ES2332314T3 - Metodo para incrementar la resistencia frente a factores de estres en los vegetales. - Google Patents
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Abstract
Método para la generación o incremento de la resistencia frente a al menos un factor de estrés biótico en plantas en el cual están comprendidos los siguientes pasos de trabajo: a) Incremento de la cantidad de proteína de al menos una proteína de inhibidor de Bax -1 (BI1) en al menos un tejido vegetal de la planta con la condición de que la expresión en la epidermis de la hoja permanezca esencialmente sin modificar o que se reduzca, y b) Selección de las plantas en las que en comparación con la planta de partida ya exista una resistencia contra al menos un factor de estrés biótico o se incremente; y en donde el factor de estrés es un patógeno de la planta.
Description
Método para incrementar la resistencia frente a
factores de estrés en los vegetales.
La invención se refiere a métodos para generar o
incrementar la resistencia frente a, al menos, un factor de estrés
biótico o abiótico en los vegetales, preferiblemente frente a
plantas patógenas, mediante el incremento de la expresión de, al
menos, una proteína inhibidora Bax 1 (BI1) en al menos un tejido
vegetal, con la condición de que la expresión en la epidermis de la
hoja permanece esencialmente inmodificada.
Un objetivo de los trabajos biotecnológicos en
vegetales es la producción de vegetales con propiedades novedosas y
ventajosas, por ejemplo para el incremento de la productividad
agrícola, para el incremento de la calidad en los productos
alimenticios o para la producción de determinados productos químicos
o farmacéuticos. Con frecuencia son insuficientes los mecanismos de
defensa naturales del vegetal frente a patógenos. Las solas
enfermedades por hongos conducen a pérdidas anuales en cosechas de
muchos millardos de US\textdollar. La introducción de genes
ajenos a partir de fuentes vegetales, animales o microbianas puede
incrementar las defensas. Ejemplos son la protección de tabaco
frente al daño por comida de insectos mediante expresión de
endotoxinas de Bacillus thuringiensis (Vaeck et al.
(1987) Nature 328:33-37) o la protección del tabaco
frente a la infestación de hongos mediante expresión de una
quitinasa de frijol (Broglie et al. (1991) Science
254:1194-1197). Sin embargo, la mayoría de los
planteamientos descritos solo ofrecen resistencia a un patógeno
individual o a un espectro estrecho de
patógenos.
patógenos.
Existen solo unos pocos planteamientos que
confieren resistencia a los vegetales frente a un espectro más
amplio de patógenos, en particular frente a hongos patógenos. La
resistencia sistémica adquirida ("systemic acquired
resistance"; SAR) - un mecanismo de defensa en una variedad de
interacciones de vegetal/patógeno - puede conferirse mediante
aplicación de sustancias mensajeras endógenas, tales como ácido
jasmónico (JA) o ácido salicílico (SA) (Ward et al. (1991)
Plant Cell 3:1085-1094; Uknes et al. (1992)
Plant Cell 4(6):645-656). Efectos similares
también pueden alcanzarse mediante compuestos sintéticos tales como
ácido 2,6-dicloroisonicotínico (DCINA) o éster
S-metílico de ácido
benzo(1,2,3)tiadiazol-7-tiocarboxílico
(BTH; Bion®) (Friedrich et al. (1996) Plant J
10(1):61-70; Lawton et al. (1996)
Plant J 10:71-82). La expresión de las proteínas
relacionadas con patogénesis ("pathogenesis related" (PR)),
que están altamente reguladas en el caso de SAR, también puede
provocar parcialmente resistencia patógena.
En cebada, el locus Mlo se describe como un
regulador negativo de defensa patógena. La pérdida o la pérdida de
función ("loss-of-function")
del gene Mlo ocasiona una resistencia aumentada resistencia no
específica con respecto a la raza frente a un gran número de
aislados de mildiu (Büschges R et al. (1997) Cell
88:695-705; Jorgensen JH (1977) Euphytica
26:55-62; Lyngkjaer MF et al. (1995) Plant
Pathol 44:786-790). El gen de Mlo está descrito
(Büschges R et al. (1997) Cell 88:695-705; WO
98/04586; Schulze-Lefert P, Vogel J (2000) Trends
Plant Sci. 5:343-348). Se aislaron diversos
homólogos de Mlo de otras especies de cereales. Se han descrito
métodos usando estos genes para lograr una resistencia patógena
(WO.98/04586; WO 00/01722; WO 99/47552). La desventaja es que las
plantas con deficiencia de Mlo también inician los mecanismos de
defensa arriba mencionados en ausencia de un patógeno que se
manifiesta en una mortandad espontánea de células de la hoja.
(Weiter M et al. (1993) Mol Gen Genet
239:122-128). Por esto las plantas resistentes a mlo
sufren un menoscabo de rendimiento de alrededor de 5% (Jörgensen
JH (1992) Euphytica 63: 141-152). La muerta
espontánea de las células de hoja implica además una
hiper-susceptibilidad desventajosa frente a
patógenos necrotrofos y hemibiotrofos tales como Magnaporte grisea
(M. grisea) o Cochliobolus sativus (Bipolaris
sorokiniana) (Jarosch B et al. (1999) Mol Plant Microbe
Interact 12:508-514; Kumar J et al. (2001)
Phytopathology 91: 127-133).
Los factores que inducen un efecto comparable de
resistencia mlo frente a hongos necrotrofos, no han podido
identificarse hasta ahora. La razón para esto puede ser el mecanismo
de infección específico de los hongos necrotrofos: en lugar de una
penetración facilitada por appressoria, primero liberan micotoxinas
y enzimas dentro de las células huésped de la planta, lo cual
conduce a la muerte de la célula. Sólo entonces la célula es
penetrada (Shirasu K and Schulze-Lefert P (2000)
Plant Mol Biol 44:371-385). Estrategias similares de
infección se emplean por patógenos bacterianos tales como Erwinina
carotovora (Whitehead NA et al. (2002) Antonie van
Leeuwenhoek 81: 223-231). Una resistencia a la
penetración con la ayuda de la formación de papilas no representa
una estrategia eficiente de defensa.
La apoptosis, también denominada muerte celular
programada, es un mecanismo esencial para mantener la homeostasis
de tejido y, de esta manera, constituye un mecanismo negativamente
regulador que contrarresta la división celular. En organismos
multicelulares, la apoptosis es una parte natural de la ontogénesis
e involucra, entre otros, el desarrollo de los órganos y la
remoción de células envejecidas, infectadas o mutadas. La apoptosis
permite que tenga lugar una eliminación eficiente de células
indeseadas. Una interferencia o inhibición de la apoptosis
contribuye a la patogénesis de un rango de enfermedades, entre otras
de la carcinogénesis. Los efectores principales de la apoptosis son
proteasas de cisteína específicas a aspartato, las llamadas
caspasas. Estas pueden activarse por medio de, al menos, dos rutas
de señales de apoptosis: primero, la activación de la familia
receptora de TNF (Tumor Necrosis Factor); segundo, el papel central
desempeñado por las micondrias. La activación de las rutas de señal
apoptótica de las mitocondria está regulada por proteínas de la
familia Bcl-2. Esta familia de proteínas consiste
en proteínas anti-apoptóticas y
pro-apoptóticas tales como, por ejemplo, Bax. En el
caso de un estímulo apoptótico, tiene lugar un cambio conformacional
alostérico de la proteína Bax sufre el cual conduce a un anclaje de
la proteína en la membrana externa de la mitocondria y a su
oligomerización. El resultado de estos oligómeros es que se liberan
moléculas pro-apoptóticas desde la mitocondria
hacia el zitosol y estas moléculas ocasionan una cascada de señal
apoptóticas y, finalmente, la degradación de sustratos celulares
específicos, lo cual tiene la muerte celular como consecuencia. El
inhibidor Bax 1 BI1 se aisló por su propiedad de inhibir el efecto
proapoptótico de BAX (Xu Q & Reed JC (1998) Mol Cell
1(3): 337-346). BI1 representa una proteína
altamente conservada. Se encuentra predominantemente como componente
integral de membranas intracelulares. BI1 interactúa con
bcl-2 y bcl-x1. La sobreexpresión de
BI1 en células de mamíferos suprime el efecto proapoptótico de BAX,
etoposido y staurosporina, pero no de antígeno Fas (Roth W and Reed
JC (2002) Nat Med 8: 216-218). La inhibición de BI1
por ARN antisense, por el contrario induce apoptosis (Xu Q &
Reed JC (1998) Mol Cell 1(3):337-346). Los
primeros homólogos vegetales de BI1 han sido aislados de arroz y
Arabidopsis (Kawai et al. (1999) FEBS Lett
464:143-147; Sanchez et al (2000) Plant J
21:393-399). Estas proteínas vegetales suprimen la
muerte celular inducida por BAX en levadura. La homología de
secuencia de aminoácido con BI1 es de cerca del 45%. El homólogo de
Arabidopsis AtBI1 es capaz de suprimir, en vegetales recombinantes,
el efecto pro-apoptótico de BAX de ratón
(Kawai-Yamada et al. (2001) Proc Natl Acad
Sci USA 98(21):12295-12300). El homólogo BI1
de arroz (Oryza sativa) se expresa en todos los tejidos
vegetales (Kawai et al. (1999) FEBS Lett 464:
143-147). Además, se encuentran descritos genes BI1
de cebada (Hordeum vulgare; GenBank Acc.-No.: AJ290421),
arroz (GenBank Acc.-No.: AB025926), Arabidopsis (GenBank Acc.-No.:
AB025927), tabaco (GenBank Acc.-No.: AF390556) y colza (GenBank
Acc.-No.: AF390555, Bolduc N et al. (2003) Planta
216:377-386). La expresión de BI1 en cebada en
altamente regulada como consecuencia de una infección con mildiu
(Hückelhoven R et al. (2001) Plant Mol Biol
47(6):739-748). WO 00/26391 describe la
sobreexpresión de los genes antiapoptóticos Ced-9
de C. elegans, sfIAP de Spodoptera frugiperda,
bcl-2 del ser humano y bcl-xl de
gallina en vegetales para elevar la resistencia frente a hongos
necrotrofos o hemibiotrofos. Los homólogos de BI1 vegetales no han
sido divulgados. La expresión se realiza bajo el control de
promotores constitutivos. Además se describe la expresión de
proteína BI1 de Arabidopsis bajo el fuerte promotor constitutivo 35S
CaMV en células de arroz y una resistencia, inducida por ésta,
contra las sustancias que inducen a muerte celular a partir de
Magnaporthe grisea (Matsumura H et al. (2003) Plant J
33:425-434).
