WO2020025679A1 - Vorrichtung und verfahren zur optischen charakterisierung von fluiden und/oder darin eingeschlossener objekte in mikrokanälen - Google Patents

Vorrichtung und verfahren zur optischen charakterisierung von fluiden und/oder darin eingeschlossener objekte in mikrokanälen Download PDF

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microscope
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Karen Lemke
Robert Römer
Andreas Grodrian
Stefan Wiedemeier
Danny ECHTERMEYER
Gunter Gastrock
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Definitions

  • the invention relates to a device for the optical characterization of fluids and / or objects enclosed therein in a microchannel, comprising a measuring cell, the microchannel being guided through the measuring cell, characterized in that the measuring cell is filled with a liquid, the microchannel within the measuring cell is in the liquid, the fluid and / or objects enclosed therein can be moved in the microchannel and the microchannel can be moved manually or automatically within the measuring cell and / or the measuring cell with the microchannel.
  • the invention further relates to a measuring cell for the device and method for the optical characterization of fluids and / or objects enclosed therein in a microchannel by means of the device according to the invention.
  • microfluidic processes based on microfluidic principles have established themselves extensively in the laboratory.
  • the advantages include a lower consumption of reagents and sample materials per test batch while increasing the number of test batches that can be carried out simultaneously.
  • An example of this are wells from microtiter plates, in which up to 1536 parallel measurements are possible per plate.
  • so-called “drop-based” microfluidic processes are increasingly used. for biological and biomedical applications.
  • pbb pipe based bioreactors
  • pbb pipe based bioreactors
  • It is a modular cell cultivation system based on the principle of drop-based or compartment-based microfluidics and is designed for medium to high throughputs.
  • a microchannel formed here by a tube
  • drops which consist of biological media with cells inside.
  • Each drop can be viewed as a “microbioreactor”.
  • the generally aqueous drops are separated with a water-immiscible fluid, for example an oil.
  • the hose is made of polytetrafluoroethylene (PTFE) or fluoroethylene propylene (FEP) and has a length of several meters, is wound on a disc and holds a large number of drops.
  • the tubular disc with the drops in it can be cultivated in the incubator for up to several weeks, with the cells in the drops being detected at certain intervals. In the simplest case, the tube disk is removed from the incubator and microscoped.
  • Polymer chips are generally suitable for transmitted light and epifluorescence microscopy, but not for special processes such as light sheet microscopy, in which the excitation light (laser light sheet) is coupled in perpendicular to the direction of the detection objective.
  • Another challenge is the exact positioning of the drops in the tube in the beam path of the optical image of a microscope.
  • the droplets in the hose are generally transported by means of syringe pumps or pressure-driven pumps.
  • Syringe pumps must build up a minimum pressure to move the compartments, which depends on the back pressure in the hose, which in turn depends on its length and the number of drops in the hose. When this minimum pressure is reached, the drops begin to move and a constant pressure value is set. Precise stopping of the moving drops for the purpose of positioning a drop in the optical path of the optical image is not possible due to a pressure hysteresis, i.e. the drop sequence will continue to run until constant pressure conditions have been established in the tube again. The use of syringe pumps for the exact positioning of the drops is therefore ruled out.
  • the object of the invention is therefore to overcome the disadvantages of the prior art and to develop devices and methods which enable improved optical detection (microscopy, spectroscopy) of the samples located in a microchannel.
  • the invention provides a device for the optical characterization of fluids and / or objects enclosed therein in a microchannel, comprising a measuring cell, a microchannel being guided through the measuring cell, characterized in that the measuring cell is filled with a liquid, the microchannel is in the liquid within the measuring cell, the fluid in the microchannel and / or objects enclosed therein can be moved in the microchannel, and the microchannel within the measuring cell and / or the measuring cell with the microchannel can be moved manually or automatically.
  • the liquid with which the measuring cell is filled is selected from an aqueous or a non-aqueous liquid.
  • the liquid with which the measuring cell is filled is an aqueous liquid, particularly preferably water, for example tap water, distilled water or deionized water, or water with specific properties such as buffer or cell culture medium.
  • the liquid with which the measuring cell is filled is a non-aqueous liquid, preferably an oil. It is particularly preferred if the measuring cell is filled with perfluorodecalin (PFD).
  • PFD perfluorodecalin
  • the refractive indices of the liquid with which the measuring cell is filled and of the fluid, located in the microchannel and similar to the material from which the wall of the microchannel is made ie are comparable.
  • the microchannel is preferably a tube made of PTFE or FEP, since these materials have a refractive index similar to the refractive index of water (see Table 1) and have hydrophobic surface properties. It is particularly preferred if the hose consists of FEP, since FEP has better optical properties, better transparency and better surface topography than PTFE.
  • the microchannel of the device according to the invention has an inner diameter between 50 pm and 2400 pm, preferably between 100 pm and 1800 pm, particularly preferably between 250 pm and 1200 pm, particularly preferably between 500 pm and 1000 pm.
  • the fluid that is in the microchannel is a liquid and preferably two-phase and consists of serially arranged drops, which consist of biological media with cells, tissue fragments or 3D cell structures such as spheroids located therein. Each drop can be viewed as a “microbioreactor”.
  • the aqueous drops are separated with a water-immiscible liquid, for example an oil.
  • the fluid located in the microchannel is a single-phase liquid, such as, for example, a nutrient medium, a buffer solution, saline or the like, with cells, tissue fragments or 3D cell structures located therein, no drop separation by an oil or something similar.
  • the fluid in the microchannel is a multiphase liquid, comprising serially arranged drops in an oil or an organic liquid, which consists of biological media with cells, tissue fragments or 3D cell structures such as spheroids therein , consist.
  • Each drop can be viewed as a “microbioreactor”.
  • the aqueous drops are separated with a water-immiscible liquid, for example an oil or an organic liquid.
  • At least one further non-aqueous phase can be located within the aqueous drops, such as, for example, at least one oil drop and / or at least one gas bubble and / or at least one compartment from an organic liquid and / or at least one gel-like compartment.
  • a gas bubble can also be positioned between two aqueous drops, for example to serve as an additional gas supply.
  • the microchannel is guided through a measuring cell filled with a liquid.
  • the liquid with which the measuring cell is filled can be selected so that its refractive index is comparable to the refractive index of the wall of the microchannel and of the fluid in the microchannel, which improves the quality of the images of the Performs samples in the microchannel with a microscope.
  • the liquid with which the measuring cell is filled can be conditioned, so that a diffusion of 0 2 and / or C0 2 takes place through the wall of the microchannel and thus biological objects in the drop can be supplied.
  • the position of the microchannel can be changed by translational and / or rotary movements, as a result of which the position of the samples in the microchannel relative to the objective of the microscope can also be changed in a defined manner while maintaining the position of the measuring cell relative to the objective.
  • the microchannel can be moved manually or automatically.
  • samples are understood to mean drops, compartments or segments of an aqueous medium in a two-phase or multiphase fluid, the drops being separated with a water-immiscible fluid, for example an oily fluid.
  • a preferred oily fluid is perfluorodecalin (PFD) because this oil has a refractive index comparable to that of water.
  • PFD perfluorodecalin
  • the drops, compartments or segments separated by this oily fluid contain the actual microscopic objects such as cells, tissues or spheroids. If a single-phase fluid is used in the device according to the invention, samples in the sense of the invention are understood to mean microscopic objects such as cells, tissues or spheroids located in the single-phase fluid.
  • the measuring cell of the device according to the invention is filled with a liquid, such as water or an oil.
  • a liquid such as water or an oil.
  • the part of the microchannel that is to be introduced into the beam path of a microscope for the optical analysis of the samples is in the liquid in the measuring cell.
  • This has the advantage that the liquid fills the topographical irregularities (production marks etc.) on the outer surface of the microchannel, such as a sample tube, and thus guarantees an undisturbed transition of spruce.
  • the adjustment of the refractive indices water - FEP (or PTFE) - water or oil) leads to a further improvement in the optical image (refractive indices see table 1).
  • the device has a pump at the entrance of the microchannel into the measuring cell or at the entrance of the microchannel into the measuring cell and at the exit of the microchannel from the measuring cell or at the exit of the microchannel from the measuring cell.
  • this pump is preferably designed as a hose or roller pump.
  • the device preferably has a pump at the entrance of the microchannel into the measuring cell and at the exit of the microchannel from the measuring cell.
  • these pumps are designed as pressure pumps, the pump operating at the outlet of the microchannel from the measuring cell with negative pressure. With the use of pressure pumps, the problem of tracking the drop sequence described at the outset can be avoided particularly effectively.
  • the pumps are preferably coupled to a means or system for determining the sample position.
  • the signal coming from this system switches off the pump (s) in a defined manner and the drop sequence stops immediately.
  • a defined preselection of the sample position in the region of the beam path of the optical image of a microscope is thus possible.
  • the device according to the invention has a valve (shut-off valve) between the pump and the measuring cell at the input of the microchannel into the measuring cell and / or a further valve (shut-off valve) between the pump and the measuring cell at the output of the microchannel from the measuring cell , It is important that the stopcocks do not cause any volume displacement in the sample tube. Otherwise the samples would perform undefined, erratic movements.
  • the samples must not be transported by operating the stopcocks, which would lead to undefined adhesion effects in the stopcocks.
  • the stopcocks switch back to passage and the pumps convey the next sample of the sample sequence into the area of the optical image of the microscope.
  • the measuring cell has a closed housing and the entrance of the microchannel into the measuring cell and the exit of the microchannel from the measuring cell have means for sealing the microchannel relative to the housing of the measuring cell, which allows the mobility of the microchannel within the Enable the measuring cell and at the same time prevent the liquid from escaping from the measuring cell.
  • the entrance of the microchannel into the measuring cell and the exit of the microchannel from the measuring cell can be arranged on every outer surface of the measuring cell.
  • the input of the microchannel into the measuring cell is arranged on an outer surface of the measuring cell and the outlet of the microchannel is arranged on the opposite outer surface of the measuring cell.
  • the input of the microchannel into the measuring cell and the output of the microchannel from the measuring cell are arranged on the same outer surface.
  • the measuring cell has a housing which is open on one side and through which the microchannel projects into and out of the measuring cell, part of the microchannel projecting into the measuring cell and part of the protruding from the measuring cell Microchannel using one in all Movements in space and means that are not connected to the measuring cell are firmly connected.
  • the measuring cell has feedthroughs for filling the measuring cell with a liquid, for venting the measuring cell, for carrying out light sources and sensors, for example light guides for coupling light into the measuring cell or of light barriers or electrodes for determining the position of samples in the microchannel or for carrying lenses for emitting and detecting electromagnetic radiation.
  • light sources and sensors for example light guides for coupling light into the measuring cell or of light barriers or electrodes for determining the position of samples in the microchannel or for carrying lenses for emitting and detecting electromagnetic radiation.
  • connection of light guides which can couple light into the samples in the microchannel, makes it possible for the samples (cells) in the drops of a sample tube to be excited on one or both sides by means of light guides, for example for fluorescence microscopy.
  • Spectroscopic (turbidimetry, nephelometry, etc.) measurements and combinations of different optical detection methods can thus be implemented in an advantageous manner. It is possible to implement several optical and fluidic inputs / outputs arranged in parallel on the measuring cell.
  • the measuring cell has a frame with seals for the microchannel and two plates made of transparent material, preferably a plastic or glass, particularly preferably made of glass, for the optical, which are connected to the frame in a liquid-tight manner (eg seals, adhesive connections) Beam path of the microscope objective.
  • the measuring cell has a microchannel, such as a sample tube, which is introduced into the measuring cell via an inlet and is led out of the measuring cell via an outlet. Further connections of the measuring cell serve to fill the chamber with the aqueous liquid and to vent the chamber.
  • the microchannel such as a sample tube
  • the microchannel can be pulled forwards or backwards through the inlet and the outlet through the chamber and / or rotated about the axis of the sample tube.
  • This makes it possible to position the samples in the sample tube, eg compartments, drops, exactly in the area of the beam path of the microscope objective.
  • This possibility of pulling and rotating the sample tube is essential in the case of using syringe pumps for sample transport, since an exact positioning of the drops is not possible with syringe pumps. in the If pressure-based pump systems are used, an exact positioning of the sample is possible even without the relative movement of the hose.
  • the two plates for sealing the measuring cell can be cover glasses, for example.
  • the measuring cell has connections which are connected to a conditioning module, a pump conveying conditioned liquid from the conditioning module through the measuring cell and back to the conditioning module.
  • the conditioning of the liquid can include, for example, the following parameters: water temperature T, 0 2 - and C0 2 concentration. Gas exchange is possible, for example, within certain limits using a PTFE tube. This enables the conditioning of the 0 2 - and the pH of the fluid in the microchannel, in particular in the drop. The possibility of conditioning also allows longer-lasting investigations in the measuring cell.
  • the measuring cell of the device according to the invention consists of optically transparent materials or optically non-transparent materials or of a combination or a combination of optically transparent and non-transparent materials, such as for example made of glass, suitable plastics, metal or combinations or composites thereof.
  • the measuring cell is a glass cuvette.
  • This has a lid and a bottom, in which the microchannel is sealed and rotatably and displaceably guided.
  • the glass cuvette is filled with an aqueous liquid. The lighting can be done on both sides.
  • the measuring cell is a measuring cell for diving lenses, which in turn is filled with an aqueous liquid and uses diving lenses.
  • the microchannel implementation and microchannel movement take place analogously to the previously described embodiments of the measuring cells.
  • the measuring cell can be closed.
  • the bushings for the microchannel are then provided with seals.
  • the introduction and the discharge of the microchannel on a surface of the measuring cell preferably on one side, such as on its cover respectively.
  • the microchannel for example a sample tube, can be pulled at one end and pushed in the same way at the other end, or pulled only at one end or pushed only at one end, or pulled or pushed at both ends at the same time, around those in the sample tube Position samples, eg compartments, drops, exactly in the area of the beam path of the microscope objective.
  • the measuring cell is open at the top, but is also filled with a liquid.
  • the microchannel such as a sample tube, is not fixed to the measuring cell, but independently of the measuring cell.
  • the sample tube fixed in this way can be moved as a whole in all spatial directions and, within certain limits, can also be rotated around the samples in the sample tube, e.g. Compartments or drops to be positioned exactly in the area of the beam path of the microscope objective.
  • the measuring cell additionally has a metering module.
  • the metering module has a microvalve for the defined and precise addition of active ingredients to the samples in the microchannel, as well as means for positioning the samples in the microchannel, the beam path of a microscope, such as light barriers, measuring electrodes, sensors or a camera.
  • the samples located in the microchannel e.g. Compartments or drops are positioned exactly in the area of the beam path of the microscope objective.
