ES2272673T3 - Detecciones para el diagnostico de la enfermedad de alzheimer. - Google Patents

Detecciones para el diagnostico de la enfermedad de alzheimer. Download PDF

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Abstract

Un método in vitro para el diagnóstico de la enfermedad de Alzheimer en una persona que comprende la identificación de la presencia de una anomalía en la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S en las células no neuronales de una persona.

Description

Detecciones para el diagnóstico de la enfermedad de Alzheimer.
Campo de la invención
La presente invención se refiere a detecciones para el diagnóstico de la enfermedad de Alzheimer, y en particular a las pruebas de diagnóstico basadas en la detección por la presencia de cambios celulares que se producen al principio en la patología de la enfermedad de Alzheimer.
Antecedentes de la invención
A medida que aumentan las expectativas de vida la enfermedad de Alzheimer (AD) se está convirtiendo en un problema sanitario principal en el mundo occidental. Ha habido intensa investigación orientada a identificar una curación fiable o medidas preventivas para la enfermedad, hasta el momento sin éxito.
Uno de los problemas mayores en el diseño y experimentación de cualquier agente terapéutico es la falta de criterios de diagnóstico fiables que puedan identificar a los que padecen AD lo suficientemente al principio para cualquier intervención significativa. Sin embargo, las herramientas de diagnóstico clínico disponibles actualmente no permiten un diagnóstico preciso y fiable de la enfermedad de Alzheimer en otros pacientes más que los gravemente enfermos. Además no permite la identificación de pacientes con la enfermedad de Alzheimer preclínica que pudieran beneficiarse de la intervención preventiva.
Los criterios de diagnóstico clínico utilizados más frecuentemente son los criterios NINCDS/ADRDA (McKhann, G. et al., (1984) Neurology 34: 939-944), originalmente diseñados a título de investigación. Estos criterios son muy sensibles pero presentan una baja especificidad. Esto es debido al hecho de que el valor previsible positivo de un diagnóstico de "probable" o "posible" de la enfermedad de Alzheimer es muy elevado, pero el valor previsible negativo es muy bajo (13). En otras palabras, si un paciente cumplimenta los requisitos de los criterios NINCDS/ADRDA para la enfermedad de Alzheimer es muy probable que el paciente realmente no padezca la enfermedad de Alzheimer. Sin embargo, una proporción de los pacientes que no cumplimentan estos criterios (p. ej. se consideran referencias) se encuentra que padecen la enfermedad de Alzheimer en un examen post mortem (13).
Como consecuencia de su baja especificidad, los criterios NINCDS/ADRDA no son ideales para fines de diagnóstico clínico. Además no son adecuados como criterios de diagnóstico para pruebas clínicas con vistas a terapias preventivas o curativas que puedan tener su mejor probabilidad de ser eficaces si se utilizan antes de desarrollar una demencia significativa. Así continúa existiendo necesidad de una prueba de diagnóstico fiable para la enfermedad de Alzheimer, y en particular para una prueba que pueda utilizarse en la detección precoz de personas con la enfermedad de Alzheimer preclínica que puedan beneficiarse de la intervención preventiva.
En los últimos años se está aceptando más ampliamente que la base patógena de la enfermedad de Alzheimer es la reentrada aberrante de diferentes poblaciones neuronales en el ciclo de la división celular (14). En el ciclo celular rápido de individuos jóvenes sanos la interrupción y rediferenciación puede seguir a esta reentrada en el ciclo celular. En cambio, en individuos con la enfermedad de Alzheimer el mecanismo de regulación parece fracasar y las neuronas evolucionan en las últimas etapas del ciclo celular conduciendo a la acumulación de una patología relacionada con AD y/o la muerte neuronal (14).
Los estudios de los presentes inventores y de otros indican que se produce anomalía de la regulación del ciclo celular en la enfermedad de Alzheimer en el punto de control de la transición G1/S (3). Los estudios previos sobre fibroblastos y linfocitos de los pacientes con enfermedad de Alzheimer indican que la regulación del ciclo de división celular puede interrumpirse en otras células aparte de las neuronas en esta enfermedad (8, 9 y 17). Es sabido también que los pacientes de la enfermedad de Alzheimer son más propensos a algunas formas de cáncer (4) y que los pacientes con síndrome de Down, que desarrollan AD en la vida adulta temprana, son más propensos a la leucemia que la población general (7, 10). Es plausible sin embargo suponer que la anomalía de la regulación del ciclo celular en las neuronas, incluso en las etapas preliminares (preclínicas) de AD, puede reflejarse por la malfunción de la regulación del ciclo celular similar en linfocitos.
Los presentes inventores han demostrado ahora que la sensibilidad in vitro de los linfocitos al tratamiento con inhibidor G1 es significativamente menos eficaz en pacientes con enfermedad de Alzheimer que en los pacientes de referencia. Además, en las personas que presentan síntomas clínicos de enfermedad de Alzheimer incipiente la respuesta a los linfocitos es similar que la observada en los pacientes con enfermedad de Alzheimer. Estos descubrimientos representan pruebas directas para apoyar la hipótesis de que la anomalía de control de transición de G1/S no se limita a las neuronas en los pacientes con la enfermedad de Alzheimer, sino que se produce también en las células periféricas, tales como linfocitos.
La observación de que la anomalía de la regulación en la transición G1/S se produce también en las células periféricas proporciona las bases de nuevas pruebas clínicas, útiles en el diagnóstico de la enfermedad de Alzheimer, que se basan en producir la activación del punto de control de la transición de G1/S en células no neuronales, tales como los cultivos de linfocitos. Como la anomalía de la regulación del ciclo celular en las neuronas parece ser un episodio muy precoz en la patogénesis de la enfermedad de Alzheimer, se prevé que dichas pruebas serán de utilidad para la identificación de personas en las etapas preclínicas de la enfermedad de Alzheimer que no cumplimentan los requisitos de los criterios NINCDS/ADRDA para la demencia, pero se beneficiarían de la intervención precoz con medidas preventivas para la enfermedad de Alzheimer.
Descripción de la invención
Según un primer aspecto de la invención se proporciona un método para el diagnóstico de la enfermedad de Alzheimer en un paciente humano que comprende la identificación de la presencia de una anomalía en la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S en las células no neuronales de una persona.
El método de la invención se realiza más preferentemente in vitro o en células no neuronales aisladas de la persona en el que se ha de ensayar. Las células no neuronales pueden ser cualquier tipo de célula no neuronal que presente la misma anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición de G1/S que está presente en las neuronas en la enfermedad de Alzheimer. En la forma de realización más preferida el método se realiza en linfocitos aislados de la persona y cultivados in vitro. Existen obvias ventajas prácticas en ser capaz de demostrar la presencia de la anomalía de la regulación del ciclo celular en un tipo de célula no neuronal. La utilización de linfocitos es especialmente conveniente, ya que se aíslan fácilmente de la muestra de sangre y pueden cultivarse in vitro. Otra opción preferida es la utilización de fibroblastos, particularmente fibroblastos de la piel que pueden obtenerse de forma conveniente a partir de una biopsia de piel.
Cuando se utiliza el método de la invención para diagnóstico, la presencia de una anomalía en la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S en un tipo de célula no neuronal se considera una indicación de que la persona presenta la enfermedad de Alzheimer. De manera típica, una reducción en la eficacia del control del punto de control en la transición G1/S se considera una indicación de que la persona presenta la enfermedad de Alzheimer.
La disponibilidad de una prueba fiable para una anomalía que se basa en la patología de la enfermedad de Alzheimer mejorará significativamente la capacidad de diagnosticar la enfermedad, y en particular permitirá el diagnóstico precoz. Los criterios de diagnóstico operativos disponibles actualmente para la enfermedad de Alzheimer solamente permiten el diagnóstico de AD posible o probable muy tardío, cuando la demencia ya está presente. Un diagnóstico definitivo de la enfermedad de Alzheimer puede realizarse solamente tras un examen post mortem. Es evidente a partir de la investigación de los presentes inventores que una anomalía en el control del ciclo celular es detectable en las células periféricas (no neuronales), tales como los linfocitos, mucho antes de que aparezcan los síntomas clínicos de la demencia totalmente desarrollados. Por consiguiente, el método de la invención proporciona una herramienta para el diagnóstico precoz de la enfermedad de Alzheimer, especialmente la detección de individuos que están en las etapas preclínicas de la enfermedad, y para la identificación de los individuos que no han desarrollado todavía la enfermedad de Alzheimer como tal pero están "en situación de riesgo" de hacerlo debido a la presencia de la anomalía de la regulación del ciclo celular. Esto abre la posibilidad de la intervención precoz con medidas preventivas, que incluyen, entre otras, cambios en el estilo de vida y regímenes de vitaminas y HRT para las mujeres
postmenopáusicas.
