EP0333813A1 - Procede de fixation et de separation de molecules comportant au moins un fragment d'adn naturel ou synthetique - Google Patents

Procede de fixation et de separation de molecules comportant au moins un fragment d'adn naturel ou synthetique

Info

Publication number
EP0333813A1
EP0333813A1 EP19880908250 EP88908250A EP0333813A1 EP 0333813 A1 EP0333813 A1 EP 0333813A1 EP 19880908250 EP19880908250 EP 19880908250 EP 88908250 A EP88908250 A EP 88908250A EP 0333813 A1 EP0333813 A1 EP 0333813A1
Authority
EP
European Patent Office
Prior art keywords
dna
substrate
molecules
solvent
fixing
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Withdrawn
Application number
EP19880908250
Other languages
German (de)
English (en)
Inventor
Daniel Dupret
Martine Sauvageot
Véronique HARSANY
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
APPLIGENE
Appligene SA
Original Assignee
APPLIGENE
Appligene SA
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from FR8713010A external-priority patent/FR2620706A1/fr
Priority claimed from FR8716338A external-priority patent/FR2623505B1/fr
Application filed by APPLIGENE, Appligene SA filed Critical APPLIGENE
Publication of EP0333813A1 publication Critical patent/EP0333813A1/fr
Withdrawn legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/1003—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor
    • C12N15/1017—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor by filtration, e.g. using filters, frits, membranes