33:425-434).
De manera sorprendente se ha encontrado en el
marco de esta invención que si bien una expresión constitutiva de
una proteína BI1 causa una resistencia frente a hongos necrotrofos,
esto tiene como consecuencia, sin embargo, una ruptura de la
resistencia mediada por mlo frente a mildiu polvoriento
obligado-biotrófico (véase experimento comparativo
1). Esto cuestiona la utilidad económica de los métodos descritos en
el estado de la técnica.
La tarea consistió en suministrar métodos de
defensa patógena vegetal que hicieran posible una defensa efectiva
contra patógenos vegetales (preferiblemente patógenos necrotrofos)
sin romper ninguna resistencia existente frente a otros patógenos
(tales como, por ejemplo, patógenos biotrofos). Esta tarea se
resuelve mediante el método de acuerdo con la invención.
Un primer objeto de la invención se refiere a
métodos para generar o incrementar la resistencia en vegetales a al
menos un factor de estrés biótico o abiótico, el cual comprende los
siguientes pasos:
- a)
- incremento de la cantidad de proteína de al menos una proteína de inhibidor BAX 1 (BI1) en al menos un tejido vegetal con la condición de que la expresión en la epidermis de la hoja se mantenga esencialmente inmodificada o se reduzca, y
- b)
- selección de los vegetales en los que, en comparación con los vegetales de partida, exista, o se incremente, una resistencia frente a al menos un factor de estrés biótico o abiótico.
El factor de estrés biótico preferido es un
patógeno, preferiblemente un patógeno seleccionado del grupo de
patógenos necrotrofos y hemibiotrofos.
Por epidermis, la persona técnica en la materia
entiende el tejido epidermal predominante de las partes del vegetal
primarias superficiales (encima de la tierra), por ejemplo del
tallo, de las hojas, de las flores, frutas y semillas. Las células
epidermales secretan hacia afuera una capa repelente al agua, la
cutícula. Las raíces están rodeadas por rizodermis que en muchos
casos se asemeja a la epidermis pero también muestra diferencias
pronunciadas. La epidermis se genera de la capa más externa del
meristema apical. Por el contrario, la formación de rizodermis es
menos clara. Dependiendo de las especies puede considerarse, en
términos de evolución, o bien como parte de la piloriza (caliptra)
o bien como parte de la corteza primaria. La epidermis tiene
numerosas funciones: protege la planta contra la desecación y regula
la velocidad de transpiración. Protege la planta frente a las más
diversas influencias químicas y físicas externas, frente a ser
devorados por animales y frente al ataque de parásitos. Participa
en el intercambio de gas, en la secreción de determinados productos
metabólicos y en la absorción de agua. Comprende receptores para la
luz y los estímulos mecánicos. De esta manera actúa como
transformador de señal entre el medio ambiente y la planta. De
acuerdo con sus diversas funciones, la epidermis comprende un
número de células diferenciadas de manera diferente. A esto deben
añadirse variantes específicas por especies y organizaciones
diferentes epidérmicas en las partes individuales de una planta.
Esencialmente consiste en tres categorías de células: las
"propias" células de epidermis, las células de los estomas y
los trichomas (del griego: trichoma, pelo), apéndices de la
epidermis de forma, estructura y función diferentes. Las
"propias" células de la epidermis, es decir, las menos
especializadas constituyen la masa principal de las células del
tejido final. Desde una vista superior, éstas son o bien poligonales
(de forma plana o de plato) o alongadas. Las paredes entre ellas
son frecuentemente onduladas o sinuosas. No se conoce qué induce a
esta forma durante el desarrollo; las hipótesis existentes solo
ofrecen explicaciones insatisfactorias para esto. Pueden
encontrarse células epidérmicas alongadas en órganos o partes de
órganos que son ellos mismos alongados como, por ejemplo en los
tallos, peciolos, venas de hojas y en las hojas de la mayoría de
los monocotiledóneas. La parte superior e inferior de los limbos
pueden cubrirse con diferentes estructuras de epidermis y es
posible que pueda variar tanto la forma de las células, el grosor de
las paredes como también la distribución y el número de las células
especializadas (estomas y/o trichomas) por unidad de superficie.
También se encuentran grandes variaciones dentro de familias
individuales, por ejemplo las Crassulaceas. En la mayoría de los
casos, la epidermis consiste en una capa individual aunque se han
encontrado epidermis multicapas que almacenan agua en especies de
varias familias (Moraceae: aquí, la mayoría de las especies de
ficus, Piperaceae: peperonia [Peperonie], Begoniaceae, Malvaceae,
entre otras). Sin embargo, las células epidérmicas secretan una
cutícula en la parte de afuera que cubre todas las superficies
epidérmicas como una película ininterrumpida. Puede ser tersa o
estructurada por turgencias, cordeles, arrugas o surcos. Sin
embargo, no siempre las arrugas de la cutícula, que pueden
observarse al inspeccionar la superficie, son ocasionadas por la
formación de cordeles cuticulares. En realidad existen casos cuando
las arrugas cuticulares son tan solo la expresión de bultos
subyacentes de la pared celular. Los apéndices epidérmicos de
diversa forma, estructura y función se denominan trichomas y, en el
presente contexto, también se entienden por el término de
"epidermis". Aparecen en forma de pelos protectores, pelos de
soporte y pelos de glándulas, en la forma de escamas, de diversas
papilas y en las raíces como pelos absorbentes. Se forman
exclusivamente por células epidérmicas. Con frecuencia, un trichoma
se forma sólo por una célula así, aunque ocasionalmente más de una
célula participa en dicha formación. Así mismo, bajo el término
"epidermis" están comprendidas las papilas. Las papilas son
protuberancias de la superficie epidérmica. El ejemplo de libro de
texto son las papilas sobre las superficies de flor pensamiento
(viola tricolor) así como las superficies de hojas de muchas
especies en los bosques lluviosos tropicales. Confieren a la
superficie una consistencia aterciopelada. Algunas células de la
epidermis pueden formarse como almacenamientos de agua. Un ejemplo
típico representan las células vesiculares en las superficies de
muchas especies de margaritas y otras plantas suculentas. En el
caso de algunas plantas, por ejemplo en flores campanilla (campanula
persicifolia) las paredes externas de la epidermis se espesan como
lentes.
La masa principal de todos los tejidos forma el
tejido fundamental o parénquima. Los tejidos de parénquima incluyen
el mesófilo que puede estar diferenciado en el parénquima de
empalizada y parénquima de espuma.
Por consiguiente, la persona técnica en la
materia entiende por mesófilo un tejido de parénquima. Las células
de parénquima están vivas sin excepción, la mayoría isodiamétricas,
rara vez alongadas. La médula de las yemas, los tejidos de
almacenamiento de los frutos, las semillas, la raíz y otros órganos
que se ubican bajo tierra deben considerarse así mismo como
parénquimas, como el mesófilo.
El mesófilo se subdivide en las hojas de la
mayoría de los helechos y fanerógamos, de manera particularmente
marcada en las dicotiledóneas y muchas monocotiledóneas, en
parénquimas de empalizada y de esponja. Una hoja "típica" está
estructurada de manera dorsiventral. El parénquima dorsiventral se
encuentra en tal caso, la mayoría de las veces, en el lado superior
de la hoja, inmediatamente debajo de la epidermis. El parénquima
esponjoso llena el espacio subyacente. Se intercala por un sistema
intercelular voluminoso cuyo espacio gaseoso se encuentra en
contacto directo con el mundo exterior por medio de las estomas. El
parénquima de empalizada está compuesto de células cilíndricas
alongadas. En algunas especies, las células son irregulares,
ocasionalmente bifurcadas (en forma de Y: parénquima de empalizada
de brazo). Tales variantes se encuentran en helechos, coníferas y
unas pocas angioespermas (por ejemplo en algunas especies
Ranunculaceae y Caprifoliaceae [ejemplo: saúco]). Junto a las
formas de organización más ampliamente difundidas acabadas de
describir, se han detectado las siguientes variantes:
- parénquima de empalizada en el lado inferior de la hoja. Particularmente ostensible en las hojas escamosas. Ejemplo: la tuya (Thuja), así como en las hojas de ajo silvestre o de oso (Allium ursinum).
