CZ20021034A3 - Fibrinolyticky aktivní polypeptid - Google Patents
Fibrinolyticky aktivní polypeptid Download PDFInfo
- Publication number
- CZ20021034A3 CZ20021034A3 CZ20021034A CZ20021034A CZ20021034A3 CZ 20021034 A3 CZ20021034 A3 CZ 20021034A3 CZ 20021034 A CZ20021034 A CZ 20021034A CZ 20021034 A CZ20021034 A CZ 20021034A CZ 20021034 A3 CZ20021034 A3 CZ 20021034A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- leu
- ser
- asn
- ala
- asp
- Prior art date
Links
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 title claims abstract description 49
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 title claims abstract description 48
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 title claims abstract description 46
- 230000003480 fibrinolytic effect Effects 0.000 title description 5
- 239000003527 fibrinolytic agent Substances 0.000 title description 3
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 39
- 208000007536 Thrombosis Diseases 0.000 claims abstract description 15
- 108010006035 Metalloproteases Proteins 0.000 claims abstract description 10
- 102000005741 Metalloproteases Human genes 0.000 claims abstract description 10
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims abstract description 10
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 claims abstract description 4
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 68
- 108010090109 Fibrolase Proteins 0.000 claims description 38
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 33
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 13
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 claims description 12
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 12
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 11
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 11
- 241000235058 Komagataella pastoris Species 0.000 claims description 10
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 10
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 10
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 10
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims description 9
- 241000235648 Pichia Species 0.000 claims description 5
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 5
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 claims description 5
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 4
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 claims description 3
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 claims description 3
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 3
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 2
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 claims description 2
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 abstract description 8
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 abstract description 5
- 239000000463 material Substances 0.000 abstract description 4
- 230000002537 thrombolytic effect Effects 0.000 abstract description 3
- 239000003146 anticoagulant agent Substances 0.000 abstract description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 22
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 21
- 241000271510 Agkistrodon contortrix Species 0.000 description 19
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 15
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 13
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 13
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 13
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 13
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 12
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 12
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 12
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 11
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 description 11
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 10
- 241000894007 species Species 0.000 description 9
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 8
- 108010016616 cysteinylglycine Proteins 0.000 description 8
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 8
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 7
- XELISBQUZZAPQK-CIUDSAMLSA-N Cys-His-Cys Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N XELISBQUZZAPQK-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 7
- OXFOKRAFNYSREH-BJDJZHNGSA-N Cys-Ile-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N OXFOKRAFNYSREH-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 7
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 7
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 7
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 7
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 7
- VBDMWOKJZDCFJM-FXQIFTODSA-N Ala-Ala-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)N VBDMWOKJZDCFJM-FXQIFTODSA-N 0.000 description 6
- BMNVSPMWMICFRV-DCAQKATOSA-N Arg-His-Asp Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)CC1=CN=CN1 BMNVSPMWMICFRV-DCAQKATOSA-N 0.000 description 6
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 6
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 6
- IEWBEPKLKUXQBU-VOAKCMCISA-N Leu-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IEWBEPKLKUXQBU-VOAKCMCISA-N 0.000 description 6
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- XERQKTRGJIKTRB-CIUDSAMLSA-N Ser-His-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CO)N)CC1=CN=CN1 XERQKTRGJIKTRB-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 6
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 6
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 6
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 6
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 6
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 6
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 6
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 6
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 6
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 6
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 6
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- MEFILNJXAVSUTO-JXUBOQSCSA-N Ala-Leu-Thr Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MEFILNJXAVSUTO-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 5
- RJUHZPRQRQLCFL-IMJSIDKUSA-N Asn-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RJUHZPRQRQLCFL-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 5
- XLHLPYFMXGOASD-CIUDSAMLSA-N Asn-His-Asp Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N XLHLPYFMXGOASD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 5
- PAWIVEIWWYGBAM-YUMQZZPRSA-N Gly-Leu-Ala Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O PAWIVEIWWYGBAM-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 5
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- KLYYKKGCPOGDPE-OEAJRASXSA-N Phe-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KLYYKKGCPOGDPE-OEAJRASXSA-N 0.000 description 5
- WNQJTLATMXYSEL-OEAJRASXSA-N Thr-Phe-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O WNQJTLATMXYSEL-OEAJRASXSA-N 0.000 description 5
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 5
- 102000003990 Urokinase-type plasminogen activator Human genes 0.000 description 5
- 108090000435 Urokinase-type plasminogen activator Proteins 0.000 description 5
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 5
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 5
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 5
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 5
- 235000004554 glutamine Nutrition 0.000 description 5
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 5
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 5
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 5
- 229960005356 urokinase Drugs 0.000 description 5
- HQJKCXHQNUCKMY-GHCJXIJMSA-N Ala-Ile-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)N HQJKCXHQNUCKMY-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 4
- PEEYDECOOVQKRZ-DLOVCJGASA-N Ala-Ser-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O PEEYDECOOVQKRZ-DLOVCJGASA-N 0.000 description 4
- XTWSWDJMIKUJDQ-RYUDHWBXSA-N Arg-Tyr Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XTWSWDJMIKUJDQ-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 4
- UVTGNSWSRSCPLP-UHFFFAOYSA-N Arg-Tyr Natural products NC(CCNC(=N)N)C(=O)NC(Cc1ccc(O)cc1)C(=O)O UVTGNSWSRSCPLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- NURJSGZGBVJFAD-ZLUOBGJFSA-N Asp-Cys-Ser Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N)C(=O)O NURJSGZGBVJFAD-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 4
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 4
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- QPCVIQJVRGXUSA-LURJTMIESA-N Gly-Gly-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN QPCVIQJVRGXUSA-LURJTMIESA-N 0.000 description 4
- AYBKPDHHVADEDA-YUMQZZPRSA-N Gly-His-Asn Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O AYBKPDHHVADEDA-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 4
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 4
- UCDWNBFOZCZSNV-AVGNSLFASA-N His-Arg-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O UCDWNBFOZCZSNV-AVGNSLFASA-N 0.000 description 4
- SUPVSFFZWVOEOI-UHFFFAOYSA-N Leu-Ala-Tyr Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 SUPVSFFZWVOEOI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- REPBGZHJKYWFMJ-KKUMJFAQSA-N Leu-Lys-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N REPBGZHJKYWFMJ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 4
- PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N Nickel Chemical compound [Ni] PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- NBBJYMSMWIIQGU-UHFFFAOYSA-N Propionic aldehyde Chemical compound CCC=O NBBJYMSMWIIQGU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 4
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 4
- 108010069205 aspartyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 4
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 4
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 4
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 4
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 4
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 4
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 4
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 4
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 4
- 108010051242 phenylalanylserine Proteins 0.000 description 4
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 4
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 4
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 4
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 4
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 3
- 108020005029 5' Flanking Region Proteins 0.000 description 3
- ODHCTXKNWHHXJC-VKHMYHEASA-N 5-oxo-L-proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCC(=O)N1 ODHCTXKNWHHXJC-VKHMYHEASA-N 0.000 description 3
- FXKNPWNXPQZLES-ZLUOBGJFSA-N Ala-Asn-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FXKNPWNXPQZLES-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- DYXOFPBJBAHWFY-JBDRJPRFSA-N Ala-Ser-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](C)N DYXOFPBJBAHWFY-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 3
- JQFZHHSQMKZLRU-IUCAKERBSA-N Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N JQFZHHSQMKZLRU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 3
- HYQYLOSCICEYTR-YUMQZZPRSA-N Asn-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HYQYLOSCICEYTR-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- GZXOUBTUAUAVHD-ACZMJKKPSA-N Asn-Ser-Glu Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O GZXOUBTUAUAVHD-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 3
- HCZQKHSRYHCPSD-IUKAMOBKSA-N Asn-Thr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HCZQKHSRYHCPSD-IUKAMOBKSA-N 0.000 description 3
- PUUPMDXIHCOPJU-HJGDQZAQSA-N Asn-Thr-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)O PUUPMDXIHCOPJU-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 3
- UXHYOWXTJLBEPG-GSSVUCPTSA-N Asn-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UXHYOWXTJLBEPG-GSSVUCPTSA-N 0.000 description 3
- FHCRKXCTKSHNOE-QEJZJMRPSA-N Asn-Trp-Glu Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N FHCRKXCTKSHNOE-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 3
- HSPSXROIMXIJQW-BQBZGAKWSA-N Asp-His Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 HSPSXROIMXIJQW-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- ICZWAZVKLACMKR-CIUDSAMLSA-N Asp-His-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O)CC1=CN=CN1 ICZWAZVKLACMKR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- RQHLMGCXCZUOGT-ZPFDUUQYSA-N Asp-Leu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O RQHLMGCXCZUOGT-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 3
- BRRPVTUFESPTCP-ACZMJKKPSA-N Asp-Ser-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O BRRPVTUFESPTCP-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 3
- KNDCWFXCFKSEBM-AVGNSLFASA-N Asp-Tyr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KNDCWFXCFKSEBM-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- CZIVKMOEXPILDK-SRVKXCTJSA-N Asp-Tyr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CZIVKMOEXPILDK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- WZJLBUPPZRZNTO-CIUDSAMLSA-N Cys-Ser-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CS)N WZJLBUPPZRZNTO-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- JZDHUJAFXGNDSB-WHFBIAKZSA-N Glu-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JZDHUJAFXGNDSB-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- LKDIBBOKUAASNP-FXQIFTODSA-N Glu-Ala-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O LKDIBBOKUAASNP-FXQIFTODSA-N 0.000 description 3
- TUTIHHSZKFBMHM-WHFBIAKZSA-N Glu-Asn Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O TUTIHHSZKFBMHM-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- YKLNMGJYMNPBCP-ACZMJKKPSA-N Glu-Asn-Asp Chemical compound C(CC(=O)O)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N YKLNMGJYMNPBCP-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 3
- RTOOAKXIJADOLL-GUBZILKMSA-N Glu-Asp-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N RTOOAKXIJADOLL-GUBZILKMSA-N 0.000 description 3
- BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- BRFJMRSRMOMIMU-WHFBIAKZSA-N Gly-Ala-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BRFJMRSRMOMIMU-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- OGCIHJPYKVSMTE-YUMQZZPRSA-N Gly-Arg-Glu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OGCIHJPYKVSMTE-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- RPLLQZBOVIVGMX-QWRGUYRKSA-N Gly-Asp-Phe Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O RPLLQZBOVIVGMX-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N Gly-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N Gly-Leu-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- TVUWMSBGMVAHSJ-KBPBESRZSA-N Gly-Leu-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 TVUWMSBGMVAHSJ-KBPBESRZSA-N 0.000 description 3
- VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N Glycyl-alanine Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 3
- JATYGDHMDRAISQ-KKUMJFAQSA-N His-Tyr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O JATYGDHMDRAISQ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 3
- XENGULNPUDGALZ-ZPFDUUQYSA-N Ile-Asn-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N XENGULNPUDGALZ-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 3
- NCSIQAFSIPHVAN-IUKAMOBKSA-N Ile-Asn-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N NCSIQAFSIPHVAN-IUKAMOBKSA-N 0.000 description 3
- UCGDDTHMMVWVMV-FSPLSTOPSA-N Ile-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O UCGDDTHMMVWVMV-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 3
- VEPIBPGLTLPBDW-URLPEUOOSA-N Ile-Phe-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N VEPIBPGLTLPBDW-URLPEUOOSA-N 0.000 description 3
- RCFDOSNHHZGBOY-UHFFFAOYSA-N L-isoleucyl-L-alanine Natural products CCC(C)C(N)C(=O)NC(C)C(O)=O RCFDOSNHHZGBOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N L-leucyl-L-arginine Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- OXKYZSRZKBTVEY-ZPFDUUQYSA-N Leu-Asn-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O OXKYZSRZKBTVEY-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 3
- JKGHDYGZRDWHGA-SRVKXCTJSA-N Leu-Asn-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O JKGHDYGZRDWHGA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- QVFGXCVIXXBFHO-AVGNSLFASA-N Leu-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O QVFGXCVIXXBFHO-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- HQUXQAMSWFIRET-AVGNSLFASA-N Leu-Glu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN HQUXQAMSWFIRET-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N 0.000 description 3
- QPXBPQUGXHURGP-UWVGGRQHSA-N Leu-Gly-Met Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N QPXBPQUGXHURGP-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 3
- LVTJJOJKDCVZGP-QWRGUYRKSA-N Leu-Lys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O LVTJJOJKDCVZGP-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- ZDBMWELMUCLUPL-QEJZJMRPSA-N Leu-Phe-Ala Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ZDBMWELMUCLUPL-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 3
- IZPVWNSAVUQBGP-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O IZPVWNSAVUQBGP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- PBIPLDMFHAICIP-DCAQKATOSA-N Lys-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O PBIPLDMFHAICIP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 3
- XOQMURBBIXRRCR-SRVKXCTJSA-N Lys-Lys-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN XOQMURBBIXRRCR-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- TYEJPFJNAHIKRT-DCAQKATOSA-N Lys-Met-Cys Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N TYEJPFJNAHIKRT-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- PELXPRPDQRFBGQ-KKUMJFAQSA-N Lys-Tyr-Asn Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)O PELXPRPDQRFBGQ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 3
- XYLSGAWRCZECIQ-JYJNAYRXSA-N Lys-Tyr-Glu Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XYLSGAWRCZECIQ-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 3
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 3
- MUYQDMBLDFEVRJ-LSJOCFKGSA-N Met-Ala-His Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 MUYQDMBLDFEVRJ-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 3
- FZDOBWIKRQORAC-ULQDDVLXSA-N Met-Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](CCSC)N FZDOBWIKRQORAC-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 3
- NSTPXGARCQOSAU-VIFPVBQESA-N N-formyl-L-phenylalanine Chemical compound O=CN[C@H](C(=O)O)CC1=CC=CC=C1 NSTPXGARCQOSAU-VIFPVBQESA-N 0.000 description 3
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 3
- 108010002311 N-glycylglutamic acid Proteins 0.000 description 3
- KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M Potassium hydroxide Chemical compound [OH-].[K+] KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- ODHCTXKNWHHXJC-GSVOUGTGSA-N Pyroglutamic acid Natural products OC(=O)[C@H]1CCC(=O)N1 ODHCTXKNWHHXJC-GSVOUGTGSA-N 0.000 description 3
- BKOKTRCZXRIQPX-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ala-Cys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N BKOKTRCZXRIQPX-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- HRNQLKCLPVKZNE-CIUDSAMLSA-N Ser-Ala-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HRNQLKCLPVKZNE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- RDFQNDHEHVSONI-ZLUOBGJFSA-N Ser-Asn-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RDFQNDHEHVSONI-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N Ser-Asp Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 3
- HBTCFCHYALPXME-HTFCKZLJSA-N Ser-Ile-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HBTCFCHYALPXME-HTFCKZLJSA-N 0.000 description 3
- ZIFYDQAFEMIZII-GUBZILKMSA-N Ser-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZIFYDQAFEMIZII-GUBZILKMSA-N 0.000 description 3
- XUDRHBPSPAPDJP-SRVKXCTJSA-N Ser-Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CO XUDRHBPSPAPDJP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- XJDMUQCLVSCRSJ-VZFHVOOUSA-N Ser-Thr-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O XJDMUQCLVSCRSJ-VZFHVOOUSA-N 0.000 description 3
- PURRNJBBXDDWLX-ZDLURKLDSA-N Ser-Thr-Gly Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)O PURRNJBBXDDWLX-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 3
- QYBRQMLZDDJBSW-AVGNSLFASA-N Ser-Tyr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O QYBRQMLZDDJBSW-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- LGNBRHZANHMZHK-NUMRIWBASA-N Thr-Glu-Asp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N)O LGNBRHZANHMZHK-NUMRIWBASA-N 0.000 description 3
- HYNAKPYFEYJMAS-XIRDDKMYSA-N Trp-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HYNAKPYFEYJMAS-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 3
- GFHYISDTIWZUSU-QWRGUYRKSA-N Tyr-Asn-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O GFHYISDTIWZUSU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- HDSKHCBAVVWPCQ-FHWLQOOXSA-N Tyr-Glu-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O HDSKHCBAVVWPCQ-FHWLQOOXSA-N 0.000 description 3
- MVYRJYISVJWKSX-KBPBESRZSA-N Tyr-His-Gly Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)NCC(=O)O)N)O MVYRJYISVJWKSX-KBPBESRZSA-N 0.000 description 3
- CNNVVEPJTFOGHI-ACRUOGEOSA-N Tyr-Lys-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O CNNVVEPJTFOGHI-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 3
- GQVZBMROTPEPIF-SRVKXCTJSA-N Tyr-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O GQVZBMROTPEPIF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- 108010084455 Zeocin Proteins 0.000 description 3
- ODHCTXKNWHHXJC-UHFFFAOYSA-N acide pyroglutamique Natural products OC(=O)C1CCC(=O)N1 ODHCTXKNWHHXJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010011559 alanylphenylalanine Proteins 0.000 description 3
- 108010013835 arginine glutamate Proteins 0.000 description 3
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 3
- 108010068265 aspartyltyrosine Proteins 0.000 description 3
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 3
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 3
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 3
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 3
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 3
- 108010069495 cysteinyltyrosine Proteins 0.000 description 3
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 3
- 108010080575 glutamyl-aspartyl-alanine Proteins 0.000 description 3
- HPAIKDPJURGQLN-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-histidyl-L-phenylalanine Natural products C=1C=CC=CC=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(NC(=O)CN)CC1=CN=CN1 HPAIKDPJURGQLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010066198 glycyl-leucyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 3
- 230000002008 hemorrhagic effect Effects 0.000 description 3
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 3
- 238000009776 industrial production Methods 0.000 description 3
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 description 3
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 3
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 3
- 230000006320 pegylation Effects 0.000 description 3
- CWCMIVBLVUHDHK-ZSNHEYEWSA-N phleomycin D1 Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)NCCC=1SC[C@@H](N=1)C=1SC=C(N=1)C(=O)NCCCCNC(N)=N)[C@@H](O[C@H]1[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1)O[C@@H]1[C@H]([C@@H](OC(N)=O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)C=1N=CNC=1)C(=O)C1=NC([C@H](CC(N)=O)NC[C@H](N)C(N)=O)=NC(N)=C1C CWCMIVBLVUHDHK-ZSNHEYEWSA-N 0.000 description 3
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 3
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 3
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 3
- 108010048397 seryl-lysyl-leucine Proteins 0.000 description 3
- FVAUCKIRQBBSSJ-UHFFFAOYSA-M sodium iodide Chemical compound [Na+].[I-] FVAUCKIRQBBSSJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 3
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 3
- 229920003169 water-soluble polymer Polymers 0.000 description 3
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 2
- LZRNYBIJOSKKRJ-XVYDVKMFSA-N Ala-Asp-His Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N LZRNYBIJOSKKRJ-XVYDVKMFSA-N 0.000 description 2
- GRPHQEMIFDPKOE-HGNGGELXSA-N Ala-His-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O GRPHQEMIFDPKOE-HGNGGELXSA-N 0.000 description 2
- IFKQPMZRDQZSHI-GHCJXIJMSA-N Ala-Ile-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O IFKQPMZRDQZSHI-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 2
- 102100033312 Alpha-2-macroglobulin Human genes 0.000 description 2
- NXDXECQFKHXHAM-HJGDQZAQSA-N Arg-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O NXDXECQFKHXHAM-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 2
- LXMKTIZAGIBQRX-HRCADAONSA-N Arg-Phe-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O LXMKTIZAGIBQRX-HRCADAONSA-N 0.000 description 2
- AUIJUTGLPVHIRT-FXQIFTODSA-N Arg-Ser-Cys Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)CN=C(N)N AUIJUTGLPVHIRT-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- JPAWCMXVNZPJLO-IHRRRGAJSA-N Arg-Ser-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O JPAWCMXVNZPJLO-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- MSBDSTRUMZFSEU-PEFMBERDSA-N Asn-Glu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O MSBDSTRUMZFSEU-PEFMBERDSA-N 0.000 description 2
- UJGRZQYSNYTCAX-SRVKXCTJSA-N Asp-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O UJGRZQYSNYTCAX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- HJCGDIGVVWETRO-ZPFDUUQYSA-N Asp-Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O)C(O)=O HJCGDIGVVWETRO-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 2
- WOPJVEMFXYHZEE-SRVKXCTJSA-N Asp-Phe-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WOPJVEMFXYHZEE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 2
- 102000008946 Fibrinogen Human genes 0.000 description 2
- 108010049003 Fibrinogen Proteins 0.000 description 2
- XXCDTYBVGMPIOA-FXQIFTODSA-N Glu-Asp-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XXCDTYBVGMPIOA-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- KRRFFAHEAOCBCQ-SIUGBPQLSA-N Glu-Ile-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O KRRFFAHEAOCBCQ-SIUGBPQLSA-N 0.000 description 2
- GNBMOZPQUXTCRW-STQMWFEESA-N Gly-Asn-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 GNBMOZPQUXTCRW-STQMWFEESA-N 0.000 description 2
- LCNXZQROPKFGQK-WHFBIAKZSA-N Gly-Asp-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O LCNXZQROPKFGQK-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- QLQDIJBYJZKQPR-BQBZGAKWSA-N Gly-Met-Cys Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)CN QLQDIJBYJZKQPR-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- 102000001554 Hemoglobins Human genes 0.000 description 2
- 108010054147 Hemoglobins Proteins 0.000 description 2
- JWTKVPMQCCRPQY-SRVKXCTJSA-N His-Asn-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O JWTKVPMQCCRPQY-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- WZOGEMJIZBNFBK-CIUDSAMLSA-N His-Asp-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O WZOGEMJIZBNFBK-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- FIMNVXRZGUAGBI-AVGNSLFASA-N His-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FIMNVXRZGUAGBI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- 108010093488 His-His-His-His-His-His Proteins 0.000 description 2
- KAXZXLSXFWSNNZ-XVYDVKMFSA-N His-Ser-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KAXZXLSXFWSNNZ-XVYDVKMFSA-N 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- DRCKHKZYDLJYFQ-YWIQKCBGSA-N Ile-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DRCKHKZYDLJYFQ-YWIQKCBGSA-N 0.000 description 2
- ZYVTXBXHIKGZMD-QSFUFRPTSA-N Ile-Val-Asn Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N ZYVTXBXHIKGZMD-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 2
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- HPBCTWSUJOGJSH-MNXVOIDGSA-N Leu-Glu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HPBCTWSUJOGJSH-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 2
- XWOBNBRUDDUEEY-UWVGGRQHSA-N Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 XWOBNBRUDDUEEY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- XBCWOTOCBXXJDG-BZSNNMDCSA-N Leu-His-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 XBCWOTOCBXXJDG-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- DSFYPIUSAMSERP-IHRRRGAJSA-N Leu-Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N DSFYPIUSAMSERP-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- MXMDJEJWERYPMO-XUXIUFHCSA-N Lys-Ile-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O MXMDJEJWERYPMO-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 2
- WVJNGSFKBKOKRV-AJNGGQMLSA-N Lys-Leu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O WVJNGSFKBKOKRV-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 2
- XIZQPFCRXLUNMK-BZSNNMDCSA-N Lys-Leu-Phe Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N XIZQPFCRXLUNMK-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- ALGGDNMLQNFVIZ-SRVKXCTJSA-N Lys-Lys-Asp Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N ALGGDNMLQNFVIZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 2
- CSYVXYQDIVCQNU-QWRGUYRKSA-N Phe-Asp-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O CSYVXYQDIVCQNU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- 239000004372 Polyvinyl alcohol Substances 0.000 description 2
- 108010015078 Pregnancy-Associated alpha 2-Macroglobulins Proteins 0.000 description 2
- WTWGOQRNRFHFQD-JBDRJPRFSA-N Ser-Ala-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O WTWGOQRNRFHFQD-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 2
- LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N Ser-Asn Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- BYIROAKULFFTEK-CIUDSAMLSA-N Ser-Asp-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO BYIROAKULFFTEK-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- BPMRXBZYPGYPJN-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BPMRXBZYPGYPJN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- XKFJENWJGHMDLI-QWRGUYRKSA-N Ser-Phe-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(O)=O XKFJENWJGHMDLI-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 2
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 2
- NLSNVZAREYQMGR-HJGDQZAQSA-N Thr-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NLSNVZAREYQMGR-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 2
- PAXANSWUSVPFNK-IUKAMOBKSA-N Thr-Ile-Asn Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)N PAXANSWUSVPFNK-IUKAMOBKSA-N 0.000 description 2
- BVOVIGCHYNFJBZ-JXUBOQSCSA-N Thr-Leu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O BVOVIGCHYNFJBZ-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 2
- WCRFXRIWBFRZBR-GGVZMXCHSA-N Thr-Tyr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 WCRFXRIWBFRZBR-GGVZMXCHSA-N 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 239000011149 active material Substances 0.000 description 2
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 2
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 2
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 2
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 2
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 2
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 2
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 2
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 2
