DK174705B1 - Peptider med immunologiske egenskaber svarende til HIV-2 virus, antigene og immunogene midler indeholdende sådanne peptider samt fremgangsmåde og kit til en vitro diagnose af HIV-2 - Google Patents

Peptider med immunologiske egenskaber svarende til HIV-2 virus, antigene og immunogene midler indeholdende sådanne peptider samt fremgangsmåde og kit til en vitro diagnose af HIV-2 Download PDF

Info

Publication number
DK174705B1
DK174705B1 DK198805133A DK513388A DK174705B1 DK 174705 B1 DK174705 B1 DK 174705B1 DK 198805133 A DK198805133 A DK 198805133A DK 513388 A DK513388 A DK 513388A DK 174705 B1 DK174705 B1 DK 174705B1
Authority
DK
Denmark
Prior art keywords
peptide
groups
hiv
peptides
immunological properties
Prior art date
Application number
DK198805133A
Other languages
English (en)
Other versions
DK513388A (da
DK513388D0 (da
Inventor
Marc Alizon
Luc Montagnier
Denise Guetard
Pierre Sonigo
Mireille Guyader
Pierre Tiollais
Lisa Chakrabarti
Francois Clavel
Ronald Desrosiers
Original Assignee
Pasteur Institut
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=27251436&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=DK174705(B1) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Priority claimed from US07/003,764 external-priority patent/US5051496A/en
Priority claimed from FR8701739A external-priority patent/FR2610632B1/fr
Priority claimed from FR8705398A external-priority patent/FR2614025B1/fr
Application filed by Pasteur Institut filed Critical Pasteur Institut
Publication of DK513388D0 publication Critical patent/DK513388D0/da
Publication of DK513388A publication Critical patent/DK513388A/da
Priority to DK200201277A priority Critical patent/DK175879B1/da
Application granted granted Critical
Publication of DK174705B1 publication Critical patent/DK174705B1/da

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
    • C07K7/06—Linear peptides containing only normal peptide links having 5 to 11 amino acids
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
    • A61P31/18—Antivirals for RNA viruses for HIV
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N7/00—Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
    • C12Q1/701—Specific hybridization probes
    • C12Q1/702—Specific hybridization probes for retroviruses
    • C12Q1/703—Viruses associated with AIDS
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/569—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
    • G01N33/56983—Viruses
    • G01N33/56988—HIV or HTLV
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00—Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011—Details
    • C12N2740/10011—Retroviridae
    • C12N2740/15011—Lentivirus, not HIV, e.g. FIV, SIV
    • C12N2740/15022—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00—Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011—Details
    • C12N2740/10011—Retroviridae
    • C12N2740/16011—Human Immunodeficiency Virus, HIV
    • C12N2740/16111—Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV env
    • C12N2740/16122—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00—Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011—Details
    • C12N2740/10011—Retroviridae
    • C12N2740/16011—Human Immunodeficiency Virus, HIV
    • C12N2740/16211—Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV gagpol
    • C12N2740/16222—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/005—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from viruses
    • G01N2333/08—RNA viruses
    • G01N2333/15—Retroviridae, e.g. bovine leukaemia virus, feline leukaemia virus, feline leukaemia virus, human T-cell leukaemia-lymphoma virus
    • G01N2333/155—Lentiviridae, e.g. visna-maedi virus, equine infectious virus, FIV, SIV
    • G01N2333/16—HIV-1, HIV-2
    • G01N2333/162—HIV-1, HIV-2 env, e.g. gp160, gp110/120, gp41, V3, peptid T, DC4-Binding site
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2469/00—Immunoassays for the detection of microorganisms
    • G01N2469/20—Detection of antibodies in sample from host which are directed against antigens from microorganisms

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Virology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • AIDS & HIV (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)

