ES2254977T3 - Ensayo de fosfomidasas. - Google Patents
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Abstract
Uso de al menos uno de los sustratos seleccionados del grupo consistente en FDP, DDAO, DiFMUP, fosfato ELF®39 y fosfato ELF®97 para la caracterización y determinación cualitativa y/o cuantitativa de la actividad de una fosfoamidasa mediante la detección de la hidrólisis de enlaces fosfoéster (P-O).
Description
Ensayo de fosfoamidasas.
La presente invención se refiere al uso de
compuestos y a métodos para la detección, caracterización y
determinación cualitativa y/o cuantitativa de la actividad de
fosfoamidasas o fosfoamidasas proteicas específicas para hidrolizar
enlaces fosfoamida (P-N) de aminoácidos básicos
N-fosforilados tales como fosfolisina, fosfoarginina
y fosfohistidina o de péptidos que comprenden dichos aminoácidos
fosforilados.
La comunicación entre células individuales en
organismos multicelulares es esencial para la regulación y
coordinación de procesos celulares complejos tales como
crecimiento, diferenciación, migración y apoptosis. Las redes de
transducción de señales que median dichos mecanismos biológicos
utilizan la fosforilación de proteínas reversible como una
herramienta fundamental. De acuerdo con una estimación modesta,
alrededor de un tercio de las proteínas conocidas pueden ser
fosforiladas en eucariotas. En las pasadas décadas se reveló que una
multitud de ciclos reguladores están interconectados íntimamente a
través de sustratos de solapamiento y la regulación mutua de
quinasas y fosfatasas por vía de fosforilación/desfosforilación por
otras quinasas y fosfatasas, respectivamente (Cohen, P. (2000)
Trends Biochem. Sci. 25, 596-601). La
desregulación de la desfosforilación enzimática causará importantes
malfunciones que serán por tanto causantes de enfermedades.
Las fosfatasas proteicas quedan agrupadas de
acuerdo con su actividad sobre los diversos
fosfo-aminoácidos, concretamente sobre los
aminoácidos fosforilados más prominentes: serina (Ser), treonina
(Thr) y tirosina (Tyr). Sin embargo, es necesario considerar otros
aminoácidos como fosfo-derivados relevantes,
concretamente histidina (His), lisina (Lys), cisteína (Cys), ácido
aspártico (Asp) y ácido glutámico (Glu). La clasificación
sistemática de quinasas concierne a la naturaleza de los aminoácidos
aceptadores de fosfato, por ejemplo de si se forma un fosfato
éster, tioéster, fosfoamidato o fosfato carboxilato anhídrido
(Matthews, H.R. & Chan, K. (2001) Methods Mol. Biol.
124: 171-182).
Una exposición general acerca de la fosfoamidasa
de clase enzimática puede encontrarse en la página de Internet
(<URL:
http.brenda.uni.koeln.de/php/result_flat.php3?ecno=3.9.1.1.), en
donde se muestra la actividad y especificidad de fosfoamidasas que
abarcan diferentes especies junto con citas bibliográficas.
Los fosfo-aminoácidos His, Asp,
Glu, Lys y Cys muestran distintas propiedades químicas tales como
labilidad por ácidos e inversión fisiológica más rápida que se
emplean comúnmente para la caracterización (Sickmann, A. &
Meyer, H.E. (2001) Proteomics 1,
200-206). Hasta ahora, los
fosfo-aminoácidos menos abundantes aparecieron
predominantemente en procesos celulares de bacterias, plantas
(Chang, C. & Meyerowitz, E.M. (1995) Proc. Natl. Acad. Sci.
USA 92, 4129-4133) y eucariotas
inferiores (Huang, J.M. et al. (1991) J. Biol. Chem.
266, 9023-9031). Debido a sus enlaces
fosfato de alta energía, los mismos se emplean en reacciones de
fosfotransferencia rápida, tal como el sistema de dos componentes y
la señalización de fosfo-transmisión (West, A.H.
& Stock, A.M. (2001) Trenes Biochem. Sci. 26,
369-376).
Más recientemente, se identificó que la
fosforilación de histidina contribuía a procesos reguladores en
vertebrados, tal como la estimulación de plaquetas humanas
(Crovello, C.S. et al. (1995) Cell 82,
279-286) o la función reguladora de anexina I
(Muimo, R. et al. (2000) J. Biol. Chem. 275,
36632-36636). Otro ejemplo bien establecido es la
fosforilación reguladora de ATP-citrato liasa por el
nucleósido difosfato quinasa (NDPK) (Wagner, P.D. & Vu, N.D.
(1995) J. Biol. Chem. 270,
21758-21764). Sin embargo, raramente se describen
fosfoamidasas proteicas que actúan específicamente sobre
fosfo-amidatos en proteínas tales como proteínas
fosforiladas de histidina. La primera evidencia de dicha actividad
de tipo fosfoamidasa se comprobó como una función adicional de PP1
y PP2A cuando actúan sobre P-His histona 4 (Kim, Y.
et al. (1993) J. Biol. Chem. 268,
18513-18518; Kim, Y. et al. (1995)
Biochim. Biophys. Acta 1268, 221-228).
Aunque se sabe que el fosfato de histidina está presente en
mamíferos (Crovello, C.S. et al. (1995) Cell,
82, 279-286), no ha sido posible hasta la
fecha identificar cualquiera de las correspondientes quinasas o de
las fosfoamidasas relevantes. Una proteína con actividad de
fosfoamidasa específica asignada, que reconoce entre otros sustratos
P-His-NDPK pero que no hidroliza
sustratos O-fosforilados, fue aislada a partir de
hígado bovino pero no se ha publicado ninguna identidad de
secuencias (Hiraishi, H. et al. (1999) J. Biochem.
(Tokyo) 126, 368-374). Además, se ha
descrito una fosfoamidasa de 17-kDa que es
específica únicamente para Arg fosforilada y que está libre de la
actividad que hidroliza compuestos O-fosforilados
(Kuba, M. et al. (1992) Eur. J. Biochem. 208,
747-752; Yokohama, K., et al. (1993) J.
Biochem. 113, 236-240; Kumon, A. et
al. (1996) J. Biochem. 119,
719-724).
Una fosfoamidasa proteica específica para
hidrolizar residuos de histidina N-fosforilada en
péptidos o proteínas y que no tiene actividad para hidrolizar
péptidos o proteínas O-fosforilados es PHP1 (WO
00/52175; Ek, P. et al (2002) Eur. J. Biochem.
269, 5016-5023).
Al objeto de entender el papel fisiológico de las
fosfoamidasas y ser capaces de interaccionar con situaciones
pato-fisiológicas, es importante identificar de
manera inequívoca la especificidad por sustratos enzimáticos de una
fosfoamidasa y desarrollar herramientas para interferir por medio de
una inhibición o activación de la enzima.
