BRPI0903187B1 - método de predição da resposta clínica do paciente infectado pe1o vírus da dengue durante os primeiros dias após o início dos sintomas, método de diagnóstico de infecção pelo vírus da dengue, e, kit para determinar o prognóstico da resposta clínica do paciente infectado por dengue - Google Patents

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Ernesto Marques Junior
Ulisses M. Braga-neto
Eduardo Nascimento
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Fundação Oswaldo Cruz
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Abstract

marcadopes prognósticos de pesposta clínica de pacientes infectados com vírus da dengue a invenção se refere a um método para fornecer o prognóstico de resposta clínica de pacientes infectados com o vírus da dengue conduzido através da análise da expressão de um grupo de genes, bem como polimorfismo alélico e níveis de proteínas codificadas por eles através do seguintes métodos: microarranjos de dna, nortbern blot, pcr, pcr quantitativa, western blot, elisa e citometria de fluxo, o uso de qualquer dos métodos acima referidos, ou outros relacionados, é a base para desenvolvimento de kíts preditores de resposta clínica, desta forma facilitando o manejo clínico.

Description

MÉTODO DE PREDIÇÃO DA RESPOSTA CLÍNICA DO PACIENTE INFECTADO PE1O VÍRUS DA DENGUE DURANTE OS PRIMEIROS DIAS APÓS O INÍCIO DOS SINTOMAS, MÉTODO DE DIAGNÓSTICO DE INFECÇÃO PELO VÍRUS DA DENGUE, E, KIT PARA DETERMINAR O PROGNÓSTICO DA RESPOSTA CLÍNICA DO PACIENTE INFECTADO POR DENGUE
Esta invenção diz respeito a prognósticos para a resposta clínica de pacientes infectados pelo vírus da dengue, baseados no nível de expressão dos genes listados nas Tabelas 2-7, ou em suas proteínas codificadas, bem como polimorfismo alélico, em amostras biológicas.
FUNDAMENTOS DA INVENÇÃO
O vírus da dengue é um membro da família Flaviviridae, gênero flavivírus com guatro sorotipos antigenicamente distintos (DENV-1 a DENV-4). A infecção pelo vírus da dengue é um problema de saúde pública mundial, com uma incidência estimada em 50-100 milhões de casos de febre do dengue (FD ou dengue clássica), resultando em 500.000 casos clínicos de febre hemorrágica do dengue com risco de vida (FHD ou dengue hemorrágica) e 24.000 mortes por ano (Green e Rothman 2006). A FHD é caracterizada por vasculopatia, o gue leva a um extravasamento plasmático súbito gue reduz o volume sanguíneo e pode resultar em chogue hipovolêmico, o gue é conhecido como Síndrome de Chogue do Dengue (SCD) . Não há nenhuma terapia antiviral para o tratamento da infecção por dengue nem meios para impedir o desenvolvimento da FHD.
Durante a fase aguda da infecção, os pacientes com FD e FHD têm guadros clínicos muito similares. No entanto, a defervescência (depois de 2 a 7 dias do início dos sintomas) é acompanhada por sinais de perturbações circulatórias em pacientes com FHD (OMS 1999) . Por isso, acreditamos gue a assinatura genética diferenciando as duas diferentes formas
Petição 870180125506, de 03/09/2018, pág. 7/13 clinicas de dengue poderia ser uma ferramenta poderosa a ser usada em áreas endêmicas para prever a resposta do paciente, facilitando o manejo clinico.
O conceito atualmente aceito como subjacente à imunopatologia da FHD se apóia na sequência de infecção e indução de anticorpos não-neutralizantes (Endy, Nisalak et al. 2004; Pang, Cardosa et al. 2007), bem como na ativação de clones de célula T reativa-cruzada (MANGADA, Endy et al. 2002; Mongkolsapaya, Dejnirattisai et al. 2003; MANGADA Rothman e 2005; Mongkolsapaya, Duangchinda et al. 2006) ambos adquiridos após a infecção primária. Alguns dos marcadores de gravidade encontrados no sangue periférico, que foram correlacionados com o extravasamento plasmático na FHD incluem citocinas inflamatórias, quimiocinas e moléculas de aderência expressas em níveis elevados (Green, Vaughn et al. 1999; Juffrie, van der Meer et al. 2000; Mustafa, Elbishbishi
et al'. 2001; Suharti, van Gorp et al. 2002; Hatfield, Hung et
al. 2003; Nguyen, Lei et al. 2004; Cardier, Marino et al.
2005; Tseng, Lo et al. 2005) , a ativação de complemento
(Avirutnan, Punyadee et al. 2006) , além de aumentar a
frequência das células ativadas (Green, Vaughn et al. 1999; Azeredo, De Oliveira-Pinto et al. 2006) e ocorrência de apoptose (Mongkolsapaya, et al Dejnirattisai. 2003; Myint, Endy et al. 2006). Estas descobertas contribuíram para o avanço da compreensão dos mecanismos imunológicos envolvidos no desenvolvimento da FHD, mas não foi provado que nenhuma delas seja confiável ou útil como marcador biológico para uso clínico.
O microarranjo de DNA tem sido utilizado como uma ferramenta para localizar assinaturas genéticas e prever com sucesso a resposta clínica do paciente com câncer (van de
Vijver, He et al. 2002; Chen, infecções bacterianas e virai
Scherer, Magness et al. 2007)
Yu et al. 2007), bem como para
> (Ramilo, Allman et al. 2007;
. Van de Vijver et al (2002)
prognóstico de 70 genes, relataram o uso de perfil previamente associado com o risco de metástase distante precoce em pacientes jovens com câncer de mama cujos linfonodos foram negativos para a presença de células cancerosas, como um instrumento de orientação para a terapia adjuvante nesses doentes (van de
Desta forma, melhora-se a seleção
Vijver, He et al. 2002).
de pacientes que iriam se beneficiar com o tratamento adjuvante sistêmico, reduzindo as taxas tanto de tratamento excessivo como de subtratamento.
No modelo de infecção de dengue, o padrão de expressão gênica foi caracterizado junto com a fase de infecção em pessoas acometidas com a forma mais grave da doença, em duas diferentes coortes de dengue: Simmons et al. (2007) mostraram uma assinatura molecular em Células Mononucleares do Sangue Periférico (PBMCs), representando as fases aguda e convalescente da Síndrome de Choque do Dengue e eles relataram que os transcritos gênicos para 24 genes estimulados por IFN foram menos abundantes em adultos (6 pacientes) com síndrome de choque do dengue do que em 8 pacientes com dengue sem SCD, enquanto que genes envolvidos em apoptose estavam expressos em maior quantidade (Simmons, Popper et al. 2007). Recentemente Ubol et al (2008) em uma coorte de crianças da Tailândia confirmaram conceitualmente os resultados mostrados neste relatório e no estudo vietnamita, associando a diminuição da resposta imune inata e o aumento da apoptose com o desenvolvimento de FHD (Ubol, Masrinoul et al. 2008), mas o padrão genético difere do que 5 mostramos aqui. Uma possível razão pode ser a faixa etária utilizada, na medida em que sabe-se que fenotipicamente o repertório da resposta imune é diferente durante os primeiros anos, onde predomina a resposta inata, comparativamente aos adultos (Pettiford, Jason et al. 2002). Em contraste, Kruif 10 et al. (2008) relataram uma associação geral da gravidade do dengue e maior quantidade de expressão dos genes envolvidos na resposta imune inata (de Kruif, Setiati et al. 2008).
Vários exames laboratoriais de dengue baseados em sorologia ou detecção viral estão disponíveis e são capazes 15 de confirmar o diagnóstico de infecção de dengue. Quando utilizados separadamente, cada um desses exames têm limitações, porém, quando utilizados nas combinações corretas, é possível confirmar ou afastar com segurança o diagnóstico de infecção pelo vírus da dengue. No entanto, a maior 20 limitação no manejo clínico de casos de dengue é a capacidade do clínico avaliar o risco de um determinado paciente infectado de dengue desenvolver os seus sintomas fatais e a sua real necessidade de ser hospitalizado. A incidência de FHD é de aproximadamente 1% e é fatal se não for tratada 25 rapidamente. Mesmo sob assistência médica a taxa de mortalidade devido a FHD pode atingir 10 a 20%. Infelizmente a maior parte dessas mortes poderíam ser evitadas com os cuidados médicos adequados. Um dos principais culpados da falta de assistência adequada é o caos causado pelos grandes surtos. A Organização Mundial de Saúde (OMS) estabeleceu critérios clínicos para definir os casos de FHD, mas as dificuldades tanto para preencher esses critérios como para identificar precocemente os casos graves, fazem com que o 5 manejo clínico das formas graves da doença se torne um desafio até mesmo maior (Bandyopadhyay, Lum et al. 2006; Deen, Harris et al. 2006). Por isso, a busca de novas ferramentas para prever a resposta clínica do paciente é essencial para facilitar a avaliação da necessidade de intervenções médicas.
SUMÁRIO DA INVENÇÃO
A presente invenção consiste num método de avaliar a resposta clinica do paciente infectado com o virus da dengue durante a fase aguda da infecção e antes de surgirem os sinais de vasculopatia. 0 método consiste na análise dos 15 niveis de expressão de um grupo de genes (Tabelas 2-7), ou proteínas codificadas por eles, assim como polimorfismos alélicos.
Num aspecto da invenção, a predição da resposta clínica dos pacientes infectados com o vírus da dengue é baseada na 20 análise de expressão dos 73 genes mostrados na Tabela 6, originados pela combinação dos melhores 200 genes mais significativos (menor valor p) e 200 maiores diferenças na expressão (magnitude fold change) entre dengue clássica e dengue hemorrágica.
Num outro aspecto da invenção, os genes na Tabela 2 são usados para caracterização e diferenciação da expressão gênica em pessoas infectadas com vírus da dengue (FD + FHD) de outras causas de doenças febris (não dengue ou ND).
Ainda um aspecto da invenção, diz respeito ao uso da Análise de Discriminação Linear, como regra de classificação, e resubstituição potencializada (bolstered resubstitution), como estimador de erro, de genes na forma isolada, dupla, trio ou mais genes para predizer resposta clínica de pacientes infectados com vírus da dengue.
Em outro aspecto da invenção, a expressão de duplas de genes baseados na lista de 1981 genes (Tabela 7) é usada como classificador para predizer resposta clínica de pacientes infectados com vírus da dengue.
Em outro aspecto da invenção, a expressão de trio de genes baseados na lista de 1981 genes (Tabela 7) é usada como classificador para predizer resposta clínica de pacientes infectados com vírus da dengue.
Em outro aspecto da invenção, a expressão de quarteto de genes baseados na lista de 1981 genes (Tabela 7) é usada como classificador para predizer resposta clínica de pacientes infectados com vírus da dengue.
Em ainda um outro aspecto da invenção, a avaliação da expressão gênica pode ser realizada por qualquer das técnicas destinadas a detectar RNA, cDNA, cRNA (PCR, RT-PCR, PCR quantitativa, microarranjo de DNA, Northern biotting e outros).
Em ainda um outro aspecto da invenção, a avaliação dos níveis dos produtos proteicos codificados pelos genes mostrados na Tabela 7 pode ser realizada por qualquer técnica destinada a detectar formas desnaturadas e nativas das proteínas (ELISA, Western biotting, dot-blotting, citometria de fluxo e outros).
ι
BREVE DESCRIÇÃO DAS FIGURAS
FIG. 1 mostra medidas de ruído e eficiência. A seta indica o único arranjo, no grupo não dengue, que mostrou reduzida tanto a relação sinal/ruído quanto percentagem de chamadas presentes.
FIG. 2 é um gráfico de degradação de RNA.
FIG. 3 mostra a análise exploratória dos dados baseados nos 1981 genes selecionados. (A) dendrograma de agrupamento hierárquico. (B) Gráfico MDS 2-D. (C) Gráfico MDS 3-D. A
elipse em (B) representa os dois maiores grupos de amostras.
FIG. 4 mostra os 40 melhores genes diferencialmente
expressos entre amostras FD e FHD. (A) Mapa de expressão com
anotação do GeneBank. (B) Dendograma de agrupamento
hierárquico (apenas os 40 melhores genes). (C) Gráfico MDS 3D (apenas os 40 melhores genes) .
FIG. 5 mostra o classificador para o par de genes PSMB9 e MT2A, na discriminação de FD contra FHD. Menor expressão de ambos os genes é característica de FHD, enquanto maior expressão de ambos os genes é característica de FD. A probabilidade estimada de erro para este classificador é de apenas 5.38%.
FIG. 6 mostra níveis de expressão de genes para discriminação entre pacientes FD e FHD. (A) para todos os genes testados, os ensaios de pPCR foram realizados usando uma mistura de 8 pacientes FD e 8 FHD usados no ensaio de microarranjos. (B) Para todos os genes, os ensaios de qPCR foram realizados para um grupo de 8 amostras FD e 8 FHD usados no ensaio de microarranjo (coluna branca), ou um grupo de 8 amostras FD e 8 FHD independentes (coluna cinza) . O experimento foi realizado duas vez e cada grupo foi analisado em triplicata.
FIG. 7 fornece gráficos Vulcões mostrando os valores p correlacionados com a magnitude de diferença de expressão (fold change) em pacientes FD versus FHD e casos de dengue (FD+FHD) versus não dengue. Os genes destacados em vermelho e azul representam os 40 melhores genes de acordo com os valores p e magnitude de diferença de expressão respectivamente.
DESCRIÇÃO DETALHADA DA INVENÇÃO
A tecnologia de microarranjos de DNA é uma importante ferramenta todos os para estudar a expressão de RNAm simultaneamente de genes num genoma. Esta tecnologia consiste de milhares de diferentes sequências de
DNA representando diferentes genes adsorvidos em regiões conhecidas de uma matriz sólida, tais como lâmina de vidro.
As lâminas podem ser hibridizadas com sondas derivadas de RNAm de células ou tecidos. Arranjos de oligonucleotidios (composto por DNA de
25-mers) se baseia na estratégia do pareamento perfeito/despareamento (match/mismatch) da sonda no chip de
DNA, onde são usadas sondas que pareiam perfeitamente (match) e sondas que diferem da primeira por uma base em seu centro (mismatch) e que por isso não hibridizam ao chip de DNA. Neste tipo de microarranjo, apenas um fluorocromo é usado para marcação do RNA complementar (RNAc) e o sinal é detectado usando um equipamento de escaneamento óptico. A quantificação da sonda hibridizada é realizada comparando os sinais dos oligos mismatch (hibridização não especifica) e os oligos que pareiam perfeitamente (match).
«
I
Microarranjos de DNA tem sido usado como ferramenta para achar assinaturas gênicas e predizer com sucesso a resposta clinica de pacientes com câncer (van de Vijver, He et al. 2002; Chen, Yu et al. 2007) assim como para infecções bacterianas e virais (Ramilo, Allman et al. 2007; Scherer, Magness et al. 2007). van de Vijver et al (2002) relataram o uso de perfil prognóstico usando 70 genes como ferramenta para guiar a terapia adjuvante nesses pacientes através da seleção daqueles pacientes que realmente se beneficiariam desse tratamento adjuvante sistêmico e reduzindo tanto a taxa de tratamento excessivo ou subtratamento. Os 70 genes utilizados por esses autores foram previamente associados com risco de metástase distante em pacientes jovens com câncer de mama e cujo linfonodos foram negativos para a presença de células cancerosas (van de Vijver, He et al. 2002).
Há muitas evidências que fatores genéticos, envolvidos em susceptibilidade/resistência à doenças infecciosas, influenciam a resposta imune em humanos. Esses fatores são complexos e geneticamente controlados e não seguem um perfil de herança Mendeliana (Clementi and Di Gianantonio 2006). Alguns desses fatores identificados por microarranjos de DNA são envolvidos com alteração da regulação gênica e algumas vezes devido a polimorfismos que interferem com a expressão gênica de várias formas, seja diretamente se ligando ao promotor, seja interferindo na cascata de sinais que interfere com a ativação gênica. Polimorfismo genético do hospedeiro relacionado com resposta imune tem sido mostrado estar correlacionado com expressão gênica alterada e susceptibilidade a desenvolver FHD, tais como o alelo TNF-308, associado com elevados níveis de TNFa, tem sido correlacionado com aumentado risco de desenvolver a forma mais grave da doença (Fernandez-Mestre, Gendzekhadze et al. 2004; Soundravally and Hoti 2007) . Uma associação tem sido recentemente relatada entre o genótipo selvagem ΆΆ MBL2, altos níveis de MBL e alto risco de desenvolver trombocitopenia associado com infecção pelo vírus da dengue (Acioli-Santos, Segat et al. 2008). Por outro lado, polimorfismo no promotor de CD209 (Sakuntabhai, Turbpaiboon et al. 2005), foi associado com reduzida expressão de DC-SIGN e, possivelmente, reduzida susceptibilidade de células dendriticas a infecção pelo vírus da dengue. Portanto, a procura por alteração na expressão gênica entre diferentes quadros clínicos de dengue usando microarranjos de DNA pode elucidar em alta escala os fatores genéticos e mecanismos imunopatológicos relacionados com gravidade da dengue.
Usando essa tecnologia, o perfil de expressão gênica foi caracterizado em pessoas que desenvolveram FHD em duas diferentes coortes:
Simmons at al. (2007) mostraram uma assinatura molecular em células mononucleares de sangue periférico (PBMC) representando as fases aguda convalescente de pacientes que desenvolveram síndrome de choque de dengue (SCD). Neste trabalho eles relataram que transcritos gênicos para 24 genes estimulados por interferon estavam menos abundante em adultos (6 pacientes) com SCD do que e 8 pacientes com pacientes FHD que não desenvolveram choque, enquanto aqueles genes envolvidos em apoptose estavam expressos em maior quantidade Recentemente Ubol et al (2008) numa coorte de crianças Tailandesas também observaram redução ι
na expressão de genes da imunidade inata e aumento da expressão de genes envolvidos em apoptose com gravidade da infecção pelo vírus da dengue (Ubol, Masrinoul et al. 2008).
Durante a fase aguda da infecção, pacientes afetados com a forma benigna (FD) e maligna (FHD) da doença desenvolvem o mesmo quadro clínico. No entanto, durante o período de defervescência (4 a 7 dias do início dos sintomas) é acompanhado pelos distúrbios circulatórios, cuja magnitude é diretamente proporcional a gravidade da doença (WHO 1999). Com isso, os eventos que precedem a defervescência são determinantes para resposta clínica do paciente.
A presente invenção fornece o uso da expressão diferencial de um grupo de genes como ferramenta prognostica para predizer resposta clínica de pacientes infectados com dengue baseado nos dados de expressão gênica obtida, antes de começarem os sintomas circulatórios, usando microarranjos de oligonucleotidios. Amostras de sangue heparinizado (também pode ser utilizado citrato de sódio ou EDTA como anticoagulante) coletados de pacientes (Tabela 1), cuja infecção pelo vírus da dengue foi confirmada por sorologia para IgM assim como isolamento viral ou detecção de RNA viral através de RT-PCR; foram usados. Isolamento de PBMC usando gradiente de densidade pode ser usado para minimizar o ruído causado pelos granulócitos. Consequentemente, moderada a pequena mudanças na expressão gênica entre as diferentes manifestações clínicas de dengue pode ser prontamente detectada. Uma vez obtidas as amostras contendo as células, o RNA mensageiro ou total pode ser extraído e amplificado para avaliação da expressão gênica. O RNA amplificado é então marcado para que este possa ser hibridizado num microarranjo de DNA, que por sua vez, é escaneado e os dados obtidos são processados para a obtenção dos dados de perfil de expressão gênica.
A qualidade dos dados do microarranjo de DNA é avaliada usando vários critérios:
inspeção visual, medida da relação ruido/eficiência, genes controles embutidos (spiked in) de amplificação (dap, thr, phe, lys) e hibridização (bioB, bioC, bioD, cre), expressão de genes constitutivos (GAPDH - gliceraldeido-
3-fosfatase desidrogenase humano- e beta actina), e gráficos de degradação de RNA.
Inspeção visual baseada em arquivos de alta definição DAT não deve revelar sinais de arranhões ou manchas e as sondas oligos B2 devem ser visíveis (perfil de tabuleiro de xadrez bem como o nome do arranjo).
Medida da relação ruído/eficiência é feita pelo programa MAS 5.0. Fator Q de ruído, background, fator de escalonamento e percentagem de sondas presentes devem ser similar entre os microarranjos.
A seleção dos genes preditores de resposta clínica de pacientes infectados com vírus da dengue, bem como aqueles característicos de infecção pelo vírus da dengue independente da manifestação clínica [comparação entre casos de dengue (FD + FHD) e grupo não dengue ou ND, cuja etiologia da doença febril foi desconhecida mas que foi descartada a possibilidade de ser pelo vírus da dengue], foi baseado em 26 microarranjos de oligonucleotidios distribuídos como se segue:
oriundos de pacientes com FD, 10 de pacientes FHD e 8 de pacientes ND. Esses microarranjos foram analisados através do programa Affymetrix MAS 5.0 (Hubbell, Liu et al. 2002) para normatizar os dados e produzir sinal e detectar as sondas presentes dentre os 54.675 transcritos gênicos em cada microarranjo. Desses, 12.299 transcritos foram considerados presentes (p<0.04) em todas os microarranjos, enquanto 20.365 transcritos foram considerados ausentes em qualquer dos microarranjos.
Para manter apenas os genes mais promissores para futuras análises, foram empregados dois filtros inespecificos: (i) filtro de detecção para eliminar genes não expressos, o que manteve apenas os genes considerados presentes em pelo menos 24 dos 26 microarranjos, resultando num total de 15.848 genes. Desta forma, foram tolerados 3.549 genes (15.848 - 12.299 = 3.549) que foram considerados ausentes em um ou dois microarranjos; (ii) filtro de variância para eliminar genes de expressão constitutiva, o que manteve os maiores 1/8 dos 15.848 genes previamente citados, resultando em 1981 genes com potencial prognóstico (Tabela 7). Esses genes foram confirmados como potenciais prognósticos quando foram realizados agrupamento hierárquico e escalonamento multidimensional em 2D e 3-D (Figure 3) , revelando a formação de dois grandes grupos, um grupo contendo amostras ND e metade das amostras FD; e outro grupo contendo pacientes FHD, duas amostras ND e a outra metade dos pacientes FD. A medida de dissimilaridade usada foi 1 - r, onde r é correlação de Pearson dos valores transformados em log. Os microrranjos foram coloridos de acordo com a classe diagnostica. Nota-se que as amostras FHD constituem um grupo mais coeso do que o grupo ND, representado por pacientes com doenças febris de etiologia desconhecida. Enquanto as amostras FD podem ser divididas em dois grupos, um similar e outro diferente das amostras FHD, este último estando mais próximo das amostras ND. O pequeno valor de estresse (13.52% no Gráfico 2-D e 7.32% no Gráfico 3-D), particularmente no Gráfico 3-D significa que a estrutura que os dados representam é intrinsecamente de baixa dimensão, o que indica que um pequeno número de assinaturas gênicas pode representar o conteúdo discriminatório dos dados.
Em seguida foi realizado um teste estatístico entre as médias (Welch two-sample t-tests) para achar os genes que foram diferencialmente expressos entre os diferentes grupos analisados. Duas comparações foram consideradas: FD verso FHD e Dengue (FD+FHD) verso ND. Gráficos de vulcão na Figura 4 mostram que os valores p foram bem correlacionados com magnitude de diferença de expressão (fold change) em ambas as comparações. A lista de genes com maiores fold-change mostrados nos gráficos vulcão são mostrados nas Tabelas 2 e 3
A Figura 5 mostra o mapa de expressão para os 40 mais significativos (menores valores p) genes que discriminam os grupos FD de FHD de acordo com o critério do teste Welch t, assim como o agrupamento hierárquico e gráficos MDS para os mesmos 40 genes.
Entre os 200 mais significativos genes diferencialmente expressos entre FD e FHD de acordo com o Welch two-sample ttests foi comparado com 200 genes com maiores fold-change da média de expressão dos níveis de RNAm, há 7 3 genes em comum (Tabela 6) , o que representa os melhores genes mais significativos e com maior diferença na magnitude de expressão (fold-change) entre FD e FHD.
Dentre os genes diferencialmente expressos entre FD e FHD, 19 fazem parte da categoria de resposta imune, incluindo HLA-ΏΡαβ genes, complement factor D, CX3CR, MyD88, TNFSF17 (BCMA), TNFSF13 (APRIL). Sete genes foram incluídos no grupo de resposta a defesa, entre eles temos o gene de Resistência a mixovírus (Mx), 2’, 5'-oligoadenilato sintetase (OAS1 and OAS2) e fatores estimulados por IFN. Estes foram expressos em menor magnitude em pessoas que depois desenvolveram FHD. Este genes tem sido implicados em resposta imune inata, confirmando que esse braço da resposta imune pode ser crucial para a resposta clínica de pacientes infectados com o vírus da dengue. Alem disso, 6 genes (PDCD4, PACAP, Tumor protein D52, MAGED1, proapoptotic caspase adaptor protein and TNF ligand super family) associados com apoptose estão expressos em maior quantidade em pacientes FHD. Além disso, CD53, uma tetraspanina produzida por monócitos e linfócitos B e previne essas células de sofrerem apoptose (Yunta and Lazo 2003) estava expressa em menor quantidade no grupo FHD, reforçando a premissa de que aumento de células que sofre apoptose está associado com desenvolvimento da forma mais severa da doença.
Comparando com o estudo conduzido por Simmons et al (2007) (Simmons, Popper et al. 2007), existe uma consistência nos genes propostos como sendo prognósticos para desenvolvimento de FHD. Neste estudo, alguns genes estimulados por IFN, cuja expressão estava reduzida em pacientes desenvolvendo SCD, tais como as MX, IFIT, and OAS, bem como níveis elevados de pro-apoptotíc caspase adaptor protein e
PDCD5 (programmed cell death 5) fazem parte da nossa lista de genes prognósticos.
Desta forma, com base nos 1981 genes identificados foram selecionados grupos de genes marcadores de FHD para serem utilizados em ensaios mais simples, tais como PCR quantitativa. Para isso, foi realizada uma seleção exaustiva com todas as possíveis combinações de genes isolados ou combinados em forma de dupla ou trio, através análise discriminante linear como método de classificação, implementado pela estimativa direta das médias das amostras e matrizes de covariância para cada classe diagnostica (Braga-Neto 2005); e precisão de classificação estimada pelo método de resubstituição potencializada (bolstead resubstitution, Braga-Neto 2004), que é ideal para seleção de grupo de genes numa situação com número menor de amostra (Sima, Attoor et al. 2005; Sima, Braga-Neto et al. 2005).
A Tabela 5 mostra os melhores genes na forma isolada (40) ou combinada [dupla (40) ou trio (100)], ranqueados pelo erro estimado. Há 37 únicos genes entre os melhores 40 pares, enquanto há 86 únicos genes em os melhores 100 trios. A lista de trios é dominada pelos genes PSMB9, MT2A e LOC400368. A média do erro estimado para os melhores classificadores contendo 1 gene (40) = 0.1639 ± 0.0286, 2 genes (40) = 0.0686 ± 0.0096, 3 genes (100) = 0.0395 ± 0.0040, o que indica que a classificação usando pares de genes é mais precisa que 1 gene, enquanto a classificação utilizando 3 genes é mais precisa do que 2 genes (a margem de erro acima se refere a um intervalo de confidência de 95%) . O método de seleção acima descrito com 2 ou 3 genes tem um potencial de selecionar genes que não são possíveis de serem encontrados usando métodos univariados, tais como t-test. Isto pode ser visto na lista com os melhores duplas de classificadores. Por exemplo, o gene HLA-F (cuja expressão é reduzida in FHD em relação a FD) A Figura 6 mostra o gráfico contendo um dos genes classificadores baseado na dupla de genes PSMB9 e MT2A. A probabilidade de erro em futuros dados para este classificador é de 5.38%. Neste caso, reduzida expressão de ambos os genes é característica de FHD, enquanto aumento de expressão é característica de FD. Para confirmar a potencialidade desses genes como preditores de gravidade de dengue, selecionamos alguns (PSMB9, MT2A, HLA-F and C3aRl) para desenvolver ensaios de RT-PCR quantitativo com amostras FD e FHD. Os genes foram amplificados e detectados usando o ensaio de expressão gênica TaqMan® com iniciadores (primers) e sondas comercialmente disponíveis (Applied Biosystems). O RNA foi extraído com auxilio do kit RNeasy (Qiagen) . O RNA total foi reversamente transcrito usando o sistema de síntese da primeira fita SuperScript III para PCR quantitativo usando iniciadores aleatórios (random primers) e a PCR quantitativa foi realizada no ABI PRISM 7500 (Applied Biosystems). Beta actina foi usado como controle endógeno e todos os dados foram normalizados baseados neste gene constitutivo. As amostras usadas neste ensaio são descritas na Tabela 1 (amostras de pacientes ND, bem como os pacientes FHD 105 e 112 não foram usados). Os resultados de RT-PCR quantitativa foram comparáveis com aqueles obtidos nos ensaios de microarranjos (Figura 7). Além disso, usando um grupo de amostras independentes daquelas amostras usadas nos ensaios de microarranjos, os níveis de acima também foram confirmados resultados do ensaio de PCR expressão dos genes citados (Figura 7). Desta forma, os quantitativa confirmaram a expressão dos genes selecionados em amostras coletadas na primeira visita médica de um paciente infectado com vírus da dengue, podendo predizer se uma pessoa infectada pelo vírus da dengue pode desenvolver ou não FHD. Portanto, o objeto desta invenção representa um meio útil de guiar o manejo clínico de pacientes com dengue.
Métodos de escolha para estabelecer níveis de expressão gênica para predição de resposta clínica de pacientes com dengue incluem microarranjos de DNA, RT-PCR, northern blot, RT-PCR competitiva, RT-PCR em tempo real, diferential display RT-PCR. Enquanto é possível conduzir essas técnicas usando reações de PCR individuais, é melhor amplificar o DNA complementar (cDNA) e analisá-lo via PCR quantitativa e então normalizar os resultados usando a expressão de algum gene constitutivo. Em seguida, as análises poderão ser feitas usando quantificação tanto absoluta quanto relativa para que o perfil de expressão gênica possa ser determinado.
Níveis de proteínas codificadas pelos genes preditivos de gravidade da dengue, quantificados de qualquer fluido corpóreo (sangue, plasma, soro, exudados) podem ser usadas para prognóstico de gravidade da dengue. No entanto, amostras de plasma são preferidas. Para estes tipos de amostras, qualquer ensaio imunológico (ELISA, imunofluorescência, western blot, dot blot etc) pode ser empregado. Além do mais, níveis de proteínas podem ser indiretamente avaliados através da análise da frequência de células (PBMC, por exemplo) expressando uma dada proteína em qualquer compartimento de células por citometria de fluxo.
O uso de qualquer dos métodos acima mencionados e outros relacionados constitui uma fonte para desenvolvimento de kits preditores de gravidade da dengue durante a fase aguda da infecção e antes que o extravasamento plasmático ocorra em pacientes FHD.
A invenção é ilustrada pelo seguintes exemplos a seguir os quais não devem ser considerados como limitantes do escopo de proteção.
EXEMPLOS
Os genes analisados de acordo com esta invenção são tipicamente relacionados a completa sequência de ácidos nucléicos que codificam para produção de uma proteína ou peptídeo. No entanto, a identificação da sequência completa não é necessária do ponto de vista analítico. Isto é, porções da sequência ou ESTs podem ser selecionadas de acordo com os princípios bem conhecidos para as quais as sondas podem ser desenhadas para avaliar a expressão gênica para o correspondente gene.
Exemplo 1 - Desenho da coorte de dengue e estratégia para estudos de genômica funcional
Uma coorte de casos febris de casos suspeitos de infecção pelo vírus da dengue atendidos em 3 hospitais da cidade de Recife, Pernambuco, Brasil, foi estabelecido e descrito (Cordeiro, Schatzmayr et al. 2007; Cordeiro, Silva et al. 2007). Brevemente, apenas a completa explicação dos objetivos do estudo, a cada participante desta coorte (ou responsável) foi solicitado a assinatura do termo de consentimento e foi pedido uma doação sequencial de sangue dentro de um período de 30 dias apos o inicio dos sintomas. Soro, plasma e PBMC foram separados e criopreservados. 0 diagnóstico de dengue foi realizado através de isolamento viral em células C6/36 (Igarashi 1978) e RT-PCR (Lanciotti, Calisher et al. 1992) nas amostras coletadas no dia da admissão (primeira amostra) assim como através de sorologia para identificação de IgM (Bio-Manguinhos, Fundação Oswaldo Cruz, Brasil ou PanBio, Pty., Ltd., Brisbane, Austrália) e IgG (PanBio, Pty., Ltd., Brisbane, Austrália) anti-dengue na primeira e subseguentes amostras. 0 tipo de infecção foi caracterizado baseado na cinética de produção de IgM/IgG e títulos de anticorpos em ensaio de inibição de hemaglutinação (HI) (Clarke and Casais 1958).
Os casos de dengue (confirmados por sorologia, RT-PCR ou isolamento viral) foram clinicamente classificados de acordo com o critério da Organização Mundial de Saúde em duas classes: febre de dengue (FD ou dengue clássica) e febre hemorrágica do dengue (FHD) (OPAS 1995). Os casos de FD foram caracterizados por febre (39°C to 40°C) durando até 7 dias acompanhado por pelo menos 2 dos sintomas, tais com odor de cabeça, dor retrorbital, mialgia, artralgia e rash. Os casos de FHD foram definidos com a mesma sintomatologia encontrada em FD, mas com evidência de hemorragia, trombocitopenia (plaquetas <1000.000/mm3) e extravasamento plasmático seguindo a defervescência.
Este estudo foi revisado e aprovado pelo comitê de ética do Ministério da Saúde Brasileiro CONEP : 4909; Processo n° 25000.119007/2002-03; CEP: 68/02. Além disso, o comitê de revisão institucional da Universidade Johns Hopkins (EUA) também revisou e aprovou este estudo como protocolo JHM-IRB-3:
03-08-27-01.
