WO2022244908A1 - 항-bcam 항체 또는 그의 항원 결합 단편 - Google Patents

항-bcam 항체 또는 그의 항원 결합 단편 Download PDF

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    • C07K2317/92—Affinity (KD), association rate (Ka), dissociation rate (Kd) or EC50 value

Definitions

  • the present invention relates to anti-BCAM antibodies or antigen-binding fragments thereof, and uses thereof.
  • the anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof of the present invention can be used for the prevention or treatment of conditions associated with cells expressing BCAM, such as cancer.
  • Basal cell adhesion molecule is an Ig superfamily transmembrane protein, also known as Lutheran blood group glycoprotein (Lu). Lu was initially studied as an antigen of the Lutheran blood group system, and BCAM was identified as an up-regulated antigen in ovarian cancer. Lu and BCAM have the same extracellular domain but different cytoplasmic tails. Specifically, BCAM lacks the COOH-terminal 40 amino acids present in the Lu cytoplasmic tail. Furthermore, Lu-specific cytoplasmic regions have SH3 binding motifs, dileucine motifs and potential phosphorylation sites. The common region of the Lu and BCAM cytoplasmic tails contains a spectrin-binding motif. As such, since the structures of BCAM and Lu overlap with each other, it is difficult to distinguish between Lu and BCAM in the actual tissue, and Lu and BCAM are interchangeably referred to as Lu/BCAM or CD239.
  • the extracellular domain of BCAM includes one V-set, one C1-set and three I-set domains (V-C1-I-I-I). Since BCAM binds specifically to laminin ⁇ 5, a major component of the basement membrane, it is thought to be involved in cell adhesion to the basement membrane. Laminin ⁇ 5 associates with ⁇ and ⁇ chains to form a heterotrimer, which is found in many basement membranes of normal and diseased tissues. In addition, BCAM promotes migration of lung cancer cells on laminin-511 (LM-511) composed of ⁇ 5, ⁇ 1 and ⁇ 1 chains. Migration of tumor cells on LM-511 is also inhibited in the presence of functional inhibitory antibodies to BCAM. It was confirmed that overexpression of BCAM was observed not only in ovarian carcinoma, but also in skin cancer and hepatocellular carcinoma, and accordingly, BCAM was proposed as a useful antigen for the diagnosis and development of antibody drugs.
  • LM-511 laminin-511
  • An object of the present invention is to provide an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to a BCAM protein.
  • the present invention also provides uses of these antibodies or antigen-binding fragments for the prevention or treatment of conditions associated with cells expressing BCAM, such as cancer.
  • the present invention provides anti-BCAM antibodies or antigen-binding fragments thereof.
  • the present invention provides a pharmaceutical composition for preventing or treating cancer comprising the anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof.
  • the present invention provides antibodies or antigen-binding fragments in the form of antibody-drug conjugates (ADCs) capable of selectively delivering inhibitors to target BCAM-expressing cells.
  • ADCs antibody-drug conjugates
  • the present invention in one embodiment, the present invention
  • a heavy chain CDR1 comprising any one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 7, 9 and 11;
  • a heavy chain CDR2 comprising any one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 13, 15 and 17;
  • a heavy chain CDR3 comprising any one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 19, 21 and 23;
  • a light chain CDR1 comprising any one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 8, 10 and 12;
  • a light chain CDR2 comprising any one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 14, 16 and 18, and
  • a light chain CDR3 comprising any one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 20, 22 and 24
  • anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof including a.
  • the present invention in one embodiment, the present invention
  • Any one heavy chain variable region selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 1, 3 and 5; and
  • It provides an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof, comprising.
  • the antigen-binding fragment of the present invention is Fab, Fab', Fab'-SH, Fv, single chain antibody scFv, F(ab')2 fragment, VL, VH, Diabody, triabody, tetrabody, minibody ((scFV-CH3)2), IgGdeltaCH2, scFv-Fc, (scFv)2-Fc, Fynomer, Dual-affinity re-targeting (DART), TRIDENT.
  • the antibody of the present invention may be a chimeric antibody, a humanized antibody or a human antibody, and may be a multispecific antibody.
  • the present invention provides a nucleic acid molecule encoding the antibody or antigen-binding fragment thereof and a recombinant expression vector comprising the nucleic acid molecule.
  • the present invention also provides a composition for preventing or treating cancer, comprising the antibody or antigen-binding fragment thereof as an active ingredient.
  • the pharmaceutical composition may be used in combination with an additional anti-cancer agent, such as another anti-cancer agent or chemotherapeutic agent, or in combination with radiation therapy.
  • the present invention also provides a composition for analyzing or detecting a BCAM protein comprising the antibody or antigen-binding fragment thereof.
  • the anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof of the present invention binds to human BCAM protein with high affinity. Through this, the anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof of the present invention can be usefully used for preventing or treating cancer.
  • Figure 1 shows the amino acid sequences of the heavy chain variable region (1a) and light chain variable region (1b) of the selected antibody. Sequences in bold and underlined indicate the CDR sequences of each region.
  • Figure 2 shows the binding ability of the antibodies of the present invention to BCAM according to ELISA analysis.
  • Figure 3 shows the binding ability of the antibody of the present invention to BCAM according to FACS analysis (PBS and human IgG values are overlapped).
  • Figure 4 shows the binding ability of the antibodies of the present invention to BCAM according to Octet analysis.
  • Figure 5 shows the degree of cellular internalization of the antibodies of the present invention observed by confocal laser scanning microscopy.
  • the present invention provides an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to a BCAM protein.
  • an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof of the present invention is provided.
  • a heavy chain CDR1 comprising any one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 7, 9 and 11;
  • a heavy chain CDR2 comprising any one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 13, 15 and 17;
  • a heavy chain CDR3 comprising any one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 19, 21 and 23;
  • a light chain CDR1 comprising any one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 8, 10 and 12;
  • a light chain CDR2 comprising any one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 14, 16 and 18, and
  • a light chain CDR3 comprising any one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 20, 22 and 24
  • an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof of the present invention is provided.
  • heavy chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13;
  • heavy chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19;
  • a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8;
  • a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14;
  • a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 20;
  • heavy chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15;
  • heavy chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21;
  • a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 16;
  • a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 22;
  • heavy chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17;
  • heavy chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 23;
  • a light chain CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 12;
  • a light chain CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18;
  • a light chain CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 24;
  • each chain or variable region thereof includes a specific amino acid sequence means that it includes the entire amino acid sequence, has the entire amino acid sequence, or consists of the amino acid sequence.
  • the antibody or antigen-binding fragment thereof comprises a heavy chain CDR1 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; heavy chain CDR2 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13; heavy chain CDR3 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19; light chain CDR1 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8; light chain CDR2 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14; and a light chain CDR3 having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 20.
  • the antibody or antigen-binding fragment thereof comprises a heavy chain CDR1 consisting essentially of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; heavy chain CDR2 consisting essentially of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13; a heavy chain CDR3 consisting essentially of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19; a light chain CDR1 consisting essentially of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8; a light chain CDR2 consisting essentially of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14; and a light chain CDR3 consisting essentially of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 20.
  • the antibody or antigen-binding fragment thereof comprises a heavy chain CDR1 consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; heavy chain CDR2 consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13; heavy chain CDR3 consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19; light chain CDR1 consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8; light chain CDR2 consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14; and a light chain CDR3 consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 20.
  • an antibody or antigen-binding fragment thereof comprising a recited amino acid sequence may, essentially or not, include additional amino acid sequences not recited.
  • an antibody or antigen-binding fragment thereof consisting essentially of the recited amino acid sequence may contain substitutions of one or more amino acid residues that do not materially affect the properties of the antibody or fragment thereof.
  • Each chain or variable region of another antibody or antigen-binding fragment thereof defined herein may also contain, have, or consist of the same amino acid sequence as in the above example.
  • Complementarity determining regions refer to the amino acid residues of antibody variable regions that are required for antigen binding. Each variable region typically has three CDR regions identified as CDR1, CDR2, and CDR3.
  • an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof of the present invention is provided.
  • Any one heavy chain variable region selected from the group consisting of SEQ ID Nos: 1, 3 and 5; and
  • an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof of the present invention is provided.
  • Antibody variable regions refer to the light and heavy chain portions of an antibody molecule that include the amino acid sequences of the CDRs and framework regions (FRs).
  • antibody refers to an immunoglobulin molecule capable of specifically binding to a target, such as a carbohydrate, polynucleotide, lipid, polypeptide, protein, etc., through at least one antigen recognition site located in the variable region of an immunoglobulin molecule. It is a globulin molecule.
  • antibody herein is used in the broadest sense and thus includes intact polyclonal or monoclonal antibodies, as well as dimer, multimer, multispecific antibodies (eg bispecific antibodies), antigens thereof Binding fragments, antibody fragments, fusion proteins comprising any other modified arrangement of immunoglobulin molecules comprising antigen recognition sites (eg variable regions), synthetic antibodies (eg "antibody mimetics"), "FynomAbs", etc. are widely used. to include
  • immunoglobulin (Ig)M immunoglobulin (Ig)M, IgD, IgG, IgA, and IgE, each containing a heavy chain made from heavy chain constant region genes ⁇ , ⁇ , ⁇ , ⁇ , and ⁇ .
  • the light chain and heavy chain of an antibody are divided into a variable region with different amino acid sequences for each antibody and a constant region with the same amino acid sequence.
  • Each domain consists of two ⁇ -sheets with an intramolecular disulfide bond connecting them.
  • An antibody comprising a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 herein is referred to as "111a", a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3, and a sequence
  • An antibody comprising a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4 is "111b", an antibody comprising a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6 It is referred to as "111c”.
  • Antibodies of the present invention may be chimeric, humanized, or human.
  • chimeric antibody refers to an antibody in which the variable region sequences are from one species and the constant region sequences are from another species, e.g., the variable region sequences are from a mouse antibody and the constant region sequences are from a mouse antibody. It means an antibody derived from a human antibody.
  • Methods of making chimeric antibodies are known in the art. For example, reference may be made to Morrison, Science 229:1202 (1985) and the like, which are incorporated herein by reference in their entirety.
  • humanized antibody refers to the insertion of one or more CDR sequences from the germline of a non-human species, such as another mammalian species, eg, mouse or chicken, into frame work sequences from a human immunoglobulin molecule.
  • a non-human species such as another mammalian species, eg, mouse or chicken
  • Frame work sequences can be further modified, such as through mutation methods.
  • NCBI Database Entez Gene
  • Using appropriate sequences reduce the immunogenicity, reduce, enhance or alter the binding, affinity, on-rate, off-rate, affinity, specificity, half-life or any other suitable characteristic of the antibody. can make it
  • human antibody refers to antibodies comprising variable regions in which both the frame work and CDR regions are derived from human immunoglobulin sequences.
  • the constant regions of antibodies are also derived from human immunoglobulin sequences.
  • antibody fragment is typically meant to include at least a portion (eg, one or more CDRs) or variable region of an antigen-binding domain of a parent antibody.
  • An antibody fragment retains at least a portion of the binding specificity of the parent antibody.
  • antigen-binding fragments examples include Fab, Fab', Fab'-SH, Fv, single chain antibody scFv, F(ab')2 fragment, VL, VH, diabody, triabody ), tetrabody, minibody ((scFV-CH3)2), IgGdeltaCH2, scFv-Fc, (scFv)2-Fc, Fynomer, dual-affinity retargeting -targeting: DART), Anticalins, FN3 Monobodies, DARPins, Affibodies, Affilins, Affimers, Affitins, Alphabodies, Avimers, Im7, VLR, VNAR, Trimab, CrossMab, TRIDENT, Nanobodies, Vi but is not limited to binanobodies or di-sdFv.
  • a Fab fragment refers to a monovalent fragment consisting of the VL, VH, CL and CH1 domains.
  • Fab' fragments differ from Fab fragments by the addition of a few residues at the carboxy terminus of the CH1 domain, including one or more cysteines from the antibody hinge region.
  • Fab'-SH refers to Fab' in which the cysteine residues of the constant domains bear free thiol groups.
  • F(ab')2 antibody fragments are produced as pairs of Fab' fragments via a hinge cysteine between the Fab' fragments.
  • Fv is the smallest antibody fragment that contains a complete antigen recognition site and antigen binding site. This fragment consists of a dimer of one heavy chain variable region and one light chain variable region in tight, non-covalent association. These two regions fold to form six hypervariable loops (three loops each from the heavy and light chains), which provide amino acid residues for antigen binding and confer antigen-binding specificity to the antibody. However, even a single variable region has the ability to recognize and bind antigen, albeit with lower affinity than the entire binding site.
  • Single-chain antibody scFvs are antibody fragments comprising VH and VL antibody domains linked by a single polypeptide chain.
