CZ20598A3 - Inhibice buněčného dýchání a produkce rostlin se samčí sterilitou - Google Patents
Inhibice buněčného dýchání a produkce rostlin se samčí sterilitou Download PDFInfo
- Publication number
- CZ20598A3 CZ20598A3 CZ98205A CZ20598A CZ20598A3 CZ 20598 A3 CZ20598 A3 CZ 20598A3 CZ 98205 A CZ98205 A CZ 98205A CZ 20598 A CZ20598 A CZ 20598A CZ 20598 A3 CZ20598 A3 CZ 20598A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- gene
- plant
- cells
- tissue
- genes
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8216—Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
- C12N15/8218—Antisense, co-suppression, viral induced gene silencing [VIGS], post-transcriptional induced gene silencing [PTGS]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8287—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for fertility modification, e.g. apomixis
- C12N15/8289—Male sterility
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Virology (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Description
Oblast techniky produkce rostlin se samčí
Předkládaný vynález se týká způsobu produkce rostlin se samčí sterilitou tak, že se využije gen, který se může v rostlině exprimovat a inhibuje základní buněčnou funkci, a tím poruší úplnou expresi vybraných znaků rostlin.
Dosavadní stav techniky
Naše mezinárodní patentová přihláška č. WO 90/08831 popisuje a nárokuje si inhibici dýchání užitím různých porušovacích genů (porušovačů) , které také nazýváme geny inaktivující pyl.
Schopnost takových inaktivujících genů působit tímto způsobem je velmi rozdílná, a proto je nutné nadále zlepšovat genové sekvence, aby bylo možné vybírat vhodné geny pro určité aplikace.
Podstata vynálezu
Předmětem tohoto vynálezu je poskytnout geny, které se použijí pro brzdění genové exprese.
Podle předkládaného vynálezu je poskytnut způsob brzdění (inhibice) genové exprese v cílovém rostlinném pletivu zahrnující trvale transformovanou rostlinnou buňku takového druhu, že z ní může být regenerována celá rostlina, s rekombinantním genem (t.j.rekombinantní molekulou DNA) nesoucím tkáňově nebo vývojově specifický promotor, který funguje v buňkách cílového pletiva, a dále nesoucím porušovací gen kódující takový protein, který je schopen, je-li exprimován, inhibovat buněčné dýchání v cílovém pletivu, což
vede k odumření buněk. Porušovací gen je vybrán ze skupiny skládající se z genu T-urfl3, genů kódujících a- nebo βtubulin, krátké ko-suprese ve směru čtení („sense) dvou základních genů buněčného cyklu kukuřice, cdc25 a aktivátoru replikačního počátku (ROA), a krátké, ve směru čtení orientované („sense), molekuly genu translokátoru adenin nukleotidu (ANT) z vnitřní mitochondriální membrány.
Utlumení („down-regulation) genové aktivity způsobené ko-supresí ve směru čtení („sense co-supression) je popsáno v naší mezinárodní patentové přihlášce č. WO 90/08299.
Geny a- nebo β-tubulinu působí jako porušovače tím, že destabilizují uspořádání mikrotubulů v rostlinných buňkách, čímž ruší základní funkci mikrotubulů v cílové tkáni, což vede k odumření buněk.
Užití krátké ko-suprese ve směru čtení dvou základních genů buněčného cyklu kukuřice, cdc25 a aktivátoru replikačního počátku (ROA), porušuje buněčné dělení a vede k růstovým defektům v cílovém orgánu nebo pletivu.
Promotor je nejlépe promotor specifický pro prašník a/nebo tapetum nebo promotor specifický pro pyl, takže exprese porušovacího proteinu v příslušném pletivu regenerované rostliny vede k rostlině se samčí sterilitou. Výhodněji je promotor specifický pro prašník a/nebo tapetum izolován užitím sekvencí cDNA, které jsou ukázány na obrázcích 1, 2, 3, a způsoby popsanými v naší mezinárodní patentové přihlášce č. WO 90/08826.
Plasmidové vektory obsahující sekvence DNA z obrázků
1,2,3 jsou deponovány podle Budapešťské konvence.
Plasmíd pMSIO v hostitelském kmeni Escherichia coli RR1 obsahující genovou sekvenci na obr. 1, byl deponován v národní kolekci průmyslových a mořských bakterií 9. ledna 1989 pod přístupovým číslem NCIB 40090.
Plasmíd pMS14 v hostitelském kmeni E. coli DH5a, obsahující genovou sekvenci na obr. 2, byl deponován v národní • · • ·
kolekci průmyslových a mořských bakterií 9. ledna 1989 pod přístupovým číslem NCIB 40099.
Plasmid pMS18 v hostitelském kmeni E. coli RR1, obsahující genovou sekvenci na obr. 3, byl deponován v národní kolekci průmyslových a mořských bakterií 9. ledna 1989 pod přístupovým číslem NCIB 40100.
Izolace a charakterizace těchto genových sekvencí je plně popsána ve WO 93/01294.
Je možné použít také jiné promotory, například promotor MFS14 specifický pro tapetum.
Předkládaný vynález také poskytuje rostlinu, která má ve svém genomu trvale inkorporovanou rekombinantní molekulu DNA nesoucí geny obsahující tkáňově specifický nebo vývojově specifický promotor, který funguje v buňkách cílového pletiva, a dále nesoucí porušovací gen kódující takový protein, který je schopen, je-li exprimován, inhibovat základní buněčnou funkci jako je například dýchání, uspořádání mikrotubulů nebo buněčné dělení v buňkách cílového pletiva, což vede k odumření buněk.
Vynález také poskytuje rostlinu, zejména jednodšložnou rostlinu, konkrétně kukuřici, která má ve svém genomu trvale inkorporovanou rekombinantní molekulu DNA nesoucí geny obsahující tkáňově specifický promotor, který funguje v buňkách cílového pletiva, a dále nesoucí porušovací gen kódující takový protein, který je schopen inhibovat základní buněčnou funkci jako je dýcháni, uspořádání mikrotubulů v buňkách cílového pletiva, což vede k odumření buněk, přičemž porušovací gen je vybrán ze skupiny skládající se z genu Turfl3, krátké, ve směru čtení orientované, molekuly genu translokátoru adenin nukleotidu (ANT), genů kódujících a- nebo β-tubulin a krátké ko-suprese ve směru čteni dvou základních genů buněčného cyklu kukuřice, cdc25 a ROA.
Tyto rekombinantní geny být použity jako prostředek inhibice buněčného růstu v řadě organismů, od jednoduchých jednobuněčných ke složitým mnohobuněčným organismům, jako jsou rostliny a zvířata. Použitím tkáňově nebo buněčně specifických promotorů mohou být ve složitých organismech zaměřeny a zničeny konkrétní buňky nebo tkáně. Jedno konkrétní použití zamýšlené pro tento vynález je zničení buněk nezbytných pro vývoj samčího květu, což vede k samčí sterilitě.
Vynález tedy poskytuje způsob prevence nebo inhibice růstu a vývoje rostlinných buněk založený na rekombinantních genech, které inhibují základní buněčnou funkci jako je dýchání nebo uspořádání mikrotubulů. Technika má široké použití u velkého množství zemědělských plodin, kde se vyžaduje inhibice konkrétních buněk nebo tkáně.
Obzvláštnímu zájmu se těší inhibice samčí plodnosti u kukuřice pro produkci hybridů Fl in šitu. Koncept inhibice mitochondriální funkce jako mechanismu pro samčí sterilitu pochází z určitého předběžného výzkumu cytoplasmatické samčí sterility typu T u kukuřice (cms-T), který prokázal spojení mezi samčím sterilním fenotypem a mitochondriální dysfunkcí. Ačkoliv musí být ještě určen přímý kauzální vztah mezi mitochondriální dysfunkcí a cms-T, narůstající důkazy potvrzují, že jsou nezbytné plně funkční mitochondrie, zejména v tapetálních buňkách prašníků. Toto je kritické zejména během mikrosporogeneze, protože metabolické požadavky kladené na tapetální buňky mají za následek 40-násobné zvýšení počtu mitochondrií.
