ES2291407T3 - Metodos y aparatos para ensayos de luminiscencia mejorados. - Google Patents

Metodos y aparatos para ensayos de luminiscencia mejorados. Download PDF

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Abstract

Un aparato para realizar un ensayo de unión para un analito de interés en una muestra, basado en la medición de la electroquimioluminiscencia de una superficie de un electrodo, que comprende: a) una celda electroquímica que tiene un volumen para albergar muestras y medios de entrada y salida; b) un sistema de electrodo de trabajo para proporcionar energía electroquímica para provocar la electroquimioluminiscencia; c) un dispositivo de control del voltaje para suministrar señales de voltaje al sistema del electrodo de trabajo; d) un imán colocado en una orientación apropiada y en estrecha proximidad al electrodo de trabajo, de forma que las partículas magnéticamente sensibles se concentrarán en la superficie del electrodo de trabajo, en donde dicho imán está colocado por debajo de dicho electrodo y en donde dicho imán es capaz de ser retirado de la superficie del electrodo; e) un dispositivo de detección/medición de la luz para medir la electroquimioluminiscencia provocada en la superficie del electrodo; y f) una bomba para proporcionar el transporte de fluido hacia, a través y desde la celda electroquímica.

Description

Métodos y aparatos para ensayos de luminiscencia mejorados.
Referencia cruzada a solicitudes relacionadas
Esta solicitud es una continuación en parte de la solicitud de Massey et al. en trámite nº de serie 07/652.427, presentada el 6 de febrero de 1991, que a su vez es una continuación en parte de la solicitud nº de serie 266.882, presentada el 3 de noviembre de 1988, actualmente abandonada, titulada "Ensayos electroquimioluminiscentes"; esta solicitud es también una continuación en parte de la solicitud nº de serie 539.389, presentada el 18 de junio de 1990, que es una continuación de la solicitud nº de serie 266.882. Se hace referencia también a la solicitud presentada al mismo tiempo de Massey et al., nº de serie 07/827.269, titulada "Método y aparato para un ensayo de luminiscencia basado en micropartículas magnéticas que incluye una pluralidad de imanes" (expediente CMS 370068-3401), que es también una continuación en parte de la solicitud nº de serie 07/652.427.
Campo de la invención
Esta solicitud se refiere generalmente a métodos y aparatos para realizar ensayos de unión, más particularmente a los que miden la presencia de un analito de interés midiendo la luminiscencia emitida por uno o más componentes marcados del sistema de ensayo. Más específicamente, la invención se refiere a ensayos de unión específicos homogéneos o heterogéneos exactos, reproducibles y precisos de sensibilidad mejorada, en los que el componente luminiscente es concentrado en la composición del ensayo y recogido en el sistema de detección antes de que se provoque la electroquimioluminiscencia.
Antecedentes de la invención
Se han desarrollado numerosos métodos y sistemas para la detección y cuantificación de analitos de interés en sustancias bioquímicas y biológicas. Los métodos y sistemas que son capaces de medir cantidades residuales de microorganismos, productos farmacéuticos, hormonas, virus, anticuerpos y ácidos nucleicos y otras proteínas son de gran utilidad para investigadores y facultativos.
Se ha desarrollado una estructura muy sustancial de la técnica basada en reacciones de unión bien conocidas, por ejemplo, reacciones antígeno-anticuerpo, técnicas de hibridación de ácidos nucleicos y sistemas de proteínas-ligandos. El elevado grado de especifidad en muchos sistemas de unión bioquímicos y biológicos ha conducido a muchos métodos y sistemas de ensayo de utilidad en la investigación y diagnósticos. Normalmente, la existencia de un analito de interés está indicada por la presencia de o ausencia de un "marcador" observable unido a uno o más de los materiales de unión. Son de particular interés los marcadores que se pueden hacer entrar en luminiscencia a través de medios fotoquímicos, químicos y electroquímicos. La "fotoluminiscencia" es el procedimiento por el que se induce que un material entre en luminiscencia cuando absorbe una radiación electromagnética. La fluorescencia y fosforescencia son tipos de fotoluminiscencia. Los procedimientos "quimioluminiscentes" entrañan la creación de especies luminiscentes por transferencia o energía química. La "electroquimioluminiscencia" entraña la creación de especies luminiscentes por vía electroquímica.
Se han desarrollado técnicas de ensayos quimioluminiscentes en las que una muestra que contiene un analito de interés se mezcla con un reactivo marcado con un marcador quimioluminiscente. La mezcla de reacción se incuba y alguna parte del reactante marcado se une al analito. Después de incubar, las fracciones unidas y sin unir de la mezcla se separan y se puede determinar la concentración del marcador en cualquiera o en las dos fracciones por técnicas quimioluminiscentes. El nivel de quimioluminiscencia determinado en una o en las dos fracciones indica la cantidad de analito de interés de la muestra biológica.
Las técnicas de ensayos electroquimioluminiscentes (ECL) son una mejora de las técnicas quimioluminiscentes. Proporcionan una medición sensible y precisa de la presencia y concentración de un analito de interés. En tales técnicas, la muestra incubada se expone a un de trabajo voltamétrico con el fin de provocar la luminiscencia. En el entorno químico apropiado, tal electroquimioluminiscencia es provocada por un voltaje que se imprime sobre el electrodo de trabajo en un tiempo particular y de una manera particular. La luz producida por el marcador se mide e indica la presencia o cantidad del analito. Para una descripción más detallada de tales técnicas de ECL, se hace referencia a la solicitud PCT publicada US85/01253 (WO86/02734), solicitud PCT publicada número US87/00987 y solicitud PCT publicada U.S. 88/03947.
Es deseable llevar a cabo ensayos electroquimioluminiscentes sin necesidad de una etapa de separación durante el procedimiento del ensayo y maximizar la modulación de la señal a diferentes concentraciones de analito, de forma que se puedan hacer mediciones precisas y sensibles. Entre los métodos de la técnica anterior para ensayos que no son de separación están los que emplean una materia en forma de micropartículas puesta en suspensión en la muestra de ensayo para unirse a uno o más de los componentes de unión del ensayo.
La patente de EE.UU. nº 4.305.925 se refiere a la detección y determinación de proteínas y péptidos clínicamente relevantes por medio de métodos nefelométricos y turbidimétricos. Los métodos descritos incluyen la unión del antígeno o anticuerpo a partículas de látex que realizan la función de dispersión o adsorción de la luz.
La patente de EE.UU. nº 4.480.042 se refiere a técnicas que emplean reactivos de partículas que consisten en partículas de núcleo-corteza. La corteza contiene grupos funcionales a los que se pueden unir covalentemente los compuestos de interés biológico, y el elevado índice de refracción del núcleo da lugar a una elevada sensibilidad a las mediciones de dispersión de la luz. La técnica se basa en reacciones de aglutinación que resultan de la reacción de anticuerpos divalentes con antígenos multivalentes de interés para producir agregados que pueden ser detectados y/o medidos de diversas formas.
La patente de EE.UU. nº 4.419.453 se refiere análogamente al uso de métodos de ensayo de aglutinación en látex coloreado útiles para detectar la presencia de productos inmunoquímicos tales como anticuerpos e inmunogenes.
Basándose en esta técnica anterior, no habría parecido posible usar una materia en forma de micropartículas en ensayos en los que se mide un fenómeno luminiscente. Se podría esperar que la luminiscencia de restos quimioluminiscentes o electroquimioluminiscentes sería absorbida, dispersada o sufriría de alguna otra forma la interferencia de la materia en forma de micropartículas.
Contrariamente a lo esperado, a solicitud de EE.UU. nº de serie 539,3898 (solicitud PCT publicada U.S. 89/04919) expone métodos de ensayos de unión sensibles y específicos basados en un fenómeno luminiscente en el que una materia en forma de micropartículas inertes se une específicamente a uno de los reactantes de unión del sistema de ensayo. Los ensayos se pueden realizar en un formato de ensayo heterogéneo (una o más etapas de separación) y pueden ser usados lo más ventajosamente en un formato de ensayo homogéneo (sin separación).
El documento US 89/04919 se refiere a una composición para un ensayo basado en una reacción de unión para la medición de un fenómeno luminiscente, composición que incluye una pluralidad de partículas en suspensión que tienen una superficie capaz de unirse a un componente en la mezcla del ensayo. En otro aspecto, se elige a un sistema para detectar o cuantificar un analito de interés en una muestra, sistema que es capaz de realizar los métodos del ensayo usando composiciones de ensayo de las invenciones. El sistema incluye medios para inducir el compuesto marcado en el medio del ensayo a entrar en luminiscencia, y medios para medir la luminiscencia, para detectar la presencia del analito de interés en la muestra.
Se encontró que la unión del componente del sistema de ensayo al que se había enlazado un resto electroquimioluminiscente, a la materia en forma de partículas en suspensión, modulaba grandemente la intensidad de la señal luminiscente generada por el resto electroquimioluminiscente enlazado a este componente, proporcionando así un medio para verificar la reacción de unión específica del sistema de ensayo. Incluso más sorprendentemente, se encontró que las partículas en suspensión tenían poco o ningún efecto sobre la intensidad de la señal luminiscente generada por el resto electroquimioluminiscente enlazado al componente del sistema que permanecía sin unirse a la materia en forma de micropartículas en suspensión.
Por tanto, el documento U.S. 89/04919 se dirige a métodos para la detección de un analito de interés en una muestra, método que incluye las etapas de (1) formar una composición que comprende (a) una muestra que se sospecha que contiene un analito de interés, (b) una sustancia de realización del ensayo seleccionada entre el grupo que consiste en (i) el analito de interés o un análogo del analito de interés, (ii) un asociado de unión al analito de interés o su dicho análogo, y (iii) un componente reactivo capaz de unirse con (i) o (ii), en los que una de dichas sustancias está enlazada a un compuesto marcador que tiene un resto químico capaz de inducir luminiscencia, y (c) una pluralidad de partículas en suspensión capaces de unirse específicamente al analito y/o a una sustancia definida en (b) (i), (ii) o (iii); (2) incubar la composición para formar un complejo que incluye una partícula y dicho compuesto marcador; (3) inducir el compuesto marcador a entrar en luminiscencia; y (4) medir la luminiscencia emitida por la composición para detectar la presencia de analito de interés en la muestra. Esos mismos métodos se pueden usar para cuantificar la cantidad de analito en una muestra comparando la luminiscencia de la composición del ensayo con la luminiscencia de una composición que contenga una cantidad conocida de analito.
Los análogos del analito de interés, que pueden ser naturales o sintéticos, son compuestos que tienen propiedades de unión comparables al analito, pero incluyen también compuestos de capacidad de unión superior o inferior. Los asociados de unión adecuados para ser usados en la presente invención son bien conocidos. Son ejemplos los anticuerpos, enzimas, ácidos nucleicos, lecitinas, cofactores y receptores. Los componentes reactivos capaces de unirse con el analito o su análogo y/o con un asociado de unión de los mismos pueden ser un segundo anticuerpo o proteína tal como Proteína A o Proteína G o puede ser avidina o biotina u otro componente que se conoce en la técnica que interviene en reacciones de unión.
Ventajosamente, la luminiscencia surge de la electroquimioluminiscencia (ECL) inducida por la exposición del compuesto marcador, ya sea unido o sin unir a asociados de unión específicos, a un electrodo de trabajo voltamétrico. Se provoca que la mezcla reactiva ECL emita controladamente una luz por un voltaje impreso sobre el electrodo de trabajo en un tiempo particular y de una manera particular para generar luz. Aunque la emisión de luz visible es una característica ventajosa, la composición o sistema puede emitir otros tipos de radiación electromagnética, tal como luz infrarrojos o ultravioleta, rayos X, microondas, etc. El uso de los términos "electroquimioluminiscencia", "electroquimioluminiscente", "luminiscencia", "luminiscente" y "luminiscencia" incluye la emisión de luz otras formas de radiación electromagnética.
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Los métodos expuestos en el documento WO 90/05301 permiten la detección y cuantificación de cantidades extremadamente pequeñas de analitos en una diversidad de ensayos realizados en establecimientos de investigación y clínicos. Las exigencias de los investigadores y facultativos hace imperativo, sin embargo, disminuir los límites de detección de los ensayos realizados mediante estos métodos para aumentar las sensibilidades de esos ensayos y aumentar la velocidad a que se pueden realizar.
Se conocen diversos métodos en la técnica para aumentar la señal de especies marcadas concentrándolas antes de someterlas a una etapa de medición. En la patente de EE.UU. nº 4.652.333, por ejemplo, las partículas marcadas con marcadores fluorescentes, fosforescentes o fluorescentes atómicos se concentran por microfiltración antes de que se realice una etapa de medición.
Es conocido también en la técnica concentrar especies inmunoquímicas marcadas antes de una etapa de medición, por ejemplo, atrayendo partículas marcadas magnéticamente sensibles a la superficie de un recipiente de medición. En las patentes de EE.UU. nº 4.731.337, 4.777.145 y 4.115.535, por ejemplo, tales partículas son atraídas a la pared del recipiente y seguidamente son irradiadas para excitar una emisión flourofórica de luz.
En la patente de EE.UU. nº 4.945.045, las partículas son concentradas sobre un electrodo magnético. Tiene lugar una reacción electroquímica en el electrodo facilitada por un mediador químico marcado. La reacción de unión inmunoquímica altera la eficacia del mediador, dando lugar a una señal modulada cuando tiene lugar la unión.
Estos métodos de la técnica anterior no son relevantes para los procedimientos de excitación selectiva superficial de la invención. Aunque no hay vinculación alguna a ninguna explicación mecanística particular de excitación superficial, por ejemplo, electroquimioluminiscencia, se cree que el marcador sobre el complejo de fase sólida debe ser oxidado en el electrodo. Esto requiere que un electrón se traslade desde el marcador al electrodo. Se cree que el electrón hace este "salto" mediante un fenómeno conocido como tunelación, en el que el electrón pasa a través del espacio (una zona en la que su energía potencial es muy elevada, por ejemplo, la solución) sin tener que ir "sobre" la barrera de energía potencial. Puede tener un efecto de túnel a través de la barrera de energía y, por tanto, trasladarse de una molécula a otra o de una molécula a un electrodo sin ningún aporte adicional de energía. Sin embargo, este fenómeno de túnel solamente puede funcionar para distancias muy cortas. La probabilidad del fenómeno de túnel cae exponencialmente a medida que aumenta la distancia entre las dos especies. La probabilidad de que el fenómeno de túnel se produzca entre dos especies es bastante elevada si la distancia es menor que 25 Angstoms (2,5 nm) pero es bastante baja si la distancia es mayor. La distancia de 25 \ring{A} es una regla empírica usada por los expertos en la técnica, pero no es una limitación absoluta.
Consecuentemente, solamente los marcadores de ECL dentro de 25 \ring{A} de la superficie del electrodo se puede esperar que participen en el procedimiento de ECL. El área de partícula que está dentro de 25 \ring{A} de la superficie de un electrodo es de forma típica extremadamente pequeña.
Consecuentemente, no sería de esperar que la ECL de una superficie de una partícula fuera medible en ningún grado significativo. Además de ello, la luz que es producida por el procedimiento de ECL debe pasar a través de la partícula para alcanzar el fotomultiplicador. Como las partículas son esencialmente opacas (una suspensión concentrada de las mismas es negra) no sería de esperar, incluso si se pudieran producir cantidades significativas de luz por ECL, que la luz pudiera pasar a través de la partícula y ser medida por el fotomultiplicador.
Objetos de la invención
Por lo tanto, es un objeto principal de esta invención proporcionar métodos homogéneos (sin separación) y heterogéneos (separación), reactivos y aparatos para la realización de ensayos de unión.
Es un objeto adicional de esta invención proporcionar ensayos de unión específica sin separación, reactivos y aparatos basados en la medición de electroquimioluminiscencia emitida desde una composición de ensayo que contiene materia en forma de micropartículas.
Es un objeto adicional y relacionado proporcionar estos ensayos, reactivos y aparatos que tienen una sensibilidad mejorada, tiempo de reacción más rápido, mayor especifidad, límites de detección más bajos y mayor precisión de lo que ha sido conseguido hasta ahora.
Descripción de la invención Definición de términos
La expresión "resto ECL", "resto ECL que contiene metales", "marcador", "compuesto marcado" y "sustancia marcada" se usan de forma intercambiable. Está dentro del alcance de la invención para las especies denominadas "resto ECL", "resto ECL que contiene metales", "organo-metálico", "quelato metálico", "quelato de metal de transición", "quelato de metal de tierras raras", "compuesto marcado", "sustancia marcada" y "marcador" estén enlazados a moléculas tales como un analito o análogo del mismo, un asociado de unión del analito o un análogo del mismo y asociados de unión adicionales de tal asociado de unión anteriormente mencionado, o un componente reactivo de unión con el analito, o análogo del mismo, o un asociado de unión como se mencionó anteriormente. Las especies anteriormente mencionadas pueden estar también enlazadas a una combinación de uno o más asociados de unión y/o uno o más componentes reactivos. Adicionalmente, las especies anteriormente mencionadas pueden estar enlazadas también a un analito o su análogo unido a un asociado de unión, un componente reactivo o una combinación de uno o más asociados de unión y/o uno o más componentes reactivos. Está también dentro del alcance de la invención para una pluralidad de las especies anteriormente mencionadas que estén unidas directamente o a través de otras moléculas, como se expuso anteriormente, a un analito o su análogo. Para fines de brevedad, estos ligandos se denominan una sustancia de realización del ensayo.
