ES2277581T3 - PROTEINS AND PEPTIDES ALLERGEN FROM DOMESTIC POWDER ACAROS AND USES OF THE SAME. - Google Patents
PROTEINS AND PEPTIDES ALLERGEN FROM DOMESTIC POWDER ACAROS AND USES OF THE SAME. Download PDFInfo
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Abstract
Ácido nucleico aislado que comprende una secuencia de nucleótidos que codifica un alergeno proteínico Der f VII que comprende la secuencia de aminoácidos de la ID SEC Nº: 7 o la porción madura de dicho alergeno.Isolated nucleic acid comprising a nucleotide sequence encoding a Der f VII protein allergen comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 or the mature portion of said allergen.
Description
Proteínas y péptidos alergenos de ácaros del polvo doméstico y usos de los mismos.Mite allergen proteins and peptides from household dust and uses thereof.
Los individuos de aproximadamente el 10% de la población devienen hipersensibilizados (alérgicos) al sufrir exposición a antígenos de una variedad de fuentes ambientales. Aquellos antígenos que inducen tipos inmediatos y/o retardados de hipersensibilidad son conocidos como alergenos (King, T.P., (1976) Adv. Immunol., 23:77-105). Éstos incluyen productos de gramíneas, árboles, malas hierbas, caspa animal, insectos, alimentos, drogas y productos químicos. Se cree que la predisposición genética de un individuo desempeña un papel en el desarrollo de respuestas alérgicas inmediatas (Young, R. P. et al., (1990) Clin. Sci., 79:19) tales como atopia y anafilaxis cuyos síntomas incluyen la fiebre del heno, el asma y la urticaria.Individuals of approximately 10% of the population become hypersensitized (allergic) upon exposure to antigens from a variety of environmental sources. Those antigens that induce immediate and / or delayed types of hypersensitivity are known as allergens (King, TP, (1976) Adv. Immunol ., 23 : 77-105). These include grass products, trees, weeds, animal dander, insects, food, drugs and chemicals. It is believed that the genetic predisposition of an individual plays a role in the development of immediate allergic responses (Young, RP et al ., (1990) Clin. Sci ., 79 : 19) such as atopy and anaphylaxis whose symptoms include fever Hay, asthma and hives.
Los anticuerpos que intervienen en la alergia
atópica pertenecen principalmente a la clase IgE de
inmunoglobulinas. La IgE se fija a los basófilos, los mastocitos y
las células dendríticas a través de un receptor específico de alta
afinidad Fc\varepsilonRI (Kinet, J.P., (1990) Curr. Opin.
Immunol., 2:499-505). Al tener lugar la
combinación de un alergeno que actúa como ligando con su IgE
receptora afín, el FceRI fijado a la IgE puede ser objeto de unión
intermolecular sobre la superficie de la célula, dando como
resultado manifestaciones fisiológicas de la interacción entre el
alergeno y la IgE. Estos efectos fisiológicos incluyen la liberación
de, entre otras sustancias, histamina, serotonina, heparina y
fac-
tor(es) quimiotáctico(s) para leucocitos
eosinofílicos y/o leucotrienos C4, D4 y E4, que ocasionan una
constricción prolongada de las células de músculo liso bronquiales
(Hood, L.E. et al., Immunology (2ª ed.), The
Benjamin/Cumming Publishing Co., Inc. (1984)). Por consiguiente, la
última consecuencia de la interacción de un alergeno con IgE es la
consistente en la aparición de síntomas alérgicos activados por la
liberación de los mediadores anteriormente mencionados. Tales
síntomas pueden ser de naturaleza sistémica o local, en dependencia
de la ruta de entrada del antígeno y del patrón de deposición de IgE
sobre los mastocitos o los basófilos. Las manifestaciones locales
tienen generalmente lugar en las superficies epiteliales en el sitio
de entrada del alergeno. Los efectos sistémicos pueden inducir
anafilaxis (shock anafiláctico) que es resultado de la respuesta de
la combinación de IgE-basófilo al antígeno
circulante (intravascular).The antibodies involved in atopic allergy belong mainly to the IgE class of immunoglobulins. IgE is fixed to basophils, mast cells and dendritic cells through a specific high affinity receptor Fc? (Kinet, JP, (1990) Curr. Opin. Immunol ., 2 : 499-505). When the combination of an allergen that acts as a ligand with its related receptor IgE takes place, the FceRI bound to the IgE can be subject to intermolecular binding on the cell surface, resulting in physiological manifestations of the interaction between the allergen and the IgE These physiological effects include the release of, among other substances, histamine, serotonin, heparin and fac-
chemotactic tor (s) for eosinophilic leukocytes and / or C4, D4 and E4 leukotrienes, which cause prolonged constriction of bronchial smooth muscle cells (Hood, LE et al ., Immunology (2nd ed.), The Benjamin / Cumming Publishing Co., Inc. (1984)). Therefore, the last consequence of the interaction of an allergen with IgE is that it consists in the appearance of allergic symptoms activated by the release of the mediators mentioned above. Such symptoms may be systemic or local in nature, depending on the route of entry of the antigen and the pattern of IgE deposition on mast cells or basophils. Local manifestations generally take place on epithelial surfaces at the site of allergen entry. Systemic effects can induce anaphylaxis (anaphylactic shock) that results from the response of the IgE-basophil combination to the circulating (intravascular) antigen.
Los estudios llevados a cabo con alergenos purificados han demostrado que aproximadamente el 80% de los pacientes que son alérgicos al ácaro Dermatophagoides pteronyssinus producen IgE reactiva al Der p I y al Der p II (Chapman M.D. et al., J. Immunol. (1980) 125:587-92; Lind P., J. Allergy Clin. Immunol. (1985) 76:753-61; Van derZee J.S. et al., J. Allergy Clin. Immunol. (1988) 81:884-95). Para aproximadamente la mitad de los pacientes, estas especificidades constituyen el 50% del anticuerpo antiácaro IgE. El alergeno Der p III, recientemente identificado como tripsina, (Stewart G.A. et al., Immunology (1992) 75:29-35) reacciona con una frecuencia similar o más alta (Stewart G.A. et al., supra; Ford S.A. et al., Clin. Exp. Allergy (1989) 20:27-31). Sin embargo, en el único estudio cuantitativo llevado a cabo hasta la fecha, los investigadores informaron de que el nivel de fijación de IgE es considerablemente inferior al del Der p I. Las técnicas de electroforesis (Ford S.A. et al., supra; Bengtsson A. et al., Int. Arch. Allergy Appl. Immunol. (1986) 80:383-90; Lind P. et al., Scand. J. Immunol. (1983) 17:263-73; Tovey E.R. et al., J. Allergy Clin. Immunol. (1987) 79:93-102) han puesto de manifiesto que la mayoría de sueros reconocen otros alergenos. Por ejemplo, en el estudio de Ford et al. (supra) el análisis Western blot mostró 8 sueros que reaccionaban con 1-2 bandas, 6 con 3-6 y 3 con un número mayor, incluyendo uno con al menos 13. En otro estudio, Baldo et al. (Adv. Bioscience (1989) 4:13:31) informan sobre el hallazgo de componentes a nivel de una Mr de 30, 26 y 25 K que reaccionan con el 50% de sueros. Para determinar la importancia de las especificidades particulares en las reacciones alérgicas, se requerirían alergenos purificados para los ensayos cuantitativos de fijación de IgE y para examinar la frecuencia y el perfil linfocínico para la reactividad de las células T.Studies with purified allergens have shown that approximately 80% of patients who are allergic to the Dermatophagoides pteronyssinus mite produce IgE reactive to Der p I and Der p II (Chapman MD et al ., J. Immunol . (1980 ) 125 : 587-92; Lind P., J. Allergy Clin. Immunol . (1985) 76 : 753-61; Van derZee JS et al ., J. Allergy Clin. Immunol . (1988) 81 : 884-95) . For approximately half of the patients, these specificities constitute 50% of the IgE anti-mite antibody. The allergen Der p III, recently identified as trypsin, (Stewart GA et al ., Immunology (1992) 75 : 29-35) reacts with a similar or higher frequency (Stewart GA et al ., Supra ; Ford SA et al . , Clin. Exp. Allergy (1989) 20 : 27-31). However, in the only quantitative study conducted to date, the researchers reported that the level of IgE fixation is considerably lower than that of Der p I. Electrophoresis techniques (Ford SA et al ., Supra ; Bengtsson A . et al ., Int. Arch. Allergy Appl. Immunol . (1986) 80 : 383-90; Lind P. et al ., Scand. J. Immunol . (1983) 17 : 263-73; Tovey ER et al . J. Allergy Clin. Immunol . (1987) 79 : 93-102) have shown that most sera recognize other allergens. For example, in the study by Ford et al . ( supra ) Western blot analysis showed 8 sera reacting with 1-2 bands, 6 with 3-6 and 3 with a larger number, including one with at least 13. In another study, Baldo et al . ( Adv. Bioscience (1989) 4 : 13: 31) report on the finding of components at the level of a Mr of 30, 26 and 25 K that react with 50% of sera. To determine the importance of particular specificities in allergic reactions, purified allergens would be required for quantitative IgE fixation assays and to examine the frequency and lymphokine profile for the reactivity of T cells.
El tratamiento de los pacientes con sensibilidad a los ácaros del polvo doméstico mediante la administración de dosis crecientes de extractos de polvo doméstico tiene los inconvenientes de la potencial anafilaxis durante el tratamiento y de la posible necesidad de continuar la terapia por espacio de un período de tiempo de varios años para generar una tolerancia suficiente que redunde en una importante disminución de los síntomas clínicos. Serían beneficiosos una composición terapéutica y un método terapéutico que evitasen estos problemas.The treatment of sensitive patients to house dust mites by dose administration Increasing domestic dust extracts has the drawbacks of the potential anaphylaxis during treatment and of the possible need to continue therapy for a period of time of several years to generate a sufficient tolerance that results in a significant decrease in clinical symptoms. A therapeutic composition and method would be beneficial therapeutic to avoid these problems.
Esta invención aporta ácidos nucleicos aislados que codifican péptidos que tienen la actividad antigénica del Der f VII, que es un alergeno proteínico de la especie Dermatophagoides faringe. El ácido nucleico preferido es el cDNA (cDNA = DNA complementario) que tiene una secuencia de nucleótidos ilustrada en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 6) (Der f VII). La invención es también relativa a péptidos que son codificados por todo este cDNA (ID SEC Nº: 6) o por una parte del mismo y que tienen la actividad antigénica del Der f VII. Están también contemplados ácidos nucleicos que hibriden bajo condiciones estrictas (es decir, equivalentes a aproximadamente 20-27ºC por debajo de la temperatura de fusión (T_{m}) y a sal aproximadamente 1M) para formar un ácido nucleico con una secuencia de nucleótidos ilustrada en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 6) o que codifican un péptido que comprende la totalidad o una parte de una secuencia de aminoácidos de la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 7) (Der f VII). Se aportan también ácidos nucleicos que codifican péptidos que tienen una actividad de Der f VII y tienen al menos un 50% de homología con una secuencia ilustrada en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 7) (Der f VII). Son también aportados por esta invención péptidos que tienen una actividad de Der f VII producidos por medio de la expresión recombinante de un ácido nucleico de la invención, y péptidos que tienen una actividad de Der f VII preparados por síntesis química. Los péptidos preferidos tienen la capacidad de inducir una respuesta de las células T que puede incluir la estimulación de las células T (medida, por ejemplo, por medio de la proliferación de células T o de la secreción de citoquina) o la incapacidad de respuesta de las células T (es decir que el contacto con el péptido o con un complejo del péptido con una molécula de MHC (MHC = complejo mayor de histocompatibilidad) de una célula que presente el antígeno induce a la célula T a ser incapaz de responder a las señales estimuladoras o a ser incapaz de proliferar). Otros péptidos preferidos, ya sea aparte de o bien además de la capacidad de inducir una respuesta de las células T, tienen la capacidad de fijar la IgE específica de los ácaros del polvo doméstico de los sujetos alérgicos a los ácaros del polvo. Tales péptidos son útiles para diagnosticar la sensibilidad de un sujeto a los ácaros del polvo. Aun otros péptidos, ya sea aparte o bien además de la capacidad de inducir una respuesta de las células T, tienen una capacidad considerablemente reducida para fijar la IgE alérgica a los ácaros del polvo. Tales péptidos son particularmente útiles como agentes terapéuticos.This invention provides isolated nucleic acids encoding peptides that have the antigenic activity of Der f VII, which is a protein allergen of the Dermatophagoides pharynx species. The preferred nucleic acid is cDNA (cDNA = complementary DNA) having a nucleotide sequence illustrated in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 6) ( Der f VII). The invention is also related to peptides that are encoded throughout this cDNA (SEQ ID NO: 6) or a part thereof and that have the antigenic activity of Der f VII. Nucleic acids that hybridize under strict conditions are also contemplated (ie, equivalent to about 20-27 ° C below the melting temperature (T m) and about 1M salt) to form a nucleic acid with a nucleotide sequence illustrated in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 6) or encoding a peptide comprising all or a portion of an amino acid sequence of Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 7) ( Der f VII). Nucleic acids encoding peptides that have a Der f VII activity and have at least 50% homology are also provided with a sequence illustrated in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 7) ( Der f VII). Peptides having a Der f VII activity produced by means of the recombinant expression of a nucleic acid of the invention are also provided by this invention, and peptides having a Der f VII activity prepared by chemical synthesis. Preferred peptides have the ability to induce a T cell response that may include stimulation of T cells (measured, for example, by proliferation of T cells or cytokine secretion) or inability to respond to T cells (that is, contact with the peptide or with a peptide complex with an MHC molecule (MHC = major histocompatibility complex) of a cell presenting the antigen induces the T cell to be unable to respond to stimulatory signals or being unable to proliferate). Other preferred peptides, either apart from or in addition to the ability to induce a T-cell response, have the ability to fix the specific IgE of house dust mites of subjects allergic to dust mites. Such peptides are useful for diagnosing the sensitivity of a subject to dust mites. Even other peptides, either apart or in addition to the ability to induce a T-cell response, have a considerably reduced ability to fix allergic IgE to dust mites. Such peptides are particularly useful as therapeutic agents.
Otros péptidos preferidos comprenden una secuencia de aminoácidos ilustrada en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 7) (Der f VII). En una realización se aportan péptidos que tienen actividad antigénica de Der f VII y comprenden una parte de la secuencia de aminoácidos de la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 7). Tales péptidos son de una longitud de al menos 8-30 aminoácidos, preferiblemente de una longitud de 10-20 aminoácidos, y con la máxima preferencia, de una longitud de 10-16 aminoácidos.Other preferred peptides comprise an amino acid sequence illustrated in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 7) ( Der f VII). In one embodiment, peptides are provided that have Der f VII antigenic activity and comprise a part of the amino acid sequence of Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 7). Such peptides are at least 8-30 amino acids in length, preferably 10-20 amino acids in length, and most preferably, 10-16 amino acids in length.
Otro aspecto de la invención aporta anticuerpos que son específicamente reactivos con un péptido que tiene actividad antigénica del Der f VII. Puede ser utilizado en composiciones adecuadas para administración farmacéutica un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII. Tales composiciones pueden ser utilizadas de una manera similar a como se utilizan los extractos de ácaros del polvo para tratar o prevenir las reacciones alérgicas a un alergeno de los ácaros del polvo en un sujeto. Pueden ser también utilizados para diagnosticar la sensibilidad de un sujeto a un alergeno de los ácaros del polvo ácidos nucleicos de la invención y péptidos que tengan la actividad antigénica del Der f VII.Another aspect of the invention provides antibodies that are specifically reactive with a peptide having antigenic activity of Der f VII. A peptide having the antigenic activity of Der f VII can be used in compositions suitable for pharmaceutical administration. Such compositions can be used in a manner similar to how dust mite extracts are used to treat or prevent allergic reactions to an allergen from dust mites in a subject. They can also be used to diagnose the sensitivity of a subject to an allergen in the dust mites nucleic acids of the invention and peptides having the antigenic activity of Der f VII.
La Fig. 1 ilustra la frecuencia de fijación de la IgE de sueros alérgicos con placas de \lambdagt11-HD6.Fig. 1 illustrates the fixing frequency of IgE of allergic sera with plaques λ11-HD6.
La Fig. 2 muestra la reactividad de la IgE y del anticuerpo de conejo antiácaros del polvo doméstico frente al producto de fusión del inserto HD6 clonado en pGEX-1 glutatión-S-transferasa purificada.Fig. 2 shows the reactivity of IgE and rabbit dust mite antibody against domestic HD6 insert fusion product cloned into pGEX-1 glutathione-S-transferase purified.
La Fig. 3A y la Fig. 3B es la secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos deducida del clon de Der p VII HD6.Fig. 3A and Fig. 3B is the nucleotide sequence and the deduced amino acid sequence of the Der p VII HD6 clone.
La Fig. 4 muestra extractos de ácaros de polvo doméstico caracterizados por electroforesis en un SDS-PAGE (SDS-PAGE = procedimiento de caracterización por electroforesis en gel de poliacrilamida en presencia de dodecilsulfato sódico) al 8-18%, con electrotransferencia a nitrocelulosa y reacción con suero alérgico combinado absorbido con lisados de E. coli que contienen un control vectorial pGEX-1 (carril 1) o HD6 de pGEX-1 (carril 2).Fig. 4 shows extracts of house dust mites characterized by electrophoresis in an SDS-PAGE (SDS-PAGE = characterization procedure by polyacrylamide gel electrophoresis in the presence of sodium dodecyl sulfate) at 8-18%, with electrotransfer to nitrocellulose and Combined allergic serum reaction absorbed with E. coli lysates containing a vector control pGEX-1 ( lane 1 ) or HD6 of pGEX-1 ( lane 2 ).
La Fig. 5 muestra la reactividad de anticuerpos anti-HD6 purificados según afinidad para con extractos de D. Pteronyssinus. Anticuerpos de conejo fueron purificados según afinidad sobre nitrocelulosa, y fueron utilizados para servir de sonda en un análisis Western blot de extractos de ácaros, con electroforesis en SDS-PAGE al 8-18%, y fueron revelados con A proteínica-^{125}I.Fig. 5 shows the reactivity of anti-HD6 antibodies purified according to affinity for extracts of D. Pteronyssinus . Rabbit antibodies were purified according to affinity on nitrocellulose, and were used to serve as a probe in a Western blot analysis of mite extracts, with electrophoresis in 8-18% SDS-PAGE, and were revealed with Protein A -125 I.
La Fig. 6A y la Fig. 6B es la secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos deducida de Der f VII.Fig. 6A and Fig. 6B is the nucleotide sequence and the deduced amino acid sequence of Der f VII.
La Fig. 7A, 7B, 7C, 7D y 7E es una comparación de la secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos deducida entre Der f VII y Der p VII. Los puntos indican igualdad en la secuencia de nucleótidos Der f VII y Der p VII. Se indican las bases de nucleótidos que difieren entre Der f VII y Der p VII, junto con cualquier diferencia en los aminoácidos correspondientes.Fig. 7A, 7B, 7C, 7D and 7E is a comparison of the nucleotide sequence and the deduced amino acid sequence between Der f VII and Der p VII. The dots indicate equality in the nucleotide sequence Der f VII and Der p VII. Nucleotide bases that differ between Der f VII and Der p VII are indicated, along with any difference in the corresponding amino acids.
Esta invención es relativa a ácidos nucleicos aislados que codifican péptidos que tienen la actividad antigénica del Der f VII, que es un alergeno de la especie Dermatophagoides farinae. Preferiblemente, el ácido nucleico es un cDNA que comprende una secuencia de nucleótidos ilustrada en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 6) (Der f VII).This invention is related to isolated nucleic acids encoding peptides having the antigenic activity of Der f VII, which is an allergen of the Dermatophagoides farinae species. Preferably, the nucleic acid is a cDNA comprising a nucleotide sequence illustrated in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 6) ( Der f VII).
El cDNA ilustrado en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 6) codifica un péptido de Der f VII. Dicho péptido de Der f VII es codificado por las bases 43 a 681 de esta secuencia de cDNA. La secuencia de aminoácidos deducida de Der f VII basada en este cDNA está también ilustrada en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 7). Dicho péptido de Der f VII puede contener una secuencia de cabeza no encontrada en la proteína madura.The cDNA illustrated in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 6) encodes a Der f VII peptide. Said Der f VII peptide is encoded by bases 43 to 681 of this cDNA sequence. The deduced amino acid sequence of Der f VII based on this cDNA is also illustrated in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 7). Said Der f VII peptide may contain a head sequence not found in the mature protein.
