ES2220400T3 - Procedimiento para la deteccion de analitos en una muestra de medicion, asi como soportes de medicion para ello. - Google Patents
Procedimiento para la deteccion de analitos en una muestra de medicion, asi como soportes de medicion para ello.Info
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Abstract
Procedimiento para la detección de analitos en una muestra de medición, en el que, sobre un substrato en forma de disco (3), se inmovilizan en un gran número de campos de detección (5, 7) sobre una de sus caras planas unos elementos de fijación (15), específicos para ciertos analitos, seguidamente la muestra de medición se pone en contacto con los campos de detección (5, 7), y a continuación, se determina la presencia o/y la cantidad de los analitos (17) que se han de detectar mediante una evaluación óptica de los campos de detección (5, 7), utilizándose un substrato (3) producido a base de un material ópticamente transparente, y los campos de detección (5, 7) se disponen, distribuidos sobre el substrato (3), a lo largo de por lo menos una línea en espiral (27) o/y a lo largo de un gran número de líneas circulares concéntricas, caracterizado porque después de una puesta en contacto de la muestra de medición con los campos de detección (5, 7), se aplica por encima de los campos de detección(5, 7) una capa reflectora óptica (21) sobre la cara plana del substrato (3), que es portadora de los campos de detección (5, 7).
Description
Procedimiento para la detección de analitos en
una muestra de medición, así como soportes de medición para
ello.
El invento se ocupa de la detección de analitos
en una muestra de medición. Como analitos entran en cuestión, por
ejemplo, proteínas, péptidos, ácidos nucleicos y sus derivados, así
como moléculas que se pueden fijar a éstos.
Como muestra de medición entra en cuestión
cualquier tipo de muestra, de la que se suponga que ella contenga
por lo menos una parte de los analitos buscados. En este caso, se
puede tratar, p.ej. de una muestra de sangre, de una muestra de
suero o/y de una muestra de orina, o, por lo general, de cualquier
solución que contenga el analito buscado.
Para la detección de analitos en una muestra de
medición es conocido el empleo de los denominados ensayos de
fijación. En tales ensayos de fijación se detectan, por regla
general, analitos por medio de su interacción específica con
receptores. Ejemplos de tales interacciones son las interacciones
entre una proteína y otra proteína, que aparecen, por ejemplo,
durante la expresión de genes, las interacciones entre una enzima y
un substrato o las interacciones entre una enzima y un efector, que
aparecen en el metabolismo, o las interacciones entre una proteína y
un ADN o entre una proteína y un ARN durante la expresión de genes.
Una comprensión sistemática de estas interacciones moleculares
constituye una premisa fundamental para la comprensión de todos los
procesos biológicos, tanto en células normales como también en
células enfermas.
Además, con los ensayos de fijación se pueden
detectar también ácidos nucleicos. Las interacciones entre un ADN y
otro ADN desempeñan un cometido primordial en la biología molecular,
en particular en el caso de la identificación de genes y en el caso
de estrategias para cartografiar los ADN, en el caso de la detección
y de la cuantificación de la expresión de genes, así como en el caso
de la diagnosis molecular o la terapia de enfermedades. Por supuesto
que también entran en cuestión las interacciones entre un ADN y un
ARN y entre un ARN y otro ARN.
A causa del gran número de genes, proteínas,
efectores químicos o aptámeros de ARN, una comprensión o una
intervención en procesos bioquímicos requiere con frecuencia el
reconocimiento, la cuantificación o la clasificación de un gran
número de interacciones moleculares, o la identificación de
partícipes eficaces en interacciones a partir de un gran número de
combinaciones posibles. El escrutinio y el análisis de un gran
número de interacciones moleculares está limitado, sin embargo, con
frecuencia en los casos de los procedimientos conocidos a partir del
estado de la técnica.
Las muestras de medición deben ser investigadas
con frecuencia en cuanto a un gran número de analitos. En este caso,
se plantea el problema de que al realizar la evaluación resultan
grandes cantidades de datos. Para subsistir con éxito en la
práctica, la evaluación tiene que ser posible, no obstante, en un
período de tiempo justificable. Los sistemas de análisis conocidos
se han manifestado en este contexto sólo como condicionadamente
satisfactorios.
A partir de un artículo "Metal Nano Clusters as
Transducers for Bioaffinity Interactions"
(Nano-racimos metálicos como transductores para
interacciones de bioafinidad) de Thomas Schalkhammer en la obra
Monatshefte für Chemie 000, 1-26, editorial Springer
1998, páginas 1-26, se conoce una estructura de
sensor para procesos de fijación biorrecognitivos (para
reconocimiento biológico) y para procesos
catalítico-enzimáticos, en la que sobre un substrato
hecho de un policarbonato se dispone una capa especular a base de
plata y, sobre ésta, una capa distanciadora a base de un material
polimérico. La capa distanciadora sirve, por su parte, como soporte
para los elementos de fijación que están inmovilizados sobre ella.
La evaluación se efectúa con ayuda de racimos metálicos, con los que
se marcan los analitos que se han de detectar, y que pasan a tomar
parte de una interacción electromagnética con la capa especular
metálica. En las zonas del sensor que presentan un intenso
cubrimiento con racimos metálicos, la luz, que es irradiada desde la
cara de la capa especular, que está apartada del substrato de
policarbonato, se absorbe más intensamente que en las zonas del
sensor que están sin cubrimiento o están más débilmente cubiertas,
lo que hace posible la lectura óptica del sensor por medio de
mediciones de absorción.
Para la función de este conocido sensor, el
espesor de la capa distanciadora constituye un parámetro decisivo.
Éste se debe de seleccionar dentro un intervalo preestablecido, que
depende de la longitud de onda de la luz irradiada al realizar la
evaluación posterior. En particular, tiene que estar asegurado que
la capa distanciadora posea un espesor uniforme por toda su
extensión. Para esto se ha de dedicar un gran esfuerzo técnico de
producción.
En el artículo abordado se proponen para la
evaluación óptica de este sensor ya unos aparatos de lectura que
permiten dominar también grandes cantidades de datos, entre otras
cosas aparatos de lectura en CD-ROM.
A partir del documento de solicitud de patente
internacional WO 96/09.548 se conoce un soporte de medición en forma
de disco circular, sobre cuya superficie está inmovilizado un
elemento de fijación específico para ciertos analitos. En el soporte
de medición está incorporada una capa reflectora; por lo demás, él
consta de un material óptico transparente. Para la detección de
analitos, que están adheridos a los elementos de fijación, sirve un
aparato óptico de lectura, que explora en forma de espiral con un
rayo láser la superficie del soporte de medición, que está provista
de los elementos de fijación.
A partir del documento WO 98/12.559 se conoce
asimismo un soporte de medición en forma de disco circular, sobre
cuya superficie unos elementos de fijación específicos para ciertos
analitos están inmovilizados en un gran número de campos de
detección, que están distribuidos a lo largo de pistas circulares o
en espiral. Los campos de detección están dispuestos sobre una capa
de substrato del soporte de medición, sobre cuya cara enfrentada a
ellos se encuentra una capa reflectora. Para la lectura de los
campos de detección sirve, de nuevo, un rayo láser que explora, como
en el caso de una unidad de discos del CD-ROM, la
cara que es portadora de los campos de detección del soporte de
medición.
A partir del documento WO 98/01533 se conocen,
además, los recursos de marcar moléculas de fijación, que se
encuentran en los campos de detección sobre un soporte de medición
en forma de discos circulares, con marcadores magnéticos, y evaluar
los campos de detección por medio de un procedimiento magnético de
lectura.
Es misión del invento mostrar una vía de cómo se
pueda investigar una muestra de medición en cuanto a una muy
abundante cantidad de analitos, con un pequeño esfuerzo, no sólo en
lo que se refiere a la evaluación técnica de los datos, sino también
en lo que respecta a la puesta a disposición del sensor.
