ES2323392T3 - Ligando (act-4-l) para un receptor situado sobre la superficie de las celulas t cd4+activadas. - Google Patents
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Abstract
LA INVENCION SE REFIERE A CIERTOS MIEMBROS DE UNION ESPECIFICOS, EN PARTICULAR LIGANDOS Y FRAGMENTOS, VARIANTES, MUTANTES O DERIVADOS PARA UN RECEPTOR SOBRE LA SUPERFICIE DE CELULAS-T ACTIVADAS P. EJ. CELULAS-T DC4{SUP,+} ACTIVADAS. LOS LIGANDOS EJEMPLARES ESTAN BASADOS EN UN LIGANDO DESIGNADO TCA-4L-H-1. LOS FRAGMENTOS PREFERIDOS INCLUYEN DOMINIOS EXTRACELULARES DE LIGANDOS. ADEMAS LA INVENCION PROPORCIONA CIERTAS PORCIONES DE UNION CON ESPECIFICIDAD PARA LOS MIEMBROS DE UNION ESPECIFICOS ANTERIORMENTE MENCIONADOS. LAS PORCIONES DE UNION ADECUADAS INCLUYEN ANTICUERPOS HUMANIZADOS Y HUMANOS PARA EL LIGANDO. LA INVENCION ADEMAS PROPORCIONA SEGMENTOS DE ACIDO NUCLEICO QUE CODIFICAN TALES MIEMBROS DE UNION ESPECIFICOS O PORCIONES DE UNION ASI COMO VECTORES DE EXPRESION Y LINEAS DE CELULAS QUE LOS INCLUYEN. LA INVENCION ADEMAS PROPORCIONA COMPOSICIONES FARMACEUTICAS QUE CONTIENEN LOS MIEMBROS DE UNION ESPECIFICOS Y LAS PORCIONES ESPECIFICAS JUNTO CON LOS METODOS PARA LA UTILIZACION DE LOS MIEMBROS DE UNION ESPECIFICOS Y PORCIONES DE UNION EN EL TRATAMIENTO DE VARIAS ENFERMEDADES Y CONDICIONES DEL SISTEMA INMUNE. TAMBIEN SE PROPORCIONAN POR LA INVENCION METODOS PARA EL CONTROL DE LAS CELULAS-T ACTIVADAS P. EJ. CELULAS-T DC4{SUP,+} ACTIVADAS USANDO LOS MIEMBROS DE UNION ESPECIFICOS O FRAGMENTOS DE LOS MISMOS, JUNTO CON LOS MATERIALES NECESARIOS PARA SU USO EN ESTOS METODOS.
Description
Ligando
(ACT-4-L) para un receptor situado
sobre la superficie de las células T CD4^{+} activadas.
La presente invención se refiere de manera
general al aislamiento y caracterización de un ligando
(ACT-4-L) para un receptor situado
sobre la superficie de las células T CD4^{+} activadas. Asimismo,
la presente invención proporciona anticuerpos contra el ligando y
procedimientos para utilizar el ligando y los anticuerpos en el
seguimiento y/o modulación de las respuestas inmunológicas.
Las respuestas inmunológicas se encuentran
mayoritariamente mediadas por una colección diversa de células
sanguíneas periféricas denominadas leucocitos. Entre los leucocitos
se incluyen linfocitos, granulocitos y monocitos. Los granulocitos
se subdividen adicionalmente en neutrófilos, eosinófilos y
basófilos. Los linfocitos se subdividen adicionalmente en
linfocitos T y B. Los linfocitos T se originan en las células madre
del embrión asignadas a linfocitos. La diferenciación se produce en
el timo y sigue las etapas intermedias protimocítica, timocítica
cortical y timocítica medular, produciendo diversos tipos de células
T maduras. Entre estos subtipos se incluyen las células T CD8^{+}
(también conocidas como células T citotóxicas/supresoras) que, al
activarse, presentan la capacidad de lisar células diana, y las
células T CD4^{+} (también conocidas como células T ayudantes y
células T inductoras) que, al activarse, presentan la capacidad de
estimular otros tipos celulares del sistema inmunológico.
Las respuestas del sistema inmunológico se
inducen en varias situaciones diferentes. La respuesta más
frecuente es una protección deseable frente a microorganismos
infecciosos. Sin embargo, puede producirse una respuesta
inmunológica no deseada tras el trasplante de tejido foráneo o en
una enfermedad autoinmunológica, en la que uno de los propios
antígenos del cuerpo es la diana para la respuesta inmunológica. Las
respuestas inmunológicas también pueden ser iniciadas in
vitro por mitógenos o anticuerpos contra determinados
receptores. En cada una de estas situaciones, se transduce una
respuesta inmunológica a partir de un suceso de estimulación
mediante una interacción compleja de tipos celulares leucocíticos.
Sin embargo, los tipos celulares participantes y la naturaleza de
la interacción entre los tipos celulares puede variar para
diferentes sucesos de estimulación. Por ejemplo, las respuestas
inmunológicas contra las bacterias invasoras con frecuencia se
transducen mediante la formación de complejos entre un receptor del
MHC de clase II y un antígeno bacteriano, que después activan
células T CD4^{+}. En contraste, las respuestas inmunológicas
contra infecciones víricas son transducidas principalmente por la
formación de complejos de MHC de clase I/antígenos víricos y la
posterior activación de las células CD8^{+}.
En años recientes se han identificado muchos
antígenos de superficie celular de leucocitos, algunos de los
cuales se ha demostrado que presentan un papel en la transducción de
señales. Se ha descubierto que pueden transducirse señales entre un
receptor de superficie celular y un ligando soluble o un ligando
unido a la superficie celular. Las secuencias de aminoácidos de las
moléculas de superficie de los leucocitos comprenden varias
secuencias o motivos recurrentes característicos. Estos motivos se
ha predicho que se encuentran relacionados evolutivamente,
presentan patrones de plegamiento similares y median en tipos
similares de interacciones. Se han descrito varias superfamilias,
incluyendo las superfamilias de receptor de inmunoglobulina y de
receptor del factor de crecimiento nervioso. Entre los miembros de
la familia del receptor del factor de crecimiento nervioso se
incluyen NGFR, presente sobre las células neurales, el antígeno CD40
de las células B, el antígeno OX-40 de rata,
presente sobre las células CD4^{+} activadas (Mallet et
al., EMBO J. 9:1063-1068, 1990) (incorporado en
la presente invención como referencia a todos los fines), dos
receptores del factor de necrosis tumoral (TNF),
LTNFR-1 y TNFR-II, presente en una
diversidad de tipos celulares; 4-1BB presente sobre
las células T, SFV-T2, un marco de lectura abierta
en el virus del fibroma de Shope, y posiblemente fas, CD27 y
CD30 (ver de manera general Mallet y Barclay, Immunology Today
12:220-222, 1990) (incorporado en la presente
invención como referencia a todos los fines).
La identificación de receptores de superficie
celular ha sugerido nuevos agentes para suprimir respuestas
inmunológicas no deseables, tales como el rechazo del trasplante, la
enfermedad autoinmunológica y la inflamación. Algunos agentes,
particularmente los anticuerpos, que bloquean la unión de las
células inmunológicas a moléculas solubles o receptores unidos a
células puede afectar negativamente a las respuestas inmunológicas.
Idealmente, un agente debería bloquear únicamente las respuestas
inmunológicas no deseadas (por ejemplo el rechazo del trasplante),
dejando una capacidad residual de producir respuestas deseables (por
ejemplo la respuesta frente a microorganismos patogénicos). La
acción inmunosupresora de algunos agentes, por ejemplo los
anticuerpos contra el receptor CD3 y el receptor
IL-2, ya han sido probados en ensayo clínico. Aunque
algunos ensayos han mostrado resultados positivos, siguen
existiendo problemas significativos. En primer lugar, un paciente
puede desarrollar una respuesta inmunológica contra el agente de
bloqueo, interrumpiendo los efectos inmunosupresores a menos que se
encuentren disponibles otros agentes diferentes. En segundo lugar,
las células que expresan el antígeno diana podrían ser capaces de
adaptarse a la presencia del agente de bloqueo cesando la expresión
del antígeno aunque conservando funciones inmunológicas. En esta
situación, resulta ineficaz el tratamiento continuo con un único
agente inmunosupresor. En tercer lugar, muchas dianas para agentes
terapéuticos se encuentran situadas sobre más de un subtipo de
leucocito, con el resultado de que generalmente no resulta posible
bloquear o eliminar selectivamente la respuesta de únicamente
subtipos celulares específicos, y de esta manera se conserva una
capacidad inmunológica residual para combatir microorganismos
infecciosos. Basándose en lo anteriormente expuesto, resulta
evidente que existe una necesidad de agentes adicionales y mejorados
capaces de suprimir respuestas inmunológicas, particularmente
agentes capaces de supresión selectiva. La presente invención
satisface ésta y otras necesidades, en parte, al proporcionar un
ligando (ACT-4-L) para un receptor
localizado sobre linfocitos T CD4^{+} activados.
Godfrey et al., Tissue Antigens
42(4):253, describen un homólogo humano del antígeno
OX-0 de rata. La secuencia de aminoácidos completa
tal como se muestra en la fig. 10 se da a conocer en Muira et
al., Mol. Cell Biol. 11:1313-1325, 1991, como
comprendiendo una proteína gp34, aunque no se asigna ninguna
utilidad a la misma. Se cultivaron anticuerpos contra esta
proteína.
La invención proporciona una pareja de unión
específica para un polipéptido receptor ACT-4 que es
un polipéptido según las reivindicaciones.
En particular la invención se refiere a
polipéptidos ligandos ACT-4L purificados según las
reivindicaciones.
Asimismo, la invención proporciona dominios
extracelulares purificados de ligandos ACT-4L según
se define en las reivindicaciones. Estos dominios comprenden por lo
menos cinco aminoácidos contiguos del dominio extracelular
ACT-4-L-h-1
de longitud completa. El dominio extracelular se encuentra
localizado en la región C-terminal, corriente abajo
del sitio SmaI de la secuencia de ácidos nucleicos mostrada en la
figura 10. Algunos de estos dominios extracelulares son de longitud
completa.
Algunas parejas de unión específica, tales como
los dominios extracelulares, inhiben la activación in vitro
de las células T CD4^{+} que expresan el receptor
ACT-4-h-1 sobre la
superficie de las mismas. Otras parejas de unión específica, tales
como los dominios extracelulares, estimulan la activación in
vitro de dichas células T. En el caso de que la pareja de unión
específica sea un fragmento de ligando, puede competir con la
pareja de unión específica mostrada en la figura 10 para la unión a
un anticuerpo.
Cualquiera de las parejas de unión específica
anteriormente indicadas, incluyendo los dominios extracelulares,
puede comprender además un segundo polipéptido unido que puede
conjugarse covalentemente o formar parte de una proteína de fusión.
Entre los ejemplos de polipéptidos unidos adecuados se incluyen la
región constante de una cadena pesada de inmunoglobulina, así como
toxinas o marcajes.
Las parejas de unión específica de la invención
convenientemente se encuentran en forma soluble y pueden marcarse.
En particular, la invención proporciona un polipéptido soluble que
es un agente de unión específica capaz de unión específica a
ACT-4. Este polipéptido presentará la secuencia de
aminoácidos de la figura 10, excepto por la subsecuencia
transmembranal de la misma.
Asimismo, la invención se refiere a grupos de
unión, tales como anticuerpos según se definen en las
reivindicaciones, que se unen específicamente a
ACT-4-L-h-1,
preferentemente a un dominio extracelular del mismo.
La invención también proporciona un grupo de
unión según se define en las reivindicaciones.
Un aspecto adicional de la invención comprende
un ácido nucleico según se define en las reivindicaciones. Estos
segmentos de ácidos nucleicos pueden utilizarse en la preparación de
las proteínas respectivas mediante la incorporación en un vector de
expresión replicable apropiado y la incorporación en una célula
huésped que sea una célula procariótica o eucariótica, que
seguidamente se cultiva. Las líneas celulares y vectores implicados
en este procedimiento forman aspectos adicionales de la invención
definida en las reivindicaciones.
En otro aspecto, la invención se refiere a
composiciones farmacéuticas según se define en las
reivindicaciones.
La invención resulta útil en procedimientos para
modificar una respuesta inmunológica en un paciente, por ejemplo
suprimir la respuesta inmunológica, comprendiendo los procedimientos
administrar una cantidad eficaz de una composición farmacéutica,
tal como aquéllas indicadas anteriormente. La administración puede
llevarse a cabo ex vivo. Los agentes preferentes son
anticuerpos monoclonales, polipéptidos ligandos
ACT-4-L y polipéptidos receptores
ACT-4. La invención también resulta útil en
procedimientos para suprimir una respuesta inmunológica en la que
el agente compite con el ligando
ACT-4-L-H1 para la
unión específica al receptor
ACT-4-h-1. Los
procedimientos resultan útiles en el tratamiento de un paciente que
presenta una enfermedad o condición inmunológica. Entre los
ejemplos de condiciones en las que estos procedimientos pueden
resultar útiles se incluyen el rechazo del trasplante, GVHD, una
enfermedad autoinmunológica, inflamación, agentes infecciosos,
células infectadas por HTVL o por VIH, así como enfermedad o
trastorno intestinal inflamatorio.
La invención también proporciona un
procedimiento in vitro de cribado según se define en las
reivindicaciones.
Los procedimientos pueden utilizarse para el
cribado de agentes inmunosupresores, en cuyo caso los
procedimientos comprenden poner en contacto una pareja de unión
específica, en particular un polipéptido ligando
ACT-4-L-h-1,
con un potencial agente inmunosupresor. Se detecta la unión
específica entre el polipéptido ligando
ACT-4-L-h-1
y el agente. La unión específica es indicativa de actividad
inmunosupresora.
Fig. 1: Tinción de dos colores de linfocitos
sanguíneos periféricos para analizar la expresión de
ACT-4h-1 en diferentes tipos
celulares.
Fig. 2: cinética de la expresión de
ACT-4h-1 sobre células T CD4^{+}
activadas por aloantígeno. MCF=fluorescencia media por canal.
Fig. 3: cinética de la expresión de
ACT-4-h-1 sobre
células T CD4^{+} activadas por el toxoide del tétanos.
Fig. 4: cinética de la expresión de
ACT-4h-1 sobre células T CD4^{+}
activadas por PHA.
Fig. 5: secuencia de ADNc (parte superior) y
deducida de aminoácidos (parte inferior) de
ACT-4-h-1. La figura
indica las localizaciones de una secuencia de señal
N-terminal, dos posibles sitios de corte de señal
(flechas verticales), dos sitios de glucosilación (gly), un dominio
transmembranal (TM), un codón de parada y una secuencia de señal
poli-A.
Fig. 6: construcción de vector de expresión para
la producción de transfectantes estables que expresan
ACT-4h-1.
Fig. 7: análisis FACS^{TM} que muestra la
expresión de
ACT-4-h-1 sobre
transfectantes estables de las líneas celulares
COS-7, Jurkat y SP2/O.
Fig. 8: fusión de un dominio extracelular de
ACT-4-h-1 con una
región constante de cadena pesada de inmunoglobulina para formar
una globulina recombinante.
Fig. 9: representación topográfica esquemática
de una globulina recombinante formada a partir de una fusión de un
dominio extracelular de
ACT-4-h-1 con una
región constante de cadena pesada de inmunoglobulina para formar
una globulina recombinante.
Fig. 10: secuencia de ADNc y secuencia de
aminoácidos predicha de
ACT-4-L-h-1.
Las regiones en cajas se refieren a un dominio transmembranal,
cuatros sitios de glucosilación y una señal
poli-A.
Las abreviaturas para los veinte aminoácidos
naturales siguen el uso convencional (Immunology - A Synthesis,
E.S. Golub y D.R. Gren, editores, Sinauer Associates, Sunderland,
MA, 2a edición, 1991) (incorporada en la presente invención como
referencia a todos los fines). Los estereoisómeros (por ejemplos los
D-aminoácidos) de los veinte aminoácidos
convencionales, aminoácidos no naturales tales como los aminoácidos
\alpha,\alpha-disustituidos, los
N-alquil aminoácidos, el ácido láctico y otros
aminoácidos no convencionales, también puede ser componentes
adecuados para los polipéptidos de la presente invención. Entre los
ejemplos de aminoácidos no convencionales se incluyen:
4-hidroxiprolina,
\gamma-carboxiglutamato,
\varepsilon-N,N,N-trimetillisina,
\varepsilon-N-acetil-lisina,
O-fosfoserina, N-acetilserina,
N-formilmetionina, 3-metilhistidina,
5-hidroxilisina,
\omega-N-metilarginina y otros
aminoácidos e iminoácidos similares (por ejemplo
4-hidroxiprolina). En la notación de los
polipéptidos utilizada en la presente invención, la dirección
izquierda es la dirección amino-terminal y la
dirección derecha es la dirección carboxi-terminal,
de acuerdo con el uso y convención estándares. De manera similar, a
menos que se especifique lo contrario, el extremo izquierdo de las
secuencias polinucleótidas monocatenarias es el extremo 5'; la
dirección izquierda de las secuencias polinucleótidas bicatenarias
se denomina dirección 5'. La dirección de adición 5' a 3' de los
transcritos nacientes de ARN se denomina dirección de transcripción;
las regiones de secuencia en la cadena de ADN que presentan la
misma secuencia en la cadena de ADN y que se encuentran en el lado
5' del extremo 5' del transcrito de ARN se denominan "secuencias
cadena arriba"; las regiones de secuencia en la cadena de ADN
que presentan la misma secuencia que el ARN y que se encuentran
situadas en el lado 3' del extremo 3' del transcrito de ARN se
denominan "secuencias cadena abajo".
La expresión "secuencia polinucleótida" se
refiere a un polímero de una o dos cadenas de bases
desoxiribonucleótidas o ribonucleótidas leído desde el extremo 5'
hasta el extremo 3'. Incluye plásmidos autoreplicantes, polímeros
infecciosos de ADN o ARN y ADN o ARN no funcional.
Las expresiones siguientes se utilizan para
describir las relaciones de secuencia entre dos o más
polinucleótidos: "secuencia de referencia", "ventana de
comparación", "identidad de secuencia", "porcentaje de
identidad de secuencia" e "identidad sustancial". Una
"secuencia de referencia" es una secuencia definida utilizada
como base para una comparación de secuencias: una secuencia de
referencia puede ser un subconjunto de una secuencia más grande,
por ejemplo un segmento de un ADNc de longitud completa o una
secuencia génica dada en un listado de secuencias, tal como una
secuencia polinucleótida mostrada en la fig. 5 o en la fig. 10, o
puede comprender una secuencia completa de ADNc o génica.
Generalmente, una secuencia de referencia presenta una longitud
mínima de 20 nucleótidos, frecuentemente de por lo menos 25
nucleótidos, y con frecuencia de por lo menos 50 nucleótidos.
Debido a que dos polinucleótidos pueden, cada uno, (1) comprender
una secuencia (es decir, una parte de la secuencia polinucleótida
completa) que es similar entre los dos polinucleótidos, y puede
comprender además una secuencia que es divergente entre los dos
polinucleótidos, las comparaciones entre secuencias de dos (o más)
polinucleótidos típicamente se llevan a cabo mediante la comparación
de secuencias de los dos polinucleótidos a lo largo de una
"ventana de comparación" para identificar y comparar regiones
locales de similitud de secuencia. Una "ventana de
comparación", tal como se utiliza en la presente invención, se
refiere a un segmento conceptual de por lo menos 20 posiciones
nucleótidas contiguas, en el que puede compararse una secuencia
polinucleótida con una secuencia de referencia de por lo menos 20
nucleótidos contiguos y en la que la parte de la secuencia
polinucleótida en la ventana de comparación puede comprender
adiciones o deleciones (es decir, huecos) de 20 por ciento o menos
en comparación con la secuencia de referencia (que no comprende
adiciones ni deleciones) para la alineación óptima de las dos
secuencias. La alineación óptima de secuencias para la alineación de
una ventana de comparación puede llevarse a cabo con el algoritmo
de homología local de Smith y Waterman, Appl. Math. 2:482, 1981,
mediante el algoritmo de alienación de homología de Needleman y
Wunsch, J. Mol. Biol. 48:443, 1970, mediante el procedimiento de
búsqueda de similitud de Pearson y Lipman, Proc. Natl. Acad. Sci.
