ES2240970T3 - Polimorfismos de nucleotido simple y su uso en analisis geneticos. - Google Patents
Polimorfismos de nucleotido simple y su uso en analisis geneticos.Info
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Abstract
SE PRESENTAN MOLECULAS Y METODOS ADECUADOS PARA IDENTIFICAR ZONAS POLIMORFICAS EN EL GENOMA DE UNA PLANTA O UN ANIMAL. LA IDENTIFICACION DE TALES ZONAS ES UTIL EN LA DETERMINACION DE LA IDENTIDAD, ANCESTROS, PREDISPOSICION A ENFERMEDADES GENETICAS, LA PRESENCIA O AUSENCIA DE RASGOS DESEADOS, ETC.
Description
Polimorfismos de nucleótido simple y su uso en
análisis genéticos.
La presente invención se desarrolla en el ámbito
de la tecnología de recombinación del ADN. Más concretamente, la
invención se relaciona directamente con métodos adecuados para la
identificación de polimorfismos de nucleótido simple en el genoma de
un animal, en particular de un caballo o de un ser humano, y
utilizar estas posiciones para analizar rasgos de identidad, de
ascendencia y genéticos.
La capacidad de hallar el genotipo de un animal,
una planta o un microbio es de importancia fundamental en las
ciencias forense, medicina y epidemiología, salud pública, y en el
ámbito de la crianza y exhibición de animales. Esta capacidad es
necesaria, por ejemplo, para establecer la identidad de un agente
causante de alguna enfermedad infecciosa, determinar si dos
indivisos están emparentados, o para averiguar si un animal
concreto, como un caballo, es de pura sangre.
Los análisis de identidad y de parentesco, junto
con la capacidad de diagnosticar enfermedades son también de
interés central para el estudio genético de los seres humanos, los
animales y las plantas, en particular para las evaluaciones forenses
o de parentesco y para la valoración del riesgo de un individuo a
padecer enfermedades genéticas. Estas metas se han venido
acometiendo mediante el análisis de las variaciones en las
secuencias del ADN que distinguen el ADN de un individuo con
respecto a otro.
Si una de estas variaciones altera las longitudes
de los fragmentos que se generan a partir de una segmentación por
restricción de la endonucleasa, estas variaciones se denominan
polimorfismos de longitud fragmentada por restricción (PLFR). Los
PLFR han sido ampliamente empleados en análisis genéticos de
animales y seres humanos (Glassberg, J., solicitud de patente UK
2135774; Skolnick, M.H. y otros, Cytogen. Cell Genet.
32:58-67 (1982); Botstein, D. y otros, Ann.
J. Hum. Genet. 32: 314-331 (1980); Fischer, S.G.
y otros (solicitud PCT WO90/11368; Uhlen, M., solicitud PCT
Wo90/11369)). Cuando es posible vincular un rasgo hereditario con un
PLFR particular, la presencia del PLFR en un animal individual
permite hallar la probabilidad de que cualquier individuo de esa
especie animal también exhiba dicho carácter. Se han desarrollado
algunos métodos estadísticos que permiten efectuar un análisis
multilocus de PLFR y trazar un mapa de los rasgos complejos
que dependen de alelos múltiples (Lander, S. y otros, Proc.
Natl. Acad. Sci. (U.S.A.) 83:7353-7357 (1986);
Lander, S. y otros, Proc. Natl. Acad. Sci. (U.S.A.)
84:2363-2367 (1987);
Donis-Keller, H. y otros, Cell
51:319-337 (1987); Lander, S. y otros,
Genetics 121:185-199 (1989)). Dichos métodos
pueden utilizarse para desarrollar un mapa genético, así como para
desarrollar plantas o animales que presenten un carácter deseable
(Donis-Keller, H. y otros, Cell
51:319-337 (1987); Lander, S. y otros,
Genetics 121:185-199 (1989)).
En algunos casos, las variaciones en la secuencia
del ADN se hallan en unas regiones del genoma caracterizadas por
cortas repeticiones a pares (CRP) que incluyen patrones de di- o
trinucleótidos que se repiten a pares. Estas repeticiones a pares
también reciben el nombre de polimorfismos de "repetición por
pares de número variable" (RPNV). Las RPNV han utilizado el
análisis de identidad y de parentesco (Weber, J.L., patente U.S.
5.075.217); Armour, J.A.L. y otros, FEBS Lett.
307:113-115 (1992); Jones, L. y otros, Eur.
J. Haematol, 39:144-147 (1987); Horn, G.T. y
otros, solicitud PCT WO91/14003; Jeffreys, A.J., solicitud de
patente europea 370.719; Jeffreys, A.J., patente U.S. 5.175.082);
Jeffreys, A.J. y otros, Amer, J. Hum. Genet.
39:11-24 (1986); Jeffreys, A.J. y otros,
Nature 316:76-79 (1985); Gray, I.C. y otros,
Proc. R. Acad. Soc. Lond. 243:241-253 (1991);
Moore, S.S. y otros, Genomics 10:654-660
(1991); Jeffreys, A.J. y otros, Anim. Genet.
18:1-15 (1987); Hillel, J. y otros, Anim.
Genet. 20:145-155 (1989); Hillel, J. y otros,
Genet. 124:783-789 (1990)) y actualmente se
emplean en un gran número de estudios de trazado del mapa
genético.
Li y Sadler (Genetics 129:513-523
(1991)) han estudiado la diversidad de los nucleótidos en seres
humanos utilizando secuencias publicadas de cADN y de genomas.
Definieron como medida de variabilidad genética el número
nucleótidos diferentes para cada posición de dos secuencias
elegidas al azar de una población de individuos. Sobre esta base, se
halló que la diversidad nucleotida en los seres humanos es
baja.
Una tercera clase de variación en las secuencias
de ADN se debe a polimorfismos de nucleótido simple (PNS) entre
individuos de una misma especie. Estos polimorfismos son mucho más
frecuentes que los PLFR, los CRP y los RPNV. En muchos casos, estos
polimorfismos contienen mutaciones que son la característica
determinante de una enfermedad genética. Una simple mutación en un
único nucleótido de un gen codificante de una proteína puede
efectivamente bastar para causar la enfermedad (por ejemplo,
hemofilia, anemia falciforme). En muchos casos, estos PNS se hallan
en regiones no codificantes de un genoma. A pesar de la importancia
central de estos polimorfismos en la genética moderna, no se ha
desarrollado ningún método práctico de análisis genéticos que
permitan un análisis masivo en paralelo de muchos PNS alelos
correspondientes a dos o más individuos.
La presente invención proporciona dicho método
mejorado. En efecto, la presente invención proporciona métodos y
secuencias de genes que permiten un análisis genético de identidad
y de parentesco y el diagnóstico de enfermedades por determinación
de las variaciones de polimorfismos de nucleótido simple.
La presente invención se orienta a moléculas que
contienen polimorfismos de nucleótido simple (PNS) presentes en el
ADN de los mamíferos y, en particular, polimorfismos en el ADN
genómico de los équidos y los seres humanos. La invención se orienta
a métodos de: (i) identificación de polimorfismos de nucleótido
simple nuevos, (ii) análisis y comprobaciones repetidas de estos
PNS en diferentes muestras y (iii) explotación de dichas posiciones
en el análisis genético de animales individuales y poblaciones de
animales.
El análisis (genotipificación) de dichas
posiciones resulta de utilidad para la determinación de
características de identidad, de ascendencia, predisposición a
enfermedades genéticas, presencia o ausencia de algún rasgo
determinado, etc. En detalle, la invención proporciona:
un método para el análisis genético de un
conjunto de individuos de la misma especie, el cual:
proporciona una serie polimórfica que constituye
un conjunto de polimorfismos de nucleótido simple (PNS); y
determina la presencia o ausencia de
polimorfismos en el conjunto de PNS para cada conjunto de
individuos; y
determina si la presencia o ausencia de un alelo
particular de un polimorfismo en el conjunto de PNS se halla
asociado a algún rasgo particular.
La invención también proporciona:
un método para la determinación de la
probabilidad de que una muestra de ácido nucleico proviene de un
individuo particular, el cual:
proporciona una serie polimórfica que constituye
un conjunto de polimorfismos de nucleótido simple (PNS)
correspondientes a dicho individuo y una serie polimórfica
correspondiente a dicha muestra;
determina la presencia o ausencia de
polimorfismos PNS múltiples marcadores en las dos series y compara
los resultados para cada polimorfismos PNS marcador;
determina a partir de ello una probabilidad de
identidad / no identidad para cada comparación; y
determina a partir de ello una probabilidad
acumulada de identidad / no- identidad como el producto de
probabilidades obtenidas en cada comparación.
La invención también proporciona:
un método de determinación de la probabilidad de
que un individuo sea o no progenie de un antecesor o unos
antecesores putativos, el cual:
proporciona una serie polimórfica que constituye
un conjunto de polimorfismos de nucleótido simple (PNS)
correspondiente a dicho individuo y una serie polimórfica
correspondiente a dicho antecesor o antecesores putativos;
determina la presencia o ausencia de
polimorfismos PNS múltiples marcadores en la serie individual y la
del antecesor o los antecesores y compara los resultados para cada
polimorfismo PNS marcador; y
determina a partir de ello la probabilidad de que
el individuo sea o no progenie del antecesor o los antecesores
putativos.
La invención también proporciona:
un método de generación de un mapa genético de un
individuo, el cual:
(a) proporciona una serie polimórfica compuesta
por tres o más polimorfismos de nucleótido simple (PNS);
(b) identifica las variantes de PNS presentes en
un antecesor del individuo por determinación de los rasgos de
identidad básicos para cada posición del PNS en el cromosoma del
individuo;
(c) determina el número de coincidencias entre el
individuo y el antecesor;
(d) calcula el alcance de vinculación genética
entre cada alelo a partir del número de coincidencias obtenido en
el punto (c) y de la probabilidad de que cualquier par de alelos
hallado en el individuo haya sido heredada del mismo antecesor sobre
la base de las frecuencias alélicas de las variantes de
polimorfismos PNS de la serie polimórfica, con lo cual construye el
mapa genético del individuo.
La Figura 1 ilustra el método preferente para la
clonación de fragmentos de genoma arbitrarios. El ADN del genoma se
fracciona según su tamaño y a continuación se introduce en un
vector plásmido con el fin de obtener clones arbitrarios. Se diseñan
los PCR primers (reacción en cadena de polimerasa,
cebadores) y se emplean para secuenciar las secuencias de
genoma insertadas
La Figura 2 ilustra los datos resultantes
generados por el método preferente para la identificación de nuevas
secuencias polimórficas, es decir, una secuenciación cíclica de un
fragmento de genoma arbitrario.
La Figura 3 ilustra el método PLFR para aislar
clones arbitrarios en secuencias polimórficas. Tras la optimización
inicial de las condiciones PCR (arriba), el material amplificado es
fragmentado con diversos enzimas de restricción, y se analizan los
patrones resultantes (centro). A continuación se lleva a cabo un
estudio de la población para determinar las frecuencias
alélicas.
La Figura 4 muestra un gráfico con la
probabilidad de que dos individuos con un panel determinado de
marcadores genéticos tengan genotipos idénticos. El eje de abscisas
representa el número de pruebas efectuadas y el eje de ordenadas, la
probabilidad acumulada de no-identidad. Leyenda:
o indica el prototipo extrapolado; x indica 3 alelos (51%,
34%, 15%); el triángulo indica 2 alelos (79%, 21%).
La Figura 5 muestra un gráfico con la
probabilidad de que unos paneles determinados de 20 marcadores
genéticos excluyan a un padre arbitrario en una prueba de paternidad
en que la madre no está en cuestión. El número de pruebas se
representa en el eje de abscisas y la probabilidad en el eje de
ordenadas. La línea horizontal indica el 0,95% de probabilidad de
exclusión. La leyenda es la misma que para la Figura 4.
La Figura 6 ilustra en la Tabla 1 la organización
de las secuencias a partir del PNS identificado en el clon
177-2.
La Figura 7 ilustra el método preferente PNS para
la determinación del genotipo. Las siete etapas ilustran cómo
efectuar un GBA a partir de una muestra biológica.
Las Figuras 8A y 8B ilustran cómo aparecen los
datos de parentesco equino en el nivel de un macho de
microtitulación.
Las secuencias de genes particulares de interés
para la presente invención incluyen "polimorfismos de nucleótido
simple". Un "polimorfismo" es una variación en la secuencia
de ADN de algunos miembros de una especie. Los genomas de los
animales y las plantas sufren de manera natural mutaciones
espontáneas en el curso de su continua evolución (Gusella, J.F.,
Ann. Rev. Biochem. 55:831-854 (1986)). La
mayoría de tales mutaciones crean polimorfismos. La secuencia
mutada y la secuencia inicial coexisten en la población de la
especie. En algunos casos, esta coexistencia está en equilibrio
estable o cuasiestable. En otras ocasiones, la mutación otorga una
ventaja para la supervivencia o evolutiva a la especie y,
consecuentemente, puede eventualmente (esto es, en términos de
tiempos evolutivos) llegar a quedar incorporada al ADN de todos los
individuos de aquella especie.
Un polimorfismo se denomina "alélico"
porque, debido a la existencia de un polimorfismo, algunos
individuos de una especie pueden tener la secuencia no mutada (es
decir, el "alelo" original), a la vez que otros pueden tener la
secuencia mutada (esto es, el alelo variante o mutado). En el caso
más simple, sólo existe una secuencia mutada, y se dice que el
polimorfismo es dialélico. los polimorfismos dialélicos son los más
comunes y los preferentes para la presente invención. La ocurrencia
de mutaciones alternativas puede dar lugar a polimorfismos
trialélicos, etc. Un alelo puede ser definido por el nucleótido o
los nucleótidos que involucra la mutación. Así, por ejemplo, en la
Tabla 1, el clon 177-2 (Id. sec. Nº: 1 y id. sec.
Nº: 2) ilustra la secuencia de una hebra de un polimorfismo
dialélico en el cual un alelo tiene una "C" y el otro alelo una
"T" en la posición polimórfica.
La presente invención se dirige a una clase
particular de polimorfismos alélicos y a su empleo para el
genotipado de una planta o un animal. Estos polimorfismos alélicos
se van a denominar a partir de ahora "polimorfismos de nucleótido
simple", o PNS. Los polimorfismos de nucleótido simple vienen
definidos por los atributos siguientes. Un atributo central de un
polimorfismo de este tipo es que contiene un lugar polimórfico, X,
preferentemente ocupado por un único nucleótido, que es el lugar de
la variación entre las secuencias del alelo. Una segunda
característica de un PNS es que, preferentemente, el lugar
polimórfico X va precedido y seguido por secuencias del alelo
invariantes. El lugar polimórfico del PNS se dice que yace así
"inmediatamente" 3' hacia una secuencia
"5'-proximal" invariante, o
"inmediatamente" 5' hacia una secuencia
"3'-distal" invariante. Estas secuencias
flanquean el lugar polimórfico.
Tal y como se ha venido haciendo hasta aquí, se
dice que una secuencia de un alelo es "invariante" si la
secuencia no presenta variaciones en la población de la especie, y
si se trazara el mapa genético, la secuencia "correspondiente"
remitiría al mismo alelo en el genoma de todos los miembros de la
población de la especie. Se dice que dos secuencias son secuencias
"correspondientes" si son análogas la una respecto a la otra y
se han obtenido a partir de orígenes distintos. Las secuencias de
genes codificantes de la hemoglobina en dos seres humanos sirven
como ejemplo de secuencias alélicas correspondientes. Hasta aquí se
ha pretendido aclarar, la definición que se ha venido utilizando de
"alelos correspondientes", aunque no alterar el significado de
este término tal como es entendido comúnmente por cualquier
especialista en este ámbito. Cada fila de la Tabla 1 muestra la
identidad de un nucleoide de la posición polimórfica de alelos
"correspondientes" equinos, además de las secuencias
5'-proximal y 3'-distal
invariantes, que también son atributos de aquel PNS. La Tabla 5
muestra "alelos correspondientes" relativos a seres humanos.
Cada fila de la Tabla 5 muestra la identidad del nucleótido de la
posición polimórfica de alelos correspondientes humanos, además de
las secuencias 5'-proximal y
3'-distal invariantes, que también son atributos de
aquel PNS.
Puesto que el ADN genómico es una cadena de doble
hebra, cada PNS puede definirse en términos de cada una de las
hebras. Así, para cada PNS, una hebra contendrá una secuencia
inmediatamente 5'-proximal invariante y la otra
contendrá una secuencia inmediatamente 3'-distal
invariante. En la forma de realización preferente , en que la
posición polimórfica del PNS, X, es un único nucleótido, cada hebra
de la cadena doble del ADN del PNS contendrá tanto una secuencia
inmediatamente 5'-proximal invariante como una
secuencia 3'-distal invariante.
