ES2232812T3 - Serina proteasas resistentes a inhibidores. - Google Patents
Serina proteasas resistentes a inhibidores.Info
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Abstract
PROTEASAS DE SERINA DE LA SUPERFAMILIA QUIMIOTRIPSINA SE MODIFICAN, DE FORMA QUE EXHIBEN RESISTENCIA A LOS INHIBIDORES DE PROTEASAS DE SERINA. SI TALES PROTEASAS DE SERINA MODIFICADA TIENEN PROPIEDADES FIBRINOLITICAS, TROMBOLITICAS, ANTITROMBOTICAS O PROTROMBOTICAS, SON UTILES EN EL TRATAMIENTO DE ESTADOS O ENFERMEDADES DE COAGULACION SANGUINEA.
Description
Serina proteasas resistentes a inhibidores.
La presente invención se refiere a serina
proteasas de la superfamilia de las quimotripsinas que se han
modificado de manera que muestran resistencia a los inhibidores de
la serina proteasa. La invención también se refiere a los
precursores de tales compuestos, su preparación, al ácido nucleico
que las codifica y a su uso farmacéutico.
Las serina proteasas son endopeptidasas que usan
serina como el nucleófilo en la escisión del enlace de péptidos.
Existen dos superfamilias conocidas de serina proteasas y éstas son
la superfamilia de la quimotripsinas y la superfamilia de la
subtilisina de Streptomices (Barrett, A. J., en Proteinase
Inhibitors, Ed. Barrett, A. J. y col., Elsevier, Ámsterdam, pp.
3 - 22 (1986) y James, M. N. G., en Proteolysis and Physiological
Regulation, Ed. Ribbons, D. W. y col., Academic Press, Nueva
York, pp. 125 - 142 (1976).
La presente invención se refiere particularmente
a las serina proteasas de la superfamilia de las quimotripsinas que
incluye compuestos tales como plasmina, activador de plasminógeno de
tejidos (t - PA), activador de plaasminógeno de tipo uroquinasa (u -
PA), tripsina, quimotripsina, granzima, elastasa, acrosina, tonina,
mieloblastina, antígeno específico de próstata (PSA), gamma -
renina, triptasa, serina proteasas de veneno de serpiente, adipsina,
proteína C, catepsina G, componentes C1R, C1S y C2 de complemento,
factores B, D e I de complemento, quimasa, hepsina, medulasina y
proteínas de la cascada de la coagulación de la sangre incluyendo
calicreína, trombina, y factores VIIa, IXa, XIa y XIIa. Los miembros
de la superfamilia de las quimotripsinas tienen homología de
aminoácidos y estructural de los dominios catalíticos, aunque una
comparación de las secuencias de los dominios catalíticos revela la
presencia de inserciones o supresiones de aminoácidos.
Sin embargo estas inserciones y supresiones
mapean la superficie de la molécula plegada y así no afecta la
estructura básica aunque es probable que contribuyan a la
especificidad de interacciones de la molécula con sustratos e
inhibidores (Strassburger, W. y col., FEBS Lett., 157,
219 - 223 (1983)).
Los inhibidores de la serina proteasa se conocen
bien y se dividen en las siguientes familias: la familia de los
inhibidores de la tripsina pancreática bovina (BTPI), la familia
Kazal, la familia de la affa - 2 macroglobulina (A2M), la familia de
los inhibidores de la subtilina de Streptomyces (SSI), la
familia de las serpinas, la familia de Kunitz, la familia del núcleo
de de cuatro disulfuros, la familia de los inhibidores de patata y
la familia de Bowman - Birk.
Los inhibidores de las serina proteasas inhiben
sus serina proteasas afines y forman complejos estables 1:1 con
estas proteasas. Los datos estructurales están disponibles para
varios complejos proteasa - inhibidor incluyendo tripsina - BTPI,
inhibidor de quimotripsina - ovomucoide e inhibidor de quimotripsina
- patata (Read, R. J. y col., en: Proteinase Inhibitors, Ed.
Barreto, A. J. y col., Elsevier, Ámsterdam, pp. 301 - 336 (1986)).
Una característica estructural que es común a todos los inhibidores
de serina proteasas es un bucle que se extiende desde la superficie
de la molécula que contiene la secuencia de reconocimiento para el
sitio activo de la serina proteasa afín y, de hecho, existe una
notable similitud en las interacciones específicas entre los
diferentes inhibidores y sus serina proteasas análogas, a pesar de
las diversas secuencias de los inhibidores.
Las serina proteasas de la superfamilia de las
quimotripsinas juegan un papel importante en la fisiología humana y
animal. Alguno de los inhibidores de las serian proteasas más
importantes son los que están implicados en la coagulación sanguínea
y fibrinolisis. En el proceso de coagulación sanguínea, una cascada
de las actividades enzimáticas está implicada en al generación de
una red de fibrina que forma el marco conservado de un coágulo o
trombo. La degradación de la red de fibrina (fibrinolisis) implica
el inhibidor de proteasa plasmina. La plasmina se forma en el cuerpo
a partir de su plasminógeno de precursor inactivo mediante la
escisión del enlace peptídico entre arginina 561 y valina 562 de
plasminógeno. Esta reacción está catalizada por t - PA o por u -
PA.
En el balance entre la coagulación y los sistemas
fibrinolíticos se llega a alterar localmente, los coágulos
intravasculares se pueden formar en localizaciones inapropiadas que
conducen a condiciones tales como trombosis coronaria e infarto de
miocardio, trombosis de vena profunda, accidente cerebrovascular,
oclusión arterial periférica y embolia. Una forma conocida de tratar
tales afecciones es administrar a un paciente una serina proteasa de
la superfamilia de las quimotripsinas o el precursor de tal enzima.
Por ejemplo, t - PA, u - PA y plasminógeno en la forma de
plasminógeno anisolado formando complejo con estreptoquinasa se usan
en el tratamiento de infarto de miocardio; el plasminóegno se usa
para complementar el nivel de plasminógeno circulatorio natural para
potenciar la terapia trombolílica; y la proteína C se usa como un
agente antitrombótico. Las serina proteasas de la superfamilia de
las quimotripsinas, por ejemplo, los factores VIIa y IX, se
administran para inducción de la coagulación sanguínea en trastornos
tales como hemofilia. Un problema importante con el uso de todos
estos agentes en este tipo de terapia es su rápida neutralización
mediante los inhibidores de las serina proteasas que reduce la
eficacia de la terapia e incrementa la dosis de agente requerida.
Por lo tanto sería ventajoso desarrollar análogos modificados de
estas endopeptidasas que son resistentes a la inactivación mediante
los inhibidores de las serina proteasas mientras mantienen su
actividad. Sin embargo, no es fácil predecir modificaciones que
darán como resultado un aumento de resistencia a la inhibición sin
descenso significativo en al actividad de las endopeptidasas.
El documento WO - A - 9010649 describe las serina
proteasas de la superfamilia de las quimotripsinas que se han
modificado y que se dice que tienen resistencia incrementada a los
inhibidores de las serian proteasas. Los autores de ese documento
han estudiado la estructura conocida del complejo entre tripsina y
BPTI y han reconocido que, aparte de los aminoácidos en el sitio de
reconocimiento principal, los aminoácidos de tripsina que forman el
contacto directo con BPTI se localizan en la región entre los
residuos 37 y 41 en la región entre los residuos 210 y 213 de la
cadena polipeptídica. Por lo tanto los inventores han extrapolado a
partir de esto basándose en que existe un alto grado de homología
estructural entre los dominios catalíticos de las serina proteasas y
han sugerido que una mutación de un residuo en cualquier serina
proteasa equivalente al residuo Tyr - 39 en tripsina conduciría a un
aumento de resistencia de los análogos modificados comparado con la
serina proteasa de tipo salvaje. También sugieren que los análogos
de t - PA resistentes a la inhibición se pueden realizar por
mutación de un tramo adicional de siete aminoácidos que se produce
en tPA, pero no en tripsina, adyacente al punto de contacto predicho
en Arg - 304 (equivalente a Tyr - 39 de tripsina). Sin embargo,
aunque los dominios catalíticos de los miembros de la superfamilia
de quimotripsina de las serina proteasas, en general, tienen
homología estructural y de secuencias, Tyr - 39 de tripsina está en
una estructura de bucle sobre la superficie de la proteína y, como
se muestra en la figura 1, las regiones equivalentes de otras serina
proteasas son altamente variables dentro de la superfamilia. De
hecho, esto se reconoce en el documento WO - A - 9010649. Por lo
tanto, no es evidente mediante ningún medio que la conformación
específica del bucle en esta región de la proteína se conserve entre
diferentes serina proteasas, especialmente en los casos donde el
número de residuos en el bucle difiere, como es el caso de tripsina
y plasmina. Así pues, aunque los residuos en la región se pueden
alinear secuencialmente debido al alineamiento de sus regiones
flanqueantes que no tienen secuencias similares, no es del todo
evidente que sus cadenas laterales estén en localizaciones
espaciales equivalentes y, por lo tanto, los residuos que son
equivalente en un alineamiento de secuencias no necesariamente son
capaces de formar interacciones equivalentes en la proteína plegada.