La disponibilidad de herramientas para diagnóstico capaces de detectar cambios precoces en individuos que no han desarrollado todavía la enfermedad de Alzheimer como tal facilitarán también el desarrollo y experimentación de terapias propuestas para interrumpir la evolución de la enfermedad en un punto antes del desarrollo de una patología cerebral significativa. Las pruebas para diagnóstico pueden también aplicarse en el desarrollo de modelos animales de la enfermedad de Alzheimer precoz, por ejemplo en la identificación de un modelo de ratón que presente una anomalía análoga en la regulación del ciclo celular a la que presenta en la enfermedad de Alzheimer.
La capacidad para identificar individuos que tienen una anomalía de la regulación del ciclo celular en la transición G1/S puede aplicarse a la selección de individuos que deben incluirse en las pruebas clínicas. Las pruebas clínicas son más probablemente para producir resultados significativos si los individuos incluidos en la prueba se seleccionan aquellos que sea más probable que se beneficien del tratamiento a prueba.
La identificación de la anomalía de la regulación G1/S en los linfocitos extraídos de un paciente que padece la enfermedad de Alzheimer incipiente o completamente desarrollada puede indicar la presencia de problemas inmunitarios en el paciente, o una probabilidad de que el paciente desarrolle problemas inmunitarios a medida que evoluciona la enfermedad. La disponibilidad de dicha información ayudará al médico a decidir si intervenir con la terapia ayuda a aliviar/prevenir los problemas inmunitarios que complican la enfermedad de Alzheimer.
El método de la invención es especialmente preferido para el diagnóstico de la enfermedad de Alzheimer esporádica. Sin embargo, sería también útil en el diagnóstico de formas de la enfermedad de Alzheimer familiar que presenta una anomalía de la regulación del ciclo celular equivalente. Generalmente esto no incluirá la enfermedad de Alzheimer familiar asociada a mutaciones de presenilina-1 o presenilina-2.
Existen varias maneras en las que para identificar la presencia de una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S en las células no neuronales según la invención. En una realización la identificación de la presencia de la anomalía de la regulación del ciclo celular puede llevarse a cabo en primer lugar induciendo a las células a que se dividan, produciendo a continuación la interrupción del ciclo celular mediante la adición de una sustancia inhibidora de la división celular y ensayando la sensibilidad de los mecanismos reguladores del ciclo celular G1/S de las células a la adición de la sustancia inhibidora de la división celular.
Más preferentemente, la sustancia inhibidora de la división celular será un inhibidor de G1 específico, por ejemplo rapamicina. La división celular puede ser inducida mediante la adición de un estímulo mitógeno, por ejemplo uno o más factores de crecimiento. Si la prueba se realiza utilizando linfocitos entonces puede usarse fitohemoaglutinina para inducir la división celular.
En una realización adicional relacionada el tratamiento con la sustancia inhibidora de la división celular puede sustituirse por el tratamiento con un estímulo que produzca la interrupción del ciclo celular en G1, por ejemplo un estímulo medioambiental. La identificación de la presencia de la anomalía de la regulación de G1/S se lleva a cabo por consiguiente: induciendo a las células a que se dividan, exponiendo las células a un estímulo que induzca la interrupción del ciclo celular en G1 y ensayando la sensibilidad de los mecanismos reguladores del ciclo celular de G1/S de las células a la adición del estímulo que produce la interrupción del ciclo celular.
Los estímulos adecuados de la interrupción del ciclo celular incluyen, entre otros, la radiación ionizante, hipoxia, radiación ultravioleta, etc. En una realización preferida, la interrupción del ciclo celular puede inducirse mediante tratamiento de las células con H_{2}O_{2} para producir agresión oxidativa. Como antes, la división celular puede inducirse mediante la adición de un estímulo mitógeno, por ejemplo uno o más factores de crecimiento. Puede utilizarse fitohemoaglutinina para inducir la división celular en los linfocitos cultivados.
El fundamento subyacente de ambos métodos es en primer lugar estimular a las células para que se dividan, después intentar interrumpir el ciclo celular en la etapa G1 utilizando bien un inhibidor de división celular u otro estímulo que produzca la interrupción del ciclo celular y luego evaluar el efecto de dicho tratamiento sobre el sistema regulador del ciclo celular. El efecto sobre la regulación del ciclo celular puede evaluarse mediante una variedad de medios diferentes, como se expone a continuación. El tratamiento con un inhibidor de la división celular u otro estímulo que induzca la interrupción del ciclo celular puede ser denominado en esta memoria "tratamiento inhibidor del ciclo celular" o "tratamiento inhibidor". Si una anomalía de la regulación del ciclo celular en la transición G1/S está presente entonces éste afectará la sensibilidad de las células para intentar interrumpir el ciclo celular. En general, la presencia de una anomalía de la regulación del ciclo celular en G1/S produce una sensibilidad reducida al tratamiento con un inhibidor de la división celular u otro estímulo que induce la interrupción del ciclo celular en G1, es decir, el tratamiento inhibidor es menos eficaz para interrumpir el ciclo celular en el punto de control de G1/S en las células con dicha anomalía.
Varios métodos pueden realizarse antes y después de la adición del estímulo mitógeno y antes y después de intentar la interrupción del ciclo celular para determinar la sensibilidad de las células al tratamiento inhibidor del ciclo celular. Una lista no exhaustiva de métodos preferidos que pueden utilizarse según la invención se proporciona a continuación, otros métodos adecuados serán conocidos por los expertos en la materia:
(1) Ensayo de proliferación realizado para evaluar si se ha producido la interrupción del ciclo celular y en qué medida como resultado del tratamiento inhibidor. El ensayo de proliferación puede realizarse según cualquiera de los protocolos habituales conocidos en la materia. Un ejemplo especialmente adecuado es el ensayo de supervivencia de MTT (comercialmente disponible en Chemicon International Ltd., véase Mosmann, T. en J. Immunol. Methods, 1983, vol.: 65, 55-63).
En una detección típica los ensayos de proliferación se realizan en ambas células tratadas con un inhibidor de división celular u otro estímulo que induzca la interrupción del ciclo celular y las células de referencia no tratadas de la misma persona. Como el tratamiento inhibidor será efectivo únicamente en presencia de un sistema regulador G1/S intacto, la diferencia en el grado de proliferación entre las células tratadas y no tratadas será significativamente más pequeña en los pacientes con enfermedad de Alzheimer que en los individuos de referencia de la misma edad. En general, un cambio pequeño o ninguno en la actividad proliferante de las células de la persona en presencia de tratamiento inhibidor, indica una sensibilidad reducida a la inhibición del ciclo celular en la fase G1, y por consiguiente la presencia de una anomalía de la regulación en la transición G1/S. La presencia de dicha anomalía de la regulación se considera a su vez como una indicación de que la persona tiene la enfermedad de Alzheimer.
(2) Cálculo de la prolongación relativa de la fase G1 del ciclo celular en células de la persona como resultado de la exposición a un inhibidor de división celular o al estímulo que induce la interrupción del ciclo celular. La prolongación relativa de la fase G1 como resultado de la exposición al inhibidor de la división celular o al estímulo que produce la interrupción del ciclo celular se calcula utilizando la fórmula RL=100f-100 (expresada en tanto por ciento). "f" es la relación del tiempo en G1 para las células (células no neuronales de una persona a prueba) expuestas al tratamiento inhibidor con el inhibidor de la división celular o el estímulo que induce la interrupción del ciclo celular (TG1_{tr}) frente al tiempo en G1 para las células de referencia no tratadas (es decir, también células no neuronales de la persona a prueba) no expuestas al tratamiento inhibidor (TG1_{c}). f puede calcularse según la relación
siguiente:
(5)f=TG1_{tr}/TG1_{c}=[ln2-ln(2-G1_{tr})][ln(2-G1_{c})]/[ln(2-G1_{tr})][ln2-ln(2-G1_{c})]
Pueden emplearse varias técnicas para obtener los valores de TG1_{tr} y TG1_{c}. En una realización preferida TG1_{tr} y TG1_{c} pueden obtenerse determinando la proporción de células en varias fases del ciclo celular para ambas células tratadas (células no neuronales de la persona a prueba tratada con la sustancia inhibidora de la división celular o el estímulo que induce la interrupción del ciclo celular) y células de referencia no tratadas (células no neuronales de la misma persona no expuestas a la sustancia inhibidora de la división celular o al estímulo que induce la interrupción del ciclo celular). La proporción de células en varias fases del ciclo celular puede determinarse fácilmente mediante la incorporación de un análogo nucleotídico marcado, preferiblemente bromodesoxiuridina (BrdU), seguido de clasificación celular activada por fluorescencia (análisis FACS), o equivalente, tal como se describe en los ejemplos adjuntos.
