WO2023096197A1 - 효소 처리를 통한 2'-푸코실락토오스의 생산성 증대 방법 - Google Patents

효소 처리를 통한 2'-푸코실락토오스의 생산성 증대 방법 Download PDF

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    • C12Y504/02—Phosphotransferases (phosphomutases) (5.4.2)
    • C12Y504/02008—Phosphomannomutase (5.4.2.8)

Definitions

  • the present invention relates to a method for increasing the productivity of 2'-fucosyllactose (2'-FL) through enzyme treatment, and more particularly, by enzymatic treatment based on lactose as a substrate to further It relates to a method for increasing the productivity of 2'-fucosyllactose without a medium.
  • Human milk oligosaccharides are oligosaccharides contained in human milk and are the third most abundant component in human milk after lactose and fat. There are about 200 types of human milk oligosaccharides, and they have various benefits, such as strengthening the immune function or having a good effect on the development and behavior of children.
  • 2'-fucosyllactose which is present in the largest amount, is involved in various biological activities.
  • methods for producing 2'-fucosyllactose include direct extraction from breast milk and chemical or enzymatic extraction methods.
  • the method of extracting directly from breast milk is unethical, and that breast milk supply is limited and productivity is low.
  • the chemical synthesis method has problems such as expensive substrates, low isomer selectivity and production yield, and the use of toxic reagents. There is a problem that the purification cost is high.
  • the present invention is to provide a method for increasing the productivity of 2'-fucosyllactose economically without an additional medium by decomposing lactose as a substrate by enzymatic treatment.
  • the present invention is transformed to express ⁇ -1,2-fucosyltransferase, GDP-D-mannose-4,6-dehydratase (GDP-D-mannose -4,6-dehydratase), transformed to express GDP-L-fucose synthase, and transformed to express lactose permease Recombinant Corynebacterium glutamicum characterized by having phosphomannomutase and GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase glutamicum ) is cultured in a medium to which lactose is added to produce 2'-fucosyllactose, lactase is added to the medium during the stationary phase or death phase. It provides a method for producing 2'-fucosyllactose, characterized in that.
  • the recombinant Corynebacterium glutamicum is preferably transformed to overexpress phosphomannomutase
  • GTP-mannose-1-phosphate guanyltransferase GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase
  • the medium may preferably contain glucose.
  • the method for producing 2'-fucosyllactose of the present invention is preferably added with glucose or lactose during cultivation. It may be carried out in fed-batch culture supplied with
  • the lactase is preferably used at the time of transition from the stationary phase to the death phase. It may be injecting into the medium.
  • lactose used as a substrate is treated with a small amount of enzyme to decompose it in the latter half of the culture stationary phase, and the glucose obtained therefrom is consumed to produce guanosine diphosphate-L-fucose, a precursor of 2'-fucosyllactose.
  • the lactose remaining after the culture can be maximally utilized for the production of 2'-fucosyllactose. Through this, it is possible to economically increase the productivity of 2'-fucosyllactose because it does not require additional glucose while minimizing by-products.
  • Figure 1 shows a schematic diagram showing the production pathway of 2'-Foucault room lactose for a recombinant Corynebacterium strain.
  • Figure 2 is a schematic diagram showing the decomposition of lactose by beta-galactosidase.
  • Figure 3 is a graph showing the productivity of 2'-fucosyllactose through lactose degradation.
  • the present inventors have previously registered 10-1731263 (Registration date: 2017.04.24) and 10-2014925 (Registration date: 2019.08.21) using recombinant Corynebacterium glutamicum ( Corynebacterium glutamicum ) - There has been a proposal for a technology for producing FL.
  • the present invention is transformed to express ⁇ -1,2-fucosyltransferase, and GDP-D-mannose-4,6-dehydratase (GDP-D- mannose-4,6-dehydratase), transformed to express GDP-L-fucose synthase, and transformed to express lactose permease Recombinant Corynebacterium glutamicum (which is characterized by having phosphomannomutase and GTPmannose-1-phosphate guanylyltransferase) Corynebacterium glutamicum ) is cultured in a lactose-added medium to produce 2'-fucosyllactose, lactase is added to the medium in the stationary phase or death phase. It provides a method for producing 2'-fucosyllactose, characterized in that the input.
  • the pathway for producing 2'-fucosyllactose using the strain of the present invention is shown in Figure 1.
  • the lactase is preferably beta-galactosidase, more preferably treated with 60 to 100 units of enzyme per g of lactose remaining in the culture medium. It is good to do. Lactose is broken down by lactase to produce galactose and glucose. From the produced glucose, GDP-L-fucose, which is the final substrate for the synthesis of 2'-fucosyllactose, is produced, and 2'-fucosyllactose is added by reacting with undigested lactose.
