ES2321122T3 - Antagonistas de quimiocinas cc. - Google Patents
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Abstract
Un polipéptido seleccionado del grupo que consiste en: a) una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos de ChBP-59 (SEC ID NO: 5); b) una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos de ChBP-59 maduro (SEC ID NO: 6); c) una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos de ChBP-59-HIS (SEC ID NO: 17); d) una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos de ChBP-59-HIS maduro (SEC ID NO: 18); e) una proteína codificada por una molécula de ácido nucleico capaz de hibridación a una secuencia de ácido nucleico que codifica una proteína de a), b), c) o d) bajo condiciones moderadamente rigurosas, codificando dicho ácido nucleico una proteína que se une a una quimiocina CC; f) una proteína por lo menos aproximadamente 70% idéntica en secuencia de aminoácidos a una proteína de a), b), c) o d), y que se une a una quimiocina CC; g) una proteína que comprende un fragmento de una proteína de a), b), c), d), o) o f), en donde el fragmento se une a una quimiocina CC.
Description
Antagonistas de quimiocinas CC.
La invención se refiere a nuevos antagonistas de
quimiocinas CC y sus usos, particularmente como compuestos
antiinflamatorios y en el tratamiento o la prevención de
enfermedades relacionadas con las quimiocinas CC.
Las quimiocinas son pequeñas proteínas
proinflamatorias segregadas, que median la migración direccional de
los leucocitos de la sangre hacia el sitio de lesión. Dependiendo de
la posición de las cisteínas conservadas que caracterizan esta
familia de proteínas, la familia de quimiocinas puede dividirse
estructuralmente en quimiocinas C, CC, CXC y CX_{3}C que se unen
a una serie de receptores de membrana (Baggiolini M et al.,
1997; Fernandez EJ y Lolis E, 2002). Estos receptores de membranas,
todos receptores acoplados a la proteína G heptahelicoidal,
permiten que las quimiocinas ejerzan su actividad biológica en las
células diana, que pueden presentar combinaciones específicas de
receptores de acuerdo a su estado y/o tipo. Los efectos fisiológicos
de las quimiocinas son producidos por un complejo y un sistema
integrado de interacciones concurrentes: los receptores a menudo
tienen especificad de ligandos que se superpone, de modo que un
receptor individual puede unirse a diferentes quimiocinas. Una
quimiocina individual puede también unirse a diferentes
receptores.
Los estudios sobre las relaciones entre
estructura y actividad indican que las quimiocinas tienen dos sitios
principales de interacción con sus receptores, la región flexible
aminoterminal y el bucle conformacionalmente rígido que sigue a la
segunda cisteína. Se cree que las quimiocinas se acoplan a los
receptores mediante la región de bucle, y se piensa que este
contacto facilita la unión de la región aminoterminal que produce la
activación del receptor.
Usualmente, las quimiocinas se producen en el
sitio de lesión y causan la migración y activación de los
leucocitos, desempeñando un papel fundamental en los procesos
inflamatorios, inmunitarios, homeostásicos, hematopoyéticos y
angiogénicos. Por lo tanto, estas moléculas se consideran buenos
candidatos diana para la intervención terapéutica en enfermedades
asociadas a dichos procesos. La inhibición de las quimiocinas, o de
sus receptores, puede reducir la maduración, reclutamiento y
activación de leucocitos, como también otros procesos patológicos
asociados con angiogénesis o arteriosclerosis (Baggiolini M, 2001;
Loetscher P y Clark-Lewis I, 2001; Godessart N y
Kunkel SL, 2001).
Además de las quimiocinas inhibidoras mutantes,
los anticuerpos y péptidos, y los inhibidores de moléculas pequeñas
que bloquean los receptores, la búsqueda de antagonistas eficaces de
quimiocinas también se ha extendido a una serie de virus y otros
organismos que, cuando se pongan en contacto con hospedantes humanos
o mamíferos, muestren potentes actividades inmunomoduladoras que
afecten al hospedante.
El mimitismo vírico de las citocinas,
quimiocinas y sus receptores puede indican estrategias de modulación
inmunitaria para desarrollar productos terapéuticos (Alcami A,
2003; Lindow M et al., 2003). Recientemente, se han revisado
los factores inmunomoduladores expresados por artrópodos hematófagos
(como mosquitos, jejenes y garrapatas) (Gillespie, RD et
al., 2000).
En particular, las glándulas salivales de las
garrapatas producen una mezcla compleja de moléculas bioactivas que
tienen, en particular, actividades antiinflamatorias,
antihemostáticas y antiinmunitarias. Éstas incluyen proteínas
bioactivas que controlan la histamina, se unen a las
inmunoglobulinas o inhiben la cascada de complemento alternativa u
otras proteasas.
A pesar de la gran cantidad de bibliografía,
solamente algunos artículos mencionan las secuencias de cDNA
identificadas por secuenciación aleatoria y cribados diferenciales
de colecciones generadas a partir de diversas garrapatas y/o
especies. No obstante, la gran mayoría de estas secuencias no se
caracterizan bioquímica o funcionalmente, y muchas anotaciones se
realizan solamente en base a la similitud de secuencia con proteínas
conocidas implicadas en las funciones celulares básicas, como
aquellas previamente caracterizadas en las glándulas salivales de
garrapatas por actividades enzimáticas o por inducir respuestas de
anticuerpos. En particular, no hay indicios de que las proteínas de
garrapatas actúen como proteínas de unión a las quimiocinas CC ni
de que funcionen como antagonistas de las quimiocinas CC.
Sorprendentemente, se ha descubierto que la
saliva de Rhipicephalus sanguineus (garrapata canina)
contiene una nueva proteína denominada ChBP-59, que
se une a las quimiocinas CC e inhibe su actividad. Se clonó
ChBB-59 de una colección de cDNA de
Rhipicephalus sanguineus y se expresó en células mamíferas.
Esta proteína, como también sus derivados, fragmentos o miméticos,
se pueden usar terapéuticamente, p. ej., como antagonistas de
quimiocinas CC en organismos de mamíferos, o como dianas para la
vacunación y el control de garrapatas y de patógenos transmitidos
por garrapatas.
Un primer aspecto de la invención se refiere,
por lo tanto, a un polipéptido que comprende la secuencia de
aminoácidos de ChBP-59 o su fragmento o análogo. Los
polipéptidos preferidos de la presente invención se unen a una
quimiocina CC, e inhiben su
\hbox{actividad biológica. Un
ejemplo específico de dicho polipéptido es ChBP-59
o su fragmento.}
Un segundo aspecto de la invención se refiere a
moléculas de ácido nucleico que codifican un polipéptido tal como
se definió anteriormente. Dichos ácidos nucleicos también incluyen
oligonucleótidos aislados de ellos y vectores que contienen dichas
moléculas, en particular vectores de expresión.
Un tercer aspecto de la presente invención se
refiere a anticuerpos que se unen selectivamente a los polipéptidos
anteriormente definidos.
Un cuarto aspecto de la presente invención se
refiere a células hospedantes y a animales no humanos transgénicos
que expresan un polipéptido como el anteriormente definido, como
también a métodos para producir dichas células y animales no
humanos transgénicos.
Un quinto aspecto de la presente invención es un
procedimiento para preparar un polipéptido según se definió
anteriormente, típicamente usando tecnologías recombinantes.
Un sexto aspecto de la invención es una
composición farmacéutica (incluyendo una vacuna o inmunógeno) que
comprende un polipéptido o molécula de ácido nucleico según se
definió anteriormente y un vehículo farmacéuticamente
aceptable.
Un séptimo aspecto de la invención se refiere al
uso de un polipéptido o molécula de ácido nucleico según se definió
anteriormente para la preparación de un medicamento para regular una
respuesta inmunitaria o inflamatoria en un mamífero.
Otras características y ventajas de la invención
serán obvias a partir de la siguiente descripción detallada.
Figura 1: Alineación de la secuencia de cDNA de
ChBP-59 con la secuencia de la proteína
ChBP-59 codificada por el Marco de Lectura Abierto
(ORF) relevante. La secuencia de señal (residuos
1-20, según lo pronosticado por el algoritmo
SIGNALJ) se encuentra subrayada. El sitio de poliadenilación
pronosticado está recuadrado. Los residuos Cisteína presentes en la
proteína madura están resaltados. Los sitios de glucosilación unidos
a N pronosticados están en negrita.
Figura 2: Alineación de cDNA de
ChBP-59 compatible con Gateway que contiene los
sitios flanqueadores attB obtenidos por dos tandas sucesivas de
PCR. Las flechas indican la posición y el sentido de los cebadores
PCR relevantes (que se resumen en la Tabla III). Los codones de
comienzo y finalización están en negrita. Los aminoácidos que
forman la secuencia de señal están subrayados.
Figura 3: (A) Mapa del vector de entrada
pDONR221_ChBP-59-HIS para el sistema
de clonación Gateway. B) Mapa del vector de expresión
pDEST8_ChBP-59-HIS en células de
insectos (TN5). (C) Mapa del vector de expresión
pEAK12d_ChBP-59-HIS para la
expresión en células de mamífero (HEK293/EBNA).
Figura 4: 10% SDS-gel de
poliacrilamida (SDS-PAGE) con solución azul de
Coomassie que muestra el peso molecular de
ChBP-59-HIS purificado de células
HEK293 y células TN5 infectadas con baculovirus (marcadas BV en la
fig. 4) usando cromatografía de afinidad Ni^{2+} y de intercambio
aniónico. Los patrones de peso molecular se indican a la izquierda
(M_{R}).
Figura 5: Autorradiografía del
SDS-PAGE que muestra los complejos formados por el
entrecruzamiento de la quimiocina CC
^{125}l-marcada CCL3/MIP-1 alfa
con ChBP-59-HIS recombinante
expresado en proteína de células HEK293 (HEK) o células TN5 de
insecto (TN5), con la proteína de unión a la quimiocina CC vírica
(vCCI, control positivo), con saliva de garrapata en bruto de
Rhipicephalus sanguineus (RSs) o con Albúmina de Suero Bovino
(BSA, control negativo). Las proteínas no marcadas se añadieron a
la quimiocina CC radiomarcada
(^{125}I-CCL3/MIP-1alfa) en
presencia (+) o ausencia (-) del agente de entrecruzamiento
(BS^{3}). Los patrones de peso molecular (en Kd) se indican a la
izquierda (M).
Figura 6: Actividad de unión de la quimiocina CC
de ChBP-59-HIS recombinante
purificado de células de insectos infectados con baculovirus. El
efecto inhibidor de ChBP-59-HIS se
midió por adición de diluciones en serie de la proteína
recombinante hasta una cantidad constante de un receptor de
quimiocina inmovilizado por perlas SPA (CCR5) y de CCL5/RANTES (A),
CCL3/MIP-1 alfa (B)_{t} o
CCL2/MCP-1 (C) radiomarcado.
Figura 7: Efecto inhibidor de
ChBP-59-HIS en un ensayo que mide la
quimiotaxia inducida por
CCL3/MIP-1alfa-y CCL5/RANTES en
células L1.2 de ratón que expresan el receptor de quimiocina CC,
CCR5. La quimiocina CC se añadió a una concentración constante (1,0
nM) en las diferentes muestras que tenían una concentración molar
en aumento (expresada en Log) de
ChBP-59-HIS. Las unidades de
Fluorescencia son proporcionales al número de células migradas.
Figura 8: Efecto inhibidor de
ChBP-59-6His sobre el reclutamiento
peritoneal inducido por CCL3/MIP-1\alpha. Se
administró ChBP-59-6His por vía
subcutánea a una dosis de 1,5 mg/kg, 45 min antes de la
administración de CCL3/MIP-1\alpha a 0,15 mg/kg
por vía intraperitoneal. Después de 18 h, los ratones se
sacrificaron y se enumeró el número de células reclutadas en la
cavidad peritoneal.
Figura 9: Dosis y respuesta del efecto inhibidor
de ChBP-6His sobre el reclutamiento peritoneal
inducido por CCL3/MIP-1a en dos cepas de murino. Se
administró ChBP-59-6His por vía
subcutánea en diversas dosis, 45 min antes de la administración de
CCL3/MIP-1\alpha a 0,5 mg/kg por vía
intraperitoneal. Después de 18 h, se enumeró el número de
granulocitos reclutados en la cavidad peritoneal. A) Balb/C B) cepa
de ratón C57B6.
Figura 10: Visualización del proceso de
reclutamiento celular por microscopia intravital. Se inyectaron
juntos MIP-1\alpha (0,15 mg/kg) o
ChBP-59 (0,5 mg/kg) y MIP-1a (0,15
mg/kg) por vía intraescrotal. Después de 1 h, se extirpó el músculo
cremáster y se observó la circulación con el microscopio intravital
y se tomaron los registros para el análisis independiente. A)
Rodaje. B) Adhesión. C) Emigración.
Figura 11: Efecto inhibidor de
ChBP-59-6His sobre el reclutamiento
celular de Th2 en los pulmones. Se sensibilizaron ratones con 2.500
huevos de Schistosoma mansoni por vía intraperitoneal en el
día 1 y en el día 7. Siete días después, se expusieron a antígeno
de huevo de Schistosoma (SEA) por vía intransal. Seis días después,
se administró ChBP-6His s.c. a 0,5 mg/kg 45 min
antes de una segunda exposición a SEA por vía intratraqueal, y se
proporcionó una segunda administración de ChBP-6His
a 0,5 mg/kg, 24 h más tarde. Después de 48 h, se extrajo fluido BAL
para enumeración celular. A) células totales. B) eosinófilos. C)
células mononucleares.
Figura 12: Efecto inhibidor de
ChBP-59-6His sobre la inflamación
pulmonar inducida por ovalbúmina. Se inmunizaron los ratones dos
veces con ovalbúmina en Al(OH)_{3} (alum). Después
de 14 días, se expusieron a la prueba con ovalbúmina en aerosol al
1% ovalbúmina aerosol durante 20 min. Se administró
ChBP-59-6His a 0,5 mg/kg s.c., 45
min antes de la exposición al aerosol y posteriormente cada 12 h. Se
extrajo BAL 2 días después de la exposición al aerosol para
enumeración celular. A) células totales. B) eosinófilos. C) células
mononucleares.
Figura 13: Efecto inhibidor de
ChBP-59-6His sobre inflamación
pulmonar inducida por bleomicina. Los ratones se sensibilizaron con
0,125 unidades de bleomicina por vía intratraqueal en el día 0.
Antes de la sensibilización, se trataron con
ChBP-59-6His a 0,5 mg/kg s.c., 45
min antes de la administración de bleomicina, y posteriormente con
la misma dosis cada 12 h durante los 12 días siguientes. Los ratones
que se analizaron en el día 2 después de la sensibilización se
trataron con 3 dosis de
ChBP-59-6His. En el día 2 o en el
día 8, se extrajo BAL para enumeración celular. A) células totales.
B) eosinófilos C) células mononucleares.
La presente invención provee nuevas
composiciones y métodos para regular la actividad de las
quimiocinas. Más particularmente, la presente invención describe
una nueva proteína que tiene propiedades de unión a la quimiocina
CC, que se puede usar para inhibir la acción de la quimiocina. Los
ejemplos demuestran que esta proteína, que deriva de saliva de
garrapata, se puede expresar y purificar en forma recombinante, y se
une eficazmente a las quimiocinas CC e inhibe su acción, p. ej., la
respuesta quimiotáctica específica de las células inducida por una
quimiocina
CC.
CC.
Un primer aspecto de la invención reside, por lo
tanto, en un polipéptido ChBP-59, es decir,
cualquier polipéptido que comprenda la secuencia de aminoácidos de
ChBP-59 o su fragmento o análogo. Los polipéptidos
preferidos de la presente invención se unen a una quimiocina CC e
inhiben la actividad de dicha quimiocina. Los polipéptidos
particulares de la presente invención se seleccionan del grupo que
consiste en:
a) una proteína que comprende una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59 (SEC ID NO: 5);
b) una proteína que comprende una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59 maduro (SEC ID NO: 6);
c) una proteína que comprende una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59-HIS (SEC ID
NO: 17);
d) una proteína que comprende una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59-HIS maduro
(SEC ID NO: 18);
e) una proteína codificada por una molécula de
ácido nucleico capaz de hibridación a una secuencia de ácido
nucleico que codifica una proteína de a), b), c) o d) bajo
condiciones moderadamente rigurosas, en donde dicha molécula de
ácido nucleico codifica una proteína que se une a una quimiocina CC
e inhibe la actividad de dicha quimiocina;
f) una proteína por lo menos aproximadamente 70%
idéntica en secuencia de aminoácidos a la proteína de a), b), c) o
d) y que se une a una quimiocina CC e inhibe la actividad de dicha
quimiocina;
g) una proteína que comprende un fragmento de
una proteína de a), b), c), d), e) o f), en donde el fragmento
retiene la capacidad de unirse a una quimiocina CC e inhibe la
actividad de dicha quimiocina.
En una realización preferida, la proteína se
selecciona del grupo que consiste en:
a) una proteína que tiene una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59 (SEC ID NO: 5);
b) una proteína que tiene una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59 maduro (SEC ID NO 6);
c) una proteína que tiene una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59-HIS (SEC ED
NO: 17);
d) una proteína que tiene una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59-HIS maduro
(SEC ID NO: 18);
e) una proteína que comprende un fragmento de
una proteína de a), b), c) o d), en donde el fragmento se une a una
quimiocina CC e inhibe la actividad de dicha quimiocina.
Los polipéptidos de la invención pueden estar en
forma madura, resultante de una o más modificaciones
post-transicionales (glucosilación, fosforilación,
modificación con endo/exopeptidasas para eliminar el péptido de
señal, por ejemplo) o de una adición dentro del marco de la
secuencia que codifica secuencias heterólogas (como marcadores o
dominios que mejoran la detección y/o la purificación). Por ejemplo,
ChBP-59 se ha expresado como proteína marcada con
histidina recombinante en la forma completa (SEC ID NO: 17) y en la
forma madura (SEC ID NO: 18), en líneas celulares tanto de mamífero
como de insecto.
Los polipéptidos de la presente invención o sus
correspondientes ácidos nucleicos pueden estar en forma aislada (p.
ej., no en su entorno natural), incluyendo ácidos nucleicos y
polipéptidos recombinantes o sintéticos.
Los ejemplos muestran que los polipéptidos
ChBP-59 se unen a las quimiocinas CC y se pueden
utilizar para inhibir (p. ej., reducir) su actividad. Esta
caracterización se realizó haciendo uso de una serie de ensayos
bioquímicos, incluyendo el uso de quimiocinas CC radiactivas, o
ensayos funcionales que incluyen ensayos basados en células, como
también modelos de enfermedad animal in vivo. Como se
demuestra en los ejemplos, los polipéptidos ChBP-59
se unen, en particular, a las quimiocinas CC tales como CCL5/RANTES,
CCL3/MIP-1 alfa o CCL2/MCP-1, o en
general a las quimiocinas CC que se unen a los receptores CCR1 o
CCR5. La proteína ChBP-59 se puede considerar una
proteína de unión a la quimiocina CC de amplio espectro,
reconociendo otras quimiocinas CC tales como TARC/CCL17,
CCL18/PARC, CCL4/MIP-1 beta, MDC/CCL22,
MCP-3/CCL7, MCP-2/CCL7 y
Eotaxina/CCL11, no obstante con actividades diferentes. Dicho
espectro de actividad confiere a los polipéptidos
ChBP-59 de la presente invención una amplia gama de
utilidad terapéutica, como se analizará a continuación.
Dentro del contexto de la presente invención, un
fragmento de un polipéptido designa cualquier fragmento que
comprende por lo menos 5, 7, 7, 8, 9 ó 10 residuos aminoácido
consecutivos de dicha secuencia de polipéptidos. Los fragmentos
particulares de la presente invención comprenden 15, 20, 25 o más
residuos aminoácido de una proteína ChBP-59, tal
como se describe en esta memoria. Los fragmentos preferidos retienen
la capacidad de unir a la quimiocina por lo menos una actividad
biológica de una proteína de longitud total, p. ej., una actividad
inmunogénica o una actividad inmunomoduladora.
