A 3-I 2-R 2的合成
以化合物32为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率84.3％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.44-7.39(d,J＝7.2Hz,2H),7.32-7.28(t,J＝6.9Hz,2H),7.27-7.19(m,5H),6.91-6.86(d,J＝8.2Hz,4H)，5.22(s,1H),5.02-4.9(m,1H),4.5-4.98(s,J＝3.5Hz,1H),3.9-3.88(m,1H),3.84-3.80(m,2H)，3.76(s,6H),3.73-3.65(m,1H),3.48-3.38(m,1H),3.04-2.99(m,2H)，2.97-2.94(m,2H)，2.93-2.88(m,4H)，2.87-2.84(m,2H)，2.58-2.54(m,2H)，2.12(s,3H),2.05-2.01(m,2H),2.00(s,3H),1.88(s,3H),1.77(s,12H)，1.66(s,3H),1.5-1.4(m,2H),1.39-1.3(m,2H)，1.29-1.19(m,10H).MS(ESI),m/z:1130.6([M+Na] +).
实施例28化合物A 3-I 2-R 3的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000076
(1)化合物33的合成
以化合物A 3-I 2为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率83.8％。MS(ESI),m/z:942.4([M+Na] +).
(2)化合物A 3-I 2-R 3的合成
以化合物33为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率85.2％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.46-7.41(d,J＝7.2Hz,2H),7.37-7.31(t,J＝6.9Hz, 2H),7.28-7.19(m,5H),6.92-6.86(d,J＝8.2Hz,4H)，5.22(s,1H),5.02-4.9(m,1H),4.5-4.98(s,J＝3.5Hz,1H),4.08-3.99(m,3H),3.9-3.88(m,1H),3.84-3.80(m,2H)，3.75(s,6H),3.73-3.65(m,1H),3.48-3.38(m,1H),3.05-3.00(m,3H),2.91-2.86(m,2H)，2.88-2.84(m,2H)，2.77-2.71(m,1H)，2.59-2.54(m,2H)，2.12(s,3H),2.05-2.01(m,2H),2.00(s,3H),1.88(s,3H),1.86-1.81(m,2H)，1.77(s,12H)，1.66(s,3H),1.5-1.4(m,2H)，1.39-1.3(m,2H)，1.29-1.19(m,10H).MS(ESI),m/z:1142.5([M+Na] +).
实施例29化合物A 1-II 1-R 1的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000077
(1)化合物34的合成
250mL圆底烧瓶中，加入化合物N-苄氧羰基--6-氨基己酸(10g，37.69mmol)，1-乙基-(3-二甲基氨基丙基)碳酰二亚胺盐酸盐(EDC.HCL)(8.67g，45.23mmol)，N-羟基琥珀酰亚胺(4.67g，41.46mmol)，二氯甲烷100mL。常温搅拌反应0.5h后加入化合物R’ 1-H(14.8g，37.69mmol)，TLC监测反应，4h后反应完全。反应液依次用饱和碳酸氢钠溶液50mL和饱和食盐水50mL洗涤，有机相无水硫酸钠干燥，浓缩，经硅胶柱(乙酸乙酯：石油醚V:V＝4：1)分离得到白色固体19.8g，产率82.1％。MS(ESI),m/z:663.1([M+Na] +).
(2)化合物35的合成
100mL圆底烧瓶，化合物34(5g，7.8mmmol),Pd/C(0.5g，10％)溶于10mL甲醇和40mL乙酸乙酯中，接入氢气球，TLC监测反应，6h后反应完全。反应液硅藻土过滤，硅藻土甲醇淋洗，滤液减压浓缩旋干，得白色固体3.8g，产率96.1％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.64-7.61(d,J＝7.2Hz,1H),7.43-7.37(d,J＝8.2Hz,2H)，7.33-7.28(t,J＝6.9Hz,2H)，7.27-7.19(m,5H),6.92-6.87(d,J＝8.2Hz,4H)，5.12(m,2H)，4.63-4.58(m,1H)，4.05-3.97(m,1H),3.73(s,6H),3.5-3.42(m,2H),3.04-2.99(m,2H),2.95-2.90(m,2H)，2.12-2.06(m,2H)，1.52-1.45(m,2H)，1.42-1.35(m,2H)，1.28-1.20(m,2H).MS(ESI),m/z:529.3([M+Na] +).
(3)化合物36的合成
250mL圆底烧瓶中，加入化合物A 1-I 1(10g，22.37mmol)，1-乙基-(3-二甲基氨基丙基)碳酰二亚胺盐酸盐(EDC.HCL)(5.15g，26.85mmol)，N-羟基琥珀酰亚胺(2.83g，24.61mmol)，二氯甲烷100mL。常温搅拌反应0.5h后加入化合物35(11.32g，22.37mmol)，TLC监测反应，6h后反应完全。反应液依次用饱和碳酸氢钠溶液50mL和饱和食盐水50mL洗涤，有机相用无水硫酸钠干燥，浓缩，经硅胶柱(二氯甲烷：甲醇V:V＝20：1)分离得到白色固体17.3g，产率82.7％。MS(ESI),m/z:958([M+Na] +).
