EA044245B1 - КОМПОЗИЦИИ иРНК КОМПОНЕНТА КОМПЛЕМЕНТА C5 И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ - Google Patents
КОМПОЗИЦИИ иРНК КОМПОНЕНТА КОМПЛЕМЕНТА C5 И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ Download PDFInfo
- Publication number
- EA044245B1 EA044245B1 EA201591707 EA044245B1 EA 044245 B1 EA044245 B1 EA 044245B1 EA 201591707 EA201591707 EA 201591707 EA 044245 B1 EA044245 B1 EA 044245B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- nucleotides
- nucleotide
- strand
- dsrna
- dsrna agent
- Prior art date
Links
Abstract
Изобретение относится к иРНК, например двухцепочечной рибонуклеиновой кислоте (dsRNA), композициям, нацеленным на ген компонента комплемента С5, а также способам применения таких иРНК, например dsRNA, композициям для ингибирования экспрессии С5 и для лечения субъектов, страдающих заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, например ночной пароксизмальной гемоглобинурией.
Description
Перечень последовательностей
Настоящая заявка включает перечень последовательностей, который был подан в электронном виде в формате с кодировкой ASCII и, таким образом, включен в данный документ посредством ссылки в полном объеме. Указанная копия файла с кодировкой ASCII, созданная 10 марта 2014 г., имеет название 121301-00520 SL.txt, и ее размер составляет 734486 байт.
Уровень техники
Комплемент был впервые обнаружен в 1890-х годах, когда было обнаружено способствование или комплектное уничтожение бактерий термостабильными антителами, присутствующими в нормальной сыворотке (Walport, M.J. (2001) N Engl J Med. 344:1058). Система комплемента состоит из более чем 30 белков, которые либо присутствуют в виде растворимых белков в крови, или присутствуют в виде белков, ассоциированных с мембраной. Активация комплемента приводит к последовательному каскаду ферментативных реакций, известных как пути активации комплемента, в результате чего формируются мощные анафилотоксины C3a и С5а, которые вызывают множество физиологических реакций, варьирующих от хемоаттракции до апоптоза. Первоначально считалось, что комплемент играет важную роль во врожденном иммунитете, в результате чего устанавливается надежная и быстрая реакция против вторжения патогенных микроорганизмов. Тем не менее, в последнее время становится все более очевидным, что комплемент также играет важную роль в адаптивном иммунитете с участием Т- и В-клеток, которые помогают в ликвидации патогенных микроорганизмов (Dunkelberger J.R. и Song W.C. (2010) Cell Res. 20:34; Molina H., et al. (1996) Proc Natl Acad Sci USA. 93:3357), в поддержании иммунологической памяти, предотвращающей повторное вторжение патогенов, и участвует в многочисленных патологических состояниях человека (Qu, H., et al. (2009) Mol Immunol. 47:185; Wagner, E. и Frank M.M. (2010) Nat Rev Drug Discov. 9:43).
Активация комплемента, как известно, происходит по трем разным путям: альтернативному, классическому и лектиновому (фиг. 1) с участием белков, которые преимущественно существуют в виде неактивных зимогенов, которые затем последовательно отщепляются и активируются. Все пути активации комплемента ведут к отщеплению молекулы С5 с образованием анафилатоксина С5а и С5Ь, который впоследствии формирует терминальный комплекс комплемента (С5Ь-9). С5а оказывает преобладающую провоспалительную активность путем взаимодействия с рецептором C5aR (CD88) классического Gбелка, а также с рецептором C5L2 (GPR77) белка, отличающегося от G-белка, экспрессируемых на различных иммунных и не иммунных клетках. С5Ь-9 вызывает цитолиз посредством формирования мембраноатакующего комплекса (MAC), при этом субъединицы литического MAC и растворимый С5Ь-9 обладают множеством не цитолитических иммунных функций. Эти два эффектора комплемента, С5а и С5Ь-9, образованные при отщеплении от С5, являются ключевыми компонентами системы комплемента, ответственные за распространение и/или инициирование патологии при различных заболеваниях, включая ночную пароксизмальную гемоглобинурию, ревматоидный артрит, травмы впоследствии ишемии и нейродегенеративные заболевания.
На сегодняшний день доступно только одно терапевтическое средство, нацеленное на С5-С5а компоненты, для лечения заболеваний, связанных с компонентом комплемента С5, которое представляет собой антитело к С5, экулизумаб (Soliris®). Хотя экулизумаб показал эффективность при лечении пароксизмальной ночной гемоглобинурии (PNH) и атипичного гемолитико-уремического синдрома (aHUS), и в настоящее время оценивается в клинических испытаниях для лечения дополнительных заболеваний, связанных с компонентом комплемента С5, терапия экулизумабом требует еженедельных инфузий высоких доз, с дальнейшими инфузиями раз в две недели, с ежегодной стоимостью приблизительно 400000 $. Соответственно, существует потребность в данной области в альтернативной терапии и комбинированной терапии для субъектов, имеющих заболевание, связанное с компонентом комплемента С5.
Краткое описание изобретения
Настоящее изобретение относится к композициям иРНК, которые воздействуют на опосредованное РНКиндуцированным комплексом сайленсинга (RISC) отщепление РНК-транскриптов гена С5. Ген С5 может находиться в пределах клетки, например, клетки в пределах субъекта, такого как человек. Настоящее изобретение также относится к способам и комбинированной терапии для лечения субъекта с нарушениями, на которое можно оказать благоприятное воздействие путем ингибирования или снижения экспрессии гена С5, например, заболевания, связанного с компонентом комплемента С5, такого как ночная пароксизмальная гемоглобинурия (PNH) и атипичный гемолитико-уремический синдром (aHUS) с помощью композиций иРНК, которые воздействуют на отщепление, опосредованное комплексом сайленсинга, индуцированным РНК (RISC), РНК-транскриптов гена С5 для ингибирования экспрессии гена С5.
- 1 044245
Соответственно, в одном аспекте настоящее изобретение относится к средству, представляющему собой двухцепочечную рибонуклеиновую кислоту (dsRNA), для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5, где dsRNA содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь, где смысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, и антисмысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:5.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к средству, представляющему собой двухцепочечную рибонуклеиновую кислоту (dsRNA), для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5, где dsRNA содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь, при этом антисмысловая цепь содержит участок комплементарности, который содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающийся не более чем на 3 нуклеотида от любой из антисмысловых последовательностей, перечисленных в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23.
В одном варианте осуществления смысловая и антисмысловая цепи содержат последовательности, выбранные из группы, состоящей из А-118320, А-118321, А-118316, А-118317, А-118332, А-118333, А118396, А-118397, А-118386, А-118387, А-118312, А-118313, А-118324, А-118325, А-119324, А-119325, А-119332, А-119333, А-119328, А-119329, А-119322, А-119323, А-119324, А-119325, А-119334, А-119335, А-119330, А-119331, А-119326, А-119327, А-125167, А-125173, А-125647, А-125157, А-125173, и А125127. В другом варианте осуществления смысловая и антисмысловая цепи содержат последовательности, выбранные из группы, состоящей из последовательностей в любой из таблиц 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23. В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеотид.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к средству, представляющему собой двухцепочечную рибонуклеиновую кислоту (dsRNA), для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5, где средство, представляющее собой dsRNA, содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь, где смысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность AAGCAAGAUAUUUUUAUAAUA (SEQ ID NO:62) и где антисмысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность UAUUAUAAAAAUAUCUUGCUUUU (SEQ ID NO:113). В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеотид, как описано ниже.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к двухцепочечному средству RNAi для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5, где двухцепочечное средство RNAi содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь, образующие двухцепочечный участок, где смысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, и антисмысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO:5, где практически все нуклеотиды смысловой цепи и практически все нуклеотиды антисмысловой цепи являются модифицированными нуклеотидами и где смысловая цепь конъюгирована с лигандом, присоединенным на 3'-конце.
В одном варианте осуществления все нуклеотиды смысловой цепи и все нуклеотиды антисмысловой цепи содержат модификации.
В одном варианте осуществления практически все нуклеотиды смысловой цепи являются модифицированными нуклеотидами, выбранными из группы, состоящей из 2'-O-метил модификации, 2'-фтор модификации и 3'-концевого дезокси-тимина (dT) нуклеотида. В другом варианте осуществления практически все нуклеотиды антисмысловой цепи являются модифицированными нуклеотидами, выбранными из группы, состоящей из 2'-O-метил модификации, 2'-фтор модификации и 3'-концевого дезокситимин (dT) нуклеотида. В другом варианте осуществления модифицированные нуклеотиды представляют собой короткую последовательность дезокси-тимин (dT) нуклеотидов. В другом варианте осуществления смысловая цепь содержит две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 5'-конце. В одном варианте осуществления антисмысловая цепь содержит две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 5'конце и две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 3'-конце. В еще одном варианте осуществления смысловая цепь конъюгирована с одним или несколькими производными GalNAc, присоединенными через разветвленный двухвалентный или трехвалентный линкер на 3'-конце.
В одном варианте осуществления по меньшей мере один из модифицированных нуклеотидов выбран из группы, состоящей из 3'-концевого дезокси-тимин (dT) нуклеотида, 2'-O-метил модифицированного нуклеотида, 2'-фтор модифицированного нуклеотида, 2'-дезокси-модифицированного нуклеотида, замкнутого нуклеотида, абазического нуклеотида, 2'-амино-модифицированного нуклеотида, 2'-алкилмодифицированного нуклеотида, нуклеотида морфолино, фосфорамидата, нуклеотида, содержащего основу не природного происхождения, нуклеотида, содержащего 5'-фосфотиоатную группу, и концевого нуклеотида, связанного с производным холестерина или бис-дециламидной группой додекановой кислоты.
В другом варианте осуществления модифицированные нуклеотиды содержат короткую последовательность 3'-концевого дезокси-тимин (dT) нуклеотида.
- 2 044245
В одном варианте осуществления участок комплементарности составляет по меньшей мере 17 нуклеотидов в длину. В другом варианте осуществления участок комплементарности составляет от 19 до 21 нуклеотидов в длину.
В одном варианте осуществления участок комплементарности составляет 19 нуклеотидов в длину.
В одном варианте осуществления каждая цепь составляет не более 30 нуклеотидов в длину.
В одном варианте осуществления по меньшей мере одна цепь содержит 3'-выступ по меньшей мере 1 нуклеотида. В другом варианте осуществления по меньшей мере одна цепь содержит 3'-выступ по меньшей мере 2 нуклеотидов.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, дополнительно содержит лиганд.
В одном варианте осуществления лиганд конъюгирован с 3'-концом смысловой цепи средства, представляющего собой dsRNA.
В одном варианте осуществления лиганд представляет собой производное N-ацетилгалактозамина (GalNAc).
В одном варианте осуществления лиганд представляет собой но ^он н н
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, конъюгировано с лигандом, как показано на следующей схеме:
3'
AcHN £ Η Н где X представляет собой О или S.
В одном варианте осуществления X представляет собой О.
В одном варианте осуществления участок комплементарности состоит из одной из антисмысловых последовательностей в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, выбрано из группы, состоящей из AD-58123, AD-58111, AD-58121, AD-58116, AD-58133, AD-58099, AD-58088, AD-58642, AD58644, AD-58641, AD-58647, AD-58645, AD-58643, AD-58646, AD-62510, AD-62643, AD-62645, AD62646, AD-62650 и AD-62651.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к средству, представляющему собой двухцепочечную рибонуклеиновую кислоту (dsRNA), для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5, где средство, представляющее собой dsRNA, содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь, где смысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность AAGCAAGAUAUUUUUAUAAUA (SEQ ID NO:62) и где антисмысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность UAUUAUAAAAAUAUCUUGCUUUUdTdT (SEQ ID NO:2899).
В другом аспекте настоящее изобретение относится к средству, представляющему собой двухцепочечную рибонуклеиновую кислоту (dsRNA), для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5, где средство, представляющее собой dsRNA, содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь, где смысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность asasGfcAfaGfaUfAfUfuUfuuAfuAfauaL96 (SEQ ID NO:2876) и где антисмысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность usAfsUfuAfuaAfaAfauaUfcUfuGfcuususudTdT (SEQ ID NO:2889).
- 3 044245
В одном аспекте настоящее изобретение предусматривает двухцепочечное средство RNAi для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5 в клетке, где двухцепочечное средство RNAi содержит смысловую цепь, комплементарную антисмысловой цепи, где антисмысловая цепь содержит участок, комплементарный части мРНК, кодирующей С5, где каждая цепь составляет в длину от приблизительно 14 до приблизительно 30 нуклеотидов, где двухцепочечное средство RNAi представлено формулой (III):
смысловая: 5’ np -Na -(X X X) ±-Nb -Y Υ Υ —Nb — (Ζ Ζ Z)j -Na - nq 3 ' антисмысловая: 3’ np ' -Na ' - (X 'X 'X ') k-Nb '-Υ Ύ Ύ ' -Nb ' - (Ζ ' Ζ ' Z ') b-Na ' - nq ' 5’ (III), где каждый из i, j, k и l независимо равняется 0 или 1;
каждый из р, р', q и q' независимо равняется 0-6;
каждый из Na и Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-25 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации, при этом каждая последовательность содержит по меньшей мере два модифицированных различными способами нуклеотида;
каждый из Nb и Nb' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации;
каждый из np, np', nq и nq', каждый из которых может присутствовать или отсутствовать, независимо представляет собой выступающий нуклеотид;
каждый из XXX, YYY, ZZZ, X'X'X', Y'Y'Y' и Z'Z'Z' независимо представляет собой один мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов;
модификации Nb отличаются от модификации Y, а модификации Nb' отличаются от модификации Y'; и где смысловая цепь конъюгирована по меньшей мере с одним лигандом.
В одном варианте осуществления i равняется 0; j равняется 0; i равняется 1; j равняется 1; как i, так и j равняется 0 или как i, так и j равняется 1.
В одном варианте осуществления k равняется 0; l равняется 0; k равняется 1; l равняется 1; как k, так и l равняется 0 или как k, так и l равняется 1.
В одном варианте осуществления XXX комплементарен Х'Х'Х', YYY комплементарен Y'Y'Y', и ZZZ комплементарен Z'Z'Z'.
В одном варианте осуществления мотив YYY находится в сайте расщепления смысловой нити или рядом с ним.
В одном варианте осуществления мотив Y'Y'Y' находится в 11, 12 и 13 положениях антисмысловой цепи от 5'-конца.
В одном варианте осуществления Y' представляет собой 2'-О-метил.
В одном варианте осуществления формула (III) представлена формулой (IIIa): смысловая: 5' np -Na -YYY -Na - nq 3 ' антисмысловая: 3' np,-Na,- ΥΎΎ'- Na>- nq- 5' (Illa).
В другом варианте осуществления формула (III) представлена формулой (IIIb): смысловая: 5' np -Na -YYY -Nb -ZZZ -Na - nq 3' антисмысловая: 3' np--Na-- Υ Ύ 1Y ' -Nb--Z ' Z ' Z ' - Na-- nq- 5' (IIIb), где каждый из Nb и Nb' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 1-5 модифицированных нуклеотидов.
В еще одном варианте осуществления формула (III) представлена формулой (IIIc): смысловая: 5' np -Na -XXX -Nb -YYY -Na - nq 3' антисмысловая: 3' np--Na-- X'X'X'-Nb-- Y'Y'Y'- Na-- nq- 5' (IIIc), где каждый из Nb и Nb' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 1-5 модифицированных нуклеотидов.
В другом варианте осуществления формула (III) представлена формулой (IIId):
Iсмысловая: 5’ np -Na -X X X- Nb -Υ Υ Υ -Nb -Ζ Ζ Ζ -Na - nq 3’ антисмысловая: 3' np--Na-- X'X'X'- Nb--Y ' Y ' Y '-Nb--Z ' Z ' Z ' - Na-- nq- 5' (IIId), где каждый из Nb и Nb' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 1-5 модифицированных нуклеотидов, и каждый из Na и Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 2-10 модифицированных нуклеотидов.
В одном варианте осуществления двухцепочечный участок составляет в длину 15-30 пар нуклеотидов.
В одном варианте осуществления двухцепочечный участок составляет в длину 17-23 пар нуклеотидов. В другом варианте осуществления двухцепочечный участок составляет в длину 17-25 пару нуклеотидов. В другом варианте осуществления двухцепочечный участок составляет в длину 23-27 пары нук- 4 044245 леотидов. В еще одном варианте осуществления двухцепочечный участок составляет в длину 19-21 пар нуклеотидов. В другом варианте осуществления двухцепочечный участок составляет в длину 21-23 пару нуклеотидов.
В одном варианте осуществления каждая цепь содержит 15-30 нуклеотидов.
В одном варианте осуществления модификации нуклеотидов выбраны из группы, состоящей из LNA, HNA, CeNA, 2'-метоксиэтила, 2'-O-алкила, 2'-O-аллила, 2'-С-аллила, 2'-фтора, 2'-дезокси, 2'гидроксила и их комбинаций.
В другом варианте осуществления модификациями нуклеотидов представляют собой 2'-O-метил или 2'-фтор модификации.
В одном варианте осуществления лигандом является одно или несколько производных GalNAc, присоединенных посредством двухвалентного или трехвалентного разветвленного линкера. В одном варианте осуществления лиганд представляет собой
В одном варианте осуществления лиганд прикреплен к 3'-концу смысловой цепи.
В одном варианте осуществления средство RNAi конъюгировано с лигандом, как показано на следующей схеме:
В одном варианте осуществления средство дополнительно содержит по меньшей мере одну фосфотиоатную или метилфосфонатную межнуклеотидную связь.
В одном варианте осуществления фосфотиоатная или метилфосфонатная межнуклеотидная связь находится на 3'-конце одной цепи.
В одном варианте осуществления цепь представляет собой антисмысловую цепь. В другом варианте осуществления цепь представляет собой смысловую цепь.
В одном варианте осуществления фосфотиоатная или метилфосфонатная межнуклеотидная связь находится на 5'-конце одной цепи.
В одном варианте осуществления цепь представляет собой антисмысловую цепь. В другом варианте осуществления цепь представляет собой смысловую цепь.
В одном варианте осуществления фосфотиоатная или метилфосфонатная межнуклеотидная связь находится как на 5'-, так и на 3'-конце одной цепи.
В одном варианте осуществления цепь представляет собой антисмысловую цепь.
В одном варианте осуществления пара оснований в 1 положении 5'-конца антисмысловой цепи дуплекса является парой оснований AU.
В одном варианте осуществления нуклеотиды Y имеют 2'-фтор-модификацию.
В одном варианте осуществления нуклеотиды Y' имеют 2'-O-метил-модификацию.
В одном варианте осуществления р’>0.
В одном варианте осуществления р-2.
В одном варианте осуществления q'=0, p=0, q=0, и выступающие нуклеотиды р' комплементарны целевой мРНК.
В другом варианте осуществления q'=0, p-0, q-0, и выступающие нуклеотиды р' не комплементарны целевой мРНК.
В одном варианте осуществления смысловая цепь содержит в общей сложности 21 нуклеотид, а антисмысловая цепь содержит в общей сложности 23 нуклеотида.
- 5 044245
В одном варианте осуществления по меньшей мере один np' связан с соседним нуклеотидом посредством фосфотиоатной связи.
В одном варианте осуществления все np' связаны с соседними нуклеотидами посредством фосфотиоатных связей.
В одном варианте осуществления средство RNAi выбрано из группы средств RNAi, перечисленных в табл. 4, табл. 18, табл. 19 или табл. 23. В другом варианте осуществления средство RNAi выбрано из группы, состоящий из AD-58123, AD-58111, AD-58121, AD-58116, AD-58133, AD-58099, AD-58088, AD58642, AD-58644, AD-58641, AD-58647, AD-58645, AD-58643, AD-58646, AD-62510, AD-62643, AD62645, AD-62646, AD-62650 и AD-62651.
В одном аспекте настоящее изобретение предусматривает двухцепочечное средство RNAi для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5 в клетке, где указанное двухцепочечное средство RNAi содержит смысловую цепь, комплементарную антисмысловой цепи, где указанная антисмысловая цепь содержит участок, комплементарный части мРНК, кодирующей компонент комплемента С5, где каждая цепь составляет в длину от приблизительно 14 до приблизительно 30 нуклеотидов, где указанное двухцепочечное средство RNAi представлено формулой (III):
смысловая: 5’ np -Na -(X X X) i-Nb -YYY -Nb - (Ζ Z Z)j -Na - nq 3 ’ антисмысловая: 3' np '-Na ' - (X'X'X ') k-Nb '-Υ Ύ Ύ '-Nb ' - (Ζ ' Ζ ' Ζ ') b-Na ' - nq ' 5’ (III), где каждый из i, j, k и l независимо равняется 0 или 1;
каждый из р, р', q и q' независимо равняется 0-6;
каждый из Na и Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-25 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации, при этом каждая последовательность содержит по меньшей мере два модифицированных различными способами нуклеотида;
каждый из Nb и Nb' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации;
каждый из np, np', nq и nq', каждый из которых может присутствовать или отсутствовать, независимо представляет собой выступающий нуклеотид;
каждый из XXX, YYY, ZZZ, X'X'X', YY'Y' и Z'Z'Z' независимо представляет собой один мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов, и где модификации являются 2'-Oметил- или 2'-фтор-модификациями;
модификации Nb отличаются от модификации Y, а модификации Nb' отличаются от модификации Y'; и где смысловая цепь конъюгирована по меньшей мере с одним лигандом.
В другом аспекте настоящее изобретение предусматривает двухцепочечное средство RNAi для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5 в клетке, где указанное двухцепочечное средство RNAi содержит смысловую цепь, комплементарную антисмысловой цепи, где указанная антисмысловая цепь содержит участок, комплементарный части мРНК, кодирующей компонент комплемента С5, где каждая цепь составляет в длину от приблизительно 14 до приблизительно 30 нуклеотидов, где указанное двухцепочечное средство RNAi представлено формулой (III):
смысловая: 5’ np -Na - (X X X) i-Nb -YYY -Nb -(Ζ Z Z)j -Na - nq 3 ’ антисмысловая: 3’ np ' -Na ' - (X 'X 'X ') k-Nb '-Y Ύ Ύ ' -Nb ' - (Ζ ' Ζ ' Z ') b-Na ' - nq ' 5’ (III), где каждый из i, j, k и l независимо равняется 0 или 1;
каждый из np, nq, и nq', каждый из которых может присутствовать или отсутствовать, независимо представляет собой выступающий нуклеотид;
каждый из р, q и q' независимо равняется 0-6;
np'>0, и по меньшей мере один np' связан с соседним нуклеотидом посредством фосфотиоатной связи;
каждый из Na и Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-25 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации, при этом каждая последовательность содержит по меньшей мере два модифицированных различными способами нуклеотида;
каждый из Nb и Nb' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации;
каждый из XXX, YYY, ZZZ, X'X'X', Y'Y'Y' и Z'Z'Z' независимо представляет собой один мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов, и где модификации являются 2'-Oметил- или 2'-фтор-модификациями;
модификации Nb отличаются от модификации Y, а модификации Nb' отличаются от модификации Y'; и где смысловая цепь конъюгирована по меньшей мере с одним лигандом.
- 6 044245
В другом аспекте настоящее изобретение предусматривает двухцепочечное средство RNAi для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5 в клетке, где указанное двухцепочечное средство RNAi содержит смысловую цепь, комплементарную антисмысловой цепи, где указанная антисмысловая цепь содержит участок, комплементарный части мРНК, кодирующей компонент комплемента С5, где каждая цепь составляет в длину от приблизительно 14 до приблизительно 30 нуклеотидов, где указанное двухцепочечное средство RNAi представлено формулой (III):
смысловая: 5’ np -Na - (X X X) i-Nb -YYY -Nb -(Z Z Z)j -Na - nq 3 ’ антисмысловая: 3’ np '-Na ' - (X'X'X ') k-Nb '-Y ' Y ' Y '-Nb ' - (Z ' Z ' Z ') b-Na ' - nq ' 5’ (III), где каждый из i, j, k и l независимо равняется 0 или 1;
каждый из np, nq, и nq', каждый из которых может присутствовать или отсутствовать, независимо представляет собой выступающий нуклеотид;
каждый из р, q и q' независимо равняется 0-6;
np'>0, и по меньшей мере один np' связан с соседним нуклеотидом посредством фосфотиоатной связи;
каждый из Na и Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-25 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации, при этом каждая последовательность содержит по меньшей мере два модифицированных различными способами нуклеотида;
каждый из Nb и Nb' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации;
каждый из XXX, YYY, ZZZ, X'X'X', Y'Y'Y' и Z'Z'Z' независимо представляет собой один мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов, и где модификации являются 2'-Oметил- или 2'-фтор-модификациями;
модификации Nb отличаются от модификации Y, а модификации Nb' отличаются от модификации Y'; и где смысловая цепь конъюгирована по меньшей мере с одним лигандом, где лигандом является одно или несколько производных GalNAc, присоединенных посредством двухвалентного или трехвалентного разветвленного линкера.
В еще одном аспекте настоящее изобретение предусматривает двухцепочечное средство RNAi для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5 в клетке, где указанное двухцепочечное средство RNAi содержит смысловую цепь, комплементарную антисмысловой цепи, где указанная антисмысловая цепь содержит участок, комплементарный части мРНК, кодирующей компонент комплемента С5, где каждая цепь составляет в длину от приблизительно 14 до приблизительно 30 нуклеотидов, где указанное двухцепочечное средство RNAi представлено формулой (III):
смысловая: 5’ np -Na - (X X X) i-Nb -YYY -Nb -(Z Z Z)j -Na - nq 3 ’ антисмысловая: 3’ np ' -Na ' - (X 'X 'X ') k-Nb '-Y Ύ Ύ ' -Nb ' - (Z ' Z ' Z ') b-Na ' - nq ' 5’ (III), где каждый из i, j, k и l независимо равняется 0 или 1;
каждый из np, nq, и nq', каждый из которых может присутствовать или отсутствовать, независимо представляет собой выступающий нуклеотид;
каждый из р, q и q' независимо равняется 0-6;
np'>0, и по меньшей мере один np' связан с соседним нуклеотидом посредством фосфотиоатной связи;
каждый из Na и Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-25 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации, при этом каждая последовательность содержит по меньшей мере два модифицированных различными способами нуклеотида;
каждый из Nb и Nb' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации;
каждый из XXX, YYY, ZZZ, X'X'X', Y'Y'Y' и Z'Z'Z' независимо представляет собой один мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов, и где модификации являются 2'-Oметил- или 2'-фтор-модификациями;
модификации Nb отличаются от модификации Y, а модификации Nb' отличаются от модификации Y';
где смысловая цепь содержит по меньшей мере одну фосфотиоатную связь; и где смысловая цепь конъюгирована по меньшей мере с одним лигандом, где лигандом является одно или несколько производных GalNAc, присоединенных посредством двухвалентного или трехвалентного разветвленного линкера.
В другом аспекте настоящее изобретение предусматривает двухцепочечное средство RNAi для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5 в клетке, где указанное двухцепочечное средство
- 7 044245
RNAi содержит смысловую цепь, комплементарную антисмысловой цепи, где указанная антисмысловая цепь содержит участок, комплементарный части мРНК, кодирующей компонент комплемента С5, где каждая цепь составляет в длину от приблизительно 14 до приблизительно 30 нуклеотидов, где указанное двухцепочечное средство RNAi представлено формулой (III):
смысловая: 5' np -Na -Y Y Y - Na - nq 3' антисмысловая: 3' np'-Na'- ΥΎΎ'- Na'- nq' 5' (Illa), где каждый из np, nq, и nq', каждый из которых может присутствовать или отсутствовать, независимо представляет собой выступающий нуклеотид;
каждый из р, q и q' независимо равняется 0-6;
np'>0, и по меньшей мере один np' связан с соседним нуклеотидом посредством фосфотиоатной связи;
каждый из Na и Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-25 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации, при этом каждая последовательность содержит по меньшей мере два модифицированных различными способами нуклеотида;
каждый из YYY и YY'Y' независимо представляет собой один мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов, и где модификации являются 2'-O-метил- или 2'-фтормодификациями;
где смысловая цепь содержит по меньшей мере одну фосфотиоатную связь; и где смысловая цепь конъюгирована по меньшей мере с одним лигандом, где лигандом является одно или несколько производных GalNAc, присоединенных посредством двухвалентного или трехвалентного разветвленного линкера.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к двухцепочечному средству RNAi для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5, где двухцепочечное средство RNAi содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь, образующие двухцепочечный участок, где смысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, и антисмысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO:5, где практически все нуклеотиды смысловой цепи содержат модификации, выбранные из группы, состоящей из 2'-O-метuл модификации и 2'фтор модификации, где смысловая цепь содержит две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 5'-конце, где практически все нуклеотиды антисмысловой цепи содержат модификации, выбранные из группы, состоящей из 2'-O-метuл модификации и 2'-фтор модификации, где антисмысловая цепь содержит две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 5'-конце и две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 3'-конце, и где смысловая цепь конъюгирована с одним или несколькими производными GalNAc, присоединенными через разветвленный двухвалентный или трехвалентный линкер на 3'-конце.
В одном варианте осуществления все нуклеотиды смысловой цепи и все нуклеотиды антисмысловой цепи представляют собой модифицированные нуклеотиды. В другом варианте осуществления каждая цепь содержит 19-30 нуклеотидов.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к клетке, содержащей средство, представляющее собой dsRNA, по настоящему изобретению.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к вектору, кодирующему по меньшей мере одну цепь средства, представляющего собой dsRNA, где средство, представляющее собой dsRNA, содержит участок комплементарности к по меньшей мере части мРНК, кодирующей компонент комплемента С5, где dsRNA составляет в длину 30 пар оснований или меньше, и где средство, представляющее собой dsRNA, нацелено на мРНК с целью отщепления.
В одном варианте осуществления участок комплементарности составляет по меньшей мере 15 нуклеотидов в длину. В другом варианте осуществления участок комплементарности составляет 19-21 нуклеотида в длину. В другом варианте осуществления каждая цепь содержит 19-30 нуклеотидов.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к клетке, содержащей вектор по настоящему изобретению.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции для ингибирования экспрессии гена компонента комплемента С5, содержащей средство, представляющее собой dsRNA, по настоящему изобретению.
В одном варианте осуществления средство RNAi вводят в не забуференном растворе.
В одном варианте осуществления не забуференный раствор представляет собой физиологический раствор или воду.
В одном варианте осуществления средство RNAi вводят в буферном растворе.
В одном варианте осуществления буферный раствор содержит ацетат, цитрат, проламин, карбонат или фосфат, или любую их комбинацию.
В другом варианте осуществления буферный раствор представляет собой забуференный фосфатом физиологический раствор (PBS).
- 8 044245
В другом аспекте настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, содержащей двухцепочечное средство RNAi по настоящему изобретению и липидный состав.
В одном варианте осуществления липидный состав включает LNP. В другом варианте осуществления липидный состав включает MC3.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к композиции, содержащей средство антисмыслового полинуклеотида, выбранного из группы, состоящей из последовательностей, перечисленных в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 19, 18, 20, 21 и 23.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к композиции, содержащей средство смыслового полинуклеотида, выбранного из группы, состоящей из последовательностей, перечисленных в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 19, 18, 20, 21 и 23.
В еще одном аспекте настоящее изобретение относится к средству модифицированного антисмыслового полинуклеотида, выбранного из группы, состоящей из антисмысловых последовательностей, перечисленных в любой из табл. 4, 6, 18, 19, 21 и 23.
В дополнительном аспекте настоящее изобретение относится к средству модифицированного смыслового полинуклеотида, выбранного из группы, состоящей из смысловых последовательностей, перечисленных в любой из табл. 4, 6, 18, 19, 21 и 23.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к способам лечения субъекта, страдающего заболеванием или нарушением, при котором снижение экспрессии компонента комплемента С5 окажет благоприятное воздействие. Способы включают введение субъекту терапевтически эффективного количества средства, представляющего собой dsRNA, содержащего смысловую цепь и антисмысловую цепь, где смысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, и антисмысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:5, осуществляя тем самым лечение субъекта.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способам предотвращения по меньшей мере одного симптома у субъекта, страдающего заболеванием или нарушением, при котором снижение экспрессии компонента комплемента С5 окажет благоприятное воздействие. Способы включают введение субъекту терапевтически эффективного количества средства, представляющего собой dsRNA, содержащего смысловую цепь и антисмысловую цепь, где смысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, и антисмысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:5, предотвращая тем самым по меньшей мере один симптом у субъекта, страдающего заболеванием, при котором снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способам лечения субъекта, страдающего заболеванием или нарушением, при котором снижение экспрессии компонента комплемента С5 окажет благоприятное воздействие. Способы включают введение субъекту терапевтически эффективного количества средства, представляющего собой dsRNA, содержащего смысловую цепь и антисмысловую цепь, при этом антисмысловая цепь содержит участок комплементарности, который содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающийся не более чем на 3 нуклеотида от любой из антисмысловых последовательностей, перечисленных в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21, 23, осуществляя тем самым лечение субъекта.
В еще одном аспекте настоящее изобретение относится к способам предотвращения по меньшей мере одного симптома у субъекта, страдающего заболеванием или нарушением, при котором снижение экспрессии компонента комплемента С5 окажет благоприятное воздействие. Способы включают введение субъекту профилактически эффективного количества средства, представляющего собой dsRNA, содержащего смысловую цепь и антисмысловую цепь, при этом антисмысловая цепь содержит участок комплементарности, который содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающийся не более чем на 3 нуклеотида от любой из антисмысловых последовательностей, перечисленных в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23, предотвращая тем самым по меньшей мере один симптом у субъекта, страдающего заболеванием, при котором снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к способам лечения субъекта, страдающего заболеванием или нарушением, при котором снижение экспрессии компонента комплемента С5 окажет благоприятное воздействие, которые включают введение субъекту терапевтически эффективного количества двухцепочечного средства RNAi, где двухцепочечное средство RNAi содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь, образующие двухцепочечный участок, где смысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, и антисмысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO:5, где практически все нуклеотиды антисмысловой цепи и практически все нуклеотиды смысловой цепи являются модифицированными нуклеотидами, и где смысловая цепь конъюгирована с одним или несколькими лигандами на 3'-конце.
- 9 044245
В одном варианте осуществления все нуклеотиды смысловой цепи и все нуклеотиды антисмысловой цепи представляют собой модифицированные нуклеотиды.
В одном варианте осуществления введение представляет собой подкожное введение.
В одном варианте осуществления практически все нуклеотиды смысловой цепи являются модифицированными нуклеотидами, выбранными из группы, состоящей из 2'-O-метил модификации, 2'-фтор модификации и 3'-концевого dT нуклеотида. В другом варианте осуществления практически все нуклеотиды антисмысловой цепи являются модифицированными нуклеотидами, выбранными из группы, состоящей из 2'-O-метил модификации, 2'-фтор модификации и 3'-концевого дезокси-тимин (dT) нуклеотида. В другом варианте осуществления модифицированные нуклеотиды представляют собой короткую последовательность дезокси-тимин (dT) нуклеотидов. В другом варианте осуществления смысловая цепь содержит две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 5'-конце. В одном варианте осуществления антисмысловая цепь содержит две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 5'-конце и две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 3'-конце. В еще одном варианте осуществления смысловая цепь конъюгирована с одним или несколькими производными GalNAc, присоединенными через разветвленный двухвалентный или трехвалентный линкер на 3'-конце.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способам предотвращения по меньшей мере одного симптома у субъекта, страдающего заболеванием или нарушением, при котором снижение экспрессии компонента комплемента С5 окажет благоприятное воздействие, которые включают введение субъекту профилактически эффективного количества двухцепочечного средства RNAi, где двухцепочечное средство RNAi содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь, образующие двухцепочечный участок, где смысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, и антисмысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO:5, где практически все нуклеотиды антисмысловой цепи и практически все нуклеотиды смысловой цепи являются модифицированными нуклеотидами, и где смысловая цепь конъюгирована с одним лигандом на 3'-конце.
В одном варианте осуществления все нуклеотиды смысловой цепи и все нуклеотиды антисмысловой цепи представляют собой модифицированные нуклеотиды.
В одном варианте осуществления введение представляет собой подкожное введение.
В одном варианте осуществления практически все нуклеотиды смысловой цепи являются модифицированными нуклеотидами, выбранными из группы, состоящей из 2'-O-метил модификации, 2'-фтор модификации и 3'-концевого dT нуклеотида. В другом варианте осуществления практически все нуклеотиды антисмысловой цепи являются модифицированными нуклеотидами, выбранными из группы, состоящей из 2'-O-метил модификации, 2'-фтор модификации и 3'-концевого дезокси-тимин (dT) нуклеотида. В другом варианте осуществления модифицированные нуклеотиды представляют собой короткую последовательность дезокси-тимин (dT) нуклеотидов. В другом варианте осуществления смысловая цепь содержит две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 5'-конце. В одном варианте осуществления антисмысловая цепь содержит две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 5'-конце и две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 3'-конце. В еще одном варианте осуществления смысловая цепь конъюгирована с одним или несколькими производными GalNAc, присоединенными через разветвленный двухвалентный или трехвалентный линкер на 3'-конце.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к способам лечения субъекта, страдающего заболеванием или нарушением, при котором снижение экспрессии компонента комплемента С5 окажет благоприятное воздействие. Способы включают введение субъекту терапевтически эффективного количества средства, представляющего собой dsRNA, содержащего смысловую цепь, комплементарную антисмысловой цепи, где антисмысловая цепь содержит участок, комплементарный части мРНК, кодирующей С5, где каждая цепь составляет в длину от приблизительно 14 до приблизительно 30 нуклеотидов, где двухцепочечное средство RNAi представлено формулой (III):
смысловая: 5’ пр -Na - (X X X) i-Nb -Y Y Y -Nb - (Ζ Ζ Z)j -Na - nq 3 ’ антисмысловая: 3’ пр ' -Na ' - (X 'X 'X ') k-Nb '-Υ Ύ Ύ ' -Nb ' - (Ζ ' Ζ ' Ζ ' ) b-Na ' - nq ' 5’ (III), где каждый из i, j, k и l независимо равняется 0 или 1;
каждый из р, р', q и q' независимо равняется 0-6;
каждый из Na и Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-25 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации, при этом каждая последовательность содержит по меньшей мере два модифицированных различными способами нуклеотида;
каждый из Nb и Nb' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации;
каждый из np, np', nq и nq', каждый из которых может присутствовать или отсутствовать, независимо представляет собой выступающий нуклеотид;
- 10 044245 каждый из XXX, YYY, ZZZ, X'X'X', YY'Y' и Z'Z'Z' независимо представляет собой один мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов;
модификации Nb отличаются от модификации Y, а модификации Nb' отличаются от модификации
Y'; и где смысловая цепь конъюгирована с по меньшей мере одним лигандом; с помощью которого осуществляется лечение субъекта, при котором осуществляется лечение субъекта, страдающего заболеванием или нарушением, при котором снижение экспрессии компонента комплемента С5 окажет благоприятное воздействие.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способам предотвращения по меньшей мере одного симптома у субъекта, страдающего заболеванием или нарушением, при котором снижение экспрессии компонента комплемента С5 окажет благоприятное воздействие. Способы включают введение субъекту профилактически эффективного количества средства, представляющего собой dsRNA, содержащего смысловую цепь, комплементарную антисмысловой цепи, где антисмысловая цепь содержит участок, комплементарный части мРНК, кодирующей С5, где каждая цепь составляет в длину от приблизительно 14 до приблизительно 30 нуклеотидов, где двухцепочечное средство RNAi представлено формулой (III):
смысловая: 5’ np -Na - (X X X) i-Nb -YYY -Nb -(Z Z Z)j -Na - nq 3 ’ антисмысловая: 3’ np ' -Na ' - (X 'X 'X ') k-Nb '-Y Ύ Ύ ' -Nb ' - (Z ' Z ' Z ') b-Na ' - nq ' 5’ (III), где каждый из i, j, k и l независимо равняется 0 или 1;
каждый из р, р', q и q' независимо равняется 0-6;
каждый из Na и Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-25 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации, при этом каждая последовательность содержит по меньшей мере два модифицированных различными способами нуклеотида;
каждый из Nb и Nb независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации;
каждый из np, np', nq и nq', каждый из которых может присутствовать или отсутствовать, независимо представляет собой выступающий нуклеотид;
каждый из XXX, YYY, ZZZ, X'X'X', Y'Y'Y' и Z'Z'Z' независимо представляет собой один мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов;
модификации Nb отличаются от модификации Y, а модификации Nb' отличаются от модификации Y'; и где смысловая цепь конъюгирована с по меньшей мере одним лигандом; с помощью которого предотвращается по меньшей мере один симптом у субъекта, страдающего заболеванием, при котором снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, тем самым предотвращая по меньшей мере один симптом у субъекта, страдающего заболеванием или нарушением, при котором снижение экспрессии компонента комплемента С5 окажет благоприятное воздействие.
В одном варианте осуществления введение dsRNA субъекту приводит к уменьшению внутрисосудистого гемолиза, стабилизации уровня гемоглобина и/или снижению скопления белка С5.
В одном варианте осуществления заболевание представляет собой заболевание, связанное с компонентом комплемента С5. В одном варианте осуществления заболевание, связанное с компонентом комплемента С5, выбрано из группы, состоящей из ночной пароксизмальной гемоглобинурии (PNH), атипичного гемолитико-уремического синдрома (aHUS), астмы, ревматоидного артрита (RA), синдрома антифосфолипидных антител, волчаночного нефрита, ишемически-реперфузионного повреждения, типичного или инфекционного гемолитико-уремического синдрома (tHUS), болезни плотного осадка (DDD), оптиконевромиелита (NMO), мультифокальной моторной нейропатии (MMN), рассеянного склероза (MS); дегенерации желтого пятна (например, связанной с возрастом дегенерации желтого пятна (AMD)); синдрома, включающего гемолиз, повышение активности печеночных ферментов и снижение числа тромбоцитов (HELLP-синдром); пурпуры тромботической тромбоцитопенической (ТТР); спонтанной потери плода; пауци-иммунного васкулита; буллезного эпидермолиза; рецидивирующей потери плода; преэклампсии, черепно-мозговой травмы, миастении, болезни холодовых агглютининов, дерматомиозита буллезного пемфигоида, связанного с Шига-подобным токсином Е. coli гемолитико-уремического синдрома, C3-нефропатии, васкулита, связанного с антителами к цитоплазме нейтрофилов; реакций отторжения трансплантата, вызванных гуморальными и сосудистыми механизмами, дисфункции трансплантата, инфаркта миокарда, аллогенной трансплантации, сепсиса, заболевания коронарной артерии, дерматомиозита, болезни Грейвса, атеросклероза, болезни Альцгеймера, сепсиса, связанного с системным воспалительным ответом, септического шока, травмы спинного мозга, гломерулонефрита, тиреоидита Хашимото, диабета I типа, псориаза, пузырчатки, аутоиммунной гемолитической анемии (AIHA), ITP, синдрома Гудпасчера, болезни Дегоса, антифосфолипидного синдрома (APS), катастрофического APS (CAPS), сердечно-сосудистых нарушений, миокардита, цереброваскулярного нарушения, перифериче- 11 044245 ских сосудистых нарушений, реноваскулярной гипертензии, нарушений брыжеечных/кишечных сосудов, васкулита, нефрита Шенлейна-Геноха, васкулита, связанного с системной красной волчанкой, васкулита, связанного с ревматоидным артритом, васкулита, связанного с иммунными комплексами, болезни Такаясу, дилатационной кардиомиопатии, диабетической ангиопатии, болезни Кавасаки (артериита), венозной газовой эмболии (VGE) и рестеноза после установки стента, вращательной атерэктомии, перепончатой нефропатии, синдрома Гийена-Барре и чрескожной транслюминальной коронарной ангиопластики (РТСА). В другом варианте осуществления заболевание, связанное с компонентом комплемента С5, представляет собой ночную пароксизмальную гемоглобинурию (PNH). В еще одном варианте осуществления заболевание, связанное с компонентом комплемента С5, представляет собой атипичный гемолитико-уремический синдром (aHUS).
В одном варианте осуществления субъектом является человек.
В другом варианте осуществления способы по настоящему изобретению дополнительно включают введение субъекту антитела к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающего фрагмента.
В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент ингибирует расщепление компонента комплемента С5 на фрагменты С5а и С5Ь. В другом варианте осуществления антитело к компоненту комплемента С5 представляет собой экулизумаб.
В другом варианте осуществления способы по настоящему изобретению дополнительно включают введение субъекту менингококковой вакцины.
В одном варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг в течение 4 недель с последующей пятой дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 900 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 900 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В другом варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 900 мг в течение 4 недель с последующей пятой дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 1200 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 1200 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В одном варианте осуществления возраст субъекта меньше чем 18 лет и экулизумаб вводят субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 900 мг в течение 4 недель с последующей пятой дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 1200 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 1200 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В другом варианте осуществления возраст субъекта меньше чем 18 лет и экулизумаб вводят субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг в течение 2 недель с последующей третьей дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 900 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 900 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В другом варианте осуществления возраст субъекта меньше чем 18 лет и экулизумаб вводят субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг в течение 2 недель с последующей третьей дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 600 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 600 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В еще одном варианте осуществления возраст субъекта меньше чем 18 лет и экулизумаб вводят субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг в течение 1 недели с последующей второй дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 300 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 300 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В одном варианте осуществления возраст субъекта меньше чем 18 лет и экулизумаб вводят субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 300 мг в течение 1 недели с последующей второй дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 300 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 300 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В другом варианте осуществления способы по настоящему изобретению дополнительно включают плазмоферез или замещение плазмы у субъекта. В одном таком варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту в дозе менее чем приблизительно 600 мг или в дозе менее чем приблизительно 300 мг.
В другом варианте осуществления способы по настоящему изобретению дополнительно включают инфузию плазмы субъекту. В одном таком варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту в дозе менее чем приблизительно 300 мг.
В одном варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту в дозе от приблизительно 0,01 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг или от приблизительно 0,5 мг/кг до приблизительно 15 мг/кг. В другом варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту в дозе от приблизительно 5 мг/кг до приблизительно 15 мг/кг.
В одном варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту в дозе, выбранной из группы, состоящей из 0,5 мг/кг, 1 мг/кг, 1,5 мг/кг, 3 мг/кг, 5 мг/кг, 7 мг/кг, 10 мг/кг и 15 мг/кг.
В одном варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту путем внутривенной инфузии.
В другом варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту подкожно.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят в дозе от приблизительно 0,01 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг или от приблизительно 0,5 мг/кг до приблизительно 50 мг/кг.
- 12 044245
В другом варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят в дозе от приблизительно 10 мг/кг до приблизительно 30 мг/кг.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят в дозе, выбранной из группы, состоящей из 0,5 мг/кг, 1 мг/кг, 1,5 мг/кг, 3 мг/кг, 5 мг/кг, 10 мг/кг и 30 мг/кг.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят субъекту один раз в неделю. В другом варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят субъекту два раза в неделю. В другом варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят субъекту два раза в месяц.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят субъекту подкожно.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, и экулизумаб вводят субъекту подкожно. В другом варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, и экулизумаб вводят субъекту одновременно.
В одном варианте осуществления сначала вводят субъекту средство, представляющее собой dsRNA, в период времени, достаточный для снижения уровня компонента комплемента С5 у субъекта, и затем вводят экулизумаб в дозе менее чем приблизительно 600 мг.
В одном варианте осуществления уровень компонента комплемента С5 у субъекта снижен на по меньшей мере приблизительно 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85% или 90%.
В одном варианте осуществления экулизумаб вводят в дозе приблизительно 100-500 мг.
В одном варианте осуществления способы по настоящему изобретению дополнительно включают измерение уровней гемоглобина и/или LDH у субъекта.
В одном варианте осуществления dsRNA конъюгирована с лигандом.
В одном варианте осуществления лиганд конъюгирован с 3'-концом смысловой цепи dsRNA.
В одном варианте осуществления лиганд представляет собой производное N-ацетилгалактозамина (GalNAc).
В одном аспекте настоящее изобретение относится к способам ингибирования экспрессии компонента комплемента С5 в клетке. Способы включают приведение клетки в контакт со средством, представляющим собой dsRNA, содержащим смысловую цепь и антисмысловую цепь, где смысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, и антисмысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:5; и поддержание клетки, полученной на стадии (а) в течение времени, достаточного для разрушения транскрипта мРНК гена С5, тем самым ингибируя экспрессию гена С5 в клетке.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способам ингибирования экспрессии компонента комплемента С5 в клетке. Способы включают приведение клетки в контакт со средством, представляющим собой dsRNA, содержащим смысловую цепь и антисмысловую цепь, где антисмысловая цепь содержит участок комплементарности, который содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающийся не более чем на 3 нуклеотида от любой из антисмысловых последовательностей, перечисленных в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23; и поддержание клетки, полученной на стадии (а) в течение времени, достаточного для разрушения транскрипта мРНК гена С5, тем самым ингибируя экспрессию гена С5 в клетке.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способам ингибирования экспрессии компонента комплемента С5 в клетке, включающими приведение клетки в контакт со средством, представляющим собой dsRNA, содержащим смысловую цепь и антисмысловую цепь, содержащую участок комплементарности, где смысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, и антисмысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO:5, где практически все нуклеотиды антисмысловой цепи и практически все нуклеотиды смысловой цепи являются модифицированными нуклеотидами и где смысловая цепь конъюгирована с одним или несколькими лигандами на 3'-конце; и поддержание клетки, полученной на первой стадии в течение времени, достаточного для разрушения транскрипта мРНК гена С5, тем самым ингибируя экспрессию гена С5 в клетке.
В одном варианте осуществления все нуклеотиды смысловой цепи и все нуклеотиды антисмысловой цепи представляют собой модифицированные нуклеотиды.
В одном варианте осуществления практически все нуклеотиды смысловой цепи являются модифицированными нуклеотидами, выбранными из группы, состоящей из 2'-O-метил модификации, 2'-фтор модификации и 3'-концевого dT нуклеотида. В другом варианте осуществления практически все нуклеотиды антисмысловой цепи являются модифицированными нуклеотидами, выбранными из группы, состоящей из 2'-O-метил модификации, 2'-фтор модификации и 3'-концевого дезокси-тимин (dT) нуклеотида. В другом варианте осуществления модифицированные нуклеотиды представляют собой короткую последовательность дезокси-тимин (dT) нуклеотидов. В другом варианте осуществления смысловая цепь содержит две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 5'-конце. В одном варианте осуществления ан- 13 044245 тисмысловая цепь содержит две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 5'-конце и две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 3'-конце. В еще одном варианте осуществления смысловая цепь конъюгирована с одним или несколькими производными GalNAc, присоединенными через разветвленный двухвалентный или трехвалентный линкер на 3'-конце.
В еще одном аспекте настоящее изобретение относится к способам ингибирования экспрессии компонента комплемента С5 в клетке. Способы включают приведение клетки в контакт со средством, представляющим собой dsRNA, содержащим смысловую цепь, комплементарную антисмысловой цепи, где антисмысловая цепь содержит участок, комплементарный части мРНК, кодирующей С5, где каждая цепь составляет в длину от приблизительно 14 до приблизительно 30 нуклеотидов, где двухцепочечное средство RNAi представлено формулой (III):
смысловая: 5’ np -Na - (X X X) i-Nb -Y Y Y -Nb - (Ζ Ζ Z)j -Na - nq 3 ’ антисмысловая: 3’ np ' -Na ' - (X 'X 'X ') k-Nb '-Y Ύ Ύ ' -Nb ' - (Ζ ' Ζ ' Z ') b-Na ' - nq ' 5’ (III), где каждый из i, j, k и l независимо равняется 0 или 1;
каждый из р, р', q и q' независимо равняется 0-6;
каждый из Na и Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-25 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации, при этом каждая последовательность содержит по меньшей мере два модифицированных различными способами нуклеотида;
каждый из Nb и Nb' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации;
каждый из np, np', nq и nq', каждый из которых может присутствовать или отсутствовать, независимо представляет собой выступающий нуклеотид;
каждый из XXX, YYY, ZZZ, X'X'X', YYY и Z'Z'Z' независимо представляет собой один мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов;
модификации Nb отличаются от модификации Y, а модификации Nb' отличаются от модификации Y'; и где смысловая цепь конъюгирована с по меньшей мере одним лигандом; и поддержание клетки, полученной на стадии (а) в течение времени, достаточного для разрушения транскрипта мРНК гена С5, тем самым ингибируя экспрессию гена С5 в клетке.
В одном варианте осуществления клетка находится в субъекте.
В одном варианте осуществления субъектом является человек.
В одном варианте осуществления, субъект-человек страдает от заболевания, связанного с компонентом комплемента С5.
В одном варианте осуществления заболевание, связанное с компонентом комплемента С5, выбрано из группы, состоящей из ночной пароксизмальной гемоглобинурии (PNH), атипичного гемолитикоуремического синдрома (aHUS), астмы, ревматоидного артрита (RA), синдрома антифосфолипидных антител, волчаночного нефрита, ишемически-реперфузионного повреждения, типичного или инфекционного гемолитико-уремического синдрома (tHUS), болезни плотного осадка (DDD), оптиконевромиелита (NMO), мультифокальной моторной нейропатии (MMN), рассеянного склероза (MS); дегенерации желтого пятна (например, связанной с возрастом дегенерации желтого пятна (AMD)); синдрома, включающего гемолиз, повышение активности печеночных ферментов и снижение числа тромбоцитов (HELLP-синдром); пурпуры тромботической тромбоцитопенической (ТТР); спонтанной потери плода; пауци-иммунного васкулита; буллезного эпидермолиза; рецидивирующей потери плода; преэклампсии, черепно-мозговой травмы, миастении, болезни холодовых агглютининов, дерматомиозита буллезного пемфигоида, связанного с Шига-подобным токсином Е. coli гемолитико-уремического синдрома, C3нефропатии, васкулита, связанного с антителами к цитоплазме нейтрофилов; реакций отторжения трансплантата, вызванных гуморальными и сосудистыми механизмами, дисфункции трансплантата, инфаркта миокарда, аллогенной трансплантации, сепсиса, заболевания коронарной артерии, дерматомиозита, болезни Грейвса, атеросклероза, болезни Альцгеймера, сепсиса, связанного с системным воспалительным ответом, септического шока, травмы спинного мозга, гломерулонефрита, тиреоидита Хашимото, диабета I типа, псориаза, пузырчатки, аутоиммунной гемолитической анемии (AIHA), ITP, синдрома Гудпасчера, болезни Дегоса, антифосфолипидного синдрома (APS), катастрофического APS (CAPS), сердечнососудистых нарушений, миокардита, цереброваскулярного нарушения, периферических сосудистых нарушений, реноваскулярной гипертензии, нарушений брыжеечных/кишечных сосудов, васкулита, нефрита Шенлейна-Геноха, васкулита, связанного с системной красной волчанкой, васкулита, связанного с ревматоидным артритом, васкулита, связанного с иммунными комплексами, болезни Такаясу, дилатационной кардиомиопатии, диабетической ангиопатии, болезни Кавасаки (артериита), венозной газовой эмболии (VGE) и рестеноза после установки стента, вращательной атерэктомии, перепончатой нефропатии, синдрома Гийена-Барре и чрескожной транслюминальной коронарной ангиопластики (РТСА). В другом варианте осуществления заболевание, связанное с компонентом комплемента С5, представляет собой
- 14 044245 ночную пароксизмальную гемоглобинурию (PNH). В другом варианте осуществления заболевание, связанное с компонентом комплемента С5, представляет собой атипичный гемолитико-уремический синдром (aHUS).
В одном варианте осуществления способы дополнительно включают приведение клетки в контакт с антителом к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающим фрагментом.
В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент ингибирует расщепление компонента комплемента С5 на фрагменты С5а и С5Ь.
В одном варианте осуществления, антитело к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающий фрагмент представляет собой экулизумаб.
В одном варианте осуществления способы дополнительно включают приведение клетки в контакт с менингококковой вакциной.
В одном варианте осуществления клетку приводят в контакт с экулизумабом раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг в течение 4 недель с последующей пятой дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 900 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 900 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В другом варианте осуществления клетку приводят в контакт с экулизумабом раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 900 мг в течение 4 недель с последующей пятой дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 1200 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 1200 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В другом варианте осуществления клетку приводят в контакт с экулизумабом раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 900 мг в течение 4 недель с последующей пятой дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 1200 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 1200 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В еще одном варианте осуществления клетку приводят в контакт с экулизумабом раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг в течение 2 недель с последующей третьей дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 900 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 900 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В одном варианте осуществления клетку приводят в контакт с экулизумабом раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг в течение 2 недель с последующей третьей дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 600 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 600 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В другом варианте осуществления клетку приводят в контакт с экулизумабом раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг в течение 1 недели с последующей второй дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 300 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 300 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В одном варианте осуществления клетку приводят в контакт с экулизумабом раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 300 мг в течение 1 недели с последующей второй дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 300 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 300 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В одном варианте осуществления клетка находится в субъекте.
В одном варианте осуществления способы по настоящему изобретению дополнительно включают плазмоферез или замещение плазмы у субъекта. В одном варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту в дозе менее чем приблизительно 600 мг. В другом варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту в дозе менее чем приблизительно 300 мг.
В одном варианте осуществления способы по настоящему изобретению дополнительно включают инфузию плазмы субъекту. В одном варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту в дозе менее чем приблизительно 300 мг.
В одном варианте осуществления клетку приводят в контакт с экулизумабом в дозе от приблизительно 0,01 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг или от приблизительно 0,5 мг/кг до приблизительно 15 мг/кг.
В другом варианте осуществления клетку приводят в контакт с экулизумабом в дозе от приблизительно 5 мг/кг до приблизительно 15 мг/кг.
В одном варианте осуществления клетку приводят в контакт с экулизумабом в дозе, выбранной из группы, состоящей из 0,5 мг/кг, 1 мг/кг, 1,5 мг/кг, 3 мг/кг, 5 мг/кг, 7 мг/кг, 10 мг/кг и 15 мг/кг.
В одном варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту путем внутривенной инфузии. В другом варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту подкожно.
В одном варианте осуществления клетку приводят в контакт со средством, представляющим собой dsRNA, в дозе от приблизительно 0,01 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг или от приблизительно 0,5 мг/кг до приблизительно 50 мг/кг.
В другом варианте осуществления клетку приводят в контакт со средством, представляющим собой dsRNA, в дозе от приблизительно 10 мг/кг до приблизительно 30 мг/кг.
В одном варианте осуществления клетку приводят в контакт со средством, представляющим собой dsRNA, в дозе, выбранной из группы, состоящей из 0,5 мг/кг, 1 мг/кг, 1,5 мг/кг, 3 мг/кг, 5 мг/кг, 10 мг/кг и 30 мг/кг.
- 15 044245
В одном варианте осуществления клетку приводят в контакт со средством, представляющим собой dsRNA, один раз в неделю. В другом варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят субъекту два раза в неделю. В другом варианте осуществления клетку приводят в контакт со средством, представляющим собой dsRNA, два раза в месяц.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят субъекту подкожно.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, и экулизумаб вводят субъекту подкожно. В другом варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, и экулизумаб вводят субъекту одновременно.
В одном варианте осуществления клетку приводят в контакт со средством, представляющим собой dsRNA, и экулизумабом одновременно.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят субъекту сначала в период времени, достаточный для снижения уровня компонента комплемента С5 у субъекта, а экулизумаб вводят затем в дозе менее чем приблизительно 600 мг.
В одном варианте осуществления уровень компонента комплемента С5 у субъекта снижается на по меньшей мере приблизительно 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85% или 90%.
В одном варианте осуществления экулизумаб вводят в дозе приблизительно 100-500 мг.
В одном варианте осуществления сначала клетку приводят в контакт со средством, представляющим собой dsRNA, в период времени, достаточный для снижения уровня компонента комплемента С5 в клетке, и затем клетку приводят в контакт с экулизумабом в дозе менее чем приблизительно 600 мг.
В одном варианте осуществления уровень компонента комплемента С5 в клетке снижается на по меньшей мере приблизительно 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85% или 90%.
В одном варианте осуществления клетку приводят в контакт с экулизумабом в дозе приблизительно 100-500 мг/кг.
В одном аспекте настоящее изобретение предусматривает способы ингибирования экспрессии С5 у субъекта. Способы включают введение субъекту терапевтически эффективного количества средства, представляющего собой dsRNA, содержащего смысловую цепь и антисмысловую цепь, где смысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, и антисмысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:5, тем самым ингибируя экспрессию С5 у субъекта.
В другом аспекте настоящее изобретение предусматривает способы ингибирования экспрессии С5 у субъекта. Способы включают введение субъекту терапевтически эффективного количества средства, представляющего собой dsRNA, содержащего смысловую цепь и антисмысловую цепь, при этом антисмысловая цепь содержит участок комплементарности, который содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающийся не более чем на 3 нуклеотида от любой из антисмысловых последовательностей, перечисленных в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19,, 20, 21 и 23, тем самым ингибируя экспрессию С5 у субъекта.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способам ингибирования экспрессии компонента комплемента С5 у субъекта, включающие введение субъекту терапевтически эффективного количества средства, представляющего собой dsRNA, содержащего смысловую цепь и антисмысловую цепь, образующие двухцепочечный участок, где смысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, и антисмысловая цепь содержит по меньшей мере 15 смежных нуклеотидов, отличающаяся не более чем на 3 нуклеотида от нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO:5, где практически все нуклеотиды антисмысловой цепи и практически все нуклеотиды смысловой цепи являются модифицированными нуклеотидами и где смысловая цепь конъюгирована с одним или несколькими лигандами на 3'конце, тем самым ингибируя экспрессию гена С5 у субъекта.
В одном варианте осуществления все нуклеотиды смысловой цепи и все нуклеотиды антисмысловой цепи представляют собой модифицированные нуклеотиды.
В одном варианте осуществления введение представляет собой подкожное введение.
В одном варианте осуществления практически все нуклеотиды смысловой цепи являются модифицированными нуклеотидами, выбранными из группы, состоящей из 2'-О-метил модификации, 2'-фтор модификации и 3'-концевого dT нуклеотида. В другом варианте осуществления практически все нуклеотиды антисмысловой цепи являются модифицированными нуклеотидами, выбранными из группы, состоящей из 2'-О-метил модификации, 2'-фтор модификации и 3'-концевого дезокси-тимин (dT) нуклеотида. В другом варианте осуществления модифицированные нуклеотиды представляют собой короткую последовательность дезокси-тимин (dT) нуклеотидов. В другом варианте осуществления смысловая цепь содержит две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 5'-конце. В одном варианте осуществления антисмысловая цепь содержит две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 5'-конце и две фосфотиоатные межнуклеотидные связи на 3'-конце. В еще одном варианте осуществления смысловая цепь конъюгирована с одним или несколькими производными GalNAc, присоединенными через разветвленный двухвалентный или трехвалентный линкер на 3'-конце.
- 16 044245
В другом аспекте настоящее изобретение предусматривает способы ингибирования экспрессии С5 у субъекта. Способы включают введение субъекту терапевтически эффективного количества средства, представляющего собой dsRNA, содержащего смысловую цепь, комплементарную антисмысловой цепи, где антисмысловая цепь содержит участок, комплементарный части мРНК, кодирующей С5, где каждая цепь составляет в длину от приблизительно 14 до приблизительно 30 нуклеотидов, где двухцепочечное средство RNAi представлено формулой (III):
смысловая: 5’ np -Na -(X X X) i-Nb -Y Y Y -Nb - (Ζ Ζ Z)j -Na - nq 3 ’ антисмысловая: 3' np ' -Na ' - (X 'X 'X ') k-Nb '-Y Ύ Ύ ' -Nb ' - (Ζ ' Ζ ' Z ') b-Na ' - nq ' 5’ (III), где каждый из i, j, k и l независимо равняется 0 или 1;
каждый из р, р', q и q' независимо равняется 0-6;
каждый из Na и Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-25 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации, при этом каждая последовательность содержит по меньшей мере два модифицированных различными способами нуклеотида;
каждый из Nb и Nb' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10 нуклеотидов, которые либо модифицированы, либо не модифицированы, или их комбинации;
каждый из np, np', nq и nq', каждый из которых может присутствовать или отсутствовать, независимо представляет собой выступающий нуклеотид;
каждый из XXX, YYY, ZZZ, X'X'X', ΥΎΎ и Z'Z'Z' независимо представляет собой один мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов;
модификации Nb отличаются от модификации Υ, а модификации Nb' отличаются от модификации Υ'; и где смысловая цепь конъюгирован с по меньшей мере одним лигандом, тем самым ингибируя экспрессию С5 у субъекта.
В одном варианте осуществления способы дополнительно включают введение субъекту антитела к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающего фрагмента.
В одном варианте осуществления, антитело к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающий фрагмент представляет собой экулизумаб.
В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент ингибирует расщепление компонента комплемента С5 на фрагменты С5а и С5Ь.
В одном варианте осуществления способы по настоящему изобретению дополнительно включают введение субъекту менингококковой вакцины.
В одном варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг в течение 4 недель с последующей пятой дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 900 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 900 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В другом варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 900 мг в течение 4 недель с последующей пятой дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 1200 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 1200 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В одном варианте осуществления возраст субъекта меньше чем 18 лет и экулизумаб вводят субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 900 мг в течение 4 недель с последующей пятой дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 1200 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 1200 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В другом варианте осуществления возраст субъекта меньше чем 18 лет и экулизумаб вводят субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг в течение 2 недель с последующей третьей дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 900 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 900 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В одном варианте осуществления возраст субъекта меньше чем 18 лет и экулизумаб вводят субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг в течение 2 недель с последующей третьей дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 600 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 600 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В другом варианте осуществления возраст субъекта меньше чем 18 лет и экулизумаб вводят субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг в течение 1 недели с последующей второй дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 300 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 300 мг приблизительно каждые две недели после этого.
В еще одном варианте осуществления возраст субъекта меньше чем 18 лет и экулизумаб вводят субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 300 мг в течение 1 недели с последующей второй дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 300 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 300 мг приблизительно каждые две недели после этого.
- 17 044245
В одном варианте осуществления способы дополнительно включают плазмоферез или замещение плазмы у субъекта. В одном варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту в дозе менее чем приблизительно 600 мг. В другом варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту в дозе менее чем приблизительно 300 мг.
В одном варианте осуществления способы дополнительно включают инфузию плазмы субъекту. В одном варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту в дозе менее чем приблизительно 300 мг.
В одном варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту в дозе от приблизительно 0,01 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг или от приблизительно 0,5 мг/кг до приблизительно 15 мг/кг. В другом варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту в дозе от приблизительно 5 мг/кг до приблизительно 15 мг/кг.
В другом варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту в дозе, выбранной из группы, состоящей из 0,5 мг/кг, 1 мг/кг, 1,5 мг/кг, 3 мг/кг, 5 мг/кг, 7 мг/кг, 10 мг/кг и 30 мг/кг.
В одном варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту путем внутривенной инфузии. В другом варианте осуществления экулизумаб вводят субъекту подкожно.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят в дозе от приблизительно 0,01 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг или от приблизительно 0,5 мг/кг до приблизительно 15 мг/кг.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят в дозе от приблизительно 10 мг/кг до приблизительно 30 мг/кг. В другом варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят в дозе, выбранной из группы, состоящей из 0,5 мг/кг, 1 мг/кг, 1,5 мг/кг, 3 мг/кг, 5 мг/кг, 10 мг/кг и 30 мг/кг.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят субъекту один раз в неделю. В другом варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят субъекту два раза в неделю. В другом варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят субъекту два раза в месяц.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, вводят субъекту подкожно.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, и экулизумаб вводят субъекту подкожно. В другом варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, и экулизумаб вводят субъекту одновременно.
В одном варианте осуществления сначала вводят субъекту средство, представляющее собой dsRNA, в период времени, достаточный для снижения уровня компонента комплемента С5 у субъекта, и затем вводят экулизумаб в дозе менее чем приблизительно 600 мг.
В одном варианте осуществления уровень компонента комплемента С5 у субъекта снижается на по меньшей мере приблизительно 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85% или 90%.
В одном варианте осуществления экулизумаб вводят в дозе приблизительно 100-500 мг.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой dsRNA, конъюгировано с лигандом.
В одном варианте осуществления лиганд конъюгирован с 3'-концом смысловой цепи средства, представляющего собой dsRNA.
В одном варианте осуществления лиганд представляет собой производное N-ацетилгалактозамина (GalNAc).
Краткое описание графических материалов
Фиг. 1 представляет собой схематическое изображение трех путей комплемента: альтернативного, классического и лектинового.
Фиг. 2 представляет собой график, показывающий процентную долю компонента комплемента С5, оставшуюся у мышей линии C57BL/6 после разовой дозы 10 мг/кг указанных иРНК.
Фиг. 3 представляет собой график, показывающий процентную долю компонента комплемента С5, оставшуюся у мышей линии C57BL/6 после разовой дозы 10 мг/кг указанных иРНК.
Фиг. 4 представляет собой график, показывающий процентную долю компонента комплемента С5, оставшуюся у мышей линии C57BL/6 через 48 ч после разовой дозы 10 мг/кг указанных иРНК.
Фиг. 5А представляет собой график, показывающий процентную долю гемолиза, оставшуюся в дни 4 и 7 у крыс после разового подкожного введения AD-58642 в дозе 2,5 мг/кг, 10 мг/кг или 25 мг/кг.
На фиг. 5В представлены данные вестерн-блоттинга, показывающие количество компонента комплемента С5, оставшееся на день 7 у крыс после разового подкожного введения AD-58642 в дозе 2,5 мг/кг, 10 мг/кг или 25 мг/кг.
Фиг. 6А и 6В представляют собой графики, показывающие процентную долю компонента комплемента С5, оставшуюся у мышей линии C57BL/6 через 5 дней после разовой дозы AD-58642 1,25 мг/кг, 2,5 мг/кг, 5 мг/кг, 10 мг/кг или 25 мг/кг.
Фиг. 7А и 7В представляют собой графики, показывающие процентную долю гемолиза, оставшуюся на 5-й день у мышей линии C57BL/6 после разовой дозы AD-58642 1,25 мг/кг, 2,5 мг/кг, 5 мг/кг, 10 мг/кг или 25 мг/кг.
- 18 044245
На фиг. 8 представлены данные вестерн-блоттинга, показывающие количество компонента комплемента С5, оставшееся на день 5 у мышей линии C57BL/6 после разовой дозы AD-58642 1,25 мг/кг,
2,5 мг/кг, 5 мг/кг, 10 мг/кг или 25 мг/кг.
Фиг. 9 представляет собой график, показывающий количество белка компонента комплемента С5, оставшееся на день 5 и 9 в сыворотке мышей после разовой дозы AD-58641 0,625 мг/кг, 1,25 мг/кг, 2,5 мг/кг, 5,0 мг/кг или 10 мг/кг. Нижний предел количественного определения (LLOQ) в ходе анализа показан в виде пунктирной линии.
Фиг. 10 представляет собой график, показывающий количество белка компонента комплемента С5, оставшееся на день 8 в сыворотке мышей после введения AD-58641 в дни 0, 1, 2, и 3 в дозе 0,625 мг/кг, 1,25 мг/кг или 2,5 мг/кг. Нижний предел количественного определения (LLOQ) в ходе анализа показан в виде пунктирной линии.
На фиг. 11A и 11В показана эффективность и кумулятивный эффект повторного введения соединения AD-58641 у крыс. Фиг. 11A представляет собой график, показывающий гемолитическую активность, сохранившуюся в сыворотке крыс на день 0, 4, 7, 11, 14, 18, 25 и 32 после повторного введения в дозе 2,5 мг/кг/доза или 5,0 мг/кг/доза, q2w х3 (два раза в неделю в течение 3 недель). На фиг. 11В представлены данные вестерн-блоттинга, показывающие количество белка компонента комплемента С5, оставшегося в сыворотке животных.
Фиг. 12 представляет собой график, показывающий количество белка компонента комплемента С5 в сыворотке макаков-крабоедов в различные моменты времени до, во время и после двух циклов подкожного введения AD-58641 в дозе 2,5 мг/кг или 5 мг/кг каждый третий день в количестве восьми доз. Уровни белка С5 приводили к среднему из трех образцов до введения препарата.
Фиг. 13 представляет собой график, показывающий процентную долю гемолиза, оставшуюся в сыворотке макаков-крабоедов в различные моменты времени до, во время и после двух циклов подкожного введения AD-58641 в дозе 2,5 мг/кг или 5 мг/кг каждый третий день в количестве восьми доз. Процентную долю гемолиза рассчитывали по отношению максимального гемолиза к фоновому гемолизу в контрольных образцах.
Фиг. 14 представляет собой график, показывающий процентную долю белка компонента комплемента С5, оставшуюся на день 5 в сыворотке мышей линии C57BL/6 после разовой дозы 1 мг/кг указанных иРНК.
Фиг. 15 представляет собой график, показывающий процентную долю белка компонента комплемента С5, оставшуюся на день 5 в сыворотке мышей линии C57BL/6 после разовой дозы 0,25 мг/кг, 0,5 мг/кг, 1,0 мг/кг или 2,0 мг/кг указанных иРНК.
Фиг. 16 представляет собой график, показывающий процентную долю белка компонента комплемента С5, оставшуюся в сыворотке мышей линии C57BL/6 на день 6, 13, 20, 27 и 34 после разовой дозы 1 мг/кг указанных иРНК.
Фиг. 17 представляет собой график, показывающий процентную долю гемолиза, оставшуюся в сыворотке крыс в различные моменты времени после введения дозы 5 мг/кг указанных соединений в день 0, 4 и 7.
На фиг. 18А показана последовательность нуклеотидов компонента комплемента 5 (С5) Homo sapiens (SEQ ID NO:1); на фиг. 18В показана последовательность нуклеотидов компонента комплемента 5 (С5) Масаса mulatta (SEQ ID NO:2); на фиг. 18С показана последовательность нуклеотидов компонента комплемента 5 (С5) Mus musculus (SEQ ID NO:3); на фиг. 18D показана последовательность нуклеотидов компонента комплемента 5 (С5) Rattus norvegicus (SEQ ID NO:4); на фиг. 18Е показано обратное дополнение SEQ ID NO:1 (SEQ ID NO:5); на фиг. 18Е показано обратное дополнение SEQ ID NO:2 (SEQ ID NO: 6); на фиг. 18С показано обратное дополнение SEQ ID NO:3 (SEQ ID NO:7); и на фиг. 18Н показано обратное дополнение SEQ ID NO:4 (SEQ ID NO:8).
Подробное описание изобретения
Настоящее изобретение относится к средствам, представляющим собой иРНК, которые воздействуют на опосредованное РНК-индуцированным комплексом сайленсинга (RISC) отщепление РНКтранскриптов гена компонента комплемента С5.
иРНК по настоящему изобретения содержат цепь РНК (антисмысловую цепь), содержащую участок, составляющий приблизительно 30 нуклеотидов или менее в длину, например, 15-30, 15-29, 15-28, 15-27, 15-26, 15-25, 15-24, 15-23, 15-22, 15-21, 15-20, 15-19, 15-18, 15-17, 18-30, 18-29, 18-28, 18-27, 18-26, 18-25, 18-24, 18-23, 18-22, 18-21, 18-20, 19-30, 19-29, 19-28, 19-27, 19-26, 19-25, 19-24, 19-23, 19-22, 19-21, 19-20, 20-30, 20-29, 20-28, 20-27, 20-26, 20-25, 20-24,20-23, 20-22, 20-21, 21-30, 21-29, 21-28, 21-27, 21-26, 21-25, 21-24, 21-23 или 21-22 нуклеотидов в длину, при этом участок, по сути, комплементарен по меньшей мере части транскрипта мРНК гена С5. Применение этих иРНК обеспечивает целевое разрушение мРНК гена С5 у млекопитающих. Очень низкие дозы иРНК С5, в частности, могут специфически и эффективно опосредовать интерференцию РНК (RNAi), что приводит к значительному ингибированию экспрессии гена С5. Авторы настоящего изобретения продемонстрировали, что иРНК, нацеленные на С5, могут опосредовать RNAi in vitro и in vivo, что приводит к значительному ингибированию экспрессии гена С5. Таким образом, способы и композиции, включающие эти иРНК, полезны при лечении субъекта,
- 19 044245 у которого снижение уровня и/или активности белка С5 окажет благоприятное воздействие, например, субъекта, страдающего заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, таким как ночная пароксизмальная гемоглобинурия (PNH).
Настоящее изобретение также относится к способам и комбинированной терапии для лечения субъекта с нарушением, на которое можно оказать благоприятное воздействие путем ингибирования или снижения экспрессии гена С5, например, заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, такого как ночная пароксизмальная гемоглобинурия (PNH) и атипичный гемолитико-уремический синдром (aHUS) с помощью композиций иРНК, которые воздействуют на опосредованное РНК-индуцированным комплексом сайленсинга (RISC) отщепление РНК-транскриптов гена компонента комплемента С5.
Настоящее изобретение также относится к способам предотвращения по меньшей мере одного симптома, например, гемолиза, у субъекта, страдающего нарушением, при котором ингибирование или снижение экспрессии гена С5 окажет благоприятное воздействие, например, заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, такого как ночная пароксизмальная гемоглобинурия (PNH) и атипичный гемолитико-уремический синдром (aHUS). Настоящее изобретение дополнительно относится к композициям иРНК, которые воздействуют на опосредованное РНК-индуцированным комплексом сайленсинга (RISC) отщепление РНК-транскриптов гена компонента комплемента С5. Ген С5 может находиться в пределах клетки, например, клетки в пределах субъекта, такого как человек.
Комбинированная терапия по настоящему изобретению включает введение субъекту, страдающему заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, средства RNAi по настоящему изобретению и дополнительного терапевтического средства, например, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента к компоненту комплемента С5, например, экулизумаба.
Комбинированные терапии по настоящему изобретению снижают уровень С5 у субъекта (например, приблизительно на 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или приблизительно 99%) путем нацеливания на мРНК С5 средства iRNA по настоящему изобретению и, соответственно, позволяют снизить требуемое терапевтически (или профилактически) эффективное количество экулизумаба при лечении субъекта, тем самым уменьшают расходы на лечение и позволяют применять более легкие и более удобные способы введения экулизумаба, такие как подкожное введение.
Нижеследующее подробное описание раскрывает способы получения и применения композиций, содержащих иРНК, для ингибирования и экспрессии гена С5, а также композиции, применения и способы лечения субъектов, страдающих заболеваниями или нарушениями, при которых ингибирование и/или снижение экспрессии этого гена окажет благоприятное воздействие.
I. Определения.
Для того чтобы настоящее изобретение можно было более легко понять, вначале даны определения соответствующим терминам. Кроме того, следует отметить, что в случаях, когда в данном документе перечисляются значение или диапазон значений переменной, подразумевают, что значения и диапазоны, промежуточные по отношению к перечисленным значениям, также подразумеваются как часть настоящего изобретения.
Форму единственного числа используют в данном документе для обозначения одного или нескольких (т.е. по меньшей мере одного) грамматических объектов статьи. В качестве примера, элемент означает один элемент или несколько элементов, например, множество элементов.
Выражение включающий используют в данном документе для обозначения фразы включающий без ограничения и используют взаимозаменяемо с ней.
Выражение или используют в данном документе для обозначения выражения и/или и используют взаимозаменяемо с ним, если контекст явно не указывает иное.
Применяемый в данном документе компонент комплемента С5, используемый взаимозаменяемо с выражением С5, относится к хорошо известному гену и полипептиду, также известному в данной области техники как CPAMD4, C3- и PZP-подобной белок, содержащий домен альфа-2-макроглобулина, аналог анафилотоксина С5а, гемолитический комплемент (Hc) и единица комплемента С5. Последовательность транскрипта мРНК С5 человека можно найти, например, в GenBank, № GI: 38016946 (NM_001735.2; SEQ ID NO:1). Последовательность мРНК С5 макак можно найти, например, в GenBank, № GI: 297270262 (ХМ_001095750.2; SEQ ID NO:2). Последовательность мРНК С5 мыши можно найти, например, в GenBank, № GI: 291575171 (NM_010406.2; SEQ ID NO:3). Последовательность мРНК С5 крысы можно найти, например, в GenBank, № GI: 392346248 (ХМ_345342.4; SEQ ID NO:4). Дополнительные примеры последовательностей мРНК С5 легко доступны в публичных базах данных, например, GenBank.
Выражение С5, применяемое в данном документе, также относится к встречающимся в природе вариациям последовательностей ДНК гена С5, таким как однонуклеотидный полиморфизм в гене С5. Были определены многочисленные SNP в гене С5 и могут быть найдены, например, в dbSNP NCBI (см., например, ncbi.nlm.nih.gov/snp). Не ограничивающие примеры SNP в гене С5 можно найти в dbSNP NCBI, номера доступа rs121909588 и rs121909587.
Применяемая в данном документе целевая последовательность относится к непрерывной части нуклеотидной последовательности молекулы мРНК, образованной в процессе транскрипции гена С5, в
- 20 044245 том числе к мРНК, которая является продуктом процессинга РНК первичного продукта транскрипции. В одном варианте осуществления целевая часть последовательности будет, по меньшей мере, достаточно длинной, чтобы служить в качестве подложки для иРНК-направленного отщепления на или вблизи этой части нуклеотидной последовательности молекулы мРНК, образующейся при транскрипции гена С5.
Целевая последовательность может составлять приблизительно 9-36 нуклеотидов в длину, например, приблизительно 15-30 нуклеотидов в длину. Например, целевая последовательность может составлять приблизительно 15-30 нуклеотидов, 15-29, 15-28, 15-27, 15-26, 15-25, 15-24, 15-23, 15-22, 15-21, 1520, 15-19, 15-18, 15-17, 18-30, 18-29, 18-28, 18-27, 18-26, 18-25, 18-24, 18-23, 18-22, 18-21, 18-20, 19-30, 1929, 19-28, 19-27, 19-26, 19-25, 19-24, 19-23, 19-22, 19-21, 19-20, 20-30, 20-29, 20-28, 20-27, 20-26, 20-25, 2024,20-23, 20-22, 20-21, 21-30, 21-29, 21-28, 21-27, 21-26, 21-25, 21-24, 21-23, или 21-22 нуклеотидов в длину. Диапазоны и длины, промежуточные по отношению к перечисленным выше диапазонам и длинам, также рассматриваются как часть настоящего изобретения.
Применяемое в данном документе выражение цепь, содержащая последовательность относится к олигонуклеотиду, содержащему цепь нуклеотидов, которая характеризуется последовательностью, обозначаемой с использованием стандартной номенклатуры нуклеотидов.
Каждый из G, С, А, Т и U, как правило, означает нуклеотид, который содержит гуанин, цитозин, аденин, тимидин и урацил в качестве основания, соответственно. Однако, будет понятно, что выражение рибонуклеотид или нуклеотид также может означать модифицированный нуклеотид, который подробнее описан ниже, или имитирующий нуклеотид заменяющий фрагмент (см, например, табл. 2). Специалисту в данной области хорошо известно, что гуанин, цитозин, аденин и урацил могут быть замещены другими фрагментами без изменения в значительной степени свойств спаривания оснований олигонуклеотида, содержащего нуклеотид, несущий такой заменяющий фрагмент. Например, без ограничения, нуклеотид, содержащий инозин в качестве основания, может образовывать пару оснований с нуклеотидами, содержащими аденин, цитозин или урацил. Следовательно, нуклеотиды, содержащие урацил, гуанин или аденин, могут быть замещены в нуклеотидных последовательностях dsRNA, описанных в настоящем изобретении, нуклеотидами, содержащими, например, инозин. В другом примере аденин и цитозин в любой точке олигонуклеотида могут быть замещены гуанином и урацилом, соответственно, с образованием неоднозначного спаривания оснований G-U с целевой мРНК. Последовательности, содержащие такие заменяющие фрагменты, подходят для композиций и способов, описанных в настоящем изобретении.
Выражения иРНК, средство RNAi, средство, представляющее собой иРНК, средство РНКинтерференции, применяемые в данном документе взаимозаменяемо, означают средство, которое содержит РНК в том значении, в котором это выражение описано в данном документе, и которое опосредует нацеленное отщепление РНК-транскрипта через путь РНК-индуцированного комплекса сайленсинга (RISC). иРНК направляет специфичное в отношении последовательности разрушение мРНК посредством процесса, известного как РНК-интерференция (RNAi). иРНК модулирует, например, ингибирует экспрессию С5 в клетке, например, клетке субъекта, как, например, субъекта-млекопитающего.
В одном варианте осуществления средство RNAi по настоящему изобретению включает одноцепочечную РНК, которая взаимодействует с целевой последовательностью РНК, например, целевой последовательностью мРНК С5, с направлением отщепления целевой РНК. Не желая привязываться к теории, считают, что длинная двухцепочечная РНК, введенная в клетки, разрезается на siRNA эндонуклеазой III типа, известной как Dicer (Sharp et al. (2001) Genes Dev. 15:485). Dicer, подобный рибонуклеазе III типа фермент, участвует в процессинге dsRNA на короткие интерферирующие РНК длиной 19-23 пары оснований с характерными выступами на 3'-конце в два основания (Bernstein, et al., (2001) Nature 409:363). siRNA затем встраиваются в РНК-индуцированный комплекс сайленсинга (RISC), в котором одна или несколько хеликаз раскручивают дуплекс siRNA, позволяя комплементарной антисмысловой цепи направлять распознавание мишени (Nykanen, et al., (2001) Cell 107:309). После связывания с соответствующей целевой мРНК одна или несколько эндонуклеаз в RISC расщепляют мишень для индукции сайленсинга (Elbashir, et al., (2001) Genes Dev. 15:188). Таким образом, в одном аспекте настоящее изобретение относится к одноцепочечной РНК (siRNA), образованной внутри клетки, и которая способствует образованию RISC-комплекса с осуществлением сайленсинга целевого гена, т.е. гена С5. Соответственно, выражение siRNA также используют в данном документе для обозначения RNAi, описанной выше.
В другом варианте осуществления средство RNAi может быть одноцепочечной siRNA, которую вводят в клетку или организм для ингибирования целевой мРНК. Одноцепочечные средства RNAi связываются с Argonaute 2, обладающим эндонуклеазной активностью в комплексе RISC, который затем отщепляет целевую мРНК. Одноцепочечные siRNA, как правило, составляют 15-30 нуклеотидов и химически модифицированы. Строение и испытание одноцепочечных siRNA описаны в патенте США № 8101348 и в Lima et al., (2012) Cell 150: 883-894, полное содержание каждого из которых, таким образом, включено в данный документ при помощи ссылки. Любые антисмысловые нуклеотидные последовательности, описанные в данном документе, можно использовать в качестве одноцепочечной siRNA, которая описана в данном документе или которая химически модифицирована способами, описанными в Lima et al., (2012) Cell 150: 883-894.
- 21 044245
В другом варианте осуществления иРНК для применения в композициях, применениях и способах по настоящему изобретению является двухцепочечной РНК и в данном документе ее называют двухцепочечным средством RNAi, молекулой двухцепочечной РНК (dsRNA), средством, представляющим собой dsRNA или dsRNA. Выражение dsRNA означает комплекс молекул рибонуклеиновых кислот с дуплексной структурой, содержащий две встречно-параллельные и, по сути, комплементарные цепи нуклеиновых кислот, рассматриваемые как имеющие смысловую и антисмысловую ориентацию по отношению к целевой РНК, т.е. гену С5. В некоторых вариантах осуществления по настоящему изобретению двухцепочечная РНК (dsRNA) запускает расщепление целевой РНК, например, мРНК через пост-транскрипционный механизм сайленсинга генов, называемый в данном документе РНКинтерференцией или RNAi.
В общем, большинство нуклеотидов каждой цепи молекулы dsRNA являются рибонуклеотидами, но, как описано подробно в данном документе, каждая или обе цепи могут также включать один или несколько нуклеотидов, не являющихся рибонуклеотидами, например, дезоксирибонуклеотид и/или модифицированный нуклеотид. Кроме того, применяемое в данном описании, средство RNAi может включать рибонуклеотиды с химическими модификациями; средство RNAi может включать значительные модификации множества нуклеотидов. Такие модификации могут включать все типы модификаций, раскрытых в данном документе или известных в области техники. Любые такие модификации, которые применяются в молекуле типа siRNA, охвачены выражением средство RNAi в контексте данных описания и формулы изобретения.
Дуплексный участок может быть любой длины, при которой возможно специфичное разрушению желаемой целевой РНК через путь RISC и может составлять от приблизительно 9 до 36 пар оснований в длину, например, приблизительно 15-30 пар оснований в длину, например, приблизительно 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36 или пар оснований в длину, например, приблизительно 15-30, 15-29, 15-28, 15-27, 15-26, 15-25, 15-24, 15-23, 15-22, 15-21, 1520, 15-19, 15-18, 15-17, 18-30, 18-29, 18-28, 18-27, 18-26, 18-25, 18-24, 18-23, 18-22, 18-21, 18-20, 19-30, 1929, 19-28, 19-27, 19-26, 19-25, 19-24, 19-23, 19-22, 19-21, 19-20, 20-30, 20-29, 20-28, 20-27, 20-26, 20-25, 2024,20-23, 20-22, 20-21, 21-30, 21-29, 21-28, 21-27, 21-26, 21-25, 21-24, 21-23, или 21-22 пар оснований в длину. Диапазоны и длины, промежуточные по отношению к перечисленным выше диапазонам и длинам, также рассматриваются как часть настоящего изобретения.
Две цепи, образующие дуплексную структуру, могут быть различными частями одной большей молекулы РНК или они могут быть отдельными молекулами РНК. В тех случаях, когда две цепи являются частью одной большей молекулы и, следовательно, соединены непрерываемой цепью нуклеотидов от 3'конца одной цепи до 5'-конца соответствующей другой цепи, образующих дуплексную структуру, соединяющую цепь РНК, называют шпилькой петли. Шпилька петли может содержать по меньшей мере один неспаренный нуклеотид. В некоторых вариантах осуществления шпилька петли может содержать по меньшей мере 2, по меньшей мере 3, по меньшей мере 4, по меньшей мере 5, по меньшей мере 6, по меньшей мере 7, по меньшей мере 8, по меньшей мере 9, по меньшей мере 10, по меньшей мере 20, по меньшей мере 23 или более неспаренных нуклеотидов.
В тех случаях, когда две, по сути, комплементарные цепи dsRNA содержат отдельные молекулы РНК, эти молекулы не обязательно могут быть соединены ковалентно. В тех случаях, когда две цепи соединены ковалентно способом, отличным от непрерываемой цепи нуклеотидов от 3'-конца одной цепи до 5'-конца соответствующей другой цепи, образующих дуплексную структуру, то соединяющую структуру называют линкером. Цепи РНК могут иметь одинаковое или различное число нуклеотидов. Максимальное количество пар оснований является количеством нуклеотидов в самой короткой цепи dsRNA минус любые выступы, которые присутствуют в дуплексе. Помимо дуплексной структуры средство RNAi может содержать один или несколько нуклеотидных выступов.
В одном варианте осуществления средство RNAi по настоящему изобретению представляет собой dsRNA из 24-30 нуклеотидов, которая взаимодействует с целевой последовательностью РНК, например целевой последовательностью мРНК С5, направляя отщепление целевой РНК. Не желая привязываться к теории, длинная двухцепочечная РНК, введенная в клетки, разрезается на siRNA эндонуклеазой III типа, известной как Dicer (Sharp et al. (2001) Genes Dev. 15:485). Dicer, подобный рибонуклеазе III типа фермент, участвует в процессинге dsRNA на короткие интерферирующие РНК длиной 19-23 пары оснований с характерными выступами на 3'-конце в два основания (Bernstein, et al., (2001) Nature 409:363). siRNA затем встраиваются в РНК-индуцированный комплекс сайленсинга (RISC), в котором одна или несколько хеликаз раскручивают дуплекс siRNA, позволяя комплементарной антисмысловой цепи направлять распознавание мишени (Nykanen, et al., (2001) Cell 107:309). После связывания с соответствующей целевой мРНК одна или несколько эндонуклеаз в RISC расщепляют мишень для индукции сайленсинга (Elbashir, et al., (2001) Genes Dev. 15:188).
Применяемое в данном документе выражение нуклеотидный выступ относится к по меньшей мере одному неспаренному нуклеотиду, который выпячивается из дуплексной структуры иРНК, например, dsRNA. Например, когда 3'-конец одной цепи dsRNA выходит за пределы 5'-конца другой цепи или vice versa, существует нуклеотидный выступ. dsRNA может содержать выступ по меньшей мере одного нук
- 22 044245 леотида; альтернативно выступ может содержать по меньшей мере два нуклеотида, по меньшей мере три нуклеотида, по меньшей мере четыре нуклеотида, по меньшей мере пять или более нуклеотидов. Нуклеотидный выступ может содержать или состоять из аналога нуклеотида/нуклеозида, включая дезоксинуклеотид/нуклеозид. Выступ(ы) может быть на смысловой цепи, антисмысловой цепи или любой их комбинации. Кроме того, нуклеотид(ы) выступа может находиться на 5'-конце, 3'-конце или обоих концах, либо антисмысловой, или смысловой цепи dsRNA.
В одном варианте осуществления антисмысловая цепь dsRNA содержит 1-10 нуклеотидов, например, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или нуклеотидов, выступающих на 3'-конце и/или 5'-конце. В одном варианте осуществления смысловая цепь dsRNA содержит 1-10 нуклеотидов, например, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или нуклеотидов, выступающих на 3'-конце и/или 5'-конце. В другом варианте осуществления один или несколько нуклеотидов выступа замещаются нуклеозид-тиофосфатом.
Затупленный конец или тупой конец означают, что на конце двухцепочечного средства RNAi нет неспаренных нуклеотидов, т.е. нет нуклеотидного выступа. Средство RNAi с тупыми концами представляет собой dsRNA, которая является двухцепочечной по всей длине, т.е. не имеет нуклеотидного выступа на любом конце молекулы. Средства RNAi по настоящему изобретению включают средства RNAi с нуклеотидными выступами на одном конце (т.е. средства с одним выступом и одним тупым концом) или с нуклеотидными выступами на обоих концах.
Выражение антисмысловая цепь или направляющая цепь означает цепь иРНК, например, dsRNA, которая включает участок, который, по сути, комплементарен целевой последовательности, например, мРНК С5. Применяемое в данном документе выражение участок комплементарности относится к участку антисмысловой цепи, который, по сути, комплементарен последовательности, например целевой последовательности, например, последовательности нуклеотидов, С5, как определено в данном документе. В тех случаях, когда участок комплементарности не полностью комплементарен целевой последовательности, несовпадения могут присутствовать во внутренних или концевых участках молекулы. Как правило, наиболее приемлемые несовпадения располагаются в концевых участках, например, в пределах 5, 4, 3 или 2 нуклеотидов 5'- и/или 3'-конца иРНК.
Выражение смысловая цепь или пассажирская цепь, применяемое в данном документе, означает цепь иРНК, которая включает участок, который, по сути, комплементарен участку антисмысловой цепи, в том значении, в котором это выражение описано в данном документе.
Применяемое в данном документе выражение участок отщепления относится к участку, который расположен вплотную к сайту расщепления. Сайт расщепления является сайтом мишени, по которому происходит расщепление. В некоторых вариантах осуществления участок отщепления содержит три основания на любом конце сайта расщепления и расположенных вплотную к нему. В некоторых вариантах осуществления участок отщепления содержит два основания на любом конце сайта расщепления и расположенных вплотную к нему. В некоторых вариантах осуществления сайт расщепления главным образом находится в сайте, граничащем с нуклеотидами 10 и 11 антисмысловой нити, и участок отщепления содержит нуклеотиды 11, 12 и 13.
Применяемое в данном документе, и если не указано иное, выражение комплементарный при использовании для описания первой нуклеотидной последовательности по отношению ко второй нуклеотидной последовательности означает способность олигонуклеотида или полинуклеотида, содержащего первую нуклеотидную последовательность, гибридизироваться и образовывать дуплексную структуру при определенных условиях с олигонуклеотидом или полинуклеотидом, содержащим вторую нуклеотидную последовательность, как будет понятно специалисту в данной области. Такие условия, например, могут быть жесткими условиями, где жесткие условия могут включать: 400 мМ NaCl, 40 мМ PIPES, рН 6,4, 1 мМ EDTA, 50°C или 70°C в течение 12-16 ч с последующим отмыванием (см., например, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Sambrook, et al. (1989) Cold Spring Harbor Laboratory Press). Можно применять другие условия, такие как физиологически соответствующие условия, которые могут встречаться в организме. Специалист в данной области сможет определить набор условий, наиболее подходящих для анализа комплементарности двух последовательностей в соответствии с конечным применением гибридизированных нуклеотидов.
Комплементарные последовательности в пределах иРНК, например, в пределах dsRNA, описанных в данном документе, включают спаренные основания олигонуклеотида или полинуклеотида, содержащие первую нуклеотидную последовательность олигонуклеотида или полинуклеотида, содержащую вторую нуклеотидную последовательность по всей длине одной или обеих нуклеотидных последовательностей. Такие последовательности могут быть отнесены к полностью комплементарным по отношению друг к другу в данном документе. Однако, когда первую последовательность в данном документе характеризуют как по сути, комплементарную по отношению ко второй последовательности, тогда две последовательности могут быть полностью комплементарными или они могут образовывать одну или несколько, но, как правило, не более 5, 4, 3 или 2 несовпадающих пар оснований при гибридизации с образованием дуплекса до 30 пар оснований, сохраняя способность к гибридизации при условиях, наиболее соответствующих их конечному применению, например, ингибированию экспрессии гена через путь RISC. Однако, когда два олигонуклеотида предназначены образовывать при гибридизации один или несколько од
- 23 044245 ноцепочечных выступов, то такие выступы не будут считаться несовпадениями применительно к определению комплементарности. Например, dsRNA, содержащая один олигонуклеотид с длиной 21 нуклеотид и другой олигонуклеотид с длиной 23 нуклеотида, где более длинный олигонуклеотид содержит последовательность из 21 нуклеотида, которая полностью комплементарна более короткому олигонуклеотиду, может при этом называться полностью комплементарной для целей, описанных в данном документе.
Комплементарные последовательности, применяемые в данном документе, могут также включать или могут быть образованы полностью из пар оснований, составленных не по модели Уотсона-Крика, и/или пар оснований, образованных из неестественных и модифицированных нуклеотидов, в такой степени, при которой выполняются вышеуказанные требования по отношению к их способности гибридизоваться. Такие пары оснований, составленные не по модели Уотсона-Крика, включают без ограничения неоднозначное или Хугстиновское спаривание оснований G:U.
Выражения комплементарный, полностью комплементарный и по сути, комплементарный в данном документе можно применять по отношению к совпадению оснований между смысловой цепью и антисмысловой цепью dsRNA или между антисмысловой цепью средства, представляющего собой иРНК, и целевой последовательностью, как будет понятно из контекста их применения.
Применяемый в данном документе полинуклеотид, который по сути, комплементарен по меньшей мере части матричной РНК (мРНК), означает полинуклеотид, который, по сути, комплементарен непрерывной части мРНК, представляющей интерес (например, мРНК, кодирующей С5). Например, полинуклеотид комплементарен по меньшей мере части мРНК С5 если последовательность, по сути, комплементарна непрерывающейся части мРНК, кодирующей С5.
В общем, большинство нуклеотидов каждой цепи являются рибонуклеотидами, но, как описано подробно в данном документе, каждая или обе цепи могут также включать один или несколько нуклеотидов, не являющихся рибонуклеотидами, например, дезоксирибонуклеотид и/или модифицированный нуклеотид. Кроме того, иРНК может включать рибонуклеотиды с химической модификацией. Такие модификации могут включать все типы модификаций, раскрытых в данном документе или известных в области техники. Любые такие модификации, которые используются в молекуле иРНК, охвачены выражением иРНК в контексте данных описания и формулы изобретения.
В одном аспекте настоящего изобретения средство для применения в способах и композициях по настоящему изобретению представляет собой одноцепочечную молекулу антисмысловой РНК, которая ингибирует целевую мРНК с помощью механизма ингибирующего действия антисмысловых РНК. Молекула одноцепочечной антисмысловой РНК комплементарна последовательности в целевой мРНК. Одноцепочечные антисмысловые олигонуклеотиды могут ингибировать трансляцию стехиометрическом образом при спаривание оснований с мРНК и физически препятствуя механизму трансляции, см. Dias, N. et al., (2002) Mol Cancer Ther 1:347-355. Молекула одноцепочечной антисмысловой РНК может составлять от приблизительно 15 до приблизительно 30 нуклеотидов в длину и иметь последовательность, комплементарную целевой последовательности. Например, молекула одноцепочечной антисмысловой РНК может содержать последовательность, которая представляет собой по меньшей мере приблизительно 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более смежных нуклеотидов из любой из антисмысловых последовательностей, описанных в данном документе.
Выражение липидная наночастица или LNP относится к пузырьку, содержащему липидный слой, заключающий фармацевтически активную молекулу, такую как молекула нуклеиновой кислоты, например, иРНК или плазмида, из которой транскрибируется иРНК. LNP описаны, например, в патентах США №№ 6858225, 6815432, 8158601 и 8058069, полное содержание которых включено в данный документ посредством ссылки.
Применяемый в данном документе субъект представляет собой животное, такое как млекопитающее, включая приматов (таких как человек, примат, отличный от человека, например, обезьяна и шимпанзе), не-приматов (таких как корова, свинья, верблюд, лама, лошадь, коза, кролик, овца, хомяк, морская свинка, кошка, собака, крыса, мышь, лошадь и кит) или птиц (например, утка или гусь). В одном варианте осуществления субъектом является человек, такой как человек, подвергаемый лечению или диагностике заболевания, нарушения или состояния, при которых снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие; человек, имеющий риск развития заболевания, нарушения или состояния, при которых снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие; человек, переносящий заболевание, нарушение или состояние, при которых снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие; и/или человек, подвергаемый лечению заболевания, нарушения или состояния, при которых снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, как описано в данном документе.