(USA) 85:2444, 1988, mediante implementaciones computerizadas de
estos algoritmos (FASTDB (Intelligenetics), BLAST (National Center
for Biomedical Information), o GAP, BESTFIT, FASTA y TFASTA
(Wisconsin Genetics Software Package Release 7.0, Genetics Computer
Group, 575 Science Dr., Madison, WI) o mediante inspección, y se
selecciona la mejor alineación (es decir, la que resulte en el
porcentaje más elevado de similitud de secuencias a lo largo de la
ventana de comparación) generada mediante los diversos
procedimientos. La expresión "identidad de secuencia" se
refiere a que las dos secuencias polinucleótidas son idénticas (es
decir, nucleótido a nucleótido) a lo largo de la ventana de
comparación. La expresión "porcentaje de identidad de
secuencias" se calcula comparando dos secuencias óptimamente
alineadas a lo largo de la ventana de comparación, determinando el
número de posiciones en las que se encuentra la base ácido nucleico
idéntica (por ejemplo A, T, C, G, U o I) en ambas secuencias, de
manera que se obtiene el número de posiciones correspondientes, y
dividiendo el número de posiciones correspondientes por el número
total de posiciones en la ventana de comparación (es decir, el
tamaño de la ventana), y multiplicando el resultado por 100 para
obtener el porcentaje de identidad de secuencia. Las expresiones
"identidad sustancial" tal como se utiliza en la presente
invención se refiere a una característica de una secuencia
polinucleótida, en la que el polinucleótido comprende una secuencia
que presenta un porcentaje de identidad de secuencias de 70, 80 ó
85, preferentemente de por lo menos 90 a 95 por ciento, más
habitualmente de por lo menos 99 por ciento, comparado con una
secuencia de referencia a lo largo de una ventana de comparación de
por lo menos 20 posiciones nucleótidas, frecuentemente a lo largo
de una ventana de por lo menos 25 a 50 nucleótidos, en la que el
porcentaje de identidad de secuencia se calcula comparando la
secuencia de referencia con la secuencia polinucleótida, que puede
incluir deleciones o adicionales que en total constituyen 20 por
ciento o menos de la secuencia de referencia a lo largo de la
ventana de comparación. La secuencia de referencia puede ser un
subconjunto de una secuencia mayor, por ejemplo un segmento de la
secuencia de longitud completa de
ACT-4-h-1 mostrada
en la fig. 5 o un segmento de la secuencia de longitud completa de
ACT-4-L-h-1
mostrada en la fig. 10.
Aplicada a polipéptidos la expresión
"identidad sustancial" se refiere a que dos secuencias
peptídicas, tras alinearlas óptimamente, tal como mediante los
programas BLAZE (Intelligenetics), GAP o BESTFIT utilizando pesos
de hueco por defecto, comparten una identidad de secuencia de por lo
menos 70 por ciento u 80 por ciento, preferentemente por lo menos
90 por ciento, más preferentemente por lo menos 95 por ciento o más
(por ejemplo una identidad de secuencia de 99 por ciento).
Preferentemente las posiciones de residuo que no son idénticas
difieren por sustituciones conservadoras de aminoácidos. Las
sustituciones conservadoras de aminoácidos se refieren a la
intercambiabilidad de los residuos que presentan cadenas laterales
similares. Por ejemplo, un grupo de aminoácidos que presenta
cadenas laterales alifáticas es: glicina, alanina, valina, leucina e
isoleucina; un grupo de aminoácidos que presenta cadenas laterales
alifáticas-hidroxilo es: serina y treonina; un grupo
de aminoácidos que presenta cadenas laterales que contienen amida
es: asparagina y glutamina; un grupo de aminoácidos que presenta
cadenas laterales aromáticas es: fenilalanina, tirosina y
triptófano; un grupo de aminoácidos que presenta cadenas laterales
básicas es: lisina, arginina e histidina; y un grupo de aminoácidos
que presenta cadenas laterales que contienen azufre es: cisteína y
metionina. Los grupos preferentes de sustitución conservativa de
aminoácidos son:
valina-leucina-isoleucina,
fenilalanina-tirosina,
lisina-arginina, alanina-valina y
asparagina-glutamina.
La expresión "sustancialmente puro" se
refiere a que una especie es la especie presente predominante (es
decir, sobre una base molar, es más abundante que cualquier otra
especie individual en la composición) y preferentemente una
fracción sustancialmente purificada es una composición en la que la
especie comprende por lo menos aproximadamente 50 por ciento (sobre
una base molar) de todas las especies macromoleculares presentes.
Generalmente una composición sustancialmente pura comprenderá más de
aproximadamente 80 a 90 por ciento de todas las especies
macromoleculares presentes en la composición. Más preferentemente,
la especie se purifica hasta esencialmente la homogeneidad (no
pueden detectarse especies contaminantes en la composición mediante
procedimientos de detección convencionales), donde la composición
consiste esencialmente de una única especie macromolecular.
La expresión "natural" tal como se utiliza
en la presente invención aplicada a un objeto se refiere al hecho
de que un objeto puede encontrarse en la naturaleza. Por ejemplo,
una secuencia polipeptídica o polinucleótida presente en un
organismo (incluyendo los virus) que puede aislarse a partir de una
fuente natural y que no ha sido deliberadamente modificada por el
hombre en el laboratorio es natural.
El término "epítopo" incluye cualquier
determinante de proteína capaz de unirse específicamente a un
receptor de inmunoglobulina o de células T. Los determinantes
epitópicos habitualmente consisten de agrupaciones de moléculas de
superficie químicamente activas, tales como cadenas laterales de
aminoácidos o sacáridas y habitualmente presentan características
estructurales tridimensionales específicas, así como características
de carga específicas.
Se produce la unión específica cuando la
constante de disociación para un complejo dimérico es s 1 \muM,
preferentemente s 100 nM, y más preferentemente s 1 nM.
La expresión "variantes afines superiores"
tal como se utiliza en la presente invención se refiere a una
secuencia génica que se encuentra evolutiva y funcionalmente
relacionada entre seres humanos y especies de mamífero superior,
tales como primates, porcinos y bovinos. La expresión no incluye
secuencias génicas procedentes de roedores, tales como ratas. De
esta manera, el gen afín de primate del gen
ACT-4-h-1 es el gen
de primate que codifica una proteína expresada que presenta el grado
más alto de identidad de secuencia con la proteína receptora
ACT-4-h-1 y que
muestra un patrón de expresión similar al de la proteína
ACT-4-h-1 (es
decir, expresada sobre las células CD4^{+} activadas). De manera
similar, el gen afín de primate del gen
ACT-4-L-h-1
es el gen cuya proteína expresada muestra la máxima identidad de
secuencia con la proteína ligando
ACT-4-L-h-1
y que muestra un patrón de expresión similar (es decir, expresado
sobre las células B activadas).
Una población celular se encuentra
sustancialmente enriquecida en un tipo celular seleccionado cuando
ese tipo celular constituye por lo menos 30, 50 ó 70% de la
población.
El término "paciente" incluye sujetos
humanos y veterinarios.
Una sustancia de ensayo compite con una
referencia para la unión específica a un antígeno cuando un exceso
de la sustancia de ensayo inhibe sustancialmente la unión de la
referencia en un ensayo de competición. Se encuentran disponibles
numerosos tipos de ensayo de competición, incluyendo el
radioinmunoensayo y ELISA (ver Harlow y Lane, Antibodies, A
Laboratory Manual, Cold Spring Harbor, 1988). La inhibición
sustancial se refiere a que la sustancia de ensayo reduce la unión
específica de la referencia habitualmente en por lo menos 10%, 25%,
50%, 75% o 90%. Entre las sustancias de ensayo identificadas por un
ensayo de competición se incluyen aquéllas que se unen al mismo
epítopo que la referencia y aquéllas que se unen a un epítopo
contiguo suficientemente próximo al epítopo unido al anticuerpo de
referencia para que se produzcan impedimentos estéricos.
\vskip1.000000\baselineskip
En la presente invención se describen receptores
sobre la superficie de células T CD4^{+} activadas (denominadas
receptores ACT-4) y fragmentos de los mismos. La
expresión polipéptido receptor ACT-4 se utiliza
genéricamente para incluir proteínas de longitud completa y
fragmentos de las mismas. El término receptor ACT-4
habitualmente se reserva para proteínas de longitud completa. La
secuencia de aminoácidos del primer receptor ACT-4
que se ha caracterizado [en lo sucesivo en la presente invención
denominado
ACT-4-h-1] se
muestra en la fig. 5. El sufijo -h designa el origen humano y el
sufijo -1 indica que
ACT-4-h-1 es el
primer receptor ACT-4 que se ha caracterizado. La
expresión receptor ACT-4 se refiere no sólo a la
proteína que presenta la secuencia mostrada en la fig. 5, sino
también otras proteínas que representan variantes alélicas, no
alélicas y afines superiores de
ACT-4-h-1 y mutantes
naturales o inducidas de cualquiera de ellas. Habitualmente los
polipéptidos receptores ACT-4 también muestran
identidad de secuencia sustancial con la secuencia de
ACT-4-h-1.
Típicamente un polipéptido receptor ACT-4 contendrá
por lo menos 4, y más comúnmente 5, 6, 7, 10 ó 20, 50 o más
aminoácidos contiguas a la secuencia de
ACT-4-h-1. Es bien
conocido de la técnica que los dominios funcionales, tales como los
dominios de unión o epítopos pueden formarse a partir de tan sólo
cuatro residuos aminoácidos.
Los polipéptidos receptores
ACT-4 típicamente muestran una identidad de
secuencia de aminoácidos sustancial con la secuencia de aminoácidos
de ACT-4-h-1 y
pueden encontrarse codificados por secuencias de nucleótidos que
muestran identidad de secuencia sustancial con la secuencia de
nucleótidos codificante de
ACT-4-h-1 mostrada
en la fig. 5. Los nucleótidos codificantes de las proteínas
receptores ACT-4 también se hibridan típicamente a
la secuencia de
ACT-4-h-1 bajo
condiciones restrictivas. Sin embargo, estos nucleótidos
habitualmente no se hibridan bajo condiciones restrictivas al ácido
nucleico codificante del receptor OX-40, tal como
describen Mallet et al., EMBO J. 9:1063-68,
1990 (incorporada en la presente invención como referencia a todos
los fines) (ver particularmente la fig. 2A de la referencia Mallet
et al.). Las condiciones restrictivas son dependientes de la
secuencia y serán diferentes bajo circunstancias diferentes.
Generalmente se seleccionan las condiciones restrictivas para que
sean aproximadamente 5ºC inferiores al punto de fusión térmica (Tm)
para la secuencia específica una fuera iónica y pH definidos. La Tm
es la temperatura (bajo una fuerza iónica y pH definidos) a la que
50% de la secuencia diana se hibrida a una sonda perfectamente
correspondiente. Típicamente las condiciones restrictivas son
aquéllas en las que la concentración de sales es por lo menos
aproximadamente 0,02 molar a pH 7 y la temperatura es por lo menos
aproximadamente 60ºC. Debido a que otros factores pueden afectar
significativamente a la astringencia de la hibridación, incluyendo,
entre otros, la composición de bases y el tamaño de las cadenas
complementarias, la presencia de solventes orgánicos y el grado de
desapareamiento de las bases, la combinación de parámetros es más
importante que la magnitud absoluta de cualquiera de los
mismos.
Habitualmente los polipéptidos receptores
ACT-4 comparten por lo menos un determinante
antigénico con
ACT-4-h-1 pero no
son específicamente reactivos con anticuerpos
anti-polipéptido OX-40 de rata. La
existencia de un determinante antigénico común se pone de
manifiesto en la reactividad cruzada de la proteína variante con
cualquier anticuerpo preparado contra
ACT-4-h-1 (ver la
sección IV). La reactividad cruzada con frecuencia se somete a
ensayo utilizando sueros policlonales contra
ACT-4-h-1, aunque
también puede someterse a ensayo utilizando uno o más anticuerpos
monoclonales contra
ACT-4-h-1, tal como
el anticuerpo denominado L106.
Con frecuencia los polipéptidos receptores
ACT-4 contienen esqueletos polipéptidos modificados.
Entre las modificaciones se incluyen derivatizaciones químicas de
los polipéptidos, tales como acetilaciones, carboxilaciones y
similares. También se incluyen modificaciones por glucosilación
(N-ligada u O-ligada) y variantes de
procesamiento de un polipéptido típico. Entre estas etapas de
procesamiento se incluyen específicamente modificaciones
enzimáticas, tales como la ubiquitinización y la fosforilación
(ver, por ejemplo, Hershko y Ciechanover, Ann. Rev. Bioch.
51:335-364, 1982). La proteína
ACT-4-h-1, por
ejemplo, se encuentra fuertemente modificada, en el aspecto de que
el peso molecular observado es aproximadamente 50 kDa, mientras que
el peso molecular predicho basándose en la secuencia de aminoácidos
es de sólo 27 kDa. Se han identificado dos sitios de glucosilación
putativa en el dominio extracelular del mismo.
Los receptores ACT-4
probablemente comparten algunas o todas las características
topológicas que se han observado en
ACT-4-h-1. La
secuencia de aminoácidos de
ACT-4-h-1 contiene
una secuencia putativa de señal N-terminal de 22 ó
24 aminoácidos. La longitud de 24 aminoácidos de la secuencia más
probablemente se basa en los criterios de von Heijne, Nucleic Acids
Res. 14:4683-4690, 1986 (incorporada como referencia
a todos los fines). El receptor
ACT-4-h-1 contiene
un único tramo hidrofóbico adicional de 27 aminoácidos que comprende
los residuos 213 a 240. El tramo hidrofóbico probablemente
corresponde a un dominio transmembranal y su existencia es
consistente con que
ACT-4-h-1 sea una
proteína membranal integral de tipo I (es decir, que presenta un
único dominio transmembranal en el que el dominio
N-terminal comprende la región extracelular y el
extremo C-terminal comprende la región
intracelular). Los 189 ó 191 aminoácidos (dependiendo de la
localización exacta del sitio de corte de señal) de
ACT-4-h-1 situados
en el lado amino del segmento transmembranal se denominan
"dominio extracelular", mientras que los 37 aminoácidos en el
lado carboxi del segmento transmembranal se denominan "dominio
intracelular". Desde el extremo amino-terminal,
el dominio extracelular presenta una secuencia putativa de señal
hidrofóbica NH_{2}-terminal y tres bucles
intracadena formados mediante enlaces disulfuro entre residuos de
cisteína apareados.
La organización topológica de los polipéptidos
receptores ACT-4 resulta similar a la de otros
miembros de la familia del receptor del factor de crecimiento
nervioso, particularmente a la del receptor OX-40 de
rata. Sin embargo, los demás miembros muestran algunas divergencias
en el número de bucles disulfuro extracelulares y de sitios de
glucosilación, y en el tamaño del dominio intracelular (ver Mallet y
Barclay, supra).
Aunque no todos los dominios comentados
anteriormente se encuentran necesariamente presentes en todos los
polipéptidos receptores ACT-4, se espera la
presencia de un dominio extracelular en la mayoría. En efecto, en
algunos polipéptidos receptores ACT-4, resulta
posible la presencia de únicamente un dominio extracelular, y el
estado natural de estas proteínas no es como proteínas unidas a la
superficie celular sino como proteínas solubles, por ejemplo
dispersadas en un líquido corporal extracelular. La existencia de
formas variantes solubles ha sido observada en otros receptores de
superficie celular, incluyendo un miembro de la familia del receptor
del factor de crecimiento nervioso, SFV-T2 (ver
Mallet y Barclay, supra).
Aparte de polipéptidos de sustancialmente
longitud completa, se describen en la presente invención fragmentos
biológicamente activos de los polipéptidos. Entre las actividades
biológicas significativas se incluyen la unión de receptores, la
unión de anticuerpos (por ejemplo el fragmento compite con un
receptor ACT-4 intacto para la unión específica a
un anticuerpo), la inmunogenicidad (es decir, la posesión de
epítopos que estimulan las respuestas de células B o T contra el
fragmento) y el agonismo o antagonismo de la unión de un
polipéptido receptor ACT-4 a los ligandos del mismo.
Un segmento de una proteína receptor ACT-4 o un
dominio de la misma habitualmente comprende por lo menos 5, 7, 9,
11, 13, 16, 20, 40 ó 100 aminoácidos contiguos.
Con frecuencia se terminan segmentos de
polipéptidos receptores ACT-4 cerca de límites de
dominios funcionales o estructurales. Estos segmentos consisten
esencialmente de los aminoácidos responsables de una propiedad
funcional o estructural particular. Los dominios estructurales y
funcionales se identifican comparando los datos de secuencias de
nucleótidos y/o de aminoácidos, tal como se muestra en la fig. 5,
con bases de datos públicas o propietarias de secuencias.
Preferentemente se utilizan procedimientos computerizados de
comparación para identificar los motivos de secuencia o los dominios
predichos de conformación de proteína presentes en otras proteínas
de estructura y/o función conocida. Entre los dominios estructurales
se incluyen un dominio intracelular, un dominio transmembranal y un
dominio extracelular, que a su vez contiene tres bucles unidos por
enlaces disulfuro. Entre los dominios funcionales se incluyen un
dominio de unión extracelular a través de que interacciona el
polipéptido receptor ACT-4 con moléculas solubles
externas u otros ligandos unidos a células y un dominio transductor
de señales intracelulares.
Algunos fragmentos contienen únicamente dominios
extracelulares, tales como uno o más bucles unidos por enlace
disulfuro. Estos fragmentos con frecuencia conservan la
especificidad de unión de un polipéptido receptor
ACT-4, pero son solubles; no se encuentran unidos a
membrana. Estos fragmentos resultan útiles como inhibidores
competitivos de la unión del receptor ACT-4.
Los receptores ACT-4 se
identifican adicionalmente por su condición de miembros de la
familia del receptor del factor de crecimiento nervioso. La
secuencia de aminoácidos de
ACT-4-h-1 es por lo
menos 20% idéntica a NGF-R, TNF-R,
CD40, 4-1BB y fas/APO1.
ACT-4-h-1 muestra
una identidad de secuencia de aminoácidos de 62% con el gen
OX-40 de rata, que también se ha caracterizado
mediante expresión selectiva sobre células CD4+ activadas.
Los receptores ACT-4 también se
identifican por una distribución celular característica. Más
notablemente, los receptores ACT-4 habitualmente se
detectan con facilidad sobre células T CD4^{+} activadas (el
porcentaje de células que los expresan habitualmente es superior a
aproximadamente 25% o 50%, y con frecuencia aproximadamente 80%;
la fluorescencia media por canal habitualmente es superior a
aproximadamente 10, y con frecuencia aproximadamente de 20 a 25, en
un citómetro de flujo Coulter-Profile tras tinción
de inmunofluorescencia). Los receptores ACT-4
habitualmente están sustancialmente ausentes de las células en
reposo T, B (a menos que hayan sido activadas con PMA), NK y
monocitos (a menos que hayan sido activadas con PMA). La expresión
"sustancialmente ausente" se refiere a que el porcentaje de
células que expresa ACT-4 es habitualmente inferior
a aproximadamente 5% y más habitualmente inferior a aproximadamente
2%, y que el canal promedio es habitualmente inferior a
aproximadamente 4, y más habitualmente inferior a aproximadamente
2, medido en un citómetro de flujo Coulter-Profile
tras tinción de inmunofluorescencia de las células (ver el Ejemplo
2). Los receptores ACT-4 habitualmente se expresan
a niveles reducidos sobre las células CD8^{+} activadas (el
porcentaje de células expresantes es aproximadamente 4% a 10%;
fluorescencia media por canal de aproximadamente 2 a 4 en un
citómetro de flujo Coulter-Profile tras tinción de
inmunofluorescencia). El reducido nivel de expresión observado en
las células CD8^{+} sugiere que la expresión se limita a una
subpoblación de las células CD8^{+}. Se ha observado expresión de
receptores ACT-4 sobre la superficie de las células
CD4^{+} activadas mediante varios mecanismos diferentes,
incluyendo con estímulos aloantigénicos, un toxoide tetánico o un
mitogénico (por ejemplo PHA). La expresión alcanza un máximo tras
aproximadamente 78 días de estimulación aloantigénica o con toxoide
tetánico y tras aproximadamente tres días de estimulación con PHA.