En este sentido, dentro del contexto de la
presente invención, actividad "inmunomoduladora" designa
cualquier actividad detectada in vitro o in vivo que
afecta la respuesta inmunitaria o bien en un modo positivo o
negativo. Los ejemplos de dichas actividades son actividades
inmunizantes, actividades inmunosupresoras, actividades
antiinflamatorias, actividades pro-/anti-apoptóticas
o actividades antitumorales.
Alternativamente, el fragmento se puede
identificar por proveer actividad inmunizante cuando se administra
a un mamífero. Estos fragmentos deben tener propiedades antigénicas
e inmunogénicas apropiadas para provocar una respuesta inmunitaria
cuando sea necesaria (por ejemplo, contra garrapatas u organismos
patógenos transmitidos por garrapatas). La bibliografía proporciona
muchos ejemplos de cómo dichas secuencias funcionales pueden
identificarse como antígenos de vacunas experimentales, y
eventualmente administrarse con adyuvantes y/o entrecruzarse con un
vehículo. (Mulenga A et al. 2000; WO 01/80881; WO 03/030931;
WO 01/87270). Se puede usar un antígeno o grupo de antígenos
específico identificado en ChBP-59 para prevenir o
reducir la infección o enfermedad ectoparasitaria en un animal, de
modo que la inmunidad del animal al ectoparásito se refuerce por
exposición natural del animal al ectoparásito (WO 95/22603).
Finalmente, el fragmento se puede utilizar también para producir
anticuerpos dirigidos a toda la proteína para aplicaciones de
detección o diagnóstico.
Las propiedades de ChBP-59
anteriormente definidas y ejemplificadas en esta memoria, que usan
variantes recombinantes de esta secuencia, se pueden mantener o
incluso potenciar en los mutantes activos. Esta categoría de
moléculas incluye análogos naturales o sintéticos de dicha
secuencia, en donde se han añadido, eliminado o sustituido uno o
más residuos aminoácido, siempre que exhiban la misma actividad
biológica caracterizada en la presente invención a niveles
comparables o superiores, según lo determinado por lo que se
describe en los Ejemplos a continuación.
En particular, el término "activo"
significa que dichos compuestos alternativos deben mantener, o
incluso potenciar, las propiedades de inmunomodulación y unión a la
quimiocina CC de ChBP-59.
Las moléculas mutantes activas se pueden generar
por técnicas de mutagénesis dirigida al sitio, tecnologías
combinatorias al nivel de la secuencia de DNA codificante (como
barajado de DNA, visualización/selección de fagos) o por estudios
de diseño asistido por ordenador, o cualquier otra técnica conocida
adecuada, que proporcione un conjunto finito de péptidos o
polipéptidos sustancialmente mutados o acortados en forma
correspondiente. Estas moléculas alternativas se pueden obtener y
ensayar rutinariamente por el experto en la técnica, usando las
enseñanzas presentadas en la técnica anterior y en los Ejemplos que
siguen.
De acuerdo con la presente invención, los
cambios preferidos en estos mutantes activos se conocen comúnmente
como sustituciones "conservadoras" o "seguras", e implican
residuos no básicos. Las sustituciones de aminoácidos conservadoras
son aquellas con aminoácidos que tienen propiedades químicas
suficientemente similares, con el fin de conservar la estructura y
la función biológica de la molécula. Está claro que las inserciones
y deleciones de aminoácidos pueden además elaborarse en las
secuencias anteriormente definidas sin alterar su función,
particularmente si las inserciones implican solamente unos pocos
aminoácidos, p. ej., menos de diez y preferiblemente menos de tres,
y no eliminan ni desplazan aminoácidos que son críticos para la
conformación funcional de una proteína o péptido.
La bibliografía provee muchos modelos mediante
los cuales se puede llevar a cabo la selección de sustituciones de
aminoácidos conservadoras en base a estudios estadísticos y de
físico-química de la secuencia y/o la estructura de
la proteína natural (Rogov SI y Nekrasov AN, 2001). Los experimentos
de diseño de proteínas han demostrado que el uso de subconjuntos
específicos de aminoácidos pueden producir proteínas plegables y
activas, ayudando a la clasificación de sustituciones
"sinónimas" de aminoácidos que se pueden acomodar más
fácilmente en la estructura de la proteína y que se pueden usar
para detectar homólogos y parálogos de ChBP-59
funcionales y estructurales (Murphy LR et al., 2000). Los
grupos aminoácidos sinónimos y los grupos sinónimos más preferidos
para las sustituciones son aquellos definidos en la Tabla I.
No obstante, en el contexto de la secuencia de
ChBP-59, los residuos específicos pueden tener
particular importancia. Por ejemplo, ChBP-59 no es
significativamente homólogo a cualquier proteína conocida pero
contiene un número par de residuos cisteína en la proteína madura,
en particular en la posición correspondiente a 32, 49, 53, 66, 85,
90, 95 y 104 en ChBP-59 de longitud total de acuerdo
con la SEC ID NO: 5. No obstante, ChBP-59 contiene
tres sitios de glucosilación potenciales en la posición
correspondiente a Asparagina 39, 54, y 62 de ChBP-59
de longitud total de acuerdo con la SEC ID NO: 5. Estos residuos
pueden ser importantes para el correcto pliegue y/o actividad, y
preferiblemente deben conservarse en las correspondientes posiciones
de estos polipéptidos alternativos. Alternativamente, las cisteínas
sustituidas o los sitios de glucosilación pueden restablecerse en
una posición diferente de la proteína.
Alternativamente, los mutantes activos de
ChBP-59 pueden ser la consecuencia de alteraciones
de secuencia que reducen la inmunogenicidad de dicha proteína de
unión a la quimiocina CC cuando se administra a un mamífero. La
bibliografía provee muchos ejemplos de estas alteraciones de
secuencia que se pueden diseñar e introducir en este alcance o para
otras optimizaciones funcionales que permiten una administración
segura y eficaz de una proteína terapéutica, especialmente cuando
es una proteína no humana, no mamífera o no natural (Schellekens H,
2002). Los ejemplos de planteamientos técnicos para lograr estas
moléculas son la evolución dirigida (Vasserot AP et al.,
2003), el diseño racional (Marshall SA et al., 2003), la
bioinformática (Gendel SM, 2002), la identificación y
neutralización de epítopos de células T CD4+ (WO 03/104263; WO
03/006047; WO 02/98454; WO 98/52976; WO 01/40281), la fusión con
otras secuencias de proteínas (WO 02/79415; WO 94/11028) o la
conjugación con otros compuestos (WO 96/40792).
Las secuencias derivadas de
ChBP-59 activas pueden ser análogos u ortólogos
naturales de ChBP-59 que se pueden aislar, en
particular, de otras especies de garrapata, en particular aquellas
que pertenecen a la familia Ixodidae, y más en particular, a
la subfamilia Rhipicephalinae, a la cual pertenece
Rhipicephalus sanguineus, como también otras subfamilias
como Ixodinae (que incluye Ixodes scapularis e
Ixodes ricinus) o Amblyomminae (que incluye
Amblyomma variegatum y Amblyomma americanum).
Alternativamente, se pueden identificar ortólogos en mamíferos,
como de ser humano y ratón.
Se dispone de información limitada sobre el
genoma y el transcriptoma de artrópodos hematófagos, y mayormente
se asocia con secuencias ribosómicas y mitocondriales, que se
estudiaron para determinar las relaciones filogenéticas en base a
su conservación (Murrell A et al., 2001). Los datos genómicos
de la garrapata están disponibles solamente en formatos parciales y
preliminares (Ullmann AJ et al, 2002), pero se pueden
realizar otros análisis de los genes de garrapata que codifican las
proteínas de unión a la quimiocina CC mediante el uso de DNA
genómico que puede extraerse de garrapatas ixodidas aplicando
condiciones y métodos específicos (Hill CA y Gutierrez, J A 2003),
en particular para detectar cualquier polimorfismo significativo en
proteínas de glándula salival, como ya se demostró (Wang H et
al., 1999). Las secuencias genómicas y de proteínas de estos
organismos son importantes para entender su fisiología y biología,
proporcionando así información útil para entender la función de las
proteínas de la invención en las relaciones entre hospedantes,
parásitos y patógenos transmitidos por parásitos (Valenzuela JG,
2002b).
La caracterización bioquímica y fisiológica de
las actividades de unión a la quimiocina CC descrita para la
proteína homóloga a ChBP-59 en la presente invención
se puede realizar aplicando cualquiera de las tecnologías
recientemente mejoradas para el estudio de garrapatas y patógenos
transmitidos por garrapatas, como electroforesis en gel
bidimensional (Madden RD et al., 2004) o interferencia de RNA
(Aijamali MN et al, 2003). Además, se pueden realizar otros
estudios para mapear el sitio de reconocimiento de la quimiocina CC
en estas proteínas y los mecanismos del antagonismo de la
quimiocina CC (Véase BT et al., 2001; Beck CG et al.,
2001; Burns JM et al., 2002; Webb LM et al., 2004) o
para identificar las modificaciones
post-transicionales relevantes
(Alarcon-Chaidez FJ et al., 2003).
Otro aspecto de la invención son proteínas de
fusión que comprenden un polipéptido ChBP-59, como
se definió anteriormente, operativamente unido a un dominio
heterólogo, p. ej., una o más secuencias de aminoácidos que pueden
seleccionarse de lo siguiente: un dominio extracelular de una
proteína unida a una membrana, regiones constantes de
inmunoglobulina (región Fc), dominios de multimerización, señales de
exportación y secuencias de marcadores (como aquellas que ayudan a
la purificación por afinidad: marcador HA, marcador Histidina, GST,
péptidos FLAAG o MBP).
En el contexto de una proteína de fusión, la
expresión "operativamente unido" indica que el polipéptido
ChBP-59 y las secuencias de aminoácidos adicionales
se asocian a través de enlace(s) peptídicos, o bien
directamente o vía residuos espaciadores (p. ej., un enlazador), en
este modo, la proteína de fusión puede producirse en forma
recombinante, por expresión directa en una célula hospedante de una
molécula de ácido nucleico que codifica la misma, como se analizará
a continuación. Además, si es necesario, las secuencias de
aminoácidos adicionales incluidas en la proteína de fusión se
pueden eliminar, o bien al final de proceso de
producción/purificación o in vivo, p. ej., mediante una
endo-/exopeptidasa apropiada, como se analizará a continuación. El
resto heterólogo puede estar operativamente unido a la porción
N-terminal o C-terminal del
polipéptido ChBP-59.
El diseño de los restos y/o enlazadores, como
también los métodos y estrategias para la construcción,
purificación, detección, maduración y uso de las proteínas de
fusión se analiza ampliamente en la bibliografía (Nilsson J et
al., 1997; "Applications of chimeric genes and hybrid
proteins" Methods Enzymol. Vol. 326-328, Academic
Press, 2000). En general, las secuencias heterólogas tienen como
fin proveer propiedades adicionales sin debilitar la actividad
terapéutica de la proteína original (unión a la quimiocina CC, por
ejemplo) en un modo significativo. Los ejemplos de dichas
propiedades adicionales son un procedimiento más simple de
purificación, una semivida más prolongada en los fluidos
corporales, un resto de unión adicional, la maduración mediante una
digestión endoproteolítica, la estabilidad durante la producción
recombinante o la localización extracelular. Esta última
característica es de particular importancia para definir un grupo
específico de proteínas de fusión o quiméricas incluidas en la
definición anterior, ya que permite que los polipéptidos se
localicen en el espacio en donde se facilita el aislamiento y la
purificación de estos polipéptidos, y en donde las quimiocinas CC
normalmente están activas.
La opción de que una o más de estas secuencias
se condensen a un polipéptido ChBP-59 es funcional
al protocolo de uso y/o purificación de dicha proteína como
proteína recombinante. Por ejemplo, la actividad de
CHBP-59 se ensayó en los ejemplos mediante una
proteína de fusión que incluye una secuencia del marcador histidina,
facilitando tanto la detección como la purificación de
CHBP-59. Estas secuencias se pueden elegir entre los
siguientes tres grupos básicos de secuencias heterólogas.
Un primer grupo de dichas secuencias consiste en
ayudar a la secreción y la purificación de la proteína usando
tecnologías de DNA recombinante, como un péptido de señal y señales
de exportación (Rapoport TA et al., 1996), o secuencias de
marcadores que ayudan a la purificación por afinidad (marcador HA,
marcador Histidina, GST, FLAG o MBP).
Un segundo grupo de secuencias heterólogas se
representa mediante aquellos que permiten una mejor estabilidad y
bioactividad de las proteínas.
Un ejemplo típico de una estrategia que permite
una semivida prolongada de una proteína es la fusión con albúmina
de suero humano o con péptidos y otras secuencias modificadoras (p.
ej., por miristoilación) que permiten la unión a albúmina de suero
humano circulante (Chuang VT et al., 2002; Graslund T et
al., 1997; WO 01/77137). Alternativamente, la secuencia
adicional puede ayudar a direccionar hacia la localización
específica, como en el cerebro (WO 03/32913).
Otra forma de mejorar la estabilidad de una
proteína recombinante cuando se administra a un sujeto consiste en
generar multímeros de la proteína, condensando dominios aislados de
otras proteínas, lo cual permite la formación de dímeros, trímeros,
etc. Los ejemplos de secuencias de proteínas que permiten la
multimerización de los polipéptidos de la invención son dominios
aislados de proteínas tales como hCG (WO 97/30161), colágeno X (WO
04/33486), C4BP (WO 04/20639), proteínas Erb (WO 98/02540) o
péptidos con bobinas bobinadas (WO 01/00814).
Un ejemplo muy conocido de dichas proteínas de
fusión se representa por la región constante/Fc de las proteínas de
la inmunoglobulina humana, lo que permite la dimerización común a
inmunoglobulinas humanas. En la bibliografía, se describen
diferentes estrategias para generar la proteína de fusión que
comprende una proteína terapéutica y un fragmento de
inmunoglobulina (WO 91/08298; WO 96/08570; WO 93/22332; WO
04/085478; WO 01/03737, WO 02/66514). Por ejemplo, la secuencia de
ácido nucleico que codifica CHBP-59 maduro se puede
clonar en un vector de expresión condensado a una secuencia de
ácido nucleico que codifica la secuencia de señal de
CHBP-59 original (o cualquier otra secuencia de
señal/exportación apropiada) en su extremo 5', y la secuencia de
ácido nucleico que codifica la región constante de cadena pesada
lambda de inmunoglobulina humana IgG1 (NCBI Acc. No. CAA75302;
segmento 246-477) en su extremo 3'. El vector
resultante se puede emplear para transformar una línea celular de
CHO o HEK293, y se pueden seleccionar clones que expresan y
segregan establemente la proteína de fusión recombinante que tiene
CHBP-59 en el término N y la secuencia IgG1 en el
término C. Una vez hecho esto, se pueden utilizar para aumentar a
escala la producción y para purificar la proteína de fusión
recombinante del medio de cultivo. Alternativamente, la posición
del ácido nucleico que codifica la región constante de la cadena
pesada lambda de inmunoglobulina humana IgG1 y
CHBP-59 se puede invertir, y la proteína resultante
se puede expresar y segregar usando incluso la secuencia de señal
original de CHBP-59 o cualquier otra secuencia de
señal/exportación apropiada. Usando esta tecnología, puede ser
también posible generar heterodímeros si los dos constructos
diferentes que expresan una proteína de fusión
CHBP-59-Fc y el otro una proteína de
fusión diferente basada en Fc (por ejemplo, otro antagonista de la
quimiocina CC) se co-expresan en la misma célula
hospedante (WO 00/18932).
Otro grupo de secuencias heterólogas se
representa por aquellas que añaden una actividad funcional adicional
que puede sinergizar o ampliar las que se muestran mediante
CHBP-59. Estas secuencias, que se espera que se
aíslen de un dominio extracelular de una proteína unida a una
membrana (como el receptor de quimiocina CC) o que estén presentes
en una proteína segregada, pueden ser activas como también
antagonistas de la quimiocina CC y, en general, deben tener una
actividad inmunomoduladora.
Como se mencionó anteriormente, la secuencia
adicional incluida en las proteínas de fusión puede eliminarse, p.
ej., al final del proceso de producción o purificación, o in
vivo, si es necesario, p. ej., mediante una endo-/exopeptidasa
apropiada. Por ejemplo, la secuencia del enlazador incluida en la
proteína recombinante puede presentar un sitio de reconocimiento
para una endopeptidasa (como una caspasa) que se puede emplear para
separar enzimáticamente la proteína deseada de la secuencia
heteróloga, o bien in vivo o in vitro.
Alternativamente, si la secuencia de la proteína que se ha de
expresar no contiene una metionina de partida (por ejemplo, si la
secuencia codifica solamente la secuencia madura de la proteína, sin
el péptido de señal), una proteína de la invención se puede
expresar correctamente en una célula hospedante con una Metionina de
partida. Este aminoácido adicional puede luego mantenerse en la
proteína recombinante resultante o, mediante una exopeptidasa, tal
como Metionina Aminopeptidasa, de acuerdo con los métodos descritos
en la bibliografía (Van Valkenburgh HA y Kahn RA, 2002;
Ben-Bassat A, 1991).
Se pueden obtener otras variantes o análogos de
los polipéptidos de la invención en la forma de miméticos de
péptidos (también llamados péptido-miméticos), en
los que la naturaleza del péptido o polipéptido ha sido
químicamente modificada al nivel de las cadenas laterales de
aminoácidos, de la quiralidad de los aminoácidos y/o de la cadena
principal del péptido. Estas alteraciones tienen como fin proveer
antagonistas con mejores características de purificación, potencia
y/o farmacocinética. Por ejemplo, cuando el péptido susceptible a
escisión por peptidasas después de la inyección al sujeto representa
un problema, el reemplazo de un enlace peptídico particularmente
sensible con un mimético de péptido no escindible puede proporcionar
un péptido más estable y, por consiguiente, más útil como
terapéutico. De modo similar, el reemplazo de un residuo aminoácido
L es una forma convencional de tornar el péptido menos sensible a
proteólisis y, finalmente, más similar a los compuestos orgánicos
que no son péptidos. También son útiles los grupos bloqueantes
aminoterminales tales como t-butiloxicarbonilo,
acetilo, teílo, succinilo, metoxisuccinilo, suberilo, adipilo,
azelaílo, dansilo, benciloxicarbonilo, fluorenilmetoxicarbonilo,
metoxiazelaílo, metoxiadipilo, metoxisuberilo y
2,4-dinitrofenilo. Se conocen en la técnica muchas
otras modificaciones que proporcionan mayor potencia, actividad
prolongada, facilidad de purificación y/o mayor semivida (WO
02/10195; Villain M et al., 2001). Los grupos
"sinónimos" alternativos preferidos para derivados de
aminoácidos incluidos en los miméticos de péptidos son aquellos
definidos en la Tabla II. Por "derivado de aminoácido" se
entiende un aminoácido o entidad química de tipo aminoácido que no
sea uno de los 20 aminoácidos genéticamente codificados que ocurren
naturalmente. En particular, el derivado de aminoácido puede
contener restos alquilo sustituidos o no sustituidos que pueden ser
lineales, ramificados o cíclicos, y puede incluir uno o más
heteroátomos. Los derivados de aminoácido se pueden elaborar de
novo u obtenerse de fuentes comerciales
(Calbiochem-Novabiochem AG, Suiza; Bachem, EE. UU.).