  • the scFv polypeptide further comprises a polypeptide linker between the VH and VL domains that allows the scFv to form the desired structure for antigen binding.
  • scFv antibody fragment antigen-binding fragment scFv, scFv antibody, antibody scFv, or simply scFv.
  • Diabodies consist of a short linker (about 5-10 ⁇ m) between the VH and VL domains, such that intra-chain pairing of the V domains is achieved, resulting in a bivalent fragment, i.e., a fragment with two antigen binding sites. canine residues) to construct scFv fragments.
  • Bispecific diabodies are heterodimers composed of two "bridged" scFv fragments in which the VH and VL domains of the two antibodies are on different polypeptide chains.
  • a triabody and a tetrabody may comprise three and four polypeptide chains, respectively, and have three antigen binding sites and four antigen binding sites, respectively, which may be the same or different. form parts.
  • Fynomer refers to a non-immunoglobulin-derived binding polypeptide derived from the human Fyn SH3 domain.
  • Fyn SH3-derived polypeptides are well known in the art and are described, for example, in Grabulovski et al. (2007) JBC, 282, p. 3196-3204], WO 2008/022759 and the like.
  • Fynomers can be genetically engineered to be fused with other molecules (such as antibodies) to create “FynomAbs,” ie forms that can be engineered to have dual specificities.
  • Dual-affinity re-targeting (DART) and TRIDENT refer to those designed to bind to two or more targets simultaneously.
  • DART refers to a dual-specific diabody linked covalently, such as a diabody linked via a C-terminal disulfide bridge, and its specific structure and definition are described in [J. Mol. Biol. (2010) 399, 436-449].
  • the antibody or antigen-binding fragment thereof of the present invention may specifically bind to a BCAM protein, such as a human BCAM protein.
  • the present invention provides an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to human BCAM, wherein antibody 111a, 111b, or 111c binds to the same epitope as that binding to human BCAM.
  • BCAM antibodies or antigen-binding fragments thereof are provided.
  • CDR1, CDR2, and CDR3 of each of the heavy and light chains of the antibody or antigen-binding fragment thereof are 80% or more, preferably, 90% or more of CDR1, CDR2, and CDR3 of each of the heavy and light chains of antibody 111a, 111b or 111c. , particularly preferably have 100% homology.
  • each of the heavy and light chains of the antibody or antigen-binding fragment thereof has at least 80%, preferably at least 90%, particularly preferably at least 100% homology with each of the heavy and light chains of antibody 111a, 111b or 111c.
  • BCAM is a basal cell adhesion molecule and is a surface glycoprotein that acts as a receptor for laminin, an extracellular matrix protein.
  • BCAM is also known as Lutheran blood group glycoprotein (Lu) or CD239, and herein, “BCAM”, “Lu”, “Lu/BCAM”, and “CD239” refer to the same protein and may be used interchangeably with each other. have.
  • the term "specifically binds to” or “specific to” means to be deterministic for the presence of a target in the presence of a heterogeneous population of molecules, including biological molecules, and refers to measurable and reproducible interactions such as binding between antibodies.
  • an antibody that specifically binds to a particular target binds to that target with greater affinity, with greater avidity, more readily and/or for a longer duration than it does to other targets.
  • a particular target e.g., an epitope
  • the term "specifically binding to human BCAM protein” means binding to human BCAM protein with an association dissociation equilibrium constant (K D ) of 1 x 10 -7 M or less, preferably 5 x 10 -8 M It may mean an antibody that binds below. Accordingly, the anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof of the present invention can bind to human BCAM with an association dissociation equilibrium constant (K D ) of 1 x 10 -7 M or less, preferably with a K D of 5 x 10 -8 M or less. It may be binding to proteins.
  • K D values for antibodies can be determined using methods well established in the art.
  • a preferred method for determining the KD value of an antibody is surface plasmon resonance (SRP), preferably using a biosensor system such as the Biacore® system, or biolayer interference (Bio-layer Interferometry, BLI) methods such as the Octet® system can be used.
  • SRP surface plasmon resonance
  • BLI Bio-layer Interferometry
  • the K D mentioned herein may be a value obtained through biolayer interferometry using the Octet® system.
  • an antibody or antigen-binding fragment thereof of the invention may be conjugated to a drug, i.e., form an antibody-drug conjugate (ADC).
  • ADC antibody-drug conjugate
  • M an antibody molecule
  • L an optional linker or linker unit
  • D a suitable drug or prodrug
  • n an integer from about 1 to about 20.
  • Drugs included in the ADC may be appropriately selected according to therapeutic or diagnostic purposes, as long as they do not interfere with the specific binding of the antibody of the present invention.
  • the drug includes, but is not limited to, a cytotoxic agent (eg, a chemotherapeutic agent), a prodrug converting enzyme, a radioactive isotope or compound, or a toxin, and the like.
  • a cytotoxic agent eg, a chemotherapeutic agent
  • a prodrug converting enzyme e.g., a radioactive isotope or compound, or a toxin, and the like.
  • Drugs and linkers that may be included in the ADC and methods for preparing them may be prepared according to methods known in the art. Accordingly, the present invention provides an antibody-drug conjugate comprising an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof.
  • the anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof of the invention is 150 nM or less, such as 130 nM or less, 100 nM or less, 50 nM or less, 20 nM or less, or 10 nM or less, as measured by an ELISA assay. It binds to the BCAM protein with an EC50 of
  • EC50 refers to an in vitro or in vivo assay using an antibody, and refers to the concentration of antibody that elicits a response that is 50% of the maximal response, i.e., an intermediate response between the maximal response and the baseline (baseline). do.
  • Another aspect of the invention relates to a nucleic acid molecule encoding an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof of the invention.
  • Nucleic acids may be present in whole cells or cell lysates, or may be present in a specifically purified or substantially pure form. Nucleic acids can be isolated from other cellular components or other contaminants, e.g. other cellular nucleic acids or proteins, by standard techniques such as alkaline/SDS treatment, CsCl banding, column chromatography, agarose gel electrophoresis and other sugars. An "isolated” or “isolated substantially pure" nucleic acid when it has been purified and removed by methods well known in the art.
  • a nucleic acid of the invention can be, for example, DNA or RNA, and may or may not contain intronic sequences.
  • the nucleic acid is a cDNA molecule.
  • a nucleic acid molecule of the present invention encodes a light chain region, a heavy chain region, or both light and heavy chain regions of an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof of the present invention, preferably a light chain variable region, a heavy chain variable region. region, or both light and heavy chain variable regions.
  • DNA fragments encoding the VL and/or VH regions can be further manipulated, for example by standard recombinant DNA techniques, resulting in variable region genes, full-length antibody chain genes, Fab fragments. gene or scFv gene.
  • a VL- or VH-encoding DNA fragment is operably linked to another DNA fragment encoding another protein, such as an antibody constant region or flexible linker.
  • the term “operably linked” refers to when two DNA fragments are joined so that the amino acid sequence encoded by the two DNA fragments remains in-frame. .
  • the isolated DNA encoding the VH region can be converted to a full-length heavy chain gene by operably linking the VH-encoding DNA to other DNA molecules encoding the heavy chain constant regions (CH1, CH2 and CH3).
  • the heavy chain constant region may be an IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA, IgE, IgM or IgD constant region.
  • the VH-encoding DNA can be operably linked to another DNA molecule encoding only the heavy chain CH1 constant region.
  • VL- and VH-encoding DNA fragments can be operably linked to a flexible linker, such as another fragment encoding the amino acid sequence (Gly4-Ser)3, resulting in VL and VH sequences can be expressed as contiguous single-chain proteins with VL and VH regions joined by flexible linkers.
  • a flexible linker such as another fragment encoding the amino acid sequence (Gly4-Ser)3, resulting in VL and VH sequences can be expressed as contiguous single-chain proteins with VL and VH regions joined by flexible linkers.
  • Nucleic acid sequences of the invention can be isolated from a variety of sources, genetically engineered, amplified and/or recombinantly expressed. Any recombinant expression system can be used, including insect or mammalian systems other than bacteria such as yeast. Nucleic acid manipulations such as, for example, subcloning into expression vectors, labeled probes, sequencing and hybridization can be performed as is known in the art.
  • the present invention provides a recombinant expression vector comprising the nucleic acid molecule.
  • vector used interchangeably with recombinant vector, cloning vector, expression vector, refers to a DNA molecule capable of self-replication in prokaryotic and/or eukaryotic cells, generally referring to a gene or DNA fragment inserted into a cell. It is used as an intermediate carrier for delivery to the back.
  • Vectors are usually replication origins capable of replicating in prokaryotic and/or eukaryotic cells, selectable marker genes capable of conferring resistance to specific conditions/substances such as antibiotic degradation enzymes, promoters capable of transcription of genes in eukaryotic or primary cells, It includes, but is not limited to, translatable sequences.
  • vector refers to a circular double-standard DNA loop into which additional DNA fragments can be ligated.
  • viral vector in which additional DNA fragments may be ligated into the viral genome.
  • Certain vectors are capable of autonomous replication in a host cell into which they are introduced (eg, bacterial vectors having a bacterial origin of replication and episomal mammalian vectors).
  • Antibodies or antigen-binding fragments thereof of the present invention can be prepared according to conventionally known methods.
  • antibodies or antigen-binding fragments thereof of the invention can be prepared using antibody display technology, such as phage display technology.
  • the antibody phage library is cloned in the form of fusion of human antibody heavy and light chain variable region genes to phage surface protein (pIII) in a phagemid vector, expressed in Escherichia coli, and then infected with M13 helper phage, An antibody library displaying antibody fragments (scFv or Fab) having sequences of heavy and light chain variable regions in various combinations on the surface is prepared. From this library, an antibody fragment that binds to a specific antigen is isolated using a panning method, and after characterization of the isolated antibody fragment, it is converted into a “whole IgG” form and expressed in large quantities in animal cells to obtain a specific human monoclonal antibody. produce antibodies
  • a naive antibody library using antibody genes already present in the human body may be used, or a synthetic antibody library in which diversity is increased by inserting random synthetic sequences into antibody CDRs may be used.
  • phagemid vector is a plasmid DNA having a phage origin of replication, and usually has an antibiotic resistance gene as a selection marker.
  • a phagemid vector used for phage display contains the gIII gene or a part thereof of M13 phage, and the scFv gene is ligated to the 5' end of the gIII gene to be expressed through transformants.
  • helper phage is a phage that provides genetic information necessary for the assembly of phagemids into phage particles. Since only gIII or part of the phage gene is present in the phagemid, the host cell (transformant) transformed with the phagemid is infected with the helper phage to supply the remaining phage genes. There are types such as M13K07 or VCSM13, and most of them contain antibiotic resistance genes such as kanamycin so that transformants infected with helper phage can be selected. In addition, since the packaging signal is defective, the phagemid gene is selectively assembled into the phage particle rather than the helper phage gene.
  • antibodies of the invention are injected with BCAM antigen into test subjects (eg, mice) according to methods well known in the art, followed by isolation of hybridomas expressing antibodies having the desired sequence or functional properties. By doing so, for example, it can be prepared in the form of a monoclonal antibody.
  • DNA encoding the monoclonal antibody is readily isolated and sequenced using conventional methods (eg, using oligonucleotide probes capable of binding specifically to genes encoding the heavy and light chains of the monoclonal antibody).
  • Hybridoma cells serve as a preferred source of such DNA.
  • the DNA can be placed into an expression vector and then used in a host cell, such as E. monoclonal in recombinant host cells by transfection into E. coli cells, simian COS cells, Chinese hamster ovary (CHO) cells, or myeloma cells that do not otherwise produce immunoglobulin proteins Synthesis of raw antibodies can be obtained.
  • the antibody or antigen-binding fragment thereof of the present invention is for preventing or treating cancer by specifically binding to BCAM.
  • the present invention provides a method for preventing, ameliorating or treating cancer, comprising administering an effective amount of an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof to a subject.
  • the present invention provides use of an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof for the prevention, amelioration or treatment of cancer.
  • the present invention provides a pharmaceutical composition for preventing, improving or treating cancer, comprising an anti-BCAM antibody or an antigen-binding fragment thereof.
  • the anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof may be included in an effective amount in a pharmaceutical composition.
  • Non-human animals include all vertebrates, such as mammals and non-mammals, including non-human primates, sheep, dogs, cats, cows, horses, chickens, amphibians, and reptiles, but include For example, mammals such as non-human primates, sheep, dogs, cats, cattle and horses are preferred. Preferred subjects are humans in need of prevention or treatment of cancer.
  • the anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof of the present invention can effectively bind to cancer cells expressing BCAM by specifically binding to BCAM protein, thereby inhibiting the growth of cancer cells in vivo, thereby preventing cancer. It can be usefully used to prevent, improve or treat.