Vynález poskytuje tedy řadu negativních mutací, které působí v mitochondriích tak, že inhibují dýchání. Jsou-li exprimovány specificky v prašníkovém pletivu kukuřice, mají tyto mutace za následek samčí sterilní fenotyp.
K porušení buněčné funkce se používá také expresi genů anebo β-tubulinu. Během normálního buněčného života je exprese tubulinových genů regulována jejich endogenními promotory a úzce souvisí s požadavky buněk na tyto proteiny, které jsou polymerizovány a složeny do mikrotubulů během růstu a vývoje ···· 0 0 0 0 rostliny. Expresí tubulinových genů neregulovaným způsobem za použití netubulinových promotorů v konkrétním pletivu nebo stádiu vývoje je porušena rovnováha mezi volnými tubulinovými monomery a molekulami, které jsou polymerizovány v mikrotubulech, což má za následek nestabilitu komplexu mikrotubulů a buněčnou dysfunkci. Tento účinek při expresi v buňkách tapeta nebo jiných buňkách prašníku způsobí, že jsou rostliny sterilní.
Navrhuje se také použití krátké ko-suprese ve směru čtení dvou základních genů buněčného cyklu, např. cdc25 a ROA, k utlumení funkce. Tento účinek při expresi v tapetu nebo jiných buňkách prašníku způsobí, že jsou rostliny sterilní.
Způsob použitý pro transformaci rostlinných buněk není pro tento vynález obzvláště podstatný a může být použita jakákoliv metoda vhodná pro cílovou rostlinu. Transgenní rostliny se získají regenerací z transformovaných buněk. Z literatury jsou známy četné transformační postupy, jako je např. infekce za použití Agrobacterium tumefaciens nebo jeho plasmidu Ti, elektroporace, mikroinjekce rostlinných buněk a protoplastů, mikroprojektilová transformace a transformace pylové láčky. Pro plné detaily známých metod se odkazuje na literaturu.
Nyní bude popsán vývoj a testování těchto rekombinantních genů jako porušovačů mitochondriální funkce v jednobuněčném organismu, kvasince. Bude také popsán mechanismus, kterým jsou tyto rekombinantních geny použity pro inhibici růstu a diferenciace buňky v transformované rostlině postupů je použít kvasinku jako identifikaci a optimalizaci rekombinantních genů proteinů, které porušují mitochondriální funkci, rostlinné buňky transformovány vybranými rekombinantními geny a budou z nich regenerovány celé rostliny.
Cílem těchto modelový systém pro pro expresi Poté budou • ·
Popis obrázků
| Obrázek 1 ukazuje | sekvenci | cDNA | specifickou | pro | prašník, |
| nesenou plasmidem pMSIO Obrázek 2 ukazuje | sekvenci | cDNA | specifickou | pro | tapetum, |
| nesenou plasmidem pMS14 Obrázek 3 ukazuje | sekvenci | cDNA | specifickou | pro | prašník, |
nesenou plasmidem pMS18.
Obrázek 4 ukazuje sekvenci genu T-urfl3 (sekvence s identifikačním číslem 1) s primery Turf-1 (sekvence s identifikačním číslem 2) a Turf-2R (sekvence s identifikačním číslem 3), které jsou podtrženy.
Obrázek 5 ukazuje DNA kódující oblast 59 aminokyselin z genu ATP-2 z Nicotinia plumbaginifolia (sekvence s identifikačním číslem 4 a 5) s primery PREB-IB (sekvence s identifikačním číslem 6) a PREB-R (sekvence s identifikačním číslem 7.
Obrázek 6 ukazuje štěpné místo sekvence pre-β.
Obrázek 7 je mapa vektoru pCaMVI-,Ν.
Obrázek 8 je mapa vektoru RMS17.
Obrázek 9 je mapa vektoru pIE109.
Obrázek 10 ukazuje promotorovou sekvenci MFS14 (sekvence s identifikačním číslem 8) s následujícími rysy:
pozice 2198 začátek transkripce CCTACAA (souhlasný CTCATCA) pozice 2167 ATCCATT (možný motiv sekvence TATA) pozice 2141 CCAT (možný motiv sekvence CAAT) pozice 2233 začátek cDNA CACACAG pozice 2295 začátek translace GCAACAATGGCG (souhlasný TAAACAATGGCT).
Obrázek 11 je mapa vektoru RMS11.
Obrázek 12 je mapa vektoru pMANT3.
Obrázek 13 ukazuje konstrukci vektorů pro transformaci kukuřičné buněčné linie.
• · • ·
Obrázek 14 je graf ukazující počty transformovaných rostlin v různých pokusech.
Vynález bude nyní ilustrován následujícími příklady.
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1
Sestrojení vektoru RMS17 pro transformaci kukuřice
Pro amplifikaci genu T-urfl3 z kukuřice cms-T (linie
RW33:TMS) a mitochondriální cílové sekvence pre-β z Nicotiana plumbaginifolia se použila metoda polymerázové řetězové reakce - PCR. Vzorky DNA z rostlinného materiálu byly připraveny za použití metody popsané Edwardsem a kol. (Nucleic Acids Research, 1991, 19, 1349) .
Kompletní gen T-urfl3 byl amplifikován metodou PCR pomocí primerů turf-1 (5'ATCGGATCCATGATCACTACTTTCTTAAACCTTCCT-3', identifikačním číslem 2) (5'TAGTCTAGATCACGGTACTTGTACGCTATCGGT - 3', identifikačním číslem 3), které byly sekvence s a turf-2R sekvence s navrženy podle publikované sekvence (Dewey a kol., 1986, Cell, 44, 429-449). Podmínky PCR byly následující: 3 5 cyklů denaturace v 94°C po 0,8 min, nasednutí primerů v 65°C po 1 min a prodlužování řetězce v 72 °C po 2,5 min. Aby se napomohlo následnému klonování, byly primery pro PCR navrženy tak, že zavedly jedinečná restrikční místa BamHI a Xbal na 5' a 3' konce genu, v uvedeném pořadí. Pozice těchto primerů odpovídající sekvenci genu T-urfl3 je ukázána na obrázku 4.
Podobně byla amplifikována metodou PCR oblast 59 aminokyselin z genu ATP2 z Nicotiana plumbagini folia, která kóduje funkční mitochondriální cílovou sekvenci pre-β, pomocí primerů PREB-IB (5'ATCGGTACCGCCATGGCTTCTCGGAGGCTTCTCGCCT-3', • · • · · • · ·· · sekvence s identifikačním číslem 6) a PREB-R (5'ATCGGATCCCGCTGCGGAGGTAGCGTA-3', sekvence s identifikačním číslem 7) , které byly navrženy podle publikované sekvence (Boutry a kol., 1987, Nátuře, 328, 341). Podmínky pro PCR byly stejné jak je uvedeno výše, kromě teploty pro nasednutí primerů, která byla snížena na 60 °C. Aby se napomohlo následnému klonování, byly PREB-IB a PREB-2R navrženy tak, že zavedly jedinečná restrikční místa Kpnl a BamHI na 5' a 3' konce amplifikovaného fragmentu, v uvedeném pořadí. Pozice těchto primerů odpovídající genu ATP2 je ukázána na obrázku 5.
Po amplifikaci v PCR byl fragment pre-B štěpen Kpnl a
BamHI, aby vznikly kohezivní konce, a byl klonován do odpovídajících míst vektoru pUC18 za vzniku plasmidu pPBl. PCR produkt TURF13 byl štěpen BamHI a Xbal a klonován na odpovídající místa v pPBl za vzniku plasmidu pPB2. V pPB2 je sekvence pre-β fúzována s genem T-urfl3 při dodržení čtecího rámce tak, že po expresi v rostlinné buňce je celý produkt transportován do mitochondrií. Štěpení sekvence pre-β v předpovězeném místě mezi zbytky 55 a 56 uvolní protein Turfl3, který na svém NH2 konci obsahuje další 4 zbytky ze sekvence pre-β (obrázek 6).