Una célula huésped transfectada con un vector de expresión que contenía una secuencia de nucleótidos que codificaba Der f VII fue depositada según el Tratado de Budapest en los Laboratorios Analíticos del Estado Australiano el 10 de mayo de 1994, y a dicha célula le fue dado el número de registro de entrada N94/8705.A host cell transfected with an expression vector containing a nucleotide sequence encoding Der f VII was deposited according to the Budapest Treaty at the Australian State Analytical Laboratories on May 10, 1994, and said cell was given the number of entry register N94 / 8705.
En consecuencia, un aspecto de esta invención es relativo a ácidos nucleicos aislados que comprenden secuencias de nucleótidos que codifican Der f VII, a fragmentos de los mismos que codifican péptidos que tienen la actividad antigénica del Der f VII, y a equivalentes de tales ácidos nucleicos. En el sentido en el que se la utiliza en la presente, se entiende que la expresión ácido nucleico incluye tales fragmentos y equivalentes. El vocablo "equivalente" es utilizado con la intención de incluir secuencias de nucleótidos que codifican proteínas de Der f VII funcionalmente equivalentes o péptidos funcionalmente equivalentes que tienen la actividad antigénica del Der f VII. En el sentido en el que se le define en la presente, un péptido que tiene una actividad de Der f VII tiene al menos una actividad biológica del alergeno Der f VII. Las secuencias nucleotídicas equivalentes incluirán secuencias que difieran en una o varias sustituciones, adiciones o deleciones nucleotídicas, tales como variantes alélicas, e incluirán también secuencias que difieran de la secuencia nucleotídica que codifica Der f VII ilustrada en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 6) debido a la degeneración del código genético. Los equivalentes incluirán también secuencias de nucleótidos que hibriden bajo condiciones estrictas (es decir, equivalentes a aproximadamente 20-27ºC por debajo de la temperatura de fusión (T_{m}) y a sal aproximadamente 1M) para formar la secuencia de nucleótidos del Der f VII ilustrada en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 6).Accordingly, one aspect of this invention is related to isolated nucleic acids comprising nucleotide sequences encoding Der f VII, fragments thereof encoding peptides having the antigenic activity of Der f VII, and equivalent of such nucleic acids. In the sense that it is used herein, it is understood that the term "nucleic acid" includes such fragments and equivalents. The term "equivalent" is used with the intention of including nucleotide sequences encoding functionally equivalent Der f VII proteins or functionally equivalent peptides having the antigenic activity of Der f VII. In the sense defined herein, a peptide having a Der f VII activity has at least one biological activity of the Der f VII allergen. The equivalent nucleotide sequences will include sequences that differ in one or more substitutions, additions or nucleotide deletions, such as allelic variants, and will also include sequences that differ from the nucleotide sequence encoding Der f VII illustrated in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO. : 6) due to the degeneracy of the genetic code. The equivalents will also include nucleotide sequences that hybridize under strict conditions (i.e., equivalent to approximately 20-27 ° C below the melting temperature (T m) and approximately 1M salt) to form the nucleotide sequence of Der f VII illustrated in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 6).
Los péptidos a los que se alude en la presente como péptidos que tienen la actividad antigénica del Der f VII o que tienen una actividad de Der f VII son definidos en la presente como péptidos que tienen una secuencia de aminoácidos que corresponde en sustancia a la totalidad o a una parte de la secuencia de aminoácidos del Der f VII ilustrada en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 7), cuyo péptido tiene la actividad antigénica del Der f VII. Por ejemplo, un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII puede tener la capacidad de inducir una respuesta en células T restringidas por Der f VII, tal como la estimulación (p. ej. la proliferación de células T o la secreción de citoquina), o de inducir la incapacidad de respuesta de las células T. Como alternativa, o bien adicionalmente, un péptido que tenga una actividad de Der f VII puede tener la capacidad de fijar (de ser reconocido por) anticuerpos de inmunoglobulina E (IgE) de los sujetos alérgicos a los ácaros del polvo. Los péptidos que fijan la IgE son útiles en los métodos para detectar la sensibilidad alérgica al Der f VII en un sujeto. Los péptidos que no fijan la IgE, o que fijan la IgE en menor grado en comparación con el grado en que una proteína de Der f VII nativa purificada fija la IgE, son particularmente útiles como agentes terapéuticos.Peptides referred to herein as peptides that have Der f VII antigenic activity or that have Der f VII activity are defined herein as peptides having an amino acid sequence that substantially corresponds to the totality. or to a part of the amino acid sequence of Der f VII illustrated in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 7), whose peptide has the antigenic activity of Der f VII. For example, a peptide having the antigenic activity of Der f VII may have the ability to induce a response in T cells restricted by Der f VII, such as stimulation (eg T cell proliferation or cytokine secretion ), or to induce the inability to respond to T cells. Alternatively, or additionally, a peptide having a Der f VII activity may have the ability to bind (if recognized by) immunoglobulin E (IgE) antibodies of subjects allergic to dust mites. Peptides that bind IgE are useful in methods to detect allergic sensitivity to Der f VII in a subject. Peptides that do not bind IgE, or that bind IgE to a lesser extent compared to the degree to which a purified native Der f VII protein binds IgE, are particularly useful as therapeutic agents.
En una realización, el ácido nucleico es un cDNA que codifica un péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII. Preferiblemente, el ácido nucleico es una molécula de cDNA que comprende al menos una parte de la secuencia de nucleótidos que codifica Der f VII ilustrada en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 6). Una parte preferida de las moléculas de cDNA de la Figura 6A y 6B incluye la región codificadora de la molécula.In one embodiment, the nucleic acid is a cDNA encoding a peptide that has the antigenic activity of Der f VII. Preferably, the nucleic acid is a cDNA molecule comprising at least a part of the nucleotide sequence encoding Der f VII illustrated in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 6). A preferred part of the cDNA molecules of Figure 6A and 6B includes the coding region of the molecule.
En otra realización, el ácido nucleico de la invención codifica un péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII, y comprende una secuencia de aminoácidos ilustrada en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 7) (Der f VII). Los ácidos nucleicos preferidos codifican un péptido que tiene actividad antigénica de Der f VII y al menos aproximadamente un 50%, con más preferencia al menos aproximadamente un 60%, y con la máxima preferencia al menos aproximadamente un 70%, de homología con una secuencia expuesta en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 6) (Der f VII). Están también comprendidos dentro del alcance de la invención ácidos nucleicos que codifican péptidos que tienen actividad antigénica de Der f VII y tienen al menos aproximadamente un 90%, con más preferencia al menos aproximadamente un 95%, y con la máxima preferencia al menos aproximadamente un 98-99%, de homología con una secuencia expuesta en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 7) (Der f VII). El vocablo homología se refiere a la similitud de secuencias entre dos péptidos que tienen una actividad de Der f VII o entre dos moléculas de ácido nucleico. La homología puede ser determinada a base de comparar una posición en cada secuencia, cuyas secuencias pueden ser alineadas a efectos comparativos. Cuando una posición en la secuencia comparada está ocupada por la misma base o por el mismo aminoácido, las moléculas son entonces homólogas en esa posición. Un grado de homología entre secuencias es una función del número de posiciones coincidentes u homólogas compartidas por las secuencias.In another embodiment, the nucleic acid of the invention encodes a peptide that has the antigenic activity of Der f VII, and comprises an amino acid sequence illustrated in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 7) ( Der f VII). Preferred nucleic acids encode a peptide having Der f VII antigenic activity and at least about 50%, more preferably at least about 60%, and most preferably at least about 70%, homology with a sequence set forth in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 6) ( Der f VII). Nucleic acids encoding peptides that have Der f VII antigenic activity and have at least about 90%, more preferably at least about 95%, and most preferably at least about one within the scope of the invention are also within the scope of the invention. 98-99%, homology with a sequence set out in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 7) ( Der f VII). The term homology refers to the similarity of sequences between two peptides that have a Der f VII activity or between two nucleic acid molecules. Homology can be determined by comparing a position in each sequence, whose sequences can be aligned for comparative purposes. When a position in the compared sequence is occupied by the same base or by the same amino acid, the molecules are then homologous in that position. A degree of homology between sequences is a function of the number of matching or homologous positions shared by the sequences.
Otro aspecto de la invención aporta un ácido nucleico que hibrida bajo condiciones muy o poco estrictas para formar un ácido nucleico que codifica un péptido que tiene la totalidad o una parte de una secuencia de aminoácidos ilustrada en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 7) (Der f VII). Las condiciones de exigencia apropiadas que favorecen la hibridación, como por ejemplo 6,0 x de cloruro sódico/citrato sódico (SSC) a aproximadamente 45ºC, seguido por un lavado a 2,0 x SSC a 50ºC, son bien conocidas por los expertos en la materia o bien se pueden encontrar en Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, N.Y. (1989), 6.3.1-6.3.6. Por ejemplo, la concentración de sal en la etapa de lavado se puede seleccionar desde unas condiciones poco estrictas, de aproximadamente 2,0 x SSC a 50ºC, hasta unas condiciones muy estrictas, de aproximadamente 0,2 x SSC a 50ºC. Además, la temperatura en la etapa de lavado puede aumentar desde unas condiciones poco estrictas, a temperatura ambiente (aproximadamente 22ºC), hasta unas condiciones muy estrictas, a aproximadamente 65ºC.Another aspect of the invention provides a nucleic acid that hybridizes under very strict conditions to form a nucleic acid encoding a peptide that has all or part of an amino acid sequence illustrated in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 7) ( Der f VII). Appropriate requirement conditions that favor hybridization, such as 6.0 x sodium chloride / sodium citrate (SSC) at about 45 ° C, followed by washing at 2.0 x SSC at 50 ° C, are well known to those skilled in the matter can be found in Current Protocols in Molecular Biology , John Wiley & Sons, NY (1989), 6.3.1-6.3.6. For example, the salt concentration in the washing step can be selected from a few strict conditions, from about 2.0 x SSC at 50 ° C, to very strict conditions, from about 0.2 x SSC at 50 ° C. In addition, the temperature in the washing stage may increase from a few strict conditions, at room temperature (approximately 22 ° C), to very strict conditions, at approximately 65 ° C.
Están también dentro del alcance de la invención ácidos nucleicos aislados que codifican péptidos que tienen la actividad antigénica del Der f VII, según se describe en la presente, y que tienen una secuencia que difiere de las secuencias de nucleótidos ilustradas en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 6) debido a degeneración en el código genético. Tales ácidos nucleicos codifican péptidos funcionalmente equivalentes (es decir, un péptido que tiene una actividad de Der f VII) pero difieren en cuanto a la secuencia de las secuencias de la Figura 6A y 6B debido a la degeneración del código genético. Por ejemplo, un número de aminoácidos están designados por más de un triplete. Los codones que especifican el mismo aminoácido, o sinónimos (por ejemplo, CAU y CAC son sinónimos para la histidina), pueden redundar en mutaciones "silenciosas" que no afectan la secuencia de aminoácidos de la proteína de Der f VII. Sin embargo, es de esperar que existan dentro de la población de ácaros del polvo polimorfismos de la secuencia de DNA que den lugar a modificaciones de la secuencia de aminoácidos del Der f VII. Un experto en la materia será consciente de que estas variaciones en uno o varios nucleótidos (en hasta aproximadamente un 3-4% de los nucleótidos) de los ácidos nucleicos que codifican péptidos que tienen una actividad de Der f VII pueden existir entre los distintos ácaros del polvo debido a la variación alélica natural. Están dentro del alcance de esta invención todas y cualesquiera de tales variaciones de los nucleótidos y de los resultantes polimorfismos de los aminoácidos. Además, puede haber una o varias isoformas o uno o varios miembros emparentados e interreaccionantes de la familia del Der f VII. Tales isoformas o miembros de la familia son definidas(os) como proteínas emparentadas en cuanto a la función y a la secuencia de aminoácidos con el Der f VII pero codificadas por genes en loci distintos.Also within the scope of the invention are isolated nucleic acids encoding peptides that have Der f VII antigenic activity, as described herein, and which have a sequence that differs from the nucleotide sequences illustrated in Figure 6A and 6B. (SEQ ID NO: 6) due to degeneracy in the genetic code. Such nucleic acids encode functionally equivalent peptides (i.e., a peptide that has a Der f VII activity) but differ in terms of the sequence of the sequences of Figure 6A and 6B due to the degeneracy of the genetic code. For example, a number of amino acids are designated by more than one triplet. Codons that specify the same amino acid, or synonyms (for example, CAU and CAC are synonyms for histidine), can result in "silent" mutations that do not affect the amino acid sequence of the Der f VII protein. However, it is expected that polymorphisms of the DNA sequence that result in modifications of the amino acid sequence of Der f VII exist within the dust mite population. One skilled in the art will be aware that these variations in one or more nucleotides (in up to about 3-4% of the nucleotides) of the nucleic acids encoding peptides having a Der f VII activity may exist between different mites. of dust due to natural allelic variation. All and any such variations of the nucleotides and the resulting polymorphisms of the amino acids are within the scope of this invention. In addition, there may be one or more isoforms or one or more related and interreactive members of the Der f VII family. Such isoforms or family members are defined as related proteins in terms of function and amino acid sequence with Der f VII but encoded by genes in different loci.
Están también dentro del alcance de la invención fragmentos del ácido nucleico que codifica Der f VII. En el sentido en el que se la utiliza en la presente, la expresión "fragmento del ácido nucleico que codifica Der f VII" se refiere a una secuencia de nucleótidos que tiene menos nucleótidos que la secuencia de nucleótidos que codifica la totalidad de la secuencia de aminoácidos de la proteína de Der f VII y que codifica un péptido que tiene una actividad de Der f VII (es decir, un péptido que tiene al menos una actividad biológica del alergeno Der f VII) según se define en la presente.Fragments of the nucleic acid encoding Der f VII are also within the scope of the invention. In the sense that it is used herein, the term "nucleic acid fragment encoding Der f VII" refers to a nucleotide sequence that has fewer nucleotides than the nucleotide sequence encoding the entire sequence of amino acids of the Der f VII protein and encoding a peptide that has an activity of Der f VII (i.e., a peptide that has at least one biological activity of the Der f VII allergen) as defined herein.
Los fragmentos de ácido nucleico preferidos codifican péptidos de una longitud de al menos aproximadamente 7 residuos de aminoácidos, con preferencia de una longitud de aproximadamente 13-40 residuos de aminoácidos, y con mayor preferencia, de una longitud de aproximadamente 16-30 residuos de aminoácidos. Están también dentro del alcance de esta invención fragmentos de ácido nucleico que codifican péptidos que tienen una actividad de Der f VII de una longitud de al menos aproximadamente 30 residuos de aminoácidos, una longitud de al menos aproximadamente 40 residuos de aminoácidos, una longitud de al menos aproximadamente 60 residuos de aminoácidos, una longitud de al menos aproximadamente 80 residuos de aminoácidos, una longitud de al menos aproximadamente 100 residuos de aminoácidos, una longitud de al menos aproximadamente 140 residuos, y una longitud de al menos aproximadamente 200 residuos o más. En general, la expresión de los péptidos en una célula huésped transformada es ventajosa al máximo cuando el péptido deseado es de una longitud de más de aproximadamente 20 aminoácidos. Los péptidos más cortos son típicamente sintetizados con mayor facilidad por la vía química.Preferred nucleic acid fragments encode peptides of a length of at least about 7 amino acid residues, preferably of a length of about 13-40 amino acid residues, and more preferably, of a length of approximately 16-30 amino acid residues. . Also within the scope of this invention are nucleic acid fragments encoding peptides having a Der f VII activity of a length of at least about 30 amino acid residues, a length of at least about 40 amino acid residues, a length of at at least about 60 amino acid residues, a length of at least about 80 amino acid residues, a length of at least about 100 amino acid residues, a length of at least about 140 residues, and a length of at least about 200 residues or more. In general, the expression of the peptides in a transformed host cell is maximally advantageous when the desired peptide is more than about 20 amino acids in length. Shorter peptides are typically synthesized more readily by chemical means.
Los fragmentos de ácido nucleico que están dentro del alcance de la invención incluyen aquéllos que son capaces de hibridar bajo condiciones muy o poco estrictas con ácidos nucleicos de otras especies animales para ser utilizados en protocolos de selección para detectar Der f VII o alergenos que interreaccionen con Der f VII. Generalmente, el ácido nucleico que codifica un péptido que tiene una actividad de Der f VII será seleccionado a partir de las bases que codifican la proteína madura, si bien en algunos casos puede ser deseable seleccionar la totalidad o parte de un péptido a partir de la parte de la secuencia de cabeza de los ácidos nucleicos de la invención. Los ácidos nucleicos que quedan dentro del alcance de la invención pueden también contener secuencias ligadoras, sitios para endonucleasa de restricción modificados y otras secuencias útiles para la clonación molecular, la expresión o la purificación de péptidos recombinantes que tengan una actividad de Der f VII.Nucleic acid fragments that are within the scope of the invention include those that are capable of hybridizing under very strict conditions with nucleic acids of other animal species to be used in screening protocols to detect Der f VII or allergens that interact with Der f VII. Generally, the nucleic acid encoding a peptide having a Der f VII activity will be selected from the bases encoding the mature protein, although in some cases it may be desirable to select all or part of a peptide from the part of the head sequence of the nucleic acids of the invention. Nucleic acids that are within the scope of the invention may also contain binding sequences, modified restriction endonuclease sites and other sequences useful for molecular cloning, expression or purification of recombinant peptides having a Der f VII activity.
Un ácido nucleico que codifique un péptido que tenga una actividad de Der f VII puede ser obtenido de RNAm (RNAm = RNA mensajero) del ácaro del polvo Dermatophagoides farinae. Debería ser también posible obtener del DNA genómico de Dermatophagoides farinae ácidos nucleicos que codifiquen Der f VII. Por ejemplo, el gen que codifica Der f VII puede ser clonado ya sea a partir de un cDNA o bien a partir de una biblioteca genómica según los protocolos que aquí se describen. Puede ser obtenido un cDNA que codifique Der f VII a base de aislar RNAm total del Dermatophagoides farinae. Pueden ser entonces preparados a partir del RNAm total cDNAs de cadena doble. Subsiguientemente, los cDNAs pueden ser insertados en un adecuado vector plasmídico o bacteriofágico utilizando una cualquiera de las de una serie de técnicas conocidas. Pueden ser también clonados genes que codifiquen Der f VII utilizando acreditadas técnicas de reacción en cadena de la polimerasa (véanse los Ejemplos 1 y 2) de acuerdo con la información de la secuencia de nucleótidos aportada por la invención. Los ácidos nucleicos de la invención pueden ser DNA o RNA. Un ácido nucleico preferido es un cDNA que codifica el Der f VII que tiene la secuencia ilustrada en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 6) (Der f VII).A nucleic acid encoding a peptide having a Der f VII activity can be obtained from mRNA (mRNA = messenger RNA) from the Dermatophagoides farinae dust mite. It should also be possible to obtain nucleic acids from the Dermatophagoides farinae genomic DNA encoding Der f VII. For example, the gene encoding Der f VII can be cloned either from a cDNA or from a genomic library according to the protocols described herein. A cDNA encoding Der f VII can be obtained based on isolating total mRNA from Dermatophagoides farinae . Then double stranded cDNAs can be prepared from the total mRNA. Subsequently, cDNAs can be inserted into a suitable plasmid or bacteriophage vector using any of a series of known techniques. Genes encoding Der f VII can also be cloned using accredited polymerase chain reaction techniques (see Examples 1 and 2) according to the nucleotide sequence information provided by the invention. The nucleic acids of the invention can be DNA or RNA. A preferred nucleic acid is a cDNA encoding Der f VII having the sequence illustrated in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 6) ( Der f VII).
