CZ2011782A3 - Vyuzití polymethiniových solí jako mitochondriálních sond - Google Patents

Vyuzití polymethiniových solí jako mitochondriálních sond Download PDF

Info

Publication number
CZ2011782A3
CZ2011782A3 CZ20110782A CZ2011782A CZ2011782A3 CZ 2011782 A3 CZ2011782 A3 CZ 2011782A3 CZ 20110782 A CZ20110782 A CZ 20110782A CZ 2011782 A CZ2011782 A CZ 2011782A CZ 2011782 A3 CZ2011782 A3 CZ 2011782A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
substituent
salts
group
alkyl
mitochondria
Prior art date
Application number
CZ20110782A
Other languages
English (en)
Other versions
CZ304094B6 (cs
Inventor
Král@Vladimír
Bríza@Tomás
Kejík@Zdenek
Králová@Jarmila
Rimpelová@Silvie
Ruml@Tomás
Martásek@Pavel
Original Assignee
Vysoká skola chemicko-technologická v Praze
Ústav molekulární genetiky Akademie ved CR
Univerzita Karlova v Praze I. Lékarská Fakulta
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Vysoká skola chemicko-technologická v Praze, Ústav molekulární genetiky Akademie ved CR, Univerzita Karlova v Praze I. Lékarská Fakulta filed Critical Vysoká skola chemicko-technologická v Praze
Priority to CZ20110782A priority Critical patent/CZ304094B6/cs
Publication of CZ2011782A3 publication Critical patent/CZ2011782A3/cs
Publication of CZ304094B6 publication Critical patent/CZ304094B6/cs

Links

Landscapes

  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Vyuzití polymethiniových solí obecného vzorce I a II, kde význam obecných substituentu je uveden v popisné cásti, pro prípravu selektivních bunecných sond pro znacení mitochondrií a to jak v zivých, tak i v mrtvých bunkách.