Los términos detección y cuantificación se denominan "medición", debiendo entenderse que la cuantificación puede requerir la preparación de composiciones y calibraciones de referencia.
Los términos "recogida y concentración de un complejo" se pueden usar de forma intercambiable para describir la concentración de un complejo dentro de la composición del ensayo y la recogida del complejo, por ejemplo, en la superficie del electrodo.
Breve descripción de los dibujos
La Fig. 1 es un dibujo esquemático de una celda para realizar los ensayos de la invención de no separación y de separación basados en micropartículas.
La Fig. 2 es un diagrama simplificado de un aparato de control del voltaje para ser usado con la celda de la Fig. 1.
La Fig. 3 es una representación esquemática de un formato de PCR de incorporación directa que usa oligonucleótidos marcados electroquimioluminiscentes y oligonucleótidos marcados electroquimioluminiscentes de biotina como cebadores.
La Fig. 4 es una representación esquemática de un formato de PCR normal que usa un cebador biotinilado para permitir la generación de PRODUCTO DE PCR biotinilado.
La Fig. 5 es una representación esquemática de un formato de ensayo de PCR asimétrico que genera DNA biotinilado de cadena única para la posterior hibridación a oligonucleótidos marcados electroquimioluminiscentes.
La Fig. 6 es un gráfico que muestra estudios de especifidad de la incorporación directa de oligonucleótidos marcados electroquimioluminiscentes en productos de PCR biotinilados.
La Fig. 7 es una curva estándar de marcador electroquimioluminiscente y oligonucleótidos biotinilados directamente incorporados en productos de PCR HPV16.
La Fig. 8 es un gráfico que muestra un ensayo de mutación puntual para el oncogen Ha-ras.
La Fig. 9 es un gráfico que muestra una evaluación de la especifidad de las sondas marcadas electroquimioluminiscentes que usan sondas marcadas electroquimioluminiscentes de P^{32} para el oncogen Aa-ras.
La Fig. 10 es un gráfico que muestra la determinación del valor relativo del marcador electroquimioluminiscente en el marcador electroquimioluminiscente de P^{32} para la determinación de mutaciones puntuales en el oncogen Aa-ras.
La Fig. 11 es una curva estándar del ensayo de hibridación "sin lavado" rápido para HPV18.
La Fig. 12 es una representación esquemática de una celda de ensayo usada para realizar ensayos que se basan en la fuerza de gravedad para causar que el complejo sedimente.
La Fig. 13 es un gráfico que muestra la distancia en que sedimenta el complejo como una función del tiempo bajo la influencia de la gravedad; a saber, una velocidad de sedimentación de Partículas Dynal (Y=-0,28+0,48 x; velocidad = 0,5 mm por minuto).
La Fig. 14 es un gráfico que muestra la intensidad de la electroquimioluminiscencia como una función del tiempo en celdas de gravedad que tienen alturas diferentes de composición del ensayo sobre el electrodo, es decir, una comparación de la relación intensidad-tiempo para dos grosores de las juntas, en el que los valores representados por los círculos vacíos son para una junta de 0,038 centímetros y los valores representados por los círculos oscuros son para una junta de 0,19 centímetros.
La Fig. 15 es un gráfico que muestra la intensidad de la electroquimioluminiscencia en celdas de gravedad que tienen diferentes alturas de composición del ensayo en la superficie del electrodo, según se miden para la medición de proteína fetal alfa, es decir, una comparación de celdas para un ensayo AFP, en el que los valores representados por los círculos vacíos son para una junta de 0,038 centímetros y los valores representados por los círculos oscuros son para una junta de 0,29 centímetros.
La Fig. 16 es una representación esquemática de una celda de ensayo de sedimentación que emplea un electroimán para causar que el complejo sedimente en la superficie del electrodo.
La Fig. 17 es un gráfico que muestra las velocidades relativas de asentamiento de un complejo en forma de micropartículas bajo la influencia de un campo magnético y de la gravedad, respectivamente, es decir, una comparación de los tiempos de asentamiento de micropartículas entre un asentamiento inducido por campo magnético y un asentamiento por gravedad, en el que los valores para el asentamiento por campo magnético están representados por círculos vacíos y los valores para el asentamiento por gravedad están representados por círculos oscuros.
La Fig. 18 es una representación esquemática de una celda de recogida que incluye un imán permanente.
La Fig. 19 es un gráfico que muestra el aumento en la intensidad de ECL como una función del tiempo en ensayos realizados con la celda de la Fig. 18, es decir, el efecto del tiempo de recogida sobre la intensidad de la ECL.
La Fig. 20 es una representación esquemática de las líneas de fuerza en las proximidades de la superficie del electrodo como una función de la orientación del imán por debajo de la superficie del electrodo.
La Fig. 21 es una representación esquemática de una celda de flujo rotatorio en la que los complejos se depositan en la superficie del electrodo por centrifugación; el método y aparato de centrifugación de la invención para capturar partículas y la celda de flujo centrífugo de la invención.
La Fig. 22 es una representación esquemática de una detección de fluorescencia de ondas evanescentes.
Las Figs. 23 y 24 muestran una celda y una pluralidad de imanes para realizar la separación basada en micropartículas magnéticas o el método de ensayo de no separación de la invención; la pluralidad de imanes o el sistema de imanes impone las líneas de campo que son mayormente paralelas al plano de la superficie del electrodo.
La Fig. 25 es un dibujo esquemático de una celda para realizar los ensayos de no separación y de separación basados en micropartículas de la invención; la celda emplea un electrodo de trabajo y una pluralidad de imanes como en las Figs. 23 y 24.
Breve descripción de la invención
En su realización más amplia, la invención es un método para realizar un ensayo de unión para un analito de interés presente en una muestra. Las etapas incluyen:
(a) formar una composición que contiene
(i)
dicha muestra
(ii)
una sustancia de rendimiento en el ensayo que contiene un componente unido a un compuesto marcador capaz de ser inducido a luminiscencia, y
(iii)
una pluralidad de partículas capaces de unirse específicamente al analito y/o dicha sustancia de rendimiento en el ensayo;
(b) incubar dicha composición para formar un complejo que incluye una partícula y dicho compuesto marcador;
(c) recoger dicho complejo en una zona de medición;
(d) inducir la luminiscencia de dicho compuesto marcador por excitación superficial selectiva; y
(e) medir la luminiscencia emitida para medir la presencia del analito de interés en la muestra.
El complejo puede ser recogido, por ejemplo, en una superficie de un electrodo en la que es excitado e inducido a una electroquimioluminiscencia, como imponiendo un voltaje sobre el electrodo, o puede ser recogido en una superficie y posteriormente inducido a fluorescer mediante excitación superficial, como se describe con posterioridad. La fluorescencia de reflexión interna total (TIRF) ha sido descrita como una técnica sensible en superficies para excitar y detectar marcadores fluoróforos y la reflexión interna total ha sido usada con RAMAN y absorción de infrarrojos como otra técnica sensible en superficies para medir la presencia de un marcador. La resonancia de plasmón superficial es una técnica óptica que puede ser usada según los métodos de la invención para medir marcadores en superficies. Por tanto, la invención está dirigida a métodos para excitar luminiscencia mediante técnicas de excitación de superficies.
Aunque la invención se lleva a cabo preferentemente recogiendo el complejo en una zona de medición, es decir, en una superficie en la que se puede provocar una luminiscencia, la invención abarca también métodos en los que el complejo se recoge fuera de una zona de medición y posteriormente se llevan medios a esa zona o se pueden adoptar otras etapas para inducir y medir la luminiscencia.
La recogida del complejo se puede llevar a cabo mediante diversos métodos diferentes, incluidas la sedimentación por gravedad, filtración, centrifugación y atracción magnética de partículas con sensibilidad magnética que forman parte del complejo. La diversas realizaciones se describen más en detalle con posterioridad.
Los ensayos basados en la medición de la electroquimioluminiscencia en una superficie del electrodo se llevan a cabo ventajosamente usando las fuerzas de la gravedad por medio de
(a) formar una composición que contiene
(i)
dicha muestra
(ii)
una sustancia de realización del ensayo que contiene un componente enlazado a un compuesto marcador capaz de ser inducido a entrar en electroquimioluminiscencia; y
(iii)
una pluralidad de partículas en suspensión que tienen una densidad mayor que el resto de dicha composición y que son capaces de unirse específicamente con el analito y/o dicha sustancia de realización del ensayo;
(b) incubar dicha composición para formar un complejo que incluye una partícula y dicho compuesto marcador;
(c) introducir dicha composición en una celda de ensayo;
(d) recoger dicho complejo en la superficie de un electrodo colocado por debajo de al menos una parte sustancial del volumen de dicha celda de ensayo, permitiendo que dicha composición resida en dicha celda durante un tiempo suficiente para permitir que las partículas sedimenten sobre dicha superficie de un electrodo por la fuerza de la gravedad;
(e) inducir el compuesto marcador en dicho complejo recogido a entrar en electroquimioluminiscencia imponiendo un voltaje sobre dicho electrodo; y
(f) medir la luminiscencia emitida para medir la cantidad de analito de interés en la muestra.
Aunque se pueden realizar ensayos discontinuos, se pueden realizar ensayos continuos o semicontinuos en celdas de flujo. En una celda de flujo, la fase sólida permanece en la celda de medición, mientras que la solución fluye a su través y sale de la celda. Si la fase sólida (por ejemplo, partículas) es más densa que el agua, es decir, tiene una densidad mayor que la del agua (más de 1,0 g/ml) la fuerza de gravedad sobre las partículas causa que caigan al fondo de la celda. La celda se puede construir de forma que las partículas sedimenten en el fondo a medida que el fluido fluye a través de la celda, o la celda se puede construir de forma que la mayoría de la muestra esté contenida en la celda en un compartimento en columna por encima del electrodo de trabajo de un sistema de ECL. Se debe proporcionar un tiempo de residencia suficiente en la celda para permitir que las partículas sedimenten en la superficie del electrodo antes de inducir la ECL.
En otra realización de la invención, la composición del ensayo que contiene partículas en suspensión que tienen una densidad mayor que el resto de la composición del ensayo se puede someter a centrifugación con el fin de separar las partículas a una zona de medición en la que se ponen posteriormente en contacto, por ejemplo, con un electrodo, para inducir la electroquimioluminiscencia, o se ponen directamente en contacto con un electrodo en la etapa de centrifugación.
En esta realización, la celda de medición está provista con medios para rotar rápidamente la muestra y el recinto de la muestra. La fuerza centrífuga causa que las partículas en la muestra se muevan hacia fuera del eje de rotación del recinto de la muestra y se recojan en la superficie externa del recinto de la muestra. Las superficies externas de tal recinto de la muestra pueden constituir el electrodo de trabajo en sistema de medición de ECL.
En una tercera realización, las partículas se pueden separar por filtración de la composición del ensayo. En esta realización, las partículas no necesitan tener una densidad mayor que el resto de la composición del ensayo. Las partículas se separan de la solución y se concentran haciendo pasar la solución a través de un filtro, por ejemplo, bombeando y recogiendo las partículas en la superficie del filtro. Esta superficie del filtro, por ejemplo, está revestida con una película metálica delgada que puede servir como el electrodo de trabajo en un sistema de detección de ECL.
En una realización preferida, las partículas en suspensión son magnéticamente sensibles, por ejemplo, pueden ser paramagnéticas o ferromagnéticas, y se recogen en una zona de medición o, preferentemente, directamente en la superficie de un electrodo, mediante la imposición de un campo magnético sobre las partículas. La celda de medición está equipado con un imán. El campo magnético del imán aplica una fuerza sobre las partículas mientras éstas residen en una celda discontinua o a medida que fluyen a través de una celda de flujo, causando que se separen del volumen de la solución en la superficie de la celda que está en una mayor proximidad respecto al imán. Si el imán se coloca en una orientación apropiada y en estrecha proximidad al electrodo de trabajo de un sistema de detección de ECL, las partículas se concentrarán en la superficie del electrodo de trabajo.
Se pueden poner en práctica diversos formatos heterogéneos y homogéneos diferentes para ensayos de unión, usando los métodos anteriormente descritos para recoger y concentrar el complejo en la superficie de un electrodo. En un ensayo de unión heterogéneo, el complejo se separa de la composición antes de medir la luminiscencia del marcador. En ensayos homogéneos, no se hace ninguna separación de los reactivos marcados unidos (a la fase sólida) y sin unir.
En un ensayo heterogéneo, cuando el complejo se concentra en la superficie del electrodo de trabajo, la señal medida a partir del marcador es mucho mayor de lo que sería en ausencia de una etapa de recogida. La señal de los reactivos marcados sin complejar, por el contrario, no es alterada. Por tanto, a pesar de la presencia de los reactivos marcados sin complejar en la celda de medición, la señal del complejo recogido es más fuerte que en un ensayo sin recogida de complejo. El límite de detección para el ensayo de unión se mejora mucho como consecuencia del procedimiento de recogida.
En una realización preferida de la invención, se incluye una etapa de separación in situ en el procedimiento de ensayo homogéneo de unión. Después de que se han bombeado la composición del ensayo, es decir, la muestra, la sustancia de realización del ensayo y las partículas en la celda de medición y se captura el complejo sobre el electrodo de trabajo, se bombea un segundo fluido a través de la celda que está exento de marcador o reactivos marcados, realizando así un lavado o separación in situ en el complejo de los componentes sin unir de la composición del ensayo. Este procedimiento de ensayo es técnicamente un ensayo de unión heterogéneo. Sin embargo, la capacidad para realizar la separación en el interior de la celda de medición es ventajosa en cuanto que no requiere ningún aparato adicional de separación y el procedimiento es generalmente mucho más rápido que los métodos se separación externos.
Los ensayos de unión heterogéneos se realizan poniendo en práctica la invención mezclando los componentes de la composición del ensayo y permitiendo que reaccionen durante un período de tiempo predeterminado. La composición del ensayo se somete seguidamente a una etapa de separación en la que se separa la solución de las partículas. Seguidamente se mide la electroquimioluminiscencia del complejo o bien de la solución. La medición de la ECL del complejo después de una etapa de concentración permite una medición del analito con mayor exactitud y con un límite de detección inferior de lo que era posible sin la concentración.
Descripción detallada de la invención
La invención, así como otros objetos y características de la misma, se comprenderán de forma más clara y completa a partir de la siguiente descripción de ciertas realizaciones preferidas.
La invención es aplicable ampliamente a analitos de interés que son capaces de intervenir en reacciones de unión. Estas reacciones incluyen, por ejemplo, reacciones de antígenos-anticuerpos, receptores de ligandos, interacciones de DNA y RNA y otras conocidas. La invención se refiere a diferentes métodos y ensayos para detectar cualitativa y cuantitativamente la presencia de tales analitos de interés en una muestra multicomponentes.
Las muestras
La muestra que puede contener el analito de interés puede estar en forma sólida, de emulsión, suspensión, líquida o gaseosa, se puede suministrar, por ejemplo, a partir de células y productos de derivados de células, agua, alimentos, sangre, suero, cabello, sudor, orina, heces, tejidos, saliva, aceites, disolventes orgánicos o aire. La muestra puede comprender adicionalmente, por ejemplo, agua, acetonitrilo, dimetil-sulfóxido, dimetil-formamida, N-metil-pirrolidona o alcoholes o sus mezclas.
Los analitos
Los analitos típicos de interés son una célula completa o antígeno superficial, partícula subcelular, virus, prión, viroide, anticuerpo, antígeno, hapteno, ácido graso, ácido nucleico, proteína, lipoproteína, polisacárido, lipopolisacárido, glicoproteína, péptido, polipéptido, metabolito celular, hormona, agente farmacológico, molécula orgánica sintética, molécula organometálica, tranquilizante, barbiturato, alcaloide, esteroide, vitamina, aminoácido, azúcar, lecitina, proteína recombinante o derivada, biotina, avidina, estreptavidina o molécula inorgánica presente en la muestra. Normalmente, el analito de interés está presente a una concentración de 10^{-3} o menos, por ejemplo, tan baja como 10^{-12} molar o inferior.
Sustancia de realización del ensayo
La sustancia de realización del ensayo que se combina con la muestra que contiene el analito de interés contiene al menos una sustancia seleccionada entre el grupo que consiste en (i) un analito añadido de interés o su análogo, como se definió anteriormente, (ii) un asociado de unión del analito de interés o su dicho análogo, y (iii) un componente reactivo, como se definió anteriormente, capaz de unirse con (i) o (ii), en donde una de dichas sustancias está enlazada a un compuestos o resto, por ejemplo, un resto de ECL capaz de ser inducido a entrar en luminiscencia. La sustancia marcada puede ser una célula completa o antígeno superficial, una partícula subcelular, virus, prión, viroide, anticuerpo, hapteno, lípido ácido graso, ácido nucleico, polisacárido, proteína, lipoproteína, lipopolisacárido, glicoproteína, péptido, polipéptido, metabolito celular, hormona, agente farmacológico, tranquilizante, barbiturato, alcaloide, esteroide, vitamina, aminoácido, azúcar, polímero no biológico (preferentemente soluble), lecitina, proteína recombinante o derivada, molécula orgánica sintética, molécula organométalica, molécula inorgánica, biotina, avidina o estreptavidina. En una realización, el reactivo es un resto electroquimioluminiscente conjugado a un anticuerpo, antígeno, ácido nucleico, hapteno, secuencia pequeña de nucleótidos, oligómero, ligando, enzima o biotina, avidina, estreptavidina, Proteína A, Proteína G o sus complejos, u otro asociado de unión secundario capaz de unirse a un asociado de unión primario a través de interacciones con proteínas.
