ES2299242T3 - Antagonistas de los receptores copulados a proteina g. - Google Patents
Antagonistas de los receptores copulados a proteina g. Download PDFInfo
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Abstract
Una molécula moduladora de los receptores copulados a proteína G (GPCR) aislada consistente en un péptido o peptidomimético de 5 a 50 aminoácidos que es un análogo estructural de un dominio de transmembrana de un GPCR, donde dicha molécula tiene un extremo N y un extremo C y dicha molécula tiene un extremo extracelular que está negativamente cargado y un extremo intracelular que tiene carga neutra en condiciones fisiológicas, y donde dicha molécula tiene un grupo carboxilo C-terminal amidado cuando dicho extremo C tiene carga neutra, y, cuando dicho extremo intracelular es dicho extremo N, dicho péptido o peptidomimético incluye al menos cuatro de los cinco primeros aminoácidos N-terminales que tienen cadenas laterales de aminoácidos de carga neutra en condiciones fisiológicas; dicha molécula se inserta espontáneamente en una membrana en la misma orientación que el dominio GPCR de transmembrana del que deriva; y dicha molécula modula una propiedad o actividad biológica de dicho GPCR alterando la estructura o la organización de dicho GPCR.
Description
Antagonistas de los receptores copulados a
proteína G.
La presente invención se relaciona con la
modulación, especialmente la inhibición, de las actividades
biológicas de los receptores copulados a proteína G (GPCR) por
exposición de los GPCR a moléculas que interfieren con la correcta
organización de los receptores. En particular, la invención se
relaciona con péptidos aislados del dominio de transmembrana de los
GPCR que inhiben la transducción de señal mediada por GPCR.
Muchos fenómenos fisiológicamente importantes
están mediados por la unión de proteínas reguladoras de la unión a
nucleótidos de guanina (proteínas G) a receptores copulados a
proteína G (GPCR). Estos fenómenos incluyen vasodilatación,
estimulación o reducción del ritmo cardíaco, broncodilatación,
estimulación de las secreciones endocrinas y aumento de la
peristalsis intestinal, desarrollo, mitogénesis, proliferación
celular y oncogénesis.
Las proteínas G son una superfamilia diversa de
proteínas que se unen a nucleótidos de guanina y que tienen un
papel central en la transducción de señal y en la regulación del
metabolismo celular. Están generalmente constituidas por tres
subunidades: una subunidad alfa que se une a
guanil-nucleótidos, una subunidad beta y una
subunidad gamma. (Para una revisión, véase Conklin y col., Cell 73,
631-641, (1993)). Las proteínas G cambian
comúnmente entre dos formas, dependiendo de si se une GDP o GTP a la
subunidad alfa. Cuando se une GDP, la proteína G existe como un
heterotrímero, el complejo
alfa-beta-gamma G. Cuando un
complejo alfa-beta-gamma se asocia
operativamente con un GPCR activado por ligando en una membrana
celular, la velocidad de intercambio de GTP por GDP unido aumenta y
la subunidad alfa G se disocia del complejo
beta-gamma G. La subunidad alfa G libre y el
complejo beta-gamma G son capaces de transmitir una
señal a elementos secuencia abajo de una variedad de rutas de
transducción de señal, por ejemplo por unión a, y activación de, la
adenil-ciclasa. Este esquema fundamental de
fenómenos forma la base para una multiplicidad de diferentes
fenómenos de señalización celular.
Recientes estudios han sugerido que todos los
miembros de la superfamilia GPCR tienen una estructura conservada.
Comparaciones de los ADNc de receptores
beta-adrenérgicos aviares y de mamíferos (Yarden y
col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83: 6795-6799,
1986; Dixon y col., Nature 321:75-79, 1986; y
Kobilka y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
84:46-50, 1987), un ADNc de rodopsina bovina
(Nathans y Hogness, Cell 34:807-814, 1983), un
receptor alfa-2-adrenérgico (Kobilka
y col., Science 238:650-656, 1987), un ADNc de
receptor de angiotensina (Young y col., Cell
45:711-719, 1986; Jackson y col., Nature
335:437-439, 1988), un receptor de substancia K
bovino (Masu y col., Nature 329:836-838, 1987) y un
ADNc de receptor de acetilcolina muscarínico (Kubo y col., Nature
323:411-416, 1986) predicen que todos los GPCR
comparten una presencia altamente conservada de siete dominios de
transmembrana hidrofóbicos que se sugiere son hélices de
transmembrana de 20-30 aminoácidos conectadas por
bucles extracelulares o citoplásmicos. Kobilka y col., Science 240:
1310 (1988); Maggio y col., FEBS Lett. 319: 195 (1993); Maggio y
col., Proc. Natl. Acad. Sci USA 90: 3103 (1993); Ridge y col., Proc.
Natl. Sci USA 91, 3204 (1995); Schonenberg y col., J. Biol. Chem.
270: 18000 (1995); Huang y col., J. Biol. Chem. 256: 3802 (1981);
Popot y col., J. Mol. Biol. 198: 655 (1987); Kahn y Engelman,
Biochemistry 31: 6144 (1992); Schoneberg y col., EMBO J. 15: 1283
(1996); Wong y col., J. Biol. Chem. 265: 6219 (1990); Monnot y
col., J. Biol. Chem. 271: 1507 (1996); Gudermann y col., Annu. Rev.
Neurosci. 20: 399 (1997); Osuga y col., J. Biol. Chem. 272: 25006
(1997); Lefkowitz y col., J. Biol. Chem.
263:4993-4996, 1988; Panayotou y Waterfield, Curr.
Opinion Cell Biol. 1:167-176, 1989. Estos dominios
de transmembrana de receptores copulados a proteína G designados
como TM1, TM2, TM3, TM4, TMS, TM6 y TM7, TM4, TM5, TM6 y TM7 son los
más altamente conservados y se postula que proporcionan secuencias
que imparten actividad biológica a los GPCR. TM3 está también
implicado en la transducción de señal.
Se dice que la copulación de GPCR a moléculas de
señalización intracelular tales como la adenilato ciclasa
(Anand-Srivastava y col., J. Biol. Chem. 271:
19324-19329 (1996)) y las proteínas G (Merkouris y
col., Mol. Pharmacol. 50: 985-993 (1996)) está
inhibida por péptidos correspondientes a los bucles intracelulares
de los receptores. Esos estudios fueron realizados primariamente
para obtener una comprensión de los mecanismos moleculares de la
función de los receptores y no podrían ser directamente aplicados al
diseño de fármacos, por las dificultades en la administración
intracelular de los inhibidores.
WO 94/05695 y la Patente EE.UU. Nº 5.508.384
exponen secuencias de regiones de transmembrana para 74 GPCR. La
publicación de patente WO 94/05695 describe y reivindica
polipéptidos correspondientes a fragmentos o secuencias homólogas
de GPCR que pueden unirse a un ligando GPCR o que pueden modular la
unión de ligando. Ambas referencias describen que un fragmento que
se expande por la membrana del tercer dominio TM del receptor de
dopamina D2 se unía específicamente a un ligando del receptor
intacto en un modelo de pequeñas vesículas unilamelares simples. El
fragmento usado acababa en una lisina (que está positivamente
cargada a pH fisiológico) en un extremo y en un ácido aspártico
(que está negativamente cargado a pH fisiológico) en el otro. No se
esperaría que este péptido se insertara fácilmente en una membrana
biológica.
La invención comprende, en general, compuestos
peptídicos o peptidomiméticos que modulan, y preferiblemente
inhiben, las propiedades y actividades biológicas de los GPCR
abordando porciones de transmembrana de estos receptores. Los
antagonistas de GPCR pueden ser usados para alterar la función de
los GPCR.
Se describe aquí el uso de tecnología de ADN
química o recombinante para obtener polipéptidos GPCR, que
preferiblemente son lo más pequeños posible conservando a pesar de
ello una afinidad suficientemente alta para unirse o asociarse a
GPCR. Como ejemplos no limitativos de polipéptidos GPCR, se incluyen
fragmentos de 10 a 50 aminoácidos correspondientes a al menos un
dominio de transmembrana de los dominios 1-7. Los
siguientes son ejemplos no limitativos de péptidos GPCR con
propiedades antagonistas.
Del GPCR CXCR4
- F-2-2: LLFVITLPFWAVDAVANWYFGNDD
- F-2-5: LLFVITLPFWAVDAVANDD-OH
- F-4-2: VYVGVWIPALLLTIPDFIFANDD-OH
- F-6-1: VILILAFFACWLPYYIGISID-OH
- F-7-3: DDEALAFFHCCLNPILYAFL-NH_{2}
- F-7-4: DDSITEALAFFHCCLNPILYAFL-NH_{2}
Del GPCR CCR5
- CCR5-TM-2-2: LFFL LTVPFWAHYAAAQWDFGDD
- CCRS-TM-4-1: FGVVTSVITWWAVFASLPGIIFTSSDD
- CCRS-TM-6-1: LIFTIMIVYFLFWAPYNIVLLLNTFQED
Del GPCR CCR2
- CCR2-TM-2-1: IYLLNLAISDLLFLITLPLWADD-OH
- CCR2-TM-2-2: LLFLITLPLWAH SAANEWVFGNDD-OH
- CCR2-TM-4-1: FGVVTSVITWLVAVF ASVPGIIFTDD
- CCR2-TM-6-1: VIFTIMIVYFLFWTPYN IVILLNTFQED
Del GPCR CCR3
- CCR3-TM-2-1: LLFLVTLPFW IHYVRGHNWVFGDDD
- CCR3-TM-4-1: FGVITSIVTWGLAVLAALPEFI FYETED
- CCR3-TM-6-1: IFVIMAVFFI FWTPYNVAILLSSYQSDD
Del GPCR CCKAR
- CCKAR-TN-2-1: FLLSLAVSDLMLCLFCMPFNLP
- CCKAR-TM-2-2: FLLSLAVSDLMLCLFCM PFNLIDD
- CCKAR-TM-6-4: IVVLFFLCWMPIFSANAWRAYDTVDD
Una realización de la invención es una molécula
moduladora del receptor copulado a proteína G (GPCR) aislada que
tiene un péptido o peptidomimético de 5 a 50 aminoácidos que es un
análogo estructural de una porción de un dominio de transmembrana
de un GPCR, donde dicha molécula tiene un extremo N y un extremo C
y dicha molécula tiene un extremo extracelular que está
negativamente cargado y un extremo intracelular que tiene una carga
neutra en condiciones fisiológicas, y donde dicha molécula tiene un
grupo carboxilo C-terminal amidado cuando dicho
extremo N tiene una carga neutra, y, cuando dicho extremo
intracelular es dicho extremo N, dicho péptido o peptidomimético
incluye al menos cuatro de los primeros cinco aminoácidos
N-terminales que tienen cadenas laterales de
aminoácidos de carga neutra en condiciones fisiológicas; dicha
molécula se inserta espontáneamente en una membrana en la misma
orientación que el dominio GPCR de transmembrana del que deriva; y
dicha molécula modula una propiedad o actividad biológica de dicho
GPCR alterando la estructura u organización de dicho GPCR.
En una realización particular, las moléculas
contienen un grupo de cabeza no peptídico hidrofílico negativamente
cargado y una cola no cargada, que asegura la correcta orientación
de la molécula en la membrana celular. En otra realización, el
grupo de cabeza negativamente cargado es uno o más aminoácidos
ácidos.
Otra realización es una molécula moduladora de
GPCR aislada que tiene un péptido o peptidomimético que es un
análogo estructural de una porción de un dominio de transmembrana de
CXCR4, donde dicha porción de dicho dominio de transmembrana tiene
una secuencia seleccionada entre:
\vskip1.000000\baselineskip
LLFVITLPFWAVDAVANWYGNDD,
LLFVITLPFWAVDAVANDD-OH,
VYVGVWIPALLLTIPDFIFANDD-OH,
VILILAFFACWLPYYIGISID-OH,
DDEALAFFHCCLNPILYAFL-NH_{2}
y
DDSITEALAFFHCCLNPIL Y
AFL-NH_{2},
\vskip1.000000\baselineskip
y donde dicha molécula modula una
actividad biológica de dicho CXCR4. La actividad CXCR4 modulada por
dicho péptido incluye la inhibición de la liberación de Ca^{2+}
intracelular mediada por CXCR4 y la inhibición de la infección por
VIH mediada por
CXCR4.
La invención también incluye las moléculas de la
invención para uso en un método terapéutico consistente en modular
una actividad biológica de un GPCR de interés por contacto de una
célula que expresa dicho GPCR con una molécula de la invención. En
un método, el GPCR de interés es CXCR4, CCR5 o CCR2 y la actividad
biológica modulada es la inhibición de la infección por VIH mediada
por GPCR. En otro método, el GPCR de interés es CXCR4 y la
actividad biológica modulada es la inhibición de la liberación de
Ca^{2+} intracelular mediada por CXCR4.
Otra realización es el uso de una molécula
moduladora de GPCR de la invención para la fabricación de un
medicamento para inhibir la infección por VIH-1,
donde el contacto de una célula que expresa el GPCR con dicha
molécula inhibe la infección por VIH-1. El péptido o
peptidomimético puede ser un análogo estructural de una porción de
un dominio de transmembrana de CXCR4 o CCR5. El péptido
correspondiente a regiones TM o CXCR4, un GPCR que funciona como
correceptor durante la entrada en la célula del VIH, fue diseñado y
estudiado en células y dio una potente inhibición de la entrada del
VIH sin aparente toxicidad para las células.
Se demuestra la utilidad de este uso abordando
especialmente el CXCR4 que funciona como correceptor durante la
entrada en la célula de cepas trópicas de células T de
VIH-1. Los péptidos que contenían
20-25 residuos de aminoácidos inhibían la
señalización de receptores y la infección por VIH-1
in vitro a concentraciones de tan sólo 0,2 micromolar.
En una realización, las moléculas de la presente
invención imitan un dominio de transmembrana del receptor
seleccionado y bloquean la autoorganización de ese receptor,
posiblemente por inhibición competitiva con el dominio TM nativo.
Bloquean o inhiben así la transducción de señal en la célula
afectada.
La invención también incluye análogos peptídicos
peptidomiméticos que poseen propiedades beneficiosas tales como una
mayor vida media, falta de inmunogenicidad y capacidad para cruzar
la barrera hematoencefálica.
Los análogos peptídicos de la invención median
en los efectos químicos y/o biológicos de agonistas/antagonistas de
hormonas u otros péptidos. Se cree que son útiles para el desarrollo
de técnicas farmacéuticas, terapéuticas y diagnósticas. En
consecuencia, los análogos son usados en métodos para producir una
respuesta profiláctica o terapéutica en un mamífero por
administración al mamífero de una cantidad farmacéuticamente
efectiva de uno o más análogos peptídicos de la invención. En
realizaciones preferidas, se usan los análogos en métodos para
producir tales respuestas por modulación de la actividad de al menos
un receptor unido a proteína G de mamífero administrando una
cantidad efectiva de uno o más análogos peptídicos de la
invención.
En otra realización, un péptido de la invención
puede modular la actividad biológica de más de un GPCR. En otra
realización, se administran más de un péptido de la invención como
un cóctel para modular la actividad biológica de más de un
GPCR.
Figura 1. Eficacia anti-VIH y
toxicidad del ensayo F-2-2. Se
infectaron células CEM-SS con la cepa LAV de
VIH-1.
Figura 2. Eficacia anti-VIH y
toxicidad de F-4-2 en
citoprotección. Se infectaron células CEM-SS con la
cepa RF de VIH-1, que causa la muerte celular si el
inhibidor de la infección no está presente.
Figura 3. El modelo propuesto de acción de los
antagonistas de transmembrana.
\vskip1.000000\baselineskip
Una "proteína G" es cualquier miembro de la
superfamilia de proteínas de unión a nucleótidos de guanina de
transducción de señal.
Un "receptor copulado a proteína G" es
cualquier miembro de una superfamilia de receptores que media en la
transducción de señal copulándose con una proteína G. Como ejemplos
de tales receptores, se incluyen, aunque sin limitación: el
receptor de quimiokina CC 5 (CCR5), el receptor de quimiokina CXC
(CXCR4), el receptor de tipo A de colecistokinina (CCKAR), los
receptores de adenosina, los receptores de somatostatina, los
receptores de dopamina, los receptores colinérgicos muscarínicos,
los receptores alfa-adrenérgicos, los receptores
beta-adrenérgicos, los receptores de opiáceos, los
receptores de cannabinoides, el factor de liberación de la hormona
del crecimiento, el glucagón, los receptores de AMPc, los
receptores de serotonina (5-HT), los receptores de
histamina H2, los receptores de trombina, los receptores de
quinina, los receptores de la hormona estimulante del folículo, las
opsinas y rodopsinas, los receptores odoríferos, los GPCR de
citomegalovirus, los receptores de histamina H2, los receptores de
octopanmina, los receptores de N-formilo, los
receptores de anafilatoxina, los receptores del tromboxano, los
receptores de IL-8, los receptores del factor
activador de plaquetas, los receptores de endotelinas, el receptor
del péptido liberador de bombesina gastrina, los receptores de
bombesina que prefieren neuromedina B, los receptores del péptido
intestinal vasoactivo, los receptores de neurotensina, los
receptores de bradiquinina, los receptores de la hormona liberadora
de tirotropina, los receptores de la substancia P, los receptores
de neuromedina K, los receptores de tipo I de la angiotensina II
renal, los receptores del oncogén mas (angiotensina), los
receptores de lutropina-coriogonadotropina, los
receptores de tirotropina, los receptores de la hormona estimulante
del folículo, los receptores de cannabinoides, los receptores
inducidos por glucocorticoides, los GPCR de las células
endoteliales, los GPCR del testículo y los GPCR de la aorta
torácica, y homólogos de los mismos que tienen una homología de al
menos un 80% con al menos uno de los dominios de transmembrana
1-7, como se describe aquí. Véase, v.g., Probst y
col., DNA and Cell Biology 11: 1-20 (1992), aquí
incorporado en su totalidad como referencia. El término abarca
además subtipos de los receptores nombrados y mutantes y homólogos
de los mismos, junto con las secuencias de ADN que los
codifican.
El término "membrana" se refiere en general
a una bicapa lipídica. Preferiblemente, la bicapa lipídica es la
membrana plasmática que delimita una célula, pero puede ser
cualquier membrana celular. El término membrana incluye también
estructuras de bicapa, tales como liposomas artificiales.
El término "polipéptido GPCR" incluye
polipéptidos que tienen una secuencia de aminoácidos que corresponde
substancialmente a al menos un fragmento de 10 a 50 (v.g., 10, 20,
25 ó 30 residuos) aminoácidos y/o una secuencia homóloga de un GPCR
conocido o grupo de GPCR, donde el polipéptido GPCR tiene homología
de al menos un 80%, tal como un 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89,
90, 91, 92 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 ó 100% de homología,
manteniendo actividad moduladora de GPCR, donde un polipéptido GPCR
de la presente invención no es de origen natural o es de origen
natural, pero está en forma purificada o aislada que no aparece en
la naturaleza.
Preferiblemente, un polipéptido GPCR de la
presente invención corresponde substancialmente a un dominio de
transmembrana de un GPCR. También se prefieren polipéptidos GPCR en
los que la secuencia de aminoácidos del GPCR tiene una longitud de
5-10 a 50 aminoácidos, tal como 5, 6, 7, 8, 9, 10,
11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27,
28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44,
45, 46, 47, 48, 49 ó 50 aminoácidos, o cualquier rango dentro de
éste.
El término "se inserta espontáneamente en una
membrana" significa que un péptido que se pone en contacto con
una membrana se autoorganizará, en condiciones fisiológicas, en la
bicapa lipídica de tal forma que la porción hidrofóbica del péptido
esté dentro de la membrana y cualquier extremo cargado quede
expuesto a cualquiera de las superficies de una membrana.
Preferiblemente, las moléculas de la presente invención que tienen
una carga neta negativa en un extremo se orientarán de tal forma
que el extremo cargado dé a la superficie extracelular de la
célula.