Description

Oblast techniky
Vynález se týká použití systémů založených na polymethiniových solích. Tyto systémy lze využít v oblasti selektivní intracelulámí lokalizace. Systémy jsou založeny na použití strukturního motivu polymethiniových solí připravených z příslušných malondialdehydů.
Dosavadní stav techniky
Mitochondrie jsou semiautonomní dynamické, pleomorfní organely (DiMauro, S., Schon, A. E. (2003): Mitochondrial respirátory chain diseases, N. Engl. J. Med. 348,2656~2668), které tvoří až 40 % cytoplazmy metabolicky aktivních eukaryotických buněk.
Dynamika mitochondrií je dána jejich konstantním pohybem včetně jejich neustálého dělení a fúzování, což je doprovázeno změnami ve velikosti, tvaru, počtu a hmotě mitochondrií. (Nisoli, E., Carruba, M. O. (2006): Nitric oxide and mitochondrial biogenesis. J. Cell Sci. 119, 2855-2862).
Hlavní rolí mitochondrií v buňce je produkce energie ve formě adenosintrifosfátu (ATP) prostřednictvím elektronového transportního řetězce [ETC]. (Anderson, S., Bankier, A. T., Barrell, B. G., de Bruijn, Μ. H., Coulson, A. R., Drouin, J., Eperon, C. I., Nierlich, D. P., Roe, A. B., Sanger, F., Schreier, Η. P., Smith, A. J., Staden, R., Young, G. O. (1981): Sequence and organization of the human mitochondrial genome. Nátuře 290, 457-465). Kromě produkce energie hrají mitochondrie klíčovou roli v řadě dalších funkcí týkajících se zprostředkování buněčné smrti apoptózy, termogeneze, translace a transkripce mitochondriálních genů. (Leonard, J. V., Schapira, A. Η. V. (2000): Mitochondrial respirátory chain disorders I: mitochondrial DNA defects. Lancet 355, 299-304). Navíc jsou v nich lokalizovány některé metabolické procesy, jako je např. beta-oxidace, citrátový cyklus, degradace aminokyselin, biosyntéza hernu, metabolismus steroidů, močovinový cyklus, (Mancuso, M., Calsolaro, V., Orsucci, D., Carlesi, C., Choub, A., Piazza, S., Siciliano,
G. (2009): Mitochondria, cognitive impairment, and Alzheimer’s disease. Int JAlzheimers Dis. Jul 6; 951548), udržení buněčného redoxně-oxidačního potenciálu, homeostáze vápenatých iontů a další. (Di Lisa, F., Bernardi, P. (1998): Mitochondrial function as a determinant of recovery or death in cell response to injury. Mol Cell Biochem. 184, 379— —391).
/ r . f
Mitochondrie jsou křižovatkou na pomezí života a smrti buňky a jejich poškození je spojeno s řadou onemocnění. To je činí slibným cílem pro vývoj léků a nových terapeutických přístupů. (Anders, M. W., Robotham, J. L., Sheu, S. S. (2006): Mitochondria: new drug targets for oxidative stress-induced diseases. Expert Opin. Drug. Metab. Toxicol. 2, 71-79). Kromě výše jmenovaných funkcí jsou mitochondrie hlavními producenty intracelulámích reaktivních kyslíkových částic, které vznikají jako vedlejší produkt oxidační fosforylace. Díky různým deficiencím v oxidační fosforylaci je sníženo zásobování buněk energií a je zvýšena produkce reaktivních kyslíkových částic, která může indukovat mutace a oxidativní poškození mitochondriální DNA. (Larsen, B. N., Ramussen, M., Ramussen, J. L. (2005): Nuclear and mitochondrial DNA repair: similar pathways? Mitochondrion 5, 89-108). Mnoho z těchto poškození mitochondriální DNA pravděpodobně přispívá ke vzniku rakoviny, stárnutí a neurodegenerativním onemocněním. (Bohr, A. V. (2002): Repair of oxidative DNA damage in nuclear and mitochondrial DNA, and some changes with aging in mammalian cells. Free Rádie. Biol. Med. 32, 804-812).
Pro studium mitochondrií jsou využívány biochemické, genetické a elektron- mikroskopické přístupy. Pro studium aktivity mitochondrií v buňkách, je využíváno dvou přístupů založených na jejich značení in šitu nebo izolaci mitochondrií uvolněných z buněk. Při jejich izolaci je tkáň mechanicky rozrušena a organely jsou puntíkovány pomocí gradientově nebo diferenciální centrifugace. Izolované mitochondrie se však nemusejí chovat tak, jako za fyziologických podmínek a navíc může dojít ke zničení mitochondriální sítě. Během lyže buněk dochází k uvolnění buněčných komponent včetně v nich obsažených proteáz, což může vést ke zničení anebo snížené regeneraci organel. Vývoj fluorescenčních značících technik v kombinaci s mikroskopií umožnil studium komplexní struktury a funkce neporušených organel in vivo. Použitím sond je možné se vyvarovat izolaci a purifikaci organel a zachovat jejich strukturu. (Jakobs, S. (2006): High resolution imaging of live mitochondria. Biochim. Biophys. Acta. 1763, 561-575). Nadějná je zejména mikroskopie buněk v reálném čase, která je nepostradatelným nástrojem pro objasnění časoprostorové mitochondriální dynamiky.
