ES2319636T3 - Purificacion de proteinas. - Google Patents

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ES2319636T3 ES03737590T ES03737590T ES2319636T3 ES 2319636 T3 ES2319636 T3 ES 2319636T3 ES 03737590 T ES03737590 T ES 03737590T ES 03737590 T ES03737590 T ES 03737590T ES 2319636 T3 ES2319636 T3 ES 2319636T3
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Jeffrey R. Gorrell
Kathlyn Pham Lazzareschi
Philip M. Lester
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Abstract

Procedimiento para purificar una proteína, que comprende una región C H2/C H3, de una solución contaminada de la misma mediante cromatografía de Proteína A, que comprende: (a) adsorber la proteína de dicha solución contaminada a la Proteína A inmovilizada en una fase sólida; (b) eliminar los contaminantes mediante el lavado de la fase sólida con una composición que comprende detergente en una concentración entre aproximadamente 0,01% y aproximadamente 5% y sal a una concentración de entre aproximadamente 0,1 M y aproximadamente 2 M, teniendo la composición un pH de aproximadamente pH 4,5 a aproximadamente 5,5; y (c) recuperar la proteína de la fase sólida con un tampón de elución que tiene un pH en el intervalo de aproximadamente 2 a aproximadamente 5.

Description

Purificación de proteínas.
Antecedentes de la invención Campo de la invención
La presente invención se refiere en general a la purificación de proteínas. En particular, la presente invención se refiere a un procedimiento para purificar proteínas que contienen la región C_{H}2/C_{H}3, tales como anticuerpos e inmunoadhesinas, mediante cromatografía de afinidad de Proteína A.
Antecedentes de la invención
La purificación económica a gran escala de proteínas es un importante problema creciente para la industria de la biotecnología. En general, las proteínas se producen mediante el cultivo celular utilizando líneas celulares de mamífero o bacterianas diseñadas para producir la proteína de interés mediante la inserción de un plásmido recombinante que contiene el gen para esa proteína. Dado que las líneas celulares utilizadas son organismos vivos, deben alimentarse con un medio de crecimiento complejo, que contiene azúcares, aminoácidos y factores de crecimiento, normalmente suministradas a partir de preparaciones de suero animal. La separación de la proteína deseada de la mezcla de compuestos suministrados a las células y de los subproductos de las propias células hasta una pureza suficiente para su uso como producto terapéutico humano plantea un tremendo desafío.
Los procedimientos para la purificación de proteínas a partir de debris celular dependen inicialmente del sitio de expresión de la proteína. Se puede provocar que algunas proteínas se secreten directamente desde la célula a los medios de crecimiento circundantes; otros se realizan intracelularmente. Para estas últimas proteínas, la primera etapa de un proceso de purificación implica la lisis de la célula, que se puede realizar mediante una serie de procedimientos, incluyendo cizalla mecánica, choque osmótico o tratamientos enzimáticos. Dicha rotura libera todo el contenido de la célula en el homogenato y, además, produce fragmentos subcelulares que son difíciles de eliminar debido a su pequeño tamaño. Éstos se eliminan generalmente mediante centrifugación diferencial o mediante filtración. Los mismos problemas aparecen, aunque a menor escala, con proteínas secretadas directamente debido a la muerte natural de las células y la liberación de proteínas intracelulares de células huésped en el transcurso del proceso de producción de la proteína.
Una vez se ha obtenido una solución purificada que contiene la proteína de interés, su separación de las otras proteínas producidas por la célula se intenta normalmente utilizando una combinación de técnicas cromatográficas diferentes. Estas técnicas separan mezclas de proteínas en base a su carga, el grado de hidrofobicidad o el tamaño. Están disponibles diversas resinas para cromatografía diferentes para cada una de estas técnicas, permitiendo un ajuste preciso del esquema de purificación para la proteína concreta implicada. La esencia de cada uno de estos métodos de separación es que se puede provocar que las proteínas se muevan a diferentes velocidades bajando por una columna larga, consiguiendo una separación física que aumenta a medida que sigue bajando por la columna, o se adhieren de manera selectiva al medio de separación, eluyéndose a continuación de manera diferencial mediante diferentes disolventes. En algunos casos, la proteína deseada se separa de las impurezas cuando las impurezas se adhieren específicamente a la columna y la proteína de interés no lo hace, es decir, la proteína de interés está presente en "flujo de paso".
La cromatografía de afinidad, que aprovecha la interacción específica entre la proteína a purificar y un agente de captura inmovilizado, también puede ser una opción para algunas proteínas. La proteína A es un adsorbente útil para la cromatografía de afinidad de proteínas, tales como anticuerpos, que contienen una región Fc. La proteína A es una proteína de la pared celular de 41 kD de Staphylococcus aureas que se une con una afinidad elevada (aproximadamente 10^{-8} M a IgG humanas) a la región Fc de los anticuerpos.
La proteínas se pueden purificar utilizando un cristal de poro controlado (Sulkowski, E. Protein Purification: Micro to Macro, pág. 177-195 (1887); Cada et al., Preparative Biochemistry 11 (4): 467-482 (1981)) o sílice no derivado (Reifsnyder et al. J. Chromatography 753: 73-80 (1996)).
Las Patentes US Nos. 6.127.526 y 6.333.398 (Blank, G.) describen una etapa de lavado intermedio durante la cromatografía de la Proteína A utilizando electrolitos hidrofóbicos, por ejemplo, cloruro de tetrametilamonio (TMAC) y cloruro de tetraetilamonio (TEAC), para eliminar los contaminantes, pero no la Proteína A inmovilizada o la proteína de interés, unidos a la columna de Proteína A.
Iyer et al. (Biopharm, 1: 14-20, 2002) considera factores que afectan a la purificación de anticuerpos de cultivos celulares utilizando la cromatografía de Proteína A.
Descripción resumida de la invención
La presente invención proporciona varios tampones de lavado intermedios, diferentes de TMAC o TEAC, para su uso en la cromatografía de Proteína a.
En una realización, la presente invención proporciona un procedimiento para purificar una proteína que comprende la región C_{H}2/C_{H}3, de una solución contaminada de la misma mediante cromatografía de Proteína A que comprende: (a) adsorber la proteína a la Proteína A inmovilizada en una fase sólida; (b) eliminar contaminantes mediante el lavado de la fase sólida con una composición que comprende detergente en una concentración entre aproximadamente 0,01% y aproximadamente 5% y sal a una concentración entre aproximadamente 0,1 M y aproximadamente 2 M, teniendo la composición un pH de aproximadamente pH 4,5 a aproximadamente 5,5; y (c) recuperarla proteína de la fase sólida.
En realizaciones preferidas, la proteína es un anticuerpo (por ejemplo, uno que se une a HER2, factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF), IgE, CD20, CD40, CD11a, factor tisular (TF), antígeno de células madre de próstata (PSCA), interleuquina-8 (IL-8), receptor del factor de crecimiento epidérmico (EGFR), HER3, HER4, \alpha4\beta7 o \alpha5\beta3) o una inmunoadhesina (por ejemplo, una inmunoadhesina de receptor de TNF).
Breve descripción de los dibujos
Las figuras 1A-B muestran la secuencia de aminoácidos de la cadena ligera (SEC ID No. 1) y la secuencia de aminoácidos de la cadena pesada (SEC ID No. 2) de Trastuzumab (HERCEPTIN®).
La figura 2 representa el cribado ("screening") de varios tampones de lavado intermedios con respecto al antígeno anti-IgE E26. Se representa la cantidad de contaminación de Proteína de Ovario de Hámster Chino (CHOP) en el pool de elución (ppm).
La figura 3 muestra el cribado de tampones de lavado intermedios que contienen polietilenglicol (PEG). El anticuerpo es E26.
La figura 4 ilustra el cribado de lavados intermedios de urea, en el que el anticuerpo es E26.
La figura 5 representa el cribado de varios tampones de lavado intermedios con respecto al anticuerpo anti-HER2 Trastuzumab. Se representa la cantidad de CHOP en el pool de elución (ppm).
La figura 6 representa el cribado de varios tampones de lavado intermedios con respecto a Trastuzumab y un anticuerpo CD11a humanizado.
La figura 7 muestra CHOP en el pool de Proteína A para Trastuzumab y un tampón de lavado intermedio que incluye sal de citrato sódico o acetato sódico; o E26 y un tampón de lavado intermedio que incluye sal de sulfato sódico o citrato sódico.
La figura 8 representa la alteración de polisorbato 20 en el tampón de lavado intermedio para E26.
La figura 9 ilustra el efecto del pH en CHOP en el pool de elución para Trastuzumab y E26.
Descripción detallada de las realizaciones preferentes Definiciones
Cuando se utiliza en la presente invención "Proteína A" comprende Proteína A recuperada de una fuente nativa de la misma, Proteína A producida sintéticamente (por ejemplo, mediante síntesis de péptidos o mediante técnicas recombinantes), y variantes de la misma que mantienen la capacidad de unirse a proteínas que tienen una región C_{H}2-/C_{H}3. La Proteína A se puede adquirir comercialmente en Repligen, Pharmacia y Fermatech.
La Proteína A se inmoviliza en una fase sólida. Por "fase sólida" se entiende una matriz no acuosa a la que la Proteína A se adhiere. La fase sólida de interés en la presente invención es generalmente aquella que comprende una superficie de vidrio, sílice, agarosa o poliestireno. La fase sólida puede ser una columna de purificación o una fase discontinua de partículas discretas. En realizaciones preferidas, la fase sólida es una columna de vidrio de poro controlado o una columna de ácido silícico. En ciertas realizaciones, la fase sólida está recubierta con un reactivo (tal como glicerol) que pretende evitar la adherencia no específica de contaminantes a la fase sólida.
La proteína de interés de la presente invención es aquella que comprende una región C_{H}2/C_{H}3 y, por lo tanto, es susceptible de purificación mediante la cromatografía de Proteína A. El término "región C_{H}2/C_{H}3" cuando se utiliza en la presente invención se refiere a aquellos residuos de aminoácidos en la región Fc de una molécula de inmunoglobulina que interacciona con la Proteína A. En realizaciones preferidas, la región C_{H}2/C_{H}3 comprende una región C_{H}2 intacta seguida de una región C_{H}3 intacta, y lo más preferible, comprende una región Fc de una inmunoglobulina. Entre los ejemplos de proteínas que contienen la región C_{H}2/C_{H}3 se incluyen anticuerpos, inmunoadhesinas y proteínas de fusión que comprenden una proteína de interés fusionada a, o conjugada con, una región C_{H}2/C_{H}3.