El término "célula tumoral" o "célula
cancerosa" o "célula neoplásica" denota una célula que
demuestra una proliferación no regulada inapropiada. Se dice que
una línea celular es "maligna" si, cuando se inyecta la línea
celular en un animal hospedador, el animal hospedador desarrolla
tumores o cánceres que son anaplásicos, invasivos y/o metastáticos.
Un tumor "humano" está constituido por células que tienen
cromosomas humanos. Dichos tumores incluyen los de un paciente
humano y tumores resultantes de la introducción de una línea celular
maligna humana en un animal no humano si las células de dichos
tumores tienen cromosomas humanos.
Los términos "tratamiento del cáncer",
"terapia del cáncer" y similares significan generalmente un
tratamiento que causa cualquier mejoría en un mamífero que tiene un
cáncer, donde la mejoría se debe al tratamiento con un péptido de
la invención. La mejoría puede ser subjetiva u objetiva. Por
ejemplo, si el mamífero es humano, el paciente puede notar un mayor
vigor o vitalidad o un menor dolor como síntomas subjetivos de
mejoría o respuesta a la terapia. Alternativamente, el clínico
puede observar una disminución en el tamaño del tumor o en la carga
tumoral en base al examen físico, a los parámetros de laboratorio, a
los marcadores tumorales o a los hallazgos radiográficos.
La expresión "inhibición del crecimiento
tumoral [o celular]" significa generalmente que la velocidad de
aumento en la masa, el tamaño, el número y/o el metabolismo de las
células y/o tumores tratados es más lenta como resultado del
tratamiento que la de las células y/o tumores no tratados. El
crecimiento de una línea celular o tumor se dice que es
"inhibido" por un tratamiento si, cuando se estudia por medios
tales como la incorporación de radioisótopos a las células, las
células tratadas aumentan en número a un ritmo menor que la
velocidad de proliferación de las células control no tratadas, y
preferiblemente menor de aproximadamente el 50% de la velocidad de
proliferación de las células no tratadas. Más preferiblemente, la
velocidad de crecimiento se inhibe en al menos un 80%. Si se
estudia el crecimiento por un medio tal como plaqueo en
metilcelulosa, se dice que el crecimiento de una línea celular
resulta "inhibido" si las células tratadas dan lugar a menos
que el número de colonias que crecen a partir de un número similar
de células no tratadas. Preferiblemente, el número de colonias
procedentes de células tratadas es menor de aproximadamente el 70%
del número procedente de células no tratadas. Más preferiblemente,
el número de colonias se reduce en al menos un 50%. "Inhibición
del crecimiento celular" también incluye el crecimiento cero y,
lo que es más importante, la consiguiente muerte de las células
tumorales y la erradicación del tumor. Cuando se mide in
vivo, la "inhibición del crecimiento tumoral" abarca menos
tumores o más pequeños (por ejemplo, de menor diámetro) en
comparación con los animales control o los pacientes no tratados.
La progresión de un tumor se refiere a fenómenos distintos del
crecimiento, tales como cambios morfológicos y fisiológicos y
cambios en la expresión génica y proteica.
Se puede evaluar la inhibición por cualquier
método aceptado para medir si el crecimiento o el tamaño del tumor
y/o el aumento de células cancerosas o tumorales se han enlentecido,
detenido o revertido. Esto incluye la observación directa y la
evaluación indirecta, tal como síntomas subjetivos o signos
objetivos. El clínico puede observar una reducción del tamaño
tumoral o de la carga tumoral (número de tumores) en base al examen
físico, a los parámetros de laboratorio, a los marcadores tumorales
o a los hallazgos radiográficos. Alternativamente, si el mamífero
es un humano, el paciente puede observar un mayor vigor o vitalidad
o un menor dolor como síntomas subjetivos de mejoría o respuesta a
la terapia. Algunos signos de laboratorio que el clínico puede
observar como respuesta a la terapia incluyen la normalización de
pruebas tales como el recuento de células blancas de la sangre, el
recuento de células rojas de la sangre, el recuento de plaquetas, la
velocidad de sedimentación de los eritrocitos y diversos niveles
enzimáticos tales como las transaminasas y las hidrogenasas.
Adicionalmente, el clínico puede observar una reducción en un
marcador tumoral detectable tal como el antígeno específico
prostático (PSA) o el antígeno corioembrionario (CEA).
Alternativamente, se pueden usar otras pruebas para evaluar la
mejoría objetiva, tales como sonogramas, barridos de tomografía
axial computerizada, barridos de resonancia magnética nuclear y
pruebas de emisión de positrones.
El término "péptido de transmembrana GPCR"
puede incluir un fragmento de dominio de transmembrana GPCR y/o un
péptido homólogo del mismo, de al menos 5-50, y
preferiblemente de 5-30, y preferiblemente de al
menos 10-30 aminoácidos de longitud, tal como 5, 6,
7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23,
24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40,
41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49 ó 50 aminoácidos, o cualquier
rango dentro de éste o cualquier secuencia correspondiente que tenga
substituciones conservadoras de aminoácidos. Como muestras de
péptidos de transmembrana de la invención, se incluyen, aunque sin
limitación, los péptidos enlistados en la Tabla I de la presente
descripción. Un péptido de transmembrana preferido de la presente
invención, cuando contacta con una estructura celular o de membrana
(v.g., liposoma) que contiene un GPCR biológicamente activo, modula
la actividad biológica de dicho GPCR in vitro, in vivo o
in situ. La concentración del péptido en una solución que
contacta con la célula in vivo (v.g., plasma sanguíneo o
fluido intersticial) o in vitro (v.g., medio de cultivo) es
de entre 1 nanomolar y 50 micromolar, preferiblemente de entre 1
nanomolar y 1 micromolar y más preferiblemente menor de 5
micromolar.
El término "residuo" se refiere a un
aminoácido o mimético de aminoácido incorporado en un oligopéptido
por un enlace amida o un mimético de enlace de amida.
"Cargado negativamente" se refiere a
aquellos aminoácidos, derivados de aminoácidos, miméticos de
aminoácidos y restos químicos que están cargados negativamente a pH
fisiológico. Como aminoácidos cargados negativamente, se incluyen,
por ejemplo, Asp y Glu. Un residuo "ácido" es un residuo que
está cargado negativamente a pH fisiológico.
"Cargado positivamente" se refiere a
aquellos aminoácidos, derivados de aminoácidos, miméticos de
aminoácidos y restos químicos que están cargados positivamente a pH
fisiológico. Como aminoácidos cargados positivamente, se incluyen,
por ejemplo, Lys y Arg. Un "residuo básico" es un residuo que
está positivamente cargado a pH fisiológico.
"Neutro" se refiere a aquellos aminoácidos,
derivados de aminoácidos, miméticos de aminoácidos y restos
químicos que no están cargados ni positiva ni negativamente a pH
fisiológico.
Secuencia "consenso" se refiere a péptidos
que son distintos de las secuencias GPCR conocidas en cuanto a
características estructurales críticas, pero que derivan de
secuencias consenso de los dominios de transmembrana de GPCR
1-7 homólogos. Dichos péptidos consenso pueden ser
derivados por modelado molecular, eventualmente combinado con
análisis de hidrofobicidad y/o ajuste a hélices modelo, como
ejemplos no limitativos. Dicho modelado puede ser realizado según
etapas de métodos conocidos usando algoritmos de modelado conocidos,
tales como, aunque sin limitación, ECEPP, INSIGHT, DISCOVER,
CHEM-DRAW, AMBER, FRODO y CHEM-X.
Dichos algoritmos comparan dominios de transmembrana entre
receptores copulados a proteína G relacionados, determinan probables
estructuras con energía minimizada y definen fragmentos
polipeptídicos consenso alternativos.
Se dice que una secuencia de aminoácidos o de
ácido nucleico de un polipéptido GPCR de la presente invención
"se corresponde substancialmente" con otra secuencia de
aminoácidos o de ácido nucleico, respectivamente, si la secuencia
de aminoácidos o ácido nucleico en ambas moléculas proporciona
polipéptidos que tienen actividad biológica que es substancialmente
similar, cualitativa o cuantitativamente, a la del correspondiente
fragmento de al menos un dominio de transmembrana GPCR, o que
pueden ser sinérgicos cuando dos o más dominios de transmembrana,
secuencias consenso u homólogos de los mismos están presentes.
Adicional o alternativamente, dichas secuencias
"substancialmente correspondientes" de polipéptidos GPCR
incluyen substituciones conservadoras de aminoácidos o nucleótidos o
substituciones de codones de nucleótidos degenerativas, donde las
substituciones individuales de aminoácidos o nucleótidos son bien
conocidas en la técnica.
El término "modula una propiedad o actividad
biológica" significa que, en presencia de un péptido de
transmembrana de ensayo, un parámetro o fenómeno biológico
mensurable aumenta o disminuye en relación a un control en ausencia
de dicho péptido. Como ejemplos de propiedad o actividad biológica,
se incluyen: la conformación del GPCR, la asociación del GPCR con
otras moléculas, la transducción de señal, la secreción extracelular
de proteínas celulares, los cambios conformacionales en proteínas,
los cambios en la actividad enzimática, los cambios en la actividad
metabólica, los cambios en la afinidad por un ligando, los cambios
en los niveles de infección vírica, los cambios en la
vasodilatación, la modulación del ritmo cardíaco, la modulación de
la broncodilatación, la modulación de las secreciones endocrinas y
la modulación del peristaltismo intestinal. Obsérvese que la
actividad biológica del GPCR no necesita ser una que esté limitada
al papel preciso in vivo desempeñado por el GPCR. El término
también cubre las propiedades del GPCR, tales como la unión a
proteínas víricas, que no son parte del papel biológico in
vivo del GPCR. También cubre las propiedades intrínsecas de los
GPCR que son sólo desentrañadas por manipulación experimental en el
laboratorio, tales como la capacidad de los GPCR en bicapas
artificiales (v.g., liposomas) para interaccionar con ligandos de
GPCR.
"Transducción de señal" es el proceso
mediante el cual se traduce la unión de un ligando a un receptor en
un cambio fisiológico. En general, la unión de un ligando a un
receptor provoca un cambio en una propiedad física del receptor,
por ejemplo un cambio en su conformación, o en su orientación, o en
su capacidad para unirse a otros ligandos. Este cambio en una
propiedad física puede dar lugar, directa o indirectamente, a
mayores o menores flujos de iones, a mayor o menor actividad
enzimática, a mayor o menor desfosforilación, a mayor o menor
translocación del receptor o de cualquier molécula (v.g., un resto
de inositol o una subunidad de proteína G) de un compartimento
celular a otro.
"Ligandos GPCR" se refiere a moléculas
biológicas que se unen a los GPCR in vitro, in situ o
in vivo y pueden incluir hormonas, neurotransmisores, virus o
dominios de unión a receptores de los mismos, proteínas G, opsinas,
rodopsinas, nucleósidos, nucleótidos, factores de la cascada de
coagulación, odorizantes o feromonas, toxinas, factores
estimulantes de colonias, factores de activación plaquetaria,
péptidos neuroactivos, neurohumor o cualquier compuesto
biológicamente activo, tal como fármacos o compuestos sintéticos o
de origen natural.
La expresión "inhibe la infección por VIH"
significa que un péptido de la invención inhibe la unión de un VIH
a un GPCR o inhibe una actividad biológica del GPCR que media en la
entrada y en la reproducción exitosa de un virus VIH en una célula
que expresa GPCR.
El término "cantidad efectiva" significa
una dosificación suficiente para producir un resultado deseado. El
resultado deseado puede consistir en cambios subjetivos u objetivos
en la actividad biológica de un GPCR, especialmente la transducción
de señal. Las cantidades efectivas del polipéptido o composición
GPCR, que pueden también incluir un derivado funcional del mismo,
son de aproximadamente 0,01 microgramos a aproximadamente 100 mg/kg
de peso corporal, y preferiblemente de aproximadamente 10
microgramos a aproximadamente 50 mg/kg de peso corporal, tal como
0,05, 0,07, 0,09, 0,1, 0,5, 0,7, 0,9, 1, 2, 5, 10, 20, 25, 30, 40,
45 ó 50 mg/kg.
Una "substitución conservadora", cuando se
describe una proteína, se refiere a un cambio en la composición de
aminoácidos de la proteína que no altera substancialmente la
actividad de la proteína. Así, "variaciones conservadoramente
modificadas" de una secuencia de aminoácidos particular se
refiere a substituciones de aminoácidos de aquellos aminoácidos que
no son críticos para la actividad de la proteína o a substitución de
aminoácidos con otros aminoácidos que tienen propiedades similares
(v.g., ácidos, básicos, cargados positiva o negativamente, polares
o no polares, etc.), de tal forma que las substituciones incluso de
aminoácidos críticos no alteran substancialmente la actividad. Se
conocen bien en la técnica tablas de substituciones conservadoras
que proporcionan aminoácidos funcionalmente similares. Dichas
substituciones son preferiblemente realizadas según la lista
siguiente, cuyas substituciones pueden ser determinadas por
experimentación rutinaria y proporcionan propiedades estructurales
y funcionales modificadas de una molécula polipeptídica sintetizada,
manteniendo al mismo tiempo la unión a receptores, o inhibiendo o
imitando la actividad biológica, según se determina mediante ensayos
conocidos de actividad de los receptores GPCR.
Dicho de manera diferente, los seis grupos
siguientes contienen cada uno aminoácidos que son substituciones
conservadoras entre sí:
- 1)
- Alanina (A), Serina (S), Treonina (T);
- 2)
- Ácido aspártico (D), Ácido glutámico (E);
- 3)
- Asparragina (N), Glutamina (Q);
- 4)
- Arginina (R), Lisina (K);
- 5)
- Isoleucina (I), Leucina (L), Metionina (M), Valina (V), y
- 6)
- Fenilalanina (F), Tirosina (Y), Triptófano (W).
Véase también Creighton (1984) PROTEINS, W.H.
Freeman and Company. Además, las substituciones, deleciones o
adiciones individuales que alteran, añaden o suprimen un solo
aminoácido o un pequeño porcentaje de aminoácidos en una secuencia
codificada son también "variaciones conservadoramente
modificadas".
El término "identidad substancial" o
"similitud substancial" en el contexto de un polipéptido indica
que un polipéptido tiene una secuencia que puede tener una
identidad de secuencia del 40% con una secuencia de referencia, o
preferiblemente del 70%, o más preferiblemente una identidad de
secuencia del 85% con la secuencia de referencia, o más
preferiblemente una identidad del 90% sobre una ventana de
comparación de aproximadamente 10-20 residuos de
aminoácido. "Porcentaje de identidad de aminoácidos" o
"porcentaje de identidad en la secuencia de aminoácidos" se
refiere a una comparación de los aminoácidos de dos polipéptidos
que, cuando se alinean óptimamente, tienen aproximadamente el
porcentaje designado de los mismos aminoácidos. Por ejemplo, "un
95% de identidad de aminoácidos" se refiere a una comparación de
los aminoácidos de dos polipéptidos que, cuando se alinean
óptimamente, tienen un 95% de identidad de aminoácidos.
Preferiblemente, las posiciones de residuos que no son idénticos
difieren por substituciones conservadoras de aminoácidos. Como los
aminoácidos substituidos tienen propiedades similares, las
substituciones no cambian las propiedades funcionales de los
polipéptidos. Una indicación de que dos secuencias polipeptídicas
son substancialmente idénticas es que un péptido es
inmunológicamente reactivo con anticuerpos producidos contra el
segundo péptido. Así, un polipéptido es substancialmente idéntico a
un segundo polipéptido, por ejemplo, cuando los dos péptidos
difieren sólo por una substitución conservadora. Una indicación de
que dos secuencias de ácidos nucleicos son substancialmente
idénticas es que el polipéptido al que codifica el primer ácido
nucleico presenta reacción inmunológicamente cruzada con el
polipéptido codificado por el segundo ácido nucleico. Otra
indicación de que dos secuencias de ácido nucleico son
substancialmente idénticas es que las dos moléculas se hibridan
entre sí en condiciones estrictas.
Para la comparación de secuencias, típicamente
una secuencia actúa como una secuencia de referencia, con la que se
comparan secuencias de ensayo. Cuando se usa un algoritmo de
comparación de secuencias, se introducen las secuencias de ensayo y
de referencia en un ordenador, se designan las coordenadas de
subsecuencia, si es necesario, y se designan los parámetros del
programa del algoritmo de secuencias. El algoritmo de comparación
de secuencias calcula entonces el porcentaje de identidad de
secuencia para la(s) secuencia(s) de ensayo en
relación a la secuencia de referencia, en base a los parámetros del
programa designados.
Se puede realizar la alineación óptima de
secuencias para comparación, v.g., por el algoritmo de homología
local de Smith y Waterman, Adv. Appl. Math. 2: 482 (1981),
por el algoritmo de alineación de homología de Needleman y Wunsch,
J. Mol. Biol. 48: 443 (1970), por el método de búsqueda de
similitud de Pearson y Lipman, Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA
85: 2444 (1988), por implementaciones computerizadas de estos
algoritmos (GAP, BESTFIT, FASTA y TFASTA en el Paquete de Programas
de Genética de Wisconsin, Genetics Computer Group, 575 Science Dr.,
Madison, WI), o por inspección visual (véase, en general, Ausubel y
col., antes citado).
Un ejemplo de un algoritmo útil es PILEUP.
PILEUP crea una alineación de secuencia múltiple a partir de un
grupo de secuencias relacionadas usando alineaciones progresivas por
pares para mostrar la relación y el porcentaje de identidad de
secuencia. También representa un árbol o dendrograma que muestra las
relaciones de agrupamiento usadas para crear la alineación. PILEUP
usa una simplificación del método de alineación progresiva de Feng
y Doolittle, J. Mol. Evol. 35: 351-360
(1987). El método empleado es similar al método descrito por
Higgins y Sharp, CABIOS 5:151-153 (1989). El
programa puede alinear hasta 300 secuencias, cada una de una
longitud máxima de 5.000 nucleótidos o aminoácidos. El procedimiento
de alineación múltiple comienza con la alineación por pares de las
dos secuencias más similares, produciendo un grupo de dos secuencias
alineadas. Este grupo es luego alineado con la siguiente secuencia
o grupo de secuencias alineadas más relacionadas. Dos grupos de
secuencias son alineados por una extensión simple de la alineación
por pares de dos secuencias individuales. Se consigue la alineación
final por una serie de alineaciones progresivas por pares. Se
desarrolla el programa designando secuencias específicas y sus
coordenadas de aminoácidos o nucleótidos para regiones de
comparación de secuencias y designando los parámetros del programa.
Por ejemplo, se puede comparar una secuencia de referencia con
otras secuencias de ensayo para determinar el porcentaje de relación
de identidad de secuencia utilizando los siguientes parámetros:
peso de hueco por defecto (3,00), peso de longitud de hueco por
defecto (0,10) y huecos de extremos pesados.
Otro ejemplo de algoritmo adecuado para
determinar el porcentaje de identidad de secuencias y de similitud
de secuencias es el algoritmo BLAST, que se describe en Altschul y
col., J. Mol. Biol. 215:403-410 (1990). El
programa para realizar análisis BLAST es de disponibilidad pública a
través del National Center for Biotechnology Information
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/). Este algoritmo conlleva la
identificación primeramente de pares de secuencias de alta
puntuación (HSP) identificando palabras cortas de longitud W en la
secuencia problema que o bien se correspondan o bien satisfagan
alguna puntuación de umbral T de valor positivo cuando se alinean
con una palabra de la misma longitud en una secuencia de base de
datos. Se hace referencia a T como el umbral de puntuación de
palabras de la vecindad (Altschul y col., antes citado). Estos
aciertos de palabras de la vecindad iniciales actúan como semillas
para iniciar búsquedas para encontrar HSP más largos que las
contienen. Los aciertos de palabras son entonces prolongados en
ambas direcciones a lo largo de cada secuencia hasta donde se puede
aumentar la puntuación de alineación acumulativa. Se detiene la
prolongación de los aciertos de palabras en cada dirección cuando:
la puntuación de alineación acumulativa cae en la cantidad X desde
su máximo valor alcanzado; la puntuación acumulativa va a cero o
por debajo de cero debido a la acumulación de una o más
alineaciones de residuos que puntúan negativamente; o se alcanza el
extremo de cualquiera de las secuencias. Los parámetros del
algoritmo BLAST W, T y X determinan la sensibilidad y la velocidad
de la alineación. El programa BLAST usa como defectos una longitud
de palabras (W) de 11, alineaciones de la matriz de puntuación
BLOSUM62 (véase Henikoff y Henikoff, Proc. Natl. Acad. Sci.