Obecně vzato jsou mitochondrie obtížně pozorovatelné pomocí fázového nebo Nomarského diferenciálního interferenčního kontrastu. Z tohoto důvodu je vyvíjena snaha nalézt vitální barviva pro specifické barvení mitochondrií v živých buňkách. Vstup většiny barviv do mitochondrií je závislý na membránovém potenciálu těchto organel v intaktním stavu. Některé z pozitivně nabitých, lipofilních fluorescenčních barviv mění svou emisi v závislosti na bezprostředním okolí a mohou být proto použity pro kvalitativní nebo dokonce • · kvantitativní měření mitochondriálního membránového potenciálu. (Plasek, J., Sigler, K. (1996): Slow fluorescent indicators of membrane potential: a survey of different approaches to probe response analysis. J. Photochem. Photobiol. B. 33, 101-124). V současnosti jsou pro značení mitochondrií využívány zejména lipofilní kationické xantyliové deriváty jako tetrametylrosamin, rhodamin 123, rhodamin 6G. (Roťhe, G, Emmendorffer, A, Oser, A, Roesler, J, Válet, G. (1991): Flow cytometric measurement of the respirátory burst activity of phagocytes using dihydrorhodamine 123. J. Immunol. Methods 138, 133-135). Nicméně potenciál těchto fluorescenčních barviv je značně limitován. Nevýhodami jsou jejich nízká fotostabilita, nevhodné spektrální vlastnosti a vysoká fototoxicita. Navíc dochází při fixaci mitochondrií k vymytí barviva z buněk díky ztrátě membránového potenciálu. (Poot, M., Zhang, Y. Z., Kramer, A. J., Wells, K. S., Jones, J. L., Hanzel, D. K., Lugade, A. G., Singer, L. V., Haugland, P. R. (1996): Analysis of mitochondrial morphology and function with novel fixable fluorescent stains. J. Histochem. Cytochem.. 44, 1363-1372).
Podstata vynálezu
Uvedené nevýhody odstraňuje využití polymethinioých solí, které vykazují velmi výraznou fluorescenci a vysokou afinitu pro mitochondrie, jako mitochondriálních sond.
Předmětem vynálezu jsou dále nové dosud nepopsané polymethiniové sole obecného vzorce Iz kde obě koncové heteroaromatické skupiny methiniového řetězce jsou totožné a tvoří je heteroaromatické cykly odvozené od benzenu, jejichž konkrétní struktura je charakterizována skupinou A, B, X, Y a jednou nebo více skupinami R na obou koncích methiniové sole, kde skupina A jsou alkyl Cl až Cl2a substituenty, glykolové řetězce s počtem glykolových (-OCH2CH2-) opakujících se jednotek 1 až 8 končící O-alkyl substituentem Cl až C12 nebo -OH skupinou, alkyl Cl až C8 sulfonové kyseliny nebo odpovídající jejich lithné nebo sodné, nebo draselné, nebo česné, nebo rubidné sole, benzylová skupina, allylová
• · skupina, 8-substituovaný kobalt bis(dikarbollid) a nebo cyklodextrinový kruh různé velikosti (α-γ), kde skupina B je aromatický nebo heteroaromatický kruh, případně oligoaromatický nebo oligoheteroaromatický kruh, který může být dále substituován jedním či více stejnými 11 rom, jod, hydroxy-,
S-propyl.
amino, N-metyí, N-eíyl, N-propyl, N-butyl, N-dimethyl, N-dietyl, N-dipropyl, N-dibutyl, N-bocyl, nitril, karboxyl, karboxymel^l, karboxyeífl, karboxypropyl, karboxybutyl, nitroso, azid, kyanát, kde v případě dvojnásobně nabitých solí, skupinu B tvoří řV-alkylamoniumheteroaromát, trialkylamoniový substituent nebo dialkylsulfoniový substituent, přičemž kvartemizace na atomu dusíku nebo síry je provedena skupinou A, kde skupina R je fluor, chlor, brom, jod, hydroxy, trifluormetyl, O-trimelýlsilyl, thiol, karboxybutyl, nitroso, azid, kyanát, isokyanát, thiokyanát, isothiokyanát, N-alkyl, N-dialkyl substituent s Cl až C 12*. řetězcem, alkyl Cl až Cl2/ substituent, O-alkyl Cl až C12v substituent, glykolový řetězec s počtem glykolových jednotek 1 až 8 končící O-alkyl substituentem Cl až Cl2* nebo -OH skupinou, 8-substituovaný kobalt bis(dikarbollid) a nebo cyklodextrinový kruh různé velikosti (α - γ), kde X je dusík, kyslík, síra, selen nebo dimethyl methylenová skupina, kde Y je chlorid, bromid, jodid, metýlsulfonát, toluensulfonát, nebo nonafluorbutylsulfonát a polymethiniové sole obecného vzorce IIZ
• · • • · • • · • • · · • a · · • · • ·
• · • ·
• · • · · • ·
. 1 kde obě koncové heteroaromatické skupiny methiniového řetězce jsou totožné a tvoří je heteroaromatické cykly odvozené od naftalenu a kde skupiny A, B, X, Y a R mají vpředu uvedený význam.
Předmětem vynálezu jsou polymethiniové sole obecného vzorce I a II, pro přípravu selektivních buněčných sond pro značení mitochondrií, a to jak v živých i mrtvých buňkách. Polymethiniové sole jsou navíc zadrženy v mitochondriích i po fixaci různými činidly (např. formaldehyd, glutaraldehyd), popř. permeabilizaci (aceton, metanol).
Předmětem vynálezu patentu jsou polymethiniové sole obecného vzorce I a II, pro přípravu sond pro značení izolovaných mitochondrií.
