BRPI0719072A2 - Método para preparar um polipeptídeo, polipeptídeo, e, método para realizar uma reação catalisada por lipase - Google Patents

Método para preparar um polipeptídeo, polipeptídeo, e, método para realizar uma reação catalisada por lipase Download PDF

Info

Publication number
BRPI0719072A2
BRPI0719072A2 BRPI0719072-7A BRPI0719072A BRPI0719072A2 BR PI0719072 A2 BRPI0719072 A2 BR PI0719072A2 BR PI0719072 A BRPI0719072 A BR PI0719072A BR PI0719072 A2 BRPI0719072 A2 BR PI0719072A2
Authority
BR
Brazil
Prior art keywords
leu
ser
thr
asp
val
Prior art date
Application number
BRPI0719072-7A
Other languages
English (en)
Inventor
Leonardo De Maria
Jesper Brask
Michael Skjot
Shamkant Anant Patkar
Kim Borch
Allan Svendsen
Original Assignee
Novozymes As
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Novozymes As filed Critical Novozymes As
Publication of BRPI0719072A2 publication Critical patent/BRPI0719072A2/pt

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/16Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • C12N9/18Carboxylic ester hydrolases (3.1.1)
    • C12N9/20Triglyceride splitting, e.g. by means of lipase
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/40Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a carboxyl group including Peroxycarboxylic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/62Carboxylic acid esters
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/64Fats; Fatty oils; Ester-type waxes; Higher fatty acids, i.e. having at least seven carbon atoms in an unbroken chain bound to a carboxyl group; Oxidised oils or fats
    • C12P7/6409Fatty acids
    • C12P7/6418Fatty acids by hydrolysis of fatty acid esters
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y301/00Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
    • C12Y301/01Carboxylic ester hydrolases (3.1.1)
    • C12Y301/01003Triacylglycerol lipase (3.1.1.3)

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Oil, Petroleum & Natural Gas (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Description