USA 89:10915 (1989)) (B) de 50, expectativa (E) de 10, M = 5, N
= -4 y una comparación de ambas hebras.
Además de calcular el porcentaje de identidad de
secuencia, el algoritmo BLAST también realiza un análisis
estadístico de la similitud entre dos secuencias (véase, v.g.,
Karlin y Altschul, Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA
90:5873-5787 (1993)). Una medida de similitud
proporcionada por el algoritmo BLAST es la probabilidad de la suma
más pequeña (P(N)), que proporciona una indicación de la
probabilidad con la cual se produciría una correspondencia entre
dos secuencias de nucleótidos o de aminoácidos por azar. Por
ejemplo, se considera que un ácido nucleico es similar a una
secuencia de referencia si la probabilidad de la suma más pequeña en
una comparación del ácido nucleico de ensayo con el ácido nucleico
de referencia es menor de aproximadamente 0,1, más preferiblemente
menor de aproximadamente 0,01 y más preferiblemente menor de
aproximadamente 0,001.
El término "ácido nucleico" se refiere a
deoxirribonucleótidos o ribonucleótidos y polímeros de éstos en
forma de una sola o de doble hebra. A menos que se limite
específicamente, el término incluye ácidos nucleicos que contienen
análogos conocidos de nucleótidos naturales que tienen propiedades
de unión similares al ácido nucleico de referencia y se metabolizan
de forma similar a los nucleótidos naturales. A menos que se indique
en contrario, una secuencia de ácido nucleico particular también
incluye implícitamente variantes de la misma conservadoramente
modificadas (v.g. substituciones de codones degenerados) y
secuencias complementarias, así como la secuencia explícitamente
indicada. Concretamente, se pueden conseguir sustituciones de
codones degenerados generando secuencias en las que la tercera
posición de uno o más codones seleccionados (o de todos) está
substituida con residuos de bases mixtas y/o desoxiinosina (Batzer
y col., Nucleic Acid Res. 19:5081 (1991); Ohtsuka y col., J. Biol.
Chem. 260:2605-2608 (1985); y Cassol y col., 1992;
Rossolini y col., Mol. Cell. Probes 8: 91-98
(1994)). Se usa el término ácido nucleico indistintamente con gen,
ADNc y ARNm codificado por un gen.
La expresión "una secuencia de ácido nucleico
codificante" se refiere a un ácido nucleico que contiene
información de secuencia para un ARN estructural tal como ARNr, un
ARNt o la secuencia primaria de aminoácidos de una proteína o
péptido específicos, o un sitio de unión para un agente regulador de
trans-acción. Esta expresión incluye
específicamente codones degenerados (es decir, diferentes codones
que codifican para un solo aminoácido) de la secuencia o secuencias
nativas que pueden ser introducidos para conformarse a la
preferencia de codones en una célula huésped específica.
"Sondas de ácido nucleico" pueden ser
fragmentos de ADN o de ARN. Se pueden preparar fragmentos de ADN,
por ejemplo, digiriendo ADN plasmídico, o usando PCR, o se pueden
sintetizar por el método de la fosforamidita descrito por Beaucage
y Carruthers, Tetrahedron Lett. 22:1859-1862 (1981),
o por el método de los triésteres según Matteucci, y col., J. Am.
Chem. Soc., 103:3185 (1981), ambos aquí incorporados como
referencia. Se puede obtener entonces un fragmento de doble hebra,
si se desea, hibridando las hebras simples químicamente sintetizadas
entre sí en condiciones apropiadas o sintetizando la hebra
complementaria usando ADN polimerasa con una secuencia cebadora
apropiada. Cuando se da una secuencia específica para una sonda de
ácido nucleico, se entiende que también se identifica e incluye la
hebra complementaria. La hebra complementaria funcionará igual de
bien en situaciones en las que el objetivo es un ácido nucleico de
doble hebra.
Los términos "identidad substancial" o
"identidad de secuencia substancial", aplicados a secuencias
de ácidos nucleicos y tal como se usan aquí, denotan una
característica de una secuencia polinucleotídica, donde el
polinucleótido tiene una secuencia que tiene al menos un 85 por
ciento de identidad de secuencia, preferiblemente al menos de un 90
a un 95 por ciento de identidad de secuencia y más preferiblemente
al menos un 99 por ciento de identidad de secuencia en comparación
con una secuencia de referencia en una ventana de comparación de al
menos 20 posiciones nucleotídicas, frecuentemente en una ventana de
al menos 25-50 nucleótidos, donde el porcentaje de
identidad de secuencia es calculado comparando la secuencia de
referencia con la secuencia polinucleotídica, que puede incluir
deleciones o adiciones que totalicen un 20 por ciento o menos de la
secuencia de referencia en la ventana de comparación. La secuencia
de referencia puede ser un subconjunto de una secuencia mayor.
La expresión "se une específicamente a un
anticuerpo" o "específicamente inmunorreactivo con", cuando
hace referencia a una proteína o péptido, se refiere a una reacción
de unión que es determinativa de la presencia de la proteína en
presencia de una población heterogénea de proteínas y de otros
productos biológicos. Así, en las condiciones de inmunoensayo
designadas, los anticuerpos especificados se unen a una proteína
particular y no se unen en cantidad significativa a otras proteínas
presentes en la muestra. La unión específica a un anticuerpo en
tales condiciones puede requerir un anticuerpo seleccionado por su
especificidad para una proteína particular. Se pueden usar una
variedad de formatos de inmunoensayo para seleccionar anticuerpos
específicamente inmunorreactivos con una proteína particular. Por
ejemplo, se usan rutinariamente inmunoensayos de ELISA en fase
sólida para seleccionar anticuerpos monoclonales específicamente
inmunorreactivos con una proteína. Véase Harlow y Lane (1988)
ANTIBODIES, A LABORATORY MANUAL, Cold Spring Harbor Publications,
New York, para una descripción de formatos de inmunoensayo y de
condiciones que se pueden usar para determinar la inmunorreactividad
específica.
Todas las referencias aquí citadas, incluyendo
los artículos de revistas o resúmenes, solicitudes de patente
EE.UU. o extranjeras publicadas o correspondientes, patentes EE.UU.
o extranjeras concedidas o cualquier otra referencia, quedan
incluidas aquí en su totalidad, incluyendo todos los datos, tablas,
figuras y texto presentados en las referencias citadas.
Adicionalmente, los contenidos de las referencias citadas en las
referencias aquí citadas quedan también incorporados en su
totalidad a modo de referencia.
La presente invención se basa parcialmente en
evidencias de que los dominios de transmembrana (TM) de los GPCR
interaccionan de una forma específica en el montaje de las moléculas
de los receptores. Estas interacciones no conducen a una estructura
rígida, ya que se requiere algo de flexibilidad para permitir hacer
cambios conformacionales después de la unión de ligandos para
obtener la capacidad de la molécula para dar una señal desde la
superficie celular hasta las partes intracelulares. También se
demostró para varios GPCR que los dominios de transmembrana están
implicados en la unión de ligandos y por ello contienen aberturas
que permiten la penetración de los ligandos. Informes de que la
expresión de dominios de transmembrana ausentes rescata receptores
truncados inactivos de vasopresina V2,
beta-adrenérgicos y muscarínicos M3 (Schoneberg y
col., EMBO J. 15: 1283 (1996); Wong y col., J. Biol. Chem. 265: 6219
(1990); Monnot y col., J. Biol. Chem. 271: 1507 (1996); Gudermann y
col., Annu. Rev. Neurosci. 20: 399 (1997); Osuga y col., J. Biol.
Chem. 272: 25006 (1997)) sugirieron que el péptido derivado del
sexto dominio de transmembrana del receptor
P2-adrenérgico resultaba inhibir la activación y
dimerización de receptores (Hebert y col., J. Biol. Chem., 271 (27):
16384-92 (1996)). Todas estas observaciones nos
sugerían que dirigirse a las interacciones de transmembrana de los
GPCR puede regular específicamente la función de los GPCR.
La naturaleza hidrofóbica de los péptidos de
transmembrana hace altamente probables sus penetraciones en la
bicapa. La orientación dentro de la membrana puede ser controlada
por adición de residuos cargados al extremo que se supone que es
extracelular.
Los polipéptidos GPCR de la presente invención,
o los ácidos nucleicos que los codifican, incluyen un grupo finito
de secuencias substancialmente correspondientes como péptidos o
polinucleótidos de substitución que pueden ser rutinariamente
obtenidos por alguien con conocimientos ordinarios en la técnica,
sin excesiva experimentación, en base a las enseñanzas y a las
directrices que aquí se presentan. Para una descripción detallada
de la química y estructura de las proteínas, véase Schulz y col.,
PRINCIPLES OF PROTEIN STRUCTURE, Springer-Verlag,
New York, 1978, y Creighton, T. E., PROTEINS: STRUCTURE AND
MOLECULAR PROPERTIES, W. H. Freeman & Co., San Francisco, 1983.
Para una presentación de substituciones de secuencias nucleotídicas,
tales como preferencias de codones, véase Ausubel y col., antes
citado, en las secciones A.1.1-A.1.24, y Sambrook y
col., antes citado, en los Apéndices C y D.
Los polipéptidos GPCR incluyen secuencias
homólogas y/o fragmentos de al menos uno de los dominios de
transmembrana 1-7 de uno o más GPCR u homólogos de
los mismos, cuyos polipéptidos GPCR no son de origen natural y/o se
presentan en forma aislada y/o purificada que no se encuentra en la
naturaleza.
Sin embargo, en el contexto de la presente
invención, se prefieren polipéptidos GPCR de más de
15-20 aminoácidos para que los polipéptidos GPCR
sean capaces de extenderse por la bicapa lipídica.
Se prefiere en particular seleccionar los
péptidos de la invención o modificarlos de tal forma que un extremo
esté cargado y el otro sea neutro en condiciones fisiológicas. Esto
es para que el péptido se inserte espontáneamente en una membrana.
Es particularmente importante que el péptido se inserte en la misma
orientación que el dominio de GPCR de transmembrana del que
deriva.
Los péptidos de la invención pueden derivar de
cualquiera de los 7 dominios de TM. Como ejemplos ilustrativos no
limitativos de dominios de transmembrana TM1 y TM2 de GPCR que se
usan para generar moléculas de la presente invención, se incluyen
los siguientes:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(Tabla pasa a página
siguiente)
Se obtuvieron las secuencias anteriores de una
base de datos pública. Se incluyen ejemplos de secuencias de
dominios de transmembrana TM3 y TM5 en WO 94/05695 y se incorporan
como referencia. Los ejemplos de secuencias de dominios de
transmembrana TM4, TM6 y TM7 pueden ser obtenidos de forma similar
de fuentes públicas.
Los péptidos o fragmentos de GPCR pueden ser
aislados de una fuente natural, químicamente sintetizados o
producidos recombinantemente, para obtener polipéptidos GPCR que
imitan, modulan o inhiben la unión de ligandos a receptores
copulados a proteína G.
Los péptidos de transmembrana de la presente
invención son producidos usando procedimientos bien conocidos de
síntesis peptídica, como se describe en, v.g., Merrifield, Science
232: 341-347 (1986), Barany y Merrifield, THE
PEPTIDES, Gross y Meienhofer, eds. (N.Y., Academic Press), pp.
1-284 (1979); y Stewart y Young, SOLID PHASE
PEPTIDE SYNTHESIS (Rockford, III., Pierce), 2ª Ed. (1984), aquí
incorporados como referencia.
Los péptidos fueron sintetizados por una
síntesis peptídica en fase sólida de flujo a través en un
Sintetizador Peptídico de Applied Biosystems 432A utilizando
derivados Fmoc de aminoácidos. Para vencer la agregación que
frecuentemente aparece durante la síntesis de péptidos hidrofóbicos
y da lugar al bloqueo de la cadena peptídica en crecimiento, se
introdujeron derivados FmocHmb de Ala, Val y Leu en las diferentes
secuencias, pero no más de dos derivados de cada tipo por péptido
para evitar el bloqueo estérico durante la síntesis. Se prolongó la
copulación en la etapa después del aminoácido FmocHmb a 90 min., ya
que este grupo protector provoca un enlentecimiento de la siguiente
etapa de copulación debido a bloqueo estérico (T. Johnson, M.
Quibell, Tetrahedron Lett. 35:463 (1994)). La pureza de los péptidos
fue valorada por HPLC de fase invertida y las estructuras fueron
confirmadas por espectrometría de masas con desorción de láser
asistida por matriz.
Se pueden obtener ácidos nucleicos que codifican
péptidos de transmembrana GPCR por sintetización, aislamiento u
obtención de una secuencia de ácido nucleico que codifique una
proteína GPCR y subclonación de una región de la secuencia que
codifica un péptido de transmembrana deseado.
Los oligonucleótidos usados en la presente
invención, incluyendo secuencias que codifican péptidos de
transmembrana, son eventualmente sintetizados químicamente usando el
método de triéster de fosforamidita en fase sólida de Beaucage y
Carruthers, Tetrahedron Lett., 22(20):
1859-1862 (1981), usando un sintetizador
automatizado como se describe en Needham-VanDevanter
y col., Nucleic Acids Res., 12: 6159-6168 (1984). Se
purifican entonces los oligonucleótidos químicamente sintetizados
por electroforesis en gel de acrilamida nativa o por HPLC de
intercambio aniónico como se describe en Pearson y Regnier, J.
Chrom., 255: 137-149 (1983). Se verifica la
secuencia del oligonucleótido sintético, por ejemplo usando el
método de degradación química de Maxam y Gilbert en Grossman, L. y
Moldave, D., eds. Academic Press, New York, Methods in Enzymology,
65:499-560 (1980).
Se pueden modificar (es decir, mutar) las
secuencias de ADN codificantes de los péptidos y proteínas de
transmembrana GPCR para preparar diversas mutaciones. Dichas
mutaciones pueden ser degenerativas, es decir, que la mutación no
cambia la secuencia de aminoácidos codificada por el codon mutado, o
no degenerativas, es decir, que la mutación cambia la secuencia de
aminoácidos codificada por el codon mutado. Estas secuencias de ADN
modificadas pueden ser preparadas, por ejemplo, mutando secuencias
conocidas de tal forma que la mutación dé lugar a la deleción,
substitución, inserción, inversión o adición de uno o más
aminoácidos en el polipéptido codificado usando diversos métodos
conocidos en la técnica. Por ejemplo, se pueden emplear los métodos
de mutagénesis dirigida a sitio descritos en Taylor y col., Nucl.
Acids Res. 13, 8749-8764 (1985), y Kunkel, Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 82, 482-492 (1985). Además, se
pueden comprar kits para mutagénesis dirigida a sitio a vendedores
comerciales. Por ejemplo, se puede comprar un kit para realizar
mutagénesis dirigida a sitio a Amersham Corp. (Arlington Heights,
III.). Tanto las mutaciones degenerativas como las no degenerativas
pueden ser ventajosas en la producción o el uso de los polipéptidos
de la presente invención. Por ejemplo, estas mutaciones pueden
permitir mayores niveles de producción o una más fácil purificación,
o proporcionar sitios adicionales de reconocimiento de
endonucleasas de restricción. Todos estos ADN modificados (y las
moléculas polipeptídicas codificadas) están incluidos en el alcance
de la presente invención.
Se pueden aislar ácidos nucleicos que codifican
GPCR a partir de librerías genómicas o de ADNc, subclonando la
librería en vectores de expresión, marcando sondas, hibridación de
ADN y similares, como se describe en Sambrook, y col., MOLECULAR
CLONING - A LABORATORY MANUAL (2ª Ed.), Vol. 1-3,
Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, 1989.
Se hace aquí referencia en adelante a este manual como "Sambrook y
col." y se incorpora aquí como referencia.
\newpage
También se pueden usar varios métodos de
amplificación de secuencias de interés, tales como la reacción en
cadena de polimerisa (PCR), para preparar ADN codificante de
péptidos de transmembrana GPCR o de un fragmento peptídico de los
mismos. En las técnicas de PCR, se sintetizan cebadores
oligonucleotídicos complementarios a los dos extremos 3' de la
región de ADN que se ha de amplificar. Se lleva a cabo entonces la
reacción en cadena de polimerasa usando dos cebadores. Véase PCR
PROTOCOLS: A GUIDE TO METHODS AND APPLICATIONS. (Innis, M, Gelfand,
D., Sninsky, J. y White, T., eds.), Academic Press, San Diego
(1990). Se pueden seleccionar cebadores para amplificar la
totalidad de las regiones codificantes de un péptido de
transmembrana GPCR de longitud completa o para amplificar segmentos
de ADN de menor tamaño, según se desee. Una vez se amplifican por
PCR las secuencias seleccionadas, se pueden preparar sondas
oligonucleotídicas a partir de la secuencia obtenida. Se pueden
usar luego estas sondas para aislar ADN codificantes de péptidos de
transmembrana GPCR o de un fragmento peptídico de los mismos.
Una vez se aísla y clona un ácido nucleico
codificante de un péptido de transmembrana GPCR o de un fragmento
peptídico del mismo, el ácido nucleico es expresado en una variedad
de células sometidas a ingeniería recombinante para determinar que
el ácido nucleico aislado realmente codifica los péptidos de
transmembrana GPCR deseados o un fragmento de los mismos. Se
consigue típicamente la expresión de ácidos nucleicos naturales o
sintéticos uniendo operativamente un ácido nucleico de interés a un
promotor (que es constitutivo o inducible), incorporando la
construcción a un vector de expresión e introduciendo el vector en
una célula huésped adecuada. Los vectores típicos contienen
finalizadores de la transcripción y de la traducción, secuencias de
iniciación de la transcripción y de la traducción y promotores
útiles para la regulación de la expresión del ácido nucleico
particular. Los vectores incluyen eventualmente cassettes de
expresión genéricos que contienen al menos una secuencia
finalizadora independiente, secuencias que permiten la replicación
del cassette en eucariotas o procariotas o ambos (v.g., vectores
lanzadera) y marcadores de selección para sistemas tanto
procarióticos como eucarióticos. Los vectores son adecuados para
replicación e integración en procariotas, eucariotas o
preferiblemente ambos. Véanse Giliman y Smith (1979), Gene, 8:
81-97; Roberts y col., (1987), Nature,
328:731-734; Berger y Kimmel, Guide to Molecular
Cloning Techniques, Methods in Enzymology 152, Academic Press, Inc.,
San Diego, CA (Berger); Sambrook y col., (1989), MOLECULAR CLONING
- A LABORATORY MANUAL (2ª ed.) Vol. 1-3, Cold
Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Press, N.Y.,
(Sambrook); y F.M. Ausubel y col., CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR
BIOLOGY, eds., Current Protocols, una empresa conjunta entre Greene
Publishing Associates, Inc. y John Wiley & Sons, Inc.,
(Suplemento de 1994) (Ausubel). La información del producto de
fabricantes de reactivos biológicos y equipo experimental también
proporciona información útil sobre métodos biológicos conocidos.
Dichos fabricantes incluyen la compañía química SIGMA (Saint Louis,
MO), R&D Systems (Minneapolis, MN), Pharmacia LKB Biotechnology
(Piscataway, NJ), CLONTECH Laboratories, Inc. (Palo Alto, CA), Chem.