Aunque los PNS preferentes para la presente
invención involucran una sustitución de un nucleótido por otro en la
posición polimórfica del PNS, los PNS también pueden presentar
formas más complejas e involucrar la delección de un nucleótido de,
o la inserción de un nucleótido en una de las dos secuencias
correspondientes. Por ejemplo, una secuencia de genes concreta
puede contener una A en una posición polimórfica particular en
algunos animales, mientras que en otros animales puede haber en
aquella posición una delección de base simple o múltiple. Aunque
los PNS preferentes para esta invención tienen tanto una secuencia
proximal invariante como una secuencia distal invariante, los PNS
pueden tener sólo una secuencia proximal invariante o una secuencia
distal invariante.
Las moléculas de ácido nucleico que tienen una
secuencia complementaria a la de una secuencia inmediatamente
3'-distal invariante de un PNS pueden, si se
replican "siguiendo un molde", formar un producto replicado que
contendría la posición polimórfica del PNS. Un ejemplo preferente
de molécula tal de ácido nucleico es una molécula de ácido nucleico
cuya secuencia sea la misma que la de una secuencia
5'-proximal invariante del PNS. Replicar
"siguiendo un molde" se refiere a la capacidad de una
polimerasa para mediar la réplica de un primer de modo tal
que la secuencia replicada sea complementaria de la secuencia de un
molde de ácido nucleico. Un primer es un oligonucleótido de
hebra única o un polinucleótido de hebra única capaz de ser
replicado por adición covalente de un nucleótido en una reacción de
replicación "según un molde". Para poseer dicha capacidad, el
primer ha de tener un radical 3'-hidroxil y
pasar por un proceso de hibridación hacia una segunda molécula de
ácido nucleico (esto es, el "molde"). Un primer consta
típicamente de 11 bases o más; preferentemente, un primer tendrá 20
bases, aunque también servirán primers de longitudes menores
o mayores. Una "polimerasa" es una enzima capaz de incorporar
trifosfatonucleósidos para replicar un grupo
3'-hidroxil de una molécula de ácido nucleico. Se
puede hallar una discusión acerca de las enzimas de polimerasa en
Watson, J.D., en: Molecular Biology of the gene, 3ª ed.,
W.A. Benjamin, Inc., Menlo Park, CA (1977) y en textos similares.
Otras polimerasas como el gran fragmento proteolítico de la
ADN-polimerasa I de la bacteria E. coli,
conocido comúnmente como polimerasa "Klenow",
ADN-polimerasa I de E. coli y
ADN-polimerasa T7 bacteriófaga, también pueden
emplearse para llevar a la práctica el método descrito aquí. Es
posible conseguir la ligación, siguiendo un molde, de ácidos
nucleicos que presentan la misma secuencia que los de la secuencia
inmediatamente 3'-distal invariante de un PNS a un
primer cuya secuencia sea la misma que la secuencia
inmediatamente 5'-proximal que ha sido replicada
por un nucleótido siguiendo un molde.
Las posiciones polimórficas de nucleótido simple
de la presente invención pueden ser utilizadas para analizar el ADN
de cualquier planta o animal. Estas posiciones resultan
especialmente aptas para analizar el genoma de los mamíferos, entre
los cuales se pueden incluir seres humanos, primates no humanos,
animales domésticos (perros, gatos, etc.), animales de granja
(vacuno, ovino y otras reses) y otros animales cuya relevancia
económica es significativa, en particular, caballos. Sin embargo,
también pueden ser utilizadas en relación con otros tipos de
animales en particular, aves (pollos, pavos, etc.). Los
polimorfismos de tipo PNS presentan diversas ventajas notables
respecto a los de tipo PLFR, CRP y RPNV.
En primer lugar, los PNS se dan con mayor
frecuencia (aproximadamente entre 10 y 100 veces más) y mayor grado
de uniformidad que los PLFR y los RPNV. Una mayor frecuencia de los
PNS significa que pueden ser identificados con mayor presteza que
los otros tipos de polimorfismos. La mayor uniformidad de su
distribución permite la identificación de PNS "más próximos" a
un cierto rasgo de interés particular. El efecto combinado de estos
atributos convierten a los PNS en polimorfismos altamente valiosos.
Por ejemplo, si una característica particular (por ejemplo,
predisposición a padecer cáncer) refleja una mutación en un
locus particular, cualquier polimorfismo asociado a aquel
locus particular puede servir para estimar la probabilidad de
que un individuo exhiba dicha característica.
El valor de tal estimación viene determinado en
parte por la distancia entre el polimorfismo y el locus. Así,
si el locus se halla lejos de cualquier patrón de secuencia
de nucleótidos repetidos a pares, los análisis RPNV serán de valor
muy limitado. De modo parecido, si el locus está lejos de
cualquier PLFR detectable, un análisis PLFR no sería de precisión.
Sin embargo, dado que la presencia de PNS es de aproximadamente uno
por cada 300 bases del genoma de los mamíferos y presenta una
distribución uniforme, estadísticamente puede hallarse un PNS por
cada 150 bases, independientemente de cualquier lesión o mutación
genética particular. Ciertamente, la mutación particular puede ser
en sí misma un PNS. En ese caso, la variación del nucleótido en ese
locus de la secuencia es determinante de la característica en
cuestión.
En segundo lugar, los PNS son más estables que
otras clases de polimorfismos. Su ritmo de mutación espontánea es de
en torno a 10^{-9}, aproximadamente 1.000 veces menos frecuente
que el de los RPNV. Notablemente, los polimorfismos de tipo RPNV se
caracterizan por ritmos de mutación altos.
Tercero, los PNS presentan la ventaja añadida de
que su frecuencia alélica puede ser inferida a partir del estudio de
relativamente pocas muestras representativas. Estas características
de los PNS permiten alcanzar niveles de resolución genética de
identidad, prueba de paternidad y análisis de predisposición a
determinados rasgos genéticos en animales que no son posibles con
los polimorfismos PLFR ni con los RPNV.
Cuarto, los PNS presentan la definición de
información genética más alta posible: la posición del nucleótido y
la identidad de la base. A pesar de proporcionar un nivel de
definición tan alto, los PNS pueden ser detectados con mayor
presteza que los PLFR o los RPNV, y con una mayor flexibilidad. Al
ser, en efecto, el ADN una cadena de doble hebra, es posible
analizar la hebra complementaria del alelo para confirmar la
presencia y la identidad de cualquier PNS.
La flexibilidad con que puede caracterizarse un
PNS identificado es un aspecto notable de los PNS. Los polimorfismos
del tipo RPNV, por ejemplo, son más fáciles de detectar por métodos
de fraccionamiento según tamaño que pueden discernir una variación
en el número de las repeticiones. Los PLFR se detectan más
fácilmente por métodos de fraccionamiento según tamaño tras su
digestión por restricción.
En contraste, los PNS pueden ser caracterizados
por una amplia variedad de métodos. Entre estos métodos se incluyen
la secuenciación directa o indirecta de la posición, el uso de
enzimas de restricción donde los respectivos alelos del lugar crean
o destruyen una posición de restricción, el empleo de sondas de
hibridación específicas de alelo, la utilización de anticuerpos
específicos para las proteínas codificadas por los diferentes
alelos del polimorfismo, o por medio de interpretación
biomédica.
El método "Análisis de bit genético" (ABG)
desarrollado por Goelet, P. y otros (WO 92/15712) y
discutido a continuación es un método preferente de la presente
invención para la detección de los polimorfismos de nucleótido
simple. ABG es un método de averiguación de posiciones polimórficas
en que la información de la secuencia de nucleótidos alrededor de
la posición de la variación en una secuencia del ADN original se
emplea para diseñar un primer oligonucleótido que sea complementario
a la región inmediatamente adyacente, pero que no incluya, al
nucleótido variable del ADN original. El molde de ADN original se
selecciona a partir de la muestra biológica y se hibrida para
transformarlo al primer de averiguación. Este primer
se amplía con un solo didesoxinucleótido etiquetado usando la
ADN-polimerasa en presencia de dos, y
preferentemente los cuatro precursores de las cadenas de los
radicales de trifosfatonucleósidos. Cohen, D. y otros
(solicitud PCT WO91/02087) describe un método de genotipificación
relacionado.
Recientemente se han descrito algunos procesos de
incorporación guiada de nucleótidos al primer para hallar
posiciones polimórficas en el ADN (Kohmer, J.S. y otros, Nucl.
Acids. Res. 17:7779-7784 (1989); Solokov,
B.P., Nucl. Acids Res. 18:3671 (1990); Syvänen, A.-C.
y otros, Genomics 8:684-692 (1990);
Kuppuswamy, M.N. y otros, Proc. Natl. Acad. Sci. (U.S.A.)
88:1143-1147 (1991); Prezant, T.R. y
otros, Hum. Mutat. 1:159-164 (1992);
Ugozzoli, L. y otros, GATA 9:107-112
(1992); Nyrén, P. y otros, Anal. Biochem.
208:171-175 (1993)). Estos métodos se
diferencian del método ABG en que se basan en incorporar
desoxinucleótidos etiquetados para distinguir las bases en
posiciones polimórficas. De esta forma, dado que la señal es
proporcional al número de desoxinucleótidos incorporados, los
polimorfismos del mismo nucleótido que ocurren en un segmento dan
lugar a señales proporcionales a la longitud del segmento (Syvänen,
A.-C. y otros, Amer. J. Hum. Genet.
52:46-59 (1993)). El espectro de señales de
este tipo, específicos del locus, podría ser más complejo de
interpretar, sobre todo para heterozigotos, en comparación con la
sencilla clase ternaria (2:0, 1:1 o 0:2) de señales producidas por
el método ABG. Además, la incorporación de un desoxinucleótido
incorrecto puede ocurrir en algunos loci incluso en la
presencia del didesoxinucleótido correcto (Kohmer, J.S. y otros,
Nucl. Acids. Res. 17:7779-7784 (1989)).
Estos casos de incorporación errónea de desoxinucleótidos pueden
deberse a que el factor K_{m} de la ADN-polimerasa
para el sustrato desoxi- desparejado sea comparable, en algunos
contextos de la secuencia, al relativamente pobre K_{m} de,
incluso, un sustrato de base didesoxi- correctamente emparejado
(Kornberg, A. y otros, en: DNA Replication, 2ª ed. W.H.
Freeman and. Co. (1992), Nueva York; Tabor, S. y otros, Proc.
Natl. Acad. Sci. (U.S.A.) 86 :4076-4080
(1989)). Este efecto contribuiría al ruido de fondo del análisis de
averiguación de posiciones polimórficas.
Un método preferente para descubrir posiciones
polimórficas implica una secuenciación comparativa de fragmentos
genómicos del ADN a partir de unos cuantos genomas haploides. En
la forma de realización preferente, ilustrada en la Figura 1, la
secuenciación se lleva a cabo a partir de una biblioteca genómica de
fragmentos de ADN aleatorios que contiene 0,5-3 kb
fragmentos de ADN obtenidos de un individuo de una especie. Las
secuencias obtenidas por recombinación aleatoria de estos
fragmentos se emplean entonces para obtener secuenciaciones PCR,
correspondientes a los mismos loci genómicos, de algunos
individuos de aquella especie seleccionados arbitrariamente.
A partir de estas bibliotecas genómicas
(típicamente, de alrededor de unos 50.000 clones), varios
centenares de clones individuales son purificados, y determinadas
las secuencias de sus radicales de inserción. Sólo es necesario
conseguir una pequeña cantidad de datos de la secuencia radical
(100-200 bases) para obtener una amplificación PCR
de la región clonada. El propósito de la secuenciación es obtener
suficiente información para permitir la síntesis de primers
adecuada para mediar la amplificación de los fragmentos
equivalentes a partir de muestras del ADN genómico de otros miembros
de la especie. Preferentemente, estas determinaciones de secuencias
se llevan a cabo mediante algun tipo de metodología de ciclo
secuenciador.
Los primers se usan para amplificar el ADN
a partir de un panel de individuos de la especie considerada
seleccionados arbitrariamente. El número de individuos que
constituyen el panel determina la frecuencia más baja de los
polimorfismos que se van a aislar. Así, si se evalúan seis
individuos, un polimorfismo cuya frecuencia sea de, por ejemplo,
0,01 podría no ser identificado. En un ilustrativo aunque muy
simplificado tratamiento matemático, a partir de una muestra de seis
individuos se esperaría identificar sólo aquellos polimorfismos que
se dan con una frecuencia mayor de un valor de en torno a 0,08
(esto es, la frecuencia total 1,0 dividida por 6 individuos y
dividido por 2 alelos por genoma). Luego, si uno pretendo
identificar polimorfismos menos frecuentes, es necesario evaluar un
panel de mayor número de individuos.
Algunos instrumentos de secuenciación
automatizada de ADN y algunas aplicaciones de software (Applied
Biosystems, Inc.) facilitan el análisis cíclico de secuencias
(Mullis, K. y otros, Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol.
51:263-273 (1986); Erlich H. y otros,
solicitud de patente europea 50.424; solicitud de patente europea
84.796, solicitud de patente europea 258.017, solicitud de patente
europea 237.362; Mullis, K., solicitud de patente europea 201.184;
Mullis, K. y otros, patente E.E.U.U. nº. 4.683.202; Erlich,
H., patente E.E.U.U. nº 4.582.788; y Saiki, R. y otros,
patente E.E.U.U. nº 4.683.194). Estas herramientas permiten
identificar las diferencias entre secuencias de animales distintos
y confirmarlas por simple inspección de la porción relevante de
cromatogramas en la pantalla del ordenador. Estas diferencias se
interpretan para reflejar un polimorfismo en el ADN sólo si se
dispone de los datos correspondientes a las dos hebras, y si se
hallan presentes en más de un ejemplo de haploide entre la
población de animales examinados. La Figura 2 ilustra el método
preferente de identificación de secuencias polimórficas nuevas, que
consiste en una secuenciación cíclica de un fragmento genómico
arbitrario. Los fragmentos PCR de cinco caballos sin relación entre
sí fueron electroeludidos con geles acrilamida y secuenciados por
medio de ciclos repetitivos de ADN-polimerasa
T_{aq} termoestable en presencia de una mezcla de dNTP y ddNTP
fluorescentes. A continuación se separaron los productos y se
analizaron con un instrumento de secuenciación de ADN automatizado
de Applied Biosystems, Inc. Los datos fueron analizados con un
software ABI. Las diferencias entre las secuencias de animales
diferentes fueron identificadas por el software y confirmadas por
inspección de la porción relevante de cromatogramas en la pantalla
del ordenador. Las diferencias se presentan como "polimorfismos
del ADN" sólo si se dispone de los datos para las dos hebras y se
hallan presentes en más de un ejemplo de haploide entre los cinco
caballos examinados. El panel de arriba muestra un homozigoto
"A", el panel del centro, un heterozigoto "AT" y el panel
de abajo un homozigoto "T".
A pesar de la naturaleza arbitraria de estas
búsquedas de polimorfismos, estas secuenciaciones y comparaciones
de clones de ADN aleatorios es efectivamente capaz de identificar
polimorfismos apropiados. En efecto, en referencia al ejemplo de los
caballos, aproximadamente 1/400 nucleótidos secuenciados por estos
métodos serían identificados como posiciones polimórficas de tipo
PNS.
Alternativamente, el descubrimiento de posiciones
polimórficas puede llevarse a cabo por la estrategia que se
esquematiza en la Figura 3. En esta forma de realización, los
polimorfismos de la secuencia de ADN son identificados por
comparación de los perfiles de segmentación de endonucleasa por
restricción generados por un panel de diversos enzimas de
restricción sobre productos de la reacción PCR a partir de moldes
genómicos de individuos no relacionados. Preferentemente, cada
nucleasa de restricción empleada tendrá cuatro secuencias para el
reconocimiento de bases, y de este modo proporcionará un número
deseable de cortes en los productos amplificados.
Los patrones de digestión por restricción
obtenidos a partir de los ADN genómicos se comparan,
preferentemente, directamente con los patrones obtenidos de los
productos PCR generados a partir de los correspondientes moldes
plásmidos. Tal comparación proporciona un control interno que indica
que las secuencias amplificadas a partir de los ADN genómico y
plásmido derivan de loci equivalentes. Este control también
permite la identificación de primers que amplifican
fortuitamente secuencias repetidas o copias múltiples de
loci, ya que generan muchos más fragmentos a partir de los
moldes genómicos que a partir de los moldes plásmidos.
