ES2221920T3 - Sistema de liberacion de polinucleotidos de autoensamblaje que comprende un peptido cationico anfipatico. - Google Patents
Sistema de liberacion de polinucleotidos de autoensamblaje que comprende un peptido cationico anfipatico.Info
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Abstract
ESTA INVENCION PROVEE UN SISTEMA DE DISTRIBUCION POLINUCLEOTIDO DE AUTOMONTAJE QUE COMPRENDE LOS COMPONENTES QUE AYUDAN EN LA DISTRIBUCION DEL POLINUCLEOTIDO A LOS DESTINOS DESEADOS QUE ESTAN ASOCIADOS POR INTERACCIONES NO COVALENTES CON EL POLINUCLEOTIDO. LOS COMPONENTES DE ESTE SISTEMA INCLUYEN COMPONENTES ENMASCARADORES DE DNA, COMPONENTES DE RECONOCIMIENTO DE CELULA, NEUTRALIZACION DE CARGA Y COMPONENTES DE PERMEABILIZACION DE MEMBRANA, Y COMPONENTES DE LOCALIZACION SUBCELULAR. SE PREVEEN LOS COMPONENTES ESPECIFICOS UTILES EN ESTE SISTEMA
Description
Sistema de liberación de polinucleótidos de
autoensamblaje que comprende un péptido catiónico anfipático.
Esta invención se refiere al campo de la
liberación de oligonucleótidos y de la terapia génica. En
particular, esta invención se refiere a un sistema de liberación de
polinucleótidos de autoensamblaje que comprende componentes que
ayudan a liberar el polinucleótido en el sitio deseado, que están
asociados por interacciones no covalentes con el polinucleótido. Los
componentes de este sistema incluyen componentes de enmascaramiento
de ADN, componentes de reconocimiento celular, componentes de
neutralización de carga y de permeabilización de membrana, y
componentes de localización subcelular.
La fibrosis quística (CF) es una enfermedad
genética recesiva fatal caracterizada por anormalidades en el
transporte de cloruro (McPherson & Dorner, 1991). El locus de la
enfermedad se ha localizado en mutaciones en el gen que codifica el
regulador de la conductancia transmembrana de la fibrosis quística
(CFTR). J. R. Riordan et al., Science (1989)
245:1066-1073; B. Kerem et al.,
Science (1989) 245:1073-1080. La
corrección del defecto génico subyacente por complementación o
reemplazo del CFTR defectuoso es la curación final de la CF. La
terapia génica, la liberación in vivo y la expresión de
genes, es una ciencia que se desarrolla rápidamente y que puede
usarse para reemplazar genes defectuosos.
La terapia génica ya es posible. T. Friedmann,
Science (1989) 244:1275-1281; M.
Bluestone, Biotechnol (1992)
10:132-134. En la técnica se conocen sistemas
y polímeros para liberar polinucleótidos. P.L. Felgner, Adv Drug
Delivery Rev (1990) 5:163-187. Se han
usado vectores adenovirales para transferir CFTR al pulmón de rata
de algodón in vivo. M.A. Rosenfeld et al., Cell (1992)
68:143-155. Aunque se ha informado que se
producen altos niveles de transfección in vivo con los
vectores adenovirales, los sistemas de liberación no virales tienen
varias ventajas y deben desarrollarse enérgicamente. Rosenfeld et
al., supra; M.A. Rosenfeld et al., Science (1991)
252:431-434.
Durante la última década, se han desarrollado
varios métodos para introducir genes funcionales en células de
mamífero in vitro. Estas técnicas son aplicables a la terapia
génica si es posible retirar del cuerpo las células diana,
tratarlas, amplificar las células transfectadas y después
devolverlas al paciente. Esta opción no es posible en los pacientes
con CF. En el momento actual, se obtienen las mejores eficacias de
transfección in vivo con retrovirus (Bluestone, supra)
y adenovirus (Rosenfeld et al., supra). Sin embargo, la
eficacia es variable y un problema es que la liberación de un gen
basado en un virus podría producir infecciones víricas o cáncer.
Ciertos ensayos clínicos humanos iniciales han revelado que no se
producen complicaciones agudas con vectores retrovirales, pero la
posibilidad de que se produzcan complicaciones a largo plazo exige
un control cuidadoso de los pacientes. K. Cornetta et al., Human
Gene Ther (1991) 2:3-14.
El riesgo de usar vectores basados en virus y las
ventajas conceptuales en el uso de construcciones de ADN plasmídico
para terapia génica (discutido en P.L. Felgner et al., Nature
(1991) 349:351-352) han conducido a un
desarrollo paralelo de diversos métodos físicos y químicos para la
transferencia génica. Los sistemas estudiados más intensamente
implican el tratamiento de las células con fosfato cálcico o un
facilitador catiónico (Felgner et al., supra). Otros métodos
populares implican la inyección de ADN durante la punción física de
la membrana (M.R. Capecchi, Cell (1980)
22:479-485) o la captación pasiva durante una
permeabilización o abrasión de la membrana celular (Felgner et
al., supra). Todos estos métodos son intrínsecamente agresivos y
aplicables sólo in vitro.
Esta invención pertenece al campo de la
liberación génica directa que no implica el uso de vehículos
virales. Un vehículo no viral para liberación génica debe poder
superar muchas barreras: debe sobrevivir en circulación, debe poder
dirigirse a la célula elegida, debe poder introducir ADN en el
citoplasma, y debe poder transportar el ADN al núcleo.
Enmascaramiento. Una preocupación acerca
de la liberación directa de genes in vivo es la capacidad del
polinucleótido para sobrevivir en circulación durante suficiente
tiempo como para llegar al destino celular deseado. El
"enmascaramiento" o la protección de los polinucleótidos es una
forma de solucionar este problema.
Los microparticulados (tales como los eritrocitos
fantasmas, envueltas virales reconstituidas y liposomas), se han
usado en parte como protección en la transferencia de genes. C.
Nicolau et al., Crit Rev Ther Carr Sys (1989)
6:239-271; R.J. Mannio et al.,
Biotechniques (1988) 6:682-690. El
sistema de liposomas más satisfactorio usa el reactivo lipídico
catiónico dioleiloxitrimetilamonio (DOTMA). P.L. Felgner et al.,
Proc Natl Acad Sci (USA) (1987)
84:7413-7417. DOTMA se mezcla con
fosfatidiletanolamina (PE) para formar el reactivo Lipofectin™. La
ventaja de usar Lipofectin™ es que el liposoma catiónico simplemente
se mezcla con el ADN y se añade a la célula. No es necesario
encapsular el ADN dentro del liposoma con los reactivos catiónicos.
Lipofectin™ se ha usado para introducir genes indicadores por medio
de transfección en células epiteliales de pulmón humano en cultivo
(L. Lu et al., Pflugers Arch (1989)
415:198-203), para introducir el gen CAT en
ratas por vía intratraqueal (T.A. Hazinski et al., Am J Respir
Cell Mol Biol (1991) 4:206-209) y para
introducir el gen CAT en ratones por vía intratraqueal e intravenosa
(K.L. Brigham et al., Am J Med Sci (1989)
298:278-281; A. Bout et al.,
"Abstracts of the 1991 Cystic Fibrosis Conference", Abstract nº
87 (1991)). Aproximadamente un 50% de las células epiteliales de las
vías respiratorias expresaban de forma transitoria el gen indicador
de la \beta galactosidasa (Hazinski et al., supra), pero no
se cuantificó el nivel de expresión. Cuando se introdujo por
transfección cloranfenicol acetiltransferasa (CAT) unida a un
promotor sensible a esteroides en pulmón de rata, la expresión pudo
regularse positivamente por dexametasona. Hazinski et al.,
supra. Con altas concentraciones de Lipofectin™ existe el
problema de la citotoxicidad.
Los sustitutos de DOTMA incluyen lipopoliamina
(J. Loeffler et al., J. Neurochem (1990)
54:1812-1815), polilisinas lipófilas (X. Zhou
et al., Biochim Biophys Acta (1991)
1065:8-14) y un colesterol catiónico (X. Gao
et al., Biochem Biophys Res Comm (1991)
179:280-285). Estos sustitutos se han usado
para mediar la transferencia génica en cultivo. Aunque se han
observado algunas mejoras con respecto a las velocidades de
transfección observadas con Lipofectin™ (aproximadamente tres veces
mayores), la toxicidad sigue siendo un problema. Debe mencionarse
que no se dispone de estudios sobre el mecanismo responsable de la
transfección usando los lípidos catiónicos. La estrategia previa ha
sido sintetizar diferentes lípidos catiónicos y probarlos en ensayos
de transfección en lugar de estudiar sistemáticamente cómo los
sistemas de liberación introducen ADN en la célula. Los liposomas de
DOTMA/PE pueden experimentar fusión de bicapas con liposomas
aniónicos (N. Duzgunes et al., Biochem (1989)
28:9179-9184), lo que sugiere que en el modo
de acción de DOTMA está implicada la entrada directa del ADN a
través de la membrana plasmática. La transfección de alta eficacia
usando sistemas lipídicos catiónicos requiere la inclusión de PE,
posiblemente porque la PE puede formar intermedios lipídicos
intramembrana que facilitan la fusión de las membranas. Se ha
estudiado ampliamente el papel de la PE en la permeabilización y
fusión de las membranas. Por ejemplo, M.,-Z. Lai et al.,
Biochem (1985) 24:1646-1653; H. Ellens et
al., Biochem (1986) 25:285-294; J. Bentz
et al., Biochem (1987)
26:2105-2116).
Dirección Celular. Una transferencia
génica eficaz requiere la dirección del ADN a la célula elegida.
Recientemente se han descrito procedimientos basados en endocitosis
mediada por receptores para la transferencia génica. G.Y. Wu et
al., J Biol Chem (1987) 262:4429; G.Y. Wu et al., J
Biol Chem (1988) 263:14621-14624. Un
complejo de ligando-polilisina con especificidad de
célula se une a ácidos nucleicos por medio de interacciones de
carga. El complejo resultante se recoge por las células diana. Wu
et al., supra, informaron que se producía una transfección
eficaz de la línea celular de hepatoma humano HepG2 y de hepatocitos
de rata in vivo usando este sistema de liberación con
asialoorosomucoide como ligando. Huckett et al., Biochem
Pharmacol (1990) 40:253-263, notificaron
la expresión estable de una actividad enzimática en células HepG2
después de la dirección dirigida por insulina. Finalmente, Wagner
et al., Proc Natl Acad Sci (USA) (1990)
87:3410-3414 y (1991)
88:4255-4259 observaron la liberación de un
plásmido mediada por policationes de transferrina en la línea de
células de leucemia humana K-562 y la posterior
expresión del gen de luciferasa codificado. Sin embargo, los
sistemas de liberación descritos se basan en proteínas de dirección
de alto peso molecular unidas al ADN a través de un enlazador de
polilisina. Estos conjugados grandes de
ligando-policatión son heterogéneos en cuanto al
tamaño y la composición, no están bien definidos químicamente y son
difíciles de preparar de una forma reproducible (Wu et al.,
supra; Wagner et al., supra). Además, en muchos de los
sistemas mediados por receptor, se requiere cloroquina u otros
agentes para alterar el tráfico intracelular para conseguir altos
niveles de transfección. En un estudio, se ha usado adenovirus para
mejorar la liberación génica de los sistemas mediados por
receptores. D.T. Curiel et al., Proc Natl Acad Sci (USA)
(1991) 88:8850-8854.
Todos estos estudios conjuntamente demuestran que
pueden liberarse genes en el interior de células de mamífero por
endocitosis mediada por receptor y que una fracción del ADN exógeno
escapa a la degradación, entra en el núcleo y se expresa. El nivel
de expresión es bajo, probablemente debido a la entrada limitada del
ADN extraño en el citoplasma.
La liberación directa de genes se ayuda por la
capacidad de neutralizar la gran carga negativa presente en el
polinucleótido, y la capacidad (a menudo concomitante) de
permeabilizar la membrana de la célula diana. El uso de policationes
para neutralizar la carga del polinucleótido y ayudar a la
permeabilización de la membrana y a la translocación es bien
conocido. Felgner, supra. También se han usado lípidos
catiónicos para este fin. P.L. Felgner et al., Proc Natl Acad Sci
(USA) (1987) 84:7413-7417; Patente de
Estados Unidos Nº 4.946.787 de Eppstein et al. También se
conocen ciertos lípidos catiónicos denominados lipopoliaminas y
lipointercaladores. J.-P. Behr, Tet Lett (1986)
27:5861-5864.
Localización Subcelular. Una vez que el
polinucleótido ha entrado en la célula diana, la liberación directa
de genes se ayudaría por la capacidad de dirigir los genes a la
localización subcelular apropiada. Una diana obvia para la
liberación de desoxirribonucleótidos es el núcleo. Son ligandos que
se sabe que ayudan en este proceso péptidos de localización nuclear,
o proteínas que contienen estas secuencias de localización nuclear.
C. Dingwall et al., TIBS (1991)
16:478-481.