Definitions

  • the subject of the present invention is a method for separating DNA or molecules containing DNA fragments.
  • the Applicant proposes a new process. It is a process for fixing and separating molecules comprising at least one fragment of natural or synthetic DNA from a liquid mixture containing said molecules, characterized in that: a) said liquid mixture is put in the presence of a substrate having a composition and a structure such that it provides with DNA a non-covalent, reversible and selective bond; b) in that, after DNA binding, the residual mixture is removed; c) the bound DNA is then removed, after having been subjected to one or more physical and / or chemical reactions in the presence of at least one solvent in which the molecules comprising at least one DNA fragment and the substrate are practically insoluble .
  • the Applicant has developed a process which consists in carrying out the said reaction on the DNA which is fixed in a reversible and non-covenanted manner on an insoluble support, both in the reaction solvent and in water.
  • the support used can be a finely divided support, such as glass powder for example, the particles of which are of dimension equal to or less than 5 ⁇ m. Then, by addition of solvent, a DNA suspension fixed on glass powder is obtained, which makes it possible to directly treat the DNA in heterogeneous phase in the chosen solvent, without having to carry out liquid-liquid phase separation.
  • Glass powder can be used in suspension where it has no drawbacks, but if it is desired to use it as a packing for a column, then great difficulties are encountered.
  • the size of the active glass particles (5 ⁇ m maximum) and their angular nature mean that they have a coefficient of. very low vacuum which requires the use of enormous pressures to pass fluids through columns of glass powder (HPLC) and the DNA is then rapidly degraded by the pressures applied and the shear forces.
  • cellular DNA itself, but also natural or synthetic oligonucleotides as well as DNA having undergone chemical or physical modifications such as chemical labeling, presence of intercalating agent or physicochemical bond such as fixation by the avidin-biotin pair.
  • it When it is in unit form, it will preferably be a product in sintered form, for example a glass or metallic frit.
  • the fibers When it is a divided substrate, it will be in the form of fibers or beads.
  • the fibers can be entangled as in a glass wool type wool, or else combined in braids for example. In the case of balls, the diameters will be adapted to the implementation envisaged.
  • the use of frit is particularly advantageous in the production of diagnostic kits or else for single uses. Indeed, a frit based on compressed glass particles and welded together has a mechanical strength which allows it to be used directly as a column. Although the porosity of such a support is low (less than
  • the liquid mixture brought into contact with the substrate may be of any origin, it may be a medium obtained after cracking. cell or a medium of synthetic origin for example; preferably, this medium will be an aqueous medium containing a chaiotropic agent such as sodium iodide or potassium perchlorate.
  • a chaiotropic agent such as sodium iodide or potassium perchlorate.
  • the substrate used must be insoluble in said medium.
  • the elution of the molecules fixed from the substrate is preferably carried out with an aqueous solution which may, optionally contain at least one mineral salt, a buffering agent, a chelating agent and / or an antioxidant agent.
  • This method also makes it possible to subject the fixed molecules to one or more physical and / or chemical reactions in a solvent in which the DNA and the substrate are insoluble.
  • the water capable of being added to the solvent can be added, for example, a small amount of sodium chloride, EDTA or Tris HCl.
  • the DNA-substrate complex is subjected to a treatment with a view to obtaining DNA or purified molecules.
  • the treatment with solvents essentially aims at separating from the DNA the contaminating molecules which are attached to it.
  • These contaminating molecules can be, among other proteins, agrose, fatty substances or fluorescent agents such as ethidium bromide, used for 'the. labeling of DNA molecules.
  • the choice of solvent is, in this case, a function of the origin of the DNA to be purified: thus in the case where the DNA is contaminated for the most part with proteins, phenol saturated with water will advantageously be used, while that in the case where the contaminant consists essentially of fatty substances, the solvent will preferably be chloroform.
  • the invention relates to the application of said substrates in low pressure chromatography, as well as said substrates comprising a fixed DNA molecule.
  • Example 1 is intended to demonstrate other - characteristics and advantages of the process according to the present invention.
  • This example describes the obtaining of plasmid DNA from the bacterium Escherichia coli.
  • 1.5 ml of E. coli culture are centrifuged, the pellet is taken up in 100 ⁇ l of TGE (Tris HCl 25 mM pH 7.5; EDTA 10 mM; Glucose 50 mM) -. All subsequent steps are carried out at ° C.
  • the mixture is centrifuged for 2 to 5 minutes (microfuge centrifuge) and 400 ⁇ l of supernatant is recovered.
  • the pellet is taken up in 400 ⁇ l of phenol saturated with water and the mixture is stirred for 5 minutes. Centrifuge for 1 to 5 minutes and remove the supernatant.
  • the pellet is taken up in 50 to 100 ⁇ l of TE and mixed for 5 minutes. Centrifuge for 5 minutes and recover the supernatant.
  • the plasmid DNA obtained is extremely pure, the steps of treatment with RNase, with proteinase K, with phenol, with chloroform ne T O are no longer necessary.
  • the frit used is obtained from glass powder 732.01 20 Pyrex sold in particular by Corning France, ground to an average particle size of 5 microns.
  • the frit is washed with 10 ml of 8 M Nal and then with
  • RNA did not attach, only the DNA attached and was eluted. Soluble proteins were not fixed and those that were attached to DNA were released by phenol treatments.

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Solid-Sorbent Or Filter-Aiding Compositions (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)

Abstract

La présente invention concerne un procédé de fixation et de séparation de molécules comportant au moins un frag­ ment d'ADN naturel ou synthétique à partir d'un mélange liquide contenant lesdites molécules, caractérisé en ce que: a) ledit mélange liquide est mis en présence d'un substrat présentant une composition et une structure telle qu'il assure avec l'ADN une liaison non covalente, réversible et sélective; b) en ce que, après liaison de l'ADN, le mélange résiduel est éli­ miné; c) l'ADN lié est ensuite élué, après avoir été soumis à une ou plusieurs réactions physiques et/ou chimiques en pré­ sence d'au moins un solvant dans lequel les molécules comportant au moins un fragment d'ADN et le substrat sont prati­ quement insolubles.
Abstract
The present invention relates to a method for fixing and separating molecules comprising at least one natural or syn­ thetic DNA fragment from a liquid mixture containing said molecules, characterized in that: a) said liquid mixture is set in the presence of a substrate presenting a composition and a structure such that it provides with the DNA a non-covalent, reversible and selective binding; b) in that, after binding with DNA, the residual mixture is removed; c) the bound DNA is then eluted, after it has been subjected to one or a plurality of physical and/or chemical reactions in the presence of at least one solvent wherein the molecules comprising at least one DNA fragment and the substrate are substantially unsoluble.

