CZ292296B6 - Deriváty nukleosidů s fotolabilními chránicími skupinami, způsob jejich přípravy a jejich použití - Google Patents
Deriváty nukleosidů s fotolabilními chránicími skupinami, způsob jejich přípravy a jejich použití Download PDFInfo
- Publication number
- CZ292296B6 CZ292296B6 CZ19971836A CZ183697A CZ292296B6 CZ 292296 B6 CZ292296 B6 CZ 292296B6 CZ 19971836 A CZ19971836 A CZ 19971836A CZ 183697 A CZ183697 A CZ 183697A CZ 292296 B6 CZ292296 B6 CZ 292296B6
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- nitrophenyl
- ethoxycarbonyl
- mmol
- thymidine
- solvent
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
- C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
- C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
- C07H19/06—Pyrimidine radicals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
- C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
- C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
- C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
- C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
- C07H19/06—Pyrimidine radicals
- C07H19/10—Pyrimidine radicals with the saccharide radical esterified by phosphoric or polyphosphoric acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
- C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
- C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
- C07H19/16—Purine radicals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
- C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
- C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
- C07H19/16—Purine radicals
- C07H19/20—Purine radicals with the saccharide radical esterified by phosphoric or polyphosphoric acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
- Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
- Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
- Y02P20/55—Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Nitrogen Condensed Heterocyclic Rings (AREA)
Abstract
Deriv ty nukleosid s fotolabiln mi chr nic mi skupinami obecn ho vzorce I, kde R.sup.1.n. znamen vod k, CN, OCH.sub.3.n., halogen, alkyl, alkenyl, alinyl nebo alkoxyalkyl s 1 a 4 atomy uhl ku, R.sup.2.n. znamen vod k nebo OCH.sub.3.n., R.sup.3.n. znamen vod k, fluor, chlor, brom nebo NO.sub.2.n., R.sup.4.n. znamen vod k, halogen, OCH.sub.3.n. nebo alkylovou, alkenylovou i alkinylovou skupinu s 1 a 4 atomy uhl ku, R.sup.5.n. znamen vod k nebo chr nic fosfitamidovou funk n skupinu, R.sup.6.n. znamen vod k, OH, halogen nebo zbytek O-methyl nebo O-ethyl, O-allyl, O-tetrahydropyranyl, O-methoxytetrahydropyranyl nebo O-t-butyldimethylsilyl, B znamen adenin, cytosin, guanin, thymin, uracil, 2,6-diaminopurin-9-yl, hypoxantin-9-yl, 5-methylcytosin-1-yl, 5-amino-4- (aminokarbonyl)imidazol-1-yl, 5-amino-4-(aminokarbonyl)imidazol-3-yl, p°i em v p° pad , e B znamen zbytek adeninu, cytostinu nebo guaninu, m prim rn aminoskupina eventu ln stabiln chr nic skupinu. Zp soby jejich p° pravy a jejich pou it pro synt zu oligonukleotid ° zenou sv tlem.\
Description
Deriváty nukleosidů s fotolabilními chránícími skupinami, způsob jejich přípravy a jejich použiti
Oblast techniky
Předmětem předloženého vynálezu jsou deriváty nukleosidů s fotolabilními chránícími skupinami, způsoby jejich přípravy a jejich použití.
Dosavadní stav techniky
Fotolabilní chránící skupiny pro hydroxylovou a fosfátovou funkci v nukleosidech nebo nukleotidech jsou zvlášť zajímavé, protože jsou vhodné např. pro paralelní, světlem řízené syntézy oligonukleotidů na pevném nosiči (S.P.A. Fodor a spol. Science 1991,251,767). S jejich pomocí se dají připravit takzvané DNA-činy (nosné destičky, na jejichž povrchu je umístěna řada různých oligonukleotidů), které se v molekulární biologii používají k rychlé analýze DNA sekvencí.
Podle dosavadního stavu techniky se používaly doposud jakožto fotolabilní chránící skupiny v chemii nukleotidů a nukleosidů především o-nitrobenzylové skupiny nebo jejich deriváty (V. N. R. Pillai Org. Photochem. 1987, 9, 225 nebo J. W. Walker a spol., J. Amer. Chem. Soc. 1988, 110, 7170). U těchto chránících skupin se ukázalo jako zvlášť nevýhodné, že odblokování odpovídajících nukleosidových nebo nukleotidových derivátů probíhá pomalu a často neúplně. Kromě toho vznikají při odštěpení o-nitrobenzylových sloučenin částečně také nežádoucí vedlejší produkty ve formě toxických nitrosofenylových sloučenin.
Jako další fotolabilní chránící skupina pro nukleosidy byla podle článku W. Pfleiderera a spol. v „Biophosphates and their Analogues - Synthesis, Structure, Metabolism and Activity“, Elsevier Science Publishers Β. V. (Amsterdam) 1987, 133 doporučena 2-(o-nitrofenyl)eťhylová skupina, která se ale zavádí výhradně jako chránící skupina v bazické části, zejména v poloze O6guanosinu. Ve stejné publikaci jsou popsány také p-nitrofenylethoxykarbonyl (NPEOC) a 2,4-dinitrofenylethoxykarbonyl (DNPEOC) skupiny jako chránící skupiny jak pro aminofunkci, tak pro hydroxylové funkce v cukerní části, odštěpení těchto skupin však probíhá výhradně bazicky katalyzovanou β-aliminací.
Podstata vynálezu
Základním úkolem předloženého vynálezu je vyvinout deriváty nukleosidů s fotolabilními chránícími skupinami pro 5'-OH funkci v cukerní části, které by nevykazovaly jmenované nevýhody podle stavu techniky, ale které se dají ochránit relativně rychle, kvantitativně a bez tvorby nežádoucích vedlejších produktů.
Tento úkol byl podle vynálezu vyřešen deriváty nukleosidů s fotolabilními chránícími skupinami obecného vzorce I
-1 CZ 292296 B6
R1 znamená vodík, CN, OCH3, halogen, alkyl, alkenyl, alkinyl nebo alkoxyalkyl s 1 až 4 atomy uhlíku,
R2 znamená vodík nebo OCH3,
R3 znamená vodík, fluor, chlor, brom nebo NO2,
R4 znamená vodík, halogen, OCH3 nebo alkylovou, alkenylovou či alkinylovou skupinu s 1 až atomy uhlíku,
R5 znamená vodík nebo chránící fosfitamidovou funkční skupinu vzorce
I 7 I 7
NC-CHrCH2-O-P-N(R7)2 nebo {>-N02-C6H4-CH2-CH2-O-P-N(R7)2, kde skupiny R7 jsou stejné nebo různé a znamenají lineární nebo rozvětvené alkylové zbytky s 1 až 4 atomy uhlíku, s výhodou ethylové nebo izopropylové skupiny,
R6 znamená vodík, OH, halogen nebo zbytek O-methyl nebo O-ethyl, O-allyl, O-tetrahydropyranyl, O-methoxytetrahydropyranyl nebo O-t-butyldimethylsilyl,
B znamená adenin, cytosin, guanin, thymin, uráčil, 2,6-diaminopurin-9-yl, hypoxanthin-9-yl, 5-methylcytosin-l-yl, 5-amino—4-(aminokarbonyl)imidazol-l-yl, 5-amino-4-(aminokarbonyl)imidazol-3-yl, přičemž v případě, že B znamená zbytek adeninu, cytosinu nebo guaninu, má primární aminoskupina eventuálně stabilní chránící skupinu.
Překvapivě se totiž ukázalo, že se chránící skupiny podle vynálezu dají odštěpit podstatně rychleji a úplněji než např. o-nitrobenzylové skupiny. Kromě toho se při odblokování nedaly zjistit nežádoucí vedlejší produkty, což se také nedalo předvídat.
Ve výhodném případě u derivátů nukleosidů obecného vzorce I znamenají R1 a R2 a R3 vodík, přičemž R4 neznamená vodík.
výhodou u derivátů nukleosidů podle obecného vzorce I když R3 znamená vodík, tak R2 znamená OCH3.
U derivátů nukleosidů obecného vzorce I s výhodou R4 znamená methylový zbytek.
U derivátů nukleosidů obecného vzorce I je R5 s výhodou fosfitamidová skupina se vzorcem
NC-CH2-CH2-O-P-N(R7)2 nebo p-NO2-C6H4-CH2-CH2-O-P-N(R7)2, kde skupiny R7 jsou stejné nebo různé a znamenají lineární nebo rozvětvené alkylové zbytky s 1 až 4 atomy uhlíku, s výhodou ethylové nebo izopropylové skupiny. Přitom je R7 s výhodou ethylový nebo izopropylový zbytek.
U derivátů nukleosidů obecného vzorce I je jako R6 s výhodou zaveden zbytek O-methyl nebo O-ethyl, O-allyl, O-tetrahydropyranyl, O-methoxytetrahydropyranyl nebo O-t-butyldimethylsilyl.
U derivátů nukleosidů podle nároků 1 až 7, obecného vzorce I, je tam, kde B znamená zbytek adeninu, cytosinu nebo guaninu s výhodou stabilní chránící skupinou fenoxyacetylový nebo dimethylformamidinový zbytek.
U derivátů nukleosidů obecného vzorce I jsou tam, kde B znamená zbytek adeninu s výhodou stabilními chránícími skupinami benzoylové nebo p-nitrofenylethoxykarbonylové zbytky.
U derivátů nukleosidů obecného vzorce I jsou tam, kde B znamená zbytek guaninu s výhodou stabilními chránícími skupinami izobutyrylové nebo p-nitrofenylethoxykarbonylové zbytky.
U derivátů nukleosidů obecného vzorce I jsou tam, kde B znamená zbytek cytosinu s výhodou stabilními chránícími skupinami benzoylové nebo p-nitrofenylethoxykarbonylové zbytky.
U derivátů nukleosidů obecného vzorce I je s výhodou zaveden jako atom halogenu v R1 nebo R6 atom fluoru, chloru nebo bromu.
Příprava derivátů nukleosidů obecného vzorce I podle vynálezu se provádí ve dvou stupních tak, že se nechá reagovat
a) alkohol obecného vzorce Π
kde R1, R2, R3 a R4 mají výše uvedené významy, s derivátem fosgenu zvoleným ze skupiny sestávající z fosgenu, difosgenu a trifosgenu a následně takto vytvořený ester chlorouhličité kyseliny ve stupni b) reaguje snukleosidy obecného vzorce ΙΠ
-3CZ 292296 B6
kde R5, R6 a B mají výše uvedený význam a případně se zavede v poloze 3' derivátů nukleosidů s R5 znamenajícím vodík fosfitamidová skupina
I 7 I 7
NC-CH2-CH2-O-P-N(R7)2 nebo í>-NO2-C6H4-CH2-CH2-O-P-N(R7)2, podle známých metod.
Způsob se s výhodou provádí tak, že se stupeň a) provádí v nepolárním organickém rozpouštědle při teplotách mezi -20 a +25 °C. S výhodou se používá ve stupni a) derivát fosgenu ve dvou až pětinásobném molámím přebytku vzhledem k alkoholu. S výhodou se rovněž ve stupni a) používá jakožto nepolární organické rozpouštědlo toluen nebo tetrahydrofuran. Koncentrace alkoholu ve stupni a) je s výhodou 0,1 až 10 molů na 10 ml rozpouštědla. Stupeň b) se s výhodou provádí ve směsi rozpouštědel, složené z dichlormethanu a polárního organického rozpouštědla, případně za přítomnosti báze při teplotách mezi -60 a +25 °C. Ve stupni b) se s výhodou používá jako polární organické rozpouštědlo dimethylformamid nebo pyridin. Ve stupni b) se s výhodou používá směsi rozpouštědel složené z dichlormethanu a dimethylformamidu a báze, která je vybrána ze skupiny pyridin, triethylamin a ethyldiizopropylamin. Molámí poměr dichlormethanu k pyridinu nebo dimethylformamidu ve směsi je s výhodou 1:1 až 3:1. Molámí poměr nukleosidu k esteru chlorouhličité kyseliny je s výhodou 1:1 až 1:2. Ve stupni b) se s výhodou předloží nukleosid rozpuštěný v pyridinu nebo směsi dimethylformamidu a báze a přikapává se roztok esteru kyseliny chlorouhličité v dichlormethanu. Koncentrace nukleosidu ve směsi rozpouštědel ve stupni b) je s výhodou 0,1 až 3 mmol na 10 ml rozpouštědla. Zavedení fosfitamidové skupiny ve stupni c) se s výhodou provádí reakcí derivátů nukleosidů, přičemž R5 v nich znamená vodík, s odpovídajícími fosfiny za přítomnosti lH-tetrazolu jakožto aktivátoru, ve směsi rozpouštědel z dichlormethanu a acetonitrilu a při teplotách mezi 0 a 25 °C.
Alkoholová složka je ve většině případů známá nebo je možné ji připravit analogickým způsobem známými postupy. Jako nepolárního organického rozpouštědla se používá ve stupni a) přednostně toluenu nebo THF. Reakční komponenty se dají použít ve stechiometrickém poměru, většinou se však nasadí derivát fosgenu ve zřetelném přebytku, např. ve 2 až 5 násobném přebytku vzhledem k alkoholové komponentě. I koncentrace alkoholové komponenty je možno široce obměnit, zvlášť výhodné jsou koncentrace od 0,1 až do 10 mmol na 10 ml rozpouštědla.
Při této reakci (doba reakce 1 až 6 hodin) vznikají v dobré čistotě a vysokém výtěžku (> 90 %) odpovídaj ící chlorouhličitany obecného vzorce IV
( IV) .4.
Zpracování odpovídajících produktů se přednostně provádí tím, že se nejdříve oddestiluje přebytek fosgenu a rozpouštědlo ve vakuu. Chlorouhličitan (IV) se podrobí pak bez dalšího zpracování ve stupni b) reakci s nukleosidy obecného vzorce ΙΠ
kde R5, R6 a B mají výše uvedený význam.
Reakce probíhá nejlépe ve směsi rozpouštědel složené z dichlormethanu a polárního organického rozpouštědla, případně v přítomnosti báze při teplotách mezi -60 a +25 °C. Jako polární organické rozpouštědlo se používá nejlépe DMF nebo pyridin, v případě pyridinu není třeba přidat další bázi. Pracuje-li se však se směsmi rozpouštědel dichlormethan/DMF, je vhodný přídavek báze jako např. pyridin, triethylamin neoethyldiizopropylamin, k odstranění protonů uvolněných v reakci. Poměr dichlormethanu k pyridinu, eventuálně DMF také není kritický, s výhodou se však nasazuje 1 až 3 objemové díly dichlormethanu na objemový díl pyridinu, resp. DMF.
Podle výhodného způsobu provedení se předloží odpovídající nukleosid (ΙΠ), rozpuštěný v pyridinu nebo DMF/bázi a přikapává se roztok chlorouhličitanu v dichlormethanu při odpovídající reakční teplotě. Molární poměr nukleosidu k chlorouhličitanu může být stechiometrický 1:1. S výhodou se však používá chlorouhličitan v přebytku a to tak, že molární poměr nukleosid k orthouhličitanu se upraví na 1:1 až 1:2. Konečně je však také možné měnit koncentraci nukleosidu ve směsi rozpouštědel v širokém rozmezí, přednostně se však pracuje při poměru 0,1 až 3 mmol na 10 ml rozpouštědla.
Po ukončené reakci (doba 1 až 5 hodin) je možno získané deriváty nukleosidu izolovat nebo čistit známými způsoby, jako např. zředěním dichlormethanem, vypíráním všech solí vodou, sušením organické fáze, zahuštěním roztoku nebo krystalizaci a navazující chromatografii na silikagelu. Tímto způsobem lze získat deriváty nukleosidu ve vysoké čistotě a v dobrých výtěžcích (60-85 %).
Podle vhodného způsobu provedení je možno v návaznosti na reakční stupeň b) zavést do polohy 3' nukleosidových derivátů s R5 = H fosfitamidovou skupinu
I 7 I 7
NC-CH2-CH2-O-P-N(R7)2 nebo p-NO2-C6H4-CH2-CH2-O-P-N(R7)2, známými způsoby. Obvykle se tato reakce provádí s odpovídajícími fosfiny v přítomnosti ΙΗ-tetrazolu jakožto aktivátoru ve směsi rozpouštědel dichlormethan-acetonitril při teplotách mezi 0 až 25 °C. S výhodou se používá dvoj- až trojnásobný molární přebytek fosfinu, zatímco poměr fosfinu k ΙΗ-tetrazolu se upraví na 3:1. Poměr množství dichlormethanu k acetonitrilu je relativně nedůležitý a je nejlépe 1:1 až 4:1. Po ukončené reakci (asi 10 až 20 hodin) se odpovídající nukleosid zpracovává, jak bylo popsáno ve stupni b).
Předmětem vynálezu je rovněž použití výše uvedeného derivátu nukleosidu obecného vzorce I pro syntézu oligonukleotidů řízenou světlem. Světlem řízená syntéza oligonukleotidů probíhá
-5CZ 292296 B6 s výhodou na pevném nosiči. Derivát nukleosidu je s výhodou definován tak, jak je to uvedeno ve výhodných provedeních derivátů nukleosidu obecného vzorce I.
Jak bylo prokázáno ozařovacími pokusy polychromatickým světlem >289 nm, dají se nukleosidy velmi rychle (to,s = 1 až 7 minut) a dalekosáhle odchránit (výtěžky až 97 %), takže je vynikajícím způsobem splněn zvláštní požadavek fotolability chránících skupin.