Y. Kaneda et al., Science (1989)
243:375-378, demostraron que la eficacia de
transfección obtenida con envueltas virales reconstituidas aumenta
cuando el gen extraño se libera en el interior de las células diana
junto con proteínas nucleares. El ADN mezclado con proteínas
nucleares presenta un aumento modesto en la transfección con
respecto al ADN que se mezcló con albúmina (Kaneda et al.,
supra). Se supone que el ADN se incorpora en el núcleo más
fácilmente cuando están asociadas con el plásmido proteínas que
contienen la secuencia de localización nuclear (NLS)
pro-lys-lys-lys-arg-lys-val
(P.A. Silver. Cell (1991) 64:489-497).
La NLS en una proteína la designa para el transporte a través del
poro nuclear. Se han unido secuencias de localización nucleares de
14 aminoácidos a una diversidad de macromoléculas e incluso a
partículas de oro (diámetro de 150 A) y, cuando se introducen en el
citoplasma, se incorporan rápidamente en el núcleo (D.R. findlay
et al., J. Cell Sci Supp (1989)
11:225-242; Silver, supra). La
sugerencia de que la entrada en el núcleo es limitante de la
velocidad para conseguir una transfección estable satisfactoria,
también se confirma por el hallazgo de que el ADN plasmídico
microinyectado en el citoplasma no puede realizar la transfección de
las células (ausencia de transfección en 1000 inyecciones
citoplásmicas), mientras que la microinyección de plásmidos
directamente en el núcleo produce una transfección de más del 50% de
las células microinyectadas. Cappecchi, supra. Si la unión de
señales de localización nuclear en el plásmido conduce al transporte
del ADN plasmídico al interior del núcleo, aumentaría la eficacia de
transfección. Proponemos un nuevo método para unir NLS y otros
ligando al polinucleótido deseado.
Finalmente, los investigadores han demostrado que
las eficacias de transfección aumentan cuando el ADN se condensa
usando diversas proteínas catiónicas. T.I. Tikchonenko et al.,
Gene (1988) 63:321-330; M. Bottger et
al., Biochim Biophys Acta (1988)
950:221-228; Wagner et al., supra. La
razón de por qué la condensación de ADN aumenta la transfección no
es fácilmente evidente, puede aumentar la captación celular de ADN
(Wagner et al., supra), pero también puede reducir la
susceptibilidad del ADN a la actividad nucleasa, lo cual puede
producir mayores cantidades de ADN intacto en la célula.
Asociación de Polinucleótidos. La
liberación directa de genes asociados con una de las clases
descritas anteriormente de moléculas se ayuda adicionalmente por la
capacidad de esos componentes de permanecer asociados con el ADN. Wu
et al., supra, asociaron su ligando de receptor con el
polinucleótido uniendo covalentemente el ligando al policatión
polilisina. Wagner et al., supra, además de a la polilisina,
también unieron covalentemente el ligando a un intercalador de ADN,
homodímero de etidio (diclorhidrato de dicloruro de
(5,5'-diazadecametilen-bis(3,8-diamino-6-fenilfenantridio)).
P.E. Nielsen, Eur J Biochem (1982)
122:283-289, asociaron marcadores de
fotoafinidad al ADN por medio de la unión covalente a
9-aminoacridina y ciertas
bis-acridinas.
Ninguna de las referencias anteriores describe un
sistema para la liberación de polinucleótidos dirigido a los
múltiples aspectos de los problemas implicados en la puesta
de un polinucleótido circulante en una localización subcelular diana
de una célula diana. Esta invención soluciona esos problemas
asociando el polinucleótido con una combinación de uno o más de los
siguientes componentes funcionales: componentes de enmascaramiento
del ADN, componentes de reconocimiento celular, componentes de
neutralización de carga y de permeabilización de la membrana, y
componentes de localización subcelular.
A la luz de los problemas mencionados
anteriormente de la liberación génica directa, esta invención
contempla un sistema de liberación de polinucleótidos de
autoensamblaje de acuerdo con la reivindicación 1 que utiliza uno o
más de un componente de permeabilización de la membrana y
preferiblemente de los siguientes componentes funcionales:
componentes de enmascaramiento del ADN, componentes de
reconocimiento celular, componentes de neutralización de carga y
componentes de localización subcelular. Cada componente de este
sistema puede realizar su función indicada y también ser capaz de
ensamblarse o desensamblarse con el polinucleótido cuando sea
necesario. Por ejemplo, ciertos componente pueden tener que
disociarse del polinucleótido para realizar su función deseada.
Por consiguiente, es un objeto primario de esta
invención proporcionar una composición de acuerdo con la
reivindicación 1 para presentar un polinucleótido a un componente
subcelular de una célula eucariota, que comprende el polinucleótido
asociado con un componente de permeabilización de membrana capaz de
transportar el polinucleótido a través de la membrana citoplásmica
de la célula eucariota.
Una composición para presentar un polinucleótido
al núcleo de una célula eucariota comprende el polinucleótido
asociado adicionalmente con un componente de reconocimiento celular
capaz de reconocer la célula eucariota.
Una composición para presentar un polinucleótido
al núcleo de una célula eucariota comprende el polinucleótido
asociado tanto con un componente de reconocimiento celular capaz de
reconocer la célula eucariota, como con un componente de
permeabilización de la membrana capaz de transportar el
polinucleótido a través de la membrana citoplásmica de la célula
eucariota.
Una composición para presentar un polinucleótido
a un componente subcelular de una célula eucariota comprende el
polinucleótido asociado adicionalmente con un componente de
localización subcelular capaz de liberar el polinucleótido desde el
citoplasma de la célula eucariota a un componente subcelular de la
célula eucariota.
Una composición para presentar un polinucleótido
a un componente subcelular de una célula eucariota comprende el
polinucleótido, un componente de reconocimiento celular capaz de
reconocer dicha célula eucariota, un componente de permeabilización
de la membrana capaz de transportar el polinucleótido a través de la
membrana citoplásmica de dicha célula eucariota, un componente de
localización subcelular capaz de liberar el polinucleótido desde el
citoplasma de dicha célula eucariota a un componente subcelular de
dicha célula eucariota, y un componente de enmascaramiento capaz de
aumentar la vida media en circulación del polinucleótido.
Un componente útil en sistemas de liberación de
polinucleótidos de autoensamblaje tiene la fórmula
Ar_{1}---NH---(CH_{2})_{n}---
\uelm{N}{\uelm{\para}{\uelm{C=O}{\uelm{\para}{\uelm{\hskip-0.1cm(CH _{2} ) _{p} }{\uelm{\para}{X-Y}}}}}}---(CH_{2})_{m}---NH---Ar_{2}
donde cada uno de n y m es
independientemente un número entero de 1 a 20, p es un número entero
de 0 a 20, Ar_{1} y Ar_{2} se seleccionan independientemente
entre el grupo compuesto por bromuro de etidio, acridina,
mitoxantrona, oxazolopiridocarbazol, elipticina y
N-metil-2,7-diazapirenio,
y derivados de los mismos, X es un grupo de acoplamiento reactivo, e
Y se selecciona entre el grupo compuesto por ligandos del receptor
de la superficie celular, secuencias de localización subcelular y
componentes de permeabilización de la
membrana.
Un componente intercalador reactivo tiene la
fórmula
Ar_{1}---NH---(CH_{2})_{n}---
\uelm{N}{\uelm{\para}{\uelm{C=O}{\uelm{\para}{\uelm{\hskip-0.1cm(CH _{2} ) _{p} }{\uelm{\para}{X}}}}}}---(CH_{2})_{m}---NH---Ar_{2}
donde cada uno de n y m es
independientemente un número entero de 1 a 20, p es un número entero
de 0 a 20, Ar_{1} y Ar_{2} se seleccionan independientemente
entre el grupo compuesto por bromuro de etidio, acridina,
mitoxantrona, oxazolopiridocarbazol, elipticina y
N-metil-2,7-diazapirenio,
y derivados de los mismos, y X es un grupo
reactivo.
La figura 1 muestra una realización del sistema
de liberación de polinucleótidos de la invención, donde NLS es una
secuencia de localización nuclear, MD es un componente de
permeabilización de la membrana y el ligando es un componente de
reconocimiento celular.
La figura 2 muestra la estructura de la
gramicidina S.
La figura 3 compara la eficacia de la
transfección de luciferasa con Lipofectin™, liposomas sensibles al
pH y el complejo de gramicidina S/DOPE/ADN.
La figura 4 muestra el efecto de la relación
entre gramicidina S y ADN sobre la eficacia de la transfección.
La figura 5 muestra el efecto de la relación
entre gramicidina S y DOPE sobre la eficacia de la transfección.
La figura 6 muestra el efecto del tipo de lípido
en el complejo de gramicidina S/lípido/ADN sobre la eficacia de la
transfección.
La figura 7 muestra el efecto de substituir la
gramicidina S en el complejo de gramicidina S/lípido/ADN por otros
péptidos sobre la eficacia de la transfección.
La figura 8 muestra un esquema sintético para
unir carbohidratos de dirección y/o maleimida reactiva a espermidina
bis-acridina.
La figura 9 muestra el esquema básico para
acoplar péptidos a la maleimido-espermidina
bis-acridina.
La figura 10 muestra un esquema sintético para el
acoplamiento a un péptido Lys-Lys degradable
bis-acridina.
La figura 11 muestra los resultados del ensayo de
retardo en gel del ejemplo 3.
La figura 12 muestra la capacidad de varias
galactosil bis-acridinas para unirse al ADN
plasmídico en hepatocitos.
La figura 13 muestra un esquema sintético para la
espermidina bis-acridina trigalactosilada del
ejemplo 6.
El término "polinucleótido", como se usa en
este documento, incluye las secuencias de ARN o ADN de más de un
nucleótido en forma de una sola cadena, de dúplex o de múltiples
cadenas. "Polinucleótido" es genérico para
polidesoxirribonucleótidos (que contienen
2'-desoxi-D-ribosa o
formas modificadas de la misma) es decir, ADN, para
polirribonucleótidos (que contienen D-ribosa o
formas modificadas de la misma) es decir, ARN, y para cualquier otro
tipo de polinucleótido que sea un N-glicósido o
C-glicósido de una base de purina o pirimidina, o
una base de purina o pirimidina modificada o nucleótidos abásicos.
El polinucleótido puede codificar regiones promotoras, regiones
operadoras, regiones estructurales, regiones de terminación,
combinaciones de las mismas o cualquier otro material genéticamente
relevante.
Los polinucleótidos de la invención también
pueden contener uno o más enlaces "sustitutos", como se
entiende generalmente en la técnica. Algunos de estos enlaces
substitutos son no polares y contribuyen a la capacidad deseada del
polinucleótido de difundir a través de las membranas. Otros
contribuyen a un aumento o reducción de la biodegradabilidad del
polinucleótido. (La biodegradabilidad se verá afectada, por ejemplo,
por un aumento o reducción de la sensibilidad a nucleasas). Estos
enlaces "sustitutos" se definen en este documento como enlaces
alternativos convencionales tales como fosforotioato o
fosforamidato, y se sintetizan como se describe en la bibliografía
disponible generalmente. No es necesario que todos estos enlaces
sean idénticos en el mismo polinucleótido.
También se incluyen modificaciones en el resto de
azúcar del polinucleótido, por ejemplo, donde uno o más de los
grupos hidroxilo se reemplazan por halógeno, grupos alifáticos o se
funcionalizan como éteres, aminas y similares, o donde la ribosa o
desoxirribosa se reemplaza por otras estructuras funcionalmente
equivalentes. Las modificaciones en el resto de la base incluyen
purinas o pirimidinas alquiladas, purinas o pirimidinas aciladas, u
otros heterociclos. Tales "purinas análogas" y "pirimidinas
análogas" son las conocidas generalmente en la técnica, y muchas
de ellas se usan como agentes quimioterapéuticos.
En particular, el esqueleto de
azúcar-fosfato del polinucleótido puede reemplazarse
por un esqueleto sin carbohidratos tal como un péptido u otro tipo
de esqueleto polimérico como se describe en P.E. Nielsen et al.,
Science (1991) 254:1497-1500.
La expresión "componente funcional", como se
usa en este documento, incluye componentes de enmascaramiento del
ADN, componentes de reconocimiento celular, componentes de
neutralización de carga y de permeabilización de membrana, y
componentes de localización subcelular.
La expresión "componente de enmascaramiento de
ADN", como se usa en este documento, se refiere a una molécula
capaz de enmascarar todo o parte del polinucleótido, aumentando de
esta manera su vida media en circulación por medio de la inhibición
del ataque por reactivos de degradación (tales como nucleasas)
presentes en la circulación.
La expresión "componente de permeabilización de
la membrana", como se usa en este documento, se refiere a
cualquier componente que ayuda en el paso de un polinucleótido a
través de una membrana. De esta manera, este término incluye en
parte componentes de neutralización de carga, normalmente
policationes, que neutralizan la gran carga negativa sobre los
polinucleótidos, y permiten que el polinucleótido atraviese el
interior hidrófobo de una membrana. Muchos componentes
neutralizadores de carga pueden actuar como agentes de
permeabilización de la membrana. La permeabilización de la membrana
también puede producirse con moléculas anfipáticas.
