BRPI0718989A2 - Ablação genética de células com gene prp usando uma estratégia de captura de promotor direcionada para a produção de proteínas recombinantes isentas de soro como produtos terapêuticos. - Google Patents

Ablação genética de células com gene prp usando uma estratégia de captura de promotor direcionada para a produção de proteínas recombinantes isentas de soro como produtos terapêuticos. Download PDF

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Description

Relatório Descritivo da Patente de Invenção para "ABLAÇÃO GENÉTICA DE CÉLULAS COM GENE PRP USANDO UMA ESTRATÉGIA DE CAPTURA DE PROMOTOR DIRECIONADA PARA A PRODUÇÃO DE PROTEÍNAS RECOMBINANTES ISENTAS DE SORO COMO PRODUTOS TERAPÊUTICOS".
A presente invenção refere-se a uma linhagem de célula huma- na somática imortalizada isenta de proteína de príon (PrP) em que ambos os alelos do gene PrP foram completamente deletados. A invenção ainda pro- porciona um método para a produção da referida linhagem de célula e seu uso para a produção de proteínas-alvo humanas as quais são adequadas como biofarmacêuticos. Introdução
Prions são patógenos infecciosos que causam encefalopatias espongiformes no sistema nervoso central em animais. Em contraste aos vírus e viróides, prions são totalmente desprovidos de ácido nucleico e são resistentes à proteases. A partícula infecciosa foi identificada como PrPsc, uma isoforma de PrPc, a proteína de príon celular normal. A hipótese de prí- on (Prusiner, Proc. Natl. Acad. Sei. 95, 13363-13383, (1988)) propõe que a molécula de PrPsc em si converte PrPc à conformação anormal, quer através de um processo de heterodimerização ou através de polimerização nuclear.
As doenças por príon mais comuns de animais são scrapie em ovelhas e cabras e encefalopatia espongiforme bovina (EEB) em gado. Em seres humanos, quatro doenças por príon foram identificadas: (1) Kuru, (2) doença de Creutzfeldt-Jakob (CJD), (3) doença de Gerstmann-Straussler- Scheinker (GSS) e (4) insônia familial fatal (FFI). As doenças humanas por príon podem ter origem infecciosa ou genética, esporádica.
A primeira doença por príon infecciosa descrita foi scrapie como uma doença de ovelha e cabras há 250 anos. A scrapie foi demonstrada como sendo experimentalmente transmissível há 50 anos. Não há evidência de que a scrapie tenha sido ainda transmitida para o homem. A BSE foi pri- meiro descrita em gado no Reino Unido em 1985 (Wells e outros, Veterinary Record 121, 419-420, (1987)) e acredita-se que tenha se disseminado atra- vés de consumo oral de carne derivada de ruminante e farinha de osso (Wi- Iesmith e outros, Veterinary Record 123, 638-644, (1988)). A doença se es- palhou amplamente, atingindo um pico em 1992 com mais de 180.000 casos clínicos no Reino Unido, embora estimativas matemáticas sugiram que 1 a 2 milhões de gado possam ter sido infectados, mas abatidos e entraram na cadeia alimentar humana antes que eles estivessem velhos o bastante para demonstrar evidência de doença clínica (Anderson e outros, Nature 382, 779-5 788, (1996)). A BSE passou para até 20 outras espécies, incluindo gatos domésticos e exóticos (Wyatt e outros, Veterinary Record 129: 233- 236, (1991); Kirk-wood e Cunningham, Veterinary Record 135, 296-303 (1994)) e ungulados exóticos em zôos Britânicos. Em Julho de 1988, a dis- seminação da BSE levou o Governo do Reino Unido a restringir o uso de carne e farinha de osso derivadas de ruminante como uma ração para ani- mais e em Novembro de 1989 especificar que sobras bovinas fossem bani- das para consumo humano.
A transmissão de doenças por príon para seres humanos foi primeiro reportada em pessoas que vinham da Papua-Nova Guiné no final de 1950 (Gajdusek & Zigas, New England Journal of Medicine 257, 974-978 (1957)) e acredita-se que tenha sido transmitida durante canibalismo ritualís- tico e ritos funerários com sacrifícios. A transmissão latrogênica de CJD foi bem documentada através de inoculação direta do CNS através de instru- mentos e enxertos médicos contaminados. A transmissão latrogênica tam- bém ocorreu via hormônio de crescimento da pituitária humana cadavérica e gonadotropinas administradas através de injeção intramuscular (Buchanan e outros, British Medicai Journal 302, 824-824, (1991); Brown e outros, Trans- fusion 38: 810-816, (1992)).
A CJD variante (vCJD) é uma doença por príon humana aparen- temente resultante de exposição ao agente da encefalopatia espongiforme bovina (BSE). A vCJD foi primeiro descrita há 10 anos (Will e outros, Lancet 347: 921-5, (1996)) como um resultado de monitoramento sistemático da incidência e fenotipo clínico de CJD no Reino Unido.
Para vCJD, em contraste com outras doenças por príon em se- res humanos, a forma doença-associada da proteína de príon e infectividade é prontamente detectável em tecidos linfóides por todo o corpo (Hill1 A.F. e outros, Lancet 353: 83-9 (1999); Head, M.W. e outros, Am. J. Pathol. 164: 142 (2004)), mesmo antes do início de doença clínica (Hilton, D.A. e outros, Lancet 352: 703-4 (1998)). Isso dá origem à preocupações de que o sangue e produtos sangüíneos também possam conter partículas infecciosas, repre- sentando uma possível fonte de disseminação latrogênica de CJD variante.
Essa preocupação foi reforçada após a transmissão experimen- tal de BSE no modelo com ovelhas de transfusão de sangue e camada Ieu- coplaquetária de animais na fase pré-clínica da enfermidade (Hunter e ou- tros, J. Gen. Virol. 83: 2897-905 (2002)).
Estudos em modelos com animais sugerem que a maior parte da infectividade no sangue pode estar associada à célula, com menores níveis no plasma (Brown P. e outros, Transfusion 38: 810-816 (1998)) e há evidên- cia para sugerir que qualquer infectividade presente pode ser reduzida du- rante o processo de fracionamento do plasma (Stenland, CJ. e outros, Transfusion 42: 1497-500 (2002); Gregori, L. e outros, Biologicals 32: 1-10 (2004)). Em resposta à transmissão de vCJD através de transfusão sangüí- nea, um adiamento de doadores que eram recipientes de componentes san- guíneos desde 1980 foi instituído de forma a reduzir o risco de transmissões terciárias ou de ordem superior que levam a um surto autossustentado. To- davia, a possibilidade de que o plasma ou produtos sangüíneos possam transmitir a doença não pode ser excluída, uma vez que um teste de sangue apropriado ainda não está disponível (Aguzzi, A. & Glatzel M., Nat. Clin. Pract. Neurol. 2: 321-329 (2006)).
O risco de transmissão de distúrbios príon-relacionados através de produtos humanos é uma grave preocupação de saúde. No caso de pro- dutos sangüíneos, o método de prevenção é, por um lado, a manipulação de doadores de vCJD combinado com por exemplo, limpeza do sangue, através de filtração.
Por outro lado, há a produção segura de proteínas humanas re- combinantes, prevenindo o risco de transmissão de príon através de transfu- são sangüínea por doadores contaminados. A produção de proteínas huma- nas em organismos tais como Escherichia coli e Saccharomyces cerevisiae permite a produção de muitas proteínas humanas em síntese em larga esca- la, mas fatores tais como estabilidade do plasmídeo e insolubilidade do pro- duto de proteína desejado podem limitar a utilidade desses sistemas. A mai- oria das proteínas humanas requer modificações pós-traducionais adicionais para desempenhar a função da proteína endógena e, assim, requerem sua síntese em células de mamífero ou mesmo linhagens de célula espécie- específicas para funcionamento semelhante ao plasma da proteína produzi- da.
Por exemplo, para o fator VIII, o uso de linhagens de célula não humanas, tais como células de ovário de hâmster Chinês (CHO), se defronta com desvantagens críticas pelo fato de que as proteínas terapêuticas purifi- cadas são contaminadas com componentes vestigiais celulares, causando reações antigênicas nos pacientes (Refacto, Wyeth, bula na embalagem).
Além disso, proteínas expressas através de sistemas de expres- são não-humanos podem ter padrões de glicosilação não-humanos que também dão origem à reações antigênicas no paciente. A estabilidade bioló- gica e eficácia de fatores de coagulação são substancialmente influenciadas por seu padrão de O- e N-glicosilação. Especialmente, monossacarídeos periféricos e terminais são importantes porque eles são detectados por re- ceptores específicos de células as quais são responsáveis por sua degrada- ção. Fatores de coagulação trazem resíduos de ácido siálico como monos- sacarídeos terminais. Modificação na composição de ácidos siálicos nas an- tenas de glicoproteínas pode resultar em padrões de glicosilação heterogê- neos. Assim, a estabilidade biológica e eficácia são crucialmente afetadas quando modificação ocorre. Consequentemente, a avaliação da influência de glicosilação em linhagens de célula de produção não-humanas é uma consi- deração importante na produção de fatores de coagulação recombinantes. De modo geral, linhagens de célula humanas são mais qualificadas para a produção de fatores de coagulação recombinantes do que linhagens de célu- la não-humanas. A razão para isso é provavelmente que nenhum oligossa- carídeo estranho será incorporado nas porções de oligossacarídeo durante síntese de proteínas recombinantes.
Por essas razões, sistemas de mamífero, especialmente huma- nos, são preferíveis para a produção de proteínas humanas recombinantes.
Em particular, a linhagem de célula imortalizada HEK293 e seus derivados, por exemplo, Freestyle HEK293F, são capazes de expressão de proteínas humanas recombinantes (EP 05 105 965.7). Uma vez que muitos produtos terapêuticos são produzidos em sistemas de mamífero, há uma necessidade em assegurar a segurança desses produtos isolados de tais sistemas com relação à ausência completa de proteínas de príon. Levando em conta que, por um lado, nenhum teste apropriado para infectividade por príon está dis- ponível e que, por outro lado, propagação e infectividade por príon são de- pendentes da expressão da proteína de príon celular normal, a qual poderia converter a proteína de príon infecciosa, a forma mais segura e promissora para impedir a infectividade por príon em tais sistemas é prevenir completa- mente a expressão do gene de proteína de príon nos sistemas de produção através de "knockout" completo do gene de príon.
Tal sistema de produção de linhagem de célula com "knockout", conforme aquele descrito na presente invenção, impede completamente a expressão da proteína de príon e proporcionará proteínas humanas recom- binantes absolutamente livres de proteínas de príon infecciosas e livres de um risco de contaminação para os pacientes que recebem produtos farma- cêuticos recombinantes produzidos nessas células sem príon.
De forma a impedir especificamente a expressão de um deter- minado gene em uma célula eucariota, várias abordagens foram desenvolvi- das empregando tecnologias de engenharia genética e biologia molecular. Ablação genética (também comumente conhecida como ""knockout" genéti- co" no jargão usado pelos versados na técnica) implica na remoção da se- qüência de DNA que codifica uma proteína em particular. Como uma conse- quentemente dessa remoção, a "célula com "knockout"" resultante é comple- tamente incapaz de expressar o gene que sofreu "knockout". Em contraste, tecnologias de "RIMA de interferência" (RNAi) não removem a seqüência de DNA1 mas antes, introduzem uma seqüência antissenso ou complementar a qual, então, impede a tradução do gene suprimido. Na maioria dos casos, o gene com "knockdown" resultante é apenas parcialmente suprimido, permi- tindo algum nível de expressão residual.
Em virtude do amplo uso do camundongo como um modelo de
doença humana e em virtude da disponibilidade precoce de células tronco embriônicas de murino (ES) as quais são facilmente passíveis de manipula- ções genéticas e embriônicas, tecnologias de "knockout" foram desenvolvi- das principalmente em células ES de camundongo (Joyner A.L., Oxford U- niv. Press, Reino Unido 1993). Atualmente, a tecnologia de "knockout" no camundongo se desenvolveu o bastante para permitir não apenas "knoc- kout" completo ("alelos nulos"), mas também mutantes condicionais. A muta- ção direcionada pode ser temporariamente induzida ou suprimida, por e- xemplo, através de suplementação da ração para camundongo com tetraci- clina (sistemas "tet-on", "tet-off, Gossen, M. e Bujard, H. Proc. Natl. Acad. Sei, USA 89: 5547-5551 (1992)); ela pode ser acionada por um promotor célula- ou tecido-específico ou por um promotor abundante, mas regulado pelo desenvolvimento, o qual pode ser desviado durante desenvolvimento embriônico, mas rapidamente ativado após o nascimento. A geração de uma linhagem de célula ES com "knockout" sem-
pre requer as mesmas etapas iniciais: (1) a geração de um construto de di- recionamento especificamente criado para realizar "knockout" de um gene particular; (2) introdução desse construto nas células ES e (3) seleção e var- redura de células trazendo uma deleção direcionada do gene desejado. O construto de direcionamento sempre deve conter um cassete
de seleção e uma região significativa de homologia ao gene o qual sofrerá "knockout". Esses dois elementos são absolutamente necessários para obter e detectar a integração apenas no Iocus desejado: a região de homologia ao gene endógeno dispara a recombinação homóloga entre os dois fragmentos de DNA homólogos, enquanto que o cassete de seleção permite a varredura de células trazendo o construto integrado. O cassete de seleção mais am- plamente usado em tecnologia de "knockout" de ES é o cassete de fosfo- transferase de neomicina ("rieo"), consistindo na ORF que codifica essa en- zima acionada por um promotor de quínase de fosfoglicerato (pGK) de ca- mundongo (Soriano e outros, Cell 64, 693-702 (1991)) e flanqueada a jusan- te por um sinal de término de transcrição poliA. Quando de introdução do construto de direcionamento em células ES e seleção com G418, apenas aquelas células onde o construto foi estavelmente integrado serão resisten- tes ao antibiótico. Dentre essas células resistentes existirão algumas onde o construto de direcionamento substituiu a seqüência original endógena. Even- tos direcionados em clones isolados podem, então, ser selecionados através de PCR genômica ou através de análise de Southern blot genômica. Em cé- lulas ES de camundongo, a freqüência com a qual o construto de direciona- mento se integra na região desejada do genoma é muito menor do que a- quela de integração aleatória, o que usualmente torna necessário selecionar várias centenas de clones resistentes a antibiótico antes que um correta- mente direcionado seja identificado.
