DK2385983T3 - Transaminase-polypeptider - Google Patents

Transaminase-polypeptider Download PDF

Info

Publication number
DK2385983T3
DK2385983T3 DK10729606.3T DK10729606T DK2385983T3 DK 2385983 T3 DK2385983 T3 DK 2385983T3 DK 10729606 T DK10729606 T DK 10729606T DK 2385983 T3 DK2385983 T3 DK 2385983T3
Authority
DK
Denmark
Prior art keywords
polypeptide
transaminase
seq
product
amino acid
Prior art date
Application number
DK10729606.3T
Other languages
English (en)
Inventor
Ish Kumar Dhawan
Gregory Miller
Xiyun Zhang
Original Assignee
Codexis Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=42317179&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=DK2385983(T3) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Codexis Inc filed Critical Codexis Inc
Application granted granted Critical
Publication of DK2385983T3 publication Critical patent/DK2385983T3/da

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10—Transferases (2.)
    • C12N9/1096—Transferases (2.) transferring nitrogenous groups (2.6)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
    • C12P13/001—Amines; Imines
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P41/00—Processes using enzymes or microorganisms to separate optical isomers from a racemic mixture
    • C12P41/006—Processes using enzymes or microorganisms to separate optical isomers from a racemic mixture by reactions involving C-N bonds, e.g. nitriles, amides, hydantoins, carbamates, lactames, transamination reactions, or keto group formation from racemic mixtures
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y206/00—Transferases transferring nitrogenous groups (2.6)
    • C12Y206/01—Transaminases (2.6.1)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y206/00—Transferases transferring nitrogenous groups (2.6)
    • C12Y206/01—Transaminases (2.6.1)
    • C12Y206/01018—Beta-alanine-pyruvate transaminase (2.6.1.18)
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/52—Improvements relating to the production of bulk chemicals using catalysts, e.g. selective catalysts

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Claims (15)