  • BCAM is associated with tumor migration, and furthermore, its overexpression is known to appear especially in skin cancer, ovarian cancer, pancreatic cancer, breast cancer, etc. (refer to F.R.M. Latini et al., Blood Cells, Molecules and Diseases 50 (2013) 161-165, etc.) .
  • the anti-BCAM antibody of the present invention can be used for all cancers in which tumor migration is observed, such as metastatic cancer, and can also be used in specific carcinomas in which overexpression thereof is observed.
  • cancers for which growth may be inhibited using the antibodies of the present invention include melanoma (eg metastatic malignant melanoma), renal cancer (eg clear cell carcinoma), prostate cancer (eg , hormone-refractory prostate adenocarcinoma), breast cancer, colorectal cancer, rectal cancer, colon and lung cancer (eg, non-small cell lung cancer), bone cancer, pancreatic cancer, liver cancer, skin cancer, head or neck cancer, uterine cancer, ovarian cancer, rectal cancer, anus Bowel cancer, stomach cancer, testicular cancer, fallopian tube carcinoma, endometrial carcinoma, cervical carcinoma, vaginal carcinoma, female vulvar carcinoma, Hodgkin's disease, non-Hodgkin's lymphoma, esophageal cancer, small intestine cancer, endocrine system cancer, thyroid cancer, parathyroid cancer , adrenal cancer, soft tissue sarcoma, urethral cancer, penile cancer, chronic and acute leukemias such as acute myelog
  • the antibody or antigen-binding fragment thereof of the present invention can be used for the prevention or treatment of cancer by specifically binding to BCAM protein to form an antibody-drug conjugate (ADC).
  • ADC antibody-drug conjugate
  • the present invention provides an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment in the form of a conjugated drug.
  • the drug includes, but is not limited to, a cytotoxic agent (eg, a chemotherapeutic agent), a prodrug converting enzyme, a radioactive isotope or compound, or a toxin, and the like.
  • Drugs and linkers that can be included in the ADC and methods for preparing them may be prepared according to methods known in the art.
  • Antibodies or antigen-binding fragments of the present invention may be used alone or in combination with other anti-cancer therapies.
  • Other anti-cancer therapies include, for example, standard cancer therapies (eg, chemotherapy, radiation therapy or surgery); or other anti-cancer agents such as cytotoxic agents, cytostatic agents, anti-hormonal agents, anti-angiogenic or anti-metabolite agents, targeted anti-cancer agents, immune stimulating or immunomodulating agents, immune checkpoint inhibitors or cytotoxic agents, cytostatic agents , and antibodies conjugated to other toxic agents.
  • the antibody or antigen-binding fragment of the present invention can be used in combination therapy with other anticancer agents, such as immune checkpoint inhibitors, chemotherapeutic agents, or radiation therapy.
  • the immune checkpoint inhibitor is, for example, an anti-CTLA-4 antibody (eg ipilimumab), an anti-PD-1 antibody (eg pembrolizumab, nivolumab), or an anti-PD-L1 antibody (eg atezolizumab, avelumab, durvalumab) ) can be.
  • an anti-CTLA-4 antibody eg ipilimumab
  • an anti-PD-1 antibody eg pembrolizumab, nivolumab
  • an anti-PD-L1 antibody eg atezolizumab, avelumab, durvalumab
  • chemotherapeutic agents include alkylating agents, antimetabolites, kinase inhibitors, spindle toxic plant alkaloids, cytotoxic/antitumor antibiotics, topoisomerase inhibitors, photosensitizers, antiestrogens and selective estrogen receptor modulators (SERMs), antiprogesterones, estrogen receptor downregulators (ERDs), estrogen receptor antagonists, luteinizing hormone releasing hormone agonists, antiandrogens, aromatase inhibitors, EGFR inhibitors, VEGF inhibitors, antisense oligonucleotides that inhibit the expression of genes implicated in abnormal cell proliferation or tumor growth; , but not limited to this.
  • chemotherapeutic agent of the present invention include gemcitabine, vinorelbine, etoposide (VP-16), platinum analogs such as cisplatin or carboplatin, taxoids such as paclitaxel and albumin. -Includes conjugated paclitaxel, docetaxel, and the like.
  • the antibodies or antigen-binding fragments of the present invention When used together with other anticancer drugs, they can be administered separately or applied in the form of a combination product in which a plurality of active ingredients are present in one pharmaceutical preparation. When they are administered in separate formulations, the two formulations may be administered sequentially or simultaneously. In the case of simultaneous administration, they are given to the patient together. In the case of sequential administration, tours may be given over a period of time that is not too long, for example, administered to the patient within a period of 12 hours or less, or 6 hours or less.
  • the present invention provides a method for preventing, ameliorating or treating cancer, comprising administering to a subject an effective amount of an antibody or antigen-binding fragment in combination with an additional anti-cancer agent.
  • the anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment is simultaneously administered together with an additional anticancer agent in one composition, as well as simultaneously or sequentially administering a composition containing each separately to a patient in need thereof.
  • the present invention provides the use of an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof for use in combination with an additional anti-cancer agent for the prevention, amelioration or treatment of cancer.
  • the present invention provides a pharmaceutical composition or combination comprising an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof and an additional anti-cancer agent for preventing, ameliorating or treating cancer.
  • a pharmaceutical composition or combination comprising an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof, and an additional anti-cancer agent herein is not only when the two components physically exist together in the form of one formulation, but also simultaneously or sequentially as separate formulations. or sequentially administered, in which case the two drugs may be provided individually or may be provided together in one kit. Accordingly, the present invention provides a kit for preventing, improving or treating cancer, comprising an anti-BCAM antibody or antigen-binding fragment thereof, and an additional anticancer agent.
  • compositions of therapeutic and diagnostic agents can be prepared by mixing with physiologically acceptable carriers, excipients or stabilizers in the form of, for example, lyophilized powders, slurries, aqueous solutions or suspensions.
  • Suitable routes of administration include parenteral administration, such as intramuscular, intravenous, or subcutaneous administration.
  • Administration of the antibody used in the pharmaceutical composition of the present invention or used to practice the method of the present invention is performed by various conventional methods such as topical application or dermal, subcutaneous, intraperitoneal, parenteral, intraarterial or intravenous injection. can do.
  • an antibody of the invention is administered intravenously or subcutaneously.
  • Example 1 Preparation of BCAM-specific antibodies through phage display
  • Antibodies of the present invention were prepared through a phage display method.
  • cDNA was synthesized by amplifying the mRNA of the heavy and light chain variable regions of the antibody obtained from human blood or bone marrow by PCR. After cloning into a phagemid vector using a restriction enzyme, it was expressed by electroporation in E. coli . Then, by infecting the helper phage, a human library in scFv form was prepared.
  • Antibodies that bind to the target antigen, BCAM, with high affinity were screened for the library through biopanning. Positive clones binding to BCAM were selected, and a unique scFv sequence was selected for BCAM through sequencing.
  • the light and heavy chain regions of the scFv selected in Example 1.1 were cloned into an expression vector.
  • the DNA was transiently transfected and cultured to express the antibody, and the culture was conjugated to kappa region capture to elute the antibody to prepare three anti-BCAM human IgG4 antibodies (111a, 111b, 111c).
  • amino acid sequences of the light chain and heavy chain variable regions of each IgG4 antibody and the CDRs of each variable region are shown in Figure 1, Table 1, and Table 2, respectively (sequences shown in bold and underlined in Figure 1 and Table 1 are each CDR indicates)
  • SEQ ID NO: 1 111a heavy chain variable region (VH) QVTLKESGPGLVKPSGTLSLTCAVS GGSISSSNWWS WVRQPPGKGLEWIG EIYHSGSTNYNPSLKS RVTISVDKSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR AYTVTTTYFDY WGQGTLVTVSS SEQ ID NO: 2 111a light chain variable region (VL) NIQMTQSPSTLSASVGDRVTITC RASQSMSTWLA WYQQKPGRAPKLLIY KASALET GVPSRFSGSGSGTQFTLTISSLQPDDFATYYC QQYDEFAS FGQGTKVEIK SEQ ID NO: 3 111b heavy chain variable region (VH) EVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS GYTFTSYYMH WVRQAPGQGLEWMG IINPSGGSTSYAQKFQG RVTMTRDTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYC
  • sequence number area order SEQ ID NO: 7 111a VH CDR1 GGSISSSNWWS SEQ ID NO: 8 111a VL CDR1 RASQSMSTWLA SEQ ID NO: 9 111b VH CDR1 GYTFTSYYMH SEQ ID NO: 10 111b VL CDR1 TGNSNNVGNQGAA SEQ ID NO: 11 111c VH CDR1 GFTFSDYYMS SEQ ID NO: 12 111c VL CDR1 TGTSSDVGGYNYVS SEQ ID NO: 13 111a VH CDR2 EIYHSGSTNYNPSLKS SEQ ID NO: 14 111a VL CDR2 KASALET SEQ ID NO: 15 111b VH CDR2 IINPSGGSTSYAQKFQG SEQ ID NO: 16 111b VL CDR2 RNNDRPS SEQ ID NO: 17 111c VH CDR2 YTSSSGSTIYYADSVKG SEQ ID NO: 18 111c VL CDR2
  • Example 1 In order to confirm the binding ability of each antibody prepared in Example 1 to the antigen protein (BCAM protein), an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) test was performed.
  • Antigen protein was diluted in PBS buffer, prepared at a concentration of 15 nM, and 50 ⁇ L was coated on each well of a 96 well half plate (Costar, Cat. No. 3690), followed by overnight incubation at 4 °C. The next day, after removing all solutions from the plate, blocking buffer (3% BSA in PBS) was added to each well, followed by incubation at 37 °C for 1 hour.
  • the three antibody samples (111a, 111b, and 111c) were serially diluted in blocking buffer from 1 ⁇ M to 7 points (1 pM) at a 10-fold dilution ratio. After the blocking process was completed, the buffer was removed from the well, and 50 ⁇ L of the antibody prepared by dilution was added to each well and incubated at 37 ° C. for 2 hours. Wash with 0.1% PBST (0.1% Tween 20 in PBS) and treat with HRP-conjugated anti-human IgG Fc antibody (ThermoFisher Scientific, Cat. No.: 31423), a secondary antibody for antibody detection, at 37 ° C for 1 hour After that, it was washed again with 0.1% PBST.
  • PBST 0.1% Tween 20 in PBS
  • HRP-conjugated anti-human IgG Fc antibody ThermoFisher Scientific, Cat. No.: 31423
  • Human BCAM antigen was expressed in HEK293FT cells by transfection (using 293FT/BCAM1 plasmid). Transfected HEK293FT cells (1x10 5 cells) were suspended in PBS, and 50 ⁇ l of them were seeded on the plate.
  • each anti-BCAM antibody and Isotype control (human IgG) antibody of Example 1 were diluted 12 times through 3-fold dilution starting at a concentration of 45 ⁇ g/ml using PBS, and the plate was plated at an appropriate time and temperature. Incubated. As a negative control, PBS buffer was used.
  • the binding ability confirmation test according to BLI for the three antibodies prepared in Example 1 was performed using Octet (Octet QK, ForteBio).
  • Reactive 2nd Generation (AR2G) biosensors (Cat. No. 18-5094, Sartorius) are installed and AR2G Reagent Kit (Cat. No. 18-5095) is used. and activated it. Then, the biosensor was put into an antigen solution for 10 minutes to bind human BCAM, and the reaction was terminated by putting it in an ethanolamine solution for 5 minutes.
  • the human BCAM-coupled biosensor was placed in a buffer containing the prepared three different antibodies 111a, 111b, and 111c, and the binding reaction was monitored for 5 minutes, and then the dissociation reaction was confirmed for 15 minutes.
  • association (Ka) and dissociation (Kd) rate constants were determined by fitting to a 1:1 association model using curve fitting software.
  • the antibody of the present invention binds to human BCAM protein with high affinity.
  • Example 3 confocal Confirmation of cellular internalization of antibodies through laser scanning microscopy
  • the cell slide to be used as a negative control group was fixed using 4% PFA (paraformaldehyde; Sigma, USA) (Fixation, treatment at room temperature for 10 minutes), and the cell slide to be used as a cell internalization induction group was moved to a 37 ° C incubator for 1 hour. After culturing for a while, immobilization was performed using 4% PFA as in the negative control group. Each cell slide after immobilization was completely washed with PBS to remove PFA, and then treated with 0.1% TritonX100 at room temperature for 15 minutes to allow permeabilization of the secondary antibody.
  • PFA paraformaldehyde
  • a fluorescently conjugated secondary antibody (10 ⁇ g/mL Alexa488-conjugated Goat anti-human IgG; Invitrogen, USA) was added at 4 °C. treated for 1 hour.
  • Cell slides completed up to secondary antibody treatment were treated with Hoechst 33342 (Invitrogen, USA) for 3 minutes at room temperature for nuclei staining, washed with PBS, treated with mounting solution (Agilent Technologies, USA), and covered with cover glass. has been completed.