- Parénquima de empalizada en ambos lados de la hoja (lado superior e inferior). Con frecuencia en plantas de lugares secos (xerophytos). Ejemplo: lechuga espinosa (Lactuca serriola);
- parénquima de empalizada cerrada con forma de anillo: en hojas organizadas de manera cilíndrica y en las agujas de las coníferas
La variabilidad de las células de la parénquima
esponjosa y la organización de parénquima esponjosa misma son
incluso más variadas que aquella de la parénquima de empalizada. La
mayoría de las veces se denomina tejido de aireación puesto que
comprende un gran número de espacios intercelulares enlazados unos
con otros. El mesófilo puede comprender el llamado tejido de
asimilación, pero los términos mesófilo y tejido de asimilación son
deben usarse como sinónimos. Existen hojas libres de cloroplastos
cuya organización difiere sólo en menor grado de hojas verdes
comparables. Como consecuencia, comprenden mesófilo, pero no tiene
lugar una asimilación; viceversa, la asimilación tiene lugar en,
por ejemplo, secciones del vástago. La persona técnica en la materia
puede encontrar otras ayudas en la caracterización de epidermis y
mesófilo, por ejemplo en v. GUTTENBERG, H.: Lehrbuch der
Allgemeinen Botanik (Manual de botánica general). Berlin:
Akademie-Verlag (editorial), 1955 (5. edición),
HABERLANDT, G.: Physiologische Pflanzenanatomie (Anatomía
fisiológica de los vegetales). Leipzig: W. Engelmann 1924 (6.
Edición); TROLL, W.: Morphologie der Pflanzen (Morfología de los
vegetales). Volumen 1: órganos de los vegetales. Berlin: Gebr.
Borntraeger, 1937; TROLL, W.: Praktische Einführung in die
Pflanzenmorphologie (Introducción práctica a la morfología de los
vegetales). Jena: VEB G. Thieme Verlag (editorial) 1954/1957;
TROLL, W., HÖHN, K.: Allgemeine Botanik (Botánica general).
Stuttgart: F. Enke Verlag (editorial), 1973 (4. edición.).
\newpage
En una modalidad la epidermis se caracteriza
bioquímicamente. En una modalidad, la epidermis puede caracterizarse
por la actividad de uno o más de los siguientes promotores:
- -
- WIR5 (=GstA1), acc. X56012, Dudler & Schweizer, no publicado.
- -
- GLP4, acc. AJ310534; Wei, Y.; Zhang, Z.; Andersen, C.H.; Schmelzer, E.; Gregersen, P.L.; Collinge, D.B.; Smedegaard-Petersen, V.; Thordal-Christensen, H. (1998) An epidermis/papilla-specific oxalate oxidase-like protein in the defence response of barley attacked by the powdery mildew fungus. Plant Molecular Biology 36, 101-112.
- -
- GLP2a, acc. AJ237942, Schweizer, P., Christoffel, A. and Dudler, R. (1999). Transient expression of members of the germin-like gene family in epidermal cells of wheat confers disease resistance, Plant J 20, 541-552.
- -
- Prx7, acc. AJ003141, Kristensen BK, Ammitzböll H, Rasmussen SK & Nielsen KA. 2001. Transient expression of a vacuolar peroxidase increases susceptibility of epidermal barley cells to powdery mildew. Molecular Plant Pathology, 2(6), 311-317
- -
- GerA, acc. AF250933; Wu S, Druka A, Horvath H, Kleinhofs A, Kannangara G & von Wettstein D, 2000. Functional characterization of seed coat-specific members of the barley germin gene family. Plant Phys Biochem 38, 685-698
- -
- OsR0C1, acc. AP004656
- -
- RTBV, acc. AAV62708, AAV62707; Klöti, A, Henrich C, Bieri S, He X, Chen G, Burkhardt PK, Wünn J, Lucca, P, Hohn, T, Potrykus I & Fütterer J, 1999, Upstream and downstream sequence elements determine the specificity of the rice tungro bacilliform virus promotor and influence RNA production after transcription initiation. PMB 40, 249-266
\vskip1.000000\baselineskip
En una modalidad la epidermis se distingue
porque todos los promotores mencionados son activos en el tejido o
en la célula. En otra modalidad la epidermis se distingue porque
sólo una parte de los promotores es activa, por ejemplo 2, 3, 5 ó
7 ó más, aunque al menos uno de los arriba enumerados.
\vskip1.000000\baselineskip
En una modalidad el mesófilo se caracteriza
bioquímicamente. El mesófilo puede distinguirse en una modalidad
por la actividad de uno o más de los siguientes promotores:
- -
- PPCZm1 (=PEPC); Kausch, A.P., Owen, T.P., Zachwieja, S.J., Flynn, A.R. and Sheen, J. (2001) Mesophill-specific, light and metabolic regulation of the C(4) PPCZm1 promotor in transgenic maize. Plant Mol. Biol. 45, 1-15
- -
- OsrbcS, Kyozuka et al PlaNT Phys: 1993 102: Kyozuka J, NcElroy D, Hayakawa T, Xie Y, Wu R & Shimamoto K. 1993. Light-regulated and cell-specific expression of tomato rbcs-gusA and rice rbcs-gusA fusion genes in transgenic rice. Plant Phys 102, 991-1000
- -
- OsPPDK, acc. AC099041, no publicado
- -
- TaGF-2.8, acc. M63223; Schweizer, P., Christoffel, A. and Dudler, R. (1999). Transient expression of members of the germin-like gene family in epidermal cells of wheat confers disease resistance, Plant J 20, 541-552.
- -
- TaFBPase, acc. X53957; no publicado
- -
- TaWIS1, acc. AF467542; US 200220115849
- -
- HvBIS1, acc. AF467539; US 200220115849
- -
- ZmMIS1, acc. AF467514; US 200220115849
- -
- HvPR1a, acc. X74939; Bryngelsson et al. Molecular Plant-Microbe Interactions (1994)
- -
- HvPR1b, acc. X74940; Bryngelsson et al. Molecular Plant-Microbe Interactions (1994)
- -
- HvB1, 3gluc; acc. AF479647; no publicado
- -
- HvPrx8, acc. AJ276227; Kristensen et al MPP 2001 (véase arriba)
- -
- HvPAL, acc. X97313; Wei, Y.; Zhang, Z.; Andersen,C.H.; Schmelzer,E.; Gregersen, P.L.; Collinge, D.B.; Smedegaard-Petersen, V.; Thordal-Christensen,H. (1998) An epidermis/papilla-specific oxalate oxidase-like protein in the defence response of barley attacked by the powdery mildew fungus. Plant Molecular Biology 36, 101-112.
En una modalidad el mesófilo se distingue porque
todos los promotores mencionados están activos en el tejido o en la
célula. En otra modalidad el mesófilo se distingue porque solo una
parte de los promotores es activa, por ejemplo 2, 3, 5 ó 7 o más,
aunque por lo menos uno de los arriba enumerados.
En una modalidad en un vegetal usado o producido
de acuerdo con la invención o en un vegetal de acuerdo con la
invención en la epidermis y en el mesófilo todos los promotores
mencionados son activos. En una modalidad solo una parte de los
promotores mencionados son activos, por ejemplo 2, 5, 7 o más,
aunque al menos uno de los promotores arriba enumerados es
respectivamente activo.
En una modalidad preferida el incremento de la
cantidad de proteína de la proteína BI1 se realiza de manera
específica para la raíz, el tubérculo o el mesófilo, de manera
particularmente preferida específica para mesófilo, por ejemplo
mediante expresión recombinante de una secuencia de ácido nucleico
que codifica para dicha proteína BI1 bajo el control de un promotor
específico para raíz, tubérculo o mesófilo, preferiblemente bajo el
control de un promotor específico para mesófilo.
En una modalidad, tal como se describe aquí, se
incrementa la expresión o función de la proteína según la invención
o de su BI1 en el mesófilo de un vegetal. Un incremento de la
expresión puede lograrse tal como se describe abajo. Por incremento
de la expresión se entiende aquí tanto la activación como el aumento
de la expresión de la proteína endógena, incluyendo una expresión
de novo como también un incremento o aumento mediante la expresión
de una proteína o factor transgénicos.
En una modalidad particularmente preferida, el
incremento de la cantidad de proteína de al menos una proteína
vegetal BI1 puede combinarse con un fenotipo resistente a mlo o con
la inhibición o reducción, en comparación con una planta de
control, de la expresión de MLO, RacB y/o NaOx en la planta o en una
parte de la misma, por ejemplo en un tejido, aunque de manera
particularmente ventajosa en la epidermis o en una parte esencial
de las células de la epidermis y/o con el incremento de la expresión
de PEN2 y/o PEN1 en la planta, por ejemplo de manera constitutiva,
o en una parte de la misma, por ejemplo en un tejido, aunque de
manera particularmente ventajosa al menos en la epidermis o en una
parte esencial de las células de epidermis, con la condición de que
la expresión de una proteína vegetal BI1 en la epidermis de la hoja
permanece esencialmente inmodificada o se reduce y de esa manera se
logra una resistencia combinada contra patógenos tanto necrotróficos
como también biotróficos.
El locus Mlo ha sido descrito en cebada como
regulador negativo de defensa patógena. La pérdia, o pérdida de
función ("loss-of-function"),
del gen Mlo condiciona una resistencia elevada, no específica para
raza, frente a una cantidad de aislados de mildiu (Büschges R et
al. (1997) Cell 88:695-705; Jorgensen JH (1977)
Euphytica 26:55-62; Lyngkjaer MF et al.
(1995) Plant Pathol 44:786-790). El gen Mlo está
descrito (Büschges R et al. (1997) Cell
88:695-705; WO 98/04586;
Schulze-Lefert P, Vogel J (2000) Trends Plant Sci.