Zjistili jsme, že tyto sole vykazují velmi výraznou fluorescenci. In vitro studie těchto látek zaměřené na jejich intracelulámí distribuci ukázaly jejich vysokou afinitu pro mitochondrie. Jejich mitochondriální lokalizace byla nalezena pro nejrůznější strukturní motivy těchto látek. Při vstupu, polymethiniových solí do mitochondrií dochází kjejich obarvení a díky jejich vysoké fluorescenci, jsou fluorescenčně značené mitochondrie snadno pozorovatelné a detekovatelné. Pro tento typ látek toto chování nebylo dosud pozorováno. Tento jev je způsoben jejich vysokou specifitou pro kardiolipin, který je hojně zastoupený ve vnitřní membráně mitochondrií.
Použití nových fluorescenčních vitálních barviv pro zobrazování mitochondrií by mohlo sloužit jako neinvazivní, finančně nenáročná a funkční alternativa komerčně dostupných barviv specifických pro mitochondrie. Tato barviva pro zobrazovací techniky mitochondrií by mohla být použita při studiu aktivity, morfologie a množství mitochondrií v buňce a sledování účinku farmakologických derivátů. Tyto sondy by tak umožnily monitorování klíčové intracelulámí organely v živých systémech v reálném čase a získat tak citlivý a specifický náhled do metabolismu, funkce, fyziologie a patofyziologie mitochondrií. Polymethiniové sole, které jsou předmětem tohoto patentu, jsou založeny na kondenzaci vhodného aromatického malondialdehydu se solí příslušného heteroaromátu (Schéma 1) tak, jak je příprava popsána pro podobné systémy. (Bříza, T., Kejík, Z., Císařová, I., Králová, J., Martásek, P., Král, V. (2008): Optical sensing of sulphate by polymethinium salt receptors: Colorimetric sensor for heparin. Chemical Communication. 1901-1903). Nesymetrické polymethiniové sole lze připravit dle námi již dříve popsaných postupů týkajících se podobných struktur (Bříza T., Kejík Z., Králová J., Martásek P., Král V. Synthesis of unsymmetric cyanine dye via merocyanine and their interaction with DNA. Coll. Czech. Chem. Comm. (2009), 74, 1081-1090) s tím rozdílem, že je pro jejich syntézu využito neutrálního merocyaninového barviva, které je finálně kondenzováno se solí příslušného heteroaromátu (Schéma 1).
Dvakrát kvartemizované symetrické nebo nesymetrické polymethiniové sole se připravují tak, že se sůl kvartemizuje na příslušném heteroatomu do druhého stupně odpovídajícím alkylačním činidlem (Schéma 1).
Schéma 1
Přehled obrázků
Obrázek 1
Lokalizace látky 1 v mitochondriích buněk myšího karcinomu mléčné žlázy 4T1. a, fázový kontrast; b, fluorescence látky 1; c, fluorescence mitochondriální sondy MitoTracker GreenFM; d, překryv snímků bac znázorňující jejich shodnou lokalizaci v mitochondriích.
Obrázek 2
Lokalizace látky 1 v mitochondriích v buněčné linii lidského osteosarkmou U2OS a, fázový kontrast; b, fluorescence látky 1; c, fluorescence jaderné sondy DAPI; d, překryv snímků bac.
Obrázek 3
Lokalizace látky 3 v mitochondriích primárních kuřecích fibroblastů CEF.
a, fázový kontrast; b, fluorescence látky 1; c, fluorescence mitochondriální sondy MitoTracker GreenFM; d, překryv snímků bac znázorňující jejich shodnou lokalizaci v mitochondriích.
Vlastnosti a způsob přípravy nově připravených látek jsou doloženy následujícími příklady, aniž by jimi byly jakkoliv omezeny.
Příklady provedení
Příklad 1
Příprava látky 1. Směs 2-quinaxolidinmalondialdehydu (50 mg), 2-metyl-3-propyl benzothiazolu (180 mg) a suchého n-butanolu (7 ml) byla za míchání zahřívána na 110 °C po dobu 18 h. Po ochlazení na laboratorní teplotu byla směs zfiltrována, pevný podíl promyt metanolem (3 ml) a sušen ve vakuu. Produkt byl získán ve formě zeleného kovově lesklého prášku. Výtěžek 136 mg, 81%.
I
J
Charakterizace: 'H-NMR: 8,65 (1H, s); 8,49 (1H, d, J=14,l Hz); 8,32 (1H, d, J=14,l Hz); 8,24 - 7,99 (7H, m); 7,82 - 7,58 (6H, m); 7,46 (1H, t, >7,3 Hz); 4,82 (2H, s); 4,68 (2H, s); 2,05 (4H, m); 1,20 (6H, m). 13C-NMR: 158,3; 149,0; 147,9; 141,2; 140,5; 139,1; 138,6; 129,1; 128,8; 128,5; 128,3; 128,2; 127,9; 127,8; 126,9; 126,5; 125,6; 124,9; 123,8; 123,2; 119,0; 115,3; 114,1; 106,4; 48,7; 47,3; 21,5; 20,4; 11,3; 10,8.
ES-MS vypočteno: 547; nalezeno: 545 (M+-2H); HRMS nalezeno: 545,1823.
Elementární analýza: vypočteno: C 58,75 %; H 4,63 %; nalezeno: C 59,12 %; H 4,87 %.
Absorbční maxima látky 1 v různých prostředích
Prostředí ^*max 6max/100 000
dimetylsulfoxid 609 1,06
Methanol 608 1,34
Fosfátový pufr (pH 7,4) 493 0,33
Emisní maxima látky 1 v různých prostředích
Prostředí ^max
dimetylsulfoxid 637
Methanol 630
Fosfátový pufr (pH 7,4) 627
Příklad 2
Příprava látky 2. Směs 2-(4-pyridyl)malondialdehydu (150 mg), 2-metyl-3-propyl benzothiazolu (640 mg) a suchého n-butanolu (10 ml) byla za míchání zahřívána na 110 °C f
po dobu 18 h. Po ochlazení na laboratorní teplotu byla směs přefiltrována, pevný podíl promyt metanolem (3 ml) a sušen ve vakuu. Produkt byl získán ve formě zeleného kovově lesklého prášku. Výtěžek 498 mg, 79%.