Esta invención aporta también vectores de expresión que contienen un ácido nucleico que codifica un péptido que tiene una actividad de Der f VII, ligado operativamente a al menos una secuencia reguladora. La expresión "ligado operativamente" es utilizada para expresar que la secuencia de nucleótidos es ligada a una secuencia reguladora de una manera que permite la expresión de la secuencia de nucleótidos. Las secuencias reguladoras están reconocidas en la técnica y son seleccionadas para dirigir la expresión del péptido que tiene una actividad de Der f VII. En consecuencia, la expresión "secuencia reguladora" incluye promotores, potenciadores y otros elementos de control de la expresión. Tales secuencias reguladoras están descritas en Goeddel; Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, CA (1990). Debe entenderse que el diseño del vector de expresión puede depender de factores tales como la selección de la célula huésped a transformar y/o el tipo de proteína que se desee expresar. En una realización, el vector de expresión incluye un DNA que codifica un péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII. Tales vectores de expresión pueden ser utilizados para transfectar células para con ello producir proteínas o péptidos, incluyendo proteínas o péptidos de fusión codificados por ácidos nucleicos aquí descritos.This invention also provides expression vectors containing a nucleic acid encoding a peptide having a Der f VII activity, operably linked to at least one regulatory sequence. The term "operably linked" is used to express that the nucleotide sequence is linked to a regulatory sequence in a manner that allows the expression of the nucleotide sequence. Regulatory sequences are recognized in the art and are selected to direct the expression of the peptide that has a Der f VII activity. Consequently, the term "regulatory sequence" includes promoters, enhancers and other expression control elements. Such regulatory sequences are described in Goeddel; Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185 , Academic Press, San Diego, CA (1990). It should be understood that the design of the expression vector may depend on factors such as the selection of the host cell to be transformed and / or the type of protein to be expressed. In one embodiment, the expression vector includes a DNA encoding a peptide having the antigenic activity of Der f VII. Such expression vectors can be used to transfect cells to thereby produce proteins or peptides, including fusion proteins or peptides encoded by nucleic acids described herein.
Esta invención es además relativa a una célula huésped transfectada para expresar un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII. La célula huésped puede ser cualquier célula procariótica o eucariótica. Por ejemplo, un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII puede ser expresado en células bacterianas tales como E. coli, células de insectos (baculovirus), levadura o células de mamífero tales como células de ovario de hámster de la China (CHO). Pueden encontrarse otras células huésped adecuadas en Goeddel, (1990) supra, o bien tales células son conocidas para los expertos en la materia.This invention is also relative to a transfected host cell to express a peptide having the antigenic activity of Der f VII. The host cell can be any prokaryotic or eukaryotic cell. For example, a peptide having the antigenic activity of Der f VII can be expressed in bacterial cells such as E. coli , insect cells (baculovirus), yeast or mammalian cells such as hamster ovary cells from China (CHO ). Other suitable host cells can be found in Goeddel, (1990) supra , or such cells are known to those skilled in the art.
La expresión en células eucarióticas tales como células de mamífero, de levadura o de insecto, puede dar lugar a una glicosilación parcial o completa y/o a la formación de relevantes enlaces disulfuro intercadenas o intracadena de proteína recombinante. Los ejemplos de vectores para la expresión en levadura S. cerivisae incluyen el PYepSec1 (Baldari. et al., (1987) Embo J., 6: 229 - 234), el pMFa (Kurjan y Herskowitz, (1982) Cell, 30: 933 - 943), el pJRY88 (Schultz et al., (1987) Gene, 54: 113 - 123) y el pYES2 (Invitrogen Corporation, San Diego, CA). Los vectores de baculovirus disponibles para la expresión de proteínas en células de insecto cultivadas (células SF 9) incluyen la serie pAc (Smith et al., (1983) Mol. Cell Biol., 3: 2156 - 2165) y la serie pVL (Lucklow, V.A. y Summers, M.D., (1989) Virology, 170: 31 - 39). Generalmente se utilizan células COS (Gluzman, Y., (1981) Cell, 23: 175 - 182) en conjunción con vectores tales como el pCDM 8 (Aruffo, A. y Seed, B., (1987) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 84: 8573 - 8577) para la amplificación/expresión transitoria en células de mamífero, mientras que se utilizan células CHO (dhfr- Ovario de Hámster de la China) con vectores tales como el pMT2PC (Kaufman et al., (1987) EMBO J., 6: 187 - 195) para la amplificación/expresión estable en células de mamífero. El DNA vector puede ser introducido en las células de mamífero mediante técnicas convencionales tales como la de la coprecipitación en fosfato cálcico o cloruro cálcico, la transfección mediada por DEAE-dextrano (= dietilaminoetildextrano) o la electroporación. Pueden encontrarse métodos adecuados para transformar células huésped en Sambrook et al., (Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2ª Edición, Cold Spring Harbor Laboratory press (1989)) y en otros libros de texto de laboratorio.Expression in eukaryotic cells, such as mammalian, yeast or insect cells, may result in partial or complete glycosylation and / or the formation of relevant interchain chains or intra-chain disulfide bonds of recombinant protein. Examples of vectors for S. cerivisae yeast expression include PYepSec1 (Baldari. Et al ., (1987) Embo J. , 6 : 229-234), pMFa (Kurjan and Herskowitz, (1982) Cell , 30: 933-943), pJRY88 (Schultz et al ., (1987) Gene , 54 : 113-123) and pYES2 (Invitrogen Corporation, San Diego, CA). Baculovirus vectors available for protein expression in cultured insect cells (SF 9 cells) include the pAc series (Smith et al ., (1983) Mol. Cell Biol ., 3 : 2156-2165) and the pVL series ( Lucklow, VA and Summers, MD, (1989) Virology , 170 : 31-39). COS cells (Gluzman, Y., (1981) Cell , 23 : 175-182) are generally used in conjunction with vectors such as pCDM 8 (Aruffo, A. and Seed, B., (1987) Proc. Natl. Acad Sci. USA , 84 : 8573-8577) for transient amplification / expression in mammalian cells, while CHO (dhfr-Ovary Hamster of China) cells with vectors such as pMT2PC (Kaufman et al ., (1987) EMBO J. , 6 : 187-195) for stable amplification / expression in mammalian cells. The vector DNA can be introduced into mammalian cells by conventional techniques such as coprecipitation in calcium phosphate or calcium chloride, transfection mediated by DEAE-dextran (= diethylaminoethyldextran) or electroporation. Suitable methods for transforming host cells can be found in Sambrook et al ., ( Molecular Cloning: A Laboratory Manual , 2nd Edition, Cold Spring Harbor Laboratory press (1989)) and in other laboratory textbooks.
La expresión en procariotas es con la máxima frecuencia llevada a cabo en E. coli con vectores de expresión inducibles de fusión o no de fusión. Los vectores de fusión habitualmente añaden un número de aminoácidos con terminal NH2 al gen objetivo expresado. A estos aminoácidos con terminal NH2 a menudo se les denomina grupo informador. Tales grupos informadores tienen habitualmente las dos finalidades siguientes: 1) incrementar la solubilidad de la proteína recombinante objetivo; y 2) ayudar a la purificación de la proteína recombinante objetivo actuando como ligando en la purificación según afinidad. A menudo, en los vectores de expresión de fusión es introducido un sitio de segmentación proteolítica en la unión del grupo informador y de la proteína recombinante objetivo para permitir a la proteína recombinante objetivo separarse del grupo informador a continuación de la purificación de la proteína de fusión. Tales enzimas y sus secuencias de reconocimiento afines incluyen Factor Xa, trombina y enterocinasa. Los típicos vectores de expresión de fusión incluyen el pGEX (Amrad Corp. Melbourne, Australia), el pMAL (New England Biolabs, Beverly, MA) y el pRIT5 (Pharmacia, Piscataway, NJ), que fusionan glutationa S-transferasa, proteína fijadora de maltosa E, o A proteínica, respectivamente, con la proteína recombinante objetivo.Prokaryotic expression is most often carried out in E. coli with inducible fusion or non-fusion expression vectors. Fusion vectors usually add a number of amino acids with NH2 terminal to the expressed target gene. These amino acids with the NH2 terminal are often called the reporter group. Such reporter groups usually have the following two purposes: 1) increase the solubility of the target recombinant protein; and 2) assist in the purification of the target recombinant protein by acting as a ligand in the affinity purification. Often, a proteolytic segmentation site is introduced into the fusion expression vectors at the junction of the reporter group and the target recombinant protein to allow the target recombinant protein to separate from the reporter group after purification of the fusion protein . Such enzymes and their related recognition sequences include Factor Xa, thrombin and enterokinase. Typical fusion expression vectors include pGEX (Amrad Corp. Melbourne, Australia), pMAL (New England Biolabs, Beverly, MA) and pRIT5 (Pharmacia, Piscataway, NJ), which fuse glutathione S-transferase, binding protein of maltose E, or protein A, respectively, with the target recombinant protein.
Los vectores de expresión no de fusión inducibles incluyen el pTrc (Amann et al., (1988) Gene, 69: 301 - 315) y el pET 11d (Studier et al., Gene Expressión Technology: Methods in Enzymology, 185, Academic Press, San Diego, California (1990) 60-89). Mientras que la expresión de los genes objetivo se basa en la transcripción de RNA polimerasa huésped desde el promotor de fusión trp-lac híbrido en el pTrc, la expresión de los genes objetivo insertados en el pET 11d se basa en la transcripción desde el promotor de fusión T7 gn10-lac 0 mediada por RNA polimerasa viral coexpresada (T7 gn1). Esta polimerasa viral es suministrada por las cepas huésped BL21(DE3) o HMS174(DE3) de un profago \lambda residente que alberga una T7 gn1 bajo el control transcripcional del promotor lacUV 5.Inducible non-fusion expression vectors include pTrc (Amann et al ., (1988) Gene , 69 : 301-315) and pET 11d (Studier et al ., Gene Expression Technology: Methods in Enzymology , 185 , Academic Press , San Diego, California (1990) 60-89). While the expression of the target genes is based on the transcription of host RNA polymerase from the trp-lac hybrid fusion promoter in the pTrc, the expression of the target genes inserted into the pET 11d is based on the transcription from the promoter of T7 gn10-lac 0 fusion mediated by coexpressed viral RNA polymerase (T7 gn1). This viral polymerase is supplied by the BL21 (DE3) or HMS174 (DE3) host strains of a resident λ proago that hosts a T7 gn1 under the transcriptional control of the lacUV 5 promoter.
Nuestra estrategia para maximizar la expresión del Der f VII recombinante en E. coli es la de expresar la proteína en una bacteria huésped con una deteriorada capacidad para segmentar proteolíticamente la proteína recombinante (Gottesman, S., Gene Expression Technology: Methods in Enzymology, 185, Academic Press, San Diego, California (1990) 119-128). Otra estrategia es la de alterar el ácido nucleico que codifica la proteína de Der f VII a insertar en un vector de expresión para que los codones individuales para cada aminoácido sean los preferentemente utilizados en las proteínas de E. coli altamente expresadas (Wada et al., (1992) Nuc. Acids Res., 20: 2111 - 2118). Tal alteración de ácidos nucleicos de la invención puede ser llevada a cabo mediante técnicas de síntesis de DNA estándar.Our strategy to maximize the expression of recombinant Der f VII in E. coli is to express the protein in a host bacterium with an impaired ability to proteolytically segment the recombinant protein (Gottesman, S., Gene Expression Technology: Methods in Enzymology , 185 , Academic Press, San Diego, California (1990) 119-128). Another strategy is to alter the nucleic acid encoding the Der f VII protein to be inserted into an expression vector so that the individual codons for each amino acid are preferably used in highly expressed E. coli proteins (Wada et al . , (1992) Nuc. Acids Res ., 20 : 2111-2188). Such alteration of nucleic acids of the invention can be carried out by standard DNA synthesis techniques.
Los ácidos nucleicos de la invención pueden ser también sintetizados químicamente utilizando técnicas estándar. Son conocidos varios métodos para sintetizar químicamente polidesoxinucleótidos, incluyendo la síntesis en fase sólida, que, como la síntesis de los péptidos, ha sido plenamente automatizada en los sintetizadores de DNA que están comercialmente disponibles (véase, p. ej., Itakura et al., Patente U.S. Nº 4.598.049; Caruthers et al., Patente U.S. 4.458.066; e Itakura, Patentes U.S. Núms. 4.401.796 y 4.373.071, incorporadas a la presente por referencia).The nucleic acids of the invention can also be chemically synthesized using standard techniques. Several methods are known for chemically synthesizing polydeoxynucleotides, including solid phase synthesis, which, like peptide synthesis, has been fully automated in commercially available DNA synthesizers (see, e.g., Itakura et al . , US Patent No. 4,598,049; Caruthers et al ., US Patent 4,458,066; and Itakura, US Patent Nos. 4,401,796 and 4,373,071, incorporated herein by reference).
Esta invención es además relativa a métodos para producir péptidos que tienen la actividad antigénica del Der f VII. Por ejemplo, una célula huésped transfectada con un vector de ácido nucleico que dirige la expresión de una secuencia de nucleótidos que codifica un péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII puede ser cultivada bajo condiciones apropiadas para permitir que tenga lugar la expresión del péptido. El péptido puede ser secretado y aislado de una mezcla de células y medio que contenga el péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII. Como alternativa, el péptido puede ser retenido citoplasmáticamente, y las células pueden ser recolectadas y lisadas, y puede aislarse la proteína. Un cultivo celular incluye células huésped, medios y otros subproductos. Los medios adecuados para el cultivo celular son bien conocidos en la técnica. El péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII puede ser aislado del medio de cultivo celular, de las células huésped o de ambos utilizando técnicas conocidas en la técnica de purificación de proteínas, incluyendo la cromatografía de intercambio iónico, la cromatografía de filtración en gel, la ultrafiltración, la electroforesis y la purificación según inmunoafinidad con anticuerpos específicos de un péptido que tenga una actividad de Der f VII.This invention is also related to methods for producing peptides having the antigenic activity of Der f VII. For example, a host cell transfected with a nucleic acid vector that directs the expression of a nucleotide sequence encoding a peptide that has the antigenic activity of Der f VII can be cultured under appropriate conditions to allow peptide expression to take place. . The peptide can be secreted and isolated from a mixture of cells and medium containing the peptide having the antigenic activity of Der f VII. Alternatively, the peptide can be retained cytoplasmically, and the cells can be collected and lysed, and the protein can be isolated. A cell culture includes host cells, media and other byproducts. Suitable media for cell culture are well known in the art. The peptide having the antigenic activity of Der f VII can be isolated from cell culture medium, host cells or both using techniques known in the art of protein purification, including ion exchange chromatography, filtration chromatography on gel, ultrafiltration, electrophoresis and purification according to immunoaffinity with antibodies specific to a peptide having an activity of Der f VII.
Otro aspecto de la invención es relativo a péptidos aislados que tienen la actividad antigénica del Der f VII. Un péptido que tenga una actividad de Der f VII tiene al menos una actividad biológica del alergeno Der f VII. Por ejemplo, un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII puede tener la capacidad de inducir una respuesta en células T específicas de Der f VII, tal como la estimulación (la proliferación de células T o la secreción de citoquina) o de inducir la incapacidad de respuesta de las células T. En una realización, un péptido que tiene una actividad de Der f VII estimula las células T según ponen de manifiesto, por ejemplo, la proliferación de las células T o la secreción de citoquina. En otra realización, péptidos que tienen la actividad antigénica del Der f VII inducen la incapacidad de respuesta de las células T por cuanto que las células T no responden a una subsiguiente confrontación con un péptido de Der f VII al ser expuestas al péptido. Aun en otra realización, un péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII tiene una reducida actividad de fijación de IgE en comparación con la proteína de Der f VII nativa purificada. Un péptido que tenga una actividad de Der f VII puede diferir en cuanto a la secuencia de aminoácidos de la secuencia de Der f VII ilustrada en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 7) (Der f VII), pero tales diferencias redundan en una proteína modificada que funciona de la misma manera o de una manera similar a como lo hace la proteína de Der f VII nativa, o que tiene características iguales o similares a las de la proteína de Der f VII nativa. Están descritas en detalle en la presente varias modificaciones de la proteína de Der f VII para producir estos péptidos y otros péptidos funcionalmente equivalentes. En el sentido en el que se le utiliza en la presente, el vocablo "péptido" se refiere a proteínas de longitud completa y a polipéptidos o a fragmentos peptídicos de los mismos.Another aspect of the invention is related to isolated peptides having the antigenic activity of Der f VII. A peptide having an activity of Der f VII has at least one biological activity of the Der f VII allergen. For example, a peptide having the antigenic activity of Der f VII may have the ability to induce a response in Der f VII specific T cells, such as stimulation (proliferation of T cells or cytokine secretion) or to induce inability to respond to T cells. In one embodiment, a peptide having a Der f VII activity stimulates T cells as evidenced, for example, by T cell proliferation or cytokine secretion. In another embodiment, peptides having the antigenic activity of Der f VII induce the inability of T cells to respond because T cells do not respond to a subsequent confrontation with a Der f VII peptide when exposed to the peptide. In yet another embodiment, a peptide having the antigenic activity of Der f VII has a reduced IgE binding activity compared to the purified native Der f VII protein. A peptide having a Der f VII activity may differ in terms of the amino acid sequence of the Der f VII sequence illustrated in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 7) ( Der f VII), but such differences result in in a modified protein that functions in the same way or in a manner similar to that of the native Der f VII protein, or that has the same or similar characteristics as the native Der f VII protein. Various modifications of the Der f VII protein to produce these peptides and other functionally equivalent peptides are described in detail herein. In the sense in which it is used herein, the term "peptide" refers to full-length proteins and polypeptides or peptide fragments thereof.
Un péptido puede ser producido por modificación de la secuencia de aminoácidos de la proteína de Der f VII ilustrada en la Figura 6A y 6B (ID SEC Nº: 7) (Der f VII), tal como una sustitución, adición o deleción de un residuo de aminoácidos que no está directamente implicado en la función de la proteína. Los péptidos de la invención pueden ser de una longitud de al menos aproximadamente 10 residuos de aminoácidos, con preferencia de una longitud de aproximadamente 10-20 residuos de aminoácidos, y con mayor preferencia, de una longitud de aproximadamente 10-16 residuos de aminoácidos. Están también incluidos dentro del alcance de esta invención péptidos que tienen la actividad antigénica del Der f VII y que son de una longitud de al menos aproximadamente 30 residuos de aminoácidos, de una longitud de al menos aproximadamente 40 residuos de aminoácidos, de una longitud de al menos aproximadamente 60 residuos de aminoácidos, de una longitud de al menos aproximadamente 80 residuos de aminoácidos, y de una longitud de al menos aproximadamente 100 residuos de aminoácidos.A peptide may be produced by modification of the amino acid sequence of the Der f VII protein illustrated in Figure 6A and 6B (SEQ ID NO: 7) ( Der f VII), such as a substitution, addition or deletion of a residue of amino acids that is not directly involved in protein function. The peptides of the invention may be at least 10 amino acid residues in length, preferably approximately 10-20 amino acid residues, and more preferably, approximately 10-16 amino acid residues in length. Also included within the scope of this invention are peptides that have the antigenic activity of Der f VII and that are of a length of at least about 30 amino acid residues, of a length of at least about 40 amino acid residues, of a length of at least about 60 amino acid residues, of a length of at least about 80 amino acid residues, and of a length of at least about 100 amino acid residues.
Otra realización de la invención aporta una preparación en sustancia pura de un péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII. Tal preparación está en sustancia exenta de las proteínas y de los péptidos con los cuales el péptido se da de manera natural (es decir, otros péptidos de los ácaros del polvo) ya sea en una célula o bien al ser secretado por una célula.Another embodiment of the invention provides a pure substance preparation of a peptide having the antigenic activity of Der f VII. Such a preparation is in substance free of the proteins and peptides with which the peptide occurs naturally (i.e., other peptides from dust mites) either in a cell or when secreted by a cell.
En el sentido en el que se le utiliza en la presente, el vocablo "aislado" se refiere a un ácido nucleico o péptido que está en sustancia exento de material celular o medio de cultivo cuando es producido por técnicas de DNA recombinante, o de precursores químicos o de otras sustancias químicas cuando es sintetizado químicamente. Tales proteínas o péptidos están también caracterizadas(os) por el hecho de estar exentas(os) de todas las otras proteínas de los ácaros del polvo. En consecuencia, un péptido aislado que tiene la actividad antigénica del Der f VII es producido por recombinación o síntesis y está en sustancia exento de material celular y medio de cultivo o está en sustancia exento de precursores químicos o de otras sustancias químicas y está en sustancia exento de todas las demás proteínas de los ácaros del polvo. Un ácido nucleico aislado está también exento de las secuencias que de manera natural flanquean al ácido nucleico (es decir, de las secuencias situadas en los extremos 5' y 3' del ácido nucleico) en el organismo del cual se deriva el ácido nucleico.In the sense that it is used herein, the word "isolated" refers to a nucleic acid or peptide that is in substance free of cellular material or culture medium when produced by recombinant DNA techniques, or precursors. chemical or other chemical substances when chemically synthesized. Such proteins or peptides are also characterized by the fact that they are free from all other proteins in dust mites. Consequently, an isolated peptide having the antigenic activity of Der f VII is produced by recombination or synthesis and is in substance free of cellular material and culture medium or is in substance free of chemical precursors or other chemical substances and is in substance free of all other proteins from dust mites. An isolated nucleic acid is also free of the sequences that naturally flank the nucleic acid (that is, of the sequences located at the 5 'and 3' ends of the nucleic acid) in the organism from which the nucleic acid is derived.