  • it is possible to carry out in situ tests on the samples, in which active ingredients, test substances, etc. can be metered directly into the samples located in the microchannel.
  • the connections on the measuring cell also make it possible to exchange the liquid present in the measuring cell and to adapt its composition so that the liquid has a refractive index that is comparable to the wall of the microchannel and the fluid in the microchannel.
  • the device according to the invention therefore has a means for setting the refractive index of the liquid in the measuring cell.
  • This is for example a system with at least one storage container for liquids and at least one pump and corresponding hoses, with the aid of which the measuring cell can be filled with the desired liquid.
  • the device according to the invention is particularly suitable for use on an upright or inverted microscope. It could be shown that the quality of the optical imaging of cells in drops, which were in a PTFE tube, which was in a measuring cell filled with water, could be significantly increased compared to imaging of cells in drops, which were in a PTFE hose that was not in a measuring cell filled with water.
  • the quality of the optical image can be increased even further by using FEP tubing with greater transparency than PTFE tubing.
  • a miniaturization of the measuring cell and a reduction in the wall thickness of the tube as a result of the shorter optical path lengths further improve the image quality.
  • the device according to the invention can be designed such that the sample positioning in the beam path of an optical image takes place automatically.
  • the device according to the Invention can advantageously also be used in light sheet microscopy and can be used for sample examination in high throughput.
  • the microchannel of the device according to the invention can be contained in a tube probe in a further embodiment.
  • the measuring cell can represent, for example, a measuring cell suitable for use in a light-sheet microscope, the measuring cell for the light-sheet microscope also being filled with a liquid, which results in the improvement in the quality of the optical imaging of samples in the microchannel.
  • the microchannel in the tube probe can preferably be positioned in the liquid-filled measuring cell of a light-sheet microscope.
  • the measuring cell for the light sheet microscope is preferably open at the top and has at least one hole for inserting an objective for fluorescence measurement and / or at least one hole for inserting an illumination lens for a light sheet.
  • the measuring cell for the light-sheet microscope preferably has a bore for the insertion of an objective for fluorescence measurement and two bores for the insertion of two illumination objectives, offset by 180 °, for two sheets of light.
  • the device according to the invention has at least one means for determining the position of samples in the microchannel, preferably at least one light barrier, camera, a measuring electrode or a sensor.
  • This embodiment of the device according to the invention is particularly advantageous since the samples in the microchannel, such as drops in a sample tube that contains a two-phase or multi-phase fluid, or cells and / or spheroids in a microchannel that contains a single-phase fluid, exactly can be positioned in the area of the beam path of the optical image.
  • the system also works automatically.
  • the output signal of the means for determining the position of samples switches off the pump (s) in a defined manner and the fluid containing the samples stops immediately. This enables a defined preselection of the sample position in the area of the beam path of the optical image.
  • the combination of a top-open measuring cell with the pump-based sample transport system offers excellent conditions, for example for tomographic image acquisition methods in serial throughput.
  • a fine adjustment would be desirable, for example, to be able to generate tomographic images of the sample.
  • the device having a means for automatically moving the tube probe, which has a microchannel, within the measuring cell of the light-sheet microscope filled with a liquid, preferably a piezo drive.
  • This means for automatically moving the microchannel is used for fine adjustment and enables the sample tube to be moved in any direction in the room and thus to characterize the sample from different directions or to generate z-stacks and thus spatial characterization of the samples and those in the samples to realize existing cells and / or 3D cell structures.
  • the invention further provides a measuring cell for the optical characterization of fluids and / or objects enclosed therein in microchannels.
  • a microchannel is passed through the measuring cell, the measuring cell being leadthroughs for filling the measuring cell with a liquid, for venting the measuring cell, for carrying out light sources and sensors, for example light guides for coupling light into the measuring cell or of light barriers or electrodes for determining the position of Samples in the microchannel or for carrying lenses for emitting and detecting electromagnetic radiation.
  • the measuring cell is filled with a liquid
  • the microchannel is inside the measuring cell in the liquid and the microchannel inside the measuring cell and / or the measuring cell with the microchannel can be moved manually or automatically.
  • the device and the measuring cell are advantageously suitable for enabling a defined preselection of the sample position in the region of the beam path of the optical image of a microscope and for providing optical images of samples in the microchannel in improved quality.
  • the generation of optical images of samples in the microchannel is automated with the device according to the invention and can be adapted for the examination of samples in high throughput. Further embodiments of the device according to the invention enable the production of tomographic image recordings in serial throughput.
  • the invention also provides a method for the optical characterization of fluids and / or objects enclosed therein in a microchannel by means of the device described herein, the microchannel being located within a measuring cell according to the invention which is filled with a liquid, and the method the steps include:
  • the automatic movement of the measuring cell filled with a liquid which contains the microchannel takes place by moving the microscope stage in the three spatial directions by means of stepper motors.
  • the positioning of samples contained in the microchannel can be carried out by
  • a peristaltic pump roll pump
  • pressure pumps which preferably work with different pressures (pressure, negative pressure), with changing pressure ratios being regulated by means of pressure sensors, can be used.
  • the device according to the invention and the method according to the invention have numerous advantages. Fast, reproducible and high-resolution optical detection of biological samples plays a dominant role for drop-based microfluidics and especially for the technological platform “pipe based bioreactors”.
  • the device according to the invention and the method according to the invention can be used as a simple flow-through system for microscopic / spectroscopic routine examinations up to applications for automated, tomography-based imaging processes and thus have a broad application potential. Both for the measuring cell in the light-sheet microscope and for the measuring cell on the upright / inverted microscope there is also the possibility of a uniform, continuous flow of the drops. With the light-sheet microscope, tomographic examinations could be carried out in flow.
  • FIG. 1 the production of drops from cell culture medium (DMEM, gray)
  • Figure 2 shows the structure of an inventive measuring cell
  • FIG. 3 shows an embodiment of the measuring cell according to the invention as a microscope cell
  • Figure 4 further embodiments of the measuring cell as a glass cuvette
  • FIG. 5 further embodiments of the measuring cell with one-sided supply and removal of the hose, as a closed measuring cell and as a measuring cell open at the top;
  • FIG. 6 shows the differences between microscopic images of cells in drops which are in a PTFE tube, with and without the measuring cell according to the invention
  • FIG. 8 basic representations of the measuring cell for a spike leaf microscope
  • FIG. 9 shows a schematic diagram of the fluidic regime on a fir tree microscope
  • Figure 11 Schematic diagram of the fluidic regime on the upright or inverse
  • Figure 12 shows the position detection of stem cell spheroids in a drop in one
  • Figure 1 shows parts of a "pipe based bioreactor" (pbb) of the prior art.
  • Drops (20) from cell culture medium (DMEM, colored gray) are generated in a microfluidic module made of polycarbonate and are separated by an oily fluid (PFD, transparent).
  • 1A illustrates drop generation.
  • the connection of the sample tube (13) is located in the right area of the channel of the microfluidic module.
  • 1B shows the drop sequence in a sample tube (13) wound on a tube disc (50).
  • the tubular disc (50) with the compartments (drops (20)) therein can be cultivated for several weeks in the incubator, the cells in the drops (20) having to be detected at certain intervals. In the simplest case, the tube disk (50) is removed from the incubator and microscoped.
  • Each drop (20) can be regarded as a "microbioreactor".
  • the aqueous drops (20) are separated with a fluid that is not miscible with water, for example an oil.
  • this is perfluorodecalin (PFD).
  • PFD perfluorodecalin
  • PTFE polytetrafluoroethylene
  • FEP fluoroethylene propylene
  • FIGS. 2A shows a section through a measuring cell (10) and illustrates the task of the liquid (14) located in the measuring cell (10).
  • this is water.
  • 2B shows the technical implementation of the measuring cell (10) as a microscopy module with a sample tube (13), (15: inlet, 16: outlet) and the connection (17) for filling the measuring cell (10) with an aqueous liquid (14). and connection (18) for venting the chamber of the measuring cell (10).
  • the sample tube (13) can be pulled through the measuring cell (10) via the connections (15), (16) (in the direction of the arrows or in the opposite direction) and / or rotated about the axis of the sample tube (13). This makes it possible to position the samples (20), for example compartments, located in the sample tube (13) exactly in the region of the beam path of the microscope objective (not shown).
  • the measuring cell (10) can be connected to an external conditioning module, e.g. via the connections (17) and (18) in Fig. 2B, and a pump then conveys conditioned liquid from the conditioning module through the measuring cell (13 ').
  • the conditioning of the liquid (14) can include the following parameters: water temperature T, 0 2 - and C0 2 concentration.
  • a gas exchange is possible within certain limits, for example, via a sample tube (13) made of PTFE, which enables the 0 2 and the pH in the drop (20) to be conditioned.
  • the possibility of conditioning also allows longer-term investigations in the measuring cell (10).
  • the connections (17, 18) provided on the measuring cell (10) also make it possible to exchange the liquid (14) present in the measuring cell and to adapt its composition so that the liquid (14) has a refractive index that matches the wall of the sample tube (13) and the fluid in the sample tube (13) is comparable.
  • the device (200) can have a means for setting the refractive index of the liquid (14) in the measuring cell (10). This is, for example, a system with at least one storage container for liquids and at least one pump and corresponding hoses (13 '), with the aid of which the measuring cell can be filled with the desired liquid (14).
  • FIG. 3 shows an embodiment of the measuring cell (10).
  • 3A shows the simplest embodiment of the arrangement of the measuring cell (10) as a microscope cell.
  • the position of the lens (30) can be seen for the Fichtmikroskopie or the epifluorescence microscopy.
  • the connections (17) and (18) shown in FIG. 2B for filling the chamber of the measuring cell (10) can also be occupied by, for example, fiber conductors (22), which couple Ficht into and into the samples (20) in the tube (13) excite the fluorescent dyes present (FIG. 3B).
  • FIG. 4 shows further embodiments of the measuring cell (10). 4A the hose
  • a measuring cell (10) which is designed as a glass cuvette. This has a lid and a bottom, in which the sample tube (13) is sealed and rotatably and displaceably guided (comparable to Fig. 2).
  • the measuring cell (10) is with a liquid
  • FIG. 4B shows an arrangement with a material-independent housing of the measuring cell (10), which in turn is filled with a liquid (14), such as water or an oil, and uses diving objectives (30).
  • the hose feed-through and hose movement are carried out in the same way as the variants of the measuring cells (10) previously presented.
  • FIG. 5 shows further embodiments of the measuring cell (10).
  • the measuring cell (10) is closed, filled with water (14) and the hose bushings are provided with seals (21).
  • the sample tube (13) can be pulled at one end and pushed in the same way at the other end or pulled only at one end or pushed only at one end or pulled or pushed simultaneously at both ends.
  • 5B the measuring cell (10) is open at the top, but is also filled with water (14).
  • the sample tube (13) is not fixed to the measuring cell (10) (see FIG. 5A), but independently of the measuring cell (10).
  • the sample tube (13) fixed in this way can be moved as a whole in all spatial directions and can also be rotated within certain limits.
  • 5A and 5B can be implemented both as a glass cuvette and as a material-independent housing (cf. FIG. 4).
  • "Material-independent" housing means that the housing can be made of all suitable materials, such as glass, a plastic, a metal or combinations or combinations thereof, provided that in this case bushings can be inserted into the housing walls that enable lenses (30) of a microscope, as shown in FIG. 4B, into the measuring cell (10).
  • Figure 6 illustrates the differences between microscopic images of cells in drops (20), which are located in a sample tube (13) made of PTFE.
  • 6A and 6B were recorded through a sample tube (13) without a measuring cell (10), in FIGS. 6C and 6D the sample tube (13) was in a measuring cell (10) filled with water (14) (cf. 2 B).
  • Phase contrast images were taken under the following conditions: Fig. 6A: 40x magnification, without measuring cell (10).
  • Fig. 6B 600x magnification, focused on cell accumulation in the area of the marked
  • Fig. 6C 40x magnification, with measuring cell (10), filled with water (14).
  • Fig. 6D 600x magnification, focused on cell accumulation in the area of the marked
  • FIG. 7 shows two variants for moving and positioning the drops (20) in the region of the beam path of the optical image by means of the device (200) according to the invention.
  • 7A shows the relatively simple structure based on a syringe pump (60).
  • 7B shows the structure with pumps (70, 70 ').
  • the pumps (70, 70 ') are designed as pressure pumps.
  • a drop position determination (41) is necessary. This can be done by means of a light barrier, but can also be realized with a camera and fast image evaluation.
  • the output signal of the drop position determination (41) switches off the pump (60), the drop sequence moving further in the case of the syringe pump and only coming to a standstill after pressure equalization in the sample tube (13).
  • the technical solution shown in FIG. 7B is based on the use of pressure-based pumps and avoids the problem described above of the tracking of the drop sequence.
  • a system for determining the drop position (41) is also necessary here.
  • the signal emanating from this system switches off the pressure pumps (70, 70 ') in a defined manner and the drop sequence stops immediately. A defined preselection of the drop position in the area of the beam path of the optical image is thus possible.
  • stopcocks (90, 90 ') do not cause any volume displacement in the sample tube (13), otherwise the drops (20) would perform undefined, erratic movements; and that the drops (20) are not transported through the stopcocks (90, 90 '), which is due to the positioning of the stopcocks (90) and (90') between Storage container and hose disk (50, 50 ') is given. Otherwise, this would lead to undefined adhesion effects in the stopcocks (90, 90 ').
  • the stopcocks (90, 90 ') switch back to passage, and the pressure pumps (70, 70') convey the next drop of the drop sequence into the area of the optical image of the microscope.
  • a fine adjustment (40) can be carried out, for example, by moving the microscope stage or by a piezo actuator.
  • the combination of an open measuring cell (cf. FIG. 5B) with the drop transport system with pressure pumps (70, 70 ') according to FIG. 7B offers excellent conditions, for example for tomographic image recording methods in serial throughput.
  • the fine adjustment (41) makes it possible to move the sample tube (13) in any direction (for example with piezo actuators) and thus to characterize the drops (20) from different directions or to generate z-stacks and thus a spatial characterization of the drops (20 ) and the cells or 3D cell structures located in the drops (20).
  • the cells or 3D cell structures are cultivated in tube disks (50, 50 ') over a predetermined period.
  • the pressure pumps (70, 70 ') convey fluid from the storage container (91) into the storage container (91') or vice versa.
  • the device (200) according to the invention can also contain a hose pump instead of the pressure pumps (70, 70 ').
  • the stopcocks (90, 90 ') can then be omitted if necessary.
  • FIG. 8 shows details of a tube probe (100) with a microchannel or sample tube (13), which was specially developed and tested for the measuring cell (120) of a spruce leaf microscope.