Si se toma la plasmina como ejemplo, se puede observar en la figura
1 que existen tres residuos hidrófobos (Phe - 22, Met - 24 y Phe -
26) que podrían estar implicados en una interacción similar
hidrófoba a la de
\hbox{Tyr -} 39 en el complejo
tripsina/BPTI. La numeración de los residuos de plasmina recién
mencionados es la numeración de la SEC IID Nº: 2 que muestra el
dominio proteasa de la plasmina. El residuo designado 1 en la SEC ID
Nº 2 está en la posición 562 de la proteína madura. Un estudio de la
figura 1 muestra que cualquiera de estos residuos podría ser
equivalente a Tyr - 39 de tripsina que se produce en la posición 29
en la numeración de la figura 1. Evidentemente, por lo tanto, el
procedimiento descrito en el documento WO - A - 9010649 para
diseñar una proteasa que es resistente a la inhibición no es
totalmente fiable y debería ser preferible diseñar mutantes
resistentes a la inhibición de una forma diferente.
Los presentes inventores se han dado cuenta que,
debido a que los inhibidores de las serina proteasas son
estructuralmente homólogos en su bucle central activo y forman
interacciones similares con sus serina proteasas homólogas (Read, R.
J. y col., en: Proteinase Inhibitors, Ed. Barret, A. J. y
col., Elsevier, Ámsterdam, pp. 301 - 336 (1986)), las mutaciones en
cualquier serina proteasa dada que dan como resultado resistencia a
la inhibición mediante un inhibidor de las serina proteasas pueden
ser aplicables a las mutaciones de residuos equivalentes espacial o
secuencialmente en cualquier otro miembro de la superfamilia de las
quimotripsinas.
La interacción entre enzima e inhibidor
responsable de la inhibición de la actividad enzimática implica los
aminoácidos del sitio catalítico de la enzima y los aminoácidos del
sitio reactivo del inhibidor. Esta principal interacción se
establece mediante otras interacciones entre las moléculas. Aunque
existe una superficie de interacción comparativamente grande entre
la proteasa y el inhibidor, el complejo proteasa/inhibidor se
establece principalmente mediante unas pocas interacciones claves.
Éstas se ejemplifican mediante las interacciones observadas en el
complejo proteasa/inhibidor entre tripsina y BPTI (Huber, R, y col.,
J. Mol. Biol. 89: 73 - 101 (1974)), que sirve como
modelo para la interacción entre los dominios catalíticos de otras
serina proteasas y sus inhibidores homólogos. En el complejo
tripsina/BPTI, los residuos claves de la proteasa, aparte de
aquellos en el sitio de reconocimiento principal, que interactúan
con el inhibidor son los residuos 37 - 41 y 210 - 213 (numeración de
quimotripsina), con Tyr - 39 siendo el más importante. Esta
interacción sirvió como la base para el documento WO - A - 9010649
en el que se identificaron los residuos equivalentes especialmente
en el complejo t - PA/PAI - 1, y se describieron los mutantes
resistentes a inhibidores.
En contraste a la descripción en el documento WO
- A - 9010649, los presentes inventores han reconocido que la
interrupción deseada de las interacciones proteasa/inhibidor que
conducen a la resistencia a los inhibidores no necesitan producirse
por mutación de los residuos específicos identificados en ese
documento o sus equivalentes en otras serina proteasas. En cambio,
los residuos en proximidad espacial, mejor que secuencial, a estos
residuos claves, se pueden mutar dando como resultado un complejo
menos estable entre la proteasa y el inhibidor.
En un primer aspecto de la presente invención, se
proporciona una endopeptidasa modificada de la superfamilia de las
quimotripsinas de las serina proteasas o un precursor de tal
endopeptidasa, que es resistente a los inhibidores de la serina
proteasa, caracterizado porque la modificación comprende la mutación
de uno o más residuos en proximidad estrecha espacial (distinta de
la proximidad secuencial) a un sitio de interacción entre la
proteasa y el inhibidor de la proteasas afín.
En el contexto de esta invención, el término
"precursor", cuando se usa en relación a una serina proteasa,
se refiere a una proteína que se escinde mediante una enzima para
producir una serina proteasa activa.
Las mutaciones que dan como resultado resistencia
al inhibidor pueden inducir:
- i)
- un cambio conformacional en el pliegue local de la proteasa de manera que el complejo resultante con el inhibidor es menos estable que el complejo equivalente entre el inhibidor y la proteína de tipo salvaje;
- ii)
- un cambio en las orientaciones relativas de la proteasa e inhibidor en la formación de un complejo de manera que el complejo resultante es menos estable que el complejo equivalente entre el inhibidor y la proteína de tipo salvaje;
- iii)
- un cambio en la cantidad estérica de la proteasa en la región del sitio de unión al inhibidor de manera que el complejo resultante es menos estable que el complejo equivalente entre el inhibidor y la proteína de tipo salvaje;
- iv)
- un cambio en el cambio potencial electrostático en la región del sitio de unión al inhibidor de manera que el complejo resultante es menos estable que el complejo equivalente entre el inhibidor y la proteína de tipo salvaje; o
- v)
- cualquier combinación de lo anterior.
Los residuos a mutar no necesitan estar próximos
secuencialmente a los residuos claves implicados en la interacción
proteasa/inhibidor, ya que el plegamiento tridimensional de la
cadena de proteasa lleva los residuos distantes secuencialmente en
proximidad espacial. Es necesario seleccionar los residuos para
mutación basándose en un modelo de bien la proteasa usada para
generar el mutante, o de otro miembro de la superfamilia de las
quimotripsinas de las serina proteasas. Cuando la estructura
tridimensional de la proteasa a mutar se conoce, la selección de los
residuos para mutación se puede basar bien en un modelo
tridimensional de la proteína a mutar derivada usando modelado de
homología u otras técnicas, o sobre los alineamientos de secuencias
entre la proteína a mutar y otros miembros de la superfamilia de las
quimotripsinas con estructuras tridimensionales conocidas. Si se
emplean alineamiento de secuencias, no es necesario generar un
modelo estructural dimensional de la proteasa de interés con el fin
de seleccionar residuos para mutación que proporcionen resistencia a
inhibidores, ya que la proximidad espacial a los residuos se puede
inferir de las proteínas en el alineamiento con las estructuras
tridimensionales conocidas. La relación espacial entre los residuos
a mutar y los residuos claves en la interacción proteasa/inhibidor
se puede inferir mediante cualquier procedimiento adecuado. Los
expertos en la técnica conocen los procedimientos adecuados.
La serina proteasa modificada puede ser cualquier
serina proteasa de la superfamilia de las quimotripsina ya que todas
estas enzimas tienen un mecanismo común de acción. Los ejemplos de
los inhibidores de las serina proteasas que se pueden modificar
según la presente invención son como sigue:
plasmina, activador de plasminógeno de tejidos (T
- PA), activador de plasminógeno de tipo uroquinasa (u - PA),
tripsina, quimotripsina, granzima, elastasa, acrosina, tonina,
mieloblastina, antígeno específico de próstata (PSA), gamma -
renina, triptasa, serina proteasas de veneno de serpiente, adipsina,
proteína C, catepsina G, componentes C1R, C1S y C2 de complemento,
factores B, D e I de complemento, quimasa, hepsina, medulasina y
proteínas de la cascada de la coagulación de la sangre incluyendo
calicreína, trombina, y factores VIIa, IXa, Xa, XIa y XIIa.
Sin embargo, los análogos modificados de
plasmina, t - PA, u - PA, proteína C activada, trombina, factor
VIIa, factor IXa, factor Xa, factor XIa y factor XIIa son
particularmente útiles, ya que es una versión modificada de
plasminógeno, puesto que todos estos compuestos se pueden usar como
agentes fibrinolíticos o trombóticos. Un análogo de plasmina
resistente a la inhibición se prefiere particularmente.