Para la presente invención se puede emplear
cualquiera de los diversos métodos de identificación de la posición
polimórfica, X, de un polimorfismo de nucleótido simple. El método
preferente para dicha identificación consiste en discernir
directamente la secuencia de la posición polimórfica para cada
polimorfismo que se analiza. Esta aproximación difiere, sin
embargo, notablemente del método PLFR, la cual analiza patrones de
bandas en lugar de propiamente la secuencia específica de un
polimorfismo.
Las muestras de especímenes de ácido nucleico de
un individuo de la especie objeto de análisis pueden obtenerse por
medios "invasivos" o "no invasivos". Un medio de
obtención de una muestra recibe el nombre de "invasivo" si
obtiene las muestras de ácido nucleico del interior de la piel o
los órganos de un animal (incluidos, especialmente, un múrido,
ovinos, equinos, bovinos, porcinos, caninos, felinos y seres
humanos). Entre los ejemplos de métodos invasivos se incluyen la
extracción de sangre, de semen, la biopsia hipodérmica, la
aspiración pleural, etc. Algunos ejemplos de estos métodos se
desarrollan en Kim, C.H. y otros (J. Virol.
66:3879-3882 (1992)); Biswas, B. y otros
(Annals NY Acad. Sci. 590:582-583
(1990)); Biswas, B. y otros (J. Clin. Microbiol.
29:2228-2233 (1991)).
Por el contrario, un método de obtención de
muestras "no invasivo" obtiene las moléculas de ácido nucleico
de alguna superficie interna o externa del animal. Como ejemplos de
obtención de muestras por métodos no invasivos se incluyen el uso de
torundas y la obtención de lágrimas, saliva, orina, defecaciones,
sudor o exudados, etc. Tal y como se emplea en este texto, la
expresión "uso de torundas" denota poner en contacto un
elemento de aplicación/obtención (la torunda), que consta de algún
material adsorbente, con una superficie de modo tal que permita
recoger trazas de la superficie y/o células muertas o viejas o
restos celulares. Esta obtención puede ser por introducción de la
torunda en los orificios nasales, oral, rectal, vaginal o aurales, o
bien por contacto directo con la piel o los lacrimales, por
recolección de folículos capilares, etc.
Se han empleado torundas nasales para obtener
especímenes clínicos para amplificación por PCR (Olive, D.M. y
otros, J. Gen. Virol. 71:2141-2147
(1990); Wheeler, J.G. y otros, Amer. J. Vet. Res.
52:1799-1803 (1991)). El uso de folículos
capilares para identificar polimorfismos RPNV para las pruebas de
paternidad en caballos ha sido descrito en Ellegren, H. y otros
(Anim. Genetics 23:133-142 (1992). Los
estados de referencia que un sistema de comprobación normalizado
basado en polimorfismos microsatélites analizados por PCR pueden
acabar siendo una alternativa razonable a la determinación de
genoma a partir de una muestra de sangre en las pruebas de
paternidad.
Para la obtención del ADN se requerirá
preferentemente un tipo de torunda que disponga de algún apoyo
sólido, una parte del cual por lo menos estará diseñada para
adsorber ADN. La parte diseñada para adsorber ADN puede presentar
una textura compresible, como de gomaespuma o similar.
Alternativamente, puede presentar una composición fibrosa
adsorbente, como algodón, poliéster, nylon o semejante. Aún
en otra forma de realización, la parte diseñada para adsorber ADN
puede ser alguna materia abrasiva, como un cepillo o pincel, o
presentar una superficie rugosa. La parte de la torunda diseñada
para adsorber ADN puede ser una combinación de las texturas y
composiciones mencionadas arriba (por ejemplo, un cepillo
compresible, etc.). La torunda tendrá preferentemente forma de
varilla, flecha o champiñón, y dispondrá de un segmento por donde
el individuo que recoje la muestra pueda sujetar la torunda, y una
punta o extremo que pueda entrar en contacto con la superficie que
contiene la muestra de ADN que se pretende obtener. En una forma de
realización, la torunda puede disponer de algún tipo de cámara para
el almacenamiento de la muestra, por ejemplo un tubo o cilindro de
vidrio o plástico, uno de cuyos extremos puede estar abierto, como
en un tubo de ensayo. O bien, el tubo puede tener los dos extremos
abiertos, de modo que la torunda se puede sujetar por un extremo e
introducirse en el tubo por el otro extremo. Y aún, en otra forma
de realización, el tubo puede tener los dos extremos abiertos, de
tal modo que, tras usar la torunda, el tubo pueda servir de capilar
en el tratamiento posterior del ADN obtenido. En una forma de
realización, el extremo o los extremos de la cámara de
almacenamiento se sellan automáticamente tras haber recogido la
muestra.
La torunda o la cámara de almacenamiento pueden
contener agentes antimicrobianos en concentraciones suficientes para
evitar la proliferación de microbios (bacterias, levaduras, mohos,
etc.) durante su subsiguiente almacenamiento y tratamiento.
En una forma de realización, la torunda o la
cámara de almacenamiento puede contener un agente cromogénico que
reaccione a la presencia de ADN y produzca una señal detectable que
pueda ser identificada en el mismo momento de la obtención de la
muestra. Preferentemente, este agente deberá tener la concentración
mínima para un ensayo de análisis de ADN de "análisis de punto
final indeterminado". Este ensayo es capaz de detectar
concentraciones de ácidos nucleicos entre un nivel mínimo hasta un
nivel máximo de saturación. El nivel de saturación es ajustable, y
puede incrementarse por reducción del tiempo de reacción. Entre los
agentes reactores cromogénicos se cuentan los anticuerpos
anti-ADN conjugados de enzimas, ácido
diaminopimélico, etc.
El empleo de métodos de amplificación del ADN
puede facilitar la detección de posiciones polimórficas en una
muestra de ADN. Estos métodos incrementan específicamente la
concentración de secuencias que abarcan la posición polimórfica o
incluyen aquella posición y secuencias dispuestas tanto distal como
proximalmente a ésta. Estas moléculas replicadas pueden detectarse
con rapidez por gel para electroforesis u otros medios.
El método preferido para conseguir esta
amplificación es el PCR, que parte de unos pares primer que
son capaces de hibridar las secuencias proximales que definen un
polimorfismo en su forma de doble hebra.
En lugar de PCR pueden emplearse métodos
alternativos como la "Ligase Chain Reaction" (LCR) (Barany,
F., Proc. Natl. Acad. Sci. (U.S.A.)
88:189-193 (1991)). La LCR utiliza dos pares
de muestras de oligonucleótidos sonda para conseguir una
amplificación exponencial de la sustancia original específica. Las
secuencias de cada par de oligonucleótidos se seleccionan de modo
tal que el par hibrida las secuencias colindantes de la misma hebra
de sustancia analizada. Esta hibridación forma un sustrato para un
enlace según molde. Igual que en el PCR, los productos resultantes
sirven como molde en los ciclos subsiguientes y se obtiene una
amplificación exponencial de la secuencia deseada.
De acuerdo con la presente invención, la LRC
puede llevarse a cabo con oligonucleótidos que tengan secuencias
proximal y distal de una posición polimórfica en una misma hebra.
En una forma de realización, se elegirá cualquier oligonucleótido
que incluya la posición polimórfica del polimorfismo. En esta forma
de realización, las condiciones de la reacción se eligen de tal
modo que los oligonucleótidos sólo pueden enlazarse si la molécula
que se replica contiene o carece del nucleótido específico
complementario en la posición polimórfica del oligonucleótido.
En una forma de realización alternativa, los
oligonucleótidos no incluirán la posición polimórfica, de modo que
cuando hibridan la molécula de origen, se crea un "hueco"
(gap) (véase Segev, D., aplicación PCT WO 90/01069). Este
hueco se "llena" entonces con dNTP complementarios (por medio
de ADN-polimerasa) o con pares de oligonucleótidos
adicionales. Así, al final de cada ciclo, cada hebra tiene un
complemento que puede servir como raíz durante el ciclo siguiente y
se obtiene una amplificación exponencial de la secuencia.
Nickerson, D.A. y otros han descrito un ensayo de
detección de ácido nucleico que combina atributos de PCR y OLA
(Nickerson, D.A. y otros, Proc. Natl. Acad. Sci. (U.S.A.)
87:8923-8927 (1990)). Este método emplea un
PCR para conseguir una amplificación exponencial del ADN, que a
continuación se detecta con OLA. Sin embargo, estas combinaciones
heredan todos los problemas asociados con PCR y OLA.
También son conocidos (Wu, D.Y. y otros,
Genomics 4:560) los esquemas basados en enlaces de dos
(o más) oligonucleótidos en presencia de ácido nucleico que
proporcionan una secuencia resultante de
"di-oligonucleótido", los cuales pueden ser
fácilmente adaptados a los propósitos de la presente invención.
Otros procedimientos conocidos de replicación de
ácido nucleico, como los sistemas de amplificación por
transcripción (Malek, L.T. y otros, patente U.S. 5.130.238;
Davey, C y otros, solicitud de patente europea 329.822;
Schuster y otros, patente U.S. 5.169.766; Miller, H.I. y
otros, aplicación OCT WO 89/06700; Kwoh, D. y otros, Proc.
Natl. Acad. Sci. (U.S.A) 86:1173 (1989); Gingeras, T.R.
y otros, aplicación PCT WO 88/10315)), o métodos de
amplificación isoterma (Walker, G.T. y otros, Proc. Natl. Acad.
(U.S.A.) 89:392-396 (1992)).
El análisis directo de la secuencia de un PNS de
la presente invención puede acometerse ya sea por el "método de
terminación de cadena mediante dideoxido", conocido también como
el "método Sanger" (Sanger, F. y otros, J. Molec. Biol.
94:441 (1975)) o por el "método por degradación
química", también conocido como el "método
Maxam-Gilbert" (Maxam, A.M. y otros, Proc.
Natul. Acad. Sci. (U.S.A) 74:560 (1977)), ambos a partir
de aquí incorporados por referencia. Los métodos de secuenciación de
ADN que se basan tanto en el "método de terminación de cadena
mediante dideoxido" como en el "método
Maxam-Gilbert" son ampliamente conocidos entre
aquellas personas expertas en la materia. Dichos métodos se
desarrollan, por ejemplo, en Sambrook, J. y otros, Molecular
Cloning, a Laboratory Manual (2ª ed.), Cold Spring Harbor Press,
Cold Spring Harbor, Nueva York (1989), y en Zyskind, J.W. y
otros, Recombinant DNA Laboratory Manual, Academic Press, Inc.
Nueva York (1988).
Donde una molécula de ácido nucleico contiene una
doble hebra de ADN (o ARN), o donde se ha empleado un protocolo de
amplificación de una doble hebra de ácido nucleico (como PCR), en
general es deseable tratar las moléculas de doble hebra antes de
efectuar dicho análisis de la secuencia para obtener un preparado
que en el que preferentemente se enriquece predominantemente una
sola de las dos hebras.
El método más sencillo para generar moléculas de
ADN bicatenarias es su desnaturalización por tratamiento con calor o
sustancias alcalinas.
Las moléculas de ADN monocatenarias también
pueden producirse utilizando la molécula de ADN monocatenaria
bacteriófaga M13 (Messing, J. y otros, Meth. Enzymol
101:20 (1983); véase también Sambrook, J. y otros (En:
Molecular Clonning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor
Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY (1989)).
Diversos otros métodos pueden emplearse para
generar hebras simples de moléculas de ADN. Gyllensten, U. y
otros (Proc. Natl. Acad. Sci. (U.S.A.)
85:7652-7656 (1988) y Mihovilovic, M. y
otros, (BioTechniques) 7(1) :14 (1989)) describen
un método, denominado "PCR asimétrico", en que el método
estándar PCR se lleva a cabo a partir de diversas concentraciones
molares de primers. Higuchi, R.G. y otros (Nucleic Acids
Res. 17:5865 (1985)) ejemplifica un método adicional para
amplificar hebras simples de productos. El método involucra la
fosforilación del radical 5' de una de las hebras de la doble
cadena del producto que se desea amplificar, para a continuación
permitir que una
5' \rightarrow 3' exonucleasa (por ejemplo, la exonucleasa) degrade la hebra fosforilada.
5' \rightarrow 3' exonucleasa (por ejemplo, la exonucleasa) degrade la hebra fosforilada.
Otros métodos han explotado las propiedades de
resistencia de las nucleasas de compuestos tiofosfatados para
generar hebras simples de moléculas de ADN (Benkovic y
otros, patente U.S. nº 4.521.509; 4 de junio, 1985); Sayers,
J.R. y otros (Nucl. Acids Res. 16:791-802
(1988); Eckstein, F. y otros, Biochemistry
15:1685-1691 (1976); Ott, J. y otros,
Biochemistry 26:8237-8241 (1987)).
En Nikiforov, T. (solicitud de patente U.S.
número de serie 08/005.061, correspondiente a WO94/16090, publicada
el 21 de julio de 1994) se discuten las ventajas y los
inconvenientes relativos de estos métodos de producción de moléculas
de hebra simple.
Estas moléculas de hebra simple se producirán
preferentemente por los métodos descritos por Nikiforov, T.
(supra). En pocas palabras, estos métodos utilizan
compuestos de nucleótidos resistentes a nucleasas e incorporan estos
compuestos, por síntesis química o enzimas, a las moléculas
primer, o a su producto ampliado, en el lugar de los
nucleótidos que se dan de manera natural.
Los compuestos de nucleótidos adecuados incluyen
compuestos en que uno o dos de los oxígenos no enlazantes del
fosfato central de un nucleótido han sido sustituidos por algún
grupo sulfuro- (especialmente un tiofosfato), por un grupo alquil
(especialmente un metil o un etil), un grupo nitrógeno-
(especialmente un amina) y/o un grupo selenio-, etc.
Los compuestos desoxirribonucleicos o
ribonucleicos fosforotiados (por ejemplo, un nucleósido
5'-O-1-tiotrifosfato)
son los compuestos de nucleótidos preferidos. Para producir estos
compuestos tiofosfatados se puede emplear cualquiera de los
diversos métodos químicos que existen (véase, por ejemplo, Zon, G.
y otros, Anti-Canc. Drug Des.
6:539-568 (1991); Kim, S.G. y otros,
Biochem. Biophys. Res Commun.
179:1614-1619 (1991); Vu, H. y otros
Tetrahedron Lett. 32:3005-3008 (1991);
Taylor, J.W. y otros, Nucl. Acids Res.
13:8749-8764 (1985); Eckstein, F. y otros,
Biochemistry 15:1685-1691 (1976); Ott, J. y
otros Biochemistry 26:8237-8241 (1987);
Ludwig, J. y otros, J. Org. Chem.
54:631-635 (1989)). Los compuestos de
nucleótidos tiofosfatados también pueden obtenerse comercialmente en
Amersham o Pharmacia.
Es importante que el compuesto del nucleótido
seleccionado permita su replicación in vitro por
primer y confiera resistencia a exonucleasas hasta la zona
de la molécula de ácido nucleico donde se incorpore. En la forma de
realización preferente, este compuesto ha de conferir resistencia a
las exonucleasas que atacan la cadena doble de ADN desde el extremo
5' (5' \rightarrow 3' exonucleasas). Ejemplos de estas
exonucleasas incluyen la exonucleasa 6 gen T7 bacteriófaga ("T7
exonucleasa") y la exonucleasa lambda bacteriófaga ("\lambda
exonucleasa"). Tanto la T7 exonucleasa como la \lambda
exonucleasa están significativamente inhibidas por la presencia de
enlaces tiofosfatados para permitir la degradación selectiva de las
hebras. Sin embargo, es posible utilizar cualquier 5' \rightarrow
3' exonucleasa específica de cadena doble para este proceso, puesto
que su actividad se ve afectada por la presencia de los enlaces de
los compuestos de nucleótidos resistentes a nucleasas. El enzima
preferido al utilizar compuestos tiofosfatados es la T7 exonucleasa
6 gen bacteriófaga, que presenta una actividad enzimática máxima en
la misma solución tampón utilizada para muchas soluciones tampón de
ADN-polimerasa, incluida la polimerasa T_{aq}. Las
propiedades de resistencia de la 5' \rightarrow 3' exonucleasa de
las moléculas de ADN que contienen compuestos tiofosfatados se
discuten, por ejemplo, en Kunkel, T.A. (En: Nucleic Acids and
Molecular Biology, vol. 2, 124-135 (Eckstein, F
y otros, ed.), Springer-Verlag, Berlín, (1988)).
Las propiedades de resistencia de la 3' \rightarrow 5' exonucleasa
de los nucleótidos tiofosfatados que contienen moléculas de ácido
nucleico se discuten en Putney, S.D. y otros (Proc. Natl. Acad.
Sci. (U.S.A.) 78:7350-7354 (1981) y
Gupta, A.P. y otros (Nucl. Acids. Res.