Description

PROCEDE DE FIXATION ET DE SEPARATION DE MOLECULES COMPOR¬ TANT AU MOINS UN FRAGMENT D'ADN NATUREL OU SYNTHETIQUE
La présente invention a pour objet un procédé de séparation d'ADN ou de molécules contenant des fragments d'ADN.
On sait que l'ADN est soluble presqu'exclusivement dans l'eau, ce qui rend très difficile, voire impossible, de lui faire subir des transformations chimiques faisant intervenir des réactions dans des solvants non miscibles à l'eau.
On connaît également les difficultés rencontrées dans l'obtention d'ADN purifié, les procédés mis au point à ce jour faisant appel à une succession d'extractions en phases liquides qui présentent l'inconvé¬ nient d'être longues, délicates et difficilement automatisables. Parmi ces procédés, l'un des plus récents consiste à fixer l'ADN en solution aqueuse sur les particules d'une poudre de verre au moyen d'un agent chaiotropique tel que 'l'iodure de sodium ou le perchlorate de potassium. Cette fixation se faisant sélectivement permet de séparer l'ADN des protéines et de TARN en solution qui l'accompagnent généralement, et conduit à l'obtention d'un produit de fixation de l'ADN sur la poudre de verre, dont on sépare l'ADN par une élution pratiquée au moyen d'une solution aqueuse. La solution d'ADN ainsi obtenue doit être ensuite soumise à une succession d'opérations de purification, qui consistent généralement en des traitements successifs à la RNase, à la protéinase , au phénol et au chloroforme, tous opérés en phases liquides.
Le traitement de l'ADN et sa purification se heurtent à de nombreuses difficultés, en particulier compte tenu du grand nombre d'opérations successives à mettre en oeuvre, ce qui nuit à la rentabilité du traitement, empêchant en particulier la mise au point d'appareillages automatiques.
C'est pourquoi, dans le but d'améliorer le traitement, en particulier la mise en réaction chimique ou physique de l'ADN, et sa purification, la Demanderesse propose un nouveau procédé. II s'agit d'un procédé de fixation et de séparation de molécules comportant au moins un fragment d'ADN naturel ou synthétique à partir d'un mélange liquide contenant iesdites molécules,, caractérisé en ce que : a) ledit mélange liquide est mis en présence d'un substrat présentant une composition et une structure telle qu'il assure avec l'ADN une liaison non covalente, réversible et sélective ; b) en ce que, après liaison de l'ADN, le mélange résiduel est éliminé ; c) l'ADN lié est ensuite éiué, après avoir été soumis à une ou plusieurs réactions physiques et/ou chimiques en présence d'au moins un solvant dans lequel les molécules comportant au moins un fragment d'ADN et le substrat sont pratiquement insolubles.
Dans le but d'améliorer le traitement, en particulier la mise en réaction chimique ou physique de l'ADN, la Demanderesse a mis au point un procédé qui consiste à mettre en oeuvre ladite réaction sur l'ADN fixé de façon réversible et non covaiente sur un support insoluble, à la fois dans le solvant de la réaction et dans l'eau. Selon ce procédé, le support utilisé peut être un support finement divisé, tel que la poudre de verre par exemple, dont les particules sont de dimension égale ou inférieure à 5 μm. On obtient alors, par addition de solvant, une suspension ADN fixé sur poudre de verre, ce qui permet de traiter directement l'ADN en phase hétérogène dans le solvant choisi, sans avoir à effectuer de séparation de phase liquide-liquide.
