ES2242441T3 - Proteina akt-3. - Google Patents
Proteina akt-3.Info
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Abstract
Una molécula de ácido nucleico que codifica la proteína Akt-3 humana o un equivalente funcional de ésta, que comprende la secuencia de aminoácidos determinada en la SEQ Nº de ID 3, donde un equivalente funcional es una proteína Akt-3 capaz de fosforilar la histona H2B cuando se expresa y purifica como una proteína de fusión GST recombinante.
Description
Proteína Akt-3.
La presente invención se refiere a la clonación y
expresión de una nueva serina/treonina quinasa humana denominada
"Akt-3" y, en particular, a moléculas de ácido
nucleico que codifican la proteína Akt-3, la
proteína misma y compuestos que se pueden usar para inhibir la
supervivencia celular.
Un rasgo característico de muchas células
cancerosas es su capacidad de multiplicarse independientemente de
la adhesión. En contraste, cuando se impide que las células
endoteliales sin transformar se adhieran a la matriz extracelular
(ECM), éstas sufren apoptosis (Frisch y Francis, 1994; Meredith
et al, 1993). El proceso por el cual se provoca que células
normalmente adherentes sufran apoptosis cuando no pueden adherirse a
la ECM se ha denominado "anoikis" (Frisch y Ruoslahti, 1997) y
es un ejemplo del efecto que tiene sobre una célula la eliminación
de un factor de supervivencia. Cambios en la señalación provocados
por moléculas de adhesión pueden producir resistencia a la anoikis
(Frisch y Ruoslahti, 1997) y esto puede contribuir al mecanismo
mediante el cual las células cancerosas que se multiplican
independientemente de la adhesión pueden evitar la anoikis.
Akt (también conocida como proteína quinasa B
(PKB) o "proteína quinasa relacionada con A y C"
(RAC-PK)) es una serina/treonina quinasa que ha sido
implicada en la regulación de la supervivencia celular (Khwaja et
al., 1997; Dudek et al., 1997;
Kauffmann-Zeh et al., 1997; Kennedy et
al., 1997; Datta et al., 1997; Marte y Downward, 1997).
La Akt puede inhibir la apoptosis inducida por el desprendimiento
de la ECM (anoikis; Khwaja et al., 1997), así como por la
eliminación de factores de supervivencia (Kennedy et al.,
1997; Ahmed et al., 1997; Dudek et al., 1997;
Kauffman-Zeh et al., 1997; Philpott et
al., 1997; Crowder y Freeman, 1998; Eves et al., 1998) o
la irradiación (Kulik et al., 1997).
Akt comprende un dominio de homología a
plecstrina (PH, pleckstrin homology) en la región
NH_{2}-terminal involucrado en la unión a lípidos,
un dominio quinasa y una "cola" COOH-terminal.
Se cree que Akt se activa por reclutamiento hacia la membrana
plasmática y posterior fosforilación por dos quinasas secuencia
arriba, PDK-1 y PDK-2 (estudiado en
Coffer et al, 1998; Alessi y Cohen, 1998). Se cree que la
unión de 3-fosfoinositidos, generada por la
fosfatidilinositol-3-quinasa (PI
3-quinasa), al dominio PH de la Akt promueve la
translocación a la membrana plasmática y facilita la fosforilación
de Akt-1 por PDK-1 en Tre^{308}
(Thr^{308} en inglés) (Alessi et al., 1996; Alessi et
al., 1997; Stephens et al., 1998) o de
Akt-2 en Tre^{309} (Meier et al., 1997).
Además de la fosforilación de Tre^{308}, la activación total
requiere la fosforilación de la cola COOH en Ser^{473} en
Akt-1 (Alessi et al, 1996) o en Ser^{474}
en Akt-2 (Meier et al., 1997). La enzima
responsable de la fosforilación de Ser^{473}/Ser^{474} se
denominó originalmente PDK-2 pero recientemente la
quinasa vinculada a integrina, ILK (Delcommenne et al.,
1998) surgió como una candidata para esta función.
Hasta la fecha se describieron dos isoformas
humanas de Akt, Akt-1 y Akt-2
(Coffer y Woodgett, 1991; Jones et al., 1991; Cheng et
al., 1992). Se describió una tercera isoforma, a la que aquí se
hace referencia como Akt-3, en la rata (Konishi
et al., 1995). Dado que esta Akt-3 de rata
posee una cola aparentemente truncada y de ese modo carece de
Ser^{473}, su regulación puede diferir de la de
Akt-1 y Akt-2. Tanto
Akt-1 como Akt-2 se expresan
ampliamente, aunque la expresión de Akt-2 es muy
importante en los tejidos que responden a la insulina, como el
hígado y el músculo esquelético (Konishi et al., 1994;
Altomare et al., 1995). Akt-1 y
Akt-2 son activadas por la insulina en los
adipocitos, los hepatocitos y el músculo esquelético de rata. En
contraste, la Akt-3 no parece ser activada en gran
medida por la insulina en estos tejidos (Walker et al.,
1998). La función de las diversas isoformas de Akt en la
señalización de la insulina puede limitar la utilidad de los
compuestos que inhiben la actividad de Akt-1 o
Akt-2 puesto que dichos agentes pueden inducir los
síntomas observados en los pacientes con diabetes. Formulamos la
hipótesis de que este problema se podía evitar utilizando
inhibidores selectivos de Akt-3 y esto nos indujo a
identificar el análogo humano de la Akt-3 de
rata.
Los presentes inventores identificaron y
caracterizaron una molécula de ácido nucleico que codifica la
isoforma humana de la Akt-3. Significativamente, la
Akt-3 humana posee una cola
COOH-terminal que contiene un residuo de aminoácido
análogo a Ser^{473}/Ser^{474} previamente implicado en la
activación de Akt-1/Akt-2, pero
ausente en la proteína Akt-3 de rata.
Por consiguiente, un primer aspecto de la
presente invención provee de una molécula de ácido nucleico que
codifica la Akt-3 humana o un equivalente funcional,
derivado o bioprecursor de ésta, que contiene la secuencia de
aminoácidos ilustrada en la figura 2. Preferentemente, la molécula
es una molécula de ADN y aún más preferentemente una molécula ADNc,
e incluso aún más preferentemente contiene la secuencia de los
nucleótidos ilustrados en la figura 1. Este aspecto de la invención
también provee de una molécula de ácido nucleico capaz de
hibridarse a la molécula de acuerdo con la invención en condiciones
de restricción alta.
Restricción de la hibridación como se usa aquí se
refiere a las condiciones bajo las cuales los ácidos polinucleicos
son estables. La estabilidad de los híbridos se refleja en la
temperatura de fusión (Tm) de los mismos. Se puede calcular
aproximadamente la Tm mediante la fórmula:
81,5^{o}C +
16,6(log_{10} [Na^{+}]+0,41
\hskip1cm(%G \ y \ C)-600/1
donde 1 es la longitud de los
híbridos en los nucleótidos. Tm disminuye aproximadamente en
1-1,5ºC con cada 1% de reducción en la homología de
la
secuencia.
El término "restricción" se refiere a las
condiciones de hibridación en las que un ácido nucleico
monocatenario se une con una hebra complementaria cuando las bases
purina o pirimidina de él se aparean con su base correspondiente por
puentes de hidrógeno. Las condiciones de restricción alta favorecen
el apareamiento de bases homólogas mientras que las condiciones de
restricción baja favorecen el apareamiento de bases no
homólogas.
La condiciones de "restricción baja"
comprenden, por ejemplo, una temperatura de aproximadamente 37ºC o
inferior, una concentración de formamida menor que aproximadamente
50%, y una concentración de sal entre moderada y baja (SSC); o,
alternativamente, una temperatura de aproximadamente 50ºC o
inferior, y una concentración de sal entre moderada y alta (SSPE),
por ejemplo NaCl 1 M.
Las condiciones de "restricción alta"
comprenden, por ejemplo, una temperatura de aproximadamente 42ºC o
inferior, una concentración de formamida menor que aproximadamente
20% y una concentración de sal baja (SSC); o, alternativamente, una
temperatura de aproximadamente 65ºC o inferior, y una concentración
de sal baja (SSPE). Por ejemplo, las condiciones de restricción alta
comprenden la hibridación en NaH_{2}PO4 0,5 M, dodecil sulfato de
sodio al 7% (SDS) y EDTA 1 mM a 65ºC (Ausubel, F.M. et al.
Current Protocols in Molecular Biology. Vol. I, 1989; Green
Inc. New York, en 2.10.3).
"SSC" comprende una hibridación y solución
de lavado. Una solución de reserva de 20X SSC contiene cloruro de
sodio 3M, citrato de sodio 0,3 M y pH 7,0.
"SSPE" comprende una hibridación y solución
de lavado. Una solución 1X SSPE contiene NaCl 180 mM,
NaH_{2}PO_{4} l0 mM, EDTA 1 mM y pH 7,4.
El ácido nucleico capaz de hibridarse a las
moléculas de ácido nucleico de acuerdo con la invención en general
tendrá una homología de al menos 85%, preferentemente de al menos
90% y aún más preferentemente de al menos 95% con las secuencias de
nucleótidos de acuerdo con la invención.
Las moléculas de ADN de acuerdo con la invención
pueden, de manera ventajosa, ser incluidas en un vector de
expresión apropiado para expresar polipéptidos que codifican de
allí en un huésped apropiado.
La presente invención también comprende dentro de
su alcance proteínas o polipéptidos codificados por las moléculas
de ácido nucleico de acuerdo con la invención o un equivalente
funcional, derivado o bioprecursor de éste.
