CZ2014941A3 - Příprava vysoce čistého intermediátu pro syntézu Odanacatibu - Google Patents

Příprava vysoce čistého intermediátu pro syntézu Odanacatibu Download PDF

Info

Publication number
CZ2014941A3
CZ2014941A3 CZ2014-941A CZ2014941A CZ2014941A3 CZ 2014941 A3 CZ2014941 A3 CZ 2014941A3 CZ 2014941 A CZ2014941 A CZ 2014941A CZ 2014941 A3 CZ2014941 A3 CZ 2014941A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
formula
mmol
odanacatib
synthesis
reaction
Prior art date
Application number
CZ2014-941A
Other languages
English (en)
Inventor
Peter Babiak
Josef Zezula
Original Assignee
Zentiva, K.S.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Zentiva, K.S. filed Critical Zentiva, K.S.
Priority to CZ2014-941A priority Critical patent/CZ2014941A3/cs
Priority to PCT/CZ2015/000151 priority patent/WO2016095879A1/en
Publication of CZ2014941A3 publication Critical patent/CZ2014941A3/cs

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07CACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C253/00Preparation of carboxylic acid nitriles
    • C07C253/30Preparation of carboxylic acid nitriles by reactions not involving the formation of cyano groups
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07CACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C2601/00Systems containing only non-condensed rings
    • C07C2601/02Systems containing only non-condensed rings with a three-membered ring

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)

Abstract

Způsob výroby (S)-2-(((S)-1-(4-bromofenyl)-2,2,2-trifluoroethyl)amino)-N-(1-cyanocyklopropyl)-4-fluoro-4-methylpentanamidu vzorce 1, který je intermediátem pro syntézu Odanacatibu, reakcí kyseliny vzorce 3 nebo jejich solí se sloučeninou vzorce 4, přičemž reakce probíhá v rozpouštědle za přítomnosi anhydridu kyseliny n-propanfosfonové vzorce 5 a báze.