L'un des problèmes auquel on se heurte toutefois lors du traitement - de l'ADN par ce procédé est que lorsque l'on souhaite automatiser le processus ou bien lorsque l'on souhaite le présenter sous forme de trousse de diagnostic par exemple, la poudre de verre présente de nombreux inconvénients.
La poudre de verre peut être utilisée en suspension où elle ne présente aucun inconvénient mais si on souhaite l'utiliser sous forme de garnissage pour une colonne, alors on se heurte à de grandes difficultés.
En effet, la taille des particules de verre actives (5 μm maximum) et leur nature anguleuse font qu'elles présentent un coefficient de. vide très faible ce qui impose l'utilisation de pressions énormes pour passer des fluides au travers de colonnes de poudre de verre (HPLC) et l'ADN est alors rapidement dégradé par les pressions appliquées et les forces de cisaillement.
La présente invention a pour but également de proposer un procédé de traitement de l'ADN qui rende aisée la manipulation de l'ADN à des fins de purification ou de modification chimique ou enzymatique de la molécule d'ADN, ledit procédé pouvant être applicable à des techniques facilement automatisables, par exemple des techniques de type technique chromatographie basse pression. La présente invention concerne, en outre, un procédé de fixation et de séparation de molécules comportant au moins un fragment d'ADN naturel ou synthétique à partir d'un mélange liquide contenant lesdites molécules, caractérisé en ce que : a) ledit mélange liquide est mis en présence d'un substrat présentant une composition et une structure telle qu'il assure avec l'ADN une liaison non covalente, réversible et sélective, ledit substrat pouvant être utilisé en chromatographie basse pression, b) en ce que, après liaison de l.'ADN, le mélange résiduel est éliminé, c) l'ADN lié est ensuite élue, éventuellement après avoir été soumis à une ou plusieurs réactions physiques et/ou chimiques.
Parmi les molécules comportant au moins un fragment d'ADN naturel ou synthétique, il faut citer l'ADN cellulaire lui-même, mais également les oligonucléotides naturels ou synthétiques ainsi que les ADN ayant subi des modifications chimiques ou physiques telles que marquage chimique, présence d'agent intercalant ou liaison physico-chimique telle qu'une fixation par le couple avidine-biotine.
Le substrat mis en oeuvre peut être composé de matériaux divers, notamment des verres, des céramiques ou des métaux ou bien des composés mixtes tels que vitro-céramiques pourvu qu'ils soient capables de fixer l'ADN par une liaison non covalente, réversible et sélective.
Parmi ces matériaux, il faut citer les matériaux contenant du bore tels que les verres borosilicatés, notamment le verre Pyrex 732-01 commercialisé par Corning France. Dans le cas de la technique antérieure, les études ont montré l'influence de granulométrie de la poudre de verre sur sa sélectivité, dans le cas présent la porosité du substrat doit être supérieure à 1 micron, les éléments du substrat étant éventuellement jointifs, mais on utilisera de préférence des porosités de l'ordre de 2 à 10 microns, par exemple de 2 à
5 microns.
Ce substrat peut se présenter sous une forme unitaire ou sous une forme divisée.
Lorsqu'il est sous forme unitaire, il s'agira de préférence d'un produit sous forme frittée, par exemple un fritte de verre ou métallique.
Lorsqu'il s'agira d'un substrat divisé, celui-ci sera sous forme de fibres ou de billes. Les fibres pourront être enchevêtrées comme dans une laine type laine de verre, ou bien réunies en tresses par exemple. Dans le cas de billes, les diamètres seront adaptés à la mise en oeuvre envisagée. L'utilisation de fritte est particulièrement avantageuse dans la réalisation de trousse de diagnostic ou bien pour des usages uniques. En effet, un fritte à base de particules de verre comprimées et soudées entre elles présente une résistance mécanique qui permet de l'utiliser directement comme colonne. Bien que la porosité d'un tel support soit faible (inférieure à