1. Transaminaseenzym, omfattende: et polypeptid med transaminaseaktivitet med forhøjet termostabilitet ved 50°C sammenlignet med polypeptidet af SEQ ID NO:2, hvor polypeptidet omfatter en aminosyresekvens der er mindst 80% identisk med SEQ ID NO: 18 og har sammenlignet med SEQ ID NO:2 sættet af substitutioner: X9 er T, X45 er Η, X86 er Y, X177 er L, X211 er K, X294 er V, X324 er G, og X391 er A, hvor polypeptidet har mindst ca. 10% restaktivitet i omdannelen af pyruvat til L-alanin i tilstedeværelse af aminodonor isopropylamin efter behandling af polypeptidet ved 50°C i 23 timer.
2. Transaminaseenzymet ifølge krav 1 hvor aminosyresekvensen har mindst ét af følgende sæt af substitutioner: X45 er Η, X86 er Y, X177 er L, X211 er K, X294 er V, X324 er G; X391 er A, X398 er R, og X420 er N; X21 er N, X45 er Η, X177 er L, X208 er I, X211 er K, X324 er G, og X391 er A; og X9 er T, X21 er N, X86 er Y, X208 er I, og X294 er V.
3. Transaminaseenzymet ifølge krav 2, der omfatter en aminosyresekvens svarende til SEQ ID NO: 18.
4. Transaminaseenzymet ifølge krav 1 eller 2: i) yderligere med forhøjet transaminaseaktivitet sammenlignet med SEQ ID NO: 2 til omdannelse af et aminoacceptorsubstrat til det tilsvarende kirale aminoprodukt: a) hvor aminosyresekvensen har yderligere ét eller flere af trækkene valgt fra: X30 er A; X31 er A; X57 er I eller L; X82 er Η; X85 er A, C, S, N, T, eller V; X153 er G, N, S, eller T; X317 er M eller Y; X319 er Q; X320 er A; X398 er R; X417 er A, C eller I; og X420 er N; b) hvor aminosyresekvensen yderligere har ét eller flere aftrækkene valgt fra: X30 er A; X31 er A; og X82 er H; c) hvor aminosyresekvensen har yderligere mindst ét af følgende træk valgt fra: X12 er G og X434 er V; X44 er A og X166 er S; X57 er I og X153 er S; X82 er H og X417 er F; X85 er A og X317 er L; X85 er S og X153 er A; X85 er A og X153 er A; X85 er S og X153 er S; X112 er I og X317 er L; X113 er H og X407 er S; X153 er S og X233 er S; X311 er V og X314 er T; X314 er V og X409 er G; og X318 er G og X408 er A; d) hvor aminosyresekvensen har yderligere mindst ét af følgende træk: X57 er A, X153 er S og X318 er G; X57 er A, X153 er C og X321 er L; X57 er F, X318 er F og X417 er S; X57 er F, X318 er G og X417 er I; X57 er L, X417 er C og X438 er L; X57 er F, X127 er L og X417 er C; X57 er S, X233 er L og X417 er V; X85 er A, X147 er G og X153 er A; X85 er S, X153 er A og X233 er T; X85 er A, X153 er S og X417 er S; X95 er T, X153 er A og X417 er C; X113 er C, X385 er R og X417 er C; X153 er A, X317 er L og X318 er G; X153 er A, X233 er T og X417 er C; X153 er S, X318 er R og X417 er E; X153 er C, X233 er L og X318 er R; X153 er T, X228 er G og X321 er L; X153 er S, X317 er L og X417 er C; X153 er T, X319 er V og X417 er I; X153 er S, X228 er G og X417 er V; X153 er C, X317 er Y og X319 er Q; X153 er T, X228 er G og X417 er A; X228 er G, X317 er L og X417 er C; X228 er G, X318 er G og X417 er C; X233 er L, X321 er L og X417 er I; og X317 er L, X318 er R og X417 er T; ii) hvor polypeptidet er i stand til at omdanne aminoacceptorsubstratet til det tilsvarende aminoprodukt med forbedret R-enantioselektivitet sammenlignet med SEQ ID NO: 18: a) hvor aminosyresekvensen har yderligere ét eller flere af følgende træk valgt fra: X57 er L; X82 er Η; X85 er A, C, N, T, eller V; og X153 er S, N, G, eller T; eller b) hvor aminosyresekvensen har yderligere ét af følgende træk valgt fra: X85 er A; X85 er A og X153 er A; og X85 er S og X153 er A; iii) der er i stand til at omdanne aminoacceptorsubstratet valgt fra 3,4-dihydronaphthalen-l(2H)-on, l-phenylbutan-2-on, 3,3-dimethylbutan-2-on, octan-2-on, ethyl 3-oxobutanoat, 4-phenylbutan-2-on, og l-(4-bromphenyl)ethanon til det tilsvarende aminprodukt ved en hastighed der er større end polypeptidet af SEQ ID NO:2 eller 18: a) hvor aminosyresekvensen har yderligere mindst ét af følgende træk valgt fra: X30 er A; X31 er A; X57 er I; X82 er Η; X85 er V; X85 er C; X153 er S; X317 er Μ; X317 er Y; X417 er A; X319 er Q; X320 er A; X417 er I; XI13 er H og X407 er S; X44 er A og X166 er S; X314 er V og X409 er G; X153 er S og X233 er S; X311 er V og X314 er T; X153 er S, X318 er R og X417 er E; X153 er C, X233 er L og X318 er R; X153 er S, X317 er L og X417 er C; X233 er L, X321 er L, og X417 er I; og X153 er C, X317 er Y og X319 er Q; b) hvor polypeptidet er i stand til at omdanne aminoacceptorsubstratet l-phenylbutan-2-on til aminoproduktet (S)-l-phenylbutan-2-amin med forbedret S-enantioselektivitet sammenlignet med SEQ ID NO:2 eller 18, hvor aminosyresekvensen har yderligere mindst ét af følgende træk valgt fra X228 er G, X317 er L og X417 er C; X57 er A, X153 er S og X318 er G; X57 er A, X153 er C og X321 er L; X228 er G, X318 er G og X417 er C; X153 er S, X318 er R og X417 er E; X153 er C, X233 er L og X318 er R; X153 er T, X228 er G og X321 er L; X153 er S, X317 er L, X417 er C; X153 er S, X228 er G og X417 er V; X153 er C, X317 er Y og X319 er