Os estudos de genômica funcional foram realizados com amostras de PBMC coletadas no momento da primeira visita médica. Amostras provenientes de 18 casos confirmados de dengue (RT-PCR, isolamento viral e/ou IgM positivos), genótipo III, e 8 amostras controles provenientes de casos febris que foram negativos para dengue em todos os testes realizados em 3 ou mais amostras (aqui chamados de não dengue ou ND) foram usados nessa avaliação. As amostras foram divididas em três grupos: FD, FHD e ND. As amostras referentes a esses três grupos foram selecionadas para evitar diferença significante em relação a idade, gênero, histórico de infecção pelo virus da dengue e dias de sintomas. Nenhum dos pacientes apresentaram sintomas de FHD no momento que as amostras usadas nessa avaliação foram coletadas. No momento da coleta das amostras, os pacientes relataram que tiveram sintomas por menos de 8 dias (media de 5.3 dias). Entre os casos confirmados de dengue, 8 foram caracterizados como FD e 10 foram classificados como FHD (Tabela 1) . Em negrito na Tabela 1 estão indicadas as amostras usadas exclusivamente nos ensaios de qPCR. FD: febre do dengue; FHD: febre hemorrágica do dengue; ND: Non-Dengue; M: macho; F: fêmea; Pos: positivo; Neg: negativo; -: sem informação.
Exemplo 2 - Processamento das amostras para hibridização nos chips gênicos
Amostras de sangue coletados dos pacientes cadastrados nesta avaliação foram coletadas em tubos vacutainers heparinizados (BD Vacutainer) e dentro 2 horas da coleta, as amostras PBMC foram separadas por gradiente de densidade usando Ficoll-Paque (Amersham Biosciences) e criopreservadas em 10% (v/v) de dimetil sulfoxide (DMSO; Sigma-Aldrich) em soro fetal bovino inativado (FBS; Hyclone). Quatro milhões de células foram descongelados e imediatamente lisadas com Trizol (Invitrogen) para extração de RNA total com clorofórmio e precipitação com álcool isopropilico de acordo com as instruções do fabricante [a expressão usando amostras 10 frescas ou congeladas foram comparadas e se mostraram ser similares, razão pela qual células congeladas foram escolhidas para estudos de genômica funcional (dados não mostrados)] .
O RNA total foi, então, purificado usando o kit RNeasy 15 MinElute Cleanup (Qiagen) de acordo com o protocolo do fabricante e quantificado por espectrofotometria a 260nm e 280nm (espectro ultravioleta). RNA total foi usado para a síntese de RNA complementar (cRNA) através do kit de marcação do alvo em dois ciclos (Affymetrix). Brevemente, RNA isolado 20 de PBMC foi marcado com biotina e hibridizado a microarranjos de oligonucleotideos (Affymetrix) usando um método de síntese de cDNA em dois ciclos. No primeiro ciclo, a primeira fita de cDNA foi preparada usando um iniciador T7-(dT) e a transcriptase reversa Superscript II (Invitrogen) a partir de 25 10-100ng de RNA celular. A síntese da segunda fita foi realizada usando DNA polimerase I de Escherichia coli e cDNA de dupla fita foi usado no ensaio de transcrição in vitro (IVT) para amplificação de cRNA usando o kit Megascript T7 (Ambion). O produto deste primeiro ciclo de reações foi usado para transcrição reversa de cDNA como descrito para o primeiro ciclo. Este cDNA foi usado para IVT para síntese de cRNA marcado com biotina, que foi fragmentado e enviado para o Microarray Core Facility na Universidade Johns Hopkins para hibridização do cRNA ao chip de DNA humano U133 Plus 2.0 (Affymetrix), marcação e escaneamento.
Exemplo 3 - Controle de qualidade dos microarranjos
A qualidade dos dados dos microarranjos foi avaliada usando os seguintes critérios: inspeção visual, medidas da relação ruído/eficiência, controles embutidos, expressão de genes constitutivos, e gráficos de degradação de RNA. Inspeção visual baseada em arquivos de alta resolução DAT não revelaram arranhões ou manchas, e as sondas B2-oligo (num formato de tabuleiro de xadrez e o nome do microarranjo) foram também visíveis. Medidas de ruído/eficiência foram feitas pelo programa Affymetrix MAS 5.0 que pode ser usado para avaliar a qualidade dos microarranjos (Figure 1). Fatores Q de ruído, background, fatores de escalonamento e percentagem de genes presentes foram similares em todas os microarranjos. Os valores médios de background foram abaixo de 100 para 20 dos 26 microarranjos; os fatores de escalonamento foram dentro da ordem de 3x para 2 5 dos 2 6 microarranjos; e a percentagem de genes presentes foi em torno de 40% ou mais para 25 dos 26 microarranjos. Nenhum dos 6 microarranjos que apresentaram alto background tiveram uma taxa de genes presentes significantemente abaixo de 40%. Todos as sondas 3' e as sondas da parte intermediária para todos os genes controles embutidos (dap, thr, phe, lys) estavam presentes em todos os microarranjos, assim como para o grupo de genes procarióticos usados para o controle da hibridização (bioB, bioC, bioD, cre) e genes constitutivos
GAPDH (gliceraldeido-3-fosfatase desidrogenase humano) e beta-actina.Além do mais, o gráfico de degradação de RNA mostrando a intensidade média das sondas na mesma posição numérica em todos os grupos de sondas (para todos os genes) demonstra uma consistente tendência de aumento na intensidade de sinal a partir do final 5' para o final 3' , o que é esperado devido a decréscimo na eficiência na síntese de cDNA (Figura 2).
Exemplo 5 - Validação dos dados de Microarranjo de DNA através de PCR em tempo real quantitativo
Quatro genes diferencialmente expressos entre DF e FHD (MT2A, PSMB9, C3aRl e HLA-F) foram selecionados para quantificação por PCR em tempo real quantitativo (qPCR). Os genes foram amplificados e detectados usando ensaios de expressão gênica TaqMan® com iniciadores e sondas comercialmente disponíveis (Applied Biosystems). Extração de
RNA foi realizada usando o kit RNease (Qiagen) de acordo com as instruções do fabricante. RNA total foi reversamente transcrito a cDNA usando o sistema de síntese de primeira fita Superscript
III (Invitrogen) para qPCR usando iniciadores aleatórios (radom primers) de acordo com a sugestão do fabricante.
qPCR foi realizado no aparelho ABI
PRISM 7500 (Applied Biosystems). O gene para beta actina foi selecionado como um controle endógeno e todos os dados foram normalizados contra este. A reação foi realizada em triplicata e incluiu 2 μΐ de cDNA, iniciadores (20 μΜ cada) e 6.25 μΜ da sonda especifica ou comercialmente pré-desenhada mistura para ensaio de expressão gênica (Applied Biosystems), beta-actina humana (Applied Biosystems), mistura universal para PCR TaqMan (Applied Biosystems) e água adicionados para um volume final de 25 μΐ. Triplicatas de controles não templates (NTC) foram incluídos cada vez que qPCR foi realizada. Os ciclos de reações foram: após incubação de 2min a 50°C e 10 minutos a 95°C, as amostras passaram por 40 ciclos de 95°C por 15 segundos e 60°C por lmin. A linha de base e o threshold utilizados para a determinação do Cycle threshold foram ajustados manualmente através do programa Sequence Detection Software, versão 1.4 (Applied Biosystems). A eficiência de amplificação (E) da molécula-alvo foi calculada a partir da fórmula (E= 10Λ(-1/Slope) - 1) onde slope é inclinação da reta gerada pelos Cts obtidos de curva padrão, dado automaticamente pelo programa. Para os cálculos de quantificação relativa, foi utilizado o método baseado nos valores de Delta Ct [ABI PRISM® 7000 Sequence Detection System and AppliedBiosystems 7500 Real-Time PCR System - User Bulletin, Applied Biosystems] uma vez que os ensaios apresentam eficiência de amplificação de 100% ± 10% [Application Note 127AP05-02]. As amostras usadas nos ensaios de qPCR são descritas na Tabela 1 (amostras de pacientes ND e pacientes FHD número 105 e 112 não foram usados).
Exemplo 6 - Análise Estatística
Controle de qualidade dos dados dos pacientes, análise estatística e gráficos foram realizados usando o programa Affymetrix MAS 5.0 (Hubbell, Liu et al. 2002) e o pacote estatístico R de acesso aberto, versão 2.5.0 (Ihaka 1996) e biblioteca adicional, em particular a biblioteca BioConductor, versão 1.16 (Gentleman, Carey et al. 2004). Dendogramas e gráficos MDS foram produzidos com as funções R hclust e isoMDS, respectivamente, enquanto os mapas de expressão (heatmaps) foram obtidos com as funções hset.emap e heatmap. Os valores p correspondentes a two-tailed Welch's two-sample t test foram obtidos com a função t-test. Análise de categoria funcional foi realizada com o programa EASE (Expression Analysis Systematic Explorer) no website DAVID Bioinformatic (http://david.abcc.ncifcrf.gov) (Dennis, Sherman et al. 2003). 0 método de classificação usou análise discriminante linear implementado pela direta estimativa da média das amostras e matrizes de covariância para cada classe diagnostica (Braga-Neto 2005). A precisão da classificação foi estimada pelo método de resubstituição potencializada (bolsted resubstitution, Braga-Neto 2004), que é adequado para seleção de grupo de genes quando o número de amostra é baixo (Sima, Attoor et al. 2005; Sima, Braga-Neto et al. 2005).
Exemplo 7 - Processamento dos dados de Microarranjos de DNA
Programa Affymetrix MAS 5.0 foi usado para escalonar os dados e produzir sinal e detection calls para os 54.675 genes em cada dos 26 microarranjos. Destes, 12.2999 foram considerados presentes (p<0.04) em todas os microarranjos, enquanto 20.365 não estavam presentes em nenhum dos microarranjos. Para manter apenas os genes promissores para futuras análises, foram empregados dois filtros não específicos: (i) filtro de detecção para eliminar genes não expressos, o que manteve apenas os genes considerados presentes em pelo menos 24 dos 26 microarranjos, resultando num total de 15.848 genes. Desta forma, foram tolerados 3.549 genes (15.848 - 12.299 = 3.549) que foram considerados ausentes em um ou dois microarranjos; (ii) filtro de variância para eliminar genes de expressão constitutiva, o que manteve os maiores 1/8 dos 15.848 genes previamente citados, resultando em 1981 genes com potencial prognóstico (Tabela 7) .
Exemplo 8 - Análise exploratória
A Figura 3A mostra o dendograma para o agrupamento hierárquico dos 26 microarranjos de acordo com a expressão dos 1981 genes selecionados no estágio de pré-processamento. Foram empregados Average linkage e correlação de Pearson dos valores de expressão transformados em log. Foi observado que as amostras caíram em dois grandes grupos: o da direita contendo amostras ND e metade das amostras FD; enquanto o grupo da esquerda contem todas as amostras FHD , duas amostras ND (incluindo o outlier ND_199) e a outra metade dos pacientes FD. Este fato está de acordo com a intuição de que ND e FHD são os grupos mais diferentes e amostras FD formando um grupo intermediário. Isto é confirmado pelos gráficos de escalonamento multidimensional (MDS) em 2-D e 3-D para os 1981 genes, mostrados na Figura 3B e C. A medida de dissimilaridade usada foi 1 - r, onde r é a correlação de Pearson dos valores transformados em log. Microarranjos foram coloridos de acordo com a classe diagnostica. Pode-se observar que as amostras FHD constituem um grupo mais coeso do que as amostras ND, como esperado já que o grupo ND foi obtido de indivíduos com doença febril de etiologia desconhecida, enquanto as amostras FD podem ser divididas em dois grupos, um similar e um outro diferente de FHD, sendo este último mais próximo do grupo ND (esses são os dois grupos marcados na Figura 5). O baixo valor de stress (13.52% no gráfico 2-D e 7.32% no caso 3-D), particularmente no gráfico 3-D, significa que a estrutura delineante dos dados é intrinsecamente de baixa dimensão, o que indica que o pequeno número de assinaturas gênicas é capaz de representar o conteúdo discriminatório no dados.
Exemplo 9 - Análise de expressão diferencial
Foram realizados os testes estatísticos das diferenças entre as médias (Welch two-sample t-tests) para encontrar genes diferencialmente expressos entre os diferentes grupos diagnósticos. Foram consideradas duas principais comparações: FD versus FHD e dengue (FD + FHD) versus ND. A primeira comparação corresponde as 18 amostras oriundas dos pacientes comprovadamente infectados com vírus da dengue e é a mais importante comparação para a presente invenção, pois esta discrimina entre a forma benigna (FD) e maligna (FHD) da doença. Importantes genes usados para caracterizar estas duas manifestações clínicas assim como aqueles específicos para infecção pelo vírus da dengue são mostrados nas Tabelas 2 e 3. Gráfico de vulcão na Figura 4 e a correspondente lista de genes (Tabelas 2 e 3) mostram que os valores p correlacionam bem com magnitude de diferença de expressão (fold-change) em ambas as situações analisadas.
A Figura 5 mostra o mapa de expressão (heatmap) para os melhores 40 genes que discriminam as amostras FD de FHD, de acordo com critério de Welch t-test, assim como o agrupamento hierárquico e gráficos MDS para os 40 melhores genes discriminatórios entre FD e FHD. A Tabela 4 mostra os resultados da análise da representação de categoria funcional da lista dos melhores 40 genes discriminatórios entre FD e FHD com o programa EASE como descrito no Exemplo 6. A análise indicou o enriquecimento de certas categorias de genes. Cinco categorias apresentaram scores significantes (p<0.05) após a correção de Benferroni para múltiplos testes, incluindo aqueles envolvidos na resposta imune e defesa, resposta a estímulos bióticos, ligação a cobre/cádmio e homeostase do ion cobre (Tabela 4).
Exemplo 10 - Identificação dos genes classificadores
Além da seleção univariada realizada por testes t, foi realizada a seleção exaustiva (todas as possíveis combinações) de genes isolados, bem como duplas e trios a partir dos 10981 genes, usando análise de discriminação linear e resubstituição potencializada. A Tabela 5 mostra os classificadores baseados em 1, 2 ou 3 genes, ranqueados pelo erro de classificação estimado. Há 37 únicos genes entre os melhores 40 pares, enquanto há 87 únicos genes entre os melhores 100 trios classificadores. A lista dos trios de genes é dominada pelos genes PSMB9, MT2A, e LOC400368. Na verdade, apenas um trio não contém qualquer desses três, este é SFRS5, PDCD4, MKNK2, cujo erro estimado é de 0.0383. As médias para o erro estimado dos melhores classificadores são:
classificador com 1 gene (40) = 0.1639 ± 0.0286,
classificador com 2 genes (40) = 0.0686 ± 0.0096,
classificador com 3 genes (100) = 0.0395 ± 0.0040, o que
indica que a classificação com pares de genes é mais acurado do que genes individuais, enquanto a classificação com tripla de genes é mais precisa do que com pares (a margem de erro acima se refere ao intervalo de confidência de 95%) . A seleção com dois e três genes têm o potencial de recuperar genes que usando métodos univariados (tais como test-t) não é possível recuperar. Isto é possível se perceber na lista dos melhores classificadores com 2 genes, por exemplo, o gene HLA-F (que é menos expresso em FHD do que FD) . A Figura 6 mostra o gráfico para o classificador com 2 genes PSMB9 e MT2A. A probabilidade estimada de erro em futuros dados é de 5.38%. Neste caso, a menor expressão de ambos os genes é assinatura de FHD, enquanto maior expressão de ambos os genes é característico de FD.
Exemplo 11 - Validação dos dados de microrranjos usando PCR em tempo real quantitativo
Ensaios de PCR em tempo real quantitativo (qPCR) foram realizados para validar os resultados obtidos nos ensaios de microarranjos. Foram selecionados os seguintes genes: PSMB9, MT2A, HLA-F and C3aRl, cuja expressão foi predominante em amostras FD comparado às amostras FHD. qPCRs dos genes acima citados foram realizados usando oito amostras FD e oito FHD obtidas dos mesmos pacientes testados nos ensaios de microarranjos. De acordo com a Figura 7A, a quantificação por qPCR mostrou uma boa correlação com os dados dos microarranjos. Além disso, qPCR foi também realizado num grupo de amostra independentes das amostras utilizadas nos ensaios de microarranjos, coletadas dentro de 11 dias do inicio dos sintomas e antes do inicio dos sintomas de vasculopatia. Os resultados de qPCR também indicaram que os níveis de expressão dos genes selecionados foram mais reduzidos em FHD do que em FD, corroborando com os resultados obtidos com o modelo 2D mostrado na Figura 3. Com isso, cada um dos quatro genes foram expressos em menor quantidade em
FHD e eles foram corretamente classificados nas amostras
analisadas (Figura 7B) .
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Oncogene 22 (8) : 1219-1224.
Tabela 2. Lista de genes mostrados no gráfico vulcão Dengue (FD+FHD) vs. ND de acordo com fold change e valor p.
Símbolo Descrição p-val fc méd sig
CD52 CD52 antigen (CAMPATH-l antigen) 0.000039 -1.9724 8.12979
ZFP36L1 zinc finger protein 36, C3H typelike 1 0.000059 -1.9941 7.26806
HLA-DPA1 major histocompatibility complex, class II, DP alpha 1 0.000117 -2.5446 6.93612
HDLBP high density lipoprotein binding protein (vigilin) 0.000131 +2.7809 7.39547
PITPNC1 phosphatidylinositol transfer protein, cytoplasmic 1 0.000133 -1.8424 7.20502
MAGED1 melanoma antigen family D, 1 0.000153 +2.1404 6.85927
SPCS3 signal peptidase complex subunit 0.000207 3 homolog (S. cerevisiae) +2.2348 7.35861
FLJ20701 ... 0.000423 -2.0834 6.04034
SEC23B Sec23 homolog B (S. cerevisiae) 0.000480 +1.8829 7.10342
TRIM25 tripartite motif-containing 25 0.000612 +1.9769 7.63673
TRAI tumor rejection antigen (gp96) 1 0.000664 +4.3968 6.42347
... ... 0.000687 -2.0036 7.61945
LOC440667 ... 0.000687 -2.3399 7.88564
HLA-DQB1 major histocompatibility complex, class II, DQ beta 1 0.000702 -2.3344 6.54292
CD83 CD83 antigen (activated B lymphocytes, immunoglobulin superf 0.000844 -2.8956 7.65248
MAN1A1 mannosidase, alpha, class IA, member 1 0.001023 +2.4278 7.25466
PDIA6 protein disulfide isomerase family A, member 6 0.001064 +2.8677 6.78112
IGLC2 immunoglobulin lambda constant 2 (Kem-Oz- marker) 0.001162 +5.5892 6.50222
TARDBP TAR DNA binding protein 0.001218 +1.8105 7.54527
PDIA4 protein disulfide isomerase family A, member 4 0.001223 +2.7304 6.94884
MGC11256 ... 0.001435 +2.4209 7.81936
LOC91353 ... 0.001704 +4.5913 8.19856
GMPPB GDP-mannose pyrophosphorylase B 0.001715 +2.7956 6.78685
DERL1 Derl-like domain family, member 1 0.001716 +1.9988 7.78196
PDIA6 protein disulfide isomerase family A, member 6 0.001844 +2.5145 7.19699
PDIA6 protein disulfide isomerase 0.001923 +2.5691 7.10724
family A, member 6
SPCS2 DC36 signal peptidase complex subunit 0.002134 +2.0393 +2.2111
2 homolog (S. cerevisiae) 0.002190
TRD@ T cell receptor delta locus 0.002300 -1.8996
LOC400741 ... 0.002411 -2.0124
CD38 CD38 antigen (p45) 0.002578 +3.3724
IGKV1D-13 immunoglobulin kappa variable 1D-13 0.002587 +3.6265
IGLC2 immunoglobulin lambda constant 2 (Kem-Oz- marker) 0.002701 +4.3190
PRC1 protein regulator of cytokinesis 1 0.002702 +2.6800
KLRB1 killer cell lectin-like receptor subfamily B, member 1 0.003008 -2.2458
MMD monocyte to macrophage differentiation-associated 0.003105 +1.9302
EGR1 early growth response 1 0.003240 -2.3419
HLA-DQA1 major histocompatibility complex, class II, DQ alpha 1 0.003294 -3.7052
C19orfl0 chromosome 19 open reading frame 10 0.003448 +1.8677
ITM2C integral membrane protein 2C 0.003476 +2.6957
DUSP2 dual specificity phosphatase 2 0.003588 -1.7949
HSPA5 heat shock 70kDa protein 5 (glucose-regulated protein, 78kDa 0.003715 +2.2640
BTG1 B-cell translocation gene 1, antiproliferative 0.004162 -2.0340
EGR1 early growth response 1 0.004223 -1.8033
TIFA ... 0.004504 +1.7820
IFI16 interferon, gamma-inducible protein 16 0.004681 +1.9522
SAMD9L sterile alpha motif domain containing 9-like 0.004820 +2.6353
PLAUR plasminogen activator, urokinase 0.005299 receptor -2.2833
UBE2J1 ubiquitin-conjugating enzyme E2, J1 (UBC6 homolog, yeast) 0.005315 +2.0183
IGKC immunoglobulin kappa constant 0.005329 +2.4514
KIAA0746 ... 0.005694 +2.3672
CRR9 ... 0.005779 +2.1834
C5orfl4 chromosome 5 open reading frame 14 0.005805 +1.7734
KLHL14 kelch-like 14 (Drosophila) 0.005924 +4.4604
SIGLEC10 sialic acid binding Ig-like lectin 10 arginine-rich, mutated in early stage tumors 0.005997 -2.7531
ARMET 0.006618 +1.9474
TRD@ T cell receptor delta locus 0.006991 -1.8322
TXNDC5 thioredoxin domain containing 5 0.007668 +2.3417
C7orf24 chromosome 7 open reading 0.007762 +1.9157
frame 24
7.45086
7.45736
7.40155
7.25052
7.38196
7.14328
5.94850
6.27996
7.32421
6.80604
6.41955
6.71183
7.41872
6.33080
7.53773
7.04440
6.83080
6.36035
7.28424
8.22690
6.35057
6.42455
7.46490
7.86119
6.84767
7.12743
7.30565
6.19582
6.48276
7.23923
6.98857
8.67580
6.78388
LOC339562 ... 0.008089 0.008115 +2.6159 +2.5068 6.33496 8.17149
SMC4L1 SMC4 structural maintenance of chromosomes 4-like 1 (yeast) 0.008325 +2.9479 6.25656
UBE2J1 ubiquitin-conjugating enzyme E2, J1 (UBC6 homolog, yeast) 0.008359 +1.8638 6.94727
NT5C3 5'-nucleotidase, cytosolic III 0.008360 +1.8688 6.91759
DF D component of complement (adipsin) 0.008687 -2.7181 6.85144
P4HB procollagen-proline, 2oxoglutarate 4-dioxygenase (proline 4 0.008716 +1.7954 8.04407
PALM2- ΑΚΑΡ ... 0.008921 +2.2190 7.14109
RASGEF1B RasGEF domain family, member 0.009825 1 r> -3.0515 5.90641
SEC13L1 SEC13-like 1 (S. cerevisiae) 0.010184 +1.8486 7.24982
TUBB tubulin, beta polypeptide 0.010994 +2.1076 6.89461
SEC11L3 SECll-like 3 (S. cerevisiae) 0.011247 +2.1820 6.70416
PRDX4 peroxiredoxin 4 0.011364 +1.9468 7.18909
SSR3 signal sequence receptor, gamma 0.011751 (translocon-associated prote +1.9620 7.69621
ZWINT ZW10 interactor 0.011795 +2.8555 7.04377
IER3 immediate early response 3 0.012348 -2.1041 7.27412
MGC27165 ... 0.012667 +4.0779 6.48172
NC0A3 nuclear receptor coactivator 3 0.012749 +2.2970 6.70409
IL8 interleukin 8 0.012961 -1.8904 7.50247
HIST1H3H histone 1, H3h 0.013216 +2.4035 6.20241
G0S2 GO/Glswitch 2 0.013273 -2.6994 6.11488
PPIB peptidylprolyl isotnerase B (cyclophilin B) 0.013490 +2.0063 8.39863
IGLC2 immunoglobulin lambda constant 2 (Kem-Oz- marker) 0.013786 +3.3635 7.22352
RORA RAR-related orphan receptor A 0.013877 -1.7492 7.79580
PRDX3 peroxiredoxin 3 0.014354 +1.9203 6.97942
BST2 bone marrow stromal cell antigen 2 0.014571 +1.7981 6.98131
FYN FYN oncogene related to SRC, FGR, YES 0.014649 -1.8662 6.81907
CLEC7A C-type lectin domain family 7, member A 0.014745 -2.2778 6.56259
Tabela 3. Lista de genes mostrados no gráfico vulcão FD vs.
FHD de acordo com fold change e valor p.
Símbolo Descrição p value Fold-change Média sinal
UBE2J1 ubiquitin-conjugating enzyme E2, 0.000119 0.000119 0.000419 2.3447 2.3447 -2.3147 6.7868 6.7868 7.37628
UBE2J1 J1 (UBC6 homolog, yeast) ubiquitin-conjugating enzyme E2, 0.000419 -2.3147 7.37628
CD300A J1 (UBC6 homolog, yeast) CD300A antigen 0.000864 2.1544 7.07896
CD300A CD300A antigen 0.000864 2.1544 7.07896
IGLC2 immunoglobulin lambda constant 0.001172 -3.0718 6.38877
IGLC2 2 (Kem-Oz- marker) immunoglobulin lambda constant 0.001172 -3.0718 6.38877
MT1X 2 (Kem-Oz- marker) metallothionein IX 0.001294 2.2122 7.5485
MT1X metallothionein IX 0.001294 2.2122 7.5485
MAGED1 melanoma antigen family D, 1 0.001644 -2.0342 7.06166
MAGED1 melanoma antigen family D, 1 0.001644 -2.0342 7.06166
GBP1 guanylate binding protein 1, 0.00216 1.9967 7.83435
VAMP3 interferon-inducible, 67kDa vesicle-associated membrane 0.002351 1.8814 7.11909
C3AR1 protein 3 (cellubrevin) complement component 3 a 0.002707 4.5817 6.08138
C3AR1 receptor 1 complement component 3 a 0.002707 4.5817 6.08138
MYD88 receptor 1 myeloid differentiation primary 0.002823 1.8194 8.06109
FCGR3B response gene (88) Fc fragment of IgG, low affinity 0.002868 4.1952 6.1543
FCGR3B Illb, receptor (CD 16b) Fc fragment of IgG, low affinity 0.002868 4.1952 6.1543
SAMHD1 Illb, receptor (CD 16b) S AM domain and HD domain 1 0.003019 2.4624 5.7873
SAMHD1 SAM domain and HD domain 1 0.003019 2.4624 5.7873
UBE2G1 ubiquitin-conjugating enzyme 0.003307 -2.1036 6.92056
UBE2G1 E2G 1 (UBC7 homolog, yeast) ubiquitin-conjugating enzyme 0.003307 -2.1036 6.92056
EGR1 E2G 1 (UBC7 homolog, yeast) early growth response 1 0.00334 3.2916 6.10353
EGR1 early growth response 1 0.00334 3.2916 6.10353
MT1H metallothionein 1H 0.003445 2.0475 6.75503
MT1H metallothionein 1H 0.003445 2.0475 6.75503
TPD52 tumor protein D52 0.003567 -2.2114 7.0498
IPD52 tumor protein D52 0.003567 -2.2114 7.0498
POU2AF1 POU domain, class 2, associating 0.00391 -2.7707 8.05215
factor 1
POU2AF1 POU domain, class 2, associating factor 1 0.00391 -2.7707 8.05215
PPAPDC1B phosphatidic acid phosphatase type 2 domain containing 1B 0.004347 -2.3491 7.07497
PPAPDC1B phosphatidic acid phosphatase type 2 domain containing 1B 0.004347 -2.3491 7.07497
LOC441168 ··· 0.004813 2.3726 8.08179
LOC441168 • · · 0.004813 2.3726 8.08179
SIDT2 SID1 transmembrane family, member 2 0.00485 1.9548 8.34325
GBP1 guanylate binding protein 1, interferon-inducible, 67kDa 0.004938 2.3334 7.01359
GBP1 guanylate binding protein 1, interferon-inducible, 67kDa 0.004938 2.3334 7.01359
GBP1 guanylate binding protein 1, interferon-inducible, 67kDa 0.005006 2.4888 7.58986
GBP1 guanylate binding protein 1, interferon-inducible, 67kDa 0.005006 2.4888 7.58986
IGLC2 immunoglobulin lambda constant 2 (Kem-Oz- marker) 0.005057 -2.9244 7.02255
IGLC2 immunoglobulin lambda constant 2 (Kem-Oz- marker) 0.005057 -2.9244 7.02255
TRAI tumor rejection antigen (gp96) 1 0.005488 -1.9074 8.2753
CRR9 ... 0.006054 -1.8843 7.36728
NDUFB6 NADH déydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 6,17kDa 0.006174 -1.828 7.27376
RNASET2 ribonuclease T2 0.006686 2.0165 7.81902
RNASET2 ribonuclease T2 0.006686 2.0165 7.81902
GBP2 guanylate binding protein 2, interferon-inducible 0.007125 1.8139 7.64193
EGR1 early growth response 1 0.007242 4.6155 6.04876
EGR1 early growth response 1 0.007242 4.6155 6.04876
CD97 CD97 antigen 0.007485 2.2044 6.8153
CD97 CD97 antigen 0.007485 2.2044 6.8153
TYROBP TYRO protein tyrosine kinase binding protein 0.007507 2.8639 7.71104
TYROBP TYRO protein tyrosine kinase binding protein 0.007507 2.8639 7.71104
LOC91353 ... 0.007524 -2.578 8.63641
LOC91353 ... 0.007524 -2.578 8.63641
SERPIN Al serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteínase, 0.00763 2.463 7.455
SERPIN Al serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteínase, 0.00763 2.463 7.455
FGL2 fibrinogen-like 2 0.007811 2.6573 7.57893
FGL2 fibrinogen-like 2 0.007811 2.6573 7.57893
TUBA3 ... 0.008598 1.8686 8.62436
TNFRSF17 tumor necrosis factor receptor superfamily, member 17 0.009406 -2.7543 7.26921
TNFRSF17 tumor necrosis factor receptor 0.009406 -2.7543 7.26921
superfamily, member 17
GMNN geminin, DNA replication inhibitor 0.009426 -2.2142 7.19724
GMNN geminin, DNA replication inhibitor 0.009426 -2.2142 7.19724
SMC4L1 SMC4 structural maintenance of chromosomes 4-like 1 (yeast) 0.009866 -2.2396 6.61279
SMC4L1 SMC4 structural maintenance of chromosomes 4-like 1 (yeast) 0.009866 -2.2396 6.61279
FGR Gardner-Rasheed feline sarcoma viral (v-fgr) oncogene homolo 0.009879 2.1941 7.25545
FGR Gardner-Rasheed feline sarcoma viral (v-fgr) oncogene homolo 0.009879 2.1941 7.25545
TNFSF13 tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 13 0.010068 2.352 6.33822
IGLC2 immunoglobulin lambda constant 2 (Kem-Oz- marker) 0.010428 -2.6368 6.33398
... ... 0.011066 -2.6563 7.40797
IGKV1D-13 immunoglobulin kappa variable 1D-13 0.011292 -2.3235 7.51906
... ... 0.011735 2.152 7.57258
SEC11L3 SECll-like 3 (S. cerevisiae) 0.011854 -2.0503 6.92968
CX3CR1 chemokine (C-X3-C motif) receptor 1 0.012371 2.3472 7.89988
DF D component of complement (adipsin) 0.013175 2.7446 6.51822
FN5 ... 0.013342 2.1468 6.62795
SAMD9L sterile alpha motif domain containing 9-like 0.01406 2.3893 7.12239
LOC441168 ... 0.014525 3.2665 6.68643
PACAP ... 0.015153 -2.4229 7.03573
KIAA0746 ... 0.015464 -2.0754 7.06113
HLA-DPB1 major histocompatibility complex, class II, DP beta 1 0.015645 2.4265 7.80659
... ... 0.016187 -2.6756 7.03496
... ... 0.01639 -2.3461 6.36245
PACAP ... 0.016535 -2.367 7.80789
S100A9 SI00 calcium binding protein A9 (calgranulin B) 0.017515 2.0885 8.32804
S100A6 SI 00 calcium binding protein A6 0.019028 2.0002 7.28308
(calcyclin)
Tabela 4. Análise EASE da abundância funcional da lista dos
40 mais significantes genes discriminatótios entre FD e FHD. Categorias funcionais estatisticamente significantes (p<0.05)
após correção p => 2?3 miί Ί +- ί rxΊ i ci riodc clS .
Genes de Resposta Genes de Resposta de Resposta a Genes de Genes de ligação de Genes de Homcostr.si
Imunoiógica Defesa Etimulo Biótico Cobrr/Cadmio de Cobre Ferro
EASE D . Bonferrom EASE D , Bonferrom EASE „ , Bonferrom EASE D . Bonferrom EASE „ , Bonferrom
score score score score score
3.91 E-06 1.19E-03 1.11E-05 3.38E-03 2.26E-05 6.89E-03 3.12E-05 9.53E-03 1.52E-04 4.64E-02
CD300A CD300A CD300A
CD97 CD97 CD97 MT1H MTIH
CX3CR1 CX3CR1 CX3CR1
C3AR1 C3AR1 C3AR1 MT1X
CFD CFD CFD
FCGR3B FCGR3B FCGR3B
GBP1 GBP1 GBP1
GBP2 GBP2 GBP2
IGKV1D-13 IGKV1D-13 IGKV1D-13
HLA-DPA1 HLA-DPA1 HLA-DPA1
HLA-DPB1 HLA-DPB1 HLA-DPB1
MYD88 MYD88 MYD88
POU2AF1 POU2AF1 POU2AFI
S100A9 S100A9 S100A9
TNFSF12-TNFSF13 TNFSF12-TNFSF13 TNFSF12-TNFSF13
TNFSF13 TNFSF13 TNFSF13
TNFRSF17 TNFRSFI7 TNFRSF17
TYROBP TYROBP TYROBP
FGR
Tabela 5. Classificadores baseados em genes individuais, duplas ou trios ranqueados pelo erro estimado.
