ES2242460B1 - Acido nucleico que codifica una proteina p19 h-ras de mamifero y su exon idx,peptidos y proteinas codificados por dicho acido nucleico,y sus aplicaciones. - Google Patents
Acido nucleico que codifica una proteina p19 h-ras de mamifero y su exon idx,peptidos y proteinas codificados por dicho acido nucleico,y sus aplicaciones. Download PDFInfo
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Abstract
Acido nucleico que codifica una proteína P19 H-Ras de mamífero y su exón IDX, péptidos y proteínas codificados por dicho ácido nucleico, y sus aplicaciones. La invención está relacionada con la detección del cáncer y su tratamiento. Se describe una nueva proteína llamada "p19 H-Ras" cuyo gen está implicado en la regulación del ciclo celular de las células eucariotas. La proteína p19 H-Ras está codificada por un ácido nucleico derivado del gen H-Ras. Esta nueva proteína es la segunda que es codificada por el mismo gen y esto es debido a que existe un procesamiento alternativo de exones en el ácido nucleico llamado pre-ARNm (pre-ARN mensajero). Este procesamiento alternativo del pre-ARNm también es conocido como "splicing" alternativo.
Description
Ácido nucléico que codifica una proteína p19
H-Ras de mamífero y su exón IDX, péptidos y
proteínas codificados por dicho ácido nucléico, y sus
aplicaciones.
La invención está relacionada con la detección
del cáncer y su tratamiento. Se describe una nueva proteína llamada
"p19 H-Ras" cuyo gen está implicado en la
regulación del ciclo celular de las células eucariotas. La proteína
p19 H-Ras está codificada por un ácido nucléico
derivado del gen H-ras. Esta nueva proteína es la segunda que
es codificada por el mismo gen y esto es debido a que existe un
procesamiento alternativo de exones en el ácido nucléico llamado
pre-ARNm (pre-ARN mensajero). Este
procesamiento alternativo del pre-ARNm también es
conocido como "splicing" alternativo.
Las células de mamíferos contienen los genes
funcionales c-ras:
c-H-Ras,
c-K-Ras y
c-N-Ras, que en los últimos 20 años
han generado un importante conocimiento tanto sobre la transducción
de señal tanto normal como tumoral, revisado por (Barbacid, 1987;
Malumbres and Pellicer, 1998; Reuther and Der, 2000). La proteínas
Ras son GTPasas que también unen los nucleótidos GDP y GTP. El
cambio de las proteínas Ras entre el estado inactivo, proteína unida
a GDP, y el estado activo, proteína unida a GTP, en combinación con
la unión a proteínas diana, es la llave para la transducción de la
señal celular. Las señales celulares son transmitidas por una
cascada de modificaciones bioquímicas de factores proteicos que
regulan varios vías fisiológicas que acaban afectando el ciclo
celular, y provocando, según la naturaleza del estímulo externo,
tanto proliferación como diferenciación o apoptosis de células
normales, revisado en (Barbacid, 1987; Malumbres and Pellicer, 1998;
Reuther and Der, 2000). Ras activado se ha detectado en un 30% de
los tumores humanos testados y está frecuentemente mutado en
animales modelos experimentales, siendo los genes más frecuentemente
activados en cáncer, revisado por (Barbacid, 1987; Malumbres and
Pellicer, 1998).
Dos K-Ras ARNms se obtienen a
partir del mismo pre-ARNm por splicing alternativo
de los últimos exones codificantes 4A y 4B, que se traducen a las
proteínas p21 K-Ras4A y p2l
K-Ras4B, respectivamente. Las proteínas p21
H-Ras, N-Ras,
K-Ras4A y K-Ras4B presentan 100% de
identidad en los aminoácidos 20-48 (los cuales son
importantes para la interacción con los efectores) y una identidad
total de secuencia de alrededor del 85%, ver revisión (Barbacid,
1987; Malumbres and Pellicer, 1998; Reuther and Der, 2000). La
región más divergente entre estas cuatro proteínas es la zona
hipervariable o carboxilo-terminal. Catorce
aminoácidos en la zona carboxilo-terminal de las
proteínas Ras contienen todos los elementos necesarios para su
localización en la membrana plasmática: H-Ras,
ESGPGCMSCKCVLS; N-Ras,
DGTQGCMGLPCVVM; K-Ras4A;
KTPGCVKIKKCIIM y K-Ras4B,
KKKKKKSKTKCVIM(Apolloni et al., 2000; Choy et
al., 1999) (el motivo CAAX y la cisteína interna palmitoliada
están subrayadas). Estos catorce aminoácidos dirigen tres
modificaciones post-traduccionales: farnesilación de
la cisteína 186 en el motivo CAAX; proteolisis de AAX y
carboximetilación de la cisteína 186 (Dai et al., 1998;
Romano et al., 1998; Schmidt et al., 1998). Estas
modificaciones dan a lugar a cuatro proteínas más hidrofóbicas con
más afinidad por membranas.
No está nada claro si estas cuatro proteínas
tienen una función redundante o diferente, pero evidencias
recientes indican que ellas pueden tener diferentes funciones
fisiológicas. Experimentos de desactivación de los genes ras
(knock-out) indican que H-ras, pero no
H-ras o N-ras, es esencial para el desarrollo del
ratón (Esteban et al., 2001; Ise et al., 2000; Johnson
et al., 1997; Koera et al., 1997; Umanoff et
al., 1995), pero esto no excluye que H-ras y N-ras
tengan un papel importante en la célula. Las proteínas Ras también
difieren en su microlocalización en la membrana plasmática, transito
dentro de la células e interacción con los proteínas efectoras de
Ras, revisado en (Barbacid, 1987; Malumbres and Pellicer, 1998;
Reuther and Der, 2000). La estructura de las caveolas es esencial
para la activación de RafI por H-Ras pero no es
esencial cuando esta activación es realizada por
K-Ras4B, lo cual sugiere que K-Ras4B
está asociado a un microdominio diferente de la membrana plasmática
(Barbacid, 1987; Malumbres and Pellicer, 1998; Reuther and Der,
2000). K-Ras4B parece activar mejor RafI que
II-Ras; H-Ras activa mejor
fosfoinositol 3-quinasa que K-Ras4B,
revisado por (Barbacid, 1987; Malumbres and Pellicer, 1998; Reuther
and Der, 2000).
En 1989 Cohen et al. sugirió que la
familia Ras podría ser más extensa. Estos autores publicaron que el
pre-mRNA de H-Ras tenía un splicing
alternativo en el penúltimo 3' exon codificante (Cohen et
al., 1989). El gen c-H-Ras puede
dar lugar a dos mRNAs, uno con un codón de stop en el exón 4A (E4A)
y un segundo mensaje con un codón de stop en el exon llamado IDX
(ver figura 1). El mensaje
E0-E1-E2-E3-E4A-E4B
codifica la conocida p21 H-Ras4A y el mensaje
E0-E1-E2-E3-IDX-E4A-E4B
codifica para una proteína hipotética llamada p19
H-RasIDX (que aquí llamaremos p 19
H-Ras). Estos autores sugirieron que el ARNm era
inestable, muy dificil de detectar y que posiblemente la proteína
p19 H-Ras no sería obtenida (Cohen et al.,
1989). Estos mismos autores sugirieron que el producto de este
splicing alternativo, el ARNm de la p19 H-Ras (o la
proteína hipotética que codifica), no tenía potencial transformante;
ellos también sugirieron que la actividad transformante del gen
H-ras es inversamente proporcional a la eficiencia
del splicing alternativo del pre-ARNm de
H-ras hacia en ARNm de la p19 H-Ras
(Cohen et al., 1989). Más tarde, Huang y Cohen sugirieron que
si la hipotética proteína p 19 H-Ras existiera esta
podría tener propiedades para ser un regulador negativo de la
proteína p21 H-Ras (Huang and Cohen, 1997). Hasta
ahora no se sabía si la proteína p19 H-Ras
existía.