5:343-348). Se han aislado diversos homólogos de
Mlo-Homologe de otras especies de cereales. Un
fenotipo resistente a mlo puede obtenerse tal como se describe en
el estado de la técnica. Los métodos en los que se usan estos genes
para lograr una resistencia patógena se describen, entre otros, en
WO 98/04586; WO 00/01722; WO 99/47552.
Ventajosamente, en una modalidad de la presente
invención, puede inhibirse la actividad o la expresión de MLO, RacB
y/o NaOx en la planta o en una parte de la misma, por ejemplo en un
tejido, aunque de manera particularmente ventajosa al menos en la
epidermis o en una parte esencial de las células de la epidermis o
reducirse en comparación con una planta de control o una parte de
la misma. Reduciendo la actividad de MLO, RacB y/o NaOx en la planta
o en una parte de la misma, por ejemplo en un tejido, aunque de
manera particularmente ventajosa al menos en la epidermis o en una
parte esencial de las células de la epidermis, se eleva
preferiblemente la resistencia o la fuerza de resistencia frente a
patógenos biotróficos en las plantas producidas de acuerdo con la
invención. En combinación con una reducción o supresión de la
muerte celular necrótica esto es particularmente ventajoso. La
actividad de MLO, RacB y/o NaOX puede reducirse o inhibirse de
manera análoga a lo que se ha descrito para MLO en WO 98/04586; WO
00/01722; WO 99/47552 y las otras publicaciones mencionadas más
abajo, en particular para describir la actividad e inhibición de
MLO. La descripción de las publicaciones mencionadas describe
proceso, métodos y modalidades particularmente preferidas para
disminuir o inhibir la actividad o la función de MLO, los ejemplos
indican concretamente cómo puede llevarse esto a cabo. La reducción
de la actividad, opcionalmente de la expresión de RacB se describe
detalladamente en la WO 2003020939. La descripción de la
publicación mencionada describe procesos y métodos para disminuir o
inhibir la actividad de BI-1, los ejemplos indican
concretamente cómo puede llevarse a cabo esto. Particularmente se
prefiere llevar a cabo la reducción o inhibición de la actividad o
función de RacB según las modalidades y los ejemplos particularmente
preferidos en la WO 2003020939 y los organismos allí representados
como particularmente preferibles, en particular en una planta o en
una parte de la misma, por ejemplo un tejido, aunque de manera
particularmente ventajosa al menos en la epidermis o en una parte
esencial de las células de epidermis. La reducción de la actividad,
opcionalmente de la expresión de RacB se describe detalladamente
en la WO 2003020939. La persona técnica en la materia encuentra en
la WO 2003020939 las secuencias que codifican para proteínas de RacB
y también pueden identificar RacB por medio del método puesto a
disposición en la WO 2003020939. La reducción de la actividad,
opcionalmente de la expresión de NaOX se describe detalladamente en
la PCT/EP/03/07589. La descripción del paso mencionado describe
procesos y métodos para la reducción o inhibición de la actividad de
NaOx, los ejemplo indican concretamente cómo puede llevarse a cabo
esto. Particularmente se prefiere realizar la reducción o inhibición
de la actividad de NaOx según las modalidades particularmente
preferidas en la PCT/EP/03/07589 y en los ejemplos y en los
organismos allí representados como particularmente preferidos, en
especial en una planta o en una parte de la misma, por ejemplo en
un tejido, aunque de manera particularmente ventajosa al menos en
la epidermis o en una parte esencial de las células de epidermis.
La persona técnica en la materia encuentra en la PCT/EP/03/07589
las secuencias que codifican para proteína NaOx y puede también
identificas NaOx con el método puesto a disposición en la
PCT/EP/03/07589.
Ventajosamente, en una modalidad de la presente
invención puede elevarse la actividad, expresión de PEN1, PEN2 y/o
SNAP34 en la planta, por ejemplo de manera constitutiva, o en una
parte de la misma, por ejemplo en un tejido, aunque de manera
particularmente ventajosa en la epidermis o en una parte esencial de
las células de epidermis. El incremento de la actividad, que
también comprende una expresión de novo, de PEN1, PEN2 y/o SNAP 34
en la planta, por ejemplo de manera constitutiva, o en una parte de
la misma, por ejemplo en un tejido, aunque de manera
particularmente ventajosa al menos en la epidermis o una parte
esencial de las células de epidermis también elevará
preferiblemente la resistencia o la fuerza de resistencia frente a
los patógenos biotróficos en las plantas producidas según la
invención. En combinación con una reducción o una supresión de la
muerte celular necrótica, esto es particularmente ventajoso. El
incremento de la actividad, opcionalmente la expresión de PEN2 está
descrita detalladamente en la WO03074688. La descripción de la
publicación mencionada describe procesos y métodos para la
disminución o inhibición de PEN2, los ejemplos indican de manera
concreta cómo se puede realizar esto. Particularmente se prefiere
realizar la reducción o inhibición de la actividad o función de
PEN2 según las modalidades particularmente preferidas y los ejemplos
y los organismos representados en WO03074688 como particularmente
preferidos, en especial en plantas, por ejemplo de manera
constitutiva o en una parte de las mismas, por ejemplo en un
tejido, aunque de manera particularmente ventajosa al menos en la
epidermis o en una parte esencial de las células de epidermis. La
persona técnica en la materia encuentra en la WO03074688 las
secuencias que codifican para PEN2 y también puede identificar PEN2
con el método puesto a disposición en la WO03074688. La expresión
de PEN1 y SNAP34 puede elevarse de manera análoga a los métodos
descritos en la WO03074688. Con base en su conocimiento técnico
general y al estado de la técnica conocido para ella, la persona
técnica puede aislar y sobreexpresar secuencias de ácido nucleico y
secuencias de proteína de PEN1 y SNAP34. Seq ID NO.: 39 describe la
secuencia de ácido nucleico que codifica para PEN1 de cebada, la
secuencia de proteína está descrita en Seq ID No.: 40. Seq ID NO.:
41 describe la secuencia de ácido nucleico que codifica para PEN1
de Arabidopsis thaliana, la secuencia de proteína se describe
en Seq ID No.: 42. PEN1 de Arabidopsis thaliana se divulga
bajo los (números de acceso) NM 202559 y NM 112015. El homólogo de
cebada se divulga como ROR2 en números de acceso AY246907 y
AY246906. Se trata de miembros de la familia bastante grande de las
proteínas syntaxina. La persona técnica en la materia puede
identificar de esta manera, mediante simple homología, a otras
proteínas syntaxina, las cuales se expresan como genes de
resistencia potenciales en el proceso de acuerdo con la
invención.
Seq ID NO.: 43 describe la secuencia de ácido
nucleico que codifica para SNAP34 de cebada, la secuencia de
proteína está descrita en Seq ID No.: 44. El homólogo
SNAP-34 de cebada también está divulgado bajo AY
247208 (SNAP-34). Se encuentran divulgados
homólogos de función desconocida que pueden desempeñar un papel en
la resistencia bajo AY 247209 (SNAP-28) y AY 247210
(SNAP-25). Los siguientes genes de arabidopsis
muestran una homología superior con la cebada SNAP34 que las
cebadas SNAP-28 o SNAP-25 con
SNAP-34 y de esta manera pueden
co-sobreexpresarse ventajosamente como genes
potenciales que inducen resistencia:
- AAM 62553 - Arabidopsis SNAP25a
- NP 200929 - Arabidopsis SNAP33b
- NP 172842 - Arabidopsis SNAP30
- NP 196405 - Arabidopsis SNAP29
Por consiguiente, la invención también se
refiere a una planta en la que, en la epidermis, se
sobre-expresa al menos adicionalmente un
polipéptido que se codifica por una molécula de ácido nucleico que
comprende las secuencias de aminoácido mostradas en Seq. ID No.:
39, 41 o 43 o una de las secuencias mostradas en las publicaciones
de banco de datos mencionadas o que comprende las secuencias
mostradas en Seq. ID No.: 40, 42 o 44 o una de las secuencias
mostradas en las publicaciones mencionadas de banco de datos, o que
comprende un equivalente funcional de la misma o que tiene una
homología de al menos 50%, preferible 70%, más preferible 80%, aún
más preferible 90% o más con las secuencias nombradas al nivel de la
molécula codificante de ácido nucleico o preferible a nivel de
aminoácido, o una planta en la que, de manera constitutiva o en una
parte, por ejemplo un tejido, aunque de manera particularmente
ventajosa al menos en la epidermis o en una parte esencial de las
células de epidermis, se activa el polipéptido caracterizado
previamente o se eleva su actividad.
Puede efectuarse una reducción de la expresión o
actividad mediante métodos corrientes para la persona técnica en la
materia, por ejemplo mutagénesis, por ejemplo EMS, opcionalmente
Tilling, iRNA; ribozymas, silencing, knockout, etc. En especial se
describen métodos para la reducción en WO 2003020939, cuyos métodos
pueden fácilmente ajustarse a las secuencias aquí descritas.
La reducción o disminución de la expresión de
una proteína BI-1 o de la actividad
BI-1 puede realizarse de un tipo y una forma
variados.
"Reducción", "reducir",
"disminución" o "disminuir" debe entenderse en el sentido
amplio en conexión con una proteína BI-1 o una
actividad BI-1 y comprende la prevención o bloqueo
parcial o esencialmente completa de la funcionalidad de una
proteína BI-1 como resultado de diferentes
mecanismos biológicos de la célula. Una disminución en el sentido
de la invención también comprende una reducción cuantitativa de una
proteína BI-1 hasta una ausencia esencialmente
completa de la proteína BI-1 (es decir, la falta de
capacidad de detección de actividad de BI-1 o
función de BI-1 o falta de capacidad de detección
inmunológica de la proteína BI-1). En este
contexto, la expresión de una determinada proteína
BI-1 o de la actividad BI-1 en una
célula o un organismo se reduce en más de 50%, particularmente
preferible en más de 80%, muy particularmente preferible en más de
90%.