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010092854 aspartyllysine Proteins 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- ZTQSAGDEMFDKMZ-UHFFFAOYSA-N butyric aldehyde Natural products CCCC=O ZTQSAGDEMFDKMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OSGAYBCDTDRGGQ-UHFFFAOYSA-L calcium sulfate Chemical compound [Ca+2].[O-]S([O-])(=O)=O OSGAYBCDTDRGGQ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 210000001715 carotid artery Anatomy 0.000 description 2
- 125000003636 chemical group Chemical group 0.000 description 2
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 2
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 2
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 description 2
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 2
- 229940012952 fibrinogen Drugs 0.000 description 2
- 125000000404 glutamine group Chemical group N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)* 0.000 description 2
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 2
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- 108010025306 histidylleucine Proteins 0.000 description 2
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 description 2
- 229920001519 homopolymer Polymers 0.000 description 2
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 2
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 2
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 2
- 108010044374 isoleucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 2
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 2
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 2
- DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N monopropylene glycol Natural products CC(O)CO DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 210000004897 n-terminal region Anatomy 0.000 description 2
- 229910052759 nickel Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 2
- 210000001322 periplasm Anatomy 0.000 description 2
- 229920002451 polyvinyl alcohol Polymers 0.000 description 2
- 229920000036 polyvinylpyrrolidone Polymers 0.000 description 2
- 239000001267 polyvinylpyrrolidone Substances 0.000 description 2
- 235000013855 polyvinylpyrrolidone Nutrition 0.000 description 2
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 230000009465 prokaryotic expression Effects 0.000 description 2
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 2
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 2
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 2
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 2
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 2
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 2
- 239000003998 snake venom Substances 0.000 description 2
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 2
- 238000007910 systemic administration Methods 0.000 description 2
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 2
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 2
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 2
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 2
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- JIAARYAFYJHUJI-UHFFFAOYSA-L zinc dichloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Zn+2] JIAARYAFYJHUJI-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- XSYUPRQVAHJETO-WPMUBMLPSA-N (2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidaz Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 XSYUPRQVAHJETO-WPMUBMLPSA-N 0.000 description 1
- IGXNPQWXIRIGBF-KEOOTSPTSA-N (2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoic acid Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 IGXNPQWXIRIGBF-KEOOTSPTSA-N 0.000 description 1
- ASWBNKHCZGQVJV-UHFFFAOYSA-N (3-hexadecanoyloxy-2-hydroxypropyl) 2-(trimethylazaniumyl)ethyl phosphate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OCC(O)COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C ASWBNKHCZGQVJV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- -1 (alum) Substances 0.000 description 1
- CXCHEKCRJQRVNG-UHFFFAOYSA-N 2,2,2-trifluoroethanesulfonyl chloride Chemical compound FC(F)(F)CS(Cl)(=O)=O CXCHEKCRJQRVNG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UFBJCMHMOXMLKC-UHFFFAOYSA-N 2,4-dinitrophenol Chemical compound OC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1[N+]([O-])=O UFBJCMHMOXMLKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000271045 Agkistrodon contortrix contortrix Species 0.000 description 1
- 101000774685 Agkistrodon contortrix contortrix Snake venom metalloproteinase fibrolase Proteins 0.000 description 1
- YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- ALZVPLKYDKJKQU-XVKPBYJWSA-N Ala-Tyr Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 ALZVPLKYDKJKQU-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HJAICMSAKODKRF-GUBZILKMSA-N Arg-Cys-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O HJAICMSAKODKRF-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- XLWSGICNBZGYTA-CIUDSAMLSA-N Arg-Glu-Asp Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O XLWSGICNBZGYTA-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- PYZPXCZNQSEHDT-GUBZILKMSA-N Arg-Met-Asn Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N PYZPXCZNQSEHDT-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- PQBHGSGQZSOLIR-RYUDHWBXSA-N Arg-Phe Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PQBHGSGQZSOLIR-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- NGYHSXDNNOFHNE-AVGNSLFASA-N Arg-Pro-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NGYHSXDNNOFHNE-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- XMZZGVGKGXRIGJ-JYJNAYRXSA-N Arg-Tyr-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O XMZZGVGKGXRIGJ-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- SJUXYGVRSGTPMC-IMJSIDKUSA-N Asn-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O SJUXYGVRSGTPMC-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- WIDVAWAQBRAKTI-YUMQZZPRSA-N Asn-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O WIDVAWAQBRAKTI-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- GLWFAWNYGWBMOC-SRVKXCTJSA-N Asn-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O GLWFAWNYGWBMOC-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- QJMCHPGWFZZRID-BQBZGAKWSA-N Asn-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O QJMCHPGWFZZRID-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- KYQJHBWHRASMKG-ZLUOBGJFSA-N Asn-Ser-Cys Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O KYQJHBWHRASMKG-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- VBKIFHUVGLOJKT-FKZODXBYSA-N Asn-Thr Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)O VBKIFHUVGLOJKT-FKZODXBYSA-N 0.000 description 1
- FLJVGAFLZVBBNG-BPUTZDHNSA-N Asn-Trp-Arg Chemical compound N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](Cc1c[nH]c2ccccc12)C(=O)N[C@@H](CCCNC(=N)N)C(=O)O FLJVGAFLZVBBNG-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 1
- VAWNQIGQPUOPQW-ACZMJKKPSA-N Asp-Glu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VAWNQIGQPUOPQW-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- WBDWQKRLTVCDSY-WHFBIAKZSA-N Asp-Gly-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WBDWQKRLTVCDSY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- WYOSXGYAKZQPGF-SRVKXCTJSA-N Asp-His-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N WYOSXGYAKZQPGF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- YZQCXOFQZKCETR-UWVGGRQHSA-N Asp-Phe Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 YZQCXOFQZKCETR-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- CUQDCPXNZPDYFQ-ZLUOBGJFSA-N Asp-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O CUQDCPXNZPDYFQ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N Asp-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 1
- NALWOULWGHTVDA-UWVGGRQHSA-N Asp-Tyr Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 NALWOULWGHTVDA-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-N Aspirin Chemical compound CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(O)=O BSYNRYMUTXBXSQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- 101000851165 Bothrops pirajai Snake venom metalloproteinase BpirMP Proteins 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 125000001433 C-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 229920002134 Carboxymethyl cellulose Polymers 0.000 description 1
- 206010048964 Carotid artery occlusion Diseases 0.000 description 1
- 101100007328 Cocos nucifera COS-1 gene Proteins 0.000 description 1
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N Copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 1
- YXQDRIRSAHTJKM-IMJSIDKUSA-N Cys-Ser Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YXQDRIRSAHTJKM-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- GGRDJANMZPGMNS-CIUDSAMLSA-N Cys-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O GGRDJANMZPGMNS-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- IAYPIBMASNFSPL-UHFFFAOYSA-N Ethylene oxide Chemical compound C1CO1 IAYPIBMASNFSPL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- 102000009123 Fibrin Human genes 0.000 description 1
- 108010073385 Fibrin Proteins 0.000 description 1
- BWGVNKXGVNDBDI-UHFFFAOYSA-N Fibrin monomer Chemical compound CNC(=O)CNC(=O)CN BWGVNKXGVNDBDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IYAUFWMUCGBFMQ-CIUDSAMLSA-N Glu-Arg-Cys Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)CN=C(N)N IYAUFWMUCGBFMQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- NKLRYVLERDYDBI-FXQIFTODSA-N Glu-Glu-Asp Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NKLRYVLERDYDBI-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- ZCFNZTVIDMLUQC-SXNHZJKMSA-N Glu-Ile-Trp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N ZCFNZTVIDMLUQC-SXNHZJKMSA-N 0.000 description 1
- IRXNJYPKBVERCW-DCAQKATOSA-N Glu-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IRXNJYPKBVERCW-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N Gly-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- PMNHJLASAAWELO-FOHZUACHSA-N Gly-Asp-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PMNHJLASAAWELO-FOHZUACHSA-N 0.000 description 1
- FSPVILZGHUJOHS-QWRGUYRKSA-N Gly-His-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CNC=N1 FSPVILZGHUJOHS-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- ZVXMEWXHFBYJPI-LSJOCFKGSA-N Gly-Val-Ile Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O ZVXMEWXHFBYJPI-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- 102000004457 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Human genes 0.000 description 1
- 108010017213 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 1
- 101710154606 Hemagglutinin Proteins 0.000 description 1
- HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N Heparin Chemical compound OC1C(NC(=O)C)C(O)OC(COS(O)(=O)=O)C1OC1C(OS(O)(=O)=O)C(O)C(OC2C(C(OS(O)(=O)=O)C(OC3C(C(O)C(O)C(O3)C(O)=O)OS(O)(=O)=O)C(CO)O2)NS(O)(=O)=O)C(C(O)=O)O1 HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LSQHWKPPOFDHHZ-YUMQZZPRSA-N His-Asp-Gly Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)NCC(=O)O)N LSQHWKPPOFDHHZ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- YOSQCYUFZGPIPC-PBCZWWQYSA-N His-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O YOSQCYUFZGPIPC-PBCZWWQYSA-N 0.000 description 1
- SKYULSWNBYAQMG-IHRRRGAJSA-N His-Leu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O SKYULSWNBYAQMG-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- ILUVWFTXAUYOBW-CUJWVEQBSA-N His-Ser-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N)O ILUVWFTXAUYOBW-CUJWVEQBSA-N 0.000 description 1
- HYXQKVOADYPQEA-CIUDSAMLSA-N Ile-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N HYXQKVOADYPQEA-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- SCHZQZPYHBWYEQ-PEFMBERDSA-N Ile-Asn-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N SCHZQZPYHBWYEQ-PEFMBERDSA-N 0.000 description 1
- GAZGFPOZOLEYAJ-YTFOTSKYSA-N Ile-Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)O)N GAZGFPOZOLEYAJ-YTFOTSKYSA-N 0.000 description 1
- QHUREMVLLMNUAX-OSUNSFLBSA-N Ile-Thr-Val Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N QHUREMVLLMNUAX-OSUNSFLBSA-N 0.000 description 1
- HQLSBZFLOUHQJK-STECZYCISA-N Ile-Tyr-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N HQLSBZFLOUHQJK-STECZYCISA-N 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- BQSLGJHIAGOZCD-CIUDSAMLSA-N Leu-Ala-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BQSLGJHIAGOZCD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- SUPVSFFZWVOEOI-CQDKDKBSSA-N Leu-Ala-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 SUPVSFFZWVOEOI-CQDKDKBSSA-N 0.000 description 1
- NTRAGDHVSGKUSF-AVGNSLFASA-N Leu-Arg-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O NTRAGDHVSGKUSF-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- FJUKMPUELVROGK-IHRRRGAJSA-N Leu-Arg-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N FJUKMPUELVROGK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- OGCQGUIWMSBHRZ-CIUDSAMLSA-N Leu-Asn-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O OGCQGUIWMSBHRZ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- OYQUOLRTJHWVSQ-SRVKXCTJSA-N Leu-His-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O OYQUOLRTJHWVSQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- HNDWYLYAYNBWMP-AJNGGQMLSA-N Leu-Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N HNDWYLYAYNBWMP-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 1
- LIINDKYIGYTDLG-PPCPHDFISA-N Leu-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LIINDKYIGYTDLG-PPCPHDFISA-N 0.000 description 1
- JKSIBWITFMQTOA-XUXIUFHCSA-N Leu-Ile-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O JKSIBWITFMQTOA-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- OTXBNHIUIHNGAO-UWVGGRQHSA-N Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN OTXBNHIUIHNGAO-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- KPYAOIVPJKPIOU-KKUMJFAQSA-N Leu-Lys-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O KPYAOIVPJKPIOU-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- PTRKPHUGYULXPU-KKUMJFAQSA-N Leu-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PTRKPHUGYULXPU-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N Leu-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- 239000006137 Luria-Bertani broth Substances 0.000 description 1
- CKSXSQUVEYCDIW-AVGNSLFASA-N Lys-Arg-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCCN)N CKSXSQUVEYCDIW-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- NTBFKPBULZGXQL-KKUMJFAQSA-N Lys-Asp-Tyr Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 NTBFKPBULZGXQL-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- PGLGNCVOWIORQE-SRVKXCTJSA-N Lys-His-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PGLGNCVOWIORQE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N Magnesium Chemical compound [Mg] FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YRAWWKUTNBILNT-FXQIFTODSA-N Met-Ala-Ala Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O YRAWWKUTNBILNT-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- BQVJARUIXRXDKN-DCAQKATOSA-N Met-Asn-His Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 BQVJARUIXRXDKN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- HDNOQCZWJGGHSS-VEVYYDQMSA-N Met-Asn-Thr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O HDNOQCZWJGGHSS-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- NDYNTQWSJLPEMK-WDSKDSINSA-N Met-Cys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O NDYNTQWSJLPEMK-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 1
- 101710135898 Myc proto-oncogene protein Proteins 0.000 description 1
- 102100038895 Myc proto-oncogene protein Human genes 0.000 description 1
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000729 N-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 101710093908 Outer capsid protein VP4 Proteins 0.000 description 1
- 101710135467 Outer capsid protein sigma-1 Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- FRPVPGRXUKFEQE-YDHLFZDLSA-N Phe-Asp-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O FRPVPGRXUKFEQE-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- KDYPMIZMXDECSU-JYJNAYRXSA-N Phe-Leu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 KDYPMIZMXDECSU-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- INHMISZWLJZQGH-ULQDDVLXSA-N Phe-Leu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 INHMISZWLJZQGH-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- FENSZYFJQOFSQR-FIRPJDEBSA-N Phe-Phe-Ile Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FENSZYFJQOFSQR-FIRPJDEBSA-N 0.000 description 1
- XDMMOISUAHXXFD-SRVKXCTJSA-N Phe-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O XDMMOISUAHXXFD-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 102000001938 Plasminogen Activators Human genes 0.000 description 1
- 108010001014 Plasminogen Activators Proteins 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 1
- SXJOPONICMGFCR-DCAQKATOSA-N Pro-Ser-Lys Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O SXJOPONICMGFCR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- 101710118538 Protease Proteins 0.000 description 1
- 101710176177 Protein A56 Proteins 0.000 description 1
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 1
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 1
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 1
- 239000012980 RPMI-1640 medium Substances 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- 101001007682 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) Kexin Proteins 0.000 description 1
- 108091081021 Sense strand Proteins 0.000 description 1
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 1
- SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N Ser-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CO SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- SWIQQMYVHIXPEK-FXQIFTODSA-N Ser-Cys-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O SWIQQMYVHIXPEK-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- GYXVUTAOICLGKJ-ACZMJKKPSA-N Ser-Glu-Cys Chemical compound C(CC(=O)O)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N GYXVUTAOICLGKJ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N Ser-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- SVWQEIRZHHNBIO-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Cys Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O SVWQEIRZHHNBIO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- SBMNPABNWKXNBJ-BQBZGAKWSA-N Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO SBMNPABNWKXNBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 241000187747 Streptomyces Species 0.000 description 1
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 1
- 208000036064 Surgical Blood Loss Diseases 0.000 description 1
- PXQUBKWZENPDGE-CIQUZCHMSA-N Thr-Ala-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)N PXQUBKWZENPDGE-CIQUZCHMSA-N 0.000 description 1
- IHAPJUHCZXBPHR-WZLNRYEVSA-N Thr-Ile-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)N IHAPJUHCZXBPHR-WZLNRYEVSA-N 0.000 description 1
- BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- UJQVSMNQMQHVRY-KZVJFYERSA-N Thr-Met-Ala Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O UJQVSMNQMQHVRY-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- IQHUITKNHOKGFC-MIMYLULJSA-N Thr-Phe Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 IQHUITKNHOKGFC-MIMYLULJSA-N 0.000 description 1
- IEZVHOULSUULHD-XGEHTFHBSA-N Thr-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O IEZVHOULSUULHD-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- 101710150448 Transcriptional regulator Myc Proteins 0.000 description 1
- VNRTXOUAOUZCFW-WDSOQIARSA-N Trp-Val-His Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](N)Cc1c[nH]c2ccccc12)C(=O)N[C@@H](Cc1cnc[nH]1)C(O)=O VNRTXOUAOUZCFW-WDSOQIARSA-N 0.000 description 1
- JXGUUJMPCRXMSO-HJOGWXRNSA-N Tyr-Phe-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 JXGUUJMPCRXMSO-HJOGWXRNSA-N 0.000 description 1
- BYOHPUZJVXWHAE-BYULHYEWSA-N Val-Asn-Asn Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N BYOHPUZJVXWHAE-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- KDKLLPMFFGYQJD-CYDGBPFRSA-N Val-Ile-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N KDKLLPMFFGYQJD-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 description 1
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001138 acetylsalicylic acid Drugs 0.000 description 1
- 230000001154 acute effect Effects 0.000 description 1
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 108010070944 alanylhistidine Proteins 0.000 description 1
- 108010070783 alanyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 125000003172 aldehyde group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001299 aldehydes Chemical class 0.000 description 1
- 230000029936 alkylation Effects 0.000 description 1
- 238000005804 alkylation reaction Methods 0.000 description 1
- 229940037003 alum Drugs 0.000 description 1
- WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K aluminium hydroxide Chemical compound [OH-].[OH-].[OH-].[Al+3] WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000908 ammonium hydroxide Substances 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 125000000637 arginyl group Chemical group N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)* 0.000 description 1
- 108010060035 arginylproline Proteins 0.000 description 1
- 210000001367 artery Anatomy 0.000 description 1
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N aspartic acid group Chemical group N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- 230000017531 blood circulation Effects 0.000 description 1
- 230000036765 blood level Effects 0.000 description 1
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 1
- KGBXLFKZBHKPEV-UHFFFAOYSA-N boric acid Chemical compound OB(O)O KGBXLFKZBHKPEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004327 boric acid Substances 0.000 description 1
- 239000008366 buffered solution Substances 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 239000001175 calcium sulphate Substances 0.000 description 1
- 235000011132 calcium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 1
- 239000001768 carboxy methyl cellulose Substances 0.000 description 1
- 235000010948 carboxy methyl cellulose Nutrition 0.000 description 1
- 239000008112 carboxymethyl-cellulose Substances 0.000 description 1
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 1
- 239000006143 cell culture medium Substances 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- GFHNAMRJFCEERV-UHFFFAOYSA-L cobalt chloride hexahydrate Chemical compound O.O.O.O.O.O.[Cl-].[Cl-].[Co+2] GFHNAMRJFCEERV-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000003636 conditioned culture medium Substances 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 229910052802 copper Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 1
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 1
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 1
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 1
- 229940068840 d-biotin Drugs 0.000 description 1
- 230000009615 deamination Effects 0.000 description 1
- 238000006481 deamination reaction Methods 0.000 description 1
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 1
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 1
- 238000003936 denaturing gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000009795 derivation Methods 0.000 description 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 239000012470 diluted sample Substances 0.000 description 1
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 1
- 210000001840 diploid cell Anatomy 0.000 description 1
- 231100000673 dose–response relationship Toxicity 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 1
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 1
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 1
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 1
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 1
- YYXLGGIKSIZHSF-UHFFFAOYSA-N ethene;furan-2,5-dione Chemical compound C=C.O=C1OC(=O)C=C1 YYXLGGIKSIZHSF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 1
- 229950003499 fibrin Drugs 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 125000000291 glutamic acid group Chemical group N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)* 0.000 description 1
- 108010057083 glutamyl-aspartyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N glycylglycine Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC([O-])=O YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 1
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 239000000185 hemagglutinin Substances 0.000 description 1
- 229960002897 heparin Drugs 0.000 description 1
- 229920000669 heparin Polymers 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 1
- 230000016784 immunoglobulin production Effects 0.000 description 1
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 1
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 1
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 208000014674 injury Diseases 0.000 description 1
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 1
- 239000002054 inoculum Substances 0.000 description 1
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 238000001361 intraarterial administration Methods 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- SURQXAFEQWPFPV-UHFFFAOYSA-L iron(2+) sulfate heptahydrate Chemical compound O.O.O.O.O.O.O.[Fe+2].[O-]S([O-])(=O)=O SURQXAFEQWPFPV-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000001155 isoelectric focusing Methods 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 108010045069 keyhole-limpet hemocyanin Proteins 0.000 description 1
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 238000001638 lipofection Methods 0.000 description 1
- 230000002934 lysing effect Effects 0.000 description 1
- 108010003700 lysyl aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 description 1
- 229910052749 magnesium Inorganic materials 0.000 description 1
- 229940076230 magnesium sulfate monohydrate Drugs 0.000 description 1
- 229940091250 magnesium supplement Drugs 0.000 description 1
- LFCFXZHKDRJMNS-UHFFFAOYSA-L magnesium;sulfate;hydrate Chemical compound O.[Mg+2].[O-]S([O-])(=O)=O LFCFXZHKDRJMNS-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N maleic acid Chemical compound OC(=O)\C=C/C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 235000010755 mineral Nutrition 0.000 description 1
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 1
- 239000007758 minimum essential medium Substances 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 239000002808 molecular sieve Substances 0.000 description 1
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 1
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 238000001668 nucleic acid synthesis Methods 0.000 description 1
- 238000011275 oncology therapy Methods 0.000 description 1
- 230000003204 osmotic effect Effects 0.000 description 1
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 1
- 150000004686 pentahydrates Chemical class 0.000 description 1
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 1
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 1
- 108010064486 phenylalanyl-leucyl-valine Proteins 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 229940127126 plasminogen activator Drugs 0.000 description 1
- 229920001583 poly(oxyethylated polyols) Polymers 0.000 description 1
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 229920000447 polyanionic polymer Polymers 0.000 description 1
- 229920005862 polyol Polymers 0.000 description 1
- 150000003077 polyols Chemical class 0.000 description 1
- 229920005606 polypropylene copolymer Polymers 0.000 description 1
- 229920001451 polypropylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- OTYBMLCTZGSZBG-UHFFFAOYSA-L potassium sulfate Chemical compound [K+].[K+].[O-]S([O-])(=O)=O OTYBMLCTZGSZBG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910052939 potassium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001120 potassium sulphate Substances 0.000 description 1
- 235000011151 potassium sulphates Nutrition 0.000 description 1
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 235000019833 protease Nutrition 0.000 description 1
- 239000008213 purified water Substances 0.000 description 1
- 229920005604 random copolymer Polymers 0.000 description 1
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 1
- 238000005932 reductive alkylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000007363 ring formation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000009738 saturating Methods 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N sodium aluminosilicate Chemical compound [Na+].[Al+3].[O-][Si]([O-])=O.[O-][Si]([O-])=O URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 235000009518 sodium iodide Nutrition 0.000 description 1
- RWVGQQGBQSJDQV-UHFFFAOYSA-M sodium;3-[[4-[(e)-[4-(4-ethoxyanilino)phenyl]-[4-[ethyl-[(3-sulfonatophenyl)methyl]azaniumylidene]-2-methylcyclohexa-2,5-dien-1-ylidene]methyl]-n-ethyl-3-methylanilino]methyl]benzenesulfonate Chemical compound [Na+].C1=CC(OCC)=CC=C1NC1=CC=C(C(=C2C(=CC(C=C2)=[N+](CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C)C=2C(=CC(=CC=2)N(CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C)C=C1 RWVGQQGBQSJDQV-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 238000011146 sterile filtration Methods 0.000 description 1
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 1
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 1
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 1
- 230000001502 supplementing effect Effects 0.000 description 1
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- 230000009424 thromboembolic effect Effects 0.000 description 1
- 229960000103 thrombolytic agent Drugs 0.000 description 1
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 1
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 1
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 1
- 229910021654 trace metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- IERBVBGUKBHALB-UHFFFAOYSA-K tripotassium;phosphate;dihydrate Chemical compound O.O.[K+].[K+].[K+].[O-]P([O-])([O-])=O IERBVBGUKBHALB-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
- 239000002023 wood Substances 0.000 description 1
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 1
- 150000003751 zinc Chemical class 0.000 description 1
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 1
- 239000011592 zinc chloride Substances 0.000 description 1
- 235000005074 zinc chloride Nutrition 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
- C12N9/64—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
- C12N9/6421—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from mammals
- C12N9/6489—Metalloendopeptidases (3.4.24)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- A61K38/1703—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
- A61P7/02—Antithrombotic agents; Anticoagulants; Platelet aggregation inhibitors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
- C12N9/64—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
- C12N9/6402—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from non-mammals
- C12N9/6418—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from non-mammals from snakes
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Marine Sciences & Fisheries (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Diabetes (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Materials For Medical Uses (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
Description
Oblast techniky
Tento vynález se vztahuje k fibrinolyticky aktivní metaloproteináze, která má v přírodě se nevyskytující sekvenci, k metodám její výroby a k jejímu použití v léčbě trombóz in vivo.