I “MÉTODO PARA PREPARAR UM POLIPEPTÍDEO, POLIPEPTÍDEO, E, MÉTODO PARA REALIZAR UMA REAÇÃO CATALISADA POR LIP ASE”
CAMPO DA INVENÇÃO
A presente invenção refere-se a um polipeptídeo com atividade
de enzima lipolítica e a um método para prepará-lo.
FUNDAMENTOS DA INVENÇÃO
WQ8802775 descreve lipase B de Candida antarctica (CALB). Uppenberg, Hansen, Patkar, Jones, Structure 2, 293-308 (1994) 10 descrevem a seqüência de aminoácidos e a estrutura tridimensional (3D) de CALB. A estrutura 3D foi encontrada no Research Collaboratory for Structural Bioinformatics Protein Data Bank (RCBS PDB) (http://www.rcsb.org/), seu identificador sendo 1TCA.
Variantes de CALB são descritas em Zhang et al. Prot. Eng. 2003, 16, 599-605; Lutz. 2004, Tetrahedron: Asymmetry, 15, 2743-2748; Qian e Lutz, JACS, 2005, 127, 13466-13467; e em WO 2004/024954.
W09324619 descreve uma lipase de Hyphozyma sp. Seqüências de aminoácidos para outras lipases podem ser encontradas em UniProt [o Universal Protein Resource] com números de acesso Q4pepl, Q7RYD2, Q2UE03, Q4WG73, Q6BVP4 e Q4HUY1.
SUMÁRIO DA INVENÇÃO
Os inventores realizaram simulação de dinâmica molecular (MD) sobre a estrutura de 1TCA. A análise revela dois capuzes até agora desconhecidos com mobilidade notável, Capuz 1 consistindo dos resíduos de 25 135 ou 136 a 155 ou 160, e Capuz 2 consistindo dos resíduos 267-295. A simulação indicou uma forma semelhante a mais fechada em solução aquosa e uma forma mais totalmente aberta em solução em solvente orgânico. A análise revelou áreas importantes reveladas na estrutura 3D para afetar a atividade e a funcionalidade da lipase, e os inventores usaram isto para projetar variantes de enzima lipolítica com atividade específica aumentada, particularmente para substratos volumosos (e.g. ésteres de um ácido ramificado ou ácido graxo de cadeia longa e/ou um álcool secundário) e/ou atividade aumentada em pH alto (mais alto que pH ótimo) e/ou enanciosseletividade aumentada.
Ademais, os inventores têm selecionado resíduos de aminoácido e projetado variantes de enzima lipase baseado em um alinhamento de CALB com algumas seqüências de lipase homólogas.
Consequentemente, a invenção proporciona um método para preparar um polipeptídeo, compreendendo
a) selecionar um polipeptídeo originário que tem atividade de enzima lipolítica e tem uma seqüência de aminoácidos com pelo menos 30% de identidade com CALB (SEQ ID NO: 1),
b) selecionar um ou mais resíduos de aminoácido na seqüência correspondendo a qualquer um dos resíduos 1, 13, 25, 38-51, 53-55, 58, 69- 79, 91, 92, 96, 97, 99, 103, 104-110, 113, 132-168, 173, 187-193, 197-205, 215, 223-231, 242, 244, 256, 259, 261-298, 303, 305, 308-313, ou 315 de CALB (SEQ ID NO: 1),
c) alterar a seqüência de aminoácidos selecionada sendo que a alteração compreende substituição ou deleção do(s) resíduo(s) selecionado(s) ou inserção de pelo menos um resíduo adjacente ao(s) resíduo(s) selecionado(s),
d) preparar um polipeptídeo alterado tendo a seqüência de aminoácidos alterada,
e) determinar a atividade de enzima lipolítica ou a enanciosseletividade para ligações de éster carboxílico do polipeptídeo alterado, e
f) selecionar um polipeptídeo alterado que tem atividade de enzima lipolítica mais alta ou uma enanciosseletividade mais alta do que a do polipeptídeo originário. A invenção também proporciona um polipeptídeo que:
a) tem atividade de enzima lipolítica, e
b) tem uma seqüência de aminoácidos que tem pelo menos 80% de identidade (particularmente pelo menos 90% ou pelo menos 95% de identidade) com CALB (SEQ ID NO: 1) e tem uma diferença de CALB (SEQ ID NO: 1) que compreende uma substituição, deleção ou inserção de aminoácido em uma posição correspondendo a qualquer um dos resíduos
1,13, 25, 38-51, 53-55, 58, 69-79, 91, 92, 96, 97, 99, 103, 104-110, 113, 132- 168, 173, 187-193, 197-205, 215, 223-231, 242, 244, 256, 259, 261-298, 303, 305, 308-313, ou 315.
Finalmente, a invenção proporciona o uso do polipeptídeo variante acima em um processo catalisado por lipase.
BREVE DESCRIÇÃO DOS DESENHOS
Fig. 1 mostra um alinhamento de seqüências de aminoácidos de SEQ ID NOS. 1-7.
DESCRIÇÃO DETALHADA DA INVENÇÃO Polipeptídeo originário
O polipeptídeo originário tem atividade de enzima lipolítica e tem uma seqüência de aminoácidos com pelo menos 30% de identidade (particularmente pelo menos 40%, pelo menos 50%, pelo menos 60%, pelo menos 70%, pelo menos 80% ou pelo menos 90%) com lipase B de Candida antarctica (CALB, SEQ ID NO: 1) que é descrita em WQ8802775, e cuja seqüência é dada em Uppenberg, J., Hansen, M.T., Patkar, S., Jones, T.A., Structure v2 pp. 293-308, 1994. O polipeptídeo originário pode ser qualquer uma das seguintes lipases. Um alinhamento é mostrado em Fig. 1.
SEQ ID NO: 1: lipase B de Candida antarctica (CALB),
ITCA
SEQ ID NO: 2: Hyphozyma sp., W09324619 SEQ ID NO: 3: Ustilago maydis, UniProt Q4pepl SEQ ID NO: 4: Gibberella zeae (Fusarium graminearum), UniProt Q4HUY1
SEQ ID NO: 5: Debaryomyces hansenii, UniProt Q6BVP4 SEQID NO: 6: Aspergillus fumigatus, UniProt Q4WG73
SEQ ID NO: 7: Aspergillus oryzae, UniProt Q2UE03
SEQ ID NO: 8: lipase de Neurospora crassa, UniProt
Q7RYD2
O alinhamento foi feito usando o programa agulha do pacote 10 EMBOSS (http://www.emboss.org) versão 2.8.0 com os seguintes parâmetros: Penalidade de abertura de lacuna: 10,00, Penalidade de extensão de lacuna: 0,50, Matriz de substituição: EBLOSUM62. O programa de computador é descrito em EMBOSS: The European Molecular Biology Open Software Suite (2000), Rice,P. LongdenJ. e BleasbyA, Trends in Genetics 16, 15 (6) pp276-277. O programa agulha implementa o algoritmo de alinhamento global descrito em Needleman, S. B. e Wunsch, C. D. (1970) J. Mol. Biol. 48, 443-453, e Kruskal, J. B. (1983).
Outros polipeptídeos originários podem alinhar com as seqüências em Fig. 1 pelo mesmo método ou pelos métodos descritos em D. Sankoff e J. B. Kruskal, (ed.), "Time warps, string edits and macromolecules: the theory and practice of sequence comparison", pp. 1-44 Addison Wesley. Capuzes e estrutura tridimensional (3D)
Em ITCA de estrutura 3D, os inventores identificaram dois capuzes com mobilidade alta em resíduos de aminoácido de 135 ou 136 a 155 25 ou 160 (Capuz 1) e resíduos 267-295 (Capuz 2) de SEQ ID NO: I. A simulação MD indicou que as seguintes regiões são de interesse particular por causa de uma mobilidade particularmente alta: resíduos 141-149 em Capuz 1 e as seguintes regiões em Capuz 2: 267-269, 272, 275-276, 279-280, 282-283, 286-290. Seleção de resíduo de aminoácido
Um resíduo de aminoácido pode ser selecionado tendo um átomo de não-hidrogênio dentro de 0,8 nm de um átomo de não-hidrogênio em Capuz 1 ou Capuz 2 em uma estrutura 3D. Este critério seleciona os 5 seguintes resíduos na estrutura 1TCA: 38-51, 53-55, 58, 69-79, 104-110, 113, 132-168, 173, 187-193, 197-205, 223-231, 259, 261-298, 305, 308-313, 315 de SEQ ID NO: 1.
O resíduo pode ser particularmente selecionado dentro de 0,6 nm dos capuzes, levando aos seguintes resíduos em 1TCA: 40-42, 46-51, 54, 58, 70-77, 79, 104-107, 109, 133-165, 167, 173, 187-192, 197-203, 223-225, 228-229, 261-297, 308-312.
Um resíduo de aminoácido também pode ser selecionado pelo alinhamento de seqüências de enzima lipolítica homólogas e seleção de um resíduo em uma posição com variabilidade, i.e. uma posição onde seqüências 15 diferentes têm resíduos diferentes. Assim, os seguintes resíduos em CALB (SEQ ID NO: 1) podem ser selecionados por uma comparação com Hyphozyma lipase (SEQ ID NO: 2) baseado no alinhamento mostrado em Fig. 1:1,3, 5, 10, 12-15, 25, 30, 31, 32, 57, 62, 66, 76, 78, 80, 83, 88, 89, 91, 92, 96, 97, 114, 121, 123, 143, 147-149, 159, 163, 164, 168, 169, 174, 188, 194, 20 195, 197, 199, 205, 210, 214, 215, 221, 223, 229, 238, 242, 244, 249, 251, 254, 256, 261, 265, 268, 269, 212-21 A, 277-280, 282-284, 287, 303-306, 309,314,315,317.
Os seguintes resíduos são de interesse especial: 1,13, 25, 38, 42, 74, 140, 143, 147, 164, 168, 190, 199, 215, 223, 242, 244, 256, 265, 277, 280, 281, 283, 284, 285, 292, 303, 315 de CALB (SEQ ID NO: 1).
