CA2960840C - Procedes et systemes pour analyser des donnees de sequencage d'acide nucleique - Google Patents
Procedes et systemes pour analyser des donnees de sequencage d'acide nucleiqueInfo
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Abstract
L'invention concerne un procédé, consistant à recevoir des données de séquençage comprenant une pluralité de lectures d'échantillons qui présentent des séquences correspondantes de nucléotides et à attribuer les lectures d'échantillons à des sites désignés. Le procédé consiste également à analyser les lectures attribuées pour chaque site désigné de manière à identifier des régions correspondantes d'intérêt (region-of-interest - ROI) au sein des lectures attribuées. Chacune des ROI comporte une ou plusieurs séries de motifs récurrents. Le procédé consiste également à trier les lectures attribuées sur base des séquences des ROI, de telle sorte que les ROI présentant des séquences différentes sont attribuées en tant qu'allèles potentiels différents. Le procédé consiste également à analyser, pour les sites désignés présentant des allèles potentiels multiples, les séquences des allèles potentiels afin de déterminer si un premier allèle des allèles potentiels est soupçonné d'être un produit de "bégaiement" (stutter) d'un deuxième allèle des allèles potentiels.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201462052189P | 2014-09-18 | 2014-09-18 | |
| US62/052,189 | 2014-09-18 | ||
| PCT/US2015/050129 WO2016044233A1 (fr) | 2014-09-18 | 2015-09-15 | Procédés et systèmes pour analyser des données de séquençage d'acide nucléique |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CA2960840A1 CA2960840A1 (fr) | 2016-03-24 |
| CA2960840C true CA2960840C (fr) | 2026-04-28 |
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