Un permeabilizador de la membrana es una molécula
que puede ayudar a una molécula normalmente impermeable a atravesar
las membranas celulares y entrar en el citoplasma de la célula. Un
permeabilizador de la membrana puede ser un péptido, sal biliar,
glicolípido, carbohidrato, fosfolípido o molécula de detergente. Los
permeabilizadores de membrana a menudo tienen propiedades
anfipáticas de tal forma que una porción sea hidrófoba y otra sea
hidrófila, permitiendo que interaccionen con las membranas.
El término "liposoma", como se usa en este
documento, se refiere a vesículas pequeñas compuestas de lípidos
anfipáticos dispuestos en bicapas esféricas. Los liposomas
normalmente se clasifican como vesículas unilamelares pequeñas
(SUV), vesículas unilamelares grandes (LUV), o vesículas
multilamelares (MLV). Las SUV y LUV, por definición, tienen sólo una
bicapa, mientras que las MLV contienen muchas bicapas concéntricas.
Los liposomas pueden usarse para encapsular diversos materiales,
atrapando moléculas hidrófilas en el interior acuoso o entre
bicapas, o atrapando moléculas hidrófobas dentro de la bicapa.
Los liposomas presentan una amplia diversidad de
características, dependiendo de su tamaño, composición y carga. Por
ejemplo, los liposomas que tienen un pequeño porcentaje de lípidos
insaturados tienden a ser ligeramente más permeables, mientras que
los liposomas que incorporan colesterol u otros esteroles tienden a
ser más rígidos y menos permeables. Los liposomas pueden tener carga
positiva, negativa o neutra, dependiendo del grupo hidrófilo. Por
ejemplo, los lípidos basados en colina imparten una carga global
neutra, los lípidos basados en fosfato y sulfato aportan una carga
negativa, los lípidos basados en glicerol generalmente tienen una
carga negativa, y los esteroles generalmente son neutros en solución
pero tienen grupos cargados.
La expresión "componente de reconocimiento
celular", como se usa en este documento, se refiere a una
molécula capaz de reconocer un componente en la superficie de una
célula diana. Los componentes de reconocimiento celular incluyen:
anticuerpos contra antígenos de la superficie celular, ligandos para
receptores de la superficie celular incluyendo los implicados en
endocitosis mediada por receptores, hormonas peptídicas y
similares.
La expresión "resto de asociación al ADN" se
refiere a una molécula o a porciones de la misma que interaccionan
de una forma no covalente con los ácidos nucleicos. Los restos de
asociación al ADN incluyen agentes de unión a los surcos
mayoritarios y minoritarios, que son moléculas que se cree que
interaccionan con el ADN por asociación con el surco mayoritario o
minoritario del ADN bicatenario. Los restos de asociación al ADN
también incluyen intercaladores de ADN, que son moléculas planas o
porciones planas de moléculas que se cree que se intercalan en el
ADN por inserción entre pares de bases de nucleótidos y en posición
paralela a estos pares de bases. Los restos de asociación al ADN
también incluyen policationes, que se cree que se asocian con las
cargas negativas del esqueleto de ADN. Cuando como cadena
terapéutica se usa un ARN o ADN monocatenario, la "cadena
enlazadora" complementaria, como se describe en este documento,
puede actuar funcionalmente como "resto de asociación al
ADN".
Los restos de asociación del ADN pueden unirse
covalentemente a través de un "grupo reactivo" a un componente
funcional de esta invención. Estos grupos reactivos reaccionan
fácilmente con un nucleófilo presente sobre el componente funcional.
Tales grupos reactivos (con sus correspondientes nucleófilos
reactivos) incluyen, pero sin limitación:
N-hidroxisuccinimida (amina), maleimida y
maleimidofenil (sulfhidrilo), piridil disulfuro (sulfhidrilo),
hidrazida (carbohidrato), y fenilglioxal (arginina).
La expresión "componente de localización
subcelular", como se usa en este documento, se refiere a una
molécula capaz de reconocer un componente subcelular en una célula
diana. Los componentes subcelulares reconocidos incluyen el núcleo,
ribosomas, mitocondrias y cloroplastos. Los componentes de
localización subcelular particulares incluyen los "componentes de
localización nuclear" que ayudan a llevar las moléculas al
interior del núcleo y se sabe que incluyen los péptidos de
localización nuclear y secuencias de aminoácidos.
Las composiciones de esta invención en parte son
sistemas de liberación de polinucleótidos de autoensamblaje que
utilizan, de acuerdo con la reivindicación 1, un polinucleótido en
combinación con un componente de permeabilización de la membrana y
preferiblemente uno o más de los siguientes componentes funcionales:
componentes de enmascaramiento del ADN, componentes de
reconocimiento celular, componentes de neutralización de carga y
componentes de localización subcelular. Cada elemento de este
sistema puede realizar su función indicada y también ser capaz de
ensamblarse o desensamblarse con el polinucleótido cuando se
requiera. También se contemplan como parte de esta invención
elementos individuales de este sistema y métodos e intermedios para
obtener estos elementos. En la figura 1 se muestra una realización
del sistema.
El polinucleótido puede ser ARN o ADN
monocatenario, ADN bicatenario o un híbrido de
ADN-ARN. También se contemplan dentro del alcance
de esta invención polinucleótidos de triple o cuádruple cadena con
valor terapéutico. Los ejemplos de ADN bicatenario incluirían genes
estructurales, genes que incluyen regiones de control y terminación
de operadores, y sistemas de autorreplicación tales como ADN
plasmídico.
Los polinucleótidos monocatenarios incluyen
polinucleótidos antisentido (ADN y ARN), ribozimas y
oligonucleótidos que forman triplex. Esta "cadena terapéutica",
para tener una actividad prolongada, preferiblemente tiene como
algunos o todos los enlaces nucleotídicos, enlaces estables que no
son fosfodiéster. Tales enlaces incluyen, por ejemplo, los enlaces
fosforotioato, fosforoditioato, fosforoselenato, u
O-alquil fosfotriéster donde el grupo alquilo es
metilo o etilo.
En el caso de estos polinucleótidos
monocatenarios, puede ser preferible preparar la cadena
complementaria a la cadena terapéutica como parte de la composición
administrada. Esta cadena complementaria se denomina "cadena
enlazadora", y normalmente se sintetiza con un enlace
fosfodiéster para que se degrade después de entrar en la célula. La
"cadena enlazadora" puede ser una cadena separada o puede estar
unida covalentemente o ser una mera extensión de la cadena
terapéutica de forma que la cadena terapéutica se doble
esencialmente e hibride consigo misma.
La cadena enlazadora también puede tener
funcionalidades en el extremo 3' o 5' o en el carbohidrato o
esqueleto del enlazador, que sirven como componentes funcionales
para aumentar la actividad de la cadena terapéutica. Por ejemplo, la
cadena enlazadora de fosfodiéster puede contener un ligando de
dirección tal como un derivado de folato que permita el
reconocimiento e internalización en las células diana. Si el
enlazador está unido a su cadena terapéutica complementaria que está
compuesta de enlaces resistentes a la degradación, el duplex se
internaliza. Una vez dentro de la célula, el enlazador se degrada
liberando la cadena terapéutica. De esta manera, la cadena
terapéutica no tiene funcionalidades adicionales unidas y su función
no se ve impedida por restos no esenciales. Esta estrategia se
podría aplicar a cualquier ribozima o polinucleótido formador de
triplex antisentido. Se podría usar para liberar polinucleótidos
antivirales, antibacterianos, antineoplásicos, antiinflamatorios,
antiproliferativos, anti-bloqueo de receptores o
anti-transporte, y similares.
Puede sintetizarse una "cadena enlazadora"
por separado que tenga la secuencia complementaria directa a la
cadena terapéutica e hibride de una forma de uno a uno. Como
alternativa, la cadena enlazadora puede construirse de forma que la
región 5' de la cadena enlazadora hibride con la región 5' de la
cadena terapéutica y la región 3' de la cadena enlazadora hibride
con la región 3' de la cadena terapéutica para formar un concatenado
de la siguiente estructura
5'--------------------
\hskip0,2cm--------------------
\hskip0,2cm--------------------
\hskip1cm3'--------------------
\hskip0,2cm--------------------
\hskip0,2cm--------------------
Este concatenado tiene la ventaja de que se
aumenta el peso molecular aparente de los ácidos nucleicos
terapéuticos y sus propiedades farmacocinéticas y la relación de
ligando de dirección: ligando terapéutico puede ajustarse para
conseguir el efecto terapéutico óptimo.
Componentes de Enmascaramiento del ADN. El
elemento de enmascaramiento de ADN de este sistema es una molécula
capaz de enmascarar todo o parte del polinucleótido, aumentando de
esta manera su vida media en circulación por medio de la inhibición
del ataque por reactivos de degradación presentes en la
circulación.
En esta invención, puede unirse covalentemente
polietilenglicol (PEG) con un resto de asociación al ADN por métodos
convencionales como se describe más adelante, y usarse como
componente de enmascaramiento del ADN. El PEG tendrá un peso
molecular de aproximadamente 700 a aproximadamente 20.000 daltons,
preferiblemente de aproximadamente 1800 a 6000 daltons, y
preferiblemente estará presente en una relación (moléculas PEG:pb de
ADN) de aproximadamente 1:4 a 1:100, más preferiblemente de
aproximadamente 1:20.
Como alternativa, el ADN puede enmascararse por
medio de la asociación con lípidos. En una realización, el ADN se
encierra en liposomas convencionales como se describe, por ejemplo,
en la Patente de Estados Unidos Nº 4.394.448 de Szoka et
al.
En otra realización, el ADN se incuba con un
lípido catiónico sintético similar a los descritos en la Patente de
Estados Unidos Nº 4.897.355 de Eppstein et al. Estos lípidos
catiónicos tienen la fórmula general
en la que n es un número entero de
1 a 8, R^{1} y R^{2} son iguales o diferentes y son alquilo o
alquenilo que tienen de 6 a 24 átomos de carbono, R^{3} es
hidrógeno, alquilo o alquilamina que tiene de 1 a 10 átomos de
carbono y R^{4} es un alquilo o alquilamina lineal o ramificado,
cargado positivamente, que tiene de 1 a 30 átomos de carbono, donde
uno o más de los átomos de carbono puede estar substituido con NR',
donde R' es hidrógeno, alquilo o alquilamina que tiene de 1 a 10
carbonos. Son grupos preferidos que pueden funcionar como resto
N-R' tris(aminoetil)amina
(NH_{2}CH_{2}CH_{2})_{3}N, agmatina
(descarboxiarginina)
H_{2}N(CH_{2})_{4}C(=NH)NH_{2},
3-aminoetil-1,3-propanodiamina
H_{2}N(CH_{2})_{3}NH(CH_{2})_{2}NH_{2},
3-dimetilaminopropilamina
(CH_{3})_{2}NH(CH_{2})_{3}NH_{2},
iminobis(N,N')dimetilpropilamina
NH((CH_{2})_{3}N(CH_{3})_{2})_{2},
iminobis(3-aminopropil)-1,3-propanodiamina,
1,4-bis(3-aminopropil)piperazina,
bis(propilamina)
(NH_{2}(CH_{2})_{3})_{2}NH, espermidina
y espermina, donde estos grupos se unen a la molécula de lípido a
través de uno de sus átomos de
nitrógeno.
En una realización preferida específicamente, el
lípido catiónico sintético es un lípido de cola catiónica sintético
que tiene la fórmula
en la que n es un número entero de
6 a 24, Y se selecciona entre el grupo compuesto por hidrógeno,
etanolamina, colina, glicerol, serina e inositol, R^{1} es alquilo
o alquenilo que tiene de 6 a 24 átomos de carbono, R^{3} es
hidrógeno, alquilo o alquilamina que tiene de 1 a 10 átomos de
carbono, y R^{4} es un alquilo o alquilamina lineal o ramificado,
cargado positivamente, que tiene de 1 a 30 átomos de carbono, donde
uno o más de los átomos de carbono puede estar substituido con NR',
donde R' es hidrógeno, alquilo o alquilamina que tiene de 1 a 10
carbonos. Son grupos preferidos que pueden funcionar como resto
N-R' tris(aminoetil)amina
(NH_{2}CH_{2}CH_{2})_{3}N, agmatina
(descarboxiarginina)
H_{2}N(CH_{2})_{4}C(=NH)NH_{2},
3-aminoetil-1,3-propanodiamina
H_{2}N(CH_{2})_{3}NH(CH_{2})_{2}NH_{2},
3-dimetilaminopropilamina
(CH_{3})_{2}
NH(CH_{2})_{3}NH_{2}, iminobis(N,N')dimetilpropilamina NH((CH_{2})_{3}N(CH_{3})_{2})_{2}, iminobis(3-aminopropil)-1,3-propanodiamina, 1,4-bis(3-aminopropil)piperazina, bis(propilamina) (NH_{2}(CH_{2})_{3})_{2}NH, espermidina y espermina, donde estos grupos se unen a la molécula de lípido a través de uno de sus átomos de nitrógeno.
