ES2209869T3 - Procedimiento para retardar la desactivacion de glutarilamidasa durante una catalisis enzimatica. - Google Patents

Procedimiento para retardar la desactivacion de glutarilamidasa durante una catalisis enzimatica.

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ES2209869T3 ES00925285T ES00925285T ES2209869T3 ES 2209869 T3 ES2209869 T3 ES 2209869T3 ES 00925285 T ES00925285 T ES 00925285T ES 00925285 T ES00925285 T ES 00925285T ES 2209869 T3 ES2209869 T3 ES 2209869T3
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Abstract

Procedimiento para retardar la desactivación de la glutarilamidasa durante una catálisis enzimática, caracterizado porque la enzima se pone en contacto con al menos un tiol. La glutarilamidasa está acoplada a un soporte polímero para lo que se utiliza un poliacrilato activado con oxirano.

Description

Procedimiento para retardar la desactivación de glutarilamidasa durante una catálisis enzimáticas.
La presente invención se refiere a un procedimiento para retardar la desactivación de glutarilamidasa durante una catálisis enzimática.
La síntesis enzimática del precursor de antibiótico ácido 7-aminocefalosporínico (7-ACS) tiene lugar - como se representa en la Fig. 1 - en dos etapas de reacción. Primero se oxida cefalosporina C, bajo la acción de D-aminoácido-oxidasa (DAO), en \alpha-cetoadipil-ACS. En la etapa siguiente se hidroliza este compuesto a 7-ACS mediante la glutarilamidasa (GAE). El 7-ACS es de gran interés comercial para la producción de antibióticos de cefalosporina semisintéticos.
La síntesis tiene lugar con las enzimas D-aminoácido-oxidasa o glutarilamidasa inmovilizadas, por lo regular, sobre soportes. Estas enzimas, después de finalizar la reacción, se separan de la solución de producto y pueden emplearse de nuevo en la carga siguiente. La utilización repetida de las enzimas conduce, no obstante, a su desactivación y equivale a un consumo de enzimas.
Es conocido en la bibliografía que las oxidaciones que alteran la estructura en las proteínas pueden inhibirse con el empleo de reactivos tiólicos, tales como p. ej., 2-mercaptoetanol (P. Golini et al. Enzyme and Microbial Technology, 17, 1995, 324-329; Int. J. Peptide Protein Res., 48, 1996, 532-538).
Por ejemplo, la D-aminoácido-oxidasa (DAO) puede regenerarse con tioles. La flavoproteína DAO cataliza la desaminación estereoespecífica de D-aminoácidos en los correspondientes \alpha-cetoácidos y amonio como se muestra, por ejemplo, en la Fig. 1 la reacción de cefalosporina C en ácido \alpha-cetoadipil-7-aminocefalosporínico (\alpha-ceto-adipil-7-ACS). El \alpha-cetoadipil-7-ACS se descarboxila in situ en glutaril-7-ACS (P. Golini et al. Enzyme and Microbial Technology 17, 1995, 324-329). En la aplicación técnica la utilización frecuentemente no tiene lugar en disolución, sino en forma inmovilizada por unión a polímeros tales como, p.ej., polímeros aminoalquilados o polímeros activados con oxirano. Con ello puede separarse por filtración el catalizador enzimático después de la reacción y se encuentra disponible para su reutilización. El catalizador inmovilizado DAO sufre una inactivación parcial. Si el catalizador enzimático, ya usado, se utiliza de nuevo en una reacción ulterior, por lo demás bajo iguales condiciones, se prolonga el tiempo de reacción necesario para la reacción máxima del sustrato. Esta prolongación del tiempo de reacción que se presenta en cada reutilización es una medida de la estabilidad del catalizador en el proceso de preparación de, p. ej., glutaril-7-ACS. La magnitud de la modificación del tiempo de reacción hasta la conversión máxima del sustrato, calculada a lo largo de varios ciclos de producción, se designa como estabilidad operacional. La estabilidad operacional de la DAO inmovilizada se puede mejorar si después de la reacción se separa por filtración el catalizador enzimático de la mezcla de reacción y se mezcla con un tiol, por ejemplo 2-mercaptoetanol. La DAO contiene algunos grupos sulfhidrilo fácilmente oxidables, principalmente como grupos funcionales de los aminoácidos cisteínicos de la proteína. La acción del 2-mercaptoetanol se basa en la acción reductora del tiol frente a los grupos sulfhidrilo sensibles a la oxidación de las cisteínas. La regeneración de estos grupos sulfhidrilo oxidados da como resultado una notable mejora de la estabilidad operacional. En el caso particular de la DAO la regeneración debe producirse después de separar la enzima de la mezcla de reacción, dado que durante la catálisis enzimática se genera H_{2}O_{2}. Este compuesto, como oxidante fuerte, inactivaría un tiol que se añadiera.