Un vector de expresión de acuerdo con la
invención incluye un vector que tiene un ácido nucleico de acuerdo
con la invención unido operablemente a las secuencias reguladoras,
como las regiones del promotor, que son capaces de efectuar la
expresión de dichos fragmentos de ADN. La expresión "unido
operablemente" se refiere a una yuxtaposición en la que los
componentes descritos están en una relación que les permite
funcionar de la manera en que fueron concebidos. Tales vectores se
pueden transformar en una célula huésped apropiada para asegurar la
expresión de un polipéptido de acuerdo con la invención. Por lo
tanto, en un aspecto adicional, la invención provee de un proceso
para preparar polipéptidos de acuerdo con la invención que comprende
el cultivo de una célula huésped, transformada o transfectada con
un vector de expresión como se describió anteriormente en
condiciones para asegurar la expresión por el vector de una
secuencia de codificación que codifique los polipéptidos y la
recuperación de los polipéptidos expresados.
Los vectores pueden ser, por ejemplo vectores
plasmídicos, víricos o fágicos provistos de un origen de
replicación, opcionalmente un promotor para la expresión de dicho
nucleótido y opcionalmente un regulador del promotor. Los vectores
pueden contener uno o más marcadores seleccionables, como, por
ejemplo, resistencia a la ampicilina.
Los elementos reguladores necesarios para la
expresión incluyen secuencias promotoras para unirse a la ARN
polimerasa y secuencias de inicio de la transcripción para unirse
al ribosoma. Por ejemplo, un vector de expresión bacteriana puede
incluir un promotor como el promotor lac y para el inicio de la
transcripción la secuencia de Shine-Dalgarno y el
codón de inicio AUG. De manera semejante, un vector de expresión
eucariótica puede incluir un promotor homólogo o heterólogo para la
ARN polimerasa II, una señal de poliadenilación secuencia abajo, el
codón de inicio AUG y un codón de terminación para el
desprendimiento del ribosoma. Dichos vectores se pueden obtener
comercialmente o reunir de las secuencias descritas por los métodos
bien conocidos por los técnicos de la profesión.
Una molécula de ácido nucleico de acuerdo con la
invención se puede insertar en los vectores descritos en una
orientación antisentido para asegurar la producción de ARN
antisentido. El ARN antisentido u otros ácidos nucleicos antisentido
se pueden producir por métodos sintéticos.
De acuerdo con la presente invención, un ácido
nucleico definido incluye no sólo el ácido nucleico idéntico sino
también todas las variaciones menores de las bases incluidas en
particular, las sustituciones en las bases que dan lugar a un codón
sinónimo (un codón diferente que especifica el mismo residuo de
aminoácido) debido al código degenerado en las sustituciones
conservativas de los aminoácidos. La expresión "secuencia de
ácidos nucleicos" también incluye la secuencia complementaria de
cualquier secuencia monocatenaria dada considerando las variaciones
de bases.
La presente invención también proporciona de
manera ventajosa las secuencias de ácidos nucleicos de al menos
aproximadamente 10 nucleótidos contiguos de un ácido nucleico de
acuerdo con la invención y preferentemente de 10 a 120, y aún más
preferentemente de 10 a aproximadamente 50 nucleótidos. Estas
secuencias pueden, ser utilizadas de manera ventajosa como sondas o
cebadores para iniciar la replicación, o algo semejante. Dichas
secuencias de ácidos nucleicos se pueden producir según las
técnicas bien conocidas por los técnicos de la profesión, como por
ejemplo por métodos recombinantes o sintéticos. También pueden
usarse en los equipos de diagnóstico o similares para detectar la
presencia de un ácido nucleico de acuerdo con la invención. Estas
pruebas comprenden en general poner en contacto la sonda con la
muestra en condiciones de hibridación y detectar la presencia de
cualquier formación doble o triple entre la sonda y cualquier ácido
nucleico de la muestra.
De acuerdo con la presente invención esas sondas
se pueden sujetar a un soporte sólido. Preferentemente, están
presentes en una matriz de modo que las múltiples sondas se puedan
hibridar simultáneamente a una única muestra biológica. Las sondas
se pueden colocar en la matriz o sintetizar in situ en ésta.
(Ver Lockhart et al., Nature Biotechnology, vol. 14 de
diciembre de 1996 "Expression monitoring by hybridisation to high
density oligonucleotide arrays". Una única matriz puede contener
por encima de 100, 500 o incluso 1.000 diferentes sondas en las
ubicaciones discretas.
De manera ventajosa, las secuencias de ácidos
nucleicos, de acuerdo con la invención se pueden producir usando
dichos métodos recombinantes o sintéticos, como por ejemplo usando
los mecanismos de clonación de RCP que implican en general preparar
un par de cebadores, que pueden ser de aproximadamente 10 a 50
nucleótidos para una región del gen que se desea clonar, poniendo
los cebadores en contacto con el ARNm, el ADNc, o el ADN genómico de
una célula humana, llevando a cabo una reacción en cadena de la
polimerasa en condiciones que provocan la amplificación de la
región deseada, aislando la región o el fragmento amplificado y
recuperando el ADN amplificado. Generalmente, dichas técnicas como
las definidas aquí son bien conocidas por los técnicos de la
profesión, como se describe en Sambrook et al (Molecular
Cloning; a Laboratory Manual, 1989).
Los ácidos nucleicos o los oligonucleótidos de
acuerdo con la invención pueden llevar un marcador que se puede
revelar. Los marcadores apropiados incluyen radioisótopos como
^{32}P o ^{35}S, marcadores enzimáticos u otros marcadores
proteicos como biotina o marcadores fluorescentes. Dichos
marcadores se pueden agregar a los ácidos nucleicos o a los
oligonucleótidos de la invención y se pueden detectar usando las
técnicas conocidas per se.
Un aspecto adicional de la invención comprende la
Akt-3 humana o un equivalente funcional, derivado o
bioprecursor de ésta, que contiene una secuencia de aminoácidos
como la que se ilustra en la figura 2.
El polipéptido designado Akt-3
humana de acuerdo con la invención incluye todas las variantes
posibles de los aminoácidos codificados por la molécula de ácido
nucleico de acuerdo con la invención, incluido un polipéptido
codificado por dicha molécula y que tiene cambios conservativos en
los aminoácidos. Los polipéptidos de acuerdo con la invención
incluyen además variantes de dichas secuencias, incluidas las
variantes alélicas que se producen naturalmente que son
prácticamente homólogas de dichos polipéptidos. En este contexto, la
homología sustancial se considera como una secuencia que tiene al
menos 90% de homología en los aminoácidos con los polipéptidos
codificados por las moléculas del ácido nucleico de acuerdo con la
invención y aún más preferentemente al menos 95% de homología en los
aminoácidos.
La molécula del ácido nucleico o la
Akt-3 humana de acuerdo con la invención pueden, de
manera ventajosa, ser utilizados como un medicamento o en la
preparación de un medicamento, para tratar la enfermedad asociada a
la actividad de la Akt-3 como, el cáncer o
similares.
De manera ventajosa, se puede suministrar la
molécula del ácido nucleico o el polipéptido de acuerdo con la
invención en una preparación farmacéutica junto con un vehículo,
diluyente o excipiente de éstos aceptables desde el punto de vista
farmacéutico.
La presente invención apunta además a la
inhibición in vivo de la Akt-3 mediante el
uso de la tecnología antisentido. La tecnología antisentido se puede
utilizar para controlar la expresión de genes a través de la
formación de triple hélice o de ADN o ARN antisentido; ambos métodos
se basan en la unión de un polinucleótido al ADN o al ARN. Por
ejemplo, la porción de codificación 5' de la secuencia proteica
madura, que codifica la proteína de la presente invención, se usa
para diseñar un oligonucleótido de ARN antisentido de 10 a 40 pares
de bases de longitud. Se diseña un oligonucleótido de ADN para ser
complementario de una región del gen involucrada en la
transcripción (triple-helix, consultar Lee et
al. Nucl. Acids Res., 6:3.073 (1979); Cooney et al.,
Science, 241:456 (1988); y Dervan et al., Science, 251: 1.360
(1991), evitando de este modo la transcripción y la producción de
Akt-3. El oligonucleótido de ARN antisentido se
hibrida al ARNm in vivo y bloquea la traducción de una
molécula de ARNm en la Akt-3 (antisense - Okano, J.
Neurochem., 56:560 (1991); Oligodeoxynucleotides as Antisense
Inhibitors of Gene Expression, CRC Press, Boca Raton, FL
(1998)).
Alternativamente, el oligonucleótido descrito
antes se puede suministrar a las células mediante procedimientos
conocidos por los técnicos de la profesión de modo que el ARN o ADN
antisentido se puedan expresar in vivo para inhibir la
producción de Akt-3 de la manera descrita
antes.
Las construcciones antisentido para
Akt-3 pueden, por lo tanto, inhibir la
supervivencia celular y evitar el crecimiento posterior del cáncer o
tumor.
De acuerdo con otro aspecto de la invención se
provee también de una célula, tejido u organismo transgénicos que
contienen un transgén capaz de expresar la proteína
Akt-3 humana de acuerdo con la invención. El término
"transgén capaz de expresar" como se usa aquí significa una
secuencia de ácidos nucleicos apropiada que conduce a la expresión
de la Akt-3 humana o de las proteínas humanas que
tienen la misma función y/o actividad. El transgén, puede incluir,
por ejemplo, el ácido nucleico genómico aislado de células humanas
o el ácido nucleico sintético, incluido el ADN integrado en el
genoma o en un estado extracromosómico. Preferentemente, el transgén
contiene la secuencia de ácidos nucleicos que codifica las
proteínas de acuerdo con la invención según se describió aquí, o un
fragmento funcional de dicho ácido nucleico. Un fragmento funcional
de dicho ácido nucleico se debe interpretar como un fragmento del
gen que contiene dicho ácido nucleico que codifica las proteínas de
acuerdo con la invención o un equivalente funcional, derivado o
derivado no funcional como un mutante dominante negativo, o
bioprecursor de dichas proteínas. Por ejemplo, sería fácilmente
evidente para los técnicos con experiencia que se pueden usar
sustituciones o supresiones de nucleótidos utilizando técnicas
corrientes, que no afecten a la secuencia de proteínas codificada
por dicho ácido nucleico, o que codifiquen una proteína funcional de
acuerdo con la invención.
La proteína Akt-3 humana
expresada por dicha célula, tejido u organismo transgénicos o un
equivalente funcional o bioprecursor de dicha proteína también forma
parte de la presente invención.