Q; og X153 er T, X228 er G og X417 er A; c) hvor polypeptidet er i stand til at omdanne aminoacceptorsubstratet 3,3-dimethylbutan-2-on til aminoproduktet (S)-3,3-dimethylbutan-2-amin med forbedret S-enantioselektivitet sammenlignet med SEQ ID NO:2 eller 18, hvor aminosyresekvensen omfatter yderligere mindst på et af følgende træk valgt blandt: X30 er A; X31 er A; X57 er L; X57 er I; X82 er Η; X85 er V; X85 er S; X85 er T; X85 er A; X85 er N; X85 er C; X153 er T; X153 er N; X153 er G; X153 er S; X317 er Μ; X317 er Y; X319 er Q; X320 er A; X417 er A; X417 er I; X417 er C; X12 er G og X434 er V; X44 er A og X166 er S; X57 er I og X153 er S; X82 er H og X417 er F; X85 er S og X153 er A; X85 er A og X153 er A; X85 er A og X317 er L; X112 er I og X317 er L; X113 er H og X407 er S; X153 er S og X233 er S; X311 er V og X314 er T; X314 er V og X409 er G; X318 er G og X408 er A; X57 er L, X417 er C og X438 er L; X57 er F, X127 er L og X417 er C; X57 er S, X233 er L og X417 er V; X57 er A, X153 er S og X318 er G; X57 er F, X318 er F og X417 er S; X57 er F, X318 er G og X417 er I; X95 er T, X153 er A, og X417 er C; X113 er C, X385 er R og X417 er C; X153 er A, X317 er L og X318 er G; X153 er A, X233 er T og X417 er C; X153 er C, X233 er L og X318 er R; X153 er T, X228 er G, og X321 er L; X153 er S, X317 er L, og X417 er C; X153 er T, X319 er V og X417 er I; X153 er S, X228 er G og X417 er V; X153 er C, X317 er Y, og X319 er Q; X153 er T, X228 er G og X417 er A; X233 er L, X321 er L og X417 er I; X228 er G, X318 er G og X417 er C; og X317 er L, X318 er R og X417 er T; d) hvor polypeptidet er i stand til at omdanne aminoacceptorsubstratet octan-2-on til aminoproduktet (S)-octan-2-amin med forbedret S-enantioselektivitet sammenlignet med SEQ ID NO:2 eller 18, hvor aminosyresekvensen har yderligere mindst ét af følgende træk valgt fra X30 er A; X31 er A; X57 er I; X57 er L; X82 er Η; X85 er V; X85 er S; X85 er T; X85 er A; X85 er N; X85 er C; X153 er S; X153 er T; X153 er N; X153 er G; X317 er Μ; X317 er Y; X417 er A; X319 er Q; X320 er A; X417 er I; X417 er C; X12 er G og X434 er V; X44 er A og X166 er S; X57 er I og X153 er S; X82 er H og X417 er F; X85 er A og X317 er L; X85 er S og X153 er A; X85 er A og X153 er A; X112 er I og X317 er L; X113 er H og X407 er S; X153 er S og X233 er S; X311 er V og X314 er T; X314 er V og X409 er G; X318 er G og X408 er A; X57 er L, X417 er C og X438 er L; X57 er F, X127 er L og X417 er C; X57 er S, X233 3 er L og X417 er V; X57 er A, X153 er S og X318 er G; X57 er A, X153 er C og X321 er L; X57 er F, X318 er F og X417 er S; X57 er F, X318 er G og X417 er I; X95 er T, X153 er A og X417 er C; X113 er C, X385 er R og X417 er C; X153 er A, X233 er T og X417 er C; X153 er S, X318 er R og X417 er E; X153 er C, X233 er L og X318 er R; X153 er S, X228 er G og X417 er V; X153 er C, X317 er Y og X319 er Q; X153 er T, X228 er G, og X417 er A; X153 er T, X319 er V og X417 er I; X153 er T, X228 er G og X321 er L; X153 er S, X317 er L og X417 er C; X153 er A, X317 er L og X318 er G; X228 er G, X318 er G og X417 er C; X228 er G, X317 er L og X417 er C; X233 er L, X321 er L og X417 er I; og X317 er L, X318 er R og X417 er T; e) hvor polypeptidet er i stand til at omdanne aminoacceptorsubstratet l-(4-bromphenyl)ethanon, til aminoproduktet (S)-I-(4-bromphenyl)ethanamin med forbedret S-enantioselektivitet sammenlignet med SEQ ID NO:2 eller 18, hvor aminosyresekvensen har yderligere mindst ét af følgende træk valgt blandt X30 er A; X57 er L; X57 er I; X82 er H; X85 er V; X85 er T; X85 er A; X85 er N; X153 er S; X153 er T; X153 er N; X153 er G; X317 er Μ; X317 er Y; X319 er Q; X320 er A; X417 er A; X417 er I; X417 er C; X12 er G og X434 er V; X44 er A og X166 er S; X57 er I og X153 er S; X82 er H og X417 er F; X85 er S og X153 er A; X85 er A og X153 er A; X112 er I og X317 er L; X113 er H og X407 er S; X153 er S og X233 er S; X314 er V og X409 er G; X318 er G og X408 er A;X57 er L, X417 er C og X438 er L; X57 er F, X127 er L og X417 er C; X57 er F, X318 er F og X417 er S; X57 er F, X318 er G og X417 er I; X95 er T, X153 er A og X417 er C; X113 er C, X385 er R og X417 er C; X153 er A, X233 er T og X417 er C; X153 er A, X317 er L og X318 er G; X153 er S, X318 er R og X417 er E; X153 er T, X228 er G og X321 er L; X153 er S, X317 er L og X417 er C; X153 er C, X233 er L og X318 er R; X153 er S, X228 er G og X417 er V; X153 er T, X319 er V og X417 er I; X153 er C, X317 er Y og X319 er Q; X153 er T, X228 er G og X417 er A; X228 er G, X317 er L og X417 er C; X228 er G, X318 er G og X417 er C; X233 er L, X321 er L og X417 er I; og X317 er L, X318 er R og X417 er T; eller f) der er i stand til stereoselektivt at omdanne 4-phenylbutan-2-on til (R)-4-phenylbutan-2-amin ved en hastighed der er større end polypeptidet af SEQ ID NO:2 eller 18, hvor aminosyresekvensen har yderligere mindst ét af følgende træk valgt fra: X57 er L; X57 er I; X85 er V; X85 er S; X85 er T; X85 er