Description

DK 174705 B1
Den foreliggende opfindelse angår peptider med immunologiske egenskaber, eventuelt immunogene egenskaber, der er fælles med antigener, der kan opnås i renset form, ud fra virus, som er i stand til at fremprovokere lymphadenopatier, der kan udvikle sig til erhvervet immunde-' 5 fektsyndrom (AIDS) hos mennesker.
Opfindelsen angår nærmere bestemt hidtil ukendte peptider af den i krav 1 angivne art. Disse peptider kan genkendes af antistoffer, der induceres i mennesker af virus betegnet ved forkortelsen HIV (ifølge nomenklaturen 10 defineret i NATURE). Peptiderne ifølge opfindelsen har immunogene egenskaber kan gøres immunogene in vivo, hvilken immunogenicitet kan manifestere sig ved en induktion in vivo af antistoffer, der genkender de antigener, som er karakteristiske for HIV-2 virus, samt (for så vidt angår visse af disse peptider) antigener karakteristiske for HIV-1. Opfindelsen 15 angår endvidere et antigent middel af den i krav 23 angivne art eller et immunogent middel af den i krav 24 angivne art.
Opfindelsen angår også anvendelsen af disse peptider til diagnosticering in vitro af HIV-2-infektion i en biologisk væske.
20
Endelig angår opfindelsen et kit til in vitro diagnosticering af HIV-2-infektion i en biologisk væske.
Visse af de omhandlede peptider kan anvendes i metoder til diagnose in 25 vivo af visse former for AIDS hos mennesker, og peptiderne kan endvidere anvendes i systemer eller "kits" til diagnose.
Et første retrovirus, som er benævnt LAV-1 eller HIV-1, er blevet isoleret og beskrevet i GB patentansøgning nr. 83/24.800 og EP patentansøgning 30 nr. 84/401.834 indleveret den 14. september 1984. Dette virus er ligeledes blevet beskrevet af F. Barre Sinoussi et al i Science 220, 45-99, side 868-871.
2 DK 174705 B1
Varianter af dette HIV-1 virus, som betegnes LAV, EU og LAV MAL, er ligeledes blevet isoleret, karakteriseret og beskrevet i EP patentansøgning nr. 84/401.834.
5 HIV-1 virus og disses varianter besidder de følgende egenskaber:
Som foretrukne målceller har de humane Leu3 celler (eller T4-lymfocytter) og disses "immortaliserede" cellederivater.
10 De har en revers transcriptase-aktivitet, som nødvendiggør tilstedeværelsen af Mg2+-ioner, og udviser en kraftig aktivitet overfor poly(adenylat-oligo-deoxythymidylase) poly(A)-oligo(dT)12-18).
| De har en densitet på 1,16-1,17 bestemt i en saccharose-gradient.
15
De har en middeldiameter på 139 nm og en gennemsnitlig kernediameter på 41 nm.
Lysateme af disse virus indeholder et protein benævnt p25 (kerneprotein), 20 som ikke udviser immunologisk krydsning med proteinet p24 fra HTLV-1.
De indeholder et protein benævnt p42, som hører til deres kappe, og de indeholder desuden et kappe-glycoprotein benævnt gp110, som har en molekylvægt på 110 000.
25
Isoleringen og karakteriseringen af retrovirus, som hører til en bestemt klasse og som kun har et reduceret immunologisk slægtskab med sine ophav, er beskrevet i EP patentansøgning nr. 87/400.151.4. Disse retrovirus, som er blevet grupperet under betegnelsen HIV-2, er blevet isoleret i 30 forbindelse med talrige afrikanske sygdomstilfælde, hvor der forekommer symptomer på en lymphadenopati eller et AlDS-tilfælde.
3 DK 174705 B1
Retrovirus af typen HIV-2 udmærker sig, ligesom retrovirus af typen HIV-' 1, ved en tropisme overfor humane T4-lymfocytter og ved en cytopatogen I effekt over for disse lymfocytter, når de formerer sig. Herved forårsages dels generaliserede og vedvarende polyadenopatier og dels AIDS.
5 Nærmere bestemt kan det siges, at retrovirus oprenset fra HIV-2 generelt besidder følgende egenskaber: de foretrukne målceller for HIV-2 retrovirus er humane Leu3-celler (eller 10 T4-lymfocytter) og immortaliserede celler afledt af disse T4-lymfocytter; de er cytotoksiske overfor humane T4-lymfocytter, de har en revers transcriptaseaktivitet, der nødvendiggør tilstedeværelsen af Mg2+-ioner og udviser en kraftig aktivitet overfor poly(adenylat-oligodeoxythymidylase) 15 (poly(A)-oligo(dT)12-18); I de har en densitet på 1,16 bestemt i en saccharose-gradient; de har en middeldiameter på 140 nm og en kerne med en middeldiameter 20 på 41 nm; de kan dyrkes i permanente stammer af typen HUT eller som udtrykker T4-proteinet; 25 de inficerer ikke T8-lymfocytter; lysater af disse virus indeholder et protein benævnt p26, der ikke udviser immunologisk overkrydsning med protein p24 fra HTLV-I virus eller HTLV-II virus; 30 disse lysater indeholder endvidere et protein benævnt p16, der ikke genkendes immunologisk af proteinet p19 fra HTLV-I eller HTLV-I I virus i ra-dioimmunopræcipitationsassay; 4 DK 174705 B1 I.
de indeholder endvidere et kappeglycoprotein med molekylvægt af størrelsesordenen 130.000-140.000, der ikke udviser immunologisk overkrydsning med gp110 fra HIV-1, men som til gengæld krydser immunologisk 5 med kappeglycoproteinet gp140 fra STLV-III (virus isoleret fra aber); disse lysater indeholder endvidere antigener, der kan mærkes med 35S-cystein, hvis molekylvægt ligger mellem 32 000 og 42 000-45 000: de omfatter endvidere et antigen med molekylvægt af størrelsesordenen 36 000 10 og et antigen med en molekylvægt af størrelsesordenen 42 000, idet et af disse antigener (benævnt p36 og p42) sandsynligvis udgør et transmembran-glycoprotein fra HIV-2 virus, det genomiske RNA i HIV-2 hybridiserer ikke med genomisk RNA fra HIV-15 1 under stringente betingelser; under ikke-stringente betingelser hybridiserer det genomiske RNA fra HIV-2 hverken med env-genet eller med LTR, som støder op til genet, i HIV-1, eller med sekvenser fra pol-regionen i HIV-1 genomet; 20 under ikke-stringente betingelser hybridiserer det svagt med nucleotidse-kvenserne i HIV-1 regionen.
Et andet retrovirus benævnt SIV-1, hvilken betegnelse erstatter den tidlige-25 re anvendte betegnelse STLV-IH, er isoleret hos rhesusaber (M.D. Daniel et al. Science 228, 1201 (1985) N.L. Letwin et al, Science 230, 71 (1985) under betegnelsen "STLV-lllmac").
Et yderligere retrovirus benævnt "STLV-IIIagm" (eller SIVagm) er isoleret 30 hos vilde grønne aber. Men i modsætning til de virus, der er til stede hos rhesusaben, synes tilstedeværelsen af "STLV-IIIagm" ikke at fremkalde sygdomme af typen AIDS hos afrikanske grønne aber.
5 DK 174705 B1
En stamme af retrovirus SIV-1mac er deponeret ved CNCM den 7. februar 1986 under nr. 1-521. Studier har vist, at retrovirus SIV-1 indeholder visse proteiner, der udviser et vist immunologisk slægtskab med struktur-i proteiner eller -glycoproteiner, der kan opnås under analoge betingelser ! 5 ud fra HIV-2. Denne retrovirus SIV-1, hvis infektiøse karakter man har konstateret hos aber, blev betegnet STLVIII af de forskere, der isolerede det (jævnfør de bibliografiske referencer ovenfor).
Af sproglige årsager bliver disse virus i det følgende kun betegnet ved ud-10 trykket SIV (udtrykket SIV er den engelske forkortelse for "Simian Immunodeficiency Virus" (immundefektvirus hos aber) eventuelt efterfulgt af en forkortelse, der angiver den abeart, hvorfra de er opnået, f.eks. MAC eller mac for rhesusaber eller AGM for afrikanske grønne aber (forkortelse for African Green Monkey).
15
Ved at anvende de samme teknikker, som beskrevet ovenfor, har man konstateret, at man også ud fra SIV-1 mac kan opnå: et principalt kerneprotein benævnt p27, der har en molekylvægt af størrel-20 sesordenen 27 kd, et større kappeglycoprotein, benævnt gp140, et protein benævnt p32, der sandsynligvis er et transmembrant protein, 25 der sjældent observeres ved radioimmunopræcipationsassay (RIPA), når virus forinden er mærket med 35S-cystein, men som kan observeres ved immunoaftryksprøver (Western blots) i form af brede bånd.
Mere præcise undersøgelser er gennemført på de ovennævnte virus HIV-30 2 og SIV virus. Fortsatte studier af HIV-2 retrovirus har ligeledes ført til opnåelse af komplementære DNA-sekvenser (cDNA) til RNA i disses ge-nomer. Den komplette nucleotidsekvens for cDNA for et repræsentativt retrovirus af klassen HIV-2 (HIV-2-ROD) er deponeret den 21. februar 6 DK 174705 B1 1986 ved CNCM med nummeret I- 522 under referencebetegnelsen LAV-II ROD.
Denne nucleotidsekvens og de åbne læserammer som de indeholder er 5 angivet på figur 1 A.
I øvrigt har fortsatte studier af andre retrovirus ligeledes muliggjort en kort-læggelse af disses fuldstændige nucleotidsekvenser. Dette gælder især for cDNA afledt af genomisk RNA fra SIV-virus.
10
Kloning og sekvensbestemmelse af SIV-1mac virus har muliggjort en kort-læggelse af dettes nucleotidsekvens og gennemførtes under følgende betingelser: 15 DNA fra HUT 78 celler inficeret med SIV-virus (isolat STLV-III mac 142-83 beskrevet af Daniel et al (1985) Science, 228. side 1201-1204), og partielt nedbrudt med restriktionsenzymet Sau3A blev klonet i BamHI-restriktionsstedet i bakteriophag _-vektoren ELBL3 til opnåelse af et genomisk bibliotek. De 2 millioner rekombinante phager i det således sam-20 mensatte genomiske bibliotek blev undersøgt in situ under sikkerhedsbestemmelser P3 ved hjælp af sekvenser af HIV-2 virus stammende fra klonerne lambda-ROD4, lambda-ROD35 og E2 (Clevel et al (1986) Nature, 324. side 691) og blev nick-translateret.
25 Hybridiseringen gennemførtes ved 5xSSC ved 50 °C, og udvaskningerne ved 2xSSC ved 50 °C. En enkelt klon indeholdende samtlige virussekvenser opnåedes. Denne klon benævntes lambda-SIV-1. Indsætningen i phag lambda-SIV-1 måler 16,5 kb i alt og omfatter en integreret provirus, hvor der kun mangler de 250 første baser fra det venstrestillede LTR, mens det 30 højrestillede LTR er komplet.
7 DK 174705 B1
Det integrerede provirus blev sekvensbestemt ved dideoxynucleotidmetoden efter subkloning af tilfældige fragmenter i pha-gen M13mp8. Der analyseredes 300 subkloner.
I' 5 cDNA-fragmenter stammende fra klonen lambda-SIV-1 indsat i plasmider- ne pSIV1.1 og pSIV-1.2 blev deponeret ved CNCM den 15. april 1987 under numrene I-658 (pSIV-1.1) og I-659 (pSIV-1.2).
Resultaterne er angivet i de nedenfor beskrevne figurer.
10
Fig. TB betegner nucleotidsekvensen af genomet fra SIV virus og de sekvenser, der er afledt deraf for de virale proteiner svarende til produkterne af generne gag, pol, env, Q, X, R, tat, art, F.
15 Fig. 3-11 og fig. 1C viser sammenligning af de teoretiske produkter af de virale gener og af LTR mellem HlV-2 og SIVmac (_SIV-1).
Nucleinsyresekvenserne for cDNA fra SIV er anbragt over for nucleinsyre-sekvenserne i HIV-2 ROD virus for så vidt angår LTR-sekvensen (jvf. fig.
20 1 C). Denne præsentation som man genkender fra det fuldstændige genom ved at sammenligne fig. 1B med fig. 3-11 muliggør at man kan finde frem til eller aflede de nucleinsyrer, der har essentielle strukturelementer fælles med de to virus.
25 Komparative studier, som ligeledes har muliggjort, at man opnår resultater for kerneproteiner, i det følgende benævnt gag-proteiner, samt kappeproteiner, i det følgende benævnt env-proteiner, er ligeledes beskrevet i den ovennævnte EP ansøgning nr. 87/400.151.4. Disse resultater viser, at kerneproteiner (gag-proteiner) i HIV-2 udviser mindre tydelige forskelle fra 30 celler fra virus HIV-1 end kappeproteinerne (env-proteinerne). Totalt set har env-proteinerne i HIV-2 vist sig at udvise ekstremt svage om ikke ikke-eksisterende immunologiske ligheder med de korresponderende env-proteiner i HIV-1 virus.