NH(CH_{2})_{3}NH_{2}, iminobis(N,N')dimetilpropilamina NH((CH_{2})_{3}N(CH_{3})_{2})_{2}, iminobis(3-aminopropil)-1,3-propanodiamina, 1,4-bis(3-aminopropil)piperazina, bis(propilamina) (NH_{2}(CH_{2})_{3})_{2}NH, espermidina y espermina, donde estos grupos se unen a la molécula de lípido a través de uno de sus átomos de nitrógeno.
Se ha descubierto que los lípidos catiónicos
sintéticos descritos anteriormente enmascaran eficazmente el ADN
cuando se asocian con él. Sin intención de limitar la intención de
forma alguna, se cree que los lípidos forman una estructura de
monocapa que encapsula el ADN de alguna forma.
Componentes de Reconocimiento Celular. El
elemento de reconocimiento celular de este sistema es una molécula
capaz de reconocer un componente en la superficie de una célula
diana, unido covalentemente con un resto de asociación al ADN por
métodos convencionales como se describe más adelante. Los
componentes de reconocimiento celular incluyen: anticuerpos contra
antígenos de la superficie celular, ligandos para receptores de la
superficie celular incluyendo los implicados en endocitosis mediada
por receptores, hormonas peptídicas, etc. Los ligandos específicos
contemplados por esta invención incluyen: ligandos de carbohidrato
tales como galactosa, manosa, manosil 5-fosfato,
fucosa, grupos siálicos, N-acetilglucosamina o
combinaciones de estos grupos como carbohidratos complejos, tales
como los encontrados en glicolípidos de los grupos sanguíneos o en
diversas proteínas secretadas. Otros ligandos incluyen folato,
biotina, diversos péptidos que pueden interaccionar con receptores
de la superficie celular o intracelulares tales como el péptido
quimioatrayente
N-formil-met-leu-phe,
péptidos que contienen la secuencia
arg-asp-glicina o péptidos
cys-ser-gly-arg-glu-asp-val-trp,
péptidos que contienen un resto de cistina o que interaccionan con
proteínas de la superficie celular tales como la proteína
GP-120 del virus de la inmunodeficiencia humana, y
péptidos que interaccionan con CD-4. Otros ligandos
incluyen anticuerpos o fragmentos de anticuerpo tales como los
descritos por A. Hertler y A. Frankel, J. Clin Oncol
7: 1932-1942. La especificidad de los
anticuerpos puede dirigirse contra una diversidad de epítopos que
pueden expresarse en las superficies celulares incluyendo
macromoléculas de histocompatibilidad, antígenos autoinmunes,
proteínas virales, parasitarias o bacterianas. Otros ligandos
proteicos incluyen hormonas tales como la hormona de crecimiento e
insulina o factores de crecimiento de proteínas tales como
GM-CSF, G-CSF, eritropoyetina,
factor de crecimiento epidérmico, factor de crecimiento de
fibroblastos básico y ácido y similares. Otros ligandos proteicos
incluirían diversas citoquinas que actuarían por medio de receptores
de la superficie celular, tales como interleuquina 2, interleuquina
1, factor de necrosis tumoral y fragmentos peptídicos adecuados de
tales macromoléculas.
Componentes de Permeabilización de la
Membrana. El elemento de permeabilización de la membrana de este
sistema es una molécula que ayuda en el paso de un polinucleótido a
través de una membrana. Los liposomas y lípidos catiónicos
sintéticos descritos anteriormente como componentes de
enmascaramiento de ADN también pueden funcionar como componentes de
permeabilización de la membrana.
El componente de permeabilización de la membrana
de la invención es un péptido catiónico anfipático. Los péptidos
catiónicos anfipáticos son péptidos cuya configuración nativa es tal
que se considera que el péptido tiene una cara catiónica y una cara
hidrófoba neutra. En una realización preferida, el péptido es un
péptido cíclico. Son ejemplos de los péptidos cíclicos catiónicos
anfipáticos de esta invención gramicidina S (cuya estructura se
muestra en la figura 2) y las tirocidinas. El péptido también puede
contener algunos o todos los aminoácidos en la configuración D en
oposición a la configuración L que existe de forma natural.
En una realización particularmente preferida, el
elemento de permeabilización de la membrana incluye, además de los
péptidos cíclicos catiónicos anfipáticos, (1) un lípido o (2) una
poliamina simple, o ambas cosas.
El lípido de la invención es una molécula
anfipática que es capaz de formar liposomas, y es sustancialmente no
tóxico cuando se administra a las concentraciones necesarias en
forma nativa o como liposomas. Los lípidos adecuados generalmente
tienen un extremo polar o hidrófilo y un extremo no polar o
hidrófobo. Los lípidos adecuados incluyen, sin limitación,
fosfatidilcolina de huevo (EPC), fosfatidiletanolamina,
dipalmitoilfosfatidilcolina (DPPC), colesterol (Chol),
colesterilfosforilcolina,
3,6,9-trioxaoctan-1-colesteril-3e-ol,
dimiristoil-fosfatidilcolina (DMPC), y otros
derivados de hidroxicolesterol o aminocolesterol (véase, por
ejemplo, K.R. Patel et al., Biochim Biophys Acta (1985)
814:256-64). El lípido preferiblemente se
añade en forma de liposomas.
La poliamina añadida preferiblemente es espermina
o espermidina.
Los elementos de permeabilización de la membrana
- - el péptido cíclico y el fosfolípido y la poliamina
opcionales - - pueden añadirse a la composición simultánea o
consecutivamente. Preferiblemente, primero se añade el péptido
cíclico y posteriormente se añade el fosfolípido o la poliamina. La
relación molar entre el péptido cíclico añadido y la poliamina
añadida preferiblemente es de aproximadamente 1:1 a aproximadamente
1:3. La relación molar entre el péptido cíclico añadido y el
fosfolípido añadido preferiblemente es de aproximadamente 1:1 a
aproximadamente 1:20.
Componentes de Localización Subcelular. El
elemento de localización subcelular de este sistema es una molécula
capaz de reconocer un componente subcelular en una célula diana,
unido covalentemente con un resto de asociación al ADN por métodos
convencionales como se describe más adelante. Los componentes
subcelulares particulares incluyen el núcleo, los ribosomas, las
mitocondrias y los cloroplastos.
En una realización preferida de esta invención,
el componente de localización subcelular es un componente de
localización nuclear. El componente de localización nuclear incluye
péptidos conocidos de secuencias de aminoácidos definidas, y
secuencias más largas que contienen estos péptidos. Una secuencia
peptídica conocida es el antígeno T grande de SV 40 heptapeptídico
pro-lys-lys-lys-arg-lys-val.
Otros péptidos incluyen la nucleoproteína del virus de la influenza
decapeptídica
ala-ala-phe-glu-asp-leu-arg-val-leu-ser,
y la secuencia de la proteína EIa de adenovirus
lys-arg-pro-arg-pro.
Pueden encontrarse otras secuencias en C. Dingwall et al.,
TIBS (1991) 16:478-481.
En otra realización, el componente de
localización subcelular es un componente de localización lisosomal.
Un componente conocido para la dirección hacia el lisosoma es un
péptido que contiene la secuencia
lys-phe-glu-arg-gln.
En otra realización, el componente de localización subcelular es un
componente de localización mitocondrial. Un componente conocido para
la dirección hacia las mitocondrias es un péptido que contiene la
secuencia
met-leu-ser-leu-arg-gln-ser-ile-arg-phe-phe-lys-pro-ala-thr-arg.
El resto de asociación al ADN de este sistema se
refiere a una porción de un componente funcional que interacciona de
una forma no covalente con ácidos nucleicos. El resto se une
covalentemente al resto del componente funcional por medios
convencionales o como se describe más adelante. Los restos de
asociación al ADN preferiblemente son agentes de unión a los surcos
mayoritarios o minoritarios, intercaladores de ADN o agentes de
unión al ADN generales. En el caso de polinucleótidos
monocatenarios, el resto de asociación al ADN puede incluso ser la
cadena enlazadora que se ha descrito anteriormente. En tal caso, el
resto funcional, tal como el componente de reconocimiento celular o
de localización subcelular, se une covalentemente a la cadena
enlazadora.
En una realización preferida, el resto de
asociación al ADN es un agente de unión a los surcos mayoritarios o
minoritarios. Estos agentes de unión a los surcos mayoritarios y
minoritarios son restos que se sabe que se asocian o "se
sitúan" en el surco mayoritario o minoritario del ADN. Estos
agentes de unión incluyen distamicina A y colorante Hoechst
33258.
En otra realización, el resto de asociación al
ADN es un agente de unión al ADN no específico tal como un
policatión. Los policationes de esta invención incluyen polilisina,
poliarginina, poli(lisina-arginina) y
polipéptidos similares, y las poliaminas.
En otra realización preferida, el resto de
asociación al ADN es un intercalador de ADN. Los intercaladores de
ADN son moléculas policíclicas planas tales como bromuro de etidio,
acridina, mitoxantrona, oxazolopiridocarbazol, elipticina y
N-metil-2,7-diazapirenio,
y derivados de los mismos. En una realización particular preferida,
el intercalador es un dímero que consta de dos moléculas
policíclicas planas unidas covalentemente. Un resto dimérico
policíclico plano de esta invención tiene la estructura
Ar_{1}---NH(CH_{2})_{n}---
\uelm{N}{\uelm{\para}{\uelm{C=O}{\uelm{\para}{\uelm{\hskip-0.2cm(CH _{2} ) _{p} }{\uelm{\para}{Z}}}}}}---(CH_{2})_{m}---NH---Ar_{2}
en la que Z es un enlace, cada uno
de n y m es independientemente un número entero de 1 a 20 y p es un
número entero de 0 a 20;
y
Ar_{1} y Ar_{2} se seleccionan
independientemente entre el grupo compuesto por bromuro de etidio,
acridina, mitoxantrona, oxazolopiridocarbazol, elipticina y
n-metil-2,7-diazapirenio,
y derivados de los mismos.
Los valores de n y m son importantes ya que
determinan la separación de los monómeros de acridina intercalados
en el ADN. Los valores más preferidos de n y m son 3 y 4,
respectivamente. Se prefieren los dímeros de
bis-acridina donde tanto Ar_{1} como Ar_{2} son
acridina.
Este resto de asociación al ADN preferido se
unirá covalentemente a un resto funcional, siendo dicho resto un
resto de reconocimiento celular, un resto de localización subcelular
o un resto de permeabilización de la membrana como se ha descrito
anteriormente. El valor de p determina la separación del
intercalador del resto funcional. Son valores preferidos para p de 0
a 8.
El resto de asociación al ADN puede unirse
covalentemente a copias múltiples de un resto funcional o a más de
un resto funcional. Por ejemplo, el dímero de
bis-acridina puede unirse a tres restos de galactosa
que se unen al receptor asialoorosomucoide de hepatocitos como se
muestra en la figura 13.
En un método preferido para unir el dímero de
asociación al ADN al resto funcional está implicado un precursor que
tiene la fórmula
Ar_{1}---NH---(CH_{2})_{n}---
\uelm{N}{\uelm{\para}{\uelm{C=O}{\uelm{\para}{\uelm{\hskip-0.1cm(CH _{2} ) _{p} }{\uelm{\para}{X}}}}}}---(CH_{2})_{m}---NH---Ar_{2}
en la que cada uno de n y m es
independientemente un número entero de 1 a 20 y p es un número
entero de 0 a
20;
Ar_{1} y Ar_{2} se seleccionan
independientemente entre el grupo compuesto por bromuro de etidio,
acridina, mitoxantrona, oxazolopiridocarbazol, elipticina y
n-metil-2,7-diazapirenio,
y derivados de los mismos; y
X es un grupo reactivo seleccionado entre el
grupo compuesto por N-hidroxisuccinimida, maleimida,
maleimidofenilo, piridil disulfuro, hidrazida y fenilglioxal.
En una realización preferida, Ar_{1} y Ar_{2}
son acridina, p es 4 y X es p-maleimidofenilo. Este
resto de intercalación después se acopla al resto funcional a través
de un grupo sulfhidrilo presente en el resto funcional, por ejemplo,
para obtener un componente bifuncional que tiene la estructura
Ar_{1}---NH---(CH_{2})_{n}---
\uelm{N}{\uelm{\para}{\uelm{C=O}{\uelm{\para}{\uelm{\hskip-0.1cm(CH _{2} ) _{p} }{\uelm{\para}{X-Y}}}}}}---(CH_{2})_{m}---NH---Ar_{2}
en la que Y es un componente
funcional;
cada uno de n y m es independientemente un número
entero de 1 a 20, y p es un número entero de 0 a 20;
Ar_{1} y Ar_{2} se seleccionan
independientemente entre el grupo compuesto por bromuro de etidio,
acridina, mitoxantrona, oxazolopiridocarbazol, elipticina y
N-metil-2,7-diazapirenio,
y derivados de los mismos; y
X es un grupo reactivo seleccionado entre el
grupo compuesto por N-hidroxisuccinimida, maleimida,
maleimidofenilo, piridil disulfuro, hidrazida y fenilglioxal.