De acuerdo con la invención están comprendidas
diversas estrategias para la reducción de la expresión de una
proteína BI-1 o de la actividad
BI-1. La persona técnica en la materia reconoce que
hay disponibles una serie de diversos métodos para influir la
expresión de una proteína BI-1 o la actividad de
BI-1 de una manera deseada.
Una disminución de la actividad
BI-1 se logra preferiblemente mediante una expresión
reducida de una proteína endógena BI-1.
\vskip1.000000\baselineskip
Una disminución de la cantidad de proteína
BI-1, o de la actividad BI-1 puede
realizarse usando los siguientes métodos:
- a)
- introducción de una secuencia de aminoácido de ARN BI-1 bicatenaria (BI-1-dsRNA) o de uno o unos casetes de expresión que asegura(n) la expresión de la misma;
- b)
- introducción de una secuencia de ácido nucleico antisense BI-1 o de un casete de expresión que garantice la expresión de la misma. Están comprendidos aquellos métodos en los que la secuencia de ácido nucleico antisense está dirigida contra un gen BI-1 (es decir, secuencias de ADN genómicas) o un transcripto de gen de BI-1 (es decir, secuencias de ARN). También están comprendidas secuencias de ácido nucleico \alpha-anoméricas.
- c)
- Introducción de una secuencia de ácido nucleico antisense BI-1 combinada con una ribozima o un casete de expresión que garantice su expresión.
- d)
- introducción de secuencias de ácido nucleico sense BI-1 para la inducción de una co-supresión o de un casete de expresión que garantice su expresión.
- e)
- introducción de una secuencia de ácido nucleico que codifique para proteína BI-1 dominante-negativa o de un casete de expresión que garantice su expresión.
- f)
- Introducción de factores enlazantes de ADN o de proteína contra genes, ARNs o proteínas de BI-1 o un casete de expresión que asegura su expresión.
- g)
- Introducción de las secuencia de ácido nucleico virales que provocan la degradación de ARN de BI-1 y constructos de expresión o de un casete de expresión que asegura su expresión.
- h)
- Introducción de constructos para la inducción de una recombinación homóloga en genes endógenes de BI-1, por ejemplo para la generación de mutantes knockout.
- i)
- Introducción de mutantes en genes endógenos de BI-1 para la generación de una pérdida de función (por ejemplo, generación de codones stop, translaciones en el marco de lectura, etc.)
y cada uno de los métodos nombrados debe ser
realizado de manera específica para la epidermis; es decir, la
expresión en el tejido de epidermis permanece sin modificar o se
reduce. En tal caso, cada uno de esto métodos individuales puede
provocar una reducción de la expresión de BI-1 o de
la actividad de BI-1 en el sentido de la invención.
También es concebible una aplicación combinada. Otros métodos son
conocidos para la persona técnica en la materia y pueden comprender
el bloqueo o prevención del procesamiento de la proteína
BI-1, del transporte de la proteína
BI-1 o de su mRNPr, inhibición de la adhesión a
ribosomas, inhibición de empalme de ARN, inducción de una enzima
que degrada ARN BI-1 y/o inhibición de la elongación
o terminación de la translación.
\vskip1.000000\baselineskip
La reducción específica para epidermis puede
efectuarse, por ejemplo, mediante una aplicación transitoria de los
métodos nombrados en las células de epidermis o mediante una
transformación específica de esencialmente solo células de
epidermis o mediante control de expresión de los constructos
descritos bajo un promotor específico de epidermis u otro elemento
de control específico para epidermis.
\newpage
Los métodos individuales preferidos se
describirán brevemente a continuación:
El método de la regulación de genes por medio de
ARN bicatenario ("double-stranded RNA
interference"; dsRNAi) ha sido descrito repetidamente en
organismos animales y vegetales (por ejemplo, Matzke MA et
al. (2000) Plant Mol Biol 43: 401-415; Fire A.
et al (1998) Nature 391:806-811; WO 99/32619;
WO 99/53050; WO 00/68374; WO 00/44914; WO 00/44895; WO 00/49035; WO
00/63364). Los procesos y métodos descritos en las citas de arriba
se toman expresamente como referencia. Una supresión de genes
eficiente también puede mostrarse en el caso de una expresión
transitoria o después de una expresión transitoria como resultado de
una transformación biolística (Schweizer P et al. (2000)
Plant J 2000 24: 895-903). Los métodos dsRNAi se
basan en el fenómeno de que una introducción simultánea de una
cadena y contra-cadena complementarias de un
transcripto génico provoca una supresión altamente eficiente de la
expresión del gen correspondiente. El fenotipo originado es muy
similar a un correspondiente mutante knock-out
(Waterhouse PM et al. (1998) Proc Natl Acad Sci USA 95:
13959-64). El método de dsRNAi ha demostrado se
especialmente eficiente y ventajoso para reducir expresión. Tal como
se describe, entre otros, en WO 99/32619, los planteamientos de
dsRNAi sobrepasan de manera significativa los planteamientos
antisense clásicos. Otro objeto de la invención se refiere por lo
tanto a moléculas de ARN bicatenarias (moléculas de dsRNA) que
provocan la reducción de una BI-1 al introducir en
una planta (o en una célula derivada de la misma, un tejido,
órganos, especialmente epidermis de la hoja). La molécula de ARN
bicatenaria para la reducción de la expresión de una proteína
BI-1 se caracteriza porque
- a)
- una de las dos cadenas de ARN es esencialmente idéntica a al menos una parte de una secuencia de ácido nucleico BI-1, y
- b)
- la otra cadena respectiva de ARN es esencialmente idéntica a al menos una parte de la cadena complementaria de una secuencia de ácido nucleico BI-1.
En otra modalidad preferida, la molécula de ARN
bicatenaria para la reducción de la expresión de una proteína
BI-1 comprende
- a)
- una cadena de ARN "sense" que comprende al menos una secuencia de ribonucleótido que en esencia es idéntica a al menos una parte del transcripto de ARN "sense" de una secuencia de ácido nucleico que codifica para una proteína BI-1, y
- b)
- una cadena de ARN "antisense" que es esencialmente - preferiblemente completamente - complementaria a la cadena de ARN sense de a).
Con respecto a la molécula de ARN bicatenaria,
la molécula de ARN bicatenaria se refiere a una secuencia de ácido
nucleico BI-1, preferible a una secuencia según SEQ
ID NO: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31,
33 ó 38 o un equivalente funcional de las mismas.
"Esencialmente idéntico" significa que la
secuencia de dsRNA también puede presentar inserciones, deleciones,
así como mutaciones individuales puntuales en comparación con la
secuencia destino BI-1 y, no obstante, provocar una
reducción eficiente de la expresión. Según la definición de arriba,
la homología es preferiblemente de al menos 50% ó 75%, preferible
de al menos 80%, muy particularmente preferible de al menos 90%, lo
más preferible 100% entre la cadena "sense" de un dsARN
inhibitorio y un segmento parcial de una secuencia de ácido
nucleico BI-1 (o entre la cadena "antisense" de
la cadena complementaria de una secuencia de ácido nucleico
BI-1). La longitud del segmento parcial es de al
menos 10 bases, preferiblemente de al menos 256 bases,
particularmente preferible de al menos 50 bases, muy
particularmente preferible de al menos 100 bases, lo más preferible
de al menos 200 bases o al menos 300 bases. De manera alternativa,
un dsARN "esencialmente idéntico" también puede definirse como
secuencia de ácido nucleico que es capaz de hibridar con una parte
de un transcripto génico BI-1 (por ejemplo en NaCl
de 400 mM, PIPES de 40 mM, pH 6,4, EDTA de 1 mM a 50ºC o 70ºC
durante 12 a 16 h).
"Esencialmente complementario" significa
que la cadena de ARN antisense también puede presentar inserciones,
deleciones, así como mutaciones individuales de punto en comparación
con el complemento de la cadena de ARN "sense". La homología
es preferiblemente de al menos 80%, preferiblemente de al menos de
90%, muy particularmente preferible de al menos 95%, lo más
preferible 100% entre la cadena de ARN "antisense" y el
complemento de la cadena de ARN "sense".
"Parte del trancripto "sense"de ARN"
de una secuencia de ácido nucleico que codifica para una proteína
BI-1 o un equivalente funcional de la misma
significan fragmentos de un ARN o mARN transcrito de una secuencia
de ácido nucleico que codifica para una proteína
BI-1 o un equivalente funcionales de la misma,
preferible de un gen BI-1. En tal caso los
fragmentos tienen preferiblemente una longitud de secuencia de al
menos 20 bases, preferiblemente de al menos 50 bases,
particularmente preferible de al menos 100 bases, muy
particularmente preferible de al menos 200 bases, lo más preferible
de al menos 500 bases. También está comprendido ARN o mARN
totalmente transcrito. También está comprendido el uso de las
moléculas de dsARN de acuerdo con la invención en los procesos de
la invención para la generación de una resistencia patógena en las
plantas. EL dsARN puede componerse de una o más cadenas de
ribonucleótidos polimerizados. Además, pueden estar presentes
modificaciones tanto de la estructura de azúcar -fosfato como
también de los nucleósidos. Por ejemplo, los compuestos
fosforo-diestéricos del ARN natural pueden estar
modificados en tal sentido que comprendan al menos un heteroátomo
de nitrógeno o de azufre.