Genová fúze pre^/T-urf13 v pBB2 je odstraněna štěpením enzymy Kpnl a Balí, opatřena tupými konci a klonována do plasmidu pCAMVIxN (obrázek 7) , který byl naštěpen BamHI a opatřen tupými konci za vzniku pPB3. Tento klonovací krok umístí fúzovaný gen pre^/T-urf13 pod transkripční kontrolu promotoru CAMV 35S. V tomto rekombinantním genu je přítomen intron Adhl, aby zvýšil úroveň exprese v kukuřičných buňkách (Mascarenhas et al., 1990, Plant Mol. Biol., 15, 913-920) a sekvence nos 3' poskytuje místo pro přidání polyA. Aby vznikl konečný vektor RMS17 (obrázek 8), byla zavedena selekční kazeta PAT z pIE109 (obrázek 9) jako fragment EcdRI do jedinečného místa BcoRI v pPB3, což umožňuje in vitro selekci transformovaných kukuřičných buněk na médiu s bialaphosem.
• · • ·
Příklad 2
Transformace buněk BMS kukuřice plasmidem RMS17
Cílem tohoto pokusu bylo ukázat, že exprese rekombinantního genu prep/T-urfl3 v kukuřičných buňkách BMS pěstovaných v tkáňové kultuře vede ke snížení životaschopnosti buněk, jak bylo měřeno stanovením transgenních kalusů po transformaci. Vektor RMS17 (obrázek 8) byl do kukuřičných buněk BMS pěstovaných v tkáňové kultuře zaveden pomocí transformační techniky užívající mikrovláken karbidu křemíku. Příprava mikrovláken karbidu křemíku
Se suchými mikrovlákny se vždy zacházelo v digestoři, aby se předešlo vdechnutí a možnému poškození plic. Tato vlákna mohou být karcinogenní, protože mají podobné vlastnosti jako azbest. Vlákna Silar SC-9 byla poskytnuta Advanced Composite Materiál Corporation Greer, South Carolina, USA. Sterilní suspenze vláken byla připravena následujícím postupem. Přibližně 50 mg vláken bylo vloženo do předem zvážené 1,5 ml zkumavky Eppendorf, která byla uzavřena a zvážena znovu, aby se určila hmotnost vláken. Víčko zkumavky bylo proděravěno injekční jehlou a přikryto dvojitou vrstvou hliníkové folie. Zkumavka byla sterilizována v autoklávu (121°C, 15 psi, 20 minut) a usušena. Pro každý pokus se připravily čerstvé suspenze vláken, protože bylo publikováno, že úroveň transformace DNA byla vyšší při použití čerstvých roztoků než při použití roztoků starších. 5 % (hmotnost/objem) suspenze vláken byla připravena ve sterilní deionizované vodě. Seuspenze se několik sekund třepala na mikrotřepačce, aby se vlákna resuspendovala těsně před použitím.
Přenos (transformace) DNA do buněk
Všechny postupy se prováděly v digestoři s laminárním prouděním vzduchu za aseptických podmínek. DNA byla do buněk transformována následujícím postupem. Specifické modifikace této metody jsou v textu vyznačeny.
···· 0 · 00 · Β • · « 0 · · « ·· » 4 • 0 ···*
0 <
0 00
Buňky a suspenze mikrovláken byly pipetovány za použití pipetových špiček Gilson s odříznutým koncem. Do sterilní zkumavky Eppendorf se odměřilo 100 μΐ čerstvého média BMS (viz příloha 1) . K němu se přidalo 40 μΐ 5 % (hmotnost/objem) suspenze vláken a 25 μΐ (1 mg/ml) plasmidové DNA, vše bylo protřepáno na stolní mikrotřepačce (Vortex Genie 2 Scientific Industries, lne) nejvyšší rychlostí po dobu 60 s. Okamžitě po protřepání bylo přidáno 500 μΐ buněčné suspenze, tj . 250 μΐ buněk (po stočení). Zkumavka Eppendorf byla poté uzavřena víčkem a protřepána nejvyšší rychlostí po dobu 60 s ve vzpřímené pozici. Pro transformaci dalších buněčných linií byl použit stejný postup.
V tomto pokuse byly zahrnuty tři kontroly. Dva pozitivní kontrolní vektory, z nichž pPG3 obsahoval samotnou selekční kazetu PAT, a RMS15, který je totožný s RMS17 kromě toho, že gen T-urfl3 je nahrazen genem mitochondriálního rozpojovacího proteinu, UCP, který nemá žádný účinek na buňky BMS pěstované v tkáňové kultuře. V obou rekombinantních genech je přítomná cílová sekvence pre-β. Negativní kontrolu, která by měla kompletně zabránit založení transgenních kalusů, poskytl RMS13, který je totožný s RMS17 kromě toho, že fúzovaný gen preP/T-urfl3 je nahrazena genem cytotoxické ribonukleázy, barnázy.
Průměrný počet transgenních kalusů založených v tomto pokuse je ukázán v tabulce 1.
TABULKA 1
| Počet transgenních kalusů v pokusu | ||||
| Vektor | Průměr | 1 | 2 | 3 |
| pPG3 | - | 44 | 33 | 39 |
| RMS13 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| RMS15 | 40 | 30 | 43 | 38 |
| RMS17 | 12 | 13 | 23 | 16 |
·· ΒΒ
Β Β Β Β
Β Β·Β • ΒΒΒΒ Β
Tato data ukazují, že vzhledem ke dvěma pozitivním kontrolám, pPG3 a RMS15, vede exprese fúzovaného genu prep/Turfl3 k významnému snížení (p < 5 % nebo lépe) v zakládání transgenních kalusů. Toto naznačuje, že protein T-urfl3 zacílený na mitochondrie, má na buňky škodlivý účinek, pravděpodobně díky zhoršení mitochondriální funkce. Exprese cytotoxické ribonukleázy, barnázy, kompletně ruší založení transformovaných kalusů.
Příklad 3
Sestrojení vektoru RMS11 pro transformaci kukuřice
RMS11 je transformační vektor, ve kterém je exprese fúzovaného genu pre-P/T-urf13 řízena promotorem z kukuřičného tapeta MFS14. Sekvence promotoru MFS14 a nepřekládané zaváděcí oblasti od pozice -2198 do +97 je ukázána na obrázku 10. Tímto způsobem je exprese proteinu T-urfl3 omezena na buňky tvořící pyl a není v celé rostlině.
Aby se sestrojil RMS11, byl fragment Kpnl-Sall z pPB2 obsahující fúzovaný gen pre-p/T-urf13 opatřen tupými konci a vložen do tupě zakončeného místa BamHI plasmidu pSC9 za vzniku pPB4 . V pPB4 je fúzovaný gen pre-P/T-urf13 nyní umístěn mezi pozicemi -152 až +97 promotorového fragmentu a 3' polyadenylační sekvencí nos. Tato kompletní kazeta byla z pPB4 odstraněna štěpením Sad a FcoRI a klonována do odpovídajících míst pSC7 za vzniku plasmidu pB5. pSC7 obsahuje oblast pozic -153 až -5800 promotoru MFS14, takže vložení fragmentu SacI-EcoRI z pPB4 obnoví plný promotor MFS14 o délce
5,8 kb.
RMS11 (obrázek 11) byl dokončen vložením in vitro selekční kazety PAT z plE109 do jedinečného místa EcoRI plasmidu pPB5.