Para la solución del problema planteado por esta
misión se ha previsto conforme al invento un procedimiento de
acuerdo con la reivindicación 1.
En el caso del invento, los campos de detección
pueden estructurarse directamente sobre el substrato. En este caso,
se puede recomendar el recurso de tratar previamente en primer
término por vía química la superficie del substrato, o de producir
una modificación de la superficie mediante un tratamiento previo con
un plasma de oxígeno. Esta modificación puede facilitar la
aplicación de los elementos de fijación para la estructuración de
los campos de detección específicos para ciertos analitos. Por
consiguiente, por debajo de los elementos de fijación no se tiene
que aplicar sobre el substrato, en el caso del invento, ninguna capa
distanciadora con un espesor que se tenga que respetar exactamente,
tal como es obligatoriamente necesario en el caso del sensor
conocido a través de la cita de Schalkhammer. Por consiguiente, se
establece un reducido esfuerzo técnico de fabricación.
La capa reflectora se necesita para la evaluación
óptica del ensayo. Ésta, después de haber completado las etapas
biológicas moleculares del procedimiento, se aplica sobre el
substrato, por encima de los campos de detección. Debido a su buena
capacidad reflectora, se recomiendan ciertos materiales metálicos.
Fundamentalmente, también son concebibles otros materiales, por
ejemplo materiales dieléctricos. De manera preferida, la capa
reflectora se forma a base de aluminio. También se puede concebir la
plata como material para la capa reflectora. La capa reflectora se
puede formar mediante una aplicación química desde una fase de
vapor. No obstante, también es posible pegar una lámina reflectora
prefabricada sobre el substrato.
La transparencia óptica del substrato hace
posible, en común con la capa reflectora dispuesta sobre la cara de
los campos de detección que está alejada del substrato, recurrir al
hardware (soporte físico) de los aparatos de lectura de CD (discos
compactos) usuales en el comercio para la evaluación óptica de este
sensor biológico molecular de acuerdo con el invento. En particular,
en el caso de una disposición en espiral de los campos de detección,
tales aparatos de lectura de CD usuales en el comercio pueden ser
modificados con un esfuerzo comparativamente pequeño, de tal manera
que, a partir de la luz retornante del rayo láser que explora los
campos de detección, se puedan filtrar y seleccionar las
informaciones deseadas. También se puede concebir que para ello sean
necesarias solamente ciertas modificaciones al nivel del software
(soporte lógico). Incluso en el caso de una disposición en forma
circular de los campos de detección, la tecnología de tales aparatos
de lectura de CD se puede aplicar fundamentalmente, siempre y cuando
que se creen las premisas constructivas y a nivel del software para
un salto del rayo láser, que explora los campos de detección, desde
una línea circular a otra línea circular.
Se adecua especialmente un aparato de lectura de
CD-ROM que, en el caso de su incorporación en una
arquitectura de ordenador, ofrezca al usuario la posibilidad de
definir por sí mismo el software de evaluación.
La evaluación de los campos de detección puede
proporcionar, en dependencia del algoritmo de evaluación
seleccionado, afirmaciones e informaciones tanto cuantitativas como
también cualitativas. Mediante unos marcadores apropiados, se pueden
hacer diferenciables las propiedades ópticas, en particular el
comportamiento de absorción, de los campos de detección, en los que
ciertos analitos se han adherido a receptores, con respecto de los
campos de detección, a cuyos receptores no se ha fijado ningún
analito. De esta manera es posible, por ejemplo, a través de
mediciones de absorción, reconocer los campos de detección que son
portadores de analitos, después de haberse terminado las etapas
biológicas moleculares del procedimiento. En principio, esto
constituiría solamente una afirmación o información puramente
cualitativa. Si, además de esto, se quieren realizar afirmaciones o
informaciones cuantitativas, entonces se puede concebir el recurso
de explorar varias veces los campos de detección y modificar
escalonadamente de una pasada de exploración a otra pasada de
exploración un umbral, que se toma, en el caso de la evaluación,
como límite de decisión entre la presencia o la ausencia de
analitos, De esta manera, se pueden realizar afirmaciones e
informaciones acerca de la cantidad de los analitos que han quedado
adheridos en los campos de detección individuales.
Cuando se lee el ensayo con una unidad de discos
del CD-ROM adaptado eventualmente de manera
apropiada, entonces, un ordenador conectado hace posible al usuario
el tratamiento ulterior de la cantidad de datos proporcionada por la
unidad de discos, pudiendo aquél guardar el resultado de este
tratamiento ulterior en medios externos de almacenamiento de datos,
por ejemplo con el fin de establecer bancos de datos acerca de
pacientes. Para el almacenamiento de datos se pueden utilizar medios
clásicos de almacenamiento, tales como ilustrativamente discos duros
o disquetes. Con la ayuda de un ordenador es posible una evaluación
rápida del torrente de datos procedente de la unidad de discos. Por
regla general, la capacidad de los ordenadores y sistemas de
almacenamiento convencionales es tan suficiente, que en ellos se
pueden llevar a cabo también complejos análisis de genes.
Por regla general, se deseará obtener unos campos
de detección definidos de una manera nítida, que adicionalmente
deben ser muy pequeños, con el fin de alojar un número suficiente de
campos de detección sobre el disco de substrato, que posee
convenientemente el tamaño de un CD (disco compacto) convencional.
Cuando se parte del hecho de que la distancia radial entre dos
espiras consecutivas es de manera conveniente aproximadamente 1,6
\mum, se recomienda aplicar los elementos de fijación en unos
campos, que en dirección radial tienen una anchura no mayor que 1
\mum, para que entre los campos de detección contiguos en
dirección radial, referido al eje del disco, exista una distancia
suficiente, y que cada campo de detección individual pueda ser
localmente resuelto como tal. De manera preferida, los campos de
detección son incluso más estrechos que 1 \mum en dirección
radial, pudiendo ser conveniente estructurarlos con una anchura
radial, que corresponda esencialmente a la anchura de las cavidades
con datos (las denominadas en inglés "pits") grabadas en los
CD's convencionales, a saber, aproximadamente de 0,5 \mum. De
igual modo, se recomienda disponer los campos de detección contiguos
a lo largo de la línea en espiral, o bien de una línea circular, con
una distancia entre sí, tal que se haga posible su resolución
individual mediante el sistema de evaluación. Los campos de
detección se pueden estructurar en forma de superficies
esencialmente cuadradas o circulares. También se puede concebir
estructurarlos en forma alargada, por ejemplo, ovalada o
rectangular, de manera correspondiente a la forma de las cavidades
de datos de los CD's convencionales en su dirección circunferencial,
por lo tanto en la dirección de las líneas en espiral o
circulares.
Para aplicar sobre el substrato los elementos de
fijación en las condiciones marginales (límites) de dimensiones
esbozadas anteriormente para los campos de detección, se adecuan en
particular las técnicas de microimpresión, las técnicas de impresión
con chorros de tinta o las técnicas de proyección eléctrica (en
inglés electrospray). Para la consulta, en lo que se refiere a las
técnicas de microimpresión, se remite a modo de ejemplo a la cita
bibliográfica: "Microfabrication, Microstructures and
Microsystems" (Microfabricación, microestructuras y
microsistemas) de Dong Qin y colaboradores, en la obra "Topics In
Current Chemistry", tomo 194, 1998, páginas 6 y siguientes,
editorial Springer. En lo referente a las técnicas de impresión con
chorros de tinta se remite, por ejemplo, a la cita bibliográfica:
"A new device for multifunctional dosage of liquids by a free
jet" (Un nuevo dispositivo para la dosificación multifuncional de
líquidos por medio de un chorro libre) de N. Hey y colaboradores,
Proceedings IEEE-Mems 1998 CH 36176. En lo que se
refiere a las técnicas de proyección eléctrica, en particular a las
técnicas de nanoproyección eléctrica, se puede consultar, por
ejemplo, el artículo "Analytical Properties of the
Nanoelectrospray Ion Source" (Propiedades analíticas de la fuente
de iones de nanoproyección eléctrica) de M. Wilm y M. Mann en la
cita bibliográfica Analytical Chemistry, tomo 68, nº 1, 1 de enero
de 1996, páginas 1-8, así como en el artículo
"Electrospray and
Taylor-Cone-theory, Dole's beam of
macromolecules at last?" (La proyección eléctrica y la teoría del
Cono de Taylor, )Por fin el haz de macromoléculas de Dole's) de M.