La adición de tiol puede reducir también la actividad de las proteínas. También este efecto puede explicarse por la existencia de restos cisteína. Un ejemplo de ello es la aminoacilasa. La aminoacilasa es una enzima dímera con un átomo de Zn^{2+} por subunidad. Cada subunidad de la enzima contiene 2 grupos SH de cisteína y 2 enlaces disulfuro. La modificación química de los grupos SH así como la ruptura de las uniones disulfuro puede conducir a una inactivación de la enzima. Se ha podido demostrar que por adición de 2-mercaptoetanol se reduce la actividad de la aminoacilasa, mientras que, por el contrario, después de separar el 2-mercaptoetanol por diálisis o por filtración en gel se puede restablecer casi por completo la actividad enzimática original (W. Kördel y F. Schneider Biochem. Biophys. Acta 445, 1976, 446-457).
Puesto que evidentemente la acción del tiol se induce por la oxidación, o la reducción, de grupos sulfhidrilo de restos cisteína, la adición de tioles a enzimas, de las que se sabe que no contienen restos cisteína, no tendría en consecuencia que conducir a ninguna modificación de la actividad enzimática.
En el marco de la utilización repetida de GAE en las reacciones catalíticas del catalizador tiene lugar, como se ha descrito al principio para la síntesis de 7-ACS (véase la Fig. 1), una desactivación de la enzima que equivale a un consumo. La estabilidad del catalizador se correlaciona con importantes costes de producción del proceso como la demanda de tiempo, la generación de residuos y los costes de catalizadores. Hasta el momento no se conoce un procedimiento adecuado, comparable con el descrito anteriormente para la DAO, para estabilizar la GAE o para aumentar su estabilidad operacional. La enzima GAE consta de 2 cadenas peptídicas (proteína A y proteína B). La interacción de las cadenas tiene lugar a través de enlaces de puente de hidrógeno, así como a través de interacciones hidrófilas e hidrófobas de dominios proteínicos. Applied Biochemistry and Biotechnology, 69(1), 1998, 53-67, Battistel da a conocer un procedimiento para la purificación de glutaril-7-ACA acilasa y su desactivación mediante guanidina.
La clonación del gen a partir de Pseudomonas, así como la expresión en E.coli se ha descrito, p. ej., en el documento de patente EP-P-0504798 (US 5830743), así como en el documento de patente EP-A-0708180 (US 5766881). La utilización de microorganismos o de enzimas de éstos para la preparación de 7-ACS se encuentra en el documento de patente EP-A-0275901 (US 4990444), así como en el documento de patente EP 0525861 B1 (US 5332663). Un procedimiento de purificación de la enzima partiendo de una cepa sobre productora de E. coli está descrito en D. Bianchi et al., Enzyme and Microbiological Technology 20, 1997, 368-372.
El cometido de la presente invención es poner a disposición un procedimiento para retardar la desactivación de la glutarilamidasa durante una catálisis enzimática.