Los análogos del analito de interés, que pueden ser naturales o sintéticos, son normalmente compuestos que tienen propiedades de unión comparables al analito, pero pueden ser también compuestos de capacidad de unión superior o inferior. El componente reactivo capaz de unirse con el analito o su análogo, y/o con un asociado del mismo, y a cuyo través se puede enlazar el resto de ECL al analito, es adecuadamente un segundo anticuerpo o una proteína tal como Proteína A o Proteína G, o avidina o biotina u otro componente que se conoce en la técnica que interviene en reacciones de unión.
Los marcadores
Ventajosamente, los restos de ECL son quelatos metálicos. El metal de ese quelato es adecuadamente cualquier metal, de forma que el quelato metálico entre en luminiscencia bajo las condiciones electroquímicas que se imponen sobre el sistema de reacción en cuestión. El metal de tales quelatos metálicos es, por ejemplo, un metal de transición (tal como un metal de transición del bloque d) o un metal de tierras raras. El metal es preferentemente rutenio, osmio, renio, iridio, rodio, platino, indio, paladio molibdeno, tecnecio, cobre, cromo o wolframio. Son especialmente preferidos el rutenio y el osmio.
Los ligandos que están enlazados al metal en tales quelatos son habitualmente de naturaleza heterocíclica u orgánica, y desempeñan una función para determinar si el quelato metálico es soluble o no en un entorno acuoso o en un entorno orgánico u otro no acuoso. Los ligandos pueden ser polidentados y pueden estar sustituidos. Los ligandos polidentados incluyen ligandos aromáticos y alifáticos. Los ligandos polidentados aromáticos adecuados incluyen ligandos heterocíclicos aromáticos. Los ligandos heterocíclicos aromáticos preferidos son los que contienen nitrógeno tales como, por ejemplo, bipiridilo, bipirazilo, terpiridilo y fenantrolilo. Los sustituyentes adecuados incluyen, por ejemplo, alquilo, alquilo sustituido, arilo, arilo sustituido, aralquilo, aralquilo sustituido, carboxilato, carboxaldehído, carboxamido, ciano, amino, hidroxi, imino, hidroxicarbonilo, aminocarbonilo, amidino, guanidinio, ureído, grupos que contienen azufre, grupos que contienen fósforo y el éster de carboxilato de N-hidroxisuccinimida. El quelato puede tener uno o más ligandos monodentados, de los que una amplia diversidad son conocidos en la técnica. Los ligandos monodentados adecuados incluyen, por ejemplo, monóxido de carbono, cianuros, isocianuros, haluros y fosfolinas, aminas, estilbenos y arsinas alifáticas, aromáticas y heterocíclicas.
Ejemplos de quelatos adecuados son bis[(4,4'-carbometoxi)-2,2'-bipiridino]-2-[3-(4-metil-2,2'-bipiridino-4-il)propil]-1,3-dioxolano-rutenio (II); bis(2,2'-bipiridino)[4-(butan-1-al-4'-metil-2,2'-bipiridino]-rutenio (II); bis(2,2'-bipiridino)[ácido 4-(4'-metil-2,2'-bipiridino-4'-il)-butírico]-rutenio (II); tris(2,2'-bipiridino)-rutenio (II); (2,2'-bipiridino)[bis-bis(1,2-difenilfosfino)etileno]-2-[3-(4-metil-2,2'-bipiridino-4'-il)propil]-1,3-dioxolano-osmio (II); bis(2,2'-
bipiridino)[4-(4'-metil-2,2'-bipiridino)-butilamino]-rutenio (II); bis-(2,2'-bipiridino)[1-bromo-4-(4'-metil-2,2'-bipiridino-4-il)butano]-rutenio (II); [4-metil-2,2'-bipiridino-4'-butilamida de ácido bis(2,2'-bipiridino)maleimidohexanoico]-rutenio (II). Otros restos de ECL se describen en la solicitud PCT publicada US87/00987 y en la solicitud PCT publicada 88/0394.
La función de los restos de ECL es emitir una radiación electromagnética como consecuencia de la introducción en el sistema de reacción de una energía electroquímica. Con el fin de hacer estos, deben ser capaces de ser estimulados hasta un estado de energía excitada y ser capaces también de emitir una radiación electromagnética, tal como un fotón o luz, tras descender desde ese estado excitado. Aunque no se desea ninguna vinculación a análisis teóricos del mecanismo de la participación de los restos de ECL en la reacción electroquimioluminiscente, se cree que son oxidados mediante la introducción de energía electroquímica en el sistema de reacción y, seguidamente, a través de una interacción con un reductor presente en el sistema, se convierten en el estado excitado. Este estado es relativamente inestable, y el quelato metálico desciende rápidamente a un estado más estable. Al hacer esto, el quelato desprende una radiación electromagnética, tal como un fotón o luz, que es detectable.
La cantidad de quelato metálico u otro resto de ECL que contiene metales incorporada de acuerdo con la invención variará de un sistema a otro. Generalmente, la cantidad de tal resto utilizada es la cantidad que sea eficaz para dar lugar a la emisión de una energía electromagnética detectable y, si se desea, cuantificable, a partir la composición o sistema anteriormente mencionado. La detección y/o cuantificación de un analito de interés se hace normalmente a partir de la comparación de la luminiscencia de una muestra que contiene un analito de interés y un resto de ECL con la luminiscencia emitida por un patrón de calibración desarrollado con cantidades conocidas del analito de interés y el resto de ECL. Esto adopta un formato homogéneo. En el modo heterogéneo, se lleva a cabo una separación como se expuso anteriormente antes del análisis de ECL.
Como se puede apreciar por un experto ordinario en la técnica, la identidad y la cantidad del resto de ECL que contiene metales variará de un sistema a otro, dependiendo de las condiciones predominantes. El resto de ECL apropiado que contiene metales, y su cantidad suficiente para obtener el resultado deseado, se pueden determinar empíricamente por los expertos ordinarios en la técnica, una vez instruidos con las exposiciones de la presente memoria descriptiva, sin una excesiva experimentación.
Las partículas
Las partículas comprenden ventajosamente una materia que tiene un diámetro de 0,001 a 200 \mum, tal como 0,05 \mum a 200 \mum, preferentemente 0,1 \mum a 100 \mum, lo más preferentemente 0,5 \mum a 10 \mum, y un componente superficial capaz de unirse al analito y/o una o más de otras sustancias anteriormente descritas. Por ejemplo, la materia en forma de micropartículas puede ser almidón reticulado, dextranos, celulosa, proteínas, polímeros orgánicos, un copolímero de estireno tal como copolímero de estireno/butadieno, copolímero de acrilonitrilo/butadieno/estireno, copolímero de vinilacetilo-acrilato o copolímero de cloruro de vinilo/acrilato, partículas inorgánicas inertes, dióxido de cromo, óxidos de hierro, sílice, mezclas de sílice y materia proteinácea o sus mezclas. Deseablemente, las partículas están en suspensión en el sistema de ECL. Las partículas pueden ser o pueden incluir partículas magnéticamente sensibles.
Medios de ensayo
Con el fin de hacer funcionar un sistema en el que un electrodo introduce una energía electroquímica, es necesario proporcionar un electrolito en el que el electrodo se sumerge y que contiene el resto de ECL. El electrolito es una fase a cuyo través se transporta una carga por iones. Generalmente, el electrolito está en la fase líquida, y es una solución de una o más sales u otras especies en agua, un líquido orgánico o mezcla de líquidos orgánicos o una mezcla de agua y uno o más líquidos orgánicos. Sin embargo, otras formas de electrolitos son también útiles en ciertas realizaciones de la invención. Por ejemplo, el electrolito puede ser una dispersión de una o más sustancias en un fluido, por ejemplo, un líquido, un vapor o un fluido supercrítico, o puede ser una solución de una o más sustancias en un sólido, un vapor o un fluido supercrítico.
El electrolito es adecuadamente una solución de una sal en agua. La sal puede ser una sal de sodio o una sal de potasio preferentemente, pero la incorporación de otros cationes es también adecuada en ciertas realizaciones, en la medida en que el catión no interfiera con la secuencia de interacciones electroquimioluminiscentes. El anión de la sal puede ser un fosfato, por ejemplo, pero es permisible también el uso de otros aniones en ciertas realizaciones de la invención, una vez más, en la medida en que el anión seleccionado no interfiera con la secuencia de interacciones electroquimioluminiscentes.
La composición puede ser también no acuosa. Aunque en ciertos casos se pueden emplear ventajosamente fluidos supercríticos, es más típico utilizar un electrolito que comprenda un líquido orgánico en una composición no acuosa. Como un electrolito acuoso, el electrolito no acuoso es también una fase a cuyo través se transporta una carga por iones. Normalmente, esto significa que una sal está disuelta en el medio líquido orgánico. Ejemplos de líquidos orgánicos adecuados son acetonitrilo, dimetilsulfóxido (DMSO), dimetilformamida (DMF), metanol, etanol y mezclas de dos o más de los anteriores. Ilustrativamente, las sales de tetraalquilamonio, tal como tetrafluoroborato de tetrabutilamonio, que son solubles en líquidos orgánicos, se pueden usar con ellos para formar electrolitos no acuosos.
El electrolito es, en ciertas realizaciones de la invención, un sistema tamponado. Los tampones de fosfato son a menudo ventajosos. Ejemplos de ello son una solución acuosa de fosfato de sodio/cloruro de sodio, y una solución acuosa de fosfato de sodio/fluoruro de sodio.
Otros componentes del ensayo
Como se describe en la solicitud PCT publicada US 89/04859, titulada "reacción electroquimioluminiscente que utiliza un reductor derivado de amina", es deseable incluir un reductor, normalmente una amina o resto de amina (de una molécula mayor) que se puede oxidar y descomponer espontáneamente para convertirse en especies altamente reductoras. Se cree que la amina o resto de amina se oxida también por la energía electroquímica introducida en el sistema de reacción. La amina o resto de amina pierde un electrón, y seguidamente se desprotona, o se reagrupa en sí mismo, en forma de un agente reductor fuerte. Este agente interacciona con el resto de ECL que contiene metal oxidado y provoca que este adopte el estado excitado anteriormente expuesto. Con el fin de llevar a cabo esta función, la amina o resto de amina tiene preferentemente un radical centrado en un átomo de carbono con un electrón que puede ser donado desde tal átomo de carbono, y un átomo de carbono alfa que actúa seguidamente como un donante de protones durante la desprotonación con el fin de formar el reductor. El reductor derivado de amina proporciona el estímulo necesario para convertir el resto de ECL que contiene un metal a su estado excitado, a partir del cual se emite una radiación electromagnética detectable.
Se puede utilizar una amplia gama de aminas y restos correspondientes de aminas para poner en práctica la presente invención. Generalmente, la amina o resto de amina se escoge para adecuar el pH del sistema que va a ser analizado por electroquimioluminiscencia. Otro factor relevante es que la amina o resto de amina debe ser compatible con el entorno en el que debe funcionar durante el análisis, es decir, compatible con un entorno acuoso o no acuoso, según sea el caso. Todavía, otra consideración es que la amina o resto de amina seleccionado debe formar un reductor derivado de amina bajo las condiciones predominantes que sea suficientemente fuerte para reducir el resto de ECL que contiene metal oxidado en el sistema.
Las aminas (y los correspondientes restos derivados de las mismas) que se utilizan ventajosamente en la presente invención son aminas alifáticas tales como alquil-aminas primarias, secundarias y terciarias, teniendo los grupos alquilo de cada una de uno a tres átomos de carbono, así como aminas alifáticas sustituidas. La tripropil-amina es una amina especialmente preferida ya que conduce, comparativamente hablando, a una emisión de radiación electromagnética particularmente elevada, que aumenta la sensibilidad y exactitud de la detección y cuantificación en las realizaciones en que se usa. También son adecuadas las diaminas tales como hidrazina, y poliiminas tales como polietilenimina. Ejemplos de otras aminas adecuadas para poner en práctica la invención son trietanolamina, trietilamina, 1,4-diazabiciclo-(2.2.2)-octano, 1-piperidino-etanol, 1,4-piperazino-bis-(ácido etanosulfónico), tri-isopropil-amina y polietilenimina.
Normalmente, el resto de ECL que contiene metal utilizado en la presente invención es el constituyente limitante de la reacción. Consecuentemente, es también típico que la amina o resto de amina se proporcione en un exceso estequiométrico con respecto al mismo. Ilustrativamente, la amina o resto de amina se emplea en una concentración de 50-150 mM. Para ser utilizada a un pH de aproximadamente 7, es a menudo ventajosa una concentración de 100 mM. En ciertas realizaciones, el límite superior sobre la concentración de amina o resto de amina se determina por la solubilidad máxima de la amina o resto de amina en el entorno en que está siendo usada, por ejemplo en agua. En general, la cantidad de amina o resto de amina empleada es la que sea suficiente para efectuar la transformación del resto de ECL que contiene metal oxidado en su estado excitado de forma que se produzca la luminiscencia. Los expertos ordinarios en la técnica, con el conocimiento de lo expuesto en la presente memoria descriptiva, pueden determinar empíricamente la cantidad de amina o resto de amina ventajosamente usada para el sistema particular que se esté analizando, sin una experimentación excesiva.
Como se describe en la solicitud PCT publicada US 89/04915, titulado "reacción electroquimioluminiscente mejorada", los ensayos de la invención se llevan a cabo deseablemente en presencia de un mejorador, normalmente un compuesto de fórmula
1
en la que R es hidrógeno o C_{n}H_{2n+1}, R' es C_{n}H_{2n}, x es 0 a 70 y n es de 1 a 20. Preferentemente, n puede ser de 1 a 4. Ejemplos específicos son una sustancia disponible en el comercio bajo la denominación Triton X-100 de fórmula
2
en la que x es 9-10, y una sustancia disponible en el comercio bajo la denominación Triton N-401 (NPE-40), de fórmula
3
en la que x es 40. El mejorador se utiliza generalmente en una cantidad suficiente de forma que en su presencia se produzca el aumento deseado en la emisión de radiación electromagnética. Normalmente, la cantidad es 0,01% a 5,0%, más específicamente 0,1% a 1,0%, v/v.
El resto de ECL usado de acuerdo con la presente invención es inducido a emitir una radiación electromagnética estimulándolo en un estado excitado. Esto se realiza exponiendo el sistema en el que se ha incorporado el resto de ECL a una energía electroquímica. El potencial al que se produce la oxidación del resto de ECL y las especies que forman un reductor fuerte depende de sus estructuras químicas exactas, así como de factores tales como el pH del sistema y la naturaleza del electrodo usado para inducir la energía electroquímica. Es bien conocido por los expertos rutinarios en la técnica el modo de determinar el potencial óptimo y la longitud de onda de emisión de un sistema electroquimioluminiscente. Ciertos métodos preferidos de estimular el sistema de ECL se describen en la solicitud publicada US 89/01814.
Aparato para medir la electroquimioluminiscencia
Un aparato para llevar a cabo los ensayos de la invención se describe en las Figs. 1 y 2. La Fig. 1 describe un aparato de ECL ventajoso, pero los métodos de la presente invención no están limitados a una aplicación en el aparato 10, sino que en vez de ello se pueden emplear en otros tipos de aparatos de ECL que incluyen un electrodo de trabajo u otra superficie inductora para proporcionar una energía electroquímica para provocar que el resto de ECL sea electroquimioluminiscente. Aunque los métodos de la invención se pueden llevar a cabo en un modo estático o a través de un flujo, el aparato 10 incluye una celda a través de flujo, que proporciona ventajas distintas para muchos tipos de muestras que incluyen muestran de ensayos de unión. Detalles adicionales de aparatos para llevar a cabo los ensayos de ECL de la invención se describen en las solicitudes PCT publicadas US 98/04854 y US 90/01370.
El aparato 10 incluye una celda electroquímica 12, un dispositivo 14 de detección/medición de la luz, que puede ser ventajosamente un tubo fotomultiplicador (PMT), un fotodiodo, un dispositivo de acoplamiento de carga, una película o emulsión fotográfica o similar y una bomba 16, que es ventajosamente una bomba peristáltica, para proporcionar el transporte de un fluido hacia, a través y desde la celda 12. Alternativamente, se puede usar una boba de desplazamiento positivo. Se proporciona un mecanismo de cierre 18 entre la celda 12 y el PMT 14 y se hace funcionar de forma controlada para abrirse solamente en una medida para exponer el PMT a la celda 12 durante los períodos de medición de la ECL. El mecanismo de cierre puede estar cerrado, por ejemplo, durante el mantenimiento. También está incluido en el aparato 10, pero no se ilustra en la Fig. 1, un alojamiento a prueba de luz destinado a tener dispuestos en su interior los diversos componentes y proteger el PMT 14 de cualquier luz externa durante las mediciones de ECL.