La "etapa de lavado intermedia" es una etapa realizada después de cargar la proteína de interés en la fase sólida y de adsorberse a la Proteína A, pero antes de que la proteína A se recupere de la columna. La etapa de lavado intermedia sirve para eliminar los contaminantes unidos no específicamente a la fase sólida, anticuerpo y/o Proteína A, sin eluir significativamente la proteína de interés o la proteína A de la fase sólida. En la etapa de lavado intermedia, la fase sólida se lava con el "tampón de lavado intermedio" deseado (por ejemplo, el tampón de lavado intermedio se pasa a través de la columna de Proteína A, en la que la fase sólida es una columna).
Un "tampón" es una solución tamponada que resiste cambios en el pH mediante la acción de sus componentes conjugados ácido-base.
Un "tampón de equilibrio" en la presente invención es aquel que se usa para preparar la fase sólida (con Proteína A inmovilizada) para cargar la proteína de interés. El tampón de equilibrio es preferiblemente isotónico y habitualmente tiene un pH en el intervalo de aproximadamente 6 a aproximadamente 8. El tampón de equilibrio del ejemplo era 25 mM Tris, 25 mM NaCl, 5 mM EDTA, pH 7,1.
El "tampón de carga" es aquel que se utiliza para cargar la mezcla de la proteína que contiene la región C_{H}2/C_{H}3 y un contaminante o contaminantes sobre la fase sólida a la que se inmoviliza la Proteína A. A menudo, los tampones de equilibrio y carga son los mismos.
El "tampón de elución" se utiliza para eluir la proteína que contiene la región C_{H}2/C_{H}3 de la Proteína A inmovilizada. Preferiblemente, el tampón de elución tiene un pH bajo y, por tanto, rompe las interacciones entre la Proteína A y la proteína de interés. Preferiblemente, el tampón de elución de pH bajo tiene un pH en el intervalo de aproximadamente 2 a aproximadamente 5, lo más preferible en el intervalo de aproximadamente 3 a aproximadamente 4. Entre los ejemplos de tampones que controlarán el pH en este intervalo se incluyen tampones fosfato, acetato, citrato y amonio, así como combinaciones de los mismos. Entre estos los tampones preferidos son los tampones citrato y acetato, lo más preferible tampones de citrato sódico o acetato sódico. Entre otros tampones de elución que se contemplan se incluyen tampones de pH elevado (por ejemplo, aquellos que tienen un pH de 9 o más) o tampones que comprenden un compuesto o composición, tal como MgCl_{2} (2 mM) para eluir la proteína de interés.
El "tampón de lavado intermedio" es el tampón utilizado para eliminar el contaminante o contaminantes, tales como CHOP, de la Proteína A inmovilizada sin eliminar cantidades significativas de la proteína de interés unida a la Proteína A. El tampón de lavado intermedio comprende preferiblemente (a) sal y detergente (por ejemplo, polisorbato); (b) sal y disolvente (por ejemplo, hexilenglicol); (c) sal de concentración elevada (por ejemplo, tampón Tris de molaridad elevada); o (d) sal y polímero (por ejemplo, PEG).
Una "sal" es un compuesto formado por la interacción de un ácido y una base. La sal preferida en la presente invención es acetato (por ejemplo, acetato sódico), citrato (por ejemplo, citrato sódico), cloruro (por ejemplo, cloruro sódico), sulfato (por ejemplo, sulfato sódico) o una sal potásica.
Tal como se utiliza en la presente invención, "disolvente" se refiere a una sustancia líquida capaz de disolver o dispersar una o más de otras sustancias para proporcionar una solución. El disolvente preferido es un disolvente orgánico, no polar, tal como etanol, metanol, isopropanol, acetonitrilo, hexilenglicol, propilenglicol y 2,2-tiodiglicol.
El término "detergente" se refiere a tensioactivos no iónicos, tales como polisorbatos (por ejemplo, polisorbatos 20 u 80); poloxámeros (poloxámero 188(); Tritón; dodecilsulfato sódico (SDS); laurel sulfato sódico; octil glicósido sódico; lauril-, miristil-, linoleil- o estearil-sulfobetaína; lauril-, miristil-, linoleil- o estearil-sarcosina; lauril-, miristil-, o cetil-betaína; lauroamidopropil-, cocamidopropil-, linoleamidopropil-, miristamidopropil-, palmidopropil-, o isostearamidopropil-betaína (por ejemplo, lauroamidopropil); miristamidopropil-, palmidopropil-, o isostearamidopropil-dimetilamina; metil cocoil sódico, o metil oleil taurato disódico; y la serie MONAQUAT^{TM} (Mona industries, Inc, Paterson, Nueva Jersey). El detergente preferido es un polisorbato, tal como polisorbato 20 (TWEEN 20®) o polisorbato 80 (TWEEN 80®).
Un "polímero" en la presente invención es una molécula formado mediante un enlace covalente de dos o más monómeros, en el que los monómeros no son residuos de aminoácidos. Entre los ejemplos de polímeros se incluyen polietil glicol, polipropil glicol y copolímeros de etilenglicol y propilenglicol (por ejemplo, Pluronics, PF68 etc). El polímero preferido es polietilenglicol (PEG), por ejemplo, PEG 400 y PEG 8000.
El término "anticuerpo" se utiliza en el sentido más amplio y cubre específicamente anticuerpos monoclonales (incluyendo anticuerpos monoclonales de longitud completa), anticuerpos policlonales, anticuerpos multiespecíficos (por ejemplo, anticuerpos biespecíficos) y fragmentos de anticuerpos, siempre y cuando mantengan, o se modifiquen para comprender, una región C_{H}2/C_{H}3 tal como se define en la presente invención.
"Fragmentos de anticuerpos" comprenden una parte de un anticuerpo de longitud completa, generalmente la región de unión a antígeno o región variable de la misma. Ente los ejemplos de fragmentos de anticuerpos se incluyen fragmentos Fab, Fab', F(ab')_{2} y Fv; moléculas de anticuerpo de cadena única; diabodies, anticuerpos lineales; y anticuerpos multiespecíficos formados de fragmentos de anticuerpos.
El término "anticuerpo monoclonal" tal como se utiliza en la presente invención se refiere a un anticuerpo obtenido a partir de una población de anticuerpos sustancialmente homogéneos, es decir, los anticuerpos individuales que comprenden la población son idénticos a excepción de posibles mutaciones naturales que pueden estar presentes en cantidades menores. Los anticuerpos monoclonales son altamente específicos, dirigiéndose contra un único sitio antigénico. Además, a diferencia de las preparaciones de anticuerpos convencionales (policlonales), que incluyen habitualmente diferentes anticuerpos dirigidos contra diferentes determinantes (epítopos), cada anticuerpo monoclonal se dirige contra un único determinante en el antígeno. El modificador "monoclonal" indica el carácter del anticuerpo que se ha obtenido a partir de una población de anticuerpos sustancialmente homogénea y no debe interpretarse que se requiere la producción del anticuerpo mediante ningún procedimiento particular. Por ejemplo, los anticuerpos monoclonales que se utilizarán según la presente invención pueden prepararse por el procedimiento del hibridoma descrito por primera vez por Kohler et al., Nature, 256:495 [1975], o pueden prepararse mediante procedimientos de ADN recombinante (véase por ejemplo la patente EEUU No. 4.816.567). Los "anticuerpos monoclonales" también pueden aislarse de bibliotecas de anticuerpos en fagos utilizando las técnicas descritas en Clackson et al., Nature, 352:624-628 [1991] y Marks et al., J. Mol. Biol., 222:581-597 (1991).
Los anticuerpos monoclonales descritos en la presente invención incluyen específicamente anticuerpos (inmunoglobulinas) "quiméricos" en los cuales una parte de la cadena pesada y/o ligera es idéntica u homóloga a las secuencias correspondientes en anticuerpos derivados de una especie particular o que pertenecen a una clase o subclase de anticuerpo particular, mientras que el resto de la cadena o cadenas es idéntica u homóloga a las secuencias correspondientes en anticuerpos derivados de otra especie o que pertenecen a otra clase o subclase de anticuerpo, así como fragmentos de dichos anticuerpos, mientras muestren la actividad biológica deseada (patente US No. 4.816.567; y Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81:6851-6855 [1984]).
El término "región hipervariable" cuando se utiliza en la presente invención se refiere a los residuos de aminoácidos de un anticuerpo que son sensibles a la unión a antígeno. La región hipervariable comprende residuos de aminoácidos de una "región determinante de complementariedad" o "CDR" (es decir, residuos 24-34 (L1), 50-56 (L2) y 89-97 (L3) en el dominio variables de la cadena ligera y 31-35 (H1), 50-65 (H2) y 95-102 (H3) en el dominio variable de cadena pesada; Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5ª Ed. Public Health Service, National institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)) y/o los residuos de un "bucle hipervariable" (es decir, residuos 26-32 (L1), 50-52 (L2), y 91-96 (L3) en el dominio variable de cadena ligera y 26-32 (H1), 53-55 (H2) y 96-101 (H3) en el dominio variable de cadena pesada; Chothia y Lesk J. Mol. Biol. 196: 901-917 (1987)). Los residuos "armazón" o "FR" son aquellos residuos de dominio variable diferentes de los residuos de la región hipervariable tal como se define en la presente invención.
Las formas "humanizadas" de anticuerpos no humanos (por ejemplo, múridos) son anticuerpos quiméricos que contienen una secuencia mínima derivada de inmunoglobulina no humana. Por lo general, los anticuerpos humanizados son inmunoglobulinas humanas (anticuerpo receptor) en las cuales los residuos de la región hipervariable del receptor se sustituyen por residuos de la región hipervariable de una especie no humana (anticuerpo dador), tal como ratón, rata, conejo o primate no humano que tienen la especificidad, afinidad y capacidad deseadas. En algunos casos, los residuos de la región armazón Fv (FR) de la inmunoglobulina humana se sustituyen por los residuos no humanos correspondientes. Además, los anticuerpos humanizados pueden comprender residuos que no se encuentran ni el anticuerpo receptor ni en el anticuerpo dador. Estas modificaciones se realizan para refinar mejor el rendimiento del anticuerpo. En general, el anticuerpo humanizado comprenderá sustancialmente como mínimo uno, y habitualmente dos, dominios variables en los cuales todos o sustancialmente todos los bucles hipervariables correspondientes a los de una inmunoglobulina no humana y todas o sustancialmente todas las regiones FR son las de una secuencia de inmunoglobulina humana. El anticuerpo humanizado comprenderá también opcionalmente por lo menos una parte de una región constante de inmunoglobulina (Fc), habitualmente la de una inmunoglobulina humana. Para más detalles, véase Jones et al., Nature, 321:522-525 (1986); Reichmann et al., Nature, 332: 323-329 [1988]; y Presta, Curr. Op. Struct. Biol., 2: 593-596 (1992).