• ·
Příklad 4
Transformace buněk kukuřice vektorem RMS11 metodou bombardování mikročásticemi, která vede ke vzniku trvale transformovaných rostlin se samčí sterilitou
K transformování regenerovatelné buněčné kultury kukuřice metodou bombardování mikročásticemi byl použit vektor RMS11. Rostlinný materiál
Embryogenní drobivý kalus typu II byl indukován z nezralých zygotických embryí vyjmutých z rostlin A188, buď pěstovaných ve skleníku nebo na poli, a to 10 až 12 dní po opylení pylem z inbrední linie B73. Médium použité pro indukci a udržování kalusu bylo založeno na médiu typu N6 podle Armstronga a Greena. Médium obsahovalo 6 mM L-prolin, 2 % (hmotnost/objem) sacharózu, 2 mg/1 2,4-dichlorfenoxyoctovou kyselinu (2,4-D) a 3 % (hmotnost/objem) Gelrit (Obchodní značka, Caroline Biological Supply), a mělo hodnotu pH 6,0. Kalus byl pěstován 4 týdny před tím, než byla indukována suspenzní kultura. Suspenzní kultura byla indukována v tekutém médiu typu MS obsahujícím 100 mg/1 myoinositolu, 2 mg/1 2,4-D, 2 mg/1 1-naftalenoctové kyseliny (NAA), 6 mM L-prolin, 200 ml/1 hydrolyzátu kaseinu (Difco Laboratories), 3 % (hmotnost/objem) sacharózu a 5 % (objemových) kokosového mléka (Difco Laboratories), a mělo hodnotu pH 6,0. Buněčné suspenze byly udržovány v médiu ve 125 ml Erlemeyerových baňkách při teplotě 28 °C ve tmě na třepačce s rychlostí 125 rpm. Suspenze byly každého 3,5 dne pasážovány tak, že bylo odebráno 3 ml (po stočení) buněk a 10 ml starého média a přeneseno do 20 ml čerstvého kultivačního média. Suspenzní kultury byly v době, kdy byly použity pro bombardování, staré 6 měsíců až 1 rok. V některých transformacích byly použity suspenzní kultury předtím uchowávané kryoprezervací a obnovené.
Bombardování mikročásticemi • ·
Buněčné suspenze byly přefiltrovány přes 1,0 mm a pak 0,5 mm sítko. Buňky o celkovém objemu 0,2 ml (po stočení), které prošly sítkem, byly resuspendovány v 5 ml média a rovnoměrně naneseny na disk filtračního papíru Whatman 4 pomocí vakuové filtrace v mikroanalytickém Precipitace plasmidové DNA wolframové mikročástice, a držáku o průměru v nadšroubovicové poté bombardování
4,7 cm. formě na použitím přístroje PDS-100 Biolistics (Obchodní značka, DuPont) byly provedeny v podstatě tak, jak popisuje výrobce. Cílové destičky byly bombardovány jednou.
Selekce transformovaných buněk a regenerace rostlin
Každý disk filtračního papíru s buňkami byl po bombardování přenesen na médium typu N6 obsahující 100 mg/1 myoinositolu, 2 mg/1 2,4-D, 3 % (hmotnost/objem) sacharózu a 0,3 % (hmotnost/objem) Gelrit, a mělo pH 6,0. Pro selekci byl využit gen NPTII, a proto bylo médium doplněno kanamycin sulfátem v koncentraci 200 mg/1. Disky byly přeneseny na čerstvé médium se selekčním činidlem po 7 dnech, a pak opět po 14 dnech. Suspense pak byla rozdělena na 2 stejné části a každá byla přenesena na Petriho misku 100x20 mm s 20 ml pevného média obsahujícího selekční činidlo a 3 % Gelrit (hmotnost/objem). Po 2 až 5 týdnech byly rychle rostoucí, a tedy pravděpodobně transformované, kalusy přemístěny na čerstvé selektivní médium. Rostliny byly z kalusu regenerovány tím, že se kalusy přesadily na médium typu MS obsahující 1 g/1 myoinositolu, 1 mg/1 NAA, 6 % (hmotnost/objem) sacharózu a 3 % (hmotnost/objem) Gelrit, mělo pH 6,0. Po dalších 2 až 3 týdnech byly kalusy přesazeny na MS médium obsahující 0,25 mg/1 NAA a 3 % (hmotnost/objem) sacharózu a přemístěny na světlo, kde se začalo objevovat klíčení embryí. Poté byly rostlinky pěstovány na médiu typu MS poloviční koncentrace obsahujícím 500 mg/1 myoinositolu, 3 % (hmotnost/objem) sacharózu a 0,3 % Gelrit a mělo pH 6,0 a to po dobu 1 až 2 týdnů před tím, než byly přesazeny do skleníku.
• · • ·
Po přesazení do skleníku byla každá rostlina z nezávisle transformovaného klonu testována na přítomnost rekombinantního genu MFS14/pre-B/T-urf13 pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR) . DNA byly izolována z malých kousků listového pletiva metodou dle Edwardse et al. , (1991, Nucleic Acid Research 19, 1349) . Tato DNA pak byla užita v PCR s oligonukleotidovými primery 14-SA (5'-AGACGCTGAGCTCAAGGACGTGA-3', sekvence s identifikačním číslem 9) a turf-2R (viz příklad 1).
V době kvetu byly rostliny z každého nezávisle transformovaného klonu vizuálně hodnoceny ve skleníku podle stupnice vyvinuté pro hodnocení linií se samčí sterilitou (viz tabulka 2) . Rostliny hodnocené stupněm 4 a níže jsou funkčně sterilní. Hodnocení nezávislých klonů pozitivních v PCR jako kumulativní skóre je ukázáno v tabulce 3 a porovnáno s linií kukuřice, která vznikla transformací bombardováním plasmidem RMS11, ale byla v PCR negativní.
Sterilní rostliny byly zpětně kříženy pylem z fertilních netransgenních rostlin BE70. Semena vzniklá jedním takovým křížením (klon YK23, rostliny 5xBE70) byla vyseta ve skleníku a rostliny ponechány do květu. Přítomnost rekombinantní molekuly MFS14/pre-B/T-urf13 byla vyhodnocena pomocí PCR a testem PAT (který hodnotí přítomnost selektovatelného markéru použitého při transformaci). Hodnocení fertility těcto rostlin ukazuje tabulka 4. Nežádoucí, v PCR negativní rostliny, byly ze skleníku odstraněny ještě před kvetením. Rostliny 1 a 2 měly nejednoznačný výsledek PCR testu a byly ponechány ve skleníku až do kvetení. Rostlina 12 byla udržována jako kontrola. Jak je vidět v tabulce 4, 6 rostlin z potomstva bylo sterilních, a tato sterilita korelovala s přítomností vneseného transgenu, jak bylo potvrzeno testem PCR a PAT. To je v souladu s přítomností jediného transgenního lokusu zodpovědného za sterilitu.
TABULKA 2
Klasifikace prašníků (podle L.M. Josephsona)
| Třída 0 | Žádné prašníky nejsou vyvinuty |
| Třída 1 | Je vyvinuta méně než polovina prašníků a všechny jsou malé, suché a tvrdé, nepráší pyl |
| Třída 2 | Většina prašníků je vyvinuta, ale všechny jsou malé, suché a tvrdé, nepráší pyl |
| Třída 3 | Jsou vyvinuty částečně fertilní prašníky, práší trochu pylu, poměr vyvinutých prašníků je vysoce variabilní |
| Třída 4 | Lehce abnormální prašníky, vyvinuty přibližně na 75 až 100 procent |
| Třída 5 | Normální prašníky a plně fertilní |
Rostliny kukuřice spadající do třídy 4 a 5 byly považovány za fertilní.