Se pueden preparar, de manera ventajosa,
anticuerpos antiAkt-3 humana mediante técnicas
conocidas en la profesión. Por ejemplo, se pueden preparar
anticuerpos policlonales inoculando un animal huésped, como un
ratón, con Akt-3 humana de acuerdo con la invención
o un epítopo de ésta y recuperando el antisuero. Los anticuerpos
monoclonales se pueden preparar según técnicas conocidas como las
descritas por Kohler R. y Milstein C., Nature (1975) 256,
495-497.
Los anticuerpos de acuerdo con la invención
también se pueden utilizar en un método para detectar la presencia
de Akt-3 humana de acuerdo con la invención, donde
dicho método comprende hacer reaccionar el anticuerpo con una
muestra e identificar cualquier proteína unida a dicho anticuerpo.
Asimismo se provee de un equipo para llevar a cabo dicho método que
comprende un anticuerpo de acuerdo con la invención y medios para
hacer reaccionar el anticuerpo con dicha muestra.
Las proteínas que interactúan con el polipéptido
de la invención se pueden identificar, por ejemplo, investigando
las interacciones proteína-proteína utilizando el
sistema vector de dos-híbridos propuesto primero por
Chien et al (1991). Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:
9.578-9.582.
Esta técnica se basa en la reconstitución
funcional in vivo de un factor de transcripción que activa
un gen indicador. Más en particular la técnica comprende
proporcionar una célula huésped apropiada con una construcción de
ADN que contiene un gen indicador bajo el control de un promotor
regulado por un factor de transcripción que tiene un dominio de
unión a ADN y un dominio de activación, que expresa en la célula
huésped una primera secuencia de ADN híbrido que codifica una
primera fusión de un fragmento o de toda una secuencia de ácidos
nucleicos de acuerdo con la invención y o dicho dominio de unión de
ADN o dicho dominio de activación del factor de transcripción, que
expresa en la célula huésped al menos una segunda secuencia de ADN
híbrido, como una genoteca o similar, que codifica supuestas
proteínas de unión para ser investigadas junto con el dominio de
unión a ADN o de activación del factor de transcripción que no está
incorporado en la primera fusión; detectar cualquier unión de las
proteínas para ser investigada con una proteína de acuerdo con la
invención detectando la presencia de cualquier producto del gen
indicador en la célula huésped; y opcionalmente aislar las segundas
secuencias de ADN híbrido que codifican la proteína de unión.
Un ejemplo de dicha técnica utiliza la proteína
GAL4 en la levadura. GAL4 es un activador de la transcripción del
metabolismo de la galactosa en la levadura y tiene un dominio
separado para la unión a los activadores que están secuencia arriba
de los genes que metabolizan la galactosa así como un dominio de
unión a proteínas. Se pueden construir vectores de nucleótidos, uno
de los cuales comprenda los residuos de nucleótidos que codifican el
dominio de unión al ADN de GAL4. Estos residuos del dominio de unión
se pueden fusionar a una secuencia de codificación conocida, como
por ejemplo los ácidos nucleicos de acuerdo con la invención. El
otro vector contiene los residuos que codifican el dominio de unión
a proteínas de GAL4. Estos residuos se fusionan a los residuos que
codifican una proteína de prueba. Cualquier interacción entre los
polipéptidos codificados por el ácido nucleico de acuerdo con la
invención y la proteína que se va a probar conduce a la activación
de la transcripción de una molécula indicadora en una célula de
levadura que tiene una transcripción GAL-4
deficiente en la cual se han transformado los vectores.
Preferentemente, una molécula indicadora como la
\beta-galactosidasa se activa con la restauración
de la transcripción de los genes del metabolismo de la galactosa de
la levadura.
Un aspecto adicional de la invención provee de un
método de identificación de los compuestos que inhiben
selectivamente la promoción de la supervivencia celular mediada por
la Akt-3 humana, donde dicho método comprende i)
proporcionar una célula transformada con un vector de expresión que
activa la vía de la Akt-3, donde dicha célula
sobrevive en presencia o ausencia de un factor de supervivencia en
comparación con una célula de control que no ha sido transformada
con dicho vector y que morirá en ausencia de dicho factor de
supervivencia ii) poner en contacto dichas células con un compuesto
de prueba después de eliminar de dichas células dichos factores de
supervivencia, donde la muerte de dicha célula transformada es
indicativa de la inhibición selectiva de dicho compuesto sobre la
vía de la Akt-3 humana que promueve la
supervivencia.
Alternativamente, se podría evaluar la actividad
promotora de la supervivencia de la Akt-3 i)
proporcionando una célula transformada con un vector de expresión
que activa la vía de la Akt-3 además de una célula
de control que no ha sido transformada con dicho vector, ii)
poniendo en contacto cada una de dichas células con un agente que
induzca la muerte, mediante lo cual la muerte de dicha célula de
control y la supervivencia de dicha célula transformada son
indicativas de la actividad promotora de la supervivencia de la vía
de la Akt-3 activada, iii) poniendo en contacto a
continuación dicha célula transformada sin la eliminación de dicho
agente inductor de dicha muerte, con un compuesto de prueba, donde
la muerte de dicha célula es indicativa de la inhibición selectiva
de dicho compuesto sobre la vía de la Akt-3 humana
que promueve la supervivencia.
En otro aspecto la presente invención provee de
métodos para identificar a los agentes que afectan a la actividad
de la proteína Akt-3 humana, que comprenden poner en
contacto dicha proteína con un sustrato, una molécula reguladora o
un sustituto de ésta y vigilar la interacción con la sustancia de
prueba utilizando ensayos de fosforilación o unión estándar bien
conocidos por los técnicos de la profesión.
Los compuestos que se identifican de acuerdo con
este aspecto de la invención además de los anticuerpos anti
Akt-3 humana se pueden utilizar, de manera
ventajosa, como un medicamento o alternativamente en la preparación
de un medicamento para tratar las enfermedades asociadas a la
expresión de la proteína Akt-3 humana de acuerdo
con la invención.
Otro aspecto de la invención proporciona una
preparación farmacéutica que comprende o un compuesto o una
molécula antisentido o un anticuerpo de acuerdo con la invención
junto con un vehículo, diluyente o excipiente de éstos aceptables
desde el punto de vista farmacéutico.
Las moléculas antisentido o con más razón los
compuestos identificados como agonistas o antagonistas de los
ácidos nucleicos o de los polipéptidos de acuerdo con la invención
se pueden utilizar en forma de una preparación farmacéutica, la que
se puede preparar de acuerdo con los procedimientos bien conocidos
por los técnicos de la profesión. Las preparaciones preferidas
incluyen un vehículo, diluyente o excipiente aceptables desde el
punto de vista farmacéutico, como por ejemplo, una solución salina
fisiológica. También se pueden usar otros vehículos aceptables desde
el punto de vista farmacéutico incluso otras sales no tóxicas, agua
estéril o similares. También puede estar presente una solución
amortiguadora apropiada que permita la liofilización y el
almacenamiento en condiciones estériles de las preparaciones antes
de su reconstitución mediante el agregado de agua estéril para su
posterior administración. Se puede llevar a cabo la incorporación
de los polipéptidos de la invención en una matriz sólida o
semisólida biológicamente compatible la cual se puede implantar en
los tejidos que requieren tratamiento.
El vehículo también puede contener otros
excipientes aceptables desde el punto de vista farmacéutico para
modificar otras condiciones como pH, osmolaridad, viscosidad,
esterilidad, lipofilicidad, solubilidad o similares.
También se pueden incluir excipientes aceptables
desde el punto de vista farmacéutico que permitan la liberación
sostenida o retardada posterior a la administración.
Los polipéptidos, las moléculas o compuestos del
ácido nucleico de acuerdo con la invención se pueden administrar
por vía oral. En esta materialización se pueden encapsular y
combinar con vehículos apropiados en formas farmacéuticas sólidas
bien conocidas por los técnicos con experiencia.
Como es bien sabido por los técnicos de la
profesión, la pauta posológica específica se puede calcular en
función del área de superficie corporal del paciente o el volumen
de espacio corporal a ser ocupado, dependiendo de la vía particular
de administración que se va a utilizar. La cantidad de la
preparación que se administre en realidad, no obstante, será
determinada por un médico, sobre la base de las circunstancias
correspondientes al trastorno que se va a tratar, como la gravedad
de los síntomas, la preparación que se va a administrar, la edad,
el peso y la respuesta de cada paciente y la vía de administración
elegida.
La presente invención se puede comprender más
claramente con referencia al ejemplo siguiente que es meramente
ejemplar y los dibujos que lo acompañan donde:
La figura 1 es una ilustración de la secuencia de
ADNc y la secuencia de aminoácidos deducida de la
Akt-3 humana. En la columna de la izquierda se
muestran y se numeran la secuencia de codificación de la
Akt-3 y partes de las regiones 5' y 3' no
traducidas. La secuencia de aminoácidos deducida de la proteína
Akt-3 se muestra encima de la correspondiente
secuencia de ADN y se numera en la columna de la derecha. Los dos
residuos de aminoácido que se presumen que se fosforilan con la
activación de Akt-3 (Tre^{305} y Ser^{472})
están en negrita y marcados con un asterisco. La parte
COOH-terminal de la proteína Akt-3
humana que difiere del homólogo de rata está subrayada.
La figura 2 es una alineación de las secuencias
de aminoácidos deducidas para las Akt-1,
Akt-2 y Akt-3 humanas. Las
secuencias se alinearon usando el programa de alineación de
ClustalW (EMBL, Heidelberg, Alemania). Los residuos de aminoácido
conservados entre las tres proteínas se incluyen en las áreas
negras. Los residuos conservados entre sólo dos de las secuencias
están sombreados en gris. Los residuos de aminoácido están
numerados en la columna de la derecha. Los residuos Tre y Ser
conservados que se presume que se fosforilan con la activación están
marcados con un asterisco encima de la secuencia.