Uma possibilidade para aumentar a freqüência de direcionamen- to de um determinado construto é aumentar o comprimento da região de homologia, uma vez que há uma relação linear entre ambos os parâmetros (Hasty e outros, Mol Cell Biol. Nov. de 1991; 11(11): 5586-91 (1991)). Alter- nativamente, uma série de "abordagens de captura" foram desenvolvidas, as quais contam com o uso de elementos do Iocus-alvo para expressão eficien- te do cassete de seleção. Por exemplo, na abordagem de captura de endó- gena, o vetor de direcionamento é criado de uma forma tal que a maquinaria transcricional do gene alvo endógeno acionará a expressão do cassete de seleção clonado no vetor de direcionamento. Nesse caso, o vetor contém regiões homólogas ao gene-alvo as quais não têm qualquer atividade pro- motora e, portanto, a maioria dos clones nos quais a integração ocorreu ale- atoriamente não pode sobreviver à seleção com antibiótico. Tipicamente, seleções por captura de promotor obtêm enriquecimentos de 100 vezes para os clones-alvo.
Usando metodologias de RNAi, expressão do gene PrP tem si- do, até o momento, apenas transitória e parcialmente silenciada em células de neuroblastoma de camundongo infectadas com scrapie em cultura (Dau- de e outros, J. Cell. Sci., 1 de Julho de 2003; 116 (Pt 13): 2775-9 (2003)).
O direcionamento genético do gene de príon no genoma de ca- mundongo foi reportado com sucesso usando diferentes abordagens (Tabela 1) de forma a elucidar a conseqüência funcional de sua perda de função e sua possível relação com TSEs.
Tabela 1: Dados de "knockout" de PrP em camundongos disponíveis da lite- ratura _
Nome do "knoc- kout" Método Seleção com anti- biótico Braços ho- mólogos (kb) Células hospedei- ras Fre- qüência de re- combi- nação direcio- nada Zurich I Conven- cional G418 a 0,3 mg/ml n/a ES AB1 1/5000 Edin- burgh Conven- cional G418 a 0,2 mg/ml Ganeiclovir a 2 μΜ Esquerdo: 1,2 Direito: 2,4 E14 1/800 Nagasa- ki Conven- cional G418 a 0,2 mg/ml FIAU a 200 nM Esquerdo: 3,0 Direito: 9,0 J1 ES 1/321 RcmO Conven- cional G418 a 1 mg/ml n/a Neuroblas- toma N2a n/a Zurieh Il Condi- cional G418 a 0,4 mg/ml Esquerdo: 1,4 Direito: 3,7 E14.1 82/1046( PCR), 5/82
Conforme esperado a partir da "teoria de proteína de príon ape-
nas" (Prusiner Nobel Lecture, 8 de Dez. de 1997), camundongos homozigó- ticos para o gene inativado (isto é, totalmente desprovido de expressão de PrP) são na verdade resistentes à infecção por príon. Mais importante, con- tudo, todos os camundongos com "knockout" de PrP mencionados acima são viáveis e normais quanto ao desenvolvimento. Apenas um fenotipo neu- rológico relativamente brando foi caracterizado nos knockouts Nagasaki, RcmO e Zürich Il (Rossi e outros, EMBO J. 20, 4, 694-702, (2001)), indicando que a função do gene PrP não é absolutamente essencial. Alternativamente, conforme foi sugerido, pode haver algum mecanismo de compensação fun- cional do gene pelo Dpl1 um gene que mostra homologia considerável ao PrP e mapeando apenas 16 Kb a jusante do qual é superregulado no CNS de camundongos com "knockout" de PrP (Moore e outros, J. Mol. Biol. 292, 797-817 (1999)).
A tecnologia de "knockout" descrita acima tem se defrontado com dois problemas principais quando aplicada à células somáticas. Primei- ro, "knockout" de um gene nessas células proporciona apenas informação limitada a respeito das conseqüências funcionais da ruptura, uma vez que o fenotipo de células com "knockout" em cultura não reflete necessariamente o efeito final em um organismo mutante, tal como o camundongo derivado de células de ES com "knockout". O segundo problema e mais crítico é que a freqüência de direcionamento de recombinação homóloga em células somá- ticas é cerca de duas ordens de magnitude maior do que em células de ES (Hanson e Sedivy, Mol. Cell Biol. 15(1): 45-51 (1995)). Para direcionamento eficiente de gene em células somáticas, abordagens de captura de promotor utilizando vetores sem promotor são absolutamente essenciais (Sedivy e Dutriaux, Trends Genet. 15(3): 88-90 (1999)), uma vez que elas podem, tipi- camente, obter enriquecimentos de 100 a 500 vezes. Quando de introdução em células somáticas e seleção por antibiótico, o cassete de seleção pode ser expresso apenas após recombinação homóloga a partir do promotor do gene-alvo. Direcionamento gênico também pode ser aprimorado através da tecnologia CIonePix disponível da Genetix, Reino Unido.
Agora, descobriu-se que uma linhagem de célula somática hu- mana (por exemplo, uma linhagem de célula derivada da linhagem de célula HEK293F) poderia ser estabelecida na qual o gene que codifica a seqüência da proteína de príon tenha sido inativado em pelo menos um, de preferência em ambos os alelos ou três alelos em células triplóides. Isso foi obtido atra- vés de recombinação homóloga de um vetor "knockout" contendo um mar- cador de seleção o qual após integração do alvo no genoma permite a ex- pressão de dito marcador de seleção pelo promotor de PrP endógeno. Tais células com ablação de príon resultantes são adequadas para a produção recombinante de proteínas-alvo humanas após transfecção com um vetor de expressão adequado que codifica a proteína-alvo. Em combinação com uma purificação de proteína e inativação de vírus adequadas, esse método pro- porciona um sistema eficaz para produzir proteínas humanas recombinantes seguras e altamente ativas livres de proteínas de príon para aplicação tera- pêutica em seres humanos. Sumário da Invenção
A presente invenção refere-se a:
(1) uma linhagem de célula somática, imortalizada, sem proteína de príon (PrP) em que ambos os alelos do gene de PrP foram completamen- te deletados;
(2) um método para produção da linhagem de célula imortalizada isenta de PrP conforme definido em (1) acima o qual compreende subse- quente deleção de ambos os alelos da ORF de PrP em uma respectiva célu-
Ia inicial através de recombinação homóloga com construtos com "knockout" de PrP;
(3) um construto com "knockout" de PrP conforme definido em
(2) acima;
(4) o uso da linhagem de célula imortalizada isenta de PrP con- forme definido em (1) acima para a produção recombinante isenta de PrP de
uma proteína humana ou um derivado ou mutante da mesma (aqui depois "proteína-alvo");
(5) um método para preparo de uma linhagem de célula para a produção recombinante isenta de PrP de uma proteína-alvo o qual compre-
ende transfecção de uma linhagem de célula hospedeira imortalizada isenta de PrP conforme definido em (1) acima com um vetor de transfecção com- preendendo uma origem de replicação e um gene que codifica a referida proteína-alvo humana, pelo que o gene para a proteína-alvo humana está ligada, em sua extremidade 5', com um promotor e, em sua extremidade 3', com um sinal poliA;
(6) uma linhagem de célula imortalizada isenta de PrP estavel- mente transfectada, de preferência sob condições isentas de soro, com o vetor de transfecção conforme definido em (5) acima; e
(7) um método para produção recombinante isenta de PrP de uma proteína-alvo humana a ser usada como produto farmacêutico o qual compreende cultura da linhagem de célula humana imortalizada isenta de 5 PrP conforme definido em (6) acima.
O método da modalidade (7) da invenção é particularmente ade- quado para a produção de proteínas humanas recombinantes e anticorpos terapêuticos, incluindo fatores de coagulação, tal como fator Vll/a, fator VIII, fator IX, fator de von Willebrand (vWF) e Adamtsl 3 e fatores de crescimento, 10 tais como fator de estimulação de colônia de granulócito (G-CSF) ou fator de estimulação de colônia de macrófago granulócito (GM-CSF), isenta de con- taminação por proteína de príon. Para esse método, uma linhagem de célula humana imortalizada, por exemplo, uma linhagem de célula HEK 293, com ablação de uma seqüência de proteína de príon da invenção é utilizada. Es- 15 sa linhagem de célula é obtenível através de transfecção de uma linhagem de célula humana imortalizada com um vetor contendo um marcador sele- cionável ou de seleção tal como, por exemplo, a ORF de fosfotransferase de neomicina, desprovido de seu próprio promotor e início de tradução.
Em uma modalidade, a linhagem de célula é uma linhagem de célula humana, tal como uma linhagem de célula derivada de células HEK 293F ou Per.C6 (células de retina fetal humana imortalizadas). Outras célu- las adequadas são células CHO (células de Ovário de Hâmster Chinês) e BHK (células de Rim de Hâmster Bebê).
Breve Descrição das figuras Figura 1: Estratégia de captura de promotor para realizar abla-
ção do gene de PrP humano.
Figura 2: Construto com K.O. de PrP pBS_Neo_P' _R+L_Braço_2B.
Figura 3: Estratégia de clonagem para gerar o construto pBS_Neo_P"_L+R_Braço_2B, A seqüência da região clonada no vetor pBlu- escript, i) gene de neomicina sem seu próprio promotor e ATG, ii) Braço es- querdo para recombinação homóloga, iii) Braço direito para recombinação homóloga.
Figura 4: Estratégia de seleção baseada em PCR após seleção
com G418.
Figura 5: Estratégia de Southern genômica para caracterizar clo- nes após integração estável do construto pBS_Neo-_P-_L+R_Braço_2B.
Figura 6: Varredura PCR genômica após integração do construto de direcionamento pBS_Neo_P-_R+L_Braço_2B. Marcador de DNA: Mistura GeneRuIer DNA Ladder; Controle positivo: DNA genômico de uma popula- ção mista de célula de PrP alvo. A1-8 e B1-8 são os clones de célula sele- 10 cionados através do CIonePixFL. Os clones rotulados com um círculo verde foram identificados como clones positivos através de PCR em virtude das bandas de 2,3 kb.
Figura 7: Análise de Southern de células com K.O. de PrP após integração direcionada do primeiro construto de K.O. pBS_Neo_P- 15 _R+L_Braço_2B: o seguinte é utilizado: Marcador de DNA: Mistura GeneRu- Ier DNA Ladder; WT: 293F do tipo selvagem: K.O.: um clone com K.O. iden- tificado após integração direcionada do 1o K.O. Construto pBS_Neo_P- _R+L_Braço_2B. DNA genômico do clone com K.O. e células 293F do tipo selvagem foi hibridizado com 5’-, 3’- e Neo-sondas. Conforme esperado, 20 293F do tipo selvagem mostram uma banda de 10,8 kb do tipo selvagem com ambas as sondas 5’- e 3’-, mas nenhum sinal com a Neo-sonda. Para os clones com K.O., uma banda de 4,2 kb com uma 3’-sonda e uma banda de 6,5 kb com uma 3’-sonda puderam ser detectadas; adicionalmente, uma banda de 6,5 kb foi observada com a Neo-sonda.
Figura 8: Análise por FISH de células com K.O. de PrP com um
alelo de PrP direcionado: padrão a: dois sinais de chr20 e Bac; Padrão b: 3 sinais chr20 e Bac; padrão c: 3 sinais de chr20, mas apenas 2 sinais de Bac.
Figura 9: Análise por ELISA de células com K.O. de PrP com um alelo de PrP direcionado e células 293F: 2 linhagens de célula com K.O. tra- zendo um alelo de PrP direcionado (K.O. 1 e K.O. 6) foram analisadas e comparadas com células 293F do tipo selvagem.
Figura 10: 2. Construto de K.O. de PrP pBS_Zeo_Fr _R+L_Braço.
Figura 11: Varredura por PCR de clones de células ou popula- ções de células mistas com duas integrações de K.O. de PrP: No gel, o se- guinte é utilizado: Marcador de DNA: Mistura GeneRuIer DNA Ladder; Con- 5 trole positivo: DNA genômico de uma população mista de células de PrP di- recionada. T3-1 é uma população de células mista selecionada com zeocina. T3-2 é uma população de células mista selecionada com zeocina e G418. Ambas as populações de células mistas foram identificadas como positivas.
Figura 12: Estratégia de Southern genômica para caracterizar clones após integração estável do construto de direcionamento pBS_Neo- _P-_L+R_Braço_.
Figura 13: Eficiência de transfecção de células com KO de PrP com um alelo direcionado de PrP. A mesma quantidade de células foi trans- fectada com um plasmideo de expressão e a eficiência de transfecção foi comparada.
Figura 14: Expressão de FVIII (Fig. 14a), FIX (Fig. 14b) e G- CSFb (Fig. 14c) em células com K.O. de PrP com um alelo de PrP direcio- nado. A expressão de unidades arbitrárias de FVIII, FIX e G-CSFb por célu- las 10E6 comparado com células 293F do tipo selvagem.
Descrição Detalhada da Invenção
As seguintes definições e abreviações são utilizadas no presente
pedido.