10 μm), elle permet cependant de faire passer des fluides avec des pressions très faibles et des débits de plusieurs millilitres par minute, par exemple il est possible d'utiliser une trompe à vide.
Le mélange liquide mis en présence du substrat peut être d'origine quelconque, il peut s'agir d'un milieu obtenu après craquage. de cellule ou bien un milieu d'origine synthétique par exemple ; de préférence, ce milieu sera un milieu aqueux contenant un agent chaiotropique tel que l'iodure de sodium ou le perchlorate de potassium.
Bien entendu, le substrat utilisé devra être insoluble dans ledit milieu.
L'élution des molécules fixées à partir du substrat est effectuée de préférence avec une solution aqueuse qui pourra, éventuelle¬ ment contenir au moins un sel minéral, un agent tampon, un agent chélatant et/ou un agent antioxydant. Ce procédé permet également de soumettre les molécules fixées à une ou plusieurs réactions physiques et/ou chimiques dans un solvant dans lequel l'ADN et le substrat sont insolubles.
L'un des avantages de ce procédé est que l'ADN fixé sur un support présente une réactivité (en particulier grâce à la surface de contact très importante) améliorée lors de réactions chimiques par rapport à une réaction en phase homogène.
Il convient de remarquer que ces réactions ne doivent pas être confondues avec l'élimination du mélange résiduel notamment l'agent chaiotropique que peut impliquer l'usage de solvants tels que l'alcool éthylique.
Le solvant mis en oeuvre, dans ce cas, peut être n'importe quel solvant organique ou minéral présentant la particularité de ne pas solubiliser l'ADN ou le substrat. Il peut être additionné d'eau ou d'une solution aqueuse d'au moins un sel minéral pouvant renfermer également au moins un agent tampon, un agent chélatant et/ou un agent antioxydant.
A titre d'exemple de solvants utilisables dans -le procédé selon l'invention, on peut citer les alcools, les solvants halogènes et/ou le phénol notamment le chloroforme, l'éthanol, l'isopropanol, le butanol ou encore une solution de phénol saturé d'eau.
L'eau susceptible d'être ajoutée au solvant peut être additionnée, par exemple, d'une faible quantité de chlorure de sodium, d'EDTA ou de Tris HC1.
Dans un mode de mise en oeuvre du procédé, le complexe ADN-substrat est soumis à un traitement dans un solvant en vue d'une modification chimique ou enzymatique de la molécule au moyen d'un réactif convenable.
Dans un autre mode de mise en oeuvre du procédé selon l'invention, le complexe ADN-substrat est soumis à un traitement en vue de l'obtention d'ADN ou de molécules purifiés. Dans ce cas, le traitement à l'aide de solvants vise essentiellement à séparer de l'ADN les molécules contaminantes qui s'y trouvent fixées. Ces molécules contaminantes peuvent être entre autres des protéines, de l'agrose, des corps gras ou des agents fluorescents tels que le bromure d'éthidium, utilisés pour ' le. marquage des molécules d'ADN. Le choix du solvant est, dans ce cas, fonction de l'origine de l'ADN à purifier : ainsi dans le cas où l'ADN est contaminé en majeure partie par des protéines, on utilisera avantageusement du phénol saturé d'eau, tandis que dans le cas où le contaminant est essentiellement constitué de corps gras, le solvant sera de préférence du chloroforme.