Dosavadní stav techniky
Fibroláza je enzymaticky aktivní polypeptid (konkrétně metaloproteináza), tvořený 203 aminokyselinami,který byl poprvé izolován purifikací z jedu hada Southern Copperhead (Patent USA č. 4, 610,879, vydaný 9.září 1986 (Markland et al.); a Guan et. Al., Archives of Biochemistry and Biophysics, svazek 289, číslo 2, strany 197-207 (1991) . Enzym vykazuje přímou fibrinolytickou aktivitu se slabou nebo žádnou hemoragickou aktivitou. Rozpouští krevní sraženiny tvořené z fibrinogenu nebo z plné krve.
Aminokyselinová sekvence fibrolázy byla určena a také byly popsány metody pro rekombinantní produkci v kvasinkách a použití pro úpravu tromboembolických podmínek in vivo. Randolph et al., Protein Science, Cambridge University Press (1992), strany 590-600 a Evropská patentová žádost č. 0 323 722 (Valenzuela et al.), publikovaná 12. července 1989.
Podstata vynálezu
Tento vynález poskytuje fibrinolytickou metaloproteinázu o aminokyselinové sekvenci, která se běžně v přírodě nevyskytuje (popsaná viz. SEQ ID NO:1 a také popisována zde jako novel acting thrombolytic (NAT). Také jsou poskytnuty sekvence nukleové kyseliny jako např. SEQ ID NO: 2 a její varianty, které kódují NAT.
• · · · · ······· · · • · · · ·· · · · · · • * · · ·· · · · · ·
Termín „zralý je používán v jeho konvenčním smyslu-označuje biologicky aktivní polypeptid, který byl enzymaticky zpracován in sítu v hostitelské buňce, vyštěpením zprepro oblasti.
Vzhledem k fibrinolytické aktivitě je NAT použitelný in vivo jako lyzační činidlo krevních sraženin při léčení trombóz u savců (včetně krys, prasat a člověka).
NAT polypeptid v tomto vynálezu jako léčebné činidlo poskytuje výhody oproti v přírodě se vyskytující fibroláze (např.fibrinolytický polypeptid nalezený v hadím jedu). U nativní fibrolázy je popsáno několik alternativních N-konců: QQRFP, EQRFP a ERFP (kde E značí cyklický glutamín nebo kyselinu pyroglutamovou). Přesněji, molekula fibrolázy, která začíná na N-konci sekvencí QQRFP, je degradována na 2 izoformy, které mají N-konce EQRFP a ERFP. Rekombinantní fibroláza vyráběná v kvasinkách je směs všech těchto 3 forem a tudíž není homogenní. Viz. Loayza et al, Journal of Chromatography, B 662, strany 227-243 (1994).
A navíc cyklický glutamín blokuje N-konec a znemožňuje tak sekvenování.
Ve srovnání s tím rekombinantní NAT (popisovaný v tomto vynálezu) poskytuje jednu formu: pouze jeden N-konec je typicky vyráběn. Výsledkem je větší homogenita koncového produktu ve srovnání s rekombinantní fibrolázou, což je výhodné, když jako konečné upotřebení jsou zamýšleny lékařské aplikace.
Stručný přehled obrázků na výkresech
Obrázek 1 zobrazuje v lineárním tvaru celou aminokyselinovou sekvenci NATu (Seq ID NO:3), skládající se z „ prepo oblasti (podtržená), která obsahuje „signální peptid, a zralý polypeptid (nepodtržený).
Podrobný přehled obrázků na výkresech
NAT může být vyráběn rekombinantní expresí molekuly nukleové kyseliny o SEQ ID NO:4, která kóduje kompletní aminokyselinovou • · sekvenci NATu (SEQ ID NO:3), včetně „prepo oblasti (nukleotidy 1173) a zralého polypeptidu (nukleotidy 784-1386), ve vhodném hostiteli. Následně po expresi, je prepo oblast v hostitelské buňce enzymaticky odštěpena a poskytuje zralý aktivní polypeptid (SEQ ID NO:1).
NAT je vyráběn v kvasinkách, jak bude vysvětleno detailněji níže.
Zralý polypeptid (SEQ ID NO: 1), který je takto vyráběn může mít a také nemusí jako koncovou aminokyselinu- methionin a to v závislosti na způsobu přípravy. Typicky je methionin, jako koncová aminokyselina přítomen, když je polypeptid vyráběn rekombinantně v nesekretujícím bakteriálním druhu (např. E.coli) jako hostiteli.
Kromě toho, molekula nukleové kyseliny o SEQ ID NO: 2, je také použitelná, protože je to degenerovaná sekvence a kóduje stejný polypeptid. Tento vynález zahrnuje také molekuly nukleové kyseliny, které mohou kódovat další aminokyseliny hraničící na 5'nebo 3'konci s oblastí která kóduje zralý polypeptid, stejně jako sekvence kódující alternativní pre/pro oblasti (např. sekvence zodpovědné za sekreci polypeptidu přes buněčné membrány) v místě nativní pre/pro oblasti, (např. nalezené v přírodě vyskytující se fibroláze). Další sekvence mohou také být nekódující sekvence, včetně regulačních oblastí jako promotor transkripce nebo translace, v závislosti na hostitelské buňce.
NAT může být připraven pomocí dobře známých rekombinantních technik, které jsou popsány blíže v Sambrook et al., Molecular cloning: Laboratory manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press,
Cold Spring Harbor, NY (1989) a/nebo v Aqusubel et al., editors, Current Protocols in Molecular Biology, Green Publishers lne. and Wiley and Sons, New York (1994).
DNA molekula kódující polypeptid nebo jeho zkrácená verze, může být získána například pomocí metody: „screening genomové nebo cDNA knihovny, nebo pomocí PCR amplifikace. Následuje nahrazení kodónu, který kóduje N-koncové aminokyseliny QQR, kodónem pro serin (S).
Alternativně, může být molekula kódující NAT připravena chemickou syntézou, pomocí metod, které jsou dobře známé zkušeným chemikům. Popsány byly Engelsem et al. v Angew. Chem. Intl. Ed., Volume 28, strany 716-734 (1989). DNA je několik stovek nukleotidů • · · · · · ·· · • · · · · · · · 9 · # · · · · ······· · >
• · · * ·· · · · · · ·· * · ·· · ·· ·· dlouhá. Nukleové kyseliny delší než jedno sto nukleotidů mohou být syntetizovány stejnými metodami jako několik fragmentů a následně tyto fragmenty mohou být ligovány k sobě, tak aby vytvořily nukleotidovou sekvenci o žádané délce.
DNA molekula je vložena do příslušného expresního vektoru pro expresi ve vhodné hostitelské buňce.
Vektor je vybrán, tak aby fungoval v dané hostitelské buňce (např. vektor je kompatibilní s hostitelským buněčným aparátem, tak že dochází k expresi DNA).
Třebaže polypeptid může být exprimován v prokaryotické, kvasinkové, hmyzí (bakulovirový systém) nebo eukaryotické hostitelské buňce, kvasinka je upřednostněna, jak bude dále podrobněji vysvětleno.
Vektory používané k expresi NAT v jakékoliv hostitelské buňce mohou také obsahovat 5' hraničící oblast (zmiňovaná jako „promotér) a další regulační prvky prakticky připojené k DNA tak, aby byly exprimovány. Jsou to enhancery, začátek replikačního elementu, celá sekvence intronu, obsahující donorové a akceptorové vystřihovací místo, signální peptidová sekvence, sekvence pro vazbu ribozomu a polyadenylační sekvence, polylinkerová oblast pro inzerci nukleové kyseliny kódující NAT a selekční markér.
Každý z těchto elementů je diskutován dále.
Ne nutně, může vektor také obsahovat „tag sekvenci, např. oligonukleotidovou sekvenci lokalizovanou na 5'nebo 3'konci polypetid-kódující sekvence, která kóduje póly His (jako hexaHis) nebo krátké imunogenní sekvence ( jako c-myc nebo hemaglutininový epiptop, pro které jsou protilátky, včetně monoklonálních protilátek, komerčně dostupné. Tento tag je exprimován společně s NAT a může sloužit jako afinitní tag pro purifikaci tohoto polypeptidu z hostitelské buňky. Následně může být tag odstraněn z purifikovaného polypeptidu různými způsoby, například použitím selektivní peptidázy.
5' hraniční sekvence může být v přírodě se vyskytující sekvence, nebo může být homologní (např. ze stejného druh nebo rodu jako hostitelská buňka), heterogenní (např. z jiného druhu nebo rodu, než je hostitelská buňka), hybridní (např. kombinace
5'hraniční sekvence z více než jednoho druhu) nebo syntetická.
• · · · ·· · ···· · « * • < to·· toto····· · ···· ·· · ··· ·· · · toto a <·· ·>
Zdrojem může být jakýkoliv prokaryotický nebo eukaryotický organismus, nebo jakákoliv rostlina, za předpokladu, že 5' hraniční sekvence je funkční, a může být aktivován systémem hostitelské buňky.
Začátek replikace je většinou součástí prokaryotických expresních vektorů, které jsou komerčně dostupné, a napomáhá replikaci vektoru v hostitelské buňce. Amplifikace vektoru v určitém počtu kopií, může být v některých případech důležitá pro optimální expresi „NATu. Jestliže vybraný vektor neobsahuje začátek replikace, může být na základě známé sekvence chemicky syntetizován a následně vložen do vektoru.
Prvek konce transkripce je typicky lokalizován na 3'konci polypeptidové kódující sekvence a slouží k ukončení transkripce mRNA. Terminační prvek v prokaryotických buňkách je většinou G-C bohatý fragment následovaný polyT sekvencí. Tento prvek je snadno klonovatelný z knihovny nebo komerčně dostupný jako součást vektoru, a také může být připraven metodami syntézy nukleových kyselin.
Gen pro selekční markér kóduje protein nezbytný pro přežití a růst hostitelské buňky na selektivním kultivačním médiu. Typický selekční markerový gen kóduje proteiny, které (a) propůjčují resistenci na antibiotika nebo na jiné toxiny, například, ampicilin, tetracyklin nebo kanamycin v prokaryotických hostitelských buňkách, zeocin v kvasinkách a neomycin v savčích hostitelských buňkách; (b) doplněk auxotrofické deficience buněk; nebo (c) doplněk kritických živin nedostupných z komplexního média. Preferované selekční markéry používané při prokaryotické expresi jsou geny pro rezistenci na kanamycin, ampicilin a tetracyklin.
Ribozomální vazebný prvek, běžně nazývaný „Shine-Dalgarno sekvence (u prokaryotů) nebo „Kozák sekvence (pro eukaryoty), je nezbytný pro iniciaci translace mRNA. Tento prvek je typicky lokalizován na 3' konci od promotoru a na 5'konci od kódující sekvence polypeptidů, který je syntetizován.
„Shine-Dalgarno sekvence je variabilní, ale typicky obsahuje polypurin (např. vysoký obsah A-G). Mnoho „Shine-Dalgarno sekvencí bylo identifikováno, každá může být snadno syntetizována pomocí metod, které byly popsány a použita v prokaryotickém vektoru.
• · * · ••«Μ····» 4 4 4 4 4 · 4 ·« · • 4 4 · » ······· « « • · · · « « · ···«
4· ·· · · 4 · · · · „Kozák sekvence zahrnuje sekvence bezprostředně před a za iniciačním kodónem.
Preferovaná „Kozák sekvence je ta, která je asociovaná s vysokou účinností s iniciací translace v AUG start kodónu.
V těch případech, kdy je žádoucí aby NAT polypeptid byl sekretován z hostitelské buňky, může být signální sekvence použita k nasměrování polypeptidu ven z buňky, ve které byl syntetizován.
Signální sekvence je umístěna v kódující oblasti sekvence nukleové kyseliny, nebo přímo na 5' konci kódující oblasti. Mnoho signálních sekvencí bylo identifikováno a jakýkoli z nich funguje ve vybrané hostitelské buňce a může zde být použit. Tudíž, signální sekvence může být homologní nebo heterologní s polypeptidem.
Navíc signální sekvence může být chemicky syntetizována za použití metod popsaných výše.
Když je vektor zkonstruován a nukleová kyselina byla vložena do správného místa ve vektoru, celý vektor může být vložen do vhodné hostitelské buňky a dále amplifikován a/nebo polypeptid exprimován.
Jak již bylo zmíněno, hostitelské buňky mohou být prokaryotické (jako E.coli) nebo eukaryotické (jako kvasinkové buňky, nebo hmyzí nebo buňky obratlovců). Hostitelská buňka, ať již je to kvasinka nebo jiný hostitel, za vhodných podmínek může syntetizovat NAT, který může být později sbírán z kultivačního média (jestliže je hostitelskou buňkou sekretován do média), nebo přímo z hostitelských buněk, které ho produkují (jestliže není sekretován). Po sběru NAT polypeptidu může být purifikován použitím metod, jako je molekulární síťová chromatografie, afinitní chromatografie a podobné.
Výběr hostitelské buňky bude z velké míry záviset na způsobu, » jakým je buňka schopna sbalit NAT do jeho nativní sekundární a terciální struktury (např. správná orientace di-sulfidických můstků, apod.), tak aby byl biologicky aktivní. Přesto, dokonce když hostitelská buňka nesyntetizuje biologicky aktivní materiál, může být „sbalen po syntéze za použití vhodných chemických podmínek, takových, které jsou známy zkušeným chemikům. V tomto případě, může být správné „sbalení odvozeno z faktu, ze materiál je biologicky aktivní.
Vhodné hostitelské buňky, nebo tkáňové kultury mohou být savčí buňky, jako například buňky z vaječníku čínského křečka (CHO-Chinese hamster ovary cells) nebo 3T3 buňky. Vhodné savčí hostitelské buňky a metody transformace, kultivace, množení, screeningu, a výroby produktu a jeho purifikace jsou obecně známé.
Další vhodné savčí buněčné kultury jsou opičí COS-1 a COS-7 buněčné linie a CV-1 buněčná linie. Další případné savčí hostitelské buňky jsou buněčné linie primátů a hlodavců, včetně transformovaných buněčných linií. Vhodné jsou také normální diploidní buňky, buněčné druhy odvozené od in vitro kultivovaných primárních tkáňových linií, stejně jako primární explantáty. Kandidátní buňky by měly být genotypově deficitní v selekčním genu, nebo by měly obsahovat dominantně působící selekční gen.
Avšak i další savčí buněčné linie je možné použít, HeLa, myší L-929 buňky, 3T3 buňky odvozené od Swiss, Balb-c nebo NIH myších,
BHK nebo HaK buněčné linie z křečka.
Užitečné jsou také bakterie jako hostitelské buňky. Například různé druhy E.Coli (např. HB101, DH5a, DH10 a MC1061) jsou dobře známé jako hostitelské buňky používané v biotechnologii.
Různé druhy B.subtilis, Pseudomonas druhy, jiné druhy Bacillus, Streptomyces a jim podobné mohou být také použity. Navíc mnoho druhů kvasinkových buněk je také použitelných jako hostitelské buňky pro expresi polypeptidu prezentovaného v tomto vynálezu. Také hmyzí buňky mohou být použity jako hostitelské buňky. Popsáno například v „ Miller et al., Genetic Engineering, Volume 8, strany 277-298 (1986).
Inzerce (také nazývaná jako transformace nebo transfekce) vektoru do vybrané hostitelské buňky může být provedena pomocí kalcium fosfátu, elektroporací, mikroinjekcí, lipofekcí nebo DEAEdextranem.
Vybraná metoda musí funkčně korelovat s použitou hostitelskou buňkou. Tyto a jiné vhodné metody jsou známé zkušeným chemikům a popsány leckde (např. v Sambrook et al.)
Hostitelské buňky obsahující vektor mohou být kultivovány ve standardním médiu. Médium většinou obsahuje všechny nezbytné živiny pro růst a přežití buněk.
