EA048006B1 - Антитела, специфично распознающие рецептор-альфа гранулоцитарно-макрофагального колониестимулирующего фактора, и их применения - Google Patents
Антитела, специфично распознающие рецептор-альфа гранулоцитарно-макрофагального колониестимулирующего фактора, и их применения Download PDFInfo
- Publication number
- EA048006B1 EA048006B1 EA202191470 EA048006B1 EA 048006 B1 EA048006 B1 EA 048006B1 EA 202191470 EA202191470 EA 202191470 EA 048006 B1 EA048006 B1 EA 048006B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- seq
- amino acid
- acid sequence
- variant
- cdr3
- Prior art date
Links
Abstract
Согласно настоящему изобретению предложены антитела, в том числе их антигенсвязывающий фрагмент, которые специфично распознают рецептор гранулоцитарно-макрофагального колониестимулирующего фактора (GM-CSFRa). Также предложены способы получения и применения этих антител.
Description
Представление перечня последовательностей в текстовом файле в формате ASCII
Содержимое указанного ниже документа, представленного в текстовом файле в формате ASCII (Стандартный американский код обмена информацией), включено в данное описание посредством ссылки во всей свое полноте: а именно, машиночитаемой формы (CRF) Перечня последовательностей (с названием файла: 710262000140SEQLIST.txt, датой создания: 7 ноября 2018 г., размером: 248 кБ (килобайт)).
Область техники, к которой относится изобретение
Эта заявка относится к антителам, которые специфично распознают рецептор-альфа гранулоцитарно-макрофагального колониестимулирующего фактора (GM-CSFRa), и способам их получения и применения, в том числе способам лечения аутоиммунных и воспалительных состояний и рака.
Предшествующий уровень техники
Гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор (GM-CSF) также известен как колониестимулирующий фактор 2 (CSF2). GM-CSF представляет собой провоспалительный цитокин I типа, который играет роль в обострении воспалительных, респираторных и аутоиммунных заболеваний. Рецептор GM-CSF является членом надсемейства рецепторов гемопоэтической системы. Он является гетеродимерным белком, состоящим из альфа- и бета-субъединиц. GM-CSF способен связываться с относительно низкой аффинностью с отдельно взятой α-субъединицей (Kd (константа диссоциации) 1-5 нМ), но совсем не связывается с отдельно взятой β-субъединицей. Однако, присутствие обеих a- и β-субъединиц приводит к образованию высокоаффинного лиганд-рецепторного комплекса (Kd примерно 100 пМ). Поэтому подавление связывания GM-CSF с GM-CSFRa представляет собой терапевтический подход к лечению заболеваний и состояний, опосредуемых GM-CSFR. Антитело к GM-CSFRa человека, обозначенное как маврилимумаб (моноклональное антитело (Mab), используемое в качестве контроля в разделе примеры), описано в WO2007110631.
Описания всех публикаций, патентов, патентных заявок и опубликованных патентных заявок, упомянутых в данном документе, тем самым включены в данную заявку посредством ссылки во всей своей полноте.
Краткое описание сущности данного изобретения
Согласно одному из аспектов настоящего изобреения предложено выделенное антитело к GMCSFRa, которое специфично связывается с эпитопом на GM-CSFRa человека, при этом данный эпитоп содержит один, два, три, четыре, пять или шесть остатков аминокислот, выбранных из группы, состоящей из Val50, Glu59, Lys194, Lys195, Arg283 и Ile284 GM-CSFRa человека. В некоторых воплощениях эпитоп дополнительно содержит аминокислотные остатки: (1) Val51, Thr63 и Ile196; (2) Leu191 и Il196; или (3) Arg49, Val51, Asn57 и Ser61. В некоторых воплощениях выделенное антитело к GM-CSFRa связывается с GM-CSFRa человека с Kd от примерно 0,1 пМ до примерно 1 нМ.
В некоторых воплощениях, соответствующих любому из выделенных антител к GM-CSFRa, описанных выше, выделенное антитело к GM-CSFRa содержит: вариабельный домен тяжелой цепи (VH), содержащий определяющий комплементарность участок 1 тяжелой цепи (HC-CDR1), содержащий X1X2X3H (SEQ ID NO: 76), где Xi представляет собой Е, N, G, D, M, S, P, F, Y, А, V, K, W, R или С, Х2 представляет собой S, С или Р, и Х3 представляет собой I или М; HC-CDR2, содержащий GFDX1X2X3X4EX5X6YAQKX7QG (SEQ ID NO: 77), где Xi представляет собой Р, G, Т, S или V, Х2 представляет собой Е, D, G или А, Х3 представляет собой D, G, I, W, S или V, Х4 представляет собой G, E, D или Н, Х5 представляет собой Т или А, Х6 представляет собой N или I, и Х7 представляет собой S или F; и HC-CDR3, содержащий GRYX1X2X3X4X5X6YGFDY (SEQ ID NO: 78), где Х1 представляет собой С, Т, S, I, А или V, Х2 представляет собой S, G, E, F, W, Н, I, V, N, Y, Т или R, Х3 представляет собой Т, Н, L, F, P, I, S, Y, K, A, D, V, N или G, Х4 представляет собой D, A, M, Y, F, S, T, G или W, Х5 представляет собой Т, S, F, Q, A, N, L, E, I, G или М, и Х6 представляет собой С, Т, N, S или А; и вариабельный домен легкой цепи (VL), содержащий определяющий комплементарность участок 1 легкой цепи (LC-CDR1), содержащий RAX1X2X3VX4X5X6LA (SEQ ID NO: 293), где Xi представляет собой S, L, N, А, K, R, I, Q, G, Т, Н, М или С, Х2 представляет собой Q, Y, P, A, I, F, T, R, V, L, E, S или С, Х3 представляет собой S, H, W, L, R, K, Т, Р, I, F, V, Е, А или Q, Х4 представляет собой S, L, W, M, A, Y, K, R, G, Т, Е, V, N, F или С, Х5 представляет собой S, T, R, A, H, Q, P, M, L или G, и Х6 представляет собой Y, L или F; LC-CDR2, содержащий XiX2X3S RAT (SEQ ID NO: 294), где Xi представляет собой G или Т, Х2 представляет собой A, G, R, Н, K, S, Т, М или F, и Х3 представляет собой S, A, W, R, L, T, Q, F, Y, Н или N; и LC-CDR3, содержащий QQYX1X2X3PX4T (SEQ ID NO: 79), где Х1 представляет собой N, D, S, R, A, T, L, Y, Q, W или G, Х2 представляет собой N, D, E, T, Y, G, A, M, F, S, I или L, Х3 представляет собой W, S, Р, V, G или R, и Х4 представляет собой Р, Y, H, S, F, N, D, V или G. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит: VH, содержащий HC-CDR1, содержащий ELX1X2H (SEQ ID NO: 295), где Х1 представляет собой S, С или Р, и Х2 представляет собой I или М; HC-CDR2, содержащий GFDX1X2X3X4EX5X6YAQKX7QG (SEQ ID NO: 77), где Х1 представляет собой Р, G, T, S или V, Х2 представляет собой Е, D, G или А, Х3 представляет собой D, G, I, W, S или V, Х4 представляет собой G, E, D или Н, Х5 представляет собой Т
- 1 048006 или А, Х6 представляет собой N или I, и Х7 представляет собой S или F; и HC-CDR3, содержащий GRYX1X2X3X4X5X6YGFDY (SEQ ID NO: 78), где Х1 представляет собой С, Т, S, I, А или V, Х2 представляет собой S, G, E, F, W, Н, I, V, N, Y, Т или R, Х3 представляет собой Т, Н, L, F, P, I, S, Y, K, A, D, V, N или G, Х4 представляет собой D, A, M, Y, F, S, T, G или W, Х5 представляет собой Т, S, F, Q, A, N, L, E, I, G или М, и Х6 представляет собой С, Т, N, S или А; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51); LC-CDR2, содержащий GASSRAT (SEQ ID NO: 52); и LC-CDR3, содержащий QQYX1X2X3PX4T (SEQ ID NO: 79), где Х1 представляет собой N, D, S, R, A, T, L, Y, Q, W или G, X2 представляет собой N, D, E, T, Y, G, A, M, F, S, I или L, X3 представляет собой W, S, P, V, G или R, и Х4 представляет собой P, Y, H, S, F, N, D, V или G.
В некоторых воплощениях предложено выделенное антитело к GM-CSFRa, которое содержит: VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 1-4 или ее вариант, содержащий примерно до 3 аминокислотных замен; HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 5-16 или ее вариант, содержащий примерно до 3 аминокислотных замен; и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 1750 или ее вариант, содержащий примерно до 3 аминокислотных замен; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51 или ее вариант, содержащий примерно до 3 аминокислотных замен; LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52 или ее вариант, содержащий примерно до 3 аминокислотных замен; и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 53-75 или ее вариант, содержащий примерно до 3 аминокислотных замен.
В некоторых воплощениях предложено выделенное антитело к GM-CSFRa, содержащее VH, содержащий HC-CDR1, HC-CDR2 и HC-CDR3 VH, содержащего аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 80-121; и VL, содержащий LC-CDR1, LC-CDR2 и LC-CDR3 из VL, содержащего аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 122-144.
В некоторых воплощениях предложено выделенное антитело к GM-CSFRa, которое содержит: (1) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LC-CDR; (2) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 56, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LC-CDR; (3) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LCCDR; (4) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LC-CDR; (5) VH, содержащий HCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LC-CDR; (6) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37, или
- 2 048006 их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LC-CDR; (7) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LC-CDR; (8) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных НС-CDR; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LCCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LC-CDR; (9) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LC-CDR.
В некоторых воплощениях, соответствующих любому из выделенных антител к GM-CSFRa, описанных выше, выделенное антитело к GM-CSFRa содержит аминокислотные остатки: (1) Е, Н, N, G, D, M, S, P, F, Y, А, V, K, W, R или С в положении 31 VH; и/или (2) S, L, N, А, K, R, I, Q, G, Т, Н, М или С в положении 26 VL; и/или (3) Q, Y, P, A, I, F, T, R, V, L, E, S или С в положении 27 VL; и/или (4) S, Н, W, L, R, K, Т, Р, I, F, V, Е, А или Q в положении 28 VL; и/или (5) S, L, W, M, A, Y, K, R, G, Т, Е, V, N, F или С в положении 30 VL; и/или (6) S, T, R, A, H, Q, P, M, L или G в положении 31 VL; и/или (7) Y, L или F в положении 32 VL; и/или (8) G или Т в положении 50 VL; и/или (9) A, G, R, Н, K, S, Т, М, F, N или V в положении 51 VL; и/или (10) S, A, W, R, L, T, Q, F, Y, Н или N в положении 52 У^и/или (11) D, A, Q, или W в положении 92 VL; и/или (12) N, D, E, T, Y, G, A, M, F, S, I или L в положении 93 VL; и/или (13) аминокислотные остатки, выбранные из Т, Н, V, Е, Р, L, M, S, W, С, А, G, N или K в положении 28 VH; и/или (14) аминокислотные остатки, выбранные из Т, Р, D, E, Y, W, V, М, N, L, Q, G, S, А, K или R в положении 30 VH, при этом нумерация соответствует EU-индексу по Kabat. В некоторых воплощениях, соответствующих любому из выделенных антител к GM-CSFRa, описанных выше, выделенное антитело к GMCSFRa содержит: VH, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 80-121 и 246-287 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью любой из SEQ ID NO: 80-121 и 246-287; и VL, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 122-144, 150-245 и 288-289 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью любой из SEQ ID NO: 122-144, 150-245 и 288-289. В некоторых воплощениях выделенное антитело к GM-CSFRa содержит: (1) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 80; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123; (2) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 125; (3) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 86; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126; (4) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126; (5) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 99; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122; (6) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 101; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126; (7) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123; (8) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 99; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126; (9) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 121; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126; (10) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 241; (11) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 193; (12) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 248;
- 3 048006 и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 188; (13) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 248; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 193; (14) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 288; (15) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 188; (16) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 236; или (17) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 288.
В некоторых воплощениях предложено выделенное антитело к GM-CSFRa, которое специфично связывается с GM-CSFRa, конкурируя с любым из выделенных антител к GM-CSFRa, которые описаны выше. В некоторых воплощениях предложено выделенное антитело к GM-CSFRa, которое специфично связывается с тем же эпитопом, что и любое из выделенных антител к GM-CSFRa, которые описаны выше.
В некоторых воплощениях, соответствующих любому из выделенных антител к GM-CSFRa, описанных выше, выделенное антитело к GM-CSFRa содержит Fc фрагмент. В некоторых воплощениях выделенное антитело к GM-CSFRa представляет собой полноразмерное антитело IgG типа. В некоторых воплощениях выделенное антитело к GM-CSFRa представляет собой полноразмерное антитело IgG1 или IgG4 подтипа. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa является химерным, человеческим или гуманизированным.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa представляет собой антигенсвязывающий фрагмент, выбранный из группы, состоящей из Fab, Fab', F(ab)'2, Fab'-SH, одноцепочечного Fv (scFv), вариабельного фрагмента (Fv), однодоменного антитела (dAb), Fd, нанотела, диатела и линейного антитела.
В некоторых воплощениях предложена(ы) выделенная(ые) молекула(ы) нуклеиновой кислоты, которая(ые) кодирует(ют) любое из антител к GM-CSFRa, описанных выше. В некоторых воплощениях предложен вектор, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты, соответствующую любой из молекул нуклеиновой кислоты, описанных выше. В некоторых воплощениях предложена клетка-хозяин, содержащая любое из антител к GM-CSFRa, описанных выше, любое из молекул нуклеиновой кислоты, описанных выше, или любой из векторов, описанных выше. В некоторых воплощениях предложен способ получения антитела к GM-CSFRa, включающий: а) культивирование любой из клеток хозяина, описанных выше, в условиях, эффективных для экспрессии антитела к GM-CSFRa; и b) выделение экспрессированного антитела к GM-CSFRa из клетки-хозяина.
В некоторых воплощениях предложен способ лечения заболевания или состояния у индивида, нуждающегося в этом, включающий введение индивиду эффективного количества антитела к GM-CSFRa, соответствующего любому из антител к GM-CSFRa, описанных выше. В некоторых воплощениях заболевание или состояние представляет собой воспалительное, респираторное или аутоиммунное заболевание или состояние. В некоторых воплощениях заболевание или состояние выбрано из группы, состоящей из ревматоидного артрита, астмы, хронической обструктивной болезни легких, аллергической реакции, рассеянного склероза, миелоидного лейкоза, атеросклероза.
Кроме того, предложены фармацевтические композиции, наборы и изделия производства, содержащие любое из антител к GM-CSFRa, описанных выше.
Краткое описание графических материалов
На фиг. 1А-1С показана аффинность связывания типичных антител к GM-CSFRa с GM-CSFRa человека, что проанализировано посредством ELISA (иммуноферментный твердофазный анализ). На фиг. 1А показаны кривые связывания Т119, Е9, Е16, Е27, Е29, Е30, Е35, Е36, Е54 и Е34 с GM-CSFRa человека. На фиг. 1В показаны кривые связывания Т119, Е108, Е105, Е113, Е87, Е85, Е39, Е40, EII55, Е200а и EII81 с GM-CSFRa человека. На фиг. 1С показаны кривые связывания Т119, Е61, Е83, Е88, Е90, Е84, Е172, Е164, Е1 и Е31 с GM-CSFRa человека.
На фиг. 2 показана аффинность связывания Е35, Е200а, Т119, Е87 и Е108 с GM-CSFRa яванского макака, что проанализировано посредством ELISA.
На фиг. 3 показана аффинность связывания Е35, Е87 и Е108 с рецептором интерлейкина 3, тип A (IL3RA), рецептором интерлейкина 5, тип A (IL5RA) и G-CSFR (рецептор гранулоцитарного колониестимулирующего фактора) в сравнении с GM-CSFRa.
На фиг. 4 показана аффинность связывания E35-IgG4 с клетками WIL2S, экспрессирующими GMCSFRa, в сравнении с контрольными клетками WIL2S, которые не экспрессируют GM-CSFRa, что проанализировано методом сортировки флуоресцентно-активированных клеток (FACS).
На фиг. 5A-5D показаны результаты анализа конкурентного связывания в отношении способности исходного антитела Т119 и антител, оптимизированных как соединения-лидеры, конкурировать с GMCSF за связывание с GM-CSFRa, по результатам измерений с использованием конкурентного ELISA. На фиг. 5А показаны результаты анализа конкурентного связывания для Т119, Е01, Е09, Е194, Е27, Е29,
- 4 048006
Е34, Е35, Е40 и Е30. На фиг. 5В показаны результаты анализа конкурентного связывания для Т119, Е83, Е87, EII81, Е85, Е54, EII55, Е31, Е105 и Е84. На фиг. 5С показаны результаты анализа конкурентного связывания для Т119, Е164, Е172, Е108, Е16, Е36, Е61, Е88 и Е39. На фиг. 5D показаны результаты анализа конкурентного связывания для Т119, Е90, EII33, Е200а, Е94, Е113 и EII52.
На фиг. 6А и 6В показаны температурные профили плавления и температурные профили агрегации антител к GM-CSFRa Mab-IgG1, T119-IgG1, E35-IgG1 и E35b-IgG1, анализ которых выполнен с использованием платформы UNcle. На фиг. 6А показаны температурные профили плавления этих антител. На фиг. 6В показаны температурные профили агрегации этих антител.
На фиг. 7 показаны результаты анализа пролиферации TF-1 клеток в случае исходного антитела Т119 и оптимизированных как соединения-лидеры антител.
На фиг. 8 показаны результаты анализа изменения формы гранулоцитов человека в случае Е35, Е108 и Е87Ь.
На фиг. 9 показаны результаты анализа изменения формы гранулоцитов яванского макака в случае Е35.
На фиг. 10 показаны результаты анализа жизнеспособности гранулоцитов в случае Е35, Е108 и Е87Ь.
На фиг. 11 показаны результаты анализа экспрессии кластера дифференцировки 11b (CD 11b) в случае Е35 и Е87Ь по сравнению с Mab.
На фиг. 12А и 12В показаны результаты анализов высвобождения фактора а некроза опухоли (TNFa) в случае Е35 и Е87Ь по сравнению с Mab. На фиг. 12А показаны результаты анализа высвобождения TNFa в случае Е35 и Е87Ь по сравнению с Mab по результатам измерений с использованием панели макрофагов/микроглий человека. На фиг. 12В показаны результаты анализа высвобождения TNFa в случае Е35 и Е87Ь по сравнению с Mab по результатам измерений посредством ELISA.
На фиг. 13 показаны результаты анализа продуцирования интерлейкина 1β (ΓΓ-1β) в случае Е35 и Е87Ь по сравнению с Mab.
На фиг. 14А и 14В показаны результаты фармакокинетического анализа Mab и Е35 на крысах по результатам измерений посредством ELISA. На фиг. 14А показаны концентрации антител Mab и Е35 в сыворотке крови после внутривенной инъекции соответствующих антител в дозе 2 мг/кг. На фиг. 14В показаны фармакокинетические параметры для Mab и Е35 после внутривенной инъекции соответствующих антител в дозе 20 мг/кг.
На фиг. 15 показаны результаты фармакокинетического анализа Mab и Е35 на яванских макаках по результатам измерений посредством ELISA.
На фиг. 16A-D показаны полученные с использованием FACS диаграммы анализа изменения формы гранулоцитов in vivo после введения Mab-IgG4 или E35-^G4 яванским макакам. На фиг. 16А показаны полученные с использованием FACS диаграммы для гранулоцитов до введения антител. На фиг. 16В показаны полученные с использованием FACS диаграммы для гранулоцитов через 14 суток после введения антител. На фиг. 16С показаны полученные с использованием FACS диаграммы для гранулоцитов через 21 сутки после введения антител. На фиг. 16D показаны результаты анализа изменения формы гранулоцитов in vivo от момента до введения антитела до 21 суток включительно после введения антител.
На фиг. 17A-17G показаны результаты ингибирующего действия E35-IgG4 на GM-CSFиндуцированное повышение уровня воспалительных клеток. На фиг. 17А показаны результаты ингибирующего действия E35-IgG4 на GM-CSF-индуцированное повышение уровня лейкоцитов. На фиг. 17В показаны результаты ингибирующего действия E35-IgG4 на GM-CSF-индуцированное повышение уровня нейтрофилов. На фиг. 17С показаны результаты ингибирующего действия Е35-[gG4 на GM-CSFиндуцированное повышение уровня лимфоцитов. На фиг. 17D показаны результаты ингибирующего действия E35-IgG4 на GM-CSF-индуцированное повышение уровня базофилов. На фиг. 17Е показаны результаты ингибирующего действия E35-IgG4 на GM-CSF-индуцированное повышение уровня эозинофилов. На фиг. 17F показаны результаты ингибирующего действия F35-IgG4 на GM-CSFиндуцированное повышение уровня моноцитов. На фиг. 17G показаны результаты ингибирующего действия E35-IgG4 на GM-CSF-индуцированное повышение уровня эритроцитов.
На фиг. 18А-18С показана аффинность связывания E35-IgG4, E87b-IgG4 и T119-IgG4 с GMRah дикого типа и GMRah с мутациями в типичных аминокислотных остатках по результатам измерений посредством ELISA. На фиг. 18А показана аффинность связывания E35-IgG4 с GMRah дикого типа и с содержащим мутации GMRah. На фиг. 18В показана аффинность связывания E87b-IgG4 с GMRah дикого типа и с содержащим мутации GMRah. На фиг. 18С показана аффинность связывания Т119-IgG4 с GMRah дикого типа и с содержащим мутации GMRah.
На фиг. 19А-19В показаны результаты выравнивания последовательностей для последовательностей вариабельных доменов антител к GM-CSFRa. Указаны определяющие комплементарность участки. На фиг. 19А показаны результаты выравнивания последовательностей для последовательностей вариабельных доменов тяжелой цепи. На фиг. 19В показаны результаты выравнивания последовательностей для последовательностей вариабельных доменов легкой цепи.
- 5 048006
На фиг. 20 показана нумерация остатков аминокислот 16-296 в GM-CSFRa.
Подробное описание изобретения
Согласно одному из аспектов настоящего изобретения предложены антитела к GM-CSFRa. Применяя сочетание селекции с использованием фаговых библиотек для scFv, созревания аффинности и соответствующим образом разработанных биохимических и биологических анализов, авторы изобретения идентифицировали высокоэффективные молекулы антител, которые связываются с GM-CSFRa человека и ингибируют действие GM-CSF человека на свой рецептор. Результаты, представленные в данном описании, указывают на то, что предложенные авторами изобретения антитела связываются с другим участком или эпитопом GM-CSFRa по сравнению с известным антителом к GM-CSFRa маврилимумабом, и неожиданным образом оказываются еще более эффективными, чем маврилимумаб, что продемонстрировано в ряде биологических анализов.
Антитела к GM-CSFRa, предложенные согласно настоящему изобретению, включают, например, полноразмерные антитела к GM-CSFRa, антитела к GM-CSFRa в формате scFv, антитела к GM-CSFRa в формате Fc-слитых белков, мультиспецифичные (например, биспецифичные) антитела к GM-CSFRa, иммуноконъюгаты на основе антитела к GM-CSFRa и тому подобное.
Согласно одному из аспектов предложены антитела к GM-CSFRa, которые специфично связываются с эпитопом на GM-CSFRa человека, при этом данный эпитоп содержит аминокислотные остатки Val50, Glu59, Lys194, Lys195, Arg283 и Ile284 из GM-CSFRa человека.
Согласно другому аспекту предложено антитело к GM-CSFRa, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи (VH), содержащий HC-CDR1, содержащий Х1Х2Х3Н (SEQ ID NO: 76), где Х1 представляет собой Е, N, G, D, M, S, P, F, Y, А, V, K, W, R или С, Х2 представляет собой S, С или Р, и Х3 представляет собой I или М; HC-CDR2, содержащий GFDX1X2X3X4EX5X6YAQKX7QG (SEQ ID NO: 77), где Х1 представляет собой P, G, T, S или V, X2 представляет собой E, D, G или А, Х3 представляет собой D, G, I, W, S или V, X4 представляет собой G, E, D или Н, Х5 представляет собой Т или А, Х6 представляет собой N или I, и Х7 представляет собой S или F; и HC-CDR3, содержащий GRYX1X2X3X4X5X6YGFDY (SEQ ID NO: 78), где Х1 представляет собой C, Т, S, I, А или V, Х2 представляет собой S, G, E, F, W, Н, I, V, N, Y, Т или R, Х3 представляет собой Т, Н, L, F, P, I, S, Y, K, A, D, V, N или G, Х4 представляет собой D, A, M, Y, F, S, T, G или W, Х5 представляет собой Т, S, F, Q, A, N, L, E, I, G или М, и Х6 представляет собой С, Т, N, S или А; и вариабельный домен легкой цепи (VL), содержащий LC-CDR1, содержащий RAX1X2X3VX4X5X6LA (SEQ ID NO: 293), где Х1 представляет собой S, L, N, А, K, R, I, Q, G, Т, Н, М или С, Х2 представляет собой Q, Y, P, A, I, F, T, R, V, L, E, S или С, Х3 представляет собой S, H, W, L, R, K, Т, Р, I, F, V, Е, А или Q, Х4 представляет собой S, L, W, M, A, Y, K, R, G, Т, Е, V, N, F или С, Х5 представляет собой S, T, R, A, H, Q, P, M, L или G, и Х6 представляет собой Y, L или F; LC-CDR2, содержащий X1X2X3S RAT (SEQ ID NO: 294), где Х1 представляет собой G или Т, Х2 представляет собой A, G, R, Н, K, S, Т, М или F, и Х3 представляет собой S, A, W, R, L, T, Q, F, Y, Н или N; и LC-CDR3, содержащий QQYX1X2X3PX4T (SEQ ID NO: 79), где Х1 представляет собой N, D, S, R, A, T, L, Y, Q, W или G, Х2 представляет собой N, D, E, T, Y, G, A, M, F, S, I или L, Х3 представляет собой W, S, Р, V, G или R, и Х4 представляет собой Р, Y, H, S, F, N, D, V или G.
Кроме того, предложены нуклеиновые кислоты, кодирующие антитела к GM-CSFRa, композиции, содержащие антитела к GM-CSFRa, и способы получения и применения антител к GM-CSFRa.
Определения.
Использованный в данном описании термин лечение или подвергание лечению относится подходу для получения благоприятных или желаемых результатов, в том числе клинических результатов. С точки зрения задач этой заявки благоприятные или желаемые клинические результаты включают, но не ограничиваются этим, один или более чем один результат из следующих: ослабление одного или более симптомов, обусловленных заболеванием, снижение степени заболевания, стабилизация заболевания (например, предотвращение или замедление ухудшения заболевания), предупреждение или задержка распространения (например, метастазирования) заболевания, предупреждение или задержка рецидива заболевания, задержка или замедление прогрессирования заболевания, уменьшение интенсивности симптомов болезненного состояния, обеспечение ремиссии (частичной или полной) заболевания, снижение дозы одного или более чем одного другого лекарственного средства, необходимого для лечения заболевания, для замедления прогрессирования заболевания, повышения или улучшения качества жизни, повышения прироста массы и/или продления выживаемости. Термином лечение также охватывается уменьшение патологического последствия заболевания (такого как, например, объем опухоли в случае рака). Способы по данной заявке предусматривают какой-либо один или более чем один из этих аспектов лечения.
Термин антитело включает в себя полноразмерные антитела и их антигенсвязывающие фрагменты. Полноразмерное антитело содержит две тяжелые цепи и две легкие цепи. Вариабельные области легких или тяжелых цепей отвечают за связывание с антигеном. Вариабельные области в обеих цепях обычно содержат три высоко вариабельные петли, называемые определяющими комплементарность участками (CDR) (CDR легкой цепи (LC), включая LC-CDR1, LC-CDR2 и LC-CDR3, CDR тяжелой цепи (НС),
- 6 048006 включая HC-CDR1, HC-CDR2 и HC-CDR3). Границы CDR для антител и антигенсвязывающих фрагментов, описанных в данном документе, могут быть определены или идентифицированы в соответствии с правилами Kabat, Chothia или Al-Lazikani (Al-Lazikani, 1997; Chothia, 1985; Chothia, 1987; Chothia, 1989; Kabat, 1987; Kabat, 1991). Эти три CDR тяжелой или легкой цепей расположены между фланкирующими участками, известными как каркасные области (FR), которые характеризуются более высокой консервативностью, чем CDR, и образуют каркас для поддержки гипервариабельных петель. Константные области тяжелых и легких путей не участвуют в связывании с антигеном, но проявляют различные эффекторные функции. Антитела обозначают согласно классам на основе аминокислотной последовательности константной области своей тяжелой цепи. Существуют пять основных классов или изотипов антител IgA, IgD, IgE, IgG и IgM, которые характеризуются наличием тяжелых цепей α, δ, ε, γ и μ, соответственно. Некоторые из этих основных классов антител подразделяются на подклассы, такие как IgG1 (тяжелая цепь γ1), IgG2 (тяжелая цепь γ2), IgG3 (тяжелая цепь γ3), IgG4 (тяжелая цепь γ4), 11 gA1 (тяжелая цепь а1) или 11 gA2 (тяжелая цепь α2).
Использованный в данном описании термин антигенсвязывающий фрагмент относится к фрагменту антитела, включая, например, диатело, Fab, Fab', F(ab')2, Fv фрагмент, стабилизированный дисульфидными связями Fv фрагмент (dsFv), (dsFv)2, биспецифичный dsFv (dsFv-dsFv'), стабилизированное дисульфидными связями диатело (ds диатело), одноцепочечный Fv (scFv), scFv димер (бивалентное диатело), мультиспецифичное антитело, образованное из части антитела, содержащее один или более CDR, однодоменное антитело, наноантитело, доменное антитело, бивалентное доменное антитело или любой другой фрагмент антитела, который связывается с антигеном, но по своей структуре не является полноразмерным антителом. Антигенсвязывающий фрагмент обладает способностью связываться с тем же антигеном, с которым связывается исходное антитело или фрагмент исходного антитела (например, исходный scFv). В некоторых воплощениях антигенсвязывающий фрагмент может содержать один или более чем один CDR из конкретного человеческого антитела, привитый к каркасной области из одного или более чем одного другого человеческого антитела.
Термин эпитоп, использованный в данном описании, относится к специфической группе атомов или аминокислот в антигене, с которой связывается антитело или группировка антитела. Два антитела или две группировки антитела могут связываться с одним и тем же эпитопом в антигене, если они демонстрируют конкурентное связывание с данным антигеном.
Как использовано в данном описании, первое антитело конкурирует со вторым антителом за связывание с целевым GM-CSFRa, когда первое антитело ингибирует связывание второго антитела с целевым GM-CSFRa по меньшей мере примерно на 50% (как например, по меньшей мере приблизительно на любое значение из 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% или 99%) в присутствии первого антитела в эквимолярной концентрации или наоборот. Высокопроизводительный способ биннинга антител, основанный на их перекрестной конкуренции, описан в публикации РСТ № WO 03/48731.
Использованный в данном описании термин специфично связывается, специфично распознающий или является специфичным к относится к подлежащим измерению и воспроизводимым взаимодействиям, таким как связывание между мишенью и антителом, по которому можно определить наличие этой мишени в присутствии гетерогенной популяции молекул, в том числе биологических молекул. Например, антитело, специфично распознающее мишень (которой может быть эпитоп), представляет собой антитело, которое связывается с этой мишенью с более высокой аффинностью, авидностью, с большей легкостью и/или большей продолжительностью, чем в случае его связывания с другими мишенями. В некоторых воплощениях антитело, которое специфично распознает антиген, взаимодействует с одной или несколькими антигенными детерминантами антигена с аффинностью связывания, которая по меньшей мере примерно в 10 раз превышает его аффинность связывания с другими мишенями.
Термин выделенное антитело к GM-CSFRa, использованный в данном описании, означает антитело к GM-CSFRa, которое (1) не ассоциировано с белками, обнаруженными в природе, (2) не содержит других белков из того же источника, (3) экспрессируется клеткой другого вида или (4) не существует в природе.
Подразумевается, что использованный в данном описании термин выделенная нуклеиновая кислота, означает геномную нуклеиновую кислоту, кДНК или нуклеиновую кислоту синтетического происхождения либо некоторую их комбинацию, которая в силу своего происхождения как выделенная нуклеиновая кислота (1) не ассоциирована со всем полинуклеотидом, или его частью, в котором выделенная нуклеиновая кислота встречается в природе, (2) функционально связана с полинуклеотидом, с которым она не соединена в природе, или (3) не существует в природе в виде части более длинной последовательности.
Подразумевается, что использованный в данном описании термин CDR или определяющий комплементарность участок, означает несмежные связывающие антиген сайты, обнаруживаемые в пределах вариабельной области полипептидов обеих тяжелой и легкой цепей. Эти особые участки описаны в Kabat et al., J. Biol. Chem., 252: 6609-6616 (1977); Kabat et al., U.S. Dept. of Health and Human Services, Sequences of proteins of immunological interest (1991); Chothia et al., J. Mol. Biol., 196: 901-917 (1987); Al
- 7 048006
Lazikani B. et al., J. Mol. Biol., 273: 927-948 (1997); MacCallum et al., J. Mol. Biol., 262: 732-745 (1996); Abhinandan and Martin, Mol. Immunol., 45: 3832-3839 (2008); Lefranc M.P. et al., Dev. Сотр. Immunol., 27: 5577 (2003); и Honegger and Pluckthun, J. Mol. Biol., 309: 657-670 (2001), при этом в случае сравнения относительно друг друга данные определения включают перекрывающиеся аминокислотные остатки или их подмножества. Тем не менее подразумевается, что применение любого определения для обозначения CDR антитела или привитых антител либо их вариантов находится в объеме данного термина, как он определен и используется в данном описании. Аминокислотные остатки, которые входят в состав CDR, определенных в процитированных выше ссылках, приведены ниже в табл. 1 в качестве сравнения. Алгоритмы для предсказания CDR и их границы известны в данной области техники, включая, например, Abhinandan and Martin, Mol. Immunol., 45: 3832-3839 (2008); Ehrenmann F. et al., Nucleic Acids Res., 38: D301-D307 (2010); и Adolf-Bryfogle J. et al., Nucleic Acids Res., 43: D432-D438 (2015). Содержание ссылок, процитированных в этом абзаце, включено в данное описание посредством ссылки во всей своей полноте для применения в настоящей заявке и для возможного включения в один или более пунктов формулы данного изобретения.