(4)化合物A 1-II 1-R 1的合成
以化合物36为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率84.7％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.84-7.80(d,J＝7.2Hz,1H),7.72-7.66(m,1H)，7.64-7.61(d,J＝7.2Hz,1H),7.43-7.37(d,J＝8.2Hz,2H)，7.33-7.28(t,J＝6.9Hz,2H)，7.27-7.19(m,5H),6.92-6.87(d,J＝8.2Hz,4H)，5.20(s,1H),5.0-4.95(q,J＝4.2Hz,1H),4.51-4.46(d,J＝7.2Hz,1H),4.15-4.11(m,3H),4.05-3.97(m,1H)，3.89-3.79(m,3H),3.76(s,6H),3.74-3.69(m,1H),3.54-3.49(m,2H)，3.46-3.36(m,1H)，3.04-2.99(m,2H)，2.95-2.90(m,2H)，2.88-2.84(m,2H)，2.59-2.54(m,2H)，2.22-2.14(t,J＝7.2Hz，2H)，2.15(s,3H)，2.12-2.06(m,2H)，2.00(s，3H)，1.95(s，3H)，1.87(s，3H)，1.77(s，12H)，1.59-1.42(m,6H)，1.41-1.35(m,2H)，1.28-1.20(m,2H).MS(ESI),m/z:1158.5([M+Na] +).
实施例30化合物A 1-II 1-R 2的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000078
(1)化合物37的合成
以化合物R’ 2-H为原料，参照化合物34的合成。白色固体，产率84.3％。MS(ESI),m/z:677.5([M+Na] +).
(2)化合物38的合成
以化合物37为原料，参照化合物35的合成。白色固体，产率88.2％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.44-7.38(d,J＝8.2Hz,2H)，7.34-7.29(t,J＝6.9Hz,2H)， 7.28-7.20(m,5H),6.92-6.87(d,J＝8.2Hz,4H)，5.12(m,2H)，4.63-4.58(m,1H)，3.73(s,6H),3.5-3.42(m,2H),3.04-2.99(m,2H)，2.95-2.90(m,2H)，2.88-2.82(m,4H)，2.12-2.06(m,2H)，1.52-1.45(m,2H)，1.42-1.35(m,2H)，1.28-1.20(m,2H).MS(ESI),m/z:543.3([M+Na] +).
(3)化合物39的合成
以化合物38为原料，参照化合物36的合成。白色固体，产率80.7％。MS(ESI),m/z:972.6([M+Na] +).
(4)化合物A 1-II 1-R 2的合成
以化合物39为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率84.1％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.83-7.79(d,J＝7.2Hz,1H),7.72-7.66(m,1H)，7.42-7.36(d,J＝8.2Hz,2H)，7.33-7.28(t,J＝6.9Hz,2H)，7.27-7.19(m,5H),6.92-6.87(d,J＝8.2Hz,4H)，5.20(s,1H),5.0-4.95(q,J＝4.2Hz,1H),4.51-4.46(d,J＝7.2Hz,1H)，4.15-4.10(m,3H)，3.89-3.79(m,3H)，3.76(s,6H),3.74-3.69(m,1H),3.54-3.49(m,2H)，3.46-3.36(m,1H)，3.04-2.99(m,2H)，2.95-2.90(m,2H)，2.88-2.84(m,6H)，2.59-2.54(m,2H)，2.22-2.14(t,J＝7.2Hz,2H)，2.15(s,3H)，2.12-2.06(m,2H)，2.00(s，3H)，1.95(s，3H)，1.87(s，3H)，1.77(s，12H)，1.59-1.42(m，6H)1.41-1.35(m,2H)，1.28-1.20(m,2H).MS(ESI),m/z:1172.7([M+Na] +).
实施例31化合物A 1-III 1-R 1的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000079
(1)化合物40的合成
以化合物35为原料，参照化合物34的合成。白色固体，收率82.6％。MS(ESI),m/z:776.7([M+Na] +).
(2)化合物41的合成
以化合物40为原料，参照化合物35的合成。白色固体，收率96.7％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.71-7.67(m,1H),7.65-7.62(d,J＝7.2Hz,1H),7.45-7.39(d,J＝8.2Hz,2H)，7.34-7.29(t,J＝6.9Hz,2H)，7.26-7.19(m,5H),6.93-6.88(d,J＝8.2Hz,4H)， 5.14(m,2H)，4.64-4.58(m,1H)，4.05-3.98(m,1H),3.72(s,6H),3.5-3.43(m,4H),3.05-2.99(m,2H),2.95-2.90(m,2H)，2.12-2.06(m,4H)，1.52-1.45(m,4H)，1.41-1.35(m,4H)，1.29-1.20(m,4H).MS(ESI),m/z:642.3([M+Na] +).
(3)化合物42的合成
以化合物41为原料，参照化合物36的合成。白色固体，收率86.3％。MS(ESI),m/z:1071.4([M+Na] +).