Gene 1 Gene 2
1-Gene Classificados
ΜΤ2Λ
PSMB9
IGLC2
ADAR
LOC400368
FCGR3B
HLA-F
CD53
VAMP3
CXXC5
DKFZP586
LOC91353
LRRFIP1
MT1H
SAMHD1
UBE2J1
PDCD4
PACAP
POU2AF1
KLHL14
FYB
PACAP
(no symbol)
SEC11L3
NDUFB6
MT1X
NCL
C1QBP
HIST1H4C
SAMHD1
TNFRSF17
IFITM1
IGKC
CHSY1
MRLC2
CXXC5
LOC400741
ATP6V0E
HSPA5
TPD52
2-Genes Classificados
PSMB9 LRRFIP1
H3F3B MT2A
SFRS5 PDCD4
Gene 3 Erro Estimado
0.0870
0.0927
0.1182
0.1202
0.1277
0.1301
0.1314
0.1365
0.1389
0.1443
0.1477
0.1513
0.1555
0.1604
0.1626
0.1634
0.1669
0.1674
0.1688
0.1695
0.1708
0.1729
0.1734
0.1749
0.1767
0.1772
0.1793
0.1821
0.1850
0.1881
0.1885
0.1893
0.1910
0.1920
0.1933
0.1941
0.1956
0.1963
0.1966
0.1970
0.0351
0.0496
0.0501
LRRFIPI LOC400368 0.0504
PSMB9 MT2A - 0.0538
MT2A TMBIM4 0.0589
HA-1 LOC400368 0.0602
RHOA MT2A 0.0603
MT2A XRN1 0.0635
MRLC2 LOC400368 0.0661
NCL PSMB9 0.0665
DKFZP586 LOC400368 0.0666
MT2A CNOT2 0.0669
ITM2B LOC400368 0.0687
PSMB9 HA-1 0.0688
CD52 LOC400368 0.0702
ADAR ΜΤ2Λ 0.0708
MT2A HIPK3 0.0709
SELL MT2A 0.0710
PSMB9 ATP6V0E 0.0713
PSMB9 MRLC2 0.0715
NCL MT2A 0.0721
RAP1B MT2A 0.0730
MT2A LOC400368 0.0733
PSMB9 HLA-C 0.0736
ADAR PSMB9 0.0740
PSMB9 FNBP3 0.0742
MT2A ACTR3 0.0743
PSMB9 ARHGEF6 0.0744
UBE2J1 LOC400368 0.0752
SFRS5 MT2A 0.0762
RPS25 PSMB9 0.0765
TMSB4X LOC400368 0.0766
PSMB9 RPL14 0.0766
RPS15A LOC400368 0.0769
PSMB9 GNA13 0.0769
EIF5A LOC400368 0.0769
ARPC1B 0.0770
PSMB9 MYL6 0.0772
RPL9 LOC400368 0.0773
'-Genes Classificados HNRPA1 PSMB9 MT2A 0.0256
LRRFIPI MRLC2 LOC400368 0.0302
PSMB9 SAP18 LRRFIPI 0.0316
PSMB9 LRRFIPI LOC400368 0.0319
ADAR PSMB9 ARHGEF6 0.0321
PSMB9 HLA-B MT2A 0.0323
LRRFIPI RPS21 LOC400368 0.0324
DEK LRRFIPI LOC400368 0.0326
EIF4A2 PSMB9 LRRFIPi 0.0326
DEK ADAR PSMB9 0.0329
PSMB9 HLA-C MT2A 0.0331
MT2A ACTB LOC400368 0.0332
CAPi LRRFIPI LOC400368 0.0339
PSMB9 MT2A HLA-C 0.0339
PSMB9 MT2A HNRPA1 0.0340
PSMB9 MT2A RPL14 0.0344
PSMB9 DDX17 MT2A 0.0344
PSMB9 MT2A HLA-A 0.0353
ΜΤ2Α ARHGEF10 LOC400368 0.0353
HNRPA1 MT2A LOC400368 0.0353
ADAR PSMB9 LRRFIPI 0.0358
HLA-E PSMB9 MT2A 0.0362
PSMB9 MT2A EEF1D 0.0362
LRRFIPI ITM2B LOC400368 0.0364
PSMC1 PSMB9 LRRFIPI 0.0367
LRRFIPI PTMA LOC400368 0.0374
SKP1A LRRFIPI LOC400368 0.0374
PSMB9 H3F3B MT2A 0.0378
PSMB9 MT2A PTPRC 0.0381
LRRFIPI TMSB4X LOC400368 0.0382
SFRS5 PDCD4 MKNK.2 0.0383
PSMB9 MT2A RAC2 0.0384
PSMB1 PSMB9 LRRFIPI 0.0385
DEK PSMB9 LRRFIPI 0.0389
LRRFIPI MRFAP1 LOC400368 0.0389
LRRFIPI ARPC2 LOC400368 0.0390
EIF4A2 LRRFIPI LOC400368 0.0392
PSMB9 DDX17 LRRFIPI 0.0394
PSMB9 MT2A MRLC2 0.0395
ADAR PSMB9 MT2A 0.0397
PSMB9 MT2A RPS19 0.0397
MT2A HNRPA1 LOC400368 0.0402
TMEM66 PSMB9 MT2A 0.0402
LRRFIPI GLTSCR2 LOC400368 0.0403
PSMB9 MT2A HLA-A 0.0403
I DDCTu 1 CD47 LOC400368 0.0403
LRRFIPI KPNB1 LOC400368 0.0404
PSMB9 CKTVí MT2A Λ A4A.4 v^v-rv-r
PSMB9 LRRFIPI Clorf43 0.0405
UBE2J1 IVi^V T 4 AAm íCQ VO A Λ4ΛΛ v.v-r w
PSMB9 LRRFIPI IFITM1 0.0407
PSMB9 uTXr> λ ut i. LRRFIPI A A.4AQ v.v—w
UCP2 LRRFIPI LOC400368 0.0408
SAP 18 t DDCTD1 Áí i Γ WtíM :Kv OU Γι Γ1.4 1 1 U.U“1 1
LRRFIPI HA-1 LOC400368 0.0411
U1M E> DAí z zz x ÍS. i n.i HA-I T ΓλΓ'ΜΠΑ ι τ v w A A4 í t v-v-r s í
UBE2J1 IGKC LOC400368 0.0411
XI A O? í 3 i tn-íí. í i íi i v vo A A .4 í O v.v-r i z.
LRRFIPI MORF4L1 LOC400368 0.0413
LRRFIPI MT2A LOC40C« >68 0.0413
ARL6IP5 LRRFIPI LOC400368 0.0415
í DDDIDÍ ii 1 GGAl íájLAÍíííj 68 0.0416
STK24 LRRFIPI LOC400368 0.0416
PSMB10 LRRFIPI LOC400368 0.0417
PSMB9 EEF1A1 MT2A 0.0417
PSMB9 MT2A LOC440055 0.0418
RPL35 LRRFIP1 LOC400368 0.0420
LRRFIP1 LOC400368 0.0420
RPS29 PSMB9 MT2A 0.0420
ΜΤ2Α RPL14 LOC400368 0.0423
ACTB MT2A LOC400368 0.0425
RPS27 PSMB9 MT2A 0.0425
LRRFIP1 H3F3B LOC400368 0.0425
HA-1 HNRPA1 LOC400368 0.0425
NCL MT2A RAC2 0.0427
ARPC1B PSMB9 BTN3A3 0.0428
LRRFIP1 PSMB1 LOC400368 0.0429
TOMM7 LRRFIP1 LOC400368 0.0429
MT2A HLA-A LOC400368 0.0430
COX4I1 LRRFIP1 LOC400368 0.0430
CAP1 ADAR PSMB9 0.0430
LRRFIP1 SEPT9 LOC400368 0.0431
UBE2J1 LOC400368 0.0431
PSMB9 LRRFIP1 0.0432
TXNL4A PSMB9 LRRFIP1 0.0433
UBE2J1 LOC400368 0.0433
UBE2J1 LOC400368 0.0434
ADAR PSMB9 CD52 0.0435
NCL RAP1B MT2A 0.0435
TPD52 IGKC LOC400368 0.0436
ACTB MT2A LOC400368 0.0436
EIF4A2 PSMB9 MT2A 0.0436
LRRFIP1 YWHAB LOC400368 0.0436
PTMA LRRF1P1 LOC400368 0.0437
HLA-B MT2A LOC400368 0.0438
PSMB9 LRRFIP1 KPNB1 0.0439
LRRFIP1 TMSB10 LOC400368 0.0439
LAMP1 PSMB9 MT2A 0.0440
LRRFIP1 LOC400368 0.0440
MT2A DAZAP2 LOC400368 0.0440
HNRPA1 PSMB9 MT2A 0.0256
LRRFIP1 MRLC2 LOC400368 0.0302
Tabela 6. Lista dos 73 genes diferencialmente expressos entre casos de FD e FHD que foram, comuns entre aqueles 200 mais significantes genes de acordo com o teste Welch's t-test e os
200 genes com maiores fold-change da média de expressão dos níveis de RNAm.
Simbolo Titulo do Gene p-val rank fc méd_sig
RNF36 ring finger protein 36 0.000119 2 2.3447 6.7868
UBE2J1 ubiquitin-conjugating enzyme E2, J1 (UBC6 homolog, yeast) 0.000419 4 -2.3147 7.3763
CD300A CD300a molecule 0.000864 8 2.1544 7.079
IGL@ Immunoglobulin lambda locus 0.001172 9 -3.0718 6.3888
MT1X metallothionein IX 0.001294 11 2.2122 7.5485
MAGED 1 GBP1 melanoma antigen family D, 1 0.001644 14 -2.0342 7.0617
guanylate binding protein 1, interferon- 0.00216 20 1.9967 7.8344
inducible, 67kDa /// guanylate binding protein 1, interferon-inducible, 67kDa
VAMP3 vesicle-associated membrane protein 3 (cellubrevin) 0.002351 22 1.8814 7.1191
C3AR1 complement component 3 a receptor 1 0.002707 27 4.5817 6.0814
MYD88 myeloid differentiation primary response gene (88) 0.002823 30 1.8194 8.0611
FCGR3B Fc fragment of IgG, low affinity Illb, receptor (CD 16b) 0.002868 31 4.1952 6.1543
SAMHD 1 UBE2G1 S AM domain and HD domain 1 0.003019 32 2.4624 5.7873
ubiquitin-conjugating enzyme E2G 1 0.003307 33 -2.1036 6.9206
(UBC7 homolog, yeast)
EGR1 early growth response 1 0.00334 35 3.2916 6.1035
MT1H metallothionein 1H 0.003445 37 2.0475 6.755
TPD52 tumor protein D52 0.003567 38 -2.2114 7.0498
POU2AF 1 POU domain, class 2, associating factor 1 0.00391 40 -2.7707 8.0521
PPAPDC Phosphatidic acid phosphatase type 2 0.004347 45 -2.3491 7.075
IB domain containing 1B
RP193H18.5 hypothetical protein LOC441168 0.004813 51 2.3726 8.0818
SIDT2 SID1 transmembrane family, member 2 0.00485 52 1.9548 8.3433
GBP1 guanylate binding protein 1, interferoninducible, 67kDa /// guanylate binding protein 1, interferon-inducible, 67kDa 0.004938 54 2.3334 7.0136
GBP1 guanylate binding protein 1, interferoninducible, 67kDa 0.005006 55 2.4888 7.5899
LOC966 Hypothetical protein similar to 0.005057 56 -2.9244 7.0226
10/// KIAA0187 gene product ///
IGL@ Immunoglobulin lambda locus
HSP90B heat shock protein 90kDa beta (Grp94), 0.005488 59 -1.9074 8.2753
1 member 1
CRR9 cisplatin resistance related protein CRR9p 0.006054 64 -1.8843 7.3673
NDUFB NADH déydrogenase (ubiquinone) 1 beta 0.006174 66 -1.828 7.2738
6 subcomplex, 6, 17kDa
RNASE T2 ribonuclease T2 0.006686 70 2.0165 7.819
GBP2 guanylate binding protein 2, interferoninducible /// guanylate binding protein 2, interferon-inducible 0.007125 76 1.8139 7.6419
EGR1 Early growth response 1 0.007242 77 4.6155 6.0488
CD97 CD97 molecule 0.007485 79 2.2044 6.8153
TYROB TYRO protein tyrosine kinase binding 0.007507 80 2.8639 7.711
P protein
CTA- 246H3.1 similar to omega protein 0.007524 81 -2.578 8.6364
SERPIN serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha- 0.00763 83 2.463 7.455
Al 1 antiproteínase, antitrypsin), member 1
FGL2 fibrinogen-like 2 0.007811 87 2.6573 7.5789
TUBA3 tubulin, alpha 3 0.008598 93 1.8686 8.6244
TNFRSF tumor necrosis factor receptor 0.009406 98 -2.7543 7.2692
17 superfamily, member 17
GMNN geminin, DNA replication inhibitor 0.009426 99 -2.2142 7.1972
SMC4L1 SMC4 structural maintenance of chromosomes 4-like 1 (yeast) 0.009866 102 -2.2396 6.6128
FGR Gardner-Rasheed feline sarcoma viral (vfgr) oncogene homolog 0.009879 103 2.1941 7.2555
TNFSF1 tumor necrosis factor (ligand) 0.010068 105 2.352 6.3382
3/// superfamily, member 13 /// tumor
TNFSF1 necrosis factor (ligand) superfamily,
2- member 12-member 13
TNFSF1
IGL@ Immunoglobulin lambda locus 0.010428 106 -2.6368
GNAS GNAS complex locus 0.010903 111 -1.8682
UAP1 UDP-N-acteylglucosamine pyrophosphorylase 1 0.010949 112 -1.9816
ARMET arginine-rich, mutated in early stage tumors 0.011018 113 -1.8831
Immunoglobulin kappa light chain (IGKV) mRNA variable region, joining region, and constant region /// Immunoglobulin kappa light chain (IGKV) mRNA variable region, joining region, and constant region 0.011066 114 -2.6563
HLA- DPA1 major histocompatibility complex, class II, DP alpha 1 0.011235 115 1.9378
IGKV 1D -13 /// LOC649 876 immunoglobulin kappa variable 1D-13 /// similar to Ig kappa chain V-I region HK102 precursor 0.011292 116 -2.3235
PYCAR n PYD and CARD domain containing 0.011531 117 1.904
A_7 KIAA15 05 KIAA1505 protein 0.011735 118 2.152
SEC11L SECll-like 3 (S. cerevisiae) 0.011854 120 -2.0503
CX3CR1 chemokine (C-X3-C motif) receptor 1 0.012371 124 2.3472
MT1E metallothionein 1E (fiinctional) 0.012654 125 1.8414
CFD complement factor D (adipsin) 0.013175 130 2.7446
Cllorf7 5 chromosome 11 open reading frame 75 0.013342 133 2.1468
SRPRB signal recognition particle receptor, B subunit 0.01398 139 -1.8251
SAMD9 L sterile alpha motif domain containing 9like 0.01406 142 2.3893
RP193H18.5 hypothetical protein LOC441168 0.014525 151 3.2665
PACAP proapoptotic caspase adaptor protein 0.015153 156 -2.4229
KIAA07 KIAA0746 protein 0.015464 162 -2.0754
6.334
8.2788
6.8578
7.4254
7.408
7.2184
7.5191
7.3968
7.5726
6.9297
7.8999
6.5549
6.5182
6.628
7.2025
7.1224
6.6864
7.0357
7.0611
HLA- major histocompatibility complex, class 0.015645 166 2.4265 7.8066
DPB1 II, DP beta 1
PRDX4 peroxiredoxin 4 0.01571 167 -1.8982 7.3706
Transcribed locus 0.016136 171 -1.9733 6.7522
LOC652 similar to Ig kappa chain V-I region 0.016187 172 -2.6756 7.035
745 Walker prècursor
TCF7L2 transcription factor 7-like 2 (T-cell specific, HMG-box) 0.016262 174 1.8697 8.0753
—— Immunoglobulin kappa chain, V-region (SPK.3) 0.01639 176 -2.3461 6.3625
PACAP proapoptotic caspase adaptor protein 0.016535 178 -2.367 7.8079
ITM2C integral membrane protein 2C /// integral membrane protein 2C 0.016602 179 -1.9904 6.6164
C9orfl9 chromosome 9 open reading trame 19 0.0169 182 1.9849 6.9941
LRRC59 leucine rich repeat containing 59 0.017101 185 -1.8304 7.1703
S100A9 SI 00 calcium binding protein A9 (calgranulin B) 0.017515 189 2.0885 8.328
SPTLC2 serine palmitoyltransferase, long chain base subunit 2 0.017518 190 1.9835 7.0682
PARP12 poly (ADP-ribose) polymerase family, member 12 0.017657 193 1.9566 7.7735
S100A6 SI00 calcium binding protein A6 0.019028 199 2.0002 7.2831
(calcyclin)
Tabela 7. Lista dos 1981 genes após o processamento dos dados de microarranjo.
Simbolo GenBank Descrição médjsig p-val Fold change
RPS16 AA583817 ribosomal protein S16 9.72102 0.277282 1.0953
RPS20 BF184532 ribosomal protein S20 9.68353 0.148291 1.1517
... NM 173704 9.63312 0.143144 1.1571
RPL37A NM 000998 ribosomal protein L37a 9.63014 0.235864 1.124
HUWE1 NM_017627 HECT, UBA and WWE domain containing 9.59332 0.263327 1.1138
IGL@ AA680302 immunoglobulin lambda locus 9.59311 0.26474 -1.2208
RPS6 NM 001010 ribosomal protein S6 9.58439 0.448575 1.0543
RPS2 AI183766 ribosomal protein S2 9.58222 0.203036 1.1329
RPL5 BF214492 ribosomal protein L5 9.58055 0.60019 1.0277
TPT1 BG498776 tumor protein, translationally-cont 9.57284 0.250297 1.1063
RPL10A BG231561 ribosomal protein LlOa 9.57011 0.183032 1.1372
RPLP1 NM 001003 ribosomal protein, large, PI 9.56849 0.355849 1.0739
... AFFXHUM A ... 9.5606 0.222693 1.1384
RPS11 NM 001015 ribosomal protein SI 1 9.55964 0.158163 1.1408
TMSB10 NM 021103 thymosinbeta 10 9.55496 0.071749 1.1801
RPS3A NM 001006 ribosomal protein S3A 9.55158 0.532298 1.0521
EEF1A1 NM 001403 eukaryotic translation elongation f 9.55085 0.188962 1.1368
... NM 173710 ... 9.5493 0.116896 1.1738
OAF NM 173705 OAF homolog (Drosophila) 9.54913 0.370259 1.0809
B2M NM 004048 beta-2-microglobulin 9.54197 0.090167 1.1779
RPS10 AA320764 ribosomal protein S10 9.53284 0.235061 1.118
RPS19 NM 001022 ribosomal protein S19 9.53197 0.202512 1.1221
UNC5B AF253979 unc-5 homolog B (C. elegans) 9.51965 0.362171 1.084
RPL41 NM 021104 ribosomal protein L41 9.51841 0.204405 1.1252
ACTB AA809056 actin, beta 9.51448 0.042627 1.2607
RPS19 BE259729 ribosomal protein S19 9.5107 0.284201 1.0841
RPS23 NM 001025 ribosomal protein S23 9.51007 0.594312 1.0499
EEF1A1 AL515273 eukaryotic translation elongation f 9.50998 0.15173 1.1471
ACTB AK025873 actin, beta 9.50928 0.044908 1.2484
OAF NM 173705 OAF homolog (Drosophila) 9.50312 0.288608 1.1074
RPL15 NM 002948 ribosomal protein LI 5 9.50277 0.386678 1.0834
RPL23A BF125158 ribosomal protein L23a 9.50045 0.388508 1.0715
RPS3A AI925635 ribosomal protein S3A 9.49856 0.553253 1.0479
RPL31 NM 000993 ribosomal protein L31 9.49816 0.313692 1.086
FAU NM 001997 Finkel-Biskis-Reilly murine sarcoma 9.49129 0.2122 1.096
RPL23A U43701 ribosomal protein L23a 9.49081 0.331343 1.0855
RPL23A BC001865 ribosomal protein L23a 9.48737 0.312354 1.0872
EEF1D AI613383 eukaryotic translation elongation f 9.48636 0.213286 1.1055
RPS4X NM 001007 ribosomal protein S4, X-linked 9.48595 0.408488 1.0624
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TPT1 AI721229 tumor protein, translationally-cont 9.47991 0.285558 1.1002
RPL39 BC001019 ribosomal protein L39 9.47553 0.096318 1.1696
ACTB NM 001101 actin, beta 9.47114 0.0697 1.1949
RPS15 NM 001018 ribosomal protein S15 9.46707 0.196897 1.1154
... AFFX-R2-P1 ... 9.46578 0.089216 1.2245
RPS9 BE348997 ribosomal protein S9 9.46084 0.253801 1.1066
IGL@ M87790 immunoglobulin lambda locus 9.4486 0.593009 -1.1058
UBB NM 018955 ubiquitin B 9.44118 0.220373 1.1155
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RPL7 NM 000971 ribosomal protein L7 9.436 0.801954 1.0063
EEF1A1 BE786672 eukaryotic translation elongation f 9.43375 0.427973 1.0545
RPLPO BC005863 ribosomal protein, large, P0 9.42602 0.763185 1.0109
HNRNPA1 NM_002136 heterogeneous nuclear ribonucleopro 9.41967 0.406989 1.0617
RPS27 NM 001030 ribosomal protein S27 (metallopanst 9.41628 0.336861 1.0765
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HLA-C M63438 major histocompatibility complex, c 9.41477 0.750739 -1.0047
RPS1O NM 001014 ribosomal protein S10 9.41418 0.75229 1.0432
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HLA-C BC005332 major histocompatibility complex, c 9.40659 0.785125 -1.0054
RPLPO BC003655 ribosomal protein, large, P0 9.40178 0.4799 1.0697
UNC5B AF253979 unc-5 homolog B (C. elegans) 9.40113 0.582518 1.044
HLA-C AK024836 major histocompatibility complex, c 9.39887 0.024909 1.2349
RPS13 NM 001017 ribosomal protein S13 9.39684 0.459016 1.0558
... AI799007 ... 9.39384 0.197631 1.1377
S100A8 NM 002964 S100 calcium binding protein A8 9.39086 0.015169 1.5466
RPLPO NM 001002 ribosomal protein, large, P0 9.38461 0.485979 1.0669
EEF1A1 BE964125 eukaryotic translation elongation f 9.37992 0.13346 1.1524
RPL3 BG339228 ribosomal protein L3 9.37871 0.839669 -1.044
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RPL3 BC006483 ribosomal protein L3 9.36888 0.737559 -1.068
RP11- 78J2 AL568186 heterogeneous nuclear ribonucleopro 9.36012 0.367155 1.0744
RPL24 AI560573 ribosomal protein L24 9.35859 0.501768 1.0478
RPL27 NM 000988 ribosomal protein L27 9.3577 0.503576 1.0509
ACTB AFFX-HSACO actin, beta 9.3571 0.01343 1.3012
EEF1A1 NM 001402 eukaryotic translation elongation f 9.35146 0.240016 1.1134
RPSA AW304232 ribosomal protein SA 9.35114 0.471434 1.0593
RPL30 L05095 ribosomal protein L30 9.35061 0.243352 1.092
RPS4X AW132023 ribosomal protein S4, X-linked 9.35047 0.581757 1.0265
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ACTG1 AW190090 actin, gamma 1 9.33579 0.445738 1.0586
FTL BG53719O ferritin, light polypeptide 9.33422 0.071832 1.2664
RPS16 AI200589 ribosomal protein S16 9.33387 0.391346 1.0779
HLA-C AW575927 major histocompatibility complex, c 9.32293 0.355996 1.084
ACTG1 BE741683 actin, gamma 1 9.32133 0.44021 1.0587
RPS3 U14990 ribosomal protein S3 9.32019 0.477698 1.0542
HLA-C BC004489 major histocompatibility complex, c 9.31866 0.033383 1.2311
RPS2 AA630314 ribosomal protein S2 9.31738 0.4672 1.0644
... NM 173709 ... 9.31716 0.46121 1.1032
RPL37 BF216701 ribosomal protein L37 9.31715 0.311818 1.0865
RPL13A BC001675 ribosomal protein LI3a 9.30846 0.850195 1.0084
RPL7A NM 000972 ribosomal protein L7a 9.30744 0.98087 -1.0241
HLA-A AA573862 major histocompatibility complex, c 9.30649 0.039143 1.2435
FTHP1 J04755 ferritin, heavy polypeptide pseudog 9.30328 0.153458 1.2082
RPS6 BC000524 ribosomal protein S6 9.30218 0.76263 1.0115
HLA-E NM 005516 major histocompatibility complex, c 9.29981 0.005682 1.3252
... AFFX-R2-P1 ... 9.29925 0.141108 1.1733
HSP90AA 1 ACTG1 R01140 heat shock protein 90kDa alpha (cyt 9.29619 0.472471 1.0427
BG026805 actin, gamma 1 9.28695 0.481606 1.0628
RPL34 NM 000995 ribosomal protein L34 9.28618 0.345932 1.0919
HMGB1 AF283771 high-mobility group box 1 9.28533 0.420569 1.0493
RPL12 AK026491 ribosomal protein LI 2 9.28392 0.529619 1.0438
PPIA AI708767 peptidylprolyl isomerase A (cycloph 9.28151 0.801456 1.0087
HLA-C M12679 major histocompatibility complex, c 9.27185 0.006432 1.3952
UBC AB009010 ubiquitin C 9.26849 0.179327 1.1239
HLA-A AI923492 major histocompatibility complex, c 9.26464 0.066598 1.2639
PPIA BC001224 peptidylprolyl isomerase A (cycloph 9.26039 0.73387 1.0166
RPL17 NM 000985 ribosomal protein LI7 9.25929 0.590458 1.0354
IGLJ3 X57812 immunoglobulin lambda joining 3 9.2531 0.852679 -1.0772
LAMP1 NM 005561 lysosomal-associated membrane prote 9.2518 0.02758 1.2336
IGHA1 S55735 immunoglobulin heavy constant alpha 9.24575 0.161432 -1.2587
RPL13A BF942308 ribosomal protein LI 3a 9.24495 0.907602 -1.019
RPS7 AI970731 ribosomal protein S7 9.24089 0.394691 1.0693
IGHG3 M87789 immunoglobulin heavy constant gamma 9.23447 0.118872 -1.4418
PPIA BE731738 peptidylprolyl isomerase A (cycloph 9.23348 0.914791 -1.0103
PPIA NM 021130 peptidylprolyl isomerase A (cycloph 9.23292 0.774203 1.0124
IFITM2 AA749101 interferon induced transmembrane pr 9.22991 0.010733 1.3418
RPL12 AA281332 ribosomal protein L12 9.22863 0.442312 1.059
PPIA BC005982 peptidylprolyl isomerase A (cycloph 9.22852 0.766783 1.0121
ACTG1 BC001920 actin, gamma 1 9.22635 0.391136 1.0697
TMSB4X AL133228 thymosin beta 4, X-linked 9.22436 0.09178 1.1714
TXNIP NM 006472 thioredoxin interacting protein 9.22385 0.017551 1.3428
RPS18 NM 022551 ribosomal protein S18 9.22347 0.640855 1.0232
B2M AW188940 beta-2-microglobulin 9.22284 0.064391 1.1544
CFL1 NM 005507 cofilin 1 (non-muscle) 9.22219 0.209578 1.1488
HLA-B L42024 major histocompatibility complex, c 9.22158 0.060992 1.2255
Z98200 similar to ribosomal protein L3 9.22142 0.462473 -1.1381
LOC64274
LOC65400 7 BE963164 similar to Elongation factor 1-gamm 9.21894 0.893903 1.0008
/ ACTGl AA703939 actin, gamma 1 9.21769 0.478674 1.0512
ACTG1 NM 001614 actin, gamma 1 9.215 0.624088 1.0412
ACTGl AL515810 actin, gamma 1 9.21184 0.445591 1.0659
RPL12 NM 000976 ribosomal protein LI 2 9.20909 0.583603 1.0366
ACTG1 AU145192 actin, gamma 1 9.20749 0.830784 1.0105
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RPS28 BC000354 ribosomal protein S28 9.19855 0.381597 1.0702
RPL17 BE733979 ribosomal protein LI 7 9.19503 0.70165 1.0193
CXCR4 AJ224869 chemokine (C-X-C motif) receptor 4 9.19395 0.356133 1.0951
GAPDH BE561479 glyceraldéyde-3 -phosphate déydrog 9.19303 0.95088 -1.0228
RPLPO AI953822 ribosomal protein, large, P0 9.1842 0.76663 -1.0503
RPL27A NM 000990 ribosomal protein L27a 9.18373 0.344058 -1.1138
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TPT1 AL565449 tumor protein, translationally-cont 9.16944 0.678257 1.0367
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PARK7 NM 007262 Parkinson disease (autosomal recess 9.13486 0.868402 -1.0256
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RPL14 AV698647 ribosomal protein L14 9.124 0.203838 -1.304
EEF1G AF119850 eukaryotic translation elongation f 9.11523 0.926845 -1.0024
MYL6 BE734356 myosin, light chain 6, alkali, smoo 9.11311 0.039513 1.2264
TPT1 AI888178 tumor protein, translationally-cont 9.1127 0.254352 1.1035
RPL13 AI186735 ribosomal protein LI 3 9.11066 0.871378 1.0094
OAZ1 D87914 omithine decarboxylase antizyme 1 9.10971 0.084005 1.1848
RPL7A BE559788 ribosomal protein L7a 9.10954 0.454251 -1.1136
ACTR3 Z78330 ARP3 actin-related protein 3 homolo 9.10385 0.267007 1.0904
RPL13A NM 012423 ribosomal protein LI 3a 9.10061 0.631542 -1.0628
FTH1 NM 002032 ferritin, heavy polypeptide 1 9.09524 0.297546 1.2596
RPL7 BG3 89744 ribosomal protein L7 9.09364 0.515805 -1.086
TUBA1B BC006379 tubulin, alpha lb 9.08109 0.841614 1.0253
RPL13A BC000514 ribosomal protein LI 3a 9.077 0.864916 1.0343
ACTG1 AL567820 actin, gamma 1 9.07471 0.831466 -1.0315
H3F3A AI955655 H3 histone, family 3A 9.07186 0.425505 1.0604
EEF1G NM 001404 eukaryotic translation elongation f 9.07124 0.915188 1.0009
HLA- DRB4 NM 021983 major histocompatibility complex, c 9.07049 0.004755 1.615
RPL13 BC004954 ribosomal protein LI 3 9.06753 0.987902 -1.0063
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IGHM BC001872 immunoglobulin heavy constant mu 9.06679 0.060332 -1.5376
LDHB BE042354 lactate déydrogenase B 9.06533 0.254782 -1.1837
RPL6 NM 000970 ribosomal protein L6 9.06527 0.763928 -1.0322
GAPDH AK026525 glyceraldéyde-3-phosphate déydrog 9.06447 0.691828 -1.0585
HMGB1 NM 002128 high-mobility group box 1 9.06167 0.634429 -1.0681
... AFFXHUMRG ... 9.05778 0.754369 1.0464
PSAP NM 002778 prosaposin (variant Gaucher disease 9.0513 0.014358 1.4793
PGK1 NM 000291 phosphoglycerate kinase 1 9.04979 0.708498 1.0253
RPL13 AA789278 ribosomal protein LI 3 9.04579 0.705579 -1.0621
RPS17 BC004886 ribosomal protein SI 7 9.04447 0.86706 -1.0172
IFITM2 NM 006435 interferon induced transmembrane pr 9.0441 0.008667 1.4253
ΑΤΡ5Α1 AI587323 ATP synthase, H+ transporting, mito 9.04128 0.343458 -1.1345
VDAC3 BC002456 voltage-dependent ânion channel 3 9.04039 0.855195 -1.038
RPS6 BE741754 ribosomal protein S6 9.03922 0.87524 1.011
GAPDH BF689355 glyceraldéyde-3-phosphate déydrog 9.03653 0.721786 -1.0612
AL356115 similar to v-fos transformation eff 9.03645 0.469549 -1.0701
LOC43999
RPS15A NM 001019 ribosomal protein SI5a 9.03616 0.703533 1.0195
H3F3B Z48950 H3 histone, family 3B (H3.3B) 9.03523 0.018645 1.2441
CCDC72 BG167522 coiled-coil domain containing 72 9.03313 0.558874 1.0339
... AFFX-CREX- ... 9.03182 0.11733 1.1922
GLTSCR2 NM 015710 glioma tumor suppressor candidate r 9.03081 0.321885 1.095
RPS17 NM 001021 ribosomal protein S17 9.02791 0.677306 1.0101
LDHB NM 002300 lactate déydrogenase B 9.02343 0.142411 -1.2633
PTP4A2 U48297 protein tyrosine phosphatase type I 9.0221 0.290558 1.09
RPL38 NM 000999 ribosomal protein L38 9.01145 0.463186 1.0524
RPL4 AI953886 ribosomal protein L4 9.00683 0.291573 -1.1686
RPL4 BC005817 ribosomal protein L4 9.00391 0.291551 -1.1778
CALM2 NM 001743 calmodulin 2 (phosphorylase kinase, 9.00315 0.061735 1.2351
HLA- M27487 major histocompatibility complex, c 8.99731 0.116661 1.3641
DPA1
RPS16 NM 001020 ribosomal protein SI6 8.98755 0.504482 -1.0885
SUBI BG231551 SUBI homolog (S. cerevisiae) 8.98712 0.785248 -1.0771
SRGN NM 002727 serglycin 8.98252 0.021124 1.2154
NPM1 BC002398 nucleophosmin (nucleolar phosphopro 8.97804 0.942268 -1.0452
GZMB J03189 granzyme B (granzyme 2, cytotoxic T 8.9728 0.839811 1.0587
... AFFX- ... 8.97248 0.927282 -1.0267
RPS25 HUMRG AA888388 ribosomal protein S25 8.968 0.451603 1.0507
RAC2 BE138888 ras-related C3 botulinum toxin subs 8.96722 0.04496 1.2077
RPL19 NM 000981 ribosomal protein LI 9 8.96643 0.984973 -1.02
IFITM3 BF338947 interferon induced transmembrane pr 8.95608 0.004324 1.5349
TUBA1B BC006481 tubulin, alpha lb 8.9533 0.82065 1.0221
H3F3A AA477655 H3 histone, family 3A 8.95196 0.779353 1.0034
YBX1 BC002411 Y box binding protein 1 8.94972 0.491025 -1.085
FTL BG538564 ferritin, light polypeptide 8.94766 0.038142 1.318
TXNDC5 NM 030810 thioredoxin domain containing 5 8.94106 0.030516 -1.748
SFRS11 NM 004768 splicing factor, arginine/serine-ri 8.93673 0.153725 -1.1644
YWHAZ NM 003406 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 8.93617 0.4536 1.0417
LDHA NM 005566 lactate déydrogenase A 8.93369 0.229237 -1.2105
TUBA1B AL581768 tubulin, alpha lb 8.93318 0.700624 -1.052
UBA52 AF348700 ubiquitin A-52 residue ribosomal pr 8.93116 0.191727 1.1365
BF026595 similar to 40S ribosomal protein SI 8.93012 0.569538 -1.101
LOC40205 7
/ BE043477 ATPase, H+ transporting, lysosomal 8.92881 0.00176 1.3477
ATP6V0E 1 SAT1
NM 002970 spermidine/spermine N1-acetyltransf 8.92734 0.052755 1.253
PSMB1 W86293 proteasome (prosome, macropain) sub 8.92652 0.290971 1.065
EIF1 AL537707 eukaryotic translation initiation f 8.92356 0.225941 1.1509
RPL4 NM 000968 ribosomal protein L4 8.92326 0.231891 -1.2041
HMGN2 BC003689 high-mobility group nucleosomal bin 8.91576 0.995282 -1.0087
CUGBP2 U69546 CUG triplet repeat, RNA binding pro 8.91464 0.12645 1.1179
ΑΝΡ32Β NM 006401 acidic (leucine-rich) nuclear phosp 8.91131 0.75023 -1.0683
LAPTM5 NM 006762 lysosomal associated multispanning 8.89919 0.01393 1.3365
ARHGDIB NM_001175 Rho GDP dissociation inhibitor (GDI 8.89875 0.147922 1.1675
HLA- DRB5 NM_002125 major histocompatibility complex, c 8.89872 0.024751 1.392
EIF1 W67644 eukaryotic translation initiation f 8.89125 0.286604 1.1281
MCL1 AI275690 myeloid cell leukemia sequence 1 (B 8.8908 0.010518 1.4101