TABULKA 3
| Klon | počet rostlin | stav fertility | P.C.R |
| WK23 | 2 | 0 | + |
| 3 | 3 | + | |
| WK23 | 2 | 0 | + |
| YK23 | 3 | 0 | + |
| 1 | 4 | + | |
| YE23 | 4 | 5 | - |
TABULKA 4
| ROSTLINA | TEST PCR | TEST PAT | STAV FERTILITY |
| YK23/5/1 | + /- | - | 0 |
| YK23/5/2 | + /- | + | 0 |
| YK23/5/3 | - | ODSTRANĚNO | |
| YK23/5/4 | - | ODSTRANĚNO | |
| YK23/5/5 | ŽÁDNÉ KLÍČENÍ | ||
| YK23/5/6 | + | + | 1 |
| YK23/5/7 | + | + | 0 |
| YK23/5/8 | - | ODSTRANĚNO | |
| YK23/5/9 | + | + | 0 |
| YK23/5/10 | - | ODSTRANĚNO | |
| YK23/5/11 | + | + | 0 |
| YK23/5/12 | - | - | 5 |
Přiklad 5
Konstrukce vektoru pRMS-23 pro transformaci kukuřice
Zkoušelo se, zda exprese, souhlasně se směrem čtení, krátké rekombinantní molekuly DNA odvozené z genu pro adenin nukleotid translokátor (ANT) kukuřice vede k poruše růstu buněk kukuřice. Fragment z kukuřičného genu ANT byl izolován metodou PCR a oligonukleotidových primerů navržených podle sekvence kukuřičného genu, který publikoval Bathgate et al. (1989, Eur. J. Biochem., 83, 303-310).
Fragment genu ANT byl amplifikován pomocí primerů MANT-1 (5'-ATGCCCGGGCTTGCAATGTCTGTTAGCGGTGGCATCA-3', sekvence s identifikačním číslem 10) a MANT-2RB (5'ATGCCCGGGCGATGGGGTAAGATGCAAGACCA-3', sekvence s identifikačním číslem 11). Podmínky pro PCR byly: 35 cyklů složených z denaturace při 94 °C po 0,8 min, nasednutí primerů při 65 °C po 1 min a prodlužování řetězce při 72 °C po 2,5 min. Kvůli usnadnění klonování byly primery pro PCR navrženy tak, že vnesly jedinečné restrikční místo Smál na 5' i 3' konec klonovaného genu. Sekvence kukuřičného genu ANT byla publikována v Eur. J. Biochem. (1989) 183, 303-310. Sekvence primeru MANT-1 odpovídá sekvenci ze začátku kódující sekvence genu a sekvence MANT-2R leží blízko konce genu.
Po proběhnutí PCR, ve které vznikl fragment DNA očekávané velikosti 1050 bp, byla DNA naštěpena Smál a fragment byl subklonován do místa Smál plasmidu pUC18, čímž vznikl plasmid pojmenovaný pMANTl. Následovalo zavedení fragmentu SacI-EcoRI polyadenylační signální sekvence ze 3' konce genu nos do 3' konce klonovaného genu ANT, a tak vznikl plasmid pMANT2. Dále byl vložen fragment HindiII-BamHI nesoucí 35s promotor CaMV a intron ADH1 z pCaMVIJSI (obr. 5) do příslušných míst pMANT2, a tím vznikl pMANT3. Konstrukce pRMS-23 (obr.12) byla ukončena vložením genové kazety PAT z plasmidu pIE109 (obr.7), umožňující in vitro selekci, do jedinečného místa EcoRI plasmidu pMANT3.
Příklad 6
Transformování buněk BMS z kukuřice plasmidem pRMS-23
Cílem tohoto pokusu bylo ukázat, že exprese plasmidu pRMS-23 v kultivovaných buňkách BMS kukuřice snižuje životaschopnost buněk, měřenou jako schopnost zakládat transgenní kalusy jako důsledek transformace. Vektorové DNA byly vneseny do buněk BMS v buněčné kultuře technikou, která pro transformaci využívá vláken karbidu křemíku, jak je popsáno v příkladu 2.
Po transformaci plasmidem pRMS-23 byl stanoven průměrný počet transgenních kalusů relativně vzhledem k pozitivní kontrole transformované pPG3, která obsahovala samotnou in vitro selekční genovou kazetu (tab. 5). Data v tabulce • · ukazují, že exprese krátkého úseku genu translokátoru adenin nukleotidu významně snižuje vznik transgenních kalusů.
TABULKA 5
| Počet transgenních kalusů v pokusu | ||||
| 1 | 2 | 3 | Průměr | |
| Pokus 1 | ||||
| pPG3 | 16 | 20 | 22 | 19 |
| pRMS-23 | 3 | 4 | 3 | 3 |
| Pokus 2 | ||||
| pPG3 | 49 | 48 | 40 | 46 |
| pRMS-23 | 10 | 15 | 23 | 16 |
Příklad 7
Konstrukce vektorů pTBR a pTBS pro transformování kukuřice
Zkoušelo se, zda neregulovaná exprese genu a-tubulinu povede k poruchám růstu buněk kukuřice. Byly připraveny dva rekombinantní geny, obsahující cDNA kódující α-tubulin ze dvou biotypů Eleusine indica. Plasmid pTBR (obr.13) obsahuje cDNA pro α-tubulin z biotypu Eleusine indica rezistentního k dinitroanilinu, který byl klonován jako Hinfl fragment s tupými konci do pCaMVIxN s tupými konci štěpeného BamHI (obr.7). pTBS (obr. 13) obsahuje cDNA pro α-tubulin z citlivého biotypu, který byl klonován stejně jako v případě popsaném pro pTBR.
Příklad 8
Transformace buněk BMS kukuřice vektory pTBR a pTBS
Cílem pokusu bylo ukázat, že exprese pTBR a pTBS v kultivovaných buňkách BMS kukuřice vede ke snížení životaschopnosti buněk vyjádřené jako schopnost zakládat po • » transformaci transgenní kalusy. Vektorové DNA byly vneseny do buněk BMS v buněčné kultuře technikou, která pro transformaci využívá vláken karbidu křemíku, jak je popsáno v příkladu 2.
Po transformaci vektory pTBR a pTBS byl stanoven průměrný počet transgenních kalusů relativně vzhledem k pozitivní kontrole transformované pPG3, která obsahovala samotnou in vitro selekční genovou kazetu (obr. 14). Data v tabulce ukazují, že neregulovaná exprese genu pro α-tubulin z obou biotypů Eleusine indica významně snižuje vznik transgenních kalusů.
Průmyslová využitelnost
Předkládaný vynález se týká způsobu produkce rostlin se samčí sterilitou tak, že se využije gen, který se může v rostlině exprimovat a inhibuje základní buněčnou funkci, a tím poruší úplnou expresi vybraných znaků rostlin. Vynález poskytuje způsob inhibice růstu a vývoje rostlinných buněk založený na rekombinantních genech, jejichž exprese vede k inhibici základní buněčné funkce jako je dýchání nebo uspořádání mikrotubulů. Konkrétní použití zamýšlené pro tento vynález je zničení buněk nezbytných pro vývoj samčího květu, což vede k samčí sterilitě. Technika má široké použití u velkého množství zemědělských plodin, kde se vyžaduje inhibice konkrétních buněk nebo pletiva.