(4)化合物A 1-III 1-R 1的合成
以化合物42为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。白色固体，产率84.1％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.85-7.81(d,J＝7.2Hz,1H),7.78-7.74(m,1H),7.72-7.66(m,1H)，7.65-7.61(d,J＝7.2Hz,1H),7.42-7.38(d,J＝8.2Hz,2H)，7.34-7.29(t,J＝6.9Hz,2H)，7.27-7.18(m,5H),6.93-6.87(d,J＝8.2Hz,4H)，5.22(s,1H),5.0-4.96(q,J＝4.2Hz,1H),4.51-4.46(d,J＝7.2Hz,1H),4.15-4.11(m,3H),4.05-3.97(m,1H)，3.89-3.79(m,3H),3.76(s,6H),3.74-3.69(m,1H),3.54-3.49(m,4H)，3.46-3.36(m,1H)，3.04-2.99(m,2H)，2.95-2.90(m,2H)，2.88-2.84(m,2H)，2.59-2.54(m,2H)，2.22-2.14(t,J＝7.2Hz，2H)，2.15(s,3H)，2.12-2.06(m,4H)，2.00(s，3H)，1.95(s，3H)，1.87(s，3H)，1.77(s，12H)，1.59-1.42(m,8H)，1.41-1.35(m,4H)，1.28-1.20(m,4H).MS(ESI),m/z:1271.2([M+Na] +).
实施例32化合物A 1-IV 1-R 1的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000080
(1)化合物43的合成
以化合物A 1-III 1为原料，参照化合物16的合成。白色固体，产率82.8％。MS(ESI),m/z:877.4([M+Na] +).
(2)化合物A 1-III 1-R 1的合成
以化合物40为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。产率82.9％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.76-7.72(d,J＝8.9Hz,1H)，7.70-7.66(d,J＝8.0Hz,1H)，7.40-7.36(d,J＝7.2Hz,2H),7.32-7.28(t,J＝6.9Hz,2H)，7.27-7.19(m,5H)，6.91-6.86(d,J＝8.2Hz,4H，5.21(s,1H),5.0-4.96(q,J＝4.2Hz,1H)，4.45-4.51(d,J＝7.2Hz,1H)，4.12-4.07(m,3H)，4.05-3.97(m,1H),3.88-3.78(m,3H)，3.74(s,6H)，3.72-3.68(m，2H)，3.62-3.58(m， 2H)，3.56-3.46(m,4H)，3.04-2.99(m,2H)，2.95-2.90(m,2H)，2.89-2.85(m,2H)，2.58-2.53(m,2H)，2.15(s，3H)，2.00(s，3H)，1.95(s，3H)，1.88(s，3H)，1.76(s,12H).MS(ESI),m/z:502.6([M+1] +). 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：MS(ESI),m/z:1077.3([M+Na] +).
实施例33化合物A 1-V 1-R 4的合成
Figure PCTCN2017118591-appb-000081
(1)化合物44的合成
250mL圆底烧瓶，化合物6(5g，15.2mmol)，1，6-己二醇(9g，76mmol)溶于无水1，2－二氯乙烷100mL中，搅拌30分钟后加入三氟甲磺酸三甲基硅酯(0.55mL,3mmol)，常温过反应过夜，反应液二氯甲烷萃取，有机相用饱和碳酸氢钠溶液80mL洗涤两遍，无水硫酸钠干燥，减压浓缩，经硅胶柱(石油醚：乙酸乙酯V:V＝3：2)分离得到透明油状液体5.86g，产率86.2％。MS(ESI),m/z:470.2([M+Na] +).
(2)化合物A 1-V 1-R 4的合成
以化合物41为原料，参照化合物A 1-I 1-R 1的合成。产率84.1％。 1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ：7.80-7.75(d,J＝8.9Hz,1H),5.21(s,1H),5.02-4.95(q,J＝4.2Hz,1H),4.50-4.76(d,J＝7.2Hz,1H),4.12-4.07(m,3H),3.88-3.79(m,3H),3.80-3.69(m,2H),3.46-3.36(m,2H)，2.88-2.84(m,2H)，2.59-2.54(m,2H),2.23-2.28(m，2H)，2.22-2.14(m，2H)，2.15(s，3H)，2.00(s，3H)，1.95(s，3H)，1.87(s，3H)，1.79(s,12H)，1.58-1.42(m，4H).MS(ESI),m/z:870.5([M+Na] +).