ETS1 BE218980 v-ets erythroblastosis vírus E26 on 8.89057 0.337203 1.0935
PGAM1 NM 002629 phosphoglycerate mutase 1 (brain) 8.88869 0.404531 1.057
TPT1 AF072098 tumor protein, translationally-cont 8.88478 0.351409 -1.0899
EIF1 AF083441 eukaryotic translation initiation f 8.88283 0.190526 1.1643
RPLPO-lik AA555113 ribosomal protein P0-like 8.88164 0.224729 -1.2465
JTB NM 006694 jumping translocation breakpoint 8.87785 0.181525 -1.1605
PPIB NM 000942 peptidylprolyl isomerase B (cycloph 8.87774 0.179995 -1.1752
HMGB2 BC000903 high-mobility group box 2 8.87201 0.630332 -1.058
DDX5 NM 004396 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypept 8.87179 0.071368 1.1292
STK24 AF083420 serine/threonine kinase 24 (STE20 h 8.87093 0.745207 1.0089
NBPF12 AI800419 neuroblastoma breakpoint family, me 8.87085 0.019139 1.3092
KARS NM 005548 lysyl-tRNA synthetase 8.86896 0.184249 1.2056
GAPDH AFFXHUMGA glyceraldéyde-3-phosphate déydrog 8.86808 0.422229 -1.1047
RAP1B NM 015646 RAP1B, member of RAS oncogene famil 8.86544 0.201436 1.1411
NCOA4 AL162047 nuclear receptor coactivator 4 8.85785 0.080125 1.202
LYZ AV711904 lysozyme (renal amyloidosis) 8.85778 0.037997 1.4136
NACA NM 005594 nascent polypeptide-associated comp 8.85536 0.424115 -1.0899
NACA BF976260 nascent polypeptide-associated comp 8.85465 0.43483 -1.0977
HSPA8 AA704004 heat shock 70kDa protein 8 8.85434 0.562599 1.0674
TUBA1B BE300252 tubulin, alpha lb 8.85365 0.791074 -1.04
RPL29 BF683426 ribosomal protein L29 8.85113 0.981075 -1.0072
JTB AF151056 jumping translocation breakpoint 8.85066 0.360407 -1.1149
HLA- DRB1 U65585 major histocompatibility complex, c 8.84778 0.004772 1.6714
H3F3A BF312331 H3 histone, family 3A 8.84764 0.948572 -1.0226
RPL22 BG152979 ribosomal protein L22 8.84735 0.21061 -1.1931
RPL18 NM 000979 ribosomal protein LI 8 8.84354 0.603153 -1.0798
COX7A2 NM 001865 cytochrome c oxidase subunit Vila p 8.84329 0.862977 -1.056
CALM1 BC000454 calmodulin 1 (phosphorylase kinase, 8.84239 0.491245 1.0676
SEPT9 AB023208 septin 9 8.83562 0.318261 1.0829
RPL21 NM 000982 ribosomal protein L21 8.83217 0.491557 -1.0984
LOC39018 AL121916 similar to Ribosomal protein S4, X- 8.82901 0.320864 -1.1639
D TMEM66 NM 016127 transmembrane protein 66 8.82831 0.449138 1.0411
SFRS10 NM 004593 splicing factor, arginine/serine-ri 8.82767 0.722992 1.0123
MRFAP1 BG435643 Mof4 family associated protein 1 8.82497 0.009441 1.2186
PABPC1 AI734929 poly(A) binding protein, cytoplasmi 8.82396 0.788552 -1.0244
YWHAB NM 014052 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 8.82329 0.042936 1.2248
USMG5 BG291685 upregulated during skeletal muscle 8.82282 0.40484 -1.0995
SNX3 AB047360 sorting nexin 3 8.82178 0.081311 1.1552
DUSP1 NM 004417 dual specificity phosphatase 1 8.81961 0.074007 1.5588
HNRPM AL713781 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.81197 0.333136 -1.1198
PTPRC Y00062 protein tyrosine phosphatase, recep 8.81028 0.030575 1.1735
EIF4G2 NM 001418 eukaryotic translation initiation f 8.80702 0.496202 -1.072
FKBP11 NM 016594 FK506 binding protein 11,19 kDa 8.80684 0.031309 -1.5631
EIF3EIP NM 016091 eukaryotic translation initiation f 8.80043 0.244783 -1.2092
RPL5 NM 000969 ribosomal protein L5 8.79898 0.115551 -1.2494
ARL6IP5 NM 006407 ADP-ribosylation-like factor 6 inte 8.79615 0.008646 1.2454
RPS9 NM 001013 ribosomal protein S9 8.7888 0.649216 1.0829
LRRFIP1 AF130054 leucine rich repeat (in FLII) inter 8.7862 0.001476 1.4494
CD53 NM 000560 CD53 molecule 8.78328 0.00198 1.3513
SELL NM 000655 selectin L (lymphocyte adhesion mol 8.78176 0.017184 1.252
TNFAIP3 NM 006290 tumor necrosis factor, alpha-induce 8.77338 0.310663 1.1847
RPS5 NM 001009 ribosomal protein S5 8.77137 0.261117 -1.2117
SEC11A NM 014300 SEC11 homolog A (S. cerevisiae) 8.77122 0.671295 1.0215
NDUFS6 NM 004553 NADH déydrogenase (ubiquinone) Fe- 8.7707 0.487406 -1.0913
H3F3B NM 005324 H3 histone, family 3B (H3.3B) 8.77049 0.006003 1.2459
RPL22 D17652 ribosomal protein L22 8.76953 0.224893 -1.1997
IFI30 NM 006332 interferon, gamma-inducible protein 8.76733 0.006894 1.7446
ITM2B NM 021999 integral membrane protein 2B 8.76641 0.018103 1.239
SNHG5 BG339050 small nucleolar RNA host gene (non- 8.76076 0.686548 1.0655
ANXA2 BE908217 annexin A2 8.7589 0.112224 1.1966
LBR NM 002296 lamin B receptor 8.73636 0.49024 1.0725
DAZAP2 NM 014764 DAZ associated protein 2 8.73274 0.040265 1.192
CAP1 AA806142 CAP, adenylate cyclase-associated p 8.73267 0.095262 1.1986
MORF4L2 NM 012286 mortality factor 4 like 2 8.73006 0.983915 -1.0086
DAZAP2 N34846 DAZ associated protein 2 8.7283 0.015479 1.3032
PSME2 NM 002818 proteasome (prosome, macropain) act 8.72604 0.344588 1.1192
LOC15266 α AJ224080 similar to ribosomal protein L7a 8.7241 0.427953 -1.137
j RPL15 AF279903 ribosomal protein LI 5 8.72273 0.776328 -1.0353
IGJ AV733266 immunoglobulin J polypeptide, linke 8.71951 0.543791 -1.0706
COPB1 NM 016451 coatomer protein complex, subunit b 8.71621 0.955809 -1.0384
TRAM1 BC000687 translocation associated membrane p 8.71566 0.215917 -1.1522
HSPA8 AF217511 heat shock 70kDa protein 8 8.71414 0.887456 1.0461
OAZ1 AF090094 omithine decarboxylase antizyme 1 8.71171 0.16295 1.1394
TUBA1C BC004949 tubulin, alpha lc 8.70601 0.690914 -1.0738
CDV3 AK025647 CDV3 homolog (mouse) 8.70557 0.416355 -1.1748
NFKBIZ AB037925 nuclear factor of kappa light polyp 8.70271 0.184594 1.2322
JTB BC004239 jumping translocation breakpoint 8.70164 0.147036 -1.1991
MRLC2 U26162 myosin regulatory light chain MRLC2 8.69791 0.001244 1.2847
CBX3 NM_016587 chromobox homolog 3 (HP1 gamma homo 8.6959 0.626431 -1.0583
NBPF1 BF740216 neuroblastoma breakpoint family, me 8.69552 0.020385 1.307
RPL14 U16738 ribosomal protein LI 4 8.69417 0.733336 -1.0329
SLC25A6 AI961224 solute carrier family 25 (mitochond 8.69288 0.411253 -1.0783
SNRPG NM 003096 small nuclear ribonucleoprotein pol 8.69182 0.564187 -1.0556
NBPF11 BE299495 neuroblastoma breakpoint family, me 8.69027 0.027597 1.2842
EIF4A2 NM 001967 eukaryotic translation initiation f 8.68518 0.27169 1.0921
GNAS NM 000516 GNAS complex locus 8.68128 0.136389 -1.2194
HIF1A NM 001530 hypoxia-inducible factor 1, alpha s 8.68125 0.55657 1.096
ANXA2 NM 004039 annexin A2 8.67919 0.198595 1.1553
LOC38834 Λ AW574664 similar to RPL13 protein 8.67576 0.510046 -1.1066
ANXA2 BC001388 annexin A2 8.67456 0.150184 1.1769
TUBA1B NM 006082 tubulin, alpha lb 8.67401 0.649176 -1.0709
HNRPD D55672 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.67246 0.109788 -1.2204
GNAS AI591100 GNAS complex locus 8.6705 0.21107 -1.1814
RPL13A BF979419 ribosomal protein LI 3a 8.67017 0.656611 -1.0468
H2AFZ BF718636 H2A histone family, member Z 8.66877 0.128288 -1.2753
RABIA BC000905 RABIA, member RAS oncogene family 8.66619 0.265013 1.084
YWHAQ BF033313 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 8.66619 0.548594 -1.0615
SUMO2 AI971724 SMT3 suppressor of mif two 3 homolo 8.66018 0.264149 1.1115
NDUFB8 NM 005004 NADH déydrogenase (ubiquinone) 1 b 8.65785 0.457879 -1.0677
C0X4I1 NM 001861 cytochrome c oxidase subunit IV iso 8.65772 0.993453 1.0122
CD47 BG230614 CD47 molecule 8.65507 0.197202 1.0755
RPS26 NM 001029 ribosomal protein S26 8.65078 0.128958 -1.3425
HNRPH1 NM 005520 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.64889 0.11545 1.1881
C20orfll8 AA603344 chromosome 20 open reading frame 11 8.6481 0.001997 1.5776
GNAS NM 016592 GNAS complex locus 8.64755 0.216701 -1.1834
... AFFX-M2783 ... 8.64732 0.329731 -1.1112
NBPF1 N32025 neuroblastoma breakpoint family, me 8.64711 0.040338 1.2668
PPIB NM 000942 peptidylprolyl isomerase B (cycloph 8.64481 0.061964 -1.3924
HNRPA3 BC012090 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.64043 0.213013 1.1624
DDX17 Z97056 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypept 8.63854 0.19513 1.1077
SKP1 AA927664 S-phase kinase-associated protein 1 8.63829 0.272737 1.0682
GDI2 NM 001494 GDP dissociation inhibitor 2 8.63786 0.502036 1.0918
IGLL3 AL022324 immunoglobulin lambda-like polypept 8.63641 0.007524 -2.578
SPCS2 NM 014752 signal peptidase complex subunit 2 8.63436 0.211341 -1.2067
ADD3 NM 019903 adducin 3 (gamma) 8.63106 0.883335 1.0068
TPM3 BC000771 tropomyosin 3 8.62948 0.006796 1.2679
TUBA1A AF141347 tubulin, alpha la 8.62436 0.008598 1.8686
RRM2 BE966236 ribonucleotide reductase M2 polypep 8.62408 0.07486 -1.5518
SULT1C4 NM 006588 sulfotransferase family, cytosolic, 8.62073 0.607141 -1.0942
YWHAQ AA854017 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 8.62006 0.83803 -1.0346
MATR3 AA129420 matrin 3 8.61975 0.947878 -1.0071
FNTA BG168896 famesyltransferase, CAAX box, alph 8.61832 0.420763 1.0906
CIRBP NM 001280 cold inducible RNA binding protein 8.61794 0.667038 1.0242
PSMC2 NM 002803 proteasome (prosome, macropain) 26S 8.61788 0.768603 -1.0291
... AFFX-CREX- ... 8.61406 0.120663 1.203
SPCS1 NM 014041 signal peptidase complex subunit 1 8.61253 0.03051 -1.4228
NM 006791 mortality factor 4 like 1 8.61235 0.438021 1.0409
M0RF4L1
ADAR NM 001111 adenosine deaminase, RNA-specific 8.61157 0.002492 1.3729
HNRPK BC000355 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.61084 0.826012 1.0163
... AV756161 ... 8.61014 0.8532 -1.045
CllorflO NM 014206 chromosome 11 open reading frame 10 8.60968 0.051991 -1.2891
PTMA NM 002823 prothymosin, alpha (gene sequence 2 8.6087 0.658373 1.021
BTN3A3 NM 006994 butyrophilin, subfamily 3, member A 8.60384 0.005682 1.3936
IFITM1 NM 003641 interferon induced transmembrane pr 8.60378 0.001576 1.5969
TUBA1C BC005946 tubulin, alpha lc 8.60342 0.694183 -1.0727
SEC61B NM 006808 Sec61 beta subunit 8.60329 0.063735 -1.3585
PABPC3 NM 030979 poly(A) binding protein, cytoplasmi 8.60118 0.388877 -1.104
CYCS BC005299 cytochrome c, somatic 8.60042 0.075356 -1.2815
PTMA AF348514 prothymosin, alpha (gene sequence 2 8.5994 0.144158 1.2109
ARPC2 BG034239 actin related protein 2/3 complex, 8.59816 0.127318 1.1544
RPL36AL NM 001001 ribosomal protein L36a-like 8.59726 0.229918 -1.236
PRICKLE A NM 017601 prickle homolog 4 (Drosophila) 8.59693 0.728453 -1.0464
H· STAT1 NM 007315 signal transducer and activator of 8.59651 0.022135 1.4528
C20orfll8 BF437747 chromosome 20 open reading frame 11 8.5961 0.001886 1.6089
RPS27A NM 002954 ribosomal protein S27a 8.59553 0.070705 -1.4124
TMEM123 BG538627 transmembrane protein 123 8.59401 0.349258 1.1005
RHOA BC001360 ras homolog gene family, member A 8.59283 0.016069 1.1702
RPS24 BC000523 ribosomal protein S24 8.59161 0.393334 -1.1115
TMBIM4 AF161526 transmembrane B AX inhibitor motif c 8.58976 0.310843 1.1017
SERBP1 AF131807 SERPINE1 mRNA binding protein 1 8.58742 0.385759 -1.1135
CD52 N90866 CD52 molecule 8.58717 0.032139 1.3885
C20orf24 NM 018840 chromosome 20 open reading frame 24 8.58661 0.023381 1.1904
SAT1 M55580 spermidine/spermine N1 -acetyltransf 8.5846 0.077824 1.5407
SLC25A5 NM 001152 solute carrier family 25 (mitochond 8.58375 0.198028 -1.1865
ITGB1 BG500301 integrin, beta 1 (fibronectin recep 8.58222 0.847869 1.0179
DHX15 NM_001358 DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypept 8.57962 0.983785 -1.0249
HMGN1 NM 004965 high-mobility group nucleosome bind 8.57611 0.373303 -1.0987
NPM1 AA191576 nucleophosmin (nucleolar phosphopro 8.57503 0.040137 -1.5236
... AFFX- HUMRG ... 8.57265 0.788727 -1.0247
ATP5E NM 006886 ATP synthase, H+ transporting, mito 8.57105 0.962371 -1.0062
SFPQ AL558875 splicing factor proline/glutamine-r 8.57035 0.708656 -1.0445
SLC25A3 NM 002635 solute carrier family 25 (mitochond 8.56151 0.267652 -1.1243
FCN1 NM 002003 ficolin (collagen/fibrinogen domain 8.55761 0.059741 1.9616
GNA13 AI928136 guanine nucleotide binding protein 8.55261 0.160771 1.141
PRF1 AI445650 perforin 1 (pore forming protein) 8.55224 0.146867 1.3625
EIF3F NM 003754 eukaryotic translation initiation f 8.55096 0.087846 -1.2208
SSR4 NM 006280 signal sequence receptor, delta (tr 8.5484 0.039545 -1.3429
ACTR3 NM 005721 ARP3 actin-related protein 3 homolo 8.54681 0.299654 1.1411
GZMA NM 006144 granzyme A (granzyme 1, cytotoxic T 8.54675 0.861827 1.0809
PPP1CC NM 002710 protein phosphatase 1, catalytic su 8.54295 0.14502 -1.1641
SERP1 NM 014445 stress-associated endoplasmic retic 8.54186 0.289653 -1.1623
ATP5B NM 001686 ATP synthase, H+ transporting, mito 8.54112 0.256857 -1.1449
NACAP1 AF315951 nascent-polypeptide-associated comp 8.53938 0.48654 1.1192
OGT AF070560 O-linked N-acetylglucosamine (GlcNA 8.53847 0.383879 -1.1115
SNX3 AL078596 sorting nexin 3 8.53255 0.025265 1.1446
MRCL3 NM 006471 myosin regulatory light chain MRCL3 8.5315 0.021295 1.2678
CARS AI769685 cysteinyl-tRNA synthetase 8.53135 0.559251 1.0334
BTG1 AL535380 B-cell translocation gene 1, anti-p 8.53125 0.66227 1.0778
TFRC BC001188 transferrin receptor (p90, CD71) 8.52902 0.258864 1.1189
GLRX NM 002064 glutaredoxin (thioltransferase) 8.52836 0.363547 1.2252
SFRS3 BC000914 splicing factor, arginine/serine-ri 8.52745 0.196148 -1.2157
NDUFB2 NM 004546 NADH déydrogenase (ubiquinone) 1 b 8.52523 0.808646 1.0203
CAPZA1 NM 006135 capping protein (actin filament) mu 8.52204 0.563771 1.0601
EIF4A1 BC006210 eukaryotic translation initiation f 8.52195 0.319129 -1.1174
HINT1 AK054976 histidine triad nucleotide binding 8.51944 0.801409 -1.0371
ARPC2 NM 005731 actin related protein 2/3 complex, 8.51808 0.382069 1.1455
ENO1 NM 001428 enolase 1, (alpha) 8.51426 0.78052 -1.0508
Cllorf31 AA526939 chromosome 11 open reading frame 31 8.51262 0.885715 -1.0008
RPL22 NM 000983 ribosomal protein L22 8.5116 0.064639 -1.3701
RPN2 AL514285 ribophorin II 8.50781 0.026513 -1.3485
H3F3B BC001124 H3 histone, family 3B (H3.3B) 8.50458 0.008086 1.2685
RRM2 BC001886 ribonucleotide reductase M2 polypep 8.49655 0.075038 -1.6033
WAC AL135461 WW domain containing adaptor with c 8.49213 0.470841 1.0736
XAF1 AA142842 XIAP associated factor 1 8.4916 0.026902 1.8594
RPL35 NM 007209 ribosomal protein L35 8.49106 0.953744 -1.017
AQP3 N74607 aquaporin 3 (Gill blood group) 8.48628 0.041547 -1.5061
SLC38A2 AF298897 solute carrier family 38, member 2 8.4831 0.724251 1.0312
SEPT2 NM 004404 septin 2 8.48295 0.601425 -1.0528
PNRC2 NM 017761 proline-rich nuclear receptor coact 8.48146 0.529099 1.0428
SERBP1 BC002488 SERPINE1 mRNA binding protein 1 8.48085 0.074077 -1.2827
RPN2 AI560720 ribophorin II 8.48047 0.020623 -1.3683
HNRNPA1 X79536 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.48 0.109978 -1.1823
PSME1 NM 006263 proteasome (prosome, macropain) act 8.47861 0.020071 1.1923
ATP5C1 AV711183 ATP synthase, H+ transporting, mito 8.47568 0.35253 -1.0916
VCAN BF218922 versican 8.47389 0.379926 1.2321
PSMB4 NM 002796 proteasome (prosome, macropain) sub 8.47364 0.347902 -1.0981
RPL11 NM 000975 ribosomal protein Ll 1 8.47332 0.879096 -1.0063
GTF3A NM 002097 general transcription factor IIIA 8.47227 0.126196 -1.195
EEF1B2 NM 001959 eukaryotic translation elongation f 8.47175 0.074916 -1.3207
HLA-C BG536224 major histocompatibility complex, c 8.46867 0.028967 -1.7709
PTP4A2 AF208850 protein tyrosine phosphatase type I 8.46819 0.626678 -1.0479
PLAC8 NM 016619 placenta-specific 8 8.46743 0.160626 1.4257
PSMA6 BC002979 proteasome (prosome, macropain) sub 8.46112 0.745441 1.0126
ATP5F1 BC005960 ATP synthase, H+ transporting, mito 8.46058 0.306271 -1.11
GTF3A BE542815 general transcription factor IIIA 8.45894 0.185403 -1.1777
HIST1H4C NM_003542 histone cluster 1, H4c 8.45875 0.040247 -1.7231
PSMB9 NM 002800 proteasome (prosome, macropain) sub 8.45623 0.00005 1.5788
HSPD1 NM 002156 heat shock 60kDa protein 1 (chapero 8.45522 0.014228 -1.6062
CANX M94859 calnexin 8.448 0.06167 -1.3139
GPX1 NM 000581 glutathione peroxidase 1 8.44558 0.551288 1.1574
PABPC1 U64661 poly(A) binding protein, cytoplasmi 8.44432 0.43789 -1.0964
YWHAZ NM 003406 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 8.44163 0.973987 -1.0225
SNRPD3 NM 004175 small nuclear ribonucleoprotein D3 8.44146 0.098063 -1.2019
GNLY M85276 granulysin 8.44141 0.369248 1.3198
UBC M26880 ubiquitin C 8.44112 0.036395 1.2383
HNRNPR BC001449 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.44106 0.215056 -1.1047
CROP NM 006107 cisplatin resistance-associated ove 8.44072 0.549831 -1.1129
IFI16 AF208043 interferon, gamma-inducible protein 8.43852 0.126521 1.388
HLA-F AW514210 major histocompatibility complex, c 8.43622 0.000621 1.43
RTN4 AF320999 reticulon 4 8.43528 0.00766 1.2524
KLF2 NM 016270 Kruppel-like factor 2 (lung) 8.43483 0.382317 1.1502
HLA-B L07950 major histocompatibility complex, c 8.43407 0.03959 1.3362
CLIC1 AF034607 chloride intracellular channel 1 8.43405 0.194511 1.1505
RANBP9 AF306510 RAN binding protein 9 8.42932 0.148105 -1.1877
HSP90AA 1 C20orf24 BG420237 heat shock protein 90kDa alpha (cyt 8.42928 0.464569 1.0409
BC004446 chromosome 20 open reading frame 24 8.4271 0.038037 1.2048
MAPRE1 NM 012325 microtubule-associated protein, RP/ 8.4262 0.931121 -1.0322
H3F3A BE869922 H3 histone, family 3A 8.42557 0.937962 -1.08
RPL3 L22453 ribosomal protein L3 8.4254 0.098997 -1.3361
KLF6 BU683415 Kruppel-like factor 6 8.42156 0.046383 1.5129
YME1L1 NM 014263 YMEl-like 1 (S. cerevisiae) 8.42027 0.8865 -1.0083
SUBI BE784583 SUBI homolog (S. cerevisiae) 8.41998 0.039766 -1.331
CAPN2 M23254 calpain 2, (m/II) large subunit 8.4195 0.411411 1.0755
IL23A AL559122 interleukin 23, alpha subunit pl9 8.41855 0.904095 1.0529
ATP5C1 BC000931 ATP synthase, H+ transporting, mito 8.41843 0.375003 -1.0987
IRF2BP2 AW242432 interferon regulatory factor 2 bind 8.4171 0.227106 1.2063
IL7R BE217880 interleukin 7 receptor 8.41659 0.973402 1.0126
TRIB1 NM 025195 tribbles homolog 1 (Drosophila) 8.41559 0.796679 1.0818
RPL35A AW402660 ribosomal protein L35a 8.41197 0.872273 -1.029
SSR1 NM 003144 signal sequence receptor, alpha (tr 8.41137 0.00612 -1.5507
PRPF40A NM_017892 PRP40 pre-mRNA processing factor 40 signal recognition particle 14kDa ( 8.40789 0.276653 1.0767
SRP14 NM 003134 8.40329 0.403397 -1.0662
HSP90AA 1 NONO AF028832 heat shock protein 90kDa alpha (cyt 8.40219 0.38341 -1.0762
NM 007363 non-POU domain containing, octamer- 8.40037 0.631831 -1.0413
ALDOA AK026577 aldolase A, fructose-bisphosphate 8.40029 0.405992 1.1089
ZC3HAV1 AI133727 zinc finger CCCH-type, antiviral 1 8.39856 0.49176 1.0454
NFKBIA AI078167 nuclear factor of kappa light polyp 8.39693 0.723447 1.0851
HLADRB1 AJ297586 major histocompatibility complex, c 8.39671 0.017874 1.7361
PRDX1 L19184 peroxiredoxin 1 8.39621 0.233972 -1.1572
DNAJC1 BF591419 DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, 8.3948 0.295562 -11586
FAM120A BE963765 family with sequence similarity 120 8.39418 0.86461 1.0183
NM_002137 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.39305 0.128769 -1.1834
HNRNPA2 BI
HNRPDL D89092 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.3923 0.849824 -1.0149
LAP3 NM 015907 leucine aminopeptidase 3 8.39046 0.092932 1.4073
XRN1 BG534738 5-3' exoribonuclease 1 8.3903 0.007922 1.3637
IKZF1 AI741188 IKAROS family zinc finger 1 (Ikaros 8.38925 0.1615 1.1392
PTPRO U20489 protein tyrosine phosphatase, recep 8.38858 0.45852 -1.0965
... AI475680 ... 8.38786 0.73979 1.0292
YY1 NM 003403 YY1 transcription factor 8.38742 0.894068 1.006
EIF4A1 NM 001416 eukaryotic translation initiation f 8.38655 0.411834 -1.0963
ATP5L AF070655 ATP synthase, H+ transporting, mito 8.38536 0.130216 -1.1949
MKNK2 NM 017572 MAP kinase interacting serine/threo 8.38535 0.007243 1.374
CD99 NM 002414 CD99 molecule 8.38057 0.768741 1.0809
GLUL AL161952 glutamate-ammonia ligase (glutamine 8.38042 0.026311 1.7408
SFRS2 NM 003016 splicing factor, arginine/serine-ri 8.37976 0.549051 -1.1154
BAT2D1 AL096857 BAT2 domain containing 1 8.37657 0.65826 1.0339
SSR2 NM 003145 signal sequence receptor, beta (tra 8.37371 0.053499 -1.3037
RASSF5 BC004270 Ras association (RalGDS/AF-6) domai 8.37363 0.425454 1.0467
HNRPA3P 1 NDUFA12 BG505670 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.37123 0.337738 -1.1205
AF217092 NADH déydrogenase (ubiquinone) 1 a 8.37103 0.540797 -1.0946
ATF4 NM 001675 activating transcription factor 4 ( 8.37068 0.038601 -1.2466
PDLA6 BE910010 protein disulfide isomerase family 8.37012 0.020271 -1.4064
UCP2 U94592 uncoupling protein 2 (mitochondrial 8.37008 0.034364 1.3434
COX6B1 NM 001863 cytochrome c oxidase subunit Vib po 8.36865 0.526681 1.0611
KPNB1 BG249565 karyopherin (importin) beta 1 8.36813 0.6602 -1.0783
CD 164 NM 006016 CD 164 molecule, sialomucin 8.36798 0.03153 1.1897
C14orf2 AF116639 chromosome 14 open reading frame 2 8.36406 0.324647 -1.0952
HIATL1 AF130099 hippocampus abundant transcript-lik 8.36375 0.140116 -1.1371
MX1 NM 002462 myxovírus (influenza vírus) resista 8.36328 0.520428 1.3424
ARF4 NM 001660 ADP-ribosyiation factor 4 8.36192 0.385816 -1.1148
RPL35A BE968801 ribosomal protein L35a 8.3604 0.165992 -1.1602
COX7B NM 001866 cytochrome c oxidase subunit Vllb 8.35879 0.552375 -1.0948
CUTA AF230924 cutA divalent cation tolerance homo 8.35867 0.068731 -1.241
GGA1 AW009695 golgi associated, gamma adaptin ear 8.35687 0.629857 1.0509
SFRS5 NM 006925 splicing factor, arginine/serine-ri 8.35184 0.027215 1.2557
MSN NM 002444 moesin 8.35141 0.181786 1.1855
DUT U62891 deoxyuridine triphosphatase 8.35055 0.188521 -1.2369
ATP5L AL050277 ATP synthase, H+ transporting, mito 8.34504 0.083496 -1.2366
NARS NM 004539 asparaginyl-tRNA synthetase 8.34449 0.635304 -1.0749
SIDT2 AA150165 SID1 transmembrane family, member O 8.34325 0.00485 1.9548
GHITM AF131820 z growth hormone inducible transmembr 8.34322 0.106941 -1.2067
DEK NM 003472 DEK oncogene (DNA binding) 8.34219 0.098052 1.1739
ISG20 U88964 interferon stimulated exonuclease g 8.34132 0.524488 1.1486
TP53INP1 AW341649 tumor protein p53 inducible nuclear 8.33664 0.013329 -1.4612
RPL23 NM 000978 ribosomal protein L23 8.33294 0.947883 -1.0515
EEF1D NM 001960 eukaryotic translation elongation f 8.33234 0.745396 -1.037
DDX3X NM_001356 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypept 8.33229 0.953913 -1.0772
RPL36 NM015414 ribosomal protein L36 8.32832 0.321675 -1.097
S100A9 NM 002965 SI 00 calcium binding protein A9 8.32804 0.017515 2.0885
GCH1 NM 000161 GTP cyclohydrolase 1 (dopa-responsi 8.32697 0.002631 1.6161
ALDOA NM 000034 aldolase A, fructose-bisphosphate 8.32541 0.537656 1.0768
ATP5C1 NM 005174 ATP synthase, H+ transporting, mito 8.32478 0.402435 -1.0772
HNRNPC AV725195 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.32323 0.619889 -1.0633
MT2A NM 005953 metallothionein 2A 8.32201 0.000184 1.7931
RABGGT B CEBPB U49245 Rab geranylgeranyltransferase, beta 8.32127 0.727953 -1.0337
AL564683 CCAAT/enhancer binding protein (C/E 8.3206 0.041769 1.7553
C2orf25 NM 015702 chromosome 2 open reading frame 25 8.31939 0.118611 -1.1739
HLA-E X56841 major histocompatibility complex, c 8.31854 0.026943 1.4724
BTF3 X74070 basic transcription factor 3 8.31805 0.081674 -1.1602
FGD2 NM_173558 FYVE, RhoGEF and PH domain containi 8.31601 0.048059 1.9222
S100A4 NM 002961 SI00 calcium binding protein A4 8.314 0.020537 1.6863
CTSS AK024855 cathepsin S 8.31386 0.052636 1.5002
XPO1 D89729 exportin 1 (CRM1 homolog, yeast) 8.31266 0.714281 1.0576
COX4I1 AA854966 cytochrome c oxidase subunit IV iso 8.31042 0.337784 1.1079
RGS1 S59049 regulator of G-protein signaling 1 8.30962 0.667615 -1.1409
BTG1 NM 001731 B-cell translocation gene 1, anti-p 8.30697 0.347294 1.097
EIF3E BC000734 eukaryotic translation initiation f 8.30594 0.229759 -1.1144
RBM39 NM 004902 RNA binding motif protein 39 8.30573 0.621206 1.0377
... AFFX-R2-EC ... 8.30493 0.136681 1.188
IL23A M15564 interleukin 23, alpha subunit pl9 8.30309 0.613798 -1.0291
TMEM50 A AL550722 transmembrane protein 50A 8.30289 0.50782 -1.0896
r\ ERH NM 004450 enhancer of rudimentary homolog (Dr 8.30258 0.964687 -1.0172
CKAP4 NM 006825 cytoskeleton-associated protein 4 8.29994 0.229647 -1.2417
HNRPD M94630 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.29747 0.160675 -1.1848
GGA1 AW001443 golgi associated, gamma adaptin ear 8.29674 0.586356 1.0567
URG4 BF970023 up-regulated gene 4 8.29555 0.306455 -1.1575
ARPC2 AF279893 actin related protein 2/3 complex, 8.29498 0.249624 1.1009
STARD7 NM 020151 StAR-related lipid transfer (START) 8.29465 0.954305 -1.0062
RPS27L NM 015920 ribosomal protein S27-like 8.29376 0.540076 1.0992
SMCR8 N25727 Smith-Magenis syndrome chromosome r 8.29287 0.088141 1.2924
RPL24 NM 000986 ribosomal protein L24 8.29274 0.506332 -1.0651
LOC64689 0 SEPT7 W72220 hypothetical LOC646890 8.29227 0.24446 1.0969
AU157515 septin 7 8.29012 0.615907 1.0426
RAC1 BG292367 ras-related C3 botulinum toxin subs 8.28598 0.142416 1.1527
SDCBP NM 005625 syndecan binding protein (syntenin) 8.2835 0.062812 1.3584
GNLY NM 006433 granulysin 8.28235 0.383517 1.3033
FOXP1 AK026898 forkhead box Pl 8.28233 0.950153 -1.039
KHDRBS1 NM 006559 KH domain containing, RNA binding, 8.282 0.880587 -1.0146
ISG15 NM_005101 ISG15 ubiquitin-like modifier 8.28172 0.083812 1.913
CAP1 NM 006367 CAP, adenylate cyclase-associated p 8.28066 0.057672 1.2419
FTH1 AA083483 ferritin, heavy polypeptide 1 8.28056 0.360314 1.4026
GNAS AF088184 GNAS complex locus 8.27878 0.010903 -1.8682
GNB2L1 NM 006098 guanine nucleotide binding protein 8.27566 0.157792 -1.2041
HSP90B1 NM 003299 heat shock protein 90kDa beta (Grp9 8.2753 0.005488 -1.9074
ANXA1 NM 000700 annexin Al 8.27519 0.121859 1.247
SNRPA1 NM 003090 small nuclear ribonucleoprotein pol 8.27426 0.266829 -1.0958
COX8A NM 004074 cytochrome c oxidase subunit 8A (ub 8.27069 0.766653 -1.0428