Estos datos indican que los receptores ACT-4
deberían clasificarse como antígenos de activación temprana
sustancialmente ausentes en las células en reposo. La observación de
que los receptores ACT-4 se expresan
preferentemente sobre células CD4^{+} activadas y que se expresan
en un grado muy inferior sobre células CD8^{+} activadas, pero
que se encuentran sustancialmente ausentes de la mayoría o de todos
los demás subtipos de células linfoides (excepto en respuesta a
estímulos altamente no fisiológicos, tales como PMA) contrasta con
la especificidad de tipo celular de otros antígenos activadores
presentes en los leucocitos humanos.
La expresión de los receptores
ACT-4 sobre la superficie de las células T CD4^{+}
activadas sugiere que el receptor presenta un papel en la
activación de estas células. Este papel es consistente con el de
algunos otros miembros de la familia del receptor del factor de
crecimiento nervioso. Por ejemplo, CD40 estimula la transición
entre las fases G1 y S en los linfocitos B, y el receptor del factor
de crecimiento nervioso transduce una señal de la citoquina factor
de crecimiento nervioso, resultando en la diferenciación y
supervivencia neuronales (Barde, Neuron
2:1525-1534, 1989) (incorporada como referencia a
todos los fines). Sin embargo, también pueden contemplarse otros
papeles para los receptores ACT-4, por ejemplo la
interacción con otros tipos celulares linfoides. La existencia de
estos papeles es consistente con las diversas funciones de otros
miembros de la familia del receptor del factor de crecimiento
nervioso, tales como el factor de necrosis tumoral, la interacción
de los cuales con el receptor del factor de necrosis tumoral puede
resultar en inflamación o en la muerte de las células
tumorales.
Pueden fusionarse fragmentos o análogos que
comprenden sustancialmente uno o más dominios funcionales (por
ejemplo un dominio extracelular) de receptores ACT-4
con secuencias polipeptídicas heterólogas, de manera que la
proteína de fusión resultante muestra la propiedad o propiedades
funcionales proporcionadas por el fragmento del receptor
ACT-4 y/o por la pareja de fusión. La orientación
del fragmento de receptor ACT-4 respecto a la
pareja de fusión dependerá de consideraciones experimentales, tales
como la facilidad de construcción, la estabilidad frente a la
proteolisis, la estabilidad térmica, la reactividad inmunológica, la
modificación de residuos amino-terminales o
carboxi-terminales, etc. Entre las potenciales
parejas de fusión se incluyen enzimas cromogénicos, tales como la
\beta-galactosidasa, la proteína A o G, una
proteína FLAG, tal como la descrita por Blanar y Rutter, Science
256:1014-1018, 1992, toxinas (por ejemplo la toxina
diftérica, la exotoxina A de Pseudomonas, la toxina ricina o
la fosfolipasa C) y componentes de inmunoglobulina.
Las globulinas recombinantes (Rg) formadas
mediante fusión de fragmentos de receptor ACT-4 y
componentes de inmunoglobulina con frecuencia presentan la mayoría
o todas las propiedades fisiológicas asociadas a la región
constante de la clase particular de inmunoglobulina utilizada. Por
ejemplo, las globulinas recombinantes pueden ser capaces de fijar
el complemento, mediar en la toxicidad celular dependiente de
anticuerpos, estimular las células B o atravesar paredes de vasos
sanguíneos y entrar en el espacio intersticial. Las globulinas
recombinantes habitualmente se forman fusionando el extremo
C-terminal de un dominio extracelular de receptor
ACT-4 al extremo N-terminal del
dominio de región constante de una inmunoglobulina de cadena pesada.
La cadena de inmunoglobulina preferentemente es de origen humano,
particularmente si la globulina recombinante está destinada al uso
terapéutico. Las globulinas recombinantes habitualmente son solubles
y presentan varias propiedades ventajosas respecto a los receptores
ACT-4 no modificados. Entre estas propiedades se
incluyen una vida media en suero prolongada, la capacidad de lisar
células diana para las que presenta afinidad un receptor
ACT-4, funciones efectoras y la capacidad de unirse
a moléculas tales como las proteínas A y G, que pueden utilizarse
para inmovilizar la globulina recombinante en los análisis de
ligamiento.
La invención también proporciona ligandos según
se define en las reivindicaciones, que se unen específicamente a un
polipéptido receptor ACT-4 y que son capaces de
formar un complejo con dicho polipéptido, por lo menos en parte,
mediante enlace no covalente. La expresión "polipéptido ligando
ACT-4-L" se utiliza genéricamente
para incluir proteínas de longitud completa y fragmentos de las
mismas. Esta expresión habitualmente no incluye anticuerpos contra
los polipéptidos receptores ACT-4. La expresión
"ligando de ACT-4" habitualmente se utiliza
para referirse a una proteína de longitud completa. Los ligandos
pueden ser moléculas naturales o sintéticas, y pueden encontrarse
en forma soluble o ancladas a la superficie de una célula. Múltiples
ligandos diferentes pueden unirse al mismo receptor
ACT-4. A la inversa, un ligando puede unirse a más
de un receptor ACT-4. Habitualmente la unión de un
ligando a un receptor ACT-4 iniciará una señal que
altere el fenotipo físico y/o funcional de una célula que porta el
receptor ACT-4 y/o una célula que porta el ligando
para ACT-4. Los anticuerpos contra
ACT-4 o sus ligandos pueden presentar la capacidad
de bloquear o estimular la transducción de señales. Evidentemente
se reconocerá que la designación de ACT-4 como
receptor y la pareja o parejas de unión específica del mismo como
ligando o ligandos es algo arbitraria y podría, bajos determinadas
circunstancias, invertirse.
Se identifican los materiales que suministran
los polipéptidos ligandos ACT-4-L
mediante el cribado de diferentes tipos celulares, particularmente
de células linfoides y hematopoyéticas, líquidos corporales y
extractos de tejidos, con polipéptidos receptores
ACT-4 marcados, preferentemente en forma soluble en
solución acuosa, a modo de sonda. Las células B activadas o las
líneas de células B pueden resultar adecuadas (ver el Ejemplo 8).
También resultan adecuadas las células T infectadas por
HTLV-I. Con frecuencia, el receptor
ACT-4 o un fragmento ligante del mismo se fusiona, o
se une de otra manera, a una segunda proteína con fines de cribado.
Resultan particularmente adecuadas las globulinas recombinantes
formadas mediante la fusión de la parte extracelular de
ACT-4-h-1 con la
región constante de una cadena pesada de inmunoglobulina. Los
polipéptidos ligandos ACT-4-L se
purifican a partir de células u otros materiales biológicos
identificados mediante este procedimiento de cribado utilizando
técnicas de química clásica de proteínas. Entre estas técnicas se
incluyen la precipitación selectiva con sustancias tales como
sulfato amónico, cromatografía de columna, procedimientos de
inmunopurificación y otros (ver, por ejemplo, R. Scopes, Protein
Purification: Principles and Practice
(Springer-Verlag, NY, 1982) (incorporada como
referencia a todos los fines). Habitualmente entre los
procedimientos de purificación se incluyen una etapa de
cromatografía de afinidad en la que se utiliza un polipéptido
receptor ACT-4 o un fragmento ligante del mismo
como el reactivo inmovilizado. Las regiones constantes de
ACT-4 pueden inmovilizarse convenientemente
mediante la unión del grupo de región constante a la proteína A o G.
Los polipéptidos ligandos ACT-4-L
también pueden purificarse utilizando anticuerpos antiidiotípicos
contra receptores ACT-4 como el reactivo de
afinidad.
Para determinar la secuencia de aminoácidos o
para obtener fragmentos polipeptídicos de un ligando, éste puede
digerirse con tripsina. Pueden separarse fragmentos peptídicos
mediante cromatografía líquida de alto rendimiento (HPLC) de fase
reversa y analizarse mediante secuenciación de la fase gaseosa.
También pueden utilizarse otros procedimientos de secuenciación
conocidos de la técnica. Los datos de secuencias pueden utilizarse
para diseñar sondas degeneradas para el aislamiento de ADNc o clones
genómicos codificantes de polipéptidos ligandos
ACT-4-L.
ACT-4-L.
Alternativamente, pueden obtenerse clones de
ADNc codificantes de polipéptidos ligandos
ACT-4-L mediante clonación de
expresión. En este enfoque, se prepara una biblioteca de ADNc a
partir de células que expresan un polipéptido ligando
ACT-4-L (identificado tal como se ha
comentado supra). La biblioteca se expresa en células
apropiadas (por ejemplo COS-7) y los clones que
portan el polipéptido ligando
ACT-4-L se identifican mediante
cribado con ACT-4 marcado o con un fragmento ligante
del mismo, opcionalmente fusionado a un dominio constante de una
cadena pesada de inmunoglobulina.
La secuencia de ADNc y la secuencia de
aminoácidos predicha del primer ligando para un polipéptido
receptor ACT-4 que debe caracterizarse se muestran
en la fig. 10. Este ligando se denomina
ACT-4-L-h-1,
haciendo referencia el sufijo "h" al origen humano, e
indicando el sufijo "1" que éste es el primer ligando que se
caracteriza. La parte codificante de la secuencia de ADNc de
ACT-4-L-h-1
es idéntica o prácticamente idéntica a la de un polipéptido
denominado gp34 o TA34 (ver Miura et al., Mol. Cell. Biol.
11:1313-1325, 1991) (incorporada como referencia en
su totalidad a todos los fines). La invención también incluye
ligandos según se define en las reivindicaciones; las variantes
indicadas en la presente invención típicamente muestran una
identidad de secuencia sustancial con la secuencia de
ACT-4-L-h-1
y contienen por lo menos 4, y más comúnmente 5, 6, 7, 10 ó 20, 50 o
más aminoácidos contiguos de la secuencia de
ACT-4-L-h-1.
Estas variantes típicamente también se encontrarán codificadas por
las secuencias de nucleótidos que muestran una identidad de
secuencia sustancial con la secuencia de nucleótidos codificante de
ACT-4-L-h-1
mostrada en la fig. 10. Los nucleótidos codificantes de dichas
variantes típicamente también se hibridarán a una secuencia de ADN
de
ACT-4-L-h-1
bajo condiciones restrictivas. Sin embargo, algunos de dichos
nucleótidos no se hibridan bajo condiciones restrictivas a
secuencias de ADN codificantes de variantes afines inferiores (por
ejemplo de rata) de
ACT-4-L-1. Muchas
variantes de
ACT-4-L-h-1
comparten por lo menos un determinante antigénico con un polipéptido
ligando
ACT-4-L-h-1,
según se pone de manifiesto por la reactividad cruzada con
anticuerpos monoclonales o policlonales contra el mismo. Sin
embargo, algunas de estas variantes no reaccionan cruzadamente con
sueros contra las variantes afines inferiores de
ACT-4-L-h-1.
Aunque muchos polipéptidos ligandos
ACT-4-L muestran similitudes a
ACT-4-L-h-1
en por lo menos uno de los aspectos comentados anteriormente,
resulta enteramente posible que existan otras familias de ligandos
para el receptor ACT-4 que no muestren nada en común
con
ACT-4-L-h-1
excepto por la capacidad de unirse específicamente a un receptor
ACT-4.
Con frecuencia los polipéptidos ligandos
ACT-4-L contienen modificaciones de
sus esqueletos, de los tipos comentados en la Sección I,
supra. El polipéptido
ACT-4-L-h-1,
por ejemplo, se encuentra fuertemente modificado en el aspecto de
que el peso molecular observado es aproximadamente 34 kDa, mientras
que el peso molecular predicho basándose en la secuencia de
aminoácidos es de sólo 21 kDa. Se han identificado cuatro sitios
putativos de glucosilación N-ligada en el dominio
extracelular.
Muchos polipéptidos ligandos
ACT-4-L probablemente comparten
algunas o todas las características topológicas observadas en
ACT-4-L-h-1.
La secuencia de aminoácidos de
ACT-4-L-h-1
contiene un dominio intracelular N-terminal
putativo (aminoácidos 1 a 23), un dominio transmembranal hidrofóbico
putativo (aminoácidos 24 a 50) y un dominio
C-terminal extracelular putativo (aminoácidos 51 a
183). Esta organización estructural es consistente con que
ACT-4-L-h-1
sea una proteína membranal integral de tipo II (es decir, que
presente un único dominio transmembranal, comprendiendo el dominio
C-terminal la región extracelular y comprendiendo el
extremo N-terminal la región intracelular).
Los polipéptidos ligandos
ACT-4-L también pueden compartir
algunas de las características estructurales y/o funcionales de
ligandos que se unen a otros miembros de la superfamilia del
receptor del factor de crecimiento nervioso. Entre estos ligandos
se incluyen TNF-\alpha,
TNF-\beta, C040-L,
CD27-L, CD30-L. Aunque
ACT-4-L-h-1
muestra únicamente una identidad débil de secuencia primaria de
aminoácidos con TNF-\alpha e incluso un grado
menor de similitud con otros ligandos de la superfamilia, resulta
evidente una mayor similitud entre todos dichos ligandos en su
capacidad teórica de formar estructuras de orden superior. Los
dominios extracelulares de los ligandos conocidos de la
superfamilia consisten de aproximadamente 150 aminoácidos y forman
varias láminas \beta plegadas, que se ensamblan en una estructura
cilíndrica ranurada (denominada "rollo de gelatina" por Bazan
et al., Current Biology 3:603-606, 1993)
(incorporada como referencia a todos los fines). El dominio
extracelular de
ACT-4-L-h-1
consiste de 133 aminoácidos, y el patrón de plegamiento predicho es
consistente con la formación de láminas \beta plegadas y un
"rollo de gelatina". Notablemente, todos los ligandos de la
superfamilia excepto TNF-\beta también existen, en
parte, en forma de proteínas membranales integrales de superficie
celular de tipo II. Los ligandos de la superfamilia también existen
en forma de proteínas solubles, sugiriendo que existen dichas
formas para los polipéptidos ligandos
ACT-4-L. El dominio extracelular
C-terminal de
ACT-4-L-h-1
muestra cierta similitud de secuencia con diversas deshidrogenasas.
De esta manera, algunos polipéptidos ligandos
ACT-4-L pueden presentar una
actividad de deshidrogenasa, que podría desempeñar un papel en la
señalización intercelular.
Aparte de los polipéptidos de sustancialmente
longitud completa, la presente invención proporciona fragmentos
biológicamente activos de polipéptidos ligandos
ACT-4-L de longitud completa según
se define en las reivindicaciones. Entre las actividades biológicas
significativas se incluyen la unión a un receptor
ACT-4, tal como
ACT-4-h-1, la unión
a un segundo polipéptido ligando
ACT-4-L, la unión a anticuerpos (por
ejemplo el fragmento compite con un polipéptido ligando
ACT-4-L-h-1
intacto para la unión específica a un anticuerpo), la
inmunogenicidad (es decir, la posesión de epítopos que estimulan las
respuestas de células B o T contra el fragmento) y el agonismo o
antagonismo de la unión de un segundo polipéptido ligando
ACT-4-L a un polipéptido receptor
ACT-4, tal como
ACT-4-h-1. Un
segmento de un polipéptido ligando
ACT-4-L de longitud completa
habitualmente comprende por lo menos 5 aminoácidos contiguos,
aunque no más de 160 aminoácidos contiguos de la secuencia de
aminoácidos mostrada en la fig. 10. Con frecuencia los segmentos
contienen aproximadamente 10, 20, 50, 75, 100 ó 133 aminoácidos, y
no más de 150 aminoácidos contiguos, de la secuencia mostrada en la
fig. 10.
Algunos fragmentos contienen únicamente dominios
extracelulares. Estos fragmentos contienen los dominios de longitud
completa de polipéptidos ligandos
ACT-4-L de origen natural. Otros
fragmentos contienen componentes de los mismos. Estos fragmentos
con frecuencia conservan la especificidad de unión de un polipéptido
ligando ACT-4-L intacto, pero son
solubles y no se encuentran unidos a membrana. Estos fragmentos
resultan útiles como inhibidores competitivos de la unión de
polipéptido ligando ACT-4-L a un
receptor.
Los fragmentos de los polipéptidos ligandos
ACT-4-L de longitud completa con
frecuencia terminan, en un extremo o en ambos, cerca (es decir, a
menos de aproximadamente 5, 10 ó 20 aminoácidos) de los límites de
dominios funcionales o estructurales. Los fragmentos terminados en
ambos extremos en límites estructurales o funcionales consisten
esencialmente de un segmento (o dominio) particular de los
aminoácidos de ACT-4-L responsables
de una propiedad funcional o estructural. Los dominios estructurales
y funcionales se identifican mediante comparación de los datos de
secuencia de nucleótidos y/o de aminoácidos, tal como se muestra en
la fig. 10, con bases de datos públicas o propietarias de
secuencias. Preferentemente se utilizan procedimientos
computerizados de comparación para identificar los motivos de
secuencia o los dominios de conformación de proteína predichos,
presentes en otras proteínas de estructura y/o función conocidas.
Pueden identificarse dominios de unión mediante mapado de epítopos
(ver la Sección VI, infra). Entre los dominios estructurales
se incluyen un dominio intracelular, un dominio transmembranal y un
dominio extracelular. Entre los dominios funcionales se incluyen un
dominio de unión extracelular a través del cual los polipéptidos
ligandos ACT-4-L interaccionan con
moléculas solubles externas o con receptores unidos a células y un
dominio transductor de señal intracelular.
La expresión de
ACT-4-L-h-1
y ligandos relacionados depende del tipo celular y del estatus de
activación (ver el Ejemplo 8). Más notablemente,
ACT-4-L-h-1
se detecta con facilidad en algunas líneas de células B activadas
por PMA/yonomicina.
ACT-4-L-h-1
se encuentra sustancialmente ausente en células B en reposo frescas.
ACT-4-L-h-1
también se expresa sobre las células T infectadas por
HLTV-1 y puede infectarse en otros tipos de célula
T bajo algunas circunstancias (ver el Ejemplo 8).
La afinidad de un ligando
ACT-4-L (expresado sobre células B
activadas) para un receptor ACT-4 (expresado
predominantemente en células CD4^{+} activadas) sugiere que la
interacción entre el ligando y el receptor podría desempeñar un
papel en la activación/diferenciación de las células T CD4^{+} y/o
de las células B. La activación tanto de las células T CD4^{+}
como de las células B es conocido que es un proceso multietapa que
requiere estímulos específicos de antígeno y no específicos. La
interacción entre ACT-4 y
ACT-4-L probablemente constituye un
estímulo no específico de antígeno eficaz en uno cualquiera o en
ambos tipos celulares que porten estos antígenos. El estímulo
podría ser directo, por ejemplo en el caso de la unión de
ligando-receptor que desencadena una actividad
enzimática en el dominio intracelular de ligando y/o de receptor;
actividad que a su vez inicia una cascada de sucesos metabólicos en
uno o ambos tipos celulares. Alternativamente, el estímulo podría
ser indirecto, por ejemplo la interacción entre
ACT-4 y ACT-4-L
podría incrementar la avidez de las interacciones celulares entre
otras parejas de ligando-receptor o controlar la
localización y migración de los leucocitos. La interacción de
ACT-4 y ACT-4-L
podría actuar conjuntamente con la unión de otras parejas receptor
de células T_{H}-B/ligando, tales como
CD2/LFA-3 (Moingeon et al., Nature 339:314,
1988), CD4/MHC de clase II (Doyle y Stominger, Nature
330:256-259, 1987),
LFA-1/ICAM-I/ICAM-2
(Makgoba et al., Nature 331:86-88, 1988) y
Staunton et al., Nature 339:61-64, 1989) y
B7/CD28 (Linsley et al., J. Exp. Med.