Dentro del significado de la presente invención,
el término "fosfoamidasa" define una enzima que hidroliza
enlacea fosfoamida (P-N) de aminoácidos básicos
fosforilados tales como P-His,
P-Lys, P-Arg, o de péptidos o
proteínas que comprenden estos aminoácidos fosforilados y que está
desprovista de actividad hidrolizante de proteínas o péptidos
O-fosforiladas. Ejemplos de dichas fosfoamidasas
dentro del significado de la presente invención se describen en
Hiraishi, H. et al. (1999) J. Biochem. (Tokyo)
126, 368-374, Kuba, M. et al. (1992)
Eur. J. Biochem. 208, 747-752 y WO
00/52175.
Dentro del significado de la presente invención,
el término "fosfoamidasa proteica" describe una fosfoamidasa
que hidroliza enlaces fosfoamida (P-N) de
aminoácidos básicos fosforilados, tales como P-His,
P-Lys o P-Arg, únicamente dentro de
péptidos o proteínas y que está desprovista de actividad
hidrolizante de proteínas o péptidos
O-fosforiladas. Un ejemplo de dicha fosfoamidasa
proteica dentro del significado de la presente invención es la
fosfoamidasa proteica específica a histidina-fosfato
PHP1 descrita en WO 00/52175.
Dentro del significado de la presente invención,
el término "histidina-fosfoamidasa proteica"
define una fosfoamidasa proteica específica para hidrolizar
histidina fosforilada dentro de péptidos o proteínas. Un ejemplo
dentro del significado de la presente invención es PHP1 descrita en
WO 00/52175.
Dentro del significado de la presente invención,
el término "fosfatasa" define una enzima que hidroliza enlaces
fosfoéster (P-O) de aminoácidos fosforilados tales
como P-Thr, P-Ser o
P-Tyr, o de péptidos o proteínas que comprenden
estos aminoácidos fosforilados. Estas enzimas pueden tener además
una actividad de fosfoamidasa.
Dentro del significado de la presente invención,
el término "fosfatasa proteica" define una fosfatasa que
hidroliza enlaces fosfoéster (P-O) de aminoácidos
fosforilados, tales como P-Thr,
P-Ser o P-Tyr, únicamente dentro de
péptidos o proteínas. Estas enzimas pueden tener además una
actividad de fosfoamidasa. Ejemplos de fosfatasas proteicas dentro
del significado de la presente invención son PP1, PP2A y PP2C (Kim,
Y. et al. (1993) J. Biol. Chem. 268,
18513-18518).
Dentro del significado de la presente invención,
el término "actividad de fosfoamidasa" define la hidrolización
de un enlace fosfoamida independientemente de si es hidrolizado por
una fosfoamidasa o por una fosfatasa.
Dentro del significado de la presente invención,
el término "actividad de una fosfoamidasa" define la
hidrolización de un enlace fosfoamida por una fosfoamidasa,
fosfoamidasa proteica o histidina fosfoamidasa proteica que está
desprovista de una actividad hidrolizante de enlaces fosfoéster
(P-O) de proteínas o péptidos fosforiladas.
Existe cierta bibliografía sobre métodos
bioquímicos adecuados para la detección de la desfosforilación de
fosfohistidina. Por ejemplo, el método con verde malaquita (Ohmori,
H. et al. (1993) J. Biol. Chem. 268,
7625-7627; Ohmori, H. et al. (1994) J.
Biochem. 116, 380-385) ha sido empleado
para identificar actividad de fosfoamidasa para
6-fosfolisina y 3-fosfohistidina. El
P_{i} liberado fue analizado por adición sucesiva de verde
malaquita y ácido cítrico. La absorbancia del complejo
fosfato/molibdato fue medida a 630 nm (Kuba, M. et al. (1992)
Eur. J. Biochem. 208, 747-752). Sin
embargo, este ensayo puede interferir fuertemente con la labilidad
ácida de sustratos fisiológicos de fosfoamidasa. La
6-fosfolisina, la 3-fosfohistidina y
los correspondientes aminoácidos desfosforilados se han
identificado mediante electrofóresis de capa fina sobre celulosa y
tinción con ninhidrina o reactivo de Rosenberg.
Empleando histona
histidina-fosforilada H4 marcada con ^{32}P, se ha
demostrado que las fosfatasas proteicas PP1, PP2A y PP2C tienen una
actividad de fosfoamidasa proteica para histidina además de su
actividad de Ser-, Thr- o Tyr-fosfatasa (Kim, Y.
et al. (1993) J. Biol. Chem. 268,
18513-18518; Matthews, H.R. & MacKintosh, C.
(1995) FEBS Lett. 364, 51-54; Kim, Y.
et al. (1995) Biochim. Biophys. Acta, 1268,
221-228). La actividad de fosfoamidasa para
histidina fue detectada por incubación de [^{32}P]histona 4
con fosfatasa y posterior electrofóresis en acrilamida de la mezcla
de reacción y autorradiografía del gel. Para el análisis
cuantitativo, se separó el ^{32}P_{i} liberado de la
[^{32}P]histona 4 por ultracentrifugado y el resto del
fosfato unido a histona fue cuantificado por conteo de
centelleo
líquido.
líquido.
Otro ensayo respecto a la actividad de una
His-fosfoamidasa proteica ha sido descrito en WO
00/52175 empleando como sustrato CheA histidina fosforilada marcada
con ^{32}P. La CheA es una histidina autoquinasa bacteriana
recombinante (Bilwes, A.M. et al. (1999) Cell,
96, 131-134). El fosfato libre ha sido
identificado por cromatografía de capa fina por vía de molibdato
amónico o por autorradiografía, respectivamente.
Otra posibilidad de detectar fosfato inorgánico
ha sido descrita en WO 95/02825 y Brune et al. 1994
(Biochemistry (1994) 33, 8262-8271).
Este ensayo está basado en el cambio rápido de las características
de fluorescencia de MDCC-PBP, que es la proteína de
unión a fosfato de E. coli (PBP) marcada con
N-[2-(1-maleimidil)etil]-7-(dietilamino)cumarin-3-carboxamida
(MDCC), un marcador fluorescente detectable.
Sin embargo, debido a que los métodos mencionados
anteriormente no pueden ser empleados en un ensayo continuo, o bien
son de larga duración y/o generan residuo radiactivo, los mismos no
se pueden aplicar bien en pruebas HTS (Evaluación de Alto
Rendimiento). Por tanto, existe la necesidad de disponer de otros
ensayos de fosfoamidasas proteicas y fosfoamidasas que puedan ser
realizados fácilmente y que puedan aplicarse en pruebas HTS.