Description

Tato sloučenina je pokročilým intermediátem pro syntézu Odanacatibu - inhibitoru cathepsinu K struktury, který byl vyvinut firmou Merck pro léčbu osteoporózy (WO2003/075836).
Dosavadní stav techniky
Amidový kapling kterým se připravují deriváty typu 1 se v základním patentu (WO2003/075836) byl prováděn s následující aktivačními činidly: PyBOP (benzotriazol-l-yloxytris(pyrrolidino)fosfoniumhexafluorofosfát, HATU(o-(7-azabenzotriazol-1-yl)-N,N,N‘,N‘-tetramethyluronium hexafluorofosfát nebo EDCI (1-(3-dimethylaminopropyl)-3-ethylkarbodiimide hydrochlorid.
Patent firmy Merck Frosst (WO2008/119176) uvádí použití následujících aktivačních činidel N-hydroxysuccinimidu, 2-hydroxypyridinu, N-hydroxyftalimidu, carbonyldiimidazolu (CDI), HOBt (hydroxybenzotriazol) a činidlem je karbodiimid nebo fosfoniová či uroniová sůl. Specificky je upřednostňován EDCI (1-(3dimethylaminopropyl)-3-ethylcarbodiimide hydrochlorid).
Schéma 1:
Další procesní patent (WO2012/148555) pro kapling ve schématu 1 nárokuje širokou škálu činidel na bázi benzotriazolu a také karbodiimidové deriváty jako je EDCI za použití pyridinových bází.
Tato dosud používaná činidla však vykazovala poměrně vysokou toxicitu a dále ve vodě nerozpustné vznikající vedlejší produkty působí komplikace isolace a čištění produktu amidace.
Podstata vynálezu
Vyzkoušením různých činidel, bází, rozpouštědel jsme zjistili, že nejvhodnějším činidlem pro amidový kapling ve Schématu 2 je komerčně dostupný cyklický anhydrid T3P (anhydrid n-propanfosfonové kyseliny). Toto činidlo má oproti benzotriazolovým, uraniovým a karbodiimidovým derivátům výhodu nižší toxicity a také vedlejší produkty jsou vodorozpustné a tudíž nekomplikují isolaci a čištění produktu amidového kaplingu. Snazší oddělení vedlejších produktů se projeví zejména ve vyšší čistotě meziproduktu 1 a vyšším výtěžku. Také odpadá riziko používání potenciálně explozivního činidla HOBt ( K. D. Wehrstedt et al., J Hazardous Materials (2005), A126, 1-7).
Předložený vynález se týká způsobu výroby (S)-2-(((S)-1-(4-bromofenyl)-2,2,2-trifluoroethyl)amino)-N-(1-cyanocyklopropyl)-4-fluoro-4-methylpentanamidu vzorce 1
reakcí kyseliny nebo jejich solí vzorce 3
se sloučeninou vzorce 4:
(4) přičemž reakce probíhá za přítomnosti anhydridu kyseliny n-propanfosfonové vzorce
5, rozpouštědla a báze:
(5)
Dále v reakční směsi je přítomný Ν,Ν-dimethylaminopyridin (DMAP). Rozpouštědlem při této reakci je výhodně dimethylformamid (DMF) a bází je výhodně diisopropylethylamin (DIEA).
Detailní popis vynálezu
Schéma 2:
Optimalisovaný postup využívá výše uvedených výhod T3P, přídavek
Ν,Ν-imethylaminopyridinu (DMPA) slouží k urychlení reakce. Reakce je s výhodou prováděna v /V,/V-dimethylformamidu (DMF) kdy po ukončení reakce se získá produkt o vysoké čistotě a výtěžku pomalým přidáním vody do reakční směsi.
Příklady provedení
Příklad 1: EDC
Karboxylát (1 g, 1,82 mmol), 1-amino-1-cyclopropanekarbonitril hydrochlorid (0,216 g, 1,82 mmol) a pyridinu (0,25 g, 5,5 mmol) se suspendoval v DMF (8,5 ml) a suspenze se míchala při laboratorní teplotě 1 hodinu. Potom se reakční směs ochladila na -10 °C a pak byl pomalu přidán EDC (0,4 ml, 2,26 mmol). Reakční směs se při -10 °C míchala 1 hodinu potom 3 hodiny při -5 °C. Potom byla pomalu ohřátá na 35 °C a po 1 hodině byl k ní přidán vodný roztok H3PO4 5 % hmotn. k úpravě pH na hodnotu 7. První podíl precipitát byl isolován filtrací. Filtrát byl ještě naředěn vodou a přes noc vykrystaloval druhý podíl produktu. Celkový výtěžek 0,1 g (12,6 %), HPLC čistota 89%.
Příklad 2: HATU v DMF.
Karboxylát (1 g, 1,82 mmol) a 1-amino-1-cyclopropanekarbonitril hydrochlorid (0,216 g, 1,82 mmol) se suspendoval v DMAc (5 ml) a míchaná suspenze se ochladila na 3 °C a pak byl pomalu přidán HATU (0,83 g, 2,2mmol). Reakční směs se pak míchala 15 min a poté byl přidán diisopropylethylamin (DIEA, 1 ml, 5,5 mmol). Směs byla dále míchána 4 hodiny při 5 °C (kontrola pomocí TLC 50/1 chloroform/metanol) potom 3 hodiny při -5 °C. Reakce byla ukončena pomalým přídavkem vody (6 ml) po kapkách při 5 °C a suspenze byla dále 1 hodinu míchána. Precipitát byl isolován filtrací a promyt směsí DMAC-H2O (10 ml - 10 ml) a sušen za vakua (180 mbar) při 45 °C. Byl získán krystalický produkt 0,66 g (84 %, HPLC 91,00%).
Příklad 3: T3P v EA.
Karboxylát (1 g, 1,82 mmol), 1-amino-1-cyclopropanekarbonitril hydrochlorid (0,216 g, 1,82 mmol) a diisopropylethylamin (DIEA, 1 ml, 5,5 mmol) se suspendoval v DMF (7 ml) a suspenze se míchala 1 hodinu při laboratorní teplotě. Pak byl pomalu přidán T3P 50% roztok v EtOAc (1,16 g, 1,82 mmol po kapkách, během asi5 min). Reakční směs se pak míchala 16 hodin při laboratorní teplotě. Pak byla směs naředěna
EtOAc (5 ml) a nerozpustný podíl byl odstraněn filtrací. Organická vrstva byla promyta 1x 10 ml vody, 1x 10 ml 5% roztok NaHCO3, 1x10 ml solanky a vysušena nad Na2SO4. Po filtraci sušidla a odpaření rozpouštědla za sníženého tlaku byl získán pevný produkt (0,81 g, HPLC 72%). Rekrystalizací z toluenu byl získán bílý krystalický produkt (0,47 g, HPLC 99,40%).
Příklad 4: T3P DMF.
K suspenzi karboxylátu (40 g, 70,48mmol), 1-aminocyclopropan-1-karbonitrilu hydrochloridu (10,02 g, 84,57 mmol) a DMAP (0,86 g. 7,04 mmol) v DIEA (49 ml, 281,92 mmol) a DMF (200 ml) byl během 0,5 hodin přidán 50% roztok T3P v DMF (V=53,8 ml, n=84,57 mmol) při laboratorní teplotě. Reakční směs byla dále míchána pri 22 °C 4 hodiny. Pak byla za míchání (400 otáček/min) přidána voda (280 ml) během 3 hodin. Po přidání vody se suspenze dále míchala 16 hodin při laboratorní teplotě (100 otáček/min). Po 16 hodinách byl skoro bílý krystalický produkt odsát, promyt 100 ml DMF/voda 1:1 obj./obj. a 100 ml vody. Produkt byl sušen 24 hodin při 40 °C vo vákuové sušárně (ca. 180 mbar). Po vysušení byl získán krystalický produkt (30,5 g, 96 %, Tt= 167,8 až169,5 °C, HPLC čistota 96,5%, zbytková rozpouštědla: DIPEA 120 ppm, DMF 1100 ppm, voda 0,10 %, titrace 108,8 %, síranový popel <0,05 %, obsah DMAP <0,01 %).