El inhibidor de la serina proteasa al que la
serina proteasa modificada de la invención es resistente dependerá
obviamente de qué serina proteasas se han modificado. En el caso de
plasmina, el inhibidor fisiológico primario es \alpha2-
antiplasmina que pertenece a la familia de las serpinas de los
inhibidores de las serina proteasas. La reacción entre plasmina y
\alpha2-antiplasmina consta de dos etapas: una
reacción muy rápida reversible entre el sitio de unión de lisina
kringle 1 de plasmina y la región carboxi - terminal del inhibidor,
seguido de una reacción entre el sitio catalítico de la plasmina y
el sitio reactivo del inhibidor que da como resultado la formación
de un complejo estequiométrico enzimáticamente inactivo 1: 1
(Holmes, W. E. y col., J. Biol. Chem., 262, 1659 -
1664 (1987)). Por lo tanto, cuando la serina proteasa es plasmina,
es particularmente útil si el inhibidor de la serina proteasa al que
es resistente la plasmina sea
\alpha2-antiplasmina. La plasmina también se
inhibe por la \alpha2- macroglobulina y
\alpha1-antitripsina y resistencia a la inhibición
por estos inhibidores es también útil.
A partir de un modelo tridimensional del complejo
plasmina/antiplasmina, (descrito en el procedimiento 1), se ha
determinado que, en plasmina, los residuos que están en estrecha
proximidad espacial a los residuos clave de la interacción entre la
proteasa y el inhibidor son los residuos 17 - 20, 44 - 54, 62, 154,
158, 198 - 213. La numeración usada anteriormente es el sistema de
numeración de la SEC ID Nº: 2 que representa el dominio proteasa de
plasmina y comienza en la posición 562 de la proteína madura. Con el
fin de que sea resistente a la inhibición mediante un inhibidor de
la serina proteasa tal como \alpha2-antiplasmina,
es necesario modificar la plasmina en la posición 45, 62 y 158. La
resistencia a la inhibición de la proteasa se puede inducir en otras
serina proteasas de la superfamilia de quimotripsinas modificando
las regiones equivalentes de estas proteínas. La figura 1 muestra
las secuencias de los dominios de proteasa de una diversidad de
proteasas y, a partir de un estudio de la figura 1, es evidente
donde se deben hacer las modificaciones con el fin de inducir
resistencia a los inhibidores de proteasas. En el sistema de
numeración de la figura 1, las regiones de modificación
recientemente mencionados se producen en los residuos 45, 62 y 158.
Los tipos de mutaciones que son adecuados para inducir resistencia a
la inhibición incluyen sustituciones, adiciones o supresiones de
aminoácidos individuales o múltiples. Sin embargo, las sustituciones
se aminoácidos son particularmente preferidas.
En la plasmina, los ejemplos de mutaciones de
sustituciones de aminoácidos que dan como resultado una respuesta
modificada a la inhibición por la
\alpha2-antiplasmina, usando el sistema de
numeración de la SEC ID Nº: 2, son Glu - 62 a Lys o Ala, y Glu - 45
a Lys, Arg o Ala. La resistencia a la inhibición de proteasa se
puede inducir en otras serina proteasas haciendo modificaciones en
las posiciones equivalentes. El grado de resistencia a la inhibición
se puede alterar haciendo bien mutaciones sencillas o múltiples en
la proteasa, o alterando la naturaleza del aminoácido usado por
sustitución.
Además de la modificación de la invención, la
serina proteasa se puede modificar de otras maneras comparada con
las proteínas de tipo salvaje. Cualquier modificación se puede
realizar para la proteína con tal que no pierda su actividad.
Como alternativa a una serina proteasa
modificada, es también posible modificar un precursor de la enzima
de manera que la enzima derivada del precursor tendrá la resistencia
deseada a la inhibición. Un ejemplo de un precursor de la serina
proteasa es plasminógeno que es el precursor inactivo de la
plasmina. La conversión de plasminógeno a plasmina se llevo a cabo
mediante la escisión de la unión peptídica entre arginina 561 y
valina 562 de plasminógeno. En condiciones fisiológicas esta
escisión está catalizada por t - PA o u - PA. La escisión de una
variante de plasminógeno modificado de la presente invención
producirá una variante de plasmina como se ha descrito anteriormente
y es, por supuesto, preferible que la variante de plasminógeno se
escinda para producir una de las variantes de plasmina preferidas
descritas anteriormente.
Igualmente, como con las serina proteasas, los
precursores pueden tener otras modificaciones. El análisis de la
molécula de plasminógeno de tipo salvaje ha revelado que es una
glicoproteína compuesta de un dominio de serina proteasa, cinco
dominios kringle y una secuencia N-terminal de 78
aminoácidos que se puede eliminar mediante escisión de la plasmina.
La escisión mediante plasmina implica hidrólisis de los enlaces Arg
(68) - Met (69), Lys (77) - Lys (78) o Lys (78) - Val (79) para
crear formas de plasminógeno con un resto de metionina, lisina o
valina N-terminal todos los cuales se denominan
comúnmente como lys - plasminógeno. El plasminógeno intacto se
denomina glu - plasminógeno debido a que tiene un resto glutámico N
- terminal. La glicosilación se produce sobre los restos Asn (289) y
Thr (346) pero la amplitud y composición son variables, conduciendo
a la presencia de un número de formas de peso molecular diferentes
de plasminógeno en el plasma. Cualquiera de las variantes de
plasminógeno anteriores se puede modificar para producir una
variante según la presente invención. Los estudios de secuenciación
de proteínas de Sottrup - Jensen y col (en: Atlas of Protein
Sequence and Structure (Dayhoff, M. O.; ed.) 5 suplemento 3, p.
95 (1978)) indicó que el plasminógeno era una proteína de 790
aminoácidos y que el sitio de escisión era el enlace peptídico Arg
(560) - Val (561). Una variante de plasminógeno que es adecuada para
modificación según la presente invención es una proteína de 791
restos con un Ile extra en la posición 65 y codificada por el ADNc
aislado por Forsgren y col., (FEBS Letters, 213, 254 - 260
(1987)). El dominio de serina proteasa de cualquiera de estos
análogos de plasminógenos se pueden reconocer por su homología con
las serina proteasas y tras la activación a plasmina es el dominio
catalíticamente activo implicado en la degradación de fibrina. Los
cinco dominios kringle son homólogos a aquellos en otras proteínas
plasmáticas tales como tPA y protrombina y están implicados en la
unión a fibrina y por lo tanto la localización de plasminógeno y
plasmina a trombina.
Los análogos de plasminógenos de la presente
invención también pueden contener otras modificaciones (comparadas
con glu - plasminógeno de tipo salvaje) que pueden ser una o más
adiciones, supresiones o sustituciones. Los ejemplos de análogos de
plasminógenos adecuados se describen en las solicitudes de los
inventores en tramitación con la presente WO - A - 9109118 y GB
9222758.6 y comprenden análogos de plasminógeno que se pueden
escindir mediante una enzima implicada en coagulación sanguínea para
producir plasmina activa. Estos análogos de plasminógeno pueden,
según la presente invención, modificarse posteriormente de manera
que, tras la escisión, la plasmina que se produce es resistente a la
inhibición mediante inhibidores de resina proteasa tal como la
\alpha2-antiplasmina. Otros análogos de
plasminógenos que se pueden modificar para producir los análogos de
plasminógeno de la presente invención son análogos porque han sido
una adición, eliminación, sustitución o alteración de uno o más
dominios kringle. Otros análogos de plasminógenos adecuados son
variantes de Lys - plasminógeno en los que los aminoácidos 68, 77 ó
78 amino terminal se han suprimido. Tales variantes pueden haber
potenciado la actividad de unión a fibrina ya que se ha observado
para lys - plasminógeno comparado con glu - plasminógeno de tipo
salvaje (Bok, R. A. y Mangel, W. F., Biochemistry, 24,
3279 - 3286 (1985)). También incluidos dentro del alcance de la
presente invención están los análogos de plasminógenos pluralmente
modificados que incluyen una o más modificaciones para prevenir,
reducir o alterar los patrones de glicosilación. Tales análogos
pueden tener una larga semivida, eliminación en plasma reducida y/o
actividad específica más alta.