Vhodná média pro kultivaci E.coli jsou například Luria Broth (LB) a/nebo Terrific Broth (TB). Vhodná média pro kultivaci eukaryotických buněk jsou RPMI 1640, MEM, DMEM a všechny které mohou • · ♦ · ···« 9 9 9 • · * ···« 9 « 9 · * ♦ · 9999999 9 9
9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 ·· ·4 9 9 9 9 9 9 9 být doplněny sérem a/nebo růstovými faktory, které jsou nezbytné pro kultivaci dané buněčné linie. Vhodné médium pro kultivaci hmyzích buněk je Graceovo médium doplněné, je-li to nezbytné, yestolatem, hydrolyzátem laktoalbuminu a/nebo fetálním telecím sérem.
Antibiotika nebo jiné sloučeniny používané pro selektivní růst transformovaných buněk mohou být přidána jako doplněk do média. Sloučenina, která je použita pro selekci, je vybrána podle selekčního markéru, který je přítomen v plasmidu, kterým byla hostitelská buňka transformována. Například, když je selekční markér rezistence na kanamycin, tak se kanamycin přidává do kultivačního média.
Množství NATu vyprodukovaného hostitelskou buňkou se vyhodnocuje metodami běžně známými.
Jsou to metody jako Western blot , SDS-polyakrylamidová gelová elektroforéza, nedenaturující gelová elektroforéza, HPLC, imunoprecipitace, a/nebo stanovení aktivity jako stanovení gelového vazebného DNA posunu.
Je-li NAT sekretován z hostitelských buněk (vyjma gram negativních bakterií), většina proteinu se nachází v médiu. Je-li NAT sekretován z gram-negativních bakterií, určitá část se nalezne v periplasmě.
Není-li NAT sekretován nachází se v cytoplasmě.
V případě intracelulárního NATu se buňky mechanicky rozbijí.
Je-li NAT lokalizován v periplasmě, mechanické rozbití nebo osmotická úprava mohou být použity k uvolnění periplasmatického obsahu do pufrovaného roztoku. NAT je potom izolován přímo z roztoku. Vlastní izolace z roztoku může být provedena různými technikami. Je-li NAT syntetizován, tak obsahuje tzn. TAG , např. hexa-histidin, nebo jiný malý peptid buď karboxyl nebo amino konec, v podstatě může být purifikován v jednom kroku přes afinitní kolonovou chromatografii, kde náplň kolony je vysoce afinitní k „TAGu nebo přímo k polypeptidu (např. monoklonální protilátka).
Například poly-histidin se váže s vysokou afinitou a specificky k niklové afinitní koloně (např. Qiagen niklová kolona), která může být použita k purifikaci. (například v Ausubel et al., editors, current Protocols in Molecular Biology).
• · · · · 9 9 • · ···· · · · • » · · · · · · »
A · · · · ·····*· · >
• · ♦ · · · · · · · · * · · # · * · · · · ·
Na druhé straně, i když polypeptid nemá „TAG, nebo není vhodná protilátka, jiné dobře známé metody purifikace mohou být použity.
Jsou to iontoměničová chromatografie, fázově reverzní chromatografie, HPLC, nativní gelová elektroforéza v kombinaci s elucí z gelu a preparativní isoelektrická fokusace („Isoprime přístroj/technika, Hoefer Scientific). V některých případech dvě nebo i více těchto technik může být zkombinováno aby se docílilo vyšší čistoty.
Pro produkci NATu se s výhodou používají kvasinky, nejvýhodnější je druh Pichia (např. Pichia pastoris), kvůli jejich vyšší účinnosti při sbalování polypeptidu do původní struktury, ve srovnání s bakteriálními buňkami, např. E.coli. Vhodné rekombinantní metody pro expresi v kvasinkách jsou popsány v Patentu Spojených Států 4, 855, 231, (Stroman et al.), 4, 812, 405 (Lair et al.), 4,
818, 700 (Cregg et al.), 4, 885, 242 (Cregg), 4, 837, 148 (Cregg), které jsou začleněné uvnitř referencí.
Pichia buňky mohou být také použity na expresi fibrolázy z DNA molekul, které kódují tuto metaloproteinázu se stejnou efektivitou a takováto metoda představuje další hledisko předkládaného vynálezu.
Fibroláza je známá metaloproteináza, která byla popsána ve vědecké a patentové litetaruře, viz. Randolph et al., a Evropská patentová žádost č. 0 323 722, citovaná výše. Většinou je exprimována fibroláza o SEQ ID NO: 5, která je kódována cDNA molekulou SEQ ID NO: 6 (nebo variantami, které kódují stejnou aminokyselinovou sekvenci). Exprese fibrolázy v takovém to systému většinou navíc, kromě maturovaného polypeptidu (nukleotidy 7841392), zahrnuje DNA molekulu o SEQ ID NO: 7, která kóduje „prepo sekvenci (nukleotidy 1-783).
Chemicky modifikované varianty NATu, ve kterých je polypeptid navázán na polymer nebo jinou molekulu, aby vytvořil derivát, proto aby modifikoval vlastnosti, jsou také zahrnuty v rámci tohoto předkládaného vynálezu.
Výhodné, hlavně pro lidské léčebné účely, je derivatizovat NAT tak, že je připojena jedna nebo více chemických molekul na molekulu polypeptidu. Tyto molekuly mohou být různé ve vodě rozpustné polymery. Polymer musí být ve vodě rozpustný, protože NAT, ke kterému je připojen ve vodě , jakožto ve fyziologickém prostředí • · 0 · • · · · · · · · 4 • · · · · 0 » « « *0 0 0 · · · ·« · · * 0 0 ······· 0 0 ···· ·· 0 0 0 0 · •0 · · «0 0 «· · rozpustný. Ve vodě rozpustné polymery mohou být vybrány ze skupin sestávající se, například, z polyethylen-glykolu, kopolymerů ethylen-glycol/propylen-glykol, karboxy-methyl-celulosa, dextran, polyvinyl-alkohol, polyvinyl pyrolidon, poly-1,3-dioxalan, poly1,3, 6-trioxan, ethylen/anhydrid kyseliny maleinové kopolymer polyamino kyseliny (buď homopolymery, nebo náhodné či nenáhodné kopolymery (viz.dále u fúzních molekul) a dextran nebo póly (nvinylpyrolidon)polyethylen-glykol, homopolymery polypropylenglykolu, kopolymery polypropylenu oxid/ethylen oxid, polyoxyethylované polyoly, polystyren-maleat a polyvinyl-alkohol.
Polyethylen-glykol-propion-aldehyd je vhodný pro průmyslovou výrobu díky své stabilitě ve vodě.
Polymer může mít jakoukoliv molekulární hmotnost a může být rozvětvený nebo nerozvětvený. Pro polyethylen glykol je preferovaná molekulární hmotnost mezi 2 kilodaltony (kDa) a okolo 100 kDa (termín „okolo znamená, že při přípravě polyethylenglykolu některé molekuly váží více, jiné o něco méně než je stanovená molekulární hmotnost), což usnadní zacházení a průmyslovou výrobu. Jiné velikosti mohou být použity v závislosti na žádaném terapeutickém profilu (např. požadovaná délka doby uvolňování, účinky na biologickou aktivitu, jsou-li nějaké, usnadnění manipulace, stupeň, nebo nedostatek antigenicity nebo jiných známých efektů polyethylenglykolu na terapeutický protein.
Počet připojených molekul polymeru může být různý a zkušený chemik je schopný zjistit účinek na funkci. Může být použita derivatizace, jak mono-, tak i di-, tri-, tetra- nebo i kombinovaná, se stejnou nebo jinou chemickou molekulou (např. polymerem o jiné molekulové hmotnosti, než je polyethylenglykol).
Poměr molekul polymeru a molekul NAT polypeptidu kolísá, stejně jako kolísá jejich koncentrace v reakční směsi. Obecně, je optimální poměr (ve smyslu efektivity reakce zde není přebytek nezreagovaného polypeptidu nebo polymeru) určen faktory jako je požadovaný stupeň derivatizace (např. mono-, di-, tri-, atd.), molekulární hmotnost vybraného polymeru, je-li polymer rozvětvený či nikoliv a reakční podmínky.
Chemické skupiny by měly být připojeny k NAT s ohledem na jejich účinek na funkci nebo antigenní domény polypeptidu. Existuje • · · · · • · · · • · · · < · • · · 9 · *
9 99 99 velký počet metod pro vytvoření vazby, například viz, E- 0401 384 (spojení PEG k G-CSF) a Malík et al., Experimental Hematology,
Volume 20, strany 1028-1035 (1992) (popisující „pegylaci GM-CSF pomocí chloridu tresylového). Pro ilustraci, polyethylenglykol může být kovalentně navázán přes reaktivní skupiny aminokyselinových zbytků, jako volná amino nebo karboxylová skupina. Reaktivní skupiny jsou ty, ke kterým se aktivovaná molekula polyethylenglykolu (nebo jiné chemické skupiny) může vázat.
Aminokyselinové zbytky, které mají volné aminoskupiny mohou obsahovat lyzinové zbytky a N-koncový aminokyselinový zbytek.
Ty které mají volné karboxylové skupiny, mohou obsahovat zbytky kyseliny asparagové a glutamové a C-koncový aminokyselinový zbytek. Sulfohydrylové skupiny mohou být také použity jako reaktivní skupiny pro vazbu molekuly polyethylen-glykolu nebo jiných chemických skupin. V průmyslové výrobě je preferovaná vazba aminokyseliny jako je N-konec nebo lyzinová skupina.
Je potřeba se vyvarovat vazby na reaktivní skupiny, které jsou důležité pro vazbu receptoru, je-li navázání na receptor požadováno.
N-koncová chemicky modifikovaná derivatizace může být také požadována. Pro ilustraci, různé molekuly polyethylenglykolu mohou být vybrány (podle molekulové hmotnosti, rozvětvení, atd.), různý poměr molekul polyethylenglykolu s molekul polypeptidu v reakční směsi, typy „pegylace a metody pro získání vybraného Nkoncového pegylatovaného NATu.
Metodou k získání pegylatovaného N-konce (např. je-li nezbytné oddělení těchto sloučenin od jiných monopegylatovaných molekul) může být purifikace N-koncově pegylatovaného materiálu z populace pegylatovaných NAT molekul. Selektivní N-koncová chemická modifikace může být dosažena pomocí redukující alkylace, která využívá rozdílné reaktivity různých typů primárních amino skupin (lyzin versus N-konec), které jsou k dispozici pro derivatizaci. Viz PCT žádost WO 96/11953, publikováno 25. srpna 1996.
Za vhodných reakčních podmínek je dosažena podstatně selektivní derivatizace NATu na N-konci s karboxylovou skupinou, která obsahuje polymer. Například se může použít selektivní N-koncová pegylace NATu při pH, které pak zvýhodňuje rozdíly mezi ε-amino skupiny lysinových zbytků a α-amino skupiny N-konce polypeptidu. Díky této selektivní • · ·· ···· «· · • · · · · · « ··· • · ♦ * * ·«····· · 9
9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 * · ·· ·· · «· 9 9 derivatizaci je připojení polymeru k polypeptidu kontrolováno: konjugace s polymerem probíhá převážně na N-konci polypeptidu a nevyskytuje se žádná významná modifikace jiných reaktivních skupin, jako je postranní řetězec amino skupin lyzinu. Při použití redukující alkylace může být použit jakýkoliv z polymerů popsaný výše, a měl by mít jedinou reaktivní aldehydovou skupinu pro spojení s polypeptidem.
Polyethylenglykol propionaldehyd, obsahující jediný reaktivní aldehyd, může být použit.
NAT nebo chemicky modifikované deriváty v souhlasu s vynálezem mohou být navrženy k in vivo aplikaci, nejlépe přes intratrombus. (např. přes lokalizované podání přímo na místo sraženiny v cévě, např. přes katetr). Systémové podávání není běžně preferováno, kvůli pravděpodobnosti, že přirozený a2 makroglobulin v celkovém krevním oběhu může vytvořit komplex s NAT, a tak zabrání interakci s fibrinem nebo fibrinogenem a sníží rozpuštění sraženiny. Ačkoliv mohou být případy, kdy větší množství NATu může být aplikováno, což převýší krevní hladiny a2 makroglobulinu, a tudíž umožní systémové podáváni.
Obecně, v rámci vynálezu farmaceutická sloučenina zahrnuje efektivní množství NATu společně s farmaceuticky přijatelnými ředidly, konzervačními činidly, rozpouštědly, emulgátory, adjuvans, a/nebo nosiči. „Efektivním množstvím je míněno množství dostatečné k produkci měřitelného biologického vlivu (např. trombolyticky efektivní množství, které způsobí rozpuštění krevní sraženiny nebo vznikající sraženiny léčí).
Typicky, NAT je ve vysoce purifikované formě a jakákoliv farmaceutická sloučenina, která bude použita jako pojidlo, bude před použitím normálně sterilizována, např. filtrací přes sterilní filtrační membrány.
Zkušený farmaceut bude schopný zjistit efektivní dávky podáváním a pozorováním požadovaného terapeutického vlivu. Určité vlivy dávek budou záviset na dané nemoci nebo stavu, který bude léčen, stejně jako na věku a celkovém zdravotním stavu příjemce, a který může být určen standardními klinickými postupy.
Kde je to možné, bude vhodné stanovit křivku farmaceutického složení odezvy na dávku, nejprve in vitro -jako bio-test a potom • ··«··· • φ · φ • · φφφφ φφφ • φφφ ΦΦΦΦΦ·· φ φ φφφ * · · « « · · ·· ·· · Φ· φ φ ve vhodném zvířecím modelu (in vivo) , před tím, než se začne s testováním na lidech. Zkušený praktický lékař, po zvážení léčebných souvislostí, typu léčené nemoci a jiných vhodných faktorů bude schopný zjistit správné dávkování bez přílišného úsilí. Typicky, praktický lékař bude podávat sloučeninu NAT dokud nebude dosaženo dávky, která způsobí požadovaný efekt (např. rozpuštění krevní sraženiny). Sloučenina může být podávána jako jednorázová dávka, nebo ve dvou a více dávkách (které mohou ale nemusí obsahovat stejné množství polypeptidu) v určitých časech, nebo kontinuálně.
NAT může být také použit pro přípravu protilátek podle standardních metod. Protilátky mohou být polyklonální, monoklonální, rekombinantní, chimérické, jedno-řetězcové a/nebo bi-specifické, apod. Aby se vylepšila pravděpodobnost produkce imunitní odpovědi, aminokyselinová sekvence NATu může být analyzována, aby se určila část molekuly, která by mohla být spojena se zvýšenou imunogenitou. Například, aminokyselinová sekvence může být podrobena počítačové analýze, aby se určily povrchové epitopy, podle metod Hopa a Wooda, v Proceedings of the National Academy of Science USA, Volume 78, strany 3824-3828 (1981).
Různé známé postupy mohou být použity pro produkci polyklonálních protilátek, které rozeznají epitopy NATu. Jako hostitel na produkci protilátky mohou být imunizována různá zvířata (bez omezení králíci, myši, krysy, atd.)
Různá adjuvans mohou být použita ke zvýšení imunologické odpovědi, v závislosti na hostitelském druhu, včetně a bez omezení Freundovo adjuvans, minerální gely jako je hydroxid hlinitý, (alum), povrchově aktivní látky, jako je lysolecitin, pluronové polyoly, polyanionty, peptidy, olejové emulse, hemocyanin z přílipky, dinitrofenol a potencionálně užitečné lidské adjuvans, jako je Bacilus Calmette-Guerin a Corynebacterinm parvum.
Pro přípravu monoklonálních protilátek účinných na NAT může být použita jakákoli technika, která umožňuje přípravu molekul protilátky v buněčné linii. Například, hybridomová metoda, původně vyvinuta Kohlerm a Milsteinem, která je popsána v Nátuře, Volume 256, strany 495-497 (1975), stejně jako trioma technika, metodika hybridomů lidských B-buněk popsaná Rozborem et al., v Immunology Today, Volume 4, strana 72 (1983) a EBV-hybridomová metodika •9 9999 * 9 • 99
0 0 0 0 • 9 · • 9 9 «9 9 • 9 9 9 • · 9 · produkce monoklonálních protilátek popsaná Coleem et al. v „Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, lne., strany 77-96 (1985).Všechny tyto metody jsou použitelné pro přípravu monoklonálních protilátek v souladu s tímto vynálezem.
Protilátky tohoto vynálezu mohou být použity k léčebným účelům, jako je vazba a tím neutralizace nebo inhibice přebytečného množství NATu in vivo po podání. Protilátky mohou být dále použity k diagnostickým účelům, jako třeba ve značené formě k detekci přítomnosti NATu v tělních tekutinách, vzorcích tkáně nebo jiných extraktech, v souhlasu se známými diagnostickými metodami.
Příklady provedení vynálezu
Dále je vynález ilustrován následujícími příklady.
Příklad 1
Odvození sekvence NATu
Efektivní způsob výroby fibrolázy je exprimovat ji jako prefibrolázu, která je štěpena proteázou kex-2 na „prepo a „maturovanou část. (Získá se biologicky aktivní materiál („maturovaná fibroláza)).
V tomto uspořádání, vede syntéza a procesování prefibrolázy k sekreci maturované fibrolázy do kultivačního média. Skutečná sekvence v štěpeném místě je (...TKRjQQRF...) .
Kex-2 je endoproteáza která štěpí za dvěmi sousedními basickými aminokyselinami, v tomto případě lysinem (K)-argininem (R). Zralá fibroláza exprimovaná z DNA má, již výše zmíněný, N-koncový glutamínu (Q),který byl pozměněn deaminací a cyklizací na pyroglutamovou kyselinu (E). Tato chemická modifikace byla považována za nežádoucí, protože peptidy s N-koncovým cyklickým glutamínem (pyroglutamová kyselina) selhávaly při reakci v Edmanově odbourávání-aminokyselinovém sekvenování. Tudíž byly oba glutamíny (Q) na N-konci v sekvenci zralé fibrolázy odstraněny, a N-koncem se stal arginin (R). Protože kex-2 štěpí po dvou sousedních bazických aminokyselinách, jak bylo zmíněno, očekávalo se, že sekvence (...KRRF...), ukáže nejednoznačné místo pro štěpení kex-2.
• · φφ · · ·····«« « « • · * Φ Φ Φ
Proto byl N-koncový arginin (R ) (podtržený) nahrazen serinem (S) s výslednou sekvencí (...KRSF...) . Serin byl vybrán na základě potřeby vložení aminokyseliny, která usnadní štěpení kex-2, když se vyskytne na C-konci místa hydrolýzi. Rholam et al., European Journal of biochemistry, Volume 227, strany 707-714 (1995).
DNA sekvence preprofibrolázy byla modifikována metodou cílené mutageneze na N-konci kódující sekvence maturované fibrolázy, tak aby se nahradil kodón pro „QQR kodónem pro „S, použitím standardního PCR protokolu. Výsledkem je prepoNAT o aminokyselinové sekvenci SEQ ID NO:3. Oligonukleotidy použité jako primery pro PCR reakce jsou sepsány dále a jejich homologie s cílovou sekvencí je také naznačena. Na začátku byly provedeny 2 PCR reakce za použití oligonukleotidů 1 a 4 v jednom páru a oligonukleotidy 2 a 3 v druhém páru primerů. Templátem byla DNA. PCR produkty těchto reakcí (601 a 815 nukleotidů dlouhé) byly následně přečištěny pomocí agarozové gelové elektroforézy a dále sloužily jako templát pro druhé kolo PCR za použití oligonukleotidů 1 a 2 jako primerů. Tento konečný PCR produkt (1372 nukleotidů dlouhý) byl štěpen restrikčními endonukleázami Xhol a Notl. Rozštěpená směs byla zbavena proteinu pomocí fenol/chloroformu a DNA vysrážena. Část této znovu získané DNA byla vložena do plazmidu pPICZa (Invitrogen, Carlsbad, CA, Katalogové č. VI95-20), který byl shodně naštěpen restrikčními endonukleázami Xhol a Notl, enzymaticky defosforylován a zbaven proteinu fenol/chloroformem.
Všechny další kroky byly prováděny podle příručky Expresního Kitu- Invitrogen Pichia (Invitrogen Corp., katalogové č. K1710-01). Produkty ligační reakce byly transformovány do E.coli pomocí elektroporace a ty selektovány na pevném médiu s zeocinem. Plasmid byl vyizolován a sekvence prefibrolázy byla ověřena DNA sekvenováním. Plasmid byl linearizován štěpením restrikční endonukleázou Pmel a dále transformován do Pichia pastoris
GS115his+. Rod GS115 je běžně his-, his+ genotyp byl obnoven transformací DNA, která kóduje divokou (wild-type) verzi genu bís4. Alternativně může být his+ druh získán komerčně od Invitrogenu (X-33 tkáňová kultura, katalogové č. C180-00). Úspěšně integrované komplexy byly selektovány jako kolonie rezistentní na zeocin. Kandidátní klony byly indukovány kultivačním médiem, které • 9 9··· • · 9 9 9 9 • · * 9 9 9 9
9 9999 9999 • 9 9 9 9 9 9 • 9 9 9 9 9 9 obsahovali methanol a kultura byla testována na produkci NATu na 420 % PAGE, barvením Coomassie.