L'invention concerne, enfin, l'application desdits substrats en chromatographie à basse pression, ainsi que lesdits substrats comportant une molécule d'ADN fixée.
Les exemples ci-après sont destinés à mettre en évidence d'autres - caractéristiques et avantages du procédé selon la présente invention. Exemple 1
Cet exemple décrit l'obtention d'ADN plasmidique de la bactérie Escherichia coli. On centrifuge 1,5 ml de culture de E. coli, on reprend le culot dans 100 μl de TGE (Tris HC1 25 mM pH 7,5 ; EDTA 10 mM ; Glucose 50 mM)-. Toutes les étapes ultérieures sont réalisées à °C.
On ajoute 200 μl de solution NaOH 0,2 M SDS 1 '% on mélange, 150 μl d'acétate de potassium 5 M pH 5, on mélange et on laisse agir 5 minutes.
Le mélange est centrifugé pendant 2 à 5 minutes (centrifugeuse type microfuge) et on récupère 400 μl de surnageant.
Au surnageant on ajoute 800 μl de solution aqueuse de Nal 8 M et environ 2,5 mg de poudre de verre. On mélange 5 minutes, on centrifuge pendant 1 à 5 minutes et on élimine le surnageant.
Le culot est repris dans 400 μl de phénol saturé en eau et on agite pendant 5 minutes. On centrifuge pendant I à 5 minutes et on élimine le surnageant.
On reprend le culot dans 400 μl de chloroforme et on mélange pendant 5 minutes.
On centrifuge pendant 1 à 5 minutes et on élimine le surnageant. On reprend le culot dans 1 ml de solution de lavage à 50 % d'éthanol, TE, NaCl 0,3 M (TE = Tris HC1 10 mM pH 7,5 ; EDTA 1 mM). On mélange pendant 5 minutes.
On centrifuge pendant 1 à 5 minutes et on récupère le 5 surnageant.
On reprend le culot dans 50 à 100 μl de TE et on mélange 5 minutes. On centrifuge pendant 5 minutes et on récupère le surnageant.
L'ADN plasmidique obtenu est extrêmement pur, les étapes de traitement à la RNase, à la protéinase K, au phénol, au chloroforme ne T O sont plus nécessaires.
L'ADN ainsi préparé a été testé dans différentes réactions de biologie moléculaire et les résultats obtenus ont confirmé sa haute pureté. Exemple 2
Purification d'ADN sur fritte de verre 15 L'ADN à purifier peut être contaminé notamment par des protéines, de l'agarose et/ou de l'ARN par exemple. Dans l'exemple donné ci-dessous, l'ADN est essentiellement contaminé par des protéines et de l'ARN (80 % d'ARN, ribonucléotide, ribonucléoside).
Le fritte utilisé est obtenu à partir de poudre de verre 732.01 20 Pyrex commercialisé notamment par Corning France, broyée jusqu'à une granulométrie moyenne de 5 microns.
A la solution d'ADN sont ajoutés 2 volumes de Nal 8 M (volume final 3 ml, ADN 315 μg).
Cette solution est passée sur le fritte (diamètre 3 cm, 25 épaisseur 2 mm, porosité inférieure à 2 μm) (aspiration sous vide à la trompe à eau).
Le fritte est lavé avec 10 ml de Nal 8 M puis par
- 50 ml de phénol saturé en H-O (ceci pour décrocher les protéines fixées à l'ADN,
30 - 50 ml de chloroforme,
- 50 ml de solution d'éthanol à 50 96, NaCl 0,3 M. Le fritte est légèrement séché par aspiration 2 à 3 minutes. L'ADN est alors élue par 2 fois 2 mi de Tris HC1 10 mM pH 8, EDTA 1 mM pH 8.
Des échantillons sont déposés sur gel d'agarose 1 %. - piste 1 : échantillon de l'ADN à purifier, on voit bien l'ARN (au niveau de la flèche),
- piste 2 : 1ère éiution,
- piste 3 : 2ème éiution.
On retrouve : 70 % de l'ADN dans la 1ère éiution (220 μg)
25 % de l'ADN dans la 2ème éiution (80 μg).
Sur la photo on note bien la disparition de l'ARN des elutions 1 et 2.
L'ARN ne s'est pas fixé, seul l'ADN s'est fixé et a été élue. Les protéines solubles n'ont pas été fixées et celles qui étaient accrochées à l'ADN ont été décrochées par les traitements au phénol.