Wilm, M. Mann en la cita bibliográfica International Journal of Mass
Spectrometry and Ion Processes 136 (1994), páginas
167-180. Estas técnicas hacen posible, el recurso de
proveer a los campos de detección, de una manera planificada, de
elementos de fijación previamente determinados, con una alta
resolución local. Los elementos de fijación se pueden aplicar sobre
la superficie externa del disco de substrato. También se puede
concebir el recurso de introducir, de una manera análoga a las
cavidades de datos de los CD's convencionales, unas pequeñas
cavidades en la superficie externa del substrato, e inmovilizar allí
los elementos de fijación específicos para ciertos analitos. En caso
de que se prevean tales cavidades para los elementos de fijación,
será conveniente estructurar a éstas con una anchura radial de
aproximadamente 0,5 \mum, correspondientemente a la anchura de las
cavidades de datos de los CD's convencionales.
Para poder investigar interacciones biológicas en
el plano molecular, entran en consideración como analitos en
particular ciertos ácidos nucleicos o/y ciertas proteínas. Así, el
procedimiento de acuerdo con el invento se puede utilizar con el fin
de detectar interacciones entre una proteína y otra proteína, tal
como las que se presentan, por ejemplo, durante la expresión de
genes o como señales de células, interacciones entre una enzima y un
substrato, o interacciones entre una enzima y un efector durante el
metabolismo, o interacciones entre una proteína y un ADN, o
interacciones entre una proteína y un ARN durante la expresión de
genes.
Mediante una selección apropiada de los elementos
de fijación en los campos de detección, se pueden detectar también
interacciones entre un ADN y otro ADN, tal como es importante en
particular para la identificación de genes y para el cartografiado
de genes, al investigar y cuantificar la expresión de genes, así
como en el caso de la diagnosis molecular y/o la terapia de
enfermedades.
Las interacciones moleculares y las actividades
enzimáticas se pueden influenciar por medio de la fijación de
aptámeros de ARN o de compuestos químicos pequeños a macromoléculas.
Las moléculas de efectores naturales y sintéticos permiten, por lo
tanto, con frecuencia manipular procedimientos bioquímicos mediante
una modulación de interacciones macromoleculares o una intervención
en interacciones macromoleculares.
De manera preferida, en el caso del material de
substrato se trata de un material no poroso. La utilización de un
soporte no poroso hace posible la aplicación definida incluso de
campos de detección pequeños, por lo que es posible una
miniaturización del formato de ensayo o bien la aplicación de un
gran número de campos de detección. Materiales apropiados para el
substrato en forma de disco son p.ej. materiales sintéticos y
vidrio. Para las aplicaciones con unidades de discos de
CD-ROM, se trata de manera preferida de un material
enfocador, en particular de un policarbonato.
La inmovilización de los elementos de fijación a
los campos de detección se puede llevar a cabo de acuerdo con
procedimientos en sí conocidos. La estrategia de inmovilización
depende del tipo de la molécula que se ha de inmovilizar y del
respectivo substrato. Por lo general, los elementos de fijación se
pueden fijar directamente a una matriz a través de una reacción
química, por ejemplo a través de un aminoácido especial en una
proteína (en particular cisteína o lisina) o través de la cadena
principal de fosfatos de un ADN. La inmovilización se puede llevar a
cabo también con agentes reticuladores químicos bifuncionales o a
través de una interacción específica muy afín, tal como,
ilustrativamente, la interacción entre biotina y estreptavidina. Los
elementos de fijación específicos para ciertos analitos pueden ser
adsorbidos también sobre la superficie, prefiriéndose, no obstante,
un enlace covalente. Como elementos de fijación se aplican sobre la
superficie del substrato unas sustancias o/y moléculas, que están en
situación de fijar al analito deseado de una manera específica, en
particular con una alta afinidad.
Después de haber puesto en contacto la muestra de
medición con los campos de detección, se determinan la presencia o/y
la cantidad de los analitos que se han de detectar, mediante una
evaluación óptica de los campos de detección. En este contexto, se
pueden aprovechar todos los métodos conocidos por un experto en la
especialidad. Un procedimiento usual, con el fin de analizar
interacciones moleculares, consta de varias etapas: Un primer
partícipe en la interacción, p.ej. un elemento de fijación o
receptor, específico para ciertos analitos, se une con un soporte
sólido por enlaces covalentes o de por adsorción. Al poner en
contacto la muestra de medición con los campos de detección, un
segundo partícipe en la interacción, p.ej. el analito, puede
interactuar con el receptor. A continuación, se detecta la presencia
del analito (o la ausencia en formatos de ensayo competitivos) en el
sitio, junto al que está inmovilizado el receptor. La interacción
entre los dos partícipes en la fijación se lleva a cabo en unas
condiciones, en las que los dos reactivos se presentan en una
configuración activa natural, de manera preferida en una reacción
líquida. Se prefiere especialmente la puesta en contacto a un valor
del pH aproximadamente fisiológico y en unas condiciones
iónicas.
La detección se efectúa, en el caso del
procedimiento de acuerdo con el invento, mediante detección de una
modificación de las propiedades ópticas de los campos de detección.
La modificación óptica de los campos de detección puede ser
ocasionada, p.ej. por isótopos, enzimas, fluorocromos, colorantes,
coloides metálicos, perlas o sustancias similares. Para la
detección, uno de los partícipes en la interacción, es decir el
receptor o el analito, se marca directa o indirectamente. De manera
preferida, para la detección, se derivatizan proteínas o ácidos
nucleicos con una unidad de biotina, después de lo cual es posible
un reconocimiento por medio de conjugados con estreptavidina.
De manera preferida, el procedimiento de
detección da como resultado la precipitación de un colorante o la
localización de un fluorocromo en el sitio de la interacción
molecular, o la reacción por adición de racimos metálicos con una
fuerte interacción electromagnética. Asimismo, se pueden fijar
adosadamente perlas de un látex o perlas de un material sintético. A
causa de su comportamiento de refracción y de su superficie curvada
(esférica), éstas producen una dispersión de la luz de lectura
incidente, que se puede detectar como una disminución de la
intensidad. En el caso de un dimensionamiento apropiado de las
perlas, se pueden conseguir unos efectos de la interferencia
destructiva.