Pro cílenou PCR mutagenezu byly použity následující oligonukleotidy:
Oligo 1 5'-TACTATTGCCAGCATTGCTGC-3' (SEQ ID NO: 8)
Oligo 2 5'-GCAAATGGCATTCTGACATCC-3' (SEQ ID NO: 9)
Oligo 3 (SEQ ID NO: 10)
5'-TCCAATTAAACTTGACTAAGAGTCTTCCCACAAAGATACGTAC-3'
Oligo 4 (SEQ ID NO: 11)
5'-GTACGTATCTTTGTGGGAAAGATCTCTTAGTCAAGTTTAATTGG-3'
Umístění těchto oligonukleotidů je naznačeno níže na dvouvláknové sekvenci DNA (SEQ ID NO: 12 kódující nebo-li sens vlákno, SEQ ID NO: 13, komplementární nebo-li antisens vlákno) a korespondující aminokyselinová sekvence (SEQ ID NO:14) fibrolázy (včetně prepo úseku). N-koncové a C-koncové oblasti maturované fibrolázy jsou označeny podtržením koncové aminokyselinové sekvence (QQRF a LNKP). N-koncová oblast (QQRF) je modifikována (nahrazení S za QQF). V oligonukleotidech 3 a 4, značí vložené pomlčky místo, kde byly vynechány kodóny kódující aminokyseliny QQ na N-konci fibrolázy.
4 * · 4 4
4 4 • 4 ·
4 * · · »
9 · • 4 ·
4 4 4 • 44«·· · ·
ATGAGATTTCCTTCAATTTTTACTGCTGTTTTATTCGCAGCATCCTCCGCATTAGCTGCT
---------,+----------+---------+---------+.---------+---------+
TACTCTAAAGGAAGTTAAAAATGACGACAAAATAAGCGTCGTAGGAÓGCGTAATCGACGA
MRFPSIFTAV LFAASSALAA
CCAGTCAACACTACAACAGAAGATGAAACGGCACAAATTCCGGCTGAAGCTGTCATCGGT ---------+---------+---------+----------+---------+---------+
GGTCAGTTGTGATGTTGTCTTCTACTTTGCCGTGTTTAAGGCCGACTTCGACAGTAGCCA
PVNTTTE DETAQIPAEAVIG
TACTCAGATTTAGAAGGGGATTTCGATGTTGCTGTTTTGCCATTTTCCAACAGCACAAAT
---------+---------+---------+---------+---------+---------+
ATGAGTCTAAATCTTCCCCTAAAGCTACAACGACAAAACGGTAAAAGGTTGTCGTGTTTA
YSDLEGDFDVAVL PFSNSTN
Oligo 1 5'-TACTATTGCCAGCATTGCTGC-3'
AACGGGTTATTGTTTATAAATACTACTATTGCCAGCATTGCTGCTAAAGAAGAAGGGGTA ——-----— —————— — 4—+
TTGCCCAATAACAAATATTTATGATGATAACGGTCGTAACGACGATTTCTTCTTCCCCAT
NGLLFINTTIASIAAKEEGV • 9 ·· ·
• · · · 9 9 9
9 9 *9999·· 9 9 • 99 · 9999 •9 9 99 99
Xhol I .
TCTCTCGAGAAAAGAGAGGCTGAAGCTTCTTCTATTATCTTGGAATCTGGTAACGTTAAC
---------+---------+---------+---------+---------+---------+
AGAGAGCTCTTTTCTCTCCGACTTCGAAGAAGATAATAGAACCTTAGACCATTGCAATTG
SLEKREAEASSIILESGNVN
GATTACGAAGTTGTTTATCCAAGAAAGGTCACTCCAGTTCCTAGGGGTGCTGTTCAACCA
----------h---------+---------+----------(-----------1----------+
CTAATGCTTCAACAAATAGGTTCTTTCCAGTGAGGTCAAGGATCCCCACGACAAGTTGGT
DYEVVYPRKVTPVPRGAVQP
AAGTACGAAGATGCCATGCAATACGAATTCAAGGTTAACAGTGAACCAGTTGTCTTGCAC
------------h-----------1-----------1-----------(-----------(----------+
TTCATGCTTCTACGGTACGTTATGCTTAAGTTCCAATTGTCACTTGGTCAACAGAACGTG
KYEDAMQYEFKVNSE.PVVLH
TTGGAAAAAAACAAAGGTTTGTTCTCTGAAGATTACTCTGAAACTCATTACTCCCCAGAT
---------+---------+---------+---------+---------+---------+
AACCTTTTTTTGTTTCCAAACAAGAGACTTCTAATGAGACTTTGAGTAATGAGGGGTCTA
LEKNKGLFSEDYSETHYSPD
GGTAGAGAAATTACTACTTACCCATTGGGTGAAGATCACTGTTAGTACCATGGTAGAATC — --------------1--------—+---------+---------+---------+
CCATCTCTTTAATGATGAATGGGTAACCCACTTCTAGTGACAATGATGGTACCATCTTAG
GREITTYPLGEDHCYYHG RI gaaaacgatgctgactccactgcttctatctctgcttGtaacggtttgaagggtcatttc
---------+---------+---------+---------+---------+---------+ cttttgctacgactgaggtgacgaagatagagacgaacattgccaaacttcccagtaaag endadstasisacnglkghf aagttgcaaggtgaaatgtacttgattgaaccattggaattgtccgactctgaagcccat
---------+---------+---------+---------+---------+---------+
TTCAACGTTCCACTTTACATGAACTAACTTGGTAACCTTAACAGGCTGAGACTTCGGGTA
KLQGEMYLIEPLELSDSEAH ·· ··*·
GCTGTCTACAAGTACGAAAACGTCGAAAAGGAAGATGAAGCCCCAAAGATGTGTGGTGTT
---------+---------+---------+---------+---------+---------+
CGACAGATGTTCATGCTTTTGCAGCTTTTCCTTCTACTTCGGGGTTTCTACACACCACAA
AVYKYENVEKEDEAPKMCGV
Oligo 3 5'-TCCAATTAAACTTGACTAAG
ACCCAAAACTGGGAATCATATGAACCAATCAAGAAGGCCTTCCAATTAAACTTGACTAAG
--------------h----------H--------------------μ---------+
TGGGTTTTGACCCTTAGTATACTTGGTTAGTTCTTCCGGAAGGTTAATTTGAACTGATTC
Oligo 4 3'-GGTTAATTTGAACTGATTC
TQNWESYEPIKKAFQLNLTK
AGA------TCTTTCCCACAAAGATACGTAC-3'
AGACAACAAAGATTCCCACAAAGATACGTACAGCTGGTTATCGTTGCTGACCACCGTATG
---------'+---------+---------+---------+------«—+---------+
TCTGTTGTTTCTAAGGGTGTTTCTATGCATGTCGACCAATAGCAACGACTGGTGGCATAC TCT------AGAAAGGGTGTTTCTATGCATG-5'
R O O R F PQR YVQLVIVADHRM
AACACTAAATACAACGGTGACTCTGACAAAATCCGTCAATGGGTGCACCAAATCGTCAAC
---------+---------+---------+----------------+---------+
TTGTGATTTATGTTGCCACTGAGACTGTTTTAGGCAGTTACCCACGŤGGTTTAGCAGTTG
NTKYN GDSDKIRQWVHQIVN
ACCATTAACGAAATCTACAGACCACTGAACATCCAATTCACTTTGGTTGGTTTGGAAATC
---------+---------+---------+---------+---------+---------+
TGGTAATTGCTTTAGATGTCTGGTGACTTGTAGGTTAAGTGAAACCAACCAAACCTTTAG
TINEIYRPLNIQFTLVGLEI
TGGTCCAACCAAGATTTGATCACCGTTACTTCTGTATCCCACGACACTCTGGCATCCTTC
----------+---------+---------+---------+----------+---------+
ACCAGGTTGGTTCTAAACTAGTGGCAATGAAGACATAGGGTGCTGTGAGACCGTAGGAAG
WSNQDLITVTSVSHDTLASF • · « ««· * · • · · • ♦··· ·
GGTAACTGGCGTGAAACCGACCTGCTGCGTCGCCAACGTCATGATAACGCTCAACTGCTG ---------+---------+---------+---------+---------+---------+
CCATTGACCGCACTTTGGCTGGACGACGCAGCGGTTGCAGTACTATTGCGAGTTGACGAC
GNW RETDLLRRQRHDNAQLL
ACCGCTATCGACTTCGACGGTGATACTGTTGGTCTGGCTTACGTTGGTGGCATGTGTCAA
---------+---------+---------+---------+---------+ _.--------+
TGGCGATAGCTGAAGCTGCCACTATGACAACCAGACCGAATGCAACCACCGTACACAGTT
TAIDFDGDTVGLAYVGGMCQ
CTGAAACATTCTACTGGTGTTATCCAGGACCACTCCGCTATTAACCTGCTGGTTGCTCTG
---------+-------—+---------+---------+---------+---------+
GACTTTGTAAGATGACCACAATAGGTCCTGGTGAGGCGATAATTGGACGACCAACGAGAC
LKHSTGVI QDHSAINLLVAL
ACCATGGCACACGAACTGGGTCATAACCTGGGTATGAACCACGATGGCAACCAGTGTCAC — ------+.---------+--------—+---------+---------+---------+
TGGTACCGTGTGCTTGACCCAGTATTGGACCCATACTTGGTGCTACCGTTGGTCACAGTG
TMAHELGHNLGMNHDGNQCH
TGCGGTGCAAACTCCTGTGTTATGGCTGCTATGCTGTCCGATCAACCATCCAAACTGTTC
---------+---------+---------+---------+---------+---------+
ACGCCACGTTTGAGGACACAATACCGACGATACGACAGGCTAGTTGGTAGGTTTGACAAG
CGANSCVMA AMLSD QPSKLF
TCCGACTGCTCTAAGAAAGACTACCAGACCTTCCTGACCGTTAACAACCCGCAGTGTATC
---------+---------+---------+---------+---------+---------+
AGGCTGACGAGATTCTTTCTGATGGTCTGGAAGGACTGGCAATTGTTGGGCGTCACATAG
SDCSKKDYQT FLTVNNPQCI
Notl
CTGAACAAACCGTAAGCGGCCGCCAGCTTTCTAGAACAAAAACTCATCTCAGAAGAGGAT _________+---------+---------+-------------------+---------+
GACTTGTTTGGCATTCGCCGGCGGTCGAAAGATCTTGTTTTTGAGTAGAGTCTTCTCCTA
L N K P *AAAS .FLEQKLISEED ·» 4*·» •4 4444 ·
4444 44 4
4 4444 44 4
4 444 4444444 4 4 • 444 44 4 4444
44 ·· « 44 44
CTGAATAGCGCCGTCGACCATCATCATCATCATCATTGAGTTTGTAGCCITAGACATGAC
---------Η-----------Η---------+---------+---------+---------+
GACTTATCGCGGCAGCTGGTAGTAGTAGTAGTAGTAACTCAAACATCGGAATCTGTACTG
LNSAVDHHHHHH*VCSLRHD
TGTTCCTCAGTTCAAGTTGGGCACTTACGAGAAGACCGGTCTTGCTAGATTCTAATCAAG
---------+----------h---------4----------+----------).---------+
ACAAGGAGTCAAGTTCAACCCGTGAATGCTCTTCTGGCCAGAACGATCTAAGATTAGTTC
CSSVQ. VGHLREDRSC*ILIK
AGGATGTCAGAATGCCATTTGCCTGAGAGATGCAGGCTTCATTTTTGATACTTTTTTATT
---------+ —i-------+---------M----------+---------+---------+
TCCTACAGTCTTACGGTAAACGGACTCTCTACGTCCGAAGTAAAAACTATGAAAAAATAA CCTACAGTCTTACGGTAAACG-5' Oligo 2
RMSECHLPERCRLHF*YFFI
9999
9 9
9 9
9 9 9
9 9 9
99 ·* ···· ·> · • · · · 9 9
9 9 9 9 9 9 • · · · · 9 9 999 • · · · · · · ·· 99 99 9
Příklad 2
Exprese NATu v Pichia pastoris
Při pokusech exprimovat DNA NATu v E.coli, velmi slabé sbalení do sekundární struktury a požadavek na zředěné podmínky snížily efektivitu purifikace. Tyto a jiné úvahy vedly k použití druhu kvasinek Pichia pastoris jako hostitelské buňky. Kultura selektovaných buněčných klonů Pichia pastoris, které byly transfekovány cDNA prepo NATu (SEQ ID NO: 4) byla inokulována do 500 ml inokulačního růstového média, popsaného zde:
Na 1 litr média
Kvasničný extrakt 30,0 g
Fosforečnan draselný dihydrát 17,2 g
Glukóza 20,0 g
Biotin 0,004 g
Voda do 1 litru
Fosforečná kyselina, 85% upravit pH na 6,00
Transfekované P.pastoris byly inkubovány ve 30 °C ve třepačce po dobu 30-32 hodin. Přibližně 1% (hmotnostní) výsledné kultury bylo použito jako inokulum do 10-ti litrového fermentoru. Fermentor obsahoval sterilní základní soli a glukózu (níže) . Dvanáct mililitrů na litr PTM4 solí (PTM4 je roztok stopových kovů obsahující síran měďný pentahydrát, jodid sodný, síran hořečnatý monohydrát, molybdan sodný dihydrát, kyselina boritá, chlorid kobaltnatý hexahydrát, chlorid zinečnatý, síran železnatý heptahydrát, d-biotin, kyselina sírová a purifikovaná voda) bylo přidáno do litrové dávky média po sterilizaci fermentoru. Růstová teplota ve fermentoru byla 30°C. pH ve fermentoru bylo regulováno hydroxidem amonným a kyselinou fosforečnou na hodnotu 6.00. Zinek ze zinečnatých solí, které byly přidány do média byly inkorporovány do NATu jako součást struktury metaloproteinázy.
Základní soli na litrovou dávku média
| Fosforečná kyselina, 85% | 26,7 ml |
| Síran vápenatý | 0,93 g |
| Síran draselný | 18,2 g |
| Síran hořečnatý-7 H2O | 14,9 g |
·· ··
Hydroxid draselný Glukóza
Voda
4,13 g 30,0 g do 1 litru
Kultura se nechá růst, dokud není veškerá glukóza spotřebována (17 až 20 hodin). Potom se začne se „sytící fází. „Sytící médium je tvořeno glukózou a 12 ml PTM4 solí na 1 litr. Indukce sycení se sestává z glukózy, 25% metanolu, a 12 ml PTM4 solí na 1 litr. Při indukci je teplota reaktoru 20°C. Indukční fáze trvá 60 až 75 hodin. Upravená média byla sklizena a buněčné zbytky byly vyhozeny.
Příklad 3
Purifikace NATu z Pichia pastoris
Kvasinková živná půda z Příkladu 2 byla vyčištěna a upraveno pH na 6,5 a vodivost 10-20mS/ cm. Živná půda byla nalita na imobilizovanou kovovou afinitní pryskyřici, která byla naplněna mědí a ekvilibrována fosfátovým pufrem (PBS). Pryskyřice byla opláchnuta v PBS a vymývána gradientem imidazolu (0-100 mM) v PBS. Frakce, které obsahovaly maturovaný NAT (SEQ ID No:l) byly dány dohromady a ředěny dokud vodivost nebyla nižší než 1,5 mS/cm, pH 6,4. Ředěný vzorek byl nalit na SP Sefarózovou pryskyřici (Amersham Pharmacia Biotech, lne., Piscataway, NJ) , která byla ekvilibrována 10 mM 2-(Nmorfolino)ethan-sírovou kyselinou (MES). Kolona byla omyta pomocí MES a eluována a vymyta pomocí gradientu NaCl (0-500mM) v MES.
Frakce, které obsahovaly NAT byly dány dohromady a uschovány.
Příklad 4
Trombolýza v akutní trombóze v krysí krkavici, porovnání NATu s Urokinázou
Aby se prokázala biologická aktivita a funkční jednoznačnost maturovaného NATu (SEQ ID NO:1) byly provedeny farmakologické studie na krysách. Anodovým proudem bylo vytvořeno ohniskové poškození na jedné krkavici. Toto poškození vyvolalo do 15 minut vytvořeni okluzivni krevní sraženiny. Po vytvoření trombu, byla tepna ještě po 30 minut pozorována, zda je okluze krkavice stabilní. Poté byl aplikován intravenózně heparin a aspirin, aby se předešlo šíření trombu. Zvířata byla léčena pomocí intra-arteriálních infuzí testované látky. Byl sledován průtok krve krkavicí během podávání testovaného materiálu, takže úspěšné rozpuštění krevní sraženiny mohlo být detekováno a také mohl být zaznamenán čas lýzy. Procenta pokusů, kdy byla sraženina rozpuštěna byly zaznamenány a vypočítán průměr pouze u těch, kde byla sraženina úspěšně rozpuštěna. Protože je měřen hemoragický potenciál testované látky, všechna krev která byla vyloučena z operačního místa byla sbírána gázovými tampóny. Tampóny byly umístěny do roztoku detergentu, aby se rozpustily červené krvinky a množství uvolněného hemoglobinu bylo poté měřeno spektrofotometricky.
Podle množství vysušeného hemoglobinu byly vypočítány ztráty krve. Data získaná v testech jsou uvedena v tabulce dále.
Table 1
Výskyt lýzy krevní sraženiny, čas za který došlo k rozpuštění sraženiny a operační ztráty krve (průměr ± standardní odchylka)
| VÝSKYT LÝZY <%) | ČAS (min) | KREVNÍ ZTRÁTY (ml) | |
| FYZIOLOGICKÝ ROZTOK (n=6) | 0% ( 0 ze 6) | NEMĚŘENO | 0,10 ±0,23 |
| Urokináza 25 U/ min (n=15) | 33% (5 z 15) | 55,3 ± 15,9 | 1,06 ± 1,59 |
| Urokináza 250 U/ml (n=15) | 86 % (13 z 15) | 33,5 ± 15,3 | 1,43 ± 1,45 |
| NAT 2mg (n=14) | 78% (11 z 14) | 6,3 ± 5,8 | 0,96 ± 0,77 |
Tyto studie prokazují, že NAT je biologicky aktivní na zvířecím modelu v in vivo lýze krevní sraženiny.
Dále, rozpuštění krevní sraženiny bylo dosaženo ve značně kratším čase a s menšími ztrátami krve z operačního místa, v porovnání s urokinázou. Tak profil aktivity NATu může být odlišen od třídy plasminogen-aktivátorů trombolytických činitelů •» · • · (reprezentovaných urokinázou), tak že rozpuštění krevní sraženiny NATem proběhne rychleji a se sníženými hemoragickými komplikacemi.
Fibrinolytická aktivita NATu je srovnatelná s firolázou. A navíc, jak bylo zmíněno výše, stabilita N-konce NATu vede k větší homogenitě koncového produktu při rekombinantní expresi, což je nesporná výhoda (např. N-konec se v čase nemění na směs různých forem, což vytváří stabilnější polypeptid).
99 9
Obrázek 1
MRFPSIFTAV
YSDLEGDFDV
SLEKREAEAS
KYEDAMQYEF
GREITTYPLG
KLQGEMYLIE
TONWESYEPI
KYNGDSDKIR
NQDLITVTSV
IDFDGDTVGL
AHELGHNLGM
CSKKDYQTFL
LFAASSALAA
AVLPFSNSTN
SIILESGNVN
KVNSEPWLH
EDHCYYHGRI
PLELSDSEAH
KKAFQLNLTK
QWVHQIVNTI
SHDTLASFGN
AYVGGMCQLK
NHDGNQCHCG
TVNNPQCILN
PVNTTTEDET
NGLLFINTTI
DYEWYPRKV
LEKNKGLFSE
ENDADSTASI
AVYKYENVEK
RSFPQRYVQL
NEIYRPLNIQ
WRETDLLRRQ
HSTGVIQDHS
ANSCVMAAML
KP
AQIPAEAVIG
ASIAAKEEGV
TPVPRGAVQP
DYSETHYSPD
SACNGLKGHF
EDEAPKMCGV
VIVADHRMNT
Etlvgleiws
RHDNAQLLTA
AINLLVALTM
SDQPSKLFSD • · ···· · · • · · · • · · * · · · · • · · · · ©-· ·· ♦·
Seznam sekvencí <110> Boone, Thomas C.
Li, Huimin Mann, Michael B.