Las serina proteasas modificadas y los
precursores de serina proteasas de la invención se pueden preparar
mediante cualquier procedimiento adecuado y, en un segundo aspecto
de la invención, se proporciona un procedimiento para la preparación
de tal serina proteasa o precursor de serina proteasa, el
procedimiento comprendiendo el acoplamiento junto a los sucesivos
restos de aminoácidos y/o oligopéptidos ligantes. Aunque las
proteínas, pueden, en principio, sintetizarse completamente o
parcialmente mediante procedimientos químicos, se prefiere
prepararlos mediante traducción ribosomal, preferiblemente in
vivo, de una secuencia de ácidos nucleicos correspondiente. El
procedimiento puede además incluir una etapa de glicosilación
apropiada.
Para producir las proteínas de la invención se
prefiere el uso de la tecnología de ADN recombinante. El ADN que
codifica una serina proteasa de origen natural o precursor se puede
obtener a partir de un ADNc o clon genómico o se puede sintetizar.
Las sustituciones de aminoácidos, adiciones o supresiones se
introducen preferiblemente mediante mutagénesis específica de sitio.
Las secuencia de ADN que codifican glu - plasminógeno, lys -
plasminógeno, otros análogos de plasminógeno y variantes de serina
proteasa se pueden obtener mediante procedimientos familiares a los
expertos en la técnica de síntesis por ingeniería genética.
El procedimiento para producir proteínas que usan
tecnología de ADN recombinante usualmente incluirá las etapas de
insertar una secuencia codificante adecuada en un vector de
expresión y transferctar el vector en una célula hospedadora
adecuada. Por lo tanto, en un tercer aspecto de la invención se
proporciona un ácido nucleico que codifica una serina proteasa
modificada como se ha descrito anteriormente. El ácido nucleico
puede ser bien ADN o ARN y puede estar en la forma de un vector tal
como un plásmido, cósmido o fago. El vector se puede adaptar para
transfectar o transformar células procarióticas, tales como células
bacterianas y/o células eucarióticas, tales como células de
levaduras o de mamíferos. El vector puede ser un vector de
clonación o un vector de expresión y comprende un sitio de clonación
y, preferiblemente, al menos un gen marcador. Un vector de expresión
tendrá adicionalmente un promotor operativamente unido a la
secuencia a insertar en la clonación en el sitio y, preferiblemente,
una secuencia que permite que el producto de la proteína se
secrete.
La mayoría de las proteínas de la presente
invención, incluyendo moléculas tales como tPA, se pueden obtener
fácilmente insertando la secuencia codificante en un vector de
expresión como se ha descrito y transfectando el vector en una
célula hospedadora adecuada que puede ser una bacteria tal como
E. coli, un microorganismo eucariótico tal como levaduras o
una célula eucariótica superior. Con moléculas tales como
plasminógeno que son usualmente difíciles de expresarse, puede ser
necesario usar un vector del tipo descrito en la solicitud de los
inventores en tramitación con la presente, WO - A - 9109118, que
comprende una primera secuencia de ácido nucleico que codifica la
serina proteasa modificada, operativamente unida a una segunda
secuencia de ácido nucleico que contiene un fuerte promotor y
secuencia potenciadora derivada de citomegalovirus humano, una
tercera secuencia de aminoácidos que codifica una secuencia de
poliadenilación derivada de SV40 y una cuarta secuencia de ácido
nucleico que codifica un marcador seleccionable expresado a partir
de un promotor de SV40 y que tiene una señal de poliadenilación de
SV40 adicional en el extremo 3' de la secuencia marcadora
seleccionable. Tal vector puede bien comprender una molécula de
ácido nucleico individual o una pluralidad de tales moléculas de
manera que, por ejemplo, la primera, segunda y tercera secuencias
puede estar contenida en una primera molécula de ácido nucleico y la
cuarta secuencia puede estar contenida en una segunda molécula de
ácido nucleico. Este vector, es particularmente útil para la
expresión de plasminógeno y análogos de plasminógeno.
Para cualquier de las proteínas de la invención,
el vector se elige preferiblemente de manera que la proteína se
expresa y secreta en el medio de cultivo celular en una forma
biológicamente activa sin la necesidad de cualquier procedimiento
adicional biológico o químico. En el caso de plasminógeno, esto se
puede lograr usando el vector descrito anteriormente.
En un aspecto adicional de la invención se
proporciona un procedimiento para la preparación de ácido nucleico
que codifica una serina proteasa modificada que muestra resistencia
a los inhibidores de la serina proteasa, el procedimiento
comprendiendo el acoplamiento junto con nucleótidos sucesivos y/o
ligación de oligo- y/o polinucleótidos.
En un aspecto adicional de la adición, se
proporciona una célula transformada o transfectada mediante un
vector como se ha descrito anteriormente. Las células o líneas
celular adecuadas incluyen tanto células procarióticas como
eucarióticas. Un ejemplo típico de la célula eucariótica es una
célula bacteriana tal como E. coli. Las células eucarióticas
adecuadas incluyen células de levaduras tales como Saccharomyces
cerevisiae o Pichia pastoris. Otros ejemplos de células
eucarióticas son células de mamíferos que crecen en cultivo continuo
y los ejemplos de tales células incluyen células de ovario de
hámster chino (CHO), líneas celulares de mieloma de ratón tales como
P3X63 - Ag8. 653 y NSO, células COS, células HeLa, células 293,
células BHK, líneas celulares de melanoma tales como la línea
celular de Bowes, células L de ratón, líneas celulares de hematoma
humano tales como HepG2, fibroblastos de ratón y células NIH 3T3 de
ratón. Las células CHO son particularmente adecuadas como
hospedadoras para la expresión de plasminógeno y análogos de
plasminógeno. La transformación de las células se puede lograr
mediante cualquier procedimiento conveniente pero la electroporación
es un procedimiento particularmente adecuado.
Para algunas moléculas, tales como plasminógeno,
puede existir un nivel bajo de activación indeseable durante el
cultivo. Por lo tanto, en un aspecto adicional de la invención, se
proporciona una célula hospedadora eucariótica transfectada o
transformada con una primera secuencia de ADN que codifica una
serina proteasa resistente a serpina y con una secuencia de ADN
adicional que codifica el inhibidor afín.
Las serina proteasas modificadas de la presente
invención tienen una diversidad de usos y, si la serina proteasa es
una enzima fibrinolítica o trombolítica, será útil en un
procedimiento para el tratamiento y/o profilaxis de enfermedades o
afecciones producidas por coagulación sanguínea, el procedimiento
comprendiendo la administración a un paciente de una cantidad eficaz
de la serina proteasa.
Por lo tanto, en un aspecto adicional de la
presente invención, se proporciona una serina proteasa modificada
según el primer aspecto de la invención, que es una serina proteasa
que tiene propiedades fibrinolíticas, trombolíticas, antitrombóticas
o protrombóticas, para uso en medicina, particularmente en el
tratamiento de enfermedades mediadas por coagulación sanguínea.
Tales afecciones incluyen infarto de miocardio y cerebral, trombosis
arterial y venosa, tromboembolia, adherencias post - quirúrgicas,
tromboflebitis y vasculopatías diabéticas.
La invención también proporciona el uso de serina
proteasa fibrinolítica, trombolítica, antitrombótica o protrombótica
modificada según el primer aspecto de la presente invención en la
preparación de un agente para el tratamiento de y/o profilaxis de
enfermedades o afecciones mediadas por coagulación sanguínea. Los
ejemplos de tales afecciones se mencionan anteriormente.
Además, también se proporciona una composición
farmacéutica o veterinaria que comprende una o más serina proteasas
modificadas del primer aspecto de la presente invención junto con un
vehículo farmacéutica y/o veterinariamente aceptable.
La composición se puede adaptar para
administración mediante vías orales, tópicas o parenterales que
incluyen inyección o infusión intravenosa o intramuscular. Las
composiciones inyectables adecuadas pueden comprender una
preparación del compuesto en solución salina y/o tampón
fisiológicamente aceptable y también pueden incluir un anestésico
local para aliviar el dolor de la inyección. Se pueden usar
composiciones similares para infusiones. Si el compuesto se
administra tópicamente, se puede formular en forma de una crema,
pomada o loción en una base adecuada.
Los compuestos de la invención se pueden
suministrar en forma de dosificación unitaria, por ejemplo en forma
de un polvo seco o concentrado exento de agua en un recipiente
herméticamente sellado tal como una ampolla o un sobre.