Las moléculas que interactúan, a saber el
receptor y el analito, pueden ser detectadas o bien directamente, a
través de sus sitios específicos de fijación, o bien indirectamente,
al ser provistas de un marcador, que contiene un conocido sitio
específico de fijación. Ejemplos de marcadores de este tipo son los
epítopos, para los que se conocen anticuerpos monoclonales, o un
grupo de biotina, que es capaz de fijarse con estreptavidina. Junto
a ello, también es posible la fijación específica directa de un
anticuerpo al analito. El anticuerpo y la estreptavidina se conjugan
de manera preferida con una enzima, con el fin de hacer posible una
evaluación de los campos de detección. Ejemplos de enzimas
preferidas son la peroxidasa de rábano rusticano, la fosfatasa
alcalina y la \beta-galactosidasa. En el caso de
añadirse substratos apropiados, tiene lugar una reacción enzimática
cromógena, formándose unos productos coloreados, que precipitan en
los sitios a los que están fijadas las enzimas, y que, por
consiguiente, indican la presencia del analito. Substratos
apropiados de las enzimas anteriormente citadas, que hacen posible
una evaluación óptica, son, para la peroxidasa de rábano rusticano,
por ejemplo, la diaminobencidina (DAB), que proporciona un producto
de color pardo, insoluble en agua y etanol, DAB + un metal, que en
presencia de cobalto o níquel proporciona un producto insoluble, de
color desde gris a negro, el cloronaftol, que proporciona una
coloración soluble en agua, de color negro azulado, y el
amino-etil-carbazol, que proporciona
un producto insoluble en agua, de color rojo. Los substratos
preferidos para la fosfatasa alcalina son una mezcla de
naftol-AS-BI-fosfato
y neo-fucsina, que proporciona un producto
insoluble, de color rojo, una mezcla de
bromo-cloro-indolil-fosfato
y nitro-tetrazolio, que proporciona un precipitado
de color violeta negruzco, y para la
\beta-galactosidasa, la
bromo-cloro-indolil-b-D-galacto-piranosita
(BCIG), que proporciona un producto insoluble, de color azul. La
detección de los analitos se puede efectuar en este caso fácilmente
mediante una detección óptica de la zona coloreada.
Una posibilidad adicional para la detección de
los sitios de interacción consiste en la técnica de coloración con
coloides de oro, pudiéndose utilizar también otros tipos de racimos
metálicos o de perlas metálicas. En este contexto son ventajosas, en
particular, las partículas de plata, que pueden aumentar la
sensibilidad de un sistema óptico de detección por causa de efectos
ópticos no lineales cerca de una superficie metálica de la capa
reflectora. Además, se prefiere la utilización de colorantes, en
particular de partículas coloreadas de látex, como marcadores.
También se pueden utilizar perlas de vidrio a base de óxido de
silicio, que están llenas con un colorante en una alta
concentración.
Junto a la medición de la absorción, en el caso
de una selección de marcadores apropiados, por ejemplo sustancias
fluorescentes, también es posible una medición de la fluorescencia,
siendo la longitud de onda de detección en este caso una que es
distinta de la longitud de onda irradiada. Si se debe recurrir a
unidades de discos de CD usuales en el comercio, en particular
unidades de discos de CD-ROM, al realizar la
evaluación, en el caso de mediciones de la fluorescencia pueden ser
necesarias ciertas modificaciones constructivas de las unidades de
discos, junto a una correspondiente adaptación del software. En
particular, puede ser necesario incorporar un detector adaptado a la
longitud de onda de la fluorescencia.
El invento hace posible inscribir informaciones
adicionales sobre la cara plana del substrato, portadora de los
campos de detección, que se pueden leer y evaluar al mismo tiempo
con los campos de detección. Conforme a ello, se propone que sobre
la cara plana del substrato, portadora de los campos de detección, a
lo largo de la línea en espiral o bien de por lo menos una línea
circular, se estructuren adicionalmente unos campos de datos, que
contengan informaciones referidas a una muestra de medición o/y
referidas a un campo de detección o/y referidas a una evaluación. En
el caso de las informaciones referidas a una muestra de medición, se
puede tratar, por ejemplo, de informaciones acerca del sitio y del
momento de la obtención de la muestra de medición, acerca del tipo
de la muestra de medición o acerca de la persona, desde la que se
extrajo la muestra de medición. Las informaciones referidas a los
campos de detección pueden contener datos biológicos moleculares o
bioquímicos acerca de los campos de detección, en particular acerca
del tipo de elemento de fijación de los campos de detección
individuales. Las informaciones referidas a una evaluación pueden
contener datos acerca del principio de detección, aplicado para la
detección del analito, por ejemplo una detección enzimática, una
detección a través de colorantes, una detección a través de racimos
metálicos o similares. Además, éstas pueden contener datos acerca de
qué principio de exploración física debe aplicar un aparato de
lectura, por ejemplo, una medición de la absorción o una medición de
la fluorescencia. Además de esto, las informaciones referidas a una
evaluación pueden indicar al aparato de lectura la posición y la
localización de los campos de detección en el substrato y
señalizarle con ello, cuándo deba de conmutarse el aparato de
lectura desde un software para leer los campos de datos a un
software para leer los campos de detección. En particular se puede
concebir, que las informaciones referidas a una evaluación,
contengan ya por lo menos partes de un software de evaluación, que
sea tratado por el aparato de lectura al realizar la evaluación de
los campos de detección. De esta manera, el usuario puede ser
aliviado con respecto de penosas y complicadas misiones de
programación para la adaptación del software de su sitio de trabajo
con ordenador. El software de evaluación entero puede ser inscrito
en el sensor ya por parte del fabricante, siempre y cuando que
existan unos patrones de software apropiados.
Fundamentalmente, se puede concebir el recurso de
disponer por separado los campos de detección y los campos de datos
a lo largo de la línea en espiral. Sin embargo, también puede ser
conveniente, disponer los campos de detección y los campos de datos
alternativamente a lo largo de la línea en espiral, por ejemplo de
una manera tal que a un campo de detección individual, o a un grupo
de campos de detección, se le asocie un campo de datos, que preceda
al campo de detección o bien al grupo de campos de detección a lo
largo de la línea en espiral, y que proporcione al sistema de
evaluación informaciones acerca de este campo de detección o de este
grupo de campos de detección.
Si los campos de detección se disponen a lo largo
de líneas circulares concéntricas, se pueden disponer asimismo los
campos de detección y los campos de datos de una manera alternativa
a lo largo de por lo menos una línea circular. No obstante, se puede
concebir también que los campos de detección y los campos de datos
se estructuren en cada caso en líneas circulares separadas.
Los campos de datos deben poder ser leídos
convenientemente desde la misma cara del disco de substrato que la
que es portadora de los campos de detección. En este caso, una
posibilidad consiste en incorporar cavidades en la cara plana del
substrato, que es portadora de los campos de detección, para la
formación de los campos de datos, estando colocada la capa
reflectora de tal manera que ella se extienda dentro de la cavidad.
Convenientemente, la codificación de los datos y la disposición de
las cavidades se efectúan según la premisa de un formato de CD
corriente, en particular del formato de CD-ROM, de
modo que los campos de datos pueden ser leídos por medio de
habituales unidades de discos de CD sin modificaciones al nivel del
software.
También se puede concebir incluso el hecho de
prescindir de las cavidades para la formación de los campos de
datos. Mediante una fijación de sustancias ópticamente absorbentes o
dispersantes adosadamente al substrato, se puede asimismo ejercer
una influencia sobre la reflexión del rayo de luz dirigido hacia los
campos de detección y de datos con el fin de realizar una lectura.
Así, se puede concebir, en el caso de una selección apropiada de
perlas metálicas o de materiales sintéticos, el hecho de conseguir
unos efectos de interferencia destructiva, parecidos a los que se
consiguen por medio de cavidades en la superficie del substrato. Por
lo tanto, para la formación de los campos de datos, puede estar
previsto que sobre la cara plana del substrato, que es portadora los
campos de detección, se aplique una sustancia que influya sobre la
luz de lectura incidente.