Таблица 1
Определения cdr
| Kabat1 | Chothia2 | MacCallum3 | IMGT4 | AHo5 | |
| VH CDR1 | 31-35 | 26-32 | 30-35 | 27-38 | 25-40 |
| VH CDR2 | 50-65 | 53-55 | 47-58 | 56-65 | 58-77 |
| VH CDR3 | 95-102 | 96-101 | 93-101 | 105-117 | 109-137 |
| VlCDR1 | 24-34 | 26-32 | 30-36 | 27-38 | 25-40 |
| VL CDR2 | 50-56 | 50-52 | 46-55 | 56-65 | 58-77 |
| VL CDR3 | 89-97 | 91-96 | 89-96 | 105-117 | 109-137 |
1Нумерация остатков соответствует номенклатуре по Kabat и др., выше.
^Нумерация остатков соответствует номенклатуре по Chothia и др., выше.
3Нумерация остатков соответствует номенклатуре по MacCallum и др., выше.
4Нумерация остатков соответствует номенклатуре по Lefranc и др., выше (IMGT означает базу данных по иммуногенетике).
5Нумерация остатков соответствует номенклатуре по Honegger и Pluckthun, выше.
Термин химерные антитела относится к антителам, в которых часть тяжелой и/или легкой цепи идентична соответствующим последовательностям или гомологична им в антителах, происходящих из определенного вида либо принадлежащих к определенному классу или подклассу антител, в то время как остальная часть цепи(ей) идентична соответствующим последовательностям или гомологична им в антителах, происходящих из другого вида либо принадлежащих к другому классу или подклассу антител, а также к фрагментам таких антител, при условии, что они проявляют биологическую активность согласно этой заявке (см. патент США № 4816567; и Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81: 6851-6855 (1984)).
Fv представляет собой минимальный фрагмент антитела, который содержит полный сайт распознавания и связывания антигена. Этот фрагмент представляет собой димер, состоящий из одного домена вариабельной области тяжелой цепи и одного домена вариабельной области легкой цепи, находящихся в тесной нековалентной ассоциации. В результате фолдинга этих двух доменов образуются шесть гипервариабельных петель (по 3 петли на каждую из тяжелой и легкой цепи), которые обеспечивают наличие аминокислотных остатков для связывания с антигеном и придают этому антителу специфичность связывания с антигеном. Однако, способностью распознавать антиген и связываться с ним обладает даже единичный вариабельный домен (или половина Fv, содержащая только три CDR, специфичные к антигену), хотя и с более низкой аффинностью, чем полный сайт связывания.
Одноцепочечные Fv, также сокращенно обозначаемые как sFv или scFv, представляют собой фрагменты антител, которые содержат VH и VL домены антитела, соединенные с образованием единой полипептидной цепи. В некоторых воплощениях полипептид scFv дополнительно содержит полипептидный линкер между VH и VL доменами, который дает возможность scFv образовывать желаемую структуру для связывания с антигеном. Для обзора по scFv см. Pluckthun в The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds., Springer-Verlag, New York, pp. 269-315 (1994).
Термин диатела относится к небольшим фрагментам антител, получаемым путем конструирования scFv фрагментов (см. предыдущий абзац), обычно с использованием коротких линкеров (как например, от приблизительно 5 до приблизительно 10 остатков) между VH и VL доменами, в результате чего осуществляется межцепочечное, а не внутрицепочечное спаривание V доменов, приводящее к получению бивалентного фрагмента, т.е. фрагмента, имеющего два антиген-связывающих сайта. Биспецифичные диатела представляют собой гетеродимеры, состоящие из двух перекрещивающихся scFv фрагментов, при этом VH и VL домены этих двух антител находятся на разных полипептидных цепях. Диатела более полно описаны, например, в ЕР 404097; WO 93/11161; и Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90: 6444-6448 (1993).
- 8 048006
Гуманизированные формы антител, не являющихся человеческими (например, грызунов), представляют собой химерные антитела, которые содержат минимальную последовательность, происходящую из антитела, не являющегося человеческим. По большей части гуманизированные антитела представляет собой иммуноглобулины человека (реципиентное антитело), при этом остатки гипервариабельного участка (HVR) реципиентного антитела заменены на остатки гипервариабельного участка антител (донорного антитела) вида, не относящегося к человеку, такого как мышь, крыса, кролик или не являющийся человеком примат, имеющие желаемую специфичность, аффинность и функциональные возможности антитела. В некоторых случаях, остатки каркасной области (FR) иммуноглобулина человека заменены на соответствующие остатки антитела, не являющегося человеческими. Кроме того, гуманизированные антитела могут содержать остатки, которых нет в реципиентном антителе или в донорном антителе. Эти модификации делаются с целью дальнейшего улучшения характеристик антител. В общем случае, гуманизированное антитело будет содержать по существу все вариабельные домены, выбранные из по меньшей мере одного и обычно двух вариабельных доменов, в которых все или по существу все из гипервариабельных петель соответствуют таковым из иммуноглобулина, не являющегося человеческим, и все или по существу все FR представляют собой области с последовательностью иммуноглобулина человека. Гуманизированное антитело возможно также будет содержать по меньшей мере часть константной области (Fc) иммуноглобулина, обычно иммуноглобулина человека. Для получения дополнительных сведений см. Jones et al, Nature, 321: 522-525 (1986); Riechmann et al., Nature, 332: 323-329 (1988); и Presta, Curr. Op. Struct. Biol., 2: 593-596 (1992).
Процент (%) идентичности аминокислотной последовательности или процент гомологии по отношению к последовательностям полипептида и антитела, идентифицированным в данной заявке, определяют как процентную долю аминокислотных остатков в последовательности-кандидате, которые идентичны аминокислотным остаткам в подлежащем сравнению полипептиде после выравнивания последовательностей с учетом любых консервативных замен как части идентичности последовательностей. Выравнивание с целью определения процента идентичности аминокислотных последовательностей можно выполнить различными способами, которые находятся в пределах компетентности специалиста в данной области техники, например, используя такое общедоступное компьютерное программное обеспечение, как программное обеспечение BLAST (средство поиска основного локального выравнивания), BLAST-2, ALIGN, Megalign (DNASTAR) или MUSCLE. Специалисты в данной области техники могут определить соответствующие параметры для оценки выравнивания, включая любые алгоритмы, необходимые для достижения максимального выравнивания по всей длине сравниваемых последовательностей. Однако же, для целей данного изобретения значения % идентичности аминокислотных последовательностей получают, используя для сравнения последовательностей компьютерную программу MUSCLE (Edgar, R.C., Nucleic Acids Research, 32(5): 1792-1797, 2004; Edgar, R.C., BMC Bioinformatics, 5(1): 113, 2004).
Термины Fc-рецептор или FcR используют для описания рецептора, который связывается с Fcобластью антитела. В некоторых воплощениях FcR по этой заявке представляет собой рецептор, который связывается с антителом IgG-типа, (рецептор γ) и включает рецепторы подклассов FcyRI, FcyRII и FcyRIII, в том числе аллельные варианты и формы этих рецепторов с альтернативным сплайсингом. Рецепторы FcyRII включают FcyRIIA (активирующий рецептор) и FcyRIIB (ингибирующий рецептор), имеющие схожие аминокислотные последовательности, которые различаются главным образом своими цитоплазматическими доменами. Активирующий рецептор FcyRIIA содержит иммунорецепторный тирозиновый активирующий мотив (ITAM) в своем цитоплазматическом домене. Ингибирующий рецептор FcyRIIB содержит иммунорецепторный тирозиновый ингибирующий мотив (ITIM) в своем цитоплазматическом домене (см. обзор в М. Daeron, Annu. Rev. Immunol., 15: 203-234 (1997)). Этот термин включает в себя аллотипы, такие как аллотипы FcyRIIIA: FcYRIIIA-Phe158, FcYRIIIA-Val158, FcyRIIA-R131 и/или FcyRIIA-H131. Обзор по FcR приведен в Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol., 9: 457-92 (1991); Capel et al., Immunomethods, 4: 25-34 (1994); и de Haas et ai, J. Lab. Clin. Med., 126: 330-41 (1995). Другие FcR, включая те, которые будут идентифицированы в будущем, охватываются приведенным в данном описании термином FcR. Этот термин также включает в себя неонатальный рецептор, FcRn, который отвечает за перенос материнских IgG к плоду (Guyer et al, J. Immunol., 117: 587 (1976) и Kim et al., J. Immunol., 24: 249 (1994)).
Термин FcRn относится к неонатальному Fc-рецептору (FcRn). По своей структуре FcRn сходен с главным комплексом гистосовместимости (МНС) и состоит из а-цепи, нековалентно связанной с β2микроглобулином. Многочисленные функции неонатального Fc-рецептора, FcRn, приведены в обзоре Ghetie and Ward (2000), Annu. Rev. Immunol., 18, 739-766. FcRn принимает участие в пассивной доставке иммуноглобулинов IgG-типа от матери к детенышу и в регуляции уровней IgG в сыворотке крови. FcRn может действовать в качестве рецептора реутилизации, связывая и транспортируя пиноцитированные IgG в интактной форме как внутри клетки, так и между клетками, и спасая их от стандартного пути деградации.
СН1 домен Fc-области IgG человека (также обозначаемый как домен С1 в Н1) обычно простирается от примерно 118-й аминокислоты до примерно 215-й аминокислоты (согласно системе нуме
- 9 048006 рации EU).
Шарнирную область обычно определяют как простирающуюся от Glu216 до Pro230 в IgG1 человека (Burton, Molec. Immunol., 22: 161-206 (1985)). Можно провести выравнивание шарнирных областей IgG других изотипов с последовательностью IgG1 путем размещения первого и последнего остатков цистеина, образующих S-S связи между тяжелыми цепями, в одинаковых положениях.
СН2 домен Fc-области IgG человека (также обозначаемый как домен С2 в Н2) обычно простирается от примерно 231-й аминокислоты до примерно 340-й аминокислоты. Уникальность СН2 домена заключается в том, что он не образует близко расположенную пару с другим доменом. Точнее, между двумя СН2 доменами интактной нативной молекулы IgG расположены две N-связанные разветвленные углеводные цепи. Высказано предположение, что наличие этих углеводных цепей может обеспечить спаривание доменов и помочь стабилизации СН2 домена. Burton, Molec. Immunol., 22: 161-206 (1985).
CH3 домен (также обозначаемый как домен С3 в Н3) содержит отрезок, состоящий из Сконцевых остатков по отношению к СН2 домену в Fc-области (т.е. примерно от аминокислотного остатка 341 до С-конца последовательности антитела, обычно аминокислотного остатка 446 или 447 в IgG).
Функциональный Fc фрагмент обладает эффекторной функцией Fc-области, имеющей нативную последовательность. Типичные эффекторные функции включают связывание с первым компонентом системы комплемента (C1q); комплементзависимую цитотоксичность (CDC); связывание с Fcрецепторами; антителозависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность (ADCC); фагоцитоз; отрицательную регуляцию рецепторов клеточной поверхности (например, В-клеточного рецептора; BCR) и так далее. Как правило, для осуществления таких эффекторных функций необходимо объединение Fcобласти со связывающим доменом (например, вариабельным доменом антитела), и это можно оценить с использованием различных анализов, известных в данной области техники.
Антитело, имеющее вариант Fc-области IgG с измененной аффинностью связывания с FcR или ADCC активностью, представляет собой антитело, которое обладает либо улучшенной, либо ослабленной активностью связывания с FcR (например, FcyR или FcRn) и/или ADCC активностью по сравнению с исходным полипептидом или с полипептидом, содержащим Fc-область с нативной последовательностью. Вариант Fc, который демонстрирует более сильное связывание с FcR, связывается по меньшей мере с одним FcR с более высокой аффинностью (например, с более низким кажущимся значением Kd или IC50 (концентрация, вызывающая 50%-ное ингибирование)), чем исходный полипептид или Fc-область IgG с нативной последовательностью. Согласно некоторым воплощениям, по сравнению с исходным полипептидом связывание улучшается примерно в 3 раза, как например, приблизительно в любое число раз из 5, 10, 25, 50, 60, 100, 150, 200 или 500 раз включительно, или улучшение в связывании составляет приблизительно от 25% до 1000%. Вариант полипептида, который демонстрирует более низкое связывание с FcR, связывается по меньшей мере с одним FcR с более низкой аффинностью (например, с более высоким кажущимся значением Kd или более высоким значением IC50), чем исходный полипептид.
Уменьшение в связывании по сравнению с исходным полипептидом может составлять уменьшение в связывании примерно на 40% или больше.
Антителозависимая клеточно-опосредованная цитотоксичность или ADCC означает форму цитотоксичности, при которой секретируемый Ig связывается с Fc-рецепторами (FcR), присутствующими на определенных цитотоксических клетках (например, природных киллерных (NK) клетках, нейтрофилах и макрофагах), давая возможность этим цитотоксическим эффекторным клеткам специфически связываться с антиген-несущей клеткой-мишенью и впоследствии уничтожать эту клетку-мишень с использованием цитотоксинов. Антитела вооружают цитотоксические клетки и необходимы для такого уничтожения. Первичные клетки, опосредующие ADCC, NK клетки, экспрессируют только FcyRIII, в то время как моноциты экспрессируют FcyRI, FcyRII и FcyRIII. Информация по экспрессии FcR на гемопоэтических клетках суммирована в табл. 3 на странице 464 в Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol., 9: 457-92 (1991). Чтобы оценить ADCC активность представляющей интерес молекулы, можно выполнить анализ ADCC in vitro, как например анализ, описанный в патенте США № 5500362 или 5821337. Полезные для таких анализов эффекторные клетки включают мононуклеарные клетки периферической крови (РВМС) и природные киллерные (NK) клетки. Альтернативно или помимо этого, ADCC-активность молекулы, представляющей интерес, можно оценить in vivo, например, в такой животной модели, которая описана в Clynes et al. PNAS (USA), 95:652-656(1998).
Полипептид, содержащий вариант Fc-области, который демонстрирует более высокую ADCC или опосредует ADCC в присутствии эффекторных клеток человека более эффективно, чем полипептид, имеющий Fc-область IgG дикого типа, или исходный полипептид, представляет собой полипептид, который проявляет существенно более высокую эффективность в опосредовании ADCC in vitro или in vivo, если количества полипептида с таким вариантом Fc-области и полипептида с Fc-областью дикого типа (или исходного полипептида) в данном анализе по существу одинаковые. Как правило, такие варианты будут идентифицированы с использованием любого анализа ADCC in vitro, известного в данной области техники, такого как анализы или методы определения ADCC активности, например, в животной модели, и так далее. В некоторых воплощениях вариант демонстрирует более высокую эффективность в опосре
- 10 048006 довании ADCC, чем Fc-область дикого типа (или исходный полипептид), с превышением от примерно в 5 раз до примерно 100 раз, например, от примерно 25 до примерно 50 раз.
Комплементзависимая цитотоксичность или CDC означает лизис клетки-мишени в присутствии системы комплемента. Активация системы комплемента по классическому пути инициируется посредством связывания первого компонента системы комплемента (C1q) с антителами (соответствующего подкласса), которые связаны с распознаваемым ими антигеном. Чтобы оценить активацию системы комплемента, можно провести анализ CDC, например, который описан в Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods, 202: 163 (1996). Варианты полипептидов с измененными аминокислотными последовательностями Fc-области и повышенной или пониженной способностью связывать C1q описаны в патенте США № 6194551В1 и в заявке WO99/51642. Содержания этих патентных публикаций специально включены в данное описание посредством ссылки. Также см. Idusogie et al. J. Immunol., 164: 4178-4184 (2000).
Если не указано иное, термин нуклеотидная последовательность, кодирующая аминокислотную последовательность охватывает все нуклеотидные последовательности, которые представляют собой вырожденные версии друг друга и которые кодируют одну и ту же аминокислотную последовательность. Нуклеотидная последовательность, которая кодирует белок, или РНК также может подразумевать наличие интронов в той степени, в которой данная нуклеотидная последовательность, кодирующая белок, может в некоторой версии содержать интрон(ы).
Термин функционально связанный относится к функциональной связи между регуляторной последовательностью и гетерологичной нуклеиновокислотной последовательностью, приводящей к экспрессии последней. Например, первая нуклеиновокислотная последовательность функционально связана со второй нуклеиновокислотной последовательностью, если первая нуклеиновокислотная последовательность находится в функциональной взаимосвязи со второй нуклеиновокислотной последовательностью. Например, промотор функционально связан с кодирующей последовательностью, если этот промотор воздействует на транскрипцию или экспрессию этой кодирующей последовательности. Как правило, функционально связанные последовательности ДНК являются смежными и, если необходимо соединить области, кодирующие два белка, то находятся в одной и той же рамке считывания.
Термин гомологичные относится к сходству или идентичности последовательностей между двумя полипептидами или между двумя молекулами нуклеиновой кислоты. Когда какое-либо положение в обеих из двух сравниваемых последовательностей занято одним и тем же основанием или одной и той же мономерной аминокислотной субъединицей, например, если положение в каждой из двух молекул ДНК занято аденином, тогда молекулы являются гомологичными по этому положению. Процент гомологии между двумя последовательностями является функцией от количества совпадающих или гомологичных положений, общих для двух данных последовательностей, деленного на количество сравниваемых положений, умноженного на 100. Например, если 6 из 10 положений в двух последовательностях совпадают или гомологичны, то эти две последовательности гомологичны на 60%. В качестве примера, последовательности ДНК ATTGCC и TATGGC обладают 50%-ной гомологией. Как правило, сравнение проводят, когда две последовательности выравнены для получения максимальной гомологии.
Эффективное количество антитела к GM-CSFRa или композиции, которые описаны в данной заявке, представляет собой количество, достаточное для выполнения конкретно заявленной цели. Эффективное количество может быть определено эмпирически и известными методами, относящимися к заявленной цели.
Термин терапевтически эффективное количество относится к количеству антитела к GM-CSFRa или композиции, которые описаны в данной заявке, эффективному в отношении лечения заболевания или расстройства у индивида. В случае рака терапевтически эффективное количество антитела к GMCSFRa или композиции, которые описаны в данном изобретении, может снижать количество раковых клеток; уменьшать размер или массу опухоли; подавлять (т.е. замедлять до некоторой степени и предпочтительно останавливать) инфильтрацию раковых клеток в периферические органы; ингибировать (т.е. замедлять до некоторой степени и предпочтительно останавливать) метастазирование опухоли; подавлять до некоторой степени рост опухоли; и/или ослаблять до некоторой степени один или более симптомов, ассоциированных с раком. В той степени, в которой антитело к GM-CSFRa или композиция, которые описаны в данной заявке, могут предотвращать рост имеющихся раковых клеток и/или уничтожать их, они могут быть цитостатическими и/или цитотоксическими. В некоторых воплощениях терапевтически эффективное количество представляет собой подавляющее рост раковых клеток количество. В некоторых воплощениях терапевтически эффективное количество представляет собой количество, которое увеличивает продолжительность жизни пациента. В некоторых воплощениях терапевтически эффективное количество представляет собой количество, которое увеличивает продолжительность периода без прогрессирования заболевания у пациента.
Как использовано в данном описании, под фармацевтически приемлемым или фармакологически совместимым понимают вещество, которое не является нежелательным с биологической или иной точки зрения, например, вещество, которое может быть включено в фармацевтическую композицию, вводимую пациенту, без вызывания каких-либо значительных нежелательных биологических эффектов или взаи
- 11 048006 модействия неблагоприятным образом с какими-либо другими компонентами композиции, в которой оно содержится. Фармацевтически приемлемые носители или эксципиенты предпочтительно соответствуют требуемым стандартам токсикологических и производственных испытаний и/или включены в Справочник по неактивным ингредиентам, подготовленный Управлением по контролю качества пищевых продуктов и лекарственных средств США.
Очевидно, что воплощения заявки, изложенные в данном описании, включают термины состоящий и/или состоящий по существу из воплощений.
Упоминание в данном описании термина примерно в отношении величины или параметра включает (и описывает) вариации, которые относятся к такой величине или такому параметру как таковому. Например, описание, относящееся к примерно X, включает описание X.
Как использовано в данном описании, упоминание термина не в отношении величины или параметра как правило означает или описывает термин отличающийся от в отношении величины или параметра. Например, фраза способ не применяют для лечения рака типа X означает, что данный способ применяют для лечения типов рака, отличающихся от X.
Использованные в данном описании и в прилагаемой формуле изобретения формы единственного числа включают объекты в форме множественного числа, если контекст ясно не предусматривает иное.
Антитела к GM-CSFRa.
Согласно одному из аспектов настоящего изобретения предложены антитела к GM-CSFRa, которые специфично связываются с GM-CSFRa. Антитела к GM-CSFRa включают, но не ограничиваются этим, гуманизированные антитела, химерные антитела, мышиные антитела, человеческие антитела и антитела, содержащие CDR тяжелой цепи и/или легкой цепи, рассмотренные в данном описании. Согласно одному из аспектов настоящей заявки предложены выделенные антитела, которые связываются с GM-CSFRa. Охваченные изобретением антитела к GM-CSFRa включают, например, полноразмерные антитела к GMCSFRa (например, полноразмерный IgG1 или IgG4), антитела к GM-CSFRa в формате scFv, антитела к GM-CSFRa в формате Fc-слитых белков, мультиспецифичные (такие как биспецифичные) антитела к GM-CSFRa, иммуноконъюгаты на основе антител к GM-CSFRa и тому подобное. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa представляет собой полноразмерное антитело (например, полноразмерный IgG1 или IgG4) или его антигенсвязывающий фрагмент, который специфично связывается с GMCSFRa. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa представляет собой Fab, Fab', F(ab)'2, Fab'-SH, одноцепочечный Fv (scFv), Fv фрагмент, dAb, Fd, нанотело, диатело или линейное антитело. В некоторых воплощениях упоминание антитела, которое специфично связывается с GM-CSFRa, означает, что данное антитело связывается с GM-CSFRa с аффинностью, которая по меньшей мере примерно в 10 раз (в том числе, например, по меньшей мере примерно в любое число раз из 10, 102, 103, 104, 105, 106 или 107) больше, чем его аффинность связывания с не являющимся мишенью объектом. В некоторых воплощениях не являющийся мишенью объект представляет собой антиген, который не является GM-CSFRa. Аффинность связывания можно оценить методами, известными в данном области техники, такими как ELISA, метод сортировки флуоресцентно-активированных клеток (FACS) или радиоиммунопреципитационный анализ (RIA). Значение Kd может быть определено такими известными в данной области техники методами, как метод поверхностного плазмонного резонанса (SPR) или интерферометрия биослоев BLI).
Хотя в данном описании широко обсуждаются антитела к GM-CSFRa, содержащие последовательности из антитела человека (например, последовательности вариабельных доменов тяжелой и легкой цепи из антитела человека, содержащие последовательности CDR из антитела человека), также охвачены антитела к GM-CSFRa, не являющиеся человеческими. В некоторых воплощениях антитела к GMCSFRa, не являющиеся человеческими, содержат CDR последовательности из антитела человека к GMCSFRa, описанного в данной заявке, и каркасные последовательности из антитела, не являющегося человеческим. Каркасные последовательности из антитела, не являющегося человеческим, включают, в некоторых воплощениях, любую последовательность, которую можно использовать для создания синтетических вариабельных доменов тяжелой и/или легкой цепей с применением одной или нескольких последовательностей CDR антитела человека, описанных в данном изобретении, включая, например, таковые из млекопитающих, например, мыши, крысы, кролика, свиньи, крупного рогатого скота (например, коровы, быка, буйвола), оленя, овцы, козы, курицы, кошки, собаки, хорька, примата (например, мартышки, макаки резус) и так далее. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, не являющееся человеческим, включает антитело к GM-CSFRa, созданное путем привития одной или нескольких последовательностей CDR из антитела человека, описанных в данном изобретении, к каркасной последовательности из антитела, не являющегося человеческими (например, каркасной последовательности из антитела мыши или курицы).
Полная аминокислотная последовательность типичного GM-CSFRa человека содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 148 или состоит из нее.
- 12 048006
MLLLVTSLLL CELPHPAFLL IPEKSDLRTV APASSLNVRF DSRTMNLSWD CQENTTFSKC
FLTDKKNRW EPRLSNNECS CTFREICLHE GVTFEVHVNT SQRGFQQKLL YPNSGREGTA
121 AQNFSCFIYN ADLMNCTWAR GPTAPRDVQY FLYIRNSKRR REIRCPYYIQ DSGTHVGCHL
181 DNLSGLTSRN YFLVNGTSRE IGIQFFDSLL DTKKIERFNP PSNVTVRCNT THCLVRWKQP
241 RTYQKLSYLD FQYQLDVHRK NTQPGTENLL INVSGDLENR YNFPSSEPRA KHSVKIRAAD
301 VRILNWSSWS EAIEFGSDDG NLGSVYIYVL LIVGTLVCGI VLGFLFKRFL RIQRLFPPVP
361 QIKDKLNDNH EVEDEIIWEE FTPEEGKGYR EEVLTVKEIT
Аминокислотная последовательность внеклеточного домена типичного GM-CSFRa человека содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 149 или состоит из нее.
MLLLVTSLLL CELPHPAFLL IPEKSDLRTV APASSLNVRF DSRTMNLSWD CQENTTFSKC
FLTDKKNRW EPRLSNNECS CTFREICLHE GVTFEVHVNT SQRGFQQKLL YPNSGREGTA
121 AQNFSCFIYN ADLMNCTWAR GPTAPRDVQY FLYIRNSKRR REIRCPYYIQ DSGTHVGCHL 181 DNLSGLTSRN YFLVNGTSRE IGIQFFDSLL DTKKIERFNP PSNVTVRCNT THCLVRWKQP 241 RTYQKLSYLD FQYQLDVHRK NTQPGTENLL INVSGDLENR YNFPSSEPRA KHSVKIRAAD 301 VRILNWSSWS EAIEFGSDDG
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, описанное в данном изобретении, специфично распознает эпитоп в пределах GM-CSFRa человека. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa дает перекрестную реакцию с GM-CSFRa из видов, отличающихся от человека. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa специфично только к GM-CSFRa человека и не проявляет перекрестной реактивности в отношении объектов других видов или типов, не имеющих отношения к человеку.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, описанное в данном изобретении, специфично связывается с линейным эпитопом в пределах GM-CSFRa человека. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, описанное в данном изобретении, специфично связывается с нелинейным эпитопом в пределах GM-CSFRa человека. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, описанное в данной заявке, специфично связывается с эпитопом на GM-CSFRa человека, при этом данный эпитоп содержит один, два, три, четыре, пять или шесть остатков аминокислот, выбранных из группы, состоящей из Val50, Glu59, Lys194, Lys195, Arg283 и Ile284 в GM-CSFRa человека. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, описанное в данном изобретении, специфично связывается с эпитопом на GM-CSFRa человека, при этом данный эпитоп содержит Val50, Glu59, Lys194, Lys195, Arg283 и Ile284 в GM-CSFRa человека. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, описанное в данном изобретении, специфично связывается с эпитопом на GM-CSFRa человека, при этом данный эпитоп содержит один, два, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь или девять остатков аминокислот, выбранных из группы, состоящей из Val50, Glu59, Lys194, Lys195, Arg283, Ile284, Val51, Thr63 и Il196. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, описанное в данном изобретении, специфично связывается с эпитопом на GM-CSFRa человека, при этом данный эпитоп содержит аминокислотные остатки Val50, Glu59, Lys194, Lys195, Arg283, Ile284, Val51, Thr63 и Il196. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, описанное в данной заявке, специфично связывается с эпитопом на GM-CSFRa человека, при этом данный эпитоп содержит один, два, три, четыре, пять, шесть, семь или восемь остатков аминокислот, выбранных из группы, состоящей из Val50, Glu59, Lys194, Lys195, Arg283, Ile284, Leu191 и Il196. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, описанное в данном изобретении, специфично связывается с эпитопом на GMCSFRa человека, при этом данный эпитоп аминокислотные остатки Val50, Glu59, Lys194, Lys195, Arg283, Ile284, Leu191 и Il196. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, описанное в данном изобретении, специфично связывается с эпитопом на GM-CSFRa человека, при этом данный эпитоп содержит один, два, три, четыре, пять, шесть, семь, восемь, девять или десять остатков аминокислот, выбранных из группы, состоящей из Val50, Glu59, Lys194, Lys195, Arg283, Ile284, Arg49, Val51, Asn57 и Ser61. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, описанное в данном изобретении, специфично связывается с эпитопом на GM-CSFRa человека, при этом данный эпитоп содержит аминокислотные остатки Val50, Glu59, Lys194, Lys195, Arg283, Ile284, Arg49, Val51, Asn57 и Ser61.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa дает перекрестную реакцию по меньшей мере с одним аллельным вариантом белка GM-CSFRa (или с его фрагментами). В некоторых воплощениях аллельный вариант имеет приблизительно до 30 (например, приблизительно любое число из 1, 2, 3, 4, 5, 6,
- 13 048006
7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 или 30) аминокислотных замен (таких как консервативные замены) по сравнению с встречающимся в природе GM-CSFRa (или его фрагментами). В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa не дает перекрестной реакции с каким-либо аллельным вариантом белка GM-CSFRa (или с его фрагментами).
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa дает перекрестную реакцию по меньшей мере с одним межвидовым вариантом белка GM-CSFRa. В некоторых воплощениях, например, белок GMCSFRa (или его фрагмент) представляет собой GM-CSFRa человека, а межвидовой вариант белка GMCSFRa (или его фрагмента) представляет собой его вариант из яванского макака. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa не дает перекрестной реакции с каким-либо межвидовым вариантом белка GM-CSFRa.
В некоторых воплощениях, соответствующих любому из антител к GM- CSFRa, описанных в данном изобретении, антитело к GM-CSFRa содержит константную область тяжелой цепи антитела и константную область легкой цепи антитела. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит константную область тяжелой цепи IgG1. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит константную область тяжелой цепи IgG2. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит константную область тяжелой цепи IgG3. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит константную область тяжелой цепи IgG4. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность (в том числе состоит из или по существу состоит из аминокислотной последовательности) с SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность (в том числе состоит из или по существу состоит из аминокислотной последовательности) с SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит константную область легкой цепи лямбда. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит константную область легкой цепи каппа. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность (в том числе состоит из или по существу состоит из аминокислотной последовательности) с SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи антитела и вариабельный домен легкой цепи антитела.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий HC-CDR1, содержащий X1LX2X3H (SEQ ID NO: 76), где Xi представляет собой Е, N, G, D, M, S, P, F, Y, А, V, K, W, R или С, Х2 представляет собой S, С или Р, и Х3 представляет собой I или М; HC-CDR2, содержащий GFDX1X2X3X4EX5X6YAQKX7QG (SEQ ID NO: 77), где Х1 представляет собой Р, G, T, S или V, Х2 представляет собой Е, D, G или А, Х3 представляет собой D, G, I, W, S или V, Х4 представляет собой G, E, D или Н, Х5 представляет собой Т или А, Х6 представляет собой N или I, и Х7 представляет собой S или F; и HC-CDR3, содержащий GRYX1X2X3X4X5X6YGFDY (SEQ ID NO: 78), где Х1 представляет собой С, Т, S, I, A или V, Х2 представляет собой S, G, E, F, W, Н, I, V, N, Y, Т или R, Х3 представляет собой Т, Н, L, F, P, I, S, Y, K, A, D, V, N или G, Х4 представляет собой D, A, M, Y, F, S, T, G или W, Х5 представляет собой Т, S, F, Q, A, N, L, E, I, G или М, и Х6 представляет собой С, Т, N, S или А; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий RAX1X2X3VX4X5X6LA (SEQ ID NO: 293), где Xi представляет собой S, L, N, А, K, R, I, Q, G, Т, Н, М или С, Х2 представляет собой Q, Y, P, A, I, F, T, R, V, L, E, S или С, Х3 представляет собой S, H, W, L, R, K, Т, Р, I, F, V, Е, А или Q, Х4 представляет собой S, L, W, M, A, Y, K, R, G, Т, Е, V, N, F или С, Х5 представляет собой S, T, R, A, H, Q, Р, М, L или G, и Х6 представляет собой Y, L или F; LC-CDR2, содержащий X1X2X3S RAT (SEQ ID NO: 294), где Х1 представляет собой G или Т, Х2 представляет собой A, G, R, Н, K, S, Т, М или F, и Х3 представляет собой S, A, W, R, L, T, Q, F, Y, Н или N; и LC-CDR3, содержащий QQYX|X2X3PX4T (SEQ ID NO: 79), где Xi представляет собой N, D, S, R, A, T, L, Y, Q, W или G, Х2 представляет собой N, D, Е, Т, Y, G, A, M, F, S, I или L, Х3 представляет собой W, S, Р, V, G или R, и Х4 представляет собой Р, Y, H, S, F, N, D, V или G.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий HC-CDR1, содержащий ELX1X2H (SEQ ID NO: 295), где Xi представляет собой S, С или Р, и Х2 представляет собой I или М; HC-CDR2, содержащий GFDX1X2X3X4EX5X6YAQKX7QG (SEQ ID NO: 77), где Х1 представляет собой Р, G, Т, S или V, Х2 представляет собой Е, D, G или А, Х3 представляет собой D, G, I, W, S или V, Х4 представляет собой G, E, D или Н, Х5 представляет собой Т или А, Х6 представляет собой N или I, и Х7 представляет собой S или F; и HC-CDR3, содержащий GRYXiX2X3X4X5X6YGFDY (SEQ ID NO: 78), где Xi представляет собой C, Т, S, I, А или V, Х2 представляет собой S, G, E, F, W, Н, I, V, N, Y, Т или R, Х3 представляет собой Т, Н, L, F, P, I, S, Y, K, A, D, V, N или G, Х4 представляет собой D, A, M, Y, F, S, T, G или W, Х5 представляет собой Т, S, F, Q, A, N, L, E, I, G или М, и Х6 представляет собой С, Т, N, S или А; и VL, содержащий: LC-CDR1, содержащий RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51); LC-CDR2, содержащий GASSRAT (SEQ ID NO: 52); и LC-CDR3, содержащий QQYX1X2X3PX4T (SEQ ID NO: 79), где Х1 представляет собой N, D, S, R, A, T, L, Y, Q, W или G, X2 представляет собой N, D, E, T, Y, G, A, M, F, S, I или L, X3 представляет собой W, S, P, V, G или R, и Х4 представляет собой P, Y, H, S, F, N, D, V или G.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий: HC-CDR1, содержа
- 14 048006 щий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 1-4 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, HCCDR2, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 5-16 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 1750 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий:
HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 1-4, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 5-16, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 17-50.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VL, содержащий:
LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 5375 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VL, содержащий:
LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 53-75.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий:
HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 1-4 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 5-16 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 17-50 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен; и VL, содержащий: LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 53-75 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий: HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 1-4, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 5-16, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 17-50; и VL, содержащий: LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 53-75.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий:
HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR; и VL, содержащий: LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LCCDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LC-CDR.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий:
HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий: HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID
- 15 048006
NO: 22, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 56, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LC-CDR.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий: HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 56.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий: HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LC-CDR.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий:
HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR;
и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LC-CDR.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий:
HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID 20 NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий: HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LC-CDR.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий: HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий: HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислот
- 16 048006 ных замен в указанных LC-CDR.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий:
HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий: HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LC-CDR.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий: HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий: HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LC-CDR.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий: HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий:
HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных HC-CDR;
и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в указанных LC-CDR.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий:
HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1-50 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51-75 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1-50; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51-75.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, 5 и 17 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 54 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, 5 и 17; и VL, содержащий
- 17 048006 аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 54.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, 8 и 22 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 56 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, 8 и 22; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 56.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, 7 и 23 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 57 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, 7 и 23; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 57.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, 6 и 27 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 57 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, 6 и 27; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 57.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, 7 и 35 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 53 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, 7 и 35; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 53.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, 7 и 37 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 57 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, 7 и 37; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 57.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 3, 6 и 39 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 54 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 3, 6 и 39; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 54. В некоторых воплощениях антитело к GMCSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, 7 и 35 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 57 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, 7 и 35; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 57.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, 7 и 50 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 57 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1, 7 и 50; и VL, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 51, 52 и 57.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий HC-CDR1, HC-CDR2 и HC-CDR3 VH, содержащего аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 80-121 и 246287; и VL, содержащий LC-CDR1, LC-CDR2, и LC-CDR3 VL, содержащего аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 122-144, 150-245 и 288-289.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий один, два или три HCCDR с SEQ ID NO: 80. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий один, два или три HC-CDR с SEQ ID NO: 85. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий один, два или три HC-CDR с SEQ ID NO: 86. В некоторых воплощениях антитело к GMCSFRa содержит VH, содержащий один, два или три HC-CDR с SEQ ID NO: 91. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий один, два или три HC-CDR с SEQ ID NO: 99. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий один, два или три HC-CDR с
- 18 048006
SEQ ID NO: 101. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий один, два или три HC-CDR с SEQ ID NO: 103. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий один, два или три HC-CDR с SEQ ID NO: 121.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VL, содержащий один, два или три LCCDR с SEQ ID NO: 123. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VL, содержащий один, два или три LC-CDR с SEQ ID NO: 125. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VL, содержащий один, два или три LC-CDR с SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VL, содержащий один, два или три LC-CDR с SEQ ID NO: 122.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий HC-CDR1, HC-CDR2 и HC-CDR3 из VH с SEQ ID NO: 80, и VL, содержащий LC-CDR1, LC-CDR2 и LC-CDR3 из VL с SEQ ID NO: 123. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий HC-CDR1, HCCDR2 и HC-CDR3 из VH с SEQ ID NO: 85, и VL, содержащий LC-CDR1, LC-CDR2 и LC-CDR3 из VL с SEQ ID NO: 125. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий HCCDR1, HC-CDR2 и HC-CDR3 из VH с SEQ ID NO: 86, и VL, содержащий LC-CDR1, LC-CDR2 и LC-CDR3 из VL с SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий HC-CDR1, HC-CDR2 и HC-CDR3 из VH с SEQ ID NO: 91, и VL, содержащий LC-CDR1, LC-CDR2 и LCCDR3 из VL с SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий HC-CDR1, HC-CDR2 и HC-CDR3 из VH с SEQ ID NO: 99, и VL, содержащий LC-CDR1, LC-CDR2 и LC-CDR3 из VL с SEQ ID NO: 122. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий НС-CDRI, HC-CDR2 и HC-CDR3 из VH с SEQ ID NO: 101, и VL, содержащий LC-CDR1, LCCDR2 и LC-CDR3 из VL с SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий HC-CDR1, HC-CDR2 и HC-CDR3 из VH с SEQ ID NO: 103, и VL, содержащий LC-CDR1, LC-CDR2 и LC-CDR3 из VL с SEQ ID NO: 123. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий HC-CDR1, HC-CDR2 и HC-CDR3 из VH с SEQ ID NO: 99, и VL, содержащий lCCDR1, LC-CDR2 и LC-CDR3 из VL с SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий HC-CDR1, HC-CDR2 и HC-CDR3 из VH с SEQ ID NO: 121, и VL, содержащий LC-CDR1, LC-CDR2 и LC-CDR3 из VL с SEQ ID NO: 126.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 80-121 и 246-287 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 122-144, 150-245 и 288-289 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GMCSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 80-121 и 246-287, и VL, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 122-144, 150-245 и 288-289.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 80 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 80, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 125 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 125.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 86 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 86, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%)
- 19 048006 идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 99 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 99, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 101 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 101, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 99 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 99, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 121 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 121, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях функциональные эпитопы могут быть картированы с использованием комбинаторного аланинового сканирования. В этом способе стратегию комбинаторного аланинового сканирования можно использовать для идентификации аминокислот в белке GM-CSFRa, которые необходимы для взаимодействия с антителами к GM-CSFRa. В некоторых воплощениях эпитоп является конформационным, и для идентификации эпитопов может быть использована кристаллическая структура антител к GMCSFRa, связанных с GM-CSFRa.