Na základě těchto zvláštních vlastností se tyto nukleosidy hodí velmi dobře k přípravě oligonukleotidů odštěpením chránících skupin řízeném světlem, zejména na pevných nosičích.
Příklady provedení vynálezu
Přikladl
a) 2-(2-nitrofenyl)ethanol (1,2)
Směs o-nitrotoluenu, (9,2 g, 67 mmol) a paraformaldehvdu (0,8 g, 25 mmol) v DMSO (10 ml syntetická kvalita, přesušeno molekulovým sítem 4 x 10 cm 0,4 nm) se nechá reagovat s KOH (21 mg, 0,37 mmol) za míchání po dobu 2,5 hod. při 95 °C. Rozpouštědlo se odpaří ve vysokém vakuu. Zbytek byl přečištěn sloupcovou chromatografií (S1O2, 20x3 cm, rozpouštědlo toluen 750 ml, toluen/EtOAc 10:1 500 ml, 7:1500 ml). Byl získán 2-(2-nitrofenylethanol (2,33 g, 21 % jako žlutý olej.
Rf (SiO2, toluen)/EtOAC 10:1) 0,21.
UV (MeOH) kmax [nm] (log e): 205 (4,07), 256 (3,63), 348 (sh, 2,56).
’Η-NMR (250 MHz, CDC13): 7,93 (dd, 1 arom. H, ortho kNO2), 7,49 (m, 3 arorn H, 3,96 (t, a-CH2), 3,17 (t, P-CH2), 1,72 (s, OH).
CgH9NO3 (167,2).
Literatura:
[1] G. M. Bennet, Μ. M. Hafez, J. Chem. Soc. 1941,287 [2] E. Uhlmann, W. Pfleiderer, Helv. Chim. Acta 1981,64,16
b) 2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid
Do roztoku 2-(2-nitrofenyl)ethanolu (5,2 g, 31 mmol) v THF (20 ml, destilovaný na dCaH2) byl uváděn při pokojové teplotě za míchání fosgen. Po 1,5 hod. byl přebytek fosgenu a rozpouštědlo oddestilováno ve vysokém vakuu. Byl získán 2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid (6,69 g, 94 %) jako žlutý olej.
Rf (SiO2, CHC13) 0,84.
UV (CH3CN), [nm] (log e): 202 (4,12), 218 (sh 3,74), 256 (3,70), 298 (sh, 3,16), 346 (sh, 2,59).
'H-NMR (250 MHz, CDC13): 7,99 (dd, H-C(3)), 7,48 (m, 3 arom. H), 4,62 (t, a-CH2), 3,31 (ί,β-€Η2).
Anal. pro C9H8C1NO4 (229,62):
-6CZ 292296 B6 vypočteno: C 47,08, H 3,51, N 6,10, nalezeno:C 47,30, H 3,70, N 6,00.
c) 5 '-O-(2-(2-Nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin
Thymidin (1 g, 4,13 mmol) se kodestiluje s pyridinem (2x10 ml, p.a. ještě sušen nad molekulovým sítem 0,4 nm), pak se 10 minut přikapává roztok 2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid (1,45 g, 6,31 mmol). Po dalších 4,50 hodinách míchání za chlazení iPrOH/N2 (-30 až -15 °C) byla směs zředěna CH2CI2 (150 ml) a promývána H2O (150 ml). Vodné fáze byly ještě extrahovány CH2C12 (2x150 ml). Spojené organické fáze byly sušeny nad MgSO4, filtrovány, odpařeny a kodestilované s toluenem (5x 20 ml) a CH2CI2 (2x20 ml). Surový produkt pak byl přečištěn sloupcovou chromatografií (SiO2, 15x3,5 cm, rozpouštědlo: CH2C12 1300 ml, CH2Cl2/aceton 20:1, 1200 ml, 10:1, 600 ml, 8:1 500 ml, 5:1 500 ml, 4:1 500 ml, 2:1 750 ml, 1:1 500 ml). Byl získán 5'-O-(2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (1,15 g, 64 %) jako bezbarvá pevná látka.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc/MeOH 5:4:1) 0,46.
UV (MeOH) [nm] (log e): 205 (4,31), 262 (4,12), 334 (sh, 2,64).
'H-NMR (250 MHz, CDC13): 8,92 (s (br, NH), 7,96 (dd, (H-C(3) vNPEOC), 7,55 (t, 1 arom. H. vNPEOC), 6,35 (t, H-C(l)), 4,44 (m, H-C(3'), 2x H-C(5'), a-CH2 v. NPEOC), 4,15 (kv H-C-(4'), 3,34 (m, β-ΟΗ2 v. NPEOC), 2,89 (d, OH-C-(3)), 2,41 (m, H-C-(2)), 2,22 (m, H-C-(2)), 1,85 (s, CH3).
Anal. Vypočteno pro Ci9H21N3O9 (435,39): C 52,41, H 4,86, N 9,65, nalezeno: C 52,07, H 5,15, N 9,65.
Příklad 2
a) 2-(2,6-Dinitrofenyl)ethanol [1]
K 2,6-dinitrotoluenu (18,2 g, 0,1 mol, sušenému ve vysokém vakuu nad silikagelem) a paraformaldehydu (3 g, 0,1 mol) v DMSO (50 ml, l.č. sušeném nad molekulovým sítem 0,4 nm) byl přidán roztok terc.butylátu draselného (1,8 g, 8 mmol) v terc.butanolu (20 ml, l.č. 99 %). Po přídavku roztoku barva směsi se změnila ze žluté na temně fialovou. Bylo mícháno 5 minut při pokojové teplotě a 10 minut při 70 °C (teplota lázně). Pak bylo ochlazeno na pokojovou teplotu, směs byla neutralizovaná koncentrovanou HC1, zředěna vodou (300 ml) a nasycena NaCl. Vodná fáze byla extrahována EtOAc (3x 500 ml). Spojené organické fáze byly promyty nasyceným roztokem NaCl (300 ml), sušeny nad Na2SO4, filtrovány a odpařeny. Surový produkt (24,3 g) byl za varu rozpuštěn v malém množství EtOAc, byl přidán petrolether (PE) (100 ml) a byl ponechán v mrazicím boxu ke krystalizaci. Sraženina byla odsáta a čištěna sloupcovou chromatografií (20,7 g surového produktu, 300 g SiO2, 18x6,5 cm, rozpouštědlo toluen/EtOAc 5:1, 4:1, 3:1). Směsné frakce byly odpařeny a znovu čištěny sloupcovou chromatografií (200 v SiO2, 20x5,3 cm, toluen/EtOAc 7:1). Po odpaření čistých frakcí byl získán 2-(2,6-dinitrofenyl)ethanol (13,6 g, 64 %) jako žlutá pevná látka.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc 9:1) 0,21.
T.t. 69-70 °C (lit[lj: 69 °C).
UV (MeOH), U[nm] (log e): 203 (4,20), 231 (4,00) 280 (sh, 3,17), 327 (sh, 2,80).
-7CZ 292296 B6
Ή-NMR (250 MHz, CDC13): 8,00 (d, J= 8,1, H-C(3), H-C(5), 7,57 (t, J=8,l, H-C(4)), 3,97 (kv. a-CH2), 3,33 (t, Í3-CH2), 1,69 (t, OH).
Anal. Pro C8H8N2O5 (212,16): vypočteno C 45,29, H 3,80, N 13,20, nalezeno C 45,39, H 3,90, N 13,32.
Literatura [1] N. S. Girgis, Η. B. Cottam, R. K. Robins, J. Heterocycl. Chem. 1988, 25, 361
b) 2-(2,6-Dinitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid
K roztoku trichlormethylesteru chloromravenčí kyseliny, (3,81 g, 2,33 ml, 19,28 mmol), vTHF (10 ml, destilovaný nad CaH2), vychlazenému na 0 °C se přikapává během 20 minut roztok 2-(2,6-dmitrofenyl)ethanolu (4,08 g, 19,23 mmol) a Et3N (2,7 ml, 19,28 mmol) v THF (30 ml).
Bylo 1,45 hod. mícháno při pokojové teplotě. Směs byla filtrována přes celit. Promýváním sraženiny THF, oddestilován rozpouštědla a přebytečného činidla ze spojených filtrátů a sušením ve vysokém vakuu bylo získáno 5,13 g 2-(2,6-dinitrofenyl)-ethoxykarbonylchlorid (97 %) jako světle hnědá pevná látka.
Rf (SiO2, CH2C12) 0,76.
T.t. 84 až 85 °C.
UV CH3CN) [nm] (log e): 233 (4,02), 292 (sh, 3,11), 331 (sh, 2,82).
’Η-NMR (250 MHz, CDC13): 8,10 (d, J = 8,2, H-C(3, H-C(5)), 7,67 (t, J = 8,1, H-C(4), 4,67 (t, a-CH2), 3,50 (t, p-CH2)
Anal. Pro C9H7N2O6 (274,616): vypočteno: C 39,36; H 2,57; N 10,20; nalezeno: C 39,40; H 2,60; N 10,20.
c) 5'-0-(2-(2,6-Dinitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin
Thymidin (1 g, 4,13 mmol) se kodestiloval s pyridinem (3x 10 ml, p.a., přesušen nad molekulovým sítem 0,4 nm) rozpuštěný v pyridinu (15 ml), byl ochlazen na -50 °C. K tomu byl během 1 hodiny přikapáván roztok 2-(2,6-dinitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid (1,7 g, 6,19 mmol) vCH2C12 (15 ml, destilovaný nad CaH2). Po dalším 3,5hodinovém míchání za chlazení iPrOH/N2 (-15 až -20 °C) byla směs zředěna 50 ml CH2C12 a promyta 50 ml vody. Vodné fáze byly ještě extrahovány 2x50 ml CH2C12. Spojené organické fáze byly sušeny nad Na2SO4, filtrovány, odpařeny a odpařeny spolu s toluenem. Surový produkt (2,66 g) se digeroval za varu v 60 ml CH2Cl2/MeOH 2:1. Získaná bílá sraženina byla odsáta a rekrystalizována z MeOH (25 ml). Bylo získáno 855 mg, (43 %) 5'-0-(2-(2,6-dinitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidinu jako bezbarvá pevná látka. Spojené filtráty byly odpařeny do sucha a přečištěny sloupcovou chromatografií (1,4 g surového produktu, 56 g SiO2 17x3 cm, CH2Cl2/MeOH 100:5 1240 ml, 100:7 105 ml, 100:10 330 ml). Bylo získáno 691 mg, (34,8 %) 5'-Q-(2-(2,6-dinitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidinu jako bezbarvá pevná látka. Výtěžek tedy dohromady obnášel 1,55 g (78%).
Rf (SiO2, toluen/EtOAc/MeOH 5:4:1) 0,41.
UV (MeOH, [nm] (log e): 206 (4,28); 244 (sh.) 4,07; 256 (4,08); 355 (sh, 2,72).
-8CZ 292296 B6 'H-NMR (250 MHz, CDC13): 11,32 (s, NH), 8,27 (d, H-C(3), H-C(5)), 7,78 (t, H-C-(4)), 7,40 (s, H-C(6)) v thyminu, 6,18 (t, H-C(l')), 5,44 (d, OH-C(3)), 4,37 (t, a-CH2, 4,23 (m, H-C(3),
2xH-C(5), 3,91 (m, H-C(4)), 3,29 (t, p-CH2), 2,15 (m, 2xH-C(2')), 1,71 (s, CH3).
Anal. Pro Ci9H2oN4On (480,386): vypočteno: C 47,51; H 4,20; N 11,66; nalezeno: C 47,40; H 4,15; N 11,57.
Příklad 3
a) 2-(2-Fluor-6-nitrofenyl)ethanol [1]
K 2-fluor-6-nitrotoluenu (776 mg, 5 mmol) a paraformaldehydu (150 mg, 5 mmol) v DMSO (2,5 ml, l.č., sušeném 2 d nad molekulovým sítem 0,4 nm) se přidával roztok terc.butylátu draselného (90 mg, 0,8 mmol) v terc.butanolu (1 ml, l.č., 99 %). Po přidání se barva změnila ze žluté na temně fialovou. Bylo dále mícháno 5 minut při pokojové teplotě a 30 minut při 70 °C (teplota lázně). Pak bylo ochlazeno na pokojovou teplotu a neutralizováno několika kapkami koncentrované HC1. Směs byla zředěna EtOAc (30 ml) a promývána 20 ml vody. Vodná fáze byla extrahována EtOAc (2x20 ml). Sušení organické fáze nad Na2SO4, filtrace a odpaření rozpouštědla poskytlo surový produkt (1,11 g), který byl čištěn sloupcovou chromatografií (20 g SiO2, 12x2 cm, rozpouštědlo PE 40 ml, PE/EtOAc 10:1 110 ml, 8:1 270 ml, 6:1 210 ml, 5:1 60 ml, 4:1 50 ml). Bylo získáno 653 mg (71 %) 2-(2-fhior-6-nitrofenyl)ethanolu jako žlutá pevná látka.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc 9:1) 0,24.
UV (MeOH) λπ^ [nm] (log e): 205 (4,06), 252 (3,61), 294 (sh 3,21).
'H-NMR (250 MHz, CDC13): 7,73 (m, 1 arom. H, 7,36 (m, 2 arom H, 3,94 (t, a-CH2), 3,21 (dt, J = 2,2; 6,5; β-ΟΗ2), 1,67 (s, šir., OH).
Anal. Pro CgHgFNO3 (185,154): vypočteno: C 51,90; H 4,36, N 7,57; nalezeno: C 51,92; H 4,40; N 7,42.
Literatura:
[1] Chem. Abstr. 1989,110, P 75032 k
b) 2-(2-Fluor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid
K roztoku trichlormethylesteru chloromravenčí kyseliny (641 mg, 3,24 mmol) vTHF (6,75 ml, destilovaný nad CaH2), vychlazenému na 0 °C byl během 5 minut přidáván roztok 2-(2-fluor-6nitrofenyl)ethanolu (500 mg, 2,7 mmol) a Et3N (273 mg, 2,7 mmol, destilovaný nad KOH) v THF (6,75 ml). Bylo mícháno 1 hodinu za chlazení ledem a 1 hodinu při pokojové teplotě. Směs byla filtrována přes celit. Promývání koláče THF a oddestilován rozpouštědla a přebytečného činidla ze spojených filtrátů při 30 °C ve vysokém vakuu poskytlo 2-(2-fluor-6nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid (620 mg, 93 %) jako světle hnědý olej.
Rf (SiO2, PE/EtOAc 19:1) 0,25.
UV (MeOH), [nm] (log e): 204 (4,04); 251 (3,67); 293 (sh, 323),
-9CZ 292296 B6 ’Η-NMR (250 MHz, CDC13): 7,83 (d, J = 7,7, 1 arom. H), 7,44 (m, 2 arom. H), 4,63 (t, a-CH2),
3,37 (dt, J = 1,6,6,4, p-CH2).
Anal. pro C9H7C1FNO4 (247.609) vypočteno: C 43,66; H 2,85; N 5,66; nalezeno C 43,97; H 3,02; N 5,59.
c) 5'-0-(2-(2-Fluor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylthymidin
Thymidin (200 mg, 0,83 mmol) byl kodestilován s pyridinem (3x3 ml, p.a., sušen molekulovým sítem 0,4 nm), rozpuštěn v pyridinu a ochlazen na -60 °C (iPrOH/N2). Během 20 minut byl přikapáván roztok 2-{2-fluor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylchloridu (280 mg, 1,13 mmol) v CH2C12 (destilovaný nad CaH2). Bylo dále mícháno 3,40 hodin, za chlazení i-PrOH/N2 (-60 až -15 °C), 1 hodinu bez chlazení, ke konci byla teplota směsi 0 °C. Reakční směs byla zředěna 10 ml CH2C12 a promyta vodou (10 ml). Vodná fáze byla ještě extrahována 3x10 ml CH2C12. Sušení organických fází Na2SO4, filtrace, odpaření rozpouštědla a kodestilace s toluenem (3x10 ml) poskytlo surový produkt, který byl čištěn sloupcovou chromatografií (20 g SiO2, 12x2 cm, rozpouštědlo CH2Cl2/MeOH 100:1 50 ml, 100:2 102 ml, 100:3 206 ml, 100:3.5 ml 103 ml, 100:4 208 ml). Nejdřív byl eluován 3',5'-bis-O-(2-(2-fluor-6-nitrofenylethoxykarbonylthymidin, pak 3'-O-(2-(2-fluor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin a posléze 5'-O(2-(2-fluor-6-(mtrofenyl)ethoxykarbonyl)1hymidin. Po odpaření rozpouštědla a sušení ve vysokém vakuu byl získán 3',5'-bis-0-(2-(2-fluor-6-mtrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (27 mg, 5 %) jako světležlutá pěna, 3'-0-(2-(2-fluor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (15 mg, 4 %) jako bezbarvá pěna a 5'-0-(2-(2-fluor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (262 mg, 70 %) jako bezbarvá pevná látka.
5'-O-(2-(2-fluor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin:
Rf (SiO2, toluen/EtOAc/MeOH 5:4:1) 0,44.
UV (MeOH), Xraax [nm] (log <=): 205 (4,29); 261 (4,10);
Ή-NMR (250 MHz, CDC13): 8,09 (s (šiř.) NH), 7,76 (m, 1 arom H vFNPEOC), 7,41 (m, H-C-(6) thyminu, 2 ann. H z FNPEOC), 6,35, t, H-Cl')), 4,45 (m, H-C(3), 2xH(5'), a-CH2 v. FNPEOC), 2,23 (m, H-C(2'), OH-C(3')), 1-85 (s, CH3).