Puesto que la capa reflectora se aplica tan sólo
después de haberse terminado todas las etapas de análisis
bioquímicos o biológicos moleculares, no son posibles unas
mediciones precedentes y posteriores de los campos de detección, es
decir unas mediciones antes y después de una puesta en contacto de
la muestra de medición con los campos de detección. Para poder
obtener de todas formas, a partir de las señales de medición, unas
afirmaciones e informaciones seguras acerca de si están ocupados con
analitos ciertos campos de detección, y de qué campos de detección
están ocupados, puede ser ventajoso, estructurar sobre la cara plana
del substrato, que es portadora de los campos de detección, a lo
largo de la línea en espiral o bien de por lo menos una línea
circular, adicionalmente por lo menos un campo de referencia, cuyas
propiedades ópticas se utilizan como referencia al realizar la
evaluación de los campos de detección. Por ejemplo, estos campos de
referencia pueden poseer un grado de absorción de referencia para la
luz del rayo de luz explorador, que es típico para campos de
detección libres de analitos, que se puede diferenciar con respecto
del grado de absorción que poseen típicamente campos de detección
con analitos adheridos. Junto a esto, también pueden estar
estructurados unos campos de referencia, que contienen el analito
o/y un marcador y que, en el caso de una realización correcta del
procedimiento, sirven como un testigo positivo. Los campos de
referencia se pueden utilizar además para la calibración y la
cuantificación de las mediciones.
En la zona de los campos de detección se puede
ajustar una adherencia disminuida de la capa reflectora, cuando ésta
es aplicada directamente sobre el plano biológico molecular o
bioquímico que está situado debajo de ésta. En este caso, puede ser
favorable, después de haber puesto en contacto la muestra de
medición con los campos de detección, aplicar sobre los campos de
detección en primer lugar una capa de cubrimiento a base de un
material ópticamente transparente, antes de que se aplique la capa
reflectora. La capa de cubrimiento puede servir también para la
fijación de los reactivos en los campos de detección. El material y
el espesor de la capa de cubrimiento se adaptarán entre sí de tal
manera que no se efectúe ninguna influencia sobre las propiedades
ópticas del sensor por medio de la capa de cubrimiento, por ejemplo
por efectos de enfoque o de absorción, o que ésta se efectúe de una
manera dominable y controlable. Un material a base de un polímero se
ha manifestado como apropiado para la capa de cubrimiento. Éste se
puede aplicar p.ej. en forma de una lámina o mediante un
procedimiento de proyección. Si el sensor tiene también cavidades en
campos de datos, se tendrá que asegurarse de que las cavidades no
sean llenadas de nuevo por el material de la capa de cubrimiento,
con el fin de impedir una pérdida de las informaciones de datos
representadas por las cavidades. Para la aplicación local de la capa
de cubrimiento se pueden concebir procedimientos de proyección.
También se puede concebir el recurso de subdividir idealmente la
superficie del disco de substrato en segmentos, por ejemplo, en
sectores circulares, de los que una parte se reserva exclusivamente
para campos de detección y la otra parte se reserva exclusivamente
para campos de datos. Los segmentos con campos de datos se pueden
mantener entonces, de manera muy fácil, libres de la capa de
cubrimiento.
El substrato con los elementos de fijación
inmovilizados sobre él se puede envasar en forma de una unidad
comercializable y expedir a los usuarios. Se puede concebir que el
fabricante recopile un conjunto de elementos de fijación que sea
específico para los clientes y lo aplique sobre el substrato.
También se puede imaginar el recurso de aplicar, sobre un substrato
de una manera inespecífica para los clientes, pero específica para
una aplicación, por ejemplo, para determinados análisis de genes, un
conjunto de elementos de fijación, y ofrecerlo como un soporte de
medición preparado previamente. Se recomienda secar este soporte de
medición antes de envasarlo y expedirlo. La muestra de medición que
se ha de investigar es aplicada entonces por el usuario, es decir
por el comprador del soporte de medición. Lo mismo puede servir
también para reactivos que contienen marcadores. La aplicación de la
capa reflectora y eventualmente de la capa de cubrimiento, después
de haberse terminado el procedimiento de detección biológica
molecular o bioquímica, que también puede abarcar unas etapas de
lavado, puede ser efectuada por el usuario, siempre y cuando que
estén a disposición de éste aparatos apropiados para ello. También
se puede concebir que el usuario envíe el soporte de medición con
analitos adheridos, de retorno al fabricante o a otro laboratorio,
donde se aplican estas capas.
Sobre la capa reflectora se puede aplicar
superficialmente todavía una capa protectora, siendo apropiado para
ello, a causa de su resistencia a los golpes y a los arañazos, un
material sobre una base acrílica. El soporte de medición protegido
de esta manera se puede almacenar durante largos períodos de tiempo
y se puede leer de nuevo en cualquier momento.
El invento se refiere además a un soporte de
medición de acuerdo con la reivindicación 18, que está destinado a
su utilización en el procedimiento anteriormente explicado.
Según otro aspecto, se prevé un procedimiento de
acuerdo con la reivindicación 23.
La distribución en forma de círculos o en espiral
de los campos de detección sobre el substrato hace posible la
utilización de los aparatos lectores de placas magnéticas corrientes
en el mercado, las denominadas unidades de discos de los discos
duros. Eventualmente será necesaria una adaptación a nivel del
software del sistema de control de la unidad de discos. La lectura
magnética de los campos de detección hace posible incluso
estructurar campos de detección sobre las dos caras planas del
substrato, por lo que se puede aumentar aún más la densidad de
empaquetamiento de los sensores con campos de detección. En lo que
se refiere a las distancias recíprocas, al tamaño y a la disposición
de los campos de detección, así como de los eventuales campos de
datos y de referencia sobre el substrato, son válidos esencialmente
los datos que se han proporcionado anteriormente para el sensor
legible por vía óptica.
Con el fin de impedir que los marcadores sean
arrancados con respecto del substrato por un contacto con una cabeza
de lectura del aparato de evaluación, después de haberse puesto en
contacto la muestra de medición con los campos de detección, se
puede aplicar una capa de fijación sobre los campos de detección.
Ésta se aplicará, de manera conveniente, superficialmente sobre cada
cara plana del substrato, que es portadora de campos de detección.
Para la capa de fijación se ha acreditado como apropiado un material
sobre la base de un polímero.
Antes de la estructuración de los campos de
detección o después de una puesta en contacto de la muestra de
medición con los campos de detección se aplica una capa magnética
que contiene partículas magnéticas o/y magnetizables de manera
superficial por encima de cada cara plana del substrato que es
portadora de campos de detección. La capa magnética hace posible
inscribir en el sensor adicionalmente datos, que se pueden leer en
común con los campos de detección. Las propiedades magnéticas de la
capa magnética se seleccionan de tal manera que las oscilaciones
locales, provocadas por los marcadores, de la intensidad del campo
magnético o de la densidad del flujo magnético, no se
"desvanezcan" debido a la capa magnética y se vuelvan
indetectables. Ciertamente se puede concebir fundamentalmente, que
la capa magnética sea aplicada debajo de la capa biológica molecular
o bioquímica del sensor, directamente sobre el substrato. No
obstante, es conveniente aplicarla tan sólo después de haberse
terminado las etapas biológicas moleculares o bioquímicas del
procedimiento, puesto que ella puede servir al mismo tiempo como una
capa de fijación.
Un estuche de ensayo para la realización del
procedimiento de acuerdo con el primer o segundo aspecto que se ha
descrito anteriormente comprende un soporte de medición preparado
previamente con elementos de fijación inmovilizados, reactivos para
la realización del procedimiento de detección, en particular
reactivos de detección detectables óptica o/y magnéticamente, así
como eventualmente soluciones de lavado o/y tamponadoras. El soporte
de medición se presenta de manera preferida en una forma seca.
Finalmente, el invento se refiere a la
utilización de un soporte de medición del tipo anteriormente
descrito en un inmunoensayo o/y en un ensayo de hibridación de
ácidos nucleicos o/y en un ensayo de lectinas y azúcares o/y en un
ensayo de proteínas y ácidos nucleicos.
El invento se ilustra a continuación más
detalladamente con ayuda de los dibujos anejos. Representan en
ellos:
La Figura 1 una representación esquemática en
corte de un sensor biológico molecular o bioquímico de acuerdo con
el invento ("biosensor") con campos de detección y de datos,
y
la Figura 2 esquemáticamente la distribución de
los campos de detección y de datos sobre el biosensor.