Struktura látky 2
Charakterizace: 'Η-NMR: 8,94 (2H, d); 8,14-7,80 (8H,m); 7,58 (2H,t); 7,45 (2H,t); 6,20 (2H,d); 4,28 (4H,bs); 1,71 (4H,m); 0,85 (6H,t). 13C-NMR: 156,9; 148,2; 143,6; 141,3; 128,2; 127,1; 125,5; 123,2; 114,0; 98,3; 47,5; 20,9; 10,8.
ES-MS vypočteno: 496,7, nalezeno: 496,3.
Elementární analýza: vypočteno: C 57,78 %; H 4,85 %; nalezeno: C 57,86 %; H 4,93 %. Absorbční maxima látky 2 v různých prostředích
prostředí λπΐΗΧ Smax/100 000
dimetylsulfoxid 656 0,76
metanol 645 0,82
fosfátový pufr (pH 7,4) 641 0,46
Emisní maxima látky 2 v různých prostředích
prostředí ž<max
dimetylsulfoxid 665
metanol 662
fosfátový pufr (pH 7,4) 667
Příklad 3
Příprava látky 3. Látka 2 (55 mg) byla rozpuštěna v dimetJýlformamidu (5 ml) a byl přidán nadbytek metyljodidu (2M roztok v t-BuOMe, 0,5 ml). Směs byla uzavřena v tlakové ampuli a zahřívána přes noc 60 °C. Druhý den byla reakčni směs probublávána dusíkem, pro odstranění přebytečného meí^ljodidu. Poté byla směs odpařena dosucha. Pevný podíl byl promyt dieíyléterem a sušen ve vakuu. Produkt byl získán ve formě kovově lesklého prášku. Výtěžek 63 mg, 94%.
Struktura látky 3
Charakterizace: 'H-NMR: 8,96 (2H; d); 7,98 - 8,16 (6H, m); 7,60 (2H, t); 7,48 (2H, t); 6,32 (2H, d); 4,35 (7H, bs); 1,72 (4H, sextet); 0,85 (6H,t). 13C-NMR: 166,4; 153,4; 147,9; 145,3; 141,4; 128,3; 127,8; 125,7; 125,6; 123,3; 114,2; 98,6; 47,7; 47,1; 34,4; 21,1; 10,9.
ES-MS vypočteno: 255,8, nalezeno: 255,6 (M2+/2).
Elementární analýza: vypočteno: C 48,64 %; H 4,34 %; nalezeno: C 48,93 %; H 4,56 %. Absorbční maxima látky 3 v různých prostředích
prostředí Zmax Smax/100 000
dimetylsulfoxid 645 0,33
metanol 631 0,40
fosfátový pufr (pH 7,4) 628 0,42
Emisní maxima látky 3 v různých prostředích
prostředí λ-max
dimetylsulfoxid 666
metanol 650
fosfátový pufr (pH 7,4) 654
Příklad 4 ,
A*
Příprava látky 4. Směs 2-(4-pyridyl)malondialdehydu (75 mg; 0,50mM), 2-me^l-3-propyl a-naftothiazolium jodidu (373 mg; 10,lmM) a suchého n-butanolu (10 ml) byla za míchání zahřívána na 110 °C po dobu 18 h. Po ochlazení na laboratorní teplotu byla směs
I • ·· •· · • ·e • ·· • · ♦··
Jy přefiltrována, pevný podíl promyt etanolem (3 x 5 ml) a sušen ve vakuu. Produkt byl získán ve formě zeleného kovově lesklého prášku. Výtěžek 302 mg, 83%.
Struktura látky 4
Charakterizace: 'Η-NMR: 8,98 (2H, d, J=5,6 Hz); 8,2-7,9 (12H, m); 7,80 (2H, t, J-7,3 Hz);
7,67 (2H, t, J=7,5 Hz); 6,36 (2H, d, J=11,6 Hz); 4,45 (4H, t, J=6,5 Hz); 1,78 (4H, sextet, J=7,2); 0,94 (6H, t, J=7,3 Hz). 13C-NMR: 165,6; 140,2; 130,8; 130,1; 129,8; 129,4; 127,5; 126,6; 123,5; 122,1; 113,8; 48,5; 21,9; 11,3.
HRMS vypočteno: 596,2189 (M+); nalezeno: 596,2184 (M+)
Elementární analýza: vypočteno: C 63,06 %; H 4,74 %; nalezeno: C 63,11 %; H 4,80 %. Absorbční maxima látky 4 v různých prostředích
prostředí ληιβχ Smax/100 000
dimetylsulfoxid 686 0,99
Methanol 676 1,10
fosfátový pufr (pH 7,4) 600 0,32
Emisní maxima látky 4 v různých prostředích
prostředí λπιβΧ
dimetylsulfoxid 707
Methanol 694
fosfátový pufr (pH 7,4) 699
Využití polymethiniových solí jako buněčné sondy pro selektivní mitochondriální lokalizaci.
Látky uvedené v tomto patentu vykazují selektivní lokalizaci v mitochondriích řady buněčných linií. Nově připravené, pozitivně nabité, symetrické polymethiniové solí mají • · • · • · • · · vhodné spektroskopické vlastnosti: úzké excitační i emisní spektra, minimální fluorescenci ve vodném médiu, maximální fluorescenci při inkorporaci do lipofilního prostředí membrán mitochondrií. Tato barviva navíc vykazují výrazně vyšší fotostabilitu v porovnání s xantyliovými barvivý, komerčně používanými pro značení mitochondrií. Látky jsou navíc v mitochondriích zadržovány permanentně, což umožňuje jak výměnu média, tak fixaci a permeabilizaci buněk bez ztráty barvení.
Mitochondriální lokalizace námi připravených nových symetrických polymethiniových solí byla pozorována např. v buněčných liniích HeLa (odvozeny z karcinomu děložního čípku), LNCaP a PC-3 (buňky odvozeny z karcinomu prostaty), U2OS (buňky z osteosarkomu), MiaPaCa-2, BxPC-3, PaTu, CAPAN-2 (buňky odvozeny z adenokarcinomu pankreatu), HEK 293T (embryonální ledvinové buňky), HL-60 (buňky akutní myeloidní leukémie), KU812 (buňky chronické myelogenní leukémie), myší buněčná linie 4T1 (buňky z karcinomu mléčné žlázy) a v primárních kuřecích embryonálních fibroblastech (CEF). Těmito příklady však není použití našich látek nijak omezeno. Tyto látky vykazují vysokou selektivitu pro mitochondrie, a to v odlišném principu než běžně používaná mitochondriální barviva jako například Mitotracker Green™. Vysoká selektivita mitochondriální lokalizace byla pozorována při použití těchtoh látek, např. 1-4, a to v případě všech testovaných linií (viz Obrázek 1). V případě buněk U2OS byla účinnost lokalizace v mitochondriích dokonce značně vyšší než pro komerčně dostupný MitoTracker Green™, jehož distribuce v mitochondriích byla slabá a neselektivní (Obrázek 2).