Péptidos que tengan la actividad antigénica del Der f VII pueden ser obtenidos, por ejemplo, a base de someter a selección los péptidos producidos por recombinación a partir del correspondiente fragmento del ácido nucleico de Der f VII que codifica tales péptidos. Además, los fragmentos pueden ser sintetizados químicamente utilizando técnicas conocidas en el ramo tales como la química f-Moc o t-Boc en fase sólida de Merrifield convencional. Por ejemplo, la proteína de Der f VII puede ser dividida arbitrariamente en fragmentos de la longitud deseada sin superposición de los fragmentos, o bien puede ser preferiblemente dividida en fragmentos superpuestos de una longitud deseada. Los fragmentos pueden ser producidos (por recombinación o por síntesis química) y pueden ser analizados para identificar aquellos péptidos que tengan la actividad del Der f VII (es decir, la capacidad de inducir una respuesta de las células T tal como la estimulación (proliferación, secreción de citoquina), la incapacidad de respuesta y/o la reducida actividad de fijación de IgE).Peptides having the antigenic activity of Der f VII can be obtained, for example, by selecting the peptides produced by recombination from the corresponding Der f VII nucleic acid fragment encoding such peptides. In addition, the fragments can be chemically synthesized using techniques known in the art such as conventional solid phase f-Moc or t-Boc chemistry of Merrifield. For example, the Der f VII protein may be arbitrarily divided into fragments of the desired length without overlapping the fragments, or it may preferably be divided into overlapping fragments of a desired length. The fragments can be produced (by recombination or by chemical synthesis) and can be analyzed to identify those peptides that have the activity of Der f VII (i.e., the ability to induce a T-cell response such as stimulation (proliferation, cytokine secretion), inability to respond and / or reduced IgE binding activity).
En una realización, los péptidos que tienen la capacidad antigénica del Der f VII pueden ser identificados por la capacidad del péptido para estimular las células T o para inducir la incapacidad de respuesta de las células T. Los péptidos que estimulan las células T, según determina, por ejemplo, la proliferación de células T o la secreción de citoquina, son definidos en la presente como péptidos que comprenden al menos un epítope para células T. Se cree que los epítopes para células T intervienen en la iniciación y perpetuación de la respuesta inmune al alergeno proteínico que es responsable de los síntomas clínicos de la alergia. Se piensa que estos epítopes para células T disparan los eventos iniciales a nivel de la célula T colaboradora a base de fijarse a una apropiada molécula de HLA (HLA = antígeno linfocítico humano) sobre la superficie de una célula que presenta el antígeno, estimulando con ello la subpoblación de células T con el correspondiente receptor de las células T para el epítope. Estos eventos conducen a la proliferación de células T, a la secreción de linfocinas, a reacciones inflamatorias locales, al reclutamiento de adicionales células inmunes con destino al sitio de interacción entre el antígeno y las células T, y a la activación de la cascada de células B, conduciendo a la producción de anticuerpos. Un isótopo de estos anticuerpos, la IgE, es fundamentalmente importante para el desarrollo de los síntomas alérgicos, y su producción es influenciada tempranamente en la cascada de eventos a nivel de la célula T colaboradora por la naturaleza de las linfocinas secretadas. Un epítope para células T es el elemento básico, o la menor unidad de reconocimiento por un receptor de célula T, comprendiendo el epítope aminoácidos esenciales para el reconocimiento por parte del receptor. Están dentro del alcance de esta invención secuencias de aminoácidos que imitan las de los epítopes para células T y modifican la respuesta alérgica a los alergenos proteínicos.In one embodiment, peptides having the antigenic ability of Der f VII can be identified by the ability of the peptide to stimulate T cells or to induce the inability of T cells to respond. Peptides that stimulate T cells, as determined , for example, proliferation of T cells or cytokine secretion, are defined herein as peptides comprising at least one epitope for T cells. Epitopes for T cells are believed to be involved in the initiation and perpetuation of the immune response. to the protein allergen that is responsible for the clinical symptoms of the allergy. It is thought that these epitopes for T cells trigger the initial events at the level of the collaborating T cell based on attaching to an appropriate HLA molecule (HLA = human lymphocyte antigen) on the surface of a cell presenting the antigen, thereby stimulating subpopulation of T cells with the corresponding T cell receptor for the epitope. These events lead to the proliferation of T cells, the secretion of lymphokines, local inflammatory reactions, the recruitment of additional immune cells to the site of interaction between the antigen and T cells, and the activation of the B cell cascade. , leading to the production of antibodies. An isotope of these antibodies, IgE, is fundamentally important for the development of allergic symptoms, and their production is influenced early in the cascade of events at the level of the collaborating T cell by the nature of the secreted lymphokines. An epitope for T cells is the basic element, or the smallest unit of recognition by a T cell receptor, the epitope comprising essential amino acids for recognition by the receptor. Amino acid sequences that mimic those of epitopes for T cells and modify the allergic response to protein allergens are within the scope of this invention.
La selección de los péptidos para distinguir aquéllos que conservan la actividad antigénica del Der f VII según se describe en la presente puede ser llevada a cabo utilizando uno o varios de diversos análisis distintos. Por ejemplo, in vitro, la actividad estimuladora de las células T por parte del Der f VII es analizada a base de poner a un péptido del que se sepa o se sospeche que tiene la actividad antigénica del Der f VII en contacto con una célula que presente el antígeno y que presente apropiadas moléculas de MHC en un cultivo de células T. La presentación de un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII en asociación con apropiadas moléculas de MHC a células T en conjunción con la necesaria coestimulación tiene el efecto de transmitir a la célula T una señal que induce la producción de niveles incrementados de citoquinas, y particularmente de interleuquina-2 e interleuquina-4. El supernatante del cultivo puede ser obtenido y analizado para detectar la presencia de interleuquina-2 o de otras citoquinas conocidas. Por ejemplo, puede emplearse cualquiera de varios análisis convencionales para la determinación de la interleuquina-2, tal como el análisis descrito en Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86: 1333 (1989), cuyas partes pertinentes quedan incorporadas a la presente por referencia. Puede ser también adquirido a la Genzyme Corporation (Cambridge, MA) un conjunto de materiales y utensilios para la ejecución de un análisis de la producción de interferón.The selection of the peptides to distinguish those that retain the antigenic activity of Der f VII as described herein can be carried out using one or more of several different analyzes. For example, in vitro , the stimulating activity of T cells by Der f VII is analyzed based on putting a peptide known or suspected to have Der f VII antigenic activity in contact with a cell that present the antigen and present appropriate MHC molecules in a T-cell culture. The presentation of a peptide having the antigenic activity of Der f VII in association with appropriate MHC molecules to T cells in conjunction with the necessary costimulation has the effect of transmitting to the T cell a signal that induces the production of increased levels of cytokines, and particularly of interleukin-2 and interleukin-4. The culture supernatant can be obtained and analyzed to detect the presence of interleukin-2 or other known cytokines. For example, any of several conventional analyzes can be used for the determination of interleukin-2, such as the analysis described in Proc. Natl Acad. Sci. USA 86 : 1333 (1989), whose relevant parts are incorporated herein by reference. A set of materials and utensils can also be purchased from the Genzyme Corporation (Cambridge, MA) for the execution of an interferon production analysis.
Como alternativa, un análisis común para determinar la proliferación de células T supone medir la incorporación de timidina tritiada. La proliferación de las células T puede ser medida in vitro a base de determinar la cantidad de timidina marcada con ^{3}H incorporada al DNA replicante de las células cultivadas. Por consiguiente pueden cuantificarse la velocidad de síntesis de DNA, y a su vez, la velocidad de división celular.Alternatively, a common analysis to determine T cell proliferation involves measuring the incorporation of tritiated thymidine. T cell proliferation can be measured in vitro by determining the amount of 3 H-labeled thymidine incorporated into the replicating DNA of the cultured cells. Accordingly, the rate of DNA synthesis can be quantified, and in turn, the rate of cell division.
En una realización, los péptidos que tienen actividad de estimulación de células T del Der f VII (es decir que el péptido comprende al menos un epítope para células T) pueden ser identificados utilizando un algoritmo que pronostica la presencia de epítopes para células T en una secuencia proteínica, tal como el algoritmo descrito por Hill et al., Journal of Immunology, 147: 189-197 (1991). El algoritmo de Hill et al. pronostica la situación de los epítopes para células T en una proteína por medio de la presencia de determinadas configuraciones dentro de la secuencia que probablemente fijarán MHC y por consiguiente pueden contener epítopes para células T.In one embodiment, peptides having Der f VII T cell stimulation activity (ie the peptide comprises at least one epitope for T cells) can be identified using an algorithm that predicts the presence of epitopes for T cells in a protein sequence, such as the algorithm described by Hill et al ., Journal of Immunology , 147 : 189-197 (1991). The algorithm of Hill et al . predicts the status of epitopes for T cells in a protein by means of the presence of certain configurations within the sequence that will probably fix MHC and therefore may contain epitopes for T cells.
A fin de determinar los precisos epítopes para células T mediante, por ejemplo, técnicas de trazado preciso de mapas, un péptido que tiene actividad de estimulación de células T del Der f VII, y que por consiguiente comprende al menos un epítope para células T según determinación mediante técnicas de biología de las células T, es modificado mediante adición o deleción de residuos de aminoácidos en el terminal amino o en el terminal carboxi del péptido, y es sometido a ensayo para determinar una modificación de la reactividad de las células T al péptido modificado. Siguiendo esta técnica, los péptidos son seleccionados y producidos por recombinación o por síntesis. Los péptidos son seleccionados sobre la base de varios factores, entre los que se incluyen la fortaleza de la respuesta de las células T al péptido (p. ej. el índice de estimulación), la frecuencia de la respuesta de las células T al péptido en una población de individuos sensibles a los alergenos de los ácaros del polvo, y la interreactividad potencial del péptido con otros alergenos de los ácaros del polvo. Las propiedades físicas y químicas de estos péptidos seleccionados (p. ej. la solubilidad y la estabilidad) son examinadas para determinar si los péptidos son adecuados para ser utilizados en composiciones terapéuticas, o si los péptidos requieren modificación según se describe en la presente. Entonces se determina según se describe en la presente la capacidad de los péptidos seleccionados o de los péptidos modificados seleccionados para estimular las células T humanas (p. ej. para inducir la proliferación o la secreción de linfocinas).In order to determine the precise epitopes for T cells by, for example, precise mapping techniques, a peptide having stimulation activity of Der f VII T cells, and which therefore comprises at least one epitope for T cells according to determination by T cell biology techniques, is modified by adding or deleting amino acid residues in the amino terminal or in the carboxy terminal of the peptide, and is tested for a modification of the reactivity of the T cells to the peptide modified. Following this technique, the peptides are selected and produced by recombination or synthesis. Peptides are selected on the basis of several factors, including the strength of the response of the T cells to the peptide (eg the stimulation index), the frequency of the response of the T cells to the peptide in a population of individuals sensitive to dust mite allergens, and the potential interreactivity of the peptide with other dust mite allergens. The physical and chemical properties of these selected peptides (eg solubility and stability) are examined to determine if the peptides are suitable for use in therapeutic compositions, or if the peptides require modification as described herein. The ability of the selected peptides or of the selected modified peptides to stimulate human T cells (eg to induce lymphokine proliferation or secretion) is then determined as described herein.
En otra realización, un péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII es sometido a selección para determinar la capacidad de inducir la incapacidad de respuesta de las células T. La capacidad de un péptido del que se sepa que estimula las células T (según se haya determinado por medio de uno o varios de los análisis anteriormente descritos) para inhibir o bloquear por completo la actividad del Der f VII nativo purificado o de una parte del mismo y para inducir un estado de incapacidad de respuesta puede ser determinada utilizando subsiguientes intentos de estimulación de las células T con células que presenten antígeno y que presenten Der f VII nativo o péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII a continuación de la exposición al péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII. Si las células T no responden a los subsiguientes intentos de activación, según se determine por síntesis de interleuquina-2 y/o por proliferación de las células T, ha sido inducido un estado de incapacidad de respuesta. Con respecto a sistemas de análisis que pueden ser utilizados como la base para un análisis según la presente invención, véase, p. ej., Gimmi et al., (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90: 6586 - 6590, y Schwartz (1990) Science, 248: 1349 - 1356.In another embodiment, a peptide having the antigenic activity of Der f VII is subjected to selection to determine the ability to induce the inability of T cells to respond. The ability of a peptide known to stimulate T cells (according to has been determined by means of one or more of the analyzes described above) to inhibit or completely block the activity of the purified native Der f VII or a part thereof and to induce a state of inability to respond can be determined using subsequent attempts of stimulation of T cells with cells presenting antigen and presenting native Der f VII or peptide having the antigenic activity of Der f VII following exposure to the peptide having the antigenic activity of Der f VII. If the T cells do not respond to subsequent activation attempts, as determined by synthesis of interleukin-2 and / or proliferation of the T cells, a state of inability to respond has been induced. With respect to analysis systems that can be used as the basis for an analysis according to the present invention, see , p. eg, Gimmi et al ., (1993) Proc. Natl Acad. Sci. USA , 90 : 6586-6590, and Schwartz (1990) Science , 248 : 1349-1356.
Aun en otra realización, los péptidos que tienen la actividad antigénica del Der f VII son identificados por medio de la actividad de fijación de IgE. A efectos terapéuticos, los péptidos de la invención preferiblemente no fijan IgE específica para un alergeno de los ácaros del polvo, o bien fijan tal IgE en considerablemente menor grado (p. ej. al menos 100 veces menos, y con más preferencia al menos 1000 veces menos) en comparación con el grado en que el correspondiente alergeno de los ácaros del polvo nativo purificado fija tal IgE. La reducida actividad de fijación de IgE se refiere a una actividad de fijación de IgE que es menor que la de la proteína de Der f VII nativa purificada. Si un péptido que tiene actividad antigénica de Der f VII debe ser utilizado como reactivo de diagnosis, no es necesario que el péptido tenga una reducida actividad de fijación de IgE en comparación con el alergeno Der f VII nativo. La actividad de fijación de IgE de los péptidos puede ser determinada mediante, por ejemplo, un inmunoanálisis ligado a enzimas (ELISA) utilizando, por ejemplo, suero obtenido de un sujeto (es decir, de un sujeto alérgico) que ha sido previamente expuesto el alergeno Der f VII nativo. Brevemente, el péptido del que se sospecha que tiene actividad antigénica de Der f VII es aplicado como recubrimiento a cavidades de una placa de cultivo de microtitulación. Tras haber lavado y bloqueado las cavidades, es incubada en las cavidades solución de anticuerpos consistente en el plasma de un sujeto alérgico que ha sido expuesto a un péptido del que se sospecha que tiene actividad antigénica de Der f VII. Al plasma se le retira generalmente la IgG antes de la incubación. Es añadido a las cavidades e incubado un anticuerpo secundario marcado. La cantidad de fijación de IgE es entonces cuantificada y comparada con la cantidad de IgE fijada por una proteína de Der f VII nativa purificada. Como alternativa, la actividad de fijación de IgE de un péptido puede ser determinada mediante análisis Western blot. Por ejemplo, un péptido del que se sospeche que tiene actividad antigénica de Der f VII es pasado por un gel de poliacrilamida utilizando el SDS-PAGE (SDS-PAGE = procedimiento de caracterización por electroforesis en gel de poliacrilamida en presencia de dodecilsulfato sódico). El péptido es entonces transferido a nitrocelulosa y es subsiguientemente incubado con suero de un sujeto alérgico. Tras la incubación con un anticuerpo secundario marcado, es entonces determinada y cuantificada la cantidad de IgE fijada.In yet another embodiment, the peptides having the antigenic activity of Der f VII are identified by means of the IgE binding activity. For therapeutic purposes, the peptides of the invention preferably do not fix specific IgE for a dust mite allergen, or they fix such IgE to considerably lesser degree (eg at least 100 times less, and more preferably at least 1000 times less) compared to the degree to which the corresponding allergen from the purified native dust mites fixes such IgE. The reduced IgE binding activity refers to an IgE binding activity that is less than that of the purified native Der f VII protein. If a peptide having Der f VII antigenic activity must be used as a diagnostic reagent, it is not necessary for the peptide to have reduced IgE binding activity compared to the native Der f VII allergen. The IgE binding activity of the peptides can be determined by, for example, an enzyme-linked immunoassay (ELISA) using, for example, serum obtained from a subject (i.e., from an allergic subject) that has previously been exposed. native Der f VII allergen. Briefly, the peptide suspected of having Der f VII antigenic activity is applied as a coating to cavities of a microtiter culture plate. After washing and blocking the cavities, antibody solution consisting of the plasma of an allergic subject that has been exposed to a peptide suspected of having Der f VII antigenic activity is incubated in the cavities. Plasma is usually removed from IgG before incubation. A labeled secondary antibody is added to the cavities and incubated. The amount of IgE binding is then quantified and compared to the amount of IgE fixed by a purified native Der f VII protein. Alternatively, the IgE binding activity of a peptide can be determined by Western blot analysis. For example, a peptide suspected of having Der f VII antigenic activity is passed through a polyacrylamide gel using the SDS-PAGE (SDS-PAGE = characterization procedure by polyacrylamide gel electrophoresis in the presence of sodium dodecyl sulfate). The peptide is then transferred to nitrocellulose and is subsequently incubated with serum from an allergic subject. After incubation with a labeled secondary antibody, the amount of fixed IgE is then determined and quantified.
Otro análisis que puede ser utilizado para determinar la actividad de fijación de IgE de un péptido es un análisis ELISA competitivo. Brevemente, es generada una combinación de anticuerpos de IgE a base de combinar plasma de sujetos alérgicos a los ácaros del polvo de los que se ha comprobado mediante ELISA directo que tienen IgE que es reactiva con el Der f VII nativo. Esta combinación es utilizada en análisis competitivos ELISA para comparar la fijación de IgE del Der f VII nativo y de un péptido del que se sospecha que tiene una actividad de Der f VII. Es determinada y cuantificada la fijación de IgE para la proteína de Der f VII nativa y para un péptido del que se sospecha que tiene actividad antigénica de Der f VII.Another analysis that can be used to determine the IgE binding activity of a peptide is a competitive ELISA analysis. Briefly, a combination of IgE antibodies is generated based on combining plasma from subjects allergic to dust mites that have been verified by direct ELISA that have IgE that is reactive with native Der f VII. This combination is used in competitive ELISA analyzes to compare IgE binding of native Der f VII and a peptide suspected of having Der f VII activity. The binding of IgE for the native Der f VII protein and for a peptide suspected of having Der f VII antigenic activity is determined and quantified.
Si un péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII fija IgE y debe ser utilizado como agente terapéutico, es preferible que tal fijación no redunde en la liberación de mediadores (p. ej. histaminas) desde mastocitos o basófilos. Para determinar si un péptido que fija IgE redunda en la liberación de mediadores, puede ser llevado a cabo un análisis de liberación de histamina utilizando reactivos y protocolos estándar obtenidos, por ejemplo, de la Amac, Inc. (Westbrook, ME). Brevemente, una solución tamponada de un péptido del que se sospecha que tiene actividad antigénica de Der f VII es combinada con un volumen igual de sangre total heparinizada de un sujeto alérgico. Tras la mezcla y la incubación, las células son granuladas y los supernatantes son procesados y analizados utilizando un radioinmunoanálisis para determinar la cantidad de histamina liberada.If a peptide that has the antigenic activity of Der f VII fixes IgE and should be used as a therapeutic agent, it is preferable that such fixation does not result in the release of mediators (eg histamines) from mast cells or basophils. To determine whether a peptide that binds IgE results in the release of mediators, a histamine release analysis can be carried out using standard reagents and protocols obtained, for example, from Amac, Inc. (Westbrook, ME). Briefly, a buffered solution of a peptide suspected of having Der f VII antigenic activity is combined with an equal volume of heparinized whole blood from an allergic subject. After mixing and incubation, the cells are granulated and supernatants are processed and analyzed using a radioimmunoassay to determine the amount of histamine released.