Las técnicas para la síntesis y el desarrollo de miméticos de
péptidos, como también miméticos no peptídicos, se conocen en la
técnica (Hruby VJ y Balse PM, 2000; Golebiowski A et al.,
2001). En la bibliografía, también se describen diversas
metodologías para incorporar aminoácidos no naturales a proteínas,
usando sistemas de traducción in vitro e in vivo,
para sondear y/o mejorar la estructura de y la función de la
proteína (Dougherty DA, 2000).
Como se analizará a continuación, los
polipéptidos de la invención se pueden preparar mediante cualquier
procedimiento conocido en la técnica, incluyendo tecnologías
recombinantes y tecnologías de síntesis química.
Otro objeto de la invención reside en una
molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido según se
definió anteriormente, es decir, un polipéptido que comprende la
secuencia de aminoácidos de ChBP-59 o su fragmento
o análogo. Las moléculas de ácido nucleico particulares de la
presente invención se seleccionan del grupo que consiste en:
a) una molécula de ácido nucleico que codifica
una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos de
ChBP-59 (SEC ID NO: 5);
b) una molécula de ácido nucleico que codifica
una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos de
ChBP-59 maduro (SEC ID NO: 6);
c) una molécula de ácido nucleico que codifica
una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos de
ChBP-59-HIS (SEC ID NO: 17);
d) una molécula de ácido nucleico que codifica
una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos de
ChBP-59-HIS maduro (SEC ID NO:
18);
e) una molécula de ácido nucleico capaz de
hibridación a una molécula de ácido nucleico de a), b), c) o d)
bajo condiciones moderadamente rigurosas, y que codifica una
proteína que se une a una quimiocina CC;
f) una molécula de ácido nucleico que codifica
una proteína por lo menos aproximadamente 70% idéntica en una
secuencia de aminoácidos a una proteína de a), b), c) o d), y que se
une a una quimiocina CC;
g) una molécula de ácido nucleico que codifica
una proteína que comprende un fragmento de una proteína codificada
por una molécula de ácido nucleico de a), b), c), d), e), o f). cuyo
fragmento se une a una quimiocina CC; y
h) una variante degenerada de una molécula de
ácido nucleico de a), b), c), d), e), f) o g).
En particular, la molécula de ácido nucleico
codifica una proteína seleccionada del grupo que consiste en:
a) una proteína que tiene una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59 (SEC ID NO: 5);
b) una proteína que tiene una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59 maduro (SEC ID NO 6);
c) una proteína que tiene una secuencia de
aminoácidos de ChBP-594-HIS (SEC ID
NO: 17);
d) una proteína que tiene una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59-HIS maduro
(SEC ID NO: 18);
e) una proteína que comprende un fragmento de
una proteína de a), b), c) o d), cuyo fragmento se une a una
quimiocina CC;
f) un mutante activo de una proteína de a), b),
c) o d), en donde en dicho mutante se han añadido, eliminado o
sustituido uno o más residuos aminoácido y en donde dicho mutante se
une a una quimiocina CC; y
g) una proteína de fusión, en donde la proteína
de fusión comprende una proteína de a), b), c), d), e) o f)
operativamente unida a una o más secuencias de aminoácidos
seleccionadas de lo siguiente: un dominio extracelular de una
proteína unida a una membrana, una región constante de
inmunoglobulina, un dominio de multimerización, un péptido de
señal, una señal de exportación y una secuencia de marcador.
Dentro del contexto de la presente invención,
una "variante degenerada" designa todas las secuencias de ácido
nucleico que, en virtud de la degeneración del código genético,
codifican la misma secuencia de aminoácidos que un ácido nucleico
de referencia.
Asimismo, la expresión "molécula de ácido
nucleico" abarca todos tipos diferentes de ácidos nucleicos,
incluyendo, aunque sin limitación, ácidos desoxirribonucleicos (p.
ej., DNA, cDNA, gDNA, DNA sintético, etc.), ácidos ribonucleicos
(p. ej., RNA, mRNA, etc.) y ácidos nucleicos de péptidos (PNA). En
una realización preferida, la molécula de ácido nucleico es una
molécula de DNA, tal como una molécula de DNA bicatenaria,
típicamente un
cDNA.
cDNA.
Si los aspectos principales se dirigen al DNA y
a las secuencias de proteínas del ChBP-59 descrito
en los ejemplos, las realizaciones específicas incluyen una serie
de secuencias relacionadas con ChBP-59, como
secuencias de DNA o RNA capaces de hibridarse bajo condiciones
moderadamente rigurosas (solución de prelavado de 5 X SSC, SDS al
0,5%, EDTA 1,0 mM (pH 8,0) y condiciones de hibridación de 50ºC, 5X
SSC, durante una noche) a las secuencias de DNA que codifican
ChBP-59, y que codifican una proteína de unión a la
quimiocina CC.
Por ejemplo, la invención provee la secuencia
del cDNA de Rhipicephalus sanguineus que expresa
ChBP-59 (SEC ID NO: 3), el Marco de Lectura Abierto
asociado (ORF; SEC ID NO: 4), una secuencia de cDNA modificado que
permite la expresión de ChBP-59 como proteína
recombinante condensada a un marcador de histidina en células
hospedantes de mamíferos o insectos (SEC ID NO: 15), y el ORF
asociado (SEC ID NO: 16).
En otras realizaciones preferidas, las
secuencias relacionadas con ChBP-59 son moléculas de
DNA que codifican proteínas que son por lo menos aproximadamente
70%, preferiblemente 80% y lo más preferiblemente 90% idénticas en
secuencia de aminoácidos a ChBP-59. Este valor se
puede calcular con cualquiera de los programas especializados, como
FASTA (Pearson WR, 2000) y, para secuencias parciales o fragmentos,
se calcula sobre esa porción de ChBP-59 que está
presente en el fragmento.
Otra realización preferida es un oligonucleótido
que comprende un fragmento de, o se hibrida específicamente a una
región de la secuencia de una molécula de ácido nucleico según se
definió anteriormente. Dichos oligonucleótidos típicamente
contienen entre 5 y 100 nucleótidos de longitud, y se pueden
seleccionar, p. ej., del grupo que consiste en oligonucleótidos de
por lo menos aproximadamente 20 nucleótidos de longitud,
oligonucleótidos de por lo menos aproximadamente 30 nucleótidos de
longitud y oligonucleótidos de por lo menos aproximadamente 50
nucleótidos de longitud. Estos oligonucleótidos se pueden usar para
detectar (por PCR o transferencia Southern, por ejemplo) las
secuencias no codificantes/codificantes en transcriptos que
codifican ChBP-59 y secuencias relacionadas en una
muestra, o para generar y subclonar variantes recombinantes de
ChBP-59, como se muestra en el ejemplo para el
extremo 3' de los cebadores utilizados para subclonar y modificar la
secuencia codificante ChBP-59 como una variante
marcada con histidina (59-attB1directa y
59-attB2 inversa; SEC ID NO: 7 y 8).
En otro aspecto, las moléculas de ácido nucleico
anteriormente definidas pueden estar comprendidas en un vector de
clonación o expresión. En este sentido, un objeto particular de la
presente invención se refiere a un vector de expresión que
comprende un promotor operativamente asociado a una molécula de
ácido nucleico tal como se definió anteriormente, en un promotor
constitutivo específico de tejido o un promotor regulado (p. ej.,
inducible). El vector puede comprender cualquier elemento regulador
adicional, como un terminador, potenciador, origen de replicación,
marcador de selección, etc. El vector puede ser un plásmido,
cósmido, vector vírico, fago, cromosoma artificial y similar.
En una realización particular, este vector puede
comprender:
a) un DNA de la invención; y
b) un casete de expresión;
en donde dicho DNA (a) está
operativamente asociado a un promotor constitutivo específico de
tejido o a un promotor inducible incluido en la secuencia
(b).
Opcionalmente, si el ácido nucleico codificante
(es decir, la secuencia (a)) no contiene un codón para una
metionina de partida (por ejemplo, si esta secuencia codifica
solamente la secuencia madura de la proteína, sin el péptido de
señal), el vector o el casete de expresión puede también contener
una secuencia ATG que está clonada en 5' a dicha secuencia, de modo
tal que puede expresarse correctamente con una Metionina de
partida. Este aminoácido adicional puede luego mantenerse en la
proteína recombinante resultante, o eliminarse mediante una enzima,
tal como Metionina Aminopeptidasa, de acuerdo con métodos descritos
en la bibliografía (Van Valkenburgh HA y Kahn RA, 2002;
Ben-Bassat A, 1991).
Este vector puede permitir la expresión de las
proteínas de la invención, no solamente en la condición del cultivo
de tejido sino también in vivo, por razones experimentales o
terapéuticas. Por ejemplo, las células que
sobre-expresan la proteína de la invención pueden
transferirse (p. ej., encapsularse) en un modelo animal para
controlar los efectos fisiológicos de la administración constante de
la proteína, y eventualmente antes de aplicar las células a seres
humanos. Alternativamente, el vector se puede usar para
transferencia génica mediada por retrovirus, o cualquier otra
tecnología que permita la introducción y expresión de un vector o
de la secuencia que codifica DNA aislado en un animal bajo el
control de un promotor endógeno. Este planteamiento permite la
generación de animales no humanos transgénicos en donde las
proteínas de la invención se expresan constitutivamente o en un
modo regulado (p. ej., en tejidos específicos y/o después de la
inducción con compuestos específicos). Se aplicaron planteamientos
similares a otra proteína de unión a quimiocina no mamífera,
demostrando varios efectos de desarrollo y patológicos (Jensen KK
et al., 2003; Pyo R et al., 2004; Bursill CA et
al., 2004).
Otro objeto de la invención consiste en células
hospedantes transformadas o transfectadas con un vector de
clonación o expresión anteriormente indicado. Estos vectores se
pueden usar en un procedimiento de preparación de los polipéptidos
de la invención. En este sentido, un objeto de la invención es un
método para preparar un polipéptido ChBP-598 según
se definió anteriormente, que comprende cultivar células
recombinantes como se definió anteriormente bajo condiciones que
permiten o promueven la expresión y recuperan el polipéptido
ChBP-59. Cuando el vector expresa el polipéptido
como una proteína segregada en el espacio extracelular, la proteína
se puede recoger más fácilmente y purificarse a partir de células
cultivadas en vista de mayor procesamiento.
Muchos libros y revisiones proveen enseñanzas
sobre cómo clonar y producir proteínas recombinantes usando
vectores y células hospedantes Procarióticas o Eucarióticas, como
por ejemplo algunos títulos de la serie "A Practical Approach"
publicada por Oxford University Press ("DNA Cloning 2: Expression
Systems", 1995; "DNA Cloning 4: Mammalian Systems", 1996;
"Protein Expression", 1999; "Protein Purification
Techniques", 2001). En particular, los ejemplos muestran cómo,
una vez que la secuencia de DNA que codifica ChBP-59
ha sido identificada cribando la colección de cDNA de
Rhipicephalus sanguineus, se puede adaptar, modificar e
insertar el ORF a los vectores de expresión para obtener la
correspondiente proteína recombinante.
En general, los vectores pueden ser vectores
episomales o no/homólogamente integradores, que pueden introducirse
a las células hospedantes apropiadas por cualquier medio adecuado
(transformación, transfección, conjugación, fusión de protoplastos,
electroporación, precipitación de fosfato de calcio, microinyección
directa, etc.) para transformarlas. Los factores de importancia en
la selección de un vector plásmido, vírico o retrovírico particular
incluyen: la facilidad con la que las células receptoras que
contienen el vector pueden ser reconocidas y seleccionadas entre
aquellas células receptoras que no contienen el vector; el número de
copias del vector que se desean en un hospedante particular; y, si
se desea, ser capaces de "transportar" el vector entre células
hospedantes de diferentes especies. Los vectores deberán permitir la
expresión de las proteínas aisladas de la invención, o las
proteínas de fusión que las comprenden en la célula hospedante
procariótica o eucariótica bajo el control de las secuencias
reguladoras de la iniciación/terminación transcripcional apropiada,
que se seleccionan para ser constitutivamente activas o inducibles
en dicha célula. Una línea celular sustancialmente enriquecida en
dichas células puede entonces aislarse para proveer una línea
celular estable (como se muestra en el ejemplo con las líneas
celulares HEK293 y TN5).
Para células hospedantes Eucarióticas (p. ej.,
células de levadura, insecto o mamífero), se pueden emplear
diferentes secuencias reguladoras de transcripción y traducción,
dependiendo de la naturaleza del hospedante. Pueden derivar de
fuentes víricas, como adenovirus, papilloma virus bovino, virus de
simio o similar, en donde las señales reguladoras se asocian con un
gen particular que tiene un alto nivel de expresión. Los ejemplos
son el promotor TK del Herpes virus, el promotor temprano SV40, el
promotor del gen de levadura gal4, etc. Se pueden seleccionar
señales reguladoras de iniciación transcripcional que permitan la
represión y activación, de modo que la expresión de los genes se
pueda modular. Las células que han sido establemente transformadas
por el DNA introducido se pueden seleccionar introduciendo también
uno o más marcadores que permitan la selección de células
hospedantes que contienen el vector de expresión. El marcador puede
también proveer fototrofia a un hospedante auxotrópico, resistencia
a biocidas, p. ej., antibióticos, o metales pesados tales como cobre
o similares. El gen marcador seleccionable puede estar directamente
unido a las secuencias génicas de DNA que se han de expresar o
introducirse a la misma célula por co-transfección.
También pueden ser necesarios elementos adicionales para la
síntesis óptima de las proteínas de la invención.
Las células hospedantes para producción
recombinante pueden ser células Procarióticas o Eucarióticas. Las
células Procarióticas particularmente adecuadas incluyen bacterias
(como Bacillus subtilis o E. coli) transformadas con
un vector de expresión de DNA bacteriófago recombinante, plásmido o
cósmido. Se prefieren las células hospedantes Eucarióticas, p. ej.,
células mamíferas, como células de ser humano, mono, ratón y ovario
de hámster chino (CHO), porque proporcionan modificaciones
post-traduccionales a las moléculas de proteína,
incluyendo el correcto pliegue o glucosilación en los sitios
correctos. Las células hospedantes Eucarióticas alternativas son
células de levadura transformadas con vectores de expresión de
levadura. Las células de levadura también pueden realizar
modificaciones peptídicas post-traduccionales,
incluyendo glucosilación. Existe una serie de estrategias de DNA
recombinante que utilizan fuertes secuencias promotoras y un alto
número de copias de plásmidos que se pueden utilizar para la
producción de las proteínas deseadas en levadura. La levadura
reconoce secuencias líderes en productos génicos de mamíferos
clonados y segrega péptidos que portan secuencias líderes (es
decir, pre-péptidos).
Para la producción de alto rendimiento a largo
plazo de un polipéptido recombinante, se prefiere la expresión
estable. Por ejemplo, las líneas celulares que expresan establemente
el polipéptido de interés pueden transformarse usando vectores de
expresión que pueden contener orígenes víricos de replicación y/o
elementos de expresión endógena y un gen de marcador seleccionable
en el mismo vector o en un vector separado. Después de la
introducción del vector, se puede permitir que las células se
desarrollen durante 1-2 días en un medio
enriquecido, antes de transferirse al medio selectivo. El propósito
del marcador seleccionable es conferir resistencia a la selección,
y su presencia permite el desarrollo y la recuperación de las
células que expresan exitosamente las secuencias introducidas. Los
clones resistentes de células establemente transformadas pueden
proliferar usando técnicas de cultivo de tejido apropiadas para el
tipo de célula. Una línea celular sustancialmente enriquecida en
dichas células puede luego aislarse para proveer una línea celular
estable.
Un método particularmente preferido de
producción de alto rendimiento de un polipéptido recombinante de la
presente invención consiste en el uso de ampliación por
dihidrofolato reductasa (DHFR) en células CHO deficientes de DHFR,
mediante el uso de niveles sucesivamente en aumento de metotrexato,
como se describe en la patente US 4.889.803. El polipépetido
obtenido puede estar en forma glucosilada.
Las líneas celulares de mamíferos disponibles
como hospedantes para expresión se conocen en la técnica e incluyen
muchas líneas celulares inmortalizadas disponibles de American Type
Culture Collection (ATCC) incluyendo, aunque sin limitación,
células de ovario de hámster chino (CHO), HeLa, riñón de hámster
bebé (BHK), riñón de mono (COS), C127, 3T3, BHK, HEK 293, melanoma
Bowes y carcinoma hepatocelular humano (por ejemplo, Hep G2) y una
serie de otras líneas celulares. En el sistema de baculovirus, los
materiales para sistemas de expresión celular de
baculovirus/insecto se comercializan en forma de un estuche, entre
otros, por Invitrogen.
Alternativamente, los polipéptidos de la
presente invención se pueden preparar por síntesis artificial. En
este sentido, los ejemplos de tecnologías de síntesis química son
síntesis de fase sólida y síntesis de fase líquida. Como síntesis
de fase sólida, por ejemplo, el aminoácido correspondiente al
término carboxi del péptido que se ha de sintetizar se une a un
soporte que es insoluble en disolventes orgánicos, y por repetición
alternativa de reacciones, uno en donde los aminoácidos con sus
grupos amino y grupos funcionales de cadena lateral protegidos con
grupos protectores apropiados se condensan uno por uno desde el
término carboxi hasta el término amino, y uno donde se liberan los
aminoácidos unidos a la resina o al grupo protector de los grupos
amino de los péptidos, la cadena de péptidos se extiende por lo
tanto de esta manera. Los métodos de síntesis de fase sólida se
clasifican ampliamente por el método tBoc y el método Fmoc,
dependiendo del tipo de grupo protector utilizado. Típicamente, los
grupos protectores incluyen tBoc
(t-butoxicarbonilo), Cl-Z
(2-clorobenciloxicarbonilo), Br-Z
(2-bromobenciloxicarbonilo), Bzl (bencilo), Fmoc
(9-fluorenilmetioxicarbonilo), Mbh
(4,4,-dimetoxidibenzhidrilo), Mtr
(4-metoxi-2,3,6-trimetilbencenosulfonilo),
Trt (tritilo), Tos (tosilo), Z (benciloxicarbonilo) y
Cl2-Bzl (2,6-diclorobencilo) para
los grupos amino; NO2 (nitro) y Pmc
(2,2,5,7,8-pentametilcromano-6-sulfonilo)
para los grupos guanidino); y tBu (t-butilo) para
los grupos hidroxilo). Después de la síntesis del polipéptido
deseado, se somete a la reacción de desprotección y se corta del
soporte sólido. Dicha reacción de corte del péptido se puede llevar
a cabo con fluoruro de hidrógeno o ácido trifluorometanosulfónico
para el método Boc, y con TFA para el método Fmoc. Las proteínas
totalmente sintéticas de tamaño comparable a aquel de
ChBP-59 se describen en la bibliografía (Brown A
et al., 1996).
Los polipéptidos de la presente invención se
pueden producir, formular, administrar o utilizar genéricamente en
otras formas alternativas que pueden preferirse de acuerdo con el
método deseado de uso y/o producción. La proteína de la invención
se puede modificar post-traduccionalmente, por
ejemplo por glucosilación, como se muestra en los ejemplos.
En general, la proteína de la invención se puede
proveer en forma de fracciones activas, precursores, sales,
derivados, conjugados o complejos.
Como se indicó anteriormente, el término
"activo" o la expresión "biológicamente activo" significa
que dichos compuestos alternativos deben mantener, o incluso
potenciar, las propiedades inmunomoduladoras y/o de unión a la
quimiocina CC de ChBP-59.