Para unir el componente funcional al intercalador
también pueden usarse enlazadores biodegradables tales como péptidos
que tienen la secuencia -lys-lys-.
En otra realización de esta invención, el dímero
policíclico plano tiene la fórmula
(aa)_{x}---
\delm{aa _{1} }{\delm{\para}{\delm{N ^{1} H}{\delm{\para}{Ar _{1} }}}}---(aa)_{y}---\delm{aa _{2} }{\delm{\para}{\delm{
N ^{2} H}{\delm{\para}{Ar _{2} }}}}---
(aa)_{z}
en la que Ar_{1} y Ar_{2} se
seleccionan independientemente entre el grupo compuesto por bromuro
de etidio, acridina, mitoxantrona, oxazolopiridocarbazol, elipticina
y
N-metil-2,7-diazapirenio
y derivados de los
mismos;
cada aa es independientemente un aminoácido;
x y z son números enteros seleccionados
independientemente de 1 a 100;
y es un número entero de 0 a 5;
aa_{1} y aa_{2} son restos de lisina; y
N^{1} y N^{2} son nitrógenos de los grupos
\in-amino de los restos de lisina aa_{1} y
aa_{2}.
El sistema de liberación de polinucleótidos de la
invención es útil en un contexto terapéutico. En aplicaciones
terapéuticas, el sistema de la invención puede formularse para una
diversidad de modos de administración, incluyendo la administración
sistémica, tópica o localizada. Pueden encontrarse técnicas y
formulaciones generalmente en Remington's Pharmaceutical
Sciences, Mack Publishing Co., Easton, PA, última edición.
En el caso de la administración sistémica, se
prefiere la administración parenteral, tal como la inyección,
incluyendo la inyección intramuscular, intravenosa, intraperitoneal
y subcutánea. Para tratar trastornos del pulmón, la administración
del sistema de liberación de polinucleótidos se realiza por
inhalación o instilación del sistema directamente en el pulmón.
Para inyección, los sistemas de la invención se
formulan en soluciones líquidas, preferiblemente en tampones
fisiológicamente compatibles tales como solución de Hank o solución
de Ringer. Además, los sistemas pueden formularse en forma sólida y
redisolverse o resuspenderse inmediatamente antes del uso. También
se incluyen formas liofilizadas.
La administración sistémica también puede
realizarse por vía transmucosa o transdérmica, o los sistemas pueden
administrarse por vía oral, o a través de aerosoles intranasales o
inhalados. Para la administración transmucosa o transdérmica, en la
formulación se usan penetrantes apropiados para la barrera a
atravesar. Tales penetrantes generalmente son conocidos en la
técnica e incluyen, por ejemplo, para la administración a través de
la mucosa, sales biliares y derivados de ácido fusídico. Además,
pueden usarse detergentes para facilitar la infiltración. La
administración a través de la mucosa puede realizarse por medio de
pulverizaciones nasales, por ejemplo, o usando supositorios. Para la
administración oral, los sistemas se formulan en formas de
administración oral convencionales tales como cápsulas, comprimidos
y tónicos.
Para la administración tópica, los sistemas de la
invención se formulan en pomadas, ungüentos, geles o cremas, como
generalmente es conocido en la técnica.
Los siguientes ejemplos pretenden ilustrar, pero
no limitar la invención.
Lipofectin™ es un lípido catiónico sintético,
dioleiloxitrimetilamonio (DOTMA) en combinación con
fosfatidiletanolamina para formar un complejo de carga con ADN
cargado negativamente. Se cree que este complejo se fusiona con la
membrana celular y libera el ADN en el interior del citoplasma. Una
estrategia alternativa usa liposomas sensibles al pH compuestos de
un lípido cargado negativamente y fosfatidiletanolamina. C.Y. Wang
et al., Biochem (1989) 28:9508-9514.
El mecanismo de liberación implica la endocitosis del liposoma, ya
que el pH del endosoma se vuelve ácido, la bicapa liposomal se
desestabiliza y se fusiona con la membrana endosómica. El contenido
del liposoma después se introduce en el citoplasma de la célula.
C.-J. Chu et al., Pharmaceut Res (1990)
7:824-834.
Hemos comparado Lipofectin™ con una composición
de liposomas sensible al pH de colesterilhemisuccinato
(Chems)/fosfatidiletanolamina (PE) y con complejos de gramicidina
S/dioleoil-fosfatidiletanolamina (DOPE)/ADN con
respecto a la liberación y expresión de ADN en células de mamífero.
Como indicadores para la transferencia génica se usaron plásmidos
que contenían promotores fuertes y luciferasa de luciérnaga o
\beta-galactosidasa.
Se proporcionaron células CV-1,
p388D1, HepG2 y HeLa por la UCSF Cell Culture Facility. El reactivo
Lipofectin™ se usó como se describe en el prospecto del producto
(Gibco-BRL, Gaithersburg, MD). Se obtuvieron células
KD83 en DNAX (Palo Alto, CA). Las células se cultivaron a una
densidad de 0,5-1 x 10^{6} células por placa de 60
mm y se dejaron crecer durante un período de 16 a 20 horas a 37ºC
con un 5% de CO_{2} en el medio apropiado que contenía un 10% de
suero de ternero fetal (FCS). Antes de la incubación con liposomas,
Lipofectin™ o el complejo de gramicidina S/DOPE/ADN, las células se
lavaron una vez con 2 ml de medio DME H-21 sin FCS.
Después se añadió el sistema de transfección en 2 ml del mismo
medio. En algunos experimentos, la transfección tuvo lugar en DME
H-21 que contenía un 10% de FCS. Después de 5 horas,
se retiró el medio y se reemplazó por 3 ml del medio apropiado con
un 10% de FCS. La actividad luciferasa se midió después de 48 horas
como se ha descrito (A.R. Brasier et al., Biotechniques
(1989) 7:1116-1122). En resumen, las células
se lavaron dos veces con solución salina tamponada con fosfato
enfriada con hielo sin Ca^{2+} y Mg^{2+} (PBS), se trataron con
400 \mul de glicilglicina 25 mM (pH 7,8) en tampón de lisis (que
contenía un 1% de Triton) y se rasparon. Después de la
centrifugación, se mezclaron 100 \mul de sobrenadante con una
cantidad óptima de ATP 50 mM. Después se inyectó
D-luciferina (Sigma, 100 \mul de una solución 1
mM) y la luz emitida se integró durante los 10 primeros segundos
usando un bioluminómetro (Bioluminescence Analytical Laboratories
Inc., San Diego, CA). Las proteínas del sobrenadante se ensayaron
usando la técnica de Bradford (kit Bio-Rad). Los
resultados se expresaron como unidades de luz por mg de proteína
celular.
Para comparar la potencia de tres promotores
virales diferentes del gen de la luciferasa, RSV, SV40 y CMV, hemos
transfectado varias líneas de células de mamífero con los
correspondientes plásmidos complejados con Lipofectin™. Cada placa
de células recibió 2 \mul de plásmido combinados con 10 \mul de
Lipofectin™ como se ha descrito anteriormente. La fuerza del
promotor se estimó por la expresión de luciferasa a las 48 horas
proporcionada por el plásmido correspondiente. El promotor de CMV
(plásmido pCluc4) condujo a la mayor expresión de la luciferasa en
células HeLa, HepG2 y p38BBD1, mientras que el promotor de SV40
(plásmido pSV2) fue más potente en células CV-1. Por
lo tanto, para experimentos adicionales, en células
CV-1 se ha usado el plásmido pSV2 y en otras líneas
celulares se ha usado pCluc4.
La eficacia de encapsulación de los plásmidos se
determinó después de la separación de los plásmidos encapsulados de
los no encapsulados en gradientes de Ficoll. Se encapsuló
aproximadamente un 22 \pm 3% del ADN total añadido. Los diámetros
de los liposomas se midieron por dispersión de luz dinámica y fueron
de 327\pm38 nm, 295\pm65 nm y 464\pm20 nm para los liposomas
DOPE/CHEMS, DOPC/CHEMS y PS/Chol respectivamente (los resultados son
la media \pm desviación típica de tres determinaciones de
dispersión de luz independientes).
Se realizó la preparación típica del complejo
diluyendo 20 \mug de ADN plasmídico en 300 \mul de Tris Cl pH 9
30 mM en un tubo de poliestireno. Se diluyó gramicidina S en tampón
Tris Cl pH 9 30 mM hasta una concentración de 2 mg/ml a partir de
una solución madre a 20 mg/ml en DMSO. Se añadieron 20 \mul de
gramicidina S diluida (es decir, 40 \mug) al ADN y se mezclaron
rápidamente. Después se añadieron lentamente 170 nmoles de liposomas
gota a gota a la mezcla de ADN y gramicidina S. Los liposomas se
prepararon secando 4 \mumoles de lípidos en una atmósfera de
nitrógeno con un evaporador rotatorio y rehidratando la película con
4 ml de tampón Tris Cl pH 9 30 mM. Los liposomas posteriormente se
sonicaron durante 30 minutos en una atmósfera de argón usando un
sonicador de baño. El diámetro del complejo se determinó por
dispersión de luz dinámica. Para formar el complejo con ADN y
lípidos también se usaron otros péptidos, incluyendo tirocidina
(U.S. Biochemicals), polimixina B (Sigma) y polilisina 100
(Sigma).
La eficacia de la transfección se controló
midiendo la expresión de luciferasa en células CV-1
como se ha descrito anteriormente. En la figura 3 se ilustra la
respuesta a la dosis comparando la cantidad de ADN añadido en los
tres sistemas de transfección. En el eje Y se representan las
unidades de luz por mg de proteína celular en una escala logarítmica
y en el eje X la cantidad de ADN añadido. El recuadro blanco designa
los resultados usando el complejo de gramicidina
S-dioleoilfosfatidil
etanolamina-ADN. Este complejo induce un nivel de
expresión diez veces mayor que el obtenido con Lipofectin, y un
nivel de expresión de 1000 a 10.000 veces mayor que el obtenido
usando los liposomas sensibles al pH.
Se preparó el complejo de gramicidina
S-DOPE-ADN como se ha descrito en el
ejemplo 1-A con la excepción de que la cantidad de
gramicidina S añadida al complejo se varió a cantidades constantes
de ADN (20 \mug) y DOPE (170 nmoles). El complejo se añadió a
células CV-1 y la actividad luciferasa se midió como
se describe en el ejemplo 1. El resultado se presenta en la figura 4
e ilustra que la expresión máxima usando el complejo de gramicidina
S-DOPE-ADN se produce cuando la
carga del ADN se neutraliza por la carga de la gramicidina.
Se preparó el complejo de gramicidina
S-DOPE-ADN como se ha descrito en el
ejemplo 1 con la excepción de que la cantidad de DOPE añadida al
complejo se varió a cantidades constantes de ADN (20 \mug) y
gramicidina S (40 \mug). El complejo se añadió a células
CV-1 y la actividad luciferasa se midió como se ha
descrito en el ejemplo 1. El resultado se presenta en la figura 5,
que ilustra que en ausencia del DOPE, la expresión es baja. Se
produce una expresión máxima usando el complejo de gramicidina
S-DOPE-ADN cuando la relación entre
DOPE y gramicidina S está por encima de 5/1:mol/mol.
Se preparó el complejo de gramicidina
S-lípido-ADN como se ha descrito en
el ejemplo 1 con la excepción de que el tipo de fosfolípido añadido
al complejo se varió a cantidades constantes de ADN (20 \mug) y
gramicidina S (40 \mug). Las composiciones de lípidos empleadas
fueron DOPE; DOPE:dioleoilfosfatidilcolina (DOPC):2/1,
palmitoiloleoilfosfatidiletanolamina (POPE), monometil DOPE
(mmDOPE); dimetil DOPE (dm DOPE); DOPC y
dipalmitoilfosfatidiletanolamina (DPPE). El complejo se añadió a
células CV-1 y la actividad luciferasa se midió como
se describe en el ejemplo 1. El resultado se presenta en la figura
6, que ilustra que la expresión de la actividad luciferasa es máxima
con DOPE o una mezcla de DOPE/DOPC:2/1 en el complejo. La actividad
luciferasa se reduce apreciablemente cuando el grupo amino del DOPE
está substituido con 2 (dm DOPE) o 3 grupos metilo (DOPC). La
expresión del gen codificado también se reduce apreciablemente
cuando se usa DPPE. Este último lípido tiene cadenas acilo saturadas
y una alta temperatura de transición, lo que significa que las
cadenas acilo de DPPE son menos fluidas que los otros lípidos
ensayados en esta serie.