RPS8 NM 001012 ribosomal protein S8 8.27038 0.160062 -1.168
PPP6C NM 016294 protein phosphatase 6, catalytic su 8.2644 0.335491 -1.1229
MAPK1IP 1L S100A10 AI671747 mitogen-activated protein kinase 1 8.26426 0.590003 -1.0544
NM 002966 SI00 calcium binding protein A10 8.26219 0.064505 1.2626
HNRPDL NM 005463 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.25823 0.180024 -1.1425
DBI NM 020548 diazepam binding inhibitor (GABA re 8.25394 0.284601 1.0937
PTGES3 BC003005 prostaglandin E synthase 3 (cytosol 8.25277 0.892391 -1.0057
PTMA BF686442 prothymosin, alpha (gene sequence 2 8.25224 0.652471 1.0518
MAP3K5 NM 005923 mitogen-activated protein kinase ki 8.25208 0.25101 1.1085
CCT2 NM 006431 chaperonin containing TCP1, subunit 8.24577 0.063573 -1.3234
CD3D NM_000732 CD3d molecule, delta (CD3-TCR compl 8.24324 0.9706 1.0481
KCMF1 NM 020122 potassium channel modulatory factor 8.23504 0.155602 -1.1713
TNPO1 AI307759 transportin 1 8.23501 0.339538 -1.1128
HMGB1 BF673940 high-mobility group box 1 8.23251 0.474802 -1.072
GAPDH AFFXHUMGA glyceraldéyde-3-phosphate déydrog 8.2321 0.169197 -1.258
P4HB J02783 procollagen-proline, 2-oxoglutarate 8.23102 0.086088 -1.3641
NDUFA1 NM 004541 NADH déydrogenase (ubiquinone) 1 a 8.2212 0.626282 -1.2111
SUMO3 NM 006936 SMT3 suppressor of mif two 3 homolo 8.2195 0.437147 1.0869
LGALS1 NM 002305 lectin, galactoside-binding, solubl 8.21919 0.572261 1.1837
EDF1 AB002282 endothelial differentiation-related 8.21902 0.526316 -1.1349
RAN AF054183 RAN, member RAS oncogene family 8.21807 0.065397 -1.3724
FBXO9 AL031178 F-box protein 9 8.21739 0.409716 1.0657
ATP6V0E 1 UBE2L6 NM 003945 ATPase, H+ transporting, lysosomal 8.21734 0.002317 1.3355
NM 004223 ubiquitin-conjugating enzyme E2L 6 8.21408 0.008367 1.6999
YPEL5 NM 016061 yippee-like 5 (Drosophila) 8.21168 0.904653 1.0332
ATP5O NM 001697 ATP synthase, H+ transporting, mito 8.21023 0.242888 -1.1563
EEF2 NM 001961 eukaryotic translation elongation f 8.20901 0.058201 -1.4298
MTCH1 AF189289 mitochondrial carrier homolog 1 (C. 8.20823 0.655524 1.1502
PSMA1 BC005932 proteasome (prosome, macropain) sub 8.20799 0.076977 -1.1429
BTF3 R83000 basic transcription factor 3 8.20789 0.738831 -1.0181
ATP6V1A AF113129 ATPase, H+ transporting, lysosomal 8.2055 0.524883 1.1079
DDX47 NM_016355 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypept 8.20268 0.432305 -1.1056
CHCHD2 NM 016139 coiled-coil-helix-coiled-coil-helix 8.20227 0.116734 -1.2208
DICER1 BF590131 dicer 1, ribonuclease type III 8.19873 0.448877 1.0573
VAPA AF154847 VAMP (vesicle-associated membrane 8.19855 0.484614 -1.0647
Ρ
IFI16 NM 005531 interferon, gamma-inducible protein 8.19783 0.083394 1.3594
C0X5B AI557312 cytochrome c oxidase subunit Vb 8.19555 0.386195 1.05
BTF3 NM 001207 basic transcription factor 3 8.19465 0.369525 -1.074
GSPT1 BE906054 G1 to S phase transition 1 8.18832 0.121258 -1.2841
RPL36A NM 021029 ribosomal protein L36a 8.18795 0.106761 -1.3204
HNRNPC NM 004500 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.1878 0.804821 -1.0209
DYRK1A D86550 dual-specificity tyrosine-(Y)-phosp 8.18478 0.898476 -1.0302
ANAPC5 T33068 anaphase promoting complex subunit 8.18364 0.295651 -1.1779
WARS NM 004184 tryptophanyl-tRNA synthetase 8.18244 0.104168 2.0094
COX7C NM 001867 cytochrome c oxidase subunit VIIc 8.18229 0.443055 -1.0968
ARMCX6 AK000818 armadillo repeat containing, X-link 8.18138 0.798858 -1.0141
IQGAP1 NM 003870 IQ motif containing GTPase activati 8.18103 0.141181 1.1429
SH3KBP1 AF230904 SH3-domain kinase binding protein 1 8.18004 0.40147 1.0527
C0X6A1 NM 004373 cytochrome c oxidase subunit Via po 8.17859 0.109778 -1.2556
CCT8 NM 006585 chaperonin containing TCP1, subunit 8.17805 0.205106 -1.1569
UQCRC2 AV727381 ubiquinol-cytochrome c reductase co 8.17547 0.229933 -1.1033
TMED2 AK024976 transmembrane emp24 domain traffick 8.17265 0.15154 -1.2146
HLA-B D83043 major histocompatibility complex, c 8.16695 0.07086 1.366
ISG20 NM 002201 interferon stimulated exonuclease g 8.16677 0.867817 1.0728
STK17B N51102 serine/threonine kinase 17b 8.16663 0.099987 1.172
CMTM6 NM 017801 CKLF-like MARVEL transmembrane doma 8.16611 0.217529 1.2073
PHC3 AI042019 polyhomeotic homolog 3 (Drosophila) 8.16489 0.217167 -1.1318
H2AFY NM 004893 H2A histone family, member Y 8.16429 0.469588 1.0658
HNRPH1 AV753392 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.16164 0.650321 -1.0907
CHMP4A NM 014169 chromatin modifying protein 4A 8.16139 0.244815 1.1012
ATP5L NM 006476 ATP synthase, H+ transporting, mito 8.16055 0.097009 -1.2291
GMFG NM 004877 glia maturation factor, gamma 8.1584 0.107106 1.199
IL23A AF043179 interleukin 23, alpha subunit pl9 8.15722 0.828678 1.0446
HSPA8 AF352832 heat shock 70kDa protein 8 8.15684 0.898128 1.0527
ZFP36L2 U07802 zinc finger protein 36, C3H type-li 8.1533 0.699391 1.0579
CDIPT NM 006319 CDP-diacylglycerol—inositol 3-phos 8.15137 0.193167 1.1208
NDUFA11 AI743115 NADH déydrogenase (ubiquinone) 1 a 8.15083 0.455681 -1.0867
USP7 AI160440 ubiquitin specific peptidase 7 (her 8.15075 0.774305 1.0109
EIF3K AW083133 eukaryotic translation initiation f 8.14838 0.387202 -1.101
CORO1A U34690 coronin, actin binding protein, 1A 8.1448 0.662056 1.1124
BUB3 AF047473 BUB3 budding uninhibited by benzimi 8.14397 0.223256 -1.142
IFI44 NM 006417 interferon-induced protein 44 8.14365 0.216154 1.3768
Clorf41 AV702994 chromosome 1 open reading frame 41 8.14335 0.234725 -1.2484
RAC1 BC004247 ras-related C3 botulinum toxin subs 8.1431 0.053696 1.2382
ATP1B3 U51478 ATPase, Na+/K+ transporting, beta 3 8.14151 0.722562 -1.0507
USP3 AF077040 ubiquitin specific peptidase 3 8.14094 0.975649 1.0204
RTN4 ABO 15639 reticulon 4 8.14039 0.118429 1.1444
RPL10A NM 007104 ribosomal protein LlOa 8.14036 0.079958 -1.4033
NADK AI334128 NAD kinase 8.13858 0.303548 1.2529
HLA-C BG485135 major histocompatibility complex, c 8.13812 0.039267 -1.6007
TMBIM4 AF182414 transmembrane BAX inhibitor motif c 8.13702 0.331949 1.1757
PHF11 BF055474 PHD finger protein 11 8.13442 0.013218 1.4247
UQCR NM 006830 ubiquinol-cytochrome c reductase, 6 8.1329 0.532081 1.1853
PRKCB1 M13975 protein kinase C, beta 1 8.13205 0.232981 1.1366
ΊΟ
CCT4 NM 006430 chaperonin containing TCP1, subunit 8.13147 0.16879 -1.1908
SF3B1 NM 012433 splicing factor 3b, subunit 1, 155k 8.13137 0.098079 -1.1353
NDUFB9 AF261090 NADH déydrogenase (ubiquinone) 1 b 8.13045 0.040803 -1.254
NAP1L1 AW148801 nucleosome assembly protein 1-like 8.12871 0.429853 -1.0828
TNFSF13 Β S0D1 AF134715 tumor necrosis factor (ligand) supe 8.12797 0.060071 1.9273
NM 000454 superoxide dismutase 1, soluble (am 8.12528 0.613424 -1.0658
AFG3L2 AA905788 AFG3 ATPase family gene 3-like 2 (y 8.12264 0.309957 -1.1194
KLF6 BG250721 Kruppel-like factor 6 8.12184 0.047534 1.5436
CCL5 NM 002985 chemokine (C-C motif) ligand 5 8.11657 0.7246 1.4152
ACTR3 Z78330 ARP3 actin-related protein 3 homolo 8.11364 0.059794 1.2148
SNRPB AL049650 small nuclear ribonucleoprotein pol 8.11331 0.303023 -1.131
HNRPD AA865357 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.11085 0.733618 -1.0929
JAK1 AL039831 Janus kinase 1 (a protein tyrosine 8.11071 0.530372 1.0315
HMHA1 BE349017 histocompatibility (minor) HA-1 8.1093 0.092012 1.2394
HSPC152 NM 016404 hypothetical protein HSPC152 8.10919 0.326201 -1.1359
GSTO1 NM 004832 glutathione S-transferase omega 1 8.10821 0.090006 1.3182
CCL5 M21121 chemokine (C-C motif) ligand 5 8.1054 0.620439 1.3123
ATP5J2 NM 004889 ATP synthase, H+ transporting, mito 8.1041 0.63643 -1.0692
JUND NM 005354 jun D proto-oncogene 8.10089 0.272302 1.1922
PAG1 AK000680 phosphoprotein associated with glyc 8.10064 0.643176 -1.1113
SLC38A1 BF247552 solute carrier family 38, member 1 8.09983 0.292745 -1.1328
HIPK3 AV693403 homeodomain interacting protein kin 8.098 0.014359 1.2149
GABARA p NM 007278 GABA(A) receptor-associated protein 8.09673 0.099454 1.394
ICAM3 NM 002162 intercellular adhesion molecule 3 8.09583 0.024752 1.2527
CRELD2 NM 024324 cysteine-rich with EGF-like domains 8.0945 0.073672 -1.4127
FDFT1 AA872727 famesyl-diphosphate famesyltransf 8.09397 0.849569 -1.001
CD48 NM 001778 CD48 molecule 8.0936 0.073903 1.1852
ASAH1 AI934569 N-acylsphingosine amidohydrolase (a 8.09224 0.149826 1.3797
CHST6 NM 021615 carbohydrate (N-acetylglucosamine 6 8.09216 0.216899 1.5145
TRAF3IP3 AL022398 TRAF3 interacting protein 3 8.09147 0.717668 1.0645
SET NM 003011 SET translocation (myeloid leukemia 8.09111 0.497269 -1.1402
STOM M81635 stomatin 8.09103 0.020133 1.4155
GZMH M36118 granzyme H (cathepsin G-like 2, pro 8.0882 0.163366 1.7024
NDUFS5 NM 004552 NADH déydrogenase (ubiquinone) Fe- 8.08662 0.012009 -1.3304
ZNF207 NM 003457 zinc finger protein 207 8.08452 0.11384 -1.1966
PECAM1 AW574504 platelet/endothelial cell adhesion 8.08292 0.492454 1.1582
PIP4K2A BE878277 phosphatidylinositol-5-phosphate 4- 8.08197 0.181779 1.1271
FAM26F AV734646 family with sequence similarity 26, 8.08179 0.004813 2.3726
IER2 NM 004907 immediate early response 2 8.08119 0.103088 1.2748
VIM AI922599 vimentin 8.08044 0.373999 -1.1106
PSMB2 NM 002794 proteasome (prosome, macropain) sub 8.07895 0.083045 -1.367
NUCKS1 AW515443 nuclear casein kinase and cyclin-de 8.07748 0.443498 -1.1117
SCO2 NM 005138 SCO cytochrome oxidase defícient ho 8.07667 0.039569 1.8079
SLC25A6 AA916851 solute carrier family 25 (mitochond 8.07578 0.415097 -1.0743
NLRC5 AA005023 NLR family, CARD domain containing 8.07544 0.004076 1.7472
TCF7L2 AI949687 transcription factor 7-like 2 (T-ce 8.07535 0.016262 1.8697
GNS BE880245 glucosamine (N-acetyl)-6-sulfatase 8.07425 0.158787 1.6006
NDUFA6 NM 002490 NADH déydrogenase (ubiquinone) 1 a 8.07369 0.741775 1.0076
KPNA2 NM 002266 karyopherin alpha 2 (RAG cohort 1, 8.06967 0.057832 -1.3577
... AFFX-BIODN ... 8.06934 0.11027 1.212
ARF1 AF052179 ADP-ribosylation factor 1 8.06919 0.517062 1.0392
FBX09 AF176704 F-box protein 9 8.06764 0.353218 1.1014
ARGLU1 NM 018011 arginine and glutamate rich 1 8.06662 0.68851 -1.0125
STAT1 BC002704 signal transducer and activator of 8.06656 0.131885 1.4237
H2AFZ NM 002106 H2A histone family, member Z 8.06542 0.051489 -1.5297
RPL29 NM 000992 ribosomal protein L29 8.06512 0.55845 -1.1119
Cllorf58 NM 014267 chromosome 11 open reading frame 58 8.06336 0.314178 -1.1069
MYD88 U70451 myeloid differentiation primary res 8.06109 0.002823 1.8194
WSB1 NM_015626 WD repeat and SOCS box-containing 1 TROVE domain family, member 2 8.06062 0.00276 1.4536
TROVE2 AL538601 8.06052 0.265045 -1.107
HLA-E M31183 major histocompatibility complex, c 8.05639 0.055986 1.263
PLEKHA2 BF968578 pleckstrin homology domain containi 8.05497 0.194794 1.1324
HNRNPU NM 004501 heterogeneous nuclear ribonucleopro 8.05472 0.7649 -1.0324
P0U2AF1 NM 006235 POU class 2 associating factor 1 8.05215 0.00391 -2.7707
UQCRFS1 BC000649 ubiquinol-cytochrome c reductase, R 8.05026 0.191958 -1.1716
... AF112222 ... 8.04967 0.920772 -1.0059
WIPF1 AW058622 WAS/WASL interacting protein family 8.04929 0.66926 -1.0195
MAX BC003525 MYC associated factor X 8.04404 0.210946 1.1229
PSMG2 NM 020232 proteasome (prosome, macropain) ass 8.04348 0.428247 -1.0691
XRCC6 NM 001469 X-ray repair complementing defectiv 8.04347 0.249394 -1.1711
NDUFB1 NM 004545 NADH déydrogenase (ubiquinone) 1 b 8.0421 0.846981 1.0042
TACC1 NM 006283 transforming, acidic coiled-coil co 8.04071 0.549207 1.0396
CD55 AI679555 CD55 molecule, decay accelerating f 8.04067 0.784258 1.1724
FAM46C AL046017 family with sequence similarity 46, 8.03968 0.096586 -1.4895
NOMO2 AL512687 NODAL modulator 2 8.03869 0.098951 -1.3523
PAN3 AI970788 PAN3 polyA specific ribonuclease su 8.03825 0.89689 1.0132
VCAN NM 004385 versican 8.03597 0.385148 1.292
PPA1 NM 021129 pyrophosphatase (inorganic) 1 8.03509 0.069984 -1.3591
MBNL1 AW296451 muscleblind-like (Drosophila) 8.0338 0.486855 1.0128
PSMA1 NM 002786 proteasome (prosome, macropain) sub 8.03335 0.014331 -1.314
PSMB8 U17496 proteasome (prosome, macropain) sub 8.03203 0.186064 1.1656
NOP5/NO P5 SLC38A1 AF161469 nucleolar protein NOP5/NOP58 8.03187 0.093332 -1.3236
NM 030674 solute carrier family 38, member 1 8.0278 0.025016 -1.4021
Clorf43 BC000152 chromosome 1 open reading frame 43 8.02721 0.059845 -1.1982
LNPEP AA156754 leucyl/cystinyl aminopeptidase 8.02703 0.026253 1.2604
GYG1 AF087942 glycogenin 1 8.02642 0.534641 -1.2035
CYBA NM 000101 cytochrome b-245, alpha polypeptide 8.02426 0.053699 1.277
TRIM22 AA083478 tripartite motif-containing 22 8.0224 0.030426 1.6719
SNHG1 AL530869 small nucleolar RNA host gene (non- 8.02118 0.004411 -1.4879
MRPL3 BC003375 mitochondrial ribosomal protein L3 8.0203 0.015573 -1.3782
BE260771 keratinocyte associated protein 2 8.01882 0.136134 -1.2214
KRTCAP2
RPS20 NM 001023 ribosomal protein S20 8.0188 0.565374 -1.0488
ΙΤΜ2Β AF092128 integral membrane protein 2B 8.01825 0.242755 1.1838
EPSTI1 AA781795 epithelial stromal interaction 1 (b 8.01662 0.077436 1.644
SRP72 BE856385 signal recognition particle 72kDa 8.01516 0.006937 -1.4357
SNHG6 BG169443 small nucleolar RNA host gene (non- 8.01504 0.308839 -1.0917
DDX21 NM 004728 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypept 8.01428 0.485314 -1.0679
TDG NM 003211 thymine-DNA glycosylase 8.01252 0.40529 -1.0824
NC0A7 AL035689 nuclear receptor coactivator 7 8.01191 0.071178 1.5739
PTMA AL121585 prothymosin, alpha (gene sequence 2 8.01149 0.471739 -1.1039
TOP1 J03250 topoisomerase (DNA) I 8.00829 0.525123 -1.0487
CSDE1 AA167775 cold shock domain containing El, RN 8.00733 0.520295 -1.1743
C14orfl66 NM 016039 chromosome 14 open reading trame 16 8.00683 0.041707 -1.2839
AP3S1 NM 001284 adaptor-related protein complex 3, 8.00663 0.970597 -1.0021
DERL1 NM 024295 Derl-like domain family, member 1 8.00362 0.082843 -1.3332
... AFFX-R2-EC ... 8.00211 0.085496 1.2493
TIMM23 AI804075 translocase of inner mitochondrial 8.0019 0.095141 -1.225
PCNA NM 002592 proliferating cell nuclear antigen 8.00098 0.085038 -1.4205
LGALS3 BC001120 lectin, galactoside-binding, solubl 7.99569 0.552808 -1.1585
NTN2L AW404894 netrin 2-like (chicken) 7.99496 0.019948 -1.9949
RNASEK BE744389 ribonuclease, RNase K 7.99337 0.321241 1.0922
EPC1 AK024117 enhancer of polycomb homolog 1 (Dro 7.99307 0.896893 -1.0439
SNX5 AA131508 sorting nexin 5 7.99189 0.025089 -1.3304
ARHGEF6 D25304 Rac/Cdc42 guanine nucleotide exchan 7.99103 0.161681 1.1065
TEGT NM 003217 testis enhanced gene transcript (BA 7.99026 0.370488 1.0665
MYADM BE908995 myeloid-associated differentiation 7.98985 0.448536 1.1484
ARPC1B NM 005720 actin related protein 2/3 complex, 7.98766 0.024046 1.2572
TRMT5 AB037814 TRM5 tRNA methyltransferase 5 homol 7.98761 0.391108 -1.0948
PGM2 BF512139 phosphoglucomutase 2 7.98617 0.724018 1.0917
DDX39 NM 005804 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypept 7.98519 0.211137 -1.2886
USP1 NM 003368 ubiquitin specific peptidase 1 7.98427 0.103234 -1.3175
TBCA NM 004607 tubulin folding cofactor A 7.98365 0.195429 -1.1178
NKG7 NM 005601 natural killer cell group 7 sequenc 7.98363 0.530321 1.2459
C0X5A NM 004255 cytochrome c oxidase subunit Va 7.97854 0.106624 -1.267
R0D1 AI735576 ROD1 regulator of differentiation 1 7.97738 0.049041 1.1834
SH3BGRL NM 003022 SH3 domain binding glutamic acid-ri 7.97732 0.043681 1.2939
UQCRH NM 006004 ubiquinol-cytochrome c reductase hi 7.97623 0.010479 -1.5162
HCLS1 NM 005335 hematopoietic cell-specific Lyn sub 7.9739 0.394064 1.0679
ANAPC5 BC006301 anaphase promoting complex subunit 7.97301 0.285519 -1.176
CYFIP2 AL161999 cytoplasmic FMR1 interacting protei 7.97235 0.608979 1.0753
C7orf30 BG397444 chromosome 7 open reading trame 30 7.97118 0.09616 -1.1582
TALDO1 NM 006755 transaldolase 1 7.97109 0.472856 1.1701
PSMB1 NM 002793 proteasome (prosome, macropain) sub 7.96981 0.055941 -1.1383
ATP5I BC003679 ATP synthase, H+ transporting, mito 7.96511 0.120927 -1.4173
PPT1 NM 000310 palmitoyl-protein thioesterase 1 (c 7.96429 0.409818 1.1569
RPS14 AF116710 ribosomal protein S14 7.96324 0.326332 -1.2222
... AL031589 ... 7.96259 0.071552 -1.4326
BG107203 RAB GTPase activating protein 1-lik 7.96179 0.1958 1.2853
RABGAP1 τ
L· SET M93651 SET translocation (myeloid leukemia 7.96036 0.329404 -1.1751
PSMB3 NM 002795 proteasome (prosome, macropain) sub 7.9592 0.464727 -1.1011
SRI L12387 sorcin 7.9591 0.041935 1.2553
ACLY NM 001096 ATP citrate lyase 7.95858 0.588659 -1.0694
NDUFA4 NM 002489 NADH déydrogenase (ubiquinone) 1 a 7.95513 0.218428 -1.1443
PSMB10 NM 002801 proteasome (prosome, macropain) sub 7.95506 0.008457 1.4388
NAP1L1 AI888672 nucleosome assembly protein 1-like 7.95473 0.429714 -1.1087
CECR1 NM 017424 cat eye syndrome chromosome region, 7.9532 0.054082 1.4717
EIF3H NM 003756 eukaryotic translation initiation f 7.953 0.13323 -1.1329
PSMC1 NM 002802 proteasome (prosome, macropain) 26S 7.95027 0.028256 -1.2037
IFI44L NM 006820 interferon-induced protein 44-like 7.94977 0.31081 1.5435
PFDN5 AB055804 prefoldin subunit 5 7.94688 0.148682 1.2697
NAP1L1 AI985751 nucleosome assembly protein 1-like 7.93972 0.423449 -1.0898
IFI27 NM 005532 interferon, alpha-inducible protein 7.93893 0.948533 1.3222
IFNGR1 NM 000416 interferon gamma receptor 1 7.9384 0.291485 1.2536
LIMS1 AL110164 LIM and senescent cell antigen-like 7.93759 0.888499 -1.0143
HLA-G M90684 major histocompatibility complex, c 7.93684 0.137039 1.2659
C15orfl5 AF165521 chromosome 15 open reading frame 15 7.93433 0.869033 1.0055
TINP1 NM 014886 TGF beta-inducible nuclear protein 7.93385 0.118064 -1.2099
TYMS NM 001071 thymidylate synthetase 7.93346 0.043902 -1.7356
CLTC NM 004859 clathrin, heavy chain (Hc) 7.93169 0.262781 -1.1206
D ADI NM 001344 defender against cell death 1 7.93131 0.084036 -1.3032
ARPC5 AL516350 actin related protein 2/3 complex, 7.93019 0.023254 1.3929
MESDC2 AK026606 mesoderm development candidate 2 7.92901 0.271806 -1.1771
EIF4E2 BF516289 eukaryotic translation initiation f 7.9273 0.215405 1.1607
RNF213 AA233374 iing finger protein 213 7.92579 0.004581 1.553
DKC1 NM 001363 dyskeratosis congênita 1, dyskerin 7.92572 0.057177 -1.2269
NM_004493 hydroxysteroid (17-beta) déydrogen 7.92345 0.608285 -1.0662
HSD17B1 Λ
U FKBP5 ΑΓ753747 FK506 binding protein 5 7.9231 0.057854 1.4185
CD52 NM 001803 CD52 molecule 7.91932 0.524059 1.1436
RBMS1 AL517946 RNA binding motif, single stranded 7.91705 0.046484 1.2965
MIF NM 002415 macrophage migration inhibitory fac 7.91423 0.106448 -1.3398
SAT1 BE326919 spermidine/spermine N1 -acetyltransf 7.91179 0.264597 1.8175
CSTA NM 005213 cystatin A (stefm A) 7.90955 0.072264 1.8634
HLA-F NM 018950 major histocompatibility complex, c 7.90836 0.017175 1.3924
ECOP NM 030796 EGFR-coamplified and overexpressed 7.9055 0.07665 -1.3057
MCM6 NM 005915 minichromosome maintenance 7.90157 0.038118 -1.602
complex
PPTC7 AW300598 PTC7 protein phosphatase homolog (S 7.90069 0.356898 -1.0665
... AFFX-R2-BS ... 7.90066 0.884237 -1.2344
SSR3 AW087870 signal sequence receptor, gamma (tr 7.90011 0.014039 -1.7728
CX3CR1 U20350 chemokine (C-X3-C motif) receptor 1 7.89988 0.012371 2.3472
SFRS7 BF033354 splicing factor, arginine/serine-ri 7.89544 0.436289 -1.1439
RBM39 AI890947 RNA binding motif protein 39 7.89424 0.448342 -1.0918
SFT2D1 ΤΙΜΜ8Β BF975327 NM 012459 SFT2 domain containing 1 translocase of inner mitochondrial 7.89083 0.798093 7.88921 0.681191 -1.0423 -1.0325
FBXL5 AF142481 F-box and leucine-rich repeat prote 7.88865 0.016196 1.3524
YWHAZ BC003623 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 7.8884 0.698486 -1.1792
0DC1 NM 002539 omithine decarboxylase 1 7.88718 0.09129 -1.3131
LSM14A BG054966 LSM14A, SCD6 homolog A (S. cerevisi 7.88606 0.059241 -1.179
CDC42SE o AF131831 CDC42 small effector 2 7.88516 0.198825 -1.15
SFRS9 NM 003769 splicing factor, arginine/serine-ri 7.8827 0.667166 -1.0837
HNRPA3 AA528233 heterogeneous nuclear ribonucleopro 7.88217 0.37059 -1.1008
SAP18 U78303 Sin3A-associated protein, 18kDa 7.88139 0.150022 -1.1034
ZFAND5 AF062347 zinc finger, ANl-type domain 5 7.88095 0.063681 1.4311
H3F3B AW138159 H3 histone, family 3B (H3.3B) 7.87842 0.377711 1.161
PEBP1 AF130103 phosphatidylethanolamine binding pr 7.87794 0.019274 -1.5278
CCT7 NM 006429 chaperonin containing TCP1, subunit 7.87698 0.076044 -1.3172
RBM15 NM 022768 RNA binding motif protein 15 7.87652 0.407893 -1.177
PHB2 NM 007273 prohibitin 2 7.87581 0.140475 -1.2495
SFRS6 AL031681 splicing factor, arginine/serine-ri 7.87558 0.051458 -1.2458
TPI1 NM 000365 triosephosphate isomerase 1 7.8746 0.487514 -1.1066
ΚΙ A AO 101 NM 014736 KIAA0101 7.87436 0.049651 -1.6844
SERF2 BE568651 small EDRK-rich factor 2 7.87325 0.421448 1.0767
ADD3 BE545756 adducin 3 (gamma) 7.87255 0.392151 -1.0707
CROP NM 016424 cisplatin resistance-associated ove 7.87218 0.567651 -1.1491
CFLAR AF005775 CASP8 and FADD-like apoptosis regul 7.87209 0.169911 -1.255
ATP5J NM 001685 ATP synthase, H+ transporting, mito 7.87151 0.023635 -1.3658
TCF7 NM 003202 transcription factor 7 (T-cell spec 7.87083 0.340212 -1.1737
LAPTM5 AI589086 lysosomal associated multispanning 7.87044 0.168989 1.1309
RAP2B AW005535 RAP2B, member of RAS oncogene famil 7.86988 0.363821 1.0953
... AW084125 ... 7.86975 0.545528 -1.2461
COP1 NM 052889 caspase-1 dominant-negative inhibit 7.86974 0.015776 1.7438
EVI2B BC005926 ecotropic viral integration site 2B 7.86582 0.361829 1.1354
ARPP-19 AF084555 cyclic AMP phosphoprotein, 19 kD 7.86548 0.500026 -1.1665
NDUFC2 NM 004549 NADH déydrogenase (ubiquinone) 1, 7.86547 0.022416 -1.3152
CLEC2B BC005254 C-type lectin domain family 2, memb 7.86529 0.427371 1.1774
UFC1 NM 016406 ubiquitin-fold modifier conjugating 7.86429 0.14366 -1.171
HDAC1 NM 004964 histone deacetylase 1 7.86357 0.695006 -1.0059
CBFB NM 001755 core-binding factor, beta subunit 7.86157 0.302277 -1.1185
ADSL NM 000026 adenylosuccinate lyase 7.86154 0.115159 -1.2038
NDUFB8 NM 005004 NADH déydrogenase (ubiquinone) 1 b 7.861 0.268462 -1.1956
DENR AB014731 density-regulated protein 7.86099 0.405568 -1.09
CSNK1A1 AW268585 casein kinase 1, alpha 1 7.8604 0.96556 -1.0223
PSCDBP L06633 pleckstrin homology, Sec7 and coile 7.85981 0.561005 -1.094
HMGN1 NM 004965 high-mobility group nucleosome bind 7.85924 0.068964 -1.5046
NM 003730 ribonuclease T2 7.85874 0.055491 1.5828
RNASET2
STAT1 LOC72817 ο AFFX-HUMIS AL136226 signal transducer and activator of similar to LOC100037086 protein 7.85697 7.85677 0.024373 0.164486 1.6813 -1.3105
NOLC1 D21262 nucleolar and coiled-body phosphopr 7.85496 0.086744 -1.2281
PABPC1 ΑΓ760366 poly(A) binding protein, cytoplasmi 7.85478 0.94926 1.0167
NMI NM 004688 N-myc (and STAT) interactor 7.8532 0.006946 1.5219
EIF3G BC000733 eukaryotic translation initiation f 7.85094 0.730483 1.0383
COX6C NM 004374 cytochrome c oxidase subunit VIc 7.85042 0.051302 -1.2906
FLJ22662 NM 024829 hypothetical protein FLJ22662 7.84999 0.053703 2.112
SLC2A3 NM 006931 solute carrier family 2 (facilitate 7.84894 0.186639 1.3041
ANP32E AW612574 acidic (leucine-rich) nuclear phosp 7.84885 0.081693 -1.3476
TRIM25 BE563152 tripartite motif-containing 25 7.8476 0.016936 1.4518
EIF3K AF085358 eukaryotic translation initiation f 7.84658 0.270938 -1.1342
GNG5 NM 005274 guanine nucleotide binding protein 7.84483 0.61179 -1.1253
HINT1 U27143 histidine triad nucleotide binding 7.84463 0.157242 -1.2225
C22orf32 AV751709 chromosome 22 open reading ffame 32 7.84213 0.500757 -1.0839
Clorf63 AF267856 chromosome 1 open reading frame 63 7.84158 0.439394 1.0608
EEF2 AI004246 eukaryotic translation elongation f 7.84131 0.207484 -1.4015
SET AV702810 SET translocation (myeloid leukemia 7.84122 0.085839 -1.5046
CHSY1 NM 014918 chondroitin sulfate synthase 1 7.84111 0.001841 1.4027
CD74 K01144 CD74 molecule, major histocompatibi 7.84047 0.046954 1.6994
NPC2 NM 006432 Niemann-Pick disease, type C2 7.84034 0.081141 1.6014
MTHFD2 NM 006636 methylenetetrahydrofolate déydroge 7.84011 0.637543 1.0358
STAT2 H98105 signal transducer and activator of 7.83876 0.032873 1.7502
KIAA0746 AB018289 KIAA0746 protein 7.83845 0.103401 -1.4586
TRAC M12959 T cell receptor alpha constant 7.83803 0.637512 1.0284
CD63 NM 001780 CD63 molecule 7.838 0.071032 1.3863
SON X63071 SON DNA binding protein 7.83641 0.545264 -1.0938
RPL22 AW071997 ribosomal protein L22 7.8349 0.526305 -1.0577
GBP1 NM 002053 guanylate binding protein 1, interf 7.83435 0.00216 1.9967
TncRNA BE675516 trophoblast-derived noncoding RNA 7.83321 0.053576 1.5296
KLC1 AF222691 kinesin light chain 1 7.83289 0.651812 1.0619
NR3C1 AI432196 nuclear receptor subfamily 3, group 7.83164 0.121456 1.1614
BCLAF1 NM 014739 BCL2-associated transcription facto 7.83153 0.063633 -1.1958
NOSIP NM 015953 nitric oxide synthase interacting p 7.83121 0.78545 1.146
ARL8B NM 018184 ADP-ribosylation factor-like 8B 7.83004 0.925295 1.0273
SNRPE NM 003094 small nuclear ribonucleoprotein pol 7.82908 0.114942 -1.3543
LOC44035 4 AF271775 ΡΙ-3-kinase-related kinase SMG-1 ps 7.82841 0.641383 1.0778
ATP6V0E 1 TNFAIP8 AI862255 ATPase, H+ transporting, lysosomal 7.82795 0.103392 1.2433
NM 014350 tumor necrosis factor, alpha-induce 7.82731 0.782193 -1.0404
C16orf72 AA526970 chromosome 16 open reading frame 72 7.82672 0.772311 1.0845
HINT1 N32864 histidine triad nucleotide binding 7.82349 0.193143 -1.17
D80006 MOB1, Mps One Binder kinase activat 7.82278 0.08179 1.1991
M0BKL1 Β
ZNF313 AF090934 zinc finger protein 313 7.82269 0.007947 1.2929
SFRS9 NM 003769 splicing factor, arginine/serine-ri 7.82236 0.545666 -1.1601
AL0X5 NM 000698 arachidonate 5-lipoxygenase 7.82228 0.158777 1.7109