  • the measuring cell (120) is locked in place in the fir tree microscope, but can be removed and reinserted by the user.
  • the two illumination objectives offset by 180 ° (see (30) in FIGS. 7A and 7B) and a lens for detecting the fluorescence (see FIG. 8C) protrude into the measuring cell (120).
  • the measuring cell (120) is filled with water or a non-aqueous liquid. This serves to adjust the refractive indices.
  • the tube probe (100) with the sample tube (13) protrudes freely into the measuring cell (120) and the liquid therein, but is connected to the piezo drive (110) of the firing sheet microscope, which moves and rotates the tube probe (100) in three spatial directions can.
  • 5B shows a basic illustration of the tube probe (100) with microchannel or sample tube (13), positioned in the measuring cell (10) of a light-sheet microscope.
  • 8A shows the part of the tube probe (100) with sample tube (13) which is located in the measuring cell (120).
  • 8B shows the tube probe (100) in the measuring cell (120), taken with the door camera (41) of the light-sheet microscope.
  • the tube probe (100) has a microscope window (111) which is located in the beam path of the optical image generation of the microscope.
  • FIG. 8C shows a 3D representation of the measuring cell (120) and the tube probe (100) (FIG. 8B “out of the sheet”, the bore (130) is provided for receiving an objective for fluorescence measurement, see also FIG. 9 ).
  • Figure 8D shows the side view of Figure 8C.
  • the bore (140) is provided for the use of one of the two 180 ° offset lighting lenses for light sheets 1 and 2 (see also FIG. 9).
  • FIG. 9 shows a basic illustration of the fluidic regime on a light-sheet microscope.
  • the drops (20) do not change their position in the sample tube (13) during the recordings, which take up to several minutes, which would lead to unsharp recordings.
  • the changes in the position of the biological objects in the droplet (20) necessary for the tomographic recordings are effected by the movement of the complete tube probe (100) by means of the piezo drive (110) of the light-sheet microscope, see FIG. 8.
  • the droplets (20) result Two states: i) during the measurement the drops (20) in the sample tube (13) must not move and ii) after the measurement the complete drop sequence in the sample tube (13) must be moved so that the next drop (20) falls into the The focal plane of the lenses (30) arrives and is stopped there in a defined manner.
  • the implementation of these two states is described below:
  • the pumps (70, 70 ') generate an overpressure PI or an underpressure P2 in the two storage containers (91, 91').
  • the drops (20) begin to move evenly out of the tube disk (50) in the direction of the measuring cell (120).
  • the area of the window (111) of the tube probe (100) (FIG. 8B) is monitored with a video camera (41) (door camera of the light-sheet microscope) and the results are permanently adopted in a Matlab program.
  • a light intensity of an imaginary line ((150) in FIGS. 8C and 8D) is evaluated.
  • a drop (20) in the sample tube (13) reaches this area of the window (111) of the tube probe (100), the light intensity changes in the area of this line (150), which is evaluated by Matlab and then as a signal to stop the pumps ( 70, 70 ') is output.
  • the drop sequence then stops immediately, and the Measuring drops (20) are located in the area of the optical beam path of the light-sheet microscope.
  • the pumps (70, 70 ') still regulate to a certain pressure value, which would result in a "trembling" of the drop (20).
  • the valves (90) and (90 ') switch immediately after stopping the drop sequence and decouple the pumps (70, 70') and the storage containers (90, 90 ') from the drop sequence.
  • the drop (20) in the optical beam path of the light sheet microscope and also the entire drop sequence remain in a stable position and the fluorescence measurement can be carried out with the light sheet microscope.
  • the valves (90) and (90 ') are opened again, the pumps (70, 70') are started and the next drop (20) of the drop sequence is conveyed into the area of the window (111) of the tube probe (100) , The positioning and the start of the measurement is carried out again as described above.
  • the pumps can be designed as pressure pumps (70, 70 '), which preferably operate with different pressures (pressure, negative pressure), with changing pressure conditions being regulated by means of pressure sensors.
  • FIG. 10 shows the measuring cell (10) according to FIG. 2B with the metering module (160) attached.
  • the position and the speed of the drops (20) are determined by means of two light barriers (162, l62 ') in order to use a microvalve (seen through the cable (161) to define active substances in the drops (20).
  • These light barriers (162, l62 ') can in principle also be integrated directly into the measuring cell (10), for example on their side surfaces, where they do not interfere with the microscopy process.
  • the fluidic regime of the measuring cell (10) shown here with metering device (160) In principle, the same boundary conditions apply as for the light-sheet microscope.
  • the drops (20) should be positioned stably in the area of the optical beam path.
  • the measuring cell (10) can also be moved in three spatial directions, which is similarly done with the tube probe (100) in the light-sheet microscope (moving the entire tube probe ( 100) including sample tube (13) by means of a piezo actuator (110)). Coupling the signal processing of the light barriers (162, l62 ') with the control software of the respective microscope also opens up the possibility for automated tomographic examinations of the drops (20).
  • FIG. 12B shows a stem cell spheroid (marked with a box) in a drop (20).
  • FIG. 12A shows the associated signal curve of a light barrier with significant signal changes at the phase boundaries of the drop (20) and in the area of the stem cell spheroids.

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Abstract

Die Erfindung betrifft eine Vorrichtung (200) für die optische Charakterisierung von Fluiden und/oder darin eingeschlossener Objekte in einem Mikrokanal (13), umfassend eine Messzelle (10, 120), wobei der Mikrokanal (13) durch die Messzelle (10, 120) geführt wird, wobei die Messzelle (10, 120) mit einer Flüssigkeit (14) gefüllt ist, der Mikrokanal (13) sich innerhalb der Messzelle (10, 120) in der Flüssigkeit (14) befindet, das Fluid und/oder darin eingeschlossene Objekte in dem Mikrokanal (13) bewegbar sind und der Mikrokanal (13) innerhalb der Messzelle (10, 120) und/oder die Messzelle (10, 120) mit dem Mikrokanal (13) manuell oder automatisch bewegbar ist. Die Erfindung betrifft weiterhin eine Messzelle (10, 120) für die Vorrichtung (200) und Verfahren für die optische Charakterisierung von Fluiden und/oder darin eingeschlossener Objekte in einem Mikrokanal (13) mittels der Vorrichtung (200).

Description

Vorrichtung und Verfahren zur optischen Charakterisierung von Fluiden und/oder darin eingeschlossener Objekte in Mikrokanälen
Gebiet der Erfindung
Die Erfindung betrifft eine Vorrichtung für die optische Charakterisierung von Fluiden und/oder darin eingeschlossener Objekte in einem Mikrokanal, umfassend eine Messzelle, wobei der Mikrokanal durch die Messzelle geführt wird, dadurch gekennzeichnet, dass die Messzelle mit einer Flüssigkeit gefüllt ist, der Mikrokanal sich innerhalb der Messzelle in der Flüssigkeit befindet, das Fluid und/oder darin eingeschlossene Objekte in dem Mikrokanal bewegbar sind und der Mikrokanal innerhalb der Messzelle und/oder die Messzelle mit dem Mikrokanal manuell oder automatisch bewegbar ist. Die Erfindung betrifft weiterhin eine Messzelle für die Vorrichtung und Verfahren für die optische Charakterisierung von Fluiden und/oder darin eingeschlossener Objekte in einem Mikrokanal mittels der erfindungs gemäßen Vorrichtung.
Hintergrund der Erfindung
Geräte und Verfahren auf der Basis mikrofluidischer Prinzipien haben sich im Faborbereich umfassend etabliert. Die Vorteile sind unter anderem ein geringerer Verbrauch von Reagenzien und Probenmaterialien pro Versuchsansatz bei gleichzeitiger Erhöhung der Zahl simultan durchführbarer Versuchsansätze. Ein Beispiel dafür sind Wells von Mikrotiterplatten, in denen pro Platte bis zu 1536 parallele Messungen möglich sind. Neben den etablierten plattenbasierten Verfahren setzen sich zunehmend sogenannte„tropfenbasierte“ mikrofluidische Verfahren u.a. für biologische und biomedizinische Applikationen durch.
Bereits bekannt sind sogenannte„ pipe based bioreactors“ (pbb ), wie beispielsweise von der Anmelderin entwickelt. Dabei handelt es sich um ein modular aufgebautes Zellkultivierungssystem, das auf dem Prinzip der tropfenbasierten bzw. kompartimentbasierten Mikrofluidik beruht und für mittlere bis hohe Durchsätze ausgelegt ist. In einem Mikrokanal, hier gebildet durch einen Schlauch, befinden sich seriell angeordnete Tropfen (Kompartimente), die aus biologischen Medien mit darin befindlichen Zellen bestehen. Jeder Tropfen kann dabei als„Mikrobioreaktor“ betrachtet werden. Die im Allgemeinen wässrigen Tropfen sind separiert mit einem mit Wasser nicht mischbarem Fluid, beispielsweise einem Öl. Der Schlauch besteht aus Polytetrafluorethylen (PTFE) oder Fluorethylenpropylen (FEP) und hat eine Länge von mehreren Metern, ist auf einer Disk aufgewickelt und fasst eine Vielzahl von Tropfen. Die Schlauchdisk mit den darin befindlichen Tropfen kann bis zu mehreren Wochen im Inkubator kultiviert werden, wobei in bestimmten Abständen eine Detektion der in den Tropfen befindlichen Zellen erfolgen soll. Dazu wird im einfachsten Fall die Schlauchdisk aus dem Inkubator entnommen und mikroskopiert. Allerdings ist die optische Auflösung aufgrund der ungünstigen optischen und geometrischen Eigenschaften insbesondere des PTFE- Schlauches und der unterschiedlichen Brechungsindizes n beim Übergang von Luft (n = 1) in den PTFE-Schlauch (n = 1,38) begrenzt und in den Tropfen enthaltene biologische Objekte können bei 600-facher Vergrößerung oder mehr nicht mehr sinnvoll abgebildet werden. Da in den Tropfen teilweise 3D Zellstrukturen (Sphäroide oder auch Gewebefragmente wie Biopsien) kultiviert werden, müssen die Tropfen ihre Form beibehalten. Ein Verjüngen oder Strecken der Tropfen zum besseren Mikroskopieren ist deshalb und auch aus physikalischen Gründen (Änderung des Laplace-Drucks) nicht möglich und würde zum Zerstören der Tropfen und der darin befindlichen Zellstrukturen führen. Eine Alternative wäre das Überführen der Tropfen aus dem PTFE-Schlauch in eine Glaskapillare gleichen Durchmessers. Da Glas hydrophile Oberflächeneigenschaften besitzt, muss jedoch eine hydrophobe Beschichtung der Glasinnenwand erfolgen, beispielsweise mit einem Plasmaverfahren. Die Standzeit solcher Plasmaschichten erwies sich allerdings als zu gering und nach kurzer Zeit erfolgte eine Adhäsion von Tropfen an der Glasinnenwand und damit die Zerstörung der Tropfensequenz. Problematisch sind zudem Kupplungen zwischen Schlauch und Glaskapillare, die aufgrund der geometrischen Übergänge ebenfalls die Adhäsion von Tropfen initiieren können. Eine Überführung in Polymerchips zum Mikroskopieren stellt eine weitere Alternative dar, wobei die Standzeit der Plasmabeschichtung auf Polymeroberflächen größer ist als auf Glas. Polymerchips sind im Allgemeinen für die Durchlicht- und die Epifluoreszenzmikroskopie geeignet, nicht jedoch für spezielle Verfahren wie die Lichtblattmikroskopie, bei der das Anregungslicht (Laserlichtblatt) senkrecht zur Richtung des Detektionsobjektivs eingekoppelt wird. Zudem ist der Brechungsindex von Polymeren (n = 1,585 für Polycarbonat (PC), siehe Tabelle 1) ungünstig und ein optischer Ausgleich wäre aufgrund des zwingend notwendigen kreisförmigen Querschnitts des Mikrokanals im Polymerchip nur mit hohem Aufwand möglich.
Tabelle 1: Brechungsindizes n relevanter Materialien.
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Eine weitere Herausforderung ist das exakte Positionieren der im Schlauch befindlichen Tropfen im Strahlengang der optischen Abbildung eines Mikroskops. Der Transport der Tropfen im Schlauch erfolgt im Allgemeinen mittels Spritzenpumpen oder druckgetriebenen Pumpen. Spritzenpumpen müssen zum Bewegen der Kompartimente einen Mindestdruck aufbauen, der abhängig vom Gegendruck im Schlauch ist, der wiederum von dessen Länge und der Anzahl der im Schlauch befindlichen Tropfen abhängt. Wir dieser Mindestdruck erreicht, beginnen sich die Tropfen zu bewegen und es stellt sich einen konstanter Druckwert ein. Ein exaktes Stoppen der sich bewegenden Tropfen zum Zweck des Positionierens eines Tropfens im Strahlengang der optischen Abbildung ist aufgrund einer Druckhysterese nicht möglich, d.h., es wird ein Nachlaufen der Tropfensequenz erfolgen, bis sich wieder konstante Druckverhältnisse im Schlauch eingestellt haben. Die Verwendung von Spritzenpumpen für das exakte Positionieren der Tropfen scheidet daher aus.
Eine alternative Möglichkeit zum Transportieren von Flüssigkeiten in Mikrokanälen ist die Anwendung von Schlauch- bzw. Rollenpumpen. Diese können jedoch sehr oft den in den Mikrokanälen vorherrschenden, u.a. von Länge und Durchmesser der Mikrokanäle abhängigen Druck nicht überwinden und sind aus diesem Grund nicht geeignet. Ein weiterer Nachteil ist Ungleichmäßigkeit des Flüssigkeitsstromes, hervorgerufen durch die Rollen der Schlauch- bzw. Rollenpumpen.
Für die Bewegung der Tropfensequenz mittels druckgetriebener Pumpen ist charakteristisch, dass sie durch ihr schnelles Start/Stopp- Verhalten die Tropfen exakt im Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung positionieren können. Nachteilig ist, dass die druckgetriebenen Pumpen den Druck im System und damit auch im Schlauch permanent regeln müssen, was sich in einer periodischen Bewegung (Schwingung) der Tropfen äußert. Diese Schwingung ist zwar gering, verhindert aber eine exakte optische Abbildung des Tropfens und der darin befindlichen Zellen bzw. 3D-Zellstrukturen. Die Verbindung der Lichtblattmikroskopie mit der Durchflusszytometrie ist dem Fachmann bekannt und wird in der US2014353522 diskutiert. Deschout, H. et al. (2014) beschreiben Untersuchungen von biologischen Proben in Mikrokanälen von Chip-Systemen mittels Lichtblattmikroskopie. Paie, P. et al. (2016) beschreiben die Untersuchung von Gewebeproben mittels Mikrofluidstrukturen in einem seriellen Hochdurchsatzverfahren. Die zuvor genannten Probleme der exakten Probenpositionierung im Strahlengang der optischen Abbildung eines Mikroskops und die mangelnde Qualität der erzeugbaren Abbildungen bei Vergrößerungen von mehr als 600fach konnten bislang jedoch nicht gelöst werden.