12:5897-5911 (1984)).
Además de ser resistentes a estas exonucleasas,
las moléculas de ácido nucleico que contienen compuestos
tiofosfatados en posiciones de reconocimiento de segmentaciones de
endonucleasa por restricción son resistentes a estas segmentaciones.
Taylor, J.W. y otros (Nucl. Acids Res.,
13:8749-8764 (1985)) discuten las propiedades de
resistencia a la endonucleasa de los nucleótidos tiofosfatados que
contienen moléculas de ácido nucleico.
La resistencia a la nucleasa de los enlaces
tiofosfatos se ha utilizado en el protocolo de amplificación de ADN
(Walker, T.G. y otros (Proc. Natl. Acad. Sci. (U.S.A.)
89:392-396 (1992)). En el método de Walker
y otros, los compuestos de nucleótidos tiofosfatados se
insertan en una posición de reconocimiento de endonucleasa por
restricción en una hebra de una molécula de ADN bicatenaria. La
presencia de los compuestos de nucleótidos tiofosfatados protege
aquella hebra de segmentaciones, y el resultado es que la
endonucleasa segmenta la hebra desprotegida. La amplificación se
consigue repitiendo la segmentación y la polimerización de las
hebras.
De un modo parecido, la resistencia a los
ataques de la nucleasa se ha empleado como base para un método de
secuenciación Sanger modificado (Labeit, S y otros (DNA
5:173-177 (1986)). En el método Labeit y
otros se empleaban compuestos de nucleótidos tiofosfatados de
etiquetados con ^{35}S en lugar de los dideoxinucleótidos del
método Sanger.
En la forma de realización preferente, el
compuesto tiofosfatado se incluye en el primer. El compuesto
del nucleótido puede ser incorporado al radical 5' en cualquier
posición del primer, preferentemente adyacente a otro.
Preferentemente, las moléculas primer tendrán una longitud
aproximada de unos 25 nucleótidos y contendrán en torno a entre un
4% y un 40%, y más preferentemente un 16%, de residuos de
tiofosfatos (comparados con los residuos totales). Los nucleótidos
pueden ser incorporados a cualquier posición del primer y
estar adyacentes a otro, o esparcidos por todo o por una parte del
primer.
En una forma de realización, la presente
invención puede emplearse conjuntamente con un protocolo de
amplificación, por ejemplo, PCR. En esta forma de realización es
preferente limitar el número de enlaces tiofosfatados de los
primers a unos 10 (o aproximadamente la mitad de la longitud
de los primers), de modo que los primers puedan ser
usados en una reacción PCR sin ningún tipo de cambios en el
protocolo PCR que se haya establecido para los primers no
modificados. Cuando los primers contienen más enlaces
tiofosfatados, es posible que las condiciones PCR requieran ajustes,
especialmente por lo que respecta a las temperaturas templadas,
para optimizar la
reacción.
reacción.
La incorporación de estos compuestos de
nucleótidos al ADN o ARN puede conseguirse por la acción enzimática¡
de una ADN-polimerasa (Vosberg, H.P. y otros,
Biochemistry, 16:3633-3640 (1977);
Burgers, P.M.J. y otros, J. Biol. Chem.
254:6889-6893 (1979); Kunkel, T.A., en:
Nucleic Acids and Molecular Biology, vol. 2,
124-135 (Eckstein, F. y otros, ed.),
Springer-Verlag, Berlín (1988); Olsen, D.B. y
otros, Proc. Natl. Acad. Sci. (U.S.A.)
87:1451-1455 (1990); Griep, M.A. y otros,
Biochemistry 29:9006-9014 (1990);
Sayers, J.R. y otros, Nucl. Acids Res.
16:791-802 (1988)). Alternativamente, es
posible incorporar sintéticamente compuestos de nucleótidos
tiofosfatados en un oligonucleótido (Zon, G. y otros,
Anti-Canc. Drug Des.
6:539-568 (1991)).
Las moléculas primer se hibridizan a una
molécula complementaria del ácido nucleico original, y a
continuación se replican, preferentemente por medio de una
polimerasa, hasta formar el producto amplificado. La presencia de
los nucleótidos tiofosfatados en los primer proporciona al
producto amplificado resistencia a los ataques de las nucleasas.
Como se ha indicado, los productos amplificados que contienen
tiofosfatos u otros compuestos de nucleótidos adecuados son
sustancialmente resistentes a su "eliminación" (es decir, su
degradación) por 5' \rightarrow 3' exonucleasas tales como la T7
exonucleasa o la exonucleasa; así, una 5' \rightarrow 3'
exonucleasa será sustancialmente incapaz de seguir degradando una
molécula de ácido nucleico tras encontrarse con un residuo de
tiofosfato.
Puesto que la molécula objetivo carece de
residuos resistentes a nucleasas, al incubar el producto objetivo y
su "molde" -la muestra original- en presencia de una 5'
\rightarrow 3' exonucleasa, la hebra que actúa de "molde" se
destruye y se obtiene la producción preferente de la hebra simple
deseada.
El método preferente para determinar la identidad
de la posición polimórfica de un polimorfismo consiste en la
hibridación del ácido nucleico. Aunque dicha hibridación puede
llevarse a cabo en una disolución (Berk, A.J. y otros, Cell
12:721-732 (1977); Hood, L.E. y otros,
en: Molecular Biology of Eukariotic Cells: A Problems Approach,
Menlo Park, CA: Benjamin-Cummings (1975); Wetmer,
J.G., Hybridization and Renaturation Kinetics of Nucleic Acids,
Ann. Rev. Biophys. Bioeng. 5:337-361
(1976); Itakura, K. y otros, Ann. Rev. Biochem.
53:323-356 (1984)), es preferible emplear un
ensayo de hibridación en fase sólida (véase Saiki, R.K. y otros,
Proc. Natl. Acad. Sci. (U.S.A.)
86:6230-6234(1989); Gilham y otros,
J. Amer. Chem. Soc. 86:4982 (1964) y Kremsky y otros,
Nucl. Acids Res. 15:3131-3139
(1987)).
Para inmovilizar los oligonucleótidos al soporte
sólido puede emplearse cualquiera de los diversos métodos que
existen. Uno de los más ampliamente usados para conseguir esta
inmovilización de oligonucleótidos primer para su uso
posterior en ensayos de hibridización consiste en el recubrimiento
no covalente de estas fases sólidas con estreptavidina o avidina e
inmovilizar a continuación los oligonucleótidos biotinilados
(Holmstrom, K. y otros, Anal. Biochem.
209:278-283 (1993)). Otro conocido método
(Running J.A. y otros, BioTechniques 8:
276-277 (1990); Newton, C.R. y otros, Nucl.
Acids Res. 21:1155-1162 (1993)) requiere
el prerecubrimiento de las fases sólidas de poliestireno o vidrio
con poli-L-Lis o poli
L-Lis, Phe, seguido de la unión covalente de los
oligonucleótidos modificados con amino- o sulfidril- por medio de
agentes bifuncionales de enlace cruzado. Ambos métodos presentan
los inconvenientes de que requieren el uso de oligonucleótidos
modificados y además un pretratamiento de la fase sólida.
En otro método publicado (Kawai, S y otros,
Anal. Biochem, 209:63-69), algunos
oligonucleótidos sonda cortos se unían para formar polímeros que se
unían en un vector fago. Tras una amplificación in vitro y
el aislamiento de la forma monocatenaria de estos fagémidos, se
inmovilizaban en placas de poliestireno y se fijaban con radiación
ultravioleta a 254 nm. Las sondas inmovilizadas de este modo se
empleaban para capturar y detectar un producto PCR con biotina.
También ha sido publicado un método para la unión
covalente directa de primers cortos
5'-fosforilados a placas de poliestireno modificadas
químicamente (placas "Covalink", Nunc) (Rasmussen, S.R. y
otros, Anal. Biochem. 198:138-142
(1991)). La unión covalente de los oligonucleótidos modificados y la
superficie de la fase sólida se induce por condensación en una
disolución acuosa de un carbodiamida. Este método reivindica que
garantiza una unión predominantemente 5' de los oligonucleótidos a
través de sus 5'-fosfatos; sin embargo, requiere el
uso de placas especialmente preparadas de alto coste económico.
Esta inmovilización de oligonucleótidos
(preferentemente entre 15 y 30 bases) se consigue preferentemente
por un método que permite su uso directo, sin necesidad de ningún
tipo de pretatamiento, gracias a unas placas con pocillos de
poliestireno disponibles comercialmente (placas ELISA), o láminas
de vidrio microscópicas. Puesto que se emplean hasta 96 placas de
poliestireno en los análisis ELISA, se ha despertado un
significativo interés por el desarrollo de métodos de inmovilización
de oligonucleótidos primer cortos a los pocillos de estas
placas para los posteriores ensayos de hibridación. También resulta
de interés un método de inmovilización en láminas de vidrio
microscópicas, puesto que estas últimas se emplean en el así
denominado Ensayo de lámina inmunoenzimática [Slide Inmunoenzymatic
Assay] (SIA) (de Macario, E.C. y otros, BioThecniques
3:138-145) (1985)).
El soporte sólido puede ser vidrio, plástico,
papel, etc. El soporte puede presentar cualquier forma, globular,
de varilla, tubo de ensayo, etc. En una forma de realización
preferente, el soporte será un microdisco de titulación que poseerá
varios pocillos. Los microdiscos de titulación de 96 pocillos
convencionales empleados en laboratorios de diagnóstico y en el
cultivo de tejidos son un soporte preferente. El uso de este tipo
de soporte permite determinar simultáneamente un gran número de
muestras y controles, y facilitar así el análisis. Para analizar
las posiciones polimórficas pueden utilizarse sistemas automáticos
de distribución, y los análisis pueden llevarse a cabo por
espectrómetros automatizados.
Un aspecto de la presente invención concierne a
un método de inmovilización de los oligonucleótidos para su
análisis. De acuerdo con el método, cualquiera de los diversos
tipos de placas de poliestireno disponibles comercialmente puede
emplearse directamente para la inmovilización, dado que poseen una
superficie hidrofílica. Algunos ejemplos de placas adecuadas
incluyen las cuatro placas Immulon™ (Dynatech) y las placas
Maxisorp™ (Nunc). Los oligonucleótidos quedan inmovilizados en las
placas simplemente por incubación en presencia de una sal adecuada.
En ausencia de una sal, es decir, cuando el oligonucleótido se
halla presente en solución acuosa, no se produce inmovilización
alguna. Algunos ejemplos de sales adecuadas son:
50-250 mM NaCl; 30-100 mM
hidrocloruro de 1
etil-3-(3'-dimetilaminopropil)
carbodiamina (EDC), 6,8 pH; 50-150 mM hidrocloruro
de octilmetilamina, 7,0 pH; 50-250 mM cloruro de
tetrametilamonio. La incubación para la inmovilización dura
preferentemente entre 3 y 24 horas a temperatura ambiente. Tras la
incubación, las placas se lavan, preferentemente con una disolución
de 10 mM Tris HCl, 7,5 pH, que contenga 150 mM NaCl y 0,005% vol.
Tween-20 (TNTw). El último ingrediente cumple el
importante papel de bloquear todas las posiciones de unión de los
nucleótidos libres aún presentes en la superficie del poliestireno,
de modo que no se produzca ninguna unión de oligoestirenos no
específica durante las etapas de hibridación subsiguientes. El uso
de oligonucleótidos marcados radioactivamente ha permitido
determinar que la cantidad de oligonucleótidos inmovilizados por
pocillo es de por lo menos 500 fmol. La inmovilización de los
oligonucleótidos en la superficie de la placa es bastante estable y
sólo es posible eliminar los oligonucleótidos de la superficie por
incubación en disoluciones 0,5 M NaoH a altas temperaturas durante
períodos prolongados. No es posible eliminar los oligonocleótidos de
la placa con un simple lavado con agua, TNTw (Tween 20), PBS, 1,5
molar o disoluciones parecidas.
Los oligonucleótidos inmovilizados pueden
capturar secuencias específicas de ADN por hibridación. La
hibridación se suele llevar a cabo en una disolución de NaCl 1,5 M
y EDTA 10 mM, durante 15 a 30 minutos a temperatura ambiente.
También es posible preparar otras condiciones de hibridación. Se ha
determinado que los oligonucleótidos inmovilizados de un solo
pocillo hibridan más de 400 fmol de una secuencia específica de
ADN. Este ADN se une a los oligonucleótidos inicialmente
inmovilizados por enlaces de hidrógeno
Watson-Crick, que pueden retirarse fácilmente de los
pocillos con un simple lavado con una disolución de NaCl 0,1 M, sin
que se eliminen de la placa los oligonucleótidos inicialmente
unidos. Si el fragmento de ADN capturado no está marcado
radioactivamente, es decir, con un residuo de biotina, su detección
también puede efectuarse con un ensayo de unión enzimática
adecuado.
Aunque el método no requiere introducir
modificaciones en los oligonucleótidos sintéticos, si se desea,
permite la inmovilización de oligonucleótidos etiquetados (por
ejemplo, con biotina). La cantidad de oligonucleótidos que pueden
inmovilizarse en un único pocillo de una placa ELISA por este
método es de como mínimo 500 fmol. Los oligonucleótidos así
inmovilizados en fase sólida pueden hibridar "moldes"
adecuados y también participar en reacciones enzimáticas como
amplificaciones dirigidas según "molde" y ligamientos.
Para aplicaciones que requieren grandes volúmenes
de ensayos, son deseables métodos de detección no radioactivos. En
estos casos es preferible el uso de dideoxinucleótidos haptenados;
los dideoxinucleótidos con biotina son preferentemente aptos porque
dicha modificación proporciona una base detectable por medio de
enzimas conjugados de avidina (o estreptavidina) estándares
utilizados en los ensayos ELISA. Los ddNTPs con biotina se preparan
preferentemente por reacción de los cuatro respectivos
(3-aminopropin-1-il)
trifosfatonucleósidos con sulfosuccinimidil 6-(biotinamido)
exanoatos. Así, los
(3-aminopropin-1-il)
5'-trifosfatonucleósidos se preparan tal como se
describe en Hobbs, F.W. y otros (J. Org. Chem. 54:
3420-3422 (1989)) y en Hobbs, F.W. y otros
(patente U.S. número 5.047.519). El
(3-aminopropin-1-il)
5'-trifosfatonucleósido (50 mol) se disuelve en una
disolución acuosa 1 M de 1 ml, de 7,6 pH, de bicarbonato
trietilamonio (BTEA). Se añade sal de sulfosuccinimidil
6-(biotinamido) exanoato de sodio (Pierce, 55,7 mg, 100 mol) y la
disolución se calienta a 50º en un tubo tapado durante 2 horas. La
mezcla reactiva se diluye a 10 ml con agua y se aplica a un capilar
DEAE-Sephadex
A-25-120 (1,6 x 19 cm). La columna
se eluye con una disolución acuosa de BTEA (0,1 M a 1,0 M) de pH
7,6 con gradiente lineal manteniendo el eluyente a 270 nm . El pico
más alto del levigante final se recoge, se aparta y se evapora
conjuntamente con etanol. El producto bruto, que contiene
trifosfatonucleósido biotinilado y, en algunos casos, material
inicial contaminante, se purifica por cromatografía capilar de fase
inversa (empaquetado Baker C-18, lecho de 2 x 12 cm
). El material se carga en una disolución de BTEA 0,1 M de 7,6 pH y
se leviga con un gradiente escalonado de acetonitrilo en una BTEA
0,1 M de 7,6 pH (0% a 36%, en incrementos de 2%, 8 ml/etapa). En
cualquier caso, el producto biotinilado queda fijado con mayor
firmeza y se detecta con mayor nitidez a partir del material de
partida. Las fracciones que contienen el producto se retienen, se
apartan y se evaporan conjuntamente con etanol. El producto se mete
en agua y el resultado se calcula por el coeficiente de absorción
para los nucleótidos de partida. Los espectros NMR del ^{3}H y del
^{31}P son consistentes con la estructura esperada y confirman la
ausencia de contenido en fósforo o de impurezas de otros compuestos
de nucleótidos. Se ha observado que por HPLC los materiales
alcanzan niveles de pureza superiores al 99% (Waters Bondapak
C-18, 4,6 x 250 mm, 1 ml/min, 1 a 35% CH_{3}CN/pH
7/0,01 M acetato
trietilamonio).
trietilamonio).
La síntesis de
5(-3(-6-biotinamida(hexanoamida))propin-1-il)-2',
3'-dideoxiuridina-5'-trifosfato
presenta un resultado aproximado del 25% (asumiendo = 12.400 a
291,5 nm); HPLC t_{x} = 16,1 min.