Příklad 1
Příprava zásobního roztoku:
Vzhledem k nízké rozpustnosti našich sloučenin ve vodě byly sloučeniny rozpuštěny v diméíylsulfoxidu (popř. dimerylformamid, metanol, e Mnol). Koncentrace zásobních roztoků, které byly uchovávány ve tmě při -20 °C, byla 5mM. Před použitím byly vzorky za nepřístupu světla ustáleny na laboratorní teplotu cca 23 °C a řádně promíchány.
Příklad 2
Příprava buněk pro značení mitochondrií
Buňky linie HeLa (popř. U2OS, MiaPaCa-2, HEK293T, 4T1) byly kultivovány vDMEM médiu (Dulbecco's Modified Eagle medium, Sigma USA), LNCaP vlscove médiu (Sigma, USA), BxPC-3 (popř. HL-60, KU-812) vRPMI-1640 médiu (Sigma, USA), CAPAN-2 vMcCoy médiu (Sigma, USA), PaTu vDMEM:F12 (1:1) médiu (Sigma, USA) doplněných
o 10% fetální bovinní sérum (FBS, Invitrogen, USA), 2mM Glutamax™ (Invitrogen, USA) a 1% směs vitamínů (MEM vitamins solution, Invitrogen, USA). Buňky byly udržovány v logaritmické fázi růstu a kultivovány za standardních podmínek (37 °C, 5% CO2,95% vlhkosti). Pro mikroskopické experimenty bylo inokulováno 100 000 buněk na kultivační misky se skleněným dnem (průměr 35 mm, MatTek, USA). Buňky byly inkubovány 16 Já4*** 24 h za standardních podmínek.
Příklad 3
Barvení mitochondrií v živých buňkách
Buňky připraveny podle Příkladu 2 byly třikrát omyty fosfátovým pufrem (PBS; pH 7,4) a 10 min. inkubovány s 0-200 nM polymethiniovou solí rozpuštěnou v kompletním médiu. Pro dosažení co nej účinnějšího barvení mitochondrií a minimálního nespecifického barvení byla typicky používána 20-50 nM koncentrace polymethiniových solí. Po barvení byly buňky 2x omyty fosfátovým pufrem a inkubovány v čerstvém kompletním médiu bez fenolové červeni.
Příklad 4
Fixace mitochondrií
Mitochondrie značené našimi novými fluorescenčními sondami je možno pozorovat nejen za nativních podmínek, ale lze je také fixovat. Fixace je možná např. 8% roztokem glutaraldehydu ve fosfátovém pufru; pH 7,4 při pokojové teplotě po 20 min. anebo 4% roztokem paraformaldehydu ve fosfátovém pufru za stejných podmínek a mikroskopovány.
Příklad 5
Kolokalizace dvou mitochondriálních barviv
Buňky připravené podle Příkladu 2 byly nejprve barveny roztokem polymethiniových solí 1, 2, 3 nebo 4 s 20-50nM koncentrací. Po barvení byly buňky 2x omyty fosfátovým pufrem a dobarvovány 120nM roztokem mitochondriální sondy MitoTracker GreenFM (Molecular Probes) rozpuštěné v kompletním médiu, kultivace buněk probíhala za standardních podmínek (37 °C, 5% CO2, 95% vlhkost) po dobu 10 min. Buňky byly 2x omyty fosfátovým pufrem a inkubovány s čerstvým kompletním médiem bez fenolové červeni a mikroskopovány (viz Obrázek 1 a Obrázek 3).
Příklad 6
Značení mitochondrií a jiných organel v buňce • ·
1Δ ··· · t _ - - * « ee ··· ··· ···· ·♦
Buňky připravené podle Příkladu 2 byly barveny 20-50nM roztokem polymethinových solí 1,
2, 3 nebo 4. Po barvení byly buňky 2x omyty fosfátovým pufrem a barveny po 20 min. 150nM roztokem sondy pro lysosomy LysoTracker Green (Molecular Probes) rozpuštěné v kompletním médiu za standardních kultivačních podmínek. Buňky byly 2x omyty fosfátovým pufrem a inkubovány 5 min. s roztokem jaderné sondy 4,6'-diamidino-2-fenylindolu (DAPI, 5 pg/ml) v kompletním médiu (viz Obrázek 2). Buňky byly 2x omyty fosfátovým pufrem a inkubovány v čerstvém kompletním médiu bez fenolové červeni. Barvení mitochondrií je možné kombinovat se značením dalších buněčných organel, jako je např. endoplazmatické retikulum anebo Golgiho komplex.
Příklad 7
Mikroskopie
Buňky byly třikrát omyty fosfátovým pufrem a pozorovány pomocí inverzního fluorescenčního mikroskopu CellAR (Olympus, Japonsko) za použití 60x (numerická apertura 1,4), popř. lOOx imersního objektivu (Immersion oil 30cc, Olympus, Japonsko). V závislosti na spektroskopických vlastnostech testované látky byl použit filtr pro červený fluorescenční protein (RFP; ex. 535-555 nm / em. 570-625 nm, cut off 565 nm) anebo Cy5 filtr (ex. 590-650nm / em. 663-738 nm, cut off 660 nm). Byla studována subbuněčná lokalizace polymethiniových solí v živých buňkách jednotlivých buněčných linií v reálném čase anebo fixovaných preparátů.
Mitochondriální značení našimi novými pozitivně nabitými symetrickými polymethiniovými solemi je možné kombinovat s barvením dalších studovaných proteinů pomocí fluorescenčně značených protilátek.
Průmyslová využitelnost
Polymethiniové soli jsou využitelné ve farmaceutickém průmyslu k přípravě mitocdÉldriálních sond pro využití v medicíně.