"BAC" significa cromossoma artificial bacteriano. "bp" significa pares de base. "G418" e "zeocina" são dois anticorpos de seleção diferen- 25 tes; células transfectadas estavelmente com construtos trazendo os mesmos como marcadores de seleção se tornam resistentes ("G418R" ou "zeocinaR") a esses antibióticos, "recombinação homóloga" se refere a um mecanismo pelo qual dois fragmentos de DNA de seqüência homóloga se recombinam um com o outro. "Braço esquerdo" se refere à região intrônica do gene de 30 PrP localizada imediatamente a montante do éxon 3. "Braço direito" se refe- re à região imediatamente a jusante do éxon 3 do gene de PrP. "Neo" se refere ao gene de fosfotransferase de neomicina. "ORF" significa rede de leitura aberta. "PCR" significa reação em cadeia de polimerase, "PrP" signifi- ca gene de príon ou a proteína de príon. "HEK293F" se refere a uma linha- gem de célula de rim embriônica humana específica.
Assim, a modalidade (1) da invenção se refere a uma linhagem 5 de célula humana somática, imortalizada, isenta de proteína de príon (PrP) em que ambos os alelos do gene de PrP foram completamente deletados.
De acordo com a invenção, a referida linhagem de célula é ca- paz de ser transfectada e ser cultivada sob condições isentas de soro.
Ainda, é preferido que a linhagem de célula tenha sido tornada 10 imortal através de integração de seqüências adenovirais em seu genoma. A linhagem de célula pode ser derivada de uma célula inicial selecionada do grupo consistindo em células de rim, bexiga, fígado, pulmão, músculo cardí- aco, músculo liso, ovário e gastrintestinais. É preferido que a célula inicial seja uma linhagem de célula de rim humano, tal como uma célula de rim fe- 15 tal humana. Particularmente preferido é que a célula de rim humano fetal seja uma célula FreeStyIe 293 (células 293F; Invitrogen R79007), HEK 293 (células 293; ATCC CRL-1573; DSM ACC 305) ou célula 293T (DSM ACC 2494), de preferência é uma célula 293F (Invitrogen R79007).
Em outra modalidade preferida da invenção, a ORF de PrP foi completamente deletada através de recombinação homóloga com "armadi- lhas" de "knockout" trazendo genes marcadores de seleção ou selecioná- veis, de modo que a expressão do marcador selecionável ou de seleção é acionada pelo promotor de PrP endógeno.
Em uma modalidade particularmente preferida, a linhagem de célula isenta de príon da modalidade (1) é a linhagem de célula 293F isenta de príon pf293F, a qual inclui todas as populações mistas intermediárias, clones isolados necessários para isolar a referida linhagem de célula com "knockout" final e modificações derivadas da mesma.
No método da modalidade (2) da invenção, os construtos com "knockout" podem ser adequados para deletar a ORF de PrP inteira em am- bos os alelos. Ainda, os construtos de "knockout" podem trazer os mesmos ou diferentes genes marcadores de seleção sem promotor flanqueados por duas seqüências homólogas ao sítio de inserção dentro do gene de PrP da célula inicial. Contudo, é preferido que os construtos de "knockout" tragam diferentes genes marcadores de seleção ou marcadores selecionáveis. Os construtos de "knockout" podem ainda trazer uma das seguintes seqüências 5 funcionais: uma seqüência poli A, seqüências de reconhecimento de recom- binase, IRES e similares.
As seqüências homólogas da construto de "knockout" podem ter um comprimento de 1 a 10 kb, de preferência de cerca de 6 kb e, de prefe- rência, correspondem às seqüências a montante e a jusante da ORF de PrP 10 da linhagem de célula inicial. Particularmente preferido é que as seqüências homólogas sejam aquelas mostradas em SEQ ID NOs: 2 e 3. Marcadores de seleção adequados codificam marcadores de seleção positivos incluindo, mas não limitado a, fosfotransferase de neomicina, zeocina, higromicina; e o marcador selecionável inclui marcadores de fluorescência, tais como GFP e 15 Dsred e enzimas, tal como LacZ.
É particularmente preferido que os construtos de "knockout" te- nham uma ou mais das seqüências mostradas em SEQ ID NOs: 1 e 16.
A invenção, além disso, é descrita através de referência à célu- las HEK 293 ou HEK 293F. Em tais linhagens de célula da invenção, a regi- ão de codificação do gene de PrP é completamente deletada por meio de captura de promotor. Três etapas consecutivas são necessárias para dele- ção da região de codificação do gene de PrP em células HEK 293F:
1. Direcionamento da região de codificação de PrP sobre um alelo com um construto de "knockout" de PrP (aqui depois "K.O.") contendo
um marcador de seleção de neomicina.
2. Identificação e isolamento de clones trazendo apenas um ale- lo de PrP direcionado e um alelo de PrP do tipo selvagem. Essa etapa é ne- cessária em virtude da heterogeneidade genética das células HEK 293F pa- rentais, as quais trazem 3 cópias do gene de PrP em 75% da população e 2
cópias em 25% da população.
3. Direcionamento da região de codificação de PrP sobre o alelo restante com um segundo construto de K.O. de PrP, nesse momento con- tendo um marcador de seleção de zeocina.
Após a transfecção estável do primeiro construto de K.O. de PrP (trazendo neomicina como o marcador selecionável, figura 2) em células HEK 293F, clones G418R foram isolados em várias concentrações diferentes 5 de antibiótico e selecionados através de uma estratégia baseada em PCR a qual identifica eventos direcionados (figura 4, figura 6). Clones trazendo inte- rações PrP-direcionadas foram, então, caracterizados através de análise de Southern blot genômica de forma a avaliar:
(a) se a integração do construto de direcionamento está correta em suas extremidades 5'e 3'
(b) quantos alelos de PrP foram direcionados (um, dois ou três) e quantos ainda estão intactos (tipo selvagem: um ou dois).
No segundo ciclo de K.O., o segundo construto de K.O. de PrP (trazendo zeocina ao invés de neomicina como o marcador selecionável) foi, 15 então, usado para realizar "knockout" do alelo de PrP restante naqueles clo- nes onde o alelo tinha sido direcionado com neomicina e o segundo alelo de PrP ainda estava intacto. Após varredura por PCR e análise de Southern genômica de clones zeocinaR isolados, a ablação completa do gene de PrP foi confirmada através de análise por RT-PCR para demonstrar a falta de 20 mRNA de PrP e através de análise de Western blot para mostrar a ausência completa da proteína de PrP.
A linhagem de célula com K.O. de PrP total resultante descrita na presente invenção pode, então, ser usada para expressão isenta de príon garantida de proteínas recombinantes humanas.
Durante o processo todo de transfecção, seleção por antibiótico,
isolamento de clone, varredura e expansão, as células foram cultivadas sob condições isentas de soro (por exemplo, em meio FreeStyIe ou meio particu- lar Octapharma). Após estabelecimento e caracterização genética e fenotípi- ca completa do clone de célula com K.O. de PrP final, um Banco de Célula 30 de Pesquisa foi gerado (vide métodos de cultura de célula de células 293F em 6.1 de Materiais e Métodos). Essa linhagem de célula com K.O. de PrP, aqui depois denominada "linhagem de célula 293F isenta de príon" pode, então, ser estavelmente transfectada com qualquer gene de interesse (por exemplo, Fator VIII, Fator IX, G-CSF, vWF, GM-CSF, Fator Vll/Vlla ou anti- corpos) completamente sob condições isentas de soro de acordo com o pe- dido de patente (vide EP 05 105 965 co-pendente, a divulgação do qual é 5 aqui incorporada em sua totalidade).
As células resultantes de tal transfecção estável realizada com células 293F isentas de príon que crescem rotineiramente em meio isento de soro e, por exemplo, com um construto pcDNA3.1 trazendo o gene de inte- resse são cultivadas em meio semissólido baseado em metil celulose con- 10 tendo um antibiótico apropriado para seleção de clone e um anticorpo rotu- lado para detecção dos maiores clones produtores via fluorescência. Gran- des números (por exemplo, dez mil) de clones são, então, analisados usan- do CIonePixFL (Genetix) com relação ao número de células e proteína re- combinante secretada de forma a selecionar subsequentemente apenas uns 15 poucos clones melhor produtores. Em contraste a outros métodos conheci- dos, onde clones não produtores e clones misturados são todos aleatoria- mente selecionados, o CIonePixFL permite identificação e seleção simultâ- neas dos clones de crescimento mais rápido os quais também são os maio- res produtores e os quais se originam de células únicas. As células selecio- 20 nadas são expandidas em lâminas de microtitulação e depois em tubos para centrífuga, frascos de cultura de célula e fermentadores sob condições isen- tas de soro para o procedimento todo.
Aqui também, todo o procedimento de transfecção estável é ge- rado sob condições isentas de soro. Adicionalmente, durante todo o proce- dimento seguinte de expansão e cultura de célula, as células não têm qual- quer contato com soro ou proteínas derivadas de animal.
Durante expansão, os melhores clones são selecionados com relação à robustez, alta taxa de crescimento, capacidade de escalonamento e produção, por exemplo, de proteína recombinante ativa, conforme medido 30 através de um teste ELISA. Durante essa seleção, o número é reduzido no- vamente para uns poucos melhores clones produtores. Além da produtivida- de, seqüência de cDNA correta, teor de mRNA e comportamento da célula quando de fermentação são critérios para identificar o(s) melhor(es) clone para subclonagem. Para isso, células do(s) clone(s) selecionado(s) são reco- locadas em lâminas, analisadas e selecionadas com CIonePixFL e, então, expandidas e selecionadas conforme descrito acima. Subclonagem é uma 5 etapa essencial de forma a selecionar apenas os melhores clones produto- res, eliminando possíveis variações genéticas na subpopulação do clone colocada na lâmina. Após subclonagem, o(s) clone(s) selecionado(s) é(são) testado(s) novamente sob condições isentas de soro. A proteína humana recombinante expressa pelo(s) subclone(s) selecionado(s) final é caracteri- 10 zada bioquimicamente em maiores detalhes.
Além disso, os clones com K.O. podem ser isolados em meio semissólido usando CIonePixFL com um anticorpo fluorescentemente rotu- lado que detecta clones nos quais o gene de PrP sofreu "knockout" comple- tamente.
Exemplos
Materiais e Métodos
1. Dispositivos usados para Técnicas de Biologia Molecular
Dispositivo Fornecedor Tipo Número de Comentários catálogo Câmara de eletrofo- BioRad SUB-CELL rese em gel de aga- GT rose Suprimento de ener¬ BioRad PAC 3000 gia para eletroforese UV-transiluminador Vilber Lourmat Centrífuga Heraeus Biofuge fres¬ Máximo de co 13,000 rpm Thermomixer Eppendorf 5436 Banho de água HAAKE Type 002- 9917 Incubadora a 37°C Menmert Modelo 300 Refrigerador Liebherr - +2-8°C Freezer Liebherr - -20°C Continuação...
Sistema de água Millipore Milli-Q pura Pipetas de transfe¬ Gilson P2, P20, - - rência P200, P1000 Pontas amarelas Josef Peske -200 μΙ oHG Pontas azuis Josef Peske -1000 μΙ oHG Pontas de filtro, 5 a Peske (ΜμΙίί) Rack de im, 1491-11 250 μΙ estéril Pontas de filtro, 100 Peske (ΜμΙίί) Rack im, 1420-111 a 1000 μΙ estéril espectrofotômetro Beckman DU 530 Sistema de docu¬ BioSciTec. Gelscript mentação em gel Science Group versão 1.1 Lâmina de 1 μΙ Ibidi ibiT reat 81826 2. Reagentes e Kits para técnicas de Biologia Molecular
Reagente Fornecedor Número de Condições de Comentários pedido armazenamento Pfx polimerase Invitrogen 11708-013 -20°C Notl NEB R0189S -20°C EcoRI NEB R0142S -20°C Kpnl NEB R0142S -20°C Notl NEB R0146S -20°C Sistema Concert® GIBCO 11453-024 TA Rapid Plasmid Mini- prep Kit de purificação por Qiagen 28104 TA PCR QIAquick Kit de Extração em Qiagen 28704 TA Gel Qia Quick Mistura DNA Ladder MBI SM0331/3 -20°C Continuação...
SmartLadder Eurogentec MW-1700- -20°C 07 agarose Sigma A9539 TA Triptona Sigma T9410 TA Extrato de levedo GIBCO 30393-029 TA NaCI Roth 9265.1 TA Agar Sigma A5054 TA T4 Iigase NEB #M0202S -20°C Células supercompe- Stratagene 200152 -80°C tentes SURE 2 Células competentes Invitrogen 44-0300 -80°C One shot Top10F’ Kit HiSpeed Plasmid Qiagen 12643 TA Midi Kit EndoFree Plasmid Qiagen 12362 TA Maxi Kit DNAeasy Blood & QIAGEN 69504 TA Tissue Kit Gentra Puregene QIAGEN 158767 TA Cell 3. Meio de crescimento bacteriano
Meio LB: 10 g de Triptona, 5 g de Extrato de Levedo, 10 g de NaCI1 dissolvido em 1 I de H2O1 então, submetido à autoclave.
Lâminas de agar LB/amp: agar a 1,5% em meio LB contendo
100 pg/ml de ampicilina.
4. Materiais para cultura de células 293/293F
4.1. Linhagens de célula
Linhagem de célula 293: A linhagem de célula 293 é uma Iinha- gem de célula permanente a qual cresce aderentemente na presença de soro. Ela foi estabelecida a partir de rim humano embriônico primário trans- formado com DNA de adenovírus do tipo 5 humano cisalhado (Graham e outros, 1977; Harrison e outros., 1977). O gene de adenovírus E1A é ex- presso nessas células e participa da transativação de alguns promotores virais, permitindo que essas células produzam níveis muito altos de proteína.
Linhagem de célula 293F: A linhagem de célula FreeStyIe 293F 5 é uma variante da linhagem de célula 293 que foi adaptada ao crescimento em suspensão em meio de expressão FreeStyIe 293. A linhagem de célula original foi obtida de Robert Horlick na Farmacopéia em 1988. A linhagem de célula FreeStyIe 293F é derivada da linhagem de célula 293 e se destina a ser usada com o sistema de expressão FreeStyIe 293 (Invitrogen Catálogo 10 n° K9000-01) disponível da Invitrogen ou outro meio isento de soro, tal como o meio particular Octapharma. As células FreeStyIe 293F são adaptadas à cultura em suspensão em meio de expressão FreeStyIe 293. A linhagem de célula FreeStyIe 293F exibe as seguintes características:
- Preparada a partir de culturas do Máster Cell Bank de baixa passagem derivadas de células 293F parentais que foram reclonadas atra- vés de diluição limitativa. As culturas derivadas de clones 293 são mantidas em condições isentas de soro durante apenas 30 a 35 passagens no total.