La figura 3 es una ilustración de la
fosforilación de la histona H2B por las variantes de
Akt-3. (A) Akt-3 se expresó como una
proteína de fusión GST en E. coli. Para evaluar la actividad
de la hAkt-3, se incubó la histona H2B con
GST-Akt-3 y variantes de
GST-Akt-3 durante el tiempo indicado
y el grado de fosforilación se evaluó después de la
SDS-PAGE. Las variantes de Akt-3 se
designan: W.T., el tipo salvaje; T305D, Tre^{305} mutada a Asp;
S472D, Ser^{472}mutada a Asp; T305D, S472D, ambas Tre^{305} y
Ser^{472}mutadas a Asp. No se observó ninguna fosforilación
significativa cuando se usó GST en lugar de
GST-Akt. Los resultados son la media (\pm
s.e.m.(error estándar de la media por sus siglas en inglés); n = 3
a 6) y se expresan con relación al grado de fosforilación de H2B
catalizada por T305D y S472D hAkt-3 después de 45
minutos. Inserto, La pureza de la GST purificada (carril 1),
Akt-3 tipo salvaje (carril 2), T305D
Akt-3 (carril 3), S472D Akt-3
(carril 4) o T305D/S472D Akt-3 (carril 5) se evaluó
por SDS-PAGE y por tinción con azul de Coomassie.
(B) se transfectaron células HEK-293 o bien con
vector (carriles 1 y 2) o Akt-3 (carriles 3 y 4)
Akt-3T305A (carriles 5 y 6) o Akt-3
S472A (carriles 7 y 8) y o bien se trataron con solución
amortiguadora (carriles 1, 3, 5 y 7) o IGF-1 (50
ng/ml; carriles 2, 4, 6 y 8). Se inmunoprecipitó
Akt-3 con anticuerpo 3F10 (etiqueta
anti-HA o anti HA-tag). Las muestras
se analizaron por transferencia con respecto a
HA-tag (panel superior) o con un anticuerpo
fosfoespecífico que reconoce a la Ser^{472} fosforilada (panel
inferior). (C) se evaluó la actividad de Akt en inmunoprecipitados
de HA de las muestras preparadas como se describió anteriormente
midiendo la fosforilación de un sustrato peptídico (Crosstide). Los
resultados se expresan como el aumento de la actividad en
comparación con células no estimuladas transfectadas con vector
vacío (media \pm s.e.m., n=7).
La figura 4 es una ilustración de la inhibición
de Akt-3 por estaurosporina y RO
31-8220. Se trató histona H2B con
Akt-3 (variante T305D,S472D) en presencia de las
concentraciones indicadas o bien de estaurosporina o bien de RO
31-8220. Después de 30 minutos, la reacción se
terminó y el grado de fosforilación de H2B se cuantificó en un
phosphorimager después de la SDS-PAGE. Los
resultados (media \pm s.e.m., n=3) se expresan con relación al
(%) de fosforilación observada en presencia de solvente (control,
"C").
La figura 5 es una ilustración de la localización
cromosómica de Akt-3 humana. (A)Diagrama de
los resultados del mapeo de FISH de Akt-3. Cada
mancha representa las señales de FISH dobles detectadas en el
cromosoma humano 1, región q43 - q44. (B) Ejemplo de mapeo de FISH
de Akt-3. El panel de la izquierda muestra las
señales de FISH en el cromosoma 1. El panel de la derecha muestra
la misma figura mitótica teñida con
4',6-diamidino-2-fenilindol
para identificar el cromosoma 1.
La figura 6 es una ilustración de la expresión de
Akt-3 en diferentes tejidos humanos. (A) Análisis
de transferencia Northern de la expresión tisular de
Akt-3. La expresión del ARNm de
Akt-3 en diferentes tejidos humanos se evaluó usando
una sonda correspondiente a la región 3' no traducida de
hAkt-3 para analizar una transferencia de ARN
poliA^{+} humano ("Multiple Tissue Northern"). Se usó
\beta-actina humana como un control para
confirmar la misma carga en los carriles (no se muestran los
datos). (B) y (C) análisis de TI-RCP de la expresión
tisular de Akt-3. Los análisis de
TI-RCP se llevaron a cabo en ADNc de diferentes
tejidos humanos (B) y de diferentes líneas celulares tumorales (C)
usando cebadores específicos para Akt-3 humana o
G3PDH (control) para el número indicado de ciclos de RCP. Las bandas
del tamaño esperado (425 bp para Akt-3 y 1 kb para
G3PDH) son visibles en los geles. Las imágenes de los geles de
agarosa al 1,2% teñidos con bromuro de etidio se invirtieron para
lograr mayor claridad usando el software EagleSight (Stratagene).
Los resultados de reacciones RCP similares realizados para 25, 30 ó
35 ciclos no se muestran pero indicaron que los resultados de esta
figura están dentro del rango lineal de amplificación.
Caco-2 = adenocarcinoma colorrectal;
T-84 = carcinoma colorrectal; MCF-7
= adenocarcinoma de mama; T-47D = carcinoma de la
glándula ductal de la mama; HT1080 = fibrosarcoma óseo;
SaOS-2 = osteosarcoma;
SK-N-MC = neuroblastoma; HepG2 =
hepatoblastoma; JURKAT = leucemia de células T.
La figura 7 es una ilustración de los resultados
obtenidos por recuento por centelleo obtenidos en un ensayo de
centelleo por proximidad para identificar los agentes que modulan
la actividad de Akt-3.
La figura 8 es una ilustración de los resultados
obtenidos de un ensayo de filtración de Akt-3 para
identificar los agentes que modulan la actividad de la
Akt-3.
Todos los cebadores se obtuvieron de Eurogentec,
Seraing, Bélgica. Se diseñaron cebadores de secuenciación
específicos del inserto (15- y 16-mers) por
inspección visual de las secuencias de ADN. El ADN se preparó en
columnas Qiagen-tip-20 o en columnas
spin Qiaquick (Qiagen GmbH, Dusseldorf, Alemania) y se recuperó de
las columnas spin en 30 \mul de solución amortiguadora Tris/EDTA
(TrisHCl l0 mM, pH 7,5, EDTA 1 mM (sal sódica)). Las reacciones de
secuenciación se realizaron utilizando equipos Big Dye™ Terminador
Cycle Sequencing Ready Reaction (Perkin Elmer, ABI Division, Foster
City, CA, EUA) y se corrieron en un secuenciador de ADN Applied
Biosystems 377 (Perkin Elmer, ABI Division, Foster City, CA,
EUA).
Usando la secuencia
RAC-PK\gamma de rata (Konishi et al, 1995;
GenBank acc. No. D49836) como una secuencia de interrogación, se
llevó a cabo una búsqueda BLAST (Basic Local Alignment Search Tool);
Atschul et al., 1990) en la base de datos de marcador de
secuencia expresada (EST) WashU Merck (Lennon et al., 1996) y
en la base de datos EST humana patentada LifeSeq™ (Incyte
Pharmaceuticals Inc, Palo Alto, CA, EUA). Se identificaron varios
clones EST humanos con gran semejanza al
RAC-PK\gamma de rata. Una secuencia EST (número de
acceso Incyte 2573448) derivada de una genoteca de ADNc
hipocámpico, contenía parte de la secuencia de codificación que
incluye el supuesto codón de inicio metionina (ATG) y parte de la
región 5' no traducida. El codón de inicio se rodeó de una
secuencia consenso Kozak para comenzar la traducción y había
presente un codón de parada del marco de lectura en las posiciones
-6 a -3. Sobre la base de esta secuencia de 239 bp, se sintetizaron
cebadores sentido de oligonucleótidos para experimentos de técnica
de amplificación rápida de los extremos 3' de ADNc (3' RACE):
Akt-3spl = 5'-ACC ATT TCT CCA AGT
TGG GGG CTC AG-3' y Akt-3sp2 =
5'GGG AGT CAT CAT GAG CGA' TGT TAC C-3'. Se
realizaron experimentos 3' RACE en Marathon-Ready™
ADNc de cerebro fetal humano o cerebelo humano (Clontech
Laboratories, Palo Alto, CA, EUA) según las instrucciones del
fabricante usando Akt-3sp1/race-ap1
como cebadores en la RCP primaria y
Akt-3sp2/race-ap2 en la RCP anidada.
Los fragmentos de RCP resultantes se clonaron y secuenciaron. Esto
extendió la secuencia de codificación de la Akt-3 en
916 bp, pero la nueva secuencia no incluía un codón de parada del
marco de lectura. Se realizó una segunda ronda de amplificación 3'
RACE en Marathon Ready™ ADNc de cerebro humano utilizando cebadores
sentido sobre la base de la secuencia obtenida en la primera ronda
(Akt-3sp3 = 5'CAC TCC AGA ATA TCT GGC ACC AGA
GG-3' y Akt-3sp4 = 5'CTA TGG CCG
AGC AGT AGA CTG GTG G-3') en combinación con
race-ap1 y race-ap2,
respectivamente. La secuencia obtenida incluía un codón de parada
del marco de lectura y la secuencia 3' no traducida hasta la cola
poli(A). Se diseñaron cebadores antisentido basados en la
región 3' no traducida (Akt-3ap4 =
5'-TGC CCC TGC TAT GTG TAA GAG CTA
GG-3' y Akt-3ap5 = 5' AAG AGC TAG
GAC TGG TGA TGT CCA GG-3') y la secuencia de
codificación completa de Akt-3 se amplificó del ADNc
hipocámpico humano utilizando
Akt-3sp1/Akt-3ap4 (RCP primaria) y
Akt-3sp2/Akt-3ap5 (RCP anidada) como
cebadores. El fragmento de RCP resultante de 1.200 bp se clonó
después en el vector pCR2.1 en el TA-cloning (equipo
original para clonación TA, Invitrogen BV, Leek, Países Bajos) y se
secuenciaron completamente los insertos de varios clones. Un clon
que contenía un inserto con la secuencia confirmada
(hAkt-3/pCR2.1) se usó para subclonación posterior
en el vector de expresión en mamíferos pcDNA-3
(Invitrogen), produciendo la construcción
hAkt-3/pcDNA-3. A fin de preparar
una construcción que codificara una proteína Akt-3
etiquetada con un COOH-terminal, se amplificó un
fragmento de 553 bp a partir del plásmido
Akt-3/pcDNA-3 utilizando un cebador
antisentido que incorpora un sitio de restricción XhoI y la
secuencia que codifica una hemaglutinina (HA) tag (YPYDVPDYA)
después del aminoácido 479 de la secuencia de Akt-3.