La presente invención se refiere al uso de los
compuestos FDP (difosfato de fluoresceína), DDAO
(9H-(1,3-dicloro-9,9-dimetil-acridin-2-ona-7-il)fosfato),
DiFMUP (fosfato de
6,8-difluor-4-metilum-beliferilo),
fosfato ELF®39
(2-(2'-fosfofenil)-4-(3H)-quinazolinona) y fosfato ELF®97 (2-(5'-cloro-2'-fosfofenil)-6-cloro-4-(3H)-quina-
zolinona) (compuestos todos ellos suministrados por Molecular probes, Inc., Eugene Oreg.), para la detección, caracterización y determinación cualitativa y/o cuantitativa de la actividad de fosfoamidasas o fosfoamidasas proteicas independientemente de la disponibilidad de un sustrato fisiológico, el cual suele ser desconocido para nuevas enzimas. Dichos compuestos son de interés con respecto a caracterizar el papel fisiológico de fosfoamidasas o
fosfoamidasas proteicas y a identificar de manera inequívoca su especificidad por el sustrato enzimático, así
como con respecto al desarrollo de herramientas para interferir por medio de una inhibición o activación de la
enzima.
(2-(2'-fosfofenil)-4-(3H)-quinazolinona) y fosfato ELF®97 (2-(5'-cloro-2'-fosfofenil)-6-cloro-4-(3H)-quina-
zolinona) (compuestos todos ellos suministrados por Molecular probes, Inc., Eugene Oreg.), para la detección, caracterización y determinación cualitativa y/o cuantitativa de la actividad de fosfoamidasas o fosfoamidasas proteicas independientemente de la disponibilidad de un sustrato fisiológico, el cual suele ser desconocido para nuevas enzimas. Dichos compuestos son de interés con respecto a caracterizar el papel fisiológico de fosfoamidasas o
fosfoamidasas proteicas y a identificar de manera inequívoca su especificidad por el sustrato enzimático, así
como con respecto al desarrollo de herramientas para interferir por medio de una inhibición o activación de la
enzima.
En otro aspecto, la invención se refiere a
métodos para la identificación de una sustancia de ensayo como un
inhibidor o activador de fosfoamidasas y/o fosfoamidasas proteicas.
Dicho método puede comprender las etapas de:
- a)
- establecer una muestra que comprende la fosfoamidasa o fosfoamidasa proteica y una sustancia de ensayo,
- b)
- administrar FDP, DDA, DiFMUP, fosfato ELF®39 y fosfato ELF®97 a la muestra,
- c)
- detectar la señal producida por el sustrato y
- d)
- identificar la sustancia de ensayo como un activador o inhibidor de la fosfoamidasa o fosfoamidasa proteica a través de la comparación de la señal producida en la muestra que comprende la sustancia de ensayo con la señal producida en una muestra de control que no comprende sustancia de ensayo.
Otra modalidad de la invención consiste en
proporcionar métodos para la detección de fosfoamidasas en geles
naturales, geles SDS o transferencias de los mismos por incubación
de los geles o transferencias con fosfato ELF®39 y/o fosfato ELF®97
después de la electrofóresis y detección de la fluorescencia
producida por los sustratos después de la reacción con las enzimas,
por ejemplo, mediante un iluminador UV de sobremesa estándar.
Por otro lado, la presente invención proporciona
métodos para identificar inhibidores o activadores específicos para
una fosfoamidasa distinta en una muestra que comprende otras
fosfoamidasas o fosfatasas por incubación de
los geles o transferencias después de la electrofóresis con la sustancia a ensayar y posteriormente con fosfato
ELF®39 y/o fosfato ELF®97. La especificidad del inhibidor se puede determinar comparando las señales
producidas en el gel incubado con la sustancia de ensayo con las señales en un gel de control sin sustancia de
ensayo.
los geles o transferencias después de la electrofóresis con la sustancia a ensayar y posteriormente con fosfato
ELF®39 y/o fosfato ELF®97. La especificidad del inhibidor se puede determinar comparando las señales
producidas en el gel incubado con la sustancia de ensayo con las señales en un gel de control sin sustancia de
ensayo.
Otros objetos de la presente invención resultarán
evidentes para el experto en la materia en base a la siguiente
descripción detallada.
Figura 1: Dependencia del pH de las velocidades
de reacción iniciales de la conversión de sustratos fluorogénicos y
cromogénicos por PHP1.
Figura 2: Medición de resolución en el tiempo de
fosfato liberado a partir de fosfopéptidos por fosfatasa alcalina
(AP) (diagrama de la izquierda) y PHP1 (diagrama de la derecha). La
señal de fluorescencia se convierte en concentración de sustrato
empleando un factor de normalización derivado de la curva de
valoración estándar de fosfato inorgánico con proteína de unión a
fosfato fluorescente.
Figura 3: Detección de la actividad de fosfatasa
empleando el ensayo con verde malaquita para la reacción de
LAR-PTP (diagrama de la izquierda ) y de PHP1
(diagrama de la derecha) con fosfopéptidos.
Figura 4: Análisis espectrométrico de masas del
producto de reacción de la incubación de fosfopéptidos con
fosfatasas/fosfoamidasas individuales. La pérdida de masa de 80 Da
indica la escisión enzimática de fosfato del péptido pS por
\lambdaPP y AP.
Figura 5: Análisis espectrométrico de masas del
producto de reacción de la incubación de fosfopéptidos con
fosfatasas/fosfoamidasas individuales. La pérdida de masa de 80 Da
indica la escisión enzimática de fosfato del péptido pT por
\lambdaPP y AP.
Figura 6: Análisis espectrométrico de masas del
producto de reacción de la incubación de fosfopéptidos con
fosfatasas/fosfoamidasas individuales. La pérdida de masa de 80 Da
indica la escisión enzimática de fosfato del péptido pY1 por
Lar-PTP y AP.
Figura 7: Análisis cinético de la conversión de
DiFMUP por PHP1:
- a)
- Incremento de fluorescencia debido a la desfosforilación de DiFMUP en diversas concentraciones de sustrato (en \muM). El incremento de la señal de fluorescencia inicial se debe a la fluorescencia de fondo del sustrato sin reaccionar.
- b)
- Correlación de la fluorescencia relativa con la concentración de sustrato totalmente convertido para fines de cuantificación.
- c)
- Gráfico de Leneweaver-Burk de las velocidades iniciales invertidas versus concentración invertida de DiFMUP con ajuste lineal.
- d)
- Gráfico de Michaelis-Menten de las velocidades de reacción iniciales versus la concentración de sustrato. La correlación lineal no permite el ajuste no lineal de la curva que se deriva del parámetro de Michaelis-Menten.
Figura 8: Análisis cinético de la conversión de
FDP por PHP1:
- a)
- Incremento de fluorescencia debido a la desfosforilación de FDP en diversas concentraciones de sustrato (en \muM). El incremento de la señal de fluorescencia inicial se debe a la fluorescencia de fondo del sustrato sin reaccionar.
- b)
- Correlación de la fluorescencia relativa con la concentración de sustrato totalmente convertido para fines de cuantificación.
- c)
- Gráfico de Leneweaver-Burk de las velocidades iniciales invertidas versus concentración invertida de FDP con ajuste lineal.
- d)
- Gráfico de Michaelis-Menten de las velocidades de reacción iniciales versus la concentración de sustrato. La correlación hiperbólica permite el ajuste no lineal de la curva que se deriva del parámetro de Michaelis-Menten.
Figura 9: Gráfico de la concentración de
inhibidor versus la lectura de DiFMUP después de un tiempo de
reacción de 5 minutos a una concentración de PHP1 de 0,1
\muM.