实施例34制备修饰的单链寡核苷酸
本实施例中，修饰寡聚核苷酸按照理论产量1μmol规格合成，过程如下：
(1)称取1μmol规格通用固相支持物CPG或3’-胆固醇修饰CPG(购置于Chemgenes)，2’-O-TBDMS保护RNA亚磷酰胺的单体、DNA单体、2’-甲氧基单体、2’-氟单体(购置于Sigma Aldrich)溶解于无水乙腈溶液中使其浓度达到0.2M。对于磷酸骨架硫代修饰的寡聚核苷酸以0.2M PADS溶液作为硫代试剂。配制5-乙硫基-1H-四唑(购置于Chemgenes)乙腈溶液作为活化剂(0.25M)，配制0.02M碘的吡啶/水溶 液作为氧化剂，以及3％三氯乙酸二氯甲烷溶液作为脱保护试剂，放置于ABI 394型号DNA/RNA自动合成仪对应的试剂指定位置。
(2)设置合成程序，输入指定的寡聚核苷酸碱基序列，检查无误后，开始循环寡聚核苷酸合成，每步偶合时间6分钟，半乳糖配体对应单体(A x-linker-R x化合物)偶合时间10-20分钟。经自动循环后，完成寡核苷酸固相合成。
(3)以干燥氮气吹干CPG，转移到5mL EP管中，加入氨水/乙醇溶液(3/1)2mL，55℃加热16～18小时。在10000rpm的转速下离心10min取上清液，抽干浓氨水/乙醇后得到白色胶状固体。固体溶于200μL 1M TBAF THF溶液，室温震荡20小时。加入0.5mL 1M Tris-HCl缓冲液(pH 7.4)，室温震荡15分钟，置于离心抽干机抽至体积为原体积1/2，除去THF。溶液用0.5mL氯仿萃取2次，加入1mL 0.1M TEAA上样液，将混合溶液倒入固相萃取柱，除去溶液中过量盐。
(4)所得寡聚核苷酸浓度由微量紫外分光光度计(KO5500)测定含量。在Oligo HTCS LC-MS system(Novatia)系统上，完成质谱检测分析。以一级扫描后以Promass软件归一化计算核酸分子量。
实施例35制备修饰的单链寡核苷酸
本实施例中，修饰寡核苷酸按照理论产量1μmol的规格合成，过程如下：
(1)称取1μmol规格通用固相支持物CPG或3’-胆固醇修饰CPG(购置于Chemgenes)，DNA单体、2’-甲氧基单体、2’-氟单体(购置于Sigma Aldrich)溶解于无水乙腈溶液中使其浓度达到0.2M。对于磷酸骨架硫代修饰的寡聚核苷酸以0.2M PADS溶液作为硫代试剂。配制5-乙硫基-1H-四唑(购置于Chemgenes)乙腈溶液作为活化剂(0.25M)，配制0.02M碘的吡啶/水溶液作为氧化剂，以及3％三氯乙酸二氯甲烷溶液作为脱保护试剂，放置于ABI 394型号DNA/RNA自动合成仪对应的试剂指定位置。
(2)设置合成程序，输入指定的寡聚核苷酸碱基序列，检查无误后，开始循环寡聚核苷酸合成，每步偶合时间6分钟，半乳糖配体(A x-linker-R x化合物)对应单体偶合时间6-10分钟。经自动循环后，完成寡核苷酸固相合成。
(3)以干燥氮气吹干CPG，转移到5mL EP管中，加入氨水溶液2mL，55℃加热16～18小时。在10000rpm的转速下离心10min取上清液，抽干浓氨水/乙醇后得到白色或黄色胶状固体。加入1mL 0.1M TEAA上样液，将混合溶液倒入固相萃取 柱，除去溶液中过量盐。
(4)所得寡聚核苷酸浓度由微量紫外分光光度计(KO5500)测定含量。在Oligo HTCS LC-MS system(Novatia)系统上，完成质谱检测分析。以一级扫描后以Promass软件归一化计算核酸分子量。
实施例36制备修饰的双链寡核苷酸
过程如下：完成修饰的单链寡核苷酸的制备后，按照紫外吸收含量1：1混合，加热至95℃三分钟后，冷却至室温，形成双链。
实施例34-36中，对于粗品纯度低于50％的修饰寡核苷酸，以DNAPAc PA-100离子交换柱线性梯度纯化，流动相A：20mM NaOH；流动相B：20mM NaOH+2M NaCl混合液。
示例性的修饰寡核苷酸的序列以及对应分子量检测结果见表1。
缩写说明：N＝RNA；dN＝DNA；mN＝2'OMe修饰；fN＝2'F修饰。
表1
Figure PCTCN2017118591-appb-000082
Figure PCTCN2017118591-appb-000083
实施例37修饰寡核苷酸的细胞靶向性检测。
动物实验用的修饰寡核苷酸，注射前经0.22μm膜过滤处理。
1、小鼠原代肝细胞分离
麻醉小鼠，剪开皮肤和肌肉层，暴露肝脏，将灌注导管插入门静脉，下腔静脉剪开小口，准备肝脏灌注。40℃预热perfusion Solution I(Hank’s，0.5mM EGTA，pH 8)和perfusion Solution II(Low-glucose DMEM，100U/mL Type IV，pH 7.4)，37℃perfusion Solution I沿门静脉插管灌注肝脏，流速7mL/min，灌注5min，肝脏变灰白色为止。接着用37℃perfusion Solution II灌注肝脏，流速7mL/min，灌注7min。灌注完成后，取下肝脏置于Solution III(10％FBS low-glucose DMEM，4℃)终止消化，镊子划破肝脏包膜，轻轻抖动释放肝细胞。用70μm细胞滤器过滤肝细胞，50g离心2min后弃上清。用Solution IV(40％percoll low-glucose DMEM，4℃)重悬细胞，100g离心2min后弃上清。加入2％FBS low-glucose DMEM重悬细胞，备用。台盼蓝染色鉴定细胞活力。
2、测定GalNAc结合曲线和Kd值