- Adaptada a crescimento em suspensão em alta densidade, i- sento de soro; pode ser mantida em meio de expressão FreeStyIe 293.
- Alta eficiência de transfecção com 293fectin.
- Culturas em suspensão podem ser transfectadas em Meio de Expressão FreeStyIe 293 sem a necessidade de trocar de meio.
- Permite a transfecção de células em grandes volumes.
4.2. Dispositivos para cultura de células 293/293F
Dispositivo Fornecedor Tipo Número Comentários de catᬠlogo Vaporizador esté¬ Heraeus HeraSafe ril Incubadora Kendro BDD6220 - CN O O ^ N- ^ Λ OO Continuação...
Agitador orbital GFL 3005 Colocado em uma incuba¬ dora de CO2 Incubadora com KuhnerAG ISF-W-1 SM1503 agitador de CO2 Microscópio Zeiss Axiovert 25 - - Centrífuga Kendro Megafuge 1.0 - Refrigerador Liebherr 200381 - +2-8°C Congelador a - Liebherr 20°C Congelador a - Heraeus HFC 586 Ba¬ - - 80°C sic Banho de água Memmert WB 14 - - GmbH Hemocitômetro Peske Neubauer Im- Profundidade (Neubauer) proved de 0,100 mm 0,0025 mm2 Lamínula de vidro Peske 03-0000 20 x 26 x 0,4 para hemocitôme¬ mm tro Contador manual Rexel, Reino ENM - - de células Unido Banho de isopro- Nalgene Recipiente de 5100- A ser enchido panol congelamento 0001 com 250 ml a 1°C de isopropa- nol Biostore (nitrogê¬ Air liquide Arpege 110 nio líquido, sub¬ mersão) Frascos de Er- Corning 125, 250, 500, 431143- Policarbonato lenmeyer, uso 1000 ml com 431147 único tampa com abertura para filtro Continuação...
Pipetas de uso Schubert & 9.380.431 único 1 mL Weiss Pipetas de uso Falcon/Costar - 356507 - único 2 mL Pipetas de uso Nunc - 159625 - único 5 mL Pipetas de uso Nunc - 159633 - único 10 mL Pipetas de uso Nunc - 159641 - único 25 mL Pipetas de uso Nunc - 159668 - único 50 mL Auxiliar de pipete- Sigma-Aldrich Accujet 356555 - amento Tubos de centri- Peske 17-1200 Embalado fugação de 15 ml estéril Tubos de centri- Peske 17-1020 Embalado fugação de 50 ml estéril Rótulos adesivos CILS Rótulos de LSL7-W- para criofrascos autolaminação 5-TN finos Criofrascos Simport plas- T-311-2 1,8 ml tics (CAN) Rack de manipu¬ TPP 100 x 200 x 99016 Veja figura 1 lação para crio¬ 25 mm de SOP frascos Criocaixas Simport 136x136x T314- 50 mm 2100 Fotômetro Dynex MRX Espectrofotômetro Beckman DU530 Microscópio de Olympus BX-41 fluorescência 4.3. Reaqentes para cultura de células 293/293F
Reagente Fornecedor Número de Condições de Comentários pedido armazenamento Meio de cultura isen¬ Invitrogen 12338-026 +8°C no escuro “ to de soro FreeSt- yle293 Lipofectami- Invitrogen 12566-014 4°C ne2000CD OptiProSFM Invitrogen 12309-019 4°C DMSO Sigma D-2650 temperatura Não armaze¬ ambiente, escu¬ nar a +8°C ro ou mais ge¬ lado, uma vez que o material co¬ meça a cris¬ talizar Etanol a 80% + MEK Zefa ADR §/36 temperatura Para desin- a 1% ambiente fecção Isopropanol 100% Sigma Al- I0398 temperatura Para banho p.a. drich ambiente, ar¬ de isopropa- mazenar venti¬ nol lado para sol¬ ventes inflamᬠveis Opti-MEM I Invitrogen 51985-034 +8°C no escuro - Zeocina Invitrogen R250-01 A-20°C - G418 PAA P11-012 A 4°C - Lipofectamin 2000CD Invitrogen 12566-014 4°C OptiPRO SFM Invitrogen 12309-019 4°C Colcimid Biochrom L6221 -20°C AG Tween 20 Sigma P9416 RT Albuminative a 40 g/l Octapharma Batch N0: 4417136161 4.4. Reaqentes para FISH. Imunocoloração e ELISA
Reagente Fornecedor Número de Condições de Comentários Pedido armazenamento Sonda de coloração Aquarius LPP20G -20°C de cromossoma intei¬ ro Chromosome 20 DAPI Antifade Aquarius DES 150L -20°C Protein Assay (Brad- BioRad 500-0006 4°C ford) Kit Príon Protein EIA SpiBio 589751 -20°C 3F4 (primeiro Ab) Sigma 054K1525 -20°C FITC - anticamun- Novus NB720-F 4°C dongo de cabra (se¬ gundo Ab) SAF32FITC (1,3 Spibio Sem n° de -20°C mg/ml) pedido SAF32 (200 pg) Spibio Sem n° de -20°C pedido POM 17 (1 mg/ml) Dr.Aguzzi -20°C Lab, Zurique, ETH POM 12 (1 mg/ml) Dr.Aguzzi -20°C Lab, Zurique, ETH 4.5. Meio inicial e de crescimento padrão para células 293F
Meio FreeStyle293, sem aditivos.
O meio de expressão FreeStyIe 293 permite crescimento, manu- 5 tenção e transfecção de células FreeStyIe 293F. Meio de expressão FreeSt- yle 293 disponível da Invitrogen é uma formulação isenta de soro, definida, especificamente desenvolvida para a cultura em suspensão em alta densi- dade e transfecção de células 293. O meio não contém componentes origi- nários de animal ou ser humano e é formulado com Glutamax-I para aumen- 10 tar a estabilidade e maximizar a vida útil.
4.6. Meio de congelamento para células 293F
Meio FreeStyle293 + DMSO a 10%.
5. Métodos de Biologia Molecular 5.1 Isolamento de DNA genômico de péletes de célula com o kit QIAGEN DNAeasy Blood & Tissue (cat N0 69504) ou o kit Gentra Cell (QIAGEN Cat N0 158767) para análise por PCR e Southern.
5.2 Isolamento de DNA genômico de uma lâmina com 96 cavidades para análise por PCR:
• As células foram enxaguadas duas vezes com PBS.
• Adicionar 50 μΙ de tampão de Iise (0,6 ml de proteinase K deve- rão ser adicionados a 12 ml de tampão de Iise [Tris a 10 mM, 10 mg de ED- TA, NaCI a 10 mM, sarcosila a 0,5%] a cada cavidade de acordo com a tabe-
Ia a seguir.
• Incubar as lâminas durante a noite a 50 0C, as lâminas deverão ser cobertas com Parafilm.
• Centrifugar a 2500 rpm durante 1 min. Adicionar 100 μΙ de Na- CI/EtOH (150 (I de NaCI a 5M a 10 ml de etanol absoluto gelado) a cada ca-
vidade e agitar a lâmina durante 20 min em temperatura ambiente. Os áci- dos nucleicos se precipitam como uma rede filamentosa.
(Centrifugar a 2500 rpm durante 1 min, inverter a lâmina cuida- dosamente para descartar a solução; os ácidos nucleicos permanecem pre- sos à lâmina. Secar o excesso de líquido sobre toalhas de papel.
(Enxaguar o ácido nucleico 3 vezes pingando 100 (I de etanol a
80% por cavidade usando uma pipeta multi-canais. Agitar a lâmina durante 30 min durante cada etapa de lavagem. Centrifugar a 2500 rpm durante 1 min e descartar o álcool cuidadosamente invertendo a lâmina cada vez.
(Dissolver o DNA genômico em 50 (I de TE e cobrir com Para-
film. A lâmina foi colocada na incubadora a 37 oC durante a noite ou 1-2 ho- ras a 50 oC para dissolver completamente.
• Armazenar a lâmina com DNA genômico a 4 0C para uso ou a - 20 0C para armazenamento.
6. Transfecção de células com Lipofectamin 2000CD:
Antes de começar, certificar-se de que as células são saudáveis e >90% vi- áveis.
1. Um dia antes de transfecção, preparar uma cultura em sus- Tl pensão com uma densidade celular de 0,8-1,1 x 106 células/ml em meio de crescimento sem antibióticos.
2. No dia de transfecção: preparar uma cultura em suspensão com 1,1 x 106 células viáveis/ml.
3. Para cada transfecção, preparar complexos usando as se-
guintes quantidades e volumes de reagente para cada ml de células trans- fectadas com ou sem Albuminative como suplemento no meio de crescimen- to:
• Diluir 0,5 a 1,5 μg de DNA em 34 μΙ de OptiMEM® SFM ou OptiPRO® SFM · Diluir 1-10 μΙ de Lipofectamin® 2000 CD em 34 μΙ de OptiMEM® SFM ou OptiPro® SFM
4. Adicionar os complexos ao frasco/lâminas contendo células e
meio.
5. Incubar as células sobre as lâminas a 37 0C ou cultivar em suspensão sobre um agitador orbital girando a 125 rpm durante 24 a 96 h
em uma incubadora com CO2.
6.3. Seleção da transfecção. expansão da cultura, cultura de células sobre lâminas com 96 cavidades e preparo para seleção de clone com CIonePix- FL:
1. Após transfecção, os antibióticos zeocina ou G418 foram adi-
cionados à cultura transfectada para seleção.
2. Após seleção, as células resistentes a antibiótico foram cole- tadas para isolamento de DNA genômico e selecionadas através de análise por PCR.
3. A cultura com resultado de seleção positiva por PCR foi ex-
pandida para atingir 5 x 105 células/ml.
4. Cultivar as células em uma lâmina com 96 cavidades com 1000 células/cavidade com meio de crescimento.
5. Preparar lâminas repetidas para PCR e congelamento de cé- lula, se a densidade celular atinge 50%.
6. No caso em que uma densidade celular de 80% foi atingida, a lâmina está pronta para seleção por PCR. 7. Empoçar as células positivas por PCR e cultivar novamente em 200 a 250 células por cavidade em uma lâmina com 96 cavidades; ou expandir as células positivas por PCR separadamente e cultivar 200 a 250 células/cavidade em uma lâmina com 96 cavidades.
8. Preparar lâminas repetidas para PCR e congelamento de cé-
lula se a densidade celular atinge 50%.
9. No caso em que uma densidade celular de 80% foi atingida, a lâmina está pronta para seleção por PCR.
10. Expandir as células positivas por PCR para 5 x 105 célu- Ias/ml para teste de cultura.
11. Cultivar as células em diferentes densidades em Meio Se- missólido para descobrir a melhor densidade celular, de modo que colônias únicas possam ser selecionadas através de CIonePixFL sem tocar outras colônias.
12. Selecionar colônias de células únicas com CIonePixFL.
13. Sincronizar e expandir as colônias selecionadas em uma lâ- mina com 96 cavidades, preparar réplicas a partir de células para congela- mento e análise por PCR.
7. Análise de FISH: Determinação do número de cromossomas 20 em célu- Ias 293F e células pf293F:
Antes de começar, certificar-se de que as células são saudáveis e >85% viáveis.
1. Preparar uma cultura em suspensão com uma densidade de células de 1-3 x 106 células em 5-10 ml de meio de crescimento.
2. Adicionar 0,2 μg/ml de Colcemid ao meio e incubar sobre um
agitador orbital girando a 125 rpm durante 30 minutos a 1 hora.
3. Coletar as células através de centrifugação a 1100 rpm duran- te 10 minutos.
4. Remover o excesso de sobrenadante para 500 μΙ e resuspen- der o pélete.
5. Incubação de 8 a 10 minutos em 5 a 10 ml de KCI a 75 mM em temperatura ambiente. O primeiro ml de solução de KCI deverá ser for- necido gota a gota às células.
6. Adicionar 2 a 3 ml de solução fixadora e centrifugar a 1100 rpm durante 10 minutos.
7. Transferir pélete de célula para um pequeno frasco para mi- crocentrífuga e fazer todas as subsequentes lavagens de fixador nesse fras- co. É importante que as células estejam completamente resuspensas.
8. As células são lavadas 3 a 6 vezes em solução fixadora, após cada etapa de lavagem centrifugar as células durante 1 minuto a 6000 rpm em uma microcentrífuga.
9. As lâminas devem estar em temperatura ambiente, passar a
lâmina através de vapor quente durante 2 a 3 minutos para umidificar a su- perfície (banho de água a 75 a 80 0C).
10. Colocar 10 a 30 μΙ de suspensão de célula sobre a lâmina, não deixar o líquido secar.
11. Após a superfície se tornar granular, passar a lâmina nova-
mente durante 1-2 segundos através de vapor quente.
12. Secar imediatamente a placa de metal realizando um gradi- ente de temperatura através de sua superfície.
13. Incubar as lâminas durante 2 a 3 dias em temperatura ambi-
ente ou incubar as lâminas durante a noite a 65 0C.
14. Submergir as lâminas em 2X SSC, pH de 7,0 durante 2 mi- nutos.
15. Desidratar as lâminas em uma série de etanol (70%, 85% e 100%), cada um durante 2 minutos.
16. Remover a sonda (sonda de coloração de cromossoma, Cy-
tocell/Aquarius, LPP20G) a partir de -20 0C e deixar aquecer para a tempera- tura ambiente.