Figura 10: Transferencia de manchas con dilución
en serie de PHP1 (5 \mug, 2,5 \mug, 1,3 \mug, 0,6 \mug, 0,3
\mug, 0,15 \mug, 0,08 \mug, 0,04 \mug) y
Lar-PTP (1 \mug, 0,5 \mug, 0,25 \mug, 0,13
\mug, 0,06 \mug, 0,03 \mug, 0,015 \mug, 0,08 \mug).
Figura
11:
- a)
- Imagen de SDS-PAGEs después de la separación de I) AP, II) PHP1 y III) Lar-PTP (cada una 5 \mug) y posterior renaturalización e impregnación con sustratos fluorogénicos (fosfato ELF®39 y fosfato ELF®97). El primer carril fue cargado con marcador de proteínas pre-teñido que exhibe auto-fluorescencia.
- b)
- Imagen de transferencias de tipo Western correspondientes a los SDS-PAGEs mostrados en la figura 8a) después de la separación de a) AP, b) PHP1 y c) Lar-PTP (cada una 5 \mug) y posterior renaturalización e impregnación con sustratos fluorogénicos (fosfato ELF®39 y fosfato ELF®97). El primer carril se cargó con marcador de proteínas pre-teñido que exhibe auto-fluorescencia.
En general, los ensayos para la determinación de
la actividad de fosfatasa proteica están basados frecuentemente en
la determinación del fosfato inorgánico liberado de los sustratos
cromogénicos o fluorogénicos.
Varias fosfatasas reconocen ésteres mono- o
difosfato de pequeños compuestos fluoróforos o cromóforos como
sustratos artificiales, escinden los enlaces éster fosfato y con
ello liberan el fluoróforo o cromóforo respectivamente. Estos
sustratos tienen un fluoróforo o cromóforo con mitades hidroxilo en
común que forman un enlace éster con un grupo fosfato. Los mismos
se emplean frecuentemente en ensayos de fosfatasas, por ejemplo para
fosfatasa alcalina (AP) o PP2A. La actividad de fosfatasas es
seguida por la mayor respuesta de fluorescencia o absorción del
producto de reacción. Debido a diferentes propiedades químicas tal
como el valor pKa del éster fosfato, los sustratos DiFMUP (fosfato
de
6,8-difluor-4-metilum-beliferilo)
(Gee, K.R. et al. (1999) Anal. Biochem. 273,
41-48), MUP (fosfato de
4-metilumbeliferilo) (Anthony, F.A. et al.
(1986) Anal. Biochem. 155, 103-107;
Rietz, B. & Guilbault, G.G. (1975) Clin. Chem. 21,
1791-1794), DDAO
(9H-(1,3-dicloro-9,9-dimetil-acridin-2-ona-7-il)fosfato)
(Leira, F. et al. (2000) Toxicon 38,
1833-1844), FDP (difosfato de fluoresceína) (Huang,
Z. et al. (1999) J. Biomol. Screen. 4,
327-334), pNPP (fosfato de
para-nitrofenol) y DCAP (Osawa, S. et al.
(1995) Clin. Chem. 41, 200-203) son
compatibles con una amplia variedad de fosfatasas.
La histidina fosfoamidasa proteica PHP1 no
hidroliza enlaces fosfoéster (P-O) de proteínas o
péptidos fosforiladas (véase figuras 2-6) ni acepta
el éster fosfato pNPP, un sustrato comúnmente empleado de fosfatasas
tal como PP2A y fosfatasa ácida. También MUP, un sustrato de AP,
PP1, PP2A y fosfatasa ácida no es aceptado como sustrato por PHP1
(véase figura 1). Por tanto, resultó ser sorprendente que PHP1
acepte DiFMUP, un derivado fluorado de MUP, FDP, DDAO, fosfato
ELF®39 y fosfato ELF®97 (véase figuras 1 y 7 a 11) como sustratos
aunque estos compuestos sean ésteres fosfato así como pNPP y
MUP.
Por ejemplo, la figura 2 (diagrama de la
izquierda) muestra la reactividad de AP con los sustratos comúnmente
empleados y comercialmente disponibles para fosfatasas proteicas,
pY1 (Secuencia: RRLIEDAEpYAARG), pY2 (Secuencia: TSTEPQpYQPGENL),
pS (Secuencia: RRApSVA) y pT (Secuencia: KRpTIRR). Para la detección
del fosfato liberado de los péptidos, ha sido empleado el ensayo de
MDCC-PBP como se describe en los ejemplos. Los
péptidos de fosfo-tirosina pY1 y pY2 son
desfosforilados por AP con una velocidad (pmolPi/min) de 11 para pY1
y de alrededor de 12 para pY2 y una actividad específica
(nmol/min*mg) de alrededor de 33 para pY1 y de alrededor de 36 para
pY2. En un grado más pequeño, el péptido de
fosfo-serina pS es desfosforilado con una velocidad
de 3 y una actividad específica de 9. El péptido de
fosfo-treonina pT no es desfosforilado por AP.
Como se muestra en la figura 3 (diagrama de la
izquierda), la tirosina-fosfatasa proteica LAR
(LAR-PTP) desfosforila el péptido de
fosfo-tirosina pero no el péptido de
fosfo-serina ni el péptido de
fosfo-treonina. En estos experimentos, se ha
utilizado en ensayo con verde malaquita, como se describe en los
ejemplos, para la detección del fosfato liberado de los péptidos.
En fuerte contraste, empleando PHP1 como enzima (figuras 2 y 3,
diagramas de la derecha), la actividad desfosforilante no excede
del valor testigo aunque la concentración de enzima fue 30 veces
mayor que la de AP y 40 veces mayor que la de
LAR-PTP.
Estos resultados fueron verificados mediante el
uso de espectrometría de masas (véase figuras 4-6),
la cual es una herramienta poderosa para la identificación de
biopolímeros a través de sus masas individuales. Los sustratos de
fosfo-péptidos tienen masas de
700-1.500 Da y perderán 80 Da tras la escisión del
grupo fosfato. Esta diferencia de masa es fácilmente detectada con
una alta precisión en un espectrómetro MALDI-TOF.
Además, es un hecho bien aceptado que los péptidos desfosforilados
son detectados en los espectrómetros de masas más fácilmente que
sus contrapartidas fosforiladas (Sickmann, A. & Meyer, HE (2001)
Proteomics 1, 200-206). Por tanto,
podrá detectarse incluso una pequeña fracción de péptidos
convertidos en el caso de que el sustrato sea aceptado por la
respectiva fosfatasa. Otra ventaja de este método es que se controla
directamente la naturaleza de la entidad del sustrato. Incluso la
desfosforilación inducida por MALDI puede distinguirse fácilmente de
la desfosforilación enzimática en el caso de residuos de
fosfo-serina y -treonina, ya que la primera
producirá diferencias de masa de 98 Da en lugar de \Deltam = 80
Da en el último caso.