Aquí demostramos que el ARNm de la proteína p19
H-Ras es estable y que la proteína existe.
Se descubre que el ARNm de la p19
H-Ras es estable y se descubre que la proteína
existe y es fácilmente detectable con un anticuerpo específico. Para
ello se presenta un ensayo Northern blot en el que una matriz de
puntos conteniendo ARN mensajero de diferentes tejidos es hibridado
con una sonda específica que reconoce sólo el mensajero de la p19
H-Ras. La figura 2 demuestra que este mensajero es
diferencialmente expresado y es estable en diferentes tejidos
humanos y líneas celulares. El segundo experimento es hacer un
anticuerpo contra los 20 aminoácidos - o bien contra un zona de
estos 20 aminoácidos - los cuales son específicos de la zona
carboxilo-terminal de una proteína p19
H-Ras, y ensayar mediante la técnica de Western
blot, la figura 3 enseña cómo se detecta sin dificultad esta
proteína con los anticuerpos específicos. La figura 4 enseña la
secuencia de ácido nucléico cuyo uso reivindicamos en esta patente,
y se presenta de diferentes mamíferos. La figura 5 enseña la
secuencia de 20 aminoácidos específica de la zona
carboxilo-terminal de una proteína p19
H-Ras, secuencia peptídica cuyo uso reivindicamos en
esta patente, y se presenta esta secuencia de diferentes mamíferos.
La figura 6 es la secuencia codificante de aminoácidos de una
proteína p19 H-Ras humana cuyo uso reivindicamos en
esta patente. También reivindicamos el uso de unas proteínas p19
H-Ras homólogas de otros mamíferos.
El pre-mRNA del gen
H-ras puede dar a lugar a dos mensajes de ARN
mensajero finales, que se traducirán a dos proteínas parcialmente
distintas. Esto es debido a que existe dos secuencias de ácido
nucléico, llamadas exones, dentro del pre-ARNm. El
mensaje final de la p19 H-Ras contiene el exón IDX
como exón 3' terminal codificante, mientras que la ya conocida
proteína p21 H-Ras contiene el exón E4A como exón 3'
terminal codificante y no contiene el exón IDX dentro de su mensaje
(ver Figura 1). Nadie había detectado la proteína p19
H-Ras antes que los inventores de este
documento.
Se reivindica el uso de una proteína p19
H-Ras humana y de otros mamíferos. Esta invención
también reivindica lo siguiente: una molécula de ácido nucléico que
híbrida con un exón IDX humano y de otros mamíferos. El exón IDX es
un ácido nucléico formado por una secuencia que codifica veinte
aminoácidos diferenciales de una proteína p19 H-Ras;
anticuerpos que se unan a los 20 aminoácidos
carboxi-terminales de una proteína p19
H-Ras; anticuerpos contra polipéptidos derivados de
los 20 aminoácidos carboxi-terminales de una
proteína p19 H-Ras; métodos para detectar ácidos
nucléicos que codifican específicamente una proteína p19
H-Ras, o sea un ácido nucléico que contenga una
secuencia IDX humana o de otros mamíferos; métodos para detectar
ácidos nucléicos alterados o mutados que codifican específicamente
una proteína p19 H-Ras, o sea un ácido nucléico
alterado o mutado que contenga una secuencia IDX humana o de otros
mamíferos; métodos para producir una proteína p19
H-Ras usando el ácido nucléico que contiene una
secuencia IDX, la cual codifica para el
carboxi-terminal de una proteína p19
H-Ras; una proteína p19 H-Ras
obtenida por medios recombinantes; una proteína p19
H-Ras recombinante purificada fusionada que esté
derivada de la fusión de la secuencia polipeptídica de una proteína
p19 H-Ras con una segunda secuencia polipeptídica;
métodos para tratar el cáncer que empleen una proteína p19
H-Ras recombinante purificada; métodos para tratar
el cáncer que empleen la proteína p19 H-Ras
recombinante purificada fusionada a otras proteínas; métodos que
induzcan la parada del ciclo celular empleando una proteína p19
H-Ras o el ácido nucléico IDX que codifica el
carboxilo-terminal de una proteína p19
H-Ras; métodos para detectar una proteína p19
H-Ras empleando anticuerpos que reconozcan los 20
aminoácidos carboxilo-terminales de una proteína p19
H-Ras; métodos que selectivamente vayan dirigidos a
matar células que tengan un crecimiento descontrolado empleando
anticuerpos que reconozcan los 20 aminoácidos
carboxilo-terminales de una proteína p19
H-Ras, o conjugados derivados de estos anticuerpos o
fragmentos derivados de estos anticuerpos; métodos que estimulen el
crecimiento celular empleando 20 aminoácidos
carboxilo-terminales de una proteína p19
H-Ras, o conjugados derivados de estos anticuerpos o
fragmentos derivados de estos anticuerpos; mamíferos
no-humanos transgénicos que tengan una proteína p19
H-Ras alterada por ingeniería genética en uno o
varios nucleótidos del ácido nucléico IDX; mamíferos
no-humanos transgénicos que contengan una o más
copias del ácido nucléico que codifica para una proteína p 19
H-Ras humana o de otros mamíferos en forma salvaje o
mutante, en adición del gen H-ras natural estando el
gen H-ras natural en forma salvaje o bien modificado
(mutado); mamíferos no-humanos transgénicos que han
sido modificados para sobre-expresar una proteína
p19 H-Ras humana o de otros mamíferos, estando esta
en forma salvaje o mutada.
Figura 1. Splicing alternativo del gen
H-ras. Los codones de stop están remarcados en la
figura.
Figura 2. El ARNm de la p19
H-Ras es estable y se expresa diferencialmente en
varios tejidos humanos y líneas celulares.
Ensayo mediante Nothern exónico sobre una matriz
de puntos conteniendo ARN poliadenilado obtenido de diferentes
tejidos (MTE). El Northern blot fue incubado con una ribosonda
anti-IDX marcada radioactivamente. La mayor
intensidad del punto radioactivo refleja mayor expresión del ARNm de
la p19 H-Ras. Tejidos: 1A, cerebro total; 1B,
corteza cerebral 1C Lóbulo frontal; 1D lóbulo parietal; 1E , lóbulo
occipital; 1F, lóbulo temporal; 1G p.g. de la corteza cerebral; 1H
puentes de Varolio; 2A, cerebelo izquierdo; 2B, cerebelo derecho;
2C, cuerpo callozúm; 2D, amígdala; 2E, Núcleo del caudato;
2F, hipocampo; 2G, oblongota de la médula; 2H, pujamen; 3B, núcleo
de accumbens; 3C, tálamo; 4A, corazón; 4B, aorta,; 4C, atrio
izquierdo; 4D, atrio derecho; 4E, ventrículo izquierdo; 4F,
ventrículo derecho; 4G, tabique intraventricular; 4H, ápice del
corazón; 5A, esófago; 5B, estómago; 5C, duodeno; 5D, jejunum;
5E, ileum; 5F, ilocecum; 5G, apéndice; 5H, colón
ascendente; 6A, colón transversal; 6B, colón descendente; 6C, recto;
7A, riñón; 7B, músculo esquelético; 7C, bazo; 7D, timo; 7E,
leucocito periférico de sangre; 7F, nódulo de la linfa; 7G, médula;
7H, tráquea; 8A, pulmón; 8B, placenta; 8C, vejiga; 8D, útero; 8E,
próstata; 8F, testículos; 8G, ovario; 9A, hígado; 9B, páncreas; 9C,
glándula suprarrenal; 9D, glándula de tiroides; 9E, glándula
salivar; 10A, células HL-60; 10B, células HeLa S3;
10C, células K-562; 10D, células
MOLT-4; 10E, células Raji; 10F, células Daudi; 10G,
células SW480; 10H, células A549; 11A, cerebro fetal; 11B, corazón
fetal; 11C, riñón fetal; 11D, hígado fetal; 11E, bazo fetal; 11F,
timo fetal; 11G, pulmón fetal; 12A, ARN total de levadura; 12B,
total ARNt de levadura; 12C, ARN ribosomal de bacteria; 12D, ADN de
bacteria; 12E, poliribosomal; 12F; ADN humano Cot-1;
12G, ADN humano 100 ng y 12H, ADN humano 500 ng.
Figura 3. Detección por ensayos de Western Bloc
de la proteína p19 H-Ras endógena en extractos
proteicos nucleares de la especie humana.
Ensayo hecho con el anticuerpo SP1 descrito en
materiales y métodos. Carriles 3 y 6 contienen proteínas de un
extracto nuclear de células humanas HeLa, hecho por extracción con
SDS e incubado con el suero pre-inmune del conejo
(control negativo) y con el suero SP1, respectivamente; carriles 2 y
5 contienen proteínas de un extracto total bacteriano que expresa la
proteína de fusión recombinante GST-p19
H-Ras e incubado con el suero
pre-inmune del conejo (control negativo) y con el
suero SP1, respectivamente y carriles 1 y 4 contienen proteínas de
un extracto total bacteriano que expresa la proteína de fusión
recombinante GST-p21 H-Ras4A e
incubado con el suero pre-inmune del conejo (control
negativo) y con el suero SP1, respectivamente.
Figura 4. Secuencias de ácidos nucléicos que
definen el exon IDX en diferentes mamíferos. Se reivindica su
uso.
Conservación del exón IDX en los mamíferos. La
figura enseña diferentes secuencias del exón IDX de diferentes
mamíferos. La secuencia más conservada se enseña debajo (consensos).
Las secuencias que estaban en el banco gnómico son las siguientes:
humana (Homo sapiens, número de acceso BC006499.1) (SEQ ID
NO: 1); hámster (Mesocricetus auratus, número de acceso
M84166.1) (SEQ ID NO: 6) y ratón (Mus musculus, AF081118)
(SEQ ID NO: 8); secuencias obtenidas por los inventores de esta
patente mediante secuenciación directa de ARNm de las siguientes
mamíferos: mono (células en cultivo COS-1,
Cercopithecus aethiops) (SEQ ID NO: 2); buey (Bos
Taurus) (SEQ ID NO: 3); cerdo (Sus scrofa) (SEQ ID NO:
4); conejo (Oryctolagus cuniculus) (SEQ ID NO: 5) y rata
(células en cultivo Rat-1, Rattus norvegicus)
(SEQ ID NO: 7).
Figura 5. Secuencias peptídicas que son
obtenidas de la traducción del exón IDX de diferentes especies:
humana (SEQ ID NO: 9), mono (SEQ ID NO: 10), buey (SEQ ID NO: 11),
cerdo (SEQ ID NO: 12), conejo (SEQ ID NO: 13), hámster (SEQ ID NO:
14), rata (SEQ ID NO: 15) y ratón (SEQ ID NO: 16). Se reivindica el
uso de esta secuencia.
Se obtuvieron de la traducción de la secuencia
de ácido nucléico que se presenta en la figura 4. Se presentan los
aminoácidos más conservados (consensos).
Figura 6. Secuencia de amino ácidos de la
proteína p19 H-Ras humana (SEQ ID NO: 17).
Se reivindica el uso de esta secuencia completa,
y de secuencias mutantes o modificadas de los 20 aminoácidos
carboxilo-terminales de la proteína p19
H-Ras.
Esta invención se refiere a vectores como los
plásmidos que comprenden una molécula de ácido nucléico (ADN) que
codifica la p19 H-Ras, adaptada para la expresión en
bacteria, levaduras o células de mamíferos la cual contiene además
los elementos reguladores necesarios para la expresión del ácido
nucléico en bacteria, levaduras o células de mamíferos de tal manera
localizadas respecto al ácido nucléico que codifica la p19
H-Ras para así permitir su expresión. Ejemplos de
vectores son los bacteriófagos (como el fago lambda), cósmidos,
plásmidos (como pUC 18, que se puede obtener de Pharmacia,
Piscataway, NJ), y otros vectores recombinantes. Existen muchos
vectores distintos para bacteria, levaduras y mamíferos. Un ejemplo
de vector de levaduras pGADT7 (Clontech) y un ejemplo de vector de
mamíferos es pcDNA3 (Invitrogen). Las moléculas de ácido nucléico se
insertan en los genomas de los vectores por métodos bien conocidos
por personas que normalmente los usan o vayan a usarlos. Un ejemplo
de estos plásmidos que contienen el ácido nucléico IDX es la
Ribosonda Anti-IDX para el ensayo de Northern sobre
ARNs de múltiples tejidos (MTE, figura 2), y los otros vectores
descritos en construcción de vectores en materiales y métodos. De
manera alternativa, para obtener estos vectores, el inserto y vector
de ácido nucléicos pueden ser ambos expuestos a enzimas de
restricción para crear terminales complementarios en ambas moléculas
los cuales se aparean unos terminales con otros (el terminal del
inserto con el terminal del vector) y después son ligados con una
ligasa. Alternativamente, moléculas de ácido nucléico puente pueden
ser ligadas al ácido nucléico inserto las cuáles corresponden a un
sitio de restricción del vector ácido nucléico, ambas moléculas son
digeridas con el enzima de restricción que corta este sitio presente
en el puente y en el vector. Existen otras maneras de crear vectores
con el inserto.
Sonda es una prueba de ácido nucléico que
comprende un ácido nucléico de al menos 13 nucleótidos que tenga
capacidad de hibridar específicamente con cualquier región de las
secuencias enseñadas en la figura 4. La frase "hibridar
específicamente" significa la habilidad que tiene una molécula de
ácido nucléico de reconocer la secuencia de ácido nucléico
complementaria a si misma y formar segmentos de doble hélice
mediante puentes de hidrógeno entre las bases complementarias. La
tecnología para hacer sondas de ácido nucléico es bien conocida por
personas que la usan, las cuales van a apreciar que estas sondas
pueden variar enormemente en longitud y también pueden ser marcadas
con un marcador detectable, como un radioisótopo o un marcador
fluorescente, para facilitar la detección de la sonda. La detección
del nivel del ácido nucléico que codifica la p19
H-Ras es útil como un test diagnóstico para
cualquier proceso de enfermedad en el cual los niveles de expresión
de la correspondiente proteína p19 H-Ras están
alterados. Las sondas de ácido nucléico se consiguen por inserción
de una molécula de ácido nucléico que codifica el ácido nucléico IDX
ó fragmentos de IDX, de cualquiera de las especies arriba
mencionadas, en un vector adecuado, como plásmidos o bacteriófagos,
seguido de la inserción en una célula bacteriana adecuada y
replicación y recuperación de la prueba de ácido nucléico, empleando
en el proceso métodos muy bien conocidos en esta tecnología. Por
ejemplo, el ácido nucléico puede ser extraído a partir de un lisado
celular con fenol y etanol, digerido con enzimas de restricción
correspondientes a los sitios de inserto del ácido nucléico sonda
dentro del vector (discutido en materiales y métodos), separado por
electroforesis y cortado del gel. Otra manera es transcribir el ARN
complementario a partir del vector purificado para hacer Northerns
con ribosonda. Este último proceso es muy bien conocido en esta
tecnología. Un ejemplo de vector sonda es la ribosonda
Anti-IDX para el ensayo de Northern sobre ARNs de
múltiples tejidos (MTE, figura 2). La detección Northern es proceso
muy bien conocido en esta tecnología. Un ejemplo se enseña arriba en
materiales y métodos con el Northern exónico con la ribosonda
anti-IDX (MTE, figura 2) y es aplicable a todas las
especies mencionadas. Toda la tecnología es muy conocida y como
bibliografia damos el manual: Maniatis, T. Et al. Molecular
Cloning; Cold Spring Harbor Laboratory (1982).
Como ejemplo de método de detección de la
expresión del ARNm que codifica la proteína p19
H-Ras gen puede ser por Northern o por
RT-PCR ambos descritos arriba en materiales y
métodos. Toda la tecnología es muy conocida y como bibliografía
damos el manual: Maniatis, T. Et al. Molecular Cloning; Cold
Spring Harbor Laboratory (1982).
El método para obtener la proteína p19
H-Ras recombinante es muy conocido y standard. Los
vectores pueden tener secuencias marcadores como GST o cola de
histidinas que permiten aislar la proteína. Como ejemplo
presentamos en materiales y métodos el vector
GST-p19 H-Ras obtenido tal como
indica el proveedor del plásmido
pGEX-4T-3 (Pharmacia). Reivindicamos
la purificación de la proteína p19 H-Ras unida a
cualquier marcador. Otro método de obtener una proteína p19
H-Ras comprende inducir las células a expresar más
p19 H-Ras, recuperar la p19 H-ras a
partir de estas células y purificar la proteína p19
H-Ras de extracto recuperado. Un ejemplo de una
proteína p19 H-Ras aislada de células es una
proteína aislada (sea por sobreexperesión de la proteína mediante el
uso de vectores o bien por inducción de la expresión endógena) que
contenga la misma secuencia de aminoácidos descritas en la Figura 5.
Como ejemplo, las células que expresan p19 H-Ras
pueden ser homogeneizadas y la proteína p19 H-Ras
puedes ser purificada con una columna de inmunoafinidad
confeccionada con un anticuerpo anti-p19 H.Ras. Otro
ejemplo es a partir del homogenizado celular se hacen columnas de
intercambio fónico y se determinan las fracciones que contienen p19
H-Ras empleando los anticuerpos
anti-p19 H-Ras.
Los anticuerpos específicos de la p19
H-Ras, tanto policlonales como monoclonales, son
útiles para la detección del nivel de expresión de la proteína p19
H-Ras. La detección del nivel de la proteína p19
H-Ras es útil como un test diagnóstico para
cualquier proceso de enfermedad en el cual los niveles de expresión
de la correspondiente proteína p19 H-Ras están
alterados. Los anticuerpos permiten también detectar la secuencia
específica dé la proteína p19 H-Ras en cualquier
circunstancia y son por tanto un producto que puede volverse muy
rápidamente comercial. Un ejemplo del uso de este anticuerpo se
enseña en la Figura 3 mediante la técnica de Western blot que es una
técnica muy conocida para los conocedores de esta tecnología.
Esta invención reivindica un mamífero no humano
transgénico que contenga el ácido nucléico IDX enseñadas en la
Figura 4. También reivindica un mamífero no humano transgénico que
contenga la secuencia de ácido nucléico IDX enseñadas en la Figura 4
mutadas de tal manera que la proteína p19 H-Ras es
incapaz de ejercer su función o bien, por ejemplo, no se expresa la
proteína p19 H-Ras nativa. Se reivindica también un
mamífero no humano transgénico cuyo genoma contiene un ácido
nucléico (ADN) que codifica la secuencia IDX, o fragmentos de ella,
añadido de tal manera para ser transcrito como ácido nucléico
anti-sentido (antisense-ARN) que
será complementario a la secuencia de ácido nucléico IDX con la
finalidad de reducir la traducción del ARNm a la proteína p19
H-Ras. El ácido nucléico (ADN) añadido puede
adicionalmente contener un promotor inducible o contener elementos
reguladores específicos de tejido, y así su expresión puede ser
inducida o restringida a tipos celulares específicos. Ejemplos de
moléculas de ácido nucléico ADN son ADN y ADN complementario que
contienen la secuencia IDX son substancialmente las mismas que se
enseñan en la Figura 4. Un ejemplo de un animal transgénico es un
ratón transgénico. Ejemplos de regiones que determinan especificidad
de tejido es el promotor de la metallothioneina (Low, M.J.,
Lechan, R. M., Hammer, R.E. et al. Science 231:
1002-1004, 1986, y el promotor L7 (Oberdick, J.,
Smeyne, R.J., Mann, J.R., Jackson, S. Y Morgan, J.I. Science
248:223-226, 1990).
Sistemas de animales modelo que permiten
elucidar el papel fisiológico y comportamiento de la proteína p19
H-Ras se consiguen mediante una variedad de técnicas
creando animales transgénicos donde se incrementa o disminuye la
expresión de la p19 H-Ras, o bien se alteran los
aminoácidos codificados por el ácido nucléico IDX. Ejemplos de estas
técnicas incluyen, pero no están limitadas a: 1) inserción de
versiones normales o mutantes de ADN que codifica la proteína p19
H-Ras humana, o bien versiones de este gen homólogas
de otros animales, por microinyección, infección retroviral (u otros
medios bien conocidos por personas entrenadas en esta tecnología) en
embriones fertilizados apropiados con la finalidad de obtener el
animal transgénico (Hogan B et al. Manipulating the Mouse
Embryo, A Laboratory Manual, Cold Spring Harboir Laboratory, 1986)
o, 2) Recombinación homóloga (Capecchi M.R. Science 244:
1288-1292, 1989; Zimmer, A. And Gruss, P. Nature
338: 150-153, 1989), de versión mutante o normal, de
versión humana o animal del gen que codifica la proteína p19
H-Ras, con el locus del gen nativo en animales
transgénicos para alterar la regulación de la expresión o la
estructura de la proteína p19 H-Ras. La técnica de
recombinación homóloga es bien conocida por personas entrenadas en
esta tecnología. Ella reemplaza el gen nativo con el gen insertado y
así es útil para producir un animal que no puede expresar la
proteína p19 H-Ras nativa pero si expresa, por
ejemplo una proteína p19 H-Ras humana mutada, la
cual ha reemplazado la proteína p19 H-Ras nativa en
el genoma animal por recombinación homóloga, resultado en la
disminución de la expresión de la proteína p19
H-Ras. Microinyección adiciona genes al genoma, pero
no los reemplaza, y así es útil para producir animales que expresan
por si mismos p19 H-Ras añadida, resultado en la
sobreexpresión de la proteína p19 H-Ras.
Una manera accesible para producir animales
transgénicos, con el ratón como ejemplo, es la siguiente: Ratones
hembra son apareadas, y los huevos fertilizados resultantes son
obtenidos de sus oviductos. Los huevos se conservan en un medio
apropiado como el medio M2 (Bogan B et al. Manipulating the
Mouse Embryo, A Laboratory Manual, Cold Spring Harboir Laboratory,
1986). ADN o ADN complementario que codifica el gen de la proteína
p19 H-Ras se purifica de un vector (como el
GST-p19 H-Ras descrito arriba)
métodos bien conocidos en este tipo de tecnología. Promotores
inducibles pueden ser fusionados con la región codificante del ADN
para permitir un medio experimental para regular la expresión del
trans-gen. El ADN, diluido en una solución tampón
apropiada, se introduce dentro de una aguja de microinyección (la
cual se puede hacer a partir de un tubo capilar) y el huevo a ser
inyectado se pone en un slide cóncavo. La aguja se inserta en el
pronúcleo del huevo, y la solución de DNA es inyectada. El huevo
inyectado es transferido dentro de un oviducto de un ratón
pseudoembarazada (un ratón estimulado por hormonas apropiadas para
mantener un pseudoembarazo pero no estando realmente embarazada),
donde se dirige hacia el útero, se implanta, y se desarrolla hasta
el término del embarazo. Como se ha descrito arriba, la
microinyección no es el único método para insertar ADN dentro de un
huevo, y la usamos aquí con el propósito de dar un ejemplo.
Estos sistemas de animales modelo son útiles
para predecir o evaluar posibles aplicaciones terapéuticas de
drogas que activan o inhiben la función de la p19
H-Ras mediante la inducción o inhibición de la
expresión del gen nativo o del trans-gen y así
incrementando o disminuyendo la expresión de la proteína p19
H-Ras tanto normal como mutada en animales vivos.
Así pues, un sistema animal modelo se produce para evaluar drogas
antes incluso de que estas drogas sean accesibles. Un animal
transgénico que sobre- o infraexpresa a proteína p19
H-Ras indica por su estado fisiológico si la sobre
o infraproducción es terapéuticamente útil. Es pues útil evaluar la
acción de una droga basada en un sistema transgénico modelo.
Células HeLa, Rat-1,
COS-1 se propagaron en medio DMEM complementado con
un método similar al descrito previamente (de la Iglesia et
al., 1999). ARN total de cada línea celular fue obtenido por
extracción con tiocianato de guanidinio y ultracentrifugación en un
cojín de cloruro de cesio con un método similar al descrito
previamente (Glisin et al., 1974).Extractos proteicos
nucleares fueron preparados con un método similar al descrito
previamente (Dignam et al., 1983). Los extractos en dodecil
sulfato sódico (SDS) se obtuvieron en tampón de muestras proteico
con un método similar al descrito previamente (Cleveland et
al., 1977). Origen del ARN total que se ha obtenido de
diferentes mamíferos: COS-1, es una célula de mono
establecida para cultivo celular; Rat-1 es una
célula de rata establecida para cultivo celular; los demás provenían
de hígado de cerdo, conejo y buey.
Anticuerpos que reconocen específicamente la
proteína p19 H-Ras fueron obtenidos a partir de
inmunizaciones de conejos empleando el péptido humano
GSRSGSSSSSGTLWD (SEQ ID NO: 18) que corresponde a los 15 primeros
aminoácidos de la zona carboxilo-terminal de la p19
H-Ras (ver figura 5). Este péptido se sintetizó con
una cisteína adicional en la zona carboxilo-terminal
para su posterior conjugación a hemocianina de molusco (KLH) con un
método similar al descrito previamente (Babia et al., 1999).
Suero pre-inmune (control negativo) fue obtenido de
los conejos antes de iniciar la inmunización. El suero fue testado
en ensayos de Western blot, cuyos blots contenían extracto total
bacteriano (Escherichia coli, cepa BL21), de dos cepas que
expresan, respectivamente, las proteínas recombinantes
GST-p19 H-Ras y
GST-p21 H-Ras. Estos extractos
bacterianos han sido obtenidos con un método similar a uno
previamente descrito (Kaelin et al., 1992). Un suero con
buena especificidad fue obtenido (enseñado en la figura 3) y fue
nombrado SP1; este suero también fue ensayado en ELISAs de
competición con ELISAs conteniendo el péptido inicial con un método
similar a uno previamente descrito (Babia et al., 1999).
Todos los insertos de plásmidos fueron obtenidos
por PCR empleando una ADN polimerasa Pfu, con la excepción de
la ribosonda antisentido (anti-IDX) que fue
amplificada con una Taq ADN polimerasa. Todos los plásmidos
fueron comprobados por secuenciación de ADN. La ribosonda
Anti-IDX para el ensayo de Northern sobre ARNs de
múltiples tejidos (MTE, figura 2) fue obtenida con los cebadores
IDXfor (SEQ ID NO: 22) y IDXrev (SEQ ID NO: 24) y
RT-PCR sobre ARNm humano. La ribosonda
antisentido anti-IDX fue transcrita con la ARN
polimerasa T3 después que se linealizó el plásmido con NotI.
Vector de expresión GST-p19
H-Ras: el fragmento que codifica el ácido
nucléico ARNm de la proteína p19 H-Ras fue
amplificado a partir de RNA total de células humanas HeLa empleando
el método PCR y los cebadores E1 for (SEQ ID NO: 25) y
IDX-GSTrev (SEQ ID NO: 26). El producto de PCR fue
digerido con BamHI y EcoRI y clonado en los mismos sitios del vector
pGEX-4T-3. Vector de expresión
GST-p21 H-Ras4A: fue obtenido
como el vector de expresión GST-p19
H-Ras pero empleando los cebadores
p21-GSTrev (SEQ ID NO: 27) en lugar de
IDX-GSTrev (SEQ ID NO: 26).
Las reacciones de RT-PCR fueron
hechas con un método similar al descrito previamente (Codony et
al., 2001). Todas las bandas obtenidas por PCR fueron
secuenciadas mediante técnicas standard de secuenciación del ADN.
Las secuencias nuevas de IDX de otros mamíferos fueron obtenidas por
RT-PCR del RNA total empleando oligodT para la
reacción de RT, y Pfu ADN polimerasa para la PCR, en tres
experimentos independientes.
E3for: SEQ ID NO: 19; E4Arev: SEQ ID NO: 20;
ratE4rev: SEQ ID NO: 21; IDXfor: SEQ ID NO: 22; D2/848: SEQ ID NO:
23; IDXrev: SEQ ID NO: 24; E 1 for: SEQ ID NO: 25;
IDX-GSTrev: SEQ ID NO: 26;
p21-GSTrev: SEQ ID NO: 27; GFP-p19
dir: SEQ ID NO: 28.
Ensayos Northern exónicos en puntos fueron
hechos con un método similar al descrito (Porchet and Aubert, 2000).
El array MTE fue comprado a la empresa Clontech (número de catálogo
7775-1) y fue ensayado con la ribosonda
anti-IDX (antisense). Esta membrana de Nylon
contenía una carga normalizada de ARN poli A+ de 72 tejidos humanos
diferentes y ocho ARNs o ADNs controles. La normalización había sido
hecha por la empresa Clontech antes de vender el papel de Nylon MTE.
Esta normalización tiene en cuenta las diferencias de los niveles de
trascripción, y la empresa Clontech normaliza la carga de poli A+
respecto a ocho genes "housekeeping" que son genes de
naturaleza constitutiva y se expresan en la mayoría de las células,
, \beta-actina; gliceraldehido
3-fosfato deshidrogenasa; ubiquitina; proteína de 23
kDa altamente básica; \alpha-tubulina; fosfolipasa
A2; proteína ribosomal S9; receptor de la transferrina y hipoxantina
guanina fosforribosil transferasa) porque estos ARNs presentan una
variación en todos los puntos ensayados en el MTE array y también
pertenecen a clases funcionales diferentes. Así pues la intensidad
obtenida en los puntos indicarán la abundancia relativa del ARNm de
la p19 H-Ras presente en diferentes tejidos.
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proteína p19 H-Ras de mamífero y su exón IDX,
péptidos y proteínas codificados por dicho ácido nucléico, y sus
aplicaciones
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<210> 1
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<211> 82
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<212> DNA
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<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 1
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\hskip-.1em\dddseqskipggcagccgct ctggctctag ctccagctcc gggaccctct gggacccccc gggacccatg
\hfill60
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\hskip-.1em\dddseqskiptgacccagcg gcccctcgcg ct
\hfill82
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<212> DNA
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<213> Cercopithecus aethiops
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\hskip-.1em\dddseqskiptgacccagcg gcccctcgcg ct
\hfill82
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<213> Bos taurus
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\hskip-.1em\dddseqskipggcagccgct ctggctctgg ctccagctcc gggaccctct gggaccctcc gggacccccg
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\hskip-.1em\dddseqskiptgacccagcc gcccctct
\hfill78
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<212> DNA
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\hskip-.1em\dddseqskiptgacccagca gcccctcctg ct
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<211> 82
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<211> 81
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<212> DNA
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\hfill81
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\hskip-.1em\dddseqskiptgacccatgt gacccagcgg ccctcatgct
\hfill90
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\hskip-.1em\dddseqskipggcagccgct ctggctccag ctccgggacc ctctgggatc ccccctcccc cgggacccat
\hfill60
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\hskip-.1em\dddseqskipgtgacccagc ggccctcaag ct
\hfill82
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\sa{Gly Ser Arg Ser Gly Ser Ser Ser Ser Ser Gly
Thr Leu Trp Asp Pro}
\sac{Pro Gly Pro Met}
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\sa{Val Ser Arg Ser Gly Ser Gly Ser Ser Ser Gly
Thr Leu Trp Asp Pro}
\sac{Pro Gly Pro Met}
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Thr Leu Trp Asp Pro}
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Thr Leu Trp Asp Pro}
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<211> 20
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Oryctolagus cuniculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Ser Arg Ser Gly Ser Gly Ser Ser Ser Gly
Thr Leu Trp Asp Pro}
\sac{Pro Gly Pro Met}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mesocricetus auratus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Ser Arg Ser Gly Ser Gly Ser Ser Ser Gly
Ser Leu Trp Asp Pro}
\sac{Pro Gly Pro Met}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Rattus norvegicus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Ser Arg Ser Gly Ser Gly Ser Ser Ser Gly
Thr Leu Trp Asp Pro}
\sac{Pro Gly Pro Met}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Ser Arg Ser Gly Ser Ser Ser Gly Thr Leu
Trp Asp Pro Pro Ser}
\sac{Pro Gly Thr His Val Thr Gln Arg Pro Ser
Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 170
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Ser Arg Ser Gly Ser Ser Ser Ser Ser Gly
Thr Leu Trp Asp}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220> DNA sintético
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido E3for
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggagcagatc aaacgggtga
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220> DNA sintético
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido E4Arev
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipctgccggatc tcacgcacca
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220> DNA sintético
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido ratE4Arev
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipctagtgtcag gacagcacac
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220> DNA sintético
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido IDXfor
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggcagccgct ctggctctag
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220> DNA sintético
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido D2/848
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipagtccccctc acctgcgtca
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220> DNA sintético
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido IDXrev
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcgcgaggggc cgctgggtca
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220> DNA sintético
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido Elfor
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcgatgggatc ctatgacgga atataagctg gtggtg
\hfill36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220> DNA sintético
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido
IDX-GSTrev
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipctgtcgaatt ctcacatggg tcccgggggg tccca
\hfill35
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220> DNA sintético
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido
p21-GSTrev
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipctgtcgaatt ctcaggagag cacacacttg cagct
\hfill35
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220> DNA sintético
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido
GFP-p19 dir
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipctgtcgaatt ctatgacgga atataagctg gtggtg
\hfill36
Claims (50)
1. Una molécula de ácido nucléico, aislada,
seleccionada entre:
- a)
- una molécula de ácido nucléico que codifica el péptido correspondiente al exón IDX de una proteína p19 H-Ras de mamífero;
- b)
- una molécula de ácido nucléico que hibrida con dicha molécula de ácido nucléico definida en a) y que codifica el péptido correspondiente al exón IDX de una proteína p19 H-Ras de un mamífero;
- c)
- una molécula de ácido nucléico que tiene una secuencia codificante degenerada con respecto a la secuencia codificante de la molécula de ácido nucléico definida en a) y en b) y que codifica el péptido correspondiente al exón IDX de una proteína p19 H-Ras de un mamífero; y
- d)
- una molécula de ácido nucléico que codifica una proteína p19 H-Ras de mamífero o una forma mutada de dicha proteína con actividad alterada.
2. Molécula de ácido nucléico según la
reivindicación 1, cuya secuencia de nucleótidos se selecciona del
grupo formado por SEQ. ID. NO: 1, SEQ. ID. NO: 2, SEQ. ID. NO: 3,
SEQ. ID. NO: 4, SEQ. ID. NO: 5, SEQ. ID. NO: 6, SEQ. ID. NO: 7 y
SEQ. ID. NO: 8.
3. Molécula de ácido nucléico según la
reivindicación 1, cuya secuencia de nucleótidos codifica un péptido
cuya secuencia de aminoácidos se selecciona del grupo formado por
SEQ. ID. NO: 9, SEQ. ID. NO: 10, SEQ. ID. NO: 11, SEQ. ID. NO: 12,
SEQ. ID. NO: 13, SEQ. ID. NO: 14, SEQ. ID. NO: 15 y SEQ. ID. NO: 16,
o una proteína cuya secuencia de aminoácidos es la definida en la
SEQ. ID. NO: 17.
4. Molécula de ácido nucléico según cualquiera
de las reivindicaciones 1 a 3, en la que dicho ácido nucléico se
selecciona entre ácido desoxirribonucleico y ácido ribonucleico.
5. Molécula de ácido nucléico según la
reivindicación 4, en la que dicha molécula de ácido nucléico es una
molécula de ADN.
6. Molécula de ADN según la reivindicación 5, en
la que dicha molécula de ADN es una molécula de ADNc.
7. Molécula de ácido nucléico según la
reivindicación 4, en la que dicha molécula de ácido nucléico es una
molécula de ARN.
8. Molécula de ácido nucléico según la
reivindicación 7, en la que dicha molécula de ARN es una molécula de
ARN complementaria antisentido (antisense) a la molécula de ácido
nucléico definida en la reivindicación 1.
9. Molécula de ácido nucléico según cualquiera
de las reivindicaciones 1 a 8, en la que dicha proteína p 19
H-Ras es una forma mutada de una proteína p 19
H-Ras de mamífero con actividad alterada.
10. Un vector que comprende una molécula de
ácido nucléico según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9.
11. Vector según la reivindicación 10, en el que
dicho vector se selecciona entre un bacteriófago, un cósmido y un
plásmido.
12. Vector según cualquiera de las
reivindicaciones 10 ú 11, en el que dicho vector es un vector
adaptado para su expresión en una célula bacteriana que comprende
los elementos reguladores necesarios para la expresión en dicha
célula bacteriana del ácido nucléico que codifica dicha proteína p19
H-Ras de mamífero o forma mutada de la misma con
actividad alterada, localizados respecto a dicho ácido nucléico de
tal manera que permiten la expresión de dicho ácido nucléico que
codifica dicha proteína p19 H-Ras de mamífero o
forma mutada de la misma con actividad alterada.
13. Vector según cualquiera de las
reivindicaciones 10 ú 11, en el que dicho vector es un vector
adaptado para su expresión en una célula de levadura que comprende
los elementos reguladores necesarios para la expresión en dicha
célula de levadura del ácido nucléico que codifica dicha proteína
p19 H-Ras de mamífero o forma mutada de la misma con
actividad alterada, localizados respecto a dicho ácido nucléico de
tal manera que permiten la expresión de dicho ácido nucléico que
codifica dicha proteína p19 H-Ras de mamífero o
forma mutada de la misma con actividad alterada.
14. Vector según cualquiera de las
reivindicaciones 10 ú 11, en el que dicho vector es un vector
adaptado para su expresión en una célula de mamífero que comprende
los elementos reguladores necesarios para la expresión en dicha
célula de mamífero del ácido nucléico que codifica dicha proteína
p19 H-Ras de mamífero o forma mutada de la misma con
actividad alterada, localizados respecto a dicho ácido nucléico de
tal manera que permiten la expresión de dicho ácido nucléico que
codifica dicha proteína p19 H-Ras de mamífero o
forma mutada de la misma con actividad alterada.
15. Una célula de mamífero que comprende un
vector según cualquiera de las reivindicaciones 10 ú 11 o un vector
según la reivindicación 14.
16. Una sonda de ácido nucléico que comprende
una molécula de ácido nucléico de, al menos, 13 nucleótidos capaz de
hibridar específicamente con una secuencia de nucleótidos incluida
dentro de la secuencia de una molécula de ácido nucléico definida
según los apartados a), b) o c) de la reivindicación 1.
17. Sonda de ácido nucléico según la
reivindicación 16, en la que dicho ácido nucléico se selecciona
entre ácido desoxirribonucleico y ácido ribonucleico.
18. Sonda de ácido nucléico según la
reivindicación 16, en la que dicho ácido nucléico es ARN.
19. Sonda de ácido nucléico según la
reivindicación 16, en la que la secuencia de nucleótidos comprende
oligonucleótidos degenerados.
20. Un oligonucleótido en sentido contrario
(antisense) cuya secuencia de nucleótidos comprende una secuencia de
nucleótidos capaz de unirse específicamente a una molécula de ARNm
codificada por una molécula de ácido nucléico definida según los
apartados a), b) o c) de la reivindicación 1, de manera que impida
la traducción de la molécula de ARNm.
21. Un oligonucleótido en sentido contrario
(antisense) cuya secuencia de nucleótidos comprende una secuencia de
nucleótidos capaz de unirse específicamente a una molécula de ADNc
según la reivindicación 6.
22. Un oligonucleótido en sentido contrario
(antisense) cuya secuencia de nucleótidos comprende una secuencia de
oligonucleótidos degenerados de un oligonucleótido en sentido
contrario (antisense) según cualquiera de las reivindicaciones 20 ó
21.
23. Oligonucleótido en sentido contrario
(antisense) según cualquiera de las reivindicaciones 20 a 22, cuya
secuencia de nucleótidos comprende análogos químicos de
nucleótidos.
24. Un método para detectar la expresión de una
proteína p19 H-Ras de mamífero que comprende obtener
ARN de células o tejidos de dicho mamífero, poner en contacto dicho
ARN con una sonda de ácido nucléico según cualquiera de las
reivindicaciones 16 a 19 bajo condiciones de hibridación, y detectar
la presencia de cualquier ARNm hibridado con dicha sonda, en donde
la presencia de ARNm hibridado con dicha sonda es indicativa de la
expresión de proteína p19 H-Ras de mamífero en
dichas células o tejidos de mamífero.
25. Un método para la detección de la expresión
específica de una proteína p19 H-Ras de mamífero en
una célula o tejido de mamífero por hidridización in situ,
que comprende poner en contacto dicha célula o tejido con una sonda
de ácido nucléico según cualquiera de las reivindicaciones 16 a 19,
o bien con un oligonucleótido en sentido contrario (antisense) según
cualquiera de las reivindicaciones 20 a 23 bajo condiciones de
hibridación, y detectar la presencia de cualquier ARNm hibridado con
dicha sonda u oligonucleótido en sentido contrario (antisense), en
donde la presencia de ARNm hibridado con dicha sonda o con dicho
oligonucleótido es indicativa de la expresión de proteína p19
H-Ras de mamífero.
26. Un método para la detección de un gen que
codifica una proteína p19 H-Ras de mamífero, por
homología de secuencias de ácidos nucléicos, que comprende el empleo
de una sonda de ácido nucléico según cualquiera de las
reivindicaciones 16 a 19.
27. Un método para la detección de un gen que
codifica una proteína p19 H-Ras de mamífero que
comprende el empleo de la reacción en cadena de la polimerasa para
obtener una molécula de ADN, por homología con la secuencia de una
molécula de ácido nucléico según la reivindicación 1, útil para
detectar un gen que codifica una proteína p19 H-Ras
de mamífero.
28. Molécula de ácido nucléico que comprende el
gen identificado por el método de cualquiera de las reivindicaciones
26 ó 27.
29. Un método para el aislamiento de una
molécula de ADN según la reivindicación 3, que comprende el
crecimiento de bacterias transformadas con un vector según la
reivindicación 10 que comprende el ADN de la reivindicación 3, la
lisis de las células transformadas y la purificación de dicho ADN a
partir de las células lisadas.
30. Un péptido o proteína codificado según la
molécula de ácido nucléico de cualquiera de las reivindicaciones 1 a
9.
31. Péptido según la reivindicación 30
codificado por una molécula de ácido nucléico definida en los
apartados a), b) o c) de la reivindicación 1.
32. Péptido según la reivindicación 31, cuya
secuencia de aminoácidos se selecciona del grupo formado por SEQ.
ID. NO: 9, SEQ. ID. NO: 10, SEQ. ID. NO: 11, SEQ. ID. NO: 12, SEQ.
ID. NO: 13, SEQ. ID. NO: 14, SEQ. ID. NO: 15 y SEQ. ID. NO: 16.
33. Proteína según la reivindicación 30
codificada por una molécula de ácido nucléico definida en el
apartado e) de la reivindicación 1.
34. Proteína según la reivindicación 33, cuya
secuencia de aminoácidos es la definida en la SEQ. ID. NO: 17.
35. Un método para la obtención de una proteína
p 19 H-Ras de mamífero, según cualquiera de las
reivindicaciones 33 ó 34, que comprende inducir células que expresan
dicha proteína a expresar dicha proteína p 19 H-Ras
de mamífero, recuperar dicha proteína p 19 H-Ras de
mamífero de las células resultantes, y purificar dicha proteína p19
H-Ras de mamífero recuperada.
36. Un método para la obtención de una proteína
p19 H-Ras de mamífero, según cualquiera de las
reivindicaciones 30, 33 ó 34, que comprende insertar una molécula de
ácido nucléico definida en el apartado d) de la reivindicación 1 que
codifica dicha proteína p19 H-Ras de mamífero, en un
vector, insertar el vector resultante en una célula huésped,
recuperar dicha proteína p19 H-Ras de mamífero
producida por la célula resultante, y purificar dicha proteína p19
H-Ras de mamífero recuperada.
37. Una proteína de fusión que comprende una
proteína p19 H-Ras codificada por una molécula de
ácido nucléico definida en el apartado d) de la reivindicación 1,
fusionada a una segunda secuencia polipeptídica.
38. Proteína de fusión según la reivindicación
37, en el que dicha proteína p19 H-Ras tiene la
secuencia de aminoácidos definida en la SEQ. ID. NO: 17.
39. Un anticuerpo seleccionado entre un
anticuerpo dirigido contra una proteína p19 H-Ras de
mamífero según la reivindicación 33 ó 34, y un anticuerpo dirigido
contra un péptido según cualquiera de las reivindicaciones 30 a
32.
40. Anticuerpo según la reivindicación 39, en el
que dicho anticuerpo es un anticuerpo monoclonal.
41. Un mamífero no humano transgénico, cuyo
genoma comprende una molécula de ácido nucléico según cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 9, en el que dicha molécula de ácido
nucléico es una molécula de ácido nucléico humano.
42. Un mamífero no humano transgénico, cuyo
genoma comprende una molécula de ácido nucléico según cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 7, en el que dicha molécula de ácido
nucléico es una molécula de ácido nucléico humano que está dispuesta
de manera que se transcribe en un ARNm en sentido contrario
(antisense) complementario del ARNm que codifica una proteína p19
H-Ras humana y se hibrida con el ARNm que codifica
una proteína p 19 H-Ras humana para reducir su
traducción.
43. Mamífero no humano transgénico según
cualquiera de las reivindicaciones 41 ó 42, en el que la molécula de
ácido nucléico comprende, además, un promotor inducible.
44. Mamífero no humano transgénico según
cualquiera de las reivindicaciones 41 ó 42, en el que la molécula de
ácido nucléico comprende, adicionalmente, elementos reguladores
específicos de tejido.
45. Mamífero no humano transgénico según
cualquiera de las reivindicaciones 41 ó 42, en el que dicho mamífero
no humano transgénico es un ratón.
46. Empleo de una proteína p19
H-Ras de mamífero según la reivindicación 33 ó 34, o
de una proteína de fusión según la reivindicación 37 ó 38, en la
elaboración de un medicamento para el tratamiento del cáncer.
47. Empleo de un anticuerpo según cualquiera de
las reivindicaciones 39 ó 40, o de un conjugado derivado de dicho
anticuerpo o de un fragmento derivado de dicho anticuerpo, en la
elaboración de una composición para matar células que tengan un
crecimiento descontrolado.
48. Un test para diagnosticar una enfermedad en
la que los niveles de expresión de la proteína p19
H-Ras están alterados que comprende el empleo de un
anticuerpo según cualquiera de las reivindicaciones 39 ó 40.
49. Un método para detectar la proteína p 19
H-Ras de mamífero que comprende el empleo de un
anticuerpo según cualquiera de las reivindicaciones 39 ó 40.
50. Empleo de un mamífero no humano transgénico
según cualquiera de las reivindicaciones 41-45 como
modelo para predecir o evaluar posibles aplicaciones terapéuticas de
drogas que activan o inhiben la función de la proteína p 19
H-Ras de mamífero mediante la inducción o inhibición
de la expresión del gen nativo o del transgén.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| ES200200900A ES2242460B1 (es) | 2002-04-08 | 2002-04-08 | Acido nucleico que codifica una proteina p19 h-ras de mamifero y su exon idx,peptidos y proteinas codificados por dicho acido nucleico,y sus aplicaciones. |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| ES200200900A ES2242460B1 (es) | 2002-04-08 | 2002-04-08 | Acido nucleico que codifica una proteina p19 h-ras de mamifero y su exon idx,peptidos y proteinas codificados por dicho acido nucleico,y sus aplicaciones. |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| ES2242460A1 ES2242460A1 (es) | 2005-11-01 |
| ES2242460B1 true ES2242460B1 (es) | 2007-03-01 |
Family
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Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| ES200200900A Withdrawn - After Issue ES2242460B1 (es) | 2002-04-08 | 2002-04-08 | Acido nucleico que codifica una proteina p19 h-ras de mamifero y su exon idx,peptidos y proteinas codificados por dicho acido nucleico,y sus aplicaciones. |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| ES (1) | ES2242460B1 (es) |
-
2002
- 2002-04-08 ES ES200200900A patent/ES2242460B1/es not_active Withdrawn - After Issue
Non-Patent Citations (2)
| Title |
|---|
| BASE DE DATOS EMBL, Hinxton, UK, 01.06.2001. STRAUSBERG, R.L. et al. "V-Ha-ras Harvey rat sarcoma viral oncogene homolog, isoform 2 (P19H-Ras IDX protein)". Nº de acceso Q9BR65, resumen. * |
| CODONY, C. et al. "Modulation in vitro of H-ras oncogene expression by trans-splicing". ONCOGENE. 2001. Vol. 20, páginas 3683-3694, todo el documento. * |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| ES2242460A1 (es) | 2005-11-01 |
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Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| EC2A | Search report published |
Date of ref document: 20051101 Kind code of ref document: A1 |
|
| FG2A | Definitive protection |
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|
| FA2A | Application withdrawn |
Effective date: 20071001 |