La celda 12 en sí incluye un primer bloque 20 de montaje a cuyo través pasa un tubo 22 de entrada y un tubo 24 de salida, que pueden estar ventajosamente construidos de acero inoxidable. El bloque 20 de montaje tiene una primera superficie externa 26 y una seguida superficie interna 28 que definen un lado de un volumen 30 de mantenimiento de la muestra de la celda 12 en el que la celda 12 mantiene las soluciones de limpieza y/o acondicionamiento y/o medición durante las correspondientes operaciones del aparato 10. Los tubos 22 y 24 de entrada y salida pasan a través del bloque 20 de montaje desde la superficie exterior 26 hasta la superficie interior 28 y se abren en forma de un volumen 30 de mantenimiento de la muestra. Un segundo bloque 32 de montaje, construido ventajosamente de acero inoxidable, tienen también una primera superficie externa 34 y una segunda superficie interna 36. El segundo bloque de montaje 32 está separado del primero bloque 20 de montaje por un separador anular 38, construido ventajosamente de Teflon u otro material no contaminable. Por tanto, la superficie externa 34 del bloque 32 de montaje define parte del segundo lado del volumen 30 de mantenimiento de la muestra. El separador 38 tiene una parte externa 40 y una abertura central 42 cuyo borde interno 44 define la pared lateral del volumen 30 de mantenimiento de la muestra. La parte externa 40 sella la superficie interna 28 del primero bloque 20 de montaje a la superficie externa 34 del segundo bloque 32 de montaje para evitar que cualquier solución pase fuera del volumen 30 de mantenimiento de la muestra entre las dos superficies 28 y 34. El bloque 32 de montaje tiene adicionalmente una abertura central 46 en la que una ventana 48 está fijada por sellado para definir el resto del segundo lado del volumen 30 de mantenimiento de la muestra como una continuación de la superficie externa 34. La ventana 48 está formada de un material que sea sustancialmente transparente a la longitud de onda de la luz electroquimioluminiscente emitida por el resto de ECL. La ventana 48, por lo tanto, está formada ventajosamente de vidrio, plástico, cuarzo o similar.
El tubo 22 de entrada intersecciona con el volumen 30 de mantenimiento de la muestra en un primer externo 50 del mismo adyacente al separador 38 y el tubo 24 de salida intersecciona con el volumen 30 de mantenimiento de la muestra en un segundo extremo 52 del mismo, adyacente al separador 38. La combinación del tubo 22 de entrada, volumen 30 de mantenimiento de la muestra y tubo 24 de salida proporciona así una trayectoria de flujo continuo para el flujo estrecho y sustancialmente laminar de una solución hacia, a través y desde la celda 12. Las flechas A y B representan el flujo adentro y afuera del tubo 22 de entrada y el tubo 24 de salida, respectivamente.
Dispuesto en la superficie interna 28 del primer bloque 20 de montaje está un sistema 54 de electrodos de trabajo que, en la realización ilustrada, incluye unos primero y segundo electrodos de trabajo 56 y 58. En otras realizaciones, se puede proporcionar ventajosamente un único electrodo de trabajo, o solamente el electrodo 56 puede ser un electrodo de trabajo. Los electrodos de trabajo 56 y 58 están donde pueden tener lugar las reacciones de interés electroquímicas y de ECL. Los electrodos de trabajo 56 y 58 son electrodos voltamétricos sólidos y, por lo tanto, pueden estar construidos ventajosamente de platino, oro, carbonos u otros materiales que sean eficaces para esta finalidad. Los conectores 60 y 62 de alambres, conectados a los electrodos de trabajo 56 y 58, pasan por fuera a través del primero bloque 20 de montaje.
Los conectores 60 y 62 están conectados ambos a un primer terminal 64 de "electrodos de trabajo" de un control 66 del voltaje, ilustrado en la Fig. 2. El control 66 del voltaje funciona ventajosamente a la manera de un potenciostato para suministrar señales de voltaje a los electrodos de trabajo 56 y 58 y, opcionalmente, para medir la corriente que fluye desde los mismos durante una medición de la ECL. Alternativamente, los conectores 60 y 62 pueden estar conectados a terminales separados de control 66 del voltaje para un funcionamiento individual.
El funcionamiento del potenciostato de control 66 del voltaje se efectúa adicionalmente a través de un contra-electrodo 68 y, opcional pero ventajosamente, un electrodo 70 de referencia. En la realización ilustrada, el bloque 32 de montaje está hecho de acero inoxidable y el contra-electrodo 68 consiste en las superficies expuestas 72 y 74 del bloque 32 de montaje. Los contra-electrodos 72 y 74 y los electrodos 56 y 58 de trabajo proporcionan la superficie interfacial para imprimir el potencial a la solución dentro del volumen 30 de mantenimiento de la muestra que aporta la energía para las reacciones químicas y provoca la electroquimioluminiscencia en la muestra y/o proporciona energía para limpiar y acondicionar las superficies de la celda 12. Los contra-electrodos 72 y 74 están conectados por un conector 76 de alambre a un segundo terminal 78 de "contra-electrodos" de control 66 del voltaje.
El electrodo 70 de referencia proporciona un voltaje de referencia al que se refiere el voltaje aplicado por los electrodos 56 y 58 de trabajo, por ejemplo, +1,2 voltios frente a la referencia. El electrodo 70 de referencia se coloca ventajosamente en el tubo 24 de salida en una posición 80 separada de la celda 12, y está conectado a través de un conector 82 de alambre a un tercer terminal 84 de "electrodos de referencia" de control 66 del voltaje. En el modo de tres electrodos, la corriente no puede fluir a través del electrodo 70 de referencia. El electrodo 70 de referencia se puede usar en un modo de funcionamiento de tres electrodos para proporciona un voltaje equilibrado, conocido y estable y, por lo tanto, se construye ventajosamente de plata/cloruro de plata (Ag/AgCl) o es un electrodo de calomelanos saturado (SCE).El control 66 del voltaje se puede hacer funcionar en un modo de funcionamiento de dos electrodos usando solamente el electrodo 56 de referencia y el electrodo 58 como un electrodo contrario/referencia. En este modo de funcionamiento de dos electrodos, el electrodo 58 contrario/referencia está eléctricamente conectado a los terminales 78 y 84 de control del voltaje en el control 66 del voltaje. En este caso, el control 66 del voltaje funciona esencialmente como una batería. El control 66 del voltaje suministra señales de voltaje a los electrodos 56 y 58 de trabajo y contrario y, opcionalmente, mide la corriente que fluye a través de los electrodos respectivos. El electrodo 70 de referencia puede ser alternativamente un denominado electrodo de "casi referencia" construido de platino, oro, acero inoxidable u otro material, que proporcione un voltaje menos estable, y que sin embargo sea medible con respecto a la solución en contacto. En el modo tanto de dos como de tres electrodos, el electrodo 70 o 58 de referencia sirve para la finalidad de proporcionar una referencia frente a la cual se mide el voltaje aplicado a los electrodos 56 de referencia. La referencia de voltaje equilibrado se considera actualmente que es más ventajosa. El control 66 del voltaje en su funcionamiento de potenciostato controla los diversos electrodos proporcionando un voltaje conocido a los electrodos 56 y 58 de trabajo con respecto al electrodo 70 de referencia, mientras mide el flujo de corriente entre los electrodos 56 y 58 de trabajo y el contraelectrodo 72 y 74. Los potenciostatos para esta finalidad son bien conocidos, y la estructura interna del control 66 del voltaje puede corresponder por lo tanto a cualquiera de los potenciostatos convencionales disponibles en el comercio que produzcan las funciones anteriormente citadas y, por tanto, no forman parte de la presente invención per se. De hecho, el aparato 10 se puede construir alternativamente sin un control 66 del voltaje interno, y se puede adaptar para estar conectado a un potenciostato externo que está separadamente controlado para proporcionar las señales de voltaje requeridas a los electrodos 56, 58, 72, 74 y 70. Estas señales de voltaje, aplicadas de una manera específica como se describe con posterioridad, proporcionan condiciones repetibles para las superficies de los electrodos 56 y 58 de trabajo y, ventajosamente, para las superficies de la celda 12 en su conjunto, una característica que contribuye significativamente a una precisión mejorada en mediciones de ECL.
La bomba 16 se coloca ventajosamente en el tubo 24 de entrada para "propulsar" la solución desde un volumen de muestras en la dirección de la flecha A al interior del tubo 22 de entrada. La solución fluirá a través del tubo 22 de entrada, el volumen 30 de mantenimiento de muestras y el tubo 24 de salida, pasará por el electrodo 70 de referencia y hacia afuera en la dirección de la flecha B. Alternativamente, la bomba 16 se puede colocar en un tubo 22 de entrada para "propulsar" la solución a través del aparato 10. Ventajosamente, esta misma trayectoria del flujo transversal del tuvo 22, volumen 30 de mantenimiento de muestras y tubo 24 de salida se usa para todas las soluciones y fluidos que pasan a través de la celda 12, con lo que cada fluido realiza una acción de limpieza hidrodinámica al forzar el fluido previo fuera de la celda 12. La bomba 16 puede estar controlada para suspender su funcionamiento para mantener una solución particular en la celda 12 durante cualquier período de tiempo.
La construcción de flujo transversal del aparato 10 permite que a los electrodos de trabajo se les imprima un voltaje variable o se mantengan continuamente a un potencial preoperativo mientras están continuamente expuestos a una o más soluciones, sin exponer los electrodos 56 y 58 de trabajo (o los electrodos 72, 74 y 70 contrarios y de referencia) al aire. La exposición al aire, que abre el circuito al electrodo 70 de referencia, permite fluctuaciones de voltaje desconocidas y al azar que destruyen el carácter reproducible en las condiciones superficiales en los electrodos 56 y 58 de trabajo. La construcción de flujo transversal permite la rápida alternancia entre las etapas de inicio, en las que el sistema 54 de electrodos es limpiado y acondicionado, y las etapas de medición, en las que una o más formas de ondas o barridos de las mediciones provocan la ECL.
Las Figs. 23 y 24 muestran esquemáticamente una celda e imanes 27/37 que están equipados con un sistema de imanes que imponen ventajosamente líneas de campo que son principalmente paralelas al plano de la superficie 56 y 58 del electrodo. El sistema de imanes consiste en una pluralidad de electroimanes individuales y permanentes que están apilados y orientados de forma que los polos norte y sur de los imanes 27/37 se alternan en el apilamiento. Los imanes individuales entre los imanes 27/37 están separados por aire o cualquier material que no sea magnéticamente sensible. La disposición que se muestra en las Figs. 23 y 24 aplica ventajosamente líneas de fuerza magnéticas a la zona por encima del electrodo de trabajo que son aproximadamente horizontales al plano del electrodo. Esto induce una orientación de las partículas magnéticamente sensibles en las que las partículas descansan en la superficie del electrodo y son fácilmente accesibles para la energía electroquímica suministrada por el electrodo; véase la Fig. 20.
El sistema de imanes 27/37 mostrado en las Figs. 23 y 24 es también ventajoso en cuanto que las líneas del campo magnético no se extienden una distancia larga desde la estructura de imanes; véase la Fig. 20. El campo magnético a partir de tal sistema de imanes, por lo tanto, no es probable que induzca un comportamiento magnético permanente para materiales ferromagnéticos cerca del aparato de los electrodos, y no afectará gravemente al funcionamiento del tubo fotomultiplicador cerca del aparato de la celda de flujo. El aparato expuesto en la Fig. 21 es como el mostrado en las Figs. 1 y 2, y es como se describió anteriormente con respecto a las Figs. 1 y 2, con la excepción de que en la Fig. 25, colocados verticalmente por debajo del electrodo 56 o los electrodos 56 y 58, está una pluralidad de imanes 27/37 en una orientación norte-sur, como se muestra en las Figs. 23 y 24.
La invención se dirige también a composiciones de reactivos. De forma amplia, las composiciones de reactivos pueden estar en uno cualquiera de los componentes del sistema de ensayo de la invención, es decir, (a) electrolito, (b) compuesto marcador que contiene un resto de ECL, (c) partículas, incluidas partículas magnéticamente sensibles, (d) analito de interés o un análogo del analito de interés, (e) un asociado de unión del analito de interés o de su análogo, (f) un componente reactivo capaz de reaccionar con (d) o (e), (g) un reductor, o (h) un mejorador de la reacción de electroquimioluminiscencia. Los reactivos pueden ser combinados unos con otros por motivos de conveniencia de uso, es decir, pueden ser preparadas mezclas de dos componentes, tres componentes y más componentes múltiples, con la condición de que los componentes no sean reactivos unos con otros durante el almacenamiento, de forma que se obstaculice su función en el ensayo previsto. Deseablemente, los reactivos son mezclas de dos componentes o múltiples componentes que contienen partículas así como uno o más de otros componentes.
La invención se dirige también a estuches de ensayo. Los estuches de ensayo pueden incluir recipientes que contengan uno o más de los componentes (a) a (h) anteriormente citados, o los estuches de ensayo pueden contener recipientes que contengan una o más composiciones de reactivos como se describieron anteriormente, que comprendan mezclas de esos componentes, todo ello para ser usado en los métodos y sistemas de ensayo de la invención.
Descripción de realizaciones preferidas de la invención
Aunque puede ser empleada una amplia diversidad de partículas en los ensayos basados en partículas de la invención, generalmente las partículas tienen una densidad de 1,0 a 5,0 g/ml y, preferentemente, tienen una densidad de 1,1 a 2 g/ml. La elección de la densidad óptima está dentro de los conocimientos de la técnica, siendo la velocidad de sedimentación en ensayos movidos por la gravedad un compromiso entre la velocidad del ensayo y el deseo de crear una capa uniforme de complejo en la superficie de los electrodos.
Pueden ser empleadas también partículas que tengas un amplio intervalo de diámetros medios. Pueden ser usadas partículas que tengan un diámetro medio de 0,001 a 200 \mum, como 0,05 a 200 \mum; y preferentemente las partículas tienen un diámetro medio de 0,01 a 10 \mum.
Se pueden emplear también amplios intervalos de concentración de partículas en la composición del ensayo, Por ejemplo, la concentración puede variar en el intervalo de 1 a 10.000 \mug/ml a preferentemente de 5 a 1000 \mug/ml. Deseablemente, la densidad de las partículas, su tamaño y su concentración se seleccionan de forma que las partículas sedimenten a una velocidad de al menos 0,5 mm/min y, preferentemente, a una velocidad mayor.
En el modo de filtración de realizar la invención, los medios de filtración tienen deseablemente un tamaño de poros, medido como diámetro medio, desde ampliamente 0,01 a 90% del diámetro medio de las partículas y, preferentemente, de 10% a 90% de ese diámetro.
En la técnica se ha descrito un cierto número de partículas magnéticas que se pueden usar en los ensayos de la invención. Por ejemplo, las patentes de EE.UU. nº 4.628.037, 4.695.392, 4.695,393, 4.698,302 y 4.554.088, la solicitud de patente británica GB 2.005.019A y el documento EP 0.180.384 describen una diversidad de partículas magnéticas que se pueden usar satisfactoriamente. Las partículas pueden ser paramagnéticas o ferromagnéticas y pueden estar revestidas con diversos materiales a los que son acoplados compuestos de unión, de forma que la partícula magnética pueda ser usada en inmunoensayos. Deseablemente, las partículas magnéticas usadas en la invención tienen una susceptibilidad de al menos 0,001 unidades cgs y deseablemente la susceptibilidad es de al menos 0,01 unidades cgs. Las partículas magnéticas pueden tener una amplia gana de densidades, es decir, desde sustancialmente menor que la del agua, 0,01, a 5 g/ml y, preferentemente, de 0,5 a 2 g/ml. El tamaño de partículas puede variar en el intervalo de 0,001 a 200, como 0,001 a 200 o 0,05 a 200 \mum; y preferentemente de 0,01 a 10 \mum. La concentración de las partículas puede variar ampliamente en el intervalo de 1 a 10.000 \mug por ml y, preferentemente, es de
5 a 1000 \mug por ml.
Deseablemente, las partículas magnéticas que se usan tienen una baja resonancia magnética, como se describe, por ejemplo, en el documento EP 0.180.384, de forma que después de que se retira el campo magnético de la superficie del electrodo, las partículas se desmagnetizan y pueden ser barridas fuera de la celda de ensayo. Deseablemente la densidad, concentración y tamaño de partículas de las partículas magnéticas se escogen de forma que el tiempo de sedimentación sea al menos 0,5 mm/min y, deseablemente, está por encima de esa velocidad. En el funcionamiento de la celda magnética, es a menudo deseable retirar los medios de imanes de la superficie del electrodo antes de introducir la electroluminiscencia con el fin de no interferir con el funcionamiento del tubo fotomultiplicador.
Ensayos
Se puede realizar una variedad de ensayos usando los métodos de la invención.
Se realizó un ensayo como se muestra en la Fig. 3. Los productos de PCR que resultaban de la reacción se marcaron con biotina y un marcador de ECL (tri-2,2'-bipiridino)Ru II, Ru(bpy)_{3}^{2+}). Los gránulos de estreptavidina capturaban el DNA bifuncionalizado a través de la unión de biotina-estreptavidina y esto estuvo seguido de un lavado. El producto unido a los gránulos se sometió seguidamente a un análisis de detección del marcador de ECL.
Se realizó un ensayo como se muestra en la Fig. 4. El producto de PCR biotinilado se capturó sobre gránulos de estreptavidina y la cadena no biotinilada se separó. El producto de PCR unido a los gránulos fue seguidamente hibridado con un oligonucleótido de ECL marcado (Ru(bpy)_{3}^{2+}). Esto estuvo seguido de un análisis de ECL para detectar el marcador.
Se realizó un ensayo como se muestra en la Fig. 5. Los híbridos se capturaron sobre gránulos de estreptavidina. Esto estuvo seguido de un análisis de ECL sin lavado.