Anal: pro Ci9H20FN3O9 (453,379) vypočteno: C 50,34; H 4,45; N 9,27; nalezeno C 50,22; H 4,49; N9,18.
Příklad 4
a) 2-(2-Chlor-6-nitrofenyl)ethanol [1,2]
Ke směsi 2-chlor-6-nitrotoluenu (25 g, 146 mmol) a paraformaldehydu (1,9 g, 60 mmol) v DMSO (20 ml, l.č. ještě dosušeno molekulovým sítem 0,4 nm) byl přidán Triton B (2 ml, 35% v MeOH) a bylo mícháno při 90 °C. Po 2 hodinách byla reakční směs neutralizována několika kapkami kc. HC1, ředěna 50 ml vody a extrahována 4x150 ml EtOAc. Spojené organické fáze byly sušeny MgSO4, filtrovány a odpařeny. Surový produkt byl čištěn sublimací ve vysokém vakuu (6,7 Pa, teplota lázně 95 °C. Bylo získáno 8,01 g (66 %) 2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethanolu ve formě světležlutých krystalů.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc 10:1) 0,36.
T.t. 59 až 61 °C.
-10CZ 292296 B6
UV (MeOH) [nm], (log e): 212 (4,13), 248 (3,48), 294 (sh 3,03); 336 (sh 2,58).
Ή-NMR (250 MHz, CDClj): 7,70 (dd, 1 arom. H), 7,62 (dd, 1 arom. H), 7,31 (t, H-C(4), 3,94 (kv, a-CH2); 3,26 (t, β-CHj), 1,701 (OH).
Anal. Pro C8H8C1NO3 (201,61): vypočteno: C 47,66; H 4,00; N 6,95; nalezeno: C 47,79; H 4,06; N 6,92.
Literatura:
[1] T. Morimoto, I. Hashimoto, H. Yamaoka, Chem. Abstr. 1978, 88,104880 v.
[2] Y. Tsuji, S. Kotachi, K.-T. Huh, Y Watanabe, J. Org. Chem. 1990, 55, 580.
b) 2-(2-Chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid
Do roztoku 2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethanolu (31 g, 154 mmol) v THF (190 ml, destilovaný nad CaH2) byl za míchání při pokojové teplotě zaváděn fosgen. Po 2,5 hodinách se přebytek fosgenu a rozpouštědlo oddestilovalo ve vysokém vakuu. Byl získán
2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid (39,4 g, 97 %) jako žlutý olej.
Rf (SiO2, CHCI3) 0,76.
UV (CH3CN), [nm] (log ε): 211 (4,14); 253 (3,53); 300 sh. 3,02.
’H-NMR (250 MHz, CDC13): 7,81 (dd, 1 arom. H, 7,69 (dd, 1 arom H, 7,41 (t, H-C(4)), 4,63 (t, a-CH2), 3,46 (ζ |3-CH2).
Anal. Pro CsHzCLNC^ (264,06) vypočteno: C 40,94; H 2,67; N 5,30; nalezeno: C 41,05; H 2,73; N 5,00.
c) 5 '-0-(2-(2-Chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin
Thymidin (4 g, 16,5 mmol) byl kodestilován s pyridinem (3x40 ml), p.a. dosušeným nad molekulovým sítem 0,4 nm, rozpuštěn v pyridinu (48 ml) a ochlazen na -50 °C (iPrOH/N2). Během 2,45 hodin se přikapával roztok 2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylchloridu (5,2 g, 19,8 mmol) v CH2C12 (48 ml, dest. nad CaH2). Pak bylo ponecháno dalších 30 minut za chlazení iPrOH/N2 (-50 až -30 °C) a za míchání. Reakční směs byla zředěna 100 ml CH2C12 a promývána 100 ml vody. Vodná fáze byla extrahována 2x100 ml CH2C12. Sušení organických fází Na2SO4, filtrace, odpaření rozpouštědla a kodestilace s toluenem (3x50 ml) poskytlo surový produkt, který byl čištěn sloupcovou chromatografií (305 g SiO2, 22x5,9 cm, rozpouštědlo: CH2C12 200 ml, CH2Cl2/MeOH 100:2 1020 ml, 100:3 515 ml, 100:4 1560 ml, 100:5 850 ml, 100:6 318 ml, 100:8 324 ml, 100:9 654 ml). Nejdříve byla eluována směsná frakce (1,4 g) 3',5'-bis-O-(2-(2-chlor6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidinu a 3 '-0-(2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidinu, potom směsná frakce (367 g) 3'-0-(2-(2^chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylthymidinu a 5'-O-(2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidinu a nakonec čistá frakce 5'-0-(2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidinu (6,21 g, 80 %, bezbarvá pevná látka). Směsné frakce byly dále zpracovány sloupcovou chromatografií. Byl získán 3',5'-bis-O-(2-(2chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylthymidin (1,175 g, 10 %) jako světle žlutá pěna, 3'-O-(2-(2chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (203 mg, 3 %) jako bezbarvá pěna a 5'-O-(2-(2chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (182 mg, 2 %) jako bezbarvá pevná látka. Celkový výtěžek 5'-0-(2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidmu byl 6,392 g (82 %).
-11 CZ 292296 B6
Rf (SiO2, toluen/EtOAc/MeOH 5:4:1) 0,53.
UV (MeOH) [nm] (log e): 210 (4,36,263 (4,05).
Ή-NMR (250 MHz, CDC13): 8,11 s, NH, 7,74 (d, J= 8,2; 1 arom. H v. C1NPEOC, 7,67 (d, J = 8,0, 1 arom H v C1NPEOC, 7,39 (t, H-C(4) v. C1NPEOC, 7,38 (s, H-C(6) v. thymidinu), 6,36 (ζ H-C(l')), 4,44 (m, a-CH2) v. C1NPEOC, H-C-(3'), 2x H-C(5)), 4,15 (kv, H-C(4')), 3,45 (t, P-CH2 v.CINPEOC, 2,38 (m, H-C(2')), 2,26 (m, H-C(2')), 2,18 (d, J = 3,9; OH-C (3')), 1,86 (s,CH3).
Anal. Pro C19H2oC1N309 (469,83) vypočteno: C 48,57; H 4,29, N 8,94; nalezeno: C 48,53; H 4,34; N 8,91.
Příklad 5
a) 2-(2-Brom-6-nitrofenyl)ethanol [1]
K 2-brom-6-nitrotoluenu (1,08 g, 5 mmol) a paraformaldehydu (150 mg, 5 mmol) v DMSO (2,5 ml, l.č., dosušeno molekulovým sítem 0,4 nm) byl přidán roztok terc.butylátu draselného (90 mg, 0,8 mmol) v terc.butanolu (1 ml, l.č., 99 %). Po přidání roztoku barva směsi se změnila ze žluté na temně fialovou. Bylo mícháno 5 minut při pokojové teplotě a 30 minut při 70 °C (teplota lázně). Pak bylo ochlazeno na pokojovou teplotu a neutralizováno několika kapkami konc. HC1. Směs byla zředěna 30 ml EtOAc a promývána 20 ml vody. Vodná fáze byla extrahována 2x20 ml EtOAc. Sušením organických fází Na2SO4, filtrací a odpařením rozpouštědla byl získán surový produkt (1,49 g), který byl přečištěn sloupcovou chromatografií (20 g SiO2, 20x2cm, rozpouštědlo: PE 45 ml, PE/EtOAc 10:1 110 ml, 8:1 180 ml, 7,5:1 340 ml, 6:1 140 ml). Bylo získáno 867 mg (70 %) 2-(2-brom-6-nitrofenylethanolu jako žlutá pevná látka.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc 9:1) 0,32.
UV (MeOH, Xmax [nm] (log e): 204 (4,18), 210 (sh, 4,16), 251 (3,48); 293 (sh, 3,07).
'H NMR (250 MHz, CDC13): 7,82 (dd, J = 1,1; 8,0; 1 arom. H), 7,74 (dd, J = 1,1; 8,2; 1 arom. H.), 7,26 (m, H-C(4), 3,96 (t, a-CH2), 3,30 (t, β-ΟΗ2); 1,75 (s (šiř.), OH).
Anal. Pro CgHgBrNO3 (246,06): vypočt. C 39,05; H 3,28; N 5,69; nalezeno: C 39,09; H3,26; N 5,56.
Literatura:
[1] Chem. Abstr. 1989,110, P 75032 k
b) 2-(2-Brom-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid
K roztoku trichlormethylesteru chloromravenčí kyseliny (442 mg, 2,23 mmol) vychlazenému na 0 °C v 5 ml THF (dest nad CaH2) se během 10 minut přidával roztok 2-(2-brom-6-nitrofenyl)ethanolu (500 ml, 2,03 mmol) a Et3N (206 mg, 2,03 mmol, dest. nad KOH) v THF (5 ml). Bylo mícháno 5 minut za chlazení ledem a 1,45 minut při pokojové teplotě. Směs byla filtrována celitem. Promývání filtračního koláče THF a oddestilování rozpouštědla a přebytku činidla ze spojených filtrátů při 30 °C ve vysokém vakuu poskytlo 2-(2-brom-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid (625 mg, 99,8 %) jako světle hnědý olej.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc 19:1) 0,31.
-12CZ 292296 B6
UV (MeOH, [nm] (log e): 205 (sh), 4,14; 211 (4,16) 254 (3,52), 2,97 (sh), 3,05).
*H NMR (250 MHz, CDC13): 7,85 (2 arom. H, 7,33 (t, H-C(4)), 4,62 (t, a-CH2), 3,47 (t, β-ΟΗ2).
Anal. Pro C9H7BrClNO4 (308,515) vypočteno: C 35,04, H2,29, N 4,54, nalezeno: C 35,50; H 2,58, N 4,50.
c) 5 '-O-(2-(2-Brom-6-mtrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin
Thymidin, (200 mg, 0,83 mmol) byl odpařen s přídavkem pyridinu (3x3 ml, p.a., dosušeno nad molekulovým sítem 0,4 nm), rozpuštěn v pyridinu (3 ml) a chlazen na -60 °C (iPrOH/N2). Během 10 minut byl přikapáván roztok 2-(2-brom-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylchloridu (354 mg, 1,15 mmol) vCH2C12 (3 ml, dest. nad CaH2). Bylo mícháno 3,40 hodin za chlazení i-PrOH/N2 (-60 až -20 °C). Reakční směs byla zředěna 10 ml CH2C12 a promyta 10 ml vody. Vodná fáze byla dále extrahována 2x10 ml CH2C12. Sušením organických fází Na2SO4, filtrací, odpařením rozpouštědla a odpařením spolu s toluenem (4x10 ml) byl získán surový produkt (552 mg). Krystalizaci z malého množství CH2C12 a MeOH byl izolován 5'-O-(2-(2-brom-6nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (163 mg, 38 %) jako bezbarvá pevná látka. Zbytek byl přečištěn sloupcovou chromatografií (18 g SiO2, 11x2 cm, rozpouštědlo: CH2Cl2/MeOH 100:1 50 ml, 100:3 103 ml, 100:4 208 ml, 100:5 52 ml). První byl eluován 3',5'-bis-0-(2-(2-brom-6nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin, potom 3 '-0-(2-(2-brom-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin a posléze 5'-O-(2-(2-brom-6-nitrofenyl)ethoxythymidin. Frakce byly odpařeny a sušeny ve vysokém vakuu: byl získán 3',5'-bis-0-(2-(2-brom-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (62 mg, 10 %) jako bezbarvá pěna, 3'-0-(2-(2-brom-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (8 mg, 2 %) jako bezbarvý olej a 5'-O-(2-(2-brom-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (151 mg, 35 %) jako bezbarvá pevná látka. Úhrnný výtěžek 5'-O-2-(2-brom-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidinu byl 314 mg, (73 %).
5'-O-2-(2-brom-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin
Rf (SiO2, toluen/EtOAc/MeOH 5:4:1) 0,38.
UV (MeOH, Xmax [nm] (log e): 210 (4,37), 263 (4,06).
JH NMR (250 MHz, CDC13): 8,35 (s, NH), 7,85 (d, 1 arom. H, v. BNPEOC), 7,76 (d, 1 arom. H v. BNPEOC), 7,38 (s, H-C(6) v. thymin), 7,30 (t, H-(4) v. BNPEOC, částečně překrytý signálem CHC13), 6,37 (t, H-(ď), 4,45 (m, H-C(3'), 2x H-C (5'), a-CH2 v. BNPEOC)), 4,15 (m, H-(C4')), 3,47 (t, p-CH2 v BNPEOC), 2,41 (m, H-C(2'), OH-C(3')); 2,25 (m, H-C(2'), 1,86 (s, CH3).
Anal. Pro Ci9H2oBrN309 (514,285) vypočteno: C 44,37; H 3,92, N 8,17; nalezeno: C 44,31; H 3,96; N 8,11.
Příklad 6
a) 2-(4-ChIor-2-nitrofenyl)ethanol [1,2,3]
Směs 4-chlor-2-nitrotoluenu (50 g, 291 mmol) a paraformaldehydu (3,8 g, 120 mmol) v DMSO (40 ml, l.č., dosušen 2d nad molekulovým sítem 0,4 nm) byla 2,5 hodin míchána při 90 °C s Tritonem B (4 ml, 35% v MeOH). Bylo neutralizováno několika kapkami koncentrované HC1, zředěno 100 ml vody a extrahováno EtOAc (5x150 ml). Spojené organické fáze byly sušeny MgSO4, filtrovány a odpařeny. Olejovitý zbytek byl přečištěn sublimací ve vysokém vakuu
-13CZ 292296 B6 (13 Pa, teplota lázně 110 °C). Bylo získáno 13,23 g, (55 %) 2-(4-chlor-2-nitrofenyl)ethanolu ve formě žlutých krystalů.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc 10:1) 0,26.
T.t.: 61 až 64 °C.
UV (MeOH, [nm] (log e): 213 (4,29); 252 (3,61); 294 (sh, 3,10).
*H NMR (250 MHz, CDC13): 7,94 (d, J = 2,2; H-C(3); 7,53 (dd, H-C(5)); 7,4 (d, H-C(6); 3,93 (t, a-CH2); 3,14 (t, β-ΟΗ2); 1,70 (s, OH).
Anal. Pro C8H8C1NO3 (201,61) vypočteno: C 47,66, H 4,00; N 6,95; nalezeno: C 47,65; H 4,01; N 6,75.
Literatura:
[1] J. Bakke, Acta Chem. Scand. 1969,23, 3055.
[2] T. Morimoto, I. Hashimoto, H. Yamaoka, Chem. Abstr. 1978, 88,104880 v.
[3] Y. Tsui, S. Kotachi, K.-T. Huh, Y. Watanabe, J. Org. Chem. 1990, 55, 580.
b) 2-(4-Chlor-2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid
Do roztoku 2-(4-chlor-2-nitrofenyl)ethanolu (6,8 g; 34 mmol) v THF (50 ml, dest. nad CaH2) byl při pokojové teplotě uváděn fosgen. Po 2,5 hod. byl přebytek fosgenu a rozpouštědlo oddestilováno ve vysokém vakuu. Byl získán 2-(4-chlor-2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid (8,53 g; 95 %) jako žlutý olej.
Rf (SiO2, CHC13) 0,85.
UV (CH3CN) [nm] (log e): 213 (4,26; 254 (3,63) 300 (sh, 3,14).
’H NMR (250 MHz, CDC13): 8,03 (d, H-C(3), 7,59 (dd, H-C (5), 7,36 (d, H-C(6), 4,62 (t, a-CH2), 3,32 (β-ΟΗ2).
Anal. pro C9H7C12NO4 (264,06): C vypočteno 40,94; H 2,67; N 5,30, nalezeno: C 40,97; H 2,69; N 5,00.
c) 5'-0-(2-(4-Chlor-2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin
Thymidin (150 mg, 0,62 mmol) byl kodestilován s pyridinem (2x5 ml, p.a., sušeno molekulovým sítem), pak přikapán roztok 2-(4-chlor-2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchloridu (255 mg, 0,97 mmol) v 3 ml CH2C12, destilovaném nad CaH2. Po 4-hodinovém míchání za chlazení i-PrOH/N2 (-30 až -15 °C) byla směs ředěna 30 ml CH2C12 a promyta 30 ml vody. Vodná fáze byla ještě vytřepána 2x30 ml CH2C12. Spojené organické fáze byly sušeny MgSO4, filtrovány a společně odpařeny s 4x10 ml toluenu a 20 ml CH2C12. Surový produkt byl zpracován sloupcovou chromatografíí (SiO2, 15x3 cm, rozpouštědlo CH2Cl2/MeOH 100:7 700 ml). Byl získán 5'-O-(4-chlor-2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (219 g, 75 %) jako bezbarvá pevná látka.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc/MeOH 5:4:1) 0,36.
UV (MeOH, [nm] (log e): 212 (4,43); 261 (4,08); 310 (sh, 3,07).
-14CZ 292296 B6
Ή NMR (250 MHz, CDC13): 8,75 (s (šiř., NH), 7,94 (d, H-C(3) v.CNPEOC); 7,52 (dd, H-C(5));
7,31 (m, H-C(6) v. CNPEOC, H-C(6) zthyminu); 6,32 (t, H-C(l'); 4,41 (m, H-C(3');
2x H-C(5'); a-CH2 v. CNPEOC); 4,12 (kv. H-C(4')); 3,27 (t, p-CH2 v. CNPEOC), 2,75 (s, šiř., OH-C(3')); 2,39 (m, H-C(2')), 2,19 (m, H-C(2')), 1,86 (s, CH3).