Los datos presentados en el ejemplo 2 demuestran
que la expresión génica debida al complejo de gramicidina
S-DOPE-ADN es máxima cuando las
cargas negativas del ADN se neutralizan por las cargas positivas de
la gramicidina. Para determinar si es más importante la
neutralización de carga o la permeabilización de la membrana para la
transferencia génica usando este sistema, se reemplazó de forma
creciente la contribución de la carga positiva de la gramicidina S
por la poliamina cargada positivamente, espermidina. Se preparó el
complejo de gramicidina S-lípido-ADN
como se ha descrito en el ejemplo 1, con la excepción de que la
cantidad de gramicidina S añadida al complejo se varió a cantidades
constantes de ADN (20 \mug). Las cargas positivas requeridas para
neutralizar el ADN se suministraron por la espermidina. El complejo
se preparó con o sin 170 nmoles de DOPE. El complejo se añadió a
células CV-1 y la actividad luciferasa se midió como
se ha descrito en el ejemplo 1. Los resultados se proporcionan en la
tabla 1 presentada a continuación, expresándose la actividad
luciferasa como unidades de luz/mg de proteína celular. La primera
actividad siempre fue mayor cuando estaba presente DOPE en el
complejo. En ausencia de DOPE, un reemplazo secuencial de la carga
positiva debida a la gramicidina S por espermidina conduce a una
respuesta bifásica; la expresión de la luciferasa aumenta
inicialmente hasta un valor aproximadamente 100 veces menor que la
respuesta máxima obtenida en presencia de DOPE. Cuando el porcentaje
de neutralización de carga debida a la gramicidina S se redujo por
debajo del 25%, se perdió totalmente la actividad de transfección.
De esta manera, la función de permeabilización de la membrana de la
gramicidina S es más importante que la función de neutralización de
carga.
| Neutralización de Carga de la Espermidina | ||
| % de cargas aportadas por GS | sin lípidos | con lípidos |
| 100 | 4,5 \pm 2 10^{3} | 8,5 \pm 0,7 10^{8} |
| 75 | 4 \pm 2,5 10^{5} | 5 \pm 2 10^{8} |
| 25 | 2 \pm 2,5 10^{6} | 2 \pm 0,5 10^{7} |
| 12,5 | 0 | 2 \pm 0,5 10^{7} |
Se preparó el complejo de
péptido-DOPE-ADN como se ha descrito
en el ejemplo 1, con la excepción de que el tipo de péptido añadido
al complejo se varió a cantidades constantes de ADN (20 \mug) y
DOPE (170 nmoles). Los péptidos empleados fueron polimixina B, un
péptido catiónico cíclico; polilisina, un péptido catiónico lineal;
tirocidina, un péptido catiónico cíclico con una estructura similar
a la de la gramicidina S pero que sólo contenía una carga positiva,
y gramicidina S. El plásmido de luciferasa también se introdujo en
las células por transfección usando Lipofectin. El complejo se
añadió a células CV-1 y la actividad luciferasa se
midió como se ha descrito en el ejemplo 1. La figura 7 demuestra que
la gramicidina S inducía el mayor nivel de expresión, seguida de
cerca por el péptido cíclico relacionado tirocidina. Los dos
péptidos cíclicos fueron superiores a Lipofectin en la transferencia
del ADN al interior de las células. También se observó actividad con
los otros dos péptidos, polimixina B y polilisina, sin embargo, el
nivel de expresión de luciferasa mediada por estos dos péptidos
catiónicos fue inferior a la inducida por la gramicidina S o la
tirocidina.
Para encontrar alternativas mejor definidas
químicamente a los polímeros de poliamina tales como la polilisina,
hemos empleado macromoléculas policatiónicas ramificadas hidrófilas
también conocidas como micropartículas de dendrímero Starburst™,
Tomalia et al., supra, para formar un complejo con ADN o con
ADN y el péptido anfipático de permeabilización GALA. R. Parente
et al., Biochemistry (1990)
29:8720-8728. El complejo se preparó
diluyendo 12 \mug del plásmido pCLUC4 en 660 \mul de HBS (Hepes
20 mM, NaCl 150 mM, pH 7,4) en un tubo de poliestireno. Se
disolvieron polilisina (Sigma Chemical Co.) o micropartículas de
dendrímero Starburst™ de la quinta generación (1 nmol)
(Polysciences, Inc) en 340 \mul de HBS y se añadieron lentamente
(gota a gota) a la solución de ADN. En estas condiciones, las cargas
positivas de los grupos epsilon-amino de las
polilisinas o de las aminas periféricas de los dendrímeros están en
un exceso de 1,3 veces con respecto a las cargas negativas de los
plásmidos. Cuando se añadió el péptido GALA, se añadió de forma que
las cargas negativas de GALA neutralizaran las cargas en exceso del
dendrímero. La mezcla se dejó en reposo durante 30 minutos después
de la última adición a temperatura ambiente, y después se añadieron
500 \mul de la mezcla a células CV-1. El protocolo
de transfección se realizó como se ha descrito anteriormente. En
este experimento, el mejor protocolo de transfección se realizó con
el complejo GALA-dendrímero-ADN,
seguido de dendrímero-ADN y después de
polilisina-ADN (tabla 2).
| Transfección mediada por ADN-Dendrímero | |
| Condición | Iluminaciones de luciferasa (unidades por mg de proteína celular) |
| Dendrímero-GALA-ADN | (9 \pm 2) x 10^{5} (n = 2) |
| Dendrímero-ADN | (5 \pm 2) x 10^{5} (n = 2) |
| Polilisina-ADN | (2,7 \pm 0,1) x 10^{5} (n = 2) |
Los derivados de espermidina
bis-acridina (la síntesis se muestra en la figura 8)
se intercalan en ácidos nucleicos bicatenarios con constantes de
afinidad mayores que 1 x 10^{4} (pH 7,4; NaCl 0,2 M) y pueden
usarse para unir una diversidad de moléculas de dirección al ADN.
Como ligandos de dirección pueden usarse carbohidratos, péptidos,
hormonas, vitaminas, cofactores, proteínas o anticuerpos.
El esquema para dirigir los ácidos nucleicos a
ciertos sitios del cuerpo se basa en la intercalación de un ligando
que interacciona con un componente de la superficie celular en el
ADN bicatenario. Se ha informado sobre un procedimiento para la
N^{4}-acilación selectiva de la espermidina,
usando N^{1}, N^{8}-bis
(t-butoxicarbonil) espermidina como material de
partida. R.J. Bergeron et al., Synthesis (1982)
689-692. Hemos usado este procedimiento (figura 8)
para asociar los derivados de galactosilo funcionalizados con ácido
9 y 9' al grupo amino secundario de la
N^{1},N^{8}-espermidina
Boc-protegida (15), y las espermidinas
galactosiladas resultantes 17 y 17', después de la desprotección, se
alquilaron adicionalmente con 9-fenoxiacridina por
un procedimiento químico convencional para transformarlas en
compuestos bis-intercaladores 21 y 21'. La síntesis
de los derivados de galactosilo funcionalizados con ácido
carboxílico se detalla (J. Haensler et al., Biochim Biophys
Acta (1988) 946:95-105) y es fácilmente
aplicable a una amplia serie de ligandos constituidos por
carbohidratos (M.M. Ponpipom et al., J Med Chem (1981)
24:1388-1395). Los compuestos del título se
obtuvieron con un rendimiento total del 30% y los datos de RMN y de
espectrometría de masas son coherentes con la estructura
propuesta.
Basándose en el esquema anterior, se ha creado un
método versátil para unir péptidos a un derivado de espermidina
bis-acridina. Se N^{4}-aciló
N^{1},N^{8}-bis(t-butoxicarbonil)espermidina
con
N-succinimidil-4-(p-maleimidofenil)butirato
(SMPB) (4), se desprotegió y se acopló a anillos de acridina para
obtener un bis-intercalador que llevaba un grupo
maleimida (20). Se obtuvo un solo compuesto después de la
purificación cromatográfica en ácido silícico con un rendimiento
total del 25%. Los resultados de la RMN y de la espectrometría de
masas son coherentes con la estructura asignada.
El péptido NLS PKKKRKV (Kaneda et al.,
supra) y péptidos de control con la misma composición pero con
una secuencia diferente se han sintetizado en un sintetizador de
péptidos automático ABI con un resto de cisteína
N-terminal. El cisteína-péptido
después se une al intercalador que lleva maleimida (figura 9) y
puede anclarse a ácidos nucleicos bicatenarios.
Se sintetizan enlazadores biodegradables que
constan de un enlace peptídico lys-lys de la manera
mostrada en la figura 10. En la figura, se pone un resto de
galactosa sobre la amina desprotegida. Como alternativa, se
sintetiza un péptido protegido que contiene dos restos de lisina
adyacentes por síntesis en fase sólida. El péptido lleva funciones
de permeabilización de la membrana o funciones de dirección y se
añaden restos de acridina a los dos grupos
\in-amino de las lisinas.
Para demostrar que las
bis-acridinas galactosiladas 21 y 21' del ejemplo 2
(21' es el homólogo de 21 donde la galactosa está separada de la
espermidina bis-acridina por tres carbonos extra)
pueden interaccionar con un receptor soluble mientras están unidas
al ADN, usamos un ensayo de desplazamiento en gel. En este ensayo se
incubó una proteína de unión a galactosa, lectina de Ricinus
communis RCA_{120}, con el complejo de
galactosil-bis-acridina-ADN.
Si esta proteína interacciona con el complejo y el complejo
permanece asociado con el ADN, el ADN no migra al interior del gel
de electroforesis. Cada muestra del plásmido pC LUC4 (2 \mul; 140
ng) se mezcló con 13,5 pmoles de 21 o 21' y se añadió 1 \mul (33,3
pmoles) de RCA_{120} con un exceso de galactosa libre (1,35
nmoles) cuando está indicado. Después de 30 minutos de incubación a
temperatura ambiente, las muestras se sometieron a electroforesis a
través de un gel de agarosa al 0,8% usando un sistema tampón
Tris-acetato 0,04 M (pH 7,6) y se tiñeron con
bromuro de etidio para visualizar el ADN (figura 11).
La intercalación de las espermidina
bis-acridinas galactosiladas en el plásmido pC LUC4
se demuestra por el retraso observado para el plásmido cuando formó
complejos con los compuestos 21' (calle B) o 21 (calle E). La
intercalación de la bis-acridina en el ADN produce
un cambio desde la forma superenrollada a una forma circular
relajada, que migra más lentamente.
La capacidad del complejo de
plásmido-galactosa para unirse a un receptor soluble
para la galactosa se muestra por el retraso casi completo del
complejo en presencia de la lectina de Ricinus communis
RCA_{120} (calles C y F). RCA_{120} es un dímero y tiene dos
sitios de unión selectivos para los restos de
\beta-D-galactosilo terminales,
por lo que también puede formar enlaces cruzados con los complejos
de plásmido-galactosa. La interacción de RCA_{120}
con el plásmido pC LUC4 cuando forma complejos con los compuestos 21
o 21', ocasiona la formación de agregados grandes que no penetran en
el gel. Cuando el plásmido forma complejos con 21' esta interacción
parece ser mucho más eficaz que cuando forma complejos con 21. Para
formar enlaces cruzados con los plásmidos, RCA_{120} tiene que
superar las repulsiones electrostáticas existentes entre plásmidos
adyacentes. De esta manera, al separar la galactosa de la superficie
de los plásmidos por un brazo espaciador, como ocurre en los
complejos obtenidos con el compuesto 21', se facilita la unión de la
lectina. Como resultado de una interacción multivalente, los
agregados de plásmido formados por RCA_{120} son muy estables y no
se disocian por un exceso de 100 veces de un ligando monovalente
competitivo tal como galactosa (calles D y G).
La afinidad de las bis-acridinas
por ADN de timo de ternero se calculó a partir del desplazamiento de
bromuro de etidio desde ácidos nucleicos bicatenarios (Nielsen,
supra). El desplazamiento de etidio se controló por la
reducción de la fluorescencia de bromuro de etidio (ex. = 540 nm,
em. = 610 nm) que se produce cuando se libera desde el ADN. Las
constantes de asociación de las bis-acridinas con
respecto al bromuro de etidio se calculan a partir de su IC_{50}.