Se realizó un ensayo y los resultados se muestran en la Fig. 6. El ensayo fue para la presencia de HPV 16 y 18 usando muestras de DNA aisladas a partir de las de líneas celulares SiHa y HeLa positivas para ambos tipos de virus y oligonucleótidos específicos para cada tipo de virus. Los cebadores 2PV16, 2PV18 se biotinilaron y 3PV16, 3PV18 eran oligonucleótidos marcados de ECL. Los oligonucléotidos 2/3PV16 y 2/3PV18 eran específicos para HPV 16 y 18, respectivamente. El marcador de ECL resultante capturados en los gránulos se analizó en cuanto a ECL usando un analizador como se describió en la Fig. 1. Los resultados se representaron gráficamente como recuentos de ECL para cada combinación de sondas de muestras.
Se realizó un ensayo y los resultados se muestran en la Fig. 7. El marcador de ECL unido a los gránulos resultante se analizó en cuanto a ECL usando un analizador como se describe en la Fig. 1. Los recuentos de fotones picos de ECL se representaron gráficamente frente a concentraciones crecientes de HPV 16 DNA, expresadas como una relación de copias virales respecto a copias totales de DNA celular. Los cebadores usados en este análisis para HPV16 fueron 1PV16 (marcador de biotina) y 2PV16 (marcador de ECL). El DNA usado para cada PCR se mantuvo a 1 \mug constante usando DNA de timo de ternera.
Se realizó un ensayo y los resultados se muestran en la Fig. 8. El PCR se realizó usando HRP2 biotinilado con HRP1 sin marcar (para las sondas 1T24 y 1CHR) y HRP1 biotinilado con HRP2 sin marcar (para las sondas 2T24 y 2CHR), generando dianas de cadena única unidas a gránulos para la hibridación. Las muestras de DNA eran la normal Gen Ha-ras (Placenta) y la mutante Gen Ha-ras (NIH3T3-T24). La hibridación del DNA unido a los gránulos con marcador de ECL-1T24 (1T24), marcador de ECL-2T24 (2T24), marcador de ECL-1CHR y marcador de ECL-2CHR (2CHR) estuvo seguida de lavados con TEMAC. El marcador de ECL unidos a los gránulos resultante se analizó en cuanto a ECL usando un analizador como se describe en la Fig. 1. Los resultados se representaron gráficamente como recuentos de ECL para cada combinación de sondas de muestras.
Se realizó un ensayo y los resultados se muestran en la Fig. 9. El PCR se realizó como se describió en la Fig. 8 usando solamente HRP2 biotinilado con HRP1 sin marcar (para las sondas 1T24 y 1CHR). Las sondas usadas fueron: 1T24 y 1CHR que contenían P^{32} (1-T24-P, 1-CHR-P) como testigos. Con la 1T24 y 1CHR que contenían ambas P^{32} y marcador de ECL se determinaron los efectos del marcador de ECL. Las muestras se lavaron como anteriormente con TEMAC. El P^{32} unido a los gránulos resultante se analizó por adición a una combinación de escintilación en un contador de escintilación. Los resultados se representaron gráficamente como recuentos de P^{32} por segundo para cada combinación de muestra-sonda.
Se realizó un ensayo y los resultados se muestran en la Fig. 10. El ensayo se realizó como se describe en la Fig. 4. La muestra era DNA placental y la amplificación se realizó usando HRP2 biotinilada con HRP1 sin marcar (para las sondas 1T24 y 1CHR). Seguidamente se tomaron muestras del producto de PCR resultante para proporcionar un conjunto de muestras que contenían cantidades diferentes de producto. Estos conjuntos de muestras fueron seguidamente hibridados con sondas marcadas con P^{32} (1T24-P32 y 1CHR-P32) o marcador de ECL (1T24-ECL y 1CHR-ECL). Los resultados de cada uno de los estudios se normalizaron seguidamente usando el valor medio de los picos de cada marcador para la muestra de 90 \mul. Estas cifras normalizadas permiten una comparación más eficaz de la señal respecto al fondo y la respuesta comparativa de los dos métodos. La cifra en recuadro ilustra la respuesta al nivel inferior de la curva de dilución. Las muestras fueron manejadas como se describió anteriormente (Fig. 6 y Fig. 8).
Se realizó un ensayo y los resultados se muestran en la Fig. 11. El PCR se realizó usando 2PV18 biotinilado y 1PV18 sin marcar usando HeLa DNA (400 copias por celda) usando el formado de PCR ilustrado en la Fig. 3. La reacción de PCR resultante fue seguidamente hibridada con el marcador de ECL de sonda específica 3PV18. La mezcla de hibridación se añadió seguidamente a gránulos revestidos con estreptavidina y el marcador de ECL resultante unido a los gránulos fue seguidamente analizado en cuanto a ECL usando un analizador de ECL como se describió en la Fig. 1. Los resultados se representaron gráficamente como recuentos de ECL frente a copias de HPV18 añadidas al PCR.
Los siguientes Ejemplos no limitativos se proporcionan a modo de ilustración y no se han de considerar como una limitación de esta invención, muchas variaciones evidentes de la cual son posibles sin apartarse de su alcance y características generales.
Ejemplos Instrumentación, materiales y métodos (1) Instrumentación
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Se usó un aparato de flujo transversal, que empleaba tres electrodos, como se describe en las Figs. 1 y 2.
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Electrodo de trabajo - - disco de Au, 3 mm de diámetro
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Contra-electrodo - - disco de Au, 3 mm de diámetro
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Electrodo de referencia - - Ag/AgCl
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Junta de Teflon (0,38 cm de grosor)
\quad
Cara frontal de plexiglás
\quad
Tubo de entrada = 0,106 cm diámetro interno de polipropileno
\quad
Velocidades de aspiración: variables desde 0,01 a 5 ml/minuto.
\quad
Potenciostato: controlado por microprocesador.
\quad
Luminómetro usando Hamamatsu R374 PMT (tubo sensible al rojo de aumento bajo); voltaje de PMT variable 0-1400 V.
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(2) Materiales
(a) Marcador de ECL:
Ru(bpy)_{3}^{2+}
(b) Tampón ECL:
KH_{2}PO_{4} 112 mM, K_{2}HPO_{4}\cdot3H_{2}O 88 mM, NaCl 50 \muM, NaN_{3} 6,5 mM, Triton X-100 0,8 \muM, Tween 20 0,4 mM, tripropilamina 10 mM en H_{2}O
(c) Diluyente de ECL:
KH_{2}PO_{4} 37,5 mM, K_{2}HPO_{4}\cdot3H_{2}O 198,2 mM, NaCl 151,7 mM, NaN_{3} 0,65 mM, albúmina de suero bovino 0,43 mM en H_{2}O
(d) Ru(bpy)_{3}^{2+}-NHS:
Ru(2,2'-bipiridil)-2-(4-[3-81,3-dioxolan-2-il)propil]-4'-metil-2,2'-bipiridina)^{2+}
(e) Partículas Dynal:
(i) Dynal M-450 Dynabeads, partículas supermagnéticas de 4,5 \mum de diámetro, 30 {}\hskip0.4cm mg/ml, obtenidas de la empresa Dynal, 45 North Station Paza, Great Neck, NY {}\hskip0.4cm 11021
\quad
(ii) Dynal M-280 Dynabeads, partículas supermagnéticas de 2,8 \mum de diámetro, 10 {}\hskip0.4cm mg/ml, obtenidas de la empresa Dynal, 45 North Station Paza, Great Neck, NY {}\hskip0.4cm 11021
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(3) Ciclo de medición de la ECL (funcionamiento con celda de tres electrodos)
El ciclo de medición de la ECL consiste en tres etapas: (1) preacondicionamiento, (2) medición y (3) limpieza. La etapa de preacondicionamiento incluye la aplicación de una onda de voltaje triangular de 0,0 V a +2,2 V a -1,0 V a +0,6 V para 2,0 V/s. La etapa de medición incluye la aplicación de una forma de onda triangular de +0,6 V a +2,8 V a +2,0 V a 1,0 V/s. La etapa de limpieza incluye la aplicación de una onda de voltaje cuadrada de +0,0 V a +3,0 V a -0,5 V a 0,0 V. Todos los voltajes son con relación al electrodo de referencia de Ag/AgCl.
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Ejemplo 1 Aparato y método para la recogida de micropartículas por la fuerza de la gravedad
La medición se realiza en una celda como se muestra en la Fig. 12. Las referencias se hacen a la Fig. 12 que expone un aparato para realizar un ensayo usando la fuerza de la gravedad. Los componentes del aparato incluyen una ventana transparente identificada por el número de referencia 48, una junta identificada por el número de referencia 222, un bloque 20 que incluye una entrada 22, un electrodo de trabajo 56/58, un contra-electrodo 72/74 y un orificio 24 de salida. El plano del bloque de la celda es horizontal, es decir, perpendicular a la dirección del campo gravitacional de la tierra. Se impulsan micropartículas marcadas (Dynal) en un tampón de ECL por medio de una bomba peristáltica. La bomba se apaga después de que las partículas alcanzan la celda. Las micropartículas en la cámara de la celda caen en la superficie del electrodo de trabajo. La velocidad de caída de las micropartículas se determina para que sea aproximadamente constante a 0,5 mm/min sobre una distancia de 10 mm, como se muestra en la Fig. 13. El número de partículas que sedimentan es una función del tiempo y de la velocidad de caída. La intensidad de la ECL es proporcional al número de partículas que sedimentan sobre el electrodo de trabajo. El número de partículas que alcanzan la superficie y, por lo tanto, la intensidad de la ECL están limitados por la altura de muestra de fluido sobre el electrodo de trabajo. La Fig. 14 muestra la intensidad de la ECL como una función del tiempo de depósito para dos celdas de diferentes grosores de las juntas, 0,038 mm y 0,19 mm, respectivamente. Ambas celdas tienen similares velocidades de depósito de micropartículas, pero la celda con una junta más gruesa proporciona una lectura máxima que es cinco veces mayor. Los resultados de un ensayo de AFP (proteína fetal alfa) se muestran en la Fig. 15, que compara dos celdas. Nuevamente, la celda con la junta más gruesa proporciona cinco veces la intensidad de la señal de ECL.
Ejemplo 2 Aparato y método de ECL para la depósito de micropartículas
Recogida magnética usando una celda de sedimentación.
Una celda para realizar un ensayo que usa una fuerza magnética para causar que la micropartícula sedimente se muestra en la Fig. 16. La referencia numérica 48 se refiere a una ventana transparente, el número de referencia 122 a una junta, el número de referencia 22 a la entrada en el bloque de la celda, los números de referencia 56/58 al electrodo de trabajo, el número de referencia 24 a la salida de la muestra, el número de referencia 20 al bloque de la celda en sí y la referencia 27 a un electroimán.
El plano del bloque de la celda está orientado horizontalmente. Se propulsan micropartículas marcadas (Dynal) en tampón ECL a la celda por medio de una bomba peristáltica. La bomba se apaga después de que las micropartículas alcanzan la celda. Las micropartículas en la cámara de la celda son propulsadas al electrodo de trabajo por medio de un campo magnético generado usando el electroimán 27 que funciona a 12 voltios y 1,5 amperios. Mediante la aplicación del electroimán, la velocidad de depósito de micropartículas se aumenta grandemente con respecto a la observada cuando las micropartículas sedimentan solamente debido a la fuerza de la gravedad. Esto se muestra en la Fig. 17.
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Ejemplo 3 Aparato y método de ECL para la depósito de micropartículas
Recogida magnética usando una celda de recogida.
Se lleva a cabo un ensayo en una celda como se describe en la Fig. 18. Con respecto a la Fig. 18, la referencia numérica 48 se refiere a una ventana transparente, el número de referencia 132 a una junta, el número de referencia 22 a una entrada en el bloque de la celda, los números de referencia 56/58 a un electrodo de trabajo, el número de referencia 20 al bloque de la celda en sí, el número de referencia 24 a la salida de la muestra y el número de referencia 37 a un imán permanente.
El plano del bloque de la celda está orientado horizontalmente. Se propulsan micropartículas marcadas (Dynal) en tampón ECL a la celda electroquímica por medio de una bomba peristáltica. Antes de la introducción de la muestra, el imán permanente 37 se coloca inmediatamente por debajo del electrodo de trabajo/superficie interfacial de la solución a una distancia de 0,9 mm. A medida que la muestra está siendo propulsada en la celda, las micropartículas se depositan sobre un área sobre el electrodo de trabajo, definida por el área del imán. La bomba se apaga y el imán se retira después de que se haya depositado la totalidad de la muestra. Cuanto más largo sea el tiempo de recogida, más partículas se depositan. El aumento de la concentración de partículas sobre el electrodo de trabajo da lugar a una intensidad aumentada de ECL, como se muestra en la Fig. 19.
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Ejemplo 4 Uso de un imán para la depósito de micropartículas
Orientación del campo magnético.
Las micropartículas 96, 96' que son atraídas a un imán 27/37, tanto si es un imán permanente como si es un electroimán, se alinean con la orientación del campo magnético 98, 98', tal como en la Fig. 20, que expone los campos magnéticos 98 y 98', y las ordenaciones 96 y 96' de las partículas resultantes que son paralelas (A) y perpendiculares (B) a la superficie del electrodo de trabajo 56/58, en las proximidades de esa superficie.
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Ejemplo 5 Recogida y concentración de partículas por filtración
Las micropartículas que son magnéticamente sensibles, no sensibles magnéticamente y de una amplia gama de densidades, se pueden recoger ventajosamente por filtración en la superficie de un filtro de membrana. En una realización de la invención, las partículas son bombeadas a través de una parte de una membrana del filtro que tiene tamaños de poros que son más pequeños que el diámetro de las partículas, pero preferentemente son sustancialmente más pequeños que el diámetro de las partículas y a una densidad superficial suficientemente elevada, de forma que la recogida de partículas no cause un bloqueo de los poros. Ventajosamente, el filtro es mayormente transparente de forma que el filtro, después de la recogida de las partículas, se puede colocar en la superficie de un electrodo de trabajo con la finalidad de inducir una ECL a partir de las partículas y medir la luminiscencia para medir la cantidad de marcador de ECL en las partículas.
En otra realización, el filtro de membrana que tiene tamaños de poros como se describió anteriormente está unido o colocado en la superficie de un material absorbente de forma que la capilaridad o "succión" impulsará espontáneamente los fluidos que contienen micropartículas a través del filtro de membrana sin requerir ningún aparato para inducir el fluido de flujo transversal del filtro.
En la realización preferida, el filtro de membrana, que tiene un tamaño de poros como se describió anteriormente, está revestido con una película delgada de metal u otro material conductor de la electricidad, de forma que la superficie de la membrana puede servir como un electrodo de trabajo en un aparato de ECL. Las películas conductoras se aplican fácilmente a la superficie de una membrana mediante métodos comúnmente usados en la fabricación de dispositivos microelectrónicos, por ejemplo, evaporación térmica o pulverización iónica. Tal filtro-electrodo se dispone fácilmente en una celda de flujo, de forma que la trayectoria del flujo para el fluido sea a través del filtro-electrodo. Las partículas en la corriente son atrapadas por el filtro-electrodo y son fácilmente lavadas in situ, proporcionando un medio rápido y sencillo para realizar ensayos heterogéneos sin ningún aparato de lavado externo.
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Ejemplo 6 Recogida y concentración de partículas por el método centrífugo
La celda de flujo rotatorio mostrada en la Fig. 21 proporciona otro medio para capturar el complejo en la superficie del electrodo de trabajo con el fin de medir la luminiscencia. La solución del ensayo entra en el aparato a través de la entrada 261 y es bombeada en la celda 262 a través del sello rotatorio 263 mientras que se confiere un movimiento rotatorio a la celda, como se indica mediante la flecha R. Las partículas más densas del complejo se concentran en la superficie del electrodo de trabajo 264. Aunque la celda esté todavía rotando, la solución sale de la celda a través de la salida 268. La luz producida que pasa a través de la ventana 267 de la celda se mide mediante el tubo fotomultiplicador 265. La luz producida se dirige desde la(s) superficie(s) vertical(es) 264 de los electrodos de trabajo, reflejándose en la(s)
superficie(s) curvada(s) 266 de espejos colocados en el centro de la celda; se muestran también contra-electrodo(s)
269. La celda se inunda seguidamente y se limpia para el siguiente ciclo. Esto se puede realizar con la celda tapada o en rotación. Por tanto, la Fig. 21 muestra un método y aparato centrífugos de la invención para capturar partículas, así como una celda de flujo centrífugo de la invención.
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Ejemplo 7 Revestimiento de partículas con proteína marcada no específica a una concentración superficial moderada
Se lavaron 30 mg (1 ml) de gránulos M-450 DYNABEADS (DYNAL, Oslo, Noruega) de poliestireno magnéticamente sensibles y sin revestir, de 4,5 \mum, mediante separación magnética con una solución a pH 7,5 de tampón de fosfato 150 mM usando 2 ml/lavado. Se añadieron a las partículas 150 \mug de IgG de ratón marcado con Ru(bpy)_{3}^{2+} (Jackson Immunochemicals) en 1 ml de solución salina tamponada con fosfato (PBS) con 0,05% de timerasol. Esta mezcla se dejó incubar durante una noche a temperatura ambiente con rotación. Seguidamente, la solución fue magnéticamente separada de las partículas y fue retirada. A los sitios sin reaccionar del bloque, se añadieron a las partículas 1 ml de 3% de BSA/PBS con 0,05% de azida de sodio, y la solución resultante se dejó incubar 2 horas a temperatura ambiente. Las partículas se lavaron 5 veces (2 ml/lavado), y finalmente se volvieron a poner en suspensión en 6 ml del mismo tampón para ser almacenadas.