将新鲜分离的小鼠原代肝细胞铺到96孔板中，2×10 4个/孔，100μL/孔。每孔分别加GalNAc-siRNA。每条GalNAc-siRNA设置终浓度为0.9nM、2.7nM、8.3nM、25nM、50nM或100nM。4℃孵育2h后50g离心2min，弃上清。10μg/mL PI重悬细胞，染色10min后50g离心2min。用预冷的PBS洗细胞，50g离心2min后弃上清。PBS重悬细胞。流式细胞仪测定活细胞平均荧光强度MFI(Mean Fluorescence Intensity)，GraphPad Prism 5软件进行非线性拟合及解离常数K d值计算。结果如表2、表3和图1所示。数据表明，GalNAc-siRNA能特异靶向肝细胞；其GalNAc配体与细胞受体的Kd值为7.6-53.4nM之间，与现有技术(PCT/US2014/046425)优选的半乳糖配体相比具有相当的高亲和力(Ki值5.2-51.3nM)，不同缀合物结构的GalNAc-siRNA呈现出的与受体结合能力有一定的差异，A3、A4结构呈现出相对较强的受体亲和力(Kd值越小，亲和力越大)。
表2.各实验组K d值(nM)和B max值
Figure PCTCN2017118591-appb-000084
表3.各实验组K d值(nM)和B max值
组别 P8G8-C3 P8G8-D3 P8G8-E3 P8G8-F3 P8G8-G3 P8G8-H2I P9G20-A3
B max 197556 163439 169699 164021 176761 138114 170152
K d 12.26 17.56 14.90 18.54 17.87 8.89 9.87
实施例38体内肝脏靶向性试验
试验采用雄性、6～7周周龄的SPF级Balb/c-nu小鼠13只(购自北京维通利华实验动物有限公司)，随机分成4组，空白对照组、P8G8对照组(未缀合配体)、P8G8-A3组、P8G8-B3组。各组动物数分别为2、3、4、4只，尾静脉注射给药，给药剂量约为10mg/kg(实验设计见表4)。药前、给药后15min、30min、1h、2h、4h、6h对所有动物进行活体成像，包括白光和X光成像。药后6小时安乐死后，取出脑、唾液腺、心脏、脾脏、肺脏、肝脏、肾脏和肠道进行离体器官成像。
表4.肝靶向实验设计
序号 组别 供试品 给药剂量(mg/kg) 给药体积(mL)
1 空白对照组 生理盐水 0 0.2
2 NC1 P8G8 10 0.2
3 阳性组 P8G8-A3 10 0.2
4 阳性组 P8G8-B3 10 0.2
离体成像分析(表5-表6)结果显示，给药后6小时，P8G8-A3组、P8G8-B3组肝脏的荧光强度均高于阴性对照组。结果表明，P8G8-A3、P8G8-B3对肝脏均有一定靶向性。
表5.扣除背景后离体器官荧光强度值统计结果(×10 8ps/mm 2)
Figure PCTCN2017118591-appb-000085
Figure PCTCN2017118591-appb-000086
表6.荧光强度比值结果
  唾液腺 肝脏 肾脏 肠道
P8G8-A3/P8G8 1.05 3.50 1.12 1.19
P8G8-B3/P8G8 1.10 2.88 0.92 1.30
尽管本发明的具体实施方式已经得到详细的描述，但本领域技术人员将理解：根据已经公开的所有教导，可以对细节进行各种修改和变动，并且这些改变均在本发明的保护范围之内。本发明的全部范围由所附权利要求及其任何等同物给出。

Claims (31)

  1. 包含寡核苷酸和缀合物基团的化合物，其通式为
    Figure PCTCN2017118591-appb-100001
    其中，PN为寡核苷酸，Y选自1-10之间的整数，X选自0-10之间的整数，M T选自如式(1)、式(2)、式(3)和式(4)所示的缀合物基团，当X不为0时，X个M各自独立地选自如式(1’)、式(2’)和式(3’)所示的缀合物基团，
    Figure PCTCN2017118591-appb-100002
    其中，A x为配体，linker为连接臂，Q为羟基或修饰物。
  2. 权利要求1的化合物，式(1)-式(4)、式(1’)-式(3’)所示的缀合物基团中，A x各自独立地为人去唾液酸糖蛋白受体(ASGPR)的配体；
    优选地，式(1)-式(4)、式(1’)-式(3’)所示的缀合物基团中，A x各自独立地选自半乳糖、乙酰氨基半乳糖、含半乳糖的多糖、含乙酰氨基半乳糖的多糖、半乳糖衍生物(例如半乳糖的酯，例如半乳糖乙酸酯)或乙酰氨基半乳糖衍生物(例如乙酰氨基 半乳糖的酯，例如乙酰氨基半乳糖乙酸酯)；
    任选地，A x上还各自独立地带有修饰基团，例如羰基烷基或酯基烷基，所述烷基优选为C 1-6烷基或C 6-12烷基；
    优选地，A x选自：
    Figure PCTCN2017118591-appb-100003
  3. 权利要求1或2的化合物，式(1)-式(4)、式(1’)-式(3’)所示的缀合物基团中，linker的结构各自独立地如式(i)、式(ii)、式(iii)、式(iv)或式(v)所示：
    Figure PCTCN2017118591-appb-100004
    其中，n选自1-10之间的整数，优选地，n为1或6；
    Figure PCTCN2017118591-appb-100005
    其中，n 1和n 2各自独立地选自1-10之间的整数，优选地，n 1为1，优选地，n 2为4；
    Figure PCTCN2017118591-appb-100006
    其中，n 1、n 2、n 3各自独立地选自1-10之间的整数，优选地，n 1为1，优选地，n 2为3，优选地，n 3为4；
    Figure PCTCN2017118591-appb-100007
    其中，n选自1-10之间的整数，优选地，n为1；
    Figure PCTCN2017118591-appb-100008
    其中，n选自1-10之间的整数，优选地，n为4。
  4. 权利要求1-3任一项的化合物，式(1)或式(1’)所示的缀合物基团中，
    A x各自独立地选自A 1、A 2、A 3、A 1’、A 2’或A 3’，linker的结构如式(i)所示；或者
    A x各自独立地选自A 1或A 1’，linker的结构如式(ii)所示；或者
    A x各自独立地选自A 1或A 1’，linker的结构如式(iii)所示，或者
    A x各自独立地选自A 1或A 1’，linker的结构如式(iv)所示。