Como puede deducirse del análisis de aminoácidos (Tabla 1), a la glutarilamidasa (GAE) le falta el aminoácido cisteína. Según esto el uso de reactivos tiólicos para la estabilización no debería producir en este biocatalizador ningún aumento de la estabilidad operacional. Sorprendentemente, en la experimentación se pudo demostrar lo contrario. La adición de diferentes reactivos que contenían tioles (p. ej. 2-mercaptoetanol, cisteína) dio lugar en la GAE, dependiendo de la concentración, a un aumento drástico de la estabilidad operacional.
De acuerdo con esto, se resuelve el cometido de la presente invención mediante un procedimiento para retardar la inactivación durante una catálisis enzimática de glutarilamidasa, que se caracteriza porque la enzima se pone en contacto con al menos un tiol. Opcionalmente, en este caso la enzima puede estar presente en forma libre o unida a un material de soporte. Un material de soporte preferido es, por ejemplo, un poliacrilato activado con oxirano.
Se entiende por tiol o mercaptano un compuesto químico tal como 2-mercaptoetanol, glutation o el aminoácido cisteína, cuya característica común es que contienen un grupo tiol (-SH) en la molécula. La GAE acoplada a un soporte consta de un catalizador enzimático GAE, que se presenta unido, por ejemplo, a poliacrilatos (= soportes) -activados con oxirano o también aminoalquilados. En D. Bianchi et al., Enzyme and Microbial Technology 20, 1997, 368-372, se encuentra un procedimiento para la preparación de GAE acoplada a un soporte. Ejemplos de soportes son Eupergit®, Amberlite® XAD7 o Duolite® A365 (todos Röhm und Haas).
La presente invención se refiere a un procedimiento para retardar la desactivación de glutarilamidasa durante una catálisis enzimática, que se caracteriza por que la enzima se pone en contacto con al menos un tiol.
En una forma preferida de realización del procedimiento la glutarilamidasa está acoplada a un soporte polímero, que puede tratarse en especial de un poliacrilato activado con oxirano. Preferentemente se emplea como tiol el 2-mercaptoetanol, que se emplea preferentemente en el intervalo de concentraciones de 1 a 100 mM. En otra forma de realización preferida del procedimiento se emplea como tiol la cisteína, que se aplica preferentemente en el intervalo de concentraciones de 1 a 100 mM.
Un tiol como el descrito anteriormente puede utilizarse en forma continua o discontinua. En la utilización continua el tiol está presente durante la reacción, mientras que en la utilización discontinua el tratamiento se efectúa entre las etapas de reacción. En una forma de ejecución preferida del procedimiento de la presente invención se utiliza como sustrato ácido glutaril-7-aminocefalosporínico. El ácido glutaril-7-cefalosporínico está presente preferentemente en el intervalo de 5-500 mM.
El procedimiento de la presente invención es especialmente adecuado para la preparación de ácido 7-aminocefalosporínico utilizando glutarilamidasa como catalizador enzimático, efectuándose la desactivación de la glutarilamidasa de la forma descrita anteriormente.
La invención se refiere, además, a la utilización de al menos un tiol para retardar la desactivación de la glutarilamidasa de acuerdo con un procedimiento tal como el descrito anteriormente.