La presencia de una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S se indica mediante una prolongación relativa reducida de la fase G1 en presencia de la sustancia inhibidora de la división celular o del estímulo en células de la persona a prueba, en comparación con las células de referencia que no presentan anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S (véase más arriba (1) para la definición con más detalle de las células de referencia adecuadas). Las células de referencia que no presentan anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S no deben confundirse con las células "de referencia no tratadas" utilizadas para el cálculo de RL, que son células de la persona a prueba que no han sido expuestas al tratamiento inhibidor.
(3) Evaluación de la proteína reguladora del ciclo celular o de la expresión de ARNm. La expresión de las proteínas reguladoras del ciclo celular puede evaluarse utilizando técnicas normalizadas bien conocidas en la materia tales como, por ejemplo, inmunotransferencia, transferencia Western, ELISA o métodos relacionados. La evaluación de la expresión de los ARNm correspondientes que codifican las proteínas reguladoras del ciclo celular puede realizarse también por medios de métodos normalizados tales como, por ejemplo, técnicas de hibridación, análisis del "chip del ADN" o métodos relacionados o técnicas basadas en la ampliación tales como RT-PCR o ampliación basada en la secuencia del ácido nucleico (NASBA). Los métodos adecuados para la detección/cuantificación de los ARNm que pueden utilizarse de acuerdo con la invención son bien conocidos por los expertos en la materia. Algunos de estos métodos, por ejemplo RT-PCR, se basan en la detección/cuantificación de una copia de ADNc del ARNm apropiado.
La anomalía de la regulación del ciclo celular presente en la enfermedad de Alzheimer puede producir cambios en el modelo de expresión de las proteínas reguladoras del ciclo celular y en sus ARNm correspondientes. La identificación de cambios en la expresión de determinadas proteínas reguladoras del ciclo celular y/o en los correspondientes ARNm puede utilizarse por consiguiente en el diagnóstico para identificar la presencia de una anomalía de la regulación del ciclo celular en G1/S. Además, la expresión de las proteínas reguladoras del ciclo celular puede utilizarse como un marcador de la evolución a lo largo del ciclo celular. Por consiguiente, la sensibilidad de las células para el tratamiento inhibidor puede evaluarse observando la expresión de una o más proteínas reguladoras del ciclo celular, para determinar el alcance al que el tratamiento inhibidor da lugar a la interrupción del ciclo celular en las células de la persona de la prueba. Las proteínas reguladoras adecuadas del ciclo celular comprenden CDKN3, pl5ink4B, p16ink4A, p19ink4D, p27kip1, p21cip1, p57kip2 y TP53. Las secuencias de estas proteínas, y los genes que las codifican, están disponibles al público. Una lista de los números de registro de OMIM de estas proteínas se proporciona en los Ejemplos adjuntos. Los anticuerpos útiles para la detección de cada una de esas proteínas están disponibles en el mercado.
(4) Evaluación de la viabilidad celular y de la muerte celular por cualquier método conocido en la materia. Cuando una célula proliferante se interrumpe en la transición G1/S, puede resultar uno de los dos posibles fenómenos "aguas abajo", bien la diferenciación o la muerte celular programada. Estos fenómenos aguas abajo pueden utilizarse como indicación de la presencia en la población celular de una anomalía de la regulación en la transición G1/S, ya que si la regulación de la transición G1/S es anómala entonces los efectos aguas abajo de la interrupción del ciclo celular en G1/S serán también anormales. Un grado menor de muerte celular o un grado mayor de viabilidad celular en respuesta al tratamiento inhibidor en las células de la persona de la prueba, en comparación con las células de referencia, se considera una indicación de que la persona padece la enfermedad de Alzheimer.
(5) Evaluación de la proteína relacionada con la muerte celular (inductora o preventiva) o de la expresión del ARNm utilizando técnicas normalizadas. En esta realización, la expresión de las proteínas relacionadas con la muerte celular, o los ARNm correspondientes, se utiliza como evaluación indirecta de los efectos aguas abajo del tratamiento con un inhibidor de la división celular u otros estímulos que inducen la interrupción del ciclo celular en la transición G1/S. Las proteínas relacionadas con la muerte celular adecuadas incluyen miembros de la familia bcl-2 de proteínas, de las que existen muchas conocidas en la materia.
(6) Evaluación de la expresión de las proteínas del elemento de respuesta al daño del ADN o de los ARNm correspondientes utilizando técnicas normalizadas. Este método puede utilizarse cuando el estímulo utilizado para inducir la interrupción del ciclo celular en G1/S es el daño al ADN, por ejemplo en tratamiento con un agente químico que produce el daño al ADN o la exposición a radiación UV. En circunstancias normales la presencia del daño al ADN inducirá que la célula interrumpa la fase de transición G1/S e intente reparar el ADN dañado mediante la activación de la serie de reacciones de respuesta al daño del ADN. Las alteraciones en el modelo de expresión de las proteínas implicadas en la respuesta normal al daño al ADN, o los ARNm correspondientes, en respuesta a la presencia del ADN dañado pueden utilizarse por consiguiente como una indicación de la presencia de una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S. Los elementos de respuesta al daño al ADN adecuados comprenden TP53, Gadd34, Gadd45A (126335), Gadd45B (604948), Gadd45G (604949), Gadd153 (126337) y PCNA (176740). Una lista de los números
\hbox{de registro de OMIM para estos
elementos de respuesta al daño al  ADN se proporciona a
continuación.}
(7) Evaluación del contenido del ADN de las células no neuronales, con o sin análisis del ciclo celular. En esta realización, la medición del contenido de ADN de las células de la persona de la prueba tratadas con un inhibidor de división celular u otros estímulos que producen la interrupción del ciclo celular proporciona una indicación indirecta de la presencia de una anomalía de la regulación en la transición G1/S en dichas células. El fundamento subyacente a este método es la diferencia en el contenido de ADN entre las células en la fase G1 y las células en la fase G2 que han pasado a través de la etapa de replicación del ADN del ciclo celular. Cuando una población de células normales (es decir, sin una anomalía de la regulación en G1/S) se trata para inducir la interrupción del ciclo celular en G1 o en G1/S, la mayoría de las células permanecerá en la fase G1. Sin embargo, si las células presentan una anomalía de la regulación en G1/S, una proporción de las células pasará a través del punto de control de G1/S y experimentará la replicación del ADN. Así, un contenido de ADN creciente en las células de una persona de la prueba, comparado con las células de referencia que no presentan una anomalía de la regulación en G1/S, después del tratamiento para inducir la interrupción del ciclo celular en G1 se considera una indicación de la presencia de una anomalía de la regulación en G1/S. La presencia de dicha anomalía de la regulación se considera a su vez una indicación de que la persona padece la enfermedad de Alzheimer.
La lista anterior de técnicas adecuadas para su utilización en la experimentación de la sensibilidad de las células no neuronales, especialmente los linfocitos cultivados, para el tratamiento inhibidor con un inhibidor de división celular o el estímulo que induce la interrupción del ciclo celular se pretende que sea ilustrativa o más bien limitativa de la invención.
Más preferiblemente, el método de la invención implicará la identificación de la presencia de al menos una mutación o variante alélica en un gen regulador del ciclo celular seleccionado del grupo consistente en CDKN3, p15ink4B, p16ink4A, p19knk4D, p27kip1, p21cip1, p57kip2 y TP53.
El método de la invención no se limita a identificar la presencia de alguna mutación específica o variante genética, aunque la identificación de la presencia de mutaciones/variantes específicas demuestra que está asociada a la enfermedad de Alzheimer. La invención abarca la exploración del gen regulador del ciclo celular, o una subzona del mismo, para la presencia de mutaciones o variantes genéticas, incluyendo las mutaciones/variantes anteriormente desconocidas. Para evitar dudas, el término "gen" incluye las zonas reguladoras, en particular la zona del activador. La presencia de una o más mutaciones o variantes genéticas en un gen regulador del ciclo celular, especialmente las mutaciones/variantes que producen un cambio en la secuencia de aminoácidos de la proteína codificada por el gen o que alteran la función de la proteína codificada o que alteran el nivel de expresión de la proteína, se considera una indicación de que el individuo padece la enfermedad de Alzheimer, basándose en que la presencia de dicha mutación o variante es indicativa de una anomalía de la regulación del ciclo celular.