Resíduos correspondentes em outras lipases podem ser identificados de um alinhamento de seqüência. Um alinhamento de várias seqüências é mostrado em Fig. 1. Outras seqüências podem ser alinhamentos por métodos conhecidos, tais como AlignX (um componente do vetor nti suite 9.0.0) usando ajustes padrão.
Seqüência de aminoácidos alterada
A seqüência de aminoácidos alterada é derivada da seqüência originária pela realização de alteração de um aminoácido em uma ou mais 5 posições selecionadas, e opcionalmente também em outras posições. Cada alteração de aminoácido consiste de substituição ou deleção do resíduo selecionado ou inserção de pelo menos um resíduo adjacente ao resíduo selecionado no lado N- ou C-terminal.
Substituições particulares As seguintes alterações em SEQ ID NO: 1 podem ser
opcionalmente combinadas:
• Kl3Q, A25G, P38V,L,S, T42N, N74Q, V78I, Y91S, A92S, N96S, L99V, W104H, D134L,M,N, T138L, L140E, P143S,L, D145S, A146T, L147N,F, A148P, V149P, S150A, W155Q,N, Q157N, T158S,
L163F, T164V, R168D, V190I.A, S197L,G, L199P, V215I, D223G, T229Y, R242A, T244P, T256K, L261A, D265P, P268A, E269Q, L277I, P280V, A281S, A283K, A284N, I285E,D, G288D, N292C,Q, P303K, K308D, otV3151.
• Substituições múltiplas:
o I258D G288D
o S197GL199P o T164VL163F o V190XQ157X o A281XW155X o D223XA281X
o D223XI285X ο A281XI285X o A281XW155XA148X o D145XK308XK138X o D223XA281ΧΙ285Χ
• Inserções: L147FN, G137ASV, V190GAH, LIQL,
LlQGPL
• Deleção: N97*
Baseado no alinhamento tal como aquele mostrado em Fig. 1,
uma seqüência pode ser usada como um modelo para alterações em outra seqüência. Assim, Capuz 1 ou Capuz 2 de uma seqüência pode ser substituído pela região de capuz correspondente de outra seqüência. As seguintes variantes são projetadas pela alteração de Capuz 1 de CALB usando o polipeptídeo indicado como modelo:
• Q7RYD2 (Neurospora crassa) como modelo: Y135F K136H V139M G142Y P143G D145C L147G A148N V149F S15OGKVAKAGAPC A151P W155L
• Q4HUY1 (Fusarium graminearum) como modelo: Vl391 G142N P143I L144G D145G L147T A148G V149L S150IN A151T S153A
W155V
• lipase de Hyphozyma sp. como modelo: L140E P143L L147F A148G V149L.
• Q4PEP1 (Ustilago maydis) como modelo: V1391 L140E P143L D145S A146T L147F A148G V149L S150A A151S P152Q.
Cada uma das variantes acima pode ser opcionalmente combinada com N292C e/ou D223G e/ou A281S e/ou I285E.
As seguintes substituições podem ser feitas em SEQ ID NO: 2 (lipase de Hyphozyma sp.): V192I, Q159N, D136L,M,N, P41V.L, S50A, N45S, W106H.
Nomenclatura para alterações de aminoácido
Neste relatório descritivo, uma substituição de aminoácido é descrita pelo uso de códigos de uma letra, e.g. W155Q. X é usado para indicar uma substituição com qualquer resíduo diferente (e.g. V190X). Substituições múltiplas são concatenadas, e.g. S197G L199P para indicar uma variante com duas substituições. Alternativas são indicadas por vírgulas, e.g. W155Q,N para indicar uma substituição de Wl 55 com Q ou N. Um asterisco indica uma deleção. Uma inserção é indicada como substituição de um resíduo com dois ou mais resíduos (e.g. Ll 47FN)
Atividade de enzima lipolítica
Os polipeptídeos originários e variante têm atividade de enzima lipolítica (particularmente atividade de lipase), i.e. são capazes de hidrolisar ligações éster carboxílico para liberar carboxilato (EC 3.1.1), particularmente ligações éster em triglicerídeos (atividade de triacil-glicerol- lipase, EC 3.1.1.3).
A atividade de enzima pode ser expressada como atividade específica, i.e. atividade hidrolítica por mg de proteína enzima. A quantidade de proteína enzima pode ser determinada e.g. da absorção a 280 nm ou por titulação de sítio-ativo (AST), como descrito por Rotticci et al. Biochim. Biophys. Acta 2000, 1483, 132-140.
Enanciosseletividade
Enanciosseletividade é muitas vezes um parâmetro importante em reações catalisadas por CaLB, tanto na hidrólise quanto na direção de 20 síntese. O substrato pode ser uma mistura racêmica de dois enanciômeros, ou pode ser uma forma meso pró-quiral. Em ambos os casos um produto de enanciômero único é muitas vezes desejado. Excesso enanciomérico (ee) é medido pela quantificação da quantidade de ambos os produtos enancioméricos, e então calculando ee = (rendimento de enanciômero 25 desejado - rendimento de outro enanciômero) / (soma de ambos os rendimentos). A quantificação é muitas vezes por cromatografia gasosa (GC) quiral ou cromatografia líquida de desempenho alto (HPLC).
Uso de variante de enzima lipolítica
A variante de enzima lipolítica pode ser usada para biocatálise em uma reação catalisada por lipase, tanto em hidrólise de éster quanto em reações de síntese, e.g. em síntese de alguns polímeros. A reação catalisada por lipase pode ser:
a) hidrólise com um éster de ácido carboxílico e água como reagentes, e um ácido carboxílico livre e um álcool como produtos,
b) síntese de éster com um ácido carboxílico livre e um álcool como reagentes, e um éster de ácido carboxílico como produto,
c) alcoólise com um éster de ácido carboxílico e um álcool como reagentes, ou
d) acidólise com um éster de ácido carboxílico e um ácido
graxo livre como reagentes.
Como CALB, a variante da invenção pode ser particularmente usada em aplicações onde quimio-, regio-, e/ou estereosseletividade, estabilidade e velocidade de reação de enzima ou a capacidade para aceitar
uma variedade relativamente ampla de substratos é importante. Os produtos de reação são tipicamente usados na indústria química, de química fina, farmacêutica, ou agroquímica, ou como ingredientes de alimento. A variante pode estar imobilizada, e.g. por adsorção sobre uma resina adsorvente tal como polipropileno.
O éster na reação catalisada por lipase pode ter um grupo ácido
volumoso ou uma parte de álcool secundário ou volumoso, tal como 2-Me- butirato de pNP, octanoato de 6,8-difluoro-4-metil-umbeliferila (octanoato de DiFMU) ou um iso-propil-éster de ácido graxo iso- (e.g. ácido Ci6-Cjs graxo que pode ser saturado ou insaturado).
A variante pode ser usada como descrito para CALB em A. J.
J. Straathof, S. Panke, A. Schmid. Curr. Opin. Biotechnol. 2002, 13, 548-556; E. M. Anderson, Κ. M. Larsson, O. Kirk. Biocat. Biotrans. 1998, 16, 181- 204; R. A. Gross, A. Kumar, B. Kaira. Chem. Rev. 2001,101, 2097-2124). EXEMPLOS Exemplo 1: Seleção de resíduos de aminoácido por dinâmica molecular
Foram encontradas a partir de simulações de dinâmica molecular 2 regiões de importância alta para a atividade de lipase B de Candida antarctica, como segue.
5 CHARMm foi usado para preparar a estrutura de ITCA para
as simulações. Átomos de hidrogênio foram adicionados em ambas proteína e águas usando o comando HBUILD. O sistema foi embebido em moléculas de água explícitas e confinado em uma caixa cúbica de lado igual a 9,0 nanômetros. Houve no total 24630 moléculas de água incluindo aquelas já presentes na estrutura de 1TCA. Uma simulação em temperatura constante, 300K, e pressão constante, 102,668 quilopascais, foi realizada por um total de nanossegundos usando NAMD. Método de copulação de Berendsen foi usado para manter a temperatura e a pressão nos valores desejados. Os resultados da estimulação foram então analisados usando CHARMm (Referências para CHARMM: MacKerell, A. D., Bashford, D., Bellott, M., Dunbrack, R. L, Evanseck, J. D., Field, M. J., Fischer, S., Gao, J., Guo, H., Ha, S., Joseph-McCarthy, D., Kuchnir, L, Kuczera, K., Lau, F. T. K., Mattos, C, Michnick, S., Ngo, T., Nguyen, D. T., Prodhom, B., Reiher, W. E., Roux, B., Schlenkrich, M., Smith, J. C, Stote, R., Straub, J., Watanabe, M., Wiorkiewicz-Kuczera, J., Yin, D., Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586; MacKerell, A. D., Jr., Brooks, B., Brooks, C. L, III, Nilsson, L, Roux, B., Won, Y., Karplus, M. Em The Encyclopedia of Computational Chemistry; Schleyer, P. v. R. et al., Eds.; John Wiley & Sons: Chichester, 1998; Vol. 1, p 271; Brooks, B. R., Bruccoleri, R. E., Olafson, B. D., States, D. J., Swaminathan, S., Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983,4, 187).