Los péptidos que tienen la actividad antigénica del Der f VII y que deben ser utilizados como agentes terapéuticos son preferiblemente probados en modelos de atopia a los ácaros del polvo en mamíferos, tales como el modelo del ratón descrito en Tamura et al., (1986) Microbiol. Immunol., 30: 883 - 896, o en la Patente U.S. 4.939.239, o en el modelo del primate descrito en Chiba et al., (1990) Int. Arch. Allergy Immunol., 93: 83 - 88. La selección inicial para determinar la fijación de IgE a un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII puede ser llevada a cabo mediante pruebas de rascado o pruebas cutáneas intradérmicas en animales de laboratorio o voluntarios humanos, o bien en sistemas in vitro tales como la RAST (RAST = prueba radioalergosorbente), la inhibición en la RAST, el análisis ELISA, RIA (radioinmunoanálisis), o un análisis de la liberación de histamina, según se ha descrito anteriormente.Peptides that have the antigenic activity of Der f VII and that should be used as therapeutic agents are preferably tested in atopy models to dust mites in mammals, such as the mouse model described in Tamura et al ., (1986) Microbiol Immunol ., 30 : 883-896, or in US Patent 4,939,239, or in the primate model described in Chiba et al ., (1990) Int. Arch. Allergy Immunol ., 93 : 83-88. Initial to determine the binding of IgE to a peptide that has the antigenic activity of Der f VII can be carried out by scratch tests or intradermal skin tests in laboratory animals or human volunteers, or in in vitro systems such as RAST (RAST = radioallergosorbent test), inhibition in RAST, ELISA analysis, RIA (radioimmunoassay), or an analysis of histamine release, as described above.
Es posible modificar la estructura de un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII con finalidades tales como las de incrementar la solubilidad o potenciar la eficacia terapéutica o profiláctica o la estabilidad (p. ej. la duración de conservación ex vivo y la resistencia a la degradación proteolítica in vivo). Tales péptidos modificados son considerados equivalentes funcionales de los péptidos que tienen la actividad antigénica del Der f VII según se define en la presente. Puede ser producido un péptido modificado en el cual ha sido alterada la secuencia de aminoácidos por procedimientos tales como los de sustitución, deleción o adición de aminoácidos, para modificar la inmunogenicidad y/o reducir la alergenicidad, o al cual ha sido añadido un componente con la misma finalidad.It is possible to modify the structure of a peptide that has the antigenic activity of Der f VII for purposes such as increasing solubility or enhancing therapeutic or prophylactic efficacy or stability (eg, ex vivo shelf life and resistance to proteolytic degradation in vivo ). Such modified peptides are considered functional equivalents of the peptides having the antigenic activity of Der f VII as defined herein. A modified peptide can be produced in which the amino acid sequence has been altered by procedures such as substitution, deletion or addition of amino acids, to modify immunogenicity and / or reduce allergenicity, or to which a component with The same purpose.
Por ejemplo, un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII puede ser modificado para que conserve la capacidad de inducir la incapacidad de respuesta de las células T y fijar proteínas de MHC sin capacidad para inducir una fuerte respuesta proliferativa o posiblemente respuesta proliferativa alguna al ser administrado en forma inmunogénica. En este caso, los residuos fijadores decisivos para la función receptora de las células T pueden ser determinados mediante la utilización de técnicas conocidas (p. ej. la sustitución de cada residuo y la determinación de la presencia o ausencia de reactividad de las células T). Aquellos residuos de los que se haya comprobado que son esenciales para interactuar con el receptor de la célula T pueden ser modificados a base de sustituir el aminoácido esencial por otro residuo de aminoácido preferiblemente similar (una sustitución conservadora) cuya presencia se compruebe que potencia, disminuye pero no elimina la reactividad de la célula T o no la afecta. Además, aquellos residuos de aminoácidos que no sean esenciales para la interacción con el receptor de la célula T pueden ser modificados a base de ser sustituidos por otro aminoácido cuya incorporación pueda potenciar, disminuir pero no eliminar la reactividad de la célula T o no afectarla, pero no elimine la fijación al correspondiente MHC.For example, a peptide having the antigenic activity of Der f VII may be modified to retain the ability to induce the inability of T-cells to respond and fix MHC proteins without the ability to induce a strong proliferative response or possibly any proliferative response. when administered immunogenicly. In this case, the decisive fixative residues for the receptor function of the T cells can be determined by the use of known techniques (eg the replacement of each residue and the determination of the presence or absence of reactivity of the T cells) . Those residues that have been proven to be essential for interacting with the T cell receptor can be modified by replacing the essential amino acid with another preferably similar amino acid residue (a conservative substitution) whose presence is proven to increase potency. but it does not eliminate the reactivity of the T cell or does not affect it. In addition, those amino acid residues that are not essential for interaction with the T cell receptor can be modified based on being replaced by another amino acid whose incorporation can enhance, decrease but not eliminate the reactivity of the T cell or not affect it, but do not remove the attachment to the corresponding MHC.
Adicionalmente, un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII puede ser modificado a base de sustituir un aminoácido del que se haya comprobado que es esencial para interactuar con el complejo proteínico MHC por otro residuo de aminoácido preferiblemente similar (sustitución conservadora) cuya presencia se haya comprobado que potencia, disminuye pero no elimina la actividad de la célula T o no la afecta. Además, los residuos de aminoácidos que no son esenciales para la interacción con el complejo proteínico MHC pero que sin embargo fijan el complejo proteínico MHC pueden ser modificados a base de ser sustituidos por otro aminoácido cuya incorporación pueda potenciar, no afectar o disminuir pero no eliminar la reactividad de las células T. Las preferidas sustituciones de aminoácidos para los aminoácidos no esenciales incluyen sustituciones con alanina, ácido glutámico o un metilaminoácido, pero no están limitadas a éstas.Additionally, a peptide having the antigenic activity of Der f VII can be modified by replacing an amino acid that has been found to be essential to interact with the MHC protein complex with another preferably similar amino acid residue (conservative substitution) whose presence it has been proven that potency decreases but does not eliminate T cell activity or does not affect it. In addition, amino acid residues that are not essential for interaction with the MHC protein complex but that however fix the MHC protein complex can be modified based on being replaced by another amino acid whose incorporation can enhance, not affect or decrease but not eliminate the reactivity of T cells. Preferred amino acid substitutions for non-essential amino acids include substitutions with alanine, glutamic acid or a methylamino acid, but are not limited thereto.
Otro ejemplo de modificación de un péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII es la sustitución de residuos de cisteína preferiblemente con residuos de alanina, serina, treonina, leucina o ácido glutámico para minimizar la dimerización a través de enlaces disulfuro. Además pueden ser modificadas químicamente las cadenas laterales de aminoácidos de fragmentos de la proteína de la invención. Otra modificación es la ciclización del péptido.Another example of modification of a peptide having the antigenic activity of Der f VII is the substitution of cysteine residues preferably with alanine, serine, threonine, leucine or glutamic acid residues to minimize dimerization through disulfide bonds. In addition, the amino acid side chains of fragments of the protein of the invention can be chemically modified. Another modification is the cyclization of the peptide.
A fin de potenciar su estabilidad y/o
reactividad, un péptido que tenga la actividad antigénica del Der
f VII puede ser modificado para que incorpore uno o varios
polimorfismos en la secuencia de aminoácidos del alergeno proteínico
resultante de cualquier variación alélica natural. Adicionalmente,
pueden ser sustituidos o añadidos D-aminoácidos,
aminoácidos no naturales o análogos no aminoácidos para producir una
proteína modificada que quede dentro del alcance de esta invención.
Además, un péptido que tenga la actividad antigénica del Der
f VII puede ser modificado utilizando polietilenglicol (PEG)
según el método de A. Sehon y colaboradores (Wie et al.,
supra) para producir una proteína conjugada con PEG. Además
puede ser añadido PEG durante la síntesis química de la proteína.
Otras modificaciones de un péptido que tenga la actividad antigénica
del Der f VII incluyen la reducción/alquilación (Tarr,
Methods of Protein Microcharacterization, J. E. Silver ed.,
Humana Press, Clifton NJ 155-194 (1986)); la
acilación (Tarr, supra); el acoplamiento químico a un soporte
apropiado (Mishell y Shiigi, eds, Selected Methods in Cellular
Immunology, WH Freeman, San Francisco, CA (1980), Patente U.S.
4.939.239); o el tratamiento con formalina de baja concentración
(Marsh, (1971) Int. Arch. Of Allergy and Appl. Immunol., 41:
199 -
215).In order to enhance its stability and / or reactivity, a peptide having the antigenic activity of Der f VII can be modified to incorporate one or more polymorphisms in the amino acid sequence of the protein allergen resulting from any natural allelic variation. Additionally, D-amino acids, unnatural amino acids or non-amino acid analogs may be substituted or added to produce a modified protein that is within the scope of this invention. In addition, a peptide having the antigenic activity of Der f VII can be modified using polyethylene glycol (PEG) according to the method of A. Sehon et al . (Wie et al ., Supra ) to produce a protein conjugated to PEG. In addition, PEG can be added during chemical synthesis of the protein. Other modifications of a peptide having the antigenic activity of Der f VII include reduction / alkylation (Tarr, Methods of Protein Microcharacterization , JE Silver ed., Humana Press, Clifton NJ 155-194 (1986)); acylation (Tarr, supra ); chemical coupling to an appropriate support (Mishell and Shiigi, eds, Selected Methods in Cellular Immunology , WH Freeman, San Francisco, CA (1980), US Patent 4,939,239); or low concentration formalin treatment (Marsh, (1971) Int. Arch. Of Allergy and Appl. Immunol ., 41: 199 -
215).
Para facilitar la purificación e incrementar potencialmente la solubilidad de un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII, es posible añadir una mitad de fusión de aminoácidos a la cadena principal del péptido. Por ejemplo, puede ser añadida hexa-histidina a la proteína para la purificación por cromatografía de afinidad de iones metálicos inmovilizados (Hochuli, E. et al., (1988) Bio/Technology, 6: 1321 - 1325). Además, para facilitar el aislamiento de los péptidos exentos de secuencias irrelevantes, pueden ser introducidos sitios de segmentación por endoproteasa específica entre las secuencias de la mitad de fusión y del péptido. A fin de desensibilizar con éxito a un sujeto al alergeno proteínico Der f VII o al alergeno emparentado con el mismo, puede ser necesario incrementar la solubilidad de la proteína a base de añadir grupos funcionales a la proteína, o bien a base de omitir regiones hidrofóbicas de la proteína. Grupos funcionales tales como aminoácidos con carga eléctrica y pares de aminoácidos con carga eléctrica son adecuados para incrementar la solubilidad al ser añadidos al terminal amino o carboxi del péptido.To facilitate purification and potentially increase the solubility of a peptide having the antigenic activity of Der f VII, it is possible to add a fusion half of amino acids to the peptide backbone. For example, hexa-histidine can be added to the protein for purification by affinity chromatography of immobilized metal ions (Hochuli, E. et al ., (1988) Bio / Technology , 6 : 1321-1325). In addition, to facilitate the isolation of peptides free of irrelevant sequences, specific endoprotease segmentation sites can be introduced between the fusion half and the peptide sequences. In order to successfully desensitize a subject to the Der f VII protein allergen or the related allergen, it may be necessary to increase the solubility of the protein by adding functional groups to the protein, or by omitting hydrophobic regions of protein. Functional groups such as electrically charged amino acids and electrically charged amino acid pairs are suitable for increasing solubility when added to the amino or carboxy terminal of the peptide.
Para ayudar potencialmente al correcto procesamiento antigénico de los epítopes para células T dentro del Der f VII, pueden ser introducidos entre regiones sitios canónicos sensibles a la proteasa que comprendan cada uno al menos un epítope para células T utilizando métodos de recombinación o síntesis. Por ejemplo, pares de aminoácidos con carga eléctrica, tales como KK o RR, pueden ser introducidos entre regiones dentro de una proteína o de un fragmento durante la construcción recombinante de la misma o del mismo. Al péptido resultante puede hacérsele sensible a la segmentación por catepsina y/u otras enzimas análogas a la tripsina, que generarían partes de la proteína que contendrían uno o varios epítopes para células T. Además, tales residuos de aminoácidos cargados eléctricamente pueden redundar en un incremento de la solubilidad del péptido.To potentially help the correct antigen processing of the epitopes for T cells within Der f VII, canonical protease-sensitive sites that each comprise at least one epitope for T cells can be introduced between regions using recombination or synthesis methods. For example, pairs of electrically charged amino acids, such as KK or RR, can be introduced between regions within a protein or a fragment during recombinant construction thereof or the same. The resulting peptide can be made sensitive to the segmentation by cathepsin and / or other trypsin-like enzymes, which would generate parts of the protein that would contain one or more epitopes for T cells. In addition, such electrically charged amino acid residues can result in an increase of the solubility of the peptide.
La mutagénesis específica de sitio de un ácido nucleico que codifique un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII puede ser utilizada para modificar la estructura del péptido por métodos conocidos en la técnica. Tales métodos pueden incluir, entre otros, la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) con cebadores oligonucleotídicos que lleven una o varias mutaciones (Ho et al., (1989) Gene, 77: 51 - 59) o la síntesis total de genes mutados (Hostomsky, Z. et al., (1989) Biochem. Biophys. Res. Comm, 161: 1056 - 1063). Para potenciar la expresión de la proteína recombinante, los métodos anteriormente mencionados pueden ser aplicados para cambiar los codones presentes en la secuencia de cDNA de la invención por los preferiblemente utilizados por la célula huésped en la cual es expresada la proteína recombinante (Wada et al., supra).Site-specific mutagenesis of a nucleic acid encoding a peptide having the antigenic activity of Der f VII can be used to modify the structure of the peptide by methods known in the art. Such methods may include, among others, polymerase chain reaction (PCR) with oligonucleotide primers carrying one or more mutations (Ho et al ., (1989) Gene , 77 : 51-59) or total gene synthesis mutated (Hostomsky, Z. et al ., (1989) Biochem. Biophys. Res. Comm , 161 : 1056-1063). To enhance the expression of the recombinant protein, the aforementioned methods can be applied to change the codons present in the cDNA sequence of the invention to those preferably used by the host cell in which the recombinant protein is expressed (Wada et al . , supra ).
Otro aspecto de la invención es relativo a un anticuerpo que es específicamente reactivo con un péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII. Los anticuerpos de esta invención pueden ser utilizados para estandarizar extractos de alergeno o para aislar la forma que se da de manera natural o forma nativa del Der f VII. Por ejemplo, a base de utilizar péptidos que tengan una actividad de Der f VII basada en la secuencia de cDNA del Der f VII pueden hacerse antisueros antiproteínicos/antipeptídicos o anticuerpos monoclonales a base de utilizar métodos estándar. Un mamífero tal como un ratón, un hámster o un conejo puede ser inmunizado con una forma inmunogénica del péptido (p. ej. proteína de Der f VII o un fragmento antigénico que sea capaz de provocar una respuesta de los anticuerpos). La técnicas para conferir inmunogenicidad a una proteína o a un péptido incluyen la conjugación con soportes u otras técnicas bien conocidas en el ramo. Un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII puede ser administrado en presencia de adyuvante. El progreso de la inmunización puede ser supervisado mediante la detección de los títulos de anticuerpos en el plasma o en el suero. El inmunoanálisis ELISA estándar u otro inmunoanálisis puede ser utilizado con el inmunógeno como antígeno para evaluar los niveles de anticuerpos.Another aspect of the invention is related to an antibody that is specifically reactive with a peptide having the antigenic activity of Der f VII. The antibodies of this invention can be used to standardize allergen extracts or to isolate the naturally occurring form or native form of Der f VII. For example, based on using peptides having a Der f VII activity based on the cDNA sequence of Der f VII, antiprotein / antipeptide antisera or monoclonal antibodies can be made based on using standard methods. A mammal such as a mouse, a hamster or a rabbit can be immunized with an immunogenic form of the peptide (eg Der f VII protein or an antigenic fragment that is capable of eliciting an antibody response). Techniques for conferring immunogenicity to a protein or peptide include conjugation with supports or other techniques well known in the field. A peptide having the antigenic activity of Der f VII can be administered in the presence of adjuvant. The progress of immunization can be monitored by detecting antibody titers in the plasma or in the serum. Standard ELISA immunoassay or other immunoassay can be used with the immunogen as an antigen to evaluate antibody levels.
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A continuación de la inmunización puede ser obtenido antisuero anti-Der f VII, y, si se desea, pueden ser aislados del suero anticuerpos anti-Der f VII policlonales. Para producir anticuerpos monoclonales, células productoras de anticuerpos (linfocitos) pueden ser recolectadas de un animal inmunizado y fusionadas por procedimientos de fusión celular somática estándar con células inmortalizadoras tales como células de mieloma para obtener células de hibridoma. Tales técnicas son bien conocidas en el ramo, como por ejemplo la técnica del hibridoma desarrollada originalmente por Kohler y Milstein (1975) Nature, 256: 495 - 497), así como otras técnicas tales como la técnica del hibridoma de células B humanas (Kozbar et al., (1983) Immunology Today, 4: 72) y la técnica del hibridoma de EBV (EBV = virus de Epstein-Barr) para producir anticuerpos monoclonales humanos (Cole et al., (1985) Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, Inc. pp. 77-96). Las células de hibridoma pueden ser sometidas a selección inmunoquímica para la producción de anticuerpos específicamente reactivos con un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII, y los anticuerpos monoclonales pueden ser aislados.Following immunization, anti- Der f VII antiserum can be obtained, and, if desired, polyclonal anti- Der f VII antibodies can be isolated from the serum. To produce monoclonal antibodies, antibody producing cells (lymphocytes) can be collected from an immunized animal and fused by standard somatic cell fusion procedures with immortalizing cells such as myeloma cells to obtain hybridoma cells. Such techniques are well known in the field, such as the hybridoma technique originally developed by Kohler and Milstein (1975) Nature , 256 : 495-497), as well as other techniques such as the human B-cell hybridoma technique (Kozbar et al ., (1983) Immunology Today , 4 : 72) and the EBV hybridoma technique (EBV = Epstein-Barr virus) to produce human monoclonal antibodies (Cole et al ., (1985) Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy , Alan R. Liss, Inc. pp. 77-96). The hybridoma cells can be subjected to immunochemical selection for the production of antibodies specifically reactive with a peptide having the antigenic activity of Der f VII, and the monoclonal antibodies can be isolated.
En el sentido en el que se le utiliza en la presente, el vocablo "anticuerpo" es utilizado para incluir fragmentos del mismo que sean también específicamente reactivos con el péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII. Los anticuerpos pueden ser fragmentados utilizando técnicas convencionales, y los fragmentos pueden ser sometidos a selección con respecto a su utilidad de la misma manera como se ha descrito anteriormente para los anticuerpos totales. Por ejemplo, pueden ser generados fragmentos F(ab')_{2} a base de tratar al anticuerpo con pepsina. El fragmento F(ab')_{2} resultante puede ser tratado para reducir los puentes disulfuro para producir fragmentos Fab'. Se entiende además que el anticuerpo de la presente invención incluye moléculas biespecíficas y quiméricas que tienen una porción anti-Der f VII.In the sense in which it is used herein, the term "antibody" is used to include fragments thereof that are also specifically reactive with the peptide having the antigenic activity of Der f VII. The antibodies can be fragmented using conventional techniques, and the fragments can be screened for their usefulness in the same manner as described above for total antibodies. For example, F (ab ') 2 fragments can be generated by treating the antibody with pepsin. The resulting F (ab ') 2 fragment can be treated to reduce disulfide bridges to produce Fab' fragments. It is further understood that the antibody of the present invention includes bispecific and chimeric molecules that have an anti- Der f VII portion.