Beschreibung der Erfindung
Die Aufgabe der Erfindung besteht deshalb darin, die Nachteile des Standes der Technik zu überwinden und Vorrichtungen und Verfahren zu entwickeln, die eine verbesserte optische Detektion (Mikroskopie, Spektroskopie) der sich in einem Mikrokanal befindlichen Proben ermöglichen.
Diese Aufgabe wird gelöst durch eine Vorrichtung nach Anspruch 1, eine Messzelle nach Anspruch 8 sowie ein Verfahren nach Anspruch 11.
Die Erfindung stellt insbesondere eine Vorrichtung für die optische Charakterisierung von Fluiden und/oder darin eingeschlossener Objekte in einem Mikrokanal bereit, umfassend eine Messzelle, wobei durch die Messzelle ein Mikrokanal geführt wird, dadurch gekennzeichnet, dass die Messzelle mit einer Flüssigkeit gefüllt ist, der Mikrokanal sich innerhalb der Messzelle in der Flüssigkeit befindet, das Fluid im Mikrokanal und/oder darin eingeschlossene Objekte in dem Mikrokanal bewegbar sind, und der Mikrokanal innerhalb der Messzelle und/oder die Messzelle mit dem Mikrokanal manuell oder automatisch bewegbar ist.
Die Flüssigkeit, mit der die Messzelle gefüllt ist, ist ausgewählt aus einer wässrigen oder einer nicht wässrigen Flüssigkeit. In einer bevorzugten Ausführungsform der Erfindung ist die Flüssigkeit, mit der die Messzelle gefüllt ist, eine wässrige Flüssigkeit, besonders bevorzugt Wasser, beispielsweise Feitungs wasser, destilliertes Wasser oder deionisiertes Wasser, oder Wasser mit spezifischen Eigenschaften wie Puffer oder Zellkulturnährmedium. In einer alternativen Ausführungsform der Erfindung ist die Flüssigkeit, mit der die Messzelle gefüllt ist, eine nichtwässrige Flüssigkeit, vorzugsweise ein Öl. Besonders bevorzugt ist es, wenn die Messzelle mit Perfluordecalin (PFD) gefüllt ist.
Besonders gute Ergebnisse in Bezug auf die Qualität der Abbildungen, die von dem Fluid und/oder darin enthaltenen Proben in dem Mikrokanal mit einem Mikroskop erhalten werden können, werden erzielt, wenn die Brechungsindizes der Flüssigkeit, mit der die Messzelle gefüllt ist und des Fluids, das sich in dem Mikrokanal befindet und des Materials, aus dem die Wandung des Mikrokanals besteht, ähnlich, d.h. vergleichbar sind. Vorzugsweise weisen die Flüssigkeit, mit der die Messzelle gefüllt ist und das Fluid, das sich in dem Mikrokanal befindet und das Material, aus dem die Wandung des Mikrokanals besteht, Brechungsindizes von kleiner als n = 1,5, vorzugsweise von kleiner als n = 1,4, besonders bevorzugt im Bereich von n = 1,30 bis 1,39, beispielsweise zwischen n = 1,31 und 1,38 auf.
Der Mikrokanal ist vorzugsweise ein Schlauch, der aus PTFE oder FEP besteht, da diese Materialien einen Brechungsindex ähnlich zu dem Brechungsindex von Wasser aufweisen (siehe Tabelle 1) und hydrophobe Oberflächeneigenschaften besitzen. Besonders bevorzugt ist es, wenn der Schlauch aus FEP besteht, da FEP im Vergleich zu PTFE bessere optische Eigenschaften, eine bessere Transparenz und eine bessere Oberflächentopografie aufweist.
Der Mikrokanal der erfindungsgemäßen Vorrichtung weist einen Innendurchmesser zwischen 50 pm und 2400 pm, vorzugsweise zwischen 100 pm und 1800 pm, besonders bevorzugt zwischen 250 pm und 1200 pm, insbesondere bevorzugt zwischen 500 pm und 1000 pm auf.
Das Fluid, dass sich in dem Mikrokanal befindet, ist eine Flüssigkeit und vorzugsweise zweiphasig und besteht aus seriell angeordneten Tropfen, die aus biologischen Medien mit darin befindlichen Zellen, Gewebefragmenten oder 3D-Zellstrukturen, wie Sphäroiden, bestehen. Jeder Tropfen kann dabei als„Mikrobioreaktor“ betrachtet werden. Die wässrigen Tropfen sind separiert mit einer mit Wasser nicht mischbaren Flüssigkeit, beispielsweise einem Öl. In einer weiteren Ausführungsform der Erfindung handelt es sich bei dem in dem Mikrokanal befindlichen Fluid um eine einphasige Flüssigkeit, wie beispielsweise ein Nährmedium, eine Pufferlösung, Saline oder ähnliches, mit darin befindlichen Zellen, Gewebefragmenten oder 3D-Zellstrukturen, wobei keine Tropfenseparierung durch ein Öl oder ähnliches erfolgt. In einer weiteren Ausführungsform der Erfindung handelt es sich bei dem in dem Mikrokanal befindlichen Fluid um eine mehrphasige Flüssigkeit, umfassend seriell angeordnete Tropfen in einem Öl oder einer organischen Flüssigkeit, die aus biologischen Medien mit darin befindlichen Zellen, Gewebefragmenten oder 3D-Zellstrukturen, wie Sphäroiden, bestehen. Jeder Tropfen kann dabei als„Mikrobioreaktor“ betrachtet werden. Die wässrigen Tropfen sind separiert mit einer mit Wasser nicht mischbaren Flüssigkeit, beispielsweise einem Öl oder einer organischen Flüssigkeit. Innerhalb der wässrigen Tropfen kann sich mindestens eine weitere nicht-wässrige Phase befinden, wie beispielsweise mindestens ein Öltropfen und/oder mindestens ein Gasbläschen und/oder mindestens ein Kompartiment aus einer organischen Flüssigkeit und/oder mindestens ein gelartiges Kompartiment. Eine Gasblase kann auch zwischen zwei wässrigen Tropfen positioniert werden, um beispielsweise als zusätzliche Gasversorgung zu dienen.
Der Mikrokanal wird erfindungsgemäß durch eine mit einer Flüssigkeit gefüllte Messzelle geführt. Dies hat den Vorteil, dass die Flüssigkeit, mit der die Messzelle gefüllt ist, so ausgewählt werden kann, dass deren Brechungsindex mit dem Brechungsindex der Wandung des Mikrokanals und des sich in dem Mikrokanal befindlichen Fluids vergleichbar ist, was zur Verbesserung der Qualität der Abbildungen der Proben in dem Mikrokanal mit einem Mikroskop führt. Zudem ist die Flüssigkeit, mit der die Messzelle gefüllt ist, konditionierbar, sodass eine Diffusion von 02 und/oder C02 über die Wandung des Mikrokanals erfolgt und somit eine Versorgung von biologischen Objekten im Tropfen erfolgen kann.
In einer bevorzugten Ausführungsform der Erfindung kann die Position des Mikrokanals durch translatorische und/oder rotatorische Bewegungen verändert werden, wodurch auch die Position der Proben im Mikrokanal gegenüber dem Objektiv des Mikroskops bei gleichzeitiger Beibehaltung der Position der Messzelle gegenüber dem Objektiv definiert geändert werden kann. Die Bewegung des Mikrokanals kann manuell oder automatisiert erfolgen.
Alternativ ist es auch möglich, die Position der gesamten Messzelle, die den Mikrokanal enthält, zu verändern und dadurch die Position der Proben im Mikrokanal gegenüber dem Objektiv des Mikroskops definiert zu ändern. Unter Proben werden im Sinne der Erfindung Tropfen, Kompartimente oder Segmente eines wässrigen Mediums in einem zweiphasigen oder mehrphasigen Fluid verstanden, wobei die Tropfen mit einem mit Wasser nicht mischbarem Fluid, beispielsweise einem öligen Fluid, separiert sind. Ein bevorzugtes öliges Fluid ist Perfluordecalin (PFD), da dieses Öl eine zu dem von Wasser vergleichbaren Brechungsindex aufweist. Die durch dieses ölige Fluid separierten Tropfen, Kompartimente oder Segmente enthalten die eigentlichen mikroskopischen Objekte wie Zellen, Gewebe oder Sphäroide. Wird in der erfindungsgemäßen Vorrichtung ein einphasiges Fluid verwendet, so werden unter Proben im Sinne der Erfindung die sich in dem einphasigen Fluid befindlichen mikroskopischen Objekte wie Zellen, Gewebe oder Sphäroide verstanden.
Die Messzelle der erfindungsgemäßen Vorrichtung ist in einer besonders bevorzugten Ausführungsform mit einer Flüssigkeit, wie beispielsweise Wasser oder einem Öl, gefüllt. Der Teil des Mikrokanals, der in den Strahlengang eines Mikroskops zur optischen Analyse der Proben eingebracht werden soll, befindet sich in der Flüssigkeit in der Messzelle. Dies hat den Vorteil, dass die Flüssigkeit die topografischen Unregelmäßigkeiten (Fertigungsspuren etc.) an der Außenfläche des Mikrokanals, wie beispielsweise eines Probenschlauches, ausfüllt und so einen ungestörten Fichtübergang garantiert. Die Anpassung der Brechungsindizes (Wasser - FEP (bzw. PTFE) - Wasser bzw. Öl) führt zu einer weiteren Verbesserung der optischen Abbildung (Brechungsindizes siehe Tabelle 1).
In einer weiteren Ausführungsform der Erfindung weist die Vorrichtung am Eingang des Mikrokanals in die Messzelle oder am Eingang des Mikrokanals in die Messzelle und am Ausgang des Mikrokanals aus der Messzelle oder am Ausgang des Mikrokanals aus der Messzelle eine Pumpe auf. Enthält die Vorrichtung nur eine Pumpe am Eingang oder am Ausgang des Mikrokanals in bzw. aus der Messzelle, so ist diese Pumpe vorzugsweise als Schlauch- oder Rollenpumpe ausgeführt. Vorzugsweise weist die Vorrichtung eine Pumpe am Eingang des Mikrokanals in die Messzelle und am Ausgang des Mikrokanals aus der Messzelle auf. In einer besonders bevorzugten Ausführungsform sind diese Pumpen als Druckpumpen ausgeführt, wobei die Pumpe am Ausgang des Mikrokanals aus der Messzelle mit Unterdrück arbeitet. Mit der Verwendung von Druckpumpen kann das eingangs geschilderte Problem des Nachlaufens der Tropfensequenz besonders effektiv vermieden werden. Vorzugsweise sind die Pumpen mit einem Mittel bzw. System zur Bestimmung der Probenposition gekoppelt. Das von diesem System ausgehende Signal schaltet die Pumpe(n) definiert ab und die Tropfensequenz stoppt unmittelbar. Damit ist eine definierte Vorwahl der Probenposition im Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung eines Mikroskops möglich.
Das bereits beschriebene Schwingen der Proben, wie beispielsweise der Tropfen in einem Mikrokanal, aufgrund der notwendigen Regelung der Pumpe(n), wird erfindungsgemäß eliminiert durch die fluidische Entkopplung der Pumpe(n) vom Mikrokanal, wie beispielsweise einem Probenschlauch, und damit von der Tropfensequenz während der optischen Detektion. Hierzu weist die erfindungsgemäße Vorrichtung gemäß einer weiteren Ausführungsform zwischen der Pumpe und der Messzelle am Eingang des Mikrokanals in die Messzelle ein Ventil (Absperrhahn) und/oder zwischen der Pumpe und der Messzelle am Ausgang des Mikrokanals aus der Messzelle ein weiteres Ventil (Absperrhahn) auf. Dabei ist es wichtig, dass die Absperrhähne keine Volumen Verdrängung im Probenschlauch hervorrufen. Anderenfalls würden sich die Proben Undefinierte, sprunghafte Bewegungen ausführen. Außerdem dürfen die Proben nicht durch die Betätigung der Absperrhähne transportiert werden, was zu Undefinierten Adhäsionseffekten in den Absperrhähnen führen würde. Nach Abschluss der Probendetektion schalten die Absperrhähne wieder auf Durchgang, und die Pumpen fördern die nächste Probe der Probensequenz in den Bereich der optischen Abbildung des Mikroskops.
In einer Ausführungsform der erfindungs gemäßen Vorrichtung weist die Messzelle ein geschlossenes Gehäuse auf und der Eingang des Mikrokanals in die Messzelle und der Ausgang des Mikrokanals aus der Messzelle weisen Mittel zur Abdichtung des Mikrokanals gegenüber dem Gehäuse der Messzelle auf, die die Bewegbarkeit des Mikrokanals innerhalb der Messzelle ermöglichen und gleichzeitig das Austreten der Flüssigkeit aus der Messzelle verhindern. Der Eingang des Mikrokanals in die Messzelle und der Ausgang des Mikrokanals aus der Messzelle sind an jeder Außenfläche der Messzelle anordenbar. In einer Ausführungsform der Erfindung ist der Eingang des Mikrokanals in die Messzelle an einer Außenfläche der Messzelle angeordnet und der Ausgang des Mikrokanals an der gegenüberliegenden Außenfläche der Messzelle. In einer weiteren Ausführungsform der Erfindung sind der Eingang des Mikrokanals in die Messzelle und der Ausgang des Mikrokanals aus der Messzelle an der gleichen Außenfläche angeordnet.
In einer weiteren Ausführungsform der erfindungsgemäßen Vorrichtung weist die Messzelle ein an einer Seite offenes Gehäuse auf, durch die der Mikrokanal in die Messzelle hinein- und aus der Messzelle herausragt, wobei ein Teil des in die Messzelle hineinragenden Mikrokanals und ein Teil des aus der Messzelle herausragenden Mikrokanals mittels eines in alle Raumrichtungen bewegbaren und mit der Messzelle nicht in Verbindung stehenden Mittels fest verbunden ist.
In einer weiteren Ausführungsform der erfindungsgemäßen Vorrichtung weist die Messzelle Durchführungen zum Befüllen der Messzelle mit einer Flüssigkeit, zum Entlüften der Messzelle, zum Durchführen von Lichtquellen und Sensoren, beispielsweise von Lichtleitern zur Einkopplung von Licht in die Messzelle oder von Lichtschranken oder Elektroden zur Positionsbestimmung von Proben im Mikrokanal oder zum Durchführen von Objektiven zum Emittieren und Detektieren von elektromagnetischer Strahlung auf.