Claims (2)

  1. Patentové nároky
    1. Využití polymethiniových solí obecného vzorce kde obě koncové. heteroaromatické skupiny methiniového řetězce jsou totožné a tvoří je heteroaromatické cykly odvozené od benzenu, jejichž konkrétní struktura je charakterizována skupinou A, B, X, Y a jednou nebo více skupinami R na obou koncích methiniové sole, kde skupina A jsou alkyl Cl až Cl2- substituenty, glykolové řetězce s počtem glykolových (-OCH2CH2-) opakujících se jednotek 1 až 8 končící O-alkyl substituentem Cl až C12 nebo -OH skupinou, alkyl Cl až C8 sulfonové kyseliny nebo odpovídající jejich lithné nebo sodné, nebo draselné, nebo česné, nebo rubidné sole, benzylová skupina, allylová skupina, 8-substituovaný kobalt bis(dikarbollid) a nebo cyklodextrinový kruh různé velikosti (α - γ), kde skupina B je aromatický nebo heteroaromatický kruh, případně oligoaromatický nebo oligoheteroaromatický kruh, který může být dále substituován jedním či více stejnými nebo různými substituenty vybranými ze skupiny: fluor, chlor, brom, jod, hydroxy-, trifluormeíýí, O-meíýl, O-eí^l, O-propyl, O-trimeíýlsilyl, thiol, S-me^l, S-e$d, S-propyl, amino, N-me^l, N-et^l, N-propyl, N-butyl, N-dimethyl, N-dieí^l, N-dipropyl, N-dibutyl, N-bocyl, nitril, karboxyl, karboxyme^l, karboxye^l, karboxypropyl, karboxybutyl, nitroso, azid, kyanát, kde v případě dvojnásobně nabitých solí, skupinu B tvoří 7V-alkylamonium-heteroaromát, trialkylamoniový substituent nebo dialkylsulfoniový substituent přičemž kvartemizace na atomu dusíku nebo síry je provedena skupinou A, kde skupina R je fluor, chlor, brom, jod, hydroxy, trifluorme^ýl, O-trime^lsilyl, thiol, SS-e$l, S-propyl, amino, N-me^í, N-etyl, N-propyl, N-butyl, N-dimethyl, N-dieí^í, N^dipropyl, N-dibutyl, N-bocyl, nitril, karboxyl, karboxyme$l, karboxye^l, karboxypropyl, karboxybutyl, nitroso, azid, kyanát, isokyanát, thiokyanát, isothiokyanát, N-alkyl, N-dialkyl substituent s Cl až C 12< řetězcem, alkyl Cl až Cl 24 substituent, O-alkyl Cl až Cl 2* substituent, glykolový řetězec s počtem glykolových jednotek 1 až 8 končící O-alkyl substituentem Cl až Cl2* nebo -OH skupinou, 8-substituovaný kobalt bis(dikarbollid) a nebo cyklodextrinový kruh různé velikosti (α - γ), kde X je dusík, kyslík, síra, selen nebo dimethyl methylenová skupina, kde Y je chlorid, bromid, jodid, mefylsulfonát, toluensulfonát, nebo nonafluorbutylsulfonát kde obě koncové heteroaromatické skupiny methiniového řetězce jsou totožné a tvoří je heteroaromatické cykly odvozené od naftalenu a kde B, R, X, Y, a A mají vpředu uvedený význam, pro přípravu selektivních buněčných sond pro značení mitochondrií, a to jak v živých i mrtvých buňkách.
  2. 2. Využití polymethiniových solí obecného vzorce I a II, podle nároku 1 pro přípravu sond pro značení izolovaných mitochondrií.
CZ20110782A 2011-12-01 2011-12-01 Vyuzití polymethiniových solí jako mitochondriálních sond CZ304094B6 (cs)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ20110782A CZ304094B6 (cs) 2011-12-01 2011-12-01 Vyuzití polymethiniových solí jako mitochondriálních sond