  • the recombinant Corynebacterium glutamicum is preferably transformed to overexpress phosphomannomutase, and GTP-mannose-1 -Phosphate guanyltransferase (GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) is preferably transformed to overexpress.
  • Corynebacterium glutamicum has its own genes encoding phosphomannomutase (ManB) and GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase (ManC).
  • the term 'expression' used in the present invention refers to the introduction of an external gene into the strain to artificially express an enzyme that the Corynebacterium glutamicum strain of the present invention cannot express on its own. Expression It means to do, and the term 'overexpression' means that the Corynebacterium glutamicum strain of the present invention has a gene encoding the enzyme itself and can express it by itself, but for the purpose of mass production, its expression level It means overexpression by artificially increasing the expression level of the enzyme in order to increase the enzyme.
  • the medium may preferably contain glucose.
  • the growth of the strain becomes active, and 2'-Foucault room lactose can be produced with higher productivity.
  • glutose or lactose is continuously supplied through fed-batch culture, the growth of the cells can be further increased, and 2'-foucault room lactose can be produced with high purity, high yield, and high productivity.
  • Detailed local techniques related to fed-batch culture may use known techniques in the art, so the description thereof will be omitted.
  • the lactase is preferably used at the time of transition from the stationary phase to the death phase. It may be injecting into the medium.
  • the present invention treats beta-galactosidase, which is a lactose-degrading enzyme, in the latter half of the culture stationary period, thereby securing 126% of 2'-fucosyllactose as compared to before and after enzyme treatment. It was confirmed that productivity can be greatly increased. This is because guanosine diphosphate -L-fucose, which is the final substrate for the synthesis of 2'-fucosyllactose from glucose obtained by decomposition of lactose, is not produced from glucose because no additional medium is added.
  • Escherichia coli K-12 MG1655 and Corynebacterium glutamicum ( Corynebacterium glutamicum ) ATCC 13032 were used.
  • the gmd-wcaG gene cluster was generated from the genomic DNA of Escherichia coli K-12 MG1655 through PCR using two DNA primers, GW-F and GW-R. was amplified, and the promoter of the Sod gene was amplified from the genomic DNA of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 through a PCR reaction using two DNA primers Sod-F and Sod-R, and then the two DNA The pSod-Gmd-WcaG DNA fragment was synthesized through an overlap PCR reaction using primers Sod-F and GW-R.
  • pGW plasmid was constructed by inserting it into pCES208 plasmid cut with restriction enzyme BamHI.
  • the Tuf gene promoter was amplified and synthesized from the genomic DNA of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 through a PCR reaction using two DNA primers, Tuf-F1 and Tuf-R1, and synthesized Pseudopedobacter saltans ( Pseudopedobacter saltans ) DSM ⁇ -1,2-fucosyltransferase from ⁇ -1,2-fucosyltransferase derived from 12145 through PCR reaction using two DNA primers FT(Ps)-F and FT(Ps)-R After amplifying fucose transferase, pTuf-FT(Ps) DNA fragments were synthesized through an overlap PCR reaction using two primers, Tuf-F and FT(Ps)-R.
  • the pFGW(Ps) plasmid was constructed by treating the constructed pGW plasmid with restriction enzyme NotI and inserting pTuf-FT(Ps).
  • the lacY gene was amplified from the genomic DNA of Escherichia coli K-12 MG1655 through a PCR reaction using two DNA primers, ilvC-lacY-F and lacY pX-R, and Corynebacterium glutamicum
  • the promoter of the ilvC gene was amplified from the genomic DNA of ATCC 13032 through a PCR reaction using two DNA primers pX-ilvC-F and ilvC-lacY-R, and then the two DNA primers pX-ilvC-F and lacY pX-R were used.
  • pXIL plasmid was constructed by inserting it into the pX plasmid (pXMJ19) treated with restriction enzymes NotI and EcoRI.
  • strain, primer, plasmid, nucleic acid and amino acid sequences used in this preparation example are shown in Tables 1 to 4 below.