В некоторых воплощениях согласно настоящему изобретению предложены антитела, которые конкурируют с любым из антител к GM-CSFRa, описанных в данном документе, за связывание с GMCSFRa. В некоторых воплощениях согласно настоящему изобретению предложены антитела, которые конкурируют с любым из антител к GM-CSFRa, предложенных в данном изобретении, за связывание с эпитопом на GM-CSFRa. В некоторых воплощениях предложено антитело к GM-CSFRa, которое связывается с тем же эпитопом, что и антитело к GM-CSFRa, содержащее VH, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 80-121 и 246-287, и VL, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 122-144, 150-245 и 288-289. В некоторых воплощениях предложено антитело к GM-CSFRa, которое специфично связывается с GM-CSFRa, конкурируя с антителом к GMCSFRa, содержащим VH, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 80121 и 246-287, и VL, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 122-144, 150-245 и 288-289.
В некоторых воплощениях для идентификации моноклинального антитела, которое конкурирует с антителом к GM-CSFRa, описанным в данном изобретении, за связывание с GM-CSFRa, могут быть использованы конкурентные анализы. Конкурентные анализы можно использовать для определения того,
- 20 048006 связываются ли два антитела с одним и тем же эпитопом посредством распознавания идентичных или стерически перекрывающихся эпитопов или ингибирует ли одно антитело конкурентным образом связывание другого антитела с антигеном. В некоторых воплощениях такое конкурирующее антитело связывается с тем же эпитопом, с которым связывается антитело, описанное в данном изобретении. Типичные конкурентные анализы включают, но не ограничиваются этим, рутинные анализы, например, приведенные в Harlow and Lane (1988) Antibodies: A Laboratory Manual, ch.14 (Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y.). Подробные типичные методы картирования эпитопа, с которым связывается антитело, приведены в Morris (1996) Epitope Mapping Protocols в Methods in Molecular Biology, vol. 66 (Humana Press, Totowa, N.J.). В некоторых воплощениях указывается, что два антитела связываются с одним и тем же эпитопом, если каждое блокирует связывание другого на 50% или больше. В некоторых воплощениях антитело, которое конкурирует с антителом к GM-CSFRa, описанным в данном изобретении, представляет собой химерное, гуманизированное или человеческое антитело.
Последовательности, типичные для антител к GM-CSFRa, показаны в табл. 2, 3 и 18 и на фиг. 19А, 19В. Специалистам в данной области техники будет понятно, что известно много алгоритмов для предсказания положений CDR и для определения границ вариабельных областей тяжелой цепи и легкой цепи антитела. Антитела к GM-CSFRa, содержащие последовательности CDR, VH и/или VL из антител, описанных в данном изобретении, но основанные на алгоритмах предсказания, отличающихся от тех, что в качестве примеров приведены ниже в таблицах, находятся в пределах объема этого изобретения.
- 21 048006
Типичные последовательности CDR антител к GM-CSFRa
Таблица 2
| Наименование антитела | HC-CDR1 | HC-CDR2 | HC-CDR3 |
| Т119 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETNYAQKSQG (SEQ ID NO: 5) | GRYCSTDTCYGFDY (SEQ ID NO: 17) |
| Е01 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETNYAQKSQG (SEQ ID NO: 5) | GRYCSTDTCYGFDY (SEQ ID NO: 17) |
| Е09 | ELSMH (SEQ ID NO: 2) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYCGHASCYGFDY (SEQ ID NO: 18) |
| Е105 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYTSLMFTYGFDY (SEQ ID NO: 19) |
| Е108 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYTELYQNYGFDY (SEQ ID NO: 20) |
| Е113 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKSQG (SEQ ID NO: 7) | GRYTELFASYGFDY (SEQ ID NO: 21) |
| Е16 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGEAIYAQKSQG (SEQ ID NO: 8) | GRYSEHSTSYGFDY (SEQ ID NO: 22) |
| Е194 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKSQG (SEQ ID NO: 7) | GRYTGLMNSYGFDY (SEQ ID NO: 23) |
| Е27 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYISFMFTYGFDY (SEQ ID NO: 24) |
| Е29 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYCFPDTCYGFDY (SEQ ID NO: 25) |
| ЕЗО | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYCSTDTCYGFDY (SEQ ID NO: 17) |
| Е34 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYSFTDLAYGFDY (SEQ ID NO: 26) |
| Е35 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYTSLATTYGFDY (SEQ ID NO: 27) |
| Е36 | ELSMH (SEQ ID NO: 2) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYAFIDTAYGFDY (SEQ ID NO: 28) |
| Е39 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYCSSDLCYGFDY (SEQ ID NO: 29) |
| Е40 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYTSLDESYGFDY (SEQ ID NO: 30) |
| Е54 | ELSMH (SEQ ID NO: 2) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYSSYDIAYGFDY (SEQ ID NO: 31) |
| Е61 | ELSMH (SEQ ID NO: 2) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYAWTDIAYGFDY (SEQ ID NO: 32) |
| Е83 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKSQG (SEQ ID NO: 7) | GRYCFYDLCYGFDY (SEQ ID NO: 33) |
| Е85 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKSQG | GRYSSYFTNYGFDY |
- 22 048006
| (SEQ ID NO: 7) | (SEQ ID NO: 34) | ||
| E87 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKSQG (SEQ ID NO: 7) | GRYVSLFFNYGFDY (SEQ ID NO: 35) |
| E88 | ELSMH (SEQ ID NO: 2) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYCHKDGCYGFDY (SEQ ID NO: 36) |
| E90 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKSQG (SEQ ID NO: 7) | GRYTGLYASYGFDY (SEQ ID NO: 37) |
| E94 | ELSMH (SEQ ID NO: 2) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYCETDICYGFDY (SEQ ID NO: 38) |
| E200a | ELPMH (SEQ ID NO: 3) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYTIITTNYGFDY (SEQ ID NO: 39) |
| EII33 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDGDGEETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 9) | GRYTSLAATYGFDY (SEQ ID NO: 40) |
| EII52 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDGDIEETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 10) | GRYTSLATTYGFDY (SEQ ID NO: 27) |
| EII81 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYTSLAATYGFDY (SEQ ID NO: 40) |
| E161 | ELCMH (SEQ ID NO: 4) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYAVTDMAYGFDY (SEQ ID NO: 41) |
| E163 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYAFAGLAYGFDY (SEQ ID NO: 42) |
| E164 | ELSMH (SEQ ID NO: 2) | GFDPEDGETIYAQKSQG (SEQ ID NO: 7) | GRYTNDFANYGFDY (SEQ ID NO: 43) |
| E170 | ELSMH (SEQ ID NO: 2) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYSSVGSTYGFDY (SEQ ID NO: 44) |
| E172 | ELSMH (SEQ ID NO: 2) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYANLYNNYGFDY (SEQ ID NO: 45) |
| E174 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYVYLASNYGFDY (SEQ ID NO: 46) |
| E181 | ELSMH (SEQ ID NO: 2) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYSTNFSNYGFDY (SEQ ID NO: 47) |
| E84 | ELSMH (SEQ ID NO: 2) | GFDPEDGETIYAQKSQG (SEQ ID NO: 7) | GRYTRGWFNYGFDY (SEQ ID NO: 48) |
| EII55 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDGDWHETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 14) | GRYTSLDATYGFDY (SEQ ID NO: 49) |
| E87b | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKSQG (SEQ ID NO: 7) | GRYVSLFFNYGFDY (SEQ ID NO: 35) |
- 23 048006
| E31 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKSQG (SEQ ID NO: 7) | GRYSESFASYGFDY (SEQ ID NO: 50) |
| E41 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPAWGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 15) | GRYTSLATTYGFDY (SEQ ID NO: 27) |
| EII41 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDTGDDETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 11) | GRYTSLDATYGFDY (SEQ ID NO: 49) |
| EII46 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDSEWGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 12) | GRYTSLATTYGFDY (SEQ ID NO: 27) |
| EII49 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDVASGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 13) | GRYTSLDATYGFDY (SEQ ID NO: 49) |
| EII7 | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDSEVGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 16) | GRYTSLAATYGFDY (SEQ ID NO: 40) |
| E35a | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYTSLATTYGFDY (SEQ ID NO: 27) |
| E35b | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYTSLATTYGFDY (SEQ ID NO: 27) |
| E35c | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYTSLATTYGFDY (SEQ ID NO: 27) |
| E35d | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYTSLATTYGFDY (SEQ ID NO: 27) |
| E35e | ELSIH (SEQ ID NO: 1) | GFDPEDGETIYAQKFQG (SEQ ID NO: 6) | GRYTSLATTYGFDY (SEQ ID NO: 27) |
| Наименование антитела | LC-CDR1 | LC-CDR2 | LC-CDR3 |
| T119 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYNNWPPT (SEQ ID NO: 53) |
| E01 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNWPPT (SEQ ID NO: 54) |
| E09 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYNNWPPT (SEQ ID NO: 53) |
| E105 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYNNWPPT (SEQ ID NO: 53) |
| E108 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYNNWPPT (SEQ ID NO: 53) |
| E113 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYNNWPYT (SEQ ID NO: 55) |
- 24 048006
| E16 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDSWPYT (SEQ ID NO: 56) |
| E194 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNWPYT (SEQ ID NO: 57) |
| E27 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYNNWPPT (SEQ ID NO: 53) |
| E29 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNSPHT (SEQ ID NO: 58) |
| ЕЗО | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNSPHT (SEQ ID NO: 58) |
| Е34 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDSSPPT (SEQ ID NO: 59) |
| Е35 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNWPYT (SEQ ID NO: 57) |
| Е36 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYSNSPPT (SEQ ID NO: 60) |
| Е39 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNSPHT (SEQ ID NO: 58) |
| Е40 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNSPYT (SEQ ID NO: 61) |
| Е54 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYNSSPPT (SEQ ID NO: 62) |
| Е61 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNSPST (SEQ ID NO: 63) |
| Е83 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYSNSPPT (SEQ ID NO: 60) |
| Е85 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYNNWPYT (SEQ ID NO: 55) |
| Е87 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYNNWPPT (SEQ ID NO: 53) |
| Е88 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDSSPHT (SEQ ID NO: 64) |
| Е90 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNWPYT (SEQ ID NO: 57) |
| Е94 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYNNWPPT (SEQ ID NO: 53) |
| Е200а | RASQSVSSYLA (SEQ | GASSRAT (SEQ ID NO: | QQYDNWPPT (SEQ |
- 25 048006
| ID NO: 51) | 52) | ID NO: 54) | |
| EII33 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYRNWPFT (SEQ ID NO: 65) |
| EII52 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYANPPNT (SEQ ID NO: 66) |
| EII81 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYTNVPDT (SEQ ID NO: 67) |
| E161 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYNNSPPT (SEQ ID NO: 68) |
| E163 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNSPPT (SEQ ID NO: 69) |
| E164 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYNNWPYT (SEQ ID NO: 55) |
| E170 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNSPYT (SEQ ID NO: 61) |
| E172 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYNNWPPT (SEQ ID NO: 53) |
| E174 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYNNWPPT (SEQ ID NO: 53) |
| E181 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNWPYT (SEQ ID NO: 57) |
| E84 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYNNWPYT (SEQ ID NO: 55) |
| EII55 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYGNRPDT (SEQ ID NO: 73) |
| E87b | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNWPYT (SEQ ID NO: 57) |
| E31 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNWPYT (SEQ ID NO: 57) |
| E41 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNGPET (SEQ ID NO: 74) |
| EII41 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYLNSPFT (SEQ ID NO: 70) |
| EII46 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYSNVPVT (SEQ ID NO: 71) |
| EII49 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYYNGPGT (SEQ ID NO: 72) |
| EII7 | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYRNGPPT (SEQ ID NO: 75) |
| E35a | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNSPHT (SEQ ID NO: 58) |
| E35b | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNSPYT (SEQ ID NO: 61) |
| E35c | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDSSPHT (SEQ ID NO: 64) |
| E35d | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYDNWPPT (SEQ ID NO: 54) |
| E35e | RASQSVSSYLA (SEQ ID NO: 51) | GASSRAT (SEQ ID NO: 52) | QQYSNSPPT (SEQ ID NO: 60) |
- 26 048006
Типичные последовательности
Таблица 3
| SEQ ID NO | Описание | Последовательность |
| 148 | hGM-CSFRa | MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIPEKSDLRTVAPASSLNVRFDSRTMNLSWDC QENTTFSKCFLTDKKNRVVEPRLSNNECSCTFREICLHEGVTFEVHVNTS QRGFQQKLLYPNSGREGTAAQNFSCFIYNADLMNCTWARGPTAPRDVQ YFLYIRNSKRRREIRCPYYIQDSGTHVGCHLDNLSGLTSRNYFLVNGTSR EIGIQFFDSLLDTKKIERFNPPSNVTVRCNTTHCLVRWKQPRTYQKLSYLD FQYQLDVHRKNTQPGTENLLINVSGDLENRYNFPSSEPRAKHSVKIRAAD VRILNWSSWSEAIEFGSDDGNLGSVYIYVLLIVGTLVCGIVLGFLFKRFLRI QRLFPPVPQIKDKLNDNHEVEDEIIWEEFTPEEGKGYREEVLTVKEIT |
| 80 | VH из Е01, Т119 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGHTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETNYAQKSQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCA TGRYCSTDTCYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 81 | VH из Е09 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGHTLTELSMHWVRQAPGKGLEW MGGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYC ATGRYCGHASCYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 82 | VH из Е105 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYTSLMFTYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 83 | VH из Е108н | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGHTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYTELYQNYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 84 | VH из Е113 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKSQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYTELFASYGFDYWGQGTLVTVSS |
- 27 048006
| 85 | VH из E16 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGEAIYAQKSQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYSEHSTSYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 86 | VH из E194 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKSQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYTGLMNSYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 87 | VH из E27 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYISFMFTYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 88 | VH из E29 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGHTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYCFPDTCYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 89 | VH из E30 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGHTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYCSTDTCYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 90 | VH из Е34 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYSFTDLAYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 91 | VH из Е35, Е35а-е | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT G RYTSLATTYG FDYWGQGTLVTVSS |
| 92 | Vh из Е36 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGHTLTELSMHWVRQAPGKGLEW MGGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYC ATGRYAFIDTAYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 93 | VH из Е39 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGHTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYCSSDLCYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 94 | VH из Е40 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGHTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYTSLDESYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 95 | VH из Е54 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSMHWVRQAPGKGLEW MGGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYC ATGRYSSYDIAYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 96 | VH из Е61 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSMHWVRQAPGKGLEW MGGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYC ATGRYAWTDIAYGFDYWGQGTLVTVSS |
- 28 048006
| 97 | VH из E83 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKSQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYCFYDLCYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 98 | VH из E85 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKSQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYSSYFTNYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 99 | VH из E87, E87b | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKSQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYVSLFFNYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 100 | VH из E88 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGHTLTELSMHWVRQAPGKGLEW MGGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYC ATGRYCHKDGCYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 101 | VH из E90 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKSQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT G RYTG LYASYG FDYWGQGTLVTVSS |
| 102 | VH из E94 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGHTLTELSMHWVRQAPGKGLEW MGGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYC ATGRYCETDICYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 103 | VH из E200a | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELPMHWVRQAPGKGLEW MGGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYC ATGRYTIITTNYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 104 | VH из EII33 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDGDGEETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT G RYTSLAATYG FDYWGQGTLVTVSS |
| 105 | VH из EII52 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDGDIEETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT G RYTSLATTYG FDYWGQGTLVTVSS |
| 106 | VH из EII81 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT G RYTSLAATYG FDYWGQGTLVTVSS |
| 107 | VH из E161 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGHTLTELCMHWVRQAPGKGLEW MGGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYW ATGRYAVTDMAYGFDYWGQETLVSVSS |
| 108 | VH из E163 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYAFAGLAYG FDYWGQGTLVTVSS |
- 29 048006
| 109 | VH из E164 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGHTLTELSMHWVRQAPGKGLEW MGGFDPEDGETIYAQKSQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYC ATGRYTNDFANYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 110 | VH из E170 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGHTLTELSMHWVRQAPGKGLEW MGGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYC ATGRYSSVGSTYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 111 | VH из E172 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSMHWVRQAPGKGLEW MGGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYC ATGRYANLYNNYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 112 | VH из E174 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGHTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYVYLASNYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 113 | VH из E181 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSMHWVRQAPGKGLEW MGGFDPEDGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYC ATGRYSTNFSNYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 114 | VH из E84 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSMHWVRQAPGKGLEW MGGFDPEDGETIYAQKSQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYC ATGRYTRGWFNYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 115 | VH из EII41 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDTGDDETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYTSLDATYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 116 | VH из EII46 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDSEWGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCA TGRYTSLATTYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 117 | VH из EII49 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDVASGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYTSLDATYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 118 | VH из EII55 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDGDWHETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCA TGRYTSLDATYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 119 | VH из E41 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPAWGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCA TGRYTSLATTYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 120 | VH из EII7 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDSEVGETIYAQKFQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT G RYTSLAATYG FDYWGQGTLVTVSS |
- 30 048006
| 121 | VH из E31 | QMQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLTELSIHWVRQAPGKGLEWM GGFDPEDGETIYAQKSQGRVTMTGDTSTDTAYLELSSLRSEDTALYYCAT GRYSESFASYGFDYWGQGTLVTVSS |
| 122 | VL из T119, E87, E09, E105, E108, E27, E94, E172, E174 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYNNWPPTFG QGTKLEIK |
| 123 | VL из E01, E200a, E35d | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYDNWPPTFG QGTKLEIK |
| 124 | VL из E113, E85, E164, E84 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYNNWPYTFG QGTKLEIK |
| 125 | VL из E16 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYDSWPYTFGQ GTKLEIK |
| 126 | VL из E194, E35, E90, E181, E87b, E31 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYDNWPYTFG QGTKLEIK |
| 127 | VL из E29, E30, E39, E35a | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYDNSPHTFGQ GTKLEIK |
| 128 | VL из E34 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYDSSPPTFGQ GTKLEIK |
| 129 | VL из E36, E83, E35e | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYSNSPPTFGQ GTKLEIK |
| 130 | VL из E40, E170, E35b | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYDNSPYTFGQ GTKLEIK |
| 131 | VL из E54 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYNSSPPTFGQ GTKLEIK |
| 132 | VL из E61 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG |
- 31 048006
| ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYDNSPSTFGQ GTKLEIK | ||
| 133 | VL из E88, E35c | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYDSSPHTFGQ GTKLEIK |
| 134 | VL из EII33 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYRNWPFTFGQ GTKLEIK |
| 135 | VL из EII52 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYANPPNTFGQ GTKLEIK |
| 136 | VL из EII81 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYTNVPDTFGQ GTKLEIK |
| 137 | VL из E161 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYNNSPPTFGQ GTKLEIK |
| 138 | VL из E163 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYDNSPPTFGQ GTKLEIK |
| 139 | VL из EII41 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYLNSPFTFGQ GTKLEIK |
| 140 | VL из EII46 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYSNVPVTFGQ GTKLEIK |
| 141 | VL из EII49 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYYNGPGTFGQ GTKLEIK |
| 142 | VL из EII55 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYGNRPDTFGQ GTKLEIK |
| 143 | VL из E41 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYDNGPETFGQ GTKLEIK |
| 144 | VL из EII7 | EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYG ASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYRNGPPTFGQ |
- 32 048006
| GTKLEIK | ||
| 145 | Константная область тяжелой цепи lgG1 | ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSG VHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVE PKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVWDV SHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWL NGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVS LTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDK SRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK |
| 146 | Константная область тяжелой цепи lgG4 | ASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSG VHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVE SKYGPPCPSCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQE DPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGK EYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTC LVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSR WQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK |
| 147 | Константная область легкой цепи | RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQS GNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPV TKSFNRGEC |
GM-CSF.
Гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор (GM-CSF), также известный как колониестимулирующий фактор 2 (CSF2), продуцируется макрофагами, Т-клетками, тучными клетками, природными киллерными клетками, эндотелиальными клетками и фибробластами. GM-CSF представляет собой провоспалительный цитокин I типа, который повышает выживаемость, усиливает пролиферацию и/или дифференцировку большого разнообразия типов гемопоэтических клеток, включая нейтрофилы, эозинофилы, моноциты и макрофаги, как например, дифференцировку миелоидных клеток, рекрутмент и дифференцировку происходящих из моноцитов дендритных клеток, инициацию и активацию нейтрофилов. Он также способствует образованию кровеносных сосудов, а также росту опухолей. В клиниках GM-CSF часто используют для улучшения восстановления костного мозга после процедур облучения.
GM-CSF является одним из первых провоспалительных цитокинов, которые появляются в места воспаления, и играет решающую роль в регуляции воспалительного процесса, посредством, например, усиления дифференцировки гемопоэтических клеток в нейтрофилы, эозинофилы, моноциты и макрофаги (Nature Reviews Rheumatology, 2015, 7 (11): 415-430). Активируя клетки эндотелия сосудов, GM-CSF способствует рекрутменту моноцитов и макрофагов. Кроме того, GM-CSF усиливает пролиферацию моноцитов и макрофагов, таких как макрофаги из синовиальных суставов при ревматоидном артрите; а также способствует продуцированию цитокинов макрофагами, включая GM-CSF и другие воспалительные цитокины, такие как TNF-α, IL-6, IL-1 и хемокины. Помимо этого, GM-CSF участвует в модулировании антигенпредставляющих клеток в воспалительных тканях и способствует продуцированию IL-23 макрофагами и дендритными клетками, что вместе с IL-6 и IL-1 модулирует дифференцировку Т-клеток. Эндогенный GM-CSF модулирует сенсорные нейроны, используя болевые сигналы и повышая чувствительность к боли. Нокаут GM-CSF у мышей не затрагивал развития миелоидных клеток, что подтверждает лимитированную роль GM-CSF в стимулировании развития миелоидных клеток (Stanley et al. PNAS, 1994, 91(12): 5592-5594). Однако, в связи с отсутствием соответствующих воспалительных реакций мыши с нокаутом GM-CSF оказались более предрасположены к инфекциям (Trapnell et al. N. Engl. J. Med., 2003, 349: 2527-2539; Dranoff et al. Science, 1994, 264: 713-716). Отсутствие GM-CSF снижало вероятность возникновения ревматоидного артрита, энцефаломиелита и аутоиммунного миокардита, и это позволяет предположить, что GM-CSF вовлечен главным образом в воспалительный процесс (Lawlor et al. Arthritis & Rheumatism, 2005, (52) 3749-3754; McQualter et al. Journal of Experimental Medicine, 2001; 194(7): 873-882; Sonderegger et al. Journal of Experimental Medicine 2008, 205(10): 2281-2294).
GM-CSFR.
Рецептор GM-CSF является членом надсемейства рецепторов гемопоэтической системы. Он является гетеродимерным белком, состоящим из альфа- и бета-субъединиц. Альфа-субъединица является высокоспецифичной субъединицей у GM-CSF, в то время как бета-субъединица является общей среди других рецепторов цитокинов, включая IL3 и IL5. Это находит отражение в более широком распределении бетасубъединицы рецептора в тканях. Альфа-субъединица, GM-CSFRa, экспрессируется главным образом в миелоидных клетках и негемопоэтических клетках, таких как нейтрофилы, макрофаги, эозинофилы, дендритные клетки, эндотелиальные клетки и клетки дыхательного эпителия. Полноразмерная GM-CSFRa представляет собой состоящий из 400 аминокислот мембранный гликопротеин I типа, который принадлежит к семейству цитокиновых рецепторов I типа и состоит из сигнального пептида из 22 аминокислот (положения 1-22), внеклеточного домена из 298 аминокислот (положения 23-320), трансмембранного
- 33 048006 домена (положения 321-345) и короткого внутриклеточного домена из 55 аминокислот. Сигнальный пептид отщепляется с образованием зрелой формы белка GM-CSFRa из 378 аминокислот. Доступны клоны кДНК для GM-CSFRa человека и мыши, и на уровне белка, субъединицы этих рецепторов имеют идентичность 36%. GM-CSF способен связываться с относительно низкой аффинностью с отдельно взятой aсубъединицей (Kd 1-5 нМ), но совсем не связывается с отдельно взятой β-субъединицей. Однако, присутствие обеих a- и β-субъединиц приводит к образованию высокоаффинного лиганд-рецепторного комплекса (Kd примерно 100 пМ). При передаче сигнала с участием GM-CSF сначала происходит его связывание с a-цепью GM-CSFR, и затем происходит перекрестное объединение с более крупной субъединицей, общей β-цепью, для осуществления высокоаффинного взаимодействия, в результате чего происходит фосфорилирование участников пути JAK-STAT (янус-киназ-передатчиков сигнала и активаторов транскрипции). Обзор по связыванию GM-CSFR с GM-CSF приведен в Haman et al., Journal of Biological Chemistry, 1999, 274 (48). В результате этого взаимодействия также возможна передача сигнала через фосфорилирование остатков тирозина и активацию пути митоген-активируемой протеинкиназы (MAPK). Показано, что при патологических состояниях GM-CSF играет роль в обострении воспалительных, респираторных и аутоиммунных заболеваний. Поэтому подавление связывания GM-CSF с GM-CSFRa представляет собой терапевтический подход к лечению заболеваний и состояний, опосредуемых GM-CSFR.
Полноразмерное антитело к GM-CSFRa.
Антитело к GM-CSFRa в некоторых воплощениях представляет собой полноразмерное антитело к GM-CSFRa. В некоторых воплощениях полноразмерное антитело к GM-CSFRa представляет собой IgA, IgD, IgE, IgG или IgM. В некоторых воплощениях полноразмерное антитело к GM-CSFRa содержит константные домены IgG, такие как константные домены любого из IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4, в том числе их варианты. В некоторых воплощениях полноразмерное антитело к GM-CSFRa содержит константную область легкой цепи лямбда. В некоторых воплощениях полноразмерное антитело к GM-CSFRa содержит константную область легкой цепи каппа. В некоторых воплощениях полноразмерное антитело к GM-CSFRa представляет собой полноразмерное антитело к GM-CSFRa человека. В некоторых воплощениях полноразмерное антитело к GM-CSFRa содержит последовательность Fc-области мышиного иммуноглобулина. В некоторых воплощениях полноразмерное антитело к GM-CSFRa содержит последовательность Fc-области, которая преобразована или по-иному изменена так, что она обладает усиленной эффекторной функцией в виде антителозависимои клеточной цитотоксичности (ADCC) или комплементзависимой цитотоксичности (CDC).
Так, например, в некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa специфично связывается с GMCSFRa. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, и константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG2, при этом антитело к GM-CSFRa специфично связывается с GM-CSFRa. В некоторых воплощениях IgG2 представляет собой IgG2 человека. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG3, при этом антитело к GM-CSFRa специфично связывается с GM-CSFRa. В некоторых воплощениях IgG3 представляет собой IgG3 человека. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa специфично связывается с GM-CSFRa. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, и константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
- 34 048006
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 1-4 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 5-16 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 17-50 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 53-75 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG2, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 1-4 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 5-16 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 17-50 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 53-75 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен. В некоторых воплощениях IgG2 представляет собой IgG2 человека. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG3, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 1-4 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 5-16 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 17-50 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 53-75 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен. В некоторых воплощениях IgG3 представляет собой IgG3 человека. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи,
- 35 048006 содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 1-4 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 5-16 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 17-50 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LC- CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 5375 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 1-4, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 5-16, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 17-50 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен в последовательностях HC-CDR; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 53-75 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен в последовательностях LC-CDR. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи антитела к GM-CSFRa содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи антитела к GM-CSFRa содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM- CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 1-4, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 5-16, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 17-50 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен в последовательностях HC-CDR; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 53-75 или ее вариант, содержащий примерно до 3 (как например, приблизительно любое количество из 1, 2 или 3) аминокислотных замен в последовательностях LC-CDR. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи,
- 36 048006 содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 1-4, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 5-16, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 17-50; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 53-75. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 1-4, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 5-16, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 17-50; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 53-75. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 56. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2,
- 37 048006 содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM- CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM- CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM- CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM- CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокис
- 38 048006 лотную последовательность SEQ ID NO: 39; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM- CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM- CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM- CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LC
- 39 048006
CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 56. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23; и ^вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM- CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий ами
- 40 048006 нокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, и константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39; и ^вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35; и ^вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит а) вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50; и b) вариабельный домен легкой цепи, содержащий LCCDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 80-121 и 246-287 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 122144, 150-245 и 288-289 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по мень
- 41 048006 шей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG2, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 80-121 и 246-287 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 122144, 150-245 и 288-289 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90%(например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности. В некоторых воплощениях IgG2 представляет собой IgG2 человека. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG3, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 80-121 и 246-287 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 122144, 150-245 и 288-289 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности. В некоторых воплощениях IgG3 представляет собой IgG3 человека. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 80-121 и 246-287 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 122144, 150- 245 и 288-289 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 80-121 и 246-287, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 122144, 150-245 и 288-289. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи,
- 42 048006 содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 80-121 и 246-287, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 122144, 150-245 и 288-289. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 80, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 125. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 86, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 99, и вариабельный домен легкой цепи,
- 43 048006 содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 101, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 99, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, и константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 121, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 80, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123. В некоторых воплощениях IgG4
- 44 048006 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146 и константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 125. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, и константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 86, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, и константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 99, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 101, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содер
- 45 048006 жит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 99, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложено полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG4, при этом антитело к GM-CSFRa содержит вариабельный домен тяжелой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 121, и вариабельный домен легкой цепи, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146, а константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
Аффинность связывания.