Claims (4)

  1. Patentové nároky
    1. Způsob výroby (S)-2-(((S)-1 -(4-bromofenyl)-2,2,2-trifluoroethyl)amino)-N-(1 -cyanocyklopropyl)-4-fluoro-4-methylpentanamidu vzorce 1
    Lf cf3 r
    H reakcí kyseliny nebo jejich solí vzorce 3 cf3 se sloučeninou vzorce 4:
    vyznačující se tím, že reakce probíhá v rozpouštědle za přítomnosti anhydridu kyseliny n-propanfosfonové vzorce 5 a báze.
    (5)
  2. 2. Způsob podle nároku 1 vyznačující se tím, že je v reakční směsi dále přítomný N,N-dimethylaminopyridin.
  3. 3. Způsob podle některého z nároků 1 nebo 2 vyznačující se tím, že rozpouštědlem je dimethylformamid.
  4. 4. Způsob podle některého z předchozích nároků vyznačující se tím, že bází je diisopropylethylamin.
CZ2014-941A 2014-12-19 2014-12-19 Příprava vysoce čistého intermediátu pro syntézu Odanacatibu CZ2014941A3 (cs)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ2014-941A CZ2014941A3 (cs) 2014-12-19 2014-12-19 Příprava vysoce čistého intermediátu pro syntézu Odanacatibu
PCT/CZ2015/000151 WO2016095879A1 (en) 2014-12-19 2015-12-14 Preparation of a highly pure intermediate for the synthesis of odanacatib

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ2014-941A CZ2014941A3 (cs) 2014-12-19 2014-12-19 Příprava vysoce čistého intermediátu pro syntézu Odanacatibu

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CZ2014941A3 true CZ2014941A3 (cs) 2016-06-29

