CA2382483A1 - Techniques et compositions permettant de construire et d'utiliser des bibliotheques de fusion - Google Patents

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Abstract

L'invention concerne des bibliothèques d'acides nucléiques de fusion, chacune comprenant des acides nucléiques codant pour un enzyme de modification d'acide nucléique (NAM), et un acide nucléique codant pour une protéine candidate. L'invention concerne également une bibliothèque de polypeptides de fusion comprenant un enzyme de modification d'acide nucléique (NAM), et une protéine candidate, notamment une bibliothèque de vecteurs d'expression, chaque vecteur comprenant i) un acide nucléique de fusion renfermant un acide nucléique codant pour un enzyme de modification d'acide nucléique (NAM), et un acide nucléique codant pour une protéine candidate, et ii) une séquence de fixation d'enzyme (EAS). Il existe au moins deux protéines candidates différentes. L'enzyme NAM est, de préférence, une protéine Rep, et EAS est, de préférence, plus long que 20 nucléotides. De même, des modes de réalisation préférés utilisent des acides nucléiques de fusion comprenant des acides nucléiques codant pour des structures de présentation, des acides nucléiques codant pour des marqueurs, ou des acides nucléiques codant pour des séquences cibles. L'invention concerne également des bibliothèques de conjugués d'acide nucléique/protéine (NAP), chacun renfermant un polypeptide de fusion comprenant un enzyme NAM et une protéine candidate. Les conjugués NAP comprennent également un vecteur d'expression comprenant un acide nucléique de fusion renfermant un acide nucléique codant pour un enzyme NAM, un acide nucléique codant pour une protéine candidate, et une séquence de fixation d'enzyme (EAS) reconnue par l'enzyme NAM. Les enzymes EAS et NAM sont fixés de manière covalente. L'invention concerne enfin des bibliothèques de cellules hôtes et des procédés de criblage.
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Families Citing this family (53)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE69935248T2 (de) 1998-12-02 2007-11-08 Adnexus Therapeutics, Inc., Waltham Dna-protein fusionen sowie anwendungen derselben
US20030036643A1 (en) * 2000-09-14 2003-02-20 Jin Cheng He Methods and compositions for the construction and use of fusion libraries
WO2002022826A2 (fr) * 2000-09-14 2002-03-21 Xencor, Inc. Methodes et compositions de construction et d'utilisation de bibliotheques de fusion
AU2002255451A1 (en) * 2000-12-14 2002-09-04 Xencor Procaryotic libraries and uses
US20030049647A1 (en) * 2001-02-22 2003-03-13 Bassil Dahiyat Use of nucleic acid libraries to create toxicological profiles
AU2002251999A1 (en) * 2001-02-22 2002-09-12 Xencor Methods and compositions for the construction and use of fusion libraries using computational protein design methods
US20020168640A1 (en) * 2001-02-22 2002-11-14 Min Li Biochips comprising nucleic acid/protein conjugates
NZ532635A (en) 2001-11-13 2007-05-31 Univ Pennsylvania A method of identifying unknown adeno-associated virus (AAV) sequences and a kit for the method
WO2003100100A1 (fr) * 2002-05-24 2003-12-04 Somagenics, Inc. Procedes et compositions de production de bibliotheques dirigees de sequences
US20090010920A1 (en) 2003-03-03 2009-01-08 Xencor, Inc. Fc Variants Having Decreased Affinity for FcyRIIb
US9714282B2 (en) 2003-09-26 2017-07-25 Xencor, Inc. Optimized Fc variants and methods for their generation
US8883147B2 (en) 2004-10-21 2014-11-11 Xencor, Inc. Immunoglobulins insertions, deletions, and substitutions
US8399618B2 (en) 2004-10-21 2013-03-19 Xencor, Inc. Immunoglobulin insertions, deletions, and substitutions
EP1701772A4 (fr) 2003-11-21 2012-03-28 Univ Johns Hopkins Motifs de separation biomoleculaire et utilisations
WO2005086679A2 (fr) 2004-03-05 2005-09-22 Medical College Of Ohio Procedes et compositions pour l'evaluation d'acides nucleiques et d'alleles
WO2005106036A2 (fr) 2004-04-12 2005-11-10 Medical College Of Ohio Methodes et compositions pour analyser des analytes
DK1817340T3 (da) 2004-11-12 2012-08-13 Xencor Inc Fc-varianter med ændret binding til fcrn
US8367805B2 (en) 2004-11-12 2013-02-05 Xencor, Inc. Fc variants with altered binding to FcRn
WO2007008943A2 (fr) 2005-07-08 2007-01-18 Xencor, Inc. Proteines optimisees qui ciblent la molecule ep-cam