La síntesis de
5(-3(-6-biotinamida(hexanoamida))propin-1-il)-2',
3'-dideoxicitidina-5'-trifosfato
presenta un resultado aproximado del 63% (asumiendo = 9.230 a 294,5
nm); HPLC t_{x} = 19,4 min.
La síntesis de
7(-3(-6-biotinamida(hexanoamida))propin-1-il)-7-deasa-2',
3'-dideoxiadenosina-5'-trifosfato
presenta un resultado aproximado del 39% (asumiendo = 13.600 a
278,5 nm); HPLC t_{x} = 23,1 min.
La síntesis de
7(-3(-6-biotinamida(hexanoamida))propin-1-il)-7-deasa-2',
3'-dideoxiguanosina-5'-trifosfato
presenta un resultado aproximado del 44% (asumiendo = 9.300 a 291
nm); HPLC t_{x} = 21,2 min.
Aunque la identidad de los nucleótidos de las
posiciones polimórficas de la presente invención puede determinarse
de diversos modos, un método especialmente preferente aprovecha las
pruebas de diagnóstico basadas en las variaciones de los
oligonucleótidos en la secuencia del ácido nucleico desarrollado en
Goelet, P. y otros (aplicación PCT WO92/15712). En esta
prueba, un oligonucleótido purificado, con una secuencia definida
(complementaria a una secuencia inmediata proximal o distal de un
polimorfismo) está ligado a un soporte sólido y cualesquiera
moléculas de la muestra original por analizar presentes pueden
hibridar el oligonucleótido enlazado.
En una forma de realización preferente, un
oligonucleótido cuya secuencia sea complementaria a una secuencia
distal inmediata de un polimorfismo se prepara con alguno de los
métodos arriba descritos (preferentemente el de Nikiforov, T.
(solicitud de patente U.S. número de serie 08/005.061,
correspondiente a WO94/16090, publicada el 21 de julio de 1994)).
El radical del oligonucleótido se halla unido al soporte sólido,
como se ha descrito, por ejemplo, en Goelet, P. y otros (aplicación
PCT WO92/15712), de modo que el 3'-extremo del
oligonucleótido puede servir de sustrato para la amplificación del
primer.
El primer inmovilizado se incuba entonces
en presencia de una molécula ADN (preferentemente una molécula de
ADN genómico), que posea un polimorfismo de nucleótido simple cuya
secuencia distal inmediata sea complementaria a la del
primer inmovilizado. Preferentemente, dicha incubación tiene
lugar en completa ausencia de cualquier tipo de dNTP (es decir,
dATP, dCTP, dGTP o dTTP), pero sólo en presencia de uno o más
compuestos de nucleotidotrifosfatos de terminación de cadena (como
por ejemplo, compuestos de dideóxidos), y en condiciones adecuadas
para que estos compuestos se puedan incorporar al
3'-radical del primer. Como se observará,
donde sólo existen dos o tres alelos en la posición polimórfica es
tal que (tal que sólo podrían incorporarse, respectivamente, dos o
tres especies de dNTP al producto de amplificación del
primer). La identidad del nucleótido añadido viene
determinada por el nucleótido en la posición polimórfica y es
complementaria a éste.
En esta forma de realización, el nucleótido de la
posición polimórfica se determina, por tanto, por averiguación de
qué conjunto de nucleótidos etiquetados ha sido incorporado al
3'-radical del oligonucleótido enlazado por una
polimerasa dependiente del primer. Preferentemente, cuando
se empleen simultáneamente varios compuestos de dideoxinucleótidos,
se utilizarán etiquetas distintas que permitirán diferenciar la
identidad del compuesto de dideoxinucleótido incorporado.
En una forma de realización preferente, la
identidad del nucleótido de la posición polimórfica se determina
por un proceso mediado por polimerasas/ligasas. Igual que en la
forma de realización anterior, se emplea un oligonucleótido
primer, el cual es complementario de la secuencia invariante
3'-distal inmediata del PNS. Un segundo
oligonucleótido se fija a la fase sólida por su
3'-extremo. La secuencia de este oligonucleótido es
complementaria de la secuencia 5'-proximal del
polimorfismo que se analiza, pero es incapaz de hibridar el
oligonucleótido primer.
Estos oligonucleótidos son incubados en presencia
del ADN que contiene el polimorfismo de nucleótido simple que se
desea analizar, y por lo menos un 2',
5'-desoxinucleotidotrifosfato. La reacción de
incubación incluye además una ADN-polimerasa y una
ADN-ligasa. Así, por ejemplo, si al evaluar el
polimorfismo del clon 177-2 (Tabla 1), el
oligonucleótido fijado contuviera la secuencia
3'-distal de Id. sec. Nº:2, el segundo
oligonucleótido tendría la secuencia 5'-proximal de
Id. sec. Nº:1.
Los oligonucleótidos fijados y los solubles son
de este modo capaces de hibridar la misma hebra del polimorfismo de
nucleótido simple analizado. Las condiciones secuenciales obligan a
los dos nucleótidos a hibridar las secuencias proximal y distal del
PNS que flanquean la posición polimórfica X del polimorfismo; de
este modo, los oligonucleótidos hibridados quedan separados por un
"hueco" de un nucleótido simple en el lugar exacto de la
posición polimórfica.
La presencia de polimerasa y de un 2',
5'-desoxinucleotidotrifosfato complementario a X
permite la ligación del primer amplificado con el 2',
5'-desoxinucleotidotrifosfato complementario al
oligo complementario a la secuencia distal; un 2',
5'-desoxinucleotidotrifosfato que es complementario
al nucleótido de la posición polimórfica permite la creación de un
sustrato ligable. La reacción de la ligación inmoviliza el
nucleótido 2', 5'-desoxinucleotidotrifosfato y el
anteriormente soluble oligonucleótido primer, al soporte
sólido.
La identidad de la posición polimórfica que era
opuesta al "hueco" se puede determinar entonces por diversos
métodos. En una forma de realización preferente, el 2',
5'-desoxinucleotidotrifosfato de la reacción está
etiquetado y su detección revela así la identidad del nucleoide
complementario de la posición polimórfica. Puede haber distintos 2',
5'-desoxinucleotidotrifosfatos, cada uno etiquetado
de una manera diferente. Alternativamente, pueden producirse
reacciones independientes para cada uno de los 2',
5'-desoxinucleotidotrifosfatos. En una forma de
realización alternativa secundaria, los 2',
5'-desoxinucleotidotrifosfatos no están etiquetados,
pero lo está el segundo oligonucleótido soluble, y cada uno de los
2', 5'-desoxinucleotidotrifosfatos sin etiquetar
provoca una reacción diferente. La reacción que contiene el
oligonucleótido complementario permite la formación del sustrato
para el ligamiento, y se detecta por detección de la inmovilización
del oligonucleótido previamente soluble.
Podemos incrementar la sensibilidad de los
pruebas de detección de hibridación del ácido nucleico si alteramos
la forma en que la detección se transmite al observador. Por
ejemplo, es posible aumentar la sensibilidad de una prueba si se
usan reactivos con etiquetas detectables. Con este fin se han
diseñado una amplia variedad de estos métodos de amplificación de
señal. Kourilsky y otros (patente U.S. 4.581.333) describe
el empleo de etiquetas enzimáticas para incrementar la sensibilidad
en una prueba de detección. También se han utilizado etiquetas
fluorescentes (Albarella y otros, EP 144914), etiquetas
químicas (Sheldon III y otros, patente U.S. 4.582.789;
Albarella y otros, patente U.S. 4.563.417), bases
modificadas (Miyoshi y otros, EP 119448), etc., en un
esfuerzo por mejorar la eficiencia con que se pueda observar la
hibridación.
Es preferible emplear utilizar etiquetas
fluorescentes y aún más etiquetas cromogénicas (enzimas
especiales), que permiten determinar la identidad del nucleótido
incorporado de manera automática o semiautomática con un
espectrofotómetro.
La utilidad de la determinación de las posiciones
polimórficas de la presente invención proviene del hecho de que
dichas posiciones pueden utilizarse para estimar la probabilidad
estadística de que dos individuos posean los mismos alelos para un
polimorfismo dado.
Los análisis estadísticos de los PNS pueden
emplearse para una gran diversidad de propósitos. El análisis
genético practicado a un animal puede servir como una "huella
dactilar" con la cual determinar si un cierto animal es, o no,
aquel animal particular.
Los métodos de la presente invención también se
pueden practicar al padre o los padres putativos de un individuo
para determinar la probabilidad de que un determinado individuo sea
o no progenie de dicho o dichos padres. Así, la detección y el
análisis de VNS puede servir para descartar la posibilidad de que
un macho o varón sea el padre de un individuo particular (como por
ejemplo, que un semental sea el padre de un potro), o establecer la
probabilidad de que un individuo particular sea progenie de una
determinada hembra (por ejemplo, que un potro sea hijo de una yegua
en particular).
Como se indica más adelante, la presente
invención permite construir un mapa genético de una especie
determinada. De este modo, la serie particular de polimorfismos
identificados mediante los métodos que propone la presente invención
pueden correlacionarse con una característica concreta que ayude a
prever la predisposición de un animal (o planta) concreto a contraer
una enfermedad genética o a presentar unas condiciones o unas
particularidades determinados. Debemos entender que el término
"característica", tal como se va a emplear de aquí en adelante,
incluye los conceptos "enfermedad genética", "condición"
y "particularidad". El término "enfermedad genética"
involucra un estado patológico causado por una mutación,
independientemente de que dicho estado pueda ser detectado o sea
asintomático. Una "condición" denota una predisposición a
presentar unas determinadas peculiaridades (por ejemplo, asma,
huesos débiles, ceguera, úlcera, cáncer, enfermedades coronarias o
cardiovasculares, defectos esqueletomusculares, etc.). Una
carcaterística es un atributo que imparte valor económico a una
planta o un animal. Como ejemplos de características podemos
mencionar la longevidad, la velocidad, la resistencia, el ritmo de
envejecimiento, la fertilidad, etc.
Las mediciones más útiles para determinar la
potencia de un sistema de identificación y verificación de
paternidad son: (i) la "probabilidad de identidad"
(p(ID)) y (ii) la "probabilidad de exclusión"
(p(exc)). La p(ID) calcula la probabilidad de que dos
individuos arbitrarios tengan el mismo genotipo con respecto a un
marcador polimórfico dado. La probabilidad de que un macho o varón
arbitrario tenga un genotipo incompatible consigo mismo siendo el
padre en un caso de paternidad en que la identidad de la madre no
se halla en cuestión. Puesto que los loci genéticos simples,
incluidos los loci con múltiples alelos como la región de
mayor histocompatibilidad, raramente proporcionan pruebas con
niveles adecuados de fiabilidad estadística para las pruebas de
paternidad, es deseable una prueba que mida preferentemente
loci múltiples desenlazados en paralelo. Las probabilidades
acumuladas de identidad o no identidad y las probabilidades
acumuladas de exclusión de paternidad para estas pruebas
multi-locus se calculan como el producto de las
probabilidades correspondientes a cada locus.
Las mediciones estadísticas de mayor interés son:
(i) la probabilidad acumulada de no identidad
(p_{ac}(no-ID)) y (ii) la probabilidad
acumulada de exclusión de paternidad (p_{ac}(exc)).
A continuación se dan las fórmulas empleadas para
calcular el valor de estas probabilidades. A efectos de
simplicidad, estas expresiones se dan primero para loci de 2
alelos, en que un alelo se denota de tipo A y el otro de tipo B. En
este modelo son posibles cuatro genotipos: AA, AB, BA y BB (los
tipos AB y BA son bioquímicamente indistinguibles). La frecuencia
alélica viene dada por el número de veces que A (f(A),
denotamos la frecuencia de A con una p) o B (f(B), denotamos
la frecuencia de B con una q, siendo q = 1 - p) se halla en el
genoma del haploide. La probabilidad de hallar un genotipo dado en
un locus determinado es:
- Homocigoto: p(AA) = p^{2}
- Heterocigoto único: p(AB) = p(BA) = pq = p(1-p)
- Dos heterocigotos: p(AB+BA) = 2pq = 2p(1-p)
- Homocigoto: p(BB) = (1-p)^{2}
La probabilidad de identidad en un locus
(es decir, la probabilidad de que dos individuos seleccionados
aleatoriamente de una población, tengan genotipos idénticos en un
locus dado) viene dada por la ecuación:
p(ID) =
(p^{2})^{2} + (2pq)^{2} +
q^{2}
Luego, la probabilidad de identidad acumulada
para n loci viene dada por la ecuación:
p_{ac}(ID) =
\subseteq p
(ID_{1})p(ID_{2})p(ID_{3})...p(ID_{n})
La propiedad de no identidad acumulada para n
loci (es decir, la probabilidad de que dos individuos sean
diferentes en uno o más loci) viene dada por la ecuación:
p_{ac}(no-ID) = 1
-
p_{ac}(ID)
La probabilidad de exclusión de paternidad
(representada por la probabilidad de que un macho o varón
arbitrario tenga un genotipo respecto a un locus dado que lo
incompatibilice como padre respecto a una situación promedio de
paternidad en que la identidad de la madre no está en discusión)
viene dada por la ecuación:
p(exc) =
pq(1-pq)
La probabilidad de no exclusión (representada por
la probabilidad de que en un locus dado un macho o varón
arbitrario tenga no sea excluido como padre respecto a una
situación promedio de paternidad) viene dada por la ecuación:
p(no-exc) =
1 -
p(exc)
Luego, la propiedad de no exclusión acumulada
(representada por el valor obtenido cuando se consideran n
loci) es:
p_{ac}(no-exc) =
\subseteq p
(no-exc_{1})p(no-exc_{2})p(no-exc_{3})...p(no-
exc_{n})
La probabilidad de exclusión acumulada
(representada por la probabilidad de que, considerando un panel de
n loci, un macho o varón arbitrario esté bioquímicamente
excluido como padre en una situación promedio de paternidad en que
la madre no está en cuestión) viene dada por la ecuación:
p_{ac}(exc) =
1 -
p_{ac}(no-exc)
Estos cálculos pueden ampliarse a cualquier
número de alelos en un locus dado. Por ejemplo, la
probabilidad de identidad de p(ID) para un sistema de 3
alelos cuyas frecuencias de aparición en la población son p, q y r,
respectivamente, es igual a la suma de los cuadrados de las
frecuencias de genotipo:
p(ID) =
p^{4} + (2pq)^{2} + (2qr)^{2} + (2pr)^{2} + r^{4} +
q^{4}
Análogamente, la probabilidad de exclusión para
el sistema de tres alelos viene dada por:
p(exc) =
pq(1-pq) + qr(1-qr) +
pr(1-pr) +
3pqr(1-pqr)
En un locus de n alelos se utiliza
el desarrollo binomial correspondiente para calcular p(ID) y
p(exc).
Las Figuras 4 y 5 muestran cómo aumentan la
probabilidad y la probabilidad acumulada en función del número y el
tipo de loci genéticos considerados. Puede observarse que en
un sistema de tres alelos se alcanza un poder de discriminación más
elevado cuantos menos marcadores se consideran. En las figuras 4 y
5, los triángulos indican el aumento de los valores de la
probabilidad para números crecientes de loci con dos alelos
en que el alelo común presenta una frecuencia de aparición de p =
0,79. Las cruces de las Figuras 4 y 5 muestran el mismo análisis
para números crecientes de loci de tres alelos en que p =
0,51, q = 0,34 y r = 0,15.
Sin embargo, la elección entre si emplear
loci con 2, 3 o más alelos resulta enormemente influida por
las consideraciones bioquímicas arriba descritas. Es posible
diseñar una prueba de análisis polimórficos para obtener el número
de alelos correspondientes a un locus determinado. En caso
de querer determinar el número de alelos por gel electroforesis,
cada alelo deberá ser fácilmente resoluble por gel electroforesis.
Dado que las variaciones longitudinales en las familias
multialélicas suelen ser pequeñas, las pruebas con ADN humano que
emplean familias multialélicas incluyen correcciones estadísticas
para compensar identificaciones de alelos erróneas. Es más, aunque
la aparición de un alelo raro en un sistema alélico múltiple puede
ser altamente informativa, la rareza de estos alelos dificulta
extremadamente tomar medidas exactas de su frecuencia de aparición
en la población. Para corregir errores en las estimaciones de
frecuencias de estos alelos poco habituales, los análisis
estadísticos de estos datos incluyen una medida de los efectos
acumulados de incertidumbre en estas estimaciones de frecuencias. Al
utilizar estos sistemas multialélicos se incrementa además la
probabilidad de descubrir en la población alelos nuevos o raros en
el curso de grandes cribados de la población. La integridad de los
datos genéticos recogidos con anterioridad se revisarían
empíricamente para reflejar el descubrimiento de un nuevo alelo.