17. Assegurar que a solução de sonda está uniforme através de mistura repetida com uma pipeta.
18. Remover 5 a 10 μΙ de sonda e colocar sobre a lâmina, cobrir
com uma lamínula de vidro de 24 x 24 mm e vedar com cola de solução de borracha ou esmalte de unha. 19. Desnaturar a 75 0C (+/-1 0C) durante 2 minutos e hibridizar a 37 0C (+/- 1°C) durante a noite.
20. Remover a lamínula e todos os vestígios de cola cuidadosa- mente.
21. Lavar a lâmina em 0,4 X SSC (pH de 7,0) a 72°C (+/- 1°C)
durante 2 minutos.
22. Drenar a lâmina e lavar em 2XSSC, Tween20 a 0,005% (pH de 7,0) em temperatura ambiente durante 30 segundos.
23. Drenar a lâmina e aplicar 10 μΙ de DAPI antifade.
24. Cobrir com uma lamínula e deixar a cor se desenvolver no
escuro durante 10 minutos.
25. Observar com um microscópio de fluorescência.
8. Imunocoloração: Análise da quantidade de proteína de PrP sobre a super- fície celular de células 293F e células pf293F:
Antes de começar, certificar-se de que as células são saudáveis
e >85% viáveis.
1. Cultivar 1-3 x 105 células por cavidade (lâmina de 1 μ, Ibidi) em 30 a 100μΙ de meio de crescimento e incubar durante a noite a 37°C.
2. Se as células crescem bem e se tornam aderentes, começar a
coloração.
3. Aspirar cuidadosamente o meio de cultura e enxaguar as célu- las cuidadosamente com PBS, não agitar.
4. Adicionar fixador gelado (Etanol a 50%, Metanol a 50%) du- rante 1 minuto em temperatura ambiente.
5. Lavar imediatamente as células duas vezes durante 5 minutos
com PBS.
6. Cobrir as células com BSA a 8%/PBS e incubar durante 1 ho- ra em temperatura ambiente. Realizar a incubação em uma câmara vedada à umidade para impedir secagem das células fixadas pelo ar.
7. Lavar as células duas vezes durante 5 minutos com 1x PBS.
8. Remover gentilmente o excesso de PBS e cobrir as células com anticorpo primário (3F4, POM12, POM17, SAF32, SAF32FITC, 6H4) diluído em BSA a 1%/PBS e incubar durante 1 a 2 horas em temperatura ambiente. Realizar a incubação em uma câmara vedada à umidade para impedir secagem das seções teciduais pelo ar.
9. Lavar as células duas vezes com PBS durante 5 minutos.
10. Remover gentilmente o PBS em excesso e cobrir as células
com anticorpo secundário (FITC - anticamundongo de cabra) diluído em BSA a 1%/PBS durante 1 a 2 horas em temperatura ambiente. Realizar a incuba- ção em uma câmara vedada à umidade para impedir secagem das seções teciduais pelo ar.
11. Lavar as células com PBS três vezes durante 5 minutos no
escuro.
12. Adicionar Dapi-anti-fade à lâmina, montar sobre uma lamínu- la e examinar o espécime sob um microscópio de fluorescência.
9. Ensaio ELISA: Quantificação dos níveis de proteína de PrP em células 293F e células pf293F contendo um ou dois alelos de PrP:
1. Coletar 2 x 107 células e centrifugar a 800 rpm durante 5 minu- tos.
2. Remover o meio.
3. Lavar as péletes de célula com 5 ml de PBS gelado.
4. Centrifugar as células a 800 rpm durante 5 minutos.
5. Remover o PBS.
6. Lavar o pélete de células com 1 ml de PBS gelado e centrifu- gar a 6000 rpm durante 5 min, remover o PBS.
7. O pélete de células pode ser submetido à Iise diretamente ou congelado para armazenamento a -80 0C.
8. 1000 μΙ de tampão de Iise gelado são adicionados ao pélete
de células.
9. Passar os Iisatos através de agulhas de seringa com calibre
20, 23 e 26.
10. A concentração de proteína dos Iisatos de célula foi medida
através do Ensaio de Bradford. Exemplo 1: Descrição detalhada para o primeiro ciclo de "knockout" com o construto de K.O. de PrP pBS_Neo_P‘ R+L_Braço_2B (SEQ ID NO:1) contendo neomicina
A. Estratégia de direcionamento:
5 Expressão de PrP será completamente anulada em células HEK
293 ou HEK 293F humanas por meio de uma armadilha de promotor. Essa estratégia (esboçada na figura 1) foi criada para selecionar especificamente aquelas células nas quais a ORF do gene de PrP é substituída pela ORF de fosfotransferase de neomicina (exceto o códon de início de tradução, o qual pertence ao gene de PrP).
O construto de plasmídeo 2B (representado na figura 2) consiste em 4 componentes principais: a parte principal do vetor (não-representada na figura): pBluescript, 2. Um cassete truncado "neo"(= fosfotransferase de neomicina), consistindo da ORF completa para esse gene, exceto seu pró- 15 prio códon de início de tradução, seguido por um sinal de término de trans- crição (veja SEQ ID NO. 1). Problemas críticos: esse cassete truncado de neo não traz qualquer promotor em si. A ORF de neo foi criada para ser tra- duzida a partir do códon ATG inicial o qual pertence ao gene de PrP. 3. Uma região de "braço esquerdo" a montante de neo, com seqüência idêntica ao 20 íntron de PrP localizado entre E2 e E3 (veja SEQ ID NO. 2). 4. Uma região de "braço direito" localizada a jusante de neo, com seqüência idêntica à re- gião de PrP a jusante da ORF de PrP (veja SEQ ID NO. 3).
Quando (a) de transfecção desse construto nas células hospe- deiras 293F, (b) subsequente integração em seu genoma e (c) seleção com 25 G418, o objetivo dessa abordagem foi enriquecimento daquelas células nas quais recombinação homóloga (simbolizada na figura 1 por dois "X" em pre- to) resulta em integração da ORF de neo a jusante das seqüências regulató- rias de transcrição e tradução de PrP (P, E1, E2).
Apenas aquelas células transfectadas nas quais o construto se integrou a jusante de um promotor funcional sobreviverão à seleção com G418. Portanto, espera-se que todas as células sobreviventes tragam inte- rações a jusante de promotores funcionais (consequentemente, "armadilha de promotor"). Em virtude da longa homologia dos braços do construto ao gene de PrP (no total, seqüência homóloga de ~6 kb), espera-se que re- combinação homóloga objetiva especificamente essa integração no Iocus de PrP1 resultando na integração representada na terceira fileira da figura 1.
B: Geração do construto de K.O. de direcionamento de PrP (pBS Neo P~ R+L Braco 2B>:
A geração do construto de direcionamento consiste em três eta- pas de clonagem consecutivas (figura 3), cada uma das quais inclui: uma etapa de amplificação por PRC para produzir um "inserto", uma etapa de 10 ligação de tal inserto em um vetor e transformação da mistura de ligação em E. coli e seleção de clones corretos através de digestão com enzima de res- trição.
1. Geração do construto pBS_Neo_P-_2B:
A ORF de neo foi amplificada através de PCR usando, como um modelo, o vetor pcDNA3.1+ (Invitrogen) usando os seguintes oligonucleotí- deos sintéticos:
2B-Neo-F: 5’-
GGCAAGAATTCGOIGAGCAGT CATT ATGATT GAACAAGAT GGATT GCAC
- GCAG -3’ (SEQ ID NO. 4)
2B-Neo-R: 5’- Ggaccgctcgag-Atgcttccggctcgtatgttgt-S1
(SEQ ID NO. 5),
os quais têm sítios de restrição EcoRI e Xhol (sublinhados). O produto ampli- ficado (1244 bp) foi digerido com EcoRI e Xhol e ligado no pBluescript Il KS+ digerido com EcoRHXhoI (Stratagene). A mistura de ligação foi, então, trans- 25 formada em células competentes One shot ToplOF’ (Invitrogen). Seleção foi realizada através de digestão por restrição com EcoRI/Xhol do DNA de plasmídeo preparado a partir de colônias individuais.
2. Geração do construto pBS_Neo_P-_L_Braço_2B:
O braço esquerdo do construto de direcionamento foi amplifica- do através de PCR usando, como um modelo, o clone 186 de DNA de BAC (BACPAC Resources Center, BPCR, http://bacpac.chori.org/) e os seguintes oligonucleotídeos sintéticos: 2B-L-F: 5’- GGCAAGCGGCCGC-CTCTGTCTAGGAACACTGCTGTG-3’ (SEQ ID NO. 6)
2B-L-R: 5’- GGCAAGAATT C-AAAAT GAAGAG GAGAAC GT CAGAGT C-3’ (SEQ ID NO. 7),
os quais têm sítios de restrição Notl e EcoRI, respectivamente (sublinhados). O produto amplificado (1929 bp) foi digerido com EcoRI e Notl e ligado no pBS_Neo_P-_2B digerido com EeoRI/ Noti A mistura de ligação foi, então, transformada em células competentes One shot ToplOF’ (Invitrogen). Sele- ção foi realizada através de digestão por restrição com EcoRIINotI do DNA 10 de plasmídeo preparado a partir de colônias individuais.
3. Geração do construto pBS_Neo_P-_R+L_Braço_2B:
O braço direito do construto de direcionamento foi amplificado através de PCR usando, como um modelo, o mesmo clone 186 de DNA de BAC conforme em B.2 acima e os seguintes oligonucleotídeos sintéticos:
2B-R-F: 5’- GGACCGCTCGAG-T GT GT ACCGAGAACT GGGGT GAT G-3’ (SEQ ID NO. 8)
2 B-R-R: 5’- GGCGGGGTACC-GCAGAAT CT CT GAGCT CACCT CAG-3’ (SEQ ID NO. 9),
os quais têm sítios Xhol e Kpnl, respectivamente (sublinhados).
O produto amplificado (4,6 Kb) foi digerido com Xhol e Kpnl e
ligado no pBS_Neo_P-_L_Braço_2B digerido com Xhol / Kpnl. A mistura de ligação resultante foi, então, transformada em células supercompetentes SURE 2 (Stratagene). Seleção foi realizada através de digestão por restrição com Xhol/Kpnl do DNA de plasmídeo preparado a partir de colônias indivi- 25 duais. No construto resultante, pBS_Neo_P-_R+L_Braço_2B (seqüência da região clonada apresentada em SEQ ID NO. 1), a ORF de neo (cassete de seleção sem qualquer seqüência promotora e sem seu próprio códon de iní- cio de tradução) foi flanqueada:
- a montante pela região intrônica a qual, no genoma humano, precede o éxon 3 do gene de PrP; e
- a jusante pela região de PrP a qual, no genoma humano, se- gue a ORF de PrP. 4. Linearização do construto pBS_Neo_P-_R+L_Braço_2B:
O construto de direcionamento foi Iinearizado através de diges- tão por restrição com Kpnl, purificado usando o kit de extração em gel QIA Quick (veja Métodos de Biologia Molecular, 5.2) e, então, quantificado pas- sando uma alíquota de 1 μΙ sobre um gel de agarose a 0,8% junto com 5 μΙ de marcador SmartLadder (Eurogentec).
C. Introdução do construto pBS Neo P- R+L Braço 2B em células huma- nas:
O construto de direcionamento pBS_Neo_P-_R+L_Braço_2B foi 10 introduzido nas células hospedeiras (293F, Invitrogen) usando o reagente Lipofectamin 2000CD (Invitrogen, veja método de transfecção, 6.2). 48 h após transfecção, as células foram colocadas sobre discos de 10 cm em uma densidade entre 1,25 e 1,5 x 106 células. Seleção com antibiótico foi iniciada no momento de cultura em concentrações oscilando entre 30 e 120 15 μg de G418/ml. Troca de meio foi realizada a cada dois/três dias durante 14 a 21 dias.
D. Seleção de clones direcionados:
Quando as células atingiram a confluência sob seleção com an- tibiótico, DNA genômico foi preparado, quer a partir de 1 x 106 a 1 x 107 célu- 20 Ias G418r usando o kit de tecido QIA DNAeasy (veja Métodos de Biologia Molecular, 5.3) ou usando um método previamente descrito desenvolvido para preparar DNA genômico de células de ES colocadas sobre lâminas com 96 cavidades (Ramirez-Solis e outros, 1992). De cada preparado de DNA genômico, uma mistura de PCR foi preparada contendo 80 a 300 ng de 25 DNA genômico, 1x tampão de PCR, cada iniciador de oligonucleotídeo a 200 nM, MgCI2 a 5 mM, dNTP a 200 nM e 1,33 unidades de Expand Fidelity Polymerase (Roche). A seqüência dos oligonucleotídeos sintéticos usados para seleção era como segue:
K.O.-F1: 5' CGACTCAGTGTCATTCCCTGCAGTCTC 3' (SEQ ID NO. 10)
K.O.-R1: 5' CATAGCCGAATAGCCTCTCCACCCAAG 3' (SEQ ID NO. 11)
Os parâmetros de ciclo foram como segue: 94°C 2 min; [94°C, 15 s; 71,6°C, 30 s; 72°C 100 s] x16 ciclos; [94°C, 15 s; 71,6°C, 30 s; 72°C 100 s + 3 s a mais em cada ciclo sucessivo]x26 ciclos; 72°C 7 min. Amostras de DNA genômico que proporcionam um produto de PCR de 2,3 kb indicam a presença de um ou vários alelos direcionados na população de célula. Clones direcionados foram ainda analisados através de análise de Southern 5 blot.
E. Caracterização de clones direcionados trazendo um alelo de PrP direcio- nado:
1. Seleção por PCR genômica (figura 4):
DNA genômico foi isolado de populações de célula mistas ou colônias de células isoladas conforme descrito em D acima. Todas as rea- ções de PCR para seleção de K.O. de PrP foram realizadas com controles positivos e negativos. O modelo para o controle positivo foi 200 ng de DNA genômico de uma mistura de população de célula na qual um alelo de PrP direcionado tinha sido previamente detectado com o método de seleção por PCR de K.O. de PrP; o controle negativo usado foi água ao invés de DNA genômico como um modelo. O aparecimento de um produto de PCR de 2,2 kb sobre o gel de agarose após eletroforese indica que a colônia de célula correspondente traz pelo menos um alelo de célula de PrP direcionado. Com esse método, os clones selecionados através de CIonePixFL foram analisa- dos e os resultados são mostrados na figura 6.