A; X153 er S; X153 er T; X153 er N; X153 er G; X319 er Q; X317 er Μ; X317 er Y; X320 er A; X417 er A; X417 er I; X417 er C; X44 er A og X166 er S; X57 er I og X153 er S; X82 er H og X417 er F; X85 er A og X153 er A; X85 er A og X317 er L; X85 er S og X153 er A; X113 er H og X407 er S; X318 er G og X408 er A; X153 er S og X233 er S; X57 er A, X153 er S og X318 er G; X57 er A, X153 er C og X321 er L; X57 er L, X417 er C og X438 er L; X57 er S, X233 er L og X417 er V; X57 er F, X318 er F og X417 er S; X57 er F, X318 er G og X417 er I; X113 er C, X385 er R og X417 er C; X153 er A, X233 er T og X417 er C X153 er A, X317 er L og X318 er G; X153 er S, X318 er R og X417 er E; X153 er C, X233 er L og X318 er R; X153 er T, X228 er G og X321 er L; X153 er S, X317 er L og X417 er C; X153 er S, X228 er G og X417 er V; X153 er C, X317 er Y og X319 er Q; X153 er T, X228 er G og X417 er A; X228 er G, X317 er L og X417 er C; X228 er G, X318 er G og X417 er C; X233 er L, X321 er L og X417 er I; og X317 er L, X318 er R og X417 er T; iv) der er i stand til stereoselektivt at omdanne l-(6-methoxynaphthalen-2-yl)ethanon, til produktet (S)-l-(6-methoxynaphthalen-2-yl)ethanamin ved en hastighed der er større end polypeptidet af SEQ ID NO: 2 eller 18, hvor aminosyresekvensen har yderligere mindst ét af følgende træk valgt fra: X57 er L; X417 er C, I eller A; X57 er S, X233 er L, og X417 er V; X57 er A, X153 er S og X318 er G; X57 er A, X153 er C, og X321 er L; X57 er L, X417 er C og X438 er L; X57 er F, X318 er F og X417 er S; X153 er S, X317 er L og X417 er C; X153 er T, X228 er G og X417 er A; X57 er F, X127 er L og X417 er C; X228 er G, X317 er L og X417 er C; X233 er L, X321 er L og X417 er I; X228 er G, X318 er G og X417 er C; X153 er S, X228 er G og X417 er V; X57 er F, X318 er G og X417 er I; X153 er T, X228 er G og X321 er L; X317 er L, X318 er R og X417 er T; X153 er C, X317 er Y, og X319 er Q; X57 er I og X153 er S; X153 er A, X233 er T og X417 er C; og X95 er T, X153 er A og X417 er C; v) der er i stand til stereoselektivt at omdanne 1-(2,3-dihydrobenzo[b][l,4]dioxin-6-yl)ethanon, til produktet (S)-l-(2,3-dihydrobenzo[b][l,4]dioxin-6-yl)ethanamin ved en hastighed der er større end polypeptidet af SEQ ID NO:2 eller 18, hvor aminosyresekvensen har yderligere mindst ét af følgende træk valgt fra: X31 er A; X57 er C, I eller L; X153 er G eller S; X417 er T eller I; X57 er I og X153 er S; X57 er L, X417 er C, og X438 er L; X57 er S, X233 er L, og X417 er V; X57 er A, X153 er S, X318 er G; X57 er A, X153 er C og X321 er L; og X153 er C, X233 er Log X318 er R; vi) der er i stand til stereoselektivt at omdanne l-(4-phenoxyphenyl)ethanon, til produktet (S)-l-(4-phenoxyphenyl)ethanamin ved en hastighed der er større end polypeptidet af SEQ ID NO:2 eller 18, hvor aminosyresekvensen har yderligere mindst ét af følgende træk valgt fra: X31 er A; X57 er L eller I; X153 er S eller G; X417 er A eller I; X57 er I og X153 er S; X153 er S og X233 er S; X95 er T, X153 er A og X417 er C; X57 er L, X417 er C og X438 er L; X57 er S, X233 er L og X417 er V; X57 er S, X57 er A, X153 er S, X318 er G; X153 er C, X233 er L og X318 er R; og X153 er T, X228 er G og X417 er A; vii) der er i stand til stereoselektivt at omdanne (R)-4-oxotetrahydro-2H-pyran-3-yl-benzoate til produktet (3S,4S)-3-aminotetrahydro-2H-pyran-3-yl benzoat ved en hastighed der er større end polypeptidet af SEQ ID NO: 2 eller 18, hvor aminosyresekvensen har yderligere mindst ét af følgende træk valgt fra: X57 er I og X153 er S; X57 er A, X153 er S og X318 er G; og X57 er A, X153 er C og X321 er L; eller viii) der er i stand til stereoselektivt at omdanne (R)-3-benzyloxydihydro-2H-pyran-4(3H)-on, til produktet (3S,4S)-3-benzyloxytetrahydro-2H-pyran-4-amin ved en hastighed der er større end polypeptidet af SEQ ID NO:2 eller 18, hvor aminosyresekvensen har yderligere mindst ét af følgende træk valgt blandt: X30 er A; X31 er A; X57 er I eller L; X82 er H; X85 er S, T, A; X153 er N, G, S, T; X317 er M eller Y; X319 er Q; X320 er A; X417 er A, I eller C; X57 er I og X153 er S; X85 er S og X153 er S; X85 er S og X153 er A; X85 er A og X153 er A; X314 er V og X409 er G; X82 er H og X417 er F; X85 er A og X317 er L; X318 er G og X408 er A; X153 er S og X233 er S; X113 er H og X407 er S; X12 er G og X434 er V; X112 er I og X317 er L; X44 er A og X166 er S; X57 er F, X127 er L og X417 er C; X57 er S, X228 er G, X317 er L, X417 er C; X153 er S, X228 er G og X417 er V; X57 er L, X417 er C og X438 er L; X57 er A, X153 er C og X321 er L; X57 er S, X233 er L og X417 er V; X57 er F, X318 er F og X417 er S; X153 er T, X319 er V og X417 er I; X57 er S, X233 er L og X417 er V; X57 er F, X318 er G og X417 er I; X153 er C, X317 er Y og X319 er Q; X233 er L, X321 er L og X417 er I; X95 er T, X153 er A; og X417 er C; X228 er G, X318 er G og X417 er C; X85 er S, X153 er A og X233 er T; X57 er A, X153 er S og X318 er G; X153 er S, X318 er R og X417 er E; X153 er C, X23 er L og X318 er R; X153 er A; X23 er T og X417 er C; X85 er A, X147 er G og X153 er A; X153 er S, X317 er L og X417 er C; X317 er L, X318 er R og X417 er T; X153 er T, X228 er G og X417 er A; X153 er A, X317 er L og X318 er G; X153 er T, X228 er G, X321 er L; og X113 er C, X385 er R og X417 er C.