Применяемые в данном документе выражения осуществлять лечение или лечение относятся к полезному или желаемому результату, включая без ограничения ослаблению или облегчению одного или нескольких симптомов, связанных с нежелательной активацией пути комплемента (например, гемолиза и/или хронического воспаления); уменьшению степени нежелательной активации пути комплемента; стабилизации (т.е. без ухудшения) состояния хронического воспаления и/или гемолиза; облегчению или временному ослаблению нежелательной активации пути комплемента (например, хронического воспале- 24 044245 ния и/или гемолиза), что либо установлено, либо не установлено. Лечение также может означать продление жизни по сравнению с ожидаемой выживаемостью в отсутствие лечения.
Выражение ниже в контексте уровня компонента комплемента С5 у субъекта, или маркера заболевания, или симптома относится к статистически значимому снижению такого уровня. Снижение может быть на, например, по меньшей мере 10%, по меньшей мере 15%, по меньшей мере 20%, по меньшей мере 25%, по меньшей мере 30%, по меньшей мере 35%, по меньшей мере 40%, по меньшей мере 45%, по меньшей мере 50%, по меньшей мере 55%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 65%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95% или более и, предпочтительно, вплоть до уровня, принятого в пределах нормального для человека без такого нарушения.
Применяемое в данном документе предотвращение или осуществление профилактики, используемое в отношении заболевания, нарушения или его состояния, при которых снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, относится к снижению вероятности того, что у субъекта будет развиваться симптом, связанный с таким заболеванием, нарушением или состоянием, например, симптом нежелательной активации комплемента, например, хроническое воспаление, гемолиз и/или тромбоз. Вероятность развития тромбоза снижается, например, когда у индивидуума, имеющего один или несколько факторов риска к развитию тромбоза, либо не развивается тромбоз, или тромбоз развивается в меньшей степени тяжести по отношению к популяции, имеющей те же факторы риска и не получающей лечение, как описано в данном документе. Неспособность развития заболевания, нарушения или состояния, или снижение развития симптома, связанного с таким заболеванием, нарушением или состоянием (например, по меньшей мере на приблизительно 10% по клинически принятой шкале для этого заболевания или нарушения), или демонстрирование запаздывающих симптомов с опозданием (например, дни, недели, месяца или года) считается эффективным предотвращением.
Применяемое в данном документе выражение болезнь, связанная с компонентом комплемента С5 представляет собой заболевание или нарушение, которое вызвано или связано с активацией комплемента. Такие заболевания, как правило, связаны с воспалением и/или активацией иммунной системы, например, лизисом, опосредованным атакующим мембрану комплексом, анафилаксией и/или гемолизом. Неограничивающие примеры заболеваний, связанных с компонентом комплемента С5, включают ночную пароксизмальную гемоглобинурию (PNH), атипичный гемолитико-уремический синдром (aHUS), астму, ревматоидный артрит (RA), синдром антифосфолипидных антител, волчаночный нефрит, ишемическиреперфузионное повреждение, типичный или инфекционный гемолитико-уремический синдром (tHUS), болезнь плотного осадка (DDD), оптиконевромиелит (NMO), мультифокальную моторную нейропатию (MMN), рассеянный склероз (MS); дегенерацию желтого пятна (например, связанная с возрастом дегенерации желтого пятна (AMD)); синдром, включающий гемолиз, повышение активности печеночных ферментов и снижение числа тромбоцитов (HELLP-синдром); пурпуру тромботическую тромбоцитопеническую (ТТР); спонтанную потерю плода; пауци-иммунный васкулит; буллезный эпидермолиз; рецидивирующую потерю плода; преэклампсию, черепно-мозговую травму, миастению, болезнь холодовых агглютининов, дерматомиозит буллезный пемфигоид, связанный с Шига-подобным токсином Е. coli гемолитико-уремический синдром, C3-нефропатию, васкулит, связанный с антителами к цитоплазме нейтрофилов (например, гранулематоз с полиангиитом (ранее известный как гранулематоз Вегенера), синдром Черджа-Стросс и микроскопический полиангиит); реакции отторжения трансплантата, вызванные гуморальными и сосудистыми механизмами, дисфункцию трансплантата, инфаркт миокарда (например, повреждение тканей и ишемия при инфаркте миокарда), аллогенную трансплантацию, сепсис (например, неблагоприятный исход сепсиса), заболевания коронарной артерии, дерматомиозит, болезнь Грейвса, атеросклероз, болезнь Альцгеймера, сепсис, связанный с системным воспалительным ответом, септический шок, травма спинного мозга, гломерулонефрит, тиреоидит Хашимото, диабет I типа, псориаз, пузырчатку, аутоиммунную гемолитическую анемию (AIHA), ITP, синдром Гудпасчера, болезнь Дегоса, антифосфолипидный синдром (APS), катастрофический APS (CAPS), сердечно-сосудистые нарушения, миокардит, цереброваскулярные нарушения, периферические (например, опорно-двигательного аппарата) сосудистые нарушения, реноваскулярную гипертензию, нарушения брыжеечных/кишечных сосудов, васкулит, нефрит Шенлейна-Геноха, васкулит, связанный с системной красной волчанкой, васкулит, связанный с ревматоидным артритом, васкулит, связанный с иммунными комплексами, болезнь Такаясу, дилатационную кардиомиопатию, диабетическую ангиопатию, болезнь Кавасаки (артериит), венозную газовую эмболию (VGE) и рестеноз после установки стента, вращательную атерэктомию, перепончатую нефропатию, синдром Гийена-Барре и чрескожную транслюминальную коронарную ангиопластику (РТСА) (см., например, Holers (2008) Immunological Reviews 223:300-316; Holers and Thurman (2004) Molecular Immunology 41:147-152; публикация патента США № 20070172483).
В одном варианте осуществления заболевание, связанное с компонентом комплемента С5, представляет собой ночную пароксизмальную гемоглобинурию (PNH). PNH может быть классической PNH или PNH в условиях синдрома недостаточности другого костного мозга и/или миелодиспластического синдрома (MDS), например, цитопении. В другом варианте осуществления заболевание, связанное с компонентом комплемента С5, представляет собой атипичный гемолитико-уремический синдром (aHUS).
- 25 044245
II. иРНК по изобретению.
Настоящее изобретение относится к иРНК, ингибирующим экспрессию гена компонента комплемента С5. В одном варианте осуществления средство, представляющее собой иРНК, включает молекулы двухцепочечной рибонуклеиновой кислоты (dsRNA) для ингибирования экспрессии гена С5 в клетке, например, клетке субъекта, например, млекопитающего, такого как человек, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, например, PNH. dsRNA содержит антисмысловую цепь, имеющую участок комплементарности, который комплементарен по меньшей мере части мРНК, образованной при экспрессии гена С5. Участок комплементарности составляет приблизительно 30 нуклеотидов или менее в длину (например, приблизительно 30, 29, 28, 27, 26, 25, 24, 23, 22, 21, 20, 19 или 18 нуклеотидов или менее в длину). При контакте с клеткой, экспрессирующей ген С5, иРНК ингибирует экспрессию гена С5 (например, гена С5 человека, примата, отличного от примата или птицы) по меньшей мере на приблизительно 10%, что оценивали с помощью, например, PCR или анализа на основе разветвленной ДНК (bDNA), или анализом на основе белков, например, с помощью иммунофлуоресцентного анализа с использованием, например, методов вестерн-блоттинга или проточной цитометрии.
dsRNA включает две цепи РНК, которые комплементарны и гибридизованы с образованием дуплексной структуры при условиях, в которых dsRNA будут применять. Одна цепь dsRNA (антисмысловая цепь) содержит участок комплементарности, который, по сути, является комплементарным, и, как правило, полностью комплементарный целевой последовательности. Целевая последовательность может быть получена из последовательности мРНК, образующейся при экспрессии гена С5. Другая цепь (смысловая цепь) содержит участок, который является комплементарным антисмысловой цепи, при этом две цепи гибридизуются и образуют дуплексную структуру при объединении в подходящих условиях. Как описано в данном документе и как известно в данной области техники, комплементарные последовательности dsRNA также могут содержаться в виде комплементарных себе участков одной молекулы нуклеиновой кислоты, вместо того, чтобы располагаться на отдельных олигонуклеотидах.
Как правило, дуплексная структура содержит от 15 до 30 пар оснований в длину, например, в пределах 15-29, 15-28, 15-27, 15-26, 15-25, 15-24, 15-23, 15-22, 15-21, 15-20, 15-19, 15-18, 15-17, 18-30, 18-29,
18-28, 18-27, 18-26, 18-25, 18-24, 18-23, 18-22, 18-21, 18-20, 19-30, 19-29, 19-28, 19-27, 19-26, 19-25, 19-24,
19-23, 19-22, 19-21, 19-20, 20-30, 20-29, 20-28, 20-27, 20-26, 20-25, 20-24,20-23, 20-22, 20-21, 21-30, 21-29,
21-28, 21-27, 21-26, 21-25, 21-24, 21-23, или 21-22 пар оснований в длину. Диапазоны и длины, промежуточные по отношению к перечисленным выше диапазонам и длинам, также рассматриваются как часть настоящего изобретения.
Аналогично, участок комплементарностицелевой последовательности составляет в пределах 15 и 30 нуклеотидов в длину, например, в пределах 15-29, 15-28, 15-27, 15-26, 15-25, 15-24, 15-23, 15-22, 15-21, 15-20, 15-19, 15-18, 15-17, 18-30, 18-29, 18-28, 18-27, 18-26, 18-25, 18-24, 18-23, 18-22, 18-21, 18-20, 19-30, 19-29, 19-28, 19-27, 19-26, 19-25, 19-24, 19-23, 19-22, 19-21, 19-20, 20-30, 20-29, 20-28, 20-27, 20-26, 20-25, 20-24,20-23, 20-22, 20-21, 21-30, 21-29, 21-28, 21-27, 21-26, 21-25, 21-24, 21-23, или 21-22 нуклеотидов в длину. Диапазоны и длины, промежуточные по отношению к перечисленным выше диапазонам и длинам, также рассматриваются как часть настоящего изобретения.
В некоторых вариантах осуществления dsRNA составляет от приблизительно 15 до приблизительно 20 нуклеотидов в длину, или от приблизительно 25 до приблизительно 30 нуклеотидов в длину. В общем, dsRNA является достаточно длинной, чтобы служить в качестве субстрата для фермента Dicer. Например, как хорошо известно в данной области техники, dsRNA с длиной более, чем приблизительно 21-23 нуклеотидов в длину, могут служить субстратами для Dicer. Как также будет понятно обычному специалисту, участок РНК, представляющий собой цель для отщепления, чаще всего будет частью более крупной молекулы РНК, часто молекулы мРНК. Где это уместно, частью мРНК-мишени является непрерывная последовательность целевой мРНК достаточной длины, чтобы позволить ей быть субстратом для RNAi-направленного отщепления (т.е. отщепление через путь RISC).
Специалисту в данной области также будет понятно, что дуплексный участок является основной функциональной частью dsRNA, например, дуплексный участок от приблизительно 9 до 36 пар оснований, например, приблизительно 10-36, 11-36, 12-36, 13-36, 14-36, 15-36, 9-35, 10-35, 11-35, 12-35, 13-35, 14-35, 15-35, 9-34, 10-34, 11-34, 12-34, 13-34, 14-34, 15-34, 9-33, 10-33, 11-33, 12-33, 13-33, 14-33, 15-33, 932, 10-32, 11-32, 12-32, 13-32, 14-32, 15-32, 9-31, 10-31, 11-31, 12-31, 13-32, 14-31, 15-31, 15-30, 15-29, 1528, 15-27, 15-26, 15-25, 15-24, 15-23, 15-22, 15-21, 15-20, 15-19, 15-18, 15-17, 18-30, 18-29, 18-28, 18-27, 1826, 18-25, 18-24, 18-23, 18-22, 18-21, 18-20, 19-30, 19-29, 19-28, 19-27, 19-26, 19-25, 19-24, 19-23, 19-22, 1921, 19-20, 20-30, 20-29, 20-28, 20-27, 20-26, 20-25, 20-24,20-23, 20-22, 20-21, 21-30, 21-29, 21-28, 21-27, 21-
26, 21-25, 21-24, 21-23, или 21-22 пар оснований. Таким образом, в одном варианте осуществления до того момента, пока участок подвергается обработке в функциональный дуплекс из, например, 15-30 пар оснований, что направляет желаемую РНК для отщепления, молекула РНК или комплекс молекул РНК, имеющие дуплексный участок больше, чем 30 пар оснований, представляют собой dsRNA. Таким образом, специалисту в данной области будет понятно, что в одном варианте осуществления miRNA представляют собой dsRNA. В другом варианте осуществления dsRNA представляет собой не встречающуюся в природе miRNA. В другом варианте осуществления средство, представляющее собой иРНК, приме-
- 26 044245 няемое для нацеливания на экспрессию С5, не образуется в целевой клетке путем расщепления большей dsRNA.
dsRNA, описанная в данном документе, может дополнительно включать один или несколько одноцепочечных выступов нуклеотидов, например, 1, 2, 3 или 4 нуклеотидов. dsRNA, имеющие по меньшей мере один нуклеотидный выступ, могут обладать неожиданно высокими ингибирующими свойствами по отношению к их аналогам с тупыми концами. Нуклеотидный выступ может содержать или состоять из аналога нуклеотида/нуклеозида, включая дезоксинуклеотид/нуклеозид. Выступ(ы) может быть на смысловой цепи, антисмысловой цепи или любой их комбинации. Кроме того, нуклеотид(ы) выступа может находиться на 5'-конце, 3'-конце или обоих концах, либо антисмысловой, или смысловой цепи dsRNA.
dsRNA можно синтезировать с помощью стандартных способов, известных в данной области техники, как описывается ниже, например, с применением автоматического синтезатора ДНК, таких как коммерчески доступные у, например, Biosearch, Applied Biosystems, Inc.
Соединения иРНК по настоящему изобретению можно получать с применением двухэтапной процедуры. Во-первых, отдельные цепи молекулы двухцепочечной РНК получают по отдельности. Затем составные цепи отжигают. Отдельные цепи соединения siRNA можно получать с применением синтеза в жидкой фазе или твердофазного органического синтеза, или обоих. Органический синтез имеет преимущество в том, что можно легко получать олигонуклеотидные цепи, содержащие неприродные или модифицированные нуклеотиды. Одноцепочечные олигонуклеотиды по настоящему изобретению можно получать с применением синтеза в жидкой фазе или твердофазного органического синтеза, или обоих.
В одном аспекте dsRNA по настоящему изобретению содержит по меньшей мере две нуклеотидных последовательности, смысловую последовательность и антисмысловую последовательность. Смысловая цепь выбрана из группы последовательностей, представленной в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23, и антисмысловая цепь, соответствующая смысловой цепи, выбрана из группы последовательностей из любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23. В этом аспекте одна из двух последовательностей комплементарна другой из двух последовательностей, причем одна из последовательностей, по сути, комплементарна последовательности мРНК, образованной при экспрессии гена С5. Таким образом, в этом аспекте dsRNA будет содержать два олигонуклеотида, где один олигонуклеотид описан как смысловая цепь в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23, а второй олигонуклеотид описан как антисмысловая цепь, соответствующая смысловой цепи, в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23. В одном варианте осуществления практически комплементарные последовательности dsRNA содержатся в отдельных олигонуклеотидах. В другом варианте осуществления практически комплементарные последовательности dsRNA содержатся в одном олигонуклеотиде.
Следует понимать, что хотя некоторые из последовательностей в табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23 описаны как модифицированные и/или конъюгированные последовательности, РНК из числа иРНК по настоящему изобретению, например, dsRNA по настоящему изобретению, может содержать любую из последовательностей, указанных в табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23, которые не являются модифицированными или конъюгированными, и/или модифицированы и/или конъюгированы иначе, чем описано в данном документе.
Специалисту в данной области хорошо известно, что dsRNA с дуплексной структурой из приблизительно 20 и 23 пар оснований, например, 21 пара оснований, были расценены как особенно эффективные в отношении индукции РНК-интерференции (Elbashir et al., EMBO 2001, 20:6877-6888). Тем не менее, было обнаружено, что более короткие или более длинные дуплексные структуры РНК также могут быть эффективными (Chu and Rana (2007) RNA 14:1714-1719; Kim et al. (2005) Nat Biotech 23:222-226). В вариантах осуществления, описанных выше, в силу характера олигонуклеотидных последовательностей, представленных в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23, описанные в данном документе dsRNA могут содержать по меньшей мере одну цепь длиной в 21 нуклеотид минимально. Разумно ожидать, что более короткие дуплексы, имеющие одну из последовательностей любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23, минус только несколько нуклеотидов на одном или обоих концах, могут быть одинаково эффективны по сравнению с dsRNAs, описанными выше. Следовательно, dsRNA, имеющие последовательность из по меньшей мере 15, 16, 17, 18, 19, 20 или более смежных нуклеотидов, полученных из одной из последовательностей любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23, и отличающиеся по своей способности ингибировать экспрессию гена С5 не более чем на приблизительно 5, 10, 15, 20, 25 или 30% ингибирования в сравнении с dsRNA, содержащей полную последовательность, рассматриваются в пределах объема по настоящему изобретению.
Кроме того, РНК, представленные в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23, идентифицируют сайт(ы) в С5-транскрипте, который восприимчив к RISC-опосредованному расщеплению. Таким образом, в настоящем изобретении дополнительно описаны иРНК, которые нацелены на один из этих сайтов. Применимо к данному документу, говорят, что иРНК нацелена на конкретный сайт транскрипта РНК, если иРНК способствует расщеплению транскрипта в любом месте этого конкретного сайта. Такая иРНК, как правило, будет содержать по меньшей мере приблизительно 15 смежных нуклеотидов из одной из последовательностей, представленных в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23, соединенных с дополнительными нуклеотидными последовательностями, взятыми из участка, прилегающего к выбранной последовательности в гене С5.
- 27 044245
В то время как целевая последовательность, как правило, составляет приблизительно 15-30 нуклеотидов в длину, существует большое разнообразие в пригодности конкретных последовательностей в этом диапазоне для направления расщепления любой заданной целевой РНК. Различные пакеты программного обеспечения и принципы, изложенные в данном документе, обеспечивают руководство по идентификации оптимальных целевых последовательностей для любого данного гена-мишени, но также можно принять эмпирический подход, в котором окно или маска данного размера (в качестве не лимитирующего примера, 21 нуклеотид) буквально или фигурально (в том числе, например, в кремнии), размещены на последовательности целевой РНК для идентификации последовательностей в диапазоне размеров, которые могут служить в качестве целевых последовательностей. Перемещая постепенно окно последовательности одного нуклеотида выше или ниже начального положения целевой последовательности, может быть идентифицирована следующая потенциальная целевая последовательность, пока полный набор возможных последовательностей не определен для любого данного целевого выбранного размера. Этот способ в сочетании с систематическим синтезом и тестированием идентифицированных последовательностей (с применением анализов, как описано в данном документе, или как известно в данной области техники) для идентификации тех последовательностей, которые действуют оптимально, может идентифицировать те последовательности РНК, которые при нацеливании со средством, представляющим собой иРНК, опосредуют лучшее ингибирование экспрессии целевого гена. Таким образом, в то время как последовательности идентифицированы, например, в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23 представлены эффективные целевые последовательности, предполагается, что дальнейшая оптимизация эффективности ингибирования может быть осуществлена путем постепенного перемещением окна одного нуклеотида выше или ниже заданных последовательностей для идентификации последовательностей с одинаковыми или улучшенными характеристиками ингибирования.
Кроме того, предполагается, что для любой идентифицированной последовательности, например, в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23, дополнительную оптимизацию можно достичь путем систематического либо добавления, или удаления нуклеотидов с образованием более длинных или более коротких последовательностей и проверки тех последовательностей, образованных в результате перемещения окна более длинного или более короткого размера вверх или вниз по целевой РНК с этой точки. Опять же, присоединение данного подхода к образованию новых целей у кандидатов с тестированием эффективности иРНК на основе тех целевых последовательностей в анализе ингибирования, известными в данной области техники и/или как описано в данном документе, может привести к дальнейшему повышению эффективности ингибирования. В продолжение, такие оптимизированные последовательности можно корректировать путем, например, введения модифицированных нуклеотидов, как описано в данном документе или как известно в данной области техники, добавлением или изменением выступа или другими модификациями, известными в данной области техники и/или описанных в данном документе, для дальнейшей оптимизации молекулы (например, увеличение стабильности в сыворотке или периода полувыведения из кровотока, увеличение термостабильности, улучшение трансмембранной доставки, нацеливание на конкретное положение или тип клетки, увеличение взаимодействия с ферментами пути сайленсинга, увеличение высвобождения из эндосом) в качестве ингибитора экспрессии.
иРНК, как описано в данном документе, может содержать одно или несколько несовпадений с целевой последовательностью. В одном варианте осуществления иРНК, как описано в данном документе, содержит не более чем 3 несовпадения. Если антисмысловая цепь иРНК содержит несовпадения с целевой последовательностью, предпочтительно, чтобы область несовпадения находилась не в центре участка комплементарности. Если антисмысловая цепь иРНК содержит несовпадения с целевой последовательностью, предпочтительно, чтобы несовпадение было ограничено в пределах последних 5 нуклеотидов от либо 5'-, или 3'-конца участка комплементарности. Например, для средства, представляющего собой иРНК, состоящего из 23 нуклеотидов, цепь, комплементарная участку гена С5, как правило, не содержит каких-либо несовпадений в пределах 13 центральных нуклеотидов. Описанные в данном документе способы или способы, известные в данной области техники, можно применять для определения является ли иРНК, содержащая несовпадение с целевой последовательностью, эффективной в ингибировании экспрессии гена С5. Рассмотрение эффективности иРНК с несовпадением в ингибировании экспрессии гена С5 является важным, особенно если конкретный участок комплементарности в гене С5, как известно, имеет изменение полиморфной последовательности в популяции.
III. Модифицированные иРНК по изобретению.
В одном варианте осуществления РНК из числа иРНК по настоящему изобретению, например, dsRNA, является немодифицированной и не содержит, например, химические модификации и/или конъюгации, известные в данной области техники и описанные в данном документе. В другом варианте осуществления РНК из числа иРНК по настоящему изобретению, например, dsRNA, является химически модифицированной для повышения стабильности или других полезных характеристик. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения практически все из нуклеотидов иРНК по настоящему изобретению являются модифицированными. В других вариантах осуществления настоящего изобретения все из нуклеотидов иРНК по настоящему изобретению являются модифицированными. иРНК по настоящему изобретению, в которых практически все нуклеотиды модифицированы являются в значи- 28 044245 тельной степени, но не полностью модифицированными и могут содержать не более 5, 4, 3, 2 или 1 немодифицированных нуклеотидов.
Нуклеиновые кислоты, описанные в настоящем изобретении, могут быть синтезированы и/или модифицированы способами, хорошо известными в данной области техники, такими как те, которые описаны в Current protocols in nucleic acid chemistry, Beaucage, S.L. et al. (Edrs.), John Wiley & Sons, Inc., Нью-Йорк, Нью-Йорк, США, которая включена в данное описание посредством ссылки. Модификации включают, например, модификации концов, например, 5'-концевые модификации (фосфорилирование, конъюгация, перевернутые связи) или 3'-концевые модификации (сопряжение, нуклеотиды ДНК, инвертированные связи, и т.д.); модификации оснований, например, замещение стабилизирующими основаниями, дестабилизирующими основаниями или основаниями, которые образуют пару с расширенным набором партнеров, удаление оснований (абазические нуклеотиды), или сопряженные основания; модификации сахара (например, в 2'-положении или 4'-положение) или замещение сахара; и/или остовные модификации, включая модификации или замещения фосфодиэфирных связей. Конкретные примеры соединений, представляющих собой иРНК, применяемые в описанных в данном документе вариантах осуществления, включают без ограничения РНК, содержащие модифицированные остовы или межнуклеозидные связи не природного происхождения. РНК, содержащие модифицированные остовы включают, среди прочего, те, которые не содержат атом фосфора в остове. В контексте данного описания и как иногда упоминается в данной области техники, модифицированные РНК, не содержащие атом фосфора в их межнуклеозидном остове, также могут считаться олигонуклеозидами. В некоторых вариантах осуществления модифицированная иРНК будет содержать атом фосфора в ее межнуклеозидном остове.
Остовы модифицированных РНК включают, например, фосфотиоаты, хиральные фосфотиоаты, фосфодитиоаты, фосфотриэфиры, аминоалкилфосфотриэфиры, метиловые и другие алкил фосфонаты, включая 3'-алкилен фосфонаты и хиральные фосфонаты, фосфинаты, фосфорамидаты, включая 3'-амино фосфорамидат и аминоалкилфосфорамидаты, тионофосфорамидаты, тионоалкилфосфонаты, тионоалкилфосфотриэфиры и боранофосфаты с нормальными 3'-5'-связями, их 2'-5'-связанные аналоги, а также те, полярность которых инвертируется, где соседние пары нуклеозидных единиц связаны через 3'-5'- с 5'3'- или 2'-5'- с 5'-2'-. Также включают различные соли, смешанные соли и формы свободной кислоты.
Иллюстративные патенты США, которые описывают получение вышеуказанных фосфорсодержащих связей, включают без ограничения патенты США №№ 3687808; 4,469,863; 4,476,301; 5,023,243; 5,177,195; 5,188,897; 5,264,423; 5,276,019; 5,278,302; 5,286,717; 5,321,131; 5,399,676; 5,405,939; 5,453,496;
5,455,233; 5,466,677; 5,476,925; 5,519,126; 5,536,821; 5,541,316; 5,550,111; 5,563,253; 5,571,799; 5,587,361;
5,625,050; 6,028,188; 6,124,445; 6,160,109; 6,169,170; 6,172,209; 6,239,265; 6,277,603; 6,326,199; 6,346,614;
6,444,423; 6,531,590; 6,534,639; 6,608,035; 6,683,167; 6,858,715; 6,867,294; 6,878,805; 7,015,315; 7,041,816;
7,273,933; 7,321,029 и патент США № RE39464, полное содержание каждого из которых включено в данный документ посредством ссылки.
Остовы модифицированной РНК, которые не включают атом фосфора, представляют собой остовы, которые образуются межнуклеозидными связями коротких алкильных или циклоалкильных цепей, смешанными межнуклеозидными связями гетероатомов и алкильных или циклоалкильных цепей, или межнуклеозидными связями одной или нескольких более коротких гетероатомных или гетероциклических цепей. Они включают те, которые имеют морфолино-связи (формируются частично из части нуклеозида, представляющей собой сахар); силоксановые остовы; сульфид, сульфоксидные и сульфоновые остовы; формацетиловые и тиоформацетиловые остовы; метилен-формацетиловые и тиоформацетиловые остовы; алкен-содержащие остовы; сульфаматные остовы; метилен-имино и метилен-гидразиновые остовы; сульфонатные и сульфонамидные остовы; амидные остовы; и другие, включающие смешанные составные части N, О, S и СН2.
Иллюстративные патенты США, которые описывают получение вышеуказанных олигонуклеозидов, включают без ограничения патенты США №№ 5034506, 5,166,315; 5,185,444; 5,214,134; 5,216,141; 5,235,033; 5,64,562; 5,264,564; 5,405,938; 5,434,257; 5,466,677; 5,470,967; 5,489,677; 5,541,307; 5,561,225; 5,596,086; 5,602,240; 5,608,046; 5,610,289; 5,618,704; 5,623,070; 5,663,312; 5,633,360; 5,677,437 и 5677439, полное содержание каждого из которых включено в данный документ посредством ссылки.
В других вариантах осуществления рассматриваются подходящие РНК-миметики для применения в иРНК, в которой и связь сахара, и межнуклеозидная связь, т.е. остов нуклеотидных единиц, заменяются новыми группами. Единицы оснований поддерживают в течение гибридизации с целевым соединением соответствующей нуклеиновой кислоты. Одно из таких олигомерных соединений, РНК-миметик, которое продемонстрировало прекрасные характеристики гибридизации, называют пептидной нуклеиновой кислотой (PNA). В соединениях PNA, остов сахара в РНК замещают амид-содержащим остовом, в частности, аминоэтилглициновым остовом. Азотистые основания сохраняют и связывают прямо или косвенно с атомами азота аза-группы амидной части остова. Иллюстративные патенты США, которые описывают получение соединениях PNA, включают без ограничения патенты США. №№ 5539082, 5714331, полное содержание каждого из которых включено в данный документ посредством ссылки. Дополнительные соединениях PNA, подходящие для применения в иРНК по настоящему изобретению, описаны, например, в Nielsen et al., Science, 1991, 254, 1497-1500.
Некоторые варианты осуществления, описанные в настоящем изобретении, включают РНК с фосфотиоат- 29 044245 ными остовами и олигонуклеозиды с гетероатомными остовами, и, в частности, --CH2--NH--CH2-, --CH2--N(CH3)--О--CH2-- [известный как метиленовый (метилимино) или остов MMI], --CH2--O--N(CH3)--CH2--, --CH2--N(CH3)--N(CH3)--CH2-- и --N(CH3)--CH2--CH2-- [где родной фосфодиэфирный остов представлен как --О--Р--О--СН2--] из вышеупомянутого патента США. № 5489677 и амидные остовы из вышеупомянутого патента США № 5602240. В некоторых вариантах осуществления РНК, описанные в данном документе, имеют структуру морфолино-остова, как в вышеупомянутом патенте США № 5034506.
Модифицированные РНК также могут содержать один или несколько замещенных фрагментов, представляющих собой сахара. иРНК например, dsRNA, описанные в данном документе, могут включать один из следующих заместителей в 2'-положении: ОН; F; О-, S- или N-алкил; О-, S- или N-алкенил; О-, Sили N-алкинил; или О-алкил-О-алкил, где алкил, алкенил и алкинил могут быть замещенными или незамещенными Cl-Cl0-алкилом или C2-Cl0-алкенилом и алкинилом. Иллюстративные подходящие модификации включают O[(CH2)nO]mCH3, О(CH2)nOCHз, O(CH2)nNH2, O(CH2)nCH3, O(CH2)nONH2, и О(CH2)nON[(CH2)nCH3]2, где n и m равняется от 1 до приблизительно 10. В других вариантах осуществления dsRNA включают один из следующих заместителей в положении 2': C1-C10 низший алкил, замещенный низший алкил, алкарил, аралкил, О-алкарил либо О-аралкил, SH, SCH3, OCN, Cl, Br, CN, CF3, OCF3, SOCH3, SO2CH3, ONO2, NO2, N3, NH2, гетероциклоалкил, гетероциклоалкарил, аминоалкиламино-, поли алкиламино-, замещенный силил, группа расщепления РНК, репортерная группа, интеркалятор, группа для улучшения фармакокинетических свойств иРНК, или группа для улучшения фармакодинамических свойства иРНК, и другие заместители, обладающие подобными свойствами. В некоторых вариантах осуществления модификация включает 2'-метоксиэтокси (2'-О--СН2СН2ОСН3, также известный как 2'-О-(2-метоксиэтил) или 2'-МОЕ) (Martin et al., Helv. Chim. Acta, 1995, 78:486-504) т.е. алкокси-алкоксигруппу. Другая иллюстративная модификация представляет собой 2'-диметиламинооксиэтокси, т.е. группа О(CH2)2ON(CH3)2, также известная как 2'-DMAOE, как описано в примерах в данном документе ниже, и 2'-диметиламиноэтоксиэтокси (также известная в данной области техники как 2'-О-диметиламиноэтоксиэтил или 2'-DMAEOE), т.е. 2'-О--CH2--О--CH2--N(CH2)2.
Другие модификации включают 2'-метокси (2'-ОСН3), 2'-аминопропокси (2'-OCH2CH2CH2NH2) и 2'-фтор (2'-F). Похожие модификации можно осуществить в других положениях РНК из числа иРНК, в частности, в З'-положении сахара на З'-конце нуклеотида, или в 2'-5'-связанных dsRNA и 5'-положении 5'-концевого нуклеотида. иРНК также может иметь миметики сахара, такие как фрагменты циклобутила на месте сахара пентофуранозил. Иллюстративные патенты США, которые описывают получение таких структур модифицированного сахара включают без ограничения патенты США №№ 4981957; 5,118,800; 5,319,080; 5,359,044; 5,393,878; 5,446,137; 5,466,786; 5,514,785; 5,519,134; 5,567,811; 5,576,427; 5,591,722; 5,597,909; 5,610,300; 5,627,053; 5,639,873; 5,646,265; 5,658,873; 5,670,633 и 5700920, некоторые из которых, как правило, признают настоящую заявку. Полное содержание каждой из вышеупомянутых заявок включено в данный документ посредством ссылки.
иРНК также может включать модификации или замещения азотистого основания (часто называемого в данной области техники просто как основание). Применяемые в данном документе немодифицированные или природные азотистые основания включают пуриновые основания аденина (А) и гуанина (G), и пиримидиновые основания тимина (Т), цитозина (С) и урацила (U). Модифицированные азотистые основания включают другие синтетические и природные азотистые основания, такие как дезокситимин (dT), 5-метилцитозин (5-МеС), 5-гидроксиметилцитозин, ксантин, гипоксантин, 2-аминоаденин, 6-метил и другие алкиловые производные аденина и гуанина, 2-пропил и другие алкиловые производные аденина и гуанина, 2-тиоурацил, 2-тиотимин и 2тиоцитозин, 5-галогенурацил и цитозин, 5-пропинилурацил и цитозин, 6-азоурацил, цитозин и тимин, 5урацил(псевдоурацил), 4-тиоурацил, 8-галоген, 8-амино, 8-тиол, 8-тиоалкил, 8-гидроксил анал и другие 8замещенные аденины и гуанины, 5-галоген, в частности 5-бром, 5-трифторметил и другие 5-замещенные соединения урацила и цитозина, 7-метилгуанин и 7-метиладенин, 8-азагуанин и 8-азааденин, 7-деазагуанин и 7деазааденин, и З-деазагуанин и З-деазааденин. Дополнительные азотистые основания включают те, которые описаны в патенте США. № 3687808, которые описаны в Modified Nucleosides in Biochemistry, Biotechnology and Medicine, Herdewijn, P. ed. Wiley-VCH, 2008; которые описаны в The Concise Encyclopedia Of Polymer Science And Engineering, pages 858-859, Kroschwitz, J.L., ed. John. Wiley & Sons, 1990, которые описаны Englisch et al., Angewandte Chemie, International Edition, 1991, 30, 613 и которые описаны Sanghvi, Y.S., Chapter 15, dsRNA Research and Applications, pages 289-302, Crooke, S.T. and Lebleu, В., Ed., CRC Press, 1993. Некоторые из этих азотистых оснований особенно полезны для увеличения аффинности связывания олигомерных соединений, описанных в настоящем изобретении. Они включают 5-замещенные пиримидины, 6-азапиримидины и N-2, N-6 и О-6 замещенные пурины, включая 2-аминопропиладенин, 5-пропинилурацил и 5-пропинилцитозин. Замещения 5метилцитозина продемонстрировали увеличение стабильности дуплекса нуклеиновой кислоты при 0,6-1,2°C (Sanghvi, Y.S., Crooke, S.T. and Lebleu, В., Eds., dsRNA Research and Applications, CRC Press, Boca Raton, 1993, pp. 276-278) и являются иллюстративными замещениями оснований, еще более предпочтительно в комбинации с модификацией сахара 2'-О-метоксиэтил.
Иллюстративные патенты США, которые описывают получение некоторых из выше указанных модифицированных азотистых оснований, а также других модифицированных азотистых оснований включают без ограничения указанные выше патенты США №№ 3687808, 4,845,205; 5,130,30; 5,134,066;
- 30 044245
5,175,273; 5,367,066; 5,432,272; 5,457,187; 5,459,255; 5,484,908; 5,502,177; 5,525,711; 5,552,540; 5,587,469;
5,594,121, 5,596,091; 5,614,617; 5,681,941; 5,750,692; 6,015,886; 6,147,200; 6,166,197; 6,222,025; 6,235,887;
6,380,368; 6,528,640; 6,639,062; 6,617,438; 7,045,610; 7,427,672 и 7495088, полное содержание каждого из которых включено в данный документ посредством ссылки.
РНК из числа иРНК также могут быть модифицированы с включением одной или нескольких замкнутых нуклеиновых кислот (LNA). Замкнутая нуклеиновая кислота представляет собой нуклеотид, содержащий фрагмент модифицированной рибозы, где фрагмент рибозы содержит дополнительный мост, соединяющий 2'- и 4'-атомы углерода. Эта структура эффективно замыкает рибозу в 3'-эндо структурной конформации. Добавление замкнутых нуклеиновых кислот в siRNA продемонстрировало повышение стабильности siRNA в сыворотке и снижение эффектов не целевого действия (Elmen, J. et al., (2005) Nucleic Acids Research 33(1):439-447; Mook, OR. et al., (2007) Mol Canc Ther 6(3):833-843; Grunweller, A. et al., (2003) Nucleic Acids Research 31 (12): 3185-3193).
Иллюстративные патенты США, которые описывают получение нуклеотидов с замкнутыми нуклеиновыми кислотами, включают без ограничения следующие: патенты США №№ 6268490, 6670461, 6794499, 6998484, 7053207, 7084125 и 7399845, полное содержание каждого из которых включено в данный документ посредством ссылки.
Потенциальные стабилизирующие модификации на концах молекул РНК могут включать N(ацетиламинокапроил)-4-гидроксипролинол (Нур-C6-NHAc), N-(капроил-4-гидроксипролинол (Нур-С6), N-(ацетил-4-гидроксипролинол (Hyp-NHAc), тимидин-2'-O-дезокситимидин (эфир), N-(аминокапроил) 4-гидроксипролинол (Нур-C6-амино), 2-докосаноил-уридин-3''-фосфат, инвертированное основание dT(idT) и др. Раскрытие этой модификации можно найти в публикации РСТ № WO 2011/005861.
А. Модифицированные иРНК, содержащие мотивы, по изобретению.
В некоторых аспектах настоящего изобретения двухцепочечные средства RNAi по настоящему изобретению включают средства с химическими модификациями, которые раскрыты, например, в предварительной заявке на патент США № 61/561710, поданной 18 ноября 2011 г., или в заявке PCT/US2012/065691, поданной 16 ноября 2012 г., полное содержание каждой из которой включено в данный документ посредством ссылки.
Как показано в данном документе и в предварительной заявке № 61/561710 или заявке РСТ № PCT/US2012/065691, превосходные результаты могут быть получены путем введения одного или нескольких мотивов из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов в смысловую цепь и/или антисмысловую цепь средства RNAi, в частности, в сайт расщепления или рядом с ним. В некоторых вариантах осуществления смысловая нить и антисмысловая нить средства RNAi могут быть полностью модифицированы иным способом. Введение таких мотивов нарушает паттерн модификаций, если он имеется, смысловой и/или антисмысловой нити. Средство RNAi, к примеру смысловая нить, может быть необязательно конъюгировано с лигандом, представляющим собой производное GalNAc. Полученные в результате средства RNAi характеризуются превосходной активностью в отношении сайленсинга генов.
Более конкретно, неожиданно было обнаружено, что в тех случаях, когда смысловая нить и антисмысловая цепь двухцепочечного средства RNAi полностью модифицированы так, что имеют один или несколько мотивов из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов в сайте расщепления по меньшей мере одной цепи средства RNAi или рядом с ним, тогда активность средства RNAi в отношении сайленсинга генов была наилучшим образом повышена.
Соответственно, настоящее изобретение предусматривает двухцепочечные средства RNAi, способные ингибировать экспрессию целевого гена (т.е. гена компонента комплемента С5 (С5)) in vivo. Средство RNAi содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь. Каждая цепь средства RNAi может варьироваться в длину от 12 до 30 нуклеотидов. Например, каждая цепь может составлять от 14 до 30 нуклеотидов в длину, от 17 до 30 нуклеотидов в длину, от 25 до 30 нуклеотидов в длину, от 27 до 30 нуклеотидов в длину, от 17 до 23 нуклеотидов в длину, от 17 до 21 нуклеотида в длину, от 17 до 19 нуклеотидов в длину, от 19 до 25 нуклеотидов в длину, от 19 до 23 нуклеотидов в длину, от 19 до 21 нуклеотида в длину, от 21 до 25 нуклеотидов в длину или от 21 до 23 нуклеотидов в длину.
Смысловая цепь и антисмысловая цепь, как правило, образуют двухцепочечный РНК-дуплекс (dsRNA), также называемый в данном документе как средство RNAi. Дуплексный участок средства для RNAi может составлять 12-30 пар нуклеотидов в длину. Например, дуплексный участок может составлять 14-30 пар нуклеотидов в длину, 17-30 пар нуклеотидов в длину, 27-30 пар нуклеотидов в длину, 17-23 пары нуклеотидов в длину, 17-21 пара нуклеотидов в длину, 17-19 пар нуклеотидов в длину, 19-25 пар нуклеотидов в длину, 19-23 пары нуклеотидов в длину, 19-21 пара нуклеотидов в длину, 21-25 пар нуклеотидов в длину или 21-23 пары нуклеотидов в длину. В другом примере дуплексный участок выбран из 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26 и 27 нуклеотидов в длину.
В одном варианте осуществления средство RNAi может содержать один или несколько выступающих участков и/или блокирующих групп на 3'-конце, 5'-конце или обоих концах одной или обеих цепей. Выступ может составлять 1-6 нуклеотидов в длину, например, 2-6 нуклеотидов в длину, 1-5 нуклеотидов в длину, 2-5 нуклеотидов в длину, 1-4 нуклеотида в длину, 2-4 нуклеотида в длину, 1-3 нуклеотида в длину, 2-3 нуклеотида в длину или 1-2 нуклеотида в длину. Выступы могут быть результатом того, что
- 31 044245 одна нить длиннее другой, или того, что две нити одинаковой длины расположены в шахматном порядке.
Выступ может образовывать несовпадение с целевой мРНК или он может быть комплементарным генным последовательностям, с которыми происходит целевое взаимодействие, или может иметь другую последовательность. Первая и вторая цепи также могут быть соединены, например, дополнительными основаниями с образованием шпильки или при помощи других линкеров, не являющихся основаниями.
В одном варианте осуществления каждый из нуклеотидов в выступающем участке средства RNAi независимо может быть модифицированным или немодифицированным нуклеотидом, в том числе, без ограничения, с сахаром с 2'-модификацией, такой как 2-F, 2'-O-метил, тимидин (Т), 2'-O-метоксиэтил-5метилуридин (Тео), 2'-О-метоксиэтиладенозин (Аео), 2'-O-метоксиэтил-5-метилцитидин (m5Сео) и любые их комбинации. Например, ТТ может быть выступающей последовательностью для любого конца на любой цепи. Выступ может образовывать несовпадение с целевой мРНК или он может быть комплементарным генным последовательностям, с которыми происходит целевое взаимодействие, или может иметь другую последовательность.
5'- или 3'-выступы смысловой цепи, антисмысловой цепи или обеих цепей средства RNAi могут быть фосфорилированы. В некоторых вариантах осуществления выступающий(ие) участок(и) содержит (содержат) два нуклеотида с фосфотиоатом между двумя нуклеотидами, при этом два нуклеотида могут быть одинаковыми или различными. В одном варианте осуществления выступ присутствует на 3'-конце смысловой цепи, антисмысловой цепи или обеих цепей. В одном варианте осуществления этот 3'-выступ присутствует у антисмысловой цепи. В одном варианте осуществления этот 3'-выступ присутствует у смысловой цепи.
Средство RNAi может содержать только один выступ, который может усиливать интерферирующую активность RNAi без воздействия на его общую стабильность. Например, одноцепочечный выступ может быть расположен на 3'-конце смысловой цепи или, в качестве альтернативы, на 3'-конце антисмысловой цепи. RNAi также может иметь тупой конец, расположенный на 5'-конце антисмысловой цепи (или 3'-конце смысловой цепи) или vice versa. Как правило, антисмысловая цепь RNAi имеет нуклеотидный выступ на 3'-конце, а 5'-конец является тупым. Не желая быть связанными теорией, асимметричный тупой конец на 5'-конце антисмысловой цепи и выступ с 3'-конца антисмысловой цепи способствуют включению направляющей цепи в RISC-процесс.
В одном варианте осуществления средство RNAi представляет собой олигомер с обоими тупыми концами, составляющий 19 нуклеотидов в длину, где смысловая цепь содержит по меньшей мере один мотив из трех 2'-F-модификаций трех последовательных нуклеотидов в положениях 7, 8, 9 от 5'-конца. Антисмысловая цепь содержит по меньшей мере один мотив из трех 2'-О-метил-модификаций трех последовательных нуклеотидов в положениях 11, 12, 13 от 5'-конца.
В другом варианте осуществления средство RNAi представляет собой олигомер с обоими тупыми концами, составляющий 20 нуклеотидов в длину, где смысловая цепь содержит по меньшей мере один мотив из трех 2'-F-модификаций трех последовательных нуклеотидов в положениях 8, 9, 10 от 5'-конца. Антисмысловая цепь содержит по меньшей мере один мотив из трех 2'-O-метил-модификаций трех последовательных нуклеотидов в положениях 11, 12, 13 от 5'-конца.
В еще одном варианте осуществления средство RNAi представляет собой олигомер с обоими тупыми концами, составляющий 21 нуклеотидов в длину, где смысловая цепь содержит по меньшей мере один мотив из трех 2'-Р-модификаций трех последовательных нуклеотидов в положениях 9, 10, 11 от 5'конца. Антисмысловая цепь содержит по меньшей мере один мотив из трех 2'-О-метил-модификаций трех последовательных нуклеотидов в положениях 11, 12, 13 от 5'-конца.
В одном варианте осуществления средство для RNAi содержит смысловую цепь из 21 нуклеотида и антисмысловую цепь из 23 нуклеотидов, где смысловая цепь содержит по меньшей мере один мотив из трех 2'-Р-модификаций трех последовательных нуклеотидов в положениях 9, 10, 11 от 5'-конца; антисмысловая цепь содержит по меньшей мере один мотив из трех 2'-О-метил-модификаций трех последовательных нуклеотидов в положениях 11, 12, 13 от 5'-конца, где один конец средства RNAi тупой, в то время как другой конец содержит выступ из 2 нуклеотидов. Предпочтительно, выступ из 2 нуклеотидов находится на 3'-конце антисмысловой цепи. В тех случаях, когда выступ из 2 нуклеотидов находится на 3'-конце антисмысловой цепи, между концевыми тремя нуклеотидами могут быть две фосфотиоатные межнуклеотидные связи, при этом два из трех нуклеотидов являются выступающими нуклеотидами, а третий нуклеотид является спаренным нуклеотидом рядом с выступающим нуклеотидом. В одном варианте осуществления средство RNAi дополнительно содержит две фосфотиоатные межнуклеотидные связи между концевыми тремя нуклеотидами как на 5'-конце смысловой цепи, так и на 5'-конце антисмысловой цепи. В одном варианте осуществления каждый нуклеотид в смысловой цепи и антисмысловой цепи средства RNAi, в том числе нуклеотиды, которые являются частью мотивов, являются модифицированными нуклеотидами. В одном варианте осуществления каждый остаток независимо модифицирован 2'-О-метилом или 3'-фтором, например, при чередующемся мотиве. Необязательно средство RNAi дополнительно содержит лиганд (предпочтительно GalNAc3).
В одном варианте осуществления средство RNAi содержит смысловую и антисмысловую цепь, где смысловая цепь составляет 25-30 нуклеотидных остатков в длину, в которой, начиная с 5'-концевого нуклеотида (положение 1), позиции с 1 до 23 первой цепи содержат по меньшей мере 8 рибонуклеоти- 32 044245 дов; антисмысловая цепь составляет 36-66 нуклеотидных остатков в длину и, начиная с 3'-концевого нуклеотида содержит по меньшей мере 8 рибонуклеотидов в позициях, спаренных с позициями 1-23 смысловой цепи с образованием дуплекса; где по меньшей мере 3'-концевой нуклеотид антисмысловой цепи представляет собой неспаренный со смысловой цепью и до 6 последовательных 3'-концевых нуклеотида являются неспаренными со смысловой цепью, тем самым образуя 3'-одноцепочечный выступ из 1-6 нуклеотидов; где 5'-конец антисмысловой цепи содержит от 10-30 последовательных нуклеотидов, неспаренных со смысловой цепью, тем самым образуя 5'-одноцепочечный выступ из 10-30 нуклеотидов; где по меньшей мере 5'-концевые и 3'-концевые нуклеотиды смысловой цепи являются спаренными основаниями с нуклеотидами антисмысловой цепи, при этом смысловая и антисмысловая цепи выровнены для максимальной комплементарности, тем самым образуя практически дуплексный участок между смысловой и антисмысловой цепями; и антисмысловая цепь достаточно комплементарна целевой РНК на протяжение по меньшей мере 19 рибонуклеотидов антисмысловой цепи в длину для уменьшения экспрессии целевого гена при введении двухцепочечной нуклеиновой кислоты в клетку млекопитающего; и где смысловая цепь содержит по меньшей мере один мотив из трех 2'-F-модификаций в трех последовательных нуклеотидах, где по меньшей мере один из мотивов происходит в сайте расщепления или рядом с ним. Антисмысловая цепь содержит по меньшей мере один мотив из трех 2'-О-метил-модификаций трех последовательных нуклеотидов в сайте расщепления или рядом с ним.
В одном варианте осуществления средство RNAi содержит смысловую и антисмысловую цепи, где средство RNAi содержит первую цепь с длиной, которая составляет по меньшей мере 25 и самое большее 29 нуклеотидов, и вторую цепь с длиной, которая составляет самое большее 30 нуклеотидов, по меньшей мере с одним мотивом из трех 2'-О-метил-модификаций трех последовательных нуклеотидов в положении 11, 12, 13 от 5'-конца; где 3'-конец первой цепи и 5'-конец второй цепи образуют тупой конец, а вторая цепь на 1-4 нуклеотида длиннее на 3'-конце, чем первая цепь, где дуплексный участок составляет по меньшей мере 25 нуклеотидов в длину, а вторая цепь в достаточной степени комплементарна целевой мРНК на протяжении по меньшей мере 19 нуклеотидов длины второй цепи, для снижения экспрессии целевого гена, где средство RNAi вводят в клетки млекопитающего, и где расщепление средства RNAi при помощи dicer предпочтительно дает в результате siRNA, содержащую 3'-конец второй цепи, снижая, таким образом, экспрессию целевого гена у млекопитающего. Необязательно, средство RNAi дополнительно содержит лиганд.
В одном варианте осуществления смысловая цепь средства RNAi содержит по меньшей мере один мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов, где один из мотивов находится в сайте расщепления в смысловой цепи.
В одном варианте осуществления антисмысловая цепь средства RNAi может также содержать по меньшей мере один мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов, где один из мотивов находится в сайте расщепления в смысловой цепи или рядом с ним.
Для средства RNAi с дуплексным участком, составляющим 17-23 нуклеотида в длину, сайт расщепления антисмысловой цепи находится обычно приблизительно в 10, 11 и 12 положении от 5'-конца. Таким образом, мотивы из трех одинаковых модификаций могут находиться в 9, 10, 11 положениях; 10, 11, 12 положениях; 11, 12, 13 положениях; 12, 13, 14 положениях или 13, 14, 15 положениях антисмысловой цепи, при этом отсчет начинается с 1го нуклеотида от 5'-конца антисмысловой цепи или отсчет начинается с 1го спаренного нуклеотида в дуплексном участке от 5'-конца антисмысловой цепи. Сайт расщепления в антисмысловой цепи может также изменяться в соответствии с длиной дуплексного участка RNAi от 5'конца.
Смысловая цепь средства RNAi может содержать по меньшей мере один мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов в сайте расщепления цепи; а антисмысловая цепь может характеризоваться по меньшей мере одним мотивом из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов в сайте расщепления цепи или рядом с ним. В тех случаях, когда смысловая цепь и антисмысловая цепь образуют дуплекс dsRNA, смысловая цепь и антисмысловая цепь могут быть выравнены так, что один мотив из трех нуклеотидов в смысловой цепи и один мотив из трех нуклеотидов в антисмысловой цепи имеют перекрытие по меньшей мере в один нуклеотид, т.е. по меньшей мере один из трех нуклеотидов мотива в смысловой цепи образует пару оснований по меньшей мере с одним из трех нуклеотидов мотива в антисмысловой цепи. В качестве альтернативы, по меньшей мере два нуклеотида могут перекрываться, или все три нуклеотида могут перекрываться.
В одном варианте осуществления смысловая цепь средства RNAi может содержать несколько мотивов из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов. Первый мотив может находиться в сайте расщепления цепи или рядом с ним, а другие мотивы могут быть фланкирующей модификацией. Выражение фланкирующая модификация в данном документе означает мотив, встречающийся в другой части цепи, который отделен от мотива в сайте расщепления той же цепи или рядом с ним. Фланкирующая модификация либо прилегает к первому мотиву, либо отделена по меньшей мере одним или несколькими нуклеотидами. В тех случаях, когда мотивы непосредственно прилегают друг к другу, тогда химическая структура мотивов отличается друг от друга, а когда мотивы разделены одним или несколькими нуклеотидами, тогда химические структуры могут быть одинаковыми или отличными. Могут
- 33 044245 присутствовать две или более фланкирующие модификации. Например, когда присутствует две фланкирующие модификации, то каждая фланкирующая модификация может находится на одном конце по отношению к первому мотиву, который находится в сайте расщепления или рядом с ним или с обеих сторон ведущего мотива.
Подобно смысловой цепи, антисмысловая цепь средства RNAi может содержать несколько мотивов из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов, при этом по меньшей мере один из мотивов находится в сайте расщепления цепи или рядом с ним. Данная антисмысловая цепь может также содержать одну или несколько фланкирующих модификаций, при выравнивании подобных фланкирующим модификациям, которые могут присутствовать в смысловой цепи.
В одном варианте осуществления фланкирующая модификация в смысловой цепи или антисмысловой цепи средства RNAi обычно не включает первый один или первые два концевых нуклеотида на 3'конце, 5'-конце или на обоих концах цепи.
В другом варианте осуществления фланкирующая модификация в смысловой цепи или антисмысловой цепи средства RNAi обычно не включает первый один или первые два спаренных нуклеотида в дуплексном участке на 3'-конце, 5'-конце или на обоих концах цепи.
В тех случаях, когда каждая из смысловой цепи и антисмысловой цепи средства RNAi содержит по меньшей мере одну фланкирующую модификацию, фланкирующие модификации могут попадать на один и тот же конец дуплексного участка и иметь перекрытие в один, два или три нуклеотида.
В тех случаях, когда каждая из смысловой цепи и антисмысловой цепи средства RNAi содержит по меньшей мере две фланкирующие модификации, смысловая цепь и антисмысловая цепь могут быть выравнены так, что две модификации, каждая от одной цепи, попадает на один конец дуплексного участка с перекрытием в один, два или три нуклеотида; две модификации, каждая от одной цепи, попадает на другой конец дуплексного участка с перекрытием в один, два или три нуклеотида; две модификации одной цепи попадают по обе стороны от ведущего мотива с перекрытием в один, два или три нуклеотида в дуплексном участке.
В одном варианте осуществления каждый нуклеотид в смысловой цепи и антисмысловой цепи средства RNAi, в том числе нуклеотиды, которые являются частью мотивов, могут быть модифицированы. Каждый нуклеотид может быть модифицирован одинаковой или различной модификацией, которая может включать одно или несколько изменений одного или обоих несвязанных атомов кислорода фосфата и/или одного или нескольких связанных атомов кислорода фосфата; изменение компонента рибозного сахара, например, 2'-гидроксила в рибозном сахаре; полное замещение фосфатного фрагмента на дефосфоризованные линкеры; модификацию или замещение встречающегося в природе основания и замещение или модификацию рибознофосфатного остова.
Поскольку нуклеиновые кислоты являются полимерами из субъединиц, то многие из модификаций встречаются в положении, которое повторяется в нуклеиновой кислоте, например, модификация основания, или фосфатного фрагмента, или несвязанного О фосфатного фрагмента. В некоторых случаях модификация будет встречаться во всех рассматриваемых положениях в нуклеиновой кислоте, но во многих случаях не будет. В качестве примера, модификация может встречаться только в 3'- или 5'-концевом положении, может встречаться только в концевом участке, например, в положении концевого нуклеотида или в последних 2, 3, 4, 5 или 10 нуклеотидах цепи. Модификация может встречаться в двухцепочечном участке, в одноцепочечном участке или в обоих. Модификация может встречаться только в двухцепочечном участке РНК или может встречаться только в одноцепочечном участке РНК. Например, модификация фосфотиоата в несвязанном положении О может встречаться только на одном или обоих концах, может встречаться только в концевом участке, например, в положении концевого нуклеотида или в последних 2, 3, 4, 5 или 10 нуклеотидах цепи, или может встречаться в двухцепочечном и одноцепочечном участках, в частности на конце. 5'-конец или концы могут быть фосфорилированы.
Это может быть возможно, например, для повышения стабильности, для включения конкретных оснований в выступы или для включения модифицированных нуклеотидов или нуклеотидных заместителей в одноцепочечные выступы, например, в 5'- или 3'-выступ или в оба. Например, может быть желательно включить пуриновые нуклеотиды в выступы. В некоторых вариантах осуществления все или некоторые из оснований в 3'- или 5'-выступе могут быть модифицированы, например, при помощи модификаций, описанных в данном документе. Модификации могут включать, например, применение модификаций в 2'-положении рибозного сахара при помощи модификаций, которые известны в данной области, например, применение дезоксирибонуклеотидов, 2'дезокси-2'-фтор-(2'Т) или 2'-О-метил-модифицированных вместо рибозного сахара азотистого основания, и модификации фосфатной группы, например, модификации фосфотиоата. Выступы могут не быть гомологичными с целевой последовательностью.
В одном варианте осуществления каждый остаток смысловой цепи и антисмысловой цепи независимо модифицирован LNA, HNA, CeNA, 2'-метоксиэтилом, 2'-О-метилом, 2'-О-аллилом, 2'-С-аллилом, 2'-дезокси, 2'-гидроксилом или 2'-фтором. Цепи могут содержать несколько модификаций. В одном варианте осуществления каждый остаток смысловой цепи и антисмысловой цепи независимо модифицирован 2'-О-метилом или 2'-фтором.
По меньшей мере две различные модификации, как правило, присутствуют в смысловой цепи и ан- 34 044245 тисмысловой цепи. Эти две модификации могут быть 2'-О-метил- или 2'-фтор-модификациями или другими.
В одном варианте осуществления Na и/или Nb имеет модификации чередующегося паттерна. Выражение чередующийся мотив, применяемое в данном документе, означает мотив с одной или несколькими модификациями, при этом каждая модификация встречается у чередующихся нуклеотидов одной цепи. Выражение чередующийся нуклеотид может означать один на каждые два нуклеотида, или один на каждые три нуклеотида, или сходный паттерн. Например, если каждый из А, В и С представляет собой один тип модификации нуклеотида, то чередующийся мотив может представлять собой АВАВАВАВАВАВ..., ААВВААВВААВВ..., ААВААВААВААВ..., AAABAAABAAAB..., АААВВВАААВВВ... или АВСАВСАВСАВС... и т.д.
Тип модификаций, содержащихся в чередующемся мотиве, может быть одинаковым или различным. Например, если каждый из А, В, С, D представляет собой один тип модификации нуклеотида, то чередующийся паттерн, т.е. модификации каждого второго нуклеотида, может быть одинаковым, но каждая из смысловой цепи или антисмысловой цепи может быть выбрана из нескольких возможных модификаций в чередующемся мотиве, как, например, АВАВАВ..., АСАСАС..., BDBDBD... или CDCDCD... и т.д.
В одном варианте осуществления средство RNAi по настоящему изобретению содержит паттерн модификаций для чередующегося мотива смысловой цепи, сдвинутый относительно паттерна модификации для чередующегося мотива антисмысловой цепи. Сдвиг может быть таким, что модифицированная группа нуклеотидов смысловой цепи соответствует модифицированной другим способом группе нуклеотидов антисмысловой цепи и vice versa. Например, при спаривании смысловой цепи с антисмысловой цепью в дуплекс dsRNA чередующийся мотив в смысловой цепи может начинаться с АВАВАВ от 5'-3'концу цепи, а чередующийся мотив в антисмысловой цепи может начинаться с ВАВАВА от 5'-3'-концу цепи в дуплексном участке. В качестве другого примера, чередующийся мотив в смысловой цепи может начинаться с ААВВААВВ от 5'-3'-концу цепи, а чередующийся мотив в антисмысловой цепи может начинаться с ВВААВВАА от 5'-3'-концу цепи в дуплексном участке, так что между смысловой цепью и антисмысловой цепью присутствует полный или частичный сдвиг паттернов модификаций.
В одном варианте осуществления средство RNAi первоначально содержит паттерн чередующегося мотива 2'-О-метил-модификации и 2'-Р-модификации в смысловой цепи и первоначально имеет сдвиг в отношении паттерна чередующегося мотива 2'-О-метил-модификации и 2'-F-модификации в антисмысловой цепи, т.е. 2'-О-метил-модифицированный нуклеотид в парах оснований смысловой цепью с 2'-Fмодифицированным нуклеотидом в антисмысловой цепи и vice versa. 1 положение в смысловой цепи может начинаться с 2'-F-модификации, а 1 положение в антисмысловой цепи может начинаться с 2'-Ометил-модификации.
Введение одного или нескольких мотивов из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов в смысловую цепь и/или антисмысловую цепь нарушает первоначальный паттерн модификаций, присутствующий в смысловой цепи и/или антисмысловой цепи. Такое нарушение паттерна модификаций смысловой и/или антисмысловой цепи путем введения одного или нескольких мотивов из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов в смысловую и/или антисмысловую цепь неожиданно повышает активность относительно сайленсинга генов в отношении целевого гена.
В одном варианте осуществления в тех случаях, когда мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов вводят в любую из цепей, модификация нуклеотида, следующего за мотивом, является модификацией, отличной от модификации мотива. Например, часть последовательности, содержащей мотив, представляет собой ...NaYYYNb..., где Y представляет собой модификацию мотива из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов, a Na и Nb представляют собой модификацию нуклеотида, следующего за мотивом YYY, который отличается от модификации Y, и где Na и Nb могут быть одинаковыми или различными модификациями. В качестве альтернативы, Na и/или Nb могут присутствовать или отсутствовать, когда присутствует фланкирующая модификация.
Средство RNAi может дополнительно содержать по меньшей мере одну фосфотиоатную или метилфосфонатую межнуклеотидную связь. Модификация фосфотиоатной или метилфосфонатной межнуклеотидной связи может встречаться у любого нуклеотида смысловой цепи, или антисмысловой цепи, или обеих цепей в любом положении в цепи. Например, модификация межнуклеотидной связи может встречаться у каждого нуклеотида смысловой цепи и/или антисмысловой цепи; каждая модификация межнуклеотидной связи может встречаться в чередующемся паттерне в смысловой цепи и/или антисмысловой цепи; или смысловая цепь или антисмысловая цепь могут содержать обе модификации межнуклеотидной связи в чередующемся паттерне.
Чередующийся паттерн модификации межнуклеотидной связи смысловой цепи может быть одинаковым или отличным от антисмысловой цепи, и чередующийся паттерн модификации межнуклеотидной связи смысловой цепи может характеризоваться сдвигом относительно чередующегося паттерна модификации межнуклеотидной связи антисмысловой цепи. В одном варианте осуществления двухцепочечное средство RNAi содержит 6-8 фосфотиоатных межнуклеотидных связей. В одном варианте осуществления антисмысловая цепь содержит две фосфотиоатных межнуклеотидных связи на 5'-конце и две фос- 35 044245 фотиоатных межнуклеотидных связи на 3'-конце, и смысловая цепь содержит по меньшей мере две фосфотиоатных межнуклеотидных связи либо на 5'-конце, или 3'-конце.
В одном варианте осуществления RNAi имеет модификацию фосфотиоатной или метилфосфонатной межнуклеотидной связи в выступающем участке. Например, выступающий участок может содержать два нуклеотида с фосфотиоатной или метилфосфонатной межнуклеотидной связью между двумя нуклеотидами. Модификации межнуклеотидной связи также могут быть выполнены для соединения выступающих нуклеотидов с концевыми спаренными нуклеотидами в дуплексном участке. Например, по меньшей мере 2, 3, 4 или все выступающие нуклеотиды могут быть связаны посредством фосфотиоатной или метилфосфонатной межнуклеотидной связи и, необязательно, могут присутствовать дополнительные фосфотиоатные или метилфосфонатные межнуклеотидные связи, соединяющие выступающий нуклеотид со спаренным нуклеотидом, который следует за выступающим нуклеотидом. Например, может быть по меньшей мере две фосфотиоатные межнуклеотидные связи между концевыми тремя нуклеотидами, где два из трех нуклеотидов являются выступающими нуклеотидами, а третий является спаренным нуклеотидом рядом с выступающим нуклеотидом. Эти концевые три нуклеотида могут быть на 3'-конце антисмысловой цепи, 3'-конце смысловой цепи, 5'-конце антисмысловой цепи и/или 5'-конце антисмысловой цепи.
В одном варианте осуществления выступ из 2 нуклеотидов находится на 3'-конце антисмысловой цепи и между концевыми тремя нуклеотидами присутствуют две фосфотиоатные межнуклеотидные связи, при этом два из трех нуклеотидов являются выступающими нуклеотидами, а третий нуклеотид является спаренным нуклеотидом рядом с выступающим нуклеотидом. Необязательно, средство RNAi может дополнительно иметь две фосфотиоатные межнуклеотидные связи между концевыми тремя нуклеотидами как на 5'-конце смысловой цепи, так и на 5'-конце антисмысловой цепи.
В одном варианте осуществления средство RNAi содержит несовпадение (несовпадения) с мишенью в дуплексе или их комбинации. Несовпадение может встречаться в выступающем участке или дуплексном участке. Пары оснований можно выстраивать исходя из их склонности содействовать диссоциации или плавлению (например, по свободной энергии ассоциации или диссоциации определенного спаривания, наиболее простым подходом является изучение пар по отдельным парам оснований, хотя можно также выполнить анализ следующей соседней пары или подобный). В плане содействия диссоциации: A:U более предпочтительна, чем G:C; G:U более предпочтительна, чем G:C; а ТгС более предпочтительна, чем G:C (1=инозин). Несовпадения, например, неканонические или отличные от канонических типы спаривания (которые описаны в других частях данного документа), более предпочтительны, чем канонические типы спаривания (А:Т, A:U, G:C); и типы спаривания, которые включают универсальные основания, более предпочтительны, чем канонические типы спаривания.
В одном варианте осуществления средство RNAi содержит по меньшей мере одну из первых 1, 2, 3, 4 или 5 пар оснований в дуплексных участках от 5'-конца антисмысловой цепи, независимо выбранную из группы, состоящей из: A:U, G:U, I:C и несовпадающих пар, например, неканонических или отличных от канонических типов спаривания или типов спаривания, которые включает универсальные основания, для содействия диссоциации антисмысловой цепи на 5'-конце дуплекса.
В одном варианте осуществления нуклеотид в 1 положении в дуплексном участке от 5'-конца в антисмысловой цепи выбран из группы, состоящей из A, dA, dU, U и dT. В качестве альтернативы, по меньшей мере одна из первых 1, 2 или 3 пар оснований в дуплексном участке от 5'-конца антисмысловой цепи является парой оснований AU. Например, первая пара оснований в дуплексном участке от 5'-конца антисмысловой цепи является парой оснований AU.
В другом варианте осуществления нуклеотид на 3'-конце смысловой цепи представляет собой дезокситимин (dT). В другом варианте осуществления нуклеотид на 3'-конце антисмысловой цепи представляет собой дезокси-тимин (dT). В одном варианте осуществления присутствует короткая последовательность дезокситимин нуклеотидов, например, два dT нуклеотида на 3'-конце смысловой и/или антисмысловой цепи.
В одном варианте осуществления последовательность смысловой цепи может быть представлена формулой (I):
5' np-Na-(X X X ) i-Nb-Y Y Y -Nb-(Z Ζ Ζ ) j-Na-nq 3' (I) где каждый из i и j независимо равняется 0 или 1;
каждый из р и q независимо равняется 0-6;
каждая из Na независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-25 модифицированных нуклеотидов, при этом каждая последовательность содержит по меньшей мере два модифицированных различными способами нуклеотида;
каждая из Nb независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10 модифицированных нуклеотидов;
каждый из np и nq независимо представляет собой выступающий нуклеотид;
где Nb и Y имеют неодинаковую модификацию; и каждый из XXX, YYY и ZZZ независимо представляет собой один мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов. Предпочтительно, в YYY все нуклеотиды 2'-F-модифицированы.
В одном варианте осуществления Na и/или Nb имеет модификации чередующегося паттерна.
- 36 044245
В одном варианте осуществления мотив YYY находится в сайте расщепления смысловой цепи или рядом с ним. Например, если средство RNAi содержит дуплексный участок, составляющий 17-23 нуклеотида в длину, то мотив YYY может находиться в сайте расщепления или вблизи него (например, может находиться в положениях 6, 7, 8, 7, 8, 9, 8, 9, 10, 9, 10, 11, 10, 11, 12 или 11, 12, 13) в смысловой цепи, при этом отсчет начинается с 1го нуклеотида от 5'-конца или, необязательно, отсчет начинается с 1го спаренного нуклеотида в дуплексном участке от 5'-конца.
В одном варианте осуществления i равняется 1, a j равняется 0, или i равняется 0, a j равняется 1, или как i, так и j равняются 1. Смысловая цепь, таким образом, может быть представлена следующими формулами:
5’ np-Na-YYY-Nb-ZZZ-Na-nq 3’ (lb) ;
5’ np-Na-XXX-Nb-YYY-Na-nq 3’ (Ic); или
5’ np-Na-XXX-Nb-YYY-Nb-ZZZ-Na-nq 3’ (Id) .
В тех случаях, когда смысловая цепь представлена формулой (Ib), Nb представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10, 0-7, 0-5, 0-4, 0-2 или 0 модифицированных нуклеотидов. Каждая из Na независимо может представлять собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 2-20, 2-15 или 2-10 модифицированных нуклеотидов.
В тех случаях, когда смысловая цепь представлена формулой (Ic), Nb представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10, 0-7, 0-10, 0-7, 0-5, 0-4, 0-2 или 0 модифицированных нуклеотидов. Каждая из Na независимо может представлять собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 2-20, 2-15 или 2-10 модифицированных нуклеотидов.
В тех случаях, когда смысловая цепь представлена формулой (Id), каждая Nb независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10, 0-7, 0-5, 0-4, 0-2 или 0 модифицированных нуклеотидов. Предпочтительно, Nb равняется 0, 1, 2, 3, 4, 5 или 6. Каждая Na независимо может представлять собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 2-20, 2-15 или 2-10 модифицированных нуклеотидов.
Каждый из X, Y и Z может быть одинаковым или отличным от остальных.
В других вариантах осуществления i равняется 0, a j равняется 0, и смысловая цепь может быть представлена формулой
5’ np-Na-YYY- Na-nq 3' (la).
В тех случаях, когда смысловая цепь представлена формулой (Ia), каждая Na независимо может представлять собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 2-20, 2-15 или 2-10 модифицированных нуклеотидов.
В одном варианте осуществления последовательность антисмысловой цепи RNAi может быть представлена формулой (II)
5' nq,-Na r-(Z'Z'Z')k-Nb'-Y'Y'Y'-Nb'-(X'X'X ' ) Σ-Ν'a-np ' 3’ (II) где каждый из k и l независимо равняется 0 или 1;
каждый из р' и q' независимо равняется 0-6;
каждая из Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-25 модифицированных нуклеотидов, при этом каждая последовательность содержит по меньшей мере два модифицированных различными способами нуклеотида;
каждая из Nb' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10 модифицированных нуклеотидов;
каждый из np' и nq' независимо представляет собой выступающий нуклеотид;
где Nb' и Y' имеют неодинаковую модификацию; и каждый из Х'Х'Х', Y'Y'Y' и Z'Z'Z' независимо представляет собой один мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов.
В одном варианте осуществления Na' и/или Nb' имеет модификации чередующегося паттерна.
Мотив Y'Y'Y' находится в сайте расщепления антисмысловой цепи или рядом с ним. Например, если средство RNAi содержит дуплексный участок, составляющий 17-23 нуклеотида в длину, то мотив Y'Y'Y' может находиться в положениях 9, 10, 11; 10, 11, 12; 11, 12, 13; 12, 13, 14 или 13, 14, 15 антисмысловой цепи, при этом отсчет начинается с 1го нуклеотида от 5'-конца или, необязательно, отсчет начинается с 1го спаренного нуклеотида в дуплексном участке от 5'-конца. Предпочтительно, мотив Y'Y'Y' находится в положениях 11, 12, 13.
В одном варианте осуществления в мотиве Y'Y'Y' все нуклеотиды 2'-ОМе-модифицированы.
В одном варианте осуществления k равняется 1, а l равняется 0, или k равняется 0, а l равняется 1, или как k, так и l равняется 1.
- 37 044245
Антисмысловая цепь, таким образом, может быть представлена следующими формулами:
5’ nq--Na'-Z 'Z 'Z ’-Nb'-Y'Y'Y’-Na'-npl З'(ПЬ);
5' nq'-Na '-Υ Ύ Ύ '-Nb г-X'X'X '-Пр- 3' (Ис); или
5' nq.-Na'- Z 'Z 'Z '-Nb'-YrYrYr-Nb'- X'X'X '-Na '-np. 3' (Hd).
В тех случаях, когда антисмысловая цепь представлена формулой (IIb), Nb' представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10, 0-7, 0-10, 0-7, 0-5, 0-4, 0-2 или 0 модифицированных нуклеотидов. Каждая из Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 2-20, 2-15 или 2-10 модифицированных нуклеотидов.
В тех случаях, когда антисмысловая цепь представлена формулой (IIc), Nb' представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10, 0-7, 0-10, 0-7, 0-5, 0-4, 0-2 или 0 модифицированных нуклеотидов. Каждая из Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 2-20, 2-15 или 2-10 модифицированных нуклеотидов.
В тех случаях, когда антисмысловая цепь представлена формулой (IId), каждая из Nb' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10, 0-7, 0-10, 0-7, 0-5, 0-4, 02 или 0 модифицированных нуклеотидов. Каждая из Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 2-20, 2-15 или 2-10 модифицированных нуклеотидов. Предпочтительно, Nb равняется 0, 1, 2, 3, 4, 5 или 6.
В других вариантах осуществления k равняется 0, а l равняется 0, и антисмысловая цепь может быть представлена формулой
5' np.-Na.-Y'Y'Y'- Na--nq> 3' (la).
В тех случаях, когда антисмысловая цепь представлена формулой (IIa), каждая из Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 2-20, 2-15 или 2-10 модифицированных нуклеотидов.
Каждый из X', Y' и Z' может быть одинаковым или отличным от остальных.
Каждый нуклеотид смысловой цепи и антисмысловой цепи независимо может быть модифицирован LNA, HNA, CeNA, 2'-метоксиэтилом, 2'-O-метилом, 2'-О-аллилом, 2'-С-аллилом, 2'-гидроксилом или 2'фтором. Например, каждый нуклеотид смысловой цепи и антисмысловой цепи независимо модифицирован 2'-О-метилом или 2'-фтором. Каждая X, Y, Z, X', Y' и Z', в частности, может представлять собой 2'-Ометил-модификацию или 2'-фтор-модификацию.
В одном варианте осуществления смысловая цепь средства RNAi может содержать мотив YYY, находящийся в 9, 10 и 11 положениях цепи, в тех случаях, когда дуплексный участок составляет 21 нуклеотид, при этом отсчет начинается с 1го нуклеотида от 5'-конца или, необязательно, отсчет начинается с 1го спаренного нуклеотида в дуплексном участке от 5'-конца; и Y представляет собой 2'-F-модификацию. Смысловая цепь может дополнительно содержать мотив XXX или мотивы ZZZ в качестве фланкирующих модификаций на противоположном конце дуплексного участка; и каждый из XXX и ZZZ независимо представляет собой 2'-ОМе-модификацию или 2'-Б-модификацию.
В одном варианте осуществления антисмысловая цепь может содержать мотив Y'Y'Y', находящийся в положениях 11, 12, 13 цепи, при этом отсчет начинается с 1го нуклеотида от 5'-конца или, необязательно, отсчет начинается с 1го спаренного нуклеотида в дуплексном участке от 5'-конца; и Y' представляет собой 2'-О-метил-модификацию. Антисмысловая цепь может дополнительно содержать мотив Х'Х'Х' или мотивы Z'Z'Z' в качестве фланкирующих модификаций на противоположном конце дуплексного участка; и каждый из Х'Х'Х' и Z'Z'Z' независимо представляет собой 2'-ОМе-модификацию или 2'-Fмодификацию.
Смысловая цепь, представленная любой из вышеприведенных формул (Ia), (Ib), (Ic) и (Id), образует дуплекс с антисмысловой цепью, представленной любой из формул (IIa), (IIb), (IIc) и (IId), соответственно.
Соответственно, средства RNAi для применения в способах по настоящему изобретению могут содержать смысловую цепь и антисмысловую цепь, при этом каждая цепь содержит от 14 до 30 нуклеотидов, дуплекс RNAi, представленный формулой (III):
смысловая: 5’ np -Na - (X X X) i-Nb -YYY -Nb -(Z Z Z)j -Na - nq 3 ’ антисмысловая: 3’ np ' -Na ' - (X 'X 'X ') k-Nb '-Y Ύ Ύ ' -Nb ' - (Z ' Z ' Z ') b-Na ' - nq ' 5’ (III), где каждый из i, j, k и l независимо равняется 0 или 1;
каждый из р, р', q и q' независимо равняется 0-6;
каждый из Na и Na независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-25 модифицированных нуклеотидов, при этом каждая последовательность содержит по меньшей мере два модифицированных различными способами нуклеотида;
каждый из Nb и Nb' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10 модифицированных нуклеотидов;
где каждый из np', np, nq' и nq, каждый из которых может присутствовать или отсутствовать, независимо представляет собой выступающий нуклеотид; и
- 38 044245 каждый из XXX, YYY, ZZZ, X'X'X', ΥΎΎ' и Z'Z'Z' независимо представляет собой один мотив из трех одинаковых модификаций трех последовательных нуклеотидов.
В одном варианте осуществления i равняется 0, a j равняется 0; или i равняется 1, a j равняется 0; или i равняется 0, a j равняется 1; или как i, так и j равняются 0; или как i, так и j равняются 1. В другом варианте осуществления k равняется 0, а l равняется 0; или k равняется 1, а l равняется 0; k равняется 0, а l равняется 1; или как k, так и l равняется 0; или как k, так и l равняется 1.
Иллюстративные комбинации смысловой цепи и антисмысловой цепи, образующих дуплекс RNAi, включают формулы, приведенные ниже:
’ np - Na -Y Y Y -Na-nq 3 ’
3’ np'-Na'-Y ' Y ' Υ ' -Na'nq' 5’ (Ша)
5’ ηρ -Na -YYY -¾ -ZZZ -Na-nq 3’
3’ np'-Na'-Y'Y'Y'-Nb'-Z 'Z 'Z '-Na'nq' 5’ (Illb) ’ np-Na- X X X -Nb -Y Y Y - Na-nq 3 ’
3’ np'-Na'-X'X'X'-Nb'-Y'Y'Y'-Na'-nq' 5’ (IIIc) ’ np -Na -XXX -Nb-Y Y Y -Nb- ZZZ -Na-nq 3 ’ 3' np'-Na'-X'X'X'-Nb'-Y'Y'Y'-Nb'-Z'Z'Z'-Na-nq' 5' (Hid)
В тех случаях, когда средство RNAi представлено формулой (IIIa), каждый из Na независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 2-20, 2-15 или 2-10 модифицированных нуклеотидов.
В тех случаях, когда средство RNAi представлено формулой (IIIb), каждый из Nb независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 1-10, 1-7, 1-5 или 1-4 модифицированных нуклеотида. Каждый из Na независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 2-20, 2-15 или 2-10 модифицированных нуклеотидов.
В тех случаях, когда средство RNAi представлено формулой (IIIc), каждый из Nb, Nb' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10, 0-7, 0-10, 0-7, 0-5, 0-4, 02 или 0 модифицированных нуклеотидов. Каждый из Na независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 2-20, 2-15 или 2-10 модифицированных нуклеотидов.
В тех случаях, когда средство RNAi представлено формулой (IIId), каждый из Nb, Nb' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 0-10, 0-7, 0-10, 0-7, 0-5, 0-4, 02 или 0 модифицированных нуклеотидов. Каждый из Na, Na' независимо представляет собой олигонуклеотидную последовательность, содержащую 2-20, 2-15 или 2-10 модифицированных нуклеотидов. Каждый из Na, Na', Nb и Nb' независимо содержит модификации чередующегося паттерна.
Каждый из X, Y и Z в формулах (III), (IIIa), (IIIb), (IIIc) и (IIId) может быть одинаковой или отличной от остальных.
В тех случаях, когда средство RNAi представлено формулой (III), (IIIa), (IIIb), (IIIc) и (IIId), по меньшей мере один из нуклеотидов Y может образовывать пару оснований с одним из нуклеотидов Y'. В качестве альтернативы, по меньшей мере два из нуклеотидов Y образуют пары оснований с соответствующими нуклеотидами Y'; или все три из нуклеотидов Y образуют пары оснований с соответствующими нуклеотидами Y'.
В тех случаях, когда средство RNAi представлено формулой (IIIb) или (IIId), по меньшей мере один из нуклеотидов Z может образовывать пару оснований с одним из нуклеотидов Z'. В качестве альтернативы, по меньшей мере два из нуклеотидов Z образуют пары оснований с соответствующими нуклеотидами Z'; или все три из нуклеотидов Z образуют пары оснований с соответствующими нуклеотидами Z'.
В тех случаях, когда средство RNAi представлено формулой (IIIc) или (IIId), по меньшей мере один из нуклеотидов X может образовывать пару оснований с одним из нуклеотидов X'. В качестве альтернативы, по меньшей мере два из нуклеотидов X образуют пары оснований с соответствующими нуклеотидами X'; или все три из нуклеотидов X образуют пары оснований с соответствующими нуклеотидами X'.
В одном варианте осуществления модификация нуклеотида Y отличается от модификации нуклеотида Y', модификация нуклеотида Z отличается от модификации нуклеотида Z', и/или модификация нуклеотида X отличается от модификации нуклеотида X'.
В одном варианте осуществления в тех случаях, когда средство RNAi представлено формулой (IIId), модификациями Na являются 2'-О-метил- или 2'-фтор-модификации. В другом варианте осуществления в тех случаях, когда средство RNAi представлено формулой (IIId), модификациями Na являются 2'-Oметил- или 2'-фтор-модификации, и np'>0, и по меньшей мере один np' соединен с соседним нуклеотидом
- 39 044245 посредством фосфотиоатной связи. В еще одном варианте осуществления в тех случаях, когда средство RNAi представлено формулой (IIId), модификациями Na являются 2'-O-метил- или 2'-фтор-модификации, np'>0, и по меньшей мере один np' соединен с соседним нуклеотидом посредством фосфотиоатной связи, а смысловая цепь конъюгирована с одним или несколькими производными GalNAc, присоединенными посредством двухвалентного или трехвалентного разветвленного линкера (описанного ниже). В другом варианте осуществления в тех случаях, когда средство RNAi представлено формулой (IIId), модификациями Na являются 2'-O-метил- или 2'-фтор-модификации, np'>0, и по меньшей мере один np' соединен с соседним нуклеотидом посредством фосфотиоатной связи, смысловая нить содержит по меньшей мере одну фосфотиоатную связь, и смысловая нить конъюгирована с одним или несколькими производными GalNAc, присоединенными посредством двухвалентного или трехвалентного разветвленного линкера.
В одном варианте осуществления в тех случаях, когда средство RNAi представлено формулой (IIIa), модификациями Na являются 2'-О-метил- или 2'-фтор-модификации, np'>0, и по меньшей мере один np' соединен с соседним нуклеотидом посредством фосфотиоатной связи, смысловая нить содержит по меньшей мере одну фосфотиоатную связь, и смысловая нить конъюгирована с одним или несколькими производными GalNAc, присоединенными посредством двухвалентного или трехвалентного разветвленного линкера.
В одном варианте осуществления средство RNAi является мультимером, содержащим по меньшей мере два дуплекса, представленных формулой (III), (IIIa), (IIIb), (IIIc) и (IIId), где дуплексы соединены линкером. Линкер может быть расщепляемым или нерасщепляемым. Необязательно, мультимер дополнительно содержит лиганд. Каждый из дуплексов может быть нацелен на один и тот же ген или на два различных гена или каждый из дуплексов может быть нацелен на один и тот же ген в двух различных целевых сайтах.
В одном варианте осуществления средство RNAi является мультимером, содержащим три, четыре, пять, шесть или более дуплексов, представленных формулой (III), (IIIa), (IIIb), (IIIc) и (IIId), где дуплексы соединены линкером. Линкер может быть расщепляемым или нерасщепляемым. Необязательно, мультимер дополнительно содержит лиганд. Каждый из дуплексов может быть нацелен на один и тот же ген или на два различных гена или каждый из дуплексов может быть нацелен на один и тот же ген в двух различных целевых сайтах.
В одном варианте осуществления два средства RNAi, представленные формулой (III), (IIIa), (IIIb), (IIIc) и (IIId), соединены друг с другом на 5'-конце, и один или оба 3'-конца необязательно конъюгированы с лигандом. Каждое из средств может быть нацелено на один и тот же ген или на два различных гена или каждое из средств может быть нацелено на один и тот же ген в двух различных целевых сайтах.
В различных публикациях описаны мультимерные средства для RNAi, которые можно применять в способах по настоящему изобретению. Такие публикации включают WO 2007/091269, патент США № 7858769, WO 2010/141511, WO 2007/117686, WO 2009/014887 и WO 2011/031520, полное содержание которых, таким образом, включено в данный документ при помощи ссылки.
Как описано более подробно ниже, средство RNAi, содержащее один или нескольких углеводных фрагментов, конъюгированных со средством RNAi, может улучшать одно или несколько свойств средства RNAi. Во многих случаях углеводный фрагмент будет прикреплен к модифицированннй субъединице средства RNAi. Например, рибозный сахар одной или нескольких рибонуклеотидных субъединиц средства, представляющего собой dsRNA, можно замещать другими фрагментами, например, отличным от углевода (предпочтительно циклическим) носителем, к которому присоединен углеводный лиганд. Рибонуклеотидную субъединицу, в которой рибозный сахар субъединицы был замещен таким образом, называют в данном документе субъединицей с модификацией-замещением рибозы (RRMS). Циклический носитель может быть карбоциклической кольцевой системой, т.е. все атомы в кольце являются атомами углерода, или гетероциклической кольцевой системой, т.е. один или несколько атомов в кольце могут быть гетероатомами, например, азотом, кислородом, серой. Циклический носитель может быть моноциклической кольцевой системой или может содержать два или более колец, например, конденсированные кольца. Циклический носитель может быть полностью насыщенной кольцевой системой или он может содержать одну или несколько двойных связей.
Лиганд может быть присоединен к полинуклеотиду через носитель. Носители включают: (i) по меньшей мере одну точку присоединения к остову, предпочтительно две точки присоединения к остову и (ii) по меньшей мере одну связывающую точку присоединения. Выражение точка присоединения к остову, используемое в данном документе, означает функциональную группу, например, гидроксильную группу, или, как правило, связь, доступную для введения носителя в остов и которая подходит для этого, например, фосфат или модифицированный фосфат, например, серосодержащий остов рибонуклеиновой кислоты. Выражение связывающая точка присоединения (ТАР) в некоторых вариантах осуществления означает входящий в кольцо атом циклического носителя, например, атом углерода или гетероатом (отличный от атома, который обеспечивает точку присоединения к остову), с которым связывается выбранный фрагмент. Фрагмент может быть, например, углеводом, например, моносахаридом, дисахаридом, трисахаридом, тетрасахаридом, олигосахаридом и полисахаридом. Необязательно, выбранный фрагмент соединен промежуточной связью с циклическим носителем. Таким образом, цикличе- 40 044245 ский носитель будет часто включать функциональную группу, например, аминогруппу, или, как правило, обеспечивать связь, которая подходит для введения или связывания другого химического структурного элемента, например, лиганда, с составным кольцом.
Средства RNAi можно конъюгировать с лигандом через носитель, где носитель может быть циклической группой или ациклической группой; предпочтительно циклическая группа выбрана из пирролидинила, пиразолинила, пиразолидинила, имидазолинила, имидазолидинила, пиперидинила, пиперазинила, [1,3]-диоксолана, оксазолидинила, изоксазолидинила, морфолинила, тиазолидинила, изотиазолидинила, хиноксалинила, пиридазинонила, тетрагидрофурила и декалина; предпочтительно ациклическая группа выбрана из остова, представляющего собой серинол, или остова, представляющего собой диэтаноламин.
В определенных конкретных вариантах осуществления средством RNAi для применения в способах по настоящему изобретению является средство, выбранное из группы, состоящей из средств, перечисленных в любой из табл. 3, 4, 5, 6, 18, 19, 20, 21 и 23. Такие средства могут дополнительно содержать лиганд.
IV. иРНК, конъюгированные с лигандами.
Другая модификация РНК из числа иРНК по настоящему изобретению включает химическое связывание с одним или несколькими лигандами РНК, фрагментами или конъюгатами, которые повышают активность, клеточное распределение или клеточное поглощение иРНК. Такие фрагменты включают без ограничения липидные группы, такие как фрагмент холестерина (Letsinger et al., Proc. Natl. Acid. Sci. USA, 1989, 86: 6553-6556), холевую кислоту (Manoharan et al., Biorg. Med. Chem. Let., 1994, 4:1053-1060), тиоэфир, например, берилл-S-тритилтиол (Manoharan et al., Ann. N.Y. Acad. Sci., 1992, 660:306-309; Manoharan et al., Biorg. Med. Chem. Let., 1993, 3:2765-2770), тиохолестерин (Oberhauser et al., Nucl. Acids Res., 1992, 20:533-538), алифатическую цепь, например, остатки додекандиола или ундецила (SaisonBehmoaras et al., EMbO J, 1991, 10:1111-1118; Kabanov et al., FEBS Lett., 1990, 259:327-330; Svinarchuk et al., Biochimie, 1993, 75:49-54), фосфолипид, например, ди-гексадецил-рац-глицерин или триэтиламмоний 1,2-ди-О-гексадецил-рац-глицеро-3-фосфонат (Manoharan et al., Tetrahedron Lett., 1995, 36:36513654; Shea et al., Nucl. Acids Res., 1990, 18:3777-3783), цепь полиамина или полиэтиленгликоля (Manoharan et al., Nucleosides & Nucleotides, 1995, 14:969-973) или адамантан-уксусная кислота (Manoharan et al., Tetrahedron Lett., 1995, 36:3651-3654), пальмитиловый фрагмент (Mishra et al., Biochim. Biophys. Acta, 1995, 1264:229-237), или октадециламин или фрагмент гексиламино-карбонилоксихолестерина (Crooke et al., J. Pharmacol. Exp. Ther., 1996, 277:923-937).
В одном варианте осуществления лиганд изменяет распределение, нацеливание или время существования средства, представляющего собой иРНК, в которое он введен. В предпочтительных вариантах осуществления лиганд обеспечивает повышенную аффинность в отношении выбранной мишени, например, молекулы, клетки или типа клеток, компартмента, например, клеточного компартмента или части органа, ткани, органа или участка тела, например, по сравнению с видами, у которых отсутствует такой лиганд. Предпочтительные лиганды не будут принимать участие в спаривании дуплекса в дуплексной нуклеиновой кислоте.
Лиганды могут включать вещество, встречающееся в природе, такое как белок (например, сывороточный альбумин человека (HSA), липопротеин низкой плотности (LDL), или глобулин); углевод (например, декстран, пуллулан, хитин, хитозан, инулин, циклодекстрин, N-ацетилгалактозамин или гиалуроновая кислота) или липид. Лиганд также может быть рекомбинантной или синтетической молекулой, такой как синтетический полимер, например, синтетическая полиаминокислота. Примеры полиаминокислот включают полиаминокислоту, представляющую собой полилизин (PLL), поли-L-аспарагиновую кислоту, поли-к-глутаминовую кислоту, сополимер стирола и ангидрида малеиновой кислоты, сополимер L-лактида и гликолида, сополимер дивинилового эфира и малеинового ангидрида, N-(2гидроксипропил)меакриламидный сополимер (НМРА), полиэтиленгликоль (PEG), поливиниловый спирт (PVA), полиуретан, поли(2-этилакриловую кислоту), N-изопропилакриламидные полимеры или полифосфазин. Примеры полиаминов включают полиэтиленимин, полилизин (PLL), спермин, спермидин, полиамин, псевдопептид-полиамин, полиамин-пептидомиметик, полиамин-дендример, аргинин, амидин, протамин, катионный липид, катионный порфирин, четвертичную соль полиамина или альфаспиральный пептид.
Лиганды также включают нацеливающие группы, например, нацеливающее на клетку или ткань средство, например, лектин, гликопротеин, липид или белок, например, антитело, которое связывается с определенным клеточным типом, таким как клетка почки. Нацеливающей группой может быть тиреотропин, меланотропин, лектин, гликопротеин, поверхностный белок А, углевод-муцин, поливалентная лактоза, поливалентная галактоза, N-ацетилгалактозамин, N-ацетилглюкозамин, поливалентная манноза, поливалентная фукоза, гликозилированные полиаминокислоты, поливалентная галактоза, трансферрин, бисфосфонат, полиглутамат, полиаспартат, липид, холестерин, стероид, желчная кислота, фолат, витамин В12, витамин А, биотин или RGD-пептид, или миметик RGD-пептида.
Другие примеры лигандов включают красители, интеркалирующие средства (например, акридины), сшивающие средства (например, псорален, митомицин С), порфирины (ТРРС4, тексафирин, сапфирин),
- 41 044245 полициклические ароматические углеводороды (например, феназин, дигидрофеназин), искусственные эндонуклеазы (например, EDTA), липофильные молекулы, например, холестерин, холевую кислоту, адамантануксусную кислоту, 1-пиренмасляную кислоту, дигидротестостерон, 1,3-бисO(гексадецил)глицерин, геранилоксигексильную группу, гексадецил-глицерин, борнеол, ментол, 1,3пропандиол, гептадецильную группу, пальмитиновую кислоту, миристиновую кислоту, O3(олеоил)литохолевую кислоту, O3-(олеоил)холеновую кислоту, диметокситритил или феноксазин и пептидные конъюгаты (например, пептид antennapedia, Tat-пептид), алкилирующие средства, фосфат, амино, меркапто, PEG (например, PEG-40K), MPEG, [MPEG]2, полиамино, алкил, замещенный алкил, меченные радиоизотопом маркеры, ферменты, гаптены (например, биотин), помощники транспорта/всасывания (например, аспирин, витамин Е, фолиевую кислоту), синтетические рибонуклеотиды (например, имидазол, бисимидазол, гистамин, имидазольные кластеры, конъюгаты акридин-имидазол, комплекс Eu3+ тетраазамакроциклы), динитрофенил, HRP или АР.
Лигандами могут быть белки, например, гликопротеины, или пептиды, например, молекулы со специфической аффинностью в отношении ко-лиганда, или антитела, например, антитело, которое связывается с определенным клеточным типом, таким как печеночная клетка. Лиганды также могут включать гормоны и рецепторы гормонов. Они также могут включать отличные от пептидов виды, такие как липиды, лектины, углеводы, витамины, кофакторы, поливалентную глюкозу, поливалентную галактозу, Nацетилгалактозамин, N-ацетилглюкозамин, поливалентную маннозу или поливалентную фукозу. Лигандом, например, может быть липополисахарид, активатор МАР-киназы р38 или активатор NF-kB.
Лигандом может быть вещество, например, лекарственное средство, которое может увеличивать поглощение средства, представляющего собой иРНК, клеткой, например, путем разрушения цитоскелета клетки, например, путем разрушения микротрубочек, микрофиламентов и/или промежуточных филаментов клетки. Лекарственным средством, например, может быть таксон, винкристин, винбластин, цитохалазин, нокодазол, яплакинолид, латрункулин А, фаллоидин, свинголид А, инданоцин или миосервин.
В некоторых вариантах осуществления лиганд присоединен к иРНК, как описано в данном документе, и действует как фармакокинетический модулятор (PK-модулятор). PK-модуляторы включают липофилы, желчные кислоты, стероиды, фосфолипидные аналоги, пептиды, белок-связывающие средства, PEG, витамины и т.д. Иллюстративные PK-модуляторы включают без ограничения холестерин, жирные кислоты, холевую кислоту, литохолевую кислоту, диалкил-глицериды, диацил-глицерид, фосфолипиды, сфинголипиды, напроксен, ибупрофен, витамин Е, биотин и т.д. Олигонуклеотиды, которые содержат некоторое количество фосфотиоатных связей, также, как известно, связываются с сывороточным белком, таким образом, короткие олигонуклеотиды, например, олигонуклеотиды из приблизительно 5 оснований, 10 оснований, 15 оснований или 20 оснований, содержащие множество фосфотиоатных связей в остове, также пригодны в настоящем изобретении в качестве лигандов (например, в качестве PK-модулирующих лигандов). Кроме того, аптамеры, которые связываются с сывороточными компонентами (например, сывороточными белками) также пригодны для применения в качестве PK-модулирующих лигандов в описанных в данном документе вариантах осуществления.
Лиганд-конъюгированные олигонуклеотиды по настоящему изобретению могут быть синтезированы с применением олигонуклеотида, который несет боковую реакционноспособную функциональность, такие как те, полученные из присоединения связывающей молекулы на олигонуклеотиде (описано ниже). Этот реакционноспособный олигонуклеотид можно непосредственно подвергать взаимодействию с коммерчески доступными лигандами, лигандами, которые синтезированы с наличием любой из разнообразных защитных групп, или лигандами, которые имеют связующий фрагмент, присоединенный к нему.
Олигонуклеотиды, применяемые в конъюгатах по настоящему изобретению, можно получать удобным и обычным способом путем хорошо известного твердофазного синтеза. Оборудование для такого синтеза продается несколькими поставщиками, включая, например, Applied Biosystems (Foster City, Calif). Дополнительно или альтернативно могут быть применены любые другие средства для такого синтеза, известные в данной области техники. Также известно применение аналогичных методов для получения других олигонуклеотидов, таких как фосфотиоаты и алкилированные производные.
Лиганд-конъюгированные олигонуклеотиды и лиганд-молекула, несущая последовательностьспецифические связанные нуклеозиды по настоящему изобретению, олигонуклеотиды и олигонуклеозиды могут быть собраны на подходящем синтезаторе ДНК с применением стандартных предшественников нуклеотида или нуклеозида, или предшественников нуклеотид- или нуклеозид-коньюгата, которые уже несут связывающий фрагмент, предшественников лиганд-нуклеотида или нуклеозид-коньюгата, которые уже несут молекулу лиганда, или строительных блоков, несущих лиганд, отличный от нуклеозида.
При применении предшественников нуклеотид-конъюгата, которые уже несут связывающий фрагмент, синтез последовательность-специфических связанных нуклеозидов, как правило, завершают и молекулу лиганда затем подвергают взаимодействию со связывающим фрагментом с образованием лиганд-конъюгированного олигонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления олигонуклеотиды или связанные нуклеозиды по настоящему изобретению синтезируют с помощью автоматического синтезатора с применением фосфорамидитов, полученных из лиганд-нуклеозид конъюгатов, в дополнение к стандартным фосфорамидитам и нестандартным фосфорамидитам, которые коммерчески доступны и обычно применяются в синтезе олигонуклеотидов.
- 42 044245
А. Конъюгаты липидов.
В одном варианте осуществления лиганд или коньюгат представляет собой липид или молекулу на основе липида. Такие липиды или липидные молекулы предпочтительно связываются с сывороточным белком, например, сывороточным альбумином человека (HSA). Связывающийся с HSA лиганд делает возможным распределение конъюгата в целевой ткани, например, отличной от ткани почек целевой ткани организма. Например, целевой тканью может быть печень, в том числе паренхиматозные клетки печени. Также в качестве лигандов можно использовать другие молекулы, которые могут связываться с HSA. Например, можно использовать напроксен или аспирин. Липид или липидный лиганд может (а) увеличивать устойчивость к разрушению конъюгата, (b) увеличивать нацеливание или транспорт в целевую клетку или клеточную мембрану и/или (с) может быть использован для корректировки связывания с сывороточным белком, например, HSA.
Липидный лиганд можно применять для ингибирования, например, регулирования связывания конъюгата с целевой тканью. Например, менее вероятно, что липид или липидный лиганд, который связывается с HSA более сильно, будет целенаправленно воздействовать на почки и, таким образом, менее вероятно, что он будет выводиться из организма. Липид или липидный лиганд, которые связываются с HSA менее сильно, можно применять для нацеливания конъюгата на почки.
В предпочтительном варианте осуществления липидный лиганд связывается с HSA. Предпочтительно, он связывается с HSA с достаточной аффинностью, так что конъюгат будет предпочтительно распределяться в ткани, отличной от ткани почек. Однако, предпочтительно, чтобы аффинность не была настолько сильной, чтобы связывание HSA-лиганд было необратимым.
В другом предпочтительном варианте осуществления липидный лиганд связывается с HSA слабо или вообще не связывается, так что конъюгат предпочтительно будет распределяться в почке. Другие фрагменты, которые нацелены на клетки почек, также можно использовать вместо или в дополнение к липидным лигандам.