SEZNAM SEKVENCÍ (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 1:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 357 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: dvojité (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: DNA (genomová) (vii) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: T-urfl3 (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 1:
| ATCGGATCCA | TGATCACTAC | TTTCTTAAAC | CTTCCTCCCT | TTGATCAAGG | TTTGGTATTT | 60 |
| TTCGGTTCTA | TTTTTATTTT | TTTTTTGTGC | ATATTATTGA | TAAAGGGATA | TCTCCGTAAA | 120 |
| ATGGATGATT | CCTATTTGGC | TCAACTCTCC | GAGTTAGCCA | ACCACAATAG | AGTGGAAGCG | 180 |
| GCAAAAGCGG | GCCACGTGGC | CCTGCATGAG | CTATCCTTCT | CGTGGTTGAG | GGGGGTTCAA | 240 |
| ATTAGGGTGA | GGACCTTACC | TATACAACGG | AATGAAGGAG | GGGGTCGAAG | CAACGACCAA | 300 |
| TCCACTCTCT | CTAAGCCTAA | GTATTCCTCA | ATGACCGATA | GCGTACAAGT | ACCGTGA | 357 |
(2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 2:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 36 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: DNA (vii) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: Turf-1 primer • · (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 2:
ATCGGATCCA TGATCACTAC TTTCTTAAAC CTTCCT 36 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 3:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 33 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: DNA (vii) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: Turf-2R primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 3:
TAGTCTAGAT CACGGTACTT GTACGCTATC GGT 33 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 4:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 269 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: dvojité (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: DNA (genomová) (vii) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: gen ATP-2 z Nicotinia plumbaginifolia (ix) ZNAKY:
(A) JMÉNO/OZNAČENÍ: CDS (3) POZICE: 1...267 (D) DALŠÍ INFORMACE: /startovací kodon = 1 (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 4:
| ATG Met 1 | GCT Ala | TCT Ser | CGG Arg | AGG Arg 5 | CTT Leu | CTC Leu | GCC Ala | TCT Ser | CTC Leu 10 | CTC Leu | CGT Arg | CAA Gin | TCG Ser | GCT Ala 15 | CAA Gin | 48 |
| CGT | GGC | GGC | GGT | CTA | ATT | TCC | CGA | TCG | TCA | GGA | AAC | TCC | ATC | CCT | AAA | 96 |
| Arg | Giv | Gly | Gly 20 | Leu | lle | Ser | Arg | Ser 25 | Ser | Gly | Asn | Ser | lle 30 | Pro | Lys | |
| TCC | GCT | TCA | CGC | GCC | TCT | TCA | CGC | GCA | TCC | CCT | AAG | GGA | TTC | CTC | TTA | 144 |
| Ser | Ala | Ser 35 | Arg | Ala | Ser | Ser | Arg 40 | Ala | Ser | Pro | Lys | Gly 45 | Phe | Leu | Leu | |
| AAC | CGC | GCC | GTA | CAG | TAC | GCT | ACC | TCC | GCA | GCG | GCA | CCG | GCA | TCT | CAG | 192 |
| Asn | Ara 50 | Ala | Val | Gin | Tyr | Ala 55 | Thr | Ser | Ala | Ala | Ala 60 | Pro | Ala | Ser | Gin | |
| CCA | TCA | ACA | CCA | CCA | AAG | TCC | GCC | AGT | GAA | CCG | TCC | GGA | AAA | ATT | ACC | 240 |
·· ·· ·· ·· » · · · » · ·· • · · · · ♦ · ·
| Pro 65 | Ser | Thr | Pro | Pro | Lvs 70 | Ser | Ala |
| GAT | GAG | TTC | ACC | GGC | GCT | GGT | TCG |
| Asp | Glu | Phe | Thr | Gly 85 | Ala | Gly | Ser |
ATC GG Ile
Ser Glu Pro Ser Gly Lys Ile Thr 75 80
269 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 5:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 89 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: protein (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 5:
| Met | Ala | Ser | Arg | Arg | Leu | Leu | Ala | Ser | Leu | Leu | Arg | Gin | Ser | Ala | Gin |
| 1 | - | 5 | 10 | 15 | |||||||||||
| Arg | Gly | Gly | Gly | Leu | Ile | Ser | Arg | Ser | Ser | Gly | Asn | Ser | Ile | Pro | Lys |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Ser | Arg | Ala | Ser | Ser | Arg | Ala | Ser | Pro | Lys | Gly | Phe | Leu | Leu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Asn | Arg | Ala | Val | Gin | Tyr | Ala | Thr | Ser | Ala | Ala | Ala | Pro | Ala | Ser | Gin |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Pro | Ser | Thr | Pro | Pro | Lys | Ser | Ala | Ser | Glu | Pro | Ser | Gly | Lys | Ile | Thr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Asp | Glu | Phe | Thr | Gly | Ala | Gly | Ser | Ile |
(2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 6:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 37 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: DNA (vii) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: PREB-IB primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 6:
ATCGGTACCG CCATGGCTTC TCGGAGGCTT CTCGCCT 37 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 7:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 27 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: DNA
(vii) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: PREB-2R primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 7:
ATCGGATCCC GCTGCGGAGG TAGCGTA 27 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 8:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
| (A) DÉLKA: 2285 párů bázi (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: dvojité (D) TOPOLOGIE: lineární | ||||||
| (il) | TYP MOLEKULY: DNA (genomová) | |||||
| (vii) | PŮVODNÍ ZDROJ: (A) ORGANISMUS: promotor MFS14 | |||||
| (xi) POPIS | SEKVENCE: | SEKVENCE | S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 8: | |||
| AAAAGCGTAC | CAGTAAGGGA | TAAAGAAAAT | AAACAAACAC | GAAATGCTTC | CCCATCGGCC | 60 |
| AATTCGCCTA | GGTGTGCTAG | GAACTGGCCT | ATATGTTCGT | GTGTGCTTCT | CCTATTTTCA | 120 |
| CCAGAAAACT | TAGAAAACTC | TGGTATCCTT | GCCCCTTGTG | GATATGGGAC | AATGTCAAAC | 180 |
| CGGTGATCAT | ATGGCTTCTG | ATATC-ATTGC | CCCACTCTAT | CCACACCAAC | TCCGAGTCTA | 240 |
| TCTCAAAATA | GTTTAGCCAT | CTCTTCCCTA | ATTTTCTACA | TTGCACTCGG | TGGCAGACCA | 300 |
| CCGGACCCTA | GGCTGTGGGG | TTCATTCGGT | CGGGCATTGT | TATGCCGACC | TTCTTGCCAT | 360 |
| GACCGATTC-A | TAATGTTGAT | CGGCCTGTGA | TCATATGGCG | TGTTGTGGGT | TAAATATGTA | 420 |
| GGGGGCAGA^ | CATACTGCCG | TTGTGGTATG | TAATAATTTG | GTGCATAGTG | TGCGACAGTA | 480 |
| GGTTCTGTGT | ATGTGTATCC | GATATGTCCG | GTGGTACATC | TGAACTGGCC | GGTTGTGTTA | 540 |
| GCTATTATTG | GGGCGCCACG | CGTAGCCCTG | GTGCGGCCCG | GACTATCCGG | CAGAGAAAGC | 600 |
| CGACGGTCTG | TGTAAGGGCC | GAACTATCCA | GACAAAAGCT | CGGACGGTCC | GACCGTGTAG | 660 |
| AGGGCCGTCG | ATCTGCCAAG | CAAGGACGAT | GGTGATGGTA | TTTGCCCTC-G | ATATGAGTTC | 720 |
| ATCAACATAC | CATATAATGG | ATGGGGCTGC | AAATCCCCAT | TTGTCGCCGA | TGTATTAGAC | 780 |
| ataaatatca | TGTTACTAGT | TTCATATGAT | GGAAAACTAG | GAGCAACAGA | CTTCTCCAAC | 840 |