Durch den Anschluss von Lichtleitern, die Licht in die Proben im Mikrokanal einkoppeln können, wird ermöglicht, dass eine einseitige oder beidseitige Anregung der Proben (Zellen) in den Tropfen eines Probenschlauches über Lichtleiter, beispielsweise für die Lluorenzenzmikro skopie erfolgen kann. Spektroskopische (Turbidimetrie, Nephelometrie u.a.) Messungen und Kombinationen aus unterschiedlichen optischen Detektionsmethoden sind damit in vorteilhafter Weise realisierbar. Es ist möglich, mehrere parallel angeordnete optische und fluidische Ein/ Ausgänge an der Messzelle zu realisieren.
In einer bevorzugten Ausführungsform der erfindungs gemäßen Vorrichtung weist die Messzelle einen Rahmen mit Dichtungen für den Mikrokanal und zwei mit dem Rahmen flüssigkeitsdicht (z.B. Dichtungen, Klebeverbindungen) verbundene Platten aus durchsichtigem Material, vorzugsweise einem Kunststoff oder Glas, besonders bevorzugt aus Glas, für den optischen Strahlengang des Mikroskopobjektivs auf. Die Messzelle weist einen durchgeführten Mikrokanal, wie beispielsweise einen Probenschlauch, auf, der über einen Eingang in die Messzelle eingeführt wird und über einen Ausgang aus der Messzelle herausgeführt wird. Weitere Anschlüsse der Messzelle dienen dem Befüllen der Kammer mit der wässrigen Llüssigkeit sowie dem Entlüften der Kammer. Der Mikrokanal, wie beispielsweise ein Probenschlauch, kann durch den Eingang und den Ausgang durch die Kammer hindurch vor- oder zurückgezogen werden und/oder um die Achse des Probenschlauches gedreht werden. Dadurch ist es möglich, die im Probenschlauch befindlichen Proben, z.B. Kompartimente, Tropfen, exakt im Bereich des Strahlenganges des Mikroskopobjektivs zu positionieren. Diese Möglichkeit des Ziehens und Drehens des Probenschlauches ist für den Fall der Verwendung von Spritzenpumpen zum Probentransport essenziell, da mit Spritzenpumpen ein exaktes Positionieren der Tropfen nicht möglich ist. Im Fall der Verwendung von druckbasierten Pumpsystemen ist ein exaktes Positionieren der Probe auch ohne die Relativbewegung des Schlauches möglich. Die beiden Platten zur Abdichtung der Messzelle können beispielsweise Deckgläser sein.
In einer weiteren Ausführungsform der erfindungsgemäßen Vorrichtung weist die Messzelle Anschlüsse auf, die mit einem Konditionierungsmodul verbunden sind, wobei eine Pumpe konditionierte Flüssigkeit aus dem Konditionierungsmodul durch die Messzelle und zurück zum Konditionierungsmodul fördert. Die Konditionierung der Flüssigkeit, die dann in die Messzelle eingebracht wird und den Mikrokanal umgibt, kann beispielsweise folgende Parameter umfassen: Wassertemperatur T, 02- und C02-Konzentration. Ein Gasaustausch ist beispielsweise über einen PTFE-Schlauch in bestimmten Grenzen möglich. Dadurch wird die Konditionierung des 02- und des pH-Wertes des Fluids in dem Mikrokanal, insbesondere im Tropfen, ermöglicht. Die Möglichkeit zur Konditionierung erlaubt damit auch länger andauernde Untersuchungen in der Messzelle.
Die Messzelle der erfindungsgemäßen Vorrichtung besteht aus optisch transparenten Materialien oder optisch nicht transparenten Materialien oder aus einer Kombination oder einem Verbund optisch transparenter und nicht transparenter Materialien, wie beispielsweise aus Glas, geeigneten Kunststoffen, Metall oder Kombinationen oder Verbunden davon.
In einer weiteren Ausführungsform der erfindungs gemäßen Vorrichtung ist die Messzelle eine Glasküvette. Diese weist einen Deckel und einen Boden auf, in denen der Mikrokanal abgedichtet und dreh- und verschiebbar geführt ist Die Glasküvette ist mit einer wässrigen Flüssigkeit gefüllt. Die Beleuchtung kann wiederum beidseitig erfolgen.
In einer weiteren Ausführungsform der erfindungs gemäßen Vorrichtung ist die Messzelle eine Messzelle für Tauchobjektive, die wiederum mit einer wässrigen Flüssigkeit gefüllt ist und Tauchobjektive verwendet. Die Mikrokanaldurchführung und Mikrokanalbewegung erfolgt analog zu den bisher vorgestellten Ausführungsformen der Messzellen.
In einer Ausführungsform kann die Messzelle geschlossen sein. Die Durchführungen für den Mikrokanal sind dann mit Dichtungen versehen. In Abhängigkeit des verwendeten Mikroskops kann es konstruktiv bevorzugt sein, dass die Einleitung und die Ausleitung des Mikrokanals an einer Fläche der Messzelle, vorzugsweise an einer Seite, wie beispielsweise an deren Deckel erfolgen. Der Mikrokanal, beispielweise ein Probenschlauch, kann an einem Ende gezogen und in gleicher Weise gleichzeitig am anderen Ende geschoben werden oder nur an einem Ende gezogen oder nur an einem Ende geschoben werden oder an beiden Enden gleichzeitig gezogen oder geschoben werden, um die im Probenschlauch befindlichen Proben, z.B. Kompartimente, Tropfen, exakt im Bereich des Strahlenganges des Mikroskopobjektivs zu positionieren.
In einer weiteren besonders bevorzugten Ausführungsform ist die Messzelle nach oben hin offen, aber ebenfalls mit einer Flüssigkeit befüllt. In diesem Fall erfolgt die Fixierung des Mikrokanals, wie beispielsweise eines Probenschlauches, nicht an der Messzelle, sondern unabhängig von der Messzelle. Der so fixierte Probenschlauch kann als Ganzes in alle Raumrichtungen bewegt und in gewissen Grenzen auch gedreht werden, um die im Probenschlauch befindlichen Proben, z.B. Kompartimente oder Tropfen, exakt im Bereich des Strahlenganges des Mikroskopobjektivs zu positionieren.
In einer weiteren Ausführungsform der erfindungsgemäßen Vorrichtung weist die Messzelle zusätzlich ein Zudosiermodul auf. Das Zudosiermodul weist ein Mikroventil zur definierten und zielgenauen Zugabe von Wirkstoffen zu den Proben im Mikrokanal sowie Mittel zur Positionierung der Proben in den Mikrokanal dem Strahlengang eines Mikroskops, wie Lichtschranken, Messelektroden, Sensoren oder eine Kamera auf. Damit können einerseits in vorteilhafter Weise die im Mikrokanal befindlichen Proben, z.B. Kompartimente oder Tropfen, exakt im Bereich des Strahlenganges des Mikroskopobjektivs positioniert werden. Andererseits ist es möglich, in situ Untersuchungen an den Proben durchzuführen, in dem Wirkstoffe, Testsubstanzen usw. direkt zu den im Mikrokanal befindlichen Proben zudosiert werden können. Aufgrund der Vielzahl der getrennten und seriell angeordneten Proben in einem zweiphasigen oder mehrphasigen Fluid in dem Mikrokanal ist es daher möglich, eine Vielzahl verschiedener Untersuchungen und Tests in kurzer Zeit durchzuführen bzw. die Wirkung einer Vielzahl von Testsubstanzen im Hochdurchsatz zu untersuchen.
Durch die an der Messzelle vorhandenen Anschlüsse ist es auch möglich, die in der Messzelle vorhandene Flüssigkeit auszutauschen und deren Zusammensetzung so anzupassen, dass die Flüssigkeit einen Brechungsindex aufweist, der mit der Wandung des Mikrokanals und dem sich in dem Mikrokanal befindlichen Fluid vergleichbar ist. In einer besonders bevorzugten Ausführungsform weist die erfindungsgemäße Vorrichtung deshalb ein Mittel zum Einstellen des Brechungsindexes der Flüssigkeit in der Messzelle auf. Dabei handelt es sich beispielsweise um ein System mit mindestens einem Vorratsbehälter für Flüssigkeiten und mindestens einer Pumpe sowie entsprechenden Schläuchen, mit deren Hilfen die Messzelle mit der gewünschten Flüssigkeit befüllbar ist.
Die erfindungsgemäße Vorrichtung ist besonders geeignet für Verwendung am Aufrecht- bzw. Inversmikroskop. Es konnte gezeigt werden, dass die Qualität der optischen Abbildung von Zellen in Tropfen, die sich in einem PTFE-Schlauch befanden, der sich in einer mit Wasser befüllten Messzelle befand, erheblich gesteigert werden konnte gegenüber Abbildungen von Zellen in Tropfen, die sich in einem PTFE-Schlauch befanden, der sich nicht in einer mit Wasser befüllten Messzelle befand. Durch die Verwendung von FEP-Schlauch mit im Vergleich zu PTFE-Schläuchen höheren Transparenz lässt sich die Qualität der optischen Abbildung noch weiter steigern. Ebenso ist mit einer Miniaturisierung der Messzelle und einer Verringerung der Wandstärke des Schlauches infolge der geringeren optischen Weglängen eine weitere Verbesserung der Bildqualität erreichbar.
Die erfindungsgemäße Vorrichtung kann, wie nachfolgend beschrieben, so ausgestaltet sein, dass die Probenpositionierung im Strahlengang einer optischen Abbildung automatisiert erfolgt. Damit kann die erfindungs gemäße Vorrichtung in vorteilhafter Weise auch in der Lichtblattmikroskopie eingesetzt werden und zur Probenuntersuchung im Hochdurchsatz verwendet werden. Dazu kann der Mikrokanal der erfindungsgemäßen Vorrichtung in einer weiteren Ausführungsform in einer Schlauchsonde enthalten sein. Die Messzelle kann beispielsweise eine für die Verwendung in einem Lichblattmikroskop geeignete Messzelle darstellen, wobei die Messzelle für das Lichtblattmikroskop ebenfalls mit einer Flüssigkeit gefüllt ist, was in der Verbesserung der Qualität der optischen Abbildung von Proben im Mikrokanal resultiert. Der Mikrokanal in der Schlauchsonde ist vorzugsweise in der flüssigkeitsgefüllten Messzelle eines Lichblattmikroskop s positionierbar.
Die Messzelle für das Lichtblattmikroskop ist vorzugsweise nach oben hin offen und weist mindestens eine Bohrung für das Einsetzen eines Objektivs zur Fluoreszenzmessung und/oder mindestens eine Bohrung für das Einsetzen eines Beleuchtungsobjektivs für ein Lichtblatt auf. Vorzugsweise weist die Messzelle für das Lichtblattmikroskop eine Bohrung für das Einsetzen eines Objektivs zur Fluoreszenzmessung und zwei Bohrungen für das Einsetzen von zwei um l80°versetzte Beleuchtungsobjektive für zwei Lichtblätter auf. In einer weiteren Ausführungsform weist die erfindungsgemäße Vorrichtung mindestens ein Mittel zur Positionsbestimmung von Proben im Mikrokanal, vorzugsweise mindestens eine Lichtschranke, Kamera, eine Messelektrode oder einen Sensor, auf. Diese Ausgestaltung der erfindungsgemäßen Vorrichtung ist besonders vorteilhaft, da so die Proben in dem Mikrokanal, wie zum Beispiel Tropfen in einem Probenschlauch, der ein zweiphasiges oder mehrphasiges Fluid enthält, oder Zellen und/oder Sphäroide in einem Mikrokanal, der ein einphasiges Fluid enthält, exakt im Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung positioniert werden können. In Kombination mit Pumpen arbeitet das System zudem automatisiert. Das Ausgangssignal des Mittels zur Positionsbestimmung von Proben schaltet die Pumpe(n) definiert ab und das die Proben enthaltende Fluid stoppt unmittelbar. Damit ist eine definierte Vorwahl der Probenposition im Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung möglich. Das bereits beschriebene Schwingen der Proben aufgrund der notwendigen Regelung der Pumpe(n) wird eliminiert durch die fluidische Entkopplung der Pumpe(n) vom Mikrokanal und damit von der Probensequenz während der optischen Detektion. Das kann mittels Absperrhähnen erfolgen, die im Bereich zwischen den Druckpumpen und der Messzelle angeordnet sind.
Die Kombination einer nach oben offenen Messzelle mit dem Pumpen-basierten Probentransportsystem bietet hervorragende Voraussetzungen beispielsweise für tomografische Bildaufnahmeverfahren in seriellem Durchsatz. Wünschenswert wäre eine Feinjustierung, um beispielsweise tomographische Aufnahmen der Probe erzeugen zu können. Dieses Problem wird durch eine weitere Ausführungsform der erfindungs gemäßen Vorrichtung gelöst, wobei die Vorrichtung ein Mittel zum automatischen Bewegen der Schlauchsonde, die einen Mikrokanal aufweist, innerhalb der mit einer Flüssigkeit gefüllten Messzelle des Lichtblattmikroskops, vorzugsweise einen Piezoantrieb, aufweist. Dieses Mittel zum automatischen Bewegen des Mikrokanals dient der Feinjustierung und ermöglicht es, den Probenschlauch in beliebigen Richtungen im Raum zu bewegen und so die Probe aus verschiedenen Richtungen zu charakterisieren oder z-Stapel zu erzeugen und somit eine räumliche Charakterisierung der Proben und der in den Proben befindlichen Zellen und/oder 3D Zellstrukturen zu realisieren.
Die Erfindung stellt weiterhin eine Messzelle für die optische Charakterisierung von Fluiden und/oder darin eingeschlossener Objekte in Mikrokanälen bereit. Durch die Messzelle wird ein Mikrokanal geführt, wobei die Messzelle Durchführungen zum Befüllen der Messzelle mit einer Flüssigkeit, zum Entlüften der Messzelle, zum Durchführen von Lichtquellen und Sensoren, beispielsweise von Lichtleitern zur Einkopplung von Licht in die Messzelle oder von Lichtschranken oder Elektroden zur Positionsbestimmung von Proben im Mikrokanal oder zum Durchführen von Objektiven zum Emittieren und Detektieren von elektromagnetischer Strahlung aufweist. Erfindungsgemäß ist die Messzelle mit einer Flüssigkeit gefüllt, der Mikrokanal befindet sich innerhalb der Messzelle in der Flüssigkeit und der Mikrokanal innerhalb der Messzelle und/oder die Messzelle mit dem Mikrokanal ist manuell oder automatisch bewegbar.
