ES2287959T3 - Receptores clonados de peptidos 2 de tipo glucagon. - Google Patents
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Abstract
LA PRESENTE INVENCION SE REFIERE A UNOS NUCLEOTIDOS Y SECUENCIAS DE ACIDOS AMINADOS QUE CODIFICAN UNOS RECEPTORES DE PEPTIDOS SIMILARES AL GLUCAGON, CELULAS HUESPEDES DE RECOMBINACION TRANSFORMADAS POR DICHOS NUCLEOTIDOS, ASI COMO A SUS PROCEDIMIENTOS DE USO ESPECIALMENTE EN LA INVESTIGACION DE MEDICAMENTOS.
Description
Receptores clonados de péptidos 2 de tipo
glucagón.
La invención hace referencia al campo de la
biología molecular. Se refiere, más particularmente, a receptores
clonados de péptidos 2 de tipo glucagón y su uso en el cribado de
fármacos y en aplicaciones relacionadas.
El péptido 2 de tipo glucagón
(GLP-2) es un péptido de 33 aminoácidos, que se
expresa en un tejido determinado a partir del gen de glucagón
pleiotrófico y se encuentra altamente relacionado en términos de
secuencia aminoacídica al péptido 1 de glucagón y de tipo glucagón
(GLP-1). Las formas de los mamíferos de
GLP-2 se encuentran altamente conservadas: por
ejemplo, las formas humanas y de degu (un roedor de
Sur-América) se diferencian por uno y tres
aminoácidos respectivamente del GLP-2 de rata.
Recientemente se ha demostrado que el GLP-2 es una
hormona peptídica intestinotrófica; cuando se da de forma exógena,
el GLP-2 puede producir un aumento marcado en la
proliferación del epitelio intestinal pequeño de los ratones de la
prueba (Drucker et al, (1996) PNAS,
93:7911-7961). Más recientemente, se ha mostrado
que el GLP-2 aumenta la velocidad de transporte
máxima de D-Glucosa a través de la membrana
vasolateral intestinal (Cheeseman and Tseng: American Journal of
Physiology (1996) 271:G477-G482). La WO 93/19175
revela la clonación del receptor GLP-1 de rata y
humano.
Para acelerar la investigación en la biología
gastrointestinal y el desarrollo de fármacos útiles en el
tratamiento de varias condiciones médicas incluyendo desórdenes
gastrointestinales, será útil proporcionar el receptor a través del
cual se medía los efectos de GLP-2.
El receptor de GLP-2 ha sido
clonado y caracterizado. Como consecuencia, la presente invención
proporciona un polinucleótido aislado que codifica el receptor de
GLP-2, en particular incluyendo las formas de los
mamíferos y sus homólogos como, en unas realizaciones específicas,
las formas de rata y humanas. En aspectos de la invención, el
polinucleótido que codifica para un receptor de
GLP-2 se utiliza para la expresión para obtener una
proteína de receptor funcional y, en una forma identificada
opcionalmente, para la clonación génica adicional para identificar
proteínas de receptor estructuralmente relacionadas. En aspectos
relacionados de la invención, las versiones
anti-sentido de los polinucleótidos que codifican el
receptor de GLP-2 y sus fragmentos se obtienen y se
utilizan para regular la expresión del receptor de
GLP-2.
En otro de sus aspectos, la invención
proporciona el receptor de GLP-2 como producto de la
producción recombinante en un huésped celular. En aspectos
relacionados, se proporcionan células huésped recombinantes que
expresan el receptor de GLP-2, así como membranas
que soportan el receptor derivadas de estas células, y
construcciones de expresión en las que el polinucleótido que
codifica para el receptor de GLP-2 se encuentra
unido a controles de expresión funcionales en la célula huésped
seleccionada.
En otro de sus aspectos, el receptor de
GLP-2 se utiliza en el programa de cribado de
moléculas químicas para identificar ligandos del receptor de
GLP-2. Este método comprende los pasos de incubar
los ligandos candidatos con una célula que produce receptor de
GLP-2 de la presente invención, o con una
preparación de membrana derivada de ahí, y después midiendo el
grado de unión. Utilizando las células que expresan un receptor de
GLP-2 acoplado funcionalmente a un sistema de
segundo mensajero, de tal forma que la unión se pueda determinar
indirectamente, para mostrar el ligando frente a la actividad,
mediante la detección de un reportero apropiado.
En otro de sus aspectos, la invención
proporciona anticuerpos dirigidos al receptor de
GLP-2, para el uso por ejemplo en procedimientos de
diagnóstico.
La invención se describe además con referencia a
las siguientes figuras en las que:
La Figura 1 revela una secuencia de cADN (SEQ ID
NO: 1), nucleótidos 137-1786 que codifican el
receptor de GLP-2 de rata dónde los pares de bases
ambiguos se indican utilizando la nomenclatura IUB estándar (R: A o
G, Y: C o T, M: A o C, K: G o T, S: G o C, W: A o T).
La Figura 2 revela la secuencia aminoacídica del
producto de expresión (SEQ ID NO: 2) del cADN de la Figura 1.
La Figura 3 ilustra las potencias relativas del
péptido GLP-2 y los péptidos GLP-1
para el receptor codificad mediante la SEQ ID NO: 1.
La Figura 4 revela una secuencia de cADN de 667
nucleótidos (SEQ ID NO: 9) que codifica un fragmento de 222
aminoácidos (SEQ ID NO: 10) de un receptor de GLP-2
humano.
La Figura 5 revela la secuencia de aminoácidos
(SEQ ID NO: 10) expresada a partir del cADN de la Figura 4.
La Figura 6 revela una secuencia de cADN (SEQ ID
NO: 11), nucleótidos 122-1780 que codifican el
receptor de GLP-2 humano.
La Figura 7 revela la secuencia de aminoácidos
del producto de expresión (SEQ ID NO: 12) a partir del cADN de la
Figura 6.
La Figura 8 ilustra la activación funcional
mediante el péptido de GLP-2 del receptor humano
codificado mediante la SEQ ID NO: 11 (Figura 8).
La Figura 9 compara las secuencias de
aminoácidos del receptor de GLP-2 de rata y el
receptor de GLP-2 humano.
La Figura 10 compara las secuencias de
aminoácidos del receptor de GLP-2 de rata y el
receptor de GLP-2 humano frente el receptor de
GLP-1 de rata.
La invención se refiere a los polinucleótidos,
en su forma aislada, que codifican para el receptor de
GLP-2s. Tal y como se utiliza aquí "aislado"
significa separado de los polinucleótidos que codifican otras
proteínas. En el contexto de librerías de polinucleótido, por
ejemplo, el polinucleótido que codifica para el receptor de
GLP-2 se considera "aislado" cuando se ha
seleccionado, y en consecuencia se ha eliminado la asociación con
otros polinucleótidos dentro de la librería. Estos polinucleótidos
se pueden encontrar en la forma de ARN, o en la forma de ADN
incluyendo cADN, ADN genómico y ADN sintético. Los receptores de
GLP-2s se caracterizan por características
estructurales comunes a la clase de los receptores acoplados a
proteína G, incluyendo siete regiones transmembrana, y mediante las
propiedades funcionales de unirse al péptido GLP-2
de forma selectiva, es decir, preferentemente, el péptido de
GLP-1. Esta unión selectiva se revela como una mayor
unión significativa estadísticamente a GLP-2
respeto a GLP-1, en el contexto del ensayo
seleccionado para medir esta afinidad. Cuando se expresa
funcionalmente en una célula huésped, es decir, en conexión operable
con un sistema de segundo mensajero sensible los receptores de
GLP-2s son capaces además de responder a la unión de
GLP-2 mediante la transducción del señal. En este
sentido, la actividad de un receptor acoplado a proteína G como un
receptor de GLP-2 se puede medir utilizando
cualquiera de una variedad de ensayos funcionales apropiados en los
que la activación del receptor resulta en un cambio detectable a
nivel de alguno de los sistemas de segundo mensajero, como el
adenilato ciclasa, la movilización de calcio, los productos de
hidrólisis de fosfolípido de inositol o el guanililo ciclasa.
Con referencia a la Figura 9 y la Figura 10, que
revelan homologías a través de las secuencia de aminoácido que
representan el receptor de GLP-2s de rata y humano,
las regiones del 100% de identidad se indican mediante barras
verticales sólidas. En las realizaciones de la invención, los
receptores de GLP-2s se definen estructuralmente
como receptores que incorporan estas regiones de secuencia
aminoacídica y que también exhiben la característica funcional de
unión del péptido GLP-2 de forma selectiva, respeto
al péptido GLP-1. En uno de los ejemplos de
realización más preferida, la estructura del receptor de
GLP-2 también incorpora aquellos aminoácidos que, a
través del receptor de las especies de rata y humano, se encuentran
altamente conservados (indicados mediante ':'). En estas
posiciones, será apreciable que la secuencia puede contener
cualquier aminoácido dentro de la familia de aminoácidos altamente
conservados a la que pertenecen los aminoácidos identificados. En
unas realizaciones todavía más preferidas, los receptores de
GLP-2s presentan una estructura que además incorpora
a los aminoácidos conservados de forma moderada (indicados mediante
'.') que significa, que en estas posiciones, los aminoácidos dentro
de la familia a la que pertenecen se encuentran conservados de forma
moderada. Además de estas secuencias, la estructura del receptor de
GLP-2 puede
variar ampliamente en realizaciones de la invención, ya que permite sustituciones de aminoácidos no conservativas.
variar ampliamente en realizaciones de la invención, ya que permite sustituciones de aminoácidos no conservativas.
En uno de los ejemplos de realización de la
invención, el receptor de GLP-2 es un receptor de
GLP-2 de rata que presenta la secuencia
aminoacídica de SEQ ID NO:2. En uno de los ejemplos de realización
específica de la invención, este receptor de GLP-2
de rata está codificado por la secuencia de polinucleótidos de SEQ
ID NO: 1. Este polinucleótido que codifica el receptor de
GLP-2 particular, también denominado como el gen
WBR, es un cADN de origen de rata. El producto de expresión de este
polinucleótido incorpora la forma madura del receptor de GLP- 2, y
de forma adicional incorpora una señal de secreción que se elimina
antes de integrarse a la membrana del producto de receptor de
GLP-2 maduro. Esta secuencia señal se puede
presentar de forma natural sobre los polipéptidos o se puede
reemplazar con una señal de secreción equivalente funcionalmente que
es heterólogo al receptor de GLP-2. Esta señal de
secreción de reemplazo dependerá del sistema de expresión que se
utiliza y normalmente, pero no esencialmente será endógeno al
huésped seleccionado y, también normalmente pero no esencialmente,
será homólogo a las secuencias que controlan la expresión
seleccionadas.
El producto del receptor de
GLP-2 de rata expresado (Figura 2, SEQ ID NO: 2) se
caracteriza estructuralmente como una sola cadena polipeptídica de
550 aminoácidos que presenta un peso molecular pronosticado de
72kDa. Se han identificado dos sitios de inicio de traducción
funcional del receptor de GLP-2 de rata, estos son
los codones que codifican la metionina 1 y la metionina 42 de la SEQ
ID NO:2. Sin deseo a limitarse, por analogía con el receptor de
GLP-1, se cree que los residuos de
1-66 de la SEQ ID NO:2 se separan para proporcionar
una proteína madura (es decir, la secuencia aminoacídica del
receptor ya que se hace presente en la membrana celular) de 484
aminoácidos. Con respeto a los dominios estructurales de este
receptor de GLP-2, los análisis de hidropatía y los
alineamientos de secuencias con los miembros relacionados de esta
subfamilia de receptores acoplados a proteína G indican siete
dominios transmembrana, uno que abarca los residuos
181-203 inclusive (TM 1), otro que abarca los
residuos 211-230 (TM II), un tercero que abarca los
residuos 262-285 (TM III), un cuarto que abarca los
residuos 300-321 (TM VI), un quinto que abarca los
residuos 339-362 (TM V), un sexto que abarca los
residuos 386-405 (TM VI) y un séptimo que abarca los
residuos 422-441 (TM VII). Basándose en esta
asignación, es muy probable que este receptor de
GLP-2, en su forma de unido a la membrana natural,
consista de un dominio N-terminal extracelular,
seguido por un dominio transmembrana que contiene siete regiones
hidrofóbicas y un dominio C-terminal de los
aminoácidos 442-550 intracelular. La proteína exhibe
el mayor grado de homología con el receptor de
GLP-1 de rata con un 49% de identidad a nivel
aminoacídico.
En uno de los ejemplos de realización
relacionada, el receptor de GLP-2 es de origen
humano (SEQ ID NO: 9) e incorpora el fragmento de receptor humano
de GLP-2 que presenta los aminoácidos de SEQ ID NO:
10.
Este polinucleótido se aisló utilizando la
secuencia de cADN de rata tal y como se describe de forma general
más adelante y tal y como se detalla en el Ejemplo 3. En uno de los
ejemplos de realización relacionada adicional de la invención, el
cADN es de origen humano (SEQ ID NO: 11) y codifica el receptor de
GLP-2 humano en toda su longitud presentando los
residuos 67-533 de la secuencia aminoacídica de la
SEQ ID NO: 12. El producto precursor del receptor de
GLP-2 humano (Figura 7, SEQ ID NO: 12) se
caracteriza estucturalmente como una cadena polipeptídica de 553
aminoácidos que presenta un peso molecular pronosticado de 72 kDa.