Claims

REVENDICATIONS
1 ) Procédé de fixation et de séparation de molécules comportant au moins un fragment d'ADN naturel ou synthétique à partir d'un mélange liquide contenant lesdites molécules,, caractérisé en ce que : a) ledit mélange liquide est mis en présence d'un substrat présentant une composition et une structure telle qu'il assure avec l'ADN une liaison non covalente, réversible et sélective ; b) en ce que, après liaison de l'ADN, le mélange résiduel est éliminé ; c) l'ADN lié est ensuite élue, après avoir été soumis à une ou plusieurs réactions physiques et/ou chimiques en présence d'au moins un solvant dans lequel les molécules comportant au moins un fragment d'ADN et le substrat sont pratiquement insolubles.
2) Procédé selon la revendication 1, caractérisé en ce que ledit substrat est apte à être utilisé en chromatographie basse pression. 3) Procédé selon l'une des revendications 1 et 2, caractérisé en ce que la réaction physique et/ou chimique est effectuée au sein d'un solvant choisi parmi les alcools, les solvants halogènes et/ou le phénol.
4) Procédé selon la revendication 3, caractérisé en ce que le solvant est choisi dans le groupe que constituent le chloroforme, l'éthanol, l'isopropanol, le butanol et le phénol en solution aqueuse.
5) Procédé selon l'une des revendications 1 à 4, caractérisé en ce que les molécules comportant au moins un fragment d'ADN sont soumises à :
- une délipidation par au moins un solvant halogène et/ou - une déprotéinisation par au moins un solvant phénolique.
6) Procédé selon l'une des revendications 1 à 5, caractérisé en ce que les molécules comportant au moins un fragment d'ADN sont soumises à une réaction chimique au sein du solvant.
7) Procédé selon l'une des revendications 1 à 6, caractérisé en ce que ledit substrat est constitué d'un verre, d'une céramique, d'un métal ou de composants mixtes de ces compositions.
8) Procédé selon l'une des revendications 1 à 7, caractérisé en ce que la porosité du substrat est supérieure à 1 micron. 9) Procédé selon l'une des revendications 1 à 7, caractérisé en ce que le substrat à une porosité de l'ordre de 2 à 10 microns.
10) Procédé selon l'une des revendications 1 à 9, caractérisé en ce que le substrat est sous forme de fritte, de fibres ou de billes. H) Procédé selon l'une des revendications 1 à 10, caractérisé en ce que le substrat est un verre.
12) Procédé selon la revendication 1 1, caractérisé en ce que le substrat est un verre borosilicate.
13) Procédé selon l'une des revendications 1 à 12, caractérisé en ce que le substrat est un fritte de verre.
14) Procédé selon l'une des revendications I à 13, caractérisé en ce que le mélange liquide contenant lesdites molécules est un milieu aqueux.
15) Procédé selon l'une des revendications 1 à 14, caractérisé en ce que le mélange ayant servi à la fixation et contenant lesdites molécules contient un agent chaiotropique.
16) Procédé selon la revendication 15, caractérisé en ce que l'agent chaiotropique est choisi parmi l'iodure de sodium et le perchlorate de potassium. - 17) Procédé selon l'une des revendications 15 ou 16, caractérisé en ce que le mélange résiduel ayant servi à la fixation est éliminé par traitement avec un solvant de l'agent chaiotropique.
18) Procédé selon l'une des revendications 1 à 17, caractérisé en ce que l'ADN lié est soumis à une ou plusieurs réactions physiques et/ou chimiques dans un solvant dans lequel l'ADN et le substrat sont insolubles.
19) Procédé selon l'une des revendications 1 à 18, caractérisé en ce que i'élution est effectuée par une solution aqueuse.
20) Procédé selon la revendication 19, caractérisé en ce que la solution aqueuse peut également comporter au moins un composé choisi parmi les sels minéraux, les agents tampon, les agents chelatants et les agents antioxydants.
EP19880908250 1987-09-17 1988-09-16 Procede de fixation et de separation de molecules comportant au moins un fragment d'adn naturel ou synthetique Withdrawn EP0333813A1 (fr)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR8713010 1987-09-17
FR8713010A FR2620706A1 (fr) 1987-09-17 1987-09-17 Procede de traitement par solvants d'adn en phase heterogene
FR8716338A FR2623505B1 (fr) 1987-11-25 1987-11-25 Procede de fixation et de separation de molecules comportant au moins un fragment d'adn naturel ou synthetique
FR8716338 1987-11-25

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EP0333813A1 true EP0333813A1 (fr) 1989-09-27