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ20110782A CZ304094B6 (cs) 2011-12-01 2011-12-01 Vyuzití polymethiniových solí jako mitochondriálních sond

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CZ2011782A3 true CZ2011782A3 (cs) 2013-06-12
CZ304094B6 CZ304094B6 (cs) 2013-10-16

Family

ID=48570609

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ20110782A CZ304094B6 (cs) 2011-12-01 2011-12-01 Vyuzití polymethiniových solí jako mitochondriálních sond

Country Status (1)

Country Link
CZ (1) CZ304094B6 (cs)

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CZ306320B6 (cs) * 2014-04-01 2016-11-30 Vysoká škola chemicko - technologická v Praze Využití nových typů pentamethiniových solí s expandovanou chinoxalinovou jednotkou v protinádorové terapii
CZ2014306A3 (cs) * 2014-05-06 2015-11-25 Vysoká škola chemicko- technologická v Praze Benzothiazolem substituované cyklobut-3-en-1,2-dion-3-hydrazony a jejich použití k léčbě leukémií a nádorových onemocnění
GB2567124A (en) 2017-05-08 2019-04-10 Vysoka Akola Chemicko Tech V Praze Imaging agents and methods
CZ310199B6 (cs) 2022-02-23 2024-11-13 Univerzita Karlova Polymethiniové soli jako inhibitory dihydroorotát dehydrogenázy

Family Cites Families (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6291203B1 (en) * 1995-11-13 2001-09-18 Molecular Probes, Inc. Cyanine dyes that stain cells and mitochondria
DE60126297T2 (de) * 2000-09-29 2007-11-15 Molecular Probes, Inc., Eugene Modifizierte carbocyaninfarbstoffe und deren konjugate
US7776529B2 (en) * 2003-12-05 2010-08-17 Life Technologies Corporation Methine-substituted cyanine dye compounds
WO2007028118A2 (en) * 2005-09-02 2007-03-08 Visen Medical, Inc. Nicotinic acid and picolinic acid derived near-infrared fluorophores
FR2913424B1 (fr) * 2007-03-09 2009-07-24 Cis Bio Internat Sa Derives de cyanine, conjuges fluorescents les contenant et leur utilisation

Also Published As

Publication number Publication date
CZ304094B6 (cs) 2013-10-16

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Miao et al. A new class of fast-response and highly selective fluorescent probes for visualizing peroxynitrite in live cells, subcellular organelles, and kidney tissue of diabetic rats
Singh et al. Fluorescent probes for targeting endoplasmic reticulum: design strategies and their applications
Xu et al. Fluorescent probes for the selective detection of chemical species inside mitochondria
Shen et al. A rhodamine B-based lysosomal pH probe
Xu et al. A near-infrared reversible fluorescent probe for real-time imaging of redox status changes in vivo
Shi et al. Rhodamine-based fluorescent probe for direct bio-imaging of lysosomal pH changes
US9334281B2 (en) Fluorochromes for organelle tracing and multi-color imaging
Xu et al. A novel near-infrared fluorescent probe for detecting intracellular alkaline phosphatase and imaging of living cells
Zhang et al. Fluorene-derived two-photon fluorescent probes for specific and simultaneous bioimaging of endoplasmic reticulum and lysosomes: group-effect and localization
US20160376296A1 (en) Biocompatible flavonoid compounds for organelle and cell imagining
US8715944B2 (en) Fluorochromes for organelle tracing and multi-color imaging
Fang et al. Subcellular localised small molecule fluorescent probes to image mobile Zn 2+
Yang et al. A novel mitochondria-targeted ratiometric fluorescent probe for endogenous sulfur dioxide derivatives as a cancer-detecting tool
CN110057804B (zh) 基于n-甲基邻苯二胺盐酸盐的荧光碳点在溶酶体靶向中的应用
JP2018530630A (ja) 染料化合物
Shi et al. Selective imaging of cancer cells with a pH-activatable lysosome-targeting fluorescent probe
CZ2011782A3 (cs) Vyuzití polymethiniových solí jako mitochondriálních sond
Ren et al. A novel Boranil-based turn-on fluorescent probe for imaging of biothiols in living cells
Dai et al. Red fluorescent probes based on a Bodipy analogue for selective and sensitive detection of selenols in solutions and in living systems
Ma et al. Dual-functional probes for sequential thiol and redox homeostasis sensing in live cells
CN111004246A (zh) 监测线粒体自噬的罗丹明类pH荧光探针及制备和应用
Zhou et al. A highly sensitive fluorescent probe for selective detection of cysteine/homocysteine from glutathione and its application in living cells and tissues
Li et al. Novel coumarin-based sensitive and selective fluorescent probes for biothiols in aqueous solution and in living cells
CN114437053B (zh) 一种纳米探针与其在检测高尔基体中超氧阴离子的应用
CN103044947B (zh) 一类尼罗蓝荧光染料,其制备方法及应用