Este fragmento se volvió a clonar en el plásmido
hAkt-3/pcDNA-3 utilizando los sitios
de restricción BstEII y XhoI produciendo la
construcción
HA-hAkt-3/pcDNA-3.
A fin de expresar la proteína
Akt-3 humana en E. coli, la secuencia de
codificación completa de Akt-3 se amplificó a partir
del plásmido hAkt-3/pCR2.1 usando cebadores que
introducen un sitio de restricción EcoRI y un sitio de
restricción XhoI en los extremos 5' y 3', respectivamente.
Este fragmento de RCP se clonó como un fragmento
EcoRI/XhoI en el vector
pGEX-4T-3 (Amersham Pharmacia
Biotech, Uppsala, Suecia) produciendo la construcción
hAKT-3(WT)/pGEX-4T-3
y la secuencia del inserto se confirmó por análisis secuencial.
Los mutantes de esta construcción se prepararon
utilizando el equipo de mutagénesis sitio-dirigida
Quickchange (Stratagene, La Jolla, CA, EUA) según las instrucciones
del fabricante. El mutante T305D (construcción
hAKT-3(T305D)/pGEX-4T-3)
se creó mutando ACA en la posición 923-925 a GAG, lo
que dio por resultado una mutación de Tre^{305} a Asp en la
proteína resultante. El mutante S472D (construcción
hAKT-3(S472D)/pGEX-4T-3)
se creó cambiando TC en la posición 1404-1405 a GA
utilizando RCP con un cebador antisentido largo que incorpora el
cambio, lo que dio por resultado una mutación de una Ser^{472} a
Asp en la proteína resultante. También se construyó un mutante
doble por mutagénesis sitio-dirigida en
hAKT-3(S472D)/pGEX-4T-3
y contuvo ambas mutaciones (construcción
hAKT-3(T305D/S472D)/pGEX-4T-3).
Los insertos de todas las construcciones resultantes se confirmaron
por análisis secuencial completo. Las proteínas de fusión que
resultaron de la expresión de estas construcciones en E. coli
contienen una porción GST acoplada al
NH_{2}-terminal de la secuencia
Akt-3 humana.
Akt-3 se expresó transitoriamente
en Cos-7 por transfección en fosfato de calcio de
las células con la construcción
HA-hAkt-3/pcDNA-3.
Las células se estimularon con 10 ng/ml de IGF-1
durante 30 minutos, se lisaron y la Akt-3 se
inmunoprecipitó con mAb 12CA5. La actividad de
Akt-3 se evaluó según se describe más adelante.
Para la expresión en las células
HEK-293, las células se transfectaron con
construcciones pCDNA-3 Akt-3 según
se describió previamente (Alessi et al 1996). Después de la
estimulación con IGF, las células se lisaron (Alessi et al
1996) y HA-Akt se inmunoprecipitó con anticuerpo
3F10 (Roche Molecular Biochemicals). Se evaluó la actividad de Akt
en los complejos inmunitarios midiendo la fosforilación de un
sustrato peptídico (Crosstide) en presencia de PKI 1\muM
(inhibidor de PKA) y GF 109302X 1\muM (inhibidor de PKC) según se
describe.
Las construcciones de expresión pGEX se
transformaron en la cepa BL21 DE3 de E. coli y las proteínas
de fusión GST de Akt-3 tipo salvaje y mutada se
purificaron en glutatión-sefarosa según las
instrucciones del fabricante (Amersham Pharmacia Biotech, Uppsala,
Suecia). La proteína eluida de las perlas se almacenó en glicerol al
50% a -20ºC. La actividad de Akt se evaluó incubando 0,8 \mug de
la enzima purificada durante 30 minutos a temperatura ambiente (a
menos que se indique lo contrario) en una solución amortiguadora
que contenía HEPES 10 mM, MgCl 10 mM, DTT 1 mM y 0,1 mg/ml de
histona H2B a pH 7,0, en un volumen total de 25 \mul y que
contenía 10 \muCi
[\gamma-^{32}P]-ATP(6.000
Ci/mmol). Los experimentos iniciales indicaron que la reacción fue
lineal con el tiempo durante al menos 45 minutos. La reacción se
detuvo agregando 25 \mul de solución amortiguadora de la muestra
para SDS-PAGE. Los resultados se cuantificaron en un
phosphorimager después de un SDS-PAGE en un gel de
acrilamida al 15% (p/v).
SeeDNA Biotech Inc, Toronto, Canadá llevó a cabo
estudios de mapeo cromosómico usando análisis por hibridación
fluorescente in situ (FISH) esencialmente según se describe
(Heng et al., 1992; Heng y Tsui, 1993), Brevemente, se
cultivaron linfocitos humanos a 37ºC durante 68-72
h antes del tratamiento con 0,18 mg/ml de
5-bromo-2'-deoxiuridina
(BrdU) para sincronizar el ciclo celular en la población de
células. Las células sincronizadas se lavaron y se volvieron a
cultivar a 37ºC durante 6 h. Se cosecharon las células se
prepararon extendidos en portaobjetos usando los procedimientos
corrientes incluidos tratamiento hipotónico, fijación y secado al
aire. Se biotiniló una sonda de ADNc para Akt-3
(fragmento EcoRI de 1,44 kb del clon
hAkt-3/pcDNA-3) y se usó para la
detección de FISH. Los extendidos se llevaron a estufa a 55ºC
durante 1 h, se trataron con Rnasa y se desnaturalizaron en
formamida al 70% (v/v) en 2x NaCl/Cit. (NaCl 0,3 M, citrato
disódico 0,03 M, pH 7,0) durante 2 min a 70ºC seguido de
deshidratación en etanol. Las sondas se desnaturalizaron antes de
cargarlas en los extendidos cromosómicos desnaturalizados. Después
de una hibridación durante toda la noche, los extendidos se lavaron
y se registraron las señales de FISH y el patrón de bandas del
4',6-diamidino-2-fenilindol
por separado en película fotográfica, y la asignación de los datos
de mapeo de FISH a las bandas cromosómicas se logró por
superposición de las señales de FISH con las bandas de cromosomas
teñidos con
4',6-diamidino-2-fenilindol
(Heng & Tsui, 1993).
Se hibridaron transferencias Northern que
contenían 2 \mug de ARN enriquecido en poli(A) derivado de
diferentes tejidos humanos (Clontech Laboratories, Palo Alto, CA,
EUA) según las instrucciones del fabricante con un fragmento marcado
NotI- XbaI de Akt-3 (nucleótidos 1404 a
1857) de 454 bp cebado al azar con
\alpha-^{32}P-dCTP (equipo
HighPrime, Boehringer Mannheim) correspondiente a parte de la
secuencia 3' no traducida.
Se diseñaron cebadores de oligonucleótidos para
la amplificación RCP específica de un fragmento de
Akt-3. Estos cebadores fueron
Akt-3sp2 = 5'-GGG AGT CAT CAT GAG
CGA TGT TAC C-3' (cebador sentido) y
Akt-3ap1 = 5'- GGG TTG TAG AGG CAT CCA TCT CTT CC
-3' (cebador antisentido), originando un producto de 425 bp. Las
amplificaciones RCP de la
gliceraldehido-3-fosfato
deshidrogenasa (G3PDH) se realizaron en las mismas muestras de ADNc
utilizando como controles positivos cebadores de G3PDH
5'-TGA AGG TCG GAG TCA ACG GAT TTG
GT-3' (cebador sentido) y 5'-CAT GTG
GGC CAT GAG GTC CAC CAC-3' (cebador antisentido),
produciendo un fragmento de 1.000 bp. Estos cebadores se utilizaron
para amplificaciones RCP en paneles de ADNc de múltiples tejidos
(Clontech Laboratories) y en ADNc preparado de líneas celulares
tumorales. Para la preparación de ADNc de células tumorales, las
células se homogeneizaron y se preparó el ARN total usando el
equipo RNeasy Mini (Qiagen GmbH, Hilden, Alemania) según las
instrucciones del fabricante. Se hizo una transcripción inversa de 1
\mug del ARN total usando oligo(dT)_{15} como un
cebador y 50 U de transcriptasa inversa Expand™ (Boehringer
Mannheim, Mannheim, Alemania) según las instrucciones del
fabricante. Se realizaron reacciones de RCP con cebadores
específicos para Akt-3 o específicos para G3PDH en
1 \mul de ADNc. Se obtuvieron imágenes de geles teñidos con
bromuro de etidio usando el sistema de vídeo Eagle Eye II
(Stratagene, La Jolla, CA, EUA) y las bandas de RCP se analizaron
usando el software EagleSight.
Para identificar los agentes que modulan la
actividad de Akt-3, se pusieron a punto ensayos de
SPA (ensayo de centelleo por proximidad) y ensayos de filtración
para la actividad de la Akt-3.
Los ensayos de SPA se realizaron a 25ºC durante 3
h en presencia de Hepes 25 mM, pH 7.0, que contenía MgCl_{2} 15 mM
y DTT 1 mM. Cada ensayo se realizó en un volumen de reacción de 100
\mul que contenía GST-AKT-3 111 nM
(diluido en Hepes 25 mM, pH 7,0, que contenía MgCl_{2} 15 mM, DTT
1 mM), histona biotinilada H2B 0,75 \muM,
[\gamma-^{33}P] - ATP 2nM y todos los agentes en
análisis. La reacción se terminó agregando 100 \mul de mezcla de
detención (ATP 50 \muM, EDTA 5 mM, BSA al 0,1%, Triton
X-100 al 0,1% y 7,5 mg/ml de perlas para SPA de PVT
(poliviniltolueno) recubiertas con estreptavidina). Después de
permitir que las perlas se asentaran durante 30 minutos, se hizo el
recuento de la mezcla de ensayo en un contador de centelleo de
placa microtiter. Los resultados se ilustran en la figura 7.