8 DK 174705 B1
Derimod har komparative studier mellem strukturerne af cDNA-sekvenserne i HIV-2 og SIV-virus muliggjort, at man kan fastlægge visse fælles karakteristika, som viser sig på proteinniveauet.
5
Totalt set udviser proteinerne fra HIV-2 og SIV-1 vigtige immunologiske ligheder.
Det væsentligste kappeprotein fra HIV-2 har vist sig at være nærmere be-10 slægtet med det væsentligste kappeglycoprotein fra SIV i immunologisk henseende end med det væsentligste kappeglycoprotein fra HIV-1.
Disse konstateringer viser sig ikke blot hvad angår molekylvægtene: 130-140 kd for de væsentligste glycoproteiner fra HIV-2 og SIV overfor ca. 110 15 kd for det væsentligste kappeglycoprotein fra HIV-1, men også hvad angår de immunologiske egenskaber, eftersom udtagne serumprøver fra patienter inficeret med HIV-2 og især antistoffer dannet mod gp140 fra HIV-2 genkender gp140 fra SIV-1 mac, mens de samme serumprøver og de samme HIV-2-antistoffer ved tilsvarende forsøg ikke genkender gp110 fra 20 HIV-1. Men anti-HIV-1 serum, som aldrig har reageret med gp140 fra HIV-2, udfælder et protein på 26 kd mærket med 35S-cystein, der er indeholdt i HIV-2 ekstrakter.
Det væsentligste kerneprotein fra HIV-2 synes at udvise en middelmole-25 kylvægt på ca. 26 000, som ligger imellem molekylvægten for p25 fra HIV-1 og p27 fra SIV.
Disse observationer stammer fra forsøg gennemført på virusekstrakter opnået ud fra HIV-2 isoleret fra en af de ovennævnte patienter. Lignende 30 resultater er opnået med virusekstrakter af HIV-2 isoleret fra en anden patient.
9 DK 174705 B1
Mere omfattende forsøg har fået opfinderne til at erkende en første klasse af peptider, der har aminosyresekvenser, der enten er identiske eller nært beslægtede med sekvenser indeholdt i det indre af strukturerne for gag-proteinerne for HIV-2 eller fra SIV, og endog fra HIV-1. Disse pep-5 tider er særligt anvendelige til diagnose af en infektion hos mennesker | med HIV-2 virus eller en variant deraf.
| i På denne baggrund kan fremgangsmåden og midlet ifølge opfindelsen anvendes til diagnose in vitro af antistoffer rettet mod HIV-2 virus eller va- 10 rianter deraf, især i biologiske prøver, navnlig serumprøver fra patienter, der har været udsat for en infektion med HIV-2 virus, idet visse af disse i ! peptider muliggør en særlig tydelig diskrimination mellem infektioner forår- saget af HIV-2 virus og HIV-1 virus.
15 Disse omfattende studier har ligeledes ført til muligheden for at syntetisere peptider, der er immunogene eller kan gøres immunogene, og som udviser strukturelle karakteristika, der muliggør at de in vivo kan inducere dannelsen af antistoffer, der er i stand til at genkende env-proteiner både fra HIV-1 og HIV-2, og i det mindste for en del af disse peptiders vedkom- 20 mende at binde sig både til HIV-1 virus og til HIV-2 virus, specielt med det formål at neutralisere disse. Anvendelsen af disse typer peptider er således særligt indiceret til fremstilling af aktive bestanddele af vacciner mod HIV-virus, og dermed imod AIDS.
25 For nedenfor at beskrive de aminosyrerester, der indgår i strukturen af de omhandlede peptider, anvender man for aminosyren den entydige internationale nomenklatur, der betegner hver naturlig aminosyre med et stort bogstav ifølge den nedenstående tabel: 30 M Methionin L Leucin I Isoleucin V Valin DK 174705 B1 i 10 i F Phenylalanin S Serin P Prolin T Threonin 5 A Alanin Y Tyrosin I H Histidin | Q Glutamin 10 N Asparagin K Lysin D Asparaginsyre E Glutaminsyre C Cystein 15 W Tryptophan R Arginin G Glycin Når en aminosyre p.g.a. sin position midt i aminosyrekæden, der er karak-20 teristisk for et givet peptid, kan have flere betydninger, kan den enten være betegnet med en bindestreg hvis dens betydning kan være vilkårlig, eller ved et lille bogstav, når denne aminosyre kan udvise et antal foretrukne betydninger, og dette antal imidlertid altid er større end 1. I sidstnævnte tilfælde er de mulige betydninger af det lille bogstav altid angivet i 25 forbindelse med det peptid, som det tilhører.
For at lette læsningen bliver disse peptider også betegnet med en forkortelse env efterfulgt af et tal, ved reference til de indeholdte aminosyrer efter omstændighederne, i env-proteinerne i visse typer af HIV-1, HIV-2 eller 30 SIV. Dette omtales nærmere nedenfor.
I de efterfølgende definitioner betegner grupperne X enten en fri NHr gruppe eller en amideret gruppe især med en eller to alkylgrupper inde- 11 DK 174705 B1 holdende 1 -5 carbonatomer, eller en peptidgruppe, der indeholder 1 -5 aminosyrer, hvor den N-terminale aminosyre selv udviser en fri NH2-gruppe eller amidgruppe, som angivet tidligere, og grupperne Z betegner enten en fri -OH-gruppe eller alkoxygruppe og indeholder så en alkylgrup-5 pe omfattende 1-5 carbonatomer, eller en peptidgruppe omfattende 1-5 aminosyrer, hvis C-terminale aminosyre selv udviser en fri -OH-gruppe eller alkoxygruppe, som angivet ovenfor, idet de grupper på 1-5 aminosyrer, der eventuelt indgår i X eller Z eller i begge er sådanne, hvis tilstedeværelse ikke er inkompatibel med bevarelsen i hovedsagen af de immuno-10 logiske, eventuelt immunogene egenskaber ved de peptider, som de er fjernet fra.
Peptiderne ifølge opfindelsen, som har immunologiske egenskaber fælles med antigener fra HIV-2 og for visse af dem endvidere med antigener fra 15 HIV-1 eller varianter deraf, er kendetegnet ved, at de ligeledes har en peptidstruktur fælles med antigener fra SIV. Med fordel omfatter disse peptider normalt højst 40 aminosyrerester.
Foretrukne peptider er de følgende: 20 env1
XRV-AIEKYL-DQA-LN-WGCAFRQVCZ
env2 25 X-LE-AQI-QQEKNMYELQKLNZ env3
XELGDYKLVEITPIG-APT-KR----Z
30 env4
X—VTV-Y G VP-WK-AT-LF C A-Z
, DK 174705 B1 12 env5 X—QE-L-NVTE-F-W-NZ env6
5 XL—S-KPCVKLTPLCV--Z
env7
| X—N-S-IT--C-K—Z
10 env8 X-l—YC-P-G-A-L-C-N-TZ env9
X-----A-C-----W-Z
15
env1Q
X-G-DPE---NC-GEF-YCN-----NZ
env11
20 X—C-IKQ-I----G—YZ
Nærmere bestemt angår opfindelsen følgende peptider: env1 25 XRV-AIEKYL-DQA-LN-WGCAFRQVCZ env2 X-LE-AQIQQEKNMYELQKLNZ 30 env3
XELGDYKLVEITPIG-APT-KR----Z
env4 13 DK 174705 B1 X—VTV-YGVP-W-AT-LF CA-Z env5 X—E--L-NVTE-F-W-NZ 5 env6 XL—S-KPCVKL-PLC—Z env7 10 X—N-S-l— C-K—Z env8
X-l—YC-P-G-A-L-C-N-TZ
15 env9
X----A-C----W-Z
env10
Z-G-DPE----NC-GEF-VC---NZ
20 env11
X—C-l-Q-l----G—YZ
Særligt fordelagtige peptider svarende til de foregående udviser de føl-25 gende formler: env1 XRVTAIEKYLQDQARLNSWGCAFRQVCZ, eller XRVTAIEKYLKDQAQLNAWGCAFRQVCZ 30 env2
XSLEQAQIQQEKNMYELQKLNSWZ, eller XLLEEAQIQQEKNMYELQKLNSWZ
14 DK 174705 B1 env3 ! XELGDYKLVEITPIGFAPTKEKRYSSAHZ, eller
5 XELGDYKLVEITPIGLAPTNVKRYTTG-Z
Man bemærker, at peptiderne env1. env2. env3 bekræfter den meget store lighed mellem HIV-2 og SIV-1. Faktisk er det første peptid inkluderet i HIV-2 genomet og det andet i SIV-1 genomet.
10 env4
XabsdVTVeYGVPfWogAThiLFCAjZ, hvori bogstaverne a-j og o kan have følgende betydninger: 15
a er C, E eller D b er T, K, D, N eller I c er Q eller L d er Y eller W 20 e er F eller Y f er T, V eller A g er N eller E h er I eller T i er P eller T 25 j er T eller S o er K eller R
env5
XabcoEdeLfNVTEgFhiWjNZ, 30
hvori bogstaverne a-j og o kan have de følgende betydninger: a er D eller P
15 DK 174705 B1
b er D eller N c er Y eller P
d er I, V, I eller L 5 e er T, V, E eller A f er V, G eller E eller -g er A, N, G eller S h er D eller N i er A eller M 10 j er N,K eller E o er Q eller S
env6 XLabcSd KPCVKLoP LCuef KZ, 15 hvori bogstaverne a-f, o og u kan have følgende betydninger:
a er F eller W b er E eller D 20 c er T eller Q d er I eller L e er A, S eller T f er M eller L o er T eller S 25 u er V eller I
env7
XabCNxSylocdCeKfghiZ, 30 hvori bogstaverne a-i og x og y kan have følgende betydninger:
a er N eller T eller I b er H eller S eller N
16 DK 174705 B1
c er E eller Q d er S, A eller C
e er D eller P 5 f er H, Veller D g er Y eller S h er W eller F i er D eller E X er T eller R 10 y er Veller A
0 er T eller Q
env8
XalbcdYCxPeGfAgLhCiNjTZ, 15 hvori bogstaverne a-k og x kan have følgende betydninger:
a er A eller P b er R eller P 20 c er F, I eller C d er R eller H e er P eller A f er Y eller F g er L eller I 25 h er R eller K
1 er - eller N
j er D eller K x er A eller T
30 env9
XwabcxyAdCefghizWjkZ, hvori bogstaverne a-k og x-z kan have følgende betydninger: 17 DK 174705 B1
a er K eller - eller E b er R eller -5 c er P eller M eller I d er Weller H eller Y e er W eller N eller T eller R f er F eller I
g er K eller S eller N eller G 10 h er G eller R eller E i er - eller A eller T j er K eller N eller D eller S k er D eller A eller N eller K eller E w er N, D eller I 15 x er R eller G eller K y er Q eller K eller R z er K eller E eller Q eller N
env10 20 XaGbDPEcdefghNCiGEFjYCokxImnNZ, hvori bogstaverne a-n og x kan have følgende betydninger:
a er K eller - eller G 25 b er S eller G eller -c er V eller I d er A eller V eller T e er Y eller T eller M eller F f er M eller H 30 g er W eller S h erT eller F i er R eller G j er L eller F
18 DK 174705 B1
0 er N eller K k er M eller S
1 er W eller Q eller K eller G 5 m er F eller L
n er L eller F x er T eller S eller N
i env11 10 XabcdwCeloQflxgyhizGjklYZ, hvori bogstaverne a-l og w-z kan have følgende betydninger:
a er R eller T eller S eller N 15 b er N eller I c er Y eller T d er A eller L eller V e er H eller R
i f er I eller F
20 g er T eller M
h er H eller Q eller A i er K eller E j er R eller K k er N eller A 25 I er V eller M w er P eller Q x er N eller K y er W eller V z er V eller T eller K 30 o er K eller R
Det skal generelt bemærkes, at de aminosyrer, der har en entydig betydning (og som således er repræsenteret af et stort bogstav svarende det 19 DK 174705 B1 internationale nomenklatur), og som indgår i de definitioner for peptiderne ifølge opfindelsen, der er angivet ovenfor, viser sig at korrespondere med identiske aminosyrer placeret i samme rækkefølge i de korresponderende sekvenser i mindst en HIV- eller SIV-1 virus.
5
Positionerne af disse sekvenser er understreget og fordelt inde i aminosy-resekvenserne i eny-proteinerne for henholdsvis HIV-2 ROD (CNCM nr. I-532) og HIV-1 BRU (CNCM nr. I-232) vist på fig. 2. Rækkefølgen af ami-nosyrerne i env- og gag-proteinerne for henholdsvis SIV-1 mac (CNCM nr.
10 1-521) og af HIV-2 ROD vist på fig. 3 og fig. 4.
De ubrudte linier, der er vist på visse steder af disse sekvenser, skal understrege, at visse aminosyrer indeholdt i disse sekvenser er frivilligt udeladt på præsentationen for at muliggøre, at identiske aminosyrer bringes 15 på linie (markeret med en stjerne), eller at to vertikale punkter på en og samme vertikale linie i de korresponderende proteinsekvenser fra på den ene side HIV-1 og HIV-2 og på den anden side SIV og HIV-2.