Tal como se utiliza en la presente invención, el término "inmunoadhesina" designa moléculas de tipo anticuerpo que combinan el "dominio de unión" de una proteína "adhesina" heteróloga (por ejemplo, un receptor, ligando o enzima) con las funciones efectoras de un dominio constante de inmunoglobulina. Estructuralmente, las inmunoadhesinas comprenden una fusión de la secuencia de aminoácidos de la adhesina con la especificidad de unión deseada diferente del sitio de reconocimiento y unión a antígeno (sitio de combinación a antígeno) de un anticuerpo (es decir, es "heterólogo") y una secuencia del dominio constante de inmunoglobulina. La secuencia del dominio constante de inmunoglobulina en la inmunoadhesina deriva preferiblemente de las cadenas pesadas \gamma1, \gamma2 o \gamma4, ya que las inmunoadhesinas que comprenden estas regiones se pueden purificar mediante cromatografía de Proteína A (Lindmark et al., J. Immunol. Meth. 62: 1-13 (1983)).
El término "dominio de unión a ligando" tal como se utiliza en la presente invención se refiere a cualquier receptor nativo de la superficie celular o cualquier región o derivado de la misma que mantiene por lo menos una unión de ligando cualitativa de un receptor nativo correspondiente. En una realización específica, el receptor es de un polipéptido de la superficie celular que tiene un dominio extracelular que es homólogo a un miembro de la familia de supergenes de inmunoglobulinas. Otros receptores, que no son miembros de la familia de supergenes de inmunoglobulinas pero, sin embargo, están cubiertos por esta definición, son receptores para citoquinas y, en particular, receptores concretos con actividad tirosina quinasa (receptor tirosina quinasa), miembros de las superfamilias del receptor de hematopoyetina y factor de crecimiento nervioso, y moléculas de adhesión celular, por ejemplo selectinas (E. L y P).
El término "dominio de unión a receptor" se utiliza para designar cualquier ligando nativo para un receptor, incluyendo moléculas de adhesión celular, o cualquier región o derivado de dicho ligando nativo que mantiene por lo menos la capacidad de unión cualitativa al receptor de un ligando nativo correspondiente. Esta definición, incluye específicamente, entre otras, secuencias de unión de ligandos para los receptores mencionados anteriormente.
Una "quimera anticuerpo-inmunoadhesina" comprende una molécula que combina por lo menos un dominio de unión de un anticuerpo (tal como se define en la presente invención) con por lo menos una inmunoadhesina (tal como se define en esta solicitud). Algunos ejemplos de quimeras anticuerpo-inmunoadhesina son las quimeras CD4-IgG biespecíficas descritas en Berg et al., PNAs (USA) 88:4723-4727 (1991) y Chamow et al., J. Immunol. 153: 4268 (1994).
"Trastuzumab" o "HERCEPTIN®" es un anticuerpo anti-HER2 humanizado que comprende la secuencia de aminoácidos de la cadena ligera de la SEC ID No. 1 y la secuencia de aminoácidos de la cadena pesada de SEC ID No. 2 o variantes de las secuencias de aminoácidos de las mismas que mantienen la capacidad de unirse a HER2 e inhibir el crecimiento de células tumorales que sobreexpresan HER2 (Véase Patente de Estados Unidades 5.677.171).
Modos para llevar a cabo la invención
El proceso de la presente invención implica la purificación de una proteína que contiene la región C_{H}2/C_{H}3 de contaminantes mediante la cromatografía de Proteína A. En realizaciones preferidas, la proteína a purificar utilizando la cromatografía de Proteína A es un anticuerpo, una inmunoadhesina o una proteína fusionada o conjugada con una región C_{H}2/C_{H}3. A continuación, se describirán técnicas para generar dichas moléculas.
1. Anticuerpos
La proteína preferida a purificar según la presente invención es un anticuerpo. Los anticuerpos dentro del alcance de la presente invención incluyen, pero sin limitación: anticuerpos anti-HER2 que incluyen Trastuzumab (HERCEP-TIN®) (Carter et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89: 4285-4289 (1992), Patente de Estados Unidos No. 5.725.856); anticuerpos anti-CD20, tales como anti-CD20 quimérico "C2B8" como en la Patente de Estados Unidos No. 5.736.137 (RITUXAN®), una variante quimérica o humanizada del anticuerpo 2H7 como en la Patente de Estados Unidos No. 5.721.108, o Tositumomab (BEXXAR®); anti-IL8 (St John et al., Chest, 103: 932 (1993), y la Publicación Internacional No. WO 95/23865); anticuerpos anti-VEGF que incluyen anticuerpos anti-VEGF humanizados y/o maduros por afinidad, tales como el anticuerpo anti-VEGF humanizado huA4.6.1 AVASTIN® (Kim et al., Growth Factors, 7: 53-64 (1992), Publicación Internacional No. WO 96/30046, y WO 98/45331, publicada el 15 de octubre de 1998); anticuerpos anti-PSCA (WO01/40309), anticuerpos anti-CD40, que incluyen S2C6 y variantes humanizadas de los mismos (WO00/75348); anti-CD11a (Patente de Estados Unidos No. 5.622.700, WO 98/23761, Steppe et al., Transplant Intl. 4: 3-7 (1991), y Hourmant et al., Transplantation 58: 377-380 (1994)); anti-IgE (Presta et al., J. Immunol. 151: 2623-2632 (1993), y la Publicación Internacional No. WO 95/19181); anti-CD18 (Patente de Estados Unidos No. 5.622.700, concedida el 22 de abril de 1997, o como en WO 97/26912, publicada el 31 de Julio de 1997); anti-IgE (que incluye E25, E26 y E27; Patente de Estados Unidos No. 5.714.338, concedida el 3 de febrero de 1998 o la Patente de Estados Unidos No. 5,091,313, concedida el 25 de febrero de 1992, WO 93/04173 publicada el 4 de marzo de 1993, o la Solicitud Internacional No. PCT/US98/13410 solicitada el 30 de junio de 1998, la Patente de Estados Unidos No. 5.714.338); anticuerpo anti- receptor Apo-2 (WO 98/51793 publicada el 19 de noviembre de 1998); anticuerpos anti-TNF-\alpha que incluyen cA2 (REMICADE®), CDP571 MAK-195 (Véase, Patente de Estados Unidos No. 5.672.347 concedida el 30 de septiembre de 1997, Lorenz et al. J. Immunol. 156 (4): 1646-1653 (1996), y Dhainaut et al. Crit. Care Med. 23 (9): 1461-1469 (1995)); anti-Factor Tisular (TF) (Patente Europea No. 0 420 937 B1 concedida el 9 de noviembre de 1994); integrina \alpha4\beta7 anti-humana (WO 98/06248 publicada el 19 de febrero de 1998); anti-EGFR (anticuerpo 225 quimerizado o humanizado como en WO 96/40210 publicada el 19 de diciembre de 1996); anticuerpos anti-CD3, tales como OKT3 (Patente de Estados Unidos No. 4.515.893 concedida el 7 de mayo de 1985); anticuerpos anti-CD25 o anti-tac, tales como CHI-621 (SIMULECT®) y (ZENAPAX®) (Véase la Patente de Estados Unidos No. 5.693.762 concedida el 2 de diciembre de 1997); anticuerpos anti-CD4, tales como el anticuerpo cM-7412 (Choy et al. Arthritis Rheum 39 (1): 52-56 (1996)); anticuerpos anti-CD52, tales como CAMPATH-1 H (Riechmann et al. Nature 332: 323-337 (1988)); anticuerpos anti-receptor Fc, tales como el anticuerpo M22 dirigido contra FcyRl como en Graziano et al. J. Immunol. 155 (10): 4996-5002 (1995); anticuerpos anti-antígeno carcinoembriónico (CEA), tales como hMN-14 (Sharkey et al. Cancer Res. 55 (23Suppl): 5935s-5945s (1995); anticuerpos dirigidos contra células epiteliales de mama que incluyen huBrE-3, hu-Mc 3 y CHL6 (Ceriani et al. Cancer Res. 55 (23): 5852s-5856s (1995); y Richman et al. Cancer Res. 55 (23 Supp): 5916s-5920s (1995)); anticuerpos que se unen a células de carcinoma de colon, tales como C242 (Litton et al. Eur J. Immunol. 26 (1): 1-9 (1996)); anticuerpos anti-CD38, por ejemplo, AT 13/5 (Ellis et al. J. Immunol. 155 (2): 925-937 (1995)); anticuerpos anti-CD33, tales como Hu M195 (Jurcic et al. Cancer Res 55 (23 Suppl): 5908s-5910s (1995) y CMA-676 o CDP771; anticuerpos anti-CD22, tales como LL2 o LinfoCide (Juweid et al. Cancer Res 55 (23 Suppl): 5899s-5907s (1995)); anticuerpos anti-EpCAM, tales como 17-1A (PANOREX®): anticuerpos anti-GpIIb/IIIa, tales como abciximab o c7E3 Fab (REPRO®); anticuerpos anti-RSV, tales como MEDI-493 (SYNAGIS®); anticuerpos anti-CMV, tales como PROTOVIR®; anticuerpos anti-VIH, tales como PRO542; anticuerpos anti-hepatitis, tales como el anticuerpo anti-Hep B OSTAVIR®, anticuerpo anti-CA 125 OvaRex; anticuerpos del epítopo GD3 anti-idiotípico BEC2; anticuerpo anti-\alphav\beta3 VITAXIN®; anticuerpos de carcinoma de células renales anti-humano, tales como ch-G250; ING-1; anticuerpos 17-1A anti-humano (3622W94); anticuerpo de tumor colorrectal anti-humano (A33); anticuerpos de melanoma anti-humano R24 dirigido contra el gangliósido GD3; anti-carcinoma de células escamosas humanas (SF-25); y anticuerpos anti-antígenos de leucocitos humanos (HLA), tales como ID10 y el anticuerpo DR anti-HLA Oncolym (Lym-1). Los antígenos Diana preferidos para el anticuerpo de la presente invención son: HER2 receptor, VEGF, IgE, CD20, CD11a, y CD40.