2. Análise de Southern genômica (figura 7):
Clones de célula 293F com PrP direcionado identificados através de PCR genômica, conforme descrito acima, foram ainda geneticamente ca- racterizados através de análise de Southern blot. Após separação eletroforé- 25 tica de DNA genômico digerido com EcoRI e transferência capilar para membranas Hybond+, as blots foram radioativamente hibridizadas com son- das de DNA especificamente criadas (representadas como setas vermelhas na figura 5) de forma a verificar a integração correta e intacta da ORF de neo. Sondas 5’- e 3’- são homólogas às regiões externas 5’- e 3’- do sítio de 30 integração esperado. A Neo-sonda é usada para verificar se o construto de K.O. está integrado no Iocus alvo ou apenas aleatoriamente. As sondas 5’- e 3’- foram geradas através de amplificação por PCR usando o clone 186 de DNA de BAC descrito na seção B.2 desse exemplo. A sonda Neo foi amplifi- cada a partir do plasmídeo pcDNA3.1(+), o qual inclui um cassete de neomi- cina, resumido na tabela a seguir: _
Nome Comprimento Seqüência dos iniciadors de PCR Padrão de Sou¬ da son¬ da sonda de para sondas de DNA thern esperado da DNA para células com PrP dire¬ cionado sobre um alelo 5’-sonda 251 bp 5-K.O.-F1 (SEQ ID N0 12): 4,2 kbe 10,8 kb 1 5'-AGCTTTACCGTCCAGTCTTC-3’ 5-K.O.-R1 (SEQ ID N0 13): 5’-GGTCTTGATGGCGATAACTC-3’ 5’-sonda 252 bp 5-K.O.-F2 (SEQ ID N0 14): 4,2 kbe 10,8 kb 2 5’- GAGTTATCGCCATCAAGACC-3’ 5 -K.O.-R2 (SEQ ID N°15): 5’- CATGAGAACCAACGCTAGAG-3’ New 3’- 288 bp Nova-3’-sonda-dianteira (SEQ ID N0 28): 6,5 kbe 10,8 kb sonda 5’- CTAGAGGTCCAGGTCATCTTG -3’ Nova-3’-sonda-reversa (SEQ ID N0 29): 5’- TCAGGGAAATTGGGGATCCTG-3’ Neo- 304 bp Neo-Sonda-F (SEQ ID N0 21): 6,5 kb sonda 5’-AGCGAGCACGT ACT CGGAT G-3’ Neo-sonda-R (SEQ ID N°22): 5’-AAGCACGAGGAAGCGGTCAG-3’ A estratégia de Southern genômica com o construto pBS_Neo-
5 _P-_L+R_Braço_2B é representada na figura 5. Após digestão genômica com EcoRI e hibridização radioativa, clones de PrP direcionados mostram uma banda de 4,2 kb com a sonda 5-DNA e uma banda de 6,5 kb com a sonda 3’-DNA, enquanto que a banda do tipo selvagem do alelo não direcio- nado, detectada com qualquer sonda, é de 10,8 kb. Com a Neo-sonda, uma 10 banda de DNA de 6,5 kb deverá ser detectada para o alelo direcionado de PrP e nenhuma banda deverá ser detectada para as células 293F do tipo selvagem.
Clones mostrando o padrão correto em PCR e Southern blot com todas as 3 sondas foram identificados como células com K.O. de PrP direcionado sobre um alelo. Esses clones positivos foram ainda analisados com FISH, ELISAe imunocoloração. 3. Análise de FISH (figura 8):
O gene de PrP humano está localizado sobre o cromossoma 20. Células 293F foram hibridizadas com uma sonda WCP (coloração de cro- mossoma inteiro) para coloração do cromossoma 20. Essa análise por FISH 5 mostra que 25% das células 293F do tipo selvagem têm 2 cópias do cro- mossoma 20, enquanto que 75% das células 293F trazem 3 cópias do cro- mossoma 20. Tecnicamente, é muito difícil e quase impossível realizar a inativação "knockout" de 3 genes de PrP usando as tecnologias atuais. Por- tanto, análise por FISH com a sonda de coloração chr20 WCP ajuda a dis- 10 tinguir se os clones de célula já trazendo um alelo de PrP direcionado têm dois ou três cromossomas 20. Adicionalmente, uma sonda de clone 186 de DNA de BAC, a qual abrange mais de 100 kb, incluindo o gene de PrP e é uma parte do cromossoma 20, também foi usada para hibridização de FISH para detecção de possíveis deleções e translocações de cromossoma.
Três padrões de FISH diferentes puderam ser observados para
linhagens de célula com K.O. de PrP após a integração direcionada do 1o construto de K.O. pBS_Neo_P-_R+L_braço_2B:
a. Dois cromossomas/metáfase foram corados com a sonda cromossoma 20 e ambos mostraram o sinal de BAC (figura 8a).
b. Três cromossomas/metáfase foram corados e todos três mos-
travam o sinal de BAC (figura 8b).
c. Três cromossomas/metáfase foram corados (um cromossoma apenas parcialmente em virtude de uma translocação de um braço do cro- mossoma 20 para outro cromossoma) e apenas os dois cromossomas 20 completos mostraram o sinal de BAC (figura 8c).
A análise estatística para várias linhagens de célula com K.O. de PrP é re- sumida na tabela a seguir:
Linhagem 2 x chr. 20 3 x chr20 3 x chr. 20 outros N0 total de de célula 2xBAC 3 x BAC 2 x Bac células a- (padrão a) (padrão b) (padrão c) nalisadas K.O. 1 4 (12%) 1 (3%) 29 (85%) --- 34 K.O. 2 --- 22 (69%) 10(31%) --- 32 Continuação...
K.O. 3 2 (5%) 35 (87%) ~ 3 (8%) 40 K.O. 4 11 (27,5%) 28 (70%) --- 1 40 (2,5%) K.O. 5 --- 4(15%) 21 (78%) 2(7%) 27 K.O. 6 --- 1 (4%) 23 (96%) --- 24 Células com K.O. com dois sinais de BAC foram tomadas para
"knockout" do segundo gene de PrP, a despeito da existência de duas ou três cópias de chr20 por célula. Portanto, as duas linhagens de célula com K.O. a seguir foram escolhidas:
K.O. 1: essa linhagem de célula tinha uma população com duas cópias do cromossoma 20 corados e ambos com o sinal de BAC através de FISH (12% das células detectadas). Uma população maior (85%) mostrou três cópias do cromossoma 20 coradas. Um desses cromossomas foi ape- 10 nas parcialmente corado e translocado para outro cromossoma. Apenas os dois cromossomas 20 completamente corados mostraram o sinal do BAC através de FISH.
K.O. 6: 96% das células tinham três sinais de cromossoma 20 e 2 sinais de BAC.
K.O. 1 e K.O. 6 foram ainda analisadas através de ELISA para
determinar se seus níveis de proteína de PrP eram cerca de metade das células 203F do tipo selvagem.
4. Teste ELISA (figura 9)
ELISA foi realizado para quantificar a concentração de proteína 20 de PrP em células com K.O. de PrP comparado com células 203F do tipo selvagem. As linhagens de célula K.O. 1 e K.O. 6 trazendo um alelo com K.O. de PrP expressavam consistentemente apenas metade da proteína de PrP comparado com células 293F do tipo selvagem (figura 9). Esses dados sustentam adicionalmente e verificam adicionalmente a conclusão após aná- 25 Iise por FISH. Exemplo 2: Descrição detalhada para o segundo ciclo de "knockout" com um construto de K.O. de PrP contendo zeocina
A estratégia de direcionamento é a mesma conforme descrito no Exemplo 1, exceto que o antibiótico é diferente. Isto é, zeocina ao invés de neomicina é incluída no segundo construto de K.O. de PrP e, portanto, sele- ção de clones resistentes a antibiótico é realizada com zeocina ao invés de G418.
A. Clonagem do 2° construto de K.O. de PrP contendo cassete de zeocina:
A ORF de neomicina no primeiro construto de K.O. de PrP1 pBS_Neo_P-_L+R_Braço_2B, foi substituída pela ORF de zeocina sem seu próprio promotor e o códon de início de tradução ATG. O cassete de zeocina foi amplificado através de PCR sem seu próprio ATG a partir do plasmídeo pcDNA3.1-Zeo(+) com os seguintes iniciadors de PCR:
Zeo-F: 5’-
GGCAAGAATTCGCAGAGCAGTCATTATGGCCAAGTTGACCAGTGCCGTT CC-3’ (SEQ ID N0 27)
Zeo-R: 5’-GGACCGCTCGAGTCAGTCCTGCTCCTCGGCCAC-3’ (SEQ ID N0 18)
O produto de PCR resultante tem 412 bp de comprimento.
O plasmídeo pBS_Neo_P-_R+L_Braço_2B foi digerido com E-
coRI e Xhol e ligado com o cassete de Zeocina PCR-amplificado, o qual con- tém, sobre suas extremidades, sítios de restrição EcoRI e Xhol. O plasmídeo gerado a partir dessa ligação foi denominado pBS_Zeo_P-_R+L_Braço (Fig. 10) (SEQ ID NO. 16) e usado para direcionamento do segundo alelo de PrP. 25 Esse segundo construto de K.O. de PrP, pBS_Zeo_P-_R+L_Braço, foi Iinea- rizado com BamHI para transfecção, conforme descrito em B.4.
B. Introdução do segundo construto de K.O. de PrP, pBS Zeo P R+L Braco em células com K.O. de PrP com um alelo do gene de PrP:
O segundo construto de K.O. de PrP, pBS_Zeo_P_R+L-Braço, foi introduzido em células alvo identificadas com um alelo de PrP direcionado usando reagente Lipofectamin 2000 CD (veja método de transfecção, página 19). 48 h após transfecção, as células foram colocadas sobre discos de 10 cm ou ainda cultivadas em suspensão em frascos de agitação de 125 ml em uma densidade entre 1,25 e 1,5 x 106 células/ml. Para seleção com antibióti- co, G418 e zeocina foram adicionados à cultura nas seguintes concentra- ções: G418, 0-30 pg/ml e zeocina, 0-30 pg/ml. Troca de meio foi realizada a cada dois/três dias durante 14-30 dias.
C. Seleção de clones zeocina-direcionados:
Quando as células atingiram a confluência sob seleção com an- tibiótico, DNA genômico foi preparado exatamente conforme descrito para a seleção do primeiro K.O. (página 25,D).
A estratégia de PCR foi similar àquela do Exemplo 1D, exceto
que o iniciador reverso para PCR foi criado para ser homólogo à ORF de zeocina.
Uma mistura de PCR foi preparada, contendo 20-300 ng de DNA genômico, 1x tampão de PCR, cada iniciador de oligonucleotídeo a 200 nM, MgCI2 a 1,25 mM, dNTP a 200 nM e 1,33 unidades de Expand Fidelity Poly- merase (Roche). A seqüência dos oligonucleotídeos sintéticos usados para seleção eram como segue:
Zeo-K.O.-F2: 5' CTCCTCTTCCTCCCATCTTACC 3' (SEQ ID NO. 19) Zeo-K.O.-R2: 5' CGAAGTCGTCCTCCACGAAGTC 3' (SEQ ID NO. 20)
Os parâmetros de ciclo foram como segue: 94°C 4 min; [94°C,
15 s; 63°C, 30 s; 72°C 100 s] x16 ciclos; [94°C, 15 s; 63°C, 30 s; 72°C 100 s + 3 s a mais em cada ciclo sucessivo] x24 ciclos; 72 0C 7 min. Amostras de DNA genômico que proporcionam um produto de PCR de 2,3 kb indicam a presença de um ou vários alelos direcionados na população de célula.
D. Caracterização de clones direcionados com dois alelos de PrP direciona- dos:
1. Seleção por PCR genômica (figura 11): para identificar se as células ou população misturada de célula traz dois alelos de PrP direciona- dos, duas seleções por PCR independentes deverão ser realizadas. O par 30 de iniciador de PCR Zeo-K.O.-F2 e Zeo-K.O.-R2 foi usado para provar a in- tegração direcionada do segundo construto de K.O. de PrP (pBS_Zeo_P- _R+L_Braço), enquanto que o par de iniciador K.O.-F1 e K.O.-F2 prova a integração direcionada do primeiro construto de K.O. de PrP (pBS_Neo_P- _R+L_Braço_2B).
DNA genômico foi isolado de populações de célula mista ou co- lônias de célula isoladas conforme descrito em C acima. Todas as reações 5 de PCR de seleção de K.O. de PrP foram realizadas com controles positivos e negativos. O modelo para o controle positivo foi 200 ng de DNA genômico de uma população de célula mista na qual um alelo de PrP direcionado tinha sido previamente detectado com o método de seleção por PRC de K.O. de PrP a princípio com o par de iniciador Zeo-K.O.-F2 e Zeo-K.O.-R2; o controle 10 negativo usado foi água ao invés de DNA genômico como um modelo. O aparecimento de um produto de PCR de 2,3 kb sobre o gel de agarose após eletroforese indica que a colônia de célula correspondente traz células tra- zendo um cassete de zeocina ao invés do gene de PrP como o resultado do segundo ciclo de K.O. Os resultados são mostrados na figura 11. Clones 15 identificados como positivos através de PCR com os iniciadors Zeo-K.O.-F2 e Zeo-K.O.-R2 foram ainda analisados através de PCR com K.O.-F1 e K.O.- R1 de forma a determinar se a integração alvo do primeiro construto de K.O. ainda está presente ou se foi substituído pelo segundo construto de K.O. (figura 11).
No caso em que ambas as PCR são positivas, esse clone será
ainda analisado com análise de Southern blot.