HLA-G M90685 major histocompatibility complex, c 7.82127 0.038981 1.3489
CD69 L07555 CD69 molecule 7.82017 0.687162 1.0872
NM 003730 ribonuclease T2 7.81902 0.006686 2.0165
RNASET2
BZW1 NM 014670 basic leucine zipper and W2 domains 7.81898 0.177089 -1.1269
DYNLT1 NM 006519 dynein, light chain, Tctex-type 1 7.81805 0.061789 1.3837
N0LA2 BC000009 nucleolar protein family A, member 7.81794 0.117219 -1.2346
HNRPK AI701949 heterogeneous nuclear ribonucleopro 7.81234 0.63527 -1.0982
SFRS5 AW084582 splicing factor, arginine/serine-ri 7.81152 0.311355 1.1523
TLE4 NM 007005 transducin-like enhancer of split 4 7.81145 0.132057 1.3109
TPI1 BF116254 triosephosphate isomerase 1 7.81126 0.534216 -1.0895
CUL3 AF062537 cullin 3 7.81014 0.134901 -1.152
LCK NM 005356 lymphocyte-specific protein tyrosin 7.80984 0.620879 1.0406
AK021514 hypothetical protein LOC 152719 7.80935 0.322153 1.2531
LOC15271
y NMO16459 hypothetical protein MGC29506 7.80789 0.016535 -2.367
MGC2950
0 HLA- NM 002121 major histocompatibility complex, c 7.80659 0.015645 2.4265
DPB1
CHD2 AV756026 chromodomain helicase DNA binding 7.80599 0.443294 -1.133
CTSB NM 001908 P cathepsin B 7.80529 0.034551 1.723
DNAJC9 BE551340 DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, 7.80528 0.056206 -1.4413
PPTC7 AA521311 PTC7 protein phosphatase homolog (S 7.80492 0.477164 1.1038
GUSB NM 000181 glucuronidase, beta 7.80487 0.894855 1.0117
TEGT AF033095 testis enhanced gene transcript (BA 7.80374 0.094836 -1.2708
PIK3AP1 AW575754 phosphoinositide-3-kinase adaptor p 7.80278 0.002432 1.784
EIF3B U78525 eukaryotic translation initiation f 7.80229 0.08966 -1.206
CNPY2 NM 014255 canopy 2 homolog (zebrafish) 7.80183 0.036005 -1.348
TXNL1 NM 004786 thioredoxin-like 1 7.8013 0.30414 -1.2076
RHEB NM 005614 Ras homolog enriched in brain 7.79979 0.145509 1.1426
TPP1 NM 000391 tripeptidyl peptidase I 7.79764 0.105129 1.3029
SRGN J03223 serglycin 7.79742 0.27782 1.1307
ARS2 AI523895 arsenate resistance protein 2 7.79677 0.169276 -1.1821
MYLIP AW292746 myosin regulatory light chain inter 7.79607 0.365412 1.1535
C20orf24 AF274948 chromosome 20 open reading frame 24 7.79507 0.074121 1.2021
ELOVL5 AL136939 ELOVL family member 5, elongation Λ 7.79473 0.203901 -1.1545
SATB1 NM 002971 U SATB homeobox 1 7.79286 0.53287 -1.1779
CD38 NM 001775 CD38 molecule 7.79243 0.03203 -1.7441
IL10RA NM 001558 interleukin 10 receptor, alpha 7.79042 0.075688 1.2713
TNFAIP8 BC005352 tumor necrosis factor, alpha-induce 7.78993 0.841802 -1.0513
PLSCR3 AI783924 phospholipid scramblase 3 7.78967 0.405584 1.0809
ISCU AY009128 iron-sulfur cluster scaffold homolo 7.78952 0.012091 -1.3315
SQRDL NM 021199 sulfide quinone reductase-like (yea 7.78824 0.003312 1.4912
UQCRC1 NM 003365 ubiquinol-cytochrome c reductase co 7.7878 0.622634 -1.0617
MAFF AL021977 v-maf musculoaponeurotic fibrosarco 7.78766 0.738139 1.145
TMED8 AK025695 transmembrane emp24 protein transpo 7.78137 0.508269 -1.0791
IRAK1 NM 001569 interleukin-1 receptor-associated k 7.78133 0.214125 -1.4576
NAT13 NM 025146 N-acetyltransferase 13 7.78116 0.065522 -1.291
PDE4C NM 000923 phosphodiesterase 4C, cAMP-specific 7.78109 0.25063 1.1866
MRPL20 NM 017971 mitochondrial ribosomal protein L20 7.78045 0.016396 -1.2407
NDUFAB1 NM 005003 NADH déydrogenase (ubiquinone) 1, 7.7794 0.219845 -1.2044
SNX18 AU146771 sorting nexin 18 7.77704 0.15195 1.2225
HERPUD1 AF217990 homocysteine-inducible, endoplasmic 7.77613 0.234465 -1.1203
SEPW1 AW514401 selenoprotein W, 1 7.77532 0.110662 1.2029
RBPJ AL513759 recombination signal binding protei 7.77514 0.739594 1.0815
C6orf32 NM 015864 chromosome 6 open reading frame 32 7.77475 0.048169 1.4238
PARP12 NM 022750 poly (ADP-ribose) polymerase family 7.77347 0.017657 1.9566
ACBD3 NM_022735 acyl-Coenzyme A binding domain cont heterogeneous nuclear ribonucleopro 7.77159 0.205912 -1.1597
HNRPM AF061832 7.76851 0.189384 -1.159
BUB3 AF081496 BUB3 budding uninhibited by benzimi 7.76831 0.065539 -1.3456
AW006185 hypothetical LOC283666 7.76594 0.44857 -1.1251
LOC28366
LRRFIP1 BF965566 leucine rich repeat (in FLII) inter 7.76381 0.084756 1.2432
... AV755522 ... 7.76233 0.165238 1.3526
MDH2 BC001917 malate déydrogenase 2, NAD (mitoch 7.76125 0.068119 -1.3197
HP1BP3 AK023129 heterochromatin protein 1, binding 7.761 0.039728 1.2879
ZNF706 NM 016096 zinc fínger protein 706 7.76023 0.089784 -1.2373
AAK1 AW451954 AP2 associated kinase 1 7.75954 0.703591 -1.0683
NCL NM 005381 nucleolin 7.75885 0.000569 -1.5782
TM9SF2 NM 004800 transmembrane 9 superfamily member 7.75885 0.027909 -1.4065
BF209337 hypothetical LOC541471 7.75746 0.298291 -1.1599
LOC54147
MICB NM 005931 MHC class I polypeptide-related seq 7.75672 0.772778 1.0784
MYCBP2 AA488899 MYC binding protein 2 7.75577 0.995848 -1.0321
TXNDC1 AL080080 thioredoxin domain containing 1 7.75221 0.485506 -1.0883
FAM91A2 AW340595 family with sequence similarity 91, 7.74928 0.182376 1.1404
FAM107B BC004872 family with sequence similarity 107 7.74756 0.499811 -1.0544
ARPC3 AF004561 actin related protein 2/3 complex, 7.74657 0.084024 1.3605
CD2 NM 001767 CD2 molecule 7.74656 0.362389 1.3499
MYCBP2 NM 015057 MYC binding protein 2 7.74341 0.908252 -1.0037
YWHAQ NM 006826 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 7.74296 0.17355 -1.1902
COX7C AF042165 cytochrome c oxidase subunit VIIc 7.74258 0.807011 -1.039
AP1S2 AA551090 adaptor-related protein complex 1, 7.74165 0.064008 1.5971
LOC64797 Q AV729406 hypothetical protein LOC647979 7.74088 0.949464 -1.0534
RAB8B AI807023 RAB8B, member RAS oncogene family 7.73834 0.041937 1.1996
PCMT1 NM 005389 protein-L-isoaspartate (D-aspartate 7.73767 0.045632 1.2617
ΤΑΡ1 NM 000593 transporter 1, ATP-binding cassette 7.73755 0.013995 1.462
CGGBP1 BF979809 CGG triplet repeat binding protein 7.7372 0.690437 -1.0409
PSMB7 NM 002799 proteasome (prosome, macropain) sub 7.73632 0.159487 -1.1414
TARDBP NM 007375 TAR DNA binding protein 7.73201 0.609571 -1.0645
PDE4B NM 002600 phosphodiesterase 4B, cAMP-specific 7.73163 0.399776 -1.1585
SNX3 BE962615 sorting nexin 3 7.73033 0.134193 1.1233
TXNDC4 BC005374 thioredoxin domain containing 4 (en 7.72965 0.2594 -1.1368
CRTC3 NM 022769 CREB regulated transcription coacti 7.7277 0.27079 -1.1452
NUSAP1 NM 016359 nucleolar and spindle associated pr 7.72637 0.064059 -1.5978
FYN M14333 FYN oncogene related to SRC, FGR, Y voltage-dependent anion channel 2 7.7257 0.567563 1.0851
VDAC2 L08666 7.72313 0.089074 -1.2089
NDUFB4 NM 004547 NADH déydrogenase (ubiquinone) 1 b 7.72166 0.125707 -1.1992
VPS35 NM 018206 vacuolar protein sorting 35 homolog 7.72133 0.18938 1.2765
PPHLN1 NM 016488 periphilin 1 7.72121 0.668043 -1.0863
PRR11 AK000296 proline rich 11 7.72094 0.110951 1.1819
PPP1CB AI700962 protein phosphatase 1, catalytic su 7.71929 0.535542 -1.1476
VPS4B AF195514 vacuolar protein sorting 4 homolog 7.7165 0.24156 1.1774
EIF3C BC000533 eukaryotic translation initiation f 7.71464 0.576111 -1.1357
FBL M30448 fibrillarin 7.71345 0.062648 -1.3937
PSMA5 NM 002790 proteasome (prosome, macropain) sub 7.71335 0.326924 -1.1319
TYROBP NM 003332 TYRO protein tyrosine kinase bindin 7.71104 0.007507 2.8639
HNRNPC AA664258 heterogeneous nuclear ribonucleopro 7.71058 0.387002 -1.1427
SERPINB9 AI986192 serpin peptidase inhibitor, clade B 7.71009 0.189443 1.581
EIF5 AK026933 eukaryotic translation initiation f 7.70884 0.735741 1.0475
MALAT1 BE708432 metastasis associated lung adenocar 7.70861 0.039277 1.5142
CBWD5 AV709992 COBW domain containing 5 7.7071 0.020212 -1.5882
BLVRA NM 000712 biliverdin reductase A 7.70582 0.03669 1.5987
PFDN5 NM 002624 prefoldin subunit 5 7.70578 0.53748 1.1262
TMED10 BE780075 transmembrane emp24-like traffickin 7.70531 0.011932 -1.3384
PTGER4 AA897516 prostaglandin E receptor 4 (subtype 7.70461 0.358765 1.1919
... AFFX-DAPX- ... 7.70305 0.926458 -1.3185
PTEN AK024986 phosphatase and tensin homolog (mut 7.70196 0.125612 1.2289
DUSP22 NM 020185 dual specificity phosphatase 22 7.70104 0.143362 1.1578
CLINT1 NM 014666 clathrin interactor 1 7.70064 0.055364 -1.2644
SETD2 AI761110 SET domain containing 2 7.69961 0.591759 -1.0521
SAMD9L BE966604 sterile alpha motif domain containi 7.69861 0.126238 1.8851
CAB39 NM 016289 calcium binding protein 39 7.69848 0.427307 1.0981
NAP1L1 NM 004537 nucleosome assembly protein 1-like 7.69746 0.365014 -1.1487
TGFBR3 AW193698 transforming growth factor, beta re 7.69733 0.918318 1.1724
ANP32B AV712577 acidic (leucine-rich) nuclear phosp 7.69711 0.237782 -1.2431
ESD AU145746 esterase D/formylglutathione hydrol 7.6957 0.760036 1.0544
PSMA4 NM 002789 proteasome (prosome, macropain) sub 7.69483 0.020933 1.2925
TXNL4A NM 006701 thioredoxin-like 4A 7.69333 0.01074 -1.3401
SGK1 NM 005627 serum/glucocorticoid regulated kina 7.69052 0.709699 1.1343
TIMM17A AK023063 translocase of inner mitochondrial 7.69006 0.038309 -1.291
REXO2 NM_015523 REX2, RNA exonuclease 2 homolog (S: biliverdin reductase A 7.68937 0.094987 -1.3334
BLVRA BC005902 7.68887 0.042683 1.5364
KBTBD2 AF161402 kelch repeat and BTB (POZ) domain c 7.65478 0.332791 -1.1842
CAPZB U03271 capping protein (actin filament) mu 7.65426 0.063275 1.2362
C8orf59 BF674436 chromosome 8 open reading frame 59 7.65366 0.330133 -1.13
SNRPB J04564 small nuclear ribonucleoprotein pol 7.65286 0.787873 -1.0088
ITGB2 NM 000211 integrin, beta 2 (complement compon 7.6523 0.031817 1.4305
CCT3 NM 005998 chaperonin containing TCP1, subunit 7.65149 0.094926 -1.2758
LITAF AB034747 lipopolysaccharide-induced TNF fact 7.65111 0.892974 -1.0235
LITAF NM 004862 lipopolysaccharide-induced TNF fact 7.65038 0.748136 -1.0584
GRN NM 002087 granulin 7.6487 0.095302 1.6698
CNDP2 NM 018235 CNDP dipeptidase 2 (metallopeptidas 7.64763 0.018839 1.5663
HNRPAB NM 004499 heterogeneous nuclear ribonucleopro 7.6475 0.026283 -1.5461
TCIRG1 NM 006019 T-cell, immune regulator 1, ATPase, 7.64672 0.11177 1.4449
HADHA AI972144 hydroxyacyl-Coenzyme A déydrogenas 7.64496 0.227576 -1.2751
HDLBP AA515560 high density lipoprotein binding pr 7.64419 0.113027 -1.8803
DPM1 NM 003859 dolichyl-phosphate mannosyltransfer 7.64394 0.045461 -1.2781
PDCD10 BC002506 programmed cell death 10 7.64317 0.929259 1.0005
HCST AF285447 hematopoietic cell signal transduce 7.64258 0.066254 1.4105
GBP2 NM 004120 guanylate binding protein 2, interf 7.64193 0.007125 1.8139
KIAA0528 AB011100 KIAA0528 7.64193 0.557386 1.0826
PGK1 NM 000291 phosphoglycerate kinase 1 7.64048 0.824762 -1.0473
S0RL1 AV728268 sortilin-related receptor, L(DLR cl 7.64047 0.699823 -1.0597
EIF4A3 NM 014740 eukaryotic translation initiation f 7.64006 0.077666 -1.3463
ACTB AFFX-HSACO actin, beta 7.63897 0.83752 -1.0353
LYN NM 002350 v-yes-1 Yamaguchi sarcoma viral rei 7.63878 0.148443 1.6308
ITSN2 U61167 intersectin 2 7.63774 0.151286 -1.1829
PSMD2 NM 002808 proteasome (prosome, macropain) 26S 7.63759 0.489536 -1.1115
ARHGAP9 BC006107 Rho GTPase activating protein 9 7.63661 0.142569 1.1795
PRKCH NM 024064 protein kinase C, eta 7.6348 0.950108 1.0768
LOC64244 1 MRPL47 AA532655 hypothetical LOC642441 7.63466 0.526681 1.0626
ΑΙ189156 mitochondrial ribosomal protein L47 7.63417 0.411821 -1.1572
SUBI AV715940 SUBI homolog (S. cerevisiae) 7.63286 0.026136 -1.3039
RBM5 NM 005778 RNA binding motif protein 5 7.63107 0.768865 -1.0712
RORA BC040965 RAR-related orphan receptor A 7.6292 0.837724 -1.1189
CTSH NM 004390 cathepsin H 7.62474 0.484803 1.5466
LOC40115 o AL571684 HCV F-transactivated protein 1 7.6246 0.179093 1.1974
£ LOC44145 Λ NM_016171 hypothetical gene supported by BC01 7.6242 0.280802 1.243
TARP M27331 TCR gamma altemate reading frame p 7.62325 0.206759 1.4124
ARPC5L AU158936 actin related protein 2/3 complex, 7.62292 0.980358 1.0329
EIF3C NM 003752 eukaryotic translation initiation f 7.61952 0.297822 -1.2262
ARHGEF3 NM-019555 Rho guanine nucleotide exchange fac 7.61652 0.016341 1.3373
SUMO2 AK024823 SMT3 suppressor of mif two 3 homolo 7.61631 0.992351 1.0376
CRTAP BQ876971 cartilage associated protein 7.61515 0.303588 1.2446
ECHDC1 AL109939 enoyl Coenzyme A hydratase domain c 7.61129 0.619859 -1.0557
MGEA5 AF307332 meningioma expressed antigen 5 (hya 7.60983 0.765516 1.0303
CDKN1B BC001971 cyclin-dependent kinase inhibitor 1 7.60896 0.781614 -1.0792
CIRBP NM 001280 cold inducible RNA binding protein 7.60839 0.747999 -1.2397
SP110 NM 004509 SP110 nuclear body protein 7.60812 0.00872 1.7371
USP14 NM 005151 ubiquitin specific peptidase 14 (tR 7.60677 0.021071 -1.4681
RBM25 AV757384 RNA binding motif protein 25 7.60566 0.504875 1.1059
IGL@ AJ249377 immunoglobulin lambda locus 7.60489 0.024751 -2.276
OCIAD1 H09533 OCIA domain containing 1 7.60459 0.139441 1.1284
SFRS1 BC006181 splicing factor, arginine/serine-ri 7.60329 0.202276 -1.207
CCND3 NM 001760 cyclin D3 7.60316 0.03019 1.3374
METTL7A NM_014033 methyltransferase like 7 A 7.60293 0.002606 -1.585
RCSD1 AI659418 RCSD domain containing 1 7.60286 0.02614 1.2837
PTBP1 BC002397 polypyrimidine tract binding protei 7.60284 0.566035 -1.1215
RAB8A BC002977 RAB8A, member RAS oncogene family 7.6024 0.232362 1.1982
RBL2 X76061 retinoblastoma-like 2 (pl30) 7.60119 0.63202 1.0944
TOMM7 NM 019059 translocase of outer mitochondrial 7.60107 0.683046 1.0374
UHRF2 BF511410 ubiquitin-like, containing PHD and 7.59971 0.643307 1.0558
LOC64712 1 CDC25B W84421 embigin homolog (mouse) pseudo gene 7.59742 0.801185 -1.0343
NM 021873 cell division cycle 25 homolog B (S 7.59643 0.527043 -1.0346
SP11O AF280095 SP110 nuclear body protein 7.59548 0.0269 1.8226
CHMP5 NM 015961 chromatin modifying protein 5 7.59535 0.190712 1.3799
SEPT6 D50918 septin 6 7.59449 0.642472 -1.0339
UBL5 NM 024292 ubiquitin-like 5 7.59393 0.558221 1.1465
JOSD3 AF275800 Josephin domain containing 3 7.59186 0.19658 1.1678
ETS1 AA702930 v-ets erythroblastosis vírus E26 on 7.59159 0.683206 -1.1849
UQCRQ NM 014402 ubiquinol-cytochrome c reductase, c 7.59127 0.052296 -1.3784
SPCS3 AL136660 signal peptidase complex subunit 3 7.59062 0.020842 -1.6207
GBP1 AWO14593 guanylate binding protein 1, interf 7.58986 0.005006 2.4888
TXNIP AA812232 thioredoxin interacting protein 7.58879 0.139682 1.4068
CREG1 NM 003851 cellular repressor of El A-stimulate 7.58617 0.06744 1.7291
ACTR2 NM 005722 ARP2 actin-related protein 2 homolo 7.58578 0.336164 -1.1813
MNDA NM 002432 myeloid cell nuclear differentiatio 7.58475 0.044113 1.846
C19orfl0 AL524093 chromosome 19 open reading frame 10 7.58374 0.013063 -1.7683
EIF3K AF119846 eukaryotic translation initiation f 7.58167 0.186686 -1.1911
ID2 AI819238 inhibitor of DNA binding 2, dominan 7.58066 0.284787 1.3264
CD47 AL118798 CD47 molecule 7.58055 0.571242 1.1101
ANKRD10 BC001727 ankyrin repeat domain 10 7.58047 0.617954 -1.0351
WTAP AU147416 Wilms tumor 1 associated protein 7.57985 0.125873 -1.2422
APBB1IP AI093231 amyloid beta (A4) precursor protein 7.57972 0.029023 1.3843
FGL2 NM 006682 fibrinogen-like 2 7.57893 0.007811 2.6573
CMPK2 AI742057 cytidine monophosphate (UMP-CMP) ki 7.57862 0.299205 1.3557
AA526907 7.57802 0.255906 1.2036
IFI35 BC001356 interferon-induced protein 35 7.57709 0.063075 1.7289
C14orf2 NM 004894 chromosome 14 open reading frame 2 7.57518 0.627111 -1.0523
PF4 NM 002619 platelet factor 4 (chemokine (C-X-C 7.57337 0.75131 -1.2073
FGL2 AW135176 fibrinogen-like 2 7.57258 0.011735 2.152
PACSIN2 NM 007229 protein kinase C and casein kinase 7.57082 0.199546 1.3663
NM 014761 KIAA0174 7.56978 0.038297 1.4021
KIAA0174
RPL22L1 BE274422 ribosomal protein L22-like 1 7.56951 0.009481 -1.621
ZFAND5 AW471220 zinc finger, ANl-type domain 5 7.56933 0.586264 1.2604
C19orf22 W07773 chromosome 19 open reading frame 22 7.56927 0.931835 -1.0658
PSMD14 NM 005805 proteasome (prosome, macropain) 26S 7.56905 0.123876 -1.3085
GOLPH3 NM 022130 golgi phosphoprotein 3 (coat-protei 7.56816 0.584915 -1.066
EVI2A NM 014210 ecotropic viral integration site 2A 7.5677 0.086504 1.275
NUB1 AF300717 negative regulator of ubiquitin-lik 7.56685 0.015278 1.6007
CTNNB1 AW362945 catenin (cadherin-associated protei 7.56606 0.145529 1.5022
AI708524 OK/SW-cl.16 7.56507 0.426833 -1.1241
LOC44055
CD44 BE903880 CD44 molecule (Indian blood group) 7.56473 0.558221 -1.0431
MARCH6 BF000409 membrane-associated ring finger (C3 7.56463 0.013467 -1.3494
DYNLL1 NM 003746 dynein, light chain, LC8-type 1 7.56367 0.253683 -1.2446
ARRB2 AL832061 arrestin, beta 2 7.56323 0.062545 1.7626
APLP2 NM 001642 amyloid beta (A4) precursor-like pr 7.56241 0.133196 1.4098
MRPL53 AV726817 mitochondrial ribosomal protein L53 7.56013 0.34919 -1.1371
CMBL BE537881 carboxymethylenebutenolidase homolo 7.56006 0.333511 1.0747
XRCC5 AA205834 X-ray repair complementing defectiv 7.56003 0.048827 -1.3751
MRPL9 BC004517 mitochondrial ribosomal protein L9 7.55995 0.094155 -1.2938
CTSC NM 001814 cathepsin C 7.55947 0.096722 1.247
MX2 NM 002463 myxovírus (influenza vírus) resista 7.55943 0.041424 2.1826
FBXO10 BF969806 F-box protein 10 7.55907 0.105034 -1.3277
PIM1 M24779 pim-1 oncogene 7.5587 0.330076 1.1246
NAMPT NM 005746 nicotinamide phosphoribosyltransfer 7.5582 0.401092 1.3771
TSC22D3 AL110191 TSC22 domain family, member 3 7.55805 0.270426 1.239
RNF213 AI523817 ring finger protein 213 7.55698 0.021716 1.7133
LOC91316 AA398569 similar to bK246H3.1 (immunoglobuli 7.55684 0.053479 -1.3375
PDCD4 N92498 programmed cell death 4 (neoplastic 7.55561 0.000465 -1.4445
ASAH1 AI379338 N-acylsphingosine amidohydrolase (a 7.55424 0.251223 1.3524
ERP29 NM 006817 endoplasmic reticulum protein 29 7.5541 0.135128 -1.2378
NHP2L1 AF155235 NHP2 non-histone chromosome protein 7.55201 0.014327 -1.3928
KRAS W80678 v-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral 7.55122 0.401921 -1.1013
PRKACB AA130247 protein kinase, cAMP-dependent, cat 7.55067 0.47977 -1.0582
YTHDF2 BC002559 YTH domain family, member 2 7.5503 0.159619 -1.1997
SCOTIN BC001463 scotin 7.54927 0.008933 1.4562
MT1X NM 005952 metallothionein IX 7.5485 0.001294 2.2122
IL6ST AL049265 interleukin 6 signal transducer (gp 7.54659 0.172712 -1.1861
SP 100 NM 003113 SP 100 nuclear antigen 7.5456 0.76144 1.0909
SORL1 NM 003105 sortilin-related receptor, L(DLR cl 7.54378 0.648127 -1.1037
PTTG1IP NM 004339 pituitary tumor-transforming 1 inte 7.54347 0.022243 1.5717
KLRF1 NM 016523 killer cell lectin-like receptor su 7.54219 0.362944 1.2632
MPEG1 T64884 macrophage expressed gene 1 7.54219 0.109901 1.7748
Λ»
HLA- M60334 major histocompatibility complex, c 7.53958 0.074368 1.7024
DRA
TncRNA AV699657 trophoblast-derived noncoding RNA 7.53898 0.469198 1.1495
... AI355441 ··♦ 7.53775 0.487568 1.5091
ATG3 AF202092 ATG3 autophagy related 3 homolog (S 7.5331 0.104555 1.2959
SCP2 NM 002979 sterol carrier protein 2 7.53261 0.689884 -1.091
0LA1 NM 013341 Obg-like ATPase 1 7.53169 0.098121 -1.3585
TAF10 NM 006284 TAF10 RNA polymerase II, TATA box b 7.53086 0.789107 -1.0356
SNRPD2 NM 004597 small nuclear ribonucleoprotein D2 7.52668 0.284636 -1.246
PTPRJ AI631833 protein tyrosine phosphatase, recep 7.52601 0.167334 1.2153
SMAP2 AL137764 stromal membrane-associated GTPase- 7.5256 0.195852 1.291
LEF1 AF288571 lymphoid enhancer-binding factor 1 7.5253 0.346488 -1.2846
MAGT1 BG292405 magnesium transporter 1 7.52387 0.057105 -1.3367
KLF4 BF514079 Kruppel-like factor 4 (gut) 7.52317 0.028447 2.1705
SAMD9 AA741307 sterile alpha motif domain containi 7.52251 0.045497 2.2987
SMCHD1 AV699744 structural maintenance of chromosom 7.52033 0.506626 -1.0667
ARL4C BG435404 ADP-ribosylation factor-like 4C 7.51949 0.803521 1.0818
IGKV1D- 13 CBX4 AW408194 immunoglobulin kappa variable 1D-13 7.51906 0.011292 -2.3235
AI570531 chromobox homolog 4 (Pc class homol 7.51868 0.1376 -1.2016
PRNP NM 000311 prion protein (p27-30) (Creutzfeldt 7.5181 0.190006 1.1833
PRELID1 AF153607 PRELI domain containing 1 7.51744 0.755179 1.0634
MAN1A1 BG287153 mannosidase, alpha, class 1 A, membe 7.51738 0.016691 -1.7464
TUBB BC001002 tubulin, beta 7.51425 0.164881 -1.2605
NUP153 NM 005124 nucleoporin 153kDa 7.51356 0.290198 -1.1644
MTDH AI886796 metadherin 7.51177 0.034911 -1.4497
EIF2S1 NM 004094 eukaryotic translation initiation f 7.50966 0.063345 -1.3382
CTBP1 BF337195 C-terminal binding protein 1 7.50955 0.206279 1.1575
TLOC1 BE866511 translocation protein 1 7.50919 0.364502 -1.3357
GOLGA8 G TUFM AI620911 golgi autoantigen, golgin subfamily 7.50826 0.036389 1.2952
NM 003321 Tu translation elongation factor, m 7.50771 0.089252 -1.3499
TAGLN2 NM 003564 transgelin 2 7.50657 0.801935 -1.0711
NME2 NM 002512 non-metastatic cells 2, protein (NM 7.50512 0.079858 -1.3013
DNAJA1 AL534104 DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, 7.50394 0.093258 1.254
CSGALN ACT NM_018590 chondroitin sulfate N-acetylgalacto 7.50278 0.032418 1.4213
PLCG2 NM 002661 phospholipase C, gamma 2 (phosphati 7.50223 0.259505 -1.3438
ICAM2 AA126728 intercellular adhesion molecule 2 7.49956 0.108815 1.3548
HINT1 NM 005340 histidine triad nucleotide binding 7.49859 0.236295 -1.172
SLC7A7 NM 003982 solute carrier family 7 (cationic a 7.49659 0.024929 1.9475
LOC20205 1 CNOT2 AK098740 hypothetical protein LOC202051 7.49571 0.824139 -1.0248
BG105204 CCR4-NOT transcription complex, cnh 7.49562 0.911068 -1.0029
DBT NM 001918 dihydrolipoamide branched chain tra 7.49442 0.012876 1.3057
C5orf26 BF314746 chromosome 5 open reading frame 26 7.494 0.267609 -1.1904
ZMIZ2 AA868332 zinc finger, ΜΙΖ-type containing 2 7.49286 0.413808 1.0621
IL18RAP NM 003853 interleukin 18 receptor accessory p 7.49267 0.799441 -1.0059
RAB27A AF125393 RAB27A, member RAS oncogene family 7.49264 0.152316 -1.2575
... H15073 ... 7.4892 0.561536 -1.0862
RBMX AI452524 RNA binding motif protein, X-linked 7.48838 0.11949 -1.2771
PDLA6 NM 005742 protein disulfíde isomerase family 7.48819 0.020639 -1.6636
AB046820 KIAA1600 7.48724 0.918689 -1.0282
KIAA1600 MTDH AI972475 metadherin 7.48459 0.087143 -1.483
P2RY8 AI436587 purinergic receptor P2Y, G-protein 7.48332 0.781117 1.0328
NOL7 AF130102 nucleolar protein 7, 27kDa 7.48322 0.003969 -1.4731
ITGAM NM 000632 integrin, alpha M (complement compo 7.48256 0.220182 1.2548
CNOT6L AW514857 CCR4-NOT transcription complex, sub dolichyl-diphosphooligosaccharide-p 7.48203 0.206903 -1.2963
DDOST BC002594 7.48163 0.006695 -1.6168
PTTG1 NM 004219 pituitary tumor-transforming 1 7.48147 0.061812 -1.6711
C6orf62 AL136632 chromosome 6 open reading frame 62 7.47929 0.221789 1.1691
SLAMF7 AL121985 SLAM family member 7 7.47911 0.617842 1.0548
RPS21 AW024383 ribosomal protein S21 7.47875 0.701514 1.0728
USP4 NM 003363 ubiquitin specific peptidase 4 (pro 7.47733 0.231369 1.2597
MAP3K2 AI125541 mitogen-activated protein kinase ki 7.47715 0.786999 -1.0287
MPEG1 BF590697 macrophage expressed gene 1 7.47382 0.039243 2.0856
AKAP2 BG540494 A kinase (PRKA) anchor protein 2 7.47092 0.175072 -1.2104
MDM4 AA961420 Mdm4, transformed 3T3 cell double m 7.47089 0.732265 -1.0289
CENTD1 AB011152 centaurin, delta 1 7.47025 0.108507 1.3393
WIPF1 BF446719 WAS/WASL interacting protein family 7.4694 0.655506 -1.0311
KPNB1 AA861608 karyopherin (importin) beta 1 7.46879 0.105199 1.1363
YME1L1 AF070656 YMEl-like 1 (S. cerevisiae) 7.46872 0.014474 -1.4003
SELPLG AI741056 selectin P ligand 7.46846 0.002757 1.5125
RHOG NM 001665 ras homolog gene family, member G ( 7.46808 0.032551 1.4664
PRR11 NM 018304 proline rich 11 7.46652 0.863727 -1.0063
MCM5 AA807529 minichromosome maintenance complex 7.46633 0.084716 -1.4164
TXNIP AI439556 thioredoxin interacting protein 7.46546 0.206057 1.3365
C20orfll8 AV715309 chromosome 20 open reading frame 11 7.46429 0.005605 1.7538
YME1L1 AJ295618 YMEl-like 1 (S. cerevisiae) 7.46389 0.16034 -1.245
IARS NM 013417 isoleucyl-tRNA synthetase 7.46337 0.016927 -1.7784
IMPDH2 NM 000884 IMP (inosine monophosphate) déydro 7.46123 0.049026 -1.5509
CSK NM 004383 c-src tyrosine kinase 7.46116 0.029042 1.3099
C6orf48 NM_016947 chromosome 6 open reading frame 48 7.46101 0.913713 -1.0409
SMC1A D80000 structural maintenance of chromosom 7.46013 0.220713 -1.1873
EDF1 AB002282 endothelial differentiation-related 7.45753 0.28854 -1.1791
GRN AK023348 granulin 7.45646 0.105118 1.6091
AW516297 Notch homolog 2 (Drosophila) N-term 7.45595 0.300512 1.3554
NOTCH2 NL MDH1 NM 005917 malate déydrogenase 1, NAD (solubl 7.45588 0.077683 -1.2739
AF119873 serpin peptidase inhibitor, clade A 7.455 0.00763 2.463
SERPINA
TIFA AA195074 TRAF-interacting protein with forkh 7.45438 0.025884 -1.5536
MRCL3 NM 006471 myosin regulatory light chain MRCL3 7.45291 0.346892 1.1996
TXNDC15 NM_024715 thioredoxin domain containing 15 7.4518 0.021086 -1.6983
MBNL1 AI697540 muscleblind-like (Drosophila) 7.45172 0.796887 -1.0028
CXXC5 AK001782 CXXC fmger 5 7.44996 0.005124 -1.4299
IRF8 AI073984 interferon regulatory factor 8 7.44988 0.17711 1.4919
SERPINB9 BC002538 serpin peptidase inhibitor, clade B 7.44743 0.747091 1.1748
GARS D30658 glycyl-tRNA synthetase 7.4472 0.014336 -1.4931
ANXA5 NM 001154 annexin A5 7.44647 0.992456 -1.0378
ILF3 AF141870 interleukin enhancer binding factor 7.44341 0.033018 -1.3358
EFHD2 NM 024329 EF-hand domain family, member D2 7.44186 0.160768 1.3945
RPL18A NM 000980 ribosomal protein LI 8a 7.43716 0.723726 -1.1276
TES NM 015641 testis derived transcript (3 LIM do 7.43591 0.015809 1.3989
MTDH AV700332 metadherin 7.43543 0.00632 -1.619
... AW392551 ... 7.43535 0.086173 1.7432
ZEB2 AF086037 zinc finger E-box binding homeobox 7.43467 0.611448 1.2008
RSAD2 AW189843 radical S-adenosyl methionine domai 7.43424 0.112533 3.1446
FAM45A BE565675 family with sequence similarity 45, 7.43319 0.25883 1.3032
C22orf9 AK025608 chromosome 22 open reading frame 9 7.43169 0.029455 1.5386