Anal. pro Ci9H20C1N3O9 (469,83) vypočteno: C 48,57; H 4,29; N 8,94; nalezeno: C 48,87; H 4,56; N 8,64.
Příklad 7
a) 2-(5-Methoxy-2-nitrofenyl)ethanol [1,2]
Ke směsi 5-methoxy-2-nitrotoluenu (25 g, 150 mmol) a paraformaldehydu (2,3 g, 73 mmol) v DMSO (20 ml, l.č., dosušeno 2 d nad molekulovým sítem 0,4 nm) byl přidán při 80 °C Triton B (2 ml, 35% v MeOH). Po 2,5 hodinovém míchání při této teplotě bylo ponecháno ochladit na pokojovou teplotu a bylo neutralizováno několika kapkami koncentrované HC1. Směs byla zředěna 50 ml vody a extrahována 5x100 ml EtOAc. Organické fáze byly sušeny MgSO4, filtrovány a odpařeny. Zbytek byl podroben destilaci ve vysokém vakuu (13,3 Pa), přičemž byla získána při 70 °C frakce s eduktem (12,1 g). Zbytek surového produktu byl čištěn sloupcovou chromatografií (240 g SiO2, rozpouštědlo: toluen/EtOAc 8:1 1400 ml, 7:1 1600 ml, 6:1 400 ml, 5:1 400 ml, 3:1 400 ml, 2:1 600 ml a 1:1 600 ml). Byl získán 2-(5-methoxy-2-nitrofenyl)ethanol (6,87 g, 48 %) jako žlutý olej.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc 1:1) 0,34.
UV (MeOH), [nm] (log e): 204 (4,00); 231 (3,82); 301 (3,84).
Ή NMR (250 MHz, CDC13): 8,04 (dd, H-C(4); 6,82 (m, H-C(3); H-C(6)), 3,94 (kv, a-CH2); 3,87 (s, OCH3); 3,20 (t, p-CH2), 1,64 (s (šir., OH).
Anal. Pro C9HnNO4 (197,19): vypočteno: C 54,82; H 5,62; N 7,10; nalezeno: C 54,78; H 5,86; N 7,00.
Literatura:
[1] T. Morimoto, I. Hashimoto, H. Yamaoka, Chem. Abstr. 1978, 88,104880 v.
[2] Y. Tsui, S. Kotachi, K.-T. Huh, Y. Watanabe, J. Org. Chem. 1990, 55, 580.
b) 2-(5-Methoxy-2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid
Do roztoku 2-(5-methoxy-2-nitrofenyl)ethanolu (3,0 g, 15 mmol) v THF (40 ml, destilovaný nad CaH2) byl za míchání při pokojové teplotě uváděn fosgen. Po 2,5 hodinách byl přebytek fosgenu a rozpouštědlo oddestilováno ve vysokém vakuu. Byl získán 2-(5-methoxy-2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid (3,72 g, 96 %) jako žlutý olej.
Rf (SiO2, CHC13) 0,79.
UV (CH3CN), [nm] (log e): 222 (sh, 3,87); 230 (3,90); 303 (3,87).
Ή NMR (250 MHz, CDC13): 8,12 (d, H-C(3)); 6,88 (dd, H-C(4)); 6,79 (D, J = 2,8, H-C(6)); 4,63 (t, a-CH2), 3,89 (s, OCH3); 3,35 (t, β-CHj).
Anal. pro C10H10CINO5 vypočteno: C 46,26; H 3,88; N 5,39; nalezeno: C 46,42; H 4,00; N 5,50.
-15CZ 292296 B6
c) 5'-O-(2-(-5-Methoxy-2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin
Thymidin (150 mg, 0,62 mmol) byl kodestilován s 2x5 ml pyridinu, p.a., sušeným molekulovým sítem 0,4 nm), rozpuštěn v 5 ml pyridinu a vychlazen na -30 °C (i-PrOH/N2). K tomu byl v 5 minutách přikapáván roztok 2-(5-methoxy-2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid (250 mg, 0,96 mmol) vCH2Čl2 (5 ml, destilovaný nad CaH2). Po dohromady 4 hodinách míchám za chlazení i-PrOH/N2 (-30 až -15 °C) byla směs zředěna 30 ml CH2C12 a promyta 30 ml vody. Vodná fáze byla vytřepána 2x30 ml CH2C12. Sušení organických fází Na2SO4, filtrace, odpaření rozpouštědla a odpaření spolu s 4x10 ml toluenem a 10 ml CH2C12 poskytlo surový produkt, který byl přečištěn sloupcovou chromatografii (SiO2, 16x3 cm, CH2Cl2/MeOH 100:6 800 ml). Byl získán 5'-0-(2-(5-methoxy-2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (205 mg, 71 %) jako bezbarvá pevná látka.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc/MeOH 5:4:1) 0,32.
UV (MeOH), [nm] (log e): 205 (4,30; 234 (sh, 3,94); 270 (4,01); 302 (sh, 3,84).
’H NMR (250 MHz, CDC13): 8,79 (s, NH); 8,06 (H-C(3); MNPEOC), 7,34 (s, H-C(6); thymin); 6,85 (dd, H-C (4); MNPEOC), 6,77 (d, J = 2,7; H-C(6); MNPEOC), 6,32 (t, H-C(l')), 4,43 (m, H-C(3'); 2x H-C(5'), a-CH2, MNPEOC), 4,12 (kv, H-C(4')), 3,85 (s, OCH3); 3,33 (m, p-CH2, MNPEOC), 2,75 (d, OH-C(3')); 2,38 (m, H-C(2')); 2,18 (m, H-C(2')); 1,83 (s, CH3).
Anal. pro C20H23N3O10 (465,42) vypočteno: C 51,61; H 4,98; N 9,03; nalezeno: C 51,31; H 5,09; N 8,63.
Příklad 8
a) 2-(2,4-Dichlor-6-nitrofenyl)ethanol
Ke směsi 2,4-dichlor-6-nitrotoluenu (1,03 g, 5 mmol) a paraformaldehydu (150 mg, 5 mmol) v DMSO (2,5 ml, l.č., přesušeno nad molekulovým sítem) byl přidán roztok terc.butylátu draselného (90 mg, 0,8 mmol) v terc.butanolu (1 ml, 99%). Po přidání přešla barva směsi ze žluté na temně fialovou. Bylo mícháno 5 minut při pokojové teplotě a 30 minut při 70 až 80 °C (teplota lázně). Pak bylo ochlazeno na pokojovou teplotu, neutralizováno několika kapkami koncentrované HC1. Směs byla zředěna 30 ml EtOAc a promyta 30 ml vody. Vodná fáze byla vytřepána 2x30 ml EtOAc. Sušení organických fází Na2SO4, filtrace a odpaření rozpouštědla poskytlo surový produkt, který byl čištěn sloupcovou chromatografii (20 g SiO2, 12x2 cm, rozpouštědlo PE 30 ml, PE/EtOAc 10:1 110 ml, 9:1 100 ml, 8:1 360 ml, 7:1 80 ml). Byl získán 2-(2,4dichlor-6-nitrofenyl)ethanol (769 mg, 65 %) jakožto žlutá pevná látka.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc 9:1) 0,41.
UV (MeOH, /.mx [nm] (log e): 205 (4,32); 2,18 (4,20); 254 (sh, 3,40); 292 (3,08).
Ή NMR (250 MHz, CDC13): 7,73 (d, J = 2,0; 1 arom. H); 7,65 (d, J = 2,0; 1 arom. H); 3,92 (m, a-CH2); 3,26 (t, p-CH2); 1,70 (s, šiř., OH).
Anal. Pro CgHyCy^TC^ (236,054) vypočteno: C 40,71; H2,99; N 5,93; nalezeno: C 40,36; H 2,96; N 5,85.
b) 2-(2,4-Dichlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid
-16CZ 292296 B6
K roztoku trichlormethylesteru chloromravenčí kyseliny (503 mg, 2,5 mmol) v THF (5 ml, dest. nad CaH2) se během 5 minut přidával roztok 2-(2,4-dichlor-6-nitrofenyl)ethanolu (500 mg, 2,12 mmol) a Et3N (214 mg, 2,12 mmol, dest. nad KOH) v THF (5 ml). Za chlazení ledem bylo mícháno 1 hodinu a 1 hodinu při pokojové teplotě. Směs byla pak filtrována přes celit. Promývání filtračního koláče THF a oddestilování rozpouštědla a přebytečného činidla ze spojených filtrátů při 30 °C ve vysokém vakuu poskytlo 2-(2,4-dichlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid (597 mg, 94 %) jako světle žlutou pevnou látku.
Rf (SiO2, PE/EtOAc 19:1) 0,57.
UV (MeOH, [nm] (log e): 204 (4,35); 217 (4,25); 252 (sh, 3,47); 295 (3,10).
Ή NMR (250 MHz, CDC13): 7,82 (d, J= 1,8; 1 arom H, 7,70 (d, J= 1,8, 1 arom. H, 4,59 (t, a-CH2), 3,42 (t, β-€Η2).
Anal. Pro C9HC13NO4 (298.509) vypočteno: C 36,21; H 3,03; N 4,69; nalezeno: C 36,37; H 2,30; N 4,60.
c) 5 '-0-(2-(2,4-Dichlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin
Thymidin (200 mg, 0,83 mmol) byl odpařen s přídavkem pyridinu (3x3 ml, p.a., sušeno molekulovým sítem 0,4 nm), byl rozpuštěn v pyridinu, (3 ml) a ochlazen na -60 °C (i-PrOH/N2). V průběhu 15 minut byl přikapáván roztok 2-(2,4-dichlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylchloridu (320 mg, 1,07 mmol) v CH2C12 (3 ml, destilovaný nad CaH2). Po dohromady 6 hodinovém míchání pod i-PrOH/N2 (-60 až -15 °C) směs byla zředěna 10 ml CH2C12 a promyta 10 ml vody. Vodná fáze byla extrahována 2x10 ml CH2C12. Sušení organických fází Na2SO4, filtrace, odpaření rozpouštědla a odpaření za přídavku 4x10 ml toluenu poskytlo surový produkt (543 mg), který byl čištěn sloupcovou chromatografií (20 g SiO2, 12,5x2,1 cm, rozpouštědlo CH2Cl2/MeOH 100:1 50 ml, 100:2 204 ml, 100:3 360 ml). Nejprve byl eluován 3',5'-bis-O-(2(2,4-dichlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin, potom 3 '-0-(2-(2,4-dichlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin a 5'-O-(2-(2,4-dichlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin. Frakce byly odpařeny a ve vysokém vakuu sušeny. Byl získán 3',5'-bis-O-(2-(2,4-dichlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (53 mg, 8 %) jako světle žlutá pěna, dále 3'-O-(2-(-2,4-<iichlor6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (14 mg, 3%) a 5'-O-(2-(2,4-dichlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (339 mg, 81 %) jako bezbarvé pěny.
5'-O-(2-(2,4-dichlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin:
Rf (SiO2, toluen/EtOAc/MeOH 5:4:1) 0,40.
UV (MeOH, [nm] (log e): 203 (4,51); 214 (sh, 4,38); 263 (4,02); 304 (sh, 3,06).
JH NMR (250 MHz, CDC13): 8,91 (s, NH); 7,75 (d, J= 2,1; 1 arom. H, DCNPEOC), 7,68 (d, J = 2,1; arom. H, DCNPEOC); 7,37 (t, H-C(6), thymin), 6,37 (t, H-C(l')), 4,63 (m, H-C(3'), 2x H-C (5'), a-CH2, DC1NPEOC), 4,16 (m, H-C(4')), 3,40 (t, p-CH2, DC1NPEOC), 2,86 (d, OH-C(3')); 2,42 (m, H-C)2')); 2,24 (m, H-C(2')); 1,89 (s, CH3).
Anal. Pro C19Hi9Cl2N3O9 (504,279) vypočteno: C 45,25; H 3,80; N 8,33; nalezeno: C 45,02; H 3,89; N 8,04.
Příklad 9
a) 2-(4,5-Dimethoxy-2-nitrofenyl)ethanol [1]
-17CZ 292296 B6
Ke směsi homoveratrylalkoholu (3,02 g, 16,6 mmol) v ledové kyselině octové (30 ml), chlazené ledem a solí na -10 °C byla během 6 minut za míchání přikapávána konc. kyselina dusičná (4,8 ml, 65%, d=l,4). Pak bylo ponecháno během 30 minut ohřát na 23 °C. Po 1 hodině míchání při této teplotě byla směs zředěna 30 ml vody, neutralizována NaHCO3 a extrahována 3x30 ml EtOAc. Spojené organické fáze byly sušeny Na2SO4, filtrovány a zahuštěny. Zbytek (3,25 g) byl čištěn sloupcovou chromatografií (90 g SiO2, toluen/EtOAc 4:1, 500 ml, 3:1 400 ml, 2:1 300 ml). Bylo získáno 2,13 g, (56 %) 2-(4,5-dimethoxy-2-nitrofenyl)ethanolu jako žlutá pevná látka.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc 2:1) 0,24.
UV (MeOH), [nm] (log e): 202 (4,18); 216 (4,06, 242 (3,97); 297 (3,63); 340 (3,70).
Ή NMR (250 MHz, CDC13): 7,61 (s, H-C(3)); 6,80 (s, H-C(6), 3,97 (s, OCH3); 3,96 (m, a-CH2, schovaný), 3,95 (s, OCH3), 3,21 (t, β-ΟΗ2), 1,70 (s šir., OH).
Anal. pro Ci0Hi3NO5 (227,216) vypočteno: C 52,86; H 5,77; N 6,16; nalezeno: C 52,87; H 5,82; N 6,12.
Literatura [1] E. McDonald, R. D. Wylie, Tetrahedron 1979, 35. 1415.
b) 2-(4,5-dimethoxy-2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid
Trichlormethylester chloromravenčí kyseliny (0,26 ml, 2,2 mmol) v THF (5 ml, dest. nad CaH2) byl ledovou lázní chlazen na 0 °C. Pak byl přikapáván roztok 2-(4,5-dimethoxy-2-nitrofenyl)ethanolu (500 mg, 2,2 mmol) a Et3N (218 mg, 0,3 ml, 2,2 mmol) v THF (14 ml, dest. nad CaH2) během 10 minut. Pak byla odstavena lázeň, bylo dále mícháno při pokojové teplotě. Po 30 minutách míchání bylo přidáno aktivní uhlí na špičku špachtle, reakční směs byla po dalších 2,5 hodinách míchání při pokojové teplotě odsáta přes celit. Rozpouštědlo a přebytek činidla byl z filtrátu oddestilováno ve vysokém vakuu a byl získán 2-(4,5-dimethoxy-2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid (624 mg, 98 %) jako žlutohnědá pevná látka.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc 2:1) 0,77.
UV (MeOH), [nm] (log e): 303 (4,18); 217 (4,08); 242 (4,01); 297 (3,67); 339 (3,73).
'Η NMR (250 MHz, CDC13): 7,67 (s, H-C(3)); 6,74 (s, H-C(6)); 4,66 (t, a-CH2); 3,99 (s, OCH3); 3,96 (s, OCH3); 3,36 (t, β-ΟΗ2).
Anal. pro CiiHnNOeCI (289,671) vypočteno: C 45,61; H4,18; N 4,84; nalezeno: C 45,59; H 4,26; N 4,94.
c) 5'-O-(2-(4,5-Dimethoxy-2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin
Thymidin (200 mg, 0,83 mmol) byl kodestilován s 2x2 ml pyridinu, (p.a., sušen molekulovým sítem 0,4 Nm), rozpuštěn ve 2,4 ml pyridinu a vychlazen na -60 °C (iPrOH/N2). Potom byl přikapáván roztok 2-(4,5-dimethoxy-2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid (361 g, 1,25 mmol) v CH2C12 (2,4 ml, dest. nad CaH2). Po 6,5-hodinovém míchání při chlazení i-PrOH/N2 (-^10 až -15 °C) byla směs zředěna 10 ml CH2C12 a promyta 10 ml vody. Vodná fáze byla extrahována 2x10 ml CH2C12. Sušení organických fází Ňa2SO4, filtrace, odpaření rozpouštědla a odpaření s přídavkem 4x20 ml toluenu poskytlo 530 mg surového produktu, který byl čištěn sloupcovou chromatografií (20 g SiO2, CH2Cl2/MeOH) 100:3 309 ml, 100:4 104 ml, 100:5 160 ml). Jako první byl eluován 3',5'-bis-O-(2-(4,5-dimethoxy-2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin a potom 5'-O-(2-(4,5-dimetiioxyfenyl)ethoxykarbonyl)thymidin. Frakce byly odpařeny a sušeny
-18CZ 292296 B6 ve vysokém vakuu. Byl získán 3',5'-bis-0-2-(4,5-dimethoxy-2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (154 mg, 25%) a 5'-O-(2-(4,5-dimethoxy-2-nitrofenyl)ethoxykarbonylthymidin (272 mg, 66 %) jako žluté pevné látky.
5'-0-(2-(4,5-Dimethoxy-2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin
Rf (SiO2, toluen/EtOAc/MeOH 5:4:1) 0,23.
UV (MeOH, [nm] (log e): 20R(4,33); 212 (sh), 4,30; 247 (4,13); 267 (4,03); 343 (3,69).