Аффинность связывания можно выразить, используя Kd, константу скорости диссоциации (Koff), константу скорости ассоциации (Kon) или константу аффинности (Ka). Подразумевается, что термин Koff, использованный в данном описании, относится к константе скорости диссоциации антитела из комплекса антитело/антиген, определяемой на основании набора кинетических данных.
Подразумевается, что термин Kon, использованный в данном описании, относится к константе скорости ассоциации антитела с антигеном с образованием комплекса антитело/антиген. Использованный в данном описании термин равновесная константа диссоциации, Kd, относится к константе диссоциации конкретного комплекса, образованного в результате взаимодействия между антителом и антигеном, и описывает концентрацию антигена, необходимую для того, чтобы занять половину из всех антитело-связывающих доменов, присутствующих в растворе молекул антител в равновесии, и она равна Koff/Kon. Измерение Kd предполагает, что все участвующие в связывании вещества находятся в растворе. В случае, когда антитело связано с клеточной стенкой, например, в системе экспрессии дрожжей, соответствующую константу равновесия выражают в виде ЕС50 (эффективная концентрация, вызывающая эффект величиной 50%), что является хорошим приближением для оценки Kd. Константа аффинности, Ka, представляет собой величину, обратную константе диссоциации, Kd.
Константу диссоциации (Kd) используют в качестве индикатора, характеризующего аффинность группировок антитела к антигенам. Например, можно провести простой анализ согласно методу Скэт
- 46 048006 чарда, используя антитела, меченные разнообразными маркерными агентами, а также анализ с применением Biacore (производства Amersham Biosciences), анализ взаимодействий биомолекул методом поверхностного плазмонного резонанса в соответствии с руководством для пользователя и прилагаемым набором. Значение Kd, которое может быть получено с использованием этих методов, выражают в единицах измерения М (моль). Антитело, которое специфично связывается с мишенью, может иметь Kd, например, <10-7 М, <10-8 М, <10-9 М, <10-10 М, <10-11 М, <10-12 М или <10-13 М.
Специфичность связывания антитела может быть определена экспериментально методами, известными в данной области техники. Такие методы включают, но не ограничиваются этим, методы тестирования с использованием вестерн-блоттинга, ELISA, RIA, электрохемилюминесцентного анализа (ECL), иммунорадиометрического анализа (IRMA), иммуноферментного анализа (EIA), платформы BIAcore и снятие пептидных сканограмм.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa специфично связывается с мишенью GM-CSFRa с Kd от приблизительно 10-7 М до приблизительно 10-13 М (как например, от приблизительно 10-7 М до приблизительно 10-13 М, от приблизительно 10-8 М до приблизительно 10-13 М, от приблизительно 10-9 М до приблизительно 10-13 М или от приблизительно 10-10 М до приблизительно 10-12 М). Так, в некоторых воплощениях Kd для связывания между антителом к GM-CSFRa и GM-CSFRa составляет от приблизительно 10-7М до приблизительно 10-13 М, от приблизительно 1х 10-7 М до приблизительно 5х10-13 М, от приблизительно 10-7 М до приблизительно 10-12 М, от приблизительно 10-7 М до приблизительно 10-11 М, от приблизительно 10-7 М до приблизительно 10-10 М, от приблизительно 10-7 М до приблизительно 10-9 М, от приблизительно 10-8 М до приблизительно 10-13 М, от приблизительно 1х 10-8 М до приблизительно 5х10-13 М, от приблизительно 10-8 М до приблизительно 10-12 М, от приблизительно 10-8 М до приблизительно 10-11 М, от приблизительно 10-8 М до приблизительно 10-10 М, от приблизительно 10-8 М до приблизительно 10-9 М, от приблизительно 5х10-9 М до приблизительно 1 х 10-13 М, от приблизительно 5х10-9 М до приблизительно 1х10-12 М, от приблизительно 5х10-9 М до приблизительно 1х10-11 М, от приблизительно 5х10-9 М до приблизительно 1х 10-10 М, от приблизительно 10-9 М до приблизительно 10-13 М, от приблизительно 10-9 М до приблизительно 10-12 М, от приблизительно 10-9 М до приблизительно 10-11 М, от приблизительно 10-9 М до приблизительно 10-10 М, от приблизительно 5х10-10 М до приблизительно 1 х 10-13 М, от приблизительно 5х10-10 М до приблизительно 1 х 10-12 М, от приблизительно 5х10-10 М до приблизительно 1х10-11 М, от приблизительно 10-10 М до приблизительно 10-13 М, от приблизительно 1х 10-10 М до приблизительно 5х 10-13 М, от приблизительно 1х 10-10 М до приблизительно 1х 10-12 М, от приблизительно 1х 10-10 М до приблизительно 5х10-12 М, от приблизительно 1х 10-10 М до приблизительно 1х10-11 М, от приблизительно 10-11 М до приблизительно 10-13 М, от приблизительно 1х 10-11 М до приблизительно 5х10-13 М, от приблизительно 10-11 М до приблизительно 10-12 М или от приблизительно 10-12 М до приблизительно 10-13 М. В некоторых воплощениях Kd для связывания между антителом к GM-CSFRa и GM-CSFRa составляет от приблизительно 10-7 М до приблизительно 10-13 М.
В некоторых воплощениях Kd для связывания между антителом к GM-CSFRa и не являющимся мишенью объектом превышает Kd для связывания между антителом к GM-CSFRa и мишенью, и в данном описании в случае некоторых воплощений называется аффинностью связывания антитела к GMCSFRa с мишенью (например, GM-CSFRa), которая превышает таковую с не являющимся мишенью объектом. В некоторых воплощениях не являющийся мишенью объект представляет собой антиген, который не является GM-CSFRa. В некоторых воплощениях Kd для связывания между антителом к GMCSFRa (против GM-CSFRa) и мишенью, не являющейся GM-CSFRa, может превышать по меньшей мере приблизительно в 10 раз, как например, приблизительно в 10-100 раз, приблизительно в 100-1000 раз, приблизительно в 103-104 раз, приблизительно в 104-105 раз, приблизительно в 105-106 раз, приблизительно в 106-107 раз, приблизительно в 107-108 раз, приблизительно в 108-109 раз, приблизительно в 109-1010 раз, приблизительно в 1010-1011 раз или приблизительно в 1011-1012 раз значение Kd для связывания между антителом к GM-CSFRa и мишенью GM-CSFRa.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa связывается с не являющимся мишенью объектом с Kd от приблизительно 10-1 М до приблизительно 10-6 М (как например, от приблизительно 10-1 М до приблизительно 10-6 М, от приблизительно 10-1 М до приблизительно 10-5 М или от приблизительно 10-2 М до приблизительно 10-4 М). В некоторых воплощениях не являющийся мишенью объект представляет собой антиген, который не является GM-CSFRa. Так, в некоторых воплощениях Kd для связывания между антителом к GM-CSFRa и мишенью, не являющейся GM-CSFRa, составляет от приблизительно 10-1 М до приблизительно 10-6 М, от приблизительно 1х 10-1 М до приблизительно 5х 10-6 М, от приблизительно 10-1 М до приблизительно 10-5 М, от приблизительно 1х 10-1 М до приблизительно 5х10-5 М, от приблизительно 10-1 М до приблизительно 10-4 М, от приблизительно 1х10-1 М до приблизительно 5х10-4 М, от приблизительно 10-1 М до приблизительно 10-3 М, от приблизительно 1 х 10-1 М до приблизительно 5х10-3 М, от приблизительно 10-1 М до приблизительно 10-2 М, от приблизительно 10-2 М до приблизительно 10-6 М, от приблизительно 1 х 10-2 М до приблизительно 5х10-6 М, от приблизительно 10-2 М
- 47 048006 до приблизительно 10-5 М, от приблизительно 1х 10-2 М до приблизительно 5х10-5 М, от приблизительно 10-2 М до приблизительно 10-4 М, от приблизительно 1 х 10-2 М до приблизительно 5х 10-4 М, от приблизительно 10-2 М до приблизительно 10-3 М, от приблизительно 10-3 М до приблизительно 10-6 М, от приблизительно 1 х 10-3 М до приблизительно 5х10-6 М, от приблизительно 10-3 М до приблизительно 10-5 М, от приблизительно 1х10-3 М до приблизительно 5х10-5 М, от приблизительно 10-3 М до приблизительно 10-4 М, от приблизительно 10-4 М до приблизительно 10-6 М, от приблизительно 1х 10-4 М до приблизительно 5х10-6 М, от приблизительно 10-4 М до приблизительно 10-5 М или от приблизительно 10-5 М до приблизительно 10-6 М.
В некоторых воплощениях указание, что антитело к GM-CSFRa специфично распознает мишень GM-CSFRa с высокой аффинностью связывания и связывается с не являющимся мишенью объектом с низкой аффинностью связывания, означает, что антитело к GM-CSFRa будет связываться с мишенью GM-CSFRa с Kd от приблизительно 10-7 М до приблизительно 10-13 М (как например, от приблизительно 10-7 М до приблизительно 10-13 М, от приблизительно 10-8 М до приблизительно 10-13 М, от приблизительно 10-9 М до приблизительно 10-13 М или от приблизительно 10-10 М до приблизительно 10-12 М) и будет связываться с не являющимся мишенью объектом с Kd от приблизительно 10-1 М до приблизительно 10-6 М (как например, от приблизительно 10-1 М до приблизительно 10-6 М, от приблизительно 10-1 М до приблизительно 10-5 М или от приблизительно 10-2 М до приблизительно 10-4 М).
В некоторых воплощениях указание, что антитело к GM-CSFRa специфично распознает GMCSFRa, означает, что аффинность связывания антитела к GM-CSFRa сопоставима с таковой у контрольного антитела к GM-CSFRa (такого как маврилимумаб). В некоторых воплощениях Kd для связывания между контрольным антителом к GM-CSFRa и GM-CSFRa может превышать по меньшей мере приблизительно в 2 раза, как например, приблизительно в 2 раза, приблизительно в 3 раза, приблизительно в 4 раза, приблизительно в 5 раз, приблизительно в 6 раз, приблизительно в 7 раз, приблизительно в 8 раз, приблизительно в 9 раз, приблизительно в 10 раз, приблизительно в 10-100 раз, приблизительно в 1001000 раз, приблизительно в 103-104 раз Kd для связывания между антителом к GM-CSFRa, описанным в данном изобретении, и GM-CSFRa.
Нуклеиновые кислоты.
Также включены молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие антитела к GM-CSFRa. В некоторых воплощениях предложена нуклеиновая кислота (или набор нуклеиновых кислот), кодирующая полноразмерное антитело к GM-CSFRa, в том числе любое из полноразмерных антител к GM-CSFRa, описанных в данном изобретении. В некоторых воплощениях нуклеиновая кислота (или набор нуклеиновых кислот), кодирующая антитело к GM-CSFRa, описанное в данном изобретении, может дополнительно содержать нуклеиновокислотную последовательность, кодирующую пептидную метку (такую как метка, используемая при очистке белков, например, гистидиновую метку (His-метку), НА (гемагглютинин) метку).
Кроме того, в данное описание включены выделенные клетки-хозяева, содержащие антитело к GMCSFRa, выделенную нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептидные компоненты антитела к GMCSFRa, или вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую полипептидные компоненты антитела к GM-CSFRa, описанного в данном изобретении.
Настоящее изобретение также включает варианты этих нуклеиновокислотных последовательностей. Например, варианты включают нуклеотидные последовательности, которые гибридизуются с нуклеиновокислотными последовательностями, кодирующими антитела к GM-CSFRa по настоящему изобретению, по меньшей мере в умеренно жестких условиях гибридизации.
Кроме того, в настоящем изобретении предложены векторы, в которые встроена нуклеиновая кислота по настоящему изобретению.
Кратко резюмируя, экспрессия антитела к GM-CSFRa (например, полноразмерного антитела к GMCSFRa) с участием существующей в природе или полученной методом синтеза нуклеиновой кислоты, кодирующей антитело к GM-CSFRa, может быть достигнута путем вставки данной нуклеиновой кислоты в соответствующий экспрессирующий вектор таким образом, чтобы нуклеиновая кислота была функционально связана с 5'- и 3-регуляторными элементами, в том числе, например, с промотором (например, специфичным для лимфоцитов промотором) и 3'-нетранслируемым участком (UTR). Векторы могут подходить для репликации и интеграции в эукариотические клетки-хозяева. Типичные клонирующие и экспрессирующие векторы содержат терминаторы транскрипции и трансляции, инициирующие последовательности и промоторы, полезные для регуляции экспрессии желаемой нуклеиновокислотной последовательности.
Нуклеиновые кислоты по настоящему изобретению также можно использовать для иммунизации нуклеиновой кислотой и для генной терапии с применением стандартных протоколов доставки генов. Способы доставки генов известны в данной области техники. См., например, патенты США №№ 5399346, 5580859, 5589466, включенные в данное описание посредством ссылки во всей своей полноте. В некоторых воплощениях данного изобретения предложен вектор для генной терапии.
- 48 048006
Нуклеиновая кислота может быть клонирована в векторы ряда типов. Например, нуклеиновая кислота может быть клонирована в вектор, в том числе в плазмиду, фагмиду, производное фага, вирус животных и космиду, но не ограничиваясь этим. Векторы, представляющие особый интерес, включают экспрессирующие векторы, репликативные векторы, генерирующие зонды векторы и векторы для секвенирования.
Кроме того, экспрессирующий вектор может быть доставлен в клетку в форме вирусного вектора. Технология с использованием вирусных векторов хорошо известна в данной области техники и описана, например, в Green and Sambrook (2013, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York) и в других руководствах по вирусологии и молекулярной биологии. Вирусы, которые полезны в качестве векторов, включают, но не ограничиваются этим, ретровирусы, аденовирусы, аденоассоциированные вирусы, вирусы герпеса и лентивирусы. В общем случае, подходящий вектор содержит ориджин репликации, функциональный по меньшей мере в одном организме, последовательность промотора, подходящие сайты эндонуклеаз рестрикции и один или более чем один селектируемый маркер (см., например, WO 01/96584, WO 01/29058 и патент США № 6326193).
Для переноса генов в клетки млекопитающих разработан ряд систем, основанных на использовании вирусов. Например, удобную платформу для систем доставки генов обеспечивают ретровирусы. Используя методы, известные в данной области техники, выбранный ген можно встроить в вектор и упаковать в ретровирусные частицы. Затем можно выделить рекомбинантный вирус и доставить в клетки субъекта или in vivo, или ex vivo. В данной области техники известен ряд ретровирусных систем. В некоторых воплощениях используют аденовирусные векторы. В данной области техники известен ряд аденовирусных векторов. В некоторых воплощениях используют лентивирусные векторы. Векторы, происходящие из ретровирусов, таких как лентивирус, являются подходящими инструментами для достижения долгосрочного переноса генов, поскольку они обеспечивают долгосрочную, стабильную интеграцию трансгена и его размножение в дочерних клетках. Лентивирусные векторы обладают дополнительным преимуществом по сравнению с векторами, происходящими из онкоретровирусов, таких как вирусы мышиного лейкоза, заключающимся в том, что они могут трансдуцировать непролиферирующие клетки, такие как гепатоциты. У них также есть дополнительное преимущество в виде низкой иммуногенности.
Дополнительные элементы промоторов, например энхансеры, регулируют частоту инициации транскрипции. Обычно они расположены в области 30-110 пар оснований (п.о.) вверх по течению от стартового сайта, хотя недавно было показано, что ряд промоторов также содержит функциональные элементы, расположенные вниз по течению от стартового сайта. Расстояние между элементами промотора часто бывает не строго установленным, благодаря чему функция промотора сохраняется, когда элементы инвертируются или перемещаются друг относительно друга. В промоторе гена тимидинкиназы (tk) расстояние между элементами промотора может быть увеличено до 50 п.о., прежде чем активность начнет снижаться.
Одним из примеров подходящего промотора является последовательность немедленно-раннего промотора цитомегаловируса (CMV). Последовательность этого промотора представляет собой последовательность сильного конститутивного промотора, способного задавать высокие уровни экспрессии любой полинуклеотидной последовательности, связанной с ним функционально. Другим примером подходящего промотора является промотор фактора-1а элонгации роста (EF-1a). Однако, также можно использовать последовательности других конститутивных промоторов, включая, но не ограничиваясь этим, ранний промотор обезьяньего вируса 40 (SV40), промотор вируса опухоли молочной железы мышей (MMTV), промотор вируса иммунодефицита человека (ВИЧ) на основе длинного концевого повтора (LTR), промотор вируса мышиного лейкоза Молони (MoMuLV), промотор вируса лейкоза птиц, немедленно-ранний промотор вируса Эпштейна-Барр, промотор вируса саркомы Рауса, а также промоторы генов человека, такие как, но не ограничиваясь этим, промотор гена актина, промотор гена миозина, промотор гена гемоглобина и промотор гена креатинкиназы. Кроме того, данное изобретение не ограничивается применением конститутивных промоторов. Также включены индуцибельные промоторы как часть данного изобретения. Применение индуцибельного промотора обеспечивает наличие молекулярного переключателя, способного включить экспрессию полинуклеотидной последовательности, связанной с ним функционально, когда эта экспрессия желательна, или выключить экспрессию, когда экспрессия нежелательна. Примеры индуцибельных промоторов включают, но не ограничиваются этим, промотор гена металлотионина, промотор генов глюкокортикоидных рецепторов, промотор гена рецептора прогестерона и тетрациклин-чувствительный промотор.
В некоторых воплощениях экспрессия антитела к GM-CSFRa является индуцибельной. В некоторых воплощениях нуклеиновокислотная последовательность, кодирующая антитело к GM-CSFRa, функционально связана с индуцибельным промотором, в том числе с любым индуцибельным промотором, описанным в данном изобретении.
Индуцибельные промоторы.
Применение индуцибельного промотора обеспечивает наличие молекулярного переключателя, способного включить экспрессию полинуклеотидной последовательности, связанной с ним функционально,
- 49 048006 когда эта экспрессия желательна, или выключить экспрессию, когда экспрессия нежелательна. Типичные системы индуцибельных промоторов для применения в эукариотических клетках включают, но не ограничиваются этим, регулируемые гормонами элементы (например, см. Mader, S. and White, J.H. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90: 5603-5607), регулируемые синтетическими лигандами элементы (см., например, Spencer, D. M. etal. (1993) Science, 262: 1019-1024) и регулируемые ионизирующим излучением элементы (например, см. Manome, Y. et al. (1993) Biochemistry, 32: 10607-10613; Datta, R. et al. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89: 1014-10153). Другие типичные системы индуцибельных промоторов для применения в системах млекопитающих in vitro или in vivo приведены в обзоре Gingrich et al. (1998) Annual Rev. Neurosci., 21: 377-405. В некоторых воплощениях система индуцибельного промотора для применения с целью экспрессии антитела к GM-CSFRa представляет собой Tet систему. В некоторых воплощениях система индуцибельного промотора для применения с целью экспрессии антитела к GMCSFRa представляет собой систему лактозного(1ас)-репрессора из Е.соН.
Типичной системой индуцибельного промотора для применения в соответствии с настоящей заявкой является Tet система. Такие системы основаны на Tet системе, описанной Gossen и др. (1993). В типичном воплощении представляющий интерес полинуклеотид находится под контролем промотора, который содержит один или более чем один сайт для Tet оператора (TetO). В неактивном состоянии Tet penpeccop (TetR) будет связываться с сайтами TetO и репрессировать транскрипцию с промотора. В активном состоянии, например, в присутствии индуцирующего агента, такого как тетрациклин (Тс), ангидротетрациклин, доксициклин (Dox) или их активный аналог, индуцирующий агент вызывает высвобождение TetR из TetO, тем самым позволяя осуществляться транскрипции. Доксициклин является членом тетрациклинового семейства антибиотиков, имея химическое название 1-диметиламино-2,4а,5,7,12пентагидрокси-11-метил-4,6-диоксо-1,4а,11,11а,12,12а-гексагидротетрацен-3-карбоксамид.
В одном из воплощений TetR кодон-оптимизирован для экспрессии в клетках млекопитающих, например, мышиных или человеческих клетках. Большинство аминокислот кодируются более чем одним кодоном вследствие вырожденности генетического кода, что позволяет вносить существенные изменения в нуклеотидную последовательность заданной нуклеиновой кислоты без какого-либо изменения в аминокислотной последовательности, кодируемой этой нуклеиновой кислотой. Однако, многие организмы демонстрируют различия в частоте использования кодонов, также известные как предпочтение кодонов (т.е. предпочтение в отношении использования конкретного(ых) кодона(ов) для данной аминокислоты). Предпочтение кодонов часто коррелирует с наличием преобладающего вида транспортной РНК (тРНК) для конкретного кодона, что в свою очередь повышает эффективность трансляции мРНК. Соответственно, кодирующая последовательность, происходящая из конкретного организма (например, прокариота), может быть адаптирована для улучшенной экспрессии в другом организме (например, эукариоте) посредством оптимизации кодонов.
Другие конкретные варианты Tet системы включают следующие Tet-Off и Tet-On системы. В Tet-Off системе транскрипция неактивна в присутствии Тс или Dox. В этой системе контролируемый тетрациклином трансактиваторный (tTA) белок, который состоит из TetR, слитого с сильным трансактивирующим доменом белка VP16 из вируса простого герпеса, регулирует экспрессию целевой нуклеиновой кислоты, которая находится под транскрипционным контролем элемента тетрациклинчувствительного промотора (TRE). TRE состоит из конкатемеров, содержащих последовательности TetO, слитых с промотором (обычно с минимальной последовательностью промотора, происходящей из немедленно-раннего промотора цитомегаловируса человека (hCMV). В отсутствие Тс или Dox tTA связывается с TRE и активирует транскрипцию гена-мишени. В присутствии Тс или Dox tTA не может связываться с TRE, и экспрессия гена-мишени остается неактивированной.
В противоположность этому, в Tet-On системе, транскрипция активирована в присутствии Тс или Dox. Tet-On система основана на использовании обратного контролируемого тетрациклином трансактиватора, rtTA. Так же, как и tTA, rtTA представляет собой слитый белок, содержащий репрессор TetR и трансактивирующий домен VP16. Однако замена четырех аминокислот в ДНК-связывающей группировке TetR изменяет относящиеся к связыванию характеристики rtTA так, что он может распознавать последовательности TetO в TRE трансгена-мишени только в присутствии Dox. Таким образом, в Tet-On системе транскрипция TRE-регулируемого гена-мишени стимулируется rtTA только в присутствии Dox.
Другой системой индуцибельного промотора является система lac- репрессора из Е. coli (см. Brown et al., Cell, 49: 603-612 (1987)). Система lac-репрессора функционирует, регулируя транскрипцию представляющего интерес полинуклеотида, функционально связанного с промотором, содержащим lacоператор (lacO). Lac-penpeccop (lacR) связывается с LacO, предотвращая таким образом транскрипцию представляющего интерес полинуклеотида. Экспрессия представляющего интерес полинуклеотида индуцируется подходящим индуцирующим агентом, например, изопропил-в-Э-тиогалактопиранозидом (IPTG).
Чтобы оценить наличие экспрессии полипептида или его частей, экспрессирующий вектор, предназначенный для введения в клетку, также может содержать или ген селектируемого маркера, или репортерный ген, или и тот и другой, для облегчения идентификации и отбора экспрессирующих клеток из
- 50 048006 популяции клеток, в отношении которых делается попытка трансфицирования или инфицирования с использованием вирусных векторов. Согласно другим аспектам селектируемый маркер может находиться на отдельном участке ДНК и использоваться в методике совместной трансфекции. И гены селектируемых маркеров, и репортерные гены могут быть фланкированы соответствующими регуляторными последовательностями для обеспечения экспрессии в клетках хозяина. Полезные селектируемые маркеры включают, например, гены устойчивости к антибиотикам, такие как пео, и тому подобное.
Репортерные гены используют для идентификации возможно трансфицированных клеток и оценки функциональности регуляторных последовательностей. Как правило, репортерный ген представляет собой ген, который не присутствует или не экспрессируется в организме или ткани реципиента и который кодирует полипептид, экспрессию которого можно обнаружить с использованием некоторого легко детестируемого свойства, например, ферментативной активности. Экспрессию репортерного гена оценивают в подходящий момент времени после введения ДНК в реципиентные клетки. Подходящие репортерные гены могут включать гены, кодирующие люциферазу, р-галактозидазу, хлорамфениколацетилтрансферазу, секретируемую щелочную фосфатазу, или ген зеленого флуоресцентного белка (например, Ui-Tel et al, 2000, FEBS Letters, 479: 79-82). Подходящие системы экспрессии хорошо известны и могут быть получены с использованием известных методов или приобретены путем закупки. Как правило, конструкцию с минимальным 5'-фланкирующим участком, показывающую самый высокий уровень экспрессии репортерного гена, идентифицируют как промотор. Такие промоторные участки могут быть соединены с репортерным геном и использованы для оценки агентов на предмет способности модулировать управляемую промотором транскрипцию.
В некоторых воплощениях предложена нуклеиновая кислота, кодирующая полноразмерное антитело к GM-CSFRa, соответствующее любому из полноразмерных антител к GM-CSFRa, описанных в данной заявке. В некоторых воплощениях нуклеиновая кислота содержит одну или несколько нуклеиновокислотных последовательностей, кодирующих тяжелые и легкие цепи полноразмерного антитела к GMCSFRa. В некоторых воплощениях каждая из одной или нескольких нуклеиновокислотных последовательностей содержится в отдельном векторе. В некоторых воплощениях по меньшей мере некоторые из нуклеиновокислотных последовательностей содержатся в одном и том же векторе. В некоторых воплощениях все нуклеиновокислотные последовательности содержатся в одном и том же векторе. Векторы могут быть выбраны, например, из группы, состоящей из экспрессирующих векторов млекопитающих и вирусных векторов (таких как векторы, происходящие из ретровирусов, аденовирусов, аденоассоциированных вирусов, вирусов герпеса и лентивирусов).
В данной области техники известны методы введения генов в клетку и их экспрессии в клетке. Что касается экспрессирующего вектора, то данный вектор может быть легко введен в клетку хозяина, например, клетку млекопитающих, бактерий, дрожжей или насекомых, любым известным в данной области техники методом. Например, клетку хозяина можно трансфицировать экспрессирующим вектором, используя физические, химические или биологические методы.
Физические методы введения полинуклеотида в клетку хозяина включают осаждение фосфатом кальция, липофекцию, бомбардировку частицами, микроинъекцию, электропорацию и тому подобное. Методы получения клеток, содержащих векторы и/или экзогенные нуклеиновые кислоты, хорошо известны в данной области техники. См., например, Green and Sambrook (2013, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York). В некоторых воплощениях введение полинуклеотида в клетку хозяина осуществляют путем трансфекции с использованием фосфата кальция.
Биологические методы введения представляющего интерес полинуклеотида в клетку хозяина включают применение ДНК и РНК векторов. Вирусные векторы, и особенно ретровирусные векторы, стали самым широко используемым средством для встраивания генов в клетки млекопитающих, например, человеческие клетки. Другие вирусные векторы могут происходить из лентивируса, поксвирусов, вируса простого герпеса 1, аденовирусов и аденоассоциированных вирусов и тому подобного. См., например, патенты США №№ 5350674 и 5585362.
Химические средства для введения полинуклеотида в клетку хозяина включают коллоидные дисперсионные системы, такие как макромолекулярные комплексы, нанокапсулы, микросферы, гранулы и системы на основе липидов, включая эмульсии типа масло-в-воде, мицеллы, смешанные мицеллы и липосомы. Типичной коллоидной системой для применения в качестве средства доставки in vitro и in vivo является липосома (например, искусственная мембранная везикула).
В том случае, когда используется невирусная система доставки, типичным средством доставки является липосома. Для введения нуклеиновых кислот в клетку хозяина (in vitro, ex vivo или in vivo) предполагается применение липидных композиций. Согласно другому аспекту, нуклеиновая кислота может находиться в ассоциации с липидом. Нуклеиновая кислота, находящаяся в ассоциации с липидом, может быть инкапсулирована во внутреннюю водную часть липосомы, помещена в липидный бислой липосомы, присоединена к липосоме через связывающую молекулу, которая связана как с липосомой, так и с олигонуклеотидом, захвачена в липосому, может образовывать комплекс с липосомой, может быть диспергирована в растворе, содержащем липид, смешана с липидом, объединена с липидом, находиться в
- 51 048006 виде суспензии в липиде, содержаться в мицелле или образовывать комплекс с мицеллой или иным образом быть ассоциированной с липидом. Ассоциированные с липидом, липидом/ДНК или липидом/экспрессирующим вектором композиции не ограничиваются какой-либо конкретной структурой в растворе. Например, они могут быть представлены в виде бислойной структуры, в виде мицелл или колапсированной структуры. Они также могут быть просто введены в раствор с возможным образованием агрегатов неоднородного размера или формы. Липиды представляют собой жирные вещества, которые могут иметь природное или синтетическое происхождение. Например, липиды включают капли жира, которые естественным образом встречаются в цитоплазме, а также класс соединений, которые содержат длинноцепочечные алифатические углеводороды и их производные, такие как жирные кислоты, спирты, амины, аминоспирты и альдегиды.
Для подтверждения присутствия последовательности рекомбинантной ДНК в клетке хозяина могут быть выполнены различные виды анализов независимо от метода, использованного для введения экзогенных нуклеиновых кислот в клетку хозяина, или от иного воздействия ингибитора по настоящему изобретению на клетку.
Такие анализы включают, например, молекулярно-биологические анализы, хорошо известные специалистам в данной области техники, такие как саузерн- и нозерн-блоттинг, ОТ-ПЦР (полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией) и ПЦР; биохимические анализы, такие как детектирование наличия или отсутствия конкретного пептида, например, иммунологическими средствами (ELISA и вестерн-блоттинг) или с использованием анализов, изложенных в данном описании для идентификации агентов, попадающих в объем данного изобретения.
Получение антител к GM-CSFRa.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa представляет собой моноклональное антитело или происходит из моноклинального антитела. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH и VL домены или их варианты из моноклонального антитела. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa дополнительно содержит СН1 и CL домены или их варианты из моноклонального антитела. Моноклональные антитела могут быть получены, например, с использованием известных в данной области техники методов, включая методы с использованием гибридом, методы фагового дисплея или методы рекомбинантнои ДНК. Кроме того, типичные методы фагового дисплея изложены в данном описании и в приведенном ниже разделе Примеры.
В методе с использованием гибридом иммунизацию хомяка, мыши или другого соответствующего животного-хозяина обычно проводят с использованием иммунизирующего агента, чтобы вызвать активацию лимфоцитов, продуцирующих или способных продуцировать антитела, которые будут специфично связываться с иммунизирующим агентом. Альтернативно, лимфоциты могут быть активированы in vitro. Иммунизирующий агент может представлять собой полипептид или белок, слитый с представляющим интерес белком. Как правило, если желательны клетки человеческого происхождения, то используют лимфоциты периферической крови (PBL), либо, если в качестве источников желательны млекопитающие, не являющиеся человеком, то используют клетки селезенки или клетки лимфатических узлов. Далее проводят слияние лимфоцитов с линией иммортализованных клеток, используя подходящий для слияния агент, такой как полиэтиленгликоль, с образованием гибридомы. Линии иммортализованных клеток обычно представляют собой трансформированные клетки млекопитающих, в частности, миеломные клетки грызунов, крупного рогатого скота и клетки человеческого происхождения. Обычно используют линии миеломных клеток крысы или мыши. Гибридомы можно культивировать в подходящей культуральной среде, которая предпочтительно содержит одно или несколько веществ, ингибирующих рост или выживаемость не подвергшихся слиянию иммортализованных клеток. Например, если в родительских клетках отсутствует фермент гипоксантин-гуанинфосфорибозилтрансфераза (HGPRT или HPRT), то культуральная среда для гибридом обычно будет включать в себя гипоксантин, аминоптерин и тимидин (HAT среда), что предотвращает рост HGPRT-дефицитных клеток.
В некоторых воплощениях слияние линий иммортализованных клеток с отобранными антителопродуцирующими клетками происходит эффективно, при этом поддерживается стабильно высокий уровень экспрессии антитела и чувствительность к такой среде, как HAT среда. В некоторых воплощениях линии иммортализованных клеток представляют собой линии миеломных клеток мышей, которые могут быть получены, например, из Центра распределения клеток Института Солка, San Diego, California, и Американской коллекции типовых культур, Manassas, Virginia. Также описано использование линий миеломных клеток человека и гетеромиеломных клеток мыши-человека для получения моноклональных антител человека.
Далее культуральная среда, в которой культивируют гибридомы, может быть проанализирована на предмет наличия моноклональных антител, направленных против данного полипептида. Специфичность связывания моноклональных антител, продуцируемых гибридомами, можно определить посредством иммунопреципитации или в анализе связывания in vitro, таком как радиоиммуноанализ (RIA) или иммуноферментный твердофазный анализ (ELISA).
Такие методы и анализы известны в данной области техники. Аффинность связывания монокли
- 52 048006 нального антитела можно определить, например, методом Скэтчарда, приведенным в Munson and Pollard, Anal. Biochem., 107: 220 (1980).
После идентификации желаемых гибридом клоны могут быть подвергнуты субклонированию с использованием процедур предельного разведения и выращены стандартными методами (Goding, выше). Подходящие для этой цели культуральные среды включают, например, модифицированную по способу Дульбекко среду Игла и среду 1640 от Мемориального института Розуэлла Парка (RPMI). Альтернативно, гибридомы можно выращивать in vivo в виде асцита в организме млекопитающего.
Моноклональные антитела, секретированные субклонами, могут быть выделены или очищены из культуральной среды или асцитной жидкости с использованием таких традиционных методик очистки иммуноглобулинов как, например, хроматография на сефарозе с иммобилизованным белком А, хроматография на гидроксилапатите, гель-электрофорез, диализ или аффинная хроматография.
В некоторых воплощениях, соответствующих любому из антител к GM-CSFRa, описанных в данном изобретении, антитело к GM-CSFRa содержит последовательности из клона, выбранного из библиотеки антител (такой как фаговая библиотека, представляющая scFv или Fab фрагменты). Клон может быть идентифицирован путем скрининга комбинаторных библиотек для фрагментов антител с желаемой активностью или активностями. Например, в данной области техники известен ряд способов создания библиотек фагового дисплея и скрининга таких библиотек на предмет антител, обладающих желаемыми характеристиками связывания. Обзор таких методов представлен, например, в Hoogenboom et al., Methods in Molecular Biology, 178: 1-37 (O'Brien et al., ed., Human Press, Totowa, N.J., 2001) и также описан, например, в McCafferty et al., Nature, 348: 552-554; Clackson et al., Nature, 352: 624-628 (1991); Marks et al., J. Mol. Bioi, 222: 581-597 (1992); Marks and Bradbury, Methods in Molecular Biology, 248: 161-175 (Lo, ed., Human Press, Totowa, N.J., 2003); Sidhu et al., J. Mol. Bioi, 338(2): 299-310 (2004); Lee et al., J. Mol. Bioi., 340(5): 1073-1093 (2004); Fellouse, Proc. Nati. Acad Sci. USA, 101(34): 12467-12472 (2004); и Lee et al., J. Immunol. Methods, 284(1-2): 119-132 (2004).