El término "fracción" se refiere a
cualquier fragmento de la cadena del polipéptido del compuesto
propiamente dicho, solo o combinado con moléculas relacionadas o
residuos unidos a éste, por ejemplo residuos de azúcares o
fosfatos. Dichas moléculas pueden resultar también de otras
modificaciones que normalmente no alteran la secuencia primaria,
por ejemplo, derivatización química de péptidos in vitro
(acetilación o carboxilación), y aquellas elaboradas modificando la
proteína post-traduccionalmente, como por
fosforilación (introducción de residuos fosfotirosina, fosfoserina
o fosforotreonina) o por glucosilación (exponiendo el péptido a
enzimas que afectan la glucosilación, p. ej., glucosilando o
desglucosilando enzimas mamíferas) durante su síntesis y/o en
etapas de procesamiento adicionales. En particular, se ha
caracterizado ChBP-59 en saliva de garrapata en
ambas formas recombinantes descritas en este documento como más o
menos pesadamente glucosiladas. Esta modificación se puede efectuar
in vitro, usando la enzima modificadora apropiada, o in
vitro, eligiendo las células hospedantes apropiadas para la
producción recombinante.
Los "precursores" son compuestos que pueden
convertirse en los compuestos de la presente invención por
procesamiento metabólico y enzimático antes o después de la
administración a las células o al organismo.
El término "sales" en este documento se
refiere a ambas sales de grupos carboxilo y a sales de adición de
ácido de grupos amino de los péptidos, polipéptidos o sus análogos,
de la presente invención. Las sales de un grupo carboxilo pueden
formarse por métodos conocidos en la técnica e incluyen sales
inorgánicas, por ejemplo, sales de sodio, calcio, amonio, hierro o
zinc, y similares, y sales con bases orgánicas como aquellas
formadas, por ejemplo, con aminas, tales como trietanolamina,
arginina o lisina, piperidina, procaína y similares. Las sales de
adición de ácido incluyen, por ejemplo, sales con ácidos minerales
tales como, por ejemplo, ácido clorhídrico o ácido sulfúrico, y
sales con ácidos orgánicos tales como, por ejemplo, ácido acético o
ácido oxálico. Cualquiera de dichas sales deberá tener actividad
sustancialmente similar a los péptidos y polipéptidos de la
invención o sus análogos.
El término "derivados", tal como se emplea
en esta memoria, se refiere a derivados que se pueden preparar a
partir de grupos funcionales presentes en las cadenas laterales de
los restos aminoácido o en los grupos amino-/o
carboxi-terminales de acuerdo con métodos conocidos.
Dichos derivados incluyen, por ejemplo, ésteres o amidas alifáticas
de los grupos carboxilo y derivados de N-acilo de
los grupos amino libres o derivados de O-acilo de
los grupos hidroxilo libres y se forman con grupos acilo, como por
ejemplo grupos alcanoílo o aroílo.
Las proteínas de la invención pueden estar en la
forma de conjugado o complejo activo con una molécula seleccionada
entre etiquetas radiactivas, biotina, etiquetas fluorescentes,
agentes citotóxicos y agentes de administración de fármacos. Los
conjugados o complejos útiles se pueden generar usando moléculas y
métodos conocidos en la técnica para diversos propósitos, por
ejemplo para la detección de la interacción con quimiocinas CC u
otras proteínas (etiquetas radiactivas o fluorescentes, biotina),
eficacia terapéutica (agentes citotóxicos) o para mejorar los
agentes en términos de eficacia de administración de fármacos, como
polietilenglicol y otros polímeros naturales o sintéticos (Harris
JM y Chess RB, 2003; Greenwald RB et al., 2003; Pillai O y
Panchagnula R, 2001).
Estos compuestos derivados de
ChBP-59 se pueden producir siguiendo una
modificación dirigida al sito de un residuo apropiado, en una
posición interna o terminal. Los residuos se pueden usar para la
unión, siempre que tengan una cadena lateral sujeta a la unión de
polímeros (es decir, la cadena lateral de un aminoácido que porta
un grupo funcional, p. ej., lisina, ácido aspártico, ácido
glutámico, cisteína, histidina, etc.). Alternativamente, un residuo
en estos sitios se puede reemplazar con un aminoácido diferente que
tenga una cadena lateral sujeta a la unión de polímeros.
Por ejemplo, se puede añadir una Cisteína
adicional que permita la PEGilación directa en el término N o C de
la secuencia de proteínas maduras por tecnologías de DNA
recombinante o enzimáticamente. Alternativamente, la Cisteína puede
incluirse en la proteína por la sustitución de un residuo, por
ejemplo en correspondencia de un sitio de glucosilación.
Además, las cadenas laterales de los aminoácidos
genéticamente codificados se pueden modificar químicamente para
unión de polímeros, o se pueden emplear aminoácidos no naturales con
grupos funcionales de cadena lateral apropiada. La unión de
polímeros puede efectuarse no solo a la cadena lateral del
aminoácido natural en una posición específica del antagonista o a
la cadena lateral de un aminoácido natural o no natural que
reemplaza al aminoácido natural en una posición específica del
antagonista, sino también a un carbohidrato u otro resto que esté
unido a la cadena lateral del aminoácido en la posición diana.
Los polímeros adecuados para estos propósitos
son biocompatibles, a saber, no son tóxicos para los sistemas
biológicos, y muchos de dichos polímeros se conocen. Dichos
polímeros pueden ser hidrófobos o hidrófilos por naturaleza,
biodegradables, no biodegradables o una combinación de éstos. Estos
polímeros incluyen polímeros naturales (tales como colágeno,
gelatina, celulosa, ácido hialurónico), como también polímeros
sintéticos (tales como poliésteres, poliortoésteres,
polianhídridos). Los ejemplos de polímeros hidrófobos no degradables
incluyen polidimetilsiloxanos, poliuretanos,
politetrafluoroetilenos, polietilenos, polivinilcloruros y
polimetilmetacrilatos. Los ejemplos de polímeros no hidrófilos no
degradables incluyen
poli(2-hidroxietilmetacrilato), alcohol
polivinílico, poli(N-vinilpirrolidona),
polialquilenos, poliacrilamida y sus copolímeros.
Los polímeros preferidos comprenden, como una
unidad de repetición secuencial, óxido de etileno, tal como un
polietilenglicol (PEG).
El método de unión preferido emplea una
combinación de una síntesis peptídica y ligadura química.
Ventajosamente, la unión de un polímero soluble en agua se
realizará a través de un enlazador biodegradable, especialmente en
la región aminoterminal de una proteína. Dicha modificación actúa
para proveer la proteína en una forma precursora (o
"profármaco") que, tras la degradación del enlazador libera la
proteína sin modificación del polímero.
En otro aspecto, la presente invención se
refiere a anticuerpos que se unen selectivamente a las proteínas de
la invención.
El término "anticuerpo", tal como se emplea
en la presente memoria, abarca anticuerpos monoclonales y
policlonales, quiméricos, humanizados, totalmente humanos,
biespecíficos o multiespecíficos, como también sus fragmentos,
tales como anticuerpos de cadena sencilla (scFv) o anticuerpos de
dominio, como se explicará en más detalle a continuación.
Dentro del contexto de la presente invención, el
término unión "selectiva" indica que los anticuerpos se unen
con preferencia al polipéptido o epítopo diana, es decir, con una
afinidad mayor que cualquier unión a cualquier otro antígeno o
epítopo. En otros términos, la unión al polipéptido diana se puede
discriminar de la unión no específica a otros antígenos. Se
prefiere que los anticuerpos de acuerdo con la presente invención
exhiban afinidad de unión (Ka) al polipéptido o epítopo diana de
10^{6} M^{-1} o más, preferiblemente 10^{7} M^{-1} o más,
más preferiblemente 10^{8} M^{-1} o más y lo más preferiblemente
10^{9} M^{-1} o más. La afinidad de unión de un anticuerpo la
puede determinar fácilmente una persona con experiencia ordinaria
en la técnica, por ejemplo, por análisis Scatchard (Scatchard G.,
1949).
Los anticuerpos de la presente invención pueden
ser anticuerpos monoclonales o policlonales, o sus fragmentos o
derivados que tienen sustancialmente la misma especificidad de
antígenos.
Los métodos para preparar anticuerpos
policlonales de diversas especies, incluyendo roedores, primates y
caballos, se han descrito, por ejemplo, en Vaitukaitis et al
(1971). Los anticuerpos policlonales pueden generarse en un
mamífero, por ejemplo, con una o más inyecciones de un agente
inmunizante y, si se desea, un adyuvante. Típicamente, el agente
inmunizante y/o adyuvante se inyectará en el mamífero por
inyecciones subcutáneas o intraperitoneales múltiples. El agente
inmunizante puede incluir el polipéptido de la SEC ID NO 5, 6, 17,
18 o una variante, como se describió anteriormente en la presente
memoria, o su proteína de fusión. Puede ser útil conjugar el agente
inmunizante a una proteína conocida para que sea inmunogénico en el
mamífero que se esté inmunizando. Los ejemplos de dichas proteínas
inmunogénicas incluyen, aunque sin limitarse a ello, hemocianina de
molusco, albúmina de suero, tiroglobulina bovina e inhibidor de
tripsina de soja. Los ejemplos de adyuvantes que se pueden emplear
incluyen adyuvante completo de Freund y adyuvante
MPL-TDM (Lípido A monosfoforilo, trehalosa
dicorinomicolato sintético). Se pueden aplicar inyecciones
repetidas. Se toman muestras de sangre y se separan las
inmunoglobulinas y el suero.
Los anticuerpos pueden, alternativamente, ser
anticuerpos monoclonales. La expresión "anticuerpo monoclonal",
como se emplea en esta memoria, se refiere a un anticuerpo obtenido
de una población de anticuerpos sustancialmente homogéneos, es
decir, los anticuerpos individuales que comprenden la población son
idénticos, excepto por posibles mutaciones que ocurren naturalmente
que pueden estar presentes en cantidades menores. Los anticuerpos
monoclonales son altamente específicos, dirigiéndose contra un solo
sitio antigénico. El modificador "monoclonal" indica que el
carácter del anticuerpo se obtiene de una población de anticuerpos
sustancialmente homogénea, y no se interpretará que requiere la
producción del anticuerpo por un método particular.
Los métodos para producir anticuerpos
monoclonales se pueden hallar, por ejemplo, en Kohler et al
(Nature 256 (1975) 495), incorporada a la presente memoria por
referencia.
En un método de hibridoma, típicamente se
inmuniza a un ratón, hámster u otro animal hospedante apropiado,
con un agente de inmunización (el agente inmunizante típicamente
incluirá el polipéptido de la SEC ID NO: 5, 6,17,18 o una variante
como la anteriormente descrita en la presente memoria, o su proteína
de fusión) para producir linfocitos que produzcan o sean capaces de
producir anticuerpos que se unirán específicamente al agente
inmunizante. Alternativamente, los linfocitos se pueden inmunizar
in vitro. En general, se usan linfocitos de sangre
periférica ("PBL") si se desean células de origen humano, o se
usan células del bazo o de los ganglios linfáticos si se desean
fuentes mamíferas no humanas. Los linfocitos se condensan luego a
una línea celular inmortalizada, usando un agente de condensación
adecuado, como polietilenglicol, para formar una célula de
hibridoma (Goding 1986). Las líneas celulares inmortalizadas son por
lo general células mamíferas transformadas, particularmente células
de mieloma de origen roedor, bovino y humano. Usualmente, se
emplean líneas celulares de mieloma de rata o ratón. Las células de
hibridoma se pueden cultivar en un medio de cultivo adecuado que
preferiblemente contiene una o más sustancias que inhiben el
crecimiento o la supervivencia de las células no condensadas,
inmortalizadas. Por ejemplo, si las células parentales carecen de
hipoxantina guanina fosforribosil transferasa (HGPRT o HPRT), el
medio de cultivo para los hibridomas típicamente incluirá
hipoxantina, aminopterina y timidina ("medio HAT"), cuyas
sustancias previenen el desarrollo de células deficientes de HGPRT.
Las líneas celulares inmortalizadas preferidas son aquellas que se
condensan eficientemente, soportan un alto nivel de expresión
estable del anticuerpo por las células que producen el anticuerpo
seleccionado y son sensibles a un medio tal como el medio HAT. Las
líneas celulares inmortalizadas más preferidas son líneas de
mieloma murino, que se pueden obtener, por ejemplo, del Salk
Institute Cell Distribution Center, San Diego, California y de la
American Type Culture Collection, Manassas, Virginia. También se han
descrito las líneas celulares de mieloma humano y hetermieloma de
\hbox{ratón y humano para la producción de anticuerpos
monoclonales humanos.}
El medio de cultivo en el que se cultivan las
células de hibridoma puede luego ensayarse para presencia de
anticuerpos monoclonales dirigidos contra el péptido inmunizante.
Preferiblemente, la especificidad de unión de los anticuerpos
monoclonales producidos por las células de hibridoma se determina
por inmunoprecipitación o por un ensayo de unión in vitro,
tal como radioinmunoensayo (RIA) o ensayo inmunoabsorbente de unión
a enzimas (ELISA). Dichas técnicas y ensayos se conocen en el
campo.
Una vez que se identifican las células de
hibridoma, los clones se pueden subclonar por procedimientos de
dilución limitativos y desarrollarse por métodos convencionales
(Goding, supra). Los medios de cultivo adecuados para este
propósito incluyen, por ejemplo, Medio de Eagle Modificado por
Dulbecco y medio RPMI-1640. Alternativamente, las
células de hibridoma pueden desarrollarse in vivo como
ascitis en un mamífero.
Los anticuerpos monoclonales segregados por los
subclones se pueden aislar o purificar del medio de cultivo o
fluido ascítico por procedimientos de purificación convencionales,
tales como, por ejemplo, proteína A-Sepharose,
cromatografía de hidroxilapatita, electroforesis en gel, diálisis o
cromatografía por afinidad.
Los anticuerpos monoclonales pueden también
elaborarse por métodos de DNA recombinante, como aquellos descritos
en la patente estadounidense No. 4.816.567. El DNA que codifica los
anticuerpos monoclonales de la invención se puede aislar y
secuenciar fácilmente usando procedimientos convencionales (p. ej.,
usando sondas de oligonucleótidos que son capaces de unirse
específicamente a genes que codifican las cadenas pesada y liviana
de anticuerpos murinos). Las células de hibridoma de la invención
sirven como origen preferido de dicho DNA. Una vez aislado, el DNA
puede disponerse en vectores de expresión, que luego se transfectan
a células hospedantes como células COS de simio, células de ovario
de hámster chino (CHO) o células de mieloma que de otra manera no
producen la proteína de inmunoglobulina, para obtener la síntesis
de anticuerpos monoclonales en las células hospedantes
recombinantes.
Los "anticuerpos monoclonales" pueden
también aislarse de colecciones de anticuerpos de fago, usando las
técnicas descritas en Clackson et al., 1991 y en Marks et
al, 1991.
Los anticuerpos pueden ser anticuerpos
monovalentes. Los métodos para preparar anticuerpos monovalentes se
conocen en la técnica. Por ejemplo, un método implica la expresión
recombinante de la cadena liviana de inmunoglobulina y la cadena
pesada modificada. La cadena pesada está truncada en general en
cualquier punto en la región Fc como para prevenir el
entrecruzamiento de la cadena pesada. Alternativamente, los residuos
cisteína relevantes se sustituyen con otro residuo aminoácido o se
eliminan como para prevenir el entrecruzamiento.
Los métodos in vitro también son
adecuados para preparar anticuerpos monovalentes. La digestión de
anticuerpos para producir sus fragmentos, particularmente, Fab, se
puede lograr usando técnicas de rutina conocidas en el campo.
Los anticuerpos pueden también producirse por
selección de colecciones combinatorias de inmunoglobulinas, como se
describe, por ejemplo, en Ward et al (1989).
Los anticuerpos de la invención pueden además
comprender anticuerpos humanizados o anticuerpos humanos. Las
formas humanizadas de anticuerpos no humanos (p. ej., murinos) son
inmunoglobulinas quiméricas, cadenas de inmunoglobulinas o sus
fragmentos (como Fv, Fab, Fab', F(ab')2 u otras subsecuencias
de unión a antígenos de anticuerpos) que contienen secuencia mínima
derivada de inmunoglobulina no humana. Los anticuerpos humanizados
incluyen inmunoglobulinas humanas (anticuerpo receptor) en las que
los residuos de una región determinante complementaria (CDR) del
receptor se reemplazan por residuos de una CDR de especies no
humanas (anticuerpo donante) como de ratón, rata o conejo que
tienen la especificidad, afinidad y capacidad deseadas. En algunos
casos, los residuos de marco Fv de la inmunoglobulina humana se
reemplazan por los correspondientes residuos no humanos.
Los métodos para humanizar anticuerpos no
humanos se conocen en la técnica. La humanización se puede realizar
esencialmente siguiendo el método de Winter y sus colegas (Jones
et al., Nature, 321:522-525 (1986)),
sustituyendo las correspondientes secuencias de un anticuerpo
humano por CDR de roedor o secuencias de CDR. Por consiguiente,
dichos anticuerpos "humanizados" son anticuerpos quiméricos
(patente estadounidense No. 4.816.567), en los que sustancialmente
menos que un dominio variable humano intacto ha sido sustituido con
la correspondiente secuencia de una especie no humana.
Los anticuerpos humanos también se pueden
producir usando diversas técnicas conocidas en el campo, incluyendo
colecciones de visualización de fagos (Hoogenboom y Winter, (1991).
De modo similar, los anticuerpos humanos se pueden producir
introduciendo locus de inmunoglobulina humana en animales
transgénicos, p. ej., ratones en los que los genes de
inmunoglobulina endógenos han sido parcial o totalmente inactivados.
Tras la exposición, se observa la producción de anticuerpos
humanos, que se asemeja en gran medida a aquella vista en seres
humanos en todos los aspectos, incluyendo redisposición de genes,
ensamblaje y repertorio de anticuerpos. Este planteamiento se
describe, por ejemplo, en las patentes estadounidenses No.
5.545.807; 5.545.806; 5.569.825; 5.625.126; 5.633.425;
5.661.016.
La invención también se refiere a
inmunoconjugados que comprenden un anticuerpo conjugado a restos
heterólogos, como agentes citotóxicos, etiquetas, fármacos u otros
agentes terapéuticos, covalentemente unidos o no, o bien
directamente o a través del uso de agentes de acoplamiento o
enlazadores. Los agentes citotóxicos incluyen agentes
quimioterapéuticos, toxinas (p. ej., una toxina enzimáticamente
activa de origen bacteriano, fúngico, vegetal o animal, o sus
fragmentos), o un isótopo radiactivo (es decir, un
radioconjugado).
Las toxinas enzimáticamente activas y sus
fragmentos que se pueden utilizar incluyen cadena de difteria A,
fragmentos activos que no son de unión de toxina de difteria, cadena
de exotoxina A (de Pseudomonas aeruginosa), cadena de ricina
A, cadena de abrina A, cadena de modeccina A, alfasarcina, proteínas
de Aleurites fordii, proteínas de diantina, proteínas de
Phytolaca americana (PAPI, PAPII y PAP-S),
inhibidor de momordica charantia, curcina, crotina,
inhibidor de sapaonaria officinalis, gelonina, mitogelina,
restrictocina, fenomicina, enomicina y tricotecenos. Están
disponibles una diversidad de radionúclidos para la producción de
anticuerpos radioconjugados. Los ejemplos incluyen ^{212}Bi,
^{131}I, ^{131}In, ^{90}Y y ^{186}Re.
En otra realización, el anticuerpo se puede
conjugar a un "receptor" (como estreptavidina) para utilización
en la diana previa de tumores en los que el conjugado
anticuerpo-receptor se administra al paciente,
seguido por eliminación de conjugado no unido de la circulación,
usando un agente de aclaramiento y luego la administración de un
"ligando" (p. ej., avidina) que se conjuga a un agente
citotóxico (p. ej., un radionucleótido).
Además, los anticuerpos o fragmentos de
anticuerpo de la presente invención se pueden PEGilar usando métodos
conocidos en la técnica y descritos en esta memoria. Los
anticuerpos descritos en esta memoria se pueden formular también
como inmunoliposomas. Los liposomas con tiempo de circulación
potenciado se describen en la patente estadounidense No.