A análise revelou até agora capuzes desconhecidos com mobilidade alta. Foi verificado que várias regiões se movem quando a enzima está em solução. Foi concluído que a especificidade e a funcionalidade da enzima são dependentes desta mobilidade e a estrutura específica no meio escolhido para a hidrólise ou a reação de síntese. A simulação indicou uma forma semelhante a mais fechada em solução aquosa e uma forma mais totalmente aberta em solução em solvente orgânico, i.e. mais semelhante à estrutura cristalina em solução aquosa contendo algum tensoativo.
Uso de cálculo do Quadrado da Média da Raiz dos Deslocamentos isotrópicos para os átomos de C-alfa dos resíduos em CALB ao longo da simulação mencionada acima, regiões com mobilidade aumentada foram identificadas. As regiões de capuz móveis encontradas foram resíduos 136-160 para Capuz 1 e resíduos 267-295 para Capuz 2. Foi concluído que os resíduos na vizinhança destes capuzes novos interagem com a mobilidade de capuz e são assim muito importantes para a atividade de enzima.
Exemplo 2: Reações de hidrólise
Atividade hidrolítica das variantes foi avaliada em butirato de pNP, 2-metil-butirato de pNP racêmico, e octanoato de 6,8-difluoro-4-metil- umbeliferila (octanoato de DiFMU). 2-Me-butirato de pNP racêmico foi sintetizado de acordo com J. Biol Chem. 1971, 246, 6019-6023. Octanoato de DiFMU, adquirido de Molecular Probes, tem sido previamente relatado por Lutz et al. (J. Am. Chem. Soc. 2005,127, 13466-13467) em ensaios de CALB. Enquanto que 2-Me-butirato de pNP seleciona variantes com aceitação melhorada de substratos com um grupo ácido volumoso, octanoato de DiFMU seleciona variantes com aceitação melhorada de uma parte de álcool volumosa. Reações foram realizadas em tampão aquoso de fosfato 50 mM, pH 7,0 com 0,1% de Triton X-100. Cinética de reação foi seguida por aproximadamente 15 min em placas de microtítulo, medindo a 405 nm (pNP) ou 350/485 nm (ex/em para DiFMU). Atividades foram normalizadas baseado em A28o de enzima. o ο (^γΗ°2
butirato de pNP
2-Me-butirato de pNP
Octanoato de DiEMU
Resultados são mostrados abaixo como atividade para vários substratos em % de CALB de tipo selvagem.
Variante Butirato de 2-Me-butirato Octanoato de pNP de pNP DiFMU N74Q 77 113 110 P143S 50 113 42 A281S 215 232 208 P38S 35 107 44 N292Q 73 158 105 LlQGPL 63 144 85 LlQL 65 193 49 I285E 233 332 236 L147F 98 232 90 L147N 79 178 79 N292C 80 282 90 L140E 51 151 79 P143L 79 192 112 A146T 55 126 42 P280V 48 100 36 A283K 104 115 94 A284N 65 125 19 T103G, A148P 70 167 0 W104H, A148P 11 146 0 N74Q, A281S 88 156 0 V190A 64 143 L199P 74 162 75 T256K 105 120 79 T42N 35 216 47 R242A 24 119 39 V215I 105 133 43 T164 V 75 130 80 L163F, T164V 81 160 92 D265P 28 117 44 P303K 35 108 50 R168D 62 122 53 A25G 66 111 26 V3151 65 102 19 T244P 56 146 20 K13Q 56 122 39 L277I 53 137 51 Y91S, A92S, N96S, N97*, L99V 39 135 76 D223G 830 3621 820 originário (CALB) 100 100 100 Os resultados demonstram que a atividade específica para um
substrato volumoso (éster com um ácido graxo ramificado) pode ser aumentada em até 37 vezes pela substituição de um único resíduo de aminoácido selecionado.
Exemplo 3: Variantes com substituição de capuz
Variantes baseadas em CaLB de tipo selvagem (SEQ ID NO: 1) foram projetadas pela substituição de capuz 1 pelos resíduos correspondentes da lipase de Fusahum (SEQ ID NO: 4), da lipase de Debaryomyces (SEQ ID NO: 5) ou da lipase de Neurospora (SEQ ID NO: 8).
Outras variantes foram projetadas pela combinação desta com uma única substituição de um resíduo selecionado (A281S). Resultados são expressados
como atividade em % de atividade de CALB sobre o mesmo substrato.
Variante butirato de 2-Me-butirato octanoato de pNP de pINP DiFMU V1391, G142N, P143I, L144G, D145G, 187 661 836 L147T, A148G, V149L, S150IN, A151T,S153A, W155V Y135F, V139R, L140M, A141V, G142P, 62 306 14 P143V, D145C, A146P, L147S, A148F, V149P, S150KLSC, A151P,W155L Y135F, K136H, V139M, G142Y, P143G, 341 1223 14 D145C, L147G, A148N, V149F, S15OGKVAKAGAPC, A151P, W155L V1391, G142N, P143I, L144G, D145G, 1052 1612 631 L147T, A148G, V149L, S150IN, A151T, S153A, W155V, A281S Y135F, K136H, V139M, G142Y, P143G, 378 2397 76 D145C, L147G, A148N, V149F, S150GKVAKAGAPC, A151P, W155L, A281S Os resultados demonstram que a atividade específica para um
substrato volumoso pode ser significativamente aumentada pela substituição do capuz de uma lipase pelo capuz de outra lipase, e que esta pode ser adicionalmente aumentada pela combinação com uma única substituição de um resíduo selecionado.
Exemplo 4: Enanciosseletividade
Reações de hidrólise foram realizadas em escala de 2 mL 5 usando 2-Me-butirato de pNP 2 mM como substrato em tampão fosfato de sódio, 0,5 M pH 7,0 com 1% de Triton X-100. As reações foram interrompidas pela adição de HCl 2 M (0,1 mL), e então extraídas em Et2O (2 mL). Após análise por GC quiral (coluna Varian CP-Chiralsil-DEX CB 10 m, programa de temperatura 80 a 180°C a 2 °C/min), E (razão enanciomérica) foi 10 calculada como E = ln[eep(l-ees)/(eep+ees)] / ln[eep(l+ees)/(eep+ees)], com ees e eep sendo ee (excesso enanciomérico) para substrato e produto, respectivamente. Reações foram realizadas em tripletos para cada enzima (interrompida em conversões diferentes) e E relatado como uma média.
CALB foi testada e comparada com variante Y135F, K136H, 15 V139M, G142Y, P143G, D145C, L147G, A148N, V149F, S150GKVAKAGAPC, A151P, W155L. Os resultados foram E=2,4 para a variante e E= 1,05 para a lipase originária (CALB), mostrando que CALB é quase inteiramente não-seletiva, mas a variante tem uma enanciosseletividade aumentada.
Exemplo 5: Hidrólise de éster de ácido graxo de cadeia longa
Constantes de Michaelis-Menten foram determinadas para uma variante de CALB com laurato de pNP como um substrato de cadeia longa. Experimentos foram realizados em tampão fosfato de sódio 0,5 M, pH
7,0, contendo 1% de Triton X-IOO (para evitar soluções turvas em concentrações de substrato altas). _
kca, (S-') Km (micro-M) IwTCm^M-1) originário (caLB) 3,1 535 0,58 *104 V139I, G142N, P1431, L144G, D145G, 23 170 O L147T, A148G, V149L, S150IN, AI51T, * S153A, W155V I Os resultados mostram que a variante é 23 vezes mais ativa do que a lipase originária sobre substrato de cadeia longa (medido como Iccat / Km).
Exemplo 6: Hidrólise de iso-propil-éster
A variante usada no exemplo prévio também foi testada em hidrólise de palmitato de iso-propila. Os resultados mostraram que a hidrólise foi 26% mais alta para a variante do que para CALB. A hidrólise foi realizada como segue:
Como substrato, palmitato de isopropila foi adicionado em uma concentração de 3 mg/ml em Acetato de Na 50 mM Na de pH 5,0 (= tampão), aquecido a 60°C por 5 minutos e homogeneizado por Ultra Turrax por 45 segundos e usado imediatamente após a preparação. Preparações de enzima purificada foram diluídas para uma concentração correspondendo a 00280=0,00016 em água dessalinizada e 10 ppm de Triton X-100. Em placas para PCR 20 micro-L de tampão, 60 micro-L de substrato e 20 micro-L de solução de enzima foram misturados a 800 RPM por 20 segundos e transferidos para um termociclizador de PCR por 30 minutos de reação a 3 0°C seguido por 5 minutos a 90°C para inativar as enzimas e adição de 20 micro-L de solução 10% de TritonXlOO (em água dessalinizada). A quantidade para ácidos graxos produzidos foi determinada usando o kit NEFA C de Wako e resultados foram calculados como uma média de 6 determinações e subtração do branco de enzima.
Exemplo 7: Atividade em pH alto
Atividade de lipase de duas variantes de CALB foi medida em vários pH a 30°C com tributirina como substrato e goma arábica como emulsificador. Os resultados são expressados como atividade relativa, considerando a atividade em pH 7,0 como 100.
pH5,0 pH6,0 pH7,0 pH8,0 pH9,0 Y135F, K136H, V139M, G142Y, P143G, D145C, 53 97 100 90 151 L147G, A148N, V149F, S150GKVAKAGAPC, A151P, W155L V139I, G142N, P143I, L144G, D145G, L147T, 41 76 100 99 148 A148G, V149L, S150IN, A15IT, S153A,W155V Lipase originária (CALB) 47 62 100 60 49 10
É visto que as variantes têm atividade aumentada em pH alcalino (pH 7-9) e um ótimo pH mais alto.
Exemplo 8: Reações de síntese
As variantes foram imobilizadas em polipropileno poroso Accurel por adsorção física para uma carga de 20 mg/g (baseada em A280). Reações foram realizadas em tubos Eppendorf com 1 mmol de cada reagente, aproximadamente 0,8 mL de hexano, e 5 mg de enzima imobilizada @ 40 0C, 1200 rpm. Amostras foram retiradas para análise por NMR e GC quiral.