Genes Corp., Aldrich Chemical Company (Milwaukee, WI), Glen
Research, Inc., GIBCO BRL Life Technologies, Inc. (Gaithersberg,
MD), Fluka Chemica-Biochemika Analytika (Fluka
Chemie AG, Buchs, Suiza) y Applied Biosystems (Foster City, CA),
así como otras muchas fuentes comerciales conocidas para un
experto.
Los ácidos nucleicos (v.g., secuencias
codificantes, promotores y vectores) usados en el presente método
pueden ser aislados de fuentes naturales, obtenidos de fuentes tales
como librerías ATCC o GenBank o preparados por métodos sintéticos.
Los ácidos nucleicos sintéticos pueden ser preparados por una
variedad de métodos en solución o en fase sólida. Hay una amplia
disponibilidad de descripciones detalladas de los procedimientos
para la síntesis en fase sólida de ácidos nucleicos por química de
fosfitos-triésteres, fosfotriésteres y
H-fosfonatos. Véanse, por ejemplo, Itakura, Patente
EE.UU. Nº 4.401.796; Caruthers y col., Patentes EE.UU. Nº 4.458.066
y 4.500.707; Beaucage y col. (1981), Tetrahedron Lett.,
22:1859-1862; Matteucci (1981) y col., J. Am. Chem.
Soc., 103:3185-3191; Caruthers, y col. (1982),
Genetic Engineering, 4:1-17; Jones, capítulo 2,
Atkinson y col., capítulo 3, y Sproat y col., capítulo 4, en
OLIGONUCLEOTIDE SYNTHESIS: A PRACTICAL APPROACH, Gait (ed.), IRL
Press, Washington D.C. (1984); Froehler y col. (1986), Tetrahedron
Lett., 27:469-472; Froehler y col. (1986), Nucleic
Acids Res., 14:5399-5407; Sinha y col. (1983),
Tetrahedron Lett., 24:5843-5846; y Sinha y col.
(1984), Nucl. Acids Res., 12:4539-4557, aquí
incorporadas como referencia.
Es bien conocido el diseño de péptidos y
miméticos de péptidos químicamente modificados que son resistentes
a la degradación por enzimas proteolíticas o tienen una mejor
solubilidad o propiedades de unión.
Los aminoácidos modificados o derivados químicos
de péptidos GPCR según la presente invención pueden contener restos
químicos adicionales o aminoácidos modificados que normalmente no
forman parte de una proteína. Se incluyen así modificaciones
covalentes del péptido en el alcance de la presente invención.
Dichas modificaciones pueden ser introducidas en un polipéptido
GPCR por reacción de residuos de aminoácidos deseados del
polipéptido con un agente derivatizante orgánico capaz de
reaccionar con cadenas laterales o residuos terminales
seleccionados. Los siguientes ejemplos de derivados químicos son
facilitados a modo de ilustración y no a modo de limitación.
El diseño de miméticos de péptidos resistentes a
la degradación por enzimas proteolíticas es bien conocido, tanto
para el diseño de agonistas/antagonistas de hormonas como para el de
inhibidores enzimáticos. Véanse, v.g., Sawyer, en
STRUCTURE-BASED DRUG DESIGN, P. Verapandia, Ed., NY
1997; Patente EE.UU. Nº 5.552.534; y Patente EE.UU. Nº 5.550.251,
todas ellas incorporadas como referencia.
Históricamente, el foco principal del diseño de
peptidomiméticos ha evolucionado a partir de la investigación para
el descubrimiento de fármacos dirigidos a receptores y no ha sufrido
un impacto directo de una estructura tridimensional
experimentalmente determinada de la proteína de interés. No
obstante, una aproximación jerárquica de diseño molecular
péptido\rightarrowpeptidomimético y modificación química ha
evolucionado a lo largo de las dos últimas décadas, en base a la
transformación sistemática de un ligando peptídico y al análisis
iterativo de las relaciones estructura-actividad y
estructura-conformación de análogos de "segunda
generación". Dicho trabajo ha integrado típicamente técnicas
biofísicas (cristalografía de rayos x y/o espectroscopía de RMN) y
modelación molecular asistida por ordenador con pruebas biológicas
para avanzar el diseño de fármacos peptidomiméticos.
Las propiedades de estructura tridimensional de
péptidos se definen en términos de ángulos de torsión (\psi,
\phi, \omega, \chi) entre el nitrógeno de la amina del
esqueleto (N^{\alpha}), el carbono del carbonilo del esqueleto
(C^{1}), el carbono de la metionina del esqueleto (C^{\alpha}) y
la funcionalización del hidrocarburo de cadena lateral (v.g.,
C^{\beta}, C^{\lambda}, C^{\delta}, C^{\varepsilon} de Lys)
derivado de la secuencia de aminoácidos. Un gráfico de Ramachandran
(\psi frente a \phi) puede definir las combinaciones preferidas
de ángulos de torsión para estructuras secundarias ordenadas
(conformaciones), tales como la \alpha-hélice, el
giro \beta, el giro \gamma o la lámina \beta. La flexibilidad
molecular está directamente relacionada con interacciones de unión
covalente y/o no covalente en un péptido particular. Incluso
modificaciones químicas modestas por
N^{\alpha}-metilo,
C^{\alpha}-metilo o
C^{\beta}-metilo pueden tener consecuencias
significativas sobre la conformación resultante.
El andamiaje
N^{\alpha}-C^{\alpha}-C' puede
ser transformado por introducción de substitución de olefina (v.g.,
C^{\alpha}-C^{\beta}\rightarrow C = C o
deshidroaminoácido o por inserción (v.g.,
C^{\alpha}-C' \rightarrow
C^{\alpha}-C=C-C' o aminoácido
vinílogo. También se puede substituir el carbono C\beta para
avanzar el diseño de así llamados aminoácidos "quiméricos".
Finalmente, con respecto a amidas N-substituidas,
merece también la pena mencionar la interesante aproximación de
substituir el andamiaje tradicional del péptido por bloques de
construcción de glicina N-substituida. Globalmente,
dichas modificaciones del andamiaje
N^{\alpha}-C^{\alpha}-C o de la
cadena lateral C^{\alpha}-C^{\beta} expanden la
diversidad molecular basada en péptidos (es decir, así llamadas
librerías "de peptoides"), así como nuestro conocimiento
estructural 3-D el espacio
\phi-\Psi-\chi
tradicional.
En una aproximación, tal como describen Sherman
y Spatola, J. Am. Chem. Soc. 112: 433 (1990), se substituyen uno o
más enlaces amida en de un modo esencialmente isoestérico por una
variedad de grupos químicos funcionales. Por ejemplo, se puede
substituir cualquier unión amida en cualquiera de los polipéptidos
GPCR por un resto de cetometileno, v.g.
(-C(=O)-CH_{2}-) para
(-(C=O)-NH-). Unas cuantas de las substituciones de
enlaces amida conocidas incluyen: aminometileno o
\psi[CH_{2}NH]; cetometileno o \psi[COCH_{2}];
etileno o \psi[CH_{2}CH_{2}]; olefina o
\psi[CH=CH]; éter o \psi[CH_{2}O]; tioéter o
\psi[CH_{2}S]; tetrazol o \psi[CN_{4}]; tiazol
o \psi[thz]; retroamida o \psi[NHCO]; tioamida o
\psi[CSNH]; y éster o \psi[CO_{2}]. Estos
substitutos de enlaces amida alteran las propiedades
conformacionales y de uniones de H que pueden ser necesarias para el
reconocimiento molecular peptídico y/o la actividad biológica en
blancos de receptores. Más aún, dichas substituciones en el
esqueleto pueden impartir estabilidad metabólica hacia la escisión
con peptidasas en relación al péptido parental. El descubrimiento
de aún otro isóstero de enlaces amida no hidrolizable ha tenido un
impacto particular en el diseño de inhibidores de proteasas y éstos
incluyen: hidroximetileno o \psi[CH(OH)];
hidroxietileno o \psi[CH(OH)CH_{2}] y
\psi[CH_{2}CH(OH)]; dihidroxietileno o
(\psi[CH(OH)CH(OH)], hidroxietilamina
o \psi[CH(OH)CH_{2}N], dihidroxietileno e
hidroximetileno simétrico C_{2}. Dichas modificaciones en el
esqueleto han resultado extremadamente efectivas, ya que pueden
representar miméticos de estado de transición o bioisoésteres del
intermediario tetraédrico hipotético (v.g.,
\psi[C(OH)_{2}NH]) para esta clase de
enzimas proteolíticas. Se espera que dichos derivados tengan la
propiedad de una mayor estabilidad a la degradación enzimática y
que, por lo tanto, posean ventajas para la formulación de
compuestos que pueden tener mayores vidas medias in vivo, al
ser administrados por vía oral, intravenosa, intramuscular,
intraperitoneal, tópica, rectal, intraocular u otras vías.
\global\parskip0.900000\baselineskip
Tanto las modificaciones en el esqueleto
peptídico como en la cadena lateral pueden proporcionar extremos
prototípicos para el diseño de miméticos de estructura secundaria,
como sugiere típicamente el hecho de que la substitución de
D-aminoácidos,
N^{\alpha}-Me-aminoácidos,
C^{\alpha}-Me-aminoácidos y/o
deshidroaminoácidos en un extremo peptídico puede inducir o
estabilizar conformaciones regioespecíficas de giro \beta, giro
\gamma, lámina \beta o \alpha-hélice. Hasta la
fecha, se han diseñado una variedad de miméticos de estructura
secundaria y se incorporado a péptidos o peptidomiméticos. El giro
\beta ha tenido un interés particular en el área del
descubrimiento de fármacos peptidomiméticos dirigidos a receptores.
Esta unidad estructural secundaria existe en una secuencia
tetrapeptídica en la cual el primer y cuarto átomo de C^{\alpha}
están separados en \leq 7 \ring{A} y se caracterizan además por
aparecer en una región no helicoidal de la secuencia peptídica y
poseer un enlace de H intramolecular de diez miembros entre los
residuos de aminoácidos i y i\rightarrow4. Una de las
aproximaciones iniciales de significación para el diseño de
miméticos de giro \beta era la plantilla basada en dipéptidos
monocíclica que emplea una restricción de cadena lateral a esqueleto
en los sitios i + 1 e i + 2. A lo largo de la pasada década, se han
desarrollado una variedad de otras plantillas monocíclicas o
bicíclicas como miméticos de giro \beta. Se han descrito miméticos
de giro \beta monocíclicos que ilustran la oportunidad potencial
para diseñar andamiajes que pueden incorporar cada una de las
cadenas laterales (posiciones i, i+1, i+2 e i+3), así como cinco de
las ocho funcionalidades NH o C=O, en la secuencia tetrapeptídica
parental, secuencia tetrapeptídica modelada en conformaciones de
giro \beta de tipos I-IV. De forma similar, una
plantilla de benzodiazepina ha mostrado utilidad como andamiaje de
mimético de giro \beta que también puede estar multisubstituido
para simular funcionalización de cadena lateral, particularmente en
las posiciones i e i + 3 de la secuencia tetrapeptídica
correspondiente modelada en conformaciones de giro \beta de tipo
I-VI. Un mimético de giro \gamma recientemente
descrito ilustra una aproximación innovadora para incorporar un
substituto de retroamida entre los residuos de aminoácidos i e
i\rightarrow1 con un puente de etileno entre los átomos N^{1}
(es decir, nitrógeno que substituye al C' del carbonilo) y N de las
posiciones i e i+2, y esta plantilla permite la posibilidad de las
tres cadenas laterales de la secuencia tripeptídica parental.
Finalmente, el diseño de un mimético de lámina \beta proporciona
una plantilla atractiva para restringir el esqueleto de un péptido
al que simula una conformación extendida. La lámina \beta es de
interés particular en el área del descubrimiento de fármacos
peptidomiméticos dirigidos a
proteasas.
proteasas.
Los aminoácidos aromáticos pueden estar
substituidos con D- o L-naftilalanina, D- o
L-fenilglicina, D- o
L-2-tienilalanina, D- o
L-1-, 2-, 3- o
4-pirenilala-nina, D- o
L-3-tienilalanina, D- o
L-(2-piridinil)ala-nina, D-
o L-(3-piridinil)alanina, D- o
L-(2-pirazinil)-alanina, D- o
L-(4-isopropil)fenilglicina,
D-(trifluoro-metil)fenilglicina,
D-(trifluorometil)fenilalanina,
D-p-fluorofenilalanina, D- o
L-p-bifenilfenilalanina, D- o
L-p-metoxibifenilfenilalanina, D- o
L-2-indol(alquil)alani-nas
y D- o L-alquilaininas, donde el alquilo puede ser
metilo, etilo, propilo, hexilo, butilo, pentilo, isopropilo,
isobutilo, sec-butilo, isopentilo o aminoácidos no
ácidos de C_{1}-C_{20} substituidos o sin
substituir.
Los aminoácidos ácidos pueden estar substituidos
con aminoácidos no carboxilados, manteniendo aún una carga
negativa, y derivados o análogos de los mismos, tales como los
ejemplos no limitativos de (fosfono)alanina, glicina,
leucina, isoleucina, treonina o serina; o sulfatados (v.g.,
-SO_{3}H), como treonina, serina o tirosina.
Otras substituciones pueden incluir aminoácidos
hidroxilados no naturales producidos combinando "alquilo"
(según se define aquí y ejemplifica) con cualquier aminoácido
natural. Los aminoácidos básicos pueden estar substituidos con
grupos alquilo en cualquier posición de los aminoácidos naturales
lisina, arginina, ornitina, citrulina o ácido
(guanidino)acético, u otros ácidos
(guanidino)alquilacéticos, donde "alquilo" se define
como antes. Los derivados de nitrilo (v.g., que contienen el resto
CN en lugar de COOH) pueden también substituir a la asparragina o a
la glutamina y el sulfóxido de metionina puede substituir a la
metionina. Los métodos de preparación de dichos derivados
peptídicos son bien conocidos para un experto en la técnica.
Además, cualquier aminoácido de dichos péptidos
puede estar substituido por el mismo aminoácido, pero de quiralidad
opuesta. Así, cualquier aminoácido natural en la configuración L (a
la que también puede hacerse referencia como R o S, dependiendo de
la estructura de la entidad química) puede estar substituido con un
aminoácido del mismo tipo estructural químico, pero de
"caroled" opuesto, al que generalmente se hace referencia como
aminoácido D, pero al que se puede hacer adicionalmente referencia
como R o S, dependiendo de su composición y configuración química.
Dichos derivados tienen la propiedad de una estabilidad mucho mayor
a la degradación enzimática y, por lo tanto, son ventajosos en la
formulación de compuestos que pueden tener vidas medias in
vivo más prolongadas, cuando se administran por vía oral,
intravenosa, intramuscular, intraperitoneal, tópica, rectal,
intraocular u otras.
Como modificaciones de aminoácidos adicionales
de aminoácidos de polipéptidos GPCR de la presente invención, se
pueden incluir los siguientes: pueden reaccionar residuos de
cisteína con alfa-haloacetatos (y correspondientes
aminas), tales como ácido 2-cloroacético o
cloroacetamida, para dar derivados carboximetílicos o
carboxiamidometílicos. También se pueden derivatizar residuos de
cisteinilo por reacción con compuestos tales como
bromotrifluoroacetona, ácido
alfa-bromo-beta-(5-imidozoil)propiónico,
fosfato de cloroacetilo, N-alquilmaleimidas,
disulfuro de
3-nitro-2-piridilo,
disulfuro de metil-2-piridilo,
p-cloromercuribenzoato,
2-cloromercuri-4-nitrofenol
o
cloro-7-nitrobenzo-2-oxa-1,3-diazol.
Se pueden derivatizar los residuos de histidilo
por reacción con compuestos tales como procarbonato de dietilo,
v.g., a pH 5,5-7,0, ya que este agente es
relativamente específico para la cadena lateral de histidilo, y
también se puede usar bromuro de para-bromofenacilo;
v.g., cuando la reacción es preferiblemente llevada a cabo en
cacodilato de sodio 0,1 M a pH 6,0.
Los residuos terminales de lisinilo y amino
pueden reaccionar con compuestos tales como anhídrido de ácido
succínico u otros anhídridos de ácidos carboxílicos. Se espera que
la derivatización con estos agentes tenga un efecto de reversión de
la carga de los residuos de lisinilo. Otros reactivos adecuados para
derivatizar residuos que contienen alfa-amino
incluyen compuestos tales como imidoésteres, v.g., como
picolinimidato de metilo, piridoxal fosfato, piridoxal,
cloroborohidruro, ácido trinitrobencenosulfónico,
O-metilisourea, 2,4 pentanodiona y la reacción
catalizada con transaminasas con glioxilato.
Los residuos de arginilo pueden ser modificados
por reacción con uno o más reactivos convencionales, entre ellos
fenilglioxal, 2,3-butanodiona,
1,2-ciclohexanodiona y ninhidrina según etapas de
método conocidas. La derivatización de los residuos de arginina
requiere llevar a cabo la reacción en condiciones alcalinas debido
al alto pKa del grupo funcional guanidina. Más aún, estos reactivos
pueden reaccionar con los grupos de la lisina, así como con el
grupo épsilon-amino de la arginina.
Los residuos de tirosilo pueden ser modificados
por reacción con compuestos de diazonio aromáticos o
tetranitrometano. Se pueden usar N-acetilimidazol y
tetranitrometano para formar especies
O-acetiltirosilo y
3-nitroderivados, respectivamente.
Los grupos laterales carboxilo (aspartilo o
glutamilo) pueden ser selectivamente modificados por reacción con
carbodiimidas
(R'-NC-N-R') tales
como
1-ciclohexil-3-(2-morfolinil(4-etil)carbodiimida
o
1-etil-3-(4-azonia-4,4-dimetilpentil)carbodiimida.
Más aún, los residuos de aspartilo y glutamilo pueden convertirse
en residuos de asparraginilo y glutaminilo por reacción con iones
amonio.
Los residuos de glutaminilo y asparraginilo
pueden ser desamidados a los correspondientes residuos de glutamilo
y aspartilo. Alternativamente, estos residuos pueden ser desamidados
en condiciones débilmente ácidas. Cualquier forma de estos residuos
entra dentro del alcance de la presente invención.
\global\parskip1.000000\baselineskip
La derivatización con agentes bifuncionales es
útil para el entrecruzamiento del péptido con ciertos restos
químicos. Como agentes entrecruzantes comúnmente usados, se
incluyen, v.g.,
1,1-bis(diazoacetil)-2-feniletano,
glutaraldehído, ésteres de N-hidroxisuccinimida,
por ejemplo ésteres con ácido 4-azidosalicílico,
imidoésteres homobifuncionales, incluyendo ésteres
disuccinimidílicos tales como
3,3'-ditiobis(succinimidilpropionato) y
maleimidas bifuncionales tales como
bis-N-maleimido-1,8-octano.
Los agentes derivatizantes tales como
metil-3-[(p-azidofenil)ditio]propioimidato
dan intermediarios fotoactivables capaces de formar
entrecruzamientos en presencia de luz. Alternativamente, se pueden
usar matrices insolubles en agua, tales como carbohidratos activados
con bromuro de cianógeno y los substratos reactivos descritos en
las Patentes EE.UU. Nº 3.969.287, 3.691.016, 4.195.128, 4.247.642,
4.229.537 y 4.330.440 (aquí incorporadas en su totalidad como
referencia), para la inmovilización de proteínas.
Otras modificaciones de los polipéptidos GPCR de
la presente invención pueden incluir la hidroxilación de prolina y
lisina, la fosforilación de los grupos hidroxilo de los residuos
serilo o treonilo, la metilación de los grupos
alfa-amino de las cadenas laterales de lisina,
arginina e histidina (T. E. Creighton, Proteins: Structure and
Molecule Properties, W. H. Freeman & Co., San Francisco, pp.
79-86 (1983)), la acetilación de la amina
N-terminal, la metilación de los residuos de amida
de la cadena principal (o substitución con
N-metilaminoácidos) y, en algunos casos, la
amidación de los grupos carboxilo C-terminales,
según etapas de método conocidas.