Otro aspecto de esta invención aporta clones de células T y receptores de células T solubles específicamente reactivos con un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII. Poblaciones de células T monoclonales (es decir, de células T genéticamente idénticas entre sí y que expresan idénticos receptores de células T) pueden ser obtenidas de un individuo sensible al Der f VII, efectuándose a continuación estimulación repetitiva in vitro con una proteína o péptido de Der f VII que tenga la actividad antigénica del Der f VII en presencia de células que presenten el antígeno en emparejamiento con MHC. Las distintas células que con el MHC responden al Der f VII pueden ser entonces clonadas por dilución limitativa, y las líneas permanentes pueden ser expandidas y mantenidas por reestimulación in vitro periódica. Como alternativa, pueden ser producidos hibridomas T-T específicos de Der f VII por una técnica similar a la de la producción de hibridomas de células B. Por ejemplo, un mamífero tal como un ratón es inmunizado con un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII, y las células T son entonces purificadas y fusionadas con una línea tumoral de células T de crecimiento autónomo. A partir de los hibridomas resultantes, se seleccionan y clonan las células que respondan a un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII. Procedimientos para propagar poblaciones de células T monoclonales están descritos en Cellular and Molecular Immunology (Abul K. Abbas et al. ed.), W.B. Saunders Company, Philadelphia, PA (1991), página 139. Receptores de células T solubles específicamente reactivos con un péptido que tiene una actividad de Der f VII pueden ser obtenidos por inmunoprecipitación utilizando un anticuerpo contra el receptor de célula T según se describe en Immunology: A Synthesis (Segunda Edición), Edward S. Golub et al., ed., Sinauer Associates, Inc., Sunderland, MA (1991), páginas 366-269.Another aspect of this invention provides T cell clones and soluble T cell receptors specifically reactive with a peptide having the antigenic activity of Der f VII. Monoclonal T cell populations (i.e. genetically identical T cells with each other and expressing identical T cell receptors) can be obtained from an individual sensitive to Der f VII, then repeated in vitro stimulation with a protein or peptide of Der f VII having the antigenic activity of Der f VII in the presence of cells presenting the antigen in pairing with MHC. The different cells that respond to Der f VII with the MHC can then be cloned by limiting dilution, and the permanent lines can be expanded and maintained by periodic in vitro restimulation. Alternatively, Der f VII-specific hybridomas can be produced by a technique similar to that of the production of B-cell hybridomas. For example, a mammal such as a mouse is immunized with a peptide having Der f antigenic activity. VII, and the T cells are then purified and fused with a tumor cell line of autonomous growth. From the resulting hybridomas, cells that respond to a peptide having the antigenic activity of Der f VII are selected and cloned. Procedures for propagating monoclonal T cell populations are described in Cellular and Molecular Immunology (Abul K. Abbas et al . Ed.), WB Saunders Company, Philadelphia, PA (1991), page 139. Soluble T cell receptors specifically reactive with a peptide having a Der f VII activity can be obtained by immunoprecipitation using an antibody against the T cell receptor as described in Immunology: A Synthesis (Second Edition), Edward S. Golub et al ., ed., Sinauer Associates, Inc., Sunderland, MA (1991), pages 366-269.
Clones de células T específicamente reactivos
con un péptido que tiene la actividad antigénica del Der f
VII pueden ser utilizados para aislar y clonar molecularmente el gen
que codifica el correspondiente receptor de célula T. Además, un
receptor de célula T soluble específicamente reactivo con un péptido
que tiene la actividad antigénica del Der f VII puede ser
utilizado para interferir con o inhibir la activación
antígenodependiente de la relevante subpoblación de células T, por
ejemplo, mediante administración a un individuo sensible al Der
f VII. Anticuerpos específicamente reactivos con tal receptor de
célula T pueden ser producidos según las técnicas aquí descritas.
Tales anticuerpos pueden ser utilizados para bloquear o interferir
la interacción de las células T con los péptidos presentados
por
los MHC.T cell clones specifically reactive with a peptide having the antigenic activity of Der f VII can be used to molecularly isolate and clone the gene encoding the corresponding T cell receptor. In addition, a soluble T cell receptor specifically reactive with a peptide having the antigenic activity of Der f VII can be used to interfere with or inhibit antigen-dependent activation of the relevant subpopulation of T cells, for example, by administration to an individual sensitive to Der f VII. Antibodies specifically reactive with such a T-cell receptor can be produced according to the techniques described herein. Such antibodies can be used to block or interfere with the interaction of T cells with the peptides presented by
the MHC.
La exposición de sujetos alérgicos a péptidos que tengan la actividad antigénica del Der f VII y que tengan la actividad estimuladora de las células T puede hacer que las apropiadas subpoblaciones de células T devengan incapaces de responder al respectivo alergeno proteínico (p. ej. no logrando estimular una respuesta inmune al tener lugar tal exposición). Además, tal administración puede modificar el perfil de secreción de linfocinas en comparación con la exposición al alergeno proteínico que se da de manera natural o a una porción del mismo (redundando, p. ej., en una disminución de IL-4 y/o un incremento de IL-2). Además, la exposición a péptidos que tengan la actividad antigénica del Der f VII y que tengan la actividad estimuladora de las células T puede influenciar a las subpoblaciones de células T que normalmente participan en la respuesta al alergeno de forma tal que estas células T sean alejadas del sitio o de los sitios de exposición normal al alergeno (p. ej. la mucosa nasal, la piel y el pulmón) siendo llevadas hacia el sitio o los sitios de administración terapéutica de la proteína o del fragmento derivado de la misma. Esta redistribución de las subpoblaciones de células T puede mejorar o reducir la capacidad del sistema inmune de un individuo para estimular la respuesta inmune habitual en el sitio de exposición normal al alergeno, redundando en una disminución de los síntomas alérgicos.Exposure of allergic subjects to peptides that have the antigenic activity of Der f VII and that have the stimulatory activity of T cells may make the appropriate subpopulations of T cells unable to respond to the respective protein allergen (eg not achieving stimulate an immune response when such exposure occurs). In addition, such administration may modify the lymphokine secretion profile compared to exposure to the naturally occurring protein allergen or to a portion thereof (resulting, for example, in a decrease in IL-4 and / or a increase in IL-2). In addition, exposure to peptides that have the antigenic activity of Der f VII and that have the stimulatory activity of T cells can influence the subpopulations of T cells that normally participate in the allergen response so that these T cells are removed from the site or sites of normal exposure to the allergen (eg nasal mucosa, skin and lung) being carried to the site or sites of therapeutic administration of the protein or fragment derived therefrom. This redistribution of T-cell subpopulations can improve or reduce the ability of an individual's immune system to stimulate the usual immune response at the site of normal allergen exposure, resulting in a decrease in allergic symptoms.
Al ser administrado a un sujeto sensible a los alergenos de los ácaros del polvo, un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII es capaz de modificar la respuesta de las células B, la respuesta de las células T o tanto la respuesta de las células B como la respuesta de las células T del sujeto al alergeno. En el sentido en el que la expresión es utilizada en la presente, la modificación de la respuesta alérgica de un sujeto a un alergeno de los ácaros del polvo puede ser definida como una incapacidad de respuesta o disminución de síntomas al alergeno según determinación efectuada por procedimientos clínicos estándar (véase, p. ej., Varney et al., (1990) British Medical Journal, 302: 265 - 269), incluyendo una disminución de los síntomas asmáticos inducidos por los ácaros del polvo. En el sentido en el que se alude a la expresión en la presente, una disminución de síntomas incluye toda reducción de la respuesta alérgica de un sujeto al alergeno a continuación de un régimen de tratamiento con un péptido de la invención. Esta disminución de síntomas puede ser determinada subjetivamente (p. ej. el paciente se siente más cómodo tras haber sido expuesto al alergeno) o bien clínicamente, tal como con una prueba cutánea estándar.When administered to a subject sensitive to dust mite allergens, a peptide having the antigenic activity of Der f VII is capable of modifying the response of B cells, the response of T cells or both the response of B cells as the response of the subject's T cells to the allergen. In the sense that the expression is used herein, the modification of the allergic response of a subject to an allergen from dust mites can be defined as an inability to respond or decrease symptoms to the allergen as determined by procedures. standard clinics (see, e.g., Varney et al ., (1990) British Medical Journal , 302 : 265-269), including a decrease in asthmatic symptoms induced by dust mites. In the sense that the expression is referred to herein, a decrease in symptoms includes any reduction of the allergic response of a subject to the allergen following a treatment regimen with a peptide of the invention. This decrease in symptoms can be determined subjectively (eg the patient feels more comfortable after being exposed to the allergen) or clinically, such as with a standard skin test.
Los péptidos o anticuerpos de la presente
invención pueden ser también utilizados para detectar y diagnosticar
la sensibilidad al Der f VII. Por ejemplo, esto puede hacerse
in vitro a base de combinar sangre o productos sanguíneos
obtenidos de un sujeto para el que deba evaluarse la sensibilidad
con péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII
bajo condiciones apropiadas para la fijación de componentes de la
sangre (p. ej. anticuerpos, células T, células B) con el péptido o
con los péptidos y a base de determinar el grado en que tiene lugar
tal fijación. Otros métodos de diagnosis de enfermedades alérgicas
en los que pueden ser utilizados los péptidos o anticuerpos de la
presente invención incluyen la prueba radioalergosorbente (RAST), la
prueba radioinmunosorbente sobre papel (PRIST), el inmunoanálisis
ligado a enzimas (ELISA), los radioinmunoanálisis (RIA), los
análisis inmunorradiométricos (IRMA), los inmunoanálisis por
luminiscencia (LIA), los análisis de liberación de histamina y las
inmunotransferencias
de IgE.The peptides or antibodies of the present invention can also be used to detect and diagnose Der f VII sensitivity. For example, this can be done in vitro by combining blood or blood products obtained from a subject for which the sensitivity with peptide having the antigenic activity of Der f VII should be evaluated under appropriate conditions for the fixation of blood components ( eg antibodies, T cells, B cells) with the peptide or with the peptides and on the basis of determining the degree to which such fixation takes place. Other methods of diagnosing allergic diseases in which the peptides or antibodies of the present invention can be used include the radioallergosorbent test (RAST), the radioimmunosorbent test on paper (PRIST), enzyme-linked immunoassay (ELISA), radioimmunoassays ( RIA), immunoradiometric analyzes (IRMA), luminescence immunoassays (LIA), histamine release analyzes and immunoblotting
of IgE.
La presente invención aporta además métodos para detectar y tratar la sensibilidad de un sujeto al Der f VII. La presencia en los sujetos de IgE específica para Der f VII y la capacidad de las células T de los sujetos para responder a los epítopes de Der f VII para las células T pueden ser determinadas a base de administrar al sujeto una prueba de Hipersensibilidad de Tipo Inmediato y/o una prueba de Hipersensibilidad de Tipo Retardado (véase, p. ej., Immunology (1985) Roitt, I.M., Brostoff, J., Male, D.K. (eds), C.V. Mosby Co., Gower Medical Publishing, London, NY, pp. 19.2-19.18; pp. 22.1-22.10) utilizando un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII o una forma modificada de un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII, cada uno de los cuales fije IgE específica para el alergeno. A los mismos sujetos se les administra una prueba de Hipersensibilidad de Tipo Retardado antes de, simultáneamente a o subsiguientemente a la administración de la prueba de Hipersensibilidad de Tipo Inmediato. Naturalmente, si la prueba de Hipersensibilidad de Tipo Inmediato es administrada antes de la prueba de Hipersensibilidad de Tipo Retardado, la prueba de Hipersensibilidad de Tipo Retardado sería administrada a aquellos sujetos que presentasen una reacción de Hipersensibilidad de Tipo Inmediato Específica. La prueba de Hipersensibilidad de Tipo Retardado utiliza un péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII, tiene actividad de estimulación de células T humanas y no fija IgE específica para el alergeno en un considerable porcentaje de la población de sujetos sensibles al alergeno (p. ej. de al menos aproximadamente un 75%). A aquellos sujetos que resulten tener tanto una reacción de Hipersensibilidad de Tipo Inmediato específica como una Reacción de Hipersensibilidad de Tipo Retardado específica se les administra una cantidad de una composición adecuada para la administración farmacéutica. La composición comprende el péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII según se le utiliza en la prueba de Hipersensibilidad de Tipo Retardado y un vehículo o diluyente farmacéuticamente aceptable.The present invention also provides methods for detecting and treating the sensitivity of a subject to Der f VII. The presence in subjects of IgE specific for Der f VII and the ability of the T cells of the subjects to respond to epitopes of Der f VII for T cells can be determined by administering a Type Hypersensitivity test to the subject. Immediate and / or a Delayed Type Hypersensitivity Test ( see , e.g., Immunology (1985) Roitt, IM, Brostoff, J., Male, DK (eds), CV Mosby Co., Gower Medical Publishing, London, NY, pp. 19.2-19.18; pp. 22.1-22.10) using a peptide having the antigenic activity of Der f VII or a modified form of a peptide having the antigenic activity of Der f VII, each of which sets IgE Allergen specific. The same subjects are administered a Delayed Type Hypersensitivity test before, simultaneously with or subsequent to the administration of the Immediate Type Hypersensitivity test. Of course, if the Immediate Type Hypersensitivity test is administered before the Delayed Type Hypersensitivity test, the Delayed Type Hypersensitivity test would be administered to those subjects who had a Specific Immediate Type Hypersensitivity reaction. The Delayed Type Hypersensitivity test uses a peptide that has the antigenic activity of Der f VII, has human T cell stimulation activity and does not fix specific IgE for the allergen in a considerable percentage of the population of allergen sensitive subjects (p eg of at least about 75%). Those subjects who turn out to have both a specific Immediate Type Hypersensitivity reaction and a specific Delayed Type Hypersensitivity Reaction are administered an amount of a composition suitable for pharmaceutical administration. The composition comprises the peptide having the antigenic activity of Der f VII as used in the Delayed Type Hypersensitivity test and a pharmaceutically acceptable carrier or diluent.
Un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII puede ser utilizado en métodos para diagnosticar, tratar o prevenir las reacciones alérgicas a un alergeno de los ácaros del polvo o a un alergeno proteínico interreactivo. Así, la presente invención aporta composiciones adecuadas para el uso in vitro y para la administración farmacéutica que comprenden una cantidad de al menos un péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII. Las composiciones farmacéuticas serán típicamente formuladas con un vehículo farmacéuticamente aceptable.A peptide having the antigenic activity of Der f VII can be used in methods to diagnose, treat or prevent allergic reactions to an allergen from dust mites or an interreactive protein allergen. Thus, the present invention provides compositions suitable for in vitro use and for pharmaceutical administration comprising an amount of at least one peptide having the antigenic activity of Der f VII. Pharmaceutical compositions will typically be formulated with a pharmaceutically acceptable carrier.
Cuando una composición según la invención está
destinada a ser administrada a un sujeto a desensibilizar, tal
administración puede ser llevada a cabo utilizando procedimientos
conocidos y con dosificaciones y por espacio de períodos de tiempo
que resulten eficaces para reducir la sensibilidad (es decir, para
reducir la respuesta alérgica) del sujeto a un alergeno de los
ácaros del polvo. El vocablo "sujeto" es utilizado con la
intención de incluir organismos vivientes en los cuales pueda ser
provocada una respuesta inmune, como son p. ej. los mamíferos. Los
ejemplos de sujetos incluyen los seres humanos, los perros, los
gatos, los ratones, las ratas y las especies transgénicas de los
mismos. Una cantidad de al menos un péptido que tenga la actividad
antigénica del Der f VII necesaria para lograr un efecto
terapéutico puede variar según factores tales como el grado de
sensibilidad del sujeto a los ácaros del polvo, la edad, el sexo y
el peso del sujeto, y la capacidad de un péptido que tenga la
actividad antigénica del Der f VII para provocar una
respuesta antigénica en el sujeto. Los regímenes de dosificación
pueden ser ajustados para proporcionar la respuesta terapéutica
óptima. Por ejemplo, pueden ser administradas diariamente varias
dosis divididas, o bien la dosis puede ser reducida
proporcionalmente según indiquen las exigencias de la
situación
terapéutica.When a composition according to the invention is intended to be administered to a subject to be desensitized, such administration can be carried out using known methods and with dosages and for periods of time that are effective in reducing sensitivity (i.e., in reducing the allergic response) of the subject to an allergen from dust mites. The word "subject" is used with the intention of including living organisms in which an immune response can be provoked, such as p. ex. the mammals. Examples of subjects include humans, dogs, cats, mice, rats and transgenic species thereof. An amount of at least one peptide having the antigenic activity of Der f VII necessary to achieve a therapeutic effect may vary according to factors such as the degree of sensitivity of the subject to dust mites, age, sex and weight of the subject. , and the ability of a peptide having the antigenic activity of Der f VII to elicit an antigenic response in the subject. Dosage regimens can be adjusted to provide the optimal therapeutic response. For example, several divided doses may be administered daily, or the dose may be proportionally reduced as indicated by the requirements of the situation.
therapy.
El compuesto activo (es decir, un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII) puede ser administrado de una manera conveniente tal como por inyección (subcutánea, intravenosa, etc.), administración oral, inhalación, aplicación transdérmica o administración rectal. En dependencia de la ruta de administración, el compuesto activo puede estar recubierto con un material para proteger al compuesto contra la acción de enzimas, ácidos y otras condiciones naturales que puedan inactivar el compuesto.The active compound (i.e., a peptide having the antigenic activity of Der f VII) can be administered in a convenient manner such as by injection (subcutaneous, intravenous, etc.), oral administration, inhalation, transdermal application or rectal administration. Depending on the route of administration, the active compound may be coated with a material to protect the compound against the action of enzymes, acids and other natural conditions that may inactivate the compound.
Para administrar un péptido que tenga la
actividad antigénica del Der f VII por una vía distinta de la
administración parenteral, puede ser necesario recubrir al péptido
con, o coadministrar el péptido con, un material para impedir su
inactivación. Por ejemplo, un péptido que tenga la actividad
antigénica del Der f VII puede ser administrado a un
individuo en un apropiado vehículo, diluyente o adyuvante, o bien
puede ser coadministrado con inhibidores enzimáticos o en un
apropiado vehículo tal como liposomas. Los diluyentes
farmacéuticamente aceptables incluyen soluciones salinas y
soluciones tampón acuosas. El vocablo "adyuvante" es utilizado
en su sentido más amplio e incluye todo compuesto estimulante inmune
tal como el interferón. Los adyuvantes contemplados en la presente
incluyen resorcinoles y agentes superficiactivos no iónicos tales
como éter polioxietilenoleílico y éter de
n-hexadecilpolietileno. Los inhibidores enzimáticos
incluyen inhibidor de tripsina pancreática,
diisopropilfluorofosfato (DEP) y trasilol. Los liposomas incluyen
emulsiones CGF de agua en aceite en agua, así como liposomas
convencionales (Strejan et al., (1984) J.
Neuroimmunol., 7: 27). A efectos de inducir la
incapacidad de respuesta de las células T, la composición es
preferiblemente administrada en forma no inmunogénica, y p. ej. en
una forma que no contenga
adyuvante.To administer a peptide having the antigenic activity of Der f VII by a route other than parenteral administration, it may be necessary to coat the peptide with, or co-administer the peptide with, a material to prevent its inactivation. For example, a peptide having the antigenic activity of Der f VII can be administered to an individual in an appropriate vehicle, diluent or adjuvant, or it can be co-administered with enzyme inhibitors or in an appropriate vehicle such as liposomes. Pharmaceutically acceptable diluents include saline solutions and aqueous buffer solutions. The word "adjuvant" is used in its broadest sense and includes all immune stimulating compounds such as interferon. Adjuvants contemplated herein include resorcinols and non-ionic surface agents such as polyoxyethylenelethyl ether and n-hexadecyl polyethylene ether. Enzymatic inhibitors include pancreatic trypsin inhibitor, diisopropylfluorophosphate (DEP) and trasylol. Liposomes include water CGF emulsions in oil in water, as well as conventional liposomes (Strejan et al, (1984) J. Neuroimmunol, 7:.. 27). In order to induce the inability to respond to T cells, the composition is preferably administered in a non-immunogenic manner, and e.g. ex. in a way that does not contain
adjuvant
El compuesto activo puede ser también administrado parenteralmente o intraperitonealmente. Las dispersiones pueden ser también preparadas en glicerol, polietilenglicoles líquidos y mezclas de los mismos y en aceites. Bajo condiciones ordinarias de almacenamiento y uso, estas preparaciones pueden contener un preservativo para impedir el desarrollo de microorganismos.The active compound can also be administered parenterally or intraperitoneally. The dispersions can also be prepared in glycerol, liquid polyethylene glycols and mixtures thereof and in oils. Under ordinary conditions of storage and use, these preparations may contain a condom to prevent the microorganism development
Las composiciones farmacéuticas adecuadas para
uso inyectable incluyen soluciones (cuando sean solubles en agua) o
dispersiones acuosas estériles y polvos estériles para la
preparación extemporánea de soluciones o dispersiones inyectables
estériles. En todos los casos, la composición debe ser estéril y
debe ser fluida en la medida necesaria para que la composición pueda
ser fácilmente inyectada con una jeringa. La composición debe ser
estable bajo las condiciones de fabricación y almacenamiento, y debe
ser preservada contra la acción contaminante de microorganismos
tales como bacterias y hongos. El vehículo puede ser un disolvente o
un medio de dispersión que contenga, por ejemplo, agua, etanol,
poliol (por ejemplo, glicerol, propilenglicol y polietilenglicol
líquido y similares), adecuadas mezclas de los mismos y aceites
vegetales. La correcta fluidez puede ser mantenida, por ejemplo,
mediante la utilización de un recubrimiento tal como lecitina,
mediante el mantenimiento del requerido tamaño de partículas en el
caso de la dispersión, y mediante la utilización de agentes
superficiactivos. La evitación de la acción de los microorganismos
puede lograrse mediante varios agentes antibacterianos y
antifúngicos, como por ejemplo parahidroxibenzoatos, clorobutanol,
fenol, ácido ascórbico, timerosal y similares. En muchos casos será
preferible incluir en la composición agentes isotónicos como por
ejemplo azúcares, polialcoholes tales como manitol, sorbitol o
cloruro sódico. La absorción prolongada de las composiciones
inyectables puede ser provocada a base de incluir en la composición
un agente que retrase la absorción, como por ejemplo monoestearato
de aluminio y
gelatina.Pharmaceutical compositions suitable for injectable use include solutions (when soluble in water) or sterile aqueous dispersions and sterile powders for the extemporaneous preparation of sterile injectable solutions or dispersions. In all cases, the composition must be sterile and must be fluid to the extent necessary so that the composition can be easily injected with a syringe. The composition must be stable under the conditions of manufacture and storage, and must be preserved against the contaminating action of microorganisms such as bacteria and fungi. The carrier may be a solvent or dispersion medium containing, for example, water, ethanol, polyol (for example, glycerol, propylene glycol and liquid polyethylene glycol and the like), suitable mixtures thereof and vegetable oils. The correct fluidity can be maintained, for example, by the use of a coating such as lecithin, by the maintenance of the required particle size in the case of dispersion, and by the use of surface-active agents. Avoidance of the action of microorganisms can be achieved by various antibacterial and antifungal agents, such as parahydroxybenzoates, chlorobutanol, phenol, ascorbic acid, thimerosal and the like. In many cases it will be preferable to include in the composition isotonic agents such as sugars, polyalcohols such as mannitol, sorbitol or sodium chloride. Prolonged absorption of injectable compositions can be caused by including in the composition an agent that delays absorption, such as aluminum monostearate and
jelly.