Resultados de uma reação de síntese com 2-etil-l-hexanol e acetato de vinila como reagentes são mostrados abaixo como conversão % (ee%):
Variante 15 min 30 min 1 h 2 h 3 h originária (CaLB) 11 (32) 24 (27) 43 (22) 61(17) 63(17) Y135F K136H V139M G142Y P143G D145C 6(46) 13(46) 24 (45) 41 (40) 52 (38) L147G A148N V149F S150GKV AKAG APC A151P W15 5 L V139I G142N P143I L144G D145G L147T 0,1 (51) 6(49) 12(50) 22 (49) 33 (48) A148G V149L S150rN A151T S153AW155V A razão enanciomérica foi calculada pela fórmula dada acima. Os resultados foram E= 1,9 para a lipase originária (CALB), e E=3,0 e E=3,2 para as duas variantes. Assim, os resultados mostram enanciosseletividade melhorada para as duas variantes.
Outro experimento foi feito na mesma maneira, mas com benzoato de vinila e 1-hexanol como reagentes.
o
_ . _ -0-
O^
Após 72 horas, foi verificada uma conversão de 17% para a variante I285E, enquanto que a CALB originária deu 9%. I LISTAGEM DE SEQÜÊNCIAS
LISTAGEM DE SEQÜÊNCIA
<?10> NovozyirBS AiS
<120> Vaxicintes da enzima lipolítica <130> 10617-VO
<160> 8
<170> Patentln ver si on 3,4
<210> 1 <211> 317 <212> PRF
<213> Candidaantarctlca <400 > 1
Leu Pro Ser Gl y Sei Asp Pro Aia Phe Ser Qn Pro Lys Ser Vai Leu 15 10 15
Asp Al a Q y Leu Thr Oys Q n Q y Al a Ser Ro Ser Ser Val 20 25 30
Ser Lys
Pro 11 e Leu Leu Val Pro Gy Thr Gy Thf Thr Qy Pro 3n Ser Phe 35 40 45
Asp Ser Asn Trp Ne FVo Leu Ser 50 55
Thr <3 n Leu Q y Tyr
60
Thr Pro CVs
Trp 11 @ Ser Pf o Pro Ro Phe kfet Leu Asn Asp Thr G n Val Asn Thr 65 70 75 80
O u Tyr Mst Val
Asn
85
Al a I I e Thr Al a
Leu
90
Tyr Al a Q y Ssr
G y Asn 95
Asn Lys Leu Ro Val Leu Thr Trp Ssr QnGyQy Lsu Val Al a Q n 100 105 110
Trp Gy Leu Thr
115
Pha Phe Pro Ser
120
I e Arq Ser Lys Val
125
Asp Arg Leu
f«bt
Al a Pha
130
Pro Asd Tyr Lys Q v Thr 135
Val
Lsy Al a Gy Pr í 140
Lou
Asp Al a Leu 145
Al a Val
Ser
150
Ai a Pr o Ser Va l
Tf p Qn Qn Thr Thr 155
Q y
160
Ser Ala Leu Thr Thr Aia Leu Arg Asn Ala Qy Gy Leu Tnr GnHe 165 170 175
Val Pro Thr
Thr Asn Leu Tyr
180
Ser
Al a 185
Thr Asp Gull
190
G n Pr o
Q n Vai Ser Asn Ser Pr o Leu Asp Ser Ser Tyr Lbsj Phe Asn Gy Lys 195 200 205 Asn Val GrtAIaGnAa Val Cys G y Pro Leu Phe Val 11 e Asp H s
A a G y Ser Leu Thr Ser G n Phe S&r Tyr Val Vaf G y Arg Ser Aa 225 230 235 240
Leu Ar g Ser Thr Thr <3y Gn Ala Ag Ser Aí a Asp Tyr Gy Ile Thr 245 250 255
Asp Cys Asn Rro Leu Pro Ai a Asn Asp Leu Thr Pro Gu Gn Lys Val
260 265 270
AaAlaAaAla Ley Lsu AaProAaAaAaAaiieVai AaQy 27S 280 285
Pro Lys G n Asn Cys Gu Pro Asp Leu f*fel Pf o Tyr Al a Arg Pro Rie 290 295 300
Aa Val Gy Lvs Arg Thr Cys Ser GyIIe Val Thr Pro 305 31D 315
<21Q> 2 <211> 319
c212> PRT
<213> HypbazynB sp.
<400> 2
Phe Thr Pro Ftie Pro Thr GyAa Asp Pro A a Phe Thr G n Ser G n 10 15
A a Thr Leif Asp AaGy Leu Thr Cys O n Ser G y Ser Pr o Ser Ser 20 25 30
Gn Lys Asrt Pr o Ne Ley Leu Va! Pro Qy Thr Gy Asn Tiir G y Pro 35 40 45
G n Ser Phe Asp Ser Asn Trp Ile Pro Leu Ser AaGn Leu G y Tyr 5§ 55 60
Ser Pro Cys Trp Vai Ser Pro Pro Pro Phe Kfei Ieu Asn Asp Ser G n 65 70 75 SO
i i e Asn AaGu Tyr 11 e Val Asn Aa Ile Hs Thr Leu Ser Ser Q y 85 90 95
Ser Q y Ser Lys Val Pro Val Leu Thr Trp Ser GnQyQy Leu Aa 100 105 110
AaGn Trp Aa Leu Thr Pfie Phe Pro Ser Thr Arg Asn Lys Va! Asp
115 120 125 Pe Q Leu Kfet Λ a Phe At a Pro Asp Tyr Lys Q y Thr Val Qu Al a Q y 130 1-35 140
Leu Leu As-p Al a Phe Q y Leu Ser Al a Pro Ser Vai: Trp Qn Qn Ttir 145 150 155 160
AaQn Ser Al a Phe Val Thr Al a Leu Asp QnAIaQyQy Leu Asn 165 1:70 175
Q n Ile Val FV o Thr Thr Asn Leu Tyr Ser M a Thr Asp Q u Val Val 180 185 190
<3 n Pro On Ftie Al a Asn Qy Pro Pro Asp Ser Ser Tyr Leu Ser Asn 195 200 205
Q: y Lys Asrt fie Qn Af a Qn Ser ΪI e Qf s Q y Pro Leu Phe Ile Us
210 215 220
QyHsAIaQy Ssr Leu Tyr Ser Q n Phe Ser Tyr Val Val Q y Lys 230 235 24D
Ser Ala Leu Ala Ser FsTo Tfir Qy Gn Ala Qn Ser Ser Asp Tyr Ser 245 250 255
f I e Lys Asp Cys Asn FVo A) a Pro Al a Asn FV o Leu Thr Ai s Qn Qn
260 265 270
Lys Leu Asp Ser Al a M a He Ne Leu Val Al a Gy Lvs Asn 11 e Val
275 280 285
Thr Qy FsTo Lys Gfl Asn Cys Q u Pro Asp Leu Wfet Pro Tyr ,Ala Arg 290 296 3DO
Lys Tyr Ar§ He Gy Lys Lys Thr Qys Ser Qy Vai Ile Thr Qy 305 310 315
«210> 3 <211> 336 <212> PRT
<213> Ltei i I ago rraydi s <400 > 3
foteí Lys Thr Thr Ser Val IS e Ser Al a Leu Val Thr Leu Al a Ser 11 10 15
e Arg Al a Al a Fro Leu Al a Ser Ser Asp Ρϊo Al a Phe Sfer Ihr Pro 20 25 30
Lys Al a Thr Leu Asp AaQy Leu Q u Cys Q n Thr Q y Ser Pro Ser 35 40 45
Ser Qn Thr Lys Pro He Leu Leu Val Pro Qy Thr Qy Ala Asn Qy 50 55 60 Thr Gln Thr Rhe Asp Ser Ser Trp 11 e Pro Leu Ser Λ a Lys Leu Qy 65 70 75 60
Phe Ssr Pro Cys Trp Me Sôr Pro Pro Pro Phe Kfet Leu Asn Asp Ser
85 90 95
Q η Val Asn Val Q υ Tyr 1I θ Vai Asn Al a Val Qn Thr Leu Tyr At a 100 105 110
Qy Ser Qy Ser Lys Lys Val Pro Val Lew Thr Trp Ser Qn Qy Qy 115 120 125
Leu Al a Thr O η Trp Al a Leu Thr Phe Phe Pr o Ser 11 e Ar g Asn Q η 130 136 140
Val Asp Arg Leu Wbl Al a Piie Al a Pro Asp Tyr Lys Q y Thr IIeQu 145 ISD 155 160
Al a G y Leu Leu Ser Thr Phe Q y Leu Al a Ser Q η Ser Val Trp Q η 1:65 170 175
Qn Qn Ala Qy Ser Al a Ptie Val Thr Al a Leu Lys Asn Al a Qy Qy
180 185 190
Lqu Thr Ser Ftie Va! RrO Thr Thr Asn Leu Tvr Ser PhB Phe Asp Q u
195 200 205
I I β Val Q π Pr ο Q π Val Pha Asn Ser Asp Al a Asp Ser Ssr Tyr Lau 210 215 2:20
Q y Asn Ser Lys Asn Hs Qn Al a Gn Thr Val Cys QyQy Phe Phe
225 23 D 235 24D
Val I I β Asp H ε Al a Q y Ser Leu Thr Ser O η Phe Ser Tyr Val Val
245 250 255
Q y Lys Ser Al a Leu Thr Ser Ser Ser G y Val Al a Asn Ster Al a Asp
260 265 270
Tyr Ser Ser Lys Asp Cys Lys Al a Ser Pro Al a Asp Asp Leu Ser Al a 275 ' 280 285
Lys G η Lys Al a ASp Ai a Ser Al a Leu Leu Fhe Vai Al a Ai a Gv Asn 290 295 300
Leu Leu AJ a Qy Pro Lys Qn Asr* Cys G u Pro Asp Leu Lys Pro Tyr 305 31D 315 320
Ai a Arg <3 η Phe Al a Val Qy Lys Lys Thr Cys Ser Q y Thr 11 β Asn 325 330 335 <210> 4
<211> 445
<212> Pm
<213> Gbberel la zaaa
<400> 4
Λ a Pro Ssr Tvr Sei Asp Leu Qu Ser Arg Gn Lsu Ile Gy Gy Leu
1 5 10 15
Leu Lys G y Val Asp G y Thr Leu 3 u Thr Val Val GyG y Leu Leu 20 25 30
Gy Tlir Leu Λ-g Lys Ala He Asp Ser G y Asp Arg Asp Lys Thr Leu 35 40 45
Asp 11 e Leu Hs s Vai Leu Gu Pro Al a Lys Lys H s Lys Asn VaJ G u 50 55 60
G u Al a Phe Al a Al a Leu G u Lys 11 e Ser Lys Ser Lys Pr o Lys Thr 65 70 75 BO
He Ile Asp Tyr Ser A! a G n Leu He Val Asn G y Leu 11 e Ser G y 85 90 95
Asr Thr Leu Asp Leu Phe Al a Tyr Al a Lys G y Leu Val Ser Al a G n
100 105 110
Asn Q y Ser Asn Asn Lys Asn Arg Asn Pro Pro Lys G u Val Tyf Pro
115 120 125
Lys Val Al a Asn Cys Aso Al a Ser Tyr Thr Thr Ser Q u Ala Lys Leu
130 ' 135 140
Arg Al a Ala lie Hs Ne Pf o Pro Thr Phe Thr Tyr QyQu Lys Pr o
145 150 155 160
Pro Val He Leu Phe Pro Gy Thr Qy Ser Thr Qy Phe Thr Thr Tyr
155 170 175
Arg Qy Asn Ffne He Pro Leu Leu Thr Asp Val Gu Trp ASa Asp Pro
180 185 190
Val Trp Val Asn Val FVo Val Leu Leu Leu Gu Asp Al a G n Val Asn
195 200 205
Ala Gu Tyr Al a Ala Tyr Al a Leu Asn Tyr Ils Al a Ser Leu Thr Lys
210 215 220
Arg Asn Vsl Ssr Vai 11 e Al a Trp Ssr QnOy Asn 11 a Asp Val □ n
225 230 235 240
Trp Ala Leu Lys Tyr Trp Pro Ser Thr Arg Lys Val Thr Thr Asp H s 245 250 ' 255
Val Al a Ne Ser Al a Asp Tyr Lys G y Thr 11 e Leu Al a Asrt IIeOy
260 265 270
Q y Al a Thr O y Leu 11 e Asn Thr Pro Al a Val Val On Qn 0« Aia 275 280 285
Q y Ser Thr Rie 11 β Asn Tftr Lsu Arg Ser Asn Asp G y Asp Sér Q y 290 235 300
Tyr ! I β Pro Tfir Thr Ssr Leu Tyr Ser Ser Leu Phe Asp Qu Val Vâl 305 310 315 320
Gm Pro Sn Qu Gy Ala Gy Ala Ser Ala Tyr Ieu Leu £sp Al a Arg
325 330 335
Asp Vai Q y Val Thr Asn Al a G u Val Q n Lys Val Cys Thr G y Lys 340 345 350
Leu Gy Qy Ser Phe Tyr Ttsr Hs Gu Sei Mg? Leu Ala Asn Pro Leu 355 360 365
Thr Phe Al a Leu Al a Lys Asp Al a Leu Thr Hs Gu Qy Pr o Gy Thr
370 3/6 360
11 e Ser Ara Leu Asp Leu Ala Asp Vai Cys Asn Arg Ser Leu Al a Pro
385 390 395
Q ¥ Leu Q y Leu Lys Asp Leu Leu ! l © Thr Qu Asn Al a Val Vai 11 e 405 410 415
Al a Ala Leu Ser Leu Val Leu Tyr Leu Pro Lys Gn N e Asp Q u Fto 420 426 430
Ala Ila Lvs Qn Tyf AJa Leu Qu Ala Thr Gl y Thf Cys
435 440 445
<210> 5 <211> 455 <212> PRT