El análisis espectrométrico de masas demuestra
que el péptido pS fue reconocido como sustrato de fosfatasa por
\lambdaPP y AP pero no por Lar-PTP no por PHP1
(figura 4). Después de la incubación con cualquiera de \lambdaPP o
AP llega a desfosforilarse una fracción principal dentro del tiempo
de reacción y se puede detectar una especie con una masa reducida
en 80 Da correspondiente al péptido desfosforilado. El péptido pS
incubado con Lar-PTP o con PHP1 no se escinde en
absoluto. El análisis espectrométrico de masas demuestra que el
péptido pT fue reconocido como sustrato de fosfatasa únicamente por
\lambdaPP pero no por Lar-PTP ni por PHP1 o AP
(figura 5). Después de la incubación con \lambdaPP llega a
desfosforilarse una fracción importante dentro del tiempo de
reacción y se puede detectar una especie con una masa reducida en
80 Da correspondiente al péptido desfosforilado. El péptido pT
incubado con Lar-PTP, AP o PHP1 no cambia en
absoluto.
En contraste con los residuos de
fosfo-serina y -treonina, el péptido de
fosfo-tirosina exhibe una fracción importante de
especies desfosforiladas incluso en la muestra de control. El origen
de esta especie sigue siendo incierto, ya que la
fosfo-tirosina puede eliminar ácido fosfórico bajo
condiciones MALDI que representaría una pérdida de \Deltam = 80
Da. Esto es esencialmente la misma diferencia de masa observada
después de la escisión enzimática.
El análisis espectrométrico de masas demuestra
que el péptido pY fue reconocido como sustrato de fosfatasa por
Lar-PTP y AP pero no por \lambdaPP ni por PHP1
(figura 6). Después de la incubación con cualquiera de
Lar-PTP o AP, el péptido llega a desfosforilarse
por completo dentro del tiempo de reacción y se puede detectar una
especie con una masa reducida en 80 Da correspondiente al péptido
desfosforilado. El péptido pT incubado con \lambdaPP o PHP1 no
cambia en absoluto en comparación con la muestra de control.
En resumen, en ninguna de las mezclas de reacción
fue aceptado un fosfo-péptido como un sustrato para
PHP1 sino en realidad para las otras fosfatasas ensayadas con las
especificidades esperadas para el sustrato.
Como resultado del hallazgo de que los compuestos
DFP, DDAO, DiFMUP, fosfato ELF®39 y fosfato ELF®97 son sustratos
para fosfoamidasas y fosfoamidasas proteicas del tipo PHP1, la
presente invención proporciona ensayos enzimáticos continuos
fácilmente realizables para la determinación de fosfoamidasas y
fosfoamidasas proteicas.
Debido a que es bien conocido que el uso de
fosfo-fluoróforos del tipo DiFMUP, MUP, DDAO o FDP
como sustratos de fosfatasas presenta ciertas limitaciones como
consecuencia de la compatibilidad de los valores pKa del sustrato
con el valor óptimo de pH de la respectiva fosfatasa, ha de
determinarse la dependencia del pH de la reactividad de PHP1 hacia
los referidos sustratos fluorogénicos. Como se muestra en la figura
1, el pH es variado desde pH = 5-9 en etapas de 0,5
unidades de pH. Con el fin de evitar efectos indeseados de
aplanamiento de la fluorescencia como consecuencia de una alta
absorción por el producto de reacción que se acumula, la velocidad
de reacción inicial se utiliza como una medida relativa de la
dependencia del pH de la reactividad de PHP1 hacia el sustrato
seleccionado. Este enfoque proporciona resultados razonables para
MUP, DiFMUP y FDP pero no para DDAO incluso a una dilución de 25
\muM. Esto último, por tanto, puede proporcionar una alta
sensibilidad para la detección de trazas de actividad de fosfatasa,
pero no puede ser óptimo para utilizarse como un sustrato por
encima de bajas concentraciones en \muM, por ejemplo, para
estudios de cinética enzimática.
A partir de este experimento, llega a ser
evidente una selectividad clara por el sustrato de PHP1 hacia los
ésteres fosfato DiFMUP, DDAO, FDP empleados como sustratos. Como se
ha indicado anteriormente, el sustrato de fosfatasa artificial más
profusamente utilizado con pNPP de amplia capacidad de aplicación,
así como el sustrato típico de fosfatasa alcalina MUP, no son
reconocidos ni procesados pro PHP1 en cualquier valor pH. Las
curvas de valoración de los otros sustratos muestran formas muy
distintas que pueden reflejar tanto la dependencia del pH de la
reacción enzimática como las propiedades químicas, tal como el grado
de protonación de los fluoróforos. Los tres sustratos DiFMUP, FDP y
DDAO muestran todos ellos velocidades de inversión en incremento
medidas en sus longitudes de onda de emisión estándar cuando el pH
se cambia desde valor ácido a valor neutro con un máximo en pH =
6,5-7. Se sabe que el pH óptimo para PHP1 se
encuentra en un pH de alrededor de 6, pero un efecto de
superposición debido a la protonación del fluoróforo y cambio de las
propiedades espectrales resulta obvio a partir de un cambio de
color de todas las muestras en medio ácido. Si bien DiFMUP revela un
descenso en la velocidad de inversión en medios más alcalinos, la
inversión de DDAO permanece relativamente constante y la curva para
FDP exhibe un segundo máximo distinto. La causa de estas últimas
observaciones puede proceder de dos poblaciones de FDP mono y
doblemente desfosforilado con propiedades espectrales individuales
o del reconocimiento del sustrato por
PHP1.
PHP1.
En otros experimentos, se han determinado los
valores K_{M} de la reacción de PHP1 con DiFMUP y FDP (véase
figuras 7 y 8). Los valores K_{M} para DiFMUP y FDP pueden ser
aproximados registrando la velocidad de reacción inicial en función
de la concentración de sustrato, tal como se observa por el
incremento de la fluorescencia relativa en los respectivos máximos
de emisión de fluorescencia tras la adición de PHP1. La velocidad de
reacción de la conversión de DiFMUP y FDP por PHP1 depende
claramente de la concentración de sustrato. A partir de los
experimentos de valoración con sustrato totalmente convertido llega
a ponerse de manifiesto que se presenta una saturación de señal
dentro del intervalo de bajos valores de \muM, en particular para
el derivado de fluoresceína FDP. Este efecto limita el intervalo de
variación de sustrato. Para concentraciones de FDP >20 \muM, el
enfriamiento rápido de la señal perturba las mediciones de la
velocidad de la reacción de manera perjudicial. Sin embargo, el
análisis de datos empleando un ajuste no lineal de curvas con una
función hiperbólica permite deducir una constante de Michaelis de
K_{M} \approx 20 \muM con una alta inseguridad. Las mediciones
para DiFMUP quedan limitadas a concentraciones por debajo de 500
\muM. A pesar de este mayor intervalo para la variación del
sustrato no pudo observarse saturación en la velocidad de reacción
inicial ya que la correlación entre las velocidades y la
concentración de sustrato siguió siendo lineal. A partir del gráfico
de Lineweaver-Burk podría estimarse que el valor
K_{M} excedía de 1 mM. Por la bibliografía al respecto se conocen
valores K_{M} de 20 \muM, por ejemplo para la reacción
enzimática de tirosina fosfatasa de células T sobre DiFMUP (Kerby,
M. et al. (2001) Electrophoresis 22,
3916-3923). El mayor valor para la reacción de PHP1
sobre DiFMUP podría reflejar la aceptación de sustrato menos exacta
por PHP1 para sustratos de éster fosfato. A este respecto, FDP no es
comparable a DiFMUP ya que porta dos grupos fosfato y esto mejorará
con seguridad la interacción con el sustrato
enzimático.
enzimático.
Con el fin de ensayar si los sustratos de
fosfoamidasa y fosfoamidasa proteica de la presente invención son o
no adecuados para la identificación de inhibidores o activadores de
estas proteínas, se determinó la actividad de PHP1 con el sustrato
DiFMUP en presencia de
biperoxo-(bipiridina)-oxovanadato
[(bp)V(bipy)], un inhibidor bien caracterizado de
fosfo-tirosina fosfatasa proteica (figura 9). La
concentración de inhibidor varió de 0,01 a 30 \muM, la
concentración de enzima se mantuvo en 0,1 \muM y la concentración
de sustrato en 50 \muM. Después de incubación durante 15 minutos
a temperatura ambiente, se detectó la fluorescencia en 450 nm tras
la excitación a 360 nm. El ensayo proporcionó una inhibición de la
actividad de PHP1 para (bp)V(bipy), reproducible y
claramente dependiente de la dosis. De manera sorprendente, el
compuesto (bp)V(bipy) activó la actividad de PHP1 en
concentraciones equimolares en un factor de dos y mostró un efecto
inhibidor solo por encima de 10 \muM.
A partir de estos experimentos llega a ser
evidente que los sustratos de fosfoamidasa y fosfoamidasa proteica
FDP, DDAO, DiFMUP, fosfato ELF®39 y fosfato ELF®97 son adecuados
para la identificación de inhibidores o activadores de dichas
enzimas. Estos sustratos permiten la ejecución de ensayos
enzimáticos fácilmente realizables, ahorradores de tiempo y no
generadores de residuos radioactivos, aplicables también en pruebas
HTS.
Los compuestos fosfato ELF®39 y fosfato ELF®97
son sustratos fluorogénicos para fosfatasas alcalinas destinadas a
aplicarse en inmuno-transferencias y tinturas
histológicas de actividad enzimática. Estos sustratos presentan las
propiedades para convertirse en un precipitado insoluble fuertemente
fluorescente tras la escisión de fosfato en el lugar específico de
actividad de fosfatasa. Normalmente, la AP es detectada por la
conversión del sustrato debido a la alta actividad específica en
comparación con otras fosfatasas y a una amplia especificidad de
esta enzima por el sustrato.
De manera sorprendente, PHP1 reconoce ambos
sustratos fluorogénicos fosfato ELF®39 y fosfato ELF®97 como
sustratos. La figura 10 muestra una transferencia de manchas de una
dilución en serie de PHP1 y LAR-PTP después de la
posterior incubación con la solución de sustrato de fosfato
ELF®97.
Como queda demostrado en la figura 10, PHP1
muestra una señal distinta en cantidades enzimáticas por debajo de
100 ng incluso aunque se utilice un medio de detección relativamente
insensible. La producción del precipitado fluorescente en el lado
de la actividad de fosfoamidasa permite en principio cualquier tipo
de resolución espacial, pero no proporciona ninguna guía con
respecto a la naturaleza de la fosfoamidasa. La combinación de la
separación de proteínas por SDS-PAGE, elecrofóresis
en gel natural, electrofóresis 2D o focalización isoeléctrica con
la enzima puede soslayar este problema. Generalmente, la actividad
enzimática se detecta después de electrofóresis por extracción de
la enzima de la matriz de poliacrilamida o por conversión de
sustratos que han sido copolimerizados en la matriz de
poliacrilamida o que han migrado conjuntamente al gel con la
muestra de enzima. La impregnación del gel con pequeños sustratos
artificiales proporciona una alternativa que ya está siendo
utilizada pero con el frecuente inconveniente de que dichos
sustratos retienen un reverso soluble y difuso del gel a la
solución en bruto una vez que se convierten los mismos. El fosfato
ELF®39 y el fosfato ELF®97 representan sustratos únicos que cambian
no solo las propiedades espectrales sino también su solubilidad y,
por tanto, permanecen dentro del gel en donde está situada la
fosfatasa o fosfoamidasa. Un hecho importante es que las
fosfoamidasas han de ser renaturalizadas al menos para la parte del
dominio catalítico después de haberse realizado
SDS-PAGE o electrofóresis 2D
desnaturalizante.
desnaturalizante.
En los experimentos presentados en las figuras
11a) y 11b), han sido separadas muestras de a) AP, b) PHP1 y c)
Lar-PTP (cada una 5 \mug) sobre 10% NOVEX®
NuPAGE®. Tanto la SDS-PAGE como las transferencias
de tipo western demuestran que PHP1 experimentó la renaturalización
después de la separación y fue capaz de convertir los sustratos
fluorogénicos fosfato ELF®39 y fosfato ELF®97 a los precipitados
fluorescentes deseados. Estos precipitados se acumulan en el lugar
de la banda de proteína de PHP1 en el SDS Page, con el peso
molecular aparente esperado de 14 kDa (estimado a partir del
marcador de la proteína y contra-tinción con azul de
coomassie).
Con estos sustratos también es posible determinar
si un cierto inhibidor o activador actúa de forma específica solo
sobre una fosfoamidasa o fosfatasa en una muestra que comprende
otras fosfoamidasas o fosfatasas o si el inhibidor o activador
inhibe o activa varias fosfoamidasas o fosfatasas. Para ello, una
muestra que comprende varias fosfoamidasas y/o fosfatasas se
separa, por ejemplo, por electrofóresis en gel natural. A
continuación, el gel se equilibra en una primera etapa con el
inhibidor o activador y, en la segunda etapa, con el fosfato ELF®39
y/o fosfato ELF®97. La especificidad del inhibidor o activador se
puede determinar comparando la señal producida en el gel incubado
con el inhibidor o activador con las señales en un gel de control
sin la sustancia de ensayo. Por ejemplo, si la muestra separada por
electrofóresis en gel contiene cinco fosfatasas o fosfoamidasas
diferentes que reaccionan con fosfato ELF®39 y/o fosfato ELF®97, el
gel mostrará cinco manchas resultantes de la desfosforilación del
sustrato. Si se incuba un segundo gel con un inhibidor específico
para solo una de las fosfatasas o fosfoamidasas, la posterior
incubación con fosfato ELF®39 y/o fosfato ELF®97 se traducirá solo
en cuatro manchas. Comparando el gel que no contiene inhibidor con
el gel incubado con el inhibidor, se puede evaluar la especificidad
del inhibidor. Si en lugar de un gel natural se emplea un gel SDS o
IEF, ha de asegurarse que las proteínas de interés hayan sido
renatura-
lizadas.
lizadas.
Con el fin de evaluar la especificidad en
sustrato de PHP1 hacia otras secuencias de péptidos fosforilados,
se han seleccionados fosfo-péptidos sintéticos como
sustratos artificiales. Estos péptidos comercialmente disponibles
(Upstate Inc., Waltham, MA) son sustratos comúnmente utilizados para
fosfatasas proteicas que desfosforilan
fosfo-serina, fosfo-treonina o
fosfo-tirosina con las respectivas
sensibilidades:
| Nombre | Tipo de fosfopéptido | Secuencia | Fuente |
| pY1 | fosfopéptido de tirosina | RRLIEDAEpYAARG | Upstate Inc., Waltham, MA |
| pY2 | fosfopéptido de tirosina | TSTEPQpYQPGENL | Upstate Inc., Waltham, MA |
| PS | fosfopéptido de serina | RRApSVA | Upstate Inc., Waltham, MA |
| PT | fosfopéptido de treonina | KRpTIRR | Upstate Inc., Waltham, MA |
Las fosfatasas empleadas para estudios
comparativos de reconocimiento del sustrato son
LAR-PTP (tirosina fosfatasa LAR, recombinante),
\lambda-PP (fosfatasa proteica lambda,
recombinante) y AP (fosfatasa alcalina, intestino bovino).
Las concentraciones de enzima son ajustadas
individualmente para cada disposición experimental de manera que
las reacciones enzimáticas puedan ser controladas según un régimen
lineal en la escala de tiempo de segundos a minutos.
En una primera serie de experimentos, se compara
la reacción de fosfatasa de PHP1 con la de fosfatasa alcalina
empleando como sustratos los fosfopéptidos antes mencionados. Con el
fin de seguir la reacción de forma continua, se detecta la entidad
fosfato que fue escindida por la fosfatasa empleando la proteína de
unión a fosfato marcada con cumarilo MDCC-PBP (WO
95/02825; Brune et al. (1994) Biochemistry 33,
8262-8271) que es suministrada por el Medical
Research Council, London, UK. En una primera etapa, ha de
determinarse el nivel basal de fosfato libre en soluciones de
fosfo-péptido 40 \muM (en tampón de ensayo: 25 mM
Hepes pH 7,0, 1 mM MgCl_{2}, 20 mM NaCl, 0,01 mg/ml BSA) por
valoración versus una solución de proteína de unión a fosfato 4
\muM. Ninguna de las soluciones de péptidos excedió de 0,5 moles%
de fosfato libre/péptido. La reacción de fosfatasa/fosfoamidasa fue
realizada mezclando 50 \mul de solución de péptido (concentración
final 20 \muM) con 50 \mul de dilución con
MDCC-PBP 6 \muM en tampón de ensayo en microplacas
blancas a temperatura ambiente y por último añadiendo 50 \mul de
la solución de fosfatasa o fosfoamidasa. La concentración final de
las enzimas en la solución de ensayo es de 0,035 \muM para EP y
de 1 \muM para PHP1. Se mide el incremento de fluorescencia (Ex
425 nm; Em 465 nm) con resolución en el tiempo empleando un lector
de microplacas estándar.
La reacción enzimática de
Lar-tirosina fosfatasa proteica hacia los
fosfopéptidos es comparada con la de PHP1 empleando el ensayo
clásico con fosfato de malaquita. El fosfato inorgánico escindido
del sustrato péptido es detectado como un
co-complejo verde con molibdato y colorante de
malaquita. La reacción de fosfatasa es realizada mezclando 950
\mul de solución de péptido (concentración final 50 \muM) con 50
\mul de solución de fosfatasa/fosfoamidasa, habiendo sido
preparadas ambas soluciones madre en tampón de ensayo estándar (25
mM Hepes pH 7,0, 1 mM MgCl_{2}, 20 mM NaCl, 0,01 mg/ml BSA). La
concentración final de las enzimas en la solución de ensayo es de
0,025 \muM para Lar-PTP y 1 \muM para PHP1.
Después de intervalos de tiempo discretos se mezcló una muestra de
50 \mul de cada mezcla de reacción con la solución de detección
de molibdato/malaquita (BIOMOL) y se incubó a temperatura ambiente.
La liberación de fosfato fue identificada por el incremento de
absorción en 630 nm.
La mezcla de reacción fue preparada diluyendo el
sustrato de la solución madre 10 mM en DMSO en el tampón de
reacción acuoso consistente en 25 mM de sustancia tampón, 20 mM
NaCl, 1 mM MgCl_{2}, 0,1 mg/ml BSA para proporcionar una
concentración final de 100 \muM para MUP y DiFMUP o 25 \muM para
DDAO y FDP, respectivamente. Como sustancia tampón se utilizó
MES/NaOH para valores pH de 5,0, 5,5, 6,0, 6,5, mientras que se
utilizó Tris/HCl para valores pH de 7,0, 7,5, 8,0, 8,5, 9,0. Para
iniciar la reacción se añadió PHP1 a partir de una
pre-dilución en el respectivo tampón de reacción
para proporcionar una concentración final de 0,1 \muM. La reacción
fue controlada registrando el incremento de fluorescencia relativa
en los respectivos máximos de emisión de fluorescencia (lector de
microplacas Fluoromax Gemini XL).
La mezcla de reacción se prepara diluyendo el
sustrato a partir de una solución madre 10 mM en DMSO en el tampón
de reacción acuoso estándar (25 mM HEPES pH = 7,0, 20 mM NaCl, 1 mM
MgCl_{2}, 0,01 mg/ml BSA) para proporcionar una concentración
final de 1-400 \muM. Para iniciar la reacción, se
añadió PHP1 a partir de una solución madre a una concentración
final de 0,1 \muM. La reacción fue controlada registrando el
incremento de fluorescencia relativa en los respectivos máximos de
emisión de fluorescencia en un espectrómetro de fluorescencia SLM.
Para poder realizar la cuantificación, la señal de fluorescencia fue
normalizada empleando una curva estándar registrada para una
dilución en serie de DiFMUP y FDP totalmente desfosforiladas,
respectivamente. Todos los registros fueron realizados en el mismo
voltaje PM y tiempo de integración con corrección respecto a la
ganancia de señal relativa.
La disposición experimental es como sigue: el
sustrato de fosfo-péptidos se diluye a partir de
soluciones madre a concentraciones de 50 \muM y se mezcla con la
fosfatasa individual para proporcionar concentraciones de enzima
finales de 1 \muM PHP1, 0,05 \muM Lar-PTP, 0,05
\muM \lambdaPP y 0,05 \muM AP. La mezcla se incuba durante 2
horas a temperatura ambiente y por último se salpica en volúmenes
de 0,5 \mul sobre una diana de MALDI. Muy poco después, se añadió
la solución de matriz de ácido
alfa-hidroxi-cinámico y se dejaron
secar las gotitas. La espectrometría de masas fue realizada en un
espectrómetro MALDI-TOF en el modo reflectivo con
extracción retardada.