Die Vorrichtung und die Messzelle sind in vorteilhafter Weise dazu geeignet, eine definierte Vorwahl der Probenposition im Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung eines Mikroskops zu ermöglichen und optische Abbildungen von Proben im Mikrokanal in verbesserter Qualität bereitzustellen. Das Erzeugen von optischen Abbildungen von Proben im Mikrokanal ist mit der erfindungsgemäßen Vorrichtung automatisierter und für die Untersuchung von Proben im Hochdurchsatz anpassbar. Weitere Ausführungsformen der erfindungsgemäßen Vorrichtung ermöglichen das Erzeugen tomo grafischer Bildaufnahmen in seriellem Durchsatz.
In diesem Zusammenhang stellt die Erfindung auch ein Verfahren zur optischen Charakterisierung von Fluiden und/oder darin eingeschlossener Objekte in einem Mikrokanal mittels der hierin beschriebenen Vorrichtung bereit, wobei sich der Mikrokanal innerhalb einer erfindungsgemäßen Messzelle befindet, die mit einer Flüssigkeit gefüllt ist, und das Verfahren die Schritte umfasst:
a) Bereitstellen eines Proben-enthaltenden einphasigen, zweiphasigen oder mehrphasigen Fluids in einem Mikrokanal; und
b) Positionieren der in dem Mikrokanal enthaltenen Proben im Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung eines Mikroskops,
dadurch gekennzeichnet, dass die Positionierung der in dem Mikrokanal enthaltenen Proben im Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung erfolgt durch
c) manuelles axiales Verschieben und/oder Rotieren des Mikrokanals gegenüber der Messzelle; oder
d) automatisches Bewegen des Mikrokanals innerhalb der mit einer Flüssigkeit gefüllten Messzelle, vorzugsweise mittels eines Piezoantriebs; e) automatisches oder manuelles Bewegen der mit einer Flüssigkeit gefüllten Messzelle, die den Mikrokanal enthält, mittels Bewegung des Mikroskoptisches in den drei Raumrichtungen .
Das automatische Bewegen der mit einer Flüssigkeit gefüllten Messzelle, die den Mikrokanal enthält, erfolgt in einer bevorzugten Ausführungsform durch Bewegen des Mikroskoptisches in den drei Raumrichtungen mittels Schrittmotoren.
In einer weiteren Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahrens kann die Positionierung von in dem Mikrokanal enthaltenen Proben erfolgen durch
f) Bewegen der Tropfen im Probenschlauch mittels einer oder mehrerer Pumpen und Stoppen der Pumpe(n), wenn sich die Probe im Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung befindet; oder
g) exaktes Bewegen der Tropfen im Probenschlauch mittels einer oder mehrerer Pumpen, Stoppen der Pumpe(n) und fluidisches Entkoppeln der Pumpe(n) von der Tropfensequenz im Mikrokanal mittels Ventilen von der Tropfensequenz im Probenschlauch, wenn sich die Probe im Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung befindet.
Besonders bevorzugt ist es, wenn in dem erfindungsgemäßen Verfahren die Positionierung von in dem Mikrokanal enthaltenen Proben erfolgt durch
h) automatische Erkennung von Proben im Mikrokanal mit Hilfe eines Mittels zur Positionsbestimmung der Proben im Mikrokanal, vorzugsweise mittels einer Kamera, einer Messelektrode oder mittels Lichtschranken und Stoppen der Pumpe(n), wenn sich die Probe im Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung befindet.
Zum Bewegen der Tropfen im Probenschlauch können beispielsweise eine Schlauchpumpe (Rollenpumpe) oder Druckpumpen, die vorzugsweise mit verschiedenen Drücken (Druck, Unterdrück) arbeiten, wobei wechselnde Druckverhältnisse mittels Drucksensoren geregelt werden, verwendet werden.
Für die erfindungsgemäße Messzelle und das erfindungs gemäße Verfahren gelten die gleichen bevorzugten Ausgestaltungen und Ausführungsformen, wie für die erfindungsgemäße Vorrichtung beschrieben, so dass auf die detaillierte Beschreibung der erfindungsgemäßen Vorrichtung Bezug genommen wird und auf weitere Wiederholungen verzichtet wird.
Die erfindungsgemäße Vorrichtung und das erfindungs gemäße Verfahren haben zahlreiche Vorteile. Für die tropfenbasierte Mikro fluidik und insbesondere für die technologische Plattform„ pipe based bioreactors“ spielt die schnelle, reproduzierbare und hochaufgelöste optische Detektion biologischer Proben eine dominierende Rolle. Die erfindungsgemäße Vorrichtung und das erfindungsgemäße Verfahren können als einfaches Durchflusssystem für mikroskopische/spektroskopische Routineuntersuchungen bis hin zu Anwendungen für automatisierte, tomografiebasierte bildgebende Verfahren eingesetzt werden und besitzen damit ein breites Anwendungspotenzial. Sowohl für die Messzelle im Lichtblattmikroskop als auch für die Messzelle am Aufrecht-/Inversmikroskop ist auch die Möglichkeit des gleichmäßigen, kontinuierlichen Flusses der Tropfen gegeben. Beim Lichtblattmikroskop könnten damit tomografische Untersuchungen im Durchfluss durchgeführt werden. Voraussetzung ist, dass die Bilder schnell genug aufgenommen und durch den PC verarbeitet werden können. Dies wurde bereits erfolgreich durch Jiang, H. et al (2017) demonstriert. Ebenso ist es möglich, einphasige Fluide bzw. darin befindliche Objekte wie Zellen oder 3D- Zellstrukturen zu untersuchen. Auch für die einphasigen Fluide besteht die Möglichkeit, diese bzw. darin befindliche 3D-Zellstrukturen kontinuierlich oder im Start-Stopp-Betrieb zu untersuchen.
Die Erfindung wird nachfolgend anhand von 12 Zeichnungen näher veranschaulicht.
Es zeigen:
Figur 1 die Herstellung von Tropfen aus Zellkulturmedium (DMEM, grau)
kompartimentiert in einem öligen Fluid (PFD, transparent);
Figur 2 den Aufbau einer erfindungs gemäßen Messzelle;
Figur 3 eine Ausführungsform der erfindungsgemäßen Messzelle als Mikroskopierzelle;
Figur 4 weitere Ausführungsformen der Messzelle als Glasküvette und als
materialunabhängige Messzelle mit Tauchobjektiven; Figur 5 weitere Ausführungsformen der Messzelle mit einseitiger Zu- und Abführung des Schlauches, als geschlossene Messzelle und als nach oben hin offene Messzelle;
Figur 6 die Unterschiede zwischen mikroskopischen Aufnahmen von Zellen in Tropfen, die sich in einem PTFE-Schlauch befinden, mit und ohne erfindungsgemäße Messzelle;
Figur 7 Varianten zum Bewegen und Positionieren der Tropfen im Bereich des
Strahlenganges der optischen Abbildung eines Mikroskops;
Figur 8 Prinzipdarstellungen der Messzelle für ein Fichtblattmikroskop;
Figur 9 eine Prinzipdarstellung des fluidischen Regimes am Fichtblattmikroskop;
Figur 10 ein Zudosiermodul für die erfindungsgemäße Messzelle auf der Basis der
Bestimmung von Position und Geschwindigkeit der Proben mittels zwei
Fichtschranken;
Figur 11 Prinzipdarstellung des fluidischen Regimes am aufrechten oder inversen
Mikroskop; und
Figur 12 die Positionserkennung von Stammzellsphäroiden in einem Tropfen in einem
Mikrokanal.
Figur 1 zeigt Teile eines„pipe based bioreactors“ (pbb) des Standes der Technik. Tropfen (20) aus Zellkulturmedium (DMEM, grau gefärbt) werden in einem aus Polycarbonat bestehenden mikrofluidischen Modul generiert und sind durch ein öliges Fluid (PFD, transparent) getrennt. Fig. 1A veranschaulicht die Tropfengenerierung. Im rechten Bereich des Kanals des mikrofluidischen Moduls befindet sich der Anschluss des Probenschlauches (13). Fig. 1B zeigt die Tropfensequenz in einem auf eine Schlauchdisk (50) auf gewickelten Probenschlauch (13). Die Schlauchdisk (50) mit den darin befindlichen Kompartimenten (Tropfen (20)) kann mehrere Wochen im Inkubator kultiviert werden, wobei in bestimmten Abständen eine Detektion der in den Tropfen (20) befindlichen Zellen erfolgen muss. Dazu wird im einfachsten Fall die Schlauchdisk (50) aus dem Inkubator entnommen und mikroskopiert.
Jeder Tropfen (20) kann dabei als„Mikrobioreaktor“ betrachtet werden. Die wässrigen Tropfen (20) werden mit einem mit Wasser nicht mischbarem Fluid separiert, beispielsweise einem Öl. In dem hier gezeigten Fall handelt es sich dabei um Perfluordecalin (PFD). PFD ist biologisch völlig inert, hat eine hohe Sauerstoffaufnahmekapazität und wird im medizinischen Bereich beispielsweise zum Transport von Transplantaten verwendet. Der Probenschlauch (13), aufgrund der Notwendigkeit hydrophober Oberflächeneigenschaften vorzugsweise entweder aus Polytetrafluorethylen (PTFE) oder Fluorethylenpropylen (FEP) bestehend, hat vorzugsweise eine Länge von drei Metern, ist auf einer Disk (50) aufgewickelt (Fig. 1B) und fasst bis zu 900 Tropfen.
Fig. 2A zeigt den Schnitt durch eine Messzelle (10) und verdeutlicht die Aufgabe der in der Messzelle (10) befindlichen Flüssigkeit (14). Diese ist im hier gezeigten Fall Wasser. Das Wasser (14) gleicht Unebenheiten der Außenfläche des Probenschlauches (13) aus und verhindert dadurch Lichtstreuungen, die im Fall ohne Wasser (14) (Brechungsindex nwasser=l,333) beim Übergangs des Lichts von Luft (Brechungsindex nmft=l) in den Probenschlauch (13) (Brechungsindex nFEP=l,344) und aus dem Probenschlauch (13) in die Luft zurück signifikant wären. Streueffekte würden eine deutlich schlechtere Abbildung verursachen (siehe auch die Figuren 6A und 6B) als bei der Verwendung von Wasser (14) als Umgebungsmedium (siehe Figuren 6C und 6D). Fig. 2B zeigt die technische Realisierung der Messzelle (10) als Mikroskopiermodul mit durchgeführtem Probenschlauch (13), (15: Eingang, 16: Ausgang) sowie dem Anschluss (17) zum Befüllen der Messzelle (10) mit einer wässrigen Flüssigkeit (14) und Anschluss (18) zum Entlüften der Kammer der Messzelle (10). Der Probenschlauch (13) kann über die Anschlüsse (15), (16) durch die Messzelle (10) gezogen werden (in Richtung der Pfeile bzw. in umgekehrter Richtung) und/oder um die Achse des Probenschlauches (13) gedreht werden. Dadurch ist es möglich, die im Probenschlauch (13) befindlichen Proben (20), z.B. Kompartimente, exakt im Bereich des Strahlenganges des Mikroskopobjektivs (nicht gezeigt) zu positionieren. Diese Möglichkeit des Ziehens und Drehens des Probenschlauches (13) ist für den Fall der Verwendung von Spritzenpumpen zum Probentransport essenziell, da mit Spritzenpumpen ein exaktes Positionieren der Tropfen (20) nicht möglich ist. Im Fall der Verwendung von druckbasierten Pumpsystemen ist ein exaktes Positionieren des Tropfens (20) auch ohne die Relativbewegung des Schlauches (13) möglich. Zur Abdichtung der Kammer der Messzelle (10) wurden Glasplatten (12) (Deckgläser: nGias=l,5255) verwendet. Dies ist von Vorteil, da die Lichtübergänge optisch korrigiert werden können. Die Messzelle (10) kann mit einem externen Konditionierungsmodul verbunden werden, z.B. über die Anschlüsse (17) und (18) in Fig. 2B, und eine Pumpe fördert dann über die Schläuche (13‘) konditionierte Flüssigkeit aus dem Konditioniermodul durch die Messzelle (10) und zurück zum Konditionierungsmodul (Kreislauf). Die Konditionierung der Flüssigkeit (14) kann folgende Parameter umfassen: Wassertemperatur T, 02- und C02-Konzentration. Ein Gasaustausch ist beispielsweise über einen aus PTFE bestehenden Probenschlauch (13) in bestimmten Grenzen möglich, dadurch ist die Konditionierung des 02- und des pH-Wertes im Tropfen (20) möglich. Die Möglichkeit zur Konditionierung erlaubt damit auch länger dauernde Untersuchungen in der Messzelle (10).
Durch die an der Messzelle (10) vorhandenen Anschlüsse (17, 18) ist es auch möglich, die in der Messzelle vorhandene Flüssigkeit (14) auszutauschen und deren Zusammensetzung so anzupassen, dass die Flüssigkeit (14) einen Brechungsindex aufweist, der mit der Wandung des Probenschlauchs (13) und dem sich in dem Probenschlauch (13) befindlichen Fluid vergleichbar ist. Dazu kann die Vorrichtung (200) ein Mittel zum Einstellen des Brechungsindexes der Flüssigkeit (14) in der Messzelle (10) auf. Dabei handelt es sich beispielsweise um ein System mit mindestens einem Vorratsbehälter für Flüssigkeiten und mindestens einer Pumpe sowie entsprechenden Schläuchen (13‘), mit deren Hilfen die Messzelle mit der gewünschten Flüssigkeit (14) befüllbar ist.
Figur 3 zeigt eine Ausführungsform der Messzelle (10). Fig. 3A zeigt die einfachste Ausführungsform der Anordnung der Messzelle (10) als Mikroskopierzelle. Zu erkennen ist die Position des Objektivs (30) für die Fichtmikro skopie oder die Epifluoreszenzmikroskopie. In dem vom Rahmen (11) und den Glasfenstern (12) gebildeten Raum befindet sich als Flüssigkeit (14) Wasser oder alternativ ein Öl, wie Perfluordecalin. Die in Fig. 2B dargestellten Anschlüsse (17) und (18) zum Befüllen der Kammer der Messzelle (10) können auch belegt werden durch beispielsweise Fichtleiter (22), die Ficht in die Proben (20) im Schlauch (13) einkoppeln und darin befindliche Fluoreszenzfarbstoffe anregen (Fig. 3B). Spektroskopische (Turbidimetrie, Nephelometrie, u.a.) Messungen und Kombinationen aus unterschiedlichen optischen Detektionsmethoden sind realisierbar. Es ist möglich, mehrere parallel angeordnete optische und fluidische Ein/ Ausgänge im Bereich der Anschlüsse (17) und (18) zu realisieren. Fig. 3C zeigt die Draufsicht des in Fig. 3A gezeigten Bildes. Figur 4 zeigt weitere Ausführungsformen der Messzelle (10). In Fig. 4A wird der Schlauch
(13) durch eine Messzelle (10) geführt, die als Glasküvette ausgeführt ist. Diese weist einen Deckel und einen Boden auf, in denen der Probenschlauch (13) abgedichtet und dreh- und verschiebbar geführt ist (vergleichbar mit Fig. 2). Die Messzelle (10) ist mit einer Flüssigkeit
(14), wie Wasser oder einem Öl, gefüllt. Die Beleuchtung kann wiederum beidseitig erfolgen. Fig. 4B zeigt eine Anordnung mit einem materialunabhängigen Gehäuse der Messzelle (10), das wiederum mit einer Flüssigkeit (14), wie Wasser oder einem Öl gefüllt ist und Tauchobjektive (30) verwendet. Die Schlauchdurchführung und Schlauchbewegung erfolgt analog zu den bisher vorgestellten Varianten der Messzellen (10).