| ATACACGTTA | ATTTTCTAAT | TGGTTCTTCT | AACCCTCTAA. | TCTAATGCTT | CATTTGATTA | 900 |
| TGCAAATGGT | CTACATACTG | TTTAATAGAT | TGGATG.TCGT | CGGGTTTACT | TACGTTAGGG | 960 |
| ACTTGAAGCG | AAGATAGAAG | AGATGTGACG | TCGGTATCGC | ATGTTTGACA | ACTTTCTGGT | 1020 |
| GACGATCCAC | CATGTATTGT | GACAAC-AATT | TCTCCTTCGT | TTGACACATG | TAGTCCTCGT | 1080 |
| ATTGTTGTTG | CTCATCGGTC | C-TCGGACTCT | TAATAGCCGG | CTTTAGGATA | TTGTCCGGC-G | 1140 |
| AC-ATATCC-GT | GTGATCTTTA | Gz“AC CGC CAT | TTGAT G GC CT | GAGTTTTAGT | AGATCTAGAC | 1200 |
···· ····
ACATTTCCCC AACGGAGTCG CCAAAAAGTG TGTTGGCGCC GATCCAGGCG CGAAACACTG 1260
GAGATGGACC GTTTGGCGGT GTTCTCCGGG TGAGGACGGT CCGCGACCTG GGTCCAGCAG 1320
CGACTCTCCT CTACGTGTGT CCGGACGGTC CGTCGTCTGG GGCTCGGACG GTCGCGATGG 1380
CGCAGAGGGT CTTCTTCTTC GCAGCCGACC TAGATCTCGC CTCCCGGGAG GGACCGTCGG 1440
GGAGGAGAGA TTGTAGGGTG TGTCTTGGCG TCGACAGGCC ACACAATACG CCTCTAGTCG 1500
ACGTAGAGCC GAAGAGAGGT GAAGGATTGA GGTAGAAGGA GGCTAAACTT GGGCTAAACT 1560
AGAACTACTG CTAATGCATA AGGTAAAAAC GAGAAGTGGA CTTCATTTGA TCGATTGTGG 1620
AAGTAATCTG ACTGTAGCCC TTTATCTATA TAAAGGGGAG GTATGGACCC GTTACAAGCC 1680
GTTTTCCGAG CTAATCTCAC GGTTTTAGTT AATAAATCCT GCGAGAAACT CGGAACTCTA 1740
ACTGATTCTA CTCATGCGCG AACCATTCGT GCGCCACCGC TGCCCGTCCC GCGATCGCTC 1800
AGTTAACCCT GTGTTGTGCG CTGTGATTTG GTGGCATATA AAACCACATT TGCAATAAAA 1860
ATTTGTAGGG ATTTAACATA CCAAGTGCTG CGAAAGGAAT CGTTTTCGGA GGACCCAAAA 1920
TTAAAGAGGC AGATGCTAGA GCTCGTCCAG CTCAGCGCTG AGCACCTGTG TTGTCTTCCT 1980
CGTCCACGCC GGCGGAGATG AACGGCAACA AAGGCGGAAA GGCCGAGACG CTGAGCTCAA 2040
GGACGTGACA CCGCGCGTAC CTCGCGTTCA GTTGGCTCAC ACAACAGCAG CTCGCTCGCC 2100
CCAAGC7CCC GCGTCCTGAT CCGTAGGTGA GCCATGCAAA GGTCGCCGCG CGCCCTGATC 2160
CATTGCACCC TTCAAAGCTC GAACCTACAA ATAGCGTGCA CCAGGCATCC TGGCCACACC 2220
CACACAGCAA GCCAGCAGAG CAGAAAGCAG CCGCAGCCCC AGCCCCCACA AAGACGAAGG 2280
CAACA 2285 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 9:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 23 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: DNA (vii) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: 14-SA primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 9:
AGACGCTGAG CTCAAGGACG TGA 23 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 10:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 37 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární
| 25 | • fa ·· • fafa fa • fa • fa • fa • fafafa fafafafa | • fa fa • • fa fa • fa | |
| (ii) | TYP MOLEKULY: DNA | ||
| (vii) | PŮVODNÍ ZDROJ: | ||
| (A) ORGANISMUS: MANT-1 primer | |||
| xi) POPIS | SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM | ČÍSLEM | 10: |
ATGCCCGGGC TTGCAATGTC TGTTAGCGGT GGCATCA (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 11:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 32 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: DNA (vii) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: MANT-2RB primer (Xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 11:
ATGCCCGGGC GATGGGGTAA GATGCAAGAC CA ty ΙοΓ-IŠ
Claims (9)
- PATENTOVÉ NÁROKY1. Způsob brzděni (inhibice) genové exprese v cílovém rostlinném pletivu vyznačující se tím, že zahrnuje trvalou transformaci rostlinné buňky takového druhu, že z ní může být regenerována celá rostlina, rekombinantním genem nesoucím tkáňově nebo vývojově specifický promotor, který funguje v buňkách cílového rostlinného pletiva, a dále nesoucím porušovací gen kódující takový protein, který je schopen, je-li exprimován, inhibovat buněčné dýchání v cílovém pletivu, což vede_ k odumření buněk, přičemž porušovací gen je vybrán ze skupiny skládající se z genu T-urfl3, genů kódujících a- nebo β-tubulin, krátké ko-suprese ve směru čtení („sense cosupression) dvou základních genů buněčného cyklu kukuřice, cdc25 a aktivátoru replikačního počátku (ROA), a krátkého úseku genu translokštoru adenin nukleotidu (ANT), orientovaného ve směru čtení („sense), z vnitřní mitochondriální membrány.
- 2. Rostlina, která má ve svém genomu trvale inkorporovanou rekombinantní molekulu DNA nesoucí tkáňově specifický nebo vývojově specifický promotor, který funguje v buňkách cílového pletiva, a dále nesoucí porušovací gen kódující takový protein, který je schopen, je-li exprimován, inhibovat základní buněčnou funkci, jako je dýchání, uspořádání mikrotubulů nebo buněčné dělení v buňkách cílového pletiva, což vede k odumření buněk, přičemž porušovací gen je vybrán ze skupiny skládající se z genu T-urfl3, genů kódujících a- nebo β-tubulin, krátké kosuprese ve směru čtení („sense) dvou základních genů buněčného cyklu kukuřice, cdc25 a aktivátoru replikačního počátku (ROA), a krátkého úseku („sense) genu translokátoru adenin nukleotidu (ANT) z vnitřní mitochondriální membrány.
- 3. Rostlina, která má ve svém genomu trvale inkorporovanou rekombinantní molekulu DNA nesoucí tkáňově specifický promotor, který funguje v buňkách cílového pletiva, a dále nesoucí porušovací gen kódující takový protein, který je schopen inhibovat základní buněčnou funkci jako je dýchání, uspořádáníSUBSTITUTE SHEET • · · < · · · · <• · · · « ·· *»· ·· mikrotubulů v buňkách cílového pletiva, což vede k odumření buněk, přičemž porušovací gen je vybrán ze skupiny skládající se z genu T-urfl3, krátkého úseku („sense) genu translokátoru adenin nukleotidu (ANT), genů kódujících a- nebo β-tubulin a krátké ko-suprese vedoucí k utlumení („sense down-regulation) dvou základních genů buněčného cyklu kukuřice, cdc25 a ROA.
- 4. Rostlina podle nároku 2 nebo 3, která je jednoděložná rostlina.
- 5. Rostlina podle nároku 4, která je kukuřice.
- 6. Způsob podle nároku 1 nebo rostlina podle kteréhokoliv z nároků 2 až 5, vyznačující se tím, že promotor je promotor specifický pro prašník a/nebo tapetum.
- 7. Způsob nebo rostlina podle nároku 6, vyznačuj ící se t í m, že promotor je izolován za použití sekvencí cDNA z jakéhokoliv obrázku 1 až 3.
- 8. Způsob nebo rostlina podle nároku 6, vyznačuj ící se t í m, že promotor je promotor z genu MFS14 (sekvence s identifikačním číslem 8).
- 9. Samčí sterilní rostlina kukuřice, která má ve svém genomu trvale inkorporovanou rekombinantní molekulu DNA nesoucí promotor specifický pro tapetum, který funguje v buňkách tapeta, a dále nesoucí porušovací gen kódující takový protein, který je schopen inhibovat základní buněčnou funkci jako je dýchání nebo uspořádání mikrotubulů v buňkách tapeta, což vede k odumření buněk, přičemž porušovací gen je vybrán ze skupiny skládající se z genu T-urfl3, krátkého úseku („sense) genu translokátoru adenin nukleotidu (ANT), genů kódujících a- nebo β-tubulin a krátké ko-suprese vedoucí k utlumení („sense downregulation) dvou základních genů buněčného cyklu kukuřice, cdc25 a ROA.