173:721-730, 1991). Las interacciones
ACT-4-/ACT-4-L
también pueden incrementarse o reducirse debido a la unión de
moléculas solubles a células T CD4^{+} y/o a células B. Las
moléculas solubles probables son citoquinas, incluyendo, por
ejemplo, las interleuquinas IL-1 a
IL-13, los factores \alpha y \beta de necrosis
tumoral, los interferones \alpha, \beta y \gamma, el factor
beta de crecimiento tumoral (TGF-\beta), el factor
estimulante de colonias (CSF) y el factor estimulante de colonias
de granulocitos-monocitos
(GM-CSF).
La expresión del ligando
ACT-4-L en determinados subtipos de
células T en algunas circunstancias podría proporcionar papeles
adicionales o alternativos para las interacciones
ACT-4/ACT-4-L. Por
ejemplo, la eficiencia de infección de las células T por el virus
de la inmunodeficiencia humana (VIH) u otros virus y patógenos
podría resultar afectada por ACT-4 o
ACT-4-L o por interacciones entre
ambos. Además resulta posible que ACT-4 o
ACT-4-L sean expresados por las
mismas células (por ejemplo células T CD4^{+} activadas). En estas
circunstancias, las interacciones entre receptor y ligando podrían
afectar al crecimiento y estado de activación de sus células
respectivas.
Los fragmentos o análogos que comprenden
sustancialmente uno o más dominios funcionales (pro ejemplo un
dominio extracelular) de los polipéptidos ligandos
ACT-4-L pueden fusionarse, o unirse
de otra manera, a secuencias polipeptídicas heterólogas, de manera
que la proteína de fusión resultante muestre la propiedad o
propiedades funcionales proporcionadas por el polipéptido ligando
ACT-4-L y/o la pareja de fusión. Las
parejas de fusión adecuadas se han comentado en la Sección I,
supra.
Los polipéptidos ligandos
ACT-4-L pueden utilizarse para
purificar por afinidad los receptores de ACT-4
respectivos. Los polipéptidos ligandos
ACT-4-L también resultan útiles como
agonistas o antagonistas de un segundo ligando
ACXT-4-L o un receptor
ACT-4, y pueden utilizarse en los procedimientos
terapéuticos comentados en la Sección VII, infra. Los
polipéptidos ligandos ACT-4 también resultan útiles
en ensayos de cribado para identificar agonistas y antagonistas de
ACT-4 y/o de
ACT-4-L.
\vskip1.000000\baselineskip
Las secuencias de nucleótidos y de aminoácidos
de ACT-4-h-1
mostradas en la fig. 5, y las secuencias correspondientes para
otras variantes de receptor ACT-4 permiten la
producción de polipéptidos de longitud completa, secuencias de
polipéptidos receptores de ACT-4 y fragmentos de los
mismos. De manera similar, la secuencia de aminoácidos de
ACT-4-L-h-1
y las secuencias correspondientes para otras variantes de
polipéptidos ligandos ACT-4-L
permiten la producción de polipéptidos ligandos de longitud completa
y fragmentos de los mismos. Estos polipéptidos pueden producirse en
células huésped procarióticas o eucarióticas mediante la expresión
de polinucleótidos codificantes de ACT-4 o
ACT-4-L, o fragmentos y análogos de
cualquiera de los mismos. Las secuencias de ADN clonadas se
expresan en huéspedes tras ligar operablemente las secuencias a (es
decir, situadas para garantizar el funcionamiento de) una secuencia
de control de expresión en un vector de expresión. Los vectores de
expresión son típicamente replicables en los organismos huésped, en
forma de episomas o como parte integral del ADN cromosómico del
huésped. Comúnmente los vectores de expresión contienen marcadores
de selección, por ejemplo resistencia a tetraciclina o a
higromicina, para permitir la detección y/o la selección de aquellas
células transformadas con las secuencias de ADN deseadas (ver, por
ejemplo, la patente US nº 4.704.362).
- E. coli es un huésped procariótico útil para clonar las secuencias de ADN de la presente invención. entre otros huéspedes microbianos adecuados para la utilización se incluyen bacilos, tales como Bacillus subtilis, y otras enterobacteriáceas, tales como Salmonella, Serratia y diversas especies de Pseudomonas. En estos huéspedes procarióticos, también pueden prepararse vectores de expresión, que típicamente contienen secuencias de control de la expresión compatibles con la célula huésped (por ejemplo un origen de replicación). Además, se encuentra presente cualquiera de entre una diversidad de promotores bien conocidos, tales como el sistema de promotor lactosa, un sistema de promotor triptófano (trp), un sistema de promotor beta-lactamasa, o un sistema promotor procedente del fago lambda. Los promotores típicamente controlan la expresión, opcionalmente con una secuencia operadora, y presentan secuencias de sitio de unión ribosómica y similares, para iniciar y completar la transcripción y la traducción.
También pueden utilizarse otros microbios, tales
como levaduras, para la expresión. Saccharomyces es un
huésped preferente, presentando los vectores adecuados secuencias de
control de la expresión, tales como promotores, incluyendo la
3-fosfoglicerato quinasa u otros enzimas
glucolíticos, y un origen de replicación, secuencias de terminación
y similares, según se desee. También resultan adecuadas las células
de insecto (por ejemplo SF9) con vectores apropiados, habitualmente
derivados de baculovirus, para expresar un receptor
ACT-4 o polipéptidos ligandos (ver Luckow et
al., Bio/Technology 6:47-55, 1988, incorporada
como referencia a todos los fines).
También puede utilizarse un cultivo celular de
tejido eucariótico superior de mamífero para expresar y producir
los polipéptidos de la presente invención (ver Winnacker, From Genes
to Clones, VCH Publishers, NY, NY, 1987) (incorporada como
referencia a todos los fines). Las células eucarióticas de hecho
resultan preferentes, debido a que se han desarrollado en la
técnica varias líneas de células huésped adecuadas capaces de
secretar y modificar realmente las proteínas humanas, y entre ellas
se incluyen las líneas de células CHO, diversas líneas de células
COS, células HeLa, líneas celulares de mieloma, células de Jurkat,
etc. Entre los vectores de expresión para estas células pueden
incluirse secuencias de control de expresión, tales como un origen
de replicación, un promotor (por ejemplo un promotor tk o un
promotor pgk (fosfoglicerato quinasa) de HSV), un
intensificador (Queen et al., Immunol. Rev. 89:49, 1986) y
sitios necesarios de procesamiento de la información, tales como
sitios de unión ribosómica, sitios de procesamiento del ARN, sitios
de poliadenilación (por ejemplo un sitio de adición de antígeno T
grande de SV40-poliA) y secuencias terminadoras de
transcripción. Las secuencias de control de expresión preferentes
son promotores derivados de genes de inmunoglobulina, SV40,
adenovirus, papilomavirus bovino y similares. Los vectores que
contienen los segmentos de ADN de interés (por ejemplo polipéptidos
codificantes de un receptor ACT-4) pueden
transferirse al interior de la célula huésped mediante
procedimientos bien conocidos, que varían dependiendo del tipo de
huésped celular. Por ejemplo la transfección con CaCl_{2} se
utiliza comúnmente para las células procarióticas, mientras que el
tratamiento con CaPO_{4} o la electroporación pueden utilizarse
para otros huéspedes celulares. Los vectores pueden encontrarse
presentes en forma de episomas o integrados en el cromosoma del
huésped.
Se aíslan polipéptidos receptores de
ACT-4 naturales mediante técnica convencionales,
tales como la cromatografía de afinidad. Por ejemplo, se cultivan
anticuerpos policlonales o monoclonales contra
ACT-4-h-1
anteriormente purificado y unido a una columna de afinidad adecuada
mediante técnicas bien conocidas (ver, por ejemplo, Hudson y Hay,
Practical Immunology (Blackwell Scientific Publications, Oxford, UK,
1980), capítulo 8, incorporada como referencia a todos los fines).
Por ejemplo, puede inmovilizarse
anti-ACT-4-h-1
en una columna de proteína A-sefarosa mediante
entrecruzamiento del dominio Fc con un agente de entrecruzamiento
homobifuncional, tal como pimelimidato de dimetilo. A continuación,
se pasan los extractos celulares a través de la columna y la
proteína receptora ACT-4 unida específicamente a la
columna se eluye con, por ejemplo, ácido pirogénico 0,5 M, pH 2,5.
Habitualmente, se obtiene una forma intacta de receptor de
ACT-R mediante dichas técnicas de aislamiento. Se
generan fragmentos peptídicos a partir de receptores de
ACT-4 intactos mediante corte químico (por ejemplo
bromuro de cianógeno) o enzimático (por ejemplo proteasa V8 o
tripsina) de la molécula intacta. Pueden purificarse polipéptidos
ligandos ACT-4-L naturales
utilizando un enfoque análogo, excepto en que el reactivo de
afinidad es un anticuerpo específico para
ACT-4-L-h-1.
Alternativamente, pueden sintetizarse
polipéptidos ACT-4 o
ACT-4-L mediante procedimientos
químicos o producirse mediante sistemas de traducción in
vitro utilizando un molde polinucleótido para dirigir la
traducción. Los procedimientos para la síntesis química de
polipéptidos y la traducción in vitro son bien conocidos de
la técnica y se describen adicionalmente en Berger y Kimmel, Methods
in Enzymology, volumen 152, Guide to Molecular Cloning Techniques,
Academic Press, Inc., San Diego, CA, 1987).
El Ejemplo 5 presenta datos de secuencias de
ácidos nucleicos para un clon de ADNc de un receptor
ACT-4 denominado
ACT-4-h-1. La
secuencia incluye una región traducida y regiones 3' y 5'
flanqueantes. Estos datos de secuencia pueden utilizarse para
diseñar sondas con las que aislar otros genes de receptor
ACT-4. Entre estos genes se incluyen el gen
genómico humano codificante de
ACT-4-h-1 y ADNcs y
clones genómicos de especies de mamífero superior, y variantes
alélicas y no alélicas, y mutantes naturales e inducidas de la
totalidad de estos genes. Específicamente se proporcionan todos los
fragmentos de ácidos nucleicos codificantes de todos los
polipéptidos receptores de ACT-4 dados a conocer en
la presente solicitud. Se encuentran disponibles comercialmente
bibliotecas genómicas de muchas especies (por ejemplo, Clontech,
Palo Alto, CA) o pueden aislarse de novo mediante
procedimientos convencionales. Las bibliotecas de ADNc se preparan
mejor a partir de células CD4^{+} activadas, que expresan
ACT-4-h-1 en grandes
cantidades.
Las sondas utilizadas para aislar clones
típicamente comprenden una secuencia de aproximadamente por lo
menos 24 nucleótidos contiguos (o el complemento de los mismos) de
la secuencia de ADNc mostrada en la fig. 5. Por ejemplo, puede
marcarse un polinucleótido de longitud completa correspondiente a la
secuencia mostrada en la fig. 5 y utilizarse como sonda de
hibridación para aislar clones genómicos a partir de una biblioteca
de clones genómicos humanos en, por ejemplo, \LambdaEMBL4 o
\LambdaGEM11 (Promega Corporation, Madison, WI); las condiciones
de hibridación típicas para el cribado de transferencias de placa
(Benton y Davis, Science 196:180, 1978) pueden ser: 50% de
formamida, 5 x SSC o SSPE, 1-5 x solución de
Denhardt, SDS al 0,1-1%, 100 a 200 \mug de ADN
heterólogo cortado, dextrán sulfato al 0-10%, 1 x
10^{5} a 1 x 10^{7} cpm/ml de sonda desnaturalizada con una
actividad específica de aproximadamente 1 x 10^{8} cpm/\mug e
incubación a 42ºC durante aproximadamente 6 a 36 horas. Las
condiciones de prehibridación son esencialmente idénticas excepto
en que no se incluye sonda y típicamente se reduce el tiempo de
incubación. Las condiciones de lavado típicamente son: 1 a 3 x SSC,
SDS al 0,1-1%, 50ºC a 70ºC con un cambio de la
solución de lavado tras aproximadamente 5 a 30 minutos. Las
condiciones de hibridación y de lavado típicamente son menos
restrictivas para el aislamiento de variantes afines superiores o
de variantes no alélicas que para, por ejemplo, el clon genómico
humano de
ACT-4-h-1.
Alternativamente pueden utilizarse sondas para
clonar genes del receptor ACT-4 mediante
procedimientos que utilizan la reacción en cadena de la polimerasa
(PCR). Los procedimientos de amplificación por PCR se describen en,
por ejemplo, PCR Technology: Principles and Applications for DNA
Amplification (editor H.A. Erlich, Freeman Press, NY, NY, 1992);
PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications (editores Innis
et al., Academic Press, San Diego, CA, 1990); Mattila et
al., Nucleic Acids Res. 19:4967, 1991; Eckert, K.A. y Kunkel,
T.A., PCR Methods and Applications 1:17, 1991; PCR (editores
McPherson et al., IRL Press, Oxford) y patente US nº
4.683.202 (cada una de las cuales se incorpora como referencia a
todos los fines).
Alternativamente, pueden construirse secuencias
polinucleótidas sintéticas correspondientes a la totalidad o parte
de las secuencias mostradas en la fig. 5 mediante síntesis química
de oligonucleótidos. Pueden incorporarse sustituciones, deleciones
y adiciones de nucleótidos en los polinucleótidos de la invención.
La variación de la secuencia de nucleótidos puede resultar de la
degeneración del código genético, de los polimorfismos de secuencia
de diversos alelos del receptor ACT-4, de errores
menores de secuenciación o puede introducirse mediante mutagénesis
aleatoria de los ácidos nucleicos codificantes utilizando
irradiación o exposición a EMS, o mediante cambios introducidos
mediante mutagénesis sitio-específica u otras
técnicas de la biología molecular moderna (ver Sambrook et
al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, C.S.H.P. Press, NY,
2a edición, 1989) (incorporada como referencia a todos los fines).
Para las secuencias de nucleótidos que son capaces de transcribirse
y traducirse para producir un polipéptido funcional, la degeneración
del código genético resulta en varias secuencias de nucleótidos que
codifican el mismo polipéptido. La invención incluye todas dichas
secuencias. Generalmente las sustituciones, deleciones y adiciones
de nucleótidos no deberían alterar sustancialmente la capacidad de
un polinucleótido de receptor ACT-4 de hibridarse a
la secuencia de
ACT-4-h-1 mostrada
en la fig. 5 bajo condiciones restrictivas. Típicamente los
polinucleótidos del receptor ACT-4 comprenden por
lo menos 25 nucleótidos consecutivos que son sustancialmente
idénticos a una secuencia de receptor ACT-4 natural
(por ejemplo, fig. 5), más habitualmente los polinucleótidos de
receptor ACT-4 comprenden por lo menos 50 a 100
nucleótidos consecutivos, que son sustancialmente idénticos a una
secuencia de receptor ACT-4 natural.
Los polinucleótidos de receptor
ACT-4 pueden ser oligonucleótidos cortos (por
ejemplo aproximadamente 10, 15, 25, 50 ó 100 bases contiguas de la
secuencia de ACT-h-1 mostrada en la
fig. 5), tal como para la utilización como sondas de hibridación y
cebadores de PCR (o LCR). Las secuencias polinucleótidas de receptor
ACT-4 también pueden comprender parte de un
polinucleótido mayor que incluye secuencias que facilitan la
transcripción (secuencias de expresión) y la traducción de las
secuencias codificantes, de manera que se produce el producto
polipéptido codificado. La construcción de dichos polinucleótidos
es bien conocida de la técnica y se describe adicionalmente en
Sambrook et al., supra (C.S.H.P. Press, NY, 2a
edición, 1989). El polinucleótido del receptor ACT-4
puede fusionarse en el mismo marco de lectura con otra secuencia
polinucleótida codificante de una proteína diferente (por ejemplo
glutatión S-transferasa,
\beta-galactosidasa o un dominio Fc de
inmunoglobulina) para codificar la expresión de una proteína de
fusión (ver, por ejemplo, Bym et al., Nature
344:667-670, 1990) (incorporada como referencia a
todos los fines).
Los ácidos nucleicos codificantes de los genes
de ACT-4-L pueden producirse
mediante un enfoque análogo, utilizando la secuencia de ADNc de
ACT-4-L-h-1
mostrada en la fig. 10 como material de partida para el diseño de
la sonda. Entre los genes de ACT-4-L
se incluyen el gen genómico humano codificante de
ACT-4-L-h-1,
variantes alélicas y no alélicas, variantes afines superiores y
mutantes naturales e inducidos de la totalidad de dichos genes.
Específicamente, se proporcionan todos los fragmentos de ácidos
nucleicos (genómicos, ADNc o sintéticos) codificantes de todos los
polipéptidos ACT-4-L dados a conocer
en la presente solicitud. En los fragmentos de ácidos nucleicos que
presentan mutaciones de secuencias naturales, generalmente la
mutación no altera sustancialmente la capacidad de un
polinucleótido de ACT-4-L de
hibridarse con la secuencia de nucleótidos de
ACT-4-L-h-1
bajo condiciones restrictivas. Los polinucleótidos del ligando
ACT-4-L pueden ser oligonucleótidos
cortos (por ejemplo 10, 15, 25, 50 ó 100 bases contiguas de la
secuencia de
ACT-4-L-h-1
mostrada en la fig. 10), tal como para la utilización como sondas
de hibridación y cebadores de PCR (o de LCR). Las secuencias
polinucleótidas del ligando ACT-4-L
también pueden comprender parte de un polinucleótido mayor, tal como
se ha comentado en referencia a las secuencias polinucleótidas de
ACT-4.
En otra realización de la invención, se
proporcionan anticuerpos contra los polipéptidos
AT-4-L según se define en las
reivindicaciones.
Los anticuerpos o inmunoglobulinas típicamente
están compuestas de cuatro cadenas peptídicas unidas
covalentemente. Por ejemplo, un anticuerpo IgG presenta dos cadenas
ligeras y dos cadenas pesadas. Cada cadena ligera se encuentra
covalentemente unida a una cadena pesada. A su vez, cada cadena
pesada se encuentra unida covalentemente a la otra, formando una
configuración de "Y", también conocida como conformación de
inmunoglobulina. Los fragmentos de estas moléculas, o incluso
cadenas pesadas o ligeras solas, pueden unirse a antígenos. Los
anticuerpos, fragmentos de anticuerpo y las cadenas individuales
también se denominan en la presente invención inmunoglobulinas.