En la Figura 1, que no reproduce con exactitud
fielmente las relaciones de tamaños reales, el biosensor se designa
por regla general con 1. Él posee la forma de un disco circular. Su
tamaño corresponde convenientemente al de un disco compacto (CD)
convencional, cuyo diámetro es de manera usual de aproximadamente 12
cm. El biosensor 1 comprende un substrato de soporte 3, que está
fabricado a base de un material ópticamente transparente, de manera
preferida a base de un policarbonato. Sobre la cara plana superior,
representada en la Figura 1, del substrato 3 están estructurados
unos campos de detección 5 y 7, así como unos campos de datos 9. En
los campos de datos 9 se han depositado informaciones acerca de la
muestra de medición o/y acerca de los campos de detección o/y acerca
de la evaluación. Al igual que en los CD's habituales, las
informaciones en los campos de datos 9 están representadas por unas
zonas rebajadas 11 y unos zonas no rebajadas 13, que se alternan,
del substrato 3.
En los campos de detección 5, 7 están
inmovilizados unos elementos de fijación o receptores, que son
específicos para ciertos analitos. Estos elementos de fijación se
simbolizan en la Figura 1 esquemáticamente por medio de unos cortos
trazos 15. Cada campo de detección 5, 7 lleva un gran número de
elementos de fijación 15 del mismo tipo o de tipos diferentes. El
campo de detección 7 representa en la Figura 1 un campo de
detección, al que, después de una puesta en contacto de la muestra
de medición con los campos de detección 5,7, no han quedado
adheridos analitos. Por el contrario, el campo de detección 5
representa un campo de detección, al que han quedado adheridos
analitos. Estos analitos se representan esquemáticamente en la
Figura1 por medio de pequeños círculos 17, que simbolizan al mismo
tiempo a los marcadores, con ayuda de los cuales es posible la
detección óptica de la presencia de los analitos.
Los campos de detección 5,7 están empotrados en
un capa de cubrimiento 19, que sólo se ha aplicado en las zonas del
substrato 3, que son portadoras de los campos de detección 5, 7,
pero no en las zonas del substrato 3, que son portadoras de los
campos de datos 9. La capa de cubrimiento 19 se compone asimismo de
un material ópticamente transparente, de manera preferida de un
material polimérico. Ésta fija al marcador sobre el substrato 3 y
sirve, al mismo tiempo, como inductor de adherencia entre el
substrato 3, y una capa reflectora 21, que está aplicada
superficialmente sobre el substrato 3, se extiende a lo largo de
todos los campos de detección 5, 7 y se extiende dentro de todos los
campos de datos 9, y penetra en las cavidades 11 de los campos de
datos 9. La capa reflectora 21 se compone, de manera preferida, de
aluminio, pero también se puede componer, por ejemplo, de plata y es
producida convenientemente por medio de una aplicación química desde
fase de vapor. La capa reflectora 21 sirve como reflector para la
luz de un rayo láser 23, que está dirigido hacia el biosensor 1
desde la parte inferior del substrato 3 para la lectura de los
campos de detección 5, 7 y de los campos de datos 9. La luz
reflejada se evalúa mediante métodos corrientes. Por ejemplo, ella
es separada por medio de un filtro de polarización con respecto de
la luz irradiada, y es evaluada seguidamente en cuanto a su
intensidad. El material del substrato 3 tiene ventajosamente un
índice de refracción tal que el rayo láser 23 es enfocado en el
substrato en su camino de ida, de manera que se pueda mantener a un
nivel muy pequeño la mancha de luz que incide sobre los campos de
detección 5, 7 y los campos de datos 9.
Hacia la cara superior, el biosensor 1 está
cerrado por una capa de cubrimiento 25 aplicada superficialmente,
que protege al biosensor 1 con respecto de influencias químicas o
mecánicas perjudiciales. De manera preferida, ésta se compone de un
material acrílico.
Los campos de detección 5, 7 y los campos de
datos 9 están dispuestos sobre el substrato 3 en un orden de
sucesión alternativo a lo largo de una línea en espiral. La Figura 2
muestra una sección de detalle de dos espiras consecutivas de la
línea en espiral. Esta última se representa en la Figura 2 como una
línea de trazos y es designada con 27. Con d se designa además la
distancia radial entre las dos espiras, es decir la pendiente de la
espiral. Por ejemplo, ésta es de aproximadamente 1,6 \mum. Las
cavidades 11, que en el caso de la utilización de la codificación
habitual para CD's, en particular para CD-ROM's,
pueden poseer una longitud circunferencial variable de manera
escalonada, tienen por ejemplo una anchura de aproximadamente 0,5
\mum en la dirección radial. Para evitar solapamientos radiales
con los campos de detección o de datos de las espiras contiguas de
la espiral, los campos de detección 5,7 están estructurados,
asimismo en dirección radial, tan estrechos que existe una distancia
suficiente con respecto de los campos de las espiras contiguas de la
espiral. En particular, los campos de detección 5,7 pueden tener
asimismo una anchura de 0,5 \mum. En el caso de un
dimensionamiento de este tipo, se puede aceptar sin problemas
también el "deshilachamiento", que se observa con frecuencia en
el caso de una detección por vía enzimática de los analitos
adheridos a los campos de detección 5. En la dirección
circunferencial, los campos de detección 5, 7 pueden ser alargados,
de tal manera que se pueden estructurar con un área de superficie
total suficientemente grande. Los campos de detección 5, 7 tendrán
también en la dirección circunferencial una distancia
suficientemente grande entre ellos y con respecto de los campos de
datos 9.
Los datos de mediciones anteriormente citados se
recomiendan, en particular, cuando para la lectura de los campos de
datos y de detección se utilizan unidades de discos de los CDs con
un diámetro de la mancha del rayo láser 23 de aproximadamente 2
\mum.
A continuación, se ilustran todavía algunos
ejemplos de aplicación biológicos moleculares o bioquímicos del
invento.
Las aplicaciones se pueden clasificar de acuerdo
con la naturaleza del partícipe (A) en la fijación, inmovilizado,
del elemento de fijación específico para ciertos analitos, y con la
naturaleza de su "ligando", es decir del analito (B). Como
partícipes en la interacción se utilizan preferiblemente ácidos
nucleicos y/o proteínas, pero se pueden emplear también otros pares
específicos de fijación, tales como ilustrativamente lectinas o
azúcares.
De manera preferida, los receptores o los
analitos, en particular las proteínas y los ácidos nucleicos, se
derivatizan con un grupo de biotina, siendo detectado entonces el
grupo de biotina ventajosamente con un conjugado de estreptavidina y
una enzima, tal como ilustrativamente la peroxidasa de rábano
rusticano. El substrato de la reacción enzimática se elige de tal
manera que junto al sitio de la interacción molecular se forme un
precipitado intenso, de color oscuro, que extingue al láser de
detección. Junto a esto, la detección se puede efectuar también
mediante una derivatización directa de un partícipe en la
interacción con un fluorocromo, en combinación con un láser
apropiado.
El receptor (A) es un aptámero de ARN, un péptido
o una molécula efectora natural o sintética y el analito (B) es una
proteína.
Las propiedades de una enzima o de un factor de
regulación en la expresión de genes, se modulan con frecuencia por
medio de la asociación de pequeñas moléculas de efectores o
ligandos. Un ejemplo de ello son los receptores de hormonas, que,
después de haberse fijado a la hormona, se transforman en una
conformación activa. La función de la proteína se puede modular por
medio de la interacción de un compuesto análogo a un substrato o
mediante efectores alostéricos. Para poder identificar agentes
químicos pequeños apropiados se llevan a cabo procedimientos de
escrutinio en cuanto a ligandos, investigándose un gran número de
agentes químicos diferentes.