5.013.556.
La invención se refiere además a "fragmentos
de anticuerpo" que comprenden una porción de un anticuerpo
intacto, preferiblemente la región variable o de unión a antígenos
del anticuerpo intacto. Los ejemplos de fragmentos de anticuerpos
incluyen fragmentos Fab, Fab', F(ab')2 y Fv; diacuerpos;
anticuerpos lineales; moléculas de anticuerpos de cadena sencilla;
monocuerpos; diacuerpos; monocuerpos camelizados; anticuerpos de
dominio y anticuerpos multiespecíficos formados a partir de
fragmentos de anticuerpo.
"Fv" es el fragmento de anticuerpo mínimo
que contiene un reconocimiento de antígenos y un sitio de unión a
antígenos completo. Esta región consiste en un dímero de un dominio
variable de una cadena pesada y una cadena liviana en asociación
firme y no covalente. Es en esta configuración que interactúan los
tres CDR de cada dominio variable para definir un sitio de unión a
antígenos en la superficie del dímero VH-VL.
Colectivamente, los seis CDR confieren especificidad de unión a
antígenos al anticuerpo. No obstante, incluso un solo dominio
variable (o la mitad de un Fv que comprende solamente tres CDR
específicas para un antígeno) tiene la capacidad de reconocer y
unirse a un antígeno, aunque con una afinidad inferior que el sitio
de unión completo.
El fragmento Fab también contiene el dominio
constante de la cadena liviana y el primer dominio constante (CH1)
de la cadena pesada. Los fragmentos Fab difieren de los fragmentos
Fab' por la adición de algunos residuos en el término carboxi del
dominio CH1 de la cadena pesada, incluyendo una o más cisteínas de
la región bisagra del anticuerpo. Fab'-SH es la
designación en esta memoria para Fab' en donde el/los
residuo(s) cisteína de los dominios constantes portan un
grupo tiol libre. Los fragmentos de anticuerpo F(ab')2
originalmente era producidos como pares de fragmentos Fab' que
tenían cisteínas bisagra entre ellos. También se conocen otros
acoplamientos químicos de fragmentos de anticuerpos. Las "cadenas
livianas" de anticuerpos (inmunoglobulinas) de cualquier especie
vertebrada pueden asignarse a uno de dos tipos claramente distintos,
denominados kappa y lambda, en base a las secuencias de aminoácidos
de sus dominios constantes.
Las "moléculas de anticuerpos de cadena
sencilla" son fragmentos de un anticuerpo que comprenden dominios
VH y VL de dicho anticuerpo, en donde estos dominios están
presentes en una sola cadena de polipéptidos. Preferiblemente, el
polipéptido Fv comprende además un enlazador de polipéptidos entre
los dominios VH y VL, que permite que la molécula de anticuerpos de
una sola cadena forme la estructura deseada para la unión a
antígenos.
El término "diacuerpos" se refiere a
pequeños fragmentos de anticuerpo con dos sitios de unión a
antígenos, en donde los fragmentos comprenden un dominio variable
de cadena pesada (VH) conectado a un dominio variable de cadena
liviana (VL) en la misma cadena de polipéptidos (VH - VL). Usando un
enlazador que sea demasiado corto para permitir el apareamiento
entre los dos dominios de la misma cadena, los dominios son forzados
a aparearse con los dominios complementarios de otra cadena y a
crear dos sitios de unión a antígenos. Los diacuerpos se describen
en más detalle, por ejemplo, en los documentos EP 404.097; WO
93/11161.
El término "monocuerpo", tal como se emplea
en esta memoria, se refiere a una molécula de unión a antígenos con
un domino variable de cadena pesada y ningún dominio variable de
cadena liviana. Un monocuerpo puede unirse a un antígeno en
ausencia de cadenas livianas y típicamente tiene tres regiones CDR
designadas CDRH1, CDRH2 y CDRH3. Un monocuerpo de IgG de cadena
pesada tiene dos moléculas de unión a antígenos de cadena pesada
conectadas a un enlace disulfuro. El dominio variable de cadena
pesada comprende una o más regiones CDR, preferiblemente una región
CDRH3.
\newpage
Un "anticuerpo camelizado" se refiere a un
monocuerpo o su porción de unión a antígenos obtenido de un origen
animal de la familia de los camélidos, incluyendo animales con pies
con dos dedos y plantas de cuero. Los animales de la familia de los
camélidos incluyen camellos, llamas y alpacas. Se ha publicado que
los camellos (Camelus dromedaries y Camelus
bactrianus) a menudo carecen de dominios de cadena liviana
variable cuando se analiza el material de tipo IgG del suero,
indicando que pueden derivar suficiente especificidad y afinidad de
los dominios VH (tres bucles de CDR) solos.
También incluidos dentro de la invención se
encuentran los anticuerpos de un solo dominio. Los anticuerpos de
un solo dominio, también llamados anticuerpos de dominio o dAb, son
las unidades de anticuerpos de unión funcional más pequeñas,
correspondientes a las regiones variables o bien de las cadenas
pesada (VH) o liviana (VL) de los anticuerpos humanos. Los dominios
de anticuerpo tienen un peso molecular de aproximadamente 13 kDa, o
menos de una décima del tamaño de un anticuerpo completo. En
contraste con los anticuerpos convencionales, los anticuerpos de
dominio se expresan bien en sistemas de células bacterianas, de
levadura y mamífero. A su vez, muchos anticuerpos de dominio son
altamente estables y retienen actividad incluso después de someterse
a condiciones arduas, como liofilización o termodesnaturalización,
lo que los hace susceptibles a una amplia gama de condiciones de
formulación farmacéutica y procedimientos de elaboración.
Las proteínas de la invención se pueden proveer
en formas más o menos purificadas. Los ejemplos muestran cómo
clonar ácidos nucleicos necesarios para expresar
ChBP-59 recombinante, cómo purificar
ChBP-59 recombinante o natural usando afinidad
hacia las quimiocinas CC y tecnologías cromatográficas, y cómo
seleccionar células que expresan correctamente esta proteína
mediante ensayos para detectar las actividades de unión a la
quimiocina CC.
En particular, la purificación de los
antagonistas naturales, sintéticos o recombinantes de la invención
se puede llevar a cabo mediante cualquiera de los métodos conocidos
para este propósito, es decir, cualquier procedimiento convencional
que implique extracción, precipitación, cromatografía,
electroforesis o similar. Otro procedimiento de purificación que se
puede usar con preferencia para purificar la proteína de la
invención es la cromatografía por afinidad que usa anticuerpos
monoclonales o grupos de afinidad, que unen la proteína diana y que
se producen e inmovilizan en una matriz de gel contenida dentro de
una columna. Las preparaciones impuras que contienen las proteínas
se pasan por la columna. La proteína se une a la columna con
heparina o con el anticuerpo específico mientras pasan las
impurezas. Después del lavado, la proteína se eluye del gel por un
cambio en el pH o fuerza iónica. Alternativamente, se puede emplear
HPLC (Cromatografía Líquida de Alta Resolución). La elución se
puede llevar a cabo usando un disolvente a base de
agua-acetonitrilo comúnmente empleado para la
purificación de proteínas. Preparaciones purificadas de las
proteínas de la invención, como se usan en este documento, se
refieren a las preparaciones que son por lo menos 1% (en peso seco),
y preferiblemente por lo menos 5%, de dichas proteínas.
Otro aspecto de la presente invención es una
composición farmacéutica que comprende un polipéptido
ChBP-59 según se definió anteriormente (en la forma
de proteínas y sus formas alternativas ya descritas) como
ingrediente activo, y un diluyente o vehículo adecuado.
Otro aspecto de la presente invención es una
composición farmacéutica que comprende una molécula de ácido
nucleico que codifica un polipéptido ChBP-59 como se
definió anteriormente, o un vector o célula hospedante recombinante
correspondiente, y un diluyente o vehículo adecuado.
Otro aspecto de la presente invención se refiere
al uso de un polipéptido ChBP-59 según se definió
anteriormente, o un ácido nucleico que lo codifica, para la
elaboración de un medicamento para uso en la regulación de una
respuesta inmunitaria en un sujeto.
Estas composiciones se pueden usar como
medicamentos, en particular, para regular una respuesta inmunitaria
o inflamatoria en un mamífero, y más particularmente como compuestos
antiinflamatorios.
En general, dada la implicancia de las
quimiocinas CC en muchos trastornos humanos y veterinarios, las
proteínas de unión a la quimiocina CC de la invención se pueden
usar como antagonistas de la quimiocina CC (como CCL5/RANTES,
CCL3/MIP-1 alfa o CCL2/MCP-1) para
el tratamiento o la prevención de trastornos relacionados con la
quimiocina CC en animales. Un listado no exhaustivo de trastornos
relacionados con la quimiocina CC incluye: enfermedades
inflamatorias, enfermedades autoinmunitarias, infecciones,
enfermedades alérgicas, enfermedades cardiovasculares, enfermedades
metabólicas, enfermedades gastrointestinales, enfermedades
neurológicas, septicemia, enfermedades relacionadas con rechazo a
trasplantes o enfermedades fibróticas. Los ejemplos no limitativos
de estas enfermedades son los siguientes: artritis, artritis
reumatoidea (RA), artritis psoriásica, psoriasis, artritis
reumatoidea, restenosis, septicemia, artrosis, lupus eritematoso
sistémico (SLE), esclerosis sistémica, escleroderma, polimiositis,
glomerulonefritis, fibrosis, enfermedades alérgicas o de
hipersensibilidad, dermatitis, asma, enfermedad pulmonar
obstructiva crónica (EPOC), enfermedad inflamatoria de los
intestinos (IBD), enfermedad de Crohn, fibromas, colitis ulcerosa,
esclerosis múltiple, choque septicémico, infección vírica, cáncer,
endometriosis, trasplante, enfermedad de injerto contra hospedante
(GVHD), lesión por reperfusión cardíaca y renal, isquemia y
aterosclerosis.
Las proteínas de la invención, o fragmentos
específicos, se pueden usar como ingredientes activos en la
elaboración de composiciones farmacéuticas para regular una
respuesta inmunitaria o inflamatoria en un mamífero, por ejemplo de
composiciones antiinflamatorias. Alternativamente, las proteínas de
la invención, o fragmentos específicos, se pueden usar como
ingredientes activos en la elaboración de composiciones
farmacéuticas para la vacunación de un mamífero contra parásitos,
virus o bacterias. El procedimiento de preparación de dichas
composiciones farmacéuticas comprende combinar
ChBP-59 junto con un diluyente o vehículo
farmacéuticamente aceptable.
Una composición farmacéutica que contiene una
proteína de la invención como ingrediente activo se puede usar para
unir una quimiocina CC in vivo, bloquear la unión de una
citocina CC a un receptor de superficie celular correspondiente y
consecuentemente producir un efecto potencialmente terapéutico, como
un efecto antiinflamatorio. Se puede usar también una composición
que contenga una proteína de la invención como ingrediente activo,
para unir a análogos de la quimiocina CC presentes en los virus,
bacterias o parásitos para bloquear la entrada del virus, bacteria
o parásito a las células. Las composiciones farmacéuticas para la
vacunación de un mamífero contra un parásito, virus o bacteria
puede comprender un fragmento de la proteína de la invención como
ingrediente activo. Las composiciones anteriormente indicadas
pueden además comprender una sustancia inmunosupresora o
antiinflamatoria adicional.
Las composiciones farmacéuticas pueden contener,
en combinación con las proteínas de la invención como ingrediente
activo, diluyentes, vehículos, vehículos biológicamente compatibles
y aditivos que son adecuados para administración a un animal (por
ejemplo, solución salina fisiológica) y eventualmente comprenden
auxiliares (como excipientes, estabilizantes o adyuvantes) que
facilitan el procesamiento de los compuestos activos en
preparaciones que se pueden usar farmacéuticamente Las
composiciones farmacéuticas se pueden formular en cualquier forma
aceptable para satisfacer las necesidades del modo de
administración. Por ejemplo, el uso de biomateriales y otros
polímeros para administración de fármacos, como también las
diferentes técnicas y modelos para validar un modo específico de
administración, se describen en la bibliografía (Luo B y Prestwich
GD, 2001; Cleland JL et al., 2001).
"Farmacéuticamente aceptable" abarca
cualquier vehículo, que no interfiera con la eficacia de la
actividad biológica del ingrediente activo y que no sea tóxico para
el hospedante al que se administra. Por ejemplo, para
administración parenteral, los ingredientes activos anteriormente
mencionados se pueden formular en forma de dosificación unitaria
para inyección en vehículos tales como solución salina, solución de
dextrosa, albúmina de suero y solución de Ringer. Los vehículos se
pueden seleccionar también de almidón, celulosa, talco, glucosa,
lactosa, sacarosa, gelatina, malta, arroz, harina, tiza, gel de
sílice, estearato de magnesio, estearato de sodio, monoestearato de
glicerol, cloruro de sodio, leche desnatada deshidratada, glicerol,
propilenglicol, agua, etanol y diversos aceites, incluyendo
aquellos de origen de petróleo, animal, vegetal o sintético (aceite
de cacahuete, aceite de soja, aceite mineral, aceite de sésamo).
Se puede emplear cualquier modo de
administración aceptado y determinarse por el experto en la técnica
para establecer los niveles sanguíneos deseados de los ingredientes
activos. Por ejemplo, la administración se puede realizar por
diversas rutas parenterales tales como subcutánea, intravenosa,
intradérmica, intramuscular, intraperitoneal, intranasal,
transdérmica, rectal, oral o bucal. Las composiciones farmacéuticas
de la presente invención también se pueden administrar en formas de
administración de liberación sostenida o controlada, que incluyen
inyecciones de absorción lenta, bombas osmóticas y similares, para
la administración prolongada del polipéptido a un índice
predeterminado, preferiblemente en formas de dosificación unitarias
adecuadas para la administración única de las dosis precisas.
La administración parenteral puede ser por
inyección intravenosa rápida o por perfusión gradual en el tiempo.
Las preparaciones para administración parenteral incluyen
suspensiones, emulsiones y soluciones estériles acuosas o no
acuosas, que pueden contener agentes o excipientes auxiliares
conocidos en la técnica, y se pueden preparar según métodos de
rutina. Además, se puede administrar la suspensión de los compuestos
activos como inyección oleosa apropiada. Los disolventes o
vehículos lipófilos adecuados incluyen aceites grasos, por ejemplo,
aceite de sésamo, o ésteres de ácido graso sintético, por ejemplo,
etiloleato o triglicéridos. Las suspensiones para inyección acuosas
que pueden contener sustancias que aumentan la viscosidad de la
suspensión incluyen, por ejemplo, carboximetilcelulosa sódica,
sorbitol y/o dextrano. Opcionalmente, la suspensión puede también
contener estabilizantes. Las composiciones farmacéuticas incluyen
soluciones adecuadas para administración por inyección, y contienen
entre aproximadamente 0,01 y 99,99 por ciento, preferiblemente entre
aproximadamente 20 y 75 por ciento de compuesto activo junto con el
excipiente.
Se ha de entender que la dosis administrada
dependerá de la edad, el sexo, la salud y el peso del receptor, la
clase de tratamiento concurrente, si lo hubiese, la frecuencia de
tratamiento y la naturaleza del efecto deseado. La dosis se
adaptará al sujeto individual, como entenderá y determinará el
experto en la técnica. La dosis total requerida para cada
tratamiento puede administrarse por dosis múltiples o en una sola
dosis. La composición farmacéutica de la presente invención se
puede administrar sola o junto con otros agentes terapéuticos
dirigidos a la afección o dirigidos a otros síntomas de la afección.
Usualmente, una dosis diaria del ingrediente activo está
comprendida entre 0,01 y 100 miligramos por kilogramo de peso
corporal por día. Comúnmente, 1 a 40 miligramos por kilogramo por
día administrados en dosis divididas o en forma de liberación
sostenida son eficaces para obtener los resultados deseados. La
segunda administración o las administraciones subsiguientes se
pueden realizar a una dosis que sea igual, menor o mayor que la
dosis inicial o previa administrada al individuo.
También se describe el uso de una proteína
codificada por un DNA de la invención como medicamento, en
particular en la preparación de una composición para regular una
respuesta inmunitaria o inflamatoria en un mamífero.
También se describen métodos para inmunizar a un
animal contra un ectoparásito que se alimenta de sangre, o para
regular una respuesta inmunitaria o inflamatoria en un animal que lo
necesita, que comprende administrar a dicho animal una proteína de
la invención durante un tiempo y bajo condiciones suficientes para
regular dicha respuesta inmunitaria.
También se describe un método para tratar o
prevenir enfermedades relacionadas con la quimiocina CC, que
comprende la administración de una cantidad eficaz de los
compuestos de la presente invención.
Una "cantidad eficaz" se refiere a una
cantidad de los ingredientes activos que es suficiente para afectar
el curso y la gravedad de la enfermedad, conduciendo a la reducción
o remisión de dicha patología. La cantidad eficaz dependerá de la
ruta de administración y del estado del paciente.
La expresión "enfermedades relacionadas con la
quimiocina CC" indica cualquier enfermedad debida a una
producción de quimiocina CC excesiva o descontrolada, que conduce a
una infiltración masiva de monocitos/macrófagos/
neutrófilos/células T, y en donde la administración de ChBP-59 puede provocar un efecto beneficioso. Se proporcionó anteriormente en este documento un listado no exhaustivo de dichas enfermedades crónicas, agudas o heredadas.
neutrófilos/células T, y en donde la administración de ChBP-59 puede provocar un efecto beneficioso. Se proporcionó anteriormente en este documento un listado no exhaustivo de dichas enfermedades crónicas, agudas o heredadas.
Las aplicaciones terapéuticas de los
antagonistas de quimiocina CC de la invención y de los reactivos
relacionados se pueden evaluar (en términos de seguridad,
farmacocinética y eficacia) mediante los ensayos in vivo o
in vitro que hacen uso de células, tejidos y modelos
mamíferos (Coleman R et al., 2001; Li A, 2001; Methods Mol.
Biol vol. 138, "Chemokines Protocols", editado por Proudfoot A
et al., Humana Press Inc., 2000; Methods Enzymol, vol. 287 y
288, Academic Press, 1997). Una lista no limitativa de ensayos
incluye: movilización de calcio, desgranulación, aumento de
citocinas proinflamatorias, aumento de proteasas, inhibición de
reclutamiento celular in vitro e in vivo.
Otro aspecto de la invención son estuches de
prueba que contienen cualquier compuesto descrito en asociación con
las proteínas de unión a la quimiocina CC de la invención. Por
ejemplo, un estuche para detectar una quimiocina CC o un análogo,
una proteína de unión a una quimiocina CC o un receptor, la
interacción de la quimiocina CC y una proteína de unión a la
quimiocina CC o antagonistas o agonistas de dicha interacción, que
comprende un reactivo de detección y por lo menos un compuesto
seleccionado del grupo que consiste en:
a) Una molécula de ácido nucleico (p. ej., un
DNA);
b) Un oligonucleótido;
c) Una proteína; y
d) Un anticuerpo;
derivado de la proteína de unión a
la quimiocina CC de la
invención.
Estos estuches se pueden utilizar en los métodos
aplicables in vitro o in vivo en los que una muestra
se pone en contacto mediante uno de estos compuestos, que se puede
marcar o inmovilizar en un soporte sólido.
La presente invención se ha descrito con
referencia a las realizaciones específicas, pero el contenido de la
descripción comprende todas las modificaciones y sustituciones que
puede realizar una persona experimentada en la técnica sin
extenderse más allá del significado y propósito de las
reivindicaciones.
La invención será ahora descrita mediante los
siguientes Ejemplos, que no deben interpretarse como limitativos en
modo alguno de la presente invención. Los Ejemplos harán referencia
a las Figuras anteriormente especificadas en este documento.