Una cadena pesada o ligera de anticuerpo normal
presenta una región variable (V) N-terminal
(NH_{2}) y una región constante (C) C-terminal
(-COOH). La región variable de cadena pesada se denomina V_{H}
(incluyendo, por ejemplo, V_{\gamma}) y la región variable de
cadena ligera se denomina V_{L} (incluyendo V_{\kappa} o
V_{\lambda}). La región variable es la parte de la molécula que se
une al antígeno afín del anticuerpo, mientras que la región Fc (el
segundo y tercer dominios de la región C) determina la función
efectora del anticuerpo (por ejemplo la fijación del complemento,
la opsonización). La inmunoglobulina de longitud completa o las
"cadenas ligeras" del anticuerpo (generalmente de
aproximadamente 25 kDa, aproximadamente 214 aminoácidos) se
encuentran codificadas por un gen de región variable en el extremo
N-terminal (generalmente de aproximadamente 110
aminoácidos) y un gen de región constante \kappa (kappa) o
\lambda (lambda) en el extremo COOH. La inmunoglobulina de
longitud completa o las "cadenas pesadas" de anticuerpo
(generalmente de aproximadamente 50 kD, aproximadamente 446
aminoácidos) se encuentran codificadas de manera similar por un gen
de región variable (generalmente codificante de aproximadamente 116
aminoácidos) y uno de los genes de la región constante, por ejemplo
gamma (codificante de aproximadamente 330 aminoácidos). Típicamente
"V_{L}" incluye la parte de la cadena ligera codificada por
los segmentos génicos V_{L} y/o J_{L} (J, región de unión) y
"V_{H}" incluye la parte de la cadena pesada codificada por
los segmentos génicos V_{H} y/o D_{H} (D, región de diversidad)
y J_{H} (ver, de manera general, Roitt et al., Immunology
(2a edición, 1989), capítulo 6, y Paul, Fundamental Immunology
(Raven Press, 2a edición, 1989) (cada una de las cuales se incorpora
como referencia a todos los fines).
Una región variable de cadena ligera o pesada de
inmunoglobulina consiste de una "región marco" interrumpida
por tres regiones hipervariables, también denominadas regiones
determinantes de complementariedad o CDRs. Se ha definido la
amplitud de la región marco y de las CDRs (ver Kabat et al.,
"Sequences of Proteins of Immunological Interest", U.S.
Department of Health and Human Services, 1987; Chothia et
al., J. Mol. Biol. 196:901-917, 1987) (cada una
de las cuales se incorpora como referencia a todos los fines). Las
secuencias de las regiones marco de diferentes cadenas ligeras o
pesadas se encuentran relativamente conservadas dentro de una
especie. La región marco de un anticuerpo, es decir las regiones
marco combinadas de las cadenas ligera y pesada constituyentes,
sirve para situar y alinear las CDRs en el espacio tridimensional.
Las CDRs son responsables principalmente de la unión a un epítopo
de un antígeno. Las CDRs típicamente se denominan CDR1, CDR2 y CDR3,
numeradas secuencialmente partiendo del extremo
N-terminal.
La región constante de la molécula de cadena
pesada, también conocida como C_{H}, determina el isotipo del
anticuerpo. Los anticuerpos se denominan IgM, IgD, IgG, IgA e IgE,
dependiendo del isotipo de la cadena pesada. Los isotipos se
encuentran codificados en los segmentos mu (\mu), delta
(\Delta), gamma (\gamma), alfa (\alpha) y epsilon
(\varepsilon) de la región constante de la cadena pesada,
respectivamente. Además, existen varios subtipos de \gamma.
Existen dos tipos de cadena ligera: \kappa y \lambda. Los
determinantes de estos subtipos típicamente residen en la región
constante de la cadena ligera, también denominada C_{L} en
general, y C\kappa o C\lambda, en particular.
Los isotipos de cadena pesada determinan
diferentes funciones efectoras del anticuerpo, tales como la
opsonización o la fijación del complemento. Además, el isotipo de la
cadena pesada determina la forma secretada del anticuerpo. Los
isotipos IgG, IgD e IgE secretados se encuentran típicamente en
forma de única unidad o monomérica. El isotipo IgM secretado se
encuentra en forma pentamérica; puede encontrarse IgA secretado en
forma tanto monomérica como dimérica.
Los anticuerpos que se unen a un receptor
ACT-4, a un ligando
ACT-4-L o a fragmentos ligantes de
cualquiera de los mismos, pueden producirse mediante una diversidad
de medios. La producción de anticuerpos monoclonales no humanos,
por ejemplo murinos, de rata, etc., es bien conocida y puede
conseguirse, por ejemplo, inmunizando el animal con una preparación
que contiene un receptor ACT-4 o los ligandos del
mismo, o un fragmento inmunogénico de cualquiera de los mismos.
Particularmente, resultan útiles como inmunógenos las células
establemente transfectadas con un gen de ACT-4 o
ACT-4-L recombinante y expresando un
receptor ACT-4 o ligando para el mismo sobre la
superficie de dichas células. Las células productoras de anticuerpos
obtenidas a partir de los animales inmunizados se inmortalizan y se
criban para la producción de un anticuerpo que se une a los
receptores de ACT-4 o los ligandos de los mismos
(ver Harlow y Lane, Antibodies, A Laboratory Manual, C.S.H.P. NY,
1988) (incorporada como referencia a todos los fines). Varios
anticuerpos murinos contra una proteína que presentan una secuencia
de aminoácidos primaria idéntica o sustancialmente similar a
ACT-4-L-h-1
han sido comentados por Tozawa et al., Int. J. Cancer
41:231-238, 1988; Tanaka et al., Int. J.
Cancer 36:549-555, 1985 (incorporada como
referencia en su totalidad a todos los fines).
También se han descrito varias técnicas para
generar anticuerpos monoclonales humanos, aunque generalmente
resultan más onerosas que las técnicas murinas y no aplicables a
todos los antígenos (ver, por ejemplo, Larrick et al.,
patente US nº 5.001.065, para una revisión (incorporada como
referencia a todos los fines)). Una técnica que ha sido utilizada
con éxito para generar anticuerpos monoclonales humanos contra una
diversidad de antígenos es la metodología del trioma de Ostberg
et al., Hybridoma 2:361-367, 1983; Ostberg,
patente US nº 4.634.664, y Engleman et al., patente US nº
4.634.666 (incorporada como referencia a todos los fines). Las
líneas celulares productoras de anticuerpos obtenidas mediante el
presente procedimiento se denominan triomas, debido a que
descienden de tres células: dos humanas y una de ratón. Se ha
encontrado que los triomas producen anticuerpos más establemente
que los hibridomas ordinarios preparados a partir de células
humanas.
Un enfoque alternativo es la generación de
inmunoglobulinas humanizadas mediante la unión de las regiones CDR
de anticuerpos no humanos a regiones constantes humanas mediante
técnicas de ADN recombinante (ver Queen et al., Proc. Natl.
Acad. Sci. USA 86:10029-10033, 1989, y patente WO nº
90/07861 (incorporada como referencia a todos los fines). Las
inmunoglobulinas humanizadas presentan residuos de marco de región
variable sustancialmente procedentes de una inmunoglobulina humana
(denominada inmunoglobulina aceptora) y regiones determinantes de
complementariedad sustancialmente procedentes de una inmunoglobulina
de ratón, por ejemplo el anticuerpo L106 (ver el Ejemplo 1)
(denominada inmunoglobulina donante). La región o regiones
constantes, en caso de hallarse presentes, también proceden
sustancialmente de una inmunoglobulina humana. Los dominios
variables humanos habitualmente se seleccionan de entre los
anticuerpos humanos cuyas secuencias de marco muestran un grado
elevado de identidad de secuencia con los dominios de región
variable murina a partir de los que se derivan las CDRs. Los
residuos de marco de región variable de cadena pesada y de cadena
ligera pueden derivarse a partir de secuencias de anticuerpo humano
iguales o diferentes. Las secuencias de anticuerpo humanas pueden
ser secuencias de anticuerpos humanos naturales o pueden ser
secuencias de consenso de varios anticuerpos humanos (ver Carter
et al., patente WO nº 92/22653). Se seleccionan determinados
aminoácidos de entre los residuos de marco de la región variable
humana para la sustitución basándose en su posible influencia sobre
la conformación y/o unión al antígeno de la CDR. La investigación de
estas posibles influencias se realiza mediante modelado, examen de
las características de los aminoácidos en localizaciones
particulares, o la observación empírica de los efectos de la
sustitución o mutagénesis de aminoácidos particulares.
Por ejemplo, cuando un aminoácido es diferente
en un residuo de marco de región variable de L106 murino y en un
residuo de marco de región variable humana seleccionada, el
aminoácido de marco humano habitualmente debería sustituirse por el
aminoácido de marco equivalente procedente del anticuerpo de ratón
cuando se espere razonablemente que el aminoácido:
- (1)
- se una de manera no covalente al antígeno directamente,
- (2)
- sea contiguo a una región CDR,
- (3)
- interaccione de otra manera con una región CDR (por ejemplo se encuentre a menos de aproximadamente 3 \ring{A} de una región CDR), o
- (4)
- participe en la interfaz V_{L}-V_{H}.
Otros candidatos para la sustitución con
aminoácidos de marco humanos aceptores que son poco habituales para
una inmunoglobulina humana en esa posición. Estos aminoácidos pueden
sustituirse por aminoácidos de la posición equivalente del
anticuerpo L106 o de las posiciones equivalentes de inmunoglobulinas
humanas más típicas.
Un enfoque adicional para aislar secuencias de
ADN que codifican un anticuerpo monoclonal humano o un fragmento
ligante del mismo es mediante cribado de una biblioteca de ADN
procedente de células B humanas según el protocolo general descrito
de manera general por Huse et al., Science
246:1275-1281, 1989, y después clonar y amplificar
las secuencias que codifican el anticuerpo (o fragmento ligante) de
la especificidad deseada. El protocolo descrito por Huse resulta
más eficiente en combinación con tecnología de expresión fágica
(ver, por ejemplo, Dower et al., patente WO nº 91/17271 y
McCafferty et al., patente WO nº 92/01047). La tecnología de
expresión fágica también puede utilizarse para mutagenizar regiones
CDR de anticuerpos que se ha mostrado previamente que presentan
afinidad para los receptores de ACT-4 o los ligandos
de los mismos. Se seleccionan los anticuerpos que presentan
afinidad de unión mejorada.
Los anticuerpos anti-receptor
ACT-4 que se unen específicamente al mismo epítopo
que el anticuerpo L106 habitualmente se identifican mediante un
ensayo de unión competitiva. El ensayo presenta tres componentes:
un polipéptido ACT-4 (por ejemplo
ACT-4-h-1),
anticuerpo L106, que habitualmente se encuentra marcado, y el
anticuerpo bajo ensayo. Con frecuencia el polipéptido receptor
ACT-4 se inmoviliza en un soporte sólido. El
anticuerpo de ensayo se une al mismo epítopo que el anticuerpo L106
si reduce la cantidad de anticuerpo L106 que se une específicamente
al polipéptido receptor ACT-4. El grado de cribado
necesario para obtener dichos anticuerpos puede reducirse generando
anticuerpos mediante un protocolo en el que el epítopo específico
unido por L106 se utiliza como inmunógeno. Los anticuerpos que se
unen al mismo epítopo que L106 pueden mostrar una secuencia de
aminoácidos sustancialmente idéntica, aunque no completamente, a la
del anticuerpo L106, o pueden presentar una estructura primaria no
relacionada con el anticuerpo L106.
Se identifican anticuerpos
anti-ACT-4 que presentan una
especificidad de unión diferente que L106 (es decir, que se unen a
un epítopo diferente) mediante un enfoque complementario. Los
anticuerpos de ensayo se criban para su incapacidad de competir con
el anticuerpo L106 para la unión a un polipéptido receptor
ACT-4. El grado de cribado puede reducirse mediante
la generación de anticuerpos mediante un protocolo en el que se
utiliza como inmunógeno un fragmento sin un epítopo específico unido
por L106.
Los anticuerpos que presentan la misma o
diferente especificidad de unión para un anticuerpo seleccionado
contra un polipéptido ligando
ACT-4-L pueden identificarse
mediante procedimientos análogos.
Los anticuerpos que presentan la capacidad de
estimular o inhibir la activación de las células CD4^{+} o B
pueden identificarse mediante los procedimientos de cribado
comentados en la Sección VI, infra. Algunos anticuerpos
pueden inhibir selectivamente la activación en respuesta a algunos
estímulos (por ejemplo aloantigénicos pero no mitogénicos, o
viceversa) y no a otros. La capacidad inhibidora de algunos
anticuerpos podría depender del momento tras la activación en el
que se añade el anticuerpo. Algunos anticuerpos podrían presentar la
capacidad de activar células CD4^{+} o B independientemente de
otros estímulos, mientras que otros anticuerpos podrían presentar
únicamente la capacidad de incrementar la eficacia de otro estímulo,
tal como el proporcionado por PHA o PMA/yonomicina.
Los anticuerpos aislados mediante los
procedimientos anteriores pueden utilizarse para generar anticuerpos
anti-idiotípicos mediante, por ejemplo, la
inmunización de un animal con el anticuerpo primario. Para los
anticuerpos anti-receptor ACT-4, se
seleccionan los anticuerpos anti-idiotiípicos cuya
unión al anticuerpo primario resulta inhibida por los receptores de
ACT-4 o fragmentos de los mismos. Debido a que tanto
el anticuerpo anti-idiotípico y los receptores de
ACT-4 o fragmentos de los mismos se unen a la
inmunoglobulina primaria, la inmunoglobulina
anti-idiotípica podría representar la "imagen
interna" de un epítopo y de esta manera podría sustituir el
polipéptido ligando ACT-4-L. Los
anticuerpos anti-idiotípicos contra un polipéptido
ligando ACT-4-L que pueden
sustituir a un receptor ACT-4 pueden producirse
mediante un enfoque análogo.
El epítopo unido al anticuerpo L106 o cualquier
otro anticuerpo seleccionado contra un receptor
ACT-4 se determina proporcionando una familia de
fragmentos que contiene diferentes segmentos de aminoácidos que un
polipéptido receptor ACT-4, tal como
ACT-4-h-1. Cada
fragmento típicamente comprende por lo menos 4, 6, 8, 10, 20, 50 ó
100 aminoácidos contiguos. Colectivamente la familia de polipéptidos
cubre una gran parte o la totalidad de la secuencia de aminoácidos
de un polipéptido receptor ACT-4 de longitud
completa. Los miembros de la familia se someten a ensayo
individualmente para la unión a, por ejemplo, el anticuerpo L106. El
fragmento más pequeño que puede unirse específicamente al
anticuerpo bajo ensayo delimita la secuencia de aminoácidos del
epítopo reconocido por el anticuerpo. Se utiliza un enfoque análogo
para localizar los epítopos ligados por anticuerpos contra los
polipéptidos ligandos de ACT-4.
También se describen en la presente invención
fragmentos de anticuerpos contra receptores de ACT-4
o los ligandos de los mismos. Típicamente estos fragmentos muestran
unión específica al receptor o ligando de ACT-4 con
una afinidad de por lo menos 10^{7} M, y más típicamente de
10^{0} ó 10^{9} M. Entre los fragmentos de anticuerpo se
incluyen cadenas pesadas separadas, Fab de cadenas ligeras, Fab',
F(ab')_{2}, Fabc y Fv. Se producen fragmentos mediante
técnicas de ADN recombinante o mediante separación enzimática o
química de inmunoglobulinas intactas.
También se describen en la presente invención
inmunotoxinas.
Una inmunotoxina es un compuesto quimérico que
consiste de una toxina unida a un anticuerpo con una especificidad
deseada. El anticuerpo sirve como agente de reconocimiento para la
toxina (ver, de manera general, Pastan et al., Cell
47:641-648, 1986). Un grupo toxina se acopla a un
anticuerpo intacto o a un fragmento del mismo mediante técnicas
químicas o de ADN recombinante. Preferentemente la toxina se une a
una cadena de inmunoglobulina en forma de una proteína contigua
(ver, por ejemplo, Chovnick et al., Cancer Res. 51:465;
Chaudhary et al., Nature 339:394, 1989) (incorporada como
referencia a todos los fines). Se proporcionan ejemplos de
componentes toxinas adecuados en la Sección I, supra, y se
revisan en, por ejemplo, The Specificity and Action of Animal,
Bacterial and Plant Toxins (editor P. Cuatrecasas, Chapman Hall,
London, 1976) (incorporada como referencia a todos los fines).
Se describen en la presente invención
hibridomas, triomas y otras líneas celulares productoras de los
anticuerpos y fragmentos de los mismos comentados supra.
Entre estos se incluyen la línea de hibridoma HBL106, depositada
bajo el Tratado de Budapest en la American Type Culture Collection,
Rockville, MD 20852 como ATCC nº HB11483, que produce el anticuerpo
de ratón L106.
Los anticuerpos contra los polipéptidos
ACT-4 y ACT-4-L y
los fragmentos de unión de los mismos resultan útiles para cribar
las bibliotecas de expresión de ADNc, que contienen preferentemente
ADNc humano o de primate derivado de diversos tejidos y para
identificar clones que contienen inserciones de ADNc, que codifican
proteínas estructuralmente relacionadas con reactividad
inmunológica cruzada (ver Aruffo y Seed, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
84:8573-8577, 1987). Los anticuerpos también
resultan útiles para identificar y/o purificar proteínas con
reactividad inmunológica cruzada relacionados con los polipéptidos
nativos receptor ACT-4 o ligando
ACT-4-L o a fragmentos de los
mismos utilizados para generar el anticuerpo. Los usos diagnósticos
y terapéuticos de los anticuerpos, fragmentos ligantes de los
mismos, inmunotoxinas y anticuerpos idiotípicos se describen en la
Sección VII, infra.
Los polipéptidos ACT-4 y
ACT-L-4, fragmentos, análogos de los
mismos, anticuerpos y anticuerpos anti-idiotípicos
de los mismos, así como otros agentes químicos o biológicos, se
criban para su capacidad de bloquear o incrementar la unión de un
ACT-4 a su ligando. Además, se someten a ensayo para
su capacidad de estimular o inhibir los procesos metabólicos, tales
como la síntesis de ADN o la fosforilación de proteínas en células
que portan un receptor ACT-4 o un polipéptido
ligando ACT-4-L anclado a las
superficies de las mismas.
En algunos procedimientos, el compuesto bajo
ensayo se criba para su capacidad de bloquear o incrementar la
unión de un fragmento purificado ligante de un receptor
ACT-4 (o proteína de fusión del mismo) a un
fragmento purificado ligante de un polipéptido ligando
ACT-4-L (o proteína de fusión del
mismo). En estos experimentos, el receptor o fragmento de ligando
habitualmente se inmovilizan en un soporte sólido. A continuación,
el compuesto de ensayo compite con un fragmento de
ACT-4 o de ACT-4-L
(el que no se encuentre unido a un soporte sólido) para la unión al
suporte. Habitualmente, el compuesto de ensayo o el ligando o
receptor se encuentra marcado.
En otros procedimientos, el polipéptido receptor
ACT-4 y el ligando
ACT-4-L o fragmentos ligantes de
estas moléculas, se expresan sobre una superficie celular. Por
ejemplo, un polipéptido ligando
ACT-4-L puede expresarse sobre
células B activadas y/o un polipéptido receptor
ACT-4 expresado sobre células T CD4^{+}
activadas. Alternativamente, el ligando o el receptor pueden
expresarse a partir de ADN recombinante en, por ejemplo, las
células COS-7 (ver el Ejemplo 6). En estos
procedimientos, la existencia de agonismo o antagonismo se
determina a partir del grado de unión entre un receptor
ACT-4 y el ligando del mismo que se observa en
presencia del compuesto de ensayo. Alternativamente, la actividad
del compuesto de ensayo se somete a ensayo mediante la medición de
la incorporación de ^{3}H-timidina en ADN o la
incorporación de ^{32}P en proteínas en células que portan un
receptor ACT-4 y/o células que portan un polipéptido
ligando ACT-4-L.
Los compuestos que bloquean la síntesis de ADN
inducida por el polipéptido ACT-4 o
ACT-4-L o la desfosforlación de
proteínas son antagonistas. Los compuestos que activan la síntesis o
la fosforilación del ADN mediante la interacción con un receptor
ACT-4 o los ligandos del mismo son agonistas. La
actividad agonista o antagonista también puede determinarse a
partir de otros criterios de valoración funcionales o físicos de
activación de los leucocitos, o a partir de resultados clínicamente
deseables o no deseables, tales como la actividad citolítica o la
extravasación de leucocitos hacia tejidos procedentes de vasos
sanguíneos.