Dichos restos derivatizados pueden mejorar la
solubilidad, la absorción, la permeabilidad a través de la barrera
hematoencefálica, la vida media biológica y similares. Dichos restos
o modificaciones de los polipéptidos GPCR pueden eliminar o atenuar
alternativamente cualquier posible efecto colateral no deseable de
la proteína y similares. Se describen restos capaces de mediar en
dichos efectos, por ejemplo, en Remington's Pharmaceutical
Sciences, 16ª ed., Mack Publishing Co., Easton, Pa. (1980).
Dichos derivados químicos de los polipéptidos
GPCR pueden proporcionar también unión a soportes sólidos,
incluyendo, aunque sin limitación, agarosa, celulosa, fibras huecas
u otros carbohidratos poliméricos tales como agarosa y celulosa,
tal como para la purificación, la generación de anticuerpos o la
clonación; o para obtener propiedades físicas alteradas, tales como
resistencia a la degradación enzimática o una mayor afinidad de
unión o modulación para los GPCR, que se desea para composiciones
terapéuticas que contengan polipéptidos GPCR, anticuerpos para los
mismos o fragmentos de éstos. Dichos derivados peptídicos son bien
conocidos en la técnica, así como las etapas de los métodos para
producir dichos derivados usando carbodiimidas, ésteres activos de
N-hidroxisuccinimida o anhídridos mixtos, como
ejemplos no limitativos.
La variación sobre las secuencias de
polipéptidos GPCR de la presente invención puede incluir también:
la adición de uno o más (v.g., dos, tres, cuatro o cinco) residuos
de lisina, arginina u otros residuos básicos o uno o más (v.g.,
dos, tres, cuatro o cinco) residuos de glutamato o aspartato u otros
residuos ácidos en un extremo del péptido, donde "ácido" y
"básico" son como aquí se define. Se pueden introducir también
cargas negativas por adición de grupos carboxilo, fosfato, borato,
sulfonato o sulfato. Dichas modificaciones pueden aumentar el
contenido en alfa-hélice del péptido por el
"efecto dipolo de la hélice". También pueden aportar una mayor
solubilidad acuosa del péptido y permitir la correcta inserción de
péptidos en una estructura de membrana.
En otra aproximación, se han usado una variedad
de aminoácidos no codificados o modificados tales como
D-aminoácidos y N-metilaminoácidos
para modificar péptidos de mamíferos. Alternativamente, se ha
estabilizado una presunta conformación bioactiva por medio de una
modificación covalente, tal como ciclación, o por incorporación de
gamma-lactama o de otros tipos de puentes. Véanse,
v.g., Veber y Hirschmann, y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1978
75 2636, y Thorsett, y col., Biochem Biophys. Res. Comm., 1983 111
166. El objetivo primario de tales manipulaciones no ha sido evitar
el metabolismo o aumentar la biodisponibilidad oral, sino más bien
restringir una conformación bioactiva para aumentar la potencia o
para inducir una mayor especificidad para un subtipo de
receptor.
Los anteriores ejemplos de agonistas o
antagonistas peptidomiméticos basados en andamiaje peptídico o
plantilla no peptídica ilustran diversas estrategias para elaborar
modelos de conformación bioactiva y/o de farmacóforos de ligandos
peptídicos en sus receptores. En muchos casos, también se ha
conseguido selectividad de los subtipos de receptores pro
modificaciones estructurales sistemáticas de extremos prototípicos
de peptidomiméticos. Así, aunque las estructuras 3D de los GPCR
siguen siendo difíciles de encontrar (excepto para modelos
construidos a partir de estructuras 3D de baja resolución basadas
en homología de bacteriorrodopsina o rodopsina, véase lo que
antecede), el desarrollo de modelos de farmacóforos utilizando la
aproximación jerárquica en el diseño de fármacos basado en la
estructura de péptidos \rightarrow peptidomiméticos es
prometedor.
Los polipéptidos de esta invención pueden ser
purificados hasta una pureza substancial por técnicas estándar,
incluyendo la precipitación selectiva con substancias tales como
sulfato de amonio, la cromatografía en columna, los métodos de
inmunopurificación y otros. Véase, por ejemplo, R. Scopes, Protein
Purification: Principles and Practice,
Springer-Verlag: New York (1982), aquí incorporado
como referencia. Por ejemplo, los péptidos y proteínas de
transmembrana GPCR y los polipéptidos producidos por tecnología de
ADN recombinante son purificados por una combinación de lisis
celular (v.g., sonicación) y cromatografía de afinidad o
inmunoprecipitación con un anticuerpo específico para péptidos de
transmembrana GPCR o un fragmento peptídico de éstos. Para los
productos de fusión, la digestión posterior de la proteína de fusión
con una enzima proteolítica apropiada libera el polipéptido
deseado. Las proteínas pueden ser entonces además purificadas por
técnicas de química proteica estándar. Una proteína purificada
exhibe preferiblemente una sola banda en un gel electroforético. Se
recuerda a los expertos en la técnica que los métodos deben tener en
cuenta la naturaleza hidrofóbica de los péptidos.
Los péptidos de transmembrana GPCR o un
fragmento peptídico de los mismos pueden ser detectados o
cuantificados por una variedad de métodos. Los métodos preferidos
incluyen el uso de anticuerpos específicos.
Los métodos de producción de anticuerpos
policlonales y monoclonales son conocidos para los expertos en la
técnica. Véanse, v.g., Coligan (1991), CURRENT PROTOCOLS IN
IMMUNOLOGY, Wiley/Greene, NY; y Harlow and Lane (1989), ANTIBODIES:
A LABORATORY MANUAL, Cold Spring Harbor Press, NY; Stites y col.,
(eds.) BASIC AND CLINICAL IMMUNOLOGY (4ª ed.), Lange Medical
Publications, Los Altos, CA, y las referencias allí citadas; Goding
(1986), MONOCLONAL ANTIBODIES: PRINCIPLES AND PRACTICE (2ª ed.)
Academic Press, New York, NY; y Kohler y Milstein (1975), Nature,
256:495-497. Dichas técnicas incluyen la preparación
de anticuerpos por selección de anticuerpos a partir de librerías
de anticuerpos recombinantes en fagos o vectores similares. Véanse
Huse y col., (1989), Science, 246:1275-1281; y Ward
y col. (1989) Nature, 341:544-546. Por ejemplo, para
producir antisueros para uso como inmunoensayo, se aísla un
polipéptido como se describe aquí. Por ejemplo, se produce proteína
recombinante en una línea celular transformada. Se inmuniza una
cepa endogámica de ratones o conejos con el péptido usando un
adyuvante estándar, tal como adyuvante de Freund, y un protocolo de
inmunización estándar. Alternativamente, se puede usar un péptido
sintético derivado de las secuencias aquí descritas y conjugado a
una proteína de soporte como inmunógeno.
Se pueden usar una serie de inmunógenos para
producir anticuerpos específicamente reactivos con péptidos de
transmembrana GPCR o con un fragmento peptídico de los mismos. La
proteína recombinante es el inmunógeno preferido para la producción
de anticuerpos monoclonales o policlonales. También se puede usar
proteína natural en forma pura o impura. También se pueden usar
péptidos sintéticos producidos usando los péptidos de transmembrana
GPCR o un fragmento peptídico de los mismos de las secuencias aquí
descritas como inmunógeno para la producción de anticuerpos para la
proteína. La proteína recombinante puede expresarse en células
eucarióticas o procarióticas, como se ha descrito anteriormente, y
ser purificada como se ha descrito antes en general. El producto es
entonces inyectado en un animal capaz de producir anticuerpos. Se
pueden generar anticuerpos monoclonales o policlonales para
posterior uso en inmunoensayos para medir la proteína.
Los métodos de producción de anticuerpos
policlonales son conocidos para los expertos en la técnica.
Resumiendo, se mezcla un inmunógeno, preferiblemente una proteína
purificada tal como péptidos de transmembrana GPCR o un fragmento
peptídico de los mismos, con un adyuvante y se inyecta en un animal
de elección (v.g., un ratón, una rata, un conejo, un cerdo, una
cabra, una vaca, un caballo, pollos, etc.) a intervalos de
1-4 semanas. Se puede conjugar el inmunógeno a una
proteína de soporte y puede servir de inmunógeno. Se monitoriza la
respuesta inmune del animal a la preparación de inmunógeno tomando
muestras de ensayo de sangre y determinando el título de
reactividad con los péptidos de transmembrana GPCR o un fragmento
peptídico de éstos. Cuando se obtienen títulos apropiadamente altos
de anticuerpo para el inmunógeno, se recoge sangre del animal y se
preparan antisueros. Se puede hacer aún una fraccionación de los
antisueros para enriquecer en anticuerpos reactivos con la proteína
si se desea. (Véase Harlow y Lane, antes citado).
Se recogen los sueros policlonales y se titulan
frente a la proteína inmunogénica en un inmunoensayo, por ejemplo
un inmunoensayo en fase sólida con el inmunógeno inmovilizado sobre
un soporte sólido. Se seleccionan los antisueros policlonales con
un título de 10^{4} o superior y se comprueba su reactividad
cruzada frente a péptidos de transmembrana no-GPCR
o incluso péptidos de transmembrana GPCR de otros tipos celulares u
otras especies o un fragmento peptídico de los mismos, usando un
inmunoensayo de unión competitiva (véase, v.g., Harlow y Lane,
antes citado, en las páginas 570-573). Los
anticuerpos y antisueros monoclonales y policlonales específicos
normalmente se unirán con una K_{D} de al menos aproximadamente
0,1 mM, más normalmente de al menos aproximadamente 1 \muM,
preferiblemente de al menos aproximadamente 0,1 \muM o mayor, y
más preferiblemente de 0,01 \muM o mayor.
Se pueden obtener anticuerpos monoclonales por
diversas técnicas con las que los expertos en este campo están
familiarizados. Resumiendo, se inmortalizan células de bazo de un
animal inmunizado con un antígeno deseado, comúnmente por fusión
con una célula de mieloma (véase Kohler y Milstein, Eur. J. Immunol.
6:511-519 (1976), aquí incorporado como
referencia). Como métodos alternativos de inmortalización, se
incluyen la transformación con Virus Epstein Barr, oncogenes o
retrovirus, u otros métodos bien conocidos en la técnica. Se hace un
rastreo de colonias que surgen de células inmortalizadas simples en
cuanto a la producción de anticuerpos de la especificidad y
afinidad deseadas para el antígeno y el rendimiento de los
anticuerpos monoclonales producidos por dichas células puede
aumentar gracias a varias técnicas, incluyendo la inyección en la
cavidad peritoneal de un huésped vertebrado. Alternativamente, se
pueden aislar secuencias de ADN que codifiquen un anticuerpo
monoclonal o un fragmento de unión del mismo rastreando una
librería de ADN de células B humanas según el protocolo general
señalado por Huse y col., (1989) Science
246:1275-1281.
Se puede medir una proteína particular por una
variedad de métodos de inmunoensayo. Para una revisión de
procedimientos inmunológicos y de inmunoensayo en general, véase
BASIC AND CLINICAL IMMUNOLOGY, 7ª Edición (D. Stites y A. Terr,
eds.) 1991. Más aún, los inmunoensayos de la presente invención
pueden ser llevados a cabo en cualquiera de varias configuraciones,
que están ampliamente revisadas en ENZYME IMMUNOASSAY, E.T. Maggio,
ed., CRC Press, Boca Raton, Florida (1980); "Practice and Theory
of Enzyme Immunoassays", P. Tijssen, en LABORATORY TECHNIQUES IN
BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, Elsevier Science Publishers B.V.
Amsterdam (1985); y Harlow y Lane, ANTIBODIES, A LABORATORY MANUAL,
antes citado, cada una de las cuales es aquí incorporada como
referencia.
Los inmunoensayos para péptidos o
peptidomiméticos de transmembrana GPCR o subfragmentos de los mismos
pueden usar un antisuero policlonal producido contra un péptido o
peptidomimético de la invención. Este antisuero es seleccionado
para tener una baja reactividad cruzada frente a otros péptidos
(distintos de los péptidos de transmembrana no-GPCR
u otros péptidos de transmembrana GPCR) y cualquier reactividad
cruzada de este tipo es eliminada por inmunoabsorción antes de su
uso en el inmunoensayo.
Se pueden usar inmunoensayos en el formato de
unión competitiva para las determinaciones de reactividad cruzada.
Por ejemplo, se puede inmovilizar un antígeno peptídico de
referencia de la invención en un soporte sólido. Se mide la
capacidad de otras moléculas (distintas de los péptidos de
transmembrana no-GPCR, o desconocidas) para
competir con la unión de antisueros que reconocen el antígeno
peptídico de referencia inmovilizado. Se compara la capacidad de
tales moléculas para competir con la unión de un antisuero o
anticuerpo al péptido de referencia inmovilizado con una molécula
estándar, tal como el propio antígeno peptídico de referencia. Se
calcula el porcentaje de reactividad cruzada usando cálculos
estándar. Se seleccionan antisueros con menos de un 10% de
reactividad cruzada para moléculas que tienen reactividad cruzada y
se reúnen. Se elimina eventualmente cualquier anticuerpo que tenga
reactividad cruzada de los sueros reunidos por inmunoabsorción con
moléculas que tienen reactividad cruzada.
Se usan entonces los antisueros inmunoabsorbidos
y reunidos en un inmunoensayo de unión competitiva para comparar la
unión de una segunda proteína con la del antígeno peptídico de
referencia. Para hacer esta comparación, cada una de las dos
moléculas en un amplio rango de concentraciones y se determina la
cantidad de cada molécula requerida para inhibir el 50% de la unión
de los antisueros al antígeno peptídico de referencia inmovilizado.
Si la cantidad de la segunda proteína requerida es menor de 10 veces
la cantidad del péptido de referencia usado para producir el
anticuerpo, entonces se dice que la segunda proteína se une
específicamente a un anticuerpo generado para el antígeno peptídico
de referencia.
La presencia de un polipéptido deseado
(incluyendo péptido, producto de traducción o producto de digestión
enzimática) en una muestra puede ser detectada y cuantificada usando
análisis Western blot. La técnica consiste, en general, en separar
los productos de la muestra por electroforesis en gel en base al
peso molecular, transferir las proteínas separadas a un soporte
sólido adecuado (tal como un filtro de nitrocelulosa, un filtro de
nilón o un filtro de nilón derivatizado) e incubar la muestra con
anticuerpos de marcaje que se unen específicamente a la proteína
analito. Los anticuerpos de marcaje se unen específicamente al
analito sobre el soporte sólido. Estos anticuerpos son marcados
directamente, o alternativamente se detectan después usando agentes
de marcaje tales como anticuerpos (v.g., anticuerpos de oveja
anti-ratón marcados donde el anticuerpo para un
analito es un anticuerpo murino) que se unen específicamente al
anticuerpo de marcaje.
Los péptidos o variantes peptídicas de la
invención que modulan la actividad biológica de los GPCR son
generalmente identificados como sigue. Se seleccionan secuencias
peptídicas a partir de los dominios de transmembrana del GPCR que
se ha de abordar. Los dominios de transmembrana son fácilmente
determinados por aplicación de modelos de ordenador a secuencias
conocidas. También se utilizan modelado por ordenador y comparación
con secuencias de péptidos de transmembrana conocidas para definir
la orientación de la secuencia peptídica en la membrana,
permitiendo así la determinación del extremo de la secuencia
peptídica que se encuentra hacia el aspecto extracelular de la
membrana plasmática. La selección de un dominio de transmembrana
preferido para abordarlo es en gran medida empírica. Hemos visto
que péptidos derivados del dominio de transmembrana 2 son
inhibidores particularmente efectivos de la función GPCR.
Alternativamente, secuencias peptídicas seleccionadas a partir del
dominio de transmembrana 4 también han resultado ser antagonistas
efectivos.
Al seleccionar una secuencia peptídica, se
sintetiza una secuencia de transmembrana de referencia y se
modifica sistemáticamente para identificar variantes (o análogos)
que tengan propiedades mejoradas. Las modificaciones introducen una
carga negativa en el extremo extracelular de la secuencia peptídica.
Se pueden añadir cargas negativas en forma de residuos de
aminoácidos ácidos tales como Asp o Glu. El número de residuos
ácidos añadidos es típicamente de 1 a 3 dependiendo de la
hidrofobicidad de la secuencia peptídica y de la posterior
necesidad de aumentar la solubilidad del péptido. Además, los
péptidos preferibles tienen una carga neutra en el extremo del
péptido que se orienta hacia el aspecto intracelular de la membrana
plasmática. Así, la naturaleza hidrofóbica global de dicho péptido
de transmembrana dará lugar a inserción en una membrana y la carga
negativa en el extremo extracelular dará lugar a que el péptido
tenga la misma orientación que el dominio GPCR de transmembrana del
que deriva. Se puede estudiar la inserción en la membrana por
microscopía fluorescente de análogos peptídicos marcados usando una
metodología conocida para los expertos en la técnica, como se
ilustra aquí en el Ejemplo 3.
En general, se determina la capacidad del
péptido o de las variantes peptídicas para modular la actividad del
GPCR de interés estudiando la capacidad del péptido para inhibir la
activación inducida por un ligando natural del GPCR de interés. La
activación de la mayoría de los GPCR da lugar a un aumento en el
AMPc o a la liberación de calcio intracelular. Así, si la
activación del GPCR de interés aumenta el AMPc, se determina la
actividad inhibitoria del péptido midiendo los niveles de AMPc
mediante métodos conocidos para los expertos en la técnica (véase,
v.g., C. Nordstedt y B.B. Fredholm Anal. Chem. 189:
231-234 (1990). De forma similar, si la activación
del GPCR de interés libera calcio intracelular, se determina la
actividad inhibitoria del péptido midiendo los niveles de calcio
intracelular como se ilustra en los ejemplos que se dan a
continuación.
\vskip1.000000\baselineskip
Los péptidos pueden ser estudiados para otras
propiedades, incluyendo las siguientes:
- mayor capacidad para modular la actividad
GPCR;
- mayor resistencia a la proteolisis;
- mejor solubilidad;
- vida media más larga o más corta,
particularmente en medio de cultivo o en un fluido biológico tal
como plasma o sangre entera;
- mejor capacidad para insertarse en un
compartimento de membrana, especialmente en una orientación
particular, por medios conocidos en la técnica.
\vskip1.000000\baselineskip
También se pueden sintetizar variantes
peptídicas que tengan una o más de las siguientes
modificaciones:
- substitución conservadora o no conservadora de
cualquiera de los residuos de aminoácidos;
- deleción o adición de residuos en cualquier
posición;
- modificación química de cualquier residuo;
- análogos peptidomiméticos del péptido de
referencia.
\vskip1.000000\baselineskip
Se pueden diseñar y/o rastrear variantes
peptídicas racionalmente para usar metodologías de rastreo de alto
rendimiento aplicadas a librerías combinatorias. Los métodos de
generación de librarías combinatorias y de rastreo de tales
librerías usando métodos de alto rendimiento son bien conocidos para
los expertos en la técnica (véase, v.g., Baum, C&EN (7 de
Febrero de 1994): 20-26, y las referencias allí
citadas).
Estas variantes peptídicas son también
estudiadas en cuanto a cualquiera de las propiedades antes
enumeradas. En general, se considera que una variante peptídica
tiene mejores propiedades en relación al péptido de referencia si
una propiedad o parámetro mensurables dados tienen un valor que es
al menos un 10%, preferiblemente al menos un 30%, más
preferiblemente al menos un 75% y más preferiblemente al menos un
95% mejor que el valor para el péptido de referencia.