*H NMR (250 MHz, CDC13): 9,10 (s, NH); 7,62 (s, H-C(3)); 7,37 (d, J = 1,2; H-C(6), thymin);
6,73 (s, H-C(6)); 6,35 (t, H-C(l'), 4,44 (m, H-C(3'); 2x H-C(5'); a-CH2, DMNPEOC); 4,15 (m, H-C (4')); 3,96 (s, OCH3); 3,94 (s, OCH3); 3,33 (dt, β-ΟΗ2, DMNPEOC); 3,06 (s, šir., OH-C3')), 2,42 (m, H-C(2')), 2,20 (m, H-C(2')); 2,20 (m, H-C(2')); 1,88 (d, J = 0,9; CH3).
Anal. Pro C2iH25N3On (495,441) vypočteno: C 50,91; H 5,09; N 8,48; nalezeno: C 50,94; H 5,09; N 8,32.
Příklad 10
a) 2-(2-Nitrofenyl)propanol [1,2]
Ke 2-nitroethylbenzenu (3,02 g, 20 mmol) a paraformaldehydu (600 mg, 20 mmol) v DMSO (10 ml, l.č., sušen nad molekulovým sítem) byl přidán roztok terc.butylátu draselného (360 mg, 3,2 mmol) v terc.butanolu (4 ml, dest. nad CaH2). Bylo mícháno 15 minut při pokojové teplotě a 1,45 hodin při teplotě lázně 70 °C. Pak bylo ochlazeno na pokojovou teplotu a neutralizováno několika kapkami konc. HC1. Směs byla zředěna 100 ml EtOAc a promývána nasyceným roztokem NaCl (60 ml). Vodná fáze byla extrahována 2x100 ml EtOAc. Sušení organických fází nad Na2SO4, filtrace, odpaření rozpouštědla poskytlo surový produkt (5,06 g), který byl přečištěn sloupcovou chromatografií (80 g SiO2, 19x3,4 cm, rozpouštědlo: toluen 150 ml, toluen/EtOAc 8:1 270 ml, 7:1 240 ml, 6:1 280 ml, 5:1 180 ml). Byl získán 2-(2-nitrofenyl)propanol (2,539 g, 70 %) jako světle žlutý olej.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc 9:1) 0,25.
UV (MeOH, [nm] (log e): 206 (4,08); 220 (sh, 3,75); 254 (3,53); 285 (sh, 3,27).
‘H NMR (250 MHz, CDC13): 7,75 (dd, J = 1,2; 8,1; 1 arom. H, ortho kNO2); 7,55 (m, 2 arom. H); 7,36 (m, 1 arom. H), 3,80 (m, a-CH2); 3,52 (sextet, β-CH); s, (šir. OH, 1,33 (d, J = 6,9, CH3).
Anal. pro C9HjiNO3 (181,191) vypočteno: C 59,66; H 6,12; N 7,74; nalezeno: C 59,55; H 6,12; N 7,90.
Literatura:
[1] J.Org. Chem. 1986,3143.
[2] Chem. Abstr. 1989, 110, P 75032 k.
b) 2-(2-Nitrofenyl)propoxykarbonylchlorid
K roztoku trichlormethylesteru chloromravenčí kyseliny (655 mg, 3,3 mmol) vychlazenému na 0 °C v THF (6,75 ml, dest. nad CaH2) byl během 5 minut přidáván roztok 2-(2-nitrofenyl)
-19CZ 292296 B6 propanolu (500 mg, 2,76 mmol) a Et3N (279 mg, 0,385 ml, 2,76 mmol, dest. nad KOH v THF (6,75 ml). Potom bylo 1 hodinu mícháno v ledové lázni a 1 hodinu při pokojové teplotě. Směs byla filtrována celitem. Promývání filtračního koláče THF a oddestilování rozpouštědla a činidla ze spojených filtrátů při 30 °C ve vysokém vakuu poskytlo 2-(2-nitrofenyl)propoxykarbonylchlorid (644 mg, 96 %) jako světlehnědý olej.
Rf (SiO2, PE/EtOAc 19:1) 0,24.
UV (MeOH, [nm] (log e): 205 (4,07); 218 (sh, 3,75); 251 (3,59);
lH NMR (250 MHz, CDC13): 7,84 (dd, J = 1,2; 8,0; 1 arom. H ortho k NO2); 7,62 (m, 1 arom H, 7,44 (m, 2 arom H); 4,50 (d, J = 6,3; a-CH2); 3,80 (sextet β-ΟΗ2); 1,42 (d, J = 7,0; CH3).
Anal. pro C10H10CINO4 (243,646) vypočteno: C 49,30; H 4,14; N 5,75; nalezeno: C 49,71; H 4,32; N 5,70.
c) 5'-O-(2-(2-nitrofenyl)propoxykarbonyl)thymidin
Thymidin (1 g, 4,1 mmol) byl kodestilován s 3x15 ml p.a. pyridinu (sušený molekulovými síty), pak rozpuštěn v pyridinu (15 ml) a byl ochlazen na -60 °C (i-PrOHZN2). Během 20 minut byl přikapáván roztok 2-(2-nitrofenyl)propoxykarbonylchloridu (1,31 g, 5,38 mmol) vCH2C12 (18 ml, dest. nad CaH2). Bylo dále mícháno 6 hodin za chlazení i-PrOH/N2 (-60 až -20 °C). Reakční směs byla zředěna 50 ml CH2C12 a promyta 50 ml vody. Vodná fáze byla extrahována 3x50 ml CH2C12. Sušení organických fází Na2SO4, filtrace, odpaření rozpouštědla a kodestilace s toluenem (4x15 ml) poskytlo surový produkt (2,22 g), který byl čištěn sloupcovou chromatografií (80 g SiO2,19x3,4 cm, rozpouštědlo: CH2Cl2/MeOH 100:1 101 ml, 100:2 204 ml, 100:3 206 ml, 100:3,3 207 ml, 100:4 520 ml, 100:5 53 ml, 100:6 53 ml. Jako první byl eluován 3 ',5 '-bis-0-(2-(2-nitrofenyl)propoxykarbonyl)thymidin, potom 3 '-0-(2-(2-nitrofenyl)propoxykarbonyl)thymidin a posléze 5'-O-(2-(2-nitrofenyl)propoxykarbonyl)thymidin. Po odpaření frakcí a sušení ve vysokém vakuu byl získán 3',5'-bis-0-(2-(2-nitrofenyl)propoxykarbonyl)thymidin (145 mg, 5 %) jako světle žlutá pěna, 3'-O-(2-(2-nitrofenyl)propoxykarbonyl)thymidin (71 mg, 4 %) a 5'-O-(2-(2-nitrofenyl)propoxykarbonyl)thymidin (1,307 g, 71 %) jako bezbarvé pěny.
5'-O-(2-(2-nitrofenyl)propoxykarbonyl)thymidin:
Rf (SiO2, toluen/EtOAc/MeOH 5:4:1) 0,43.
UV (MeOH) [nm] (log e): 207 (4,30); 263 (4,07).
*H NMR (250 MHz, CDC13): 8,66 (s, NH, diastereomer); 8,64 (s, NH, diastereomer); 7,77 (m, 1 arom. H, NPPOC); 7,59 (t, 1 arom. H, NPPOC), 7,43 (m, 2 arom. H, NPPOC); 7,33 (s, H-C(6), thymin, diastereomer); 7,30 (s, H-c(6), thymin, diastereomer); 6,34 (t, H-C(l'), diastereomer, 6,32 (t, H-C(l'), diastereomer); 4,29 (m, H-C(3'), H-C(4',2xH-C(5'), a-CH2, NPPOC); 3,80 (m, β-CH, NPPOC); 2,62 (d, J = 4,2; OH-C(3'), diastereomer, 2,60 (d, J = 4,4; OH-C(3), diastereomer, 2,39 (m, H-C(2')); 2,18 (m, H-C(2')); 1,86 (s, CH3, thymin, diastereomer); 1,75 (s, CH3, thymin, diastereomer); 1,38 (d, J = 7,0, CH3, NPPOC, diastereomer); 1,37 (d, J = 7,0, CH3, NPPOC, diastereomer).
Anal. pro C20H23N3O9 (449,416) vypočteno: C 53,45; H 5,16; N 9,35; nalezeno: C 53,14; H 5,21; N9,16.
-20CZ 292296 B6
Přikladli
a) 2-Chlor-2-(2-nitrofenyl)ethanol
Roztok 2-nitrobenzylchloridu (4,3 g, 25 mmol) v DMSO (3,5 ml, sušeno molekulovým sítem) byl smíchán s paraformaldehydem (750 mg, 25 mmol) a DBU (0,5 ml; 3,3 mmol) a bylo 20 minut mícháno při pokojové teplotě. Hodnota pH reakční směsi byla nastavena pomocí několika kapek AcOH na pH 3. Směs byla zředěna 120 ml CH2C12, promyta 80 ml vody a extrahována 2x100 ml CH2C12. Organické fáze byly sušeny Na2SO4, filtrovány a odpařeny. Surový produkt (5,543 g) byl přečištěn sloupcovou chromatografii (150 g SiO2, 22x4,1 cm, rozpouštědlo: toluen 150 ml, toluen/EtOAc 25:1 260 ml, 15:1 320 ml, 10:1 330 ml, 5:1 720 ml, 4:1 250 ml.) Jako první byl eluován edukt (2,587 g, 60 %), potom směsná frakce (267 mg) a nakonec 2-chlor-2-(2-nitrofenyl)ethanol (1,178 g, 23 % vztaženo na zreagovaný edukt). Získaná směsná frakce (267 g) byla čištěna další sloupcovou chromatografii (8 g SiO2, 15x1,2 cm, rozpouštědlo: toluen 50 ml, toluen/EtOAc 100:1 50 ml). Nejdříve byl eluován další edukt (44 mg, 1 %) a potom 2-nitrostyrenepoxid (68 mg, 2 %, nebo 4 % vztaženo na zreagovaný edukt). Celkové množství zpátky izolovaného eduktu bylo 2,631 g (61 %).
2-Chlor-2-(2-nitrofenyl)ethanol (žlutá pevná látka)
Rf (SiO2, CH2C12) 0,23.
T.t. 49 až 50 °C.
UV (MeOH) [nm] (log e): 209 (4,11); 254 (3,64); 332 (sh, 2,70).
ΉNMR (250 MHz, CDC13): 7,94 (dd, J = 1,3; 8,3; 1 arom. H); 7,89 (dd, J = 1,3; 7,9; 1 arom H); 7,69 (m, 1 arom. H); 7,51 (m, 1 arom. H); 5,73 (dd, J = 4,6; 6,8; β-CH); 4,11 (dd, J = 4,6; 12,1; a-CH); 4,00 (dd, J = 6,8; 12,0; a-CH); 2,14 (s, OH).
*H NMR (250 MHz, DMSO-de): 7,94 (dd, J= 1,2; 8,1; 1 arom. H); 7,86 (dd, J = 1,5; 7,9; 1 aromH), 7,77 (dt, J= 1,2; 7,4; 1 arom H), 7,60 (dt, J= 1,6; 8,3; 1 arom H); 5,43 (t, J= 6,4; β-CH); s (šir. částečně schovaný, OH, 3,86 (d, J = 6,4; a-CH2).
Anal. pro C8H8C1NO3 (201,609): C 47,66; H 4,00; N 6,95; nalezeno: C 48,01; H 4,11; N 7,00.
b) 2-Chlor-2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid
Roztok difosgenu (1,7 ml, 14 mmol) v THF (10 ml, dest. nad CaH2) byl v ledové lázni ochlazen na 0 °C. Během 30 minut byl přidán roztok 2-chlor-2-(2-nitrofenyl)ethanolu (705 mg, 3,5 mmol) a Et3N (354 mg, 0,485 ml, 3,5 mmol) v THF (10 ml, dest. nad CaH2). Po další hodině míchání byla ledová lázeň odstavena, ještě bylo 3 hodiny mícháno při pokojové teplotě. Směs byla filtrována přes celit. Sraženina byla promyta THF (10 ml, dest. nad CaH2). Spojené filtráty byly odpařeny a sušeny ve vysokém vakuu při pokojové teplotě. Byl získán 2-chlor-(2-(2nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid (896 mg, 97 %) jako světle hnědý olej.
Rf (SiO2, CH2C12) 0,82.
UV (MeOH), [nm] (log e): 208 (4,11), 253 (3,66).
'H NMR (250 MHz, CDC13): 8,01 (dd, J = 1,1; 8,1; 1 arom. H); 7,93 (dd, J = 1,1; 7,9; 1 arom. H); 7,74 (dt, J = 1,1; 8,2; 1 arom. H); 7,57 (m, 1 arom. H); 5,89 (dd, H = 4,9; 6,4; β-CH); 4,80 (dd, J = 6,5; 11,4; a-CH); 4,73 (dd, J = 4,9; 11,5; a-CH).
-21CZ 292296 B6
Anal. pro C9H7C1NO4 (264,064) vypočteno: C 40,94; H 2,67; N 5,30; nalezeno: C 41,39; H 2,89;
N 5,38.
c) 5'-O-(2-Chlor-2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin
Thymidin (250 mg, 1,03 mmol) byl kodestilován s 2x3 ml p.a. pyridinu (dosušeného nad molekulovým sítem), pak byl rozpuštěn v pyridinu (3,5 ml) a ochlazen na -40 °C (i-PrOH/N2). Během 30 minut byl přidán roztok 2-chlor-2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchloridu (356 mg, 1,35 mmol) v CH2C12 (3,5 ml, dest. nad CaH2). Za chlazení i-PrOH/N2 (-40 až -10 °C) bylo dále mícháno 4,45 minut. Reakční směs byla zředěna 10 ml vody a extrahována 4x10 ml CH2C12. Organické fáze byly sušeny Na2SO4, filtrovány, odpařeny a kodestilovány s 4x10 ml toluenu. Surový produkt (665 mg) byl čištěn sloupcovou chromatografíí (20 g SiO2, 12x2,1 cm, rozpouštědlo CH2C12 100 ml, CH2Cl2/MeOH 100:1 101 ml, 100:2 102 ml, 100:2,5 102 ml, 100:3 206 ml, 100:4 104 ml, 100:5 105 ml. Jako první byl eluován bis-(2-chlor-2-(2-nitrofenyl)ethyl)karbonát (60 mg, 10 %) jako žlutý olej, potom 3',5'-bis-0-(2-chlor-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (48 mg) jako světležlutá pěna, potom 3'-O-(2-chlor-2-(nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (16 mg, 3 %) jako bezbarvá pěna a posléze 5-O-(2-chlor--(2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (394 mg, 81 %) jako bezbarvá pěna.
5'-O-(2-Chlor-2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin:
Rf (SiO2, toluen/EtOAc/MeOH 5:4:1) 0,34.
UV (MeOH), [nm] (log e): 209 (4,34); 262 (4,10).
*H NMR (250 MHz, CDC13): 8,37 (s, (šiř.), NH); 7,97 (d, J = 8,1; 1 arom H, CNPEOC); 7,91 (dd, J = 1,0; 7,9; 1 arom. H, CNPEOC), 7,72 (t, J = 7,3; 1 arom H, CNPEOC); 7,55 (m, 1 arom. H, CNPEOC); 7,34 (m, H-C (6), thymin); 6,35 (dd, J = 4,0; 6,7; H-C(l'), diastereomer); 6,32 (dd, J= 3,9; 6,5; H-C(l'), diastereomer); 5,89 (m, β-CH, CNPEOC); 4,57 (m, a-CH2, CNPEOC); H-C(3'), 2xH-C(5')), 4,15 (kv, J= 3,2; H-C(4’)); 2,41 (m, H-C(2')); 2,22 (m, H-C(2')); 1,90 (s, CH3, thymin, diastereomer); 1,86 (s, CH3, thymin); diastereomer); 1,61 (s, šir., OH-C(3')).
Anal. pro Ci9H20ClN3O9 (469,834): vypočteno: C 48,57; H 4,29; N 8,94; nalezeno: C 48,17; H 4,40; N 8,47.
Příklad 12
a) 2-Methoxy-2-(2-nitrofenyl)ethanol
K roztoku 2-nitrobenzylmethyletheru (4,18 g, 25 mmol) v DMSO (3,5 ml, sušeno nad molekulovým sítem) byl přidán paraformaldehyd (750 mg, 25 mmol) a DBU ((1,85 ml;
12,4 mmol) a bylo ponecháno reagovat 4 hodiny při pokojové teplotě. Hodnota pH byla několika kapkami AcOH nastavena od pH 9 na pH 3,5. Směs byla zředěna 120 ml CH2C12 a promyta 80 ml vody. Vodná fáze byla extrahována 2x80 ml CH2C12. Spojené organické fáze byly sušeny nad Na2SO4, filtrovány a odpařeny. Surový produkt (5,56 g) byl čištěn sloupcovou chromatografií (140 g SiO2, 21x4,2 cm, rozpouštědlo: toluen 300 ml, toluen/EtOAc 20:1 210 ml, 15:1 160 ml, 10:1 220 ml, 15:2 170 ml, 6:1 210 ml, 5:1 180 ml, 4:1 400 ml, 3:1 240 ml, 2:1 240 ml). Jako první byl eluován 2-nitrobenzylmethylether (2,442 g, 58 %) a potom 2-methoxy-2-(2nitrofenyl)ethanol (1,696 g, 34 % resp. 82 %, počítáno na zreagovaný edukt).