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Ejemplo
1
Se obtuvo saliva de garrapata de
Rhipicephalus sanguineus bruta de acuerdo con el protocolo
publicado (Ferreira BR y Silva JS, 1998). Se ensayaron alícuotas de
saliva de Rhipicephalus sanguineus (RSs) usando diferentes
ensayos que incluyen, como control negativo, Albúmina de Suero
Bovino (BSA) y, como control positivo, una proteína de unión a la
quimiocina CC de ectromelia virus (conocida como vCCl o
p35).
Se salpicaron diferentes cantidades de RSs y de
vCCl en filtros de nitrocelulosa en paralelo, y los filtros se
expusieron a diferentes quimiocinas CC y CXC radiomarcadas,
recombinantes.
Se diseñó un Ensayo de Proximidad de Centelleos
(SPA) para detectar moléculas que interfirieran con la interacción
quimiocina/receptor de quimiocina como se describe en la
bibliografía (Alouani S, 2000). En síntesis, se recubrieron esferas
SPA de aglutinina de germen de trigo con membranas celulares
aisladas de cepas de células CHO que expresan establemente un
receptor de quimiocina específico (p. ej.,. CCR1 o CCR5) y luego se
incubaron con la correspondiente quimiocina CC radiomarcada sola o
combinada con la quimiocina CC.
Se cosecharon glándulas salivales de 100
garrapatas adultas (Rhipicephalus sanguineus) y se
conservaron inmediatamente en solución RNAlater^{TM} (Ambion) en
hielo seco hasta su uso posterior. Se extrajo RNA total usando el
método TRIzol^{TM} (Invitrogen) de acuerdo con las instrucciones
del fabricante. La colección de cDNA se construyó en el vector
fagémido XTripIEX2 usando el estuche de construcción de la colección
de cDNA SMART (Clontech). Los cDNA se fraccionaron por tamaño con
una columna ChromaSpin 400 (Clontech) de acuerdo con las
instrucciones del fabricante antes de la ligadura al vector. El
tamaño de los insertos de cDNA clonados en la colección osciló
entre aproximadamente 0,6 kb y 1,5 kb, y la frecuencia de los
insertos fue aproximadamente 80%.
Los insertos de cDNA de la colección de cDNA de
glándula salival de Rhipicephalus sanguineus en pTriplEX2 se
cortaron con la enzima de restricción Sfil y se subclonaron en el
vector de expresión de células mamíferas pEXP-lib
(Clontech). El vector pEXP-Lib contiene un casete de
expresión que comprende el promotor/potenciador temprano inmediato
principal de citomegalovirus (CMV) humano seguido de un sitio de
clonación múltiple; un sitio de entrada al ribosoma interno (IRES)
del virus de encefalomiocarditis (ECMV); un gen que codifica
resistencia a puromicina
(puromicina-N-acetil-transferasa);
y la señal de poliadenilación de la hormona del crecimiento bovina.
El sitio de clonación múltiple contiene dos sitios Sfi I
distintos (Sfi IA y Sfi IB, que difieren en sus
secuencias interpalindrómicas), lo que permite la subclonación
direccional de insertos de cDNA del vector pTriplEX2 a pEXPII.
La proteína control vCCI (NCBI Acc. no.
CAC05575; SEC ID NO: 1) se expresó clonando el cDNA que codifica la
proteína (NCBI Acc. no. AJ277111; SEC ID NO: 2) en
pEXP-lib como se describió anteriormente para
generar pEXP-lib vCCI.
Se mantuvieron células de riñón embrionario
humano 293 (células HEK293; ATCC Cat. No. CRC-1573)
en DMEM-F12 Nut Mix, suero de ternero fetal
inactivado con calor al 10%, L-Glutamina 2 mM, 100
unidades/ml solución de
penicilina-estreptomicina.
Los plásmidos pEXP-lib que
expresan la colección de cDNA de Rhipicephalus sanguineus se
mezclaron en grupos que se transfectaron a células HEK293 usando un
estuche de transfección GenePorter2 (Gene Therapy Systems) de
acuerdo con el protocolo del fabricante. El plásmido
pEXP-lib que expresa la proteína control vCCI se
transfectó también en HEK293 del mismo modo.
Se cosechó medio de cultivo de células HEK293
transfectadas de células desarrolladas en medio completo después de
tres días en cultivo. El medio condicionado se centrifugó para
eliminar los sedimentos celulares, y el sobrenadante se usó en un
ensayo de entrecruzamiento o SPA.
Para experimentos de entrecruzamiento, se
transfirieron muestras del medio a una placa de 96 pocillos de fondo
plano (Costar). Se añadió una quimiocina CC radiomarcada
(^{125}I-CCL3/MIP-1alfa) a una
concentración final de 0,23 nM a 50 ul de cada muestra de
sobrenadante, que luego se incubó agitando durante 2 horas a
temperatura ambiente. Se transfirió luego una alícuota de 25 \mul
de cada pocillo a un nuevo pocillo que contenía 5 \mul de BS3 50
mM (reactivo de entrecruzamiento) y se incubó durante 2 horas más
con agitación. Después de este período, se añadieron 5 \mul de
tampón de muestra 10X (base Tris 125 mM, pH 6,8, que contenía SDS
al 10%, EDTA 5 mM, glicerol al 20%, azul bromofenol al 0,2% p/p, DTT
1 M) a cada pocillo para detener la reacción de entrecruzamiento.
Las muestras se sometieron luego a ebullición durante 5 minutos y a
electroforesis en un gel de SDS-poliacrilamida
Bis-Tris 10% (Invitrogen NuPAGE, catálogo no.
NP0301BOX). Después de la electroforesis, el gel se selló en una
envoltura Saran^{TM} y se expuso a una pantalla de reproducción de
imágenes fluorescentes de conservación de tipo K (Biorad) durante 8
horas. Las pantallas de imágenes se exploraron a una resolución de
100 \mum usando un reproductor de imágenes Biorad Personal FX.
La saliva de la garrapata Rhipicephalus
sanguineus ya se ha usado para caracterizar actividades
inmunomoduladoras, como supresión de IgG y producción de citocina
(Matsumoto K et al., 2003) o proliferación de células T
(Ferreira BR y Silva JS, 1998), pero no actividades dirigidas
específicamente a las quimiocinas CC.
Una actividad de unión específica a la
quimiocina CC, comparable a aquella detectada usando vCCI, una
proteína de unión a la quimiocina CC de ectromelia virus,
también conocida como p35 (Burns JM et al., 2002), se
detectó en la saliva de Rhipicephalus sanguineus usando
filtros de nitrocelulosa manchados con la saliva y expuestos a
diferentes quimiocinas CC/CXC radiomarcadas, y un Ensayo de
Proximidad de Centelleos (SPA), una tecnología de cribado de alto
rendimiento que permite la medición de las interacciones moleculares
con gran precisión.
La actividad de unión a la quimiocina CC se
identificó luego en Rhipicephalus sanguineus al nivel de la
secuencia de la proteína/DNA en una colección de cDNA generada a
partir de glándulas salivales de Rhipicephalus sanguineus.
Se usaron grupos de los cDNA de esta colección para transfectar
células mamíferas (HEK293).
Los clones que expresan cDNA transfectados que
codifican un polipéptido que contiene el péptido de señal segregan
la proteína en el medio de cultivo. Los sobrenadantes se ensayaron
directamente, a una dilución diferente, o bien en el ensayo SPA
anteriormente descrito o en un ensayo de entrecruzamiento, usando
una quimiocina CC radiomarcada
(^{125}I-CCL3/MIP-1alfa). En
particular, la adición del reactivo de entrecruzamiento a la
quimiocina CC radiomarcada/proteína de unión a la quimiocina CC
estabiliza el complejo proteico uniendo las dos moléculas
covalentemente. El complejo resultante se puede identificar por
SDS-electroforesis en gel de poliacrilamida
(SDS-PAGE) y posterior autorradiografía como una
banda desplazada. Este método de entrecruzamiento es muy sensible,
ya que se pueden detectar cantidades en nanogramos de proteína.
Los ensayos se realizaron comparando la señal
obtenida con el sobrenadante obtenido del clon que expresa la
proteína tomada como control positivo (vCCI), un sobrenadante al que
se añadió vCCl, y un sobrenadante de células no transfectadas.
Los grupos de clones de HEK293 transfectadas que
muestran la presencia de actividad de unión a la quimiocina CC se
sometieron a tandas sucesivas de cribado y deconvolución hasta que
se identificó un solo clon de HEK293 transfectada que segrega
actividad de unión a la quimiocina CC y se denominó
ChBP-59 (Fig. 1).
El cDNA que codifica ChBP-59
(SEC ID NO: 3) contiene un Marco de Lectura Abierto (ORF; SEC ID NO:
4) que codifica una proteína de 114 aminoácidos (SEC ID NO: 5). La
proteína contiene una secuencia de péptido de señal de secreción
potencial (residuos 1-20), que conduce a una
proteína madura de 94 aminoácidos (SEC ID NO: 6) que no tiene
homología significativa con proteínas conocidas.
Otras características de ChBP-59
son tres sitios de glucosilación potencial (en Asparagina 39, 54 y
62, de acuerdo con la numeración de la proteína total), y una serie
de Cisteínas que se pueden aparear para formar puentes disulfuro
(residuos 32, 49, 53, 66, 85, 90, 95 y 104, de acuerdo con la
numeración de la proteína total).
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Ejemplo
2
La primera etapa del procedimiento de clonación
Gateway implica una reacción PCR de dos etapas (PCR1 y PCR2) que
genera el ORF del ChBP-59 flanqueado en el extremo
5' por un sitio de recombinación attB1 y secuencia Kozak, y
flanqueado en el extremo 3' por una secuencia que codifica un
marcador de Histidina 6 dentro del marco (6His), a un codón
finalizador y el sitio de recombinación attB2 (cDNA compatible con
Gateway; fig. 2). La reacción PCR 1 (en un volumen final de 50
\mul) contiene: 1 \mul (40 ng) de
pEXP-Lib-ChBP-59
plásmido, 1,5 \mul de dNTP (10 mM), 10 \mul de tampón Pfx
polimerasa 10X, 1 \mul de MgSO_{4} (50 mM), 0,5 \mul cada uno
de cebador específico de genes (100 \muM)
(59-attB1directo y 59-attB2 inverso;
SEC ID NO: 7 y 8) y 0,5 \mul de DNA polimerasa Platinum
Pfx (Invitrogen). La reacción PCR1 se llevó a cabo usando una etapa
de desnaturalización inicial de 95ºC durante 2 minutos, seguida de
12 ciclos de 94ºC durante 15 s; 55ºC durante 30 s y 68ºC durante 2
min; y un ciclo de espera de 4ºC. Los productos de ampliación se
purificaron directamente usando el Sistema de Purificación de DNA
Wizard PCR Preps (Promega) y se recuperaron en 50 \mul de agua
estéril de acuerdo con las instrucciones del fabricante.
La reacción PCR2 (en un volumen final de 50
\mul) contenía 10 \mul de producto PCR1 purificado, 1,5 \mul
de dNTP (10 mM), 5 \mul de tampón de polimerasa Pxf 10X, 1 \mul
de MgSO_{4} (50 mM), 0,5 \mul de cada cebador de conversión
Gateway (100 \muM) (GCP directo y GCP inverso; SEC ID NO: 9 y 10)
y 0,5 \mul) de DNA polimerasa Platinum Pfx. Las condiciones para
la reacción PCR 2 fueron: 95ºC durante 1 minuto; 4 ciclos de 94ºC
durante 15 segundos, 50ºC durante 30 segundos y 68ºC durante 2
minutos; 25 ciclos de 94ºC durante 15 segundos, 55ºC durante 30
segundos y 68ºC durante 2 minutos; ciclo de espera a 4ºC. Los
productos PCR resultantes se visualizaron en un gel de agarosa 0,8%
en tampón TAE 1 X (Invitrogen) y la banda que migraba en la masa
molecular pronosticada (430 bp) se purificó del gel usando el
Sistema de Purificación de DNA Wizard PCR Preps (Promega) y se
recuperó en 50 \mul de agua estéril de acuerdo con las
instrucciones del fabricante.
La segunda etapa del procedimiento de clonación
Gateway implica la subclonación del producto PCR modificado por PCR
en el vector de entrada Gateway pDONR221. Se incubaron 5 \mul de
producto purificado de PCR2 con 1,5 \mul del vector pDONR221 (0,1
\mug/\mul), 2 \mul tampón BP y 1,5 \mul de mezcla enzimática
clonasa BP (Invitrogen) en un volumen final de 10 \mul a
temperatura ambiente durante 1 hora. La reacción se detuvo por
adición de proteinasa K 1 \mul (2 \mug/\mul) y se incubó a
37ºC durante otros 10 minutos. Una alícuota de esta reacción (1
\mul) se usó para transformar células DH10B de E. coli por
electroporación de la siguiente manera: se descongeló en hielo una
alícuota de 25 \mul de células electrocompetentes DH10B
(Invitrogen) y se añadió 1 \mul de la mezcla de reacción BP. La
mezcla se transfirió a una cubeta de electroporación enfriada de
0,1 cm y las células se electroporaron usando BioRad
Gene-Pulser^{TM} de acuerdo con el protocolo
recomendado por el fabricante. Se añadió medio SOC (0,5 ml), que
había sido precalentado hasta temperatura ambiente, inmediatamente
después de la electroporación. La mezcla se transfirió a un tubo de
15 ml con tapa a presión y se incubó con agitación (220 rpm)
durante 1 hora a 37ºC. Luego se dispusieron alícuotas de la mezcla
de transformación (10 \mul y 50 \mul) en placas
L-broth (LB) que contenían kanamicina (40 \mug/ml)
y se incubaron durante una noche a 37ºC.
Se preparó mini-prep DNA
plásmido a partir de 5 ml de cultivos de 6 de las colonias
resultantes usando un sistema robótico Qiaprep Turbo 9600 (Qiagen).
El DNA plasmídico (150-200 ng) se sometió a
secuenciación de DNA con cebadores 21M13 y M13Rev usando el sistema
BigDyeTerminator (Applied Biosystems cat. no. 4336919) de acuerdo
con las instrucciones del fabricante. Las reacciones de la
secuenciación se purificaron usando placas de limpieza Montage SEQ
96 (Millipore cat. no. LSKS09624), luego se analizaron en un
secuenciador Applied Biosystems 3700.
Los eluatos de plásmido (2 \mul o aprox. 150
ng) de uno de los clones, que contenía la secuencia correcta
(pDONR221__ChBP-59-HIS), se usó luego en las reacciones de recombinación que contenían 1,5 \mul o bien del vector pDEST8 o del vector pEAK12d (0,1 ug/\mul), 2 \mul de tampón LR y 1,5 \mul de clonasa LR (Invitrogen) en un volumen final de 10 \mul. Las mezclas se incubaron a temperatura ambiente durante 1 hora. Las reacciones se detuvieron por adición de Proteinasa K (2 \mug) y se incubaron a 37ºC durante otros 10 minutos. Se usó una alícuota de cada reacción (1 \mul) para transformar células DH10B de E. coli por electroporación de la siguiente manera: una alícuota de 25 \mul de células electrocompetentes DH10B (Invitrogen) se descongeló en hielo y se añadió 1 \mul de la mezcla de reacción LR. La mezcla se transfirió a una cubeta de electroporación de 0,1 cm enfriada y las células se electroporaron usando BioRad Gene-Pulser^{TM} de acuerdo con el protocolo recomendado por el fabricante. Se añadió medio SOC (0,5 ml), que había sido precalentado hasta temperatura ambiente, inmediatamente después de la electroporación. La mezcla se transfirió a un tubo con tapa a presión de 15 ml y se incubó con agitación (220 rpm) durante 1 hora a 37ºC. Las alícuotas de la mezcla de transformación (10 \mul y 50 \mul) se dispusieron luego en placas L-broth (LB) que contenían ampicilina (100 \mul/ml) y se incubaron durante una noche a 37ºC.
(pDONR221__ChBP-59-HIS), se usó luego en las reacciones de recombinación que contenían 1,5 \mul o bien del vector pDEST8 o del vector pEAK12d (0,1 ug/\mul), 2 \mul de tampón LR y 1,5 \mul de clonasa LR (Invitrogen) en un volumen final de 10 \mul. Las mezclas se incubaron a temperatura ambiente durante 1 hora. Las reacciones se detuvieron por adición de Proteinasa K (2 \mug) y se incubaron a 37ºC durante otros 10 minutos. Se usó una alícuota de cada reacción (1 \mul) para transformar células DH10B de E. coli por electroporación de la siguiente manera: una alícuota de 25 \mul de células electrocompetentes DH10B (Invitrogen) se descongeló en hielo y se añadió 1 \mul de la mezcla de reacción LR. La mezcla se transfirió a una cubeta de electroporación de 0,1 cm enfriada y las células se electroporaron usando BioRad Gene-Pulser^{TM} de acuerdo con el protocolo recomendado por el fabricante. Se añadió medio SOC (0,5 ml), que había sido precalentado hasta temperatura ambiente, inmediatamente después de la electroporación. La mezcla se transfirió a un tubo con tapa a presión de 15 ml y se incubó con agitación (220 rpm) durante 1 hora a 37ºC. Las alícuotas de la mezcla de transformación (10 \mul y 50 \mul) se dispusieron luego en placas L-broth (LB) que contenían ampicilina (100 \mul/ml) y se incubaron durante una noche a 37ºC.
Se preparó mini-prep DNA
plásmido a partir de 5 ml de cultivos inoculados con seis de las
colonias resultantes subclonadas en cada vector, usando Qiaprep Bio
Robot 8000 (Qiagen). El DNA plasmídico (200-500 ng)
en el vector pEAK12d se sometió a secuenciación de DNA con los
cebadores pEAK12F y pEAK12R (SEC ID NO: 11 y 12). De modo similar,
el DNA plasmídico (200-500 ng) en el vector pDEST8
se sometió a secuenciación de DNA con los cebadores pDEST8F y
pDESTSR (SEC ID NO: 13 y 14) como se describió anteriormente.
Se preparó maxi-prep DNA
purificado con gradiente CsCI a partir de 500 ml de cultivo de los
clones verificados de la secuencia
(pEAK12d__ChBP-59-HIS y
pDEST8__ChBP-59-HIS,) usando el
método descrito por Sambrook J. et al, 1989 (en Molecular
Cloning, a Laboratory Manual, 2^{a} edición, Cold Spring Harbor
Laboratory Press). Se resuspendió DNA plasmídico a una
concentración de 1 \mug/\mul en agua estéril (o
Tris-HCl 10 mM, pH 8,5) y se conservó a -20ºC.
Las secuencias de los cebadores utilizadas en
las diferentes etapas de sub/clonación se resumen en la Tabla
III.
Se cosechó sobrenadante de cultivo celular (450
ml) de células HEK293-EBNA 6 días después de la
transfección con
pEAK12d-ChBP-59-HIS
y se diluyó con 2 volúmenes de tampón de fosfato sódico 50 mM, pH
7,5 que contenía NaCl 0,3 M y glicerol al 10% (vol/vol). La muestra
se filtró a través de una membrana de filtro de 0,22 \mum, luego
se cargó a 1,7 ml/min a 4ºC a una columna SX 16/10 que contenía 5 ml
Ni^{2}-NTA agarosa (Catálogo No: 30250; Qiagen)
usando un sistema purificador Akta (Amersham Biosciences). El
material no específicamente unido se eliminó lavando la columna a
1,5 ml/min con 5 volúmenes de columna (CV) de tampón de fosfato
sódico 50 mM, pH 7,5 que contenía NaCl 0,3 M, glicerol al 10%
(Catálogo No: 49781; Fluka), seguidos de 50 CV del mismo tampón que
contenía Tween-20 al 1% (Catálogo No: 93773; Fluka)
y finalmente con 30 CV del tampón sin Tween-20. La
columna se eluyó en fracciones de 5 ml con 10 CV de tampón de
fosfato sódico 50 mM, pH 7,5, que contenía NaCl 0,3 M, glicerol al
10% e imidazol 12,5 mM (Catálogo No: 56749; Fluka) a 2,5 ml/min
seguido de un gradiente de 10 CV hasta una concentración máxima de
imidazol 250 mM, que se mantuvo por otros 5 CV.