En vista de estas consideraciones, aunque el uso
de loci con muchos alelos podría potencialmente ofrecer
algunas ventajas a corto plazo (ya que no haría falta seleccionar
tantos loci), es preferible efectuar análisis polimórficos
con loci de menos alelos, pero: (i) que sean más
frecuentemente representativos, y (ii) que sean más fáciles de medir
sin ambigüedades. Los ensayos de estas características pueden
alcanzar el mismo poder de discriminación que los ensayos basados
en un número más elevado de loci polimórficos, puesto que el
mismo número total de alelos se obtiene de una serie de loci
desenlazados.
Los polimorfismos detectados en un conjunto de
individuos de la misma especie (por ejemplo, en seres humanos,
caballos, etc.) o de especies muy cercanas pueden ser analizados
para determinar si la presencia o la ausencia de un polimorfismo
particular está correlacionado con una característica
particular.
Para este análisis polimórfico se determina la
presencia o la ausencia de un conjunto de polimorfismos (es decir,
de una "serie polimórfica") en un conjunto de individuos,
algunos de los cuales exhiben unas mismas características
particulares y otros exhiben características mutuamente excluyentes
(por ejemplo, en caballos, huesos frágiles o huesos resistentes;
principios de ceguera en la madurez o no ceguera; predisposición a
padecer asma o enfermedades cardiovasculares, o no presentar dicha
predisposición). A continuación se determina si la presencia o
ausencia de cada alelo concreto del conjunto va asociada con la
característica particular en estudio. Dichas correlaciones definen
un mapa genético de la especie. Los alelos que no presentan un
comportamiento aleatorio con respecto a una característica pueden
servir para estimar la probabilidad de que un animal en particular
presente dicha característica. Por ejemplo, si un determinado alelo
polimórfico está presente en sólo el 20% de los miembros de la
especie, los cuales exhiben alguna condición cardiovascular
particular, un individuo de esta especie que contenga ese alelo
tendrá una probabilidad del 20% de exhibir dicha condición
cardiovascular. Como se ha indicado, el poder de predicción del
análisis es mayor cuanto mayor es la relación entre un alelo
polimórfico particular y una característica concreta. Análogamente,
el poder de predicción del análisis se incrementa si se analizan
simultáneamente los alelos de múltiples loci polimórficos en
relación con una característica particular. Si en el ejemplo
anterior se descubre que un segundo alelo polimórfico también se
halla presente en el 20% de los individuos de la especie que
presentan la condición cardiovascular, todos los miembros examinados
que presentan dicha condición cardiovascular exhiben una
combinación particular de alelos para estos primer y segundo
polimorfismos; luego, un miembro particular de la especie que
contenga ambos alelos tendrá una probabilidad muy alta de presentar
dicha condición
cardiovascular.
cardiovascular.
La detección de posiciones polimórficas múltiples
determina la frecuencia con que estas posiciones discriminan por sí
mismas en una población. Si, por ejemplo, dos posiciones
polimórficas presentan una frecuencia de aparición aleatoria, o bien
están en cromosomas separados o bien se hallan en el mismo
cromosoma muy lejos la una de la otra. Un análisis de frecuencias
significativas de aparición permite así establecer un mapa de
marcadores genéticos. De este modo, la presente invención
proporciona un medio para trazar un mapa de los genomas de plantas
y
animales.
animales.
La resolución del mapa genético es proporcional
al número de marcadores que contiene. Dado que los métodos de la
presente invención permiten aislar un gran número de posiciones
polimórficas, es posible crear un mapa de cualquier nivel de
resolución deseado.
La secuenciación de las posiciones polimórficas
aumenta notablemente su utilidad al aplicarse a la determinación
del mapa genético. Estas secuencias pueden servir para diseñar
oligonucleótidos primer y sonda que "bajen" por el
cromosoma y vayan identificando nuevas posiciones con marcadores
(Bender, W. y otros, J. Supra. Molec. Struc. 10
(supl.):32 (1979); Chinault, A.C. y otros, Gene
5:111-126 (1979); Clarke, L. y otros,
Nature 287:504-509
(1980)).
(1980)).
La resolución del mapa puede incrementarse si se
combina el análisis polimórfico con datos sobre el fenotipo de
otros atributos de la planta o el animal cuyo genoma se intenta
descifrar. Así, si un polimorfismo particular determina el color
marrón del pelo, la posición en el mapa del locus asociado a
dicho polimorfismo ha de hallarse cerca de la posición del gen o los
genes responsables del color del pelo. De modo parecido pueden
utilizarse datos bioquímicos para incrementar la resolución del
mapa genético. En esta forma de realización, por medio de un
análisis bioquímico (por ejemplo, un serotipo, una isoforma, etc.)
se intenta averiguar si una posición polimórfica es codeterminante.
Estos mapas pueden servir, por ejemplo, para identificar mutaciones
causantes de enfermedades.
Evidentemente, la identificación de los PNS de la
presente invención permite utilizar oligonucleótidos
complementarios como primers para PRC u otras reacciones de
aislamiento y secuenciación de nuevas secuencias de genes
localizadas a ambos lados del PNS. La invención permite determinar
tales nuevas secuencias de genes. Las secuencias genómicas que
pueden aislarse por clonación con la ayuda de estos primers
pueden ser tanscritas a ADN y expresadas como proteína. La presente
invención también incluye estas proteínas, además de anticuerpos y
otras moléculas capaces de enlazar con las proteínas.
La invención se ilustra a continuación en
relación con dos formas de realización - para caballos y seres
humanos. No obstante, puesto que los principios fundamentales de la
genética se aplican por igual para cualquier especie, este ejemplo
ilustrativo es igualmente válido para cualquier otra especie. De
modo que cualquiera versado en la materia requerirá sólo utilizar
directamnente los métodos que se han explicado en la invención para
aislar PNS en cualquier otra especie, y así llevar a cabo el
análisis genético de la presente invención.
Como ya se ha indicado, el desarrollo de la
metodología LOD de marcaje de segmentos permite utilizar PLFR tanto
para seguir la herencia de las características genéticas como
construir un mapa genético de una especie (Lander, S y otros,
Proc. Natl. Acad. Sci. (U.S.A.) 83:
7353-7357 (1986); Lander, S. y otros, Proc. Natl.
Acad. Sci. (U.S.A.) 84:2363-2367 (1987);
Donis-Keller, H. y otros, Cell 51:
319-337 (1987); Lander, S. y otros, Genetics
121:185-199 (1989)). Estos métodos puede
adaptarse fácilmente para ser utilizados con los polimorfismos
considerados en la presente invención. Evidentemente, a este
respecto, estos polimorfismos son superiores a los PLFR y los CRP.
Dada la frecuencia de aparición de los PNS, es posible generar con
prontitud un denso mapa genético. Es más, como ya se ha indicado,
los polimorfismos de la presente invención son más estables que los
polimorfismos PLFR típicos (de tipo RPNV).
Los polimorfismos considerados en la presente
invención comprenden información directa de secuencias genómicas,
que puede tipificarse por diversos métodos. En un mapa según CRP o
PLFR, el análisis ha de estar basado en gel, y conlleva tener que
obtener un perfil elecroforético del ADN del animal considerado.
Por el contrario, un análisis de los polimorfismos (PNS)
considerados en la presente invención permite el uso de métodos
espectrométricos y una automatización inmediata para facilitar el
análisis de animales en gran número.
Después de describir la invención en términos
generales, el mismo planteamiento se va a entender con mayor
claridad por referencia a los ejemplos siguientes de aislamiento y
análisis de polimorfismos en equinos, los cuales hay que entender
como ejemplos ilustrativos, y no como limitantes de la presente
invención.
Como etapa inicial en la identificación de
polimorfismos en equinos, se prepararon colecciones de pequeñas
dianas a partir del ADN genómico obtenido de leucocitos sanguíneos
periféricos purificados en un gradiente de densidades
Ficoll-hypaque a partir de la sangre de un caballo
purasangre castrado de 15 años de edad (John Henry). Este ADN se
fragmentó completamente con Bam HI y Pst I y se introdujo, bien
directamente o bien después de fraccionarlo según tamaño, en geles
agarosa.
El vector pLT14 (una variante del plásmido
Stratagen pKSM13(-)) se fragmentó con Bam HI y Pst I y el ADN
linealizado se purificó con un gel agarosa. El ADN genómico tanto
del vector como el fraccionado según tamaño y la agarosa se
disolvieron en yoduro sódico saturado y a continuación el ADN
precipitó en cristales. Tras lavarlo, el ADN se elugó con agua y
etanol y precipitó con un portador de glicogen.
Se prepararon ligaciones con distintas
proporciones de vector/inserción de ADN- ligasa T4 de longitud
variable a 4ºC. El E.coli XLI se transformó con mezclas de
ligación y se depositó sobre un LB de agar con una concentración de
100 g/ml de ampicilina. Se generaron aproximadamente 50.000 clones
en diversos experimentos diferentes que utilizaban inserciones de
ADN sin fraccionar o fraccionado según tamaño. Las células
transformadas sin depositar se almacenaron a -70ºC en 7% DMSO. Se
prepararon franjas de colonias por aislamiento y plásmido a pequeña
escala para determinar el tamaño del ADN de equino introducido. Se
efectuaron preparaciones a gran escala escala por cromatografía
Qiagen.
La secuencia de los primeros
200-300 nucleótidos del genoma introducido se
determinó por el método de terminación de cadena mediante
dideoxidonucleósidos con ADN-polimerasa T7 a partir
de primers complementarios de las secuencias de plásmido.
Esta información fue utilizada para diseñar primers de
oligonucleótidos sintéticos complementarios de la secuencia de ADN
de equino que se emplearía en reacciones PCR.
En la mayoría de los casos se sintetizaron dos
conjuntos de primers PCR (en general,
25-meros). El primer conjunto se utilizó para
amplificar ADN genómico bajo un conjunto de condiciones estándar.
Los productos de estas reacciones se diluyeron y se utilizaron como
"molde" de ADN en un segundo PCR con primers anidados
ligeramente más internos que el conjunto original. Los productos
de estas dos reacciones se compararon con aquellos obtenidos a
partir del ADN plásmido original de molde. En la mayoría de casos,
con este procedimiento se obtuvo una alta calidad, productos de una
sola especie, sin intentar optimizar las condiciones de la reacción
para ningún par particular de
primers.
primers.
Se utilizaron dos métodos diferentes para cribar
secuencias polimórficas en el ADN amplificado de caballo.
Inicialmente, los fragmentos PCR procedentes de un panel de seis
caballos se mezclaron con un panel de endonucleasas de restricción
que disponía de cuatro posiciones de reconocimiento de bases. Los
productos de estas reacciones se analizaron por gel acrilamida
electroforesis con geles no desnaturalizados entre 5% y 7,5%. Los
productos de la mezcla que mostraban variabilidad al hibridarse a
diferentes miembros del panel, quedaban sujetos al analisis
secuencial de ADN. A continuación, la secuenciación del ADN se
utilizaba directamente para cribar las posiciones polimórficas. Los
fragmentos PCR de cinco caballos no relacionados entre sí eran
electroelugados con gel acrilamida y se secuenciaban por ciclos
repetitivos de reacción de polimerasa T_{aq} termoestable en
presencia de una mezcla de dNTPS y de ddNTPS fluorescentes. Los
productos se separaban y se analizaban con un instrumento de
secuenciación de ADN automatizado de Applied Biosystems, Inc. Los
datos se analizaron con software ABI. El software identificaba y
confirmaba las diferencias entre secuencias correspondientes a
animales diferentes por inspección de la parte relevante de los
cromatogramas en la pantalla del ordenador. Se concluía que dichas
diferencias constituían un polimorfismo del ADN sólo si los datos
estaban disponibles para ambas hebras, y/o se hallaban presentes en
más de un ejemplo haploide entre los cinco caballos analizados.
El programa de identificación y caracterización
de secuencias de ADN polimórficas en fragmentos arbitrarios
continuó de tal modo que ya se han caracterizado aproximadamente
550 plásmidos a este nivel. Para 200 de estos plásmidos se
determinaron las secuencias adyacentes a las posiciones de
clonación. El tamaño de los injertos de estos plásmidos
secuenciados oscilaban entre 0,25 y 3,5 kb. A partir de la
información secuencial, se diseñaban oligonucleótidos primer
que permitieran la amplificación por PCR de la misma región genómica
de diferentes caballos. Para la identificación de los nucleótidos
presentes en posiciones polimórficas, se purificaron con geles
acrilamida por electroelugación fragmentos PCR de cinco caballos y
se secuenciaron por completo por bioquímica de secuenciación con
"ciclos" de T_{aq} polimerasa y equipos de secuenciación
automatizados. Los resultados para los cinco caballos fueron
analizados por ordenador y confirmados visualmente. Las variantes
de ADN secuencial descubiertas por este método se contaban sólo si
las secuencias se obtenían para ambas hebras y la variante se había
encontrado en más de un ejemplo haploide. Los 18 clones en la Tabla
1 constituyen un subconjunto de PNS identificados. En la Tabla 1 se
muestran la secuencia inmediata 5'-proximal, la
identificación del nucleoide de la posición polimórfica y la
secuencia inmediata 3'-distal de cada PNS. Estas
secuencias se presentan en filas horizontales correspondientes a
cada PNS. Las secuencias de ADN bicatenario de la Tabla 1 se
presentan de acuerdo con los requisitos de listado de secuencias de
la Oficina de Registros y Patentes de los E.E.U.U. Así, todas las
secuencias se presentan en la misma orientación
(5' \rightarrow 3'). La organización de la tabla se ilustra en la Figura 6 con respecto a un PNS de ejemplo, el clon 177-2. Este PNS tiene una posición polimórfica que puede presentar una C o una T en una de las hebras, y una G o una A en la hebra opuesta. La secuencia de ADN 5'-proximal inmediata que precede a la posición polimórfica en la hebra C/T se designa como Id. sec. Nº:1. La secuencia 3'-distal que sigue inmediatamente a la posición polimórfica en la hebra C/T se designa como Id. sec. Nº:2. La secuencia de ADN 5'-proximal inmediata que precede a la posición polimórfica en la hebra G/A se designa como Id. sec. Nº:3. La secuencia 3'-distal que sigue inmediatamente a la posición polimórfica en la hebra G/A se designa como Id. sec. Nº:4. Si se tiene en mente que las secuencias se escriben en la misma orientación (5' \rightarrow 3'), se observa que las secuencias Id. sec. Nº:1 y Id. sec. Nº:4 son complementarias; análogamente, las secuencias Id. sec. Nº:2 y Id. sec. Nº:2 son complementarias. Las secuencias que flanquean una posición polimórfica particular se obtienen, pues, al combinar la secuencia proximal de una fila con la secuencia distal de la
misma fila.
(5' \rightarrow 3'). La organización de la tabla se ilustra en la Figura 6 con respecto a un PNS de ejemplo, el clon 177-2. Este PNS tiene una posición polimórfica que puede presentar una C o una T en una de las hebras, y una G o una A en la hebra opuesta. La secuencia de ADN 5'-proximal inmediata que precede a la posición polimórfica en la hebra C/T se designa como Id. sec. Nº:1. La secuencia 3'-distal que sigue inmediatamente a la posición polimórfica en la hebra C/T se designa como Id. sec. Nº:2. La secuencia de ADN 5'-proximal inmediata que precede a la posición polimórfica en la hebra G/A se designa como Id. sec. Nº:3. La secuencia 3'-distal que sigue inmediatamente a la posición polimórfica en la hebra G/A se designa como Id. sec. Nº:4. Si se tiene en mente que las secuencias se escriben en la misma orientación (5' \rightarrow 3'), se observa que las secuencias Id. sec. Nº:1 y Id. sec. Nº:4 son complementarias; análogamente, las secuencias Id. sec. Nº:2 y Id. sec. Nº:2 son complementarias. Las secuencias que flanquean una posición polimórfica particular se obtienen, pues, al combinar la secuencia proximal de una fila con la secuencia distal de la
misma fila.
\newpage
\newpage
La presente especificación se relaciona con las
secuencias anteriores pos sus números de identificación ID de
secuencia (es decir, Id. sec. Nº). Para facilitar las terminología,
se emplea notación algebraica (del tipo "2n + 1"), según el
álgebra convencional. Así, la notación "Id. sec. Nº:2n + 1"
designa Id. sec. Nº:5 para n = 5, Id. sec. Nº:7 para n = 3, etc.