Bortset fra de ovennævnte peptider angår opfindelsen ligeledes peptider, 20 der er modificeret ved indsætning og/eller udeladelse og/eller substitution af en eller flere aminosyrer, så længe de antigene eller immunogene egenskaber af disse peptider ikke modificeres, eller at genkendelsesegenskaberne for antigenet eller antistoffet hos disse peptider ikke er væsentligt modificeret.
25 I en særligt foretrukken udførelsesform angår opfindelsen peptider, der har immunologiske egenskaber fælles med peptidskelettet i kappeglycoprotei-net fra virus af klasse HIV-2, idet disse peptider indeholder et antal amino-syrerester, der ikke overstiger 40.
30
Disse foretrukne peptider ifølge opfindelsen udviser følgende sekvenser: env1 20 DK 174705 B1
RVTAIEKYLQDQARLNSWGCAFRQVC
AIEKYLQDQ
RVSAIEKYLKDQAQLNAWGCAFRQVC
AIEKYLKDQ
5 env2
SLEQAQIQQEKNMVELQKLNSW
QIQQEKN
LLEEAQIQQEKNMYELQKLNSW
10 env3
ELGDYKLVEITPIGFAPTKEKRYSSAH
YKLVEITPIGFAPTKEK
ELGDYKLVEITPIGLAPTNVKRYTTG-
15 YKLVEITPIGLAPTNVK
env4
CTQYVTVFYGVPTWKNATIPLFCAT VTVF Y G VPTWKN AT
20 CIQYVTVFYGVPAWRNATIPLFCAT VTVFYGVPAWRNAT
EKLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCAS VTVYY G VP VWKE AT
25 E DL WVTVYY G VP VWKEATTTLF C AS VTVYY G VP VWKE AT
D N L WVTVYY G VP VWKEATTTLFC AS VTVYYGVPVWKEAT
30 env5
DDYQEITL-NVTEAFDAWNN
L-NVTEAF
21 DK 174705 B1
DDYSELAL-NVTESFDAWEN
L-NVTESF
PNPQEWLVNVTENFNMWKN
LVNVTENF
5 PNPQEIELENVTEGFNMWKN LENVTEGF
PNPQEIALENVTENFNMWKN
LENVTENF
10 env6
ETSIKPCVKLTPLCVAMK ETSIKPCVKLSPLCITMR DQSLKPCVKLTPLCVSLK DQSLKPCVKLTPLCVTLN 15 PCVKLTPLCV
env7
NHCNTSVITESCD
NTSVIT
20 NHCNTSVIQECCD NTSVIQ
TSCNTSVITQACP
NTSVIT
INCNTSVITQACP 25 NTSVIT
INCNTSAITQACP
NTSAIT
env8
30 YCAPPGYALLRC-NDT YCAPAGFAILKCNNKT YCAPAGFAILKCNDKK YCAPAGFAILKCRDKK
22 DK 174705 B1 env9
NKRPRQAWCWFKG-KWKD NERPKQAWCRFGG-NWKE 5 N-MRQAHCNISRAKWNA D-IRRAYCTINETEWDK l-IGQAHCNISRAQWSK
env10
10 KGSDPEVAYMWTNCRGEFLYCNMTWFLN NCRGEFLYCN
GG-DPEVTFMWTNCRGEFLYCKMNWFLN
NCRGEFLYCK
-GGDPEIVTHSFNCGGEFFYCNSTQLFN 15 NCGGEFFYCN
-GGDPEITTHSFNCRGEFFYCNTSKLFN
NCRGEFFYCN
-GGDPEITTHSFNCGGEFFYCNTSGLFN
NCGGEFFYCN
20 env11
RNYAPCHIKQIINTWHKVGRNVY
CHIKQII
RNYVPCHIRQIINTWHKVGKNVY 25 CHIRQII
TITLPCRIKQFINMWQEVGKAMY
CRIKQFI
SITLPCRIKQIINMWQKTCKAMY 30 CRIKQII
NITLQCRIKQIIKMVAGR-KAIY
CRIKQII
23 DK 174705 B1
Peptiderne ifølge opfindelsen kan med fordel fremstilles ved de klassiske metoder inden for peptidsyntese. Denne syntese kan gennemføres i homogen opløsning eller i fast fase.
5 F.eks. kan man anvende synteseteknikken i homogen opløsning beskrevet af HOUBEN-WEYL i "Methode der Organischen Chemie", Ed. E. Wunsch, vol. 15-1 og II., THIEME, Stuttgart 1974.
Ved denne metode kondenserer man successivt to og to de successive 10 aminoacylgrupper i den krævede rækkefølge eller man kondenserer ami-noacylgrupper og foruddannede fragmenter, der allerede indeholder flere aminoacylgrupper i den rigtige rækkefølge, eller flere således tidligere fremstillede fragmenter, idet det er underforstået, at man forinden har ta-! get højde for at beskytte alle de reaktive grupper på disse aminoacylgrup- 15 per eller fragmenter, bortset fra de aminogrupper i den ene og de carbo-xylgrupper i den anden eller vice-versa, som normalt skal indgå i dannelsen af peptidbindinger, især efter aktivering af carboxylgruppen ved velkendte metoder inden for peptidsyntese. Som variant kan man udnytte koblingsreaktioner, hvor der gøres brug af klassiske koblingsmidler af car-20 bodiimidtypen, som f.eks. 1-ethyl-3-(3-dimethyl-amino-propyl)-carbodiimid.
Når den anvendte aminoacylgruppe udviser en supplerende syrefunktion, især når der er tale om glutaminsyre, kan disse være grupper være beskyttet, f.eks. med t-butylester-grupper.
25 Ved progressive synteser aminosyre efter aminosyre begynder syntesen fortrinsvis med en kondensation af den C-terminale aminosyre med den aminosyre, der svarer til det nabostillede aminoacyl i den ønskede sekvens og så fremdeles indtil den N-terminale aminosyre. Ved anden fore-trukken teknik ifølge opfindelsen anvender man metoden beskrevet af 30 R.D. Merrifield, "Solid phase peptide synthesis" (J. Am. Soc., 45, 2149-2154).
24 DK 174705 B1 i
For at fremstille en peptidkæde efter Merrifield-metoden anvender man en meget porøs polymer resin, hvorpå man fikserer den første C-terminale aminosyre i kæden. Denne aminosyre fikseres på resinet ved hjælp af sin carboxylgruppe, mens dens aminogruppe er beskyttet, f.eks.
5 med en t-butyloxycarbonylgruppe.
, Når den første C-terminale aminosyre således er fikseret på resinen, fjer ner man beskyttelsesgruppen på aminogruppen og ved at vaske resinen med en syre.
10 Når beskyttelsesgruppen for aminogruppen er t-butyloxycarbonyl, kan den fjernes ved behandling af resinen med trifluoreddikesyre.
Man kobler derpå den anden aminosyre, der leverer det andet aminoacyl i 15 den tilstræbte sekvens ud fra den C-terminale aminoacyl, til den debeskyt-tede aminogruppe i den første C-terminale aminosyre fikseret til resinen.
Fortrinsvis er carboxylgruppen i den anden aminosyre aktiveret, f.eks. med dicyclohexylcarbodiimid, og aminogruppen er beskyttet, f.eks. med t-20 butyloxycarbonyl.
Man opnår således den første del af den tilstræbte peptidkæde, der omfatter to aminosyrer, og hvis terminale aminogruppe er beskyttet. Som tidligere debeskytter man aminogruppen og man kan derpå fortsætte med fikse-25 ring af det tredje aminoacyl under analoge betingelser med dem, der anvendtes ved additionen af den anden C-terminale aminosyre.
Man fikserer således den ene efter den anden af de aminosyrer, der skal udgøre peptidkæden, til aminogruppen, der hver gang forinden er de-30 beskyttet, til den allerede dannede del af peptidkæden, som er bundet til resinen.
25 DK 174705 B1 Når hele den ønskede peptidkæde er dannet, fjerner man beskyttelsesgrupperne på de forskellige aminosyrer, der udgør peptidkæden, og man frigør peptidet fra resinen, f.eks. ved hjælp af flussyre.
5 Opfindelsen angår ligeledes vandopløselige oligomere af de ovennævnte monomere peptider. Oligomeriseringen kan fremkalde en forøgelse af immunogen iciteten af de monomere peptider ifølge opfindelsen. Uden at denne talangivelse skal opfattes som begrænsende, kan man ikke desto mindre nævne, at disse oligomere f.eks. kan indeholde 2-10 monomeren-10 heder.
Monomerenhedeme, der indgår i denne oligomer, udgøres enten alle af polypeptidet fra sekvens 1 eller af polypeptidet fra sekvens 2 eller af det ene eller det andet af disse polypeptider.
15
Man kan også til gennemførelse af oligomeriseringen anvende enhver sædvanlig polymerisationsteknik inden for peptidkemien, idet denne polymerisation gennemføres, indtil man opnår en oligomer eller polymer, der | indeholder det krævede antal monomere enheder til opnåelse af den øn- 1 20 skede immunogenicitet.
En metode til oligomerisation eller polymerisation af den monomere består i at omsætte denne med et tværbindingsmiddel, såsom glutaraldehyd.
25 Man kan også anvende andre oligomerisations- eller koblingsmetoder, f.eks. den metode, der gør brug af successive koblinger af monomerenhederne ved hjælp af deres terminale carboxyl- og aminogrupper i nærværelse af bifunktionelle homo- eller heterokoblingsmidler.
30 Man kan ligeledes til fremstilling af molekyler omfattende en eller flere enheder af de ovennævnte 17 aminosyrer anvende de genteknologiske metoder, der gør brug af mikroorganismer, der er transformeret med en given 26 DK 174705 B1 nucleinsyre, og som omfatter de passende korresponderende nucleotidsekvenser.
I forbindelse med opfindelsen er der tilvejebragt nucleinsyrer, der indehol-5 der en eller flere sekvenser afledt af cDNA-sekvensen for HIV-2 ROD-virus. Disse sekvenser, der er markeret med den nummerering, der figurerer på den ovenfor beskrevne sekvens, koder for visse interessante peptider ifølge opfindelsen.
10 Sekvens, der koder for env1 nucleotid 7850 - 7927 - - - env2 - 8030-8095 - - - env3 - 7601 -7636 - - - env4 - 6170-6247 - - - env5 - 6294-6349 15 - - - - env6 - 6392 - 6445 . . . env7 - 6724 - 6763 - - - env8 - 6794-6838 - - - env9 - 7112-7162 - - - env10- 7253-7336 20 - --- env11- 7358-7426
De korresponderende nucleinsyrer fra SIV-virus indeholder ligeledes en eller flere sekvenser afledt af cDNA fra SIV-1 -virus. Disse sekvenser, der koder for peptiderne env1-env11 kan lokaliseres på fig. 3 ved sammenlig-25 ning med de korresponderende sekvenser, der er beskrevet for HIV-2.
Når de immunogene midler er konjugeret med et bæremolekyle som angivet i krav 24 opnås dette ved kovalent kobling af peptiderne ifølge opfindelsen (eller de nævnte oligomere) til naturlige eller syntetiske fysiologisk 30 acceptable og ikke-toksiske bærermolekyler, ved hjælp af komplementære reaktive grupper, der henholdsvis bæres af bærermolekylet og peptidet.
Eksempler på passende grupper er illustreret i det følgende: i 27 DK 174705 B1
Som eksempler på bærermolekyler eller makromolekylære bærere, der ! kan indgå i konstitutionen af konjugater ifølge opfindelsen, kan man nævnte naturlige proteiner, såsom tetanus anatoxin, ovalbumin, serumalbuminer, hæmocyaminer etc.
5
Som eksempler på syntetiske bærermolekyler kan man f.eks. nævne poly-lysiner eller poly(D-L-alanin)-poly(L-lysin).
i i I litteraturen nævnes andre typer anvendelige makromolekylære bærere, 10 og disse udviser i reglen en molekylvægt på over 20 000.
For at syntetisere konjugateme ifølge opfindelsen kan man anvende i og for sig kendte metoder, f.eks. som beskrevet af FRANTZ and ROBERTSON, Infect, and Immunity, 33, 193-198 (1981), eller P.E. KAUFFMAN, 15 Applied and Environmental Microbiology, (October 1981), vol. 42, nr. 4, 611-614 idet man anvender et passende peptid og bærermolekyle.
I praksis anvender man med fordel som koblingsmiddel f.eks. følgende forbindelser: glutaraldehyd, ethylchlorformiat, vandopløselige carbodiimi-20 der, såsom N-ethyl-N' -(3-dimethylaminopropyl)-carbodiimid, HCl, diiso-cyanater, bis-diazobenzidin, di- og trichlor-s-triaziner, cyanogenbromid samt de koblingsmidler, der er nævnt i Scand. J. Immunol., (1978), vol. 8, p. 7-23 AVRAMEAS, TERNYNCK, GUESDON).
25 Man kan anvende en hvilken som helst koblingsproces, hvor der gøres brug af en eller flere reaktive grupper i peptidet og en eller flere reaktive grupper i bærermolekyleme. Med fordel drejer det sig om carboxyl- og aminogrupper, der kan give anledning til en koblingsreaktion i nærvær af et koblingsmiddel af den type, der anvendes ved proteinsyntese, f.eks. 1-30 ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)-carbodiimid, N-hydroxybenzotriazol etc.
Man kan også anvende glutaraldehyd, især når det drejer sig om indbyrdes at forbinde aminogrupper, der henholdsvis sidder på peptidet og bærermolekylet.
28 DK 174705 B1
Peptiderne ifølge opfindelsen udviser antigeniske egenskaber. De kan således anvendes ved diagnostiske metoder til detektering af en infektion med HIV-2 virus.
5
Som nævnt tidligere har undersøgelser gjort det muligt at skelne mellem to grupper af peptider, der kan anvendes ved fremgangsmåder til detektering af antistoffer mod HIV-2 virus i humane biologiske væsker, især serum eller cephalospinalvæske.
10