  5. 权利要求1-3任一项的化合物，式(2)或式(2’)所示的缀合物基团中，
    A x各自独立地选自A 1、A 2、A 3、A 1’、A 2’或A 3’，linker的结构如式(i)所示；或者
    A x各自独立地选自A 1或A 1’，linker的结构如式(ii)所示。
  6. 权利要求1-3任一项的化合物，式(3)或式(3’)所示的缀合物基团中，A x各自独立地选自为A 1、A 2、A 3、A 1’、A 2’或A 3’，linker的结构如式(i)所示。
  7. 权利要求1-3任一项的化合物，式(4)所示的缀合物基团中，A x为A 1或A 1’，linker的结构如式(v)所示。
  8. 权利要求1-7任一项的化合物，式(1)-式(3)、式(1’)-式(3’)所示的缀合物基团中，Q选自：胆固醇及其衍生物、聚乙二醇、荧光探针、生物素、多肽、维生素、组织靶向性分子。
  9. 权利要求1-8任一项的化合物，其中，所述寡核苷酸为单链寡核苷酸或双链寡核苷酸；
    优选地，所述寡核苷酸包含一个或多个经过修饰的核苷酸；
    优选地，所述一个或多个经过修饰的核苷酸各自独立地选自：2′-甲氧基乙基修饰核苷酸、2′-O-烷基修饰核苷酸(例如2′-O-甲基修饰核苷酸)、2′-O-烯丙基修饰核苷酸、2′-C-烯丙基修饰核苷酸、2′-氟修饰核苷酸、2′-脱氧修饰核苷酸、2’-羟基修饰核苷酸、锁核苷酸、解锁核酸、己糖醇核酸；
    优选地，所述经过修饰的核苷酸选自2′-O-烷基修饰核苷酸、2′-氟修饰核苷酸；
    优选地，所述寡核苷酸带有末端修饰物，优选地，所述末端修饰物选自：胆固醇、聚乙二醇、荧光探针、生物素、多肽、维生素、组织靶向性分子及其任意组合；
    优选地，所述寡核苷酸的含磷酸骨架经过修饰，优选地，所述修饰为硫代修饰；
    优选地，所述寡核苷酸为siRNA；
    优选地，所述siRNA包括互补形成双链的正义链和反义链；
    优选地，所述siRNA包含如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4所示的序列。
  10. 权利要求1-9任一项的化合物，其中，
    Figure PCTCN2017118591-appb-100009
    各自独立地与所述寡核苷酸中任一条链的3’末端、5’末端或序列中间相连接；
    优选地，
    Figure PCTCN2017118591-appb-100010
    通过磷酸三酯键与寡核苷酸相连接；
    优选地，M与M T之间或者M与M之间通过磷酸三酯键相连接。
  11. 权利要求1-10任一项的化合物，其中，所述寡核苷酸为单链寡核苷酸；
    优选地，Y为1，
    Figure PCTCN2017118591-appb-100011
    与所述寡核苷酸的3’末端或5’末端相连接；
    优选地，Y为2，2个
    Figure PCTCN2017118591-appb-100012
    各自与所述寡核苷酸的3’末端和5’末端相连接。
  12. 权利要求1-10任一项的化合物，其中，所述寡核苷酸为双链寡核苷酸；
    优选地，Y为1，
    Figure PCTCN2017118591-appb-100013
    与所述寡核苷酸中的任一条链的3’末端或5’末端相连接；
    优选地，Y为2，2个
    Figure PCTCN2017118591-appb-100014
    各自与所述寡核苷酸中的同一条链的3’末端和5’末端相连接；
    优选地，Y为2，2个
    Figure PCTCN2017118591-appb-100015
    各自与所述寡核苷酸中的两条链的3’末端相连接；
    优选地，Y为2，2个
    Figure PCTCN2017118591-appb-100016
    各自与所述寡核苷酸中的两条链的5’末端相连接；
    优选地，Y为3，3个
    Figure PCTCN2017118591-appb-100017
    中，有两个各自与所述寡核苷酸中的同一条链的3’末端和5’末端相连接，第三个与另一条链的3’末端或5’末端相连接；
    优选地，Y为4，4个
    Figure PCTCN2017118591-appb-100018
    各自与所述寡核苷酸中两条链的3’末端和5’末端相连接。
  13. 权利要求1-12任一项的化合物，其中，X不为0，M T与至少一个M具有相同的A x和/或linker结构；
    优选地，X大于1，X个M具有相同或不同的结构；
    优选地，Y大于1，Y个
    Figure PCTCN2017118591-appb-100019
    具有相同或不同的结构。
  14. 权利要求1-13任一项的化合物，其中，Y为1，X为0，并且所述化合物具有以下特征中的一个：
    (1)M T的结构如式(1)所示，A x为A 1’、A 2’或A 3’，linker的结构如式(i)所示；
    (2)M T的结构如式(1)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(ii)所示；
    (3)M T的结构如式(1)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(iii)所示；
    (4)M T的结构如式(1)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(iv)所示；
    (5)M T的结构如式(2)所示，A x为A 1’、A 2’或A 3’，linker的结构如式(i)所示；
    (6)M T的结构如式(2)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(ii)所示；
    (7)M T的结构如式(3)所示，A x为A 1’、A 2’或A 3’，linker的结构如式(i)所示；