SEC13 NM 030673 SEC13 homolog (S. cerevisiae) 7.43053 0.044417 -1.517
TAP2 AA573502 transporter 2, ATP-binding cassette 7.42979 0.282417 1.4458
KRAS BF673699 v-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral 7.42914 0.420004 1.1519
LTB NM 002341 lymphotoxin beta (TNF superfamily, 7.4288 0.692661 1.099
NPM1 AB042278 nucleophosmin (nucleolar phosphopro 7.42798 0.012864 -1.5668
EPSTI1 AA633203 epithelial stromal interaction 1 (b 7.42772 0.024256 1.8602
ZRANB2 AF065391 zinc finger, RAN-binding domain con 7.42648 0.263617 -1.159
MAFB NM 005461 v-maf musculoaponeurotic fibrosarco 7.42634 0.270495 1.846
CENPL BF316352 centromere protein L 7.4262 0.244093 -1.2485
SHMT2 AW190316 serine hydroxymethyltransferase 2 ( 7.42611 0.086216 -1.4549
ARMET NM 006010 arginine-rich, mutated in early sta 7.42537 0.011018 -1.8831
SRPR NM 003139 signal recognition particle recepto 7.42306 0.022959 -1.4447
ID2 NM 002166 inhibitor of DNA binding 2, dominan 7.42165 0.088197 1.4365
CDC16 AF164598 cell division cycle 16 homolog (S. 7.41847 0.396208 1.0932
METTL9 NM 016025 methyltransferase like 9 7.4176 0.801467 -1.0204
LRRFIP1 BE674143 leucine rich repeat (in FLII) inter 7.4172 0.511552 1.1306
RUNX3 AA541630 runt-related transcription factor 3 7.41682 0.555748 1.2072
CDC2L2 AI767436 cell division cycle 2-like 2 (PITSL 7.41653 0.824159 -1.0472
CACYBP AF057356 calcyclin binding protein 7.4165 0.122575 -1.3223
UTRN N66570 utrophin 7.41403 0.047842 1.4964
BTBD1 NM 025238 BTB (POZ) dòmain containing 1 7.41175 0.792259 1.127
ACSL1 NM 021122 acyl-CoA synthetase long-chain fami 7.41119 0.350623 1.6535
TUBB BC005838 tubulin, beta 7.41074 0.066409 -1.4973
PDLA6 BC001312 protein disulfide isomerase family 7.40816 0.035045 -1.5616
... M85256 ... 7.40797 0.011066 -2.6563
Cllorf2 NM 013265 chromosome 11 open reading frame2 7.40774 0.53236 -1.0565
EIF3CL AA679705 eukaryotic translation initiation f 7.40692 0.470087 -1.1872
PALM2- AKA NM 007203 PALM2-AKAP2 7.40378 0.177918 -1.3389
UFM1 NM 016617 ubiquitin-fold modifier 1 7.40251 0.398044 -1.16
VCL NM 014000 vinculin 7.40223 0.082591 1.4216
PAM NM 000919 peptidylglycine alpha-amidating mon 7.40209 0.135836 1.3469
SAMM50 NM 015380 sorting and assembly machinery comp 7.40034 0.243735 -1.2337
SMC4 AL136877 structural maintenance of chromosom 7.39896 0.094838 -1.4237
PYCARD BC004470 PYD and CARD domain containing 7.39683 0.011531 1.904
BE616972 DKFZP434B0335 protein 7.39624 0.757367 -1.0095
DKFZP43 4B RNF19A AB029316 ring finger protein 19A 7.39262 0.522571 -1.0718
PTPRC AI809341 protein tyrosine phosphatase, recep 7.39148 0.052605 1.3771
ARHGEF1 8 C1QBP AB011093 rho/rac guanine nucleotide exchange 7.39039 0.291828 1.1023
AU151801 complement component 1, q 7.38926 0.01763 -1.5754
subcompon
UBE2G1 AW299555 ubiquitin-conjugating enzyme E2G 1 7.38718 0.007798 -1.6871
SFPQ NM 005066 splicing factor proline/glutamine-r 7.38689 0.195069 -1.4149
TFRC NM 003234 transferrin receptor (p90, CD71) 7.38343 0.806645 -1.0436
GIMAP2 AI431931 GTPase, IMAP family member 2 7.38245 0.014479 1.4662
TCEB2 NM 007108 transcription elongation factor B ( 7.38243 0.814389 -1.0055
TRIP12 AI149880 thyroid hormone receptor interactor 7.38147 0.535201 1.1087
AL121871 similar to rCG57659 7.38132 0.311524 -1.1384
LOC39250
EIF5 AL080102 eukaryotic translation initiation f 7.38014 0.036975 -1.4581
EPRS NM 004446 glutamyl-prolyl-tRNA synthetase 7.37844 0.22597 -1.241
CCNI AF135162 cyclin I 7.37819 0.514545 -1.1161
SLC35E1 NM 024881 solute carrier family 35, member El 7.37691 0.105694 1.3175
UBE2J1 AF161502 ubiquitin-conjugating enzyme E2, J1 7.37628 0.000419 -2.3147
GZMK NM_002104 granzyme K (granzyme 3 tryptase II 7.37496 1402 1402
MFSD1 NM 022736 major facilitator superfamily domai 0.092063 1.4239
STAT6 BC004973 signal transducer and activator of 7.37457 0.014624 1.583
TSPAN13 NM 014399 tetraspanin 13 7.37428 0.280816 -1.2046
NOTCH2 AA291203 Notch homolog 2 (Drosophila) 7.37239 0.048744 1.3852
LOC33875 8 DSTN AI377324 hypothetical protein LOC338758 7.37209 0.140501 1.886
NM 006870 destrin (actin depolymerizing facto 7.37099 0.80006 -1.0207
PRDX4 NM 006406 peroxiredoxin 4 7.3706 0.01571 -1.8982
SP3 AU144413 Sp3 transcription factor 7.36925 0.590485 -1.0834
ALG5 NM 013338 asparagine-linked glycosylation 5 h 7.36738 0.004891 -1.6276
CUL1 AA682674 cullin 1 7.36732 0.255345 1.3226
CLPTM1L AB045223 CLPTMl-like 7.36728 0.006054 -1.8843
PPP2R5C AL834350 protein phosphatase 2, regulatory s 7.36255 0.864325 1.0222
TRAPPC4 NM 016146 trafficking protein particle comple 7.3612 0.315876 -1.1929
EIF5B BG261322 eukaryotic translation initiation f 7.36103 0.046033 -1.6475
SF3B5 NM 031287 splicing factor 3b, subunit 5, lOkD 7.36094 0.126615 -1.2765
IER5 NM 016545 immediate early response 5 7.35968 0.147159 1.3095
TMPO AL566034 thymopoietin 7.35949 0.274761 -1.1248
GNG2 AU146329 guanine nucleotide binding protein 7.35845 0.789904 1.0497
FAM101B BG036514 family with sequence similarity 101 7.35813 0.322931 -1.1424
ARPC5L NM 030978 actin related protein 2/3 complex, 7.35652 0.143945 -1.2524
ZWINT NM 007057 ZW10 interactor 7.35345 0.059843 -1.5759
... AI678013 ... 7.35134 0.388349 1.7867
RUNX3 NM 004350 runt-related transcription factor 3 7.34961 0.527132 1.1439
ADA NM 000022 adenosine deaminase 7.3489 0.276034 -1.2502
ITGAE NM 002208 integrin, alpha E (antigen CD 103, h 7.34825 0.028698 -1.437
FAM35A NM 019054 family with sequence similarity 35, 7.34824 0.313082 -1.2523
KIAA0999 AW590838 KIAA0999 protein 7.3457 0.695174 1.0339
GOLGA8 A AF204231 golgi autoantigen, golgin subfamily 7.34547 0.710158 -1.0178
FNDC3B NM 022763 fibronectin type III domam contain 7.34525 0.108133 -1.3457
CTBP1 NM 001328 C-terminal binding protein 1 7.34475 0.237025 1.1919
KCTD12 AI718937 potassium channel tetramerisation d 7.33935 0.067832 1.6798
BCL6 NM 001706 B-cell CLL/lymphoma 6 (zinc finger 7.33849 0.384674 1.2629
CCDC84 BF446390 coiled-coil domain containing 84 7.33821 0.8569 -1.0274
CFLAR U97075 CASP8 and FADD-like apoptosis regul 7.33561 0.205271 -1.2368
DDIT4 NM 019058 DNA-damage-inducible transcript 4 7.33493 0.460119 1.3483
TNFSF1O AW474434 tumor necrosis factor (ligand) supe 7.33489 0.034056 2.1349
DNAJB9 AL080081 DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, 7.33431 0.121042 -1.3201
CSDA AL556190 cold shock domain protein A 7.33318 0.868653 1.0345
C17orf91 AF070569 chromosome 17 open reading frame 91 7.33291 0.649458 1.1213
DUSP2 NM 004418 dual specificity phosphatase 2 7.3312 0.837541 1.1135
SURF4 AK026646 surfeit 4 7.33035 0.478109 -1.0955
LAT AF036906 linker for activation of T cells 7.33018 0.541589 1.2306
HNRPD W74620 heterogeneous nuclear ribonucleopro 7.32906 0.046949 -1.4034
DDX6 BF129093 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypept 7.32766 0.204121 -1.2211
CENPL BG329175 centromere protein L 7.3258 0.684594 -1.1379
MYLIP AF212221 myosin regulatory light chain inter 7.32522 0.384416 1.1556
RNASE2 NM 002934 ribonuclease, RNase A family, 2 (li 7.32392 0.159557 1.886
SF3A1 BF129339 splicing factor 3 a, subunit 1, 120k 7.32298 0.139399 -1.3486
NFKBIZ BE646573 nuclear factor of kappa light polyp 7.3168 0.062552 1.5799
PPBP R64130 pro-platelet basic protein (chemoki 7.31478 0.884264 1.0208
P2RX5 U49396 purinergic receptor P2X, ligand-gat 7.31217 0.185142 -1.2985
ATP6V0D 1 SP11O AL566172 ATPase, H+ transporting, lysosomal 7.31157 0.307694 1.0931
AF280094 SP110 nuclear body protein 7.31119 0.011853 1.7032
SNRPA1 AA872471 small nuclear ribonucleoprotein pol 7.31014 0.517405 1.0701
HSPA5 AF216292 heat shock 70kDa protein 5 (glucose 7.3077 0.012754 -1.7213
ASH1L AI806500 ashl (absent, small, or homeotic)-l 7.30676 0.548217 1.0246
... AV687517 ... 7.3061 0.575499 -1.2606
FAM133B AK000119 family with sequence similarity 133 7.30573 0.248908 1.5029
COPS8 BC003090 COP9 constitutive photomorphogenic 7.30543 0.893859 -1.0822
RHOH BE676335 ras homolog gene family, member H 7.3021 0.023192 -1.3712
CAPZA2 AV685920 capping protein (actin filament) mu 7.30208 0.200162 1.22
APLP2 BC000373 amyloid beta (A4) precursor-like pr 7.30058 0.11537 1.4335
RAB11FIP 1 CKS2 NM 025151 RAB11 family interacting protein 1 7.29837 0.137782 1.4148
NM 001827 CDC28 protein kinase regulatory sub 7.29782 0.05086 -1.6631
KPNA2 BC005978 karyopherin alpha 2 (RAG cohort 1, 7.29757 0.020279 -1.714
NDUFA13 NM 015965 NADH déydrogenase (ubiquinone) 1 a 7.29716 0.849285 1.0985
SEC23B BC005032 Sec23 homolog B (S. cerevisiae) 7.29611 0.55733 -1.0956
ANP32E NM 030920 acidic (leucine-rich) nuclear phosp 7.29143 0.028548 -1.5776
LARS D84223 leucyl-tRNA synthetase 7.28708 0.547248 -1.2256
CD83 NM 004233 CD83 molecule 7.28581 0.758757 -1.1233
NLN AK026655 neurolysin (metallopeptidase M3 fam 7.28481 0.045965 1.2729
NCF1 AW072388 neutrophil cytosolic factor 1, (chr 7.28401 0.135512 2.0212
S100A6 NM 014624 SI 00 calcium binding protein A6 7.28308 0.019028 2.0002
LYN AI356412 v-yes-1 Yamaguchi sarcoma viral rei 7.28236 0.135674 1.6915
PLSCR1 AI825926 phospholipid scramblase 1 7.28196 0.069662 1.5452
NEK9 AL117502 NIMA (never in mitosis gene a)- rei 7.28137 0.524007 1.077
US01 NM 003715 USO1 homolog, vesicle docking prote 7.27916 0.264755 -1.182
... N25986 ... 7.27813 0.262853 -1.3216
RAP1A AW793677 RAP1A, member of RAS oncogene famil 7.27715 0.716187 -1.1077
C1QBP L04636 complement component 1, q subcompon 7.27666 0.014995 -1.7889
NDUFB6 NM 002493 NADH déydrogenase (ubiquinone) 1 b 7.27376 0.006174 -1.828
FOXP1 AF146696 forkhead box PI 7.27194 0.552374 -1.18
HSBP1 AK026575 heat shock factor binding protein 1 7.27088 0.160599 1.4323
TNFRSF1 7 NM001192 tumor necrosis factor receptor supe 7.26921 0.009406 -2.7543
/ HERC5 NM 016323 hect domain and RLD 5 7.26865 0.122196 1.985
RP11- 345P AL031282 similar to solute carrier family 35 7.26626 0.691802 -1.0472
HLADMA X76775 major histocompatibility complex, c 7.2657 0.057443 1.605
AIM1 U83115 absent in melanoma 1 7.26495 0.400738 1.1912
CTSS NM 004079 cathepsin S 7.2641 0.163119 1.3006
DC2 AF201937 DC2 protein 7.26335 0.031519 -1.7041
KIAA1267 AL137317 KIAA1267 7.26008 0.660292 1.0498
AHNAK BG287862 AHNAK nucleoprotein 7.25701 0.5372 1.0405
S100A12 NM 005621 S100 calcium binding protein A12 7.25689 0.283587 1.5395
CD8A AW006735 CD8a molecule 7.25626 0.912661 1.459
BE675995 CDC42 small effector 2 7.25621 0.517273 -1.1396
CDC42SE
FGR NM 005248 Gardner-Rasheed feline sarcoma vira 7.25545 0.009879 2.1941
HLA- NM 002118 major histocompatibility complex, c 7.25493 0.039745 1.6869
DMB PDIA4 BC006344 protein disulfide isomerase family 7.25466 0.088648 -1.4799
ΟΡΤΝ NM 021980 optineurin 7.25407 0.750935 1.0696
JARID2 BG029530 jumonji, AT rich interactive domain 7.25247 0.255552 1.1914
RICTOR W49629 rapamycin-insensitive companion of 7.25181 0.784326 1.0186
PFKFB3 NM 004566 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2 7.24874 0.703927 1.2746
• . * AW151360 ... 7.24431 0.046937 1.7632
NOL5A NM 006392 nucleolar protein 5A (56kDa with KK 7.24373 0.144876 -1.2938
PCBP2 NM 005016 poly(rC) binding protein 2 7.2433 0.320261 -1.1694
RGS2 NM 002923 regulator of G-protein signaling 2, 7.24252 0.151817 1.6989
TNFSF10 NM 003810 tumor necrosis factor (ligand) supe 7.24195 0.044441 2.3425
LOC40150 Λ BG170478 hypothetical gene supported by AK09 7.24133 0.83899 -1.078
4 MCM7 D55716 minichromosome maintenance complex 7.23949 0.112466 -1.3777
DTX3L AA577672 deltex 3-like (Drosophila) 7.23914 0.004459 1.734
TGFBR2 D50683 transforming growth factor, beta re 7.23882 0.930821 -1.1678
HRB AI989512 HIV-1 Rev binding protein 7.23788 0.658439 1.2047
TAGAP BF591040 T-cell activation RhoGTPase activat 7.23547 0.146357 1.279
PGF AK023843 placental growth factor 7.23391 0.413203 1.0952
... AFFX-R2-BS ... 7.23137 0.611685 -1.7638
FCER1G NM 004106 Fe fragment of IgE, high affinity I 7.2292 0.020635 2.5666
RASA2 AI888503 RAS p21 protein activator 2 7.22599 0.868336 -1.0089
NUCKS1 NM 022731 nuclear casein kinase and cyclin-de 7.22519 0.55243 -1.0862
FEN1 BC000323 flap structure-specific endonucleas 7.22509 0.092411 -1.4038
... AC004544 ... 7.22353 0.609314 -1.0597
LOC72885 c AA863228 hypothetical protein LOC728855 7.22337 0.066898 1.2586
0 GIMAPl NM 130759 GTPase, IMAP family member 1 7.22249 0.006328 1.7139
AIF1 BF213829 allograft inflammatory factor 1 7.22048 0.041111 2.4635
RAB24 AK021761 RAB24, member RAS oncogene family 7.21845 0.043692 1.5203
HLA- DPA1 M27487 major histocompatibility complex, c 7.21841 0.011235 1.9378
UBE2L3 BG531983 ubiquitin-conjugating enzyme E2L 3 7.21706 0.13575 -1.2806
IL7R NM 002185 interleukin 7 receptor 7.2168 0.624437 1.1379
CXXC5 BC006428 CXXC finger 5 7.21492 0.003382 -1.6791
MAP3K1 AA211369 mitogen-activated protein kinase ki 7.21372 0.356893 1.148
GLTP AI052020 glycolipid transfer protein 7.20911 0.601343 1.0788
ADFP BC005127 adipose differentiation-related pro 7.2073 0.153079 1.3121
CCND2 NM 001759 cyclin D2 7.20479 0.174284 -1.3075
SRPRB NM 021203 signal recognition particle recepto 7.20248 0.01398 -1.8251
HIST1H2B K KIAA1702 BC000893 histone cluster 1, H2bk 7.2021 0.928604 -1.0368
AK027074 KIAA1702 protein 7.20059 0.453221 -1.1038
CAMK2G NM 001222 calcium/calmodulin-dependent protei 7.19942 0.357869 -1.2771
CD36 M98399 CD36 molecule (thrombospondin recep 7.19905 0.24264 1.4246
PRDX3 NM_006793 peroxiredoxin 3 7.19854 0.204156 -1.2433
NM_005739 RAS guanyl releasing protein 1 (cal 7.19784 0.624123 1.0989
RASGRP1
GMNN NM 015895 geminin, DNA replication inhibitor 7.19724 0.009426 -2.2142
ZBTB20 NM 015642 zinc finger and BTB domain containi 7.19694 0.69319 -1.0781
PLXNC1 AF035307 plexin Cl 7.19673 0.015321 1.5884
SLC38A2 NM 018573 solute carrier family 38, member 2 7.19504 0.07105 -1.2892
PRKCH AL512701 protein kinase C, eta 7.1924 0.98413 -1.0181
HLADRA M60333 major histocompatibility complex, c 7.18903 0.076158 1.9596
ITGB2 AW303397 integrin, beta 2 (complement compon 7.18675 0.017817 1.658
CLEC7A AF313468 C-type lectin domain family 7, memb 7.18478 0.220047 1.4178
LAMP1 NM 005561 lysosomal-associated membrane prote 7.18225 0.371746 1.1169
APLP2 BC004371 amyloid beta (A4) precursor-like pr 7.18219 0.082365 1.5294
TRIM14 NM 014788 tripartite motif-containing 14 7.18179 0.007725 1.5941
SFRS11 AW241752 splicing factor, arginine/serine-ri 7.18168 0.194301 -1.3656
GBP5 BG545653 guanylate binding protein 5 7.17838 0.022718 2.7614
DR1 AW516932 down-regulator of transcription 1, 7.17832 0.855321 1.0704
NOLA3 NM 018648 nucleolar protein family A, member 7.17454 0.742457 -1.0845
NCF2 BC001606 neutrophil cytosolic factor 2 (65kD 7.17178 0.093362 2.0307
LOC15116 o AL134724 hypothetical LOC151162 7.17144 0.924836 -1.0157
TNFAIP3 AI738896 tumor necrosis factor, alpha-induce 7.17131 0.594602 1.1375
ANKRD44 AA744636 ankyrin repeat domain 44 7.17126 0.597802 1.0351
LIPA NM 000235 lipase A, lysosomal acid, cholester 7.17109 0.153066 1.315
SOCS3 AI244908 suppressor of cytokine signaling 3 7.17045 0.283484 1.3454
LRRC59 AK025328 leucine rich repeat containing 59 7.17028 0.017101 -1.8304
GLCCI1 AI761989 glucocorticoid induced transcript 1 7.16872 0.063945 -1.4757
C6orf62 BE465032 chromosome 6 open reading frame 62 7.16704 0.886 1.0798
MAFB AW135013 v-maf musculoaponeurotic fibrosarco 7.16636 0.175796 2.1682
CSE1L AF053640 CSE1 chromosome segregation 1-like 7.16629 0.085477 -1.4435
CCR2 NM 000647 chemokine (C-C motif) receptor 2 7.16298 0.855911 1.0397
TRD© X06557 T cell receptor delta locus 7.16241 0.252075 1.2233
SAT1 BE971383 spermidine/spermine Nl-acetyltransf 7.16209 0.11076 2.2781
RANBP9 BE674964 RAN binding protein 9 7.16204 0.46828 -1.3041
RUFY1 NM 025158 RUN and FYVE domain containing 1 7.16193 0.986618 1.0282
TIPARP AL556438 TCDD-inducible poly(ADP-ribose) pol limb bud and heart development homo 7.1581 0.156938 1.1786
LBH NM 030915 7.15752 0.80578 1.1163
BST2 NM 004335 bone marrow stromal cell antigen 2 7.15713 0.102735 1.5857
IL8 NM 000584 interleukin 8 7.15616 0.3474 1.0429
PRO 1073 NM 014086 PRO1073 protein 7.1561 0.595472 -1.0439
TSPO NM 000714 translocator protein (18kDa) 7.15465 0.046167 1.7312
GADD45B NM_015675 growth arrest and DNA-damage-induci 7.15422 0.379925 1.4345
STMN1 NM 005563 stathmin 1/oncoprotein 18 7.15282 0.050935 -1.5726
GRN BC000324 granulin 7.14984 0.071057 1.7539
MAL NM 002371 mal, T-cell differentiation protein 7.14856 0.359485 -1.2609
NM 004125 hypothetical protein LOC552891 7.14835 0.356859 1.2888
LOC55289
ICOS AB023135 inducible T-cell co-stimulator 7.14686 0.557642 -1.0967
CDV3 AV646549 CDV3 homolog (mouse) 7.14654 0.127723 -1.4526
PFN1 NM 005022 profilin 1 7.14346 0.946311 -1.0757
CST7 AF031824 cystatin F (leukocystatin) 7.14178 0.192562 1.6091
SLC7A1 AA148507 solute carrier family 7 (cationic a 7.14149 0.014555 -1.6575
RRM1 NM 001033 ribonucleotide reductase Ml 7.14092 0.084178 -1.4211
JMJD6 AK021780 jumonji domain containing 6 7.14044 0.897614 1.0674
NM 003516 histone cluster 2, H2aa3 7.13839 0.164608 1.5113
HIST2H2 AA TCF4 BF592782 transcription factor 4 7.13586 0.381035 -1.1181
GSPT1 AA580082 G1 to S phase transition 1 7.13564 0.568937 -1.0317
CDCA7L AK022955 cell division cycle associated 7-li 7.1356 0.143749 -1.348
BHLHB2 NM 003670 basic helix-loop-helix domain conta 7.13462 0.604043 1.0804
YAF2 AA651631 YY1 associated factor 2 7.13239 0.555127 1.1112
CYFIP1 BC005097 cytoplasmic FMR1 interacting protei 7.13211 0.172208 1.542
RPN1 NM 002950 ribophorin I 7.1321 0.023576 -1.5921
DKFZp586 I RB1CC1 AL050378 hypothetical protein DKFZp58611420 7.13198 0.579265 1.1509
AI801666 RB1-inducible coiled-coil 1 7.1292 0.467613 -1.1598
CDC42 BC002711 cell division cycle 42 (GTP binding 7.12828 0.590256 -1.1013
GIMAP5 NM 018384 GTPase, IMAP family member 5 7.12764 0.639744 1.2795
DCN NM 001920 decorin 7.12744 0.034471 -1.5559
EIF4A1 U79273 eukaryotic translation initiation f 7.12535 0.156318 1.2588
TKT L12711 transketolase (Wemicke-Korsakoff s 7.12473 0.222755 1.2949
MS4A6A AF253977 membrane-spanning 4-domains, subfam 7.12424 0.073503 1.8167
LCP2 AI123251 lymphocyte cytosolic protein 2 (SH2 7.12395 0.025919 1.6107
TRGC2 M13231 T cell receptor gamma constant 2 7.12357 0.372068 1.3134
SAMD9L BE669858 sterile alpha motif domain containi 7.12239 0.01406 2.3893
UBE2J1 AF151039 ubiquitin-conjugating enzyme E2, J1 7.12047 0.016637 -1.7689
TUBB AF141349 tubulin, beta 7.11976 0.064298 -1.5503
VAMP3 BC003570 vesicle-associated membrane protein 7.11909 0.002351 1.8814
MALAT1 AI446756 metastasis associated lung adenocar 7.11904 0.23813 1.4949
APLP2 AI525212 amyloid beta (A4) precursor-like pr 7.11836 0.073467 1.6494
JUN BG491844 jun oncogene 7.11786 0.995998 -1.0078
IDH2 U52144 isocitrate déydrogenase 2 (NADP+), 7.11618 0.163975 -1.2185
PTPLAD1 AL573951 protein tyrosine phosphatase-like A 7.11593 0.083071 -1.369
FGFBP2 AB021123 fibroblast growth factor binding pr 7.11442 0.580816 1.8223
CCL5 AF043341 chemokine (C-C motif) ligand 5 7.11339 0.671914 1.2602
... AI092770 ... 7.10964 0.390894 1.2454
ACTR2 BE566290 ARP2 actin-related protein 2 homolo 7.10953 0.759885 -1.0509
CNIH4 AL136930 comichon homolog 4 (Drosophila) 7.10846 0.032449 1.5332
PDIA6 AK026926 protein disulfide isomerase family 7.10777 0.046214 -1.6005
NT5C3 AF312735 5'-nucleotidase, cytosolic III 7.10744 0.42022 1.3836
SEC22B AA890010 SEC22 vesicle trafficking protein h 7.10737 0.217271 -1.2908
GIMAP5 AI435089 GTPase, IMAP family member 5 7.10544 0.574153 1.1821
DEGS1 BC000961 degenerative spermatocyte homolog 1 7.10495 0.104756 1.4108
C9orf72 BC020851 chromosome 9 open reading frame 72 7.10325 0.148838 1.8555
ΖΕΒ2 AI623184 zinc finger E-box binding homeobox 7.10254 0.492952 1.5442
MGAT4A AW006441 mannosyl (alpha-l,3-)-glycoprotein 7.0993 0.625945 -1.1936
PRDX2 L19185 peroxiredoxin 2 7.09884 0.11358 -1.4173
NM 024901 DENN/MADD domain containing 2D 7.09818 0.329203 1.3884
DENND2 D VAMP1
AU150319 vesicle-associated membrane protein 7.09782 0.294172 -1.3303
WDR42A AI208342 WD repeat domain 42A 7.09521 0.946306 1.0427
AI554300 serpin peptidase inhibitor, clade B 7.09301 0.015523 1.4988
SERPINB1
AA502643 platelet-activating factor acetylhy 7.09227 0.110366 -1.5971
PAFAH1B 1
NM_012197 RAB GTPase activating protein 1 7.09226 0.089805 1.4141
RABGAP1
DPYSL2 NM 001386 dihydropyrimidinase-like 2 7.09196 0.046244 1.6057
IFIT2 AA131041 interferon-induced protein with tet 7.09145 0.079307 2.3699
OCC-1 BF969397 overexpressed in colon carcinoma-1 7.09021 0.074651 -1.4051
TCF4 AI927067 transcription factor 4 7.08771 0.131507 -1.4672
KLRB1 NM 002258 killer cell lectin-like receptor su 7.08637 0.522235 1.0554
GMPPB NM 021971 GDP-mannose pyrophosphorylase B 7.08461 0.02346 -1.8817
ATP5G1 AL080089 ATP synthase, H+ transporting, mito 7.08317 0.035607 -1.5588
SET W26593 SET translocation (myeloid leukemia 7.08154 0.512452 -1.2066
AP0BEC3 B CHD1 NM 004900 apolipoprotein B mRNA editing enzym 7.08014 0.150737 -1.4155
NM_001270 chromodomain helicase DNA binding 7.07912 0.834607 1.0789
CD300A AF020314 P CD300a molecule 7.07896 0.000864 2.1544
0AS1 NM 016816 2',5'-oligoadenylate synthetase 1, 7.07526 0.227757 1.6868
BF111651 phosphatidic acid phosphatase type 7.07497 0.004347 -2.3491
PPAPDC1 B NTN2L
AF103529 netrin 2-like (chicken) 7.07069 0.027016 -2.0572
CD27 NM 001242 CD27 molecule 7.07025 0.112686 -1.3892
DDX60L AK023743 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypept 7.06917 0.053039 1.6755
SPTLC2 BC005123 serine palmitoyltransferase, long c 7.06817 0.017518 1.9835
RPL22 BE250348 ribosomal protein L22 7.06653 0.309923 -1.2338
ITPK1 AF279372 inositol 1,3,4-triphosphate 5/6 kin 7.06589 0.013765 1.4769
BCL11B AA918317 B-cell CLL/lymphoma 11B (zinc finge 7.06482 0.767873 -1.0564
NDRG1 NM 006096 N-myc downstream regulated gene 1 7.06288 0.007598 1.4415
HLA- AI583173 major histocompatibility complex, c 7.06267 0.046951 1.8401
DQB1
IRF1 NM 002198 interferon regulatory factor 1 7.06259 0.046606 1.6269
MAGED1 AF217963 melanoma antigen family D, 1 7.06166 0.001644 -2.0342
AA522514 KIAA0746 protein 7.06113 0.015464 -2.0754
KIAA0746
STAG3L1 AA554827 stromal antigen 3-like 1 7.06066 0.511692 1.1105
SYK AW467357 spleen tyrosine kinase 7.05962 0.587708 -1.0093
MS4A6A NM 022349 membrane-spanning 4-domains, 7.05799 0.024153 2.4807
subfam
ELF4 U32645 E74-like factor 4 (ets domain trans 7.05752 0.004034 1.6688
FAM46A AW246673 family with sequence similarity 46, 7.05721 0.052725 2.382
NR3C1 AI934556 nuclear receptor subfamily 3, group 7.0552 0.765834 -1.0115
AL353759 histone cluster 1, H2ac 7.05419 0.789519 -1.0609
HIST1H2
AC
S0D2 W46388 superoxide dismutase 2, mitochondri 7.05353 0.861515 -1.3685
TPD52 AA524023 tumor protein D52 7.0498 0.003567 -2.2114
AI859834 transcriptional adaptor 2 (ADA2 hom 7.0496 0.77299 1.0361
MGC2187
CXCR4 L01639 chemokine (C-X-C motif) receptor 4 7.04848 0.714744 -1.2804
CCR5 NM 000579 chemokine (C-C motif) receptor 5 7.04793 0.227199 1.4096
ZFP36L1 BG250310 zinc finger protein 36, C3H type-li 7.04767 0.163363 1.3606
ABLIM1 NM 006720 actin binding LIM protein 1 7.04749 0.253045 -1.397
NUDT5 BC000025 nudix (nucleoside diphosphate linke 7.04507 0.044097 -1.6975
... BE865517 ... 7.04074 0.003804 1.5431
POLR2L BC005903 polymerase (RNA) II (DNA directed) 7.04022 0.030649 -1.7389
HLA-C U62824 major histocompatibility complex, c 7.03785 0.231917 1.346
AF151024 hypothetical protein MGC29506 7.03573 0.015153 -2.4229
MGC2950
O AJ408433 7.03496 0.016187 -2.6756
C6orf32 AB002384 chromosome 6 open reading frame 32 7.03424 0.22556 1.3397
ZEB1 NM 030751 zinc finger E-box binding homeobox 7.03309 0.972692 -1.04
CTLA4 AI733018 cytotoxic T-lymphocyte-associated p 7.03276 0.470188 -1.1414
KLF10 NM 005655 Kruppel-like factor 10 7.03208 0.833274 1.0774
MYO1G BE646398 myosin IG 7.03128 0.027158 1.5904
CTSS BC002642 cathepsin S 7.03103 0.121835 1.4725
DPYD NM 000110 dihydropyrimidine déydrogenase 7.03016 0.169686 1.3614
PLEK NM 002664 pleckstrin 7.02538 0.070595 1.5824
IGLV1-44 U96394 immunoglobulin lambda variable 1-44 7.02255 0.005057 -2.9244
WAS UI 2707 Wiskott-Aldrich syndrome (eczema-th 7.02112 0.689594 1.0171
RNF135 BC005084 ring finger protein 135 7.02051 0.041324 1.9632
FLJ11286 AI862559 hypothetical protein FLJ11286 7.01933 0.027339 1.9741
FYB AF198052 FYN binding protein (FYB-120/130) 7.01908 0.023791 1.441
RANBP1 NM 002882 RAN binding protein 1 7.01866 0.042887 -1.5489
L48784 hypothetical gene supported by AB08 7.01833 0.05133 -1.8554
LOC40096 2
O BE500942 7.0169 0.503995 1.1605
PITPNC1 NM 012417 phosphatidylinositol transfer prote 7.0165 0.783095 -1.0205
FPR1 NM 002029 formyl peptide receptor 1 7.01379 0.07639 2.3093
GBP1 BC002666 guanylate binding protein 1, interf 7.01359 0.004938 2.3334
U03891 apolipoprotein B mRNA editing 7.0133 0.116343 2.1383
APOBEC3 A enzym
AI510829 Rho GTPase activating protein 15 7.01185 0.331165 -1.4751
ARHGAP1
NC0A3 NM 006534 nuclear receptor coactivator 3 7.01173 0.671273 -1.1932
N0TCH2 AU158495 Notch homolog 2 (Drosophila) 7.0107 0.094728 1.4133
MS4A6A AF237908 membrane-spanning 4-domains, subfam 7.00974 0.085451 1.8192
RPS11 BF680255 ribosomal protein Sl 1 7.00798 0.442837 -1.0779
GCA NM 012198 grancalcin, EF-hand calcium binding 7.00743 0.138807 1.4326
NCF1 NM 000265 neutrophil cytosolic factor 1, (chr 7.00541 0.104483 2.0763
LOC72861 BC020552 programmed cell death 6 pseudogene 7.00517 0.131366 -1.9796
CSF2RB AV756141 colony stimulating factor 2 recepto 6.99579 0.39196 1.4117
C9orfl9 H92988 chromosome 9 open reading frame 19 6.9941 0.0169 1.9849
IL8 BG340548 interleukin 8 6.99336 0.019738 -2.2463