2-Methoxy-2-(2-nitrofenyl)ethanol (žlutá pevná látka)
-22CZ 292296 B6
Rf (SiO2, CH2Cl2/MeOH 100:3) 0,31.
UV (MeOH), [nm] (log e): 206 (4,09); 256 (3,66).
’H NMR (250 MHz, CDC13): 8,00 (m, 1 arom. H, 7,70 (m, 2 arom H); 7,48 (m, 1 arom H); 4,95 (dd, J = 3,2; 7,2; β-CH); 3,94 (ddd J = 3,2; 8,8; 11,8; -CH); 3,67 (ddd, J = 4,4; 7,2; 11,7; a-CH); 3,31 (s, OCH3); 2,29 (dd, J = 4,4; 8,8; OH).
Anal. pro C9H11NO4 (197,19) vypočteno: C 54,82; H 5,62; N 7,10; nalezeno: C 55,14; H 5,57; N 7,15.
b) 2-Methoxy-2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlor
K roztoku difosgenu (1,2 ml, 10 mmol) v THF (15 ml, dest. nad CaH2), chlazenému na 0 °C byl během 1 hodiny přidán roztok 2-methoxy-2-(2-nitrofenyl)ethanolu (986 mg, 5 mmol) a Et3N (506 mg; 0,693 ml; 5 mmol) v THF (10 ml, dest. nad CaH2]). Po dalším 15 minutovém míchání při 0 °C po odstavení ledové lázně bylo ještě 1,5 hodin mícháno při pokojové teplotě. Směs byla filtrována přes celit, sraženina promyta THF (30 ml, dest. nad CaH2). Spojené filtráty byly odpařeny a sušeny ve vysokém vakuu při pokojové teplotě. Byl získán 2-methoxy-2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid (1,264 g; 97 %) jako světlehnědý olej.
Rf (SiO2, CH2C12): 0,73.
UV (MeOH) [nm] (log e): 205 (4,12; 253 (3,71; 348 (sh, 2,74).
rH NMR (250 MHz, CDC13): 7,97 (dd, J = 1,1; 8,2; 1 arom. H, 7,81 (dd, J = 1,6; 7,8; 1 arom. H,
7,73 (dt, J= 1,1; 7,6; 1 arom. H, 7,54 (m, 1 arom. H, 5,13 (dd, J= 3,3; 6,3; β-CH); 4,60 (dd, J = 3,2; 11,2; a-CH); 4,54 (dd, J = 6,4; 11,3, a-CH).
Anal. Pro C10H10CINO5 (259,645) vypočteno: C 46,26; H3,88; N 5,39; nalezeno: C 46,74; H 3,88; N 5,40.
c) 5 '-0-(2-Methoxy-2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin
Thymidin (250 mg, 1,03 mmol) byl kodestilován s 2x3 ml p.a. pyridinu, sušeným nad molekulovým sítem 0,4 nm), rozpuštěn ve 3,5 ml pyridinu a ochlazen na -50 °C. Za 1,5 hodiny byl přidán roztok 2-methoxy-2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonylchloridu (348 mg, 1,34 mmol) vCH2Cl2 (3,5 mí, dest nad CaH2). Za chlazení i-PrOH/N2 (-40 až -10 °C) bylo mícháno ještě 3,5 hodin. Reakční směs byla zředěna 10 ml vody a extrahována 3x10 ml CH2C12. Organické fáze byly sušeny Na2SO4, filtrovány, odpařeny a kodestilovány se 4x10 ml toluenu. Surový produkt (578 mg) byl čištěn sloupcovou chromatografií (20 g SiO2, 12x2,1 cm, rozpouštědlo: CH2C12 100 ml, CH2Cl2/MeOH 100:1 202 ml, 100:2 102 ml, 100:3 103 ml, 100:4 104 ml, 100:5 105 ml, 100:6 106 ml. Nejdříve byl eluován bis(2-methoxy-2-(2-nitrofenyl)eťhyl)karbonát (88 mg, 16 %) jako světle žlutá pevná látka a potom směsná frakce 3'-0-(2-methoxy-2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidinu a 5 '-0-(2-methoxy-2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidinu (323 mg). Směsná frakce byla čištěna sloupcovou chromatografií (7 g SiO2, 13x1,2 cm, rozpouštědlo CH2C12 30 ml, CH2Cl2/MeOH 100:1 50 ml, 100:2 51 ml, 100:2 51 ml, 100:2,5 51 ml, 100:3 51 ml, 100:4 52 ml, 100:5 52 ml). Byl eluován nejprve 3'-O-(2-methoxy2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (11 mg, 2 %), a potom 5'-O-(2-methoxy-2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (290 mg, 60 %), každý jako bezbarvá pěna.
5'-O-(2-Methoxy-2-(2-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin
-23CZ 292296 B6
Rf (SiO2, toluen/EtOAc/MeOH 5:4:1) 0,40.
UV (MeOH) λ™» [nm] (log e): 207 (4,33); 363 (4,12).
’H NMR (250 MHz, CDC13): 8,67 (s šiř., NH); 8,03 (d, J = 5,0; 1 arom. H, MNPEOC); 7,78 (m, 1 arom H, MNPEOC); 7,70 (t, J = 7,5; 1 arom. H, MNPEOC); 7,52 (m, 1 arom H, MNPEOC); 7,52 (m, 1 arom. H, MNPEOC); 7,43 (m, H-C(6), thymin); 6,38 (dd, J= 3,8; 6,7; H-C(l'), diastereomer); 6,35 (dd, J= 3,7; 6; 4; H-C(l'), diastereomer); 5,14 (m, β-CH, MNPEOC); 4,42 (m, a-CH2, MNPEOC, H-C(3'); 2x H-C(5')); 4,15 (kv, J = 3,2; H-C(4')); 3,28 (s, OCH3, diastereomer); 3,27 (s, OCH3, diastereomer); 2,64 (s, šir., OH-C(3')); 2,42 (m, H-C(2')), 2,23 (m, H-C(2')); 1,94 (s, CH3, thymin, diastereomer); 1,92 (s, CH3, thymin, diastereomer).
Anal. pro C20H23N3O10 (465,514) vypočteno: C 51,51; H 4,98; N 9,03; nalezeno: C 51,65; H 5,18; N 8,94.
Příklad 13
5'-0-(2-(2-Chlor-6-mtrofenyl)ethoxykarbonyl)-N4-2-(4-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-2'-desoxycytidin
N4-(2-(4-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-2'-desoxycytidin (5 g, 11,9 mol) byl kodestilován s 2x60 ml p.a. pyridinu, sušeným nad 4Á molekulovým sítem), rozpuštěn v 60 ml pyridinu a vychlazen na -60 °C (i-PrOH7N2). Během 75 minut byl přikapáván roztok 2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylchloridu (4,7 g, 17,8 mmol) vCH2C12 (60 ml, dest. nad CaH2) a bylo mícháno 1 hodinu 45 minut za chlazení i-PrOH/N2 (-40 až -25 °C). Směs byla zředěna 150 ml CH2C12 a promyta 100 ml vody. Vodné fáze byly extrahovány 100 ml CH2C12. Sušení organických fází nad Na2SO4, filtrace, odpaření rozpouštědla a kodestilace s toluenem (3x50 ml) poskytlo surový produkt (9,8 g), který byl přečištěn sloupcovou chromatografií (440 g SiO2, 32x5,9 cm, rozpouštědlo: CH2Cl2/MeOH 100:4). Byl získán 5'-O-(2-(2-Chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-N4-2-(4-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-2'-desoxycytidin (5,247 g, 68 %) jako bezbarvá pěna.
Rf (SiO2, CH2Cl2/MeOH 5:1) 0,82.
UV (MeOH) Xmax [nm] (log e): 205 (sh, 4,56); 211 (4,58; 242 (4,28); 275 (4,17).
lH NMR (250 MHz, CDC13): 8,18 (m, 2 arom. H NPEOC, ortho kNO2); 8,04 (d, H-C(6); cytosin); 8,03 (s, šir. NH, částečně skrytý), 7,73 (dd, 1 arom. H, CNPEOC); 7,66 (dd, 1 arom. H, CNPEOC); 7,41 (m, 2 arom H, NPEOC, meta kNO2); 7,37 (t, H-C(4); CNPEOC, částečně skryt); 7,22 (d, H-C(5), cytosin); 6,34 (t, H-C(l')); 4,43 (m, H-C(3'); 2x H-C(5'); a-CH2, CNPEOC, a-CH2, NPEOC); 4,26 (m, H-C)4')); 3,76 (s, šir., OH-C(3')); 3,43 (t, |3-CH2, CNPEOC); 3,12 (t, p-CH2, NPEOC); 2,73 (m, H-C(2')); 2,14 (m, H-C(2')).
Anal. pro C27H26N5Oi2Cl (647,981) vypočteno: C 50,05; H 4,04; N 10,81; nalezeno: C 49,87; H 4,17; N 10,74.
Příklad 14
5'-O-(2-(2-Chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-N6-2-(4-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-2'-desoxyadenosin
-24CZ 292296 B6
N6-2-(4-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-2'-desoxyadenosin (5 g, 11,3 mmol) byl kodestilován s 2x60 ml p.a. pyridinu sušeným ještě nad molekulovým sítem 0,4 nm), rozpuštěn v pyridinu a ochlazen na -60 °C (i-PrOH/N2). Kněmu se přikapával roztok 2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylchlorid (4,17 g, 15,8 mmol) vCH2C12 (60 ml, dest. nad CaH2). Po dalších 2 hodinách míchání za chlazení na —40 až -60 °C byla směs zředěna 150 ml CH2C12 a promyta 100 ml vody. Vodné fáze byly extrahovány 100 ml CH2C12. Sušení organických fází NaSO4, filtrace, odpaření rozpouštědla a kodestilace s 3x50 ml toluenu poskytlo surový produkt (8,73 g), který byl čištěn sloupcovou chromatografií (400 g SiO2,28x5,7 cm, rozpouštědlo: CH2Cl2/MeOH 100:3). Byl získán 5'-0-(2-(2-Chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl-N6-(2-(4-nitrofenylethoxykarbonyl)-2'-desoxyadenosin (6,318 g, 83 %) jako bezbarvá pěna.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc/MeOH 5:4:1) 0,33.
UV (MeOH) ληκ» [nm] (log e): 209 (4,67); 266 (4,46).
‘H NMR (250 MHz, CDC13): 8,71 (s, H-C(8)); 8,53 (s, šir., NH, částečně skryt); 8,23 (s, H-C(2)); 8,17 (m, 2 arom. H, NPEOC, ortho kNO2); 7,73 (dd, 1 arom H, CNPEOC); 7,65 (dd, 1 arom. H, CNPEOC); 7,44 (m, 2 arom. H, NPEOC, meta kNO2); 7,36 (t, H-C(4), CNPEOC, částečně skryt); 6,54 (t, H-C(l')); 4,77 (m, H-(C3')); 4,55 (t, a-CH2, CNPEOC); 4,41 (m, a-CH2, NPEOC, 2x H-(C5')); 4,49 (kv, H-C(4')); 3,43 (t, β-ΟΗ2, NPEOC); 3,16 (t, p-CH2, NPEOC); 3,15 (s, šir., OH-C(3'), částečně skryt); 2,89 (m, H-C(2')); 2,60 (m, H-C(2')).
Anal. pro C^H^NyOnCl (672,007) vypočteno: C 50,05; H 3,90; N 14,59; nalezeno: C 49,62; H 3,96; N 14,33.
Příklad 15
5'-0-(2-(2-Chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonylthymidin-3'-0-((|3-kyanoethyl)(N,N-diizopropylamino)fosfitamid)
V baňce v atmosféře argonu byl 5'-0-(2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin (1,9 g, 4 mmol) a lH-tetrazol (140 mg, 2 mmol) suspendován vCH2C12 (20 ml, dest. nad CaH2) aCH3CN (8 ml, p.a.) a byl přidán bis(diízopropylamino)(|3-kyanoethoxy)fosfin (1,87 g, 6,2 mmol). Po 16,5 hodinách míchání při pokojové teplotě byla směs zředěna 50 ml CH2C12 a promyta 25 ml nasyceného roztoku NaHCO3. Vodná fáze byla extrahována 2x25 ml CH2C12. Sušení organických fází NaSO4, filtrace a odpaření rozpouštědla poskytlo surový produkt (3,4 g), který byl přečištěn sloupcovou chromatografií (40 g SiO2,12x3,1 cm, rozpouštědlo.Toluen/EtOAc 5:1 160 ml, 4:1 150 ml, 3:1 120 ml, 2:1 150 ml, 1:1 100 ml, 1:2 150 ml, 1:3 160 ml, vždy za přídavku 1 % obj. Et3N. Byl získán 5'-0-(2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin3'-O-((P-kyanoethyl)(N,N-diizopropylamino)fosfitamid (2,012 g, 75 %) jako bezbarvá pěna.
Rf (toluen/EtOAc/MeOH 5:4:1) 0,64 a 0,70 (diastereomery).
UV (MeOH) [nm] (log e): 205 (4,45); 262 (4,06).
‘H NMR (250 MHz, CDC13): 8,40 (s, NH); 78,74 (td, 1 arom. H, CNPEOC); 7,66 (dd, 1 arom. H, C NPEOC); 7,38 (m, H-C(4), CNPEOC); 6,37 (m, H-C(l')); 4,61 až 4,25 (m, H-C(3'), 2xH-C(5'); a-CH2, CNPEOC); 4,28 (m, H-C(4'), diastereomer); 4,22 (m, H-C(4'), diastereomer); 3,90- 3,66 (m, a-CH2 v kyanoethoxy); 3,57 (m, 2xNCH); 3,43 (td, β-ΟΗ2, CNPEOC), 2,66 (t, |3-CH2 v kyanoethoxy); 2,48 (m, H-C(2')); 2,23 (m, H-C(2')); 1,86 (d, CH3); 1,23 (m, 2xNC(CH3)2).
31P-NMR (161,7 MHz, CDC13): 149,73 a 149,85 (diastereomery).
-25CZ 292296 B6
Anal. pro C^H^NsOioPCl (670,056) vypočteno: C 50,19; H 5,57; N 10,45; nalezeno: C 50,43; H
5,90; N 10,43.
Příklad 16
5'-0-(2-(2-Chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-N4-(2-(4-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-2'-desoxycytidin-3'-0-(([3-kyanoethyl)(N,N-diizopropylamino)fosfitamid)
V atmosféře argonu byl smíchán 5'-O-(2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-N4-(2-(4nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-2'-desoxycytidin (1,9 g, 2,9 mmol) a lH-tetrazol (102 mg, 1,45 mmol) v CH2C12 (20 ml, dest nad CaH2 a CH3CN (8 ml p.a.) s bis(diizopropylamino)([3kyanoethoxy)fosfinem (1,32 g, 4,38 mmol) a bylo mícháno při pokojové teplotě. Po
13,5 hodinách byl roztok zředěn 50 ml CH2C12 a promýván 25 ml nasyceného roztoku NaHCO3. Vodná fáze byla extrahována 2x25 ml CH2C12. Spojené organické fáze byly sušeny Na2SO4, filtrovány a odpařeny. Surový produkt (2,99 g) byl přečištěn sloupcovou chromatografií (61 g SiO2, 18x3,2 cm, rozpouštědlo PE/aceton 5:1 170 ml, 4:1 200 ml, 3:1 200 ml, 2:1 600 ml, 3:2 150 ml, 1:180 ml, 2:3 300 ml, 1:2 90 ml). Byl získán 5'-O-(2-(2-Chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-N4-(2-(4-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-2'-desoxycytidin-3'-0-((P-kyanoethyl)(N,N-diizopropylamino)fosfítamid) (2,29 g, 93 %) jako bezbarvá pěna.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc/MeOH 5:4:1) 0,61 a 0,67 (diastereomery).
UV (MeOH), [nm] (log e): 203 (4,66); 209 (sh, 4,64; 241 (30); 276 (sh 4,18).
*H NMR (250 MHz, CDC13): 8,18 (m, 2 arom. H, NPEOC, ortho k NO2; 8,02 (H-C(6); cytosin);
7,74 (td, 1 arom. H, CNPEOC); 7,66 (dd, 1 arom. H, CNPEOC); 7,40 (m, 2 arom. H, NPEOC, meta kNO2); 7,39 (m, H-C(4), CNPEOC, Částečně skryt); 7,17 (d, H-C(5), cytosin); 6,28 (m, H-C(l')); 4,47 až 4,29 (m, a-CH2, NPEOC), a-CH2, CNPEOC); H-C (3'), H-C(4'), 2x H-C(5')); 3,90 až 3,53 (m, a-CH2, kyanoethoxy, 2x NCH); 3,43 (t, (3-CH2, CNPEOC); 3,12 (t, β-ΟΗ2, NPEOC); 2,73 (m, H-C(2'); částečně skrytý); 2,65 (t, β-ΟΗ2, kyanoethoxy); 2,17 (m, H-C(2')); 1,23 (m, 2xNC(CH3)2.
31P-NMR (161,7 MHz, CDC13) 149,67 a 150,02 (diastereomery).
Anal. pro C36H43N7Oi3PCl (848,203) vypočteno: C 50,98; H 5,11; N 11,56; nalezeno: C 50,88; H 5,18; NI 1,36.