<120> Fybrinolyticky aktivní polypeptid <130> A-596 <140> 09/411,329 <141> 1999-10-01 <160> 20 <170> Patentln Ver. 2.1 <210> 1 <211> 201 PRT <213> umělá sekvence <220>
<223> Popis umělé sekvence: NAT (analog fibrolázy z Agkistrodon contortrix) <400> 1
| Ser 1 | Phe | Pro | Gin | Arg 5 | Tyr | Val | Gin | Leu | Val 10 | Ile | Val | Ala | Asp | His 15 | Arg |
| Met | Asn | Thr | Lys 20 | Tyr | Asn | Gly | Asp | Ser 25 | Asp | Lys | Ile | Arg | Gin 30 | Trp | Val |
| His | Gin | Ile 35 | Val | Asn | Thr | Ile | Asn 40 | Glu | Ile | Tyr | Arg | Pro 45 | Leu | Asn | Ile |
| Gin | Phe 50 | Thr | Leu | Val | Gly | Leu 55 | Glu | Ile | Trp | Ser | Asn .60 | Gin | Asp | Leu | Ile |
| Thr 65 | Val | Thr | Ser | Val | Ser 70 | His | Asp | Thr | Leu | Ala 75 | Ser | Phe | Gly | Asn | Trp 80 |
| Arg | Glu | Thr | Asp | Leu 85 | Leu | Arg Arg | Gin | Arg 90 | His | Asp | Asn | Ala | Gin 95 | Leu | |
| Leu | Thr | Ala | Ile 100 | Asp | Phe | Asp | Gly | Asp 105 | Thr | Val | Gly | Leu | Ala 110 | Tyr | Val |
| Gly | Gly | Met 115 | Cys | Gin | Leu | Lys | His 120 | Ser | Thr | Gly | Val | Ile 125 | Gin | Asp | His |
| Ser | Ala 130 | Ile | Asn | Leu | Leu | Val 135 | Ala | Leu | Thr | Met | Ala 140 | His | Glu | Leu | Gly |
| His 145 | Asn | Leu | Gly | Met | Asn 150 | His | Asp | Gly | Asn | Gin 155 | Cys | His | Cys | Gly | Ala 160 |
• ·
| Asn | Ser | Cys | Val | Met | Ala | Ala | Met | Leu | Ser | Asp Gin | Pro | Ser | Lys | Leu |
| 165 | 170 | 175 | ||||||||||||
| Phe | Ser | Asp | Cys | Ser | Lys | Lys | Asp | Tyr | Gin | Thr Phe | Leu | Thr | Val | Asn |
| 180 | 185 | 190 | ||||||||||||
| Asn | Pro | Gin | Cys | Ile | Leu | Asn | Lys | Pro |
195 200 <210> 2 <211> 603 <212> DNA <213> umělá sekvence <220>
<223> pOpis umělé sekvence: kódující NAT (analog fibrolázy) <400> 2 tctttcccac aaagatacgt acagctggtt atcgttgctg accaccgtat gaacactaaa 60 tacaacggtg actctgacaa aatccgtcaa tgggtgcacc aaatqgtcaa caccattaac 120 gaaatctaca gaccactgaa catccaattc actttggttg gtttggaaat ctggtccaac 180 caagatttga tcaccgttac ttctgtatcc cacgacactc tggcatcctt cggtaactgg 240 cgtgaaaccg acctgctgcg tcgccaacgt catgataacg ctcaactgct gaccgctatc 300 gacttcgacg gtgatactgt tggtctggct tacgttggtg gcatgtgtca actgaaacat 360 tctactggtg ttatccagga ccactccgct attaacctgc tggttgctct gaccatggca 420 cacgaactgg gtcataacct gggtatgaac cacgatggca accagtgtca ctgcggtgca 480 aactcctgtg ttatggctgc tatgctgtcc gatcaaccat ccaaactgtt ctccgactgc 540 tctaagaaag actaccagac cttcctgacc gttaacaacc cgcagtgtat cctgaacaaa 600 ccg 603 <210> 3 <211> 462 <212> PRT <213> Umělá sekvence <220>
<223> pOpis umělé sekvence: Nativní pro-NAT (analog fibrolázy)
| <400> 3 Met Arg 1 | Phe | Pro | Ser 5 | Ile | Phe | Thr | Ala | Val 10 | Leu | Phe | Ala | Ala | Ser 15 | Ser | |
| Ala | Leu | Ala | Ala. 20 | Pro | Val | Asn | Thr | Thr 25 | Thr | Glu | Asp | Glu | Thr 30 | Ala | Gin |
| Ile | Pro | Ala 35 | Glu | Ala | Val | Ile | Gly 40 | Tyr | Ser | Asp | Leu | Glu 45 | Gly | Asp | Phe |
| Asp | Val 50 | Ala | Val | Leu | Pro | Phe 55 | Ser | Asn | Ser | Thr | Asn 60 | Asn | Gly | Leu | Leu |
• · · • · ··· · • ·· ·
| Phe 65 | Ile | Asn | Thr | Thr | Ile 70 | Ala | Ser | Ile | Ala | Ala 75 | Lys | Glu | Glu | Gly | Val 80 |
| Ser | Leu | Glu | Lys | Arg 85 | Glu | Ala | Glu | Ala | Ser 90 | Ser | Ile | Ile | Leu | Glu 95 | Ser |
| Gly | Asn | Val | Asn 100 | Asp | Tyr | Glu | Val | Val 105 | Tyr | Pro | Arg | Lys | Val 110 | Thr | Pro |
| Val | Pro | Arg 115 | Gly | Ala | Val | Gin | Pro 120 | Lys | Tyr | Glu | Asp | Ala 125 | Met | Gin | Tyr |
| Glu | Phe 130 | Lys | Val | Asn | Ser | Glu 135 | Pro | Val | Val | Leu | His 140 | Leu | Glu | Lys | Asn |
| Lys 145 | Gly | Leu | Phe | Ser | Glu 150 | Asp | Tyr | Ser | Glu | Thr 155 | His | Tyr | Ser | Pro | Asp 160 |
| Gly | Arg | Glu | Ile | Thr 165 | Thr | Tyr | Pro | Leu | Gly 170 | Glu | Asp | His | Cys | Tyr 175 | Tyr |
| His | Gly | Arg | Ile 180 | Glu | Asn | Asp | Ala | Asp 185 | Ser | Thr | Ala | Ser • | Ile 190 | Ser | Ala |
| Cys | Asn | Gly 195 | Leu | Lys | Gly | His | Phe 200 | Lys | Leu | Gin | Gly | Glu 205 | Met | Tyr | Leu |
| Ile | Glu 210 | Pro | Leu | Glu | Leu | Ser 215 | Asp | Ser | Glu | Ala | His 220 | Ala | Val | Tyr | Lys |
| Tyr 225 | Glu | Asn | Val | Glu | Lys 230 | Glu | Asp | Glu | Ala | Pro 235 | Lys | Met | Cys | Gly | Val 240 |
| Thr | Gin | Asn | Trp | Glu 245 | Ser | Tyr | Glu | Pro | Ile 250 | Lys | Lys | Ala | Phe | Gin 255 | Leu |
| Asn | Leu | Thr | Lys 260 | Arg | Ser | Phe | Pro | Gin 265 | Arg | Tyr | Val | Gin | Leu 270 | Val | Ile |
| Val | Ala | Asp 275 | His | Arg | Met | Asn | Thr 280 | Lys | Tyr | Asn | Gly Asp 285 | Ser | Asp | Lys | |
| Ile | Arg 290 | Gin | Trp | Val | His | Gin 295 | Ile | val | Asn | Thr | Ile 300 | Asn | Glu | Ile | Tyr |
| Arg 305 | Pro | Leu | Asn | Ile | Gin 310 | Phe | Thr | Leu | Val | Gly 315 | Leu | Glu | Ile | Trp | Ser 320 |
| Asn | Gin | Asp | Leu | Ile 325 | Thr | Val | Thr | Ser | Val 330 | Ser | His | Asp | Thr | Leu 335 | Ala |
| Ser | Phe | Gly | Asn 340 | Trp | Arg | Glu | Thr | Asp 345 | Leu | Leu | Arg | Arg | Gin 350 | Arg | His |
| Asp | Asn | Ala | Gin | Leu | Leu | Thr | Ala | Ile | Asp | Phe | Asp | Gly Asp | Thr | Val |
355 360 365 ····
• · A ·· ·
| Gly | Leu 370 | Ala | Tyr | Val | Gly | Gly 375 | Met | Cys | Gin | Leu | Lys 380 | His | Ser | Thr | Gly |
| Val 385 | Ile | Gin | Asp | His | Ser 390 | Ala | Ile | Asn | Leu | Leu’ Val 395 | Ala | Leu | Thr | Met 400 | |
| Ala | His | Glu | Leu | Gly 405 | His | Asn | Leu | Gly | Met 410 | Asn | His | Asp | Gly | Asn 415 | Gin |
| Cys | His | Cys | Gly 420 | Ala | Asn | Ser | Cys | Val 425 | Met | Ala | Ala | Met | Leu 430 | Ser | Asp |
| Gin | Pro | Ser 435 | Lys | Leu | Phe | Ser | Asp 440 | Cys | Ser | Lys | Lys | Asp 445 | Tyr | Gin | Thr |
| Phe | Leu | Thr | Val | Asn | Asn | Pro | Gin | Cys | Ile | Leu | Asn | Lys | Pro |
450 455 460 <210> 4 <211> 1386 <212> DNA <213> Umělá sekvence <220>
<223> ρΟρί3 umělé sekvence: kóduje pro-NAT (analog fibrolázy) <400> 4 atgagatttc ccagtcaaca tactcagatt aacgggttat tctctcgaga gattacgaag aagtacgaag ttggaaaaaa ggtagagaaa gaaaacgatg aagttgcaag gctgtctaca acccaaaact agatctttcc aaatacaacg aacgaaatct aaccaagatt tggcgtgaaa atcgacttcg cattctactg gcacacgaac gcaaactcct tgctctaaga aaaccg cttcaatttt ctacaacaga tagaagggga tgtttataaa aaagagaggc ttgttcatcc atgccatgca acaaaggttt ttactactta ctgactccac gtgaaatgta agtacgaaaa gggaatcata cacaaagata gtgactctga acagaccact tgatcaccgt ccgacctgct acggtgatac gtgttatcca tgggtcataa gtgttatggc aagactacca tactgctgtt agatgaaacg tttcgatgtt tactactatt tgaagcttct aagaaaggtc atacgaattc gttctctgaa cccattgggt tgcttctatc cttgattgaa cgtcgaaaag tgaaccaatc cgtacagctg caaaatccgt gaacatccaa tacttctgta gcgtcgccaa tgttggtctg ggaccactcc cctgggtatg tgctatgctg gaccttcctg ttattcgcag gcacaaattc gctgttttgc gccagcattg tctattatct actccagttc aaggttaaca gattactctg gaagatcact tctgcttgta ccattggaat gaagatgaag aagaaggcct gttatcgttg caatgggtgc ttcactttgg tcccacgaca cgtcatgata gcttacgttg gctattaacc aaccacgatg tccgatcaac accgttaaca catcctccgc cggctgaagc cattttccaa ctgctaaaga
Cggaatctgg ctággggtgc gtgaaccagt .aaactcatta gttactacca acggtttgaa tgtccgactc ccccaaagat tccaattaaa ctgaccaccg accaaatcgt ttggtttgga ctctggcatc acgctcaact gtggcatgtg tgctggttgc gcaaccagtg catccaaact acccgcagtg attagctgct 60 tgtcatcggt 120 cagcacaaat 180 agaaggggta 240 taacgttaac 300 tgttcaacca 360 tgtcttgcac 420 ctccccagat 480 tggtagaatc 540 gggtcatttc 600 tgaagcccat 660 gtgtggtgtt 720 cttgactaag 780 tatgaacact 840 caacaccatt 900 aatctggtcc 960 cttcggtaac 1020 gctgaccgct 1080 tcaactgaaa 1140 tctgaccatg 1200 tcactgcggt 1260 gttctccgac 1320 tatcctgaac 1380
1386 • · « · · · <210> 5 <211> 203 <212> PRT <213> Agkistrodon contortrix <220>
<223> Nativní fibroláza z Agkistrodon contortrix <400> 5
| Gin 1 | Gin | Arg | Phe Pro 5 | Gin Arg Tyr Val Gin Leu Val Ile Val Ala Asp | |
| 10 | 15 | ||||
| His | Arg | Met | Asn Thr 20 | Lys Tyr Asn Gly Asp Ser Asp 25 | Lys Ile Arg Gin 30 |
| Trp | Val | His 35 | Gin Ile | Val Asn Thr Ile Asn Glu Ile 40 | Tyr Arg Pro Leu 45 |
| Asn | Ile 50 | Gin | Phe Thr | Leu Val Gly Leu Glu Ile Trp 55 60 | Ser Asn Gin Asp |
| Leu 65 | Ile | Thr | Val Thr | Ser Val Ser His Asp Thr Leu 70 75 | Ala Ser Phe Gly 80 |
| Asn | Trp | Arg | Glu Thr 85 | Asp Leu Leu Arg Arg Gin Arg 90 | His Asp Asn Ala 95 |
| Gin | Leu | Leu | Thr Ala 100 | Ile Asp Phe Asp Gly Asp Thr 105 | Val Gly Leu Ala 110 |
| Tyr | Val | Gly 115 | Gly Met | Cys Gin Leu Lys His Ser Thr 120 | Gly Val Ile Gin 125 |
| Asp | His 130 | Ser | Ala Ile | Asn Leu Leu Val Ala Leu Thr 135 140 | Met Ala His Glu |
| Leu 145 | Gly | His | Asn Leu | Gly Met Asn His Asp Gly Asn 150 155 | Gin Cys His Cys 160 |
| Gly | Ala | Asn | Ser Cys 165 | Val Met Ala Ala Met Leu Ser 170 | Asp Gin Pro Ser 175 |
| Lys Leu Phe Ser Asp Cys Ser Lys Lys Asp Tyr Gin 180 185 Val Asn Asn Pro Gin Cys Ile Leu Asn Lys Pro 195 200 <210> 6 <211> 609 <212> DNA <213> Agkistrodon contortrix <220> | Thr Phe Leu Thr 190 | ||||
| <223> Kóduje nativní fibrolázu z Agkistrodon contortrix |
• · · · · · • · . · · · · · · <400> 6 caacaaagat tcccacaaag atacgtacag ctggttatcg ttgctgacca ccgtatgaac 60 actaaataca acggtgactc tgacaaaatc cgtcaatggg tgcaccaaat cgtcaacacc 120 attaacgaaa tctacagacc actgaacatc caattcacCt tggttggttt ggaaatctgg 180 tccaaccaag atttgatcac cgttacttct gtatcccacg acactctggc atccttcggt 240 aactggcgtg aaaccgácct gctgcgtcgc caacgtcatg ataacgctca actgctgacc 300 gctatcgact ccgacggtga tactgttggt ctggcttacg _ttggtggcat gtgtcaactg 360 aaacattcta ctggtgttat ccaggaccac tccgctatta acctgctggt tgctctgacc 420 atggcacacg aactgggtca taacctgggt atgaaccacg atggcaacca gtgtcactgc 480 ggtgcaaact cctgtgttat ggctgctatg ctgtccgatc aaccatccaa actgttctcc 540 gactgctcta agaaagacta ccagaccttc ctgaccgtta acaacccgca gtgtatcctg 600 aacaaaccg 6Qq <210> 7 <211> 1392 <212> DNA <213> Agkistrodon contortrix <220>
<223> Kódující sekvence nativní pro-fibrolázy z Agkistrodon contortrix <400> 7 atgagatttc cttcaatttt tactgctgtt ccagtcaaca ctacaacaga agatgaaacg tactcagatt tagaagggga tttcgatgtt aacgggttat tgtttataaa tactactatt tctctcgaga aaagagaggc tgaagcttct gattacgaag ttgtttatcc aagaaaggtc aagtacgaag atgccatgca atacgaattc ttggaaaaaa acaaaggttt gttctctgaa ggtagagaaa ttactactta cccattgggt gaaaacgatg ctgactccac tgcttctatc aagttgcaag gtgaaatgta cttgattgaa gctgtctaca agtacgaaaa cgtcgaaaag acccaaaact gggaatcata tgaaccaatc agacaacaaa gattcccaca aagatacgta aacactaaat acaacggtga ctctgacaaa accattaacg aaatctacag accactgaac tggtccaacc aagatttgat caccgttact ggtaactggc gtgaaaccga cctgctgcgt accgctatcg, acttcgacgg tgatactgtt ctgaaacatt ctactggtgt tatccaggac accatggcac acgaactggg tcataacctg tgcggtgcaa actcctgtgt tatggctgct tccgactgct ctaagaaaga ctaccagacc ctgaacaaac cg ttattcgcag catcctccgc attagctgct 60 gcacaaattc cggctgaagc tgtcatcggt 120 gctgttttgc cattttccaa cagcacaaat 180 gccagcattg ctgctaaaga agaaggggta 240 tctattatct tggaatctgg taacgttaac 300 actccagttc ctaggggtgc tgttcaacca 360 aaggttaaca gtgaaccagt tgtcttgcac 420 gattactctg aaactcatta ctccccagat 480 gaagatcact gttactacca tggtagaatc 540 tctgcttgta acggtttgaa gggtcatttc 600 ccattggaat tgtccgactc tgaagcccat 660 gaagatgaag ccccaaagat gtgtggtgtt 720 aagaaggcct tccaattaaa cttgactaag 780 cagctggtta tcgttgctga ccaccgtatg 840 atccgtcaat gggtgcacca aatcgtcaac 900 atccaattca ctttggttgg tttggaaatc 960 tctgtatccc acgacactct ggcatccttc 1020 cgccaacgtc atgataacgc tcaactgčtg 1080 ggtctggctt acgttggtgg catgtgtcaa 1140 cactccgcta ttaacctgct ggttgctctg 1200 ggtatgaacc acgatggcaa ccagtgtcac 1260 atgctgtccg atcaaccatc caaactgttc 1320 ttcctgaccg ttaacaaccc gcagtgtatc 1380
1392 <210> 8 <211> 21 <212> DNA <213> umělá sekvence • · · · •« · • · · · <220>
<223> ρΟρϊ3 umělé sekvence: Oligonukleotid <400> 8 tactattgcc agcattgctg c <210> 9 <211> 21 <212> DNA <213> Umělá sekvence <220>
<223> popis umělé sekvence: Oligonukleotid <400> 9 cctacagtct tacggtaaac g <210> 10 <211> 45 <212> DNA <213> Umělá sekvence <220>
<223> Popis umělé sekvence: Oligonukleotid <400> 10 tccaattaaa cttgactaag agatctttcc cacaaagata cgtac <210> 11 <211> 44 <212> DNA <213> Umělá sekvence <220>
<223> Popis umělé sekvence: Oligonukleotid <400> 11 ggttaatttg aactgattct ctagaaaggg tgtttctatg catg <210> 12 <211> 1620 <212> DNA <213> Agkistrodon contortrix <220>
<221> misc_feature <222> Komplement ( (1) . . (1620)) β · 0·0 ·
9··· <223> KortlPlementární (sens) řetězec k antisensovému řetězci (viz SEQ ID NO:13) <220>
<223> Kódující sekvence nativní pro-fibrolázy z Agkistrodon contortrix <400> 12 atgagatttc cttcaatttt tactgctgtt ttattcgcag catcctccgc attagctgct 60 ccagtcaaca ctacaacaga agatgaaacg gcacaaattc cggctgaagc tgtcatcggt 120 tactcagatt tagaagggga tttcgaťgtt gctgttttgc cattttccaa cagcacaaat 180 aacgggttat tgtttacaaa tactactatt gccagcattg ctgctaaaga agaaggggta 240 tctctcgaga aaagagaggc tgaagcttct tctattatct tggaatctgg taacgttaac 300 gactacgaag ttgtttatcc aagaaaggcc actccagttc ctaggggtgc tgttcaacca 360 aagtacgaag atgccatgca atacgaattc aaggttaaca gtgaaccagt tgtcttgcac 420 ttggaaaaaa acaaaggttt gttctctgaa gattactctg aaactcatta ctccccagat 480 ggtagagaaa ttactactta cccattgggt gaagatcact gttactacca tggtagaatc 540 gaaaacgatg ctgactccac tgcttctatc tctgcttgta acggtttgaa gggtcatttc 600 aagttgcaag gtgaaatgta cttgattgaa ccattggaat tgtccgactc tgaagcccat 660 gctgtctaca agtacgaaaa jjgtcgaaaag gaagatgaag ccccaaagat gtgtggtgtt 720 acccaaaact gggaatcata tgaaccaatc aagaaggcct tccaattaaa cttgactaag 780 agacaacaaa gattcccaca aagatacgta cagctggtta tcgttgctga ccaccgtatg 840 aacactaaat acaacggtga ctctgacaaa atccgtcaat gggtqcacca aatcgtcaac 900 accattaacg aaatctacag accactgaac atccaattca ctttggttgg tttggaaatc 960 tggtccaacc aagatttgat caccgttact tctgtatccc acgacactct ggcatccttc 1020 ggtaactggc gtgaaaccga cctgctgcgt cgccaacgtc atgataacgc tcaactgctg 1080 accgctatcg acttcgacgg tgatactgtt ggtctggctt acgttggtgg catgtgtcaa 1140 ctgaaacatt ctactggtgt tatccaggac cactccgcta ttaacctgct ggttgctctg 1200 accatggcac acgaactggg tcataacctg ggtatgaacc acgatggcaa ccagtgtcac 1260 tgcggtgcaa actcctgtgt tatggctgct atgctgtccg atcaaccatc caaactgttc 1320 tccgactgct ctaagaaaga ctaccagacc ttcctgaccg ttaacaaccc gcagtgtatc 1380 ctgaacaaac cgtaagcggc cgccagcttt ctagaacaaa aactcatctc agaagaggat 1440 ctgaatagcg ccgtcgacca tcatcatcat catcattgag tttgtagcct tagacatgac 1500 tgttcctcag ttcaagttgg gcacttacga gaagaccggt cttgctagat tctaatcaag 1560 aggatgtcag aatgccattt gcctgagaga tgcaggcttc atttttgata cttttttatt 1620 <210> 13 <211> 1620 <212> DNA <213> Agkistrodon contortrix <220>
<221> misc_feature <222> Complement((1)..(1620)) <223> Komplementární (antisens) řetězec k sens řetězci (viz SEQ ID No:12) <220>
<223> Anti-kódující sekvence nativní pro-fibrolázy z Agkistrodon contortrix <400> 13 aataaaaaag tatcaaaaat gaagcctgca tctctcaggc aaatggcatt ctgačatcct 60 cttgattaga atctagcaag accggtcttc tcgtaagtgc ccaacttgaa ctgaggaaca 120 gtcatgtcta aggctacaaa ctcaatgatg atgatgacga tggtcgacgg cgctattcag 180
99 9
9 9·· »··· « · » 9 · 9 • 9 99 atcctcttct gagatgagtt ctcgttctag aaagctggcg gccgcttacg gtttgttcag 240 gatacactgc gggttgttaa cggtcaggaa ggtctggtag tctttcttag agcagtcgga 300 gaacagtttg gatggttgat cggacagcat agcagccata acacaggagt ttgcaccgca 360 gtgacactgg ttgccatcgt ggttcatacc caggttatga cccagttcgt gtgccatggt 420 cagagcaacc agcaggttaa tagcggagtg gtcctggaca acaccagtag aatgtttcag 480 ttgacacatg ccaccaacgt aagccagacc aacagtatca ccgtcgaagt cgatagcggt 540 cagcagttga gcgttatcat gacgctggcg acgcagcagg tcggtttcac gccagttacc 600 gaaggatgcc agagtgtcgt gggatacaga agtaacggtg atcaaatctt ggttggacca 660 gatttccaaa ccaaccaaag tgaattggat gttcagtggt ctgtagatte cgttaatggt 720 gttgacgatt tggtgcaccc attgacggat tttgtcagag tcaccgttgt atttagtgtt 780 catacggtgg tcagcaacga taaccagctg tacgtatctt tgtgggaatc tttgttgtct 840 cttagtcaag tttaattgga aggccttctt gattggttca tatgattccc agttttgggt 900 aacaccacac atctttgggg cttcatcttc cttttcgacg ttttcgtact tgtagacagc 960 atgggcttca gagtcggaca attccaatgg ttcaatcaag tacatttcac cttgcaactt 1020 gaaatgaccc ttcaaaccgt tacaagcaga gatagaagca gtggagtcag catcgttttc 1080 gattctacca tggtagtaac agtgatcttc acccaatggg taagtagtaa tttctctacc 1140 atctggggag taatgagttt cagagtaatc ttcagagaac aaacctttgt ttttttccaa 1200 gtgcaagaca actggttcac tgttaacctt gaattcgtat tgcatggcat cttcgtactt 1260
Cggttgaaca gcacccctag gaactggagt gacctttct.t ggataaacaa cttcgtaatc 1320 gttaacgtta ccagattcca agataataga agaagcttca gcctctcttt tctcgagaga 1380 taccccttct tctttagcag eaatgctggc aatagtagta tttataaaca ataacccgtt 1440 atttgtgctg ttggaaaatg gcaaaacagc aacatcgaaa tccccttcta aatctgagta 1500 accgatgaca gcttcagccg gaatttgtgc cgtttcatct tctgttgtag tgttgactgg 1560 agcagctaat gcggaggatg ctgcgaataa aacagcagta aaaattgaag gaaatctcat 1620 <210> 14 <211> 540 <212> PRT <213> Agkistrodon contortrix <220>
<223> Xaa na pozicích 465, 493, 516 a 536 značí stop kodóny.
