BRPI1006411A8 - Seleção genômica e sequenciamento utilizando microcarreadores codificados, processo para determinar a sequência de uma molécula de ácido nucleico alvo, e, dispositivo para determinar a sequência de uma amostra de ácido nucleico - Google Patents

Seleção genômica e sequenciamento utilizando microcarreadores codificados, processo para determinar a sequência de uma molécula de ácido nucleico alvo, e, dispositivo para determinar a sequência de uma amostra de ácido nucleico

Info

Publication number
BRPI1006411A8
BRPI1006411A8 BRPI1006411A BRPI1006411A BRPI1006411A8 BR PI1006411 A8 BRPI1006411 A8 BR PI1006411A8 BR PI1006411 A BRPI1006411 A BR PI1006411A BR PI1006411 A BRPI1006411 A BR PI1006411A BR PI1006411 A8 BRPI1006411 A8 BR PI1006411A8
Authority
BR
Brazil
Prior art keywords
sequence
determining
nucleic acid
capture probe
sequencing
Prior art date
Application number
BRPI1006411A
Other languages
English (en)
Inventor
Van De Stolpe Anja
M J Den Toonder Jacob
J Van Der Zaag Pieter
Original Assignee
Koninklijke Philips Electronics Nv
Koninklijke Philips Nv
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Koninklijke Philips Electronics Nv, Koninklijke Philips Nv filed Critical Koninklijke Philips Electronics Nv
Publication of BRPI1006411A2 publication Critical patent/BRPI1006411A2/pt
Publication of BRPI1006411A8 publication Critical patent/BRPI1006411A8/pt

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6869Methods for sequencing
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
    • Y10TTECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER US CLASSIFICATION
    • Y10T428/00Stock material or miscellaneous articles
    • Y10T428/29Coated or structually defined flake, particle, cell, strand, strand portion, rod, filament, macroscopic fiber or mass thereof
    • Y10T428/2982Particulate matter [e.g., sphere, flake, etc.]

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

SELEÇÃO GENÔMICA E SEQUENCIAMENTO UTILIZANDO MICROCARREADORES CODIFICADOS, PROCESSO PARA DETERMINAR A SEQUÊNCIA DE UMA MOLÉCULA DE ÁCIDO NUCLEICO ALVO, E, DISPOSITIVO PARA DETERMINAR A SEQUÊNCIA DE UMA AMOSTRA DE ÁCIDO NUCLEICO. A presente invenção refere-se a um processo para determinar a sequência de uma molécula de ácido nucleico. Aqui, uma sonda de captura do oligonucleotídeo é unida a um microcarreador codificado, em que o código do dito microcarreador identifica a sequência da dita sonda do oligonucleotídeo. A sonda de captura do oligonucleotídeo é hibridizada com uma amostra que compreende as moléculas de ácidos nucleicos, em que o dito fragmento de DNA compreende uma sequência que é complementar à sequência à sequência de sonda de captura do oligonucleotídeo. A sequência da molécula de DNA é determinada, em que a sonda de captura do oligonucleotídeo serve como um inidicador para uma polimerase do DNA; no caso do sequenciamento de molécula simples, este é um iniciador de sequenciamento. Após a determinação da sequência, a sequência de nucleotídeo da sonda de captura do oligonucleotídeo é identificada ao determinar o código no microcarreador, que corresponde à sonda de captura do oligonucleotídeo. Estas informações sobre sequência identificam diretamente a posição do fragmento de DNA arranjado em sequência no genoma, permitindo uma comparação direta.
BRPI1006411A 2009-02-27 2010-02-26 Seleção genômica e sequenciamento utilizando microcarreadores codificados, processo para determinar a sequência de uma molécula de ácido nucleico alvo, e, dispositivo para determinar a sequência de uma amostra de ácido nucleico BRPI1006411A8 (pt)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP09153909 2009-02-27
PCT/IB2010/050840 WO2010097775A1 (en) 2009-02-27 2010-02-26 Genomic selection and sequencing using encoded microcarriers

Publications (2)

Publication Number Publication Date
BRPI1006411A2 BRPI1006411A2 (pt) 2017-01-31
BRPI1006411A8 true BRPI1006411A8 (pt) 2017-09-19

Family

ID=40847903

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
BRPI1006411A BRPI1006411A8 (pt) 2009-02-27 2010-02-26 Seleção genômica e sequenciamento utilizando microcarreadores codificados, processo para determinar a sequência de uma molécula de ácido nucleico alvo, e, dispositivo para determinar a sequência de uma amostra de ácido nucleico

Country Status (6)