В другом аспекте лигандом является фрагмент, например, витамин, который поглощается целевой клеткой, например, пролиферирующей клеткой. Таковые являются особенно пригодными для лечения нарушений, характеризующихся нежелательной пролиферацией клеток, например, злокачественного или доброкачественного типа, например, раковых клеток.
Иллюстративные витамины включают витамин А, Е и K. Другие иллюстративные витамины включают витамины группы В, например, фолиевую кислоту, В12, рибофлавин, биотин, пиридоксаль, или другие витамины или питательные вещества, поглощаемые целевыми клетками, например, печеночными клетками. Также включены HAS и липопротеин низкой плотности (LDL).
В. Средства, обеспечивающие проникновение в клетку.
В другом аспекте лигандом является средство, обеспечивающее проникновение в клетку, предпочтительно спиральное средство для проникновения в клетку. Предпочтительно, средство является амфипатическим. Иллюстративным средством является пептид, такой как tat или antennopedia. Если средством является пептид, то он может быть модифицированным, включая пептидилмиметик, инвертомеры, отличные от пептидных или псевдопептидные связи и применение D-аминокислот. Спиральным средством предпочтительно является альфа-спиральное средство, которое предпочтительно характеризуется липофильной и липофобной фазой.
Лигандом может быть пептид или пептидомиметик.
Пептидомиметик (также называемый в данном документе олигопептидомиметиком) является молекулой, способной сворачиваться в определенную трехмерную структуру, подобную естественному пептиду. Прикрепление пептида и пептидомиметиков к средствам, представляющим собой иРНК, может повлиять на фармакокинетическое распределение иРНК, например, путем повышения клеточного распознавания и абсорбции. Фрагмент, представляющий собой пептид или пептидомиметик, может составлять примерно 5-50 аминокислот в длину, например, приблизительно 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45 или 50 аминокислот в длину.
Пептидом или пептидомиметиком, например, может быть пептид, обеспечивающий проникновение в клетку, катионный пептид, амфипатический пептид или гидрофобный пептид (например, состоящий главным образом из Tyr, Trp или Phe). Фрагментом, представляющим собой пептид, может быть пептиддендример, стерически затрудненный пептид или перекрестно сшитый пептид. В другом альтернативном варианте фрагмент, представляющий собой пептид, может включать гидрофобную последовательность, контролирующую перенос через мембрану (MTS). Иллюстративным содержащим гидрофобную MTS пептидом является RFGF с аминокислотной последовательностью AAVALLPAVLLALLAP (SEQ ID NO:9). RFGF-аналог (например, аминокислотная последовательность AALLPVLLAAP (SEQ ID NO:10), содержащий гидрофобную MTS, также может быть нацеливающим фрагментом. Фрагмент, представляющий собой пептид, может быть доставляющим пептидом, который может переносить большие полярные молекулы, в том числе пептиды, олигонуклеотиды и белки, через клеточные мембраны. Например, как было обнаружено, последовательности из Tat-белка HIV (GRKKRRQRRRPPQ (SEQ ID NO:11) и белка Antennapedia Drosophila (RQIKIWFQNRRMKWKK (SEQ ID NO:12) способны функционировать в качестве доставляющих пептидов. Пептид или пептидомиметик могут кодироваться случайными после
- 43 044245 довательностями ДНК, как, например, пептид, идентифицированный из библиотеки фагового дисплея или комбинаторной библиотеки одна гранула-одно соединение (ОВОС) (Lam et al., Nature, 354:82-84, 1991). Примером пептида или пептидомиметика, связанного со средством, представляющим собой dsRNA, посредством введенной мономерной единицы с целью нацеливания на клетку, является содержащий аргинин-глицин-аспарагиновую кислоту (RGD) пептид или RGD-миметик. Фрагмент, представляющий собой пептид, может характеризоваться длиной в пределах от приблизительно 5 аминокислот до приблизительно 40 аминокислот. Фрагменты, представляющие собой пептиды, могут характеризоваться структурной модификацией, такой как для повышения стабильности или управления конформационными свойствами. Можно применять любую из структурных модификаций, описанных ниже.
RGD-пептид для применения в композициях и способах по настоящему изобретению может быть линейным или циклическим, и может быть модифицирован, например, гликозилирован или метилирован для облегчения нацеливания на определенную ткань (ткани). Пептиды, содержащие RGD, и пептидомиметики могут включать D-аминокислоты, а также синтетические RGD-миметики. В дополнение к RGD можно применять другие фрагменты, которые нацелены на лиганд интегрин. Предпочтительные конъюгаты с таким лигандом нацелены на РЕСАМ-1 или VEGF.
Пептид, обеспечивающий проникновение в клетку способен проникать в клетку, например, микробную клетку, такую как бактериальная или грибная клетка, или клетку млекопитающего, такую как клетка человека. Пептидом, проникающим в микробную клетку, например, может быть α-спиральный линейный пептид (например, LL-37 или Ceropin P1), содержащий дисульфидную связь пептид (например, α-дефенсин, β-дефенсин или бактенецин), или петид, содержащий только одну или две преобладающие аминокислоты (например, PR-39 или индолицидин). Пептид, обеспечивающий проникновение в клетку, также может включать клеточный сигнал внутриядерной локализации (NLS). Например, пептидом, обеспечивающим проникновение в клетку, может быть двухкомпонентный амфипатический пептид, такой как MPG, который получен из домена слитого пептида gp41 HIV-1 и NLS из большого Т-антигена SV40 (Simeoni et al., Nucl. Acids Res. 31:2717-2724, 2003).
С. Конъюгаты углевода.
В некоторых вариантах осуществления композиций и способов по настоящему изобретению предлагается олигонуклеотид иРНК, дополнительно содержащий углевод. Конъюгированная с углеводом иРНК является предпочтительной для доставки in vivo нуклеиновых кислот, а также в композициях, пригодных для терапевтического применения in vivo, как описано в данном документе. Применяемый в данном документе углевод относится к соединению, которое является либо углеводом per se, состоящим из одной или нескольких единиц моносахарида, имеющих по меньшей мере 6 атомов углерода (который может быть линейным, разветвленным или циклическим) с кислородом, азотом или атом серы, присоединенных к каждому атому углерода; или соединению, имеющему углеводную часть в качестве его части, состоящей из одной или нескольких единиц моносахарида, имеющих по меньшей мере 6 атомов углерода (который может быть линейным, разветвленным или циклическим) с кислородом, азотом или атомом серы, присоединенных к каждому атому углерода. Типичные углеводы включают сахара (моно-, ди-, три- и олигосахариды, содержащие от примерно 4, 5, 6, 7, 8 или 9 единиц моносахарида) и полисахариды, такие как крахмалы, целлюлоза, гликоген и полисахаридные смолы. Конкретные моносахариды включают сахара С5 и выше (например, С5, C6, С7 или С8); ди- и трисахариды, включают сахара, состоящие из двух или трех единиц моносахаридов (например, С5, C6, С7 или С8).
В одном варианте осуществления конъюгат углевода для применения в композициях и способах по настоящему изобретению представляет собой моносахарид. В одном варианте осуществления моносахарид представляет собой N-ацетилгалактозамин, такой как
Формулы II
- 44 044245
В другом варианте осуществления конъюгат углевода для применения в композициях и способах по настоящему изобретению выбран из группы, состоящей из:
- 45 044245
- 46 044245
- 47 044245
HO
AcHN
- 48 044245
Еще один иллюстративный конъюгат углевода для применения в вариантах осуществления, описанных в данном документе, включает без ограничения
(Формулу XXIII), где один из X и Y представляет собой олигонуклеотид, другой представляет собой водород.
В некоторых вариантах осуществления конъюгат углевода дополнительно содержит один или несколько дополнительных лигандов, как описано выше, таких как без ограничения PK-модулятор и/или пептид, обеспечивающий проникновение в клетку.
D. Линкеры.
В некоторых вариантах осуществления конъюгат или лиганд, описанные в данном документе, могут быть присоединены к олигонуклеотиду иРНК различными линкерами, которые могут быть расщепляемыми или нерасщепляемыми.
Выражение линкер или связывающая группа означает органическую группу, которая соединяет две части соединения, например, ковалентно прикрепляет две части соединения. Линкеры обычно содержат прямую связь или атом, такой как кислород или сера, звено, такое как NR8, С(О), C(O)NH, SO, SO2, SO2NH, или цепочку атомов, такую как без ограничения замещенный или незамещенный алкил, замещенный или незамещенный алкенил, замещенный или незамещенный алкинил, арилалкил, арилалкенил, арилалкинил, гетероарилалкил, гетероарилалкенил, гетероарилалкинил, гетероциклилалкил, гетероциклилалкенил, гетероциклилалкинил, арил, гетероарил, гетероциклил, циклоалкил, циклоалкенил, алкиларилалкил, алкиларилалкенил, алкиларилалкинил, алкениларилалкил, алкениларилалкенил, алкениларилалкинил, алкиниларилалкил, алкиниларилалкенил, алкиниларилалкинил, алкилгетероарилалкил, алкилгетероарилалкенил, алкилгетероарилалкинил, алкенилгетероарилалкил, алкенилгетероарилалкенил, алкенилгетероарилалкинил, алкинилгетероарилалкил, алкинилгетероарилалкенил, алкинилгетероарилалкинил, алкилгетероциклилалкил, алкилгетероциклилалкенил, алкилгетерооциклилалкинил, алкенилгетероциклилалкил, алкенилгетероциклилалкенил, алкенилгетероциклилалкинил, алкинилгетероциклилалкил, алкинилгетероциклилалкенил, алкинил гетероциклил алкинил, алкиларил, алкениларильная, алкиниларил, алкилгетероарил, алкенилгетероарил, алкинилгетероарил, где одна или несколько метиленовых групп могут быть прерваны или удалены по О, S, S(O), SO2, N(R8), C(O), замещенный или незамещенный 8 арил, замещенный или незамещенный гетероарил, замещенный или незамещенный гетероцикл; где R представляет собой водород, ацил, алифатическое соединение или замещенное алифатическое соединение. В одном варианте осуществления линкер составляет между приблизительно 1-24 атомов углерода, 2-24, 3-24, 4-24, 5-24, 6-24, 6-18, 7-18, 8-18 атомов, 7-17, 8-17, 6-16, 7-16 или 8-16 атомов.
Расщепляемая связывающая группа является достаточно стабильной вне клетки, но при поступлении в целевую клетку расщепляется с высвобождением двух частей, которые линкер удерживает вместе. В предпочтительном варианте осуществления расщепляемая связывающая группа расщепляется по меньшей мере приблизительно в 10 раз, 20 раз, 30 раз, 40 раз, 50 раз, 60 раз, 70 раз, 80 раз, 90 раз или более, или по меньшей мере приблизительно в 100 раз быстрее в целевой клетке или при условии первой передачи (которое может, например, быть выбрано для имитирования или представления внутриклеточных условий), чем в крови субъекта, или при условии второй передачи (которое может, например, быть выбрано для имитирования или представления условий, обнаруженных в крови или сыворотке).
Расщепляемые связывающие группы являются чувствительными к средствам расщепления, например, рН, окислительно-восстановительному потенциалу или наличию дегенеративных молекул. Как правило, средства расщепления более распространены или обнаружены на более высоких уровнях или активности внутри клеток, чем в сыворотке крови или крови. Примеры таких дегенеративных средств включают: восстанавливающие средства, которые выбраны для конкретных субстратов или которые не имеют субстратной специфичности, включая, например, окислительные или восстановительные ферменты или восстановительные средства, такие как меркаптаны, присутствующие в клетках, которые могут разрушать окислительно-восстановительную расщепляемую связывающую группу путем восстановле- 49 044245 ния; эстеразы; эндосомы или средства, способные создать кислую среду, например, те, которые приводят к рН пять или меньше; ферменты, которые могут гидролизовать или разрушить кислотно-расщепляемую связывающую группу, действуя как обычная кислота, пептидазы (которые могут быть субстратспецифичными) и фосфатазы.
Расщепляемая связывающая группа, такая как дисульфидная связь, может быть восприимчива к рН. РН сыворотки крови человека составляет 7,4, тогда как среднее внутриклеточное рН составляет немного ниже, в пределах приблизительно 7,1-7,3. Эндосомы характеризуются более кислой средой с рН в пределах 5,5-6,0, а лизосомы характеризуются еще более кислой средой с рН в пределах 5,0. Некоторые линкеры будут иметь расщепляемую связывающую группу, которая расщепляется в условиях предпочтительного рН, тем самым высвобождая катионный липид из лиганда внутрь клетки или в желаемый компартмент клетки.
Линкер может содержать расщепляемую связывающую группу, которая расщепляется конкретным ферментом. Тип расщепляемой связывающей группы, введенной в линкер, может зависеть от клеткимишени. Например, лиганд, нацеленный на печень, может быть связан с катионным липидом через линкер, который содержит эфирную группу. Клетки печени богаты эстеразами и, следовательно, линкер будет расщеплен более эффективно в клетках печени, чем в типах клеток, которые не богаты на эстеразу. Другие типы клеток, богатые на эстеразы, включают клетки легкого, коры почек и яичка.
Линкеры, содержащие пептидные связи, могут быть применены для нацеливании на типы клеток, богатых на пептидазы, например, клетки печени и синовиоциты.
Как правило, пригодность расщепляемой связывающей группы кандидата можно оценить путем оценки способности разрушающего средства (или условия) расщеплять связывающую группу кандидата. Также будет желательно также исследовать расщепляемую связывающую группу кандидата на способности противостоять расщеплению в крови или при приведении в контакт с другими тканями, не являющимися целевыми. Таким образом, можно определить относительную чувствительность к расщеплению между первым и вторым условием, где первое выбрано как показатель расщепления в целевой клетке, а второе выбрано как показатель расщепления в других тканях или биологических жидкостях, например, крови или сыворотке. Оценки могут быть выполнены в свободных клеточных системах, в клетках, в клеточной культуре, в органе или ткани культуры, или на животных в совокупности. Может быть полезно произвести первоначальные оценки в свободно-клеточных или культуральных условиях и подтвердить дальнейшими оценками на животных в совокупности. В предпочтительных вариантах осуществления полезные соединения кандидатов расщепляются в по меньшей мере приблизительно 2, 4, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100 раз быстрее в клетке (или в условиях in vitro, выбранных для имитирования внутриклеточных условий) по сравнению с кровью или сывороткой (или в условиях in vitro, выбранных для имитирования внеклеточный условий).
i. Окислительно-восстановительные расщепляемые связывающие группы.
В одном варианте осуществления расщепляемая связывающая группа представляет собой окислительно-восстановительную расщепляемую связывающую группу, которая расщепляется при восстановлении или окислении. Примером восстановительной расщепляемой связывающей группы является дисульфид-связывающая группа (-S-S-). Для определения пригодности расщепляемой связывающей группы кандидата быть восстановительной расщепляемой связывающей группой или, например, быть пригодной для применения в конкретном фрагменте иРНК и конкретном нацеливающем средстве, можно использовать способы, описанные в данном документе. Например, кандидата можно оценивать путем инкубации с дитиотреитолом (DTT) или другими восстановителями с применением реагентов, известн в данной области техники, которые имитируют скорость расщепления, которое можно наблюдать в клетке, например, целевой клетке. Также кандидата можно оценивать в условиях, выбранных для имитирования условий в крови или сыворотке. В одном варианте осуществления соединения кандидатов расщепляются не более чем на приблизительно 10% в крови. В других вариантах осуществления полезные соединения кандидатов разрушаются в по меньшей мере приблизительно 2, 4, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100 раз быстрее в клетке (или в условиях in vitro, выбранных для имитирования внутриклеточных условий) по сравнению с кровью (или в условиях in vitro, выбранных для имитирования внеклеточный условий). Скорость расщепления соединений кандидатов может быть определена с помощью стандартных анализов ферментативной кинетики в условиях, выбранных для имитации внутриклеточной среды и по сравнению с условиями, выбранными для имитации внеклеточной среды.
ii. Расщепляемые связывающие группы на основе фосфата.
В другом варианте осуществления расщепляемый линкер содержит расщепляемую связывающую группу на основе фосфата. Расщепляемая связывающая группа на основе фосфата расщепляется средствами, которые разрушают или гидролизуют фосфатную группу. Примером средства, расщепляющего фосфатные группы в клетках, являются ферменты, такие как фосфатазы в клетках. Примерами связывающих групп на основе фосфата являются -O-F,(O)(ORk)-O-, -O-P(S)(ORk)-O-, -O-P(S)(SRk)-O-, -S-P(O)(ORk)-O-, -O-P(O)(ORk)-S-, -S-P(O)(ORk)-S-, -O-P(S)(ORk)-S-, -S-P(S)(ORk)-O-, -O-P(O)(Rk)-O-, -O-P(S)(Rk)-O-, -S-P(O)(Rk)-O-, -S-P(S)(Rk)-O-, -S-P(O)(Rk)-S-, -O-P(S)(Rk)-S-. Предпочтительные варианты осуществления представляют собой -O-P(O)(OH)-O-, -O-P(S)(OH)-O-, -O-P(S)(SH)-O-, -S-P(O)(OH)-O-, -O-P(O)(OH)-S-, -S-P(O)(OH)-S-, -O-P(S)(OH)-S-,
- 50 044245
-S-P(S)(OH)-O-, -Ο-Ρ(Ο)(Η)-Ο-, -O-P(S)(H)-O-, -S-P(O)(H)-O, -S-P(S)(H)-O-, -S-P(O)(H)-S-, -O-P(S)(H)-S-. Предпочтительный вариант осуществления представляет собой -О-Р(О)(ОН)-О-. Эти кандидаты могут быть оценены! с применением способов, аналогичных описанным выше.
iii. Кислотно-расщепляемые связывающие группы.
В другом варианте осуществления расщепляемый линкер содержит кислотно-расщепляемую связывающую группу. Кислотно-расщепляемая связывающая группа представляет собой связывающую группу, которая расщепляется в присутствии кислоты. В предпочтительных вариантах осуществления кислотно-расщепляемые связывающие группы расщепляются в кислотных условиях при рН приблизительно 6,5 или ниже (например, приблизительно 6,0, 5,75, 5,5, 5,25, 5,0 или ниже), или с помощью средств, таких как ферменты, которые могут действовать как обычная кислота. Специфические органеллы в клетке, содержимое которых имеет низкое значение рН, такие как эндосомы и лизосомы, могут обеспечить условия для расщепления кислотно-расщепляемых связывающих групп. Примеры кислотнорасщепляемых связывающих групп включают без ограничения гидразоны, сложные эфиры и сложные эфиры аминокислот. Кислотно-расщепляемые группы могут характеризоваться общей формулой C=NN-, C(O)O или -ОС(О). В предпочтительном варианте осуществления, когда углерод присоединен к кислороду сложного эфира (алкоксигруппе), в этом участвует арильная группа, замещенная алкильная группа или третичный алкил, такой как диметил-пентил или трет-бутил. Эти кандидаты могут быть оценены с применением способов, аналогичных описанным выше.
iv. Связывающие группы на основе сложного эфира.
В другом варианте осуществления расщепляемый линкер содержит связывающую группу на основе сложного эфира. Расщепляемая связывающая группа на основе сложного эфира расщепляется ферментами, такими как эстеразы и амидазы в клетках. Примеры расщепляемых связывающих групп на основе сложного эфира включают без ограничения сложные эфиры алкилена, алкенилена и алкиниленовых групп. Расщепляемые связывающие группы на основе сложного эфира представлены общей формулой С(О)О- или -ОС(О)-. Эти кандидаты могут быть оценены с применением способов, аналогичных описанным выше.
v. Расщепляемые группы на основе пептида.
В другом варианте осуществления расщепляемый линкер содержит расщепляемую связывающую группу на основе пептида. Расщепляемая связывающая группа на основе пептида расщепляется ферментами, такими как пептидазы и протеазы в клетках. Расщепляемые связывающие группы на основе пептида представляют собой пептидные связи, образованные между аминокислотами с образованием олигопептидов (например, дипептидов, трипептидов и т.д.) и полипептидов. Расщепляемые группы на основе пептида не включают амидную группу (-C(O)NH-). Амидная группа может быть образована между любым алкиленом, алкениленом или алкинеленом. Пептидная связь представляет собой особый тип амидной связи, образованной между аминокислотами с образованием пептидов и белков. Расщепляемая группа на основе пептида обычно ограничена пептидной связью (т.е. амидной связью), образованной между аминокислотами с образованием пептидов и белков, и не включает амидную функциональную группу целиком. Расщепляемые связывающие группы на основе пептида представлены общей формулой NHCHRAC(O)NHCHRBC(O)-, где RA и RB представляют собой R-группы двух соседних аминокислот. Эти кандидаты могут быть оценены с применением способов, аналогичных описанным выше.
- 51 044245
В одном варианте осуществления иРНК по настоящему изобретению конъюгирована с углеводом через линкер. Неограничивающие примеры углеводных конъюгатов иРНК с линкерами из композиций и способов по настоящему изобретению, включают без ограничения
(Формулы XXVI) ,
(Формулы XXVII),
- 52 044245
(формулы XXX), где один из Y или X представляет собой олигонуклеотид, другой представляет собой водород.
В некоторых вариантах осуществления композиций и способов по настоящему изобретению лиганд представляет собой один или несколько производных GalNAc (N-ацетилгалактозамина), присоединенные через двухвалентный или трехвалентный разветвленный линкер.
В одном варианте осуществления dsRNA по настоящему изобретению конъюгирована с двухвалентным или трехвалентным разветвленным линкером, выбранным из группы структур, продемонстрированных в любой из формул (XXXI)-(XXXIV): Формулы XXXI
Формулы XXXII
(2A_R2A ,Т2В_|_2В
уЗАЗА
уЗВ рв
Формулы XXXIII 5 или Формулы XXXIV ;
где q2A, q2B, q3A, q3B, q4A, q4B, q5A, q5B и q5C независимо представляют собой для каждого случая 0-20 и где повторяющиеся единицы могут быть одинаковыми или различными;
каждый из Р2А, Р2В, P3A, P3B, Р4А, Р4В, Р5А, Р5В, Р5С, Т2А, Т2В, T3A, T3B, Т4А, Т4В, Т4А, Т5В, Т5С независимо для каждого случая отсутствует, переставляет собой СО, NH, О, S, ОС(О), NHC(O), CH2, CH2NH или СН2О;
Q2A, Q2b, Q3A, Q3b, Q4A, Q4b, Q5A, Q5B, Q5C независимо для каждого случая отсутствует, представляет собой алкилен, замещенный алкилен, где один или несколько метиленов могут прерываться или оканчиваться одним или несколькими из О, S, S(O), SO2, N(Rn), C(R')=C(R''), С=С или С(О);
каждый из R2A, R2B, R3A, R3B, R4A, R4B, R5A, R5B, R5C независимо для каждого случая отсутствует, представляет собой NH, О, S, СН2, С(О)О, C(O)NH, NHCH(Ra)C(O), -С(О)-СН(Ra)-NH-, СО, CH=N-O,
- 53 044245 или гетероциклил;
L2A, L2B, L3A, L3B, L4A, L4B, L5A, L5B и L5C представляют собой лиганд; т.е. каждый независимо для каждого случая представляет собой моносахарид (например, GalNAc), дисахарид, трисахарид, тетрасахарид, олигосахарид или полисахарид; и Ra представляет собой Н или аминокислотную боковую цепь. Трехвалентные конъюгированные производные GalNac особенно полезны для применения со средствами RNAi для ингибирования экспрессии целевого гена, такие как представлены формулой (XXXV):
Формула XXXV
где L5A, L5B и L5C представляют собой моносахарид, такой как производное GalNAc.
Примеры подходящих двухвалентных и трехвалентных разветвленных групп линкера, конъюгированных с производными GalNac, включают без ограничения структуры, указанные выше как формулы II, VII, XI, X и XIII.
Иллюстративные патенты США, которые описывают получение коньюгатов РНК, включают без ограничения патенты США №№ 4828979, 4,948,882; 5,218,105; 5,525,465; 5,541,313; 5,545,730; 5,552,538; 5,578,717, 5,580,731; 5,591,584; 5,109,124; 5,118,802; 5,138,045; 5,414,077; 5,486,603; 5,512,439; 5,578,718; 5,608,046; 4,587,044; 4,605,735; 4,667,025; 4,762,779; 4,789,737; 4,824,941; 4,835,263; 4,876,335; 4,904,582; 4,958,013; 5,082,830; 5,112,963; 5,214,136; 5,082,830; 5,112,963; 5,214,136; 5,245,022; 5,254,469; 5,258,506; 5,262,536; 5,272,250; 5,292,873; 5,317,098; 5,371,241, 5,391,723; 5,416,203, 5,451,463; 5,510,475; 5,512,667; 5,514,785; 5,565,552; 5,567,810; 5,574,142; 5,585,481; 5,587,371; 5,595,726; 5,597,696; 5,599,923; 5,599,928 и 5688941, 6294664, 6320017, 6576752, 6783931, 6900297, 7037646, 8106022, полное содержание каждого из которых включено в данный документ посредством ссылки.
Не является необходимым для всех позиций в данном соединении быть равномерно модифицированными, и на самом деле более чем одна из вышеуказанных модификаций может быть включена в отдельное соединение или даже в отдельный нуклеозид в пределах иРНК. Настоящее изобретение также включает соединения иРНК, которые представляют собой химерные соединения.
Соединения химерной иРНК или химеры в контексте настоящего изобретения представляют собой соединения иРНК, предпочтительно dsRNA, которые содержат два или более химически различных участка, каждый из которых состоит по меньшей мере из одного мономера, т.е. нуклеотида в случае соединения dsRNA. Такие иРНК обычно содержат по меньшей мере один участок, где РНК модифицирована таким образом, чтобы наделить иРНК повышенной устойчивостью к разрушению нуклеазой, увеличенным клеточным поглощением и/или увеличением аффинности связывания в отношении целевой нуклеиновой кислоты. Дополнительно участок иРНК может служить в качестве субстрата для ферментов, способных расщеплять РНК:ДНК или РНК:РНК гибриды. В качестве примера, РНКаза Н является клеточной эндонуклеазой, которая расщепляет РНК-цепь в РНК:ДНК-дуплексе. Активация РНКазы Н, следовательно, приводит к расщеплению целевой РНК, тем самым значительно повышая эффективность ингибирования иРНК при экспрессии гена. Следовательно, сравнимые результаты зачастую можно получить с более короткими иРНК при применении химерных dsRNA по сравнению с фосфотиоатными дезокси гибридизациями dsRNA того же целевого участка. Расщепление РНК-мишени обычно можно обнаружить с помощью гель-электрофореза и, при необходимости, методами гибридизации связанных нуклеиновых кислот, известных в данной области техники.
В некоторых случаях РНК из числа иРНК может быть модифицирована группой, не являющейся лигандом. Ряд молекул, не являющихся лигандами, были конъюгированы с иРНК в целях повышения активности, клеточного распределения или клеточного поглощения иРНК, способы выполнения таких конъюгаций доступны в научной литературе. Такие фрагменты, не являющиеся лигандами, включали липидные фрагменты, такие как холестерин (Kubo, T. et al., Biochem. Biophys. Res. Comm., 2007, 365(1):54-61; Letsinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1989, 86:6553), холевая кислота (Manoharan et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 1994, 4:1053), тиоэфир, например, геkсил-S-тритилтиол (Manoharan et al., Ann. N.Y. Acad. Sci., 1992, 660:306; Manoharan et al., Bioorg. Med. Chem. Let., 1993, 3:2765), тиохолестерин (Oberhauser et al., Nucl. Acids Res., 1992, 20:533), алифатическую цепь, например, остатки додекандиола или ундецила (Saison-Behmoaras et al., EMBO J., 1991, 10:111; Kabanov et al., FEBS Lett., 1990, 259:327; Svinarchuk et al., Biochimie, 1993, 75:49), фосфолипид, например, ди-гексадецил-рац-глицерин или триэтил-аммоний 1,2-ди-О-гексадецил-рац-глицеро-3-Н-фосфонат (Manoharan et al., Tetrahedron Lett., 1995, 36:3651; Shea et al., Nucl. Acids Res., 1990, 18:3777), цепь полиамина или полиэтиленгликоля (Manoharan et al., Nucleosides & Nucleotides, 1995, 14:969) или адамантан-уксусная кислота (Manoharan et al., Tetrahe
- 54 044245 dron Lett., 1995, 36:3651), пальмитиловый фрагмент (Mishra et al., Biochim. Biophys. Acta, 1995, 1264:229237), или октадециламин или фрагмент гексиламино-карбонилоксихолестерина (Crooke et al., J. Pharmacol. Exp. Ther., 1996, 277:923). Иллюстративные патенты США, которые описывают получение таких коньюгатов РНК, были перечислены выше. Типичные протоколы коньюгации включают синтез РНК, несущих амино-линкер в одном или нескольких положениях последовательности. Аминогруппа затем реагирует с молекулой, подлежащей конъюгации, с применением соответствующего сочетания или активирующих реагентов. Реакцию конъюгирования можно выполнять как с РНК, все еще связанной с твердой подложкой, или после расщепления РНК в фазе раствора.
Очистка конъюгата РНК с помощью HPLC, как правило, приводит к получению чистого конъюгата.
IV. Доставка иРНК по изобретению.
Доставку иРНК по настоящему изобретению к клетке, например, клетке субъекта, такого как субъект-человек (например, субъект, нуждающийся в этом, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5), можно осуществлять различными путями. Например, доставку можно осуществлять путем приведения клетки в контакт с иРНК по настоящему изобретению либо in vitro, либо in vivo. Доставку in vivo также можно осуществлять непосредственно путем введения композиции, содержащей иРНК, например, dsRNA, субъекту. В альтернативном случае, доставку in vivo можно осуществлять опосредованно путем введения одного или нескольких векторов, которые кодируют и направляют экспрессию иРНК. Такие альтернативные случаи описаны далее ниже.
Как правило, любой способ доставки молекулы нуклеиновой кислоты (in vitro или in vivo) может быть адаптирован для применения с иРНК по настоящему изобретению (см., например, Akhtar S. and Julian R.L. (1992) Trends Cell. Biol. 2(5):139-144 и WO 94/02595, которые включены в данный документ при помощи ссылки в полном объеме). Что касается доставки in vivo, факторы, которые учитывают в контексте доставки молекулы иРНК, включают, например, биологическую стабильность доставленной молекулы, предупреждение неспецифического действия и накопление доставленной молекулы в целевой ткани. Неспецифическое действие иРНК может быть сведено к минимуму путем локального введения, например путем прямой инъекции или вживления в ткань, или местного введения препарата. Локальное введение в место обработки максимально увеличивает локальную концентрацию средства, ограничивает воздействие средства на системные ткани, которые в ином случае могут быть повреждены средством или которые могут разрушить средство, и позволяет вводить более низкую общую дозу молекулы иРНК. Несколько исследований показали эффективный нокдаун генных продуктов при введении иРНК локально. Например, было показано, что внутриглазная доставка dsRNA к VEGF путем как инъекции в стекловидное тело макаков-крабоедов (Tolentino, M.J., et al. (2004) Retina 24:132-138), так и субретинальных инъекций мышам (Reich, S.J., et al. (2003) Mol. Vis. 9:210-216) предупреждает образование новых сосудов в экспериментальной модели возрастной макулярной дистрофии. Кроме того, непосредственная внутриопухолевая инъекция dsRNA мышам уменьшает размер опухоли (Pille, J., et al. (2005) Mol. Ther. 11:267274) и может увеличивать продолжительность жизни мышей с опухолью (Kim, W.J., et al. (2006) Mol. Ther. 14:343-350; Li, S., et al. (2007) Mol. Ther. 15:515-523). РНК-интерференция также была успешной при локальной доставке к ЦНС путем непосредственной доставки (Dorn, G., et al. (2004) Nucleic Acids 32:e49; Tan, P.H., et al. (2005) Gene Ther. 12:59-66; Makimura, H., et al. (2002) BMC Neurosci. 3:18; Shishkina, G.T., et al. (2004) Neuroscience 129:521-528; Thakker, E.R., et al. (2004) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101:17270-17275; Akaneya, Y., et al. (2005) J. Neurophysiol. 93:594-602) и к легким путем интраназального введения (Howard, K.A., et al. (2006) Mol. Ther. 14:476-484; Zhang, X., et al. (2004) J. Biol. Chem. 279:10677-10684; Bitko, V., et al. (2005) Nat. Med. 11:50-55). Что касается введения иРНК системно при лечении заболевания, РНК может быть модифицирована или, в качестве альтернативы, доставлена при помощи системы доставки лекарственного средства; оба способа действуют для предупреждения быстрого разрушения dsRNA эндо- и экзонуклеазами in vivo. Модификация РНК или фармацевтический носитель также могут делать возможным нацеливание композиции с иРНК на целевую ткань, и с их помощью можно избежать нежелательного нецелевого действия. Молекулы иРНК могут быть модифицировать при помощи химической конъюгации с липофильными группами, такими как холестерин, для повышения поглощения клеткой и предупреждения разрушения. Например, иРНК, направленную против АроВ и конъюгированную с фрагментом, представляющим собой липофильный холестерин, вводили системно мышам и получали в результате нокдаун мРНК ароВ как в печени, так и в тонкой кишке (Soutschek, J., et al. (2004) Nature 432:173-178). Как было показано, конъюгация иРНК с аптамером ингибирует рост опухоли и опосредует регресс опухоли на мышиных моделях рака предстательной железы (McNamara, J.O., et al. (2006) Nat. Biotechnol. 24:1005-1015). В альтернативном варианте осуществления иРНК можно доставлять с помощью систем доставки лекарственных средств, таких как наночастица, дендример, полимер, липосомы или катионная система доставки. Положительно заряженные катионные системы доставки способствуют связыванию молекулы иРНК (отрицательно заряженной) и также увеличивают взаимодействия на отрицательно заряженной клеточной мембране с обеспечением эффективного поглощения иРНК клеткой. Катионные липиды, дендримеры или полимеры могут быть связанными либо с иРНК, либо на них воздействуют для образования пузырька или мицеллы (см., например, Kim S.H., et al. (2008) Journal of Controlled Release 129(2):107-116), которые заключают в себя иРНК. Образование
- 55 044245 пузырьков или мицелл также предупреждает разрушение иРНК при введении системно. Способы получения и введения катионных комплексов с иРНК находятся в пределах квалификации специалистов в данной области техники (см., например, Sorensen, D.R., et al. (2003) J. Mol. Biol 327:761-766; Verma, U.N., et al. (2003) Clin. Cancer Res. 9:1291-1300; Arnold, A.S. et al. (2007) J. Hypertens. 25:197-205, которые включены в данный документ при помощи ссылки в полном объеме). Некоторые неограничивающие примеры систем доставки лекарственных средств, пригодных для системной доставки иРНК, включают DOTAP (Sorensen, D.R., et al. (2003), выше; Verma, UN., et al. (2003), выше), олигофектамин, твердые частицы с нуклеиновой кислотой-липидом (Zimmermann, T.S., et al. (2006) Nature 441:111-114), кардиолипин (Chien, P.Y., et al. (2005) Cancer Gene Ther. 12:321-328; Pal, A., et al. (2005) Int J. Oncol. 26:10871091), полиэтиленимин (Bonnet M.E., et al. (2008) Pharm. Res. Aug 16 Epub ahead of print; Aigner, A. (2006) J. Biomed. Biotechnol. 71659), содержащие Arg-Gly-Asp (RGD) пептиды (Liu, S. (2006) Mol. Pharm. 3:472487) и полиамидоамины (Tomalia, DA., et al. (2007) Biochem. Soc. Trans. 35:61-67; Yoo, H., et al. (1999) Pharm. Res. 16:1799-1804). В некоторых вариантах осуществления иРНК образуют комплекс с циклодекстрином для системного введения. Способы введения и фармацевтические композиции иРНК и циклодекстринов можно найти в патенте США № 7427605, который включен в данный документ при помощи ссылки в полном объеме.
А. Кодируемые вектором иРНК по изобретению.
иРНК, нацеленные на ген С5, могут экспрессироваться транскрипционными единицами, вставленными в ДНК- или РНК-векторы (см., например, Couture, A., et al., TIG. (1996), 12:5-10; Skillern, A., et al., международную РСТ публикацию № WO 00/22113, Conrad, международную РСТ публикацию № WO 00/22114 и Conrad, патент США № 6054299). Экспрессия может быть временной (приблизительно от часов до недель) или длительной (от недель до месяцев или дольше) в зависимости от конкретной применяемой конструкции и целевых тканей или типа клеток. Такие трансгены можно вводить в виде линейной конструкции, кольцевой плазмиды или вирусного вектора, который может быть интегрирующим или неинтегрирующим вектором. Трансгены также могут быть сконструированы с возможностью наследования их в виде экстрахромосомной плазмиды (Gassmann, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1995) 92:1292).
Отдельные цепи или цепи иРНК могут транскрибироваться с промотора вектора экспрессии. В целевую клетку можно совместно вводить два отдельных вектора экспрессии (например, путем трансфекции или инфицирования) для экспрессирования двух отдельных цепей с получением, например, dsRNA. В альтернативном случае, каждая отдельная цепь dsRNA может транскрибироваться с участием промоторов, оба из которых расположены в одной и той же плазмиде экспрессии. В одном варианте осуществления dsRNA экспрессируется в виде полинуклеотидов с инвертированным повтором, соединенных линкерной полинуклеотидной последовательностью, таким образом, что dsRNA имеет структуру типа стебель-петля.
Векторы экспрессии с иРНК, как правило, являются ДНК-плазмидами или вирусными векторами. Векторы экспрессии, совместимые с эукариотическими клетками, предпочтительно совместимые с клетками позвоночных, можно использовать для получения рекомбинантных конструкций для экспрессии иРНК, как описано в данном документе. Векторы экспрессии для эукариотических клеток хорошо известны в данной области и доступны из ряда коммерческих источников. Обычно предусмотрены векторы, содержащие удобные сайты рестрикции для вставки необходимого сегмента нуклеиновой кислоты. Доставка векторов, экспрессирующих иРНК, может быть системной, как, например, путем внутривенного или внутримышечного введения, путем введения в целевые клетки, эксплантированные из пациента, с последующим обратным введением пациенту или путем любого другого способа, который обеспечивает возможность введения в желательную целевую клетку.
Целевые клетки можно трансфицировать плазмидами экспрессии иРНК в виде комплекса с носителями-катионными липидами (например, олигофектамином) или носителями на основе некатионных липидов (например, Transit-TKO™). В настоящем изобретением также рассматриваются множественные трансфекции при помощи липидов для типов иРНК-опосредованного нокдауна, нацеленного на различные участки целевой РНК, на протяжении недели или более. Успешное введение векторов в клетки хозяина можно контролировать при помощи разнообразных известных способов. Например, временную трансфекцию можно выявить при помощи репортера, такого как флуоресцентный маркер, к примеру, зеленый флуоресцентный белок (GFP). Стабильная трансфекция клеток ex vivo может быть подтверждена при помощи маркеров, которые придают трансфицированной клетке устойчивость к определенным факторам окружающей среды (например, антибиотикам и лекарственным средствам), такую как устойчивость к гигромицину В.
Системы вирусных векторов, которые можно использовать со способами и композициями, описанными в данном документе, включают, без ограничения, (а) аденовирусные векторы; (b) ретровирусные векторы, в том числе без ограничения лентивирусные векторы, вирус мышиного лейкоза Молони и т.д.; (с) векторы на основе аденоассоциированного вируса; (d) векторы на основе вируса простого герпеса; (е) векторы на основе SV40; (f) векторы на основе вируса полиомы; (g) векторы на основе вируса папилломы; (h) векторы на основе пикорнавируса; (i) векторы на основе поксвируса, такого как ортопокс, например, векторы на основе вируса осповакцины, или авипокс, например, канарипокс или оспы кур; и (j) хел
- 56 044245 пер-зависимый или слабый аденовирус. Также преимущественными могут быть вирусы с нарушенной репликацией. Различные векторы будут или не будут встраиваться в геном клеток. При необходимости, конструкции могут включать вирусные последовательности для трансфекции. В качестве альтернативы, конструкция может быть встроена в векторы, способные к эписомальной репликации, например, векторы на основе EPV и EBV. Для обеспечения экспрессии иРНК в целевых клетках в конструкциях для рекомбинантной экспрессии иРНК, как правило, требуется наличие регуляторных элементов, например, промоторов, энхансеров и т.д. Другие аспекты, учитываемые в отношении векторов и конструкций, описаны далее ниже.
Векторы, пригодные для доставки иРНК, будут включать регуляторные элементы (промотор, энхансер и т.д.), достаточные для экспрессии иРНК в желательных целевых клетке или ткани. Регуляторные элементы можно выбирать для получения либо конститутивной, либо регулируемой/индуцибельной экспрессии.
Экспрессия иРНК может быть точно регулируемой, например, путем использования индуцибельной регуляторной последовательности, которая чувствительна к определенным физиологическим регуляторам, например, уровням циркулирующей глюкозы или гормонам (Docherty et al., 1994, FASEB J. 8:20-24). Такие индуцибельные экспрессирующие системы, подходящие для управления экспрессией dsRNA в клетках или у млекопитающих, включают, например, регулирование при помощи экдизона, при помощи эстрогена, прогестерона, тетрациклина, химических индукторов димеризации и изопропил-бета-Dтиогалактопиранозида (IPTG). Специалист в данной области сможет выбрать соответствующую регуляторную/промоторную последовательность, опираясь на предполагаемое использование трансгена иРНК.
Могут быть использовать вирусные векторы, которые содержат последовательности нуклеиновых кислот, кодирующие иРНК. Например, возможно применение ретровирусного вектора (см. Miller et al., Meth. Enzymol. 217:581-599 (1993)). Такие ретровирусные векторы содержат компоненты, необходимые для правильной упаковки вирусного генома и интеграции в ДНК клетки-хозяина. Последовательности нуклеиновых кислот, кодирующие иРНК, клонируют в один или несколько векторов, которые облегчают доставку нуклеиновой кислоты пациенту. Более подробное описание ретровирусных векторов можно найти, например, в Boesen et al., Biotherapy 6:291-302 (1994), в котором описано применение ретровирусного вектора для доставки гена mdr1 к гемопоэтическим стволовым клеткам для придания стволовым клеткам большей устойчивости к химиотерапии. Другими источниками, иллюстрирующими применение ретровирусных векторов в генной терапии, являются: Clowes et al., J. Clin. Invest. 93:644-651 (1994); Kiem et al., Blood 83:1467-1473 (1994); Salmons and Gunzberg, Human Gene Therapy 4:129-141 (1993); и Grossman and Wilson, Curr. Opin. in Genetics and Devel. 3:110-114 (1993). Лентивирусные векторы, предусматриваемые для применения, включают, например, векторы на основе HIV, описанные в патентах США №№ 6143520; 5665557 и 5981276, которые включены в данный документ при помощи ссылки.
Аденовирусы также предусматриваются для применения в доставке иРНК по настоящему изобретению. Аденовирусы представляют собой особенно перспективные проводники, например, для доставки генов к респираторному эпителию. Аденовирусы естественным образом инфицируют респираторный эпителий, где они вызывают заболевание с легким течением. Другими мишенями для основанных на аденовирусах системах доставки являются печень, центральная нервная система, эндотелиальные клетки и мышца. Аденовирусы обладают преимуществом в том, что способны инфицировать неделящиеся клетки. В Kozarsky and Wilson, Current Opinion in Genetics and Development 3:499-503 (1993) представлена обзорная статья о генной терапии на основе аденовирусов. Bout и соавт., Human Gene Therapy 5:3-10 (1994) показали использование аденовирусных векторов для переноса генов в респираторный эпителий макак-резус. Дополнительные примеры использования аденовирусов в генной терапии можно найти в Rosenfeld et al., Science 252:431-434 (1991); Rosenfeld et al., Cell 68:143-155 (1992); Mastrangeli et al., J. Clin. Invest. 91:225-234 (1993); публикации PCT WO 94/12649 и Wang, et al., Gene Therapy 2:775-783 (1995). Подходящий AV вектор для экспрессии иРНК, описанной в настоящем изобретении, способ конструирования рекомбинантного AV вектора и способ доставки вектора в целевые клетки описаны в Xia Н et al. (2002), Nat. Biotech. 20: 1006-1010.
Векторы на основе аденоассоциированного вируса (AAV) также можно использовать для доставки иРНК по настоящему изобретению (Walsh et al., Proc. Soc. Exp. Biol. Med. 204:289-300 (1993); патент США № 5436146). В одном варианте осуществления иРНК может экспрессироваться в виде двух отдельных комплементарных одноцепочечных молекул РНК при помощи рекомбинантного AAV-вектора, например, либо с РНК-промоторами, U6 или H1, либо с промотором цитомегаловируса (CMV). Подходящие AAV-векторы для экспрессии dsRNA, описанной в настоящем изобретении, способы конструирования рекомбинантного AV вектора и способы доставки векторов в целевые клетки описаны в Samulski R et al. (1987), J. Virol. 61: 3096-3101; Fisher K J et al. (1996), J. Virol, 70: 520-532; Samulski R et al. (1989), J. Virol. 63: 3822-3826; патенте США № 5252479; патенте США № 5139941; международной заявке на патент № WO 94/13788 и международной заявке на патент № WO 93/24641, полное раскрытие которых включено в данный документ при помощи ссылки.
Другой вирусный вектор, подходящий для доставки иРНК по настоящему изобретению, представляет собой поксвирус, такой как вирус осповакцины, например, аттенуированный вирус осповакцины,
- 57 044245 как, например, модифицированный вирус Анкара (MVA) или NYVAC, авипокс, как, например, оспа кур или канарипокс.
Тропизм вирусных векторов может быть модифицирован путем псевдотипирования векторов белками оболочки или другими поверхностными антигенами из других вирусов или путем замены различных вирусных капсидных белков, в случае необходимости. Например, лентивирусные векторы можно подвергать псевдотипированию поверхностными белками из вируса везикулярного стоматита (VSV), вируса бешенства, вируса Эбола, вируса Мокола и т.п. AAV-векторы можно создать для нацеливания на различные клетки путем конструирования векторов так, чтобы они экспрессировали различные серотипы капсидных белков; см., например, Rabinowitz J.E. et al. (2002), J Virol 76:791-801, полное раскрытие которого включено в данный документ при помощи ссылки.
Фармацевтический препарат вектора может включать вектор в приемлемом разбавителе или может включать матрицу замедленного высвобождения, в которую включено средство доставки генов. В альтернативном случае, когда вектор доставки целого гена может вырабатываться нативно рекомбинантными клетками, например, ретровирусными векторами, тогда фармацевтический препарат может включать одну или несколько клеток, которые вырабатывают систему доставки генов.
V. Фармацевтические композиции по изобретению.
Настоящее изобретение также включает фармацевтические композиции и составы, которые включают иРНК по настоящему изобретению. В одном варианте осуществления в данном документе предусмотрены фармацевтические композиции, содержащие иРНК, которые описаны в данном документе, и фармацевтически приемлемый носитель.
Фраза фармацевтически приемлемый применяется в данном документе для обозначения соединений, веществ, композиций и/или лекарственных форм, которые в пределах погрешности медицинской оценки, пригодных для применения при взаимодействии с тканями субъекта-человека и субъектаживотного без чрезмерной токсичности, раздражения, аллергической реакции или другой проблемы или осложнения, соразмерных с разумным соотношением польза/риск.
Фраза фармацевтически приемлемый носитель, применяемая в данном документе, означает фармацевтически приемлемое вещество, композицию или носитель, такой как жидкий или твердый наполнитель, разбавитель, инертный наполнитель, вспомогательные вещества (например, смазывающее вещество, тальк, магний, стеарат кальция или цинка, или стеариновая кислота) или растворяющее инкапсулирующее вещество, участвующие в переносе и транспортировке в указанного соединения от одного органа или части тела к другому органу или части тела. Каждый носитель должен быть приемлемым в смысле совместимости с другими ингредиентами состава и не быть вредным для субъекта, подвергаемого лечению. Некоторые примеры веществ, которые могут служить в качестве фармацевтически приемлемых носителей, включают: (1) сахара, такие как лактоза, глюкоза и сахароза; (2) крахмалы, такие как кукурузный крахмал и картофельный крахмал; (3) целлюлозу и ее производные, такие как натрийкарбоксиметилцеллюлоза, этилцеллюлоза и ацетат целлюлозы; (4) порошкообразный трагакант; (5) солод; (6) желатин; (7) смазывающие средства, такие как стеарат магния, лаурилсульфат натрия и тальк; (8) наполнители, такие как масло какао и воски для суппозиториев; (9) масла, такие как арахисовое масло, хлопковое масло, сафлоровое масло, кунжутное масло, оливковое масло, кукурузное масло и соевое масло; (10) гликоли, такие как пропиленгликоль; (11) полиолы, такие как глицерин, сорбит, маннит и полиэтиленгликоль; (12) сложные эфиры, такие как этилолеат и этиллаурат; (13) агар; (14) буферные средства, такие как гидроксид магния и гидроксид алюминия; (15) альгиновую кислоту; (16) апирогенную воду; (17) изотонический раствор; (18) раствор Рингера; (19) этиловый спирт; (20) рН-буферные растворы; (21) сложные полиэфиры, поликарбонаты и/или полиангидриды; (22) наполнители, такие как полипептиды и аминокислоты (23) компонента сыворотки, такие как сывороточный альбумин, HDL и LDL; и (22) другие нетоксичные совместимые вещества, применяемые в фармацевтических составах.
Фармацевтические композиции, содержащие иРНК, пригодны для лечения заболевания или нарушения, связанного с экспрессией или активностью гена С5, например, заболевания, связанного с компонентом комплемента С5. Такие фармацевтические композиции составляют в зависимости от способа доставки. Одним примером являются композиции, которые составлены для системного введения посредством доставки парентеральным путем, например, путем подкожной (SC) или внутривенной (IV) доставки. Другим примером являются композиции, которые составлены для непосредственной доставки в паренхиму головного мозга, например, путем инфузии в головной мозг, как, например, непрерывной инфузии при помощи насоса. Фармацевтические композиции по настоящему изобретению можно вводить в дозах, достаточных для ингибирования экспрессии гена С5. Как правило, приемлемая доза иРНК по настоящему изобретению будет составлять в диапазоне от приблизительно 0,001 до приблизительно 200,0 миллиграмм на килограмм массы тела реципиента вдень, как правило, в диапазоне от приблизительно 1 до 50 мг на килограмм массы тела в день. Например, dsRNA можно вводить в количестве приблизительно 0,01 мг/кг, приблизительно 0,05 мг/кг, приблизительно 0,5 мг/кг, приблизительно 1 мг/кг, приблизительно 1,5 мг/кг, приблизительно 2 мг/кг, приблизительно 3 мг/кг, приблизительно 10 мг/кг, приблизительно 20 мг/кг, приблизительно 30 мг/кг, приблизительно 40 мг/кг или приблизительно 50 мг/кг на разовую дозу.
Например, dsRNA можно вводить в дозе приблизительно 0,1, 0,2, 0,3, 0,4, 0,5, 0,6, 0,7, 0,8, 0,9, 1, 1,1,
- 58 044245
1,2, 1,3, 1,4, 1,5, 1,6, 1,7, 1,8, 1,9, 2, 2,1, 2,2, 2,3, 2,4, 2,5, 2,6, 2,7, 2,8, 2,9, 3, 3,1, 3,2, 3,3, 3,4, 3,5, 3,6, 3,7,
3,8, 3,9, 4, 4,1, 4,2, 4,3, 4,4, 4,5, 4,6, 4,7, 4,8, 4,9, 5, 5,1, 5,2, 5,3, 5,4, 5,5, 5,6, 5,7, 5,8, 5,9, 6, 6,1, 6,2, 6,3, 6,4,
6,5, 6,6, 6,7, 6,8, 6,9, 7, 7,1, 7,2, 7,3, 7,4, 7,5, 7,6, 7,7, 7,8, 7,9, 8, 8,1, 8,2, 8,3, 8,4, 8,5, 8,6, 8,7, 8,8, 8,9, 9, 9,1,
9,2, 9,3, 9,4, 9,5, 9,6, 9,7, 9,8, 9,9, или приблизительно 10 мг/кг. Значения и диапазоны, промежуточные по отношению к перечисленным значениям, также подразумеваются как часть настоящего изобретения.
В другом варианте осуществления dsRNA вводят в дозе от приблизительно 0,1 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 0,25 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 0,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 0,75 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 1 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 1,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 2 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 2,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 3 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 3,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 4 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 4,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 7,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 10 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 15 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 50 мг/кг, приблизительно 30 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 35 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 40 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 45 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 0,1 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 0,25 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 0,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 0,75 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 1 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 1,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 2 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 2,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 3 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 3,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 4 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 4,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 7,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 10 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 15 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 45 мг/кг, приблизительно 30 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 35 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 40 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 0,1 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 0,25 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 0,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 0,75 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 1 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 1,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 2 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 2,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 3 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 3,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 4 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 4,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 7,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 10 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 15 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 30 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 35 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 0,1 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 0,25 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 0,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 0,75 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 1 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 1,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 2 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 2,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 3 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 3,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 4 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 4,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 7,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 10 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 15 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 30 мг/кг, приблизительно 20 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 0,1 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 0,25 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 0,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 0,75 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 1 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 1,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 2 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 2,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 3 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 3,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 4 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 4,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 7,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 10 до приблизительно 20 мг/кг или от приблизительно 15 до приблизительно 20 мг/кг. Значения и диапазоны, промежуточные по отношению к перечисленным значениям, также подразумеваются как часть настоящего изобретения.
Например, dsRNA можно вводить в дозе приблизительно 0,1, 0,02, 0,03, 0,04, 0,05, 0,06, 0,07, 0,08, 0,09, 0,1, 0,2, 0,3, 0,4, 0,5, 0,6, 0,7, 0,8, 0,9, 1, 1,1, 1,2, 1,3, 1,4, 1,5, 1,6, 1,7, 1,8, 1,9, 2, 2,1, 2,2, 2,3, 2,4, 2,5, 2,6, 2,7, 2,8, 2,9, 3, 3,1, 3,2, 3,3, 3,4, 3,5, 3,6, 3,7, 3,8, 3,9, 4, 4,1, 4,2, 4,3, 4,4, 4,5, 4,6, 4,7, 4,8, 4,9, 5, 5,1, 5,2, 5,3, 5,4, 5,5, 5,6, 5,7, 5,8, 5,9, 6, 6,1, 6,2, 6,3, 6,4, 6,5, 6,6, 6,7, 6,8, 6,9, 7, 7,1, 7,2, 7,3, 7,4, 7,5, 7,6, 7,7, 7,8, 7,9, 8, 8,1, 8,2, 8,3, 8,4, 8,5, 8,6, 8,7, 8,8, 8,9, 9, 9,1, 9,2, 9,3, 9,4, 9,5, 9,6, 9,7, 9,8, 9,9 или приблизительно 10 мг/кг. Значения и диапазоны, промежуточные по отношению к перечисленным значениям, также под- 59 044245 разумеваются как часть настоящего изобретения.
В другом варианте осуществления dsRNA вводят в дозе от приблизительно 0,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 0,75 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 1 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 1,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 2 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 2,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 3 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 3,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 4 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 4,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 7,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 10 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 15 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 50 мг/кг, приблизительно 30 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 35 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 40 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 45 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 0,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 0,75 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 1 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 1,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 2 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 2,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 3 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 3,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 4 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 4,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 7,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 10 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 15 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 45 мг/кг, приблизительно 30 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 35 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 40 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 0,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 0,75 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 1 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 1,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 2 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 2,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 3 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 3,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 4 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 4,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 7,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 10 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 15 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 30 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 35 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 0,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 0,75 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 1 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 1,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 2 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 2,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 3 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 3,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 4 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 4,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 7,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 10 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 15 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 30 мг/кг, приблизительно 20 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 0,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 0,75 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 1 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 1,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 2 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 2,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 3 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 3,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 4 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 4,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 7,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 10 до приблизительно 20 мг/кг или от приблизительно 15 до приблизительно 20 мг/кг. В одном варианте осуществления dsRNA вводят в дозе от приблизительно 10 мг/кг до приблизительно 30 мг/кг. Значения и диапазоны, промежуточные по отношению к перечисленным значениям, также подразумеваются как часть настоящего изобретения.
Например, можно вводить субъекту, например, подкожно или внутривенно, разовое терапевтическое количество иРНК, приблизительно 0,1, 0,125, 0,15, 0,175, 0,2, 0,225, 0,25, 0,275, 0,3, 0,325, 0,35, 0,375, 0,4, 0,425, 0,45, 0,475, 0,5, 0,525, 0,55, 0,575, 0,6, 0,625, 0,65, 0,675, 0,7, 0,725, 0,75, 0,775, 0,8, 0,825, 0,85, 0,875, 0,9, 0,925, 0,95, 0,975, 1, 1,1, 1,2, 1,3, 1,4, 1,5, 1,6, 1,7, 1,8, 1,9, 2, 2,1, 2,2, 2,3, 2,4, 2,5, 2,6, 2,7, 2,8, 2,9, 3, 3,1, 3,2, 3,3, 3,4, 3,5, 3,6, 3,7, 3,8, 3,9, 4, 4,1, 4,2, 4,3, 4,4, 4,5, 4,6, 4,7, 4,8, 4,9, 5, 5,1, 5,2, 5,3, 5,4, 5,5, 5,6, 5,7, 5,8, 5,9, 6, 6,1, 6,2, 6,3, 6,4, 6,5, 6,6, 6,7, 6,8, 6,9, 7, 7,1, 7,2, 7,3, 7,4, 7,5, 7,6, 7,7, 7,8, 7,9, 8, 8,1, 8,2, 8,3, 8,4, 8,5, 8,6, 8,7, 8,8, 8,9, 9, 9,1, 9,2, 9,3, 9,4, 9,5, 9,6, 9,7, 9,8, 9,9, 10, 10,5, 11, 11,5, 12, 12,5, 13, 13,5, 14, 14,5, 15, 15,5, 16, 16,5, 17, 17,5, 18, 18,5, 19, 19,5, 20, 20,5, 21, 21,5, 22, 22,5, 23, 23,5, 24, 24,5, 25, 25,5, 26, 26,5, 27, 27,5, 28, 28,5, 29, 29,5, 30, 31, 32, 33, 34, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49 или приблизительно 50 мг/кг. Значения и диапазоны, промежуточные по отношению к перечисленным значениям, также подразумеваются как часть настоящего изобретения.
В некоторых вариантах осуществления субъекту вводят, например, подкожно или внутривенно, несколько доз терапевтического количества иРНК, например, в дозе приблизительно 0,1, 0,125, 0,15, 0,175, 0,2, 0,225, 0,25, 0,275, 0,3, 0,325, 0,35, 0,375, 0,4, 0,425, 0,45, 0,475, 0,5, 0,525, 0,55, 0,575, 0,6, 0,625, 0,65,
- 60 044245
0,675, 0,7, 0,725, 0,75, 0,775, 0,8, 0,825, 0,85, 0,875, 0,9, 0,925, 0,95, 0,975, 1, 1,1, 1,2, 1,3, 1,4, 1,5, 1,6, 1,7,
1,8, 1,9, 2, 2,1, 2,2, 2,3, 2,4, 2,5, 2,6, 2,7, 2,8, 2,9, 3, 3,1, 3,2, 3,3, 3,4, 3,5, 3,6, 3,7, 3,8, 3,9, 4, 4,1, 4,2, 4,3, 4,4,
4,5, 4,6, 4,7, 4,8, 4,9, 5, 5,1, 5,2, 5,3, 5,4, 5,5, 5,6, 5,7, 5,8, 5,9, 6, 6,1, 6,2, 6,3, 6,4, 6,5, 6,6, 6,7, 6,8, 6,9, 7, 7,1,
7,2, 7,3, 7,4, 7,5, 7,6, 7,7, 7,8, 7,9, 8, 8,1, 8,2, 8,3, 8,4, 8,5, 8,6, 8,7, 8,8, 8,9, 9, 9,1, 9,2, 9,3, 9,4, 9,5, 9,6, 9,7,
9,8, 9,9, 10, 10,5, 11, 11,5, 12, 12,5, 13, 13,5, 14, 14,5, 15, 15,5, 16, 16,5, 17, 17,5, 18, 18,5, 19, 19,5, 20, 20,5,
21, 21,5, 22, 22,5, 23, 23,5, 24, 24,5, 25, 25,5, 26, 26,5, 27, 27,5, 28, 28,5, 29, 29,5, 30, 31, 32, 33, 34, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49 или приблизительно 50 мг/кг. Многодозный режим может включать введение терапевтического количества иРНК ежедневно, например, в течение двух дней, трех дней, четырех дней, пяти дней, шести дней, семи дней или дольше.
В других вариантах осуществления субъекту вводят, например, подкожно или внутривенно, повторную дозу терапевтического количества иРНК, например, в дозе приблизительно 0,1, 0,125, 0,15, 0,175, 0,2, 0,225, 0,25, 0,275, 0,3, 0,325, 0,35, 0,375, 0,4, 0,425, 0,45, 0,475, 0,5, 0,525, 0,55, 0,575, 0,6, 0,625, 0,65, 0,675, 0,7, 0,725, 0,75, 0,775, 0,8, 0,825, 0,85, 0,875, 0,9, 0,925, 0,95, 0,975, 1, 1,1, 1,2, 1,3, 1,4, 1,5, 1,6, 1,7, 1,8, 1,9, 2, 2,1, 2,2, 2,3, 2,4, 2,5, 2,6, 2,7, 2,8, 2,9, 3, 3,1, 3,2, 3,3, 3,4, 3,5, 3,6, 3,7, 3,8, 3,9, 4, 4,1, 4,2, 4,3, 4,4, 4,5, 4,6, 4,7, 4,8, 4,9, 5, 5,1, 5,2, 5,3, 5,4, 5,5, 5,6, 5,7, 5,8, 5,9, 6, 6,1, 6,2, 6,3, 6,4, 6,5, 6,6, 6,7, 6,8, 6,9, 7, 7,1, 7,2, 7,3, 7,4, 7,5, 7,6, 7,7, 7,8, 7,9, 8, 8,1, 8,2, 8,3, 8,4, 8,5, 8,6, 8,7, 8,8, 8,9, 9, 9,1, 9,2, 9,3, 9,4, 9,5, 9,6, 9,7, 9,8, 9,9, 10, 10,5, 11, 11,5, 12, 12,5, 13, 13,5, 14, 14,5, 15, 15,5, 16, 16,5, 17, 17,5, 18, 18,5, 19, 19,5, 20, 20,5, 21, 21,5, 22, 22,5, 23, 23,5, 24, 24,5, 25, 25,5, 26, 26,5, 27, 27,5, 28, 28,5, 29, 29,5, 30, 31, 32, 33, 34, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49 или приблизительно 50 мг/кг. Режим повторной дозы может включать введение терапевтического количества иРНК на регулярной основе, например, каждый второй день, каждый третий день, каждый четвертый день, два раза в неделю, один раз в неделю, раз в две недели или раз в месяц.
Фармацевтическая композиция может быть введена путем внутривенной инфузии в течение некоторого периода времени, например, в течение 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 и 21, 22, 23, 24 или примерно 25-минутного периода. Введение могут повторять, например, регулярно, как, например, раз в неделю, раз в две недели (т.е. каждые две недели) в течение одного месяца, двух месяцев, трех месяцев, четырех месяцев или дольше. После первичной схемы лечения, обработку можно вводить менее часто. Например, после введения раз в неделю или раз в две недели в течение трех месяцев введение можно повторять один раз в месяц в течение шести месяцев, или года, или дольше.
Фармацевтическую композицию можно вводить один раз в день или иРНК можно вводить в виде двух, трех или более частей дозы через определенные интервалы на протяжении дня, или даже при помощи непрерывной инфузии, или доставки посредством состава с контролируемым высвобождением. В таком случае, количество иРНК, содержащееся в каждой части дозы, должно быть соответственно меньше, чтобы обеспечить общую суточную дозу. Единица дозирования также может быть составлена для доставки в течение нескольких дней, например, при помощи традиционного состава с замедленным высвобождением, который предусматривает замедленное высвобождение иРНК в течение периода в несколько дней. Составы с замедленным высвобождением хорошо известны в данной области и особенно удобны для доставки средств в определенный участок, как, например, таких, которые возможно применять со средствами по настоящему изобретению. В таком варианте осуществления единица дозирования содержит соответствующее кратное число суточной дозы.
В других вариантах осуществления разовая доза фармацевтических композиций может быть длительного действия, так что последующие дозы вводят с интервалами не более 3, 4 или 5 дней или с интервалами не более 1, 2, 3 или 4 недель. В некоторых вариантах осуществления по настоящему изобретению разовую дозу фармацевтических композиций по настоящему изобретению вводят один раз в неделю. В других вариантах осуществления по настоящему изобретению разовую дозу фармацевтических композиций по настоящему изобретению вводят каждые два месяца.
Специалисту в данной области будет понятно, что определенные факторы могут влиять на дозу и временные рамки, необходимые для эффективного лечения субъекта, в том числе, без ограничения, тяжесть заболевания или нарушения, типы предшествующего лечения, общее состояние здоровья и/или возраст субъекта и другие имеющиеся заболевания. Кроме того, лечение субъекта терапевтически эффективным количеством композиции может включать один период лечения или серию периодов лечения. Оценки эффективных доз и времени полужизни in vivo для отдельных иРНК, охваченных настоящим изобретением, можно получать, используя традиционные методологии, или на основании проведения исследований in vivo с применением соответствующей животной модели, как описано в другой части данного документа.
Достижения в области генетики мышей обеспечили ряд мышиных моделей для изучения различных заболеваний человека, как, например, нарушения, на которое можно оказать благоприятное воздействие путем снижения экспрессии С5. Такие модели можно использовать для проведения in vivo исследований иРНК, а также для определения терапевтически эффективной дозы. Подходящие мышиные модели известны в данной области и включают, например, мышиную модель коллаген-индуцированного артрита (Courtenay, J.S., et al. (1980) Nature 283, 666-668), ишемии миокарда (Homeister JW и Lucchesi BR (1994) Annu Rev Pharmacol Toxicol 34:17-40), мышиную модель астмы, индуцированной яичным белком (на- 61 044245 пример, Tomkinson A., et al. (2001). J. Immunol. 166, 5792-5800), (NZBxNZW)Fl, MRL/Faslpr (MRL/lpr) и мышиную модель BXSB (Theofilopoulos, A.N. и Kono, D.H. 1999. Murine lupus models: gene-specific and genome-wide studies. In Lahita R.G., ed., Systemic Lupus Erythematosus, 3rd edn, p. 145. Academic Press, San
Diego, CA), мышиную модель aHUS (Goicoechea de Jorge et al. (2011) Развитие атипичного гемолитического уремического синдрома зависит от комплемента С5, J Am Soc Nephrol 22:137-145.
Фармацевтические композиции по настоящему изобретению можно вводить различными путями в зависимости от того, необходимо ли локальное или же системное лечение, и от области, подлежащей лечению. Введение может быть местным (например, при помощи трансдермального пластыря), легочным, например, путем ингаляции или вдувания порошков или аэрозолей, в том числе при помощи ингалятора; интратрахеальным, интраназальным, эпидермальным и трансдермальным, пероральным или парентеральным. Парентеральное введение включает внутривенную, внутриартериальную, подкожную, внутрибрюшинную или внутримышечную инъекцию или инфузию; субдермальное, например, посредством вживленного устройства; или интракраниальное, например, интрапаренхиматозное, подоболочечное или интравентрикулярное введение.
иРНК можно доставлять таким образом, чтобы происходило целенаправленное воздействие на конкретную ткань, как, например, печень (например, гепатоциты печени).
Фармацевтические композиции и составы для местного применения могут включать трансдермальные пластыри, мази, лосьоны, кремы, гели, капли, суппозитории, спреи, жидкости и порошки. Традиционные фармацевтические носители, водные, порошкообразные или масляные основы, загустители и т.п. могут быть необходимы или желательны. Также можно применять покрытые презервативы, перчатки и т.п. Подходящие составы для местного применения включают те, в которых иРНК, описанные в настоящем изобретении, находятся в смеси со средством для местной доставки, таким как липиды, липосомы, жирные кислоты, сложные эфиры жирных кислот, стероиды, хелатирующие средства и поверхностноактивные вещества. Подходящие липиды и липосомы включают нейтральные (например, диолеоил фосфатидилэтаноламин (DOPE), димиристоил фосфатидилхолин (DMPC), дистеароил фосфатидилхолин), отрицательные (например, димиристоил фосфатидилглицерин (DMPG)) и катионные (например, диолеилтетраметиламинопропил (DOTAP) и диолеоил фосфатидилэтаноламин (DOTMA)). иРНК, описанные в настоящем изобретении, могут быть инкапсулированы в липосомах или могут образовывать комплексы с ними, в частности, с катионными липосомами. В качестве альтернативы, иРНК могут образовывать комплексы с липидами, в частности, с катионными липидами. Подходящие жирные кислоты и сложные эфиры включают, без ограничения, арахидоновую кислоту, олеиновую кислоту, эйкозановую кислоту, лауриновую кислоту, каприловую кислоту, каприновую кислоту, миристиновую кислоту, пальмитиновую кислоту, стеариновую кислоту, линолевую кислоту, линоленовую кислоту, дикапрат, трикапрат, моноолеин, дилаурин, глицерил-1-монокапрат, 1-додецилазациклогептан-2-он, ацилкарнитин, ацилхолин или C1.20алкиловые сложные эфиры (например, изопропилмиристат (IPM)), моноглицерид, диглицерид или их фармацевтически приемлемую соль. Составы для местного применения подробно описаны в патенте США № 6747014, который включен в данный документ при помощи ссылки.
А. Составы с иРНК, содержащие мембранные молекулярные ансамбли.
иРНК для применения в композициях и способах по настоящему изобретению могут быть составлены для доставки в мембранный молекулярный ансамбль, например, липосому или мицеллу.
Применяемое в данном документе выражение липосома относится к пузырьку, состоящему из амфифильных липидов, расположенных в виде по меньшей мере одного бислоя, например, одного бислоя или множества бислоев. Липосомы включают однослойные и многослойные пузырьки, которые имеют мембрану, образованную из липофильного материала, и водную внутреннюю часть. Водная часть содержит композицию с иРНК. Липофильный материал отделяет водную внутреннюю среду от водной внешней среды, которая, как правило, не включает композицию с иРНК, хотя в некоторых примерах может включать. Липосомы пригодны для переноса и доставки активных ингредиентов к месту приложения действия. Благодаря тому, что мембрана липосомы структурно подобна биологическим мембранам, при применении липосом к тканям бислой липосомы сливается с бислоем клеточных мембран. По мере того как идет слияние липосомы и клетки внутреннее водное содержимое, которое включает иРНК, доставляется в клетку, где иРНК может специфически связываться с целевой РНК и может опосредовать RNAi. В некоторых случаях липосомы также являются специфически нацеленными, например, для направления иРНК в конкретные типы клеток.
Липосомы, содержащие средство RNAi, могут быть получены рядом способов. В одном примере липидный компонент липосомы растворяют в детергенте для образования мицеллы с липидным компонентом. Например, липидный компонент может быть амфипатическим катионным липидом или липидным конъюгатом. Детергент может характеризоваться высокой критической концентрацией мицеллообразования и может быть неионным. Иллюстративные детергенты включают холат, CHAPS, октилглюкозид, дезоксихолат и лауроилсаркозин. Препарат средства RNAi затем добавляют к мицеллам, которые включают липидный компонент. Катионные группы липида взаимодействуют со средством для RNAi и конденсируются вокруг средства RNAi с образованием липосомы. После конденсации детергент удаляют, например, путем диализа, с получением липосомного препарата средства для RNAi.
При необходимости соединение-носитель, которое содействует конденсации, можно добавлять во
- 62 044245 время реакции конденсации, например, путем контролируемого добавления. Например, соединениеноситель может быть полимером, отличным от нуклеиновой кислоты (например, спермином или спермидином). Также можно корректировать рН для содействия конденсации.
Способы получения стабильных полинуклеотидных средств доставки, которые включают комплекс полинуклеотида/катионного липида в качестве структурных компонентов средств доставки, дополнительно описаны, например, в WO 96/37194, полное содержание которой включено в данный документ при помощи ссылки. Образование липосом может также включать один или несколько аспектов иллюстративных способов, описанных в Feigner, P. L. et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA 8:7413-7417, 1987; патенте США № 4897355; патенте США № 5171678; Bangham, et al. M. Mol. Biol. 23:238, 1965; Olson, et al. Biochim. Biophys. Acta 557:9, 1979; Szoka, et al. Proc. Natl. Acad. Sci. 75: 4194, 1978; Mayhew, et al. Biochim. Biophys. Acta 775:169, 1984; Kim, et al. Biochim. Biophys. Acta 728:339, 1983; и Fukunaga, et al. Endocrinol. 115:757, 1984. Широко применяемые методики получения липидных агрегатов соответствующего размера для использования в качестве средств доставки включают разрушение ультразвуком и замораживание-оттаивание с экструзией (см., например, Mayer, et al. Biochim. Biophys. Acta 858:161, 1986). Микрофлюидизацию можно применять в тех случаях, когда желательны стабильно малые (от 50 до 200 нм) и относительно единообразные агрегаты (Mayhew, et al. Biochim. Biophys. Acta 775:169, 1984). Такие способы легко адаптируются для упаковки препарата средства для RNAi в липосомы.
Липосомы делятся на два широких класса. Катионные липосомы являются положительно заряженными липосомами, которые взаимодействуют с отрицательно заряженными молекулами нуклеиновых кислот с образованием стабильных комплексов. Положительно заряженный комплекс нуклеиновой кислоты/липосомы связывается с отрицательно заряженной клеточной поверхностью и интернализируется в эндосому. Липосомы разрываются, высвобождая свое содержимое в клеточную цитоплазму, вследствие кислого рН внутри эндосомы (Wang et al., Biochem. Biophys. Res. Commun., 1987, 147, 980-985).
Липосомы, которые являются рН-чувствительными или отрицательно-заряженными, захватывают нуклеиновые кислоты вместо образования комплекса с ними. Поскольку как нуклеиновая кислота, так и липид имеют одинаковый заряд, то происходит отталкивание вместо образования комплекса. Тем не менее, некоторая часть нуклеиновых кислот захватывается водной внутренней средой этих липосом. Липосомы с рН-чувствительностью использовали для доставки нуклеиновых кислот, кодирующих ген тимидинкиназы, к монослоям клеток в культуре. Экспрессию экзогенного гена обнаруживали в целевых клетках (Zhou et al., Journal of Controlled Release, 1992, 19, 269-274).
Один главный тип липосомных композиций включает фосфолипиды, отличные от полученного естественным образом фосфатидилхолина. Композиции нейтральных липосом, например, могут быть образованы из димиристоилфосфатидилхолина (DMPC) или дипальмитоилфосфатидилхолина (DPPC). Композиции анионных липосом, как правило, образованы из димиристоилфосфатидилглицерина, тогда как анионные фузогенные липосомы образованы главным образом из диолеилфосфатидилэтаноламина (DOPE). Другой тип липосомных композиций образован из фосфатидилхолина (PC), такого как, например, PC соевых бобов и PC яиц. Другой тип образован из смесей фосфолипида, и/или фосфатидилхолина, и/или холестерина.
Примеры других способов для in vitro и in vivo введения липосом в клетки включают патент США № 5283185; патент США № 5171678; WO 94/00569; WO 93/24640; WO 91/16024; Feigner, J. Biol. Chem. 269:2550, 1994; Nabel, Proc. Natl. Acad. Sci. 90:11307, 1993; Nabel, Human Gene Ther. 3:649, 1992; Gershon, Biochem. 32:7143, 1993; и Strauss EMBO J. 11:417, 1992.
Неионные липосомные системы также исследовали для определения их пригодности для доставки лекарственных средств в кожу, в частности, системы, содержащие неионное поверхностно-активное вещество и холестерин. Неионные липосомные составы, содержащие Novasome™ I (глицерилдилаурат/холестерин/полиоксиэтилен-10-стеариловый эфир) и Novasome™ II (глицерилдистеарат/холестерин/полиоксиэтилен-10-стеариловый эфир), использовали для доставки циклоспорина-А в слой дермы кожи мышей. Результаты показали, что такие неионные липосомные системы были эффективны в обеспечении депонирования циклоспорина А в различных слоях кожи (Hu et al. S.Т.P.Pharma. Sci., 1994, 4(6) 466).
Липосомы также включают пространственно стабилизированные липосомы, которые, как применяется в данном документе, означают липосомы, содержащие один или несколько специальных липидов, которые при включении в липосомы приводят к увеличению времени жизни в кровотоке по сравнению с липосомами, у которых отсутствуют такие специальные липиды. Примерами пространственно стабилизированных липосом являются те, в которых часть липидной составляющей, образующей пузырек, липосомы (А) содержит один или несколько гликолипидов, таких как моносиалоганглиозид GM1, или (В) получена из одного или нескольких гидрофильных полимеров, таких как полиэтиленгликолевый (PEG) фрагмент. Не желая быть связанными какой-либо конкретной теорией, в области техники полагают, что по меньшей мере для пространственно стабилизированных липосом, содержащих ганглиозиды, сфингомиелин или PEG-производные липиды, увеличенное время полужизни в кровотоке этих пространственно стабилизированных липосом является следствием сниженного поглощения клетками ретикулоэндотели- 63 044245 альной системы (RES) (Allen et al., FEBS Letters, 1987, 223, 42; Wu et al., Cancer Research, 1993, 53, 3765).
Разнообразные липосомы, содержащие один или несколько гликолипидов, известны в данной области. Papahadjopoulos et al. (Ann. N.Y. Acad. Sci., 1987, 507, 64) описали способность моносиалоганглиозида GM1, сульфата галактоцереброзида и фосфатидилинозитола увеличивать время полужизни липосом в крови. Эти полученные данные были прокомментированы Gabizon et al. (Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1988, 85, 6949). В патенте США № 4837028 и WO 88/04924, оба из которых принадлежат Allen и соавт., раскрыты липосомы, содержащие (1) сфингомиелин и (2) ганглиозид GM1 или сложные эфиры сульфата галактоцереброзида. В патенте США № 5543152 (Webb и соавт.) раскрыты липосомы, содержащие сфингомиелин. Липосомы, содержащие 1,2-sn-димиристоилфосфатидилхолин, раскрыты в WO 97/13499 (Lim et al).
В одном варианте осуществления применяют катионные липосомы. Катионные липосомы обладают преимуществом в том, что они способны сливаться с клеточной мембраной. Некатионные липосомы, не смотря на то, что они не могут сливаться настолько эффективно с плазматической мембраной, поглощаются макрофагами in vivo, и их можно использовать для доставки средств для RNAi к макрофагам.
Дополнительные преимущества липосом включают следующее: липосомы, полученные из натуральных фосфолипидов, биосовместимы и биоразрушаемы; липосомы могут включать широкий диапазон воды и жирорастворимых лекарственных средств; липосомы могут защищать инкапсулированные средства для RNAi во внутренних отделениях от метаболизма и разрушения (Rosoff, в Pharmaceutical Dosage Forms, Lieberman, Rieger and Banker (Eds.), 1988, volume 1, p. 245). Важными аспектами в получении липосомных составов являются заряд поверхности липида, размер пузырька и водный объем липосом.
Положительно заряженный синтетический катионный липид, хлорид N-[1-(2,3-диолеилокси)пропил]-N,N,N-триметиламмония (DOTMA), можно использовать для образования малых липосом, которые самопроизвольно взаимодействуют с нуклеиновой кислотой с образованием комплексов липиднуклеиновой кислоты, которые способны сливаться с отрицательно заряженными липидами клеточных мембран клеток культуры тканей, что приводит к доставке средства для RNAi (см., например, Feigner, P. L. et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA 8:7413-7417, 1987 и патент США № 4897355 касательно описания DOTMA и его применения с ДНК).
Аналог DOTMA, 1,2-бис-(олеоилокси)-3-(триметиламмоний)пропан (DOTAP), можно использовать в комбинации с фосфолипидом с образованием пузырьков, образующих комплекс с ДНК. Lipofectin™ (Bethesda Research Laboratories, Гейтерсберг, Мэриленд) представляет собой эффективное средство для доставки сильно анионных нуклеиновых кислот в клетки культуры живых тканей, которое содержит положительно заряженные DOTMA-липосомы, которые самопроизвольно взаимодействуют с отрицательно заряженными полинуклеотидами с образованием комплексов. Суммарный заряд полученных комплексов является также положительным в тех случаях, когда используют липосомы с достаточным положительным зарядом. Положительно заряженные комплексы, полученные таким способом, самопроизвольно прикрепляются к отрицательно заряженным клеточным поверхностям, сливаются с плазматической мембраной и эффективно доставляют функциональные нуклеиновые кислоты, например, в клетки культуры тканей. Другой коммерчески доступный катионный липид, 1,2-бис-(олеоилокси)-3,3(триметиламмоний)пропан (DOTAP) (Boehringer Mannheim, Индианаполис, Индиана), отличается от DOTMA тем, что олеиловые фрагменты связаны сложноэфирными, а не простыми эфирными связями.
Другие опубликованные соединения с катионными липидами включают те, которые были конъюгированы с рядом фрагментов, в том числе, например, карбоксиспермином, который был конъюгирован с одним из двух типов липидов и включает такие соединения, как 5-карбоксиспермилглициндиоктаолеоиламид (DOGS) (Transfectam™, Promega, Мэдисон, Висконсин) и дипальмитоилфосфатидилэтаноламина 5-карбоксиспермил-амид (DPPES) (см., например, патент США № 5171678).
Другой конъюгат с катионным липидом включает полученные производные липида с холестерином (DC-Chol), которые были составлены в виде липосом в комбинации с DOPE (см., Gao, X. and Huang, L., Biochim. Biophys. Res. Commun. 179:280, 1991). Как сообщалось, липополилизин, полученный путем конъюгации полилизина с DOPE, является эффективным при трансфекции в присутствии сыворотки (Zhou, X. et al., Biochim. Biophys. Acta 1065:8, 1991). Для определенных клеточных линий такие липосомы, содержащие конъюгированные катионные липиды, известны проявлением более низкой токсичности и обеспечением более эффективной трансфекции, чем DOTMA содержащие композиции. Другие коммерчески доступные продукты с катионными липидами включают DMRIE и DMRIE-HP (Vical, Ла-Хойя, Калифорния) и Lipofectamine (DOSPA) (Life Technology, Inc., Гейтерсберг, Мэриленд). Другие катионные липиды, подходящие для доставки олигонуклеотидов, описаны в WO 98/39359 и WO 96/37194.
Липосомные составы в особенности подходят для местного применения, при этом липосомы проявляют некоторые преимущества по сравнению с другими составами. Такие преимущества включают сниженное побочное действие по отношению к высокой системной абсорбции введенного лекарственного средства, повышенное накопление введенного лекарственного средства в необходимой мишени и воз- 64 044245 можность вводить средство RNAi в кожу. В некоторых вариантах осуществления липосомы используют для доставки средства RNAi к эпидермальным клеткам и также для усиления проникновения средства RNAi в дермальные ткани, например, в кожу. Например, липосомы можно применять местно. Была документально зафиксирована местная доставка лекарственных средств, составленных в виде липосом, в кожу (см., например, Weiner et al., Journal of Drug Targeting, 1992, vol. 2,405-410 и du Plessis et al., Antiviral Research, 18, 1992, 259-265; Mannino, R. J. and Fould-Fogerite, S., Biotechniques 6:682-690, 1988; Itani, T. et al. Gene 56:267-276. 1987; Nicolau, С. et al. Meth. Enz. 149:157-176, 1987; Straubinger, R.M. and Papahadjopoulos, D. Meth. Enz. 101:512-527, 1983; Wang, C.Y. and Huang, L., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84:78517855, 1987).
Неионные липосомные системы также исследовали для определения их пригодности для доставки лекарственных средств в кожу, в частности, системы, содержащие неионное поверхностно-активное вещество и холестерин. Неионные липосомные составы, содержащие Novasome I (глицерилдилаурат/холестерин/полиоксиэтилен-10-стеариловый эфир) и Novasome II (глицерилдистеарат/холестерин/полиоксиэтилен-10-стеариловый эфир), использовали для доставки лекарственного средства в слой дермы кожи мышей. Такие составы со средством для RNAi пригодны для лечения дерматологического нарушения.
Липосомы, которые включают иРНК, могут быть получены с высокой способностью деформироваться. Такая деформируемость может позволить липосомам проникать через пору, которая меньше, чем средний радиус липосомы. Например, типом деформируемых липосом являются трансферсомы. Трансферосомы можно получить путем добавления поверхностных пограничных активаторов, обычно поверхностно-активных веществ, к стандартной липосомной композиции. Трансферсомы, которые включают средство для RNAi, можно доставлять, например, подкожно путем инъекции для доставки средства для RNAi к кератиноцитам в коже. Для того, чтобы пройти через неповрежденную кожу млекопитающего, липидные пузырьки должны проникнуть через ряд мелких пор, каждая с диаметром менее 50 нм, под воздействием подходящего внутрикожного градиента. Кроме того, благодаря свойствам липидов, такие трансферосомы могут быть самооптимизирующимися (приспосабливающимися к форме пор, например, в коже), самовосстанавливающимися, и зачастую могут достигать свои мишени без разделения на фрагменты, и часто могут быть самозагружающимися.
Другие составы, пригодные в настоящем изобретении, описаны в предварительных заявках США с серийными №№ 61/018616, поданной 2 января 2008 г.; 61/018611, поданной 2 января 2008 г.; 61/039748, поданной 26 марта 2008 г.; 61/047087, поданной 22 апреля 2008 г., и 61/051528, поданной 8 мая 2008 г. В РСТ заявке № PCT/US2007/080331, поданной 3 октября 2007 г., также описаны составы, применимые в настоящем изобретении.
Трансферсомы представляют собой еще один тип липосом и представляют собой липидные агрегаты с высокой способностью деформироваться, они являются перспективными кандидатами как средства доставки лекарственных средств. Трансферсомы могут быть описаны как липидные капельки, которые обладают настолько высокой способностью деформироваться, что они легко могут проникать через поры, меньшие, чем капельки. Трансферсомы являются приспосабливающимися к окружающей среде, в которой их используют, например, они являются самооптимизирующимися (приспосабливающимися к форме пор в коже), самовосстанавливающимися, зачастую достигают мишеней без разделения на фрагменты и часто могут быть самозагружающимися. Для получения трансферсом можно добавлять поверхностные пограничные активаторы, обычно поверхностно-активные вещества, к стандартной липосомной композиции. Трансферсомы использовали для доставки сывороточного альбумина в кожу. Как было показано, опосредованная трансферсомами доставка сывороточного альбумина была такой же эффективной, как подкожная инъекция раствора, содержащего сывороточный альбумин.
Поверхностно-активные вещества находят широкое применение в составах, таких как эмульсии (в том числе микроэмульсии) и липосомы. Наиболее распространенным способом классифицирования и ранжирования свойств многих различных типов поверхностно-активных веществ, как естественных, так и синтетических, является использование гидролипидного баланса (HLB). Природа гидрофильной группы (также известной как головка) предоставляет наиболее эффективное средство для распределения по категориям различных поверхностно-активных веществ, используемых в составах (Rieger, в Pharmaceutical Dosage Forms, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., 1988, p. 285).
Если молекула поверхностно-активного вещества не ионизирована, то ее классифицируют как неионное поверхностно-активное вещество. Неионные поверхностно-активные вещества находят широкое применение в фармацевтических и косметических продуктах, и их можно применять при широком диапазоне значений рН. Обычно их значения HLB находятся в диапазоне от 2 до примерно 18, в зависимости от их структуры. Неионные поверхностно-активные вещества включают неионные сложные эфиры, такие как сложные эфиры этиленгликоля, сложные эфиры пропиленгликоля, сложные эфиры глицерила, сложные эфиры полиглицерила, сложные эфиры сорбитана, сложные эфиры сахарозы и этоксилированные сложные эфиры. Неионные алканоамиды и эфиры, как, например, этоксилаты жирного спирта, пропоксилированные спирты и этоксилированные/пропоксилированные блоксополимеры, также включены в данный класс. Полиоксиэтиленовые поверхностно-активные вещества являются наиболее распростра
- 65 044245 ненными представителями класса неионных поверхностно-активных веществ.
Если молекула поверхностно-активного вещества несет отрицательный заряд при растворении или диспергировании в воде, то поверхностно-активное вещество классифицируют как анионное. Анионные поверхностно-активные вещества включают карбоксилаты, как, например, омыляющие вещества, ациллактилаты, ациламиды аминокислот, сложные эфиры серной кислоты, такие как алкилсульфаты и этоксилированные алкилсульфаты, сульфонаты, такие как алкилбензолсульфонаты, ацилизетионаты, ацилтаураты и сульфосукцинаты, и фосфаты. Наиболее важными представителями класса анионных поверхностно-активных веществ являются алкилсульфаты и омыляющие вещества.
Если молекула поверхностно-активного вещества несет положительный заряд при растворении или диспергировании в воде, то поверхностно-активное вещество классифицируют как катионное. Катионные поверхностно-активные вещества включают четвертичные соли аммония и этоксилированные амины. Четвертичные соли аммония являются наиболее применяемыми представителями данного класса.
Если молекула поверхностно-активного вещества обладает способностью нести либо положительный, либо отрицательный заряд, то поверхностно-активное вещество классифицируют как амфотерное. Амфотерные поверхностно-активные вещества включают производные акриловой кислоты, замещенные алкиламиды, N-алкилбетаины и фосфатиды.
Было рассмотрено применение поверхностно-активных веществ в готовых лекарственных формах, составах и в эмульсиях (Rieger, в Pharmaceutical Dosage Forms, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., 1988, p. 285).
иРНК для применения в способах по настоящему изобретению может также предусматриваться в виде мицеллярных составов. Мицеллы в данном документе определены как конкретный тип молекулярного ансамбля, в котором амфипатические молекулы организованы в виде сферической структуры, так что все гидрофобные части молекулы направлены вовнутрь, оставляя гидрофильные части соприкасающимися с окружающей водной фазой. Противоположное расположение имеет место, если окружающая среда гидрофобная.
Смешанный мицеллярный состав, подходящий для доставки через внутрикожные мембраны, может быть получен путем смешивания водного раствора композиции с siRNA, С8-С22-алкилсульфата щелочного металла и мицеллообразующих соединений. Иллюстративные мицеллообразующие соединения включают лецитин, гиалуроновую кислоту, фармацевтически приемлемые соли гиалуроновой кислоты, гликолевую кислоту, молочную кислоту, вытяжку из ромашки, вытяжку из огурца, олеиновую кислоту, линолевую кислоту, линоленовую кислоту, моноолеин, моноолеаты, монолаураты, масло бурачника, масло первоцвета вечернего, ментол, тригидроксиоксохоланил-глицин и его фармацевтически приемлемые соли, глицерин, полиглицерин, лизин, полилизин, триолеин, эфиры полиоксиэтилена и их аналоги, простые полидоканол-алкиловые эфиры и их аналоги, хенодезоксихолат, дезоксихолат и их смеси. Мицеллообразующие соединения можно добавлять во время или после добавления алкилсульфата щелочного металла. Смешанные мицеллы будут образовываться, по сути, при любом виде смешивания ингредиентов, кроме интенсивного перемешивания для получения мицелл с меньшим размером.
В одном способе получают первую мицеллярную композицию, которая содержит композицию с siRNA и по меньшей мере алкилсульфат щелочного металла. Первую мицеллярную композицию затем смешивают по меньшей мере с тремя мицеллообразующими соединениями с образованием смешанной мицеллярной композиции. В другом способе мицеллярную композицию получают путем смешивания композиции с siRNA, алкилсульфата щелочного металла и по меньшей мере одного из мицеллообразующих соединений с последующим добавлением оставшихся мицеллообразующих соединений с интенсивным смешиванием.
Фенол и/или м-крезол можно добавлять к смешанной мицеллярной композиции для стабилизации состава и защиты от роста бактерий. В качестве альтернативы, фенол и/или м-крезол можно добавлять с мицеллообразующими ингредиентами. Изотоническое средство, такое как глицерин, также можно добавлять после образования смешанной мицеллярной композиции.
Для доставки мицеллярного состава в виде спрея состав можно поместить в аэрозольный распылитель и распылитель зарядить газом-вытеснителем. Газ-вытеснитель, который находится под давлением, находится в жидкой форме в распылителе. Соотношения ингредиентов корректируют так, что водная фаза и фаза газа-вытеснителя становятся одной, т.е. присутствует одна фаза. Если присутствует две фазы, то необходимо встряхнуть распылитель перед распылением части содержимого, например, посредством дозирующего клапана. Распыляемая доза фармацевтического средства выталкивается из дозирующего клапана в виде мелкодисперсной струи.
Газы-вытеснители могут включать водородсодержащие хлорфторуглероды, водородсодержащие фторуглероды, простой диметиловый эфир и простой диэтиловый эфир. В определенных вариантах осуществления можно использовать HFA 134а (1,1,1,2-тетрафторэтан).
Конкретные концентрации основных ингредиентов могут быть определены при помощи проведения относительно простых экспериментов. Для абсорбции через ротовую полость часто необходимо увеличить, например, по меньшей мере удвоить или утроить, дозу, предназначенную для инъекции или введения через желудочно-кишечный тракт.
В. Липидные частицы.
- 66 044245 иРНК, например, dsRNA по настоящему изобретению, может быть полностью инкапсулирована в липидном составе, например, LNP или другой частице нуклеиновой кислоты-липида.
Применяемое в данном документе выражение LNP относится к стабильной частице нуклеиновой кислоты-липида. LNP, как правило, содержат катионный липид, некатионный липид и липид, который предупреждает агрегацию частиц (например, конъюгат PEG-липид). LNP весьма пригодны для системных применений, поскольку они характеризуются длительным временем жизни в кровотоке после внутривенной (i.v.) инъекции и накапливаются в дистальных участках (например, участках, физически отделенных от места введения). LNP включают pSPLP, которая включает инкапсулированный комплекс конденсирующее средство-нуклеиновая кислота, который приведен в РСТ публикации № WO 00/03683. Частицы по настоящему изобретению обычно имеют средний диаметр от примерно 50 нм до примерно 150 нм, чаще от примерно 60 нм до примерно 130 нм, чаще от примерно 70 нм до примерно 110 нм, наиболее часто от примерно 70 нм до примерно 90 нм и по сути являются нетоксичными. Кроме того, нуклеиновые кислоты, когда присутствуют в частицах нуклеиновой кислоты-липида по настоящему изобретению, устойчивы в водном растворе к разрушению нуклеазой. Частицы нуклеиноваой кислоты-липида и способ их получения раскрыт, например, в патентах США №№ 5976567; 5981501; 6534484; 6586410; 6815432; публикации США № 2010/0324120 и РСТ публикации № WO 96/40964.
В одном варианте осуществления соотношение липида и лекарственного средства (соотношение масса/масса) (например, соотношение липида и dsRNA) будет находиться в диапазоне от примерно 1:1 до примерно 50:1, от примерно 1:1 до примерно 25:1, от примерно 3:1 до примерно 15:1, от примерно 4:1 до примерно 10:1, от примерно 5:1 до примерно 9:1 или от примерно 6:1 до примерно 9:1. Диапазоны, промежуточные по отношению к перечисленным выше диапазонам, также рассматриваются как часть настоящего изобретения.
Катионный липид может представлять собой, например, хлорид N,N-диолеил-N,N-диметиламмония (DODAC), бромид N,N-дистеарил-N,N-диметиламмония (DDAB), хлорид N-(I-(2,3-диолеоилокси)пропил)-N,N,N-триметиламмония (DOTAP), хлорид N-(I-(2,3-диолеилокси)пропил)-N,N,Nтриметиламмония (DOTMA), N,N-диметил-2,3-диолеилокси)пропиламин (DODMA), 1,2-дилинолеилокси-N,N-диметиламинопропан (DLinDMA), 1,2-дилиноленилокси-N,N-диметиламинопропан (DLenDMA), 1,2-дилинолеилкарбамоилокси-3-диметиламинопропан (DLin-C-DAP), 1,2-дилинолеилокси3-(диметиламино)ацетоксипропан (DLin-DAC), 1,2-дилинолеилокси-3-морфолинопропан (DLin-MA), 1,2дилинолеоил-3-диметиламинопропан (DLinDAP), 1,2-дилинолеилтио-3-диметиламинопропан (DLin-SDMA), 1-линолеоил-2-линолеилокси-3-диметиламинопропан (DLin-2-DMAP), хлористую соль 1,2дилинолеилокси-3-триметиламинопропана (DLin-ТМА.Cl), хлористую соль 1,2-дилинолеоил-3триметиламинопропана (DLin-TAP.Cl), 1,2-дилинолеилокси-3-Щ-метилпиперазино)пропан (DLin-MPZ) или 3-(N,N-дилинолеиламино)-1,2-пропандиол (DLinAP), 3-(N,N-диолеиламино)-1,2-пропандиол (DOAP), 1,2-дилинолеилоксо-3-(2-N,N-диметиламино)этоксипропан (DLin-EG-DMA), 1,2-дилиноленилокси-N,N-диметиламинопропан (DLinDMA), 2,2-дилинолеил-4-диметиламинометил-[1,3]-диоксолан (DLin-K-DMA) или его аналоги, (3aR,5s,6aS)-N,N-диметил-2,2-ди((9Z,12Z)-октадека-9,12диенил)тетрагидро-3aH-циклопента[d][1,3]диоксол-5-амин (ALN100), (6Z,9Z,28Z,31Z)-гептатриаконта6,9,28,31-тетраен-19-ил-4-(диметиламино)бутаноат (MC3), 1,1'-(2-(4-(2-((2-(бис-(2-гидроксидодецил)амино)этил)(2-гидроксидодецил)амино)этил)пиперазин-1 -ил)этилазанедиил)дидодекан-2-ол (T ech G1) или их смесь. Катионный липид может содержать от приблизительно 20 мол.% до приблизительно 50 мол.% или приблизительно 40 мол.% от общего содержания липидов, присутствующих в частице.
В другом варианте осуществления можно использовать соединение 2,2-дилинолеил-4диметиламиноэтил-[1,3]-диоксолан для получения наночастиц липид-siRNA. Синтез 2,2-дилинолеил-4диметиламиноэтил-[1,3]-диоксолана описан в предварительной заявке на патент США номер 61/107998, поданной 23 октября 2008 г., которая включена в данный документ при помощи ссылки.
В одном варианте осуществления частицы липид-siRNA включают 40% 2,2-дилинолеил-4диметиламиноэтил-[1,3]-диоксолана; 10% DSPC; 40% холестерина; 10% PEG-C-DOMG (мольный процент) с размером частиц 63,0±20 нм и соотношением siRNA/липид 0,027.
Ионизируемый/некатионный липид может представлять собой анионный липид или нейтральный липид, в том числе, без ограничения, дистеароилфосфатидилхолин (DSPC), диолеоилфосфатидилхолин (DOPC), дипальмитоилфосфатидилхолин (DPPC), диолеоилфосфатидилглицерин (DOPG), дипальмитоилфосфатидилглицерин (DPPG), диолеоил-фосфатидилэтаноламин (DOPE), пальмитоилолеоилфосфатидилхолин (РОРС), пальмитоилолеоилфосфатидилэтаноламин (POPE), диолеоил-фосфатидилэтаноламин-4-(М-малеимидометил)-циклогексан-1карбоксилат (DOPE-mal), дипальмитоилфосфатидилэтаноламин (DPPE), димиристоилфосфоэтаноламин (DMPE), дистеароил-фосфатидил-этаноламин (DSPE), 16-O-монометил-РЕ, 16-О-диметил-РЕ, 18-1-транс-РЕ, 1стеароил-2-олеоил-фосфатидилэтаноламин (SOPE), холестерин или их смесь. Некатионный липид может составлять от примерно 5 мол.% до примерно 90 мол.%, примерно 10 мол.% или примерно 58 мол.%, если холестерин включен, от общего содержания липидов, присутствующих в частице.
Конъюгированный липид, который ингибирует агрегацию частиц, может представлять собой, например, конъюгат полиэтиленгликоль (PEG)-липид, в том числе, без ограничения, PEG-диацилглицерин (DAG), PEG-диалкилоксипропил (DAA), PEG-фосфолипид, PEG-церамид (Cer) или их смесь. Конъюгат
- 67 044245
PEG-DAA может представлять собой, например, PEG-дилаурилоксипропил (Ci2), PEGдимиристоилоксипропил (Ci4), PEG-дипальмитилоксипропил (Ci6) или PEG-дистеарилоксипропил (Ci8).
Конъюгированный липид, который предупреждает агрегацию частиц, может составлять от 0 мол.% до примерно 20 мол.% или примерно 2 мол.% общего содержания липидов, присутствующих в частице.
В некоторых вариантах осуществления частицы нуклеиновая кислота-липид дополнительно включают холестерин в количестве, например, от примерно 10 мол.% до примерно 60 мол.% или примерно 48 мол.% общего содержания липидов, присутствующих в частице.
В одном варианте осуществления липидоид ND98-4HCl (MW 1487) (см. заявку на патент США № 12/056230, поданную 26 марта 2008 г., которая включена в данный документ при помощи ссылки), холестерин (Sigma-Aldrich) и PEG-церамид С16 (Avanti Polar Lipids) можно использовать для получения наночастицы липид-dsRNA (т.е. частиц LNP01). Маточные растворы каждого в этаноле могут быть получены следующим образом: ND98, 133 мг/мл; холестерин, 25 мг/мл, PEG-церамид С16, 100 мг/мл. Маточные растворы ND98, холестерина и PEG-церамида С16 можно затем объединять, например, в молярном соотношении 42:48:10. Объединенный липидный раствор можно смешивать с водным раствором dsRNA (например, в ацетате натрия, рН 5) так, чтобы конечная концентрация этанола составляла примерно 3545%, а конечная концентрация ацетата натрия составляла примерно 100-300 мМ. Наночастицы липидdsRNA обычно образуются самопроизвольно при смешивании. В зависимости от необходимого распределения частиц по размеру полученную смесь наночастиц можно продавливать через поликарбонатную мембрану (например, с отсечением по размеру в 100 нм) при помощи, например, экструдера с термоцилиндром, как, например, Lipex Extruder (Northern Lipids, Inc). В некоторых случаях стадию экструзии можно пропустить. Удаление этанола и одновременная замена буфера могут быть осуществлены, например, при помощи диализа или тангенциальной поточной фильтрации. Буфер можно заменить, например, забуференным фосфатом физиологическим раствором (PBS) с рН примерно 7, например, рН примерно 6,9, рН примерно 7,0, рН примерно 7,1, рН примерно 7,2, рН примерно 7,3 или рН примерно 7,4.