La cantidad de material a administrar dependerá
de la cantidad de fibrinolisis o inhibición de coagulación
requerida, la velocidad requerida de acción, la seriedad de la
posición tromoembólica y el tamaño del coágulo. La dosis precisa a
administrar la determinará el médico, debido a la misma naturaleza
de la afección con cuyos compuestos de la invención se propone
tratar. Sin embargo, como pauta, un paciente que se está tratando de
un trombo maduro generalmente recibirá una dosis diaria de un
análogo de plasminógeno de entre 0,01 a 10 mg/kg de peso corporal
bien mediante inyección en por ejemplo hasta 5 dosis o mediante
infusión.
La invención se describirá ahora a modo de
ejemplo solamente con referencia a los dibujos que siguen en los
que:
La figura 1 muestra el alineamiento de los
aminoácidos del dominio catalítico de la superfamilia de las
quimotripsinas;
La figura 2 muestra los mapas de los vectores
pGWH y pGWHgP;
La figura 3 muestra el efecto de la
\alpha2-antiplasmina sobre la actividad del
mutante A3 de plasminógeno.
La figura 4 muestra el alineamiento se secuencia
de la ovoalbúmina y la \alpha2-antiplasmina usada
para generar el modelo de la
\alpha2-antiplasmina.
Los siguientes ejemplos ilustrarán además la
invención. Las mutaciones distintas en las posiciones 45, 62 ó 158
no son parte de la invención. Los ejemplos 1 a 5 describen la
expresión de diversos análogos de plasminógeno a partir de células
eucarióticas superiores y el ejemplo 6 describe un ensayo usado para
determinar la resistencia a la
\alpha2-antiplasmina.
El aislamiento del ADNc de plasminógeno y
construcción de los vectores pGWHgp y pGWHgP (Figura 2) se han
descrito en el documento WO - A - 9109118. En el pGWHgP, la
transcripción mediante el ADNc de plasminógeno puede iniciar en el
promotor/potenciador de HCMV y se emplea en gpt marcador
seleccionable.
La técnica de manipulación genética, expresión y
purificación de proteínas usada en la fabricación de los ejemplos de
plasminógeno modificado que siguen, los conocen bien los expertos en
la técnica de ingeniería genética. Una descripción de la mayoría de
las técnicas se puede encontrar en uno de los siguientes manuales de
laboratorio: "Molecular Cloning" por T. Maniatis, E. F.,
Fritsch y J. Sambrook publicado por Cold Spring Harbor Laboratory,
Box 100, Nueva York, o "Basic Meyhods in Molecular Biology" por
L. G. Davis, M. D. Dibner y J. F. Battey publicado por Elsevier
Science publishing Co Inc, Nueva York.
Las metodologías adicionales y modificadas se
detallan en la sección de procedimientos más adelante.
Los análogos de plasminógenos que se han
construido se diseñan para que sean resistentes a la inhibición por
\alpha2-antiplasmina. A1 es un análogo de
plasminógeno en el que el aminoácido Phe - 587 se reemplaza por Asn.
A12 es un análogo de plasminógeno en el que Arg - 580 se reempalza
por Glu. La estrategia de modificación es este ejemplo es
esencialmente como se describe en el documento WO - A - 9109118
ejemplo 3, con la reacción de mutagénesis llevada a cabo en el
fragmento kpn I de 1,87 kb a Hinc II del análogo T19
análogo de plasminógeno activable por trombina clonado en el
bacteriófago M13mp18. Se preparó el molde de cadena sencilla y la
mutación se hizo mediante mutagénesis dirigida a oligonucleótido.
Para A1, se usó un oligonucleótido de 24 bases
5'GGTGCCTCCACAATTGTGCATTCC3' (SEC ID Nº: 3) para dirigir la
mutagénesis y para A12 se usó un oligonucleótido de 27 bases
5'CCAAACCTTGTTTCAAGACTGACTTGC 3' (SEC ID Nº: 7).
El ADN de plásmido se introdujo en células CHO
mediante electroporación usando 800 V y 25 \muF, como se describe
en la sección de procedimientos más adelante. Se añadió medio
selectivo (250 \mul/ml de xantina, 5 \mug/ml de ácido
microfenólico, 1 x hipoxantina - timidina(HT) a las células
24 horas después de la transfección y el medio se cambió cada dos a
tres días. Las placas que produjeron colonias resistentes a gpt se
seleccionaron para producción de plasminógeno usando un ensayo
ELISA. Las células que produjeron los niveles más altos de antígeno
se volvieron a clonar y las mejores productoras se pasaron a escala
en matraces controlándose cuidadosamente la producción. Las
soluciones madres congeladas de todas estas líneas celulares se
dejaron reposar. Las células productoras se pasaron a escala en
botellas cilíndricas para proporcionar medio reacondicionado a
partir del cual la proteína de plasminógeno se purificó usando
lisina SEPHAROSE 4B. (La palabra SEPHAROSE es una marca
registrada).
Se siguió el procedimiento del ejemplo 1 excepto
que se realizó la mutagénesis sobre un fragemento EcoRV a
Hind III (0,85 kb) conteniendo 3' de plasminógeno de tipo
salvaje clonado en M13. El oligonucleótido usado era un 27 mero
5'GTTCGAGATTCACTTTTTGGTGTGCAC3' (SEC ID Nº: 4) que cambiaba Glu -
623 a Lys, así pues cambiando un aminoácido ácido a un aminoácido
básico. El mutante resultante se clonó como un fragmento EcoRV a
Sph1 reemplazando la secuencia correspondiente de tipo salvaje.Se
usó el oligonucleótido de 27 bases 5'GTTCGAGATTCACTGCTTGGTGTGCAC3'
(SEC ID Nº: 10) para cambiar Glu - 623 a Ala para producir A16.
El mutante A4 se diseñó para interrumpir las
interacciones iónicas sobre la superficie de plasminógeno evitando
la unión a antiplasmina. La estrategia de mutagénesis y
subclonación era como se describe en el ejemplo 1 usando un
oligonucleótido de 24 bases 5'CTTGGGGACTTCTTCAAGCAGTGG3' (SEDC ID
Nº: 5) diseñado para convertir Glu - 606 a Lys. Se usó el
oligonucleótido de 24 bases 5'CTTGGGGACTTGGCTAGAGAGTGG3'
(SEC ID Nº: 8) para cambiar Glu - 606 a Ala para producir A14 y se
usó el oligonucleótido de 25 bases 5'CTTGGGGACTTCCTTAGACAGTGGG 3'
(SEC ID Nº: 9) para cambiar Glu - 606 a Arg para producir
A15.
El análogo A5 de plasminógeno se diseñó para
alterar la posición del bucle estructural conteniendo Tyr 39 y se
preparó generalmente como se ha descrito en el ejemplo 1. En A5, Ser
- 578 se ha reemplazado por Leu usando el 24 mero
5'CTCGTACGAAGCAGGACTTGCCAG3'(SEC ID Nº: 6) sobre el Kpn I a
EcoRV de plasminógeno en M13 como molde. La mutación se clonó
directamente en pGW1Hg \cdot plasminógeno usando las enzimas de
restricción HidIII y SplI. Estos sitios se habían
introducido previamente en el extremo del extremo 5' de plasminógeno
y en 1850 mediante mutagénesis; la secuencia que codifica
plasminógeno no estaba afectada por este procedimiento.
El mutante A3A4 de plasminógeno combina dos
mutaciones A3 y A4como se describe en los ejemplos 2 y 3
respectivamente.
La mutagénesis se realizó sobre el fragmento
EcoRV a SphI de A4 clonado en M13 usando el
oligonucleótido de mutagénesis A3 (SEC ID Nº: 4).
Un ensayo cromogénico se usó para determinar la
resistencia de los mutantes de paslmin (ógeno) a la inhibición
mediante \alpha2 - antiplasmina. La inhibición de la actividad de
plasmina se determinó mediante el cambio en la velocidad de escisión
del sustrato S2251 cromogénico de plasmita (Quadratech, P. O. Box
167, Epsom, Surrey. KT17 2SB).
Antes del ensayo, los plasminógenos se activaron
a plasmita usando bien uroquinasa para mutantes en plasminógeno de
tipo salvaje, o trombina para mutantes de plasminógeno activables
por trombina (documento W - O - 9109118). La activación de
plasminógeno de tipo salvaje a plasmina se logró mediante la
incubación del plasminógeno (aproximadamente 14 \mug) con
uroquinasa (16,8 x 10^{-3} U) en 1750 \mul de tampón de ensayo
(Tris 50 mM, EDTA 0,1 mM, Triton al 0,00005% X 100, albúmina sérica
humana al 0,1% (p/v), pH 8,0) a 37ºC durante 5 minutos. La
activación de mutantes de plasminógeno activable por trombina se
logró mediante incubación del plasminógeno (aproximadamente 14
\mug) con trombina en 1750 \mul de tampón de ensayo a 37ºC. Se
añadió hirudina para inhibir la actividad de trombina a medida que
al trombina escinde el sustrato cromogénico.