La capacidad relativa de los péptidos
modificados (en comparación con el péptido de referencia) para
modular una actividad biológica GPCR es estudiada como sigue. Se
expone una línea celular que expresa un GPCR y exhibe una actividad
biológica mediada por GPCR al péptido de referencia o al modificado
en condiciones idénticas y se mide la propiedad biológica del GPCR
en ausencia o presencia de cualquiera de los péptidos. Como
ejemplos de líneas celulares, GPCR expresados por la línea celular y
propiedades reguladas por GPCR medidas, se incluyen los
siguientes:
- cualquier célula que expresa de manera estable
CXCR4, especialmente células unidas, incluyendo células que están
sometidas a ingeniería genética para expresar CXCR4, incluyendo
células HeLa; CXCR4; flujo de calcio inducido por el factor I
derivado de células del estroma;
- cualquier célula que exprese establemente
CXCR4, especialmente células unidas, incluyendo células que están
sometidas a ingeniería genética para expresar CXCR4, incluyendo
células CM; CXCR4; infección por VIH-1;
- cualquier célula que exprese de forma estable
CCKAR, especialmente células unidas, incluyendo células que están
sometidas a ingeniería genética para expresar CCKAR, tales como
células CHO; CCKAR; liberación de calcio inducida por
colecistoquinina;
- cualquier que exprese de forma estable CCR5
humano. Especialmente células unidas, incluyendo células que están
sometidas a ingeniería genética para expresar CCR5, incluyendo
células HEK; CCR5; liberación de calcio inducida por RANTES.
\vskip1.000000\baselineskip
Se mide la actividad inhibitoria exponiendo
células que expresan GPCR a un rango de concentraciones de un
antagonista de ensayo y midiendo una propiedad o actividad biológica
asociada a ese GPCR. Las concentraciones de ensayo pueden variar de
1 nanomolar a 100 micromolar, dependiendo de la solubilidad y
afinidad del péptido. Se realiza el rastreo inicial usando
diluciones de factor 10, tales como 50, 5, 0,5 y 0,05 micromolar. Se
reduce entonces la menor concentración activa en decrementos del
10% para determinar la menor concentración efectiva. La propiedad
medida puede ser la unión a un ligando (por ejemplo, unión del
octapéptido de colecistoquinina a CCKAR) o la producción de una
respuesta metabólica mensurable (v.g., flujo alterado de iones o
translocación, fosforilación alterada, síntesis o degradación de
proteínas alterada, morfología celular alterada, secreción
alterada, producción alterada de componentes particulares, tales
como fosfatos de inositol solubles, unión de un virus y posterior
infección, crecimiento tumoral, quimiotaxis, respuesta mitogénica,
activación del crecimiento celular, secreción, contracción
muscular, actividad vasopresora y vasodepresora, transmisión
sináptica y liberación de calcio intracelular, etc.)
Se ha descrito que los siguientes GPCR tienen un
papel en la infección por VIH:
- STRL33
- Solicitud Provisional EE.UU. Nº 60/042.880;
- CCRR5
- Solicitud de Patente EE.UU. Nº 60/042.880;
- CCR8:
- Solicitud Provisional EE.UU. Nº 60/054.094;
- CCR2
- Proc. Natl. Acad. Sci. USA: 2752-2756 (1994)
- \quad
- J. Biol. Chem. 270: 29671-29675 (1995)
- CCR3:
- J. Biol. Chem. 270: 16491-16494 (1995)
- CX3CR1:
- DNA Cell Biol. 14: 673-680 (1995)
\vskip1.000000\baselineskip
La siguiente es una lista de péptidos de
transmembrana que tienen propiedades antagonistas de GPCR:
Del GPCR CXCR4
- F-2-2: LLFVITLPFWAVDAVANWYFGNDD
- F-2-5: LLFVITLPFWAVDAVANDD-OH
- F-4-2: VYVGVWIPALLLTIPDFIFANDD-OH
- F-6-1: VILILAFFACWLPYYIGISID-OH
- F-7-3: DDEALAFFHCCLNPILYAFL-NH_{2}
- F-7-4: DDSITEALAFFHCCLNPILYAFL-NH_{2}
Del G PCR CCR5
- CCR5-TM-2-2: LFFL LTVPFWAHYAAAQWDFGDD
- CCR5-TM-4-1; FGVVTSVITWVVAVFASLPGIIFTSSDD
- CCR5-TM-6-1: LIFTIMIVYFLFWAPYNIVLLLNTFQED
- CCRS-TM-7-1: DDQAMQVTETLGMTHCCINPIIYAFV (no un péptido de la invención)
Del GPCR CCR2
- CCR2-TM-2-1: IYLLNLAISDLLFLITLPLWADD-OH
- CCR2-TM-2-2: LLFLITLPLWAH SAANEWVFGNDD-OH
- CCR2-TM-4-1: FGVVTSVITWLVAVF ASVPGIIFTDD
- CCR2-TM-6-1: VIFTIMIVYFLFWTPYN IVILLNTFQED
- CCR2-TM-7-1: DDATQVT ETLGMTHCCINPIIYAFV (no un péptido de la invención)
Del GPCR CCR3
- CCR3-TM-2-1: LLFLVTLPFW IHYVRGHNWVFGDDD
- CCR3-TM-4-1: FGVITSIVTWGLAVLAALPEFI FYETED
- CCR3-TM-6-1: IFVIMAVFFI FWTPYNVAILLSSYQSDD
- CCR3-TM-7-1: DDLVMLVTEVIAYSHCCMNPVIYAFV (no un péptido de la invención)
Del GPCR CCKAR
- CCKAR-TM-1-6: DDEWQSALQILLYSIIFLLSVLGNTLVITV (no un péptido de la invención)
- CCKAR-TN-2-1: FLLSLAVSDLMLCLFCMPFNLP
- CCKAR-TM-2-2: FLLSLAVSDLMLCLFCM PFNLIDD
- CCKAR-TM-6-4: IVVLFFLCWMPIFSANAWRAYDTVDD
Las composiciones que contienen los presentes
péptidos de transmembrana GPCR, o un cóctel de los mismos (es
decir, con otras moléculas, incluyendo otros péptidos de la
invención), pueden ser administradas para tratamientos
terapéuticos. Las moléculas de la presente invención son usadas para
proteger a un paciente de patologías asociadas a GPCR, modulando
las actividades biológicas asociadas al GPCR. "Protección"
frente a la infección o la enfermedad, tal como se usa aquí,
pretende abarcar "prevención" o "tratamiento."
"Tratamiento" incluye la administración de la composición
protectora a un paciente que exhibe síntomas de una patología
asociada a GPCR (por ejemplo, infección por VIH-1),
para reducir o suprimir los síntomas de la patología. Otros
ejemplos de condiciones asociadas a GPCR que pueden ser tratadas con
los péptidos de la invención incluyen:
- -
- cáncer. Por ejemplo, se sabe que el receptor del péptido intestinal vasoactivo (VIP) se sobreexpresa en el cáncer de mama y el cáncer de pulmón y se sabe que los antagonistas del VIP inhiben el crecimiento tumoral. Así, un péptido de la invención es probablemente efectivo en la inhibición de tales cánceres;
- -
- antagonistas de los receptores de quimiokinas como fármacos antiinflamatorios y antiasmáticos;
- -
- rechazo de tejidos;
- -
- antagonistas del receptor del neuropéptido Y como fármacos antiobesidad;
- -
- antagonistas del receptor de dopamina D4 como fármacos para el tratamiento de la depresión, del trastorno de hiperactividad con déficit de atención y de la esquizofrenia;
- -
- antagonistas del Receptor del Factor Liberador de Corticotropina para el tratamiento de trastornos relacionados con la depresión y la ansiedad;
- -
- antagonistas del receptor de angiotensina como medio de control de la presión sanguínea;
- -
- antagonistas del receptor del péptido liberador de gastrina y de los receptores de somatostatina y gastrina como agentes antineoplásicos que enlentecen el crecimiento de tumores endocrinos;
- -
- antagonistas de los receptores de opioides como aniquiladores del dolor.
Las composiciones para administración pueden
estar en forma de solución, suspensión, tabletas, píldoras,
cápsulas, polvo, gel, crema, loción, ungüento, aerosol o similares.
En una realización preferida, las composiciones para administración
consisten en una solución de los péptidos de transmembrana GPCR
disueltos en un soporte farmacéuticamente aceptable,
preferiblemente un soporte acuoso. Se puede usar una variedad de
soportes acuosos, v.g., solución salina tamponada y similares.
Estas soluciones son estériles y están generalmente libres de
materia indeseable. Estas composiciones pueden ser esterilizadas por
técnicas de esterilización convencionales bien conocidas. En
algunas realizaciones, los péptidos de transmembrana GPCR son
presentados en forma de polvo.
Se pueden combinar los péptidos de transmembrana
GPCR y análogos con excipientes convencionales, tales como grados
farmacéuticos de manitol, lactosa, almidón, estearato de magnesio,
sacarina sódica, talco, celulosa, glucosa, sacarosa, carbonato de
magnesio y similares. Las composiciones pueden contener substancias
auxiliares farmacéuticamente aceptables según sea necesario para
aproximarse a las condiciones fisiológicas, tales como agentes para
el ajuste del pH y tamponantes, agentes para el ajuste de la
toxicidad y similares, por ejemplo acetato de sodio, cloruro de
sodio, cloruro de potasio, cloruro de calcio, lactato de sodio y
similares. La concentración del GPCR en estas formulaciones puede
variar ampliamente y se seleccionará primariamente en base a los
volúmenes de fluidos, a las viscosidades, al peso corporal y
similares según el modo particular de administración seleccionado y
las necesidades del paciente.
Se administra la composición o el medio
farmacéutico que contiene un péptido de transmembrana GPCR por vía
oral, parenteral, enteral, gástrica, tópica, subcutánea, rectal,
local o sistémica. Por ejemplo, los compuestos pueden ser
inyectados en el torrente sanguíneo usando una cánula o un catéter;
se selecciona la vena o arteria para maximizar la administración
al/a los tejido(s) afectado(s). Los métodos reales
para preparar composiciones administrables por vía parenteral serán
conocidos o aparentes para los expertos en la técnica y se
describen con más detalle en publicaciones tales como Remington's
Pharmaceutical Science, 15ª ed., Mack Publishing Company, Easton,
Pennsylvania (1980). Se reconoce que los péptidos y polipéptidos de
transmembrana GPCR y compuestos relacionados antes descritos,
cuando se administran oralmente, deben ser protegidos de la
digestión. Se consigue esto típicamente acomplejando la proteína con
una composición para hacerla resistente a la hidrólisis ácida y
enzimática o empaquetando la proteína en un soporte apropiadamente
resistente, tal como un liposoma. Se conocen bien la técnica medios
de protección de proteínas frente a la digestión.
En aplicaciones terapéuticas, las composiciones
son administradas a un paciente que sufre de una enfermedad o
condición en una cantidad suficiente para curar o al menos detener
parcialmente los síntomas de la enfermedad o condiciones y sus
complicaciones. Se define una cantidad adecuada para conseguirlo
como una "dosis terapéuticamente efectiva". Las cantidades
efectivas para este uso dependerán de la gravedad de las condiciones
que se han de tratar y del estado general de salud del
paciente.
En general, la dosificación que se ha de
administrar es la cantidad necesaria para modular una actividad
biológica GPCR. Se entiende que la dosificación de un polipéptido
GPCR de la presente invención dependerá de la edad, del sexo, de la
salud y del peso del receptor, del tipo de tratamiento concurrente,
de haberlo, de la frecuencia de tratamiento y de la naturaleza del
efecto deseado. Los rangos de dosis efectivas aquí proporcionados
no pretenden limitar a los inventores y representan rangos
preferidos de dosis. La dosificación más preferida será adaptada al
sujeto individual, como entiende y puede determinar un experto en la
técnica, sin excesiva experimentación. Se contempla que los
compuestos serán administrados bajo la guía de un médico, quien
determinará las dosificaciones exactas, monitorizará el progreso del
tratamiento y determinará si una administración dada es eficaz y
suficiente, o si se necesitan posteriores administraciones.
La concentración de compuestos que se ha de
administrar en un tiempo dado y a un paciente dado variarán de 0,1
\mug a 100 mg y preferiblemente de 0,1 a 10 mg al día por
paciente. La dosificación y el modo de administración pueden ser
seleccionados para conseguir y eventualmente mantener una
concentración local en los fluidos que contactan con las células
diana de aproximadamente 0,001-50 \mug/ml,
preferiblemente de 0,1-10 \mug/ml. Se pueden usar
dosificaciones de 0,1 a aproximadamente 100 mg por paciente al día,
particularmente cuando se administra el fármaco a un sitio apartado
y no al torrente sanguíneo, tal como a una cavidad corporal o un
lumen de un órgano. Son posibles dosificaciones substancialmente
mayores en administración tópica.
Pueden ser necesarias administraciones únicas o
múltiples de las composiciones dependiendo de la dosificación y de
la frecuencia requeridas y toleradas por el paciente. En cualquier
caso, la composición debe aportar una cantidad suficiente de los
péptidos de esta invención para tratar con efectividad al
paciente.
La presente invención describe ácidos nucleicos
codificantes de péptidos de transmembrana GPCR empaquetables para
la transformación de células in vitro e in vivo. Estos
ácidos nucleicos empaquetables pueden ser insertados en cualquiera
de una serie de vectores bien conocidos para la transfección y
transformación de células y organismos diana.
Los ácidos nucleicos son transfectados en
células, ex vivo o in vivo, a través de la interacción
del vector y de la célula diana. El ácido nucleico codificante del
péptido de transmembrana GPCR, bajo el control de un promotor,
expresa entonces el péptido de transmembrana GPCR, modulando así la
actividad biológica de un GPCR diana.
Se han usado dichos procedimientos de terapia
génica para corregir defectos genéticos adquiridos y heredados, el
cáncer y la infección vírica en una serie de contextos. La capacidad
para expresar genes artificiales en humanos facilita la prevención
y/o la cura de muchas enfermedades humanas importantes, incluyendo
muchas enfermedades que no pueden ser llevadas a tratamiento
mediante otras terapias. Como ejemplo, la expresión in vivo
de genes reguladores del colesterol, genes que bloquean
selectivamente la replicación del VIH y genes supresores de tumores
en pacientes humanos mejora dramáticamente el tratamiento de la
enfermedad cardíaca, del SIDA y del cáncer, respectivamente. Para
una revisión de procedimientos de terapia génica, véase Anderson,
Science (1992) 256:808-813; Nabel y Felgner (1993)
TIBTECH 11: 211-217; Mitani y Caskey (1993) TIBTECH
11: 162-166; Mulligan (1993) Science
926-932; Dillon (1993) TIBTECH 11:
167-175; Miller (1992) Nature 357:
455-460; Van Brunt (1988) Biotechnology
6(10): 1149-1154; Vigne (1995) Restorative
Neurology and Neuroscience 8: 35-36; Kremer y
Perricaudet (1995) British Medical Bulletin 51(1)
31-44; Haddada y col., (1995), en CURRENT TOPICS IN
MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY, Doerfler Böhm (eds.)
Springer-Verlag, Heidelberg, Alemania; y Yu y col.,
GENE THERAPY (1994) 1:13-26.
La administración del gen o del material génico
a la célula es la primera etapa crítica en el tratamiento con
terapia génica de la enfermedad. Un gran número de métodos de
administración son bien conocidos para los expertos en la técnica.
Dichos métodos incluyen, por ejemplo, administración de genes basada
en liposomas (Debs y Zhu (1993), WO 93/24640; Mannino y
Gould-Fogerite (1988), BioTechniques 6(7):
682-691; Rose, Pat. EE.UU. Nº 5.279.833; Brigham
(1991), WO 91/06309; y Felgner y col., (1987) Proc. Natl. Acad. Sci.
USA 84: 7413-7414) y vectores retrovíricos
defectivos en cuanto a replicación que albergan una secuencia
polinucleotídica terapéutica como parte del genoma retrovírico
(véanse, v.g., Miller y col. (1990), Mol. Cell. Biol. 10:4239
(1990); Kolberg (1992), J. NIH Res. 4:43, y Cornetta y col., Hum.
Gene Ther. 2:215 (1991)). Como vectores retrovíricos ampliamente
usados, se incluyen los basados en el virus de la leucemia murina
(MuLV), el virus de la leucemia de monos gibones (GaLV), el virus
de la inmunodeficiencia de los simios (SIV), el virus de la
inmunodeficiencia humana (VIH) y sus combinaciones. Véanse, v.g.,
Buchscher y col., (1992) J. Virol. 66(5)
2731-2739; Johann y col. (1992) J. Virol. 66
(5):1635-1640 (1992); Sommerfelt y col., (1990)
Virol. 176:58- 59; Wilson y col., (1989) J. Virol.
63:2374-2378; Miller y col., J. Virol.
65:2220-2224 (1991); Wong-Staal y
col., PCT/US94/05700, y Rosenburg y Fauci (1993) en Fundamental
Immunology, Tercera Edición, Paul (ed.) Raven Press, Ltd., New York
y las referencias allí citadas e Y. y col., GENE THERAPY (1994),
antes citado).
También se usan vectores basados en AAV para
transducir células con ácidos nucleicos diana, v.g., en la
producción in vitro de ácidos nucleicos y péptidos y en
procedimientos de terapia génica in vivo y ex vivo.
Véanse West y col., (1987) Virology 160: 38- 47; Carter y col.,
(1989), Patente EE.UU. Nº 4.797.368; Carter y col., WO 93/24641
(1993); Kotin (1994), Human Gene Therapy 5:793- 801; Muzyczka
(1994), J. Clin. Invest. 94:1351, y Samulski (antes citado) para
una revisión de vectores AAV. Se describe la construcción de
vectores AAV recombinantes en una serie de publicaciones, incluyendo
Lebkowski, Pat. EE.UU. Nº 5.173.414; Tratschin y col., (1985), Mol.
Cell. Biol. 5(11):3251-3260; Tratschin y
col., (1984), Mol. Cell. Biol., 4:2072-2081;
Hermonat y Muzyczka (1984), Proc. Natl. Acad. Sci. USA,
81:6466-6470; McLaughlin y col., (1988), y Samulski
y col. (1989), J. Virol., 63:03822-3828. Como líneas
celulares que pueden ser transformadas por rAAV, se incluyen las
descritas en Lebkowski y col. (1988), Mol. Cell. Biol.,
8:3988-3996.
Se espera que los expertos en la técnica tengan
conocimientos de los numerosos sistemas de expresión disponibles
para la expresión de ADN codificante de péptidos de transmembrana
GPCR o de un fragmento peptídico de los mismos. No se hace aquí
intento alguno de describir con detalle los diversos métodos
conocidos para la expresión de proteínas en procariontes o
eucariontes.
Existen varios métodos bien conocidos de
introducción de ácidos nucleicos en células bacterianas y animales,
cualquiera de los cuales puede ser usado en la presente invención.
Estos incluyen: precipitación con fosfato de calcio, fusión de las
células receptoras con protoplastos bacterianos que contienen el
ADN, tratamiento de las células receptoras con liposomas que
contienen el ADN, DEAE-dextrano, endocitosis mediada
por receptores, electroporación, microinyección del ADN
directamente en las células, infección con vectores víricos,
etc.
Para aplicaciones in vitro, se puede
realizar la administración de ácidos nucleicos a cualquier célula
crecida en cultivo, ya sea de origen bacteriano, vegetal o animal,
de vertebrados o invertebrados, y de cualquier tejido o tipo. El
contacto entre las células y las construcciones de ácidos nucleicos
de ingeniería genética, cuando se realiza in vitro, tiene
lugar en un medio biológicamente compatible. La concentración de
ácido nucleico varía ampliamente dependiendo de la aplicación
particular, pero es generalmente de entre aproximadamente 1
\mumol y aproximadamente 10 mmol. El tratamiento de las células
con el ácido nucleico es generalmente llevado a cabo a temperaturas
fisiológicas (aproximadamente 37ºC) durante períodos de tiempo de
aproximadamente 1 a 48 horas, preferiblemente de aproximadamente 2 a
4 horas.
En un grupo de realizaciones, se añade un ácido
nucleico a células plaqueadas con una confluencia de un
60-80% que tienen una densidad celular de
aproximadamente 10^{3} a aproximadamente 10^{5} células/mL, más
preferiblemente de aproximadamente 2 x 10^{4} células/mL. La
concentración de la suspensión añadida a las células es
preferiblemente de aproximadamente 0,01 a 0,2 \mug/mL, más
preferiblemente de aproximadamente 0,1 \mug/mL.