Los ensayos de filtración de AKT3 se realizaron a
25ºC durante 3 h en presencia de Hepes 25mM, pH 7,0, que contenía
MgCl_{2} 15 mM y DTT 1 mM. Cada ensayo se realizó en un volumen de
reacción de 100 \mul que contenía
GST-AKT-3 111 nM (diluido en Hepes
25mM, pH 7,0, que contenía MgCl_{2} 15 mM y DTT 1 mM), histona
H2B 25 \muM, [\gamma^{-33}P]-ATP 2nM y todos
los agentes en análisis. La reacción se terminó por agregado de 100
\mul de H_{3}PO_{4} 75 mM. Se filtraron 90 \mul de la
mezcla de ensayo a través de papel de intercambio catiónico de
fosfocelulosa. Después de lavar cinco veces con
H_{3}PO_{4}75\muM, se hizo un recuento del papel de filtro en
un contador de centelleo de placa de microtitulación. Los resultados
se ilustran en la figura 8.
La búsqueda de similitud en las bases de datos
LifeSeq™ y EMBL usando la secuencia de Akt-3 de rata
como una secuencia de interrogación produjo varias secuencias EST
humanas que codificaban parte del homólogo humano de la
Akt-3 de rata. Usando la información de la secuencia
de ADN de las bases de datos, fuimos capaces de deducir la secuencia
completa de ADNc para la Akt-3 humana en
experimentos 3' RACE posteriores (figura 1). La secuencia de ADNc
obtenida codificó una proteína de 479 residuos de aminoácido con
una masa molecular calculada de 55.770 Da. Los primeros 451
aminoácidos de la proteína Akt-3 humana contienen
sólo dos diferencias con la secuencia correspondiente de rata
(Konishi et al, 1995)- Asp (rata) a Gli (humana) (Gly en
inglés) en la posición 10 y Pro (rata) a Ala (humana) en la
posición 396 y codifican un dominio de homología a plecstrina, un
dominio quinasa y una "cola" COOH-terminal. La
proteína Akt-3 predicha (figura 2) muestra una
significativa semejanza con Akt-1 (Jones et
al, 1991; 83,6% de identidad; 87,8% de similitud) y con
Akt-2 (Cheng et al., 1992; 78% de identidad;
84,3% de similitud). Se observó la "cola"
COOH-terminal en las proteínas Akt-1
y Akt-2 tanto del ser humano como de la rata, pero
está aparentemente truncada en el única otra secuencia informada de
Akt-3 (Akt-3 de rata, Konishi et
al., 1995; número de acceso D49836). Los experimento 3' RACE
realizados en ADNc humanos derivados de diferentes tejidos no
aportaron pruebas de la existencia de una forma más corta de
Akt-3 que sería análoga a la Akt-3
de rata (no se muestran los datos). La cola en la
Akt-3 humana contiene 28 residuos de aminoácido
(YDEDGMDCMDNERRPHFPQFSYSASGRE) que reemplazan 3 residuos de
aminoácido en la secuencia de rata (CPL). La cola de la
Akt-3 humana contiene un residuo de serina en la
posición 472 (se muestra en negrita) que corresponde a Ser^{473}
en Akt-1 o Ser^{474} en Akt-2. La
fosforilación de Ser^{473} y Ser^{474} ha sido implicada
previamente en la activación de Akt-1 y
Akt-2, respectivamente (Alessi et al., 1996;
Meier et al.,1997). La Tre^{308} (en el dominio quinasa)
también ha sido implicada en la activación de Akt-1
y este residuo también se conserva en la Akt-3
humana (Tre^{305}).
Para caracterizar la actividad enzimática de
Akt-3, expresamos y purificamos la enzima
recombinante como una proteína de fusión GST. El análisis del
producto purificado por SDS-PAGE indicó que la
proteína era aparentemente >90% pura. La enzima purificada pudo
fosforilar la histona H2B (figura 3) y no se observó ninguna
fosforilación utilizando GST recombinante sola. Previamente, se
había demostrado que la actividad enzimática de
Akt-1 aumentaba por fosforilación de Tre^{308} y
Ser^{473}, y la mutación de ambos residuos a Asp (para simular la
fosforilación) activa sinérgicamente a la Akt-1
(Alessi et al., 1996). Para investigar si
Akt-3 se regula de la misma manera, las proteínas
de fusión GST en las cuales o Tre^{305} o
Ser^{472}(correspondientes a Tre^{308} y Ser^{473} en
Akt-1) o tanto Tre^{305} como Ser^{472} se
mutaron a Asp se expresaron y ensayaron en comparación con la
enzima de tipo salvaje. La mutación de Tre^{305} a Asp
("T305D") aumentó en 2 veces la tasa inicial de fosforilación
de la histona H2B, mientras que la mutación de Ser^{472} a
Asp(S472D'') aumentó la tasa inicial sólo 1,4 veces (figura
3A). Cuanto se mutaron tanto Tre^{305} como Ser^{472}
(``T305D,S472D) a Asp, se observó un aumento en 3,2 veces de la
tasa inicial de fosforilación.
Para confirmar que los estímulos extracelulares
pueden activar la Akt-3 en las células de
mamíferos, se transfectaron células Cos-7 con un
ADNc que codifica Akt-3 fusionada a una HA tag. La
actividad de Akt-3 en immunoprecipitados de HA
aumentó en 1,5 y 1,9 veces (n=2) después de la estimulación con
IGF-1 (10 ng/ml).
Para confirmar aún más que los estímulos
extracelulares pueden activar a la Akt-3 en las
células de mamíferos, se transfectaron células
HEK-293 con un ADNc que codifica
Akt-3 fusionada a un HA epítopo tag. Con el
tratamiento con IGF, la actividad de la Akt-3 en
los inmunoprecipitados de anti-HA (figura 3B)
aumentó casi 60-veces por encima de la de las
células no transfectadas (figura 3C). Las variantes de Akt en las
cuales Tre^{305} y Ser^{472} se mutaron a alanina fueron
resistentes a la activación por IGF. Compatible con esto, la
transferencia Western con un anticuerpo fosfoespecífico Ser^{472}
de inmunoprecipitados de HA de las células estimuladas con IGF
demostró que la Ser^{472} se fosforilaba después de la
estimulación con IGF (figura 3B). Además, se inhibió la activación
de Akt-3 mediante el tratamiento previo con CY29
4002 (100 \muM, 94% de inhibición), no se muestran los datos.
Para caracterizar aún más la
Akt-3 humana, investigamos la capacidad de una
variedad de inhibidores de Ser/Tre de la quinasa para inhibir a la
Akt-3. Estos incluyeron Go 6976,
GF-109203X (ambos inhibidores de la proteína quinasa
C (PKC)); H-85, H-88,
H-89 y KT5720 (inhibidores de la proteína quinasa A
(PKA)), KN-62 (inhibidor de la quinasa dependiente
de Ca^{+2}/Calmodulina) y PD 98059 (inhibidor de MEK). Cuando se
probaron a una concentración 10 \muM estos compuestos no tuvieron
un efecto significativo en la actividad de la variante T305D,S472D
de Akt-3. Sin embargo, el inhibidor de quinasa de
amplio espectro estaurosporina (IC_{50}= 2,0 \pm 0,3 \muM) y
el inhibidor de la PKC Ro 31-8220 (IC_{50}= 3,2
\pm 1,0 \muM) inhibieron la variante T305D,S472D de
Akt-3 (figura 4).
La secuencia de codificación completa de
Akt-3 se usó como una sonda para el análisis de
FISH. En las condiciones utilizadas, la eficiencia de hibridación
fue de aproximadamente 75% para esta sonda (entre 100 figuras
mitóticas comprobadas, 75 de ellas mostró señales en un par de los
cromosomas). Puesto que el bandeo DAPI se usó para identificar el
cromosoma específico, se obtuvo la asignación entre la señal de la
sonda y el brazo largo del cromosoma 1. La posición detallada se
determinó posteriormente en el diagrama basado en el resumen de 10
fotografías (figura 5A). No hubo ningún otro locus recogido por la
detección de FISH en las condiciones usadas, por consiguiente, se
concluyó que Akt-3 está ubicado en el cromosoma
humano 1, en la región q43-q44. En la figura 5B se
presenta un ejemplo de los resultados del mapeo.
Se realizó un análisis de transferencia Northern
en ARNm derivado de diferentes tejidos humanos. El ARNm de
Akt-3 se detectó como dos transcripciones de
aproximadamente 4,5 kb y 7,5 kb, que mostraron patrones de expresión
similares (fig. 6A). El ARNm de Akt-3 se expresó en
una variedad de tejidos, fundamentalmente en el cerebro. De manera
semejante, se detectó la Akt-3 de rata como
transcripciones múltiples que se expresan sobre todo en el cerebro
(Konishi et al., 1995). La expresión más débil de
Akt-3 se observó en dos tejidos que responden a la
insulina, músculo esquelético e hígado. Akt-3
también se expresó en una cantidad de líneas celulares cancerosas
incluidas SW480 de adenocarcinoma colorrectal, A549 de carcinoma de
pulmón y G361 de melanoma (no se muestran los datos).
Para confirmar el análisis de transferencia
Northern, se realizaron reacciones de RCP con cebadores específicos
de Akt-3 y específicos de G3PDH (control interno) en
ADNc derivados de diferentes tejidos humanos (fig. 6B). El mensaje
de Akt-3 estuvo presente en cada tejido que se
ensayó, puesto que se amplificó un fragmento específico de 425 bp
en cada ADNc después de 30 ciclos de RCP. La expresión del ARNm de
Akt-3 fue alta en la placenta, el ovario y el bazo.