En gruppe omfatter peptider, der nærmere bestemt svarer til de peptider, der er placeret i den transmembrane del og ved enden af den udvendige del af kappeproteinet. Disse proteiner er ovenfor betegnet env1. env2 og env3. De muliggør en specifik genkendelse af tilstedeværelsen af antistof-15 fer mod HIV-2 og muliggør således en diskrimination mellem overståede ! eller tilstedeværende infektioner p.g.a. HIV hos en person, nærmere en bestemt en diskrimination mellem infektioner, som var provokeret af HIV-2 og infektioner, som var provokeret af HIV-1.
20 Opfindelsen angår ligeledes et antigent middel, der indeholder mindst et af de ovennævnte peptider eller mindst en oligomer af et sådant peptid, som er ejendommeligt ved, at det har evnen til at kunne genkendes af serum af human oprindelse, der indeholder antistoffer mod HIV-2.
25 Opfindelsen angår endvidere en fremgangsmåde til in vitro at diagnosticere et eller flere peptider ifølge opfindelsen for at kunne detektere antistoffer mod HIV-2 i biologiske væsker, især human serum.
Mere generelt omfatter in vitro diagnosemetoden følgende trin: 30
Den biologiske væske bringes i kontakt med peptiderne, i 29 DK 174705 B1 den eventuelle tilstedeværelse af et peptid-antistofkompleks detekteres ved fysiske eller kemiske metoder i den biologiske væske.
I en foretrukken udførelsesform for fremgangsmåden ifølge opfindelsen 5 gennemføres detekteringen af antigen-antistofkomplekset ved hjælp af immunoenzymatiske prøver (af typen ELISA), immunofluorescensmetoder (af typen IFA), radioimmunologiske metoder (af typen RIA) eller radioim-munopræcipiteringsmetoder (af typen RIPA). Således angår opfindelsen ligeledes ethvert peptid ifølge opfindelsen, der er mærket ved hjælp af en 10 passende markør, f.eks. en enzymatisk, fluorescerende eller radioaktiv markør.
Sådanne metoder omfatter f.eks. følgende trin: 15 afsætning af fastlagte mængder af et peptidholdigt middel ifølge opfindelsen i brøndene i en mikrotiterplade, anbringelse af stigende fortyndinger af det serum, der skal diagnosticeres, i brøndene, 20 inkubering af mikrotiterpladen og gentagne skylninger af denne, indføring i brøndene af et mærket antistof mod immunglobulinerne i blodet, hvor mærkningen af disse antistoffer kan være gennemført ved hjælp af et 25 enzym valgt blandt enzymer, der er i stand til at hydrolysere et substrat ved at modificere absorptionen af dettes stråling, i det mindste ved en fastlagt bølgelængde, detektering ved sammenligning med en kontrolprøve af den hydrolyserede 30 mængde substrat.
Opfindelsen angår ligeledes kit til in vitro diagnose af tilstedeværelsen af antistoffer mod HIV-2 virus i et biologisk medium, som omfatter: 30 DK 174705 B1 et peptidisk middel ifølge opfindelsen, reagenser til tilvejebringelse af en sammensætning af mediet, der er hen-5 sigtsmæssig for gennemførelsen af den immunologiske reaktion, reagenser, der muliggør en detektering af antigen-antistofkomplekset dan-j net ved den immunologiske reaktion. Sådanne reagenser kan ligeledes være forsynet med en markør eller være i stand til at kunne genkendes af 10 et mærket reagens. Dette er især tilfældet, når det ovennævnte peptidiske middel ikke er mærket.
- en biologisk referencevævsvæske fri for antistoffer, der genkendes af det ovennævnte peptidiske middel.
15
Der kan dannes antistoffer mod peptiderne ifølge opfindelsen, og denne produktion er ikke begrænset til polyklonale antistoffer.
Den finder ligeledes anvendelse på et hvilket som helst monoklonalt anti-20 stof produceret af ethvert hybridom, der kan dannes ved klassiske metoder ud fra miltceller fra et dyr, især mus eller rotter, der er immuniseret med et af peptiderne ifølge opfindelsen, og celler fra en passende myelo- i macellelinie, og som kan udvælges pga. sin evne til at producere mo- ' noklonale antistoffer, der genkender det peptid, der oprindeligt blev an-25 vendt til immuniseringen af dyret.
Opfindelsen angår endvidere immunogene midler til fremstilling af vacciner, hvis aktive bestanddel består af mindst et peptid ifølge opfindelsen eller en oligomer af et sådant peptid eller et peptid, der er konjugeret med 30 et bæremolekyle, og som er ejendommeligt ved, at de inducerer dannelsen af antistoffer mod disse peptider i tilstrækkelig mængde til også at in-hibere proteiner fra HIV-2 retrovirus, ja endog selve HIV-2 retrovirus i association med en farmaceutisk acceptabel bærer.
I DK 174705 B1 i 31
De immunogene midler til fremstilling af vacciner omfatter fordelagtigt nærmere bestemt mindst et af de peptider, der ovenfor betegnedes env4. env5. env6. env7. env8. env9. env10. envil eller blandinger heraf. Blandt 5 disse peptider, der er velegnede til at udgøre aktive bestanddele i vacciner, er visse særligt foretrukne, fordi de udviser en basal aminosyrestruk-tur, der svarer til regioner i kappeglycoproteiner, der udviser en høj grad af konservering, ikke blot i HIV-2 og i SIV, men også i HIV-1 virus. Disse peptider, der er særligt foretrukne, er de peptider, der betegnes env4. og visse 10 af peptiderne env5. env6 og env10.
I en foretrukken udførelsesform for opfindelsen vælges de immunogene peptider eller fragmenter af disse, der er velegnede som aktive bestanddele i vacciner, blandt de formler, der svarer til sekvenserne som i kappegly-15 coproteinerne fra HIV-2, SIV og HIV-1, udviser en aminosyrehomologi der er over 50%, og som hører til den eksterne del af kappen af virus, og som er fri for eller næsten fri for deletioner, og som indeholder cysteinrester, der fremmer stabiliteten af bindingerne og dannelsen af "hårnåle".
20 De efterfølgende peptider tilhører denne kategori af foretrukne peptider.
env4
XVTV-YGVP-W-ATZ
25 env5
XL-NVTE-FZ
env6
XKPCVKL-PLC-Z
30 env7
XN-S-I-Z
32 DK 174705 B1 env10
XNC-GEF-YC-Z
env11
5 XC-I-Q-IZ
Fordelagtige farmaceutiske midler består af injicerbare opløsninger, suspensioner eller liposomer, der indeholder en effektiv dosis af mindst et produkt ifølge opfindelsen. Fortrinsvis tilvejebringes disse opløsninger, 10 suspensioner eller liposomer i en steril isotonisk vandfase, fortrinsvis en fysiologisk saltopløsning eller glucoseopløsning.
Der anvendes nærmere bestemt sådanne suspensioner, opløsninger eller liposomer, der er i stand til at indgives ved intradermisk, intramuskulær 15 eller subkutan injektion eller ved kopsætning.
Farmaceutiske midler, kan også indgives på anden måde, især oralt.
Farmaceutiske midler, der kan anvendes som vacciner, kan for at være 20 effektive ved dannelsen af antistoffer mod HIV-2 virus f.eks. indgives i doser på10-500 pg/kg af peptiderne ifølge opfindelsen, fortrinsvis 50-100 pg/kg.
Disse doser er kun anført som eksempler og skal ikke opfattes som be-25 grænsende.
Som anført ovenfor kan de forskellige nærmere definerede peptider omfatte modifikationer, der ikke har til virkning, at de immunologiske egenskaber modificeres på fundamental vis. De ækvivalente peptider, der derved op-30 nås, er omfattet af de efterfølgende patentkrav. Som eksempel på ækvivalente peptider kan man nævne peptider, hvis strukturer svarer til cDNA regioner i andre varianter af HIV-2, SIV eller HIV-1, når disse regioner bringes på linie under de betingelser, der svarer til de ovenfor angivne i 33 DK 174705 B1 forbindelse med HIV-2 ROD, SIV og HIV-1 BRU. Som eksempler på andre af disse peptider kan man nævne peptider, hvis struktur svarer til de regioner i cDNA, der er deponeret ved CNCM, især med numrene I-502, I-642 (HIC-2 IRMO) og I-643 (HIV-2 EHO) samt i visse tilfælde varianter af 5 HIV-1, der er deponeret ved CNCM med numrene I-232, I-240, 1-241, I-550 og 1-551.
Peptiderne ifølge opfindelsen kan også defineres ved de efterfølgende formler, hvori X, Z og bindestregerne har de ovenfor angivne betydnin-10 ger:
XRV-AIEKYL-DQA-LN-WGCAFRQVCZ
XAIEKYL-DZ
15 X-LE-AQIQQEKNMYELOQKLNSWZ XQIQQEKNZ
XELGDYKLVEITPIG-APT—KR--Z
XYKLVEITPIG-APT—KRZ
20
X—VTV-Y G VP-W-AT--LF C A-Z XVTV-YGVP-W—ATZ
X—E--L-NVTE-F--W-NZ 25 XL-NVTE-FZ
XL—S-KPCVKL-PLC—Z XKPCVKL-PLC-Z XS-KPC VKL-P LC-Z 30
X—N-S-l—C-Z XN-S-I-Z
34 DK 174705 B1
XYC-P-G-A-L-C-N-TZ
X----a-C-----W~Z
5 NKRPRQAWCWFKG-KWKD
X-G-DPE-----NC-GEF-YC-----NZ
X—C-l-Q-l----G—YZ
10
Opfindelsen angår ligeledes foruden de allerede beskrevne SIV peptider proteiner, som kodes for af cDNA fra SIV virus. De angår ligeledes proteiner fra enhver immunologisk virus, der i immunologisk henseende er nært i beslægtet med SIV-1 mac, specielt enhver virus, hvis kappeproteiner og - 15 glycoproteiner udviser immunologisk overkrydsning, og hvis cDNA udviser i en homologiprocent på mindst 95%, fortrinsvis mest 98%.
Specielt angår opfindelsen kappeproteiner og -glycoproteiner, der kodes for af env-qenet. og som er vist på fig. 3, 1 20
Aminosyrerne i de ovennævnte SIV-proteiner er vist på linie med aminosy-resekvenserne fra de korresponderende proteiner fra HIV-2 virus; de verti-| kale punkter, der figurerer mellem de to sekvenser, svarer til aminosyrer, ! der er fælles for proteinerne fra de to virus.
25 I · ' De cDNA sekvenser der koder for de ovennævnte proteiner, er vist pa fig.
ΊΒ.
Disse cDNA sekvenser lokaliseret ved den nummerering, der figurerer på de tidligere beskrevne sekvenser (figur 1B) er følgende: 30 - sekvens der koder for GAG, nucleotider 551-2068 - ........POL, " 1726-4893 - ........Q, " 4826-5467 35 DK 174705 B1 - ...... " X, " 5298- 5633 - ........R, *' 5637-5939 | - ........F, " 8569-9354 5 - ........TAT-1, " 5788-6084 - ........ART-1, " 6014-6130 - ........TAT-2, " 8296-8391 - ........ART-2, " 8294-8548 - ........ENV, " 6090-8732 10
Opfindelsen angår således naturligvis de tidligere beskrevne proteiner, hvad enten de er opnået ud fra SIV virus, eller de er fremstillet af syntetisk vej, især ved hjælp af de metoder, der er nævnt ovenfor i forbindelse med syntese af mindre peptider.
15
Opfindelsen angår ligeledes anvendelsen af de foregående proteiner til diagnose af den eventuelle tilstedeværelse af antistoffer rettet mod HIV-2 proteiner, ja endog mod hele HIV-2 eller for visse af disses vedkommende anvendelsen til diagnose af en infektion pga. en HIV virus. Proteinerne 20 ENV anvendes fortrinsvis til specifik diagnose af en infektion med HIV-2 eller en variant deraf, og sommetider til diagnose af en infektion af HIV-2 eller HIV-1.
Opfindelsen angår således ligeledes en in vitro diagnosemetode til detek-25 tering af antistoffer mod HIV-2 og eventuelt mod HIV-1 i biologiske væsker og især i human serum. Sådanne fremgangsmåder, der er anvendelige til anvendelse af de ovennævnte SIV-proteiner som diagnostiske proteiner, er beskrevet tidligere.
30 Opfindelsen angår således også kits til in vitro diagnose af tilstedeværelsen af antistoffer mod HIV-2 virus og også i tilfælde mod HIV-1 virus i et biologisk medium. Sådanne kits, der gør brug af de ovennævnte peptider, er ligeledes beskrevet ovenfor.
36 DK 174705 B1
Endvidere angår opfindelsen immunogene midler til produktion af vacciner, hvis aktive bestanddel består af i det mindste en del af proteinet ENV fra SIV-virus, idet dette protein også kan være konjugeret med et bærer-5 molekyle. Disse immunogene midler inducerer dannelsen af antistoffer mod dette peptid i tilstrækkelig mængde til at inhibere proteiner fra HIV-2 retrovirus eller endog selve HIV-2 retrovirus.
10 i j