  • nucleic Acid and Amino Acid Sequences gmd nucleic acid sequence SEQ ID NO: 1 wcaG nucleic acid sequence SEQ ID NO: 2 lacY nucleic acid sequence SEQ ID NO: 3 FT(Ps) nucleic acid sequence SEQ ID NO: 4 FT(Ps) amino acid sequence SEQ ID NO: 5
  • primer primer Sequence (5' ⁇ 3') pX-ilvC-F GTCATATGATGGTCGCGGATCCGAATTCCCAGGCAAGCTCCGC ilvC-lacY-R GTTTTTTAAATAGTACATAATCTCGCCTTTCGTAAAAATTTTGGT ilvC-lacY-F TTACGAAAGGCGAGATTATGTACTATTTAAAAAAACACAAACTTTTGGATGTTCGG lacY pX-R GCCTTTCGTTATTTGCTCGAGTGCGGCCGCTTAAGCGACTTCATTCACCTGACGAC Tuf-F1 TGGAGCTCCACCGCGGTGGCTGGCCGTTACCCTGCGAA Tuf-R1 CAAATATCATTGTATGTCCCTCCTGGACTTCG FT(ps)-F AGGACATACAATGATATTTGTAACCGGATATG FT(ps)-R CGCTTCACTAGTTCTAGCTTAAATAATGTGTCGAAACAGATTC Sod-F TTGGAGCTCCACCGCGG
  • composition of seed medium 10 g/L Yeast Extract, 20 g/L casein peptone, 10 g/L Sodium chloride, 5 g/L glucose

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Abstract

본 발명은 효소 처리를 통한 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose, 2'-FL)의 생산성 증대 방법에 관한 것으로, 배양 정지기 후반부에서 기질로 사용되는 유당에 소량의 효소를 처리하여 이를 분해하고, 이로부터 얻어진 포도당을 소비하여 2'-푸코실락토오스의 전구체인 구아노신이인산-L-푸코스를 생산하고, 배양 후기 잔존하는 유당을 2'-푸코실락토오스의 생산에 최대한 활용할 수 있다. 이를 통해 부산물을 최소화하면서도 추가적인 포도당을 필요로 하지 않아 경제적으로 2'-푸코실락토오스의 생산성을 증대시킬 수 있다.

Description

효소 처리를 통한 2'-푸코실락토오스의 생산성 증대 방법
본 발명은 효소 처리를 통한 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose, 2'-FL)의 생산성 증대 방법에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 기질인 유당 (lactose)을 기반으로 효소 처리를 하여 추가 배지 없이 2'-푸코실락토오스의 생산성을 증대시키는 방법에 관한 것이다.
모유올리고당 (Human milk oligosaccharides, HMOs)은 모유에 함유되어 있는 올리고당으로, 유당 및 지방 다음으로 모유에서 세 번째로 많은 성분이다. 모유올리고당의 종류는 약 200여종으로 다양하며, 면역 기능을 강화시키거나, 아이의 발달과 행동에 좋은 영향을 주는 등의 다양한 이점을 가진다.
주요 HMO 중 가장 많은 양으로 존재하는 2'-푸코실락토오스는 다양한 생물학적 활성에 관여한다. 기존 연구에서 2'-푸코실락토오스를 생산하는 방법은 직접 모유로부터 추출하는 방법과 화학적 또는 효소적 방법으로 추출하는 방법이 있다. 하지만 직접 모유로부터 추출하는 방법은 비윤리적이라는 것과, 모유 수급이 제한적이고 낮은 생산성이라는 문제가 있다. 또한, 화학적 합성법은 고가의 기질, 낮은 이성체 선택성과 생산수율, 그리고 독성시약의 사용 등의 문제가 있고, 효소적 합성법은 전구체가 되는 GDP-L-푸코오스가 매우 고가라는 점과 푸코오스 전이효소의 정제비용이 많이 든다는 문제점이 있다.
이같은 문제를 해결하기 위한 해결책으로 미생물을 이용하는 2'-푸코실락토오스의 생산이 있으나, 종래의 기술은 대부분 재조합 대장균을 이용한 생산기술이었다. 하지만 이는 소비자들에게 해로운 균이라는 인식이 있으며, 대장균 세포의 경우 유당 투과효소 (Lactose permease)의 작용에 의해 유당 제한 배양상태에서 '락토오스 킬링 (Lactose killing)'이라는 대장균 세포가 사멸되는 현상(Daniel dykhuizen and daniel hartl, 1987, "Transport by the lactose permease of Escherichia coli as the basis of lactose killing", 10.1128/JB.135.3.876-882, 1978, Journal of bacteiology)이 나타나므로 사용하는 것이 다소 제한적이다. 이에 기존의 방법을 극복하면서 안전하고 경제적으로 2-푸코실락토오스의 생산성을 증대시키는 새로운 생산 방법이 필요한 실정이다.
본 발명은 기질인 유당 (lactose)을 효소 처리로 분해함으로써 추가 배지 없이 경제적으로 2'-푸코실락토오스의 생산성을 증대시키는 방법을 제공하고자 한다.