ND98 isomer!
Формула I
Составы LNP01 описаны, например, в публикации международной заявки № WO 2008/042973, которая, таким образом, включена при помощи ссылки.
Дополнительные иллюстративные составы с липидом-dsRNA описаны в табл. 1.
____________________________________________Таблица 1
| Ионизируемый/катионный липид | Катионный липид/некатионный липид/холестерин/конъюга т PEG-липид Соотношение липид:siRNA |
| 1,2-дилиноленилокси-И,Nдиметиламинопропан(DLinDMA) | DLinDMA/DPPC/холестерин/ PEG-cDMA (57,1/7,1/34,4/1,4) липид : siRNA ~ 7:1 |
| 2,2-дилинолеил-4диметиламиноэтил-[1,3]диоксолан (ХТС) | XTC/DPPC/холестерин/PEG- cDMA 57,1/7,1/34,4/1,4 липид : siRNA ~ 7:1 |
- 68 044245
| LNP05 | 2,2-дилинолеил-4диметиламиноэтил-[1,3]диоксолан (ХТС) | XTC/DSPC/холестерин/РЕС- DMG 57,5/7,5/31,5/3,5 липид:siRNA ~ 6:1 |
| LNP0 6 | 2,2-дилинолеил-4диметиламиноэтил-[1,3]диоксолан (ХТС) | XTC/DSPC/холестерин/РЕС- DMG 57,5/7,5/31,5/3,5 липид:siRNA ~ 11:1 |
| LNP07 | 2,2-дилинолеил-4диметиламиноэтил-[1,3]— диоксолан (ХТС) | XTC/DSPC/холестерин/РЕС- DMG 60/7,5/31/1,5, липид:siRNA ~ 6:1 |
| LNP0 8 | 2,2-дилинолеил-4диметиламиноэтил-[1,3]— диоксолан (ХТС) | ХТС/ОБРС/холестерин/РЕб- DMG 60/7,5/31/1,5, липид:siRNA ~ 11:1 |
| LNP0 9 | 2,2-дилинолеил-4диметиламиноэтил-[1,3]— диоксолан (ХТС) | ХТС/ОБРС/холестерин/РЕб- DMG 50/10/38,5/1,5 липид:siRNA 10:1 |
| LNP10 | (3aR,5s,бaS )-N,N-диметил-2,2ди((9Z,12Z)-октадека-9,12диенил) тетрагидро-ЗаН- циклопента[d][1,3]диоксол-5амин (ALN100) | ALNIOO/DSPC/холестерин/Р EG-DMG 50/10/38,5/1,5 липид:siRNA 10:1 |
| LNP11 | (6Z,9Z,28Z,31Z)- гептатриаконта-6,9,28,31тетраен-19-ил-4- (диметиламино)бутаноат (МСЗ) | мс- 3/DSPC/XonecTepnn/PEG- DMG 50/10/38,5/1,5 липид:siRNA 10:1 |
- 69 044245
| 1, 1’-(2-(4-(2-( (2-(бис(2- гидроксидодецил)амино)этил)(2 | Tech G1/DSPC/холестерин/PEG- | |
| LNP12 | гидроксидодецил)амино)этил)пи перазин-1- ил)этилазанедиил)дидодекан-2- ол (Tech G1) | DMG 50/10/38,5/1,5 липид:siRNA 10:1 XTC/DSPC/xon/PEG-DMG |
| LNP13 | ХТС | 50/10/38,5/1,5 липид:siRNA: 33:1 MC3/DSPC/xon/PEG-DMG |
| LNP14 LNP15 | МСЗ МСЗ | 40/15/40/5 липид:siRNA: 11:1 MC3/DSPC/xon/PEGDSG/GalNAc-PEG-DSG 50/10/35/4,5/0,5 липид:siRNA: 11:1 MC3/DSPC/xon/PEG-DMG |
| LNP16 | МСЗ | 50/10/38,5/1,5 липид:siRNA: 7:1 МСЗ/ОЗРС/хол/РЕС-ОЗС |
| LNP17 | МСЗ | 50/10/38,5/1,5 липид:siRNA: 10:1 МСЗ/DSPC/хол/PEG-DMG |
| LNP18 | МСЗ | 50/10/38,5/1,5 липид:siRNA: 12:1 MC3/DSPC/xon/PEG-DMG |
| LNP19 | МСЗ | 50/10/35/5 липид:siRNA: 8:1 MC3/DSPC/хол/PEG-DPG |
| LNP2 0 | МСЗ | 50/10/38,5/1,5 липид:siRNA: 10:1 C12-200/DSPC/xon/PEG-DSG |
| LNP21 | С12-200 | 50/10/38,5/1,5 липид:siRNA: 7:1 XTC/DSPC/xon/PEG-DSG |
| LNP22 | ХТС | 50/10/38,5/1,5 липид:siRNA: 10:1 |
DSPC: дистеароилфосфатидилхолин;
DPPC: дипальмитоилфосфатидилхолин;
PEG-DMG: PEG-дидимиристоилглицерин (C14-PEG или PEG-C14) (PEG со ср. мол. весом 2000);
PEG-DSG: PEG-дистирилглицерин (C18-PEG или PEG-C18) (PEG со ср. мол. весом 2000);
PEG-cDMA: PEG-карбамоил-1,2-димиристоилоксипропиламин (PEG со ср. мол. весом 2000).
Составы, содержащие SNALP (1,2-дилиноленилокси-N,N-диметиламинопропан (DLinDMA)), описаны в международной публикации № WO 2009/127060, поданной 15 апреля 2009 г., которая, таким образом, включена при помощи ссылки.
ХТС-содержащие составы описаны, например, в предварительной заявке США с серийным № 61/148366, поданной 29 января 2009 г.; предварительной заявке США с серийным № 61/156851, поданной 2 марта 2009 г.; предварительной заявке США, поданной 10 июня 2009 г.; предварительной заявке США с серийным № 61/228373, поданной 24 июля 2009 г.; предварительной заявке США с серийным № 61/239686, поданной 3 сентября 2009 г., и международной заявке № PCT/US2010/022614, поданной 29 января 2010 г., которые, таким образом, включены при помощи ссылки.
MC3-содержащие составы описаны, например, в публикации США № 2010/0324120, поданной 10 июня 2010 г., полное содержание которой, таким образом, включено при помощи ссылки.
ALNY-100-содержащие составы описаны, например, в международной заявке на патент с номером PCT/US09/63933, поданной 10 ноября 2009 г., которая, таким образом, включена при помощи ссылки.
- 70 044245
С12-200-содержащие составы описаны в предварительной заявке США с серийным № 61/175770, поданной 5 мая 2009 г., и международной заявке № PCT/US10/33777, поданной 5 мая 2010 г., которые, таким образом, включены при помощи ссылки.
Синтез ионизируемых/катионных липидов.
Любое из соединений, например, катионные липиды и т.п., используемые в частицах нуклеиновая кислота-липид по настоящему изобретению, можно получить при помощи известных методик органического синтеза, включая способы, описанные более подробно в примерах. Все заместители являются такими, как определено ниже, если не указано иное.
Алкил означает углеводород с прямой цепью или разветвленный, нециклический или циклический, насыщенный алифатический углеводород, содержащий от 1 до 24 атомов углерода. Типичные насыщенные алкилы с прямой цепью включают метил, этил, н-пропил, н-бутил, н-пентил, н-гексил и т.п.; тогда как насыщенные разветвленные алкилы включают изопропил, втор-бутил, изобутил, трет-бутил, изопентил и т.п. Типичные насыщенные циклические алкилы включают циклопропил, циклобутил, циклопентил, циклогексил и т.п.; тогда как ненасыщенные циклические алкилы включают циклопентенил и циклогексенил и т.п.
Алкенил означает алкил, который определен выше, содержащий по меньшей мере одну двойную связь между соседними атомами углерода. Алкенилы включают как цис-, так и транс-изомеры. Типичные алкенилы с прямой цепью и разветвленные алкенилы включают этиленил, пропиленил, 1-бутенил, 2бутенил, изобутиленил, 1-пентенил, 2-пентенил, 3-метил-1-бутенил, 2-метил-2-бутенил, 2,3-диметил-2бутенил и т.п.
Алкинил означает любой алкил или алкенил, которые определены выше, которые дополнительно содержат по меньшей мере одну тройную связь между соседними атомами углерода. Типичные алкинилы с прямой цепью и разветвленные алкинилы включают ацетиленил, пропинил, 1-бутинил, 2-бутинил, 1-пентинил, 2-пентинил, 3-метил-1-бутинил и т.п.
Ацил означает любой алкил, алкенил или алкинил, в которых атом углерода в точке присоединения замещен оксогруппой, которая определена ниже. Например, -С(=O)алкил, -С(=O)алкенил и С(=O)алкинил представляют собой ацильные группы.
Гетероцикл означает 5-7-членное моноциклическое или 7-10-членное бициклическое, гетероциклическое кольцо, которое является либо насыщенным, ненасыщенным, либо ароматическим и которое содержит 1 или 2 гетероатома, независимо выбранных из азота, кислорода и серы, и где гетероатомы азота и серы необязательно могут быть окислены, и гетероатом азота необязательно может быть кватернизирован, в том числе бициклические кольца, в которых любой из вышеперечисленных гетероциклов слит с бензольным кольцом. Гетероцикл может быть присоединен через любой гетероатом или атом углерода. Гетероциклы включают гетероарилы, которые определены ниже. Гетероциклы включают морфолинил, пирролидинонил, пирролидинил, пиперидинил, пиперизинил, гидантоинил, валеролактамил, оксиранил, оксетанил, тетрагидрофуранил, тетрагидропиранил, тетрагидропиридинил, тетрагидропримидинил, тетрагидротиофенил, тетрагидротиопиранил, тетрагидропиримидинил, тетрагидротиофенил, тетрагидротиопиранил и т.п.
Выражения необязательно замещенный алкил, необязательно замещенный алкенил, необязательно замещенный алкинил, необязательно замещенный ацил и необязательно замещенный гетероцикл означают, что при замещении по меньшей мере один атом водорода заменяется заместителем. В случае оксо-заместителя (=O) замещаются два атома водорода. В связи с этим, заместители включают оксо, галоген, гетероцикл, -CN, -ORx, -NRxRy, -NRxC(=O)Ry, -NRxSO2Ry, -C(=O)Rx, -C(=O)ORx, -C(=O)NRxRy, -SOnRx и -SOnNRxRy, где n равняется 0, 1 или 2, Rx и Ry являются одинаковыми или различными и независимо представляют собой водород, алкил или гетероцикл, и каждый из указанных заместителей алкила и гетероцикла дополнительно может быть замещен одним или несколькими из оксо, галогена, -ОН, -CN, алкила, -ORx, гетероцикла, -NRxRy, -NRxC(=O)Ry, -NRxSO2Ry, -C(=O)Rx, -C(=O)ORx, -С(=O)NRxRy, -SOnRx и -SOnNRxRy
Галоген означает фтор, хлор, бром и йод.
В некоторых вариантах осуществления в способах по настоящему изобретению может потребоваться использование защитных групп. Методика с использованием защитных групп хорошо известна специалистам в данной области (см., например, Protective Groups in Organic Synthesis, Green, T.W. et al., Wiley-Interscience, New York City, 1999). Вкратце, защитные группы в контексте настоящего изобретения представляют собой любую группу, которая снижает или устраняет нежелательную химическую активность функциональной группы. Защитную группу можно добавлять к функциональной группе для блокирования ее химической активности во время определенных реакций и затем удалять с открытием исходной функциональной группы. В некоторых вариантах осуществления применяют защитную группу для спиртовой группы. Защитная группа для спиртовой группы представляет собой любую группу, которая уменьшает или устраняет нежелательную химическую активность спиртовой функциональной группы. Защитные группы можно добавлять и удалять при помощи методик, хорошо известных в данной области.
- 71 044245
Синтез формулы А.
В некоторых вариантах осуществления частицы нуклеиновая кислота-липид по настоящему изобретению составляют при помощи катионного липида формулы А:
R3 \
где R1 и R2 независимо представляют собой алкил, алкенил или алкинил, при этом каждый необязательно может быть замещен, a R3 и R4 независимо представляют собой низший алкил или R3 и R4, могут быть совмещены для образовывания необязательно замещенного гетероциклического кольца. В некоторых вариантах осуществления катионный липид представляет собой ХТС, (2,2-дилинолеил-4диметиламиноэтил-[1,3]-диоксолан). Как правило, липид формулы А, приведенной выше, может быть получен при помощи следующих схем реакций 1 или 2, где все заместители являются такими, как определено выше, если не указано иное.
Схема 1
Полученный по схеме 1 липид А, где R1 и R2 независимо представляют собой алкил, алкенил или алкинил, при этом каждый необязательно может быть замещен, a R3 и R4 независимо представляют собой низший алкил или R3 и R4 могут быть совмещены для образовывания необязательно замещенного гетероциклического кольца. Кетон 1 и бромид 2 могут быть приобретены или получены согласно способам, известным специалисту в данной области. Реакция между 1 и 2 дает кеталь 3. Обработка кеталя 3 с амином 4 дает липиды формулы А. Липиды формулы А можно превращать в соответствующую аммонийную соль при помощи органической соли формулы 5, где X представляет собой анион, противоион, выбранный из галогена, гидроксида, фосфата, сульфата или т.п.
Схема 2.
В качестве альтернативы, исходный материал, кетон 1, может быть получен согласно схеме 2. Реактив Гриньяра 6 и цианид 7 могут быть приобретены или получены согласно способам, известным специалисту в данной области. Реакция между 6 и 7 дает кетон 1. Превращение кетона 1 в соответствующие липиды формулы А является таким, как описано на схеме 1.
Схема 2
Mg-R1 4 . о/'2
Ri !рз $2
Синтез MC3.
Получение DLin-M-C3-DMA (т.е. (62,92,282,312)-гептатриаконта-6,9,28,31-тетраен-19-ил-4(диметиламино)бутаноата) было следующим. Раствор (62,92,282,312)-гептатриаконта-6,9,28,31-тетраен19-ола (0,53 г), гидрохлорида 4-N,N-диметиламиномасляной кислоты (0,51 г), 4-N,Nдиметиламинопиридина (0,61 г) и 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)карбодиимида гидрохлорида (0,53 г) в дихлорметане (5 мл) перемешивали при комнатной температуре в течение ночи. Раствор промывали
- 72 044245 разбавленной хлористоводородной кислотой, за которой следовал разбавленный водный бикарбонат натрия. Органические фракции высушивали над безводным сульфатом магния, фильтровали и растворитель удаляли при помощи роторного вакуумного испарителя. Остаток проходил через колонку с силикагелем (20 г) с использованием градиента элюирования 1-5% метанол/дихлорметан. Фракции, содержащие очищенный продукт, объединяли и растворитель удаляли с получением бесцветного масла (0,54 г). Синтез ALNY-100
Синтез кеталя 519 [ALNY-100] осуществляли с использованием следующей схемы 3.
Схема 3
Синтез 515.
К перемешиваемой суспензии LiAlH4 (3,74 г, 0,09852 моль) в 200 мл безводного THF в двугорлой RBF (1 л) медленно добавляли раствор 514 (10 г, 0,04926 моль) в 70 мл THF при 0°C в атмосфере азота. После завершения добавления реакционную смесь нагревали до комнатной температуры и затем нагревали до появления конденсации в течение 4 ч. Течение реакции контролировали при помощи TLC. После завершения реакции (определяли при помощи TLC) смесь охлаждали до 0°C и гасили аккуратным добавлением насыщенного раствора Na2SO4. Реакционную смесь перемешивали в течение 4 ч при комнатной температуре и отфильтровывали. Остаток хорошо промывали THF. Фильтрат и осадок, полученный при промывке, смешивали, и разводили 400 мл диоксана и 26 мл конц. HCl, и перемешивали в течение 20 мин при комнатной температуре. Летучие вещества отгоняли в вакууме с получением хлористоводородной соли 515 в виде белого твердого вещества. Выход: 7,12 г. 1И-ЯМР (ДМСО, 400 МГц): δ=9,34 (широкий, 2Н), 5,68 (с, 2Н), 3,74 (м, 1Н), 2,66-2,60 (м, 2Н), 2,50-2,45 (м, 5Н).
Синтез 516.
К перемешанному раствору соединения 515 в 100 мл сухого DCM в 250 мл двухгорлой RBF добавляли NEt3 (37,2 мл, 0,2669 моль) и охлаждали до 0°C в атмосфере азота. После медленного добавления N(бензилокси-карбонилокси)-сукцинимида (20 г, 0,08007 моль) в 50 мл сухого DCM реакционной смеси позволяли нагреться до комнатной температуры. После завершения реакции (2-3 ч, определяли при помощи TLC) смесь промывали последовательно раствором 1н. HCl (1x100 мл) и насыщенным раствором NaHCO3 (1x50 мл). Органический слой затем высушивали над безводн. Na2SO4 и растворитель выпаривали с получением неочищенного материала, который очищали при помощи колоночной хроматографии с силикагелем с получением 516 в виде липкой массы. Выход: 11 г (89%). 1Н-ЯМР (CDCl3, 400 МГц): δ=7,36-7,27 (м, 5Н), 5,69 (с, 2Н), 5,12 (с, 2Н), 4,96 (уш., 1Н) 2,74 (с, 3H), 2,60 (м, 2Н), 2,30-2,25 (м, 2Н). LC-MS [М+Н] - 232,3 (96,94%).
Синтез 517А и 517В.
Циклопентен 516 (5 г, 0,02164 моль) растворяли в растворе 220 мл ацетона и воды (10:1) в одногорлой 500 мл RBF и к нему добавляли N-метил-морфолин-N-оксuд (7,6 г, 0,06492 моль), за которым следовали 4,2 мл 7,6% раствора OsO4 (0,275 г, 0,00108 моль) в трет-бутаноле при комнатной температуре. После завершения реакции (~ 3 ч) смесь гасили при помощи добавления твердого Na2SO3 и полученную смесь перемешивали в течение 1,5 ч при комнатной температуре. Реакционную смесь разводили DCM (300 мл) и промывали водой (2x100 мл), после чего следовал насыщенный раствор NaHCO3 (1x50 мл), вода (1x30 мл) и в конце соляной раствор (1x50 мл). Органическую фазу высушивали над безводн. Na2SO4 и растворитель удаляли в вакууме. В результате очистки неочищенного материала при помощи колоночной хроматографии с силикагелем получали смесь диастереоизомеров, которые разделяли при помощи преп. HPLC. Выход: - 6 г неочищенного продукта.
517А - пик-1 (белое твердое вещество), 5,13 г (96%). 1Н-ЯМР (ДМСО, 400 МГц): δ=7,39-7,31 (м, 5Н), 5,04 (с, 2Н), 4,784,73 (м, 1Н), 4,48-4,47 (д, 2Н), 3,94-3,93 (м, 2Н), 2,71 (с, 3H), 1,72-1,67 (м, 4Н). LC-MS - [М+Н] 266,3, [M+NH4+] - 283,5 присутствует, HPLC-97,86%. Стереохимию подтверждали при помощи рентгенограммы.
Синтез 518.
При помощи процедуры, аналогичной описанной для синтеза соединения 505, соединение 518 (1,2 г, 41%) получали в виде бесцветного масла. 1Н-ЯМР (CDCl3, 400 МГц): δ=7,35-7,33 (м, 4Н), 7,30-7,27 (м, 1Н), 5,37-5,27 (м, 8Н), 5,12 (с, 2Н), 4,75 (м, 1Н), 4,58-4,57 (м, 2Н), 2,78-2,74 (м, 7Н), 2,06-2,00 (м, 8Н), 1,96-1,91 (м, 2Н), 1,62 (м, 4Н), 1,48 (м, 2Н), 1,37-1,25 (уш.м, 36Н), 0,87 (м, 6Н). HPLC - 98,65%.
Общая процедура для синтеза соединения 519.
Раствор соединения 518 (1 экв.) в гексане (15 мл) добавляли по каплям к охлажденному на льду
- 73 044245 раствору LAH в THF (1 М, 2 экв.). После завершения добавления смесь нагревали при 40°C в течение 0,5 ч, затем опять охлаждали на ледяной бане. Смесь аккуратно гидролизовали насыщенным водным Na2SO4, затем фильтровали через целит и переводили в масло. С помощью колоночной хроматографии получали чистое 519 (1,3 г, 68%), которое получали в виде бесцветного масла. 13С ЯМР δ=130,2, 130,1 (х2), 127,9 (х3), 112,3, 79,3, 64,4, 44,7, 38,3, 35,4, 31,5, 29,9 (х2), 29,7, 29,6 (х2), 29,5 (х3), 29,3 (х2), 27,2 (х3), 25,6, 24,5, 23,3, 226, 14,1; Electrospray MS (+ve): Молекулярный вес для C44H80NO2 (М+Н)+ вычисл. 654,6, обнаруженный 654,6.
Составы, полученные либо при помощи стандартного способа, либо при помощи способа без экструзии, характеризуются одинаковым образом. Например, составы, как правило, характеризуют при помощи визуального осмотра. Это должны быть белесые прозрачные растворы, в которых нет агрегатов или осадка. Размер частиц и распределение частиц по размеру липидных наночастиц можно измерять при помощи рассеяния света, используя, например, Malvern Zetasizer Nano ZS (Malvern, США). Размер частиц должны быть примерно 20-300 нм, например, 40-100 нм. Распределение частиц по размеру должно быть одновершинным. Общую концентрацию dsRNA в составе, а также захваченную фракцию определяют при помощи анализа на исключение красителя. Образец составленной dsRNA можно инкубировать со связывающимся с РНК красителем, например Ribogreen (Molecular Probes), в присутствии или при отсутствии разрушающего состав поверхностно-активного вещества, например, 0,5% Triton-X100. Общую dsRNA в составе можно определять по сигналу от образца, содержащего поверхностно-активное вещество, по отношению к калибовочной кривой. Захваченную фракцию определяют путем вычитания содержания свободной dsRNA (которое измерено по сигналу при отсутствии поверхностно-активного вещества) из общего содержания dsRNA. Процент захваченной dsRNA, как правило, составляет >85%. Для состава SNALP размер частиц составляет по меньшей мере 30 нм, по меньшей мере 40 нм, по меньшей мере 50 нм, по меньшей мере 60 нм, по меньшей мере 70 нм, по меньшей мере 80 нм, по меньшей мере 90 нм, по меньшей мере 100 нм, по меньшей мере 110 нм и по меньшей мере 120 нм. Подходящий диапазон, как правило, составляет от примерно по меньшей мере 50 нм до примерно по меньшей мере 110 нм, от примерно по меньшей мере 60 нм до примерно по меньшей мере 100 нм или от примерно по меньшей мере 80 нм до примерно по меньшей мере 90 нм.
Композиции и составы для перорального введения включают порошки или гранулы, микрочастицы, наночастицы, суспензии или растворы в воде или неводной среде, капсулы, желатиновые капсулы, пакетики с порошком для приготовления раствора, таблетки или минитаблетки. Необходимыми могут быть загустители, ароматизирующие вещества, разбавители, эмульгаторы, диспергирующие средства или связующие вещества. В некоторых вариантах осуществления пероральные составы являются такими, в которых dsRNA, описанные в настоящем изобретении, вводятся в сочетании с одним или несколькими веществами, способствующими проникновению, поверхностно-активными вещества и хелаторами. Подходящие поверхностно-активные вещества включают жирные кислоты и/или их сложные эфиры или соли, желчные кислоты и/или их соли. Подходящие желчные кислоты/соли желчных кислот включают хенодезоксихолевую кислоту (CDCA) и урсодезоксихенодезоксихолевую кислоту (UDCA), холевую кислоту, дегидрохолевую кислоту, дезоксихолевую кислоту, глюхолевую кислоту, глихолевую кислоту, гликодезоксихолевую кислоту, таурохолевую кислоту, тауродезоксихолевую кислоту, тауро-24,25-дигидрофузидат натрия и гликодигидрофузидат натрия. Подходящие жирные кислоты включают арахидоновую кислоту, ундекановую кислоту, олеиновую кислоту, лауриновую кислоту, каприловую кислоту, каприновую кислоту, миристиновую кислоту, пальмитиновую кислоту, стеариновую кислоту, линолевую кислоту, линоленовую кислоту, дикапрат, трикапрат, моноолеин, дилаурин, глицерил 1-монокапрат, 1додецилазациклогептан-2-он, ацилкарнитин, ацилхолин или моноглицерид, диглицерид или их фармацевтически приемлемую соль (например, натриевую). В некоторых вариантах осуществления используют комбинации веществ, способствующих проникновению, например, жирные кислоты/соли жирных кислот в комбинации с желчными кислотами/солями желчных кислот. Одной иллюстративной комбинацией является натриевая соль лауриновой кислоты, каприновой кислоты и UDCA. Дополнительные вещества, способствующие проникновению, включают полиоксиэтилен-9-лауриловый эфир, полиоксиэтилен-20-цетиловый эфир. dsRNA, описанные в настоящем изобретении, могут быть доставлены перорально, в форме гранул, в том числе распыляемых высушенных частиц, или образуют комплексы с образованием микро- или наночастиц. Комплексообразующие средства для dsRNA включают полиаминокислоты; полиимины; полиакрилаты; полиалкилакрилаты, полиоксэтаны, полиалкилцианоакрилаты; катионизированные желатины, альбумины, крахмалы, акрилаты, полиэтиленгликоли (PEG) и крахмалы; полиалкилцианоакрилаты; DEAE-производные полиимины, поллуланы, целлюлозы и крахмалы. Подходящие комплексообразующие средства включают хитозан, N-триметилхитозан, поли-L-лизин, полигистидин, полиорнитин, полиспермины, протамин, поливинилпиридин, политиодиэтиламинометилэтилен (PTDAE), полиаминостирол (например, р-амино), поли(метилцианоакрилат), поли(этилцианоакрилат), поли(бутилцианакрилат), поли(изобутилцианакрилат), поли(изогексилцианоакрилат), DEAE-метакрилат, DEAE-гексилакрилат, DEAE-акриламид, DEAE-альбумин и DEAEдекстран, полиметилакрилат, полигексилакрилат, поли(D,L-молочную кислоту), сополимер DL- 74 044245 молочной и гликолевой кислоты (PLGA), альгинат и полиэтиленгликоль (PEG). Пероральные составы для dsRNA и их получение описаны подробно в патенте США № 6887906, публикации США № 20030027780 и патенте США № 6747014, каждый из которых включен в данный документ при помощи ссылки.
Композиции и составы для парентерального, интрапаренхиматозного (в головной мозг), подоболочечного, интравентрикулярного или внутрипеченочного введения могут включать стерильные водные растворы, которые также могут содержать буферы, разбавители и другие соответствующие добавки, такие как, без ограничения, вещества, способствующие проникновению, соединения-носители и другие фармацевтически приемлемые носители или наполнители.
Фармацевтические композиции по настоящему изобретению включают, без ограничения, растворы, эмульсии и содержащие липосомы составы. Такие композиции могут быть получены из ряда компонентов, который включает, без ограничения, предварительно полученные жидкости, самоэмульгирующиеся твердые вещества и самоэмульгирующиеся полутвердые вещества. В частности, предпочтительными являются составы, которые целенаправленно воздействуют на печень при лечении заболеваний печени, таких как гепатокарцинома.
Фармацевтические составы по настоящему изобретению, которые в целях удобства могут находиться в виде единичной лекарственной формы, можно получать согласно традиционным методикам, хорошо известным в фармацевтической промышленности. Такие методики включают стадию приведения активных ингредиентов во взаимодействие с фармацевтическим (фармацевтическими) носителем (носителями) или наполнителем (наполнителями). Как правило, составы получают путем равномерного и тщательного приведения активных ингредиентов во взаимодействие с жидкими носителями или мелкоизмельченными твердыми носителями или и теми, и другими, а затем, при необходимости, придания продукту формы.
Композиции по настоящему изобретению могут быть составлены в любой из многих возможных лекарственных форм, как, например, без ограничения, таблетки, капсулы, желатиновые капсулы, жидкие сиропы, пластичные гели, суппозитории и клизмы. Композиции по настоящему изобретению также могут быть составлены в виде суспензий в водной, неводной или смешанной среде. Водные суспензии дополнительно могут содержать вещества, которые повышают вязкость суспензии, в том числе, например, карбоксиметилцеллюлозу натрия, сорбит и/или декстран. Суспензия также может содержать стабилизаторы.
С. Дополнительные составы.
i. Эмульсии.
Композиции по настоящему изобретению могут быть получены и составлены в виде эмульсий. Эмульсии, как правило, являются гетерогенными системами одной жидкости, диспергированной в другой, в форме капелек, диаметр которых обычно превышает 0,1 мкм (см., например, Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems, Allen, LV., Popovich NG., and Ansel HC., 2004, Lippincott Williams & Wilkins (8th ed.), New York, NY; Idson, в Pharmaceutical Dosage Forms, Lieberman, Rieger and Banker (Eds.), 1988, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., volume 1, p. 199; Rosoff, в Pharmaceutical Dosage Forms, Lieberman, Rieger and Banker (Eds.), 1988, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., Volume 1, p. 245; Block в Pharmaceutical Dosage Forms, Lieberman, Rieger and Banker (Eds.), 1988, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., volume 2, p. 335; Higuchi et al., в Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Co., Easton, Pa., 1985, p. 301). Эмульсии часто представляют собой двухфазные системы, содержащие две несмешиваемые жидкие фазы, тщательно перемешанные и диспрегированные одна в другой. Как правило, эмульсии могут быть эмульсиями по типу либо вода в масле (w/o), либо масло в воде (o/w). В тех случаях, когда водная фаза является мелкораспыленной в общем объеме масляной фазы и диспергированной в виде мельчайших капелек в нем, тогда полученную композицию называют эмульсией по типу вода в масле (w/o). В качестве альтернативы, в тех случаях, когда масляная фаза является мелкораспыленной в общем объеме водной фазы и диспергированной в виде мельчайших капелек в нем, тогда полученную композицию называют эмульсией по типу масло в воде (o/w). Эмульсии могут содержать дополнительные компоненты вдобавок к диспергированным фазам и активное лекарственное средство, которое может присутствовать в виде раствора либо в водной фазе, масляной фазе либо как таковое в качестве отдельной фазы. Фармацевтические наполнители, такие как эмульгаторы, стабилизаторы, красители и антиоксиданты, могут присутствовать в эмульсиях при необходимости. Фармацевтические эмульсии также могут представлять собой множественные эмульсии, которые состоят из более чем двух фаз, такие как, например, в случае эмульсий по типу масло-в-воде-в-масле (o/w/o) и вода-в-масле-вводе (w/o/w). Такие сложные составы часто обеспечивают определенные преимущества, которые не обеспечивают простые двухкомпонентные эмульсии. Множественные эмульсии, в которых отдельные масляные капельки эмульсии o/w включают маленькие водные капельки, составляют эмульсию w/o/w. Аналогично этому система масляных капелек, заключенная в каплях воды, стабилизированных в масляной диспергирующей фазе, обеспечивает эмульсию o/w/o.
Эмульсии характеризуются малой термодинамической устойчивостью либо ее отсутствием. Часто диспергированная или дисперсная фаза эмульсии хорошо диспергирована в дисперсионной или диспер- 75 044245 гирующей фазе и поддерживается в такой форме при помощи эмульгаторов или вязкости состава. Любая фаза эмульсии может быть полутвердой или твердой, как и в случае подобных эмульсии мазевых основ и кремов. Другие способы стабилизации эмульсий охватывают применение эмульгаторов, которые могут быть включены в любую фазу эмульсии. Эмульгаторы в целом могут быть классифицированы на четыре категории: синтетические поверхностно-активные вещества, встречающиеся в природе эмульгаторы, абсорбционные базы и высокодисперные твердые вещества (см., например, Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems, Allen, L.V., Popovich NG., and Ansel H.C., 2004, Lippincott Williams & Wilkins (8th ed.), New York, NY; Idson, в Pharmaceutical Dosage Forms, Lieberman, Rieger and Banker (Eds.), 1988, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., volume 1, p. 199).
Синтетические поверхностно-активные вещества, также известные как сурфактанты, нашли широкое применение в составе эмульсий и были рассмотренны в литературе (см., например, Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems, Allen, L.V., Popovich N.G., and Ansel H.C., 2004, Lippincott Williams & Wilkins (8th ed.), New York, NY; Rieger, в Pharmaceutical Dosage Forms, Lieberman, Rieger and Banker (Eds.), 1988, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., volume 1, p. 285; Idson, в Pharmaceutical Dosage Forms, Lieberman, Rieger and Banker (Eds.), Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., 1988, volume 1, p. 199). Поверхностно-активные вещества обычно являются амфифильными и содержат гидрофильную и гидрофобную часть. Соотношение гидрофильной и гидрофобной природы поверхностно-активного вещества называют гидролипидным балансом (HLB), и оно является ценным инструментом в распределении на категории и выборе поверхностно-активных веществ при получении составов. Поверхностноактивные вещества можно классифицировать на различные классы, исходя из природы гидрофильной группы: неионные, анионные, катионные и амфотерные (см., например, Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems, Allen, L.V., Popovich N.G., and Ansel HC., 2004, Lippincott Williams & Wilkins (8th ed.), New York, NY Rieger, в Pharmaceutical Dosage Forms, Lieberman, Rieger and Banker (Eds.), 1988, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., volume 1, p. 285).
Встречающиеся в природе эмульгаторы, используемые в составах эмульсий, включают ланолин, пчелиный воск, фосфатиды, лецитин и гуммиарабик. Абсорбционные базы, такие как безводный ланолин и гидрофильный вазелин, обладают гидрофильными свойствами, так что они могут впитывать воду с образованием эмульсий w/o, при этом сохраняя свою полутвердую консистенцию. Мелкоизмельченные твердые вещества также использовали в качестве подходящих эмульгаторов в особенности в комбинации с поверхностно-активными веществами и в вязких препаратах. Они включают полярные неорганические твердые вещества, такие как гидроксиды тяжелых металлов, неразбухающие глины, такие как бентонит, аттапульгит, гекторит, каолин, монтмориллонит, коллоидный силикат алюминия и коллоидный алюмосиликат магния, пигменты и неполярные твердые вещества, такие как углерод или глицерила тристеарат.
Большое разнообразие неэмульгирующих материалов также включают в составы эмульсий и улучшают свойства эмульсий. Они включают жиры, масла, воски, жирные кислоты, жирные спирты, жирные сложные эфиры, увлажнители, гидрофильные коллоиды, консерванты и антиоксиданты (Block, в Pharmaceutical Dosage Forms, Lieberman, Rieger and Banker (Eds.), 1988, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., volume 1, p. 335; Idson, в Pharmaceutical Dosage Forms, Lieberman, Rieger and Banker (Eds.), 1988, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., volume 1, p. 199).
Гидрофильные коллоиды или гидроколлоиды включают встречающиеся в природе смолы и синтетические полимеры, такие как полисахариды (например, гуммиарабик, агар, альгиновую кислоту, каррагенан, гуаровую камедь, камедь карайи и трагакант), производные целлюлозы (например, карбоксиметилцеллюлозу и карбоксипропилцеллюлозу) и синтетические полимеры (например, карбомеры, простые эфиры целлюлозы и карбоксивиниловые полимеры). Они диспергируются или набухают в воде с образованием коллоидных растворов, которые стабилизируют эмульсии путем образования крепких межфазных пленок вокруг капелек диспергированной фазы и путем повышения вязкости дисперсионной фазы.
Поскольку эмульсии часто содержат некоторое количество ингредиентов, таких как углеводы, белки, стеролы и фосфатиды, которые могут легко поддерживать рост микробов, то такие составы часто включают консерванты. Широко используемые консерванты, включенные в составы эмульсий, включают метилпарабен, пропилпарабен, четвертичные соли аммония, бензалкония хлорид, сложные эфиры ргидроксибензойной кислоты и борную кислоту. Антиоксиданты также обычно добавляют к составам эмульсий для предупреждения разрушения состава. Используемые антиоксиданты могут быть ловушками свободных радикалов, как, например, токоферолы, алкил галлаты, бутилированный гидроксианизол, бутилированный гидрокситолуол, или восстановителями, такими как аскорбиновая кислота и матабисульфит натрия, и синергистами антиоксидантов, такими как лимонная кислота, винная кислота и лецитин.
Применение составов эмульсий посредством дерматологического, перорального и парентерального путей и способы их получения были рассмотрены в литературе (см., например, Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems, Allen, L.V., Popovich N.G., and Ansel HC., 2004, Lippincott Williams & Wilkins (8th ed.), New York, NY; Idson, в Pharmaceutical Dosage Forms, Lieberman, Rieger and Banker (Eds.), 1988, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., volume 1, p. 199). Составы эмульсий для пероральной доставки очень широко применяют из-за удобства составления, а также с позиции эффективности при
- 76 044245 абсорбции и биооступности (см., например, Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems, Allen, L.V., Popovich N.G., and Ansel H.C., 2004, Lippincott Williams & Wilkins (8th ed.), New York, NY; Rosoff, в Pharmaceutical Dosage Forms, Lieberman, Rieger and Banker (Eds.), 1988, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., volume 1, p. 245; Idson, в Pharmaceutical Dosage Forms, Lieberman, Rieger and Banker (Eds.), 1988, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., volume 1, p. 199). Слабительные средства на основе минеральных масел, жирорастворимые витамины и питательные препараты с высоким содержанием жира находятся среди материалов, которые обычно вводят перорально в виде эмульсий o/w.
ii. Микроэмульсии.
В одном варианте осуществления настоящего изобретения композиции иРНК и нуклеиновые кислоты составлены в виде микроэмульсий. Микроэмульсия может быть определена как система воды, масла и амфифильного вещества, которая является отдельным оптически изотропным и термодинамически устойчивым жидким раствором (см., например, Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems, Allen, L.V., Popovich N.G., and Ansel H.C, 2004, Lippincott Williams & Wilkins (8th ed.), New York, NY; Rosoff, в Pharmaceutical Dosage Forms, Lieberman, Rieger and Banker (Eds.), 1988, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., volume 1, p. 245). Обычно микроэмульсии являются системами, которые получают путем сперва диспергирования масла в водном растворе поверхностно-активного вещества, а затем добавления достаточного количества четвертого компонента, как правило, спирта со средней длиной цепи для образования прозрачной системы. Таким образом, микроэмульсии также были описаны как термодинамически устойчивые, изотропически чистые дисперсии двух несмешиваемых жидкостей, которые стабилизируются межфазными пленками поверхностно-активных молекул (Leung and Shah, в Controlled Release of Drugs: Polymers and Aggregate Systems, Rosoff, M., Ed., 1989, VCH Publishers, New York, pages 185-215). Микроэмульсии обычно получают путем объединения от трех до пяти компонентов, которые включают масло, воду, поверхностно-активное вещество, вторичное поверхностно-активное вещество и электролит. Является ли микроэмульсия эмульсией по типу вода в масле (w/o) или по типу масло в воде (o/w), зависит от свойств используемого масла и поверхностно-активного вещества и от структуры и геометрической упаковки полярных головок и углеводородных хвостов молекул поверхностноактивного вещества (Schott, в Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Co., Easton, Pa., 1985, p. 271).
Активно изучался феноменологический подход с использованием фазовой диаграммы, и с его помощью специалистами в данной области были получены обширные данные о том, как составлять микроэмульсии (см., например, Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems, Allen, L.V., Popovich N.G., and Ansel H.C., 2004, Lippincott Williams & Wilkins (8th ed.), New York, NY; Rosoff, в Pharmaceutical Dosage Forms, Lieberman, Rieger and Banker (Eds.), 1988, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., volume 1, p. 245; Block, в Pharmaceutical Dosage Forms, Lieberman, Rieger and Banker (Eds.), 1988, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., volume 1, p. 335). По сравнению с традиционными эмульсиями микроэмульсии имеют преимущество стабилизации водонерастворимых лекарственных средств в составе термодинамически устойчивых капелек, которые образуются самопроизвольно.
Поверхностно-активные вещества, используемые в получении микроэмульсий, включают без ограничения ионные поверхностно-активные вещества, неионные поверхностно-активные вещества, Brij 96, полиокиэтиленолеиловые эфиры, сложные эфиры жирных кислот и полиглицерина, тетраглицерина монолаурат (ML310), тетраглицерина моноолеат (МО310), гексаглицерина моноолеат (РО310), гексаглицерина пентаолеат (РО500), декаглицерина монокапрат (МСА750), декаглицерина моноолеат (МО750), декаглицерина секвиолеат (SO750), декаглицерина декаолеат (DAO750) отдельно или в комбинации с вторичными поверхностно-активными веществами. Вторичное поверхностно-активное вещество, обычно являющееся спиртом с короткой цепью, таким как этанол, 1-пропанол и 1-бутанол, служит для увеличения межфазной текучести путем проникновения в пленку из поверхностно-активного вещества и соответственно создания неупорядоченной пленки из-за пустого пространства, образующегося среди молекул поверхностно-активного вещества. Однако микроэмульсии могут быть получены без применения вторичных поверхностно-активных веществ, и в данной области известны самоэмульгирующиеся системы микроэмульсий без спирта. Водной фазой, как правило, может быть вода, водный раствор лекарственного средства, глицерин, PEG300, PEG400, полиглицерины, пропиленгликоли и производные этиленгликоля. Масляная фаза может включать, без ограничения, материалы, такие как Captex 300, Captex 355, Capmul MCM, сложные эфиры жирных кислот, среднецепочечные (С8-С12) моно-, ди- и триглицериды, полиоксиэтилированные сложные эфиры жирных кислот и глицерила, жирные спирты, полигликолизированные глицериды, насыщенные полигликолизированные С8-С10-глицериды, растительные масла и силиконовое масло.
Микроэмульсии представляют особый интерес с точки зрения растворимости лекарственного средства и повышенной абсорбции лекарственных средств. Липидные микроэмульсии (как o/w, так и w/o) были предложены для увеличения пероральной биодоступности лекарственных средств, включая пептиды (см., например, патент США №№ 6191105; 7063860; 7070802; 7157099; Constantinides et al., Pharmaceutical Research, 1994, 11, 1385-1390; Ritschel, Meth. Find. Exp. Clin. Pharmacol., 1993, 13, 205). Микроэмульсии обеспечивают преимущества в виде улучшенной растворимости лекарственного средства, за
- 77 044245 щиты лекарственного средства от ферментативного гидролиза, возможного увеличения абсорбции лекарственного средства за счет индуцированных поверхностно-активным веществом изменений текучести мембран и проницаемости, удобства получения, удобства перорального введения по сравнению с твердой лекарственной формой, улучшенной клинической действенности и пониженной токсичности (см., например, патент США №№ 6191105; 7063860; 7070802; 7157099; Constantinides et al., Pharmaceutical Research, 1994, 11, 1385; Ho et al., J. Pharm. Sci., 1996, 85, 138-143). Часто микроэмульсии могут образовываться самопроизвольно, когда их компоненты объединяют при температуре окружающего воздуха. Это может быть в особенности полезным, когда составляют термолабильные лекарственные средства, пептиды или иРНК. Микроэмульсии также были эффективными при трансдермальной доставке активных компонентов как при косметических, так и при фармацевтических применениях. Предполагается, что композиции и составы микроэмульсий по настоящему изобретению будут способствовать повышенной системной абсорбции иРНК и нуклеиновых кислот из желудочно-кишечного тракта, а также улучшать локальное клеточное поглощение иРНК и нуклеиновых кислот.
Микроэмульсии по настоящему изобретению также могут содержать дополнительные компоненты и добавки, такие как сорбитанмоностеарат (Grill 3), Labrasol и вещества, способствующие проникновению, для улучшения свойств состава и для повышения абсорбции иРНК и нуклеиновых кислот по настоящему изобретению. Вещества, способствующие проникновению, используемые в микроэмульсиях по настоящему изобретению, могут классифицироваться, как принадлежащие одной из пяти основных категорий: поверхностно-активные вещества, жирные кислоты, соли желчных кислот, хелатирующие средства и нехелатирующие неповерхностно-активные вещества (Lee et al., Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems, 1991, p. 92). Каждый из этих классов был рассмотрен выше.
iii. Микрочастицы.
Средство RNAi по настоящему изобретению может быть включено в частицу, например, микрочастицу. Микрочастицы можно получать при помощи сушки распылением, но также можно получать другими способами, в том числе лиофилизацией, выпариванием, сушкой в псевдосжиженном слое, сушкой в вакууме или при помощи комбинации этих методик.
iv. Вещества, способствующие проникновению.
В одном варианте осуществления в настоящем изобретении применяют разнообразные вещества, способствующие проникновению, для воздействия на эффективную доставку нуклеиновых кислот, в частности иРНК, в кожу животных. Большинство лекарственных средств присутствуют в растворе как в ионизированной, так и в неионизированной формах. Однако, как правило, только жирорастворимые или липофильные лекарственные средства легко проходят через клеточные мембраны. Было установлено, что даже нелипофильные лекарственные средства могут проходить через клеточные мембраны, если мембрана, через которую проходит проникновения, обработана веществом, способствующим проникновению. Вдобавок к обеспечению диффузии нелипофильных лекарственных средств через клеточные мембраны вещества, способствующие проникновению, также повышают проницаемость для липофильных лекарственных средств.
Вещества, способствующие проникновению, можно классифицировать как принадлежащие одной из пяти основных категорий, т.е. поверхностно-активные вещества, жирные кислоты, соли желчных кислот, хелатирующие средства и нехелатриующие неповерхностно-активные вещества (см., например, Malmsten, M. Surfactants and polymers in drug delivery, Informa Health Care, New York, NY, 2002; Lee et al., Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems, 1991, p.92). Каждый из вышеуказанных классов веществ, способствующих проникновению, описан ниже более подробно.
Поверхностно-активные вещества (или сурфактанты) являются химическими структурными единицами, которые при растворении в водном растворе снижают поверхностное натяжение раствора или межфазное натяжение между водным раствором и другой жидкостью, в результате чего повышается абсорбция иРНК через слизистую. Вдобавок к солям желчных кислот и жирным кислотам, вещества, способствующие проникновению, включают, например, лаурилсульфат натрия, полиоксиэтилен-9лауриловый эфир и полиоксиэтилен-20-цетиловый эфир (см., например, Malmsten, M. Surfactants and polymers in drug delivery, Informa Health Care, New York, NY, 2002; Lee et al., Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems, 1991, p.92) и перфорированные эмульсии, такие как FC-43. Takahashi et al., J. Pharm. Pharmacol., 1988, 40, 252).
Разнообразные жирные кислоты и их производные, которые действуют как вещества, способствующие проникновению, включают, например, олеиновую кислоту, лауриновую кислоту, каприновую кислоту (ндекановую кислоту), миристиновую кислоту, пальмитиновую кислоту, стеариновую кислоту, линолевую кислоту, линоленовую кислоту, дикапрат, трикапрат, моноолеин (1-моноолеоил-рац-глицерин), дилаурин, каприловую кислоту, арахидоновую кислоту, глицерин 1-монокапрат, 1-додецилазациклогептан-2-он, ацилкарнитины, ацилхолины, их C1_20 алкиловые сложные эфиры (например, метиловый, изопропиловый и t-бутиловый) и их моно- и диглицериды (т.е. олеат, лаурат, капрат, миистат, пальмитат, стеарат, линолеат и т.д.) (см., например, Touitou, E., et al. Enhancement in Drug Delivery, CRC Press, Danvers, MA, 2006; Lee et al., Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems, 1991, p.92; Muranishi, Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems, 1990, 7, 133; El Hariri et al., J. Pharm. Pharmacol., 1992, 44, 651-654).
- 78 044245
Физиологическая роль желчи включает содействие в распределении и абсорбции липидов и жирорастворимых витаминов (см., например, Malmsten, M. Surfactants and polymers in drug delivery, Informa Health Care, New York, NY, 2002; Brunton, Chapter 38 in: Goodman & Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics, 9th Ed., Hardman et al. Eds., McGraw-Hill, New York, 1996, pp. 934-935). Разные природные соли желчных кислот и их синтетические производные действуют как вещества, способствующие проникновению. Таким образом, выражение соли желчных кислот включают любые встречающиеся в природе компоненты желчи, а также любое из их синтетических производных. Подходящие соли желчных кислот включают, например, холевую кислоту (или ее фармацевтически приемлемую натриевую соль, холат натрия), дегидрохолевую кислоту (дегидрохолат натрия), дезоксихолевую кислоту (дезоксихолат натрия), глюхолевую кислоту (глюхолат натрия), глихолевую кислоту (глихолат натрия), гликодезоксихолевую кислоту (гликодезоксихолат натрия), таурохолевую кислоту (таурохолат натрия), тауродезоксихолевую кислоту (тауродезоксихолат натрия), хенодезоксихолевую кислоту (хенодезоксихолат натрия), урсодезоксихолевую кислоту (UDCA), тауро-24,25-дигидро-фузидат (STDHF) натрия, гликодигидрофузидат натрия и полиоксиэтилен-9-лауриловый эфир (РОЕ) (см., например, Malmsten, M. Surfactants and polymers in drug delivery, Informa Health Care, New York, NY, 2002; Lee et al., Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems, 1991, page 92; Swinyard, Chapter 39 In: Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th Ed., Gennaro, ed., Mack Publishing Co., Easton, Pa., 1990, pages 782-783; Muranishi, Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems, 1990, 7, 1-33; Yamamoto et al., J. Pharm. Exp. Ther., 1992, 263, 25; Yamashita et al., J. Pharm. Sci., 1990, 79, 579-583).
Хелатирующие средства, используемые применительно к настоящему изобретению, можно определить как соединения, которые удаляют ионы металла из раствора путем образования комплексов с ними, в результате чего абсорбция иРНК через слизистую повышается. В отношении их применения в качестве веществ, способствующих проникновению, в настоящем изобретении хелатирующие средства обладают дополнительным преимуществом, также выступая в качестве ингибиторов ДНКазы, поскольку большинство охарактеризованных ДНК-нуклеаз требуют двухвалентный ион металла для катализа и, таким образом, ингибируются хелатирующими средствами (Jarrett, J. Chromatogr., 1993, 618, 315-339). Подходящие хелатирующие средства включают, без ограничения, двунатриевый этилендиаминтетраацетат (EDTA), лимонную кислоту, салицилаты (например, салицилат натрия, 5-метоксисалицилат и гомовалинат), Nацилпроизводные коллагена, лаурет-9 и N-аминоацилпроизводные бета-дикетонов (енамины) (см., например, Katdare, A. et al., Excipient development for pharmaceutical, biotechnology, and drug delivery, CRC Press, Danvers, MA, 2006; Lee et al., Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems, 1991, page 92; Muranishi, Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems, 1990, 7, 1-33; Buur et al., J. Control Rel., 1990, 14, 43-51).
Применяемые в данном документе нехелатирующие неповерхностно-активные соединения, способствующие проникновению, могут быть определены как соединения, которые проявляют небольшую активность в качестве хелатирующих средств или в качестве поверхностно-активных веществ, но которые тем не менее повышают абсорбцию иРНК через слизистую пищеварительного тракта (см., например, Muranishi, Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems, 1990, 7, 1-33). Этот класс веществ, способствующих проникновению, включает, например, ненасыщенные цикломочевины, производные 1-алкили 1-алкенилазацикло-алканона (Lee et al., Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems, 1991, page 92) и нестероидные противовоспалительные средства, такие как диклофенак натрия, индометацин и фенилбутазон (Yamashita et al., J. Pharm. Pharmacol., 1987, 39, 621-626).
Средства, которые усиливают поглощение иРНК на клеточном уровне, также можно добавлять к фармацевтическим и другим композициям по настоящему изобретению. Например, катионные липиды, такие как липофектин (Junichi et al, патент США № 5705188), катионные производные глицерина и поликатионные молекулы, такие как полилизин (Lollo et al., заявка РСТ WO 97/30731), так же, как известно, усиливают клеточное поглощение dsRNA. Примеры коммерчески доступных реагентов для трансфекции включают среди прочего, например, Lipofectamine™ (Invitrogen; Карлсбад, Калифорния), Lipofectamine 2000™ (Invitrogen; Карлсбад, Калифорния), 293fectin™ (Invitrogen; Карлсбад, Калифорния), Cellfectin™ (Invitrogen; Карлсбад, Калифорния), DMRIE-C™ (Invitrogen; Карлсбад, Калифорния), Freestyle™ MAX (Invitrogen; Карлсбад, Калифорния), Lipofectamine™ 2000 CD (Invitrogen; Карлсбад, Калифорния), Lipofectamine™ (Invitrogen; Карлсбад, Калифорния), RNAiMAX (Invitrogen; Карлсбад, Калифорния), Oligofectamine™ (Invitrogen; Карлсбад, Калифорния), Optifect™ (Invitrogen; Карлсбад, Калифорния), реагент для трансфекции X-tremeGENE Q2 (Roche; Грензахерштрассе, Швейцария), реагент для липосомной трансфекции DOTAP (Грензахерштрассе, Швейцария), реагент для липосомной трансфекции DOSPER (Грензахерштрассе, Швейцария) или Fugene (Грензахерштрассе, Швейцария), реагент Transfectam® (Promega; Мэдисон, Висконсин), реагент для трансфекции TransFast™ (Promega; Мэдисон, Висконсин), реагент Tfx™-20 (Promega; Мэдисон, Висконсин), реагент Tfx™-50 (Promega; Мэдисон, Висконсин), DreamFect™ (OZ Biosciences; Марсель, Франция), EcoTransfect (OZ Biosciences; Марсель, Франция), реагент для трансфекции TransPassa D1 (New England Biolabs; Ипсвич, Массачусетс, США), LyoVec™/LipoGen™ (Invitrogen; Сан-Диего, Калифорния, USA), реагент для трансфекции PerFectin (Genlan
- 79 044245 tis; Сан-Диего, Калифорния, США), реагент для трансфекции NeuroPORTER (Genlantis; Сан-Диего, Калифорния, США), реагент для трансфекции GenePORTER (Genlantis; Сан-Диего, Калифорния, США), реагент для трансфекции GenePORTER 2 (Genlantis; Сан-Диего, Калифорния, США), реагент для трансфекции Cytofectin (Genlantis; Сан-Диего, Калифорния, США), реагент для трансфекции BaculoPORTER (Genlantis; Сан-Диего, Калифорния, США), реагент для трансфекции TroganPORTER™ (Genlantis; СанДиего, Калифорния, США), RiboFect (Bioline; Тонтон, Массачусетс, США), PlasFect (Bioline; Тонтон, Массачусетс, США), UniFECTOR (B-Bridge International; Маунтин-Вью, Калифорния, США), SureFECTOR (B-Bridge International; Маунтин-Вью, Калифорния, США) или HiFect™ (B-Bridge International, Маунтин-Вью, Калифорния, США).
Для усиления проникновения введенных нуклеиновых кислот можно использовать другие средства, в том числе гликоли, такие как этиленгликоль и пропиленгликоль, пирролы, такие как 2-пиррол, азоны и терпены, такие как лимонен и ментон.
v. Носители.
Определенные композиции по настоящему изобретению также содержат в составе соединенияносители. Применяемые в данном документе выражения соединение-носитель или носитель могут означать нуклеиновую кислоту или ее аналог, которые являются инертными (т.е. не обладают биологической активностью per se), но распознаются в качестве нуклеиновой кислоты in vivo процессами, которые снижают биодоступность нуклеиновой кислоты с биологической активностью, например, путем разрушения биологически активной нуклеиновой кислоты или путем содействия ее удалению из кровотока. Совместное введение нуклеиновой кислоты и соединения-носителя, обычно с избытком последнего вещества, может привести к существенному сокращению количества нуклеиновой кислоты, перерабатываемой печенью, почками или другими внесосудистыми депо, предположительно вследствие конкуренции между соединением-носителем и нуклеиновой кислотой за общий рецептор. Например, переработка частично фосфотиоатной dsRNA печеночной тканью может быть снижена при ее совместном введении с полиинозиновой кислотой, сульфатом декстрана, полицитидиновой кислотой или 4-ацетамидо-4' изотиоциано-стильбен-2,2'-дисульфокислотой (Miyao et al., DsRNA Res. Dev., 1995, 5, 115-121; Takakura et al., DsRNA & Nucl. Acid Drug Dev., 1996, 6, 177-183.
vi. Наполнители.
В отличие от соединения-носителя фармацевтический носитель или наполнитель представляет собой фармацевтически приемлемый растворитель, суспендирующее средство или любую другую фармакологически инертную среду для доставки одной или нескольких нуклеиновых кислот в организм животного. Наполнитель может быть жидким или твердым веществом и его выбирают с учетом предполагаемого способа введения с тем, чтобы обеспечить необходимый объем, консистенцию и т.д., при объединении с нуклеиновой кислотой и другими компонентами данной фармацевтической композиции. Типичные фармацевтические носители включают без ограничения связывающие средства (например, прежелатинизированный маисовый крахмал, поливинилпирролидон или гидроксипропилметилцеллюлозу и т.д.); наполнители (например, лактозу и другие сахара, микрокристаллическую целлюлозу, пектин, желатин, сульфат кальция, этилцеллюлозу, полиакрилаты или вторичный кислый фосфат кальция и т.д.); смазывающие вещества (например, стеарат магния, тальк, кремнезем, коллоидный диоксид кремния, стеариновую кислоту, стеараты металла, гидрогенизированные растительные масла, кукурузный крахмал, полиэтиленгликоли, бензоат натрия, ацетат натрия и т.д.); разрыхлители (например, крахмал, натрия крахмалгликолат и т.д.); и смачивающие средства (например, лаурилсульфат натрия и т.д.).
Фармацевтически приемлемые органические или неорганические наполнители, подходящие для введения, отличного от парентерального, которые не реагируют неблагоприятным образом с нуклеиновыми кислотами, также можно применять для составления композиций по настоящему изобретению. Подходящие фармацевтически приемлемые носители включают, без ограничения, воду, солевые растворы, спирты, полиэтиленгликоли, желатин, лактозу, амилозу, стеарат магния, тальк, кремниевую кислоту, вязкий парафин, гидроксиметилцеллюлозу, поливинилпирролидон и т.п.
Составы для местного применения нуклеиновых кислот могут включать стерильные и нестерильные водные растворы, неводные растворы в обычных растворителях, таких как спирты, или растворы нуклеиновых кислот в жидких или твердых масляных основах. Растворы также могут содержать буферы, разбавители и другие подходящие добавки. Можно использовать фармацевтически приемлемые органические или неорганические наполнители, подходящие для введения, отличного от парентерального, которые не взаимодействуют неблагоприятным образом с нуклеиновыми кислотами.
Подходящие фармацевтически приемлемые наполнители включают, без ограничения, воду, солевые растворы, спирт, полиэтиленгликоли, желатин, лактозу, амилозу, стеарат магния, тальк, кремниевую кислоту, вязкий парафин, гидроксиметилцеллюлозу, поливинилпирролидон и т.п.
vii. Другие компоненты.
Композиции по настоящему изобретению могут дополнительно содержать другие вспомогательные компоненты, традиционно встречающиеся в фармацевтических композициях, при уровнях применения, установленных в данной области. Таким образом, например, композиции могут содержать дополнитель
- 80 044245 ные совместимые фармацевтически активные материалы, такие как, например, противозудные средства, вяжущие средства, местные анестетики или противовоспалительные средства, или могут содержать дополнительные материалы, пригодные для физического составления композиций по настоящему изобретению в различных лекарственных формах, такие как красители, ароматизирующие вещества, консерванты, антиоксиданты, замутнители, загустители и стабилизаторы. Однако, такие материалы при добавлении не должны чрезмерно вступать в конфликт с биологическими активностями компонентов композиций по настоящему изобретению. Составы могут быть стерильными и, при необходимости, их можно смешивать со вспомогательными средствами, например, смазывающими веществами, консервантами, стабилизаторами, смачивающими средствами, эмульгаторами, солями для оказания влияния на осмотическое давление, буферами, красящими веществами, ароматизаторами и/или душистыми веществами и т.п., которые не взаимодействуют неблагоприятным образом с нуклеиновой (нуклеиновыми) кислотой (кислотами) состава.
Водные суспензии могут содержать вещества, которые повышают вязкость суспензии, в том числе, например, карбоксиметилцеллюлозу натрия, сорбит и/или декстран. Суспензия также может содержать стабилизаторы.
В некоторых вариантах осуществления, фармацевтические композиции, описанные в настоящем изобретении, включают (а) одно или несколько соединений, представляющих собой иРНК, и (b) одно или несколько средств, которые действуют по механизму, отличному от RNAi, и которые пригодны в лечении гемолитического нарушения. Примеры таких средств включают, без ограничения, противовоспалительное средство, средства против стеатоза, противовирусное средство и/или средство против фиброза. Кроме того, другие вещества, обычно используемые для защиты печени, такие как силимарин, также можно использовать в сочетании с иРНК, описанными в данном документе. Другие средства, пригодные для лечения заболеваний печени, включают телбивудин, энтекавир и ингибиторы протеазы, такие как телапревир и другие, раскрытые, например, в публикациях заявок на патент США №№ 2005/0148548, 2004/0167116 и 2003/0144217, Tung et al., и в публикации заявки на патент США № 2004/0127488, Hale et al.
Токсичность и терапевтическая эффективность таких соединений могут быть определены стандартными фармацевтическими процедурами на клеточных культурах или экспериментальных животных, например, для определения LD50 (дозы, летальной для 50% популяции) и ED50 (дозы, терапевтически эффективной для 50% популяции). Соотношение доз между токсичным и терапевтическим действием является терапевтическим индексом, и его можно выражать как соотношение LD50/ED50. Предпочтительными являются соединения, которые характеризуются высоким терапевтическим индексом.
Данные, полученные при анализах клеточных культур и исследованиях на животных, можно использовать при составлении ряда доз для применения у людей. В настоящем изобретении доза композиций, описанных в данном документе, как правило, находится в диапазоне циркулирующих концентраций, который включают ED50 с малой токсичностью или без таковой. Доза может варьироваться в этом диапазоне в зависимости от применяемой лекарственной формы и используемого пути введения. Для любого соединения, применяемого в способах, описанных в настоящем изобретении, терапевтически эффективную дозу можно первоначально установить по результатам анализов клеточных культур. Доза может быть составлена для животных моделей для получения диапазона концентрации циркулирующего в плазме соединения или, при необходимости, полипептидного продукта целевой последовательности (например, достижения уменьшенной концентрации полипептида), что включает IC50 (т.е. концентрацию исследуемого соединения, при помощи которой достигают полумаксимальное ингибирование симптомов), как устанавливают в клеточной культуре. Такую информацию можно использовать для более точного определения пригодной дозы у людей. Уровни в плазме можно измерять, например, при помощи высокоэффективной жидкостной хроматографии.
В дополнении к их введению, рассматриваемому выше, иРНК, описанные в настоящем изобретении, можно вводить в комбинации с другими известными средствами, эффективными в лечении патологических процессов, опосредованных экспрессией С5. В любом случае, курирующий врач может корректировать количество и временные рамки введения иРНК, исходя из результатов, наблюдаемых при использовании стандартных средств измерения эффективности, известных в данной области или описанных в данном документе.
VI. Способы ингибирования экспрессии С5.
Настоящее изобретение предусматривает способы ингибирования экспрессии С5 в клетке. Способы включают приведение клетки в контакт со средством RNAi, например, двухцепочечным средством RNAi, в количестве, эффективном для ингибирования экспрессии С5 в клетке, ингибируя, таким образом, экспрессию С5 в клетке.
Приведение клетки в контакт с двухцепочечным средством RNAi можно выполнять in vitro или in vivo. Приведение клетки в контакт со средством RNAi in vivo включает приведение клетки или группы клеток субъекта, например, субъекта-человека, в контакт со средством RNAi. Также возможны комбинации in vitro и in vivo способов приведения в контакт. Приведение в контакт может быть непосредственным или опосредованным, как рассматривалось выше. Более того, приведение в контакт клетки можно
- 81 044245 выполнять посредством нацеливающего лиганда, в том числе любого лиганда, описанного в данном документе или известного в данной области. В предпочтительных вариантах осуществления нацеливающий лиганд представляет собой углеводный фрагмент, например лиганд, представляющий собой
GalNAc3, или любой другой лиганд, который направляет средство RNAi к месту, представляющему интерес, например, печени субъекта.
Выражение ингибирование, применяемое в данном документе, используют взаимозаменяемо с сокращением, сайленсингом, понижающей регуляцией и другими подобными выражениями, и оно включает любой уровень ингибирования.
Подразумевают, что фраза ингибирование экспрессии С5 означает ингибирование экспрессии любого гена С5 (такого как, например, ген С5 мыши, ген С5 крысы, ген С5 обезьяны или ген С5 человека), а также вариантов или мутантов гена С5. Таким образом, ген С5 может быть геном С5 дикого типа, мутантным геном С5 или трансгенным геном С5 в контексте клеток, группы клеток или организма, подвергнутых генетической манипуляции.
Ингибирование экспрессии гена С5 включает любой уровень ингибирования гена С5, например, по меньшей мере частичную супрессию экспрессии гена С5. Экспрессия гена С5 может быть оценена на основании уровня или изменения уровня любой переменной, связанной с экспрессией гена С5, например, уровня мРНК С5, уровня белка С5 или, например, СН50 активности, как меры общей гемолитической активности комплемента, АН50 для измерения гемолитической активности альтернативного пути комплемента и/или уровня лактатдегидрогеназы (LDH), как меры внутрисосудистого гемолиза и/или уровня гемоглобина. Уровни С5а-, С5Ь- и растворимого С5b-9-комплекса также можно измерять для оценки экспрессии С5. Данный уровень можно оценивать в отдельной клетке или в группе клеток, в том числе, например, образце, полученном от субъекта.
Ингибирование можно оценивать по снижению абсолютного или относительного уровня одной или нескольких переменных, которые связаны с экспрессией С5, по сравнению с контрольным уровнем. Контрольным уровнем может быть любой тип контрольного уровня, который используют в области техники, например, исходный уровень до введения препарата или уровень, определенный у подобного субъекта, клетки или образца, которые не обработаны или обработаны контролем (таким как, например, контроль только с буфером или контроль с неактивным средством).
В некоторых вариантах осуществления способов по настоящему изобретению экспрессия гена С5 ингибируется по меньшей мере приблизительно на 5%, по меньшей мере приблизительно на 10%, по меньшей мере приблизительно на 15%, по меньшей мере приблизительно на 20%, по меньшей мере приблизительно на 25%, по меньшей мере приблизительно на 30%, по меньшей мере приблизительно на 35%, по меньшей мере приблизительно на 40%, по меньшей мере приблизительно на 45%, по меньшей мере приблизительно на 50%, по меньшей мере приблизительно на 55%, по меньшей мере приблизительно на 60%, по меньшей мере приблизительно на 65%, по меньшей мере приблизительно на 70%, по меньшей мере приблизительно на 75%, по меньшей мере приблизительно на 80%, по меньшей мере приблизительно на 85%, по меньшей мере приблизительно на 90%, по меньшей мере приблизительно на 91%, по меньшей мере приблизительно на 92%, по меньшей мере приблизительно на 93%, по меньшей мере приблизительно на 94%, по меньшей мере приблизительно на 95%, по меньшей мере приблизительно на 96%, по меньшей мере приблизительно на 97%, по меньшей мере приблизительно на 98% или по меньшей мере приблизительно на 99%.
Доказательством ингибирования экспрессии гена С5 может служить снижение количества мРНК, экспрессируемой первой клеткой или первой группой клеток (такие клетки могут присутствовать, например, в образце, полученном от субъекта), в которых транскрибируется ген С5 и которую или которые обрабатывали (например, посредством приведения клетки или клеток в контакт со средством RNAi по настоящему изобретению или посредством введения средства RNAi по настоящему изобретению субъекту, в организме которого клетки находятся или находились), так что экспрессия гена С5 ингибируется по сравнению со второй клеткой или второй группой клеток, по сути, идентичных первой клетке или группе клеток, но которую или которые не обрабатывали (контрольная(ые) клетка(и)). В предпочтительных вариантах осуществления ингибирование оценивают посредством выражения уровня мРНК в обработанных клетках как процент от уровня мРНК в контрольных клетках с помощью следующей формулы:
(уровень мРНК в контрольных точках) - (уровень мРНК в обработанных клетках) (уровень мРНК в контрольных точках)
В альтернативном случае, ингибирование экспрессии гена С5 можно оценивать по снижению показателя, который функционально связан с экспрессией гена С5, например, экспрессией белка С5, экспрессией гена или белка гепсидина, или уровенем железа в тканях или сыворотке. Сайленсинг гена С5 можно выявить в любой клетке, экспрессирующей С5, либо конститутивно, либо при помощи генной инженерии, и с помощью любого анализа, известного в данной области. Печень является основным местом экспрессии С5. Другие важные места экспрессии включают почки и матку.
Доказательством ингибирования экспрессии белка С5 может служить снижение уровня белка С5, который экспрессируется клеткой или группой клеток (например, уровня белка, экспрессируемого в об- 82 044245 разце, полученном от субъекта). Как объяснялось выше в отношении оценки супрессии мРНК, ингибирование уровней экспрессии белка в обработанной клетке или группе обработанных клеток можно аналогично выражать как процент от уровня белка в контрольной клетке или группе контрольных клеток.
Контрольная клетка или группа контрольных клеток, которые можно применять для оценки ингибирования экспрессии гена С5, включают клетку или группу клеток, которые еще не были в контакте со средством RNAi по настоящему изобретению. Например, контрольная клетка или группа контрольных клеток могут быть получены от отдельного субъекта (например, субъекта-человека или субъектаживотного) перед лечением субъекта средством RNAi.
Уровень мРНК С5, которая экспрессируется клеткой или группой клеток, можно определять при помощи любого способа, известного в данной области, для оценки экспрессии мРНК. В одном варианте осуществления уровень экспрессии С5 в образце определяют путем выявления транскрибируемого полинуклеотида или его части, например, мРНК гена С5. РНК можно извлекать из клеток при помощи методик извлечения РНК, включая, например, извлечение с помощью кислого фенола/гуанидинизотиоцианата (RNAzol В; Biogenesis), наборы для получения РНК RNeasy (Qiagen) или PAXgene (PreAnalytix, Швейцария). Типичные форматы анализов, в которых используется гибридизация рибонуклеиновых кислот, включают ядерные run-on анализы, RT-PCR, анализы защиты от РНКаз (Melton et al., Nuc. Acids Res. 12:7035), нозерн-блоттинг, гибридизацию in situ и микроматричные анализы.
В одном варианте осуществления уровень экспрессии С5 определяют при помощи зонда для нуклеиновой кислоты. Выражение зонд, применяемое в данном документе, означает любую молекулу, которая способна селективно связываться со специфическим С5. Зонды могут быть синтезированы специалистом в данной области техники или получены из соответствующих биологических препаратов. Могут быть особым образом сконструированы зонды, содержащие метку. Примеры молекул, которые можно использовать в качестве зондов, включают, без ограничения, РНК, ДНК, белки, антитела и органические молекулы.
Выделенные мРНК можно использовать при анализах на основе гибридизации или амплификации, которые включают, без ограничения, анализы, представляющие собой саузерн- или нозерн-блоттинг, анализы, представляющие собой полимеразную цепную реакцию (PCR), и матрицы с зондами. Один способ определения уровней мРНК включает приведение выделенной мРНК в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты (зондом), которая может гибридизоваться с мРНК С5. В одном варианте осуществления мРНК иммобилизуют на твердой поверхности и приводят в контакт с зондом, например, путем пропускания выделенной мРНК через агарозный гель и переноса мРНК из геля на мембрану, такую как нитроцеллюлоза. В альтернативном варианте осуществления зонд(ы) иммобилизуют на твердой поверхности и мРНК приводят в контакт с зондом(ами), например, на генном микрочипе Affymetrix. Специалист в данной области может легко адаптировать известные способы обнаружения мРНК для применения в определении уровней мРНК С5.
Альтернативный способ определения уровня экспрессии С5 в образце включает способ амплификации нуклеиновой кислоты и/или обратной транскрипции (с получением кДНК), например, мРНК в образце, например, при помощи RT-PCR (экспериментальный вариант осуществления изложен в Mullis, 1987, патенте США № 4683202), лигазной цепной реакции (Barany (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:189-193), самоподдерживающейся репликации последовательностей (Guatelli et al. (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:1874-1878), транскрипционно-опосредованной амплификационной системы (Kwoh et al. (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86:1173-1177), Q-бета репликазы (Lizardi et al. (1988) Bio/Technology 6:1197), репликации по типу катящегося кольца (Lizardi et al., патент США № 5854033), или любой другой способ амплификации нуклеиновой кислоты, за которым следует обнаружение амплифицированных молекул при помощи методик, хорошо известных специалисту в данной области. Такие схемы обнаружения особенно пригодны для обнаружения молекул нуклеиновой кислоты, если такие молекулы присутствуют в очень малых количествах. В конкретных аспектах по настоящему изобретению уровни экспрессии С5 определяют при помощи флуорогенной RT-PCR (т.е. системы TaqMan™ System).
Уровни экспрессии мРНК С5 можно контролировать при помощи мембранного блота (как, например, используемого при анализе гибридизации, такого как нозерн, саузерн, дот и т.п.) или микролунок, опытных пробирок, гелей, гранул или волокон (или любой твердой подложки, содержащей связанную нуклеиновую кислоту). См. патенты США №№ 5770722, 5874219, 5744305, 5677195 и 5445934, которые включены в данный документ при помощи ссылки. Определение уровня экспрессии С5 также может включать применение зондов для нуклеиновой кислоты в растворе.
В предпочтительных вариантах осуществления уровень экспрессии мРНК оценивают с применением анализов с разветвленной ДНК (bDNA) или PCR в режиме реального времени (qPCR). Применение таких способов описано и проиллюстрировано в разделе Примеры, представленном в данном документе.
Уровень экспрессии белка С5 можно определить, применяя любой способ, известный в данной области для измерения уровней белка. Такие способы включают, например, электрофорез, капиллярный электрофорез, высокоэффективную жидкостную хроматографию (HPLC), тонкослойную хроматографию (TLC), гипердиффузионную хроматографию, реакции преципитации в жидкости или геле, абсорбцион- 83 044245 ную спектроскопию, колориметрические анализы, спектрофотометрические анализы, проточную цитометрию, иммунодиффузию (одиночную или двойную), иммуноэлектрофорез, вестерн-блоттинг, радиоиммунологический анализ (RIA), твердофазные иммуноферментные анализы (ELISA), иммунофлюоресцентные анализы, электрохемилюминисцентные анализы и т.п.
Выражение образец, применяемое в данном документе, означает отбор похожих жидкостей, клеток или тканей, выделенных из организма субъекта, а также жидкостей, клеток или тканей, присутствующих в организме субъекта. Примеры биологических жидкостей включают кровь, сыворотку и серозные жидкости, плазму, лимфу, мочу, спинномозговую жидкость, слюну, внутриглазные жидкости и т.п. Образцы тканей могут включать образцы из тканей, органов или локальных участков. Например, образцы можно получить из конкретных органов, частей органов или жидкостей или клеток в этих органах. В определенных вариантах осуществления образцы можно получить из печени (например, всей печени, или определенных сегментов печени, или определенных типов клеток в печени, таких как, например, гепатоциты). В предпочтительных вариантах осуществления образец, полученный от субъекта означает кровь или плазму, полученные от субъекта. В дополнительных вариантах осуществления образец, полученный от субъекта означает ткань печени, полученную от субъекта.
В некоторых вариантах осуществления способов по настоящему изобретению средство RNAi вводят субъекту так, что средство RNAi доставляется к конкретному месту в организме субъекта. Ингибирование экспрессии С5 можно оценивать при помощи измерений уровня или изменения уровня мРНК С5 или белка С5 в образце, полученном из жидкости или ткани из конкретного места в организме субъекта. В предпочтительных вариантах осуществления местом является печень. Местом также может быть подсекция или подгруппа клеток из любого из указанных выше мест. Место также может включать клетки, которые экспрессируют конкретный тип рецептора.
Фраза приведение клетки в контакт со средством RNAi, таким как dsRNA, применяемая в данном документе, включает приведение клетки в контакт любым возможным способом. Приведение клетки в контакт со средством RNAi включает приведение клетки в контакт с иРНК in vitro или приведение клетки в контакт с иРНК in vivo. Приведение в контакт можно осуществлять непосредственно или опосредованно. Таким образом, например, средство RNAi можно приводить в физический контакт с клеткой путем отдельного осуществления способа или, в качестве альтернативы, средство RNAi можно поместить в обстановку, которая позволит средству прийти в контакт с клеткой или послужит причиной этому.
Приведение клетки в контакт in vitro можно выполнять, например, путем инкубирования клетки со средством RNAi. Приведение клетки в контакт in vivo можно выполнять, например, путем введения инъекцией средства RNAi в ткань, в которой находится клетка, или рядом с ней или путем введения инъекцией средства RNAi в другую область, например, кровоток или подкожное пространство так, что средство будет впоследствии достигать ткани, в которой находится клетка, которую необходимо привести в контакт со средством. Например, средство RNAi может содержать лиганд и/или может быть связано с ним, например, GalNAc3, который направляет средство RNAi к месту, представляющему интерес, например, к печени. Также возможны комбинации in vitro и in vivo способов приведения в контакт. Например, клетку также можно приводить в контакт со средством RNAi in vitro и в дальнейшем пересаживать субъекту.
В одном варианте осуществления приведение клетки в контакт с иРНК включает введение или доставку иРНК в клетку, облегчая или осуществляя поглощение или абсорбцию в клетку. Абсорбция или поглощение иРНК может происходить путем произвольных диффузных или активных клеточных процессов, или с помощью вспомогательных средств или устройств. Введение иРНК в клетку может быть in vitro и/или in vivo. Например, для введения in vivo иРНК может быть введена парентерально в участок ткани или введена системно. Доставку in vivo можно осуществить с помощью системы доставки бета-глюкан, таких как описаны в патентах США №№ 5032401 и 5607677, а также публикации № US 2005/0281781, полное содержание которых включено в данный документ посредством ссылки. Введение в клетку in vitro включает способы, известные в данной области техники, такие как электропорация и липофекция. Дальнейшие подходы описаны в данном документе ниже и/или как известны в данной области техники.
VII. Способы лечения или предотвращения заболевания, связанного с компонентом комплемента С5.
Настоящее изобретение обеспечивает также терапевтические и профилактические способы, включаюшие введение субъекту, страдающиему заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, например, PNH или aHUS, средства, представляющего собой иРНК, фармацевтической композиции, содержащей средство, представляющее собой иРНК, или вектора, содержащего иРНК, по настоящему изобретению. В некоторых аспектах настоящего изобретения способы дополнительно включают введение субъекту дополнительного терапевтического средства, такого как антитело к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающего фрагмента (например, экулизумаба).
В одном аспекте настоящее изобретение относится к способам лечения субъекта, страдающего нарушением, при котором снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, например, заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, например, PNH или aHUS. Способы лечения (и при- 84 044245 менения) по настоящему изобретению включают введение субъекту, например, человеку, терапевтически эффективного количества средства, представляющего собой иРНК, нацеленного на ген С5, или фармацевтической композиции, содержащей средство, представляющее собой иРНК, нацеленной на ген С5, тем самым осуществляя лечение субъекта, страдающего заболеванием, при котором снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способам лечения субъекта, страдающего нарушением, при котором снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, например, заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, например, PNH или aHUS, которые включают введение субъекту, например, человеку, терапевтически эффективного количества средства, представляющего собой иРНК, нацеленного на ген С5, или фармацевтической композиции, содержащей средство, представляющее собой иРНК, нацеленное на ген С5, и дополнительного терапевтического средства, такого как антитело к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающего фрагмента (например, экулизумаба), тем самым осуществляя лечение субъекта, страдающего заболеванием, при котором снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к способам предотвращения по меньшей мере одного симптома у субъекта, страдающего нарушением, при котором снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, например, заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, например, PNH или aHUS. Способы включают введение субъекту профилактически эффективного количества средства, представляющего собой иРНК, например, dsRNA, или вектора по настоящему изобретению, предотвращая тем самым по меньшей мере один симптом у субъекта, страдающего заболеванием, при котором снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие. Например, настоящее изобретение предлагает способы предотвращения гемолиза субъекта, страдающего нарушением, при котором снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, например, заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, например, PNH или aHUS.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способам предотвращения по меньшей мере одного симптома у субъекта, страдающего нарушением, при котором снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, например, заболевания, связанного с компонентом комплемента С5, например, PNH или aHUS. Способы включают введение субъекту профилактически эффективного количества средства, представляющего собой иРНК, например, dsRNA, или вектора по настоящему изобретению, и дополнительного терапевтического средства, такого как антитело к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающего фрагмента (например, экулизумаба), предотвращая тем самым по меньшей мере один симптом у субъекта, страдающего заболеванием, при котором снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие.
Терапевтически эффективное количество, применяемое в данном документе, подразумевают как включающее количество средства RNAi или антитела к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающего фрагмента (например, экулизумаба), которого при введении субъекту, страдающему заболеванием, связанным с С5, достаточно для эффективного лечения заболевания (например, путем уменьшения, ослабления или поддержания существующего заболевания или одного или нескольких симптомов заболевания).
Терапевтически эффективное количество может варьировать в зависимости от средства RNAi, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, пути введения средства, заболевания и его тяжести и анамнеза, возраста, веса, семейного анамнеза, генетического строения, типов предшествующего или сопутствующего лечения, при наличии такового, и других индивидуальных особенностей субъекта, который подлежит лечению.
Профилактически эффективное количество, применяемое в данном документе, подразумевают как включающее количество средства RNAi или антитела к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающего фрагмента (например, экулизумаба), которого при введении субъекту, страдающему заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, но еще (или в настоящее время) не испытавшему или не демонстрирующему симптомы заболевания, и/или который представляет собой объект риска развития заболевания, связанного с компонентом комплемента С5, например, субъекту, страдающему реакцией отторжения трансплантата и/или после пересадки, например, сенсибилизированное или аллогенное отторжение, субъекту с сепсисом и/или субъекту с инфарктом миокарда, достаточно для предупреждения или ослабления заболевания или одного или нескольких симптомов заболевания. Ослабление заболевания включает замедление течения болезни или снижение тяжести заболевания, которое разовьется позже. Профилактически эффективное количество может варьировать в зависимости от средства, представляющего собой иРНК, или антитела к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающего фрагмента, пути введения средства, антитела к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающего фрагмента, степени риска развития заболевания и анамнеза заболевания, возраста, веса, семейного анамнеза, генетического строения, типов предшествующего или сопутствующего лечения, при наличии такового, и других индивидуальных особенностей пациента, который подлежит лечению.
Терапевтически эффективное количество или профилактически эффективное количество также включает количество средства RNAi или антитела к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязы- 85 044245 вающего фрагмента (например, экулизумаба), которое вызывает некоторый желательный локальный или системный эффект при приемлемом соотношении польза/риск, принятом по отношению к любому лечению. Средства, представляющие собой иРНК, применяемые в способах по настоящему изобретению можно вводить в количестве, достаточном для получения приемлемого соотношения польза/риск, принятого по отношению к такому лечению.
В другом аспекте настоящее изобретение обеспечивает применение терапевтически эффективного количества средства, представляющего собой иРНК, по настоящему изобретению при лечении субъекта, например, субъекта, у которого снижение и/или ингибирование экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие.
В другом аспекте настоящее изобретение обеспечивает применение терапевтически эффективного количества средства, представляющего собой иРНК, по настоящему изобретению и дополнительного терапевтического средства, например, антитела к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающего фрагмента (например, экулизумаба) при лечении субъекта, например, субъекта, у которого снижение и/или ингибирование экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие.
В еще одном аспекте настоящее изобретение относится к применению средства, представляющего собой иРНК, например, dsRNA, по настоящему изобретению, нацеленного на ген С5, или фармацевтической композиции, содержащей средство, представляющее собой иРНК, нацеленное на ген С5, при производстве лекарственного средства для лечении субъекта, например, субъекта, у которого снижение и/или ингибирование экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, такого как субъект, страдающий заболеванием, при котором снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, например, заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, например, PNH или aHUS.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к применению средства, представляющего собой иРНК, например, dsRNA, по настоящему изобретению, нацеленного на ген С5, или фармацевтической композиции, содержащей средство, представляющее собой иРНК, нацеленное на ген С5, при производстве лекарственного средства для применения в комбинации с дополнительным терапевтическим средством, таким как антитело к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающий фрагмент (например, экулизумаб), для лечения субъекта, например, субъекта, у которого снижение и/или ингибирование экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, например, с заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, например, PNH или aHUS.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к применению иРНК, например, dsRNA по настоящему изобретению для предотвращения по меньшей мере одного симптома у субъекта, страдающего нарушением, при котором снижение и/или ингибирование экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, например, заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, например, PNH или aHUS.
В еще одном аспекте настоящее изобретение относится к применению средства, представляющего собой иРНК, например, dsRNA по настоящему изобретению и дополнительного терапевтического средства, такого как антитело к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающий фрагмент (например, экулизумаб), для предотвращения по меньшей мере одного симптома у субъекта, страдающего нарушением, при котором снижение и/или ингибирование экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, например, заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, например, PNH или aHUS.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к применению средства, представляющего собой иРНК, по настоящему изобретению при производстве лекарственного средства для предотвращения по меньшей мере одного симптома у субъекта, страдающего нарушением, при котором снижение и/или ингибирование экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, например, заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, например, PNH или aHUS.
В еще одном аспекте настоящее изобретение относится к применению средства, представляющего собой иРНК, по настоящему изобретению в производстве лекарственного средства для применения в комбинации с дополнительным терапевтическим средством, таким как антитело к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающий фрагмент (например, экулизумаб), для предотвращения по меньшей мере одного симптома у субъекта, страдающего нарушением, при котором снижение и/или ингибирование экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, например, заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, например, PNH или aHUS.
В одном варианте осуществления средство, представляющее собой иРНК, нацеленное на С5, вводят субъекту, страдающему заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, таким образом, что уровни С5, например, в клетке, ткани, крови, моче или другой ткани или жидкости субъекта снижаются на по меньшей мере приблизительно 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%,
41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 53%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%,
60%, 61%, 62%, 62%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%,
79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%,
98% или по меньшей мере приблизительно 99% или более, и затем вводят субъекту дополнительное терапевтическое средство (как описано ниже).
Дополнительное терапевтическое средство может быть антителом к компоненту комплемента С5,
- 86 044245 или его антигенсвязывающим фрагментом, или его производным. В одном варианте осуществления антитело к компоненту комплемента С5 представляет собой экулизумаб (SOLIRIS®), или его антигенсвязывающий фрагмент, или его производное. Экулизумаб представляет собой гуманизированный моноклональный IgG2/4, легкую каппа-цепь антитела, который специфически связывается с компонентом комплемента С5 с высокой аффинностью и ингибирует расщепление С5 до С5а и С5Ь, тем самым ингибируя образование конечного комплекса комплемента С5Ь-9. Экулизумаб описан в патенте США № 6355245, полное содержание которого включено в данный документ посредством ссылки.
Способы по настоящему изобретению, включающие введение субъекту средства, представляющего собой иРНК, по настоящему изобретению и экулизумаба, могут дополнительно содержать введение субъекту менингококковой вакцины.
Дополнительное терапевтическое средство, например, экулизумаб и/или менингококковую вакцину можно вводить субъекту одновременно со средством, представляющим собой иРНК, нацеленным на С5, или в разное время.
Кроме того, дополнительное терапевтическое средство, например, экулизумаб, можно вводить субъекту в одном составе со средством, представляющим собой иРНК, нацеленным на С5, или в другом составе, как средство, представляющее собой иРНК, нацеленное на С5.
Схема приема экулизумаба описана, например, в инструкции на продукт экулизумаб (SOLIRIS®) и в заявке на патент США № 2012/0225056, полное содержание каждой из которых включено в данный документ посредством ссылки. В иллюстративных способах по настоящему изобретению для лечения заболевания, связанного с компонентом комплемента С5, например, PNH или aHUS, средство, представляющее собой иРНК, нацеленное на С5, сперва вводят (например, подкожно) субъекту таким образом, что уровни С5 у субъекта уменьшаются (например, на по меньшей мере приблизительно 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%,
42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 53%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%,
61%, 62%, 62%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%,
80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, или по меньшей мере приблизительно 99% или более), а затем вводят экулизумаб в дозах, меньших, чем описаны в инструкции на продукт SOLIRIS®. Например, экулизумаб можно вводить субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг в течение 4 недель с последующей пятой дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 900 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 900 мг приблизительно каждые две недели после этого. Экулизумаб также можно вводить субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 900 мг в течение 4 недель с последующей пятой дозой через приблизительно одну неделю менее чем приблизительно 1200 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 1200 мг приблизительно каждые две недели после этого. Если субъект младше 18 лет, экулизумаб можно вводить субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 900 мг в течение 4 недель с последующей пятой дозой через одну неделю в дозе менее чем приблизительно 1200 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 1200 мг приблизительно каждые две недели после этого; или если субъект младше 18 лет, экулизумаб можно вводить субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг в течение 2 недель с последующей третьей дозой через приблизительно одну неделю в дозе менее чем приблизительно 900 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 900 мг каждые две недели после этого; или если субъект младше 18 лет, экулизумаб можно вводить субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг в течение 2 недель с последующей третьей дозой приблизительно через одну неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 600 мг приблизительно каждые две недели после этого; или если субъект младше 18 лет, экулизумаб можно вводить субъекту в раз неделю в дозе менее чем приблизительно 600 мг в течение 1 недели с последующей второй дозой через приблизительно одну неделю в дозе менее чем приблизительно 300 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 300 мг приблизительно каждые две недели после этого; или если субъект младше 18 лет, экулизумаб можно вводить субъекту раз в неделю в дозе менее чем приблизительно 300 мг в течение 1 недели с последующей второй дозой через приблизительно одну неделю в дозе менее чем приблизительно 300 мг, а затем в дозе менее чем приблизительно 300 мг приблизительно каждые две недели после этого. Если объекту проводят плазмоферез или замещение плазмы, экулизумаб можно вводить субъекту в дозе менее чем приблизительно 300 мг (например, если последняя доза экулизумаба составила приблизительно 300 мг) или меньше, чем приблизительно 600 мг (например, если последняя доза экулизумаба составила приблизительно 600 мг или более). Если объекту проводят инфузию плазмы, экулизумаб можно вводить субъекту в дозе менее чем приблизительно 300 мг (например, если последняя доза экулизумаба составила приблизительно 300 мг или более). Более низкие дозы экулизумаба можно вводить либо подкожно, или внутривенно.
При комбинированной терапии по настоящему изобретению, включающей экулизумаб, экулизумаб можно вводить субъекту, например, подкожно в дозе от приблизительно 0,01 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, или от приблизительно 5 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, или от приблизительно 0,5 мг/кг до приблизительно 15 мг/кг. Например, экулизумаб можно вводить субъекту, например, подкожно в дозе
- 87 044245
0,5 мг/кг, 1 мг/кг, 1,5 мг/кг, 2 мг/кг, 2,5 мг/кг, 3 мг/кг, 3,5 мг/кг, 4 мг/кг, 4,5 мг/кг, 5 мг/кг, 5,5 мг/кг, мг/кг, 6,5 мг/кг, 7 мг/кг, 7,5 мг/кг, в дозе 8 мг/кг, 8,5 мг/кг, 9 мг/кг, 9,5 мг/кг, 10 мг/кг, 10,5 мг/кг, мг/кг, 11,5 мг/кг, 12 мг/кг, 12,5 мг/кг, 13 мг/кг, 13,5 мг/кг, 14 мг/кг, 14,5 мг/кг или 15 мг/кг.
Способы и применения по настоящему изобретению включают введение композиции, описанной в данном документе, таким образом, чтобы экспрессия целевого гена С5 уменьшилась, например, на период приблизительно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 12, 16, 18, 24, 28, 32, 36, 40, 44, 48, 52, 56, 60, 64, 68, 72, 76 или 80 ч. В одном варианте осуществления экспрессия целевого гена С5 уменьшается на протяжении длительного срока, например, по меньшей мере приблизительно двух, трех, четырех, пяти, шести, семи дней или более, например, приблизительно одной недели, двух недель, трех недель или приблизительно четырех недель или дольше.
Введение dsRNA согласно способам и применениям по настоящему изобретению может привести к снижению тяжести, признаков, симптомов и/или маркеров таких заболеваний или нарушений у пациента с заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5. Снижение в данном контексте подразумевает статистически значимое снижение такого уровня. Снижение может произойти, например, на по меньшей мере приблизительно 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или приблизительно 100%.
Эффективность лечения или предотвращения заболевания можно оценить, например, путем определения прогрессирования заболевания, ремиссии, тяжести симптомов, уменьшения боли, качества жизни, дозы лекарственного средства, необходимого для поддержания эффекта лечения, уровня маркера заболевания или любого другого измеряемого параметра, подходящего для данного заболевания, подвергаемого лечению или нацеленного на его предотвращение. Вполне в пределах способности специалиста в данной области техники контролировать эффективность лечения или профилактики путем измерения любого из таких параметров или любой комбинации параметров. Например, эффективность лечения гемолитического нарушения можно оценить, например, с помощью периодического контроля уровней LDH и СН50. Сравнение поздних показаний с начальными показаниями обеспечивает врача показаниями, является ли лечение эффективным. Вполне в пределах способности специалиста в данной области техники контролировать эффективность лечения или профилактики путем измерения любого из таких параметров или любой комбинации параметров. В связи с этим введение иРНК, нацеленной на С5, или ее фармацевтической композиции эффективной против заболевания, связанного с компонентом комплемента С5, показывает, что введение клинически соответствующим способом приводит к благотворному воздействию на по меньшей мере статистически значимую часть пациентов, такому как улучшению симптомов, лечению, снижению заболеваний, продлению жизни, улучшению качества жизни или другому эффекту, как правило признанному положительным врачами, знакомыми с лечением заболевания, связанного с компонентом комплемента С5, и связанных причин.
Эффект лечения или предупредительное действие очевидны, когда наблюдается статистически значимое улучшение одного или нескольких показателей болезненного состояния, или по отсутствию усугубления или развития симптомов в тех случаях, когда их, при иных обстоятельствах, прогнозировали. В качестве примера, благоприятное изменение измеряемого показателя заболевания по меньшей мере на 10% и предпочтительно по меньшей мере на 20%, 30%, 40%, 50% или более может служить признаком эффективного лечения. Об эффективности данного лекарственного препарата iRNA или состава этого лекарственного препарата можно также судить при помощи экспериментальной животной модели для данного заболевания, которая известна в данной области. При использовании экспериментальной животной модели, эффективность лечения доказана, когда наблюдают статистически значимое снижение маркера или ослабление симптома.
Кроме того, эффективность может быть оценена при уменьшении тяжести заболевания, что определяется специалистом в данной области диагностики, основываясь на клинически принятой шкале оценки тяжести заболевания, как один из примеров шкала интенсивности боли при ревматоидном артрите (RASS). Любое позитивное изменение, приводящее, например, к уменьшению тяжести заболевания, оцениваемому с использованием соответствующего масштаба, представляет адекватное лечение с применением иРНК или состава, представляющего собой иРНК, как описано в данном документе.
Субъекту можно вводить терапевтическое количество иРНК, например, приблизительно 0,01 мг/кг, 0,02 мг/кг, 0,03 мг/кг, 0,04 мг/кг, 0,05 мг/кг, 0,1 мг/кг, 0,15 мг/кг, 0,2 мг/кг, 0,25 мг/кг, 0,3 мг/кг, 0,35 мг/кг, 0,4 мг/кг, 0,45 мг/кг, 0,5 мг/кг, 0,55 мг/кг, 0,6 мг/кг, 0,65 мг/кг, 0,7 мг/кг, 0,75 мг/кг, 0,8 мг/кг, 0,85 мг/кг, 0,9 мг/кг, 0,95 мг/кг, 1,0 мг/кг, 1,1 мг/кг, 1,2 мг/кг, 1,3 мг/кг, 1,4 мг/кг, 1,5 мг/кг, 1,6 мг/кг, 1,7 мг/кг, 1,8 мг/кг, 1,9 мг/кг, 2,0 мг/кг, 2,1 мг/кг, 2,2 мг/кг, 2,3 мг/кг, 2,4 мг/кг, 2,5 мг/кг dsRNA, 2,6 мг/кг dsRNA, 2,7 мг/кг dsRNA, 2,8 мг/кг dsRNA, 2,9 мг/кг dsRNA, 3,0 мг/кг dsRNA, 3,1 мг/кг dsRNA, 3,2 мг/кг dsRNA, 3,3 мг/кг dsRNA, 3,4 мг/кг dsRNA, 3,5 мг/кг dsRNA, 3,6 мг/кг dsRNA, 3,7 мг/кг dsRNA, 3,8 мг/кг dsRNA, 3,9 мг/кг dsRNA, 4,0 мг/кг dsRNA, 4,1 мг/кг dsRNA, 4,2 мг/кг dsRNA, 4,3 мг/кг dsRNA, 4,4 мг/кг dsRNA, 4,5 мг/кг dsRNA, 4,6 мг/кг dsRNA, 4,7 мг/кг dsRNA, 4,8 мг/кг dsRNA, 4,9 мг/кг dsRNA, 5,0 мг/кг dsRNA, 5,1 мг/кг dsRNA, 5,2 мг/кг dsRNA, 5,3 мг/кг dsRNA, 5,4 мг/кг dsRNA, 5,5 мг/кг dsRNA, 5,6 мг/кг dsRNA, 5,7 мг/кг dsRNA, 5,8 мг/кг dsRNA, 5,9 мг/кг dsRNA, 6,0 мг/кг dsRNA, 6,1 мг/кг dsRNA, 6,2 мг/кг dsRNA, 6,3 мг/кг dsRNA, 6,4 мг/кг dsRNA, 6,5 мг/кг dsRNA, 6,6 мг/кг dsRNA, 6,7 мг/кг dsRNA, 6,8 мг/кг
- 88 044245 dsRNA, 6,9 мг/кг dsRNA, 7,0 мг/кг dsRNA, 7,1 мг/кг dsRNA, 7,2 мг/кг dsRNA, 7,3 мг/кг dsRNA, 7,4 мг/кг dsRNA, 7,5 мг/кг dsRNA, 7,6 мг/кг dsRNA, 7,7 мг/кг dsRNA, 7,8 мг/кг dsRNA, 7,9 мг/кг dsRNA, 8,0 мг/кг dsRNA, 8,1 мг/кг dsRNA, 8,2 мг/кг dsRNA, 8,3 мг/кг dsRNA, 8,4 мг/кг dsRNA, 8,5 мг/кг dsRNA, 8,6 мг/кг dsRNA, 8,7 мг/кг dsRNA, 8,8 мг/кг dsRNA, 8,9 мг/кг dsRNA, 9,0 мг/кг dsRNA, 9,1 мг/кг dsRNA, 9,2 мг/кг dsRNA, 9,3 мг/кг dsRNA, 9,4 мг/кг dsRNA, 9,5 мг/кг dsRNA, 9,6 мг/кг dsRNA, 9,7 мг/кг dsRNA, 9,8 мг/кг dsRNA, 9,9 мг/кг dsRNA, 9,0 мг/кг dsRNA, 10 мг/кг dsRNA, 15 мг/кг dsRNA, 20 мг/кг dsRNA, 25 мг/кг dsRNA, 30 мг/кг dsRNA, 35 мг/кг dsRNA, 40 мг/кг dsRNA, 45 мг/кг dsRNA или приблительно 50 мг/кг dsRNA. Значения и диапазоны, промежуточные по отношению к перечисленным значениям, также подразумеваются как часть настоящего изобретения.
В некоторых вариантах осуществления, например, когда композиция по настоящему изобретению включает dsRNA, как описано в данном документе, и липид, субъектам можно вводить терапевтическое количество иРНК, например, от приблизительно 0,01 мг/кг до приблизительно 5 мг/кг, от приблизительно 0,01 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 0,05 мг/кг до приблизительно 5 мг/кг, от приблизительно 0,05 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 0,1 мг/кг до приблизительно 5 мг/кг, от приблизительно 0,1 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 0,2 мг/кг до приблизительно 5 мг/кг, от приблизительно 0,2 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 0,3 мг/кг до приблизительно 5 мг/кг, от приблизительно 0,3 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 0,4 мг/кг до приблизительно 5 мг/кг, от приблизительно 0,4 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 0,5 мг/кг до приблизительно 5 мг/кг, от приблизительно 0,5 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 1 мг/кг до приблизительно 5 мг/кг, от приблизительно 1 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 1,5 мг/кг до приблизительно 5 мг/кг, от приблизительно 1,5 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 2 мг/кг до приблизительно 2,5 мг/кг, от приблизительно 2 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 3 мг/кг до приблизительно 5 мг/кг, от приблизительно от приблизительно 3 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 3,5 мг/кг до приблизительно 5 мг/кг, от приблизительно 4 мг/кг до приблизительно 5 мг/кг, от приблизительно 4,5 мг/кг до приблизительно 5 мг/кг, от приблизительно 4 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 4,5 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 5 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 5,5 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 6 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 6,5 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 7 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 7,5 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 8 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 8,5 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг, от приблизительно 9 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг или от приблизительно 9,5 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг. Значения и диапазоны, промежуточные по отношению к перечисленным значениям, также подразумеваются как часть настоящего изобретения.