<220>
<223> Nativní pro-fibroláza z Agkistrodon contortrix <400> 14
| Met 1 | Arg | Phe | Pro | Ser 5 | Ile | Phe | Thr | Ala | Val 10 | Leu | Phe | Ala | Ala | Ser 15 | Ser |
| Ala | Leu | Ala | Ala 20 | Pro | Val | Asn | Thr | Thr 25 | Thr | Glu | Asp | Glu | Thr 30 | Ala | Gin |
| Ile | Pro | Ala 35 | Glu | Ala | Val | Ile | Gly 40 | Tyr | Ser | Asp | Leu | Glu 45 | Gly | Asp | Phe |
| Asp | Val 50 | Ala | Val | Leu | Pro | Phe 55 | Ser | Asn | Ser | Thr | Asn 60 | Asn | Gly | Leu | Leu |
| Phe 65 | Ile | Asn | Thr | Thr | Ile 70 | Ala | Ser | Ile | Ala | Ala 75 | Lys | Glu | Glu | Gly | Val 80 |
| Ser | Leu | Glu | Lys | Arg 85 | Glu | Ala | Glu | Ala | Ser 90 | Ser | Ile | Ile | Leu | Glu 95 | Ser |
·♦··
| Gly | Asn | Val | Asn 100 | Asp | Tyr | Glu | Val | Val 105 | Tyr | Pro | Arg | Lys | Val 110 | Thr | Pro |
| Val | Pro | Arg 115 | Gly | Ala | Val | Gin | Prc 120 | Lys | Tyr | Glu | Asp | Ala 125 | Met | Gin | Tyr |
| Glu | Phe 130 | Lys | Val | Asn | Ser | Glu 135 | Pro | Val | Val | Leu .His 140 | Leu | Glu | Lys | Asn | |
| Lys 145 | Gly | Leu | Phe | Ser | Glu 150 | Asp | Tyr | Ser | Glu | Thr 155 | His | Tyr | Ser | Pro | Asp 160 |
| Gly | Arg | Glu | Ile | Thr 165 | Thr | Tyr | Pro | Leu | Gly 170 | Glu | Asp | His | Cys | Tyr 175 | Tyr |
| His | Gly | Arg | Ile 180 | Glu | Asn | Asp | Ala | Asp 185 | Ser | Thr | Ala | Ser | Ile 190 | Ser | Ala |
| Cys | Asn | Gly 195 | Leu | Lys | Gly | His | Phe 200 | Lys | Leu | Gin | Gly | Glu 205 | Met | Tyr | Leu |
| Ile | Glu 210 | Pro | Leu | Glu | Leu | Ser 215 | Asp | Ser | Glu | Ala | His 220 | Ala | Val | Tyr | Lys |
| Tyr 225 | Glu | Asn | Val | Glu | Lys 230 | Glu | Asp | Glu | Ala | Pro 235 | Lys | Met | Cys | Gly | Val 240 |
| Thr | Gin | Asn | Trp | Glu 245 | Ser | Tyr | Glu | Pro | Ile 250 | Lys | Lys | Ala | Phe | Gin 255 | Leu |
| Asn | Leu | Thr | Lys 260 | Arg | Gin | Gin | Arg | Phe 265 | Pro | Gin | Arg | Tyr | Val 270 | Gin | Leu |
| Val | Ile | Val 275 | Ala | Asp | His | Arg | Met 280 | Asn | Thr | Lys | Tyr | Asn 285 | Gly Asp | Ser | |
| Asp | Lys 290 | Ile | Arg | Gin | Trp | Val 295 | His | Gin | Ile | Val | Asn 300 | Thr | Ile | Asn | Glu |
| Ile 305 | Tyr | Arg | Pro | Leu | Asn 310 | Ile | Gin | Phe | Thr | Leu 315 | Val | Gly | Leu | Glu | Ile 320 |
| Tip | Ser | Asn | Gin | Asp 325 | Leu | Ile | Thr | Val | Thr 330 | Ser | Val | Ser | His | Asp 335 | Thr |
| Leu | Ala | Ser | Phe 340 | Gly | Asn | Trp | Arg | Glu 345 | Thr | Asp | Leu | Leu | Arg 350 | Arg | Gin |
| Arg | His | Asp 35S | Asn | Ala | Gin | Leu | Leu 360 | Thr | Ala | Ile | Asp | Phe 365 | Asp | Gly | Asp |
| Thr | Val 370 | Gly | Leu | Ala | Tyr | Val 375 | Gly | Gly | Met | Cys | Gin 380 | Leu | Lys | His | Šer |
| Thr 385 | Gly | Val | Ile Gin | Asp 390 | His | Ser Ala Ile Asn Leu Leu Val Ala Leu | |||||||||
| 395 | 400 | ||||||||||||||
| Thr | Met | Ala | His | Glu | Leu | Gly | His | Asn | Leu | Gly | Met | Asn | His | Asp | Gly |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Asn | Gin | Cys | His | Cys | Gly | Ala | Asn | Ser | Cys | Val | Met | Ala | Ala | Met | Leu |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Ser | Asp | Gin | Pro | Ser | Lys | Leu | Phe | Ser | Asp | Cys | Ser | Lys | Lys | Asp | Tyr |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Gin | Thr | Phe | Leu | Thr | Val | Asn | Asn | Pro | Gin | Cys | Ile | Leu | Asn | Lys | Pro |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Xaa | Ala | Ala | Ala | Ser | Phe | Leu | Glu | Gin | Lys | Leu | Ile | Ser | Glu | Glu | Asp |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Leu | Asn | Ser | Ala | Val | Asp | His | His | His | His | His | His | Xaa | Val | Cys | Ser |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Leu | Arg | His | Asp | Cys | Ser | Ser | Val | Gin | Val | Gly | His | Leu | Arg | Glu | Asp |
| 500 | 505 | • | 510 | ||||||||||||
| Arg | Ser | Cys | Xaa | Ile | Leu | Ile | Lys | Arg | Met | Ser | Gly | Cys | His | Leu | Pro |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Glu | Arg | Cys | Arg | Leu | His | Phe | Xaa | Tyr | Phe | Phe | Ile | ||||
| 530 | 535 | 540 |
<210> 15 <211> 203 <212> PRT <213> Agkistrodon contortrix <220>
<223> Nativní fibroláza z Agkistrodon contortrix <220>
<223> xaa na pozici 1 zastupuje chemickou sloučeninu
-kyselinu pyroglutamovou. Táto chemická sloučenina je označovaná v seznamu písmenemE.
| <400> 15 | Gin Leu Val Ile Val Ala Asp | ||||||
| Xaa Gin 1 | Arg Phe Pro 5 | Gin | Arg | Tyr | Val | ||
| 10 | 15 | ||||||
| His Arg | Met Asn Thr 20 | Lys | Tyr | Asn | Gly 25 | Asp | Ser Asp Lys Ile Arg Gin 30 |
| Trp Val | His Gin Ile 35 | Val | Asn | Thr 40 | Ile | Asn | Glu Ile Tyr Arg Pro Leu 45 |
Φ· φφφφ φφ φφφφ
| Asn | Xle 50 | Gin | Phe | Thr | Leu | Val 55 | Gly | Leu | Glu | Ile | Trp 60 | Ser | Asn | Gin | Asp |
| Leu 65 | Ile | Thr | Val | Thr | Ser 70 | Val | Ser | His | Asp | Thr 75 | Leu | Ala | Ser | Phe | Gly 80 |
| Asn | Trp | Arg | Glu | Thr 85 | Asp | Leu | Leu | Arg | Arg 90 | Gin | Arg | His | Asp | Asn 95 | Ala |
| Gin | Leu | Leu | Thr 100 | Ala | Ile | Asp | Phe | Asp 105 | Gly | Asp | Thr | Val | Gly 110 | Leu | Ala |
| Tyr | Val | Gly 115 | Gly | Met | Cys | Gin | Leu 120 | Lys | His | Ser | Thr | Gly 125 | Val | Ile | Gin |
| Asp | His 130 | Ser | Ala | Ile | Asn | Leu 135 | Leu | Val | Ala | Leu | Thr 140 | Met | Ala | His | Glu |
| Leu 145 | Gly | His | Asn | Leu | Gly 15£ | Met | Asn | His | Asp | Gly 155 | Asn | Gin | Cys | His | Cys 160 |
| Gly | Ala | Asn | Ser | Cys 165 | Val | Met | Ala | Ala | Met 170 | Leu | Ser | Asp • | Gin | Pro 175 | Ser |
| Lys | Leu | Phe | Ser 180 | ASP | Cys | Ser | Lys | Lys 185 | Asp | Tyr | Gin | Thr | Phe 190 | Leu | Thr |
| Val | Asn | Asn 195 | Pro | Gin | Cys | Ile | Leu 200 | Asn | Lys | Pro |
<210> 16 <211> 202 <212> PRT <213> Agkistrodon contortrix <220>
<223> Nativní fibroláza z Agkistrodon contortrix <220>
<223> xaa na pozici 1 zastupuje chemickou sloučeninu
-kyselinu pyroglutamovou. Tato chemická sloučenina
| je | označovaná | v seznamu | písmenemE. | |
| <400> 16 | ||||
| Xaa 1 | Arg Phe | Pro Gin Arg 5 | Tyr Val Gin | Leu Val Ile Val Ala Asp His 10 15 |
| Arg | Met Asn | Thr Lys Tyr 20 | Asn Gly Asp 25 | Ser Asp Lys Ile Arg Gin Trp 30 |
| Val | His Gin 35 | Ile Val Asn | Thr Ile Asn 40 | Glu Ile Tyr Arg Pro Leu Asn 45 |
·*«·
999·
| Ile Gin 50 | Phe | Thr Leu Val | Gly Leu Glu Ile Trp Ser Asn Gin | Asp Leu | |||||||||||
| 55 | 60 | ||||||||||||||
| Ile | Thr | Val | Thr | Ser | Val | Ser | His | Asp | Thr | Leu | Ala | Ser | Phe | Gly | Asn |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Trp | Arg | Glu | Thr | Asp | Leu | Leu | Arg | Arg | Gin | Arg | His | Asp | Asn | Ala | Gin |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Thr | Ala | Ile | Asp | Phe | Asp | Gly | Asp | Thr | Val | Gly | Leu | Ala | Tyr |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Val | Gly | Gly | Met | Cys | Gin | Leu | Lys | His | Ser | Thr | Gly | Val | Ile | Gin | Asp |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| His | Ser | Ala | Ile | Asn | Leu | Leu | Val | Ala | Leu | Thr | Met | Ala | His | Glu | Leu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Gly | His | Asn | Leu | Gly | Met | Asn | His | Asp | Gly | Asn | Gin | Cys | His | Cys | Gly |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ala | Asn | Ser | Cys | Val | *% Met | Ala | Ala | Met | Leu | Ser | Asp | Gin | Pro | Ser | Lys |
| 165 | 170 | • | 175 | ||||||||||||
| Leu | Phe | Ser | Asp | Cys | Ser | Lys | Lys | Asp | Tyr | Gin | Thr | Phe | Leu | Thr | Val |
| 180 | 185 | • | 190 | ||||||||||||
| Asn | Asn | Pro | Gin | Cys | Ile | Leu | Asn | Lys | Pro | ||||||
| 195 | 200 |
<210> 17 <211> 538 <212> PRT <213> Umělá sekvence <220>
<223> Popis umělé sekvence: analog nativní pro-fibrolázy z Agkistrodon contortrix <400> 17
| Met 1 | Arg | Phe | Pro | Ser 5 | Ile | Phe | Thr | Ala | Val 10 | Leu | Phe | Ala | Ala | Ser 15 | Ser |
| Ala | Leu | Ala | Ala 20 | Pro | Val | Asn | Thr | Thr 25 | Thr | Glu | Asp | Glu | Thr 30 | Ala | Gin |
| Ile | Pro | Ala 35 | Glu | Ala | Val | Ile | Gly 40 | Tyr | Ser | Asp | Leu | Glu 45 | Gly | Asp | Phe |
| Asp | Val 50 | Ala | Val | Leu | Pro | Phe 55 | Ser | Asn | Ser | Thr | Asn 60 | Asn | Gly | Leu | Leu |
| Phe 65 | Ile | Asn | Thr | Thr | Ile 70 | Ala | Ser | Ile | Ala | Ala 75 | Lys | Glu | Glu | Gly | Val 80 |
·· 4444 > 4 4 «
44
| Ser | Leu | Glu | Lys | Arg 85 | Glu | Ala | Glu | Ala | Ser 90 | Ser | Ile | Ile | Leu | Glu 95 | Ser |
| Gly | Asn | Val | Asn 100 | Asp | Tyr | Glu | Val | Val 105 | Tyr | Pro | Arg | Lys | Val 110 | Thr | Pro |
| Val | Pro | Arg 115 | Gly | Ala | Val | Gin | Pro 120 | Lys | Tyr | Glu | Asp | Ala 125 | Met | Gin | Tyr |
| Glu | Phe 130 | Lys | Val | Asn | Ser | Glu 135 | Pro | Val | Val | Leu | His 140 | Leu | Glu | Lys | Asn |
| Lys 145 | Gly | Leu | Phe | Ser | Glu 150 | Asp | Tyr | Ser | Glu | Thr 155 | His | Tyr | Ser | Pro | Asp 160 |
| Gly | Arg | Glu | Ile | Thr 165 | Thr | Tyr | Pro | Leu | Gly 170 | Glu | Asp | His | Cys | Tyr 175 | Tyr |
| His | Gly | Arg | Ile 180 | Glu | Asn | Asp | Ala | Asp 185 | Ser | Thr | Ala | Ser | Ile 190 | Ser | Ala |
| Cys | Asn | Gly 195, | Leu | Lys | Gly | His | Phe 200 | Lys | Leu | Gin | Gly | Glu 305 | Met | Tyr | Leu |
| Ile | Glu 210 | Pro | Leu | Glu | Leu | Ser 215 | Asp | Ser | Glu | Ala | His 22*0 | Ala | Val | Tyr | Lys |
| Tyr 225 | Glu | Asn | Val | Glu | Lys 230 | Glu | Asp | Glu | Ala | Pro 235 | Lys | Met | Cys | Gly | Val 240 |
| Thr | Gin | Asn | Trp | Glu 245 | Ser | Tyr | Glu | Pro | Ile 250 | Lys | Lys | Ala | Phe | Gin 255 | Leu |
| Asn | Leu | Thr | Lys 260 | Arg | Ser | Phe | Pro | Gin 265 | Arg | Tyr | Val | Gin | Leu 270 | Val | Ile |
| Val | Ala | Asp 275 | His | Arg | Met | Asn | Thr 280 | Lys | Tyr | Asn | Gly | Asp 285 | Ser | Asp | Lys |
| Ile | Arg 290 | Gin | Trp | Val | His | Gin 295 | Ile | Val | Asn | Thr | Ile 300 | Asn | Glu | Ile | Tyr |
| Arg 305 | Pro | Leu | Asn | Ile | Gin 310 | Phe | Thr | Leu | Val | Gly 315 | Leu | Glu | Ile | Trp | Ser 320 |
| Asn | Gin | Asp | Leu | Ile 325 | Thr | Val | Thr | Ser | Val 330 | Ser | His | Asp | Thr | Leu 335 | Ala |
| Ser | Phe | Gly | Asn 340 | Trp | Arg | Glu | Thr | Asp 345 | Leu | Leu | Arg | Arg | Gin 350 | Arg | His |
| Asp | Asn | Ala 355 | Gin | Leu | Leu | Thr | Ala 360 | Ile | Asp | Phe | Asp | Gly 365 | Asp | Thr | Val |
| Gly | Leu | Ala | Tyr | Val | Gly Gly | Met | Cys | Gin | Leu | Lys | His | Ser | Thr | Gly |
370 375 380 ·· ···· .· ··«·
| Val 385 | Ile | Gin | Asp | His | Ser 390 | Ala | Ile | Asn | Leu | Leu 395 | Val | Ala | Leu | Thr | Met 400 |
| Ala | His | Glu | Leu | Gly 405 | His | Asn | Leu | Gly | Met 410 | Asn | His | Asp | Gly | Asn 415 | Gin |
| Cys | His | Cys | Gly 420 | Ala | Asn | Ser | Cys | Val 425 | Met | Ala | Ala | Met | Leu 430 | Ser | Asp |
| Gin | Pro | Ser 435 | Lys | Leu | Phe | Ser | Asp 440 | Cys | Ser | Lys | Lys | Asp 445 | Tyr | Gin | Thr |
| Phe | Leu 450 | Thr | Val | Asn | Asn | Pro 455 | Gin | Cys | Ile | Leu | Asn 460 | Lys | Pro | Xaa | Ala |
| Ala 465 | Ala | Ser | Phe | Leu | Glu 470 | Gin | Lys | Leu | Ile | Ser 475 | Glu | Glu | Asp | Leu | Asn 480 |
| Ser | Ala | Val | Asp | His 485 | His | His | His | His | His 490 | Xaa | Val | Cys | Ser | Leu 495 | Arg |
| His | Asp | Cys | Ser 500 | Ser | Val | Gin | Val | Gly 505 | His | Leu | Arg | Glu • | Asp 510 | Arg | Ser |
| Cys | Xaa | Ile 515 | Leu | Ile | Lys | Arg | Met 520 | Ser | Glu | Cys | His | Leu 525 | Pro | Glu | Arg |
| Cys | Arg 530 | Leu | His | Phe | Xaa | Tyr 535 | Phe | Phe | Ile |
<210> 18 <211> 602 <212> DNA <213> Agkistrodon contortrix <220>
<223> Fragment fibrolázy z Agkistrodon contortrix <400> 18 tactattgcc agcattgctg ctaaagaaga aggggtatct ctcgagaaaa gagaggctga 60 agcttcttct attatcttgg aatctggtaa cgttaacgat tacgaagttg tttatccaag 120 aaaggtcact ccagttccta ggggtgctgt tcaaccaaag tacgaagatg ccatgcaata 180 cgaattcaag gttaacagtg aaccagttgt cttgcacttg gaaaaaaaca aaggtttgtt 240 ctctgaagat tactctgaaa ctcattactc cccagatggt agagaaatta ctacttaccc 300 attgggtgaa gatcactgtt actaccatgg tagaatcgaa aacgatgctg actccactgc 360 ttctatctct gcttgtaacg gtttgaaggg tcatttcaag ttgcaaggtg aaatgtactt 420 gattgaacca ttggaattgt ccgactctga agcccatgct gtctacaagt acgaaaacgt 480 cgaaaaggaa gatgaagccc caaagatgtg tggtgttacc caaaactggg aatcatatga 540 accaatcaag aaggccttcc aattaaactt gactaagaga tctttcccac aaagatacgt 600 ac 602 <210> 19 <211> 816 ·· ··· · ·· ···· ·* 9
9 9 9 9 9 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9 9 9
9 9999 9999 999 9
9 9 9 9 9 · · · · ·
99 99 9 99 99 <212> DNA.