Con el procedimiento de acuerdo con el invento es
posible ensayar exhaustivamente bibliotecas químicas. En este caso
se inmoviliza un gran número de pequeños agentes químicos diferentes
en un orden definido sobre el soporte de medición, poniéndose en
contacto con ellos la proteína en cuestión en diversas condiciones
rigurosas. Una proteína fijada, cuando está marcada con un
fluorocromo apropiado, por ejemplo una partícula de látex, se
detecta directa o indirectamente mediando utilización de una cascada
de amplificación de enzimas. De manera correspondiente, grandes
bibliotecas de aptámeros de ARN o de péptidos, o bien en un estado
aislado o incorporados en una proteína de fusión, se pueden escrutar
en lo que se refiere a interacciones con una proteína que esté en
cuestión.
El receptor (A) es una proteína y el analito (B)
es un ácido nucleico o ligando.
Se pueden escrutar bibliotecas de proteínas en lo
que se refiere a determinadas propiedades de fijación, p.ej. la
interacción con una secuencia definida de ADN. Unos soportes de
medición multiplicados, que contienen sectores definidos de
proteínas, y que representan en común los productos de una
biblioteca de expresión de ADNc, pueden ser caracterizados con
ligandos específicos o con sitios de fijación a ADN. Las proteínas
dispuestas pueden ser en la forma en que se encuentran en la
biblioteca, desconocidas y tal sólo pueden ser asociadas mediante el
procedimiento de acuerdo con el invento. Alternativamente, se pueden
investigar sectores de proteínas conocidas o derivados de una
proteína definida, tal como ilustrativamente el producto de una
mutagénesis casual.
El receptor (A) es un ADN o ARN y el analito (B)
es una proteína.
Se puede aplicar sobre los campos de detección un
gran número de diferentes fragmentos de ADN bicatenarios. En este
caso se puede tratar o bien de pequeños fragmentos, por ejemplo, de
oligonucleótidos, o bien de fragmentos más grandes de ADN, hasta de
segmentos muy grandes de ADN, que constituyen una biblioteca
ordenada de fragmentos de ADN genómicos. Las aplicaciones abarcan la
búsqueda sistemática de posibles sitios genómicos de fijación para
proteínas de fijación a ADN, pero también se pueden detectar otras
moléculas de fijación a ADN, tales como ilustrativamente
intercaladores, pequeñas moléculas con una predilección para
determinadas secuencias, PNA's y secuencias, que forman una triple
hélice. Asimismo, como moléculas de receptores se pueden aplicar en
los campos de detección moléculas de ARN, tales como
ilustrativamente los transcritos de una biblioteca de ADNc o los
derivados de un ARN definido, tales como ilustrativamente el
producto de una mutagénesis casual.
El receptor (A) es un ADN monocatenario y el
analito (B) es un ADN o ARN monocatenario.
Entretanto, ya se ha hecho posible secuenciar
genomas enteros, y los genomas de eucariotas superiores, tales como
ilustrativamente los de seres humanos, ratones y moscas, son
cartografiados y cubiertos por clones ordenados (tales como
ilustrativamente los clones de fagos P1), partiéndose en este caso
de que las secuencias de todos los genomas son obtenibles en un
período de tiempo previsible. En este contexto, se pueden producir
unos soportes de medición de acuerdo con el invento, que contienen
genomas enteros en conjuntos o sectores ordenados. Con ello, es
posible asociar un fragmento de ADN clonado, en una única etapa de
hibridación, a su localización genómica, y en dependencia de la
resolución del conjunto (que es una función de la longitud media de
la secuencia y del número de las moléculas individuales de ADN), es
incluso posible identificar el gen propiamente dicho. Un ejemplo de
una aplicación de este tipo son los conjuntos de P1 de la entidad
Genome Systems, que hasta ahora sólo se pueden escrutar de mala
manera, puesto que éstos sólo se pueden obtener sobre membranas. La
aplicación de estos conjuntos de P1 sobre los soportes de medición
de acuerdo con el invento hace posible una aplicación sencilla y
nada complicada. Las translocaciones y otras reordenaciones
genómicas, que constituyen con frecuencia una causa de enfermedades
genéticas, pueden ser cartografiadas asimismo de una manera
sencilla, inclusive las deleciones (supresiones) del genoma
mitocondrial. Además de esto, se pueden cartografiar fácilmente
inserciones de transgénes, cuando el ADN insertado se detecta en
común con una pequeña cantidad de un ADN genómico flanqueador.
Los conjuntos o sectores de oligonucleótidos
diagnósticos, que representan todos los genes conocidos de una
especie determinada, hacen posible la identificación directa de un
gen que esté en cuestión. Para esto, se pueden mejorar p.ej.
conjuntos de ADNc de la entidad Klontech o chips de ADN de la
entidad Affimetrix, sobre los cuales se han aplicado todos los genes
de levaduras, mediante su transferencia a los soportes de medición
de acuerdo con el invento.
Mediante aplicación de un ADN sobre soportes de
medición de acuerdo con el invento, que muestran todos los genes de
un organismo, se puede investigar el perfil de expresión. Sobre el
soporte de medición se aplica una mezcla compleja de ARN, que
representa el estado de la expresión de una célula determinada o de
una población de ADNc derivada de ésta. El estado de expresión, que
se ha comprobado sobre el soporte de medición, se puede comparar
fácilmente con el estado de expresión de otras células, que proceden
de otros tejidos, de otros estadios de desarrollo o de otros
estadios de metabolismo. Alternativamente, se pueden investigar
muestras de ADN, que representan determinados estados de ADN
seleccionados, tales como ilustrativamente genes del ciclo celular,
componentes de transmisores de señales, etc. Puesto que los soportes
de medición de acuerdo con el invento se pueden almacenar durante un
largo período de tiempo, se pueden establecer perfiles de expresión,
que se pueden archivar y aprovechar con finalidades de
comparación.
El procedimiento de acuerdo con el invento se
puede utilizar para la diagnosis de polimorfismos usuales y raros de
ADN, inclusive el cartografiado de mutaciones en
proto-oncogenes, que provocan los tumores usuales.
Un soporte de medición apropiado contiene oligonucleótidos
superpuestos, que abarcan en común un gen entero (p.ej. la secuencia
de tipo silvestre), en común con oligonucleótidos, que contienen
todas las mutaciones, posibles o que aparecen con frecuencia, de
esta secuencia. El correspondiente fragmento de ADN se aísla desde
los pacientes mediante una PCR (reacción en cadena de polimerasa), y
se hibrida con el relevante soporte de medición de genes en unas
condiciones, en lasque la hibridación sólo tiene lugar en el caso de
una coincidencia perfecta de las secuencias. Una comparación de la
hibridación del ADN experimental en oligonucleótidos de tipo
silvestre o mutantes hace posible comprobar exactamente qué tipo de
mutación se presenta en una secuencia.
Junto a las aplicaciones anteriormente descritas,
en las que se detecta un sencillo proceso de fijación, que produce
señales, que pueden ser reforzadas eventualmente por una cascada de
enzimas, a fin de aumentar la sensibilidad de la detección, el
procedimiento de acuerdo con el invento se puede utilizar también en
unas aplicaciones, que requieren unos tratamientos más extensos del
soporte de medición, tales como ilustrativamente una amplificación
por PCR, que se lleva a cabo de manera análoga a las amplificaciones
por PCR in situ. De esta manera se pueden detectar también
agentes infectantes.