Ejemplos
Una posibilidad de aplicación práctica para una catálisis enzimática mediante glutarilamidasa consiste, por ejemplo, en la preparación de ácido 7-aminocefalosporínico (7-ACS) a partir de ácido glutaril-7-aminocefalosporínico (véase la Fig. 1). La catálisis enzimática se efectuó del modo siguiente:
El sustrato ácido glutaril-7-aminocefalosporínico(G-7-ACS) a una concentración de 40 mM se hizo reaccionar, a 40ºC y pH 8,3, en un volumen de reacción de 120 ml, con la GAE inmovilizada (de Pseudomonas diminuta). Con ayuda de un sistema periférico automático existía la posibilidad de medir en línea parámetros relevantes del proceso (pH, temperatura) y controlarlos mediante una técnica de regulación adecuada. Así, el viraje del pH a ácido que aparece debido a la reacción se registró por auto titulación con álcali. La velocidad de la adición de álcali se correspondía con la velocidad de reacción y podía estimarse como medida para el grado de reacción del sustrato (G-7-ACS). El procesamiento de los datos asistido por PC permitió la determinación en línea de la transformación y estableció el criterio para la finalización de la reacción. La finalización de la reacción se llevó a cabo cuando se había conseguido el grado máximo de transformación. La llegada al grado máximo de transformación se manifestaba porque ya no era necesaria ninguna adición de álcali. Después de alcanzar el grado máximo de transformación se separó el catalizador de la solución de producto a través de un filtro y, a continuación, se introdujo una nueva solución de sustrato. Los tiempos de reacción de cada una de las reacciones consecutivas (= tandas) se pudieron registrar como función de las tandas. Mediante regresión lineal se obtuvo una pendiente de la recta (= coeficiente-X [min/tanda]), que podía estimarse como medida de la desactivación del catalizador. Cuanto menor era este valor, tanto mayor era la estabilidad operacional del catalizador.
Ejemplo 1 Tiempo de reacción hasta la transformación cuantitativa como función del número de tandas sin o con cisteína
En varias series de ensayos se añadió a la solución sustrato cisteína como reactivo tiólico en diferentes concentraciones, y se llevó a cabo la reacción tal como se ha descrito. Como puede verse en la tabla siguiente, al aumentar la concentración de cisteína disminuía la pendiente de la recta y con ella el coeficiente-X. Admitiendo una desactivación lineal en las reacciones efectuadas pudo calcularse para cada serie de mediciones el número de tandas posibles hasta la duplicación del tiempo de reacción. Los valores se deducen de la Tabla siguiente. Se observa un notable aumento de la estabilidad operacional, cuando la tanda de reacción contiene adicionalmente cisteína. Esto se manifiesta en el aumento del número de tandas de reacción (= tandas) efectuadas, que pueden llevarse a cabo, hasta que el tiempo de reacción se haya duplicado hasta el grado máximo de transformación del sustrato.
Los parámetros de reacción se seleccionaron del modo siguiente:
Parámetros de reacción
V_{R} = 120 ml
T = 40ºC
pH = 8,3 [amoníaco 1,66%]
[G-7-ACS] = 40 mM [KPP 100 mM]
[cisteína]_{en \ el \ sustrato} = variable
Cantidad (GAE) = 500 U
TABLA (para el Ejemplo 1) Tiempo de reacción hasta la transformación cuantitativa en función del número de tandas sin o con cisteína
sin con con con con
cisteína cisteína cisteína cisteína cisteína
[1 mM] [6 mM] [8 mM] [10 mM]
Coeficiente-X [min/tanda] 0,414 0,131 0,077 0,046 0,016
Número de tandas hasta 36 114 195 326 938
duplicar el tiempo de
reacción (con desactivación
lineal) [-]
Comparación del coeficiente-X (esto es, el aumento de tiempo por tanda) para alcanzar la transformación cuantitativa o el número de tandas hasta duplicar el tiempo de reacción en función de la concentración de cisteína en la solución sustrato.
Ejemplo 2 Tiempo de reacción hasta la transformación cuantitativa en función del número de tandas sin o con mercaptoetanol
El 2-mercaptoetanol como reactivo tiólico conduce al aumento de la estabilidad operacional de la GAE. La Tabla siguiente muestra la comparación del transcurso de los ensayos con o sin 2-mercaptoetanol. Los resultados con tiol muestran en cuanto a la estabilización de la estabilidad operacional un transcurso parecido al observado con la cisteína.