WO2007041635A2 (fr) 2005-10-03 2007-04-12 Xencor, Inc. Variants de fc dotés de propriétés de liaison aux récepteurs fc optimisées
SI3093345T1 (sl) * 2007-07-26 2019-08-30 Uniqure Ip B.V. Bakulovirusni vektorji, ki vsebujejo ponavljajoča kodirna zaporedja z različnimi kodonskimi preferencami
RU2529951C2 (ru) 2007-12-26 2014-10-10 Ксенкор, Инк. ВАРИАНТЫ Fc С ИЗМЕНЕННЫМ СВЯЗЫВАНИЕМ C FcRn
US12492253B1 (en) 2008-02-25 2025-12-09 Xencor, Inc. Anti-human C5 antibodies
US9493578B2 (en) 2009-09-02 2016-11-15 Xencor, Inc. Compositions and methods for simultaneous bivalent and monovalent co-engagement of antigens
GB2505237A (en) * 2012-08-24 2014-02-26 Stefan Grimm Method of screening for therapeutic agents using cell lines including a reference cell line
WO2015191508A1 (fr) 2014-06-09 2015-12-17 Voyager Therapeutics, Inc. Capsides chimériques
SG11201703148TA (en) 2014-11-05 2017-05-30 Voyager Therapeutics Inc Aadc polynucleotides for the treatment of parkinson's disease
CN119876138A (zh) 2014-11-14 2025-04-25 沃雅戈治疗公司 调节性多核苷酸
CA3193811A1 (fr) 2014-11-14 2016-05-19 Voyager Therapeutics, Inc. Compositions et methodes de traitement de la sclerose laterale amyotrophique (sla)
HK1245326A1 (zh) 2014-12-12 2018-08-24 Voyager Therapeutics, Inc. 用於生产scaav的组合物和方法
ES2938072T3 (es) * 2015-05-11 2023-04-04 Illumina Inc Plataforma para el descubrimiento y análisis de agentes terapéuticos
WO2017096162A1 (fr) 2015-12-02 2017-06-08 Voyager Therapeutics, Inc. Dosages pour la détection d'anticorps neutralisants de vaa
EP3448987A4 (fr) 2016-04-29 2020-05-27 Voyager Therapeutics, Inc. Compositions pour le traitement de maladies
EP3448874A4 (fr) 2016-04-29 2020-04-22 Voyager Therapeutics, Inc. Compositions pour le traitement de maladies
CA3024448C (fr) 2016-05-18 2025-09-09 Voyager Therapeutics, Inc. Polynucleotides modulateurs
CA3024449A1 (fr) 2016-05-18 2017-11-23 Voyager Therapeutics, Inc. Compositions et methodes de traitement de la maladie de huntington
WO2018044933A1 (fr) 2016-08-30 2018-03-08 The Regents Of The University Of California Procédés de ciblage et d'administration biomédicaux, et dispositifs et systèmes pour la mise en œuvre de ceux-ci
GB201702938D0 (en) 2017-02-23 2017-04-12 Univ Southampton Methods of generating and screening compartmentalised peptides libraries
JP2020518259A (ja) 2017-05-05 2020-06-25 ボイジャー セラピューティクス インコーポレイテッドＶｏｙａｇｅｒ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ，Ｉｎｃ． ハンチントン病治療組成物および方法
EP3618839A4 (fr) 2017-05-05 2021-06-09 Voyager Therapeutics, Inc. Compositions et méthodes de traitement de la sclérose latérale amyotrophique (sla)
JOP20190269A1 (ar) 2017-06-15 2019-11-20 Voyager Therapeutics Inc بولي نوكليوتيدات aadc لعلاج مرض باركنسون
JP7229989B2 (ja) 2017-07-17 2023-02-28 ボイジャー セラピューティクス インコーポレイテッド 軌道アレイガイドシステム
JP7221275B2 (ja) 2017-08-03 2023-02-13 ボイジャー セラピューティクス インコーポレイテッド Ａａｖを送達するための組成物および方法
US20200263199A1 (en) 2017-09-29 2020-08-20 Voyager Therapeutics, Inc. Rescue of central and peripheral neurological phenotype of friedreich's ataxia by intravenous delivery
TW202413649A (zh) 2017-10-16 2024-04-01 美商航海家醫療公司 肌萎縮性脊髓側索硬化症(als)之治療
WO2019079242A1 (fr) 2017-10-16 2019-04-25 Voyager Therapeutics, Inc. Traitement de la sclérose latérale amyotrophique (sla)
SG11202011296VA (en) 2018-05-15 2020-12-30 Voyager Therapeutics Inc Compositions and methods for the treatment of parkinson's disease
US12281321B2 (en) 2018-09-28 2025-04-22 Voyager Therapeutics, Inc. Frataxin expression constructs having engineered promoters and methods of use thereof
EP3956467A1 (fr) * 2019-04-16 2022-02-23 F. Hoffmann-La Roche AG Dosage cellulaire de criblage de petites molécules utilisant des billes modifiées
CN110452303B (zh) * 2019-08-08 2022-03-04 中国科学院武汉病毒研究所 共价连接核酸和肽或蛋白的方法及应用
JP7765290B2 (ja) * 2019-12-13 2025-11-06 中外製薬株式会社 細胞外プリン受容体リガンドを検出するシステムおよび当該システムを導入した非ヒト動物
CN111704655A (zh) * 2020-04-24 2020-09-25 吉林农业大学 一种可以诱导鹅胚成纤维细胞凋亡的鹅细小病毒蛋白及其制备方法
CN120424229B (zh) * 2025-03-20 2026-03-31 重庆医科大学附属第二医院 一种荧光融合蛋白及其应用

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5270170A (en) * 1991-10-16 1993-12-14 Affymax Technologies N.V. Peptide library and screening method
US5856090A (en) * 1994-09-09 1999-01-05 The Scripps Research Institute DNA-methylase linking reaction
WO1998023781A1 (fr) * 1996-11-26 1998-06-04 Johns Hopkins University Systeme de detection de ligands et procedes d'utilisation associes

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