Se mezcló plasmita (125 \mul) con 250 \mul de
S2251 (2 mg/ml en tampón de enasayo) y 125 \mul de antiplasmina
(1,25 \mug en tampón de ensayo, nº 4032 de American Diagnostica
Inc., 222 Railroad Avenue, P. O. Box 1165, Greennwich, CTO6836 -
1165) o 125 \mul de tampón de ensayo en una cubeta y se midió la
absorbancia a 405 nM con el tiempo.
Se usaron un espectrofotómetro Beckman DU64 y un
software de captura de datos Beckman "Data Leader" para
registrar la absorbancia a 405 nM a intervalos de 1 segundo durante
8 minutos. El paquete de software Data Leader se usó para calcular
el primer derivado de los datos para proporcionar la velocidad de
cambio de absorbancia a 405 nM frente al tiempo, una estimación de
la concentración de plasmina activa frente al tiempo. La plasmina de
tipo salvaje se inactivó mediante \alpha2 - antiplasmina; después
de 15 segundos solamente la plasmina esencialmente se inactivó. En
contraste, el mutante A3 de plasminógeno tiene un fenotipo
resistente a antiplasmina y solamente se inactiva lentamente
mediante la \alpha2 - antiplasmina con t1/2 (la mitad de la
velocidad del cambio de DO a t = 15 segundos) de aproximadamente 75
segundos (figura 3).
1. Las estructuras de modelo se construyeron
mediante homología basándose en las estructura de rayos X de
tripsina/BPTI. Una estructura de plasminógeno refinado se modeló
mediante homología a la trombina usando la estructura de rayos X de
tripsina/BPTI de Bode y col. (Bode, W. y col., EMBO J. 8:
3467 - 3475 (1989). Una estructura de
\hbox{alfa -} 2 -
antiplasmina [A2AP] refinada se modeló mediante homología a
ovoalbúmina usando coordenadas atómicas del Bookhaven Protein Data
Ban, entrada 1OVA, excepto que para el bucle que contenía el enlace
reactivo, que se moldeó usando las coordenadas para los residuos 13
a 19 de BPTI a partir de la entrada 2PTC de PDB. El alineamineto
usado para generar el modelo A2AP se muestra en la figura 4. El
modelo A2AP descrito en este documento no incluye las coordenadas
para los 79 residuos N - terminal y los 55 residuos C -
terminal.
La mayoría de los inhibidores dirigidos a serina
proteasa reaccionan con las enzimas afines según un mecanismo
habitual común, similar al sustrato (Bode, W. y Huber, R., Eur.
J. Biochem. 204: 433 - 451 (1992). En particular, todos poseen
un bucle de unión al sitio activo expuesto con una conformación
canónica característica. El bucle de unión sobre el modelo A2AP se
modeló por lo tanto sobre el bucle equivalente de BPTI (residuos 13
a 19), usando coordenadas atómicas a partir de la entrada 2PTC de
PBD (en el que BPTI se compleja con tripsina).
El complejo de A2AP y el dominio de serina
proteasa de plasmina se modeló usando la estructura del complejo
tripsina/BPTI a partir de la entrada 2PTC de PBD. El modelo A2AP se
ajustó a la estructura de BPTI optimizando la diferencia entre las
coordenadas de los átomos de la estructura principal en los bucles
de unión al sitio activo de los dos inhibidores. El modelo de
dominio de la serina proteasa de plasmina se ajustó a la estructura
de tripsina optimizando la diferencia de RMS entre las coordenadas
de los átomos C - alfa del residuo conservado en un alineamiento de
la secuencia óptima de las dos proteínas. El modelo del complejo
A2AP/plasmina se refinó después mediante minimización de
energía.
El modelado de homología se realizó sobre un
sistema de computación independiente Silicon Graphics Indigo usando
el programa de modelado Quanta molecular de Molecular Simulations
Incorporated. Los alineamientos de secuencias se produjeron usando
Quanta, el software de análisis de secuencias GCG de la Universidad
de Wisconsin (Devereux, Haeberli y Smithies, Nucleic Acids
Research 12 (1): 387 - 395 (1984), y el software de alineamiento
de secuencias del propietario. Sin embargo, el procedimiento real
mediante el que se construyeron los modelos de homología no es
crítico para esta invención.
Las secuencia de tripsina y BPTI usadas en el
modelado de homología se obtuvieron a partir de la entrada 2PTC de
las coordenadas atómicas de Bookhaven Protein Data Bank, la
secuencia de protrombina se obtuvo a partir del archivo de
coordenadas PPACK/trombina, la secuencia de plasminógeno a partir de
la entrada PLMN_HUMAN de la base de datos de SWISSPROT, y la
secuencia de A2AP a partir de la entrada A2AP _ HUMAN de
SWISSPROT.
Se añadieron 10 unidades de nucleasa de judía
mung a aproximadamente 1 \mu de ADN que se había digerido con una
enzima de restricción en un tampón que contenía NaOAc 30 mM, pH 5,0,
NaCl 100 mM, ZnCl 2 mM, glicerol al 10%. La nucleasa de judía mung
se incubó a 37ºC durante 30 minutos, se inactivó durante 15 minutos
a 67ºC antes de extraerse con fenol y se precipitó con etanol.
Los oligonucleótidos se sintetizaron mediante
química de fosforamiditos automática usando fosforamiditos de
cianoetilo. La metodología se usa ahora ampliamente y se ha descrito
(Beaucage, S. L. y Caruthers, M. H. Tetrahedron Letters 24, 245
(1981) y Caruthers, M. H. Science 230, 281 - 285 (1985)).
Los oligonucleótidos se desprotegieron y
retiraron del soporte de CPG mediante incubación en NH3 concentrado.
Típicamente, 50 mg de CPG que lleva 1 micromol de oligonucleótido se
desprotegió mediante incubación durante 5 horas a 70ºC en 600 \mul
de NH3 concentrado. El sobrenadante se transfirió a un tubo limpio y
se precipitó el oligómero con 3 volúmenes de etanol. Después de la
centrifugación el sedimento se secó y se volvió a suspender en 1 ml
de agua. Después se determinó la concentración de oligómero bruto
midiendo la absorbancia a 260 nm. Para la purificación por gel se
secaron 10 unidades de absorbancia del oligonucleótido bruto y se
volvieron a suspender en 15 \mul de tinte marcador (90% de
formamida desionizada, tris 10 mM, borato 10 mM, EDTA 1 mM, azul
bromofenol al 0,1%). Las muestras se calentaron a 90ºC durante 1
minuto y después se cargaron en un gel espeso de poliacrilamida
desnaturalizante con ranuras de 1,6 mm de anchura. El gel se preparó
a partir de acrilamida al 15%, bisacrilamida al 0,6% y urea 7 M en 1
X TBE y se polimerizó con persulfato amónico al 0,1% y TEMED al
0,025%. El gel se predesarrolló durante 1 hora. Las muestras se
desarrollaron a 1500 V durante 4 - 5 horas. Las bandas se
visualizaron mediante ensombrecimiento por UV y los correspondientes
al producto de longitud completa se cortaron y se transfirieron a
microtubos de ensayo. Los oligómeros se eluyeron de la sílice del
gel enjuagando en AGEB (acetato amónico 0,5 M, acetato de magnesio
0,01 M y SDS al 0,1%) durante toda una noche. El tampón de AGEB se
transfirió después a tubos limpios y se precipitó el oligómero con
tres volúmenes de etanol a 70ºC durante 15 minutos. El precipitado
se recogió mediante centrifugación en una microcentrífuga Eppendorf
durante 10 minutos, el sedimento se lavó en etanol al 80%, el
oligómero purificado se secó, se volvió a disolver en 1 ml de agua y
finalmente se filtró a través de un
\hbox{micro -} filtro
de 0,5 micrones. (La palabra EPPENDORF es una marca registrada). La
concentración del producto purificado se midió determinando su
absorbancia a 260 nm.