Los parámetros de reacción seleccionados se ajustaron del modo siguiente:
Parámetros de reacción
V_{R} = 120 ml
T = 40ºC
pH = 8,3 [amoníaco 1,66%]
[G-7-ACS] = 40 mM
Cantidad (GAE) = 500 U
[Mercaptoetanol] = 1 \mul/ml
TABLA (para el Ejemplo 2)
Tiempo de reacción hasta la transformación cuantitativa en función del número de tandas sin o con mercaptoetanol
sin mercaptoetanol con mercaptoetanol [1\mul/ml]
Coeficiente-X [min/tanda] 0,44 0,08
Número de tandas hasta duplicar el tiempo 41 225
de reacción (con desactivación lineal) [-]
Comparación del coeficiente-X (esto es el aumento de tiempo por tanda, por consiguiente la pendiente de la recta) para alcanzar la transformación cuantitativa sin o con mercaptoetanol
TABLA 1 Protocolo de análisis de aminoácidos de la GAE Suma de la secuencia total
Peso molecular = 79685,47 Número de restos = 720
Peso molecular medio por resto = 110.674 Carga = -18
Punto isoeléctrico = 5,20
Coeficiente de extinción = 132000
Resto Número Porcentaje molecular
A = Ala 85 11,806
B = Asx 0 0,000
C = Cys 0 0,000
D = Asp 49 6,806
E = Glu 32 4,444
F = Phe 31 4,306
G = Gly 55 7,639
H = His 13 1,806
I = Ile 23 3,194
K = Lys 11 1,528
L = Leu 57 7,917
M = Met 14 1,944
N = Asn 30 4,167
P = Pro 55 7,639
Q = Gln 34 4,722
R = Arg 52 7,222
S = Ser 37 5,139
T = Thr 45 6,250
V = Val 49 6,806
W = Trp 16 2,222
Y = Tyr 32 4,444
Z = Glx 0 0,000
A+G 140 19,444
S+T 82 11,389
D+E 81 11,250
D+E+N+Q 145 20,139
H+K+R 76 10,556
D+E+H+K+R 157 21,806
I+L+M+V 143 19,861
F+W+Y 79 10,972

Claims (13)

1. Procedimiento para retardar la desactivación de la glutarilamidasa durante una catálisis enzimática, caracterizado porque la enzima se pone en contacto con al menos un tiol.
2. Procedimiento conforme a la reivindicación 1, caracterizado porque la glutarilamidasa está acoplada a un soporte polímero.
3. Procedimiento conforme a la reivindicación 2, caracterizado porque como soporte polímero se utiliza un poliacrilato activado con oxirano.
4. Procedimiento conforme a una o varias de las reivindicaciones 1 a 3, caracterizado porque como tiol se utiliza 2-mercaptoetanol.
5. Procedimiento conforme a la reivindicación 4, caracterizado porque la concentración de mercaptoetanol en la tanda de reacción se encuentra en el intervalo de 1 a 100 mM.
6. Procedimiento conforme a una o varias de las reivindicaciones 1 a 3, caracterizado porque como tiol se utiliza cisteína.
7. Procedimiento conforme a la reivindicación 6, caracterizado porque la concentración de cisteína se encuentra en el intervalo de 1 a 100 mM.
8. Procedimiento conforme a una o varias de las reivindicaciones 1 a 7, caracterizado porque en la catálisis enzimática se encuentra presente continuamente al menos un tiol en la solución sustrato.
9. Procedimiento conforme a una o varias de las reivindicaciones 1 a 7, caracterizado porque la enzima, después de su separación de la solución sustrato, se pone en contacto con al menos un tiol.
10. Procedimiento conforme a una o varias de las reivindicaciones 1 a 9, caracterizado porque se utiliza ácido glutaril-7-aminocefalosporínico como sustrato de la catálisis enzimática.
11. Procedimiento conforme a la reivindicación 10, caracterizado porque se utiliza ácido glutaril-7-aminocefalosporínico en el intervalo de concentraciones de 5 a 500 mM.
12. Procedimiento para la preparación de ácido 7-aminocefalosporínico utilizando glutarilamidasa como catalizador enzimático, caracterizado porque la desactivación de la glutarilamidasa se retarda mediante un procedimiento según una o varias de las reivindicaciones 1 a 11.
13. Utilización de al menos un tiol en un procedimiento conforme a una o varias de las reivindicaciones 1 a 12 para retardar la desactivación de la glutarilamidasa.
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