Příklad 17
5'-0-(2-(2-Chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-N6-(2-(4-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-2'-<iesoxyadenosin-3'-O-((P-kyanoethyl)(N,N-diizopropylamino)fosfitamid
V baňce, vypláchnuté argonem, byla směs 5'-O-(2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-Nó2-{4-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-2'-desoxyadenosinu (2 g, 2,98 mmol) a lH-tetrazolu (104 mg, 1,49 mmol) v CH2C12 (20 ml, dest. nad CaH2) a CH3CN (8 ml, p.a.) smíchána s bis(diizopropylamino)(P-kyanoethoxy)fosfmem (1,36 g, 4,51 mmol) a při pokojové teplotě bylo mícháno
13,5 hodin. Směs byla zředěna 50 ml CH2C12, promyta 25 ml nasyceného roztoku NaHCO3. Vodná fáze byla extrahována 2x25 ml CH2C12. Spojené organické fáze byly sušeny Na2SO4, filtrovány a odpařeny. Surový produkt byl čištěn sloupcovou chromatografií (92 g SiO2, 13x4,2 cm, rozpouštědlo: PE/aceton 6:1 140 ml, 5:1 180 ml, 4:1 200 ml, 2:1 750 ml, 3:2 150 ml, 1:1 400 ml, 2:3 600 ml, vždy za přídavku 1 % obj. Et3N. Byl získán 5'-O-(2-(2-Chlor-6-nitro-26CZ 292296 B6 fenyl)ethoxykarbonyl)-N6-(2-(4-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)-2'-desoxyadenosin-3'-0-((pkyanoethyl)(N,N-diizopropylamino)fosfitamid (2,146 g, 83 %) jako bezbarvá pěna.
Rf (SiO2, toluen/EtOAc/MeOH 5:4:1) 0,71 a 0,76 (diastereomery).
UV (MeOH), λ,^ [nm] (log e): 205 (4,68; 2,66 (4,43).
’H NMR (250 MHz, CDC13): 8,74 (d, H-C(8), adenin); 8,23 (s, H-C(2), adenin); 8,18 (m, 2 arom. H, NPEOC, ortho kNO2); 7,73 (m, 1 arom. H, CNPEOC); 7,65 (m, 1 arom. H, CNPEOC); 7,44 (m, 2 arom H, NPEOC, meta kNO2); 7,36 (T, H-C(4), CNPEOC); 6,52 (m, H-C(l')); 4,77 (m, H-C(3')); 4,54 (t, a-CH2, CNPEOC); 4,39 (m, a-CH2, NPEOC); H-C(4'); 2x H-C(5')); 3,93 až 3,59 (m, 2x NCH, a-CH2, kyanoethoxy); 3,41 (td, 3~CH2, CNPEOC); 3,16 (t, |3-CH2, NPEOC); 2,90 (m, H-C(2')); 2,71 (m, H-C(2'), částečně zakrytý); 2,67 (m, β-CHj, kyanoethoxy); 1,23 (m, 2xNC(CH3)2.
31P-NMR (161,7 MHz, CDC13): 149,70 a 149,79 (diastereomery).
Anal. pro C^H^NgOnPCl (872,229) vypočteno: C 50,95; H 4,97; N 14,45; nalezeno: C 50,92; H 5,11;N 14,21.
-27CZ 292296 B6
Shrnutí příkladů přípravy
| Bsp. | R3 | R2 | R3 | R4 | R5 | R6 | B |
| 1 | H | H | H | H | H | H | Thymin |
| 2 . | H | H | W | H | H | Thymin | |
| 3 | H | H | F | H | H | H | Thymin |
| 4 | H | H | Cl | H | H | H | Thymín |
| 5 | H | H | Br | Ji | H | H | Thymin |
| 6 | Cl | H | II | H | H | : H | Thymin |
| 7 | H | och3 | H | H | H | H | Thymin |
| 8 | Cl | H | Cl | H | H | H | Thymin |
| 9 | och3 | OCH^ | H | H | H | H | Thymin |
| 10 | H | H | II | ch3 | H | H | Thymin |
| 11 | H | H | H | cl | H | ' H | Thymin |
| 12 | H | H | H | och3 | H | H | Thymín |
| 13 | H | H | Cl | H | H | H | N4-(2-pNPEOC)Cytosin |
| 14 | H | H | Cl | H | H | Ή | N6- (2-pNPEOC) Adenin |
| 15 ' | H | H | Cl | H | O-ÍCHj^—CN 1 .CH(CH3)2 —ρ-χ CHfCtyj | H | Thymin |
| 16 | H | H | Cl | H | O—(CHžh—CN 1 .CHÍCH^ —P— CHfCH^ | H | N4-(2-pNPEOC) Cytosin |
| 17 | H | H | Cl | H | O—(CH2)2—CN 1 CHÍCHsh —P— CHÍCHjfe | H | N6-(2-pNPEOC) Adenin |
Ozařovací pokusy
1. Provedení
Vhodně chráněné thymidinové nukleosidy byly ozařovány s pomocí ozařovací aparatury, která se skládala z vysokotlaké Hg-lampy (OSRAM HBO, 200 W), spojky, uzávěru s elektronickým ío řízením k nastavení dob uzavírání a temperovatelného držáku kyvet. Kromě toho byl mezi lampu a vzorek zabudovaný tepelný filtr (0,032 molámí roztok CuSO4). Byly ozařovány 0,2 mM roztoky nukleosidů vMeOH/HaO 1:1 při 20 až 30 °C s celým vlnovým spektrem (polychromatické světlo s vlnovými délkami >289 nm.
-28CZ 292296 B6
Odštěpení chránících skupin bylo kvantitativně sledováno pomocí HPLC. HPLC přístroj se skládal z následujících elementů: Merck-Hitachi L-6200 Intelligent Pump, Merck-Hitachi Intelligent Auto Sampler AS 4000, Merck-Hitachi Interface, Měrek Lichtrosorb-sloupec RP-18, 125x5 mm. UV/VIS-spektrofotometr byl přístroj UVIKON 730 LC firmy Kotron. Detekce byla provedena při 260 nm. Integrace chromatografických signálů byla provedena s pomocí Software firmy Měrek: D-6000 HPLC-Manager.
Zásadně bylo chromatografováno ve směsích MeOH/H2O. Přitom byl použit následující gradient (flow: 1 ml/min):
| doba (min) | MeOH/H2Ol:l | h2o | MeOH |
| 0 | 10 | 90 | 0 |
| 5 | 10 | 90 | 0 |
| 15 | 90 | 10 | 0 |
| 30 | 50 | 0 | 50 |
| 35 | 10 | 90 | 0 |
Pro thymidin a chráněné nukleosidy byly vstřikováním zřeďovacích sérií do chromatografií sestrojeny kalibrační křivky.
Z ozařovaných roztoků byly v určitých časových intervalech odebrány vzorky (objem 20 μΐ). Každý vzorek byl vstřikován dvakrát. Pro další vyhodnocení byla vzata střední hodnota těchto stanovení. Plochy píků v chromatogramech byly přepočteny s pomocí kalibračních křivek na koncentrace chráněných nukleosidů, resp. thymidinu. Takto získané hodnoty koncentrací byly děleny maximálně dosažitelnou koncentrací 0,2 mM (= koncentraci chráněných nukleosidů při začátku ozařování) a vynášeny jako „relativní množství“ v procentech proti době ozařování. Na tabulce v odstavci 2.3 je uveden výsledek takového měření se sloučeninou 5'-0-(2-(2-chlor-6nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin.
2. Příklady
2.1. Kalibrace thymidinu
Pro kalibraci thymidinu byla sestrojena zřeďovací série s následujícími koncentracemi: 0,2 mM, 0,16 mM, 0,12 mM, 0,08 mM, 0,04 mM. S každou koncentrací byla provedena tři měření. Ze získaných středních hodnot a hodnoty nulového bodu (0 plocha píku= 0 koncentrace) byly spočítány s pomocí lineární regrese kalibrační přímky (viz tabulku)
Kalibrace thymidinu plocha píku koncentrace thymidinu (mM)
| 516,893 | 0,20 |
| 414,730 | 0,16 |
| 307,575 | 0,12 |
| 208,952 | 0,08 |
| 99,5080 | 0,04 |
| 0,0000 | 0,00 |
Z lineární regrese vychází: y = 4,96777.10-4 + 3,85757.10-7 x, kde x je plocha píku a y = koncentrace thymidinu, r = 0,9999.
-29CZ 292296 B6
2.2. Kalibrace
5'-O-(2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidinu
Byla sestrojena zřeďovací série z následujících 3 koncentrací: 0,2 mM, 0,14 mM a 0,08 mM. Střední hodnoty 3 měření při každé koncentraci a hodnota nulového bodu byly dosazeny k výpočtu regresní přímky (viz tabulku) ío Kalibrace CNPEOC-T
| plocha píku | koncentrace CNPEOC-T (mM) |
| 617,057 | 0,20 |
| 435,070 | 0,14 |
| 238,624 | 0,08 |
| 0,0000 | 0,00 |
Z lineární regrese vychází: y = 9,27999.10-4 + 3,22516.10-7 x kde x = plocha píku a y = koncentrace CNPEOC-T, r = 0,9998.
2.3. Výsledky (a) 5 '-0-(2-(2-Chlor-6-nitrofenyl)-ethoxykarbonyl)thymidin
Ozařování 5'-O-(2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidinu
| Doba ozařování (min.) | plocha píku CNPEOC-T | koncentrace CNPEOC-T (mM) | rel. množství CNPEOC-T (%) |
| 1,00000 | 458911 | 0,1489 | 74,5 |
| 2,00000 | 253292 | 0,0826 | 41,3 |
| 3,00000 | 250989 | 0,0819 | 40,9 |
| 5,00000 | 84081,0 | 0,0281 | 14,0 |
| 15,0000 | 24181 | 0,0088 | 4,4 |
| 30,0000 | 0 | 0 | 0 |
| 60,0000 | 0 | 0 | 0 |
| 120,000 | 0 | 0 | 0 |
| Doba ozařování (min.) | plocha píku thymidin | koncentrace thymidin (mM) | rel. mn. thymidin % |
| 1,00000 | 83460,0 | 0,0327 | 16,3 |
| 2,00000 | 221149 | 0,0858 | 42,9 |
| 3,00000 | 228893 | 0,0888 | 44,4 |
| 5,00000 | 330106 | 0,1278 | 63,9 |
| 15,0000 | 432514 | 0,1673 | 83,7 |
| 30,0000 | 437588 | 0,1693 | 84,6 |
| 60,0000 | 442230 | 0,1711 | 85,5 |
| 120,000 | 407543 | 0,1577 | 78,9 |
Z tabulky zřetelně vyplývá, že fotolýza probíhá přes velký časový úsek podle kinetiky prvního řádu, což poukazuje na jednoznačný mechanismus odštěpení, bez vedlejších reakcí, snižujících 25 výtěžek.
-30CZ 292296 B6 (b) Další sloučeniny podle vynálezu
V následující tabulce jsou shrnuty vyhodnocené výsledky některých dalších derivátů a dvou srovnávacích sloučenin VI (5'-0-(2-nitrobenzyloxykarbonyl)thymidinu a V2 (5'-O-(2,4-dinitrobenzyloxykarbonyl)thymidinu, které byly získané podle výše uvedené metody vzhledem k poločasu a výtěžku (procento odblokovaného derivátu nukleosidů, vztaženo na maximálně dosažitelnou koncentraci).
| Sloučenina č. | to.s (min) | výtěžek (% Cmax) |
| 1 | 2,6 | 79 |
| 2 | 1,37 | 92 |
| 4 | 1,71 | 86 |
| 5 | 1,71 | 89 |
| 6 | 2,3 | 70 |
| 8 | 1,68 | 77 |
| 9 | 7,2 | 77 |
| 10 | 0,7 | 89 |
| 11 | 1,46 | 97 |
| VI | 2,5 | 55 |
| V2 | 3,3 | 38 |
Z tabulky je zřejmé, že deriváty nukleosidů podle předloženého vynálezu z hlediska fotolytického odštěpení chránící skupiny na 5' co do rychlosti a vysokých výtěžků významně předčí dosavadní chránící skupiny VI a V2 (porovnej zejména sloučeniny 10 a 11).
Průmyslová využitelnost
Sloučenina 5'-O-(2-(2-chlor-6-nitrofenyl)ethoxykarbonyl)thymidin a jiné deriváty nukleosidů podle předloženého vynálezu byly podle metodiky S. P. A. Fodora a spol., Science 1991, 251, str. 767 použity k přípravě oligonukleotidů na DNA-čipu. Ukázalo se, že sloučeniny podle předloženého vynálezu dovolují nekomplikovanou syntézu oligonukleotidů s velmi vysokými výtěžky a tímto se hodí v praxi pro paralelní syntézy oligonukleotidů, řízené světlem.
Claims (26)
- PATENTOVÉ NÁROKY1. Deriváty nukleosidů s fotolabilními chránícími skupinami obecného vzorce I ( I),-31 CZ 292296 B6 kdeR1 znamená vodík, CN, OCH3, halogen, alkyl, alkenyl, alkinyl nebo alkoxyalkyl s 1 až 4 atomy uhlíku,R2 znamená vodík nebo OCH3,R3 znamená vodík, fluor, chlor, brom nebo NO2,R4 znamená vodík, halogen, OCH3 nebo alkylovou, alkenylovou či alkinylovou skupinu s 1 až 4 atomy uhlíku,R5 znamená vodík nebo chrániči fosfitamidovou funkční skupinu vzorceI 7 I 7NC-CH2-CH2-O-P-N(R7)2 nebo p-N02-C6H4-CH2-CH2-O-P-N(R7)2, kde skupiny R7 jsou stejné nebo různé a znamenají lineární nebo rozvětvené alkylové zbytky s 1 až 4 atomy uhlíku, s výhodou ethylové nebo izopropylové skupiny,R6 znamená vodík, OH, halogen nebo zbytek O-methyl nebo O-ethyl, O-allyl, O-tetrahydropyranyl, O-methoxytetrahydropyranyl nebo O-t-butyldimethylsilyl,B znamená adeninu, cytosinu, guaninu, thyminu, uracilu, 2,6-diaminopurin-9-yl, hypoxanthin-9-yl, 5-methyIcytosin-l-yl, 5-amino-4-(aminokarbonyl)imidazol-l-yl, 5amino-4-(aminokarbonyl)imidazol-3-yl, přičemž v případě, že B znamená zbytek adeninu, cytosinu nebo guaninu, má primární aminoskupina eventuálně stabilní chránící skupinu.
- 2. Deriváty nukleosidů podle nároku 1, obecného vzorce I, kde R1 a R2 a R3 znamenají vodík, přičemž R4 neznamená vodík.
- 3. Deriváty nukleosidů podle nároku 1, obecného vzorce I, kde R3 znamená vodík, přičemž R2 znamená OCH3.
- 4. Deriváty nukleosidů podle nároku 1, obecného vzorce I, kde R4 znamená methylový zbytek.
- 5. Deriváty nukleosidů podle nároků 1 až 4, obecného vzorce I, kde R5 je fosfitamidová skupina vzorceI 7 I 7NC-CH2-CH2-O-P-N(R7)2 nebo p-NO2-C6H4-CH2-CH2-O-P-N(R7)2, kde skupiny R7 jsou stejné nebo různé a znamenají lineární nebo rozvětvené alkylové zbytky s 1 až 4 atomy uhlíku, s výhodou ethylové nebo izopropylové skupiny.
- 6. Deriváty nukleosidů podle nároku 5, obecného vzorce I, kde R7 je ethylový nebo izopropylový zbytek.
- 7. Deriváty nukleosidů podle nároků 1 až 6, obecného vzorce I, kde jako R6 je zaveden zbytek O-methyl nebo O-ethyl, O-allyl, O-tetrahydropyranyl, O-methoxytetrahydropyranyl nebo O-t-butyldimethylsilyl.
- 8. Deriváty nukleosidů podle nároků 1 až 7, obecného vzorce I, kde v případě, že B znamená zbytek adeninu, cytostinu nebo guaninu je stabilní chránící skupinou fenoxyacetylový nebo dimethylformamidový zbytek.-32CZ 292296 B6
- 9. Deriváty nukleosidů podle nároků 1 až 7, obecného vzorce I, kde v případě, že B znamená zbytek adeninu jsou stabilními chránícími skupinami benzoylové nebo p-nitrofenylethoxykarbonylové zbytky.
- 10. Deriváty nukleosidů podle nároků 1 až 7, obecného vzorce I, kde v případě, že B znamená zbytek guaninu jsou stabilními chránícími skupinami izobutyrylové nebo p-nitrofenylethoxykarbonylové zbytky.
- 11. Deriváty nukleosidů podle nároků 1 až 7, obecného vzorce I, ve kterých v případě, že B znamená zbytek cytosinu jsou stabilními chránícími skupinami benzoylové nebo p-nitrofenylethoxykarbonylové zbytky.
- 12. Deriváty nukleosidů podle nároků 1 až 11, obecného vzorce I, ve kterých je zaveden jako atom halogenu v R1 nebo R6 atom fluoru, chloru nebo bromu.
- 13. Způsob přípravy derivátů nukleosidů podle nároků 1 až 12, obecného vzorce I, vyznačující se tím, že se nechá reagovata) alkohol obecného vzorce Π kde R1, R2, R3 a R4 mají výše uvedené významy, s derivátem fosgenu zvoleným ze skupiny sestávající z fosgenu, difosgenu a trifosgenu a následně takto vytvořený ester chlorouhličité kyseliny ve stupnib) reaguje s nukleosidy obecného vzorce ΙΠ kde R5, R6 a B mají výše uvedený význam a případně se zavede v poloze 3' derivátů nukleosidů s R5 znamenajícím vodík fosfitamidová skupinaNC-CH2-CH2-O-P-N(R7)2 nebo p-NO2-C6H4-CH2-CH2-O-P-N(R7)2, podle známých metod.-33CZ 292296 B613. Způsob podle nároku 13, v y z n a č u j í c í se t í m, že se stupeň a) provádí v nepolárním organickém rozpouštědle při teplotách mezi -20 a +25 °C.