Country Link
US (1) US8932811B2 (pt)
EP (1) EP2401398B1 (pt)
CN (1) CN102333890B (pt)
BR (1) BRPI1006411A8 (pt)
RU (1) RU2609630C2 (pt)
WO (1) WO2010097775A1 (pt)

Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2426214A1 (en) 2010-09-01 2012-03-07 Koninklijke Philips Electronics N.V. Method for amplifying nucleic acids
WO2012168803A2 (en) 2011-06-07 2012-12-13 Koninklijke Philips Electronics N.V. Providing nucleotide sequence data
US9708660B2 (en) * 2012-02-19 2017-07-18 Nvigen, Inc. Uses of IDed nanostructures in nucleic acid technology
CA2865541C (en) * 2012-02-27 2019-11-05 Toray Industries, Inc. Nucleic acid detection method
EP2664914A1 (en) 2012-05-16 2013-11-20 Koninklijke Philips N.V. Magnetically assisted processing of a medium
EP2909343B1 (en) * 2012-10-16 2018-10-10 Abbott Molecular Inc. Methods to sequence a nucleic acid
EP2983297A1 (en) * 2014-08-08 2016-02-10 Thomson Licensing Code generation method, code generating apparatus and computer readable storage medium
CN107034267B (zh) * 2016-02-03 2021-06-08 深圳华大智造科技股份有限公司 制备候选测序探针集的方法、装置及其应用
EP3870704A4 (en) * 2018-10-25 2023-01-11 Illumina, Inc. METHODS AND COMPOSITIONS FOR IDENTIFICATION OF LIGANDS ON ARRAYS WITH INDEXES AND BARCODES
CN112867801B (zh) 2018-11-30 2024-07-12 Illumina公司 使用单一测定分析多种分析物
CN112867800B (zh) 2018-12-17 2024-07-12 Illumina公司 用于制备测序文库的方法和手段
US20220339623A1 (en) * 2019-09-30 2022-10-27 Frederick Edward TURNER Devices for determining a target nucleic acid profile and methods of use thereof

Family Cites Families (21)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5736332A (en) * 1995-11-30 1998-04-07 Mandecki; Wlodek Method of determining the sequence of nucleic acids employing solid-phase particles carrying transponders
WO2000063695A1 (en) 1999-04-16 2000-10-26 Tibotec N.V. Encoding of microcarriers
US20050244870A1 (en) 1999-04-20 2005-11-03 Illumina, Inc. Nucleic acid sequencing using microsphere arrays
US7211390B2 (en) 1999-09-16 2007-05-01 454 Life Sciences Corporation Method of sequencing a nucleic acid
US7041445B2 (en) 1999-11-15 2006-05-09 Clontech Laboratories, Inc. Long oligonucleotide arrays
AU2082701A (en) * 1999-12-09 2001-06-18 Motorola, Inc. Multilayered microfluidic devices for analyte reactions
US6934408B2 (en) * 2000-08-25 2005-08-23 Amnis Corporation Method and apparatus for reading reporter labeled beads
JP4404547B2 (ja) 2000-10-19 2010-01-27 バイオカルテイス・エス・エイ マイクロキャリアの識別用操作のための方法及び装置
US7338760B2 (en) 2001-10-26 2008-03-04 Ntu Ventures Private Limited Sample preparation integrated chip
US6956114B2 (en) 2001-10-30 2005-10-18 '454 Corporation Sulfurylase-luciferase fusion proteins and thermostable sulfurylase
DE10304653B4 (de) 2003-02-05 2005-01-27 Evotec Technologies Gmbh Mehrparametrige Detektion in einem fluidischen Mikrosystem
WO2005071412A2 (en) * 2004-01-09 2005-08-04 Applera Corporation Phosphor particle coded beads
US8486629B2 (en) * 2005-06-01 2013-07-16 Bioarray Solutions, Ltd. Creation of functionalized microparticle libraries by oligonucleotide ligation or elongation
US7932037B2 (en) * 2007-12-05 2011-04-26 Perkinelmer Health Sciences, Inc. DNA assays using amplicon probes on encoded particles
WO2007077498A1 (en) 2006-01-04 2007-07-12 Koninklijke Philips Electronics N. V. Microelectronic device with magnetic excitation wires
RU2487169C2 (ru) * 2006-01-19 2013-07-10 Зе Рисерч Фаундейшн Оф Стейт Юниверсити Оф Нью Йорк Способы и приборы для обнаружения и идентификации закодированных гранул и биологических молекул
WO2007115815A1 (en) 2006-04-07 2007-10-18 Pauwels, Rudi Method and apparatus for labelling, reading and sorting of microcarriers
EP1903337B1 (en) 2006-09-20 2015-07-22 Mycartis N.V. Coating for microcarriers
KR101556798B1 (ko) * 2006-10-05 2015-10-01 메사츄세츠 인스티튜트 어브 테크놀로지 고성능 분석을 위한 다중기능성 인코딩된 입자
JP4803125B2 (ja) 2007-05-10 2011-10-26 ソニー株式会社 ビーズ群と該ビーズ群の作製方法、並びにビーズ群を用いる方法
EP1995329B1 (en) 2007-05-10 2013-09-25 Sony Corporation Method for sequencing nucleic acids