Existen muchas técnicas conocidas en la materia para la detección de la variación genética que pueden utilizarse, según la invención, para explorar la presencia de variantes de mutaciones/variantes alélicas en un gen regulador del ciclo celular de una persona dada. Las técnicas adecuadas incluyen, por ejemplo, el análisis del polimorfismo de conformación monocatenaria (SSCP), el análisis heterodoble PCR-SSCP (HA), la electroforesis en gel con gradiente desnaturalizante (DGGE), el secuenciado del ADN, la escisión por RNasa, la escisión química de emparejamientos incorrectos (CCM), etc. (véase el estudio por Schafer y Hawkins, Nature Biotechnology, vol.: 16, págs. 33-39, 1998).
El Ejemplo 2 adjunto describe la utilización de PCR-SSCP para identificar las variantes polimórficas en los genes p21cip y p57 e identificar de este modo una variante polimórfica en el exón 2 del gen p21cip y dos variantes polimórficas en el exón 2 del gen p57. Puede emplearse el mismo método técnico para identificar variantes polimórficas en otros genes con modificación apropiada, es decir, la selección de cebadores de PCR específicos para el gen de
interés.
La identificación de la presencia de mutaciones/variantes alélicas se realiza en una muestra de ADN genómico aislada de la persona. El ADN genómico puede aislarse de manera conveniente de una muestra de sangre completa utilizando técnicas normalizadas bien conocidas en la materia. De manera ventajosa, el procedimiento de exploración de la presencia de mutaciones/variantes alélicas puede realizarse en el ADN genómico preparado a partir de los linfocitos cultivados de la persona. En el mismo cultivo de linfocitos puede analizarse "funcionalmente" también la presencia de una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S, por ejemplo determinando la sensibilidad al tratamiento inhibidor utilizando un método según el primer aspecto de la invención.
Las asociaciones entre una variante polimórfica dada y la sensibilidad a la enfermedad de Alzheimer pueden confirmarse realizando estudios de asociación genética, por ejemplo estudios de asociación basados en la familia o de caso-referencia. La asociación de la enfermedad de variantes polimórficas determinadas puede determinarse también evaluando la relación entre el genotipo y la expresión de marcadores de la evolución del ciclo celular en el cerebro. En los ejemplos adjuntos, se evaluó la relación entre el genotipo y la expresión de la ciclina B (un marcador de la evolución a través del ciclo hasta la etapa G2) en los núcleos neuronales. Otros marcadores de la evolución del ciclo celular podrían haberse utilizando con efecto equivalente. En una realización específica, el método puede conllevar el genotipado de una de las variantes polimórficas en los genes p21 y p57 descritos en los ejemplos adjuntos. Estas variantes, denominadas alelos A y B de p21E2, alelos A y B de p57E2A y alelos A y B de P57E2B, pueden genotiparse basándose en los análisis PCR-SSCP que utilizan las siguientes series de cebadores en las condiciones especificadas en los ejemplos adjuntos:
p21E2 A/B: 5'-CGGGATCCGGCGCCATGTCAGAACCGGC-3' (SEQ. ID. nº: 1) y 5'-CCAGACAGGTCAGCC
CTTGG-3' (SEQ. ID. nº: 2)
P57E2A A/B: 5'-GGC CAT GTC CGA CGC GTC-3' (SEQ. ID. nº: 3) y 5'-AGG CGG CAG CGC CCC ACC TG-3' (SEQ. ID. nº: 4)
p57E2B A/B: 5'-ATT ACG ACT TCC AGC AGG ACA TG-3' (SEQ. ID. nº: 5) y 5'-CTG GAG CCA GGA CCG GGA CTG-3' (SEQ. ID. nº: 6)
En cada caso, los alelos A y B pueden identificarse basándose en la movilidad electroforética diferencial de los productos resultantes de la PCR en las condiciones definidas en el Ejemplo 2, con referencia a la Figura 6. Sin embargo, no se pretende limitar la invención a la utilización de PCR-SSCP y pueden utilizarse otros métodos de genotipado de las mismas variantes.
El alelo A de p21E2 y el alelo A de p57E2A están asociados a la evolución creciente a través del punto de control de G1/S, y por consiguiente con predisposición para la enfermedad de Alzheimer.
Las identificaciones basadas en la detección de la presencia de mutaciones o variantes alélicas en los genes que codifican los genes reguladores del ciclo celular pueden implicar el genotipado de dos o más variantes polimórficas, o pueden implicar la identificación de la presencia de la variación genética en uno o más genes reguladores del ciclo celular. Cualquier variación genética que tenga un efecto desfavorable sobre la función de un gen regulador del ciclo celular puede producir potencialmente una derivación del punto de control de la transición G1/S y en consecuencia la patología AD. La acumulación de la variación genética en un gen regulador aislado, o a través de múltiples genes, puede tener un efecto aditivo.
Las identificaciones basadas en la detección de la presencia de mutaciones o variantes alélicas en los genes que codifican los genes reguladores del ciclo celular pueden utilizarse en el diagnóstico de la enfermedad de Alzheimer, posiblemente junto con otras pruebas de diagnóstico, tal como la identificación de la presencia de una anomalía de la regulación del ciclo celular. Pueden utilizarse también para identificar individuos que tienen una predisposición a la enfermedad de Alzheimer a causa de la presencia de la(s) mutación o mutaciones o variante(s) alélica(s) en un gen regulador del ciclo celular.
El método de identificación de mutaciones o variantes alélicas en un gen regulador del ciclo celular puede utilizarse también para determinar cualquier base genética de la enfermedad de Alzheimer en un paciente diagnosticado previamente de la enfermedad de Alzheimer. En un tercer aspecto la invención proporciona un método para la utilización en el diagnóstico de la enfermedad de Alzheimer en una persona que comprende la identificación de la presencia en el genoma de dicha persona de al menos una mutación o variante alélica en un gen que codifica una enzima para la reparación del ADN, en la que la presencia de una mutación o variante alélica en dicho gen se considera una indicación de la enfermedad de Alzheimer.
Los genes adecuados incluyen aquellos que codifican las enzimas para la reparación del ADN Ku70, Ku80, Ku86, NDHII, BLM, RECQL, RECQL4 y RECQL5. El término "gen" incluye las zonas reguladoras, en particular la zona del activador.
De nuevo, el método de la invención no requiere la identificación de la presencia de ninguna mutación o variante genética determinada, si bien se contempla la identificación de la presencia de determinados mutantes o variantes asociados a la enfermedad de Alzheimer. El método puede implicar la exploración del gen que codifica una enzima para la reparación del ADN o una subzona de dicho gen, para la presencia de cualquier mutación o variante genética, incluyendo las mutaciones/variantes previamente desconocidas.
La presencia de una o más mutaciones o variantes genéticas en el gen que codifica una enzima para la reparación del ADN se considera una indicación de la enfermedad de Alzheimer, porque las enzimas para la reparación del ADN actúan en la serie de reacciones relacionadas con la regulación del ciclo celular. La presencia de mutaciones o variantes alélicas en los genes que codifican las enzimas de reparación del ADN es indicadora indirectamente por consiguiente de una anomalía de la regulación del ciclo celular.
La cantidad de mutaciones somáticas en el cerebro en pacientes de AD se observa que está significativamente asociada a la desregulación del ciclo celular y a la gravedad de la patología de tipo AD (véanse los ejemplos adjuntos). Por consiguiente, se sugiere que la anomalía para la reparación del ADN puede conducir a la desregulación del punto de transición de G1/S conduciendo por último al desarrollo de la enfermedad de Alzheimer.
Las identificaciones basadas en la detección de la presencia de mutaciones o variantes alélicas en genes que codifican las enzimas de reparación del ADN pueden utilizarse para el diagnóstico, particularmente en la identificación de individuos con la enfermedad de Alzheimer preclínica. Identificaciones similares pueden utilizarse también para identificar individuos que están predispuestos a desarrollar la enfermedad de Alzheimer debido a la presencia de mutación(es)/variante(s) en un gen o genes que codifican las enzimas de reparación del ADN y también para determinar cualquier base genética para el Alzheimer en un paciente diagnosticado previamente de la enfermedad de Alzheimer.
El procedimiento existente de identificación de la presencia de mutaciones/variantes alélicas puede realizarse utilizando cualquiera de las técnicas conocidas en la materia, expuestas anteriormente.
En un aspecto adicional todavía, la invención proporciona un método de identificación de compuestos con actividad farmacológica potencial en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer, método que comprende las etapas siguientes:
analizar la regulación de la transición G1/S en células no neuronales, células que presentan una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S en presencia y ausencia de un compuesto de ensayo, en el que se identifica un compuesto de ensayo que produce la corrección de la anomalía de la regulación en la transición G1/S en dichas células que presenta actividad farmacológica potencial en el tratamiento de la enfermedad de
Alzheimer.