Например, dsRNA может быть введена в дозе приблизительно 0,1, 0,2, 0,3, 0,4, 0,5, 0,6, 0,7, 0,8, 0,9,
1, 1,1, 1,2, 1,3, 1,4, 1,5, 1,6, 1,7, 1,8, 1,9, 2, 2,1, 2,2, 2,3, 2,4, 2,5, 2,6, 2,7, 2,8, 2,9, 3, 3,1, 3,2, 3,3, 3,4, 3,5, 3,6,
3,7, 3,8, 3,9, 4, 4,1, 4,2, 4,3, 4,4, 4,5, 4,6, 4,7, 4,8, 4,9, 5, 5,1, 5,2, 5,3, 5,4, 5,5, 5,6, 5,7, 5,8, 5,9, 6, 6,1, 6,2, 6,3,
6,4, 6,5, 6,6, 6,7, 6,8, 6,9, 7, 7,1, 7,2, 7,3, 7,4, 7,5, 7,6, 7,7, 7,8, 7,9, 8, 8,1, 8,2, 8,3, 8,4, 8,5, 8,6, 8,7, 8,8, 8,9, 9,
9,1, 9,2, 9,3, 9,4, 9,5, 9,6, 9,7, 9,8, 9,9 или приблизительно 10 мг/кг. Значения и диапазоны, промежуточные по отношению к перечисленным значениям, также подразумеваются как часть настоящего изобрете ния.
В других вариантах осуществления, например, когда композиция по настоящему изобретению содержит dsRNA, как описано в данном документе, и N-ацетилгалактозамин, субъекту можно вводить терапевтическое количество иРНК, например, в дозе от приблизительно 0,1 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 0,25 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 0,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 0,75 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 1 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 1,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 2 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 2,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 3 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 3,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 4 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 4,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 7,5 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 10 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 15 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 50 мг/кг, приблизительно 30 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 35 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 40 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 45 до приблизительно 50 мг/кг, от приблизительно 0,1 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 0,25 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 0,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 0,75 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 1 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 1,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 2 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 2,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 3 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 3,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 4 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 4,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 5 до приблизительно 45 мг/кг, от
- 89 044245 приблизительно 7,5 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 10 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 15 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 45 мг/кг, приблизительно 30 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 35 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 40 до приблизительно 45 мг/кг, от приблизительно 0,1 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 0,25 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 0,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 0,75 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 1 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 1,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 2 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 2,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 3 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 3,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 4 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 4,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 7,5 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 10 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 15 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 30 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 35 до приблизительно 40 мг/кг, от приблизительно 0,1 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 0,25 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 0,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 0,75 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 1 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 1,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 2 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 2,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 3 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 3,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 4 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 4,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 7,5 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 10 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 15 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 20 до приблизительно 30 мг/кг, приблизительно 20 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 25 до приблизительно 30 мг/кг, от приблизительно 0,1 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 0,25 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 0,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 0,75 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 1 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 1,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 2 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 2,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 3 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 3,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 4 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 4,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 7,5 до приблизительно 20 мг/кг, от приблизительно 10 до приблизительно 20 мг/кг или от приблизительно 15 до приблизительно 20 мг/кг. В одном варианте осуществления, где композиция по настоящему изобретению содержит dsRNA, как описано в данном документе, и N-ацетилгалактозамин, субъекту можно вводить терапевтическое количество от приблизительно 10 до приблизительно 30 мг/кг dsRNA. Значения и диапазоны, промежуточные по отношению к перечисленным значениям, также подразумеваются как часть настоящего изобретения.
Например, субъектам можно вводить терапевтическое количество иРНК, например, приблизительно 0,1, 0,2, 0,3, 0,4, 0,5, 0,6, 0,7, 0,8, 0,9, 1, 1,1, 1,2, 1,3, 1,4, 1,5, 1,6, 1,7, 1,8, 1,9, 2, 2,1, 2,2, 2,3, 2,4, 2,5, 2,6, 2,7, 2,8, 2,9, 3, 3,1, 3,2, 3,3, 3,4, 3,5, 3,6, 3,7, 3,8, 3,9, 4, 4,1, 4,2, 4,3, 4,4, 4,5, 4,6, 4,7, 4,8, 4,9, 5, 5,1, 5,2, 5,3, 5,4, 5,5, 5,6, 5,7, 5,8, 5,9, 6, 6,1, 6,2, 6,3, 6,4, 6,5, 6,6, 6,7, 6,8, 6,9, 7, 7,1, 7,2, 7,3, 7,4, 7,5, 7,6, 7,7, 7,8, 7,9, 8, 8,1, 8,2, 8,3, 8,4, 8,5, 8,6, 8,7, 8,8, 8,9, 9, 9,1, 9,2, 9,3, 9,4, 9,5, 9,6, 9,7, 9,8, 9,9, 10, 10,5, 11, 11,5, 12, 12,5, 13, 13,5, 14, 14,5, 15, 15,5, 16, 16,5, 17, 17,5, 18, 18,5, 19, 19,5, 20, 20,5, 21, 21,5, 22, 22,5, 23, 23,5, 24, 24,5, 25, 25,5, 26, 26,5, 27, 27,5, 28, 28,5, 29, 29,5, 30, 31, 32, 33, 34, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49 или приблизительно 50 мг/кг. Значения и диапазоны, промежуточные по отношению к перечисленным значениям, также подразумеваются как часть настоящего изобретения.
иРНК может быть введена путем внутривенной инфузии в течение некоторого периода времени, например, в течение 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или примерно 25-минутного периода. Введение могут повторять, например, регулярно, как, например, раз в неделю, раз в две недели (т.е. каждые две недели) в течение одного месяца, двух месяцев, трех месяцев, четырех месяцев или дольше. После первичного режима обработки обработки можно вводить менее часто. Например, после введения раз в неделю или раз в две недели в течение трех месяцев введение можно повторять один раз в месяц в течение шести месяцев, или года, или дольше.
Введение иРНК может снизить уровень С5, например, в клетке, ткани, крови, моче или других компартментах пациента на по меньшей мере приблизительно 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%,
33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%,
52%, 53%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%,
71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%,
90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или по меньшей мере приблизительно 99% или более.
Перед введением полной дозы иРНК пациентам можно вводить меньшую дозу, как, например,
- 90 044245
5% инфузию и наблюдать их в отношении отрицательного действия, как, например, аллергических реакций. В другом примере пациента можно наблюдать в отношении нежелательного иммуностимулирующего действия, как, например, повышения уровней цитокина (например, TNF-альфа или INF-альфа).
Благодаря ингибирующему действию на экспрессию С5, композиция по настоящему изобретению или фармацевтическая композиция, приготовленная из нее, может повысить качество жизни.
иРНК по настоящему изобретению можно вводить в голой форме или в виде свободной иРНК. Голую иРНК вводят в отсутствие фармацевтической композиции. Голая иРНК может быть в подходящем буферном растворе. Буферный раствор может содержать ацетат, цитрат, проламин, карбонат или фосфат или любую их комбинацию. В одном варианте осуществления буферный раствор представляет собой забуференный фосфатом физиологический раствор (PBS). рН и осмолярность буферного раствора иРНК можно корректировать, с тем чтобы он подходил для введения субъекту.
Альтернативно, иРНК по настоящему изобретению можно вводить в виде фармацевтической композиции, например, в составе липосомной dsRNA.
Субъектами, у которых снижение и/или ингибирование экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, являются те, кто страдает заболеванием или нарушением, связанным с компонент комплемента С5, как описано в данном документе. В одном варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает ночной пароксизмальной гемоглобинурией (PNH). В другом варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает астомой. В другом варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает ревматоидным артритом. В еще одном варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает системной красной волчанкой. В одном варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает гломерулонефритом. В другом варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает псориазом. В еще одном варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает дерматомиозитм буллезного пемфигоида. В одном варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает атипичным гемолитико-уремическим синдромом. В другом варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает гемолитико-уремическим синдромом, вызванным Шига-подобным токсином Е. coli. В другом варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает миастенией. В еще одном варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает оптиконевромиелитом. В одном варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает болезнью плотного осадка. В одном варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает C3-нефропатией.
В другом варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает связанной с возрастом дегенерацией желтого пятна. В другом варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает болезнью холодовых агглютининов. В одном варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает васкулитом, связанноым с антителами к цитоплазме нейтрофилов. В другом варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает реакцией отторжения трансплантата, вызванной гуморальными и сосудистыми механизмами. В одном варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает дисфункцией трансплантата. В одном варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает инфартом миокарда. В другом варианте осуществления заболевание, которым страдает субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, представляет собой сенсибилизированное отторжение трансплантата. В еще одном варианте осуществления субъект, страдающий заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, страдает сепсисом.
Лечение субъекта, у которого снижение и/или ингибирование экспрессии гена С5 окажет благоприятное воздействие, включает терапевтическое и профилактическое (например, субъект перенес операцию сенсибилизированной (или аллогенной) пересадки) лечение.
Кроме того, изобретение относится к способам и применению средства, представляющего собой иРНК, или его фармацевтической композиции (включая способы и применение средства, представляющего собой иРНК, или фармацевтической композиции, содержащей средство, представляющее собой иРНК, и антитело к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающий фрагмент) для лечения субъекта, у которого снижение и/или ингибирование экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, например, у субъекта, страдающего заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, в комбинации с другими фармацевтическими препаратами и/или другими терапевтическими способами, например, известными фармацевтическими и/или терапевтическими способами, такие как, например, те, которые в настоящее время применяют при лечении этих нарушений. Например, в некоторых вариантах осу- 91 044245 ществления иРНК, нацеленную на С5, вводят в комбинации с, например, средством, пригодным при лечении заболевания, связанного с компонентом комплемента С5, как описано в других частях данного документа.
Например, дополнительные терапевтические средства и терапевтические способы, пригодные для лечения субъекта, у которого снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие, например, субъекта, страдающего заболеванием, связанным с компонентом комплемента С5, включают плазмоферез, тромболитическую терапия (например, с применением стрептокиназы), антиагреганты, фолиевую кислоту, кортикостероиды; иммунодепрессанты; эстрогены, метотрексат, 6-МР, азатиоприн, сульфасалазин, месалазин, олсалазин, хлорохин/гидроксихлорохин, пеницилламин, ауротиомалат (внутримышечно и перорально), азатиоприн, колхицин, кортикостероиды (пероральные, ингаляционные и местные инъекции), бета-2 агонисты адренорецепторов (сальбутамол, тербуталин, салметерол), ксантины (теофиллин, аминофиллин), кромогликат, недокромил, кетотифен, ипратропий и окситропий, циклоспорин, FK-506, рапамицин, микофенолятмофетил, лефлуномид, NSAID, например, ибупрофен, кортикостероиды, такие как преднизолон, ингибиторы фосфодиэстеразы, агонисты, аденозина, антитромботические средства, ингибиторы комплемента, адренергические средства, средства, препятствующие сигнальной функции провоспалительных цитокинов, такие как TNF-α или IL-1 (например, ингибиторы киназы IRAK, NIK, IKK, р38 или MAP), ингибиторы фермента ГЕ-1в-преобразования, ингибиторы фермента TNFa-преобразования (ТАСЕ), ингибиторы сигнальных Т-клеток, таких как ингибиторы киназы, ингибиторы металлопротеиназ, сульфасалазин, азатиоприн, 6-меркантопурины, ингибиторы ангиотензинпревращающего фермента, рецепторы растворимых цитокинов и их производные (например, растворимые р55 или р75 TNF-рецепторы и производные p75TNFRIgG (Enbrel™ и p55TNFRIgG (Lenercept)), sIL-1RI, sIL-1RII и sIL-6R), противовоспалительные цитокины (например, IL-4, IL-10, IL-11, IL-13 и TGFe), целекоксиб, фолиевая кислота, гидроксихлорохин сульфат, рофекоксиб, этанерцепт, моноклональное антитело инфликси, напроксен, валдекоксиб, сульфасалазин, метилпреднизолон, мелоксикам, метилпреднизолона ацетат, золото, тиомалат натрия, аспирин, триамцинолона ацетонид, пропоксифена напсилат/апап, фолат, набуметон, диклофенак, пироксикам, этодолак, диклофенак натрия, оксапрозин, оксикодона гидрохлорид, гидрокодона битартрат/апап, диклофенак натрия/мизопростол, фентанил, анакинра, рекомбинантный иммуноглобулин человека, трамадола гидрохлорид, салсалат, сулиндак, цианокобаламин/fa/пиридоксин, ацетаминофен, алендронат натрия, преднизолон, сульфат морфина, лидокаина гидрохлорид, индометацин, глюкозамин сульфат/хондроитин, амитриптилина гидрохлорид, сульфадиазин, оксикодона гидрохлорид/ацетаминофен, олопатадина гидрохлорид, мизопростол, напроксен натрия, омепразол, циклофосфамид, моноклональное антитело ритукси, IL-1 TRAP, MRA, CTLA4-IG, IL-18 ВР, антитело к IL-18, антитело к IL15, BIRB-796, SCIO-469, VX-702, AMG-548, VX-740, рофлумиласт, IC-485, CDC-801, мезопрам, циклоспорин, цитокин-супрессивный противовоспалительный лекарственный препарат(ы) (CSAIDs); CDP-571/BAY-10-3356 (гуманизированное антитело к TNFa; Celltech/Bayer); сА2/моноклональное антитело инфликси (химерное антитело к TNFa; Centocor); 75 kdTNFRIgG/этанерсепт (75 кДа рецептор TNF-IgG слитый белок; Immunex, см., например, (1994) Arthr. Rheum. 37: S295; (1996) J. Invest. Med. 44: 235A); 55 кД TNF-IgG (55 кД рецептор TNF-IgG слитый белок Hoffmann-LaRoche); IDEC-CE9.1/SB 210396 (не осуществляющее деплецию приматизированное антитело к CD4; IDEC/SmithKline; см., например, (1995) Arthr. Rheum. 38: S185); DAB 486-IL-2 и/или DAB 389-IL-2 (IL-2 слитые белки; Seragen; см., например, (1993) Arthrit. Rheum. 36: 1223); антитело к Тас (гуманизированное антитело к IL-2Ra; Protein Design Labs/Roche); IL-4 (противовоспалительный цитокин; DNAX/Schering); IL-10 (SCH 52000; рекомбинантный IL-10, противовоспалительный цитокин; DNAX/Schering); IL-4; IL-10 и/или IL-4 агонисты (например, антитела агонистов); IL-1RA (антагонист IL-1-рецептора; Synergen/Amgen); анакинра (Kineret®/Amgen); TNF-bp/s-TNF (растворимый TNFсвязывающий белок; см., например, (1996) Arthr. Rheum. 39 (9 (supplement)): S284; (1995) Amer. J. Physiol. - Heart and Circ. Physiol. 268: 37-42); R973401 (ингибитор фосфодиэстеразы тип IV; см., например, (1996) Arthr. Rheum. 39 (9 (supplement): S282); MK-966 (СОХ-2-ингибитор; см., например, (1996) Arthr. Rheum. 39 (9 (supplement): S81); илопрост (см., например, (1996) Arthr. Rheum. 39 (9 (supplement): S82); метотрексат; талидомид (см., например, (1996) Arthr. Rheum. 39 (9 (supplement): S282) и талидомидсвязанные лекарственные препараты (например, Celgen); лефлуномид (противовоспалительный и ингибитор цитокина, см. например, (1996) Arthr. Rheum. 39 (9 (supplement): S131; (1996) Inflamm. Res. 45: 103-107); транексамовая кислота (ингибитор активации плазминогена, см, например, (1996) Arthr. Rheum. 39 (9 (supplement): S284); Т-614 (ингибитор цитокина; см., например, (1996) Arthr. Rheum. 39 (9 (supplement): S282); простагландин E1 (см., например, (1996) Arthr. Rheum. 39 (9 (supplement): S282); тенидап (нестероидный противовоспалительный лекарственный препарат; см., например, (1996) Arthr. Rheum. 39 (9 (supplement): S280); напроксен (нестероидный противовоспалительный лекарственный препарат; см., например, (1996) Neuro. Report 7: 1209-1213); мелоксикам (нестероидный противовоспалительный лекарственный препарат); ибупрофен (нестероидный противовоспалительный лекарственный препарат); пироксикам (нестероидный противовоспалительный лекарственный препарат); диклофенак (нестероидный противовоспалительный лекарственный препарат); индометацин (нестероидный противо- 92 044245 воспалительный лекарственный препарат); сульфасалазин (см., например, (1996) Arthr. Rheum. 39 (9 (supplement): S281); азатиоприн(см., например, (1996) Arthr. Rheum. 39 (9 (supplement): S281); ингибитор ICE (ингибитор интерлейкин-1а превращающего фермента); ингибитор zap-70 и/или lck (ингибитор тирозинкиназы zap-70 или lck); ингибитор VEGF и/или ингибитор VEGF-R (ингибиторы фактора роста клеток эндотелия сосудов или рецептор фактора роста клеток эндотелия сосудов; ингибиторы ангиогенеза); кортикостероидные противовоспалительные лекарственные средства (например, SB203580); ингибиторы конвертазы TNF; антитела к IL-12; антитела к IL-18; интерлейкин-11 (см., например, (1996) Arthr. Rheum. 39 (9 (supplement): S296); интерлейкин-13 (см., например, (1996) Arthr. Rheum. 39 (9 (supplement): S308); ингибиторы интерлейкин-17 (см., например, (1996) Arthr. Rheum. 39 (9 (supplement): S120); золото; пеницилламин; хлорохин; хлорамбуцил; гидроксихлорохин; циклоспорин; циклофосфамид; общее облучение лимфоидной ткани; антитело-глобулин к Т-клеткам; антитела к CD4; CD5-токсины; перорально вводимые пептиды и коллаген; динатрий лобензарит; средства, регулирующие цитокины (CRA) HP228 и НР466 (Houghten Pharmaceuticals, Inc.); ICAM-1-антисмысловые фосфотиоатные олигодезоксинуклеотиды (ISIS 2302; Isis Pharmaceuticals, Inc.); растворимый рецептор комплемента 1 (ТР10; Т Cell Sciences, Inc.); преднизолон; орготеин; гликозаминогликан полисульфат; миноциклин; антитела к IL2R, липиды морского и ботанического происхождения (жирные кислоты рыбы и семян растений, см., например, DeLuca et al. (1995) Rheum. Dis. Clin. North Am. 21: 759-777); ауранофин; фенилбутазон; меклофенамовая кислота; флуфенамовая кислота; иммуноглобулин для внутривенного введения; зилеутон; азарибин; микофенолокислота (RS-61443); такролимус (FK-506); сиролимус (рапамицин); амиприлоз (терафектин); кладрибин (2-хлордезоксиаденозин); метотрексат; ингибиторы bcl-2 (см. Bruncko, M. et al. (2007) J. Med. Chem. 50(4): 641-662); противовирусные и иммуномодулирующие средства, малую молекулу ингибитора KDR, малую молекулу ингибитора Tie-2; метотрексат; преднизолон; целекоксиб; фолиевую кислоту; гидроксихлорохин сульфат; рофекоксиб; этанерсепт; моноклональное антитело инфликс; лефлуномид; напроксен; валдекоксиб; сульфасалазин; метилпреднизолон; ибупрофен; мелоксикам; ацетат метилпреднизолона; золото тиомалат натрия; аспирин; азатиоприн; триамцинолона ацетонид; пропксифена напсилат/апап; фолат; набуметон; диклофенак; пироксикам; этодолак; диклофенак натрия; оксапрозин; оксикодона гидрохлорид; гидрокодона битартрат/апап; диклофенак натрия/мизопростол; фентанил; анакинра, рекомбинантный глобулин человека; трамадола гидрохлорид; салсалат; сулиндак; цианокобаламин/fa/пиридоксин; ацетаминофен; алендронат натрия; преднизолон; сульфат морфина; лидокаина гидрохлорид; индометацин; глюкозамина сульфат/хондроитин; циклоспорин; амитриптилина гидрохлорид; сульфадиазином; оксикодон гидрохлорид/ацетаминофен; олопатадина гидрохлорид; мизопростол; напроксен натрия; омепразол; микофенолятмофетил; циклофосфамид; моноклональное антитело ритукси; IL-1 TRAP; MRA; CTLA4-IG; IL-18 BP; IL-12/23; антитело к IL 18; антитело к IL 15; BIRB-796; SCIO469; VX-702; AMG-548; VX-740; рофлумиласт; IC-485; CDC-801; мезопрам, альбутерол, сальметерол/флутиказон, монтелукаст натрия, пропионат флутиказона, будесонид, преднизон, ксинафоат салметерола, левалбутерол гидрохлорид, альбутерола сульфат/ипратропиум, натрия фосфат преднизолона, триамцинолона ацетонид, беклометазон дипропионат, ипратропия бромид, азитромицин, пирбутерола ацетат, преднизолон, теофиллин безводный, натрия сукцинат метилпреднизолон, клэритромицин, зафирлукаст, формотерола фумарат, вакцина против вируса гриппа, метилпреднизолон, амоксициллина тригидрат, флунизолид, инъекции против аллергии, кромолин натрия, фексофенадина гидрохлорид, флунизолид/ментол, амоксициллин/клавуланат, левофлоксацин, вспомогательное устройство для ингаляций, гуафенизин, дексаметазона натрия фосфат, моксифлоксацина гидрохлорид, доксициклина гиклат, гуаифенезин/d-меторфан, р-эфедрин/кодеин/хлорфенир, гатифлоксацин, цетиризина гидрохлорид, мометазона фуроат, сальметерола ксинафоат, бензонатат, цефалексин, фенилэфрин/гидрокодон/хлорфенирамин, цетиризина гидрохлорид/псевдоэфедрин, фенилэфрин/кодеин/прометазин, кодеин/прометазин, цефпрозил, дексаметазон, гуаифенезин/псевдоэфедрин, хлорфенирамин/гидрокодон, недокромил натрия, тербуталина сульфат, эпинефрин, метилпреднизолон, метапротеренола сульфат, аспирин, нитроглицерин, метопролола тартрат, эноксапарин натрия, гепарин натрия, клопидогреля бисульфат, карведилол, атенолол, морфина сульфат, метопролола сукцинат, варфарин натрия, лизиноприл, изосорбида мононитрат, дигоксин, квинаприла гидрохлорид/mag carb, буметанид, альтеплаза, эналаприлат, амиодарона гидрохлорид, тирофибана гидрохлорид м-гидрат, дилтиазема гидрохлорид, каптоприл, ирбесартан, валсартана, пропранолола гидрохлорид фуросемид, симвастатин, рамиприл, тенектеплаза, эналаприла малеат, торсемид, ретаваз, лозартан калия, фозиноприл натрия, лидокаина гидрохлорид, эптифибатид, цефазолин натрия, атропина сульфат, аминокапроновую кислоту, спиронолактон, интерферон, соталола гидрохлорид, хлорид калия, докузат натрия, добутамина гидрохлорид, алпразолам, правастатин натрий, аторвастатин кальция, мидазолама гидрохлорид, гидроморфона гидрохлорид, изосорбида динитрат, адреналин, дофамина гидрохлорид, бивалирудин, розувастатин, эзетимиб/симвастатин, авасимиб и карипорид.
Средство, представляющее собой иРНК (и/или антитело к компоненту комплемента С5) и дополнительное терапевтическое средство и/или лечение можно вводить одновременно и/или в одной комбинации, например, парентерально, или дополнительное терапевтическое средство можно вводить как часть отдельного состава, или в разное время, и/или другим способом, известным в данной области техники или описанных в данном документе.
- 93 044245
Настоящее изобретение также относится к способам применения средства, представляющего собой иРНК, по настоящему изобретению и/или композиции, содержащей средство, представляющее собой иРНК, по настоящему изобретению для уменьшения и/или ингибировать экспрессии компонента комплемента С5 в клетке. В других аспектах настоящее изобретение относится к иРНК по настоящему изобретению и/или композиции, содержащей иРНК по настоящему изобретению, для применения при уменьшении и/или ингибировании экспрессии компонента комплемента С5 в клетке. В других аспектах предусматривается применение иРНК по настоящему изобретению и/или композиции, содержащей иРНК по настоящему изобретению при производстве лекарственного средства для уменьшения и/или ингибирования экспрессии компонента комплемента С5 в клетке.
Способы и применения включают приведение клетки в контакт с иРНК, например, dsRNA по настоящему изобретению и поддержание клетки в течение времени, достаточного для обеспечения расщепления мРНК-транскрипта гена С5, ингибируя, таким образом, экспрессию гена С5 в клетке.
Уменьшение экспрессии гена можно оценить любым из способов, известных в данной области. Например, снижение экспрессии С5 можно определить путем определения уровня экспрессии мРНК С5 с применением обычных способов, известных обычному специалисту в данной области, например, Нозерн-блоттинга, qRT-PCR, путем определения уровня белка С5 с применением обычных способов, известных обычному специалисту в данной области, таких как Вестерн-блоттинг, иммунологические методы, способ проточной цитометрии, ELISA, и/или путем определения биологической активности С5, как при реакции гемолиза СН50 или АН50, и/или путем определения биологической активности одной или нескольких молекул, связанных с системой комплемента, например, продуктами С5, такими как С5а и С5Ь (или in vivo условиях, например, в условиях гемолиза).
В способах и вариантах применения настоящего изобретения клетка может вступать в контакт in vitro или in vivo, т.е. клетка может быть в пределах субъекта. В вариантах осуществления настоящего изобретения, когда клетка находится пределах субъекта, способы могут включать дополнительное приведение клетки в контакт с антителом к компоненту комплемента С5, например, экулизумабом.
Клеткой, пригодной для лечения с применением способов по настоящему изобретению, может быть любая клетка, экспрессирующая ген С5. Клеткой, пригодной для лечения с применением способов по настоящему изобретению, может быть клетка млекопитающего, например, клетка примата (например, клетка человека или клетка примата, отличного от человека, например, клетка обезьяны или клетка шимпанзе), клетка отличного от примата (например, клетка коровы, клетка свиньи, клетка верблюда, клетка ламы, клетка лошади, клетка козы, клетка кролика, клетка овцы, клетка хомяка, клетка морской свинки, клетка кошки, клетка собаки, клетка крысы, клетка мыши, клетка льва, клетка тигра, клетка медведя или клетка буйвола), клетка птицы (например, клетка утки или клетка гуся), или клетка кита. В одном варианте осуществления клетка представляет собой клетку человека, например, клетку печени человека.
Экспрессию С5 можно ингибировать в клетке на по меньшей мере 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%,
31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%,
50%, 51%, 52%, 53%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%,
69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%,
88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или приблизительно 100%.
Способы и варианты применения in vivo по настоящему изобретению могут включать введение субъекту композиции, содержащей иРНК, где иРНК включает нуклеотидную последовательность, комплементарную по меньшей мере части РНК-транскрипта гена С5 млекопитающего, подлежащего лечению. Когда организм, подлежащий лечению, представляет собой млекопитающего, такого как человек, композицию можно вводить любыми способами, известными в данной области техники, включая без ограничения подкожное, внутривенное, оральное, внутрибрюшинное или парентеральное введение, включая внутричерепное (например, внутрижелудочковое, интрапаренхимальное и интратекальное), внутримышечное, трансдермальное, через дыхательные пути (аэрозоль), назальное, ректальное и местное (в том числе трансбуккальное и подъязычное) введение. В некоторых вариантах осуществления композиции вводят в виде подкожных или внутривенных инфузий или инъекций.
В некоторых вариантах осуществления введение осуществляют посредством инъекции вещества замедленного всасывания. Инъекция вещества замедленного всасывания может высвобождать иРНК устойчивым образом в течение длительного периода времени. Таким образом, при помощи инъекции вещества замедленного всасывания можно снижать частоту введения доз, необходимых для получения необходимого действия, например, необходимого ингибирования С5, или терапевтического или профилактического действия. Инъекция вещества замедленного всасывания может также предусматривать более устойчивые концентрации в сыворотке. Инъекции вещества замедленного всасывания могут включать подкожные инъекции или внутримышечные инъекции. В предпочтительных вариантах осуществления инъекция вещества замедленного всасывания является подкожной инъекцией.
В некоторых вариантах осуществления введение осуществляют посредством насоса. Насос может быть внешним насосом или имплантированным хирургическим путем насосом. В определенных вариан
- 94 044245 тах осуществления насос является подкожно имплантированным осмотическим насосом. В других вариантах осуществления насос является инфузионным насосом. Инфузионный насос можно применять для внутривенных, подкожных, артериальных или эпидуральных инфузий. В предпочтительных вариантах осуществления инфузионный насос является подкожным инфузионным насосом. В других вариантах осуществления насос является имплантируемым хирургическим путем насосом, который доставляет иРНК в печень.
Способ введения можно выбрать, исходя из того, необходимо местное или системное лечение, и исходя из области, которая подлежит лечению. Путь и место введения можно выбрать для увеличения нацеленного воздействия.
В одном аспекте настоящее также изобретение предусматривает способы ингибирования экспрессии гена С5 у человека. Настоящее изобретение также относится к композиции, содержащей иРНК, например, dsRNA, нацеленной на ген С5 в клетке млекопитающего для применения в ингибировании экспрессии гена С5 у млекопитающего. В другом аспекте настоящее изобретение относится к применению иРНК, например, dsRNA, нацеленной на ген С5 в клетке млекопитающего, при производстве лекарственного средства для ингибирования экспрессии гена С5 у млекопитающего.
Способы и варианты применения включают введение млекопитающему, например, человеку, композиции, содержащей иРНК, например, dsRNA, нацеленной на ген С5 в клетке млекопитающего и поддержание млекопитающего в течение времени, достаточного для обеспечения расщепления мРНКтранскрипта гена С5, ингибируя, таким образом, экспрессию гена С5 у млекопитающего. В некоторых вариантах осуществления способы дополнительно включают введение субъекту антитела к компоненту комплемента С5, например, экулизумаба.
Уменьшение экспрессии гена можно оценить любым из способов, известных в данной области, например qRT-PCR, описанным в данном документе. Снижение синтеза белка можно оценить любым из способов, известных в данной области, например, ELISA или вестерн-блоттинга, описанных в данном документе. В одном варианте осуществления биопсия печени в виде пункции служит образцом ткани для мониторинга снижения экспрессии гена и/или белка С5. В другом варианте осуществления образец крови служит образцом ткани для мониторинга снижения экспрессии гена и/или белка С5. В других вариантах осуществления ингибирование экспрессии гена С5 контролируют косвенно, например, путем определения экспрессии и/или активности гена в пути биосинтеза С5, включая, например, С5а, С5Ь и растворимый С5Ь-9 (см, например, фиг. 1). Например, активность CD59 можно мониторить для определения ингибирования экспрессии гена С5. Также можно измерять СН50, АН50, образование тромбов и/или лактатдегидрогеназу (LDH) в сыворотке образца, например, крови или образце печени. Подходящие анализы дополнительно описаны в разделе примеров ниже.
Если не указано иное, все технические и научные термины, используемые в данном документе, имеют такое значение, которое обычно понятно специалисту в области техники, к которой относится настоящее изобретение. Хотя способы и материалы, аналогичные или эквивалентные таковым, описанным в данном документе, можно применять в практическом осуществлении или испытании иРНК и способов, описанных в настоящем изобретении, подходящие способы и материалы описаны ниже. Все публикации, заявки на патент, патенты и другие литературные источники, которые упоминаются в данном документе, включены посредством ссылки во всей своей полноте. В случае конфликта, настоящее описание, включая определения, будет иметь преимущественную силу. Кроме того, материалы, способы и примеры являются только иллюстративными и не подразумеваются как ограничивающие.
Примеры
Пример 1. Синтез иРНК.
Происхождение реагентов.
Если происхождение реагента конкретно не приведено в данном документе, такой реагент можно получать от любого поставщика реагентов для молекулярной биологии со стандартным качеством/чистотой для применения в молекулярной биологии.
Транскрипты.
Осуществляли конструирование siRNA для идентификации siRNA, нацеленной на транскриты С5 человека, макак резус (Масаса mulatta), мыши, крысы, отмеченных в базе данных генов NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/). В конструировании использовали следующие транскрипты из коллекции RefSeq NCBI: человека - NM_001735.2; макак резус - ХМ_001095750.2; мыши - NM_010406.2; крысы - ХМ_345342.4. Дуплексы SiRNA конструировали в нескольких отдельных партиях, включая без ограничения партии, содержащие дуплексы, соответствующие только транскриптам человека и макак резус; только транскриптам человека, макак резус и мыши; только транскриптам человека, макак резус, мыши и крысы; и только транскриптам мыши и крысы. Все дуплексы siRNA конструировали с получением 100% идентичности с указанным транскриптом человека и транскриптов других видов, рассмотренных в каждой партии конструкции (выше).
Конструирование siRNA, специфичность и прогноз эффективности.
Прогнозируемую специфичность всех возможных 19mers предсказывали из каждой последовательности. Затем отбирали 19mers кандидаты, не имеющих повторы более, чем 7 нуклеотидов. Эти 2971 кан
- 95 044245 дидата человек/макак резус, 142 человек/макак резус/мышь, 54 человек/макак резус/мышь/крыса и 807 мышь/крыса применяли в обширных исследованиях к соответствующим транскриптомам (определенным, как набор записей NM_ и ХМ_ в пределах наборов RefSeq NCBI человека, макак резуса, собаки, мыши или крысы), с применением исчерпывающего алгоритма полный перебор, реализованного в питон-скрипте BruteForce.ру. Далее скрипт разбирали на транскрипт-олиго выравнивания для создания показателя на основе положения и числа несоответствий между siRNA и любым потенциальным 'нецелевым' транскриптом. Нецелевой показатель взвешивали, чтобы подчеркнуть различия в исходном участке siRNAs, в положениях 2-9 от 5'-конца молекулы.
Каждая пара олиго-транскрипт из полного перебора получала значение несовпадения путем суммирования индивидуальных баллов несовпадения; несовпадения в положении 2-9 считали как 2,8, несовпадения в положениях сайта расщепления 10-11 считали как 1,2, и несовпадения в участке 12-19 считали как 1,0. Дополнительное нецелевое предсказание осуществляли путем сравнения частоты гептамеров и октомеров, полученных из 3 различных, производных исходных гексамеров каждого олигонуклеотида. Гексамеры с позиций 2-7 по отношению к началу 5' применяли для создания 2 гептамеров и одного октамера. Гептамер 1 создавали путем добавления 3'-А к гексамеру; гептамер 2 создавали путем добавления 5'-А к гексамеру; октомер создавали путем добавления А и к 5'-, и к 3'-концам гексамера. Предварительно рассчитывали частоту октамеров и гептамеров в 3'-UTRome человека, макак-резус, мыши или крысы (определяется как подпоследовательность транскриптома из базы данных RefSeq NCBI, где конец кодирующего участка, CDS, четко определен). Частоту октамера приводили в соответствие с частотой гептамера, используя среднее значение из диапазона частот октамера. Затем рассчитывали mirSeedScore путем расчета суммы (3 X подсчет приведенного в соответствие октамера) (2 X подсчет гептамера 2) (1 X подсчет гептамера 1)).
Обе цепи siRNA назначали к категории специфики в соответствии с расчетными баллами: оценка выше 3 квалифицируется как весьма специфическая, при значении 3 как специфическая, и между 2,2 и 2,8 как умеренно специфическая. Дуплексы сортировали по специфике антисмысловой цепи и отбирали те дуплексы, чьи антисмысловые олигонуклеотиды не содержали GC в первом положении, не содержали G в обоих положениях 13 и 14, и содержали 3 или больше U или А в исходном участке.
Для GalNaC-коньюгированных дуплексов конструировали смысловой 21mer и антисмысловой 23mer олигонуклеотиды путем расширения антисмысловых 19mers (описано выше) до 23 нуклеотидов в целевой комплементарной последовательности. Все виды транскриптов, включенные в конструкцию партии, проверяли на комплементарность. Применяли только 23mers, сохранившие 100% комплементарность последовательности по меньшей мере у 2 видов. Для каждого дуплекса определяли смысловые 21mer как обратную комплементарность первых 21 нуклеотидов антисмысловой цепи.
Выбор последовательности siRNA.
Синтезировали и формировали в дуплексы в общей сложности 23 смысловых и 23 антисмысловых, полученных от человек/макак резус, 6 смысловых и 6 антисмысловых, полученных от человек/макак резус/мыши/мышь/крыса, и 13 смысловых и 13 антисмысловых, полученных от мышь/крыса, олигомеров siRNA 19mer.
Вышеуказанные наборы 19mer расширяли до дуплексов 21/23mer для GalNac-коньюгированной конструкции и повторно классифицировали в соответствии с их новыми видовыми соответствиями. Двадцать семь смысловых и 27 антисмысловых, полученных из человек/макак резус, 1 смысловой и 1 антисмысловой, полученных из человек/макак резус/мышь, 3 смысловых и 3 антисмысловых, полученых из человек/макак резус/крыса, 4 смысловых и 4 антисмысловых, полученых из человек/макак резус/мышь/крыса, и 13 смысловых и 13 антисмысловых, полученых из мышь/крыса 21mer (смыслового) и 23mer (антисмыслового) олигонуклеотидов синтезировали и формировали в дуплексы.
Подробный список последовательностей смысловых и антисмысловых цепей С5 приведены в табл. 3-6.
Синтез siRNA.
Общие способы синтеза РНК малого и среднего размера.
РНК-олигонуклеотиды синтезировали в масштабах между 0,2-500 мкмоль с применением коммерчески доступных 5'-О-(4,4'-диметокситритил)-2'-O-t-бутилдиметилсилил-3'-О-(2-цианоэтил-N,N-диизопропил) фосфорамидит-мономеров уридина, 4-N-ацетилцитидин, 6-N-бензоиладенозина и 2-Nизобутиргуанозина и соответствующих 2'-O-метил и 2'-фторфосфорамидитов, согласно стандартным протоколам синтеза олигонуклеотидов в твердой фазе. Растворы амидита готовили в концентрации 0,10,15 М и применяли 5-этилтио-1Н-тетразол (0,25-0,6 М в ацетонитриле) в качестве активатора. В процессе синтеза вводили фосфотиоатные модификации остова с применением 0,2 М фенилацетил дисульфида (PADS) в лутидин:ацетонитрил (1:1) (об.:об.) или 0,1 М 3-(диметиламинометилен) амино-3H-1,2,4дитиазол-5 тиона (DDTT) в пиридине для стадии окисления. После завершения синтеза последовательности отщепляли от твердой подложки и снимали защиту с применением метиламина с последующим триметиламином 3HF для удаления присутствующих 2'-О-t-бутилдиметилсилил-защитных групп.
Для масштабов синтеза между последовательностей (5-500 мкмоль и полностью 2'-модифицированных 2'-фтор и/или 2'-O-метил или их комбинации), у олигонуклеотов удаляли защитную группу с применением 3:1 (об./об.) этанола и концентрированного (28-32%) водного раствора аммиака либо при
- 96 044245
35°C 16 ч, или при 55°C в течение 5,5 ч. Перед удалением защитной группы аммиака олигонуклеотиды обрабатывали 0,5 М пиперидином в ацетонитриле в течение 20 мин на твердой подложке. Неочищенные олигонуклеотиды анализировали с помощью LC-MS и анионообменной HPLC (IEX-HPLC). Очистку олигонуклеотидов проводили с помощью IEX HPLC в применением: 20 мМ фосфата, 10%-15% ACN, рН 8,5 (буфер А) и 20 мМ фосфата, 10%-15% ACN, 1 M NaBr, pH 8,5 (буфер В). Фракции анализировали на чистоту с помощью аналитической HPLC. Содержащие продукт фракции с приемлемой чистотой объединяли и концентрировали на роторном испарителе до обессоливания. Образцы обессоливали с помощью эксклюзионной хроматографии и лиофилизировали до сухости. Равные молярные количества смысловых и антисмысловых цепей отжигали в 1х PBS-буфере с получением соответствующих дуплексов siRNA.
Для малых масштабов (0,2-1 мкмоль) синтез проводили на синтезаторе MerMade 192 в формате 96 лунок. В случае полностью 2'-модифицированных последовательностей (2'-фтор и/или 2'-О-метил или их комбинаций), у олигонуклеотов удаляли защитную группу с применением метиламина при комнатной температуре в течение 30-60 мин с последующей инкубацией при 60°C в течение 30 мин или с применением 3:1 (об./об.) этанола и концентрированного (28-32%) водного раствора аммиака при комнатной температуре в течение 30-60 мин с последующей инкубацией при 40°C в течение 1,5 ч. Неочищенные олигонуклеотиды затем осаждали в растворе ацетонитрил:ацетон (9:1) и выделяли центрифугированием и декантированием супернатанта. Неочищенный олигонуклеотидный осадок ресуспендировали в 20 мМ буфера NaOAc и анализировали с помощью LC-MS и анионообменной HPLC. Неочищенные олигонуклеотидные последовательности обессоливали в глубоких 96-луночных планшетах на колонке HiTrap Sephadex G25 5 мл (GE Healthcare). Из каждой лунки отбирали 1,5 мл образцов, соответствующих индивидуальной последовательности. Эти очищенные обессоленные олигонуклеотиды анализировали с помощью LC-MS и анионообменной хроматографии. Дуплексы получали путем отжига эквимолярных количеств смысловых и антисмысловых последовательностей на роботе Tecan. Концентрацию дуплексов доводили до 10 мкМ в 1х PBS-буфере.
Синтез GalNAc-коньюгированных олигонуклеотидов для анализа in vivo.
Олигонуклеотиды, коньюгированные с лигандом GalNAc на их 3'-конце, синтезировали в масштабах между 0,2-500 мкмоль с применением твердой подложки, предварительно загруженной Y-образной линкером, несущим 4,4-диметокситритил (DMT)-защитную первичную группу гидрокси для синтеза олигонуклеотида и GalNAc-лиганда, присоединенного через фрагмент.
Для синтеза конъюгатов GalNAc в масштабах между 5-500 мкмоль, указанный протокол синтеза РНК дополняли следующими модификациями: Для подложек синтеза на основе полистирола применяли 5% дихлоруксусную кислоту в толуоле для DMT-расщепления в процессе синтеза. Отщепление от подложки и удаление защиты проводили, как описано выше. Фосфотиоатно-богатые последовательности (обычно >5 фосфотиоатов) синтезированы без удаления конечной 5'-DMT-группы (с DMT) и после расщепления и удаления защитной группы, как описано выше, очищали с помощью обращенно-фазовой HPLC с применением 50 мМ ацетата аммония в воде (буфер А) и 50 мМ ацетат аммония в 80% ацетонитриле (буфер В). Фракции анализировали на чистоту с помощью аналитической HPLC и/или LC-MS. Содержащие продукт фракции с приемлемой чистоты, объединяли и концентрировали на роторном испарителе. DMT-группу удаляли с примененим 20-25% уксусной кислоты в воде до завершения процесса. Образцы обессоливали с помощью эксклюзионной хроматографии и лиофилизировали до сухости. Равные молярные количества смысловых и антисмысловых цепей отжигали в 1х PBS-буфере с получением соответствующих дуплексов siRNA.
Для синтеза малых масштабов конъюгатов GalNAc (0,2-1 мкмоль), включая последовательности с несколькими фосфотиоатными связями, применяли протоколы, описанные выше для синтеза РНК или полностью 2'-Р/2'-ОМе-содержащих последовательностей на платформе MerMade. Синтез проводили на предварительно упакованных колонках, содержащих GalNAc-функционализированную управляемую подложку со стеклянными порами.
Пример 2. Скрининг in vitro.
Клеточная культура и трансфекции.
Клетки Hep3B (АТСС, Манассас, Вирджиния) выращивали практически до слияния при 37°C в атмосфере 5% СО2 в минимальной поддерживающей среде Игла (АТСС), дополненной 10% FBS, стрептомицином и глутамином (АТСС), перед отделением от чашки Петри путем обработки трипсином. Клетки промывали и ресуспендировали до 0,25x106 клеток/мл. Во время трансфекций клетки высевали на 96луночный планшет с приблизительно 20000 клеток на лунку.
Первичные гепатоциты мыши (РМН) выделяли непосредственно перед процедурой из самок мышей линии C57BL/6 (Charles River Labortories International, Inc. Willmington, MA), меньше чем за 1 ч до трансфекций, и выращивали в среде первичных гепатоцитов. Клетки ресуспендировали до 0,11x106 клеток/мл в среде InVitroGRO CP Rat (покрытие) (Celsis In Vitro Technologies, номер по каталогу S01494). Во время трансфекций клетки высевали на 96-луночный коллагеновый планшет BD Biocoat (BD, 356407), 10000 клеток на лунку, и инкубировали при 37°C в атмосфере 5% СО2.
- 97 044245
Криоконсервированные первичные гепатоциты яванского макака (Celsis В Vitro Technologies,
M003055-P) оттаивали при 37°C на водяной бане непосредственно перед применением и ресуспендировали до 0,26x106 клеток/мл в среде InVitroGRO CP (покрытие) (Celsis В Vitro Technologies, номер по каталогу Z99029). Во время трансфекций клетки высевали на 96-луночный коллагеновый планшет BD Biocoat (BD, 356407), 25000 клеток на лунку, и инкубировали при 37°C в атмосфере 5% CO2.
Для Hep3B, РМН и первичных гепатоцитов Cynomolgus, трансфекцию выполняли путем добавления 14,8 мкл of Opti-MEM с 0,2 мкл RNAiMax липофектамина на лунку (Invitrogen, Карлсбад Калифорния, номер по каталогу 13778-150) к 5 мкл каждого дуплекса siRNA в отдельной лунке в 96-луночном планшете. Смесь затем инкубировали при комнатной температуре в течение 20 мин. 80 мкл полных питательных сред без антибиотика, содержащих соответствующее количество клеток, затем добавляли к смеси siRNA. Клетки инкубировали в течение 24 ч перед очисткой РНК.
Эксперименты в отношении разовой дозы выполняли при конечной концентрации дуплекса 10 нМ и 0,1 нМ для GalNAc-модифицированных последовательностей или при конечной концентрации дуплекса 1 нМ и 0,01 нМ для всех других последовательностей. Эксперименты зависимости дозы-ответ проводили при 3, 1, 0,3, 0,1, 0,037, 0,0123, 0,00412 и 0,00137 нм конечной концентрации дуплекса для первичных гепатоцитов мыши и при 3, 1, 0,3, 0,1, 0,037, 0,0123, 0,00412, 0,00137, 0,00046, 0,00015, 0,00005 и 0,000017 нМ конечной концентрации дуплекса для клеток Hep3B.
Трансфекция посредством свободного поглощения.
Эксперименты свободного поглощения проводили путем добавления 10 мкл дуплексов siRNA в PBS на лунку в 96-луночный планшет. 90 мкл полной среды роста, содержащей соответствующее количество клеток для типа клеток, затем добавляли к siRNA. Клетки инкубировали в течение 24 ч перед очисткой РНК. Эксперименты в отношении разовой дозы выполняли при конечной концентрации дуплекса 500 нМ и 5 нМ и эксперименты в отношении эффекта дозы выполняли при конечной концентрации дуплекса 1000, 333, 111, 37, 12,3, 4,12, 1,37, 0,46 нМ.
Выделение общей РНК с исполвзованием набора DYNABEADS mRNA Isolation Kit (Invitrogen, номер по каталогу 610-12).
Клетки собирали и лизировали в 150 мкл лизирующего/связывающего буфера, затем смешивали в течение 5 мин при 850 об/мин с помощью Eppendorf Thermomixer (скорость смешивания была одинаковой на протяжении процесса). 10 мкл магнитных гранул и 80 мкл смеси лизирующего/связывающего буфера добавляли в круглодонный планшет и смешивали в течение 1 мин. Магнитные гранулы фиксировали при помощи магнитного стенда и супернатант удаляли без смещения гранул. После удаления супернатанта лизированные клетки добавляли к оставшимся гранулам и смешивали в течение 5 мин. После удаления супернатанта магнитные гранулы промывали 2 раза 150 мкл промывочного буфера А и смешивали в течение 1 мин. Гранулы фиксировали и супернатант удаляли. Гранулы затем промывали 150 мкл промывочного буфера В, фиксировали и супернатант удаляли. Гранулы затем промывали 150 мкл промывочного буфера В, фиксировали и супернатант удаляли. Наконец, гранулам давали возможность высохнуть в течение 2 мин. После высыхания добавляли 50 мкл элюирующего буфера и смешивали в течение 5 мин при 70°C. Гранулы фиксировали на магните в течение 5 мин. Удаляли 45 мкл супернатанта и добавляли в другой 96-луночный планшет.
Синтез кДНК с исполвзованием набора ABI High capacity cDNA reverse transcription kit (Applied Biosystems, Форстер-Сити, Калифорния, № по кат. 4368813)
Готовили мастер-микс из 2 мкл 10Х буфера, 0,8 мкл 25Х dNTP, 2 мкл случайных праймеров, 1 мкл обратной транскриптазы, 1 мкл ингибитора РНКазы и 3,2 мкл Н2О на реакцию. Равные объемы мастермикса и РНК смешивали до конечного объема 12 мкл для in vitro скрининга или 20 мкл для in vivo скрининга образцов. кДНК получали с применением термоциклера Bio-Rad C-1000 или S-1000 (Hercules, Калифирния) посредством следующих стадий: 25°C в течение 10 мин, 37°C в течение 120 мин, 85°C в течение 5 с и хранение при 4°C.
PCR в режиме реального времени.
мкл кДНК добавляли к мастер-миксу, содержащему 2 мкл Н2О, 0,5 мкл зонда TaqMan для GAPDH (Life Technologies, номер по каталогу 4326317Е для клеток Hep3B, номер по каталогу 352339Е для первичных гепатоцитов мыши или обычного зонда для первичных гепатоцитов макаков-крабоеда), 0,5 мкл зонда TaqMan для С5 (Life Technologies, номер по каталогу Hs00156197_m1 для Hep3B клеток или mm00439275_m1 для первичных гепатоцитов мыши или обычного зонда для первичных гепатоцитов яванского макака) и 5 мкл зонда мастер-микс LightCycler 480 (Roche, номер по каталогу 04887301001) на лунку в 384-луночных планшетах (Roche, номер по каталогу 04887301001). PCR в режиме реального времени выполняли в системе Roche LC480 Real Time PCR system (Roche) с применением AACt(RQ)анализа. Для скрининга in vitro каждый дуплекс испытывали с двумя биологическими повторами, если не указано иное, и каждый раз PCR в режиме реального времени проводили в одинаковых технических повторах. Для скрининга in vitro каждый дуплекс испытывали в одном или нескольких экспериментах (3 мыши на группу) и каждый раз PCR в режиме реального времени проводили в одинаковых технических повторах.
- 98 044245
Для вычисления относительного кратного изменения в уровнях мРНК С5, данные в реальном времени анализировали с применением ΔΔCt-способа и нормализовали в соответствии с данными анализов, выполненных с клетками, трансфицированными 10 нМ AD-1955, или имитационными трансфицированными клетками. IC50 вычисляли с применением модели согласования по 4 параметрам с использованием XLFit и нормализовали в соответствии с таковыми для клеток, трансфицированных AD-1955 в таком же диапазоне доз или в отношении его наиболее низкой дозы.
Смысловая и антисмысловая последовательности AD-1955 представляют собой: СМЫСЛОВАЯ: cuuAcGcuGAGuAcuucGAdTsdT (SEQ ID NO: 13);
АНТИСМЫСЛОВАЯ: UCGAAGuACUcAGCGuAAGdTsdT (SEQ ID NO: 14).
Табл. 7 показывает результаты теста разовой дозы в клетках Hep3B, трансфицированных указанными GalNAC-конъюгированными модифицированными иРНК. Данные выражены в виде процентного отношения оставшегося количества транскрипта по отношению к необработанным клеткам.
Табл. 8 показывает результаты теста трансфекции разовой дозы в первичных гепатоцитах мыши, трансфицированных указанными GalNAC-конъюгированными модифицированными иРНК. Данные выражены в виде процентного отношения оставшегося количества транскрипта по отношению к необработанным клеткам.
Табл. 9 показывает результаты теста свободного поглощения разовой дозы в первичных гепатоцитах яванского макака указанными GalNAC-конъюгированными модифицированными иРНК. Данные выражены в виде процентного отношения оставшегося количества транскрипта по отношению к необработанным клеткам.
Табл. 10 показывает результаты теста свободного поглощения разовой дозы в первичных гепатоцитах мыши указанными GalNAC-конъюгированными модифицированными иРНК. Данные выражены в виде процентного отношения оставшегося количества транскрипта по отношению к необработанным клеткам.
Табл. 11 показывает зависимость доза-ответ в тесте свободного поглощения в первичных гепатоцитах яванского макака указанными GalNAC-конъюгированными модифицированными иРНК. Указанные значения IC50 представляют значения IC50 относительно необработанных клеток.
Табл. 12 показывает зависимость доза-ответ в тесте свободного поглощения в первичных гепатоцитах мыши указанными GalNAC-конъюгированными модифицированными иРНК. Указанные значения IC50 представляют значения IC50 относительно необработанных клеток.
Табл. 13 показывает результаты теста разовой дозы в клетках Hep3B, трансфицированных указанными модифицированными и немодифицированными иРНК. Данные выражены в виде процентного отношения оставшегося количества транскрипта по отношению к необработанным клеткам. Доза 0,01 нМ представляла собой разовую биологическую трансфекцию и доза 1 нМ представляла собой повторную биологическую трансфекцию.
Табл. 14 показывает результаты теста разовой дозы в первичных гепатоцитах мыши, трансфицированных указанными модифицированными и немодифицированными иРНК. Данные выражены в виде процентного отношения оставшегося количества транскрипта по отношению к необработанным клеткам.
Табл. 15 показывает зависимость доза-ответ в клетках Hep3B, трансфицированных указанными модифицированными и немодифицированными иРНК. Указанные значения IC50 представляют значения IC50 относительно необработанных клеток.
Табл. 16 показывает зависимость доза-ответ в первичных гепатоцитах мыши, трансфицированных указанными модифицированными и немодифицированными иРНК. Указанные значения IC50 представляют значения IC50 относительно необработанных клеток.
Таблица 2
Сокращения нуклеотидных мономеров, применяемые в представлении последовательности нуклеиновой кислоты. Следует понимать, что эти мономеры, если они присутствуют в олигонуклеотиде, взаимно связаны 5'-3'-фосфодиэфирными связями
| Сокращение | Нуклеотид(ы) |
| А | Аденозин-3'-фосфат |
| Af | 2'-фтораденозин-3'-фосфат |
| Af s | 2'-фтораденозин-3'-фосфотиоат |
| As | аденозин-3'-фосфотиоат |
| С | цитидин-3'-фосфат |
| Cf | 2'-фторцитидин-3'-фосфат |
- 99 044245
| Cfs | 2'-фторцитидин-3 т-фосфотиоат |
| Cs | цитидин-3’-фосфотиоат |
| G | гуанозин-3 т-фосфат |
| Gf | 2'-фторгуанозин-3'-фосфат |
| Gf s | 2’-фторгуанозин-3'-фосфотиоат |
| Gs | гуанозин-3 т-фосфотиоат |
| T | 5'-метилуридин-3 т-фосфат |
| Tf | 2'-фтор-5-метилуридин-З'-фосфат |
| Tfs | 2’-фтор-5-метилуридин-З'-фосфотиоат |
| Ts | 5-метилуридин-3’-фосфотиоат |
| U | уридин-3’-фосфат |
| Uf | 2'-фторуридин-3'-фосфат |
| Uf s | 2’-фторуридин-3'-фосфотиоат |
| Us | уридин-3’-фосфотиоат |
| N | любой нуклеотид (G, А, С, Т или U) |
| a | 2'-0-метиладенозин-З'-фосфат |
| as | 2'-0-метиладенозин-З'-фосфотиоат |
| c | 2'-О-метилцитидин-3’-фосфат |
| cs | 2'-О-метилцитидин-3’-фосфотиоат |
| g | 2'-0-метилгуанозин-З’-фосфат |
| gs | 2'-0-метилгуанозин-З'-фосфотиоат |
| t | 2’-О-метил-5-метилуридин-З'-фосфат |
| ts | 2'-О-метил-5-метилуридин-З’-фосфотиоат |
| u | 2'-О-метилуридин-3'-фосфат |
| US | 2'-О-метилуридин-3’-фосфотиоат |
| S | фосфотиоатная связь |
| L96 | N-[трис(GalNAc-алкил)-амидодеканоил)]-4гидроксипролинол-Нур-(GalNAc-алкил)3 |
| (dt) | дезокси-тимин |
Таблица 3
Последовательности немодифицированной смысловой и антисмысловой цепи dsRNA С5_____
| ID дуплекса | Смысловая нить | Смысловая немодифицированная последовательность | SEQ ID NO: | Анти- смысловая | Антисмысловая немодифицированная последовательность | SEQ ID NO: | Виды_ название олигонуклеотида1 |
| AD- 58093.12UM3 | А-118310.1 | AAUAACUCACUA UAAUUACUU | 15 | А-118311.1 | AAGUAAUUAUAGUG AGUUAUUUU | 66 | NM_001735.2_151 7-1539_as |
| AD-58099.1 им | А-118312.1 | UGACAAAAUAAC UCACUAUAA | 16 | А-118313.1 | UUAUAGUGAGUUAU UUUGUCAAU | 67 | NM_001735.2_151 l-1533_as |
| AD-58105.1 им | А-118314.1 | CUUCCUCUGGAA AUUGGCCUU | 17 | А-118315.1 | AAGGCCAAUUUCCA GAGGAAGCA | 68 | NM_001735.2_273 3-2755_as |
| AD-58111.1 им | А-118316.1 | GACAAAAUAACU CACUAUAAU | 18 | А-118317.1 | AUUAUAGUGAGUUA UUUUGUCAA | 69 | NM_001735.2_151 2-1534_as |
- 100044245
| AD-58117.1 UM | A-118318.1 | UCCUCUGGAAAU UGGCCUUCA | 19 | A-118319.1 | UGAAGGCCAAUUUC CAGAGGAAG | 70 | NM_001735.2_273 5-2757_as |
| AD-58123.1 UM | A-118320.1 | AAGCAAGAUAUU UUUAUAAUA | 20 | A-118321.1 | UAUUAUAAAAAUAU CUUGCUUUU | 71 | NM_001735.2_784 -806_as |
| AD-58129.1 UM | A-118322.1 | AAAAUGUUUUUG UCAAGUACA | 21 | A-118323.1 | UGUACUUGACAAAA ACAUUUUCU | 72 | NM_001735.2_474 4-4766_as |
| AD-58088.1 UM | A-118324.1 | AUUUAAACAACA AGUACCUUU | 22 | A-118325.1 | AAAGGUACUUGUUG UUUAAAUCU | 73 | NM_001735.2_982 -1004_as |
| AD-58094.1 UM | A-118326.1 | AUUCAGAAAGUC UGUGAAGGA | 23 | A-118327.1 | UCCUUCACAGACUU UCUGAAUUU | 74 | NM_001735.2_457 8-4 600_as |
| AD-58100.1 UM | A-118328.1 | ACACUGAAGCAU UUGAUGCAA | 24 | A-118329.1 | UUGCAUCAAAUGCU UCAGUGUAU | 75 | NM_001735.2_169 -191_as |
| AD-58106.1 UM | A-118330.1 | GCAGUUCUGUGU UAAAAUGUC | 25 | A-118331.1 | GACAUUUUAACACA GAACUGCAU | 76 | NM_001735.2_259 l-2613_as |
| AD-58112.1 UM | A-118332.1 | AGGAUUUUGAGU GUAAAAGGA | 26 | A-118333.1 | UCCUUUUACACUCA AAAUCCUUU | 77 | NM_001735.2_295 5-2977_as |
| AD-58118.1 UM | A-118334.1 | AAUGAUGAACCU UGUAAAGAA | 27 | A-118335.1 | UUCUUUACAAGGUU CAUCAUUUU | 78 | NM_001735.2_202 5-2047_as |
| AD-58124.1 UM | A-118336.1 | AUCAUUGGAACA UUUUUCAUU | 28 | A-118337.1 | AAUGAAAAAUGUUC CAAUGAUUU | 79 | NM_001735.2_311 8-3140_as |
| AD-58130.1 UM | A-118338.1 | AGCCAGAAAUUC GGAGUUAUU | 29 | A-118339.1 | AAUAACUC C GAAUU UCUGGCUUG | 80 | NM_001735.2_231 7-2339_as |
| AD-58089.1 UM | A-118340.1 | UCCCUGGGAGAU AAAACUCAC | 30 | A-118341.1 | GUGAGUUUUAUCUC CCAGGGAAA | 81 | NM_001735.2_361 8-3 64 0_as |
| AD-58095.1 UM | A-118342.1 | GAAAAUGAUGAA CCUUGUAAA | 31 | A-118343.1 | UUUACAAGGUUCAU CAUUUUCUU | 82 | NM_001735.2_202 2-2044_as |
| AD-58101.1 UM | A-118344.1 | AUUGCUCAAGUC ACAUUUGAU | 32 | A-118345.1 | AUCAAAUGUGACUU GAGCAAUUC | 83 | NM_001735.2_918 -940 as |
| AD-58107.1 UM | A-118346.1 | GAGAUUGCAUAU GCUUAUAAA | 33 | A-118347.1 | UUUAUAAGCAUAUG CAAUCUCUG | 84 | NM_001735.2_469 8-4720_as |
| AD-58113.1 UM | A-118348.1 | GUUAUCCUGAUA AAAAAUUUA | 34 | A-118349.1 | UAAAUUUUUUAUCA GGAUAACUU | 85 | NM_001735.2_205 -227_as |
| AD-58119.1 UM | A-118350.1 | AGGAAGUUUGCA GCUUUUAUU | 35 | A-118351.1 | AAUAAAAGCUGCAA ACUUCCUCA | 86 | NM_001735.2_414 7-4169_as |
| AD-58125.1 UM | A-118352.1 | GAAGAAAUUGAU CAUAUUGGA | 36 | A-118353.1 | UC CAAUAUGAUCAA UUUCUUCUA | 87 | NM_001735.2_555 -577_as |
| AD-58131.1 UM | A-118354.1 | AUCCUGAUAAAA AAUUUAGUU | 37 | A-118355.1 | AACUAAAUUUUUUA UCAGGAUAA | 88 | NM_001735.2_208 -230_as |
| AD-58090.1 UM | A-118356.1 | UGGAAAAGAAAU CUUAGUAAA | 38 | A-118357.1 | UUUACUAAGAUUUC UUUUCCAAA | 89 | NM_001735.2_278 6-2808_as |
| AD-58096.1 UM | A-118358.1 | UCUUAUCAAAGU AUAAACAUU | 39 | A-118359.1 | AAUGUUUAUACUUU GAUAAGAUG | 90 | NM_001735.2_159 6-1618_as |
| AD-58102.1 UM | A-118360.1 | UCCCUACAAACU GAAUUUGGU | 40 | A-118361.1 | AC CAAAUUCAGUUU GUAGGGAGA | 91 | NM_001735.2_108 2-1104_as |
- 101 044245
| AD-58108.1 им | А-118362.1 | CAGGAGCAAACA UAUGUCAUU | 41 | A-118363.1 | AAUGACAUAUGUUU GCUCCUGUC | 92 | NM_001735.2 109_as | _87- |
| AD-58114.1 им | А-118364.1 | ACAUGUAACAAC UGUAGUUCA | 42 | A-118365.1 | UGAACUACAGUUGU UACAUGUAC | 93 | NM_001735.2_ 9-4131_as | _410 |
| AD-58120.1 им | А-118366.1 | CAGGAAAUCAUU GGAACAUUU | 43 | A-118367.1 | AAAUGUUCCAAUGA UUUCCUGUU | 94 | NM_001735.2_ 2-3134_as | _311 |
| AD-58126.1 им | А-118368.1 | UUUAAGAAUUUU GAAAUUACU | 44 | A-118369.1 | AGUAAUUUCAAAAU UCUUAAAGU | 95 | NM_001735.2 -781_as | _759 |
| AD-58132.1 им | А-118370.1 | UAUUCUGCAACU GAAUUCGAU | 45 | A-118371 .1 | AUCGAAUUCAGUUG CAGAAUAAC | 96 | NM_001735.2_ 2-4434_as | _441 |
| AD-58091.1 им | А-118372.1 | GCCCUUGGAAAG AGUAUUUCA | 46 | A-118373.1 | UGAAAUACUCUUUC CAAGGGCUU | 97 | NM_001735.2 6-1908_as | _18 8 |
| AD-58097.1 им | А-118374.1 | CCUGAUAAAAAA UUUAGUUAC | 47 | A-118375.1 | GUAACUAAAUUUUU UAUCAGGAU | 98 | NM_001735.2 -232_as | _210 |
| AD-58103.1 им | А-118376.1 | CCCUUGGAAAGA GUAUUUCAA | 48 | A-118377.1 | UUGAAAUACUCUUU CCAAGGGCU | 99 | NM_001735.2_ 7-1909_as | _18 8 |
| AD-58121.1 им | А-118382.1 | UGCAGAUCAAAC ACAAUUUCA | 49 | A-118383.1 | UGAAAUUGUGUUUG AUCUGCAGA | 100 | NM_010406.2 3-4965_as | _494 |
| AD-58133.1 им | А-118386.1 | CAGAUCAAACAC AAUUUCAGU | 50 | A-118387.1 | ACUGAAAUUGUGUU UGAUCUGCA | 101 | NM_010406.2 5-4967_as | _494 |
| AD-58116.1 им | А-118396.1 | GUUCCGGAUAUU UGAACUUUU | 51 | A-118397.1 | AAAAGUUCAAAUAU CCGGAACCG | 102 | NM_010406.2 0-4522_as | _450 |
| AD-58644.1 им | А-119328 .1 | AUUUAAACAACA AGUACCUUU | 52 | A-119329.1 | AAAGGUACUUGUUG UUUAAAUCU | 103 | NM_001735.2 -1004_as | _982 |
| AD-58651.1 им | А-119328.2 | AUUUAAACAACA AGUACCUUU | 53 | A-119339.1 | AAAGGUACUUGUUG UUUAAAUCU | 104 | NM_001735.2_ -1004_as | _982 |
| AD-58641.1 им | А-119322.1 | UGACAAAAUAAC UCACUAUAA | 54 | A-119323.1 | UUAUAGUGAGUUAU UUUGUCAAU | 105 | NM_001735.2 l-1533_as | _151 |
| AD-58648.1 им | А-119322.2 | UGACAAAAUAAC UCACUAUAA | 55 | A-119336.1 | UUAUAGUGAGUUAU UUUGUCAAU | 106 | NM_001735.2 l-1533_as | _151 |
| AD-58642.1 им | А-119324.1 | GACAAAAUAACU CACUAUAAU | 56 | A-119325.1 | AUUAUAGUGAGUUA UUUUGUCAA | 107 | NM_001735.2_ 2-1534_as | _151 |
| AD-58649.1 им | А-119324.2 | GACAAAAUAACU CACUAUAAU | 57 | A-119337.1 | AUUAUAGUGAGUUA UUUUGUCAA | 108 | NM_001735.2 2-1534_as | _151 |
| AD-58647.1 им | А-119334.1 | GUUCCGGAUAUU UGAACUUUU | 58 | A-119335.1 | AAAAGUUCAAAUAU CCGGAACCG | 109 | NM_010406.2_ 0-4522_as | _450 |
| AD-58654.1 им | А-119334.2 | GUUCCGGAUAUU UGAACUUUU | 59 | A-119342.1 | AAAAGUUCAAAUAU CCGGAACCG | 110 | NM_010406.2 0-4522_as | _450 |
| AD-58645.1 им | А-119330.1 | UGCAGAUCAAAC ACAAUUUCA | 60 | A-119331.1 | UGAAAUUGUGUUUG AUCUGCAGA | 111 | NM_010406.2 3-4965_as | _494 |
| AD-58652.1 им | А-119330.2 | UGCAGAUCAAAC ACAAUUUCA | 61 | A-119340.1 | UGAAAUUGUGUUUG AUCUGCAGA | 112 | NM_010406.2 3-4965_as | _494 |
| AD-58643.1 им | А-119326.1 | AAGCAAGAUAUU UUUAUAAUA | 62 | A-119327.1 | UAUUAUAAAAAUAU CUUGCUUUU | 113 | NM_001735.2 -806_as | _784 |
| AD-58650.1 им | А-119326.2 | AAGCAAGAUAUU UUUAUAAUA | 63 | A-119338.1 | UAUUAUAAAAAUAU CUUGCUUUU | 114 | NM_001735.2 -806_as | _784 |
| AD-58646.1 им | А-119332.1 | CAGAUCAAACAC AAUUUCAGU | 64 | A-119333.1 | ACUGAAAUUGUGUU UGAUCUGCA | 115 | NM_010406.2_ 5-4967_as | _494 |
| AD-58653.1 им | А-119332.2 | CAGAUCAAACAC AAUUUCAGU | 65 | A-119341 .1 | ACUGAAAUUGUGUU UGAUCUGCA | 116 | NM_010406.2 5-4967_as | _494 |
1 Название вида олигонуклеотида отражает запись GenBank (например, NM_001735.2) и положение в нуклеотидной последовательности записи GenBank (например, 1517-1539), на которую нацелена антисмысловая цепь.
2 Число, следующее после десятичной точки, относится к номеру партии.
3 НМ = Немодифицированный.
- 102 044245
Таблица 4
Последовательности модифицированной GalNAC-коньюгированной и антисмысловой цепи dsRNA C5
| ID дуплекса | Смысловая нить | Смысловая последовательность | SEQ ID NO: | Антисмысловая | Антисмысловая последовательность | SEQ ID NO: | Виды_ название олигонуклеотида4 |
| AD- 58093.1 | А- 118310.1 | AfaUfaAfcUfcAfCfUfa UfaAfuUfaCfuUfL96 | 117 | A- 118311.1 | aAfgUfaAfuUfaUfaguGfa GfuUfaUfusUfsu | 168 | |
| AD- 58099.1 | А- 118312.1 | UfgAfcAfaAfaUfAfAfc UfcAfcUfaUfaAfL96 | 118 | A- 118313.1 | uUfaUfaGfuGfaGfuuaUfu UfuGfuCfasAfsu | 169 | |
| AD- 58105.1 | А- 118314.1 | CfuUfcCfuCfuGfGfAfa AfuUfgGfcCfuUfL96 | 119 | A- 118315.1 | aAfgGfcCfaAfuUfuccAfg AfgGfaAfgsCfsa | 170 | |
| AD- 58111.1 | А- 118316.1 | GfaCfaAfaAfuAfAfCfu CfaCfuAfuAfaUfL96 | 120 | A- 118317.1 | aUfuAfuAfgUfgAfguuAfu UfuUfgUfcsAfsa | 171 | |
| AD- 58117.1 | А- 118318.1 | UfcCfuCfuGfgAfAfAfu UfgGfcCfuUfcAfL96 | 121 | A- 118319.1 | uGfaAfgGfcCfaAfuuuCfc AfgAfgGfasAfsg | 172 | |
| AD- 58123.1 | А- 118320.1 | AfaGfcAfaGfaUfAfUfu UfuUfaUfaAfuAfL96 | 122 | A- 118321.1 | uAfuU f aUf aAf aAf auaUf c UfuGfcUfusUfsu | 173 | |
| AD- 58129.1 | А- 118322.1 | AfaAfaUfgUfuUfUfUfg U f cAf aG fuAf cAfL 9 6 | 123 | A- 118323.1 | uGfuAfcUfuGfaCfaaaAfa CfaUfuUfusCfsu | 174 | |
| AD- | А- | AfuUfuAfaAfcAfAfCfa | 124 | A- | aAfaGfgUfaCfuUfguuGfu | 17 5 | |
| 58088.1 | 118324.1 | AfgUfaCfcUfuUfL96 | 118325.1 | UfuAfaAfusCfsu | |||
| AD- 58094.1 | А- 118326.1 | AfuUfcAfgAfaAfGfUfc UfgUfgAfaGfgAfL96 | 125 | A- 118327.1 | uCfcUfuCfaCfaGfacuUfu CfuGfaAfusUfsu | 176 | |
| AD- 58100.1 | А- 118328.1 | AfcAfcUfgAfaGfCfAfu UfuGfaUfgCfaAfL96 | 126 | A- 118329.1 | uUfgCfaUfcAfaAfugcUfu CfaGfuGfusAfsu | 177 | |
| AD- 58106.1 | А- 118330.1 | GfcAfgUfuCfuGfUfGfu UfaAfaAfuGfuCfL96 | 127 | A- 118331.1 | gAfcAfuUfuUfaAfcacAfg Af aCfuGfcsAfsu | 178 | |
| AD- 58112.1 | А- 118332.1 | AfgGfaUfuUfuGfAfGfu GfuAfaAfaGfgAfL96 | 128 | A- 118333.1 | uCfcUfuUfuAfcAfcucAfa AfaUfcCfusUfsu | 179 | |
| AD- 58118.1 | А- 118334.1 | AfaUfgAfuGfaAfCfCfu UfgUfaAfaGfaAfL96 | 129 | A- 118335.1 | uUf cUfuUf aC f aAf gguU f c AfuCfaUfusUfsu | 180 | |
| AD- 58124.1 | А- 118336.1 | AfuCfaUfuGfgAfAfCfa UfuUfuUfcAfuUfL96 | 130 | A- 118337.1 | aAfuG f aAf aAf aU f guuC f c AfaUfgAfusUfsu | 181 | |
| AD- 58130.1 | А- 118338.1 | Af gC f cAf gAf aAfU fUf c GfgAfgUfuAfuUfL96 | 131 | A- 118339.1 | aAfuAfaCfuCfcGfaauUfu CfuGfgCfusUfsg | 182 | |
| AD- 58089.1 | А- 118340.1 | UfcCfcUfgGfgAfGfAfu AfaAfaCfuCfaCfL96 | 132 | A- 118341.1 | gUfgAfgUfuUfuAfucuCfc CfaGfgGfasAfsa | 183 |
- 103 044245
| AD- 58095.1 | A- 118342.1 | GfaAfaAfuGfaUfGfAfa CfcUfuGfuAfaAfL96 | 133 | A- 118343.1 | uUfuAfcAfaGfgUfucaUfc AfuUfuUfcsUfsu | 184 |
| AD- 58101.1 | A- 118344.1 | AfuUfgCfuCfaAfGfUfc AfcAfuUfuGfaUfL96 | 134 | A- 118345.1 | aUfcAfaAfuGfuGfacuUfg AfgCfaAfusUfsc | 185 |
| AD- 58107.1 | A- 118346.1 | GfaGfaUfuGfcAfUfAfu GfcUfuAfuAfaAfL96 | 135 | A- 118347.1 | uUfuAfuAfaGfcAfuauGfc AfaUfcUfcsUfsg | 186 |
| AD- 58113.1 | A- 118348.1 | GfuUfaUfcCfuGfAfUfa AfaAfaAfuUfuAfL96 | 136 | A- 118349.1 | uAfaAfuUfuUfuUfaucAfg GfaUfaAfcsUfsu | 187 |
| AD- 58119.1 | A- 118350.1 | AfgGfaAfgUfuUfGfCfa GfcUfuUfuAfuUfL96 | 137 | A- 118351.1 | aAfuAfaAfaGfcUfgcaAfa CfuUfcCfusCfsa | 188 |
| AD- 58125.1 | A- 118352.1 | GfaAfgAfaAfuUfGfAfu CfaUfaUfuGfgAfL96 | 138 | A- 118353.1 | uCfcAfaUfaUfgAfucaAfu UfuCfuUfcsUfsa | 189 |
| AD- 58131.1 | A- 118354.1 | AfuCfcUfgAfuAfAfAfa AfaUfuUfaGfuUfL96 | 139 | A- 118355.1 | aAfcUfaAfaUfuUfuuuAfu CfaGfgAfusAfsa | 190 |
| AD- 58090.1 | A- 118356.1 | Uf gG f aAf aAf gAfAfAfu CfuUfaGfuAfaAfL96 | 140 | A- 118357.1 | uUfuAfcUfaAfgAfuuuCfu UfuUfcCfasAfsa | 191 |
| AD- 58096.1 | A- 118358.1 | UfcUfuAfuCfaAfAfGfu AfuAfaAfcAfuUfL96 | 141 | A- 118359.1 | aAfuGfuUfuAfuAfcuuUfg AfuAfaGfasUfsg | 192 |
| AD- 58102.1 | A- 118360.1 | UfcCfcUfaCfaAfAfGfu GfaAfuUfuGfgUfL96 | 142 | A- 118361.1 | aC f cAf aAfuU f cAf guuU f g UfaGfgGfasGfsa | 193 |
| AD- 58108.1 | A- 118362.1 | GfaGfgAfgGfaAfAfGfa UfaUfgUfcAfuUfL96 | 143 | A- 118363.1 | aAfuGfaCfaUfaUfguuUfg CfuCfcUfgsUfsc | 194 |
| AD- 58114.1 | A- 118364.1 | AfcAfuGfuAfaGfAfAfc UfgUfaGfuUfcAfL96 | 144 | A- 118365.1 | uGfaAfcUfaCfaGfuugUfu AfcAfuGfusAfsc | 195 |
| AD- 58120.1 | A- 118366.1 | CfaGfgAfaAfuCfAfUfu GfgAfaGfaUfuUfL96 | 145 | A- 118367.1 | aAfaUfgUfuCfcAfaugAfu UfuCfcUfgsUfsu | 196 |
| AD- 58126.1 | A- 118368.1 | UfuUfaAfgAfaUfUfUfu GfaAfaUfuAfcUfL96 | 146 | A- 118369.1 | aGfuAfaUfuUfcAfaaaUfu CfuUfaAfasGfsu | 197 |
| AD- 58132.1 | A- 118370.1 | UfaUfuCfuGfcAfAfGfu GfaAfuUfcGfaUfL96 | 147 | A- 118371.1 | aUfcGfaAfuUfcAfguuGfc AfgAfaUfasAfsc | 198 |
| AD- 58091.1 | A- 118372.1 | GfcCfcUfuGfgAfAfAfg AfgUfaUfuUfcAfL96 | 148 | A- 118373.1 | uGfaAfaUfaCfuCfuuuCfc Af aGfgGfcsUfsu | 199 |
| AD- 58097.1 | A- 118374.1 | C f cUf gAfuAf aAfAfAf a UfuUfaGfuUfaCfL96 | 149 | A- 118375.1 | gU f aAf cU f aAf aUfuuuUfuAf uCfaGfgsAfsu | 200 |
| AD- 58103.1 | A- 118376.1 | GfcCfuUfgGfaAfAfGfa GfuAfuUfuCfaAfL96 | 150 | A- 118377.1 | uU f gAf aAfuAf cU f cuuU f cC f a AfgGfgsCfsu | 201 |
| AD- 58121.1 | A- 118382.1 | UfgGfaGfaUfcAfAfAfc Af cAf aUfuUf cAfL 9 6 | 151 | A- 118383.1 | uGfaAfaUfuGfuGfuuuGfaUfc UfgCfasGfsa | 202 |
| AD- 58133.1 | A- 118386.1 | CfaGfaUfcAfaAfCfAfc AfaUfuUfcAfgUfL96 | 152 | A- 118387.1 | aCfuGfaAfaUfuGfuguUfuGfa UfcUfgsCfsa | 203 |
| AD- 58116.1 | A- 118396.1 | GfuUfcCfgGfaUfAfUfu UfgAfaCfuUfuUfL96 | 153 | A- 118397.1 | aAf aAf gUfuC f aAf auaUf cC f g GfaAfcsCfsg | 204 |
| AD- 58644.1 | A- 119328.1 | AfsusUfuAfaAfcAfAfUfa Af gUfaCfcUfuUfL96 | 154 | A- 119329.1 | asAfsaGfgUfaCfuUfguuGfu UfuAfaAfuscsu | 205 |
- 104 044245
| AD- 58651.1 | А- 119328.2 | Af susUfuAfaAfcAfAfCfa AfgUfaCfcUfuUfL96 | 155 | A- 119339.1 | asAfsaGfsgUfsaCfsuUfs guu GfsuUfsuAfsaAfsuscsu | 206 |
| AD- 58641.1 | А- 119322.1 | U f s gsAf cAf aAf aU fAfAf c UfcAfcUfaUfaAfL9 6 | 156 | A- 119323.1 | usUfsaUfaGfuGfaGfuuaUfu UfuGfuCfasasu | 207 |
| AD- 58648.1 | А- 119322.2 | U f s gsAf cAf aAf aU fAfAf c UfcAfcUfaUfaAfL9 6 | 157 | A- 119336.1 | usUfsaUfsaGfsuGfsaGfsuua UfsuUfsuGfsuCfsasasu | 208 |
| AD- 58642.1 | А- 119324.1 | GfsasCfaAfaAfuAfAfCfu CfaCfuAfuAfaUfL9 6 | 158 | A- 119325.1 | asUfsuAfuAfgUfgAfguuAfu UfuUfgUfcsasa | 209 |
| AD- 58649.1 | А- 119324.2 | GfsasCfaAfaAfuAfAfCfu CfaCfuAfuAfaUfL96 | 159 | A- 119337.1 | asUfsuAfsuAfsgUfsgAfsguu AfsuUfsuUfsgUfscsasa | 210 |
| AD- 58647.1 | А- 119334.1 | GfsusUfcCfgGfaUfAfUfu UfgAfaCfuUfuUfL96 | 160 | A- 119335.1 | asAfsaAfgUfuCfaAfauaUfc CfgGfaAfcscsg | 211 |
| AD- 58654.1 | А- 119334.2 | GfsusUfcCfgGfaUfAfUfu UfgAfaCfuUfuUfL96 | 161 | A- 119342.1 | asAfsaAfsgUfsuCfsaAfsaua UfscCfsgGfsaAfscscsg | 212 |
| AD- 58645.1 | А- 119330.1 | UfsgsCfaGfaUfcAfAfAfc AfcAfaUfuUfcAfL9 6 | 162 | A- 119331.1 | usGfsaAfaUfuGfuGfuuuGfa UfcUfgCfasgsa | 213 |
| AD- 58652.1 | А- 119330.2 | UfsgsCfaGfaUfcAfAfAfc AfcAfaUfuUfcAfL9 6 | 163 | A- 119340.1 | usGfsaAfsaUfsuGfsuGfsuuu GfsaUfscUfsgCfsasgsa | 214 |
| AD- 58643.1 | А- 119326.1 | AfsasGfcAfaGfaUfAfUfu UfuUfaUfaAfuAfL96 | 164 | A- 119327.1 | usAfsuUfaUfaAfaAfauaUfc UfuGfcUfususu | 215 |
| AD- 58650.1 | А- 119326.2 | AfsasGfcAfaGfaUfAfUfu UfuUfaUfaAfuAfL96 | 165 | A- 119338.1 | usAfsuUfsaUfsaAfsaAfsaua UfscUfsuGfscUfsususu | 216 |
| AD- 58646.1 | А- 119332.1 | CfsasGfaUfcAfaAfCfAfc AfaUfuUfcAfgUfL9 6 | 166 | A- 119333.1 | asCfsuGfaAfaUfuGfuguUfuGfa UfcUfgscsa | 217 |
| AD- 58653.1 | А- 119332.2 | CfsasGfaUfcAfaAfCfAfc AfaUfuUfcAfgUfL9 6 | 167 | A- 119341.1 | asCfsuGfsaAfsaUfsuGfsugu UfsuGfsaUfscUfsgscsa | 218 |
4 Название видов олигонуклеотида и положение в нуклеотидной последовательности GenBank записи, на которую нацелена ан тисмысловая цепь, соответствующая ему, показаны в табл. 3.