В некоторых методах фагового дисплея репертуары генов VH и VL клонируют по отдельности, используя полимеразную цепную реакцию (ПЦР), и снова объединяют случайным образом в фаговых библиотеках, которые затем могут быть подвергнуты скринингу на предмет антигенсвязывающего фага, как описано в Winter et al., Ann. Rev. Immunol., 12: 433-455 (1994). Фрагменты антител проявляются на поверхности фага обычно в виде scFv фрагментов или в виде Fab фрагментов. Библиотеки из иммунизированных источников обеспечивают получение высокоаффинных антител к иммуногену без необходимости конструирования гибридом. Альтернативно, можно клонировать гены, относящиеся к наивному репертуару иммуноглобулинов (например, из человека), чтобы получить единый источник антител к широкому диапазону не являющихся собственными, а также собственных антигенов без какой-либо иммунизации, как описано в Griffiths et al., EMBO J., 12: 725-734 (1993). Наконец, наивные библиотеки также могут быть получены путем синтеза с использованием клонирования не подвергнутых реаранжировке сегментов V генов из стволовых клеток и с использованием ПЦР праймеров, содержащих случайную последовательность для кодирования высоко вариабельных CDR3 участков и для завершения реаранжировки in vitro, как описано в Hoogenboom and Winter, J. Mol. Biol., 227: 381-388 (1992). Патентные публикации, описывающие фаговые библиотеки человеческих антител, включают, например: патент США № 5750373 и публикации патентных заявок США №№ 2005/0079574, 2005/0119455, 2005/0266000, 2007/0117126, 2007/0160598, 2007/0237764, 2007/0292936 и 2009/0002360.
Антитела к GM-CSFRa можно получить, используя метод фагового дисплея для скрининга библиотек на предмет группировок антител к GM-CSFRa, специфичных к целевому GM-CSFRa. Такая библиотека может представлять собой библиотеку фагового дисплея для scFv антител человека, характеризующуюся разнообразием, составляющим по меньшей мере 1х 109 (например, по меньшей мере, приблизительно любое значение из 1х109, 2,5х109, 5х109, 7,5х109, 1х1010, 2,5х1010, 5х1010, 7,5х1010 или 1х1011) уникальных фрагментов человеческого антитела. В некоторых воплощениях библиотека представляет собой наивную библиотеку антител человека, сконструированную на основе ДНК, экстрагированной из РМВС человека и селезенки от здоровых доноров, охватывающую все подсемейства тяжелых и легких цепей иммуноглобулина человека. В некоторых воплощениях библиотека представляет собой наивную библиотеку антител человека, сконструированную на основе ДНК, экстрагированной из РВМС, выделенных от пациентов с различными заболеваниями, таких как пациенты с аутоиммунными заболеваниями, раковые пациенты и пациенты с инфекционными заболеваниями. В некоторых воплощениях библиотека представляет собой полусинтетическую библиотеку антител человека, в которой CDR3 тяжелых цепей является полностью рандомизированным, причем все аминокислоты (за исключением цистеина) с равной вероятностью находятся в любом заданном положении (см., например, Hoet, R.M. et al., Nat. Biotechnol., 23(3): 344-348, 2005). В некоторых воплощениях CDR3 тяжелых цепей в такой полусинтетической библиотеке антител человека составляет по длине от приблизительно 5 до приблизительно 24 (например, приблизительно любое количество из 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 или 24) аминокислот. В некоторых воплощениях библиотека представляет собой полностью синтетическую библиотеку фагового дисплея. В некоторых воплощениях библиотека представляет собой биб
- 53 048006 лиотеку фагового дисплея антител, не являющихся человеческими.
Фаговые клоны, которые связываются с целевым GM-CSFRa с высокой аффинностью, могут быть отобраны путем повторяющегося связывания фага с целевым GM-CSFRa, который присоединен к твердой подложке (такой как, например, гранулы в случае пэннинга в растворе или клетки млекопитающих в случае клеточного пэннинга), с последующим удалением несвязавшегося фага и элюированием специфично связавшегося фага. Затем связавшиеся фаговые клоны элюируют и используют для инфицирования соответствующей клетки-хозяина, такой как Е.соН XL1-Blue, для экспрессии и очистки. Пэннинг может быть выполнен за несколько (как например, приблизительно за любое число из 2, 3, 4, 5, 6 или более) раундов посредством пэннинга в растворе, клеточного пэннинга или комбинации их обоих с целью обогащения фаговых клонов, специфичных в отношении целевого GM-CSFRa. Обогащенные фаговые клоны могут быть протестированы на предмет специфического связывания с целевым GM-CSFRa любыми методами, известными в данной области техники, включая, например, ELISA и FACS.
Моноклональные антитела также могут быть получены методами рекомбинантной ДНК, такими как методы, описанные в патенте США № 4816567. ДНК, кодирующую моноклональные антитела по данной заявке, можно легко выделить и секвенировать, используя традиционные методики (например, с применением олигонуклеотидных зондов, которые способны специфично связываться с генами, кодирующими тяжелые и легкие цепи мышиных антител). Гибридомы, описанные выше, или GM-CSFRaспецифичные фаговые клоны по данной заявке могут служить в качестве источника такой ДНК. По окончании выделения можно поместить ДНК в экспрессирующие векторы, которыми затем трансфицируют клетки-хозяева, такие как COS клетки обезьяны, клетки яичника китайского хомячка (СНО) или миеломные клетки, которые без этого не могут продуцировать белок иммуноглобулин, с целью синтеза моноклональных антител в таких рекомбинантных клетках хозяина. Кроме того, ДНК может быть модифицирована, например, путем введения последовательности, кодирующей константные домены и/или каркасные области тяжелой и легкой цепи антитела человека вместо гомологичных последовательностей антитела, не являющегося человеческим (патент США № 4816567; Morrison и др., выше), или путем ковалентного присоединения к последовательности, кодирующей иммуноглобулин, всей или части последовательности, кодирующей полипептид, не являющийся иммуноглобулином. Такой не являющийся иммуноглобулином полипептид может заменять константные домены антитела по данной заявке или может заменять вариабельные домены одного антигенсвязывающего сайта антитела по данной заявке с целью создания химерного бивалентного антитела.
Антитела могут представлять собой одновалентные антитела. Способы получения одновалентных антител известны в данной области техники. Например, один из способов включает рекомбинантную экспрессию легкой цепи иммуноглобулина и модифицированной тяжелой цепи. Тяжелую цепь обычно укорачивают в любой точке Fc-области, чтобы предотвратить перекрестное сшивание тяжелых цепей. Альтернативно, релевантные остатки цистеина заменяют на остатки других аминокислот или делетируют, чтобы предотвратить перекрестное сшивание.
Для получения одновалентных антител также подходят методы in vitro. Расщепление антител с получением их фрагментов, в частности, Fab фрагментов, может быть осуществлено с использованием любого метода, известного в данной области техники.
Можно провести слияние вариабельных доменов антител, обладающих желаемыми специфичностями связывания (антигенсвязывающих сайтов антитела), с последовательностями константных доменов иммуноглобулина. Слияние предпочтительно проводят с константным доменом тяжелой цепи иммуноглобулина, содержащим по меньшей мере часть шарнирной области, СН2 и СН3 области. В некоторых воплощениях по меньшей мере в одной из слитых конструкций присутствует первая константная область тяжелой цепи (СН1), содержащая сайт, необходимый для связывания с легкой цепью. ДНК, кодирующие слитые конструкции на основе тяжелых цепей иммуноглобулинов и, при желании, легкой цепи иммуноглобулинов, встраивают в отдельные экспрессирующие векторы и используют для совместной трансфекции подходящего организма-хозяина.
Человеческие и гуманизированные антитела.
Антитела к GM-CSFRa (например, полноразмерные антитела к GM-CSFRa) могут представлять собой гуманизированные антитела или человеческие антитела. Гуманизированными формами группировок антител, не являющихся человеческими (например, мышиных), являются химерные иммуноглобулины, цепи иммуноглобулинов или их фрагменты (такие как Fv, Fab, Fab', F(ab')2, scFv или другие антигенсвязывающие подпоследовательности антител), которые обычно содержат минимальную последовательность, происходящую из иммуноглобулина, не являющегося человеческим. Группировки гуманизированных антител включают иммуноглобулины человека, цепи иммуноглобулинов или их фрагменты (реципиентное антитело), в которых остатки из CDR реципиента заменены на остатки из CDR антитела не относящегося к человеку вида (донорного антитела), такого как мышь, крыса или кролик, обладающие желаемой специфичностью, аффинностью и эффективностью. В некоторых случаях каркасные остатки Fv иммуноглобулина человека заменены на соответствующие остатки иммуноглобулина, не являющегося человеческим. Группировки гуманизированных антител также могут содержать остатки, которые не
- 54 048006 обнаруживаются ни в реципиентном антителе, ни в последовательностях импортированных CDR или каркасов. В общем случае, гуманизированное антитело может содержать по существу все вариабельные домены, выбранные из по меньшей мере одного и обычно двух вариабельных доменов, в которых все или по существу все из участков CDR соответствуют таковым из иммуноглобулина, не являющегося человеческим, и все или по существу все из последовательностей FR областей представляют собой области из консенсусной последовательности иммуноглобулина человека.
Обычно гуманизированное антитело имеет один или несколько аминокислотных остатков, введенных в него из источника, который не относится к человеку. Эти не относящиеся к человеку аминокислотные остатки часто обозначают импортируемыми остатками, которые в типичном случае берутся из импортируемого вариабельного домена. Согласно некоторым воплощениям гуманизация по существу может быть осуществлена по методу Winter и коллег (Jones et al., Nature, 321: 522-525 (1986); Riechmann et al., Nature, 332: 323-327 (1988); Verhoeyen et al., Science, 239: 1534-1536 (1988)), путем замены CDR или последовательностей CDR грызунов на соответствующие последовательности человеческого антитела. Соответственно, такие группировки гуманизированных антител представляют собой группировки антител (патент США № 4816567), в которых на соответствующую последовательность из не относящегося к человеку вида заменена часть, по существу меньшая, чем интактный вариабельный домен антитела человека. На практике, группировки гуманизированных антител обычно представляют собой группировки человеческих антител, в которых некоторые остатки CDR и возможно некоторые остатки FR заменены на остатки из аналогичных сайтов антител грызунов.
В качестве альтернативы гуманизации, фрагменты человеческих антител могут быть сконструированы. Например, в настоящее время имеется возможность создавать трансгенных животных (например, мышей), которые способны после иммунизации продуцировать полный репертуар человеческих антител в отсутствие продуцирования эндогенных иммуноглобулинов. Например, описано, что гомозиготная делеция в гене области соединения тяжелых цепей (JH) антитела у химерных мышей и мышей с мутантной зародышевой линией приводит к полному ингибированию продуцирования эндогенных антител. Перенос набора генов иммуноглобулинов зародышевой линии человека таким мышам с мутантной зародышевой линией будет приводить к получению человеческих антител после контрольного введения антигена. См., например, Jakobovits et al., PNAS USA, 90: 2551 (1993); Jakobovits et al., Nature, 362: 255-258 (1993); Bruggemann et al., Year in Immunol., 7: 33 (1993); патенты США №№ 5545806, 5569825, 5591669, 5545807; и WO 97/17852. Альтернативно, человеческие антитела могут быть получены в результате введения локусов генов иммуноглобулинов человека трансгенным животным, например, мышам, у которых гены эндогенных иммуноглобулинов были частично или полностью инактивированы. После контрольного введения наблюдается продуцирование человеческих антител, которое во всех отношениях очень похоже на таковое, имеющееся у людей, включая реаранжировку генов, сборку и репертуар антител. Этот подход описан, например, в патентах США №№ 5545807, 5545806, 5569825, 5625126, 5633425 и 5661016 и в Marks et al., Bio/Technology, 10: 779-783 (1992); Lonberg et al., Nature, 368: 856-859 (1994); Morrison, Nature, 368: 812-813 (1994); Fishwild et al., Nature Biotechnology, 14: 845- 851 (1996); Neuberger, Nature Biotechnology, 14: 826 (1996); Lonberg and Huszar, Intern. Rev. lmmunol., 13: 65-93 (1995).
Человеческие антитела также могут быть получены с использованием активированных in vitro Вклеток (см. патенты США 5567610 и 5229275) или с использованием различных методов, известных в данной области техники, включая применение библиотек фагового дисплея. Hoogenboom and Winter, J. Mol. Biol., 227: 381 (1991); Marks et al., J. Mol. Biol., 222: 581 (1991). Для получения моноклональных антител человека также могут быть применены методы Cole и др. и Boerner и др. (Cole et al., Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, p. 77 (1985) и Boerner et al., J. Immunol., 147(1): 86-95 (1991)).
Варианты антитела к GM-CSFRa.
Некоторые воплощения предусматривают варианты аминокислотной последовательности антител к GM-CSFRa (например, полноразмерного антитела к GM-CSFRa), предложенных согласно данному изобретению. Например, может оказаться желательным улучшение аффинности связывания и/или других биологических свойств антитела. Варианты аминокислотной последовательности антитела могут быть получены посредством введения соответствующих модификаций в нуклеотидную последовательность, кодирующую данное антитело, или путем пептидного синтеза. Такие модификации включают, например, делеции из, и/или вставки в, и/или замены остатков в аминокислотных последовательностях антитела. Для приближения к окончательной конструкции можно выполнить любую комбинацию делеции, вставки и замены при условии, что такая окончательная конструкция обладает желаемыми характеристиками, например, антигенсвязывающими характеристиками.
В некоторых воплощениях предложены варианты антител к GM-CSFRa, имеющие одну или более аминокислотных замены. Места, представляющие интерес с точки зрения мутагенеза с введением замен, включают HVR и FR. В антитело, представляющее интерес, можно ввести аминокислотные замены и продукты подвергнуть скринингу на предмет желаемой активности, например, улучшенной биологической активности, сохраненного/улучшенного связывания с антигеном, сниженной иммуногенности или улучшенной ADCC либо CDC. Консервативные замены показаны ниже в табл. 4.
- 55 048006
Таблица 4
Консервативные замены
| Исходный остаток | Типичные замены | Предпочтительные замены |
| Ala (А) | Val; Leu; Ile | Val |
| Arg (R) | Lys; Gin; Asn | Lys |
| Asn(N) | Gin; His; Asp, Lys; Arg | Gin |
| Asp (D) | Glu; Asn | Glu |
| Cys (С) | Ser; Ala | Ser |
| Gin (Q) | Asn; Glu | Asn |
| Glu (E) | Asp; Gin | Asp |
| Gly (G) | Ala | Ala |
| His (H) | Asn; Gin; Lys; Arg | Arg |
| lle(l) | Leu; Val; Met; Ala; Phe; норлейцин | Leu |
| Leu (L) | Норлейцин; Ile; Val; Met; Ala; Phe | Ile |
| Lys (K) | Arg; Gin; Asn | Arg |
| Met (M) | Leu; Phe; Ile | Leu |
| Phe (F) | Trp; Leu; Val; Ile; Ala; Tyr | Tyr |
| Pro (P) | Ala | Ala |
| Ser (S) | Thr | Thr |
| Thr (T) | Val; Ser | Ser |
| Trp (W) | Tyr; Phe | Tyr |
| Tyr(Y) | Trp; Phe; Thr; Ser | Phe |
| Val (V) | Ile; Leu; Met; Phe; Ala; норлейцин | Leu |
Аминокислоты могут быть классифицированы в соответствии с общими свойствами боковых цепей на:
a) гидрофобные: норлейцин, Met, Ala, Val, Leu, Ile;
b) нейтральные гидрофильные: Cys, Ser, Thr, Asn, Gln;
c) кислотные: Asp, Glu;
d) основные: His, Lys, Arg;
e) содержащие остатки, влияющие на ориентацию цепи: Gly, Pro;
f) ароматические: Trp, Tyr, Phe.
Неконсервативные замены повлекут за собой замену представителя одного из этих классов на представителя другого класса.
Типичным вариантом с заменами является антитело с созревшей аффинностью, которое может быть создано подходящим образом, например, с использованием методов созревания аффинности, основанных на применении фагового дисплея. Кратко, вводят мутации по одному или более остаткам CDR, проявляют вариантные антитела на поверхности фага и проводят скрининг на предмет конкретной биологической активности (например, биологической активности на основе анализа пролиферации TF-1 клеток или аффинности связывания). Можно внести изменения (например, замены) в HVR, например, для улучшения биологической активности на основе анализа пролиферации TF-1 клеток или аффинности антител. Такие изменения могут быть выполнены в горячих точках HVR, т.е. в остатках, кодируемых кодонами, которые с высокой частотой подвержены мутации в процессе соматического созревания (см., например, Chowdhury, Methods Mol. Biol., 207: 179-196 (2008)), и/или в определяющих специфичность остатках (SDR), при этом полученный вариант VH или VL тестируют в отношении аффинности связывания. Метод созревания аффинности путем конструирования вторичных библиотек и повторного отбора из них описан, например, Hoogenboom и др. в Methods in Molecular Biology, 178: 1-37 (O'Brien et al., ed., Human Press, Totowa, NJ (2001)).
В некоторых воплощениях метода созревания аффинности разнообразие в гены вариабельной области, выбранные для созревания, вносят любым из ряда способов (например, посредством допускающей ошибки ПЦР, перетасовки цепей или олигонуклеотид-направленного мутагенеза). Затем создают вторичную библиотеку. После этого проводят скрининг данной библиотеки с целью идентификации любых вариантов антител с желаемой аффинностью. Другой способ внесения разнообразия включает HVRнаправленные подходы, при которых рандомизируют несколько остатков HVR (например, 4-6 остатков
- 56 048006 одновременно). Остатки HVR, вовлеченные в связывание с антигеном, можно специфически идентифицировать, например, используя аланин-сканирующий мутагенез или моделирование. Особенно часто мишенями становятся CDR-H3 и CDR-L3.
В некоторых воплощениях замены, вставки или делеции могут осуществляться в пределах одного или более HVR при условии, что такие изменения по существу не снижают способности антитела связываться с антигеном. Например, в HVR могут быть выполнены консервативные изменения (например, консервативные замены, предусмотренные в данном изобретении), которые по существу не снижают аффинности связывания. Такие изменения могут быть вне горячих точек HVR или вне SDR. В некоторых воплощениях последовательностей вариантов VH и VL, предложенных выше, каждый HVR либо не изменен, либо содержит не более одной, двух или трех аминокислотных замен.
Полезный способ идентификации остатков или участков антитела, которые могут быть мишенью для мутагенеза, называется аланин-сканирующим мутагенезом, описанным в Cunningham and Wells (1989) Science, 244: 1081-1085. В этом способе идентифицируют остаток или группу целевых остатков (например, заряженные остатки, такие как остатки arg, asp, his, lys и glu) и заменяют на остаток нейтральной или отрицательно заряженной аминокислоты (например, аланина или полиаланина), чтобы определить, повлияет ли это на взаимодействие антитела с антигеном. В положениях аминокислот, демонстрирующих функциональную чувствительность к первоначальным заменам, могут быть выполнены дальнейшие замены. Альтернативно или помимо этого, для идентификации точек контакта между антителом и антигеном может быть определена кристаллическая структура комплекса антиген-антитело. Такие контактирующие остатки и соседние с ними остатки могут быть выявлены в качестве мишени или исключены из кандидатов на замену. Варианты можно подвергнуть скринингу, чтобы определить, проявляют ли они желаемые свойства.
Вставки в аминокислотную последовательность включают вставки с получением амино- и/или карбоксил-концевых слитых конструкций длиной от одного остатка до полипептидов, содержащих сто или более остатков, а также вставки одного или нескольких аминокислотных остатков внутрь последовательности. Примеры концевых вставок включают антитело с N-концевым метионильным остатком. Другие варианты молекулы антитела со вставками включают слитую конструкцию, в которой N- или Сконец антитела соединен с ферментом (например, для антитело-опосредованной терапии с использованием ферментов и пролекарств (ADEPT)) или полипептидом, что увеличивает период полувыведения антитела из сыворотки крови.
В некоторых воплощениях данного изобретения предложены антитела к GM-CSFRa, содержащие VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в VH; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57 или их вариант, содержащий примерно до 5 аминокислотных замен в VL.
В некоторых воплощениях данного изобретения предложены антитела к GM-CSFRa, содержащие VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, при этом данный VH содержит аминокислотные замены, содержащие остатки аминокислот Е, Н, N, G, D, M, S, Р, F, Y, А, V, K, W, R или С в положении 31.
В некоторых воплощениях данного изобретения предложены антитела к GM-CSFRa, содержащие VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, при этом данный VH содержит аминокислотные остатки, выбранные из Т, Н, V, Е, Р, L, M, S, W, С, A, G, N или K в положении 28, и/или аминокислотные остатки, выбранные из Т, Р, D, E, Y, W, V, М, N, L, Q, G, S, А, K или R в положении 30.
В некоторых воплощениях данного изобретения предложены антитела к GM-CSFRa, содержащие VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, при этом данный VL содержит аминокислотные замены, содержащие S, L, N, А, K, R, I, Q, G, Т, Н, М или С в положении 26; и/или Q, Y, P, A, I, F, T, R, V, L, E, S или С в положении 27; и/или S, H, W, L, R, K, Т, Р, I, F, V, Е, А или Q в положении 28; и/или S, L, W, M, A, Y, K, R, G, Т, Е, V, N, F или С в положении 30; и/или S, T, R, A, H, Q, P, M, L или G в положении 31; и/или Y, L или F в положении 32; и/или G или Т в положении 50; и/или A, G, R, Н, K, S, T, M, F, N или V в положении 51; и/или S, A, W, R, L, T, Q, F, Y, Н или N в положении 52; и/или D, A, Q или W в положении 92; и/или N, D, E, T, Y, G, A, M, F, S, I или L в положении 93.
В некоторых воплощениях включена любая аминокислотная замена или комбинация аминокислотных замен, которые показаны в табл. 15.
- 57 048006
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 241 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 241.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 193 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 193.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 248 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 188 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 248, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 188.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 248 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 193 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 248, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 193.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 288 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 288.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 188 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 188. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 236 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 236.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% (например, по меньшей мере примерно любое значение из 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) идентичности последовательности, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 288 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 288.
Варианты Fc-области.
В некоторых воплощениях в Fc-область антитела (например, полноразмерного антитела к GMCSFRa или антитела к GM-CSFRa в формате Fc-слитого белка), предложенного в данном изобретении, может быть введена одна или несколько аминокислотных модификаций с получением тем самым варианта Fc-области. В некоторых воплощениях вариант Fc-области обладает усиленной ADCC эффекторной
- 58 048006 функцией, часто обусловленной связыванием с Fc-рецепторами (FcR). В некоторых воплощениях вариант Fc-области обладает ослабленной ADCC эффекторной функцией. Имеется много примеров изменений или мутаций последовательностей Fc, которые могут затрагивать эффекторную функцию. Например, в WO 00/42072 и Shields et al., J. Biol. Chem., 9(2): 6591-6604 (2001) описываются варианты антитела с улучшенным или ухудшенным связыванием с FcR. Содержание этих публикаций специально включено в данное описание посредством ссылки.
Антителозависимая клеточно-опосредованная цитотоксичность (ADCC) представляет собой механизм действия терапевтического антитела против опухолевых клеток. ADCC представляет собой клеточно-опосредованную иммунную защиту, благодаря которой эффекторная клетка иммунной системы активно лизирует клетку-мишень (например, раковую клетку), антигены на поверхности мембраны которой связаны со специфичными антителами (например, антителом к GM-CSFRa). Типичная ADCC заключается в активации NK клеток антителами. NK клетка экспрессирует CD16, который является Fcрецептором. Этот рецептор распознает Fc часть и связывается с Fc частью антитела, связанного с поверхностью клетки-мишени. Самый распространенный Fc-рецептор на поверхности NK клетки называется CD16 или FcyRIII. Связывание Fc-рецептора с Fc-областью антитела приводит к активации NK клетки, высвобождению цитолитических гранул и последующему апоптозу клетки-мишени. Вклад ADCC в цитолиз опухолевых клеток можно измерить с применением специфического теста, в котором используются NK-92 клетки, трансфицированные геном высокоаффинного FcR. Результаты сравнивают с NK-92 клетками дикого типа, которые не экспрессируют FcR.
В некоторых воплощениях данное изобретение предусматривает вариант антитела к GM-CSFRa (как например, вариант полноразмерного антитела к GM-CSFRa), содержащий Fc-область, обладающий некоторыми, но не всеми эффекторными функциями, что делает его желаемым кандидатом для практических применений, в которых важным является период полувыведения антитела к GM-CSFRa in vivo, в то время как некоторые эффекторные функции (такие как CDC и ADCC) не являются необходимыми или являются вредными. Для подтверждения снижения/истощения CDC- и/или ADCC-активностей можно провести анализы цитотоксичности in vitro и/или in vivo. Например, можно провести анализы связывания с Fc-рецепторами (FcR), чтобы убедиться, что у данного антитела отсутствует способность связываться с FcyR (поэтому, вероятнее всего, отсутствует ADCC-активность), но сохраняется способность связываться с FcRn (неонатальный Fc-рецептор). Первичные клетки для опосредования ADCC, NK-клетки, экспрессируют только FcyRIII, в то время как моноциты экспрессируют FcyRI, FcyRII и FcyRIII. Данные по экспрессии FcR на гемопоэтических клетках суммированы в табл. 3 на странице 464 в Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol., 9: 457-492 (1991). Неограничивающие примеры анализов in vitro для оценки ADCCактивности молекулы, представляющей интерес, описаны в патенте США № 5500362 (см., например, Hellstrom I. et al., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA, 83: 7059-7063 (1986)) и Hellstrom I. et al., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA, 82: 1499-1502 (1985); в патенте США № 5821337 (см. Bruggemann M. et al., J. Exp. Med., 166: 13511361 (1987)). Альтернативно, можно применять нерадиоактивные методы анализа (см., например, анализ цитотоксичности ACTI™ для проточной цитометрии без использования радиоактивной метки (CellTechnology, Inc. Mountain View, Calif.) и анализ цитотоксичности CYTOTOX 96™ без использования радиоактивной метки (Promega, Madison, Wis.). Полезные для таких анализов эффекторные клетки включают мононуклеарные клетки периферической крови (РВМС) и природные киллерные (NK) клетки. Альтернативно или помимо этого, ADCC-активность молекулы, представляющей интерес, можно оценить in vivo, например, в животной модели, такой как описана в Clynes et al., Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA, 95: 652-656 (1998). Также можно провести анализы связывания с C1q для подтверждения того, что антитело не обладает способностью связываться с C1q и, следовательно, не обладает CDC-активностью. См., например, данные ELISA по связыванию с C1q и С3с в WO 2006/029879 и WO 2005/100402. Для оценки активации системы комплемента можно провести анализ CDC (см., например, Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods, 202: 163 (1996); Cragg M.S. et al., Blood, 101: 1045-1052 (2003); и Cragg M.S. and M.J. Glennie, Blood, 103: 2738-2743 (2004)). Определения связывания с FcRn и клиренса/периода полувыведения in vivo также могут быть проведены с использованием методов, известных в данной области техники (см., например, Petkova S.B. et al., Int'I. Immunol. 18(12): 1759-1769 (2006)).
Антитела с ослабленной эффекторной функцией включают антитела с заменой одного или более остатков в Fc-области в положениях 238, 265, 269, 270, 297, 327 и 329 (патент США № 6737056). Такие Fc-мутанты включают Fc-мутанты с заменами аминокислот в двух или более положениях 265, 269, 270, 297 и 327, включая так называемый Fc-мутант DANA с заменой остатков 265 и 297 на аланин (патент США № 7332581).
Описаны несколько вариантов антител с улучшенным или ухудшенным связыванием с FcR (см., например, патент США № 6737056; WO 2004/056312, и Shields et al., J. Biol. Спет., 9(2): 6591-6604 (2001)).
В некоторых воплощениях предложен вариант антитела к GM-CSFRa (такого как полноразмерное антитело к GM-CSFRa), содержащий вариант Fc-области, содержащий одну или несколько аминокислотных замен, которые улучшают ADCC. В некоторых воплощениях вариант Fc-области содержит одну
- 59 048006 или несколько аминокислотных замен, которые улучшают ADCC, при этом замены находятся в положениях 298, 333 и/или 334 варианта Fc-области (нумерация остатков согласно EU). В некоторых воплощениях вариант антитела к GM-CSFRa (например, полноразмерного антитела к GM-CSFRa) содержит следующие аминокислотные замены в своем варианте Fc-области: S298A, Е™А и К334А.
В некоторых воплощениях в Fc-области выполнены изменения, которые влияют на (т.е. либо улучшают, либо ухудшают) связывание с C1q и/или комплементзависимую цитотоксичность (CDC), например, как описано в патенте США № 6194551, WO 99/51642 и Idusogie et al., J. Immunol., 164: 4178-4184 (2000).
В некоторых воплощениях предложен вариант антитела к GM-CSFRa (такого как полноразмерное антитело к GM-CSFRa), содержащий вариант Fc-области, содержащий одну или несколько аминокислотных замен, которые увеличивают период полувыведения и/или улучшают связывание с неонатальным Fc-рецептором (FcRn). Антитела с увеличенными периодами полувыведения и улучшенным связыванием с FcRn описаны в US2005/0014934A1 (Hinton и др.). Такие антитела содержат Fc-область с одной или несколькими заменами в ней, которые улучшают связывание Fc-области с FcRn. Такие варианты Fcобласти включают варианты с заменами в одном или нескольких остатках Fc-области: 238, 256, 265, 272, 286, 303, 305, 307, 311, 312, 317, 340, 356, 360, 362, 376, 378, 380, 382, 413, 424 или 434, например, с заменой остатка 434 в Fc-области (патент США №7371826).
Также см. Duncan & Winter, Nature, 322: 738-40 (1988); патент США №5648260; патент США № 5624821 и WO 94/29351, касающиеся других примеров вариантов Fc-области.
Включены антитела к GM-CSFRa (как например, полноразмерные антитела к GM-CSFRa), содержащие любой из вариантов Fc-области, описанных в данном изобретении, или их комбинации.
Варианты гликозилирования.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa (такое как полноразмерное антитело к GMCSFRa), предложенное в данном изобретении, изменено с целью увеличения или уменьшения степени гликозилирования этого антитела к GM-CSFRa. Добавление или удаление сайтов гликозилирования у антитела к GM-CSFRa можно осуществлять подходящим образом путем изменения аминокислотной последовательности антитела к GM-CSFRa или части его полипептида таким образом, чтобы создавался или удалялся один или более чем один сайт гликозилирования.
В тех случаях, когда антитело к GM-CSFRa содержит Fc-область, присоединенный к ней углевод может быть изменен. Нативные антитела, продуцируемые клетками млекопитающих, обычно содержат разветвленный, биантенный олигосахарид, который, как правило, присоединен через N-связь к Asn297 CH2 домена Fc-области. См., например, Wright et al., TIBTECH, 15: 26-32 (1997). Олигосахарид может содержать различные углеводы, например, маннозу, N-ацетилглюкозамин (GlcNAc), галактозу и сиаловую кислоту, а также фукозу, присоединенную к GlcNAc в стволе биантенной структуры олигосахарида. В некоторых воплощениях могут быть выполнены модификации олигосахарида в антителе к GMCSFRa по данному изобретению с целью создания вариантов антитела к GM-CSFRa с определенными улучшенными свойствами.
N-Гликаны, присоединенные к СН2 домену Fc-области, являются гетерогенными. Антитела или слитые с Fc белки, образуемые в клетках СНО, являются фукозилированными в результате проявления фукозилтрансферазной активности. См. Shoji-Hosaka et al., J. Biochem., 2006, 140: 777-83. В норме в сыворотке крови человека может быть обнаружено небольшое процентное содержание природных нефукозилированных IgG. N-Гликозилирование Fc-области важно для связывания с FcyR; и отсутствие фукозилирования у N-гликана усиливает способность Fc-области связываться с FcYRllla. Усиление связывания с FcYRIIIa может повышать ADCC, что может иметь преимущество при определенных терапевтических применениях антител, для которых цитотоксичность является желательной.
В некоторых воплощениях усиленная эффекторная функция может быть неблагоприятна, когда нежелательна Fc-опосредуемая цитотоксичность. В некоторых воплощениях Fc фрагмент или СН2 домен не гликозилирован. В некоторых воплощениях сайт N-гликозилирования в СН2 домене подвергнут мутации для предотвращения гликозилирования.
В некоторых воплощениях предложены варианты антитела к GM-CSFRa (такого как полноразмерное антитело к GM-CSFRa), содержащие Fc-область, при этом углеводная структура, присоединенная к Fc-области, имеет сниженное содержание остатков фукозы или не содержит остатков фукозы, что может улучшить ADCC-функцию. В частности, в данную заявку включены антитела к GM-CSFRa, имеющие сниженное содержание остатков фукозы по сравнению с количеством остатков фукозы в таком же антителе к GM-CSFRa, образованном в клетке СНО дикого типа. То есть, они характеризуются меньшим количеством остатков фукозы, чем если бы они были образованы в нативных клетках СНО (например, в клетке СНО, в которой сохраняется нативная картина гликозилирования, такой как клетка СНО, содержащая нативный ген a-1,6-фукозилтрансферaзы (FUT8)). В некоторых воплощениях антитело к GMCSFRa представляет собой антитело, у которого меньше чем примерно 50%, 40%, 30%, 20%, 10% или 5% N-связанных гликанов содержат остатки фукозы. Например, количество остатков фукозы в таком
- 60 048006 антителе к GM-CSFRa может составлять от 1% до 80%, от 1% до 65%, от 5% до 65% или от 20% до 40%. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa представляет собой антитело, у которого ни один из N-связанных гликанов не содержит остатков фукозы, т.е. когда антитело к GM-CSFRa вообще не имеет остатков фукозы, или не содержит никаких остатков фукозы, или является нефукозилированным. Количество остатков фукозы определяют, подсчитывая среднее количество остатков фукозы в углеводной цепи при Asn297 относительно общего количества всех гликоструктур, присоединенных к Asn 297 (например, комплексных, гибридных и высокоманнозных структур) по данным время-пролетной массспектрометрии с ионизацией посредством лазерной десорбции ионов из матрицы (MALDI-TOF), как описано, например, в WO 2008/077546. Обозначение Asn297 относится к остатку аспарагина, локализованному примерно в положении 297 в Fc-области (нумерация остатков Fc-области согласно EU-индексу); однако, Asn297 также может быть локализован на расстоянии примерно 3 аминокислоты выше по течению или ниже по течению относительно положения 297, т.е. между положениями 294 и 300, вследствие незначительных вариаций последовательности антител. Такие фукозилированные варианты могут иметь улучшенную ADCC-функцию. См., например, публикации заявок на патент США №№ US 2003/0157108 (Presta L); US 2004/0093621 (Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd). Примеры публикаций, касающихся дефукозилированных или дефицитных по фукозе вариантов антител, включают: US 2003/0157108; WO 2000/61739; WO 2001/29246; US 2003/0115614; US 2002/0164328; US 2004/0093621; US 2004/0132140; US 2004/0110704; US 2004/0110282; US 2004/0109865; WO 2003/085119; WO 2003/084570; WO 2005/035586; WO 2005/035778; WO 2005/053742; WO 2002/031140; Okazaki et al., J. Mol. Biol., 336: 1239-1249 (2004); Yamane-Ohnuki et al., Biotech. Bioeng., 87: 614 (2004). Примеры клеточных линий, способных продуцировать дефукозилированные антитела, включают СНО-клетки Lec13, дефицитные по фукозилированию белка (Ripka et al., Arch. Biochem.Biophys., 249: 533-545 (1986); патентная заявка США № US 2003/0157108 A1, Presta L; и WO 2004/056312 A1, Adams и др., в частности, в примере 11), и нокаутные клеточные линии, как например, СНО-клетки с нокаутом гена альфа-1,6-фукозилтрансферазы, FUT8 (см., например, Yamane-Ohnuki et al., Biotech. Bioeng., 87: 614 (2004); Kanda, Y. et al., Biotechnol. Bioeng., 94(4): 680-688 (2006) и WO 2003/085107).