El método de la invención puede realizarse utilizando esencialmente cualquier célula no neuronal que presente una anomalía de la regulación del ciclo celular análoga en la fase de transición G1/S a la observada en las neuronas en la enfermedad de Alzheimer. Las células adecuadas pueden incluir linfocitos cultivados procedentes de un individuo, o de varios individuos, que padecen la enfermedad de Alzheimer.
El "análisis" de la regulación de la transición G1/S puede realizarse utilizando cualquiera de los métodos descritos en relación con el primer aspecto de la invención, adecuados para la identificación de la presencia de una anomalía de la regulación de ciclo celular en G1/S. De manera ventajosa, el método utilizado para el análisis de la regulación de la fase de transición G1/S será el que pueda llevarse a cabo en placas de microvaloración multi-pocillo, que permita realizar la identificación del compuesto en formato medio a grande. El método más preferido adecuado para su utilización en un formato medio a grande es el ensayo de proliferación celular.
Las células que presentan una anomalía de la regulación en la transición G1/S se exponen a los compuestos de ensayo y el efecto del compuesto de ensayo sobre la regulación de la transición G1/S se evalúa con relación a referencias adecuadas, p. ej. células no expuestas a ningún compuesto de ensayo. En una identificación típica, el compuesto de ensayo se ensayará en un intervalo de diferentes concentraciones.
No existe ninguna limitación en los tipos de compuestos experimentales que deben ensayarse en los métodos de identificación de la invención. Los compuestos de ensayo pueden incluir compuestos que presentan una actividad farmacológica o biológica conocida, compuestos que no presentan dicha actividad identificada y moléculas o bancos de moléculas completamente nuevos o pueden generarse mediante química combinatoria. Los compuestos que son ADN, ARN, APN, polipéptidos o proteínas no están excluidos.
La metodología básica para la identificación del compuesto puede adaptarse también para su utilización en la evaluación de la eficacia de una forma de tratamiento de la enfermedad de Alzheimer, por ejemplo para probar el efecto de un agente farmacológico determinado sobre la regulación del ciclo celular.
En una variación útil, el método de la invención puede utilizarse específicamente para determinar si un agente farmacológico es probable que sea de utilidad en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer en una persona determinada. En este caso el ensayo se realiza utilizando células no neuronales de la persona que presenta una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S, más preferentemente linfocitos cultivados. En las células se determina la presencia de la anomalía en la regulación en la fase de transición G1/S en la transición G1/S en presencia y ausencia de agente farmacológico. Los agentes farmacológicos que producen "corrección" de la anomalía de la regulación en la transición G1/S son identificados probablemente para que sirvan en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer en el individuo. "Corrección" significa un grado significativo de restablecimiento de la regulación del ciclo celular normal. Ésta puede evaluarse con relación a las células de referencia, por ejemplo las células del mismo tipo extraídas de un individuo de referencia con la misma edad que no padezca la enfermedad de Alzheimer o cualquier prueba de una anomalía de la regulación en la transición G1/S o cualquier anomalía genética/variación alélica que puede esperarse que predisponga a la enfermedad de Alzheimer.
La invención se entenderá más con relación a los siguientes ejemplos experimentales, junto con las Figuras adjuntas, en las que:
La Figura 1 ilustra las lecturas del citómetro de flujo para linfocitos cultivados de una persona de referencia, persona preAD y paciente de AD. Los resultados se muestran tanto para las células tratadas con rapamicina como para las células no tratadas de referencia. G1 indica que las células están en la fase G1 del ciclo celular.
La Figura 2 ilustra la prolongación relativa (panel izquierdo) y relativa corregida por la edad (panel derecho) de la fase G1 del ciclo celular bajo la influencia de rapamicina en linfocitos cultivados procedentes de personas preAD, AD, ADM, possAD, DNOS y de referencia.
La Figura 3 ilustra los efectos del tratamiento con rapamicina de 24 horas sobre la supervivencia celular en linfocitos cultivados procedentes de personas preAD, AD, possADM, DNOS y de referencia. Los valores absolutos se presentan en el panel izquierdo, los valores corregidos por la edad en el panel derecho.
La Figura 4 ilustra los efectos del tratamiento con rapamicina sobre la supervivencia celular en linfocitos cultivados procedentes de personas preAD, AD, possADM, DNOS y de referencia. Los valores absolutos se presentan en el panel izquierdo, los valores corregidos por la edad en el panel derecho.
La Figura 5 ilustra los efectos del tratamiento con H_{2}O_{2} sobre la supervivencia celular en linfocitos cultivados procedentes de personas preAD, AD, possADM, DNOS y de referencia. Los valores absolutos se presentan en el panel izquierdo, los valores corregidos por la edad en el panel derecho.
La Figura 6 ilustra el resultado de la identificación por PCR-SSCP de polimorfismos en el exón 2 de p21 y en el exón 2 de p57.
La Figura 7 ilustra la relación entre las variantes A y B de p21 y la expresión de ciclina B en el cerebro. Las barras en blanco indican el porcentaje de pacientes en los que no se expresó la ciclina B en las neuronas. Las barras negras indican el porcentaje de pacientes en los que se expresó la ciclina B en los núcleos de las neuronas.
La Figura 8 ilustra la relación entre las variantes A y B del exón 2A de p21 y la expresión de ciclina B en el cerebro en pacientes con p21 normal. Las barras en blanco indican el porcentaje de pacientes en los que no se expresó la ciclina B en las neuronas. Las barras negras indican el porcentaje de pacientes en los que se expresó la ciclina B en los núcleos de las neuronas.
La Figura 9 ilustra la frecuencia de mutaciones somáticas en relación con la evolución de AD y las proteínas del ciclo celular en el cerebro. Eje x: etapas Braak de gravedad de AD; eje y: porcentaje de cebadores que generan diferentes modelos de RAPD en la sangre en comparación con el cerebro.
Claves para las Figuras
Referencia: individuos sanos con resultados normales de la prueba cognitiva y neurofisiológica;
PreAD: individuos sanos con resultados de la prueba neurofisiológica que sugieren AD incipiente;
PossAD: posible enfermedad de Alzheimer diagnosticada por los criterios NINCDS;
AD: probable enfermedad de Alzheimer diagnosticada por los criterios NINCDS;
ADM: posible enfermedad de Alzheimer (NINCDS) y pruebas de otro tipo de demencia;
DNOS: pacientes con demencia que no cumplen los requisitos de los criterios NINCDS por probable enfermedad de Alzheimer.
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Ejemplo 1
Pruebas de la aparición de una anomalía de la regulación del ciclo celular en linfocitos de pacientes de la enfermedad de Alzheimer Materiales y métodos
El estudio incluía 102 personas que eran todas participantes del Proyecto Oxford para investigar la memoria y el envejecimiento (OPTIMA). El examen OPTIMA de rutina anual incluye un examen físico, experimentación cognitiva y neurofisiológica. Se registra el consumo de fármacos y cualquier infección simultánea. Se extrajo sangre en heparina de litio o tubos al vacío con EDTA. Se aislaron linfocitos según un protocolo habitual utilizando Ficall (Sigma). Para estandarizar los métodos de cultivo para todos los pacientes se congelaron los linfocitos separados y se almacenaron para su análisis posterior.
Cuando los linfocitos fueron necesarios para el cultivo, se descongelaron en un baño de agua a 37ºC y se lavaron dos veces en RPMI (cualquier medio o tampón que soporte la supervivencia de los linfocitos puede utilizarse para lavar las células con efecto equivalente. La viabilidad celular (exclusión al Tripano Blue) fue de manera típica aproximadamente del 80 al 90%.
Se realizó una primera serie de experimentos en 49 personas (Tabla 1a), mientras que una segunda serie de experimentos se realizó en 55 personas (Tabla 1b). En la primera serie de experimentos (49 personas) se colocaron dos cultivos de linfocitos en paralelo procedentes de cada individuo en medio RPMI enriquecido con 10% de FCS a una concentración de 1\times10^{6} células por 1 ml de medio de cultivo. Se añadió fitohemoaglutinina (PHA) a los cultivos a una concentración final de 22 \mug/ml para activar los linfocitos. Se incubaron los cultivos durante 48 horas a 37ºC en una atmósfera humidificada que contenía 5% de CO_{2}. Después de 48 horas de incubación se trató un cultivo con 100 ng/ml de rapamicina, mientras que el otro cultivo no tratado se mantuvo como referencia. Después de 23 horas más de incubación se añadió BrdU a una concentración de 10 \mug/ml a todos los cultivos. Después de otra hora se "recogieron" los cultivos y se fijaron en 70% de etanol enfriado en hielo. Se evaluó la incorporación de BrdU utilizando inmunohistoquímica seguido de análisis FACS. Se determinó la proporción de células en varias fases del ciclo celular y se realizó la transformación de los datos para obtener la prolongación relativa de la fase G1
(Figura 1).