2. A estratégia de seleção por Southern blot (figura 12) foi similar àquela descrita no Exemplo 1.
A estratégia de Southern genômica com o construto pBSZeo- 25 _P-_L+R_Braço é representada na figura 11. Após digestão genômica com EcoRI e hibridização radioativa, os clones de PrP direcionados mostraram uma banda de 4,2 kb com a sonda 5’-DNA e uma banda de 5,7 kb com a sonda 3’-DNA, enquanto que a banda do tipo selvagem de alelos não dire- cionados, detectada com qualquer sonda, é de 10,8 kb. Com a Zeo-sonda, 30 uma banda de DNA de 5,7 kb deverá ser detectada para o alelo alvo de PrP e nenhuma banda pode ser detectada para células 293F do tipo selvagem.
A diferença do padrão de Southern para a integração direciona- da de ambos os construtos de K.O. pôde ser detectada apenas com a 3’- sonda e Zeo- ou Neo-sonda.
• Com a 3'-sonda: com o primeiro construto de K.O., uma banda de 6,5 kb deverá ser detectada, enquanto que, com o segundo construto de
K.O., uma banda de 5,7 kb deverá ser adicionalmente mostrada. Em ambos os casos, a banda WT é de 10,8 kb.
• Com a Neo-sonda: uma banda de 6,5 kb deverá ser detectada quando de integração do primeiro construto de K.O.
• Com a Zeo-sonda: nenhum sinal deverá ser detectado para a integração direcionada do primeiro construto de K.O., enquanto que, para o
segundo construto de K.O., uma banda de 5,7 kb deverá ser ressaltada.
• Sondas de DNA para análise de Southern e seu padrão esperado são re- sumidas na tabela a seguir:___
Nome Comprimento Seqüência de iniciadors de PCR Padrão Padrão de da da sonda de para sondas de DNA de Sou¬ Southern Sonda DNA thern esperado esperado para células para cé¬ com PrP lulas com direcionado PrP dire¬ sobre am¬ cionado bos os ale¬ sobre um los alelo 5’- 251 bp 5’-K.O.-F1 (SEQ ID N0 12): 4,2 kb e 4,2 kb e sonda 5’-AGCTTTACCGTCCAGTCTTC-3’ 10,8 kb 10,8 kb 1 5’-K.0.-R1 (SEQ ID N0 13): 5'-GGTCTTGATGGCGATAACTC-3’ 5’- 252 bp 5’-K.O.-F2(SEQ ID N0 14): 4,2 kb e 4,2 kb e sonda 5’- GAGTTATCGCCATCAAGACC-3’ 10,8 kb 10,8 kb 2 5-K.O.-R2 (SEQ ID N0 15): 5’- CATGAGAACCAACGCTAGAG- 3’ New 3’- 288 bp Nova-3’-sonda-dianteira (SEQ ID N0 6,5 kb e 5,7 kb, 6,5 sonda 28): 10,8kb kb e 10,8 5’- CTAGAGGTCCAGGTCATCTTG kb -3’ Nova-3’-sonda-reversa (SEQ ID N0 29): 5’- TCAGGGAAATTGGG- GATCCTG-3’ Continuação...
Neo- 304 bp Neo-Sonda-F (SEQ ID N0 21): 6,5 kb 6,5 kb sonda 5’-AGCGAGCACGTACTCGGATG- 3’ Neo-sonda-R (SEQ ID N0 22): 5’-AAGCACGAGGAAGCGGT CAG- 3’ Zeo- 376bp Zeo-Sonda-F (SEQ ID N0 23) Sem 5,7 kb sonda 5- banda AT GGCCAAGTT GACCAGTGCCG- 3’ Zeo-Sonda-R (SEQ ID N0 24) 5’- GT CAGT CCTGCTCCTCGGC- CAC:-3' 3. Análise por FISH: foi observado, para células 203F do tipo selvagem adaptadas isentas de soro particulares, que o número de cópias do cromossoma 20 aumentou com o tempo de cultura. É importante notar
que as células com K.O. trazendo dois alelos direcionados de PrP ainda con- têm um terceiro cromossoma 20 intacto com um Iocus de PrP do tipo selva- gem. Portanto, as células com K.O. identificadas trazendo dois alelos de PrP direcionados ainda deverão ser hibridizadas com a sonda BAC 186 e a son- da corante chr20 WCP. Para uma linhagem de célula com K.O. de PrP com- 10 pleta, não mais do que 2 sinais de BAC deverão ser observados.
4. Ensaio ELISA: realizado conforme descrito no método 9. Ne- nhuma proteína de PrP deverá ser detectada em células pf293F.
5. Imunocoloração: nenhum sinal com coloração de anticorpo sobre a superfície da célula no caso de células pf293F.
Exemplo 3: Transfecção isenta de soro da linhagem de célula 293F i- senta de príon pf293F para a geração de proteínas recombinantes isen- tas de príon
3.1 Transfecção das células pf293F com um alelo objetivo a PrP
Os clones com K.O. de PrP com um alelo direcionado de PrP foram transfectados com os vetores pcDNA3.1-FVIII (SEQ ID NO. 26), pcD- NA3.1-FIX (SEQ ID NO. 17) e pcDNA3.1-hyg(+)-G-CSFb (SEQ ID NO. 25) para expressar as proteínas FVIII, FIX e G-CSFb humanas.
Na figura 13, foi mostrado que a eficiência de transfecção quan- do de deleção do primeiro alelo de PrP é comparável com células 293F do tipo selvagem (Fig. 10). Expressão de unidades ativas de FVIII, FIX e G- CSFb por células 10E6 é comparável a células 293F do tipo selvagem (Fig. 14). Isso indica "knockout" do gene de PrP não influencia a capacidade de 5 transfecção das células nem diminui a quantidade de proteína recombinante produzida.
3.2 Transfecção isenta de soro e produção de proteínas recombinantes hu- manas em linhagens de célula 293F isentas de príon completas
A ablação com sucesso da ORF de príon resultou na geração da 10 nova linhagem de célula p293F, a qual é capaz de produzir produtos tera- pêuticos completamente isentos de príon. De forma a prevenir contaminação da nova linhagem de célula com prions resultantes, por exemplo, de subs- tâncias do meio, o procedimento todo (incluindo transfecção estável, cultura de célula e fermentação) foi realizado sob condições isentas de soro (veja 15 PCT/EP2006063705) e utilizando a abordagem CIonePixFL.
Em particular, o vetor pTG36, conforme divulgado no W001/70968 e pcDNA3.1-FIX, um fragmento de 1,4 kb contendo a rede de leitura aberta do fator de coagulação humana IX foi cortado através de di- gestão dupla com Hindlll e Notl. Esse fragmento foi ligado ao fragmento de 20 5,6 kb do vetor duplamente digerido com Hindlll e Notl pcDNA3.1Hygro(+)- zz (derivado de V870-20, Invitrogen) resultando no vetor pcDNA3.1-FIX, mostrado em SEQ ID NO. 17. 28 ml de cultura em suspensão foram prepa- rados com uma densidade de célula de 106 células pf293F viáveis. Um com- plexo de lipídio-DNA foi preparado através de diluição de 30 pg de DNA de 25 plasmídeo em Opti-MEM® I (Invitrogen) até um volume total de 1 ml e 40 μΙ de 293fectin® foram diluídos em Opti-MEM® I até um volume total de 1 ml. Após a incubação de 5 min em temperatura ambiente, DNA diluído foi adi- cionado a 293fectin® para obter um volume total de 2 ml. As amostras trans- fectadas foram incubadas durante 20 min em temperatura ambiente no escu- 30 ro. 2 ml da mistura de transfecção foram adicionados a 28 ml da cultura em suspensão de pf293F (densidade de célula final é de 1 x 106 células/ml). As células pf293F transfectadas foram incubadas a 37 °C/atmosfera umidificada de 8% de CO2 em ar sobre um agitador orbital girando a 125 rpm durante 72 h.
As células p293F transfectadas conforme descrito acima foram cultivadas em meio baseado em metilcelulose semissólido contendo um an- tibiótico apropriado, para seleção de clones e um anticorpo rotulado para detecção dos maiores clones produtores via fluorescência. Grandes núme- ros (milhares) de clones foram analisados usando CIonePixFL (Genetix) com relação ao número de célula e secreção da proteína FIX alvo de forma a, subsequentemente, selecionar apenas uns poucos clones melhor produtores de FIX. Em contraste a outros métodos conhecidos, onde clones não produ- tos e clones misturados são aleatoriamente selecionados também, o uso de CIonePixFL permite seleção de clones que crescimento rápido, os quais são altos produtores apenas, originários de células únicas. As células seleciona- das são expandidas em lâminas de microtitulação em tubos para centrífuga, frascos de cultura de célula e fermentadores sob condições isentas de soro para o procedimento completo.
Clones de produção de FIX identificados através do método descrito acima foram cultivados em meio de expressão FreeStyIe 293 isento de soro. As proteínas-alvo foram isoladas e purificadas de acordo com pro- 20 cedimentos padrões. Adicionalmente, para a produção de produtos terapêu- ticos seguros, as células Pf293F otimizadas também foram usadas para pro- dução isenta de soro de FVIII humana recombinante e G-CSF com o vetor de expressão pcDNA3.1-hyg(+)-G-CSFb (SEQ ID N0 25) e pcDNA3.1-FVIII (SEQ ID N0 26).
Listagem de Seqüência:
SEQ ID NO. 1: vetor de K.O. pBS_Neo_P-_R+L_Braço_2B Molécula: DNA de 10623 bps, circular
Tipo Início Final Nome/Descrição GENE 673 2580 Braço esquerdo de PrP GENE 2608 3807 Neo GENE 3817 8411 Braço direito de PrP GENE 9637 10494 AmpR SEQ ID Nos 2 e 3: braços esquerdo e direito de PrP SEQ ID Nos 4-15: iniciador
SEQ ID NO. 16: vetor de K.O. pBS_Zeo_P-_R+L_Braço Molécula: DNA de 9790 bps, circular
Tipo Início Final Nome/Descrição GENE 673 2581 Braço esquerdo de PrP GENE 2605 2976 Zeo GENE 2983 7583 Braço direito de PrP GENE 8805 9662 AmpR SEQ ID NO. 17: dcDNA3.1-FIX. Molécula : DNA de 6960 bps, circular Tipo Início Final Nome/Descrição REGIÃO 209 863 Promotor de CMV REGIÃO 895 'MCS GENE 939 2324 HFIX GENE 2328 2339 SV407SV40 poliA + íntron REGIÃO 2340 2370 'MCS REGIÃO 2381 2595 BGH pA REGIÃO 2658 3071 Origem f1 REGIÃO 3136 3460 Promotor SV40 GENE 3478 4501 HygR REGIÃO 4514 4886 SV40 pA REGIÃO 5819 5146 Origem C PUC GENE 6824 5964 C AmpR (fita complementar) SEQ ID Nos 18-24: iniciador
SEQ ID NO. 25: pcDNA3.1-hyg(+)-G-CSFb
Molécula: DNA circular de 6237 bps
209 863 Promotor de CMV Região 970 1584 GCSFb Gene 1658 1872 BGH pA Região 1935 2348 Origem f1 Região 2413 2737 Promotor SV40 Região 2755 3778 HygR 3791 4163 SV40 pA 5096 4423 Origem pUC 6101 5241 AmpR SEQ ID NO. 26: pcDNA3.1-FVIII Molécula: DNA circular de 9975 bps
1 655 Promotor de CMV 783 3082 h FVIII
783 839 Domínios A1 e A2 de FVIII humano Peptídeo sinalizador 840 1826 A1
Domínio A1 de hFVIII 1977 2972 A2
Domínio A2 de hFVIII 3084 3107 dobradiça 3105 5162 hFVIII
Domínios A3, C1, C2 de fator FVIII humano 3243 4226 A3
Domínio A3 de hFVIII 4227 4670 C1
Domínio C3 de hFVIII 4683 5141 C2
Domínio C2 de hFVIII 5188 5402 BGHpA 5465 5878 Origem f1 5943 6267 Promotor SV40 6285 7308 HygR 7321 7693 SV40 pA 8626 7953 Origem pUC 9631 8771 AmpR SEQ ID Nos 27-29: iniciador
Gene
Região
Região
Gene
Região
Gene
Região
Região
Região
Região
Gene
Região
Região
Região
Região
Região
Região
Gene
Região
Região
Gene *t Zf Listagem de Seqüência
<110> Octapharma AG
<12 0> "ABLAÇÃO GENÉTICA DE CÉLULAS COM GENE PRP USANDO UMA ESTRATÉGIA DE CAPTURA DE PROMOTOR DIRECIONADA PARA A PRODUÇÃO DE PROTEÍNAS RECOMBINANTES
<130> 072819WC)
<160> 29
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 10622
<212> DNA
<213> Artificial <22 0>
<223> Vetor DE KO pBS_NE0_P-_R+L_Arm_2B
<400> 1
ctaaattgta agcgttaata ttttgttaaa attcgcgtta aatttttgtt aaatcagctc 60
attttttaac caataggccg aaatcggcaa aatcccttat aaatcaaaag aatagaccga 120
gatagggttg agtgttgttc cagtttggaa caagagtcca ctattaaaga acgtggactc 180
caacgtcaaa gggcgaaaaa ccgtctatca gggcgatggc ccactacgtg aaccatcacc 240
ctaatcaagt tttttggggt cgaggtgccg taaagcacta aatcggaacc ctaaagggag 300
cccccgattt agagcttgac ggggaaagcc ggcgaacgtg gcgagaaagg aagggaagaa 360
agcgaaagga gcgggcgcta gggcgctggc aagtgtagcg gtcacgctgc gcgtaaccac 420
cacacccgcc gcgcttaatg cgccgctaca gggcgcgtcc cattcgccat tcaggctgcg 480
caactgttgg gaagggcgat cggtgcgggc ctcttcgcta ttacgccagc tggcgaaagg 540
gggatgtgct gcaaggcgat taagttgggt aacgccaggg ttttcccagt cacgacgttg 600
taaaacgacg gccagtgagc gcgcgtaata cgactcacta tagggcgaat tggagctcca 660
ccgcggtggc ggccgcctct gtctaggaac actgctgtga acaaaaccaa actcccgccc 720
taaaggagcc tgcactcccg tggagaacat gaataataag cacagaggaa ataacataat 780