Las bases pueden modificarse de tal manera que
se restrinja la actividad de adenosindeaminasa, por ejemplo. Tales
y otras modificaciones se describen más aún en lo sucesivo en el
método para estabilizar ARN-antisense. Para lograr
el mismo propósito, por supuesto también pueden introducirse a las
células o al organismo varias moléculas individuales de dsARN que
comprenden respectivamente uno de los fragmentos de secuencia de
ribonucleotido arriba definidos.
El dsARN puede prepararse de manera enzemática o
por síntesis química, total o parcialmente.
La estructura bicatenaria de dsARN puede
formarse a partir de dos cadenas de ARN complementarias, separadas
o, preferiblemente, a partir de una cadena individual de ARN
auto-complementaria. La estructura bicatenaria
puede formarse a partir de una cadena individual auto complementaria
o a partir de dos cadenas complementarias. En el caso de una cadena
individual autocomplementaria, pueden ligarse una secuencia
"sense" y una "antisense" por medio de una secuencia
enlazante ("linker") y formar, por ejemplo, una estructura de
horquilla para pelo. La secuencia enlazante puede ser un intron que
se empalma hacia afuera después de la síntesis del dsARN. La
secuencia de ácido nucleico que codifica para un dsRNA puede
contener otros elementos como, por ejemplo, señales de terminación
de transcripción o señales de poliadenilación. Si las dos cadenas
del dsARN deben combinarse en una célula o planta, esto puede
suceder de maneras diferentes:
La secuencia de ácido nucleico que codifica para
un dsRNA puede contener otros elementos, como por ejemplo señales
de terminación de transcripción o señales de poliadenilación.
Si las dos cadenas del dsRNA deben combinarse en
una célula o una planta, esto puede suceder de diferentes
maneras:
- a)
- Transformación de la célula o planta con un vector que comprende ambos casetes de expresión,
- b)
- Cotransformación de la célula o de la planta con dos vectores donde uno comprende los casetes de expresión con la cadena "sense", el otro comprende los casetes de expresión con la cadena "antisense".
- c)
- Cruce de dos plantas que han sido transformadas respectivamente con un vector donde uno comprende los casetes de expresión con la cadena "sense" y el otro comprende los casetes de expresión con la cadena "antisense".
La formación del dúplex ARN puede iniciarse o
bien fuera de la célula o bien dentro de la misma. Como en la WO
99/53050, el dsRNA también puede comprender una estructura de
horquilla de pelo enlazándose las cadenas "sense" y
"antisense" mediante un "linker" (por ejemplo un intron).
Las estructuras de dsARN autocomplementarias se prefieren por
cuanto solo requieren la expresión de un constructo y siempre
comprenden las cadenas complementarias en una proporción de
equimolar.
Los casetes de expresión que codifican para la
cadena "antisense" o "sense" de un dsRNA o para la cadena
autocomplementaria del dsARN se insertan preferiblemente a un
vector y se insertan establemente en el genoma de una planta con el
método descrito abajo (usando, por ejemplo, marcadores de selección)
bajo el control de un promotor específico para epidermis tal como
se ilustra en la presente, con el fin de asegurar una expresión
duradera del dsARN en la epidermis. El dsARN puede introducirse
usando una cantidad que haga posible al menos una copia por célula.
Cantidades superiores (por ejemplo, al menos 5, 10, 100, 500 o 1000
copias por célula) pueden opcionalmente provocar una reducción
eficiente.
Como ya se ha descrito, una identidad de
secuencia del 100% entre dsARN y un transcripto génico
BI-1 o el transcripto génico de un gen funcional
equivalente no es obligatoriamente necesario para provocar una
reducción eficiente de la expresión de BI-1. Por lo
tanto, la ventaja consiste en que el método es tolerante frente a
desviaciones de secuencia, como pueden presentarse a causa de
mutaciones genéticas, polimorfismos o divergencias evolutivas. Así,
es posible que con el dsRNA, que ha sido generado a partir de la
secuencia de BI-1 de un organismo, que se suprima
la expresión de BI-1 en el otro organismo. La alta
homología de secuencia entre las secuencias BI-1 de
arroz, maíz y cebada permite concluir que esta proteína se conserva
en un alto grado dentro de las plantas de modo que la expresión de
un dsARN derivado de una de las secuencias divulgadas de
BI-1 tal como se muestra en SEQ ID No: 1, 3 ó 5
parezca tener también un efecto ventajoso en otras especies de
plantas. También es posible que debido a la alta homología entre las
proteínas BI-1 y sus equivalentes funcionales con
un único dsARN que se haya generado a partir de una secuencia
BI-1 determinada de un organismo, se suprima la
expresión de otras proteínas BI-1 homólogas y/o sus
equivalentes funcionales del mismo organismo aunque también la
expresión de proteínas BI-1 en otros tipos
similares.
Para este propósito el dsARN comprende
preferiblemente la región de secuencia de transcriptos génicos
BI-1 que corresponden a las regiones conservadas.
Dichas regiones conservadas pueden fácilmente derivarse de
comparaciones de secuencias. El dsARN puede sintetizarse o bien
in vivo, o in vitro. Para esto, puede introducirse una
secuencia de ADN que codifica para un dsARN en un casete de
expresión bajo control de al menos un elemento genético de control
(como, por ejemplo, promotor, enhancer, silencer, donador o
aceptador splice (de empalme)); se desea una expresión específica
de epidermis del dsARN. De manera correspondiente, abajo se siguen
describiendo construcciones ventajosas. No se requiere
poliadenilación ni tampoco deben estar presentes elementos para
iniciar una translación.
Un dsARN puede sintetizarse química o
enzimáticamente. Para este propósito pueden usarse polimerasas
celulares de ARN o polimerasas bacteriófagas de ARN (como, por
ejemplo, polimerasa de ARN T3, T7 o SP6). Se describen métodos
correspondientes para la expresión in vitro de ARN (WO
97/32016; US 5,593,874; US 5,698,425, US 5,712,135, US 5,789,214,
US 5,804,693). Un dsARN sintetizado in vitro química o
enzimáticamente puede purificarse total o parcialmente antes de la
introducción a una célula, tejido u organismo, por ejemplo mediante
extracción, precipitación, electroforesis, cromatografía o
combinaciones de estos métodos. El dsARN puede introducirse
directamente a la célula o también puede aplicarse extracelularmente
(por ejemplo, en el espacio intersticial). Aunque preferiblemente
se transforma la planta de manera estable con una construcción de
expresión que realiza la expresión del dsARN en la epidermis.
Debajo se siguen describiendo los métodos correspondientes.
Los métodos para la supresión de una proteína
específica mediante la prevención de la acumulación de su mARN por
tecnología "antisense", también en plantas, se describen
copiosamente (Sheehy et al. (1988) Proc Natl Acad Sci USA
85: 8805-8809; US 4,801,340; Mol JN et al.
(1990) FEBS Lett 268(2):427-430). La molécula
de ácido nucleico antisense hibrida o enlaza con el mARN celular
y/o ADN genómico que codifica para la proteína destino
BI-1 a suprimirse. De esta manera se suprime la
transcripción y/o translación de la proteína destino. La
hibridación puede originarse de manera convencional por la formación
de un dúplex estable o - en el caso de ADN genómico - por el enlace
de la molécula de ácido nucleico anti-sense con el
dúplex del ADN genómico mediante interacción específica en el gran
surco de la hélice de ADN. La introducción se efectúa de tal manera
que se reduce la cantidad o función específicamente en la
epidermis, por ejemplo mediante transformación transitoria de la
epidermis o transformación estable bajo control de la expresión de
una construcción correspondiente con un promotor específico de
epidermis. Una secuencia de ácido nucleico antisense adecuada para
la reducción de una proteína BI-1 puede derivarse
usando la secuencia de ácido nucleico que codifica para esta
proteína, por ejemplo la secuencia de ácido nucleico según SEQ ID
NO: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31, 33 o
38 o que codifica para un equivalente funcional del mismo según las
reglas de pares de bases de Watson y Crick. La secuencia de ácido
nucleico antisense puede ser complementaria a todo el mARN
transcrito de la dicha proteína, limitarse a la región codificante
o componerse solo de un oligonucleótido, que es complementario
parcialmente a la secuencia codificante o no codificante del mARN.
Así, el oligonucleótido puede ser complementario, por ejemplo, a la
región que comprende el inicio de traslación para la proteína dicha.
Las secuencias de ácido nucleico antisense pueden tener, por
ejemplo, una longitud de 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45 o 50
nucleótidos, pero también pueden ser más largas y comprender al
menos 100, 200, 500, 1000, 2000 o 5000 nucleótidos. Las secuencias
de ácido nucleico antisense pueden expresarse de manera recombinante
o sintetizarse química o enzimáticamente usando métodos conocidos
por la persona técnica en la materia. En la síntesis química pueden
usarse nucleótidos naturales o modificados. Los nucleótidos
modificados pueden dar una estabilidad bioquímica elevada a la
secuencia de ácido nucleico antisense y conducir a una estabilidad
física elevada del dúplex formado a partir de secuencia de ácido
nucleico antisense y secuencia destino de ácido nucleico sense.