Los cálculos (prolongación relativa de la fase G1 del ciclo celular en cultivos tratados en comparación con los cultivos de referencia) estaban basados en las suposiciones de que las células estaban en fase exponencial de proliferación y en que la fracción de crecimiento en los cultivos (relación de células en división frente a células en reposo) fue 1,0 (5). Se supuso también que la rapamicina solamente alteraba la longitud de la fase G1 (19). Basándose en estas suposiciones se calculó la prolongación relativa de la fase G1 utilizando la fórmula: RL=100f-100 (expresada en tanto por ciento). La relación del tiempo G1 en los cultivos tratados frente a los cultivos de
referencia:
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(5).f=TG1_{tr}/TG1_{c}=[ln2-ln(2-G1_{tr})][ln(2-G1_{c})]/[ln(2-G1_{tr})][ln2-ln(2-G1_{c})]
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En la segunda serie de experimentos (53 personas) tras una incubación inicial de 48 horas (como anteriormente) se montaron cuatro cultivos independientes. Los cultivos de referencia se dejaron sin ningún tratamiento, una serie de cultivos se trató con 100 ng/ml de rapamicina, la tercera serie se trató con doxorrubiciba 1 \muM, mientras que la cuarta serie se trató con H_{2}O_{2} \muM. La doxorrubicina induce daños al ADN, que conducen a interrupciones en G2/M, en lugar de en G1/S. El tratamiento con H_{2}O_{2} produce agresión oxidativa, que conduce a una interrupción reversible y temporal del ciclo celular en G1/S.
Después de 20 horas de incubación se montó un ensayo de supervivencia MTT de 4 horas de duración (Chemicon Internacional Ltd.). Los resultados se leen utilizando un lector de microplacas (filtro 570, filtro de referencia 630). La relación entre el número de células en los cultivos tratados frente a las referencias se expresó en porcenta-
je.
Todos los experimentos se realizaron a ciegas para el diagnóstico clínico de los pacientes.
Los resultados se analizaron en relación con el diagnóstico clínico proporcionado por los médicos involucrados en el proyecto OPTIMA.
Se realizó el análisis estadístico utilizando el paquete informático Statgraphics. Se llevaron a cabo ensayos ANOVA para examinar el efecto del diagnóstico clínico sobre los parámetros del cultivo celular. Se realizó también una segunda serie de análisis para controlar el efecto de la edad sobre los resultados. La corrección de la edad permite cualquier variación relacionada con la edad en el parámetro concreto a ensayo. El efecto de la edad sobre un parámetro dado se determina observando los efectos de la edad sobre el parámetro en personas sanas.
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Resultados
Los diagnósticos clínicos de los pacientes incluidos en las dos series de experimentos se resumen en las tablas 1a y 1b. La prolongación relativa de la fase G1 bajo la influencia del inhibidor G1 específico rapamicina fue significativamente dependiente en el diagnóstico clínico de los pacientes (Anova p = 0,04, prueba de Kruskall-Wallis p = 0,017) (Figura 2). Los valores mayores, que indican la inhibición de G1 más eficaz por rapamicina, se encontraron en personas diagnosticadas como referencias, otros síndromes de demencia aparte de AD y posibles pacientes de la enfermedad de Alzheimer. Los pacientes diagnosticados que sufren de AD (probable AD por NINCDS) y aquellos con AD y en los que coexiste otra patología (ADM) se observó que presentaban un bloque G1 eficaz menos significativamente que las personas de referencia y los pacientes que padecen DNOS o possAD diagnosticados por los criterios NINCDS (Figura 2). Las diferencias entre las categorías de diagnóstico clínico son similares aun cuando el retardo de G1 relativo se corrigió por la edad (Figura 2).
En la segunda serie de experimentos el número de células después del tratamiento con rapamicina presentaban el modelo esperado de números de células mayores en cultivos AD y poss AD, en comparación con los cultivos de referencia (Figura 3). Sin embargo, la sensibilidad del sistema de análisis MTT es relativamente baja. El tratamiento con doxorrubicina no produjo diferencias significativas entre los grupos de pacientes (Figura 3). A diferencia del tratamiento con doxorrubicina, la reducción del número de células mediante el tratamiento con H_{2}O_{2} dependía del diagnóstico clínico. Los pacientes que padecen AD, preAD y possAD tenían un número de células significativamente mayor que las personas de referencia como resultado del tratamiento con H_{2}O_{2}. Los pacientes de DNOS presentaban amplias variaciones y no eran diferentes de los demás grupos de pacientes (Figura 4).
TABLA 1a Pacientes incluidos en este estudio
Diagnóstico clínico Nº de pacientes
Referencia 14
PreAD 13
PossAD 3
AD 9
ADM 7
DNOS 3
TABLA 1b
Diagnóstico clínico Nº de pacientes
Referencia 16
PreAD 18
ADM 3
AD 11
DNOS 5
Clave:
Referencia: individuos sanos con resultados normales de la prueba cognitiva y neurofisiológica;
PreAD: individuos sanos con resultados de la prueba neurofisiológica que sugieren AD incipiente;
PossAD: posible enfermedad de Alzheimer diagnosticada por los criterios NINCDS;
AD: probable enfermedad de Alzheimer diagnosticada por los criterios NINCDS;
ADM: posible enfermedad de Alzheimer (NINCDS) y pruebas de otro tipo de demencia;
\begin{minipage}[t]{158mm} DNOS: pacientes con demencia que no cumplen los requisitos de los criterios NINCDS por probable enfermedad de Alzheimer. \end{minipage}
Análisis
En este estudio los efectos de un inhibidor de G1 específico (rapamicina) (16, 19) sobre la longitud de la fase G1 en linfocitos se analizaron utilizando el ensayo de incorporación de BrdU y el análisis FACS. Se evaluó también la reducción del número de células en los cultivos después del tratamiento con rapamicina. En un segundo método, se produjo la inhibición de G1 por agresión oxidativa y se midió la reducción del número de células en el sistema de cultivo.
Los resultados de la primera serie de experimentos indican la interrupción del ciclo celular inducida por el inhibidor de G1 indicada por la prolongación de la fase G1 del ciclo celular, es significativamente menos eficaz en los pacientes que padecen la enfermedad de Alzheimer que en los individuos de referencia. También es evidente que estos cambios aparecen al principio, en la etapa en la que los pacientes no son aún clínicamente dementes pero presentan síntomas de pérdida de memoria rápida específica, que se sabe que es el primer síntoma explícito de demencia.
El bloque G1 inducido por rapamicina depende de la expresión y actividad del CDKI de p27kip1 que inhibe la actividad del complejo CyclinE/cdk2 (16, 19). Por consiguiente la prolongación relativa de la fase G1 bajo la influencia de la rapamicina, dependerá de la expresión/actividad de este CDKI (19). El hecho de que esta prolongación relativa de G1 sea significativamente menor en el paciente de la enfermedad de Alzheimer que en los individuos viejos sanos apoyaría la hipótesis de los investigadores de que una anomalía del punto de control de G1/S en las neuronas puede estar acompañada por un daño en el control del ciclo celular similar en otros tipos de células en estos pacientes. También es evidente que la anomalía en el control del ciclo celular es detectable en las células periféricas mucho antes de que aparezcan los síntomas de demencia completamente desarrollada. Esto hace posible que pueda utilizarse un ensayo basado en la estimulación mitógena de los linfocitos periféricos seguido de un bloque de transición G1/S ensayado para la detección precoz de pacientes que pueden estar en situación de riesgo de desarrollar patología tardía del cerebro de tipo AD.
Las diferencias en los números de células inducidas por H_{2}O_{2} fueron significativamente diferentes en los grupos de pacientes del estudio indicando que los linfocitos de las personas de referencia presentan una respuesta más pronunciada a la agresión oxidativa. Se ha demostrado que el tratamiento con H_{2}O_{2} 120 mM induce una interrupción del ciclo celular reversible y temporal en el punto de transición de g1/S (6) al permitir tiempo para la reparación del daño del ADN. Los resultados de los investigadores indican que este mecanismo no es completamente eficaz en los pacientes de la enfermedad de Alzheimer. Esta respuesta inadecuada a la agresión oxidativa está también presente en las personas que padecen AD preclínica. La respuesta alterada a la agresión oxidativa puede también ser un reflejo del daño al ADN preexistente más sustancial en los pacientes de AD (11). Sin embargo, esta posibilidad se excluye por el hecho de que el daño al ADN inducido por doxorrubicina, que induce una interrupción de G2/M más bien que una interrupción de G1, no es diferente en los grupos de pacientes de los investigadores. Los resultados de este estudio se interpretan por consiguiente indicando una anomalía específica en la regulación del punto de transición de
G1/S.