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| GBGB9515161.9A GB9515161D0 (en) | 1995-07-24 | 1995-07-24 | Production of male sterile plants |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CZ20598A3 true CZ20598A3 (cs) | 1998-04-15 |
Family
ID=10778172
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CZ98205A CZ20598A3 (cs) | 1995-07-24 | 1996-07-11 | Inhibice buněčného dýchání a produkce rostlin se samčí sterilitou |
Country Status (18)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (1) | EP0853674A1 (cs) |
| JP (1) | JPH11509417A (cs) |
| CN (1) | CN1197481A (cs) |
| AR (1) | AR002924A1 (cs) |
| AU (1) | AU705759B2 (cs) |
| BG (1) | BG102274A (cs) |
| BR (1) | BR9609535A (cs) |
| CA (1) | CA2224736A1 (cs) |
| CZ (1) | CZ20598A3 (cs) |
| GB (1) | GB9515161D0 (cs) |
| HU (1) | HUP9802858A3 (cs) |
| MX (1) | MX9800575A (cs) |
| NO (1) | NO980314L (cs) |
| NZ (1) | NZ312750A (cs) |
| PL (1) | PL324656A1 (cs) |
| RU (1) | RU2168545C2 (cs) |
| TR (3) | TR199801884T2 (cs) |
| WO (1) | WO1997004116A1 (cs) |
Families Citing this family (11)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| AU719510B2 (en) * | 1995-07-24 | 2000-05-11 | Syngenta Limited | Inhibition of cell respiration and production of male sterile plants |
| BR9907997A (pt) * | 1998-02-20 | 2000-10-24 | Zeneca Ltd | Promotor especìfico de pólen |
| DE69941869D1 (de) * | 1998-03-27 | 2010-02-11 | Max Planck Gesellschaft | Spezifische gene der basalen endosperm transferzellschicht (betl) |
| GB9820970D0 (en) * | 1998-09-25 | 1998-11-18 | Zeneca Ltd | Promoter |
| US7105720B2 (en) | 2000-03-02 | 2006-09-12 | Advanta Seeds B.V. | Embryo sac-specific genes |
| US7205454B2 (en) * | 2002-07-31 | 2007-04-17 | Bayer Bioscience N.V. | Corn root preferential promoters and uses thereof |
| MX2014011037A (es) | 2012-03-13 | 2015-05-15 | Pioneer Hi Bred Int | Reduccion genetica de la fertilidad masculina en plantas. |
| CN104203973A (zh) * | 2012-03-13 | 2014-12-10 | 先锋国际良种公司 | 植物中雄性育性的遗传减少 |
| WO2013138358A1 (en) * | 2012-03-13 | 2013-09-19 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Genetic reduction of male fertility in plants |
| CN104169296A (zh) | 2012-03-13 | 2014-11-26 | 先锋国际良种公司 | 植物中雄性育性的遗传减少 |
| CN111235163B (zh) * | 2020-03-20 | 2022-05-31 | 南京农业大学 | 水稻减数分裂发育相关基因OsMFS1及其应用 |
Family Cites Families (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5409837A (en) * | 1988-01-14 | 1995-04-25 | Mycogen Plant Science, Inc. | Modified unF-13 protein and gene |
| GB8901675D0 (en) * | 1989-01-26 | 1989-03-15 | Ici Plc | Inhibitor of gene expression |
| AU8723791A (en) * | 1990-09-06 | 1992-03-30 | E.I. Du Pont De Nemours And Company | Compounds and constructs for producing male sterile plants |
| GB9126818D0 (en) * | 1991-12-18 | 1992-02-19 | Ici Plc | Alteration of plant and plant cell morphology |
| ATE255166T1 (de) * | 1992-07-02 | 2003-12-15 | Syngenta Participations Ag | Anthere-spezifische cdna-sequenzen, genomische dna-sequenzen und rekombinante dna-sequenzen |
| CA2148451A1 (en) * | 1992-11-02 | 1994-05-11 | Peter Christiaan Sijmons | Plants with reduced susceptibility to plant-parasitic nematodes |
| AUPN225695A0 (en) * | 1995-04-07 | 1995-05-04 | Australian National University, The | Plants with altered mitochondrial function |
-
1995
- 1995-07-24 GB GBGB9515161.9A patent/GB9515161D0/en active Pending
-
1996
- 1996-07-11 RU RU98103336/13A patent/RU2168545C2/ru not_active IP Right Cessation
- 1996-07-11 AU AU64652/96A patent/AU705759B2/en not_active Ceased
- 1996-07-11 CZ CZ98205A patent/CZ20598A3/cs unknown
- 1996-07-11 WO PCT/GB1996/001675 patent/WO1997004116A1/en not_active Ceased
- 1996-07-11 CN CN96197145A patent/CN1197481A/zh active Pending
- 1996-07-11 JP JP9506406A patent/JPH11509417A/ja active Pending
- 1996-07-11 TR TR1998/01884T patent/TR199801884T2/xx unknown
- 1996-07-11 BR BR9609535A patent/BR9609535A/pt not_active Application Discontinuation
- 1996-07-11 PL PL96324656A patent/PL324656A1/xx unknown
- 1996-07-11 EP EP96924071A patent/EP0853674A1/en not_active Withdrawn
- 1996-07-11 NZ NZ312750A patent/NZ312750A/en unknown
- 1996-07-11 MX MX9800575A patent/MX9800575A/es not_active Application Discontinuation
- 1996-07-11 TR TR1998/00112T patent/TR199800112T1/xx unknown
- 1996-07-11 CA CA002224736A patent/CA2224736A1/en not_active Abandoned
- 1996-07-11 HU HU9802858A patent/HUP9802858A3/hu unknown
- 1996-07-11 TR TR1998/01883T patent/TR199801883T2/xx unknown
- 1996-07-23 AR ARP960103701A patent/AR002924A1/es not_active Application Discontinuation
-
1998
- 1998-01-23 NO NO980314A patent/NO980314L/no not_active Application Discontinuation
- 1998-02-24 BG BG102274A patent/BG102274A/xx unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN1197481A (zh) | 1998-10-28 |
| RU2168545C2 (ru) | 2001-06-10 |
| TR199801883T2 (xx) | 1998-12-21 |
| BR9609535A (pt) | 1999-02-23 |
| NO980314L (no) | 1998-03-23 |
| AR002924A1 (es) | 1998-04-29 |
| NZ312750A (en) | 2000-02-28 |
| PL324656A1 (en) | 1998-06-08 |
| NO980314D0 (no) | 1998-01-23 |
| GB9515161D0 (en) | 1995-09-20 |
| TR199800112T1 (xx) | 1998-04-21 |
| HUP9802858A2 (hu) | 1999-03-29 |
| JPH11509417A (ja) | 1999-08-24 |
| BG102274A (bg) | 1998-09-30 |
| HUP9802858A3 (en) | 2000-11-28 |
| TR199801884T2 (xx) | 2000-09-21 |
| AU6465296A (en) | 1997-02-18 |
| AU705759B2 (en) | 1999-06-03 |
| EP0853674A1 (en) | 1998-07-22 |
| WO1997004116A1 (en) | 1997-02-06 |
| MX9800575A (es) | 1998-04-30 |
| CA2224736A1 (en) | 1997-02-06 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US5929307A (en) | Method for the production of hybrid plants | |
| AU747636C (en) | Novel nucleic acid sequence encoding FLP recombinase | |
| AU708618B2 (en) | Induction of male sterility in plants by expression of high levels of avidin | |
| WO2019075295A1 (en) | SYSTEMS AND METHODS FOR CELL REPELLENCE OF A PLANT CELL | |
| EP1000164B1 (en) | Induction of male sterility in plants by expression of high levels of streptavidin | |
| US6720475B1 (en) | Modified nucleic acid sequence encoding FLP recombinase | |
| CZ20598A3 (cs) | Inhibice buněčného dýchání a produkce rostlin se samčí sterilitou | |
| CN100587071C (zh) | 一种植物花器官特异性启动子及其应用 | |
| MXPA98000575A (en) | Inhibition of cell breathing and production of sterile plants ma | |
| EP2397031A1 (en) | Compositions and methods for modulation of plant cell division | |
| US7056739B1 (en) | Compositions and methods for modulation of plant cell division | |
| AU719627B2 (en) | Inhibition of cell respiration and production of male sterile plants | |
| US20020129399A1 (en) | Biotin-binding compounds for induction of sterility in plants | |
| WO2022226316A1 (en) | Compositions and methods for generating male sterile plants | |
| CA2200496C (en) | Genetic transformation using a parp inhibitor | |
| MXPA97009731A (en) | Induction of male sterility in plants through the expression of high levels of avid |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PD00 | Pending as of 2000-06-30 in czech republic |