Family

ID=55168075

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ2014-941A CZ2014941A3 (cs) 2014-12-19 2014-12-19 Příprava vysoce čistého intermediátu pro syntézu Odanacatibu

Country Status (2)

Country Link
CZ (1) CZ2014941A3 (cs)
WO (1) WO2016095879A1 (cs)

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7375134B2 (en) 2002-03-05 2008-05-20 Axys Pharmaceuticals, Inc. Cathepsin cysteine protease inhibitors
CN1842515A (zh) * 2003-08-27 2006-10-04 默克弗罗斯特加拿大有限公司 组织蛋白酶抑制剂
US8273913B2 (en) 2007-04-02 2012-09-25 Merck Canada Inc. Amidation process for the preparation of cathepsin K inhibitors
EP2681188A4 (en) 2011-03-02 2015-04-15 Merck Sharp & Dohme amidation

Also Published As

Publication number Publication date
WO2016095879A1 (en) 2016-06-23

Similar Documents

Publication Publication Date Title
ES2588193T3 (es) Derivados de 3,4-dihidro-2H-pirazino[1,2-a]indol-1-ona activos como inhibidores de cinasa, proceso para su preparación y composiciones farmacéuticas que los comprenden
KR101523311B1 (ko) 다이펩타이드 유도체, 이의 제조방법, 이를 포함하는 화학센서 및 이를 이용한 은 이온(Ag+), 수은 이온(Hg2+), 구리 이온(I)(Cu+) 및 은나노 입자를 검출하는 방법
WO2019026014A1 (en) METHODS FOR PREPARING LIFITEGRAST AND ITS INTERMEDIATES
WO2013067391A1 (en) Fluorescent substrates for determining lysine modifying enzyme activity
JP2018507858A (ja) トピロキソスタット及びその中間体の調製のための方法
IL274757B1 (en) Process for the preparation of drug linker compounds
Kumar et al. Aroyl-isothiocyanates/isoselenocyanates as precursors to obtain novel cis-3-aroyl-thiourea/urea-β-lactams: design, synthesis, docking and biological evaluation
Heine et al. A widespread bacterial phenazine forms S-conjugates with biogenic thiols and crosslinks proteins
CN106083807B (zh) 4-氨基-5-联苯-4-基-2-羟甲基-2-甲基-戊酸化合物及其制备方法
Voitekhovich et al. Synthesis of new functionally substituted 1-R-tetrazoles and their 5-amino derivatives
CZ2014941A3 (cs) Příprava vysoce čistého intermediátu pro syntézu Odanacatibu
CN103059047B (zh) 一种制备头孢唑肟丙匹酯盐酸盐的方法
Poojari et al. Synthesis of macrocycles containing 1, 3, 4-oxadiazole and pyridine moieties
ES2991258T3 (es) Procedimientos y productos intermedios para producir compuestos de diazaespiro-lactama
JP5476541B2 (ja) テロメラーゼ阻害剤
CA2621809A1 (en) Alkoxy indolinone based protein kinase inhibitors
WO2018104962A1 (en) Hemiaminal-tag for protein labeling and purification
CN104356110B (zh) 一种硫诱导3,6‑芳香杂环不对称取代‑1,2,4,5‑四嗪化合物及其合成方法
JP6670502B2 (ja) 神経伝達物質受容体のリガンドスクリーニングシステムの開発
ES2938053T3 (es) Nuevo procedimiento de preparación de enzalutamida
Pemberton et al. Synthesis and evaluation of dihydroimidazolo and dihydrooxazolo ring-fused 2-pyridones—targeting pilus biogenesis in uropathogenic bacteria
Sinha et al. Anticancer activity of aminoacid linked novel 4-methylumbelliferone derivatives
CN101962351A (zh) 一类α-氨基酸衍生物、其制备方法、中间体及其应用
CZ201532A3 (cs) Způsob výroby vysoce čistého Rilpivirinu a jeho solí
ES2753856T3 (es) Proceso seguro y eficaz para la preparación de carmustina