La expresión vista en el cerebro, el corazón, el riñón, el colon,
la próstata, el intestino delgado y los testículos fue moderada. La
menor expresión se dio en el hígado, el pulmón, el páncreas, el
músculo esquelético, la sangre periférica, los leucocitos y el
timo. En las líneas celulares tumorales (figura 6C), la expresión
del ARNm de Akt-3 fue relativamente elevada en las
células de fibrosarcoma óseo HT-1080, en las de
osteosarcoma SaOS-2 y en las células T de leucemia
JURKAT (banda detectable de Akt-3 después de 30
ciclos de la RCP). Las células Caco-2 de
adenocarcinoma colorrectal, T84 de carcinoma colorrectal,
MCF-7 de adenocarcinoma de mama y
SK-N-MC de neuroblastoma muestran
expresión de ARNm de Akt-3 después de 35 ciclos de
RCP. En las células T-47D de carcinoma de la
glándula ductal de mama y HepG2 de hepatoblastoma, la expresión de
ARNm de Akt-3 es muy baja o está ausente (no hay
señal detectable después de 35 ciclos de RCP).
Se identificaron Akt-1 y
Akt-2 en varias especies. Se ha informado de clones
de Akt-1 humanos (Jones et al., 1991; Coffer
et al 1991), de ratón (Bellacosa et al., 1993) y
bovinos (Coffer y Woodgett, 1991), en tanto se han identificado
clones de Akt-2 humanos (Cheng et al., 1992)
de ratón (Altomare et al., 1995) y de rata (Konishi et
al., 1994). Sin embargo, la Akt-3 sólo ha sido
identificada previamente en rata (Konishi et al, 1995). Los
presentes inventores han identificado la isoforma humana de
Akt-3. Aunque la Akt-3 humana
muestra una considerable similitud con la Akt-1 y
Akt-2 humanas, el descubrimiento de la
Akt-3 humana es particularmente significativo
porque la secuencia de ADNc codifica una "cola"
COOH-terminal que incluye un sitio de fosforilación
implicado en la activación de Akt-1 y
Akt-2 (Alessi et al., 1996; Meier et
al., 1997). Esta cola está ausente en la secuencia de
aminoácidos predicha para la rata. La Akt-3 humana
parece ser activada por la fosforilación de manera similar a
Akt-1 y Akt-2. Sin embargo, su
perfil de expresión sugiere que la principal función de esta enzima
no es la regulación de las respuestas a la insulina.
La secuencia que se identificó representa el
homólogo humano de Akt-3. Esta asignación se basa en
la identidad >99% entre las secuencias de proteínas de la
Akt-3 de rata y la Akt-3 humana. Con
excepción de la cola COOH terminal vista en la
Akt-3 humana, hay sólo 2 diferencias en los
aminoácidos (Gli^{10} y Ala^{396} en la Akt-3
humana) entre las proteínas Akt-3 de rata y humana.
La alineación de todas las secuencias de Akt previamente descritas
demuestra que Gli^{10} y Ala^{396} en la proteína humana
corresponden a residuos de Gli y Ala respectivamente en las
secuencias de Akt-1 y Akt-2
identificadas en otras especies. Otras pruebas de que identificamos
la isoforma de Akt-3 provienen de la presencia de
secuencias específicas de isotipos representadas por los residuos
47-49 (LPY), 118-122 (NCSPT) y
139-141 (HHK) de Akt-3 humana. Para
cada isotipo, estas secuencias se conservan entre especies, pero
difieren entre isotipos.
Se predijo que la secuencia de ADNc de
Akt-3 humana codificaría un dominio de homología
(PH) a plecstrina NH_{2}-terminal (Musacchio et
al., 1993) y un dominio quinasa COOH-terminal.
Una diferencia sorprendente entre la secuencia de proteínas de la
Akt-3 humana y la de rata (Konishi, et al.,
1995) es la presencia de una "cola"
COOH-terminal que comprende 74 residuos después del
dominio quinasa. Los últimos 28 residuos de aminoácido en la
Akt-3 humana están ausentes en la secuencia de
Akt-3 de rata. No pudimos identificar las secuencias
de ADNc humanas que codifican un truncamiento similar, a pesar de
conducir los experimentos RACE usando ADNc de varios tejidos humanos
diferentes. La región de la Akt-3 humana que está
ausente en la Akt-3 de rata abarca un tramo de 10
residuos (residuos 467-476 en la
Akt-3 humana) que son idénticos a la
correspondiente región de Akt-1 y
Akt-2 humanas. Esto sugiere que la cola observada
en la Akt-3 humana es auténtica. La importancia de
la diferencia observada en la región de la cola de
Akt-3 de rata queda por investigar. Sin embargo, la
secuencia COOH-terminal de la Akt-3
humana incluye Ser^{472}, la cual corresponde a Ser^{473} en
Akt-1. La fosforilación de Ser^{473} mostró
conducir a un aumento en 5 veces de la actividad de la
Akt-1, mientras que se observa un aumento en
20-25 veces de la actividad de la
Akt-1 si se fosforilan tanto Ser^{473} como
Tre^{308} (Alessi et al., 1996). Por lo tanto, nuestra
observación de que Ser^{472} está presente en la
Akt-3 humana es significativa, porque sugiere que
la Akt-3 humana es potencialmente regulada de manera
similar a Akt-1 y Akt-2. Si la
Akt-3 de rata se regula de manera diferente queda
por resolver.
Los dominios quinasa y PH de
Akt-3 muestran homología con las secuencias de los
dominios consenso PH y quinasa (Musacchio et al., 1993; Hanks
y Hunter 1995). El dominio PH de la Akt-3 humana es
77% y 86% idéntico a los dominios PH de Akt-1 y
Akt-2, respectivamente, mientras que el dominio
quinasa de la Akt-3 es 88% y 87% idéntico al dominio
quinasa de Akt-1 y Akt-2,
respectivamente. La elevada conservación del dominio PH puede
indicar una función específica de Akt, porque los dominios PH son a
menudo muy divergentes (Musacchio et al, 1993). Aparte de
unirse a fosfoinositidos, se ha demostrado que el dominio PH de Akt
media interacciones entre Akt y PKC (Konishi, et al., 1995)
y también dirige la formación de los complejos multiméricos de Akt
(Datta et al, 1995). En contraste, la región entre el
dominio PH y el dominio quinasa está poco conservada entre las
secuencias de las Akt-1, Akt-2 y
Akt-3 humanas, y esta región también es importante
para mediar la formación de complejos multiméricos de Akt (Datta
et al, 1995). Esto plantea un tema interesante, si la
secuencia NH_{2}-terminal del dominio quinasa de
Akt-3 media la interacción con otros compañeros de
unión que son únicos para Akt-3 o que se unen a
múltiples isoformas de Akt.
Para comprobar que el dominio quinasa predicho
era catalíticamente activo, expresamos Akt-3 como
una proteína de fusión GST en E. coli. La proteína purificada
pudo fosforilar un sustrato exógeno, mientras que no se observó
ninguna actividad catalítica usando GST en lugar de
GST-Akt-3. Para confirmar que
Akt-3 en verdad es regulada de manera muy afín a la
de Akt-1 y Akt-2, mutamos
Tre^{305} y Ser^{473}, o por separado o conjuntamente, a Asp.
Se vio previamente que esta estrategia imitaba fielmente el efecto
de la fosforilación de estos residuos en Akt-1
(Alessi et al., 1996). La mutación de cualquiera de estos
residuos dio por resultado un aumento de la actividad, aunque el
aumento fue menor que el observado con Akt-1 (Alessi
et al., 1996). Además, no observamos una activación
sinérgica de Akt-3 por mutación tanto de Tre^{305}
como de Ser^{473}. En contraste, cuando ambos residuos
correspondientes se mutaron simultáneamente a Asp en
Akt-1, se observó activación sinérgica (Alessi
et al, 1996). Las diferencias cuantitativas evidentes entre
Akt-1 y Akt-3 pueden reflejar
verdaderas diferencias en la regulación de estas dos isoformas, o
pueden deberse a otros factores como el sistema de expresión
diferente utilizado. En el presente estudio Akt-3
se expresó como una proteína de fusión GST en E. coli,
mientras que la actividad de Akt-1 se estudió
usando una proteína etiquetada con HA expresada en células COS. No
obstante, nuestros resultados demuestran que Akt-3
es regulada cualitativamente de manera similar a
Akt-1. El trabajo anterior también mostró que la
activación de Akt depende de PI 3-quinasa para
generar 3-fosfoinositidos que se unen al dominio PH
de Akt, promueven la translocación de Akt a la membrana plasmática y
facilitan la fosforilación de Akt por las quinasas secuencia arriba
(estudiado en Alessi y Cohen, 1998; Coffer et al., 1998).
Nuestra observación de que el mutante T305D/S472D de
Akt-3 es más activo que la enzima del tipo salvaje
(figura 3), cuando se mide en ausencia de
3-fosfoinositidos, sugiere que después de la
fosforilación Akt-3 se vuelve (al menos
parcialmente) independiente de la unión a fosfoinositido.
La estructura del dominio catalítico de Akt está
estrechamente relacionada con la proteína quinasa A y la proteína
quinasa C. En realidad, una búsqueda BLAST de la base de datos
SwissProt reveló que las quinasas más estrechamente relacionadas
(distintas de las diferentes isoformas de Akt) incluyen varias
isoenzimas de la proteína quinasa C. Esto nos impulsó a investigar
si los inhibidores existentes de PKA o PKC, así como otros
inhibidores de serina/treonina quinasa, se podrían utilizar como
inhibidores de Akt-3. De los compuestos ensayados,
sólo la estaurosporina y el compuesto estructuralmente relacionado
Ro 31-8220 inhibieron potencialmente a
Akt-3. La estaurosporina es un inhibidor no
selectivo de la quinasa, mientras que Ro 31-8220 es
un inhibidor más selectivo de PKC (Davis, et al., 1992).