Figur 5 zeigt weitere Ausführungsformen der Messzelle (10). In Fig. 5A ist die Messzelle (10) geschlossen, mit Wasser (14) befüllt und die Schlauchdurchführungen sind mit Dichtungen (21) versehen. Der Probenschlauch (13) kann an einem Ende gezogen und in gleicher Weise gleichzeitig am anderen Ende geschoben werden oder nur an einem Ende gezogen oder nur an einem Ende geschoben werden oder an beiden Enden gleichzeitig gezogen oder geschoben werden. In Fig. 5B ist die Messzelle (10) nach oben hin offen, aber ebenfalls mit Wasser (14) befüllt. In diesem Fall erfolgt die Fixierung des Probenschlauches (13) nicht an der Messzelle (10) (vgl. Fig. 5A), sondern unabhängig von der Messzelle (10). Der so fixierte Probenschlauch (13) kann als Ganzes in alle Raumrichtungen bewegt und in gewissen Grenzen auch gedreht werden. Die beiden in Fig. 5A und Fig. 5B gezeigten Ausführungsformen sind sowohl als Glasküvette, als auch als materialunabhängiges Gehäuse realisierbar (vgl. Fig. 4). „Materialunabhängiges“ Gehäuse bedeutet, dass das Gehäuse aus allen geeigneten Materialien bestehen kann, wie beispielsweise Glas, einem Kunststoff, einem Metall oder Kombinationen oder Verbunden davon, vorausgesetzt, dass die in diesem Fall Durchführungen in die Gehäusewände einbringbar sind, die es ermöglichen, Objektive (30) eines Mikroskops, wie in Fig. 4B gezeigt, in die Messzelle (10) einzubringen.
Figur 6 verdeutlicht die Unterschiede zwischen mikroskopischen Aufnahmen von Zellen in Tropfen (20), die sich in einem Probenschlauch (13) aus PTFE befinden. Fig. 6A und 6B wurden durch einen Probenschlauch (13) ohne Messzelle (10) aufgenommen, bei den Fig. 6C und 6D befand sich der Probenschlauch (13) in einer mit Wasser (14) befüllten Messzelle (10) (vgl. Fig. 2B). Untersucht wurden KGl-Zellen in RPMI-Medium, segmentiert mit PFD in vergleichbaren Probenschläuchen (13) (PTFE-Schlauch, di=l,0mm, da=l,60 mm). Es erfolgten Phasenkontrastaufnahmen unter folgenden Bedingungen: Fig. 6A: 40x Vergrößerung, ohne Messzelle (10).
Fig. 6B: 600x Vergrößerung, fokussiert auf Zellansammlung im Bereich des markierten
Quadrates in Fig. 6A, ohne Messzelle (10).
Fig. 6C: 40x Vergrößerung, mit Messzelle (10), gefüllt mit Wasser (14).
Fig. 6D: 600x Vergrößerung, fokussiert auf Zellansammlung im Bereich des markierten
Quadrates in Fig. 6C, mit Messzelle (10), gefüllt mit Wasser (14).
Figur 7 zeigt zwei Varianten zum Bewegen und Positionieren der Tropfen (20) im Bereich des Strahlenganges der optischen Abbildung mittels der erfindungsgemäßen Vorrichtung (200). Hier ist eine spezielle Variante für eine mikroskopische Charakterisierung von Tropfen (20) und darin befindlichen Zellen in einem Lichtblattmikroskop, angedeutet durch die Objektive (30) des Lichtblattmikroskops, dargestellt. Fig. 7A zeigt den relativ einfachen Aufbau auf der Basis einer Spritzenpumpe (60). Fig. 7B zeigt den Aufbau mit Pumpen (70, 70‘). Die Pumpen (70, 70‘) sind hier als Druckpumpen ausgeführt. Um die Tropfen (20) exakt im Bereich der optischen Abbildung positionieren zu können, ist eine Tropfenpositionsbestimmung (41) erforderlich. Das kann mittels einer Lichtschranke erfolgen, kann aber auch mit einer Kamera und einer schnellen Bildauswertung realisiert werden. Das Ausgangssignal der Tropfenpositionsbestimmung (41) schaltet die Pumpe (60) ab, wobei sich im Fall der Spritzenpumpe die Tropfensequenz weiterbewegt und erst nach einem Druckausgleich im Probenschlauch (13) zum Stehen kommt. Die in Fig. 7B dargestellte technische Lösung beruht auf der Anwendung von druckbasierten Pumpen und umgeht das oben geschilderte Problem des Nachlaufens der Tropfensequenz. Auch hier ist ein System zur Bestimmung der Tropfenposition (41) notwendig. Das von diesem System ausgehende Signal schaltet die Druckpumpen (70, 70‘) definiert ab und die Tropfensequenz stoppt unmittelbar. Damit ist eine definierte Vorwahl der Tropfenposition im Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung möglich. Das bereits beschriebene Schwingen der Tropfen aufgrund der notwendigen Regelung der Druckpumpen (70, 70‘) wird eliminiert durch die fluidische Entkopplung der Druckpumpe(n) (70, 70‘) vom Probenschlauch (13) und damit von der Tropfensequenz während der optischen Detektion. Das kann mittels Absperrhähnen (90, 90‘) erfolgen, die im Bereich zwischen den Druckpumpen (70, 70‘) und der Messzelle (10) angeordnet sind. Besonders vorteilhaft ist, wenn die Absperrhähne (90, 90‘) keine Volumen Verdrängung im Probenschlauch (13) hervorrufen, anderenfalls würden die Tropfen (20) Undefiniert sprunghafte Bewegungen ausführen; und dass die Tropfen (20) nicht durch die Absperrhähne (90, 90‘) transportiert werden, was durch die Positionierung der Absperrhähne (90) und (90‘) zwischen Vorratsbehälter und Schlauchdisk (50, 50‘) gegeben ist. Andernfalls würde dies zu Undefinierten Adhäsionseffekten in den Absperrhähnen (90, 90‘) führen. Nach Abschluss der Tropfendetektion schalten die Absperrhähne (90, 90‘) wieder auf Durchgang, und die Druckpumpen (70, 70‘) fördern den nächsten Tropfen der Tropfensequenz in den Bereich der optischen Abbildung des Mikroskops. Eine Feinjustierung (40) kann beispielsweise durch Bewegen des Mikroskoptisches oder durch einen Piezoaktuator erfolgen. So bietet die Kombination einer offenen Messzelle (vgl. Fig. 5B) mit dem Tropfentransportsystem mit Druckpumpen (70, 70‘) gemäß Fig. 7B hervorragende Voraussetzungen beispielsweise für tomografische Bildaufnahmeverfahren in seriellem Durchsatz. Die Feinjustierung (41) ermöglicht es, den Probenschlauch (13) in beliebigen Richtungen zu bewegen (z.B. mit Piezoaktoren) und so die Tropfen (20) aus verschiedenen Richtungen zu charakterisieren oder z-Stapel zu erzeugen und somit eine räumliche Charakterisierung der Tropfen (20) und der in den Tropfen (20) befindlichen Zellen bzw. 3D-Zellstrukturen zu realisieren. Die Zellen bzw. 3D-Zellstrukturen werden in Schlauchdisks (50, 50‘) über eine vorbestimmte Dauer kultiviert. Zur Beförderung der Proben (20) in dem Probenschlauch (13) wird mittels der Druckpumpen (70, 70‘) Fluid aus dem Vorratsbehälter (91) in den Vorratsbehälter (91‘) oder umgekehrt gefördert.
In einer einfacheren Ausführungsform kann die erfindungs gemäße Vorrichtung (200) anstelle der Druckpumpen (70, 70‘) auch eine Schlauchpumpe enthalten. Die Absperrhähne (90, 90‘) können dann ggf. entfallen.
Figur 8 zeigt Details einer Schlauchsonde (100) mit Mikrokanal bzw. Probenschlauch (13), die speziell für die Messzelle (120) eines Fichtblattmikroskops entwickelt und getestet wurde. Die Messzelle (120) befindet sich örtlich arretiert im Fichtblattmikroskop, kann aber vom Anwender herausgenommen und wiedereingesetzt werden. In die Messzelle (120) ragen die beiden um 180° versetzten Beleuchtungsobjektive (vgl. (30) in Figs. 7A und 7B) sowie ein Objektiv zur Erfassung der Fluoreszenz (siehe Fig. 8C). Die Messzelle (120) ist mit Wasser oder einer nichtwässrigen Flüssigkeit gefüllt. Dies dient der Angleichung der Brechungsindizes. Die Schlauchsonde (100) mit Probenschlauch (13) ragt frei beweglich in die Messzelle (120) und die darin befindliche Flüssigkeit, ist dabei jedoch mit dem Piezoantrieb (110) des Fichtblattmikroskops verbunden, der die Schlauchsonde (100) in drei Raumrichtungen verfahren und drehen kann. Fig. 5B zeigt eine Prinzipdarstellung der Schlauchsonde (100) mit Mikrokanal bzw. Probenschlauch (13), positioniert in der Messzelle (10) eines Lichtblattmikroskops. Fig. 8A zeigt den Teil der Schlauchsonde (100) mit Probenschlauch (13), der sich in der Messzelle (120) befindet. Fig. 8B zeigt die Schlauchsonde (100) in der Messzelle (120), mit der Türkamera (41) des Lichtblattmikroskops auf genommen. Die Schlauchsonde (100) weist ein Mikroskopierfenster (111) auf, das sich im Strahlengang der optischen Bilderzeugung des Mikroskops befindet. Fig. 8C zeigt eine 3D-Darstellung der Messzelle (120) und der Schlauchsonde (100) (Fig. 8B„aus dem Blatt heraus“, die Bohrung (130) ist für die Aufnahme eines Objektivs zur Fluoreszenzmessung vorgesehen, siehe auch Fig. 9). Fig. 8D zeigt die Seitenansicht von Fig. 8C. Die Bohrung (140) ist für den Einsatz eines der zwei um 180° versetzten Beleuchtungsobjektive für die Lichtblätter 1 und 2 vorgesehen (siehe auch Fig. 9).
Figur 9 zeigt eine Prinzipdarstellung des fluidischen Regimes am Lichtblattmikroskop. Für die optischen Aufnahmen der Zellkulturen in den Tropfen (20) ist es essenziell, dass die Tropfen (20) während der bis zu mehreren Minuten dauernden Aufnahmen ihre Position im Probenschlauch (13) keinesfalls verändern, was zu unscharfen Aufnahmen führen würde. Die für die tomografischen Aufnahmen notwendigen Veränderungen der Position der im Tropfen (20) befindlichen biologischen Objekte erfolgt durch die Bewegung der kompletten Schlauchsonde (100) durch den Piezoantrieb (110) des Lichtblattmikroskops, siehe Fig. 8. Für die Tropfen (20) ergeben sich zwei Zustände: i) während der Messung dürfen sich die Tropfen (20) im Probenschlauch (13) nicht bewegen und ii) nach der Messung muss die komplette Tropfensequenz im Probenschlauch (13) so bewegten werden, dass der nächste Tropfen (20) in die Fokusebene der Objektive (30) gelangt und dort definiert gestoppt wird. Die Realisierung dieser beiden Zustände wird nachfolgend beschrieben:
Die Pumpen (70, 70‘) erzeugen in den beiden Vorratsbehältem (91, 91‘) einen Überdruck PI bzw. einen Unterdrück P2. Die Tropfen (20) beginnen sich unmittelbar nach Applikation des Drucks gleichmäßig aus der Schlauchdisk (50) in Richtung der Messzelle (120) zu bewegen. Der Bereich des Fensters (111) der Schlauchsonde (100) (Fig. 8B) wird mit einer Videokamera (41) (Türkamera des Lichtblattmikroskops) überwacht und die Ergebnisse werden permanent in ein Matlab-Programm übernommen. Dabei wird eine Lichtintensität einer imaginären Linie ((150) in Fig. 8C und 8D) ausgewertet. Gelangt ein Tropfen (20) im Probenschlauch (13) in diesen Bereich des Fensters (111) der Schlauchsonde (100), ändert sich die Lichtintensität im Bereich dieser Linie (150), was von Matlab ausgewertet und dann als Signal zum Stoppen der Pumpen (70, 70‘) ausgegeben wird. Die Tropfensequenz bleibt dann unmittelbar stehen, der zu messende Tropfen (20) befindet sich im Bereich des optischen Strahlengangs des Lichtblattmikroskops. Die Pumpen (70, 70‘) regeln nach wie vor auf einen bestimmten Druckwert, was sich in einem„Zittern“ des Tropfens (20) äußern würde. Um dies zu vermeiden, schalten unmittelbar nach dem Stoppen der Tropfensequenz die Ventile (90) und (90‘) und entkoppeln die Pumpen (70, 70‘) und die Vorratsbehälter (90, 90‘) von der Tropfensequenz. Dadurch behalten der Tropfen (20) im optischen Strahlengang des Lichtblattmikroskops und auch die gesamte Tropfensequenz eine stabile Position und die Fluoreszenzmessung mit dem Lichtblattmikroskop kann durchgeführt werden. Nach Abschluss der Messung werden die Ventile (90) und (90‘) wieder geöffnet, die Pumpen (70, 70‘) gestartet und der nächste Tropfen (20) der Tropfensequenz in den Bereich des Fensters (111) der Schlauchsonde (100) gefördert. Die Positionierung und der Start der Messung erfolgt erneut wie oben beschrieben.
In der in Figur 9 gezeigten Anordnung der Vorrichtung (200) können die Pumpen als Druckpumpen (70, 70‘) ausgeführt sein, die vorzugsweise mit verschiedenen Drücken (Druck, Unterdrück) arbeiten, wobei wechselnde Druckverhältnisse mittels Drucksensoren geregelt werden.