Claims (29)

1. Peptid, der udviser immunologiske egenskaber fælles med peptidskelettet i kappeglycoproteinet i virus af typen HIV-2, kendetegnet ved, at 5 det ligeledes udviser en peptidstruktur, der er fælles med peptidskelettet i glycoproteinet fra SIV-1 virus.
2. Peptid ifølge krav 1,kendete g-n et ved, at antallet af aminosyrer ikke overstiger 40. 10
3. Peptid ifølge krav 2, kendetegnet ved, at det udviser en af de almene formler: XRV-AIEKYL-DQA-LN-WGCAFRQVCZ 15 XAIEKYL-DZ hvori X og Z er OH- eller NHrgrupper, eller når de immunologiske egenskaber af peptider befriet for disse grupper ikke modificeres væsentligt, kan X og Z betegne grupper omfattende 1-5 aminosyrerester, og hver af 20 bindestregerne betegner en aminoacylrest valgt blandt sådanne, som muliggør, at det angivne peptid bevarer de immunologiske egenskaber fra en af følgende sekvenser: RVTAIEKYLQDQARLNSWGCAFRQVC 25 AIEKYLQDQ RVSAIEKYLKDQAQLNAWGCAFRQVC AIEKYLKDQ
4. Peptid ifølge krav 2, kendetegnet ved, at det udviser en af de al-30 mene formler: X-LE-AQIQQEKNMYELQKLNSWZ XQIQQEKNZ | DK 174705 B1 hvori X og Z er OH eller NH2-grupper, eller når de immunologiske egenskaber af peptider befriet for disse grupper ikke modificeres væsentligt, | kan X og Z betegne grupper omfattende 1-5 aminosyrerester, og hver af ! 5 bindestregerne betegner en aminoacylrest valgt blandt sådanne, som mu liggør, at det angivne peptid bevarer de immunologiske egenskaber fra en af de følgende sekvenser: SLEQAQIQQEKNMYELQKLNSW 10 QIQQEKN LLEEAQIQQEKNMYELQKLNSW
5 RNYAPCHIKQIINTWHKVGRNVY CHIKQII RNYVPCHIRQIINTWHKVGKNVY CHIRQII TITLPCRIKQFINMWQEVGKAMY 10 CRIKQFI SITLPCRIKQIINMWQKTCKAMY CRIKQtl NITLQCRIKQIIKMVAGR-KAIY CRIKQII 15
5. Peptid ifølge krav 2, kendetegnet ved, at det udviser en af de almene formler: 15 XELGDYKLVEITPIG-APT-KR----Z XYKLVEITPIG-APT-KRZ hvori X og Z er OH- eller NH2-grupper, eller når de immunologiske egen-20 skaber af peptider befriet for disse grupper ikke modificeres væsentligt, kan X og Z betegne grupper omfattende 1-5 aminosyrerester, og hver af bindestregerne betegner en aminoacylrest valgt blandt sådanne, som muliggør, at det angivne peptid bevarer de immunologiske egenskaber fra en af de følgende sekvenser: 25 ELGDYKLVEITPIGFAPTKE KRYSSAH YKLVEITPIGFAPTKEK ELGDYKLVE ITPIGLAPTNVKRYTTG-YKLVEITPIGLAPTNVK 30
6. Peptid ifølge krav 2, kendetegnet ved, at det udviser en af de almene formler: DK 174705 B1 X—VTV-YGVP-W-AT-LFCA-Z XVTV-Y GVP-W--ATZ hvori X og Z er OH eller NH2-grupper, eller når de immunologiske egen-5 skaber af peptider befriet for disse grupper ikke modificeres væsentligt, kan X og Z betegne grupper omfattende 1-5 aminosyrerester, og hver af bindestregerne betegner en aminoacylrest valgt blandt sådanne, som muliggør, at det angivne peptid bevarer de immunologiske egenskaber fra en af de følgende sekvenser: 10 CTQYVTVFYGVPTWKNATIPLFCAT VTVFYGVPTWKNAT CIQYVTVFYGVPAWRNATIPLFCAT VTVFYGVPAWRNAT
7. Peptid ifølge krav 6, kendetegnet ved, at det udviser en af formlerne: 20 CTQYVTVFYGVPTWKNATIPLFCAT VTVFYGVPTWKNAT CIQYVTVFYGVPAWRNATIPLFCAT VTVFYGVPAWRNAT
8. Peptid ifølge krav 2, kendetegnet ved, at det udviser en af de almene formler: DK 174705 B1 X—E--L-NVTE-F--W-NZ XL-NVTE-FZ 5 hvori X og Z er OH eller N^-grupper, eller når de immunologiske egenskaber af peptider befriet for disse grupper ikke modificeres væsentligt, kan X og Z betegne grupper omfattende 1-5 aminosyrerester, og hver af bindestregerne betegner en aminoacylrest valgt blandt sådanne, som muliggør, at det angivne peptid bevarer de immunologiske egenskaber fra en 10 af de følgende sekvenser: DDYQEITL-NVTEAFDAWNN L-NVTE DDYSELAL-NVTESFDAWEN 15 PNPQEWLVNVTENFNMWKN LVNVTE
9. Peptid ifølge krav 8, kendetegnet ved, at det udviser en af formlerne: 20 DDYQEITL-NVTEAFDAWNN L-NVTEAF DDYSELAL-NVTESFDAWEN L-NVTESF
10 -GGDPEITTHSFNCRGEFFYCNTSKLFN NCRGEFFYCN -GGDPEITTHSFNCGGEFFYCNTSGLFN NCGGEFFYCN
10 YCAPPGYALLRC-NDT YCAPAGFAILKCNNKT
10 NHCNTSVITESCD NTSVIT NHCNTSVIQECCD NTSVIQ TSCNTSVITQACP 15 NTSVIT
10. Peptid ifølge krav 2, kendetegnet ved, at det udviser en af de almene formler: DK 174705 B1 XL—S-KPCVKL-PLC—Z XKPCVKLTPLCVZ XS-KPCVKLTPLCVZ 5 hvori X og Z er OH eller NH^grupper, eller når de immunologiske egenskaber af peptider befriet for disse grupper ikke modificeres væsentligt, kan X og Z betegne grupper omfattende 1-5 aminosyrerester, og hver af bindestregerne betegner en aminoacylrest valgt blandt sådanne, som mu-10 liggør, at det angivne peptid bevarer de immunologiske egenskaber fra en af de følgende sekvenser: LFETSIKPCVKLTPLCVAMK LFETSIKPCVKLSPLCITMR 15 LWDQSLKPCVKLTPLCVSLK KPCVKLTPLCV KPCVKLSPLCI SLKPCVKLTPLCV
11. Peptid ifølge krav 10, kendetegnet ved, at det udviser en af de følgende strukturer: LFETSIKPCVKLTPLCVAMK LFETSIKPCVKLSPLCITM R 25 LWDQSLKPCVKLTPLCVSLK LWDQSLKPCVKLTPLCVTLN PCVKLTPLCV KPCVKLSPLCI
12. Peptid ifølge krav 2, kendetegnet ved. at det indeholder basis strukturen: X—N-S-I-- C-Z DK 174705 B1 XN-S-I-Z hvori X og Z er OH eller NH2-grupper, eller når de immunologiske egenskaber af peptider befriet for disse grupper ikke modificeres væsentligt, 5 kan X og Z betegne grupper omfattende 1 -5 aminosyrerester, og hver af bindestregerne betegner en aminoacylrest valgt blandt sådanne, som muliggør, at det angivne peptid bevarer de immunologiske egenskaber fra en af de følgende sekvenser:
13. Peptid ifølge krav 12, kendetegnet ved, at det udviser en af formlerne:
14. Peptid ifølge krav 2, kendetegnet ved, at det har den almene formel: ♦ j I DK 174705 B1 ! i \ 43 ' XYC-P-G-A-L-C-N-TZ hvori X og Z er OH eller NH2-grupper, eller når de immunologiske egenskaber af peptider befriet for disse grupper ikke modificeres væsentligt, 5 kan X og Z betegne grupper omfattende 1-5 aminosyrerester, og hver af bindestregerne betegner en aminoacylrest valgt blandt sådanne, som muliggør, at det angivne peptid bevarer de immunologiske egenskaber fra en I af de følgende sekvenser:
15. Peptid ifølge krav 14, kendetegnet ved, at det har en af formler- ; ne: 15 YCAPPGYALLRC-NDT YCAPAGFAILKCNNKT YCAPAGFAILKCNDKK YCAPAGFAILKCRDKK 20
15 EKLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCAS VTVYYGVPVWKEAT
16. Peptid ifølge krav 2, kendetegnet ved, at det har den almene formel: X-----a-C----W-Z 25 hvori X og Z er OH eller NHi-grupper, eller når de immunologiske egenskaber af peptider befriet for disse grupper ikke modificeres væsentligt, kan X og Z betegne grupper omfattende 1 -5 aminosyrerester, og hver af bindestregerne betegner en aminoacylrest valgt blandt sådanne, som mu-30 liggør, at det angivne peptid bevarer de immunologiske egenskaber fra en af de følgende sekvenser: NKRPRQAWCWFKG-KWKD DK 174705 B1 NERPKQAWCRFGG-NWKE N-MRQAHCNISRAKWNA
17. Peptid ifølge krav 16, kendetegnet ved, at det har en af formler-5 ne: NKRPRQAWCWFKG-KWKD NERPKQAWCRFGG-KWKE N-MRQAHCNISRAKWNA 10 D-IRRAYCTINETEWDK l-IGQAHCNISRAQWSK
18. Peptid ifølge krav 2, kendetegnet ved, at det udviser en af de almene formler: 15 X-G-DPE---NC-GEF-YC----NZ XNC-GEF-YC-Z I hvori X og Z er OH eller NH2-grupper, eller når de immunologiske egen- 20 skaber af peptider befriet for disse grupper ikke modificeres væsentligt, kan X og Z betegne grupper omfattende 1-5 aminosyrerester, og hver af bindestregerne betegner en aminoacylrest valgt blandt sådanne, som muliggør, at det angivne peptid bevarer de immunologiske egenskaber fra en af de følgende sekvenser: 25 KGSDPEVAYMWTNCRGEFLYCNMTWFLN NCRGEFLYCN GG-DPEVTFMWTNCRGEFLYCKMNWFLN NCRGEFLYCK
30 -GGDPEIVTHSFNCGGEFFYCNSTQLFN NCGGEFFYCN DK 174705 B1
19. Peptid ifølge krav 18, kendet egnet ved, at det udviser en af følgende strukturer: KGSDPEVAYMWTNCRGEFLYCNMTWFLN 5 NCRGEFLYCN GG-DPEVTFMWTNCRGEFLYCKMNWFLN NCRGEFLYCK -GGDPEIVTHSFNCGGEFFYCNSTQLFN NCGGEFFYCN
20. Peptid ifølge krav 2, kendetegnet ved, at det udviser en af de almene formler: X—C-l-Q-l--G—YZ XC-I-Q-IZ 20 hvori X og Z er OH eller NH2-grupper, eller når de immunologiske egenskaber af peptider befriet for disse grupper ikke modificeres væsentligt, kan X og Z betegne grupper omfattende 1 -5 aminosyrerester, og hver af bindestregerne betegner en aminoacylrest valgt blandt sådanne, som mu-25 liggør, at det angivne peptid bevarer de immunologiske egenskaber fra en af de følgende sekvenser: RNYAPCHIKQIINTWHKVGRNVY CHIKQII
30 RNYVPCHIRQIINTWHKVGKNVY CHIRQII TITLPCRIKQFINMWQEVGKAMY CRIKQFI ! DK 174705 B1
20 NHCNTSVITESCD NTSVIT NHCNTSVIQECCD NTSVIQ TSCNTSVITQACP 25 NTSVIT INCNTSVITQACP NTSVIT INCNTSAITQACP NTSAIT 30
21. Peptid ifølge krav 20, kendetegnet ved, at det udviser en af strukturerne:
22. Peptid, der udviser peptidstruktur fælles med kappeglycoprotein pep* tidskelettet fra HIV-2, kendetegnet ved, at det ligeledes udviser en peptidstruktur der er fælles med peptidskelettet i ENV aminosyresekven-sen fra SIV-1 vist i figur 3. 20
23. Antigent middel indeholdende peptidet env ifølge krav 22 eller mindst et peptid ifølge krav 3, 4 og 5 eller mindst en oligomer af et sådant peptid, kendetegnet ved, at det specifikt genkender tilstedeværelsen af antistoffer mod HIV-2. 25
24. Immunogent middel indeholdende hele eller en del af peptidet env ifølge krav 22 eller mindst et peptid eller mindst en oligomer af dette peptid eller et peptid ifølge krav 6-21 konjugeret med et bærermolekyle, i kombination med en farmaceutisk acceptabel bærer til fremstilling af vacciner, k 30 endetegnet ved, at det inducerer dannelsen af antistoffer mod disse peptider i tilstrækkelig mængde til effektivt at inhibere proteiner fra HIV-2 retrovirus, eller endog selve HIV-2 retrovirus. DK 174705 B1
25. Immunogent middel ifølge krav 24, kendetegnet ved, at det indeholder peptider med sekvenser, som i kappeglycoproteiner fra HIV-2, SIV-1 og HIV-1 udviser en aminosyrehomologi på over 50%.
25 PNPQEWLVNVTENFNMWKN LVNVTENF PNPQEIELENVTEGFNMWKN LENVTEGF PNPQEIALENVTENFNMWKN 30 LENVTENF
25 EKLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCAS VTVYYGVPVWKEAT EDLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCAS VTVYYGVPVWKEAT DN LWVTVYY GVPVWKEATTTLF CAS
30 VTVYYGVPVWKEAT
26. Immunogent middel ifølge krav 24 eller 25, kendetegnet ved, at det indeholder mindst et peptid eller mindst en oligomer af et sådant peptid eller peptidet konjugeret med et bærermolekyle, hvilket peptid er valgt blandt env4, env5. env6 og env10.
27. Fremgangsmåde til in vitro diagnosticering af HIV-2 infektioner i en biologisk væske, kendetegnet ved, at man bringer den biologiske væske i kontakt med mindst et peptid ifølge ethvert af kravene 1-5 eller et konjugat af disse peptider med et bærermolekyle, eller i kontakt med peptidet env ifølge krav 22, og detekterer den eventuelle tilstedeværelse af et 15 antigen-antistofkompleks i den biologiske væske ved hjælp af fysiske eller kemiske metoder.
28. Fremgangsmåde til in vitro diagnosticering af HIV-2 infektioner i en biologisk væske ifølge krav 27, kendetegnet ved, at detekteringen af 20 det eventuelt dannede antigen-antistofkompleks gennemføres ved hjælp af immunoenzymatiske prøver (af typen ELISA), immunofluorescensprø-ver (af typen IFA), radioimmunologiske prøver (af typen RIA) eller ra-dioimmunopræcipiteringsprøver (af typen RIPA).
29. Kit til in vitro diagnosticering af HIV-2 infektioner i en biologisk væske, kendetegnet ved, at det omfatter: et peptidisk middel indeholdende et peptid ifølge ethvert af kravene 1-5, eller en blanding af sådanne peptider eller en konjugat af disse peptider 30 med et bærermolekyle, eller peptidet env ifølge krav 22, et reagens til sammensætning af et medium, der er gunstigt for gennemførelsen af en immunologisk reaktion, DK 174705 B1 et eller flere eventuelt mærkede reagenser til detektering af antigen-antistofkomplekset dannet ved den immunologiske reaktion, samt 5 en biologisk referencevæske, der er fri for antistoffer, som genkendes af det nævnte peptidiske ! i
DK198805133A 1987-01-16 1988-09-15 Peptider med immunologiske egenskaber svarende til HIV-2 virus, antigene og immunogene midler indeholdende sådanne peptider samt fremgangsmåde og kit til en vitro diagnose af HIV-2 DK174705B1 (da)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DK200201277A DK175879B1 (da) 1987-01-16 2002-08-30 Nucleotidsekvenser, der koder for peptider med immunologiske egenskaber og rekombinante nucleinsyrer omfattende nucleotidsekvenserne