Таблица 5
Последовательности немодифицированной смысловой и антисмысловой цепи dsRNA C5
| ID дуплекса | Смысловая цепь | Смысловая немодифицированная последовательность | SEQ ID NO: | Антисмысловая | Антисмысловая немодифицированная последовательность | SEQ ID NO: | Виды_ название олигонуклеотида |
| AD- 58143.1 UM | A- 118423.1 | CACUAUAAUUAC UUGAUUU | 219 | A- 118424.1 | AAAUCAAGUAAUUAUAGUG | 302 | NM_001735.2_15221540_as |
| AD- 58149.1 UM | A- 118425.1 | UAACUCACUAUA AUUACUU | 220 | A- 118426.1 | AAGUAAUUAUAGUGAGUUA | 303 | NM_001735.2_15171535_as |
| AD- 58155.1 UM | A- 118427.1 | ACAAAAUAACUC ACUAUAA | 221 | A- 118428.1 | UUAUAGUGAGUUAUUUUGU | 304 | NM—001735.2_15111529—as |
- 105 044245
| AD- 58161.1 UM | A- 118429.1 | UCCUCUGGAAAU UGGCCUU | 222 | A- 118430.1 | AAGGCCAAUUUCCAGAGGA | 305 | NM_001735.2_2733- 2751_as |
| AD- 58167.1 UM | A- 118431.1 | CAAAAUAACUCA CUAUAAU | 223 | A- 118432.1 | AUUAUAGUGAGUUAUUUUG | 306 | NM_001735.2_1512- 1530_as |
| AD- 58173.1 UM | A- 118433.1 | CUCUGGAAAUUG GCCUUCA | 224 | A- 118434.1 | UGAAGGCCAAUUUCCAGAG | 307 | NM_001735.2_2735- 2753_as |
| AD- 58179.1 UM | A- 118435.1 | GCAAGAUAUUUU UAUAAUA | 225 | A- 118436.1 | UAUUAUAAAAAUAUCUUGC | 308 | NM_001735.2_784802_as |
| AD- 58185.1 UM | A- 118437.1 | AAUGUUUUUGUC AAGUACA | 226 | A- 118438.1 | UGUACUUGACAAAAACAUU | 309 | NM_001735.2_4744- 4762_as |
| AD- 58144.1 UM | A- 118439.1 | UUAAACAACAAG UACCUUU | 227 | A- 118440.1 | AAAGGUACUUGUUGUUUAA | 310 | NM_001735.2_9821000_as |
| AD- 58150.1 UM | A- 118441.1 | UCAGAAAGUCUG UGAAGGA | 228 | A- 118442.1 | UCCUUCACAGACUUUCUGA | 311 | NM_001735.2_45784596_as |
| AD- 58156.1 UM | A- 118443.1 | ACUGAAGCAUUU GAUGCAA | 229 | A- 118444.1 | UUGCAUCAAAUGCUUCAGU | 312 | NM—001735.2_169187—as |
| AD- 58162.1 UM | A- 118445.1 | AGUUCUGUGUU AAAAUGUC | 230 | A- 118446.1 | GACAUUUUAACACAGAACU | 313 | NM—001735.2_25912609—as |
| AD- 58168.1 UM | A- 118447.1 | GAUUUUGAGUGU AAAAGGA | 231 | A- 118448.1 | UCCUUUUACACUCAAAAUC | 314 | NM—001735.2_29552973—as |
| AD- 58174.1 UM | A- 118449.1 | UGAUGAACCUUG UAAAGAA | 232 | A- 118450.1 | UUCUUUACAAGGUUCAUCA | 315 | NM—001735.2_2025- 2043—as |
| AD- 58180.1 UM | A- 118451.1 | CAUUGGAACAUU UUUCAUU | 233 | A- 118452.1 | AAUGAAAAAUGUUC CAAUG | 316 | NM—001735.2_31183136—as |
| AD- 58186.1 UM | A- 118453.1 | CCAGAAAUUCGG AGUUAUU | 234 | A- 118454.1 | AAUAACUCCGAAUUUCUGG | 317 | NM—001735.2_23172335—as |
| AD- 58145.1 UM | A- 118455.1 | CCUGGGAGAUAAA ACUCAC | 235 | A- 118456.1 | GUGAGUUUUAUCUCCCAGG | 318 | NM_001735.2_3618- 3 63 6_as |
- 106 044245
| AD- 58151.1 UM | A- 118457.1 | AAAUGAUGAACC UUGUAAA | 236 | A- 118458.1 | UUUACAAGGUUCAUCAUUU | 319 | NM_001735.2_2022- 2040_as |
| AD- 58157.1 UM | A- 118459.1 | UGCUCAAGUCACA UUUGAU | 237 | A- 118460.1 | AUCAAAUGUGACUUGAGCA | 320 | NM_001735.2_918- 936_as |
| AD- 58163.1 UM | A- 118461.1 | GAUUGCAUAUGCU UAUAAA | 238 | A- 118462.1 | UUUAUAAGCAUAUGCAAUC | 321 | NM_001735.2_46984716_as |
| AD- 58169.1 UM | A- 118463.1 | UAUCCUGAUAAAA AAUUUA | 239 | A- 118464.1 | UAAAUUUUUUAUCAGGAUA | 322 | NM_001735.2_205- 223_as |
| AD- 58175.1 UM | A- 118465.1 | GAAGUUUGCAGCU UUUAUU | 240 | A- 118466.1 | AAUAAAAGCUGCAAACUUC | 323 | NM_001735.2_4147- 4165_as |
| AD- 58181.1 UM | A- 118467.1 | AGAAAUUGAUCAU AUUGGA | 241 | A- 118468.1 | UC CAAUAUGAUCAAUUUCU | 324 | NM_001735.2_555573_as |
| AD- 58187.1 UM | A- 118469.1 | CCUGAUAAAAAAU UUAGUU | 242 | A- 118470.1 | AACUAAAUUUUUUAUCAGG | 325 | NM_001735.2_208226_as |
| AD- 58146.1 UM | A- 118471.1 | GAAAAGAAAUCUU AGUAAA | 243 | A- 118472.1 | UUUACUAAGAUUUCUUUUC | 326 | NM—001735.2_27862804—as |
| AD- 58152.1 UM | A- 118473.1 | UUAUCAAAGUAUA AACAUU | 244 | A- 118474.1 | AAUGUUUAUACUUUGAUAA | 327 | NM—001735.2_15961614—as |
| AD- 58158.1 UM | A- 118475.1 | CCUACAAACUGAA UUUGGU | 245 | A- 118476.1 | ACCAAAUUCAGUUUGUAGG | 328 | NM—001735.2_10821100—as |
| AD- 58164.1 UM | A- 118477.1 | GGAGCAAACAUAU GUCAUU | 246 | A- 118478.1 | AAUGACAUAUGUUUGCUCC | 329 | NM_001735.2_87105—as |
| AD- 58170.1 UM | A- 118479.1 | AUGUAACAACUGU AGUUCA | 247 | A- 118480.1 | UGAACUACAGUUGUUACAU | 330 | NM—001735.2_41094127—as |
| AD- 58176.1 UM | A- 118481.1 | GGAAAUCAUUGGA ACAUUU | 248 | A- 118482.1 | AAAUGUUCCAAUGAUUUCC | 331 | NM—001735.2_31123130—as |
| AD- 58182.1 UM | A- 118483.1 | UAAGAAUUUUGAA AUUACU | 249 | A- 118484.1 | AGUAAUUUCAAAAUUCUUA | 332 | NM—001735.2_759- 777_as |
- 107 044245
| AD- 58188.1 UM | A- 118485.1 | UUCUGCAACUGAA UUCGAU | 250 | A- 118486.1 | AUCGAAUUCAGUUGCAGAA | 333 | NM_001735.2_4412- 4430_as |
| AD- 58147.1 UM | A- 118487.1 | CCUUGGAAAGAGU AUUUCA | 251 | A- 118488.1 | UGAAAUACUCUUUCCAAGG | 334 | NM_001735.2_18861904_as |
| AD- 58153.1 UM | A- 118489.1 | UGAUAAAAAAUUU AGUUAC | 252 | A- 118490.1 | GUAACUAAAUUUUUUAUCA | 335 | NM_001735.2_210- 228_as |
| AD- 58159.1 UM | A- 118491.1 | CUUGGAAAGAGU UUUCAA | 253 | A- 118492.1 | UUGAAAUACUCUUUCCAAG | 336 | NM_001735.2_1887- 1905_as |
| AD- 58190.1 UM | A- 118519.1 | CACUAUAAUUACU UGAUUU | 254 | A- 118520.1 | AAAUCAAGUAAUUAUAGUG | 337 | NM_001735.2_1522- 1540_as |
| AD- 58196.1 UM | A- 118521.1 | UAACUCACUAUAA UUACUU | 255 | A- 118522.1 | AAGUAAUUAUAGUGAGUUA | 338 | NM_001735.2_15171535_as |
| AD- 58202.1 UM | A- 118523.1 | ACAAAAUAACUCA CUAUAA | 256 | A- 118524.1 | UUAUAGUGAGUUAUUUUGU | 339 | NM_001735.2_15111529—as |
| AD- 58208.1 UM | A- 118525.1 | UCCUCUGGAAAUU GGCCUU | 257 | A- 118526.1 | AAGGCCAAUUUCCAGAGGA | 340 | NM—001735.2_27332751—as |
| AD- 58214.1 UM | A- 118527.1 | CAAAAUAACUCAC UAUAAU | 258 | A- 118528.1 | AUUAUAGUGAGUUAUUUUG | 341 | NM—001735.2_1512- 1530—as |
| AD- 58220.1 UM | A- 118529.1 | CUCUGGAAAUUGG CCUUCA | 259 | A- 118530.1 | UGAAGGCCAAUUUCCAGAG | 342 | NM—001735.2_27352753—as |
| AD- 58226.1 UM | A- 118531.1 | GCAAGAUAUUUUU AUAAUA | 260 | A- 118532.1 | UAUUAUAAAAAUAUCUUGC | 343 | NM—001735.2_784- 8 02—as |
| AD- 58231.1 UM | A- 118533.1 | AAUGUUUUUGUCA AGUACA | 261 | A- 118534.1 | UGUACUUGACAAAAACAUU | 344 | NM—001735.2_4744- 4762_as |
| AD- 58191.1 UM | A- 118535.1 | UUAAACAACAAGU ACCUUU | 262 | A- 118536.1 | AAAGGUACUUGUUGUUUAA | 345 | NM—001735.2_9821000—as |
| AD- 58197.1 UM | A- 118537.1 | UCAGAAAGUCUGU GAAGGA | 263 | A- 118538.1 | UCCUUCACAGACUUUCUGA | 346 | NM—001735.2_45784596_as |
- 108 044245
| AD- 58203.1 UM | A- 118539.1 | ACUGAAGCAUUUG AUGCAA | 264 | A- 118540.1 | UUGCAUCAAAUGCUUCAGU | 347 | NM_001735.2_169187_as |
| AD- 58209.1 UM | A- 118541.1 | AGUUCUGUGUUAA AAUGUC | 265 | A- 118542.1 | GACAUUUUAACACAGAACU | 348 | NM_001735.2_2591- 2 609_as |
| AD- 58233.1 UM | A- 118565.1 | CACUAUAAUUACU UGAUUU | 266 | A- 118566.1 | AAAUCAAGUAAUUAUAGUG | 349 | NM_001735.2_1522- 1540_as |
| AD- 58193.1 UM | A- 118567.1 | UAACUCACUAUAA UUACUU | 267 | A- 118568.1 | AAGUAAUUAUAGUGAGUUA | 350 | NM_001735.2_1517- 1535_as |
| AD- 58199.1 UM | A- 118569.1 | ACAAAAUAACUCA CUAUAA | 268 | A- 118570.1 | UUAUAGUGAGUUAUUUUGU | 351 | NM_001735.2_1511- 1529_as |
| AD- 58205.1 UM | A- 118571.1 | UCCUCUGGAAAUU GGCCUU | 269 | A- 118572.1 | AAGGCCAAUUUCCAGAGGA | 352 | NM_001735.2_27332751_as |
| AD- 58211.1 UM | A- 118573.1 | CAAAAUAACUCAC UAUAAU | 270 | A- 118574.1 | AUUAUAGUGAGUUAUUUUG | 353 | NM_001735.2_15121530—as |
| AD- 58217.1 UM | A- 118575.1 | CUCUGGAAAUUGG CCUUCA | 271 | A- 118576.1 | UGAAGGCCAAUUUCCAGAG | 354 | NM—001735.2_27352753—as |
| AD- 58223.1 UM | A- 118577.1 | GCAAGAUAUUUUU AUAAUA | 272 | A- 118578.1 | UAUUAUAAAAAUAUCUUGC | 355 | NM—001735.2_784- 8 02—as |
| AD- 58229.1 UM | A- 118579.1 | AAUGUUUUUGUC AGUACA | 273 | A- 118580.1 | UGUACUUGACAAAAACAUU | 356 | NM—001735.2_4744- 4762_as |
| AD- 58234.1 UM | A- 118581.1 | UUAAACAACAAGU ACCUUU | 274 | A- 118582.1 | AAAGGUACUUGUUGUUUAA | 357 | NM—001735.2_9821000—as |
| AD- 58194.1 UM | A- 118583.1 | UCAGAAAGUCUGU GAAGGA | 275 | A- 118584.1 | UCCUUCACAGACUUUCUGA | 358 | NM—001735.2_4578- 4596_as |
| AD- 58200.1 UM | A- 118585.1 | ACUGAAGCAUUU GAUGCAA | 276 | A- 118586.1 | UUGCAUCAAAUGCUUCAGU | 359 | NM—001735.2_169187—as |
| AD- 58206.1 UM | A- 118587.1 | AGUUCUGUGUUAA AAUGUC | 277 | A- 118588.1 | GACAUUUUAACACAGAACU | 360 | NM—001735.2_25912609—as |
- 109 044245
| AD- 58236.1 UM | A- 118423.2 | CACUAUAAUUACU UGAUUU | 278 | A- 118644.1 | AAAUCAAGUAAUUAUAGUG | 361 | NM_001735.2_1522- 1540_as |
| AD- 58242.1 UM | A- 118425.2 | UAACUCACUAUA AUUACUU | 279 | A- 118645.1 | AAGUAAUUAUAGUGAGUUA | 362 | NM_001735.2_1517- 1535_as |
| AD- 58248.1 UM | A- 118427.2 | ACAAAAUAACUC ACUAUAA | 280 | A- 118646.1 | UUAUAGUGAGUUAUUUUGU | 363 | NM_001735.2_1511- 1529_as |
| AD- 58254.1 UM | A- 118429.2 | UCCUCUGGAAAU UGGCCUU | 281 | A- 118647.1 | AAGGCCAAUUUCCAGAGGA | 364 | NM_001735.2_2733- 2751_as |
| AD- 58260.1 UM | A- 118431.2 | CAAAAUAACUCA CUAUAAU | 282 | A- 118648.1 | AUUAUAGUGAGUUAUUUUG | 365 | NM_001735.2_1512- 1530_as |
| AD- 58266.1 UM | A- 118433.2 | CUCUGGAAAUUG GCCUUCA | 283 | A- 118649.1 | UGAAGGCCAAUUUCCAGAG | 366 | NM_001735.2_27352753_as |
| AD- 58272.1 UM | A- 118435.2 | GCAAGAUAUUUU UAUAAUA | 284 | A- 118650.1 | UAUUAUAAAAAUAUCUUGC | 367 | NM_001735.2_784802—as |
| AD- 58277.1 UM | A- 118437.2 | AAUGUUUUUGUC AAGUACA | 285 | A- 118651.1 | UGUACUUGACAAAAACAUU | 368 | NM—001735.2_4744- 4762_as |
| AD- 58237.1 UM | A- 118439.2 | UUAAACAACAAG UACCUUU | 286 | A- 118652.1 | AAAGGUACUUGUUGUUUAA | 369 | NM—001735.2_9821000—as |
| AD- 58243.1 UM | A- 118441.2 | UCAGAAAGUCUG UGAAGGA | 287 | A- 118653.1 | UCCUUCACAGACUUUCUGA | 370 | NM—001735.2_45784596_as |
| AD- 58249.1 UM | A- 118443.2 | ACUGAAGCAUUU GAUGCAA | 288 | A- 118654.1 | UUGCAUCAAAUGCUUCAGU | 371 | NM—001735.2_169187—as |
| AD- 58255.1 UM | A- 118445.2 | AGUUCUGUGUU AAAAUGUC | 289 | A- 118655.1 | GACAUUUUAACACAGAACU | 372 | NM—001735.2_25912609—as |
| AD- 58279.1 UM | A- 118423.3 | CACUAUAAUUA CUUGAUUU | 290 | A- 118667.1 | AAAUCAAGUAAUUAUAGUG | 373 | NM—001735.2_15221540—as |
| AD- 58239.1 UM | A- 118425.3 | UAACUCACUAUA AUUACUU | 291 | A- 118668.1 | AAGUAAUUAUAGUGAGUUA | 374 | NM—001735.2_1517- 1535—as |
- 110 044245
| AD- 58245.1 им | А- 118427.3 | ACAAAAUAACUC ACUAUAA | 292 | А- 118669.1 | UUAUAGUGAGUUAUUUUGU | 375 | NM_001735.2_1511- 1529_as |
| AD- 58251.1 им | А- 118429.3 | UCCUCUGGAAAUU GGCCUU | 293 | А- 118670.1 | AAGGCCAAUUUCCAGAGGA | 376 | NM_001735.2_2733- 2751_as |
| AD- 58257.1 им | А- 118431.3 | CAAAAUAACUCAC UAUAAU | 294 | А- 118671.1 | AUUAUAGUGAGUUAUUUUG | 377 | NM_001735.2_1512- 1530_as |
| AD- 58263.1 им | А- 118433.3 | CUCUGGAAAUUG GCCUUCA | 295 | А- 118672.1 | UGAAGGCCAAUUUCCAGAG | 378 | NM_001735.2_2735- 2753_as |
| AD- 58269.1 им | А- 118435.3 | GCAAGAUAUUUU UAUAAUA | 296 | А- 118673.1 | UAUUAUAAAAAUAUCUUGC | 379 | NM_001735.2_784802_as |
| AD- 58275.1 им | А- 118437.3 | AAUGUUUUUGUC AAGUACA | 297 | А- 118674.1 | UGUACUUGACAAAAACAUU | 380 | NM_001735.2_4744- 4762_as |
| AD- 58280.1 им | А- 118439.3 | UUAAACAACAAGU ACCUUU | 298 | А- 118675.1 | AAAGGUACUUGUUGUUUAA | 381 | NM_001735.2_9821000—as |
| AD- 58240.1 им | А- 118441.3 | UCAGAAAGUCUGU GAAGGA | 299 | А- 118676.1 | UCCUUCACAGACUUUCUGA | 382 | NM—001735.2_45784596_as |
| AD- 58246.1 им | А- 118443.3 | ACUGAAGCAUUU GAUGCAA | 300 | А- 118677.1 | UUGCAUCAAAUGCUUCAGU | 383 | NM—001735.2_169187—as |
| AD- 58252.1 им | А- 118445.3 | AGUUCUGUGUUA AAAUGUC | 301 | А- 118678.1 | GACAUUUUAACACAGAACU | 384 | NM—001735.2_2591- 2 609—as |
Таблица 6
Последовательности модифицированной смысловой и антисмысловой цепи dsRNA C5
| ID дуплекса | Смысловая цепь | Смысловая последовательность | SEQ ID NO: | Антисмысловая | Антисмысловая последовательность | SEQ ID NO: | Виды_ название олиго Нуклеотида5 |
| AD- 58143.1 | A- 118423.1 | cAcuAuAAuuAcuu GAuuudTsdT | 385 | A-118424.1 | AAAUcAAGuAAUuAuA GUGdTsdT | 468 | |
| AD- 58149.1 | A- 118425.1 | uAAcucAcuAuAAuu AcuudTsdT | 386 | A-118426.1 | AAGuAAUuAuAGUGAG UuAdTsdT | 469 | |
| AD- 58155.1 | A- 118427.1 | AcAAAAuAAc u cAc u AuAAdTsdT | 387 | A-118428.1 | UuAuAGUGAGUuAUUU UGUdTsdT | 470 |
- 111 044245
| AD- 58161.1 | A- 118429.1 | uccucuGGAAAuuGG ccuudTsdT | 388 | A-118430.1 | AAGGCcAAUUUCcAGAG GAdTsdT | 471 |
| AD- 58167.1 | A- 118431.1 | cAAAAuAAc u cAc uAu AAudTsdT | 389 | A-118432.1 | AUuAuAGUGAGUuAUU UUGdTsdT | 472 |
| AD- 58173.1 | A- 118433.1 | cucuGGAAAuuGGccu ucAdTsdT | 390 | A-118434.1 | UGAAGGCcAAUUUCcAGA GdTsdT | 473 |
| AD- 58179.1 | A- 118435.1 | GcAAGAuAuuuuuAu AAuAdTsdT | 391 | A-118436.1 | uAUuAuAAAAAuAUCU UGCdTsdT | 474 |
| AD- 58185.1 | A- 118437.1 | AAuGuuuuuGucAAGu AcAdTsdT | 392 | A-118438.1 | UGuACUUGAcAAAAAcA UUdTsdT | 475 |
| AD- 58144.1 | A- 118439.1 | uuAAAcAAcAAGuAccu uudTsdT | 393 | A-118440.1 | AAAGGuACUUGUUGUUu AAdTsdT | 476 |
| AD- 58150.1 | A- 118441.1 | ucAGAAAGucuGuGAAG GAdTsdT | 394 | A-118442.1 | UCCUUcAcAGACUUUC UGAdTsdT | 477 |
| AD- 58156.1 | A- 118443.1 | AcuGAAGcAuuuGAuGc AAdTsdT | 395 | A-118444.1 | UUGcAUcAAAUGCUUcA GUdTsdT | 478 |
| AD- 58162.1 | A- 118445.1 | AGuucuGuGuuAAAAuG ucdTsdT | 396 | A-118446.1 | GAcAUUUuAAcAcAGAA GUdTsdT | 479 |
| AD- 58168.1 | A- 118447.1 | GAuuuuGAGuGuAAAAG GAdTsdT | 397 | A-118448.1 | UCCUUUuAcACUcAAAA UGdTsdT | 480 |
| AD- 58174.1 | A- 118449.1 | uGAuGAAccuuGuAAAG AAdTsdT | 398 | A-118450.1 | UUCUUuAcAAGGUUcAU cAdTsdT | 481 |
| AD- 58180.1 | A- 118451.1 | cAuuGGAAcAuuuuucA uudTsdT | 399 | A-118452.1 | AAUGAAAAAUGUUC cAA UGdTsdT | 482 |
| AD- 58186.1 | A- 118453.1 | ccAGAAAuucGGAGuuA uudTsdT | 400 | A-118454.1 | AAuAACUCCGAAUUUCU GGdTsdT | 483 |
| AD- 58145.1 | A- 118455.1 | с c u G G GAGAuAAAAc u c AcdTsdT | 401 | A-118456.1 | GUGAGUUUuAUCUCCcA GGdTsdT | 484 |
| AD- 58151.1 | A- 118457.1 | AAAuGAuGAAccuuGuA AAdTsdT | 402 | A-118458.1 | UUuAcAAGGUUcAUcAU UUdTsdT | 485 |
| AD- 58157.1 | A- 118459.1 | uGcucAAGucAcAuuuGA udTsdT | 403 | A-118460.1 | AUcAAAUGUGACUUGAGc AdTsdT | 486 |
| AD- 58163.1 | A- 118461.1 | GAuuGcAuAuGcuuAuAA AdTsdT | 404 | A-118462.1 | UUuAuAAG cAuAUG cAAU GdTsdT | 487 |
| AD- 58169.1 | A- 118463.1 | uAuccuGAuAAAAAAuuu AdTsdT | 405 | A-118464.1 | uAAAUUUUUuAUcAGGAu AdTsdT | 488 |
| AD- 58175.1 | A- 118465.1 | GAAGuuuGcAGcuuuu AuudTsdT | 406 | A-118466.1 | AAuAAAAGCUGcAAACU UGdTsdT | 489 |
| AD- 58181.1 | A- 118467.1 | AGAAAuuGAucAuAuuG GAdTsdT | 407 | A-118468.1 | UC cAAuAUGAUcAAUUU GUdTsdT | 490 |
| AD- 58187.1 | A- 118469.1 | c cuGAuAAAAAAuuuAG uudTsdT | 408 | A-118470.1 | AACuAAAUUUUUuAUcA GGdTsdT | 491 |
| AD- 58146.1 | A- 118471.1 | GAAAAGAAAucuuAGuAA AdTsdT | 409 | A-118472.1 | UUuACuAAGAUUUCUU UUGdTsdT | 492 |
- 112 044245
| AD- 58152.1 | A- 118473.1 | uuAu cAAAGuAuAAAcA uudTsdT | 410 | A-118474.1 | AAUGUUuAuACUUUGAu AAdTsdT | 493 |
| AD- 58158.1 | A- 118475.1 | ccuAcAAAcuGAAuuuGG udTsdT | 411 | A-118476.1 | ACcAAAUUcAGUUUGuA GGdTsdT | 494 |
| AD- 58164.1 | A- 118477.1 | GGAGcAAAcAuAuGucAu udTsdT | 412 | A-118478.1 | AAUGAcAuAUGUUUGCU GGdTsdT | 495 |
| AD- 58170.1 | A- 118479.1 | AuGuAAcAAcuGuAGuuc AdTsdT | 413 | A-118480.1 | UGAACuAcAGUUGUuAc AUdTsdT | 496 |
| AD- 58176.1 | A- 118481.1 | GGAAAucAuuGGAAcAuu udTsdT | 414 | A-118482.1 | AAAUGUUC cAAUGAUUU GGdTsdT | 497 |
| AD- 58182.1 | A- 118483.1 | uAAGAAuuuuGAAAuuAc udTsdT | 415 | A-118484.1 | AGuAAUUUcAAAAUUC UuAdTsdT | 498 |
| AD- 58188.1 | A- 118485.1 | uucuGcAAcuGAAuucGA udTsdT | 416 | A-118486.1 | AUGGAAUUcAGUUGcA GAAdTsdT | 499 |
| AD- 58147.1 | A- 118487.1 | ccuuGGAAAGAGuAuuuc AdTsdT | 417 | A-118488.1 | UGAAAuACUCUUUC cAA GGdTsdT | 500 |
| AD- 58153.1 | A- 118489.1 | uGAuAAAAAAuuuAGuuA cdTsdT | 418 | A-118490.1 | GuAACuAAAUUUUUuAU cAdTsdT | 501 |
| AD- 58159.1 | A- 118491.1 | cuuGGAAAGAGuAuuucA AdTsdT | 419 | A-1184 92.1 | UUGAAAuACUCUUUC cA AGdTsdT | 502 |
| AD- 58190.1 | A- 118519.1 | CACUAUAAUUACUUGAUU UdTdT | 420 | A-118520.1 | AAAUCAAGUAAUUAUA GUGdTdT | 503 |
| AD- 58196.1 | A- 118521.1 | UAACUCACUAUAAUUAC UUdTdT | 421 | A-118522.1 | AAGUAAUUAUAGUGAGU UAdTdT | 504 |
| AD- 58202.1 | A- 118523.1 | ACAAAAUAACUCACUAU AAdTdT | 422 | A-118524.1 | UUAUAGUGAGUUAUUUU UdTdT | 505 |
| AD- 58208.1 | A- 118525.1 | UCCUCUGGAAAUUGGCC UUdTdT | 423 | A-118526.1 | AAGGCCAAUUUCCAGAG GAdTdT | 506 |
| AD- 58214.1 | A- 118527.1 | CAAAAUAACUCACUAUA AUdTdT | 424 | A-118528.1 | AUUAUAGUGAGUUAUU UUGdTdT | 507 |
| AD- 58220.1 | A- 118529.1 | CUCUGGAAAUUGGCCUU CAdTdT | 425 | A-118530.1 | UGAAGGCCAAUUUCCAG AGdTdT | 508 |
| AD- 58226.1 | A- 118531.1 | GCAAGAUAUUUUUAUA AUAdTdT | 426 | A-118532.1 | UAUUAUAAAAAUAUCUU GCdTdT | 509 |
| AD- 58231.1 | A- 118533.1 | AAUGUUUUUGUCAAGUA CAdTdT | 427 | A-118534.1 | UGUACUUGACAAAAACA UUdTdT | 510 |
| AD- 58191.1 | A- 118535.1 | UUAAACAACAAGUAC CU UUdTdT | 428 | A-118536.1 | AAAGGUACUUGUUGUUU AAdTdT | 511 |
| AD- 58197.1 | A- 118537.1 | UCAGAAAGUCUGUGAAG GAdTdT | 429 | A-118538.1 | UCCUUCACAGACUUUCU GAdTdT | 512 |
| AD- 58203.1 | A- 118539.1 | ACUGAAGCAUUUGAUGC AAdTdT | 430 | A-118540.1 | UUGCAUCAAAUGCUUCAG UdTdT | 513 |
| AD- 58209.1 | A- 118541.1 | AGUUCUGUGUUAAAAUG UCdTdT | 431 | A-118542.1 | GACAUUUUAACACAGAA CUdTdT | 514 |
- 113 044245
| AD- 58233.1 | A- 118565.1 | C fAC fU fAU fAAU fU fAC fUfUfGAUfUfUfdTsdT | 432 | A-118566.1 | AAAUC fAAGU fAAUU fA UfAGUGdTsdT | 515 | |
| AD- 58193.1 | A- 118567.1 | U fAAC fU f C fAC fU fAU fAAUfUfACfUfUfdTsdT | 433 | A-118568.1 | AAGU fAAUU fAU fAGUG AGUUfAdTsdT | 516 | |
| AD- 58199.1 | A- 118569.1 | AC fAAAAU fAAC fU f C fA CfUfAUfAAdTsdT | 434 | A-118570.1 | UU fAU fAGUGAGUU fAU UUUGUdTsdT | 517 | |
| AD- 58205.1 | A- 118571.1 | UfCfCfUfCfUfGGAAAU fUfGGCfCfUfUfdTsdT | 435 | A-118572.1 | AAGGCC fAAUUUCC fAG AGGAdTsdT | 518 | |
| AD- 58211.1 | A- 118573.1 | C fAAAAU fAAC fU f C fAC fUfAUfAAUfdTsdT | 436 | A-118574.1 | AUU fAU fAGUGAGUU fA UUUUGdTsdT | 519 | |
| AD- 58217.1 | A- 118575.1 | CfUfCfUfGGAAAUfUfG GCfCfUfUfCfAdTsdT | 437 | A-118576.1 | UGAAGGCC fAAUUUCC fA GAGdTsdT | 520 | |
| AD- 58223.1 | A- 118577.1 | GC fAAGAU fAU fU fU fU fUfAUfAAUfAdTsdT | 438 | A-118578.1 | U fAUU fAU fAAAAAU fA UCUUGCdTsdT | 521 | |
| AD- 58229.1 | A- 118579.1 | AAUfGUfUfUfUfUfGU fCfAAGUfACfAdTsdT | 439 | A-118580.1 | UGU fACUUGAC fAAAAA CfAUUdTsdT | 522 | |
| AD- 58234.1 | A- 118581.1 | U fU fAAAC fAAC fAAGU f ACfCfUfUfUfdTsdT | 440 | A-118582.1 | AAAGGU fACUUGUUGUUU fAAdTsdT | 523 | |
| AD- 58194.1 | A- 118583.1 | UfCfAGAAAGUfCfUfGU fGAAGGAdTsdT | 441 | A-118584.1 | UCCUUC fAC fAGACUUU CUGAdTsdT | 524 | |
| AD- 58200.1 | A- 118585.1 | AC fU f GAAGC fAU fUfUf GAUfGCfAAdTsdT | 442 | A-118586.1 | UUGC fAUC fAAAUGCUU CfAGUdTsdT | 525 | |
| AD- 58206.1 | A- 118587.1 | AGUfUfCfUfGUfGUfUf AAAAUfGUfCfdTsdT | 443 | A-118588.1 | GAC fAUUUU fAAC fAC fA GAACUdTsdT | 526 | |
| AD- 58236.1 | A- 118423.2 | cAcuAuAAuuAcuuGAuu udTsdT | 444 | A-118644.1 | AAAUcAAGuAAUuAuAG uGdTsdT | 527 | |
| AD- 58242.1 | A- 118425.2 | uAAc u cAc uAuAAuuAc u udTsdT | 445 | A-118645.1 | AAGuAAUuAuAGuGAGU uAdTsdT | 528 | |
| AD- 58248.1 | A- 118427.2 | AcAAAAuAAc u cAc uAuA AdTsdT | 446 | A-118646.1 | UuAuAGuGAGUuAuUuu GUdTsdT | 529 | |
| AD- 58254.1 | A- 118429.2 | uccucuGGAAAuuGGccu udTsdT | 447 | A-118647.1 | AAGGCcAAuUUCcAGAGG AdTsdT | 530 | |
| AD- 58260.1 | A- 118431.2 | cAAAAuAAc u cAc uAuAA udTsdT | 448 | A-118648.1 | AUuAuAGuGAGUuAuUuu GdTsdT | 531 | |
| AD- 58266.1 | A- 118433.2 | cucuGGAAAuuGGccuu cAdTsdT | 449 | A-118649.1 | uGAAGGCcAAuUUCcAG AGdTsdT | 532 | |
| AD- 58272.1 | A- 118435.2 | GcAAGAuAuuuuuAuAA uAdTsdT | 450 | A-118650.1 | uAUuAuAAAAAuAUCuuG CdTsdT | 533 | |
| AD- 58277.1 | A- 118437.2 | AAuGuuuuuGucAAGuA cAdTsdT | 451 | A-118651.1 | uGuACuuGAcAAAAAcAu UdTsdT | 534 | |
| AD- 58237.1 | A- 118439.2 | uuAAAcAAcAAGuAc cu uudTsdT | 452 | A-118652.1 | AAAGGuACuuGuuGuUuA AdTsdT | 535 | |
| AD- 58243.1 | A- 118441.2 | ucAGAAAGucuGuGAAG GAdTsdT | 453 | A-118653.1 | UCCuUcAcAGACuUUCuGA dTsdT | 536 |
- 114 044245
| AD- 58249.1 | А- 118443.2 | AcuGAAGcAuuuGAuGc AAdTsdT | 454 | A-118654.1 | uuGcAUcAAAuGCuUcAGU dTsdT | 537 | |
| AD- 58255.1 | А- 118445.2 | AGuucuGuGuuAAAAuG ucdTsdT | 455 | A-118655.1 | GAcAuUUuAAcAcAGAACU dTsdT | 538 | |
| AD- 58279.1 | А- 118423.3 | cAcuAuAAuuAcuuGAu uudTsdT | 456 | A-118667.1 | AAAU CAAGuAAuuAuAgu g dTsdT | 539 | |
| AD- 58239.1 | А- 118425.3 | uAAcucAcuAuAAuuAc uudTsdT | 457 | A-118668.1 | AAGuAAuUAuAGuGAGuua dTsdT | 540 | |
| AD- 58245.1 | А- 118427.3 | AcAAAAuAAc u cAc uAu AAdTsdT | 458 | A-118669.1 | UuAuAGuGAGuuAuuuugu dTsdT | 541 | |
| AD- 58251.1 | А- 118429.3 | uccucuGGAAAuuGGcc uudTsdT | 459 | A-118670.1 | AAGGCCAAuUuCCAGAgg dTsdT | 542 | |
| AD- 58257.1 | А- 118431.3 | cAAAAuAAc u cAc uAuA AudTsdT | 460 | A-118671.1 | AuUAuAGuGAGuuAuuuug dTsdT | 543 | |
| AD- 58263.1 | А- 118433.3 | cucuGGAAAuuGGccuu cAdTsdT | 461 | A-118672.1 | UGAAGGCCAAuuuCCAgag dTsdT | 544 | |
| AD- 58269.1 | А- 118435.3 | GcAAGAuAuuuuuAuAA uAdTsdT | 462 | A-118673.1 | UAuUAuAAAAAuAu C u u g c d TsdT | 545 | |
| AD- 58275.1 | А- 118437.3 | AAuGuuuuuGucAAGuA cAdTsdT | 463 | A-118674.1 | UGuACuUGACAAAAACauu dTsdT | 546 | |
| AD- 58280.1 | А- 118439.3 | uuAAAcAAcAAGuAc cu uudTsdT | 464 | A-118675.1 | AAAGGuACuUGuuGuuuaa dTsdT | 547 | |
| AD- 58240.1 | А- 118441.3 | ucAGAAAGucuGuGAAG GAdTsdT | 465 | A-118676.1 | UCCuUCACAGACuuuCuga dTsdT | 548 | |
| AD- 58246.1 | А- 118443.3 | AcuGAAGcAuuuGAuGc AAdTsdT | 466 | A-118677.1 | UuGCAUCAAAuGCuuCagu dTsdT | 549 | |
| AD- 58252.1 | А- 118445.3 | AGuucuGuGuuAAAAuG ucdTsdT | 467 | A-118678.1 | GACAuUuUAACACAGAa cud TsdT | 550 |
5 Название видов олигонуклеотида и положение в нуклеотидной последовательности GenBank записи, на которую нацелена антисмысловая цепь, соответствующая ему, показаны в табл. 5.
- 115 044245
Таблица 7
Тест разовой дозы С5 в клетках НерЗВ с GalNAC-коньюгированными иРНК
| ID дуплекса | 10 нМ AVG | 0,1 нм AVG | 10 нМ STDEV | 0, 1 нМ STDEV |
| AD-58093.1 | 15, 62 | 21, 60 | 7,48 | 6, 52 |
| AD-58099.1 | 9, 07 | 14,70 | 1,18 | 4, 65 |
| AD-58105.1 | 36,71 | 60,23 | 5, 07 | 19, 83 |
| AD-58111.1 | 11,83 | 22,78 | 3,51 | 12,75 |
| AD-58117.1 | 12,43 | 33,46 | 2,00 | 23,56 |
| AD-58123.1 | 8,05 | 15, 18 | 2,89 | 7,94 |
| AD-58129.1 | 10,77 | 40, 06 | 1,30 | 19, 66 |
| AD-58088.1 | 6, 55 | 16,40 | 1,24 | 4,58 |
| AD-58094.1 | 19, 59 | 40, 68 | 7, 64 | 12,30 |
| AD-58100.1 | 10, 92 | 20, 12 | 0,74 | 8,38 |
| AD-58106.1 | 10, 97 | 37,23 | 2,49 | 19, 95 |
| AD-58112.1 | 13,24 | 29, 32 | 2,90 | 14,08 |
| AD-58118.1 | 6, 63 | 15, 23 | 0,54 | 5, 72 |
| AD-58124.1 | 7,17 | 13, 00 | 1,44 | 6,48 |
| AD-58130.1 | 10,38 | 17,92 | 2,36 | 6, 92 |
| AD-58089.1 | 8,81 | 30, 67 | 2,91 | 10,53 |
| AD-58095.1 | 8,72 | 14, 66 | 1,04 | 3,37 |
| AD-58101.1 | 8,17 | 19,36 | 1,30 | 5, 69 |
| AD-58107.1 | 4,84 | 18,10 | 1, 66 | 7,21 |
| AD-58113.1 | 8,78 | 14, 62 | 1,77 | 7,89 |
| AD-58119.1 | 8,90 | 15, 01 | 0, 91 | 7,35 |
| AD-58125.1 | 11, 13 | 17,04 | 2, 61 | 9, 03 |
| AD-58131.1 | 13,50 | 40, 14 | 1,08 | 12,07 |
| AD-58090.1 | 7,90 | 21,57 | 2,95 | 6, 61 |
| AD-58096.1 | 8,02 | 16, 56 | 1,54 | 6, 68 |
| AD-58102.1 | 12,40 | 27,93 | 1,83 | 11,78 |
| AD-58108.1 | 12,02 | 15, 07 | 2,88 | 5, 74 |
| AD-58114.1 | 11,86 | 25, 05 | 1,48 | 9,46 |
| AD-58120.1 | 7, 65 | 10,57 | 0,58 | 3,56 |
| AD-58126.1 | 8,45 | 15, 39 | 2,08 | 7,42 |
| AD-58132.1 | 8,50 | 19,26 | 2,52 | 9, 38 |
| AD-58091.1 | 8, 68 | 18,05 | 2,95 | 6, 62 |
| AD-58097.1 | 9, 31 | 23, 02 | 0, 67 | 10, 10 |
| AD-58103.1 | 8,53 | 17,23 | 2,90 | 7,27 |
| AD-1955 | 57,41 | 81,16 | 10,76 | 5,29 |
| Имитация | 78, 61 | 75, 97 | 5,70 | 2,76 |
| Необработанные | 100 | 100 | 6, 13 | 5, 98 |
- 116 044245
Таблица 8
Тест трансфекции разовой дозы С5 в первичных гепатоцитах мыши с GalNAC-коньюгированными иРНК
| ID дуплекса | 10 нМ AVG | 0, 1 нм AVG | 10 нМ STDEV | 0,1 нМ STDEV |
| AD-58093.1 | 1,53 | 1, 65 | 0, 17 | 0,25 |
| AD-58099.1 | 1, 65 | 1,50 | 0, 61 | 0,22 |
| AD-58105.1 | 11,20 | 46, 95 | 0, 08 | 3, 89 |
| AD-58111.1 | 2,49 | 2,13 | 0,26 | 0,20 |
| AD-58117.1 | 3, 57 | 31, 91 | 0, 93 | 0, 62 |
| AD-58123.1 | 4,29 | 2,97 | 0,11 | 2,22 |
| AD-58129.1 | 1, 19 | 8,53 | 0,23 | 0, 72 |
| AD-58088.1 | 0, 84 | 1,34 | 0, 68 | 0, 07 |
| AD-58094.1 | И, 34 | 66, 82 | 0, 17 | 3, 01 |
| AD-58100.1 | 2,78 | 1,51 | 0,43 | 0, 33 |
| AD-58106.1 | 6, 79 | 52, 91 | 4,42 | 6, 78 |
| AD-58121.1 | 1, 94 | 2,15 | 0, 04 | 0, 91 |
| AD-58133.1 | 1,74 | 3,25 | 0,19 | 1, 64 |
| AD-58116.1 | 1,76 | 2,21 | 1,27 | 0, 78 |
| AD-1955 | 87,39 | 91,71 | 5,77 | 4, 68 |
| Имитация | 79, 67 | 89, 02 | 1,51 | 3, 91 |
| Необработанные | 100 | 100 | 6, 39 | 13, 11 |
Таблица 9
Тест разовой дозы С5 в первичных гепатоцитах яванского макака с GalNAC-коньюгированными иРНК
| ID дуплекса | 500 нМ AVG | 5 нМ AVG | 500 нМ STDEV | 5 нМ STDEV |
| AD-58093.1 | 63, 94 | 83, 09 | 2, 14 | 12, 65 |
| AD-58099.1 | 61,34 | 85, 85 | 12,32 | 21,95 |
| AD-58105.1 | 91,98 | 97,57 | 6, 09 | 11,48 |
| AD-58111.1 | 71,27 | 92,28 | 1, 93 | 12,72 |
| AD-58117.1 | 73,42 | 88,82 | 3,24 | И, 08 |
| AD-58123.1 | 75, 14 | 73, 06 | 7, 72 | 9,71 |
| AD-58129.1 | 81, 66 | 90, 62 | 2, 13 | 4,77 |
| AD-58088.1 | 53, 63 | 87,03 | 5, 93 | 19, 86 |
| AD-58094.1 | 89, 62 | 93, 65 | 0, 87 | 14,76 |
| AD-58100.1 | 79, 56 | 96,70 | 4,31 | 1,10 |
| AD-58106.1 | 116,24 | 125,99 | 14,28 | 40, 65 |
| AD-58112.1 | 97,19 | 107,81 | N/A | 3, 13 |
| AD-58118.1 | 67,40 | 97,38 | 5,28 | 22, 64 |
| AD-58124.1 | 58,04 | 96, 14 | 8,72 | 10, 64 |
| AD-58130.1 | 84,19 | 88, 65 | 10,50 | 4,34 |
| AD-58089.1 | 83, 83 | 83,44 | 1, 91 | 12,26 |
| AD-58095.1 | 58,53 | 78,02 | 15, 07 | 12,45 |
| AD-58101.1 | 76, 68 | 76, 73 | 3, 95 | 6, 35 |
| AD-58107.1 | 57,37 | 86,78 | 14,71 | 2,99 |
| AD-58113.1 | 37,79 | 71,10 | 8,27 | 7,76 |
| AD-58119.1 | 36, 77 | 83,16 | 3, 42 | 9, 66 |
| AD-58125.1 | 72,40 | 96, 53 | 4,46 | 4,96 |
| AD-58131.1 | 95, 58 | 101,69 | 10, 17 | 2,21 |
| AD-58090.1 | 56, 37 | 75, 00 | 3,21 | 4,97 |
| AD-58096.1 | 44,33 | 57,99 | 11,46 | 25, 17 |
| AD-58102.1 | 95,46 | 89, 35 | 0, 83 | 1,76 |
- 117 044245
| AD-58108.1 | 41,54 | 56,41 | 8,41 | 0, 14 |
| AD-58114.1 | 88,32 | 101,88 | 20, 02 | 30,29 |
| AD-58120.1 | 37,34 | 56,41 | 0, 73 | 2,14 |
| AD-58126.1 | 84,97 | 105,90 | 2,39 | 7,96 |
| AD-58132.1 | 81,55 | 85, 12 | 12,93 | 8,94 |
| AD-58091.1 | 78,88 | 84, 60 | 44, 66 | 17,40 |
| AD-58097.1 | 106,06 | 98,16 | 13,74 | 3, 14 |
| AD-58103.1 | 57,21 | 89,46 | 6, 40 | 5, 93 |
| Необработанные | 100 | 100 | 8,77 | 10,33 |
Таблица 10
Тест свободного поглощения разовой дозы С5 в первичных гепатоцитах мыши с GalNAC-коньюгированными иРНК
| ID дуплекса | 500 нМ AVG | 5 нМ AVG | 500 нМ STDEV | 5 нМ STDEV |
| AD-58093.1 | 31, 62 | 64,91 | 7,13 | 8,39 |
| AD-58099.1 | 9,46 | 29, 63 | 1,29 | 5, 66 |
| AD-58105.1 | 84,77 | 96,41 | 5, 22 | 1, 89 |
| AD-58111.1 | 17,35 | 50,95 | 1,21 | 3, 16 |
| AD-58117.1 | 94, 95 | 139,52 | 15, 43 | 43,39 |
| AD-58123.1 | 13, 07 | 44,58 | 2,11 | 3, 49 |
| AD-58129.1 | 68, 87 | 85, 04 | 2, 62 | 4,42 |
| AD-58088.1 | 17, 61 | 48,22 | 2,22 | 3, 40 |
| AD-58094.1 | 95, 92 | 104,23 | 4,16 | 6, 53 |
| AD-58100.1 | 34, 92 | 61,71 | 1,30 | 2, 15 |
| AD-58106.1 | 85,26 | 107,53 | 2,30 | 3, 38 |
| AD-58121.1 | 12, 88 | 43,76 | 1,41 | 1,28 |
| AD-58133.1 | 20, 97 | 42,76 | 0,24 | 0, 11 |
| AD-58116.1 | 8,35 | 38,04 | 1,35 | 1,40 |
| Необработанные | 100,00 | 100,00 | 3, 85 | 4,38 |
Таблица 11
Значения IC50 в первичных гепатоцитах яванского макака с GalNAC-коньюгированными иРНК
| ID дуплекса | 1С50 (нМ) | STDEV |
| AD-58099.1 | 3, 131 | 1, 141 |
| AD-58111.1 | 12,750 | 5,280 |
| AD-58123.1 | 0, 679 | 7,587 |
| AD-58088.1 | 0,218 | 3,487 |
| AD-58113.1 | 7,296 | 3,540 |
| AD-58119.1 | 33,240 | 14,740 |
| AD-58096.1 | 10,380 | 4, 199 |
| AD-58108.1 | 0, 953 | 10,080 |
| AD-58120.1 | 36,170 | 88,070 |
- 118 044245
Таблица 12
Значения 1С5о в первичных гепатоцитах мыши с GalNAC-коньюгированными иРНК
| ID дуплекса | 1С50 (нМ) | STDEV |
| AD-58099 | 3,777 | 0, 122 |
| AD-58111 | 0, 622 | 2,421 |
| AD-58123 | 0,549 | 1, 626 |
| AD-58088 | 9, 513 | 2,588 |
| AD-58121 | 2,169 | 1,176 |
| AD-58133 | 3, 802 | 1,006 |
| AD-58116 | 2,227 | 0, 604 |
| AD-58644.1 | 4,596 | 0,3506 |
| AD-58651.1 | 59,76 | 51,99 |
| AD-58641.1 | 0, 82 | 0,2618 |
| AD-58648.1 | 7,031 | 1,256 |
| AD-58642.1 | 0,5414 | 0,7334 |
| AD-58649.1 | 3,32 | 4,922 |
| AD-58647.1 | 1,356 | 0,5215 |
| AD-58654.1 | 2,09 | 0,8338 |
| AD-58645.1 | 2,944 | 0,3315 |
| AD-58652.1 | 5, 316 | 2,477 |
| AD-58643.1 | 2,179 | 1,112 |
| AD-58650.1 | 8,223 | 3,76 |
| AD-58646.1 | 2,581 | 0, 8186 |
| AD-58653.1 | 2,451 | 1,249 |
Тест разовой дозы С5 в клетках НерЗВ с модифицированными и немодифицированными иРНК
Таблица 13
| Дуплекс | 1 нМ AVG | 0,01 нМ AVG | 1 нМ STDEV | 0,01 нМ STDEV |
| AD-58143.1 | 12,13 | 100,58 | 3,47 | 3, 94 |
| AD-58149.1 | 10,46 | 64,97 | 0, 98 | 0, 00 |
| AD-58155.1 | 44,88 | 76, 24 | 1,56 | 3,74 |
| AD-58161.1 | 8,51 | 102,30 | 1,06 | 0,50 |
| AD-58167.1 | 6, 54 | 76, 24 | 1,15 | 3,74 |
| AD-58173.1 | 6, 85 | 107,44 | 0, 85 | 4,74 |
| AD-58179.1 | 10, 19 | 78, 07 | 0,59 | 1,15 |
| AD-58185.1 | 29, 46 | 79, 99 | 3, 64 | 0,78 |
| AD-58144.1 | 16, 82 | 81, 95 | 1,09 | 0,40 |
| AD-58150.1 | 11, 05 | 76, 20 | 2,55 | 0, 00 |
| AD-58156.1 | 25, 92 | 76, 73 | 2,72 | 1,50 |
| AD-58162.1 | 13, 25 | 71, 89 | 0,43 | 3, 87 |
| AD-58168.1 | 9, 74 | 45, 16 | 0,52 | 1,11 |
| AD-58174.1 | 4,84 | 70, 14 | 0,25 | 2,75 |
| AD-58180.1 | 9,41 | 56, 77 | 1,91 | 1,95 |
| AD-58186.1 | 9, 97 | 68, 91 | 1,03 | 0,34 |
| AD-58145.1 | 14,29 | 103,38 | 1,94 | 2,03 |
| AD-58151.1 | 10, 16 | 81, 17 | 1,71 | 4,77 |
| AD-58157.1 | 4,72 | 63, 19 | 1,05 | 0, 00 |
- 119044245
| AD-58163.1 | 4, 95 | 40, 13 | 1, 65 | 0,59 |
| AD-58169.1 | 17,02 | 83, 10 | 1,88 | 2,04 |
| AD-58175.1 | 8,30 | 62,54 | 0,28 | 0,31 |
| AD-58181.1 | 21,89 | 55,26 | 4,22 | 3,52 |
| AD-58187.1 | 61,96 | 71,12 | 2, 61 | 2,79 |
| AD-58146.1 | 14,25 | 95, 23 | 2, 64 | 6, 53 |
| AD-58152.1 | 11,22 | 70, 09 | 0, 80 | 7,88 |
| AD-58158.1 | 7, 96 | 98,86 | 0,76 | 4,36 |
| AD-58164.1 | 11, 60 | 43, 83 | 2,06 | 3,43 |
| AD-58170.1 | 12,28 | 39, 59 | 0, 96 | 1,36 |
| AD-58176.1 | 6, 89 | 38,77 | 1,04 | 1,33 |
| AD-58182.1 | 18, 65 | 55,78 | 0, 96 | 0,55 |
| AD-58188.1 | 5, 40 | 69, 39 | 1,07 | 0,34 |
| AD-58147.1 | 8,22 | 106,66 | 0,77 | 2, 61 |
| AD-58153.1 | 68,10 | 104,17 | 4,44 | 18,29 |
| AD-58159.1 | 8,76 | 81,41 | 1,54 | 2,79 |
| AD-58190.1 | 21,94 | 77,26 | 2,23 | 0,76 |
| AD-58196.1 | 15, 97 | 72,43 | 1,07 | 5, 32 |
| AD-58202.1 | 11,99 | 93, 83 | 5, 34 | 2,76 |
| AD-58208.1 | 18, 63 | 52,07 | 12,88 | 2,55 |
| AD-58214.1 | 6, 85 | 94,15 | 0,51 | 2,31 |
| AD-58220.1 | 11,50 | 78,34 | 3, 85 | 0,77 |
| AD-58226.1 | 5, 77 | 57,75 | 1,71 | 1,13 |
| AD-58231.1 | 7,23 | 75, 67 | 1,07 | 0,74 |
| AD-58191.1 | 35,40 | 66, 17 | 5, 50 | 4,21 |
| AD-58197.1 | 12,05 | 67,49 | 1,70 | 0,33 |
| AD-58203.1 | 15,16 | 66, 80 | 1,46 | 1,31 |
| AD-58209.1 | 7,58 | 71,23 | 3,58 | 6,28 |
| AD-58233.1 | 27,01 | 86, 02 | 0,86 | 0,42 |
| AD-58193.1 | 15,37 | 99, 85 | 1,44 | 0, 00 |
| AD-58199.1 | 21,52 | 78,39 | 6, 02 | 16,40 |
| AD-58205.1 | 24,13 | 78,88 | 5,46 | 0,77 |
- 120 044245
| AD-58211.1 | 16,38 | 32,37 | 2, 61 | 0,48 |
| AD-58217.1 | 12,23 | 70,16 | 0,29 | 3,44 |
| AD-58223.1 | 8,51 | 72,85 | 3, 01 | 1,79 |
| AD-58229.1 | 5, 50 | 75, 93 | 1,96 | 0,37 |
| AD-58234.1 | 46,86 | 101,94 | 15, 59 | 0, 00 |
| AD-58194.1 | 14,49 | 107,05 | 2,47 | 4,20 |
| AD-58200.1 | 16,21 | 61,04 | 0, 96 | 1,20 |
| AD-58206.1 | 13,25 | 37,73 | 2,82 | 2,03 |
| AD-58236.1 | 8,29 | 119,17 | 1,16 | 2,92 |
| AD-58242.1 | 12,05 | 102,69 | 0,44 | 4,03 |
| AD-58248.1 | 62,78 | 83,41 | 15, 22 | 3,27 |
| AD-58254.1 | 11,18 | 100,54 | 1,59 | 0, 00 |
| AD-58260.1 | 8,42 | 71,84 | 1, 10 | 0,35 |
| AD-58266.1 | 14,05 | 92,21 | 1,91 | 2,26 |
| AD-58272.1 | 22, 63 | 81, 11 | 1, 62 | 1,59 |
| AD-58277.1 | 70,51 | 75, 67 | 4,80 | 0,74 |
| AD-58237.1 | 28,10 | 98,56 | 1,96 | 5,79 |
| AD-58243.1 | 14,16 | 86, 05 | 1,11 | 2,95 |
| AD-58249.1 | 77, 08 | 96, 45 | 15, 14 | 0, 95 |
| AD-58255.1 | 12,27 | 47,89 | 2,58 | 0, 00 |
| AD-58279.1 | 25,78 | 94,13 | 5, 52 | 0,46 |
| AD-58239.1 | 22,98 | 83,45 | 0,28 | 4,91 |
| AD-58245.1 | 89, 60 | 90, 93 | 15, 24 | 0,45 |
| AD-58251.1 | 28,39 | 86, 32 | 7,29 | 0, 00 |
| AD-58257.1 | 48,97 | 64,53 | 9, 10 | 1,90 |
| AD-58263.1 | 9, 14 | 83,39 | 1,27 | 1, 63 |
| AD-58269.1 | 83,84 | 75, 94 | 15, 90 | 1,12 |
| AD-58275.1 | 10,29 | 86, 32 | 0,73 | 0, 85 |
| AD-58280.1 | 72,77 | 110,04 | 7,44 | 3,24 |
| AD-58240.1 | 65,42 | 75, 69 | 3, 82 | 2,23 |
| AD-58246.1 | 59, 19 | 65, 88 | 28,95 | 0, 65 |
| AD-58252.1 | 15,35 | 97,26 | 1,14 | 7 , 62 |
| Имитация | 76,53 | 66, 57 | 14,26 | 4,72 |
| AD-1955 | 72,30 | 82,72 | 19, 54 | 49, 99 |
| Необработанные | 100,00 | 100,00 | 21, 68 | 26,78 |
- 121 044245
Таблица 14
Тест разовой дозы С5 в первичных гепатоцитах мыши с модифицированными и ^модифицированными иРНК
| 1 нМ | 0, 1 нМ | |||
| ID дуплекса | 1 нМ AVG | 0,1 нм AVG | ||
| STDEV | STDEV | |||
| AD-58143.1 | 4,51 | 81,77 | 3, 13 | 8,75 |
| AD-58149.1 | 4, 65 | 73,16 | 3, 14 | 20, 17 |
| AD-58155.1 | 65, 56 | 79, 74 | 4, 66 | 9,36 |
| AD-58161.1 | 16, 82 | 81,11 | 6, 22 | 7,43 |
| AD-58167.1 | 4,72 | 77,12 | 1,17 | 14,25 |
| AD-58173.1 | 5, 57 | 76, 00 | 3, 14 | 13,52 |
| AD-58179.1 | 14,55 | 77,88 | 1,44 | 18,40 |
| AD-58185.1 | 15, 69 | 72,59 | 8, 67 | 7,81 |
| AD-58144.1 | 8,70 | 91,49 | 0, 90 | 7,08 |
| AD-58150.1 | 12,51 | 84,01 | 1, 64 | 8,20 |
| AD-58156.1 | 18,23 | 97,32 | 1,47 | 19, 50 |
| AD-58162.1 | 7,72 | 78,89 | 5, 19 | 13, 80 |
| AD-58190.1 | 11,86 | 92,80 | 2,82 | 4,41 |
| AD-58196.1 | 7,27 | 82,71 | 1,39 | 31,81 |
| AD-58202.1 | 10, 67 | 87,11 | 1, 04 | 35,79 |
| AD-58208.1 | 32,21 | 74,39 | 8, 60 | 27,45 |
| AD-58214.1 | 4,24 | 67, 63 | 0,45 | 17,85 |
| AD-58220.1 | 13, 64 | 96, 14 | 4,56 | 14,36 |
| AD-58226.1 | 3, 83 | 63,44 | 1,30 | 11,94 |
| AD-58231.1 | 5, 95 | 82,24 | 2,80 | 17,36 |
| AD-58191.1 | 14,50 | 99, 50 | 5,48 | 5, 53 |
| AD-58197.1 | 16, 12 | 93, 09 | 0, 81 | 3,21 |
| AD-58203.1 | 12,52 | 104,63 | 5, 98 | 6, 02 |
- 122 044245
| AD-58209.1 | 8,79 | 59, 35 | 3, 05 | 13, 07 |
| AD-58233.1 | 9, 50 | 64,26 | 5, 69 | 8,70 |
| AD-58193.1 | 8,88 | 89, 60 | 3,36 | 3, 08 |
| AD-58199.1 | 13,56 | 87,14 | 2,18 | 6, 44 |
| AD-58205.1 | 46, 84 | 89, 13 | 4,48 | 17,16 |
| AD-58211.1 | 13, 10 | 111,62 | 1, 10 | 21,54 |
| AD-58217.1 | 29,79 | 117,49 | 11,85 | 20,41 |
| AD-58223.1 | 20,53 | 105,44 | 1,94 | 2,98 |
| AD-58229.1 | 13,76 | 98,15 | 1, 05 | 9, 03 |
| AD-58234.1 | 12,33 | 71,34 | 0,72 | 4,17 |
| AD-58194.1 | 14,02 | 90, 60 | 1,39 | 15, 64 |
| AD-58200.1 | 5, 25 | 90, 95 | 1,37 | 31,70 |
| AD-58206.1 | 8, 19 | 109,47 | 3, 99 | 21,75 |
| AD-58236.1 | 2,07 | 70, 19 | 0, 80 | 20,59 |
| AD-58242.1 | 4,76 | 53,26 | 1,59 | 11,56 |
| AD-58248.1 | 62,42 | 78,23 | 5, 47 | 25, 85 |
| AD-58254.1 | 16, 47 | 70,22 | 2,92 | 21,74 |
| AD-58260.1 | 2,84 | 75, 65 | 0,38 | 11,59 |
| AD-58266.1 | 40,70 | 89, 88 | 16, 05 | 11,57 |
| AD-58272.1 | 21,42 | 59, 44 | 13,29 | 10, 98 |
| AD-58277.1 | 71,72 | 121,44 | 16,35 | 21,16 |
| AD-58237.1 | 11,85 | 112,68 | 9, 22 | 12,88 |
| AD-58243.1 | 10,46 | 90, 64 | 3,42 | 4,33 |
| AD-58249.1 | 71,47 | 113,30 | 4,30 | 3, 84 |
| AD-58255.1 | 6,86 | 78,55 | 2,22 | 28,37 |
| AD-58279.1 | 7,15 | 74,96 | 2,84 | 4,72 |
| AD-58239.1 | 13, 64 | 106, 45 | 1,87 | 8,25 |
| AD-58245.1 | 68, 67 | 112,08 | 21,89 | 7,73 |
| AD-58251.1 | 47,01 | 133,20 | 4, 69 | 7,14 |
| AD-58257.1 | 30, 68 | 87,51 | 2,87 | 32,84 |
| AD-58263.1 | 7,22 | 83,23 | 2,55 | 37,50 |
| AD-58269.1 | 78,90 | 106, 06 | 5, 07 | 3, 04 |
| AD-58275.1 | 8,92 | 95, 77 | 1,91 | 7,14 |
| AD-58280.1 | 16, 67 | 78,47 | 4,15 | 6, 06 |
| AD-58240.1 | 71,03 | 138,54 | 5, 32 | 10, 87 |
| AD-58246.1 | 71,87 | 89, 02 | 4,95 | 8, 63 |
| AD-58252.1 | 4,04 | 56, 10 | 1,23 | 12,02 |
| Имитация | 66, 84 | 82,81 | 2,75 | 17,19 |
| AD-1955 | 87,44 | 102,07 | 3, 64 | 4,08 |
| Необработанные | 100,00 | 100,00 | 15,25 | 18,37 |
- 123 044245
Таблица 15
Значения IC50 в клетках НерЗВ с модифицированными и немодифицированными иРНК
| ID дуплекса | 1С50 (пМ) | STDEV |
| AD-58143.1 | 36, 35 | 12,26 |
| AD-58149.1 | 5, 735 | 6, 196 |
| AD-58161.1 | 78,12 | 26, 64 |
| AD-58167.1 | 31,03 | 18, 14 |
| AD-58173.1 | 29, 12 | 16, 53 |
| AD-58236.1 | 52,73 | 32,02 |
| AD-58242.1 | 8,859 | 4,321 |
| AD-58260.1 | 7,706 | 5, 094 |
| AD-58263.1 | 96, 64 | 47, 61 |
Таблица 16
Значения IC50 в первичных гепатоцитах мыши с модифицированными и немодифицированными иРНК
| ID дуплекса | 1С50 (пМ) | STDEV |
| AD-58260.1 | 1, 015 | 0,9676 |
| AD-58149.1 | 1,309 | 1,749 |
| AD-58167.1 | 1, 991 | 2,477 |
| AD-58242.1 | 0,5866 | 1,8 |
| AD-58236.1 | 0,4517 | 0,06392 |
| AD-58143.1 | 0,8876 | 0,1613 |
| AD-58279.1 | 3, 116 | 0,7368 |
| AD-58252.1 | 7, 153 | 1, 021 |
| AD-58173.1 | 7, 144 | 19, 88 |
| AD-58263.1 | 3,224 | 5, 478 |
Пример 3. Скрининг in vivo.
Выбирали подгруппу семи GalNAC-коньюгированных иРНК для дальнейшего исследования in vivo.
Мышам линии C57BL/6 (количество=3 на группу) подкожно инъецировали 10 мг/кг GalNAcконъюгированных дуплексов или равным объемом 1х физиологического раствора, забуференного фосфатом Дульбекко (DPBS) (Life Technologies, номер по каталогу 14040133). Сорок восемь часов спустя мышей умерщвляли и иссекали печень и мгновенно замораживали в жидком азоте. Печень измельчали в 2000 Geno/Grinder (SPEX, SamplePrep, Metuchen, Нью-Джерси). Применяли приблизительно 10 мг порошка печени на образец для выделения РНК. Образцы сначала гомогенизировали в TissueLyserII (Qiagen Inc., Валенсия, Калифорния), а затем экстрагировали РНК с пнабора RNeasy 96 Universal Tissue Kit (Qiagen Inc., номер по каталогу 74881) в соответствии с протоколом производителя с использованием вакуум/отжим технологии. Концентрацию РНК измеряли NanoDrop 8000 (Thermo Scientific, Уилмингтон, Делавэр) и доводили до 100 нг мкл. кДНК и RT-PCR проводили, как описано выше.
Результаты теста разовой дозы показаны на фиг. 2. Табл. 17 показывает результаты теста разовой дозы in vivo с указанными GalNAC-конъюгированными модифицированными иРНК. Данные выражены в виде процентного отношения оставшегося количества mRNA по отношению к обработанным DPBS мышам. В столбце Эксперименты перечислен ряд экспериментов, из которых было рассчитано среднее значение. Стандартное отклонение вычисляли у всех мышей в группе во всех анализируемых экспериментах.
- 124 044245
Таблица 17
Тест разовой дозы С5 in vivo
| ID дуплекса | Эксперименты | AVG | STDEV |
| AD-58088.2 | 2 | 82, 66 | 13,54 |
| AD-58644.1 | 1 | 37,79 | 9, 63 |
| AD-58651.1 | 1 | 75, 33 | 5,21 |
| AD-58099.2 | 2 | 71,94 | 15, 45 |
| AD-58641.1 | 1 | 20,09 | 4,09 |
| AD-58648.1 | 1 | 48,43 | 9, 07 |
| AD-58111.2 | 3 | 67,17 | 13, 60 |
| AD-58642.1 | 2 | 21,78 | 5, 32 |
| AD-58649.1 | 1 | 45, 30 | 14, 02 |
| AD-58116.2 | 2 | 70,16 | 10, 32 |
| AD-58647.1 | 1 | 26, 77 | 4,14 |
| AD-58654.1 | 1 | 50, 06 | 27, 85 |
| AD-58121.2 | 2 | 52,56 | 13, 00 |
| AD-58645.1 | 1 | 24, 60 | 1,29 |
| AD-58652.1 | 1 | 52, 67 | 3, 87 |
| AD-58123.2 | 2 | 65, 70 | 9, 60 |
| AD-58643.1 | 1 | 23,21 | 2,41 |
| AD-58 650.1 | 1 | 46, 75 | 14,10 |
| AD-58133.2 | 3 | 51,98 | 13, 45 |
| AD-58646.1 | 2 | 28, 67 | 5, 34 |
| AD-58 653.1 | 1 | 43, 02 | 10, 61 |
| PBS | 3 | 100,00 | 9, 03 |
Две наиболее эффективных GalNa- конъюгированных иРНК далее модифицировали с включением дополнительных фосфотиоатных связей (табл. 18) и эффективность этих дуплексов определяли in vivo, как описано выше. Результаты теста разовой дозы показаны на фиг. 3 и демонстрируют, что средства, представляющие собой иРНК, с дополнительными фосфотиоатными связями являются более эффективными, чем те средства, представляющие собой иРНК, которые не имеют или содержат меньшее количество фосфотиоатных связей.
Таблица 18
GalNAC-конъюгированные иРНК С5, модифицированные фосфотиоатными связями
| ID дуплекса | Смысловая нить | Смысловая последовательность | SEQ ID NO: | Антисмысловая | Антисмысловая последовательность | SEQ ID NO: | Перекрестная Реактивность |
| AD- 58642.1 | A- 119324.1 | GfsasCfaAfaAfuAfAf CfuCfaCfuAfuAfaUfL 96 | 551 | A-119325.1 | asUfsuAfuAfgUfg AfguuAfuUfuUfgU fcsasa | 555 | HumRheMusRat |
| AD- 58111.2 | A- 118316.1 | GfaCfaAfaAfuAfAfCf uCfaCfuAfuAfaUfL96 | 552 | A-118317.1 | aUfuAfuAfgUfgAf guuAfuUfuUfgUfc sAf sa | 556 | HumRheMusRat |
| AD- 58646.1 | A- 119332.1 | CfsasGfaUfcAfaAfCf Af cAfaUfuUfcAfgUfL 96 | 553 | A-119333.1 | asCfsuGfaAfaUfu GfuguUfuGfaUfcU fgscsa | 557 | MusRat |
| AD- 58133.2 | A- 118386.1 | CfaGfaUfcAfaAfCfAf cAfaUfuUfcAfgUfL96 | 554 | A-118387.1 | aCfuGfaAfaUfuGf uguUfuGfaUfcUfg sCf sa | 558 | MusRat |
С учетом влияния дополнительных фосфотиоатных связей на способности сайленсинга у средств, представляющих собой иРНК, описанных выше, эффективность дополнительных дуплексов GalNACконъюгированной РНК, содержащей фосфотиоатные связи (табл. 19), определяли in vivo, как описано выше. Результаты этого теста разовой дозы показаны на фиг. 4.
Продолжительность сайленсинга AD-58642 in vivo определяли путем введения разовой дозы 2,5 мг/кг, 10 мг/кг или 25 мг/кг крысам и определения количества белка С5 (фиг. 5В), присутствующего
- 125 044245 на 7-й день, и активность белка С5 (фиг. 5А), присутствующего на дни 4 и 7. Как показано на фиг. 5, присутствует 50% уменьшение активности белка С5 по 4-й день при дозе 25 мг/кг и больше, чем на 70% снижение активности белка С5 в день 7.
Количество белка С5 определяли с помощью вестерн-блоттинга всей сыворотки. Активность белка С5 определяли в реакции гемолиза. Вкратце, фиксированное разведение С5 человека, обедненное сывороткой человека, смешивали с сывороткой мыши и инкубировали с антитело-покрытыми эритроцитами барана в течение 1 ч. Измеряли поглощение гемоглобина и рассчитывали % гемолиза по сравнению с эталонной кривой (полученной с применением серии разведений сыворотки мыши).
Эффективность AD-58642 in vivo также анализировали у мышей после однократного подкожного введения 1,25 мг/кг, 2,5 мг/кг, 5 мг/кг, 10 мг/кг и 25 мг/кг AD-58642. На 5-й день анализировали мРНК С5 в образцах печени с применением qPCR, активность С5 анализировали по гемолизу и количество белка С5 определяли с помощью анализа вестерн-блот всей сыворотки.
Как показано на фиг. 6А и 6В, хотя имеется только незначительное улучшение (т.е. приблизительно 5%) в эффективности AD-58642 ингибировать мРНК С5 при дозе 25 мг/кг по сравнению с 10 мг/кг, в среднем наблюдается 85% сайленсинг при дозе 25 мг/кг. Кроме того, наблюдается эффект доза-ответ при значениях IC50 приблизительно 2,5 мг/кг.
На фиг. 7А и 7В, и 8 продемонстрировано, что AD-58642 является эффективным для уменьшения количества белка С5 (фиг. 8) и активности белка С5 (7А и 7В).
Продолжительность сайленсинга AD-58641 in vivo определяли путем введения разовой дозы 0,625 мг/кг, 1,25 мг/кг, 2,5 мг/кг, 5,0 мг/кг или 10 мг/кг AD-58641 мышам линии С57В1/6 (количество=3) и определения количества белка С5, присутствующего в этих животных в дни 5 и 9 с помощью анализа ELISA. Вкратце, собирали сыворотку в день 0, предварительно отобранная, и на 5-й день и 9-й день определяли количественно уровни белков С5 с помощью ELISA. Уровни белка С5 были нормализованы до уровня в день 0 в предварительно отобранной сыворотке. Как показано на фиг. 9, результаты демонстрируют, что существует дозозависимый эффект и длительный нокдаун белка С5 в сыворотке (разовая доза ED50 составляла 0,6 мг/кг).
Также испытывали соединение AD-58641 на эффективность применения протокола введения нескольких доз на мышах линии C57BL/6. Мышам подкожно вводили соединение AD-58641 в дозе 0,625 мг/кг, 1,25 мг/кг или в дозе 2,5 мг/кг в дни 0, 1, 2, и 3. Сыворотку собирали в дни 0 и 8, как показано на фиг. 10, и анализировали на уровень белка С5 с помощью ELISA. Уровни С5 были нормализованы до уровня в день 0 в предварительно отобранной сыворотке. На фиг. 10 показано, что применение нескольких доз AD-58641 приводит к сайленсингу белка С5 при всех тестируемых дозах на уровне больше чем 90% сайленсинга белка С5 при дозе 2,5 мг/кг.
Соединение AD-58641 дополнительно испытывали на эффективность и оценивали кумулятивный эффект соединения на крысах с применением протокола повторного введения. Крысам линии Sprague Dawley дикого типа производили подкожную инъекцию соединения AD-58641 в дозе 2,5 мг/кг/доза или 5,0 мг/кг/доза дважды в неделю в течение 3 недель (q2w х3). Сыворотку собирали на день 0, 4, 7, 11, 14, 18, 25 и 32. Гемолитическую активность сыворотки измеряли с примененим реакции гемолиза, в котором 1:150 разбавление сыворотки крыс инкубировали с сенсибилизированными клетками крови барана и крысы в GVB++-буфере в течение 1 ч и оценивали количественно высвобождение гемоглобина путем измерения оптической плотности при 415 нм (см. фиг. 11А). Количество С5 белка, присутствующего в образцах, также определяли с помощью ELISA (фиг. 11В). Полученные результаты демонстрируют дозозависимый эффект и длительное снижение гемолитической активности, достижение приблизительно 90% ингибирования гемолитической активности.
- 126 044245
Таблица 19
Дополнительные GalNAC-конъюгированные иРНК С5, модифицированные фосфотиоатными связями
| ID дуплекса | Смысловая нить | Смысловая последовательность | SEQ ID NO: | Антисмысловая | Антисмысловая последовательность | SEQ ID NO: | Начальное положение | Перекрестная Реактивность | PS# |
| AD- 58088.2 | А- 118324.1 | AfuUfuAfaAfc AfAfCfaAfgUf aCfcUfuUfL96 | 559 | A- 118325.1 | aAfaGfgUfaCfuU fguuGfuUfuAfaA fusCfsu | 580 | 984 | HumRheMus | 2 |
| AD- 58644.1 | А- 119328.1 | AfsusUfuAfaA fcAfAfCfaAfg UfaCfcUfuUfL 96 | 560 | A- 119329.1 | asAfsaGfgUfaCf uUfguuGfuUfuAf aAfuscsu | 581 | 984 | HumRheMus | 6 |
| AfsusUfuAfaA | asAfsaGfsgUfsa | ||||||||
| AD- 58651.1 | А- 119328.2 | fcAfAfCfaAfg UfaCfcUfuUfL | 561 | A- 119339.1 | CfsuUfsguuGfsu UfsuAfsaAfsusc | 582 | 984 | HumRheMus | 14 |
| 96 | su | ||||||||
| AD- 58099.2 | А- 118312.1 | U f gAf cAf aAf a UfAfAfcUfcAf cUfaUfaAfL96 | 562 | A- 118313.1 | uUfaUfaGfuGfaG fuuaUfuUfuGfuC fasAfsu | 583 | 1513 | HumRheMusRat | 2 |
| AD- 58641.1 | А- 119322.1 | UfsgsAfcAfaA faUfAfAfcUfc AfcUfaUfaAfL 96 | 563 | A- 119323.1 | usUfsaUfaGfuGf aGfuuaUfuUfuGf uCfasasu | 584 | 1513 | HumRheMusRat | 6 |
| UfsgsAfcAfaA | usUfsaUfsaGfsu | ||||||||
| AD- 58648.1 | А- 119322.2 | faUfAfAfcUfc AfcUfaUfaAfL | 564 | A- 119336.1 | GfsaGfsuuaUfsu UfsuGfsuCfsasa | 585 | 1513 | HumRheMusRat | 14 |
| 96 | su | ||||||||
| AD- 58111.2 | А- 118316.1 | GfaCfaAfaAfu AfAfCfuCfaCf uAfuAfaUfL96 | 565 | A- 118317.1 | aUfuAfuAfgUfgA fguuAfuUfuUfgU fcsAfsa | 586 | 1514 | HumRheMusRat | 2 |
| AD- 58642.1 | А- 119324.1 | GfsasCfaAfaA fuAfAfCfuCfa CfuAfuAfaUfL 96 | 566 | A- 119325.1 | asUfsuAfuAfgUf gAfguuAfuUfuUf gUfcsasa | 587 | 1514 | HumRheMusRat | 6 |
| GfsasCfaAfaA | asUfsuAfsuAfsg | ||||||||
| AD- 58649.1 | А- 119324.2 | fuAfAfCfuCfa CfuAfuAfaUfL | 567 | A- 119337.1 | UfsgAfsguuAf su UfsuUfsgUfscsa | 588 | 1514 | HumRheMusRat | 14 |
| 96 | sa | ||||||||
| AD- 58116.2 | А- 118396.1 | GfuUfcCfgGfa UfAfUfuUfgAf aCfuUfuUfL96 | 568 | A- 118397.1 | aAfaAfgUfuCfaA fauaUfcCfgGfaA fcsCfsg | 589 | 4502 | MusRat | 2 |
- 127 044245
| AD- 58647.1 | А- 119334.1 | GfsusUfcCfgG faUfAfUfuUfg AfaCfuUfuUfL 96 | 569 | A- 119335.1 | asAfsaAfgUfuCf aAfauaUfcCfgGf aAfcscsg | 590 | 4502 | MusRat | 6 |
| AD- 58654.1 | А- 119334.2 | GfsusUfcCfgG faUfAfUfuUfg AfaCfuUfuUfL 96 | 570 | A- 119342.1 | asAfsaAfsgUfsu CfsaAfsauaUfsc CfsgGfsaAfscsc sg | 591 | 4502 | MusRat | 14 |
| AD- 58121.2 | А- 118382.1 | UfgCfaGfaUfc AfAfAfcAfcAf aUfuUfcAfL96 | 571 | A- 118383.1 | uGfaAfaUfuGfuG fuuuGfaUfcUfgC fasGfsa | 592 | 4945 | MusRat | 2 |
| AD- 58645.1 | А- 119330.1 | UfsgsCfaGfaU fcAfAfAfcAfc AfaUfuUfcAfL 96 | 572 | A- 119331.1 | usGfsaAfaUfuGf uGfuuuGfaUfcUf gCfasgsa | 593 | 4945 | MusRat | 6 |
| AD- 58652.1 | А- 119330.2 | UfsgsCfaGfaU fcAfAfAfcAfc AfaUfuUfcAfL 96 | 573 | A- 119340.1 | usGfsaAfsaUfsu GfsuGfsuuuGfsa UfscUfsgCfsasg sa | 594 | 4945 | MusRat | 14 |
| AD- 58123.2 | А- 118320.1 | AfaGfcAfaGfa UfAfUfuUfuUf aUfaAfuAfL96 | 574 | A- 118321.1 | uAfuUfaUfaAfaA fauaUfcUfuGfcU fusUfsu | 595 | 786 | HumRheMus | 2 |
| AD- 58643.1 | А- 119326.1 | AfsasGfcAfaG faUfAfUfuUfu UfaUfaAfuAfL 96 | 575 | A- 119327.1 | usAfsuUfaUfaAf aAfauaUfcUfuGf cUfususu | 596 | 786 | HumRheMus | 6 |
| AD- 58650.1 | А- 119326.2 | AfsasGfcAfaG faUfAfUfuUfu UfaUfaAfuAfL 96 | 576 | A- 119338.1 | usAfsuUfsaUfsa Af s aAf s auaUf s c UfsuGfscUfsusu su | 597 | 786 | HumRheMus | 14 |
| AD- 58133.2 | А- 118386.1 | CfaGfaUfcAfa AfCfAfcAfaUf uUfcAfgUfL96 | 577 | A- 118387.1 | aCfuGfaAfaUfuG fuguUfuGfaUfcU fgsCfsa | 598 | 4947 | MusRat | 2 |
| AD- 58646.1 | А- 119332.1 | CfsasGfaUfcA faAfCfAfcAfa UfuUfcAfgUfL 96 | 578 | A- 119333.1 | asCfsuGfaAfaUf uGfuguUfuGfaUf cUfgscsa | 599 | 4947 | MusRat | 6 |
| AD- 58653.1 | А- 119332.2 | CfsasGfaUfcA faAfCfAfcAfa UfuUfcAfgUfL 96 | 579 | A- 119341.1 | asCfsuGfsaAfsa Uf suGfsuguUfsu GfsaUfscUfsgsc sa | 600 | 4947 | MusRat | 14 |
Пример 4. Конструирование, синтез и скрининг дополнительных siRNA in vitro конструирование siRNA.
Дуплексы С5 длиной 19 нуклеотидов как для смысловой, так и антисмысловой цепи конструировали с применением последовательности мРНК С5 человека, представленной в GenBank, № NM_001735.2. Первоначально определили пятьсот шестьдесят девять дуплексов, не содержащих повторы длиннее, чем 7 нуклеотидов, охватывая по существу весь 5480-нуклеотидный транскрипт. Все 569 дуплексов затем оценивали на предсказанную эффективность в соответствии с линейной моделью, которая оценивает пары нуклеотидов в каждом положении дуплекса, а доза и клеточная линия применяют для скрининга. Дуплексы также сопоставляли со всеми транскриптами в коллекции RefSeq человека, используя собственный алгоритм полного перебора, и считали наименьшие значения несовпадений (на цепь) к транскриптам, отличным от С5. Дуплексы синтезировали и подвергали скринингу, а затем выбирали из 569, в соответствии со следующей схемой: Начиная с 5'-конца транскрипта, дуплекс выбирали внутри окна каждые 10±2 нуклеотидов, которые:
1) имели самую высокую предсказанную эффективность,
2) имели по меньшей мере одно несовпадение в обеих цепях ко всем транскриптам, отличным от SERPINC1,
- 128 044245
3) еще не были синтезированы и не подвергались скринингу как часть других наборов дуплексов.
Если в данном окне не был идентифицирован дуплекс, который удовлетворял всем критериям, то окно пропускали.
Подробный список из 569 последовательностей смысловой и антисмысловой цепи С5 показан в табл. 20.
Эффективность in vitro дуплексов, содержащих смысловую и антисмысловую последовательности, приведенные в табл. 20, определяли с помощью следующих способов.
Клеточная культура и трансфекции.
Клетки HepG2 (ATCC, Манассас, Вирджиния) выращивали практически до слияния при 37°C в атмосфере 5% CO2 в минимальной поддерживающей среде Игла (АТСС), дополненной 10% FBS, стрептомицином и глутамином (АТСС), перед отделением от чашки Петри путем обработки трипсином. Трансфекцию выполняли путем добавления 14,8 мкл Opti-MEM с 0,2 мкл Lipofectamine RNAiMax на лунку (Invitrogen, Карлсбад, Калифорния, № по кат. 13778-150) к 5 мкл каждого из 164 дуплекса siRNA в отдельной лунке в 96-луночном планшете. Смесь затем инкубировали при комнатной температуре в течение 15 мин. 80 мкл полных питательных сред без антибиотика, содержащих ~2,5х104 клеток HepG2, затем добавляли к смеси siRNA. Клетки инкубировали в течение 24 ч перед очисткой РНК. Эксперименты выполняли при значении 20 нМ и включали наивные клетки и клетки, трансфицированные AD-1955, люцифераза-нацеленная siRNA в качестве отрицательного контроля.
Выделение общей РНК с использованием набора DYNABEADS mRNA Isolation Kit (Invitrogen, номер по каталогу 610-12).
Клетки собирали и лизировали в 150 мкл лизирующего/связывающего буфера, затем смешивали в течение 5 мин при 700об/мин на качалке с платформой (скорость смешивания была одинаковой на протяжении процесса). Десять микролитров магнитных гранул и 80 мкл смеси лизирующего/связывающего буфера добавляли в круглодонный планшет и смешивали в течение 1 мин. Магнитные гранулы фиксировали при помощи магнитного стенда и супернатант удаляли без смещения гранул. После удаления супернатанта лизированные клетки добавляли к оставшимся гранулам и смешивали в течение 5 мин. После удаления супернатанта магнитные гранулы промывали 2 раза 150 мкл промывочного буфера А и смешивали в течение 1 мин. Гранулы опять фиксировали и супернатант удаляли. Гранулы затем промывали 150 мкл промывочного буфера В, фиксировали и супернатант удаляли. Гранулы затем промывали 150 мкл буфера элюирования В, фиксировали и супернатант удаляли. Гранулам давали возможность высохнуть в течение 2 мин. После высыхания добавляли 50 мкл элюирующего буфера и смешивали в течение 5 мин при 70°C. Гранулы фиксировали на магните в течение 5 мин. Удаляли 40 мкл супернатанта, содержащего выделенную РНК, и добавляли в другой 96-луночный планшет.
Синтез кДНК с использованием набора ABI High capacity cDNA reverse transcription kit (Applied Biosystems, Форстер-Сити, Калифорния, № по кат. 4368813).
Мастер-микс из 2 мкл 10Х буфера, 0,8 мкл 25Х dNTP, 2 мкл случайных праймеров, 1 мкл обратной транскриптазы, 1 мкл ингибитора РНКазы и 3,2 мкл Н2О на реакцию добавляли в 10 мкл общей РНК. кДНК получали с использованием термоциклера Bio-Rad C-1000 или S-1000 (Hercules, Калифирния) посредством следующих стадий: 25°C 10 мин, 37°C 120 мин, 85°C 5 с, хранение при 4°C.
PCR в режиме реального времени.
мкл кДНК добавляли к смеси мастер-микса, содержащей 0,5 мкл зонда TaqMan для GAPDH человека (Applied Biosystems, номер по каталогу 4326317Е), 0,5 мкл зонда TaqMan для SERPINC1 человека (Applied Biosystems, номер по каталогу Hs00892758_m1) и 5 мкл зонда мастер-микс Lightcycler 480 (Roche, номер по каталогу 04887301001) в каждую лунку 384-луночного планшета (Roche, номер по каталогу 04887301001). PCR в режиме реального времени проводили в приборе LC480 Real Time PCR (Roche).
Для вычисления относительного кратного изменения данные в реальном времени анализировали с применением AACt-способа и нормализовали в соответствии с таковыми анализов, выполненных с клетками, трансфицированными 20 нМ AD-1955.
- 129 044245
Таблица 20
Дополнительные последовательности немодифицированной и антисмысловой цепи С5
| Название олигонуклеотида | Положение в NM_001735.2 | Смысловая последовательность | SEQ ID NO: | Антисмысловая последовательность | SEQ ID NO: |
| NM_001735.2_321_s | 3-21 | UAUCCGUGGUUUCCUGCUA | 601 | UAGCAGGAAACCACGGAUA | 1170 |
| NM_001735.2_10- 2 8_s | 10-28 | GGUUUCCUGCUACCUCCAA | 602 | UUGGAGGUAGCAGGAAACC | 1171 |
| NM-001735.2_22- 4 0_s | 22-40 | CCUCCAACCAUGGGCCUUU | 603 | AAAGGCCCAUGGUUGGAGG | 1172 |
| NM_001735.2_3351_s | 33-51 | GGGCCUUUUGGGAAUACUU | 604 | AAGUAUUCCCAAAAGGCCC | 1173 |
| NM_001735.2_4361_s | 43-61 | GGAAUACUUUGUUUUUUAA | 605 | UUAAAAAACAAAGUAUUC C | 1174 |
| NM_001735.2_4967_s | 49-67 | CUUUGUUUUUUAAUCUUCC | 606 | GGAAGAUUAAAAAACAAAG | 1175 |
| NM_001735.2_6381_s | 63-81 | CUUCCUGGGGAAAACCUGG | 607 | CCAGGUUUUCCCCAGGAAG | 1176 |
| NM_001735.2_71- 8 9_s | 71-89 | GGAAAACCUGGGGACAGGA | 608 | UCCUGUCCC CAGGUUUUC C | 1177 |
| NM_001735.2_8199_s | 81-99 | GGGACAGGAGCAAACAUAU | 609 | AUAUGUUUGCUCCUGUCCC | 1178 |
| NM_001735.2_91- 10 9_s | 91-109 | CAAACAUAUGUCAUUUCAG | 610 | CUGAAAUGACAUAUGUUUG | 1179 |
| NM_001735.2_102- 12 0_s | 102-120 | CAUUUCAGCACCAAAAAUA | 611 | UAUUUUUGGUGCUGAAAUG | 1180 |
| NM_001735.2_109127_s | 109-127 | GCAC CAAAAAUAUUC C GUG | 612 | CACGGAAUAUUUUUGGUGC | 1181 |
| NM_001735.2_123141_s | 123-141 | CCGUGUUGGAGCAUCUGAA | 613 | UUCAGAUGCUCCAACACGG | 1182 |
| NM_001735.2_130- 14 8_s | 130-148 | GGAGCAUCUGAAAAUAUUG | 614 | CAAUAUUUUCAGAUGCUCC | 1183 |
| NM_001735.2_139157_s | 139157 | GAAAAUAUUGUGAUUCAAG | 615 | CUUGAAUCACAAUAUUUUC | 1184 |
| NM_001735.2_150168_s | 150-168 | GAUUCAAGUUUAUGGAUAC | 616 | GUAUC CAUAAACUUGAAUC | 1185 |
| NM_001735.2_163181_s | 163-181 | GGAUACACUGAAGCAUUUG | 617 | CAAAUGCUUCAGUGUAUCC | 1186 |
| NM_001735.2_172190_s | 172-190 | GAAGCAUUUGAUGCAACAA | 618 | UUGUUGCAUCAAAUGCUUC | 1187 |
| NM_001735.2_183- 2 01_s | 183-201 | UGCAACAAUCUCUAUUAAA | 619 | UUUAAUAGAGAUUGUUGCA | 1188 |
| NM_001735.2_189207_s | 189-207 | AAUCUCUAUUAAAAGUUAU | 620 | AUAACUUUUAAUAGAGAUU | 1189 |
| NM_001735.2_201219_s | 201-219 | AAGUUAUC CUGAUAAAAAA | 621 | UUUUUUAUCAGGAUAACUU | 1190 |
- 130 044245
| NM_001735.2_209227_s | 209-227 | CUGAUAAAAAAUUUAGUUA | 622 | UAACUAAAUUUUUUAUCAG | 1191 |
| NM_001735.2_221- 2 3 9_s | 221-239 | UUAGUUACUCCUCAGGCCA | 623 | UGGCCUGAGGAGUAACUAA | 1192 |
| NM_001735.2_230- 2 4 8_s | 230-248 | CCUCAGGCCAUGUUCAUUU | 624 | AAAUGAACAUGGCCUGAGG | 1193 |
| NM_001735.2_242- 2 60_s | 242-260 | UUCAUUUAUC CUCAGAGAA | 625 | UUCUCUGAGGAUAAAUGAA | 1194 |
| NM_001735.2_252- 2 7 0_s | 252-270 | CUCAGAGAAUAAAUUC CAA | 626 | UUGGAAUUUAUUCUCUGAG | 1195 |
| NM_001735.2_259- 2 7 7_s | 259-277 | AAUAAAUUC CAAAACUCUG | 627 | CAGAGUUUUGGAAUUUAUU | 1196 |
| NM_001735.2_273291_s | 273-291 | CUCUGCAAUCUUAACAAUA | 628 | UAUUGUUAAGAUUGCAGAG | 1197 |
| NM_001735.2_282- 3 0 0_s | 282-300 | CUUAACAAUACAAC CAAAA | 629 | UUUUGGUUGUAUUGUUAAG | 1198 |
| NM_001735.2_292310_s | 292-310 | CAAC CAAAACAAUUGC CUG | 630 | CAGGCAAUUGUUUUGGUUG | 1199 |
| NM_001735.2_301319_s | 301-319 | CAAUUGCCUGGAGGACAAA | 631 | UUUGUCCUCCAGGCAAUUG | 1200 |
| NM_001735.2_313331_s | 313-331 | GGACAAAAC C CAGUUUCUU | 632 | AAGAAACUGGGUUUUGUCC | 1201 |
| NM_001735.2_322- 34 0_s | 322-340 | CCAGUUUCUUAUGUGUAUU | 633 | AAUACACAUAAGAAACUGG | 1202 |
| NM_001735.2_332350_s | 332-350 | AUGUGUAUUUGGAAGUUGU | 634 | ACAACUUC CAAAUACACAU | 1203 |
| NM_001735.2_342- 3 60_s | 342-360 | GGAAGUUGUAUCAAAGCAU | 635 | AUGCUUUGAUACAACUUCC | 1204 |
| NM_001735.2_349367_s | 349-367 | GUAUCAAAGCAUUUUUCAA | 636 | UUGAAAAAUGCUUUGAUAC | 1205 |
| NM_001735.2_361- 37 9_s | 361-379 | UUUUCAAAAUCAAAAAGAA | 637 | UUCUUUUUGAUUUUGAAAA | 1206 |
| NM_001735.2_371- 3 8 9_s | 371-389 | CAAAAAGAAUGCCAAUAAC | 638 | GUUAUUGGCAUUCUUUUUG | 1207 |