Alternativamente, los ácidos nucleicos
codificantes de los péptidos de transmembrana GPCR pueden ser
también introducidos en células diana in vivo, usando métodos
recombinantes bien conocidos para los expertos en la técnica. La
inserción de genes en células con el fin de una terapia medicinal es
un campo de rápido crecimiento en medicina que tiene un enorme
potencial clínico. La investigación en terapia génica ha
experimentado un avance durante varios años y ha entrado en pruebas
clínicas en humanos. Zhu y col., Science,
261:209-211 (1993), aquí incorporada como
referencia, describe la administración intravenosa del plásmido de
expresión de la cloranfenicol acetiltransferasa (CAT) de
citomegalovirus (CMV) usando complejos DOTMA-DOPE.
Hyde y col., Nature, 362:250-256 (1993), aquí
incorporada como referencia, describe la administración del gen
regulador de la conductancia de transmembrana en la fibrosis
quística (CFTR) a los epitelios de las vías aéreas y a los alvéolos
del pulmón de ratones usando liposomas. Brigham y col., Am. J. Med.
Sci., 298:278-281 (1989), aquí incorporada como
referencia, describe la transfección in vivo de pulmones de
ratones con un gen procariótico funcional codificante de la enzima
intracelular cloranfenicol acetiltransferasa (CAT).
Como formulaciones adecuadas para
administración, se incluyen soluciones para inyección estériles
isotónicas acuosas y no acuosas, que pueden contener antioxidantes,
tampones, bacteriostáticos y solutos que hacen que la formulación
sea isotónica con la sangre del pretendido receptor, y suspensiones
estériles acuosas y no acuosas, que pueden incluir agentes
suspensores, solubilizantes, agentes espesantes, estabilizadores y
conservantes. Las formulaciones de ácido nucleico empaquetado
pueden ser presentadas en recipientes sellados de dosis unitaria o
de dosis múltiple, tales como ampollas y viales. Se pueden preparar
soluciones y suspensiones para inyección a partir de polvos,
gránulos, y tabletas estériles del tipo antes descrito.
Para administración in vivo, se
administran preferiblemente composiciones farmacéuticas que
contienen ácidos nucleicos codificantes de péptidos de
transmembrana GPCR por vía parenteral, es decir, intraarticular,
intravenosa, intraperitoneal, subcutánea o intramuscularmente. Más
preferiblemente, las composiciones farmacéuticas son administradas
intravenosa o intraperitonealmente mediante una inyección en bolo.
Por ejemplo, véase Stadler y col., Patente EE.UU. Nº 5.286.634,
aquí incorporada como referencia. También se ha discutido la
administración intracelular de ácidos nucleicos en Straubringer y
col., Methods in Enzymology, Academic Press, New York,
101:512-527 (1983); Mannino y col., Biotechniques,
6:682-690 (1988); Nicolau y col., Crit. Rev. Ther.
Drug Carrier Syst., 6:239-271 (1989), y Behr, Acc.
Chem. Res., 26:274-278 (1993). Se describen aún
otros métodos de administración de agentes terapéuticos en, por
ejemplo, Rahman y col., Patente EE.UU. Nº 3.993.754; Sears, Patente
EE.UU. Nº 4.145.410; Papahadjopoulos y col., Patente EE.UU. Nº
4.235.871; Schneider, Patente EE.UU. Nº 4.224.179; Lenk y col.,
Patente EE.UU. Nº 4.522.803; y Fountain y col., Patente EE.UU. Nº
4.588.578.
En realizaciones preferidas, las preparaciones
farmacéuticas pueden ponerse en contacto con el tejido diana por
aplicación directa de la preparación al tejido. Se puede hacer la
aplicación por procedimientos tópicos "abiertos" o
"cerrados". Por "tópico", se quiere decir la aplicación
directa de la preparación farmacéutica a un tejido expuesto al
ambiente, tal como la piel, la orofaringe, el canal auditivo externo
y similares. Procedimientos "abiertos" son aquellos
procedimientos que incluyen la incisión de la piel de un paciente y
la visualización directa del tejido subyacente al que se aplican las
preparaciones farmacéuticas. Se hace esto generalmente por un
procedimiento quirúrgico, tal como una toracotomía para acceder a
los pulmones, una laparotomía abdominal para acceder a las vísceras
abdominales u otra aproximación quirúrgica directa al tejido diana.
Los procedimientos "cerrados" son procedimientos invasivos en
los que no se visualizan directamente los tejidos diana internos,
sino que se accede a ellos insertando instrumentos a través de
pequeñas heridas en la piel. Por ejemplo, se pueden administrar las
preparaciones al peritoneo mediante lavado con aguja. De igual
modo, se pueden administrar las preparaciones a través de
dispositivos endoscópicos.
El ácido nucleico puede ser también administrado
en un aerosol inhalado por los pulmones (véase Brigham y col., Am.
J. Sci., 298(4):278-281 (1989)) o por
inyección directa en el sitio de la enfermedad (Culver, Human Gene
Therapy, MaryAnn Liebert, Inc., Publishers, New York.
pp.70-71 (1994)).
Las dosis efectivas de las composiciones
variarán dependiendo de muchos factores diferentes, incluyendo el
medio de administración, el sitio diana, el estado fisiológico del
paciente y otras medicaciones administradas. Así, las
dosificaciones de tratamiento necesitarán ser tituladas para
optimizar la seguridad y la eficacia. Al determinar la cantidad
efectiva del vector que se ha de administrar, el médico evalúa el
ácido nucleico particular usado, el estado de la enfermedad
diagnosticada, la edad, el peso y la condición del paciente, los
niveles de plasma circulante, las toxicidades del vector, la
progresión de la enfermedad y la producción de anticuerpos
anti-vector. El tamaño de la dosis será también
determinado por la existencia, la naturaleza y el alcance de los
efectos colaterales que acompañan a la administración de un vector
particular. Son típicas dosis de aproximadamente 10 ng a 1 g, 100
ng a 100 mg, 1 \mug a 10 mg o 30-300 \mug de ADN
por paciente. Las dosis varían generalmente entre aproximadamente
0,01 y aproximadamente 50 mg por kilogramo de peso corporal,
preferiblemente entre aproximadamente 0,1 y aproximadamente 5 mg/kg
de peso corporal, o aproximadamente
10^{8}-10^{10} o 10^{12} partículas por
inyección. En general el equivalente de dosis de un ácido nucleico
desnudo de un vector es de aproximadamente 1 \mug a 100 \mug
para un paciente típico de 70 kilogramos y las dosis de vectores
que incluyen una partícula retrovírica son calculadas para obtener
una cantidad equivalente de ácido nucleico inhibidor.
Antes de la infusión, se obtienen muestras de
sangre y se guardan para su análisis. Se infunden entre 10^{8} y
1 X 10^{12} vectores intravenosamente a lo largo de
60-200 minutos. Se monitorizan estrechamente los
signos vitales y la saturación de oxígeno por oximetría de pulso. Se
obtienen muestras de sangre 5 minutos y 1 hora tras la infusión y
se guardan para su posterior análisis. A discreción del médico, se
repite la reinfusión cada 2 a 3 meses por un total de 4 a 6
tratamientos en un período de un año. Tras el primer tratamiento, se
pueden realizar infusiones en régimen de pacientes externos a
discreción del clínico. Si se da la reinfusión como paciente
externo, se monitoriza al participante durante al menos 4, y
preferiblemente 8, horas después de la terapia.
Si un/una paciente que experimenta infusión de
un vector o célula transducida desarrolla fiebre, escalofríos o
dolores musculares, éste/ésta recibe la dosis apropiada de aspirina,
ibuprofeno o acetaminofeno. Los pacientes que experimentan
reacciones a la infusión, tales como fiebre, dolores musculares y
escalofríos son premedicados 30 minutos antes de las infusiones
futuras con aspirina, acetaminofeno o difenhidramina. Se usa
meperidina para los escalofríos y dolores musculares más graves que
no responden rápidamente a antipiréticos y antihistamínicos. Se
enlentece o interrumpe la infusión del vector dependiendo de la
gravedad de la reacción.
Se puede practicar la transferencia génica in
vivo en una variedad de hospedadores. Como hospedadores
preferidos, se incluyen especies de mamíferos, tales como humanos,
primates no humanos, perros, gatos, vacas, caballos, ovejas y
similares.
Los siguientes ejemplos son simplemente
realizaciones de la invención y no pretenden limitar la invención.
Una persona con conocimientos ordinarios en la técnica puede
modificar y/o adaptar la invención para diversas aplicaciones sin
excesiva experimentación, sin desviarse del concepto genérico de la
presente invención. Por lo tanto, dichas adaptaciones y
modificaciones quedan dentro del alcance y rango de la presente
invención.
El Ejemplo 1 ilustra que los péptidos derivados
de regiones de transmembrana de CXCR4 inhiben los flujos de calcio
mediados por CXCR4.
Se sintetizaron péptidos que tenían las
secuencias seleccionadas por síntesis de péptidos en fase sólida de
flujo a través en un Sintetizador de Péptidos 432A de Applied
Biosystems utilizando derivados de aminoácidos Fmoc. Para resolver
la agregación que con frecuencia se produce durante la síntesis de
péptidos hidrofóbicos y da lugar al bloqueo de la cadena peptídica
en crecimiento, se introdujeron derivados FmocHmb de Ala, Val y Leu
en las secuencias difíciles. Se añadieron residuos cargados a los
extremos de los péptidos para asegurar una orientación apropiada de
los péptidos durante la penetración en la membrana celular y para
mejorar la solubilidad de los péptidos altamente hidrofóbicos.
Se valoró la pureza de los péptidos por HPLC de
fase invertida y se confirmaron las estructuras por espectrometría
de masas de desorción de láser con tiempo de vuelo asistida por
matriz (MALDI-TOF) (Tarasova y col., (1998), Ad.
Exp. Med. Biol., Plenum Press, NY, pp. 201-206).
Los péptidos usados en este ejemplo están
indicados en las Tablas 1, 2 y 3.
Se estudió el efecto de los péptidos sobre los
flujos de calcio mediados por CXCR4 en células HeLa que expresan de
forma natural el receptor CXCR4 y células U87 que expresan de forma
estable el receptor CXCR4 como sigue. Se incubaron células
cultivadas en portaobjetos con cámara de vidrio con cubierta Nunc
con Fura-2/AM 1 micromolar durante 20 min. en una
incubadora de CO_{2}, se lavaron con PBS y se montaron en la
pletina de un microscopio invertido Zeiss Axiovert. Se realizaron
las mediciones de la [Ca^{2+}]_{i} usando un sistema de
imagen digital Attofluor (Atto Instruments, Rockville, MD). Se
excitó la fluorescencia de Fura a una longitud de onda alternante
de 340 y 380 nm. Se monitorizó la fluorescencia mediante una cámara
CCD intensificada usando un filtro de corte 505. Se realizaron las
calibraciones de la [Ca^{2+}]_{i} usando patrones de
Ca^{2+} que contenían Fura 1 micromolar. Se estudiaron los
antagonistas CXCR4 en células HeLa y células U87. Se usó
factor-1\alpha derivado de estroma
(SDF-1\alpha) como agonista CXCR4 específico.
Los antagonistas CCR5, que fueron usados en
estudios de selectividad como se describe a continuación, fueron
estudiados en células HEK (carcinoma renal humano) que expresaban de
forma estable el receptor CCR5, y se usó RANTES como agonista. Se
evaluó la actividad antagonista de los péptidos midiendo la
inhibición de la liberación de Ca^{2+}i intracelular evocada por
agonistas. Estas mediciones fueron llevadas a cabo en células
tratadas con Fura-2/AM, utilizando un sistema de
imagen digital Attofluor como se ha descrito antes. El agonista fue
SDF-1\alpha.
En el cribado preliminar, se vio que los
péptidos correspondientes al segundo y sexto dominios de
transmembrana abolían la señalización inducida por
SDF-1\alpha a través del receptor CXCR4 (Tabla 1).
Otros estudios de optimización y de
estructura-actividad permitieron obtener
antagonistas derivados de todos menos del tercer y quinto dominios
de transmembrana (Tabla 2).
\vskip1.000000\baselineskip
Para entender aún más los requerimientos
estructurales para un antagonista eficaz, se realizaron estudios de
estructura-actividad sobre los péptidos derivados
del segundo dominio de transmembrana de CXCR4 (Tabla 3). El
antagonista más potente, un péptido de 24 residuos de aminoácido
F-2-2, bloqueó por completo la
transducción de señal a 0,2 micromoles. La adición de residuos
cargados negativamente a los extremos pareció ser importante para
la actividad. La eliminación de las cargas negativas añadidas
aportadas por dos residuos de Asp C-terminales
(F-2-1) disminuyó la potencia
antagonista más de diez veces. Consistentemente con estos hallazgos,
La substitución de residuos de aspartato cargados negativamente con
lisinas cargadas positivamente
(F-2-3) dio lugar a una reducción
de 100 veces en la actividad antagonista. La deleción de cinco
residuos que preceden a los aspartatos C-terminales
(F-2-4) redujo la potencia 20 veces.
La truncación de la porción de transmembrana por tres residuos
N-terminales
Leu-Leu-Phe volvió al péptido
inactivo.
\vskip1.000000\baselineskip
Se observaron también resultados similares para
péptidos derivados de regiones de transmembrana adicionales. Por
ejemplo, en el caso de péptidos correspondientes al cuarto dominio
de transmembrana, el posicionamiento del residuo cargado en el
extremo intracelular del péptido
(F-4-1, Tabla 1) en lugar del
extremo extracelular (F-4-2, Tabla
2) abolió la actividad antagonista. Además, la substitución de
aspartatos extracelulares con lisinas también abolió la actividad
antagonista (datos no mostrados).
La especificidad de la interacción del dominio
de transmembrana quedó demostrada por el hecho de que todos los
péptidos derivados de CXCR4 mostraban selectividad por ese receptor
y no tenían influencia sobre la señalización del otro receptor de
quimiokina, CCR5. De forma similar, un péptido derivado del segundo
dominio de transmembrana de CCR5, LFFLLTVPFWAHYAAAQWDFGDD, abolía
por completo la señalización inducida por agonistas del receptor en
células U87 a concentraciones 500 nM, pero no tenía efecto sobre la
señalización de CXCR4.
\newpage
Se observó además que una mezcla equimolar de
dos péptidos, F-6-1 y
F-7-3, era un orden de magnitud más
potente que el más activo de los dos péptidos. Este efecto sinérgico
producido por los derivados de la sexta y séptima regiones de
transmembrana puede ser un fenómeno general. Así, parejas de
análogos TM en combinaciones optimizadas pueden actuar como
antagonistas muy potentes.
\vskip1.000000\baselineskip
El Ejemplo 2 ilustra que péptidos sintéticos
correspondientes a los dominios de transmembrana de CXCR4 inhiben
la infección por VIH mediada por CXCR4.
Se cree que CCR5 y CXCR4 son los principales
correceptores para la entrada en la célula de VIH-1
(Broder y col. (1997), J. Leukoc. Biol. 62:2029; Doranz y col.
(1997), Immunol. Res. 16: 1528; Premack and Schall (1996), Nat.
Med. 2:11741178), aunque otros receptores de quimiokinas parecen
mediar en la infección también (Michael y col., (1997) Nat. Med.
3_(10):11602).
Se estudió la capacidad de péptidos derivados de
CXCR4 sintéticos de la Tabla 1 para inhibir la infección por
VIH-I de células CEM-SS usando una
cepa LAV del virus que se sabe utiliza CXCR4 como correceptor.
Anti-HIV-1 assay, Buckheit y col.
(1993), Antiviral Research 21:247. Se mantuvieron las células
CEM-SS en medio RPMI 1640 que contenía un 10% de
suero bovino fetal. Se pusieron las células en cada uno de los
pocillos de una placa de microtitulación de 96 pocillos hasta una
densidad de 5 x 10^{3} células por pocillo. Se infectaron las
células con virus VIH-1 a una multiplicidad de
infección (MDI) previamente determinada para producir un nivel
máximo de producción vírica a los 6 días de la infección (MDI de
0,01).
Se añadieron diluciones medio log seriadas de
los compuestos de ensayo a los pocillos apropiados por triplicado
para evaluar su capacidad para inhibir la infección por
VIH-1. Se usó AZT paralelamente como control
positivo. Después de 6 días de incubación a 37ºC, se determinó la
presencia y la abundancia relativa de proteína p24 vírica por ELISA
en sobrenadantes libres de células derivados de cada pocillo de la
placa de microtitulación. Se compró el kit ELISA p24 al AIDS
Vaccine Program, NCI, FCRDC (Frederick, MD) y se realizó el ensayo
según las instrucciones del fabricante.
La mayoría de los péptidos de la Tabla 1
mostraron alguna actividad antivírica (datos no mostrados). Sin
embargo, los péptidos correspondientes al segundo y sexto dominios
de transmembrana eran los más potentes en la inhibición de la
entrada del VIH. El compuesto F-2-2
inhibió por completo la infección a una concentración 5 micromolar
(Fig. 1).
Se usaron los péptidos correspondientes a los
dominios de transmembrana del receptor de tipo A de colecistokinina
(CCKAR) como controles negativos y no afectaron a la función CXCR4,
confirmando así la especificidad del efecto.
Los péptidos no mostraron toxicidad celular a
concentraciones de hasta 100 micromolar (no se pudieron estudiar
concentraciones mayores por problemas de solubilidad).
Se estudió adicionalmente la capacidad de los
péptidos sintéticos para inhibir la infección por
VIH-1 por un ensayo de citoprotección usando la
cepa altamente citopática de VIH-1 RF (Rice y col.
(1995), Adv. Pharmacol. 33:389) (Tabla 2). El péptido más potente,
F-4-2, inhibía por completo la
infección a una concentración 1 micromolar (Fig. 2). Los péptidos
usados como controles negativos, que corresponden a los dominios de
transmembrana del receptor de colecistokinina tipo A, no afectaron
las funciones de los receptores de quimiokinas.
Los anteriores resultados demuestran, en
general, la capacidad de moléculas externamente añadidas para
competir por la interacción entre los dominios de transmembrana de
los GPCR y así alterar la función de os receptores (Figura 3).
Además, es importante observar que los péptidos de la invención
inhiben la infección por VIH dirigiéndose a una molécula y una
función celular más que a una molécula y una función vírica. Las
proteínas víricas tienen una tasa de mutación relativamente alta,
que con frecuencia permite a los virus hacerse resistentes a un
tratamiento dado. Dado que las proteínas celulares mutan a un ritmo
mucho más lento, la probabilidad de que un virus pueda desarrollar
una resistencia está muy reducida.
\vskip1.000000\baselineskip
El Ejemplo 3 muestra que los péptidos de la
invención se reparten entre la membrana plasmática y otros
compartimentos de membrana.
Se sintetizó un derivado fluorescente de CXCR4
TM2, rodamina-F-2, por síntesis en
fase sólida en un Sintetizador de Péptidos 432A de Applied
Biosystems utilizando derivados de aminoácidos Fmoc. Se cargó
rodamina B (Fluka) en la columna de aminoácidos del instrumento. Se
valoró la pureza del péptido por HPLC de fase invertida y se
confirmaron las estructuras por espectrometría de masas de desorción
láser asistida por matriz.
\newpage
Se usó una proteína quimérica consistente en el
CXCR4 y la proteína fluorescente verde (GFP) para estudiar la
localización, la internalización y el reciclado de receptores en
células vivas en tiempo real. Se hizo esta construcción y se
expresó de forma estable en células HeLa como se describe en
Tarasova y col. (1997), J. Biol. Chem.
272:14817-14824. La fusión del extremo C del CXCR4
con el extremo N de la GFP no parecía alterar la afinidad de unión
receptor-ligando, la transducción de señal o el
patrón de expresión y distribución en superficie de los
recepto-
res.
res.