    (8)M T的结构如式(4)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(v)所示；
    (9)M T的结构如式(2)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(iii)所示；
    优选地，如式(i)所示的linker中，n为1或6；
    优选地，如式(ii)所示的linker中，n 1为1，且n 2为4；
    优选地，如式(iii)所示的linker中，n 1为1，n 2为3，且n 3为4；
    优选地，如式(iv)所示的linker中，n为1。
  15. 权利要求1-13任一项的化合物，其中，Y为1，X为1、2或3，当X为2或3时，各个M具有相同的结构，并且所述化合物具有以下特征中的一个：
    (1)M的结构如式(1’)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(i)所示；M T的结构如式(1)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(i)所示；
    (2)M的结构如式(1’)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(ii)所示；M T的结构如式(1)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(ii)所示；
    (3)M的结构如式(1’)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(iii)所示；M T的结构如式(1)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(iii)所示；
    (4)M的结构如式(2’)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(i)所示；M T的结构如式(2)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(i)所示；
    (5)M的结构如式(1’)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(ii)所示；M T的结构如式(1)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(ii)所示；
    (6)M的结构如式(1’)所示，A x为A 3’，linker的结构如式(ii)所示；M T的结构如式(1)所示，A x为A 3’，linker的结构如式(ii)所示；
    优选地，所述如式(i)所示的linker中，n为1或6；
    优选地，如式(ii)所示的linker中，n 1为1，且n 2为4；
    优选地，如式(iii)所示的linker中，n 1为1，n 2为3，且n 3为4。
  16. 权利要求1-13任一项的化合物，其中，Y为1，X为2，两个M的结构相同，如式(1’)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(iv)所示；MT的结构如式(4)所示，A x为A 1’，linker的结构如式(v)所示；
    优选地，如式(iv)所示的linker中，n为1。
  17. 权利要求1-16任一项的化合物，所述化合物选自：
    Figure PCTCN2017118591-appb-100020
    Figure PCTCN2017118591-appb-100021
    Figure PCTCN2017118591-appb-100022
    其中，n 1、n 2、n 3和n各自独立地选自1-10之间的整数。
  18. 通式为A x-linker-R 1的化合物，其中，A x为配体，linker为连接臂，R1为
    Figure PCTCN2017118591-appb-100023
    其中，Z为羟基的保护基，优选为4,4-二甲氧基三苯甲烷基(DMTr)或4-甲氧基三苯基氯甲烷基(MMT)。
  19. 通式为A x-linker-R 2的化合物，其中，A x为配体，linker为连接臂，R2为
    Figure PCTCN2017118591-appb-100024
    其中，m 1和m 2各自独立地选自1-10之间的整数，Z为羟基的保护基，优选为4,4-二甲氧基三苯甲烷基(DMTr)或4-甲氧基三苯基氯甲烷基(MMT)。
  20. 通式为A x-linker-R 3的化合物，其中，A x为配体，linker为连接臂，R3为
    Figure PCTCN2017118591-appb-100025
  21. 通式为A x-linker-R 4的化合物，其中，A x为配体，linker为连接臂，R4为
    Figure PCTCN2017118591-appb-100026
  22. 权利要求18-21任一项的化合物，其中，A x为人去唾液酸糖蛋白受体(ASGPR)的配体；
    优选地，A x为半乳糖、乙酰氨基半乳糖、含半乳糖的多糖、含乙酰氨基半乳糖的多糖、半乳糖衍生物(例如半乳糖的酯，例如半乳糖乙酸酯)或乙酰氨基半乳糖衍生物(例如乙酰氨基半乳糖的酯，例如乙酰氨基半乳糖乙酸酯)；
    任选地，A x上还各自独立地带有修饰基团，例如羰基烷基或酯基烷基，所述烷基优选为C 1-6烷基或C 6-12烷基；
    优选地，A x选自：
    Figure PCTCN2017118591-appb-100027
  23. 权利要求18-22任一项的化合物，其中，linker的结构如式(i)、式(ii)、式(iii)、式(iv)或式(v)所示：
    Figure PCTCN2017118591-appb-100028