본 발명은 α-1,2-푸코오스 전이효소 (α-1,2-fucosyltransferase)가 발현되도록 형질전환되고, GDP-D-만노오스-4,6-데하이드라타아제 (GDP-D-mannose-4,6-dehydratase)가 발현되도록 형질전환되며, GDP-L-푸코오스 신타아제 (GDP-L-fucose synthase)가 발현되도록 형질전환되고, 락토오스 퍼미아제 (lactose permease)가 발현되도록 형질전환되며, 포스포만노뮤타아제 (phosphomannomutase) 및 GTP-만노오스-1-포스페이트 구아닐릴트랜스퍼라아제 (GTPmannose-1-phosphate guanylyltransferase)를 보유하고 있는 것을 특징으로 하는 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰 (Corynebacterium glutamicum)을 락토오스가 첨가된 배지에 배양하여 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)를 생산함에 있어서, 배양 정지기 (stationary phase) 또는 사멸기 (death phase)에 유당분해효소를 배지에 투입하는 것을 특징으로 하는 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)의 생산방법을 제공한다.
한편, 본 발명의 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)의 생산방법에 있어서, 상기 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰은, 바람직하게 포스포만노뮤타아제 (Phosphomannomutase)가 과발현되도록 형질전환되고, GTP-만노오스-1-포스페이트 구아닐트랜스퍼라아제 (GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)가 과발현되도록 형질전환된 것이 좋다.
한편, 본 발명의 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)의 생산방법에 있어서, 상기 배지는, 바람직하게 글루코오스를 포함하고 있는 것일 수 있다.
한편, 본 발명의 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)의 생산방법에 있어서, 상기 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)의 생산방법은, 바람직하게 포도당 또는 락토오스를 배양 중에 추가로 공급하는 유가식 배양으로 수행하는 것일 수 있다.
한편, 본 발명의 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)의 생산방법에 있어서, 상기 유당분해효소는, 바람직하게 배양 정지기 (stationary phase)에서 사멸기 (death phase)로 전환되는 시점에 배지에 투입하는 것일 수 있다.
본 발명에서는 배양 정지기 후반부에서 기질로 사용되는 유당에 소량의 효소를 처리하여 이를 분해하고, 이로부터 얻어진 포도당을 소비하여 2'-푸코실락토오스의 전구체인 구아노신이인산-L-푸코스를 생산하고, 배양 후기 잔존하는 유당을 2'-푸코실락토오스의 생산에 최대한 활용할 수 있다. 이를 통해 부산물을 최소화하면서도 추가적인 포도당을 필요로 하지 않아 경제적으로 2'-푸코실락토오스의 생산성을 증대시킬 수 있다.
도 1은 재조합 코리네박테리움 균주에 대한 2'-푸코실락토오스의 생산 경로를 나타낸 모식도를 나타낸 것이다.
도 2는 베타-갈락토시다아제에 의한 유당 분해를 나타낸 모식도이다.
도 3은 유당 분해를 통한 2'-푸코실락토오스의 생산성을 나타낸 결과 그래프이다.
주요 모유올리고당 중 하나인 2'-푸코실락토오스는 다양한 생물학적 활성에 관여하는 등의 건강 기능적 이점을 가지므로 이를 생산하는 방법에 대한 다양한 방법이 시도되고 있다. 하지만 기존의 직접 모유에서부터 추출하는 방법이나, 화학적, 효소적 합성법은 낮은 생산성, 고가의 비용, 낮은 생산수율, 독성 등의 문제가 있어 대체하기 위한 방법이 필요하다.
이를 위해 미생물을 이용하는 생산 기술이 제안되었으나 대부분 재조합 대장균을 이용한 기술이며, 대장균 세포의 경우 유당투과효소(Lactose permease)의 작용에 의해 대장균 세포가 사멸되는 현상('락토오스 킬링')이 나타나므로 사용하는 것이 다소 제한적이다.
본 발명자들은 이전 등록특허 10-1731263호(등록일자: 2017.04.24)와 제10-2014925호(등록일자: 2019.08.21)에서 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰(Corynebacterium glutamicum)을 이용하여 2'-FL을 생산하는 기술에 대해 제안한 바가 있다.
다만, 본 발명자들은 추가적인 배지의 공급 없이 경제적으로 2'-푸코실락토오스의 생산성을 늘리기 위한 방법을 찾고자 다양한 실험적 시도를 하였고, 배양 정지기 또는 사멸기에 (바람직하게는 배양정지기에서 사멸기로 전환되는 구간) 유당분해효소를 처리함으로써 최종적인 2'-푸코실락토오스의 생산성을 더욱 늘리는 방법을 본 발명을 통해 개발한 것이다.