■c.213> Cfebaryonyces hanseni i <400> 5
H s Pt o Thr Lys Qy Leu Gu Arg Arg Asp Leu Ile Ser Asn He Asp 10 15
Asp Ile Val Asn Set Thr i i e Asp Asn Gy Ou Ai a Hs Lvs Asp Asn 20 25 30
Al a Lys Ser Al a Ile Thr Asp 11 e Pfie Asp Lys He Asn Asp QyHe 35 40 45 Lys G n Asp I i e Asp Asn Leu Lys G u Vai Gy tys Ser 11 β Al a Asp 50
55
60
Leu He Lys Ser Val Val Pro Thr Qg Asp Leu Ser Thr Pro Qu Gy
65
70
75
60
Val G η Al a Tyr Leu GyGn Leu Pfie G u Asn GyGu Asp Leu Phe
85
90
95
Lys Asn Ser Il θ Asp Nfet Vai GyHsQy Leu Lys Pro Gy Ser Ile
100
105
11
Al a G y Asn Phe QuGy Pha Ser Asp Gu He Asn Thr Ser Asp Asrs
115
120
125
Phe Asn Val Lys Gu Pro Gu Gy Ser Val Tyr Pro Qn AS a Gu Sar
130
135
140
Q u Asp Rro Ser Phe Ser Leu Ser Gu G u Qn Leu Arg Ser Al a 11 β
145
150
155
160
Gn Hs Pro Gu Qu Phs □ n Tyr G y Asn G y Ser Lys S»r Pro Val
165
170
175
11 β Leu Val Pr o G y Thr O y Ser Lys GyGy fcfeí Thr Tyr Al a Ser 180 185 190
Asn Tyr AJ a Lys Leo Leu Lys G u Thr Asp Phe Al a Asp Val Val Tr p 1S5 200 205
Lsu Asn Val Pro G y Tvr Leu Lsu Asp Asp Al a G π Asn Asn Al a G u 210 ' 215 220
Tyr Vai Al a Tyr AJ a Hs Asn Tyr He Ser Qy He Ser Asn Asn Lys 225 230 235 240
Vai Ser Me Ile Ser Tfp Ser Gn Gy Oy Leu Asp Thr Gn Trp 245 250 255
M a teu Lys Tyr Irp M a Ser Thr Arg Ser Lys Vaf Ser Asp Phe M β
260 265 270
Pro He Ser Pro Asp Phe Lys G y Tfir Arg fcfet Vaf Pro Val Leu Cys 275 280 285
Pro Ser Phe Pro Iys Leu Ser Cys PfO Pro Ser Vai Leu Gn GnGu
290
235
Tyr Asn Ser Thr Pha He Gu Thr Leu Arg Al a Asp GyGy Asp Ser
305
310
15
320 Λ a Tyr Val Pj ο Thr Thr Ssr 11 β 325
Tyr Ser G y Pha Asp Gu 11 β Val
330 335
Qn Pro Q η Ser G y Lys Ql y Al a Ser Q y Leu 11 θ Asn Asp Asn Arg
340 345 350
Asn Vat ~ Val Thi Asn Asn <3 α Vai Q η Ttir 11 s Cys Pro Asp Arg
Pro Al a Oy Lys Tyr Tyr Thr HsQuGy Val Lbu Tyr Asn Pro Val 370 375 360
<3 y Tyr Al a Leu Al â Val Asd Al a Leu Thr H:s Qu Gy Ptd Gy Gn
38B 390 395 400
Leu Ser Arg M 8 Asp Leu Αερ Thr Qu Cys Qy Arg Ile Val Pro Asp 405 410 415
Gy Leu Ihr Tyr Thr Asp Leu Leu Ala Thr G u Al a Leu 11 θ Pro Gu 420 425 430
Al a Leu Vêl Leu 11 β Leu Ser Tyr Asp Asp Lys Thr Arg Asp G υ Pro 435 440 445
Gu He Arg S&r Tyi Al a G η 450 455
<210> 6
<211> 440
<212> PRT
<213> Aspergi 11 08 fynrigatus
<400> 6
Al a Val Il 0 Ρίο Arg Gy Ala Val Pro Vai Ma Ser Asp Leu Ser Leu
1 5 10 15
Val Ser 11 & Leu Sef Sar Λ a Al a Asn Asp Sar Ser ISeGu Ser G u
Α! a Arg Sor iio Al a Ssr Leu 11 β Al a Ser Gu Na Val Ser Lys 11 β 35 40 45
Gy Lys Thr Gu Pha Ser Arg Ser Thr Lys Asp Al a Lvs Ser VaS Gn 5# 55 60
G u Al a Phs Asp Lys IIeGn Ser 11 β Phe Al a Asp G y Tlir Pro Asp 65 70 75 60
Phe Leu Lys fvfet Thf Arg Gu Ne Leu Thr Val Gv Leu Ile Pro Al a 85 90 ' 95
Asp Ils Val Ser Phe Leu Asn Gy Tyr Lbu Asn Lbu Asp Leu Asn Ser
360
365
30
100
105
110 i I e H s Aarv Ar g Asn FVo Sôr Pro Lys Qy Gn Al a Ile Tyr Pro Val 115 120 125
Lys Al a Pro 3 y Asp Al a Arg Tyr Ser Val Ai a Q u Asn AS a Leu Arg 130 135 140
Aa Al a Ile His Ile Pro Ala Ser Phe Q y Tyr Q y Lys Asn Q y Lys
145
150
155
160
Lys Pro Val Ne Ieu Val Pro Qy Thr Ala Thr Pro Ala Qy Thr Thr
165
170
175
Tvr Tyr Phe Asn Phe Q y Lys Iey Q y Ser Ai a Al a Asp Al a Asp Val
180 185 190
Val Trp Leu Asn Ne Pro Qn Ala Ser Leu Asn Asp Val Gnlle Asn
195 200 205
Ser G u Tyr Val Al a Tyr Aa He Asn Tyir 11 e Ser Al a lie Ser Gu
210 215 220
Ser Asn Val Al a VaS Leu Ssr Trp Ser Gn Gy Gy Leu Asp Thr G n
225 230 235 240
Trp Ala Leu Lys Tyr Trp Pro Ser Thr Arq Lys Val Val Asp Asp Phe
245 25Ò 255
He Al a Ile Ser Pro Asp Phe HsGv Thr Val Arg Ser Leu Val
260 265 270
Qcs Pro Trp Leu Al a Al a Leu Al a Cys Thr Pro Ser Leu Trp Qn Gn
275
280
285
Gy Trp Asn Tiir Qu PhB He Arg Thr Leu Arg Qy Qy Gy Qy Asp
290
295
300
Ser Ala Tyr Val Pro Thr Thr Thr 116 Tyr Ser Thr Phe Asp Quile 305 310 315 320
Val Gn Pro Ser Q y Ser Qn Al a Ser A! a 11 e Leu Ser Asp Ser 325 330 335
Arg Al a Val G y Vai Ser Asn Asn Hi s Leu Q n Thr 11 e Cys QyGy 34-0 345 350
Lys Pro Al a Gy Gy Val Tyr Thf Hi s Qu Qy Val Leu Tyr Asn Pr o 355 ' 360 365
Leu Al a Trp Ai a Leu A) a Val Asp Al a Leu Ser H s Asp Gy Pro G y 370 375 360 Asp Pro Ser Ar g Leu Asp Leu Asp Val Vat Cys Qy Arg VaJ Leu FVo 385 390 395 400
Pro G η Leu Gy Leu Asp Asp Ley Leu Gi y Tfir GuQy Leu Leu Leu 405 410 415
Il e Al a Lsu Al a G g Vàl Lbu Al a Tyr Lys FVo Lys Thr Phe GyQu 420 425 430
Pro Ala 11 β Al a Ser Tvr Al a H s
435 440
<210> 7 <211> 401 *212> PRT
<213> AspergH Ius oryzae <400> 7
Lau Pro Ser Ser Ser Q υ Tftr Val G u AJ a Asn Cys Vsl Lys Pro Tyr 10 15
Leu Qys QfS QyQu Leu Lys Thr Pro Leu Asp Ser Thr Leu Asp FVo 20 25 30
11 e Leu Leu Asp Leu Gy He A&p Al a Al a Ser 11 e Val O y Ser Val 35 40 45
Gy Leu Leu Cys Leu Iie Pr o Ser Lys Ala Leu Thr Oyg Leu Asn Gy 50 55 6D
Tyr Ala Me ile Asp Leu Asn Ser ile Hs Arg Hs Asn Pro Ser FVo 65 70 75 80
Gu Asn Leu Ser Ne Tyr Pro Tyr Lys Ala Lys Ser Asp Aia Pro Tyr 85 90 95
Ser He AJ a Qu Asn Thr Leu Arg Al a Al a i I e Hs Ile Pr o Arg Ser 100 105 110
FVi^ Ser H s Lys Arg Asp Lys Lys 11 e F3TO Val Leu Leu Val Pro Q y 115 ' ' 120 125
Thr Al a Val F¥ o Al a Ai a 11 e Thr Phe Tyr Ftie Asn Ftie Gy Lys Leu
130 136 140
Arg Ar g Al a Leu Pro Qy Ser Qu Leu Val Tr p I I θ Asp Leu Pr o O n
W'5 " 150 155 160
Al a Ssr Lqu Asp Asp IieQn Leu Ser Al a Q u Tyr Val AJ a Tyr Al a
165 170 1?5
Lau Asn Tyr Val Ser Al a Lsu Thr Ser Ser Lys I I a Al a Val Ile Ser 180
185
190
Trp Ser <3 n fl y Al a Leu Asp IIeQn Trp Al a Leu Lys Tyr Trp Pro 195 200 205
Ser Tbf Arg Ser Vai Val Asn Asp Phe He Ala Ile Ser Pro Asp Phe 210 215 220
HsQy Thr He Vai Lys Trp Leu Val Cys RrO Leu Leu Asn Asp Leu 225 230 235 240
Al a Cys Thr Pr ο Ser Iie Tr ρ Qn Qn Qy Tr ρ Asp Al a Asn Phe I ( e 245 250 255
Qn Al a Leu Ar g Ser Qn Qy Qy Asp Ser Ai a Tyr Val Thr Thr Thr 260 265 270
Thr (le Tyr Ser Ser Phe Asp Lys He Vaf Arg Pro Kfet Ser QyQu 275 280 285
Asrt Al a Ser Ala Arg Lsu Leu Asp Tyr Arg Qy Vai Qy Val Ser Asn 250 295 300
Asn H s Leu G η Thr He Cys Al a Asn Asn Al a Al a Q y Qy Leu Tyr 305 310 315 320
Thr Hs Qu Qy Val Leu Tyr Asn Pro Leu Al a Trp Al a Leu Thf Val
325 330 335
Asp Aia Leu Leu Hs Asp Qy Pro Ser Asn Me Thr Aro He Asp Thr
340 345 350
Q η Lys 11 e CVs G u <3 η Vai Leu Pro Pro Tyr Leu Q υ Leu Thr Asp
355 360 365
füfet Leu Q y Thr Q u Al a Leu Leu Leu Val Α! a Leu Al a Lys 11 e Leu
370 375 360
Thr Tyr Ser Pro Lys Val Ser QyQu Pro Asp 11 e Al a Lys Tyr Λα
385 390 395 400
Tyr
<210? 6
<211> 388
<212> PRT
■=213=> Neurospora crassa
<400> 8
Leu PrO Thr Thr Ser Qu Pro Vai Hi s Hs G u Ser Val Arg Al a Me 10 15 QyGu Leu Ser Hl s Arg Asp Q u Leu M S Asp Al a G y Val Vaf Trp
20
25
30
Asn Lys Val Val Arg Gn Ssr Pro Leu Val Aia Pro Thr Asp Pro Arg
35
40
46
As ρ Ser Phe Asn Asn Gn Asn Pro Αερ Val Pro Gy Val Gy Tyf Pro
50 55 60
Arg Ser Ser Asp Al a Asp Pro Al a Ris Thr Sie Pr ο Gu Al a Lys Leu
©5 70 75 60
Arg Ser Al a 11 θ T|r Lau PfO Ser Gy Phe Asn Ser Ser Thr Asn
90
95
G η Val Val Leu Phe Val Rro G y Ttir Q y Ai a Tyr Gy Hl s Gu Sar 100 105 110
Phe Al a Asp Asn Leu Leu Lys Vai IS a Thr Asn AIaGyAIaAIa Asp 115 120 125
AJ a Val Trp Val Asn Val Pro Asn Al a (At Leu Asp Asp Val G n Sar
130 135 140
Asn Al a G u Tyr 11 e Al a Tyr Al a i I e Ser Tyr Va! Lys Al a Leu 11 e 145 1SD 155 160
G y Asp Asp Ar g Asp Leu Asn Val !IeGy Tr p Ser GnGy Asn Lau
165 170 175
Al a Thr Gn Trp Val Leu Thr Tyr Trp Pro Ser Thr Al a Pr o Lys Val 180 185 130
Arg Q n Leu 11 θ Ser Val Ser Pro Asp Ftie HsGy Thr Itef Leu Al a
195 20*0 205
Tyr G y Leu Cys Ala Sy Asn Phe G y Lys Val Al a Lys A! a Qy Al a
210 215 220
Pr o Cys Pro Pro Ser Val Leu Qn Qn Leu Tyr Ser Ser Asn Leu He 225 230 235 240
Asn Thr Leu ArgAlaAla Gy Gy Gy Asp Al a G n Val Pr o Thr Thr 245 250 255
Ser Phe Trp Ser Arg Leu Thr Asp G u Vai Val Gn Pro Gn Aia Gy
260
265
2?Q
Leu Thr Ala Ser Al a Arg te! Gy Asp Ala Arg Asn Lys Gy Val Thr
275
280
285 Asn Vat Q u Val Qn Thr Val CVs Q y Lau Ser Val QyQyQvQn
290 295 300
Tyr QyHs Ser Thr Lau Afel Ala His Pro Leu Va! Al a Al a W Thr
305 310 315 320
Lau Asp Ala Leu Lys Asn Qy Qy Pro Ala Ser Lsu Ser Arg He Arg
325 330 335
Sar Q η Ptie Arg Ai a Cys Ser Asn Val Val Al a Pr o Qy Leu Q η 340 345 350
Lsu Tbr Asp Arg Ala Lys Thr QuQy Leu Leu Ala Thr Wa Qy Ala 355 360 365
Arg IAi Q y Al a Phe Pro Ttir Lys Leu Lsu Arg Qu Pro Ala Leu Arg 370 375 3Β0
Q η Tyr Al a AS a 385