| NM_001735.2_381- 3 99_s | 381-399 | GC CAAUAAC CUAUGACAAU | 639 | AUUGUCAUAGGUUAUUGGC | 1208 |
| NM_001735.2_389407_s | 389-407 | CCUAUGACAAUGGAUUUCU | 640 | AGAAAUCCAUUGUCAUAGG | 1209 |
| NM_001735.2_399417_s | 399-417 | UGGAUUUCUCUUCAUUCAU | 641 | AUGAAUGAAGAGAAAUC CA | 1210 |
| NM_001735.2_411- 42 9_s | 411-429 | CAUUCAUACAGACAAAC CU | 642 | AGGUUUGUCUGUAUGAAUG | 1211 |
| NM_001735.2_419437_s | 419-437 | CAGACAAAC CUGUUUAUAC | 643 | GUAUAAACAGGUUUGUCUG | 1212 |
| NM_001735.2_430- 4 4 8_s | 430-448 | GUUUAUACUC CAGAC CAGU | 644 | ACUGGUCUGGAGUAUAAAC | 1213 |
| NM_001735.2_441- 4 59_s | 441-459 | AGAC CAGUCAGUAAAAGUU | 645 | AACUUUUACUGACUGGUCU | 1214 |
- 131 044245
| NM_001735.2_450468_s | 450-468 | AGUAAAAGUUAGAGUUUAU | 646 | AUAAACUCUAACUUUUACU | 1215 |
| NM_001735.2_460- 4 7 8_s | 460-478 | AGAGUUUAUUC GUUGAAUG | 647 | CAUUCAACGAAUAAACUCU | 1216 |
| NM_001735.2_470- 4 8 8_s | 470-488 | CGUUGAAUGACGACUUGAA | 648 | UUCAAGUC GUCAUUCAAC G | 1217 |
| NM_001735.2_483501_s | 483-501 | CUUGAAGCCAGCCAAAAGA | 649 | UCUUUUGGCUGGCUUCAAG | 1218 |
| NM_001735.2_490508_s | 490-508 | C CAGC CAAAAGAGAAACUG | 650 | CAGUUUCUCUUUUGGCUGG | 1219 |
| NM_001735.2_503521_s | 503-521 | AAACUGUCUUAACUUUCAU | 651 | AUGAAAGUUAAGACAGUUU | 1220 |
| NM_001735.2_513531_s | 513-531 | AACUUUCAUAGAUCCUGAA | 652 | UUCAGGAUCUAUGAAAGUU | 1221 |
| NM_001735.2_519537_s | 519-537 | CAUAGAUCCUGAAGGAUCA | 653 | UGAUCCUUCAGGAUCUAUG | 1222 |
| NM_001735.2_529547_s | 529-547 | GAAGGAUCAGAAGUUGACA | 654 | UGUCAACUUCUGAUCCUUC | 1223 |
| NM_001735.2_543561_s | 543-561 | UGACAUGGUAGAAGAAAUU | 655 | AAUUUCUUCUACCAUGUCA | 1224 |
| NM_001735.2_553571_s | 553-571 | GAAGAAAUUGAUCAUAUUG | 656 | CAAUAUGAUCAAUUUCUUC | 1225 |
| NM_001735.2_562- 58 0_s | 562-580 | GAUCAUAUUGGAAUUAUCU | 657 | AGAUAAUUC CAAUAUGAUC | 1226 |
| NM_001735.2_571- 58 9_s | 571-589 | GGAAUUAUCUCUUUUCCUG | 658 | CAGGAAAAGAGAUAAUUCC | 1227 |
| NM_001735.2_579597_s | 579-597 | CUCUUUUCCUGACUUCAAG | 659 | CUUGAAGUCAGGAAAAGAG | 1228 |
| NM_001735.2_590608_s | 590-608 | ACUUCAAGAUUCCGUCUAA | 660 | UUAGACGGAAUCUUGAAGU | 1229 |
| NM_001735.2_601619_s | 601-619 | С C GUCUAAUC CUAGAUAUG | 661 | CAUAUCUAGGAUUAGACGG | 1230 |
| NM_001735.2_610628_s | 610-628 | CCUAGAUAUGGUAUGUGGA | 662 | UC CACAUAC CAUAUCUAGG | 1231 |
| NM_001735.2_623641_s | 623-641 | UGUGGACGAUCAAGGCUAA | 663 | UUAGCCUUGAUCGUCCACA | 1232 |
| NM_001735.2_629647_s | 629-647 | CGAUCAAGGCUAAAUAUAA | 664 | UUAUAUUUAGC CUUGAUC G | 1233 |
| NM_001735.2_642- 6 60_s | 642-660 | AUAUAAAGAGGACUUUUCA | 665 | UGAAAAGUC CUCUUUAUAU | 1234 |
| NM_001735.2_649667_s | 649-667 | GAGGACUUUUCAACAACUG | 666 | CAGUUGUUGAAAAGUCCUC | 1235 |
| NM_001735.2_662- 68 0_s | 662-680 | CAACUGGAACCGCAUAUUU | 667 | AAAUAUGCGGUUCCAGUUG | 1236 |
| NM_001735.2_672690_s | 672-690 | CGCAUAUUUUGAAGUUAAA | 668 | UUUAACUUCAAAAUAUGCG | 1237 |
| NM_001735.2_683- 7 01_s | 683-701 | AAGUUAAAGAAUAUGUCUU | 669 | AAGACAUAUUCUUUAACUU | 1238 |
- 132044245
| NM_001735.2_691- 7 0 9_s | 691-709 | GAAUAUGUCUUGCCACAUU | 670 | AAUGUGGCAAGACAUAUUC | 1239 |
| NM_001735.2_703721_s | 703-721 | CCACAUUUUUCUGUCUCAA | 671 | UUGAGACAGAAAAAUGUGG | 1240 |
| NM_001735.2_713- 7 31_s | 713-731 | CUGUCUCAAUCGAGCCAGA | 672 | UCUGGCUCGAUUGAGACAG | 1241 |
| NM_001735.2_719737_s | 719-737 | C AAUC GAG С C AGAAUAUAA | 673 | UUAUAUUCUGGCUCGAUUG | 1242 |
| NM_001735.2_730- 7 4 8_s | 730-748 | GAAUAUAAUUUCAUUGGUU | 674 | AAC CAAUGAAAUUAUAUUC | 1243 |
| NM_001735.2_742- 7 60_s | 742-760 | AUUGGUUACAAGAACUUUA | 675 | UAAAGUUCUUGUAACCAAU | 1244 |
| NM_001735.2_752- 7 7 0_s | 752-770 | AGAACUUUAAGAAUUUUGA | 676 | UCAAAAUUCUUAAAGUUCU | 1245 |
| NM_001735.2_762- 7 8 0_s | 762-780 | GAAUUUUGAAAUUACUAUA | 677 | UAUAGUAAUUUCAAAAUUC | 1246 |
| NM_001735.2_769- 7 8 7_s | 769-787 | GAAAUUACUAUAAAAGCAA | 678 | UUGCUUUUAUAGUAAUUUC | 1247 |
| NM_001735.2_781- 7 99_s | 781-799 | AAAGCAAGAUAUUUUUAUA | 679 | UAUAAAAAUAUCUUGCUUU | 1248 |
| NM_001735.2_789807_s | 789-807 | AUAUUUUUAUAAUAAAGUA | 680 | UACUUUAUUAUAAAAAUAU | 1249 |
| NM_001735.2_803821_s | 803-821 | AAGUAGUCACUGAGGCUGA | 681 | UCAGCCUCAGUGACUACUU | 1250 |
| NM_001735.2_810828_s | 810-828 | CACUGAGGCUGACGUUUAU | 682 | AUAAACGUCAGCCUCAGUG | 1251 |
| NM_001735.2_822- 8 4 0_s | 822-840 | CGUUUAUAUCACAUUUGGA | 683 | UC CAAAUGUGAUAUAAAC G | 1252 |
| NM_001735.2_831- 8 4 9_s | 831-849 | CACAUUUGGAAUAAGAGAA | 684 | UUCUCUUAUUCCAAAUGUG | 1253 |
| NM_001735.2_840858_s | 840-858 | AAUAAGAGAAGACUUAAAA | 685 | UUUUAAGUCUUCUCUUAUU | 1254 |
| NM_001735.2_852- 8 7 0_s | 852-870 | CUUAAAAGAUGAUCAAAAA | 686 | UUUUUGAUCAUCUUUUAAG | 1255 |
| NM_001735.2_859- 8 7 7_s | 859-877 | GAUGAUCAAAAAGAAAUGA | 687 | UCAUUUCUUUUUGAUCAUC | 1256 |
| NM_001735.2_872- 8 90_s | 872-890 | AAAUGAUGCAAACAGCAAU | 688 | AUUGCUGUUUGCAUCAUUU | 1257 |
| NM_001735.2_883901_s | 883-901 | ACAGCAAUGCAAAACACAA | 689 | UUGUGUUUUGCAUUGCUGU | 1258 |
| NM_001735.2_893911_s | 893-911 | AAAACACAAUGUUGAUAAA | 690 | UUUAUCAACAUUGUGUUUU | 1259 |
| NM_001735.2_899917_s | 899-917 | CAAUGUUGAUAAAUGGAAU | 691 | AUUC CAUUUAUCAACAUUG | 1260 |
| NM_001735.2_913931_s | 913-931 | GGAAUUGCUCAAGUCACAU | 692 | AUGUGACUUGAGCAAUUCC | 1261 |
| NM_001735.2_919937_s | 919-937 | GCUCAAGUCACAUUUGAUU | 693 | AAUCAAAUGUGACUUGAGC | 1262 |
- 133 044245
| NM_001735.2_930948_s | 930-948 | AUUUGAUUCUGAAACAGCA | 694 | UGCUGUUUCAGAAUCAAAU | 1263 |
| NM_001735.2_939957_s | 939-957 | UGAAACAGCAGUCAAAGAA | 695 | UUCUUUGACUGCUGUUUCA | 1264 |
| NM_001735.2_951- 9 69_s | 951-969 | CAAAGAACUGUCAUACUAC | 696 | GUAGUAUGACAGUUCUUUG | 1265 |
| NM_001735.2_962- 98 0_s | 962-980 | CAUACUACAGUUUAGAAGA | 697 | UCUUCUAAACUGUAGUAUG | 1266 |
| NM_001735.2_969987_s | 969-987 | CAGUUUAGAAGAUUUAAAC | 698 | GUUUAAAUCUUCUAAACUG | 1267 |
| NM_001735.2_9831001_s | 983-1001 | UAAACAACAAGUAC CUUUA | 699 | UAAAGGUACUUGUUGUUUA | 1268 |
| NM_001735.2_9901008_s | 990-1008 | CAAGUACCUUUAUAUUGCU | 700 | AGCAAUAUAAAGGUACUUG | 1269 |
| NM_001735.2_10021020_s | 1002-1020 | UAUUGCUGUAACAGUCAUA | 701 | UAUGACUGUUACAGCAAUA | 1270 |
| NM_001735.2_10111029_s | 1011-1029 | AACAGUCAUAGAGUCUACA | 702 | UGUAGACUCUAUGACUGUU | 1271 |
| NM_001735.2_10201038_s | 1020-1038 | AGAGUCUACAGGUGGAUUU | 703 | AAAUCCACCUGUAGACUCU | 1272 |
| NM_001735.2_10331051_s | 1033-1051 | GGAUUUUCUGAAGAGGCAG | 704 | CUGCCUCUUCAGAAAAUCC | 1273 |
| NM_001735.2_10421060—s | 1042-1060 | GAAGAGGCAGAAAUACCUG | 705 | CAGGUAUUUCUGCCUCUUC | 1274 |
| NM—001735.2_10501068—s | 1050-1068 | AGAAAUACCUGGCAUCAAA | 706 | UUUGAUGCCAGGUAUUUCU | 1275 |
| NM—001735.2_10611079—s | 1061-1079 | GCAUCAAAUAUGUCCUCUC | 707 | GAGAGGACAUAUUUGAUGC | 1276 |
| NM—001735.2_10711089—s | 1071-1089 | UGUCCUCUCUCCCUACAAA | 708 | UUUGUAGGGAGAGAGGACA | 1277 |
| NM—001735.2_10921110—s | 1092-1110 | GAAUUUGGUUGCUACUCCU | 709 | AGGAGUAGCAACCAAAUUC | 1278 |
| NM—001735.2_11021120—s | 1102-1120 | GCUACUCCUCUUUUCCUGA | 710 | UCAGGAAAAGAGGAGUAGC | 1279 |
| NM—001735.2_11091127—s | 1109-1127 | CUCUUUUCCUGAAGCCUGG | 711 | CCAGGCUUCAGGAAAAGAG | 1280 |
| NM—001735.2_11231141—s | 1123-1141 | CCUGGGAUUCCAUAUCCCA | 712 | UGGGAUAUGGAAUCCCAGG | 1281 |
| NM—001735.2_11331151—s | 1133-1151 | CAUAUCCCAUCAAGGUGCA | 713 | UGCACCUUGAUGGGAUAUG | 1282 |
| NM—001735.2_11391157—s | 1139-1157 | CCAUCAAGGUGCAGGUUAA | 714 | UUAACCUGCACCUUGAUGG | 1283 |
| NM—001735.2_11501168—s | 1150-1168 | CAGGUUAAAGAUUCGCUUG | 715 | CAAGCGAAUCUUUAACCUG | 1284 |
| NM—001735.2_11611179—s | 1161-1179 | UUCGCUUGACCAGUUGGUA | 716 | UACCAACUGGUCAAGCGAA | 1285 |
| NM—001735.2_11701188—s | 1170-1188 | CCAGUUGGUAGGAGGAGUC | 717 | GACUCCUCCUACCAACUGG | 1286 |
- 134044245
| NM_001735.2_11801198_s | 1180-1198 | GGAGGAGUCCCAGUAACAC | 718 | GUGUUACUGGGACUCCUCC | 1287 |
| NM_001735.2_11901208_s | 1190-1208 | CAGUAACACUGAAUGCACA | 719 | UGUGCAUUCAGUGUUACUG | 1288 |
| NM_001735.2_12001218—s | 1200-1218 | GAAUGCACAAACAAUUGAU | 720 | AUCAAUUGUUUGUGCAUUC | 1289 |
| NM—001735.2_12091227—s | 1209-1227 | AACAAUUGAUGUAAAC GAA | 721 | UUGGUUUACAUCAAUUGUU | 1290 |
| NM—001735.2_12201238—s | 1220-1238 | UAAAC CAAGAGACAUCUGA | 722 | UCAGAUGUCUCUUGGUUUA | 1291 |
| NM—001735.2_12321250—s | 1232-1250 | CAUCUGACUUGGAUCCAAG | 723 | CUUGGAUCCAAGUCAGAUG | 1292 |
| NM—001735.2_12431261—s | 1243-1261 | GAUCCAAGCAAAAGUGUAA | 724 | UUACACUUUUGCUUGGAUC | 1293 |
| NM—001735.2_12511269—s | 1251-1269 | CAAAAGUGUAACACGUGUU | 725 | AACAC GUGUUACACUUUUG | 1294 |
| NM—001735.2_12601278—s | 1260-1278 | AACACGUGUUGAUGAUGGA | 726 | UCCAUCAUCAACACGUGUU | 1295 |
| NM—001735.2_12721290—s | 1272-1290 | UGAUGGAGUAGCUUCCUUU | 727 | AAAGGAAGCUACUCCAUCA | 1296 |
| NM—001735.2_12791297—s | 1279-1297 | GUAGCUUCCUUUGUGCUUA | 728 | UAAGCACAAAGGAAGCUAC | 1297 |
| NM—001735.2_12931311—s | 1293-1311 | GCUUAAUCUCCCAUCUGGA | 729 | UCCAGAUGGGAGAUUAAGC | 1298 |
| NM—001735.2_13031321—s | 1303-1321 | CCAUCUGGAGUGACGGUGC | 730 | GCACCGUCACUCCAGAUGG | 1299 |
| NM—001735.2_13131331—s | 1313-1331 | UGACGGUGCUGGAGUUUAA | 731 | UUAAACUC CAGCACCGUCA | 1300 |
| NM—001735.2_13201338—s | 1320-1338 | GCUGGAGUUUAAUGUCAAA | 732 | UUUGACAUUAAACUCCAGC | 1301 |
| NM—001735.2_13321350—s | 1332-1350 | UGUCAAAACUGAUGCUCCA | 733 | UGGAGCAUCAGUUUUGACA | 1302 |
| NM—001735.2_13421360—s | 1342-1360 | GAUGCUCCAGAUCUUCCAG | 734 | CUGGAAGAUCUGGAGCAUC | 1303 |
| NM—001735.2_13491367—s | 1349-1367 | CAGAUCUUC CAGAAGAAAA | 735 | UUUUCUUCUGGAAGAUCUG | 1304 |
| NM—001735.2_13621380—s | 1362-1380 | AGAAAAUCAGGCCAGGGAA | 736 | UUCCCUGGCCUGAUUUUCU | 1305 |
| NM—001735.2_13711389—s | 1371-1389 | GGCCAGGGAAGGUUACCGA | 737 | UCGGUAACCUUCCCUGGCC | 1306 |
| NM—001735.2_13821400—s | 1382-1400 | GUUACCGAGCAAUAGCAUA | 738 | UAUGCUAUUGCUCGGUAAC | 1307 |
| NM—001735.2_13931411—s | 1393-1411 | AUAGCAUACUCAUCUCUCA | 739 | UGAGAGAUGAGUAUGCUAU | 1308 |
| NM—001735.2_13991417—s | 1399-1471 | UACUCAUCUCUCAGCCAAA | 740 | UUUGGCUGAGAGAUGAGUA | 1309 |
| NM—001735.2_14121430—s | 1412-1430 | GC CAAAGUUAC CUUUAUAU | 741 | AUAUAAAGGUAACUUUGGC | 1310 |
- 135 044245
| NM_001735.2_14221440_s | 1422-1440 | CCUUUAUAUUGAUUGGACU | 742 | AGUCCAAUCAAUAUAAAGG | 1311 |
| NM_001735.2_14321450_s | 1432-1450 | GAUUGGACUGAUAACCAUA | 743 | UAUGGUUAUCAGUCCAAUC | 1312 |
| NM_001735.2_14391457_s | 1439-1457 | CUGAUAACCAUAAGGCUUU | 744 | AAAGCCUUAUGGUUAUCAG | 1313 |
| NM_001735.2_14511469_s | 1451-1469 | AGGCUUUGCUAGUGGGAGA | 745 | UCUCCCACUAGCAAAGCCU | 1314 |
| NM_001735.2_14621480_s | 1462-1480 | GUGGGAGAACAUCUGAAUA | 746 | UAUUCAGAUGUUCUCCCAC | 1315 |
| NM_001735.2_14711489_s | 1471-1489 | CAUCUGAAUAUUAUUGUUA | 747 | UAACAAUAAUAUUCAGAUG | 1316 |
| NM_001735.2_14791497_s | 1479-1497 | UAUUAUUGUUAC С С С CAAA | 748 | UUUGGGGGUAACAAUAAUA | 1317 |
| NM_001735.2_14921510_s | 1492-1510 | С С CAAAAG С С CAUAUAUUG | 749 | CAAUAUAUGGGCUUUUGGG | 1318 |
| NM_001735.2_14931511_s | 1493-1511 | С CAAAAG С С CAUAUAUUGA | 750 | UCAAUAUAUGGGCUUUUGG | 1319 |
| NM_001735.2_14941512_s | 1494-1512 | CAAAAG С С CAUAUAUUGAC | 751 | GUCAAUAUAUGGGCUUUUG | 1320 |
| NM_001735.2_14951513_s | 1495-1513 | AAAAG С С CAUAUAUUGACA | 752 | UGUCAAUAUAUGGGCUUUU | 1321 |
| NM_001735.2_14961514_s | 1496-1514 | AAAG С С CAUAUAUUGACAA | 753 | UUGUCAAUAUAUGGGCUUU | 1322 |
| NM_001735.2_14971515_s | 1497-1515 | AAG С С CAUAUAUUGACAAA | 754 | UUUGUCAAUAUAUGGGCUU | 1323 |
| NM_001735.2_14981516_s | 1498-1516 | AG С С CAUAUAUUGACAAAA | 755 | UUUUGUCAAUAUAUGGGCU | 1324 |
| NM_001735.2_14991517_s | 1499-1517 | G С С CAUAUAUUGACAAAAU | 756 | AUUUUGUCAAUAUAUGGGC | 1325 |
| NM_001735.2_15001518_s | 1500-1518 | С C CAUAUAUUGACAAAAUA | 757 | UAUUUUGUCAAUAUAUGGG | 1326 |
| NM_001735.2_15011519_s | 1501-1519 | C CAUAUAUUGACAAAAUAA | 758 | UUAUUUUGUCAAUAUAUGG | 1327 |
| NM_001735.2_15021520_s | 1502-1520 | CAUAUAUUGACAAAAUAAC | 759 | GUUAUUUUGUCAAUAUAUG | 1328 |
| NM_001735.2_15031521_s | 1503-1521 | AUAUAUUGACAAAAUAACU | 760 | AGUUAUUUUGUCAAUAUAU | 1329 |
| NM_001735.2_15041522_s | 1504-1522 | UAUAUUGACAAAAUAACUC | 761 | GAGUUAUUUUGUCAAUAUA | 1330 |
| NM_001735.2_15051523_s | 1505-1523 | AUAUUGACAAAAUAACUCA | 762 | UGAGUUAUUUUGUCAAUAU | 1331 |
| NM_001735.2_15061524_s | 1506-1524 | UAUUGACAAAAUAACUCAC | 763 | GUGAGUUAUUUUGUCAAUA | 1332 |
| NM_001735.2_15071525_s | 1507-1525 | AUUGACAAAAUAACUCACU | 764 | AGUGAGUUAUUUUGUCAAU | 1333 |
| NM_001735.2_15081526_s | 1508-1526 | UUGACAAAAUAACUCACUA | 765 | UAGUGAGUUAUUUUGUCAA | 1334 |
- 136044245
| NM_001735.2_15091527_s | 1509-1527 | UGACAAAAUAACUCACUAU | 766 | AUAGUGAGUUAUUUUGUCA | 1335 |
| NM_001735.2_15101528_s | 1510-1528 | GACAAAAUAACUCACUAUA | 767 | UAUAGUGAGUUAUUUUGUC | 1336 |
| NM_001735.2_15131531—s | 1513-1531 | AAAAUAACUCACUAUAAUU | 768 | AAUUAUAGUGAGUUAUUUU | 1337 |
| NM—001735.2_15141532—s | 1514-1532 | AAAUAACUCACUAUAAUUA | 769 | UAAUUAUAGUGAGUUAUUU | 1338 |
| NM—001735.2_15151533—s | 1515-1533 | AAUAACUCACUAUAAUUAC | 770 | GUAAUUAUAGUGAGUUAUU | 1339 |
| NM—001735.2_15161534—s | 1516-1534 | AUAACUCACUAUAAUUACU | 771 | AGUAAUUAUAGUGAGUUAU | 1340 |
| NM—001735.2_15181536—s | 1518-1536 | AACUCACUAUAAUUACUUG | 772 | CAAGUAAUUAUAGUGAGUU | 1341 |
| NM—001735.2_15191537—s | 1519-1537 | ACUCACUAUAAUUACUUGA | 773 | UCAAGUAAUUAUAGUGAGU | 1342 |
| NM—001735.2_15201538—s | 1520-1538 | CUCACUAUAAUUACUUGAU | 774 | AUCAAGUAAUUAUAGUGAG | 1343 |
| NM—001735.2_15211539—s | 1521-1539 | UCACUAUAAUUACUUGAUU | 775 | AAUCAAGUAAUUAUAGUGA | 1344 |
| NM—001735.2_15231541—s | 1523-1541 | ACUAUAAUUACUUGAUUUU | 776 | AAAAUCAAGUAAUUAUAGU | 1345 |
| NM—001735.2_15241542—s | 1524-1542 | CUAUAAUUACUUGAUUUUA | 777 | UAAAAUCAAGUAAUUAUAG | 1346 |
| NM—001735.2_15251543—s | 1525-1543 | UAUAAUUACUUGAUUUUAU | 778 | AUAAAAUCAAGUAAUUAUA | 1347 |
| NM—001735.2_15261544—s | 1526-1544 | AUAAUUACUUGAUUUUAUC | 779 | GAUAAAAUCAAGUAAUUAU | 1348 |
| NM—001735.2_15271545—s | 1527-1545 | UAAUUACUUGAUUUUAUC C | 780 | GGAUAAAAUCAAGUAAUUA | 1349 |
| NM—001735.2_15281546—s | 1528-1546 | AAUUACUUGAUUUUAUC CA | 781 | UGGAUAAAAUCAAGUAAUU | 1350 |
| NM—001735.2_15291547—s | 1529-1547 | AUUACUUGAUUUUAUCCAA | 782 | UUGGAUAAAAUCAAGUAAU | 1351 |
| NM—001735.2_15401558—s | 1540-1558 | UUAUCCAAGGGCAAAAUUA | 783 | UAAUUUUGCCCUUGGAUAA | 1352 |
| NM—001735.2_15501568—s | 1550-1568 | GCAAAAUUAUCCACUUUGG | 784 | CCAAAGUGGAUAAUUUUGC | 1353 |
| NM—001735.2_15611579—s | 1561-1579 | CACUUUGGCACGAGGGAGA | 785 | UCUCCCUCGUGCCAAAGUG | 1354 |
| NM—001735.2_15711589—s | 1571-1589 | CGAGGGAGAAAUUUUCAGA | 786 | UCUGAAAAUUUCUCCCUCG | 1355 |
| NM—001735.2_15811599—s | 1581-1599 | AUUUUCAGAUGCAUCUUAU | 787 | AUAAGAUGCAUCUGAAAAU | 1356 |
| NM—001735.2_15911609—s | 1591-1609 | GCAUCUUAUCAAAGUAUAA | 788 | UUAUACUUUGAUAAGAUGC | 1357 |
| NM—001735.2_16001618—s | 1600-1618 | CAAAGUAUAAACAUUC GAG | 789 | CUGGAAUGUUUAUACUUUG | 1358 |
- 137044245
| ΝΜ_001735.2_16121630_s | 1612-1630 | AUUC CAGUAACACAGAACA | 790 | UGUUCUGUGUUACUGGAAU | 1359 |
| NM_001735.2_16221640_s | 1622-1640 | CACAGAACAUGGUUCCUUC | 791 | GAAGGAACCAUGUUCUGUG | 1360 |
| NM_001735.2_16321650_s | 1632-1560 | GGUUCCUUCAUCCCGACUU | 792 | AAGUCGGGAUGAAGGAACC | 1361 |
| NM_001735.2_16431661_s | 1643-1661 | CCCGACUUCUGGUCUAUUA | 793 | UAAUAGACCAGAAGUCGGG | 1362 |
| NM_001735.2_16531671_s | 1653-1671 | GGUCUAUUACAUCGUCACA | 794 | UGUGAC GAUGUAAUAGAC C | 1363 |
| NM_001735.2_16631681_s | 1663-1681 | AUCGUCACAGGAGAACAGA | 795 | UCUGUUCUCCUGUGACGAU | 1364 |
| NM_001735.2_16701688_s | 1670-1688 | CAGGAGAACAGACAGCAGA | 796 | UCUGCUGUCUGUUCUCCUG | 1365 |
| NM_001735.2_16821700_s | 1682-1700 | CAGCAGAAUUAGUGUCUGA | 797 | UCAGACACUAAUUCUGCUG | 1366 |
| NM_001735.2_16931711_s | 1693-1711 | GUGUCUGAUUCAGUCUGGU | 798 | ACCAGACUGAAUCAGACAC | 1367 |
| NM_001735.2_17031721_s | 1703-1721 | CAGUCUGGUUAAAUAUUGA | 799 | UCAAUAUUUAAC CAGACUG | 1368 |
| NM_001735.2_17101728_s | 1710-1728 | GUUAAAUAUUGAAGAAAAA | 800 | UUUUUCUUCAAUAUUUAAC | 1369 |
| NM_001735.2_17221740_s | 1722-1740 | AGAAAAAUGUGGCAACCAG | 801 | CUGGUUGCCACAUUUUUCU | 1370 |
| NM_001735.2_17331751_s | 1733-1751 | GCAACCAGCUCCAGGUUCA | 802 | UGAACCUGGAGCUGGUUGC | 1371 |
| NM_001735.2_17401758_s | 1740-1758 | GCUCCAGGUUCAUCUGUCU | 803 | AGACAGAUGAACCUGGAGC | 1372 |
| NM_001735.2_17511769_s | 1751-1769 | AUCUGUCUCCUGAUGCAGA | 804 | UCUGCAUCAGGAGACAGAU | 1373 |
| NM_001735.2_17621780_s | 1762-1780 | GAUGCAGAUGCAUAUUCUC | 805 | GAGAAUAUGCAUCUGCAUC | 1374 |
| NM_001735.2_17711789_s | 1771-1789 | GCAUAUUCUCCAGGCCAAA | 806 | UUUGGCCUGGAGAAUAUGC | 1375 |
| NM_001735.2_17821800_s | 1782-1800 | AGGCCAAACUGUGUCUCUU | 807 | AAGAGACACAGUUUGGCCU | 1376 |
| NM_001735.2_17921810_s | 1792-1810 | GUGUCUCUUAAUAUGGCAA | 808 | UUGCCAUAUUAAGAGACAC | 1377 |
| NM_001735.2_17991817_s | 1799-1817 | UUAAUAUGGCAACUGGAAU | 809 | AUUC CAGUUGC CAUAUUAA | 1378 |
| NM_001735.2_18091827_s | 1809-1827 | AACUGGAAUGGAUUCCUGG | 810 | C CAGGAAUC CAUUC CAGUU | 1379 |
| NM_001735.2_18211839_s | 1821-1839 | UUCCUGGGUGGCAUUAGCA | 811 | UGCUAAUGCCACCCAGGAA | 1380 |
| NM_001735.2_18301848_s | 1830-1848 | GGCAUUAGCAGCAGUGGAC | 812 | GUCCACUGCUGCUAAUGCC | 1381 |
| NM_001735.2_18421860_s | 1842-1860 | AGUGGACAGUGCUGUGUAU | 813 | AUACACAGCACUGUCCACU | 1382 |
- 138044245
| NM_001735.2_18521870_s | 1852-1870 | GCUGUGUAUGGAGUCCAAA | 814 | UUUGGACUCCAUACACAGC | 1383 |
| NM_001735.2_18631881_s | 1863-1881 | AGUCCAAAGAGGAGCCAAA | 815 | UUUGGCUCCUCUUUGGACU | 1384 |
| NM_001735.2_18701888_s | 1870-1888 | AGAGGAGCCAAAAAGCCCU | 816 | AGGGCUUUUUGGCUCCUCU | 1385 |
| NM_001735.2_18831901_s | 1883-1901 | AGCCCUUGGAAAGAGUAUU | 817 | AAUACUCUUUCCAAGGGCU | 1386 |
| NM_001735.2_18931911_s | 1893-1911 | AAGAGUAUUUCAAUUCUUA | 818 | UAAGAAUUGAAAUACUCUU | 1387 |
| NM_001735.2_19001918_s | 1900-1918 | UUUCAAUUCUUAGAGAAGA | 819 | UCUUCUCUAAGAAUUGAAA | 1388 |
| NM_001735.2_19121930_s | 1912-1930 | GAGAAGAGUGAUCUGGGCU | 820 | AGCCCAGAUCACUCUUCUC | 1389 |
| NM_001735.2_19201938_s | 1920-1938 | UGAUCUGGGCUGUGGGGCA | 821 | UGCCCCACAGCCCAGAUCA | 1390 |
| NM_001735.2_19331951_s | 1933-1951 | GGGGCAGGUGGUGGCCUCA | 822 | UGAGGCCACCACCUGCCCC | 1391 |
| NM_001735.2_19431961_s | 1943-1961 | GUGGCCUCAACAAUGCCAA | 823 | UUGGCAUUGUUGAGGCCAC | 1392 |
| NM_001735.2_19501968_s | 1950-1968 | CAACAAUGCCAAUGUGUUC | 824 | GAACACAUUGGCAUUGUUG | 1393 |
| NM_001735.2_19591977_s | 1959-1977 | CAAUGUGUUCCACCUAGCU | 825 | AGCUAGGUGGAACACAUUG | 1394 |
| NM_001735.2_19691987_s | 1969-1987 | CACCUAGCUGGACUUACCU | 826 | AGGUAAGUCCAGCUAGGUG | 1395 |
| NM_001735.2_19791997_s | 1979-1997 | GACUUACCUUCCUCACUAA | 827 | UUAGUGAGGAAGGUAAGUC | 1396 |
| NM_001735.2_19912009_s | 1991-2009 | UCACUAAUGCAAAUGCAGA | 828 | UCUGCAUUUGCAUUAGUGA | 1397 |
| NM_001735.2_2001- 2019_s | 2001-2019 | AAAUGCAGAUGACUCСCAA | 829 | UUGGGAGUCAUCUGCAUUU | 1398 |
| NM_001735.2_20132031_s | 2013-2013 | CUC C CAAGAAAAUGAUGAA | 830 | UUCAUCAUUUUCUUGGGAG | 1399 |
| NM_001735.2_20322050_s | 2032-2050 | CCUUGUAAAGAAAUUCUCA | 831 | UGAGAAUUUCUUUACAAGG | 1400 |
| NM_001735.2_20432061_s | 2043-2061 | AAUUCUCAGGCCAAGAAGA | 832 | UCUUCUUGGCCUGAGAAUU | 1401 |
| NM_001735.2_20532071_s | 2053-2071 | CCAAGAAGAACGCUGCAAA | 833 | UUUGCAGCGUUCUUCUUGG | 1402 |
| NM_001735.2_20632081_s | 2063-2081 | CGCUGCAAAAGAAGAUAGA | 834 | UCUAUCUUCUUUUGCAGCG | 1403 |
| NM_001735.2_20702088_s | 2070-2088 | AAAGAAGAUAGAAGAAAUA | 835 | UAUUUCUUCUAUCUUCUUU | 1404 |
| NM_001735.2_20822100_s | 2082-2100 | AGAAAUAGCUGCUAAAUAU | 836 | AUAUUUAGCAGCUAUUUCU | 1405 |
| NM_001735.2_2089- 2107_s | 2089-2107 | GCUGCUAAAUAUAAACAUU | 837 | AAUGUUUAUAUUUAGCAGC | 1406 |
- 139044245
| NM_001735.2_2103- 2121_s | 2103-2121 | ACAUUCAGUAGUGAAGAAA | 838 | UUUCUUCACUACUGAAUGU | 1407 |
| NM_001735.2_21102128_s | 2110-2128 | GUAGUGAAGAAAUGUUGUU | 839 | AACAACAUUUCUUCACUAC | 1408 |
| NM_001735.2_21192137_s | 2119-2137 | AAAUGUUGUUACGAUGGAG | 840 | CUC CAUC GUAACAACAUUU | 1409 |
| NM_001735.2_21302148_s | 2130-2148 | CGAUGGAGCCUGCGUUAAU | 841 | AUUAACGCAGGCUCCAUCG | 1410 |
| NM_001735.2_21422160_s | 2142-2160 | C GUUAAUAAUGAUGAAAC C | 842 | GGUUUCAUCAUUAUUAACG | 1411 |
| NM_001735.2_21502168_s | 2150-2168 | AUGAUGAAACCUGUGAGCA | 843 | UGCUCACAGGUUUCAUCAU | 1412 |
| NM_001735.2_21602178_s | 2160-2178 | CUGUGAGCAGCGAGCUGCA | 844 | UGCAGCUCGCUGCUCACAG | 1413 |
| NM_001735.2_21702188_s | 2170-2188 | CGAGCUGCACGGAUUAGUU | 845 | AACUAAUCCGUGCAGCUCG | 1414 |
| NM_001735.2_2180- 2198_s | 2180-2198 | GGAUUAGUUUAGGGCCAAG | 846 | CUUGGCCCUAAACUAAUCC | 1415 |
| NM_001735.2_21912209_s | 2191-2209 | GGGCCAAGAUGCAUCAAAG | 847 | CUUUGAUGCAUCUUGGCCC | 1416 |
| NM_001735.2_22022220_s | 2202-2220 | CAUCAAAGCUUUCACUGAA | 848 | UUCAGUGAAAGCUUUGAUG | 1417 |
| NM_001735.2_22092227_s | 2209-2227 | GCUUUCACUGAAUGUUGUG | 849 | CACAACAUUCAGUGAAAGC | 1418 |
| NM_001735.2_22192237_s | 2219-2237 | AAUGUUGUGUCGUCGCAAG | 850 | CUUGC GAC GACACAACAUU | 1419 |
| NM_001735.2_22292247_s | 2229-2247 | CGUCGCAAGCCAGCUCCGU | 851 | ACGGAGCUGGCUUGCGACG | 1420 |
| NM_001735.2_2241- 2259_s | 2241-2259 | GCUCCGUGCUAAUAUCUCU | 852 | AGAGAUAUUAGCACGGAGC | 1421 |
| NM_001735.2_22492267_s | 2249-2267 | CUAAUAUCUCUCAUAAAGA | 853 | UCUUUAUGAGAGAUAUUAG | 1422 |
| NM_001735.2_22632281_s | 2263-2281 | AAAGACAUGCAAUUGGGAA | 854 | UUCCCAAUUGCAUGUCUUU | 1423 |
| NM_001735.2_22722290_s | 2272-2290 | CAAUUGGGAAGGCUACACA | 855 | UGUGUAGCCUUCCCAAUUG | 1424 |
| NM_001735.2_2283- 2301_s | 2283-2301 | GCUACACAUGAAGACCCUG | 856 | CAGGGUCUUCAUGUGUAGC | 1425 |
| NM_001735.2_22892307_s | 2289-2307 | CAUGAAGACCCUGUUACGA | 857 | UGGUAACAGGGUCUUCAUG | 1426 |
| NM_001735.2_2303- 2321_s | 2303-2321 | UACCAGUAAGCAAGCCAGA | 858 | UCUGGCUUGCUUACUGGUA | 1427 |
| NM_001735.2_23112329_s | 2311-2329 | AGCAAGCCAGAAAUUCGGA | 859 | UCCGAAUUUCUGGCUUGCU | 1428 |
| NM_001735.2_23192337_s | 2319-2337 | AGAAAUUCGGAGUUAUUUU | 860 | AAAAUAACUCCGAAUUUCU | 1429 |
| NM_001735.2_23292347_s | 2329-2347 | AGUUAUUUUCCAGAAAGCU | 861 | AGCUUUCUGGAAAAUAACU | 1430 |
- 140044245
| NM_001735.2_23392357_s | 2339-2357 | CAGAAAGCUGGUUGUGGGA | 862 | UC C GAGAAC CAGCUUUCUG | 1431 |
| NM_001735.2_23522370_s | 2352-2370 | GUGGGAAGUUCAUCUUGUU | 863 | AACAAGAUGAACUUC С CAC | 1432 |
| NM_001735.2_2361- 2379_s | 2361-2379 | UCAUCUUGUUCCCAGAAGA | 864 | UCUUCUGGGAACAAGAUGA | 1433 |
| NM_001735.2_23722390_s | 2372-2390 | CCAGAAGAAAACAGUUGCA | 865 | UGCAACUGUUUUCUUCUGG | 1434 |
| NM_001735.2_2383- 2401_s | 2383-2401 | CAGUUGCAGUUUGCCCUAC | 866 | GUAGGGCAAACUGCAACUG | 1435 |
| NM_001735.2_23892407_s | 2389-2407 | CAGUUUGCCCUACCUGAUU | 867 | AAUCAGGUAGGGCAAACUG | 1436 |
| NM_001735.2_2401- 2419_s | 2401-2419 | CCUGAUUCUCUAACCACCU | 868 | AGGUGGUUAGAGAAUCAGG | 1437 |
| NM_001735.2_2413- 2431_s | 2413-2431 | ACCACCUGGGAAAUUCAAG | 869 | CUUGAAUUUCCCAGGUGGU | 1438 |
| NM_001735.2_24222440_s | 2422-2440 | GAAAUUCAAGGCGUUGGCA | 870 | UGCCAACGCCUUGAAUUUC | 1439 |
| NM_001735.2_2433- 2451_s | 2433-2451 | CGUUGGCAUUUCAAACACU | 871 | AGUGUUUGAAAUGC CAAC G | 1440 |
| NM_001735.2_24392457_s | 2439-2457 | CAUUUCAAACACUGGUAUA | 872 | UAUAC CAGUGUUUGAAAUG | 1441 |
| NM_001735.2_2453- 2471_s | 2453-2471 | GUAUAUGUGUUGCUGAUAC | 873 | GUAUCAGCAACACAUAUAC | 1442 |
| NM_001735.2_24632481_s | 2463-2481 | UGCUGAUACUGUCAAGGCA | 874 | UGCCUUGACAGUAUCAGCA | 1443 |
| NM_001735.2_24712489_s | 2471-2489 | CUGUCAAGGCAAAGGUGUU | 875 | AACAC CUUUGC CUUGACAG | 1444 |
| NM_001735.2_2483- 2501_s | 2483-2501 | AGGUGUUCAAAGAUGUCUU | 876 | AAGACAUCUUUGAACACCU | 1445 |
| NM_001735.2_24902508_s | 2490-2508 | CAAAGAUGUCUUCCUGGAA | 877 | UUCCAGGAAGACAUCUUUG | 1446 |
| NM_001735.2_24992517_s | 2499-2517 | CUUCCUGGAAAUGAAUAUA | 878 | UAUAUUCAUUUCCAGGAAG | 1447 |
| NM_001735.2_25112529_s | 2511-2529 | GAAUAUAC CAUAUUCUGUU | 879 | AACAGAAUAUGGUAUAUUC | 1448 |
| NM_001735.2_25202538_s | 2520-2538 | AUAUUCUGUUGUACGAGGA | 880 | UC CUC GUACAACAGAAUAU | 1449 |
| NM_001735.2_2533- 2551_s | 2533-2551 | C GAG GAGAACAGAUC CAAU | 881 | AUUGGAUCUGUUCUCCUCG | 1450 |
| NM_001735.2_25392557_s | 2539-2557 | GAACAGAUC CAAUUGAAAG | 882 | CUUUCAAUUGGAUCUGUUC | 1451 |
| NM_001735.2_2553- 2571_s | 2553-2571 | GAAAGGAACUGUUUACAAC | 883 | GUUGUAAACAGUUCCUUUC | 1452 |
| NM_001735.2_25602578_s | 2560-2578 | ACUGUUUACAACUAUAGGA | 884 | UC CUAUAGUUGUAAACAGU | 1453 |
| NM_001735.2_25692587_s | 2569-2587 | AACUAUAGGACUUCUGGGA | 885 | UCCCAGAAGUCCUAUAGUU | 1454 |
- 141 044245
| NM_001735.2_2583- 2601_s | 2583-2601 | UGGGAUGCAGUUCUGUGUU | 886 | AACACAGAACUGCAUCCCA | 1455 |
| NM_001735.2_25922610_s | 2592-2610 | GUUCUGUGUUAAAAUGUCU | 887 | AGACAUUUUAACACAGAAC | 1456 |
| NM_001735.2_26002618_s | 2600-2618 | UUAAAAUGUCUGCUGUGGA | 888 | UCCACAGCAGACAUUUUAA | 1457 |
| NM_001735.2_26122630_s | 2612-2630 | CUGUGGAGGGAAUCUGCAC | 889 | GUGCAGAUUC C CUC CACAG | 1458 |
| NM_001735.2_26202638_s | 2620-2638 | GGAAUCUGCACUUCGGAAA | 890 | UUUC C GAAGUGCAGAUUC C | 1459 |
| NM_001735.2_26332651_s | 2633-2651 | CGGAAAGCCCAGUCAUUGA | 891 | UCAAUGACUGGGCUUUCCG | 1460 |
| NM_001735.2_26412659_s | 2641-2659 | CCAGUCAUUGAUCAUCAGG | 892 | CCUGAUGAUCAAUGACUGG | 1461 |
| NM_001735.2_26532671_s | 2653-2671 | CAUCAGGGCACAAAGUCCU | 893 | AGGACUUUGUGCCCUGAUG | 1462 |
| NM_001735.2_26592677_s | 2659-2677 | GGCACAAAGUCCUCCAAAU | 894 | AUUUGGAGGACUUUGUGCC | 1463 |
| NM_001735.2_26732691_s | 2673-2691 | CAAAUGUGUGCGCCAGAAA | 895 | UUUCUGGCGCACACAUUUG | 1464 |
| NM_001735.2_26822700_s | 2682-2700 | GCGCCAGAAAGUAGAGGGC | 896 | GCCCUCUACUUUCUGGCGC | 1465 |
| NM_001735.2_26912709_s | 2691-2709 | AGUAGAGGGCUCCUCCAGU | 897 | ACUGGAGGAGCCCUCUACU | 1466 |
| NM_001735.2_27022720_s | 2702-2720 | C CUC CAGUCACUUGGUGAC | 898 | GUCACCAAGUGACUGGAGG | 1467 |
| NM_001735.2_27092727_s | 2709-2727 | UCACUUGGUGACAUUCACU | 899 | AGUGAAUGUCACCAAGUGA | 1468 |
| NM_001735.2_27202738_s | 2720-2738 | CAUUCACUGUGCUUCCUCU | 900 | AGAGGAAGCACAGUGAAUG | 1469 |
| NM_001735.2_27392757_s | 2739-2757 | GGAAAUUGGCCUUCACAAC | 901 | GUUGUGAAGGCCAAUUUCC | 1470 |
| NM_001735.2_27492767_s | 2749-2767 | CUUCACAACAUCAAUUUUU | 902 | AAAAAUUGAUGUUGUGAAG | 1471 |
| NM_001735.2_2761- 2779_s | 2761-2779 | AAUUUUUCACUGGAGACUU | 903 | AAGUCUCCAGUGAAAAAUU | 1472 |
| NM_001735.2_27702788_s | 2770-2788 | CUGGAGACUUGGUUUGGAA | 904 | UUC CAAAC CAAGUCUC CAG | 1473 |
| NM_001735.2_27802798_s | 2780-2798 | GGUUUGGAAAAGAAAUCUU | 905 | AAGAUUUCUUUUC CAAAC C | 1474 |
| NM_001735.2_27932811_s | 2793-2811 | AAUCUUAGUAAAAACAUUA | 906 | UAAUGUUUUUACUAAGAUU | 1475 |
| NM_001735.2_28022820_s | 2802-2820 | AAAAACAUUACGAGUGGUG | 907 | CACCACUCGUAAUGUUUUU | 1476 |
| NM_001735.2_28132831_s | 2813-2831 | GAGUGGUGCCAGAAGGUGU | 908 | ACACCUUCUGGCACCACUC | 1477 |
| NM_001735.2_28232841_s | 2823-2841 | AGAAGGUGUCAAAAGGGAA | 909 | UUC C CUUUUGACAC CUUCU | 1478 |
- 142044245
| NM_001735.2_28292847_s | 2829-2847 | UGUCAAAAGGGAAAGCUAU | 910 | AUAGCUUUCCCUUUUGACA | 1479 |
| NM_001735.2_28432861_s | 2843-2861 | GCUAUUCUGGUGUUACUUU | 911 | AAAGUAACACCAGAAUAGC | 1480 |
| NM_001735.2_28522870_s | 2852-2870 | GUGUUACUUUGGAUCCUAG | 912 | CUAGGAUCCAAAGUAACAC | 1481 |
| NM_001735.2_28622880_s | 2862-2880 | GGAUCCUAGGGGUAUUUAU | 913 | AUAAAUAC С C CUAGGAUC C | 1482 |
| NM_001735.2_28722890_s | 2872-2890 | GGUAUUUAUGGUACCAUUA | 914 | UAAUGGUAC CAUAAAUAC C | 1483 |
| NM_001735.2_2882- 2900_s | 2882-2900 | GUAC CAUUAG CAGAC GAAA | 915 | UUUCGUCUGCUAAUGGUAC | 1484 |
| NM_001735.2_2892- 2910_s | 2892-2910 | CAGAC GAAAGGAGUUC C CA | 916 | UGGGAACUCCUUUCGUCUG | 1485 |
| NM_001735.2_29002918_s | 2900-2918 | AGGAGUUCCCAUACAGGAU | 917 | AUCCUGUAUGGGAACUCCU | 1486 |
| NM_001735.2_29092927_s | 2909-2927 | CAUACAG GAUAC C CUUAGA | 918 | UCUAAGGGUAUCCUGUAUG | 1487 |
| NM_001735.2_29222940_s | 2922-2940 | CUUAGAUUUGGUCССCAAA | 919 | UUUGGGGACCAAAUCUAAG | 1488 |
| NM_001735.2_2933- 2951_s | 2933-2951 | UC С C CAAAACAGAAAUCAA | 920 | UUGAUUUCUGUUUUGGGGA | 1489 |
| NM_001735.2_2941- 2959_s | 2941-2959 | ACAGAAAUCAAAAGGAUUU | 921 | AAAUCCUUUUGAUUUCUGU | 1490 |
| NM_001735.2_2951- 2969_s | 2951-2969 | AAAGGAUUUUGAGUGUAAA | 922 | UUUACACUCAAAAUC CUUU | 1491 |
| NM_001735.2_29622980_s | 2962-2980 | AGUGUAAAAGGACUGCUUG | 923 | CAAGCAGUCCUUUUACACU | 1492 |
| NM_001735.2_29692987_s | 2969-2987 | AAGGACUGCUUGUAGGUGA | 924 | UCAC CUACAAGCAGUC CUU | 1493 |
| NM_001735.2_2980- 2998_s | 2980-2998 | GUAGGUGAGAUCUUGUCUG | 925 | CAGACAAGAUCUCACCUAC | 1494 |
| NM_001735.2_29893007_s | 2989-3007 | AUCUUGUCUGCAGUUCUAA | 926 | UUAGAACUGCAGACAAGAU | 1495 |
| NM_001735.2_3001- 3019_s | 3001-3019 | GUUCUAAGUCAGGAAGGCA | 927 | UGCCUUCCUGACUUAGAAC | 1496 |
| NM_001735.2_30133031_s | 3013-3031 | GAAGGCAUCAAUAUCCUAA | 928 | UUAGGAUAUUGAUGCCUUC | 1497 |
| NM_001735.2_30203038_s | 3020-3038 | UCAAUAUC CUAAC С CAC CU | 929 | AGGUGGGUUAGGAUAUUGA | 1498 |
| NM_001735.2_30333051_s | 3033-3051 | CCACCUCCCCAAAGGGAGU | 930 | ACUCCCUUUGGGGAGGUGG | 1499 |
| NM_001735.2_30393057_s | 3039-3057 | CCCCAAAGGGAGUGCAGAG | 931 | CUCUGCACUCCCUUUGGGG | 1500 |
| NM_001735.2_30503068_s | 3050-3068 | GUGCAGAGGCGGAGCUGAU | 932 | AUCAGCUCCGCCUCUGCAC | 1501 |
| NM_001735.2_30603078_s | 3060-3078 | GGAGCUGAUGAGCGUUGUC | 933 | GACAACGCUCAUCAGCUCC | 1502 |
- 143 044245
| NM_001735.2_30723090—s | 3072-3090 | CGUUGUCCCAGUAUUCUAU | 934 | AUAGAAUACUGGGACAACG | 1503 |
| NM_001735.2_30793097—s | 3079-3097 | CCAGUAUUCUAUGUUUUUC | 935 | GAAAAACAUAGAAUACUGG | 1504 |
| NM—001735.2_30913109—s | 3091-3109 | GUUUUUCACUACCUGGAAA | 936 | UUUCCAGGUAGUGAAAAAC | 1505 |
| NM-001735.2_31023120—s | 3102-3120 | CCUGGAAACAGGAAAUCAU | 937 | AUGAUUUCCUGUUUCCAGG | 1506 |
| NM_001735.2_31223140—s | 3122-3140 | GGAACAUUUUUCAUUCUGA | 938 | UCAGAAUGAAAAAUGUUC C | 1507 |
| NM_001735.2_31333151—s | 3133-3151 | CAUUCUGAC C CAUUAAUUG | 939 | CAAUUAAUGGGUCAGAAUG | 1508 |
| NM_001735.2_31423160—s | 3142-3160 | CCAUUAAUUGAAAAGCAGA | 940 | UCUGCUUUUCAAUUAAUGG | 1509 |
| NM_001735.2_31533171—s | 3153-3171 | AAAGCAGAAACUGAAGAAA | 941 | UUUCUUCAGUUUCUGCUUU | 1510 |
| NM_001735.2_31613179—s | 3161-3179 | AACUGAAGAAAAAAUUAAA | 942 | UUUAAUUUUUUCUUCAGUU | 1511 |
| NM_001735.2_31693187—s | 3169-3187 | AAAAAAUUAAAAGAAGGGA | 943 | UCCCUUCUUUUAAUUUUUU | 1512 |
| NM_001735.2_31833201—s | 3183-3201 | AGGGAUGUUGAGCAUUAUG | 944 | CAUAAUGCUCAACAUCCCU | 1513 |
| NM_001735.2_31923210—s | 3192-3210 | GAGCAUUAUGUCCUACAGA | 945 | UCUGUAGGACAUAAUGCUC | 1514 |
| NM_001735.2_32003218—s | 3200-3218 | UGUCCUACAGAAAUGCUGA | 946 | UCAGCAUUUCUGUAGGACA | 1515 |
| NM_001735.2_32113229—s | 3211-3229 | AAUGCUGACUACUCUUACA | 947 | UGUAAGAGUAGUCAGCAUU | 1516 |
| NM_001735.2_32203238—s | 3220-3238 | UACUCUUACAGUGUGUGGA | 948 | UCCACACACUGUAAGAGUA | 1517 |
| NM_001735.2_32293247—s | 3229-3247 | AGUGUGUGGAAGGGUGGAA | 949 | UUC САС C CUUC CACACACU | 1518 |
| NM_001735.2_32403258—s | 3240-3258 | GGGUGGAAGUGCUAGCACU | 950 | AGUGCUAGCACUUCCACCC | 1519 |
| NM_001735.2_32503268—s | 3250-3268 | GCUAGCACUUGGUUAACAG | 951 | CUGUUAACCAAGUGCUAGC | 1520 |
| NM_001735.2_32603278—s | 3260-3278 | GGUUAACAGCUUUUGCUUU | 952 | AAAGCAAAAGCUGUUAACC | 1521 |
| NM_001735.2_32733291—s | 3273-3291 | UGCUUUAAGAGUACUUGGA | 953 | UCCAAGUACUCUUAAAGCA | 1522 |
| NM_001735.2_32833301—s | 3283-3301 | GUACUUGGACAAGUAAAUA | 954 | UAUUUACUUGUC CAAGUAC | 1523 |
| NM_001735.2_32923310—s | 3292-3317 | CAAGUAAAUAAAUAC GUAG | 955 | CUAC GUAUUUAUUUACUUG | 1524 |
| NM_001735.2_32993317—s | 3299-3317 | AUAAAUACGUAGAGCAGAA | 956 | UUCUGCUCUACGUAUUUAU | 1525 |
| NM_001735.2_33103328—s | 3310-3328 | GAGCAGAACCAAAAUUCAA | 957 | UUGAAUUUUGGUUCUGCUC | 1526 |
- 144044245
| NM_001735.2_33223340_s | 3322-3340 | AAUUCAAUUUGUAAUUCUU | 958 | AAGAAUUACAAAUUGAAUU | 1527 |
| NM_001735.2_33323350_s | 3332-3350 | GUAAUUCUUUAUUGUGGCU | 959 | AGCCACAAUAAAGAAUUAC | 1528 |
| NM_001735.2_33423360—s | 3342-3360 | AUUGUGGCUAGUUGAGAAU | 960 | AUUCUCAACUAGCCACAAU | 1529 |
| NM—001735.2_33493367—s | 3349-3367 | CUAGUUGAGAAUUAUCAAU | 961 | AUUGAUAAUUCUCAACUAG | 1530 |
| NM—001735.2_33603378—s | 3360-3378 | UUAUCAAUUAGAUAAUGGA | 962 | UC CAUUAUCUAAUUGAUAA | 1531 |
| NM—001735.2_33733391—s | 3373-3391 | AAUGGAUCUUUCAAGGAAA | 963 | UUUCCUUGAAAGAUCCAUU | 1532 |
| NM—001735.2_33803398—s | 3380-3398 | CUUUCAAGGAAAAUUCACA | 964 | UGUGAAUUUUCCUUGAAAG | 1533 |
| NM—001735.2_33913409—s | 3391-3409 | AAUUCACAGUAUCAAC CAA | 965 | UUGGUUGAUACUGUGAAUU | 1534 |
| NM—001735.2_33993417—s | 3399-3417 | GUAUCAAC CAAUAAAAUUA | 966 | UAAUUUUAUUGGUUGAUAC | 1535 |
| NM—001735.2_34113429—s | 3411-3429 | AAAAUUACAGGGUACCUUG | 967 | CAAGGUAC C CUGUAAUUUU | 1536 |
| NM—001735.2_34193437—s | 3419-3437 | AGGGUACCUUGCCUGUUGA | 968 | UCAACAGGCAAGGUACCCU | 1537 |
| NM—001735.2_34333451—s | 3433-3451 | GUUGAAGC С C GAGAGAACA | 969 | UGUUCUCUCGGGCUUCAAC | 1538 |
| NM—001735.2_34413459—s | 3441-3559 | С C GAGAGAACAG CUUAUAU | 970 | AUAUAAGCUGUUCUCUCGG | 1539 |
| NM—001735.2_34523470—s | 3452-3470 | GCUUAUAUCUUACAGCCUU | 971 | AAGGCUGUAAGAUAUAAGC | 1540 |
| NM—001735.2_34603478—s | 3460-3478 | CUUACAGCCUUUACUGUGA | 972 | UCACAGUAAAGGCUGUAAG | 1541 |
| NM—001735.2_34823500—s | 3482-3500 | GAAUUAGAAAGGCUUUCGA | 973 | UCGAAAGCCUUUCUAAUUC | 1542 |
| NM—001735.2_34923510—s | 3492-3510 | GGCUUUCGAUAUAUGCCCC | 974 | GGGGCAUAUAUCGAAAGCC | 1543 |
| NM—001735.2_34993517—s | 3499-3517 | GAUAUAUGCCCCCUGGUGA | 975 | UCACCAGGGGGCAUAUAUC | 1544 |
| NM—001735.2_35133531—s | 3513-3531 | GGUGAAAAUCGACACAGCU | 976 | AGCUGUGUC GAUUUUCAC C | 1545 |
| NM—001735.2_35223540—s | 3522-3540 | CGACACAGCUCUAAUUAAA | 977 | UUUAAUUAGAGCUGUGUCG | 1546 |
| NM—001735.2_35293547—s | 3529-3547 | GCUCUAAUUAAAGCUGACA | 978 | UGUCAGCUUUAAUUAGAGC | 1547 |
| NM—001735.2_35423560—s | 3542-3560 | CUGACAACUUUCUGCUUGA | 979 | UCAAGCAGAAAGUUGUCAG | 1548 |
| NM—001735.2_35493567—s | 3549-3567 | CUUUCUGCUUGAAAAUACA | 980 | UGUAUUUUCAAGCAGAAAG | 1549 |
| NM—001735.2_35603578—s | 3560-3578 | AAAAUACACUGCCAGCCCA | 981 | UGGGCUGGCAGUGUAUUUU | 1550 |
- 145 044245
| NM_001735.2_3573- 3591_s | 3573-3591 | AGCCCAGAGCACCUUUACA | 982 | UGUAAAGGUGCUCUGGGCU | 1551 |
| NM_001735.2_35813599_s | 3581-3599 | GCACCUUUACAUUGGCCAU | 983 | AUGGCCAAUGUAAAGGUGC | 1552 |
| NM_001735.2_35893607_s | 3589-3607 | ACAUUGGCCAUUUCUGCGU | 984 | ACGCAGAAAUGGCCAAUGU | 1553 |
| NM_001735.2_36023620_s | 3602-3620 | CUGCGUAUGCUCUUUCCCU | 985 | AGGGAAAGAGCAUACGCAG | 1554 |
| NM_001735.2_3613- 3631_s | 3613-3631 | CUUUCCCUGGGAGAUAAAA | 986 | UUUUAUCUCCCAGGGAAAG | 1555 |
| NM_001735.2_3623- 3641_s | 3623-3641 | GAGAUAAAACUCAC C GAGA | 987 | UGUGGGUGAGUUUUAUCUC | 1556 |
| NM_001735.2_3631- 3649_s | 3631-3649 | ACUCAC C CACAGUUUC GUU | 988 | AACGAAACUGUGGGUGAGU | 1557 |
| NM_001735.2_36403658_s | 3640-3658 | CAGUUUC GUUCAAUUGUUU | 989 | AAACAAUUGAACGAAACUG | 1558 |
| NM_001735.2_36503668_s | 3650-3668 | CAAUUGUUUCAGCUUUGAA | 990 | UUCAAAGCUGAAACAAUUG | 1559 |
| NM_001735.2_36623680_s | 3662-3680 | CUUUGAAGAGAGAAGCUUU | 991 | AAAGCUUCUCUCUUCAAAG | 1560 |
| NM_001735.2_36693687_s | 3669-3687 | GAGAGAAGCUUUGGUUAAA | 992 | UUUAACCAAAGCUUCUCUC | 1561 |
| NM_001735.2_36823700_s | 3682-3700 | GUUAAAG GUAAUC СAC С CA | 993 | UGGGUGGAUUACCUUUAAC | 1562 |
| NM_001735.2_36913709_s | 3691-3709 | AAUC САС C CAUUUAUC GUU | 994 | AACGAUAAAUGGGUGGAUU | 1563 |
| NM_001735.2_36993717_s | 3699-3717 | CAUUUAUCGUUUUUGGAAA | 995 | UUUC CAAAAACGAUAAAUG | 1564 |
| NM_001735.2_37103728_s | 3710-3728 | UUUGGAAAGACAAUCUUCA | 996 | UGAAGAUUGUCUUUCCAAA | 1565 |
| NM_001735.2_3721- 3739_s | 3721-3739 | AAUCUUCAGCAUAAAGACA | 997 | UGUCUUUAUGCUGAAGAUU | 1566 |
| NM_001735.2_37303748_s | 3730-3748 | CAUAAAGACAGCUCUGUAC | 998 | GUACAGAGCUGUCUUUAUG | 1567 |
| NM_001735.2_37413759_s | 3741-3759 | CUCUGUACCUAACACUGGU | 999 | ACCAGUGUUAGGUACAGAG | 1568 |
| NM_001735.2_37523770_s | 3752-3770 | ACACUGGUACGGCACGUAU | 1000 | AUACGUGCCGUACCAGUGU | 1569 |
| NM_001735.2_37623780_s | 3762-3780 | GGCACGUAUGGUAGAAACA | 1001 | UGUUUCUACCAUACGUGCC | 1570 |
| NM_001735.2_37713789_s | 3771-3789 | GGUAGAAACAACUGCCUAU | 1002 | AUAGGCAGUUGUUUCUACC | 1571 |
| NM_001735.2_37793797_s | 3779-3797 | CAACUGCCUAUGCUUUACU | 1003 | AGUAAAGCAUAGGCAGUUG | 1572 |
| NM_001735.2_37913809_s | 3791-3809 | CUUUACUCACCAGUCUGAA | 1004 | UUCAGACUGGUGAGUAAAG | 1573 |
| NM_001735.2_38033821_s | 3803-3821 | GUCUGAACUUGAAAGAUAU | 1005 | AUAUCUUUCAAGUUCAGAC | 1574 |
- 146044245
| NM_001735.2_38093827_s | 3809-3827 | ACUUGAAAGAUAUAAAUUA | 1006 | UAAUUUAUAUCUUUCAAGU | 1575 |
| NM_001735.2_38193837—s | 3819-3837 | UAUAAAUUAUGUUAAC С CA | 1007 | UGGGUUAACAUAAUUUAUA | 1576 |
| NM—001735.2_38293847—s | 3829-3847 | GUUAAC C CAGUCAUCAAAU | 1008 | AUUUGAUGACUGGGUUAAC | 1577 |
| NM—001735.2_38393857—s | 3839-3857 | UCAUCAAAUGGCUAUCAGA | 1009 | UCUGAUAGCCAUUUGAUGA | 1578 |
| NM—001735.2_38513869—s | 3851-3869 | UAUCAGAAGAGCAGAGGUA | 1010 | UACCUCUGCUCUUCUGAUA | 1579 |
| NM—001735.2_38633881—s | 3863-3881 | AGAGGUAUGGAGGUGGCUU | 1011 | AAGCCACCUCCAUACCUCU | 1580 |
| NM—001735.2_38723890—s | 3872-3890 | GAGGUGGCUUUUAUUCAAC | 1012 | GUUGAAUAAAAGC CAC CUC | 1581 |
| NM—001735.2_38833901—s | 3883-3901 | UAUUCAAG C GAG GAGACAA | 1013 | UUGUGUCCUGGGUUGAAUA | 1582 |
| NM—001735.2_38933911—s | 3893-3911 | AGGACACAAUCAAUGCCAU | 1014 | AUGGCAUUGAUUGUGUCCU | 1583 |
| NM—001735.2_38993917—s | 3899-3917 | CAAUCAAUGCCAUUGAGGG | 1015 | CCCUCAAUGGCAUUGAUUG | 1584 |
| NM—001735.2_39093927—s | 3909-3927 | CAUUGAGGGCCUGACGGAA | 1016 | UUCCGUCAGGCCCUCAAUG | 1585 |
| NM—001735.2_39223940—s | 3922-3940 | ACGGAAUAUUCACUCCUGG | 1017 | C CAGGAGUGAAUAUUC C GU | 1586 |
| NM—001735.2_39303948—s | 3930-3948 | UUCACUCCUGGUUAAACAA | 1018 | UUGUUUAACCAGGAGUGAA | 1587 |
| NM—001735.2_39393957—s | 3939-3957 | GGUUAAACAACUCCGCUUG | 1019 | CAAGCGGAGUUGUUUAACC | 1588 |
| NM—001735.2_39513969—s | 3951-3969 | CCGCUUGAGUAUGGACAUC | 1020 | GAUGUCCAUACUCAAGCGG | 1589 |
| NM—001735.2_39633981—s | 3963-3981 | GGACAUCGAUGUUUCUUAC | 1021 | GUAAGAAACAUCGAUGUCC | 1590 |
| NM—001735.2_39693987—s | 3969-3987 | CGAUGUUUCUUACAAGCAU | 1022 | AUGCUUGUAAGAAACAUCG | 1591 |
| NM—001735.2_39813999—s | 3981-3999 | CAAGCAUAAAGGUGCCUUA | 1023 | UAAGGCACCUUUAUGCUUG | 1592 |
| NM—001735.2_39924010—s | 3992-4010 | GUGCCUUACAUAAUUAUAA | 1024 | UUAUAAUUAUGUAAGGCAC | 1593 |
| NM—001735.2_39994017—s | 3999-4017 | ACAUAAUUAUAAAAUGACA | 1025 | UGUCAUUUUAUAAUUAUGU | 1594 |
| NM—001735.2_40094027—s | 4009-4027 | AAAAUGACAGACAAGAAUU | 1026 | AAUUCUUGUCUGUCAUUUU | 1595 |
| NM—001735.2_40204038—s | 4020-4038 | CAAGAAUUUCCUUGGGAGG | 1027 | CCUCCCAAGGAAAUUCUUG | 1596 |
| NM—001735.2_40294047—s | 4029-4047 | CCUUGGGAGGCCAGUAGAG | 1028 | CUCUACUGGCCUCCCAAGG | 1597 |
| NM—001735.2_40414059—s | 4041-4059 | AGUAGAGGUGCUUCUCAAU | 1029 | AUUGAGAAGCACCUCUACU | 1598 |
- 147044245
| NM_001735.2_40514069—s | 4051-4069 | CUUCUCAAUGAUGACCUCA | 1030 | UGAGGUCAUCAUUGAGAAG | 1599 |
| NM—001735.2_40624080—s | 4062-4080 | UGACCUCAUUGUCAGUACA | 1031 | UGUACUGACAAUGAGGUCA | 1600 |
| NM—001735.2_40724090—s | 4072-4090 | GUCAGUACAGGAUUUGGCA | 1032 | UGCCAAAUCCUGUACUGAC | 1601 |
| NM—001735.2_40804098—s | 4080-4098 | AGGAUUUGGCAGUGGCUUG | 1033 | CAAGCCACUGCCAAAUCCU | 1602 |
| NM—001735.2_40924110—s | 4092-4110 | UGGCUUGGCUACAGUACAU | 1034 | AUGUACUGUAGCCAAGCCA | 1603 |
| NM—001735.2_40994117—s | 4099-4117 | GCUACAGUACAUGUAACAA | 1035 | UUGUUACAUGUACUGUAGC | 1604 |
| NM—001735.2_41134131—s | 4113-4131 | AACAACUGUAGUUCACAAA | 1036 | UUUGUGAACUACAGUUGUU | 1605 |
| NM—001735.2_41204138—s | 4120-4138 | GUAGUUCACAAAAC CAGUA | 1037 | UACUGGUUUUGUGAACUAC | 1606 |
| NM—001735.2_41304148—s | 4130-4148 | AAACCAGUACCUCUGAGGA | 1038 | UCCUCAGAGGUACUGGUUU | 1607 |
| NM—001735.2_41434161—s | 4143-4161 | UGAGGAAGUUUGCAGCUUU | 1039 | AAAGCUGCAAACUUCCUCA | 1608 |
| NM—001735.2_41534171—s | 4153-4171 | UGCAGCUUUUAUUUGAAAA | 1040 | UUUUCAAAUAAAAGCUGCA | 1609 |
| NM—001735.2_41634181—s | 4163-4181 | AUUUGAAAAUC GAUACUCA | 1041 | UGAGUAUC GAUUUUCAAAU | 1610 |
| NM—001735.2_41734191—s | 4173-4191 | CGAUACUCAGGAUAUUGAA | 1042 | UUCAAUAUC CUGAGUAUC G | 1611 |
| NM—001735.2_41824200—s | 4182-4200 | GGAUAUUGAAGCAUCCCAC | 1043 | GUGGGAUGCUUCAAUAUCC | 1612 |
| NM—001735.2_41894207—s | 4189-4207 | GAAGCAUC C CACUACAGAG | 1044 | CUCUGUAGUGGGAUGCUUC | 1613 |
| NM—001735.2_41994217—s | 4199-4217 | ACUACAGAGGCUACGGAAA | 1045 | UUUCCGUAGCCUCUGUAGU | 1614 |
| NM—001735.2_42124230—s | 4212-4230 | CGGAAACUCUGAUUACAAA | 1046 | UUUGUAAUCAGAGUUUCCG | 1615 |
| NM—001735.2_42214239—s | 4221-4239 | UGAUUACAAACGCAUAGUA | 1047 | UACUAUGCGUUUGUAAUCA | 1616 |
| NM—001735.2_42324250—s | 4232-4250 | GCAUAGUAGCAUGUGCCAG | 1048 | CUGGCACAUGCUACUAUGC | 1617 |
| NM—001735.2_42404258_s | 4240-4258 | GCAUGUGCCAGCUACAAGC | 1049 | GCUUGUAGCUGGCACAUGC | 1618 |
| NM—001735.2_42514269_s | 4251-4269 | CUACAAGCCCAGCAGGGAA | 1050 | UUCCCUGCUGGGCUUGUAG | 1619 |
| NM—001735.2_42604278_s | 4260-4278 | CAGCAGGGAAGAAUCAUCA | 1051 | UGAUGAUUCUUCCCUGCUG | 1620 |
| NM—001735.2_42704288_s | 4270-4288 | GAAUCAUCAUCUGGAUCCU | 1052 | AGGAUCCAGAUGAUGAUUC | 1621 |
| NM—001735.2_42834301—s | 4283-4301 | GAUCCUCUCAUGCGGUGAU | 1053 | AUCACCGCAUGAGAGGAUC | 1622 |
- 148044245
| NM_001735.2_42894307_s | 4289-4307 | CUCAUGCGGUGAUGGACAU | 1054 | AUGUCCAUCACCGCAUGAG | 1623 |
| NM_001735.2_42994317_s | 4299-4317 | GAUGGACAUCUCCUUGCCU | 1055 | AGGCAAGGAGAUGUCCAUC | 1624 |
| NM_001735.2_43114329_s | 4311-4329 | CUUGCCUACUGGAAUCAGU | 1056 | ACUGAUUCCAGUAGGCAAG | 1625 |
| NM_001735.2_43224340_s | 4322-4340 | GAAUCAGUGCAAAUGAAGA | 1057 | UCUUCAUUUGCACUGAUUC | 1626 |
| NM_001735.2_43324350_s | 4332-4350 | AAAUGAAGAAGACUUAAAA | 1058 | UUUUAAGUCUUCUUCAUUU | 1627 |
| NM_001735.2_43394357_s | 4339-4357 | GAAGACUUAAAAGC C CUUG | 1059 | CAAGGGCUUUUAAGUCUUC | 1628 |
| NM_001735.2_4353- 4371_s | 4353-4371 | CCUUGUGGAAGGGGUGGAU | 1060 | AUG САС С C CUUC CACAAGG | 1629 |
| NM_001735.2_43604378_s | 4360-4378 | GAAGGGGUGGAUCAACUAU | 1061 | AUAGUUGAUCCACCCCUUC | 1630 |
| NM_001735.2_43704388_s | 4370-4388 | AUCAACUAUUCACUGAUUA | 1062 | UAAUCAGUGAAUAGUUGAU | 1631 |
| NM_001735.2_43804398_s | 4380-4398 | CACUGAUUAC CAAAUCAAA | 1063 | UUUGAUUUGGUAAUCAGUG | 1632 |
| NM_001735.2_4393- 4411_s | 4393-4411 | AUCAAAGAUGGACAUGUUA | 1064 | UAACAUGUCCAUCUUUGAU | 1633 |
| NM_001735.2_44024420_s | 4402-4420 | GGACAUGUUAUUCUGCAAC | 1065 | GUUGCAGAAUAACAUGUCC | 1634 |
| NM_001735.2_4413- 4431_s | 4413-4431 | UCUGCAACUGAAUUCGAUU | 1066 | AAUCGAAUUCAGUUGCAGA | 1635 |
| NM_001735.2_44224440_s | 4422-4440 | GAAUUCGAUUCCCUCCAGU | 1067 | ACUGGAGGGAAUCGAAUUC | 1636 |
| NM_001735.2_44324450_s | 4432-4450 | С C CUC CAGUGAUUUC CUUU | 1068 | AAAGGAAAUCACUGGAGGG | 1637 |
| NM_001735.2_4441- 4459_s | 4441-4459 | GAUUUCCUUUGUGUACGAU | 1069 | AUCGUACACAAAGGAAAUC | 1638 |
| NM_001735.2_4453- 4471_s | 4453-4471 | GUAC GAUUC C GGAUAUUUG | 1070 | CAAAUAUC C GGAAUC GUAC | 1639 |
| NM_001735.2_44624480_s | 4462-4480 | CGGAUAUUUGAACUCUUUG | 1071 | CAAAGAGUUCAAAUAUC C G | 1640 |
| NM_001735.2_4473- 4491_s | 4473-4491 | ACUCUUUGAAGUUGGGUUU | 1072 | AAAC C CAACUUCAAAGAGU | 1641 |
| NM_001735.2_44824500_s | 4482-4500 | AGUUGGGUUUCUCAGUCCU | 1073 | AGGACUGAGAAACCCAACU | 1642 |
| NM_001735.2_44904508_s | 4490-4508 | UUCUCAGUCCUGCCACUUU | 1074 | AAAGUGGCAGGACUGAGAA | 1643 |
| NM_001735.2_45034521_s | 4503-4521 | CACUUUCACAGUGUACGAA | 1075 | UUCGUACACUGUGAAAGUG | 1644 |
| NM_001735.2_45094527_s | 4509-4527 | CACAGUGUAC GAAUAC CAC | 1076 | GUGGUAUUCGUACACUGUG | 1645 |
| NM_001735.2_4523- 4541_s | 4523-4541 | AC C AC AGAC C AGAUAAAC A | 1077 | UGUUUAUCUGGUCUGUGGU | 1646 |
- 149044245
| NM_001735.2_45314549_s | 4531-4549 | C CAGAUAAACAGUGUACCA | 1078 | UGGUACACUGUUUAUCUGG | 1647 |
| NM_001735.2_45404558_s | 4540-4558 | CAGUGUAC CAUGUUUUAUA | 1079 | UAUAAAACAUGGUACACUG | 1648 |
| NM_001735.2_4551- 4569_s | 4551-4569 | GUUUUAUAGCACUUCCAAU | 1080 | AUUGGAAGUGCUAUAAAAC | 1649 |
| NM_001735.2_45624580_s | 4562-4580 | CUUC CAAUAUCAAAAUUCA | 1081 | UGAAUUUUGAUAUUGGAAG | 1650 |
| NM_001735.2_45704588_s | 4570-4588 | AUCAAAAUUCAGAAAGUCU | 1082 | AGACUUUCUGAAUUUUGAU | 1651 |
| NM_001735.2_4581- 4599_s | 4581-4599 | GAAAGUCUGUGAAGGAGCC | 1083 | GGCUCCUUCACAGACUUUC | 1652 |
| NM_001735.2_45914609_s | 4591-4609 | GAAGGAGCCGCGUGCAAGU | 1084 | ACUUGCACGCGGCUCCUUC | 1653 |
| NM_001735.2_46014619_s | 4601-4619 | CGUGCAAGUGUGUAGAAGC | 1085 | GCUUCUACACACUUGCACG | 1654 |
| NM_001735.2_46124630_s | 4612-4630 | GUAGAAGCUGAUUGUGGGC | 1086 | GCCCACAAUCAGCUUCUAC | 1655 |
| NM_001735.2_46194637_s | 4619-4637 | CUGAUUGUGGGCAAAUGCA | 1087 | UGCAUUUGCCCACAAUCAG | 1656 |
| NM_001735.2_46294647_s | 4629-4647 | GCAAAUGCAGGAAGAAUUG | 1088 | CAAUUCUUCCUGCAUUUGC | 1657 |
| NM_001735.2_46394657_s | 4639-4657 | GAAGAAUUGGAUCUGACAA | 1089 | UUGUCAGAUCCAAUUCUUC | 1658 |
| NM_001735.2_46514669_s | 4651-4669 | CUGACAAUCUCUGCAGAGA | 1090 | UCUCUGCAGAGAUUGUCAG | 1659 |
| NM_001735.2_46634681_s | 4663-4681 | GCAGAGACAAGAAAACAAA | 1091 | UUUGUUUUCUUGUCUCUGC | 1660 |
| NM_001735.2_46704688_s | 4670-4688 | CAAGAAAACAAACAGCAUG | 1092 | CAUGCUGUUUGUUUUCUUG | 1661 |
| NM_001735.2_46814699_s | 4681-4699 | ACAGCAUGUAAACCAGAGA | 1093 | UCUCUGGUUUACAUGCUGU | 1662 |
| NM_001735.2_46934711_s | 4693-4711 | CCAGAGAUUGCAUAUGCUU | 1094 | AAGCAUAUGCAAUCUCUGG | 1663 |
| NM_001735.2_47024720_s | 4702-4720 | GCAUAUGCUUAUAAAGUUA | 1095 | UAACUUUAUAAGCAUAUGC | 1664 |
| NM_001735.2_47104728_s | 4710-4728 | UUAUAAAGUUAGCAUCACA | 1096 | UGUGAUGCUAACUUUAUAA | 1665 |
| NM_001735.2_47224740_s | 4722-4740 | CAUCACAUCCAUCACUGUA | 1097 | UACAGUGAUGGAUGUGAUG | 1666 |
| NM_001735.2_4733- 4751_s | 4733-4751 | UCACUGUAGAAAAUGUUUU | 1098 | AAAACAUUUUCUACAGUGA | 1667 |
| NM_001735.2_47404758_s | 4740-4758 | AGAAAAUGUUUUUGUCAAG | 1099 | CUUGACAAAAACAUUUUCU | 1668 |
| NM_001735.2_47504768_s | 4750-4768 | UUUGUCAAGUACAAGGCAA | 1100 | UUGCCUUGUACUUGACAAA | 1669 |
| NM_001735.2_47634781_s | 4763-4781 | AGGCAACCCUUCUGGAUAU | 1101 | AUAUCCAGAAGGGUUGCCU | 1670 |
- 150044245
| ΝΜ_001735.2_47704788_s | 4770-4788 | CCUUCUGGAUAUCUACAAA | 1102 | UUUGUAGAUAUCCAGAAGG | 1671 |
| NM_001735.2_47794797_s | 4779-4797 | UAUCUACAAAACUGGGGAA | 1103 | UUC С C CAGUUUUGUAGAUA | 1672 |
| NM_001735.2_47904808_s | 4790-4808 | CUGGGGAAGCUGUUGCUGA | 1104 | UCAGCAACAGCUUCCCCAG | 1673 |
| NM_001735.2_47994817_s | 4799-4817 | CUGUUGCUGAGAAAGACUC | 1105 | GAGUCUUUCUCAGCAACAG | 1674 |
| NM_001735.2_48134831_s | 4813-4831 | GACUCUGAGAUUACCUUCA | 1106 | UGAAGGUAAUCUCAGAGUC | 1675 |
| NM_001735.2_48194837_s | 4819-4837 | GAGAUUAC CUUCAUUAAAA | 1107 | UUUUAAUGAAGGUAAUCUC | 1676 |
| NM_001735.2_48314849_s | 4831-4849 | AUUAAAAAGGUAACCUGUA | 1108 | UACAGGUUACCUUUUUAAU | 1677 |
| NM_001735.2_48414859_s | 4841-4859 | UAACCUGUACUAACGCUGA | 1109 | UCAGCGUUAGUACAGGUUA | 1678 |
| NM_001735.2_48504868_s | 4850-4868 | CUAACGCUGAGCUGGUAAA | 1110 | UUUACCAGCUCAGCGUUAG | 1679 |
| NM_001735.2_48634881_s | 4863-4881 | GGUAAAAGGAAGACAGUAC | 1111 | GUACUGUCUUCCUUUUACC | 1680 |
| NM_001735.2_48714889_s | 4871-4889 | GAAGACAGUACUUAAUUAU | 1112 | AUAAUUAAGUACUGUCUUC | 1681 |
| NM_001735.2_4881- 4899_s | 4881-4899 | CUUAAUUAUGGGUAAAGAA | 1113 | UUCUUUAC C CAUAAUUAAG | 1682 |
| NM_001735.2_4893- 4911_s | 4893-4911 | UAAAGAAGC C CUC CAGAUA | 1114 | UAUCUGGAGGGCUUCUUUA | 1683 |
| NM_001735.2_49024920_s | 4902-4920 | C CUC CAGAUAAAAUACAAU | 1115 | AUUGUAUUUUAUCUGGAGG | 1684 |
| NM_001735.2_49124930_s | 4912-4930 | AAAUACAAUUUCAGUUUCA | 1116 | UGAAACUGAAAUUGUAUUU | 1685 |
| NM_001735.2_4923- 4941_s | 4923-4941 | CAGUUUCAGGUACAUCUAC | 1117 | GUAGAUGUACCUGAAACUG | 1686 |
| NM_001735.2_4931- 4949_s | 4931-4949 | GGUACAUCUAC C CUUUAGA | 1118 | UCUAAAGGGUAGAUGUACC | 1687 |
| NM_001735.2_49424960_s | 4942-4960 | CCUUUAGAUUCCUUGACCU | 1119 | AGGUCAAGGAAUCUAAAGG | 1688 |
| NM_001735.2_49524970_s | 4952-4970 | CCUUGACCUGGAUUGAAUA | 1120 | UAUUCAAUCCAGGUCAAGG | 1689 |
| NM_001735.2_4961- 4979_s | 4961-4979 | GGAUUGAAUACUGGCCUAG | 1121 | CUAGGCCAGUAUUCAAUCC | 1690 |
| NM_001735.2_49714989_s | 4971-4989 | CUGGCCUAGAGACACAACA | 1122 | UGUUGUGUCUCUAGGCCAG | 1691 |
| NM_001735.2_49794997_s | 4979-4997 | GAGACACAACAUGUUCAUC | 1123 | GAUGAACAUGUUGUGUCUC | 1692 |
| NM_001735.2_49915009_s | 4991-5009 | GUUCAUCGUGUCAAGCAUU | 1124 | AAUGCUUGACACGAUGAAC | 1693 |
| NM_001735.2_50005018_s | 5000-5018 | GUCAAGCAUUUUUAGCUAA | 1125 | UUAGCUAAAAAUGCUUGAC | 1694 |
- 151 044245
| NM_001735.2_50135031_s | 5013-5031 | AGCUAAUUUAGAUGAAUUU | 1126 | AAAUUCAUCUAAAUUAGCU | 1695 |
| NM_001735.2_50225040_s | 5022-5040 | AGAUGAAUUUGC C GAAGAU | 1127 | AUCUUCGGCAAAUUCAUCU | 1696 |
| NM_001735.2_50335051_s | 5033-5051 | С C GAAGAUAUCUUUUUAAA | 1128 | UUUAAAAAGAUAUCUUCGG | 1697 |
| NM_001735.2_50435061_s | 5043-5061 | CUUUUUAAAUGGAUGCUAA | 1129 | UUAGCAUCCAUUUAAAAAG | 1698 |
| NM_001735.2_50535071_s | 5053-5071 | GGAUGCUAAAAUUCCUGAA | 1130 | UUCAGGAAUUUUAGCAUCC | 1699 |
| NM_001735.2_50595077_s | 5059-5077 | UAAAAUUC CUGAAGUUCAG | 1131 | CUGAACUUCAGGAAUUUUA | 1700 |
| NM_001735.2_50715089_s | 5071-5089 | AGUUCAGCUGCAUACAGUU | 1132 | AACUGUAUGCAGCUGAACU | 1701 |
| NM_001735.2_50805098_s | 5080-5098 | GCAUACAGUUUGCACUUAU | 1133 | AUAAGUGCAAACUGUAUGC | 1702 |
| NM_001735.2_50935111_s | 5093-5111 | ACUUAUGGACUCCUGUUGU | 1134 | ACAACAGGAGUCCAUAAGU | 1703 |
| NM_001735.2_5099- 5117_s | 5099-5117 | GGACUCCUGUUGUUGAAGU | 1135 | ACUUCAACAACAGGAGUCC | 1704 |
| NM_001735.2_51095127_s | 5109-5127 | UGUUGAAGUUC GUUUUUUU | 1136 | AAAAAAAC GAACUUCAACA | 1705 |
| NM_001735.2_51225140_s | 5122-5140 | UUUUUUGUUUUCUUCUUUU | 1137 | AAAAGAAGAAAACAAAAAA | 1706 |
| NM_001735.2_51325150_s | 5132-5150 | UCUUCUUUUUUUAAACAUU | 1138 | AAUGUUUAAAAAAAGAAGA | 1707 |
| NM_001735.2_51395157_s | 5139-5157 | UUUUUAAACAUUCAUAGCU | 1139 | AGCUAUGAAUGUUUAAAAA | 1708 |
| NM_001735.2_51525170_s | 5152-5170 | AUAGCUGGUCUUAUUUGUA | 1140 | UACAAAUAAGACCAGCUAU | 1709 |
| NM_001735.2_51595177_s | 5159-5177 | GUCUUAUUUGUAAAGCUCA | 1141 | UGAGCUUUACAAAUAAGAC | 1710 |
| NM_001735.2_51705188_s | 5170-5188 | AAAGCUCACUUUACUUAGA | 1142 | UCUAAGUAAAGUGAGCUUU | 1711 |
| NM_001735.2_51825200_s | 5182-5200 | ACUUAGAAUUAGUGGCACU | 1143 | AGUGCCACUAAUUCUAAGU | 1712 |
| NM_001735.2_51925210_s | 5192-5210 | AGUGGCACUUGCUUUUAUU | 1144 | AAUAAAAGCAAGUGCCACU | 1713 |
| NM_001735.2_52025220_s | 5202-5220 | GCUUUUAUUAGAGAAUGAU | 1145 | AUCAUUCUCUAAUAAAAGC | 1714 |
| NM_001735.2_52125230_s | 5212-5230 | GAGAAUGAUUUCAAAUGCU | 1146 | AGCAUUUGAAAUCAUUCUC | 1715 |
| NM_001735.2_52205238_s | 5220-5238 | UUUCAAAUGCUGUAACUUU | 1147 | AAAGUUACAGCAUUUGAAA | 1716 |
| NM_001735.2_5231- 5249_s | 5231-5249 | GUAACUUUCUGAAAUAACA | 1148 | UGUUAUUUCAGAAAGUUAC | 1717 |
| NM_001735.2_5241- 5259_s | 5241-5259 | GAAAUAACAUGGCCUUGGA | 1149 | UCCAAGGCCAUGUUAUUUC | 1718 |
- 152044245
| NM_001735.2_5253- 5271_s | 5253-5271 | CCUUGGAGGGCAUGAAGAC | 1150 | GUCUUCAUGCCCUCCAAGG | 1719 |
| NM_001735.2_52595277_s | 5259-5277 | AGGGCAUGAAGACAGAUAC | 1151 | GUAUCUGUCUUCAUGCCCU | 1720 |
| NM_001735.2_5273- 5291_s | 5273-5291 | GAUACUC CUC CAAGGUUAU | 1152 | AUAACCUUGGAGGAGUAUC | 1721 |
| NM_001735.2_52795297_s | 5279-5297 | CCUCCAAGGUUAUUGGACA | 1153 | UGUCCAAUAACCUUGGAGG | 1722 |
| NM_001735.2_5293- 5311_s | 5293-5311 | GGACACCGGAAACAAUAAA | 1154 | UUUAUUGUUUCCGGUGUCC | 1723 |
| NM_001735.2_5301- 5319_s | 5301-5319 | GAAACAAUAAAUUGGAACA | 1155 | UGUUCCAAUUUAUUGUUUC | 1724 |
| NM_001735.2_53115329_s | 5311-5329 | AUUGGAACACCUCCUCAAA | 1156 | UUUGAGGAGGUGUUCCAAU | 1725 |
| NM_001735.2_53225340_s | 5322-5340 | UCCUCAAACCUACCACUCA | 1157 | UGAGUGGUAGGUUUGAGGA | 1726 |
| NM_001735.2_5331- 5349_s | 5331-5349 | CUACCACUCAGGAAUGUUU | 1158 | AAACAUUCCUGAGUGGUAG | 1727 |
| NM_001735.2_5343- 5361_s | 5343-5361 | AAUGUUUGCUGGGGCCGAA | 1159 | UUCGGCCCCAGCAAACAUU | 1728 |
| NM_001735.2_53495367_s | 5349-5367 | UGCUGGGGCCGAAAGAACA | 1160 | UGUUCUUUCGGCCCCAGCA | 1729 |
| NM_001735.2_53605378_s | 5360-5378 | AAAGAACAGUCCAUUGAAA | 1161 | UUUCAAUGGACUGUUCUUU | 1730 |
| NM_001735.2_53715389_s | 5371-5389 | CAUUGAAAGGGAGUAUUAC | 1162 | GUAAUACUCCCUUUCAAUG | 1731 |
| NM_001735.2_53805398_s | 5380-5398 | GGAGUAUUACAAAAACAUG | 1163 | CAUGUUUUUGUAAUACUCC | 1732 |
| NM_001735.2_53915409_s | 5391-5409 | AAAACAUGGCCUUUGCUUG | 1164 | CAAGCAAAGGCCAUGUUUU | 1733 |
| NM_001735.2_53995417_s | 5399-5417 | GCCUUUGCUUGAAAGAAAA | 1165 | UUUUCUUUCAAGCAAAGGC | 1734 |
| NM_001735.2_54095427_s | 5409-5427 | GAAAGAAAAUACCAAGGAA | 1166 | UUCCUUGGUAUUUUCUUUC | 1735 |
| NM_001735.2_54205438_s | 5420-5438 | CCAAGGAACAGGAAACUGA | 1167 | UCAGUUUCCUGUUCCUUGG | 1736 |
| NM_001735.2_5433- 5451_s | 5433-5451 | AACUGAUCAUUAAAGCCUG | 1168 | CAGGCUUUAAUGAUCAGUU | 1737 |
| NM_001735.2_5441- 5459_s | 5441-5459 | AUUAAAGCCUGAGUUUGCU | 1169 | AGCAAACUCAGGCUUUAAU | 1738 |
Пример 5. Сайленсинг С5 in vivo.
Группы из трех самок яванского макака обрабатывали C5-siRNA AD-58641 подкожно в лопаточную и среднюю часть спины в дозе 2,5 мг/кг или 5 мг/кг, или носителем в качестве контроля. Два круга схемы применения осуществляли в восемь доз в каждом круге, каждый третий день. С5 в сыворотке собирали и оценивали с помощью анализа ELISA, специфическом для обнаружения С5 (Abeam) в указанные моменты времени (фиг. 13). Уровни С5 приводили к среднему из трех образцов до введения препарата. Образцы, собранные до введения препарата и на день 23 (через 24 ч после последней введенной дозы в первом круге лечения) подвергали биохимическому анализу сыворотки, гематологическому анализу и анализу на свертываемость.
Анализ уровня белка С5 в сыворотке по сравнению с уровнем белка С5 в сыворотке до лечения показал, что схема лечения с дозой 5 мг/кг AD-58641 привела к уменьшению уровня белка С5 в сыворотке до 98% (фиг. 12). Средние уровни С5 в сыворотке были снижены на 97% в нижней точке, что указывает, что большинство циркулирующего С5 происходит из печени. Наблюдали дозозависимый эффект и длительный нокдаун уровня белка С5 в сыворотке при подкожном введении AD-58641. Никаких изменений в параметрах гематологии, биохимии сыворотки или коагуляции не было определено через 24 ч после первого круга схемы применения.
Гемолитическую активность сыворотки также анализировали с применением анализа сенсибилизированных эритроцитов барана для измерения активности классического пути. Процентную долю гемоли- 153 044245 за рассчитывали по отношению максимального гемолиза к фоновому гемолизу в контрольных образцах.
Средний индекс гемолиза +/- SEM для трех животных рассчитывали и анализировали (фиг. 13). Гемолиз снизился до 94% в схеме лечения с дозой 5 мг/кг со средним значением ингибирования 92% в нижней точке. Снижение гемолиза поддерживалось в течение более чем двух недель после последней дозы.
Пример 6. Скрининг дополнительных siRNA in vitro.
Последовательности смысловой и антисмысловой цепей, представленные в табл. 20, модифицировали на 3'-конце короткой последовательностью дезокси-тимин нуклеотидов (dT) (табл. 21). Эффективность in vitro дуплексов, содержащих смысловую и антисмысловую последовательности, приведенные в табл. 21, определяли с помощью следующих способов.
Клеточная культура и трансфекции.
Клетки Hep3B (АТСС, Манассас, Вирджиния) выращивали практически до слияния при 37°C в атмосфере 5% CO2 в ЕМЕМ (АТСС), дополненной 10% FBS (АТСС), перед отделением от чашки Петри путем обработки трипсином. Трансфекцию выполняли путем добавления 5 мкл Opti-MEM плюс 0,1 мкл Lipofectamine RNAiMax на лунку (Invitrogen, Карлсбад, Калифорния, номер по каталогу13778-150) к 5 мкл дуплексов siRNA на лунку в 384-луночном планшете и инкубировали при комнатной температуре в течение 15 мин. 40 мкл полных питательных сред, содержащих ~5х103 клеток Hep3B, затем добавляли к смеси siRNA. Клетки инкубировали в течение 24 ч перед очисткой РНК. Эксперименты выполняли при конечной концентрации дуплекса 10 нМ.
Выделение общей РНК с использованием набора DYNABEADS mRNA Isolation Kit (Invitrogen, номер по каталогу 610-12).
Выделение РНК проводили с применением полуавтоматического анализатора Biotek EL 405 washer. Вкратце, клетки лизировали в 75 мкл лизирующего/связывающего буфера, содержащего 2 мкл Dynabeads, затем смешивали в течение 10 мин при установке 7 электромагнитного шейкера (Union Scientific). Магнитные гранулы фиксировали при помощи магнитного стенда и супернатант удаляли. После удаления супернатанта магнитные гранулы промывали 90 мкл промывочного буфера А, затем 90 мкл промывочного буфера В. Гранулы дважды промывали 100 мкл элюирующего буфера, который затем отсасывали и получали кДНК непосредственно на РНК, связанных с гранулами, в 384-луночном планшете.
Синтез кДНК с использованием набора ABI High capacity cDNA reverse transcription kit (Applied Biosystems, Форстер-Сити, Калифорния, № по кат. 4368813).
Мастер-микс из 2 мкл 10Х буфера, 0,8 мкл 25Х dNTP, 2 мкл случайных праймеров, 1 мкл обратной транскриптазы, 1 мкл ингибитора РНКазы и 3,2 мкл H2O на реакцию добавляли непосредственно к РНК, связанных с гранулами, в 384-луночных планшетах, применяемых для выделения РНК. Затем планшеты встряхивали на электромагнитном шейкере в течение 10 мин и затем помещали в инкубатор при 37°C в течение 2 ч. После этой инкубации планшеты помещали на шейкер в инкубаторе при 80°C в течение 7 мин для инактивации фермента и элюирования РНК/кДНК из гранул.
PCR в режиме реального времени.
мкл кДНК добавляли к смеси мастер-микса, содержащей 0,5 мкл зонда TaqMan для GAPDH (Applied Biosystems, номер по каталогу 4326317Е), 0,5 мкл зонда TaqMan для С5 (Applied Biosystems, номер по каталогу Hs00156197_M1) и 0,5 мкл зонда мастер-микс Lightcycler 480 (Roche, номер по каталогу 04887301001) в каждую лунку 384-луночного планшета (Roche, номер по каталогу 04887301001). PCR в режиме реального времени проводили в системе Roche LC480 Real Time PCR (Roche). Каждый дуплекс исследовали в по меньшей мере двух независимых трансфекциях и каждую трансфекцию оценивали в двух параллельных испытаниях.
Для вычисления относительного кратного изменения данные в реальном времени анализировали с применением AACt-способа и нормализовали в соответствии с таковыми анализов, выполненных с клетками, трансфицированными 10 нМ AD-1955, или имитационными трансфицированными клетками.
Табл. 22 показывает результаты теста разовой дозы в клетках Hep3B, трансфицированных указанными dT-модифицированными иРНК. Данные выражены в виде процентного отношения оставшегося количества транскрипта по отношению к необработанным клеткам.