La capacidad de los agentes de agonizar o
antagonizar la proliferación de las células T in vitro puede
correlacionarse con la capacidad de afectar a la respuesta
inmunológica in vivo. La actividad in vivo
típicamente se somete a ensayo utilizando modelos animales
adecuados, tales como ratones o ratos. Para someter a ensayo el
efecto de los agentes sobre el rechazo del aloinjerto, pro ejemplo,
pueden administrarse potenciales agentes terapéuticos en los
animales en diversos tiempos antes de la introducción del tejido
alogénico, y puede realizarse el seguimiento de los animales para
el rechazo del trasplante. Se han descrito procedimientos adecuados
para llevar a cabo el trasplante y el seguimiento del rechazo del
trasplante (ver, por ejemplo, Hislop et al., J. Thorac.
Cardiovasc. 100:360-370, 1990) (incorporada como
referencia a todos los fines).
Las enfermedades y condiciones del sistema
inmunológico asociadas a alteraciones de la abundancia, o a la
mutación funcional, de un receptor ACT-4 o el ARNm
del mismo, o de un ligando ACT-4-L o
el ARNm del mismo pueden diagnosticarse utilizando las sondas y/o
anticuerpos de la presente invención. La detección de un receptor
ACT-4 o ARNm permite distinguir las células T
CD4^{+} activadas de otros subtipos de leucocito. Por ejemplo,
puede detectarse un receptor ACT-4 utilizando un
anticuerpo o un polipéptido ACT-4-L
que se una específicamente al receptor ACT-4. La
presencia de células T CD4^{+} activadas es indicativa de una
respuesta inmunológica inducida por MHC de clase II contra, por
ejemplo, bacterias invasoras. La comparación del número de células
CD4^{+} y CD8^{+} activadas podría permitir el diagnóstico
diferencial entre infección bacteriana y vírica, inducidas
predominantemente por estos tipos celulares activados respectivos.
La presencia de células CD4^{+} activadas también es indicativa
de enfermedades y condiciones no deseables del sistema inmunológico,
tales como el rechazo del aloinjerto, la enfermedad del injerto
contra el huésped, enfermedades autoinmunológicas, alergias e
inflamación. Puede realizarse el seguimiento de la eficacia de los
agentes terapéuticos en el tratamiento de dichas enfermedades y
condiciones.
La detección del ligando
ACT-4-L o el ARNm del mismo podría
indicar la presencia de células B activadas y/o señalizar que es
inminente la aparición de células T CD4^{+} activadas. El ligando
ACT-4-L puede detectarse, por
ejemplo, utilizando un anticuerpo o un polipéptido receptor
ACT-4 que se una específicamente al ligando
ACT-4-L. La detección sucesiva del
ligando ACT-4-L seguida del receptor
ACT-4 (o viceversa) podría permitir el seguimiento
de la progresión a través de diferentes estadios temporales de la
activación en una respuesta inmunológica.
El diagnóstico puede llevarse a cabo extrayendo
una muestra celular (por ejemplo una muestra de sangre, una biopsia
o tejido de nódulo linfático) de un paciente. A continuación, la
muestra se somete a análisis para determinar: (1) la cantidad de
receptor ACT-4 o ligando
ACT-4-L expresado en células
individuales de la muestra (por ejemplo mediante tinción
inmunohistoquímica de células fijadas con un anticuerpo, o mediante
análisis FACS^{TM}), (2) la cantidad de ARNm de receptor
ACT-4 o de ligando
ACT-4-L en células individuales
(mediante hibridación in situ con una sonda polinucleótida
complementaria marcada), (3) la cantidad de ARNm de receptor
ACT-4 o de ligando
ACT-4-L en la muestra celular
mediante extracción del ARN seguido de hibridación a una sonda
polinucleótida complementaria marcada (por ejemplo mediante
transferencia northern, transferencia por puntos, hibridación en
solución o PCR cuantitativa), o (4) la cantidad de receptor
ACT-4 o ligando
ACT-4-L en la muestra celular (por
ejemplo mediante rotura celular seguida de inmunoensayo o de
transferencia western del extracto celular resultante).
El diagnóstico también puede llevarse a cabo
mediante la administración in vivo de un reactivo
diagnóstico (por ejemplo un anticuerpo
anti-ACT-4 o
anti-ACT-4-L marcado
para el seguimiento de las células T CD4^{+} o de las células B,
respectivamente) y la detección mediante imágenes in vivo. La
concentración de agente diagnóstico administrado debería resultar
suficiente para que la unión a aquellas células con el antígeno
diana resulte detectable comparado con la señal de fondo. Además,
resulta deseable que el reactivo diagnóstico pueda ser rápidamente
eliminado del sistema circulatorio con el fin de proporcionar la
mejor proporción de señal diana-fondo. El reactivo
diagnóstico puede marcarse con un radioisótopo para la obtención de
imágenes fotográficas, o con un isótopo paramagnético para la
resonancia magnética o la obtención de imágenes de resonancia de
espín electrónico.
Un cambio (típicamente un incremento) del nivel
de proteína o de ARNm de un receptor ACT-4 o de
ligando ACT-4-L en una muestra
celular de un individuo que se encuentre fuera del rango de niveles
clínicamente establecidos como normales, podría indicar la
presencia de una reacción inmunológica no deseable en el individuo
del que se obtuvo la muestra y/o indicar una predisposición del
individuo a desarrollar (o progresar a través) de dicha reacción.
Los niveles de proteína o de ARNm pueden utilizarse como marcador de
diferenciación para identificar y tipar células de determinados
linajes (por ejemplo células CD4^{+} activadas para el receptor
ACT-4) y orígenes del desarrollo. Esta detección
específica de tipo celular puede utilizarse para el diagnóstico
histopatológico de respuestas inmunológicas no deseadas.
\vskip1.000000\baselineskip
También se describen en la presente invención
kits diagnósticos para los procedimientos diagnósticos descritos
supra. Los kits comprenden uno o más recipientes que alojan
los reactivos diagnósticos, tales como anticuerpos marcados contra
receptores de ACT-4 y ligandos
ACT-4-L, y reactivos y/o aparato
para detectar el marcaje. También pueden incluirse otros
componentes presentes rutinariamente en estos kits, conjuntamente
con instrucciones para llevar a cabo el ensayo diagnóstico.
\vskip1.000000\baselineskip
Las composiciones farmacéuticas utilizadas para
el tratamiento profiláctico o terapéutico comprenden un agente
terapéutico activo, por ejemplo un receptor ACT-4,
un ligando ACT-4-L, fragmentos de
los mismos, y anticuerpos y anticuerpos idiotípicos de los mismos,
y una diversidad de otros componentes. La forma preferente depende
del modo pretendido de administración y de la aplicación
terapéutica. Las composiciones también pueden incluir, dependiendo
de la formulación deseada, portadores o diluyentes no tóxicos
farmacéuticamente aceptables, que se definen como vehículos
utilizados comúnmente para formular composiciones farmacéuticas para
la administración animal o humana. El diluyente se selecciona de
manera que no afecte a la actividad biológica de la combinación.
Son ejemplos de estos diluyentes, agua destilada, solución salina
fisiológica, soluciones de Ringer, solución de dextrosa y solución
de Hank. Además, la composición o formulación farmacéutica también
puede incluir otros portadores, adyuvantes o estabilizadores no
tóxicos, no terapéuticos, no inmunogénicos y similares.
\vskip1.000000\baselineskip
Los procedimientos terapéuticos utilizan los
agentes terapéuticos comentados anteriormente para el tratamiento
de diversas enfermedades en seres humanos o animales,
particularmente en mamíferos vertebrados. Entre los agentes
terapéuticos se incluyen receptores de ACT-4,
fragmentos ligantes de los mismos, ligandos
ACT-4-L, fragmentos ligantes de los
mismos, receptor anti-ACT-4 y
anticuerpos anti-ligando
ACT-4-L y anticuerpos
anti-idiotípicos de los mismos, fragmentos ligantes
de estos anticuerpos, versiones humanizadas de estos anticuerpos,
inmunotoxinas y otros agentes comentados supra. Algunos
agentes terapéuticos funcionan bloqueando o antagonizando la acción
de un receptor ACT-4 con su ligando. Los agentes
terapéuticos preferentes compiten con el ligando para la unión al
receptor o compiten con el receptor para la unión al ligando. Otros
agentes terapéuticos funcionan eliminando células que portan un
polipéptido contra el que se dirige el agente. Por ejemplo, los
anticuerpos anti-receptor ACT-4 con
funciones efectoras o que se encuentran conjugadas a toxinas,
radioisótopos o fármacos, son capaces de eliminar selectivamente
células T CD4^{+} activadas. De manera similar, los anticuerpos
anti-ligando ACT-4-L
son capaces de eliminar células B activadas bajo circunstancias
análogas. La eliminación selectiva de células activadas resulta
particularmente ventajosa debido a que puede reducirse o eliminarse
una respuesta inmunológica no deseable, conservando simultáneamente
una capacidad inmunológica residual en la forma de células B
inactivadas, células CD4^{+} y células CD8^{+} para combatir
microorganismos invasores contra los que pueden exponerse
posteriormente un paciente. Otros agentes terapéuticos funcionan
como agonistas de la interacción entre un receptor
ACT-4 y ligando
ACT-4-L.
En las aplicaciones terapéuticas, se administra
una composición farmacéutica (por ejemplo comprendiendo un
anticuerpo contra
ACT-4-h-1 o
ACT-4-L-h-1),
in vivo o ex vivo, en un paciente que ya sufre una
respuesta inmunológica no deseable (por ejemplo rechazo del
trasplante) en una cantidad suficiente para curar, parcialmente
detener o enlentecer detectablemente la progresión de la enfermedad
y sus complicaciones. Una cantidad suficiente para conseguir lo
anterior se define como "dosis terapéuticamente eficaz" o
"dosis eficaz". Las cantidades eficaces para este uso
dependerán de la severidad de la condición, del estado general del
paciente y de la vía de administración, y la combinación con otros
fármacos inmunosupresores, en caso de existir, aunque generalmente
se encuentra comprendida entre aproximadamente 10 ng y
aproximadamente 1 g de agente activo por dosis, utilizándose
comúnmente unidades de dosis unitaria de entre 10 mg y 100 mg por
paciente. Las composiciones farmacéuticas pueden administrarse
sistémicamente mediante infusión intravenosa, o localmente mediante
inyección. Esta última vía resulta particularmente útil para la
respuesta inmunológica no deseada localizada, tal como el rechazo
del huésped contra el injerto. Para una breve revisión de los
procedimientos de administración de fármaco, ver Langer, Science
249:1527-1533, 1990) (incorporada como referencia a
todos los fines).
En las aplicaciones profilácticas, las
composiciones farmacéuticas se administran en pacientes bajo
riesgo, pero que todavía no sufren una reacción inmunológica no
deseada (por ejemplo un paciente que inminentemente será sometido a
cirugía de trasplante). La cantidad de agentes que debe
administrarse es una "dosis profilácticamente eficaz",
dependiendo las cantidades exactas del estado de salud del paciente
y del nivel general de inmunidad, aunque generalmente se encuentra
comprendida entre 10 ng y 1 g por dosis, especialmente entre 10 mg y
100 mg por
paciente.
paciente.
Debido a que los agentes terapéuticos de la
invención es probable que resulten más selectivos y generalmente
menos tóxicos que los agentes inmunomoduladores convencionales, es
menos probable que causen los efectos secundarios observados con
los agentes convencionales. Además, debido a que algunos agentes
terapéuticos son secuencias de proteínas humanas (por ejemplo
fragmentos ligantes de un receptor ACT-4 o de
ligando ACT-4-L o anticuerpos
humanizados), es menos probable que causen respuestas inmunológicas
tales como aquéllas observadas con los anticuerpos
anti-CD3 murinos. Los agentes terapéuticos de la
presente invención pueden combinarse entre sí. Por ejemplo, una
combinación de anticuerpos contra un ligando
ACT-4-L con anticuerpos contra un
receptor ACT-4 es probable que proporcionen un
bloqueo particularmente eficaz de la activación de las células T.
Los agentes de la invención también pueden combinarse con
terapéuticas tradicionales, y pueden utilizarse para reducir la
dosis de dichos agentes hasta niveles inferiores a aquellos
asociados a efectos secundarios. Por ejemplo, pueden utilizarse
otros agentes inmunosupresores, tales como anticuerpos contra el
dominio \alpha3, antígenos de células T (por ejemplo OKT4 y OKT3,
CD28) antígeno de células B (B7 o B7-2), globulina
antitimocitos, así como agentes quimioterapéuticos, tales como
ciclosporina, glucocorticoides, azatioprina, prednisona,
conjuntamente con los agentes terapéuticos de la presente
invención:
- para la destrucción de una población específica de células diana, puede resultar ventajoso conjugar los agentes terapéuticos de la presente invención con otra molécula. Por ejemplo, los agentes pueden unirse a liposomas que contienen agentes inmunosupresores particulares, a un anticuerpo monoclonal específicos o a una citotoxina u otro modulador de la actividad celular, de manera que la unión del conjugado a una población celular diana resulte en la alteración de la población. Se han comentado supra varias proteínas toxinas. Entre los agentes quimioterapéuticos se incluyen, por ejemplo, doxorubicina, daunorubicina, metotrexato, citotoxina y ARN antisentido. También pueden utilizarse antibióticos. Además, pueden utilizarse radioisótopos, tales como itrio 90, fósforo 32, plomo 212, yodo 131 o paladio 109. La radiación emitida destruye las células diana.
Las composiciones farmacéuticas comentadas
anteriormente resultan adecuadas para tratar varias enfermedades y
condiciones del sistema inmunológico.
Durante los últimos años se ha producido una
considerable mejora de la eficiencia de las técnicas quirúrgicas
para el trasplante de tejidos y órganos, tales como piel, riñón,
hígado, corazón, pulmón, páncreas y médula ósea. Quizás el problema
principal es la falta de agentes satisfactorios para inducir
inmunotolerancia en el receptor del aloinjerto u órgano
trasplantado. Al trasplantar en un huésped células u órganos
alogénicos (es decir, el donante y el donado son individuos
diferentes de la misma especie), el sistema inmunológico del
huésped es probable que organice una respuesta inmunológica contra
antígenos foráneos presentes en el trasplante (enfermedad del
huésped contra el injerto), conduciendo a la destrucción del tejido
trasplantado. Las células CD8^{+}, CD4^{+} y los monocitos
están todos implicados en el rechazo de los tejidos del trasplante.
Los agentes terapéuticos de la presente invención resultan útiles
para bloquear las respuestas inmunológicas inducidas por
aloantígeno en el donado (por ejemplo el bloqueo o la eliminación de
la activación por alógeno de células T CD4^{+} por anticuerpos
contra un receptor ACT-4 o ligando
ACT-4-L), evitando de esta manera
que estas células participen en la destrucción del tejido u órgano
trasplantado.
Un uso relacionado de los agentes terapéuticos
de la presente invención es en la modulación de la respuesta
inmunológica implicada en la enfermedad "injerto contra el
huésped" (GVHD). GVHD es una enfermedad potencialmente fatal que
se produce al transferir células inmunológicamente competentes a un
receptor alogénico. En esta situación, las células
inmunocompetentes del donante podrían atacar tejidos en el receptor.
Los tejidos de la piel, epitelios del tracto gastrointestinal e
hígado son dianas frecuentes y pueden resultar destruidas durante
el curso de la GVHD. La enfermedad presenta un problema
especialmente severo al trasplantar tejido inmunológico, tal como
en el trasplante de médula ósea; aunque también se ha informado de
GVHD menos severa en otros casos también, incluyendo los
trasplantes de corazón y de hígado. Los agentes terapéuticos de la
presente invención se utilizan para bloquear la activación, o para
eliminar los leucocitos del donante (particularmente las células T
CD4^{+} y las células B activadas), inhibiendo de esta manera la
capacidad de las mismas de lisar las células diana en el
huésped.
\vskip1.000000\baselineskip
Una situación adicional en la que resulta
deseable la supresión inmunológica es en el tratamiento de las
enfermedades autoinmunológicas, tales como la diabetes mellitus
insulino-dependiente, la esclerosis múltiple, el
síndrome del hombre rígido, la artritis reumatoide, la miastenia
gravis y el lupus eritematoso. En estas enfermedades, el cuerpo
desarrolla una respuesta inmunológica celular y/o humoral contra uno
de sus propios antígenos, conduciendo a la destrucción de ese
antígeno, con consecuencias potencialmente incapacitantes y/o
fatales. Las células T CD4^{+} activadas se cree que desempeñan un
papel importante en muchas enfermedades autoinmunológicas, tales
como la diabetes mellitus. Las células B activadas desempeñan un
papel importante en otras enfermedades autoinmunológicas, tales
como el síndrome del hombre rígido. Las enfermedades
autoinmunológicas se tratan mediante la administración de uno de
los agentes terapéuticos de la invención, que bloquean la
activación, y/o eliminan, las células T CD4^{+} y/o las células
B. Opcionalmente el autoantígeno, o un fragmento del mismo, contra
el que se dirige la enfermedad autoinmunológica, puede administrarse
poco antes, o concurrentemente, o poco después, del agente
inmunosupresor. De esta manera puede inducirse tolerancia frente al
autoantígeno bajo la cobertura del tratamiento supresor, evitando
de esta manera la necesidad de la inmunosupresión continua (ver,
por ejemplo, Cobbold et al., patente WO nº 90/15152,
1990).
1990).
\vskip1.000000\baselineskip
La inflamación representa la consecuencia de la
dilatación capilar con acumulación de líquido y migración de
leucocitos fagocíticos, tales como granulocitos y monocitos. La
inflamación resulta importante en la defensa de un huésped frente a
una diversidad de infecciones, aunque también puede presentar
consecuencias no deseables en los trastornos inflamatorios, tales
como el choque anafiláctico, la artritis, la gota y la isquemia por
reperfusión. Las células T activadas presentan un papel modulador
importante en la inflamación, liberando interferón \gamma y
factores estimuladores de colonias que, a su vez, activan los
leucocitos fagocíticos. Los leucocitos fagocíticos activados se
inducen para expresar varias moléculas de superficie celular
específicas denominadas receptores de localización ("homing
receptors"), que sirven para unir los fagocitos a células
endoteliales diana. Las respuestas inflamatorias pueden reducirse o
eliminarse mediante tratamiento con los agentes terapéuticos de la
presente invención. Por ejemplo, los anticuerpos contra
ACT-4 o ACT-4-L
bloquean la activación de las células CD4^{+} o eliminan las
células CD4^{+} activadas, evitando de esta manera que estas
células liberen moléculas necesarias para la activación de los tipos
celulares
fagocíticos.
fagocíticos.
\vskip1.000000\baselineskip
La invención también proporciona procedimientos
para incrementar la eficacia de vacunas en la prevención o el
tratamiento de enfermedades y condiciones resultantes de agentes
infecciosos. Los agentes terapéuticos que presentan la capacidad de
activar las células T CD4^{+} y/o las células B (por ejemplo
determinados anticuerpos monoclonales contra un ligando
ACT-4 o ACT-4-L) se
administran poco antes, concurrentemente, o poco después de la
vacuna que contiene un antígeno seleccionado. El agente terapéutico
sirve para potenciar la respuesta inmunológica contra el antígeno
seleccionado. Estos procedimientos pueden resultar particularmente
ventajosos en pacientes que sufren enfermedades de
inmunodeficiencia.