Pueden usarse, por ejemplo, derivados de fosforotioato y
nucleótidos acridina-sustituidos tales como
5-fluorouracilo, 5-bromouracilo,
5-clorouracilo, 5-yodouracilo,
hipoxantina, xantina, 4-acetilcitosina,
5-(carboxihidroxilmetil)uracilo,
5-carboximetilaminometil-2-tiouridina,
5-carboximetilaminometiluracilo, dihidrouracilo,
\beta-D-galactosilqueosina,
inosina, N6-isopenteniladenina,
1-metilguanina, 1-metilinosina,
2,2-dimetilguanina, 2-metiladenina,
2-metilguanina, 3-metilcitosina,
5-metilcitosina, N6-adenina,
7-metilguanina,
5-metilaminometiluracilo,
5-metoxiaminometil-2-tiouracilo,
\beta-D-manosilqueosina,
5'-metoxicarboximetiluracilo,
5-metoxiuracilo,
2-metiltio-N6-isopenteniladenina,
ácido uracil-5-oxiacético,
pseudouracilo, queosine, 2-tiocitosina,
5-metil-2-tiouracilo,
2-tiouracilo, 4-tiouracilo,
5-metiluracilo, éster metílico de ácido
uracil-5-oxiacético, ácido
uracil-5-oxiacético,
5-metil-2-tiouracil,
3-(3-amino-3-N-2-carboxipropil)
uracilo y 2,6-diaminopurina. En otra modalidad
preferida, la expresión de una proteína BI-1 puede
inhibirse por secuencias de nucleótidos que son complementarias a la
región regulatoria de un gen BI-1 (por ejemplo, a
un promotor BI-1 y/o enhancer) y forman estructuras
de triple hélice con el ADN de hélice doble de allí, de tal modo
que se reduce la transcripción del gen BI-1. Se
describen métodos correspondientes (Helene C (1991) Anticancer Drug
Res 6(6):569-84; Helene C et al.
(1992) Ann NY Acad Sci 660:27-36; Maher LJ (1992)
Bioassays 14(12): 807-815). En otra modalidad
la molécula de ácido nucleico puede ser un ácido nucleico
\alpha-anomérico. Moléculas de ácido nucleico
\alpha-anomérico de tal tipo forman híbridos
bicatenarios específicos con ARN complementario en los cuales las
dos cadenas corren paralelas una hacia a la otra, a diferencia de
los ácidos \beta-nucleicos convencionales.
(Gautier C et al. (1987) Nucleic Acids Res
15:6625-6641). La molécula antisense de ácido
nucleico también puede contener además
2'-O-metilribonucleótidos (Inoue
et al. (1987) Nucleic Acids Res 15:6131-6148)
o análogos quiméricos de ARN-ADN (Inoue et
al. (1987) FEBS Lett 215:327-330).
La estrategia antisense arriba descrita puede
acoplarse ventajosamente con un método de ribozima. Las moléculas
de ARN catalíticas o ribozimas pueden ajustarse a cualquier ARN
destino y partir el esqueleto del fosfodiéster en posiciones
específicas, por lo cual el ARN destino se desactiva funcionalmente
(Tanner NK (1999) FEMS Microbiol Rev
23(3):257-275). El ribozima no se modifica
por sí mismo de esta manera sino que es capaz de partir otras
moléculas de ARN destino de manera análoga, por lo cual obtiene las
propiedades de una enzima. La incorporación de secuencias de
ribozima en ARNs "antisense" les confiere a estos ARNs
"antisense" esta propiedad enzimática que parte ARN y aumenta
así su eficiencia en la inactivación del ARN destino. La preparación
y uso de moléculas correspondiente de ribozima - ARN
"antisense" se describe, por ejemplo en Haseloff et al.
(1988) Nature 334: 585-591. De este modo los
ribozimas (por ejemplo, ribozimas "Hammerhead" (cabeza de
martillo); Haselhoff y Gerlach (1988) Nature
334:585-591) pueden usarse para partir el mARN de
una enzima a suprimirse - por ejemplo de manera catalítica
BI-1 e impedir la traslación. La tecnología de
ribozima puede elevar la eficiencia de una estrategia antisense. En
EP 0 291 533, EP 0 321 201, EP 0 360 257 se describen métodos para
la expresión de ribozomas para la reducción de determinadas
proteínas. En células vegetales también se describe una expresión
de ribozima (Steinecke P et al. (1992) EMBO J
11(4):1525-1530; de Feyter R et al.
(1996) Mol Gen Genet. 250(3):329-338).
Secuencias destino y ribozimas adecuadas pueden determinarse, por
ejemplo, tal como se describe en "Steinecke P, Ribozyme, Methods
in Cell Biology 50, Galbraith et al. eds, Academic Press,
Inc. (1995), S. 449-460", mediante cálculos
estructurales secundarios de ARN de ribozima y destino, así como su
interacción (Bailey CC et al. (1992) Plant Mol Biol.
18(2):353-361; Lloyd AM and Davis RW et
al. (1994) Mol Gen Genet.
242(6):653-657). A manera de ejemplo pueden
construirse derivados de la tetrahimena L-19 IVS RNA
que presentan regiones complementarias al mARN de la proteína
BI-1 a suprimirse (véase también US 4,987,071 y US
5,116,742). De manera alterna, tales ribozimas también pueden
identificarse por un proceso de selección a partir de una biblioteca
de diversos ribozimas (Bartel D y Szostak JW (1993) Science
261:1411-1418). La expresión se realiza, por
ejemplo, bajo el control de un promotor específico de
epidermis.
La expresión específica de epidermis de una
molécula de ácido nucleico BI-1 en orientación sense
puede conducir a una co-supresión del gen endógeno
homólogo correspondiente en las células de epidermis. La expresión
de ARN sense con homología hacia un gen endógeno puede reducir o
eliminar la expresión del mismo de manera similar a como se ha
descrito para planteamientos antisense (Jorgensen et al.
(1996) Plant Mol Biol 31(5):957-973; Goring
et al. (1991) Proc Natl Acad Sci USA
88:1770-1774; Smith et al. (1990) Mol Gen
Genet 224:447-481; Napoli et al. (1990)
Plant Cell 2:279-289; Van der Krol et al.
(1990) Plant Cell 2:291-99). En tal caso, la
construcción introducida puede representar total o sólo
parcialmente al gen a reducir. La posibilidad de traslación no es
indispensable. La aplicación de esta tecnología en plantas se
describe, por ejemplo, en Napoli et al. (1990) The Plant
Cell 2: 279-289 y en US 5,034,323. Se prefiere la
co-supresión usando una secuencia que es
esencialmente idéntica a al menos una parte de la secuencia de
ácido nucleico que codifica para una proteína BI-1 o
un equivalente funcional de la misma, a manera de ejemplo de la
secuencia de ácido nucleico según SEQ ID NO: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13,
15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31, 33 o 38 o de la secuencia de
ácido nucleico que codifica para un equivalente funcional de la
misma.
La función o actividad de una proteína
BI-1 también puede reducirse de manera efectiva
mediante expresión epidermis - específica de una variante dominante
negativa de esta proteína BI-1 en células de
epidermis. Para la persona técnica en la materia son conocidos los
métodos para reducción de la función o de la actividad de una
proteína mediante la co-expresión de su forma
dominante - negativa (Lagna G y Hemmati-Brivanlou A
(1998) Current Topics in Developmental Biology
36:75-98; Perlmutter RM y
Alberola-Ila J (1996) Current Opinion in Immunology
8(2):285-90; Sheppard D (1994) American
Journal of Respiratory Cell & Molecular Biology.
11(1):1-6; Herskowitz I (1987) Nature
329(6136):219-22). El aminoácido a mutarse
preferiblemente en homólogos BI-1 de otros tipos
puede determinarse, por ejemplo, mediante comparación apoyada en
ordenador ("alignment"). Estas mutaciones para alcanzar una
variante BI-1 dominante-negativa se
llevan a cabo, preferiblemente, al nivel de la secuencia de ácido
nucleico que codifica para proteínas BI-1. Una
mutación correspondiente puede realizarse por ejemplo mediante
mutagénesis in vitro determinada por PCR usando primer de
oligonucleótido a través del cual se introduce la mutación deseada.
Para este propósito se usan métodos corrientes para la persona
versada en la materia. Por ejemplo, para este propósito puede
usarse el "LA PCR in vitro Mutagenesis Kit" (Takara
Shuzo, Kyoto). Un método para la preparación de una variante
dominante-negativa de una proteína
RacB-Proteins de maíz se describe también en WO
00/15815 (ejemplo 4, pág. 69). La expresión de un mutante así puede
realizarse entonces, por ejemplo, bajo el control de un promotor
específico de epidermis.
También es posible una reducción de una
expresión de gen BI-1 en la epidermis con factores
específicos que enlazan ADN, por ejemplo con factores del tipo de
factores de transcripción de dedo de cinc. Estos factores se alojan
en la secuencia genómica del gen endógeno de destino, preferible en
las regiones regulatorias y provocan una represión del gen
endógeno. El uso de un método así hace posible la reducción de la
expresión de un gen endógeno BI-1 sin que su
secuencia deba manipularse mediante ingeniería genética. Los métodos
correspondientes para la preparación de los factores
correspondientes se han descrito (Dreier B et al. (2001) J
Biol Chem 276(31):29466-78; Dreier B et
al. (2000) J Mol Biol 303(4):489-502;
Beerli RR et al. (2000) Proc Natl Acad Sci USA 97
(4):1495-1500; Beerli RR et al. (2000) J
Biol Chem 275(42):32617-32627; Segal DJ and
Barbas CF 3rd (2000) Curr Opin Chem Biol
4(1):34-39; Kang JS and Kim JS (2000) J Biol
Chem 275(12):8742-8748; Beerli RR et
al. (1998) Proc Natl Acad Sci USA 95(25): 14628- 14633;
Kim JS et al. (1997) Proc Natl Acad Sci USA 94 (8):3616
-3620; Klug A (1999) J Mol Biol
293(2):215-218; Tsai SY et al. (1998)
Adv Drug Deliv Rev
30(1-3):23-31; Mapp AK et
al. (2000) Proc Natl Acad Sci USA
97(8):3930-3935; Sharrocks AD et al.