A parte de los anticuerpos identificados específicamente anteriormente, el experto en la materia podría generar anticuerpos dirigidos contra un antígeno de interés, por ejemplo, utilizando las técnicas descritas a continuación.
(i) Selección y preparación de antígenos
El anticuerpo de la presente invención está dirigido contra un antígeno de interés. Preferiblemente, el antígeno es un polipéptido biológicamente importante y la administración del anticuerpo a un mamífero que padece de una enfermedad o trastorno puede dar lugar a un beneficio terapéutico en dicho mamífero. Sin embargo, se contemplan los anticuerpos dirigidos contra antígenos no polipeptídicos (tales como antígenos de glicolípidos asociados a tumores; véase la Patente de Estados Unidos 5.091.178). Cuando el antígeno es un polipéptido, puede ser una molécula transmembrana (por ejemplo, receptor) o ligando, tal como un factor de crecimiento. Los antígenos de ejemplo incluyen aquellas proteínas descritas en la sección (3) siguiente. Las dianas moleculares de ejemplo para anticuerpos comprendidas en la presente invención incluyen proteínas CD tales como la CD3, la CD4, la CD8, la CD19, la CD20, la CD22 y la CD34; miembros de la familia del receptor ErbB tales como el receptor EGF, el receptor HER2, HER3 o HER4; moléculas de adhesión celular tales como la LFA-1, Mac1, p150,95, VLA-4, ICAM-1, VCAM y la integrina \alphav/\beta3 incluyendo las subunidades \alpha o \beta de la misma (por ejemplo, los anticuerpos anti-CD11a, anti-CD18 o anti-CD11b); factores de crecimientos tales como VEGF; IgE; antígenos de grupo sanguíneo; el receptor de flk2/flt3; el receptor de obesidad (OB); el receptor mpI; CTLA-4; la proteína C, o cualquiera de los otros antígenos mencionados en la presente invención.
Los antígenos solubles o fragmentos de los mismos, opcionalmente conjugados a otras moléculas, se pueden utilizar como inmunógenos para generar anticuerpos. Para las moléculas transmembrana, tales como receptores, se pueden utilizar fragmentos de éstos (por ejemplo, el dominio extracelular de un receptor) como inmunógeno. Alternativamente, las células que expresan la molécula transmembrana se pueden utilizar como inmunógeno. Dichas células se pueden derivar a partir de una fuente natural (por ejemplo, líneas de células cancerígenas) o pueden ser células que se han transformado mediante técnicas recombinantes para expresar la molécula transmembrana.
Otros antígenos y formas de los mismos útiles para la preparación de anticuerpos serán evidentes para los expertos en la materia.
(ii) Anticuerpos policlonales
Los anticuerpos policlonales se desarrollan preferiblemente en animales mediante múltiples inyecciones subcutáneas (sc) o intraperitoneales (ip) del antígeno pertinente y un adyuvante. Puede ser útil conjugar el antígeno a una proteína que es inmunogénica en la especie a inmunizar, por ejemplo, la hemocianina de la lapa californiana, albúmina de suero, tiroglobulina bovina, o inhibidor de tripsina de soja utilizando un agente bifuncional o derivatizante, por ejemplo, éster de maleimidobenzoil sulfosuccinimida (conjugación a través de los residuos de cisteína), N-hidroxisuccinimida (a través de residuos de lisina), glutaraldehído, anhídrido succínico, SOCl_{2}, o R^{1}N=C=NR, donde R y R^{2} son grupos alquilo diferentes.
Los animales se inmunizan contra el antígeno, conjugados inmunogénicos o derivados mediante la combinación, por ejemplo de 100 \mug o 5 \mug de la proteína o conjugado (para conejos o ratones, respectivamente) con 3 volúmenes de adyuvante completo de Freund y la inyección de la solución de manera intradérmica en múltiples sitios. Un mes más tarde los animales son reforzados con 1/5 a 1/10 de la cantidad original de antígeno o conjugado en el adyuvante completo de Freund mediante inyección subcutánea en múltiples sitios. De siete a 14 días después, los animales sangran y se analiza el suero para la concentración de anticuerpos. Los animales se refuerzan hasta que la concentración es constante. Preferiblemente, los animales se refuerzan con el conjugado del mismo antígeno, pero se conjugan a una proteína diferente y/o a través de un reactivo de reticulación diferente. Los conjugados también se pueden producir en cultivos de células recombinantes como fusiones de proteínas. Además, se utilizan de manera adecuada agentes de agregación, tales como alumbre para aumentar la respuesta inmune.
(iii) Anticuerpos monoclonales
Los anticuerpos monoclonales se pueden fabricar utilizando el procedimiento del hibridoma descrito por primera vez por Kohler et al., Nature 256: 495 (1975) o se pueden fabricar mediante procedimientos de ADN recombinante (Patente de Estados Unidos No. 4.816.567).
En el procedimiento del hibridoma, un ratón u otro animal huésped apropiado, tal como un hámster o mono macaco, se inmuniza tal como se ha descrito anteriormente para obtener linfocitos que producen o son capaces de producir anticuerpos que se unirán específicamente a la proteína utilizada para la inmunización. De modo alternativo, los linfocitos se pueden inmunizar in vitro. A continuación, los linfocitos se fusionan con células de mieloma utilizando un agente de fusión adecuado, tal como polietilenglicol, para formar una célula de hibridoma Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, Academia Press, (1986), páginas 59-103).
Las células de hibridoma preparadas de esta manera se cultivan y desarrollan en un medio de cultivo adecuado que preferiblemente contiene una o más sustancias que inhiben el crecimiento o la supervivencia de las células de mieloma parentales no fusionadas. Por ejemplo, si las células de mieloma parentales carecen de la enzima hipoxantina guanina fosforribosiltransferasa (RGPRI o RPRI), el medio de cultivo para los hibridomas incluirá habitualmente hipoxantina, aminopterina y timidina (medio HAT), cuyas sustancias evitan el crecimiento de células deficientes en HGPRT.
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Las células de mieloma preferidas son aquéllas que se fusionan de manera eficaz, inducen un nivel de producción elevado estable de anticuerpo por las células productoras de anticuerpos seleccionadas, y son sensibles a un medio tal como medio HAT. Entre éstas, las líneas de células de mieloma preferidas son líneas de mieloma múrido, tales como las derivadas de tumores de ratón MOPC-21 y MPC-11 que se pueden obtener del Salk Institute Cell Distribution Center, San Diego, California Estados Unidos y las células SP-2 o X-63-Ag8-653 que se pueden obtener de la American Type Culture Collection, Rockville, Maryland, Estados Unidos. Las líneas celulares de mieloma humano y heteromieloma de ratón-humano también se han descrito para la producción de anticuerpos monoclonales humanos (Kozbor, J. Immunol., 133:3001 (1984); Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, páginas, 51-63 (Marcel Dekker, Inc., Nueva York, (1987)).
Se analiza el medio de cultivo en que las células de hibridoma crecen para la producción de anticuerpos monoclonales dirigidos contra el antígeno. Preferiblemente, la especificidad de unión de anticuerpos monoclonales producidos por las células de hibridoma se determina mediante inmunoprecipitación o mediante un ensayo de unión in vitro, tal como radioinmunoensayo (RIA) o ensayo inmunoabsorbente unido a enzima (ELISA).
Después de identificar las células de hibridoma que producen anticuerpos de la especificidad, afinidad y/o actividad deseadas, los clones se pueden subclonar limitando los procedimientos de dilución y se pueden desarrollar mediante procedimientos estándar (Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, páginas 59-103 (Academia Press 1986)). Entre los medios de cultivo adecuados para este objetivo se incluyen, por ejemplo, medio D-MEM o RPMI-1640. Además, las células de hibridoma se pueden desarrollar in vivo como tumores de ascitis en un animal.
Los anticuerpos monoclonales secretados por los subclones se separan de forma adecuada del medio de cultivo, fluido ascítico o suero mediante procedimientos de purificación de inmunoglobulina convencionales, tales como, por ejemplo, proteína A-sefarosa, cromatografía en hidroxilapatita, eletroforesis en gel, diálisis, o cromatografía de afinidad. Preferiblemente, se utiliza el procedimiento de la cromatografía de Proteína A descrita en la presente invención
El ADN que codifica los anticuerpos monoclonales se se aísla fácilmente y se secuencia utilizando procedimientos convencionales (por ejemplo, mediante la utilización de sondas de oligonucleótidos que son capaces de unirse específicamente a genes que codifican las cadenas ligeras y pesadas de los anticuerpos monoclonales). Las células de hibridoma sirven como una fuente preferida de dicho ADN. Una vez aislado, el ADN se puede situar en vectores de expresión, que a continuación se transfectan en células huésped, tales como células E. coli, células COS de simio, células de ovario de hámster chino (CHO) o células de mieloma que no producen de otro modo proteína inmunoglobulina, para obtener la síntesis de anticuerpos monoclonales en las células huésped recombinantes.
El ADN también puede modificarse, por ejemplo, mediante la sustitución de la secuencia codificante para los dominios constantes de la cadena pesada y ligera en lugar de las secuencias de murino homólogas (Patente de Estados Unidos No. 4.816.567; Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81: 6851 (1984)), o mediante unión covalente a la secuencia codificante de la inmunoglobulina de toda o parte de la secuencia codificante para un polipéptido que no es inmunoglobulina.
Habitualmente, dichos polipéptidos que no son inmunoglobulinas están sustituidos por los dominios constantes de un anticuerpo, o están sustituidos por los dominios variables de un sitio de combinación a antígeno de un anticuerpo para crear un anticuerpo bivalente quimérico que comprende un sitio de combinación a antígeno que tiene especificidad por un antígeno y otro sitio de combinación a antígeno que tiene especificidad por un antígeno diferente.