En resumen, los resultados de este estudio indican que la respuesta de los linfocitos activados a la inhibición de G1 está significativamente alterada en los pacientes de la enfermedad de Alzheimer. Además estas alteraciones aparecen al principio antes del comienzo de un síndrome de demencia totalmente desarrollado identificando a las personas que probablemente desarrollarán más tarde la enfermedad de Alzheimer. Los resultados indican que una prueba de diagnóstico que se basa en la detección de la integridad del punto de control de la transición de G1/S puede permitir la identificación de pacientes que están en situación de riesgo de desarrollar AD más tarde. La ventaja de este procedimiento de diagnóstico se basaría en su capacidad para identificar este grupo, abriendo la posibilidad de la intervención preventiva para estas personas.
Los protocolos descritos en el Ejemplo 1 para la separación y el cultivo de linfocitos, inducción de la división celular, inducción de la interrupción del ciclo celular mediante tratamiento con un inhibidor de la división celular o hipoxia inducida por H_{2}O_{2}, incorporación de BrdU/análisis FACS y ensayo de supervivencia de MTT, o menores adaptaciones de los mismos, pueden utilizarse todos para diagnóstico en la prueba de la presencia de una anomalía de la regulación en la transición G1/S.
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Ejemplo 2
Identificación de polimorfismos de un solo nucleótido en p21cip y p57 Métodos
Se amplió el exón 2 de p21cip del ADN genómico (extraído del cerebro o de la sangre) utilizando los cebadores 5'-CGGGATCCGGCGCCATGTCAGAACCGGC-3' (SEQ. ID. nº: 1) y 5'-CCAGACAGGTCAGCCCTTGG-3' (SEQ. ID. nº: 2). Se realizó la ampliación por PCR en un volumen final de 50 \mul utilizando 1,25 unidades de Taq ADN polimerasa, MgCl_{2} 1,5 mM, gelatina al 5%, 200 \muM de cada NTPd en tampón de PCR (Tris-HCl 75 mM, pH 8,8, (NH_{4})_{2}SO_{4} 20 mM y Tween al 0,01%). El comienzo en caliente (95ºC durante 5') fue seguido de 30 ciclos de 95ºC 1 min, 65ºC 1 min y 72ºC 1 min.
El primer segmento del exón 2 de p57 (exón 2Ap57) se amplió a partir del ADN genómico (extraído del cerebro o de la sangre) utilizando los cebadores 5'-GGC CAT GTC CGA CGC GTC-3' (SEQ. ID. nº: 3) y 5'-AGG CGG CAG CGC CCC ACC TG-3' (SEQ. ID. nº: 4). Se realizó la ampliación por PCR en un volumen final de 50 \mul utilizando 1,25 unidades de Taq ADN polimerasa, MgCl_{2} 1,5 mM, DMSO al 10%, 200 \muM de cada NTPd en tampón de PCR (Tris-HCl 75 mM, pH 8,8, (NH_{4})_{2}SO_{4} 20 mM y Tween al 0,01%). El comienzo en caliente (95ºC durante 5 min) fue seguido de 30 ciclos de 95ºC 30 s, 52ºC 30 s y 72ºC 30 s.
El segundo segmento del exón 2 de p57 (exón 2Bp57) se amplió a partir del ADN genómico (extraído del cerebro o de la sangre) utilizando los cebadores 5'-ATT ACG ACT TCC AGC AGG ACA TG-3' (SEQ. ID. nº: 5) y 5'-CTG GAG CCA GGA CCG GGA CTG-3' (SEQ. ID. nº: 6). Se realizó la ampliación por PCR en un volumen final de 50 \mul utilizando 1,25 unidades de Taq ADN polimerasa, MgCl_{2} 1,5 mM, 200 \muM de cada NTPd en tampón de PCR (Tris-HCl 75 mM, pH 8,8, (NH_{4})_{2}SO_{4} 20 mM y Tween al 0,01%). El comienzo en caliente (95ºC durante 5 min) fue seguido de 30 ciclos de 95ºC 30 s, 53ºC 30 s y 72ºC 30 s.
Para la identificación inicial se añadieron 4 \mul de producto de PCR a 16 \mul de disolución de desnaturalización (formamida desionizada al 95%, NaOH 10 mM, azul de bromofenol al 0,01% y xileno cianol FF al 0,01%) correspondiente a 20 \mul para la carga del gel. Se incubó la mezcla durante 5 min a 95ºC y se aplicó a un gel de metaphor agarosa (2% para el exón 2 de p21 y 3% para el exón 2A del p57 y exón 2B de p57) que contenían Gelstar 1:10.000. El aparato de electroforesis se mantuvo en un refrigerante normal a una temperatura constante de 4ºC. La electroforesis se realizó utilizando 1\timesTBE (Tris-borato 45 mM/EDTA 1 mM) a 5 V/cm durante 2 horas. Los modelos de SSCP que aparecen en el gel es detectaron por luz UV.
Resultados
Se obtuvieron polimorfismos en el exón 2 del gen cip de p21 y en el exón 2 de los genes kip2 del p57 (Figura 6). El polimorfismo detectado en el exón 2 de p21cip (variante A) estaba significativamente asociado a la desregulación del ciclo celular en las neuronas (Figura 7), es decir la evolución del ciclo celular a través de la transición G1/S en la fase G2, indicada por la positividad de ciclina B. En los pacientes con p21cip normales (variante B) el polimorfismo en el exón 2A de p57 está asociado a la positividad de la ciclina B (Figura 8), lo que indica la evolución del ciclo celular a través de la transición G1/S en la fase G2.
Ejemplo 3
Identificación por RAPD de mutaciones somáticas Métodos
Las mutaciones somáticas en las neuronas se identificaron utilizando métodos de identificación genética. Se extrajo ADN del cerebro y de la sangre de todos los pacientes. Se realizó la ampliación por PCR en ambas muestras de cada paciente. Se utilizaron cebadores de clase 10 para ampliar al azar secuencias de ADN polimórficas (cebadores listados en la tabla 2). La ampliación por PCR se realizó en un volumen final de 50 \mul utilizando 1,25 unidades de Taq ADN polimerasa, MgCl_{2} 1,5 mM, 200 \muM de cada NTPd en tampón de PCR (Tris-HCl 75 mM, pH 8,8, (NH_{4})_{2}SO_{4} 20 mM y Tween al 0,01%). El comienzo en caliente (95ºC durante 5 min) fue seguido de 40 ciclos de 94ºC 30 s, anterior 1 min y 72ºC 2 min. La temperatura de hibridación (AnT) varió entre 33ºC y 39ºC dependiendo del cebador. El producto de la PCR se aplicó a un gel de agarosa al 2% que contenía Gelstar 1:10.000. La electroforesis se realizó utilizando 1\timesTBE (Tris-borato 45 mM/EDTA 1 mM) a 6,5 V/cm durante 2 horas. Las características de la secuencia RAPD se detectaron por luz ultravioleta. Las diferencias entre las secuencias RAPD del ADN de la sangre y del cerebro se compararon para cada paciente y se expresaron como % de cebadores que conducen a diferentes perfiles de RAPD (perfiles de RAPD no mostrados).
Resultados
Se observó que la cantidad de mutaciones somáticas en el cerebro en pacientes de AD estaba significativamente asociada a la desregulación del ciclo celular y a la gravedad de la patología de tipo AD (Figura 9). Por consiguiente, se sugiere que la insuficiencia de la reparación del ADN puede conducir a la desregulación del punto de transición G1/S que conduce finalmente al desarrollo de la enfermedad de Alzheimer.
Los descubrimientos de genotipado están en concordancia con los descubrimientos anteriores en los linfocitos de los pacientes de AD que indican que existe una disfunción detectable en el control de la regulación de G1/S producido por CDKI que induce inhibidores o por agresión oxidativa al ADN.
TABLA 2 Cebadores utilizados para análisis RAPD
Secuencia SEQ ID nº
5'-CCGGCTACGG-3' 7
5'-CAGGCCCTTC-3' 8
5'-TACGGACACG-3' 9
5'-AGCTTCAGGG-3' 10
5'-AGGCATTCCC-3' 11
5'-GGTCTGAACC-3' 12
5'-TAGGCTCACG-3' 13
5'-ACGGTACACT-3' 14
5'-GTCCTCAACG-3' 15
5'-CAATGCGTCT-3' 16
Números de registro OMIM
Gen/proteína Número de registro
CDK3 123832
p15ink4B 600431
p16ink4A 600160
p19ink4D 600927
p27kip1 600778
p21cip1 116899
p57kip2 600856
TP53 191170
Gadd45A 126335
Gadd45B 604948
Gadd45G 604949
Gadd153 126337
PCNA 175740
Ku70 152690
KU80 194364
Ku86 604611
NDHII 603115
BLM 604610
RECQL 600537
RECQL4 603780
RECQL5 603781
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Claims (29)

1. Un método in vitro para el diagnóstico de la enfermedad de Alzheimer en una persona que comprende la identificación de la presencia de una anomalía en la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S en las células no neuronales de una persona.