Se cree que, tal y como para el receptor de GLP-2
de rata, esta secuencia, esta forma de precursor del receptor de
GLP-2 humano incorpora una secuencia señal
N-terminal, que se puede sustituir mediante una
secuencia señal heteróloga equivalente funcionalmente. Sin deseos
de limitar se cree que la forma madura del receptor de
GLP-2 humano resulta después de la separación de
los residuos 1-66 de la SEQ ID NO:12 (Figura 7). Con
respecto a los dominios estructurales de este receptor de
GLP-2, los análisis de hidropatía y el alineamiento
de secuencia con los miembros relacionados de esta
sub-familia de receptores acoplados a proteína G
indica siete dominios transmembrana putativos, uno que abarca los
residuos 181-203 inclusive (TM I), otro que abarca
los residuos 211-230 (TM II), un tercero que abarca
los residuos 262- 285 (TM III), un cuarto que abarca los residuos
300-321 (TM IV), un quinto que abarca los residuos
339-362 (TM V), un sexto que abarca los residuos
386-405 (TM VI), y un séptimo que abarca los
residuos 422-441 (TM VII). Basándose en esta
asignación, parece que este receptor de GLP-2, en su
forma unida a la membrana natural, consiste en un dominio
N-terminal extracelular, seguido por una región
hidrofóbica que contiene siete dominios transmembrana combinados
con seis dominio hidrofílicos cortos, y un dominio intracelular,
que se pronostica que abarca los residuos 442-553.
Una segunda forma de este receptor de GLP-2 incluida
por la invención presenta un sitio de inicio de traducción en el
codón de metionina en la posición 26 de la secuencia aminoacídica
que se presenta en la Figura 7 de SEQ ID No. 12. La cadena
polipeptídica de 528 aminoácidos resultante también consiste en un
dominio extracelular, siete dominios transmembrana, y un dominio
C-terminal intracelular, y es al menos un 95%
idéntico a nivel de secuencia a los residuos 26-553
de la secuencia presentada en la Figura 7, SEQ ID NO: 12.
En otra realización, la invención proporciona
las secuencias de polinucleótido del receptor de
GLP-2 y sus fragmentos de secuencia únicos como
herramienta útil para identificar y asilar los polinucleótidos
relacionados estructuralmente. Para facilitar el aislamiento de los
genes homólogos del receptor de GLP-2 de rata que
también son codificantes del receptor de GLP-2, se
desean condiciones de alta estringencia para identificar los
homólogos que presentan al menos el 80% (estringencia media) de
homología de identidad de secuencia a nivel de polinucleótido del
gen del receptor. Más deseablemente los homólogos del gen son el 90%
idénticos, (alta estringencia) y más deseablemente presentan al
menos un 95% (alta estringencia) de identidad cuando se comparan
respeto a WBR. Preferentemente, los homólogos de WBR aislados se
caracterizan en qué (1) se pueden amplificar utilizando los
iniciadores de PCR de la SEQ ID NO: 3 y SEQ ID NO: 4 y (2) se unen
al detector de la SEQ ID NO: 5 bajo condiciones de alta
estringencia.
De forma todavía más preferible, los homólogos
aisaldos son aquellos que se unen, bajo condiciones de alta
estringencia, con regiones consenso de los polinucleótidos que
codifican el receptor de GLP-2, es decir, aquellas
regiones de los polinucleótidos que codifican los receptores de
GLP-2 de rata y humanos que son idénticos y,
respeto a las secuencias que codifican el receptor de
GLP-1, también son únicas a los polinucleótidos que
codifican el receptor de GLP-2. El alineamiento de
esta naturaleza revela un número de regiones consenso para el
GLP-2: por ejemplo los nucleótidos que abarcan desde
1460-1786. En uno de los ejemplos de realización de
la invención, estas secuencias, y sus complementos, constituyen
fragmentos de polinucleótidos útiles, tal y como se describe para
el gen intacto, para identificar polinucleótidos relacionados
estructuralmente con el receptor de GLP-2 humano y
de rata.
En uno de los ejemplos de realización
relacionada, la secuencia de cADN o los fragmentos únicos del
receptor de GLP-2, más preferiblemente el receptor
de GLP-2 humano, se puede utilizar de forma marcada
apropiadamente, por ejemplo, p^{32}Marcado, para el diagnóstico
de las condiciones asociadas con la expresión aberrante del
receptor de GLP-2. Por ejemplo, sobre o bajo la
expresión o la expresión en un tejido inapropiado. En uno de los
ejemplos de realización apropiada los iniciadores de la PCR (por
ejemplo, regiones únicas al receptor de GLP-2 pero
conservadas entre las especies) se pueden utilizar en forma de
diagnóstico para identificar la estructura aberrante o los niveles
de ARNm de receptor de GLP-2, por ejemplo, asociados
con los estados de enfermedad heredados o adquiridos.
Se ha encontrado que el receptor de
GLP-2 de humano se encuentra en el cromosoma 17P13.
Así pues, en uno de los ejemplos de realización adicional, la
invención proporciona el producto de expresión a partir de este
locus que hibridiza respecto al polinucleótido del receptor de
GLP-2 de humano (Figura 6; SEQ ID NO: 11) bajo
condiciones rigurosas.
Como material fuente para aislar los homólogos
que codifican el receptor de GLP-2 de rata que el
gen de polinucleótido que codifican el receptor de
GLP-2, es deseable pero no necesario utilizar
librerías de tejido fetal o maduro del hipotálamo, yeyunal,
cerebelo o estómago obtenidos a partir de leas especies vertebradas
apuntadas para el aislamiento del receptor. La invención como
consecuencia incluye no solo polinucleótidos que codifican el
receptor de GLP-2 de rata de SEQ ID NO:1, también
sus homólogos estructurales y particularmente aquellos que
codifican para proteínas que presentan las propiedades del receptor
de GLP-2. Tal y como se ejemplifica más adelante,
el gen de WBR se ha utilizado de forma exitosa como material de
partida para clonar el homólogo humano del receptor de
GLP-2 de rata. Así pues, la invención proporciona
polinucleótidos que codifican el receptor de
GLP-2s, que incluyen el receptor de
GLP-2 de rata y los homólogos de vertebrado,
particularmente sus homólogos de mamífero incluyendo los homólogos
de humanos, así como las variantes sintéticas de éstos.
Se apreciará que estos homólogos también se
pueden identificar en las librerías mediante el cribado, tal y como
se indica, con fragmentos del gen de recepto de rata o el homólogo
humano, que incorpora al menos 15 nucleótidos, y preferentemente al
menos 25 nucleótidos. Con referencia a la SEQ ID NO: 1 y el numerado
de nucleótidos que aparece, los fragmentos de nucleótidos adecuados
incluyen además de los fragmentos de nucleótido consenso indicados
anteriormente, aquellos que se corresponden a nivel de secuencia con
el dominio de unión de GLP-2 extracelular, y las
regiones transmembrana estipuladas y la porción
C-terminal del receptor.
Técnicamente, la identificación de los genes del
receptor de GLP-2 se puede conseguir mediante la
aplicación de las técnicas de hibridización estándar o
amplificación a una librería de polinucleótidos derivada de un
tejido. Una gran variedad de estas librerías de encuentran
comercialmente disponibles. Cuando se requiere la construcción de
una librería de cADN, se aplican técnicas establecidas. Por ejemplo,
el aislamiento del homólogo de WBR normalmente conllevará la
extracción del ARN mensajero total a partir de la fuente fresca del
tejido, como el tejido del hipotálamo, el yeyunal, el estómago o el
cerebelo, preferentemente el tejido del hipotálamo o las líneas
celulares derivadas de estos tejidos, seguido por la conversión del
mensaje a cADN y la formación de una librería en por ejemplo un
plásmido de bacteria, más habitualmente un bacteriófago.
Este bacteriófago que contiene fragmentos del
ADN normalmente se crece mediante el sembrado sobre una placa de
bacteria E. coli susceptible, de forma que las placas de fago
individual o las colonias se pueden aislar. El ADN llevado a cabo
por la colonia de fagos entonces normalmente se inmoviliza en una
membrana de nitrocelulosa o una membrana de hibridación basada en
nylon, y después se hibridiza, bajo condiciones controladas
cuidadosamente, a una secuencia de sonda marcada radiactivamente (o
de otra forma) para identificar la colonia de fagos particular que
lleva el fragmento de ADN de interés particular, en este caso un
homólogo de GLP-2 de rata o humano. El fago que
lleva el gen particular de interés entonces se purifica lejos de
todos los otros fagos de la librería, para que el gen ajeno sea más
fácilmente caracterizado. Normalmente, el gen o una porción de éste
entonces se aíslan mediante la subclonación en un vector plasmídico
por comodidad, especialmente con respecto a la determinación total
de su secuencia de ADN.
Como alternativa para obtener el ADN que
codifica para GLP-2 como un inserto de ADN de una
librería de cADN disponible o construida, por la presente
divulgación se puede sintetizar de novo utilizando técnicas de
síntesis de gen establecidas. Debido a la longitud del los ADNs que
codifican el receptor de GLP-2 de SEQ ID NO: 1, SEQ
ID NO: 9 y SEQ ID NO: 11, la aplicación de la síntesis automática
puede requerir la construcción génica por etapas, en qué las
regiones del gen de hasta 300 nucleótidos de longitud se sintetizan
de forma individual y después se ligan en una sucesión correcta
para el ensamblaje final. Las regiones génicas sintetizadas de
forma individual se pueden amplificar por PCR. La aplicación de la
síntesis automática normalmente se aplicará a regiones o fragmentos
específicas que se sintetizan del gen y uniéndolos, normalmente
mediante solapamientos diseñados, en una correcta sucesión para
formar la secuencia del gen final. En este caso, como más largo sean
los bloques de construcción del oligonucleótido, menos uniones se
necesitarán, resultando más fácil el ensamblaje.
La aplicación de las técnicas de síntesis
génicas automatizadas proporciona una oportunidad de generar
variantes de secuencia del gen del receptor de
GLP-2 de origen natural. Se apreciará, por ejemplo,
que los polinucleótidos que codifican para el receptor de
GLP-2 descritos aquí se pueden generar mediante la
sustitución de 1 a 20 codones para aquellos que se representan en
las secuencias de polinucleótido de origen natural que se
proporcionan aquí y estas "variantes" se encuentran dentro del
objetivo de la presente invención. Además, los polinucleótidos que
codifican para las variantes sintéticas del receptor de
GLP-2 proporcionados aquí se pueden generar con la
incorporación de 1 a 20, por ejemplo, de 1 a 5, sustituciones o
deleciones o adiciones de aminoácidos. Los sitios preferidos para
esta modificación incluyen áreas de no homología entre la secuencia
de rata y humano, por ejemplo los rangos de aminoácidos de
70-92, de 328-350 y de
475-504. Ya que normalmente se desea retener el
perfil de unión del ligando natural del receptor para propósitos de
cribado, se desea limitar las sustituciones de aminoácidos, por
ejemplo a las denominadas sustituciones conservativas en las que los
aminoácidos de cara similar se sustituyen (Fig. 9), y limitar las
sustituciones a aquellos sitios menos críticos para la actividad
del receptor. Por ejemplo, la sustitución de nucleótidos "G" y
"A" por nucleótidos "A" y "G" respectivamente en las
posiciones 374 y 375 de la secuencia de cADN humano de SEQ ID NO:
11; resultando en la sustitución del residuo de arginina de origen
natural en la posición 85 de la SEQ ID NO: 12 por el residuo de
ácido glutámico, proporciona un receptor funcional. Este receptor
funcional se encuentra referido como la variante Glu^{85} del
receptor de GLP-2 de humano.
Una vez obtenido el polinucleótido que codifica
el receptor de GLP-2, el receptor de
GLP-2 se puede producir de varias formas,
incluyendo la trascripción in vitro y mediante la
incorporación del ADN a un vector de expresión adecuado y la
expresión en el huésped apropiado, por ejemplo en una bacteria como
E. coli, en levadura o en una célula de insecto o de
mamífero. La variedad de sistemas de expresión génicos se han
adaptado para el uso con estos huéspedes y ahora se encuentran
disponibles comercialmente, y cualquiera de estos se pueden
seleccionar para conducir la expresión del ADN que codifica el
receptor de GLP-2. Los vectores de expresión se
pueden seleccionar para proporcionar las líneas celulares
transformadas que expresan el ADN que codifica el receptor de forma
temporal o de forma estable. Para la expresión temporal, las células
huésped normalmente se transforman con un vector de expresión que
contiene un origen de replicación funcional en una célula de
mamífero. Para la expresión estable, estos orígenes de replicación
son innecesarios, pero los vectores normalmente contendrán un gen
que codifica para un producto que confiere sobre los transformantes
una ventaja de supervivencia, para facilitar su selección como un
gen que codifica
para la resistencia a neomicina, en este caso los transformantes se colocan en medios suplementados con neomicina.
para la resistencia a neomicina, en este caso los transformantes se colocan en medios suplementados con neomicina.
Los sistemas de expresión, normalmente
disponibles pero no exclusivamente en forma de vectores plasmídicos,
incorporan casetes de expresión los componentes funcionales de los
cuales incluyen secuencias que controlan la expresión constituidas
por ADN y de forma opcional también péptidos señal que codifican las
secuencias, que son reconocidas por el huésped y que facilitan la
expresión del ADN que codifica el receptor cuando se une a su 5'.
Los sistemas además incorporan secuencias de ADN que terminan la
expresión cuando de encuentran unidas al 3' de la región que
codifica el receptor. Así, para la expresión en el huésped celular
de mamífero seleccionado, se genera un constructo de expresión de
ADN recombinante en el que el ADN que codifica para el receptor se
encuentra unido con las secuencias de ADN que controlan la expresión
reconocidas por el huésped, y que incluyen una región 5' del ADN
que codifica el receptor para conducir la expresión, y una región 3'
para terminar la expresión.
Incluidos entre los varios sistemas de expresión
de ADN recombinante que se pueden utilizar para conseguir la
expresión de la célula de mamífero del ADN que codifica el receptor,
se encuentran aquellos que explotan los promotores de los virus que
infectan las células de mamífero, como el promotor del
citomegalovirus (CMV), el virus Rous sarcoma (RSV), el virus simian
(SV40), el virus de tumor mamario de murine (MMTV) y otros. También
son útiles para conducir la expresión los promotores como el LTR de
retroviruses, los promotores celulares de insecto como aquellos que
se encuentran regulados por la temperatura, y aislados de
Drosophila, así como los promotores del gen de mamífero como
aquellos que se encuentran regulados por metales pesados, es decir,
el promotor del gen de metalotioneina, y otros promotores inducibles
de esteroide.
En otro de sus aspectos, la invención
proporciona células o membranas derivadas de allí que se adaptan
mediante la alteración genética para el uso, por ejemplo, en la
identificación de los ligandos del receptor de
GLP-2. En las realizaciones preferidas, estas
células se adaptan genéticamente por la inserción del polinucleótido
que codifica para un receptor de GLP-2. En las
realizaciones particularmente preferidas, estas células incorporan
una molécula de ADN recombinante, por ejemplo un constructo/vector
de expresión, en el que el ADN que codifica para el receptor de
GLP-2 y los elementos funcionales que controlan la
expresión en el huésped se encuentran unidos de forma operable para
conducir la expresión del ADN. Para la incorporación del receptor en
las membranas de plasma celular, el vector se puede, si se desea,
diseñar para proporcionar una secuencia de péptido señal heteróloga
adecuada para sustituir el péptido señal codificado de forma natural
dentro del ADN del receptor.
Las células que producen GLP-2
incluyen células de ovario de hámster chino (CHO) por ejemplo de
linaje K1 (ATCC CCL 61) incluyendo la variante Pro5 (ATCC CRL
1281); las células de tipo fibroblasto derivadas de riñón de mono
verde de África transformadas de SV40 del linaje
CV-1 ATCC CCL 70), del linaje COS-1
(ATCC CRL 1650) y del linaje COS-7 (ATCC CRL 1651);
las L-células de murine, las células 3T3 de murine
(ATCC CRL 1658), las células C127 de murine, células de riñón
embrionarias humanas del linaje 293 (ATCC CRL 1573), células de
carcinoma humano incluyendo aquellos del linaje HeLa (ATCC CCL 2),
y células del neuroblastoma de las líneas IMR-32
(ATCC CCL 127), SK-N-MC (ATCC HTB
10) y SK-N-SH (ATCC HTB 11).
Para el uso en ensayos de cribado de ligandos,
las líneas celulares que expresan el ADN que codifica el receptor
se pueden almacenar congeladas para su uso posterior. Estos ensayos
se pueden llevar a cabo con células intactas, o con preparaciones
de membrana derivadas de estas células. Las preparaciones de
membrana normalmente proporcionarán un sustrato más conveniente
para los experimentos de unión de ligando, y en consecuencia se
prefieren como sustratos de unión. Para preparar las preparaciones
de membrana para el propósito de cribado, es decir, experimentos de
unión de ligandos, las células intactas congeladas se homogenizan
mientras se hallan en suspensiones de agua fría y una pastilla de
membrana se recoge después de la centrifugación. El comprimido
entonces se lava en agua fría, y se dializa para eliminar
cualquiera de los ligandos de receptor de GLP-2
endógenos que si no competiría en la unión en los ensayos. Las
membranas dializadas se pueden utilizar entonces como tal, o
después del almacenamiento en la forma liofilizada, en el ensayo de
unión de ligandos.
La unión de un ligando candidato a un receptor
de GLP-2 seleccionado de la invención se puede
conseguir normalmente utilizando una cantidad predeterminada de
membrana derivada de célula (medida por ejemplo mediante la
determinación de proteína), generalmente desde alrededor de 25 ug
hasta 100 ug. Generalmente, los ensayos de unión competitiva serán
útiles para evaluar la afinidad de un compuesto probado respeto a
GLP-2. Este ensayo de unión competitiva se lleva a
cabo mediante la incubación de una preparación de membrana con el
péptido de GLP-2 radiomarcado, por ejemplo
[H^{3}] o un análogo de GLP-2 radioiodinado, en
presencia de un compuesto de prueba no marcado añadido a
concentraciones que varían. Después de la incubación, se puede
recuperar el GLP-2 unido desplazado o radiomarcado
y se puede medir, para determinar las afinidades de unión relativas
del compuesto de la prueba y el GLP-2 para el
receptor de GLP-2 utilizado como sustrato. De este
modo, las afinidades de varios compuestos para el receptor de
GLP-2 se pueden medir.
De forma alternativa, la unión de un ligando
candidato a un receptor de GLP-2 se puede conseguir
utilizando un ensayo funcional. Utilizando esta aproximación, por
ejemplo, las células intactas recogidas aproximadamente dos días
después de la transfección transitoria o después de alrededor del
mismo periodo después del sembrado de las células transfectadas
estables se pueden utilizar para conseguir la unión del ligando. En
uno de los ejemplos de realización preferida, las células 293 EBNA
(Invitrogen Cat. R620-07) se transforman
establemente con el vector pREP7 (Invitrogen Cat.
V007-50) que incorpora de forma expresable un
receptor de GLP-2. Después, la unión de un agonista
(o utilizando un formato de base de competición de un antagonista)
al receptor se puede discernir mediante la medida del nivel de cAMP
intracelular. De forma más conveniente, el cAMP intracelular se
mide de forma indirecta utilizando un sistema de reportero, en que
un evento fácilmente mesurable y de forma preferible cuantificable
indica el nivel de cAMP intracelular. Por ejemplo, midiendo el nivel
de la expresión de un constructo génico reportero que presente la
secuencia de polinucleótido bajo el control de un promotor que
responde a cAMP. De forma alternativa, una medida del calcio
intracelular, liberado a partir del almacenamiento como respuesta a
un aumento del cAMP intracelular, se puede utilizar como indicador
del nivel de cAMP intracelular, por ejemplo, mediante la
incorporación a la célula transformada de una proteína que emite
fluorescencias con la unión a calcio. En uno de los ejemplos de
realización preferida, los niveles de cAMP intracelular se miden
utilizando el kit EIA disponible comercialmente. Una ventaja
adicional de la aproximación basada en la funcionalidad para
conseguir la unión del ligando es que el sistema permite de forma
automática un alto y ultra alto rendimiento a través del cribado de
librerías químicas vas-
tas.
tas.
Como alternativa a utilizar células que expresan
el ADN que codifica el receptor, la caracterización del ligando
también se puede llevar a cabo utilizando células por ejemplo de
oocitos de Xenopus, que producen receptor unido a la membrana
funcional después de la introducción del ARN mensajero que codifica
para el receptor de GLP-2. En este caso, el
polinucleótido que codifica el receptor de GLP-2 de
la invención normalmente se subclonaba a un vector plasmídico de
forma que el gen introducido se puede transcribir de forma fácil a
ARN mediante un promotor de transcripción de ARN adyacente
subministrado por el vector plasmídico, por ejemplo los promotores
T3 o T7 de bacteriofago. El ARN entonces se transcribe del gen
insertado in vitro, y después se puede inyectar a oocitos de
Xenopus. Cada oocito es una sola célula, pero es suficientemente
grande para ser penetrada por una microaguja de tipo fino sin
causar daño irreparable. Después de la inyección de nL volúmenes de
una solución de ARN, los oocitos se dejan incubar durante varios
días, hasta que se prueba la habilidad de los oocitos de responder
a una molécula de ligando particular que se subministra en una
solución bañada.
Los ligandos del receptor de
GLP-2 candidato pueden variar ampliamente en
estructura, y de forma más adecuada incluyen proteínas que se
encuentran altamente relacionadas con el GLP-2 en
términos de secuencia aminoacídica. Por ejemplo, los péptidos
divulgados en las aplicaciones de patentes
co-pendientes de Estados Unidos WO97/39031 y
WO96/32414, se pueden cribar de forma útil para la actividad de
unión del receptor de GLP-2.
Además de las secuencias del receptor de
GLP-2 de origen natural funcionales quiméricas, los
receptores, que incorporan porciones de secuencia del receptor de
GLP-2 y los polinucleótidos que los codifican
también son realizaciones de la invención. El receptor funcional
quimérico de GLP-2s se construye mediante la
combinación de las secuencias receptoras extracelulares de un
receptor de GLP-2 con uno o más de los segmentos
transmembrana e intracelular de los receptores acoplados a proteína
G conocidos con el propósito de la prueba. Este concepto se
demostró por Kobilka et al. (1988, Science
240:1310-1316) que creó una serie de receptores
\alpha2-\beta2 adrenérgicos quiméricos (AR)
mediante la inserción progresiva de cantidades mayores de secuencia
trasnmembránica de \alpha2-AR al
\beta2-AR. La actividad de unión de los agonistas
conocidos cambió cuando la molécula cambió de la conformación
\alpha2 a \beta2, y los elementos intermediarios mostraron una
especificidad mezclada. La especificidad para la unión de
antagonistas, sin embargo, se relacionó con la fuente del dominio
VII transmembrana. La importancia del dominio transmembrana VII para
el reconocimiento de ligando también se encontró en quimeras
utilizando dos receptores de factor \alpha de levadura, y ello es
significativo porque los receptores de levadura se clasifican como
receptores misceláneos. Así, el papel funcional de los dominios
específicos aparece conservado a través de la familia de receptores
acoplados a proteína G de siete hélices transmembrana,
independientemente de la categoría concreta a la que
pertenezcan.
De forma paralela, los segmentos internos o los
dominios citoplasmáticos de un receptor de GLP-2
particular se intercambian con los dominios análogos de un receptor
acoplado a proteína G de siete hélices transmembrana y se utilizan
para identificar los determinantes estructurales responsables del
acoplamiento de los receptores a proteínas G triméricas (Dohlman
et al. (1991) Annu Rev Biochem 60:653-688).
Un receptor quimérico en el que los dominios V, VI, y los lazos
intracelulares que conectan de \beta2-AR se
sustituyeron por \alpha2-AR mostró que unía
ligandos con especificidad por \alpha2-AR, pero
estimulaba el adenilato ciclasa como el
\beta2-AR. Esto demostró que para los receptores
de tipo adrenérgico, el reconocimiento de proteínas G se encuentra
presente en los dominios V y VI y su lazo enlazante. La situación
opuesta se predijo y se observó para un quimera en el que el lazo
V->VI de \alpha1-AR sustituyó el dominio
correspondiente de \beta2-AR y el receptor
resultante unió ligandos con especificidad por
\beta2-AR y activó la proteína G mediante el
movimiento de fosfatidilinositol de la forma
\alpha1-AR. Finalmente, las quimeras construidas a
partir de los receptores muscarínicos también mostraron que el lazo
V->VI es el mayor determinante de la especificidad para la
actividad de la proteína G.
Los receptores acoplados a proteína G de siete
hélices transmembrana quiméricos o modificados que contienen
sustituciones en las regiones extracelulares y transmembrana han
mostrado que estas porciones del receptor determinan la
especificidad de unión del ligando. Por ejemplo, dos residuos de Ser
conservados en el dominio V de todos los receptores adrenérgicos y
de D catecolamina son necesarios para una potente actividad
agonista. Estas serinas se cree que forman enlaces de hidrógeno con
el motivo catecol de los agonistas en el sitio de unión. De forma
similar, un residuo de Asp presente en el dominio III de todos los
receptores acoplados a proteína G de siete transmembrana que une
las aminas biogénicas se cree que forma un par con el grupo amina
del ligando en el sitio de unión.
Los receptores acoplados a proteína G de siete
hélices transmembrana funcionales clonados se expresan en sistemas
de expresión heterólogos y se consigue su actividad biológica (por
ejemplo, Marullo et al. (1988) Proc Natl Acad Sci
85:7551-7555; King et al. (1990) Science
250:121-123). Un sistema heterólogo introduce genes
para un receptor acoplado a proteína G de siete hélices
transmembrana de mamífero y una proteína G de mamífero en las
células de levadura. El receptor acoplado a proteína G transmembrana
de siete se ha mostrado que presenta la especificidad y la afinidad
del ligando apropiada y detecta la activación biológica apropiada
-detención del crecimiento y cambios morfológicos- de las células
de levadura.
Un procedimiento alternativo para testar los
receptores quiméricos se basa en el procedimiento de utilizar el
receptor purinérgico P_{2u} (P_{2u} ) tal y como se publica por
Erb et al. (1993, Proc Natl Acad Sci
90:104411-104453). La función se prueba fácilmente
en células de leucemia K562 cultivadas porque estas células carecen
de los receptores P_{2u}. Las células K562 se transfieren con
vectores de expresión que contienen P_{2u} normales o quiméricos
y cargados con fura-a, prueba fluorescente de Ca++.
La activación de los receptores P_{2u} ensamblados de forma
correcta y funcionales con UTP o ATP extracelular mobiliza el Ca++
intracelular que reacciona con fura-a y se mide de
forma espectrofluormétrica. Tal y como los receptores acoplados a
proteína G de siete hélices transmembrana anteriores, los genes
quiméricos se crean mediante la combinación de secuencias por
segmentos receptivos extracelulares de cualquier polipéptido de
receptores acoplados a proteína G de siete transmembrana nuevo
descubierto con los nucleótidos para los segmentos transmembrana y
intracelular de la molécula de P_{2u} conocida. El baño de las
células K562 transfectadas en micropozos que contienen los ligandos
apropiados provoca la unión y la actividad fluorescente que define
los efectores de la molécula de los receptores acoplados a proteína
G de siete transmembrana. Cuando se establece el ligando y la
función, el sistema P_{2u} es útil para definir los antagonistas
o los inhibidores que bloquean la unión y que previene estas
reacciones fluorescentes.
Además de utilizar el ADN que codifica el
receptor para construir líneas celulares útiles para el cribado de
ligandos, la expresión del ADN puede, de acuerdo con otro aspecto de
la invención, ser llevado a cabo para producir fragmentos del
receptor en la forma soluble, para la investigación de la
estructura, para construir anticuerpos y para otros usos
experimentales. Se espera que la porción extracelular del receptor
de GLP-2 contribuya de forma significativa a la
unión de la molécula de ligando. En consecuencia se desea en primera
instancia facilitar la caracterización de la interacción
receptor-ligando mediante el subministro del dominio
de unión del ligando extracelular en cantidad y en la forma
aislada, es decir, libre del resto del receptor. Este constructo se
ha hecho para el receptor de GLP-1 de rata, y se
mostró que unía a GLP-1 (Wilmen et al.
(1996) FEBS LETTS, 398:43-47).
Para conseguirlo, el ADN que codifican el
receptor de GLP-2 en toda su longitud se puede
modificar por mutagénesis dirigida, se manera que se introduce un
codón stop de traducción en la región N-terminal
extracelular, immediatamente antes de la secuencia que codifica el
primer dominio transmembrana (TM1), es decir, antes del residuo 181
de la SEQ ID NO: 2 y antes del residuo 181 de la SEQ ID NO: 12. Como
ya no se producirá ningún dominio transmembrana para "ancorar"
el receptor a la membrana, la expresión del gen modificado resultará
en la secreción, en la forma soluble, de sólo el dominio de unión
del ligando extracelular. Los ensayos de unión del ligando estándar
entonces se pueden llevar a cabo para averiguar el grado de unión de
un compuesto candidato al dominio extracelular producido.
Evidentemente puede ser necesario, utilizando la mutagénesis
dirigida, producir diferentes versiones de las regiones
extracelulares, para optimizar el grado de unión del ligando a los
dominios aislados.
Se apreciará que la producción de los dominios
de unión del ligando extracelulares se pueden conseguir en una
variedad de células huésped. Las células de mamífero como las
células CHO se pueden utilizar con este propósito, la expresión
conducida normalmente por un promotor de expresión capaz de un alto
nivel de expresión, por ejemplo el promotor de CMV
(citomegalovirus). De forma alternativa, las células de no mamífero,
como las células Sf 9 de insecto (Spodoptera frugiperda) se pueden
utilizar, con la expresión normalmente conducida por los promotores
de expresión del baculovirus, por ejemplo el promotor de proteína de
polihedron fuerte, tardío. Los sistemas de expresión filamentosos
fungoideos también se pueden utilizar para secretar grandes
cantidades de estos dominios extracelulares del receptor de
GLP-2. El Aspergillus nidulans, por ejemplo,
con la expresión siendo conducida por el promotor alcA,
constituiría este sistema aceptable. Además de estos huéspedes de
expresión, se apreciará también que cualquier sistema de expresión
procariótico o de otros eucarióticos capaz de expresar genes o
fragmentos de genes heterólogos, intracelular o extracelular será de
forma similar aceptable.
La disponibilidad de los dominio de unión al
ligando extracelulares de la proteína del receptor hace posible
determinar las estructuras tridimensional de estas regiones de unión
de estos ligandos, con o sin un ligando candidato que se compleje
allí, mediante una combinación de técnicas de cristalografía de
Rayos X y RMN de 2D avanzada. De esta forma, los nuevos compuestos
candidatos adicionales, que se predice que requieren interacciones
con la estructura del receptor tridimensional, se pueden diseñar y
probar de forma específica.
Con grandes dominios, la cristalografía es el
método de elección para la determinación de la estructura del
dominio en el aislamiento, y del co-complejo con el
ligando natural (o una molécula antagonista o agonista apropiada).
Si un dominio en particular se puede hacer suficientemente pequeño,
por ejemplo aproximadamente 100-130 aminoácidos de
longitud, entonces la técnica potente de NMR 2-D
también se puede aplicar a la determinación de la estructura. Esto
permite no sólo la determinación de la estructura del dominio, sino
que también proporciona información dinámica sobre la interacción
fármaco-receptor.
Para el uso particularmente en la detección de
la presencia y/ o la localización, por ejemplo en el tejido
intestinal, la presente invención también proporciona, en otro de
sus aspectos, anticuerpo marcado a un receptor de
GLP-2. Para aumentar estos anticuerpos, se pueden
utilizar como inmunogen al receptor intacto, soluble o su fragmento
inmunogénico, producido en una célula huésped microbiana o de
mamífero tal y como se ha descrito anteriormente mediante las
técnicas de síntesis de péptido estándar. Las regiones del receptor
de GLP-2 particularmente adecuadas para el uso como
fragmentos inmunogénicos incluyen aquellas que se corresponden a
nivel de secuencia con una región extracelular del receptor, o una
porción de la región extracelular, tal como los péptidos que
consisten en 10 o más aminoácidos de la región
401-509 de la SEQ ID NO: 2. Respecto el receptor de
GLP-2 de humano (SEQ ID NO: 12), los péptidos que
comprenden el dominio extracelular maduro (residuos
65-180); intracelular del lazo 3 (residuos
363-385) y el dominio intracelular
C-terminal (residuos 442-533) pueden
ser útiles como inmunogenes para la producción de anticuerpos al
receptor de GLP-2 de humano.
Los anticuerpos al receptor de
GLP-2 deseado o al inmunogen de fragmento se
encuentran disponibles, para la producción de anticuerpos
policlonales, de la sangre de un animal que se ha inmunizado con el
inmunogen. De forma alternativa, para la producción de anticuerpos
monoclonales, los inmunecitos como los esplenocitos se pueden
recuperar del animal inmunizado y se pueden fusionar, utilizando la
tecnología de hibridoma, a unas células de mieloma. Los productos
de fusión entonces se criban mediante el cultivo en un medio de
selección, y las células que producen el anticuerpo se recuperan
para un crecimiento continuo y la recuperación del anticuerpo. El
anticuerpo recuperado entonces se puede acoplar de forma covalente a
un marcador detectable, como un radiomarcador, un marcador de
enzima, un marcador luminescente o similares, utilizando la
tecnología de unión establecida para este propósito.
Los sistemas de modelo animal que explican los
papeles fisiológicos y de comportamiento del receptor de
GLP-2 se producen mediante la creación de animales
transgénicos en los que la actividad del receptor de
GLP-2 se aumenta o se disminuye, o la secuencia
aminoacídica del receptor de GLP-2 expresado se
altera, mediante una variedad de técnicas. Los ejemplos de estas
técnicas incluyen, pero no se limitan a: 1) Inserción de las
versiones normales o mutantes de ADN que codifica un receptor de
GLP-2, mediante la microinyección, la
electroporación, la transfección retroviral u otros modos conocidos
por aquellos especialistas en el campo, a un embrión fertilizado
apropiado para producir un animal transgénico o 2) La recombinación
homóloga de las versiones humana o animal mutante o normal, de
estos genes con el locus génico nativo en los animales transgénicos
para alterar la regulación de la expresión o la estructura de estas
secuencias de receptor de GLP-2. La técnica de
recombinación homóloga es bien conocida en el campo. Se sustituye
el gen nativo con un gen insertado y en consecuencia es útil para
producir un animal que no puede expresar el receptor de
GLP-2 nativo pero que expresa, por ejemplo, un
receptor de GLP-2 insertado mutante, que ha
reemplazado el receptor de GLP-2 nativo en el genoma
del animal mediante recombinación, resultando en una expresión por
debajo del transportador. La microinyección añade genes al genoma,
pero no los elimina, y en consecuencia es útil para producir un
animal que exprese su propio y añadido receptor de
GLP-2s, resultando en una sobreexpresión del
receptor de GLP-2s.
Una forma posible para producir animales
transgénicos, con un ratón como ejemplo, es tal y como se muestra a
continuación: los ratones hembra se aparean, y los huevos
fertilizados resultantes se diseccionan fuera de sus oviductos. Los
huevos se almacenan en un medio apropiado como el medio M2. El ADN o
cADN que codifica el receptor de GLP-2 se purifica
con cloruro de cesio a partir de un vector mediante métodos bien
conocidos en el campo. Los promotores inducibles se pueden fusionar
con las regiones codificantes de ADN para proporcionar un medio
experimental para regular la expresión del transgen. De forma
alternativa o adicional, los elementos de regulación del tejido
específicos se pueden fusionar con la región codificante para
permitir la expresión específica del trans-gen. El
ADN, en una solución tamponada de forma apropiada, se coloca en una
aguja de microinyección (que se puede hacer a partir de la pipeta
capilar utilizando un dispensador de pipetas) y el huevo al que se
debe inyectar se coloca en una hoja de depresión. La aguja se
inserta al pronúcleo del huevo, y la solución de ADN se inyecta. El
huevo inyectado después se transfiere a un oviducto de un ratón
pseudopreñado (un ratón estimulado mediante las hormonas apropiadas
para mantener el embarazo pero que en realidad no está preñada), de
dónde procede al útero, se implanta, y se desarrolla hasta el
término. Tal y como se ha indicado anteriormente, la microinyección
no es el único método para insertar ADN a una célula huevo, y se
utiliza aquí sólo para propósitos ejemplares.
La invención que se ha descrito anteriormente,
se puede entender mejor a partir de los siguientes ejemplos. Los
siguientes ejemplos se ofrecen con el propósito de ilustrar la
invención y no se debe interpretar como una limitación de la
invención.
Se preparó la librería de cADN de Intestino
neonatal de rata (Stratagene, La Jolla, CA; Cat. 936508) y el cADN
de primera cadena de yeyuno de ratón. Se utilizaron los iniciadores
degenerados M-2F/S (SEQ ID NO: 3) y
M-7R/S (SEQ ID NO: 4) para amplificar el fragmento
parcial del receptor de GLP-2 de rata a partir de la
librería de cADN de Intestino neonatal de rata y del receptor de
GLP-2 de ratón del modelo de Yeyuno de ratón. El
protocolo se describe a continuación:
\global\parskip0.950000\baselineskip
6 \mul de tampón VENT 10x de New England
Biolabs
6 \mul cada stock de dATP, dCTP, dGTP y dTTP
2.5 \muM
4 \mul de cADN de intestino de rata neonatal
(1:10 dilución)
3 \mul de iniciador M2F/S 25 \muM
[5'-TTTTTCTAGAASRTSATSTACACNGTSGGCTAC-3']
(SEQ ID NO: 3)
3 \mul de iniciador M7R/S 25 \muM
[5'-TTTTCTCGAGCCARCARCCASSWRTARTTGGC-3']
(SEQ ID NO: 4)
2 \mul (10 unidades) Amplitaq ADN polimerasa
(Perkin Elmer)
36 \mul de ddH_{2}O.
Condiciones de reacción: 35 ciclos a 94ºC, 2
minutos; 94ºC, 1 minuto; 53ºC, 30 sec.; 72ºC, 1 minuto.
El producto de la PCR predominante era un
fragmento de ADN de 303 pares de bases (bp). Se purificaron 30
\mul de muestras de la PCR anterior utilizando el kit de
purificación de QIAGEN PCR y se eluyó en 30 \mul de ddH_{2}O.
El producto resultante entonces se re-amplificó
utilizando las mismas condiciones de PCR Degenerada, con la
excepción sólo de 31 ciclos a 94ºC.
El producto predominante de 303 pares de bases
(bp) se eliminó y se purificó utilizando el protocolo de
purificación de gel QIAGEN QIAquick a 30 \mul ddH_{2}O. El
producto resultante entonces se reamplificó utilizando las mismas
condiciones de PCR Degenerada, con la excepción sólo de 31 ciclos a
94ºC.
A continuación, la doble digestión (Xba I y Xho
I) se llevó a cabo sobre la reacción de PCR reamplificada
totalmente tal y como se muestra a continuación: 28 \mul ADN; 16
\mul 10X de tampón One-Phor-All
(Pharmacia); 2 \mul (40 unidades) enzima Xba I (Pharmacia); 2
\mul (40 unidades) enzima Xho I (Pharmacia); y 30 \mul
ddH_{2}O.
Las muestras se digirieron 4 horas en un baño de
agua de bloque a 37ºC, se llevó hasta 100 \mul de volumen con
ddH_{2}O (estéril) y se purificó mediante (1) cantidades
equivalentes (100 ul) de extracción de cloroformo; (2)
precipitación el fin de semana con 2 volúmenes de etanol/10
volúmenes de acetato de sodio 3M; (3) 1x lavado con EtOH al 70%; y
(4) resuspensión en 10 \mul 1x TE (pH 8.0).
A continuación se digirió el clon 5HT1F#9 de
pBluescript con Xba I y Xho I tal y como se muestra a
continuación:
10 \mul de ADN (clon 5HT1F#9 de
pBluescript)
5 \mul de Tampón 2 NE 10X (New England
Biolabs)
3 \mul de (dilución 1:20 =3 unidades) Xba I
(New England Biolabs)
3 \mul de (dilución 1:20 =3 unidades) Xho I
(New England Biolabs)
5 \mul de (10x) BSA (New England Biolabs)
24 \mul de ddH_{2}O.
La muestra se digirió durante 3 horas en un baño
de agua de bloque a 37 C, se inactivó por calor a 65ºC durante 20
minutos y se purificó utilizando el kit GeneCleanII de BIO 101. Las
alícuotas de las reacciones de la PCR se clonaron al vector de
plásmido pBluescript anterior utilizando el kit T4 ADN ligasa (New
England Biolabs) y se transformaron a células ultracompetentes
Epicurean Coli XL-2 Blue MRF' (Stratagene). La
transformación se colocó sobre placas 2xYT + AMP y se seleccionaron
colonias únicas. Se hicieron minipreps de ADN utilizando el kit de
miniprep QIAGEN QIA-prep 8 y las secuencias de los
fragmentos se determinaron utilizando el sistema ABI. Se
identi-
ficaron secuencias nuevas que contenían un fragmento parcial de la secuencia del receptor de GLP-2 de rata y ratón.
ficaron secuencias nuevas que contenían un fragmento parcial de la secuencia del receptor de GLP-2 de rata y ratón.
Se consiguió la clonación de cADN con la región
que codifica el receptor de GLP-2 completo tal y
como se muestra a continuación: Primero, se utilizaron las
librerías de cADN a partir de los siguientes tres tejidos para el
cribado.
- 1.
- Hipotálamo de rata (RHT)
- 2.
- Cerebelo de rata Brain (RHB)
- 3.
- Duodeno y Yeyuno de rata (RDJ)
\global\parskip1.000000\baselineskip
Se prepararon las tres librerías de cADN
mediante el priming con un iniciador aleatorio y la subclonación
indirecta a los sitios Hind III y no I de pcADN3.
A continuación, las tres librerías de cADN se
cribaron por homología mediante un oligo C4-4
degenerado
[5'-AACTACATCCACMKGMAYCTGTTYVYGTCBTTCATSCT-3']
(SEQ ID NO: 5)
mediante el levantamiento de
colonia y la hibridización sobre filtro. Se utilizaron las
siguientes condiciones de hibridización: 5X SSPE (1X SSPE es NaCl
0.18M, NaH_{2} PO_{4} 10 mM (pH 7.4), EDTA 10 mM (pH 7.4)) y
solución 5X Denharts (Ficoll al 1%, Polivinilpirrolidona al 1%, BSA
al 1%); ADN de esperma de salmón a 25
mg/ml.
Los filtros se hibridizaron a 50ºC toda la
noche. Después se lavaron los filtros 2 veces en 2X SSPE y SDS al
1% a temperatura ambiente durante 30 minutos, 2 veces en 2X SSPE y
SDS al 1% a 50ºC durante 20 minutos por lavado, y finalmente dos
veces en 1X SSPE y SDS al 0.5%. Se identificaron clones positivos
mediante autoradiografía. Un taco de 1cm^{2} que envolvía el clon
positivo se eliminó de la placa y se colocó en 1 ml de 2x YT +
Glicerol al 20%, se sometió a vórtice y se congeló a -80ºC.
Se preparó el ADN de plásmido a partir de los
tacos positivos tal y como se muestra a continuación: 100 ml de
cultivo de bacteria de cada taco positivo se creció en una placa de
agar. Las células de bacteria se rasparon y se resuspendieron en 1
ml de medio 2xYT + Glicerol al 20%. El aglomerado de bacteria de los
250 mL de la resuspensión de bacteria se resuspendió en 150 ml de
la Solución I (Glucosa 50 mM, 10 mM Tris-HCl, 1 mM
EDTA), se lisó en la Solución II (NAOH 0.2M, SDS al 1%), se
neutralizó con la Solución III enfriada en hielo (acetato de
potasio; 4 vol. de acetato de potasio 5M + 1 vol. de ácido acético
10M). Después de la aglomeración de ADN de bacteria, se añadió 340
ml de isopropanol al sobrenadante. Éste se centrifugó al máximo
durante 15 minutos. El aglomerado se resuspendió en TE + RNasa a 20
mg/ml, se incubó a 37ºC durante 30 minutos y se precipitó con
isopropanol + acetato de potasio 0.2M. Después de la centrifugación,
se lavó el aglomerado con alcohol al 70% alcohol, se dejó al aire
seco y se resuspendió en TE.
El ADN de Plásmido del conjunto de 2777 clones
de la librería RHT de cADN de hipotálamo de rata a continuación se
aprovechó tal y como se muestra a continuación: Se diseñaron dos
iniciadores a partir de una área de la secuencia de cADN de
receptor de GLP-2 clonado por PCR que no presentaba
identidad con receptores de la familia de los genes conocidos. Los
dos iniciadores P23-R1 y P23-F1
amplificaron un fragmento de 196 bp sólo a partir de un ADN de clon
nuevo pero no con el cADN de receptor de GLP-1 o
cADN de receptor de PACAP. Se utilizó el sistema
Expand^{^{TM}}PCR de Boehringer Mannheim (Cat.
1681-842) bajo las siguientes condiciones:
2 \mul de Tampón 1 de 10x Expand^{^{TM}}
2.8 \mul de mezcla de dNTP 2.5 mM
0.6 \mul del iniciador P23-R1
[5'-TCATCTCCCTCTTCTTGGCTCTTAC-3']
(SEQ ID NO: 6)
0.6 \mul del iniciador P23-F1
[5'-TCTGACAGATATGACATCCATCCAC-3']
(SEQ ID NO: 7)
0.3 \mul de la enzima PCR Expand (1
unidad)
12.7 \mul de agua
1 \mul de ADN
Condiciones de reacción: 32 ciclos a 93ºC, 40
segundos; (ciclos) 58ºC, 40 segundos; (ciclos) 68ºC, 40
segundos.
Los ADNs de cada taco positivo o un conjunto de
2777 clones se amplificaron con los iniciadores específicos
P23-F1 y P23-R1 bajo las condiciones
especificadas anteriormente. Fuera de los tacos positivos de 1057
C4-4 hibridización y 884 del conjunto de 2777
clones de clon sólo cinco fuentes de modelo amplificaron un producto
de PCR de 196 bp. Éstas eran: (1) Taco 334, (2) Taco 780, (3) RHT
conjunto de 233, (4) RHT conjunto de 440, y (5) RHT conjunto de
587.
La amplificación de cADN de
GLP-2R a partir de los cinco modelos positivos
entonces se llevó a cabo. Utilizando un iniciador específico
(P23-R1 o P23-F1) y un iniciador
basado en la secuencia del vector de pcADN3 (Invitrogen) (830F o
1186R), el inserto de cADN de GLP-2R se amplificó
directamente a partir de los tacos impuros de forma clónica o los
2777 conjuntos de clones. Las secuencias de los iniciadores del
vector son tal y como se muestra a continuación:
| 830F: | [5'-AACCCACTGCTTAC-3'] | (SEQ ID NO:14) |
| 1186R: | [5'-CCCAGAATAGAATGACACC-3'] | (SEQ ID NO:15) |
Se llevó a cabo la PCR, bajo las siguientes
condiciones que se apuntan, utilizando el sistema
Expand^{^{TM}}PCR.
La banda más prominente se reamplificó, se
purificó y se secuenció. Basándose en la secuencia amplificada
obtenida, se diseñaron iniciadores adicionales y se llevó a cabo una
nueva secuenciación. De esta forma las secuencias completas de los
insertos de cADN de GLP-2R en las cinco fuentes de
los clones se determinaron. El análisis de secuencia mostró que
sólo el conjunto RHT 440 y el conjunto RHT 587 contenían clones con
la secuencia codificante completa de GLP-2R y que
los dos clones eran idénticos (derivados del mismo clon de
cADN).
Debido a la dificultad de purificar de forma
clónica el clon de cADN del receptor de GLP-2 a
partir de los conjuntos de librería de cADN de RHT 440 o RHT 587,
el cADN se amplificó y se reclonó a pcADN3. Basándose en la
secuencia obtenida a partir de RUT 440 y RHT 587, se diseñaron dos
iniciadores en los que se primaba empezar 4bp más arriba del codón
de iniciación y otro en el que se primaba empezar 8bp antes del
codón de stop.
| WBR-C5: | [5'-CAGGGGCCGGTACCTCTCCACTCC-3'] | (SEQ ID NO:16) |
| WBR-C3: | [5'-TTGGGTCCTCGAGTGGCCAAGCTGCG-3'] | (SEQ ID NO:17) |
Los dos iniciadores se utilizaron para
amplificar un fragmento de ADN de aproximadamente 1525 bp bajo las
siguientes condiciones de PCR utilizando el sistema
Expand^{^{TM}}PCR de Boehringer Mannheim (Número de Catálogo
1681-842).
10 \mul de Tampón 1 de 10x
Expand^{^{TM}}PCR
14 \mul de mezcla de dNTP 2.5 mM
3.0 \mul de Iniciador 1 (10 \muM)
(WBR-C5)
3.0 \mul de Iniciador 2 (10 \muM)
(WBR-C3)
1.5 \mul de Enzima (5 unidades)
63.5 \mul de agua
5 \mul de ADN
Condiciones de reacción: 5 ciclos (93ºC, 1 Min;
72ºC, 40s; 60ºC, 45 sec; 68ºC, 2 min) y 25 ciclos (93ºC, 1 min;
72ºC, 1 min; 68ºC, 2 min).
El producto amplificado se subclonó a los sitios
Kpn I y Xho I del vector pcADN3 (Invitrogen). El ADN de plásmido se
preparó utilizando el método descrito anteriormente.
Las células Cos-1 se
transfectaron tal y como se describe en Analytical Biochemistry,
218:460-463 (1994) con un clon de rata de 587 de
receptor de GLP-2, receptor de GLP-2
de humano clonado (pC3/HuGL2R-2), o receptor de
GLP-2 de humano de variante del residuo 85 clonado
(pC3.1/HuGL2R-MH4), pcADN3. Amida de
GLP-1 de rata (7-36) se utilizó
como péptido control. Las soluciones utilizadas fueron tal y como se
muestra a continuación:
RSC en RPMI 1640 (49 ml RPMI + 1 ml FCS + 50 ul
cloroquina, 100 mM);
DEAE/RSC Solución: 18.4 ml RSC +1.6 ml
DEAE/Dextran (10 mg/ml).
El procedimiento del ensayo implicó lo
siguiente:
a) se añadió 50 mg de receptor de
GLP-2 de 587 de clon de rata, o receptor de
GLP-2 de humano clonado, o receptor de
GLP-2 de humano de variante de residuo 85 clonado
(como pcADN3 de plásmido) a un tubo de 50 ml que contenía 6 mls de
RSC y se incubó a 37ºC.
b) Se añadió seis ml de solución DEAE/RSC a cada
tubo y se incubó a 37ºC durante 2 minutos
c) Se añadió 1.5 ml de suspensión de células
COS-1 (5.5 millones de células) a cada tubo y se
incubó durante 1 hora 45 minutos a 37ºC.
\newpage
d) Después de la incubación, la muestra se hizo
girar durante 5 minutos a baja velocidad, se lavó con DMEM/F12 +
FBS al 10% dos veces, y el aglomerado resultante se resuspendió en
12.5 ml de medio DMEM/F12 + FBS al 10%.
e) Se añadió un ml de suspensión de célula (paso
d) a cada pozo de placas de 6 pozos recubiertas con
poli-D-lisina (de Collaborative
Biomedical), que contenía 3 ml de media (0.45 millón de
células/pozo).
f) Las placas se incubaron a 37ºC durante 3
días.
Se llevó a cabo el Tratamiento de células
Cos-1 transfectadas con análogo de
GLP-1/GLP-2 tal y como se muestra a
continuación:
Soluciones: DMEM/F12 (SFM)+ IBMX
(3-isobutil-1-metilxantin)
0.85 mM +0.1% ácido ascórbico y 10 um de pargilina (todas las
soluciones compradas de Sigma). El medio se preparó fresco el día de
su uso.
Procedimiento del ensayo: El medio de cultivo de
cada pozo (placas de 6 pozos transfectadas, células) se eliminó, y
los pozos se lavaron una vez con medio SFM. Después 2 ml de medio
SFM + IBMX se añadió a cada pozo y las placas se incubaron a 37ºC
durante 10 minutos. Después de la incubación, el SFM + IBMX se
eliminó de cada pozo y se añadió medio SFM + IBMX fresco que
contenía GLP-1/GLP-2
(GLP-1,7-36,amida de Sigma,
[Gly2]hGLP-2 de Allelix) concentración 1, 3,
10 y 30 nM a los pozos apropiados. Las placas se incubaron en un
incubador a 37ºC durante 30 minutos. Después de la incubación, el
medio se eliminó de cada pozo. Se lavaron los pozos una vez con 1ml
de PBS (Salina tamponada fosfato). Cada pozo entonces se trató con
1ml de etanol al 95% frío: EDTA 5 mM (2:1) a 4ºC durante 1 hora.
Las células de cada pozo entonces se rasparon y se transfirieron a
tubos eppendorf individuales. Los Tubos se centrifugaron durante 5
minutos a 4ºC, y los sobrenadantes se transfirieron a tubos
eppendorf nuevos y se secaron al vacío a velocidad. Después del
secado, los tubos se reconstituyeron en 100 ul de Acetato de Na y
se mantuvieron a 4ºC, 25 \mul de esta solución se utilizaron para
un ensayo de cAMP.
El ensayo funcional se llevó a cabo tal y como
se muestra a continuación: se determinó el contenido de cAMP para
cada extracto por duplicado por EIA (Enzima ImmunoAssay) utilizando
el Amersham Biotrak cAMP EIA Kit (Amersham 225). Los resultados de
los ensayos, ilustrados en la Figura 3 y la Figura 8, mostraron la
selectividad de GLP-2 por los receptores de rata y
humano clonados. En un ensayo funcional similar utilizado a la unión
del receptor de GLP-1, se observó especificidad
para GLP-1.
Se cribaron un millón de clones de una librería
de cADN de \lambdagt10 del hipotálamo humano (Clontech; Cat. No.
1172a) mediante elevadores de placas sobre filtros de nitrocelulosa
(Amersham; Cat.RPN137E). La prueba se preparó mediante el marcado
de iniciadores al azar de un fragmento de ADN que contenía la región
codificante completa del receptor de GLP-2 de rata.
El fragmento de ADN se aisló del clon 587-C1, que
contenía la región codificante completa de la SEQ ID NO: 2.
La Pre-hibridización y
hibridización se llevaron a cabo toda la noche en una solución de
hibridización que consistía en formamida al 50%, 5X SSPE, solución
de Denhart's 5X, SDS al 0.5% y ADN de esperma de salmón (200
mg/ml). Después de la hibridización se lavaron los filtros bajo las
siguientes condiciones (estringencia media):
dos veces a temperatura ambiente en 2X SSPE y
SDS al 0.01%.
dos veces a 42ºC en 2X SSPE y SDS al 0.01%.
dos veces a 42ºC en 0.2X SSPE y SDS al
0.01%.
Los filtros se autoradiografiaron y se
recogieron bloques de agar, cada uno contenía numerosas placas de
bacteriofago, de las regiones en las placas que correspondían a
señales positivas sobre el filtro. De un millón de clones de cADN
muestreados en el cribado de primera ronda, se identificaron dos
clones positivos (HHP6-1 y HHP13). En el segundo
cribado sólo HHP13 se volvió positivo. Diversas placas positivas
(HHS13) de la placa HHP13 se recogieron para un tercer cribado. Se
recogieron tres placas individuales positivas de esta ronda del
cribado (HHT13-1, HHT13-2,
HHT13-3).
La amplificación por PCR entonces se utilizó
para la secuenciación parcial de los clones positivos. De una
siembra de células de bacteria (E. coli C600Hfl), 10 \mul
de suspensión de fago de cada clon se aplicó una manchas marcadas.
Después de 5 horas de incubación a 37ºC, las placas de fago fueron
claramente visibles y se cubrieron con \sim1 cm^{2}. Una
porción de cada placa se transfirió a 200 \mul de agua. Las
muestras se incubaron en un baño de agua hirviendo durante 5
minutos y se centrifugaron a temperatura ambiente durante 10
minutos. Se utilizó un mililitro de muestra para la amplificación
por PCR con dos sets de iniciadores degenerados:
\newpage
| M2FS | [5'-TTTTTCTAGAASRTSATSTACACNGTSGGCTAC-3'] | (SEQ ID NO: 3) y |
| M7RS | [5'-TTTTCTCGAGCCARCARCCASSWRTARTTGGC-3'] | (SEQ ID NO: 4); o |
| C4-4 | [5'-AACTACATCCACMKGMAYCTGTTYVYGTCBTTCATSCT-3'] | (SEQ ID NO: 5) y |
| C9-2R | [5'-TCYRNCTGSACCTCMYYRTTGASRAARCAGTA-3'] | (SEQ ID NO: 8). |
Se utilizó el sistema de Expand^{^{TM}}PCR de
Boehringer Mannheim (Cat. 1681-842) bajo las
siguientes condiciones:
5 \mul de tampón 3 de 10x Expand^{^{TM}}
7 \mul de mezcla de dNTP 2.5 mM
1.5 \mul de iniciador M2FS o
C4-4
1.5 \mul de iniciador M7RS (con M2FS) o
C9-2R (con C4-4)
0.75 \mul de Enzima de PCR de expansión (1
unidad)
33.25 \mul de agua y
1 \mul de ADN.
Las condiciones de reacción fueron: 32 ciclos a
93ºC, 1 minuto; ciclos de 50ºC, 1 minuto; ciclos de 45ºC, 1 minuto;
ciclos de 68ºC, 2 minutos.
El M2F/S y M7R/S amplificaron un fragmento de
ADN de alrededor de 300 bp y C4-4 y
C92-R amplificaron un fragmento de ADN de alrededor
de 700 bp. Los productos de la PCR se purificaron utilizando el kit
de purificación de PCR QIAGEN QIAquick PCR (Cat. 28104) y se eluyó
en 50 \mul de Tris 10 mM, pH 8.0. El análisis de secuencia de los
productos no reveló ninguna diferencia entre los modelos, tal y como
se esperaba a partir del hecho que representaban múltiples copias
de un clon de cADN individual (HHT13).
Un número de factores indican que este clon
contiene secuencia del receptor de GLP-2 de humano.
Un factor es el grado de similitud de secuencia. El cADN de
receptor de glucagón se puede utilizar para predecir el grado
esperado de conservación de secuencia encontrado entre los
receptores de rata y humano. A nivel de nucleótido, se encuentra un
82.6% de identidad dentro de las regiones codificantes de los
receptores de glucagón de rata y humano. A nivel de aminoácidos, se
encuentra un 80.9% de identidad y un 89.1% de similitud de
aminoácido entre los receptores de glucagón de las dos
especies.
En el caso del receptor de GLP-2
humano clonado aquí, la secuencia del cADN de receptor de
GLP-2 de humano parcial (HHT13) es altamente
homólogo al cADN del receptor de GLP-2 de rata a
nivel de nucleótido y a nivel de aminoácidos. La SEQ ID NO: 9
muestra un 87.1% de identidad con la secuencia del receptor de
GLP-2 de rata. La secuencia aminoacídica
pronosticada de esta región de cADN presenta un 87.4% de identidad y
un 93.2% de similitud con la secuencia aminoacídica pronosticada
del receptor de GLP-2 de rata. La longitud total
pronosticada del receptor de preproteína de rata es de 550
aminoácidos, cosa que sugiere que alrededor el 44% de la región
codificante del receptor humano se ha identificado.
Más evidencias que dan suporte a esta conclusión
viene de la comparación de la secuencia aminoacídica del receptor
de GLP-2 de humano parcial con el receptor de
GLP-2 de rata y los siguientes 3 miembros más
cercanos, que se muestra a continuación:
Estas comparaciones, junto con el estándar de
comparación proporcionado por la similitud de las secuencias entre
los receptores de glucagón de rata y humano, proporcionan una prueba
definitiva que el cADN designado HHT13 representa un fragmento del
homólogo de humano del receptor de GLP-2 de
rata.
La secuencia aminoacídica completa del receptor
de GLP-2 de humano se puede obtener primero mediante
la determinación de la secuencia de los insertos de cADN completos
en HHT13-1, HHT13-2 y
HHT13-3. Utilizando los iniciadores degenerados
para la amplificación de PCR y la secuenciación siguiente, obtuvimos
la secuencia a partir de sólo parte de cada inserto. Es posible que
estos clones idénticos contengan un inserto que abarque la secuencia
codificante completa de la preproteína de receptor de
GLP-2 de humano. Para determinar la secuencia
completa del inserto de cADN, los clones se crecen en gran cantidad
para preparar aproximadamente 20 mg de cada clon equivalente. El
inserto de cADN completo se corta por restricción con Eco RI, y se
subclona a pcADN3 (Invitrogen). De forma alternativa, dos
iniciadores de la secuencia de vector que flanquea el inserto se
utilizan para amplificar el inserto de cADN completo utilizando el
sistema Expand^{^{TM}}PCR de Boehringer Mannheim (Catálogo
1681-842). El cADN amplificado se corta con las
enzimas de restricción apropiadas y se subclona a pcADN3
(Invitrogen).
Si una secuencia codificante completa no se
encuentra presente en los clones de HHT13, se criban las librerías
de cADN para clones adicionales para completar la región codificante
del cADN de receptor de GLP-2 de humano. De forma
preferible las librerías de cADN humanas (de Stratagene o Clontech)
que representan los siguientes tejidos se utilizan para el cribado:
Hipotálamo humano; cerebro fetal humano; duodeno y yeyuno humano;
estómago humano; e intestino fetal humano.
Dos iniciadores de PCR se diseñan a partir de la
secuencia de cADN del receptor de GLP-2 de humano ya
determinada. Estos iniciadores se diseñan de forma que no puedan
amplificar ningún miembro de la familia génica relacionada excepto
el cADN del receptor de GLP-2. Una dilución del
stock de librería de cADN librería se utiliza para hacer los
sub-conjuntos de librería de forma que 50,000 clones
se representan en cada conjunto. La PCR se lleva a cabo con los
iniciadores específicos del receptor de GLP-2 para
diagnosticar los conjuntos que contienen un clon de cADN de
GLP-2 cADN, utilizando el sistema de
Expand^{^{TM}}PCR de Boehringer Mannheim (Cat.
1681-842) bajo las siguientes condiciones:
2 \mul de Tampón 1 de 10x Expand^{^{TM}}
2.8 \mul de mezcla de dNTP 2.5 mM
0.6 \mul de iniciador P1
0.6 \mul de iniciador P2
0.3 \mul de enzima de PCR de Expand (1
unidad)
12.7 \mul de agua
1 \mul de conjunto de librería que contiene
50,000 clones
Condiciones de reacción: 32 ciclos a 93ºC, 40
segundos; 50-58ºC, 40 segundos; 68ºC, 40
segundos.
La secuencia entonces se obtiene a partir del
inserto de cADN del receptor de GLP-2 completo a
partir de un conjunto positivo. Utilizando un iniciador específico
y un iniciador basado en la secuencia de vector cerca del sitio de
clonación, el inserto de cADN de receptor de GLP-2
se amplifica directamente a partir de los conjuntos del clon
impuros de forma clónica, utilizando el sistema Expand^{^{TM}}PCR
de Boehringer Mannheim (Número de Catálogo
1681-842) más adecuadamente bajo las siguientes
condiciones:
2 \mul de Tampón 1 de 10x Expand^{^{TM}}
2.8 \mul de mezcla de dNTP 2.5 mM
0.6 \mul de Iniciador 1
0.6 \mul de Iniciador 2
0.3 \mul de Enzima (1 unidad)
12.7 \mul de agua
1 \mul de stock de conjunto de librería
Condiciones de reacción: 32 ciclos a 93ºC, 45
segundos; 50ºC, 45 segundos; 68ºC, 1 minuto.
La reacción se conduce en un gel de agarosa
preparativo, y se purifica y se secuencia la banda más prominente.
Basándose en la secuencia amplificada obtenida, se diseñan
iniciadores adicionales para obtener la secuencia y los clones de
la región codificante completa y clonar el cADN completo.
Se utiliza 5' RACE y 3' RACE para obtener la
secuencia codificante del cADN de receptor de GLP-2
de humano. La amplificación rápida de los terminales de cADN (RACE)
es un procedimiento rutinario utilizado para la amplificación de
secuencias de ADN del modelo de la primera cadena de cADN (preparada
fácilmente a partir de ARNm) entre un sitio interno definido y el
terminal 3' o el 5' del ARNm. El Total o el ARNm de los distintos
tejidos humanos se encuentran disponibles comercialmente por
Clontech. Se utilizan los kits del sistema 3' RACE
(Gibco-BRL Life Technologies; Cat.
18373-019) y del sistema 5' RACE (Catálogo
18374-058). Los manuales de estos dos productos
proporcionan protocoles detallados. En breve, los protocoles son tal
y como se describe a continuación.
Para el procedimiento 3' RACE, la síntesis del
cADN de primera cadena se inicia como una cola poli (A) de ARNm
utilizando el iniciador adaptador (que se proporciona con el
sistema) que incorpora una única secuencia para la amplificación de
PCR universal de los productos RACE. Después de la síntesis de la
primera cadena de cADN a partir de este iniciador, el modelo
original de ARNm se destruye con RNasa H. La amplificación se lleva
a cabo utilizando dos iniciadores: uno es un iniciador específico de
gen (que se diseñará a partir de la secuencia de HHT13 de cADN
parcial); el otro es el iniciador de amplificación universal
proporcionado por el kit. El producto amplificado se subclona a un
vector de plásmido para la secuenciación.
Para el Sistema 5' RACE, el cADN de primera
cadena se sintetiza a partir de ARNm utilizando un iniciador
específico de gen (que se basa en la secuencia de cADN parcial
disponible de HHT13) y la transcriptasa reversa SuperScript II. El
modelo original de ARNm se elimina mediante el tratamiento con RNasa
H. Los dNTPs, iniciadores, y proteínas no incorporados se separan
del cADN utilizando un cartucho de giro. Una cola de dCTP
homopolimérica entonces se añade al terminal 3' del cADN de primera
cadena utilizando enzima TdT y nucleótidos dCTP. La amplificación
por PCR se lleva a cabo utilizando dos iniciadores: uno es un
iniciador anidado, específico de gen diseñado para la secuencia de
ADN parcial disponible de HHT13; y el otro es un "iniciador de
anclaje" proporcionado por el sistema. Ambos iniciadores
incorporan sitios de restricción para los plásmidos de subclonación
y las siguientes secuenciacio-
nes.
nes.
En una siembra de células de bacteria (E.
coli C600Hf1), 10 \mul de resuspensión de fago de cada clon se
colocaron en una mancha marcada. Después de 5 horas de incubación a
37ºC, las placas de fago eran claramente visibles. La superficie de
cada placa se transfirió a 200 \mul de agua. Las muestras se
mantuvieron en un baño de agua en ebullición durante 5 minutos y se
centrifugó a temperatura ambiente durante 10 minutos. 1 \mul de
muestra se utilizó para amplificar con un set de iniciadores
\pigt10.
| GT10-5KXb | [5'-GGGTAGTCGGTACCTCTAGAGCAAGTTCAGCC-3'] | (SEQ ID NO:18) |
| vs | ||
| GT10-3BXh | [5'-ATAACAGAGGATCCTCGAGTATTTCTTCCAG-3'] | (SEQ ID NO:19) |
Se utilizó el sistema Expand^{^{TM}}PCR de
Boehringer Mannheim (Catálogo 1681-842) bajo las
siguientes condiciones:
5 \mul de Tampón 3 de 10x Expand^{^{TM}}
7 \mul de mezcla de dNTP 2.5 mM
1.5 \mul de iniciador
GT10-5KXb
1.5 \mul de iniciador
GT10-3BXh
0.75 \mul de enzima de PCR de Expand (1
unidad)
33.25 \mul de agua
1 \mul de ADN
Condiciones de reacción: 5 ciclos de
93ºC-40 segundos; 50ºC- 1 minuto;
68ºC-2 minutos y 30 ciclos de
93ºC-40 segundos; salto a 68ºC-1
minuto; 68ºC-2 minutos.
\newpage
Un fragmento de ADN de amplificado de alrededor
de 2200 bp de longitud se percibió en el gel de agarosa de los tres
clones. Los productos de PCR se purificaron utilizando el kit de
purificación de PCR QIAGEN's QIAquick (número de Catálogo 28104) y
se eluyó en 50 \mul de Tris10 mM, pH 8.0. Los modelos se
secuenciaron.
Al ADN amplificado y purificado de los tres
clones se le aplicó restricción con Kpn I y Xho I y se subclonó a
pcADN3 restringido con enzimas de restricción similares. Los
plásmidos se nombraron pHHT13-1,
pHHT13-2, y pHHT13-3. Los ADNs de
plásmidos se prepararon utilizando el método natural (tratamiento
alcalino, precipitación de ADN de bacteria con KOAc 3 M,
precipitación de isopropanol seguido por el tratamiento con ARNsa y
segunda ronda de precipitación con isopropanol) o los kits de ADN
de plásmido de Qiagen Inc. Los modelos preparados utilizando el kit
de Qiagen's se secuenciaron.
Las transfecciones se llevaron a cabo con cada
clon, utilizando el clon GLP-2R de rata, clon 587
como control positivo para la respuesta de cAMP al péptido
GLP-2. Los métodos para la transfección, el cultivo
celular y el ensayo de cAMP eran idénticos a aquellos que se
describen para el ensayo funcional de rata, clon 587. Los
resultados mostraron que a pesar que el control positivo dio buena
respuesta a cAMP en las células COS, ninguno de los clones de HHT13
dio ninguna respuesta de cAMP. Tal y como se confirma por la
secuenciación que mostró una mutación frame-shift,
los datos funcionales sugieren que ninguna proteína
GLP-2R funcional se expresó a partir de estos
clones de cADN.
La comparación mostró una deleción de 2 bp a una
posición correspondiente a los nucleótidos 389-390
del cADN de GLP- 2R de rata, resultando en la pérdida de los
nucleótidos 374-375 de la secuencia de cADN de
GLP-2R humano que se presenta aquí.
Se utilizó la PCR para incorporar dos bp de la
secuencia de ADN de GLP-2R de rata a ADN de
HHT13-1 al sitio de la deleción de 2 bp
identificada respeto a la secuencia codificante de
GLP-2R de rata. Los siguientes iniciadores se
diseñaron a partir de secuencia de ADN de HHT13 para insertar dos
bp.
| HWBR/2BPI-475F | |
| [5'-ACAGGCATGTCTGGAAGACTTACTCAAGGAACCTTCTGGCAT-3'] | (SEQ ID NO:20) |
\vskip1.000000\baselineskip
| HWBR/2BPI-506R | |
| [5'-ATGCCAGAAGGTTCCT1TGAGTAAGTCTTCCAGACATGCCTGT-3'] | (SEQ ID NO:21) |
\vskip1.000000\baselineskip
| HWBR-F7 | |
| [5'-TTCCTCTGTGGTACCAAGAGGAATGC-3'] | (SEQ ID NO:22) y |
\vskip1.000000\baselineskip
| HWBR-1910R | |
| [5'-GGTGGACTCGAGGTACCGATCTCACTCTCTTCCAGAATC-3'] | (SEQ ID NO:23) |
\vskip1.000000\baselineskip
PCR 1: Se utilizó 1 ng de ADN de
pHHT13-1 como modelo de las dos PCRs con
iniciadores, HWBR-F7 vs
HWBR/2BPI-506R y HWBR/2BPI-475F vs
HWBR-1910R. Se utilizó el Sistema de
Expand^{^{TM}}PCR de Boehringer Mannheim (Catálogo
1681-842) bajo las siguientes condiciones:
5 \mul de Tampón 3 de Lox Expand^{^{TM}}
7 \mul de mezcla de dNTP 2.5 mM
1.5 \mul de iniciador HWBR-F7
o HWBR/2BPI-475F
1.5 \mul de iniciador
HWBR-2BPI-506R o
HWBR-1910R
0.75 \mul de enzima de PCR de Expand (1
unidad)
33.25 \mul de agua y
1 \mul de ADN.
Condiciones de reacción: 10 ciclos de
92ºC-40 segundos; 48ºC-1 mm;
68ºC-3 mm y 30 ciclos de 92ºC-40
segundos; 55ºC-40 segundos; 68ºC-2
mm.
Los iniciadores HWBR-F7 y
HWBR/2BPI-506R amplificaron un fragmento de ADN de
400 bp y HWBR/2BPI-475F y HWBR-1910R
amplificaron un fragmento de ADN de aproximadamente 1.4 kb sobre un
gel de agarosa. Las dos bandas se cortaron del gel de agarosa y se
purificaron con el kit de extracción de gel de Qiaquick de Qiagen
Inc. (número de catálogo 28706) y los ADNs se eluyeron en 50 \mul
de Tris 10 mM (pH 8.5).
PCR 2 (Extensión sin los iniciadores):
Aproximadamente 75 ng de los dos productos amplificados a partir de
la PCR 1 anterior se mezclaron y después se recombinaron sin los
iniciadores mediante la extensión bajo las siguientes
condiciones:
2 \mul de Tampón 1 de 10x Expand^{^{TM}}
2.8 \mul de de mezcla de dNTP 2.5 mM
0.3 \mul de enzima de PCR de Expand (1
unidad)
8.9 \mul de agua
6 \mul de de productos de PCR 1 combinados
Condiciones de reacción: 15 ciclos de
92ºC-1 minuto; 60ºC-5 minutos;
68ºC-3 minutos.
PCR 3: Se utilizó 1 \mul de mezcla amplificada
de la PCR 2 como modelo para amplificar con los iniciadores
HWBR-F7 y HWBR- 1910R utilizando las siguientes
condiciones:
10 \mul de Tampón 1 de 10x
Expand^{^{TM}}
14 \mul de mezcla de dNTP 2.5 mM
3.0 \mul de iniciador HWBR-F7
o HWBR/2BPI-475F
3.0 \mul de iniciador
HWBR/2BPI-506R o HWBR-1910R
1.5 \mul de enzima de PCR de Expand (1
unidad)
67.5 \mul de agua y
1 \mul de ADN.
Condiciones de reacción: 30 ciclos de
92ºC-1 minuto; 60ºC- 1 minuto;
68ºC-2 minutos.
Un fragmento de ADN de aproximadamente 1.7 kb se
amplificó tal y como se veía sobre el gel de agarosa. El producto
se PCR se purificó utilizando el kit de purificación de PCR de
QIAGEN's QIAquick (número de catálogo 28104) y se eluyó en 50
\mul de Tris 10 mM, pH 8.0. El producto purificado se sometió a
restricción con Kpn I y se subclonó a
pcADN3.1(-)/Myc-His A sometido a restricción de Kpn
I (Invitrogen, número de catálogo V855-20). Un
clon, denominado pc3.1/HuGL2R/MH6 (pHuMH6), presentaba el inserto de
1.7 kb en la orientación correcta tal y como se comprobó por PCR
utilizando el vector vs. Los iniciadores de inserto.
Se comparó el clon híbrido a
GLP-2R de rata utilizando el ensayo descrito en el
Ejemplo 2. Los resultados muestran que la sustitución de 2 bp de
"GA" al sitio de la deleción supuesto dio como resultado
un clon que codificaba una proteína GLP-2R
funcional, tal y como se muestra por la respuesta de CAMP al
tratamiento de GLP-2.
Veinte mil clones de la Librería de cADN de
\pigt10 de Estómago Humano (Clontech; Cat. HL3O17a) se colocaron
en cada placa de 150 mm de agar 100. Se añadió tampón SM (NaCl 0.1
M, Mg_{2} So_{4} 10 mM, Tris35 mM, pH-7.5,
gelatina al 0.01%) a cada placa para obtener 100 lisatos de fago
cada uno conteniendo un conjunto de 20,000 (20K) clones. Los
primeros cincuenta 20K lisatos de fago (conjunto de 20K) se
cribaron por PCR utilizando dos iniciadores diseñados a partir de
la secuencia de ADN de HHT13. El modelo de ADN de cada conjunto se
preparó mediante el hervido de lisato de fago durante 10 minutos y
la centrifugación durante 10 minutos.
\newpage
| HWBR-113F | |
| [5'-GTGGAGAGGATTTGTGCAAACATTTC-3'] | (SEQ ID NO:24) |
\vskip1.000000\baselineskip
| HWBR-578R | |
| [5'-AGAGACATTTCCAGGAGAAGAATGAG-3'] | (SEQ ID NO:25) |
\vskip1.000000\baselineskip
1 \mul de cada ADN del conjunto de 20K se
diagnosticó por PCR con los iniciadores HWBR-113F y
HWBR578R utilizando las siguientes condiciones:
2 \mul de Tampón 1 de 10x Expand^{^{TM}}
2.8 \mul de mezcla de dNTP 2.5 mM
0.6 \mul de iniciador
HWBR-113F
0.6 \mul de iniciador
HWBR-578R
0.3 \mul de enzima de PCR de Expand (1
unidad)
12.7 \mul de agua
1 \mul del conjunto de 20K de ADN
Condiciones de reacción: 35 ciclos de
92ºC-40 segundos.; 60ºC-40
segundos.; 68ºC-1 minuto.
Se visualizó un fragmento de ADN de
aproximadamente 450 bp en la amplificación de los modelos a partir
de dos conjuntos (HST 19 y HST 38).
Se cribaron 40,000 clones colocados a partir de
cada dos conjuntos de 20K positivos mediante elevadores de placas
sobre filtros de nitrocelulosa (Amersham; Catálogo RPN137E). La
prueba se preparó mediante el marcado del iniciador aleatorio de un
fragmento de ADN a partir de pHHT13-1.
1. Los filtros se
pre-hibridizaron y se hibridizaron a 42ºC toda la
noche. La solución de hibridización consistía en formamida al 50%,
5X SSPE, solución de Denhart's 5X, SDS al 0.5% y ADN de esperma de
salmón (200 mg/ml).
2. Después de la hibridización los filtros se
lavaron bajo las siguientes condiciones:
- -
- dos veces a temperatura ambiente en 2X SSPE y SDS al 0.01%;
- -
- dos veces a 42ºC en 2X SSPE y SDS al 0.01%; y
- -
- dos veces a 50ºC en 0.1X SSPE y SDS al 0.01%.
3. Los filtros se autoradiografiaron y las
regiones sobre las placas que coincidían con los signos positivos
se aislaron. Un clon positivo (HST
38-4-30) se aisló a partir del
conjunto HST 38. Se amplificó un fragmento de ADN de 450 bp a
partir del clon positivo utilizando los iniciadores
HWBR-113F y HWBR-578R y se
secuenciaron. La secuencia claramente mostró que el plásmido
contenía 2 bp (A G) en la posición 373-374 de la
secuencia de ADN de HHT13.
El inserto completo de clon HST
38-4-30 se amplificó utilizando
iniciadores \lambdagt10 tal y como se describe en el Ejemplo 1.
La PCR amplificó un fragmento de ADN de aproximadamente 1.4 kb. El
ADN amplificado se purificó y se secuenció.
Un fragmento de 700 bp obtenido por digestión de
restricción de Kpn I y Pvu II del ADN amplificado a partir del clon
UST 38-4- 30, y el fragmento de ADN de 1.4 kb a
partir de ADN de pHHT13-1 sometido a restricción de
Xho I y Pvu II se subclonaron a pcADN3 sometidos a restricción de
Kpn I y Xho I en una ligación de tres modos. El constructo de
plásmido nuevo se denominó pc3/HuGL2R-2. De esta
manera se obtuvo la secuencia del receptor de GLP-2
de humano en toda su longitud.
El nuevo clon se comparó con el clon de
GLP-2R de rata 587 tal y como se ha descrito
anteriormente. Los resultados muestran que el clon codificó la
proteína de GLP-2R humana funcional, que lleva a la
producción de cAMP en células COS como respuesta al tratamiento de
GLP-2 (Figura 8).
Anticuerpos de Antipéptido se crecieron en
conejos contra el péptido N-terminal
(QTRENTTDIWQDESE) (SEQ ID NO:26), un péptido
C-terminal (SEGDGSETLQKLR) (SEQ ID NO:27) y un lazo
extracelular 1(SHNSUSKRPDDESG) (SEQ ID NO:28) del receptor
de GLP-2 de rata.
El análisis inmunoquímico de suero producido tal
y como se ha indicado anteriormente confirmó que el suero contenía
anticuerpos dirigidos al receptor de GLP-2 que no
reaccionaban de forma cruzada con el receptor de
GLP-1 de rata.
El polinucleótido que codifica la región
C-terminal del receptor de GLP-2 de
rata (aminoácidos 444-550) se unió al
C-terminal de glutationa
5-transferasa (GST) en pGEX-2T y se
expresó en la cadena de E. coli SUREI. Se purificó la
proteína utilizando cromatografía de afinidad utilizando el
fragmento C-terminal de GLP-2
fusionado al C-terminal de la proteína que une
maltosa. Se minimizó la degradación de la proteasa utilizando un
cocktail o inhibidores de proteasa (Boeringer Mannheim).
Los anticuerpos se crecieron en general de
acuerdo con el método divulgado en Antibodies: A laboratory manual,
Harlow and Lane, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988. De forma
breve, la proteína de fusión
GLP-2-GST se utilizó para crecer
anticuerpos en conejos tal y como se muestra a continuación. La
inyección inicial era con 100 \mug de proteína de fusión en un
adyuvante de Freund's completo a múltiples sitios, de forma
intramuscular y subcutánea. Las inyecciones de Booster se llevaron
a cabo a múltiples sitios de forma intramuscular con 100 \mug de
proteína de fusión en un adyuvante de Freund's incompleto a los días
14, 21, 42 y 56.
El antisuero se purificó por afinidad utilizando
una columna de afinidad de fusión de
GLP-2-MBP. El análisis
inmunocitoquímico confirmó que estos anticuerpos reconocen de forma
específica el receptor de GLP-2.
La especificación escrita más arriba se
considera que es suficiente para facilitar que el experto en la
materia practique la invención. Además, varias modificaciones de
los modos descritos anteriormente de llevar a cabo la invención que
son obvios para el experto en el campo de la bioquímica, la biología
molecular o los campos relacionados pretenden estar dentro del
objetivo de las siguientes reivindicaciones.
\global\parskip0.000000\baselineskip
(1) INFORMACIÓN GENERAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: ALLELIX BIOPHARMACEUTICALS, INC.
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: GLUCAGÓN RECEPTORES DE TIPO PÉPTIDO 2 CLONADOS
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 28
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DIRECCIÓN: Osler, Hoskin & Harcourt
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 50 O'Connor Street
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Ottawa
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: Ontario
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: Canada K1P 6L2
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMATO LEGIBLE POR EL ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disquet
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: IBM Compatible
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: FastSEQ Version 2.0
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: PCT/CA97/00969
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 15-DEC-1997
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DE MANDATARIO /AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Aitken, David W.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA/ETIQUETA: 12771
\vskip0.500000\baselineskip
- 8607-021
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: 613-235-7234
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: 613-235-2867
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2575 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Secuencia codificante
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 137...1786
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:1:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 550 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocido
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 33 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTTTTCTAGA ASRTSATSTA CACNGTSGGC TAC
\hfill33
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTTTCTCGAG CCARCARCCA SSWRTARTTG GC
\hfill32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 38 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAACTACATCC ACMKGMAYCT GTTYVYGTCB TTCATSCT
\hfill38
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCATCTCCCT CTTCTTGGCT CTTAC
\hfill25
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCTGACAGAT ATGACATCCA TCCAC
\hfill25
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCYRNCTGSA CCTCMYYRTT GASRAARCAG TA
\hfill32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 667 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Secuencia codificante
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1...664
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:9:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 222 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocido
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:10:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2112 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Secuencia codificante
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 122...1780
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:11:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 553 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocido
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:12:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 462 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocido
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 14 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAACCCACTGC TTAC
\hfill14
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCCAGAATAG AATGACACC
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCAGGGGCCGG TACCTCTCCA CTCC
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTGGGTCCTC GAGTGGCCAA GCTGCG
\hfill26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGGTAGTCGG TACCTCTAGA GCAAGTTCAC CC
\hfill32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 31 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:19:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATAACAGAGG ATCCTCGAGT ATTTCTTCCA G
\hfill31
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 42 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACAGGCATGT CTGGAAGACT TACTCAAGGA ACCTTCTGGC AT
\hfill42
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:21:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 42 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATGCCAGAAG GTTCCTTGAG TAAGTCTTCC AGACATGCCT GT
\hfill42
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:22:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTCCTCTGTG GTACCAAGAG GAATGC
\hfill26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:23:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 39 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTGGACTCG AGGTACCGAT CTCACTCTCT TCCAGAATC
\hfill39
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:24:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:24:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTGGAGAGGA TTTGTGCAAA CATTTC
\hfill26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:25:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:25:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGAGACATTT CCAGGAGAAG AATGAG
\hfill26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:26:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 15 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocido
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:26:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Thr Arg Glu Asn Thr Thr Asp Ile Trp Gln
Asp Glu Ser Glu}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:27:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 13 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocido
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:27:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Glu Gly Asp Gly Ser Glu Thr Leu Gln Lys
Leu Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:28:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 13 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocido
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO:28:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser His Asn Ser Ser Lys Arg Pro Asp Asp Glu
Ser Gly}
Claims (32)
1. Un polinucleótido aislado que codifica un
receptor de GLP-2 seleccionado de entre:
(a) un receptor de GLP-2 de
humano que comprende la secuencia aminoacídica de los aminoácidos
67-553 de la SEQ ID NO: 12;
(b) un receptor de GLP-2 de rata
que comprende la secuencia aminoacídica de los aminoácidos
67-550 de SEQ ID NO: 2;
(c) un homólogo de mamífero que presenta al
menos el 80% de identidad de secuencia respecto a (a) o (b) que
exhibe la característica funcional de unirse a
GLP-2, y
(d) una variante de (a), (b), o (c) que exhibe
la característica funcional de unirse selectivamente a
GLP-2, comprendiendo la variante la/s
sustitución/es del 1 al 20, en la que la/s sustitución/es es/son (i)
una/s sustitución/es conservativa/s cuando se halla/n en una
posición conservada entre los receptores (a) y (b), y/o (ii) una/s
sustitución/es conservativa/s o no conservativa/s cuando se halla/n
en una posición no conservada entre los receptores (a) y
(b).
(b).
2. Un polinucleótido aislado que codifica un
receptor de GLP-2 de acuerdo con la reivindicación
1, en el que dicho receptor de GLP-2 es un receptor
de GLP-2 de humano que comprende la secuencia
aminoacídica de los aminoácidos 67-553 de la SEQ ID
NO: 12.
3. Un polinucleótido aislado que codifica un
receptor de GLP-2 de acuerdo con la reivindicación
1, en el que dicho receptor de GLP-2 es un receptor
de GLP-2 de rata que comprende la secuencia
aminoacídica de los aminoácidos 67-550 de la SEQ ID
NO: 2.
4. Un polinucleótido aislado de acuerdo con la
reivindicación 1, que comprende los nucleótidos
320-1780 de la SEQ ID NO: 11.
5. Un polinucleótido aislado de acuerdo con la
reivindicación 1, que presenta los nucleótidos
335-1786 de SEQ ID NO: 1.
6. Un polinucleótido aislado de acuerdo con la
reivindicación 1, en el que dicho polinucleótido codifica una
variante Glu85 de dicho receptor de GLP-2 de humano,
tal y como se muestra en la SEQ ID NO: 12.
7. Un polinucleótido aislado de acuerdo con la
reivindicación 1, en el que dicho polinucleótido codifica para el
receptor de GLP-2 de humano y dicho polinucleótido
codifica para la secuencia aminoacídica de los aminoácidos
1-553 de la SEQ ID NO: 12.
8. Un polinucleótido aislado de acuerdo con la
reivindicación 1, en el que dicho polinucleótido codifica para el
receptor de GLP-2 de humano y dicho polinucleótido
codifica para la secuencia aminoacídica de los aminoácidos
26-553 de la SEQ ID NO: 12.
9. Un polinucleótido aislado de acuerdo con la
reivindicación 1, en el que dicho polinucleótido codifica para el
receptor de GLP-2 de humano y dicho polinucleótido
codifica para la secuencia aminoacídica que es al menos el 95%
idéntica a los aminoácidos 26-553 de la SEQ ID NO:
12.
10. Un polinucleótido aislado que hibridiza bajo
condiciones de alta estringencia con un polinucleótido de acuerdo
con cualquiera de las reivindicaciones 1 - 9, o con el
complementario de dicho polinucleótido.
11. Un oligonucleótido que comprende al menos 15
nucleótidos y que presenta una secuencia de polinucleótido que
hibridiza bajo condiciones de alta estringencia a un polinucleótido
de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 - 10 o con el
complementario de dicho polinucleótido.
12. Un oligonucleótido de acuerdo con la
reivindicación 11, en el que la secuencia de nucleótido del
oligonucleótido es idéntica a la región del polinucleótido definida
en las reivindicaciones 4 o 5 o con el complementario de dicho
polinucleótido.
13. Un oligonucleótido de acuerdo con la
reivindicación 11, en el que la secuencia de nucleótido del
oligonucleótido es idéntica a una región común a los
polinucleótidos definidos en las reivindicaciones 4 o 5, o con el
complementario de dichos polinucleótidos.
14. En la forma marcada, un polinucleótido
seleccionado del polinucleótido tal y como se define en cualquiera
de las reivindicaciones 1 - 10.
\newpage
15. Un polinucleótido recombinante que comprende
un polinucleótido que codifica el receptor de GLP-2
tal y como se define en cualquiera de las reivindicaciones 1 -10, y
los elementos que controlan la expresión unidos de forma operable
para conducir su expresión.
16. Una célula que se ha ingeniado genéticamente
por la incorporación de forma expresa allí de un polinucleótido de
acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 - 10.
17. La célula de acuerdo con la reivindicación
16, que es una célula de mamífero.
18. Un anticuerpo que se une selectivamente a un
receptor de GLP-2 codificado por el polinucleótido
de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 - 5, 7 -
10.
19. Un receptor recombinante de
GLP-2 seleccionado de:
(a) un receptor de GLP-2 de
humano que comprende la secuencia aminoacídica de los aminoácidos
67-553 de la SEQ ID NO: 12;
(b) un receptor de rata de GLP-2
que comprende la secuencia aminoacídica de los aminoácidos de
67-550 de la SEQ ID NO: 2;
(c) un homólogo de mamífero que presenta al
menos un 80% de identidad de secuencia a (a) o (b) que exhibe la
característica funcional de unirse selectivamente a
GLP-2,
(d) una variante de (a), (b), o (c) que exhibe
la característica funcional de unirse selectivamente a
GLP-2, comprendiendo la variante de 1 a 20
sustitución/es aminoacídica/s, en la que las sustitución/es es/son
(i) una/s sustitución/es conservativa/s cuando se halla/n en una
posición conservada entre los receptores (a) y (b), y/o (ii) una/s
sustitución/es conservativa/s o no conservativa/s cuando se halla/n
en una posición no conservada entre los receptores (a) y (b), y
(e) una forma quimérica de (a), (b), (c) o (d)
que comprende uno o más dominios de un receptor acoplado a proteína
G distinto al receptor de GLP-2, en la que los
dominios son un dominio transmembrana, o un dominio
intracelular.
20. Un receptor de GLP-2
recombinante de acuerdo con la reivindicación 19, en el que dicho
receptor de GLP-2 es el receptor de
GLP-2 de humano que comprende la secuencia
aminoacídica de los aminoácidos 67-553 de la SEQ ID
NO: 12.
21. Un receptor recombinante de
GLP-2 de acuerdo con la reivindicación 19, en el que
dicho receptor de GLP-2 es un receptor de
GLP-2 de rata que comprende la secuencia
aminoacídica de los aminoácidos 67-550 de la SEQ ID
NO: 2.
22. Un receptor recombinante de
GLP-2 de acuerdo con la reivindicación 19, en el que
el receptor de GLP-2 es una variante Glu85 del
receptor de GLP-2 de humano tal y como se muestra en
la SEQ ID NO: 12.
23. Un fragmento de un receptor de
GLP-2 tal y como se define en las reivindicaciones
19 - 22, en el que dicho fragmento comprende una secuencia
aminoacídica que constituye un dominio C-terminal
intracelular de un receptor de GLP-2.
24. Un fragmento de un receptor de
GLP-2 de acuerdo con la reivindicación 23, que
comprende al menos 10 residuos de aminoácido dentro de las regiones
de la SEQ ID NO: 12 correspondientes a los aminoácidos seleccionados
del grupo que consiste en los aminoácidos 65-180,
363-385 y 442-533.
25. Un anticuerpo que une selectivamente a un
receptor de GLP-2 de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 19 - 21.
26. Una preparación de membrana de célula
derivada de una célula de acuerdo con la reivindicación 16 o la
reivindicación 17.
27. Un método para identificar los ligandos del
receptor de GLP-2, que comprende los pasos de:
(1) incubar un ligando candidato con una célula
tal y como se define en la reivindicación 16 o 17 o con una
preparación de membrana obtenida de allí, y después
(2) determinar si la unión entre el receptor de
GLP-2 y el ligando candidato ha ocurrido.
28. Un método para identificar los ligandos del
receptor de GLP-2, que comprende los pasos de:
a. identificar una célula que expresa un
receptor de GLP-2 funcional, conteniendo dicha
célula una molécula de ADN recombinante que codifica para el
receptor de GLP-2,
b. incubar un ligando candidato con la célula
que expresa un receptor funcional de GLP-2, o con
una preparación de membrana derivada de dicha célula; y
c. determinar si la unión entre el receptor de
GLP-2 y el ligando ha ocurrido.
29. Un método de acuerdo con la reivindicación
28, en el que el ligando candidato se incuba con una célula que
produce un receptor de GLP-2 funcional, y la
determinación de si la unión entre el receptor de
GLP-2 y el ligando candidato ha ocurrido se
consigue mediante la medida del cambio en el nivel de cAMP
intracelular, en el que un aumento en el nivel de cAMP indica que
el ligando candidato es un agonista de GLP-2.
30. Un polinucleótido aislado de acuerdo con la
reivindicación 1, que comprende una secuencia de nucleótido que
presenta al menos el 80% de identidad de secuencia respecto a la SEQ
ID NO: 1, en el que dicho polinucleótido codifica un receptor de
GLP-2 de mamífero que exhibe las características
funcionales de unirse selectivamente a GLP-2.
31. El polinucleótido aislado de acuerdo con la
reivindicación 1, en el que dicha secuencia de nucleótido presenta
al menos un 90% de identidad de secuencia respeto la SEQ ID NO: 1,
en el que dicho polinucleótido codifica un receptor de
GLP-2 de mamífero que exhibe las características
funcionales de unirse selectivamente a GLP-2.
32. El polinucleótido aislado de acuerdo con la
reivindicación 1, en el que dicha secuencia de nucleótido presenta
al menos el 95% de identidad de secuencia de la SEQ ID NO: 1, en el
que dicho polinucleótido codifica un receptor de
GLP-2 de mamífero que exhibe las características
funcionales de unirse selectivamente a GLP-2.
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