En una realización adicional, los anticuerpos monoclonales se pueden aislar de bibliotecas de anticuerpos en fagos generadas utilizando las técnicas descritas en McCafferty et al., Nature, 348: 552-554 (1990). Clackson et al., Nature, 352: 624-628 (1991) y Marks et al., J. Mol. Biol., 222: 581-597 (1991) describen el aislamiento de anticuerpos múridos y humanos, respectivamente, utilizando bibliotecas de fagos. Publicaciones posteriores describen la producción de anticuerpos humanos de afinidad elevada (rango de nM) mediante la recombinación de cadena (Marks et al., Bio/Technology, 10: 779-783 (1992)), así como una infección combinatoria y recombinación in vivo como estrategia para construir bibliotecas de fagos muy grandes (Waterhouse et al., Nuc. Acids. Res. 21: 2265-2266 (1993)). De este modo, estas técnicas son alternativas viables a las técnicas de hibridoma tradicionales para el aislamiento de anticuerpos monoclonales.
(iv) Anticuerpos humanizados y humanos
Un anticuerpo humanizado tiene uno o más residuos de aminoácido introducidos en el mismo de un origen que es no humano. Estos residuos de aminoácido no humanos se indican frecuentemente como residuos "importados", que se adquieren habitualmente de un dominio variable "importado". La humanización se puede realizar esencialmente siguiendo el procedimiento de Winter y colaboradores (Jones et al., Nature, 321: 522-525 (1986); Riechmann et al., Nature, 332: 323-327 (1988); Verhoeyen et al., Science, 239: 1534-1536 (1988)), mediante la sustitución de CDRs o secuencias de CDR de roedor por las correspondientes secuencias de un anticuerpo humano. Por consiguiente, dichos anticuerpos "humanizados" son anticuerpos quiméricos (Patente de Estados Unidos No. 4.816.567), en los que sustancialmente menos de un dominio variable intacto humano ha sido sustituido por la secuencia correspondiente de una especie no humana. En la práctica, los anticuerpos humanizados son habitualmente anticuerpos humanos en los que algunos residuos de CDR y posiblemente algunos residuos de FR se sustituyen por residuos de sitios análogos en anticuerpos de roedores.
La elección de dominios variables humanos, tanto ligeros como pesados, a utilizar en la fabricación de anticuerpos humanizados es muy importante para reducir la antigenicidad. Según el procedimiento denominado "mejor ajuste", la secuencia del dominio variable de un anticuerpo de roedor se criba frente a toda la biblioteca de secuencias humanas de dominio variable conocidas. La secuencia humana que está más próxima a la del roedor se acepta entonces como la FR humana para el anticuerpo humanizado (Sims et al., J. Immunol., 151: 2296 (1993)). Otro procedimiento utiliza una FR particular derivada de la secuencia de consenso de todos los anticuerpos humanos de un subgrupo particular de cadenas ligeras o pesadas. La misma FR se puede utilizar para varios anticuerpos humanizados diferentes (Carter et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89: 4285 (1992); Presta et al., J. Immunol., 151: 2623 (1993)).
Es importante además que los anticuerpos se humanicen manteniendo la afinidad elevada por el antígeno y otras propiedades biológicas favorables. Para conseguir este objetivo, según un procedimiento preferido, los anticuerpos humanizados se preparan mediante un proceso de análisis de las secuencias parentales y varios productos conceptuales humanizados utilizando modelos tridimensionales de las secuencias parentales y humanizadas. Los modelos tridimensionales de inmunoglobulinas estás disponibles habitualmente y son familiares para los expertos en la materia. Existen disponibles programas informáticos que ilustran y muestran probables estructuras conformacionales tridimensionales de secuencias de inmunoglobulinas candidatas seleccionadas. El examen de estas observaciones permite el análisis del probable papel de los residuos en el funcionamiento de la secuencia de inmunoglobulina candidata, es decir, el análisis de residuos que influencian en la capacidad de la inmunoglobulina candidata para unirse a su antígeno. De esta manera, se pueden seleccionar y combinar residuos FR a partir de las secuencias del receptor e importadas, de manera que se consigue la característica deseada del anticuerpo, tal como la mayor afinidad por el antígeno o antígenos diana. En general, los residuos de CDR están directamente y más sustancialmente implicados en la influencia sobre la unión a antígeno.
De modo alternativo, ahora es posible producir animales transgénicos no humanos (por ejemplo, ratones), que son capaces, después de inmunización, de producir un repertorio completo de anticuerpos humanos en ausencia de la producción de inmunoglobulina endógena. Por ejemplo, se ha descrito que la supresión homocigótica del gen de la región de unión (J_{H}) de la cadena pesada del anticuerpo en ratones quiméricos y mutantes en la línea germinal da lugar a la inhibición completa de la producción de anticuerpos endógenos. La transferencia del grupo de genes de inmunoglobulina de la línea germinal humana en dichos ratones mutantes en la línea germinal dará lugar a la producción de anticuerpos humanos después de la estimulación de los antígenos. Véase, por ejemplo, Jakobovits et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:2551 (1993); Jakobovits et al., Nature, 362: 255-258 (1993); Bruggermann et al., Year in Immuno., 7: 33 (1993); y Duchosal et al., Nature 355: 258 (1992). Los anticuerpos también puede derivar de bibliotecas de expresión de fagos (Hoogenboom et al., J. Mol. Biol. 227:381 (1991); Marks et al., J. Mol. Biol., 222: 591-597 (1991); Vaughan et al., Nature Biotech 14: 309 (1996)).
(v) Fragmentos de anticuerpos
Se han desarrollado varias técnicas para la producción de fragmentos de anticuerpos. Habitualmente, estos fragmentos se derivaron a través de la digestión proteolítica de anticuerpos intactos (véase, por ejemplo, Morimoto et al., Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24: 107-117 (19921 y Brennan et al., Science 229:81 (1985)). Sin embargo, estos fragmentos se pueden producir ahora directamente mediante células huésped recombinantes. Por ejemplo, los fragmentos de anticuerpos se pueden aislar de las bibliotecas de anticuerpos en fagos descritas anteriormente. De modo alternativo, los fragmentos Fab'-SH se pueden recuperar directamente de E. coli y se pueden acoplar químicamente para formar fragmentos de F(ab')_{2} (Carter et al., Bio/Technology 10:163-167 (1992)). Según otra estrategia, los fragmentos F(ab')_{2} se pueden aislar directamente de un cultivo de células huésped recombinantes. Otras técnicas para la producción de fragmentos de anticuerpos serán evidentes para el técnico habitual. En otras realizaciones, el anticuerpo de elección es un fragmento de Fv de cadena única (scFv). Véase WO 93/16185.
(vi) Anticuerpos multiespecíficos
Los anticuerpos multiespecíficos tienen especificidades de unión para por lo menos dos antígenos diferentes. Aunque dichas moléculas sólo se unirán normalmente a dos antígenos (es decir, anticuerpos biespecíficos, BsAbs), anticuerpos con especificidades adicionales, tales como anticuerpos triespecíficos, están comprendidos por esta expresión cuando se utilizan en la presente invención.
Los procedimientos para fabricar anticuerpos biespecíficos son conocidos en la técnica. La producción habitual de anticuerpos biespecíficos de longitud completa se basa en la coexpresión de dos parejas de cadena pesada/cadena ligera de inmunoglobulina, en las que las dos cadenas tienen especificidades diferentes (Millstein et al., Nature, 305: 537-539 (1983)). Debido a la variedad aleatoria de cadenas pesadas y ligeras de la inmunoglobulina, estos hibridomas (cuadromas) producen una mezcla potencial de diez moléculas diferentes de anticuerpos, de las cuales sólo una tiene la estructura biespecífica correcta. La purificación de la molécula correcta, que se realiza habitualmente mediante etapas de cromatografía de afinidad, es bastante incómoda, y los rendimientos del producto son bajos. En WO 93/08829, y en Traunecker et al., EMBO J., 10: 3655-3659 (1991) se describen procedimientos similares.
Según otra estrategia descrita en WO 96/27011, se puede diseñar la interfase entre una pareja de moléculas de anticuerpos para maximizar el porcentaje de heterodímeros que se recuperan del cultivo de células recombinantes. La interfase preferida comprende por lo menos una parte del dominio de C_{H}3 de un dominio constante de anticuerpo. En este procedimiento, una o más cadenas laterales pequeñas de aminoácidos de la interfase de la primera molécula de anticuerpo se sustituyen por cadenas laterales mayores (por ejemplo, tirosina o triptófano). Las "cavidades" compensatorias de tamaño similar o idéntico a la cadena o cadenas laterales grandes se crean en la interfase de la segunda molécula de anticuerpo mediante la sustitución de cadenas laterales grandes de aminoácidos por más pequeñas (por ejemplo, alanina o treonina). Esto proporciona un mecanismo para aumentar el rendimiento del heterodímero sobre otros productos finales no deseados, tales como homodímeros.
Los anticuerpos biespecíficos incluyen anticuerpos reticulados o "heteroconjugados". Por ejemplo, uno de los anticuerpos en el heteroconjugado puede estar acoplado a avidina, el otro a biotina. Dichos anticuerpos se han propuesto, por ejemplo, para dirigir células del sistema inmune a células no deseadas (Patente de Estados Unidos No. 4.676.980) y para el tratamiento de la infección por VIH (WO 91/00360, WO 92/300373, y EP 03089). Los anticuerpos heteroconjugados se pueden fabricar utilizando cualquier procedimiento de reticulación conveniente. Los agentes de reticulación adecuados son bien conocidos en la técnica y se describen en la Patente de Estados Unidos No. 4.676.980, junto con una serie de técnicas de reticulación.
Las técnicas para generar anticuerpos biespecíficos a partir de fragmentos de anticuerpos también se han descrito en la literatura. Por ejemplo, los anticuerpos biespecíficos se pueden preparar utilizando uniones químicas. Brennan et al., Science 229:81 (1985) describen un procedimiento en el que los anticuerpos intactos se dividen proteolíticamente para generar fragmentos F(ab')_{2}. Estos fragmentos se reducen en presencia del agente complejante de ditiol, arsenito sódico, para estabilizar los ditioles vecinales y evitar la formación de disulfuro intermolecular. A continuación, los fragmentos Fab' generados se convierten en derivados de tionitrobenzoato (TNB). A continuación, uno de los derivados de Fab'-TNB se reconvierte al Fab'-tiol mediante la reducción con mercaptoetilamina y se mezcla con una cantidad equimolar del otro derivado de Fab'-TNB para formar el anticuerpo biespecífico. Los anticuerpos biespecíficos producidos se pueden utilizar como agentes para la inmovilización selectiva de enzimas.