  • the degree of cellular internalization of the antibody was observed under a magnification of 400 times using a confocal laser scanning microscope (LSM 710 confocal laser scanning microscopy, Carl Zeiss, Germany).

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Abstract

본 발명은 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 및 그의 용도에 관한 것이다. 또한, 본 발명의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 BCAM을 발현하는 세포와 관련된 상태, 예컨대, 암의 예방 또는 치료를 위해 사용될 수 있다.

Description

항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편
본 발명은 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 및 그의 용도에 관한 것이다. 또한, 본 발명의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 BCAM을 발현하는 세포와 관련된 상태, 예컨대, 암의 예방 또는 치료를 위해 사용될 수 있다.
기저 세포 부착 분자(basal cell adhesion molecule; BCAM)는 Ig superfamily 막 횡단 단백질로서, Lutheran blood group glycoprotein(Lu)으로도 알려져 있다. Lu는 최초에는 Lutheran 혈액형 시스템의 항원으로 연구되었고, BCAM은 난소암에서 up-regulated antigen으로서 동정되었다. Lu 및 BCAM은 동일한 세포외 도메인(extracellular domain)을 갖지만 세포질 꼬리(cytoplasmic tail)는 상이하다. 구체적으로, BCAM에는 Lu 세포질 꼬리에 존재하는 COOH- 말단의 40개 아미노산이 결여되어 있다. 나아가, Lu-특이적 세포질 영역은 SH3 결합 모티프, 디류신 모티프 및 잠재적 인산화 부위를 가지고 있다. Lu 및 BCAM 세포질 꼬리의 공통 영역에는 spectrin 결합 모티프가 포함되어 있다. 이렇듯 BCAM과 Lu의 구조는 서로 중첩되므로, 실제 조직 내에서 Lu와 BCAM을 구별하기는 어려우며, Lu와 BCAM은 상호 호환적으로 지칭되며, Lu/BCAM으로 불리거나, 또는 CD239로 명명되기도 한다.
BCAM의 세포외 도메인은 1 개의 V- 세트, 1 개의 C1- 세트 및 3 개의 I- 세트 도메인 (V-C1-I-I-I)을 포함한다. BCAM은 기저막의 주요 구성 요소인 laminin α5에 특이적으로 결합하므로, 이는 기저막에 대한 세포 부착에 관여하는 것으로 여겨진다. Laminin α5는 β 및 γ 사슬과 결합하여 heterotrimer를 형성하는데, 이는 정상 조직과 질병 조직의 많은 기저막에서 발견된다. 또한 BCAM은 α5, β1 및 γ1 사슬로 구성된 laminin-511 (LM-511) 상에서 폐암 세포의 이동을 촉진한다. 또한 LM-511상에서의 종양 세포의 이동은 BCAM에 대한 기능 억제 항체의 존재하에서 억제된다. 난소 암종 뿐 아니라 피부암 및 간세포 암종에서도 BCAM의 과발현이 관찰되는 것으로 확인되었고, 이에 따라 BCAM은 항체 약물의 진단 및 개발에 유용한 항원으로 제안된 바 있다.
[선행기술문헌]
[비특허문헌]
Yamato Kikkawa et al., Scientific Report, 2018 Apr 26;8(1):6612
본 발명의 목적은 BCAM 단백질에 특이적으로 결합하는 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 제공하는 것이다.
또한, 본 발명은 BCAM을 발현하는 세포와 관련된 상태, 예컨대, 암의 예방 또는 치료를 위해 이들 항체 또는 항원 결합 단편을 사용하는 용도를 제공하는 것이다.
본 발명은 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 제공한다.
본 발명은 상기 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 포함하는 암의 예방 또는 치료용 약학 조성물을 제공한다. 또한, 본 발명은 BCAM 발현 세포를 표적화하기 위해 저해제를 선택적으로 전달할 수 있는 항체-약물 접합체(ADC) 형태인 항체 또는 항원 결합 단편을 제공한다.
일 실시태양에서, 본 발명은
서열번호 7, 9 및 11로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR1,
서열번호 13, 15 및 17로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR2,
서열번호 19, 21 및 23으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR3,
서열번호 8, 10 및 12로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR1,
서열번호 14, 16 및 18로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR2, 및
서열번호 20, 22 및 24로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR3
을 포함하는, 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 제공한다.
일 실시태양에서, 본 발명은
서열번호 1, 3 및 5로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 중쇄 가변 영역; 및
서열번호 2, 4 및 6으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 경쇄 가변 영역
포함하는, 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 제공한다.
일 실시태양에서, 본 발명의 상기 항원 결합 단편은 본 발명의 CDR 서열을 포함하는 Fab, Fab', Fab'-SH, Fv, 단일 쇄 항체 scFv, F(ab')2 단편, VL, VH, 디아바디(diabody), 트리아바디(triabody), 테트라바디(tetrabody), 미니바디((scFV-CH3)2), IgG델타CH2, scFv-Fc, (scFv)2-Fc, 피노머(Fynomer), 이중 친화성 재표적화(dual-affinity re-targeting:DART), 트리덴트(TRIDENT)일 수 있다. 본 발명의 상기 항체는 키메라 항체, 인간화 항체 또는 인간 항체일 수 있고, 다중특이적 항체일 수 있다.
또다른 실시태양에서, 본 발명은 상기 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 암호화하는 핵산 분자 및 상기 핵산 분자를 포함하는 재조합 발현 벡터를 제공한다.
본 발명은 또한 상기 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 유효성분으로 포함하는, 암의 예방 또는 치료용 조성물을 제공한다. 상기 약학 조성물은 추가 항암제, 예컨대 다른 항암제 또는 화학요법제와 함께 사용되거나, 또는 방사선 치료요법과 함께 사용될 수 있다.
본 발명은 또한 상기 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 포함하는, BCAM 단백질의 분석 또는 검출용 조성물을 제공한다.
본 발명의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 인간 BCAM 단백질에 높은 친화력으로 결합한다. 이를 통해 본 발명의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 암의 예방 또는 치료에 유용하게 사용될 수 있다.
도 1은 선별된 항체의 중쇄 가변 영역(1a) 및 경쇄 가변 영역(1b)의 아미노산 서열을 나타낸다. bold체 및 밑줄로 표시된 서열은 각 영역의 CDR 서열을 나타낸다.
도 2는 ELISA 분석에 따른 본 발명의 항체의 BCAM에 대한 결합능을 나타낸다.
도 3은 FACS 분석에 따른 본 발명의 항체의 BCAM에 대한 결합능을 나타낸다 (PBS와 human IgG 값은 중첩되어 표기됨).
도 4는 Octet 분석에 따른 본 발명의 항체의 BCAM에 대한 결합능을 나타낸다.
도 5는 공초점 레이저 주사 현미경으로 관찰된 본 발명의 항체의 세포 내재화의 정도를 보여준다.
항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편
본 발명은 BCAM 단백질에 특이적으로 결합하는 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 제공한다.
일 실시태양에서, 본 발명의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편은
서열번호 7, 9 및 11로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR1,
서열번호 13, 15 및 17로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR2,
서열번호 19, 21 및 23으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR3,
서열번호 8, 10 및 12로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR1,
서열번호 14, 16 및 18로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR2, 및
서열번호 20, 22 및 24로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR3
을 포함한다.
구체적 일 실시태양에서, 본 발명의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편은
(a) 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR1;
서열번호 13의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR2;
서열번호 19의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR3;
서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR1;
서열번호 14의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR2; 및
서열번호 20의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR3;
(b) 서열번호 9의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR1;
서열번호 15의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR2;
서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR3;
서열번호 10의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR1;
서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR2; 및
서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR3;
또는
(c) 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR1;
서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR2;
서열번호 23의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR3;
서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR1;
서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR2; 및
서열번호 24의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR3;
을 포함한다.
본원에서 각 사슬 또는 이들의 가변 영역이 특정 아미노산 서열을 포함한다는 것은, 해당 아미노산 서열 전체를 포함하는 경우, 해당 아미노산 서열 전체를 갖는 경우, 또는 해당 아미노산 서열로 이루어진 경우를 모두 의미한다.
일례에서, 상기 항체 또는 그의 항원 결합 단편은, 서열번호 7의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 CDR1; 서열번호 13의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 CDR2; 서열번호 19의 아미노산 서열을 갖는 중쇄 CDR3; 서열번호 8의 아미노산 서열을 갖는 경쇄 CDR1; 서열번호 14의 아미노산 서열을 갖는 경쇄 CDR2; 및 서열번호 20의 아미노산 서열을 갖는 경쇄 CDR3을 포함한다.
또다른 예에서, 상기 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 서열번호 7의 아미노산 서열로 본질적으로 이루어지는 중쇄 CDR1; 서열번호 13의 아미노산 서열로 본질적으로 이루어지는 중쇄 CDR2; 서열번호 19의 아미노산 서열로 본질적으로 이루어지는 중쇄 CDR3; 서열번호 8의 아미노산 서열로 본질적으로 이루어지는 경쇄 CDR1; 서열번호 14의 아미노산 서열로 본질적으로 이루어지는 경쇄 CDR2; 및 서열번호 20의 아미노산 서열로 본질적으로 이루어지는 경쇄 CDR3을 포함한다.
또다른 예에서, 상기 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 서열번호 7의 아미노산 서열로 이루어지는 중쇄 CDR1; 서열번호 13의 아미노산 서열로 이루어지는 중쇄 CDR2; 서열번호 19의 아미노산 서열로 이루어지는 중쇄 CDR3; 서열번호 8의 아미노산 서열로 이루어지는 경쇄 CDR1; 서열번호 14의 아미노산 서열로 이루어지는 경쇄 CDR2; 및 서열번호 20의 아미노산 서열로 이루어지는 경쇄 CDR3을 포함한다.
본원에 사용된 용어 "포함하는", "포함하다", 또는 이의 변형된 어구는 개방적인 의미를 나타낸다. 일 예로서, 열거된 아미노산 서열을 포함하는 항체 또는 그의 항원 결합 단편은, 본질적이든 그렇지 않은 간에, 열거되지 않은 추가적인 아미노산 서열을 포함할 수 있다.
본원에 사용된 용어 "~으로 본질적으로 이루어진다" 또는 이의 변형된 어구는 임의의 언급된 요소들을 포함하며, 그 실시 형태의 기본적이고 신규하거나 기능적인 특성에 실질적으로 영향을 미치지 않는 요소들의 존재를 허용한다. 일 예로서, 열거된 아미노산 서열로 본질적으로 이루어지는 항체 또는 그의 항원 결합 단편은, 항체 또는 그의 단편의 특성에 실질적으로 영향을 미치지 않는 1개 이상의 아미노산 잔기의 치환을 포함할 수 있다.
본원에 사용된 용어 "~로 이루어진다" 또는 이의 변형된 어구는 각각의 구성요소가 실시 형태의 그 설명에서 언급되거나 나열되지 않은 어떠한 요소도 허용하지 않는 경우를 의미한다.
본원에서 정의된 또다른 항체 또는 그의 항원 결합 단편의 각 사슬 또는 가변 영역 역시 위 예시와 동일하게 아미노산 서열을 포함하거나, 갖거나 또는 이로 이루어지는 것일 수 있다.
상보성 결정 영역(CDR; CDR1, CDR2, 및 CDR3)은 항원 결합을 위해 필요한 존재인, 항체 가변 영역의 아미노산 잔기를 지칭한다. 각 가변 영역은 전형적으로, CDR1, CDR2, 및 CDR3으로서 확인된 3개의 CDR 영역을 갖는다.
또다른 실시태양에서, 본 발명의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편은
서열번호 1, 3 및 5로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 중쇄 가변 영역; 및
서열번호 2, 4 및 6으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 경쇄 가변 영역
을 포함한다.
구체적 일 실시태양에서, 본 발명의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편은
(a) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역 및 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역;
(b) 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역 및 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역; 또는
(c) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역 및 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역;
을 포함한다.
항체 가변 영역은 CDR, 및 골격 영역(FR)의 아미노산 서열을 포함하는 항체 분자의 경쇄 및 중쇄 부분을 지칭한다.
본원에서 사용된 용어 "항체"는 면역글로불린 분자의 가변 영역 중에 위치한 적어도 하나의 항원 인식 부위를 통해 표적, 예를 들어 탄수화물, 폴리뉴클레오타이드, 지질, 폴리펩타이드, 단백질 등에 특이적으로 결합할 수 있는 면역글로불린 분자이다. 본원에서의 "항체"라는 용어는 가장 광범위한 의미로 사용되며, 따라서 온전한 폴리클로날 또는 모노클로날 항체뿐만 아니라, 이량체, 다량체, 다중특이적 항체(예컨대, 이중특이적 항체), 그의 항원 결합 단편, 항체 단편, 항원 인식 부위(예컨대 가변 영역)을 포함하는 면역글로불린 분자의 임의의 다른 변형된 배열을 포함하는 융합 단백질, 합성 항체(예컨대 "항체 모방체"), "FynomAb" 등을 광범위하게 포함한다.