Also Published As

Publication number Publication date
CN102333890A (zh) 2012-01-25
WO2010097775A1 (en) 2010-09-02
RU2011139296A (ru) 2013-04-10
US20110311975A1 (en) 2011-12-22
EP2401398A1 (en) 2012-01-04
RU2609630C2 (ru) 2017-02-02
US8932811B2 (en) 2015-01-13
CN102333890B (zh) 2017-11-14
EP2401398B1 (en) 2017-02-08
BRPI1006411A2 (pt) 2017-01-31

Similar Documents

Publication Publication Date Title
BRPI1006411A8 (pt) Seleção genômica e sequenciamento utilizando microcarreadores codificados, processo para determinar a sequência de uma molécula de ácido nucleico alvo, e, dispositivo para determinar a sequência de uma amostra de ácido nucleico
BR112014018940A8 (pt) Método e kit para detecção de uma sequência de ácido nucleico alvo
SG194745A1 (en) Nucleic acid encoding reactions
WO2010117420A3 (en) Fret-labeled compounds and uses therefor
RU2017100015A (ru) Набор или устройство для обнаружения рака желчных путей и способ обнаружения
JP2013501508A5 (pt)
ATE393244T1 (de) Verfahren zur genotypisierung durch schmelztemperaturabhängigkeit
RU2017101174A (ru) Набор или устройство для обнаружения рака печени и способ обнаружения
WO2010026488A3 (en) Methods and kits for nucleic acid sequencing
JP2010029220A5 (pt)
AR111118A2 (es) Un método para la identificación de locus de rasgos cuantitativos de resistencia a la roya de soja asiática en soja, y sus composiciones
JP2010520745A5 (pt)
RU2019138698A (ru) Способы и композиции для днк-профилирования
EP2414547A4 (en) MULTIPLE PRIMER AMPLIFICATION METHOD FOR TARGET NUCLEIC ACID BAR CODING
BR112014005205A2 (pt) métodos para etiquetar bibliotecas codificadas com dna
EP2253713A4 (en) METHOD FOR MEASURING COPY COUNTS OF CHROMOSOMES, GENES OR SPECIFIC NUCLEOTIDE SEQUENCES WITH THE AID OF AN SNP ARRAY
GB201319347D0 (en) Compositions and kits for molecular counting
WO2008033239A3 (en) Genetic polymorphisms associated with psoriasis, methods of detection and uses thereof
BR112013002299A2 (pt) método de captura e sequenciamento de uma molécula alvo de ácido nucleíco e método de determinação do estado de metilação de um fragmento de dna genônimo
RU2013158861A (ru) Способы и композиции для предсказания активности модулятора ретиноидного х-рецептора
BR112016029548A2 (pt) método de sequenciamento de um ácido nucleico e sistema de sonda biológico multicomponente
BR112013004044A2 (pt) composições e métodos para quantificação de uma sequência de ácido nucleico em uma amostra.
BR112013027876A2 (pt) "métodos para detectar uma sequência de ácido nucleico alvo e kits para detectar uma sequência de ácido nucleico alvo"
WO2009073628A3 (en) Genetic polymorphisms associated with psoriasis, methods of detection and uses thereof
BRPI0920985A2 (pt) Enzima de dna dividida para tipificação visual de polimorfismo de nucleotídeo único

Legal Events

Date Code Title Description
B25D Requested change of name of applicant approved

Owner name: KONINKLIJKE PHILIPS N.V. (NL)

B25G Requested change of headquarter approved

Owner name: KONINKLIJKE PHILIPS N.V. (NL)

B07A Application suspended after technical examination (opinion) [chapter 7.1 patent gazette]
B09B Patent application refused [chapter 9.2 patent gazette]
B09B Patent application refused [chapter 9.2 patent gazette]

Free format text: MANTIDO O INDEFERIMENTO UMA VEZ QUE NAO FOI APRESENTADO RECURSO DENTRO DO PRAZO LEGAL