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Ejemplo 8 Medición electroquimioluminiscente (ECL) usando partículas magnéticamente sensibles
Partículas magnéticamente sensibles, polímeras y no polímeras, uniformes y no uniformes (Dynal, Oslo, Noruega; Polysciences, Warrington, PA 18976; Cortex Biochem, San Leandro, CA 94577; Aldrich, Milwaukee, WI 53201) fueron revestidas con proteínas marcadas como se describió en el Ejemplo 7. Las partículas revestidas se lavaron con tampón ECL tres veces antes de constituir 2 ml de una suspensión de 300 \mug/ml. Usando una bomba peristáltica, se propulsaron 500 \mul de la suspensión de partículas en la celda de flujo (Ejemplo 3). A medida que las partículas fluían hacia el electrodo de trabajo, fueron atraídas y concentradas en la superficie del electrodo de trabajo mediante un imán. La electroquimioluminiscencia usando las partículas magnéticas se midió usando un tubo fotomultiplicador Hamamatsu R374 centrado por encima de la celda de flujo, en el que las partículas se habían concentrado en la superficie del electrodo de trabajo. La Tabla I muestra los niveles de fotoemisión ECL obtenidos a partir de las partículas magnéticamente sensibles revestidas con proteínas marcadas.
TABLA I Mediciones de ECL a partir de diferentes partículas magnéticamente sensibles
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Ejemplo 9 Medición electroquimioluminiscentes (ECL) usando partículas no magnéticas
Partículas que no eran magnéticamente sensibles, polímeras y no polímeras, uniformes y no uniformes (Aldrich, Milwaukee, WI 53201; Duke Scientific, Palo Alto, CA 94303) fueron revestidas con proteínas marcadas como se describió en el Ejemplo 7. Las partículas revestidas fueron lavadas con tampón ECL tres veces antes de constituir 2 ml de una suspensión de 300 \mug/ml. Usando una bomba peristáltica, se propulsaron 500 \mul de la suspensión de partículas en la celda de flujo. Las partículas revestidas fueron seguidamente concentradas sobre el electrodo de trabajo por medios gravitacionales, como se describió en el Ejemplo 1. La electroquimioluminiscencia usando las partículas no magnéticas se midió con un tubo fotomultiplicador Hamamatsu R374 centrado por encima de la celda de flujo, en el que las partículas se habían concentrado en la superficie del electrodo de trabajo. La Tabla II muestra los niveles de fotoemisión de ECL obtenidos a partir de las partículas no magnéticas revestidas.
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(Tabla pasa a página siguiente)
TABLA II
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Ejemplo 10 Preparación de partículas Dynal revestidas con hormona estimulante anti-tiroides (TSH) de oveja físicamente adsorbida
Reactivo I
Se lavó 1 ml de partículas de poliestireno magnéticas, sin revestir, de 4,5 \mum, con residuos -OH en su superficie (DYNAL, DYNABEADS M-450, DYNAL A.S. Oslo, Noruega) mediante separación magnética con una solución a pH 9,6 de carbonato/bicarbonato de sodio 150 mM usando 2 ml /lavado. Se añadieron a las partículas 0,5 mg de anticuerpo lavado con HCG (CIBA), anti-TSH de oveja purificado por afinidad en 1 ml de la solución de carbonato/bicarbonato. Esta mezcla se incubó durante una noche a temperatura ambiente con mezcladura. Seguidamente, la solución fue magnéticamente separada de las partículas y se retiró. Se añadió 1 ml de 3% de BSA/PBS con 0,05% de azida de sodio y se incubó 2 horas a temperatura ambiente con agitación para bloquear los sitios sin reaccionar. Las partículas se lavaron 5 veces (2 ml/lavado) y a continuación se volvieron a poner finalmente en suspensión en 1 ml del mismo tampón para ser almacenadas. La concentración final del Reactivo I de gránulos era 3% en peso.
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Ejemplo 11 Preparación de conjugado de Ouabaina-BSA
Reactivo II
Activación de ouabaina
Se mezclaron 60,4 mg de octahidrato de ouabaína (Aldrich Cat nº 14, 193-3) en 6 ml de di-H_{2}O desionizada (envueltos en una hoja) con 87 mg de metaperyodato de sodio (Mallinckrodt Cat nº 1139) y la mezcla se incubó a temperatura ambiente durante 2 horas con rotación. La reacción se terminó haciendo pasar la mezcla de reacción a través de una resina de intercambio iónico Dowex 1 x 8-50 (Aldrich Cat nº 21, 740-9) con di-H_{2}O. Se añadieron 200 \mul de fosfato de sodio a pH 7,2 para ajustar el pH de la solución a 7,0.
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Conjugación de ouabaina activada a BSA
Seguidamente se añadieron gota a gota 50 mg de Ouabaina activada (4,6 ml) a 108 mg de BSA de albúmina de suero bovino (Miles Fraction V) en 5 ml de PBS 0,15 M a pH 7,8. Esto es una relación 40:1 (OUABAINA:BSA). La reacción se incubó a temperatura ambiente durante 2 horas, con mezcladura, y seguidamente se añadieron rápidamente 30 mg de cianoborohidruro de sodio mientras se mezclaba. La ouabaína libre y el cianoborohidruro de sodio en exceso se separaron por diálisis a 4ºC en PBS 0,15 M con 0,05% de azida de sodio a pH 7,8. El Reactivo II de conjugado de Ouabaina-BSA se almacenó a 4ºC.
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Ejemplo 12 Preparación de partículas Dynal revestidas con Ouabaina-BSA físicamente adsorbidas
Reactivo III
Se lavaron 5 mg de partículas de poliestireno magnéticas sin revestir de 4,5 \mum con residuos -OH sobre su superficie (DYNAL, DYNABEADS M-450, DYNAL A.S. Oslo, Noruega) por separación magnética con una solución a pH 9,6 de carbonato/bicarbonato de sodio 150 mM usando 10 ml/lavado. Se añadieron a las partículas 3 mg de conjugado de Ouabaina-BSA (Reactivo conjugado II) en 5 ml de la solución de carbonato/bicarbonato. La mezcla se incubó durante una noche a temperatura ambiente mientras se hacía rotar. Seguidamente, la solución fue magnéticamente separada de las partículas y se retiró. Se añadieron 5 ml de 3% de BSA/PBS con 0,05% de azida de sodio y se incubó 2 horas a temperatura ambiente, haciendo rotar para bloquear los sitios sin reaccionar. Las partículas se lavaron 5 veces (10 ml/lavado) y seguidamente se volvieron a poner finalmente en suspensión en 1 ml del mismo tampón para almacenar. La concentración final de Reactivo III de partículas fue 3% en peso.
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Ejemplo 13 Preparación de anti-digoxina de ratón marcada con Ru(bpy)_{3}^{2+}
Reactivo IV
Se marcó 1 mg de anti-digoxina de ratón (Cambridge Medical Technologies Cat nº 200-014 Lote A3575) con Ru(bpy)_{3}^{2+}. El anticuerpo monoclonal (MAb) anticuerpo anti-digoxina fue intercambiado en tampón usando microconcentradores Centricon 30 (Amicon) en tampón de fosfato de potasio 0,15 M, NaCl 0,15 M a pH 7,8, siendo 0,5 ml el volumen final. Inmediatamente antes de ser usados, se disolvieron 0,5 mg de Ru(bpy)_{3}^{2+}-NHS con 125 \mul de dimetil-sulfóxido anhidro (Aldrich). Para conseguir una relación en moles 25:1 de Ru(bpy)_{3}^{2+} a proteína basada en los pesos moleculares de 1057 y 150.000, respectivamente, se añadieron 0,18 mg de Ru(bpy)_{3}^{2+}-NHS (45 \mul) a la solución de proteína mientras se agitaba. La reacción se incubó en la oscuridad a temperatura ambiente 30 minutos mientras se agitaba. La reacción se terminó mediante la adición de 25 \mul de glicina 1 M y se incubó durante 10 minutos. La mezcla de reacción se purificó mediante paso a través de una columna Sephadex G-25 (1 x 20 cm en fosfato de potasio 0,15 M, NaCl 0,15 M con 0,05% de azida de sodio, pH 7,2). Las fracciones de anti-digoxina de ratón marcada con Ru(bpy)_{3}^{2+} se recogieron y se reunieron. La proteína marcada (Reactivo IV) se determinó que tenía 12 marcadores por moléculas de proteína.
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Ejemplo 14 Preparación de anti-hormona estimuladora de tiroides (TSH) de ratón marcada con Ru(bpy)_{3}^{2+}
Reactivo V
Se marcaron 0,5 mg de anti-TSH de ratón (CIBA) con Ru(bpy)_{3}^{2+}. El anticuerpo anti-TSH MAb fue intercambiado en tampón usando microconcentradores Centricon 30 (Amicon) en tampón de fosfato de potasio 0,15 M, NaCl 0,15 M, pH 7,8, siendo 0,35 ml el volumen final. Inmediatamente antes de ser usado, se disolvieron 0,5 mg de Ru(bpy)_{3}^{2+}-NHS en 75 \mul de dimetil-sulfóxido anhidro (Aldrich). Para conseguir una relación en moles 50:1 de marcador de Ru(bpy)_{3}^{2+} a proteína basada en los pesos moleculares de 1057 y 150.000 respectivamente, se añadieron 0,176 mg de Ru(bpy)_{3}^{2+}-NHS (26,4 \mul) a la solución de proteína mientras se agitaba. El tubo de reacción se incubó en la oscuridad a temperatura ambiente, 30 minutos, mientras se agitaba. La reacción se terminó mediante la adición de 25 \mul de glicina 1 M y se incubó durante 10 minutos. La mezcla de reacción se purificó mediante su paso a través de una columna Sephadex G-25 25 (1 x 20 cm en fosfato de potasio 0,15 M, NaCl 0,15 M con 0,05% de azida de sodio, pH 7,2). Las fracciones de anti-TSH de ratón marcadas con Ru(bpy)_{3}^{2+} se recogieron y se reunieron. La proteína marcada (Reactivo V) se determinó que tenía 14 marcadores por proteína.
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Ejemplo 15 Ensayo en emparedado de separación en una etapa para hormona estimuladora de tiroides (TSH)
Se combinaron 100 \mul de calibradores de suero (estuche de ensayo de London Diagnostics TSH LumiTAG), 25 \mul de anti-TSH de ratón marcado con Ru(bpy)_{3}^{2+} (Reactivo V) en tampón ECL y 25 \mul de partículas de anti-TSH-DYNAL de oveja (Reactivo I) en tampón ECL y se incubaron en tubos de polipropileno durante 15 minutos, a temperatura ambiente, con mezcladura. Las partículas se lavaron seguidamente por separación magnética y seguidamente se volvieron a poner las suspensión las partículas en 500 \mul de tampón ECL. Este procedimiento de lavado se repitió dos veces adicionales. Finalmente, las partículas se volvieron a poner en suspensión en 1 ml de tampón ECL. La electroquimioluminiscencia (ECL) para cada muestra se leyó como se describió en el Ejemplo 3. Los recuentos de ECL son directamente proporcionales a la concentración de analito presente en la muestra (recuentos crecientes a medida que aumenta la concentración de analito). La Tabla III muestra una curva de ensayo representativa.
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TABLA III Ensayo en emparedado de separación en una etapa; detección de TSH
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Ejemplo 16 Ensayo en emparedado de no separación en una etapa para hormona estimuladora de tiroides (TSH)
Se combinaron 100 \mul de calibradores (estuche de ensayo London Diagnostics THS LumiTAG), 25 \mul de anti-TSH de ratón marcado con Ru(bpy)_{3}^{2+} (Reactivo V) en tampón ECL y se incubaron en tubos de polipropileno durante 15 minutos a temperatura ambiente con agitación. Antes de la lectura de resultados, se añadió 1 ml de tampón ECL. La electroquimioluminiscencia (ECL) para cada muestra se leyó como se describió en el Ejemplo 3. Los recuentos de ECL son directamente proporcionales a la concentración de analito presente en la muestra (recuentos crecientes a medida que aumenta la concentración de analito). La Tabla IV muestra una curva de ensayo representativa.
TABLA IV
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Ejemplo 17 Ensayo competitivo de separación en dos etapas para digoxina
Se combinaron 50 \mul de calibrador de suero (Ensayo TDx, Abbott Labs, Chicago, IL) y 25 \mul de anti-digoxina de ratón marcado con Ru(bpy)_{3}^{2+} (Reactivo IV) en tampón ECL y se incubaron 20 minutos a temperatura ambiente con mezcladura. Se añadieron 25 \mul de partículas de Oubaína-BSA-DYNAL (Reactivo III) en tampón ECL y se incubaron 20 minutos adicionales, a temperatura ambiente, con mezcladura. Las partículas se lavaron seguidamente por separación magnética y seguidamente se volvieron a poner en suspensión las partículas en 500 \mul de tampón ECL. Este procedimiento de lavado se repitió dos veces adicionales. finalmente, las partículas se volvieron a poner en suspensión en 1 ml de tampón ECL. La electroquimioluminiscencia (ECL) para cada muestra se leyó como se describió en el Ejemplo 3. Los recuentos de ECL son inversamente proporcionales a la concentración de analito presente en la muestra (recuentos decrecientes a medida que aumenta la concentración de analito). La Tabla V muestra una curva de ensayo representativa.
TABLA V
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Ejemplo 18 Ensayo competitivo de no separación en dos etapas para digoxina
Se combinaron 50 \mul de calibrador de suero (ensayo TDx, Abbott Labs., Chicago, IL) y 25 \mul de anti-digoxina de ratón marcada con Ru(bpy)_{3}^{2+} (Reactivo IV) en tapón ECL y se incubaron 20 minutos a temperatura ambiente con mezcladura. Antes de la lectura, las partículas se volvieron a poner en suspensión en 1 ml de tampón ECL. La electroquimioluminiscencia (ECL) para cada muestra le leyó como se describió en el Ejemplo 3. Los recuentos de ECL son inversamente proporcionales a la concentración de analito presente en la muestra (recuentos decrecientes a medida que aumenta la concentración de analito). La Tabla IV muestra una curva de ensayo representativa.
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TABLA VI
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Ejemplo 19 Ensayo competitivo de no separación en dos etapas para digoxina usando un ciclo de lectura con lavado adicional de la muestra final de la reacción en el electrodo
Se combinaron 50 \mul de calibrador de suero (ensayo TDx, Abbott Labs., Chicago, IL) y anti-digoxina de ratón marcada con Ru(bpy)_{3}^{2+} (Reactivo IV) en tampón ECL y se incubaron 20 minutos a temperatura ambiente con mezcladura. Se añadieron 25 \mul de partículas de oubaína-BSA-DYNAL (Reactivo III) en tampón ECL y se incubaron 20 minutos adicionales, a temperatura ambiente, con mezcladura. Antes de la lectura, las partículas se volvieron a poner en suspensión en 1 ml de tampón ECL. La electroquimioluminiscencia (ECL) para cada muestra se leyó como se describió en el Ejemplo 3. Los recuentos de ECL eran inversamente proporcionales ala concentración de analito presente en la muestra (recuentos decrecientes a medida que aumenta la concentración de analito). La Tabla VII muestra una curva de ensayo representativa.
TABLA VII
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Ejemplo 20 Síntesis de oligonucleótidos
Los oligonucleótidos se prepararon en un sintetizador de oligonucleótidos automatizado Applied Biosystemas usando la \beta-cianoetil-fosforamidita (1). Las modificaciones de amino en los oligonucleótidos en el extremo 5' se produjeron en la última etapa de acoplamiento, y en el extremo 3' usando una fase sólida modificada (vidrio de porosidad controlada). La empresa Clotech (San Diego, CA) suministró los modificadores de amino. Los oligonucleótidos modificados en 5' resultantes contenían todos un separador de seis átomos de carbono para el grupo amino denominado (C6, NH2). Los oligonucleótidos modificados en 3% contienen todos un separador de tres átomos de carbono para el grupo amino. Los oligonucleótidos construidos, sus modificaciones y utilidad se describen con posterioridad.
Los oligonucleótidos para el estudio de HPV se dirigieron a la región E6 como se describió anteriormente (2).
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Las secuencias de oligonucleótidos fueron como sigue:
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Estos oligonucleótidos hacen posible la generación de PCR de diversos fragmentos; 3PV18 con 2PV16 o 2PV18 respectivamente forman un fragmento de 62 bp; 1PV16 con 2PV16 forma un fragmento de 103 bp. Debe apreciarse que los oligonucleótidos 3PV16 y 3PV18 se pueden usar también como sondas que se hibridan a los productos de la reacción PCR de 1PV16 con 2PV16 y 1PV18 con 2PV18, así como se hibridan a la cadena producida por los oligonucleótidos 2PV16 y 2PV18 con el PCR. Los oligonucleótidos para los ensayos de mutación puntuales de Ha-ras eran como sigue:
12
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Estos dos cebadores de oligonucleótidos dirigen la síntesis PCR de un fragmento de 80 bp. Las secuencias de sondas usadas para este estudio de mutación puntual fueron como sigue:
13
Aparte de estas secuencias, se sintetizaron también las secuencias anteriores 1CHR y 2T24 sin la modificación en 5' pero con un grupo amino en 3'. Estos oligonucleótidos modificados con amino en 3' fueron marcados con el marcador ECL y se usaron in hibridaciones. El sitio de mutación/desapareamiento se indica mediante el nucleótido en negrita. Las sondas 1T24 y 1CHR se hibridan a la cadena producida por el oligonucleótido HRP2 en la PCR. Las sondas 2T24 y 2CHR se hibridan a la cadena producida por el oligonucleótido HRP1 en la PCR.