Las soluciones inyectables estériles pueden ser
preparadas a base de incorporar el agente activo (es decir, un
péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII) en
la cantidad requerida en un disolvente apropiado con uno de los
ingredientes o con una combinación de los ingredientes anteriormente
enumerados, según se requiera, efectuando a continuación
esterilización con filtración. Generalmente, las dispersiones son
preparadas a base de incorporar el compuesto activo a un vehículo
estéril que contiene un medio de dispersión básico y los otros
ingredientes requeridos seleccionados de entre los anteriormente
enumerados. En el caso de los polvos estériles para la preparación
de soluciones inyectables estériles, los métodos de preparación
preferidos son el vacuosecado y la liofilización, que da un polvo
del ingrediente activo (es decir, al menos un péptido que tiene la
actividad antigénica del Der f VII) más cualquier deseado
ingrediente adicional a partir de una solución previamente filtrada
en condiciones
estériles.Sterile injectable solutions may be prepared based on incorporating the active agent (i.e., a peptide having the antigenic activity of Der f VII) in the amount required in an appropriate solvent with one of the ingredients or with a combination of the ingredients. listed above, as required, then sterilizing with filtration. Generally, dispersions are prepared by incorporating the active compound into a sterile vehicle containing a basic dispersion medium and the other required ingredients selected from those listed above. In the case of sterile powders for the preparation of sterile injectable solutions, the preferred preparation methods are vacuum drying and lyophilization, which gives a powder of the active ingredient (i.e., at least one peptide having the antigenic activity of Der f VII) plus any desired additional ingredient from a solution previously filtered under conditions
sterile
Cuando el péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII está adecuadamente protegido, como se ha descrito anteriormente, el péptido puede ser administrado oralmente, por ejemplo, con un diluyente inerte o un vehículo comestible asimilable. El péptido y los demás ingredientes pueden ser también encapsulados en una cápsula de gelatina de vaina dura o blanda, pueden ser comprimidos formándose con los mismos tabletas, o bien pueden ser incorporados directamente a la dieta del individuo. Para administración terapéutica oral, el compuesto activo puede ser mezclado con excipientes y utilizado en forma de tabletas ingeribles, tabletas bucales, trociscos, cápsulas, elixires, suspensiones, jarabes, obleas y formas similares. El porcentaje de las composiciones y preparaciones puede naturalmente ser variado, y puede estar convenientemente situado entre aproximadamente un 5 y aproximadamente un 80% del peso de la unidad. La cantidad de componente activo en tales composiciones terapéuticamente útiles es tal que se obtendrá una adecuada dosificación.When the peptide having the antigenic activity of Der f VII is adequately protected, as described above, the peptide can be administered orally, for example, with an inert diluent or an assimilable edible carrier. The peptide and the other ingredients can also be encapsulated in a hard or soft pod gelatin capsule, they can be compressed into tablets, or they can be incorporated directly into the individual's diet. For oral therapeutic administration, the active compound can be mixed with excipients and used in the form of ingestible tablets, buccal tablets, troches, capsules, elixirs, suspensions, syrups, wafers and similar forms. The percentage of the compositions and preparations can of course be varied, and may conveniently be located between about 5 and about 80% of the weight of the unit. The amount of active component in such therapeutically useful compositions is such that an adequate dosage will be obtained.
En el sentido en el que se la utiliza en la
presente, la expresión "vehículo farmacéuticamente aceptable"
incluye todos los y cualesquiera disolventes, medios de dispersión,
revestimientos, agentes antibacterianos y antifúngicos, agentes
isotónicos y retardadores de la absorción y materiales similares. El
uso de tales medios y agentes para sustancias farmacéuticamente
activas es bien conocido en la técnica. Excepto en la medida en que
cualquier medio o agente convencional sea incompatible con el
compuesto activo, se contempla la utilización de los mismos en las
composiciones terapéuticas. Pueden ser también incorporados a las
composiciones compuestos activos
suplementarios.In the sense that it is used herein, the term "pharmaceutically acceptable carrier" includes all and any solvents, dispersion media, coatings, antibacterial and antifungal agents, isotonic agents and absorption retardants and similar materials. The use of such media and agents for pharmaceutically active substances is well known in the art. Except insofar as any conventional medium or agent is incompatible with the active compound, the use thereof in the therapeutic compositions is contemplated. They can also be incorporated into the active compound compositions
supplementary
Es especialmente ventajoso formular composiciones parenterales en forma de unidades de dosificación para una fácil administración y para lograr una uniformidad de dosificación. En el sentido en el que se la utiliza en la presente, la expresión "en forma de unidades de dosificación" se refiere a unidades físicamente discretas adecuadas como dosificaciones unitarias para los sujetos mamíferos a tratar, conteniendo cada unidad una cantidad predeterminada de compuesto activo calculada para producir el deseado efecto terapéutico en asociación con el vehículo farmacéutico requerido. Las especificaciones para las formas de las unidades de dosificación de la invención vienen determinadas por y son directamente dependientes de (a) las características singulares del compuesto activo y el concreto efecto terapéutico a lograr, y (b) las limitaciones inherentes a la técnica de combinar tal compuesto activo para el tratamiento de la sensibilidad en los sujetos.It is especially advantageous to formulate parenteral compositions in the form of dosage units for easy administration and to achieve a uniformity of dosage. In the sense in which it is used herein, the expression "in the form of dosage units" refers to to physically discrete units suitable as dosages units for mammalian subjects to be treated, containing each unit a predetermined amount of active compound calculated to produce the desired therapeutic effect in association with the Pharmaceutical vehicle required. The specifications for dosage unit forms of the invention come determined by and are directly dependent on (a) the unique characteristics of the active compound and the concrete effect therapeutic to achieve, and (b) the limitations inherent in the technique of combining such active compound for the treatment of sensitivity in the subjects
La presente invención aporta también una composición que comprende al menos dos péptidos que tienen la actividad antigénica del Der f VII (p. ej. una mezcla física de al menos dos péptidos) y que tienen cada uno actividad de estimulación de las células T. Por ejemplo, se pueden combinar al menos dos péptidos que tienen cada uno una actividad antígena de Der f VII. Como alternativa, puede ser administrado a un sujeto alérgico un péptido que tenga al menos dos regiones que tengan cada una actividad de estimulación de las células T (es decir, un péptido en el que cada una de tales regiones comprenda al menos un epítope para células T). Tal péptido puede tener al menos dos regiones derivadas del mismo alergeno Der f VII. Puede administrarse a un sujeto una composición de dos péptidos o un péptido que tenga al menos dos regiones, en forma de una composición con un vehículo farmacéuticamente aceptable según se ha descrito anteriormente. Puede ser administrada simultáneamente o secuencialmente a un sujeto sensible a un alergeno de los ácaros del polvo para tratar tal sensibilidad una cantidad de una o varias de tales composiciones. Tales composiciones pueden ser útiles para la fabricación de un medicamento para tratar la sensibilidad a los ácaros del polvo doméstico en un individuo.The present invention also provides a composition comprising at least two peptides that have the antigenic activity of Der f VII (eg a physical mixture of at least two peptides) and that each have T cell stimulation activity. For example, at least two peptides each having an antigenic activity of Der f VII can be combined. Alternatively, a peptide having at least two regions each having a T cell stimulation activity (i.e., a peptide in which each such region comprises at least one epitope for cells) can be administered to an allergic subject T). Such a peptide may have at least two regions derived from the same Der f VII allergen. A composition of two peptides or a peptide having at least two regions may be administered to a subject, in the form of a composition with a pharmaceutically acceptable carrier as described above. It may be administered simultaneously or sequentially to an allergen sensitive subject of dust mites to treat such sensitivity an amount of one or more such compositions. Such compositions may be useful for the manufacture of a medicament for treating the sensitivity to house dust mites in an individual.
El cDNA (o el RNAm que sirvió de molde durante la transcripción inversa) que codifica un péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII puede ser utilizado para identificar similares secuencias de ácidos nucleicos en cualquier variedad o tipo de animal, y por consiguiente para clonar molecularmente genes que tengan homología secuencial suficiente como para hibridarse con el cDNA que codifica un péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII. Por consiguiente, la presente invención incluye no solamente péptidos que tienen la actividad antigénica del Der f VII, sino también otras proteínas que pueden ser alergenos codificados por DNA que se hibride con DNA de la presente invención.The cDNA (or mRNA that served as a template during reverse transcription) that encodes a peptide that has the antigenic activity of Der f VII can be used to identify similar nucleic acid sequences in any variety or type of animal, and therefore to Molecularly cloning genes that have sufficient sequential homology to hybridize with the cDNA encoding a peptide that has the antigenic activity of Der f VII. Accordingly, the present invention includes not only peptides having the antigenic activity of Der f VII, but also other proteins that can be DNA-encoded allergens that hybridize with DNA of the present invention.
Están dentro del alcance de la invención los péptidos aislados que están inmunológicamente emparentados con el Der f VII tal como por interreactividad con los anticuerpos o por interreactividad con las células T, y que son distintos de los ya identificados. Tales péptidos fijan los anticuerpos específicos para la proteína y los péptidos de la invención, o estimulan las células T específicas para la proteína y los péptidos de esta invención.Within the scope of the invention are isolated peptides that are immunologically related to Der f VII such as by interreactivity with antibodies or by interreactivity with T cells, and which are distinct from those already identified. Such peptides bind the antibodies specific for the protein and peptides of the invention, or stimulate the T cells specific for the protein and peptides of this invention.
Un péptido que tenga la actividad antigénica del Der f VII (es decir, de Der f VII producido por recombinación o por síntesis química) está exento de todas las otras proteínas de los ácaros del polvo, y es por consiguiente útil en la estandarización de extractos de alergeno que son reactivos clave para la diagnosis y el tratamiento de la hipersensibilidad a los ácaros del polvo. Además, tal péptido es de una coherente y bien definida composición y actividad biológica para ser utilizado en preparaciones que puedan ser administradas a efectos terapéuticos (p. ej. para modificar la respuesta alérgica e un sujeto sensible a los ácaros del polvo). Tales péptidos pueden ser también utilizados para estudiar el mecanismo de inmunoterapia de la alergia al Dermatophagoides farinae y para diseñar derivados o análogos modificados útiles en inmunoterapia.A peptide having the antigenic activity of Der f VII (i.e. Der f VII produced by recombination or chemical synthesis) is exempt from all other dust mite proteins, and is therefore useful in the standardization of extracts of allergens that are key reagents for the diagnosis and treatment of hypersensitivity to dust mites. In addition, such a peptide is of a coherent and well defined composition and biological activity to be used in preparations that can be administered for therapeutic purposes (eg to modify the allergic response and a subject sensitive to dust mites). Such peptides can also be used to study the immunotherapy mechanism of Dermatophagoides farinae allergy and to design derivatives or modified analogs useful in immunotherapy.
Los trabajos realizados por terceros han puesto
de manifiesto que generalmente los mejores resultados durante la
inmunoterapia (es decir, el mejor alivio de los síntomas) se
obtienen con altas dosis de extractos de alergenos. Sin embargo,
muchos sujetos son incapaces de tolerar grandes dosis de tales
extractos debido a las reacciones sistémicas provocadas por los
alergenos y los otros componentes que están en estas preparaciones.
Un péptido que tiene la actividad antigénica del Der f VII
según la invención tiene la ventaja de estar exento de todas las
demás proteínas de los ácaros del polvo, y por consiguiente es más
inocuo y más adecuado para las aplicaciones
terapéuticas.The work carried out by third parties has shown that generally the best results during immunotherapy (that is, the best relief of symptoms) are obtained with high doses of allergen extracts. However, many subjects are unable to tolerate large doses of such extracts due to systemic reactions caused by allergens and the other components that are in these preparations. A peptide having the antigenic activity of Der f VII according to the invention has the advantage of being free of all other dust mite proteins, and therefore is more harmless and more suitable for applications.
therapeutic
Es ahora también posible diseñar un agente o una droga capaz de bloquear o inhibir la capacidad de un alergeno de los ácaros del polvo para inducir una reacción alérgica en sujetos sensibles. Tales agentes podrían ser diseñados, por ejemplo, de forma tal que se fijasen a las correspondientes moléculas anti-Der f VII, impidiendo así la fijación del alergeno y la IgE y la subsiguiente desgranulación de los mastocitos/basófilos. Como alternativa, tales agentes podrían fijarse a componentes celulares del sistema inmune, redundando en una supresión o desensibilización de las respuestas alérgicas a los alergenos de los ácaros del polvo. Un ejemplo no limitativo de esto es el consistente en la utilización de péptidos que incluyen epítopes de Der f VII para células B o T, o modificaciones de los mismos, basados en la estructura proteínica del cDNA de Der f VII para suprimir la respuesta alérgica a un alergeno de los ácaros del polvo. Esto podría hacerse a base de definir las estructuras de los fragmentos que codifiquen los epítopes para células B y T que afecten el funcionamiento de las células B y T en los estudios in vitro con componentes sanguíneos de sujetos sensibles a los ácaros el polvo.It is now also possible to design an agent or drug capable of blocking or inhibiting the ability of an allergen from dust mites to induce an allergic reaction in sensitive subjects. Such agents could be designed, for example, in such a way that they were fixed to the corresponding anti- Der f VII molecules, thus preventing the fixation of the allergen and the IgE and the subsequent degranulation of the mast cells / basophils. Alternatively, such agents could be fixed to cellular components of the immune system, resulting in a suppression or desensitization of allergic responses to dust mite allergens. A non-limiting example of this is the use of peptides that include epitopes of Der f VII for B or T cells, or modifications thereof, based on the protein structure of the Der f VII cDNA to suppress the allergic response to an allergen from dust mites. This could be done by defining the structures of the fragments encoding the epitopes for B and T cells that affect the functioning of B and T cells in in vitro studies with blood components of dust-sensitive mite-sensitive subjects.
Se ilustra adicionalmente la invención mediante
los ejemplos siguientes, que no deberán ser interpretados como
ejemplos que limiten adicionalmente la presente invención. Los
contenidos de todas las referencias y solicitudes de patentes
publicadas que se citan dentro de toda esta solicitud quedan
incorporados a la presente por refe-
rencia.The invention is further illustrated by the following examples, which should not be construed as examples that further limit the present invention. The contents of all references and published patent applications cited within this entire application are incorporated herein by reference.
rencia.
\newpage\ newpage
Se preparó una biblioteca de cDNA de \lambdagt11 a partir de Dermatophagoides farinae adultos vivos adquiridos a la Fa. Commonwealth Serum Laboratories, Parkville, Australia (Thomas, W., et al., Int Arch Allergy Appl Immunol (1988) 85: 127-9). La biblioteca fue preparada según Trudinger et al., (1991) Chem. Exp. Allergy, 21:33-37.A λdagt11 cDNA library was prepared from Dermatophagoides farinae live adults acquired from the Fa. Commonwealth Serum Laboratories, Parkville, Australia (Thomas, W., et al ., Int Arch Allergy Appl Immunol (1988) 85 : 127-9). The library was prepared according to Trudinger et al ., (1991) Chem. Exp. Allergy , 21: 33-37.
Se utilizó la amplificación de la PCR y la
secuenciación del DNA para aislar cDNA de Der f VII a partir
de la biblioteca de \lambdagt11. Se realizó un cebador
oligonucleotídico (Df1 en la tabla 1) basado en la secuencia
N-terminal de Der p VII prevista. Dicho
cebador tenía la secuencia
GCGAATTCGATCCAATTCACTATGAT-3' (ID SEC Nº: 8). El
primer GCGAATTC codifica un sitio EcoRI (GAATTC) y la secuencia GAT
codifica los primeros seis residuos de Der p VII. Para el
otro cebador se utilizó el cebador directo de \lambdagt11
GGTGGCGACGACTCCTGGAGCCCG-3' (ID SEC Nº: 9) (Df2 en
la tabla 1) al lado del sitio EcoRI de clonación (New England
Biolabs, Beverly, Estados
Unidos).PCR amplification and DNA sequencing were used to isolate Der f VII cDNA from the λ1 library. An oligonucleotide primer (Df1 in Table 1) was performed based on the expected N-terminal sequence of Der p VII. Said primer had the sequence GCGAATTCGATCCAATTCACTATGAT-3 '(SEQ ID NO: 8). The first GCGAATTC encodes an EcoRI site (GAATTC) and the GAT sequence encodes the first six residues of Der p VII. For the other primer the direct primer of λ GGTGGCGACGACTCCTGGAGCCCG-3 '(SEQ ID NO: 9) (Df2 in Table 1) was used next to the EcoRI cloning site (New England Biolabs, Beverly, United States).
United).
Las reacciones PCR se efectuaron en un volumen
de reacción final de 50 \mul que contiene 20 mM de
Tris-HCl a pH 8,2, 10 mM de KCl, 6 mM de
(NH_{4})_{2}SO_{4}, 2 mM de MgCl_{2}, 0,1% de Triton
X-100, 10 ng\mu de BSA libre de nucleasa, 10 mM de
dNTPs, 20 pmol de cada cebador y 2,5 unidades de Pfu DNA polimerasa.
Esto se obtuvo como conjunto de Stratagene (La Jolla, California,
Estados Unidos). Se añadió DNA objetivo (enlaces de cDNA de
\lambdagt11 D. farinae, 0,001 \mug) y se mezcló el
contenido del tubo y se cubrió con aceite de parafina. Los tubos se
desnaturalizaron inicialmente a 95ºC durante 5 minutos, a
continuación se templaron a 55ºC durante 2 minutos y se ampliaron a
72ºC durante 2 minutos. Después de esto, se realizó la
desnaturalización a 94ºC durante 1 minuto, el enfriamiento a 55ºC
durante 1 minuto y la ampliación como antes, a lo largo de 48
ciclos. En el ciclo final (el número 50), la reacción de ampliación
aumentó a 10 minutos para asegurar que todos los productos
amplificados estaban en su máxima
longitud.The PCR reactions were carried out in a final 50 µl reaction volume containing 20 mM Tris-HCl at pH 8.2, 10 mM KCl, 6 mM (NH 4) 2 SO 4 2 mM MgCl 2, 0.1% Triton X-100, 10 ng of nuclease free BSA, 10 mM dNTPs, 20 pmol of each primer and 2.5 units of Pfu DNA polymerase. This was obtained as a set of Stratagene (La Jolla, California, United States). Target DNA (cDNA bonds of λD farinae , 0.001 µg) was added and the contents of the tube were mixed and covered with paraffin oil. The tubes were initially denatured at 95 ° C for 5 minutes, then tempered at 55 ° C for 2 minutes and expanded at 72 ° C for 2 minutes. After this, denaturation was performed at 94 ° C for 1 minute, cooling at 55 ° C for 1 minute and expansion as before, over 48 cycles. In the final cycle (number 50), the expansion reaction increased to 10 minutes to ensure that all amplified products were at their maximum
length.