2. Un método según la reivindicación 1, en el que una reducción en la eficacia del control del punto de control en la transición G1/S se considera una indicación de que la persona padece la enfermedad de Alzheimer.
3. Un método según la reivindicación 1 o 2, en el que la identificación de la presencia de una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S se realiza:
induciendo la división celular en las células no neuronales y ensayando la sensibilidad de las células a una sustancia inhibidora de la división celular, en el que la sensibilidad reducida a la sustancia inhibidora de la división celular en las células de la persona, comparada con la de las células de referencia que no presentan una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S, se considera una indicación de la presencia de una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S.
4. Un método según la reivindicación 3, en el que la sustancia inhibidora de la división celular es un inhibidor específico de G1.
5. Un método según la reivindicación 1 o 2, en el que la identificación de la presencia de una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S se realiza:
induciendo la división celular en las células no neuronales y ensayando la sensibilidad de las células a un estímulo que induce la interrupción del ciclo celular, en el que una sensibilidad reducida a dicho estímulo en las células de la persona, comparada con la de las células de referencia que no presentan una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S, se considera una indicación de la presencia de una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S.
6. Un método según la reivindicación 5, en el que el estímulo que induce la interrupción del ciclo celular se selecciona de la agresión oxidativa, radiación ionizante, hipoxia o radiación ultravioleta.
7. Un método según cualquiera de las reivindicaciones 3 a 6, en el que la sensibilidad de las células a la sustancia inhibidora de la división celular o al estímulo que induce la interrupción del ciclo celular se determina mediante un ensayo de proliferación celular, la actividad proliferante relativamente elevada en las células de la persona, comparada con la de las células de referencia que no presentan una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S, después del tratamiento con el inhibidor de la división celular o considerándose el estímulo que induce la interrupción del ciclo celular una indicación de la presencia de una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S.
8. Un método según cualquiera de las reivindicaciones 3 a 6, en el que la sensibilidad de las células a la sustancia inhibidora de la división celular o al estímulo que induce la interrupción del ciclo celular se determina calculando la prolongación relativa de la fase G1 del ciclo celular en las células de la persona, una prolongación relativa reducida de la fase G1 en presencia de la sustancia inhibidora de la división celular o del estímulo en dichas células, comparado con la de las células de referencia que no presentan una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S, considerándose una indicación de la presencia de una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S.
9. Un método según cualquiera de las reivindicaciones 3 a 6, en el que la sensibilidad de las células a la sustancia inhibidora de la división celular o al estímulo que induce la interrupción del ciclo celular se determina por análisis de la expresión de una proteína reguladora del ciclo celular o de un ARNm que codifica una proteína reguladora del ciclo celular.
10. Un método según la reivindicación 9, en el que la proteína reguladora del ciclo celular se selecciona del grupo constituido por CDKN3, pl5ink4B, p16ink4A, p19ink4D, p27kip1, p21cip1, p57kip2 y TP53.
11. Un método según la reivindicación 5, en el que el estímulo que induce la interrupción del ciclo celular es un daño al ADN y la sensibilidad de las células a este estímulo se determina mediante análisis de la expresión de un elemento de respuesta al daño al ADN.
12. Un método según la reivindicación 11, en el que el elemento de respuesta al daño al ADN se selecciona del grupo constituido por TP53, Gadd34, Gadd45A, Gadd45B, Gadd45G, Gadd153 y PCNA.
13. Un método según cualquiera de las reivindicaciones 3 a 6, en el que la sensibilidad de las células a la sustancia inhibidora de la división celular o al estímulo que induce la interrupción del ciclo celular se determina por evaluación de la viabilidad celular o de la muerte celular, en el que el aumento de la supervivencia celular o un grado reducido de la muerte celular en dichas células, comparado con la de las células de referencia que no presentan una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S, después de la exposición del inhibidor de la división celular o de otros estímulos que inducen la interrupción del ciclo celular se considera una indicación de la presencia de una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S.
14. Un método según cualquiera de las reivindicaciones 3 a 6, en el que la sensibilidad de las células a la sustancia inhibidora de la división celular o al estímulo que provoca la interrupción del ciclo celular se determina por análisis de la expresión de una proteína relacionada con la muerte celular o de un ARNm que codifica una proteína relacionada con la muerte celular.
15. Un método según la reivindicación 14, en el que la proteína relacionada con la muerte celular es un miembro de la familia bcl-2 de proteínas.
16. Un método según cualquiera de las reivindicaciones 3 a 6, en el que la sensibilidad de las células a la sustancia inhibidora de la división celular o al estímulo que provoca la interrupción del ciclo celular se determina por evaluación del contenido de ADN de las células con o sin análisis del ciclo celular.
17. Un método según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 16, en el que las células no neuronales son linfocitos.
18. Un método según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 17, para el diagnóstico de la enfermedad de Alzheimer esporádica.
19. Un método de identificación in vitro de compuestos con actividad farmacológica potencial en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer, método que comprende las etapas siguientes:
analizar la regulación de la transición G1/S en células no neuronales, células que presentan una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S, en presencia y ausencia de un compuesto de ensayo, en el que se identifica que un compuesto de ensayo que produce la corrección de la anomalía de la regulación en la transición G1/S en dichas células, presenta actividad farmacológica potencial en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer.
20. Un método de determinación in vitro si un agente farmacológico es probable que sea de utilidad en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer en una persona determinada, método que comprende:
analizar la regulación de la transición G1/S en células de dicho individuo, cuyas células no son neuronales que presentan una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S, en presencia y ausencia del agente farmacológico que produce la corrección de la anomalía de la regulación en la transición G1/S en dichas células se identifica como probable que sea beneficioso en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer en dicho individuo.
21. Un método de identificación de la predisposición de una persona a la enfermedad de Alzheimer que comprende la identificación de la presencia en el genoma de dicha persona de al menos una mutación o variante alélica en un gen regulador del ciclo celular.
22. Un método según cualquiera de las reivindicaciones 19 a 21, que comprende la identificación de la presencia de mutaciones o variantes alélicas en al menos un gen seleccionado de: CDKN3, pl5ink4B, p16ink4A, p19ink4D, p27kip1, p21cip1, p57kip2 y TP53.
23. Un método según la reivindicación 22, que comprende el genotipado de uno o más del polimorfismo A/B de p21E2, del polimorfismo A/B de p57E2A o del polimorfismo A/B de p57E2B.
24. Un método para su utilización en el diagnóstico de la enfermedad de Alzheimer en una persona que comprende la identificación de la presencia en el genoma de dicha persona de al menos una mutación o variante alélica en un gen que codifica una enzima para la reparación del ADN, en el que la presencia de una mutación o variante alélica en dicho gen se considera una indicación de la enfermedad de Alzheimer.
25. Un método de determinación de cualquier base genética de la enfermedad de Alzheimer en una persona, que comprende la identificación de la presencia de mutaciones o variantes alélicas en el genoma de dicha persona en un gen que codifica una enzima de reparación del ADN.
26. Un método de identificación de la predisposición a la enfermedad de Alzheimer en una persona, que comprende la identificación de la presencia de al menos una mutación o variante alélica en el genoma de dicha persona en un gen que codifica una enzima de reparación del ADN.
27. Un método según cualquiera de las reivindicaciones 24 a 26 que comprende la identificación de la presencia de mutaciones o variantes alélicas en al menos un gen seleccionado de: Ku70, Ku80, Ku86, NDHII, BLM, RECQL, RECQL4 y RECQL5.
28. Un método de identificación de compuestos con actividad farmacológica potencial en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer, cuyo método comprende las etapas siguientes:
analizar la regulación de la transición G1/S en células no neuronales, cuyas células presentan una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S, en presencia y ausencia de un compuesto de ensayo que produce la corrección de la anomalía de la regulación en la transición G1/S en dichas células se identifica que posee actividad farmacológica potencial en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer.
29. Un método de determinar si un agente farmacológico es probable que sea de utilidad en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer en una persona determinada, cuyo método comprende:
analizar la regulación de la transición G1/S en células de dicho individuo, cuyas células son células no neuronales que presentan una anomalía de la regulación del ciclo celular en la fase de transición G1/S, en presencia y ausencia del agente farmacológico, en el que un agente farmacológico que produce la corrección de la anomalía de la regulación en la transición G1/S en dichas células se identifica como probable que sea beneficioso en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer en dicho individuo.
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