El progreso reciente ha facilitado la recuperación directa de fragmentos de Fab'-SH de E. coli, los cuales se pueden acoplar químicamente para formar anticuerpos biespecíficos. Shalaby et al., J. Exp. Med. 175: 217-225 (1992) describen la producción de una molécula de anticuerpo biespecífico totalmente humanizado F(ab')_{2}. Cada fragmento de Fab' se secretó por separado de E. coli y se sometió a un acoplamiento químico dirigido in vitro para formar el anticuerpo biespecífico. El anticuerpo biespecífico formado de esta manera era capaz de unirse a células que sobreexpresan el receptor ErbB2 y las células T humanas normales, así como de desencadenar la actividad lítica de linfocitos citotóxicos humanos contra tumores de mama humana dianas.
Se han descrito también varias técnicas para fabricar y aislar fragmentos de anticuerpos biespecíficos directamente de cultivos de células recombinantes. Por ejemplo, se han producido anticuerpos biespecíficos utilizando cremalleras de leucina. Kostelny et al., J. Immunol. 148(5): 1547-1553 (1992). Los péptidos cremallera de leucina de las proteínas Fos y Jun se unieron a las partes de Fab' de dos anticuerpos diferentes mediante fusión génica. Los homodímeros del anticuerpo se redujeron en la región bisagra para formar monómeros y, a continuación, se reoxidaron para formar los heterodímeros del anticuerpo. Este procedimiento también se puede utilizar para la producción de homodímeros de anticuerpo. La tecnología de "diabody" descrita por Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:6444-6448 (1993) ha proporcionado un mecanismo alternativo para fabricar fragmentos de anticuerpos biespecíficos. Los fragmentos comprenden un dominio variable de cadena pesada (V_{H}) conectado a un dominio variable de cadena ligera (V_{L}) mediante un enlazador que es demasiado corto para permitir el emparejamiento entre los dos dominios en la misma cadena. Por consiguiente, los dominios V_{H} y V_{L} de un fragmento son forzados a emparejarse con los dominios V_{L} y V_{H} complementarios de otro fragmento, formando así dos sitios de unión a antígeno. También se ha descrito otra estrategia para fabricar fragmentos de anticuerpos biespecíficos mediante la utilización de dímeros de Fv de cadena única (sFv). Véase Gruber et al., J. Immunol. 152:5368 (1994). Alternativamente, los anticuerpos pueden ser "anticuerpos lineales" tal como se ha descrito en Zapata et al. Protein Eng. 8 (10): 1057-1062 (1995). Brevemente, estos anticuerpos comprenden una pareja de segmentos Fd en tándem (V_{H}-C_{H}1-V_{H}C_{H}1) que forman una pareja de regiones de unión a antígeno. Los anticuerpos lineales pueden ser biespecíficos o monoespecíficos.
Se contemplan anticuerpos con más de dos valencias. Por ejemplo, se pueden preparar anticuerpos triespecíficos. Tutt et al. J. Immunol. 147: 60 (1991).
2. Inmunoadhesinas
El diseño de inmunoadhesina más simple y sencillo combina el dominio o dominios de unión de la adhesina (por ejemplo, el dominio extracelular (ECD) de un receptor) con las regiones bisagra y Fc de una cadena pesada de inmunoglobulina. Normalmente, cuando se preparan las inmunoadhesinas de la presente invención, el ácido nucleico que codifica el dominio de unión de la adhesina se fusionará por el extremo C terminal al ácido nucleico que codifica el extremo N terminal de una secuencia del dominio constante de inmunoglobulina, aunque las fusiones N-terminales también son posibles.
Habitualmente, en dichas fusiones el polipéptido quimérico codificado mantendrá por lo menos los dominios bisagra, dominios C_{H}2 y C_{H}3 funcionalmente activos de la región constante de una cadena pesada de inmunoglobulina. Las fusiones también se realizan al extremo C terminal de la parte Fc de una región constante, o al N-terminal inmediato al C_{H}1 de la cadena pesada o la región correspondiente de la cadena ligera. El sitio preciso en el que se realiza la fusión no es crítico; se conocen bien sitios concretos y se pueden seleccionar con el fin de optimizar la actividad biológica, la secreción, o características de unión de la inmunoadhesina.
En una realización preferida, la secuencia de adhesina se fusiona al extremo N-terminal del dominio Fc de la inmunoglobulina G_{1} (IgG_{1}). Es posible fusionar la región constante de cadena pesada completa con la secuencia de adhesina. Sin embargo, más preferiblemente, en la fusión se utiliza una secuencia que empieza en la región bisagra justo corriente arriba del sitio de división por papaína que define químicamente Fc de IgG (es decir, el residuo 216, tomando como el primer residuo de la región constante de cadena pesada el 114), o sitios análogos de otras inmunoglobulinas. En una realización particularmente preferida, la secuencia de aminoácidos de la adhesina se fusiona a (a) la región bisagra y C_{H}2 y C_{H}3 o (b) los dominios C_{H}1, bisagra, C_{H}2 y C_{H}3, de una cadena pesada de IgG.
Para inmunoadhesinas biespecíficas, las inmunoadhesinas se ensamblan como multímeros, y particularmente como heterodímeros heterotetrámeros. Generalmente, estas inmunoglobulinas ensambladas tendrán estructuras unitarias conocidas. Una unidad estructural básica de cuatro cadenas es la forma en la que existen IgG, IgD e IgE. Una unidad de cuatro cadenas se repite en las inmunoglobulinas de peso molecular más elevado; IgM existe generalmente como un pentámero de cuatro unidades básicas que se mantienen juntas mediante enlaces disulfuro. La globulina IgA, y ocasionalmente la globulina IgG, también pueden existir en forma multimérica en el suero. En el caso del multímero, cada una de las cuatro unidades puede ser la misma o diferente.
A continuación, se muestran esquemáticamente varias inmunoadhesinas ensambladas de ejemplo dentro del alcance de la presente invención:
(a)
AC_{L}-AC_{L};
(b)
AC_{H}-(AC_{H}, AC_{L}-AC_{H}, AC_{L}-V_{H}C_{H}, o V_{L}C_{L}-AC_{H});
(c)
AC_{L}AC_{H}-(AC_{L}-AC_{H}, AC_{L}-V_{H}C_{H}, V_{L}C_{L}-AC_{H}, o V_{L}C_{L}V_{H}C_{H})
(d)
AC_{L}-V_{H}C_{H}-(AC_{H}, o AC_{L}-V_{H}C_{H}, o V_{L}C_{L}-AC_{H});
(e)
V_{L}C_{L}-AC_{H}-(AC_{L}-V_{H}C_{H}, o V_{L}C_{L}-AC_{H}); y
(f)
(A-Y)_{n}-(V_{L}C_{L}-V_{H}C_{H})_{2},
en las que cada A representa secuencias de aminoácidos de adhesina iguales o diferentes;
V_{L} es un dominio variable de cadena ligera de inmunoglobulina;
V_{H} es un dominio variable de cadena pesada de inmunoglobulina;
C_{L} es un dominio constante de cadena ligera de inmunoglobulina;
C_{H} es un dominio constante de cadena pesada de inmunoglobulina;
n es un número entero superior a 1;
Y designa el residuo de un agente de reticulación covalente.
Por brevedad, las estructuras anteriores sólo muestran características claves; no indican los dominios de unión (J) u otros dominios de las inmunoglobulinas, ni se muestran los enlaces disulfuro. Sin embargo, cuando se necesiten dichos dominios para la actividad de unión, se interpretará que están presentes en las posiciones habituales que ocupan en las moléculas de inmunoglobulina.
Alternativamente, las secuencias de adhesina se pueden insertar entre las secuencias de cadena pesada y cadena ligera de inmunoglobulina, de manera que se obtiene una inmunoglobulina que comprende una cadena pesada quimérica. En esta realización, las secuencias de adhesina se fusionan al extremo 3' de una cadena pesada de inmunoglobulina en cada brazo de una inmunoglobulina, entre el dominio bisagra y el dominio C_{H}2, o entre los dominios C_{H}2 y C_{H}3_{.} Se han descrito construcciones similares por Hoogenboom et al., Mol. Immunol. 28: 1027-1037 (1991).
Aunque la presencia de una cadena ligera de inmunoglobulina no es necesaria en las inmunoadhesinas de la presente invención, una cadena ligera de inmunoglobulina podría estar presente asociada covalentemente a un polipéptido de fusión de adhesina-cadena pesada de inmunoglobulina, o directamente fusionada a la adhesina. En el primer caso, el ADN que codifica una cadena ligera de inmunoglobulina se coexpresa habitualmente con el ADN que codifica la proteína de fusión adhesina-cadena pesada de inmunoglobulina. Tras la secreción, el híbrido de cadena pesada y cadena ligera se asociará covalentemente para proporcionar una estructura de tipo inmunoglobulina que comprende dos parejas de cadena pesada-cadena ligera de inmunoglobulina unidas por enlaces disulfuro. Lo procedimientos adecuados para la preparación de dichas estructuras se describen, por ejemplo, en la Patente de Estados Unidos No. 4.816.567 concedida el 28 de marzo de 1989.
Las inmunoadhesinas se construyen de manera más conveniente mediante la fusión de la secuencia de ADNc que codifica la parte de adhesina en el marco de lectura a una secuencia de ADNc de inmunoglobulina. Sin embargo, también se puede utilizar la fusión a fragmentos genómicos de inmunoglobulina (véase, por ejemplo, Aruffo et al., Cell 61: 1303-1313 (1990); y Stamenkovic et al., Cell 66: 1133-1144 (1991)). El último tipo de fusión requiere la presencia de secuencias reguladoras de Ig para la expresión. Los ADNcs que codifican las regiones constantes de cadena pesada de IgG se pueden aislar en base a secuencias publicadas de bibliotecas de ADNc derivadas de linfocitos de bazo y sangre periférica, mediante técnicas de hibridación o reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Los ADNcs que codifican la "adhesina" y las partes de inmunoglobulina de la inmunoadhesina se insertan en tándem en un vector plasmídico que dirige la expresión eficaz en las células huésped elegidas.
3. Otras proteínas que contienen la región C_{H}2/C_{H}3
En otras realizaciones, la proteína a purificar es aquella que se fusiona o se conjuga con una región C_{H}2_{/}C_{H}3. Dichas proteínas de fusión se pueden producir para incrementar la vida media de la proteína en el suero y/o para facilitar la purificación de la proteína mediante cromatografía de Proteína A.