5. Transaminaseenzymet ifølge et hvilket som helst af kravene 1-4, hvor polypeptidet har forbedret ekspression i en værtscelle sammenlignet med SEQ ID NO:2.
6. Transaminaseenzymet ifølge krav 5, hvor aminosyresekvensen har yderligere ét eller flere af følgende træk valgt fra: X4 er R; X6 er R eller I eller N; X9 er T eller G; eller X9 er T og X86 er Y og X294 er V.
7. Polypeptid der koder for polypeptidet ifølge et hvilket som helst af kravene 1-6.
8. Polynukleotidet ifølge krav 7 omfattende en polynukleotidsekvens svarende til SEQ ID NO: 17.
9. Ekspressionsvektor omfattende polynukleotidet ifølge krav 7 eller 8.
10. Ekspressionsvektoren ifølge krav 9 yderligere omfattende en kontrolsekvens.
11. Ekspressionsvektoren ifølge krav 10 hvor kontrolsekvensen omfatter en promoter.
12. Værtscelle omfattende polynukleotidet ifølge krav 7 eller 8.
13. Værtscellen ifølge krav 12 der er E. coli.
14. Fremgangsmåde til omdannelsen af et substrat med formel I til det kirale aminprodukt med formel III i stereoisomerisk overskud,
I. Aminoacceptor II. Aminodonor III kiralt IV. Amino- aminprodukt acceptorbiprodukt hvor det kirale carbonatom af det kirale aminprodukt er er markeret med en *; hver af R1, R2, R3 og R4, når taget uafhængigt, er en usubstitueret eller substitueret alkyl-, alkylaryl-, eller arylgruppe, hvor R1 er forskellig fra R2 i struktur eller kiralitet, eller R1 og R2, taget sammen, er en carbonhydridkæde af 4 eller flere carbonatomer indeholdende et center af kiralitet, fremgangsmåden omfattende at bringe substratet med formel I i kontakt med et transaminasepolypeptid ifølge et hvilket som helst af kravene 1 til 6 i tilstedeværelse af en aminodonor under egnede reaktionsbetingelser til omdannelsen af substratet til produktet med formel III i stereoisomerisk overskud.
15. Fremgangsmåden ifølge krav 14 hvor: i) substratet med formel I er 3,4-dihydronaphthalen-l(2F/)-on, som omdannes til produktet (S)-l,2,3,4-tetrahydronaphthalen-l-amin i stereoisomerisk overskud; ii) substratet med formel I er l-phenylbutan-2-on, som omdannes til produktet (S)-l-phenylbutan-2-amin i stereoisomerisk overskud; iii) substratet med formel I er 3,3-dimethylbutan-2-on, som omdannes til produktet (S)-3,3-dimethylbutan-2-amin i stereoisomerisk overskud; iv) substratet med formel I er octan-2-on, som omdannes til produktet (S)-octan-2-amin i stereoisomerisk overskud, hvor transaminase-polypeptidet; v) substratet med formel I er l-(4-bromphenyl)ethanon, som omdannes til produktet (S)-l-(4-bromphenyl)ethanamin i stereoisomerisk overskud, hvor transaminase-polypeptidet; vi) substratet med formel I er 4-phenylbutan-2-on, som omdannes til produktet (R)-4-phenylbutan-2-amin i stereoisomerisk overskud, hvor transaminase-polypeptidet; vii) substratet med formel I er ethyl 3-oxobutanoat, som omdannes til produktet (Æ)-ethyl 3-aminobutanoat i stereoisomerisk overskud, hvor transaminase-polypeptidet; viii) substratet med formel I er ethyl 3-oxobutanoat, som omdannes til produktet (S)-ethyl 3-aminobutanoat i stereoisomerisk overskud, hvor transaminase-polypeptidet; ix) substratet med formel I er l-(6-methoxynaphthalen-2-yl)ethanon, som omdannes til produktet (S)-l-(6-methoxynaphthalen-2-yl)ethanamin i stereoisomerisk overskud, transaminase-polypeptidet; x) substratet med formel I er l-(2,3-dihydrobenzo[b][l,4]dioxin-6-yl)ethanon, som omdannestil produktet (S)-l-(6-methoxynaphthalen-2-yl)ethanamin i stereoisomerisk overskud, hvor transaminase-polypeptidet; xi) substratet med formel I er l-(4-phenoxyphenyl)ethanon, som omdannes til produktet (S)-l-(4-phenoxyphenyl)ethanamin i stereoisomerisk overskud, transaminase-polypeptidet; xii) substratet med formel I er (Æ)-4-oxotetrahydro-2H-pyran-3-yl-benzoate, som omdannes til produktet (3S,4S)-3-aminotetrahydro-2H-pyran-3-yl benzoat i stereoisomerisk overskud, hvor transaminase-polypeptidet; xiii) substratet med formel I er (Æ)-3-benzyloxydihydro-2H-pyran-4(3H)-on, som omdannes til produktet (3S,4S)-3-benzyloxytetrahydro-2H-pyran-4-amin i stereoisomerisk overskud, hvor transaminase-polypeptidet; xiv) aminodonoren er valgt fra gruppen bestående af isopropylamin, a-phenethylamin, D-alanin eller L-alanin; xv) reaktionsbetingelserne er: i) 20°C til 55°C; eller ii) 35°C til 50°C; xvi) aminoacceptor-biproduktet er fjernet; eller xvii) fremgangsmåden udføres i tilstedeværelse af reduceret nikotinamid-adenindinukleotid(NADH).
DK10729606.3T 2009-01-08 2010-01-08 Transaminase-polypeptider DK2385983T3 (da)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US14340109P 2009-01-08 2009-01-08
PCT/US2010/020563 WO2010081053A2 (en) 2009-01-08 2010-01-08 Transaminase polypeptides