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Oligonucleótidos JK8 y JK8C para acoplamiento a partículas:
14
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Estas dos secuencias derivan de secuencias de aecuorina y son complementarias una de otra.
100
Este oligonucleótido fue modificado con amino usando un modificador de amino de la empresa Clontech (San Diego, CA) que permite modificaciones con amino en la secuencia. JK7 fue marcado usando el marcador Ru(bpy)_{3}^{2+}.
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La sonda de oligonucleótidos para aecuorina-RNA generado por transcripción in vitro:
101
este oligo fue marcado con marcador tanto de biotina como de Ru(bpy)_{3}^{2+}. Para la detección de DNA de Escherichia coli se sintetizaron oligonucleótidos específicos para la regio Trp E/D del genoma (3) como sigue:
102 esta secuencia fue marcada con marcador de Ru(bpy)_{3}^{2+} y 103 fue marcado con biotina como se describió anteriormente.
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Ejemplo 21 Oligonucleótidos marcadores
Todos los oligonucleótidos sintéticos se purificaron para separar cualesquiera grupos amino contaminantes por filtración sobre gel en una columna Biogel P6 (BioRad Labs). Se introdujo biotina a través del grupo amino en 5' de los cebadores de PCR usando NHS-Biotina (Clontech, San Diego CA) (4). Se introdujo Ru(bpy)_{3}^{2+}-NHS a través del grupo amino de los oligonucleótidos modificados como sigue. Los oligonucleótidos (0,1 \mumoles) en 100 \mul de PBS (pH 7,4) se hicieron reaccionar con 5 \mumoles de marcador Ru(bpy)_{3}^{2+} disuelto en DMSO durante una noche a temperatura ambiente en la oscuridad. Los oligonucleótidos se recuperaron de estas reacciones de marcado por precipitación en etanol. Estudios recientes han demostrado la capacidad de marcar eficazmente (>80%) usando 0,5 \mumoles de marcador de Ru(bpy)_{3}^{2+} (datos no mostrados).
Los oligonucleótidos marcados se purificaron adicionalmente por HPLC en una columna de semipreparación Vydac C-18 de fase invertida con fases móviles de A) acetato de tetraetilamonio 100 mM, pH 7,0 y B) 50% de A) y 50% de acetonitrilo, llevando el gradiente de 20% a 40% de B.
Las sondas 1CHR y 1T24 se marcaron también con P^{32} usando métodos establecidos que usan polinucleótidos T4-quinasa que generan sondas con una actividad específica de 77.000 cpm/ng (5).
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Ejemplo 22 Preparación de partículas magnéticas de ácidos nucleicos.
Se activaron partículas Dynal M 450 activadas con tolueno-4-sulfonato de 2-fluoro-1-metilpiridinio usando procedimientos estándar (6). Estas partículas activadas se hicieron reaccionar seguidamente con los oligonucleótidos JK8 y JK8C. A 100 mg de partículas Dynal activadas se añadieron 33 mmoles de oligonucleótido en 650 \mul de NaHCO_{3} 0,1 M y seguidamente se incubó durante 3 horas con mezcladura. Las partículas se bloquearon mediante la adición de etanolamina (4 ml, 0,1 M). Las partículas acopladas se mezclaron con 0,5 mg/ml de DNA de esperma de salmón de cadena única en tampón ECL, lavado 4-5 veces en tampón ECL y vuelto a poner en suspensión a 10 mg/ml en tampón ECL que contiene 100 \mug/ml de DNA de esperma de salmón de cadena única.
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Ejemplo 23 Preparación de partículas I magnéticas de estreptavidina
Se activaron partículas Dynal M 450 con tolueno-4-sulfonato de 2-fluoro-1-metilpiridinio usando procedimientos estándar (6). Las partículas activadas se hicieron reaccionar seguidamente con estreptavidina (Sigma Ltd). Las partículas activadas (50 mg) se lavaron con NaHCO_{3} 0,1 M y seguidamente se añadió estreptavidina (1,5 mg) y se hicieron reaccionar durante una noche. Las partículas se bloquearon mediante la adición de etanolamina (4 ml, 0,1 M). Las partículas acopladas se mezclaron con 0,5 mg/ml de DNA de esperma de salmón de cadena única en tampón ECL, se lavaron 4-5 veces en tampón ECL y se volvieron a poner en suspensión a 10 mg/ml en tampón ECL que contenía 100 \mug/ml de DNA de esperma de salmón de cadena única. Las partículas de estreptavidina de Dynal M-280 de mostraron también ser útiles, pero proporcionaron señales inferiores con la presente secuencia de ensayos. Para aplicaciones en inmunoensayos, las partículas se bloquearon con BSA después de un acoplamiento con antígenos so antígenos o anticuerpos, usando los tampones usados para un revestimiento pasivo.
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Ejemplo 24 Preparación de partículas magnéticas II de estreptavidina
A 15 mg de BSA (en 2-3 ml de PBS), se añadieron 105 \mul de dimetilsulfóxido que contenía 50 mg/ml de biotina-x-NHS (Clontech, San Diego CA. 5002-1) y seguidamente se mezcló y se incubó a temperatura ambiente durante 30 minutos. La reacción se interrumpió añadiendo 30 \mul de glicina 1 M y se incubó a temperatura ambiente durante 10 minutos. La mezcla de reacción se purificó por cromatografía de filtración sobre gel (Biorad, Bio-Gel P6). Esta biotina-BSA se filtró usando una jeringa de 0,2 \mum. Se añadieron 5 mg de biotina-BSA en 10 ml de tampón de carbonato/bicarbonato de sodio 0,2 M, tampón (carbonato/bicarbonato) a pH 9,6), a 300 mg de gránulos Dynal con carbonato/bicarbonato (Dynal 14002). Esta mezcla se centrifugó y se incubó durante una noche a temperatura ambiente con mezcladura. Estas partículas fueron magnéticamente separadas tras la adición de 10 ml de diluyente ECL y 100 \mul de tRNA (10 mg/ml). Esta mezcla se incubó durante 3-4 horas a temperatura ambiente con mezcladura. Estas partículas se lavaron una vez con 10 ml de diluyente ECL y volvieron a poner en suspensión en 10 ml de diluyente ECL y 100 \mul de tRNA (10 mg/ml). Esta mezcla se mezcló y se incubó a 2-6ºC durante una noche para estabilizar las proteínas sobre las partículas. Las partículas fueron magnéticamente separadas y se pusieron en suspensión en 10 ml de PBS que contenía 15 mg de estreptavidina (Scripps S 1214) y seguidamente se mezcló durante una hora. Las partículas se lavaron 4 veces en 10 ml de diluyente ECL, con 5 minutos de mezcladura para cada lavado. Las partículas se volvieron a poner finamente en suspensión en 29,7 ml de diluyente ECL y 300 \mul de tRNA (10 mg/ml) hasta una concentración final de 10 mg/ml de partículas + 100 \mug/ml de tRNA.
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Ejemplo 25 Detección de DNA inmovilizado sobre partículas por hibridación con sondas de DNA ECL
La capacidad para detectar ECL después de una hibridación para partículas se demostró mediante la hibridación de partículas acopladas a JK8 y JK8C (Ejemplo 22) con oligonucleótido JK7 marcado con Ru(bpy)_{3}^{2+}. Se mezclaron lotes individuales de partículas (300 \mug) en tampón ECL con 50 \mul de tampón ECL que contenía 12,5, 6,3, 3,01 y 1,5 fmoles de JK7 marcado. Estas mezclas se hibridaron durante 4 horas a 52ºC y seguidamente se lavaron con 1 ml de tampón ECL y se volvieron a poner en suspensión en 830 \mul de tampón ECL. Estas mezclas se analizaron como se describió en el Ejemplo 1. La sonda JK7 es complementaria a la secuencia JK8 y no es complementaria a la secuencia JK8C.
TABLA VIII
15
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Los resultados mostrados en la Tabla VIII demuestran la capacidad para detectar, por hibridación específica, la presencia de secuencias específicas directamente inmovilizadas en la superficie de partículas por ECL.
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Ejemplo 26 Ensayo de RNA basado en ECL asociada a gránulos
Se revistieron partículas de Dynal M 450 con anticuerpo específico para anticuerpos de RNA/DNA (7) siguiendo procedimientos estándar (Ejemplo 10). Las especies específicas de RNA se generaron usando plásmidos derivados de gen de aecuorina clonada (8) del solicitante. Brevemente, el plásmido pA5' fue cortado con EcoRI purificado y sometido a transcripción in vitro usando polimerasa T3 RNA que generaba T3-RI RNA (RNA negativo). También se cortó plásmido pA5' con BamHI purificado y sometido a transcripción in vitro usando polimerasa T7 RNA que generaba T7-Bam RNA (RNA positivo). Estas dos especies de RNA representan por tanto dos especies complementarias de RNA. Estas especies de RNA se purificaron por extracción con un volumen igual de fenol:cloroformo (50:50) seguida de extracción con cloroformo y precipitación de la materia sobrenadante usando 2,5 volúmenes de etanol. La cantidad de RNA se determinó usando electroforesis de gel y espectrofotometría. Estos métodos están bien establecidos y son conocidos por los expertos en la técnica (9). Se marcó estreptavidina con marcador de Ru(bpy)_{3}^{2+} usando métodos establecidos, usando un exceso en moles de 25:1 de marcador de Ru(bpy)_{3}^{2+} sobre estreptavidina (Ejemplo 13). Esta estreptavidina marcada se purificó usando una columna de iminobiotina siguiendo métodos establecidos (10). La estreptavidina se estimó que contenía 10 marcadores de Ru(bpy)_{3}^{2+} por tetrámero de estreptavidina. Esta estreptavidina marcada se complejó seguidamente con T35 biotinilado, esto se consiguió usando una mezcla uno a uno de oligonucleótido a estreptavidina marcada. Específicamente, 20 pmoles de cada uno se mezclaron en un volumen final de 15 \mul de tampón ECL y se incubaron durante una noche a 4ºC para formar el complejo marcado de estreptavidina-oligonucleótido (SA-T35). Las muestras de RNA positivo y negativo (10 mg) se hibridaron a 2 \mul del complejo SA-T35 (ensayo de una etapa) o 25 mg del T35 biotinilado (ensayo de dos etapas). Las muestras se llevaron hasta 50 \mul y se hibridaron durante 3 horas a 50ºC tras la adición de 200 \mug de partículas revestidas con anticuerpos anti-DNA/RNA en 20 \mul de PBS-0,1 BSA. La mezcla se mezcló a temperatura ambiente durante 1 hora y seguidamente se sometió a dos lavados en tampón ECL. Las muestras de la hibridación con el complejo SA-T35 se volvieron a poner en suspensión en 530 \mul de tampón ECL y se analizaron como se describió en el Ejemplo 1. Las muestras de la hibridación con T35 solo biotinilado se incubaron seguidamente con 50 pmoles de estreptoavidina marcada y se incubaron durante 1 h con mezcladura tras dos lavados con tampón ECL. Las muestras de la hibridación se volvieron a poner en suspensión en 530 \mul de tampón ECL y se analizaron como se describió en el Ejemplo 1. Los resultados se presentan en la
Tabla IX.
TABLA IX
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Ejemplo 27 Reacciones de cadenas de polimerasa
Se realizaron reacciones de cadenas de polimerasa esencialmente como se describió (11, 12 y 13). Las reacciones fueron normalmente de 100 \mul salvo que se establezca otra cosa. Las PCR se llevaron a cabo en el modo asimétrico dirigido a la incorporación del marcador de Ru(bpy)_{3}^{2+}, usando 5 pmoles del oligonucleótido biotinilado y 50 pmoles de oligonucleótido marcado con Ru(bpy)_{3}^{2+}. Se realizó el ensayo para la mutación puntual de Ha-ras bajo condiciones idénticas, pero sin el oligonucleótido marcado con Ru(bpy)_{3}^{2+}. También, se realizó el ensayo HPV de no separación asimétricamente, pero haciendo uso de un exceso de diez veces del oligonucleótido biotinilado, normalmente 40 pmoles. Las condiciones del ciclo térmico fueron como sigue, para el ensayo de HPV 18 y 16 de incorporación directa, el perfil fue 93ºC 1 segundo, 50ºC 1 segundo, 60ºC 2 minutos; para el ensayo de mutación puntual de Ha-ras 93ºC 1 segundo, 69ºC 2 minutos; para el ensayo de HPV de no separación 93ºC 10 segundos, 50ºC 30 segundos, 60ºC 2 minutos. El número de ciclos para estos experimentos de PCR fue de 30 a 40, dependiendo del ensayo y del grado de sensibilidad requerido.
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Ejemplo 28 Formato I de ensayo de sondas de DNA. Detección y cuantificación de productos de PCR de virus de papiloma humano por incorporación enzimática
A continuación de una PCR usando la incorporación directa del oligonucleótido marcado con Ru(bpy)_{3}^{3+}, la mezcla de reacción completa (90-100 \mul) se añadió a 600 \mug de partículas magnéticas I acopladas a estreptavidina, y seguidamente se incubó durante 20 minutos a temperatura ambiente con agitación. La fase sólida en estas muestras se separó usando dispositivos magnéticos, se lavó dos veces con tampón ECL, se volvió a poner en suspensión en 530 \mul de tampón ECL y seguidamente se analizó por electroquimioluminiscencia como se describió en el Ejemplo 1. La Fig. 3 ilustra este formato de ensayo. Los resultados para este formato de ensayo se demostraron con muestras (2, 14) de virus de papiloma humano. Específicamente, estudios de la incorporación directa de oligonucleótidos marcados con Ru(bpy)_{3}^{3+} en productos de PCR biotinilados hicieron uso de tipos de virus estrechamente relacionados HPV16 y HPV18. Se hizo un ensayo en cuanto a la presencia de HPV1 16 y 18 usando muestras de DNA positivas para ambos tipos de virus y oligonucleótidos específicos para cada tipo de virus. Los cebadores fueron como sigue: 2PV16 2PV18 fueron biotinilados y 3PV16, 3PV18 eran oligonucleótidos marcados con Ru(bpy)_{3}^{3+}. Los oligonucleótidos 2/3PV16 y 2/3PV18 eran específicos para HPV 16 y 18, respectivamente. El marcador de Ru(bpy)_{3}^{3+} capturado en gránulos resultante fue analizado en cuanto a ECL como se describió en el Ejemplo 1. Los resultados se representaron gráficamente como recuentos de ECL para la combinación de cebadores de cada muestra; véase la Fig. 6.
Para demostrar la naturaleza cuantitativa del formato de ensayo de la presente invención, se generaron una curva estándar de marcador de Ru(bpy)_{3}^{3+} directamente incorporado y oligonucleótidos biotinilados en productos de PCR HPV16. El marcador de Ru(bpy)_{3}^{3+} unido a gránulos resultante se analizó en cuanto a ECL como se describió en el Ejemplo 1. Los recuentos de fotones picos de ECL se representaron gráficamente frente a concentraciones crecientes de DNA de HPV 16, expresadas como relación de copias virales a copias totales de DNA celular. Los cebadores usados en este análisis de HPV16 fueron 1PV16 (marcador de biotina) y marcador de Ru(bpy)_{3}^{3+} de 2PV16. El DNA usado para cada PCR se mantuvo a una constante de 1 \mug usando DNA de timo de ternera. Los resultados para esta curva estándar se muestran en la Figura 7. Estos resultados de especifidad y cuantificación para este formato demuestran la capacidad de estos marcadores de ECL para producir ensayos sencillos y rápidos basados en DNA. Esto demuestra también la capacidad del marcador para ejercer una acción interfacial en reacciones enzimáticas sin interferir en el procedimiento enzimático.
Ejemplo 29 Formato II de ensayo de sondas de DNA. Detección y determinación de mutaciones puntuales en el producto amplificado por PCR de oncogen humano Ha-ras
Se llevaron a cabo reacciones PCR de genes Ha-ras usando HRP1 y HRP2 oligómeros. Usando HRP1 biotinilado con HRP2 sin marcar, el producto de PCR resultante se puede hibridar a sondas de marcador de Ru(bpy)_{3}^{3+}, 2CHR y 2T24. Inversamente, usando HRP2 biotinilado con HRP1 sin marcar, el producto de PCR resultante se puede hibridar a sondas de marcadores de Ru(bpy)_{3}^{3+}, 1CHR y 1T24. El DNA usado era DNA placental humano (normal) y de células NIH353 de ratón, transfectado con el gen mutante Ha-ras del carcinoma de vejiga T24 (15).
El protocolo del ensayo fue como sigue: se añadieron 90 \mul de mezcla de reacción PCR a 600 \mug de estreptavidina acoplada a partículas magnéticas I, y seguidamente se incubó a temperatura ambiente durante 30 minutos. La fase sólida en estas muestras se separó usando dispositivos magnéticos, se lavó con NaOH 50 mM, se lavó con tampón de hibridación (NaCl 0,9 M, NaPO_{4}, pH 7,7, EDTA 5 mM, 0,1% p/v de ficoll, 0,1% p/v de polivinilpirrolidona, 0,1% p/v de albúmina de suero bovino) y se volvió a poner en suspensión en tampón de hibridación que contenía 10 \mug/ml del oligonucleótido marcado con Ru(bpy)_{3}^{3+}. Estas muestras se hibridaron durante 15 minutos a 66ºC.
La fase sólida se separó usando dispositivos magnéticos, se lavó dos veces con NaCl 0,1 M, NaPO_{4} 50 mM, pH 7,7, EDTA 5 mM, se lavó con cloruro de tetrametilamonio 3 M, Tris-HCl 50 mM, pH 8,0, EDTA 2 mM, triton X-100 al 0,025% a temperatura ambiente una vez y a 66ºC dos veces durante 20 minutos cada vez. La fase sólida se lavó con tampón ECL tres veces, se volvió a poner en suspensión en 530 \mul de tampón ECL y se detectó por electroquimioluminiscencia como se describió en el Ejemplo 1. La Fig. 4 ilustra este formato de ensayo.
Los ensayos para productos de PCR de Ha-ras usando sondas marcadas con P^{32} fueron similares a los que usaban marcador de Ru(bpy)_{3}^{3+} con la excepción de que la fase sólida se volvió a poner finalmente en suspensión en 250 \mul de tampón ECL. Estas muestras en suspensión se transfirieron seguidamente a 5 ml de fluido de escintilación en un contador de escintilación líquida Beckman LS-100C.
En la Fig. 8 se muestran datos de un ensayo de mutación puntual para el oncogen Ha-ras. La PCR se realizó como se ilustra en la Fig. 4 usando HRP2 biotinilado con HRP1 sin marcar (para las sondas 1T24 y 1CHR) y HRP1 biotinilado con HRP2 sin marcar (para sondas 2T24 y 2CHR), generando dianas de cadena única unidas a gránulos para la hibridación. Las muestras de DNA eran el gen normal Ha-ras (placenta) y el gen mutante (NIH3T3-T24) Ha-ras. La hibridación del DNA unido a gránulos con Ru(bpy)_{3}^{3+}-marcador-1T24 (1T24), Ru(bpy)_{3}^{3+}-marcador-2T24 (2T24), Ru(bpy)_{3}^{3+}-marcador-1CHR (1CHR) y Ru(bpy)_{3}^{3+}-2CHR (2CHR) estuvo seguida de lavados con TEMAC. El Ru(bpy)_{3}^{3+}-marcador unido a gránulos resultante fue analizado en cuanto a ECL como se describió en el Ejemplo 1. Los resultados se representaron gráficamente como recuentos de ECL para cada combinación de sondas de muestras. Los resultados (Fig. 8) fueron como era de esperar, hibridándose bien las sondas normales al DNA normal (véanse las sondas CHR) e hibridándose las sondas mutantes al gen mutante (véanse las sondas T24). Fue de interés que estas sondas no rindieron todas de forma equivalente. Para investigar esta anomalía aparente, se estudiaron adicionalmente estas sondas usando sondas marcadas con P^{32} con y sin marcador de Ru(bpy)_{3}^{3+}. Esta evaluación de la especifidad de las sondas marcadas con Ru(bpy)_{3}^{3+} usando sondas marcadas con P^{32} para el oncogen Ha-ras se llevó a cabo como sigue. La PCR se realizó como se describió en la Fig. 8 usando solamente HRP2 biotinilado con HRP1 sin marcar (para sondas 1T24 y 1CHR). Las sondas usadas fueron: 1T24 y 1CHR que contenían P^{32} (1T24-P, 1CHR-P) como testigos; conteniendo 1T24 y 1CHR tanto P^{32} como marcador de Ru(bpy)_{3}^{3+} para determinar los efectos del marcador de Ru(bpy)_{3}^{3+}. Las muestras se lavaron como anteriormente con TEMAC. El P^{32} unido a gránulos resultante, además de en una combinación de escintilación, se analizó en un contador de escintilación. Los resultados se representaron gráficamente como recuentos de P^{32} por segundo para cada combinación de sondas de muestras (véase la Fig. 9). Este resultado demostró que las sondas de P^{32} y las sondas marcadas con Ru(bpy)_{3}^{3+} funcionan de forma equivalente y que los problemas con la especifidad de las sonsas son debidos a las secuencias de sondas específicas usadas. Para demostrar adicionalmente esta equivalencia del marcador de Ru(bpy)_{3}^{3+} de la invención y P^{32}, se realizó una comparación entre estas sondas marcadoras. La amplificación se realizó como se describió anteriormente usando DNA placental, usando HRP1 biotinilado con HRP1 sin marcar (para sondas 1T24 y 1CHR). Seguidamente se tomaron muestras del producto de PCR resultante para proporcionar un conjunto de muestras que contenían cantidades diferentes de producto. Estos conjuntos de muestras se hibridaron seguidamente con sondas marcadas con P^{32} (1T24-P32 y 1CHR-P32) o bien con marcador de Ru(bpy)_{3}^{3+} (1T24-Ru(bpy)_{3}^{3+} y 1CHR-Ru(bpy)_{3}^{3+}). Los resultados de cada estudio se normalizaron seguidamente usando el valor medio de cada marcador para los 90 \mul de la muestra. Estas cifras normalizadas permiten una comparación más eficaz de la señal de fondo y la respuesta comparativa de los dos métodos. El recuadro en la Fig. 10 ilustra la respuesta al nivel inferior de la curva de dilución. Las muestras se manejaron como se describió anteriormente (Fig. 8 y Fig. 9). Los resultados en la Fig. 10 demostraron la equivalencia de los dos marcadores con indicaciones de una mejor respuesta de la sonda marcada con Ru(bpy)_{3}^{3+} de los presente inventores. Estos estudios demostraron la capacidad de las sondas marcadas con Ru(bpy)_{3}^{3+} para funcional tan bien como las sondas marcadas con P^{32} en su capacidad para discriminar cambios de base únicos en DNA de las muestras. Esta evidencia indica que el marcador de Ru(bpy)_{3}^{3+} hace poco para afectar a las propiedades de la sonda marcada en reacciones de hibridación.
Ejemplo 30 Formato III de ensayo de sondas de DNA. Detección y cuantificación de productos de PCR de virus de papiloma humano en un ensayo de no separación
Para el ensayo de no separación sobre HPV 18, se realizó una reacción PCR simétrica con un exceso del cebador biotinilado. Esta reacción PCR genera un exceso de DNAs de cadena única biotinilados disponibles entonces para una hibridación directa mediante las sondas marcadas con de Ru(bpy)_{3}^{3+}. Para la hibridación, se añadieron 1000 recuentos de ECL de oligonucleótido marcado con Ru(bpy)_{3}^{2+} (^{-}2ng) específico para el gen HPV amplificado a 50 \mul de la PCR después de la compleción de la amplificación, y seguidamente se incubó durante 15 minutos a 50ºC. A esta mezcla de hibridación se añadieron 60 \mul de tampón ECL que contenía 600 \mug de partículas magnéticas I acopladas a estreptavidina y se incubó con agitación a temperatura ambiente durante 15 minutos. El volumen de la muestra se aumentó a 530 \mul mediante la adición de tampón ECL y seguidamente se detectó la electroquimioluminiscencia como se describió en el Ejemplo 1. La Fig. 5 ilustra este formato de ensayo. Para demostrar este ensayo de no separación, se realizó una curva estándar de HPV18 DNA. La PCR se realizó usando 2VP18 y 1PV18 sin marcar usando HeLa DNA (14). La reacción PCR resultante se hidridó seguidamente con la sonda específica Ru(bpy)_{3}^{2+}-marcador-3PV18. La mezcla de hibridación se añadió seguidamente a partículas revestidas con estreptavidina y el marcador de Ru(bpy)_{3}^{2+} unido a gránulos resultante se analizó directamente en cuanto a ECL como se describió en el Ejemplo 1. Los resultados se representaron gráficamente como recuentos de ECL frente a copias de HPV18 añadidas a la PCR con un testigo de la sonda del oligonucleótido ras (véase la Fig. 11). Estos resultados demuestran la capacidad de generar ensayos rápidos
de no separación para secuencias de ácidos nucleicos basados en las propiedades del sistema de ensayo de ECL.
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Ejemplo 31 Ensayo para secuencias de DNA genómicas específicas
El formato de ensayo descrito a continuación hace uso de dos oligonucleótidos, los cuales se hibridan ambos a la misma cadena de DNA uno a continuación de otro, una sonda permite la captura; la otra marca el complejo (hibridación en emparedado). Este ensayo se demostró usando DNA de E. coli y sondas específicas para la región genética trp E/D. El DNA de E. coli se preparó siguiendo protocolos estándar (16). El DNA testigo de esperma de salmón se adquirió de la empresa Sigma Ltd. A las muestras de DNA se añadieron 14 \mul de tampón de hibridación (10X PBS, EDTA 10 mM 6 0,7% de SDS), 2 ng de TRP.CO4 marcado con biotina y 5 ng de TRP.CO3 marcado con Ru(bpy)_{3}^{2+}. Estas muestras se llevaron hasta 100 \mul con agua. Las muestras se calentaron a 97ºC y se incubaron a 97ºC durante 10 minutos, se enfriaron a 50ºC y se hibridaron durante 2 horas. A estas muestras se añadieron 20 \mul de partículas magnéticas II revestidas con estreptavidina y se mezclaron durante 2 horas a temperatura ambiente. Las partículas se lavaron seguidamente 4 veces en tampón ECL, se volvieron a poner en suspensión en suspensión en 500 \mul de tampón ECL y se analizaron como se describió en el Ejemplo 3. El DNA positivo es E. coli y el DNA negativo es esperma de salmón. Los resultados se muestran en la Tabla X.
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TABLA X
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Estos resultados demostraron la capacidad del sistema de ensayo ECL para funcionar en la detección de un gen genómico en E. coli usando un formato de ensayo de hibridación en emparedado sobre DNA no amplificado. Las partículas magnéticas I revestidas con estreptavidina se pueden usar análogamente en la forma en que se usan en este ejemplo las partículas magnéticas II revestidas con estreptavidina.
Ejemplo 32 Concentración de partículas en detectores de fluorescencia de ondas evanescentes
Se puede usar la concentración de complejo marcado en una superficie de detección para aumentar la sensibilidad de ensayos que usan detectores de ondas evanescentes. Tales detectores pueden usar fibras(s) óptica(s) o bien guía(s) de ondas ópticas planas 300 para llevar la luz 310 desde una fuente de luz al entorno del fluido. La luz se refleja a través de la guía de ondas o fibra óptica por reflexión interna total (TIR) 310' que se produce cuando un haz de luz incidente choca con una superficie interfacial entre un medio dieléctrico de elevado índice de refracción (n_{1}) y uno de índice de refracción inferior (n_{2}). Cuando en ángulo de incidencia del haz de luz es mayor que el ángulo crítico 315 que es \theta_{0} (el ángulo mostrado ente la línea perpendicular 300 y la trayectoria de la luz 310'), \theta_{0} = sen^{-1}(n_{2}/n_{1}), entonces la luz se refleja internamente en 100% en la superficie interfacial. En guías de ondas ópticas y fibras ópticas, la luz se desplaza con un ángulo de incidencia mayor que este ángulo crítico, y se propaga a través del medio por reflectancia interna total. La Fig. 22 expone la propagación de TIR en una guía de ondas o fibra óptica.
Aunque el rayo de luz se refleja totalmente en cada interacción con la superficie interfacial, el campo electromagnético no es cero fuera del medio. Los requisitos físicos de continuidad a través de la superficie interfacial requieren que el campo electromagnético disminuya exponencialmente a medida que penetra fuera de la fibra o guía de ondas en el entorno externo. Este campo se denomina el campo evanescente 320 y es capaz de excitar fluorescencia en los fluoróforos. La velocidad de disminución del campo evanescente depende de la longitud de onda incidente, de los índices de refracción n_{1} y n_{2} y del ángulo de incidencia. Usando una guía de ondas de cuarzo y luz visible en un entorno acuoso, el campo evanescente 320 disminuye en aproximadamente 90% en una distancia de 10 nm desde la superficie interfacial de la guía de ondas/solución. En la Fig. 22 el medio circundante 330 tiene un índice de refracción n_{2} y la(s) fibra(s) óptica(s) o guía(s) de ondas 300, un índice de refracción n_{1}.
Los mismos principios que crean el campo evanescente para que la luz se propague en la guía de ondas o fibra óptica permiten que la luz que se genera con la luminiscencia de los fluoróforos sea nuevamente capturada en el elemento óptico de forma eficaz. Adicionalmente, cualquier luz producida fuera de la zona evanescente (320) es eficazmente rechazada de la entrada al elemento óptico. La combinación de estos efectos permite que las fibras ópticas o guías de ondas se usen como elementos ópticos eficaces para medir la presencia y concentración de marcadores fluoróforos en sus superficies o sus proximidades en un entorno acuoso. La patente de EE.UU. nº 4.447.546 describe un método y aparato adecuados para realizar inmunoensayos de fluorescencia que emplean una fibra óptica para excitar y medir la fluorescencia en la zona evanescente a partir de un inmuno-reactivo marcado.
La invención se puede aplicar para mejorar la sensibilidad de ensayos de unión fluorescentes que usan fibras ópticas o guías de ondas. El ensayo se realiza usando reactivos marcados con restos fluorescentes. Después de incubar las partículas, la muestra y los reactivos, las partículas se concentran en la superficie de la guía de ondas o fibra óptica. Como el área superficial de las partículas es mayor que el área geométrica de la guía de ondas o fibra óptica, se pueden recoger más fluoróforos en la zona evanescente que rodea al elemento óptico. Por tanto, la señal luminiscente de las partículas puede ser mayor y la cuantificación del analito será más sensible, dando lugar a límites de detección mejorados.
Por tanto, tras haber descrito en detalle las realizaciones preferidas de la presente invención, debe entenderse que son posibles muchas variaciones evidentes de la misma dentro del alcance de la presente invención, tal como se define en las reivindicaciones anejas.
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Claims (19)

1. Un aparato para realizar un ensayo de unión para un analito de interés en una muestra, basado en la medición de la electroquimioluminiscencia de una superficie de un electrodo, que comprende:
a) una celda electroquímica que tiene un volumen para albergar muestras y medios de entrada y salida;
b) un sistema de electrodo de trabajo para proporcionar energía electroquímica para provocar la electroquimioluminiscencia;
c) un dispositivo de control del voltaje para suministrar señales de voltaje al sistema del electrodo de trabajo;
d) un imán colocado en una orientación apropiada y en estrecha proximidad al electrodo de trabajo, de forma que las partículas magnéticamente sensibles se concentrarán en la superficie del electrodo de trabajo, en donde dicho imán está colocado por debajo de dicho electrodo y en donde dicho imán es capaz de ser retirado de la superficie del electrodo;
e) un dispositivo de detección/medición de la luz para medir la electroquimioluminiscencia provocada en la superficie del electrodo; y
f) una bomba para proporcionar el transporte de fluido hacia, a través y desde la celda electroquímica.
2. El aparato definido en la reivindicación 1, en el que dicho imán es capaz de ser retirado durante la medición de la electroquimioluminiscencia.
3. El aparato definido en la reivindicación 1 ó 2, en el que dicho imán comprende al menos un imán en orientación norte-sur colocado perpendicular a dicho electrodo.
4. El aparato definido en una cualquiera de las reivindicaciones 1-3, en el que dicho imán comprende al menos un par de imanes que consisten en un primer imán y un segundo imán que están separados por un material que no es magnéticamente sensible.
5. El aparato definido en una cualquiera de las reivindicaciones 1-4, en el que dicho imán es un imán permanente.
6. El aparato definido en una cualquiera de las reivindicaciones 1-4, en el que dicho imán es un electroimán.
7. El aparato definido en una cualquiera de las reivindicaciones 1-6, en el que dicho volumen que contiene muestra atraviesa una entrada y una salida a dicha celda.
8. El aparato definido en una cualquiera de las reivindicaciones 1-7, en el que dicha celda es una celda de flujo transversal.
9. El aparato definido en una cualquiera de las reivindicaciones 1-8, en el que dicho dispositivo de detección/medi-
ción de la luz comprende un dispositivo acoplado de carga o una película fotográfica.
10. El aparato definido en una cualquiera de las reivindicaciones 1-8, en el que dicho dispositivo de detección/medición de la luz comprende un tubo fotomultiplicador.
11. El aparato definido en una cualquiera de las reivindicaciones 1-8, en el que dicho dispositivo de detección/medición de la luz comprende un fotodiodo.
12. El aparato definido en una cualquiera de las reivindicaciones 1-11, en el que dicho electrodo comprende oro o carbono.
13. El aparato definido en una cualquiera de las reivindicaciones 1-11, en el que dicho electrodo comprende platino.
14. El aparato definido en una cualquiera de las reivindicaciones 1-13, que comprende adicionalmente al menos un contraelectrodo.
15. El aparato definido en una cualquiera de las reivindicaciones 1-14, que comprende adicionalmente al menos un contraelectrodo y un electrodo de referencia y dicho dispositivo de control del voltaje es un potenciostato.
16. Uso del aparato de una cualquiera de las reivindicaciones 1-15 en un ensayo de electroquimioluminiscencia para un analito de interés, en el que las partículas magnéticamente sensibles son magnéticamente recogidas en dicha superficie del electrodo y la electroquimioluminiscencia emitida es medida usando dicho detector de la luz.
\newpage
17. Un método para usar el aparato de una cualquiera de las reivindicaciones 1-16 en un ensayo de electroquimioluminiscencia para un analito de interés, que comprende recoger magnéticamente dichas partículas magnéticamente sensibles sobre dicha superficie del electrodo y medir la electroquimioluminiscencia emitida.
18. El método definido en la reivindicación 17, en el que dicho imán es retirado durante la medición de la electroquimioluminiscencia.
19. El aparato definido en la reivindicación 1, en el que dicho electrodo es sustancialmente horizontal.
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