Las fracciones que contenían
ChBP-59-HIS se mezclaron y
concentraron 10 veces usando dispositivos de filtro centrífugos con
un valor de corte de 10 kDa (Amicon Ultra-15,
Catálogo No: UFC901096, Millipore). La mezcla concentrada se
sometió a cromatografía de exclusión de tamaño como segunda etapa de
la purificación. Una columna SX200 10/300 GL (volumen de lecho de
25 ml; catálogo No: 17-5175-01;
Amersham Biosciences), que se había equilibrado en PBS (solución
salina tamponada con fosfato), se inyectó con 450 \mul del eluato
de proteína que contenía
ChBP-59-HiS concentrado. La proteína
se eluyó en fracciones de 0,5 ml cada una a 2,5 ml/min. Las
fracciones que contenían la proteína
ChBP-59-HIS se mezclaron, dividieron
en alícuotas y conservaron a -80ºC.
Células de insecto Trichoplusa ni de la
cepa comercial HighFive (Catálogo No: 10486; Invitrogen) se
cultivaron en medio Excell405 (Catálogo No: 24405; JRH
Biosciences). Las células se infectaron con baculovirus recombinante
generado a partir del plásmido de expresión
pDEST8-ChBP-59-HIS.
El sobrenadante de cultivo se cosechó y clarificó por
centrifugación durante 30 minutos a 500 g. Se cosechó un total de
1200 ml de sobrenadante de las células y se diluyó en 7 volúmenes
de tampón NaPO_{4} 50 mM en hielo seco, pH 7,5, que contenía NaCl
0,3 M y glicerol al 10%, y posteriormente se filtró a través de un
filtro de 0,22 \mum. La muestra filtrada y diluida se pasó por
una resina de agarosa de 15 ml Ni^{2}*NTA (Catálogo No: 30250;
Qiagen), cargada en una columna SX 26/10 a 7 ml/min y 4ºC. La
columna se lavó a 2,5 ml/min con 5 CV de tampón de fosfato sódico 50
mM, pH 7,5, que contenía NaCl 0,3 M, glicerol al 10%, seguido de 50
CV del mismo tampón que contenía Tween20 al 1% (Catálogo No: 93772;
Fluka) y finalmente con 30 CV del tampón sin Tween20 para eliminar
todos los restos de detergente. El material no específicamente
unido se eliminó lavando la columna a 2,5 ml/ml con 10 CV de fosfato
sódico 50 mM, pH 7,5, que contenía NaCl 0,3 M, glicerol al 10% e
imidazol 12,5 mM a 2,5 ml/min. La columna se eluyó luego a 2,5
ml/min con un gradiente lineal de imidazol de 12,5 mM a 250 mM por
10 CV. La columna se eluyó por otros 5 CV a imidazol 250 mM. Las
fracciones seleccionadas se analizaron por SDS-PAGE
y transferencia Western, usando anticuerpos con marcador
anti-Histidina.
Las fracciones que contenían
ChBP-59-HIS se mezclaron y
sometieron a una segunda etapa de purificación basada en
cromatografía de intercambio aniónico. Las fracciones combinadas de
la cromatografía de afinidad post-Ni^{+2} se
diluyeron 10 veces en tampón Tris-HCl 25 mM (pH 8)
que contenía NaCl 0,03 M y se cargaron a una columna SX16/10 que
contenía 15 ml de sefarosa Q a 5 ml/min a 4ºC. Luego, la columna se
lavó con 10 CV de tampón y posteriormente se eluyó aplicando un
gradiente de sal de tampón que contiene NaCl 0,03 M a 1 M durante 10
CV. Se recogieron fracciones de 7 ml y se analizaron por
SDS-PAGE. Las fracciones que contenían
ChBP-59-HIS se mezclaron, y la
mezcla se dividió a la mitad y se dializó contra 100 volúmenes de
tampón Tris-HCl 25 mM, pH 8 o contra PBS. La
concentración de proteína de la mezcla se determinó por
espectrofotometría de UV a 280 nm, y las fracciones de proteína
mezcladas se dividieron en alícuotas y se conservaron a -80ºC.
Los eluatos de la columna se diluyeron 1:1 con
2x tampón de muestra (Invitrogen) que contenía DTT 100 mM y se
sometieron a ebullición durante 5 minutos. Las muestras y un patrón
de peso molecular marcado con HIS (Catálogo No: LC5606; Invitrogen)
se sometieron a electroforesis en un gel Bis-Tris al
10% pasado por un tampón MES a 200 V durante 35 min. Las proteínas
sometidas a electroforesis se electrotransfirieron a una membrana de
nitrocelulosa de 0,45 \mum (Catálogo No: LC2001; Invitrogen) en
tampón de transferencia (glicina 39 mM, base Tris 48 mM y metanol
al 20%, pH 8,3) durante 50 minutos a temperatura ambiente, usando
una corriente constante de 290 mA. La membrana se bloqueó incubando
en 20 ml de solución bloqueante (Tween 20 al 0,1%, leche en polvo
al 5% en PBS), durante 1 hora a temperatura ambiente en una
plataforma oscilante. La membrana se incubó luego en 15 ml de la
solución que contenía el anticuerpo con marcador
anti-Histidina primario (diluido 1:1000 en Tween 20
al 0,1%, leche en polvo al 2,5% en PBS) durante 2 horas a
temperatura ambiente con agitación. Los anticuerpos primarios
utilizados fueron sonda de His H-15
(sc-803; Santa Cruz Biotechnology) o sonda de His
G-18 (sc-804; Santa Cruz
Biotechnology). La membrana se enjuagó en tampón de lavado (Tween 20
al 0,1% en PBS) y se lavó con 3 cambios de tampón de lavado (10
minutos cada uno). La membrana se incubó luego en anticuerpo
secundario conjugado con HRP (diluido 1:3000 en Tween 20 al 0,1%,
leche en polvo al 2,5% en PBS) durante 2 horas a temperatura
ambiente con agitación. La membrana se lavó nuevamente como se
describió previamente. Finalmente, la membrana se secó con papel
secante, y se visualizó la tinción del anticuerpo usando el estuche
de Reactivos de Detección de Transferencia Western ECL^{TM}
(Catálogo No: RPN2106; Amersham Pharmacia), de acuerdo con las
instrucciones del fabricante.
El ORF que codifica ChBP-59 se
transfirió en plásmidos que permiten altos niveles de producción en
células de mamíferos o insectos, usando un estuche comercial
(Gateway^{TM}) como proteína recombinante marcada con histidina
(ChBP-59-HIS; fig. 2).
El plásmido que contenía el ORF del clon 59
(pEXP-Lib_ChBP-59) se usó como molde
de PCR para generar una versión marcada con Histidina 6 de cDNA de
ChBP-59 (SEC ID NO: 15) compatible con el sistema de
clonación Gateway. El ORF para
ChBP-59-HIS (SEC ID NO: 16) codifica
una secuencia de 120 aminoácidos (SEC ID NO: 17) que puede luego
madurar por eliminación de la secuencia de señal como secuencia de
100 aminoácidos (SEC ID NO: 18). Se generaron el vector de entrada
Gateway pDONR221_ChBP-59-HIS y los
constructos de expresión
pDEST8_ChBP-59-HIS y
pEAK12d_ChBP-59-HIS (fig. 3).
Se purificó
ChBP-59-HIS recombinante a partir de
sobrenadante celular de HEK293 transfectadas con
pEAK12d-ChBP-59 (usando
cromatografía de afinidad Ni2+ seguida de cromatografía de exclusión
de tamaño) o a partir de células de insectos TN5 infectadas con
pDE5T8-ChBP-59-HIS
(usando cromatografía de afinidad Ni2+ seguida de cromatografía de
intercambio aniónico). La tinción con azul de Coomassie de un
SDS-PAGE en el que se ha cargado la proteína
purificada sugiere que ChBP-59-HIS
se expresó y purificó como una mezcla de formas modificadas de modo
diferente post-traduccionalmente, posiblemente por
glucosilación, como se muestra para otra proteína de garrapata
expresada en células de insectos (Alarcon-Chaidez
FJ et al., 2003). De hecho, la proteína aparece como una
banda manchada, con un peso molecular promedio de aproximadamente
20-25 Kd para la proteína recombinante expresada en
células HEK293 y TN5 (fig. 4).
A la presencia de
ChBP-59-HIS recombinante durante las
diferentes etapas de purificación de ambos sobrenadantes de células
HEK293 y de insecto le siguió la transferencia Western con marcador
anti-Histidina como anticuerpo primario. El
N-terminal de la secuencia madura, purificada se ha
secuenciado, confirmando que la secuencia EDDEDYGDLG forma el
término N de la proteína madura.
La actividad de unión a la quimiocina CC de las
preparaciones finales de ChBP-59-HIS
se comparó con la actividad observada usando el control positivo
(la proteína de unión a la quimiocina CC vírica vCCI) o la saliva de
Rhipicephalus sanguineus, usando el ensayo de
entrecruzamiento empleado inicialmente para caracterizar la
actividad en saliva de garrapata.
En SDS-PAGE, la quimiocina CC
CCL 3/MIP-1alfa marcada con ^{i25}I libre migra
como una banda de 8 kDa. Cuando se añade el agente de
entrecruzamiento, una parte de la radiactividad es retenida en un
complejo de proteínas que tiene un peso molecular de
28-40 kDa, como se puede determinar aproximadamente
en base a la banda desplazada, en ambas muestras que contienen
ChBP-59 recombinante y saliva de garrapata (fig; 5).
El peso molecular de la banda desplazada es levemente diferente
entre estas muestras, probablemente debido a las diferentes clases
y nivel de modificación post-traduccional de la
proteína (glucosilación, en particular) en cada tipo de célula
hospedante.
Dado que el peso molecular para el polipéptido
ChBP-59-HIS maduro (100 aminoácidos)
es alrededor de 11 Kd, esta proteína recombinante parece ser activa
cuando se expresa en células hospedantes Eucarióticas en donde es
isoformas modificadas post-traduccionalmente. Estas
modificaciones pueden ascender hasta 10-20 Kd (según
lo indicado también por la tinción de Coomassie
\hbox{en la
fig. 4) y probablemente se deban principalmente a glucosilación
alternativa.}
Este experimento, que ha sido confirmado usando
otras quimiocinas CC radiomarcadas (CCL5/RANTES y CCL2/
MCP-1), demuestra la actividad de ChBP-59 (como proteína natural y como proteína marcada con histidina, recombinante) como proteína de unión a la quimiocina CC.
MCP-1), demuestra la actividad de ChBP-59 (como proteína natural y como proteína marcada con histidina, recombinante) como proteína de unión a la quimiocina CC.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
3
Se designó el ensayo SPA para detectar moléculas
que interfieran con la interacción quimiocina/receptor de
quimiocina, como se describe en la bibliografía (Alouani S, 2000) y
como ya se describió en este documento (Ejemplo 1).
Los experimentos de quimiotaxia se realizaron en
células L1.2 (línea pre-célula B de ratón) que
expresan establemente el receptor de quimiocina humana 5 (CCR5). Se
mantuvieron las células L1.2/CCR5 en medio de cultivo RPMI 1640
(Invitrogen, catálogo no: 31870-025) enriquecido con
FCS (Suero de ternero fetal; TerraCell, catálogo no:
CS-C08-1000-A) al
10%, L-glutamina 2 mM (Invitrogen, catálogo no:
25030-024), piruvato sódico 1 mM (Sigma, catálogo
no: S8636) y 1% penicilina-estreptomicina
(Invitrogen, catálogo no: 15140-148).
Veinticuatro horas antes de efectuar el ensayo
de quimiotaxia, las células se trataron con ácido butírico 5 mM
(Sigma, catálogo no: B-5887). Al día siguiente, las
células se cosecharon por centrifugación durante 15 minutos a 230 x
g y se resuspendieron a una densidad celular de 1 X 10^{6}
células/ml en medio RPMI 1640 sin indicador rojo fenol (Invitrogen,
catálogo no: 32404-014), enriquecido con FCS al 10%.
Se suspendió CCL3/MIP-1 alfa a 0,01 mg/ml en el
mismo medio y se prepararon once diluciones en serie 4 veces. De
modo similar, se diluyó en serie cinco veces
ChBP-59-HIS recombinante purificado
de células TN5, comenzando por 316 ng/ml, y se mezcló en cantidades
iguales con medio que contenía CCL3/MIP-1alfa 2 nM.
Se añadieron por triplicado alícuotas (32 ml) de la solución de
quimiocina o de la solución de
quimiocina-ChBP-59-HIS
diluida en serie a los compartimentos inferiores de una cámara de
quimiotaxia y se dispuso cautelosamente una unidad de filtro con
tamaño de poros de 8 \mum (Neuroprobe ChemoTx System, catálogo no:
101-8) en la parte superior del compartimento
inferior. La suspensión de células L1.2/CCR5 (20 \mul) se añadió
al compartimento superior de la cámara de quimiotaxia y se incubó
durante 2 horas a 37ºC en una incubadora humidificada con 5%
CO_{2}.
La tapa de la cámara de quimiotaxia luego se
quitó y desechó. Se dispuso boca abajo una placa con embudo de 96
pocillos (Neuroprobe ChemoTx System, catálogo No: FP1) en la parte
superior del compartimento inferior de la cámara de quimiotaxia. Se
dispuso luego boca abajo una placa de matriz negra (Vitaris,
catálogo no: 3915) en la parte superior de la placa de embudo y el
ensamblaje de la cámara de quimiotaxia/placa de embudo/placa de
matriz negra se invirtió. El medio del compartimento inferior de la
cámara de quimiotaxia se transfirió luego a la placa de matriz
negra por centrifugación durante 2 minutos a 700x g. La placa de
matriz negra que contenía las células migradas se selló y congeló
durante 2 horas a - 80ºC. La cantidad de células que habían migrado
al compartimento inferior de la cámara de quimiotaxia se determinó
indirectamente usando el estuche de ensayo de proliferación celular
CyQUANT (Molecular Probes, catálogo no: C7026). La placa negra se
descongeló, y las células se resuspendieron completamente en 200 ml
de tampón de lisis celular que contenía el tinte provisto en el
estuche, de acuerdo con las instrucciones del fabricante. La
fluorescencia se midió en una lectora de placas Wallac Victor,
usando 480 nm/520 nm longitudes de onda de excitación/emisión.
Las propiedades de unión a la quimiocina CC de
ChBP-59-HIS se estudiaron en un SPA
(Ensayo de Proximidad de Centelleos) y en un ensayo de migración
celular inducida por la quimiocina CC.
El ensayo SPA demuestra que la dilución en serie
de pares de quimiocina/receptor de quimiocina específicos de
ChBP-59-HIS recombinante puede
inhibir esta interacción. De hecho, la señal de SPA debida a la
interacción de la esfera con la quimiocina radiomarcada mediante el
receptor de quimiocina disminuye significativamente a bajas
concentraciones molares de
ChBP-59-HIS (Fig. 6). La afinidad de
ChBP-59-HIS, según lo determinado
con este planteamiento, parece mayor para
CCL3/MIP-1\alpha (la CE_{50} para la inhibición
fue 12 pM) que para CCL2/MCP-1 y CCL5/RANTES (la
CE_{50} para la inhibición estuvo en el intervalo micromolar para
ambas quimiocinas CC). Esto parece indicar una posible preferencia
de unión de ChBP-59 para algunas quimiocinas
CC.
Finalmente,
ChBP-59-HIS puede inhibir
eficazmente la quimiotaxia inducida por la quimiocina CC, en
particular quimiotaxia inducida por
CCL3/MIP-1\alpha y quimiotaxia inducida por
CCL5/RANTES de L1.2-CCR5. Nuevamente, la cantidad
de células migradas tras la exposición a la quimiocina CC disminuyó
en forma proporcional con la concentración de
ChBP-59-HIS añadida en este ensayo,
en consecuencia inhibiendo la interacción de las células con la
quimiocina CC. Este efecto es particularmente importante, ya que se
puede lograr a bajas concentraciones molares de
ChBP-59-HIS (inferiores a 10^{-10}
M; Fig. 7).
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
4
En todos estos experimentos se usaron ratones
macho Balb/C o C57B6 (18-22 g). Los animales se
alojaron en un ambiente controlado por temperatura con libre acceso
a agua y alimento.
Ratones Balb/c o C57B6 macho de 8 a 12 semanas
de vida recibieron una inyección intraperitoneal de 200 \mul de
solución salina tamponada con fosfato (PBS, pH 7,4) o
MIP-1\alpha humano (0,5 mg/Kg) diluido en 200
\mul de PBS. Para ensayar la inhibición, se administraron dosis
s.c. que oscilaban entre 0,15 y 5 mg/kg de ChBP-59
en 200 \mul de PBS, 45 min antes de la administración de
MIP-1\alpha humano (0,5 mg/kg i.p.). Los ratones
se sacrificaron 18 h después de la inyección, se les lavó la cavidad
peritoneal dos veces con 3 mL de PBS enfriado con hielo, y se
mezcló el lavaje total de los ratones individuales. Los recuentos
celulares totales se realizaron en una cámara Neubauer, usando
tinción de Turk. Los recuentos de células diferenciales se
realizaron en preparaciones de citospina (Shandon III) teñidas con
May Grunwald-Giemsa, usando criterios morfológicos
estándar para identificar tipos de células. Los resultados se
presentan como el número de células por cavidad (Fig. 8 y Fig.
9).
Para cada experimento, se administró 0,15 mg/Kg
de MIP-1\alpha humano en 0,1 mL de PBS localmente,
por inyección s.c. debajo de la piel escrotal derecha, usando una
aguja de 30G, 1 h antes de la exteriorización. Para ensayar la
inhibición, se preparó solución de ChBP-59 (0,5
mg/kg) más MIP-1\alpha (0,15 mg/Kg) en 100 \mul
de PBS, 15 min antes de la administración de la inyección
intraescrotal. El cremáster izquierdo se preparó luego para
microscopia intravital. En síntesis, se realizó una incisión en la
piel del escroto para exponer el músculo cremáster izquierdo, que
luego se extirpó cautelosamente de la fascia asociada. Se realizó
una incisión a lo largo sobre la superficie ventral del músculo
cremáster, usando un cauterio. El testículo y el epidídimo se
separaron del músculo subyacente y se transfirieron a la cavidad
abdominal. El músculo entonces se esparció sobre un pedestal para
visualización ópticamente clara y se aseguró en los bordes con una
sutura de 4-0. El tejido expuesto se bañó con
solución salina tamponada con bicarbonato sódico caliente (pH 7,4).
Se usó un microscopio intravital (Olympus BX50F4; Japón) con un
lente objetivo de 20x y una pieza ocular de 10x para examinar la
microcirculación cremastérica. Se utilizó una videocámara (5100 HS;
Panasonic, Osaka, Japón) para proyectar las imágenes en un monitor,
y las imágenes se grabaron para reproducción usando una
videocasetera convencional.
Se seleccionaron vénulas cremastéricas
individuales, no ramificadas (25-40 \mu, de
diámetro) y, para minimizar la variabilidad, se observó la misma
sección de vénula cremastérica en todo el experimento. Se determinó
el número de leucocitos rodantes, adherentes y emigrados fuera de
línea durante la reproducción en vídeo. Los leucocitos rodantes se
definieron como células que se mueven a una velocidad menor que
aquella de los eritrocitos dentro de un vaso determinado. El flujo
de células rodantes se midió como el número de células rodantes que
pasan por un punto determinado en la vénula por minuto. Un leucocito
se consideró adherente si permanecía durante por lo menos 30 s, y
se cuantificó la adhesión leucocitaria total como el número de
células adherentes dentro de una longitud de 100 \mum de vénula.