항체에는 immunoglobulin(Ig)M, IgD, IgG, IgA 및 IgE의 5종류가 있으며, 각각 중쇄 불변영역 유전자 μ, δ, γ, α, ε로부터 만들어진 중쇄를 포함한다. 항체의 경쇄와 중쇄는 아미노산 서열이 항체들마다 서로 다른 가변 영역(variable region)과 아미노산 서열이 같은 불변 영역(constant region)으로 나뉘어져 있으며, 중쇄 불변영역에는 CH1, H(hinge), CH2, CH3 도메인이 존재한다. 각 도메인은 두 개의 β-sheet로 구성되어 있고 이들 사이에 intramolecular disulfide bond가 연결되어 있다.
본원에서 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역 및 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함하는 항체를 "111a", 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역 및 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함하는 항체를 "111b", 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역 및 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함하는 항체를 "111c"로 지칭한다.
본 발명의 항체는 키메라 항체, 인간화 항체, 또는 인간 항체일 수 있다.
본원에서 사용된 용어 "키메라 항체"는 가변 영역 서열은 하나의 종으로부터 유래하고, 불변 영역 서열은 다른 종으로부터 유래하는 항체, 예를 들어, 가변 영역 서열은 마우스 항체로부터 유래하고, 불변 영역 서열은 인간의 항체로부터 유래하는 항체를 의미한다. 키메라 항체의 제조 방법은 본 기술 분야에 공지되어 있다. 예를 들어 문헌[Morrison, Science 229:1202 (1985)] 등을 참고할 수 있으며, 이들 문헌은 그 전체가 본원에 참고로 포함된다.
본원에서 사용된 용어 "인간화 항체"는 비-인간종, 예컨대 다른 포유 동물 종, 예를 들어, 마우스 또는 닭의 생식 계열로부터 유래하는 하나 이상의 CDR 서열이 인간 면역글로불린 분자로부터의 frame work 서열에 삽입된 항체를 의미한다. Frame work 서열은 추가로, 예컨대 mutation 방식을 통해 재변형될 수 있다. 인간 Ig 서열은 예를 들어, NCBI Database (Entez Gene) 등을 참고할 수 있다. 적절한 서열을 사용하여, 항체의 면역원성을 감소시키거나, 결합성, 친화성, 온-속도, 오프-속도, 친화력, 특이성, 반감기 또는 임의의 다른 적합한 특징을 감소시키거나, 향상시키거나, 변경시킬 수 있다.
본원에서 사용된 용어 "인간 항체"는, frame work 및 CDR 영역이 모두 인간 면역글로불린 서열로부터 유래하는 가변 영역을 포함하는 항체를 지칭한다. 항체의 불변 영역 역시 인간의 면역글로불린 서열로부터 유래한다.
본원에서 사용된 용어 "항원 결합 단편" 또는 "항체 단편"은 전형적으로 적어도 모 항체의 항원 결합 도메인의 적어도 일부(예를 들면, 하나 이상의 CDR) 또는 가변 영역을 포함하는 것을 의미한다. 항체 단편은 모 항체의 결합 특이성의 적어도 일부를 보유한다. 본원에서 사용될 수 있는 항원 결합 단편의 예는 Fab, Fab', Fab'-SH, Fv, 단일 쇄 항체 scFv, F(ab')2 단편, VL, VH, 디아바디(diabody), 트리아바디(triabody), 테트라바디(tetrabody), 미니바디((scFV-CH3)2), IgG델타CH2, scFv-Fc, (scFv)2-Fc, 피노머(Fynomer), 이중 친화성 재표적화(dual-affinity re-targeting:DART), 안티칼린(anticalins), FN3 모노바디, DARPins, Affibodies, Affilins, Affimers, Affitins, Alphabodies, Avimers, Im7, VLR, VNAR, Trimab, CrossMab, 트리덴트(TRIDENT), 나노바디, 바이 나노바디(binanobodies) 또는 디-sdFv를 포함하나, 이로 제한되는 것은 아니다.
구체적으로, Fab 단편은 VL, VH, CL 및 CH1 도메인으로 이루어진 1가 단편을 지칭한다.
Fab' 단편은 항체 힌지 영역으로부터의 하나 이상의 시스테인을 포함하는 CH1 도메인의 카르복시 말단에서 몇 개의 잔기가 추가된 점에서 Fab 단편과 상이하다.
Fab'-SH는 불변 도메인의 시스테인 잔기가 유리 티올기를 보유하는 Fab'를 지칭한다.
F(ab')2 항체 단편은 Fab' 단편들 사이에 힌지 시스테인을 통해 Fab' 단편들의 쌍으로서 생성된다.
Fv는 완전한 항원 인식 부위 및 항원 결합 부위를 함유하는 최소 항체 단편이다. 이 단편은 1개의 중쇄 가변 영역 및 1개의 경쇄 가변 영역이 단단하게 비-공유적으로 회합된 이량체로 이루어진다. 이들 2개 영역이 폴딩되어 6개의 초가변 루프 (중쇄 및 경쇄로부터 각각 3개의 루프)가 형성되는데, 상기 루프는 항원 결합을 위한 아미노산 잔기를 제공하고 항체에 항원 결합 특이성을 부여한다. 그러나, 단일 가변 영역일지라도 전체 결합 부위보다 친화성이 낮긴 하지만 항원을 인식하고 결합하는 능력을 갖는다.
단일 쇄 항체 scFv는 단일 폴리펩티드 사슬로 연결되어 있는 VH 및 VL 항체 도메인을 포함하는 항체 단편이다. 바람직하게는, scFv 폴리펩티드는 scFv가 항원 결합을 위한 목적하는 구조를 형성할 수 있도록 하는, VH 및 VL 도메인 사이의 폴리펩티드 링커를 추가로 포함한다. 본원에서는 scFv 항체 단편, 항원 결합 단편 scFv, scFv 항체, 항체 scFv, 또는 간단히 scFv로 지칭되기도 한다.
디아바디(diabody)는 V 도메인의 사슬간이 아닌 사슬내 쌍형성이 달성되어 2가 단편, 즉, 2개의 항원 결합 부위를 갖는 단편을 생성하도록, VH 및 VL 도메인 사이에 짧은 링커 (약 5-10개 잔기)를 사용하여 scFv 단편을 구성함으로써 제조된 작은 항체 단편을 지칭한다. 이중특이적 디아바디는 2개 항체의 VH 도메인 및 VL 도메인이 상이한 폴리펩티드 쇄에 존재하는 2개의 "가교" scFv 단편으로 이루어진 이종이량체이다. 유사하게, 트리아바디(triabody) 및 테트라바디(tetrabody)는 각각 3개의 폴리펩타이드 쇄 및 4개의 폴리펩타이드 쇄를 포함하고 동일할 수 있거나 상이할 수 있는 각각 3개의 항원 결합 부위들 및 4개의 항원 결합 부위들을 형성한다.
피노머(Fynomer)는 인간 Fyn SH3 도메인으로부터 유래된 비-면역글로불린-유래 결합 폴리펩타이드를 지칭한다. Fyn SH3-유래 폴리펩타이드는 당업계에 잘 알려져 있고, 예를 들어, 문헌 [Grabulovski et al. (2007) JBC, 282, p. 3196-3204], WO 2008/022759 등에 언급되어 있다. 피노머(Fynomer)는 다른 분자(예컨대 항체)와 유전공학적으로 융합되어 "FynomAb", 즉, 이중 특이성을 갖도록 엔지니어링될 수 있는 형태를 생성할 수 있다.
이중 친화성 재표적화(dual-affinity re-targeting:DART) 및 트리덴트(TRIDENT)는 2개 또는 그 이상의 타겟에 동시에 결합할 수 있도록 고안된 것을 지칭한다. DART는 공유적으로 연결된 이중 특이적 디아바디, 예컨대 C-말단 disulfide bridge를 통해 연결된 디아바디를 지칭하여, 이의 구체적인 구조 및 정의 등에 대해서는 문헌 [J. Mol. Biol. (2010) 399, 436-449] 등에 언급되어 있다.
본 발명의 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 BCAM 단백질, 예컨대 인간 BCAM 단백질에 특이적으로 결합하는 것일 수 있다.
구체적 일 실시태양에서, 본 발명은 인간 BCAM에 특이적으로 결합하는 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편으로서, 항체 111a, 111b 또는 111c이 인간 BCAM에 결합하는 에피토프와 동일한 에피토프에 결합하는, 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 제공한다. 상기 항체 또는 그의 항원 결합 단편의 중쇄 및 경쇄 각각의 CDR1, CDR2, 및 CDR3은 항체 111a, 111b 또는 111c의 중쇄 및 경쇄 각각의 CDR1, CDR2, 및 CDR3과 80% 이상, 바람직하게는, 90% 이상, 특히 바람직하게는, 100%의 상동성을 가진다. 유사하게, 상기 항체 또는 그의 항원 결합 단편의 중쇄 및 경쇄 각각은 항체 111a, 111b 또는 111c의 중쇄 및 경쇄 각각과 80% 이상, 바람직하게는, 90% 이상, 특히 바람직하게는, 100%의 상동성을 가진다.
본원에서 사용된 용어 "BCAM"은 기저 세포 부착 분자(basal cell adhesion molecule)로서 세포외 매트릭스 단백질인 laminin에 대한 수용체로 작용하는 표면 당단백질이다. "BCAM"은 Lutheran blood group glycoprotein (Lu) 또는 CD239로도 알려져 있으며, 본원에서 "BCAM", "Lu", "Lu/BCAM", "CD239"은 서로 동일한 단백질을 지칭하며 서로 상호 교환적으로 사용될 수 있다.
본원에서 사용된 용어 "~에 특이적으로 결합하다" 또는 "~에 특이적인"이란, 생물학적 분자를 포함하는 분자의 이종 집단의 존재 하에서 표적의 존재에 대해 결정력이 있는 것을 의미하는 것으로, 표적과 항체 사이의 결합과 같은 측정가능하고 재현가능한 상호작용을 지칭한다. 예를 들어, 특정 표적(예: 에피토프)에 특이적으로 결합하는 항체는 상기 표적에 다른 표적에 결합하는 것보다 더 큰 친화도로, 더 큰 결합력으로, 더 손쉽게 및/또는 더 긴 지속기간으로 결합하는 항체를 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "인간 BCAM 단백질에 특이적으로 결합하는"이란, 인간 BCAM 단백질과 결합 해리 평형 상수 (KD) 1 x 10-7 M 이하로 결합하거나, 바람직하게는 5 x 10-8 M 이하로 결합하는 항체를 의미할 수 있다. 이에 따라 본 발명의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 1 x 10-7 M 이하의 결합 해리 평형 상수 (KD)로, 바람직하게는, 5 x 10-8 M 이하의 KD로 인간 BCAM 단백질에 결합하는 것일 수 있다.
본원에서 사용된 용어 "KD"는 특정 항체-항원 상호작용의 결합 해리 평형 상수를 지칭하며, KD = Kd / Ka의 계산식을 통해 산출되며(이 때 Ka는 결합 속도 상수이고, Kd는 해리 속도 상수임), 상기 상수 KD는 M의 단위를 갖는다. 항체에 대한 KD값은 당 업계에 널리 확립된 방법을 이용하여 측정될 수 있다. 항체의 KD값을 측정하기 위한 바람직한 방법은 표면 플라스몬 공명법(SRP; surface plasmon resonance), 바람직하게는 바이오센서 시스템 예를 들어, 바이어코어(Biacore)® 시스템을 사용하거나, 또는 바이오레이어 간섭법 (Bio-layer Interferometry, BLI), 예를 들어 Octet® 시스템을 사용할 수 있다. 일 특정예에서, 본원에서 언급된 KD는 Octet® 시스템을 사용한 바이오레이어 간섭법을 통해 얻어진 값일 수 있다.
또다른 실시태양에서, 본 발명의 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 약물과 컨쥬게이션된 형태, 즉, 항체-약물　컨쥬게이트(ADC)를 형성할 수 있다.　본원에 사용된 용어 "항체-약물　컨쥬게이트(antibody-drug　conjugate)"또는 "ADC"는 식 M-[L-D]n으로 표시될 수 있는데, 여기서 M은 항체 분자, 즉, 본 발명의 항-BCAM 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 나타내고, L은 선택적인(optional) 링커 또는 링커 단위이고, D는 적합한　약물　또는 전구약물이고, n은 약 1에서 약 20까지의 정수이다. ADC에 포함되는 약물은 본 발명의 항체의 특이적 결합을 방해하지 않는 한, 치료 또는 진단 용도 등에 따라 적절히 선택될 수 있다. 일 구체예에서, 상기 약물은 세포독성제(예를 들어, 화학요법제), 프로드러그 전환 효소, 방사성 동위원소 또는 화합물, 또는 독소 등을 포함하나 이로 제한되지 않는다. ADC에 포함될 수 있는 약물 및 링커와 이의 제조 방법에 대해서는 당업계에 공지된 방법에 따를 수 있다. 이에 따라 본 발명은 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 포함하는 항체-약물　컨쥬게이트를 제공한다.