이에 본 발명은 α-1,2-푸코오스 전이효소 (α-1,2-fucosyltransferase)가 발현되도록 형질전환되고, GDP-D-만노오스-4,6-데하이드라타아제 (GDP-D-mannose-4,6-dehydratase)가 발현되도록 형질전환되며, GDP-L-푸코오스 신타아제 (GDP-L-fucose synthase)가 발현되도록 형질전환되고, 락토오스 퍼미아제 (lactose permease)가 발현되도록 형질전환되며, 포스포만노뮤타아제 (phosphomannomutase) 및 GTP-만노오스-1-포스페이트 구아닐릴트랜스퍼라아제 (GTPmannose-1-phosphate guanylyltransferase)를 보유하고 있는 것을 특징으로 하는 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰 (Corynebacterium glutamicum)을 락토오스가 첨가된 배지에 배양하여 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)를 생산함에 있어서, 배양 정지기 (stationary phase) 또는 사멸기 (death phase)에 유당분해효소를 배지에 투입하는 것을 특징으로 하는 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)의 생산방법을 제공한다. 본 발명의 균주를 사용하여 2'-푸코실락토오스를 생산하는 경로는 도 1에 나타내었다.
한편, 본 발명에서 상기 유당분해효소는, 바람직하게 베타-갈락토시다아제(beta-galactosidase)인 것이 좋으며, 더욱 바람직하게는 배양액 내에 잔류하는 유당(lactose)의 g당 효소 60~100 unit으로 처리하는 것이 좋다. 유당분해효소의 처리에 의해 유당이 분해되어 갈락토오스와 포도당이 생성된다. 생성된 포도당으로부터 2'-푸코실락토오스 합성반응의 최종 기질인 구아노신이인산-L-푸코오스 (GDP-L-fucose)가 생산되고, 분해되지 않은 유당과 반응하여 2'-푸코실락토오스가 추가로 생산되는 것이다. 이와 같은 과정을 통해 발효 후기에 부산물 (By-product)이 되는 유당을 최대한 활용하여 2'-푸코실락토오스의 생산량을 증가시킬수 있게 되는 것이다. 또한, 2'-푸코실락토오스의 분리 정제 과정에서 유당을 분리해야 하는 부담을 덜 수 있는 부가적인 효과도 발휘된다.
한편, 본 발명의 2'-푸코실락토오스의 생산방법에 있어서, 상기 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰은, 바람직하게 포스포만노뮤타아제 (Phosphomannomutase)가 과발현되도록 형질전환되고, GTP-만노오스-1-포스페이트 구아닐트랜스퍼라아제 (GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)가 과발현되도록 형질전환된 것이 좋다. 코리네박테리움 글루타미쿰은 포스포만노뮤타아제 (Phosphomannomutase, ManB), GTP-만노오스-1-포스페이트 구아닐트랜스퍼라아제 (GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase, ManC)를 암호화하는 유전자를 자체적으로 보유하여 발현시킬 수 있기 때문에, 굳이 이 효소를 암호화하는 유전자를 도입시켜줄 필요는 없으나, 대량 생산을 위해서는 이 효소를 과발현시켜줄 필요가 있다. 따라서, 본 발명에서는 바람직하게 이들 두 효소를 과발현할수 있도록 코리네박테리움 글루타미쿰을 형질전환하는 것이 필요한 것이다.
한편, 본 발명에서 사용하는 '발현'이라는 용어는, 본 발명의 코리네박테리움 글루타미쿰 균주가 자체적으로 발현시킬 수 없는 효소를, 인위적으로 발현시키기 위해 외부 유래의 유전자를 균주 내로 도입하여 발현시키는 것을 의미하고, '과발현'이라는 용어는 본 발명의 코리네박테리움 글루타미쿰 균주가 자체적으로 해당 효소를 암호화하는 유전자를 가지고 있어, 스스로 발현시킬 수 있으나, 대량생산을 위한 목적으로 이의 발현량을 증대시키기 위해 인위적으로 해당 효소의 발현량을 증대시켜 과발현한 것을 의미한다.
한편, 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)의 생산방법에 있어서, 상기 배지는, 바람직하게 글루코오스를 포함하고 있는 것일 수 있다. 이와 같이 추가 배지 성분을 더함으로써 균주의 생육이 활발해져 더욱 높은 생산성으로 2'-푸코실락토오스를 생산할 수 있다. 또한, 이를 위해서는 유가식 배양을 통해 글루토오스 또는 락토오스를 지속적으로 공급하면, 세포의 성장을 더욱 증대시키고, 고순도, 고수율, 고생산성으로 2'-푸코실락토오스를 생산할 수 있다. 유가식 배양에 관한 세부 지엽적 기술들은 당업계의 공지 기술을 사용할 수 있으므로, 이에 대해서는 그 기재를 생략하기로 한다.