Далее предложены варианты антитела к GM-CSFRa (такого как полноразмерное антитело к GMCSFRa) с раздвоенными олигосахаридами, например, в которых биантенный олигосахарид, присоединенный к Fc-области антитела к GM-CSFRa, имеет точки ветвления при GlcNAc. Такие варианты антитела к GM-CSFRa (например, полноразмерного антитела к GM-CSFRa) могут иметь более низкую степень фукозилирования и/или улучшенную ADCC-функцию. Примеры таких вариантов антитела описаны, например, в WO 2003/011878 (Jean-Mairet и др.); патенте США № 6602684 (Umana и др.); US 2005/0123546 (Umana и др.) и в Ferrara et al., Biotechnology and Bioengineering, 93(5): 851-861 (2006). Также предложены варианты антитела к GM-CSFRa (такого как полноразмерное антитело к GMCSFRa), содержащие по меньшей мере один остаток галактозы в олигосахариде, присоединенном к Fcобласти. Такие варианты антитела к GM-CSFRa могут иметь улучшенную CDC-функцию. Такие варианты антител описаны, например, в WO 1997/30087 (Patel и др.); WO 1998/58964 (Raju S.) и WO 1999/22764 (Raju S.).
В некоторых воплощениях варианты антитела к GM-CSFRa (такого как полноразмерное антитело к GM-CSFRa), содержащие Fc-область, обладают способностью связываться с FcyRIII. В некоторых воплощениях варианты антитела к GM-CSFRa (такого как полноразмерное антитело к GM-CSFRa), содержащие Fc-область, обладают ADCC-активностью в присутствии эффекторных клеток человека (например, Т-клеток) или обладают более высокой ADCC-активностью в присутствии эффекторных клеток человека по сравнению с иным таким же антителом к GM-CSFRa (таким как полноразмерное антитело к GM-CSFRa), содержащим Fc-область человеческого IgG1 дикого типа.
Варианты, сконструированные с остатками цистеина.
В некоторых воплощениях может быть желательно создать сконструированные с остатками цистеина антитела к GM-CSFRa (такие как полноразмерное антитело к GM-CSFRa), в которых один или несколько аминокислотных остатков заменены на остатки цистеина. В некоторых воплощениях заменяемые остатки находятся в доступных сайтах антитела к GM-CSFRa. В результате замены этих остатков на остатки цистеина реакционноспособные тиоловые группы будут располагаться в доступных сайтах антитела к GM-CSFRa и могут быть использованы для конъюгирования антитела к GM-CSFRa с другими группировками, такими как группировки лекарственного средства или группировки соединенного с линкером лекарственного средства, с целью создания иммуноконъюгата на основе антитела к GM-CSFRa, как описано далее в данном изобретении. Сконструированные с остатками цистеина антитела к GMCSFRa (например, полноразмерные антитела к GM-CSFRa) могут быть созданы так, как описано, например, в патенте США № 7521541.
Производные.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa (такое как полноразмерное антитело к GMCSFRa), предложенное в данном изобретении, может быть дополнительно модифицировано с тем, чтобы
- 61 048006 содержать дополнительные небелковые группировки, которые известны в данной области техники и легко доступны. Группировки, подходящие для получения производных антитела к GM-CSFRa, включают, но не ограничиваются этим, водорастворимые полимеры. Неограничивающие примеры водорастворимых полимеров включают, но не ограничиваются этим, полиэтиленгликоль (ПЭГ), сополимеры этиленгликоля/пропиленгликоля, карбоксиметилцеллюлозу, декстран, поливиниловый спирт, поливинилпирролидон, поли-1,3-диоксолан, поли-1,3,6-триоксан, сополимер этилена и малеинового ангидрида, полиаминокислоты (или гомополимеры, или статистические сополимеры), декстран или поли(Квинилпирролидон)полиэтиленгликоль, гомополимеры пропропиленгликоля, сополимеры пропропиленоксида/этиленоксида, полиоксиэтилированные полиолы (например, глицерин), поливиниловый спирт и их смеси. Полиэтиленгликоль-пропиональдегид может иметь преимущества при изготовлении ввиду его стабильности в воде. Полимер может иметь любую молекулярную массу и может быть разветвленным или неразветвленным. Число молекул полимеров, присоединенных к антителу к GM-CSFRa, может варьировать и, если присоединено больше одной молекулы полимера, то они могут представлять собой одинаковые или разные молекулы. В общем случае число молекул и/или тип полимеров, используемых для получения производных, могут быть определены на основании соображений, включая, но не ограничиваясь этим, конкретные свойства или функции антитела к GM-CSFRa, подлежащие улучшению, а также будет ли производное антитела к GM-CSFRa использовано в терапии в определенных условиях и так далее.
Фармацевтические композиции.
Кроме того, в данном изобретении предложены композиции (такие как фармацевтические композиции, также называемые в данном описании как препараты), содержащие любое из антител к GM-CSFRa (таких как полноразмерное антитело к GM-CSFRa), нуклеиновые кислоты, кодирующие антитела, векторы, содержащие нуклеиновые кислоты, кодирующие антитела, или клетки-хозяева, содержащие нуклеиновые кислоты или векторы, описанные в данном изобретении. В некоторых воплощениях предложена фармацевтическая композиция, содержащая любое из антител к GM-CSFRa, описанных в данном изобретении, и фармацевтически приемлемый носитель.
Подходящие композиции на основе антител к GM-CSFRa готовят путем смешивания антитела к GM-CSFRa, имеющего желаемую степень чистоты, с возможными фармацевтически приемлемыми носителями, эксципиентами или стабилизаторами (Remington's Pharmaceutical Sciences, 16-е издание, под ред. Osol А. (1980)) в форме лиофилизированных композиций или водных растворов. Приемлемые носители, эксципиенты или стабилизаторы нетоксичны для реципиентов в применяемых дозировках и концентрациях и включают буферы, например, на основе фосфата, цитрата и других органических кислот; антиоксиданты, в том числе аскорбиновую кислоту и метионин; консерванты (такие как октадецилдиметилбензиламмония хлорид; гексаметония хлорид; бензалкония хлорид; бензетония хлорид; фенол, бутиловый или бензиловый спирт;
алкилпарабены, такие как метил- или пропилпарабен; катехол; резорцин; циклогексанол; 3пентанол; и м-крезол); низкомолекулярные (состоящие из менее чем примерно 10 остатков) полипептиды; белки, такие как сывороточный альбумин, желатин или иммуноглобулины; гидрофильные полимеры, такие как поливинилпирролидон; аминокислоты, такие как глицин, глутамин, аспарагин, гистидин, аргинин или лизин; моносахариды, дисахариды и другие углеводы, в том числе глюкозу, маннозу или декстрины; хелатирующие агенты, такие как этилендиаминтетрауксусная кислота (EDTA); сахара, такие как сахароза, маннит, трегалоза или сорбит; солеобразующие противоионы, такие как ионы натрия; комплексы с металлами (например, комплексы Zn-белок); и/или неионные поверхностно-активные вещества, такие как Tween™, PLURONICS™ или полиэтиленгликоль (ПЭГ). Типичные композиции описаны в заявке WO98/56418, специально включенной в данное описание посредством ссылки. Лиофилизированные композиции, адаптированные для подкожного введения, описаны в WO97/04801. Такие лиофилизированные композиции могут быть повторно разведены в подходящем разбавителе с получением высокой концентрации белка и такую повторно разведенную композицию можно вводить подкожно подлежащему лечению индивиду согласно данному описанию. Чтобы доставить антитела к GM-CSFRa по этой заявке в клетки, можно использовать липофектины или липосомы.
Упомянутая в данном описании композиция также может содержать одно или более активных соединений помимо антитела к GM-CSFRa (такого как полноразмерное антитело к GM-CSFRa), если это необходимо для конкретного подлежащего лечению показания, предпочтительно соединений с дополняющими видами активности, которые не влияют друг на друга отрицательно. Например, может быть желательно обеспечить дополнительно наличие противоопухолевого агента, ингибирующего рост агента, цитотоксического агента или химиотерапевтического агента помимо антитела к GM-CSFRa. Такие молекулы соответственно присутствуют в комбинации в количествах, которые эффективны для предполагаемой цели. Эффективное количество таких других агентов зависит от количества антитела к GMCSFRa, присутствующего в композиции, типа заболевания или расстройства либо способа лечения и других факторов, обсуждаемых выше. Их обычно используют в тех же дозировках и с теми же путями введения, которые описаны в данном изобретении, или в количестве примерно от 1 до 99% от описанных
- 62 048006 ранее дозировок.
Антитела к GM-CSFRa (например, полноразмерные антитела к GM-CSFRa) также могут быть заключены в микрокапсулы, приготовленные, например, с использованием методов коацервации или путем межфазной полимеризации, например, в микрокапсулы из гидроксиметилцеллюлозы или желатина и микрокапсулы из поли-(метилметакрилата), соответственно, в коллоидные системы лекарственной доставки (например, липосомы, микросферы из альбумина, микроэмульсии, наночастицы и нанокапсулы) или в макроэмульсии. Могут быть приготовлены препараты с длительным высвобождением.
На основе антител к GM-CSFRa (например, полноразмерных антител к GM-CSFRa) можно приготовить препараты с длительным высвобождением.
Подходящие примеры препаратов с длительным высвобождением включают полупроницаемые матрицы из гидрофобных полимеров в твердой форме, содержащие антитело (или его фрагмент), причем эти матрицы существуют в виде изделий определенной формы, например, пленок или микрокапсул. Примеры матриц с длительным высвобождением включают сложные полиэфиры, гидрогели (например, поли(2-гидроксиэтил-метакрилат) или поли(виниловый спирт)), полилактиды (патент США № 3773919), сополимеры L-глутаминовой кислоты и этил-1-глутамата, неразлагаемый этилен-винилацетат, разлагаемые сополимеры молочной кислоты и гликолевой кислоты, такие как LUPRON DEPOT™ (инъекционные микросферы, состоящие из сополимера молочной кислоты и гликолевой кислоты и из ацетата лейпролида), и поли-Э-(-)-3-гидроксимасляную кислоту. В то время как полимеры, такие как этилен-винилацетат и сополимер молочной кислоты и гликолевой кислоты способны высвобождать молекулы в течение более 100 суток, высвобождение белков из некоторых гидрогелей происходит в течение более коротких периодов времени. Если инкапсулированные антитела остаются в организме в течение длительного времени, то они могут денатурировать или агрегировать под действием влаги при 37°С, что приводит к потере биологической активности и возможным изменениям в иммуногенности. В зависимости от задействованного механизма могут быть разработаны рациональные стратегии стабилизации антител к GMCSFRa. Например, если обнаруживается, что механизм агрегации заключается в образовании межмолекулярных S-S связей посредством тиодисульфидного обмена, то стабилизация может быть достигнута путем модификации сульфгидрильных остатков, лиофилизации из кислых растворов, регулирования содержания влаги с использованием соответствующих вспомогательных веществ и разработки полимерных матриц специального состава.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa (такое как полноразмерное антитело к GMCSFRa) готовят в буфере, содержащем цитрат, NaCl, ацетат, сукцинат, глицин, полисорбат 80 (твин 80) или любую комбинацию из перечисленного выше.
Композиции, применяемые для введения in vivo, должны быть стерильными.
Такую стерилизацию легко осуществить, например, посредством фильтрования через стерильные фильтрующие мембраны.
Способы лечения с использованием антител к GM-CSFRa.
Антитела к GM-CSFRa (например, полноразмерные антитела к GM-CSFRa) и/или композиции по данному изобретению могут быть введены индивидам (например, млекопитающим, таким как люди) для лечения заболевания или расстройства, ассоциированного с высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa, и заболевания или расстройства с нарушенным функционированием GM-CSF и/или GM-CSFRa, такого как аутоиммунные и/или воспалительные состояния или рак, характеризующиеся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GMCSF/GM-CSFRa, например, ревматоидный артрит, астма и миелоидный лейкоз, легочное заболевание. Таким образом, согласно настоящему изобретению в некоторых воплощениях предложен способ лечения аутоиммунного и/или воспалительного состояния или рака, характеризующихся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидного артрита, астмы или миелоидного лейкоза), у индивида, включающий введение индивиду эффективного количества композиции (такой как фармацевтическая композиция), содержащей антитело к GM-CSFRa (например, полноразмерное антитело к GM-CSFRa), как например, любое из антител к GM-CSFRa (например, полноразмерных антител к GM-CSFRa), описанных в данном изобретении.
В некоторых воплощениях заболевание или состояние выбрано, например, из группы, состоящей из ревматоидного артрита, астмы, хронической обструктивной болезни легких, аллергической реакции, рассеянного склероза, миелоидного лейкоза и атеросклероза. В некоторых воплощениях индивидом является человек.
Например, в некоторых воплощениях предложен способ лечения индивида, имеющего аутоиммунное и/или воспалительное состояние или рак, характеризующиеся высокими уровнями экспрессии GMCSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидный артрит, астму или миелоидный лейкоз), включающий введение индивиду эффективного количества фармацевтической композиции, содержащей антитело к GM-CSFRa (например, полноразмерное антитело к GM-CSFRa), специфично связывающееся с эпитопом на GM-CSFRa человека, при этом дан
- 63 048006 ный эпитоп содержит аминокислотные остатки Val50, Glu59, Lys194, Lys195, Arg283 и Ile284 в GMCSFRa человека. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, описанное в данном изобретении, специфично связывается с эпитопом на GM-CSFRa человека, при этом данный эпитоп содержит аминокислотные остатки Val50, Glu59, Lys194, Lys195, Arg283, Ile284, Val51, Thr63 и Il196. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, описанное в данном изобретении, специфично связывается с эпитопом на GM-CSFRa человека, при этом данный эпитоп содержит аминокислотные остатки Val50, Glu59, Lys194, Lys195, Arg283, Ile284, Leu191 и Ile196. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, описанное в данной заявке, специфично связывается с эпитопом на GM-CSFRa человека, при этом данный эпитоп содержит аминокислотные остатки Val50, Glu59, Lys194, Lys195, Arg283, Ile284, Arg49, Val51, Asn57, и Ser61. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa представляет собой полноразмерное антитело. В некоторых воплощениях полноразмерное антитело к GM-CSFRa представляет собой антитело IgG1 или IgG4 типа. В некоторых воплощениях заболевание или состояние выбрано из группы, состоящей из ревматоидного артрита, астмы, хронической обструктивной болезни легких, аллергической реакции, рассеянного склероза, миелоидного лейкоза и атеросклероза. В некоторых воплощениях индивидом является человек.
В некоторых воплощениях предложен способ лечения индивида, имеющего аутоиммунное и/или воспалительное состояние или рак, характеризующиеся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидный артрит, астму или миелоидный лейкоз), включающий введение индивиду эффективного количества фармацевтической композиции, содержащей антитело к GM-CSFRa (например, полноразмерное антитело к GM-CSFRa), содержащее вариабельный домен тяжелой цепи (VH), содержащий HC-CDR1, содержащий X|X2X3H (SEQ ID NO: 76), где Х1 представляет собой Е, N, G, D, M, S, P, F, Y, А, V, K, W, R или С, Х2 представляет собой S, С или Р, и Х3 представляет собой I или М; HC-CDR2, содержащий GFDX1X2X3X4EX5X6YAQKX7QG (SEQ ID NO: 77), где Х1 представляет собой Р, G, T, S или V, Х2 представляет собой Е, D, G или А, Х3 представляет собой D, G, I, W, S или V, Х4 представляет собой G, E, D или Н, Х5 представляет собой Т или А, Х6 представляет собой N или I, и Х7 представляет собой S или F; и HC-CDR3, содержащий GRYX1X2X3X4X5X6YGFDY (SEQ ID NO: 78), где Х1 представляет собой С, Т, S, I, А или V, Х2 представляет собой S, G, E, F, W, Н, I, V, N, Y, Т или R, Х3 представляет собой Т, Н, L, F, P, I, S, Y, K, A, D, V, N или G, Х4 представляет собой D, A, M, Y, F, S, T, G или W, Х5 представляет собой Т, S, F, Q, A, N, L, E, I, G или М, и Х6 представляет собой С, Т, N, S или А; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий RAX1X2X3VX4X5X6LA (SEQ ID NO: 293), где Х1 представляет собой S, L, N, А, K, R, I, Q, G, Т, Н, М или С, Х2 представляет собой Q, Y, P, A, I, F, T, R, V, L, Е, S или С, Х3 представляет собой S, Н, W, L, R, K, Т, Р, I, F, V, Е, А или Q, Х4 представляет собой S, L, W, M, A, Y, K, R, G, Т, Е, V, N, F или С, Х5 представляет собой S, T, R, A, H, Q, P, M, L или G, и Х6 представляет собой Y, L или F; LC-CDR2, содержащий X1X2X3S RAT (SEQ ID NO: 294), где Х1 представляет собой G или Т, Х2 представляет собой A, G, R, Н, K, S, Т, М или F, и Х3 представляет собой S, A, W, R, L, T, Q, F, Y, Н или N; и LC-CDR3, содержащий QQYX1X2X3PX4T (SEQ ID NO: 79), где Х1 представляет собой N, D, S, R, A, T, L, Y, Q, W или G, Х2 представляет собой N, D, E, T, Y, G, A, M, F, S, I или L, Х3 представляет собой W, S, Р, V, G или R, и Х4 представляет собой Р, Y, H, S, F, N, D, V или G.
В некоторых воплощениях предложен способ лечения индивида, имеющего аутоиммунное и/или воспалительное состояние или рак, характеризующиеся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидный артрит, астму или миелоидный лейкоз), включающий введение индивиду эффективного количества композиции, содержащей антитело к GM-CSFRa, содержащее: VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1-4, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5-16, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17-50, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53-75, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен.
В некоторых воплощениях предложен способ лечения индивида, имеющего аутоиммунное и/или воспалительное состояние или рак, характеризующиеся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидный артрит, астму или миелоидный лейкоз), включающий введение индивиду эффективного количества композиции, содержащей антитело к GM-CSFRa, содержащее VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 80-121 и 246-287, или его вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью любой из SEQ ID NO: 80-121 и 246-287, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122-144, 150-245 и 288289, или его вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью любой из SEQ ID NO: 122-144, 150-245 и 288-289.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данном изобретении, представ
- 64 048006 ляет собой полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1 или IgG4. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложен способ лечения индивида, имеющего аутоиммунное и/или воспалительное состояние или рак, характеризующиеся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидный артрит, астму или миелоидный лейкоз), включающий введение индивиду эффективного количества композиции, содержащей антитело к GM-CSFRa, содержащее: VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данной заявке, содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 80, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данной заявке, представляет собой полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1 или IgG4. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложен способ лечения индивида, имеющего аутоиммунное и/или воспалительное состояние или рак, характеризующиеся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидный артрит, астму или миелоидный лейкоз), включающий введение индивиду эффективного количества композиции, содержащей антитело к GM-CSFRa, содержащее: VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 56, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данном изобретении, содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 125. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данной заявке, представляет собой полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1 или IgG4. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложен способ лечения индивида, имеющего аутоиммунное и/или воспалительное состояние или рак, характеризующиеся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидный артрит, астму или миелоидный лейкоз), включающий введение индивиду эффективного количества композиции, содержащей антитело к GM-CSFRa, содержащее: VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последо
- 65 048006 вательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данном изобретении, содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 86, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данном изобретении, представляет собой полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1 или IgG4. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложен способ лечения индивида, имеющего аутоиммунное и/или воспалительное состояние или рак, характеризующиеся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидный артрит, астму или миелоидный лейкоз), включающий введение индивиду эффективного количества композиции, содержащей антитело к GM-CSFRa, содержащее: VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данном изобретении, содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данной заявке, представляет собой полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1 или IgG4. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложен способ лечения индивида, имеющего аутоиммунное и/или воспалительное состояние или рак, характеризующиеся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидный артрит, астму или миелоидный лейкоз), включающий введение индивиду эффективного количества композиции, содержащей антитело к GM-CSFRa, содержащее: VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данном изобретении, содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 99, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данном изобретении, представляет собой полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1 или IgG4. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложен способ лечения индивида, имеющего аутоиммунное и/или воспалительное состояние или рак, характеризующиеся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидный артрит, астму или миелоидный лейкоз), включающий введение индивиду эффективного количества компо
- 66 048006 зиции, содержащей антитело к GM-CSFRa, содержащее: VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данном изобретении, содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 101, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данной заявке, представляет собой полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1 или IgG4. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложен способ лечения индивида, имеющего аутоиммунное и/или воспалительное состояние или рак, характеризующиеся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидный артрит, астму или миелоидный лейкоз), включающий введение индивиду эффективного количества композиции, содержащей антитело к GM-CSFRa, содержащее: VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данном изобретении, содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данной заявке, представляет собой полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1 или IgG4. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложен способ лечения индивида, имеющего аутоиммунное и/или воспалительное состояние или рак, характеризующиеся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидный артрит, астму или миелоидный лейкоз), включающий введение индивиду эффективного количества композиции, содержащей антитело к GM-CSFRa, содержащее: VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данном изобретении, содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 99, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данном изобретении, представляет собой полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1 или IgG4. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную
- 67 048006 последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях предложен способ лечения индивида, имеющего аутоиммунное и/или воспалительное состояние или рак, характеризующиеся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидный артрит, астму или миелоидный лейкоз), включающий введение индивиду эффективного количества композиции, содержащей антитело к GM-CSFRa, содержащее: VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, или их вариант, содержащий до 5 аминокислотных замен.
В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данном изобретении, содержит VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 121, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126. В некоторых воплощениях антитело к GM-CSFRa, предложенное в данной заявке, представляет собой полноразмерное антитело к GM-CSFRa, содержащее константные домены IgG1 или IgG4. В некоторых воплощениях IgG1 представляет собой IgG1 человека. В некоторых воплощениях IgG4 представляет собой IgG4 человека. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 145. В некоторых воплощениях константная область тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 146. В некоторых воплощениях константная область легкой цепи содержит аминокислотную последовательность или состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 147.
В некоторых воплощениях индивид представляет собой млекопитающее (например, человека, не являющегося человеком примата, крысу, мышь, корову, лошадь, свинью, овцу, козу, собаку, кошку и т.д.). В некоторых воплощениях индивидом является человек. В некоторых воплощениях индивидом является клинический пациент, доброволец клинического испытания, экспериментальное животное и так далее. В некоторых воплощениях возраст индивида составляет меньше примерно 60 лет (в том числе, например, возраст составляет меньше примерно 50, 40, 30, 25, 20, 15 или 10 лет). В некоторых воплощениях возраст индивида составляет выше примерно 60 лет (в том числе, например, возраст составляет выше 70, 80, 90 или 100 лет). В некоторых воплощениях у индивида диагностировано одно или несколько заболеваний или расстройств, описанных в данном изобретении, или он генетически предрасположен к ним (таким как ревматоидный артрит, астма, хроническая обструктивная болезнь легких, аллергическая реакция, рассеянный склероз, миелоидный лейкоз или атеросклероз). В некоторых воплощениях индивид имеет один или более факторов риска, ассоциированных с одним или более чем одним заболеванием или расстройством, описанным в данном изобретении.
Согласно настоящему изобретению в некоторых воплощениях предложен способ доставки антитела к GM-CSFRa (такого как любое из антител к GM-CSFRa, описанных в данном документе, например, выделенное антитело к GM-CSFRa) в клетку, экспрессирующую GM-CSFRa на своей поверхности, у индивида, способ, включающий введение данному индивиду композиции, содержащей антитело к GMCSFRa.
В данной области техники известно много методов диагностики рака или любого другого заболевания, демонстрирующего аномальную экспрессию GM-CSF и/или GM-CSFRa, и клинических описаний этих заболеваний. Такие методы включают, но не ограничиваются этим, например, методы иммуногистохимии, ПЦР и флуоресцентной гибридизации in situ (FISH).
В некоторых воплощениях антитела к GM-CSFRa (например, полноразмерные антитела к GMCSFRa) и/или композиции по данному изобретению вводят в комбинации со вторым, третьим или четвертым агентом (включая, например, противоопухолевый агент, ингибирующий рост агент, цитотоксический агент или химиотерапевтический агент) для лечения заболеваний или расстройств с вовлечением аномальной экспрессии GM-CSF/GM-CSFRa.
Лечение рака можно оценить, например, по регрессии опухоли, уменьшению массы или размера опухоли, времени до прогрессирования, продолжительности выживания, выживаемости без прогрессирования, общему коэффициенту ответа, продолжительности ответа, качеству жизни, экспрессии белка и/или активности. Для определения эффективности терапии можно использовать подходы, включающие, например, измерение ответа с использованием радиологической визуализации.
В некоторых воплощениях эффективность лечения измеряют в виде процента ингибирования роста опухоли (% TGI), рассчитанного с использованием уравнения 100 - (Т/Сх 100), где Т представляет собой средний относительный объем опухоли в случае подвергнутой лечению опухоли, а С представляет собой средний относительный объем опухоли в случае неподвергнутой лечению опухоли.
В некоторых воплощениях % TGI составляет примерно 10%, примерно 20%, примерно 30%, примерно 40%, примерно 50%, примерно 60%, примерно 70%, примерно 80%, примерно 90%, примерно
- 68 048006
91%, примерно 92%, примерно 93%, примерно 94%, примерно 95% или выше 95%. В некоторых воплощениях эффективность лечения измеряют, используя изменение формы гранулоцитов и/или увеличение выживаемости гранулоцитов. В некоторых воплощениях эффективность лечения измеряют по возрастанию секреции цитокинов моноцитами.
Дозировка и способ введения антител к GM-CSFRa.
Доза композиций на основе антитела к GM-CSFRa (такого как выделенное антитело к GM-CSFRa), вводимых индивиду (такому как человек) может варьировать в зависимости от конкретной композиции, способа введения и типа подвергаемого лечению заболевания. В некоторых воплощениях количество композиции (такой как композиция, содержащая выделенное антитело к GM-CSFRa), является эффективным для получения объективного ответа (такого как частичный ответ или полный ответ) в лечении рака. В некоторых воплощениях количество композиции на основе антитела к GM-CSFRa является эффективным для получения полного ответа у индивида. В некоторых воплощениях количество композиции на основе антитела к GM-CSFRa является эффективным для получения частичного ответа у индивида. В некоторых воплощениях количество вводимой (например, вводимой отдельно) композиции на основе антитела к GM-CSFRa является достаточным для получения общего коэффициента ответа, превышающего любое значение из примерно 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 64%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85% или 90% среди популяции индивидов, получающих лечение композицией на основе антитела к GM-CSFRa. Ответы индивида на лечение способами, описанными в данном изобретении, могут быть определены, например, на основании уровней Критериев оценки ответа при солидных опухолях (RECIST).
В некоторых воплощениях количество композиции (такой как композиция, содержащая выделенное антитело к GM-CSFRa) является достаточным для пролонгирования выживаемости индивида без прогрессирования заболевания. В некоторых воплощениях количество такой композиции является достаточным для пролонгирования общей выживаемости индивида. В некоторых воплощениях количество композиции (например, вводимой отдельно) является достаточным для получения клинической пользы, превышающей любое значение из примерно 50%, 60%, 70% или 77% среди популяции индивидов, получающих лечений композицией на основе антитела к GM-CSFRa.
В некоторых воплощениях количество композиции (такой как композиция, содержащая выделенное антитело к GM-CSFRa), самой по себе или в комбинации со вторым, третьим и/или четвертым агентом, составляет количество, достаточное для уменьшения размера опухоли, снижения количества раковых клеток или уменьшения скорости роста опухоли по меньшей мере на любую величину из примерно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% или 100% по сравнению с соответствующим размером опухоли, количеством раковых клеток или скоростью роста опухоли у того же субъекта до лечения или по сравнению с соответствующим показателем у других субъектов, не получающих лечения. Для измерения величины этого эффекта можно использовать стандартные методы, такие как анализы in vitro с очищенным ферментом, анализы с применением клеток, животные модели или тестирование на людях.
В некоторых воплощениях количество антитела к GM-CSFRa (такого как полноразмерное антитело к GM-CSFRa) в данной композиции составляет величину ниже уровня, который вызывает токсикологический эффект (т.е. эффект, превышающий клинически приемлемый уровень токсичности), или находится на уровне, при котором возможный побочный эффект можно регулировать, или он может переноситься в случае введения данной композиции индивиду.
В некоторых воплощениях количество композиции близко к значению максимальной переносимой дозы (MTD) композиции после такого же режима введения. В некоторых воплощениях количество композиции превышает любое значение из примерно 80%, 90%, 95% или 98% от MTD.
В некоторых воплощениях количество антитела к GM-CSFRa (такого как полноразмерное антитело к GM-CSFRa) в данной композиции находится в диапазоне от примерно 0,001 мкг до примерно 1000 мкг.
В некоторых воплощениях любого из вышеупомянутых аспектов эффективное количество антитела к GM-CSFRa (такого как полноразмерное антитело к GM-CSFRa) в данной композиции находится в диапазоне от примерно 0,1 мкг/кг до примерно 100 мг/кг общей массы тела.
Композицию на основе антитела к GM-CSFRa можно вводить индивиду (такому как человек) различными путями, включая, например, внутривенный, интраартериальный, внутрибрюшинный, внутрилегочный, пероральный, ингаляционный, внутрипузырный, внутримышечный, интратрахеальный, подкожный, интраокулярный, интратекальный, трансмукозальный и трансдермальный. В некоторых воплощениях может быть использована форма композиции с замедленным непрерывным высвобождением. В некоторых воплощениях композицию вводят внутривенно. В некоторых воплощениях композицию вводят интрапортально. В некоторых воплощениях композицию вводят интраартериально. В некоторых воплощениях композицию вводят внутрибрюшинно. В некоторых воплощениях композицию вводят внутрипеченочно. В некоторых воплощениях композицию вводят посредством инфузии в печеночную артерию. В некоторых воплощениях введение осуществляют в место инъекции, удаленное от места первого заболевания.
- 69 048006
Изделия производства и наборы.
В некоторых воплощениях данного изобретения предложено изделие производства, содержащее материалы, полезные для лечения аутоиммунного и/или воспалительного состояния или рака, характеризующихся высоким уровнем экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидного артрита, астмы или миелоидного лейкоза), или для доставки антитела к GM-CSFRa (такого как полноразмерное антитело к GM-CSFRa) в клетку, экспрессирующую GM-CSFRa на своей поверхности. Изделие производства может содержать контейнер и этикетку или инструкцию по применению на контейнере или в ассоциации с ним. Подходящие контейнеры включают, например, бутылки, флаконы, шприцы и так далее. Контейнеры могут быть выполнены из разнообразных материалов, таких как стекло или пластик. Обычно контейнер содержит в себе композицию, которая эффективна для лечения заболевания или состояния, описанного в данной заявке, и может иметь стерильное входное отверстие (например, контейнер может представлять собой пакет для внутривенного раствора или флакон, снабженный пробкой, поддающейся прокалыванию иглой для подкожных инъекций). По меньшей мере один активный агент в композиции представляет собой антитело к GMCSFRa по данной заявке. На этикетке или в инструкции по применению есть указание на то, что композицию применяют для лечения конкретного состояния. Этикетка или инструкция по применению будет дополнительно содержать инструкции по введению композиции на основе антитела к GM-CSFRa пациенту. Также включены изделия производства и наборы, содержащие средства для комбинаторной терапии, описанные в данном изобретении.
Термин инструкция по применению относится к инструкциям, обычно включаемым в коммерческие упаковки терапевтических продуктов, которые содержат информацию относительно показаний, применения, дозировки, введения, противопоказаний и/или предостережениях, касающихся применения таких терапевтических продуктов. В некоторых воплощениях в инструкции по применению есть указание на то, что данную композицию применяют для лечения аутоиммунных и/или воспалительных состояний (таких как ревматоидный артрит, астма, хроническая обструктивная болезнь легких, аллергическая реакция, рассеянный склероз, миелоидный лейкоз и атеросклероз). В некоторых воплощениях в инструкции по применению есть указание на то, что данную композицию применяют для лечения рака (например, миелоидного лейкоза).
Помимо этого, изделие производства может дополнительно содержать второй контейнер, включающий в себя фармацевтически приемлемый буфер, такой как бактериостатическая вода для инъекций (BWFI), забуференный фосфатом физиологический раствор, раствор Рингера и раствор декстрозы. Кроме того, оно может содержать другие необходимые с коммерческой и потребительской точки зрения материалы, включая другие буферы, разбавители, фильтры, иглы и шприцы.