또다른 실시태양에서, 본 발명의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 ELISA assay로 측정시 150 nM 이하, 예컨대, 130 nM 이하, 100 nM 이하, 50 nM 이하, 20 nM 이하, 또는 10 nM 이하의 EC50으로 BCAM 단백질에 결합한다.
본원에 사용된 용어 "EC50"은 항체를 사용하는 시험관내 또는 생체내 분석과 관련된 용어로서, 최대 반응의 50%, 즉 최대 반응과 베이스라인(기준선)의 중간 반응을 유도하는 항체의 농도를 의미한다.
핵산 분자 및 벡터
본 발명의 또다른 측면은 본 발명의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 암호화하는 핵산 분자에 관한 것이다.
핵산은 전 세포나 세포 용해물 중에 존재할 수 있거나, 또는 구체적으로 정제된 형태 또는 실질적으로 순수한 형태로 존재할 수 있다. 핵산은 기타 세포 성분 또는 기타 오염 물질 예를 들어, 기타 세포 핵산 또는 단백질이 표준적인 기술 예를 들어, 알칼리성/SDS 처리법, CsCl 밴드 형성법(banding), 컬럼 크로마토그래피, 아가로스 겔 전기 영동법 및 기타 당업계에 널리 알려진 방법에 의해 정제되어 제거되었을 때의, "분리된" 또는 "실질적으로 순수하게 단리된" 핵산이다.
본 발명의 핵산은 예를 들어, DNA 또는 RNA일 수 있으며, 인트론 서열을 함유할 수 있거나 또는 함유하지 않을 수 있다. 바람직한 구체예에서, 핵산은 cDNA 분자이다.
일 실시태양에서, 본 발명의 핵산 분자는 본 발명의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편의 경쇄 영역, 중쇄 영역, 또는 경쇄 및 중쇄 영역 모두를 암호화하며, 바람직하게는, 경쇄 가변 영역, 중쇄 가변 영역, 또는 경쇄 및 중쇄 가변 영역 모두를 암호화한다.
일단 VL 및/또는 VH 영역을 암호화하는 DNA 단편이 얻어지면, 이와 같은 DNA 단편은 예를 들어, 표준적인 재조합 DNA 기술에 의해 추가로 조작되어, 그 결과 가변 영역 유전자를 전장 항체 사슬 유전자, Fab 단편 유전자 또는 scFv 유전자로 전환할 수 있다. 이와 같은 조작 과정에 있어서, VL- 또는 VH-암호화 DNA 단편은 다른 단백질 예를 들어, 항체 불변 영역 또는 가요성 링커를 암호화하는 기타 DNA 단편에 작동 가능하도록 결합된다. 본원에서 사용된 용어 "작동가능하도록 결합된"이란, 2개의 DNA 단편들이 결합되어, 2개의 DNA 단편에 의해 암호화되는 아미노산 서열이 인-프레임(in-frame) 상태로 남아있게 되는 경우를 의미한다.
VH 부위를 암호화하는 분리된 DNA는 VH-암호화 DNA를 중쇄 불변 영역(CH1, CH2 및 CH3)를 암호화하는 기타 DNA 분자에 작동 가능하도록 결합시킴으로써 전장 중쇄 유전자로 전환될 수 있다. 중쇄 불변 영역은 IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA, IgE, IgM 또는 IgD 불변 영역일 수 있다.
Fab 단편 중쇄 유전자에 있어서, VH-암호화 DNA는 오로지 중쇄 CH1 불변영역만을 암호화하는 다른 DNA 분자에 작동 가능하도록 결합될 수 있다.
scFv 유전자를 생산하기 위해서, VL- 및 VH-암호화 DNA 단편은 가요성 링커 예를 들어, 아미노산 서열(Gly4-Ser)3을 암호화하는 기타 단편에 작동 가능하도록 결합될 수 있으며, 그 결과, VL 및 VH 서열은, 가요성 링커에 의해 결합된 VL 및 VH 부위를 가지는 연속 단일-사슬 단백질로서 발현될 수 있다.
본 발명의 핵산 서열, 예컨대 RNA 또는 DNA는 다양한 공급원으로부터 분리되고, 유전공학처리되고, 증폭되고/되거나 재조합에 의해 발현될 수 있다. 세균, 예를 들면, 효모 이외에 곤충 또는 포유동물 시스템을 포함한 임의의 재조합 발현 시스템을 사용할 수 있다. 예를 들면, 발현 벡터로의 서브클로닝, 표지 프로브, 서열분석 및 하이브리드화와 같은 핵산 조작은 당업계에 알려진 바에 따라 수행될 수 있다.
이에 따라 본 발명은 상기 핵산 분자를 포함하는 재조합 발현 벡터를 제공한다.
본원에서 사용된 용어 "벡터"는 재조합 벡터, 클로닝 벡터, 발현 벡터와 상호교환적으로 사용되는, 원핵 및/또는 진핵 세포에서 자가 복제가 가능한 DNA 분자를 일컫는 것으로, 일반적으로 유전자 또는 DNA 단편을 세포 등으로 전달하기 위한 중간 전달체로 사용된다. 벡터는 통상 원핵 및/또는 진핵세포에서 복제할 수 있는 복제원점, 항생제 분해 효소와 같은 특정 조건/물질에 저항성을 부여할 수 있는 선별 마커 유전자, 진핵 또는 원색 세포에서의 유전자의 전사가 가능한 프로모터, 번역이 가능한 서열을 포함하나, 이로 제한하는 것은 아니다.
벡터의 한 유형은 "플라스미드"로, 이는 추가의 DNA 단편이 접합될 수 있는 원형 이중 표준 DNA 루프를 지칭한다. 벡터의 또다른 유형은 추가의 DNA 단편이 바이러스 게놈에 접합될 수 있는 바이러스 벡터이다. 특정 벡터들은 이들이 도입되는 숙주 세포에서 자율 복제될 수 있다(예를 들면, 세균성 복제 기점을 갖는 세균 벡터 및 에피좀 포유동물 벡터).
항체 또는 그의 항원 결합 단편의 제조
본 발명의 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 종래 공지된 방법에 따라 제조될 수 있다.
일 실시태양에서, 본 발명의 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 항체 디스플레이 기술, 예컨대 파지 디스플레이 기술을 이용하여 제조될 수 있다.
항체의 　파지 라이브러리는 인간 항체의 중쇄 및 경쇄 가변 영역 유전자를　 파지미드 벡터(phagemid vector) 안에 파지 표면 단백질(pIII)에 융합시킨 형태로 클로닝하여 대장균에서 발현시킨 후, 　M13 helper　phage를 감염시켜,　파지의 표면에 다양한 조합의 중쇄 및 경쇄 가변 영역의 서열을 갖는 항체 절편(scFv　또는　Fab)이 디스플레이된 항체 라이브러리(library)를 제조한다.　이 라이브러리로부터 패닝(panning)　방법을 이용하여 특정 항원에 결합하는 항체의 절편을 분리하고,　분리된 항체 절편의 특성을 규명한 후　whole IgG　형태로 전환하여 동물세포에서 대량 발현시킴으로써 특정한 인간 모노클로날 항체를 생산한다.
상기 라이브러리로는 인체에 이미 존재하는 항체 유전자를 이용하는 naive antibody library를 사용할 수 있으며, 다르게는, 항체의 CDR에 무작위 합성 서열을 넣어 다양성을 증가시킨 synthetic antibody library를 사용할 수도 있다.
본원에서 사용된 용어 "파지미드 벡터"는 파지복제시작점(phage origin of replication)을 가지는 플라스미드 DNA이며, 통상적으로 항생제 내성 유전자를 선택 마커(selection marker)로 가지고 있다. 파지 디스플레이에 사용되는 파지미드 벡터의 경우 M13 파지의 gIII 유전자 또는 그 일부가 포함되어 있으며, scFv 유전자는 gIII 유전자의 5' 말단에 라이게이션(ligation)되어 형질전환체를 통해 발현된다.
"헬퍼 파지(helper phage)"는 파지미드가 파지 입자로 조립되도록 필요한 유전정보를 제공하는 파지이다. 파지미드에는 파지 유전자 중 gIII 혹은 그 일부만이 존재하므로 파지미드로 형질전환된 숙주세포(형질전환체)를 헬퍼 파지로 감염시켜 나머지 파지 유전자를 공급하게 된다. M13K07 또는 VCSM13 등의 종류가 있으며 대부분 카나마이신(kanamycin) 등 항생제 내성 유전자를 포함하여 헬퍼 파지에 감염된 형질전환체를 선택할 수 있도록 한다. 또한 조립신호(packaging signal)에 결함이 있으므로 헬퍼 파지 유전자보다 파지미드 유전자가 선별적으로 파지입자 속으로 조립된다.
또다른 실시태양에서, 본 발명의 항체 당업계에 달려진 방법에 따라 시험 대상체(예: 마우스)에게 BCAM 항원을 주입시킨 후, 목적하는 서열 또는 기능적 특성을 갖는 항체를 발현하는 하이브리도마를 분리시킴으로써, 예컨대 모노클로날 항체의 형태로 제조할 수 있다.
모노클로날 항체를 암호화하는 DNA는 통상적인 방법(예를 들면, 모노클로날 항체의 중쇄 및 경쇄를 암호화하는 유전자에 특이적으로 결합할 수 있는 올리고뉴클레오타이드 프로브를 사용)을 사용하여 즉시 분리되고 서열화된다. 하이브리도마 세포는 이러한 DNA의 바람직한 공급원으로서 제공된다. 일단 분리되면, DNA는 발현 벡터 내로 위치시킨 후, 숙주 세포, 예를 들면, 이. 콜라이(E. coli) 세포, 시미안(simian) COS 세포, 차이니즈 햄스터 난소(Chinese hamster ovary (CHO)) 세포, 또는 면역글로불린 단백질을 달리 생산하지 않는 골수종 세포 내로 형질감염시켜 재조합 숙주 세포에서 모노클로날 항체의 합성을 수득할 수 있다.
용도 및 방법
본 발명의 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 BCAM에 특이적으로 결합하여 암을 예방 또는 치료하기 위한 것이다.
이에 따라, 일 실시태양에서, 본 발명은 유효량의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 암의 예방, 개선 또는 치료 방법을 제공한다.
또다른 실시태양에서, 본 발명은 암의 예방, 개선 또는 치료를 위한 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편의 용도를 제공한다.
또다른 실시태양에서, 본 발명은 항- BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 포함하는, 암의 예방, 개선 또는 치료용 약학 조성물을 제공한다. 상기 항- BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 약학 조성물에 유효량으로 포함될 수 있다.
본원에서 사용된 용어 "대상체"는, 인간과 비-인간 동물을 모두 포함하는 의미이다. 비-인간 동물로서는 모든 척추 동물, 예를 들어, 포유 동물과 비-포유 동물 예를 들어, 인간 이외의 영장류, 양, 개, 고양이, 소, 말, 닭, 양서류 및 파충류를 포함하나, 예를 들어, 인간 이외의 영장류, 양, 개, 고양이, 소 및 말과 같은 포유 동물이 바람직하다. 바람직한 대상체로는 암의 예방 또는 치료가 요구되는 인간이다.
바람직하게는, 본 발명의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 BCAM 단백질에 특이적으로 결합함으로써, BCAM을 발현하는 암세포에 효과적으로 결합할 수 있어, 생체 내에서 암 세포의 성장을 억제하여, 암을 예방, 개선 또는 치료하는데 유용하게 사용될 수 있다. BCAM은 종양 이동과 관련되어 있으며, 나아가 이의 과발현은 특히 피부암, 난소암, 췌장암, 유방암 등에서 나타나는 것으로 알려져 있다(F.R.M. Latini et al., Blood Cells, Molecules and Diseases 50 (2013) 161-165 등 참조). 이에 따라 본 발명의 항-BCAM 항체는 종양 이동이 관찰되는 모든 암, 예컨대 전이성 암에 사용될 수 있으며, 그 외 이의 과발현이 관찰되는 구체적인 암종에도 사용될 수 있다.