Aunque Ro 31-8220 es un inhibidor aproximadamente
100 veces más potente (IC_{50}= 10 nM; Davis, et al.,
1992) de PKC que de Akt-3, esta observación advierte
que los experimentos que usan altasconcentraciones de Ro
31-8820 pueden afectar a Akt-3. En
contraposición con la estaurosporina y Ro 31-8220,
otros dos inhibidores de PKC y otros tres inhibidores de PKA no
inhibieron a Akt-3. Esto sugiere que aunque
Akt-3 está estrechamente relacionado en la secuencia
con PKC, puede ser posible encontrar inhibidores selectivos de
Akt.
La observación de que la Akt-3 es
activada por IGF-1 sugiere que la
Akt-3 puede desempeñar una función en la regulación
de la supervivencia celular. Akt-3 puede
potencialmente suprimir la apoptosis en las células tumorales. Una
inquietud al usar Akt como un objetivo para el desarrollo de
fármacos contra el cáncer es que Akt desempeña una función en la
señalización de la insulina (estudiado en Sheperd et al,
1998). Por lo tanto, los inhibidores de Akt pueden inducir los
síntomas observados en los pacientes con diabetes. Una solución que
se ha propuesto es desarrollar inhibidores selectivos de
Akt-2 (Walker et al, 1998). Esto se basa en
parte en la observación de que la Akt-1 es activada
en gran medida por la insulina en los hepatocitos y músculo
esquelético de rata, mientras que la Akt-2 sólo es
débilmente activada por la insulina en estos tejidos. Sin embargo,
la Akt-3 de rata parece ser aún más débilmente
activada por la insulina en estos tejidos (Walker et al,
1998), y en este estudio hemos demostrado que el ARNm de
Akt-3 se expresa sólo a bajos niveles en hígado y
músculo esquelético humanos, que son tejidos que responden a la
insulina. Esto sugiere que los inhibidores selectivos de
Akt-3 podrían tener menor potencial para causar
síntomas similares a aquellos vistos en pacientes con diabetes que
los que causan los inhibidores de Akt-2. La
ubicación de Akt-3 humana en el cromosoma humano
1q43-44 también es interesante, puesto que se ha
informado de pacientes con cánceres hematológicos que tienen
anomalías cromosómicas en esta región (Mitelman et al, 1997).
Aunque la importancia de la última observación es debatible, puesto
que se han observado anomalías en varios locus en los pacientes con
cánceres hematológicos, los resultados presentados aquí indican que
la Akt-3 puede probar ser un objetivo importante
para el desarrollo de nuevos tratamientos para el tratamiento del
cáncer.
1. La secuencia Nº de ID 1 corresponde a la
secuencia de nucleótidos de Akt-3 ilustrada en la
figura 1
2. La secuencia Nº de ID 2 corresponde a la
secuencia de ácidos nucleicos de Akt-3 desde la
posición del nucleótido 11 a la 1.447 ilustrada en la figura 1.
3. La secuencia Nº de ID 3 corresponde a la
secuencia de aminoácidos de Akt-3 ilustrada en las
figuras 1 y 2.
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<400> 3
Claims (28)
1. Una molécula de ácido nucleico que codifica la
proteína Akt-3 humana o un equivalente funcional de
ésta, que comprende la secuencia de aminoácidos determinada en la
SEQ Nº de ID 3, donde un equivalente funcional es una proteína
Akt-3 capaz de fosforilar la histona H2B cuando se
expresa y purifica como una proteína de fusión GST
recombinante.
2. Una molécula de ácido nucleico de acuerdo con
la reivindicación 1 que es una molécula de ADN y preferentemente de
ADNc.
3. Una molécula de ácido nucleico de acuerdo con
la reivindicación 1 ó 2 que contiene la secuencia de nucleótidos
ilustrada en la SEQ Nº de ID 1.
4. Una molécula de ácido nucleico de acuerdo con
la reivindicación 1 ó 2 que comprende la secuencia de nucleótidos de
la SEQ Nº de ID 2.
5. Una molécula antisentido de 10 a 40 pares de
bases de longitud, capaz de hibridarse a la molécula de acuerdo con
cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 en condiciones de
restricción alta.
6. Una proteína Akt-3 humana o un
equivalente funcional, derivado o bioprecursor de ésta, que
comprende una secuencia de aminoácidos como la determinada en la
SEQ Nº de ID 3, donde un equivalente funcional es una proteína
Akt-3 capaz de fosforilar la histona H2B cuando se
expresa y purifica como una proteína de fusión GST
recombinante.
7. Una proteína Akt-3 humana
codificada por una molécula de ácido nucleico de acuerdo con
cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4.
8. Una proteína Akt-3 humana de
acuerdo con la reivindicación 7 que comprende la secuencia de
aminoácidos determinada en la SEQ Nº de ID 3.
9. Un vector de expresión que comprende una
molécula de ácido nucleico de acuerdo con la reivindicación 2 ó
3.
10. Un vector de expresión de acuerdo con la
reivindicación 9 que contiene un promotor inducible.
11. Un vector de expresión de acuerdo con la
reivindicación 9 ó 10 que contiene una secuencia que codifica una
molécula indicadora.
12. Una molécula de ácido nucleico de acuerdo con
cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5 para utilizar como un
medicamento.
13. El uso de molécula de ácido nucleico de
acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5 en la
preparación de un medicamento para tratar el cáncer.
14. Una proteína Akt-3 humana de
acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 6 a 8 para usar como
un medicamento.
15. El uso de una proteína Akt-3
humana de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 6 a 8 en la
preparación de un medicamento para tratar el cáncer.
16. Una preparación farmacéutica que contiene una
molécula de ácido nucleico de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 5 o una proteína Akt-3 humana
de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 6 a 8 junto con un
vehículo, diluyente o excipiente de ésta aceptables desde el punto
de vista farmacéutico.
17. Una célula huésped u organismo no humano,
transformado o transfectado con un vector de expresión de acuerdo
con cualquiera de las reivindicaciones 9 a 11.
18. Una célula, tejido u organismo no humano
transgénicos que contienen un transgén capaz de expresar una
proteína Akt-3 humana de acuerdo con cualquiera de
las reivindicaciones 6 a 8.
19. Una proteína Akt-3 humana
expresada a partir de la célula o el organismo no humano de acuerdo
con la reivindicación 17 ó 18.
20. Un método de identificación de compuestos que
inhiben selectivamente la promoción de la supervivencia celular
mediada por la proteína Akt-3 humana, donde dicho
método comprende:
- i)
- proveer de una célula transformada con un vector de expresión que activa la vía de la Akt-3 que sobrevive en presencia o ausencia de un factor de supervivencia en comparación con una célula de control que no fue transformada con dicho vector y que morirá en ausencia de dicho factor de supervivencia,
- ii)
- poner en contacto cada una de dichas células con un compuesto de prueba después de eliminar de dichas células dicho factor de supervivencia, donde la muerte de dicha célula transformada es indicativa de la inhibición selectiva de dicho compuesto sobre la vía de la Akt-3 humana que promueve la supervivencia.
21. Un método de identificación de compuestos que
inhiben selectivamente la promoción de la supervivencia celular
mediada por la proteína Akt-3 humana, donde dicho
método comprende:
- i)
- proveer de una célula transformada con un vector de expresión que activa la vía de la Akt-3 además de una célula de control que no ha sido transformada con dicho vector,
- ii)
- poner en contacto cada una de dichas células con un agente que induce la muerte, mediante el cual la muerte de dicha célula de control y la supervivencia de dicha célula transformada son indicativas de la actividad de promoción de la supervivencia de la vía de la Akt-3 activada,
- iii)
- poner en contacto dicha célula transformada con un compuesto de prueba, donde la muerte de dicha célula es indicativa de la inhibición selectiva de dicho compuesto sobre la vía de la Akt-3 humana que promueve la supervivencia.
22. Un método de identificación de los agentes
que influyen la actividad de una proteína Akt-3
humana de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 6 a 8,
donde dicho método comprende poner en contacto dicha proteína
Akt-3 humana con un sustrato de ésta en presencia de
un compuesto de prueba y una fuente de fosfato y controlar
cualquier fosforilación de dicho sustrato.
23. Un método de acuerdo con la reivindicación 22
donde se provee de dicha proteína Akt-3 como una
proteína de fusión o etiquetada por epítopo que tiene un dominio
capaz de fosforilar un sustrato conocido.
24. Un método de acuerdo con la reivindicación 22
donde dicha proteína Akt-3 se proporciona como una
molécula de fusión de GST y Akt-3 humana.
25. Un método de identificación de los agentes
que influyen en la actividad de una proteína Akt-3
humana de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 6 a 8,
donde dicho método comprende poner en contacto un fosfolípido o un
sustituto o equivalente funcional de éste, con un dominio PH de una
proteína Akt-3 humana de acuerdo con cualquiera de
las reivindicaciones 6 a 8 en presencia de un agente que se debe
probar y controlar cualquier unión de dicho fosfolípido, substituto
o equivalente funcional de éste con dicho dominio PH de dicha
proteína Akt-3.
26. Un método de acuerdo con la reivindicación 25
donde dicho fosfolípido contiene 3,4,5-trifosfato
de fosfatidilinositol.
27. Un método de identificación de un compuesto
que modula la actividad de la de Akt-3 quinasa, que
comprende:
- a)
- poner en contacto dicha Akt-3 con un sustrato de ésta en presencia de una fuente de fosfato radiomarcada y el compuesto que se va a probar,
- b)
- detener la reacción mediante el agregado del inhibidor de quinasa en presencia de perlas de SPA,
- c)
- controlar la señal de dichas perlas en comparación con un control que no se haya puesto en contacto con dicho compuesto.
28. Un método de identificación de un compuesto
que modula la actividad de Akt-3, que
comprende:
- a)
- poner en contacto dicha Akt-3 con un sustrato de ésta en presencia de una fuente de fosfato radiomarcada y el compuesto que se va a ensayar,
- b)
- detener la reacción,
- c)
- filtrar la mezcla de reacción a través de papel de intercambio de cationes de fosfocelulosa, y
- d)
- controlar la señal de dicho papel de filtro en comparación con un control que no se haya puesto en contacto con dicho compuesto
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