\vskip1.000000\baselineskip
Los anticuerpos contra
ACT-4-h-L-1
también resultan útiles para eliminar las células infectadas por
HTLV-I. Tal como se ha indicado anteriormente,
dichas células expresan un antígeno gp34 que es idéntico o
prácticamente idéntico a
ACT-4-h-1. Estos
procedimientos habitualmente se llevan a cabo in vivo o ex
vivo en individuos infectados por HTLV-I. Sin
embargo, los procedimientos también resultan eficaces para eliminar
las células VIH infectadas por HTLV-I in
vitro. Por ejemplo, los procedimientos resultan particularmente
útiles para proteger a los trabajadores hospitalarios de la
infección por el contacto con muestras de tejido sometidos a
análisis. El riesgo de infección por HTLV-I puede
reducirse mediante tratamiento de las muestras según los presentes
procedimientos (con la condición, evidentemente, de que las muestras
se analicen para algo que no sea la presencia de
HTLV-I). Los anticuerpos contra
ACT-4-h-L-1
y también los anticuerpos contra
ACT-4-h-1 pueden
resultar eficaces para reducir o eliminar las perturbaciones del
sistema inmunológico que se han observado en individuos que sufren
de infección por HTLV-I. Estas perturbaciones pueden
resultar de la presencia de
ACXT-4-h-L-1
como antígeno de superficie sobre células T infectadas por
HTLV-I, que permitiría que las células T infectadas
interaccionasen con las células T CD4^{+} mediante un receptor
ACT-4.
\vskip1.000000\baselineskip
El virus VIH es conocido que infecta células T
CD4^{+} humanas mediante la unión al receptor CD4. Sin embargo,
es probable que, para que se produzca la infección productiva, el
receptor CD4 deba interaccionar con otro receptor presente sobre el
receptor de las células T CD4^{+}. La identificación de
ACT-4 como un receptor sobre la superficie de las
células T activadas sugiere que ACT-4 y/o su ligando
ACT-4-L podrían interaccionar con
CD4 y contribuir a la infección por VIH de las células T. En este
caso, las cantidades terapéuticamente eficaces de los agentes
terapéuticos dirigidos contra ACT-4 o
ACT-4-L podrían resultar eficaces
para abortar la infección por VIH y, de esta manera, en el
tratamiento del SIDA. Estos agentes terapéuticos también podrían
resultar eficaces para eliminar las células T CD4^{+} infectadas
por VIH in vivo o in vitro. Los procedimientos in
vitro presentan utilidad en, por ejemplo, la protección de los
trabajadores hospitalarios frente a la infección accidental, tal
como se ha comentado anterior-
mente.
mente.
\vskip1.000000\baselineskip
Se ha encontrado que
ACT-4-L-L-I
y sus análogos y parejas ligantes específicos, incluyendo
ACT-4, pueden utilizarse en la enfermedad
intestinal inflamatoria.
La expresión en tejidos de ACT-4
se ha investigado utilizando la técnica estándar indirecta de
tinción inmunohistoquímica con fosfatasa alcalina (ver, por
ejemplo, Immunocytochemistry: Practical Applications in Pathology
and Biology, J. Polak y S. van Noorden, editores John Wright y Sons,
Bristol). Las muestras de tejido de biopsia de intestino
procedentes de pacientes tanto de colitis ulcerosa como de la
enfermedad de Crohn se tiñeron positivamente con el anticuerpo
anti-ACT-4 llamado L106. Se
observaron agrupaciones de células L106+ entre las células
linfoides infiltrantes en la lámina propia en los sitios de
inflamación. En las muestras de tejido intestinal procedentes de
pacientes normales o en muestras de tejido intestinal no implicado
procedente de pacientes, únicamente se observaron células L106+
dispersas aisladas.
Los ejemplos siguientes se proporcionan a título
ilustrativo, aunque no limitativo, de la invención.
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Ejemplo
1
Se inmunizaron ratones con linfoblastos T
transformados por PHA. Se fusionaron esplenocitos procedentes de
ratones inmunizados, con células de mieloma SP2/O y se seleccionaron
los hibridomas que secretaban anticuerpos específicos para el clon
de células T. Los hibridomas se clonaron mediante dilución
limitante. Se seleccionó un anticuerpo monoclonal, denominado L106,
producido por uno de los hibridomas resultantes, para la
caracterización adicional. Se encontró que el anticuerpo L106
presentaba un isotipo IgGI. Un hibridoma productor del anticuerpo,
denominado HBL106, ha sido depositado con el número ATCC
HB11483.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
2
Se pusieron a disposición de determinados
participantes en el Fourth International Workshop and Conference on
Human Leucocyte Differentiation Antigens (Viena, 1989) muestras que
contenían el anticuerpo L106 con el fin de identificar los tipos de
tejido y celulares que se unen al anticuerpo L106. Los datos del
taller se presentan en Leukocyte Typing IV (editor W. Knapp, Oxford
U. Press, 1989) (incorporada como referencia a todos los fines) y
en una base de datos computerizada adjunta disponible de Walter R.
Gilks, MRC Biostatistics Unit, Cambridge University, Inglaterra.
Esta referencia informa que el anticuerpo L106 se une a un
polipéptido de aproximadamente 50 kDa. Este polipéptido se ha
informa que se encuentra presente sobre células
HUT-102 (una línea de células T transformadas),
linfocitos sanguíneos periféricos activados por PHA, una línea
celular B-linfoide transformada por EBV, una línea
de células T transformada por HTLV-II, células de
amígdala activadas por PMA, PBLs activadas por ConA o PHA y
monocitos activados por PMA. Se ha informado de que el polipéptido
se encuentra sustancialmente ausente en, inter alia,
basófilos en reposo, células endoteliales, fibroblastos, monocitos
activados por interferón \gamma, células no T periféricas,
granulocitos periféricos, monocitos periféricos, células
mononucleares periféricos, células T periféricas y glóbulos rojos
periféricos.
Los presentes inventores han encontrado datos
que indican que el polipéptido de 50 kDa (en lo sucesivo denominado
"receptor
ACT-4-h-1") se
expresa preferentemente en la subespecies CD4^{+} de las células T
activadas. En una serie de experimentos, se analizó la expresión de
ACT-4-h-1 específica
de células en PBLs no fraccionadas mediante un procedimiento de
tinción de dos colores. Se activaron las PBL con PHA durante
aproximadamente dos días (utilizando las condiciones de cultivo
indicadas en el Ejemplo 3) y se analizaron para la expresión en la
superficie celular de
ACT-4-h-1 en
diferentes subtipos celulares mediante tinción con dos anticuerpos
marcados diferentemente (marcajes FITC y PE). Los marcajes se
detectaron mediante análisis FACS^{TM}, esencialmente tal como se
describe en Picker et al., J. Immunol.
150:1105-1121, 1993 (incorporada como referencia a
todos los fines). Un anticuerpo, L106, era específico para
ACT-4-h-1, el otro
anticuerpo era específico para un subtipo particular de leucocito.
La fig. 1 muestra tres gráficos en los que se muestra la tinción de
L106 en el eje Y de cada gráfico, y la tinción
anti-CD4, anti-CD8 y
anti-CD19 en los ejes x de los gráficos respectivos.
En el gráfico de tinción con anti-CD4, muchas
células aparecen como dobles positivos (es decir, expresan tanto
CD4 como ACT-4-h-1).
En el gráfico de tinción con anti-CD8, muchas menos
células aparecen como dobles positivos. En el gráfico de tinción
con anti-CD19 (un marcador de células B) las células
doble positivas se encontraban sustancialmente ausentes.
En otra serie de experimentos, se analizó la
expresión de
ACT-4-h-1 mediante
la tinción monocolor de tipos celulares aislados. Las células se
tiñeron con anticuerpo L106 marcado fluorescentemente y el marcaje
se detectó mediante análisis FACS^{TM} (ver Engleman et
al., J. Immunol. 127:2124-2129, 1981)
(incorporada como referencia a todos los fines). En algunos
experimentos, las células se activaron mediante estimulación con
PHA durante aproximadamente dos días (nuevamente utilizando las
condiciones de cultivo indicadas en el Ejemplo 3). Los resultados
de este experimento, conjuntamente con aquellos procedentes del
experimento de tinción de dos colores descrito supra, se
resumen en la Tabla 1. La Tabla 1 muestra que aproximadamente 80%
de las células CD4^{+} expresaron
ACT-4-h-1 con una
fluorescencia media por canal de >20, con independencia de si
las células CD4^{+} se encontraban aisladas (tinción monocolor) o
en PBLs no fraccionadas (tinción de dos colores). El nivel de
expresión de
ACT-4-h-1 en células
CD8^{+} activadas era mucho menor que en las células T CD4^{+}
activadas en el experimento de tinción de dos colores, y mucho menor
en la tinción monocolor. De esta manera, el grado de expresión en
células CD8^{+} activadas aparentemente depende de si las células
CD8^{+} se fraccionan de otras PBLs antes de la activación. En
células CD8^{+} no fraccionadas (tinción de dos colores),
aproximadamente 10% de las células expresaban
ACT-4-h-1, con una
fluorescencia media por canal de aproximadamente 4. En las células
fraccionadas, sólo aproximadamente 4% de las células expresaban
ACT-4-h-1, con una
fluorescencia media por canal de aproximadamente 2. Estos datos
sugieren que
ACT-4-h-1 se
expresa únicamente en un subtipo reducido de células CD8^{+}
activadas y que este subtipo es algo más prevalente en el caso de
que las células CD8^{+} se activen en presencia de otras PBLs. La
Tabla 1 también indica que
ACT-4-h-1 se
encontraba sustancialmente ausente en todos los subtipos de
leucocito en reposo sometidos a ensayo (es decir, células T
CD4^{+}, células T CD8^{+}, células B CD19^{+}, monocitos
CD14^{+}, granulocitos y plaquetas) y también se encontraba
sustancialmente ausente en células B activadas y monocitos. También
se observó que
ACT-4-h-1 se
encontraba sustancialmente ausente en la mayoría de líneas celulares
tumorales sometidas a ensayo. Sin embargo, las líneas celulares
Molt3, Raji y NC37 sí mostraron un nivel de expresión reducido.
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(Tabla pasa a página
siguiente)
\newpage
Ejemplo
3
Se sometieron a ensayo células T CD4^{+} para
la expresión de receptores
ACT-4-h-1 en
respuesta a diversos estímulos de activación. Se purificaron
células T CD4^{+} a partir de células mononucleares sanguíneas
periféricas mediante inmunoadsorción en fase sólida
("panning"). Se cultivaron 5 x 10^{4} células T CD4^{+}
con un agente activador en pocillos de microtitulación que contenían
medio RPMI suplementado con suero humano al 10%. Se utilizaron tres
agentes de activación diferentes: (1) 5 x 10^{4} monocitos
irradiados (3.000 rads), (2) PHA (1 \mug/ml) y (3) toxoide
tetánico (5 \mug/ml). Se añadió ^{3}H-timidina a
los cultivos 12 a 16 horas antes de la recolección. Tras la
recolección, las células se sometieron a ensayo para la expresión
de antígenos de superficie celular mediante incubación con diversos
anticuerpos marcados (L106, anti-CD4 y
anti-CD8), tal como describen Engleman et
al., J. Immunol. 127:2124-2129,
1981).
1981).
La figura 2 muestra la aparición de
ACT-4-h-1 en
respuesta a la activación con aloantígeno. Antes de la activación
no se observó expresión. El porcentaje de células que expresaban el
receptor ACT-4-h-1
se incrementaba en el tiempo, alcanzando un máximo en
aproximadamente 30% tras aproximadamente siete días de activación
con aloantígeno. Los resultados también muestran que esencialmente
todas las células que expresan
ACT-4-h-1 también
expresaban el receptor CD4 y que esencialmente ninguna de ellas
expresaba el receptor CD8. La figura 3 presenta datos similares
para la aparición de
ACT-4-h-1 en
respuesta a la activación del toxoide tetánico. Nuevamente, el
porcentaje de células que expresaban
ACT-4-h-1 alcanzó un
máximo aproximadamente a los siete días. Sin embargo, en este
momento un porcentaje más alto de células (aproximadamente 60%)
expresaba el receptor. La figura 4 presenta datos similares para la
aparición de
ACT-4-h-1 en células
T CD4^{+} en respuesta a la activación con PH4. En esta
situación, el porcentaje de células T CD4^{+} que expresaban el
receptor alcanzaba un máximo de aproximadamente 65% tras tres días
de
activación.
activación.
Se concluye que
ACT-4-h-1 es un
antígeno activador de las células T CD4^{+}, que se expresa en
respuesta a diversos estímulos activadores.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
4
El clon de ADNc para el receptor
ACT-4-h-1 se aisló
utilizando un sistema de expresión de células COS ligeramente
modificado, desarrollado por primera vez por Aruffo y Seed,
supra. Se aisló ARN a partir de linfocitos sanguíneos
periféricos humanos activados por PHA de 72 horas. Se extrajo el ARN
total con reactivo TRI (Molecular Research Center) y se aisló ARN
poli(A)+ mediante purificación con
oligo-dT-perlas magnéticas
(Promega). Se sintetizó ADNc mediante el procedimiento de Gubler y
Hoffman, Gene 25:263-369, 1982, utilizando
transcriptasa inversa de Superscript (Gibco/BRL) y un cebador
oligo-dT. El ADNc de extremo romos se ligó a
adaptadores BstXI no autocomplementarios y se pasó por una columna
spin de Sephacryl S-400 para eliminar los
adaptadores no ligados y los fragmentos pequeños (<300 pares de
bases). El ADNc ligado seguidamente se ligó en un vector de
expresión eucariótico cortado con BstXI, pcDNA-IRL,
una versión resistente a la ampicilina de pcDNA-I
(Invitrogen). Los productos precipitados y lavados de la reacción de
ligación se electroporaron en E. coli cepa WM1100 (BioRad).
La siembra en placa y recuento de una alícuota de las bacterias
transformadas reveló un recuento total de 2 millones de clones
independientes en la biblioteca no amplificada. Se determinó que el
tamaño medio de inserción era 1,2 kb. Se amplificó la mayor parte de
la biblioteca en cultivo líquido, 250 ml de medio LB estándar. Se
recuperó plásmido mediante lisis alcalina y se purificó en una
columna de intercambio iónico (Qiagen).
Se transfectaron células COS-7
subconfluyentes mediante electroporación con el ADN de plásmido
purificado. Las células se sembraron en placas de 100 mm y se
dejaron crecer durante 48 horas. Las células se recuperaron de las
placas con solución de PBS-EDTA, se incubaron con
anticuerpo monoclonal L106 y se realizó panning según
procedimientos estándares. Una segunda ronda de panning reveló
enriquecimiento, debido a que se adsorbieron a las placas numerosas
células COS. Se recuperó ADN episómico de las células
inmunoseleccionadas mediante el procedimiento Hirt, y se
electroporaron en bacterias para la amplificación.
Se diluyeron bacterias transformadas con
plásmido de la segunda ronda de preparación Hirt formando grupos
pequeños de aproximadamente 100 colonias. Los grupos se amplificaron
y el ADN de los mismos se purificó y se sometió a ensayo para la
capacidad de proporcionar expresión del antígeno de L106 en células
COS-7 mediante inmunofluorescencia. Se utilizó
anticuerpo L106 conjugado con ficoeritrina para teñir monocapas de
células COS-7 y las células seguidamente se
examinaron mediante microscopía de inmunofluorescencia manual. El
ADN miniprep de cuatro de entre 8 grupos era positivo al someterlo
a ensayo para la expresión. Tres de entre ocho subgrupos eran
positivos y el subgrupo E1 se sembró en placa para permitir el
análisis de colonias individuales. Se encontró que el clon
E1-27 proporcionaba un nivel elevado de expresión de
receptor ACT-4-h-1
sobre la superficie de las células COS transfectadas.
\newpage
Ejemplo
5
La inserción procedente del clon denominado
E1-27 se subclonó en pBluescript y se secuenció
mediante el procedimiento de terminación de cadena dideoxi,
utilizando el kit de secuenciación de autolectura de la polimerasa
de T7 (Pharmacia) en un secuenciador ALE (Pharmacia). El mapado de
restricción reveló varios sitios convenientes para la subclonación.
Se generaron cinco subclones en pBluescript y se secuenciaron en
ambas cadenas con cebadores directores y universales de M13.
Las secuencias de ADNc y las secuencias
deducidas de aminoácidos de
ACT-4-h-1 se
muestran en la fig. 5. La secuencia de ADNc de
ACT-4-h-1 de 1.137
pares de bases contiene una región 5' no traducida de 14 pb y una
región 3' no traducida de 209 pb. Se encuentra presente una señal de
poliadenilación AATAAA en la posición 1.041, seguida de una cola
poliA de 80 pb a partir de la posición 1.057. El marco de lectura
abierta más largo se inicia con el primer ATG en la posición 15 y
finaliza con un TGA en la posición 845. La secuencia predicha de
aminoácidos es la de una proteína membranal integral de tipo 1
típica. El análisis de hidrofobicidad reveló una putativa secuencia
de señal tras el ATG de inicio, con un tramo corto de residuos
básicos seguido de un tramo más largo de residuos hidrofóbicos. Un
sitio de corte predicho de péptido de señal se encuentra presente
en el residuo 22 ó 24 (siendo el último el más probable según los
criterios de von Heijne, Nucleic Acids Res.
14:4683-4690, 1986) (incorporada como referencia a
todos los fines), dejando una proteína madura de 253 residuos
aminoácidos (o de 255 aminoácidos si se produce el corte en el sitio
menos probable). El análisis de hidrofobicidad también reveló un
único tramo largo de 27 residuos hidrofóbicos que se predice que es
el dominio transmembranal, prediciendo un dominio extracelular de
189 (o de 191) aminoácidos y un dominio intracelular de 37
aminoácidos. El dominio extracelular es rico en cisteínas, en el
que se encuentran 18 cisteínas dentro de un tramo de 135
aminoácidos. La masa molecular predicha (Mr) para la proteína madura
es 27.400, y existen dos potenciales sitios de
N-glucosilación en los residuos aminoácidos
146
y 160.
y 160.
La comparación de la secuencia de aminoácidos de
ACT-4-h-1 con
secuencias conocidas en la base de datos swiss-prot
utilizando el programa BLAZE reveló similitud de secuencia con
miembros de la superfamilia del receptor del factor de crecimiento
nervioso. Las secuencias de aminoácidos eran idénticas por lo menos
al 20% para NGF-R, TNF-R, CD40,
41-BB y fas/APO-1, y al 62%
para OX-40, incluyendo huecos y deleciones. Las
alineaciones de las diversas proteínas revelaron la conservación de
múltiples motivos ricos en cisteínas. Tres de estos motivos se
encontraban presentes en
ACT-4-h-1 y
OX-40, en comparación con cuatro de estos motivos
en NGF-R y CD0.
La comparación de la secuencia de nucleótidos de
ACT-4-h-1 con
secuencias conocidas en las bases de datos Genbank y EMBL
utilizando los programas BLAST y FASTDB reveló un grado elevado de
similitud de secuencias con únicamente un miembro de la familia del
receptor del factor de crecimiento nervioso, OX-40.