Neben der hier beschriebenen Positionsbestimmung der Tropfen (20) ist auch die Positions bestimmung mittels Lichtschranken, Messelektroden oder Sensoren möglich, die gleichzeitig auch die Bestimmung der Tropfengeschwindigkeit erlauben würden.
Figur 10 zeigt die Messzelle (10) gemäß Figur 2B mit aufgesetztem Zudosiermodul (160). In diesem Zudosiermodul (160) werden die Position und die Geschwindigkeit der Tropfen (20) mittels zweier Lichtschranken (162, l62‘) bestimmt, um mittels eines Mikroventils (zu sehen durch das Kabel (161) definiert und zielgenau Wirkstoffe in die Tropfen (20) schießen zu können. Diese Lichtschranken (162, l62‘) sind prinzipiell auch in die Messzelle (10) direkt integrierbar, beispielsweise an deren Seitenflächen, wo sie den Mikroskopiervorgang nicht stören. Für das fluidische Regime der hier gezeigten Messzelle (10) mit Zudosiereinreichtung (160) gelten prinzipiell die gleichen Randbedingungen wie für die des Lichtblattmikroskops. Die Tropfen (20) sollen im Bereich des optischen Strahlengangs stabil positioniert werden. Dazu kann die gleiche fluidische Peripherie wie für die Messungen am Lichtblattmikroskop verwendet werden (siehe Schema in Figur 11). Im Gegensatz zum Lichtblattmikroskop, bei dem die Türkamera (41) und die daran angeschlossene Matlab-Software die Schaltsignale für die Pumpen (70, 70‘) und die Ventile (90) und (90‘) zur Verfügung stellen, würden die Signale hier von den in Messzelle (10) zu integrierenden Lichtschranken (162, l62‘) bzw. der daran angeschlossenen Hardware zur Signalaufbereitung geliefert werden.
Sind die Mikroskope mit automatisierten Objekttischen ausgerüstet, kann neben dem Positionieren der Tropfen (20) im Probenschlauch zusätzlich die Messzelle (10) in drei Raumrichtungen bewegt werden, was mit der Schlauchsonde (100) im Lichtblattmikroskop ähnlich durch geführt wird (Bewegen der gesamten Schlauchsonde (100) einschließlich Probenschlauch (13) mittels Piezoaktor (110)). Die Kopplung der Signalaufbereitung der Lichtschranken (162, l62‘) mit der Steuersoftware des jeweiligen Mikroskops eröffnet zudem die Möglichkeit für automatisierte tomografische Untersuchungen der Tropfen (20).
Figur 12B zeigt ein Stammzellsphäroid (mit Kästchen markiert) in einem Tropfen (20). Figur 12A zeigt den zugehörigen Signalverlauf einer Lichtschranke mit deutlichen Signaländerungen an den Phasengrenzen des Tropfens (20) und im Bereich des Stammzellsphäroiden.
Liste der Bezugszeichen
10 Messzelle
11 Rahmen
12 Platte aus lichtdurchlässigen Material, Glasplatte
13 Mikrokanal, Probenschlauch
13‘ Schlauch
14 wässrige Flüssigkeit, Wasser, Puffer, Nährmedium
15 Eingang für Mikrokanal, Probenschlauch
16 Ausgang für Mikrokanal, Probenschlauch
17, 18 Anschlüsse für Konditionierungs schlauch oder Lichtleiter
19 Dichtung für Gehäuse der Messzelle
20 Probe, Tropfen
21 Dichtung für Mikrokanal
22 Lichtleiter
30 Mikroskop, Objektiv, Lichtblatt
40 Leinjustierung
41 Kamera, Videokamera, Türkamera
50, 50‘ Schlauchdisk
60 Spritzenpumpe
70, 70‘ Pumpen, Druckpumpen
Pl, P2 Druck, Unterdrück
90, 90‘ Ventil, Absperrhahn
91, 91‘ V orratsbehälter
92 Druckschlauch
100 Schlauchsonde
110 Mittel zum automatischen Bewegen der Schlauchsonde, Piezoantrieb
111 Mikroskopierfenster
120 Messzelle für Lichtblattmikroskop
130 Bohrung für Lluoreszenzobjektiv
140 Bohrung für Einkopplung Lichtblatt
150 Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung
160 Zudosierungsmodul
161 Mikro ventil , l62‘ Lichtleiter
Vorrichtung
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Claims

Patentansprüche
1. Vorrichtung (200) für die optische Charakterisierung von Fluiden und/oder darin eingeschlossener Objekte in einem Mikrokanal (13), umfassend eine Messzelle (10, 120), wobei der Mikrokanal (13) durch die Messzelle (10, 120) geführt wird, dadurch gekennzeichnet, dass die Messzelle (10, 120) mit einer Flüssigkeit (14) gefüllt ist, der Mikrokanal (13) sich innerhalb der Messzelle (10, 120) in der Flüssigkeit (14) befindet, das Fluid und/oder darin eingeschlossener Objekte in dem Mikrokanal (13) bewegbar sind und der Mikrokanal (13) innerhalb der Messzelle (10, 120) und/oder die Messzelle (10, 120) mit dem Mikrokanal (13) manuell oder automatisch bewegbar ist.
2. Vorrichtung (200) nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, dass die Vorrichtung (200) zur Positionierung von Proben (20) im Mikrokanal (13) im Strahlengang eines Mikroskops am Eingang (15) des Mikrokanals (13) in die Messzelle (10, 120) eine Pumpe (70) oder am Eingang (15) des Mikrokanals (13) in die Messzelle (10, 120) eine Pumpe (70) und am Ausgang (16) des Mikrokanals (13) aus der Messzelle (10, 120) eine Pumpe (70‘), oder am Ausgang (16) des Mikrokanals (13) aus der Messzelle (10, 120) eine Pumpe (70‘) aufweist.
3. Vorrichtung (200) nach Anspruch 1 oder 2, dadurch gekennzeichnet, dass die Vorrichtung (200) vor dem Eingang (15) des Mikrokanals (13) in die Messzelle (10, 120) ein Ventil (90) und/oder nach dem Ausgang (16) des Mikrokanals (13) aus der Messzelle (10, 120) ein Ventil (90‘) zur fluidischen Entkopplung der Pumpe(n) (70, 70‘) vom Mikrokanal (13) aufweist.
4. Vorrichtung (200) nach einem der Ansprüche 1 bis 3, dadurch gekennzeichnet, dass die Messzelle (10) ein geschlossenes Gehäuse aufweist und der Eingang (15) des Mikrokanals (13) in die Messzelle (10) und der Ausgang (16) des Mikrokanals (13) aus der Messzelle (10) Mittel zur Abdichtung (21) des Mikrokanals (13) gegenüber dem Gehäuse der Messzelle aufweisen, die die Bewegbarkeit des Mikrokanals (13) innerhalb der Messzelle (10) ermöglichen; und dass der Eingang (15) des Mikrokanals (13) in die Messzelle (10) und der Ausgang (16) des Mikrokanals (13) aus der Messzelle (10) an jeder Außenfläche der Messzelle (10) anordenbar sind; oder die Messzelle (120) ein an einer Seite offenes Gehäuse aufweist, durch die der Mikrokanal (13) in die Messzelle (120) hinein- und aus der Messzelle (120) herausragt, wobei ein Teil des in die Messzelle (120) hineinragenden Mikrokanals (13) und ein Teil des aus der Messzelle (120) herausragenden Mikrokanals (13) mittels eines in alle Raumrichtungen bewegbaren und mit der Messzelle (120) nicht in Verbindung stehenden Mittels (110), vorzugsweise mittels eines Piezoantriebes, fest verbunden ist.
5. Vorrichtung nach einem der vorherigen Ansprüche, dadurch gekennzeichnet, dass die Messzelle (10, 120) aus optisch transparenten Materialien oder optisch nicht transparenten Materialien oder aus einer Kombination oder einem Verbund optisch transparenter und nicht transparenter Materialien besteht.
6. Vorrichtung nach einem der vorherigen Ansprüche, dadurch gekennzeichnet, dass die Messzelle (10, 120) Durchführungen (17, 18, 130, 140) zum Befüllen der Messzelle (10, 120) mit einer Flüssigkeit (14), zum Entlüften der Messzelle (10, 120), zum Durchführen von Lichtquellen und Sensoren, beispielsweise von Lichtleitern (22) zur Einkopplung von Licht in die Messzelle (10, 120) oder von Lichtschranken (162, l62‘) oder Elektroden zur Positionsbestimmung von Proben (20) im Mikrokanal (13) oder zum Durchführen von Objektiven (30, 30‘) zum Emittieren und Detektieren von elektromagnetischer Strahlung aufweist.
7. Vorrichtung (200) nach einem der vorherigen Ansprüche, dadurch gekennzeichnet, dass die Vorrichtung (200) mindestens ein Mittel zur Positionsbestimmung von Proben (20) im Mikrokanal (13), vorzugsweise mindestens eine Lichtschranke (162, l62‘), eine Messelektrode oder eine Kamera (41) aufweist.
8. Messzelle (10, 120) für die optische Charakterisierung von Lluiden und/oder darin eingeschlossener Proben (20) in Mikrokanälen (13), wobei durch die Messzelle (10, 120) ein Mikrokanal (13) geführt wird, wobei die Messzelle (10, 120) Durchführungen (17, 18, 130, 140) zum Befüllen der Messzelle (10, 120) mit einer Llüssigkeit (14), zum Entlüften der Messzelle (10, 120), zum Durchführen von Lichtquellen und Sensoren, beispielsweise von Lichtleitern (22) zur Einkopplung von Licht in die Messzelle (10, 120) oder von Lichtschranken (162, l62‘) oder Elektroden zur Positionsbestimmung von Proben (20) im Mikrokanal (13) oder zum Durchführen von Objektiven (30, 30‘) zum Emittieren und Detektieren von elektromagnetischer Strahlung aufweist,
dadurch gekennzeichnet, dass
die Messzelle (10, 120) mit einer Flüssigkeit (14) gefüllt ist, der Mikrokanal (13) sich innerhalb der Messzelle (10, 120) in der Flüssigkeit (14) befindet und der Mikrokanal (13) innerhalb der Messzelle (10, 120) und/oder die Messzelle (10, 120) mit dem Mikrokanal (13) manuell oder automatisch bewegbar ist.
9. Messzelle (10) nach Anspruch 8, dadurch gekennzeichnet, dass die Messzelle (10) ein geschlossenes Gehäuse aufweist und der Eingang (15) des Mikrokanals (13) in die Messzelle (10) und der Ausgang (16) des Mikrokanals (13) aus der Messzelle (10) Mittel zur Abdichtung (21) des Mikrokanals (13) gegenüber dem Gehäuse der Messzelle (10) aufweisen, die die Bewegbarkeit des Mikrokanals (13) innerhalb der Messzelle (10) ermöglichen; und dass der Eingang (15) des Mikrokanals (13) in die Messzelle (10) und der Ausgang (16) des Mikrokanals (13) aus der Messzelle (10) an jeder Außenfläche der Messzelle (10) anordenbar sind.
10. Messzelle (120) nach Anspruch 8, dadurch gekennzeichnet, dass die Messzelle (120) ein an einer Seite offenes Gehäuse aufweist, durch die der Mikrokanal (13) in die Messzelle (120) hinein- und aus der Messzelle (120) herausragt, wobei ein sich außerhalb der Messzelle (120) befindlicher Teil des in die Messzelle (120) hineinragenden Mikrokanals (13) und ein sich außerhalb der Messzelle (120) befindlicher Teil des aus der Messzelle (120) herausragenden Mikrokanals (13) mittels eines in alle Raumrichtungen bewegbaren und mit der Messzelle (120) nicht in Verbindung stehenden Mittels (110), vorzugsweise mittels eines Piezoantriebes, fest verbunden ist.
11. Verfahren zur optischen Charakterisierung von Fluiden und/oder darin eingeschlossener Objekte in einem Mikrokanal (13) mittels einer Vorrichtung (200) oder einer Messzelle (10, 120) nach einem der Ansprüche 1 bis 10, wobei sich der Mikrokanal (13) innerhalb einer Messzelle (10, 120) befindet, die mit einer Flüssigkeit (14) gefüllt ist, umfassend die Schritte: a) Bereitstellen eines Proben (20)-enthaltenden einphasigen, zweiphasigen oder mehrphasigen Fluids in einem Mikrokanal (13); und b) Positionieren der in dem Mikrokanal (13) enthaltenen Proben (20) im Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung eines Mikroskops,
dadurch gekennzeichnet, dass die Positionierung von in dem Mikrokanal (13) enthaltenen Proben (20) im Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung erfolgt durch
c) manuelles axiales Verschieben und/oder Rotieren des Mikrokanals (13) gegenüber der Messzelle (10, 120); oder
d) automatisches Bewegen des Mikrokanals (13) innerhalb der mit einer Flüssigkeit (14) gefüllten Messzelle (10, 120), vorzugsweise mittels eines Piezoantriebs (110); oder e) automatisches oder manuelles Bewegen der mit einer Flüssigkeit gefüllten Messzelle (10, 120), die den Mikrokanal (13) enthält, mittels Bewegung des Mikroskoptisches in den drei Raumrichtungen; und/oder dass die Positionierung von in dem Mikrokanal (13) enthaltenen Proben (20) erfolgt durch
f) Bewegen der Tropfen (20) im Mikrokanal (13) mittels einer oder mehrerer Pumpe(n) (70, 70‘), und Stoppen der Pumpe(n) (70, 70‘), wenn sich die Probe (20) im Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung eines Mikroskops befindet; oder
g) exaktes Bewegen der Tropfen (20) im Mikrokanal (13) mittels einer oder mehrerer Pumpe(n) (70, 70‘), Stoppen der Pumpe(n) (70, 70‘) und fluidisches Entkoppeln der Pumpe(n) (70, 70‘) von der Tropfensequenz im Mikrokanal (13) mittels Ventilen (90, 90‘), wenn sich die Probe (20) im Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung eines Mikroskops befindet; und/oder dass die Positionierung von in dem Mikrokanal (13) enthaltenen Proben (20) erfolgt durch
automatische Erkennung von Proben (20) im Mikrokanal (13) mit Hilfe eines Mittels zur Positionsbestimmung der Proben (20) im Mikrokanal (13), vorzugsweise mittels einer Kamera (41), einer Messelektrode oder mittels Lichtschranken (22, 162, l62‘) und Stoppen der Pumpe(n) (70, 70‘), wenn sich die Probe (20) im Bereich des Strahlengangs der optischen Abbildung eines Mikroskops befindet.
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