En poblaciones pequeñas (50-60
animales) se han efectuado estudios sobre algunas posiciones
polimórficas de estos polimorfismos en secuencias de ADN por el
método del Análisis de Bits Genéticos (ABG), el sistema preferente
de determinación de nucleótidos simples en fase sólida (Goelet, P.
y otros (WO 92/15712)). En la Figura 7 se ilustran las siete etapas
de la forma de realización preferente de este estudio:
Etapa
1
Preparación del ADN
Etapa
2
Amplificación de la secuencia en estudio. Después
de haber preparado el ADN de la muestra, una región específica del
genoma (locus) de la muestra se amplifica por PCR. Uno de
los primers del PCR se modifica con cuatro enlaces
tiofosfatados en el extremo 5'.
Etapa
3
Fragmentación con exonucleasa y generación de
"moldes" de hebra simple. La exonucleasa fragmenta el producto
del PCR y deja intacta la hebra tiofosfatada.
Etapa
4
Hibridación para capturar el molde amplificado.
La hebra amplificada se hibrida luego al primer del ABG
apropiado que hay inmovilizado sobre la superficie del pocillo de
titulación.
Etapa
5
Amplificación de base simple con polimerasa. Se
utilizan ADN-polimerasa y ddNTP haptenados para
amplificar según "molde" el primer del AGB por una
base.
Etapa
6
Detección colorimétrica del producto amplificado.
Después de lavar el "molde" con NaOH, la base heptanada se
detecta por medio de un conjugado antihaptén y el sustrato
colorimétrico adecuado.
Etapa
7
Interpretación del genotipo asistida por
ordenador. Los datos colorimétricos de algunos loci se
convierten en un genotipo de PNS para el individuo particular
estudiado.
El método se lleva a cabo preferentemente del
modo siguiente:
La amplificación de las secuencias genómicas se
efectuó por el protocolo de reacción por cadena de polimerasa (PCR,
por su sigla inglesa polymerase chain reaction). En una
primera etapa, se emplearon cien nanogramos de ADN genómico en
mezclas reactivas que contenían primer iniciales en
concentraciones de 2 M y 10 mM de Tris 8,3 pH, 50 mM de MgCl_{2},
0,01% de gelatina; y 0,05 unidades por I
ADN-polimerasa T_{aq} (AmpliTaq (Marca
Registrada), Perkin Elmer).
El "molde" de monocatenario para emplear con
el primer inmovilizado en fase sólida se puede obtener por
dos métodos. En el primero, 4 compuestos nucleótidotiofosfatados
median la amplificación de los primers, tal como enseño
Nikiforov, T. (solicitud de patente U.S. número de serie
08/005.061), correspondiente a WO94/16090, publicada el 21 de julio
de 1994). Alternativamente, un segundo método de PCR requiere
concentraciones "asimétricas" de primer. Los productos
de la primera reacción se diluyen hasta 1/1.000 en una segunda
reacción. Uno de los primers del segundo método se utiliza a
la concentración estándar de 2 M, y el otro a 0,08 M. En estas
condiciones se sintetizan moléculas monocatenarias durante la
reacción.
Las uniones a la fase sólida molde-primer
por el procedimiento de AGB simplifica el enjuague, el intercambio
en las disoluciones tampón, etc.; y, en principio, estas uniones
puede producirse por el molde o por el primer. Sin embargo,
en la práctica, especialmente cuando se emplean métodos de
detección por gel, es preferible la unión por el primer. Este
método permite utilizar enjuague estringentes (por ejemplo, 0,2 N
NaOH) para retirar las impurezas y los productos colaterales
mientras se retienen los dideoxidonucleótidos haptenados enlazados a
los extremos 3' del primer.
Por ello, para reacciones AGB en placas de 96
pocillos (Nunc Nunclon (Marca Registrada), placas, Roskilde,
Dinamarca), el primer AGB se acopló a la placa por enlace
covalente. Esto se consiguió por incubación en una disolución 10
pmol de primer, con un grupo 5'-amina por
pocillo, en 50 de una disolución tampón 3 mM de fosfato de sodio, 6
pH, 20 mM de
1-etil-3-(3-dimetilaminopropil)-carbodiamida
(EDC) durante toda la noche a temperatura ambiente. Tras el
acoplamiento, la placa se enjuagó tres veces con TNTw.
La hibridación covalente de ADN monocatenario a
primers acoplados en placas de pocillos se consiguió
añadiendo al producto monocatenario del PCR un volumen igual de NaCl
3 M, 20 mM EDTA e incubando cada pocillo con 20 l de esta mezcla a
20ºC durante por lo menos 30 minutos. Después, la placa se lavó
tres veces con TNTw. Y a continuación se incubaron durante por lo
menos 5 minutos a temperatura ambiente veinte litros de mezcla de
amplificación por polimerasa que contenían ddNTP (3 M por mezcla,
una de los cuales con biotina) 5 mM DTT, 7,5 mM de isocitrato de
sodio, 5 mM MnCl_{2}, 0,04 unidades por l de
ADN-polimerasa Klenow.
Después de la reacción de amplificación, la placa
se lavó una vez con TNTw. Las hebras molde se retiraron incubando
los pocillos en una disolución de 50 \mul de 0,2 N de NaOH
durante por lo menos 5 minutosa temperatura ambiente. Luego la placa
se lavó tres veces con TNTw. La incorporación de ddNTP con biotina
se midió por ensayo de enlace enzimático. Cada pocillo se incubó en
una disolución con 20 \mul de peroxidasa de estreptavidina
conjugada de rábano picante (disolución 1/1.000 en TNTw de un
producto comprado en BRL, Gaitherburg, MD) con agitación durante por
lo menos 30 minutos a temperatura ambiente. Después de lavarlo 5
veces con TNTw, se añadieron a cada pocillo 100 \mul de
o-fenilenediamina (OPD, 1 mg/ml en ácido cítrico 0,1
M, 4,5 pH) (BRL) con H_{2}O_{2} concentrado al 0,012%. La
cantidad de enzima enlazado se determinó por métodos cinéticos con
un espectrómetro "Vmax" de 96 pocillos para equipos
moleculares. Las Figuras 8A y 8B ilustran cómo aparecen los datos
de parentesco para un caballo en el nivel de la placa de titulación.
En las pruebas estándar de parentesco en caballos, en la placa se
disponen 85 muestras (columnas 1-11) más los
controles (columna 12). Para cada locus del caballo, la
presencia de los dos alelos conocidos se determina por
interrogación específica de las bases en placas independientes. Las
dos placas mostradas en las Figuras 8A y 8B son idénticas en moldes
PCR y en primer AGB y difieren sólo en los ddNTP con biotina
que se emplearon en la reacción de amplificación
(biotina-ddCTP en la Figura 8A y
biotina-ddTTP en la Figura 8B). Además de la
adición del reactivo colorimétrico (OPD), la absorbencia del color
resultante se midió en un lector de microplacas de titulación para
equipos moleculares y los datos en bruto se obtuvieron en
miliOD/min por pocillo. Los dos resultados en bruto en
representaciones en escala de grises de los datos de absorción para
estas placas se muestran en las figuras dispuestas en el mismo orden
que en la microplaca de titulación. Las intensidades de la escala
de grises se corresponde directamente con la producción en colores.
En esta posición bialélica, las bases detectadas son C (Figura 8A) y
T (Figura 8B). Aproximadamente el 40% de los caballos analizados
hasta la fecha son heterozigóticos (por ejemplo, la muestra en el
pocillo A1), y los restantes homozigotos para C (por ejemplo, A2) o
T (por ejemplo, B3). Los controles de molde sintéticos incluyen un
homozigoto C de control (pocillo E12), un homozigoto T de control
(pocillo F12) y un heterozigoto de control (pocillo G12). La escala
se expresa en miliOD/min a 450 nm. En este caso, las muestras más
positivas daban señales por encima de 100. En este formato, para
una prueba de parentesco en caballos con un panel de 28 marcadores
bialélicos, se requerirían 56 de estas placas para hallar el
genotipo completo de los 85
caballos.
caballos.
Cincuenta y un caballos no relacionados
aleatoriamente seleccionados y tres familias macho/yegua/potro
fueron elegidos para el estudio con la intención de establecer que
un subconjunto razonable del grupo de marcadores de ADN obtenido
hallado hasta la fecha podía proporcionar la deseada p(exc)
\geq 0,90, y establecer la potencia de los marcadores de ADN a la
vez que una priorización entre éstos para mediciones definitivas de
frecuencias alélicas.
El molde de ADN monocatenario generado por PCR se
preparó a partir del ADN genómico de cada animal. Este material se
codificó en relación con variaciones de los nucleótidos por el
método AGB. Los datos del genotipo obtenidos para cada posición
polimórfica se resumen en la tabla 2. A partir de estos datos del
genotipo, se determinaron las frecuencias alélicas y se emplearon
para calcular la p(exc) correspondiente a cada posición. Se
da la p(exc) acumulada para las 18 posiciones listadas en
las Tablas 1 y 2 y es de 0,955 para todo el grupo. En las Tablas
2-5, el genotipo está indicado como homozigoto (es
decir, PP o QQ) o heterozigoto (PQ). Los números entre paréntesis
denotan el número de alelos del genotipo observados.
Se analizó el genotipo de una familia constituida
por un semental, una yegua y su descendiente con respecto a las 18
posiciones variables discutidas arriba sin hallar exclusiones. Esta
familia no había sido previamente analizada. A partir de los números
para las frecuencias alélicas preliminares presentados en la Tabla
2, es posible construir una tabla de p(exc) correspondientes
a este caso específico (Tabla 3). En general, al construir esta
tabla se asumió que la identidad de la madre no está en cuestión
(aunque, en la práctica es posible excluir a la madre si ninguno de
sus alelos es heredado por el potro). La Tabla 3 muestra los datos
de genotipo para el potro y su madre con las posiciones analizadas
listadas, en este caso, por orden de significatividad. La propiedad
acumulada total en este caso era de
0,942.
0,942.
Resulta de interés utilizar los grupos de
análisis de población para deducir información preliminar acerca de
otros aspectos del panel de marcadores. Por ejemplo, a partir de
los datos de las frecuencias alélicas, es posible calcular un valor
de probabilidad de identidad [p(ID)] para las 18 posiciones,
que resulta de 4,79 x 10^{-7} o, aproximadamente, 1 entre 2,1
millones. Luego, uno podría concluir que ninguno de los caballos del
grupo de población examinado tendría un genotipo igual al de ningún
otro, y el análisis por ordenador así lo confirma. Como se muestra
en la tabla 4, la p(ID) alcanza números muy pequeños con el
análisis de comparativamente pocos loci. Con las siete
primeras posiciones, la probabilidad de que dos animales distintos
arbitrarios tengan genotipos diferentes es ya del
99%.
99%.
En el presente estudio podemos hallar dos tipos
de resultados potencialmente falsos, debidos a (1) fallos en el
proceso del PCR o (2) incompatibilidades entre el genotipo obtenido
de hebras opuestas. Sólo los datos de aquellos animales que dieron
resultados correctos en ambas hebras fueron incluidos en los
cálculos de las frecuencias alélicas. Sesenta caballos genotipados
con respecto a 18 posiciones proporcionan 1.080 genotipos. El 95% de
todos los análisis de determinación del genotipo resultaron
correctos. No se produjeron los tradicionales fallos debidos al PCR.
El 3,8% de los resultados falsos se localizaron en la etapa del
ABG, o bien debido a que la PCR falló en la réplica de la
monocadena, o a errores de manipulación. El 1,1% de todos los
genotipos proporcionó datos incompatibles entre las hebras por
motivos desconocidos.
En resumen, el método ABG (análisis de bit
genético) es un método de determinación de genotipos simple,
adecuado y fácil de automatizar. En este método, se asocian
secuencias específica a un primer con enlace a fase sólida
que seleccionan una única posición polimórfica en una muestra de
ácido nucleico, y con una reacción altamente precisa de
ADN-polimerasa con nuevos dideoxidonucleótidos no
radioactivos se determina el genotipo correspondiente a aquella
posición. Una de las características más atractivas de la
aproximación ABG es que, dado que la discriminación alélica se debe
efectivamente a la ADN-polimerasa, condiciones
distintas de reacción permiten examinar muchas posiciones
polimórficas diferentes. Esta característica reduce los costes de
las complejas pruebas de ADN porque permite el desarrollo de varias
pruebas en paralelo.
La tasa de error intrínseca del procedimiento ABG
en el formato presentado se estima baja; la relación señal/ruido en
términos de incorporación de nucleótidos correcta/incorrecta para
los homozigotos parece ser de aproximadamente 20:1. ABG es, pues, un
método suficientemente cuantitativo que permite una detección
fiable de heterozigotos en estudios de genotipo. La presencia en
la reacción de amplificación por medio de
ADN-polimerasa de los cuatro
dideoxinucleósidostiofosfato como único sustrato de nucleótidos
aumenta la fidelidad de la determinación de los genotipos al evitar
las incorporaciones erróneas. El método ABG puede utilizarse para
cualquier tipo de aplicación -incluidos los estudios de enlaces
genéticos y determinación del mapa genético, diagnósticos genéticos
y pruebas de identidad/parentesco -siempre que se conozca la
secuencia de ADN.
Los polimorfismos de nucleótido simple en seres
humanos pueden utilizarse del mismo modo que los polimorfismos
descritos para el caso de los equinos. En la tabla 5 se presentan
algunos ejemplos de polimorfismos adecuados en seres humanos.
\newpage
Con el fin de intentar convertir PNS de humanos a
un formato adecuado para un análisis ABG, una posición de PNS
fenotípicamente neutra se convirtió y se analizó por ABG. La
posición se seleccionó de entre las posiciones registradas en la
base de datos de polimorfismos humanos OBM de la Universidad John
Hopkins: La posición es met-H en el cromosoma 7 a
q31, posición de mutación 127, A a G (Horn, G.T. y otros, Clin.
Chem. 36, 1614-1619, 1990). Se
sintetizaron los oligonucleótidos siguientes (p = tiofosfato):
PCR primer nº 1552 (ID. SEC. Nº:93)
- 5'-CpApTpCpCATGTAGGAGAGCCTTAGTC
PCR primer nº 1553 (ID. SEC. Nº:94)
- 5'-CCATTTTTGTGTCTTCTAGTCTAAGG
ABG primer nº 1554 (ID. SEC. Nº:95)
- 5'-TTGAAAGATCGTCAGAAAAATCC
Las muestras de ADN se seleccionaron al azar de
los archivos de ADN de dos familias de entre la colección de
familias del Centre d'Etude du Polimorphisme Humaine (CEPH).
También se empleó un control negativo, que no contenía ADN. El ADN
de muestra se amplificó por PCR con los primer mencionados
arriba y el producto resultante se analizó por ABG para dos bases
potenciales de la posición polimórfica, G y A. Los resultados del
ABG se obtuvieron por interpretación del espectro de absorción a
450 nm en un lector de pocillos de microtitulación. Los datos se
presentaron en la Tabla 6.
Las muestras 1, 2, 3, 4, 6 y 8 eran homozigotos
de A, las muestras 7 y 9 eran homozigotos de G y las muestras 3 y 5
eran heterozigotos GA. Estos ADN no han sido analizados por ningún
otro método hasta la fecha, por su bialelismo.
En el presente estudio podemos hallar dos tipos
de resultados potencialmente falsos, debidos a (1) fallos en el
proceso del PCR o (2) incompatibilidades entre el genotipo obtenido
de hebras opuestas. Sólo los datos de aquellos animales que dieron
resultados correctos en ambas hebras fueron incluidos en los
cálculos de las frecuencias alélicas. Sesenta caballos genotipados
con respecto a 18 posiciones proporcionan 1.080 genotipos. El 95% de
todos los análisis de determinación del genotipo resultaron
correctos. No se produjeron los tradicionales fallos debidos al PCR.
El 3,8% de los resultados falsos se localizaron en la etapa del
ABG, bien debido a que la PCR falló en la réplica de la monocadena,
o a errores de manipulación. El 1,1% de todos los genotipos
proporcionó datos incompatibles entre las hebras por motivos
desconocidos.
En resumen, el método ABG (análisis de bit
genético) es un método de determinación de genotipos simple,
adecuado y fácil e automatizar. En este método, se asocian
secuencias específica a un primer con enlace a fase sólida
que seleccionan una única posición polimórfica en una muestra de
ácido nucleico, y con una reacción altamente precisa de
ADN-polimerasa con nuevos dideoxidonucleótidos no
radioactivos se determina el genotipo correspondiente a aquella
posición. Una de las características más atractivas de la
aproximación ABG es que, dado que la discriminación alélica se debe
efectivamente a la ADN-polimerasa, condiciones
distintas de reacción permiten examinar muchas posiciones
polimórficas diferentes. Esta característica reduce los costes de
las complejas pruebas de ADN porque permite el desarrollo de varias
pruebas en paralelo.