Incluyendo los huecos e inserciones, la identidad de secuencia era
de 66%. La comparación de las secuencias de nucleótidos de
ACT-4-h-1 y
OX-40 reveló que ambas contenían una región 5' no
traducida de 14 pb y ambas contienen colas poli-A
de aproximadamente 80 pb. Sin embargo, en
ACT-4-h-1 existe un
ligero alargamiento de la región 3' no traducida entre 187 pb y 209
pb, y existe un alargamiento de la región codificante entre 816 pb y
834 pb, una diferencia de 18 pb, o 6 inserciones de aminoácidos. La
alineación de dos secuencias de aminoácidos reveló que cuatro de
las inserciones de aminoácidos se produjo antes de la señal de corte
de la secuencia de señal. De esta manera, la proteína receptora
ACT-4-h-1 madura
contiene uno o más residuos aminoácidos que OX-40
(es decir, 253 frente a 252 aminoácidos). Notablemente, la
secuencia de nucleótidos de
ACT-4-h-1 era mucho
más rica en GC que la secuencia de OX-40 (70%
frente a 55%), indicando que las dos secuencias no se hibridarán
bajo condiciones restrictivas.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
6
Se extrajo un fragmento
XbaI-HindIII del constructo descrito en el Ejemplo 4
y se insertó en pcDNA-I-neo
digerido con XbaI/HindIII (Invitrogen) para generar un vector de
expresión denominado
ACT-4-h-1-neo
(fig. 6). Este vector se linearizó con SfI y se electroporó en tres
líneas celulares eucarióticas. Estas líneas celulares eran SP2/O
(un mieloma de ratón derivado de la cepa Balb/c), Jurkat (una línea
de células T humanas transformadas) y COS-7 (una
línea celular adherente de mono). Tras un periodo de recuperación de
48 horas, se seleccionaron las células transformadas en 1 mg/ml de
G418 (Gibco). Tras tres semanas de selección, se incubaron las
líneas celulares resistentes a neo con una concentración saturante
de anticuerpo L106, se lavaron y se utilizaron para recubrir placas
de Petri de 100 mm recubiertas con IgG de cabra antiratón para
seleccionar las células que expresaban
ACT-4-h-1. Tras
eliminar por lavado las células no unidas, se recuperaron las
células adherentes y se expandieron en cultivo de tejidos. Las
líneas celulares se sometieron a dos rondas adicionales de panning
y expresión. Se demostró mediante tinción de inmunofluorescencia
directa que las líneas celulares resultantes expresaban abundante
ACT-4-h-1 (fig.
7).
Se utilizó la misma estrategia y principios para
obtener una línea celular estable que expresase
ACT-4-L-h-1
(ver el Ejemplo 10).
\newpage
Ejemplo
7
Se ha construido una proteína de fusión soluble
en la que el dominio extracelular de
ACT-4-h-1 se une
mediante el extremo C-terminal al extremo
N-terminal del dominio constante de una
inmunoglobulina humana. El vector codificante de
ACT-4-h-1 descrito
en el Ejemplo 4 se cortó con SmaI y NotI para extraer todas las
secuencias de
ACT-4-h-1 cadena
abajo del sitio SmaI, incluyendo las regiones transmembranales,
citoplasmáticas y 3' no traducidas. La región restante codifica la
parte extracelular soluble de
ACT-4-h-1 (fig. 8).
La fuente de la región constante de inmunoglobulina que debía
unirse al dominio extracelular de
ACT-4-h-1 era un
plásmido denominado 5K-41BB-Eg1
(Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:10360-10364)
(incorporada como referencia a todos los fines). Este plásmido
contenía un fragmento genómico BamHI/EagI de 1,3 kb codificante de
los dominios CH2 y CH3 terminal de bisagra de Ig humana, isotipo
gamma 1. El fragmento requería la modificación por inserción en los
extremos SmaI/NotI del vector
ACT-4-h-1,
conservando simultáneamente el marco de lectura del péptido a
través de la unión SmaI que debía formarse mediante ligación de
extremo romo. Se cortó el vector
5k-41BB-Eg1 con BamH1, y las
extensiones 5' resultantes se rellenaron con fragmento Klenow. A
continuación, el vector se cortó con EgaI, liberando el fragmento
de 1,3 kb con extremo romo y extremo compatible con NotI. Este
fragmento se ligó con vector
ACT-4-h-1 digerido
con SmaI/NotI. La mezcla de ligación se electroporó en E.
coli y se cribaron múltiples clones transformantes con PCR
utilizando como cebadores fragmentos nucleótidos de
ACT-4-h-1 y de
IgG1.
Los plásmidos que contenían la región
codificante de
ACT-4-h-1-IgG1
se electroporaron en células COS. Las células se dejaron crecer
durante cinco días, después de lo cual se recolectaron los
sobrenadantes y se filtraron a esterilidad a través de una membrana
de 0,2 micrómetros. Los sobrenadantes se sometieron a ensayo para
la expresión de
ACT-4-h-1-IgG1
mediante transferencia por puntos. Los sobrenadantes se
transfirieron a nitrocelulosa y se bloquearon con leche seca no
grasa al 5%. Se sondearon réplicas de membranas con anticuerpo L106
o inmunoglobulina IgG antihumana de cabra marcada con fosfatasa
alcalina (American Qualex). Se detectó el anticuerpo L106 con IgG
antiratón de cabra marcado con fosfatasa alcalina. Se utilizó
NBT/BCIP (Pierce) como sustrato colorimétrico. Se secuenciaron en
el sitio de unión los clones positivos de producción elevada para
confirmar la construcción correcta del vector. El gen de la fusión
resultante se ilustra en la fig. 9.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
8
Los tipos celulares que expresaban un ligando
para ACT-4h-1 se identificaron
mediante tinción indirecta combinada con citometría de flujo
utilizando la proteína de fusión
ACT-4-h-1-inmunoglobulina
recombinante descrita en el Ejemplo 7 (en lo sucesivo
"ACT-4-h-1-Rg")
como sonda. La proteína de fusión unida se detectó utilizando Ig
antihumana conjugada con ficoeritrina. Estos experimentos revelaron
que se expresaba un ligando para
ACT-4-h-1 a niveles
reducidos en unas cuantas líneas de células B, incluyendo una línea
celular de linfoma de Burkitt (Jiyoye) y las LCLs transformadas por
EBV, 9037, 9059 y MSAB. Estas líneas celulares obtuvieron una
puntuación de 5% positivas con una MCF de 3 (ver la Tabla 2). En la
línea celular Jiyoye, resultó posible enriquecer las células con
tinción positiva mediante el procedimiento de panning, rindiendo una
línea celular Jo-P5, que tiñó positiva en 90% de
los casos con una MCF de 10. Otras líneas celulares sometidas a
ensayo, incluyendo PBMCs y subpoblaciones purificadas de células T,
células B, monocitos, células dendríticas, la mayor parte de las
líneas tumorales de células T y las líneas celulares de tumor
mielomonocítico recién aisladas, carecían sustancialmente de un
ligando para
ACT-4-h-1. Sin
embargo, dos líneas de células T infectadas por
HTLV-1, HUT-102 y
MT-2, expresaron
ACT-4-L-h-1,
la última a niveles extremadamente elevados.
Se repitió el experimento tras la activación de
las células utilizando PHA o una combinación de PMA/yonomicina. Las
PBMCs activadas con 2 \mug/ml de PHA durante tres días tiñeron
positivas en 2% a 10% de los casos para un ligando para
ACT-4-h-1,
dependiendo del donante. La activación de las células
B-LCL y líneas de linfoma de Burkit utilizando una
combinación de PMA (10 ng/ml) y yonomicina (500 ng/ml) indujo una
expresión sustancial de ligando en algunas líneas celulares,
particularmente aquéllas, tal como MSAB, que mostraron niveles
reducidos de expresión en el estado de reposo (ver la Tabla 2). Las
células B no fraccionadas también mostraron la expresión preferente
de ligando (15% de células positivas, MHC-5). Los
estudios de curso temporal en células MSAB indicaron que la
expresión de ligando se inició el día 2 tras la activación, y
alcanzó un máximo el día 3 ó 5. La activación con PMA/yonomicina
también indujo la expresión preferente de ligando en líneas
celulares de eritroleucemia y en una de las tres líneas celulares
mielomonocíticas sometidas a ensayo, THP-1. La
activación con PMA/yonomicina también indujo un nivel reducido de
expresión de ligando en las líneas de células T pero no en las demás
líneas de células T sometidas a ensayo.
Ejemplo
9
El clon de ADNc para el ligando se aisló
utilizando un sistema de expresión de células COS ligeramente
modificado, desarrollado por primera vez por Aruffo y Seed,
supra. Se aisló ARN a partir de células B transformadas por
EBY humanas activadas por PMA/yonomicina de 72 horas (línea celular
MSAB). Se extrajo el ARN total con reactivo TRI (Molecular Research
Center) y se aisló ARN poli(A)+ mediante purificación con
oligo-dT-perlas magnéticas
(Promega), se sintetizó ADNc mediante el procedimiento de Gubler y
Hoffman, Gene 25:263-369, 1982, utilizando
transcriptasa inversa superscript (Gibco/BRL) y un cebador
oligo-dT. El ADNc con extremo romos se ligó a
adaptadores BstXI no autocomplementarios y se pasó por una columna
Sephacryl S-500 para eliminar los adaptadores no
unidos y los fragmentos pequeños (<300 pares de bases). A
continuación, el ADN unido se ligó en un vector de expresión
eucariótico cortado con BstXI, pcDNA (Invitrogen). Los productos de
ligación se precipitaron, se lavaron y se electroporaron en E.
coli cepa MC1061/P3, generando una biblioteca no amplificada de
100 millones de clones independientes. El tamaño medio de inserción
en la biblioteca era de 1 kb. La mayor parte de la biblioteca se
amplificó en 250 ml de medio LB estándar. Se recuperó ADN de
plásmido mediante lisis alcalina y se purificó en una columna de
intercambio iónico (Qiagen).
Se transfectaron células COS-7
subconfluyentes con el ADN de plásmido purificado mediante
electroporación. Las células se sembraron en placas de 100 mm y se
dejaron crecer durante 48 horas. Las células se recuperaron de las
placas con solución PBS-EDTA, se incubaron con
anticuerpo monoclonal
ACT-4-h-1-Rg
y se sometieron a panning siguiendo procedimientos estándares. Una
segunda ronda de panning adsorbió numerosas células COS a las
placas, mostrando enriquecimiento en células que expresaban ligando.
Se recuperó ADN episómico de las células inmunoseleccionadas
mediante el procedimiento Hirt, y se electroporaron en bacterias
para la amplificación.
Las bacterias transformadas con plásmido de la
segunda ronda de selección se clonaron y se amplificaron. El ADN de
los clones individuales se purificó y se sometió a ensayo para la
capacidad de expresar un ligando para
ACT-4-h-1 en las
células COS-7. Se utilizó
ACT-4-h-1-Rg
conjugado con ficoeritrina para teñir monocapas de células
COS-7 y las células seguidamente se examinaron
mediante microscopía manual de inmunofluorescencia. Los clones nº
2, nº 26 y nº 30 proporcionaron un nivel elevado de expresión de
actividad ligante de
ACT-4-h-1-Rg.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
10
La inserción procedente del clon nº 26 en el
Ejemplo 9 se subclonó en pBluescript en los sitios de clonación
HindIII y XbaI. El clon se secuenció mediante el procedimiento de
terminación de cadena dideoxi utilizando un kit de secuenciación de
autolectura basado en la polimerasa de T7 (Pharmacia) en un
secuenciador ALF (Pharmacia). Se generaron tres subclones en
pBluescript y se secuenciaron en ambas cadenas con cebadores
directos y universales de M13. El ADNc y secuencias de aminoácidos
predichas del clon nº 26 se muestran en la fig. 10. El polipéptido
formado con la secuencia de aminoácidos predicha se denomina
ACT-4-L-1-h-1.
La secuencia de ADNc de
ACT-4-L-h-1
contiene 1.079 pares de bases, con una UTR 5' de 137 pb y una UTR
3' de 379 pb. Se encontraba presenta una señal de poliadenilación
AATAAA en la posición 1.024, seguida de una cola
poli-A de 20 bases en la posición 1.049. El análisis
del a secuencia reveló un único marco de lectura abierto que
codifica un polipéptido de 183 aminoácidos, con un peso molecular
calculado de 21.000. El marco de lectura abierto se inicia con el
primer ATG en la posición 149 y finaliza con un TGA en la posición
698. El ATG se encuentra flanqueado por una secuencia inicio de
consenso de Kozak con una posición A en -3 y una G en +4. El
análisis de hidrofobicidad reveló que la secuencia de aminoácidos
predicha es la de una proteína membranal de tipo II con un único
dominio transmembranal de aproximadamente 27 aminoácidos en la parte
amino-terminal de la proteína. Además, existen
cuatro sitios de glucosilación N-ligados en la parte
C-terminal de la molécula.
La comparación de la secuencia de nucleótidos de
ACT-4-L-h-1
con secuencias conocidas en las bases de datos Genbank y EMBL no
reveló homología significativa respecto a los genes conocidos para
un gen codificante de una proteína denominada gp34 por Miura et
al., Mol. Cell Biol. 11:1313-1325, 1991. La
secuencia de ADNc de la región codificante del ligando
ACT-4-L-h-1
era idéntica a la de gp34. Sin embargo, el ADNc de
ACT-4-L-h-1
contenía 112 nucleótidos adicionales en el extremo 5' en
comparación con la secuencia de gp34. Debido a que los nucleótidos
adicionales se encuentran dentro de la región 5' no traducida, la
presencia de los mismos es improbable que altere el producto de
expresión. Más probablemente el clon
ACT-4-L-h-1
se derivaba de un transcrito inverso más completo y es más
representativo del extremo 5' in vivo. Posiblemente la
secuencia adicional podría encontrarse implicada en la regulación
de la traducción de la proteína.
La comparación de la secuencia de aminoácidos
predicha del ligando
ACT-4-L-h-1
con secuencias conocidas en la base de datos Protein Information
Resource (PIR) utilizando el programa FastDB reveló una identidad
con gp34, y una homología muy débil con TNF alfa. Un algoritmo
predictivo de la estructura secundaria desarrollado por Chou y
Fasman predice que el ligando
ACT-4-L-h-1
y TNF-alfa es probable que formen cantidades
significativas de estructuras beta. Esta predicción es consistente
con la observación de que todos los demás miembros de la familia
TNF de proteínas se encuentran conformados o se predice que forman
configuraciones beta de rollo de gelatina ricas en estructuras
beta.
Para los fines de claridad y comprensión, la
invención se ha descrito en los presentes ejemplos y en la
exposición anterior en cierto detalle. Sin embargo, resultará
evidente que pueden ponerse en práctica determinados cambios y
modificaciones comprendidas dentro del alcance de las
reivindicaciones adjuntas.
\vskip1.000000\baselineskip
Esta lista de referencias citadas por el
solicitante está prevista únicamente para ayudar al lector y no
forma parte del documento de patente europea. Aunque se ha puesto
el máximo cuidado en su realización, no se pueden excluir errores u
omisiones y la OEP declina cualquier responsabilidad en este
respecto.
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\bullet US 4683202 A [0072]
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Claims (20)
1. Polipéptido soluble aislado que comprende por
lo menos 5 aminoácidos contiguos de la secuencia de aminoácidos del
dominio extracelular del polipéptido
ACT-4-L mostrado en la fig. 10,
presentando dicho polipéptido soluble la capacidad de unirse
específicamente al receptor
ACT-4-h-1 mostrado
en la fig. 5.
2. Polipéptido según la reivindicación 1, que
comprende una secuencia de aminoácidos que presenta una identidad
de secuencia de por lo menos 80% con la secuencia de aminoácidos del
polipéptido ACT-4-L mostrado en la
fig. 10.
3. Polipéptido según la reivindicación 1, que
consiste de la secuencia de aminoácidos del dominio extracelular de
la secuencia polipeptídica mostrada en la fig. 10.
4. Polipéptido aislado que comprende una
secuencia de aminoácidos que varía respecto a la secuencia de
aminoácidos mostrada en la fig. 10 en una sustitución de aminoácido
conservadora,
uniéndose dicho polipéptido específicamente al
receptor ACT-4-h-1
mostrado en la fig. 5 y en el que dicha secuencia de aminoácidos
presenta una identidad de secuencia de por lo menos 70% con la
secuencia de aminoácidos mostrada en la fig. 10.
5. Polipéptido según cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, que se fusiona con un polipéptido
heterólogo.
6. Polipéptido según la reivindicación 5, donde
el polipéptido heterólogo comprende un dominio de región constante
de una cadena pesada de inmunoglobulina.
7. Polipéptido según cualquiera de las
reivindicaciones anteriores que se encuentra marcado.
8. Utilización de un polipéptido según
cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7 o un polipéptido que
presenta la secuencia de aminoácidos mostrada en la fig. 10, en la
preparación de un medicamento para el tratamiento de una condición
inmunológica en un paciente.
9. Ácido nucleico aislado codificante de un
polipéptido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6.
10. Vector de expresión replicable que
comprende un ácido nucleico según la reivindicación 9.
11. Célula huésped procariótica o eucariótica
que ha sido transformada para incluir un vector de expresión según
la reivindicación 10.
12. Composición farmacéutica que comprende un
polipéptido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7 en
combinación con un portador farmacéuticamente aceptable.
13. Procedimiento de cribado in vitro
para agentes inmunomoduladores que afectan a la unión del
polipéptido receptor ACT-4 a un polipéptido ligando
ACT-4-L, comprendiendo el
procedimiento: poner en contacto
- (a)
- un polipéptido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, o un polipéptido que presenta la secuencia de aminoácidos mostrada en la figura 10,
- (b)
- un polipéptido receptor ACT-4 que presenta una secuencia tal como se muestra en la fig. 5, y
- (c)
- un agente sometido a ensayo, y
detectar la unión entre los componentes (a) y
(b).
14. Grupo de unión que comprende un anticuerpo
monoclonal humanizado que comprende una cadena pesada humanizada y
una cadena ligera humanizada:
- (1)
- comprendiendo la cadena ligera humanizada tres regiones determinantes de complementariedad (CDR1, CDR2 y CDR3) que presentan secuencias de aminoácidos sustancialmente procedentes de las regiones determinantes de complementariedad correspondientes de una cadena ligera de un anticuerpo no humano que se une específicamente a un dominio extracelular del ligando ACT-4-L-h-1, y que presenta una secuencia de marco de región variable sustancialmente idéntica a una secuencia de marco de región variable de cadena ligera humana, y
- (2)
- comprendiendo la cadena pesada humanizada tres regiones determinantes de complementariedad (CDR1, CDR2 y CDR3) que presentan secuencias de aminoácidos sustancialmente procedentes de las regiones determinantes de complementariedad correspondientes de una cadena pesada del anticuerpo no humano, y que presentan una secuencia de marco de región variable sustancialmente idéntica a una secuencia de marco de región variable de cadena pesada,
en el que el anticuerpo humanizado se une
específicamente al dominio extracelular del ligando
ACT-4-L-h-1
con una constante de disociación que es inferior o igual a 1
micromolar,
y en el que el ligando
ACT-4-L-h-1
es un polipéptido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a
4.
15. Grupo ligante que comprende un anticuerpo
monoclonal humano que se une específicamente a un dominio
extracelular del ligando
ACT-4-L-h-1
con una constante de disociación que es inferior o igual a 1
micromolar, en el que el ligando
ACT-4-L-h-1
es un polipéptido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a
4.
16. Composición farmacéutica que comprende el
grupo de unión según la reivindicación 14 ó 15.
17. Grupo ligante según la reivindicación 14 ó
15, para la utilización en el tratamiento de una condición
inmunológica en un paciente.
18. Utilización de un grupo ligante según la
reivindicación 14 ó 15, en la preparación de una composición
farmacéutica para el tratamiento de una condición inmunológica en un
paciente.
19. Utilización según la reivindicación 18, en
la que se suprime la respuesta inmunológica en un paciente.
20. Utilización según la reivindicación 18, en
el tratamiento del rechazo del trasplante, de la enfermedad del
huésped contra el injerto, de una enfermedad autoinmunológica, de la
inflamación, de agentes infecciosos, de células infectadas por
HTVL, de VIH, de la enfermedad o trastorno intestinal
inflamatorio.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US195967 | 1988-05-19 | ||
| US08/195,967 US6242566B1 (en) | 1994-02-10 | 1994-02-10 | Ligand (ACT-4-L) to a receptor on the surface of activated CD4+ T-cells |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| ES2323392T3 true ES2323392T3 (es) | 2009-07-14 |
Family
ID=22723580
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| ES95907739T Expired - Lifetime ES2323392T3 (es) | 1994-02-10 | 1995-02-06 | Ligando (act-4-l) para un receptor situado sobre la superficie de las celulas t cd4+activadas. |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
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