Applications Claiming Priority (8)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US07/003,764 US5051496A (en) 1986-01-22 1987-01-16 Peptides related to human immunodeficiency virus II (HIV-2)
US376487 1987-01-16
FR8701739A FR2610632B1 (fr) 1987-02-11 1987-02-11 Peptides caracteristiques des retrovirus d'immunodeficience humaine (virus hiv) leurs applications au diagnostic des infections dues a certains de ces virus et, le cas echeant, a la vaccination contre le sida
FR8701739 1987-02-11
FR8705398 1987-04-15
FR8705398A FR2614025B1 (fr) 1987-04-15 1987-04-15 Peptides susceptibles d'etre reconnus par des anticorps induits contre des retrovirus d'immunodeficience humaine (virus hiv) leurs applications au diagnostic des infections dues a certains de ces virus et, le cas echeant, a la vaccination contre le sida
FR8800025 1988-01-05
PCT/FR1988/000025 WO1988005440A1 (fr) 1987-01-16 1988-01-15 Peptides ayant des proprietes immunologiques 2-hiv-2

Publications (3)

Publication Number Publication Date
DK513388D0 DK513388D0 (da) 1988-09-15
DK513388A DK513388A (da) 1988-11-16
DK174705B1 true DK174705B1 (da) 2003-09-29

Family

ID=27251436

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DK198805133A DK174705B1 (da) 1987-01-16 1988-09-15 Peptider med immunologiske egenskaber svarende til HIV-2 virus, antigene og immunogene midler indeholdende sådanne peptider samt fremgangsmåde og kit til en vitro diagnose af HIV-2

Country Status (9)

Country Link
EP (1) EP0283327B1 (da)
JP (5) JP2948823B2 (da)
AT (1) ATE154808T1 (da)
AU (1) AU608294B2 (da)
DE (1) DE3855947T2 (da)
DK (1) DK174705B1 (da)
ES (1) ES2104556T3 (da)
GR (1) GR3024823T3 (da)
WO (1) WO1988005440A1 (da)