본 발명의 항체를 사용하였을 때 성장이 억제될 수 있는 암의 예로는, 흑색종(예를 들어, 전이 악성 흑색종), 신장 암(예를 들어, 투명 세포 암종), 전립선 암(예를 들어, 호르몬 난치성 전립선 선암종), 유방암, 대장암, 직장암, 결장암 및 폐암(예를 들어, 비-소형 세포 폐암), 골암, 췌장암, 간암, 피부암, 두부 또는 경부 암, 자궁암, 난소암, 직장암, 항문부 암, 위암, 고환 암, 나팔관 암종, 자궁 내막 암종, 자궁 경부 암종, 질 암종, 여성 외음부 암종, 호지킨병, 비-호지킨 림프종, 식도암, 소장 암, 내분비 시스템 암, 갑상선 암, 부갑상선 암, 부신 암, 연조직 육종, 요도 암, 음경암, 만성 및 급성 백혈병 예를 들어, 급성 골수성 백혈병, 만성 골수성 백혈병, 급성 림프구성 백혈병, 만성 림프구성 백혈병, 어린이 고형 종양, 림프구성 림프종, 방광암, 수뇨관암, 신우 암종, 중추 신경계(CNS)의 신생물 형성증, 1차 CNS 림프종, 종양 신생 혈관 형성, 척수 축 종양, 뇌간 교세포종, 뇌하수체 선암종, 카포시 육종, 표피양 암, 편평 상피 세포 암, T 세포 림프종, 환경에 의해 유발되는 암 예를 들어, 석면에 의해 유발되는 암 등을 포함하나 이로 제한되지 않는다.
일 실시태양에서, 본 발명의 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 BCAM 단백질에 특이적으로 결합하여 항체-약물 컨쥬게이트(ADC)를 형성함으로써 암의 예방 또는 치료에 사용될 수 있다. 이에 따라, 일 실시태양에서 본 발명은 약물과 컨쥬게이션된 형태로서, 항-BCAM 항체 또는 항원 결합 단편을 제공한다. 일 구체예에서, 상기 약물은 세포독성제(예를 들어, 화학요법제), 프로드러그 전환 효소, 방사성 동위원소 또는 화합물, 또는 독소 등을 포함하나 이로 제한되지 않는다. ADC에 포함될 수 있는 약물 및 링커와 이의 제조 방법에 대해서는 당업계에 공지된 방법에 따를 수 있다.
본 발명의 항체 또는 항원 결합 단편은 단독으로 또는 다른 항암 요법과 함께 사용될 수 있다. 다른 항암 요법으로는, 예를 들어, 표준 암 치료요법(예를 들면, 화학 치료요법, 방사선 치료요법 또는 수술); 또는 기타 항암제, 예를 들어, 세포독성제, 세포증식억제제, 항호르몬제, 항-혈관형성 또는 항대사산물제, 표적항암제, 면역 자극 또는 면역 조절제, 면역 관문 억제제 또는 세포독성제, 세포증식억제제, 및 기타 독성제에 접합된 항체 등을 포함할 수 있다.
바람직하게는, 본 발명의 항체 또는 항원 결합 단편은 다른 항암제, 예컨대 면역 관문 억제제, 화학요법제, 또는 방사선 치료요법 등과 함께 병용 요법으로 사용될 수 있다. 상기 면역 관문 억제제는 예를 들어, 항-CTLA-4 항체(예: ipilimumab), 항-PD-1 항체(예: pembrolizumab, nivolumab), 또는 항-PD-L1 항체(예: atezolizumab, avelumab, durvalumab)일 수 있다. 상기 화학요법제에는 알킬화제, 항대사물질, 키나제 억제제, 스핀들 독성 식물 알칼로이드, 세포 독성/항종양 항생제, 토포아이소머라제 억제제, 감광제, 항에스트로겐 및 선택적 에스트로겐 수용체 조절제(SERM), 항프로게스테론, 에스트로겐 수용체 하향 조절제(ERD), 에스트로겐 수용체 길항제, 황체 형성 호르몬 방출 호르몬 작용제, 항안드로겐, 아로마타제 억제제, EGFR 억제제, VEGF 억제제, 비정상 세포 증식 또는 종양 성장에 연루된 유전자의 발현을 억제하는 안티센스 올리고뉴클레오티드를 포함하지만, 이로 제한되지 않는다. 본 발명의 화학요법제의 구체적인 일례로는, 젬시타빈, 비노렐빈, 에토포시드 (VP-16), 백금유사체, 예를 들어, 시스플라틴 또는 카보플라틴, 탁소이드, 예를 들어, 파클리탁셀, 알부민-결합 파클리탁셀, 도세탁셀 등을 포함한다.
본 발명의 항체 또는 항원 결합 단편이 다른 항암제와 함께 사용될 때, 이들은 별도 투여하거나 복수의 활성 성분들이 하나의 약학적 제제에 존재하는 조합 제품의 형태로 적용될 수 있다. 이들이 별도의 제제로 투여되는 경우, 두 제제는 순차적으로 또는 동시에 투여될 수 있다. 동시 투여의 경우, 이들은 환자에 함께 제공된다. 순차 투여의 경우, 길지 않은 시간으로 시간차를 투어 제공될 수 있으며, 예컨대 12시간 이하, 또는 6시간 이하의 기간 내로 환자에게 투여될 수 있다.
일 실시태양에서, 본 발명은 유효량의 항체 또는 항원 결합 단편을 추가 항암제와 병용하여 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 암의 예방, 개선 또는 치료 방법을 제공한다. 상기 실시태양은 항-BCAM 항체 또는 항원 결합 단편을 추가 항암제를 하나의 조성물에 함께 포함하여 동시에 투여하는 것은 물론, 이들 각각이 별개로 포함된 조성물을 이를 필요로 하는 환자에게 동시에 또는 순차로 투여하는 것을 포함한다.
또다른 실시태양에서, 본 발명은 암의 예방, 개선 또는 치료를 위해, 추가 항암제와 병용하기 위한 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편의 용도를 제공한다.
또 다른 실시태양에서, 본 발명은 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 및 추가 항암제를 포함하는, 암의 예방, 개선 또는 치료용 약학 조성물 또는 조합물을 제공한다. 본원에서 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 및 추가 항암제를 포함하는 약학 조성물 또는 조합물은 두 성분이 물리적으로 함께 하나의 제제 형태로 존재하는 경우 뿐 아니라, 동시에 또는 순차적으로 별도의 제제로 동시에 또는 순차로 투여되는 경우를 포함하며, 이 때 두 약물은 개별적으로 제공될 수도 있고 또는 하나의 키트에 함께 제공될 수도 있다. 이에 따라 본 발명은, 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 및 추가 항암제를 포함하는, 암의 예방, 개선 또는 치료용 키트를 제공한다.
약학 조성물
본 발명은 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 포함하는 약학 조성물을 제공한다. 상기 조성물은 비활성 성분, 즉, 약학적으로 허용되는 부형제를 포함할 수 있다[Handbook of Pharmaceutical Excipients 등 참조]. 치료학적 및 진단 제제의 조성물은 예를 들면, 냉동건조된 분말, 슬러리, 수성용액 또는 현탁액의 형태로 생리학적으로 허용되는 담체, 부형제 또는 안정화제와 혼합합으로써 제조할 수 있다.
적합한 투여 경로는 비경구 투여, 예를 들면, 근육내, 정맥내, 또는 피하내 투여를 포함한다. 본 발명의 약학 조성물에 사용되거나 또는 본 발명의 방법을 실행하기 위해 사용된 항체의 투여는 국소 적용 또는 피부, 피하, 복강내, 비경구, 동맥내 또는 정맥내 주사와 같은 각종 통상의 방법으로 수행할 수 있다. 일 실시태양에서, 본 발명의 항체는 정맥내 또는 피하내 투여된다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에 있어서 자명할 것이다.
실시예 1: 파지 디스플레이를 통한 BCAM 특이적 항체 제조
1.1 파지 디스플레이를 통한 scFv 항체 라이브러리 제작 및 선별
본 발명의 항체는 파지 디스플레이 방법을 통해 제조하였다.
인간 혈액 또는 골수에서 얻어진 항체의 중쇄 및 경쇄 가변영역의 mRNA를 PCR로 증폭시켜 cDNA를 합성하였다. restriction enzyme를 이용하여 phagemid vector에 클로닝한 후 E. coli에 electroporation하여 발현시켰다. 이어서 helper phage를 infection하여, scFv 형태의 human library를 제조하였다.
상기 라이브러리를 대상으로 하여 biopanning을 통해 표적 항원인 BCAM과 고 친화성으로 결합하는 항체를 스크리닝하였다. BCAM에 결합하는 positive clone을 selection하였고, sequencing을 통해 BCAM에 unique scFv sequence를 선별하였다.
1.2 anti-BCAM IgG4 항체 111a 내지 111c의 제조
Human IgG4 형태의 항체 생산을 위해, 실시예 1.1에서 선별된 scFv의 경쇄와 중쇄 영역을 expression vector에 cloning하였다. DNA를 transient transfection하고 배양하여 항체 발현을 진행하였고, 배양액을 kappa region capture에 결합시켜 항체를 elution 하여 3개의 anti-BCAM human IgG4 항체 (111a, 111b, 111c)를 제조하였다.
각 IgG4 항체의 경쇄 및 중쇄 가변 영역, 및 각 가변 영역들의 CDR의 아미노산 서열을 도 1, 표 1, 및 표 2에 각각 나타내었다 (도 1 및 표 1에서 bold체 및 밑줄로 표시된 서열은 각 CDR을 나타냄)
서열번호 영역 서열
서열번호 1 111a 중쇄 가변 영역 (VH) QVTLKESGPGLVKPSGTLSLTCAVS GGSISSSNWWS WVRQPPGKGLEWIG EIYHSGSTNYNPSLKS RVTISVDKSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR AYTVTTTYFDY WGQGTLVTVSS
서열번호 2 111a 경쇄 가변 영역 (VL) NIQMTQSPSTLSASVGDRVTITC RASQSMSTWLA WYQQKPGRAPKLLIY KASALET GVPSRFSGSGSGTQFTLTISSLQPDDFATYYC QQYDEFAS FGQGTKVEIK
서열번호 3 111b 중쇄 가변 영역 (VH) EVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS GYTFTSYYMH WVRQAPGQGLEWMG IINPSGGSTSYAQKFQG RVTMTRDTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCAR DGKGWDYYGSGSPLQY WGQGTLVTVSS
서열번호 4 111b 경쇄 가변 영역 (VL) LPVLTQPPSVSKGLRQTATLTC TGNSNNVGNQGAA WLQQHQGHPPKLLSY RNNDRPS GISERLSASRSGNTASLTITGLQPEDEADYYC SAWDSSLSAWV FGGGTKLTVL
서열번호 5 111c 중쇄 가변 영역 (VH) EVQLVQSGGGLVKPGGSLRLSCAAS GFTFSDYYMS WIRQAPGKGLEWVS YTSSSGSTIYYADSVKG RFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR DITAFDI WGQGTMVTVSS
서열번호 6 111c 경쇄 가변 영역 (VL) LPVLTQPPSASGSPGQSVTISC TGTSSDVGGYNYVS WYQQHPGKAPKLMIY EVNKRPS GVPDRFSGSKSGNTASLTVSGLQAEDEADYYC CSYAGSNNYV FGTGTKVTVL
서열번호 영역 서열
서열번호 7 111a VH CDR1 GGSISSSNWWS
서열번호 8 111a VL CDR1 RASQSMSTWLA
서열번호 9 111b VH CDR1 GYTFTSYYMH
서열번호 10 111b VL CDR1 TGNSNNVGNQGAA
서열번호 11 111c VH CDR1 GFTFSDYYMS
서열번호 12 111c VL CDR1 TGTSSDVGGYNYVS
서열번호 13 111a VH CDR2 EIYHSGSTNYNPSLKS
서열번호 14 111a VL CDR2 KASALET
서열번호 15 111b VH CDR2 IINPSGGSTSYAQKFQG
서열번호 16 111b VL CDR2 RNNDRPS
서열번호 17 111c VH CDR2 YTSSSGSTIYYADSVKG
서열번호 18 111c VL CDR2 EVNKRPS
서열번호 19 111a VH CDR3 AYTVTTTYFDY
서열번호 20 111a VL CDR3 QQYDEFAS
서열번호 21 111b VH CDR3 DGKGWDYYGSGSPLQY
서열번호 22 111b VL CDR3 SAWDSSLSAWV
서열번호 23 111c VH CDR3 DITAFDI
서열번호 24 111c VL CDR3 CSYAGSNNYV
실시예 2: anti- BCAM IgG4 항체 결합력 확인
2.1 ELISA에 따른 항원 단백질에 대한 결합능 확인
실시예 1에서 제조된 각 항체의 항원 단백질 (BCAM protein)에 대한 결합능을 확인하기 위하여 ELISA (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay) 시험을 진행하였다. PBS buffer에 항원 단백질을 희석하여 15nM의 농도로 준비하고 96 well half plate (Costar, Cat. No. 3690) 의 각 well에 50 μL씩 coating한 후 4 ℃에서 overnight incubation하였다. 다음 날, plate에 있는 모든 용액을 제거한 후 각 well에 blocking buffer (3% BSA in PBS)를 첨가한 후 37 ℃에서 1시간 동안 incubation하였다. 3개의 항체 시료 (111a, 111b 및 111c)를 blocking buffer에 1 μM부터 10배의 희석비율로 7개 지점 (1 pM)까지 순차적으로 희석하였다. Blocking 과정이 끝난 후, well로부터 buffer를 제거하고, 희석하여 준비한 항체를 각 well에 50 μL씩 첨가하여 37 ℃에서 2시간 동안 incubation하였다. 0.1 % PBST (0.1% Tween 20 in PBS)로 wash하고 항체 detection을 위한 2차 항체인 HRP-conjugated anti-human IgG Fc antibody (ThermoFisher Scientific, Cat. No.: 31423)를 37 ℃에서 1시간 동안 처리한 후, 0.1 % PBST로 다시 wash하였다. 발색을 위해 ABTS solution (ThermoFisher Scientific, Cat. No.: 00-2024)을 각 well에 50 μL씩 넣고 상온에서 10분 반응시킨 후, 405nm에서의 흡광도(Optical density at 405nm, OD405)를 측정, 항체의 농도에 따른 OD405값을 도 2와 표 3에 나타내었다. 각 항체의 항원에 대한 결합력 정도를 비교하기 위해 각 항체의 EC50 농도를 산출하였으며, 해당 결과를 표 4에 나타내었다.