한편, 본 발명의 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)의 생산방법에 있어서, 상기 유당분해효소는, 바람직하게 배양 정지기 (stationary phase)에서 사멸기 (death phase)로 전환되는 시점에 배지에 투입하는 것일 수 있다.
한편, 하기 실험에 의하면, 본 발명은 배양 정지기 구간 후반부에 유당 분해 효소인 베타 갈락토시다아제를 처리함으로써, 효소 처리전후와 비교할 때, 최종적으로 2'-푸코실락토오스를 126% 확보하는 수준으로 생산성을 크게 증대시킬 수 있음을 확인하였다. 이는 추가 배지의 투입이 없어 포도당으로부터 구아노신이인산-L-푸코스를 생산하지 못함에도 유당 분해로 얻어진 포도당 (Glucose)으로부터 2'-푸코실락토오스 합성반응의 최종 기질인 구아노신이인산-L-푸코스 (GDP-L-Fucose)가 생산되고, 이것이 분해되지 않은 유당과 반응하여 2'-푸코실락토오스가 생산된 것으로 해석할 수 있었다. 이를 통해 최종 생산된 2'-푸코실락토오스는 추가적인 포도당을 필요로 하지 않기에 경제적으로 도움이 될 수 있고, 잔존하는 유당만을 이용하여 2'-푸코실락토오스의 생산성을 높이면서 부산물로 존재하는 유당의 양을 최소화할 수 있다. 이와 같이 안전하고도 경제적인 2'-푸코실락토오스의 생산성 증대 방법을 제공할 수 있다.
이하, 본 발명의 내용을 하기 실시예를 통해 더욱 상세히 설명하고자 한다. 다만, 본 발명의 권리범위가 하기 실시예에만 한정되는 것은 아니고, 그와 등가의 기술적 사상의 변형까지를 포함한다.
[제조예 1: 재조합 플라스미드의 제조]
플라스미드 제작 및 2'-푸코실락토오스 (fucosyllactose, 2'-FL)의 생산을 위해 각각 대장균 (Escherichia coli) K-12 MG1655와 코리네박테리움 글루타미쿰 (Corynebacterium glutamicum) ATCC 13032를 이용하였다.
pFGW(Ps) 플라스미드를 구축하기 위해 대장균인 K-12 MG1655의 유전체 (genomic) DNA로부터 두 개의 DNA 프라이머(primer) GW-F 와 GW-R를 이용한 PCR 반응을 통해 gmd-wcaG 유전자 클러스터(cluster)를 증폭하고, 코리네박테리움 글루타미쿰 (Corynebacterium glutamicum) ATCC 13032의 유전체 DNA로부터 두 개의 DNA 프라이머 Sod-F와 Sod-R를 이용한 PCR 반응을 통해 Sod 유전자의 프로모터를 증폭 한 후, 두 개의 DNA 프라이머 Sod-F와 GW-R를 이용하여 오버랩 (overlap) PCR 반응을 통해 pSod-Gmd-WcaG DNA 절편을 합성하였다.
또한, pXMJ19 플라스미드 (plasmid)로부터 두 개의 DNA 프라이머 Ter-F와 Ter-R를 이용한 PCR 반응을 통해 전사종결 서열을 증폭한 후, 상기 합성한 pSod-Gmd-WcaG와 전사종결 서열을 주형으로 두 개의 DNA 프라이머 Sod-F와 Ter-R를 이용한 PCR 반응을 통해 pSod-Gmd-WcaG-ter 서열을 합성한 후, 제한효소 BamHⅠ으로 잘려진 pCES208 플라스미드에 이를 삽입하여 pGW 플라스미드를 구축하였다.
또한, 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC 13032의 유전체 DNA로부터 두 개의 DNA 프라이머 Tuf-F1와 Tuf-R1를 이용한 PCR 반응을 통해 Tuf 유전자 프로모터를 증폭하고 합성된 슈도페도박터 살탄스 (Pseudopedobacter saltans) DSM 12145 유래 α-1,2-푸코오스 전이효소 (α-1,2-fucosyltransferase)로부터 두 개의 DNA 프라이머 FT(Ps)-F와 FT(Ps)-R를 이용한 PCR 반응을 통해 α-1,2-푸코오스 전이효소를 증폭한 후, 두 개의 프라이머 Tuf-F와 FT(Ps)-R를 이용하여 오버랩 (overlap) PCR 반응을 통해 pTuf-FT(Ps) DNA 절편을 합성하였다. 상기 구축된 pGW 플라스미드에 제한효소 NotⅠ을 처리하여 pTuf-FT(Ps)를 삽입함으로써 pFGW(Ps) 플라스미드를 구축하였다.