A continuación se buscaron bandas amplificadas por 10 microlitros de la reacción, en un gel de agarosa al 1%. El sobrante de la mezcla reactiva era etanol precipitado antes de la purificación del producto amplificado en un gel de agarosa de bajo punto de fusión (Bio-Rad., Richmond, Estados Unidos).Next, amplified bands were searched per 10 microliters of the reaction, in a 1% agarose gel. He leftover from the reaction mixture was ethanol precipitated before the Purification of the amplified product on a low agarose gel melting point (Bio-Rad., Richmond, United United).
El producto de PCR purificado se digirió con EcoRI y se ligó al vector mp18 de M13 (ver Messing, supra), se digirió con EcoRI y a continuación se transfirió a células competentes de E. coli de la cepa TG1. Se tomaron placas blancas aisladas y se usaron para preparar almacenes de fago y DNA monocatenario para su secuenciación.The purified PCR product was digested with EcoRI and ligated to the M18 mp18 vector (see Messing, supra ), digested with EcoRI and then transferred to competent E. coli cells of strain TG1. Isolated white plates were taken and used to prepare phage stores and single stranded DNA for sequencing.
La secuenciación del DNA se llevó a cabo mediante el método dideoxinucleótido de terminación de cadena, utilizando la versión 2.0 de Sequenase (USB Corp., Cleveland, Estados Unidos) de acuerdo con el protocolo del suministrador. Entre los cebadores utilizados para la secuenciación cabe citar el cebador M13 de secuenciación (-40) a 17-mer GTTTTCCCAGTCACGAC-3' (ID SEC Nº 10) (Df3 en la Tabla 1), el cebador Df1 (ID SEC Nº 8) utilizado para la reacción PCR descrita en el ejemplo 1 y otros dos cebadores oligonucleótidos, Df4 y Df5, ambos mostrados en la Tabla 1. El cebador Df4 GGTGAATTAGCCATGCG-3' (ID SEC Nº 11) se utilizó previamente para la secuenciación de Der p VII y el cebador Df5 TCAATCTTGGATCCAATTTTTGGC-3' (ID SEC Nº 12) se basó en las secuencias de Der f VII de los nucleótidos 559-582.DNA sequencing was carried out using the dideoxynucleotide chain termination method, using version 2.0 of Sequenase (USB Corp., Cleveland, United States) according to the supplier's protocol. Among the primers used for sequencing, mention should be made of the M13 sequencing primer (-40) at 17-mer GTTTTCCCAGTCACGAC-3 '(SEQ ID No. 10) (Df3 in Table 1), the Df1 primer (SEQ ID No. 8) used for the PCR reaction described in example 1 and two other oligonucleotide primers, Df4 and Df5, both shown in Table 1. Df4 primer GGTGAATTAGCCATGCG-3 '(SEQ ID No. 11) was previously used for sequencing Der p VII and primer Df5 TCAATCTTGGATCCAATTTTTGGC-3 '(SEQ ID No. 12) was based on Der f VII sequences of nucleotides 559-582.
Para aislar un cDNA que contiene la región no
traducida del lado 5' de Der f VII, se produjo un cebador
oligonucleótido basado en la secuencia terminal C de Der f
VII. Dicho cebador (Df6 en la Tabla 1) tenía la secuencia
GGAATTCTTAATTTTTTTCCAATTCACG-3' (ID SEC Nº 13). La
primera GGAATTC codifica un sitio EcoRI. Dicha secuencia y la
siguiente (TTA...) son complementarias a las secuencias inversas
del codón de parada y los últimos seis residuos de Der f VII.
Para el otro cebador se utilizó el cebador inverso de \lambdagt11
TTGACACCAGACCAACTGG
TAATG-3' (ID SEC Nº 14)
(Df7 en la Tabla 1), al lado del sitio EcoRI de clonación.To isolate a cDNA containing the untranslated region of the 5 'side of Der f VII, an oligonucleotide primer based on the C-terminal sequence of Der f VII was produced. Said primer (Df6 in Table 1) had the sequence GGAATTCTTAATTTTTTTCCAATTCACG-3 '(SEQ ID NO: 13). The first GGAATTC encodes an EcoRI site. Said sequence and the following one (TTA ...) are complementary to the reverse sequences of the stop codon and the last six residues of Der f VII. For the other primer the reverse primer of? Lambdagt11 TTGACACCAGACCAACTGG was used
TAATG-3 '(SEQ ID No. 14) (Df7 in Table 1), next to the EcoRI cloning site.
Las reacciones PCR se efectuaron de acuerdo con las condiciones descritas en el ejemplo 1. El producto PCR se purificó en un gel de agarosa de bajo punto de fusión, se digirió con EcoRI y se ligó a pUC 19 digerido con EcoRI, y a continuación se transfirió a células competentes de E. coli de la cepa TG1. Se aisló el DNA plasmídico del E. coli transformante y se usó para su secuenciación.The PCR reactions were carried out according to the conditions described in example 1. The PCR product was purified on a low melting agarose gel, digested with EcoRI and ligated to pUC 19 digested with EcoRI, and then transferred to competent E. coli cells of strain TG1. Transformative E. coli plasmid DNA was isolated and used for sequencing.
La secuenciación del DNA se llevó a cabo mediante el mismo método dideoxinucleótido de terminación de cadena, utilizando la versión 2.0 de Sequenase, descrita anteriormente. Sin embargo, antes de la secuenciación, se desnaturalizaron los moldes de DNA plasmídico de cadena doble, mediante el tratamiento con NaOH, y se neutralizaron mediante la adición de acetato sódico y de etanol precipitado de acuerdo con el protocolo del suministrador. Para obtener la región no traducida del lado 5' de cDNA de Der f VII se utilizó el cebador Df8 (ver Tabla 1). Dicho cebador tenía la secuencia ATGACGTTCGAATTTATC-3' (ID SEC Nº 15), que corresponde a la secuencia inversa de Der f VII del nucleótido nº 225-208.DNA sequencing was carried out by the same dideoxynucleotide chain termination method, using version 2.0 of Sequenase, described above. However, before sequencing, the double-chain plasmid DNA templates were denatured, by treatment with NaOH, and neutralized by the addition of sodium acetate and ethanol precipitated according to the supplier's protocol. To obtain the untranslated region of the 5 'side of Der f VII cDNA, primer Df8 was used (see Table 1). Said primer had the sequence ATGACGTTCGAATTTATC-3 '(SEQ ID No. 15), which corresponds to the inverse sequence of Der f VII of nucleotide No. 225-208.
Los expertos en la materia podrán reconocer o distinguir, usando únicamente la experimentación rutinaria, numerosos equivalentes a los ejemplos de realización específicos que se han descrito en el presente documento. Se considera que dichos equivalentes están dentro del alcance de la presente invención y cubiertos por las reivindicaciones adjuntas.Those skilled in the art may recognize or distinguish, using only routine experimentation, numerous equivalents to the specific embodiments that have been described in this document. It is considered that said equivalents are within the scope of the present invention and covered by the appended claims.
(1) Información general:(1. General Information:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (i)(i)
- SolicitanteApplicant
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Nombre: Western Australian Research Institute for Child Health Name: Western Australian Research Institute for Child Health
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Calle GPO Box D184 GPO Box D184 Street
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Ciudad: Perth City: Perth
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Estado: MA State: MA
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (E)(AND)
- País: Australia occidental Country: Western Australia
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (F)(F)
- Código postal (ZIP): 6001 Postal Code (ZIP): 6001
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ii)(ii)
- Título de la invención: Title of the invention:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- Proteina y péptidos alergénicos de los ácaros del polvo doméstico y aplicaciones para los mismosProtein and allergenic peptides of house dust mites and applications for them
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (iii)(iii)
- Número de secuencias: 15 Number of sequences: 15
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (iv)(iv)
- Dirección postal: Postal Address:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Destinatario: Lahive & Cockfield Recipient: Lahive & Cockfield
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Dirección: 60 State Street Address: 60 State Street
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Localidad: Boston Location: Boston
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Estado: MA State: MA
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (E)(AND)
- País: Estados Unidos Country: United States
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (F)(F)
- Código postal (ZIP): 02109 Postal Code (ZIP): 02109
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (v)(v)
- Forma de lectura informática: Computer reading form:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Tipo de soporte: disquete Media Type: Floppy Disk
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Ordenador: compatible IBM PC Computer: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Sistema operativo: PC-DOS/MS-DOS Operating system: PC-DOS / MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Programa : PatentIn edición n° 1.0, versión n° 1.25 Program: PatentIn edition n ° 1.0, version n ° 1.25
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (vi)(saw)
- Datos sobre la solicitud actual: Data on the current application:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Número de solicitud: Application number:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Fecha de solicitud: Application date:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Clasificación: Classification:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (vii)(vii)
- Datos sobre las solicitudes anteriores: Data on previous requests:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Número de solicitud: USSN 08/031 141 Application number: USSN 08/031 141
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Fecha de solicitud: 12 Marzo 1993 Application date: March 12, 1993
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Número de solicitud: USSN 08/081 540 Application number: USSN 08/081 540
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Fecha de solicitud: 22 Junio 1993 Application date: June 22, 1993
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (viii)(viii)
- Información sobre el agente:Information about him agent:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Nombre: Amy E. Mandragouras Name: Amy E. Mandragouras
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Número de registro: 36,207 Registration number: 36,207
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Número de referencia: 053.2 PCT (IMI-032CPPC) Reference number: 053.2 PCT (IMI-032CPPC)
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ix)(ix)
- Información de contacto: Contact information:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Teléfono: 617-227-7400 Phone: 617-227-7400
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Fax: 617-227-5941 Fax: 617-227-5941
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
(2) Informaciones para la ID SEC Nº: 1:(2) Information for SEQ ID NO: 1:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (i)(i)
- Características de la secuencia: Sequence characteristics:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Longitud: 812 pares de bases Length: 812 base pairs
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Tipo: ácido nucleico Type: nucleic acid
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Número de hebras: una hebra Number of strands: one strand
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Topología: lineal Topology: linear
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ii)(ii)
- Tipo de molécula: ADNcMolecule Type: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ix)(ix)
- Características:Features:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Nombre/clave: CDS Name / key: CDS
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Localización: 68..712Location: 68..712
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (xi)(xi)
- Descripción de la secuencia ID SEC Nº: 1: Description of the sequence SEQ ID NO: 1:
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
(2) Informaciones para la ID SEC Nº: 2:(2) Information for SEQ ID NO: 2:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (i)(i)
- Características de la secuencia: Sequence characteristics:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Longitud: 215 aminoácidos Length: 215 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Tipo: aminoácido Type: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Topología: lineal Topology: linear
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ii)(ii)
- Tipo de molécula: proteína Molecule Type: Protein
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (xi)(xi)
- Descripción de la secuencia: ID SEC Nº: 2: Sequence description: SEQ ID NO: 2:
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
(2) Informaciones para la ID SEC Nº: 3:(2) Information for SEQ ID NO: 3:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (i)(i)
- Características de la secuencia: Sequence characteristics:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Longitud: 18 pares de bases Length: 18 base pairs
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Tipo: ácido nucleico Type: nucleic acid
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Número de hebras: de una hebra Number of strands: of a strand
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Topología: lineal Topology: linear
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ii)(ii)
- Tipo de molécula: ADNc Molecule Type: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (xi)(xi)
- Descripción de la secuencia ID SEC Nº: 3: Description of the sequence SEQ ID NO: 3:
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGATCCAATTC ACTATGAT
\hfill18
\ hskip-.1em \ dddseqskipGATCCAATTC ACTATGAT
\ hfill18
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
(2) Informaciones para la ID SEC Nº: 4:(2) Information for SEQ ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (i)(i)
- Características de la secuencia: Sequence characteristics:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Longitud: 17 pares de bases Length: 17 base pairs
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Tipo: ácido nucleico Type: nucleic acid
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Número de hebras: de una hebra. Number of strands: of a strand.
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Topología: lineal Topology: linear
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ii)(ii)
- Tipo de molécula: ADNc Molecule Type: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (xi)(xi)
- Descripción de la secuencia: ID SEC Nº: 4: Sequence description: SEQ ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTGAATTAG ACATGCG
\hfill17
\ hskip-.1em \ dddseqskipGGTGAATTAG ACATGCG
\ hfill17
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
(2) Informaciones para la ID SEC Nº: 5:(2) Information for SEQ ID NO: 5:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (i)(i)
- Características de la secuencia:Characteristics of the sequence:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Longitud: 24 pares de bases Length: 24 base pairs
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Tipo: ácido nucleico Type: nucleic acid
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Número de hebras: de una hebra Number of strands: of a strand
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Topología: lineal Topology: linear
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ii)(ii)
- Tipo de molécula: ADNc Molecule Type: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (xi)(xi)
- Descripción de la secuencia: ID SEC Nº: 5: Sequence description: SEQ ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCAATTTTGG ATCCAATTTT CGCT
\hfill24
\ hskip-.1em \ dddseqskipTCAATTTTGG ATCCAATTTT CGCT
\ hfill24
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
(2) Informaciones para la ID SEC Nº: 6:(2) Information for SEQ ID NO: 6:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (i)(i)
- Características de la secuencia: Sequence characteristics:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Longitud: 761 pares de bases Length: 761 base pairs
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Tipo: ácido nucleico Type: nucleic acid
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Número de hebras: una hebra Number of strands: one strand
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Topología: lineal Topology: linear
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ii)(ii)
- Tipo de molécula: ADNcMolecule Type: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ix)(ix)
- Características:Features:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Nombre/clave: CDS Name / key: CDS
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Localización: 43…681 Location: 43… 681
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (xi)(xi)
- Descripción de la secuencia ID SEC Nº: 6:Sequence description ID SEC Nº: 6:
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
(2) Informaciones para la ID SEC Nº: 7:(2) Information for SEQ ID NO: 7:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (i)(i)
- Características de la secuencia:Characteristics of the sequence:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Longitud: 213 aminoácidosLength: 213 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Tipo: aminoácido Type: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (E)(AND)
- Topología: lineal Topology: linear
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ii)(ii)
- Tipo de molécula: proteína Molecule Type: Protein
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (xi)(xi)
- Descripción de la secuencia: ID SEC Nº: 7: Sequence description: SEQ ID NO: 7:
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
(2) Informaciones para la ID SEC Nº: 8:(2) Information for SEQ ID NO: 8:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (i)(i)
- Características de la secuencia: Sequence characteristics:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Longitud: 26 pares de bases Length: 26 base pairs
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Tipo: ácido nucleicoType: nucleic acid
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Número de hebras: de una hebra Number of strands: of a strand
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Topología: linealTopology: linear
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ii)(ii)
- Tipo de molécula: ADNc Molecule Type: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (xi)(xi)
- Descripción de la secuencia ID SEC Nº: 8: Description of the sequence SEQ ID NO: 8:
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCGAATTCGATCCAATTCACTATGAT
\hfill26
\ hskip-.1em \ dddseqskipGCGAATTCGATCCAATTCACTATGAT
\ hfill26
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
(2) Informaciones para la ID SEC Nº: 9:(2) Information for SEQ ID NO: 9:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (i)(i)
- Características de la secuencia:Characteristics of the sequence:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Longitud: 24 pares de bases Length: 24 base pairs
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Tipo: ácido nucleico Type: nucleic acid
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Número de hebras: de una hebra Number of strands: of a strand
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Topología: lineal Topology: linear
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ii)(ii)
- Tipo de molécula: ADNc Molecule Type: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (xi)(xi)
- Descripción de la secuencia ID SEC Nº: 9: Description of the sequence SEQ ID NO: 9:
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTGGCGACGACTCCTGGAGCCCG
\hfill24
\ hskip-.1em \ dddseqskipGGTGGCGACGACTCCTGGAGCCCG
\ hfill24
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
(2) Informaciones para la ID SEC Nº: 10:(2) Information for SEQ ID NO: 10:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (i)(i)
- Características de la secuencia: Sequence characteristics:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Longitud: 17 pares de bases Length: 17 base pairs
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Tipo: ácido nucleico Type: nucleic acid
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Número de hebras: de una hebra Number of strands: of a strand
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Topología: lineal Topology: linear
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ii)(ii)
- Tipo de molécula: ADNc Molecule Type: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (xi)(xi)
- Descripción de la secuencia ID SEC Nº: 10: Description of the sequence SEQ ID NO: 10:
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTTTTCCCAGTCACGAC
\hfill17
\ hskip-.1em \ dddseqskipGTTTTCCCAGTCACGAC
\ hfill17
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
(2) Informaciones para la ID SEC Nº: 11:(2) Information for SEQ ID NO: eleven:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (i)(i)
- Características de la secuencia: Sequence characteristics:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Longitud: 17 pares de bases Length: 17 base pairs
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Tipo: ácido nucleico Type: nucleic acid
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Número de hebras: de una hebra Number of strands: of a strand
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Topología: lineal Topology: linear
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ii)(ii)
- Tipo de molécula: ADNc Molecule Type: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (xi)(xi)
- Descripción de la secuencia ID SEC Nº: 11: Description of the sequence SEQ ID NO: 11:
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTGAATTAGACATGCG
\hfill17
\ hskip-.1em \ dddseqskipGGTGAATTAGACATGCG
\ hfill17
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
(2) Informaciones para la ID SEC Nº: 12:(2) Information for SEQ ID NO: 12:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (i)(i)
- Características de la secuencia:Characteristics of the sequence:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Longitud: 24 pares de bases Length: 24 base pairs
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Tipo: ácido nucleico Type: nucleic acid
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Número de hebras: de una hebra Number of strands: of a strand
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Topología: lineal Topology: linear
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ii)(ii)
- Tipo de molécula: ADNc Molecule Type: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (xi)(xi)
- Descripción de la secuencia ID SEC Nº: 12: Description of the sequence SEQ ID NO: 12:
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCAATCTTGGATCCAATTTTTGGC
\hfill24
\ hskip-.1em \ dddseqskipTCAATCTTGGATCCAATTTTTGGC
\ hfill24
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
(2) Informaciones para la ID SEC Nº: 13:(2) Information for SEQ ID NO: 13:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (i)(i)
- Características de la secuencia: Sequence characteristics:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Longitud: 24 pares de bases Length: 24 base pairs
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Tipo: ácido nucleico Type: nucleic acid
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Número de hebras: de una hebra Number of strands: of a strand
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Topología: lineal Topology: linear
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ii)(ii)
- Tipo de molécula: ADNc Molecule Type: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (xi)(xi)
- Descripción de la secuencia ID SEC Nº: 13: Description of the sequence SEQ ID NO: 13:
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGAATTCTTAATTTTTTTCCAATTCACG
\hfill28
\ hskip-.1em \ dddseqskipGGAATTCTTAATTTTTTTCCAATTCACG
\ hfill28
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
(2) Informaciones para la ID SEC Nº: 14:(2) Information for SEQ ID NO: 14:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (i)(i)
- Características de la secuencia:Characteristics of the sequence:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Longitud: 24 pares de bases Length: 24 base pairs
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Tipo: ácido nucleico Type: nucleic acid
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Número de hebras: de una hebra Number of strands: of a strand
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Topología: lineal Topology: linear
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ii)(ii)
- Tipo de molécula: ADNc Molecule Type: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (xi)(xi)
- Descripción de la secuencia ID SEC Nº: 14: Description of the sequence SEQ ID NO: 14:
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTGACACCAGACCAACTGGTAATG
\hfill24
\ hskip-.1em \ dddseqskipTTGACACCAGACCAACTGGTAATG
\ hfill24
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
(2) Informaciones para la ID SEC Nº: 15:(2) Information for SEQ ID NO: 15:
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (i)(i)
- Características de la secuencia: Sequence characteristics:
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (A)(TO)
- Longitud: 24 pares de bases Length: 24 base pairs
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (B)(B)
- Tipo: ácido nucleico Type: nucleic acid
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (C)(C)
- Número de hebras: de una hebra Number of strands: of a strand
\vskip0.500000\baselineskip\ vskip0.500000 \ baselineskip
- (D)(D)
- Topología: lineal Topology: linear
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (ii)(ii)
- Tipo de molécula: ADNc Molecule Type: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip\ vskip0.800000 \ baselineskip
- (xi)(xi)
- Descripción de la secuencia ID SEC Nº: 15: Description of the sequence SEQ ID NO: 15:
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATGACGTTCGAATTTATC
\hfill18
\ hskip-.1em \ dddseqskipATGACGTTCGAATTTATC
\ hfill18
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