atctcaagta gctgtaactg ctccagagaa taatgaagcc aggaaagggg gtgggctagg 840
gggtgctgtt ttaggtagag tgatgggaac agccccactg agcaaacttt agccacatga 900
gtagctggaa gaaaagcctt ctaggaccag ggaacagcaa gtgcaacagc cctgagacag 960
gatgggcttg tcagtttgag gagcagtggg aggcctgaac caggttacat ggggcccagc 1020 cagtatggcc acgactttgt gttttatcca gagtacaaag gagcctcact gagggacaag 1080 ggaagtggca tgatgtgacc cgcatattaa gaggagagcg ctcaatggca gccaggggag 1140 gagcagggag gctggttggg aggctgttga agaaatcagg tgagaagtga tggaagcacc 1200 gaataagatg gtcatgttgg aaaaattgag aagctgaggt gcttagcatt gattttcaag 1260 gtagagctac tgagatttgc tgatagatcc aatgtatgct gggagagaaa attcagtcac 1320 tctagagcat tggctggatt tgtcacccat tgcagcgaat ggagaaggtg ctgacataaa 1380 agccctttag actgaaagct actgactgag gggatggtgc cctagtttga tttcctgggg 1440 tgtatgagta gcagggaggc caagagctgg gcctcacgag attgtgggga ctacatcagg 1500 gaagcaggcc tgcaaagaac ctgcaccaca gacccccacc taaaagagcc tccaaaaacc 1560 ctaactggca tgacctgagt actttaactc tgcttgtaac tttcaaatat attttgattt 1620 gcttatgacc accaaggcaa aacttcccat ttcaataatg ttagtagaaa cataaacagg 1680 atgttaattt atttatttgg taattctttt tatgaatatt atccagttta atcattagct 1740 ctgaaggaga tgaaaaataa ttttctaatt tttagaaaaa tttgcagcta attgggtgat 1800 aaaggtaagg ggtttctgag ttcacaaaaa tgttctaaaa ttggcaacag tttcggttgc 1860 acgtttcatt aaatgtacta aaaaccattg aactgtacat ggtatatggt gaattatatg 1920 gtatgtgaat tatatctcaa caagctgggt attgtttttt taaaaaataa aaataaaaaa 1980 ggagaaagag agagagaaaa acaattgcag atcatcccag cactgaggac aagactaact 2040 tcagtgttcc agtatatgcc attataggtt ttacggcaca cagtgatgat ttggagccta 2100 tgatttgacc tagggtacag caggtactgt ttagcaatca ttttactatt gtcataggtc 2160 tctgctcttg gagctaagtg cccagggtaa atgagatctt taatttgaaa agagattttt 2220 gatttgatga atgtacattc tccaaagggt cataaattgt cattctggat gtttgatctg 2280 tttgttgttt tggtacaaaa attagaagaa aataattcac tcataaaatg ttaaataatg 2340 aactaaaagt cattcatcaa gtccataact tagggtcaca tttgtccttg gagcaggaga 2400 aagagttgtg ttcacccttt tcttactttt gcttttgtcc taagtgcttc agagaagtac 2460 agggtggcaa cagtgtttct actgagcagc tgataccatt gctatgcact cattcattat 2520 gcaggaaaca tttagtaatt tcaacataaa tatgggactc tgacgttctc ctcttcattt 2580 tgaattcgca gagcagtcat tatgattgaa caagatggat tgcacgcagg ttctccggcc 2640 gcttgggtgg agaggctatt cggctatgac tgggcacaac agacaatcgg ctgctctgat 2700 gccgccgtgt tccggctgtc agcgcagggg cgcccggttc tttttgtcaa gaccgacctg 2760 tccggtgccc tgaatgaact gcaggacgag gcagcgcggc tatcgtggct ggccacgacg 2820 ggcgttcctt gcgcagctgt gctcgacgtt gtcactgaag cgggaaggga ctggctgcta 2880 ttgggcgaag tgccggggca ggatctcctg tcatctcacc ttgctcctgc cgagaaagta 2940 tccatcatgg ctgatgcaat gcggcggctg catacgcttg atccggctac ctgcccattc 3000 gaccaccaag cgaaacatcg catcgagcga gcacgtactc ggatggaagc cggtcttgtc 3060 gatcaggatg atctggacga agagcatcag gggctcgcgc cagccgaact gttcgccagg 3120 ctcaaggcgc gcatgcccga cggcgaggat ctcgtcgtga cccatggcga tgcctgcttg 3180 ccgaatatca tggtggaaaa tggccgcttt tctggattca tcgactgtgg ccggctgggt 3240 gtggcggacc gctatcagga catagcgttg gctacccgtg atattgctga agagcttggc 3300 ggcgaatggg ctgaccgctt cctcgtgctt tacggtatcg ccgctcccga ttcgcagcgc 3360 atcgccttct atcgccttct tgacgagttc ttctgagcgg gactctgggg ttcgaaatga 3420 ccgaccaagc gacgcccaac ctgccatcac gagatttcga ttccaccgcc gccttctatg 3480 aaaggttggg cttcggaatc gttttccggg acgccggctg gatgatcctc cagcgcgggg 3540 atctcatgct ggagttcttc gcccacccca acttgtttat tgcagcttat aatggttaca 3600 aataaagcaa tagcatcaca aatttcacaa ataaagcatt tttttcactg cattctagtt 3660 gtggtttgtc caaactcatc aatgtatctt atcatgtctg tataccgtcg acctctagct 3720 agagcttggc gtaatcatgg tcatagctgt ttcctgtgtg aaattgttat ccgctcacaa 3780 ttccacacaa catacgagcc ggaagcatct cgagtgtgta ccgagaactg gggtgatgtt 3840 ttacttttca cagtatgggc tacacagcag ctgttcaaca agagtaaata ttgtcacaac 3900 actgaacctc tggctagagg acatattcac agtgaacata actgtaacat atatgaaagg 3960 cttctgggac ttgaaatcaa atgtttggga atggtgccct tggaggcaac ctcccatttt 4020 agatgtttaa aggaccctat atgtggcatt cctttcttta aactataggt aattaaggca 4080 gctgaaaagt aaattgcctt ctagacactg aaggcaaatc tcctttgtcc atttacctgg 4140 aaaccagaat gattttgaca tacaggagag ctgcagttgt gaaagcacca tcatcataga 4200 ggatgatgta attaaaaaat ggtcagtgtg caaagaaaag aactgcttgc atttctttat 4260 ttctgtctca taattgtcaa aaaccagaat taggtcaagt tcatagtttc tgtaattggc 4320 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Claims (17)

1. Linhagem de célula humana somática, imortalizada, isenta de proteína de príon (PrP) em que ambos os alelos do gene de PrP foram com- pletamente deletados.
2. Linhagem de célula de acordo com a reivindicação 1, a qual: (i) é capaz de ser transfectada e ser cultivada sob condições i- sentas de soro; e/ou (ii) tem seqüências adenovirais integradas em seu genoma; e/ou (Hi) é derivada de uma célula inicial selecionada do grupo consis- tindo em células de rim, bexiga, fígado, pulmão, músculo cardíaco, músculo liso, ovário e gastrintestinais, de preferência a célula inicial é uma linhagem de célula de rim humano; e/ou (iv) é adequada para a produção de proteínas recombinantes.
3. Linhagem de célula de acordo com a reivindicação 2, em que as células de rim são células de rim fetal humano, de preferência as células de rim fetal humano são selecionada de células 293 (ATCC CRL-1573; DSM ACC 305), células FreeStyIe 293 (células 293F; Invitrogen R79007) e células 293T (DSM ACC 2494), de preferência são células 293F (Invitrogen R79007).
4. Linhagem de célula de acordo com qualquer uma das reivindi- cações 1 a 3 em que os alelos do gene de PrP foram completamente deleta- dos através de recombinação homóloga com "knockout traps" trazendo ge- nes de marcador selecionável ou de seleção, de modo que expressão do marcador selecionável ou de seleção é acionada pelo promotor de PrP en- dógeno.
5. Linhagem de célula de acordo com qualquer uma das reivindi- cações 1 a 5, incluindo, mas não limitado a, linhagem de célula 293F isenta de príon final pf293F e todas as populações mistas intermediárias e clones isolados necessários para isolar a mesma.
6. Método para produção da linhagem de célula humana somáti- ca imortalizada, isenta de príon como definida em qualquer uma das reivin- dicações 1 a 5, método o qual compreende subsequente deleção da ORF de PrP na respectiva célula inicial através de recombinação homóloga com vá- rios construtos de "knockout" de PrP ou com o mesmo construto e realização de seleção com antibiótico em concentrações progressivamente crescentes.
7. Método de acordo com a reivindicação 6, em que os constru- tos de "knockout" trazem os mesmos ou diferentes genes marcadores de seleção sem promotor ou marcadores selecionáveis flanqueados por duas seqüências homólogas ao sítio de inserção dentro do gene de PrP da célula inicial.
8. Método de acordo com a reivindicação 7, em que os constru- tos de "knockout": (i) trazem diferentes genes marcadores de seleção; e/ou (ii) ainda trazem uma das seguintes seqüências funcionais: uma seqüência poliA, seqüências de reconhecimento de recombinase, IRES; e/ou (iii) as seqüências homólogas têm um comprimento de 1 a 10 kb, de preferência cerca de 6 kb e/ou correspondem à seqüências a montante e a jusante da ORF de PrP da linhagem de célula inicial, mais preferivelmente as seqüências homólogas são aquelas mostradas em SEQ ID NOs: 2 e 3; e/ou (iv) os marcadores de seleção codificam marcadores de seleção positivos incluindo, mas não limitado a, neomicina, zeocina, higromicina; e o marcador selecionável inclui marcadores de fluorescência, tais como GFP e Dsred e enzimas, tal como LacZ.
9. Método de acordo com a reivindicação 8, em que os constru- tos de "knockout" têm uma ou mais das seqüências mostradas em SEQ ID NOs: 1 e 16.
10. Construto de "knockout" de PrP como definido em qualquer uma das reivindicações 6 a 9.
11. Uso da linhagem de célula humana imortalizada isenta de PrP como definida em qualquer uma das reivindicações 1 a 5, para a produ- ção recombinante isenta de PrP de uma proteína humana ou anticorpo ou um derivado ou mutante do mesmo (proteína-alvo).
12. Método para preparo de uma linhagem de célula humana para a produção recombinante isenta de PrP de uma proteína humana ou anticorpo ou um derivado ou mutante do mesmo (proteína-alvo) o qual com- preende transfecção de uma linhagem de célula hospedeira humana imorta- lizada isenta de PrP como definida em qualquer uma das reivindicações 1 a 5, com um vetor de transfecção compreendendo uma origem de replicação e um gene que codifica a referida proteína-alvo humana, pelo que o gene para a proteína-alvo humana é ligada, em sua extremidade 5', a um promotor e, em sua extremidade 3', com um sinal poliA.
13. Método de acordo com a reivindicação 12, em que: (i) a transfecção é realizada sob condições isentas de soro; e/ou (ii) o vetor de transfecção é derivado do vetor pcDNA3.1 da Invi- trogen; e/ou (iii) a proteína-alvo humana é um fator de coagulação sanguí- nea, tal como fator de coagulação sanguínea Vlll (incluindo fator Vlll do tipo selvagem ou um fator Vlll com domínio B deletado), fator de coagulação sanguínea IX, fator Vll/Vlla, um fator de crescimento humano tal como, por exemplo, G-CSF ou GM-CSF, vWF ou alfa-1-antitripsina (A1AT) ou um anti- corpo humano.
14. Linhagem de célula de produção humana imortalizada isenta de PrP estavelmente transfectada, de preferência sob condições isentas de soro, com o vetor de transfecção como definido na reivindicação 12 ou 13.
15. Método para a produção recombinante isenta de PrP de uma proteína-alvo humana a qual compreende cultura, de preferência sob condi- ções isentas de soro, da linhagem de célula de produção humana imortali- zada isenta de PrP de acordo com a reivindicação 14.
16. Linhagem de célula imortalizada isenta de proteína de príon (PrP) em que ambos os alelos do gene de PrP foram completamente deleta- dos, selecionada de células HEK 293F ou células Per.C6 (células de retina fetal humana imortalizadas), células CHO (células de Ovário de Hâmster Chinês) e células BHK (células de Rim de Hâmster Bebê).
17. Uso da linhagem de célula imortalizada isenta de PrP como definida na reivindicação 16 para a produção recombinante isenta de PrP de uma proteína humana ou anticorpo ou um derivado ou mutante do mesmo (proteína-alvo).
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU2011250912A1 (en) * 2010-05-12 2012-11-22 Janssen Biotech, Inc. Differentiation of human embryonic stem cells
CN102277379B (zh) * 2011-08-18 2013-07-24 中国科学院遗传与发育生物学研究所 表达凝血因子viii的表达载体及其应用

Family Cites Families (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5464764A (en) * 1989-08-22 1995-11-07 University Of Utah Research Foundation Positive-negative selection methods and vectors
WO1993010227A1 (en) * 1991-11-14 1993-05-27 Charles Weissmann Transgenic animals lacking prion proteins
AU767893B2 (en) * 1998-12-22 2003-11-27 Regents Of The University Of California, The Somatic cells with ablated Prp gene and methods of use
BR0109521A (pt) * 2000-03-24 2003-06-10 Univ Massachusetts Public Inst Ungulados transgênicos sem prìons
US7265262B2 (en) * 2001-03-21 2007-09-04 Roslin Institute (Edinburgh) Telomerizing nuclear donor cells and improving the efficiency on nuclear transfer

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