- 154 044245
Таблица 21 dT-модифицированные иРНК С5
| ID дуплекса | Смысловая последовательность | SEQ ID NO: | Положение в NM_001735.2 | Антисмысловая последовательность | SEQ ID NO: |
| AD-61779.2 | UAUCCGUGGUUUCCUGCUAdTdT | 1739 | 3-21 | UAGCAGGAAACCACGGAUAdTdT | 2306 |
| AD-61785.2 | GGUUUCCUGCUACCUCCAAdTdT | 1740 | 10-28 | UUGGAGGUAGCAGGAAACCdTdT | 2307 |
| AD-61791.2 | CCUCCAACCAUGGGCCUUUdTdT | 1741 | 22-40 | AAAGGCCCAUGGUUGGAGGdTdT | 2308 |
| AD-61797.2 | GGGCCUUUUGGGAAUACUUdTdT | 1742 | 33-51 | AAGUAUUCCCAAAAGGCCCdTdT | 2309 |
| AD-61803.2 | GGAAUACUUUGUUUUUUAAdTdT | 1743 | 43-61 | UUAAAAAACAAAGUAUUCCdTdT | 2310 |
| AD-61809.2 | CUUUGUUUUUUAAUCUUCCdTdT | 1744 | 49-67 | GGAAGAUUAAAAAACAAAGdT dT | 2311 |
| AD-61815.2 | CUUCCUGGGGAAAACCUGGdTdT | 1745 | 63-81 | CCAGGUUUUCCCCAGGAAGdTdT | 2312 |
| AD-61821.2 | GGAAAACCUGGGGACAGGAdTdT | 1746 | 71-89 | UCCUGUCCCCAGGUUUUCCdTdT | 2313 |
| AD-61780.2 | GGGACAGGAGCAAACAUAUdTdT | 1747 | 81-99 | AUAUGUUUGCUCCUGUCCCdTdT | 2314 |
| AD-61786.2 | CAAACAUAUGUCAUUUCAGdTdT | 1748 | 91-109 | CUGAAAUGACAUAUGUUUGdTdT | 2315 |
| AD-61792.2 | CAUUUCAGCACCAAAAAUAdTdT | 1749 | 102-120 | UAUUUUUGGUGCUGAAAUGdTdT | 2316 |
| AD-61798.2 | GCACCAAAAAUAUUCCGUGdTdT | 1750 | 109-127 | CACGGAAUAUUUUUGGUGCdTdT | 2317 |
| AD-61804.2 | CCGUGUUGGAGCAUCUGAAdTdT | 1751 | 123-141 | UUCAGAUGCUCCAACACGGdTdT | 2318 |
| AD-61810.2 | GGAGCAUCUGAAAAUAUUGdTdT | 1752 | 130-148 | CAAUAUUUUCAGAUGCUCCdTdT | 2319 |
| AD-61816.2 | GAAAAUAUUGUGAUUCAAGdT dT | 1753 | 139-157 | CUUGAAUCACAAUAUUUUCdTdT | 2320 |
| AD-61822.2 | GAUUCAAGUUUAUGGAUACdTdT | 1754 | 150-168 | GUAUCCAUAAACUUGAAUCdTdT | 2321 |
| AD-61781.2 | GGAUACACUGAAGCAUUUGdTdT | 1755 | 163-181 | CAAAUGCUUCAGUGUAUCCdTdT | 2322 |
| AD-61787.2 | GAAGCAUUUGAUGCAACAAdTdT | 1756 | 172-190 | UUGUUGCAUCAAAUGCUUCdTdT | 2323 |
| AD-61793.2 | UGCAACAAUCUCUAUUAAAdTdT | 1757 | 183-201 | UUUAAUAGAGAUUGUUGCAdT dT | 2324 |
| AD-61799.2 | ^UCUCUAUUAAAAGUUAUdT dT | 1758 | 189-207 | AUAACUUUUAAUAGAGAUUdT dT | 2325 |
| AD-61805.2 | ^GUUAUCCUGAUAAAAAAdTdT | 1759 | 201-219 | UUUUUUAUCAGGAUAACUUdT dT | 2326 |
| AD-61811.2 | CUGAUAAAAAAUUUAGUUAdT dT | 1760 | 209-227 | UAACUAAAUUUUUUAUCAGdT dT | 2327 |
| AD-61817.2 | UUAGUUACUCCUCAGGCCAdTdT | 1761 | 221-239 | UGGCCUGAGGAGUAACUAAdTdT | 2328 |
| AD-61823.2 | CCUCAGGCCAUGUUCAUUUdTdT | 1762 | 230-248 | AAAUGAACAUGGCCUGAGGdTdT | 2329 |
| AD-61782.2 | UUCAUUUAUCCUCAGAGAAdTdT | 1763 | 242-260 | UUCUCUGAGGAUAAAUGAAdTdT | 2330 |
| AD-61788.2 | CUCAGAGAAUAAAUUCCAAdTdT | 1764 | 252-270 | UUGGAAUUUAUUCUCUGAGdTdT | 2331 |
| AD-61794.2 | 4AUAAAUUCCAAAACUCUGdTdT | 1765 | 259-277 | CAGAGUUUUGGAAUUUAUUdT dT | 2332 |
| AD-61800.2 | CUCUGCAAUCUUAACAAUAdTdT | 1766 | 273-291 | UAUUGUUAAGAUUGCAGAGdTdT | 2333 |
| AD-61806.2 | CUUAACAAUACAACCAAAAdTdT | 1767 | 282-300 | UUUUGGUUGUAUUGUUAAGdTdT | 2334 |
| AD-61812.2 | CAACCAAAACAAUUGCCUGdTdT | 1768 | 292-310 | CAGGCAAUUGUUUUGGUUGdTdT | 2335 |
| AD-61818.2 | CAAUUGCCUGGAGGACAAAdTdT | 1769 | 301-319 | UUUGUCCUCCAGGCAAUUGdTdT | 2336 |
| AD-61824.2 | GGACAAAACCCAGUUUCUUdTdT | 1770 | 313-331 | AAGAAACUGGGUUUUGUCCdTdT | 2337 |
| AD-61783.2 | CCAGUUUCUUAUGUGUAUUdTdT | 1771 | 322-340 | AAUACACAUAAGAAACUGGdTdT | 2338 |
| AD-61789.2 | AJGUGUAUUUGGAAGUUGUdTdT | 1772 | 332-350 | ACAACUUCCAAAUACACAUdTdT | 2339 |
| AD-61795.2 | GGAAGUUGUAUCAAAGCAUdTdT | 1773 | 342-360 | AUGCUUUGAUACAACUUCCdTdT | 2340 |
| AD-61801.2 | GUAUCAAAGCAUUUUUCAAdTdT | 1774 | 349-367 | UUGAAAAAUGCUUUGAUACdTdT | 2341 |
| AD-61807.2 | DUUUCAAAAUCAAAAAGAAdT dT | 1775 | 361-379 | UUCUUUUUGAUUUUGAAAAdTdT | 2342 |
| AD-61813.2 | CAAAAAGAAUGCCAAUAACdTdT | 1776 | 371-389 | GUUAUUGGCAUUCUUUUUGdTdT | 2343 |
| AD-61819.2 | GCCAAUAACCUAUGACAAUdTdT | 1777 | 381-399 | AUUGUCAUAGGUUAUUGGCdTdT | 2344 |
| AD-61825.2 | CCUAUGACAAUGGAUUUCUdTdT | 1778 | 389-407 | AGAAAUCCAUUGUCAUAGGdTdT | 2345 |
- 155044245
| AD-61784.2 | UGGAUUUCUCUUCAUUCAUdTdT | 1779 | 399-417 | AUGAAUGAAGAGAAAUCCAdTdT | 2346 |
| AD-61790.2 | CAUUCAUACAGACAAACCUdTdT | 1780 | 411-429 | AGGUUUGUCUGUAUGAAUGdTdT | 2347 |
| AD-61796.2 | CAGACAAACCUGUUUAUACdTdT | 1781 | 419-437 | GUAUAAACAGGUUUGUCUGdTdT | 2348 |
| AD-61802.2 | GUUUAUACUCCAGACCAGUdTdT | 1782 | 430-448 | ACUGGUCUGGAGUAUAAACdTdT | 2349 |
| AD-61808.2 | AGACCAGUCAGUAAAAGUUdTdT | 1783 | 441-459 | AACUUUUACUGACUGGUCUdTdT | 2350 |
| AD-61814.2 | AGUAAAAGUUAGAGUUUAUdT dT | 1784 | 450-468 | AUAAACUCUAACUUUUACUdTdT | 2351 |
| AD-61820.2 | ASAGUUUAUUCGUUGAAUGdTdT | 1785 | 460-478 | CAUUCAACGAAUAAACUCUdTdT | 2352 |
| AD-61826.2 | CGUUGAAUGACGACUUGAAdTdT | 1786 | 470-488 | UUCAAGUCGUCAUUCAACGdTdT | 2353 |
| AD-61832.2 | CUUGAAGCCAGCCAAAAGAdTdT | 1787 | 483-501 | UCUUUUGGCUGGCUUCAAGdTdT | 2354 |
| AD-61838.2 | CCAGCCAAAAGAGAAACUGdTdT | 1788 | 490-508 | CAGUUUCUCUUUUGGCUGGdTdT | 2355 |
| AD-61844.2 | 4AACUGUCUUhACUUUCAUdTdT | 1789 | 503-521 | AUGAAAGUUAAGACAGUUUdT dT | 2356 |
| AD-61850.2 | 4ACUUUCAUAGAUCCUGAAdTdT | 1790 | 513-531 | UUCAGGAUCUAUGAAAGUUdTdT | 2357 |
| AD-61856.2 | CAUAGAUCCUGAAGGAUCAdTdT | 1791 | 519-537 | UGAUCCUUCAGGAUCUAUGdTdT | 2358 |
| AD-61862.2 | GAAGGAUCAGAAGUUGACAdTdT | 1792 | 529-547 | UGUCAACUUCUGAUCCUUCdTdT | 2359 |
| AD-61868.2 | UGACAUGGUAGAAGAAAUUdTdT | 1793 | 543-561 | AAUUUCUUCUACCAUGUCAdTdT | 2360 |
| AD-61827.2 | GAAGAAAUUGAUCAUAUUGdT dT | 1794 | 553-571 | CAAUAUGAUCAAUUUCUUCdTdT | 2361 |
| AD-61833.2 | GAUCAUAUUGGAAUUAUCUdT dT | 1795 | 562-580 | AGAUAAUUCCAAUAUGAUCdTdT | 2362 |
| AD-61839.2 | GGAAUUAUCUCUUUUCCUGdTdT | 1796 | 571-589 | CAGGAAAAGAGAUAAUUCCdTdT | 2363 |
| AD-61845.2 | CUCUUUUCCUGACUUCAAGdTdT | 1797 | 579-597 | CUUGAAGUCAGGAAAAGAGdTdT | 2364 |
| AD-61851.2 | ACUUCAAGAUUCCGUCUAAdTdT | 1798 | 590-608 | UUAGACGGAAUCUUGAAGUdTdT | 2365 |
| AD-61857.2 | CCGUCUAAUCCUAGAUAUGdTdT | 1799 | 601-619 | CAUAUCUAGGAUUAGACGGdTdT | 2366 |
| AD-61863.2 | CCUAGAUAUGGUAUGUGGAdTdT | 1800 | 610-628 | UCCACAUACCAUAUCUAGGdTdT | 2367 |
| AD-61869.2 | UGUGGACGAUCAAGGCUAAdTdT | 1801 | 623-641 | UUAGCCUUGAUCGUCCACAdTdT | 2368 |
| AD-61828.2 | CGAUCAAGGCUAAAUAUAAdTdT | 1802 | 629-647 | UUAUAUUUAGCCUUGAUCGdTdT | 2369 |
| AD-61834.2 | AJAUAAAGAGGACUUUUCAdT dT | 1803 | 642-660 | UGAAAAGUCCUCUUUAUAUdTdT | 2370 |
| AD-61840.2 | GAGGACUUUUCAACAACUGdTdT | 1804 | 649-667 | CAGUUGUUGAAAAGUCCUCdTdT | 2371 |
| AD-61846.2 | CAACUGGAACCGCAUAUUUdTdT | 1805 | 662-680 | AAAUAUGCGGUUCCAGUUGdTdT | 2372 |
| AD-61852.2 | CGCAUAUUUUGAAGUUAAAdTdT | 1806 | 672-690 | UUUAACUUCAAAAUAUGCGdTdT | 2373 |
| AD-61858.2 | AASUUAAAGAAUAUGUCUUdTdT | 1807 | 683-701 | AAGACAUAUUCUUUAACUUdT dT | 2374 |
| AD-61864.2 | GAAUAUGUCUUGCCACAUUdTdT | 1808 | 691-709 | AAUGUGGCAAGACAUAUUCdTdT | 2375 |
| AD-61870.2 | CCACAUUUUUCUGUCUCAAdTdT | 1809 | 703-721 | UUGAGACAGAAAAAUGUGGdTdT | 2376 |
| AD-61829.2 | CUGUCUCAAUCGAGCCAGAdTdT | 1810 | 713-731 | UCUGGCUCGAUUGAGACAGdTdT | 2377 |
| AD-61835.2 | CAAUCGAGCCAGAAUAUAAdTdT | 1811 | 719-737 | UUAUAUUCUGGCUCGAUUGdTdT | 2378 |
| AD-61841.2 | GAAUAUAAUUUCAUUGGUUdT dT | 1812 | 730-748 | AACCAAUGAAAUUAUAUUCdTdT | 2379 |
| AD-61847.2 | AJUGGUUACAAGAACUUUAdTdT | 1813 | 742-760 | UAAAGUUCUUGUAACCAAUdTdT | 2380 |
| AD-61853.2 | AGAACUUUAAGAAUUUUGAdT dT | 1814 | 752-770 | UCAAAAUUCUUAAAGUUCUdTdT | 2381 |
| AD-61859.2 | GAAUUUUGAAAUUACUAUAdT dT | 1815 | 762-780 | UAUAGUAAUUUCAAAAUUCdTdT | 2382 |
| AD-61865.2 | GAAAUUACUAUAAAAGCAAdT dT | 1816 | 769-787 | UUGCUUUUAUAGUAAUUUCdTdT | 2383 |
| AD-61871.2 | /WkGCAAGAUAUUUUUAUAdT dT | 1817 | 781-799 | UAUAAAAAUAUCUUGCUUUdT dT | 2384 |
| AD-61830.2 | AJAUUUUUAUAAUAAAGUAdT dT | 1818 | 789-807 | UACUUUAUUAUAAAAAUAUdT dT | 2385 |
| AD-61836.2 | ?\AGUAGUCACUGAGGCUGAdTdT | 1819 | 803-821 | UCAGCCUCAGUGACUACUUdTdT | 2386 |
| AD-61842.2 | CACUGAGGCUGACGUUUAUdTdT | 1820 | 810-828 | AUAAACGUCAGCCUCAGUGdTdT | 2387 |
| AD-61848.2 | CGUUUAUAUCACAUUUGGAdTdT | 1821 | 822-840 | UCCAAAUGUGAUAUAAACGdTdT | 2388 |
| AD-61854.2 | CACAUUUGGAAUAAGAGAAdT dT | 1822 | 831-849 | UUCUCUUAUUCCAAAUGUGdTdT | 2389 |
- 156044245
| AD-61860.2 | 4AUAAGAGAAGACUUAAAAdT dT | 1823 | 840-858 | UUUUAAGUCUUCUCUUAUUdTdT | 2390 |
| AD-61866.2 | GUUAAAAGAUGAUCAAAAAdT dT | 1824 | 852-870 | UUUUUGAUCAUCUUUUAAGdTdT | 2391 |
| AD-61872.2 | GAUGAUCAAAAAGAAAUGAdT dT | 1825 | 859-877 | UCAUUUCUUUUUGAUCAUCdTdT | 2392 |
| AD-61831.2 | 4AAUGAUGCAAACAGCAAUdTdT | 1826 | 872-890 | AUUGCUGUUUGCAUCAUUUdTdT | 2393 |
| AD-61837.2 | AGAGCAAUGCAAAACACAAdT dT | 1827 | 883-901 | UUGUGUUUUGCAUUGCUGUdTdT | 2394 |
| AD-61843.2 | /WkACACAAUGUUGAUAAAdT dT | 1828 | 893-911 | UUUAUCAACAUUGUGUUUUdTdT | 2395 |
| AD-61849.2 | CAAUGUUGAUAAAUGGAAUdTdT | 1829 | 899-917 | AUUCCAUUUAUCAACAUUGdTdT | 2396 |
| AD-61855.2 | GGAAUUGCUCAAGUCACAUdTdT | 1830 | 913-931 | AUGUGACUUGAGCAAUUCCdTdT | 2397 |
| AD-61861.2 | GCUCAAGUCACAUUUGAUUdTdT | 1831 | 919-937 | AAUCAAAUGUGACUUGAGCdTdT | 2398 |
| AD-61867.2 | AJUUGAUUCUGAAACAGCAdTdT | 1832 | 930-948 | UGCUGUUUCAGAAUCAAAUdTdT | 2399 |
| AD-620 62.1 | UGAAACAGCAGUCAAAGAAdTdT | 1833 | 939-957 | UUCUUUGACUGCUGUUUCAdTdT | 2400 |
| AD-62068.1 | GAAAGAACUGUCAUACUACdTdT | 1834 | 951-969 | GUAGUAUGACAGUUCUUUGdTdT | 2401 |
| AD-62074.1 | GAUACUACAGUUUAGAAGAdT dT | 1835 | 962-980 | UCUUCUAAACUGUAGUAUGdTdT | 2402 |
| AD-6208 0.1 | GAGUUUAGAAGAUUUAAACdTdT | 1836 | 969-987 | GUUUAAAUCUUCUAAACUGdTdT | 2403 |
| AD-620 86.1 | UAAACAACAAGUACCUUUAdTdT | 1837 | 983-1001 | UAAAGGUACUUGUUGUUUAdTdT | 2404 |
| AD-62092.1 | GAAGUACCUUUAUAUUGCUdTdT | 1838 | 990-1008 | AGCAAUAUAAAGGUACUUGdTdT | 2405 |
| AD-62098.1 | UAUUGCUGUAACAGUCAUAdTdT | 1839 | 1002-1020 | UAUGACUGUUACAGCAAUAdT dT | 2406 |
| AD-62104.1 | 4ACAGUCAUAGAGUCUACAdTdT | 1840 | 1011-1029 | UGUAGACUCUAUGACUGUUdTdT | 2407 |
| AD-62063.1 | AGAGUCUACAGGUGGAUUUdTdT | 1841 | 1020-1038 | AAAUCCACCUGUAGACUCUdTdT | 2408 |
| AD-62069.1 | GGAUUUUCUGAAGAGGCAGdTdT | 1842 | 1033-1051 | CUGCCUCUUCAGAAAAUCCdTdT | 2409 |
| AD-62075.1 | GAAGAGGCAGAAAUACCUGdTdT | 1843 | 1042-1060 | CAGGUAUUUCUGCCUCUUCdTdT | 2410 |
| AD-62081.1 | AGAAAUACCUGGCAUCAAAdTdT | 1844 | 1050-1068 | UUUGAUGCCAGGUAUUUCUdTdT | 2411 |
| AD-62087.1 | GCAUCAAAUAUGUCCUCUCdTdT | 1845 | 1061-1079 | GAGAGGACAUAUUUGAUGCdTdT | 2412 |
| AD-62093.1 | UGUCCUCUCUCCCUACAAAdTdT | 1846 | 1071-1089 | UUUGUAGGGAGAGAGGACAdTdT | 2413 |
| AD-62099.1 | GAAUUUGGUUGCUACUCCUdTdT | 1847 | 1092-1110 | AGGAGUAGCAACCAAAUUCdTdT | 2414 |
| AD-62105.1 | GCUACUCCUCUUUUCCUGAdTdT | 1848 | 1102-1120 | UCAGGAAAAGAGGAGUAGCdTdT | 2415 |
| AD-62064.1 | GUCUUUUCCUGAAGCCUGGdTdT | 1849 | 1109-1127 | CCAGGCUUCAGGAAAAGAGdTdT | 2416 |
| AD-62070.1 | GCUGGGAUUCCAUAUCCCAdTdT | 1850 | 1123-1141 | UGGGAUAUGGAAUCCCAGGdTdT | 2417 |
| AD-62076.1 | GAUAUCCCAUCAAGGUGCAdTdT | 1851 | 1133-1151 | UGCACCUUGAUGGGAUAUGdTdT | 2418 |
| AD-62082.1 | GCAUCAAGGUGCAGGUUAAdTdT | 1852 | 1139-1157 | UUAACCUGCACCUUGAUGGdTdT | 2419 |
| AD-62088.1 | GAGGUUAAAGAUUCGCUUGdTdT | 1853 | 1150-1168 | CAAGCGAAUCUUUAACCUGdTdT | 2420 |
| AD-62094.1 | UUCGCUUGACCAGUUGGUAdTdT | 1854 | 1161-1179 | UACCAACUGGUCAAGCGAAdTdT | 2421 |
| AD-62100.1 | GCAGUUGGUAGGAGGAGUCdTdT | 1855 | 1170-1188 | GACUCCUCCUACCAACUGGdTdT | 2422 |
| AD-62106.1 | GGAGGAGUCCCAGUAACACdTdT | 1856 | 1180-1198 | GUGUUACUGGGACUCCUCCdTdT | 2423 |
| AD-62065.1 | GAGUAACACUGAAUGCACAdTdT | 1857 | 1190-1208 | UGUGCAUUCAGUGUUACUGdTdT | 2424 |
| AD-62071.1 | GAAUGCACAAACAAUUGAUdTdT | 1858 | 1200-1218 | AUCAAUUGUUUGUGCAUUCdTdT | 2425 |
| AD-62077.1 | 4ACAAUUGAUGUAAACCAAdTdT | 1859 | 1209-1227 | UUGGUUUACAUCAAUUGUUdTdT | 2426 |
| AD-62083.1 | UAAACCAAGAGACAUCUGAdTdT | 1860 | 1220-1238 | UCAGAUGUCUCUUGGUUUAdTdT | 2427 |
| AD-62089.1 | GAUCUGACUUGGAUCCAAGdTdT | 1861 | 1232-1250 | CUUGGAUCCAAGUCAGAUGdTdT | 2428 |
| AD-62095.1 | GAUCCAAGCAAAAGUGUAAdTdT | 1862 | 1243-1261 | UUACACUUUUGCUUGGAUCdTdT | 2429 |
| AD-62101.1 | GAAAAGUGUAACACGUGUUdTdT | 1863 | 1251-1269 | AACACGUGUUACACUUUUGdTdT | 2430 |
| AD-62107.1 | 4ACACGUGUUGAUGAUGGAdTdT | 1864 | 1260-1278 | UCCAUCAUCAACACGUGUUdTdT | 2431 |
| AD-620 66.1 | DGAUGGAGUAGCUUCCUUUdTdT | 1865 | 1272-1290 | AAAGGAAGCUACUCCAUCAdTdT | 2432 |
| AD-62072.1 | GUAGCUUCCUUUGUGCUUAdTdT | 1866 | 1279-1297 | UAAGCACAAAGGAAGCUACdTdT | 2433 |
- 157044245
| AD-62078 .1 | GCUUAAUCUCCCAUCUGGAdTdT | 1867 | 1293-1311 | UCCAGAUGGGAGAUUAAGCdTdT | 2434 |
| AD-62084.1 | GCAUCUGGAGUGACGGUGCdTdT | 1868 | 1303-1321 | GCACCGUCACUCCAGAUGGdTdT | 2435 |
| AD-62090.1 | UGACGGUGCUGGAGUUUAAdTdT | 1869 | 1313-1331 | UUAAACUCCAGCACCGUCAdTdT | 2436 |
| AD-62096.1 | GCUGGAGUUUAAUGUCAAAdTdT | 1870 | 1320-1338 | UUUGACAUUAAACUCCAGCdTdT | 2437 |
| AD-62102.1 | UGUCAAAACUGAUGCUCCAdTdT | 1871 | 1332-1350 | UGGAGCAUCAGUUUUGACAdTdT | 2438 |
| AD-62108.1 | GAUGCUCCAGAUCUUCCAGdTdT | 1872 | 1342-1360 | CUGGAAGAUCUGGAGCAUCdTdT | 2439 |
| AD-62067.1 | CAGAUCUUCCAGAAGAAAAdTdT | 1873 | 1349-1367 | UUUUCUUCUGGAAGAUCUGdTdT | 2440 |
| AD-62073.1 | AGAAAAUCAGGCCAGGGAAdTdT | 1874 | 1362-1380 | UUCCCUGGCCUGAUUUUCUdTdT | 2441 |
| AD-62079.1 | GGCCAGGGAAGGUUACCGAdTdT | 1875 | 1371-1389 | UCGGUAACCUUCCCUGGCCdTdT | 2442 |
| AD-62085.1 | GUUACCGAGCAAUAGCAUAdTdT | 1876 | 1382-1400 | UAUGCUAUUGCUCGGUAACdTdT | 2443 |
| AD-62091.1 | AJAGCAUACUCAUCUCUCAdTdT | 1877 | 1393-1411 | UGAGAGAUGAGUAUGCUAUdT dT | 2444 |
| AD-62097.1 | UACUCAUCUCUCAGCCAAAdTdT | 1878 | 1399-1417 | UUUGGCUGAGAGAUGAGUAdTdT | 2445 |
| AD-62103.1 | GCCAAAGUUACCUUUAUAUdTdT | 1879 | 1412-1430 | AUAUAAAGGUAACUUUGGCdTdT | 2446 |
| AD-62109.1 | GCUUUAUAUUGAUUGGACUdTdT | 1880 | 1422-1440 | AGUCCAAUCAAUAUAAAGGdTdT | 2447 |
| AD-62115.1 | GAUUGGACUGAUAACCAUAdTdT | 1881 | 1432-1450 | UAUGGUUAUCAGUCCAAUCdTdT | 2448 |
| AD-62121.1 | GUGAUAACCAUAAGGCUUUdTdT | 1882 | 1439-1457 | AAAGCCUUAUGGUUAUCAGdTdT | 2449 |
| AD-62127.1 | AGGCUUUGCUAGUGGGAGAdTdT | 1883 | 1451-1469 | UCUCCCACUAGCAAAGCCUdTdT | 2450 |
| AD-62133.1 | GUGGGAGAACAUCUGAAUAdTdT | 1884 | 1462-1480 | UAUUCAGAUGUUCUCCCACdTdT | 2451 |
| AD-62139.1 | CAUCUGAAUAUUAUUGUUAdT dT | 1885 | 1471-1489 | UAACAAUAAUAUUCAGAUGdT dT | 2452 |
| AD-62145.1 | UAUUAUUGUUACСССCAAAdTdT | 1886 | 1479-1497 | UUUGGGGGUAACAAUAAUAdTdT | 2453 |
| AD-62151.1 | CCCAAAAGCCCAUAUAUUGdTdT | 1887 | 1492-1510 | CAAUAUAUGGGCUUUUGGGdTdT | 2454 |
| AD-62110.1 | CCAAAAGCCCAUAUAUUGAdTdT | 1888 | 1493-1511 | UCAAUAUAUGGGCUUUUGGdTdT | 2455 |
| AD-62116.1 | GAAAAGCCCAUAUAUUGACdTdT | 1889 | 1494-1512 | GUCAAUAUAUGGGCUUUUGdTdT | 2456 |
| AD-62122.1 | 4AAAGCCCAUAUAUUGACAdTdT | 1890 | 1495-1513 | UGUCAAUAUAUGGGCUUUUdTdT | 2457 |
| AD-62128.1 | 4AAGCCCAUAUAUUGACAAdTdT | 1891 | 1496-1514 | UUGUCAAUAUAUGGGCUUUdTdT | 2458 |
| AD-62134.1 | 4AGCCCAUAUAUUGACAAAdTdT | 1892 | 1497-1515 | UUUGUCAAUAUAUGGGCUUdTdT | 2459 |
| AD-6214 0.1 | AGCCCAUAUAUUGACAAAAdTdT | 1893 | 1498-1516 | UUUUGUCAAUAUAUGGGCUdTdT | 2460 |
| AD-62146.1 | GCCCAUAUAUUGACAAAAUdTdT | 1894 | 1499-1517 | AUUUUGUCAAUAUAUGGGCdTdT | 2461 |
| AD-62152.1 | CCCAUAUAUUGACAAAAUAdTdT | 1895 | 1500-1518 | UAUUUUGUCAAUAUAUGGGdTdT | 2462 |
| AD-62111.1 | CCAUAUAUUGACAAAAUAAdTdT | 1896 | 1501-1519 | UUAUUUUGUCAAUAUAUGGdTdT | 2463 |
| AD-62117.1 | GAUAUAUUGACAAAAUAACdTdT | 1897 | 1502-1520 | GUUAUUUUGUCAAUAUAUGdT dT | 2464 |
| AD-62123.1 | AJAUAUUGACAAAAUAACUdT dT | 1898 | 1503-1521 | AGUUAUUUUGUCAAUAUAUdT dT | 2465 |
| AD-62129.1 | UAUAUUGACAAAAUAACUCdTdT | 1899 | 1504-1522 | GAGUUAUUUUGUCAAUAUAdT dT | 2466 |
| AD-62135.1 | AJAUUGACAAAAUAACUCAdT dT | 1900 | 1505-1523 | UGAGUUAUUUUGUCAAUAUdT dT | 2467 |
| AD-62141.1 | UAUUGACAAAAUAACUCACdTdT | 1901 | 1506-1524 | GUGAGUUAUUUUGUCAAUAdT dT | 2468 |
| AD-62147.1 | AJUGACAAAAUAACUCACUdT dT | 1902 | 1507-1525 | AGUGAGUUAUUUUGUCAAUdTdT | 2469 |
| AD-62153.1 | UUGACAAAAUAACUCACUAdT dT | 1903 | 1508-1526 | UAGUGAGUUAUUUUGUCAAdTdT | 2470 |
| AD-62112.1 | UGACAAAAUAACUCACUAUdT dT | 1904 | 1509-1527 | AUAGUGAGUUAUUUUGUCAdT dT | 2471 |
| AD-62118.1 | GACAAAAUAACUCACUAUAdT dT | 1905 | 1510-1528 | UAUAGUGAGUUAUUUUGUCdTdT | 2472 |
| AD-62124.1 | ikAAAUAACUCACUAUAAUUdT dT | 1906 | 1513-1531 | AAUUAUAGUGAGUUAUUUUdT dT | 2473 |
| AD-62130.1 | AA№AACUCACUAUAAUUAdT dT | 1907 | 1514-1532 | UAAUUAUAGUGAGUUAUUUdT dT | 2474 |
| AD-62136.1 | 4AUAACUCACUAUAAUUACdTdT | 1908 | 1515-1533 | GUAAUUAUAGUGAGUUAUUdT dT | 2475 |
| AD-62142.1 | AUAACUCACUAUAAUUACUdT dT | 1909 | 1516-1534 | AGUAAUUAUAGUGAGUUAUdT dT | 2476 |
| AD-62148.1 | AACUCACUAUAAUUACUUGdTdT | 1910 | 1518-1536 | CAAGUAAUUAUAGUGAGUUdT dT | 2477 |
- 158044245
| AD-62154.1 | AGUCACUAUAAUUACUUGAdT dT | 1911 | 1519-1537 | UCAAGUAAUUAUAGUGAGUdT dT | 2478 |
| AD-62113.1 | CUCACUAUAAUUACUUGAUdT dT | 1912 | 1520-1538 | AUCAAGUAAUUAUAGUGAGdT dT | 2479 |
| AD-62119.1 | UCACUAUAAUUACUUGAUUdT dT | 1913 | 1521-1539 | AAUCAAGUAAUUAUAGUGAdT dT | 2480 |
| AD-62125.1 | AGUAUAAUUACUUGAUUUUdT dT | 1914 | 1523-1541 | AAAAUCAAGUAAUUAUAGUdT dT | 2481 |
| AD-62131.1 | CUAUAAUUACUUGAUUUUAdT dT | 1915 | 1524-1542 | UAAAAUCAAGUAAUUAUAGdT dT | 2482 |
| AD-62137.1 | UAUAAUUACUUGAUUUUAUdT dT | 1916 | 1525-1543 | AUAAAAUCAAGUAAUUAUAdT dT | 2483 |
| AD-62143.1 | AJAAUUACUUGAUUUUAUCdTdT | 1917 | 1526-1544 | GAUAAAAUCAAGUAAUUAUdT dT | 2484 |
| AD-62149.1 | UAAUUACUUGAUUUUAUCCdTdT | 1918 | 1527-1545 | GGAUAAAAUCAAGUAAUUAdTdT | 2485 |
| AD-62155.1 | 4AUUACUUGAUUUUAUCCAdTdT | 1919 | 1528-1546 | UGGAUAAAAUCAAGUAAUUdT dT | 2486 |
| AD-62114.1 | AJUACUUGAUUUUAUCCAAdTdT | 1920 | 1529-1547 | UUGGAUAAAAUCAAGUAAUdT dT | 2487 |
| AD-62120.1 | UUAUCCAAGGGCAAAAUUAdTdT | 1921 | 1540-1558 | UAAUUUUGCCCUUGGAUAAdTdT | 2488 |
| AD-62126.1 | GCAAAAUUAUCCACUUUGGdTdT | 1922 | 1550-1568 | CCAAAGUGGAUAAUUUUGCdTdT | 2489 |
| AD-62132.1 | CACUUUGGCACGAGGGAGAdTdT | 1923 | 1561-1579 | UCUCCCUCGUGCCAAAGUGdTdT | 2490 |
| AD-62138.1 | GGAGGGAGAAAUUUUCAGAdTdT | 1924 | 1571-1589 | UCUGAAAAUUUCUCCCUCGdTdT | 2491 |
| AD-62144.1 | AJUUUCAGAUGCAUCUUAUdTdT | 1925 | 1581-1599 | AUAAGAUGCAUCUGAAAAUdT dT | 2492 |
| AD-62150.1 | GCAUCUUAUCAAAGUAUAAdT dT | 1926 | 1591-1609 | UUAUACUUUGAUAAGAUGCdTdT | 2493 |
| AD-62156.1 | CAAAGUAUAAACAUUCCAGdTdT | 1927 | 1600-1618 | CUGGAAUGUUUAUACUUUGdTdT | 2494 |
| AD-62162.1 | AJUCCAGUAACACAGAACAdTdT | 1928 | 1612-1630 | UGUUCUGUGUUACUGGAAUdTdT | 2495 |
| AD-62168.1 | CACAGAACAUGGUUCCUUCdTdT | 1929 | 1622-1640 | GAAGGAACCAUGUUCUGUGdTdT | 2496 |
| AD-62174.1 | GGUUCCUUCAUCCCGACUUdTdT | 1930 | 1632-1650 | AAGUCGGGAUGAAGGAACCdTdT | 2497 |
| AD-62180.1 | CCCGACUUCUGGUCUAUUAdTdT | 1931 | 1643-1661 | UAAUAGACCAGAAGUCGGGdTdT | 2498 |
| AD-62186.1 | GGUCUAUUACAUCGUCACAdTdT | 1932 | 1653-1671 | UGUGACGAUGUAAUAGACCdTdT | 2499 |
| AD-62192.1 | AJCGUCACAGGAGAACAGAdTdT | 1933 | 1663-1681 | UCUGUUCUCCUGUGACGAUdTdT | 2500 |
| AD-62198.1 | CAGGAGAACAGACAGCAGAdTdT | 1934 | 1670-1688 | UCUGCUGUCUGUUCUCCUGdTdT | 2501 |
| AD-62157.1 | CAGCAGAAUUAGUGUCUGAdTdT | 1935 | 1682-1700 | UCAGACACUAAUUCUGCUGdTdT | 2502 |
| AD-62163.1 | GUGUCUGAUUCAGUCUGGUdTdT | 1936 | 1693-1711 | ACCAGACUGAAUCAGACACdTdT | 2503 |
| AD-62169.1 | CAGUCUGGUUAAAUAUUGAdTdT | 1937 | 1703-1721 | UCAAUAUUUAACCAGACUGdTdT | 2504 |
| AD-62175.1 | GUUAAAUAUUGAAGAAAAAdT dT | 1938 | 1710-1728 | UUUUUCUUCAAUAUUUAACdTdT | 2505 |
| AD-62181.1 | /IGAAAAAUGUGGCAACCAGdTdT | 1939 | 1722-1740 | CUGGUUGCCACAUUUUUCUdTdT | 2506 |
| AD-62187.1 | GCAACCAGCUCCAGGUUCAdTdT | 1940 | 1733-1751 | UGAACCUGGAGCUGGUUGCdTdT | 2507 |
| AD-62193.1 | GCUCCAGGUUCAUCUGUCUdTdT | 1941 | 1740-1758 | AGACAGAUGAACCUGGAGCdTdT | 2508 |
| AD-62199.1 | AJCUGUCUCCUGAUGCAGAdTdT | 1942 | 1751-1769 | UCUGCAUCAGGAGACAGAUdTdT | 2509 |
| AD-62158.1 | GAUGCAGAUGCAUAUUCUCdTdT | 1943 | 1762-1780 | GAGAAUAUGCAUCUGCAUCdTdT | 2510 |
| AD-62164.1 | GCAUAUUCUCCAGGCCAAAdTdT | 1944 | 1771-1789 | UUUGGCCUGGAGAAUAUGCdTdT | 2511 |
| AD-62170.1 | AGGCCAAACUGUGUCUCUUdTdT | 1945 | 1782-1800 | AAGAGACACAGUUUGGCCUdTdT | 2512 |
| AD-62176.1 | GUGUCUCUUAAUAUGGCAAdTdT | 1946 | 1792-1810 | UUGCCAUAUUAAGAGACACdTdT | 2513 |
| AD-62182.1 | UUAAUAUGGCAACUGGAAUdTdT | 1947 | 1799-1817 | AUUCCAGUUGCCAUAUUAAdTdT | 2514 |
| AD-62188.1 | 4ACUGGAAUGGAUUCCUGGdTdT | 1948 | 1809-1827 | CCAGGAAUCCAUUCCAGUUdTdT | 2515 |
| AD-62194.1 | UUCCUGGGUGGCAUUAGCAdTdT | 1949 | 1821-1839 | UGCUAAUGCCACCCAGGAAdTdT | 2516 |
| AD-62200.1 | GGCAUUAGCAGCAGUGGACdTdT | 1950 | 1830-1848 | GUCCACUGCUGCUAAUGCCdTdT | 2517 |
| AD-62159.1 | AGUGGACAGUGCUGUGUAUdTdT | 1951 | 1842-1860 | AUACACAGCACUGUCCACUdTdT | 2518 |
| AD-62165.1 | GCUGUGUAUGGAGUCCAAAdTdT | 1952 | 1852-1870 | UUUGGACUCCAUACACAGCdTdT | 2519 |
| AD-62171.1 | AOUCCAAAGAGGAGCCAAAdTdT | 1953 | 1863-1881 | UUUGGCUCCUCUUUGGACUdTdT | 2520 |
| AD-62177.1 | AGAGGAGCCAAAAAGCCCUdTdT | 1954 | 1870-1888 | AGGGCUUUUUGGCUCCUCUdTdT | 2521 |
- 159044245
| AD-62183.1 | AGCCCUUGGAAAGAGUAUUdTdT | 1955 | 1883-1901 | AAUACUCUUUCCAAGGGCUdTdT | 2522 |
| AD-62189.1 | 4AGAGUAUUUCAAUUCUUAdTdT | 1956 | 1893-1911 | UAAGAAUUGAAAUACUCUUdTdT | 2523 |
| AD-62195.1 | UUUCAAUUCUUAGAGAAGAdT dT | 1957 | 1900-1918 | UCUUCUCUAAGAAUUGAAAdTdT | 2524 |
| AD-62201.1 | GAGAAGAGUGAUCUGGGCUdTdT | 1958 | 1912-1930 | AGCCCAGAUCACUCUUCUCdTdT | 2525 |
| AD-62160.1 | UGAUCUGGGCUGUGGGGCAdTdT | 1959 | 1920-1938 | UGCCCCACAGCCCAGAUCAdTdT | 2526 |
| AD-62166.1 | GGGGCAGGUGGUGGCCUCAdTdT | 1960 | 1933-1951 | UGAGGCCACCACCUGCCCCdTdT | 2527 |
| AD-62172.1 | GUGGCCUCAACAAUGCCAAdTdT | 1961 | 1943-1961 | UUGGCAUUGUUGAGGCCACdTdT | 2528 |
| AD-62178.1 | CAACAAUGCCAAUGUGUUCdTdT | 1962 | 1950-1968 | GAACACAUUGGCAUUGUUGdTdT | 2529 |
| AD-62184.1 | GAAUGUGUUCCACCUAGCUdTdT | 1963 | 1959-1977 | AGCUAGGUGGAACACAUUGdTdT | 2530 |
| AD-62190.1 | GACCUAGCUGGACUUACCUdTdT | 1964 | 1969-1987 | AGGUAAGUCCAGCUAGGUGdTdT | 2531 |
| AD-62196.1 | GACUUACCUUCCUCACUAAdTdT | 1965 | 1979-1997 | UUAGUGAGGAAGGUAAGUCdTdT | 2532 |
| AD-62202.1 | UCACUAAUGCAAAUGCAGAdTdT | 1966 | 1991-2009 | UCUGCAUUUGCAUUAGUGAdTdT | 2533 |
| AD-62161.1 | 4AAUGCAGAUGACUCCCAAdTdT | 1967 | 2001-2019 | UUGGGAGUCAUCUGCAUUUdTdT | 2534 |
| AD-62167.1 | GUCCCAAGAAAAUGAUGAAdTdT | 1968 | 2013-2031 | UUCAUCAUUUUCUUGGGAGdTdT | 2535 |
| AD-62173.1 | GCUUGUAAAGAAAUUCUCAdTdT | 1969 | 2032-2050 | UGAGAAUUUCUUUACAAGGdTdT | 2536 |
| AD-62179.1 | 4AUUCUCAGGCCAAGAAGAdTdT | 1970 | 2043-2061 | UCUUCUUGGCCUGAGAAUUdTdT | 2537 |
| AD-62185.1 | GCAAGAAGAACGCUGCAAAdTdT | 1971 | 2053-2071 | UUUGCAGCGUUCUUCUUGGdTdT | 2538 |
| AD-62191.1 | GGCUGCAAAAGAAGAUAGAdTdT | 1972 | 2063-2081 | UCUAUCUUCUUUUGCAGCGdTdT | 2539 |
| AD-62197.1 | AAYGAAGAUAGAAGAAAUAdT dT | 1973 | 2070-2088 | UAUUUCUUCUAUCUUCUUUdTdT | 2540 |
| AD-62203.1 | AGAAAUAGCUGCUAAAUAUdTdT | 1974 | 2082-2100 | AUAUUUAGCAGCUAUUUCUdTdT | 2541 |
| AD-62209.1 | GCUGCUAAAUAUAAACAUUdTdT | 1975 | 2089-2107 | AAUGUUUAUAUUUAGCAGCdTdT | 2542 |
| AD-62215.1 | ACAUUCAGUAGUGAAGAAAdT dT | 1976 | 2103-2121 | UUUCUUCACUACUGAAUGUdTdT | 2543 |
| AD-62221.1 | GUAGUGAAGAAAUGUUGUUdTdT | 1977 | 2110-2128 | AACAACAUUUCUUCACUACdTdT | 2544 |
| AD-62227.1 | 4AAUGUUGUUACGAUGGAGdTdT | 1978 | 2119-2137 | CUCCAUCGUAACAACAUUUdTdT | 2545 |
| AD-62233.1 | GGAUGGAGCCUGCGUUAAUdTdT | 1979 | 2130-2148 | AUUAACGCAGGCUCCAUCGdTdT | 2546 |
| AD-62239.1 | GGUUAAUAAUGAUGAAACCdTdT | 1980 | 2142-2160 | GGUUUCAUCAUUAUUAACGdTdT | 2547 |
| AD-62245.1 | AUGAUGAAACCUGUGAGCAdTdT | 1981 | 2150-2168 | UGCUCACAGGUUUCAUCAUdTdT | 2548 |
| AD-62204.1 | GUGUGAGCAGCGAGCUGCAdTdT | 1982 | 2160-2178 | UGCAGCUCGCUGCUCACAGdTdT | 2549 |
| AD-62210.1 | CGAGCUGCACGGAUUAGUUdTdT | 1983 | 2170-2188 | AACUAAUCCGUGCAGCUCGdTdT | 2550 |
| AD-62216.1 | GGAUUAGUUUAGGGCCAAGdTdT | 1984 | 2180-2198 | CUUGGCCCUAAACUAAUCCdTdT | 2551 |
| AD-62222.1 | GGGCCAAGAUGCAUCAAAGdTdT | 1985 | 2191-2209 | CUUUGAUGCAUCUUGGCCCdTdT | 2552 |
| AD-62228.1 | GAUCAAAGCUUUCACUGAAdTdT | 1986 | 2202-2220 | UUCAGUGAAAGCUUUGAUGdTdT | 2553 |
| AD-62234.1 | GCUUUCACUGAAUGUUGUGdTdT | 1987 | 2209-2227 | CACAACAUUCAGUGAAAGCdTdT | 2554 |
| AD-62240.1 | 4AUGUUGUGUCGUCGCAAGdTdT | 1988 | 2219-2237 | CUUGCGACGACACAACAUUdTdT | 2555 |
| AD-62246.1 | GGUCGCAAGCCAGCUCCGUdTdT | 1989 | 2229-2247 | ACGGAGCUGGCUUGCGACGdTdT | 2556 |
| AD-62205.1 | GCUCCGUGCUAAUAUCUCUdTdT | 1990 | 2241-2259 | AGAGAUAUUAGCACGGAGCdTdT | 2557 |
| AD-62211.1 | GUAAUAUCUCUCAUAAAGAdT dT | 1991 | 2249-2267 | UCUUUAUGAGAGAUAUUAGdT dT | 2558 |
| AD-62217.1 | 4AAGACAUGCAAUUGGGAAdTdT | 1992 | 2263-2281 | UUCCCAAUUGCAUGUCUUUdTdT | 2559 |
| AD-62223.1 | GAAUUGGGAAGGCUACACAdTdT | 1993 | 2272-2290 | UGUGUAGCCUUCCCAAUUGdTdT | 2560 |
| AD-62229.1 | GCUACACAUGAAGACCCUGdTdT | 1994 | 2283-2301 | CAGGGUCUUCAUGUGUAGCdTdT | 2561 |
| AD-62235.1 | CAUGAAGACCCUGUUACCAdTdT | 1995 | 2289-2307 | UGGUAACAGGGUCUUCAUGdTdT | 2562 |
| AD-62241.1 | UACCAGUAAGCAAGCCAGAdTdT | 1996 | 2303-2321 | UCUGGCUUGCUUACUGGUAdTdT | 2563 |
| AD-62247.1 | AGCAAGCCAGAAAUUCGGAdTdT | 1997 | 2311-2329 | UCCGAAUUUCUGGCUUGCUdTdT | 2564 |
| AD-62206.1 | AGAAAUUCGGAGUUAUUUUdTdT | 1998 | 2319-2337 | AAAAUAACUCCGAAUUUCUdTdT | 2565 |
- 160044245
| AD-62212.1 | hGUUAUUUUCCAGAAAGCUdTdT | 1999 | 2329-2347 | AGCUUUCUGGAAAAUAACUdTdT | 2566 |
| AD-62218.1 | GAGAAAGCUGGUUGUGGGAdTdT | 2000 | 2339-2357 | UCCCACAACCAGCUUUCUGdTdT | 2567 |
| AD-62224.1 | GUGGGAAGUUCAUCUUGUUdTdT | 2001 | 2352-2370 | AACAAGAUGAACUUCCCACdTdT | 2568 |
| AD-62230.1 | UCAUCUUGUUCCCAGAAGAdTdT | 2002 | 2361-2379 | UCUUCUGGGAACAAGAUGAdTdT | 2569 |
| AD-62236.1 | GCAGAAGAAAACAGUUGCAdTdT | 2003 | 2372-2390 | UGCAACUGUUUUCUUCUGGdTdT | 2570 |
| AD-62242.1 | GAGUUGCAGUUUGCCCUACdTdT | 2004 | 2383-2401 | GUAGGGCAAACUGCAACUGdTdT | 2571 |
| AD-62248.1 | CAGUUUGCCCUACCUGAUUdTdT | 2005 | 2389-2407 | AAUCAGGUAGGGCAAACUGdTdT | 2572 |
| AD-62207.1 | CCUGAUUCUCUAACCACCUdTdT | 2006 | 2401-2419 | AGGUGGUUAGAGAAUCAGGdTdT | 2573 |
| AD-62213.1 | hCCACCUGGGAAAUUCAAGdTdT | 2007 | 2413-2431 | CUUGAAUUUCCCAGGUGGUdTdT | 2574 |
| AD-62219.1 | GAAAUUCAAGGCGUUGGCAdTdT | 2008 | 2422-2440 | UGCCAACGCCUUGAAUUUCdTdT | 2575 |
| AD-62225.1 | GGUUGGCAUUUCAAACACUdTdT | 2009 | 2433-2451 | AGUGUUUGAAAUGCCAACGdTdT | 2576 |
| AD-62231.1 | GAUUUCAAACACUGGUAUAdTdT | 2010 | 2439-2457 | UAUACCAGUGUUUGAAAUGdTdT | 2577 |
| AD-62237.1 | GUAUAUGUGUUGCUGAUACdTdT | 2011 | 2453-2471 | GUAUCAGCAACACAUAUACdTdT | 2578 |
| AD-62243.1 | UGCUGAUACUGUCAAGGCAdTdT | 2012 | 2463-2481 | UGCCUUGACAGUAUCAGCAdTdT | 2579 |
| AD-62249.1 | GUGUCAAGGCAAAGGUGUUdTdT | 2013 | 2471-2489 | AACACCUUUGCCUUGACAGdTdT | 2580 |
| AD-62208.1 | hGGUGUUCAAAGAUGUCUUdTdT | 2014 | 2483-2501 | AAGACAUCUUUGAACACCUdTdT | 2581 |
| AD-62214.1 | GAAAGAUGUCUUCCUGGAAdTdT | 2015 | 2490-2508 | UUCCAGGAAGACAUCUUUGdTdT | 2582 |
| AD-62220.1 | GUUCCUGGAAAUGAAUAUAdTdT | 2016 | 2499-2517 | UAUAUUCAUUUCCAGGAAGdTdT | 2583 |
| AD-62226.1 | GAAUAUACCAUAUUCUGUUdTdT | 2017 | 2511-2529 | AACAGAAUAUGGUAUAUUCdTdT | 2584 |
| AD-62232.1 | AJAUUCUGUUGUACGAGGAdTdT | 2018 | 2520-2538 | UCCUCGUACAACAGAAUAUdTdT | 2585 |
| AD-62238.1 | CGAGGAGAACAGAUCCAAUdTdT | 2019 | 2533-2551 | AUUGGAUCUGUUCUCCUCGdTdT | 2586 |
| AD-62244.1 | GAACAGAUCCAAUUGAAAGdTdT | 2020 | 2539-2557 | CUUUCAAUUGGAUCUGUUCdTdT | 2587 |
| AD-61874.1 | GAAAGGAACUGUUUACAACdTdT | 2021 | 2553-2571 | GUUGUAAACAGUUCCUUUCdTdT | 2588 |
| AD-61880.1 | hCUGUUUACAACUAUAGGAdTdT | 2022 | 2560-2578 | UCCUAUAGUUGUAAACAGUdTdT | 2589 |
| AD-6188 6.1 | hACUAUAGGACUUCUGGGAdTdT | 2023 | 2569-2587 | UCCCAGAAGUCCUAUAGUUdTdT | 2590 |
| AD-61892.1 | UGGGAUGCAGUUCUGUGUUdTdT | 2024 | 2583-2601 | AACACAGAACUGCAUCCCAdTdT | 2591 |
| AD-61898.1 | GUUCUGUGUUAAAAUGUCUdTdT | 2025 | 2592-2610 | AGACAUUUUAACACAGAACdTdT | 2592 |
| AD-61904.1 | UUAAAAUGUCUGCUGUGGAdTdT | 2026 | 2600-2618 | UCCACAGCAGACAUUUUAAdTdT | 2593 |
| AD-61910.1 | CUGUGGAGGGAAUCUGCACdTdT | 2027 | 2612-2630 | GUGCAGAUUCCCUCCACAGdTdT | 2594 |
| AD-61916.1 | GGAAUCUGCACUUCGGAAAdTdT | 2028 | 2620-2638 | UUUCCGAAGUGCAGAUUCCdTdT | 2595 |
| AD-61875.1 | GGGAAAGCCCAGUCAUUGAdTdT | 2029 | 2633-2651 | UCAAUGACUGGGCUUUCCGdTdT | 2596 |
| AD-61881.1 | GCAGUCAUUGAUCAUCAGGdTdT | 2030 | 2641-2659 | CCUGAUGAUCAAUGACUGGdTdT | 2597 |
| AD-61887.1 | GAUCAGGGCACAAAGUCCUdTdT | 2031 | 2653-2671 | AGGACUUUGUGCCCUGAUGdTdT | 2598 |
| AD-61893.1 | GGCACAAAGUCCUCCAAAUdTdT | 2032 | 2659-2677 | AUUUGGAGGACUUUGUGCCdTdT | 2599 |
| AD-61899.1 | GAAAUGUGUGCGCCAGAAAdTdT | 2033 | 2673-2691 | UUUCUGGCGCACACAUUUGdTdT | 2600 |
| AD-61905.1 | GCGCCAGAAAGUAGAGGGCdTdT | 2034 | 2682-2700 | GCCCUCUACUUUCUGGCGCdTdT | 2601 |
| AD-61911.1 | hGUAGAGGGCUCCUCCAGUdTdT | 2035 | 2691-2709 | ACUGGAGGAGCCCUCUACUdTdT | 2602 |
| AD-61917.1 | GCUCCAGUCACUUGGUGACdTdT | 2036 | 2702-2720 | GUCACCAAGUGACUGGAGGdTdT | 2603 |
| AD-61876.1 | UCACUUGGUGACAUUCACUdTdT | 2037 | 2709-2727 | AGUGAAUGUCACCAAGUGAdTdT | 2604 |
| AD-61882.1 | GAUUCACUGUGCUUCCUCUdTdT | 2038 | 2720-2738 | AGAGGAAGCACAGUGAAUGdTdT | 2605 |
| AD-61888.1 | GGAAAUUGGCCUUCACAACdTdT | 2039 | 2739-2757 | GUUGUGAAGGCCAAUUUCCdTdT | 2606 |
| AD-61894.1 | GUUCACAACAUCAAUUUUUdTdT | 2040 | 2749-2767 | AAAAAUUGAUGUUGUGAAGdTdT | 2607 |
| AD-61900.1 | hAUUUUUCACUGGAGACUUdTdT | 2041 | 2761-2779 | AAGUCUCCAGUGAAAAAUUdTdT | 2608 |
| AD-61906.1 | CUGGAGACUUGGUUUGGAAdTdT | 2042 | 2770-2788 | UUCCAAACCAAGUCUCCAGdTdT | 2609 |
- 161 044245
| AD-61912.1 | GGUUUGGAAAAGAAAUCUUdTdT | 2043 | 2780-2798 | AAGAUUUCUUUUCCAAACCdTdT | 2610 |
| AD-61918.1 | 4AUCUUAGUAAAAACAUUAdT dT | 2044 | 2793-2811 | UAAUGUUUUUACUAAGAUUdT dT | 2611 |
| AD-61877.1 | 4AAAACAUUACGAGUGGUGdTdT | 2045 | 2802-2820 | CACCACUCGUAAUGUUUUUdTdT | 2612 |
| AD-61883.1 | GAGUGGUGCCAGAAGGUGUdTdT | 2046 | 2813-2831 | ACACCUUCUGGCACCACUCdTdT | 2613 |
| AD-61889.1 | AGAAGGUGUCAAAAGGGAAdT dT | 2047 | 2823-2841 | UUC C CUUUUGACAC CUUCUdT dT | 2614 |
| AD-61895.1 | UGUCAAAAGGGAAAGCUAUdTdT | 2048 | 2829-2847 | AUAGCUUUCCCUUUUGACAdTdT | 2615 |
| AD-61901.1 | GCUAUUCUGGUGUUACUUUdTdT | 2049 | 2843-2861 | AAAGUAACACCAGAAUAGCdTdT | 2616 |
| AD-61907.1 | GUGUUACUUUGGAUCCUAGdTdT | 2050 | 2852-2870 | CUAGGAUCCAAAGUAACACdTdT | 2617 |
| AD-61913.1 | GGAUCCUAGGGGUAUUUAUdTdT | 2051 | 2862-2880 | AUAAAUACCCCUAGGAUCCdTdT | 2618 |
| AD-61919.1 | GGUAUUUAUGGUACCAUUAdTdT | 2052 | 2872-2890 | UAAUGGUACCAUAAAUACCdTdT | 2619 |
| AD-61878.1 | GUACCAUUAGCAGACGAAAdTdT | 2053 | 2882-2900 | UUUCGUCUGCUAAUGGUACdTdT | 2620 |
| AD-61884.1 | GAGACGAAAGGAGUUCCCAdTdT | 2054 | 2892-2910 | UGGGAACUCCUUUCGUCUGdTdT | 2621 |
| AD-61890.1 | AGGAGUUCCCAUACAGGAUdTdT | 2055 | 2900-2918 | AUCCUGUAUGGGAACUCCUdTdT | 2622 |
| AD-61896.1 | GAUACAGGAUACCCUUAGAdTdT | 2056 | 2909-2927 | UCUAAGGGUAUCCUGUAUGdTdT | 2623 |
| AD-61902.1 | GUUAGAUUUGGUCCCCAAAdTdT | 2057 | 2922-2940 | UUUGGGGACCAAAUCUAAGdTdT | 2624 |
| AD-61908.1 | DCСССAAAACAGAAAUCAAdTdT | 2058 | 2933-2951 | UUGAUUUCUGUUUUGGGGAdTdT | 2625 |
| AD-61914.1 | ACAGAAAUCAAAAGGAUUUdT dT | 2059 | 2941-2959 | AAAUCCUUUUGAUUUCUGUdTdT | 2626 |
| AD-61920.1 | 4AAGGAUUUUGAGUGUAAAdTdT | 2060 | 2951-2969 | UUUACACUCAAAAUCCUUUdTdT | 2627 |
| AD-61879.1 | AGUGUAAAAGGACUGCUUGdTdT | 2061 | 2962-2980 | CAAGCAGUCCUUUUACACUdTdT | 2628 |
| AD-61885.1 | 4AGGACUGCUUGUAGGUGAdTdT | 2062 | 2969-2987 | UCACCUACAAGCAGUCCUUdTdT | 2629 |
| AD-61891.1 | GUAGGUGAGAUCUUGUCUGdTdT | 2063 | 2980-2998 | CAGACAAGAUCUCACCUACdTdT | 2630 |
| AD-61897.1 | AJCUUGUCUGCAGUUCUAAdTdT | 2064 | 2989-3007 | UUAGAACUGCAGACAAGAUdTdT | 2631 |
| AD-61903.1 | GUUCUAAGUCAGGAAGGCAdTdT | 2065 | 3001-3019 | UGCCUUCCUGACUUAGAACdTdT | 2632 |
| AD-61909.1 | GAAGGCAUCAAUAUCCUAAdTdT | 2066 | 3013-3031 | UUAGGAUAUUGAUGCCUUCdTdT | 2633 |
| AD-61915.1 | UCAAUAUCCUAACСCACCUdTdT | 2067 | 3020-3038 | AGGUGGGUUAGGAUAUUGAdTdT | 2634 |
| AD-61921.1 | GCACCUCCCCAAAGGGAGUdTdT | 2068 | 3033-3051 | ACUCCCUUUGGGGAGGUGGdTdT | 2635 |
| AD-61927.1 | GCCCAAAGGGAGUGCAGAGdTdT | 2069 | 3039-3057 | CUCUGCACUCCCUUUGGGGdTdT | 2636 |
| AD-61933.1 | GUGCAGAGGCGGAGCUGAUdTdT | 2070 | 3050-3068 | AUCAGCUCCGCCUCUGCACdTdT | 2637 |
| AD-61939.1 | GGAGCUGAUGAGCGUUGUCdTdT | 2071 | 3060-3078 | GACAACGCUCAUCAGCUCCdTdT | 2638 |
| AD-61945.1 | CGUUGUCCCAGUAUUCUAUdTdT | 2072 | 3072-3090 | AUAGAAUACUGGGACAACGdTdT | 2639 |
| AD-61951.1 | GCAGUAUUCUAUGUUUUUCdTdT | 2073 | 3079-3097 | GAAAAACAUAGAAUACUGGdT dT | 2640 |
| AD-61957.1 | GUUUUUCACUACCUGGAAAdTdT | 2074 | 3091-3109 | UUUCCAGGUAGUGAAAAACdTdT | 2641 |
| AD-61963.1 | GCUGGAAACAGGAAAUCAUdTdT | 2075 | 3102-3120 | AUGAUUUCCUGUUUCCAGGdTdT | 2642 |
| AD-61922.1 | GGAACAUUUUUCAUUCUGAdTdT | 2076 | 3122-3140 | UCAGAAUGAAAAAUGUUCCdTdT | 2643 |
| AD-61928.1 | GAUUCUGACCCAUUAAUUGdTdT | 2077 | 3133-3151 | CAAUUAAUGGGUCAGAAUGdTdT | 2644 |
| AD-61934.1 | GCAUUAAUUGAAAAGCAGAdTdT | 2078 | 3142-3160 | UCUGCUUUUCAAUUAAUGGdTdT | 2645 |
| AD-61940.1 | ZkAAGCAGAAACUGAAGAAAdTdT | 2079 | 3153-3171 | UUUCUUCAGUUUCUGCUUUdTdT | 2646 |
| AD-61946.1 | ikACUGAAGAAAAAAUUAAAdT dT | 2080 | 3161-3179 | UUUAAUUUUUUCUUCAGUUdTdT | 2647 |
| AD-61952.1 | ZkAAAAAUUAAAAGAAGGGAdT dT | 2081 | 3169-3187 | UCCCUUCUUUUAAUUUUUUdTdT | 2648 |
| AD-61958.1 | AGGGAUGUUGAGCAUUAUGdTdT | 2082 | 3183-3201 | CAUAAUGCUCAACAUCCCUdTdT | 2649 |
| AD-61964.1 | GAGCAUUAUGUCCUACAGAdTdT | 2083 | 3192-3210 | UCUGUAGGACAUAAUGCUCdTdT | 2650 |
| AD-61923.1 | UGUCCUACAGAAAUGCUGAdTdT | 2084 | 3200-3218 | UCAGCAUUUCUGUAGGACAdTdT | 2651 |
| AD-61929.1 | /UWGCUGACUACUCUUACAdTdT | 2085 | 3211-3229 | UGUAAGAGUAGUCAGCAUUdTdT | 2652 |
| AD-61935.1 | DACUCUUACAGUGUGUGGAdTdT | 2086 | 3220-3238 | UCCACACACUGUAAGAGUAdTdT | 2653 |
- 162044245
| AD-61941 .1 | AGUGUGUGGAAGGGUGGAAdTdT | 2087 | 3229-3247 | UUC САС C CUUC CACACACUdT dT | 2654 |
| AD-61947.1 | GGGUGGAAGUGCUAGCACUdTdT | 2088 | 3240-3258 | AGUGCUAGCACUUCCACCCdTdT | 2655 |
| AD-61953.1 | GCUAGCACUUGGUUAACAGdTdT | 2089 | 3250-3268 | CUGUUAACCAAGUGCUAGCdTdT | 2656 |
| AD-61959.1 | GGUUAACAGCUUUUGCUUUdTdT | 2090 | 3260-3278 | AAAGCAAAAGCUGUUAACCdTdT | 2657 |
| AD-61965.1 | UGCUUUAAGAGUACUUGGAdTdT | 2091 | 3273-3291 | UCCAAGUACUCUUAAAGCAdTdT | 2658 |
| AD-61924.1 | GUACUUGGACAAGUAAAUAdT dT | 2092 | 3283-3301 | UAUUUACUUGUCCAAGUACdTdT | 2659 |
| AD-61930.1 | CAAGUAAAUAAAUACGUAGdTdT | 2093 | 3292-3310 | CUACGUAUUUAUUUACUUGdTdT | 2660 |
| AD-61936.1 | AJAAAUACGUAGAGCAGAAdTdT | 2094 | 3299-3317 | UUCUGCUCUACGUAUUUAUdTdT | 2661 |
| AD-61942.1 | GAGCAGAACCAAAAUUCAAdTdT | 2095 | 3310-3328 | UUGAAUUUUGGUUCUGCUCdTdT | 2662 |
| AD-61948.1 | hAUUCAAUUUGUAAUUCUUdTdT | 2096 | 3322-3340 | AAGAAUUACAAAUUGAAUUdT dT | 2663 |
| AD-61954.1 | GUAAUUCUUUAUUGUGGCUdTdT | 2097 | 3332-3350 | AGCCACAAUAAAGAAUUACdTdT | 2664 |
| AD-61960.1 | AJUGUGGCUAGUUGAGAAUdTdT | 2098 | 3342-3360 | AUUCUCAACUAGCCACAAUdTdT | 2665 |
| AD-61966.1 | CUAGUUGAGAAUUAUCAAUdT dT | 2099 | 3349-3367 | AUUGAUAAUUCUCAACUAGdTdT | 2666 |
| AD-61925.1 | UUAUCAAUUAGAUAAUGGAdT dT | 2100 | 3360-3378 | UCCAUUAUCUAAUUGAUAAdTdT | 2667 |
| AD-61931.1 | hAUGGAUCUUUCAAGGAAAdTdT | 2101 | 3373-3391 | UUUCCUUGAAAGAUCCAUUdTdT | 2668 |
| AD-61937.1 | CUUUCAAGGAAAAUUCACAdTdT | 2102 | 3380-3398 | UGUGAAUUUUCCUUGAAAGdTdT | 2669 |
| AD-61943.1 | hAUUCACAGUAUCAACCAAdTdT | 2103 | 3391-3409 | UUGGUUGAUACUGUGAAUUdTdT | 2670 |
| AD-61949.1 | GUAUCAACCAAUAAAAUUAdTdT | 2104 | 3399-3417 | UAAUUUUAUUGGUUGAUACdTdT | 2671 |
| AD-61955.1 | AAAAJUACAGGGUACCUUGdTdT | 2105 | 3411-3429 | CAAGGUACCCUGUAAUUUUdTdT | 2672 |
| AD-61961.1 | AGGGUACCUUGCCUGUUGAdTdT | 2106 | 3419-3437 | UCAACAGGCAAGGUACCCUdTdT | 2673 |
| AD-61967.1 | GUUGAAGCCCGAGAGAACAdTdT | 2107 | 3433-3451 | UGUUCUCUCGGGCUUCAACdTdT | 2674 |
| AD-61926.1 | CCGAGAGAACAGCUUAUAUdTdT | 2108 | 3441-3459 | AUAUAAGCUGUUCUCUCGGdTdT | 2675 |
| AD-61932.1 | GCUUAUAUCUUACAGCCUUdTdT | 2109 | 3452-3470 | AAGGCUGUAAGAUAUAAGCdTdT | 2676 |
| AD-61938.1 | CUUACAGCCUUUACUGUGAdTdT | 2110 | 3460-3478 | UCACAGUAAAGGCUGUAAGdTdT | 2677 |
| AD-61944.1 | GAAUUAGAAAGGCUUUCGAdTdT | 2111 | 3482-3500 | UCGAAAGCCUUUCUAAUUCdTdT | 2678 |
| AD-61950.1 | GGCUUUCGAUAUAUGCCCCdTdT | 2112 | 3492-3510 | GGGGCAUAUAUCGAAAGCCdTdT | 2679 |
| AD-61956.1 | GAUAUAUGCCCCCUGGUGAdTdT | 2113 | 3499-3517 | UCACCAGGGGGCAUAUAUCdTdT | 2680 |
| AD-61962.1 | GGUGAAAAUCGACACAGCUdTdT | 2114 | 3513-3531 | AGCUGUGUCGAUUUUCACCdTdT | 2681 |
| AD-61968.1 | CGACACAGCUCUAAUUAAAdTdT | 2115 | 3522-3540 | UUUAAUUAGAGCUGUGUCGdTdT | 2682 |
| AD-61974.1 | GCUCUAAUUAAAGCUGACAdTdT | 2116 | 3529-3547 | UGUCAGCUUUAAUUAGAGCdTdT | 2683 |
| AD-61980.1 | CUGACAACUUUCUGCUUGAdTdT | 2117 | 3542-3560 | UCAAGCAGAAAGUUGUCAGdTdT | 2684 |
| AD-61986.1 | CUUUCUGCUUGAAAAUACAdTdT | 2118 | 3549-3567 | UGUAUUUUCAAGCAGAAAGdTdT | 2685 |
| AD-61992.1 | hAAAUACACUGCCAGCCCAdTdT | 2119 | 3560-3578 | UGGGCUGGCAGUGUAUUUUdTdT | 2686 |
| AD-61998.1 | AGCCCAGAGCACCUUUACAdTdT | 2120 | 3573-3591 | UGUAAAGGUGCUCUGGGCUdTdT | 2687 |
| AD-62004.1 | GCACCUUUACAUUGGCCAUdTdT | 2121 | 3581-3599 | AUGGCCAAUGUAAAGGUGCdTdT | 2688 |
| AD-62010.1 | ACAUUGGCCAUUUCUGCGUdTdT | 2122 | 3589-3607 | ACGCAGAAAUGGCCAAUGUdTdT | 2689 |
| AD-61969.1 | CUGCGUAUGCUCUUUCCCUdTdT | 2123 | 3602-3620 | AGGGAAAGAGCAUACGCAGdTdT | 2690 |
| AD-61975.1 | CUUUCCCUGGGAGAUAAAAdTdT | 2124 | 3613-3631 | UUUUAUCUCCCAGGGAAAGdTdT | 2691 |
| AD-61981.1 | GAGAUAAAACUCACCCACAdTdT | 2125 | 3623-3641 | UGUGGGUGAGUUUUAUCUCdTdT | 2692 |
| AD-61987.1 | ACUCAC C CACAGUUUC GUUdT dT | 2126 | 3631-3649 | AACGAAACUGUGGGUGAGUdTdT | 2693 |
| AD-61993.1 | CAGUUUCGUUCAAUUGUUUdTdT | 2127 | 3640-3658 | AAACAAUUGAACGAAACUGdTdT | 2694 |
| AD-61999.1 | CAAUUGUUUCAGCUUUGAAdTdT | 2128 | 3650-3668 | UUCAAAGCUGAAACAAUUGdTdT | 2695 |
| AD-62005.1 | CUUUGAAGAGAGAAGCUUUdTdT | 2129 | 3662-3680 | AAAGCUUCUCUCUUCAAAGdTdT | 2696 |
| AD-62011 . 1 | GAGAGAAGCUUUGGUUAAAdTdT | 2130 | 3669-3687 | UUUAACCAAAGCUUCUCUCdTdT | 2697 |
-163044245
| AD-61970 .1 | GUUAAAGGUAAUCCACCCAdTdT | 2131 | 3682-3700 | UGGGUGGAUUACCUUUAACdTdT | 2698 |
| AD-61976.1 | 4AUCСАСCCAUUUAUCGUUdTdT | 2132 | 3691-3709 | AACGAUAAAUGGGUGGAUUdTdT | 2699 |
| AD-61982.1 | GAUUUAUCGUUUUUGGAAAdTdT | 2133 | 3699-3717 | UUUCCAAAAACGAUAAAUGdTdT | 2700 |
| AD-61988.1 | UUUGGAAAGACAAUCUUCAdTdT | 2134 | 3710-3728 | UGAAGAUUGUCUUUCCAAAdTdT | 2701 |
| AD-61994.1 | 4AUCUUCAGCAUAAAGACAdTdT | 2135 | 3721-3739 | UGUCUUUAUGCUGAAGAUUdTdT | 2702 |
| AD-62006.1 | GUCUGUACCUAACACUGGUdTdT | 2136 | 3741-3759 | ACCAGUGUUAGGUACAGAGdTdT | 2703 |
| AD-62012.1 | ^CACUGGUACGGCACGUAUdTdT | 2137 | 3752-3770 | AUACGUGCCGUACCAGUGUdTdT | 2704 |
| AD-61971.1 | GGCACGUAUGGUAGAAACAdTdT | 2138 | 3762-3780 | UGUUUCUACCAUACGUGCCdTdT | 2705 |
| AD-61977.1 | GGUAGAAACAACUGCCUAUdTdT | 2139 | 3771-3789 | AUAGGCAGUUGUUUCUACCdTdT | 2706 |
| AD-61983.1 | GAACUGCCUAUGCUUUACUdTdT | 2140 | 3779-3797 | AGUAAAGCAUAGGCAGUUGdTdT | 2707 |
| AD-61989.1 | GUUUACUCACCAGUCUGAAdTdT | 2141 | 3791-3809 | UUCAGACUGGUGAGUAAAGdTdT | 2708 |
| AD-61995.1 | GUCUGAACUUGAAAGAUAUdTdT | 2142 | 3803-3821 | AUAUCUUUCAAGUUCAGACdTdT | 2709 |
| AD-62001.1 | AGUUGAAAGAUAUAAAUUAdT dT | 2143 | 3809-3827 | UAAUUUAUAUCUUUCAAGUdT dT | 2710 |
| AD-62007.1 | UAUAAAUUAUGUUAACCCAdTdT | 2144 | 3819-3837 | UGGGUUAACAUAAUUUAUAdT dT | 2711 |
| AD-62013.1 | GUUAACCCAGUCAUCAAAUdTdT | 2145 | 3829-3847 | AUUUGAUGACUGGGUUAACdTdT | 2712 |
| AD-61972.1 | UCAUCAAAUGGCUAUCAGAdTdT | 2146 | 3839-3857 | UCUGAUAGCCAUUUGAUGAdTdT | 2713 |
| AD-61978.1 | UAUCAGAAGAGCAGAGGUAdT dT | 2147 | 3851-3869 | UACCUCUGCUCUUCUGAUAdTdT | 2714 |
| AD-61984.1 | AGAGGUAUGGAGGUGGCUUdTdT | 2148 | 3863-3881 | AAGCCACCUCCAUACCUCUdTdT | 2715 |
| AD-61990.1 | GAGGUGGCUUUUAUUCAACdTdT | 2149 | 3872-3890 | GUUGAAUAAAAGCCACCUCdTdT | 2716 |
| AD-61996.1 | UAUUCAACCCAGGACACAAdTdT | 2150 | 3883-3901 | UUGUGUCCUGGGUUGAAUAdTdT | 2717 |
| AD-62002.1 | AOGACACAAUCAAUGCCAUdTdT | 2151 | 3893-3911 | AUGGCAUUGAUUGUGUCCUdTdT | 2718 |
| AD-62008.1 | CAAUCAAUGCCAUUGAGGGdTdT | 2152 | 3899-3917 | CCCUCAAUGGCAUUGAUUGdTdT | 2719 |
| AD-62014.1 | GAUUGAGGGCCUGACGGAAdTdT | 2153 | 3909-3927 | UUCCGUCAGGCCCUCAAUGdTdT | 2720 |
| AD-61973.1 | ACGGAAUAUUCACUCCUGGdTdT | 2154 | 3922-3940 | CCAGGAGUGAAUAUUCCGUdTdT | 2721 |
| AD-61979.1 | UUCACUCCUGGUUAAACAAdTdT | 2155 | 3930-3948 | UUGUUUAACCAGGAGUGAAdTdT | 2722 |
| AD-61985.1 | GGUUAAACAACUCCGCUUGdTdT | 2156 | 3939-3957 | CAAGCGGAGUUGUUUAACCdTdT | 2723 |
| AD-61991.1 | GCGCUUGAGUAUGGACAUCdTdT | 2157 | 3951-3969 | GAUGUCCAUACUCAAGCGGdTdT | 2724 |
| AD-61997.1 | GGACAUCGAUGUUUCUUACdTdT | 2158 | 3963-3981 | GUAAGAAACAUCGAUGUCCdTdT | 2725 |
| AD-62003.1 | CGAUGUUUCUUACAAGCAUdTdT | 2159 | 3969-3987 | AUGCUUGUAAGAAACAUCGdTdT | 2726 |
| AD-62009.1 | CAAGCAUAAAGGUGCCUUAdTdT | 2160 | 3981-3999 | UAAGGCACCUUUAUGCUUGdTdT | 2727 |
| AD-62056.1 | GUGCCUUACAUAAUUAUAAdTdT | 2161 | 3992-4010 | UUAUAAUUAUGUAAGGCACdTdT | 2728 |
| AD-62015.1 | AGAUAAUUAUAAAAUGACAdT dT | 2162 | 3999-4017 | UGUCAUUUUAUAAUUAUGUdT dT | 2729 |
| AD-62021.1 | 4AAAUGACAGACAAGAAUUdTdT | 2163 | 4009-4027 | AAUUCUUGUCUGUCAUUUUdTdT | 2730 |
| AD-62027.1 | GAAGAAUUUCCUUGGGAGGdTdT | 2164 | 4020-4038 | CCUCCCAAGGAAAUUCUUGdTdT | 2731 |
| AD-62033.1 | GCUUGGGAGGCCAGUAGAGdTdT | 2165 | 4029-4047 | CUCUACUGGCCUCCCAAGGdTdT | 2732 |
| AD-62039.1 | AGUAGAGGUGCUUCUCAAUdTdT | 2166 | 4041-4059 | AUUGAGAAGCACCUCUACUdTdT | 2733 |
| AD-62045.1 | GUUCUCAAUGAUGACCUCAdTdT | 2167 | 4051-4069 | UGAGGUCAUCAUUGAGAAGdTdT | 2734 |
| AD-62051.1 | UGACCUCAUUGUCAGUACAdTdT | 2168 | 4062-4080 | UGUACUGACAAUGAGGUCAdTdT | 2735 |
| AD-62057.1 | GUCAGUACAGGAUUUGGCAdTdT | 2169 | 4072-4090 | UGCCAAAUCCUGUACUGACdTdT | 2736 |
| AD-62016.1 | AGGAUUUGGCAGUGGCUUGdTdT | 2170 | 4080-4098 | CAAGCCACUGCCAAAUCCUdTdT | 2737 |
| AD-62022.1 | UGGCUUGGCUACAGUACAUdTdT | 2171 | 4092-4110 | AUGUACUGUAGCCAAGCCAdTdT | 2738 |
| AD-62028.1 | GCUACAGUACAUGUAACAAdTdT | 2172 | 4099-4117 | UUGUUACAUGUACUGUAGCdTdT | 2739 |
| AD-62034.1 | ?\ACAACUGUAGUUCACAAAdTdT | 2173 | 4113-4131 | UUUGUGAACUACAGUUGUUdTdT | 2740 |
| AD-62040.1 | GUAGUUCACAAAACCAGUAdTdT | 2174 | 4120-4138 | UACUGGUUUUGUGAACUACdTdT | 2741 |
- 164044245
| AD-62046.1 | 4AACCAGUACCUCUGAGGAdTdT | 2175 | 4130-4148 | UCCUCAGAGGUACUGGUUUdTdT | 2742 |
| AD-62052.1 | UGAGGAAGUUUGCAGCUUUdTdT | 2176 | 4143-4161 | AAAGCUGCAAACUUCCUCAdTdT | 2743 |
| AD-62058.1 | UGCAGCUUUUAUUUGAAAAdTdT | 2177 | 4153-4171 | UUUUCAAAUAAAAGCUGCAdTdT | 2744 |
| AD-62017.1 | AJUUGAAAAUCGAUACUCAdTdT | 2178 | 4163-4181 | UGAGUAUCGAUUUUCAAAUdTdT | 2745 |
| AD-62023.1 | CGAUACUCAGGAUAUUGAAdTdT | 2179 | 4173-4191 | UUCAAUAUCCUGAGUAUCGdTdT | 2746 |
| AD-62029.1 | GGAUAUUGAAGCAUCCCACdTdT | 2180 | 4182-4200 | GUGGGAUGCUUCAAUAUCCdTdT | 2747 |
| AD-62035.1 | GAAGCAUCCCACUACAGAGdTdT | 2181 | 4189-4207 | CUCUGUAGUGGGAUGCUUCdTdT | 2748 |
| AD-62041.1 | AGUACAGAGGCUACGGAAAdTdT | 2182 | 4199-4217 | UUUCCGUAGCCUCUGUAGUdTdT | 2749 |
| AD-62047.1 | CGGAAACUCUGAUUACAAAdTdT | 2183 | 4212-4230 | UUUGUAAUCAGAGUUUCCGdTdT | 2750 |
| AD-62053.1 | UGAUUACAAACGCAUAGUAdTdT | 2184 | 4221-4239 | UACUAUGCGUUUGUAAUCAdTdT | 2751 |
| AD-62059.1 | GCAUAGUAGCAUGUGCCAGdTdT | 2185 | 4232-4250 | CUGGCACAUGCUACUAUGCdTdT | 2752 |
| AD-62018.1 | GCAUGUGCCAGCUACAAGCdTdT | 2186 | 4240-4258 | GCUUGUAGCUGGCACAUGCdTdT | 2753 |
| AD-62024.1 | CUACAAGCCCAGCAGGGAAdTdT | 2187 | 4251-4269 | UUCCCUGCUGGGCUUGUAGdTdT | 2754 |
| AD-62030.1 | CAGCAGGGAAGAAUCAUCAdTdT | 2188 | 4260-4278 | UGAUGAUUCUUCCCUGCUGdTdT | 2755 |
| AD-62036.1 | GAAUCAUCAUCUGGAUCCUdTdT | 2189 | 4270-4288 | AGGAUCCAGAUGAUGAUUCdTdT | 2756 |
| AD-62042.1 | GAUCCUCUCAUGCGGUGAUdTdT | 2190 | 4283-4301 | AUCACCGCAUGAGAGGAUCdTdT | 2757 |
| AD-62048.1 | CUCAUGCGGUGAUGGACAUdTdT | 2191 | 4289-4307 | AUGUCCAUCACCGCAUGAGdTdT | 2758 |
| AD-62054.1 | GAUGGACAUCUCCUUGCCUdTdT | 2192 | 4299-4317 | AGGCAAGGAGAUGUCCAUCdTdT | 2759 |
| AD-62060.1 | CUUGCCUACUGGAAUCAGUdTdT | 2193 | 4311-4329 | ACUGAUUCCAGUAGGCAAGdTdT | 2760 |
| AD-62019.1 | GAAUCAGUGCAAAUGAAGAdTdT | 2194 | 4322-4340 | UCUUCAUUUGCACUGAUUCdTdT | 2761 |
| AD-62025.1 | ?\AAUGAAGAAGACUUAAAAdT dT | 2195 | 4332-4350 | UUUUAAGUCUUCUUCAUUUdTdT | 2762 |
| AD-62031.1 | GAAGACUUAAAAGCCCUUGdTdT | 2196 | 4339-4357 | CAAGGGCUUUUAAGUCUUCdTdT | 2763 |
| AD-62037.1 | CCUUGUGGAAGGGGUGGAUdTdT | 2197 | 4353-4371 | AUCCACCCCUUCCACAAGGdTdT | 2764 |
| AD-62043.1 | GAAGGGGUGGAUCAACUAUdTdT | 2198 | 4360-4378 | AUAGUUGAUCCACCCCUUCdTdT | 2765 |
| AD-62049.1 | AJCAACUAUUCACUGAUUAdT dT | 2199 | 4370-4388 | UAAUCAGUGAAUAGUUGAUdT dT | 2766 |
| AD-62055.1 | CACUGAUUACCAAAUCAAAdTdT | 2200 | 4380-4398 | UUUGAUUUGGUAAUCAGUGdTdT | 2767 |
| AD-62061.1 | AJCAAAGAUGGACAUGUUAdT dT | 2201 | 4393-4411 | UAACAUGUCCAUCUUUGAUdTdT | 2768 |
| AD-62020.1 | GGACAUGUUAUUCUGCAACdTdT | 2202 | 4402-4420 | GUUGCAGAAUAACAUGUCCdTdT | 2769 |
| AD-62026.1 | UCUGCAACUGAAUUCGAUUdTdT | 2203 | 4413-4431 | AAUCGAAUUCAGUUGCAGAdTdT | 2770 |
| AD-62032.1 | GAAUUCGAUUCCCUCCAGUdTdT | 2204 | 4422-4440 | ACUGGAGGGAAUCGAAUUCdTdT | 2771 |
| AD-62038.1 | CCCUCCAGUGAUUUCCUUUdTdT | 2205 | 4432-4450 | AAAGGAAAUCACUGGAGGGdTdT | 2772 |
| AD-62044.1 | GAUUUCCUUUGUGUACGAUdTdT | 2206 | 4441-4459 | AUCGUACACAAAGGAAAUCdTdT | 2773 |
| AD-62050.1 | GUACGAUUCCGGAUAUUUGdTdT | 2207 | 4453-4471 | CAAAUAUCCGGAAUCGUACdTdT | 2774 |
| AD-62320.1 | CGGAUAUUUGAACUCUUUGdTdT | 2208 | 4462-4480 | CAAAGAGUUCAAAUAUCCGdTdT | 2775 |
| AD-62326.1 | ACUCUUUGAAGUUGGGUUUdTdT | 2209 | 4473-4491 | AAACCCAACUUCAAAGAGUdTdT | 2776 |
| AD-62332.1 | AGUUGGGUUUCUCAGUCCUdTdT | 2210 | 4482-4500 | AGGACUGAGAAACCCAACUdTdT | 2777 |
| AD-62338.1 | UUCUCAGUCCUGCCACUUUdTdT | 2211 | 4490-4508 | AAAGUGGCAGGACUGAGAAdTdT | 2778 |
| AD-62344.1 | CACUUUCACAGUGUACGAAdTdT | 2212 | 4503-4521 | UUCGUACACUGUGAAAGUGdTdT | 2779 |
| AD-62350.1 | CACAGUGUACGAAUACCACdTdT | 2213 | 4509-4527 | GUGGUAUUCGUACACUGUGdTdT | 2780 |
| AD-62356.1 | ACCACAGACCAGAUAAACAdTdT | 2214 | 4523-4541 | UGUUUAUCUGGUCUGUGGUdTdT | 2781 |
| AD-62362.1 | CCAGAUAAACAGUGUACCAdTdT | 2215 | 4531-4549 | UGGUACACUGUUUAUCUGGdTdT | 2782 |
| AD-62321.1 | CAGUGUACCAUGUUUUAUAdTdT | 2216 | 4540-4558 | UAUAAAACAUGGUACACUGdT dT | 2783 |
| AD-62327.1 | GUUUUAUAGCACUUCCAAUdTdT | 2217 | 4551-4569 | AUUGGAAGUGCUAUAAAACdTdT | 2784 |
| AD-62333.1 | CUUCCAAUAUCAAAAUUCAdTdT | 2218 | 4562-4580 | UGAAUUUUGAUAUUGGAAGdTdT | 2785 |
- 165044245
| AD-62339.1 | AJCAAAAUUCAGAAAGUCUdTdT | 2219 | 4570-4588 | AGACUUUCUGAAUUUUGAUdTdT | 2786 |
| AD-62345.1 | GAAAGUCUGUGAAGGAGCCdTdT | 2220 | 4581-4599 | GGCUCCUUCACAGACUUUCdTdT | 2787 |
| AD-62351.1 | GAAGGAGCCGCGUGCAAGUdTdT | 2221 | 4591-4609 | ACUUGCACGCGGCUCCUUCdTdT | 2788 |
| AD-62357.1 | GGUGCAAGUGUGUAGAAGCdTdT | 2222 | 4601-4619 | GCUUCUACACACUUGCACGdTdT | 2789 |
| AD-62363.1 | GUAGAAGCUGAUUGUGGGCdTdT | 2223 | 4612-4630 | GCCCACAAUCAGCUUCUACdTdT | 2790 |
| AD-62322.1 | GUGAUUGUGGGCAAAUGCAdTdT | 2224 | 4619-4637 | UGCAUUUGCCCACAAUCAGdTdT | 2791 |
| AD-62328.1 | GCAAAUGCAGGAAGAAUUGdTdT | 2225 | 4629-4647 | CAAUUCUUCCUGCAUUUGCdTdT | 2792 |
| AD-62334.1 | GAAGAAUUGGAUCUGACAAdTdT | 2226 | 4639-4657 | UUGUCAGAUCCAAUUCUUCdTdT | 2793 |
| AD-62340.1 | GUGACAAUCUCUGCAGAGAdTdT | 2227 | 4651-4669 | UCUCUGCAGAGAUUGUCAGdTdT | 2794 |
| AD-62346.1 | GCAGAGACAAGAAAACAAAdT dT | 2228 | 4663-4681 | UUUGUUUUCUUGUCUCUGCdTdT | 2795 |
| AD-62352.1 | GAAGAAAACAAACAGCAUGdTdT | 2229 | 4670-4688 | CAUGCUGUUUGUUUUCUUGdTdT | 2796 |
| AD-62358.1 | ACAGCAUGUAAACCAGAGAdTdT | 2230 | 4681-4699 | UCUCUGGUUUACAUGCUGUdTdT | 2797 |
| AD-62364.1 | GCAGAGAUUGCAUAUGCUUdTdT | 2231 | 4693-4711 | AAGCAUAUGCAAUCUCUGGdTdT | 2798 |
| AD-62323.1 | GCAUAUGCUUAUAAAGUUAdT dT | 2232 | 4702-4720 | UAACUUUAUAAGCAUAUGCdTdT | 2799 |
| AD-62329.1 | UUAUAAAGUUAGCAUCACAdT dT | 2233 | 4710-4728 | UGUGAUGCUAACUUUAUAAdTdT | 2800 |
| AD-62335.1 | GAUCACAUCCAUCACUGUAdTdT | 2234 | 4722-4740 | UACAGUGAUGGAUGUGAUGdTdT | 2801 |
| AD-62341.1 | UCACUGUAGAAAAUGUUUUdTdT | 2235 | 4733-4751 | AAAACAUUUUCUACAGUGAdT dT | 2802 |
| AD-62347.1 | AGAAAAUGUUUUUGUCAAGdTdT | 2236 | 4740-4758 | CUUGACAAAAACAUUUUCUdTdT | 2803 |
| AD-62353.1 | DUUGUCAAGUACAAGGCAAdTdT | 2237 | 4750-4768 | UUGCCUUGUACUUGACAAAdTdT | 2804 |
| AD-62359.1 | AGGCAACCCUUCUGGAUAUdTdT | 2238 | 4763-4781 | AUAUCCAGAAGGGUUGCCUdTdT | 2805 |
| AD-62365.1 | CCUUCUGGAUAUCUACAAAdTdT | 2239 | 4770-4788 | UUUGUAGAUAUCCAGAAGGdTdT | 2806 |
| AD-62324.1 | DAUCUACAAAACUGGGGAAdTdT | 2240 | 4779-4797 | UUC С C CAGUUUUGUAGAUAdT dT | 2807 |
| AD-62330.1 | GUGGGGAAGCUGUUGCUGAdTdT | 2241 | 4790-4808 | UCAGCAACAGCUUCCCCAGdTdT | 2808 |
| AD-62336.1 | GUGUUGCUGAGAAAGACUCdTdT | 2242 | 4799-4817 | GAGUCUUUCUCAGCAACAGdTdT | 2809 |
| AD-62342.1 | GACUCUGAGAUUACCUUCAdTdT | 2243 | 4813-4831 | UGAAGGUAAUCUCAGAGUCdTdT | 2810 |
| AD-62348.1 | GAGAUUACCUUCAUUAAAAdTdT | 2244 | 4819-4837 | UUUUAAUGAAGGUAAUCUCdTdT | 2811 |
| AD-62354.1 | AJUAAAAAGGUAACCUGUAdTdT | 2245 | 4831-4849 | UACAGGUUACCUUUUUAAUdTdT | 2812 |
| AD-62360.1 | UAACCUGUACUAACGCUGAdTdT | 2246 | 4841-4859 | UCAGCGUUAGUACAGGUUAdTdT | 2813 |
| AD-62366.1 | CUAACGCUGAGCUGGUAAAdTdT | 2247 | 4850-4868 | UUUACCAGCUCAGCGUUAGdTdT | 2814 |
| AD-62325.1 | GGUAAAAGGAAGACAGUACdTdT | 2248 | 4863-4881 | GUACUGUCUUCCUUUUACCdTdT | 2815 |
| AD-62331.1 | GAAGACAGUACUUAAUUAUdT dT | 2249 | 4871-4889 | AUAAUUAAGUACUGUCUUCdTdT | 2816 |
| AD-62337.1 | GUUAAUUAUGGGUAAAGAAdTdT | 2250 | 4881-4899 | UUCUUUACCCAUAAUUAAGdTdT | 2817 |
| AD-62343.1 | UAAAGAAGCCCUCCAGAUAdTdT | 2251 | 4893-4911 | UAUCUGGAGGGCUUCUUUAdTdT | 2818 |
| AD-62349.1 | GCUCCAGAUAAAAUACAAUdTdT | 2252 | 4902-4920 | AUUGUAUUUUAUCUGGAGGdTdT | 2819 |
| AD-62355.1 | 4AAUACAAUUUCAGUUUCAdTdT | 2253 | 4912-4930 | UGAAACUGAAAUUGUAUUUdTdT | 2820 |
| AD-62361.1 | GAGUUUCAGGUACAUCUACdTdT | 2254 | 4923-4941 | GUAGAUGUACCUGAAACUGdTdT | 2821 |
| AD-62367.1 | GGUACAUCUACCCUUUAGAdTdT | 2255 | 4931-4949 | UCUAAAGGGUAGAUGUACCdTdT | 2822 |
| AD-62373.1 | GCUUUAGAUUCCUUGACCUdTdT | 2256 | 4942-4960 | AGGUCAAGGAAUCUAAAGGdTdT | 2823 |
| AD-62379.1 | GCUUGACCUGGAUUGAAUAdTdT | 2257 | 4952-4970 | UAUUCAAUCCAGGUCAAGGdTdT | 2824 |
| AD-62385.1 | GGAUUGAAUACUGGCCUAGdTdT | 2258 | 4961-4979 | CUAGGCCAGUAUUCAAUCCdTdT | 2825 |
| AD-62391.1 | CUGGCCUAGAGACACAACAdTdT | 2259 | 4971-4989 | UGUUGUGUCUCUAGGCCAGdTdT | 2826 |
| AD-62397.1 | GAGACACAACAUGUUCAUCdTdT | 2260 | 4979-4997 | GAUGAACAUGUUGUGUCUCdTdT | 2827 |
| AD-62403.1 | GUUCAUCGUGUCAAGCAUUdTdT | 2261 | 4991-5009 | AAUGCUUGACACGAUGAACdTdT | 2828 |
| AD-62409.1 | GUCAAGCAUUUUUAGCUAAdTdT | 2262 | 5000-5018 | UUAGCUAAAAAUGCUUGACdTdT | 2829 |
- 166 044245
| AD-62368.1 | A.GCUAAUUUAGAUGAAUUUdT dT | 2263 | 5013-5031 | AAAUUCAUCUAAAUUAGCUdTdT | 2830 |
| AD-62374.1 | AGAUGAAUUUGCCGAAGAUdTdT | 2264 | 5022-5040 | AUCUUCGGCAAAUUCAUCUdTdT | 2831 |
| AD-62380.1 | GCGAAGAUAUCUUUUUAAAdTdT | 2265 | 5033-5051 | UUUAAAAAGAUAUCUUCGGdTdT | 2832 |
| AD-62386.1 | GUUUUUAAAUGGAUGCUAAdTdT | 2266 | 5043-5061 | UUAGCAUCCAUUUAAAAAGdTdT | 2833 |
| AD-62392.1 | GGAUGCUAAAAUUCCUGAAdTdT | 2267 | 5053-5071 | UUCAGGAAUUUUAGCAUCCdTdT | 2834 |
| AD-62398.1 | UAAAAUUCCUGAAGUUCAGdTdT | 2268 | 5059-5077 | CUGAACUUCAGGAAUUUUAdTdT | 2835 |
| AD-62404.1 | AGUUCAGCUGCAUACAGUUdTdT | 2269 | 5071-5089 | AACUGUAUGCAGCUGAACUdTdT | 2836 |
| AD-62410.1 | GCAUACAGUUUGCACUUAUdTdT | 2270 | 5080-5098 | AUAAGUGCAAACUGUAUGCdTdT | 2837 |
| AD-62369.1 | ACUUAUGGACUCCUGUUGUdTdT | 2271 | 5093-5111 | ACAACAGGAGUCCAUAAGUdTdT | 2838 |
| AD-62375.1 | GGACUCCUGUUGUUGAAGUdTdT | 2272 | 5099-5117 | ACUUCAACAACAGGAGUCCdTdT | 2839 |
| AD-62381.1 | UGUUGAAGUUCGUUUUUUUdTdT | 2273 | 5109-5127 | AAAAAAACGAACUUCAACAdTdT | 2840 |
| AD-62387.1 | UUUUUUGUUUUCUUCUUUUdTdT | 2274 | 5122-5140 | AAAAGAAGAAAACAAAAAAdT dT | 2841 |
| AD-62393.1 | UCUUCUUUUUUUAAACAUUdTdT | 2275 | 5132-5150 | AAUGUUUAAAAAAAGAAGAdT dT | 2842 |
| AD-62399.1 | UUUUUAAACAUUCAUAGCUdTdT | 2276 | 5139-5157 | AGCUAUGAAUGUUUAAAAAdT dT | 2843 |
| AD-62405.1 | AJAGCUGGUCUUAUUUGUAdTdT | 2277 | 5152-5170 | UACAAAUAAGACCAGCUAUdTdT | 2844 |
| AD-62411.1 | GUCUUAUUUGUAAAGCUCAdTdT | 2278 | 5159-5177 | UGAGCUUUACAAAUAAGACdTdT | 2845 |
| AD-62370.1 | 4AAGCUCACUUUACUUAGAdTdT | 2279 | 5170-5188 | UCUAAGUAAAGUGAGCUUUdTdT | 2846 |
| AD-62376.1 | ACUUAGAAUUAGUGGCACUdTdT | 2280 | 5182-5200 | AGUGCCACUAAUUCUAAGUdTdT | 2847 |
| AD-62382.1 | AGUGGCACUUGCUUUUAUUdTdT | 2281 | 5192-5210 | AAUAAAAGCAAGUGCCACUdTdT | 2848 |
| AD-62388.1 | GCUUUUAUUAGAGAAUGAUdT dT | 2282 | 5202-5220 | AUCAUUCUCUAAUAAAAGCdTdT | 2849 |
| AD-62394.1 | GAGAAUGAUUUCAAAUGCUdTdT | 2283 | 5212-5230 | AGCAUUUGAAAUCAUUCUCdTdT | 2850 |
| AD-62400.1 | DUUCAAAUGCUGUAACUUUdTdT | 2284 | 5220-5238 | AAAGUUACAGCAUUUGAAAdTdT | 2851 |
| AD-62406.1 | GUAACUUUCUGAAAUAACAdTdT | 2285 | 5231-5249 | UGUUAUUUCAGAAAGUUACdTdT | 2852 |
| AD-62412.1 | GAAAUAACAUGGCCUUGGAdTdT | 2286 | 5241-5259 | UCCAAGGCCAUGUUAUUUCdTdT | 2853 |
| AD-62371.1 | GCUUGGAGGGCAUGAAGACdTdT | 2287 | 5253-5271 | GUCUUCAUGCCCUCCAAGGdTdT | 2854 |
| AD-62377.1 | AGGGCAUGAAGACAGAUACdTdT | 2288 | 5259-5277 | GUAUCUGUCUUCAUGCCCUdTdT | 2855 |
| AD-62383.1 | GAUACUCCUCCAAGGUUAUdTdT | 2289 | 5273-5291 | AUAACCUUGGAGGAGUAUCdTdT | 2856 |
| AD-62389.1 | GCUCCAAGGUUAUUGGACAdTdT | 2290 | 5279-5297 | UGUCCAAUAACCUUGGAGGdTdT | 2857 |
| AD-62395.1 | GGACACCGGAAACAAUAAAdTdT | 2291 | 5293-5311 | UUUAUUGUUUCCGGUGUCCdTdT | 2858 |
| AD-62401.1 | GAAACAAUAAAUUGGAACAdT dT | 2292 | 5301-5319 | UGUUCCAAUUUAUUGUUUCdTdT | 2859 |
| AD-62407.1 | AJUGGAACACCUCCUCAAAdTdT | 2293 | 5311-5329 | UUUGAGGAGGUGUUCCAAUdTdT | 2860 |
| AD-62413.1 | UCCUCAAACCUACCACUCAdTdT | 2294 | 5322-5340 | UGAGUGGUAGGUUUGAGGAdTdT | 2861 |
| AD-62372.1 | GUACCACUCAGGAAUGUUUdTdT | 2295 | 5331-5349 | AAACAUUCCUGAGUGGUAGdTdT | 2862 |
| AD-62378.1 | 4AUGUUUGCUGGGGCCGAAdTdT | 2296 | 5343-5361 | UUCGGCCCCAGCAAACAUUdTdT | 2863 |
| AD-62384.1 | UGCUGGGGCCGAAAGAACAdTdT | 2297 | 5349-5367 | UGUUCUUUCGGCCCCAGCAdTdT | 2864 |
| AD-62390.1 | 4AAGAACAGUCCAUUGAAAdTdT | 2298 | 5360-5378 | UUUCAAUGGACUGUUCUUUdTdT | 2865 |
| AD-62396.1 | GAUUGAAAGGGAGUAUUACdTdT | 2299 | 5371-5389 | GUAAUACUCCCUUUCAAUGdTdT | 2866 |
| AD-62402.1 | GGAGUAUUACAAAAACAUGdT dT | 2300 | 5380-5398 | CAUGUUUUUGUAAUACUCCdTdT | 2867 |
| AD-62408.1 | 4AAACAUGGCCUUUGCUUGdTdT | 2301 | 5391-5409 | CAAGCAAAGGCCAUGUUUUdTdT | 2868 |
| AD-62414.1 | GCCUUUGCUUGAAAGAAAAdTdT | 2302 | 5399-5417 | UUUUCUUUCAAGCAAAGGCdTdT | 2869 |
| AD-62415.1 | GAAAGAAAAUACCAAGGAAdTdT | 2303 | 5409-5427 | UUCCUUGGUAUUUUCUUUCdTdT | 2870 |
| AD-62416.1 | GCAAGGAACAGGAAACUGAdTdT | 2304 | 5420-5438 | UCAGUUUCCUGUUCCUUGGdTdT | 2871 |
| AD-62417.1 | 4ACUGAUCAUUAAAGCCUGdTdT | 2305 | 5433-5451 | CAGGCUUUAAUGAUCAGUUdTdT | 2872 |
- 167044245
Таблица 22
Тест разовой дозы С5 (10 мМ) в клетках НерЗВ с dT-модифицированными иРНК
- 168 044245
- 169 044245
- 170 044245
- 171 044245
- 172 044245
- 173 044245
- 174 044245
- 175 044245
- 176 044245
- 177 044245
- 178 044245
- 179 044245
- 180 044245
- 181 044245
- 182 044245
- 183 044245
- 184 044245
Пример 7. Скрининг дополнительных siRNA in vivo.
На основании последовательности AD-58643, синтезировали дополнительные четыре смысловых и три антисмысловых последовательности и применяли их для получения двенадцати, 21/25mer соединений (табл. 23). В общем, антисмысловые цепи этих соединений были расширены посредством dTdT и дуплексы содержали меньше фтор-модифицированных нуклеотидов.
Мышам линии C57BL/6 (количество=3 на группу) подкожно вводили 1 мг/кг таких GalNAcконъюгированных дуплексов, собирали сыворотку в день 0, предварительно отбирая, и на день 5 определяли количественно уровень белков С5 с помощью ELISA. Уровни белка С5 были нормализованы до уровня в день 0 в предварительно отобранной сыворотке.
Табл. 14 показывает результаты теста разовой дозы in vivo с указанными иРНК. Данные выражены в виде процентного отношения оставшегося белка С5 по отношению к уровням в предварительно отобранной сыворотке. Эти иРНК с улучшенной эффективностью по сравнению с исходным соединением включали AD-62510, AD-62643, AD-62645, AD-62646, AD-62650 и AD-62651. Эти иРНК также демонстрировали подобную эффективность (IC50 приблизительно 23-59 пМ).
- 185 044245
Эффективность этих иРНК испытывали на мышах линии C57BL/6 с применением протокола введения разовой дозы. Мышам вводили подкожно AD-62510, AD-62643, AD-62645, AD-62646, AD-62650 и
AD-62651 в дозе 0,25 мг/кг, 0,5 мг/кг, 1,0 мг/кг или 2,5 мг/кг. Сыворотку собирали в дни 0 и 5 и анализировали на уровень белка С5 с помощью ELISA. Уровни С5 были нормализованы до уровня в день 0 в предварительно отобранной сыворотке.
На фиг. 15 показано наличие зависимости доза-ответ со всеми тестируемыми иРНК и что разовое введение всех этих иРНК приводит к сайленсингу белка С5, аналогичному или улучшенному по сравнению с AD-58641.
Продолжительность сайленсинга AD-62510, AD-62643, AD-62645, AD-62646, AD-62650 и AD62651 in vivo определяли путем введения разовой дозы 1,0 мг/кг мышам линии C57BL/6 и определением количество белка С5, обнаруживаемого в дни 6, 13, 20, 27 и 34 с помощью ELISA. Уровни С5 были нормализованы до уровня в день 0 в предварительно отобранной сыворотке.
Как показано на фиг. 16, каждая из испытуемых иРНК демонстрирует ту же кинетику восстановления, что и AD-62643, с тенденцией к лучшему сайленсингу, но в пределах погрешности анализа.
AD-62510, AD-62643, AD-62645, AD-62646, AD-62650 и AD-62651 дополнительно испытывали на эффективность и оценивали кумулятивный эффект иРНК у крыс с применением протокола повторных введений. Крысам линии Sprague Dawley дикого типа производили подкожную инъекцию с каждой из иРНК в дозе 5,0 мг/кг/дозу на день 0, 4 и 7. Сыворотку собирали на день 0, 4, 7, 11, 14, 18, 25, 28 и 32. Гемолитическую активность сыворотки количественно оценивали, как описано выше.
Результаты, представленные на фиг. 17, показывают, что все из испытанных иРНК обеспечивают эффективное и продолжительное снижение гемолитической активности и аналогичное восстановление гемолиза, наблюдаемые при обработке AD-58641.
Таблица 23 Последовательности модифицированной смысловой и антисмысловой цепи GalNAc-коньюгированных dsRNA C5
| ID дуплекса | ID смысловой | Смысловая (от 5' к 3') | SEQ ID NO: | AS ID | Антисмысловая (от 5' к 3') | SEQ ID NO: |
| AD-58643 | A-119326.1 | Af sasGfcAfaGfaUfAfUfuUfuUfa UfaAfuAfL96 | 2873 | A- 119327.1 | usAf suU f aUf aAf aAf auaU f cUfuG f cUf ususu | 2886 |
| AD-62642 | A-125167.7 | asasGfcAfaGfaUfAfUfuUfuuAfu Af auaL96 | 2874 | A- 125139.1 | usAfsuuaUfaAfaAfauaUfcUfuGfcuus usudTdT | 2887 |
| AD-62510 | A-125167.7 | asasGfcAfaGfaUfAfUfuUfuuAfu Af auaL96 | 2875 | A- 125173.2 | usAfsUfuAfuAfAfaAfauaUfcUfuGfcu ususudTdT | 2888 |
| AD-62643 | A-125167.7 | asasGfcAfaGfaUfAfUfuUfuuAfu Af auaL96 | 2876 | A- 125647.1 | usAfsUfuAfuaAfaAfauaUfcUfuGfcuu susudTdT | 2889 |
| AD-62644 | A-125157.17 | asasGfcAfaGfaUfAfUfuUfuuAfu aAfuaL96 | 2877 | A- 125139.1 | usAfsuuaUfaAfaAfauaUfcUfuGfcuus usudTdT | 2890 |
| AD-62645 | A-125157.17 | asasGfcAfaGfaUfAfUfuUfuuAfu aAfuaL96 | 2878 | A- 125173.2 | usAfsUfuAfuAfAfaAfauaUfcUfuGfcu ususudTdT | 2891 |
| AD-62646 | A-125157.17 | asasGfcAfaGfaUfAfUfuUfuuAfu aAfuaL96 | 2879 | A- 125647.1 | usAfsUfuAfuaAfaAfauaUfcUfuGfcuu susudTdT | 2892 |
| AD-62647 | A-125134.1 | asasgcaagauaUfuuuua(Tgn)aau aL96 | 2880 | A- 125139.1 | usAfsuuaUfaAfaAfauaUfcUfuGfcuus usudTdT | 2893 |
| AD-62648 | A-125134.1 | asasgcaagauaUfuuuua(Tgn)aau aL96 | 2881 | A- 125173.2 | usAfsUfuAfuAfAfaAfauaUfcUfuGfcu ususudTdT | 2894 |
| AD-62649 | A-125134.1 | asasgcaagauaUfuuuua(Tgn)aau aL96 | 2882 | A- 125647.1 | usAfsUfuAfuaAfaAfauaUfcUfuGfcuu susudTdT | 2895 |
| AD-62428 | A-125127.2 | asasgcaagaUfaUfuuuuauaaual® 6 | 2883 | A- 125139.1 | usAfsuuaUfaAfaAfauaUfcUfuGfcuus usudTdT | 2896 |
| AD-62650 | A-125127.2 | asasgcaagaUfaUfuuuuauaaual9 6 | 2884 | A- 125173.2 | usAfsUfuAfuAfAfaAfauaUfcUfuGfcu ususudTdT | 2897 |
| AD-62651 | A-125127.2 | asasgcaagaUfaUfuuuuauaaual9 6 | 2885 | A- 125647.1 | usAfsUfuAfuaAfaAfauaUfcUfuGfcuu susudTdT | 2898 |
Claims (64)
1. Средство, представляющее собой двухцепочечную рибонуклеиновую кислоту (dsRNA), для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5, где указанная dsRNA содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь, образующие двухцепочечный участок, где смысловая цепь и антисмысловая цепь, каждая независимо, имеют длину 19-25 нуклеотидов, смысловая цепь содержит по меньшей мере 19 смежных нуклеотидов из нуклеотидной последовательности 5'-AAGCAAGAUAUUUUUAUAAUA-3' (SEQ ID NO:62) и указанная антисмысловая цепь содержит по меньшей мере 19 смежных нуклеотидов из нуклеотидной последовательности 5'-UAUUAUAAAAAUAUCUUGCUUUU-3') (SEQ ID NO:113), все нуклеотиды указанной смысловой цепи и все нуклеотиды указанной антисмысловой цепи включают нуклеотидную модификацию и по меньшей мере одна цепь конъюгируется с лигандом.
2. Средство, представляющее собой dsRNA, по п.1, где по меньшей мере одна из указанных нуклеотидных модификаций выбрана из группы, состоящей из 3'-концевой дезокси-тимин (dT) нуклеотидной модификации, 2'-O-метил-нуклеотидной модификации, 2'-фтор-нуклеотидной модификации, 2'-дезоксинуклеотидной модификации, замкнутой нуклеотидной модификации, абазической нуклеотидной модификации, 2'-амино-нуклеотидной модификации, 2'-алкил-нуклеотидной модификации, морфолинонуклеотидной модификации, нуклеотидной модификации фосфорамидата, содержащего основание не природного происхождения, нуклеотида, содержащего модификацию 5'-фосфоротиоатной группы, и модификации концевого нуклеотида, связанного с холестерильным производным или группой бисдециламида додекановой кислоты.
3. Средство, представляющее собой dsRNA, по п.2, где указанные модифицированные нуклеотиды содержат модификацию короткой последовательности 3'-концевых дезокси-тиминовых нуклеотидов (dT).
4. Средство, представляющее собой dsRNA, по любому из пп.1-3, где по меньшей мере одна цепь содержит 3'-выступ по меньшей мере 1 нуклеотида.
5. Средство, представляющее собой dsRNA, по любому из пп.1-3, где по меньшей мере одна цепь содержит 3'-выступ по меньшей мере 2 нуклеотидов.
6. Средство, представляющее собой dsRNA, по любому из пп.1-5, где лиганд конъюгируется с 3'концом смысловой цепи средства, представляющего собой dsRNA.
7. Средство, представляющее собой dsRNA, по любому из пп.1-6, где лиганд представляет собой производное N-ацетилгалактозамина (GalNAc).
8. Средство, представляющее собой dsRNA, по п.7, где лиганд представляет собой
9. Средство, представляющее собой dsRNA, по п.7, где средство, представляющее собой dsRNA, конъюгируется с лигандом, как показано на следующей схеме:
и где X представляет собой О или S.
10. Средство, представляющее собой dsRNA, по п.9, где X представляет собой О.
- 187 044245
11. Средство, представляющее собой dsRNA, по любому из пп.1-10, где указанное средство, представляющее собой dsRNA, дополнительно содержит по меньшей мере одну фосфоротиоатную или метилфосфонатную межнуклеотидную связь.
12. Средство, представляющее собой dsRNA, по п.11, где фосфоротиоатная или метилфосфонатная межнуклеотидная связь находится на 3'-конце одной цепи.
13. Средство, представляющее собой dsRNA, по п.12, где указанная цепь является антисмысловой цепью.
14. Средство, представляющее собой dsRNA, по п.12, где указанная цепь является смысловой цепью.
15. Средство, представляющее собой dsRNA, по п.11, где фосфоротиоатная или метилфосфонатная межнуклеотидная связь находится на 5'-конце одной цепи.
16. Средство, представляющее собой dsRNA, по п.15, где указанная цепь является антисмысловой цепью.
17. Средство, представляющее собой dsRNA, по п.15, где указанная цепь является смысловой цепью.
18. Средство, представляющее собой dsRNA, по п.11, где фосфоротиоатная или метилфосфонатная межнуклеотидная связь находится как на 5'-, так и на 3'-конце одной цепи.
19. Средство, представляющее собой dsRNA, по п.18, где указанная цепь является антисмысловой цепью.
20. Средство, представляющее собой двухцепочечную рибонуклеиновую кислоту (dsRNA) для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5, где указанное средство dsRNA содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь, образующие двухцепочечный участок, где смысловая цепь и антисмысловая цепь, каждая независимо, имеет длину 19-25 нуклеотидов, смысловая цепь содержит по меньшей мере 19 смежных нуклеотидов из нуклеотидной последовательности 5'-AAGCAAGAUAUUUUUAUAAUA-3' (SEQ ID NO:62), и указанная антисмысловая цепь содержит по меньшей мере 19 смежных нуклеотидов из нуклеотидной последовательности 5'UAUUAUAAAAAUAUCUUGCUUUU-3' (SEQ ID NO:113), все нуклеотиды указанной смысловой цепи содержат модификацию, выбранную из группы, состоящей из 2'-O-метил-модификации и 2'-фтор-модификации, указанная смысловая цепь содержит две фосфоротиоатные межнуклеотидные связи на 5'-конце, все нуклеотиды указанной антисмысловой цепи содержат модификацию, выбранную из группы, состоящей из 2'-O-метил-модификации, 2'-фтор-модификации и модификации дезокси-тимин нуклеотида, указанная антисмысловая цепь содержит две фосфоротиоатные межнуклеотидные связи на 5'-конце и две фосфоротиоатные межнуклеотидные связи на 3'-конце и указанная смысловая цепь конъюгируется с одним или несколькими производными GalNAc, присоединенными посредством одновалентного, двухвалентного или трехвалентного линкера на 3'-конце.
21. Средство dsRNA по п.20, где одно или несколько производных GalNAc присоединены посредст- вом трехвалентного разветвленного линкера.
22. Средство dsRNA по п.20 или 21, где лиганд представляет собой
- 188 044245
23. Средство dsRNA по п.22, где средство RNAi конъюгируется с лигандом, как показано на следующей схеме:
24. Средство dsRNA по любому из пп.1-23, где двухцепочечный участок составляет в длину 19-25 пар нуклеотидов.
25. Средство dsRNA по п.24, где двухцепочечный участок составляет в длину 19-23 пары нуклеотидов.
26. Средство dsRNA по п.24, где двухцепочечный участок составляет в длину 19-21 пару нуклеотидов.
27. Средство dsRNA по п.24, где двухцепочечный участок составляет в длину 21-23 пары нуклеотидов.
28. Средство dsRNA по любому из пп.1-27, где каждая цепь независимо составляет в длину 21-23 нуклеотида.
29. Средство dsRNA по любому из пп.1-28, где смысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность 5'-AAGCAAGAUAUUUUUAUAAUA-3' (SEQ ID NO:62).
30. Средство dsRNA по любому из пп.1-29, где антисмысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность 5'-UAUUAUAAAAAUAUCUUGCUUUU-3' (SEQ ID NO:113).
31. Средство dsRNA по любому из пп.1-30, где смысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность 5'-AAGCAAGAUAUUUUUAUAAUA-3' (SEQ ID NO:62) и антисмысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность 5'-UAUUAUAAAAAUAUCUUGCUUUU-3' (SEQ ID NO:113).
32. Средство dsRNA по п.31, где смысловая цепь содержит 5'-asasGfcAfaGfaUfAfUfuUfuuAfuAfaua3' (SEQ ID NO:2876) и антисмысловая цепь содержит 5'-usAfsUfuAfuaAfaAfauaUfcUfuGfcuususudTdT-3' (SEQ ID NO:2889), где a, g, с и u представляют собой 2'-O-метил (2'-OMe) А, G, С и U; Af, Gf, Cf и Uf представляют собой 2'-фтор A, G, С и U; dT представляет собой дезокси-тимин нуклеотид и s представляет собой фосфоротиоатную связь.
- 189 044245
33. Средство dsRNA по любому из пп.1-31, где смысловая и антисмысловая цепи содержат нуклеотидные последовательности, выбранные из группы, состоящей из
5' - AfaGfcAfaGfaUfAfUfuUfuUfaUfaAfuAf - 3' (SEQ ID NO:122) и
5'
- uAfuUfaUfaAfaAfauaUfcUfuGfcUfusUfsu -
3'
(SEQ
ID
NO:173)
r
5'
- AfsasGfcAfaGfaUfAfUfuUfuUfaUfaAfuAf -
3'
(SEQ
ID
NO:164)
и
5'
- usAfsuUfaUfaAfaAfauaUfcUfuGfcUfususu
- 3'
(SEQ
ID
NO:215)
5' - asasGfcAfaGfaUfAfUfuUfuuAfuAfaua - 3' (SEQ ID NO:2875) и
5' - usAfsUfuAfuAfAfaAfauaUfcUfuGfcuususudTdT - 3' (SEQ ID
NO:2 8 8 8) ;
5' - asasGfcAfaGfaUfAfUfuUfuuAfuAfaua - 3' (SEQ ID NO: 2876) и
5' - usAfsUfuAfuaAfaAfauaUfcUfuGfcuususudTdT - 3' (SEQ ID
NO:2 8 8 9) ;
5' - asasGfcAfaGfaUfAfUfuUfuuAfuaAfua - 3' (SEQ ID NO:2878) и
5' - usAfsUfuAfuAfAfaAfauaUfcUfuGfcuususudTdT - 3' (SEQ ID
NO:2891);
5' - asasGfcAfaGfaUfAfUfuUfuuAfuaAfua - 3' (SEQ ID NO:2879) и
5' - usAfsUfuAfuaAfaAfauaUfcUfuGfcuususudTdT - 3' (SEQ ID
NO:2892);
5' - asasgcaagaUfaUfuuuuauaaua - 3' (SEQ ID NO:2884) и
5' - usAfsUfuAfuAfAfaAfauaUfcUfuGfcuususudTdT - 3' (SEQ ID
NO:2897); и
5' - asasgcaagaUfaUfuuuuauaaua - 3' (SEQ ID NO:2885) и
5' - usAfsUfuAfuaAfaAfauaUfcUfuGfcuususudTdT - 3' (SEQ ID
NO:2898), где a, g, с и u представляют собой 2'-O-метил (2'-OMe) А, G, С и U; Af, Gf, Cf и Uf представляют собой 2'-фтор A, G, С и U; dT представляет собой дезокси-тимин нуклеотид и s представляет собой фосфоротиоатную связь.
34. Средство dsRNA по п.33, где смысловая цепь состоит из нуклеотидной последовательности 5'asasGfcAfaGfaUfAfUfuUfuuAfuAfaua-3' (SEQ ID NO:2876) и антисмысловая цепь состоит из нуклеотидной последовательности 5'-usAfsUfuAfuaAfaAfauaUfcUfuGfcuususudTdT-3' (SEQ ID NO:2889), a, g, с и u представляют собой 2'-O-метил (2'-OMe) А, G, С и U; Af, Gf, Cf и Uf представляют собой 2'-фтор A, G, С и U; dT представляет собой дезокси-тимин нуклеотид и s представляет собой фосфоротиоатную связь; и
- 190 044245 лиганд конъюгируется на З'-конце смысловой цепи, как показано на следующей схеме:
35. Клетка, содержащая средство, представляющее собой dsRNA, по любому из пп.1-34.
36. Фармацевтическая композиция для ингибирования экспрессии гена компонента комплемента С5, содержащая средство, представляющее собой dsRNA, по любому из пп.1-34.
37. Фармацевтическая композиция по п.36, где средство RNAi содержится в небуферном растворе.
38. Фармацевтическая композиция по п.37, где указанный небуферный раствор представляет собой физиологический раствор или воду.
39. Фармацевтическая композиция по п.38, где указанное средство RNAi присутствует с буферным раствором.
40. Фармацевтическая композиция по п.39, где указанный буферный раствор содержит ацетат, цитрат, проламин, карбонат или фосфат или любую их комбинацию.
41. Фармацевтическая композиция по п.39, где указанный буферный раствор представляет собой забуференный фосфатом физиологический раствор (PBS).
42. Способ ингибирования экспрессии компонента комплемента С5 в клетке, включающий:
(а) приведение клетки в контакт со средством dsRNA по любому из пп.1-34 или фармацевтической композицией по любому из пп.36-41 и (b) поддержание клетки, полученной на стадии (а) в течение времени, достаточного для разрушения транскрипта мРНК гена компонента комплемента С5 с ингибированием тем самым экспрессии гена компонента комплемента С5 в клетке.
43. Способ лечения субъекта, страдающего заболеванием или нарушением, при котором снижение экспрессии компонента комплемента С5 окажет благоприятное воздействие, причем способ включает введение субъекту терапевтически эффективного количества средства, представляющего собой dsRNA, по любому из пп.1-34 или фармацевтической композиции по любому из пп.36-41 с лечением тем самым указанного субъекта.
44. Способ предупреждения по меньшей мере одного симптома у субъекта, страдающего заболеванием или нарушением, при котором снижение экспрессии компонента комплемента С5 окажет благоприятное воздействие, причем способ включает введение субъекту профилактически эффективного количества средства, представляющего собой dsRNA, по любому из пп.1-34 или фармацевтической композиции по любому из пп.36-41 с предупреждением тем самым по меньшей мере одного симптома у субъекта, страдающего заболеванием, при котором снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие.
45. Способ по п.43 или 44, где введение dsRNA субъекту приводит к уменьшению внутрисосудистого гемолиза, стабилизации уровней гемоглобина и/или снижению белка С5.
46. Способ по п.43 или 44, где нарушение представляет собой заболевание, связанное с компонентом комплемента С5.
47. Способ по п.46, где заболевание, связанное с компонентом комплемента С5, выбрано из группы, состоящей из ночной пароксизмальной гемоглобинурии (PNH), атипичного гемолитико-уремического синдрома (aHUS), астмы, ревматоидного артрита (RA), синдрома антифосфолипидных антител, волчаночного нефрита, ишемически-реперфузионного повреждения, типичного или инфекционного гемолитико-уремического синдрома (tHUS), болезни плотного осадка (DDD), оптиконевромиелита (NMO), мультифокальной моторной нейропатии (MMN), рассеянного склероза (MS); дегенерации желтого пятна (например, связанной с возрастом дегенерации желтого пятна (AMD)); синдрома, включающего гемолиз, повышение активности печеночных ферментов и снижение числа тромбоцитов (HELLP); пурпуры тромботической тромбоцитопенической (ТТР); спонтанной потери плода; пауци-иммунного васкулита; буллезного эпидермолиза; рецидивирующей потери плода; преэклампсии, черепно-мозговой травмы, миастении гравис, болезни холодовых агглютининов, дерматомиозита буллезного пемфигоида, связанного с Шига-подобным токсином Е. coli гемолитико-уремического синдрома, C3-нефропатии, васкулита, связанного с антителами к цитоплазме нейтрофилов; реакций отторжения трансплантата, вызванных гуморальным и сосудистым механизмами, дисфункции трансплантата, инфаркта миокарда, аллогенной трансплантации, сепсиса, заболевания коронарной артерии, дерматомиозита, болезни Грейвса, атеро-
- 191 044245 склероза, болезни Альцгеймера, сепсиса, связанного с системным воспалительным ответом, септического шока, травмы спинного мозга, гломерулонефрита, тиреоидита Хашимото, диабета I типа, псориаза, пузырчатки, аутоиммунной гемолитической анемии (AIHA), ITP, синдрома Гудпасчера, болезни Дегоса, антифосфолипидного синдрома (APS), катастрофического APS (CAPS), сердечно-сосудистых нарушений, миокардита, цереброваскулярного нарушения, периферического сосудистого нарушения, реноваскулярного нарушения, нарушения брыжеечных/кишечных сосудов, васкулита, нефрита ШенлейнаГеноха, васкулита, связанного с системной красной волчанкой, васкулита, связанного с ревматоидным артритом, васкулита, связанного с иммунными комплексами, болезни Такаясу, дилатационной кардиомиопатии, диабетической ангиопатии, болезни Кавасаки (артериита), венозной газовой эмболии (VGE) и рестеноза после установки стента, вращательной атерэктомии, перепончатой нефропатии, синдрома Гийена-Барре и чрескожной транслюминальной коронарной ангиопластики (РТСА).
48. Способ по п.47, где заболевание, связанное с компонентом комплемента С5, представляет собой ночную пароксизмальную гемоглобинурию (PNH).
49. Способ по п.47, где заболевание, связанное с компонентом комплемента С5, представляет собой атипичный гемолитико-уремический синдром (aHUS).
50. Способ по п.43 или 44, где субъектом является человек.
51. Способ по любому из пп.43-50, дополнительно включающий введение субъекту антитела к компоненту комплемента С5 или его антигенсвязывающего фрагмента.
52. Способ по любому из пп.43-51, где средство, представляющее собой dsRNA, вводят в дозировке от приблизительно 0,01 до приблизительно 10 мг/кг или от приблизительно 0,5 до приблизительно 50 мг/кг.
53. Способ по п.52, где средство, представляющее собой dsRNA, вводят в дозировке от приблизительно 10 до приблизительно 30 мг/кг.
54. Способ по п.52, где средство, представляющее собой dsRNA, вводят субъекту один раз в неделю.
55. Способ по п.52, где средство, представляющее собой dsRNA, вводят субъекту два раза в неделю.
56. Способ по п.52, где средство, представляющее собой dsRNA, вводят субъекту два раза в месяц.
57. Способ по любому из пп.43-56, где средство, представляющее собой dsRNA, вводят субъекту подкожно.
58. Способ по п.43 или 44, дополнительно включающий измерение гемоглобина и/или уровней LDH у указанного субъекта.
59. Средство, представляющее собой двухцепочечную рибонуклеиновую кислоту (dsRNA), для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5, где dsRNA содержит смысловую цепь, содержащую нуклеотидную последовательность 5'-asasGfcAfaGfaUfAfUfuUfiiuAfuAfaua-3' (SEQ ID NO:2876) и антисмысловую цепь, содержащую нуклеотидную последовательность 5'-usAfsUfuAfuaAfaAfauaUfcUfuGfcuususudTdT-3' (SEQ ID NO:2889), где a, g, с и u представляют собой 2'-O-метил (2'-OMe) А, G, С и U; Af, Gf, Cf и Uf представляют собой 2'-фтор A, G, С и U; dT представляет собой дезокси-тимин нуклеотид и s представляет собой фосфоротиоатную связь.
60. Средство, представляющее собой двухцепочечную рибонуклеиновую кислоту (dsRNA), для ингибирования экспрессии компонента комплемента С5, где dsRNA содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь, где смысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность 5'asasGfcAfaGfaUfAfUfuUfuuAfuAfaua-3' (SEQ ID NO:2876) и антисмысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность 5'-usAfsUfuAfuaAfaAfauaUfcUfuGfcuususudTdT-3' (SEQ ID NO:2889), где a, g, с и u представляют собой 2'-O-метил (2'-OMe) А, G, С и U; Af, Gf, Cf и Uf представляют собой 2'-фтор A, G, С и U; dT представляет собой дезокси-тимин нуклеотид и s представляет собой фосфоротиоатную связь;
лиганд конъюгируется на 3'-конце смысловой цепи, как показано на следующей схеме:
где X представляет собой О.
- 192 044245
61. Фармацевтическая композиция для ингибирования экспрессии гена компонента комплемента
С5, содержащая средство, представляющее собой dsRNA, по п.60.
62. Способ лечения субъекта, страдающего заболеванием или нарушением, при котором снижение экспрессии компонента комплемента С5 окажет благоприятное воздействие, причем способ включает введение субъекту терапевтически эффективного количества средства, представляющего собой dsRNA, по п.60 или фармацевтической композиции по п.61 с лечением тем самым указанного субъекта.
63. Способ предупреждения по меньшей мере одного симптома у субъекта, страдающего заболеванием или нарушением, при котором снижение экспрессии компонента комплемента С5 окажет благоприятное воздействие, причем способ включает введение субъекту профилактически эффективного количества средства, представляющего собой dsRNA, по п.60 или фармацевтической композиции по п.61 с предупреждением тем самым по меньшей мере одного симптома у субъекта, страдающего заболеванием, при котором снижение экспрессии С5 окажет благоприятное воздействие.
64. Способ по п.62 или 63, в котором средство dsRNA или фармацевтическая композиция предназначены для подкожного введения.
Applications Claiming Priority (5)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US61/782,531 | 2013-03-14 | ||
| US61/837,399 | 2013-06-20 | ||
| US61/904,579 | 2013-11-15 | ||
| US61/912,777 | 2013-12-06 | ||
| US61/942,367 | 2014-02-20 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| EA044245B1 true EA044245B1 (ru) | 2023-08-04 |
Family
ID=
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP7717783B2 (ja) | 補体成分C5 iRNA組成物及びその使用方法 | |
| JP7602507B2 (ja) | 補体成分iRNA組成物及びその使用方法 | |
| US20210177884A1 (en) | COMPLEMENT COMPONENT C5 iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF | |
| US20220403381A1 (en) | Complement component c5 irna compositions and methods of use thereof | |
| JP2025081296A (ja) | 補体成分C5iRNA組成物及び発作性夜間血色素尿症(PNH)を処置するためのその使用方法 | |
| EA044245B1 (ru) | КОМПОЗИЦИИ иРНК КОМПОНЕНТА КОМПЛЕМЕНТА C5 И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ | |
| EA051110B1 (ru) | КОМПОЗИЦИИ НА ОСНОВЕ iRNA К КОМПОНЕНТУ КОМПЛЕМЕНТА И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ | |
| EA045602B1 (ru) | КОМПОЗИЦИИ НА ОСНОВЕ iRNA К КОМПОНЕНТУ КОМПЛЕМЕНТА И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ |