ES2290970T3 - Mutantes termoestables de enzimas de la biosintesis del almidon. - Google Patents
Mutantes termoestables de enzimas de la biosintesis del almidon. Download PDFInfo
- Publication number
- ES2290970T3 ES2290970T3 ES97948384T ES97948384T ES2290970T3 ES 2290970 T3 ES2290970 T3 ES 2290970T3 ES 97948384 T ES97948384 T ES 97948384T ES 97948384 T ES97948384 T ES 97948384T ES 2290970 T3 ES2290970 T3 ES 2290970T3
- Authority
- ES
- Spain
- Prior art keywords
- plant
- agp
- polynucleotide according
- polynucleotide
- corn
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Lifetime
Links
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 title abstract description 27
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 title abstract description 27
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 title description 13
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 claims abstract description 80
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 claims abstract description 54
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims abstract description 50
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims abstract description 50
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims abstract description 50
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 claims abstract description 49
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 31
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 30
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 30
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims abstract description 29
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 18
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 claims abstract description 16
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims description 50
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 claims description 46
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 claims description 46
- 235000013339 cereals Nutrition 0.000 claims description 23
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 21
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims description 18
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 17
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims description 15
- 241000209140 Triticum Species 0.000 claims description 13
- 235000021307 Triticum Nutrition 0.000 claims description 13
- 240000005979 Hordeum vulgare Species 0.000 claims description 8
- 235000007340 Hordeum vulgare Nutrition 0.000 claims description 8
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 7
- 235000013311 vegetables Nutrition 0.000 claims description 6
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 claims description 5
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 claims description 5
- 235000007244 Zea mays Nutrition 0.000 claims description 5
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 claims description 5
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 claims description 2
- 108010073135 Phosphorylases Proteins 0.000 claims description 2
- 102000009097 Phosphorylases Human genes 0.000 claims description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 claims description 2
- 230000004584 weight gain Effects 0.000 claims description 2
- 235000019786 weight gain Nutrition 0.000 claims description 2
- 101710166809 ADP-glucose phosphorylase Proteins 0.000 claims 7
- 239000004744 fabric Substances 0.000 claims 4
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 1
- 108700023224 Glucose-1-phosphate adenylyltransferases Proteins 0.000 abstract description 95
- 108010039811 Starch synthase Proteins 0.000 abstract description 25
- 230000008642 heat stress Effects 0.000 abstract description 8
- 235000016383 Zea mays subsp huehuetenangensis Nutrition 0.000 abstract description 3
- 235000009973 maize Nutrition 0.000 abstract description 3
- 230000035882 stress Effects 0.000 abstract description 3
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 18
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 18
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 17
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 16
- 244000061456 Solanum tuberosum Species 0.000 description 15
- 235000002595 Solanum tuberosum Nutrition 0.000 description 15
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 13
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 12
- 229920002527 Glycogen Polymers 0.000 description 9
- 229940096919 glycogen Drugs 0.000 description 9
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 8
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 8
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 230000003281 allosteric effect Effects 0.000 description 7
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 7
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 7
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 6
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 6
- 241000219315 Spinacia Species 0.000 description 6
- 235000009337 Spinacia oleracea Nutrition 0.000 description 6
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 6
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 6
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 6
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 6
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 6
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 5
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 5
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 5
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 5
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 5
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 5
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 5
- 235000008521 threonine Nutrition 0.000 description 5
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical compound [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- WFPZSXYXPSUOPY-ROYWQJLOSA-N ADP alpha-D-glucoside Chemical compound C([C@H]1O[C@H]([C@@H]([C@@H]1O)O)N1C=2N=CN=C(C=2N=C1)N)OP(O)(=O)OP(O)(=O)O[C@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O WFPZSXYXPSUOPY-ROYWQJLOSA-N 0.000 description 4
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 4
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 4
- 230000008859 change Effects 0.000 description 4
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 4
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 4
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 4
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 4
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 4
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 4
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 4
- 238000002708 random mutagenesis Methods 0.000 description 4
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 4
- 230000006918 subunit interaction Effects 0.000 description 4
- OSJPPGNTCRNQQC-UHFFFAOYSA-N 3-phosphoglyceric acid Chemical group OC(=O)C(O)COP(O)(O)=O OSJPPGNTCRNQQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 3
- 102100039556 Galectin-4 Human genes 0.000 description 3
- 101000608765 Homo sapiens Galectin-4 Proteins 0.000 description 3
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 3
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 3
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 3
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 3
- 239000002962 chemical mutagen Substances 0.000 description 3
- 238000011161 development Methods 0.000 description 3
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 3
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 3
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 3
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 3
- 230000006870 function Effects 0.000 description 3
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 3
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 3
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 3
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000008117 seed development Effects 0.000 description 3
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 150000003588 threonines Chemical class 0.000 description 3
- WFPZSXYXPSUOPY-UHFFFAOYSA-N ADP-mannose Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C(C(C1O)O)OC1COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC1OC(CO)C(O)C(O)C1O WFPZSXYXPSUOPY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150116940 AGPS gene Proteins 0.000 description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- 230000004568 DNA-binding Effects 0.000 description 2
- 108010001483 Glycogen Synthase Proteins 0.000 description 2
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 2
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 2
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 2
- 101150089165 agp gene Proteins 0.000 description 2
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 2
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 2
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 2
- 230000008021 deposition Effects 0.000 description 2
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 2
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 2
- 230000005714 functional activity Effects 0.000 description 2
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 2
- 125000000487 histidyl group Chemical class [H]N([H])C(C(=O)O*)C([H])([H])C1=C([H])N([H])C([H])=N1 0.000 description 2
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 2
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 2
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 2
- 238000012933 kinetic analysis Methods 0.000 description 2
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 2
- 230000000243 photosynthetic effect Effects 0.000 description 2
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- 238000002864 sequence alignment Methods 0.000 description 2
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 2
- 235000004400 serine Nutrition 0.000 description 2
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 2
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 2
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- BFSVOASYOCHEOV-UHFFFAOYSA-N 2-diethylaminoethanol Chemical compound CCN(CC)CCO BFSVOASYOCHEOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OSJPPGNTCRNQQC-REOHCLBHSA-N 3-phosphoglyceric acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](O)COP(O)(O)=O OSJPPGNTCRNQQC-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- OPIFSICVWOWJMJ-AEOCFKNESA-N 5-bromo-4-chloro-3-indolyl beta-D-galactoside Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=CNC2=CC=C(Br)C(Cl)=C12 OPIFSICVWOWJMJ-AEOCFKNESA-N 0.000 description 1
- 229920000945 Amylopectin Polymers 0.000 description 1
- 241000219195 Arabidopsis thaliana Species 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- -1 C3 aminopropyl Chemical group 0.000 description 1
- 101100283604 Caenorhabditis elegans pigk-1 gene Proteins 0.000 description 1
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 1
- 229920002261 Corn starch Polymers 0.000 description 1
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 1
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 1
- XPYBSIWDXQFNMH-UHFFFAOYSA-N D-fructose 1,6-bisphosphate Natural products OP(=O)(O)OCC(O)C(O)C(O)C(=O)COP(O)(O)=O XPYBSIWDXQFNMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001057636 Dracaena deremensis Species 0.000 description 1
- 241000644323 Escherichia coli C Species 0.000 description 1
- 206010064571 Gene mutation Diseases 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N Hydrazine Chemical compound NN OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N Hydroxylamine Chemical compound ON AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WTDHULULXKLSOZ-UHFFFAOYSA-N Hydroxylamine hydrochloride Chemical compound Cl.ON WTDHULULXKLSOZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 241000220317 Rosa Species 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 206010057040 Temperature intolerance Diseases 0.000 description 1
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 description 1
- 108010001244 Tli polymerase Proteins 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101001036768 Zea mays Glucose-1-phosphate adenylyltransferase large subunit 1, chloroplastic/amyloplastic Proteins 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- RNBGYGVWRKECFJ-ZXXMMSQZSA-N alpha-D-fructofuranose 1,6-bisphosphate Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@](O)(COP(O)(O)=O)O[C@@H]1COP(O)(O)=O RNBGYGVWRKECFJ-ZXXMMSQZSA-N 0.000 description 1
- HXXFSFRBOHSIMQ-VFUOTHLCSA-N alpha-D-glucose 1-phosphate Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](OP(O)(O)=O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O HXXFSFRBOHSIMQ-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 238000005349 anion exchange Methods 0.000 description 1
- 238000005571 anion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 102000005936 beta-Galactosidase Human genes 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 230000001851 biosynthetic effect Effects 0.000 description 1
- 230000006696 biosynthetic metabolic pathway Effects 0.000 description 1
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001143 conditioned effect Effects 0.000 description 1
- 239000008120 corn starch Substances 0.000 description 1
- 229940099112 cornstarch Drugs 0.000 description 1
- 238000012937 correction Methods 0.000 description 1
- 238000012272 crop production Methods 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- XPPKVPWEQAFLFU-UHFFFAOYSA-J diphosphate(4-) Chemical compound [O-]P([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O XPPKVPWEQAFLFU-UHFFFAOYSA-J 0.000 description 1
- 235000011180 diphosphates Nutrition 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 239000000386 donor Substances 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 238000001952 enzyme assay Methods 0.000 description 1
- 239000011536 extraction buffer Substances 0.000 description 1
- RNBGYGVWRKECFJ-UHFFFAOYSA-N fructose-1,6-phosphate Natural products OC1C(O)C(O)(COP(O)(O)=O)OC1COP(O)(O)=O RNBGYGVWRKECFJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000005227 gel permeation chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000012252 genetic analysis Methods 0.000 description 1
- 229950010772 glucose-1-phosphate Drugs 0.000 description 1
- 125000002791 glucosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000004554 glutamine Nutrition 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- 239000000348 glycosyl donor Substances 0.000 description 1
- 125000003147 glycosyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000008543 heat sensitivity Effects 0.000 description 1
- 238000004191 hydrophobic interaction chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 238000011835 investigation Methods 0.000 description 1
- PNDPGZBMCMUPRI-UHFFFAOYSA-N iodine Chemical compound II PNDPGZBMCMUPRI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000741 isoleucyl group Chemical group [H]N([H])C(C(C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])[H])C(=O)O* 0.000 description 1
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 1
- 101150066555 lacZ gene Proteins 0.000 description 1
- 208000020442 loss of weight Diseases 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 231100000219 mutagenic Toxicity 0.000 description 1
- 239000003471 mutagenic agent Substances 0.000 description 1
- 231100000707 mutagenic chemical Toxicity 0.000 description 1
- 230000003505 mutagenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000869 mutational effect Effects 0.000 description 1
- MHWLWQUZZRMNGJ-UHFFFAOYSA-N nalidixic acid Chemical compound C1=C(C)N=C2N(CC)C=C(C(O)=O)C(=O)C2=C1 MHWLWQUZZRMNGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960000210 nalidixic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 230000008635 plant growth Effects 0.000 description 1
- 230000004983 pleiotropic effect Effects 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 230000031070 response to heat Effects 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 238000010396 two-hybrid screening Methods 0.000 description 1
- 238000005199 ultracentrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/12—Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
- C12N9/1241—Nucleotidyltransferases (2.7.7)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
- C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
- C12N15/8245—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine involving modified carbohydrate or sugar alcohol metabolism, e.g. starch biosynthesis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Nutrition Science (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Polysaccharides And Polysaccharide Derivatives (AREA)
Abstract
LA PRESENTE INVENCION SE REFIERE A NUEVAS MOLECULAS DE POLINUCLEOTIDO MUTANTES, QUE CODIFICAN PARA ENZIMAS QUE PRESENTAN UNA TERMOESTABILIDAD INCREMENTADA. DICHOS POLINUCLEOTIDOS, CUANDO SE EXPRESAN EN PLANTAS, PRODUCEN UN RENDIMIENTO ELEVADO EN PLANTAS CULTIVADAS BAJO CONDICIONES DE ESTRES TERMICO. LAS MOLECULAS DE POLINUCLEOTIDO DE LA PRESENTE INVENCION, CODIFICAN PARA LAS ACTIVIDADES DE LA ADP GLUCOSA PIROFOSFORILASA (AGP) Y DE LA SINTESIS DE ALMIDON SOLIDO (SSS) DEL ENDOSPERMO DEL MAIZ. LAS PLANTAS Y EL TEJIDO VEGETAL SELECCIONADOS DE FORMA QUE CONTENGAN O ESTEN TRANSFORMADOS CON DICHOS POLINUCLEOTIDOS MUTANTES, Y QUE EXPRESAN LOS POLIPEPTIDOS CODIFICADOS POR DICHOS POLINUCLEOTIDOS, SE INCLUYEN ASIMISMO EN LA INVENCION. LA INVENCION SE REFIERE TAMBIEN A PROCEDIMIENTOS DE AISLAMIENTO DE POLINUCLEOTIDOS Y POLIPEPTIDOS DE LA INVENCION, ASI COMO A LOS PROCEDIMIENTOS PARA INCREMENTAR EL RENDIMIENTO EN LAS PLANTAS CULTIVADAS BAJO LAS MEJORES CONDICIONES DE ESTRES.
Description
Mutantes termoestables de enzimas de la
biosíntesis del almidón.
La naturaleza sésil de la vida vegetal genera
una exposición constante a factores medioambientales que ejercen
efectos positivos y negativos sobre su crecimiento y desarrollo. Uno
de los principales impedimentos con que se enfrenta la agricultura
moderna son las condiciones medioambientales adversas. Un factor
importante que ocasiona pérdida significativa de la cosecha es el
estrés por calor. El estrés a la temperatura reduce en gran medida
el rendimiento de los granos en muchas cosechas de cereales tales
como el maíz, trigo, y cebada. El rendimiento disminuye debido al
estrés por calor en un intervalo de 7 a 35% en los cereales de
importancia mundial.
Numerosos estudios han identificado las
probables consecuencias fisiológicas del estrés por calor. Los
trabajos pioneros por Hunter et al. (Hunter, R. B.,
Tollenaar, M., y Breuer, C. M. [1977] Can. J. Plant Sci. 57:
1127-1133) utilizando condiciones de cámara de
crecimiento mostraron que la temperatura disminuyó la duración de
llenado del grano en el maíz. Resultados similares en los cuales la
duración de llenado del grano se alteró de manera adversa mediante
temperaturas incrementadas se identificaron por Tollenaar y
Bruulsema (Tollenaar, M. y Bruulsema, T. W. [1988] Can. J. Plant
Sci. 68: 935-940). Badu-Apraku et
al. (Badu-Apraku, B., Hunter, R. B., y
Tollenaar, M. [1983] Can. J. Plant. Sci. 63:
357-363) midieron una reducción notable en el
rendimiento del crecimiento de las plantas de maíz bajo el régimen
de temperatura de día/noche de 35/15ºC en comparación con el
crecimiento en un régimen de temperatura de 25/15ºC. Los
rendimientos reducidos debido a las temperaturas incrementadas
también están apoyados por los estudios históricos así como por
estudios climatológicos (Thompson, L. M. [1986] Agron. J. 78:
649-653; Thompson, L. M. [1975] Science 1988:
535-541; Chang, J. [1981] Agricul. Metero. 24:
253-262; y Conroy, J. P., Seneweera, S., Basra, A.
S., Rogers, G., y Nissen-Wooller, B. [1994] Aust. J.
Plant Physiol. 21: 741-758).
Es evidente que los procesos fisiológicos del
desarrollo de las semillas son afectados adversamente por el estrés
por calor a partir de los estudios utilizando un sistema de cultivo
de grano in vitro (Jones, R. J.,Gengenbach, B. G., y
Cardwell, V. B. [1981] Crop Science 21: 761-766;
Jones, R. J., Ouattar, S., y Crookston, R. K. [1984] Crop Science
24: 133-137; y Cheikh, N., y Jones, R. J. [1995]
Physiol. Plant. 95: 59-66). Los granos de maíz
cultivados a la temperatura óptima anteriormente mencionada de 35ºC
mostraron una reducción dramática del peso.
El trabajo con el trigo identificó la pérdida de
actividad de sintasas solubles del almidón (SSS) como un distintivo
de la respuesta del endospermo de trigo al estrés por calor (Hawker,
J. S. y Jenner, C. F. [1993] Aust. J Plant Physiol. 20:
197-209; Denyer, K., Hylton, C. M., y Smith, A. M.
[1994] Aust. J. Plant Physiol. 21: 783-789; Jenner,
C. F. [1994] Aust. J. Plant Physiol. 21: 791-806).
Los estudios adicionales con SSS del endospermo de trigo muestran
que es lábil al calor (Rijven, A. H. G. C. [1986] Plant Physiol. 81:
448-453; Keeling, P. L., Bacon, P. J., Holt, D. C.
[1993] Planta. 191: 342-348; Jenner, C. F., Denyer,
K., y Guerin, J. [1995] Aust. J. Plant Physiol. 22:
703-709).
Los papeles de SSS y de la
ADP-glucosa pirofosforilasa (AGP) bajo condiciones
de estrés por calor en el maíz son menos claros. (AGP) cataliza la
conversión de ATP y de
\alpha-glucosa-1-fosfato
a ADP-glucosa y pirofosfato.
ADP-glucosa se utiliza como un donante de glucosilo
en la biosíntesis del almidón por las plantas, y en la biosíntesis
de glucógeno por las bacterias. La importancia de la
ADP-glucosa pirofosforilasa como una enzima clave
en la regulación de la biosíntesis del almidón se evidenció en el
estudio de mutantes deficientes en la formación de almidón del
endospermo de maíz (Zea mays) (Tsai, C. Y., y Nelson, Jr., O.
E. [1966] Science 151: 341-343; Dickinson, D. B.,
J. Preiss [1969] Plant Physiol. 44: 1058-1062).
Ou-Lee y Setter
(Ou-Lee, T. y Setter, T. L. [1985] Plant Physiol.
79: 852-855) examinaron los efectos de la
temperatura sobre las regiones apicales o puntas de las mazorcas del
maíz. Con temperaturas elevadas, la actividad de AGP fue más baja
en los granos apicales cuando se comparó con los granos basales,
durante el tiempo de depósito intenso del almidón. Por el
contrario, en los granos que se desarrollaron a temperaturas
normales, la actividad de AGP fue similar en los granos apicales y
basales durante este periodo. No obstante, la actividad de sintasa
del almidón durante este periodo no se vio afectada de manera
diferencial en los granos apicales y basales. Adicionalmente, los
granos apicales tratados con calor mostraron un incremento en la
actividad de sintasa del almidón con respecto al control. Esto no
se observó con la actividad de AGP. Singletary et al.,
(Singletary, G. W., Banisadr, R., y Keeling, P. L. [1993] Plant
Physiol. 102: 6 (suplemento); Singletary, G. W., Banisadra, R.,
Keeling, P. L. [1994] Aust. J. Plant Physiol. 21:
829-841) utilizando un sistema de cultivo in
vitro cuantificaron el efecto de diversas temperaturas durante
el período de llenado del grano. El peso de las semillas disminuyó
de manera constante conforme la temperatura se incrementaba desde
22-36ºC. Un papel para AGP en la pérdida del
rendimiento también se apoya por el trabajo a partir de Duke y
Doehlert (Duke, E. R. y Doehlert, D. C. [1996] Environ. Exp.
Botany. 36: 199-208).
El trabajo por Keeling et al. (1994,
anteriormente mencionado) cuantificó la actividad de SSS en
el maíz y en el trigo utilizando análisis Q_{10}, y mostró que SSS
es un punto de control importante en el flujo del carbono dentro
del almidón.
Los estudios bioquímicos in vitro con AGP
y SSS muestran claramente que ambas enzimas son lábiles al calor.
La AGP del endospermo de maíz pierde 96% de su actividad cuando se
calienta a 57ºC durante cinco minutos (Hannah, L. C., Tuschall, D.
M., y Mans, R. J. [1980] Genetics 95: 961-970). Esto
está en contraste con la AGP de la patata, la cual es completamente
estable a 70ºC (Sowokinos, J. R. y Preiss, J. [1982] Plant Physiol.
69: 1459-1466; Okita, T. W., Nakata, P. A.,
Anderson, J. M., Sowokinos, J., Morell, J., y Preiss, J. [1990]
Plant Physiol. 93: 785-90). Los estudios de
inactivación mediante calor con SSS mostraron que ésta también es
lábil a temperaturas mayores, y los estudios cinéticos determinaron
que el valor Km para la amilopectina se elevó
exponencialmente cuando la temperatura se incrementó desde
25-45ºC (Jenner et al., 1995,
anteriormente mencionado).
Las pruebas bioquímicas y genéticas han
identificado a la AGP como una enzima clave en la biosíntesis del
almidón en las plantas superiores, y en la biosíntesis del glucógeno
en E. coli (Preiss, J. y Romeo, T. [1994] Progress in Nuc.
Acid Res. y Mol Biol. 47: 299-329; Preiss, J. y
Sivak, M. [1996] "Starch synthesis in sinks and sources," en
Photoassimilate distribution in plants and crops:
source-sink relationships. Zamski, E., ed., Marcil
Dekker Inc. p. 139-168). AGP cataliza lo que se ve
como el paso inicial en la ruta biosintética del almidón, siendo el
producto de la reacción el donante glucosilo activado, ADP glucosa.
Este se utiliza por la sintasa del almidón para la extensión del
polímero de polisacárido (revisado en Hannah, L. Curtis [1996]
"Starch synthesis in the maize endosperm," en Advances in
Cellular and Molecular Biology of Plants, Vol. 4. B. A. Larkins and
I. K. Vasil (editores). Cellular and Molecular Biology of Plant Seed
Development. Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, Países Bajos,
(en prensa)).
Los estudios iniciales con la AGP de la patata
mostraron que la expresión en E. coli produjo una enzima con
propiedades alostéricas y cinéticas muy similares a las de la enzima
nativa del tubérculo (Iglesias, A., Barry, G. F., Meyer, C.,
Bloksberg, L., Nakata, P., Greene, T., Laughlin, M. J., Okita, T.
W., Kishore, G. M., y Preiss, J. [1993] J. Biol Chem. 268:
1081-86; Ballicora, M. A., Laughlin, M. J., Fu, Y.,
Okita, T. W., Barry, G. F., y Preiss, J. [1995] Plant Physiol. 109:
245-251). Greene et al. (Greene, T. W.,
Chantler, S. E., Kahn, M. L., Barry, G. F., Preiss, J., y Okita, T.
W. [1996] Proc. Natl. Acad. Sci. 93: 1509-1513;
Greene, T. W., Woodbury, R. L., y Okita, T. W. [1996b] Plant
Physiol. (en prensa)) mostraron la utilidad del sistema de
expresión bacteriano en los estudios de
estructura-función con la AGP de la patata. Se
identificaron múltiples mutaciones importantes en el mapeo de los
sitios alostéricos y de unión al sustrato (Okita, T. W., Greene, T.
W., Laughlin, M. J., Salamone, P., Woodbury, R., Choi, S., Ito, H.,
Kavakli, H., y Stephens, K. [1996] "Engineering Plant Starches by
the Generation of Modified Plant Biosynthetic Enzymes," en
Engineering Crops for Industrial End Uses, Shewry, P. R., Napier,
J. A., y Davis, P., editores., Portland Press Ltd., Londres (en
prensa)).
Las enzimas AGP se han aislado tanto a partir de
bacterias como de plantas. La AGP bacteriana consiste en un
homotetrámero, mientras que la AGP vegetal procedente de tejidos
fotosintéticos y no fotosintéticos es un heterotetrámero compuesto
de dos subunidades diferentes. La enzima vegetal está codificada por
dos genes diferentes, siendo una subunidad más grande que la otra.
Esta característica se ha evidenciado en numerosas plantas. Las
subunidades de la AGP en la hoja de espinaca tienen pesos
moleculares de 54 kDa y 51 kDa, según se estima mediante
SDS-PAGE. Ambas subunidades son inmunorreactivas con
anticuerpos generados contra AGP purificada procedente de hojas de
espinaca (Copeland, L., J. Preiss (1981) Plant Physiol. 68:
996-1001; Morell, M., M. Bloon, V. Knowles, J.
Preiss [1988] J. Biol. Chem. 263: 633). El análisis inmunológico
utilizando antisuero preparado contra las subunidades pequeña y
grande de la hoja de espinaca mostró que la AGP del tubérculo de la
patata también está codificada por dos genes.(Okita et al.,
1990, anteriormente mencionado). También se han aislado y
secuenciado los clones de ADNc de las dos subunidades del tubérculo
de la patata (50 y 51 kDa) (Muller-Rober, B. T., J.
Kossmann, L. C. Hannah, L. Willmitzer, U. Sounewald [1990] Mol. Gen.
Genet. 224: 136-146; Nakata, P. A., T. W. Greene,
J. M. Anderson, B. J. Smith-White, T. W. Okita, J.
Preiss [1991] Plant Mol. Biol. 17: 1089-1093). La
subunidad grande de la AGP del tubérculo de la patata es estable al
calor (Nakata et al. [1991], anteriormente
mencionado).
Como postularon Hannah y Nelson (Hannah, L. C.,
O. E. Nelson (1975) Plant Physiol. 55: 297-302.;
Hannah, L. C., y Nelson, Jr., O. E. [1976] Biochem. Genet. 14:
547-560), tanto Shrunken-2
(Sh2) (Bhave, M. R., S. Lawrence, C. Barton, L. C. Hannah
[1990] Plant Cell 2: 581-588) como
Brittle-2 (Bt2)(Bae, J.M., M. Giroux,
L.C. Hannah [1990] Maydica 35: 317-322) son genes
estructurales de la ADP-glucosa pirofosforilasa del
endospermo del maíz. Sh2 y Bt2 codifican la subunidad
grande y subunidad pequeña de la enzima, respectivamente. A partir
de la secuenciación del ADNc, se ha pronosticado el peso molecular
de las proteínas Sh2 y Bt2 de 57.179 Da (Shaw, J.R.,
L.C. Hannah [1992] Plant Physiol. 98: 1214-1216) y
52.224 Da, respectivamente. El endospermo es el sitio de mayor
deposición de almidón durante el desarrollo del grano de maíz. Los
mutantes del endospermo de maíz Sh2 y bt2 tienen
niveles de almidón reducidos en gran medida, que corresponden a
niveles deficientes de actividad de AGP. Se ha mostrado que las
mutaciones de cualquier gen reducen la actividad de AGP en
aproximadamente 95% (Tsai y Nelson, 1966, anteriormente
mencionado; Dickinson y Preiss, 1969, anteriormente
mencionado). Además, se ha observado que las actividades
enzimáticas se incrementan con la dosis de alelos funcionales de
tipo salvaje Sh2 y Bt2, mientras que las enzimas
mutantes tienen propiedades cinéticas alteradas. La AGP es la etapa
limitante de velocidad en la biosíntesis de almidón en las plantas.
Stark et al. colocaron una forma mutante de la AGP de E.
coli en el tubérculo de la patata, y obtuvieron un incremento
del 35% en el contenido de almidón (Stark et al. [1992]
Science 258: 278).
Se ha dado a conocer para diversas plantas la
clonación y caracterización de los genes que codifican las
subunidades de la enzima AGP. Estas incluyen el ADNc de Sh2
(Bhave et al., 1990, anteriormente mencionado), el
ADN genómico de Sh2 (Shaw y Hannah, 1992, anteriormente
mencionado), y el ADNc de Bt2 (Bae et al., 1990,
anteriormente mencionado) procedentes del maíz; el ADNc de la
subunidad pequeña (Anderson, J. M., J. Hnilo, R. Larson, T. W.
Okita, M. Morell, J. Preiss [1989] J. Biol. Chem. 264:
12238-12242) y el ADN genómico (Anderson, J. M., R.
Larson, D. Landencia, W. T. Kim, D. Morrow, T. W. Okita, J. Preiss
[1991] Gene 97: 199-205) procedentes del arroz; y
los ADNc de las subunidades pequeña y grande procedentes de la hoja
de espinaca (Morell et al., 1988, anteriormente
mencionado) y del tubérculo de la patata
(Muller-Rober et al., 1990, anteriormente
mencionado; Nakata, P. A., Greene, T. W., Anderson, J. W.,
Smith-White, B. J., Okita, T. W., y Preiss, J.
[1991] Plant Mol. Biol. 17: 1089-1093). Además, se
han aislado clones de ADNc a partir del endospermo y del tejido de
la hoja de trigo (Olive, M. R., R. J. Ellis, W. W. Schuch [1989]
Plant Physiol. Mol. Biol. 12: 525-538) y de la hoja
de Arabidopsis thaliana (Lin, T., Caspar, T., Sommerville,
C. R., y Preiss, J. [1988] Plant Physiol.
88:1175-1181).
La AGP funciona como una enzima alostérica en
todos los tejidos y organismos investigados hasta la fecha.
Inicialmente se mostró que las propiedades alostéricas de la AGP
eran importantes en E. coli. Se aisló un mutante de E.
coli que sobreproduce glucógeno, y la mutación se mapeó hasta el
gen estructural para AGP, designado como glyC. Se mostró que
la E. coli. mutante, conocida como
glyC-16, era más sensible al activador,
fructosa-1,6-bisfosfato, y menos
sensible al inhibidor, AMPc (Preiss, J. [1984] Ann. Rev. Microbio.
419-458). A pesar de que las AGP vegetales también
son alostéricas, éstas responden a diferentes moléculas efectoras
que las AGP vegetales. En las plantas, el ácido
3-fosfoglicérico (3-PGA) funciona
como un activador, mientras que el fosfato (PO_{4}) sirve como un
inhibidor (Dickinson y Preiss, 1969, anteriormente
mencionado).
Utilizando un sistema de mutagénesis in
vivo creado por la escisión mediada por Ac de un elemento
transponible Ds fortuitamente localizado de manera cercana a
un sitio conocido de unión a activador, Giroux et al.
(Giroux, M. J., Shaw, J., Barry, G., Cobb, G. B., Greene, T., Okita,
T. W., y Hannah, L. C. [1996] Proc. Natl. Acad. Sci. 93:
5824-5829) fueron capaces de generar mutantes
específicos del sitio en una región funcionalmente importante de la
AGP del endospermo de maíz. Un mutante, Rev 6, contenía un
inserto de tirosina-serina y condicionó un
incremento de
11-18% del peso de la semilla.
11-18% del peso de la semilla.
El documento WO91/11520 describe el uso de
formas modificadas de polinucleótidos que codifican AGP que tienen
una estabilidad mejorada al calor, para potenciar la producción de
almidón en una planta, por ejemplo Zea mays.
Charing et al., [1994], J. Biol. Chem.
269(39):214107-24113, describe la preparación
de un mutante de AGP de la hoja de espinaca, que se denomina allí
como "K419R", y que retiene más actividad que la enzima de
tipo salvaje después del tratamiento con calor a 60ºC durante 5
minutos.
Greene et al., [1996], PNAS USA
93:1509-1513, describe una mutación de aminoácido
que aumenta el peso de la semillas.
Según un aspecto de la presente invención, un
polinucleótido que codifica un polipéptido de ADP glucosa
fosforilasa (AGP) vegetal mutante comprende una mutación de
aminoácido en su subunidad grande, y muestra un aumento de
estabilidad al calor con relación a un polipéptido de AGP de tipo
salvaje, en el que la mutación comprende la sustitución del
aminoácido correspondiente a His-333,
Ala-177, Asp-400,
Val-454, Arg-104,
Thr-460 o Arg-216 en maíz. Otros
aspectos de la invención son un método para aumentar la resistencia
de una planta al calor, plantas transformadas y tejido vegetal, y
un polipéptido de AGP mutante.
Esta invención proporciona enzimas estables al
calor que se pueden usar para proporcionar plantas que tienen una
mayor tolerancia a temperaturas más elevadas, potenciando así la
producción de la cosecha de estas plantas. En una realización
particularmente preferida, la planta mejorada es un cereal. Los
cereales a los que se aplica esta invención incluyen, por ejemplo,
maíz, trigo, arroz y cebada.
Figura 1. Mutantes de la subunidad grande de la
AGP del endospermo de maíz estables al calor. Se muestra el
porcentaje de actividad de la AGP remanente después de cinco minutos
de tratamiento con calor a 60ºC.
Figura 2. Alineamiento de secuencia primaria de
la región que rodea a la mutación HS 33 con subunidades grandes de
maíz, trigo, cebada, y patata. Se recuadran las regiones
conservadas.
Figura 3. Alineamiento de secuencia primaria de
la región que rodea a la mutación HS 40 con subunidades grandes de
maíz, trigo, cebada, y patata. Se recuadran las regiones
conservadas. El resto de ácido aspártico en negrita corresponde al
mutante alostérico D413A de la patata LS (Greene, T. W., Woodbury,
R. L., y Okita, T. W. [1996] Plant Physiol. (en prensa). La
secuencia de la AGP de la hoja de espinaca es el péptido del sitio 2
del activador identificado en estudios con análogos de
3-PGA (Ball, K. y Preiss, J. [1994] J. Biol. Chem.
269: 24706-24711). El resto marcado de lisina se
encuentra en negrita.
La presente invención se refiere a nuevas
moléculas polinucleotídicas mutantes, y a los polipéptidos
codificados por las mismas, que confieren un rendimiento
incrementado en el crecimiento vegetal bajo condiciones de estrés
por calor, con relación a las plantas que tienen el genotipo de tipo
salvaje. En realizaciones específicas, las moléculas
polinucleotídicas de la presente invención codifican las actividades
de las enzimas ADP glucosa pirofosforilasa (AGP) del endospermo de
maíz y de la sintasa soluble del almidón (SSS). Las enzimas mutantes
confieren aumento de estabilidad de las semillas a las condiciones
de estrés por calor durante el desarrollo de las semillas, en
comparación con las actividades de las enzimas de tipo salvaje.
En una forma de realización, un polinucleótido
mutante de la presente invención codifica una subunidad grande de
la AGP que contiene una sustitución de aminoácidos de histidina a
tirosina en la secuencia del polipéptido. Esta sustitución se
produce en el resto número 333 de los aminoácidos, según el número
aceptado de los aminoácidos en esta proteína (Shaw y Hannah,
1992, anteriormente mencionado). La posición de esta
sustitución se puede identificar fácilmente por una persona experta
en la técnica. Una segunda mutación ejemplificada en la presente
invención es una sustitución de treonina a isoleucina en la posición
número 460 de la proteína AGP. A continuación se muestran en la
Tabla 1 mutantes adicionales que confieren un aumento de estabilidad
al calor.
Los clones de ADNc para las subunidades de la
AGP del endospermo de maíz (SH2 y BT2) y una cepa de E.
coli deficiente en la AGP bacteriana endógena
(glg C^{-})(AC70R1-504) han
facilitado el establecimiento de un sistema de expresión bacteriano
para estudiar a la AGP del endospermo del maíz. La expresión de una
subunidad particular es incapaz de complementar el mutante
glg C^{-}, y no se produce glucógeno (Iglesias, A., Barry,
G.F., Meyer, C., Bloksberg, L., Nakata, P., Greene, T., Laughlin,
M. J., Okita, T. W., Kishore, G. M., y Preiss, J. [1993] J. Biol
Chem. 268: 1081-86). No obstante, la expresión
tanto de las subunidades grande como pequeña en vectores de
expresión compatibles complementa completamente la mutación
glg C^{-} y restablece la producción de glucógeno como se
evidencia por una tinción oscura, café rojiza de las colonias
expuestas a yodo. Por lo tanto, la complementación se identifica
fácilmente mediante la simple exposición de las colonias al
yodo.
En una forma de realización, se utilizaron las
células glg C^{-} de E. coli que expresan los genes
estructurales ya sea para la AGP del endospermo de patata o de maíz.
Las células que contenían los genes de la AGP de patata pueden
sintetizar niveles abundantes de glucógeno cuando se hacen crecer a
37º o a 42ºC. No obstante, las células que expresan la AGP del
endospermo de maíz solamente sintetizan glucógeno a 37ºC. Este
resultado demuestra la sensibilidad al calor de la AGP del
endospermo de maíz de tipo salvaje. El hecho de que haya una
diferencia entre las AGP de patata y de maíz proporciona a este
respecto un sistema eficiente para seleccionar células mutantes que
tienen variantes estables al calor de la AGP del endospermo de
maíz.
Un aspecto de la presente invención se refiere a
la identificación eficiente de la AGP la cual es estable al calor.
Por consiguiente, se mutagenizó químicamente un plásmido que
comprende un polinucleótido que codifica la subunidad SH2 de la AGP
de maíz, como se describe a continuación, colocado en células
mutantes de E. coli que expresan la subunidad BT2, y se hizo
crecer a 42ºC. También se pueden usar otros mutágenos conocidos en
la técnica. Se aislaron once mutantes heredables, que se tiñen con
yodo, denominados mutantes estables al calor (HS). Se prepararon
los extractos sin purificar de estos mutantes, y se monitorizó la
estabilidad al calor de la AGP resultante. Los mutantes retuvieron
entre 8-59% de su actividad después de la incubación
a 60ºC durante cinco minutos (figura 1). Esto se compara con el
1-4% observado habitualmente para la AGP de tipo
salvaje a esta temperatura.
Los resultados muestran que las formas estables
al calor de las enzimas se pueden crear según la presente invención
mediante mutación. De manera inesperada, la actividad total de la
AGP del endospermo de maíz antes del tratamiento con calor se elevó
alrededor de 10 veces en la mayoría de estos mutantes. Este
resultado sorprendente hace a estos mutantes particularmente
ventajosos para uso en agricultura. Las técnicas de mutagénesis como
se describen en la presente invención se pueden usar según la
presente invención para identificar otros genes que codifican
enzimas de la biosíntesis del almidón estables al calor.
Se secuenciaron completamente los genes que
codifican varios de los mutantes estables al calor, incluyendo los
dos mutantes HS más estables al calor, HS 33 y HS 40. HS 33, que
retiene 59% de su actividad después del tratamiento con calor,
contiene una mutación de un solo par de bases que cambia un resto de
histidina en la posición 333 de la secuencia de aminoácidos del
polipéptido por una tirosina (figura 2). Los alineamientos de la
secuencia primaria con las subunidades grandes a partir de las AGP
de trigo y de cebada muestran que también está presente una
histidina en el resto análogo (figura 3) (Ainsworth, C., Hosein, F.,
Tarvis, M., Weir, F., Burrell, M., Devos, K. M., Gale, M. D. [1995]
Planta 197: 1-10). El análisis de secuencia de HS
40, que retiene 41% de su actividad después del tratamiento con
calor, también contenía una mutación de histidina a tirosina en la
posición 333. Se identificó una mutación puntual adicional que
generó una sustitución de treonina a isoleucina. El resto de
treonina está altamente conservado en las subunidades grandes de la
AGP, mientras que en las subunidades pequeñas de la AGP el resto
análogo es una cisteína o una serina (Ainsworth et al.,
1995, anteriormente mencionado). La sustitución de treonina a
isoleucina se localiza próxima al término carboxilo de la subunidad
grande, y próxima a un sitio de unión conocido para el activador
3-PGA (figura 3).
La presente invención también se refiere a
mutantes de la AGP estables al calor que tienen mutaciones en la
subunidad pequeña de la enzima. También se engloban dentro del
alcance de la invención polinucleótidos que codifican las
subunidades mutantes pequeñas de la AGP. También se pueden preparar
fácilmente e identificar utilizando los métodos de la presente
invención mutaciones en la subunidad pequeña de la AGP que confieren
estabilidad al calor a la enzima.
También se contemplan mediante la presente
invención las plantas y los tejidos vegetales procreados para que
contengan, o que se transformen con, los polinucleótidos mutantes, y
que expresen los polipéptidos codificados por los polinucleótidos.
Las plantas y los tejidos vegetales que expresan los polinucleótidos
mutantes producen tejidos que tienen, por ejemplo, una menor
pérdida inducida por calor del peso o del rendimiento cuando se
someten a estrés por calor durante el desarrollo.
La presente invención también se refiere a
métodos para producir e identificar polinucleótidos y polipéptidos
contemplados dentro del alcance de la invención. En una forma de
realización, se puede usar una mutación génica, seguido de la
selección usando un sistema de expresión bacteriano, para aislar
moléculas polinucleotídicas que codifican enzimas que pueden
aliviar la pérdida inducida por calor de la síntesis de almidón en
las plantas.
La presente invención se refiere además a
plantas y a tejido vegetal que tienen un gen mutante de AGP
incorporado en su genoma. También se pueden incorporar en un genoma
vegetal otros alelos descritos aquí. En una realización preferida,
la planta es una planta de cereal. Más preferiblemente, la planta es
Za mays. Las plantas que tienen un gen mutante de AGP se
pueden hacer crecer a partir de semillas que comprenden un gen
mutante en su genoma. Además, se conocen en la técnica técnicas
para transformar plantas con un gen.
Debido a la degeneración del código genético,
una variedad de diferentes secuencias polinucleotídicas puede
codificar cada una de las variantes polipeptídicas de la AGP
descritas en la presente invención. Además, se encuentra dentro de
la capacidad de una persona experta en la técnica el crear
secuencias polinucleotídicas alternativas que codifica el mismo
polipéptido, o esencialmente el mismo polipéptido, de la presente
invención. Estas secuencias polinucleotídicas variantes o
alternativas están dentro del alcance de la presente invención.
Como se usa en la presente invención, las referencias a
"esencialmente la misma" secuencia se refiere a las secuencias
que codifican las sustituciones, supresiones, adiciones o
inserciones de aminoácidos, que no alteran materialmente la
actividad funcional del polipéptido codificado por el polipéptido
mutante de la AGP descrito en la presente invención.
También se contempla dentro del alcance de la
presente invención la sustitución de aminoácidos diferentes a
aquellos específicamente ejemplificados en los mutantes descritos en
la presente invención. Los aminoácidos se pueden colocar en las
siguientes clases: no polar, polar no cargado, básico, y ácido. Las
sustituciones conservativas mediante las cuales un polipéptido
mutante de la AGP que tiene un aminoácido de una clase se sustituye
por otro aminoácido de la misma clase caen dentro del alcance de la
presente invención siempre y cuando el polipéptido mutante de la
AGP que tiene la sustitución aún retenga estabilidad incrementada al
calor con relación a un polipéptido de tipo salvaje. La Tabla 2 a
continuación proporciona una lista de los ejemplos de aminoácidos
que pertenecen a cada clase.
Por ejemplo, la sustitución de la tirosina en la
posición 333 en el mutante HS 33, HS 39, HS 40 y HS 47 de la AGP
del endospermo de maíz por otros aminoácidos, tales como Glicina,
Serina, Treonina, Cisteína, Asparagina, y Glutamina, están
comprendidas dentro del alcance de la presente invención.
La presente invención también se refiere a
polinucleótidos que codifican fragmentos del polipéptido mutante de
longitud completa, siempre y cuando aquellos fragmentos retengan
sustancialmente la misma actividad funcional que el polipéptido de
longitud completa. También se encuentran dentro del alcance de la
presente invención los fragmentos del polipéptido mutante de la AGP
codificados por estos polinucleótidos.
La presente invención también comprende aquellas
moléculas polinucleotídicas que tienen secuencias que son
suficientemente homólogas con la secuencia de ADN de Sh2 de
tipo salvaje de manera que permita la hibridación con esa secuencia
en condiciones estándares muy restrictivas. Dichas condiciones de
hibridación son convencionales en la técnica (véase, por
ejemplo, Maniatis, T., E. F. Fritsch, J. Sambrook [1989]
Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2ª edición, Cold Spring
Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, Nueva York).
Las moléculas polinucleotídicas de la presente
invención se pueden usar para transformar plantas para expresar en
aquellas plantas la enzima AGP mutante estable al calor. Además, los
polinucleótidos de la presente invención se pueden utilizar para
expresar la enzima AGP variante recombinante. Estos también se
pueden utilizar como sondas para detectar enzimas relacionadas. Los
polinucleótidos también se pueden utilizar como estándares de tamaño
de ADN.
Las moléculas polinucleotídicas de la presente
invención también incluyen aquellos polinucleótidos que codifican
enzimas AGP que confieren un aumento de peso a la semilla, además de
estabilidad mejorada al calor, a una planta. La combinación de una
mutación estabilizante al calor, HS 40, con una mutación que
confiere un aumento de peso a la semilla, por
ejemplo, Rev6, está contemplada específicamente en la
presente invención. Véase, por ejemplo, las patentes U.S. Nº
5.589.618 y 5.650.557.
Las mutaciones en las subunidades de AGP que
confieren estabilidad al calor se pueden combinar según la presente
invención con mutantes del maíz insensibles al fosfato, tal como la
mutación Rev6, para mejorar la estabilidad de la subunidad
grande codificada por Rev6.
Se espera que la actividad enzimática de SSS se
dañará a mayor temperatura, según se observó con AGP. De este modo,
las formas mutagenizadas de SSS se pueden expresar en condiciones
térmicas incrementadas (42ºC), para aislar variantes estables al
calor. Estas formas mutagenizadas estables al calor de SSS son
aspectos adicionales de la presente invención.
Todas las publicaciones y patentes citadas aquí
se incorporan aquí como referencia.
A continuación se proporcionan ejemplos que
ilustran procedimientos para poner en práctica la invención. Estos
ejemplos no deben considerarse como limitativos. Todos los
porcentajes están en peso, y todas las proporciones de las mezclas
de disolventes están en volumen excepto que se indique de otra
manera.
Se utilizó inicialmente el mutágeno químico
hidroxilamina-HCl para la mutagénesis al azar del
plásmido de expresión de la subunidad grande. La hidroxilamina
hidroxila preferiblemente el nitrógeno del amino en la posición
C-4 de la citocina, y conduce a una transición de GC
a AT (Suzuki, D. T., Griffith, A. J. F., Miller, J. H., y Lewontin,
R. C. [1989] en Introduction to genetic analysis, Freeman, NY, 4ª
edición, p. 475-499). El mutágeno químico se eligió
por su alta frecuencia de mutación. Se reconocen limitaciones del
mutágeno químico, y si no se aísla una gran variedad de variantes
genéticas, se puede llevar a cabo la mutagénesis al azar basada en
PCR. La mutagénesis mediante PCR genera un espectro de mutaciones
más amplio que incluyen frecuencias similares de transiciones y
transversiones, y proporciona una excelente alternativa al método
químico. Se puede seguir el método descrito por Cadwell y Joyce
(Cadwell, R. C. y Joyce, G. F. [1992] PCR Methods and Applications
2: 28-33) para el método basado en PCR.
Puesto que se usa el plásmido de expresión
completo en la mutagénesis al azar, es posible que se produzcan
mutaciones fuera de la región codificante. A pesar de que se espera
que dichas mutaciones no tendrán ningún efecto sobre la estabilidad
al calor de la AGP del endospermo de maíz, cada variante se puede
subclonar dentro de un plásmido de expresión sin mutar, antes de
realizar cualquier caracterización adicional a nivel enzimático.
Tanto los plásmidos de expresión de la subunidad pequeña como de la
subunidad grande se pueden construir de manera que una digestión de
NcoI/SacI liberará la región codificante completa.
Esta se puede clonar fácilmente de nuevo dentro de un plásmido de
expresión sin mutar digerido con Ncol/Sacl.
Inicialmente, se obtuvieron 11 variantes
estables al calor de la subunidad grande del endospermo del maíz.
Se han secuenciado completamente 2. La secuenciación se llevó a cabo
utilizando equipo de instrumentos DuPont y ABI.
\newpage
Los datos de secuencias se pueden comparar
habitualmente con el alelo progenitor de tipo salvaje. Este análisis
revela el grado de diversidad de los cambios que condicionan la
estabilidad al calor.
Varios de los mutantes HS secuenciados contienen
el cambio idéntico de histidina a tirosina en la subunidad grande.
Los mutantes HS derivados mediante PCR se pueden seleccionar
rápidamente en busca de la alteración de histidina a tirosina,
mediante el uso de mutagénesis específica del sitio usando cebadores
que cambian la tirosina nuevamente por histidina.
Se han caracterizado completamente las
condiciones para la expresión de la AGP del endospermo del maíz de
tipo salvaje en E. coli. Las condiciones óptimas de
crecimiento e inducción varían en cierto modo a partir de aquellas
previamente publicadas para la AGP de la patata expresada en E.
coli (Iglesias et al., 1993, anteriormente
mencionado; Ballicora et al., 1995, anteriormente
mencionado). La inducción a temperatura ambiente durante
12-14 h en presencia de IPTG 0,3 mM y 25 \mug/ml
de ácido nalidíxico produce de manera consistente niveles elevados
de expresión y de actividad. La adición de sulfato de amonio al 30%
y de KH_{2}PO_{4}^{-}/K_{2}HPO_{4}^{-} 10 mM al tampón
de extracción estabiliza la AGP del maíz en el extracto sin
purificar.
La AGP concentrada con el sulfato de amonio se
purificó adicionalmente mediante cromatografía de interacción
hidrófoba utilizando medio Tentacle C3 aminopropilo (EM Separations)
empaquetado en una columna de HR 10/10 de Pharmacia. La proteína se
une a la columna en un tampón que contiene sulfato de amonio 1 M. La
AGP se eluye de la columna mediante etapas sucesivas de gradientes
de lavados con un tampón que contiene sulfato de amonio 0,75
M,
0,5 M, 0,25 M, y 0 M. La AGP del endospermo de maíz de tipo salvaje eluye típicamente en el lavado de 0,25 M.
La AGP del endospermo de maíz purificada mediante C3 se purifica adicionalmente mediante cromatografía de intercambio aniónico utilizando medio para intercambio aniónico Macro-Prep DEAE (BioRad) empaquetado dentro de una columna HR 10/10 de Pharmacia. La AGP se eluye mediante un gradiente lineal de KCl de 100-500 mM, y típicamente eluye a una concentración de sal de alrededor de 300 mM. Para todas las etapas de cromatografía se uso un sistema FPLC de Pharmacia. Las condiciones para las etapas de purificación individuales se caracterizaron completamente. La actividad de la AGP durante la purificación se monitorizó mediante el ensayo de pirofosforilisis, y las etapas de purificación se monitorizaron mediante SDS-PAGE, tinción de Coomassie, y análisis Western utilizando anticuerpos policlonales específicos para las unidades grande y pequeña de la AGP del endospermo de maíz.
0,5 M, 0,25 M, y 0 M. La AGP del endospermo de maíz de tipo salvaje eluye típicamente en el lavado de 0,25 M.
La AGP del endospermo de maíz purificada mediante C3 se purifica adicionalmente mediante cromatografía de intercambio aniónico utilizando medio para intercambio aniónico Macro-Prep DEAE (BioRad) empaquetado dentro de una columna HR 10/10 de Pharmacia. La AGP se eluye mediante un gradiente lineal de KCl de 100-500 mM, y típicamente eluye a una concentración de sal de alrededor de 300 mM. Para todas las etapas de cromatografía se uso un sistema FPLC de Pharmacia. Las condiciones para las etapas de purificación individuales se caracterizaron completamente. La actividad de la AGP durante la purificación se monitorizó mediante el ensayo de pirofosforilisis, y las etapas de purificación se monitorizaron mediante SDS-PAGE, tinción de Coomassie, y análisis Western utilizando anticuerpos policlonales específicos para las unidades grande y pequeña de la AGP del endospermo de maíz.
Un efecto pleiotrópico completamente inesperado
de los mutantes de la AGP del endospermo de maíz HS es una
elevación de dos veces de la actividad antes del tratamiento con
calor. Una posible explicación para este resultado es que tenemos,
mediante cambio mutacional, un desplazamiento de la relación de
monómeros y polímeros de SH2 y BT2 que existen dentro de la célula
de E. coli. Tal vez, en el tipo salvaje, solamente 10% o
menos de las proteínas totales existen en la forma heterotetramérica
activa, mientras que, en los mutantes, este porcentaje es mucho
mayor. Si el polímero es más resistente al calor que los monómeros,
entonces el fenotipo de los mutantes podría ser idéntico a lo que
se ha observado. El análisis cinético se puede usar para determinar
cambios en las afinidades por sustratos y/o éfectores
alostéricos.
Para probar la idea de que la relación del
monómero/polímero se puede alterar en estos mutantes, se pueden
monitorizar las cantidades de monómeros y polímeros en el tipo
salvaje y en los mutantes seleccionados tanto antes como después
del tratamiento con calor. La disponibilidad de los anticuerpos
(Giroux, M.J. y Hannah, L. C. [1994] Mol. Gen. Genetics 243:
400-408) para ambas subunidades hace posible este
enfoque. Esto se puede examinar tanto a través de
ultracentrifugación en un gradiente de sacarosa como a través de
cromatografía en gel, y determinará fácilmente qué método es más
eficiente y definitivo.
Puesto que la AGP de plantas superiores consiste
en dos subunidades similares pero distintas que se oligomerizan
para formar la estructura heterotetramérica nativa, las mutaciones
que mejoran esta interacción pueden proporcionar estabilidad
añadida a la enzima. Se puede usar un sistema de dos híbridos de
levadura (CLONTECH Laboratories, Palo Alto, CA) para evaluar las
interacciones de las subunidades. Se pueden construir cebadores
específicos para la amplificación de las regiones codificantes.
Estos cebadores añaden sitios de restricción únicos a los extremos
5' y 3' de manera que la clonación facilita la fusión traduccional
de la subunidad individual al dominio de unión del ADN de GAL4
(pGBT9) o al dominio de activación GAL4 (pGAD424). Si las proteínas
clonadas en los vectores interaccionan, el dominio de unión al ADN
y el dominio de activación formarán un activador de la
transcripción funcional. Esto a su vez activa la expresión del gen
informador, lac Z, clonado detrás de un promotor GAL4.
Inicialmente, las condiciones se pueden
caracterizar con las subunidades de tipo salvaje. Las regiones
codificantes de las subunidades grande y pequeña de tipo salvaje se
pueden clonar en los vectores de expresión de levadura pGBT9 y
pGAD424. Se pueden generar y evaluar todas las posibles
combinaciones. Los vectores pGBT9 y pGAD424 que contienen
Sh2 y Bt2 se pueden cotransformar de la misma cepa de
levadura, y se pueden seleccionar en busca del crecimiento en medio
que carece de triptófano (pGBT9) y leucina (pGAD424). La interacción
de la subunidad como una función de la expresión de lacZ se puede
detectar de dos maneras. Las colonias positivas se identifican
visualmente mediante un ensayo de filtro con
B-galactosidasa. Con este ensayo las colonias se
unen al filtro, se lisan, y se incuban con una disolución de
X-gal. Se pueden analizar colonias que exhiben un
color azul. La interacción de la subunidad se puede analizar
adicionalmente mediante un ensayo enzimático específico para
B-galactosidasa. Esto permite la cuantificación de
la interacción. Las mutaciones que mejoran las interacciones de las
subunidades producirán niveles más elevados de actividad de la
B-galactosidasa cuando se ensayan.
Los mutantes de la subunidad grande aislados
varían en sus características de estabilidad al calor, sugiriendo
la posibilidad de múltiples mutaciones. A pesar de que el análisis
de secuencia de los mutantes HS 33 y HS 40 revela que las
secuencias mutantes no son idénticas, ambos mutantes contenían el
cambio idéntico de histidina a tirosina. Dada la identificación de
diferentes alteraciones HS dentro de la proteína SH2, es posible
construir eficientemente estos cambios dentro de una proteína.
Además, cualesquiera de las mutaciones HS dentro de la subunidad
pequeña se pueden coexpresar con los mutantes HS SH2 para mejorar
adicionalmente la estabilidad de la enzima del endospermo de
maíz.
Se pueden combinar fácilmente múltiples mutantes
HS dentro de una subunidad. Por ejemplo, se pueden utilizar
diferentes sitios de restricción únicos que dividen las regiones
codificantes de Sh2 en tres fragmentos distintos. Cuando sea
apropiado, se pueden generar combinaciones de mutaciones subclonando
el fragmento correspondiente que contiene la mutación añadida. Si
dos mutaciones se encuentran en estrecha proximidad, entonces se
puede usar la mutagénesis dirigida al sitio para diseñar dichas
combinaciones. Un método para mutaciones específicas del sitio
implica PCR, cebador mutagénico, y el uso de la endonucleasa de
restricción DpnI. Se pueden construir cebadores que
contengan la mutación en el extremo 5', y se puede usar para
amplificar mediante PCR utilizando la polimerasa Vent de corrección
de lectura. El ADN amplificado se puede digerir entonces con
Dpnl. El ADN progenitor aislado de E. coli se metila
y por lo tanto es susceptible a Dpnl. El ADN digerido se
fracciona por tamaños mediante electroforesis en gel, se liga, y se
clona en de los vectores de expresión. Las mutaciones se confirman
mediante análisis de secuencia, y se transforman en la cepa
AC70R1-504 que porta la subunidad pequeña de tipo
salvaje. Después, se pueden analizar los mutantes combinatorios.
Según la presente invención, las mutaciones
estables al calor se pueden combinar con una mutación asociada con
el peso incrementado de la semilla, tal como, por ejemplo, la
mutación Rev6. El objetivo es mantener la característica de
insensibilidad al fosfato de Rev6 a la vez que se mejora su
estabilidad. Se pueden construir mutantes dobles Rev6/HS, y
confirmar como se describe en la presente invención. Los mutantes
dobles se pueden transformar en AC70R1-504 que
porta la subunidad pequeña de tipo salvaje. La estabilidad
incrementada al calor se puede identificar fácilmente mediante una
tinción positiva al glucógeno en un medio con bajo contenido de
glucosa. Rev6 no se tiñe cuando se hace crecer en este medio.
Inicialmente, todas las combinaciones de mutantes se pueden
seleccionar enzimáticamente buscando el mantenimiento de la
insensibilidad al fosfato, y solamente se analizan adicionalmente
las combinaciones que mantienen la insensibilidad al fosfato.
Se puede obtener una cepa de glg A^{-}
E. coli, deficiente en la glucógeno sintasa bacteriana
endógena, a partir de E. coli Stock Center. Los vectores de
expresión bacteriana habitualmente usados para la expresión de AGP
se pueden usar para la expresión de SSS.
Una estrategia de clonación, como se utiliza,
por ejemplo, con Sh2 y Bt2 (Giroux et al.,
1996, anteriormente mencionado), es la siguiente: un cebador
contiene un sitio de restricción único más el término 5' del
transcrito, mientras que el otro cebador contiene otro sitio de
restricción único y las secuencias 3' con relación al codón de
terminación de la traducción del gen bajo investigación. La
clonación subsiguiente de estos produce la fusión traduccional
dentro del plásmido. Estos cebadores específicos del gen se utilizan
inicialmente en las reacciones de RT-PCR usando
poli A+ARN a partir de los endospermos en desarrollo.
La expresión de la SSS I del endospermo de maíz
complementará la ausencia de la actividad de la glucógeno sintasa
en la cepa glg A^{-}. La complementación se debería de
visualizar fácilmente con tinción con yodo como ocurre con la
expresión de AGP en la cepa glg C^{-}. Los extractos sin
purificar se pueden incubar a diversas temperaturas y longitudes de
tiempo para determinar la estabilidad al calor de la SSS I. La cepa
glg A^{-}que expresa la SSS I del endospermo del
maíz se puede hacer crecer a diversas temperaturas para determinar
si la función es sensible a la temperatura al igual que con el
sistema de expresión bacteriana de la AGP. Una vez que se establece
una temperatura restrictiva, se puede llevar a cabo una mutagénesis
al azar con el clon de SSS I. Las formas mutantes de SSS I se
pueden transformar dentro de la cepa glg A^{-}, que
se hacen crecer a la temperatura restrictiva, y las variantes
estables al calor se pueden identificar por su capacidad para
producir a la temperatura de restricción glucógeno que se tiñe con
yodo.
Claims (33)
1. Polinucleótido que codifica un polipéptido de
ADP glucosa fosforilasa (AGP) vegetal mutante, que comprende una
mutación de aminoácido en su subunidad grande y que muestra un
aumento de estabilidad al calor con relación a un polipéptido de
AGP de tipo salvaje, en el que la mutación comprende la sustitución
del aminoácido correspondiente a His-333,
Ala-177, Asp-400,
Val-454, Arg-104,
Thr-460 o Arg-216 en maíz.
2. Polinucleótido según la reivindicación 1, en
el que el polipéptido mutante es AGP del endospermo de maíz.
3. Polinucleótido según la reivindicación 1 ó 2,
en el que el polipéptido mutante retiene 8-59% de
actividad cuando se coloca en células de E. coli que
expresan la subunidad BT2 y se hacen crecer a 60ºC durante 5
minutos.
4. Polinucleótido según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3, en el que la mutación comprende la
sustitución de His-333.
5. Polinucleótido según la reivindicación 4, en
el que la sustitución es Tyr.
6. Polinucleótido según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3, en el que la mutación comprende la
sustitución de Ala-177.
7. Polinucleótido según la reivindicación 6, en
el que la sustitución es Pro.
8. Polinucleótido según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3, en el que la mutación comprende la
sustitución de Asp-400.
9. Polinucleótido según la reivindicación 8, en
el que la sustitución es His.
10. Polinucleótido según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3, en el que la mutación comprende la
sustitución de Val-454.
11. Polinucleótido según la reivindicación 10,
en el que la sustitución es Ile.
12. Polinucleótido según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3, en el que la mutación comprende la
sustitución de Arg-104.
13. Polinucleótido según la reivindicación 12,
en el que la sustitución es Thr.
14. Polinucleótido según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3, en el que la mutación comprende la
sustitución de Thr-460.
15. Polinucleótido según la reivindicación 14,
en el que la sustitución es Ile.
16. Polinucleótido según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3, en el que la mutación comprende la
sustitución de Arg-216.
17. Polinucleótido según la reivindicación 16,
en el que la sustitución es Pro.
18. Polinucleótido según cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, en el que el polipéptido mutante
comprende además una mutación Rev 6 que confiere un aumento de peso
de la semilla a una planta que expresa el polinucleótido.
19. Método para aumentar la resistencia de una
planta al calor, que comprende incorporar un polinucleótido según
cualquiera de las reivindicaciones anteriores en el genoma de la
planta, y expresar la proteína codificada de ese modo.
20. Método según la reivindicación 19, en el que
la planta es una planta de cereal.
21. Método según la reivindicación 19, en el que
el cereal es maíz, trigo, arroz o cebada.
22. Método según la reivindicación 19, en el que
la planta es Zea mays.
23. Planta que expresa el polipéptido de AGP
mutante definido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a
18.
24. Planta según la reivindicación 23, que es
una planta de cereal.
25. Planta según la reivindicación 24, en la que
el cereal es maíz, trigo, arroz o cebada.
26. Planta según la reivindicación 23, en la que
la planta es Zea mays.
27. Tejido vegetal cuyo genoma comprende la
secuencia de un polinucleótido según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 18.
28. Tejido vegetal según la reivindicación 27,
en el que la planta es una planta de cereales.
29. Tejido vegetal según la reivindicación 28,
en el que el cereal es maíz, trigo, arroz o cebada.
30. Tejido vegetal según la reivindicación 27,
en el que la planta es Zea mays.
31. Tejido vegetal según cualquiera de las
reivindicaciones 27 a 30, que es una semilla.
32. Polipéptido de ADP glucosa fosforilasa (AGP)
vegetal mutante, que comprende una mutación de aminoácido en su
subunidad grande y que muestra un aumento de estabilidad al calor
con relación a un polipéptido de AGP de tipo salvaje, en el que la
mutación comprende la sustitución del aminoácido correspondiente a
His-333, Ala-177,
Asp-400, Val-454, Arg-104, Thr-460 o Arg-216 en maíz.
Asp-400, Val-454, Arg-104, Thr-460 o Arg-216 en maíz.
33. Polipéptido según la reivindicación 32, que
es como se define según cualquiera de las reivindicaciones 2 a
18.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US3104596P | 1996-11-18 | 1996-11-18 | |
| US31045P | 1996-11-18 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| ES2290970T3 true ES2290970T3 (es) | 2008-02-16 |
Family
ID=21857370
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| ES97948384T Expired - Lifetime ES2290970T3 (es) | 1996-11-18 | 1997-11-18 | Mutantes termoestables de enzimas de la biosintesis del almidon. |
Country Status (13)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US6069300A (es) |
| EP (1) | EP0943001B8 (es) |
| JP (3) | JP4235988B2 (es) |
| AT (1) | ATE368120T1 (es) |
| AU (1) | AU5446598A (es) |
| BR (1) | BR9712771A (es) |
| CA (1) | CA2272128C (es) |
| DE (1) | DE69737951T2 (es) |
| DK (1) | DK0943001T3 (es) |
| ES (1) | ES2290970T3 (es) |
| NZ (1) | NZ336230A (es) |
| PT (1) | PT943001E (es) |
| WO (1) | WO1998022601A1 (es) |
Families Citing this family (14)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6403863B1 (en) | 1996-11-18 | 2002-06-11 | University Of Florida Research Foundation, Inc. | Heat stable mutants of starch biosynthesis enzymes |
| US6809235B2 (en) | 1996-11-18 | 2004-10-26 | University Of Florida Research Foundation, Inc. | Heat stable mutants of starch biosynthesis enzymes |
| US20030226176A1 (en) | 1998-04-03 | 2003-12-04 | Exseed Genetics Llc | Plant like starches and the method of making them in hosts |
| WO1999058698A2 (en) | 1998-05-14 | 1999-11-18 | University Of Florida | Heat stable mutants of starch biosynthesis enzymes |
| US6184438B1 (en) | 1998-11-19 | 2001-02-06 | University Of Florida | Mutant genes encoding plant ADP-glucose pyrophosphorylase and methods of use |
| WO2001064928A2 (en) * | 2000-03-01 | 2001-09-07 | Research & Development Institute, Inc. | Transgenic plants with increased seed yield, biomass and harvest index |
| US6969783B2 (en) | 2001-03-14 | 2005-11-29 | University Of Florida Research Foundation, Inc. | Heat stable mutants of starch biosynthesis enzymes |
| AU2002360463A1 (en) | 2001-12-03 | 2003-06-17 | University Of Florida Research Foundation, Inc. | Variants of adp-glucose pyrophosphorylase affecting phosphate sensitivity and other parameters |
| US8710298B2 (en) * | 2003-08-18 | 2014-04-29 | University Of Florida Research Foundation, Inc. | Heat stable variants of plant adenosine diphosphate glucose pyrophosphorylase small subunit |
| US20070083943A1 (en) * | 2003-10-31 | 2007-04-12 | Hannah L C | Materials and methods for improved sweet corn |
| US8030540B2 (en) | 2004-04-21 | 2011-10-04 | Basf Plant Science Gmbh | Transgenic corn having enhanced nutritional qualities |
| US9074193B2 (en) * | 2008-04-09 | 2015-07-07 | University Of Florida Research Foundation, Inc. | Heat resistant plants and plant tissues and methods and materials for making and using same |
| US8362321B2 (en) * | 2009-02-02 | 2013-01-29 | University Of Florida Research Foundation, Inc. | Methods and materials for increasing starch biosynthesis in plants |
| MX363548B (es) | 2014-05-19 | 2019-03-26 | Univ Florida | Métodos para aumentar el rendimiento de granos. |
Family Cites Families (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| DK0664835T3 (da) * | 1992-10-14 | 2004-09-27 | Syngenta Ltd | Nye planter og fremgangsmåde til opnåelse af dem |
| GB9223454D0 (en) * | 1992-11-09 | 1992-12-23 | Ici Plc | Novel plants and processes for obtaining them |
| GB9307408D0 (en) * | 1993-04-08 | 1993-06-02 | Danisco | Transgenic plants |
| GB9412018D0 (en) * | 1994-06-16 | 1994-08-03 | Cambridge Advanced Tech | Modification of starch content in plants |
-
1997
- 1997-11-18 BR BR9712771-0A patent/BR9712771A/pt not_active Application Discontinuation
- 1997-11-18 WO PCT/US1997/021145 patent/WO1998022601A1/en not_active Ceased
- 1997-11-18 JP JP52384698A patent/JP4235988B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 1997-11-18 EP EP97948384A patent/EP0943001B8/en not_active Expired - Lifetime
- 1997-11-18 US US08/972,545 patent/US6069300A/en not_active Expired - Lifetime
- 1997-11-18 DK DK97948384T patent/DK0943001T3/da active
- 1997-11-18 DE DE69737951T patent/DE69737951T2/de not_active Expired - Fee Related
- 1997-11-18 NZ NZ336230A patent/NZ336230A/en unknown
- 1997-11-18 AU AU54465/98A patent/AU5446598A/en not_active Abandoned
- 1997-11-18 CA CA002272128A patent/CA2272128C/en not_active Expired - Fee Related
- 1997-11-18 PT PT97948384T patent/PT943001E/pt unknown
- 1997-11-18 ES ES97948384T patent/ES2290970T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1997-11-18 AT AT97948384T patent/ATE368120T1/de not_active IP Right Cessation
-
2008
- 2008-03-25 JP JP2008078407A patent/JP2008237217A/ja active Pending
-
2009
- 2009-08-17 JP JP2009188175A patent/JP2010000084A/ja not_active Withdrawn
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP0943001B1 (en) | 2007-07-25 |
| DK0943001T3 (da) | 2007-11-26 |
| JP2008237217A (ja) | 2008-10-09 |
| CA2272128C (en) | 2009-03-17 |
| WO1998022601A1 (en) | 1998-05-28 |
| JP2010000084A (ja) | 2010-01-07 |
| AU5446598A (en) | 1998-06-10 |
| EP0943001A1 (en) | 1999-09-22 |
| US6069300A (en) | 2000-05-30 |
| BR9712771A (pt) | 1999-10-26 |
| EP0943001B8 (en) | 2007-09-19 |
| CA2272128A1 (en) | 1998-05-28 |
| JP4235988B2 (ja) | 2009-03-11 |
| DE69737951D1 (de) | 2007-09-06 |
| PT943001E (pt) | 2007-10-29 |
| ATE368120T1 (de) | 2007-08-15 |
| NZ336230A (en) | 2001-02-23 |
| JP2001504698A (ja) | 2001-04-10 |
| DE69737951T2 (de) | 2007-11-15 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US8802926B2 (en) | Heat stable mutants of starch biosynthesis enzymes | |
| JP2010000084A (ja) | デンプン生合成酵素の熱安定性変異体 | |
| JP2009106293A (ja) | デンプン生合成酵素の熱安定変異体 | |
| US6403863B1 (en) | Heat stable mutants of starch biosynthesis enzymes | |
| RU2303633C2 (ru) | Термостабильные мутанты ферментов биосинтеза крахмала | |
| US8710298B2 (en) | Heat stable variants of plant adenosine diphosphate glucose pyrophosphorylase small subunit | |
| ES2343313T3 (es) | Variantes de la adp-glucosa pirofosforilasa que afectan a la sensibilidad al fosfato y otros parametros. | |
| AU771512B2 (en) | Heat stable mutants of starch biosynthesis enzymes |