100 pmoles se oligómero se secaron y se volvieron
a suspender en 20 \mul de tampón quinasa (Tris 70 mM pH 7,6, MgCl2
10 mM, ATP 1 mM, espermidina 0,2 mM, ditiotreitol 0,5 mM). Se
añadieron 10 u de polinucleótido quinasa de T4 y la mezcla se incubó
a 37ºC durante 30 minutos. Después la quinasa se inactivó mediante
calentamiento a 70ºC durante 10 minutos.
Se usó el protocolo esencialmente como se ha
descrito (Biggin, M. D., Gibson, T. J., Hong, G. F. P. N. A. S. 80
3963 - 3965 (1983). Cuando era apropiada, el procedimiento se
modificó para permitir la secuenciación sobre ADN de plásmido como
se ha descrito (Guo, L - H, Wu R Nucleic Acids Research 11 5521 -
5540 (1983).
La transformación se logró usando procedimientos
habituales. La cepa usada como receptora en la clonación usando
vectores HW87 o DH5 tiene el siguiente genotipo:
araD139 (ara - leu) de17697 (lacIPOZY) de174 galU
galK hsdR rpsl srl recA56
RZ1032 es un derivado de E. coli que
carece de dos enzimas del metabolismo del ADN: (a) dUTPasa (dut) que
da como resultado una alta concentración de dUTP intracelular, y (b)
uracil N-glicosilasa (ung) que es responsable de la
eliminación de los uracilos incorporados erróneamente de ADN (Kunkel
y col., Methods in Enzymol., 154,
\hbox{367 -} 382
(1987)). Su principal beneficio es que estas mutaciones que conducen
a una mayor frecuencia de mutantes en mutagénesis dirigida al sitio.
RZ1032 tiene el siguiente genotipo:
HfrKL16PO/45 [lysA961 - 62], dut1, ung1, thi1,
re(A), Zbd-279::Tn10, supE44
JM103 es una cepa receptora habitual para
manipulación que implica vectores basados en M13.
El cebador de mutagéensis tratado con quinasas
(2,5 pmoles) se hibridó al ADN molde de cadena sencilla, que se
preparó usando RZ1032 como huésped, (1 \mug) en una mezcla de
reacción final de 10 \mul conteniendo Tris 70 mM, MgCl2 10 mM. La
mezcla de reacción en un microtubo de ensayo de polipropileno
(EPPENDORF) se colocó en un recipiente que contenía 250 ml de agua a
70ºC durante 3 minutos seguido de 27ºC durante 30 minutos. La mezcla
hibridaza se colocó después sobre hielo y se añadieron los
siguientes reactivos: 1 \mul de 10 X TM (Tris 700 mM, MgCl2 100
mM, pH 7,6), 1 \mul de una mezcla de los 4 desoxirribonucleótidos
cada uno a 5 mM, 2 \mul de ADN ligasa de T4 (100 u), 0,5 \mul de
fragmento Klenow de ADN polimerasa y 4,5 \mul de agua. La mezcla
de reacción de la polimerasa se incubó después a 15ºC durante 4 - 16
horas. Después de completarse la reacción, se añadieron 180 \mul
de TE (Tris 10 mM, EDTA 1 mM pH 8,0) y la mezcla de mutagénesis se
almacenó a -20ºC.
Para el aislamiento de los clones mutantes la
mezcla se transformó después en el receptor JM103 como sigue. Un
cultivo de 5 ml de cultivo de toda una noche de JM103 en 2 x YT
(bactotriptona al 1,6%, extracto de levadura al 1%, NaCl al 1%) se
diluyó 1 en 100 en 50 ml de 2 X YT precalentado. El cultivo se
desarrolló a 37ºC con aireación hasta que la A600 alcanzó 0,4. Las
células se centrifugaron y se volvieron a suspender en 0,5
volúmenes de CaCl2 50 mM y se mantuvo sobre hielo durante 15
minutos. Después las células se volvieron a centrifugar a 4ºC y se
volvieron a suspender en 2,5 ml de NaCl2 50 mM frío. Para la
trasnfección, alícuotas de 0,25, 1, 2, 5, 20 y 50 \mul de la
mezcla de mutagénesis se añadieron a 200 \mul de células de
competencia que se mantuvieron sobre hielo durante 30 minutos.
Después las células se sometieron a un choque por calor a 42ºC
durante 2 minutos. Después a cada tubo se añadieron 3,5 ml de agar
blando de YT conteniendo 0,2 ml de cultivo exponencial tardío de
JM103, los contenidos se mezclaron brevemente y después se vertieron
en la superficie de una placa precalentada conteniendo 2 X YT
solidificada con agar al 1,5%. La fase de agar blando se dejó
reposar y las placas se incubaron después a 37ºC durante toda una
noche.
Después el ADN de cadena sencilla se preparó a
partir de un clon aislado como sigue: placas individuales se
sembraron en 4 ml de 2 x YT que se habían sembrado con 10 \mul de
un cultivo reciente de toda una noche de JM103 en 2 X YT. El cultivo
se agitó vigorosamente durante 6 horas. Después se retiraron 0,5 ml
del cultivo y se añadieron a 0,5 ml de glicerol al 50% para
proporcionar una solución madre de referencia que se almacenó a
-20ºC. El cultivo restante se centrifugó para retirar las células y
se transfirió 1 ml de sobrenadante que llevaba las partículas del
fago a un tubo EPPENDORF limpio. Después se añadieron 250 \mul de
PEG6000 al 20%, NaCl 250 mM, se mezclaron y los tubos se incubaron
sobre hielo durante 15 minutos. Después el fago se centrifugó a
10.000 rpm durante 10 minutos, se desechó el sobrenadante y los
tubos se volvieron a centrifugar para recoger los indicios de
solución de PEG que después se retiraron y se desecharon. El
sedimento de fago se volvió a suspender concienzudamente en 200
\mul de TEN (Tris 10 mM, EDTA 1 mM, NaOAc 0,3 M). El ADN se aisló
mediante extracción con un volumen igual de fenol saturado con Tris.
Se separaron las fases mediante una centrifugación breve y la fase
acuosa se transfirió a un tubo limpio. El ADN se volvió a extraer
con una mezcla de 100 \mul de fenol, 100 \mul de cloroformo y se
separaron las fases de nuevo mediante centrifugación. Se retiraron
los indicios de fenol mediante tres extracciones posteriores con
cloroformo y finalmente el ADN se aisló mediante precipitación con
2,5 volúmenes de etanol a -20ºC durante toda una noche. El ADN se
centrifugó a 10.000 rpm durante 10 minutos, se lavó con etanol al
70%, se secó y finalmente se resuspendió en 50 \mul de TE.
Células de ovario de hámster chino (CHO) o la
línea celular de mieloma de ratón p3x63 - Ag8 \cdot 653 se
hicieron crecer y se recogieron en fase de crecimiento logarítmica
suave. Las células se lavaron y se resuspendieron en PBS y se hizo
un recuento de células viables. Después las células centrifugaron y
se volvieron a suspender a 1 x 10^{7} células/ml. Se añadieron 40
\mug de ADN linealizado a 1 ml de células y se dejaron en reposo
en hielo durante 15 minutos. Se administró un pulso de 800 V/25
\muF a las células usando un aparato de electroporación
comercialmente disponible (BIORAD GENE PULSER - marca registrada).
Las células se incubaron en hielo durante 15 minutos adicionales y
después se sembraron en placas de 5 X 96 pocillos con 200 \mul de
medio por pocillo (DMEM, FCS al 5%, Pen/Estrep, glutamina) o placas
de 3 x 9 cm con 10 ml de medio en cada placa y se incubaron durante
toda una noche. Después de 24 horas el medio se retiró y se
reemplazó con medio selectivo conteniendo xantina (250 \mug/ml),
ácido micofenólico (5 \mug/ml) y 1 x hipoxantina - timidina (HT).
Las células se alimentaron cada tercer día. Después de
aproximadamente 14 días colonias resistentes a gpt son evidentes en
alguno de los pocillos y sobre las placas. Las placas se analizaron
para plasminógeno retirando una alícuota de medio de cada pocillo o
placa y se ensayaron usando en ensayo ELISA. Los clones que producen
plasminógeno se pasaron a escala y se controló el nivel de expresión
para dejar la selección del mejor productor.