Las mezclas de reacción para la evaluación de
inhibidores fueron preparadas mediante dilución en serie dos veces
del inhibidor bpV(bipy) (Alexis Biochemicals San Diego)
comenzando a 60 \muM en 50 \mul del tampón de ensayo
consistente en 25 mM Hepes pH = 7, 20 mM NaCl, 1 mM MgCl_{2}, 0,01
mg/ml BSA. En la siguiente etapa, se añadieron 50 \mul de una
solución de 0,3 \muM PHP1 en tampón de ensayo a cada uno de los
pocillos y se incubó durante 5 minutos a temperatura ambiente. Con
el fin de iniciar la reacción, se añadió rápidamente a todos los
pocillos una pre-dilución de 50 \muM
DiFMUP-sustrato en tampón de ensayo. La reacción fue
controlada registrando el incremento de fluorescencia relativa en
los respectivos máximos de emisión de fluorescencia (lector de
microplacas Fluoromax Gemini XL). La actividad relativa se calculó
empleando el RFU derivado de una reacción de control sin
inhibidor.
Para demostrar la utilidad del fosfato ELF®39 y
del fosfato ELF®97 para la detección de fosfoamidasas proteicas y
fosfoamidasas, se diluyen PHP1 y LAR-PTP en serie en
un factor de 2 con tampón de ensayo (25 mM HEPES pH 7,0, 20 mM
NaCl, 1 mM MgCl_{2}, 0,1 mg/ml BSA) y se salpican 10 \mul de
cada dilución sobre una membrana de nitrocelulosa. Después de un
lavado breve (alrededor de 5 minutos) en tampón de ensayo, la
membrana se cubrió con una solución del respectivo sustrato
(dilución 1:20 de la solución madre suministrada) en tampón de
ensayo y se incubó durante al menos 1 hora o hasta que se había
desarrollado una señal estable. La fluorescencia es detectada en un
iluminador UV de sobremesa estándar (longitud de onda de excitación
normalmente 254 nm o 300-370 nm) o, para una mayor
selectividad de la señal, mediante sistemas de formación de imágenes
fluorescentes equipados con fuentes de luz de excitación y fibras
ópticas de paso estrecho que permiten compaginar de forma óptima
las propiedades espectrales de ELF®39 y ELF®97. Para la detección de
fosfoamidasa proteica en geles SDS, se separan AP, PHP1 y
Lar-PTP (cada una 5 \mug) en un sistema de
BisTris/gel MES NuPAGE® al 10% (Invitrogen®). La preparación de la
muestra se realizó añadiendo tampón de muestra SDS NuPAGE®
(Invitrogen®) a las soluciones enzimáticas y procediendo a la carga
inmediata sobre el gel esencialmente sin calentamiento previo.
Después de la separación, el gel fue utilizado directamente para la
detección o bien transferido sobre membrana de nitrocelulosa
empleando tampón de transferencia NuPAGE® (Invitrogen®)
esencialmente sin metanol. Los geles y transferencias se lavaron
entonces tres veces en salina tamponada con Tris, 1 mM MgCl_{2},
agitando suavemente durante 30 minutos a temperatura ambiente y
posterior incubación con una solución del respectivo sustrato
(dilución 1:20 de la solución madre suministrada) en tampón de
ensayo (25 mM HEPES pH 7,0, 20 mM NaCl, 1 mM MgCl_{2}, 0,1 mg/ml
BSA). Después de la incubación durante al menos 1 hora, la señal de
fluorescencia fue detectada como se ha descrito anteriormente.
Claims (10)
1. Uso de al menos uno de los
sustratos seleccionados del grupo consistente en FDP, DDAO, DiFMUP,
fosfato ELF®39 y fosfato ELF®97 para la caracterización y
determinación cualitativa y/o cuantitativa de la actividad de una
fosfoamidasa mediante la detección de la hidrólisis de enlaces
fosfoéster (P-O).
2. Uso según la reivindicación 1, en
donde la fosfoamidasa es una fosfoamidasa proteica.
3. Uso según la reivindicación 2, en
donde la fosfoamidasa proteica es una fosfoamidasa proteica de
histidina.
4. Uso según la reivindicación 3, en
donde la fosfoamidasa proteica de histidina es PHP1.
5. Método para la identificación de un
inhibidor o activador de una fosfoamidasa, que comprende las etapas
de:
- a)
- establecer una muestra que comprende una fosfoamidasa y una sustancia de ensayo,
- b)
- administrar a la muestra un sustrato seleccionado del grupo consistente en FDP, DDA, DiFMUP, fosfato ELF®39 y fosfato ELF®97,
- c)
- detectar la señal producida por la hidrólisis de los enlaces fosfoéster (P-O) del sustrato, y
- d)
- identificar la sustancia de ensayo como un activador o inhibidor de la fosfoamidasa a través de la comparación de la señal producida en la muestra que comprende la sustancia de ensayo con la señal producida en una muestra de control que no comprende sustancia de ensayo.
6. Método para la identificación de
la actividad de una fosfoamidasa en un gel de electrofóresis o
sobre una membrana de transferencia, que comprende las etapas
de:
- a)
- separar una muestra que comprende una fosfoamidasa en un gel,
- b)
- si es necesario, renaturalizar la fosfoamidasa,
- c)
- incubar el gel o la membrana de transferencia resultante de la transferencia del gel con fosfato ELF®39 y/o fosfato ELF®97 como sustrato, y
- d)
- detectar la señal producida por la hidrólisis de los enlaces fosfoéster (P-O) del sustrato.
7. Método según la reivindicación 6
para la determinación de la especificidad de un inhibidor o
activador para una cierta fosfoamidasa o fosfatasa, que comprende
las etapas de:
- a)
- separar una muestra que comprende varias fosfoamidasas en un gel,
- b)
- si es necesario, renaturalizar la fosfoamidasa,
- c)
- incubar el gel o la membrana de transferencia resultante de la transferencia del gel con el inhibidor o activador y posteriormente con fosfato ELF®39 y/o fosfato ELF®97 como sustrato, y
- d)
- determinar la especificidad del inhibidor o activador comparando la señal producida en el gel o membrana de transferencia incubado con el inhibidor o activador con la señal producida en un gel o membrana de transferencia de control que no se ha incubado con el inhibidor o activador.
8. Método según cualquiera de las
reivindicaciones 5 a 7, en donde la fosfoamidasa es una fosfoamidasa
proteica.
9. Método según la reivindicación 8,
en donde la fosfoamidasa proteica es una fosfoamidasa proteica de
histidina.
10. Método según la reivindicación 9, en
donde la fosfoamidasa proteica de histidina es PHP1.
Applications Claiming Priority (2)
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|---|---|---|---|
| EP02025128 | 2002-11-09 | ||
| EP02025128 | 2002-11-09 |
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|---|---|---|---|
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