Se cultivaron células HeLa transfectadas que
expresaban CXCR4-GFP en placas de fondo de vidrio
con cubierta de 50 mm revestidas (MatTek, MA) en medio sin rojo
fenol. Se expusieron entonces las células a péptido 1 micromolar en
medio DMEM durante 30 min. en una incubadora de CO_{2}. Se
determinó la distribución de marcaje fluorescente por microscopía
de barrido láser confocal en un microscopio confocal de barrido
láser LSM 410 invertido Zeiss. Se excitó la fluorescencia de la GFP
usando un láser de argón/kriptón de 488 nm; se detectó la
fluorescencia emitida con un filtro de 515-540 nm de
pase de banda. Para el rojo de rodamina, se usó un láser de
helio/neón de 568 nm para la excitación y se detectó la
fluorescencia con un filtro de 590-640 nm de pase
de banda.
Los resultados demostraron que el péptido
rodaminado se colocalizaba con el CXCR4-GFP y estaba
presente en la membrana celular en cuestión de minutos tras la
aplicación y saturaba los endosomas y el retículo endoplásmico
después de 15 minutos de incubación. Esto confirmaba la capacidad de
los péptidos para concentrarse en las membranas celulares y sugería
que los péptidos interaccionaban con las moléculas del receptor.
\vskip1.000000\baselineskip
El Ejemplo 4 muestra que los péptidos
correspondientes a dominios de transmembrana del receptor de
colecistokinina de tipo A (CCKAR) inhiben la liberación de calcio
intracelular evocada por agonistas con una potencia similar a los
compuestos CXCR4.
Para mayor ilustración de la presente invención,
hemos sintetizado péptidos derivados de los dominios de
transmembrana del receptor de colecistokinina de tipo A (CCKAR) de
la rata. Aunque CCKAR pertenece a la misma familia de rodopsinas de
los GPCR que CSCR4, su secuencia es sólo idéntica en un 15% a la de
CXCR4, cuando se alinean usando el programa Dialign 2 (Morgenstern
y col. (1996), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93:12098) y el grado de
identidad en las regiones de transmembrana es sólo del 27%.
La actividad de los péptidos del dominio de
transmembrana CCKAR fue estudiada en células CHO transfectadas que
expresan establemente CCKAR de rata (Tarasova y col. (1997), J.
Biol. Chem. 272: 14817-14824). El agonista CCKAR
era el octapéptido de colecistokinina sulfatado. Se realizó la
determinación de la liberación de calcio intracelular como se ha
descrito en el ejemplo 1 anterior. En la Tabla 4 se muestran los
resultados.
Ninguno de los péptidos derivados de CCKAR
sirvió como antagonista de los receptores de quimiokina y ninguno
pudo inhibir la infección por VIH-1. La actividad de
los antagonistas en la inhibición de la señalización a través del
receptor fue comparada con la capacidad para prevenir la unión de
agonistas (Tabla 4). Se valoró la inhibición de la señalización en
la liberación de calcio intracelular evocada con
CCK-8 en células CHO tratadas con
FURA-2/AM transfectadas de forma estable con CCKAR
de rata (Tarasova y col. (1997), J. Biol. Chem. 272:14817). Se
midió la inhibición de la unión de ligandos usando un agonista
fluorescente, el verde de rodamina CCK-8
(RG-CCK-8) y microscopía de barrido
láser confocal cuantitativo (Tarasova y col. (1997), J. Biol. Chem.
272:14817). Los péptidos derivados del primer, segundo y sexto
dominios de transmembrana inhibían la señalización inducida por CCK
a través del receptor CCKAR. Los péptidos derivados del primer y
segundo dominios de transmembrana,
CCKAR-1-1 y
CCKAR-2-1, tenían potencias
comparables con respecto a la inhibición de la señalización y unión
de ligandos. Un péptido derivado del sexto dominio de transmembrana,
CCKAR-6-1, era activo en la
inhibición de la señalización, pero tenía una muy baja actividad en
la inhibición de la unión de
RG-CCK-8.
\global\parskip0.000000\baselineskip
<110> Tarasova, Nadya I.
\hskip1.1cmMichejda, Christopher J.
\hskip1.1cmEl Gobierno de los Estados Unidos
de América representado por el Secretario del Ministerio de Salud y
Servicios Humanos
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Antagonistas de receptores copulados
a proteína G
\vskip0.400000\baselineskip
<130> 015280-337100PC
\vskip0.400000\baselineskip
<140> WO PCT/US99/04438
\vskip0.400000\baselineskip
<141>
26-02-1999
\vskip0.400000\baselineskip
<150> EE.UU. 60/076.105
\vskip0.400000\baselineskip
<151>
27-02-1998
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 363
\vskip0.400000\baselineskip
<170> FastSEQ para Windows Versión 3.0
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
F-2-2 GPCR CXCR4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
F-2-5 GPCR CXCR4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
F-4-2 GPCR CXCR4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
F-6-1 GPCR CXCR4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
F-7-3 GPCR CXCR4
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MOD_RES
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (20)...(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = leucinamida
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
F-7-4 GPCR CXCR4
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MOD_RES
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (23)...(23)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = leucinamida
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCR5-TM-2-2 GPCR
CCR5
\newpage
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<400> 7
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<210> 8
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<211> 28
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCR5-TM-4-1 GPCR
CCR5
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
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<210> 9
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<211> 28
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCR5-TM-6-1 GPCR
CCR5
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 26
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCR5-TM-7-1 GPCR
CCR5
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCR2-TM-2-1 GPCR
CCR2
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCR2-TM-2-2 GPCR
CCR2
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<400> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 26
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCR2-TM-4-1 GPCR
CCR2
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 28
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCR2-TM-6-1 GPCR
CCR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCR2-TM-7-1 GPCR
CCR2
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCR3-TM-2-1 GPCR
CCR3
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
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<211> 28
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCR3-TM-4-1 GPCR
CCR3
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<400> 17
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<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 28
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCR3-TM-6-1 GPCR
CCR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCR3-TM-7-1 GPCR
CCR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCKAR-TM-1-6 GPCR
CCKAR
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<400> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCKAR-TM-2-1 GPCR
CCKAR
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCKAR-TM-2-2 GPCR
CCKAR
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCKAR-TM-6-4 GPCR
CCKAR
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> GPCRAelegans GPCR TM1
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<400> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> GRH GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TRH GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> FSHprec GPCR TM1
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\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TSHprec GPCR TM1
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<400> 28
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> LH_CGprec GPCR TM1
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<400> 29
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\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 49
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> PGE_EP1 GPCR TM1
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> PGE_EP2 GPCR TM1
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<400> 31
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 45
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> PGE_EP3 GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 48
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> PGF GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> PGI GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 47
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TXA2 GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 35
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 46
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> PAF GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> M2 GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> M4 GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> M1 GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> M3 GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> M5 GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> H1 GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 42
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> H2 GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 43
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
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<213> Secuencia artificial
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<223> oxitocina GPCR TM1
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<223> conopressinLs GPCR TM1
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<211> 43
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<223> P2Y7 GPCR TM1
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TM1
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<223> OLFCOR6chicken GPCR TM1
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<213> Secuencia artificial
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<223> OLFdog GPCR TM1
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<211> 42
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLF07E GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 165
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 166
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLF07I GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 166
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 167
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLF07J GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 167
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 168
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFOR3mouse GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 168
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 169
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFrat GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 169
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 170
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFF3rat GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 170
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 171
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFF5rat GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 171
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 172
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFF6rat GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 172
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 173
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFF12rat GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 173
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 174
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFI3rat GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 174
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 175
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFI7rat GPCR TM1
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MOD_RES
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (18)...(18)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = aminoácido desconocido
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 175
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 176
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFI8rat GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 176
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 177
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFI9rat GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 177
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 178
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFI14rat GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 178
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 179
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFI15rat GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 179
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 180
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFOR17_40 GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 180
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 181
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> GUST27rat GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 181
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 182
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> RPE GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 182
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 183
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> HHRF1 GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 183
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 184
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> HHRF2 GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 184
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 185
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> HHRF3 GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 185
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 186
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> MCP-1A Y
MCP-1B GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 186
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 187
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> PPR1bovine GPCR TM1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 187
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 188
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> GPCRAelegans GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 188
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 189
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> GRH GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 189
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 190
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TRH GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 190
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 191
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> FSHprec GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 191
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 192
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TSHprec GPCR TM2
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 192
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 193
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> LH_CGprec GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 193
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 194
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> PGE_EP1 GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 194
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 195
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> PGE_EP2 GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 195
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 196
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 47
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> PGE_EP3 GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 196
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 197
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 47
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> PGF GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 197
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 198
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 48
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> PGI GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 198
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 199
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 47
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TXA2 GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 199
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 200
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> PAF GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 200
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 201
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> M2 GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 201
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 202
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> M4 GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 202
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 203
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> M1 GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 203
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 204
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> M3 GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 204
\vskip1.000000\baselineskip
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<223> AT2 GPCR TM2
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<211> 43
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<212> PRT
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<212> PRT
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\vskip0.400000\baselineskip
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<223> OLF32Acatfish GPCR TM2
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<211> 43
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLF32Bcatfish y OLF32Dcatfish GPCR
TM2
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<211> 43
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> OLF32Ccatfish GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 321
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<223> OLF47catfish GPCR TM2
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
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<223> OLF202catfish GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 323
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<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> OLFCOR1chicken, OLFCOR3chicken Y
OLFCOR4chicken GPCR TM2
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
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<223> OLFCOR2chicken y OLFCOR5chicken GPCR
TM2
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
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<223> OLFCOR6chicken GPCR TM2
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<400> 325
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 326
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFdog GPCR TM2
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 326
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 327
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLF07E GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 327
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 328
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLF07I GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 328
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 329
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLF07J GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 329
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 330
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFOR3mouse GPCR TM2
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 330
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 331
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFrat GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 331
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 332
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFF3rat GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 332
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 333
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFF5rat GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 333
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 334
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFF6rat GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 334
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 335
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFF12rat GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 335
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 336
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFI3rat GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 336
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 337
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 47
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFI7rat GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 337
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 338
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFI8rat GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 338
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 339
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFI9rat GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 339
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 340
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFI14rat GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 340
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 341
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFI15rat GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 341
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 342
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OLFOR17_40 GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 342
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 343
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> GUST27rat GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 343
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 344
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> RPE GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 344
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 345
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> HHRF1 GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 345
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 346
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> HHRF2 GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 346
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 347
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> HHRF3 GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 347
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 348
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> MCP-1A y
MCP-1B GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 348
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 349
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> PPR1bovine GPCR TM2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 349
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 350
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
F-1-5 GPCR CXCR4
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MOD_RES
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (18)...(18)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = valinamida
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 350
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 351
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
F-2-1 GPCR CXCR4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 351
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 352
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
F-3-1 GPCR CXCR4
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MOD_RES
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (23)...(23)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = leucinamida
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 352
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 353
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
F-4-1 GPCR CXCR4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 353
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 354
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
F-5-1 GPCR CXCR4
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MOD_RES
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (21)...(21)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = isoleucinamida
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 354
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 355
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
F-7-1 GPCR CXCR4
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MOD_RES
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (20)...(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = lisinamida
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 355
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 356
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> segundo dominio de transmembrana de
CXCR4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 356
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 357
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
F-2-8 GPCR CXCR4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 357
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 358
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
F-2-4 GPCR CXCR4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 358
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 359
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
AcF-2-5 GPCR CXCR4
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MOD_RES
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) ... (1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Leu acetilada
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 359
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 360
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
F-2-6 GPCR CXCR4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 360
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 361
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
Rhod-AcF-2-2 GPCR
CXCR4
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MOD_RES
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)...(1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Leu acetilada
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MOD_RES
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (26)...(26)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = rodamina unida a Lys
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 361
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 362
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCKAR-TM-4-2 (#71)
GPCR CCKAR
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 362
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 363
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
CCKAR-TM-5-3 (#45)
GPCR CCKAR
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 363
Claims (19)
1. Una molécula moduladora de los receptores
copulados a proteína G (GPCR) aislada consistente en un péptido o
peptidomimético de 5 a 50 aminoácidos que es un análogo estructural
de un dominio de transmembrana de un GPCR, donde
dicha molécula tiene un extremo N y un extremo C
y dicha molécula tiene un extremo extracelular que está
negativamente cargado y un extremo intracelular que tiene carga
neutra en condiciones fisiológicas, y donde
dicha molécula tiene un grupo carboxilo
C-terminal amidado cuando dicho extremo C tiene
carga neutra, y, cuando
dicho extremo intracelular es dicho extremo N,
dicho péptido o peptidomimético incluye al menos cuatro de los
cinco primeros aminoácidos N-terminales que tienen
cadenas laterales de aminoácidos de carga neutra en condiciones
fisiológicas;
dicha molécula se inserta espontáneamente en una
membrana en la misma orientación que el dominio GPCR de
transmembrana del que deriva; y
dicha molécula modula una propiedad o actividad
biológica de dicho GPCR alterando la estructura o la organización
de dicho GPCR.
\vskip1.000000\baselineskip
2. Una molécula de la Reivindicación 1, donde la
carga negativa del extremo extracelular de la molécula es aportada
por de uno a tres residuos de ácido que son ácidos en condiciones
fisiológicas.
3. Una molécula de la Reivindicación 1, donde la
carga negativa del extremo extracelular de la molécula es aportada
por un grupo carboxilo, fosfato, borato, sulfonato o sulfato.
\vskip1.000000\baselineskip
4. Una molécula moduladora de los receptores
copulados a proteína G (GPCR) aislada consistente en un péptido o
peptidomimético que es un análogo estructural de una porción de un
dominio de transmembrana de CXCR4,
donde dicha porción de dicho dominio de
transmembrana tiene una secuencia seleccionada entre:
\vskip1.000000\baselineskip
LLFVITLPFWAVDAVANWYFGNDD,
LLFVITLPFWAVDAVANDD-OH,
VYVGVWIPALLLTEPDFEFANDD-OH,
VILILAFFACWLPYYIGISID-OH,
DDEALAFFHCCLNPILYAFL-NH_{2},
y
DDSITEALAFFHCCLNPILYAFL-NH_{2},
\vskip1.000000\baselineskip
y donde dicha molécula modula una actividad
biológica de dicho CXCR4.
\vskip1.000000\baselineskip
5. Una molécula moduladora de los receptores
copulados a proteína G (GPCR) de la Reivindicación 4, donde la
actividad CXCR4 modulada por dicho péptido es la inhibición de la
liberación de Ca^{2+} intracelular mediada por CXCR4 o la
inhibición de la infección por VIH mediada por CXCR4.
6. Una molécula de la Reivindicación 1, 2 ó 3
para uso en un método terapéutico consistente en modular una
actividad biológica de un GPCR diana por contacto de una célula que
expresa dicho GPCR con dicha molécula.
7. Una molécula de la Reivindicación 6, donde la
concentración de la molécula es de aproximadamente 0,01 a
aproximadamente 100 micromolar.
8. Una molécula de la Reivindicación 1, 6 ó 7,
donde la molécula inhibe una propiedad o actividad biológica del
GPCR.
\newpage
9. Una molécula de la Reivindicación 8, que
consiste en un péptido o peptidomimético que es un análogo
estructural de una porción de un dominio de transmembrana de un
GPCR, seleccionado entre:
del GPCR CXCR4:
- F-2-2: LLFVITLPFWAVDAVANWYFGNDD,
- F-2-5: LLFVITLPFWAVDAVANDD-OH,
- F-4-2: VYVGVWIPALLLTIPDFIFANDD-OH,
- F-6-1: VILILAFFACWLPYYIGISID-OH,
- F-7-3: DDEALAFFHCCLNPILYAFL-NH_{2} y
- F-7-4: DDSITEALAFFHCCLNPILYAFL-NH_{2};
del GPCR CCR5:
- CCR5-TM-2-2: LFFLLTVPFWAHYAAAQWDFGDD,
- CCR5-TM-4-1: FGVVTSVITWVVAVFASLPGIIFTSSDD y
- CCR5-TM-6-1: LIFTIMIVYFLFWAPYNIVLLLNTFQED;
del GPCR CCR2:
- CCR2-TM-2-1: IYLLNLAISDLLFLITLPLWADD-OH,
- CCR2-TM-2-2: LLFLITLPLWAHSAANEWVFGNDD-OH,
- CCR2-TM-4-1: FGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFTDD y
- CCR2-TM-6-1: VIFTI1VIIVYFLFWTPYNIVILLNTFQED;
del GPCR CCR3:
- CCR3-TM-2-1: LLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGDDD,
- CCR3-TM-4-1: FGVITSNTWGLAVLAALPEFIFYETED y
- CCR3-TM-6-1: IFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSDD;
del GPCR CCKAR:
- CCKAR-TM-2-2: FLLSLAVSDLMLCLFCMPFNLIDD y
- CCKAR-TM-6-4: IVVLFFLCWMPIFSANAWRAYDTVDD.
10. Una molécula de la Reivindicación 8 ó 9,
donde la actividad biológica inhibida es el flujo de iones o la
translocación, la fosforilación, la síntesis o degradación de
proteínas, la morfología celular, la secreción, la producción de
componentes particulares tales como fosfatos solubles de inositol,
la unión de un virus y posterior infección, el crecimiento tumoral,
la quimiotaxis, la respuesta mitogénica, la activación del
crecimiento celular, la contracción muscular, la actividad
vasopresora y vasodepresora, la transmisión sináptica o la
liberación de calcio intracelular.
11. Una molécula de la Reivindicación 4 para uso
en una terapia consistente en modular la actividad biológica de un
GPCR por contacto de una célula que expresa dicho GPCR con dicha
molécula.
12. Una molécula de la Reivindicación 11, donde
la concentración de la molécula es de aproximadamente 0,2 a
aproximadamente 10 micromolar.
13. Una molécula de la Reivindicación 11, donde
el GPCR diana es CXCR4 y la actividad biológica modulada es la
inhibición de la infección por VIH mediada por CXCR4 o la inhibición
de la liberación de Ca^{2+} intracelular mediada por CXCR4.
14. Una molécula de la Reivindicación 6, donde
el GPCR es CCR5 y la actividad biológica modulada es la inhibición
de la infección por VIH mediada por CCR5 o la inhibición de
liberación de Ca^{2+} intracelular mediada por CCR5.
15. Una molécula de la Reivindicación 6, donde
el GPCR diana es CCKAR y la actividad biológica modulada es la
inhibición de la liberación de Ca^{2+} intracelular mediada por
CCKAR o la inhibición del crecimiento o progresión tumoral.
16. Uso de una molécula moduladora de GPCR de la
Reivindicación 1 para la fabricación de un medicamento para inhibir
la infección por VIH-1, donde el contacto de una
célula que expresa el GPCR con dicha molécula inhibe la infección
por VIH-1.
17. Un uso de la Reivindicación 16, donde el
péptido o peptidomimético es un análogo estructural de una porción
de un dominio de transmembrana de CXCR4, CCR2, CCR3 o CCR5.
18. Un uso de la Reivindicación 17, donde se
pone en contacto una célula que expresa CXCR4 con una molécula que
contiene un péptido de transmembrana CXCR4 que tiene una secuencia
seleccionada entre:
\vskip1.000000\baselineskip
LLFVITLPFWAVDAVANWYFGNDD,
LLFVITLPFWAVDAVANDD-OH,
VYVGVWIPALLLTIPDFIFANDD-OH,
VILILAFFACWLPYYIGISID-OH,
DDEALAFFHCCLNPILYAFL-NH_{2},
y
DDSITEALAFFHCCLNPILYAFL-NH_{2},
\vskip1.000000\baselineskip
y donde dicha molécula es efectiva en la
inhibición de la infección mediada por CXCR4 de células que expresan
CXCR4 con dicha infección por VIH.
19. Uso de una molécula según se reivindica en
cualquiera de las Reivindicaciones 1 a 5 para la fabricación de un
medicamento para un tratamiento terapéutico que consiste en modular
un GPCR.
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