La tasa de error intrínseca del procedimiento ABG
en el formato presentado se estima baja; la relación señal/ruido en
términos de incorporación de nucleótidos correcta/incorrecta para
los homozigotos parece ser de aproximadamente 20:1. ABG es, pues, un
método suficientemente cuantitativo que permite una detección
fiable de heterozigotos en estudios de genotipo. la presencia en la
reacción de amplificación por medio de
ADN-polimerasa de los cuatro
dideoxinucleósidostiofosfato como único sustrato de nucleótidos
aumenta la fidelidad de la determinación de los genotipos al evitar
las incorporaciones erróneas. El método ABG puede utilizarse para
cualquier tipo de aplicación -incluidos los estudios de enlaces
genéticos y determinación del mapa genético, diagnósticos genéticos
y pruebas de identidad/parentesco -siempre que se conozca la
secuencia de ADN.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: ORCHID BIOSCIENCES, INC.
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: POLIMORFISMOS DE NUCLEÓTIDO SIMPLE Y SU USO EN ANÁLISIS GENÉTICOS
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 95
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DISPOSITIVO LECTOR DEL COMPUTADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: disquete
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- COMPUTADOR: IBM compatible PC
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: PatentIn Release #1.0, versión #1.25
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- DATOS ACTUALES DE LA APLICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- NÚMERO DE LA APLICACIÓN: EP 95900520.8
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. 1 Nº: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- FIBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 177-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCAGCTCTAA GTGCTGTGGG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 177-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGCAGAAATT CTAAGGTGTT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 177-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAACACCTTAG AATTTCTGCA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 177-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCCACAGCAC TTAGAGCTGC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 595-3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGCTCTGGGAN TGATCCACTA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 595-3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGAGGGAAAA ATGATGATGC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 595-3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCATCATCAT TTTTCCCTCA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 595-3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTAGTGGATCA TCCCAGAGCT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 090-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAAACTAATT TGATGGCCAT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 090-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAAGTCAGAA CAATGATTGC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 090-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCAATCATTG TTCTGACTTT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 090-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATGGCCATCA AATTAGTTTT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 324-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCACAAGGCCC AAGAACAGGA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 324-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGAGTTCAGC GAGTGTCAGA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 324-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCTGACACTC GCTGAACTCA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 324-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCCTGTTCTT GGGCCTTGTG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 129-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGGGAAAGAC CACATTATTT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 129-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTTCCCTTTT GTTTCAGACC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 129-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTCTGAAAC AAAAGGGAAC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 129-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAATAATGTG GTCTTTCCCA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 21:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 007-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCATGAGTAAG AAGCATCCGG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 22:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 007-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCATGGAGTC ATAGATAAGT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 23:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 007-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACTTATCTAT GACTCCATGG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 24:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 007-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCGGATGCTT CTTACTCATG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 25:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 324-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCCAAGAACA GGATTGAGTT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 26:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 324-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 26:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGCGAGTGTC AGAGTTGTGT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 27:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 324-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 27:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACACAACTCT GACACTCGCT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 28:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 324-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 28:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAACTCAATCC TGTTCTTGGG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 29:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 177-3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 29:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGCAAGAAA TGGGGGGCCTT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 30:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 177-3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 30:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTCCTACAAT TGCCAGGAAG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 31:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 177-3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 31:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTTCCTGGCA ATTGTAGGAC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 32:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 177-3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 32:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAGGCCCCCC ATTTCTTGCT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 33:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 595-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 33:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAATATCAAT ATATATATAT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 34:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 595-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 34:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGTGTGTGTG TGTATTTGCT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 33:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 595-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 33:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGCAAATACA CACACACACA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 36:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 595-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 36:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATATATATAT ATTGATATTC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 37:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 007-3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 37:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCCATAATTA AGCCTGTATT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 38:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 007-3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 38:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTTTGTTTTA AATTTTGTGA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 39:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 007-3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 39:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCACAAAATT TAAAACAAAC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 40:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 007-3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 40:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAATACAGGCT TAATTATGGC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 41:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 459-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 41:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTGTAGAGTA GTTCAAGGAC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 42:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 459-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 42:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATGTCTTATA CCTCCCTTTT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 43:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 459-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 43:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAAAGGGAGG TATAAGACAT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 44:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 459-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 44:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTCCTTGAAC TACTCTACAC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 45:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 085-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 45:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTGAACGGAG AGCAGGCCTT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 46:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 085-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 46:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCTGCTGAAG CCTCAGACCG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 47:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 085-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 47:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGGTCTGAGG CTTCAGCAGG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 48:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 085-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 48:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAGGCCTGCT CTCCGTTCAC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 49:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 007-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 49:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTGCTCTTTA GACTATGACC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 50:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 007-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 50:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCAACCTTGC ATCATGAGCT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 51:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 007-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 51:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGCTCATGAT GCAAGGTTGA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 52:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 007-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 52:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTCATAGTC TAAAGAGCAG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 53:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 474-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 53:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTTGAGCTGG GACCTCAGTC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 54:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 474-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 54:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCTCCTGCCT TTAGACTCGA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 55:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 474-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 55:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCGAGTCTAA AGGCAGGAGA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 56:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 474-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 56:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGACTGAGGTC CCAGCTCAAA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 57:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 178-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 57:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAACCTCTGG GCCGTGGATA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 58:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 178-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 58:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTGTTCAGAA GCACAGGTGA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 59:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 178-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 59:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCACCTGTGC TTVTGAACAA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 60:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 178-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 60:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTATCCACGGC CCAGAGGTTC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 61:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 595-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 61:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTATTTGCTA GCTCTGGGAT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 62:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 595-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 62:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATCCACTAAT GAGGGAAAAA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 63:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 595-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 63:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTTTTCCCTC ATTAGTGGAT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 64:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 595-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 64:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATCCCAGAGC TAGCAAATAC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 65:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 595-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 65:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAAGTTGTGG GAVAGATGTG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 66:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 177-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 66:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGAGATGCAG CTCTAAGTGC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 67:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 177-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 67:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCACTTAGAG CTGCATCTCT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 68:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 177-1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 68:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCACATCTGTC CCACAACTTC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 69:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 459-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 69:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCATGAGGAA GCCTCCACAA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 70:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 459-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 70:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTCCCAATAG TCTGGGATTC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 71:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 459-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 71:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAATCCCAGA CTATTGGGAC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 72:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: 459-2
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 72:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTGTGGAGGC TTCCTCATGG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 73:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: IGKC 2p12
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 73:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAAGCAGACT ACGAGAAACA CAAA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 74:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: IGKC 2p12
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 74:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCTACGCCTG CGAAGTCACC CATC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 75:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: IGKC 2p12
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 75:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGATGGGTGAC TTCGCAGGCG TAGA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 76:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: IGKC 2p12
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 76:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTTGTGTTTC TCGTAGTCTG CTTT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 77:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: ILIB 2q3-q21
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 77:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTCCTGCAAT TGACAGAGAG CTCC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 78:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: ILIB 2q3-q21
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 78:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAGGCAGAGA ACAGCACCCA AGGT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 79:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: ILIB 2q3-q21
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 79:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACCTTGGGTG CTGTTCTCTG CCTC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 80:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: ILIB 2q3-q21
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 80:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGAGCTCTCT GTCAATTGCA GGAG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 81:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: LDLR 19p13.3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 81:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTCCATCTCA AGCATCGATG TCAA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 80:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: ILIB 2q3-q21
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 80:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGAGCTCTCT GTCAATTGCA GGAG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 81:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: LDLR 19p13.3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 81:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTCCATCTCA AGCATCGATG TCAA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 82:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: LDLR 19p13.3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 82:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGGGGCAACC GGAAGACCAT CTTG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 83:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: LDLR 19p13.3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 83:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCAAGATGGTC TTCCGGTTGC CCCC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 84:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: LDLR 19p13.3
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 84:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTGACATCGA TGCTTGAGAT GGAG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 85:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: MET-H 7q31
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 85:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTTTGGTCTA AGTTGCTGAT TACC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 86:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: MET-H 7q31
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 86:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGATTTTTCT GACGATCTTT CAAC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 87:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: MET-H 7q31
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 87:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTTGAAAGAT CGTCAGAAAA ATCC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 88:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: MET-H 7q31
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 88:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTAATCAGC AACTTAGACC AAAC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 89:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: PROC 2q13-q21
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 89:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCTGACAGCG GCCCACTGCA TGGA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 90:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: PROC 2q13-q21
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 90:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAGTCCAAGA AGCTCCTTGT CAGG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 91:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: PROC 2q13-q21
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 91:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCTGACAAGG AGCTTCTTGG ACTC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 92:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: PROC 2q13-q21
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 92:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCCATGCAGT GGGCCGCTGT CAGC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 93:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: MET-H 7q31
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 93:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCATCCATGTA GGAGAGCCTT AGTC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 94:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: MET-H 7q31
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 94:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCATTTTTGT GTCTTCTAGT CTAAGG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL ID. SEC. Nº: 95:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- SIN SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Equus caballus
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CLON: MET-H 7q31
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. Nº: 95:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTGAAAGATC GTCAGAAAAA TCC
\hfill
Claims (40)
1. Un método para análisis genéticos de un
conjunto de individuos de la misma especie, el cual:
proporciona una serie polimórfica que constituye
un conjunto de polimorfismos de nucleótido simple (PNS); y
determina la presencia o ausencia de
polimorfismos en el conjunto de PNS para cada conjunto de
individuos; y
determina si la presencia o ausencia de un alelo
particular de un polimorfismo en el conjunto de PNS se halla
asociado a algún rasgo particular.
2. Un método de acuerdo con la reivindicación 1,
en el cual el PNS no causa la característica.
3. Un método de acuerdo con la reivindicación 1,
que incluye además:
un análisis de las frecuencias de aparición
determinantes entre los PNS del conjunto, que permiteestablecer un
mapa genético en que los PNS actúan como marcadores.
4. Un método para determinar la probabilidad de
que una muestra de ácido nucleico provenga de un individuo
particular, el cual:
proporciona una serie polimórfica que constituye
un conjunto de polimorfismos de nucleótido simple (PNS)
correspondientes a dicho individuo y una serie polimórfica
correspondiente a dicha muestra;
determina la presencia o ausencia de
polimorfismos PNS múltiples marcadores en las dos series y compara
los resultados para cada polimorfismos PNS marcador;
determina a partir de ello una probabilidad de
identidad/no identidad para cada comparación; y
determina a partir de ello una probabilidad
acumulada de identidad/no-identidad como el
producto de probabilidades obtenidas en cada comparación.
5. Un método de acuerdo con la reivindicación 4,
en el cual la muestra de ácido nucleico es desconocida y el
individuo particular es conocido.
6. Un método de acuerdo con la reivindicación 4,
en el cual la serie polimórfica comprende un conjunto de marcadores
genéticos de referencia que incluyen tres o más PNS.
7. Un método de acuerdo con la reivindicación 4,
que involucra determinar las frecuencias alélicas de aparición de
los PNS por comparación de los resultados para cada PNS
marcador.
8. Un método de acuerdo con la reivindicación 4,
en el cual la probabilidad acumulada de identidad o
no-identidad es superior a 0,95.
9. Un método de acuerdo con la reivindicación 4,
en el cual las moléculas de ácido nucleico son ADN.
10. Un método de acuerdo con la reivindicación 4,
en el cual las moléculas de ácido nucleico son ARN.
11. Un método de determinación de la probabilidad
de que un individuo sea o no progenie de un antecesor o unos
antecesores putativos, el cual:
proporciona una serie polimórfica que constituye
un conjunto de polimorfismos de nucleótido simple (PNS)
correspondiente a dicho individuo y una serie polimórfica
correspondiente a dicho antecesor o antecesores putativos;
determina la presencia o ausencia de
polimorfismos PNS múltiples marcadores en la serie individual y la
del antecesor o los antecesores y compara los resultados para cada
polimorfismo PNS marcador; y
determina a partir de ello la probabilidad de que
el individuo sea o no progenie del antecesor o los antecesores
putativos.
12. Un método de acuerdo con la reivindicación
11, en el cual el antecesor putativo es un padre putativo, o los
antecesores putativos son los padres putativos.
13. Un método de acuerdo con la reivindicación
11, el cual se utiliza para excluir la posibilidad de paternidad de
que un macho o varón sea padre putativo de un individuo por cálculo
de una probabilidad de exclusión de paternidad por comparación de
ambos, y determinación de una probabilidad acumulada de exclusión
de paternidad por multiplicación de dichas probabilidades de
exclusión de paternidad.
14. Un método de acuerdo con la reivindicación
11, el cual se emplea para establecer la probabilidad de que un
individuo sea progenie de una hembra o mujer putativa
seleccionada.
15. Un método de acuerdo con la reivindicación
11, en el cual la probabilidad acumulada de identidad o
no-identidad es superior a 0,95.
16. Un método de acuerdo con las reivindicaciones
12 ó 13, en el cual la probabilidad acumulada de exclusión de
paternidad es superior a 0,95.
17. Un método de acuerdo con la reivindicación
16, en el cual la probabilidad de exclusión es superior a 0,99.
18. Un método de acuerdo con la reivindicación
11, el cual determina que la probabilidad de que un individuo sea o
no progenie de un antecesor o unos antecesores putativos se obtiene
a partir de la identificación de relaciones obtenidas por
comparación de los resultados para cada PNS marcador y detección de
las frecuencias alélicas de los PNS en la serie o las series
polimórficas.
19. Un método de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, en el cual los PNS marcadores se
hallan en múltiples loci desenlazados.
20. Un método de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, en el cual los PNS marcadores son
dialélicos o trialélicos.
21. Un método de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, cuyo propósito es la determinación del
genotipo de una planta o un animal.
22. Un método de acuerdo con la reivindicación
21, en el cual el individuo es un múrido, ovino, equino, bovino,
porcino, canino felino o un ser humano.
23. Un método de acuerdo con la reivindicación 1,
en el cual la característica es una predisposición a una enfermedad
genética.
24. Un método de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, en el cual la presencia o la ausencia
de los PNS viene determinada por análisis de bits genéticos
(ABG).
25. Un método de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, en el cual la serie polimórfica
incluye 3 o más PNS.
26. Un método de elaboración de un mapa genético
de un individuo, el cual:
(a) proporciona una serie polimórfica compuesta
por tres o más polimorfismos de nucleótido simple (PNS);
(b) identifica las variantes de PNS presentes en
un antecesor del individuo por determinación de los rasgos de
identidad básicos para cada posición del PNS en el cromosoma del
individuo;
(c) determina el número de coincidencias entre el
individuo y el antecesor; y
(d) calcula el alcance de vinculación genética
entre cada alelo a partir del número de coincidencias obtenido en
el punto (c) y de la probabilidad de que cualquier par de alelos
hallado en el individuo haya sido heredada del mismo antecesor sobre
la base de las frecuencias alélicas de las variantes de
polimorfismos PNS de la serie polimórfica, con lo cual construye el
mapa genético del individuo.
27. Un método de acuerdo con la reivindicación
26, en el cual las posiciones de los PNS utilizados para la
construcción del mapa genético están distribuidos arbitrariamente
por todo el genoma de la especie.
28. Un método de acuerdo con la reivindicación
26, en el cual un antecesor se selecciona entre un grupo
constituido por padres y abuelos.
29. Un método de acuerdo con la reivindicación 1,
en el cual las los PNS variantes no causan ninguna característica
genética.
30. Un método de acuerdo con la reivindicación 1,
en el cual la característica de interés es una predisposición a
padecer una enfermedad genética.
31. Un método de acuerdo con la reivindicación 1,
en el cual la característica de interés es una enfermedad
genética.
32. Un método de acuerdo con la reivindicación 1,
en el cual el individuo se selecciona de entre un animal o una
planta.
33. Un método de acuerdo con la reivindicación
32, en el cual el individuo es un mamífero.
34. Un método de acuerdo con la reivindicación
33, en el cual el mamífero se selecciona entre seres humanos,
primates no humanos, perros, gatos, vacas, ovejas, caballos,
ratones, ratas y conejos.
35. Un método de acuerdo con la reivindicación
34, en el cual el mamífero es un ser humano.
36. Un método de acuerdo con la reivindicación
35, en el cual el mamífero es un caballo.
37. Un método de acuerdo con la reivindicación 1,
en el cual cada PNS presenta una frecuencia de aparición de por lo
menos 0,20.
38. Un método de acuerdo con la reivindicación 1,
que incluirá posteriormente calcular una segmentación LOD y
determinar una relación genética entre PNS variantes y la
característica de interés.
39. Un método de acuerdo con la reivindicación 1,
en el cual la serie polimórfica incluye tres o más PNS.
40. Un método de acuerdo con la reivindicación 1,
en el cual ninguno de los PNS variantes de la serie polimórfica
causa la característica.
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