Publications (1)

Publication Number Publication Date
DK2385983T3 true DK2385983T3 (da) 2018-02-12

Family

ID=42317179

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DK17208538.3T DK3354727T3 (da) 2009-01-08 2010-01-08 Transaminasepolypeptider
DK10729606.3T DK2385983T3 (da) 2009-01-08 2010-01-08 Transaminase-polypeptider

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DK17208538.3T DK3354727T3 (da) 2009-01-08 2010-01-08 Transaminasepolypeptider

Country Status (9)

Country Link
US (12) US8470564B2 (da)
EP (2) EP2385983B1 (da)
CN (1) CN102341494B (da)
DK (2) DK3354727T3 (da)
ES (1) ES2840000T3 (da)
HU (2) HUE036104T2 (da)
IL (2) IL213950A (da)
SG (1) SG172891A1 (da)
WO (1) WO2010081053A2 (da)

Families Citing this family (35)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2840000T3 (es) 2009-01-08 2021-07-06 Codexis Inc Polipéptidos de transaminasa
SG173815A1 (en) 2009-02-26 2011-09-29 Codexis Inc Transaminase biocatalysts
ES2644992T3 (es) 2009-06-22 2017-12-01 Codexis, Inc. Reacciones de transaminasa
US8852900B2 (en) * 2010-06-17 2014-10-07 Codexis, Inc. Biocatalysts and methods for the synthesis of (S)-3-(1-aminoethyl)-phenol
EP2605772B1 (en) 2010-08-16 2016-06-22 Cardiome International AG Process for preparing aminocyclohexyl ether compounds
US8932836B2 (en) 2010-08-16 2015-01-13 Codexis, Inc. Biocatalysts and methods for the synthesis of (1R,2R)-2-(3,4-dimethoxyphenethoxy)cyclohexanamine
WO2012124639A1 (ja) * 2011-03-11 2012-09-20 株式会社カネカ 改変型アミノ基転移酵素、その遺伝子、およびそれらを利用した光学活性アミノ化合物の製造方法
US9109209B2 (en) * 2011-09-08 2015-08-18 Codexis, Inc. Biocatalysts and methods for the synthesis of substituted lactams
CN104185634B (zh) * 2012-03-23 2017-05-03 诺华股份有限公司 制备螺旋吲哚酮和其中间体的化学工艺
US9139821B2 (en) 2012-03-23 2015-09-22 Codexis, Inc. Biocatalysts and methods for synthesizing derivatives of tryptamine and tryptamine analogs
DK2828256T5 (da) 2012-03-23 2019-12-09 Novartis Ag Kemisk fremgangsmåde til fremstilling af spiroindoloner og mellemprodukter deraf
JP2015533501A (ja) * 2012-10-18 2015-11-26 サンド・アクチエンゲゼルシヤフト インドリン誘導体の調製方法
CA2895752C (en) * 2012-12-21 2021-09-21 Codexis, Inc. Engineered biocatalysts and methods for synthesizing chiral amines
BR112015024859A2 (pt) * 2013-03-27 2017-10-10 Pfizer Ireland Pharmaceuticals processo e intermediários para a preparação de pregabalina
HUE039618T2 (hu) 2013-09-27 2019-01-28 Codexis Inc Enzimvariánsok automatizált szûrése
WO2015078267A1 (zh) 2013-11-26 2015-06-04 凯莱英医药集团（天津）股份有限公司 转氨酶及其应用
EP3307880B1 (en) 2015-06-12 2021-11-10 c-LEcta GmbH Transaminases
KR20170004510A (ko) 2015-07-02 2017-01-11 씨제이제일제당 (주) 신규 트랜스아미나제 및 이를 이용한 아미노 화합물의 탈아민 방법
US10377697B2 (en) 2015-12-10 2019-08-13 Novartis Ag Process and intermediates
CA3064574A1 (en) 2017-06-14 2018-12-20 Codexis, Inc. Engineered transaminase polypeptides for industrial biocatalysis
EP3415630A1 (en) 2017-06-14 2018-12-19 EntreChem, S.L. Method for one-pot production of a primary amine from an alcohol
EP3450566A1 (en) * 2017-09-01 2019-03-06 Vito NV Method for producing chiral amines
ES2931540T3 (es) * 2018-02-05 2022-12-30 Asymchem Life Science Tianjin Co Ltd Mutante de transaminasa y aplicación del mismo
CN108384767B (zh) * 2018-02-05 2020-08-14 凯莱英生命科学技术(天津)有限公司 转氨酶突变体及其应用
CN108315365B (zh) * 2018-02-08 2021-01-29 浙江宏元药业股份有限公司 阿托伐他汀中间体的生物合成方法
CN108586346B (zh) 2018-05-10 2019-10-01 北京富盛嘉华医药科技有限公司 一种生物催化合成西他列汀及其中间体的方法
CN113736759B (zh) * 2019-05-30 2023-07-14 凯莱英生命科学技术(天津)有限公司 转氨酶突变体及其应用
CN115427557A (zh) * 2020-04-10 2022-12-02 科德克希思公司 工程化转氨酶多肽
CN112430632B (zh) * 2020-11-18 2022-09-13 上海合全药物研发有限公司 2-((反式)-4-氨基环己烷基)异丙醇的制备方法
CN112458123A (zh) * 2021-02-04 2021-03-09 凯莱英医药集团（天津）股份有限公司 手性胺的合成方法
CN115975969B (zh) * 2021-10-14 2025-08-12 弈柯莱生物科技(集团)股份有限公司 转氨酶及用于制备西他列汀或其中间体的用途
CN114507651A (zh) * 2022-03-03 2022-05-17 西南交通大学 一种重组转氨酶及其在制备尼拉帕利手性中间体中的应用
CN115807046A (zh) * 2022-09-13 2023-03-17 华中科技大学 一种转氨酶催化合成卡巴拉汀药物中间体的方法
CN119592535B (zh) * 2024-11-22 2025-10-03 浙江科技大学 一种高效催化合成(R)-手性胺类化合物的ω-转氨酶祖先酶突变体及应用
CN119242730A (zh) * 2024-12-06 2025-01-03 烟台泓源生物肥料有限公司 一种提高作物耐盐碱的β-氨基丁酸的制备方法及其应用