- 14. Způsob podle nároků 13 a 14, vyznačující se tím, že se používá ve stupni a)5 derivát fosgenu ve dvou až pětinásobném molámím přebytku vzhledem k alkoholu.
- 15. Způsob podle nároků 13 až 15, vyznačující se tím, že ve stupni a) se používá jakožto nepolární organické rozpouštědlo toluen nebo tetrahydrofuran.10
- 16. Způsob podle nároků 13 až 16, vyznačující se tím, že koncentrace alkoholu ve stopni a) je 0,1 až 10 mol na 10 ml rozpouštědla.
- 17. Způsob podle nároků 13 až 17, vyznačující se tím, že se stupeň b) provádí ve směsi rozpouštědel, složené z dichlormethanu a polárního organického rozpouštědla, případně za15 přítomnosti báze při teplotách mezi -60 až +25 °C.
- 18. Způsobpodle nároků 13 až 18, vyznačuj ící se tím, že se ve stupni b) používá jako polární organické rozpouštědlo dimethylformamid nebo pyridin.
- 20 19. Způsob podle nároků 13 až 19, vyznačující se tím, že se ve stupni b) používá směs rozpouštědel složená z dichlormethanu a dimethylformamidu a báze, která je vybrána ze skupiny pyridin, triethylamin a ethyldiizopropylamin.20. Způsob podle nároků 13 až 20, vyznačující se tím, že molámí poměr dichlor-25 methanu k pyridinu nebo dimethylformamidu ve směsi je 1:1 až 3:1.
- 21. Způsob podle nároků 13 až 21, vyznačující se tím, že molámí poměr nukleosidů k esteru chlorouhličité kyseliny je 1:1 až 1:2.30
- 22. Způsob podle nároků 13 až 22, vyznačující se tím, že se ve stupni b) předloží nukleosid rozpuštěný v pyridinu nebo směsi dimethylformamidu a báze a přikapává se roztok esteru kyseliny chlorouhličité v dichlormethanu.
- 23. Způsob podle nároků 13 až 23, vyznačující se tím,že koncentrace nukleosidů ve35 směsi rozpouštědel es tupni b) je 0,1 až 3 mmol na 10 ml rozpouštědla.
- 24. Způsob podle nároků Baž 24, vyznačující se tím, že se zavedení fosfitamidové skupiny provádí reakcí derivátů nukleosidů, přičemž R5 v nich znamená vodík, s odpovídajícími fosfiny za přítomnosti ΙΗ-tetrazolu jakožto aktivátoru, ve směsi rozpouštědel z dichlormethanu40 a acetonitrilu a při teplotách mezi 0 a 25 °C.
- 25. Použití derivátu nukleosidů podle nároku 1 obecného vzorce I pro syntézu oligonukleotidů řízenou světlem.45
- 26. Použití podle nároku 26 s tím, že syntéza oligonukleotidů probíhá na pevném nosiči.
- 27. Použití podle nároku 26 nebo 27 derivátu nukleosidů podle nároků 2 až 12.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| DE4444996A DE4444996A1 (de) | 1994-12-16 | 1994-12-16 | Nucleosid-Derivate mit photolabilen Schutzgruppen |
| PCT/EP1995/004976 WO1996018634A2 (de) | 1994-12-16 | 1995-12-15 | Nucleosid-derivate mit photolabilen schutzgruppen |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CZ183697A3 CZ183697A3 (en) | 1997-12-17 |
| CZ292296B6 true CZ292296B6 (cs) | 2003-08-13 |
Family
ID=6536071
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CZ19971836A CZ292296B6 (cs) | 1994-12-16 | 1995-12-15 | Deriváty nukleosidů s fotolabilními chránicími skupinami, způsob jejich přípravy a jejich použití |
Country Status (17)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US5763599A (cs) |
| EP (1) | EP0797580B1 (cs) |
| JP (1) | JPH11501287A (cs) |
| KR (1) | KR100395290B1 (cs) |
| AT (1) | ATE215957T1 (cs) |
| AU (1) | AU692658B2 (cs) |
| BR (1) | BR9510498A (cs) |
| CA (1) | CA2207912A1 (cs) |
| CZ (1) | CZ292296B6 (cs) |
| DE (2) | DE4444996A1 (cs) |
| DK (1) | DK0797580T3 (cs) |
| ES (1) | ES2174976T3 (cs) |
| FI (1) | FI973643A0 (cs) |
| HU (1) | HU215543B (cs) |
| IL (1) | IL116407A (cs) |
| NO (1) | NO307382B1 (cs) |
| WO (1) | WO1996018634A2 (cs) |
Families Citing this family (36)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20110028350A1 (en) * | 1995-12-15 | 2011-02-03 | Affymetrix, Inc. | Photocleavable protecting groups |
| US6147205A (en) * | 1995-12-15 | 2000-11-14 | Affymetrix, Inc. | Photocleavable protecting groups and methods for their use |
| DE69732101T2 (de) | 1996-04-17 | 2005-12-22 | Köster, Hubert, Dr., Cambridge | Kombinatorische schutzgruppestrategie für multifunktionelle molekule |
| DE19620170A1 (de) * | 1996-05-20 | 1997-11-27 | Wolfgang Prof Dr Dr Pfleiderer | Nucleosid-Derivate mit photolabilen Schutzgruppen |
| US7138384B1 (en) | 1997-08-29 | 2006-11-21 | The Regents Of The University Of California | Modulators of DNA cytosine-5 methyltransferase and methods for use thereof |
| US6222030B1 (en) * | 1998-08-03 | 2001-04-24 | Agilent Technologies, Inc. | Solid phase synthesis of oligonucleotides using carbonate protecting groups and alpha-effect nucleophile deprotection |
| AU5492499A (en) | 1998-08-21 | 2000-03-14 | University Of Virginia Patent Foundation | Signal generating oligonucleotide-based biosensor |
| US6187540B1 (en) | 1998-11-09 | 2001-02-13 | Identigene, Inc. | Method of newborn identification and tracking |
| DE19858440A1 (de) * | 1998-12-17 | 2000-06-21 | Deutsches Krebsforsch | Verfahren zur photolithografischen Biochip-Synthese |
| CA2370478A1 (en) | 1999-03-24 | 2000-09-28 | Serge L. Beaucage | N-acylphosphoramidites and their use in oligonucleotide synthesis |
| EP1212338B1 (de) * | 1999-04-08 | 2012-11-21 | Deutsches Krebsforschungszentrum Stiftung des öffentlichen Rechts | Nucleosid-Derivate mit photolabilen Schutzgruppen |
| DE19952113A1 (de) * | 1999-10-29 | 2001-05-03 | Nigu Chemie Gmbh | Nucleosid-Derivate mit photolabilen Schutzgruppen |
| EP1176151B1 (en) * | 2000-07-28 | 2014-08-20 | Agilent Technologies, Inc. | Synthesis of polynucleotides using combined oxidation/deprotection chemistry |
| EP1325017A2 (en) * | 2000-09-11 | 2003-07-09 | Affymetrix, Inc. | Photocleavable protecting groups |
| DE10105077A1 (de) * | 2001-02-05 | 2002-08-08 | Febit Ferrarius Biotech Gmbh | Hybrid-Schutzgruppe |
| DE10105079A1 (de) * | 2001-02-05 | 2002-08-08 | Febit Ferrarius Biotech Gmbh | Fotolabile Schutzgruppen für die Synthese von Biopolymeren |
| EP1401851B8 (de) * | 2001-07-03 | 2008-09-10 | febit holding GmbH | Zweistufige schutzgruppen für die synthese von biopolymeren |
| DE10152147A1 (de) * | 2001-10-25 | 2003-05-15 | Chemogenix Gmbh | Verfahren zum Aufbringen von Nukleosiden und/oder Nukleotiden auf funktionalisierten Oberflächen sowie Verfahren zur Bestimmung von Kopplungsausbeuten bei der Synthese von Nukleotiden |
| DE10156467A1 (de) * | 2001-11-16 | 2003-06-05 | Micronas Gmbh | Träger zur Synthese sowie Verfahren zur Herstellung von Biopolymeren |
| WO2003048179A2 (en) * | 2001-12-03 | 2003-06-12 | The Government Of The United States Of America, Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services | Thermolabile hydroxyl protecting groups and methods of use |
| WO2003074542A2 (en) | 2002-03-04 | 2003-09-12 | Universität Konstanz | A method for cleavage of labile functional groups from chemical compounds |
| DE10209203A1 (de) | 2002-03-04 | 2003-09-25 | Ulrich Steiner | Verfahren zur Abspaltung von labilen funktionellen Gruppen aus chemischen Verbindungen |
| AU2003290117A1 (en) * | 2002-12-23 | 2004-07-22 | Febit Biotech Gmbh | Photoactivatable two-stage protective groups for the synthesis of biopolymers |
| US20040157220A1 (en) | 2003-02-10 | 2004-08-12 | Purnima Kurnool | Methods and apparatus for sample tracking |
| US7759513B2 (en) * | 2003-02-21 | 2010-07-20 | Nigu Chemie Gmbh | Photolabile protective groups for improved processes to prepare oligonucleotide arrays |
| DE10315772A1 (de) * | 2003-04-07 | 2004-11-04 | Ulrich Prof. Dr. Steiner | Chemische Verbindung und Verfahren für den intramolekularen Energietransfer zur Abspaltung von labilen funktionellen Gruppen aus chemischen Verbindungen |
| WO2004101582A2 (en) * | 2003-05-09 | 2004-11-25 | Government Of The United States Of America, Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Thermolabile hydroxyl protecting groups and methods of use |
| DE102004019098A1 (de) * | 2004-04-20 | 2005-11-10 | Chemogenix Gmbh | Photolabile Schutzgruppen |
| WO2006065751A2 (en) * | 2004-12-13 | 2006-06-22 | Government Of The United States Of America, Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Cpg oligonucleotide prodrugs, compositions thereof and associated therapeutic methods |
| US7547775B2 (en) | 2004-12-31 | 2009-06-16 | Affymetrix, Inc. | Parallel preparation of high fidelity probes in an array format |
| US8338093B2 (en) | 2004-12-31 | 2012-12-25 | Affymetrix, Inc. | Primer array synthesis and validation |
| US8343710B1 (en) | 2005-03-11 | 2013-01-01 | The Regents Of The University Of Colorado, A Body Corporate | Photodegradable groups for tunable polymeric materials |
| US9180196B2 (en) | 2005-03-11 | 2015-11-10 | The Regents Of The University Of Colorado, A Body Corporate | Photodegradable groups for tunable polymeric materials |
| WO2012102616A1 (en) | 2011-01-28 | 2012-08-02 | Flexgen B.V. | Heterodirectional polynucleotides |
| WO2013019361A1 (en) | 2011-07-07 | 2013-02-07 | Life Technologies Corporation | Sequencing methods |
| US9745618B2 (en) | 2014-11-19 | 2017-08-29 | Roche Molecular Systems, Inc. | Photoblocked probes and methods for sequential detection of nucleic acids |
Family Cites Families (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| AU5449094A (en) * | 1992-11-02 | 1994-05-24 | Affymax Technologies N.V. | Novel photoreactive protecting groups |
-
1994
- 1994-12-16 DE DE4444996A patent/DE4444996A1/de not_active Withdrawn
-
1995
- 1995-12-15 HU HU9701821A patent/HU215543B/hu not_active IP Right Cessation
- 1995-12-15 FI FI973643A patent/FI973643A0/fi not_active IP Right Cessation
- 1995-12-15 CZ CZ19971836A patent/CZ292296B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1995-12-15 AU AU43865/96A patent/AU692658B2/en not_active Ceased
- 1995-12-15 IL IL11640795A patent/IL116407A/en not_active IP Right Cessation
- 1995-12-15 KR KR1019970704039A patent/KR100395290B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 1995-12-15 EP EP95942675A patent/EP0797580B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1995-12-15 JP JP8518276A patent/JPH11501287A/ja not_active Ceased
- 1995-12-15 AT AT95942675T patent/ATE215957T1/de not_active IP Right Cessation
- 1995-12-15 WO PCT/EP1995/004976 patent/WO1996018634A2/de not_active Ceased
- 1995-12-15 ES ES95942675T patent/ES2174976T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1995-12-15 DK DK95942675T patent/DK0797580T3/da active
- 1995-12-15 BR BR9510498-4A patent/BR9510498A/pt not_active Application Discontinuation
- 1995-12-15 DE DE59510162T patent/DE59510162D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1995-12-15 US US08/693,217 patent/US5763599A/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-12-15 CA CA002207912A patent/CA2207912A1/en not_active Abandoned
-
1997
- 1997-06-13 NO NO972754A patent/NO307382B1/no not_active IP Right Cessation
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| IL116407A (en) | 2001-09-13 |
| EP0797580B1 (de) | 2002-04-10 |
| JPH11501287A (ja) | 1999-02-02 |
| BR9510498A (pt) | 1999-11-30 |
| HUT77176A (hu) | 1998-03-02 |
| AU692658B2 (en) | 1998-06-11 |
| NO307382B1 (no) | 2000-03-27 |
| IL116407A0 (en) | 1996-03-31 |
| KR100395290B1 (ko) | 2004-03-24 |
| CA2207912A1 (en) | 1996-06-20 |
| WO1996018634A3 (de) | 1996-08-22 |
| AU4386596A (en) | 1996-07-03 |
| DE59510162D1 (de) | 2002-05-16 |
| US5763599A (en) | 1998-06-09 |
| ES2174976T3 (es) | 2002-11-16 |
| HU215543B (hu) | 1999-01-28 |
| CZ183697A3 (en) | 1997-12-17 |
| DK0797580T3 (da) | 2002-06-17 |
| EP0797580A2 (de) | 1997-10-01 |
| DE4444996A1 (de) | 1996-06-20 |
| FI973643L (fi) | 1997-09-09 |
| FI973643A7 (fi) | 1997-09-09 |
| WO1996018634A2 (de) | 1996-06-20 |
| FI973643A0 (fi) | 1997-09-09 |
| NO972754L (no) | 1997-08-11 |
| NO972754D0 (no) | 1997-06-13 |
| ATE215957T1 (de) | 2002-04-15 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US5763599A (en) | Nucleoside derivatives with photolabile protective groups | |
| JP5030998B2 (ja) | ヌクレオシド類縁体およびそのヌクレオチド類縁体を含むオリゴヌクレオチド誘導体 | |
| NO320441B1 (no) | Nukleosider, oligonukleotidanaloger, farmasoytiske preparater, prober for gener, primere for amplifikasjon og anvendelse av oligonukleotidanaloger til fremstilling av medikamenter | |
| JP2001089496A (ja) | 新規ビシクロヌクレオシド類縁体 | |
| EP1995253B1 (en) | Method for detaching protecting group on nucleic acid | |
| AU711814B2 (en) | Nucleoside derivatives with photolabile protective groups | |
| JPH07196683A (ja) | オリゴリボヌクレオチドの固相合成 | |
| Hari et al. | Synthesis and properties of thymidines with six-membered amide bridge | |
| JP2003514766A (ja) | 活性剤としてルイス酸を用いるオリゴヌクレオチド合成 | |
| EP3418289B1 (en) | Artificial nucleoside and artificial nucleotide, and artificial oligonucleotide | |
| WO2017018360A1 (ja) | 人工ヌクレオシド及び人工ヌクレオチド並びに人工オリゴヌクレオチド | |
| Bussolari et al. | Synthesis and anti-HIV evaluation of 2′, 3′-dideoxy imidazo-and ν-triazolo [4, 5-d] pyridazine nucleosides | |
| US6750335B2 (en) | Nucleoside derivatives with photolabile protective groups | |
| Oda et al. | Syntheses of pyrido [1, 2-a][1, 3, 5] triazin-4-one C-deoxyribonucleosides | |
| US7049432B2 (en) | Oligonucleotides having alkylphosphonate linkages and methods for their preparation | |
| Dahl et al. | Cyclization reactions of 1-[3′-hydroxy-2′-(hydroxymethyl) prop-1′-enyl] pyrimidine nucleobases: intramolecular Michael additions to the C (5)[double bond, length as m-dash] C (6) bonds and intramolecular dehydrations | |
| JP4255227B2 (ja) | N3’−p5’結合を有する2’,4’−bnaオリゴヌクレオチド | |
| JP2004307464A (ja) | 糖部s型配座の新規人工核酸 | |
| US20050033044A1 (en) | Methods for preparing 2-alkynyladenosine derivatives | |
| Petja et al. | Stereo-Controlled Liquid Phase Synthesis of Phosphorothioate Oligonucleotides on a Soluble Support | |
| Koch | Novel antagonists for the human adenosine A2A and A3 receptor via purine nitration: synthesis and biological evaluation of C2-substituted 6-trifluoromethylpurines and 1-deazapurines | |
| CZ20001666A3 (cs) | Deriváty adenosinu | |
| WO2004037842A1 (ja) | 糖部s型配座の新規人工核酸 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PD00 | Pending as of 2000-06-30 in czech republic | ||
| MM4A | Patent lapsed due to non-payment of fee |
Effective date: 20091215 |