La emigración de leucocitos se definió como el número de células en
el espacio extravascular dentro del área de 50 \mum de distancia
de la vénula. Solamente las células adyacentes y claramente fuera
del vaso bajo estudio se contaron como emigradas. Al final de cada
experimento, se extrajo sangre completa por punción cardíaca. Los
recuentos de células totales se realizaron en una cámara
\hbox{Neubauer modificada, usando tinción de Turk. Los
resultados se presentan en la Fig. 10.}
Se inmunizaron ratones por vía intraperitoneal
con 2500 huevos isoled S. mansoni en los días 0 y 7 del protocolo.
En el día 14, los ratones recibieron una prueba de provocación
intranasal con 10 \mug en 10 \mul de PBS para localizar la
respuesta a las vías respiratorias. Los ratones se sometieron
nuevamente a la prueba de provocación 6 días más tarde por
administración intratraqueal de 10 \mug en 25 \muL de PBS o con
PBS solo (vehículo). Para ensayar la inhibición, se administró
ChBP-59 (0,5 mg/kg) s.c., 45 min antes y 24 h
después de la prueba. Cuarenta y ocho h después de la inyección,
los ratones fueron sacrificados y los pulmones se llenaron in
situ con 0,3 mL de PBS estéril con una cánula traqueal. Se
extrajo fluido de los pulmones después de un masaje suave para
extraer las células, y se recogió en un tubo de plástico sobre
hielo. Este procedimiento se repitió tres veces, y las suspensiones
celulares recuperadas de cada animal se mezclaron para ratones
individuales. Los recuentos de células totales se realizaron en una
cámara Neubauer modificada, usando tinte de Turk. Los recuentos de
células diferenciales se realizaron en preparaciones de citospina
(Shandon III) teñidas con May Grunwald-Giemsa
usando criterios morfológicos estándar para identificar los tipos de
células. Los resultados se presentan como el número de células por
pulmones (véase Fig. 11).
Para inducir respuestas de las vías
respiratorias a OVA, los ratones se sensibilizaron con una inyección
s.c. de 10 \mug de OVA precipitada en 2 mg de hidróxido de
aluminio (2%) en un volumen total de 200 \mul. Catorce días
después de la sensibilización, los ratones recibieron PBS o una
solución de OVA al 1% diluida en PBS con aerosol durante 20 min.
Para ensayar la inhibición, se administró CbBP-59
(0,5 mg/kg) s.c. 45 min antes y cada 12h después de la prueba de
provocación con antígeno. Cuarenta y ocho horas después de la
inyección, los ratones fueron sacrificados y se llenaron los
pulmones in situ con 0,3 ml de PBS estéril mediante una
cánula traqueal. Se extrajo fluido de los pulmones después de
masajear suavemente para extraer células y se recogió en un tubo de
plástico sobre hielo. Este procedimiento se repitió tres veces, y
las suspensiones celulares recuperadas de cada animal se mezclaron
para ratones individuales. Los recuentos de células totales se
realizaron en una cámara Neubauer modificada, usando tinte de Turk.
Los recuentos de células diferenciales se realizaron en
preparaciones de citospina (Shandon HI) teñidas con May
Grunwald-Giemsa, usando criterios morfológicos
estándar para identificar tipos de células. Los resultados se
presentan como el número de células por pulmones (véase Fig.
12).
Bajo anestesia, (cetamina 3,2 mg/ratón y
xilazina 0,16 mg/ratón), se instiló 0,125 U Bleomicina (Bonar,
Laboratório Sintética, Brasil) en 30 \mul PBS en la tráquea de
ratón con una aguja 25-G insertada entre los anillos
cartilaginosos de la tráquea. Los animales control recibieron
solución salina sola. El sitio de traqueotomía se suturó, y se dejó
que los animales se recuperaran. Para ensayar la inhibición, se
administró ChBP-59 (0,5 mg/kg) s.c. 45 min antes y
cada 12 h después de la instilación con bleomicina. Dos u ocho días
después de la instilación, los ratones fueron sacrificados y se
llenaron los pulmones in situ con 0,3 mL de PBS estéril
mediante una cánula traqueal. Se extrajo fluido de los pulmones
después de masajear suavemente para extraer las células, y se
recogió en un tubo de plástico sobre hielo. Este procedimiento se
repitió tres veces, y las suspensiones celulares recuperadas de
cada animal se mezclaron para ratones individuales. Los recuentos
de células totales se realizaron en una cámara Neubauer modificada,
usando tinte de Turk. Los recuentos de células diferenciales se
realizaron en preparaciones de citospina (Shandon III) teñidas con
May Grunwald-Giemsa, usando criterios morfológicos
estándar para identificar los tipos de células. Los resultados se
presentan como el número de células por pulmones (véase Fig.
13).
Todos los resultados se presentan como error
estándar de la media. Los datos normalizados se analizaron por
análisis ANOVA de un factor, y las diferencias entre los grupos se
determinaron usando
Student-Newman-Keuls como prueba
posterior. Un valor p < 0,05 se consideró significativo.
Se ensayó la capacidad de
ChBP-59 de inhibir el reclutamiento de células
inducido por MIP-1\alpha en la cavidad
peritoneal. En una dosis única de 1,5 mg/kg, la inhibición más
significativa se observó para los granulocitos, que no es el caso
en el sistema humano en el que MIP-1\alpha recluta
predominantemente monocitos. Se realizó un segundo experimento con
dosis que oscilaban entre 0,15 y 5 mg/kg en dos cepas de murino,
Balb/C y C57B6. El número de eosinófilos reclutados en los ratones
Balb/C fue insuficiente para cuantificar su inhibición, pero se
observó buena inhibición de neutrófilos en ambas cepas en todas las
dosis, y se seleccionó 0,5 mg/kg para los experimentos
subsiguientes. La microscopia intravital confirmó que
ChBP-59 inhibía las tres etapas implicadas en el
proceso de reclutamiento, rodaje, adhesión y emigración.
Debido a la inhibición potente del reclutamiento
de eosinófilos, se ensayó la capacidad de ChBP-59 de
inhibir el reclutamiento de estas células en el pulmón, en un
modelo de sensibilización de Th2, como también en inflamación
pulmonar inducida por ovalbúmina. En ambos casos, se observó
inhibición potente del reclutamiento de eosinófilos, con poco
efecto sobre las células mononucleares. Ya que la inflamación
pulmonar inducida por bleomicina es mediada por granulocitos
neutrófilos, también se ensayó en este modelo, y se observó
inhibición significativa de neutrófilos tanto en los días 2 como 8
después de la sensibilización.
Estos resultados permiten la interpretación de
que sería probable inhibir el reclutamiento mononuclear en seres
humanos.
En consecuencia, se puede concluir que
ChBP-59 es una nueva proteína que tiene propiedades
de unión a la quimiocina CC, inhibiendo así la acción de las
quimiocinas. Esta proteína se puede aplicar útilmente en medicina
humana como compuesto antiinflamatorio, como también en problemas
de indicaciones médicas y veterinarias relacionadas con los efectos
parasíticos de garrapatas, incluyendo agentes infecciosos
transmitidos por garrapatas. Las moléculas basadas en las proteínas
de la invención que interfieren con la función de dichas proteínas
podrían romper el ciclo vital de la garrapata, controlar los
ectoparásitos y sus patógenos, o reducir la capacidad de las
garrapatas de transmitir los organismos causantes de la
enfermedad.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<160> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn version 3.1
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 247
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Ectromelia virus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,6cm
\hskip0,6cm
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 744
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Ectromelia virus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,6cm
\hskip0,6cm
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 460
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Rhipicephalus sanguineus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,6cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 342
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Rhipicephalus sanguineus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,6cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 114
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Rhipicephalus sanguineus
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\hskip0,6cm
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 94
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Rhipicephalus sanguineus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\hskip0,6cm
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Constructo sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipaagcaggctt cgccaccatg acgtttaagg cttgcattg
\hfill39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Constructo sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgtgatggtga tggtgattct tcttgtctcg ccaattg
\hfill37
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Constructo sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggggacaagt ttgtacaaaa aagcaggctt cgccacc
\hfill37
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 51
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Constructo sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggggaccact ttgtacaaga aagctgggtt tcaatggtga tggtgatggt g
\hfill51
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Constructo sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgccagcttgg cacttgatgt
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Constructo sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgatggaggtg gacgtgtcag
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Constructo sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptcttctacgg caaggtgctg
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Constructo sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipaagcaagtaa aacctctaca
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 430
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Constructo sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,6cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 360
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Constructo sintético
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,6cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 120
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Constructo sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,6cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 100
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Constructo sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,6cm
\hskip0,6cm
Claims (37)
1. Un polipéptido seleccionado del grupo que
consiste en:
a) una proteína que comprende una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59 (SEC ID NO: 5);
b) una proteína que comprende una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59 maduro (SEC ID NO: 6);
c) una proteína que comprende una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59-HIS (SEC ID
NO: 17);
d) una proteína que comprende una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59-HIS maduro
(SEC ID NO: 18);
e) una proteína codificada por una molécula de
ácido nucleico capaz de hibridación a una secuencia de ácido
nucleico que codifica una proteína de a), b), c) o d) bajo
condiciones moderadamente rigurosas, codificando dicho ácido
nucleico una proteína que se une a una quimiocina CC;
f) una proteína por lo menos aproximadamente 70%
idéntica en secuencia de aminoácidos a una proteína de a), b), c) o
d), y que se une a una quimiocina CC;
g) una proteína que comprende un fragmento de
una proteína de a), b), c), d), o) o f), en donde el fragmento se
une a una quimiocina CC.
2. El polipéptido según la reivindicación 1,
seleccionado del grupo que consiste en:
a) una proteína que tiene una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59 (SEC ID NO: 5);
b) una proteína que tiene una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59 maduro (SEC ID NO 6);
c) una proteína que tiene una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59-HIS (SEC ID
NO: 17);
d) una proteína que tiene una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59-HIS maduro
(SEC ID NO: 18);
e) una proteína que comprende un fragmento de
una proteína de a), b), c) o d), en donde el fragmento se une a una
quimiocina CC.
3. Un mutante activo de una proteína según se ha
definido en la reivindicación 1 ó 2 en donde en el mutante se han
añadido, eliminado o sustituido uno o más residuos aminoácido y en
donde el mutante se une a una quimiocina CC.
4. El mutante activo de una proteína según la
reivindicación 3, caracterizado porque dicho mutante
contiene:
a) un residuo Cisteína en la posición
correspondiente a los residuos 32, 49, 53, 66, 85, 90, 95 y 104 de
ChBP-59, de acuerdo con la SEC ID NO: 5; y
b) un sitio de glucosilación en la posición
correspondiente a Asparagina 39, 54 y 62 de ChBP-59,
de acuerdo con la SEC ID NO:5.
5. Una proteína de fusión que comprende una
proteína según se ha definido en cualquiera de las reivindicaciones
1 a 4, operativamente unida a una o más secuencias de aminoácidos
seleccionadas entre las siguientes: un dominio extracelular de una
proteína unida a una membrana, una región constante de
inmunoglobulina, un dominio de multimerización, una hormona de la
proteína heterodimérica, un péptido de señal, una señal de
exportación y una secuencia de marcador.
6. La proteína según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 5, caracterizada porque dicho
polipéptido está modificado
post-traduccionalmente.
7. La proteína según la reivindicación 6,
caracterizada porque dicha proteína está glucosilada.
8. La proteína según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 7, caracterizada porque dicha proteína
está en la forma de una fracción activa, precursor, sal, derivado,
conjugado, complejo, o está PEGilada.
9. Una molécula de ácido nucleico que codifica
un polipéptido según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a
8.
10. Una molécula de ácido nucleico según la
reivindicación 9, seleccionada del grupo que consiste en:
a) una molécula de ácido nucleico que codifica
una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos de
ChBP-59 (SEC ID NO: 5);
b) una molécula de ácido nucleico que codifica
una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos de
ChBP-59 maduro (SEC ID NO: 6);
c) una molécula de ácido nucleico que codifica
una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos de
ChBP-59-HIS (SEC ID NO: 17);
d) una molécula de ácido nucleico que codifica
una proteína que comprende una secuencia de aminoácidos de
ChBP-59-HIS maduro (SEC ID NO:
18);
e) una molécula de ácido nucleico capaz de
hibridación a una molécula de ácido nucleico de a), b), c) o d)
bajo condiciones rigurosas, y que codifica una proteína que se une a
una quimiocina CC;
f) una molécula de ácido nucleico que codifica
una proteína por lo menos aproximadamente 70% idéntica en secuencia
de aminoácidos a una proteína de a), b), c) o d), y que se une a una
quimiocina CC;
g) una molécula de ácido nucleico que codifica
una proteína que comprende un fragmento de una proteína codificada
por una molécula de ácido nucleico de a), b) c), d), e) o f), en
donde el fragmento se une a una quimiocina CC; y
h) una variante degenerada de una molécula de
ácido nucleico de a), b), c), d), e), f) o g).
11. La molécula de ácido nucleico según la
reivindicación 10, en la que dicha molécula de ácido nucleico
codifica una proteína seleccionada del grupo que consiste en:
a) una proteína que tiene una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59 (SEC ID NO: 5);
b) una proteína que tiene una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59 maduro (SEC ID NO 6);
c) una proteína que tiene una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59-HIS (SEC ID
NO: 17);
d) una proteína que tiene una secuencia de
aminoácidos de ChBP-59-HIS maduro
(SEC ID NO: 18);
e) una proteína que comprende un fragmento de
una proteína de a), b), c) o d), en donde el fragmento se une a una
quimiocina CC;
f) un mutante activo de una proteína de a), b),
c) o d), en donde en el mutante se han añadido, eliminado o
sustituido uno o más residuos aminoácido y en donde el mutante se
une a una quimiocina CC; y
g) una proteína de fusión, en donde la proteína
de fusión comprende una proteína de a), b), c), d), e) o f)
operativamente unida a una o más secuencias de aminoácidos
seleccionadas entre las siguientes: un dominio extracelular de una
proteína unida a una membrana, una región constante de
inmunoglobulina, un dominio de multimerización, un péptido de
señal, una señal de exportación, una secuencia de marcador.
12. La molécula de ácido nucleico según una
cualquiera de las reivindicaciones 9 a 11, caracterizada
porque la quimiocina CC es CCL5/RANTES, CCL3/MIP-1
alfa y/o CCL2/MCP-1.
13. La molécula de ácido nucleico según una
cualquiera de las reivindicaciones 9 a 12, en la que dicha molécula
es una molécula de DNA, particularmente una molécula de cDNA.
14. La molécula de ácido nucleico según la
reivindicación 9, en la que dicha molécula comprende o es una
secuencia de DNA de la SEC ID NO: 3 ó 15.
15. La molécula de ácido nucleico según la
reivindicación 9, en la que dicha molécula comprende o es una
secuencia de DNA de la SEC ID NO: 4 ó 16.
16. Un oligonucleótido que comprende un
fragmento de un ácido nucleico según la reivindicación 10 u 11,
seleccionado del grupo que consiste en oligonucleótidos de por lo
menos aproximadamente 20 nucleótidos de longitud, oligonucleótidos
de por lo menos aproximadamente 30 nucleótidos de longitud y
oligonucleótidos de por lo menos aproximadamente 50 nucleótidos de
longitud.
17. Un vector de clonación o expresión que
comprende una molécula de ácido nucleico según una cualquiera de
las reivindicaciones 9 a 15.
18. Un vector de expresión según la
reivindicación 17, que además comprende un promotor operativamente
unido asociado a dicha molécula de ácido nucleico, en particular un
promotor específico de tejido, constitutivo o
inducible.
inducible.
\newpage
19. Una célula hospedante transformada o
transfectada con un vector de expresión según la reivindicación 17
ó
18.
18.
20. Una célula que ha sido genéticamente
modificada para producir una proteína según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 8.
21. Un procedimiento para preparar un
polipéptido, que comprende cultivar una célula hospedante según la
reivindicación 19 ó 20, bajo condiciones que permiten o promueven
la expresión.
22. El procedimiento según la reivindicación 21,
que además comprende purificar la proteína.
23. El procedimiento según la reivindicación 21
ó 22, que además comprende formular la proteína para administración
a seres humanos.
24. Un animal no humano, transgénico que expresa
una proteína de unión a la quimiocina CC, caracterizado
porque las células de dicho animal contienen una molécula de ácido
nucleico aislada o recombinante de una cualquiera de las
reivindicaciones 9 a 15, o un vector de expresión de la
reivindicación 17 ó 18.
25. Un anticuerpo que se une selectivamente a un
polipéptido según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a
8.
8.
26. Un anticuerpo según la reivindicación 25,
que es un anticuerpo monoclonal.
27. El anticuerpo según la reivindicación 25 ó
26, que es un anticuerpo quimérico, humanizado o humano, o un
fragmento de anticuerpo tal como Fab, F(ab)^{2},
scFv o un anticuerpo de dominio.
28. Una composición farmacéutica que comprende
un polipéptido según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8,
o un ácido nucleico según una cualquiera de las reivindicaciones 9 a
18, o una célula según las reivindicaciones 19 ó 20, y un diluyente
o vehículo farmacéuticamente aceptable.
29. Un polipéptido según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 8, o una composición según la reivindicación
28, para uso como medicamento.
30. Un polipéptido según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 8, o una composición según la reivindicación
28, para uso en la regulación de una respuesta inmunitaria o
inflamatoria en un mamífero.
31. Un polipéptido según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 8, o una composición según la
reivindicación 28, para uso en el tratamiento o la prevención de
trastornos relacionados con la quimiocina CC en animales.
32. El uso de un polipéptido según una
cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8, como ingrediente activo en
la elaboración de un medicamento para tratar o prevenir un
trastorno inmunitario o inflamatorio en un mamífero.
33. El uso según la reivindicación 32,
caracterizado porque el trastorno inmunitario o inflamatorio
es causado por CCL5/RANTES, CCL3/MIP-1 alfa o
CCL2/MCP-1.
34. El uso según la reivindicación 32 ó 33, en
el que el trastorno inmunitario o inflamatorio es una enfermedad
autoinmunitaria, una infección, una enfermedad alérgica, una
enfermedad cardiovascular, una enfermedad metabólica, una
enfermedad gastrointestinal, una enfermedad neurológica, septicemia,
una enfermedad relacionada con rechazo a trasplantes o una
enfermedad fibrótica.
35. El uso de un polipéptido según una
cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8, en la preparación de un
medicamento para la vacunación de un mamífero contra parásitos,
virus o bacterias.
36. Un estuche para detectar una quimiocina CC o
un análogo, una proteína o un receptor de unión a la quimiocina, la
interacción de la quimiocina CC y una proteína de unión a la
quimiocina CC, o antagonistas o agonistas de dicha interacción, que
comprende un reactivo de detección y por lo menos un compuesto
seleccionado del grupo que consiste en:
a) Una molécula de ácido nucleico según la
reivindicación 9;
b) Un oligonucleótido según la reivindicación
16;
c) Un polipéptido según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 8; y
d) Un anticuerpo según la reivindicación 25, 26
ó 27.
37. Un método para detectar una quimiocina CC o
un análogo in vitro o in vivo, una proteína o un
receptor de unión a la quimiocina CC, la interacción de una
quimiocina CC y una proteína de unión a la quimiocina CC, o
antagonistas o agonistas de dicha interacción, en donde dicho método
comprende poner en contacto una muestra con un compuesto
seleccionado del grupo que consiste en:
a) Una molécula de ácido nucleico según la
reivindicación 9;
b) Un oligonucleótido según la reivindicación
16;
c) Un polipéptido según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 8; y
d) Un anticuerpo según la reivindicación 25, 26
ó 27.
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