Entre los ejemplos de proteínas biológicamente importantes que se pueden conjugar de esta manera se incluyen renina; una hormona del crecimiento, que incluye hormona del crecimiento humano y hormona del crecimiento bovino; factor de liberación de la hormona del crecimiento; hormona paratiroide; hormona estimuladora de la tiroides; lipoproteínas; alfa-1-antitripsina; cadena A de insulina; cadena B de insulina; proinsulina; hormona estimuladora de folículos; calcitonina; hormona luteinizante; glucagón; factores de coagulación, tales como factor VIIIC, factor IX, factor tisular, y factor de von Willebrands; factores anticoagulantes, tales como Proteína C; factor natriurético atrial; surfactante pulmonar; un activador de plasminógeno, tal como uroquinasa u orina humana o activador de plasminógeno de tejido similar (t-PA); bombesina; trombina; factor de crecimiento hematopoyético; factor alfa y beta de necrosis tumoral; encefalinasa; RANTES (regulador de la activación de las células T normalmente expresadas y secretadas); proteína inflamatoria de macrófagos humana (MIP-1-alfa); una albúmina de suero, tal como albúmina de suero humana; sustancia inhibidora Muelleriana; cadena A de relaxina; cadena B de relaxina; prorrelaxina; péptido asociado con gonadotropina de ratón; una proteína microbiana, tal como betal-lactamasa; DNasa; IgE; un antígeno asociado con linfocitos T citotóxicos (CTLA), tal como CTLA-4; inhibina; activina; factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF); receptores para hormonas o factores de crecimiento; Proteína A o D; factores reumatoides; un factor neurotrópico, tal como factor neurotrópico derivado de hueso (BDNF), neurotrofina-3, 4, 5 ó 6 (NT-3, NT-4, NT-5 o NT-6), o un factor del crecimiento nervioso, tal como NGF-\beta; factor de crecimiento derivado de plaquetas (PDGF); factor de crecimiento de fibroblastos, tal como aFGF y bFGf; factor de crecimiento epidérmico (EGF); factor de crecimiento transformante (TGF), tal como TGF-alfa y TGF-beta, que incluye TGF-\beta1, TGF-\beta2, TGF-\beta3, TGF-\beta4 o TGF-\beta5; factor de crecimiento I y II de tipo insulina (IGF-I e IGF-II); des(1-3)-IGF-I (IGF-I de cerebro), proteína de unión del factor de crecimiento de tipo insulina; proteínas CD, tales como CD3, CD4, CD8, CD19 y CD20; eritropoyetina; factores osteoinductivos; inmunotoxinas; una proteína morfogenética ósea (BMP); un interferón, tal como interferón-alfa, interferón-beta e interferón-gamma; factores estimuladores de colonias (CSFs), por ejemplo, M-CSf, GM-CSF y G-CSF; interleuquinas (ILs), por ejemplo, IL-1 a IL-10; superóxido dismutasa; receptores de células T; proteínas de superficie de membrana; factor acelerante de la degradación; antígeno viral, tal como, por ejemplo, una parte de la cubierta del SIDA; proteínas de transporte; receptores de conducción; adresinas; proteínas reguladoras; integrinas, tales como CD11a, Cd11b, CD11c, CD18, una ICAM, VLA-4 y VCAM; un antígeno asociado con tumores, tal como receptor HER2, HER3 o HER4; y fragmentos de cualquiera de los polipéptidos indicados anteriormente.
4. Purificación de proteínas
La proteína a purificar utilizando el procedimiento descrito en la presente invención se produce generalmente utilizando técnicas recombinantes. Se describen procedimientos para producir proteínas recombinantes, por ejemplo, en las Patentes de Estados Unidos Nº 5.534.615 y 4.816.567, incorporadas específicamente en la presente invención por referencia. En realizaciones preferentes, la proteína de interés se produce en una célula CHO (ver, por ejemplo WO 94/11026). Anteriormente se han descrito ejemplos de proteínas que pueden purificarse utilizando el proceso descrito en la presente invención.
Cuando se utilizan técnicas recombinantes, se puede producir la proteína intracelularmente, en el espacio periplásmico, o secretarse directamente en el medio. Si la proteína se produce intracelularmente, como una primera etapa, se eliminan los residuos particulados, ya sean células huésped o fragmentos lisados, por ejemplo, mediante centrifugación o ultrafiltración. Cuando la proteína se secreta en el medio, pueden separarse las células huésped recombinantes del medio de cultivo celular mediante filtración en flujo tangencial, por ejemplo.
La Proteína A inmovilizada en una fase sólida se utiliza para purificar la proteína que contiene la región C_{H}2/C_{H}3. Preferiblemente la fase sólida es una columna que comprende una superficie de vidrio, sílice, agarosa o poliestireno para inmovilizar la Proteína A. Preferiblemente, la fase sólida es una columna de cristal de poro controlado o una columna de ácido silícico. A veces, se ha cubierto la columna con un reactivo, tal como el glicerol, en un intento de evitar la adherencia no específica a la columna. La columna PROSEP A^{TM}, disponible comercialmente en Bioprocessing Limited, es un ejemplo de una columna de cristal de poro controlado de Proteína A que está cubierta con glicerol. Otros ejemplos de columnas contempladas en la presente invención incluyen la columna POROS 50 A^{TM} (poliestireno) o la columna de Proteína A SEPHAROSE FAST FLOW^{TM} (agarosa).
La fase sólida para la cromatografía de Proteína A se equilibra con un tampón adecuado. Por ejemplo, el tampón de equilibrado puede ser Tris 25 mM, NaCl 25 mM, EDTA 5 mM, pH 7,1.
Se carga la preparación contaminada derivada de las células huésped recombinantes en la fase sólida equilibrada utilizando un tampón de carga que puede ser el mismo que el tampón de equilibrado. A medida que la preparación contaminada fluye a través de la fase sólida, la proteína se adsorbe a la Proteína A inmovilizada y otros contaminantes (como las Proteínas de Ovario de Hámster Chino, CHOP, cuando la proteína es producida en una célula CHO) se pueden unir de manera no específica a la fase sólida.
La siguiente etapa realizada secuencialmente comprende eliminar los contaminantes unidos a la fase sólida, el anticuerpo y/o la Proteína A, mediante el lavado de la fase sólida en una etapa de lavado intermedia. Tras la carga, puede equilibrarse la fase sólida con tampón de equilibrado antes de empezar la etapa de lavado intermedia.
El tampón de lavado intermedio puede comprender sal y un compuesto adicional, donde el compuesto adicional es (a) detergente (preferiblemente polisorbato, por ejemplo polisorbato 20 o polisorbato 80); (b) disolvente (preferiblemente hexilenglicol); y (c) polímero (preferiblemente PEG).
La sal utilizada puede seleccionarse en base a la proteína de interés, pero preferiblemente es acetato (por ejemplo acetato sódico), especialmente cuando el anticuerpo es un anticuerpo anti-HER2, tal como Trastuzumab; o citrato (por ejemplo citrato sódico), especialmente cuando el anticuerpo es un anticuerpo anti-IgE tal como E26.
Las cantidades de la sal y el compuesto adicional en la composición son tales que la suma combinada eluye el contaminante o contaminantes, sin eliminar sustancialmente la proteína de interés. Las concentraciones preferentes de sal en tales tampones de lavado son desde aproximadamente 0,1 hasta aproximadamente 2 M, y más preferiblemente desde aproximadamente 0,2 M hasta aproximadamente 0,6 M. Las concentraciones de detergente útiles son desde aproximadamente 0,01 hasta aproximadamente 5%, más preferiblemente desde aproximadamente 0,1% hasta 1%, y lo más preferible aproximadamente 0,5%, por ejemplo cuando el detergente es polisorbato. Concentraciones de disolvente de ejemplo son desde aproximadamente 1% hasta 40%, preferiblemente desde aproximadamente 5 hasta aproximadamente 25%. Por ejemplo, en los ejemplos de la presente invención, la concentración preferida del disolvente (hexilenglicol) para E26 fue de aproximadamente 20%, mientras que para Trastuzumab la concentración preferida del disolvente (de nuevo hexilenglicol) fue de aproximadamente 10%. Cuando el compuesto adicional es un polímero (por ejemplo PEG 400 o PEG 8000), la concentración del mismo puede ser, por ejemplo, desde aproximadamente 1% hasta aproximadamente 20%, preferiblemente desde aproximadamente 5% hasta aproximadamente 15%.
En otra realización, la etapa de lavado intermedia implica el uso de una solución de tampón altamente concentrada, por ejemplo un tampón a una concentración de más de aproximadamente 0,8 M, por ejemplo hasta aproximadamente 2 M, y preferiblemente en el intervalo desde aproximadamente 0,8 M hasta aproximadamente 1,5 M, siendo lo más preferible aproximadamente 1 M. En esta realización, el tampón es preferiblemente un tampón de Tris, tal como Tris acetato.
El pH del tampón de lavado intermedio es preferiblemente desde aproximadamente 4 hasta aproximadamente 8, más preferiblemente desde aproximadamente 4,5 hasta aproximadamente 5,5, y siendo lo más preferible aproximadamente 5,0. En otra realización preferente, el pH es aproximadamente 7,0.
Después de la etapa de lavado intermedia del párrafo anterior, la proteína de interés se recupera de la columna. Esto se consigue normalmente utilizando un tampón de elución adecuado. La proteína puede eluirse, por ejemplo, de la columna utilizando un tampón de elución que tiene un pH bajo, por ejemplo en el intervalo desde aproximadamente 2 hasta aproximadamente 5, y preferiblemente en el intervalo desde aproximadamente 2,5 hasta aproximadamente 3,5. Ejemplos de tampones de elución para este objetivo incluyen tampones de citrato o acetato.
La preparación de proteína eluída puede someterse a etapas de purificación adicionales ya sea antes, o después, de la etapa de cromatografía de Proteína A. Las etapas de purificación adicionales de ejemplo incluyen cromatografía de hidroxilapatita; diálisis; cromatografía de afinidad utilizando un anticuerpo para capturar la proteína; cromatografía de interacción hidrofóbica (HIC); precipitación con sulfato de amonio; cromatografía de intercambio aniónico o catiónico; precipitación con etanol; HPLC de fase inversa; cromatografía en sílice; "chromatofocusing"; y filtración en gel. En los ejemplos de la presente invención, la etapa de cromatografía de Proteína A va seguido de etapas de purificación de intercambio catiónico (SP-Sefarosa) e intercambio aniónico (Q-Sefarosa) corriente abajo.