    其中，n选自1-10之间的整数，优选地，n为1或6；
    Figure PCTCN2017118591-appb-100029
    其中，n 1和n 2各自独立地选自1-10之间的整数，优选地，n 1为1，优选地，n 2为4；
    Figure PCTCN2017118591-appb-100030
    其中，n 1、n 2、n 3各自独立地选自1-10之间的整数，优选地，n 1为1，优选地，n 2为3，优选地，n 3为4；
    Figure PCTCN2017118591-appb-100031
    其中，n选自1-10之间的整数，优选地，n为1；
    Figure PCTCN2017118591-appb-100032
    其中，n选自1-10之间的整数，优选地，n为4。
  24. 权利要求18、22和23任一项的化合物，所述化合物具有以下特征中的一个：
    (1)Ax为A1、A2或A3，linker的结构如式(i)所示；
    (2)Ax为A1，linker的结构如式(ii)所示；
    (3)Ax为A1，linker的结构如式(iii)所示；
    (4)Ax为A1，linker的结构如式(iv)所示；
    优选地，如式(i)所示的linker中，n为1或6；
    优选地，如式(ii)所示的linker中，n 1为1，且n 2为4；
    优选地，如式(iii)所示的linker中，n 1为1，n 2为3，且n 3为4；
    优选地，如式(iv)所示的linker中，n为1；
    优选地，所述化合物选自：
    Figure PCTCN2017118591-appb-100033
    其中，n选自1-10之间的整数，
    Figure PCTCN2017118591-appb-100034
    其中，n 1和n 2各自独立地选自1-10之间的整数，
    Figure PCTCN2017118591-appb-100035
    其中，n 1、n 2、n 3各自独立地选自1-10之间的整数。
  25. 权利要求19、22和23任一项的化合物，所述化合物具有以下特征中的一个：
    (1)Ax为A1、A2或A3，linker的结构如式(i)所示；
    (2)Ax为A1，linker的结构如式(ii)所示；
    优选地，如式(i)所示的linker中，n为1或6；
    优选地，如式(ii)所示的linker中，n 1为1，且n 2为4；
    优选地，所述化合物选自：
    Figure PCTCN2017118591-appb-100036
    其中，n、m 1、m 2各自独立地选自1-10之间的整数，
    Figure PCTCN2017118591-appb-100037
    其中，n 1、n 2、m 1、m 2各自独立地选自1-10之间的整数，
    Figure PCTCN2017118591-appb-100038
    其中，n 1、n 2、n 3、m 1、m 2各自独立地选自1-10之间的整数。
  26. 权利要求20、22和23任一项的化合物，其中，Ax为A1、A2或A3，linker的结构如式(i)所示；
    优选地，如式(i)所示的linker中，n为1或6。
  27. 权利要求21、22和23任一项的化合物，其中，Ax为A1，linker的结构如式(v)所示；
    优选地，如式(v)所示的linker中，n为4。
  28. 对寡核苷酸进行修饰的方法，包括将一个或多个化合物连接到寡核苷酸上，所述一个或多个化合物各自独立地选自权利要求18-27任一项的化合物；
    优选地，所述方法中，通过所述化合物上的
    Figure PCTCN2017118591-appb-100039
    发生化学反应实现连接；
    优选地，所述寡核苷酸如权利要求9所定义；
    优选地，所述方法用于固相合成。
  29. 对寡核苷酸进行修饰的方法，包括以下步骤：
    步骤(1)：提供寡核苷酸，并将第一化合物连接到寡核苷酸上，得到包含缀合物M的寡核苷酸，所述第一化合物选自权利要求18-20、22-26任一项定义的化合物，
    步骤(2)：将第二化合物连接到前一步骤形成的缀合物M上，所述第二化合物选自权利要求18-27任一项的化合物；
    任选地，所述方法还包括步骤(3)：重复步骤(2)一次或多次(例如2-9次)；
    任选地，所述方法还包括步骤(4)：重复步骤(1)、步骤(2)和步骤(3)一次 或多次(例如2-9次)；
    优选地，所述步骤(1)和(2)中，通过第一化合物或第二化合物上的
    Figure PCTCN2017118591-appb-100040
    发生化学反应实现连接；
    优选地，所述寡核苷酸如权利要求9所定义；
    优选地，所述方法用于固相合成。
  30. 一种试剂盒，其包含权利要求18-27任一项的化合物；
    优选地，所述试剂盒还包含用于合成和/或修饰寡核苷酸的试剂。
  31. 一种药物组合物，其包含权利要求1-17任一项的化合物，以及任选的药学上可接受的载体；
    优选地，所述药物组合物用于预防和/或治疗受试者中与肝脏相关的疾病；
    优选地，所述与肝脏相关的疾病选自：遗传性血管水肿、I型家族性酪氨酸血症、Alagille综合征、α-1-抗胰蛋白酶缺乏症、胆汁酸合成和代谢缺陷、胆道闭锁、囊性纤维化肝病、特发性新生儿肝炎、线粒体肝病、进行性家族性肝内胆汁郁积、原发性硬化性胆管炎、转甲状腺素蛋白淀粉样变性病、血友病、纯合性家族性高胆固醇血症、高血脂症、脂肪性肝炎、非酒精性脂肪性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、高血糖症和牵涉与II型糖尿病类似的异常增高的肝葡萄糖生成的疾病、肝炎、肝性卟啉。
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