Family Cites Families (55)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4600692A (en) 1983-02-10 1986-07-15 Purification Engineering, Inc. Immobilized cells for preparing phenylalanine
US4518692A (en) * 1983-09-01 1985-05-21 Genetics Institute, Inc. Production of L-amino acids by transamination
US4826766A (en) * 1985-09-23 1989-05-02 Genetics Institute, Inc. Production of amino acids using coupled aminotransferases
JPS63273486A (ja) 1987-04-30 1988-11-10 Tanabe Seiyaku Co Ltd １−（４−メトキシフェニル）−２−アミノプロパンの製法
US5316943A (en) * 1988-06-14 1994-05-31 Kidman Gene E Racemic conversion of using a transaminase
US5300437A (en) * 1989-06-22 1994-04-05 Celgene Corporation Enantiomeric enrichment and stereoselective synthesis of chiral amines
US4950606A (en) * 1989-06-22 1990-08-21 Celgene Corporation Enantiomeric enrichment and stereoselective synthesis of chiral amines
US5169780A (en) * 1989-06-22 1992-12-08 Celgene Corporation Enantiomeric enrichment and stereoselective synthesis of chiral amines
US5346828A (en) * 1991-03-27 1994-09-13 Celgene Corporation Stereoisomeric enrichment of 2-amino-3-hydroxy-3-phenylpropionic acids using d-threonine aldolase
US5360724A (en) * 1992-12-18 1994-11-01 Celgene Corporation Process for the preparation of chiral 1-aryl-2-aminopropanes
US5605793A (en) 1994-02-17 1997-02-25 Affymax Technologies N.V. Methods for in vitro recombination
US5837458A (en) 1994-02-17 1998-11-17 Maxygen, Inc. Methods and compositions for cellular and metabolic engineering
US6335160B1 (en) 1995-02-17 2002-01-01 Maxygen, Inc. Methods and compositions for polypeptide engineering
JP3649338B2 (ja) 1994-06-03 2005-05-18 ノボザイムス バイオテック，インコーポレイティド 精製されたマイセリオフトラ・ラッカーゼ及びそれをコードする核酸
ATE294871T1 (de) 1994-06-30 2005-05-15 Novozymes Biotech Inc Nicht-toxisches, nicht-toxigenes, nicht- pathogenes fusarium expressionssystem und darin zu verwendende promotoren und terminatoren
FI104465B (fi) 1995-06-14 2000-02-15 Valio Oy Proteiinihydrolysaatteja allergioiden hoitamiseksi tai estämiseksi, niiden valmistus ja käyttö
WO1997015682A1 (en) * 1995-10-23 1997-05-01 Kaneka Corporation Process for producing optically active amino compounds
US5814473A (en) * 1996-02-09 1998-09-29 Diversa Corporation Transaminases and aminotransferases
JPH10165194A (ja) * 1996-12-12 1998-06-23 Sumitomo Chem Co Ltd 光学純度の向上方法
EP0987332B1 (en) * 1997-04-23 2009-08-19 Kaneka Corporation DNA encoding a polypeptide having stereoselective transaminase activity, and transformants comprising said DNA
US6197558B1 (en) 1997-05-19 2001-03-06 Nsc Technologies Transaminase biotransformation process
US6133018A (en) * 1997-06-02 2000-10-17 Celgro Enzymatic synthesis of chiral amines using -2-amino propane as amine donor
AU746786B2 (en) 1997-12-08 2002-05-02 California Institute Of Technology Method for creating polynucleotide and polypeptide sequences
US5866512A (en) * 1997-12-19 1999-02-02 Celgene Corporation Plant growth inhibition using the R-isomer of esprocarb
PL342882A1 (en) 1998-03-11 2001-07-16 Celgro Improvements in the enzymatic synthesis of chiral amines
WO2000023609A1 (en) 1998-10-19 2000-04-27 Nsc Technologies Llc Transaminase biotransformation process employing glutamic acid
ATE412047T1 (de) * 1998-10-30 2008-11-15 Kaneka Corp (s)-alpha-phenethylamin: pyruvattransaminase
JP4221100B2 (ja) 1999-01-13 2009-02-12 エルピーダメモリ株式会社 半導体装置
DE60013939T2 (de) * 1999-03-19 2005-10-06 Sumitomo Chemical Co. Ltd. Stereoselektive Transaminase, deren kodierende Gen und deren Verwendungen
DE19919848A1 (de) 1999-04-30 2000-11-02 Aventis Cropscience Gmbh Verfahren zur Herstellung von L-Phosphinothricin durch enzymatische Transaminierung mit Aspartat
US6107521A (en) * 1999-12-14 2000-08-22 Celgro Process for the preparation of secondary amines
AU4964101A (en) 2000-03-30 2001-10-15 Maxygen Inc In silico cross-over site selection
US20030013656A1 (en) * 2001-05-03 2003-01-16 Bing Wang Pyruvate derivatives
MXPA04000695A (es) * 2001-07-23 2005-08-26 Galileo Pharmaceuticals Inc Compuestos citoprotectores, formulaciones farmaceuticas y cosmeticas y metodos.
US20050009151A1 (en) 2003-07-10 2005-01-13 Pharmacia Corporation Methods for the stereospecific and enantiomeric enrichment of beta-amino acids
JP2007502124A (ja) 2003-08-11 2007-02-08 コデクシス， インコーポレイテッド 改良ケトレダクターゼポリペプチドおよび関連ポリヌクレオチド
US7972854B2 (en) * 2004-02-05 2011-07-05 Sangamo Biosciences, Inc. Methods and compositions for targeted cleavage and recombination
KR100718817B1 (ko) 2004-07-19 2007-05-17 김병기 신규한 오메가아미노트랜스퍼라제, 이의 유전자 및 이의이용 방법
US7172885B2 (en) 2004-12-10 2007-02-06 Cambrex North Brunswick, Inc. Thermostable omega-transaminases
US20060200878A1 (en) * 2004-12-21 2006-09-07 Linda Lutfiyya Recombinant DNA constructs and methods for controlling gene expression
US20080148432A1 (en) * 2005-12-21 2008-06-19 Mark Scott Abad Transgenic plants with enhanced agronomic traits
US8133705B2 (en) 2005-05-23 2012-03-13 Kaneka Corporation Aminotransferase, gene encoding the same, and method of using them
EP1818411A1 (en) 2006-02-13 2007-08-15 Lonza AG Process for the preparation of optically active chiral amines
US8962298B2 (en) * 2006-05-02 2015-02-24 Butamax Advanced Biofuels Llc Recombinant host cell comprising a diol dehydratase
EP1897956A1 (en) 2006-09-06 2008-03-12 Lonza AG Process for preparation of optically active amines by optical resolution of racemic amines employing a bacterial omega-transaminase
US20090118130A1 (en) 2007-02-12 2009-05-07 Codexis, Inc. Structure-activity relationships
US7588923B2 (en) * 2007-03-02 2009-09-15 Richmond Chemical Corporation Method to increase the yield and improve purification of products from transaminase reactions
WO2008127646A2 (en) 2007-04-11 2008-10-23 Dsm Ip Assets B.V. Transaminase-based processes for preparation of pregabalin
DE102007042600A1 (de) 2007-09-07 2009-03-12 Evonik Degussa Gmbh Verfahren zur Herstellung von enantiomerenangereichten Aminen
ES2840000T3 (es) * 2009-01-08 2021-07-06 Codexis Inc Polipéptidos de transaminasa
JP2010273486A (ja) 2009-05-22 2010-12-02 Toyota Industries Corp 電力変換装置とその電力変換方法
ES2599644T3 (es) 2009-09-02 2017-02-02 Lonza Ag Un proceso para la identificación y preparación de una omega-transaminasa (R)-específica
US10196657B2 (en) * 2012-12-31 2019-02-05 Invista North America S.A.R.L. Methods of producing 7-carbon chemicals via methyl-ester shielded carbon chain elongation
HUE042206T2 (hu) * 2013-02-28 2019-06-28 Codexis Inc Módosított transzamináz polipeptidek ipari biokatalízishez
BR112015024859A2 (pt) * 2013-03-27 2017-10-10 Pfizer Ireland Pharmaceuticals processo e intermediários para a preparação de pregabalina

Also Published As

Publication number Publication date
US9944909B2 (en) 2018-04-17
IL213950A0 (en) 2011-08-31
WO2010081053A3 (en) 2011-01-20
US20240150732A1 (en) 2024-05-09
US20210230564A1 (en) 2021-07-29
US8470564B2 (en) 2013-06-25
SG172891A1 (en) 2011-08-29
EP3354727B1 (en) 2020-10-07
US20180298355A1 (en) 2018-10-18
HUE036104T2 (hu) 2018-06-28
US10995323B2 (en) 2021-05-04
CN102341494B (zh) 2014-10-15
US20170073651A1 (en) 2017-03-16
US20150210988A1 (en) 2015-07-30
EP2385983A2 (en) 2011-11-16
US9029106B2 (en) 2015-05-12
US20130266994A1 (en) 2013-10-10
US20260028600A1 (en) 2026-01-29
US10323234B2 (en) 2019-06-18
WO2010081053A2 (en) 2010-07-15
CN102341494A (zh) 2012-02-01
HUE052297T2 (hu) 2021-04-28
ES2840000T3 (es) 2021-07-06
US20230120624A1 (en) 2023-04-20
US11939602B2 (en) 2024-03-26
IL249285A0 (en) 2017-01-31
EP2385983A4 (en) 2013-07-24
US20190249152A1 (en) 2019-08-15
US20100209981A1 (en) 2010-08-19
US10550370B2 (en) 2020-02-04
US12448611B2 (en) 2025-10-21
DK3354727T3 (da) 2020-11-16
EP3354727A1 (en) 2018-08-01
IL213950A (en) 2016-12-29
US10323233B2 (en) 2019-06-18
US20200109380A1 (en) 2020-04-09
EP2385983B1 (en) 2017-12-20
IL249285A (en) 2017-09-28
US11542485B2 (en) 2023-01-03
US20180201911A1 (en) 2018-07-19
US9512410B2 (en) 2016-12-06

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US12448611B2 (en) Transaminase polypeptides
US12305201B2 (en) Engineered biocatalysts and methods for synthesizing chiral amines
EP2582799B1 (en) Biocatalysts and methods for the synthesis of (s)-3-(1-aminoethyl)-phenol
US20240026401A1 (en) Engineered biocatalysts and methods for synthesizing chiral amines