결과적으로, ELISA 실험을 통해 시험이 진행된 항체 111a, 111b, 및 111c가 BCAM에 대한 우수한 결합능을 가짐을 확인하였다.
Abs (nM) 111a 111b 111c
1000 2.32 ± 0.04 0.76 ± 0.09 2.34 ± 0.06
100 2.14 ± 0.03 0.46 ± 0.03 2.26 ± 0.01
10 1.09 ± 0.03 0.43 ± 0.06 1.41 ± 0.12
1 0.46 ± 0.06 0.33 ± 0.06 0.50 ± 0.15
0.1 0.18 ± 0.06 0.35 ± 0.07 0.31 ± 0.09
0.01 0.11 ± 0.01 0.15 ± 0.00 0.25 ± 0.19
0.001 0.10 ± 0.01 0.10 ± 0.00 0.11 ± 0.01
항체 111a 111b 111c
EC50 (nM) 12.5 126.9 7.7
2.2 FACS (Fluorescence Activated Cell Sorting, Flow Cytometry )에 따른 항원 단백질에 대한 결합능 확인
실시예 1에서 제조된 3개의 항체에 대한 FACS 시험을 진행하였다.
HEK293FT cell에 transfection을 통해 human BCAM 항원을 발현시켰다(293FT/BCAM1 plasmid 이용). Transfect된 HEK293FT cell (1x105 cells) PBS 중에 현탁시키고, 이의 50 μl를 플레이트에 시딩하였다.
별도로 실시예 1의 각 항-BCAM 항체 및 Isotype control (인간 IgG) 항체를 PBS를 이용하여 45 μg/ml의 농도에서 시작하여 3배 dilution을 통해 12번 희석시키고, 플레이트를 적정 시간 및 적정 온도에서 incubation하였다. Negative control로서는 PBS 완충액을 이용하였다.
그 후 세척한 후, AlexaFluor® 647 AffiniPure Goat Anti-Human IgG (H+L) (min X Bov, Hrs, Ms Sr Prot)(Jackson) (1μg/ml)를 첨가하고 플레이트를 다시 incubation한 후, PBS 로 다시 세척하고, 유세포 분석기로 항원-항체의 결합 정도를 분석하였다.
그 결과를 표 5 및 도 3에 나타내었다.
111a 111b 111c
EC50 (μg/ml) 0.1885 0.1709 0.0427
2.3 바이오레이어 간섭법 (Bio-layer Interferometry, BLI )에 따른 항원 단백질에 대한 결합능 확인
실시예 1에서 제조된 3개의 항체에 대한 BLI에 따른 결합능 확인시험을 Octet (Octet QK, ForteBio)를 사용하여 진행하였다.
구체적으로 Amine coupling을 이용한 human BCAM (antigen)을 결합시키기 위하여 Reactive 2nd Generation (AR2G) biosensors (Cat. No. 18-5094, Sartorius)를 장착하고 AR2G Reagent Kit (Cat. No. 18-5095)를 이용하여 활성화시켰다. 이후 Biosensor를 10분간 antigen 용액에 넣어 human BCAM을 결합시켰고, 5분간 ethanolamine 용액에 넣어 반응을 종료시켰다. human BCAM이 결합된 biosensor는 제조된 3개의 서로 다른 항체 111a, 111b, 및 111c이 포함된 완충액에 넣어 5분간 결합 반응을 모니터링 하였으며, 이후 15분간 해리반응을 확인하였다. 이때, 항체 용액을 순차적으로 dilution하여 서로 다른 농도에 따른 결합 및 해리 속도를 확인하였다. 결합 (Ka) 및 해리 (Kd) 속도 상수를 곡선 피팅 소프트웨어를 사용하여 1:1 결합 모델에 피팅하여 결정하였다. 결합 해리 평형 상수 (KD)는 KD = Kd / Ka 로 계산하였다. 결합 역학 데이터를 하기 표 6에 나타내었고, 결합 sensor-gram을 도 4에 나타내었다.
Analyte Ligand ka (1/Ms) kd (1/s) KD (M)
111a Human
BCAM		 1.61 X 105 3.97 X 10-4 2.47 X 10-9
111b 2.34 X 104 3.06 X 10-4 1.31 X 10-8
111c 3.04 X 106 2.55 X 10-4 8.40 X 10-11
이로부터 본 발명의 항체는 human BCAM 단백질에 높은 친화도로 결합함을 확인하였다.
실시예 3: 공초점 레이저 주사 현미경 관찰을 통한 항체의 암세포 내재화(cellular internalization) 확인
실시예 1에서 제조된 3개의 항체를 이용하여 항체의 세포 내재화(cellular internalization)를 확인하는 실험을 진행하였다.
5 x 104개의 MKN-1 (인간 위암세포주, KCLB) 세포를 cell culture slide (SPL, Korea)에 plating하였다. 다음 날 세포가 plate에 부착된 것을 확인하고 기존의 세포 배양액을 제거한 후, 실시예 1에서 제조된 항체 111a, 111b, 및 111c를 PBS에 희석하여 10 또는 40 μg/mL로 준비하여 각 well 당 500 μl씩 처리하였다. 4℃에서 1시간 동안 항체를 반응시킨 후, 잔여량의 항체를 제거하고 세포 슬라이드를 PBS로 3회 세척하였다. 각 세포 슬라이드를 두 그룹으로 나누어 한 그룹은 세포 내재화의 음성 대조군으로 사용하고 나머지 그룹은 세포 내재화 유도 그룹으로 사용하였다. 음성 대조군으로 사용할 세포 슬라이드는 4% PFA (paraformaldehyde; Sigma, USA)를 사용하여 고정화(Fixation, 상온에서 10분 처리)를 진행하였고, 세포 내재화 유도 그룹으로 사용할 세포 슬라이드는 37 ℃ 인큐베이터로 옮겨 1시간 동안 배양한 후 음성 대조군과 마찬가지로 4% PFA를 사용하여 고정화를 진행하였다. 고정화가 완료된 각 세포 슬라이드는 PBS 세척을 통해 PFA를 완전히 제거한 후, 0.1% TritonX100을 상온에서 15분 동안 처리하여 2차 항체의 세포막 투과 (Permeabilization)가 가능하도록 준비하였다. PBS 세척과 blocking 과정 (3% BSA를 상온에서 20분 동안 처리)을 거친 후, 형광이 conjugation된 2차 항체 (10 μg/mL Alexa488-conjugated Goat anti-human IgG; Invitrogen, USA)를 4 ℃에서 1시간 동안 처리하였다. 2차 항체 처리까지 완료된 세포 슬라이드는 핵 염색을 위해 Hoechst 33342 (Invitrogen, USA)를 상온에서 3분간 처리하였으며, PBS로 세척 후, mounting solution (Agilent Technologies, USA)을 처리, cover glass로 덮어서 슬라이드 표본을 완성하였다. 항체의 세포 내재화의 정도는 공초점 레이저 주사 현미경(LSM 710 confocal laser scanning microscopy, Carl Zeiss, Germany)을 이용하여 400배의 배율 하에서 관찰하였다.
그 결과를 도 5에 나타내었다. 음성 대조군의 경우 (세포 내재화를 유도하지 않은 4 ℃, 1 hr 항체 처리 조건, 도 5의 상단 사진), 3개의 항체가 각각 암세포의 표면에 결합되어 있었으나, 세포 내재화 유도 조건인 37 ℃, 1 hr 항체 처리 조건의 경우 (도 5의 하단 사진), 각 항체가 세포 내로 내재화되어 세포 표면에서의 형광 시그널은 감소한 반면 세포 내부에서의 형광 시그널이 증가한 것이 확인되었다(핵 염색 부분의 형광 시그널은 별표로 표기되고, 각 항체 염색 부분의 형광 시그널은 triangle로 표기됨). 이러한 결과는 본 발명의 항체가 세포 내재화를 통해 cytotoxic drug을 세포 내로 운반할 수 있는 가능성이 있음을 의미하며, 즉 추후 약물과 컨쥬게이션된 ADC 형태로 사용될 수 있음을 보여준다.

Claims (15)

  1. 서열번호 7, 9 및 11로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR1,
    서열번호 13, 15 및 17로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR2,
    서열번호 19, 21 및 23으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR3,
    서열번호 8, 10 및 12로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR1,
    서열번호 14, 16 및 18로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR2, 및
    서열번호 20, 22 및 24로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR3
    을 포함하는, 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편.
  2. 제1항에 있어서,
    (a) 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR1;
    서열번호 13의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR2;
    서열번호 19의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR3;
    서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR1;
    서열번호 14의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR2; 및
    서열번호 20의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR3;
    (b) 서열번호 9의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR1;
    서열번호 15의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR2;
    서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR3;
    서열번호 10의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR1;
    서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR2; 및
    서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR3;
    또는
    (c) 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR1;
    서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR2;
    서열번호 23의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 CDR3;
    서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR1;
    서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR2; 및
    서열번호 24의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 CDR3;
    을 포함하는, 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편.
  3. 제1항에 있어서,
    서열번호 1, 3 및 5로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 중쇄 가변 영역; 및
    서열번호 2, 4 및 6으로 이루어지는 군으로부터 선택되는 어느 하나의 경쇄 가변 영역
    을 포함하는, 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편.
  4. 제1항에 있어서,
    (a) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역 및 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역;
    (b) 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역 및 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역; 또는
    (c) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역 및 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역;
    을 포함하는, 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편.
  5. 제1항에 있어서, 상기 항-BCAM 항체는 다중특이적 항체인, 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편.
  6. 제1항에 있어서, 상기 항원 결합 단편은 Fab, Fab', Fab'-SH, Fv, 단일 쇄 항체 scFv, F(ab')2 단편, VL, VH, 디아바디(diabody), 트리아바디(triabody), 테트라바디(tetrabody), 미니바디((scFV-CH3)2), IgG델타CH2, scFv-Fc, (scFv)2-Fc, 피노머(Fynomer), 이중 친화성 재표적화(dual-affinity re-targeting, DART), 또는 트리덴트(TRIDENT)인, 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편.
  7. 제1항에 있어서, 1 X 10-7 M 이하의 결합 해리 평형 상수 (KD)로 인간 BCAM 단백질에 결합하는 것인, 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편.
  8. 제1항에 있어서, 상기 항체는 키메라 항체, 인간화 항체, 또는 인간 항체인 것인, 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편.
  9. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 포함하는 항체-약물　컨쥬게이트(antibody-drug　conjugate).
  10. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 암호화하는 핵산 분자.
  11. 제10항의 핵산 분자를 포함하는 재조합 발현 벡터.
  12. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항의 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 포함하는, 암의 예방 또는 치료용 약학 조성물.
  13. 제12항에 있어서, 추가 항암제를 더 포함하는, 암의 예방 또는 치료용 약학 조성물.
  14. 제13항에 있어서, 항- BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편; 및 추가 항암제는 하나의 제제로 동시에 투여되거나, 또는 별개의 제제로 동시에 또는 순차적으로 투여되는 것인, 암의 예방 또는 치료용 약학 조성물.
  15. 인간 BCAM에 특이적으로 결합하는 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편으로서, 항체 111a, 111b 또는 111c이 인간 BCAM에 결합하는 에피토프와 동일한 에피토프에 결합하는, 항-BCAM 항체 또는 그의 항원 결합 단편.
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