Family

ID=26226223

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EP19880908250 Withdrawn EP0333813A1 (fr) 1987-09-17 1988-09-16 Procede de fixation et de separation de molecules comportant au moins un fragment d'adn naturel ou synthetique

Country Status (3)

Country Link
EP (1) EP0333813A1 (fr)
JP (1) JPH02501353A (fr)
WO (1) WO1989002436A1 (fr)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FR2728264B1 (fr) 1994-12-16 1997-01-31 Rhone Poulenc Rorer Sa Purification d'adn par formation de triple helice avec un oligonucleotide immobilise
US7038026B2 (en) 2000-05-26 2006-05-02 Centelion Purification of a triple heli formation with an immobilized oligonucleotide
DE19851156C1 (de) * 1998-11-06 2000-04-27 Merck Patent Gmbh Verfahren zur Isolierung von Plasmid-DNA

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS59227744A (ja) * 1983-06-08 1984-12-21 Rikaken Kk Ｄｎａ回収用ガラス粉粒物

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
See references of WO8902436A1 *

Also Published As

Publication number Publication date
WO1989002436A1 (fr) 1989-03-23
JPH02501353A (ja) 1990-05-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EP2082039B1 (fr) Procedes et coffret pour isoler des acides nucleiques
EP2258845B1 (fr) Procédé d'isolement et de purification d'acides nucléiques
EP2788484B1 (fr) Récupération d'une biomolécule comportant une phase aqueuse à partir d'un mélange multiphasique
JP2007529229A (ja) 核酸精製のための固相支持体として修飾された表面
EP0036372B1 (fr) Nouveaux dérivés de gangliosides, leur préparation et leur application
CN108531472A (zh) 一种用于核酸提取的裂解液
JP2000516638A (ja) 液体クロマトグラフィーを使用するポリヌクレオチド分離を実施するための系および方法
EP1339876A2 (fr) Purification de reactions de sequen age d'adn au moyen de particules magnetiques de silice
JP2005052142A (ja) Ｒｎａ単離用の装置及び方法
JP2005052142A5 (fr)
EP0333813A1 (fr) Procede de fixation et de separation de molecules comportant au moins un fragment d'adn naturel ou synthetique
US20090011469A1 (en) Method and formulation for the extraction of nucleic acids from any complex starting materials
JP2007244375A (ja) リボ核酸の分離精製方法
JP2005151975A (ja) Ｒｎａ単離用の方法と装置
EP2250182B1 (fr) Isolation de l'adn, de l'arn et de protéine à partir d'un seul et même échantillon
JP2002511147A (ja) 生体分子の濃縮および精製のための一工程装置および方法
EP1341910B1 (fr) Epuration de lysat et isolement d'acide nucleique au moyen de matrices de silice silanisee
JPH1075784A (ja) リボ核酸の単離方法
US20050282226A1 (en) Aptamer capable of specifically adsorbing to bisphenol a and method for obtaining the aptamer
EP0088002A1 (fr) Procédé d'extraction liquide-liquide de métaux à l'aide d'une microémulsion, à partir d'une solution aqueuse
FR2623505A1 (fr) Procede de fixation et de separation de molecules comportant au moins un fragment d'adn naturel ou synthetique
CA2288813A1 (fr) Procede ameliore permettant d'effectuer des separations de polynucleotides
JP2004003897A (ja) クロマトグラフィー用担体、前処理用担体及びキット
WO2014090809A1 (fr) Procede d'isolement de diamandoides
JPH11196869A (ja) リボ核酸の単離方法

Legal Events

Date Code Title Description
PUAI Public reference made under article 153(3) epc to a published international application that has entered the european phase

Free format text: ORIGINAL CODE: 0009012

AK Designated contracting states

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): AT BE CH DE FR GB IT LI LU NL SE

17P Request for examination filed

Effective date: 19890904

STAA Information on the status of an ep patent application or granted ep patent

Free format text: STATUS: THE APPLICATION IS DEEMED TO BE WITHDRAWN

18D Application deemed to be withdrawn

Effective date: 19910403