Claims (10)

1. Método para preparar um polipeptídeo, caracterizado pelo fato de compreender: a) selecionar um polipeptídeo originário que tem atividade de enzima lipolítica e tem uma seqüência de aminoácidos com pelo menos 30% de identidade com SEQ ID NO: 1, b) selecionar pelo menos um resíduo de aminoácido na seqüência correspondendo a qualquer um dos resíduos 1, 13,25,38-51,53- 55,58,69-79,91,92,96,97,99, 103, 104-110, 113, 132-168, 173, 187-193, 197- 205, 215, 223-231, 242, 244, 256, 259, 261-298, 303, 305, 308-313, ou 315 de SEQ ID NO: 1, c) alterar a seqüência de aminoácidos sendo que a alteração compreende substituição ou deleção do resíduo selecionado ou inserção de pelo menos um resíduo adjacente ao resíduo selecionado, d) preparar um polipeptídeo alterado tendo a seqüência de aminoácidos alterada, e) determinar a atividade de enzima lipolítica específica, a atividade lipolítica em pH alcalino e/ou a enanciosseletividade do polipeptídeo alterado, e f) selecionar um polipeptídeo alterado que tem uma atividade de enzima lipolítica específica maior, uma atividade mais alta em pH alcalino e/ou uma enanciosseletividade aumentada do que o polipeptídeo originário.
2. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o resíduo selecionado corresponde a qualquer um dos resíduos1,13 ,25, 38, 42, 74, 140, 143, 147, 164, 168, 190, 199, 215, 223, 242, 244 ,256, 265, 277, 280, 281, 283, 284, 285, 292, 303, 315, 135-160 ou 267-295 de SEQ ID NO: 1.
3. Método de acordo com a reivindicação 1 ou 2, caracterizado pelo fato de que a alteração compreende substituição do resíduo selecionado por um resíduo encontrado na posição correspondente de qualquer uma de SEQ ID NOS: 1-8.
4. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 3, caracterizado pelo fato de que o polipeptídeo originário é selecionado dentre SEQ ID NOS: 1-8.
5. Polipeptídeo, caracterizado pelo fato de que: a) tem atividade de enzima lipolítica, e b) tem uma seqüência de aminoácidos que tem pelo meno 80% de identidade com SEQ ID NO: 1 e comparada com SEQ ID NO: 1 compreende uma substituição, deleção ou inserção de aminoácido em uma posição correspondendo a qualquer um dos resíduos 1,13, 25, 38, 42, 74, 140, 143, 147, 164, 168, 190, 199, 215, 223, 242, 244, 256 , 265, 277, 280, 283, 284, 285, 292, 303, 315, 135-160 ou 267-295.
6. Polipeptídeo de acordo com a reivindicação 5, caracterizado pelo fato de que a diferença de SEQ ID NO: 1 compreende uma alteração correspondendo a N74Q, P143S, A281S, P38S, N292Q, L1QGPL, LIQL, I285E, L147F, L147N, N292C, L140E, P143L, A146T, P280V, A283K, A284N, T103G, A148P, W104H, A148P, N74Q, A281S, V190A, L199P, T256K, T42N, R242A, V215I, T164V, L163F, T164V, D265P, P303K, R168D, A25G, V315I, T244P, K13Q, L277I, Y91S, A92S, N96S, N97*, L99V, ou D223G.
7. Polipeptídeo de acordo com a reivindicação 5 ou 6, caracterizado pelo fato de compreender um conjunto de alterações de aminoácido em comparação com a SEQ ID NO: 1 que é: a)V139I G142N P143I L144G D145G L147T A148G V149L S150IN A151T S153A W155Y; b)Y135F V139R L140M A141V G142P P143V D145C A146P L147S A148F V149P S150KLSCA151PW155L; c)Y135F K136H V139M G142Y P143G D145C L147G A148Ν V149F S150GKVAKAGAPCA151PW155L; d) V139I G142N P143I L144G D145G L147T A148G V149L S150IN A151T S153A W155VA281S,ou e)Y135F K136H V139M G142Y P143G D145C L147G A148N V149F S150GKVAKAGAPC A151P W155LA281S.
8. Polipeptídeo de acordo com qualquer uma das reivindicações 5 a 7, caracterizado pelo fato de estar na forma imobilizada.
9. Método para realizar uma reação catalisada por lipase, caracterizado pelo fato de compreender contatar reagentes com o polipeptídeo como definido em qualquer uma das reivindicações precedentes sendo que a reação é: a) hidrólise com um éster de ácido carboxílico e água como reagentes, e um ácido carboxílico livre e um álcool como produtos, b) síntese de éster com um ácido carboxílico livre e um álcool como reagentes, e um éster de ácido carboxílico como produto, c) alcoólise com um éster de ácido carboxílico e um álcool como reagentes, ou d) acidólise com um éster de ácido carboxílico e um ácido graxo livre como reagentes.
10. Método de acordo com a reivindicação 9, caracterizado pelo fato de que a reação é hidrólise de um iso-propil-éster, ou síntese de éster ou alcoólise com iso-propanol como um reagente.
BRPI0719072-7A 2006-11-28 2007-11-26 Método para preparar um polipeptídeo, polipeptídeo, e, método para realizar uma reação catalisada por lipase BRPI0719072A2 (pt)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DKPA200601560 2006-11-28
DKPA200601560 2006-11-28
PCT/EP2007/062783 WO2008065060A2 (en) 2006-11-28 2007-11-26 Lipolytic enzyme variants