Families Citing this family (35)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
SE8701628D0 (sv) * 1987-04-16 1987-04-16 Erling Norrby Medel for analys mm
WO1989002277A2 (en) * 1987-08-28 1989-03-23 Board Of Regents, The University Of Texas System Prophylaxis and therapy of acquired immunodeficiency syndrome
EP0316695B1 (de) * 1987-11-16 1993-03-31 F. Hoffmann-La Roche Ag Rekombinante HIV-2 Polypeptide
US5780038A (en) * 1987-11-16 1998-07-14 Roche Diagnostic Systems, Inc. HIV-2 envelope polypeptides
EP0327801A1 (en) * 1988-01-08 1989-08-16 Deutsches Primatenzentrum Gesellschaft Mbh HIV-2-type retroviruses of primates, vaccines, diagnostic and pharmaceutical compositions
FR2632644B1 (fr) * 1988-06-10 1994-11-04 Pasteur Institut Antigenes precurseurs des glycoproteines d'enveloppe d'un retrovirus humain hiv-2 et antigenes presentant une parente immunologique avec ces derniers. preparation de ces antigenes. application au diagnostic
JP3093763B2 (ja) * 1988-06-09 2000-10-03 インスティチュート・パスツール ヒトレトロウィルスhiv―2の外被糖タンパク質の前駆抗原及びそれと免疫学的同族性をもつ抗原、ならびにこれらの抗原の調製方法及び診断への応用
DE346022T1 (de) * 1988-06-10 1990-05-23 Medical Research Council, London Peptidfragmente von hiv.
IL90553A0 (en) * 1988-06-13 1990-01-18 Us Health Protein and coding sequence for detection and differentiation of siv and hiv-2 group of viruses
FR2635532B1 (fr) * 1988-07-29 1992-05-22 Pasteur Institut Particules hbsag recombinantes hybrides : caracteristiques morphologiques de l'antigene hbsag contenant 1 sequence immunogene induisant des anticorps neutralisants diriges contre hiv ou susceptible d'etre reconnue par de tels anticorps; sequences nucleotidiques codant pour de telles particules; vaccins les contenant
EP0362927A3 (en) * 1988-10-06 1990-11-14 Akzo N.V. Synthetic polypeptides immunochemically reactive with hiv antibodies
CA2003383A1 (en) 1988-11-23 1990-05-23 Sushil G. Devare Synthetic dna derived recombinant hiv antigens
US5260189A (en) * 1988-12-20 1993-11-09 Immunodiagnostics, Inc. Synthetic HIV-like peptides their compositions and uses
FR2646854A1 (fr) * 1989-05-12 1990-11-16 Pasteur Institut Antigenes de la glycoproteine transmembranaire d'enveloppe d'un retrovirus humain du type hiv-2 antigenes presentant avec eux une parente immunologique
WO1990013314A2 (fr) * 1989-05-12 1990-11-15 Institut Pasteur Antigenes de la glycoproteine transmembranaire d'enveloppe d'un retrovirus humain du type hiv-2 (antigenes presentant avec eux une parente immunologique)
EP0682951B1 (en) * 1989-05-31 1997-12-17 Institut Pasteur Immunogenic compositions comprising a purified antigen constituted by the envelope glycoprotein of the HIV-2 EHO retrovirus
US7022814B1 (en) 1992-01-21 2006-04-04 Institut Pasteur And Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale Nucleotide sequences derived from the genome of retroviruses of the HIV-1, HIV-2 and SIV type, and their uses in particular for the amplification of the genomes of these retroviruses and for the in vitro diagnosis of the diseases due to these viruses
FR2647809B1 (fr) * 1989-06-02 1991-09-20 Pasteur Institut Amorces oligonucleotidiques pour l'amplification du genome des retrovirus du type hiv-1, hiv-2 et siv, et leurs applications au diagnostic in vitro des infections dues a ces virus
FR2647810B1 (fr) * 1989-06-02 1994-07-22 Pasteur Institut Amorces oligonucleotidiques pour l'amplification du genome des retrovirus du type hiv-2 et siv, et leurs applications au diagnostic in vitro des infections dues a ces virus
ES2275451T3 (es) 1989-06-02 2009-02-16 Institut Pasteur Secuencias nucleotidicas procedentes del genoma de los retrovirus del tipo vih-1,vih-2 y siv, y sus aplicaciones especialmente para la amplificacion de los genomas de estos retrovirus y para el diagnostico in vitro de las infecciones debidas a estos virus.
DE3934366A1 (de) * 1989-10-14 1991-04-18 Chemotherapeutisches Forschungsinstitut Georg Speyer Haus Vakzine zum schutz vor hiv-virusinfektionen, verfahren zu ihrer herstellung und ihre verwendung als diagnostikum und immuntherapeutikum
US6248574B1 (en) * 1989-12-13 2001-06-19 Avigdor Shaffermann Polypeptides selectively reactive with antibodies against human immunodeficiency virus and vaccines comprising the polypeptides
FR2657016B1 (fr) * 1990-01-16 1995-08-25 Clonatec Sa Peptides derivant de la glycoproteine d'enveloppe du virus-hiv-2, leurs applications a la detection d'une infection due a ce virus et a la vaccination contre le sida.
ATE164853T1 (de) * 1990-01-16 1998-04-15 Orgenics Ltd Peptide, von virus-hiv-hüllen-glycoproteinen abstammend, deren verwendung zum nachweis einer infektion dieser viren und für die impfung gegen aids
DE4002636A1 (de) * 1990-01-30 1991-08-01 Boehringer Mannheim Gmbh Expression von hiv1- und 2-polypeptiden und deren verwendung
JPH06510025A (ja) * 1991-06-03 1994-11-10 シンテロ ヴァクシン デベロップメント アクチ ボラゲット Hiv−1に対するt細胞活性化の誘導に用いられるペプチド
ES2267094T3 (es) 1991-12-23 2007-03-01 Novartis Vaccines And Diagnostics, Inc. Conjunto de sondas de vih para su uso en ensayos de hibridacion en sandwich en fase de disolucion.
JPH0748276A (ja) * 1992-03-26 1995-02-21 Inmeru:Kk Hiv感染症予防ワクチンおよびその製造法
US6479055B1 (en) 1993-06-07 2002-11-12 Trimeris, Inc. Methods for inhibition of membrane fusion-associated events, including respiratory syncytial virus transmission
DE4405810A1 (de) 1994-02-23 1995-08-24 Behringwerke Ag Von einem Retrovirus aus der HIV-Gruppe abgeleitete Peptide und deren Verwendung
CA2298438C (en) * 1997-08-01 2010-10-05 Genetic Systems Corporation Synthetic antigen for the detection of antibodies immunoreactive with hiv virus
DE19908766C2 (de) * 1999-02-19 2001-02-15 Ulrich Schubert Verwendung synthetischer Vpr-Peptide des Humanen Immundefizienzvirus Typ 1 (HIV-1) zur Entwicklung von therapeutischen und diagnostischen Reagenzien
WO2005097822A1 (en) * 2004-04-09 2005-10-20 University Of Manitoba Identification of the precise amino acid sequence of the epitope recognized by the potent neutralizing human anti-hiv-1 monoclonal antibody igg1b12
EP2420248A1 (en) * 2004-08-17 2012-02-22 Institut Gustave Roussy Mutated HIV NEF for modulating immunity
WO2007141650A2 (en) * 2006-01-17 2007-12-13 Instituto De Medicina Molecular Compositions and methods for diagnosing hiv-2 infection

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0387915B1 (en) * 1984-10-18 1993-03-10 Institut Pasteur F antigens of the human immunodeficiency virus, and their applications
ATE138100T1 (de) * 1984-12-24 1996-06-15 Genentech Inc Fusionen von aids-verwandten polypeptiden
NZ215867A (en) * 1985-04-19 1989-10-27 Hoffmann La Roche Aids envelope protein, dna vectors and method of production
US4629783A (en) * 1985-04-29 1986-12-16 Genetic Systems Corporation Synthetic antigen for the detection of AIDS-related disease
DE3533440A1 (de) * 1985-09-19 1987-03-26 Hoechst Ag N-substituierte 3,4,5,6-tetrahydrophthalimide, verfahren zu ihrer herstellung sowie ihre verwendung im pflanzenschutz
NZ217645A (en) * 1985-09-25 1991-11-26 Oncogen Recombinant viruses expressing lav/htlv-iii related epitopes and vaccine formulations
NZ219024A (en) * 1986-01-22 1990-04-26 Pasteur Institut Hiv-2 retrovirus protein and nucleic acid sequences and detection methods
FR2593189B1 (fr) * 1986-01-22 1989-10-20 Pasteur Institut Nouveau retrovirus susceptible de provoquer le sida, antigenes obtenus a partir de ce retrovirus et anticorps correspondants et leurs applications au diagnostic du sida
EP0269520A3 (fr) * 1986-11-21 1988-08-24 Institut Pasteur Rétrovirus du type HIV-2 susceptible de provoquer le sida, et ses constituants antigéniques et nucléiques
JP3105581B2 (ja) * 1991-07-03 2000-11-06 内橋エステック株式会社 面状温度ヒュ−ズ
JPH0833969A (ja) * 1994-07-22 1996-02-06 Toyota Motor Corp 加圧鋳造方法

Also Published As

Publication number Publication date
JP2862810B2 (ja) 1999-03-03
GR3024823T3 (en) 1998-01-30
ATE154808T1 (de) 1997-07-15
AU608294B2 (en) 1991-03-28
JP2004002421A (ja) 2004-01-08
EP0283327A3 (fr) 1989-01-04
DK513388A (da) 1988-11-16
ES2104556T3 (es) 1997-10-16
JPH11322792A (ja) 1999-11-24
WO1988005440A1 (fr) 1988-07-28
JP2002030099A (ja) 2002-01-29
DK513388D0 (da) 1988-09-15
JPH01502119A (ja) 1989-07-27
EP0283327B1 (fr) 1997-06-25
JPH07300498A (ja) 1995-11-14
DE3855947D1 (de) 1997-07-31
DE3855947T2 (de) 1997-12-11
EP0283327A2 (fr) 1988-09-21
AU1225088A (en) 1988-08-10
JP2948823B2 (ja) 1999-09-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2862810B2 (ja) 免疫不全レトロウイルス(hiv)関連抗原性ペプチド及びこれをコードする核酸配列
Shafferman et al. Protection of macaques with a simian immunodeficiency virus envelope peptide vaccine based on conserved human immunodeficiency virus type 1 sequences.
JP2611106B2 (ja) エイズの原因となる新規なレトロウイルス
DK174910B1 (da) Antigen, fremgangsmåde til fremstilling af antigenet, fremgangsmåde til diagnosticering samt immunogene præparater
CA1340747C (en) Hiv-2 virus variants
US8236324B2 (en) Nucleotide sequences of HIV-1 group (or subgroup) O retroviral antigens
WO1987007906A1 (en) Variants of lav viruses, their dna- and protein-components and their uses, particularly for diagnostic purposes and for the preparartion of immunogenic compositions
US7115363B1 (en) Retrovirus capable of causing AIDS, means and methods for detecting it in vitro
AU8643591A (en) Peptides for use in vaccination and induction of neutralizing antibodies against human immunodeficiency virus
EP0538283B2 (en) Synthetic peptides and mixtures thereof for detecting hiv antibodies
AU629528B2 (en) Synthetic peptides and mixtures thereof for detecting hiv antibodies
HUT61323A (en) And treating htlv-1 peptides and antibodies against them for diagnosting htlv-1 infection and for vaccination against it
IL98770A (en) Peptides, analogues and mixtures thereof, methods for the detection of I-VLTH and II-VLTH antiviral antibodies and pharmaceutical preparations containing them
DK176372B1 (da) Antigeniske gag1-peptider, antigenisk middel, fremgangsmåde til in vitro diagnosticering, samt kit til in vitro diagnosticering
EP0693938B1 (en) Peptides for use in vaccination and induction of neutralizing antibodies against human immunodeficiency virus
KR0135885B1 (ko) 인체 면역결핍증의 레트로비루스(hiv )에 대해 유도된 항체에 의해 인식될 수 있는 펩티드 및 이 비루스 감염 진단과 aids 백신 제조에 이를 사용하는 방법
DK175879B1 (da) Nucleotidsekvenser, der koder for peptider med immunologiske egenskaber og rekombinante nucleinsyrer omfattende nucleotidsekvenserne
US5695762A (en) Immunodominant sites of HTLV-I envelope protein
CA1341594C (en) Synthetic peptides and mixtures therof for detecting hiv antibodies
FR2614025A1 (fr) Peptides susceptibles d'etre reconnus par des anticorps induits contre des retrovirus d'immunodeficience humaine (virus hiv) leurs applications au diagnostic des infections dues a certains de ces virus et, le cas echeant, a la vaccination contre le sida
CA2140151A1 (en) Peptides that mimic gp120 hiv epitope
AU780017B2 (en) Nucleotide sequences of HIV-1 type (or subtype) O retrovirus antigens

Legal Events

Date Code Title Description
PUP Patent expired