한편, pXIL 플라스미드를 구축하기 위해, 대장균 K-12 MG1655의 유전체 DNA로부터 두 개의 DNA 프라이머 ilvC-lacY-F와 lacY pX-R을 이용한 PCR 반응을 통해 lacY 유전자를 증폭하고 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC 13032의 유전체 DNA로부터 두 개의 DNA 프라이머 pX-ilvC-F와 ilvC-lacY-R을 이용한 PCR 반응을 통해 ilvC 유전자의 프로모터를 증폭한 후 두 개의 DNA 프라이머 pX-ilvC-F와 lacY pX-R을 이용하여 오버랩 (overlap) PCR 반응을 통해 pilvC-lacY DNA 절편을 합성한 후 제한효소 NotⅠ과 EcoRⅠ이 처리된 pX 플라스미드 (pXMJ19)에 이를 삽입하여 pXIL 플라스미드를 구축하였다.
본 제조예에서 사용한 균주(strain), 프라이머(primer), 플라스미드(plasmid), 핵산 및 아미노산 서열은 하기 표 1 내지 4에 기재하였다.
균주
E.Coli K-12 MG1655 F-, lambda-, rph-1
C. glutamicum Wild-type strain, ATCC13032
핵산 및 아미노산 서열
gmd 핵산 서열 서열번호 1
wcaG 핵산 서열 서열번호 2
lacY 핵산 서열 서열번호 3
FT(Ps) 핵산 서열 서열번호 4
FT(Ps) 아미노산 서열 서열번호 5
프라이머
프라이머 서열 (5'→3')
pX-ilvC-F GTCATATGATGGTCGCGGATCCGAATTCCCAGGCAAGCTCCGC
ilvC-lacY-R GTTTTTTAAATAGTACATAATCTCGCCTTTCGTAAAAATTTTGGT
ilvC-lacY-F TTACGAAAGGCGAGATTATGTACTATTTAAAAAACACAAACTTTTGGATGTTCGG
lacY pX-R GCCTTTCGTTTTATTTGCTCGAGTGCGGCCGCTTAAGCGACTTCATTCACCTGACGAC
Tuf-F1 TGGAGCTCCACCGCGGTGGCTGGCCGTTACCCTGCGAA
Tuf-R1 CAAATATCATTGTATGTCCTCCTGGACTTCG
FT(ps)-F AGGACATACAATGATATTTGTAACCGGATATG
FT(ps)-R CGCTTCACTAGTTCTAGAGCTTAAATAATGTGTCGAAACAGATTC
Sod-F TTGGAGCTCCACCGCGGTGGCGGCCGCTCTAGAACTAGTGAAGCGCCTCATCAGCG
Sod-R TACACCGGTGATGAGAGCGACTTTTGACATGGTAAAAAATCCTTTCGTAGGTTTCCGCAC
GW-F ATGTCAAAAGTCGCTCTCATCACCGGTGTA
GW-R CAAGCTGAATTCTTACCCCCGAAAGCGGTC
ter-F GACCGCTTTCGGGGGTAAGAATTCAGCTTG
ter-R GGTATCGATAAGCTTGATATCGAATTCCTGCAGCCCGGGGAAAAGGCCATCCGTCAGGAT
플라스미드
Plasmid Related features Ref.
pCES208 KmR, C.glutamicum/ E.coli shuttle vector J. Microbiol. Biotechnol. (2008), 18(4), 639647
pXMJ19 CmR, C.glutamicum/ E.coli shuttle vector Biotechnology Techniques (1999), 13, 437441
pGW pCES208 + Sod-gmd-wcaG 특허 제10-2014925호
pFGW(Ps) pCES208 + Tuf-FT(Ps) + Sod-gmd-wcaG 특허 제10-2014925호
pXIL pXMJ19 + ilvC-lacY 특허 제10-2014925호
[실시예 1: 유당분해효소 처리에 따른 2'-푸코실락토오스 생산성]
본 실시예에서는 기질인 유당(lactose)을 효소 베타-갈락토시다아제(beta-galactosidase) 처리로 분해하여 추가배지 없이 2'-푸코실락토오스를 생산시키는 방법에 관한 실험이다.