TRAPPC5 BF433657 trafficking protein particle comple 6.99303 0.152229 1.4736
FOXO3 N25732 forkhead box 03 6.99217 0.100346 1.3492
PDE4D AI082004 phosphodiesterase 4D, cAMP-specific 6.98535 0.238967 -1.3065
TGFBR3 NM 003243 transforming growth factor, beta re 6.98469 0.732594 1.1537
IFI6 NM 022873 interferon, alpha-inducible protein 6.98176 0.213753 1.605
Clorfl62 AW662189 chromosome 1 open reading frame 162 6.98117 0.033182 2.1046
NAGK NM 017567 N-acetylglucosamine kinase 6.98114 0.044515 2.1669
LACTB BE892574 lactamase, beta 6.98027 0.158193 1.4705
GBP2 BF509371 guanylate binding protein 2, interf 6.97688 0.173086 1.4967
MMD NM 012329 monocyte to macrophage differentiat 6.9765 0.342755 -1.2891
CTSB NM 001908 cathepsin B 6.97419 0.075968 1.6974
PHF1 AL021366 PHD finger protein 1 6.96878 0.45642 -1.0607
PIK3R1 AI680192 phosphoinositide-3 -kinase, regulato 6.96826 0.979601 -1.0663
CTSB W47179 cathepsin B 6.96701 0.08545 1.8221
IRF7 NM 004030 interferon regulatory factor 7 6.96633 0.068472 1.7286
QKI AA935633 quaking homolog, KH domain RNA bind 6.96561 0.97386 1.0798
TRIM8 NM 030912 tripartite motif-containing 8 6.96477 0.377591 1.2891
PIK3IP1 AL540260 phosphoinositide-3-kinase interacti 6.96192 0.378665 -1.3307
C7orf24 AK021779 chromosome 7 open reading frame 24 6.95869 0.113088 -1.4106
C0TL1 AL565621 coactosin-like 1 (Dictyostelium) 6.95562 0.429298 1.3715
RNF149 AW969703 ring finger protein 149 6.95284 0.149306 1.673
EIF4B BF247371 eukaryotic translation initiation f 6.94954 0.07694 -1.5107
VPS35 BG537579 vacuolar protein sorting 35 homolog 6.94857 0.159665 1.3425
SEPX1 NM 016332 selenoprotein X, 1 6.94571 0.026552 1.7838
ISCAI BG387555 iron-sulfur cluster assembly 1 homo 6.94407 0.317862 -1.1999
NFATC2 AA489681 nuclear factor of activated T-cells 6.94069 0.758079 1.3427
IER3 NM 003897 immediate early response 3 6.93712 0.709751 -1.1538
CCR1 AI421071 chemokine (C-C motif) receptor 1 6.93654 0.050617 2.4401
KLF10 AW292830 Kruppel-like factor 10 6.93556 0.385597 1.3605
OAS2 NM 016817 2'-5'-oligoadenylate synthetase 2, 6.93337 0.081678 1.7448
SEC11C AF212233 SEC11 homolog C (S. cerevisiae) 6.92968 0.011854 -2.0503
ANKRD10 AV724266 ankyrin repeat domain 10 6.92755 0.478365 -1.1314
RYBP W84482 RING1 and YY1 binding protein 6.92684 0.177661 -1.2562
VCAN BF590263 versican 6.92446 0.416176 1.1818
CHD1 AU155298 chromodomain helicase DNA binding 6.92423 0.727865 -1.1054
Ρ
AFFX-R2-BS ... 6.92351 0.830122 -1.7299
RBM39 BE466173 RNA binding motif protein 39 6.92228 0.77089 1.0609
UBE2G1 BC002775 ubiquitin-conjugating enzyme E2G 1 6.92056 0.003307 -2.1036
HSD17B1 η NM016142 hydroxysteroid (17-beta) déydrogen 6.91876 0.358301 -1.3522
Ζ RAB31 BE789881 RAB31, member RAS oncogene family 6.91495 0.141937 1.7572
CCL3 NM 002983 chemokine (C-C motif) ligand 3 6.91345 0.541792 1.0035
G0T2 NM 002080 glutamic-oxaloacetic transaminase 2 6.91156 0.231453 -1.5351
IFNGR1 AI458949 interferon gamma receptor 1 6.91041 0.654853 1.3743
IGHM X17115 immunoglobulin heavy constant mu 6.908 0.971852 1.0089
PAICS AA902652 phosphoribosylaminoimidazole carbox 6.90641 0.032405 -1.7396
FLJ43663 AA417078 hypothetical LOC378805 6.90546 0.445461 -1.1995
ARL4C BC001051 ADP-ribosylation factor-like 4C 6.90423 0.39386 1.2068
SYNCRIP NM 006372 synaptotagmin binding, cytoplasmic 6.90175 0.088592 -1.4881
ΑΚΑΡ13 M90360 A kinase (PRKA) anchor protein 13 6.8983 0.045386 1.7568
GLCCI1 AA058770 glucocorticoid induced transcript 1 6.89694 0.234472 -1.3977
C16orf33 NM 024571 chromosome 16 open reading frame 33 6.89628 0.127879 -1.2984
CDC42 N92917 cell division cycle 42 (GTP binding 6.88917 0.799504 1.1011
CD8B NM 004931 CD8b molecule 6.88606 0.538535 1.1676
GBP5 BG271923 guanylate binding protein 5 6.885 0.065443 1.8802
HLA- DQB1 M17565 major histocompatibility complex, c 6.88466 0.079155 1.9154
UPP1 NM 003364 uridine phosphorylase 1 6.88143 0.017462 1.7345
IL1RN U65590 interleukin 1 receptor antagonist 6.88109 0.340721 1.5453
MAML2 AI148006 mastermind-like 2 (Drosophila) 6.88 0.613849 1.0164
LOC93349 AK023116 hypothetical protein BC004921 6.87802 0.023226 1.5507
FABP5 NM 001444 fatty acid binding protein 5 (psori 6.87515 0.037904 -1.617
CSNK1G2 AL530441 casein kinase 1, gamma 2 6.87398 0.111173 1.2173
PCTK2 AA436887 PCTAIRE protein kinase 2 6.86625 0.251535 -1.2816
... AFFX-LYSX- ... 6.86246 0.915527 -1.5547
... BF512254 ... 6.86092 0.894648 -1.1871
HSP90B1 AI582238 heat shock protein 90kDa beta (Grp9 6.85808 0.095424 -1.8055
UAP1 S73498 UDP-N-acteylglucosamine pyrophospho 6.85782 0.010949 -1.9816
NADK BC001709 NAD kinase 6.85706 0.015096 1.7331
AP1S2 NM 003916 adaptor-related protein complex 1, 6.85641 0.061417 1.5901
FBX011 NM 018693 F-box protein 11 6.85565 0.725629 1.0217
ZFP36 NM 003407 zinc finger protein 36, C3H type, h 6.85557 0.133838 1.6744
JARID2 NM 004973 jumonji, AT rich interactive domain 6.85296 0.675705 1.0684
MCM2 NM 004526 minichromosome maintenance complex 6.8511 0.077386 -1.4297
HSPA1A NM 005345 heat shock 70kDa protein 1A 6.8511 0.093623 2.02
AZIN1 AI742383 antizyme inhibitor 1 6.85109 0.703535 -1.1644
LY86 NM 004271 lymphocyte antigen 86 6.8442 0.060639 1.7259
RAB31 AF183421 RAB31, member RAS oncogene family 6.84267 0.117838 1.7087
GLIPR1 AI912583 GLI pathogenesis-related 1 (glioma) 6.84013 0.148953 1.3332
KCTD12 AA551O75 potassium channel tetramerisation d 6.83789 0.025993 1.8453
PTPLAD1 AJ271091 protein tyrosine phosphatase-like A 6.83371 0.142372 -1.3359
... ΑΓ707896 ... 6.83035 0.053332 1.7104
RAP2B N20927 RAP2B, member of RAS oncogene famil 6.8283 0.048376 1.417
SFRS3 BE927772 splicing factor, arginine/serine-ri 6.82812 0.27746 -1.3711
GARNL4 AK000478 GTPase activating Rap/RanGAP domain 6.82692 0.113182 1.7985
STK17A AW194730 serine/threonine kinase 17a 6.82643 0.139806 -1.3344
IL12RB1 NM 153701 interleukin 12 receptor, beta 1 6.82551 0.144978 1.2185
GABARA PL3 AF180519 GABA(A) receptors associated protei 6.82548 0.247472 1.7786
STK4 AI763206 serine/threonine kinase 4 6.82347 0.956478 -1.0819
... AW512196 ... 6.81886 0.010007 1.5776
CD97 NM 001784 CD97 molecule 6.8153 0.007485 2.2044
TSC22D1 AK027071 TSC22 domain family, member 1 6.80768 0.693231 1.1615
ETV6 AF147300 ets variant gene 6 (TEL oncogene) 6.8066 0.58475 1.2642
BCL2 AU146384 B-cell CLL/lymphoma 2 6.80617 0.512082 1.0624
PTPRE AA775177 protein tyrosine phosphatase, recep 6.80604 0.180328 1.3884
ELL2 AW057518 elongation factor, RNA polymerase I 6.80324 0.192568 -1.7096
KLRK1 NM 007360 killer cell lectin-like receptor su 6.80258 0.802833 1.2847
CTBP2 AF222711 C-terminal binding protein 2 6.80118 0.02151 1.8254
MALAT1 AF001540 metastasis associated lung adenocar 6.79622 0.142517 1.2835
KRT10 M19156 keratin 10 (epidermolytic hyperkera 6.79566 0.090969 -1.6333
BRWD2 BF062828 bromodomain and WD repeat domain 6.79355 0.721716 -1.037
TRIM69 BM976092 CO tripartite motif-containing 69 6.7868 0.000119 2.3447
TRA@ AW007751 T cell receptor alpha locus 6.78564 0.199719 1.2429
DUSP6 BC003143 dual specificity phosphatase 6 6.78413 0.055966 2.5524
SLC2A3 AW197431 solute carrier family 2 (facilitate 6.78371 0.128836 1.433
AP1S2 AF251295 adaptor-related protein complex 1, 6.78003 0.129304 1.4557
CXCR4 AF348491 chemokine (C-X-C motif) receptor 4 6.77836 0.61256 -1.2641
CAMKK2 AK024748 calcium/calmodulin-dependent protei 6.77194 0.192387 1.4644
CCL4 NM 002984 chemokine (C-C motif) ligand 4 6.76722 0.490448 -1.1534
GIMAP4 NM 018326 GTPase, IMAP family member 4 6.76541 0.048545 1.7799
BASP1 NM 006317 brain abundant, membrane attached s 6.76512 0.258315 -1.3442
ΡΑΚΙ AU154408 p21/Cdc42/Racl-activated kinase 1 ( 6.76026 0.020967 1.9259
MT1H NM 005951 metallothionein 1H 6.75503 0.003445 2.0475
ANP32E AI697657 acidic (leucine-rich) nuclear phosp 6.75217 0.016136 -1.9733
PSAP M32221 prosaposin (variant Gaucher disease 6.74555 0.076822 1.4875
TncRNA AI042152 trophoblast-derived noncoding RNA 6.74254 0.066395 1.5084
BACH2 AI052447 BTB and CNC homology 1, basic leuci 6.73005 0.041431 -1.6115
SEC14L1 AIO17770 SEC14-like 1 (S. cerevisiae) 6.72301 0.020707 -2.0975
TLR2 NM 003264 toll-like receptor 2 6.71644 0.304005 1.7565
FBXO5 NM 012177 F-box protein 5 6.7028 0.054797 -1.5874
FOSL2 AI670862 FOS-like antigen 2 6.70192 0.612354 1.1101
CTNNB1 AF130085 catenin (cadherin-associated protei 6.69747 0.346638 1.3935
CD44 NM 000610 CD44 molecule (Indian blood group) 6.69603 0.643084 -1.0849
MAML2 BF358386 mastermind-like 2 (Drosophila) 6.69589 0.559976 -1.068
FAM26F AV734646 family with sequence similarity 26, 6.68643 0.014525 3.2665
ΑΙ655467 6.68015 0.02401 2.2238
SLA U44403 Src-like-adaptor 6.67936 0.086301 1.6713
FER1L3 NM 013451 fer-l-like 3, myoferlin (C. elegans 6.67763 0.037863 2.3014
... AFFX-PHEX- ... 6.67115 0.930535 -1.8022
BRI3 AB055977 brain protein 13 6.67018 0.06886 1.6603
MS4A1 AW474852 membrane-spanning 4-domains, subfam 6.66725 0.332659 1.1704
WARS M61715 tryptophanyl-tRNA synthetase 6.66474 0.035392 2.6189
DUSP6 BC003143 dual specificity phosphatase 6 6.66131 0.035796 2.5553
ELL2 AW960145 elongation factor, RNA polymerase I 6.65868 0.433958 -1.458
NLRP3 NM 004895 NLR family, pyrin domain containing 6.65751 0.305145 1.1479
FLJ45445 AL040396 hypothetical LOC399844 6.65652 0.20665 1.6106
NR4A2 NM 006186 nuclear receptor subfamily 4, group 6.65413 0.69775 -1.1243
CD58 R64696 CD58 molecule 6.65187 0.581994 1.2954
CD36 AW299226 CD36 molecule (thrombospondin recep 6.65103 0.127415 1.6703
RPL38 BC000603 ribosomal protein L38 6.65076 0.423418 1.0077
... AA393940 ... 6.64943 0.392231 1.1523
... AI351653 ... 6.64939 0.965783 1.1026
TUBB1 N63244 tubulin, beta 1 6.64426 0.56416 -1.1933
SAMD9L AI064690 sterile alpha motif domain containi 6.643 0.124245 1.6462
GINS2 BC003186 GINS complex subunit 2 (Psf2 homolo 6.64092 0.057406 -1.8078
FYN BG222258 FYN oncogene related to SRC, FGR, v 6.63635 0.483944 1.2341
Cllorf75 NM 020179 chromosome 11 open reading frame 75 6.62795 0.013342 2.1468
TYMP NM 001953 thymidine phosphorylase 6.62316 0.133613 1.7705
HLA-C M20812 major histocompatibility complex, c 6.61859 0.024304 -1.9034
HLA- DPA1 AI 128225 major histocompatibility complex, c 6.61738 0.37239 1.6745
ITM2C NM 030926 integral membrane protein 2C 6.61644 0.016602 -1.9904
SMC4 NM 005496 structural maintenance of chromosom 6.61279 0.009866 -2.2396
... BG165011 ... 6.60993 0.080853 -1.5291
tcag7.907 AW006934 hypothetical LOC402483 6.60869 0.138441 1.8472
VPS37C BM452172 vacuolar protein sorting 37 homolog 6.60687 0.111928 1.8702
MBNL2 BE328496 muscleblind-like 2 (Drosophila) 6.58821 0.124987 -1.7822
FAM128A BG332462 family with sequence similarity 128 6.58645 0.639565 -1.0216
KLHL14 AB037805 kelch-like 14 (Drosophila) 6.58278 0.019275 -2.3468
... AI343473 ... 6.58177 0.883977 -1.1807
WDR61 BF791874 WD repeat domain 61 6.58015 0.479318 1.6652
LOC28366 AI926479 hypothetical protein LOC283663 6.5797 0.600396 -1.5841
TLR8 AW872374 toll-like receptor 8 6.57962 0.034218 2.0356
... AV717590 ... 6.56834 0.041413 -1.855
BAT2D1 BF110903 BAT2 domain containing 1 6.56237 0.51209 -1.7216
PRC1 NM 003981 protein regulator of cytokinesis 1 6.56227 0.052759 -1.7871
... BF510692 ... 6.56005 0.218008 -1.3941
C13orfl5 NM 014059 chromosome 13 open reading frame 15 6.55673 0.815108 1.3007
MT1E BF217861 metallothionein 1E 6.5549 0.012654 1.8414
NFKB1 R37337 nuclear factor of kappa light polyp 6.54436 0.719548 -1.0463
HCK NM 002110 hemopoietic cell kinase 6.54265 0.060487 2.1608
RNF144B AI953847 ring finger 144B 6.53878 0.042506 2.9791
MALAT1 AA827878 metastasis associated lung adenocar 6.53835 0.943034 -1.1608
WTAP BE464729 Wilms tumor 1 associated protein 6.53738 0.403701 -1.4199
EZR AA670344 ezrin 6.52246 0.213627 -1.2624
CFD NM 001928 complement factor D (adipsin) 6.51822 0.013175 2.7446
PHF19 BE544837 PHD finger protein 19 6.51192 0.109919 -1.5748
HERC6 NM 017912 hect domain and RLD 6 6.51025 0.240036 1.5461
... AFFX-THRX- ... 6.50818 0.997535 -1.7527
ADM NM 001124 adrenomedullin 6.50619 0.111558 2.0849
CEBPD NM_005195 CCAAT/enhancer binding protein (CZE 6.50223 0.042689 2.2678
EMILIN2 AF270513 elastin microfibril interfacer 2 6.50221 0.136331 1.8051
ARF6 AA243143 ADP-ribosylation factor 6 6.49979 0.885069 -1.3269
CLEC4A NM 016184 C-type lectin domain family 4, memb 6.48539 0.070909 1.5993
LY96 NM 015364 lymphocyte antigen 96 6.47833 0.028722 1.8432
FOS BC004490 v-fos FBJ murine osteosarcoma viral 6.47306 0.117172 1.7601
NELL2 NM 006159 NEL-like 2 (chicken) 6.47135 0.160413 -1.8655
LST1 NM 007161 leukocyte specific transcript 1 6.46765 0.038581 2.7433
RSBN1 AK022166 round spermatid basic protein 1 6.45176 0.737834 1.0279
... AFFX-R2-BS ... 6.4452 0.967272 -1.3919
SERPINA 1 CTSL1 NM 000295 serpin peptidase inhibitor, clade A 6.44127 0.025155 2.6517
NM 001912 cathepsin Ll 6.44026 0.075111 2.0229
FCGR1B L03419 Fc fragment of IgG, high affmity I 6.43791 0.034844 2.6418
NR4A2 S77154 nuclear receptor subfamily 4, group 6.43655 0.615487 -1.2521
KYNU D55639 kynureninase (L-kynurenine hydrolas 6.43563 0.050925 2.0858
C4orfl8 AF260333 chromosome 4 open reading frame 18 6.42955 0.132761 1.5552
SMCHD1 AA336502 structural maintenance of chromosom 6.42658 0.130073 1.3682
NM 003536 histone cluster 1, H3h 6.42655 0.158024 -1.577
HIST1H3 Η
GAS7 BE439987 growth arrest-specific 7 6.42452 0.181941 1.8954
ARGLU1 R53084 arginine and glutamate rich 1 6.41881 0.862775 -1.7157
H2AFY BE503981 H2A histone family, member Y 6.39933 0.486676 1.3278
HMMR NM 012485 hyaluronan-mediated motility recept 6.39826 0.092274 -1.5011
CREM D14826 cAMP responsive element modulator 6.39628 0.373941 -1.563
AIF1 AF299327 allograft inflammatory factor 1 6.39356 0.202238 1.603
IGL@ H53689 immunoglobulin lambda locus 6.38877 0.001172 -3.0718
CCNB2 NM 004701 cyclin B2 6.377 0.02646 -2.2304
... AV764378 ... 6.37123 0.494228 1.049
... AF1O353O ... 6.36245 0.01639 -2.3461
DTL AK001261 denticleless homolog (Drosophila) 6.36065 0.04699 -1.8529
TIMP1 NM 003254 TIMP metallopeptidase inhibitor 1 6.35391 0.318715 1.5269
CST3 NM 000099 cystatin C (amyloid angiopathy and 6.34496 0.077443 1.8675
... BE739287 ... 6.34092 0.706553 1.1033
TNFSF13 AF114013 tumor necrosis factor (ligand) supe 6.33822 0.010068 2.352
RPL14 AF103591 ribosomal protein L14 6.33398 0.010428 -2.6368
IL1B M15330 interleukin 1, beta 6.33362 0.985823 -2.1685
CENTA2 NM 018404 centaurin, alpha 2 6.33111 0.087184 2.2723
RGL1 EPSTI1 LILRB2 AF186779 BE645480 AF004231 ral guanine nucleotide dissociation epithelial stromal interaction 1 (b leukocyte immunoglobulin-like recep 6.31839 6.31463 6.31411 0.202314 0.0678 0.049719 2.1334 2.013 2.6937
MS4A7 AI301935 membrane-spanning 4-domains, subfam 6.30867 0.035119 2.5679
BLVRB NM 000713 biliverdin reductase B (flavin redu 6.30777 0.040453 1.8995
FLJ11903 AU120130 similar to hypothetical protein MGC 6.29959 0.316305 1.2428
LILRB1 AI681260 leukocyte immunoglobulin-like recep 6.29676 0.052061 2.2342
LST1 AI735692 leukocyte specific transcript 1 6.29361 0.037098 2.8309
CLEC7A BC013385 C-type lectin domain family 7, memb 6.29216 0.162446 1.8897
CDCA7 AY029179 cell division cycle associated 7 6.27819 0.204965 -1.1017
HLA- DQB1 M32577 major histocompatibility complex, c 6.27559 0.525221 1.2395
HLA- DQA1 BG397856 major histocompatibility complex, c 6.2684 0.270192 2.0622
S100A11 NM 005620 SI00 calcium binding protein Al 1 6.256 0.024816 1.8793
DLG7 NM 014750 discs, large homolog 7 (Drosophila) 6.25423 0.033649 -2.0616
ZCCHC2 BE676543 zinc finger, CCHC domain containing 6.24429 0.075008 1.8192
... BF724558 ... 6.24224 0.106534 2.182
SLC31A2 NM 001860 solute carrier family 31 (copper tr 6.23459 0.035495 2.4407
CLEC12A NM 138337 C-type lectin domain family 12, mem 6.23324 0.279177 1.35
BANK1 NM 017935 B-cell scaffold protein with ankyri 6.21968 0.53668 -1.1604
CHURC1 BE568660 churchill domain containing 1 6.18873 0.391562 1.2923
ZNF600 AI620827 zinc finger protein 600 6.18727 0.155702 1.2628
ZNF331 NM 018555 zinc finger protein 331 6.18617 0.231555 -1.3646
OASL NM 003733 2'-5'-oligoadenylate synthetase-lik 6.18186 0.029524 2.7191
FCGR3B J04162 Fc fragment of IgG, low affinity II 6.1543 0.002868 4.1952
TNFSF10 U57059 tumor necrosis factor (ligand) supe 6.14789 0.052835 2.325
ANKRD22 AI097229 ankyiin repeat domain 22 6.14069 0.042713 2.6953
... AW016812 ... 6.13308 0.369829 1.905
SIGLEC10 AF301007 sialic acid binding Ig-like lectin 6.12976 0.025479 3.3761
CD44 BE467023 CD44 molecule (Indian blood group) 6.12947 0.539482 -1.4378
NCAPG NM 022346 non-SMC condensin I complex, subuni 6.12877 0.042418 -2.2595
PLAUR U08839 plasminogen activator, urokinase re 6.1285 0.637177 1.0997
LST1 AF000424 leukocyte specific transcript 1 6.12233 0.041172 2.2944
... AFFX-DAPX- ... 6.11575 0.843948 -1.4703
EGR1 NM 001964 early growth response 1 6.10353 0.00334 3.2916
C3AR1 U62027 complement component 3 a receptor 1 6.08138 0.002707 4.5817
... AFFX-R2-BS ... 6.06704 0.944989 -1.6537
EGR1 AI459194 early growth response 1 6.04876 0.007242 4.6155
LYZ U25677 lysozyme (renal amyloidosis) 6.04567 0.097348 2.0446
LGALS2 NM 006498 lectin, galactoside-binding, solubl 5.99647 0.053018 1.6653
ANKRD22 AI925518 ankyrin repeat domain 22 5.97178 0.037611 2.5852
CREM AI800640 cAMP responsive element modulator 5.94068 0.458181 -1.4787
LILRA2 NM 006866 leukocyte immunoglobulin-like recep 5.90652 0.045384 2.2348
FOSB NM 006732 FBJ murine osteosarcoma viral oncog 5.90285 0.144303 1.6763
LILRB2 NM 005874 leukocyte immunoglobulin-like recep 5.88697 0.02635 3.289
... AFFX-R2-BS ... 5.87851 0.932598 -1.7862
100
... AFFX-PHEX- ... 5.84298 0.781562 -2.0474
IFIT3 NM 001549 interferon-induced protein with tet 5.81069 0.077607 2.9505
G0S2 NM 015714 GO/jGlswitch 2 5.78858 0.787938 1.2464
BCL2A1 NM 004049 BCL2-related protein Al 5.7881 0.231424 1.5545
SAMHD1 AF147427 SAM domain and HD domain 1 5.7873 0.003019 2.4624
BID1 AL080280 phosphotyrosine interaction domain 5.62461 0.807122 1.9415
BF110534 ... ·:·. 5.58112 0.500238 1.6184
HBA1 T50399 hemoglobin, alpha 1 5.34606 0.441238 1.9256
CDKN1C N33167 cyclin-dependent kinase inhibitor 1 5.33359 0.038424 7.9145
C15orf48 AF228422 chromosome 15 open reading frame 48 5.00893 0.729228 -1.3972
/5
REIVINDICAÇÃO

Claims (30)

1. Método de predição da resposta clínica do paciente infectado pelo vírus da dengue durante os primeiros dias após o início dos sintomas, caracterizado pela identificação da expressão diferencial de genes selecionados a partir de um grupo de 1981 genes listados na Tabela 7, ou dos seus polimorfismos alélicos, bem como pela análise dos níveis de expressão das suas proteínas codificadas.
2. Método de diagnóstico de infecção pelo vírus da dengue, diferenciando de outras doenças febris, durante os primeiros dias após o início dos sintomas, caracterizado pela identificação da expressão diferencial de genes selecionados a partir de um grupo de 1981 genes listados na Tabela 7, ou dos seus polimorfismos alélicos, bem como pela análise dos níveis de expressão das suas proteínas codificadas.
3. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato da identificação da expressão diferencial de genes selecionados compreender identificação de sequências de ácidos nucléicos isolados, seus complementos, partes, ou polimorfismo alélico, bem como a análise dos níveis de expressão do produto codificado dos referidos ácidos nucléicos isolados.
4. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato da identificação da expressão diferencial de genes selecionados compreender identificação de sequências de ácidos nucléicos isolados, seus complementos, partes, ou polimorfismo alélico, bem como a análise dos níveis de expressão dos produtos codificados de genes em dupla.
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5. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato da identificação da expressão diferencial de genes selecionados compreender identificação de sequências de ácidos nucleicos isolados, seus complementos, partes, ou polimorfismo alélico, bem como a análise dos níveis de expressão das proteínas codificadas de genes em trio.
6. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato da identificação da expressão diferencial de genes selecionados compreender identificação de sequências de ácidos nucleicos isolados, seus complementos, partes, ou polimorfismo alélico, bem como a análise dos níveis de expressão das proteínas codificadas de genes em quarteto ou grupos maiores.
7. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de ser conduzido com ácidos nucleicos extraídos de Células Mononucleares do Sangue Periférico (PBMC), bem como qualquer dos seus conteúdos celulares selecionados dentre células B, células T, Monócitos, Macrófagos, células NK e dendríticas.
8. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de ser conduzido em qualquer compartimento celular, bem como qualquer líquido corporal, tal como sangue, plasma, soro, exsudato e outros.
9. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de utilizar a Análise de Discriminação Linear como regra de classificação, e a potencializada (bolstered resubstitution) como estimador de erro, para seleção exaustiva de grupos de genes preditores da
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3/5 resposta clínica de pacientes infectados com vírus da dengue, usando-se um, dois ou três ou mais genes expressos diferencialmente.
10. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato do grupo de genes incluir os 73 genes listados na Tabela 6.
11. Método de acordo com reivindicação
1, caracterizado pelo fato do grupo de genes incluir os classificadores listados na Tabela
5.
12. Método de acordo com reivindicação
2, caracterizado pelo fato do grupo de genes incluir os genes listados na Tabela 2.
13. Método de acordo com reivindicação 1, caracterizado pelo fato do valor p indicando modulação diferencial ser menor que
0, 05.
14. Método de acordo com a reivindicação
1, caracterizado pelo fato de haver pelo menos uma diferença de
2 vezes na expressão dos genes modulados.
15. Método de acordo com a reivindicação
1, caracterizado pelo fato dos sorotipos infecciosos do vírus de dengue serem DENV1, DENV2, DENV3 ou DENV 4, bem como infecções múltiplas com qualquer combinação deles.
16. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de compreender pacientes acometidos por infecção primária.
17. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de compreender pacientes acometidos por infecção secundária.
18. Kit para determinar o prognóstico da resposta
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4/5 clínica do paciente infectado por dengue, caracterizado por compreender materiais para detectar sequências de ácidos nucleicos, seus complementos, partes, polimorfismo alélico de um gene ou combinação de genes serem selecionados a partir da lista de 1981 transcritos ou para detectar proteínas codificadas pelas referidas sequências de ácidos nucleicos ou células contendo as referidas proteínas.
19. Kit para diagnóstico de dengue, caracterizado por compreender materiais para detectar sequência de ácidos nucleicos, seus complementos, partes, polimorfismo alélico de um gene ou combinação de genes serem selecionados a partir da lista de 1981 transcritos ou para detectar proteínas codificadas pelas referidas sequências de ácidos nucleicos ou células contendo as referidas proteínas.
20. Kit de acordo com a reivindicação 18 ou 19, caracterizado pelo fato da combinação incluir todos os genes individualmente.
21. Kit de acordo com a reivindicação 18 ou 19, caracterizado pelo fato da combinação incluir todos os genes em duplas.
22. Kit de acordo a reivindicação 18 ou 19, caracterizado pelo fato da combinação incluir todos os genes em trios.
23. Kit de acordo com a reivindicação 18 ou 19, caracterizado pelo fato da combinação incluir todos os genes em quartetos ou mais.
24. Kit de acordo com a reivindicação 18 ou 19, caracterizado por ocorrer em uma matriz de microarranjo para identificar a expressão diferencial dos genes.
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25. Kit de acordo com a reivindicação 18 ou 19, caracterizado por ocorrer em uma reação de PCR quantitativa para identificar a expressão diferencial dos genes.
26. Kit de acordo com a reivindicação 18 ou 19, caracterizado por ocorrer em uma reação de RT-PCR para identificar a expressão diferencial dos genes. 27. Kit de acordo com a reivindicação 18 ou 19,
caracterizado por ocorrer em uma reação de Northern blotting para identificar a expressão diferencial dos genes.
28. Kit de acordo com a reivindicação 18 ou 19, caracterizado por ocorrer em uma reação de PCR para identificar a expressão diferencial do polimorfismo alélico dos genes.
29. Kit de acordo com a reivindicação 18 ou 19, caracterizado por ocorrer em teste de ELISA para identificar a produção diferencial de proteína codificada pelos genes.
30. Kit de acordo com a reivindicação 18 ou 19, caracterizado por ocorrer em teste de Western blotting para identificar a produção diferencial de proteína codificada pelos genes.
31. Kit de acordo com a reivindicação 18 ou 19, caracterizado por ocorrer em teste de Dot-blotting para identificar a produção diferencial de proteína codificada pelos genes.
32. Kit de acordo com a reivindicação 18 ou 19, caracterizado por ocorrer em teste de citometria de fluxo para identificar a produção diferencial de proteína codificada pelos genes ou qualquer compartimento celular.
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