Publications (1)

Publication Number Publication Date
BRPI0719072A2 true BRPI0719072A2 (pt) 2013-12-03

Family

ID=38024416

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
BRPI0719072-7A BRPI0719072A2 (pt) 2006-11-28 2007-11-26 Método para preparar um polipeptídeo, polipeptídeo, e, método para realizar uma reação catalisada por lipase

Country Status (7)

Country Link
US (2) US20100047836A1 (pt)
EP (5) EP2267121B1 (pt)
CN (1) CN101541956B (pt)
BR (1) BRPI0719072A2 (pt)
MY (1) MY152163A (pt)
RU (1) RU2474611C2 (pt)
WO (1) WO2008065060A2 (pt)

Families Citing this family (24)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2011033039A1 (en) * 2009-09-16 2011-03-24 Basf Se An enzymatically catalyzed method of preparing mono-acylated polyols
EP2507369A1 (en) * 2009-12-03 2012-10-10 Novozymes A/S Variants of a polypeptide with lipolytic activity and improved stability
AR084876A1 (es) 2011-01-21 2013-07-10 Novozymes As Produccion de esteres alquilicos de acidos grasos
US8765425B2 (en) 2011-03-23 2014-07-01 Butamax Advanced Biofuels Llc In situ expression of lipase for enzymatic production of alcohol esters during fermentation
US8759044B2 (en) 2011-03-23 2014-06-24 Butamax Advanced Biofuels Llc In situ expression of lipase for enzymatic production of alcohol esters during fermentation
CN103827298A (zh) * 2011-07-15 2014-05-28 诺维信公司 脂肪酶变体及其编码多核苷酸
BRPI1104122A2 (pt) * 2011-08-04 2015-08-25 Brasil Pesquisa Agropec Metodo para previsão de mutantes que aumentem o índice de hidrofobicidade da superfície de proteínas
CA2856510A1 (en) * 2011-11-22 2013-05-30 Archer Daniels Midland Company Palm oil enriched in unsaturated fatty acids
CN107988181A (zh) * 2012-04-02 2018-05-04 诺维信公司 脂肪酶变体以及编码其的多核苷酸
WO2016087401A1 (en) * 2014-12-05 2016-06-09 Novozymes A/S Lipase variants and polynucleotides encoding same
CN108138203B (zh) 2015-10-09 2022-07-26 诺维信公司 酶或非酶生物柴油精制方法
EP3630880B1 (en) 2017-05-24 2025-12-17 POET Research, Inc. Enhanced alkyl ester containing oil compositions and methods of making and using the same
EP3630990A4 (en) 2017-05-24 2021-03-03 POET Research, Inc. USING AN ESTERASE TO INCREASE THE ETHYLESTER CONTENT IN FERMENTATION MEDIA
US12157822B2 (en) 2017-05-24 2024-12-03 Poet Research, Inc. Methods of producing vegetable oils with low minerals, metals, or other contaminants
CN108220269B (zh) * 2017-12-29 2021-07-20 华南理工大学 一种耐过氧化氢脂肪酶AflB晶体及其制备方法
CA3103242C (en) 2018-06-11 2023-08-29 Poet Research, Inc. Methods of refining a grain oil composition feedstock, and related systems, compositions and uses
CN109182298B (zh) * 2018-08-14 2021-05-11 浙江工业大学 一种重组脂肪酶突变体、工程菌及应用
BR112023001818A2 (pt) 2020-08-06 2023-02-23 Poet Res Inc Lipase endógena para redução de metais em óleo de milho de destilaria
CN112375751B (zh) * 2021-01-18 2021-04-06 凯莱英生命科学技术(天津)有限公司 脂肪酶突变体及其应用
EP4334467A1 (en) 2021-05-04 2024-03-13 Novozymes A/S Enzymatic treatment of feedstock for hydrotreated vegetable oil (hvo) production
EP4511501A1 (en) 2022-04-20 2025-02-26 Novozymes A/S Process for producing free fatty acids
WO2024079301A1 (en) 2022-10-14 2024-04-18 Novozymes A/S Process for selective hydrolysis of diglycerides in an oil/fat with aid of candida antarctica lipase b
JP2026508596A (ja) * 2023-03-14 2026-03-11 バイエル・アクチエンゲゼルシヤフト 改善された立体選択性を有するリパーゼ及びリパーゼに基づくキラル分割法
CN119876087A (zh) * 2025-01-08 2025-04-25 浙江工业大学 脂肪酶突变体及其在制备(s)-3-环己烯-1-甲酸中的应用

Family Cites Families (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1988002775A1 (en) 1986-10-17 1988-04-21 Novo Industri A/S Positionally non-specific lipase from candida sp, a method for producing it, its use and a recombinant dna process for producing it
SU1430888A1 (ru) * 1986-11-13 1988-10-15 Краснодарский политехнический институт Способ стереоспецифического анализа триацилглицеролов
RU1806196C (ru) * 1991-06-26 1993-03-30 Юрий Аврамович Султанович Способ получени сложных эфиров жирных кислот
DK73592D0 (da) 1992-06-03 1992-06-03 Novo Nordisk As Nyt enzym
JP2761294B2 (ja) * 1993-05-13 1998-06-04 ロデルス−クロクラーン エステル交換トリグリセリドブレンド由来のヒト母乳脂肪代用品
GB9404483D0 (en) * 1994-03-08 1994-04-20 Norsk Hydro As Refining marine oil compositions
ATE328070T1 (de) * 1998-02-17 2006-06-15 Novozymes As Lipasevariante
CN100529069C (zh) * 2001-01-10 2009-08-19 诺维信公司 脂解酶变体
KR100475133B1 (ko) * 2002-09-13 2005-03-10 한국생명공학연구원 효모 표면 발현 벡터를 이용하여 변이 리파제를스크리닝하는 방법 및 신규 변이 리파제

Also Published As

Publication number Publication date
US20130157325A1 (en) 2013-06-20
CN101541956B (zh) 2012-04-18
EP2264158A3 (en) 2011-05-18
WO2008065060A3 (en) 2009-01-08
RU2474611C2 (ru) 2013-02-10
EP2264159A3 (en) 2011-05-18
CN101541956A (zh) 2009-09-23
EP2099908A2 (en) 2009-09-16
MY152163A (en) 2014-08-15
RU2009124454A (ru) 2011-01-10
EP2264158A2 (en) 2010-12-22
EP2264157A2 (en) 2010-12-22
EP2264159A2 (en) 2010-12-22
EP2264159B1 (en) 2014-05-14
WO2008065060A2 (en) 2008-06-05
EP2264157A3 (en) 2011-05-18
EP2267121A3 (en) 2011-05-18
EP2267121B1 (en) 2014-05-14
EP2267121A2 (en) 2010-12-29
EP2264157B1 (en) 2014-05-14
EP2099908B1 (en) 2014-05-14
US20100047836A1 (en) 2010-02-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
BRPI0719072A2 (pt) Método para preparar um polipeptídeo, polipeptídeo, e, método para realizar uma reação catalisada por lipase
Stauch et al. Open and closed states of Candida antarctica lipase B: protonation and the mechanism of interfacial activation
Zisis et al. Interfacial activation of Candida antarctica lipase B: Combined evidence from experiment and simulation
Bittner et al. Impact of deep eutectic solvents (DESs) and individual DES components on alcohol dehydrogenase catalysis: connecting experimental data and molecular dynamics simulations
Schrag et al. The open conformation of a Pseudomonas lipase
Lang et al. Crystal Structure of a Bacterial Lipase fromChromobacterium viscosumATCC 6918 Refined at 1.6 Å Resolution
Kim et al. The crystal structure of a triacylglycerol lipase from Pseudomonas cepacia reveals a highly open conformation in the absence of a bound inhibitor
Carvalho et al. Cutinase structure, function and biocatalytic applications
Fernandez-Lorente et al. Interfacially activated lipases against hydrophobic supports: Effect of the support nature on the biocatalytic properties
Sazanov et al. A role for native lipids in the stabilization and two-dimensional crystallization of the Escherichia coli NADH-ubiquinone oxidoreductase (complex I)
Brault et al. Short-chain flavor ester synthesis in organic media by an E. coli whole-cell biocatalyst expressing a newly characterized heterologous lipase
Silvestrini et al. Principles of lipid–enzyme interactions in the limbus region of the catalytic site of Candida antarctica Lipase B
Wang et al. Display of fungal hydrophobin on the Pichia pastoris cell surface and its influence on Candida antarctica lipase B
Zhang et al. Structural basis by which the N-terminal polypeptide segment of Rhizopus chinensis lipase regulates its substrate binding affinity
Zhang et al. Improving the catalytic characteristics of lipase-displaying yeast cells by hydrophobic modification
Rivera et al. Functional expression, extracellular production, purification, structure modeling and biochemical characterization of Carica papaya lipase 1
Xin et al. A comparative study on kinetics and substrate specificities of Phospholipase A1 with Thermomyces lanuginosus lipase
Rozeboom et al. Crystal structures of two Bacillus carboxylesterases with different enantioselectivities
Tjørnelund et al. Candida antarctica lipase B performance in organic solvent at varying water activities studied by molecular dynamics simulations
Li et al. Highly active and stable nanobiocatalyst based on in-situ cross-linking of phospholipase D for the synthesis of phosphatidylserine
Barends et al. Acetobacter turbidans α-amino acid ester hydrolase: how a single mutation improves an antibiotic-producing enzyme
Chen et al. Improving Pseudomonas alcaligenes lipase’s diastereopreference in hydrolysis of diastereomeric mixture of menthyl propionate by site-directed mutagenesis
Kumar et al. Enhancement of stability of a lipase by subjecting to three phase partitioning (TPP): structures of native and TPP-treated lipase from Thermomyces lanuginosa
Garcia et al. Relative effectiveness of pretreatments on performance of Rhizomucor miehei lipase in nonpolar reaction media
Diaz et al. Effect of nonionic surfactants on Rhizopus homothallicus lipase activity: a comparative kinetic study

Legal Events

Date Code Title Description
B08F Application dismissed because of non-payment of annual fees [chapter 8.6 patent gazette]

Free format text: REFERENTE A 8A ANUIDADE.

B08K Patent lapsed as no evidence of payment of the annual fee has been furnished to inpi [chapter 8.11 patent gazette]

Free format text: EM VIRTUDE DO ARQUIVAMENTO PUBLICADO NA RPI 2343 DE 01-12-2015 E CONSIDERANDO AUSENCIA DE MANIFESTACAO DENTRO DOS PRAZOS LEGAIS, INFORMO QUE CABE SER MANTIDO O ARQUIVAMENTO DO PEDIDO DE PATENTE, CONFORME O DISPOSTO NO ARTIGO 12, DA RESOLUCAO 113/2013.