Claims (27)
1. Procedimiento para la detección de analitos
en una muestra de medición, en el que, sobre un substrato en forma
de disco (3), se inmovilizan en un gran número de campos de
detección (5, 7) sobre una de sus caras planas unos elementos de
fijación (15), específicos para ciertos analitos, seguidamente la
muestra de medición se pone en contacto con los campos de detección
(5, 7), y a continuación, se determina la presencia o/y la cantidad
de los analitos (17) que se han de detectar mediante una evaluación
óptica de los campos de detección (5, 7), utilizándose un substrato
(3) producido a base de un material ópticamente transparente, y los
campos de detección (5, 7) se disponen, distribuidos sobre el
substrato (3), a lo largo de por lo menos una línea en espiral (27)
o/y a lo largo de un gran número de líneas circulares
concéntricas,
caracterizado porque después de una puesta
en contacto de la muestra de medición con los campos de detección
(5, 7), se aplica por encima de los campos de detección (5, 7) una
capa reflectora óptica (21) sobre la cara plana del substrato (3),
que es portadora de los campos de detección (5, 7).
2. Procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 1,
caracterizado porque la capa reflectora
(21) se forma a base de aluminio.
3. Procedimiento de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 y 2,
caracterizado porque, referido al eje del
disco, se disponen unos campos de detección (5, 7) contiguos en
dirección radial, con una distancia radial entre sí.
4. Procedimiento de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 3,
caracterizado porque a lo largo de la
línea en espiral (27) o bien de una línea circular se disponen unos
campos de detección (5, 7) contiguos con una distancia entre sí.
5. Procedimiento de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 4,
caracterizado porque sobre la cara plana
del substrato (3), que es portadora de los campos de detección (5,
7), a lo largo de la línea en espiral (27) o bien de por lo menos
una línea circular, se estructuran adicionalmente unos campos de
datos (9), que contienen informaciones referidas a una muestra de
medición o/y referidas a un campo de detección o/y referidas a una
evaluación.
6. Procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 5,
caracterizado porque los campos de
detección (5, 7) y los campos de datos (9) se disponen de manera
alternativa a lo largo de la línea en espiral (27) o bien de por lo
menos una línea circular.
7. Procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 5,
caracterizado porque los campos de
detección y los campos de datos se estructuran en cada caso sobre
líneas circulares separadas.
8. Procedimiento de acuerdo con una de las
reivindicaciones 5 a 7,
caracterizado porque para la formación de
los campos de datos (9) se incorporan unas cavidades (11) en la cara
plana del substrato (3), que es portadora de los campos de detección
(5, 7), y porque la capa reflectora (21) se aplica de tal manera,
que ella se extienda dentro de las cavidades (11).
9. Procedimiento de acuerdo con una de las
reivindicaciones 5 a 7,
caracterizado porque para la formación de
los campos de datos sobre la cara plana del substrato, que es
portadora de los campos de detección, se aplica una sustancia que
influye sobre la luz de lectura incidente.
10. Procedimiento de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 9,
caracterizado porque sobre la cara plana
del substrato (3), que es portadora de los campos de detección (5,
7), se estructura a lo largo de la línea en espiral (27) o bien de
por lo menos una línea circular adicionalmente por lo menos un campo
de referencia, cuyas propiedades ópticas se utilizan como referencia
al realizar la evaluación de los campos de detección (5, 7).
11. Procedimiento de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 10,
caracterizado porque, después de una
puesta en contacto de la muestra de medición con los campos de
detección (5, 7), antes de la aplicación de la capa reflectora, se
aplica sobre los campos de detección (5, 7) una capa de cubrimiento
(19) a base de un material ópticamente transparente.
12. Procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 11,
caracterizado porque para la capa de
cubrimiento (19) se utiliza un material sobre la base de un
polímero.
13. Procedimiento de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 12,
caracterizado porque se utiliza un
substrato (3) a base de un policarbonato.
14. Procedimiento de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 13,
caracterizado porque el substrato (3) es
provisto en un sitio de producción de los elementos de fijación
(15), es secado y envasado, y porque el substrato (3) preparado de
esta manera se lleva a un sitio de aplicación alejado del sitio de
su fabricación, en el que, por parte de un usuario, la muestra de
medición se pone en contacto con los campos de detección (5, 7).
15. Procedimiento de acuerdo con una de las
reivindicaciones anteriores,
caracterizado porque la detección de los
analitos se efectúa por medio de una detección de una modificación
de las propiedades ópticas de los campos de detección.
16. Procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 15,
caracterizado porque la modificación
óptica de los campos de detección es ocasionada por isótopos,
enzimas, fluorocromos, colorantes, coloides metálicos o/y
perlas.
17. Procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 16,
caracterizado porque se utilizan perlas de
látex, perlas de materiales sintéticos, perlas de vidrio o/y perlas
metálicas.
18. Soporte de medición para su utilización en
el procedimiento de acuerdo con una de las reivindicaciones 1 a
17,
que comprende un substrato (3) en forma de disco,
fabricado a base de un material ópticamente transparente, sobre el
que, en una de sus caras planas, unos elementos de fijación (15)
específicos para ciertos analitos, están inmovilizados en un gran
número de campos de detección (5, 7), estando dispuestos los campos
de detección (5, 7) distribuidos sobre el substrato (3) a lo largo
de por lo menos una línea en espiral (27) o/y de un gran número de
líneas circulares concéntricas,
caracterizado por una capa reflectora (21)
que se ha de aplicar superficialmente sobre la cara plana del
substrato, que es portadora de los campos de detección, encima de
los campos de detección (5, 7), después de haberse puesto en
contacto la muestra de medición con los campos de detección.
19. Soporte de medición de acuerdo con la
reivindicación 18,
caracterizado porque sobre la capa
reflectora (21) se aplica superficialmente una capa protectora
(25).
20. Soporte de medición de acuerdo con la
reivindicación 19,
caracterizado porque la capa protectora
(25) se fabrica a base de un material constituido sobre una base
acrílica.
21. Soporte de medición de acuerdo con una de
las reivindicaciones 18 a 20,
caracterizado porque él se pone a
disposición en forma de una unidad comercial envasada, antes de la
aplicación de la capa reflectora.
22. Soporte de medición de acuerdo con la
reivindicación 21,
caracterizado porque él se envasa en
estado seco.
23. Procedimiento para la detección de analitos
en una muestra de medición, en la que sobre un substrato en forma de
disco, por lo menos sobre una de sus caras planas, se inmovilizan
unos elementos de fijación específicos para ciertos analitos, en un
gran número de campos de detección, seguidamente se pone en contacto
la muestra de medición con los campos de detección, y a continuación
se determina la presencia o/y la cantidad de los analitos que se han
de detectar mediante una evaluación de los campos de detección,
evaluándose los campos de detección por vía
magnética y, para ello, unos elementos de fijación o los analitos
que se han de detectar se marcan con marcadores magnéticos o/y
magnetizables, y los campos de detección se disponen a lo largo de
un gran número de líneas circulares concéntricas o/y a lo largo de
por lo menos una línea en espiral, distribuidos sobre el
substrato,
caracterizado porque, antes de la
estructuración de los campos de detección o después de haber puesto
en contacto la muestra de medición con los campos de detección, se
aplica una capa magnética, que contiene partículas magnéticas o
magnetizables, superficialmente sobre cada cara plana del substrato,
que es portadora de campos de detección.
24. Procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 23,
caracterizado porque, después de la puesta
en contacto la muestra de medición con los campos de detección, se
aplica una capa de fijación sobre los campos de detección.
25. Procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 24,
caracterizado porque la capa de fijación
se aplica superficialmente sobre cada cara plana del substrato, que
es portadora de los campos de detección.
26. Procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 24 ó 25,
caracterizado porque para la capa de
fijación se utiliza un material sobre la base de un polímero.
27. Utilización de un soporte de medición de
acuerdo con una de las reivindicaciones 18 a 22 en un inmunoensayo
o/y en un ensayo de hibridación de ácidos nucleicos o/y en un ensayo
de lectinas y azúcares o en un ensayo de proteínas y ácidos
nucleicos.
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