Кроме того, предложены наборы, полезные для различных целей, например, для лечения аутоиммунного и/или воспалительного состояния или рака, характеризующихся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидного артрита, астмы или миелоидного лейкоза), или для доставки антитела к GM-CSFRa (такого как полноразмерное антитело к GM-CSFRa) в клетку, экспрессирующую GM-CSFRa на своей поверхности, возможно в комбинации с изделиями производства. Наборы по данному изобретению включают в себя один или несколько контейнеров, содержащих композицию на основе антитела к GM-CSFRa (или стандартную лекарственную форму и/или изделие производства), а в некоторых воплощениях дополнительно содержат другой агент (такой как агенты, описанные в данном изобретении) и/или инструкции для применения в соответствии с любым из способов, описанных в данном изобретении. Набор может дополнительно содержать описание выбора индивидов, подходящих для лечения. Инструкции, поставляемые в наборах по данному изобретению, обычно представляют собой инструкции, написанные на этикетке или листовке-вкладыше (например, на листе бумаги, включенном в набор), но также приемлемы считываемые компьютером инструкции (например, инструкции на магнитном или оптическом диске).
Например, в некоторых воплощениях набор включает в себя композицию, содержащую антитело к GM-CSFRa (такое как полноразмерное антитело к GM-CSFRa). В некоторых воплощениях набор включает в себя а) композицию, содержащую любое из антител к GM-CSFRa, описанных в данном изобретении, и b) по меньшей мере один другой агент в эффективном количестве, при этом такой один другой агент усиливает эффект (например, лечебный эффект, относящийся к детекции эффект) антитела к GMCSFRa. В некоторых воплощениях набор включает в себя а) композицию, содержащую любое из антител к GM-CSFRa, описанных в данном изобретении, и b) инструкции для введения композиции на основе антитела к GM-CSFRa индивиду для лечения аутоиммунного и/или воспалительного состояния или рака, характеризующихся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидного артрита, астмы или миелоидного лейкоза). В некоторых воплощениях набор включает в себя а) композицию, содержащую любое из антител к GM-CSFRa, описанных в данном изобретении, b) по меньшей мере один другой агент в эффективном количестве, при этом такой один другой агент усиливает эффект (например, лечебный эффект, отно
- 70 048006 сящийся к детекции эффект) антитела к GM-CSFRa, и с) инструкции для введения композиции на основе антитела к GM-CSFRa и другого(их) агента(ов) индивиду для лечения аутоиммунного и/или воспалительного состояния или рака, характеризующихся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GMCSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидного артрита, астмы или миелоидного лейкоза). Антитело к GM-CSFRa и другой(ие) агент(ы) могут быть представлены в отдельных контейнерах или в едином контейнере. Например, набор может включать в себя одну отдельную композицию либо две или несколько композиций, при этом одна композиция содержит антитело к GM-CSFRa, а другая композиция содержит другой агент.
В некоторых воплощениях набор включает в себя нуклеиновую кислоту (или ряд нуклеиновых кислот), кодирующую антитело к GM-CSFRa (такое как полноразмерное антитело к GM-CSFRa). В некоторых воплощениях набор содержит а) нуклеиновую кислоту (или ряд нуклеиновых кислот), кодирующую антитело к GM-CSFRa, и b) клетку хозяина для проведения экспрессии данной нуклеиновой кислоты (или ряда нуклеиновых кислот). В некоторых воплощениях набор содержит а) нуклеиновую кислоту (или ряд нуклеиновых кислот), кодирующую антитело к GM-CSFRa, и Ь) инструкции для 1) проведения экспрессии антитела к GM-CSFRa в клетке хозяина, 2) приготовления композиции, содержащей антитело к GM-CSFRa, и 3) введения композиции, содержащей антитело к GM-CSFRa, индивиду для лечения аутоиммунного и/или воспалительного состояния или рака, характеризующихся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидного артрита, астмы или миелоидного лейкоза). В некоторых воплощениях набор содержит а) нуклеиновую кислоту (или ряд нуклеиновых кислот), кодирующую антитело к GM-CSFRa, и b) клетку хозяина для проведения экспрессии данной нуклеиновой кислоты (или ряда нуклеиновых кислот) и с) инструкции для 1) проведения экспрессии антитела к GM-CSFRa в этой клетке хозяина, 2) приготовления композиции, содержащей антитело к GM-CSFRa, и 3) введения композиции, содержащей антитело к GM-CSFRa, индивиду для лечения аутоиммунного и/или воспалительного состояния или рака, характеризующихся высокими уровнями экспрессии GM-CSF и/или GM-CSFRa и/или аномальным функционированием GM-CSF/GM-CSFRa (например, ревматоидного артрита, астмы или миелоидного лейкоза).
Наборы по данному изобретению находятся в подходящей упаковке. Подходящая упаковка включает, но не ограничивается этим, флаконы, бутылки, контейнеры, гибкую упаковку (например, герметично закрываемые майларовые или пластиковые пакеты) и тому подобное. Возможно, что наборы могут содержать дополнительные компоненты, такие как буферы, и пояснительную информацию. Таким образом, согласно настоящей заявке также предложены изделия производства, которые включают флаконы (такие как герметично закрываемые флаконы), бутылки, контейнеры, гибкую упаковку и тому подобное.
Инструкции, относящиеся к применению композиции на основе антитела к GM-CSFRa, обычно включают информацию, которая касается дозировки, режима приема и пути введения для предполагаемого лечения. В контейнерах могут содержаться стандартные дозы, объемные упаковки (например, многодозовые упаковки) или субстандартные дозы. Например, могут быть предоставлены наборы, которые содержат дозировки антитела к GM-CSFRa (такого как полноразмерное антитело к GM-CSFRa), описанного в данной заявке, достаточные для обеспечения эффективного лечения индивида в течение продолжительного периода времени, такого как любой интервал, выбранный из одной недели, 8 суток, 9 суток, 10 суток, 11 суток, 12 суток, 13 суток, 2-х недель, 3-х недель, 4-х недель, 6-ти недель, 8-ми недель, 3-х месяцев, 4-х месяцев, 5-ти месяцев, 7 месяцев, 8 месяцев, 9 месяцев или больше. Кроме того, наборы могут включать в себя несколько стандартных доз антитела к GM-CSFRa и фармацевтических композиций и инструкции для применения, и могут быть упакованы в количествах, подходящих для хранения и применения в аптеках, например, больничных аптеках и в аптеках для приготовления препаратов по рецептам.
Специалистам в данной области техники будет известно, что возможны несколько воплощений в пределах объема и сущности этого изобретения. Теперь изобретение будет описано более подробно посредством ссылки на следующие неограничивающие примеры. Следующие далее примеры дополнительно иллюстрируют данное изобретение, но несомненно их не следует истолковывать как каким-либо образом ограничивающие его объем.
Примеры
В описании экспериментов, которое приведено ниже, применены следующие сокращения: GMF (GM-CSF человека); GMRa (GM-CSFRa человека);
GMRb (GM-CSFRe человека); Mab (маврилимумаб); GMRah (6His-GM-CSFRa человека); BGMRa (биотин-Avi-GM-CSFRa); mGMRa (GM-CSFRa яванского макака);
mGMRah (6His-GM-CSFRa яванского макака).
Пример 1. Создание рекомбинантного GM-CSFRa человека и отбор антител к GM-CSFRa в формате scFv.
- 71 048006
Создание рекомбинантного GM-CSFRa.
Полноразмерную последовательность GM-CSFRa человека (обозначаемого здесь как GMRa) субклонировали из вектора pSC-GM-CSFRa (Generay, Shanghai) в экспрессирующий вектор рТТ5, используя сайты распознавания ферментами рестрикции Hindlll и Xhol. Для мечения GMRa использовали His-метку или другие традиционно применяемые метки. Были созданы экспрессирующие векторы рТТ5^МКн6His (ECD), pTT5-Avi-10His-GMRa (ECD) и pTT5-GMRa (400 аминокислот (aa)). ECD означает внеклеточный домен, his или His означает His-метку, и Avi означает авидиновую метку.
Кроме того, проводили клонирование рекомбинантной конструкции на основе GM-CSFRa яванского макака. Праймеры конструировали с учетом последовательности GM-CSFRa яванского макака из базы данных Национального центра биотехнологической информации (NCBI) (ХМ_024791666.1) и использовали для получения кДНК для GM-CSFRa посредством обратной транскрипции РНК из мононуклеарных клеток периферической крови (РВМС) яванских макак. Кодирующую ECD последовательность амплифицировали из кДНК для GM-CSFRa и клонировали в экспрессирующий вектор эукариот рТТ5 с получением рТТ5-mGMRа-6his (ECD).
Экспрессию и очистку рекомбинантного GM-CSFRa человека, в том числе GMRa-6his (ECD), Avi10His-GMRa (ECD) и mGMRa-6his (ECD), проводили в соответствии с протоколом производителя. Кратко, клетки 293F трансфицировали экспрессирующими векторами и клетки культивировали при 37°С в условиях 8% СО2 и 120 об/мин в течение 5 суток. Культуральную среду собирали и очистку белков, экспрессирующих His-метку, проводили с использованием Ni-сефарозы в соответствии с протоколом производителя. Конкретно, для анализа методом аффинной хроматографии с иммобилизованным металлом (IMAC) использовали картриджи Qiagen Ni-NTA superflow. Сначала картриджи уравновешивали буфером А1 (50 мМ Na3PO4; 0,15 М NaCl; pH 7,2) со скоростью потока 150 см/ч. Значение рН супернатанта культуральной среды подводили до 7,2 и супернатант пропускали через картриджи при комнатной температуре со скоростью 150 см/ч. Затем для уравновешивания картриджей использовали буфер А1 (в объеме, в 6 раз превышающем объем картриджей) со скоростью 150 см/ч. Для промывки картриджей использовали 50 мМ забуференный фосфатом (РВ) раствор (0,15 М NaCl и 0,2 М имидазол; рН 7,2) в объеме, в 10 раз превышающем объем картриджей, и осуществляли сбор элюата.
Создание биотинилированного антигена GM-CSFRa.
Биотинилирование Avi-10His-GMRa с использованием биотинлигазы В0101А (GeneCopoeia) проводили в соответствии с протоколом производителя. Кратко, к Avi-10His-GMRa добавляли буфер А/В и лигазу BirA, затем в течение 2 часов инкубировали при 30°С. Биотинилированный GMRa обозначен как Bavih-GMRa.
Эффективность биотинилирования измеряли с использованием ELISA. Кратко, готовили серийные разведения Bavih-GMRa в соотношении 1:2, исходя из начальной концентрации 500 нг/мл, после чего использовали для нанесения покрытия в лунки планшета для ELISA. Для детектирования использовали конъюгат стрептавидина и пероксидазы хрена (SA-HRP), а в качестве контроля использовали стандартные продукты биотинилирования. Было определено, что эффективность биотинилирования составляла 70%. Биологическую активность Bavih-GMRa подтверждали, используя анализ пролиферации TF-1 клеток. Отбор антител к GM-CSFRa в формате scFv Создание библиотеки дрожжевого дисплея для антител в формате scFv. проводили обратную транскрипцию РНК, собранной из 2000 образцов крови человека, с получением кДНК, и фрагменты VH и VK амплифицировали, используя VH- и VK-специфичные праймеры. После экстракции из геля и очистки получали scFv фрагменты путем соединения VH и VK и клонировали в плазмиду для дрожжевого дисплея PYD1, которую затем использовали для электропорации дрожжей с целью создания библиотеки дрожжевого дисплея для антител в формате scFv.
Отбор антител к GM-CSFRa в формате scFv: scFv, которые распознавали GM-CSFRa, выделяли из библиотеки дрожжевого дисплея. Кратко, для обогащения клетками, экспрессирующими scFv антитела к GM-CSFRa, использовали метод сортировки магнитно-активированных клеток (MACS). Дрожжевые клетки в количестве, соответствующем 1000 единиц оптической плотности (OD), подвергали центрифугированию в течение 5 минут при 2500хд. Получали осадок клеток после центрифугирования и ресуспендировали в 1 л культуральной среды SGCAA (от англ. Synthetic Galactose plus Casein Amino Acid) с достижением OD600 = 1 в качестве исходной концентрации. Экспрессию индуцировали в течение 40-48 часов при 20°С и 250 об/мин. После центрифугирования и промывки PBSM осадок после центрифугирования ресуспендировали в 5-10-кратном объеме 1 мкМ Bavih-GMRa (в PBSM), и инкубировали в течение одного часа при 4°С. После центрифугирования и промывки PBSM несвязанные антигены отмывали, используя PBSM. Добавляли магнитные гранулы и тщательно перемешивали, после чего инкубировали в течение 30 минут при 4°С в устройстве для вращения. После центрифугирования при 2500 xg в течение 5 минут отбрасывали супернатант и осадок после центрифугирования ресуспендировали в 5-10-кратком объеме PBSM. В колонку добавляли по 7 мл суспензии клеток за один раз до тех пор, пока все клетки не были пропущены через колонку. Связанные клетки собирали и после дальнейшего культивирования и центрифугирования проводили выделение плазмиды.
Создание библиотеки фагового дисплея и отбор антител в формате scFv. проводили ПЦР
- 72 048006 амплификацию генов scFv фрагментов антител из 30 отобранных дрожжевых клеток, применяя прямой (F) и обратный (R) праймеры для scFv (scFv-F и scFv-R). Чтобы создать библиотеки фагового дисплея, гены scFv фрагментов далее клонировали в вектор pDAN5 для фагового дисплея, используя Sfil. После проведения лигирования вектор использовали для трансдукции компетентных в отношении электропорации клеток TG1 для получения библиотеки фагового дисплея для scFv антител. scFv антитела, специфичные к GM-CSFRa, выделяли из библиотеки фагового дисплея в серии повторяющихся циклов отбора. Кратко, к биотинилированному GM-CSFRa добавляли фаговую библиотеку для scFv (2x1011 PFU (бляшкообразующих единиц)) и инкубировали в течение 2 часов при 37°С. GM-CSFRa со связанным фагом захватывали на магнитные гранулы, покрытые стрептавидином. Несвязавшиеся фаговые частицы вымывали. После 8-15-кратной промывки TBST (забуференным трисом физиологическим раствором в присутствии твина 20) (с увеличением числа промывок для каждого раунда отбора) фаг, специфически связанный с GM-CSFRa, вымывали раствором глицина-HCl (рН 2,2). Эти фаги использовали для трансдукции клеток TG1, находящихся в логарифмической фазе, с добавлением ампициллина и культивировали в течение одного часа. После добавления фага-помощника клетки культивировали на качалке в течение ночи при 200 об/мин и 28°С. Культуральную среду собирали на следующие сутки, центрифугировали, получая супернатант, и подвергали следующему раунду отбора. В конце процесса отбора получали панель дающих положительный ответ scFv антител.
Отбирали моноклональные scFv антитела и подвергали анализам по связыванию с лигандом. Первый анализ был разработан для идентификации scFv антител, которые связываются с GM-CSFRa человека и/или GM-CSFRa яванского макака. Кратко, лунки 96-луночного планшета покрывали GMRah (6His-GM-CSFRa человека) или mGMRah (6His-GM-CSFRa яванского макака) в PBS в количестве 0,2 мкг/лунка и оставляли на ночь при 4°С. Перед загрузкой scFv антител планшеты промывали TBST, блокировали в течение 1-2 часов при 37°С, используя 5%-ное молоко, и снова промывали TBST. Каждый образец scFv антитела сначала разбавляли до концентрации 40 мкг/мл и по 150 мкл добавляли в первый ряд лунок. Затем готовили серийные разведения образцов scFv антител в концентрации 40 мкг/мл в соотношении 1:3 и добавляли в оставшиеся лунки. После инкубирования в течение одного часа при 37°С с последующей 6-кратной промывкой TBST, в каждую лунку добавляли по 100 мкл смеси первичного антитела и вторичного антитела (мышиного антитела к FLAG-пептиду (1:2500) и антитела к Fc мыши, конъюгированного с щелочной фосфатазой (Fc-AP) (1:2000)). После инкубирования в течение одного часа при 37°С планшет 3 раза промывали, используя TBST. Затем добавляли п-нитрофенилфосфат (pNPP) в количестве 50 мкл/лунка и инкубировали в течение 10-20 минут при 37°С. Для остановки реакции использовали 3 М раствор NaOH. Далее анализировали результаты ELISA (OD410) и с использованием программы PRISM получали кривые связывания.
Второй анализ был разработан для идентификации scFv антител, которые обладали способностью ингибировать связывание GM-CSF с GM-CSFRa, по результатам измерений с использованием конкурентного ELISA. Кратко, лунки 96-луночного планшета покрывали GM-CSF из расчета 0,5 мкг/лунка и 5%-ным молоком, инкубировали в течение 1-2 часов при 37°С и затем промывали, используя TBST. Каждый образец scFv антитела сначала разбавляли до концентрации 40 мкг/мл и по 100 мкл добавляли в первый ряд лунок. Затем готовили серийные разведения образцов scFv антител в концентрации 40 мкг/мл в соотношении 1:2 и добавляли в оставшиеся лунки. В каждую лунку добавляли по 50 мкл раствора Bavih-GMRa в PBS в концентрации 2,5 мкг/мл. После инкубирования в течение одного часа при 37°С лунки 6 раз промывали, используя TBST. Затем в каждую лунку добавляли по 100 мкл SA-HRP (1:20000) и инкубировали в течение одного часа при 37°С. Лунки 6 раз промывали, используя TBST, после чего добавляли тетраметилбензидин (ТМВ) в количестве 50 мкл/лунка и инкубировали в течение 5-10 минут при 37°С. Для остановки реакции использовали 2 М раствор H2SO4. Анализировали результаты ELISA (OD450) и с использованием программы PRISM получали кривые связывания.
Анализ пролиферации TF-1 клеток: scFv антитела, обладающие способностью ингибировать связывание между GM-CSF и GM-CSFRa, оценивали на предмет биологической активности в анализе пролиферации TF-1, согласно которому анализировали способность антител ингибировать пролиферацию TF-1 клеток, стимулированных GM-CSF. TF-1 представляет собой линию премиелоидных клеток человека, полученную от пациента с эритролейкозом. Эта клеточная линия является фактор-зависимой в отношении выживаемости и пролиферации и обычно поддерживается в присутствии GM-CSF человека. Кратко, TF-1 клетки поддерживали в среде RPMI-1640, содержащей 10% фетальной телячьей сыворотки (FBS), GM-CSF в концентрации 10 нг/мл, и пересевали два раза в неделю. Клетки промывали средой без GMCSF (RPMI1640, 10% FBS) три раза и ресуспендировали в той же среде. В каждую лунку 96-луночного планшета добавляли приблизительноу 10000 клеток и культивировали в течение ночи. На следующий день готовили серийные разведения scFv антител в соотношении 1:10 (от 10 мкг/мл до 0,0001 мкг/мл) и добавляли к клеткам. После инкубирования при 37°С в течение одного часа добавляли GM-CSF (Peprotech) в конечной концентрации 200 пг/мл. На следующий день анализировали жизнеспособность клеток, используя набор для анализа Celltiter-glo (Promega). IC50 рассчитывали с использованием PRISM.
- 73 048006
Пример 2. Создание и характеристика полноразмерных антител к GM-CSFRa человека.
Создание полноразмерных антител к GM-CSFRa.
Самые сильнодействующие scFv антитела были переформатированы в молекулы антитела человека IgG1 или IgG4-типа, содержащие константный домен тяжелой цепи IgG1 или IgG4 человека и константный домен легкой цепи-каппа IgG человека. VL и VH амплифицировали из экспрессирующего вектора для прокариот и вводили в экспрессирующие векторы эукариот рТТ5-Ь (содержащий ген константного домена каппа-цепи) и рТТ5-Н1 (содержащий ген константного домена тяжелой цепи IgG1) или рТТ5-Н4 (содержащий ген константного домена тяжелой цепи IgG4). Плазмиды, экспрессирующие легкую или тяжелую цепи, экстрагировали и использовали для трансфекции клеток 293F. После культивирования клеток при 37°С, 8% СО2 и 120 об/мин в течение пяти суток культуральные среды очищали, используя аффинную хроматографию на иммобилизованном белке А. Кратко, колонку с иммобилизованным белком А сначала уравновешивали PBS-буфером, содержащим 50 мМ PBS и 0,15 М NaCl (рН 7,2), при скорости потока 150 см/ч и с использованием объема, в шесть раз превышающего объем колонки. Супернатант культуральных сред (с рН, подведенным до 7,2) пропускали через колонку при скорости 150 см/ч. После дополнительного уравновешивания колонку промывали, используя 50 мМ раствор цитрата натрия (рН 3,5), и собирали элюат. Из полноразмерных антител, которые были получены, отбирали Т119 как исходное антитело в качестве соединения-лидера. Используя Т119 в формате scFv, создавали библиотеку фагового дисплея для scFv, содержащую мутации в участках CDR. Варианты, которые обладали способностью связываться с GM-CSFRa человека с высокой аффинностью и с низкой скоростью диссоциации, оценивали в отношении биологической активности в анализе пролиферации TF-1 клеток. scFv антитела, которые демонстрировали улучшенную биологическую активность по сравнению с Т119 в формате scFv, использовали для создания полноразмерных антител. Дальнейший раунд отбора полноразмерных антител проводили, используя анализ пролиферации TF-1 клеток. Затем отобранные оптимизированные как соединения-лидеры антитела подвергали дальнейшему биохимическому и биологическому анализу.
Аффинность антител к GM-CSFRa.
Аффинность исходного антитела Т119 и оптимизированных как соединения-лидеры антител (переформатированных в IgG1 человека) в отношении GM-CSFRa человека оценивали, используя ELISA. Как показано на фиг. 1А-1С, оптимизированные как соединения-лидеры антитела проявляли улучшенную аффинность связывания по сравнению сТ119. Затем, используя ELISA, оценивали аффинность исходного антитела Т119 и оптимизированных как соединения-лидеры антител Е35, Е200а, Е87 и Е108 (переформатированных в IgG4 человека) в отношении GM-CSFRa яванского макака (mGMRah). Как показано на фиг. 2, антитела к GM-CSFRa перекрестно взаимодействовали с GM-CSFRa яванского макака.
Специфичность антител к GM-CSFRa.
Перекрестная реактивность с гомологичными белками: с использованием ELISA антитела Е35, Е87 и Е108 (переформатированных в IgG4 человека) тестировали на предмет перекрестной реактивности с белками, гомологичными GM-CSFRa, включая IL3RA, IL5RA и G-CSFR. Как показано на фиг. 3, эти антитела связывались специфично с GMRah по сравнению с другими тестируемыми гомологичными белками, подтверждая, что антитела к GM-CSFRa обладают специфичностью к GM-CSFRa.
Специфичность связывания с GM-CSFRa-экспрессирующими WIL2S клетками: антитело к GMCSFRa E35-IgG4 дополнительно оценивали на предмет связывания с WIL2S клетками, экспрессирующими GM-CSFRa. Антитело к GM-CSFRa E35-IgG4 метили флуоресцентной меткой, используя GYL650 (Dylight Amine-Reatcive Dyes, Thermo Fisher) в соответствии с протоколом производителя.
WIL2S клетки, экспрессирующие GM-CSFRa, получали с использованием электропорации экспрессирующим вектором, содержащим ген полноразмерного GM-CSFRa, и в качестве контролей использовали необработанные клетки WIL2S. Через 48 часов после электропорации в конические пробирки емкостью 15 мл переносили как подвергнутые электропорации, так и необработанные клетки, центрифугировали в течение 5 минут при 1000 об./мин и содержимое ресуспендировали в DPBS. Затем в каждую пробирку типа эппендорф добавляли 1х 106 клеток и центрифугировали в течение 5 минут при 1000xg. GM-CSFRa-экспрессирующие WIL2S клетки обрабатывали E35-IgG4 (15 мкг/мл) в 100 мкл 1%-ного раствора бычьего сывороточного альбумина (BSA) (GMRa-E35), a контрольные WIL2S клетки обрабатывали либо 100 мкл 1%-ного раствора BSA (CK), либо E35-IgG4 (5 мкг/мл) в 100 мкл 1%-ного раствора BSA (NC-E35). Клетки из всех трех групп инкубировали в течение 40 минут при 37°С, дважды промывали 1 мл PBS, ресуспендировали в 0,2 мл PBS и подвергали анализу с использованием FACS. Как показано на фиг. 4, E35-IgG4 не связывались с контрольными WIL2S клетками, но демонстрировали сильное связывание с WIL2S клетками, экспрессирующими GM-CSFRa.
Характеристика аффинности связывания и константы диссоциации (Kd).
Аффинность связывания антител к GM-CSFRa E35 и Е87Ь (переформатированных в IgG4 человека) характеризовали, используя Biacore T200 (GE). Антитела Е35 и Е87Ь иммобилизовали на сенсорном чипе с карбоксиметилированным декстраном СМ5. Оценивали аффинности для GMRah в различных концентрациях. В диапазон концентраций включали значения 10; 5; 2,5; 1,25; 0,625; 0,3125; 0,15625; 0,078;
- 74 048006
0,039; 0,0195 и 0 нМ. Эксперименты с концентрациями 0,625 и 0 нМ повторяли еще один раз. С использованием технологии SPR измеряли константы скорости ассоциации и диссоциации и определяли аффинность связывания. В табл. 5 показаны Kon, Koff и Kd для Е35 и Е87Ь.
Таблица 5
| Антитело | коп (1/М с) | koff (1/с) | Kd(M) |
| Е35 | 5,37x10е | 4,78x10ь | 8,90х10'12 |
| Е87Ь | 3,58x10е | 2,42x10ь | 6,75х10'12 |
Антитела к GM-CSFRa конкурируют с GM-CSF за связывание с GM-CSFRa.
Эксперименты с конкурентным ELISA проводили так, как описано в примере 1, с целью оценки способности антител к GM-CSFRa распознавать сайт связывания с лигандом на GM-CSFRa и конкурировать с GM-CSF за связывание с GM-CSFRa. Как показано на фиг. 5A-5D, исходное антитело Т119 и оптимизированные как соединения-лидеры антитела (переформатированные в IgG4 человека) обладали способностью блокировать связывание GM-CSF с GM-CSFRa человека, подтверждая наличие конкурентного связывания антител с лиганд-связывающим сайтом на GM-CSFRa.
Анализы стабильности антител к GM-CSFRa.
Анализ термостабильности: анализ термостабильности T119-IgG1, E35-IgG1, E35b-IgG1 и MabIgG1 проводили, используя платформу UNcle. Для каждого антитела измеряли значения температуры плавления (Тпл) и температуры агрегации (Tagg). Значение Тпл указывает температуру разворачивания антитела в ходе изменения температуры, a Tagg указывает на температуру агрегации антитела в ходе изменения температуры. Как показано в табл. 6 и на фиг. 6А-6В, для T119-IgG1, E35-IgG1 и E35b-IgG1 продемонстрировано повышение температуры плавления по сравнению с Mab-IgG1, при этом E35-IgG1 и E35b-IgG1 демонстрировали более высокую температуру плавления, чем исходное антитело T119-IgG1. Для T119-IgG1, E35-IgG1 и E35b-IgG1 также показано повышение температуры агрегации по сравнению с Mab-IgG1, при этом E35-IgG1 и E35b-IgG1 демонстрировали более высокую температуру агрегации, чем исходное антитело T119-IgG1. Эти результаты позволяют предположить, что E35-IgG1 и E35b-IgG1 демонстрировали улучшенную термостабильность по сравнению с исходным антителом T119-IgG1, а также контрольным антителом Mab-IgG1.
Таблица 6
| Лунка | Образец | Тпп1 (°C) | Tagg 266 (°C) | Tagg 473 (°C) |
| Н1 | Mab-lgG1, 2 мг/мл | 67,8 | 64,56 | 65,6 |
| И | Т119-lgG1,2 мг/мл | 69,53 | 56,65 | 70,01 |
| Л | E35-lgG1,2 мг/мл | 73,52 | 67,15 | 77,37 |
| К1 | E35b-lgG1, 2 мг/мл | 70,42 | 69,01 | 77,64 |
Анализ пролиферации TF-1 клеток.
Анализ пролиферации TF-1 клеток проводили так, как описано в примере 1. Исходное антитело Т119 и оптимизированные как соединения-лидеры антитела (переформатированные в IgG4 человека) тестировали в отношении их способности ингибировать пролиферацию TF-1 клеток. Как показано на фиг. 7, для оптимизированных как соединения-лидеры антител продемонстрирована сопоставимая или улучшенная способность ингибировать пролиферацию TF-1 клеток по сравнению с исходным антителом Т119.
Анализ изменения формы гранулоцитов.
Далее антитела к GM-CSFRa исследовали с применением анализов изменения формы гранулоцитов человека. Кратко, РВМС выделяли из 10 мл периферической крови человека, используя градиент плотности фиколла. После удаления РВМС и буфера на основе фиколла выполняли лизис эритроцитов, используя буфер для лизиса клеток. Оставшиеся клетки промывали PBS и средой для культивирования клеток. В каждую лунку 96-луночного планшета добавляли по 100000 клеток и инкубировали в течение 30 минут при 37°С. Затем клетки обрабатывали GM-CSF в концентрации 100 пг/мл, а также серийно разведенными антителами (в разведении 1:10; от 10 мкг/мл до 0,0001 мкг/мл). После инкубирования в течение 3 часов при 37°С клетки подвергали анализу с применением FACS и изменение формы гранулоцитов оценивали на основании среднего геометрического значения по данным прямого рассеяния. Как показано на фиг. 8, Е35, Е108 и Е87Ь (переформатированные в IgG4 человека) предотвращали изменение формы гранулоцитов. Значение IC50 для каждого антитела показано в приведенной ниже табл. 7.
Таблица 7
| Антитело | Е35 | Е108 | Е87Ь |
| IC5o (мкг/мл) | 0,002050 | 0,002066 | 0,001505 |
Далее антитело к GM-CSFRa E35 (переформатированное в IgG4 человека) оценивали, используя анализы изменения формы гранулоцитов яванского макака. Гранулоциты яванского макака очищали из
- 75 048006 цельной крови и обрабатывали GM-CSF в концентрации 100 пг/мл, а также серийно разведенным Е35 (в разведении 1:10; от 10 мкг/мл до 0,0001 мкг/мл). Клетки подвергали анализу с применением FACS и изменение формы гранулоцитов оценивали на основании среднего геометрического значения по данным прямого рассеяния. Результаты продемонстрировали, что применение Е35 предотвращало изменение формы гранулоцитов яванского макака (фиг. 9) с IC50 0,002527 мкг/мл.
Анализ жизнеспособности гранулоцитов человека.
Гранулоциты оказываются жизнеспособными в течение более продолжительного периода в присутствии GM-CSF. В анализе жизнеспособности гранулоцитов человека оценивали способность антител к GM-CSFRa ингибировать этот ответ. Кратко, гранулоциты выделяли из периферической крови человека и обрабатывали GM-CSF в концентрации 100 пг/мл. Готовили серийные разведения антител в соотношении 1:10 (от 10 мкг/мл до 0,0001 мкг/мл) и добавляли к клеткам. После инкубирования в течение 48 часов проводили анализ жизнеспособности клеток, используя набор для анализа Celltiter-glo (Promega). Как показано на фиг. 10, применение Е35, Е108 и Е87Ь эффективно ингибировало жизнеспособность гранулоцитов. В табл. 8 показаны значения IC50 для каждого антитела для ингибирования жизнеспособности гранулоцитов человека.
Таблица 8
| Антитело | E35-lgG4 | E108-lgG4 | E87b-lgG4 |
| 1С50 (мкг/мл) | 0,004200 | 0,005521 | 0,002528 |
Ингибирующее действие в отношении высвобождения цитокинов Ингибирующее действие в отношении экспрессии CD11b: антитела к GM-CSFRa E35 и Е87Ь, а также Mab оценивали в отношении их способностей ингибировать экспрессию CD11b из клеток периферической крови человека. Кратко, в каждую лунку 96-луночного планшета добавляли по 50 мкл периферической крови человека и инкубировали с серийно разведенными антителами (в разведении 1:10; от 10 мкг/мл до 0,0001 мкг/мл). После инкубирования в течение 1 часа при 37°С добавляли GM-CSF в концентрации 10 нг/мл и затем инкубировали в течение еще одного часа. Для мечения CD11b использовали конъюгированное с флуоресцеинизотиоцианатом (FITC) антитело к CD11b (BD53310), проводя инкубацию в течение 30 минут при 4°С. Затем выполняли лизис эритроцитов, используя 1 мл буфера для лизиса эритроцитов (BD349202), и после двух промывок PBS проводили анализ экспрессии CD11b, применяя FACS. Как показано на фиг. 11 и в табл. 9, применение Е35 и Е87Ь демонстрировало улучшенную способность ингибировать экспрессию CD11b по сравнению с Mab. Значения IC50 для антител показаны в табл. 9.
Таблица 9
| Антитело | Mab-lgG4 | E35-lgG4 | E87b-lgG4 |
| IC50 (мкг/мл) | 0,1813 | 0,1111 | 0,1439 |
Ингибирующее действие в отношении продуцирования цитокинов: чтобы оценить ингибирующее действие антител к GM-CSFRa в отношении продуцирования цитокинов, из 10 мл периферической крови человека выделяли РВМС, используя градиент плотности фиколла, дважды промывали PBS и ресуспендировали в среде для культивирования клеток. В каждую лунку 96-луночного планшета добавляли по 1000000 клеток (100 мкл), в эти лунки добавляли по 50 мкл серийно разведенных антител (100-0,001 мкг/мл) и инкубировали в течение одного часа при 37°С. Затем добавляли липополисахарид (LPS) и GMCSF до конечной концентрации 100 нг/мл и 50 нг/мл, соответственно. После инкубирования при 37°С в течение 48 часов собирали супернатант и проводили анализ уровней TNFa и IL-1e, используя панель макрофагов/микроглий человека (Biolegend, 740503). Как показано на фиг. 12А и в табл. 10, применение Е35 и Е87Ь (переформатированных в IgG4 человека) демонстрировало улучшенное ингибирующее действие в отношении секреции TNFa по сравнению с Mab-IgG4. Как показано на фиг. 13 и в табл. 11, применение обоих антител Е35 и Е87Ь (переформатированных в IgG4 человека) демонстрировало улучшенное ингибирующее действие в отношении секреции IL-1e по сравнению с Mab-IgG4.
Таблица 10
| Антитело | Mab | Е35 | E87b |
| IC50 (мкг/мл) | 3,094 | 0,2777 | 0,06664 |
Таблица 11
| Антитело | Mab | Е35 | E87b |
| IC5o (мкг/мл) | 0,01263 | 0,003535 | 0,01333 |
Далее супернатант анализировали на предмет уровней TNFa, применяя ELISA. Результаты ELISA подтверждали, что применение Е35 и Е87Ь демонстрировало улучшенное ингибирующее действие в отношении секреции TNFa по сравнению с Mab (фиг. 12В и табл. 12).