배양을 위한 조건은 다음과 같다.
- 종배지 조성: 10 g/L Yeast Extract, 20 g/L casein peptone, 10 g/L Sodium chloride, 5 g/L glucose
- 메인배지 조성: 30 g/L Yeast Extract, 5 g/L Ammonium sulfate, 1 g/L Potassium phosphate, 1 g/L Potassium phosphate, 40 g/L glucose, 20 g/L Lactose
- 추가배지 조성 : 15 g/L Ammonium sulfate, 600 g/L glucose, 100 g/L Lactose
- 효소 : beta-galactosidase
- 배양 조건 : pH 7.0, 800 rpm, 25℃, Air 2VVM
배양 정지기 (stationary phase) 구간 후반부에 추가 배지의 투입을 종료하고 잔존하는 유당을 측정하여 g당 효소 베타-갈락토시다아제(beta-galactosidase)를 80 unit으로 처리하였다. 도 2와 같이 효소 베타-갈락토시다아제(beta-galactosidase)에 의해서 유당이 분해되면 포도당과 갈락토오스가 생기게 된다.
그 결과, 도 3과 같이 추가 배지의 투입 없이 효소 처리전 30.1 g/L의 2'-푸코실락토오스가 생산되었고, 추가 배지의 투입이 없어 포도당으로부터 구아노신이인산-L-푸코스를 생산하지 못함에도 최종적으로 38.1 g/L의 2'-푸코실락토오스가 효소에 의한 유당 분해를 통해 생산됨을 확인하였다. 최종 생산된 2'-푸코실락토오스가 추가적인 포도당을 필요로 하지 않기에 경제적으로 도움이 될 수 있고, 잔존하는 유당만을 이용하여 2'-푸코실락토오스를 126% 획득할 수 있다.
이같은 결과는 유당 분해로 얻어진 포도당 (Glucose)으로부터 2'-푸코실락토오스 합성반응의 최종 기질인 구아노신이인산-L-푸코스 (GDP-L-Fucose)가 생산되고, 이것이 분해되지 않은 유당과 반응하여 2'-푸코실락토오스가 생산된 것으로 해석할 수 있었다. 또한, 유당을 유당분해효소 처리에 의해 최대한 활용하여 2'-푸코실락토오스를 추가적으로 더 생산함으로써, 최종적으로 부산물로 존재하는 유당의 양을 최소화하며 배양을 종료화시킬 수 있었다.

Claims (5)

  1. α-1,2-푸코오스 전이효소 (α-1,2-fucosyltransferase)가 발현되도록 형질전환되고, GDP-D-만노오스-4,6-데하이드라타아제 (GDP-D-mannose-4,6-dehydratase)가 발현되도록 형질전환되며, GDP-L-푸코오스 신타아제 (GDP-L-fucose synthase)가 발현되도록 형질전환되고, 락토오스 퍼미아제 (lactose permease)가 발현되도록 형질전환되며, 포스포만노뮤타아제 (phosphomannomutase) 및 GTP-만노오스-1-포스페이트 구아닐릴트랜스퍼라아제 (GTPmannose-1-phosphate guanylyltransferase)를 보유하고 있는 것을 특징으로 하는 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰 (Corynebacterium glutamicum)을 락토오스가 첨가된 배지에 배양하여 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)를 생산함에 있어서,
    배양 정지기 (stationary phase) 또는 사멸기 (death phase)에 베타-갈락토시다아제(beta-galactosidase)를 배지에 투입하는 것을 특징으로 하는 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)의 생산방법.
  2. 제1항에 있어서,
    상기 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰은,
    포스포만노뮤타아제 (Phosphomannomutase)가 과발현되도록 형질전환되고, GTP-만노오스-1-포스페이트 구아닐트랜스퍼라아제 (GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)가 과발현되도록 형질전환된 것을 특징으로 하는 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)의 생산방법.
  3. 제1항에 있어서,
    상기 배지는,
    글루코오스를 포함하고 있는 것을 특징으로 하는 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)의 생산방법.
  4. 제3항에 있어서,
    상기 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)의 생산방법은,
    포도당 또는 락토오스를 배양 중에 추가로 공급하는 유가식 배양으로 수행하는 것을 특징으로 하는 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)의 생산방법.
  5. 제1항에 있어서,
    상기 베타-갈락토시다아제(beta-galactosidase)는,
    배양 정지기 (stationary phase)에서 사멸기 (death phase)로 전환되는 시점에 배지에 투입하는 것을 특징으로 하는 2'-푸코실락토오스 (2'-fucosyllactose)의 생산방법.
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