En este estudio, como compuesto de referencia se usó triclorhidrato
de espermidina bis-acridina
(SBA-3HCl) sintetizado como se describe (Nielsen,
supra). Como resultado de la pérdida de una de sus tres
cargas positivas, se observa una reducción ligera pero significativa
en la afinidad cuando el grupo N^{4} amino de la espermidina
bis-acridina se encaja en un enlace amida con el
carbohidrato de dirección del compuesto 21
(Gal-BA-2HCl). Sin embargo,
predecimos un aumento de afinidad cuando la espermidina
bis-acridina se une al péptido NLS PKKKRKV con una
alta carga positiva. G. Karup et al., Int J Peptide Protein
Res (1988) 32:331-343. En la tabla 3 se
proporcionan conjugados sintetizados para unir ligandos de dirección
al ADN en los diversos ejemplos.
| Constante de Disociación de las Bis-acridinas de ADN de Timo de Ternero (en M) | |
| SBA\cdot3HCl | 2,4 X 10^{-8} |
| Gal-3-bA^{1} | 3,5 X 10^{-7} |
| Gal-6-bA^{2} | 7,9 X 10^{-7} |
| Gal_{3}Lys_{2}-bA^{3} | 5,4 X 10^{-6} |
| Maleimido-bA^{4} | 6,5 X 10^{-7} |
| WTcys-bA^{5} | 1,4 X 10^{-7} |
| SNL-bA^{6} | 1,4 X 10^{-7} |
| ^{1}Compuesto 21 donde n=3 | |
| ^{2}Compuesto 21 donde n=6 | |
| ^{3}Compuesto 26 (mostrado en el ejemplo 6) | |
| ^{4}Compuesto 20 | |
| ^{5}SBA unida a CGYGPKKKRKVGG | |
| ^{6}SBA unida a CGYKPKVRGKGKG |
Las constantes de unión para las diversas
bis-acridinas se calculan a partir de un ensayo de
desplazamiento de bromuro de etidio usando un método para determinar
la afinidad de unión de un tetrámero por una red lineal por medio de
unión competitiva no cooperativa con un dímero (A. Wolfe y T.
Meehan. J. Mol. Biol. 223, 1063-1087, 1992) y una
constante de disociación intrínseca de 5,3 X 10^{-6} M para el
bromuro de etidio.
Para demostrar los factores que controlan la
capacidad de dirección de los intercaladores de
bis-acridina que contienen un ligando de dirección
de galactosilo, se aislaron hepatocitos de rata a partir de hígado
de rata y se pusieron en cultivo a una densidad de 10^{6}
hepatocitos en placas petri de 60 mm en 3 ml de medio MEM que
contenía un 5% de suero de ternero fetal y antibióticos. Se
demuestra que los hepatocitos tienen receptores de galactosa por
medio de la unión de asialoorosomucoide. Después de 18 horas a 37ºC,
el medio se retira y se reemplaza por 1 ml de MEM. Después, a la
placa de cultivo se le añade 1 \mug de ADN plasmídico marcado con
^{125}I complejado con BA\cdot3HCl,
Gal-3-bA,
Gal-6-bA o
Gal_{3}-Lys_{2}-bA en 100 \mul
de agua. La relación entre intercalador y plásmido fue de 500:1 o
1000:1. Las células se incubaron durante 1 hora más a 37ºC, después
se aclararon y la proteína se digirió en 1 ml de NaOH (1 N). En el
lisado celular se contó la radiactividad y se midió la proteína. La
cantidad de plásmido asociado a la célula se expresa como ng de
plásmido por mg de proteína celular y se representa como una función
del agente complejante (figura 12). Aunque los tres compuestos de
galactosil bis acridina se unen al ADN (tabla 2) y pueden
interaccionar con una proteína de unión a galactosa soluble (ejemplo
3), sólo el Gal_{3}-Lys_{2}-bA
pudo interaccionar con el receptor de la superficie celular. De esta
manera, una dirección eficaz a receptores de la superficie celular
requiere un brazo espaciador más largo, ya que el proporcionado por
la Gal_{3}-Lys_{2}-bA podía
interaccionar con el receptor de la superficie celular (síntesis
mostrada en la figura 13 y en el ejemplo 6).
La síntesis completa de esta molécula se muestra
en la figura 13.
Síntesis de bis-trifluoroacetato
de L-lisil-L-lisina
(22): Se mezclaron
N-\in-BOC-L-lisina
(603 mg, 2,45 mmol) y
N-N-\in-bis-BOC-L-lisina-p-nitrofenil
éster (2,28 g; 4,9 mmol) en 40 ml de N-metil
morfolina que contenía 640 \mul de N,N diisopropiletilamina (3,7
mmol). La mezcla se agitó durante una noche a temperatura ambiente
en una atmósfera de argón, se filtró para retirar las trazas
insolubles de
N-\in-BOC-L-lisina
que no había reaccionado y se evaporó a sequedad a alto vacío. El
residuo se purificó en una columna de gel de sílice eluida con el
sistema CHCl_{3}/CH_{3}OH/H_{2}O 9:1:0,1 para producir 1,22 g
de dímero de lisina protegida con BOC puro; rendimiento 87%.
Desprotección: En un matraz enfriado (hielo seco)
que contenía 700 mg (1,2 mmol) del dímero de lisina protegido con
BOC se añadieron 5 ml de TFA. La mezcla se calentó a temperatura
ambiente y se agitó en una atmósfera de argón. Después de 30 minutos
de agitación, el ácido trifluoroacético se evaporó al vacío. El
residuo se recogió en acetona y se evaporó (5 veces). Finalmente, el
residuo se redisolvió en 14 ml de agua, se extrajo tres veces con 8
ml de cloroformo y se liofilizó para dar 480 mg del compuesto del
título; rendimiento 80%.
Dímero de trigalactosil lisina protegida:
Síntesis de N\alpha-[N\alpha,
N\in-Bis(6-(1-tio-2,3,4,6,-tetra-O-acetil-\beta-D-galactopiranosil)hexanoil]-L-lisil-N\in-(6-1-tio-2,3,4,6,-tetra-O-acetil-\beta-D-galactopiranosil)hexanoil]-L-Lisina
(23). A una solución de bis-trifluoroacetato de
L-lisil-L-Lisina
(400 mg; 0,8 mmol) en 8 ml de DMF anhidra que contenía 505 \mul de
trietilamina (3,6 mmol) se le añadió
6-(1-tio-2,3,4,6-tetra-O-acetil-\beta-D-galactopiranosil)hexanoato
de p-nitrofenilo (1,44 g; 2,4 mmol). La mezcla se
agitó durante una noche en una atmósfera de argón y se evaporó a
sequedad. El residuo se purificó por cromatografía en una columna de
gel de sílice eluida con CHCl_{3}/CH_{3}OH/H_{2}) 90:10:0,5
para dar 463 mg del compuesto del título: rendimiento 35%.
MS: Calculado para
C_{73}H_{112}N_{4}O_{32}S_{3} m/z = 1652,
encontrado m/z = 1653,6 (M+H)^{+}, m/z =
1677,6 (M+Na)^{+}, m/z = 1693,6 (M+K)+.
Reacción con espermidina bloqueada
selectivamente:
N4-[N\alpha-[N\alpha,N\in-Bis(6-(1-tio-2,3,4,6-tetra-O-acetil-\beta-D-galactopiranosil)hexanoil]-L-lisil-N\in-(6-1-tio-2,3,4,6-tetra-O-acetil-\beta-D-galactopiranosil)hexanoil]-L-lisil]-N1,N8-bis-BOC-espermidina.
(24).
El compuesto 23 (132 mg; 80 \mumol) se activó
por esterificación con N-hidroxisuccinimida (11 mg,
96 \mumol) en presencia de DCC (20 mg; 97 \mumol) en 5 ml de
cloruro de metileno anhidro. Después de 4 horas de agitación a
temperatura ambiente en una atmósfera de argón, el precipitado de
urea se retiró por filtración y el filtrado se evaporó al vacío. El
residuo seco se redisolvió en 3 ml de acetonitrilo y se añadió gota
a gota a una solución de clorhidrato de N1,
N8-bis(t-butoxicarbonil
espermidina) (30 mg; 80 \mummol) en 3 ml de acetonitrilo que
contenía 14 \mul de trietilamina (100 \mul). La mezcla se agitó
adicionalmente durante 48 horas a temperatura ambiente en una
atmósfera de argón, y se evaporó al vacío hasta que se obtuvo un
residuo que se purificó en una columna de gel de sílice eluida con
CHCl_{3}/CH_{3}OH/H_{2}O 90:10:1 para producir 71 mg del
compuesto del título; rendimiento 45%.
Desprotección: síntesis de
N4-[N\alpha-[N\alpha,N\in-Bis(6-(1-tio-\beta-D-galactopiranosil)hexanoil]-L-lisil-N\in-(6-(1-tio-\beta-D-galactopiranosil)hexanoil]-L-lisil]espermidina
(25). El compuesto 24 (71 mg; 36 \mumol) se desprotegió como se ha
descrito previamente para el compuesto 11. Los grupos protectores
BOC se retiraron del enlazador de espermidina por tratamiento con 5
ml de TFA durante 30 minutos y los grupos protectores acetilo se
retiraron de los grupos de cabeza de galactosilo por tratamiento
durante una noche con una mezcla de CH_{3}OH/NEt_{3}/H_{2}O
5:4:1. La sal bis-trifluoroacetato del derivado de
espermidina se convirtió en la amina libre pasando una solución
acuosa de la sal a través de una columna BIO-RAD AG
1X2 (OH^{-}) pequeña. Las fracciones positivas para los
carbohidratos y las aminas se reunieron y se liofilizaron. Se
obtuvieron 36 mg del compuesto 25; rendimiento 79%.
Unión de acridina: Síntesis de
N4-[N\alpha-[N\alpha,N\in-Bis(6-(1-tio-\beta-D-galactopiranosil)hexanoil]-L-lisil-N\in-(6-1-tio-\beta-D-galactopiranosil)hexanoil]-L-lisil]-N1,N8-bis-acridina
espermidina. (26)
("Gal_{3}-Lys_{2}-bA").
Se disolvieron compuesto 25 (36 mg; 28,5
\mumol) y 18 mg de 9-fenoxiacridina en 3 g de
fenol a 80ºC y la solución se agitó adicionalmente durante 2 h a
80ºC en una atmósfera de argón. La mezcla después se enfrió a
aproximadamente 40ºC y se vertió en 15 ml de éter para precipitar
las aminoacridinas. El precipitado amarillo se recogió por
filtración en un papel de filtro y se redisolvió en 4 ml de una
mezcla de butanol/metanol 3:1. Esta solución después se condensó por
evaporación hasta aproximadamente 1 ml y el derivado de
bis-acridina se aisló por cromatografía en un gel de
sílice 6:2:1:2. Se obtuvieron 34 mg del compuesto del título;
rendimiento 21%; MS: Calculado para
C_{81}H_{117}N_{9}O_{20}S_{3} m/z = 1631,
encontrado m/z = 1632,8 (M+H)^{+}, m/z =
1654,8 (M+Na)^{+}.
Se añadieron 5 \mul de tampón TE que contenía
una pequeña cantidad de un plásmido radioyodado de 5Kb
(CMV-\betaGal) y 50 \mul de agua que contenían 8
nmoles del conjugado de péptido de localización
nuclear-bis-acridina del ejemplo
2-C, a 80 \mug de pCLUC4 (123 neq. pb) en solución
en 45 \mul de tampón TE (pH 8). La relación entre el plásmido y el
conjugado de péptido fue de 1:300. Después de 1 hora en reposo a
temperatura ambiente, se añadieron 100 \mul de tampón
Tris-Cl (pH 9) al complejo y la solución resultante
se mezcló con 12 \mumoles de lípidos (relación molar DOPE/CHEMS
2:1) disueltos en 600 \mul de éter para la preparación de
liposomas sensibles al pH.
Las vesículas que contenían los complejos de
ADN-péptido se separaron del material no encapsulado
por flotación de los liposomas a través de un gradiente de Ficoll.
La eficacia de encapsulación (20% \pm 4%) se determinó por
dispersión de luz dinámica (Coulter N4, Coultronics).
Las células se transfectaron con 4 \mul de
plásmido encapsulado en liposomas (100 \mul de la solución de
liposomas) durante 5 horas a 37ºC y la actividad luciferasa se contó
después de 48 horas en un bioluminómetro. La tabla 4 muestra las
unidades de luz medida/mg de proteína celular en función del
contenido de liposomas. Los valores son las medias de tres
determinaciones.
| Contenido de Liposomas | ||
| complejo de plásmido solo | complejo de plásmido WTcys-bA | plásmido-SNL-bA |
| (0,32 \pm 0,02) 10^{6} | (0,82 \pm 0,36) 10^{6} | (1,36 \pm 0,28) 10^{6} |
| Control positivo: Lipofectin™ = (1,4 \pm 0,2) 10^{8}. |
Si admitimos que los liposomas sensibles al pH
liberan su contenido en el citoplasma de la célula hospedadora, el
plásmido desnudo debe poder atravesar el núcleo.
Si excluimos que los conjugados de
péptido-bis-acridina protegen al ADN
de la degradación, el aumento de transfección observado debe ser el
resultado de una mayor entrada en el núcleo. El aumento de la
transfección de 4-5 veces coincide con los
resultados publicados (Kaneda et al., supra que usan
proteínas que se unen al ADN para aumentar la entrada del ADN en el
núcleo. Tanto el péptido SNL como el péptido WTcys aumentan la
expresión y son una técnica conveniente para dirigir el ADN al
interior del núcleo.
La síntesis de bis-acridina
espermidina acoplada a PEG sigue la química convencional e implica
las siguientes etapas:
R'O-(CH_{2}-CH_{2}-O)_{n}-H- - - - -Agente
de
activación- ->
R'O(CH_{2}-CH_{2}-O)_{n}-R*- - - - -bis-acridina- - - - ->
R'O-(CH_{2}-CH_{2}-O)_{n}-R-Bis
acridina donde R' = H o CH_{3} y R* = grupo de activación y n =
10-250, preferiblemente 20-60.