- 76 048006
Таблица 12
| Антитело | МаЬ | Е35 | Е87Ь |
| 1С50 (мкг/мл) | 1,741 | 0,3290 | 0,09349 |
Фармакокинетическое исследование антител к GM-CSFRa Значения фармакокинетических (ФК) параметров на крысах: 10 здоровых взрослых крыс (массой приблизительно по 0,2 кг) разделяли на две группы с учетом массы, по 5 в каждой группе. Крысам из первой группы внутривенной инъекцией вводили Mab-IgG4 или E35-IgG4 в дозе 20 мг/кг, тогда как крысам из второй группы внутривенной инъекцией вводили Mab-IgG4 или E35-IgG4 в дозе 2 мг/кг. Первый раз кровь отбирали через один час после инъекции, а после этого через 2 суток, 3 суток, 5 суток, 9 суток и 15 суток после инъекции. После центрифугирования, для анализа концентрации антител с применением ELISA использовали плазму крови. Кратко, для покрытия лунок 96-луночного планшета использовали синтезированный GM-CSFRa. На следующий день, после промывки PBS, содержащим твин (PBST), блокирования 200 мкл смеси PBS и молока в течение одного часа, затем другой промывки с использованием PBST, добавляли плазму крови и инкубировали в течение одного часа при 37°С. Планшет промывали 6 раз 0,1%-ным TBST, после чего в каждую лунку добавляли по 100 мкл конъюгированного с АР антитела козы к Fc-области иммуноглобулина человека (1:3000 в PBS) и инкубировали в течение одного часа. После 6-кратной промывки 0,1%ным TBST в каждую лунку добавляли по 50 мкл pNPP, и наблюдали за развитием окраски в течение 1020 минут при 37°С. Результаты прочитывали, используя ридер для микропланшетов при 410 нм, что позволяло сделать вывод, что период полувыведения E35-IgG4 был больше, чем таковой у Mab-IgG4 (фиг. 14А-14В и табл. 13).
Таблица 13
| Антитело Т1/2 | Mab-lgG4 | E35-lgG4 |
| Т1/2 (20 мг/кг) | 129 ч | 190,9 ч |
| Т1/2 (2 мг/мг) | 53,09 ч | 186,7 ч |
ФК и фармакодинамические (ФД) исследования на яванских макаках: четырем яванским макакам (массой приблизительно по 3 кг) вводили инъекцией либо E35-IgG4, либо контрольное антитело MabIgG4 в дозе 10 мг/кг. Конкретно, животным № 1 и № 2 вводили инъекцией Mab-IgG4, а животным № 3 и № 4 вводили инъекцией E35-IgG4. У каждого животного отбирали по 6 мл крови за одни сутки до инъекции (-1-е сут), через один час после инъекции (1-е сут) и затем на 2-е сут, 4-е сут, 8-е сут, 15-е сут, 22-е сут, 29-е сут и 36-е сут. Чтобы оценить фармакокинетические параметры антител, готовили плазму из 1 мл образца крови, отобранной в каждый момент времени, путем центрифугирования в течение 15 минут при 5000 xg и хранили при -80°С в виде аликвот объемом 50 мкл. Концентрации E35-IgG4 и MabIgG4 анализировали с использованием ELISA, проводимого так, как описано выше для фармакокинетического исследования на крысах. Как показано на фиг. 15 и в табл. 14, период полувыведения E35-IgG4 оказался больше такового для Mab-IgG4. Чтобы оценить фармакодинамические параметры антител, выделяли гранулоциты из 5 мл образца крови, отобранной в каждый момент времени, и подвергали анализу изменения формы гранулоцитов. Кратко, в каждую лунку 96-луночного планшета добавляли по 100 мкл суспензии гранулоцитов (2х106/мл) и инкубировали в течение 30 минут при 37°С, после чего инкубировали с GM-CSF в концентрации 100 пг/мл в течение 3 часов. Затем эти клетки подвергали анализу изменения формы с использованием FACS, как описано выше, чтобы проанализировать изменение формы гранулоцитов. Результаты показали, что применение обоих антител E35-IgG4 и Mab-IgG4 предотвращало изменение формы гранулоцитов. Неожиданным образом, действие Mab-IgG4 продолжалось только в течение 14 суток после инъекции, в то время как действие E35-IgG4 продолжалось в течение по меньшей мере 21 суток (фиг. 16A-16D).
Таблица 14
| Антитело | № животного | Т1/2 (ч) | Среднее значение Т1/2 (ч) | Ттах (ч) | Стах (нг/мл) | AUC |
| Mab-lgG4 | 1 | 44,86346 | 69,41 | 1 | 95783,719 | 17340604 |
| 2 | 93,956602 | 1 | 76499,663 | 14508393 | ||
| E35-lgG4 | 3 | 104,10626 | 106,4 | 1 | 73486,786 | 14118941 |
| 4 | 108,76885 | 1 | 77001,042 | 15830767 |
Ингибирующее действие на GM-CSF-индуцированное увеличение уровня воспалительных клеток.
Чтобы исследовать ингибирующее действие антител к GM-CSFRa на GM-CSF-индуцированное увеличение уровня воспалительных клеток, яванским макакам, предварительно получившим инъекцию E35-IgG4 или раствора NaCl в качестве контроля, вводили GM-CSF и после введения GM-CSF оценивали
- 77 048006 уровни лейкоцитов, нейтрофилов, лимфоцитов, базофилов, эозинофилов, моноцитов и эритроцитов. Кратко, 4 яванских макака распределяли на две группы, по 2 в каждой группе. Одной группе путем внутрибрюшинных инъекций в 1-е сутки и 3-й сутки вводили E35-IgG4. Другой группе вводили путем инъекции раствор NaCl в качестве контроля. На 3-й, 4-е и 5-е сутки обеим группам вводили путем инъекции GM-CSF в дозе 5,0 мкг/кг (два раза в сутки, с интервалом приблизительно 8 часов между инъекциями). Образцы крови отбирали перед первой инъекцией GM-CSF и затем через 0,5 ч, 4,0 ч, 28,0 ч, 52,0 ч, 76,0 ч, 124,0 ч и 176,0 ч после первой инъекции и анализировали уровни клеток различных типов в каждый момент времени.
Результаты показали, что по сравнению с контрольной группой антитело E35-IgG4 полностью подавляло GM-CSF-индуцированное повышение уровня лейкоцитов, нейтрофилов, лимфоцитов, базофилов, эозинофилов и моноцитов. И наоборот, уровни эритроцитов оставались неизменными до и после обработки GM-CSF в случае обеих групп (фиг. 17A-17G).
Пример 3. Идентификация вариантов Е35, сохраняющих биологическую активность.
Последовательность меченного меткой his E35-scFv клонировали в экспрессирующий вектор прокариот. По остаткам, выбранным в участках CDR, проводили насыщающий мутагенез и скрининг. Подвергнутые мутациям версии встраивали в экспрессирующие векторы прокариот и использовали для трансфицирования BL21. После высевания отбирали случайным образом 60 клонов для секвенирования и получали 14-19 разных мутаций в каждом положении. Создавали scFv, содержащие эти мутации, проводили очистку и выполняли анализ пролиферации TF-1 клеток, чтобы оценить их биологическую активность. Мутации и соответствующие значения IC50 в отношении ослабления пролиферации клеток TF1 показаны в приведенной ниже табл. 15 (нумерация соответствует EU-индексу по Kabat).
Таблица 15
Указанной единицей измерения для значений IC50 является мкг/мл
| Мут. | 1С50 | Мут. | 1С50 | Мут. | 1С50 | Мут. | 1С50 | Мут. | 1С50 | Мут. | 1С50 | Мут. | 1С50 |
| HE31N | 0,11 | Е35 | 0,12 | НТ28Н | 0,06 | LS26L | 0,044 | LQ27Y | 0,065 | LS31T | 0,060 | LS28H | 0,058 |
| HE31G | 0,116 | НТЗОР | 0,126 | HT28V | 0,08 | LS26N | 0,054 | LQ27P | 0,097 | LS31R | 0,069 | LS28W | 0,060 |
| Е35 | 0,12 | HT30D | 0,132 | НТ28Е | 0,091 | LS26A | 0,062 | LQ27A | 0,104 | LS31A | 0,078 | LS28L | 0,067 |
| HE31D | 0,13 | НТЗОЕ | 0,132 | НТ28Р | 0,093 | LS26K | 0,069 | LQ27I | 0,105 | LS31H | 0,106 | LS28R | 0,077 |
| НЕ31М | 0,13 | HT30Y | 0,142 | HT28L | 0,100 | LS26R | 0,072 | LQ27F | 0,113 | LS31Q | 0,117 | LS28K | 0,082 |
| HE31S | 0,14 | HT30W | 0,151 | НТ28М | 0,11 | LS26I | 0,073 | LQ27T | 0,113 | Е35 | 0,12 | LS28T | 0,088 |
| НЕ31Р | 0,17 | HT30V | 0,158 | HT28S | 0,11 | LS26Q | 0,075 | LQ27R | 0,117 | LS31P | 0,139 | LS28P | 0,089 |
| HE31F | 0,18 | нтзом | 0,174 | HT28W | 0,11 | LS26G | 0,078 | Е35 | 0,12 | LS31M | 0,156 | LS28I | 0,091 |
| HE31Y | 0,2 | HT30N | 0,178 | НТ28С | 0,12 | LS26T | 0,081 | LQ27V | 0,120 | LS31L | 0,235 | LS28F | 0,100 |
| НЕ31А | 0,21 | HT30L | 0,181 | Е35 | 0,12 | LS26H | 0,089 | LQ27L | 0,128 | LS31G | 0,279 | LS28V | 0,104 |
| HE31V | 0,22 | HT30Q | 0,192 | НТ28А | 0,13 | LS26M | 0,089 | LQ27E | 0,135 | LS31W | 0,649 | LS28E | 0,111 |
| НЕ31К | 0,23 | HT30G | 0,199 | HT28G | 0,16 | LS26C | 0,114 | LQ27S | 0,138 | LS31I | 0,681 | LS28A | 0,116 |
| HE31W | 0,26 | HT30S | 0,213 | HT28N | 0,17 | Е35 | 0,12 | LQ27C | 0,142 | LS31E | 0,832 | Е35 | 0,12 |
| HE31R | 0,31 | НТЗОА | 0,215 | НТ28К | 0,217 | LS31D | 1,34 | LS28Q | 0,154 | ||||
| НЕ31С | 0,36 | НТЗОК | 0,325 | ||||||||||
| HT30R | 0,350 | ||||||||||||
| Мут. | 1С50 | Мут. | 1С50 | Мут. | 1С50 | Мут. | 1С50 | Мут. | 1С50 | Мут. | 1С50 | Мут. | 1С50 |
| LS30L | 0,069 | LY32L | 0,07 | LS52A | 0,068 | LA51G | 0,12 | Е35 | 0,12 | Е35 | 0,12 | LN93D | 0,045 |
| LS30W | 0,071 | Е35 | 0,12 | LS52W | 0,073 | LA51R | 0,12 | LG50T | 0,25 | LD92A | 0,282 | LN93E | 0,081 |
| LS30M | 0,073 | LY32F | 0,21 | LS52R | 0,089 | Е35 | 0,12 | LG50A | 0,5 | LD92Q | 0,328 | Е35 | 0,12 |
| LS30A | 0,078 | LY32M | 0,42 | LS52L | 0,115 | LA51H | 0,162 | LG50D | 0,88 | LD92W | 0,342 | LN93T | 0,14 |
| LS30Y | 0,082 | LY32T | 0,51 | Е35 | 0,12 | LA51K | 0,168 | LG50Q | 0,93 | LD92V | 0,387 | LN93Y | 0,156 |
| LS30K | 0,083 | LY32Q | 0,87 | LS52T | 0,136 | LA51S | 0,18 | LG50I | 1,08 | LD92L | 0,420 | LN93G | 0,205 |
| LS30R | 0,088 | LY32W | 1,17 | LS52Q | 0,138 | LA51T | 0,18 | LG50S | 1,3 | LD92T | 0,494 | LN93A | 0,21 |
| LS30G | 0,092 | LY32V | 1,23 | LS52F | 0,167 | LA51M | 0,264 | LG50V | 1,4 | LD92R | 0,495 | LN93M | 0,27 |
| LS30T | 0,092 | LY32A | 1,35 | LS52Y | 0,181 | LA51F | 0,294 | LG50N | 1,59 | LD92M | 0,507 | LN93F | 0,3 |
| LS30E | 0,100 | LY32G | 1,35 | LS52H | 0,192 | LA51N | 0,36 | LG50P | 1,86 | LD92G | 0,522 | LN93S | 0,3 |
| Е35 | 0,12 | LY32C | 1,9 | LS52N | 0,253 | LA51V | 0,36 | LG50R | 2,79 | LD92H | 0,530 | LN93I | 0,33 |
| LS30V | 0,124 | LY32N | 2,05 | LS52P | 1,055 | LA51C | 0,37 | LG50L | 3,9 | LD92I | 0,597 | LN93L | 0,33 |
| LS30N | 0,132 | LY32R | 3,12 | LS52D | 1,751 | LA51L | 0,5 | LG50H | 4,29 | LD92S | 0,598 | LN93H | 0,45 |
| LS30F | 0,160 | LY32E | 3,75 | LA51E | 0,81 | LG50C | 25,7 | LD92K | 0,640 | LN93R | 0,6 | ||
| LS30C | 0,221 | LY32P | 5,15 | LA51W | 1,59 | LG50E | 29,85 | LD92P | 0,881 | LN93P | 0,66 | ||
| LY32K | 9,6 | LA51P | 2,1 | LG50Y | 32 | LN93K | 0,78 | ||||||
| LY32S | NA | LA51Q | 18,17 | LG50W | NA |
NA означает данные отсутствуют.
На основании этих результатов было определено, что scFv антитела, имеющие приведенные ниже аминокислотные последовательности, происходящие из антитела Е35 в формате scFv, сохраняли свои
- 78 048006 биологические активности, что оценивали с использованием анализа пролиферации TF-1 клеток:
(1) Е, Н, N, G, D, M, S, P, F, Y, А, V, K, W, R или С в положении 31 Vh;
(2) S, L, N, А, K, R, I, Q, G, Т, Н, М или С в положении 26 VL;
(3) Q, Y, P, A, I, F, T, R, V, L, E, S или С в положении 27 Vl;
(4) S, Н, W, L, R, K, Т, Р, I, F, V, Е, А или Q в положении 28 Vl;
(5) S, L, W, M, A, Y, K, R, G, Т, Е, V, N, F или С в положении 30 Vl;
(6) S, T, R, A, H, Q, P, M, L или G в положении 31 Vl;
(7) Y, L или F в положении 32 Vl;
(8) G или Т в положении 50 Vl;
(9) A, G, R, Н, K, S, Т, М, F, N или V в положении 51 Vl;
(10) S, A, W, R, L, T, Q, F, Y, Н или N в положении 52 Vl;
(11) D, A, Q или W в положении 92 Vl;
(12) N, D, E, T, Y, G, A, M, F, S, I или L в положении 93 Vl;
(13) аминокислотные остатки, выбранные из Т, Н, V, Е, Р, L, M, S, W, С, A, G, N или К в положении 28 Vh;
(14) аминокислотные остатки, выбранные из Т, Р, D, E, Y, W, V, М, N, L, Q, G, S, А, K или R в положении 30 VH.
Кроме того, создавали варианты Е35, содержащие мутации, внесенные комбинаторным мутагенезом. Анализировали значения IC50 в отношении ослабления пролиферации клеток TF-1 для полноразмерных антител IgG4 типа, содержащих варианты Е35, и они показаны в приведенной ниже табл. 16. Эти результаты позволяли предположить, что варианты Е35, содержащие мутации, внесенные комбинаторным мутагенезом, демонстрировали улучшенную эффективность в отношении ослабления пролиферации клеток TF-1.
Таблица 16
| Антитело | 1С50 (мкг/мл) | Нормирование |
| E35-IG4 | 0,0474 | 1,0000 |
| E35-VL93D-IG4 | 0,03714 | 0,7835 |
| E35-VH28H-IG4 | 0,05693 | 1,2011 |
| E35-VH28E-IG4 | 0,03073 | 0,6483 |
| E35-VH28H-VL93L-IG4 | 0,01628 | 0,3435 |
| E35-VH28H-VL93D-IG4 | 0,02783 | 0,5871 |
| E35-VH28H-VL30L-IG4 | 0,02959 | 0,6243 |
| E35-VH28H-VL30C-IG4 | 0,04306 | 0,9084 |
| E35-VH28E-VL30L-IG4 | 0,02682 | 0,5658 |
| E35-VH28E-VL30C-IG4 | 0,02077 | 0,4382 |
| E35-VH28H-VL30L-93D-IG4 | 0,02414 | 0,5093 |
Типичные последовательности вариабельных доменов тяжелой цепи и вариабельных доменов легкой цепи вариантов Е35 показаны ниже в табл. 17.
- 79 048006
Таблица 17
| Антитело | Замена | SEQ ID NO Для VH | SEQ ID NO Для VL | Антитело | Замена | SEQ ID NO Для VH | SEQ ID NO Для VL |
| АЬМ-1 | LS26A | 91 | 150 | АЬМ-74 | LS52H | 91 | 222 |
| АЬМ-2 | LS26C | 91 | 151 | АЬМ-75 | LS52L | 91 | 223 |
| АЬМ-3 | LS26G | 91 | 152 | АЬМ-76 | LS52N | 91 | 224 |
| АЬМ-4 | LS26H | 91 | 153 | АЬМ-77 | LS52Q | 91 | 225 |
| АЬМ-5 | LS26I | 91 | 154 | АЬМ-78 | LS52R | 91 | 226 |
| АЬМ-6 | LS26K | 91 | 155 | АЬМ-79 | LS52T | 91 | 227 |
| АЬМ-7 | LS26L | 91 | 156 | АЬМ-81 | LS52W | 91 | 229 |
| АЬМ-8 | LS26M | 91 | 157 | АЬМ-83 | LS52Y | 91 | 231 |
| АЬМ-9 | LS26N | 91 | 158 | АЬМ-84 | LD92A | 91 | 232 |
| АЬМ-10 | LS26Q | 91 | 159 | АЬМ-85 | LD92Q | 91 | 233 |
| АЬМ-11 | LS26R | 91 | 160 | АЬМ-86 | LD92W | 91 | 234 |
| АЬМ-12 | LS26T | 91 | 161 | АЬМ-87 | LN93A | 91 | 235 |
| АЬМ-13 | LQ27A | 91 | 162 | АЬМ-88 | LN93D | 91 | 236 |
| АЬМ-14 | LQ27C | 91 | 163 | АЬМ-89 | LN93E | 91 | 237 |
| АЬМ-15 | LQ27E | 91 | 164 | АЬМ-90 | LN93F | 91 | 238 |
| АЬМ-16 | LQ27F | 91 | 165 | АЬМ-91 | LN93G | 91 | 239 |
| АЬМ-17 | LQ27I | 91 | 166 | АЬМ-92 | LN93I | 91 | 240 |
| АЬМ-18 | LQ27L | 91 | 167 | АЬМ-93 | LN93L | 91 | 241 |
| АЬМ-19 | LQ27P | 91 | 168 | АЬМ-94 | LN93M | 91 | 242 |
| АЬМ-20 | LQ27R | 91 | 169 | АЬМ-95 | LN93S | 91 | 243 |
| АЬМ-21 | LQ27S | 91 | 170 | АЬМ-96 | LN93T | 91 | 244 |
| АЬМ-22 | LQ27T | 91 | 171 | АЬМ-97 | LN93Y | 91 | 245 |
- 80 048006
| AbM-23 | LQ27V | 91 | 172 | AbM-98 | HT28A | 246 | 126 |
| AbM-24 | LQ27Y | 91 | 173 | AbM-99 | HT28C | 247 | 126 |
| AbM-25 | LS28A | 91 | 174 | AbM-100 | HT28E | 248 | 126 |
| AbM-26 | LS28E | 91 | 175 | AbM-101 | HT28G | 249 | 126 |
| AbM-27 | LS28F | 91 | 176 | AbM-102 | HT28H | 250 | 126 |
| AbM-28 | LS28H | 91 | 177 | AbM-103 | HT28K | 251 | 126 |
| AbM-29 | LS28I | 91 | 178 | AbM-104 | HT28L | 252 | 126 |
| AbM-30 | LS28K | 91 | 179 | AbM-105 | HT28M | 253 | 126 |
| AbM-31 | LS28L | 91 | 180 | AbM-106 | HT28N | 254 | 126 |
| AbM-32 | LS28P | 91 | 181 | AbM-107 | HT28P | 255 | 126 |
| AbM-33 | LS28Q | 91 | 182 | AbM-108 | HT28S | 256 | 126 |
| AbM-34 | LS28R | 91 | 183 | AbM-109 | HT28V | 257 | 126 |
| AbM-35 | LS28T | 91 | 184 | AbM-110 | HT28W | 258 | 126 |
| AbM-36 | LS28V | 91 | 185 | AbM-111 | HT30A | 259 | 126 |
| AbM-37 | LS28W | 91 | 186 | AbM-112 | HT30D | 260 | 126 |
| AbM-38 | LS30A | 91 | 187 | AbM-113 | HT30E | 261 | 126 |
| AbM-39 | LS30C | 91 | 188 | AbM-114 | HT30G | 262 | 126 |
| AbM-40 | LS30E | 91 | 189 | AbM-115 | HT30K | 263 | 126 |
| AbM-41 | LS30F | 91 | 190 | AbM-116 | HT30L | 264 | 126 |
| AbM-42 | LS30G | 91 | 191 | AbM-117 | HT30M | 265 | 126 |
| AbM-43 | LS30K | 91 | 192 | AbM-118 | HT30N | 266 | 126 |
| AbM-44 | LS30L | 91 | 193 | AbM-119 | HT30P | 267 | 126 |
| AbM-45 | LS30M | 91 | 194 | AbM-120 | HT30Q | 268 | 126 |
| AbM-46 | LS30N | 91 | 195 | AbM-121 | HT30R | 269 | 126 |
| AbM-47 | LS30R | 91 | 196 | AbM-122 | HT30S | 270 | 126 |
| AbM-48 | LS30T | 91 | 197 | AbM-123 | HT30V | 271 | 126 |
| AbM-49 | LS30V | 91 | 198 | AbM-124 | HT30W | 272 | 126 |
| AbM-50 | LS30W | 91 | 199 | AbM-125 | HT30Y | 273 | 126 |
| AbM-51 | LS30Y | 91 | 200 | AbM-126 | HE31A | 274 | 126 |
| AbM-52 | LS31A | 91 | 201 | AbM-127 | HE31C | 275 | 126 |
| AbM-53 | LS31G | 91 | 202 | AbM-128 | HE31D | 276 | 126 |
| AbM-54 | LS31H | 91 | 203 | AbM-129 | HE31F | 277 | 126 |
| AbM-55 | LS31L | 91 | 204 | AbM-130 | HE31G | 278 | 126 |
| AbM-56 | LS31M | 91 | 205 | AbM-131 | HE31K | 279 | 126 |
| AbM-57 | LS31P | 91 | 206 | AbM-132 | HE31M | 280 | 126 |
| AbM-58 | LS31Q | 91 | 207 | AbM-133 | HE31N | 281 | 126 |
| AbM-59 | LS31R | 91 | 208 | AbM-134 | HE31P | 282 | 126 |
- 81 048006
| АЬМ-60 | LS31T | 91 | 209 | АЬМ-135 | HE31R | 283 | 126 |
| АЬМ-61 | LY32F | 91 | 210 | АЬМ-136 | HE31S | 284 | 126 |
| АЬМ-62 | LY32L | 91 | 211 | АЬМ-137 | HE31V | 285 | 126 |
| АЬМ-63 | LG50T | 91 | 212 | АЬМ-138 | HE31W | 286 | 126 |
| АЬМ-64 | LA51F | 91 | 289 | АЬМ-139 | HE31Y | 287 | 126 |
| АЬМ-65 | LA51G | 91 | 213 | АЬМ-140 | Е35-28Н- 93L-IG4 | 250 | 241 |
| АЬМ-66 | LA51H | 91 | 214 | АЬМ-141 | Е35-28Н- 30L-IG4 | 250 | 193 |
| АЬМ-67 | LA51K | 91 | 215 | АЬМ-142 | Е35-28Е- 30C-IG4 | 248 | 188 |
| АЬМ-68 | LA51M | 91 | 216 | АЬМ-143 | Е35-28Е- 30L-IG4 | 248 | 193 |
| АЬМ-69 | LA51R | 91 | 217 | АЬМ-144 | Е35-28Н- 30L93D- IG4 | 250 | 288 |
| АЬМ-70 | LA51S | 91 | 218 | АЬМ-145 | Е35-28Н- 30C-IG4 | 250 | 188 |
| АЬМ-71 | LA51T | 91 | 219 | АЬМ-146 | Е35НТ28 H-LN93D- IG4 | 250 | 236 |
| АЬМ-72 | LS52A | 91 | 220 | АЬМ-147 | Е35- LS30L- LN93D- IG4 | 91 | 288 |
Пример 4. Эпитопное картирование антител к GM-CSFRa.
Аминокислотные остатки вблизи сайтов связывания с GM-CSF на GM-CSFRa идентифицировали на основании соответствующих кристаллических структур, нумерация в GM-CSFRa находится в соответствии с кристаллической структурой (идентификационный номер в Банке данных по трехмерной структуре белков (PDB id): 4RS1), как показано на фиг. 20. Используя программное обеспечение Discovery Studio, идентифицировали предсказанные сайты связывания для Е35, выбирали аминокислотные остатки в пределах сайтов связывания и вблизи сайтов связывания и подвергали процедуре аланинового сканирования. Проводили экспрессию белков GM-CSFRa с такими отобранными мутациями. Аффинность связывания E35-IgG4, E87b-IgG4 и T119-IgG4 с каждым подвергнутым мутациям белком GMCSFRa анализировали, используя ELISA. На фиг. 18А-18С показаны полученные с использованием ELISA кривые связывания антител с подвергнутым мутациям GM-CSFRa. Как использовано в данном описании, GMRah представляет собой меченный меткой His человеческий GM-CSFRa дикого типа (GMCSFRa-6His). Мутации в различные положения аминокислотной последовательности GM-CSFRa дикого типа вносили, используя аланиновое сканирование, которое описано выше. Как показано на фиг. 18А18С, мутация в положении С60 оказывала значительное влияние на аффинность связывания Е35, Е87Ь и Т119, и ее определяли как мутацию, которая оказывала влияние на белковую структура GM-CSFRa. На основании этих результатов идентифицировали, что типичные эпитопы антител Е35, Е87Ь и Т119 содержат аминокислотные остатки, которые показаны в табл. 18. Нумерация аминокислотных остатков в GMCSFRa (SEQ ID NO: 292) показана на фиг. 20.
Таблица 18
| Антитело | R49 | V50 | V51 | N57 | Е59 | S61 | Т63 | L191 | К194 | K195 | 1196 | R283 | I284 |
| Е35 | GMR- V50 | GMR- V51 | GMR- Е59 | GMR- Т63 | G MR- KI 94 | G MR- KI 95 | G MR- 1196 | GMR- R283 | G MR1284 | ||||
| Е87Ь | GMR- V50 | GMR- Е59 | G MR- LI 91 | G MR- KI 94 | G MR- KI 95 | G MR- 1196 | GMR- R283 | G MR1284 | |||||
| Т119 | GMR- R49 | GMR- V50 | GMR- V51 | GMR- V57 | GMR- Е59 | G MR- 861 | G MR- KI 94 | G MR- KI 95 | GMR- R283 | G MR1284 |
-
Claims (9)
- (1) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 80 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 80; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 123;(1) Е, Н, N, G, D, M, S, P, F, Y, А, V, K, W, R или С в положении 31 VH; и/или (2) S, L, N, А, K, R, I, Q, G, Т, Н, М или С в положении 26 VL; и/или (3) Q, Y, P, A, I, F, T, R, V, L, E, S или С в положении 27 VL; и/или (4) S, H, W, L, R, K, Т, Р, I, F, V, Е, А или Q в положении 28 VL; и/или (5) S, L, W, M, A, Y, K, R, G, Т, Е, V, N, F или С в положении 30 VL; и/или (6) S, T, R, A, H, Q, P, M, L или G в положении 31 VL; и/или (7) Y, L или F в положении 32 VL; и/или (8) G или Т в положении 50 VL; и/или (9) A, G, R, Н, K, S, T, M, F, N или V в положении 51 VL; и/или (10) S, A, W, R, L, T, Q, F, Y, Н или N в положении 52 VL; и/или (11) D, A, Q или W в положении 92 VL; и/или (12) N, D, E, T, Y, G, A, M, F, S, I или L в положении 93 VL; и/или (13) аминокислотные остатки, выбранные из Т, Н, V, Е, Р, L, M, S, W, С, A, G, N или K в положении 28 VH; и/или (14) аминокислотные остатки, выбранные из Т, Р, D, E, Y, W, V, М, N, L, Q, G, S, А, K или R в положении 30 VH, при этом нумерация соответствует EU-индексу по Kabat.(1) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54;1. Выделенное антитело к GM-CSFRa, содержащее:VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 1-4; HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 5-16; и HCCDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 17-50; иVL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51; LCCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52; и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 53-75.
- (2) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 85; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 125 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 125;(2) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 56;2. Выделенное антитело к GM-CSFRa по п.1, содержащее:
- (3) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 86 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 86; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 126;3. Выделенное антитело к GM-CSFRa по п.1, содержащее VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27; VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LCCDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57.- 85 048006(3) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57;
- (4) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 91; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 126;4. Выделенное антитело к GM-CSFRa по п. 3, содержащее следующие аминокислотные остатки:(4) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53;
- (5) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 99 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 99; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 122;5. Выделенное антитело к GM-CSFRa по любому из пп.1-4, содержащее:VH, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 80-121 и 246-287 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью любой из SEQ ID NO: 80-121 и 246-287; иVL, содержащий аминокислотную последовательность любой из SEQ ID NO: 122-144, 150-245 и 288-289 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью любой из SEQ ID NO: 122-144, 150-245 и 288-289.(5) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57;
- (6) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 101 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 101; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 126;6. Выделенное антитело к GM-CSFRa по п.5, содержащее:(6) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54;
- 7. Выделенное антитело к GM-CSFRa по любому из пп.1-6, где указанное антитело к GM-CSFRa содержит Fc фрагмент.(7) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 103; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 123 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 123;(7) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57;
- 8. Выделенное антитело к GM-CSFRa по п.7, где указанное антитело к GM-CSFRa представляет собой полноразмерное антитело IgG типа.(8) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 99 или ее вариант, имеющий- 86 048006 по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 99; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 126;(9) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 121 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 121; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 126;(10) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 80 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 80; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 122;(11) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 81 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 81; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 122;(12) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 82 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 82; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 122;(13) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 83 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 83; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 122;(14) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 84 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 84; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 124 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 124;(15) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 87 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 87; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 122;(16) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 88 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 88; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 127 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 127;(17) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 89 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 89; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 127 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 127;(18) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 90 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 90; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 128;(19) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 92 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 92; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 129 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 129;(20) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 93 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 93; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 127 или- 87 048006 ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 127;(21) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 94 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 94; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 130;(22) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 95 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 95; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 131;(23) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 96 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 96; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 132 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 132;(24) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 97 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 97; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 129 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 129;(25) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 98 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 98; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 124 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 124;(26) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 100; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 133;(27) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 102; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 122;(28) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 104 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 104; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 134 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 134;(29) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 105 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 105; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 135 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 135;(30) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 106 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 106; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 136 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 136;(31) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 109 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 109; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 124 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 124;(32) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 111 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 111; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 122;- 88 048006 (33) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 114 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 114; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 124 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 124;(34) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 118 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 118; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 142 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 142;(35) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 91; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 130;(36) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 250; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 241 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 241;(37) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 250; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 193 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 193;(38) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 248 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 248; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 188 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 188;(39) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 248 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 248; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 193 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 193;(40) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 250; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 288 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 288;(41) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 250; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 188 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 188;(42) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 250 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 250; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 236 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 236; или (43) VH, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 91 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 91; и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 288 или ее вариант, имеющий по меньшей мере примерно 90% идентичности последовательности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 288.(8) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57;(9) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53;(10) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53;(11) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий- 83 048006 аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53;(12) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53;(13) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 55;(14) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53;(15) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 25; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58;(16) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58;(17) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59;(18) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 28; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60;(19) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 29; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58;(20) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 30; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61;(21) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 31; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62;(22) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 32; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(23) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последователь- 84 048006 ность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60;(24) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 34; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 55;(25) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 36; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 64;(26) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53;(27) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 65;(28) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 66;(29) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 67;(30) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 55;(31) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53;(32) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 48; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 55;(33) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 49; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 73;(34) VH, содержащий HC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, HC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и HC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27; и VL, содержащий LC-CDR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, LC-CDR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и LC-CDR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61.
- 9. Выделенное антитело к GM-CSFRa по п.8, где указанное антитело к GM-CSFRa представляет собой полноразмерное антитело IgG1 или IgG4 подтипа.-
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CNPCT/CN2018/117581 | 2018-11-27 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| EA048006B1 true EA048006B1 (ru) | 2024-10-21 |
Family
ID=
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US20230374144A1 (en) | Antibodies specifically recognizing interleukin-4 receptor alpha and uses thereof | |
| WO2022166739A1 (en) | Antibodies specifically recognizing thymic stromal lymphopoietin and uses thereof | |
| JP2023011887A (ja) | 顆粒球-マクロファージコロニー刺激因子受容体αを特異的に認識する抗体及びその使用 | |
| EP4596580A1 (en) | Antibody for specifically recognizing light and use thereof | |
| US20260015423A1 (en) | Antibodies specifically recognizing programmed cell death1 ligand 1 and uses thereof | |
| WO2023129870A2 (en) | ANTIBODIES SPECIFICALLY RECOGNIZING C5aR1 AND USES THEREOF | |
| US12534521B2 (en) | Antibodies specifically recognizing C5A and uses thereof | |
| US20250101120A1 (en) | Antibodies specifically recognizing fasl and uses thereof | |
| US20250136699A1 (en) | Antibodies specifically recognizing fcrn and uses thereof | |
| EP4371572A1 (en) | Antibody that specifically recognizes cd40 and application thereof | |
| WO2023186054A1 (zh) | 特异性识别c5a的抗体及其应用 | |
| EA048006B1 (ru) | Антитела, специфично распознающие рецептор-альфа гранулоцитарно-макрофагального колониестимулирующего фактора, и их применения | |
| WO2025002221A1 (en) | Multi-specific antibodies comprising antigen-binding domains specifically recognizing c5ar1 and gm-csfr alpha | |
| EA049650B1 (ru) | АНТИТЕЛА, СПЕЦИФИЧЕСКИ РАСПОЗНАЮЩИЕ C5a, И ВАРИАНТЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ | |
| CN121843960A (zh) | 特异性识别robo2的抗体及其应用 |