La proteína recuperada de este modo puede formularse en un portador farmacéuticamente aceptable y se utiliza para diversos usos diagnósticos, terapéuticos u otros usos conocidos para tales moléculas.
Los siguientes ejemplos se muestran a modo de ilustración y no a modo de limitación.
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Ejemplo 1 Soluciones de Lavado Intermedio
Se produjeron recombinadamente el anticuerpo anti-HER2 Trastuzumab (Figs. 1A-B; HERCEPTIN®), el anticuerpo anti-IgE (E26; Patente de Estados Unidos 5.994.511, Lowman et al.) y el anticuerpo anti-CD11 humanizado (XANELIM®; Patente de Estados Unidos Nº 6.037.454) en células de Ovario de Hámster Chino (CHO) y se purificaron mediante cromatografía de Proteína A como una primera etapa cromatográfica para eliminar las proteínas de CHO contaminantes (CHOP). No obstante, las CHOP tienden a unirse de manera no específica a ProSepA, la resina utilizada para esta etapa. ProSep A tiene la Proteína A de unión a anticuerpo inmovilizada en cristal de poro controlado cubierto de glicerol. Aunque la cubierta de glicerol reduce la unión no específica, algunas CHOP aún se adhieren a la estructura de cristal de la resina. Durante la fase de elución de la operación de Proteína A, cualquier CHOP unida de manera no específica se co-eluirá con el anticuerpo, comprometiendo la pureza del pool del producto. Para eliminar esta CHOP antes de la fase de elución, las Patentes de Estados Unidos Nº 6.127.526 y 6.333.398 (Blank, G.) ponen como ejemplo una etapa de lavado intermedio utilizando cloruro de tetrametilamonio (TMAC) para eliminar CHOP. Aunque el TMAC es efectivo en la eliminación de CHOP unida de manera no específica, es difícil de manejar y administrar, es tóxico, requiere una eliminación costosa como residuo peligroso, y es corrosivo en concentraciones altas y pH bajo. El siguiente estudio muestra que las composiciones de lavado alternativas, sin los inconvenientes de TMAC, pueden utilizarse en una etapa de lavado intermedia. Los otros tampones (tampones de equilibrado, carga, elución y regeneración) fueron como en el Ejemplo de las Patentes de Estados Unidos Nº 6.127.526 y 6.333.398.
Se cribó una amplia variedad de "tampones de lavado intermedio" con respecto al anticuerpo anti-IgE E26, el anticuerpo anti-HER2 Trastuzumab, y el anticuerpo anti-CD11a XANELIM^{TM}. Los tipos de tampón de lavado eran: (a) detergente y sal; (b) disolvente y sal; (c) polímero y sal; (d) tampón de alta concentración; y (e) urea.
Se determinaron el rendimiento de proteína, la eliminación de CHOP, y la agregación de proteína en pools de la Proteína A para cada uno de los tampones de lavado intermedios. Para todas los procesados ("runs"), el rendimiento fue superior al 94% a excepción de la solución de lavado intermedio con hexilenglicol al 20% donde la proteína era Trastuzumab. En las Figs. 2-6 se representa la eliminación de CHOP conseguida con los diversos tampones de lavado intermedios. La agregación de proteínas determinada mediante cromatografía de exclusión por tamaño era inferior al 1,5% para todos los procesados.
Los tampones de lavado intermedios preferentes, tomando en consideración la depuración de CHOP, el rendimiento final de proteína y la facilidad en el uso, fueron: (a) polisorbato/sal; (b) hexilenglicol/sal; y (c) tampón Tris de alta concentración. Se seleccionó el tampón de lavado intermedio de polisorbato/sal para estudios adicionales.
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Ejemplo 2 Alteración del tampón de lavado intermedio
Se evaluó el efecto de (a) el tipo y la concentración de sal, (b) la concentración de polisorbato, y (c) el pH del tampón de lavado intermedio en la eliminación de CHOP. Los anticuerpos eran el anticuerpo anti-IgE E26, y el anticuerpo anti-HER2 Trastuzumab.
La Fig. 7 representa el efecto del tipo y la concentración de sal en la eliminación de CHOP. Para E26, el nivel de CHOP en el pool de elución no se vio afectado significativamente por la concentración de citrato o sulfato en la solución de lavado. Para Trastuzumab, el nivel de CHOP en el pool de elución se vio afectado por la concentración de sal en el tampón de lavado intermedio. Las concentraciones preferentes de la sal iban desde aproximadamente 0,3 hasta aproximadamente 0,6 M.
También se evaluó el efecto de la concentración de polisorbato en el nivel de CHOP en el pool de elución. Tal y como se muestra en la Fig. 8, a medida que aumentaba la concentración de polisorbato en el tampón de lavado intermedio, disminuía la cantidad de contaminación por CHOP. La concentración preferente de polisorbato es desde aproximadamente 0,5% hasta aproximadamente 1%.
También se evaluó el efecto del pH en CHOP y se muestran los resultados de estos experimentos en la Fig. 9. Un pH menor dio lugar a menos contaminación por CHOP en la proteína eluída. El pH preferente es aproximadamente 5.
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Ejemplo 3 Acción corriente abajo ("downstream")
Se determinó la acción corriente abajo en términos de eliminación de CHOP, rendimiento, etc (SDS-PAGE, HPLC-IEC, cromatografía por exclusión de tamaño (SEC), y filtrado con proteína A), para E26 y Trastuzumab. Las etapas de purificación corriente abajo fueron la cromatografía de intercambio catiónico (SP-Sefarosa) y cromatografía de intercambio aniónico (Q-Sefarosa).
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Para E26, los tampones de lavado intermedio fueron: (a) polisorbato 20 al 0,5%/acetato de sodio 0,2 M, (b) hexilenglicol al 20%/citrato sódico 0,2 M, y (c) Tris acetato 1 M. Los resultados se muestran en la siguiente Tabla:
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TABLA 1
1
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Para Trastuzumab, los tampones de lavado intermedio fueron: (a) polisorbato 20 al 0,5%/acetato de sodio 0,5 M, (b) hexilenglicol al 10%/acetato sódico 0,5 M, y (c) Tris acetato 1 M. Los resultados se resumen en las Tablas siguientes.
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TABLA 2
2
TABLA 3
3
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Los rendimientos y la eliminación de CHOP fueron similares para los dos anticuerpos probados. El polisorbato, hexilenglicol y Tris mostraron una buena depuración y rendimiento de CHOP después de la cromatografía de Proteína A y posteriores etapas de cromatografía de intercambio iónico.
Se realizaron la Cromatografía por Exclusión de Tamaño (SEC) para medir el porcentaje de agregados y SDS-PAGE en pools de Q-Sefarosa. Se realizaron un Análisis de Intercambio Iónico (IEX) para medir el porcentaje del pico principal, y SEC para evaluar la agregación en pools de Proteína A y SP-Sepharose. Tanto para Trastuzumab como para E26, los ensayos mostraron resultados similares entre el control positivo (TMAC) y los tampones de lavado intermedios alternativos.
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Ejemplo 4 Reutilización de la columna
El objetivo de este experimento fue determinar si el polisorbato 20 en el tampón de lavado intermedio afecta a la vida de la resina. Se reciclaron tampones (equilibrado, lavado intermedio de polisorbato 20, elución y regeneración) en una columna de 6,84 ml (0,66 cm x 20 cm) durante 400 ciclos. Se realiza una curva de ruptura de HER2 cada 50 ciclos para determinar la capacidad de unión de la resina. La descripción actual para la capacidad de unión máxima es 20 gramos de anticuerpo por litro de resina. Un descenso en la capacidad de unión con ciclos crecientes indicaría que el polisorbato 20 reduce la vida de la resina. Este experimento demostró que el polisorbato 20 no reduce la vida de la resina. La reutilización se ha completado en realidad durante 140 ciclos y no se ha observado ningún cambio en el rendimiento.
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Referencias citadas en la descripción
Esta lista de referencias citadas por el solicitante está prevista únicamente para ayudar al lector y no forma parte del documento de patente europea. Aunque se ha puesto el máximo cuidado en su realización, no se pueden excluir errores u omisiones y la OEP declina cualquier responsabilidad en este respecto.
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Claims (12)

1. Procedimiento para purificar una proteína, que comprende una región C_{H}2/C_{H}3, de una solución contaminada de la misma mediante cromatografía de Proteína A, que comprende:
(a) adsorber la proteína de dicha solución contaminada a la Proteína A inmovilizada en una fase sólida;
(b) eliminar los contaminantes mediante el lavado de la fase sólida con una composición que comprende detergente en una concentración entre aproximadamente 0,01% y aproximadamente 5% y sal a una concentración de entre aproximadamente 0,1 M y aproximadamente 2 M, teniendo la composición un pH de aproximadamente pH 4,5 a aproximadamente 5,5; y
(c) recuperar la proteína de la fase sólida con un tampón de elución que tiene un pH en el intervalo de aproximadamente 2 a aproximadamente 5.
2. Procedimiento según la reivindicación 1, en el que la fase sólida comprende sílice, vidrio, agarosa o poliestireno.
3. Procedimiento según la reivindicación 2, en el que la fase sólida comprende sílice o vidrio.
4. Procedimiento según la reivindicación 1, en el que la proteína es un anticuerpo o una inmunoadhesina.
5. Procedimiento según la reivindicación 1, en el que la proteína es un anticuerpo.
6. Procedimiento según la reivindicación 5, en el que el anticuerpo se une a un antígeno seleccionado del grupo que consiste en HER2, factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF), IgE, CD20, CD40, CD11a, factor tisular (TF), antígeno de células madre de próstata (PSCA), interleuquina-8 (IL-8), receptor del factor de crecimiento epidérmico (EGFR), HER3, HER4, \alpha4\beta7 y \alpha5\beta3.
7. Procedimiento según la reivindicación 5, en el que el anticuerpo es un anticuerpo anti-HER2.
8. Procedimiento según la reivindicación 5, en el que el anticuerpo es un anticuerpo anti-IgE.
9. Procedimiento según la reivindicación 1, en el que el detergente es polisorbato.
10. Procedimiento según la reivindicación 9, en el que la concentración del polisorbato en la composición es de aproximadamente 0,1 a aproximadamente 1%.
11. Procedimiento según la reivindicación 1, en el que la sal es acetato o citrato.
12. Procedimiento según la reivindicación 1, en el que la concentración de la sal en la composición es de aproximadamente 0,2 a aproximadamente 0,6 M.
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