Hay muchos métodos para preparar moléculas de
monometoxi-PEG activadas o moléculas de PEG
activadas. D. Larwood y F. Szoka, J Labelled Comp &
Radiopharm (1984) 21:603-614 han descrito
un método preferido. Se preparó polietilenglicol 1900
carbonil-imidazol metil éter poniendo 530 mg (0,28
mmol) de PEG 1900 monometil éter seco en 2 ml de cloruro de metileno
seco y añadiendo 78 mg (0,46 mmol) de carbonildiimidazol y 10 mg
(0,11 mmol) de imidazol (sal de sodio). Después de agitar durante
una noche, se añadieron 6 ml de cloruro de metileno seco, la mezcla
se extrajo con 3,75 ml de agua y después se secó con sulfato sódico
anhidro. Después de la filtración, se retiró el disolvente con un
rendimiento cuantitativo. Como alternativa, el disolvente se retiró
y el aceite resultante se recristalizó en cloroformo/éter dietílico
a -20ºC. Los cristales blancos de carbamato de imidazol resultantes
se filtraron a través de un embudo enfriado, se aclararon con una
pequeña cantidad de éter dietílico y se usaron inmediatamente.
El carbamato de imidazol (0,1 mM) se añadió a una
concentración 0,125 mM de
N,N'-bis-(9-acridinil)-4-aza-1,8-diaminooctano
("bis acridina-espermidina", preparado como se
describe por P. Nielsen, Eur. J. Biochem.
122:283-289, 1992) disuelto en fenol y la reacción
se procesó a 80ºC en una atmósfera de argón durante 2 horas. La
mezcla se llevó a sequedad y el producto amarillo se lavó con etanol
frío y después con éter dietílico. El PEG se acopló a través de un
enlace carbamato a la amina secundaria de la
bis-acridina espermidina para formar la monometoxi
PEG-bis acridina espermidina, que soluble en
agua.
De una forma similar, el PEG no bloqueado (peso
molecular 6000) se activó como se ha indicado anteriormente para
formar el bis-imidazol carbamato PEG. El
bis-imidazol carbamato PEG se hizo reaccionar con un
exceso de 2,5 veces de bis-acridina espermidina para
formar el complejo bis(bis-acridina
espermidina)-PEG 6000.
En la patente de Estados Unidos 5.013.556 de
Woodle et al. se han descrito diversos tipos de activadores
para PEG y monometoxi PEG. Estos métodos pueden usarse para generar
PEG reactivos que puedan unirse a la molécula de
bis-acridina por medio de una diversidad de
químicas. Por ejemplo, un sulfhidrilo que contiene
monometoxi-PEG puede unirse a la
bis-acridina que contiene maleimida del ejemplo
2-B.
Las moléculas de PEG pueden usarse para
enmascarar la superficie del ADN y permitir que el ADN circule
durante un período más prolongado. Se mezcla ADN plasmídico
radioyodado con
monometoxi-PEG-1900-bis-acridina
espermidina, como se sintetizó en el ejemplo 8, en una relación de
20 pb de ADN por una molécula de PEG, durante 30 minutos a
temperatura ambiente. En cada grupo de 12 ratones se inyecta a
través de la vena de la cola una alícuota del complejo, 5 \mug de
ADN en 0,2 ml de PBS. Los ratones se sacrifican a diversos períodos
después de la inyección. Se extraen la sangre y otros órganos y se
determina la radiactividad asociada con cada órgano. El ADN que no
se ha complejado con la
monometoxi-PEG-bis-acridina-espermidina
se inyecta en un segundo grupo de ratones, denominados ratones de
control. La evidencia que demuestra que después de 10 minutos, en la
sangre de los ratones de control permanece un 15% del ADN plasmídico
radiactivo mientras que en el grupo de monometoxi
PEG-bis acridina espermidina ADN permanecen en la
circulación niveles significativamente mayores del complejo de
plásmido radiomarcado-PEG, indica un efecto de
enmascaramiento pronunciado de la molécula de ADN por la PEG bis
acridina espermidina.
La síntesis de lípidos de enmascaramiento de
polinucleótidos se realiza por medio de la química convencional, tal
como se describe en C. Pidgeon et al., Anal Biochem (1989)
176:36-47.
1. ácido
1,12-dodecanodicarboxílico +
DCC
- - - THF, 25ºC
- - - - ->
anhídrido de ácido
dodecanodicarboxílico (anhídrido
cíclico)
2. monoacil lisolecitina +
anhídrido
cíclico
- - - - -
CHCl_{3}, DMAP, 25ºC 48 h
- - - - ->
Lecitina -
COOH
3. Lecitina-COOH +
carbonildiimidazol
- - - -
CHCl_{3}, 25ºC, 2 h
- - ->
Lecitina
imidazolida
4. Lecitina imidazolida + reactivo
de
amina
- - - -
CHCl_{3}, 25ºC, 24 h
- - ->
lecitina
catiónica
La reacción final del reactivo de amina con la
lecitina imidazolida se realiza inmediatamente después de la
formación de la lectina imidazolida. La lecitina imidazolida (0,1
mM) se añade a una solución de la amina (0,7 mM) en cloroformo. En
la memoria descriptiva se indican aminas adecuadas para este
acoplamiento.
Después de dos horas a temperatura ambiente, la
mezcla de reacción se añade a un volumen de dos veces de
agua/metanol y el pH se ajusta a 10. La amina unida a la lecitina se
extrae en la fase orgánica. La fase orgánica después se lava con
cloruro sódico 0,1 M y la fase orgánica se lleva a sequedad. La acil
amina lecitina resultante se usa para enmascarar la superficie del
polinucleótido. Pueden usarse diversas moléculas de lisolecitina
para preparar la lecitina-COOH, incluyendo dodecilo,
miristoílo, palmitoílo, oleílo o fitanilo, o estearilo. La lecitina
puede substituirse por otros grupos de cabeza tales como etanolamina
o ácido fosfatídico si se protegen convenientemente en las etapas de
activación y se desprotegen al final de la reacción.
La lecitina acil amina del ejemplo 10 puede
añadirse a ADN desde una solución de etanol en una relación de una
carga positiva por cada grupo fosfato del ADN. La molécula puede
usarse para enmascarar la superficie del ADN y permitir que el ADN
circule durante un período más prolongado. Se inyecta una alícuota
del complejo, 5 \mug de ADN en 0,2 ml de PBS, a través de la vena
de la cola en cada grupo de 12 ratones. Los ratones se sacrifican a
diversos períodos después de la inyección. Se extraen la sangre y
otros órganos y se determina la radiactividad asociada con cada
órgano. El ADN que no se ha complejado con la lecitina acil amida se
inyecta en un segundo grupo de ratones, denominados ratones de
control. La evidencia que demuestra que después de 10 minutos, en
los ratones de control permanece en la sangre el 15% del ADN
plasmídico radiactivo, mientras que en el grupo de monometoxi
PEG-bis acridina espermidina ADN permanecen en la
circulación niveles significativamente mayores del complejo de
plásmido radiomarcado-PEG, indica un efecto de
enmascaramiento pronunciado de la molécula de ADN por la lecitina
acil amina.
Claims (27)
1. Una composición para presentar un
polinucleótido a un componente subcelular de una célula eucariota,
comprendiendo dicha composición el polinucleótido asociado con un
componente de permeabilización de la membrana capaz de transportar
el polinucleótido a través de la membrana citoplásmica de dicha
célula eucariota, donde dicho componente de permeabilización de la
membrana es un péptido catiónico anfipático.
2. La composición de la reivindicación 1, donde
dicho péptido es un péptido cíclico.
3. La composición de la reivindicación 2, donde
dicho péptido cíclico se selecciona entre el grupo compuesto por
gramicidina S y tirocidinas.
4. La composición de la reivindicación 3, donde
dicho péptido cíclico es gramicidina S.
5. La composición de cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 4, que comprende además un fosfolípido.
6. La composición de la reivindicación 5, donde
dicho fosfolípido es una fosfatidiletanolamina.
7. La composición de la reivindicación 6, donde
dicha fosfatidiletanolamina es dioleoil fosfatidiletanolamina.
8. La composición de la reivindicación 5, donde
dicho fosfolípido está en forma de liposomas.
9. La composición de cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 8, que comprende además un policatión.
10. La composición de la reivindicación 9, donde
dicho policatión es una poliamina.
11. La composición de la reivindicación 10, donde
dicho poliamina se selecciona entre el grupo compuesto por
espermina, espermidina,
3,3'-diamino-bispropilamina,
iminobis(N,N)-dimetilpropilamina,
iminobis(3-aminopropil)-1,3-propanodiamina,
y dendrímeros catiónicos.
12. La composición de cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 11, para presentar un polinucleótido a un
componente subcelular de una célula eucariota que comprende el
polinucleótido asociado con un componente de reconocimiento celular
capaz de reconocer dicha célula eucariota.
13. La composición de la reivindicación 12, donde
dicho componente de reconocimiento celular comprende un ligando para
un receptor de la superficie celular en dicha célula eucariota,
acoplándose dicho ligando a un resto de asociación al ADN.
14. La composición de la reivindicación 13, donde
dicho resto de asociación al ADN es un agente intercalador.
15. La composición de la reivindicación 13, donde
dicho resto de asociación al ADN es un agente de unión a los surcos
mayoritarios o minoritarios.
16. La composición de la reivindicación 14, donde
dicho agente intercalador tiene la fórmula
Ar_{1}---NH(CH_{2})_{n}---
\uelm{N}{\uelm{\para}{\uelm{C=O}{\uelm{\para}{\uelm{\hskip-0.2cm(CH _{2} ) _{p} }{\uelm{\para}{Z}}}}}}---(CH_{2})_{m}---NH---Ar_{2}en la
que
Z es un enlace;
cada uno de n y m es independientemente un número
entero de 1 a 20, y p es un número entero de 0 a 20; y
Ar_{1} y Ar_{2} se seleccionan
independientemente entre el grupo compuesto por bromuro de etidio,
acridina, mitoxantrona, oxazolopiridocarbazol, elipticina y
N-metil-2,7-diazapirenio,
y derivados de los mismos.
17. La composición de la reivindicación 16, donde
dicho agente intercalador se acopla a una pluralidad de
ligandos.
18. La composición de cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 11 para presentar un polinucleótido a un
componente subcelular de una célula eucariota, que comprende el
polinucleótido asociado con un componente de localización subcelular
capaz de suministrar el polinucleótido desde el citoplasma de dicha
célula eucariota a un componente subcelular de dicha célula
eucariota.
19. La composición de la reivindicación 18, donde
dicho componente subcelular es el núcleo, y dicho componente de
localización subcelular es un componente de localización
nuclear.
20. La composición de la reivindicación 19, donde
dicho componente de localización nuclear comprende una secuencia de
localización nuclear acoplada a un resto de asociación al ADN.
21. La composición de la reivindicación 20, donde
dicho resto de asociación al ADN es un agente intercalador.
22. La composición de la reivindicación 21, donde
dicho agente intercalador tiene la fórmula
Ar_{1}---NH(CH_{2})_{n}---
\uelm{N}{\uelm{\para}{\uelm{C=O}{\uelm{\para}{\uelm{\hskip-0.2cm(CH _{2} ) _{p} }{\uelm{\para}{Z}}}}}}---(CH_{2})_{m}---NH---Ar_{2}en la
que
Z es un enlace;
cada uno de n y m es independientemente un número
entero de 1 a 20, y p es un número entero de 0 a 20; y
Ar_{1} y Ar_{2} se seleccionan
independientemente entre el grupo compuesto por bromuro de etidio,
acridina, mitoxantrona, oxazolopiridocarbazol, elipticina y
N-metil-2,7-diazapirenio
y derivados de los mismos.
23. Una composición para presentar un
polinucleótido a un componente subcelular de una célula eucariota,
que comprende
- (a)
- el polinucleótido;
- (b)
- un componente de reconocimiento celular capaz de reconocer dicha célula eucariota;
- (c)
- el componente de permeabilización de la membrana de la reivindicación 1; y
- (d)
- un componente de localización nuclear capaz de suministrar el polinucleótido desde el citoplasma de dicha célula eucariota a un componente subcelular de dicha célula eucariota.
24. La composición de la reivindicación 23, que
comprende además:
- (e)
- un componente de enmascaramiento capaz de aumentar la vida media en circulación del polinucleótido.
25. La composición de la reivindicación 24, donde
dicho componente de enmascaramiento es polietilenglicol (PEG) unido
covalentemente a un resto de asociación al ADN.
26. La composición de la reivindicación 24, donde
uno o más de los componentes de reconocimiento celular, el
componente de permeabilización de la membrana, el componente de
localización subcelular y el componente de enmascaramiento son
capaces de disociarse del polinucleótido.
27. La composición de la reivindicación 1, donde
dicho componente de permeabilización de la membrana es GALA.
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