Placas ELISA (Pro - Bind, Falcon) se recubren con
50 \mul/pocillo de suero de plasminógeno anti - humano de cabra
(Sigma) diluido 1:1000 en tampón de recubrimiento (4,0 g Na2CO3 (10
\cdot H2O), 2,93 g de NaHCO3 por litro de H2O, pH 9,6)) y se
incubaron durante toda una noche a 4ºC. Después la solución de
recubrimiento se retira y las placas se bloquean mediante incubación
con 50 \mul/pocillo de PBS/caseína al 0,1% a temperatura ambiente
durante 15 minutos. Después las placas se lavaron tres veces con
PBS/Tween 20 al 0,05%. Las muestras se plasminógeno o patrones
diluidos en PBS/Tween se añaden a la placa y se incuban a
temperatura ambiente durante 2 horas. Después las placas se lavan
con PBS/Tween y después se añaden 50 \mul/pocillo de una solución
1:1000 en PBS/Tween de un anticuerpo de plasminógeno antihumano
monoclonal (por ej nº 3641 y nº 3642 de American Diagnostica, Nueva
York, Estados Unidos) y se incuban a temperatura ambiente durante 1
hora. Las placas se lavan otra vez 3 veces con PBS/Tween y después
50 \mul/pocillo de IgG anti - ratón de cabra conjugado con
peroxidasa de rábano picante (Sigma) y se incuban a temperatura
ambiente durante 1 hora. Como alternativa, el plasminógeno unido se
revela mediante incubación con 50 \mul/pocillo de plasminógeno
anti - humano de oveja (el sitio de unión) conjugado con peroxidasa
de rábano picante. Las placas se lavan 5 veces con PBS/Tween y
después se incuban con 100 \mul/pocillo de sustrato de peroxidasa
(tampón acetato sódico 0,1 M/ácido cítrico pH 6,0 conteniendo 100
mg/litros de 3,3',5,5' - tetrametilbenzidina y H2O2 13 mM. La
reacción se para después de aproximadamente 5 minutos mediante la
adición de 25 \mul/pocillo de ácido sulfúrico 2,5 M y se lee la
absorbancia a 450 nm sobre un lector de placas.
Los variantes de plasminógeno se purifican en una
etapa individual mediante cromatografía sobre lisina SEPHAROSE 4B
(Pharmacia). Se equilibra una columna con al menos 10 volúmenes de
columna de tampón fosfato sódico 0,05 M pH7,5. La columna se carga
con medio reacondicionado a una relación de 1 ml de resina por 0,6
mg de variante de plasminógeno como se determina por ELISA usando
glu - plasminógeno como patrón. Típicamente 400 ml de medio
reacondicionado conteniendo plasminógeno se aplican a una columna de
10 ml (H:D = 4) a un caudal lineal de 56 ml/cm/h a 4ºC. Después de
que se completa la carga, la columna se lava con un mínimo de 5
volúmenes de columna de tampón fosfato 0,05 M pH 7,5 conteniendo
NaCl 0,5 M hasta que al proteína unida no específicamente cesa para
ser eluida. La desorción de plasminógeno unido se logra mediante la
aplicación de ácido epsilón - amino - caproico 0,2 M en agua
desionizada pH 7,0. La elución requiere 2 volúmenes de columna y se
lleva a cabo a un caudal lineal de 17 ml/cm/hora. Después del
análisis por SDS PAGE para comprobar pureza, el ácido epsilón -
amino - caproico 0,2 M \mul se retira posteriormente y se
reemplaza con un tampón adecuado, por ejemplo, Tris, PBS, HEPES o
acetato, mediante cromatografía sobre columnas pre - compactadas,
desechables, PD10 que contienen SEPHADEX G - 25M (Pharmacia). (La
palabra SEPHADEX es una marca registrada). Típicamente, 2,5 ml de
cada mutante plasminógeno a una concentración de 0,3 mg/ml se tratan
de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Después se reúnen
las fracciones que contienen plasminógeno, como se determina
mediante A280.
(1) INFORMACIÓN GENERAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE British Bio - technology Limited
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: Watlington Road
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Cowley, Oxford
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: Gran Bretaña
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL (ZIP) OX4 5LY
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- título de la invención: PROTEASAS MODIFICADAS
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 10
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- FORMA LEIBLE DE ORDENADOR:
\hskip1,9cmNo aplicable
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- DATOS DE SOLICITUD ACTUAL:
\hskip1,9cmNÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 690 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- POLARIDAD OPUESTA: no
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Homo sapiens
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1 . . 690
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3,3cm/codón _ inicio = 1
\hskip3,3cm/función = "codifica el dominio de plasmina proteasa"
\hskip3,3cm/producto = "nucleótido con la proteína correspondiente"
\hskip3,3cm/número = 1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 1
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 230 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: No
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc _ característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1 . . 24
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /función = "CEBADOR DE MUTAGÉNESIS PARA A1"
\hskip3,3cm/producto = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 3
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTGCCTCCA CAATTGTGCA TTCC
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc _ característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1 . . 27
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /función = "CEBADOR DE MUTAGÉNESIS PARA A3"
\hskip3,3cm/producto = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 4
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTTCGAGATT CACTTTTTGG TGTGCAC
\hfill27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc _ característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1 . . 24
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /función = "CEBADOR DE MUTAGÉNESIS PARA A4"
\hskip3,3cm/producto = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 5
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTTGGGGACT TCTTCAAGCA GTGG
\hfill24
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc _ característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1 . . 24
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /función = "CEBADOR DE MUTAGÉNESIS USADO PARA A5"
\hskip3,3cm/producto = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 6
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTCGTACGAA GCAGGACTTG CCAG
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc _ característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1 . . 27
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /función = "CEBADOR DE MUTAGÉNESIS PARA A12"
\hskip3,3cm/producto = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 7
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCAAACCTTG TTTCAAGACT GACTTGC
\hfill27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc _ característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1 . . 24
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /función = "CEBADOR DE MUTAGÉNESIS PARA A14"
\hskip3,3cm/producto = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 8
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTTGGGGACT TGGCTAGACA GTGG
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc _ característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1 . . 25
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /función = "CEBADOR DE MUTAGÉNESIS PARA A15"
\hskip3,3cm/producto = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 9
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTTGGGGACT YCCTTAGACA GTGGG
\hfill25
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: misc _ característica
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1. . 27
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /función = "CEBADOR DE MUTAGÉNESIS PARA A16"
\hskip3,3cm/producto = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 10
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTTCGAGATT CACTGCTTGG TGTGCAC
\hfill27
Claims (10)
1. Una plasmina o un precursor de la misma, que
se ha modificado de manera que muestra resistencia a inhibidores de
plasmina, caracterizada porque la modificación comprende la
mutación de uno o más residuos correspondiente a los residuos 45,
62, y 158 (usando la numeración de la SEC ID Nº: 2).
2. Una plasmina según la reivindicación 1, que
tiene una o más de las siguientes mutaciones: GLu - 62 a Lys o Ala,
o Glu - 45 a Lys, Arg o Ala, (donde la numeración es la de la SEC ID
Nº: 2).
3. Un precursor de plasmina según la
reivindicación 1, que, cuando se escinde, forma una plasmina según
la reivindicación 1 o la reivindicación 2.
4. Un precursor de plasmina según la
reivindicación 3, que se puede escindir mediante una enzima
implicada en la coagulación sanguínea para producir una plasmina
según la reivindicación 1 o la reivindicación 2.
5. Un ácido nucleico que codifica una plasmina
modificada o precursor de la misma según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 4.
6. Ácido nucleico según la reivindicación 5 que
es un vector incluyendo un plásmido, cósmido, o fago.
7. Ácido nucleico según la reivindicación 6 que
comprende una primera secuencia de ácido nucleico que codifica la
plasmina modificada o precursor de la misma, unido operativamente a
una segunda secuencia de ácido nucleico que contiene un fuerte
promotor y secuencia potenciadora derivada de citomegaloviris
humano, una tercera secuencia de ácido nucleico que codifica una
secuencia de poliadenilación derivada de SV40 y una cuarta secuencia
de ácido nucleico que codifica un marcador seleccionable expresado a
partir del promotor SV40 y que tiene una señal de poliadenilación de
SV40 adicional en el extremo 3' de la secuencia marcadora
seleccionable.
8. Una célula transformada o transfectada
mediante ácido nucleico según una cualquiera de las reivindicaciones
5 a 7.
9. Una composición farmacéutica o veterinaria que
comprende una plasmina modificada o precursor de la misma según una
cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 junto con un vehículo
farmacéutica y/o veterinariamente aceptable.
10. Una célula según la reivindicación 8
adicionalmente transfectada mediante un vector de expresión para la
expresión de antiplasmina.
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|---|---|---|---|
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