<213> Agkistrodon contortrix <220>
<223> Fragment fibrolázy z Agkistrodon contortrix <400> 19 tccaattaaa cttgactaag agatctttcc cacaaagata cgtacagctg gttatcgttg 60 ctgaccaccg tatgaacact aaatacaacg gtgactctga caaaatccgt caatgggtgc 120 accaaatcgt caacaccatt aacgaaatct acagaccact gaacatccaa ttcactttgg 180 ttggtttgga aatctggtcc aaccaagatt tgatcaccgt tacttctgta tcccacgaca 240 ctctggcatc cttcggtaac tggcgtgaaa ccgacctgct gcgtcgccaa cgtcatgata 300 acgctcaact gctgaccgct atcgacttcg acggtgatac tgttggtctg gcttacgttg 360 gtggcatgtg tcaactgaaa cattctactg gtgttatcca ggaccactcc gctattaacc 420 tgctggttgc tctgaccatg gcacacgaac tgggtcataa cctgggtatg aaccacgatg 480 gcaaccagtg tcactgcggt gcaaactcct gtgttatggc tgctatgctg tccgatcaac 540 catccaaact gttctccgac tgctctaaga aagactacca gaccttcctg accgttaaca 600 acccgcagtg tatcctgaac aaaccgtaag cggccgccag ctttctagaa caaaaactca 660 tctcagaaga ggatctgaat agcgccgtcg accatcatca tcatcatcat tgagtttgta 720 gccttagaca tgactgttcc tcagttcaag ttgggcactt acgagaagac cggtcttgct 780 agattctaat caagaggatg tcagaatgcc atttgc 816 <210> 20 <211> 1373 <212> DNA <213> Agkistrodon contortrix <220>
<223> Fragment fibrolázy z Agkistrodon contortrix <400> 20 tactattgcc agcattgctg ctaaagaaga aggggtatct ctcgagaaaa gagaggctga 60 agcttcttct attatcttgg aatctggtaa cgttaacgat tacgaagttg tttatccaag 120 aaaggtcact ccagttccta ggggtgctgt tcaaccaaag tacgaagatg ccatgcaata 180 cgaattcaag gttaacagtg aaccagttgt cttgcacttg gaaaaaaaca aaggtttgtt 240 ctctgaagat tactctgaaa ctcattactc cccagatggt agagaaatta ctacttaccc 300 attgggtgaa gatcactgtt actaccatgg tagaatcgaa aacgatgctg actccactgc 360 ttctatctct gcttgtaacg gtttgaaggg tcatttcaag ttgcaaggtg aaatgtactt 420 gattgaacca ttggaattgt ccgactctga agcccatgct gtctacaagt acgaaaacgt 480 cgaaaaggaa gatgaagccc caaagatgtg tggtgttacc caaaactggg aatcatatga 540 accaatcaag aaggccttcc aattaaactt gactaagaga tctttcccac aaagatacgt 600 acagctggtt atcgttgctg accaccgtat gaácactaaa tacaacggtg actctgacaa 660 aatccgtcaa tgggtgcacc aaatcgtcaa caccattaac gaaatctaca gaccactgaa 720 catccaattc actttggttg gtttggaaat ctggtccaac caagatttga tcaccgttac 780 ttctgtatcc cacgacactc tggcatcctt cggtaactgg cgtgaaaccg acctgctgcg 840 tcgccaacgt catgataacg ctcaactgct gaccgctatc gacttcgacg gtgatactgt 900 tggtctggct tacgttggtg gcatgtgtca actgaaacat tctactggtg ttatccagga 960 ccactccgct attaacctgc tggttgctct gaccatggca cacgaactgg gtcataacct 1020 gggtatgaac cacgatggca accagtgtca ctgcggtgca aactcctgtg ttatggctgc 1080 tatgctgtcc gatcaaccat ccaaactgtt ctccgactgc tctaagaaag actaccagac 1140 cttcctgacc gttaacaacc cgcagtgtat cctgaacaaa ccgtaagcgg ccgccagctt 1200 tctagaacaa aaactcatct cagaagagga tctgaatagc gccgtcgacc atcatcatca 1260 tcatcattga gtttgtagcc ttagacatga ctgttcctca gttcaagttg ggcacttacg 1320 agaagaccgg tcttgctaga ttctaatcaa gaggatgtca gaatgccatt tgc 1373
44 · ·♦ 4
4 4
4 4 4 »« 4 4 4 4 4
4 4 4 4
44 44
·4«4 - .
4 4 4 4 4
4 4 * 4 4
4 4 4 4 4 4
4 4 4 4 4
Claims (15)
- PATENTOVÉ NÁROKY1. Fibrinolyticky aktivní polypeptid má aminokyselinovou sekvenci SEQ ID NO:1.
- 2. Polypeptid z nároku 1, který byl vyroben rekombinantní expresí v kvasinkách.
- 3. Molekula nukleové kyseliny kóduje polypeptid o sekvenci SEQ ID NO:1.
- 4. Molekula nukleové kyseliny z nároku 3 která má sekvenci SEQ ID NO :4.
- 5. Expresní vektor obsahuje expresní regulační prvky, které jsou účinně připojeny k molekule nukleové kyseliny podle nároku 3.
- 6. Expresní vektor podle nároku 5 ve kterém je molekula nukleové kyseliny má nukleotidovou sekvenci SEQ ID NO:4.
- 7. Hostitelská buňka transformovaná nebo transfekovaná molekulou nukleové kyseliny podle nároku 3.
- 8. Transformovaná nebo transfekovaná hostitelská buňka podle nároku 7, která je prokaryotická nebo eukaryotická.
- 9. Transformovaná nebo transfekovaná prokaryotická buňka podle nároku 8, která je kvasinková buňka.
- 10. Transformovaná nebo transfekovaná kvasinková buňka podle národu 9, která je Pichia pastoris.
- 11. Metoda produkce NATu, zahrnující kultivaci hostitelských buněk obsahujících DNA molekulu kódující uvedenou metaloproteinázu , • ft ···· ·· * ··*· • · ···· · * * • · · « · · · · « « • ft · · ft · ···· « · ft · ···· · · · ···· • ft ·» ft · · · · · · účinně připojenou k regulačním prvkům které stimulují expresi za podmínek, že je DNA molekula exprimována a izolace exprimované metaloproteinázy z kultury hostitelských buněk.
12. Metoda z nároku 11, 13. Metoda z nároku 11, kvasinky. 14 . Metoda z nároku 13, Pichia pastoris. kde DNA molekula je SEQ ID NO:4.ve které jsou hostitelské buňky ve kterém jsou kvasinkové buňky - 15. Metoda produkce metalaloproteinázy-fybrinolytického agens vybraného ze skupiny sestávající se z fibrolázy NATu, obsahující kultivaci Pichia hostitelských buněk, které obsahují DNA molekulu kódující zmíněnou metaloproteinázu, účinně připojenou k regulačním prvkům pro stimulaci exprese za podmínek kdy je DNA molekula exprimována a izolace exprimované metaloproteinázy z kultury hostitelských buněk.
- 16. Metoda z nároku 15, kde Pichia hostitelská buňka je Pichia pastořis.
- 17. Metoda léčby trombózy u savců zahrnující podávání trombolyticky efektivního množství NATu savcům.
- 18. Protilátku proti polypeptidu z nároku 1.Protilátka z nároku 17 která je monoklonální protilátka.
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US09/411,329 US6261820B1 (en) | 1999-10-01 | 1999-10-01 | Fibronolytically active polypeptide |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CZ20021034A3 true CZ20021034A3 (cs) | 2003-06-18 |
| CZ298502B6 CZ298502B6 (cs) | 2007-10-24 |
Family
ID=23628486
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CZ20021034A CZ298502B6 (cs) | 1999-10-01 | 2000-09-29 | Fibrinolyticky aktivní polypeptid a zpusob jeho produkce a použití, protilátka, molekula nukleové kyseliny, expresní vektor a hostitelská bunka |
Country Status (29)
| Country | Link |
|---|---|
| US (4) | US6261820B1 (cs) |
| EP (2) | EP1605049A3 (cs) |
| JP (1) | JP2003511034A (cs) |
| KR (2) | KR100700753B1 (cs) |
| CN (2) | CN101230340A (cs) |
| AT (1) | ATE292180T1 (cs) |
| AU (1) | AU767827B2 (cs) |
| BG (1) | BG106577A (cs) |
| BR (1) | BR0014414A (cs) |
| CA (1) | CA2386185A1 (cs) |
| CZ (1) | CZ298502B6 (cs) |
| DE (1) | DE60019147T2 (cs) |
| DK (1) | DK1224298T3 (cs) |
| EA (2) | EA006487B1 (cs) |
| ES (1) | ES2240167T3 (cs) |
| HK (1) | HK1049351B (cs) |
| HU (1) | HUP0202650A3 (cs) |
| IL (1) | IL148787A0 (cs) |
| MX (1) | MXPA02003126A (cs) |
| NO (1) | NO20021501L (cs) |
| NZ (1) | NZ517951A (cs) |
| PL (1) | PL355017A1 (cs) |
| PT (1) | PT1224298E (cs) |
| RS (1) | RS20060033A (cs) |
| SG (1) | SG127720A1 (cs) |
| SK (1) | SK4232002A3 (cs) |
| WO (1) | WO2001025445A1 (cs) |
| YU (2) | YU59604A (cs) |
| ZA (1) | ZA200202206B (cs) |
Families Citing this family (21)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6440414B1 (en) | 1999-10-01 | 2002-08-27 | Amgen Inc. | Pharmaceutical compositions of fibrinolytic agent |
| US6261820B1 (en) | 1999-10-01 | 2001-07-17 | Amgen Inc. | Fibronolytically active polypeptide |
| US7033776B2 (en) * | 1999-12-17 | 2006-04-25 | Amgen Inc. | Method for treatment of indwelling catheter occlusion using fibrinolytic metalloproteinases |
| US6455269B1 (en) * | 1999-12-17 | 2002-09-24 | Amgen, Inc. | Method for localized administration of fibrinolytic metalloproteinases |
| US6523647B2 (en) * | 2001-05-21 | 2003-02-25 | Hydro Mobile Inc. | Elevating platform assembly |
| EP1482882B1 (en) * | 2002-02-11 | 2011-09-14 | Gold-T Tech, Inc. | Implantable device for preventing thrombus formation |
| US7016409B2 (en) * | 2003-11-12 | 2006-03-21 | Sony Corporation | Apparatus and method for use in providing dynamic bit rate encoding |
| ES2239532B1 (es) * | 2004-02-06 | 2006-11-01 | Proyecto De Biomedicina Cima S.L. | Metodo para evaluar el riesgo y la predisposicion a desarrollar una patologia relacionada con la presencia de autoanticuerpos frente a epcr. |
| US20070141625A1 (en) * | 2005-02-03 | 2007-06-21 | Santos Jose H | Method for assessing risk of and predisposition to development of a pathology related to the presence of anti-epcr autoantibodies |
| EP1986568B1 (en) | 2006-02-03 | 2017-04-05 | Covidien LP | Methods and devices for restoring blood flow within blocked vasculature |
| WO2010102307A1 (en) | 2009-03-06 | 2010-09-10 | Lazarus Effect, Inc. | Retrieval systems and methods for use thereof |
| US10207240B2 (en) | 2009-11-03 | 2019-02-19 | Gen9, Inc. | Methods and microfluidic devices for the manipulation of droplets in high fidelity polynucleotide assembly |
| WO2012129363A2 (en) | 2011-03-24 | 2012-09-27 | President And Fellows Of Harvard College | Single cell nucleic acid detection and analysis |
| CN107873054B (zh) | 2014-09-09 | 2022-07-12 | 博德研究所 | 用于复合单细胞核酸分析的基于微滴的方法和设备 |
| US10456560B2 (en) | 2015-02-11 | 2019-10-29 | Covidien Lp | Expandable tip medical devices and methods |
| US11873483B2 (en) | 2015-03-11 | 2024-01-16 | The Broad Institute, Inc. | Proteomic analysis with nucleic acid identifiers |
| US11092607B2 (en) | 2015-10-28 | 2021-08-17 | The Board Institute, Inc. | Multiplex analysis of single cell constituents |
| WO2017075297A1 (en) | 2015-10-28 | 2017-05-04 | The Broad Institute Inc. | High-throughput dynamic reagent delivery system |
| US12071663B2 (en) | 2016-01-15 | 2024-08-27 | Massachusetts Institute Of Technology | Semi-permeable arrays for analyzing biological systems and methods of using same |
| US11072816B2 (en) | 2017-05-03 | 2021-07-27 | The Broad Institute, Inc. | Single-cell proteomic assay using aptamers |
| WO2022182799A1 (en) * | 2021-02-23 | 2022-09-01 | Clara Foods Co. | Compositions for preparing animal-free egg-like products |
Family Cites Families (35)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| FR2310133A2 (fr) * | 1975-05-05 | 1976-12-03 | Fabre Sa Pierre | Nouveau medicament comportant un activateur du plasminogene perfectionne |
| US4447236A (en) * | 1982-02-05 | 1984-05-08 | Cordis Corporation | Infusion catheter system |
| DE3330699A1 (de) * | 1983-08-25 | 1985-03-07 | Boehringer Mannheim Gmbh, 6800 Mannheim | Verfahren zur gleichzeitigen bestimmung von fibrinogen und fibrinogen-spaltprodukten im plasma |
| US4610879A (en) | 1984-01-06 | 1986-09-09 | University Of Southern California | Fibrinolytic enzyme from snake vernom |
| CA1237482A (en) * | 1984-03-09 | 1988-05-31 | Frank B. Stiles | Catheter for effecting removal of obstructions from a biological duct |
| US4755167A (en) * | 1984-04-10 | 1988-07-05 | Research Corporation | In vivo method for distribution and stirring of therapeutic agents |
| US4885242A (en) * | 1984-10-30 | 1989-12-05 | Phillips Petroleum Company | Genes from pichia histidine pathway and uses thereof |
| US4855231A (en) * | 1984-10-30 | 1989-08-08 | Phillips Petroleum Company | Regulatory region for heterologous gene expression in yeast |
| US4837148A (en) * | 1984-10-30 | 1989-06-06 | Phillips Petroleum Company | Autonomous replication sequences for yeast strains of the genus pichia |
| US4818700A (en) * | 1985-10-25 | 1989-04-04 | Phillips Petroleum Company | Pichia pastoris argininosuccinate lyase gene and uses thereof |
| US4812405A (en) * | 1986-02-18 | 1989-03-14 | Phillips Petroleum Company | Double auxotrophic mutants of Pichia pastoris and methods for preparation |
| US5000185A (en) * | 1986-02-28 | 1991-03-19 | Cardiovascular Imaging Systems, Inc. | Method for intravascular two-dimensional ultrasonography and recanalization |
| ZA889415B (en) | 1987-12-18 | 1989-09-27 | Chiron Corp | Compositions and method for recombinant production of crotalidus venum fibrolase |
| WO1990007352A1 (en) | 1989-01-04 | 1990-07-12 | Boston Scientific Corporation | Angioplasty catheter |
| US5222941A (en) * | 1990-01-12 | 1993-06-29 | Don Michael T Anthony | Method of dissolving an obstruction in a vessel |
| JPH05184352A (ja) * | 1990-01-16 | 1993-07-27 | Centro De Ing Genetica Y Biotecnol | ピヒア パストリス(Pichia pastoris)酵母中での異種遺伝子の発現方法、発現ベクターおよび形質転換微生物 |
| US5709676A (en) * | 1990-02-14 | 1998-01-20 | Alt; Eckhard | Synergistic treatment of stenosed blood vessels using shock waves and dissolving medication |
| US5250034A (en) * | 1990-09-17 | 1993-10-05 | E-Z-Em, Inc. | Pressure responsive valve catheter |
| US5167628A (en) * | 1991-05-02 | 1992-12-01 | Boyles Paul W | Aortic balloon catheter assembly for indirect infusion of the coronary arteries |
| US5380273A (en) * | 1992-05-19 | 1995-01-10 | Dubrul; Will R. | Vibrating catheter |
| EP0624642B1 (en) | 1993-05-12 | 1999-01-20 | Indian Council For Medical Research | Novel thrombolytic agent, process for preparing same and its use for the preparation of a thrombi dissolving medicament |
| US5370653A (en) * | 1993-07-22 | 1994-12-06 | Micro Therapeutics, Inc. | Thrombectomy method and apparatus |
| EP0689843B1 (en) | 1993-12-17 | 2003-09-10 | Mochida Pharmaceutical Co., Ltd. | Composition containing soluble thrombomodulins |
| US5626564A (en) * | 1995-03-31 | 1997-05-06 | Creighton University | Adjustable sideholes catheter |
| US5830468A (en) * | 1995-05-17 | 1998-11-03 | The New York Blood Center, Inc. | Fibrin(ogen) degradation by fibrinolytic matrix metalloproteinase |
| US6020181A (en) * | 1995-05-17 | 2000-02-01 | New York Blood, Inc. | Inhibition of thrombus formation by medical related apparatus comprising treating with fibrinolytic matrix metalloproteinase |
| US5741779A (en) * | 1996-05-10 | 1998-04-21 | Xoma Corporation | Antithrombotic materials and methods |
| DE69734060T2 (de) * | 1996-05-24 | 2006-06-29 | Angiotech Pharmaceuticals, Inc., Vancouver | Zubereitungen und verfahren zur behandlung oder prävention von krankheiten der körperpassagewege |
| US5951981A (en) * | 1996-12-02 | 1999-09-14 | Diatide, Inc. | Thrombolytic agents with antithrombotic activity |
| US6413760B1 (en) * | 1997-04-15 | 2002-07-02 | Genetics Institute, Inc. | Highly purified mocarhagin cobra venom protease polynucleotides endcoding same and related proteases and therapeutic uses thereof |
| WO1999029838A1 (en) * | 1997-12-09 | 1999-06-17 | Bristol-Myers Squibb Company | Fibrinogen-converting enzyme hybrids |
| US6261820B1 (en) | 1999-10-01 | 2001-07-17 | Amgen Inc. | Fibronolytically active polypeptide |
| US6440414B1 (en) | 1999-10-01 | 2002-08-27 | Amgen Inc. | Pharmaceutical compositions of fibrinolytic agent |
| US6455269B1 (en) * | 1999-12-17 | 2002-09-24 | Amgen, Inc. | Method for localized administration of fibrinolytic metalloproteinases |
| WO2002012283A2 (en) | 2000-08-03 | 2002-02-14 | Zymogenetics, Inc. | Disintegrin homologs, zsnk10, zsnk11, and zsnk12 |
-
1999
- 1999-10-01 US US09/411,329 patent/US6261820B1/en not_active Expired - Fee Related
-
2000
- 2000-09-20 YU YU59604A patent/YU59604A/sh unknown
- 2000-09-20 YU YU22502A patent/YU22502A/sh unknown
- 2000-09-29 WO PCT/US2000/027029 patent/WO2001025445A1/en not_active Ceased
- 2000-09-29 MX MXPA02003126A patent/MXPA02003126A/es active IP Right Grant
- 2000-09-29 NZ NZ517951A patent/NZ517951A/en unknown
- 2000-09-29 HU HU0202650A patent/HUP0202650A3/hu unknown
- 2000-09-29 PT PT00965554T patent/PT1224298E/pt unknown
- 2000-09-29 IL IL14878700A patent/IL148787A0/xx unknown
- 2000-09-29 CN CNA2008100053253A patent/CN101230340A/zh active Pending
- 2000-09-29 JP JP2001528597A patent/JP2003511034A/ja not_active Withdrawn
- 2000-09-29 KR KR1020067019636A patent/KR100700753B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 2000-09-29 RS YUP-2006/0033A patent/RS20060033A/sr unknown
- 2000-09-29 DK DK00965554T patent/DK1224298T3/da active
- 2000-09-29 DE DE60019147T patent/DE60019147T2/de not_active Expired - Fee Related
- 2000-09-29 EA EA200400290A patent/EA006487B1/ru unknown
- 2000-09-29 PL PL00355017A patent/PL355017A1/xx not_active IP Right Cessation
- 2000-09-29 EP EP05006771A patent/EP1605049A3/en not_active Withdrawn
- 2000-09-29 SG SG200401889A patent/SG127720A1/en unknown
- 2000-09-29 KR KR1020027004225A patent/KR100711312B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 2000-09-29 SK SK423-2002A patent/SK4232002A3/sk not_active Application Discontinuation
- 2000-09-29 EA EA200200410A patent/EA005944B1/ru not_active IP Right Cessation
- 2000-09-29 AU AU76254/00A patent/AU767827B2/en not_active Ceased
- 2000-09-29 EP EP00965554A patent/EP1224298B1/en not_active Expired - Lifetime
- 2000-09-29 ES ES00965554T patent/ES2240167T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2000-09-29 HK HK03100667.9A patent/HK1049351B/en not_active IP Right Cessation
- 2000-09-29 CZ CZ20021034A patent/CZ298502B6/cs not_active IP Right Cessation
- 2000-09-29 AT AT00965554T patent/ATE292180T1/de not_active IP Right Cessation
- 2000-09-29 CA CA002386185A patent/CA2386185A1/en not_active Abandoned
- 2000-09-29 CN CNB008163219A patent/CN100357430C/zh not_active Expired - Fee Related
- 2000-09-29 BR BR0014414-2A patent/BR0014414A/pt not_active Application Discontinuation
-
2001
- 2001-05-01 US US09/846,729 patent/US6617145B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2002
- 2002-03-19 ZA ZA200202206A patent/ZA200202206B/en unknown
- 2002-03-26 NO NO20021501A patent/NO20021501L/no not_active Application Discontinuation
- 2002-04-04 BG BG106577A patent/BG106577A/bg unknown
-
2003
- 2003-05-20 US US10/441,667 patent/US7195903B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2007
- 2007-02-06 US US11/702,972 patent/US20080058256A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CZ20021034A3 (cs) | Fibrinolyticky aktivní polypeptid | |
| JP4722989B2 (ja) | 新規な抗血管形成ペプチド、それをコードするポリヌクレオチド、および血管形成を阻害する方法 | |
| HU224827B1 (hu) | Új antiangiogén peptidek, azokat kódoló polinukleotidok, és eljárások angiogenezis gátlására | |
| TWI486168B (zh) | 治療內皮功能不良之方法 | |
| AU2004200776B2 (en) | Fibrinolytically active polypeptide | |
| EP2370574A1 (en) | Mutants of staphylokinase carrying amino and carboxy-terminal extensions for polyethylene glycol conjugation | |
| HK1079242A (en) | Fibrinolytically active polypeptide | |
| NZ530114A (en) | Fibrinolytically active polypeptide | |
| US20030153064A1 (en) | Disintegrin homologue, MAHBP | |
| MXPA01005168A (en) | Zace1:a human metalloenzyme |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | Patent lapsed due to non-payment of fee |
Effective date: 20080929 |