(1997) Int J Biochem Cell Biol
29(12):1371-1387; Zhang L et al.
(2000) J Biol Chem 275(43):33850-33860).
La selección de estos factores puede realizarse
usando cualquier porción deseada de un gen BI-1.
Este segmento se localiza preferiblemente en la región de promotor.
Para supresión de gen, sin embargo, también puede estar en la
región de los exones o intrones que codifican. Los segmentos
correspondientes pueden obtenerse por parte de la persona técnica
en la materia por medio de búsqueda en el banco de datos o del banco
génico o a partir de un cADN BI-1 cuyo gen no está
presente en el banco de genes, mediante inspección sistemática de
una biblioteca genómica para hallar clones genómicos
correspondientes. Los métodos requeridos para este propósito son
corrientes para la persona técnica, por ejemplo estos factores
pueden expresarse bajo el control de un promotor
epidermis-específico u otros factores que median en
la expresión epidermis-específico. Además, es
posible introducir a la célula factores que inhiben la célula
BI-1 de destino misma. Los factores que enlazan
proteína pueden ser, por ejemplo, aptámeros (Famulok M y Mayer G
(1999) Curr Top Microbiol Immunol 243:123-36) o
anticuerpos o fragmentos de anticuerpos o anticuerpos de cadena
única. La obtención de estos factores está descrita y son conocidos
por la persona técnica en la materia. Por ejemplo, se empleó un
anticuerpo scFv citoplasmático para modular la actividad de la
proteína fitocroma A en plantas de tabaco modificadas (Owen M et
al. (1992) Biotechnology (N Y)
10(7):790-794; Franken E et al. (1997)
Curr Opin Biotechnol 8(4):411-416; Whitelam
(1996) Trend Plant Sci 1:286-272).
La expresión del gen también puede suprimirse
mediante compuestos sintéticos de bajo peso molecular, diseñados a
la medida, como por ejemplo del tipo poliamida (Dervan PB y Bürli RW
(1999) Current Opinion in Chemical Biology
3:688-693; Gottesfeld JM et al. (2000) Gene
Expr 9(1-2):77-91). Estos
oligómeros se componen de unidades estructurales de
3-(dimetilamino)-propilamina,
N-metil-3-hidroxipirrol,
N-metilimidazol y N-metilpirroles y
pueden ajustarse a cada pieza del ADN bicatenario de modo que se
enlacen en secuencia específica con el gran surco y bloqueen la
expresión de las secuencias génicas de allí. Se describen métodos
correspondientes (véanse, entre otros, Bremer RE et al.
(2001) Bioorg Med Chem. 9(8):2093-103; Ansari
AZ et al. (2001) Chem Biol.
8(6):583-92; Gottesfeld JM et al.
(2001) J Mol Biol. 309(3):615-29; Wurtz NR
et al. (2001) Org Lett 3(8):1201-3;
Wang CC et al. (2001) Bioorg Med Chem 9(3):
653-7; Urbach AR y Dervan PB (2001) Proc Natl Acad
Sci USA 98(8):4343-8; Chiang SY et al.
(2000) J Biol Chem. 275(32):24246-54).
Todos los factores mencionados se introducen de
manera específica a la epidermis para asegurar una reducción de la
actividad BI-1sólo en las células de epidermis, por
ejemplo mediante la expresión bajo el control de un promotor
específico de epidermis, tal como se nombran arriba, por
ejemplo.
La expresión BI-1 en la
epidermis también puede realizarse efectivamente mediante inducción
de la descomposición específica de ARN BI-1 en las
células de epidermis con ayuda de un sistema viral de expresión
(Amplikon) (Angell, SM et al. (1999) Plant J. 20(3):
357-362). Estos sistemas - denominados también como
"VIGS" (viral induced gene silencing) - introducen a la
planta moléculas de ácido nucleico con homología hacia los
transcriptos a suprimirse por medio de vectores virales. La
transcripción se interrumpe luego, supuestamente mediada por
mecanismos de defensa de la planta contra virus. Se describen
técnicas y métodos correspondientes (Ratcliff F et al.
(2001) Plant J 25(2): 237-45; Fagard M y
Vaucheret H (2000) Plant Mol Biol
43(2-3):285-93; Anandalakshmi
R et al. (1998) Proc Natl Acad Sci USA
95(22):13079-84; Ruiz MT (1998) Plant Cell
10(6): 937-46).
Para la producción de un organismo recombinante
homólogo con actividad BI-1 reducida en las células
de epidermis se utiliza, por ejemplo, un constructo de ácido
nucleico que contiene al menos una parte de un gen
BI-1 endógeno, el cual se modifica por una
deleción, adición o sustitución de al menos un nucleótido, de tal
modo que reduzca la funcionalidad o se anule totalmente. La
modificación también puede referirse a elementos regulatorios (por
ejemplo, al promotor) del gen, de tal modo que quede sin modificar
la secuencia codificante, aunque no tenga lugar una expresión
(transcripción y/o traslación) y se reduzca. En la recombinación
homóloga convencional, la región modificada se flanquea en sus
extremos 5' y 3' con otras secuencias de ácidos nucleicos que deben
tener una longitud suficiente para hacer posible la recombinación.
La longitud se encuentra normalmente en un rango de algunos cientos
de bases hasta varios kilobases (Thomas KR y Capecchi MR (1987) Cell
51:503; Strepp et al. (1998) Proc Natl Acad Sci USA
95(8):43368-4373). Para la recombinación
homóloga se transforma el organismo huésped, por ejemplo una
planta, con el constructo de recombinación usando los métodos
descritos abajo y se seleccionan exitosamente los clones
recombinados usando, por ejemplo, una resistencia a antibióticos o a
herbicidas.
La recombinación homóloga es un evento
relativamente raro en las eucariotas superiores, especialmente en
las plantas. Predominan las integraciones casuales con el genoma
huésped. Una posibilidad de eliminar las secuencias integradas
casualmente y así incrementar el número de clones de célula con una
recombinación homóloga correcta es el uso de un sistema de
recombinación específico de secuencia tal como se describe en US
6,110,736, por el cual pueden volverse a deletar secuencias
integradas de manera no específica, lo cual facilita la selección
de eventos que se han integrado exitosamente. Puede usarse un gran
número de sistemas de recombinación
secuencia-específica; como ejemplos se mencionan el
sistema Cre/lox del bacteriofago P1, el sistema FLP/FRT de la
levadura, la recombinasa Gin del fago Mu, la recombinasa Pin de
E. coli y el sistema R/RS del plásmido pSR1. Se prefieren los
sistemas de bacteriófagos P1 Cre/lox y de levadura FLP/FRT. Los
sistemas recombinantes FLP/FRT y cre/lox se habían aplicado ya en
sistemas vegetales (Odell et al. (1990) Mol Gen Genet 223:
369-378). La recombinación específica de epidermis
puede asegurarse, por ejemplo, por el hecho de que la expresión de
los sistemas y enzimas que inducen la recombinación se realiza bajo
control de un promotor específico de epidermis.
Otros métodos adecuados para la reducción de la
actividad BI-1 son introducir mutaciones nonsense en
genes BI-1 endógenos, por ejemplo mediante la
introducción de oligonucleótidos ARN/ADN en las células de epidermis
(Zhu et al. (2000) Nat Biotechnol
18(5):555-558) así como la generación de
mutantes de knock-out con ayuda de, por ejemplo,
mutagénesis TADN (Koncz et al. (1992) Plant Mol Biol
20(5):963-976), mutagénesis de
ENU-(N-etil-N-nitrosourea)
o recombinación homóloga (Hohn B y Puchta (1999) H Proc Natl Acad
Sci USA 96:8321-8323.). También pueden generarse
mutaciones puntuales por medio de híbridos de
ADN-ARN, los cuales se conocen también como
"chimeraplasty" (Cole-Strauss et al.
(1999) Nucl Acids Res 27(5):1323-1330; Kmiec
(1999) Gene therapy American Scientist 87(3):
240-247).
Los métodos de dsARNi, de la
co-supresión mediante ARN sense y de "VIGS"
("virus induced gene silencing") también se denomina como
"post-transcriptional gene silencing" (PTGS).
Los métodos de PTGS, como también la reducción de la función
BI-1 o actividad con variantes BI-1
dominante-negativa, son especialmente ventajosas
porque los requerimientos de homología entre el gen endógeno a
suprimirse y la secuencia de ácido nucleico sense o de dsARN
expresada transgénicamente (o bien entre el gen endógeno y su
variante dominante -negativa) son más bajos que, por ejemplo, en un
planteamiento antisense. En la descripción del método dsARNI se
mencionan criterios de homología correspondientes y en general
pueden aplicarse a métodos de PTGS o a planteamientos
dominantes-negativos. Así, usando las secuencias de
ácido nucleico BI-1, probablemente también es
posible suprimir de manera efectiva la expresión de proteínas
BI-1 homólogas en otras especies sin que sean
necesarios obligatoriamente el aislamiento y elucidación de la
estructura de los homólogos BI-1 existentes. Esto
aligera considerablemente el trabajo empleado. De manera análoga
probablemente también pueden reducirse o suprimirse de manera
efectiva la función/actividad de su homólogo en otras especies de
vegetales usando variantes dominantes-negativas de
una proteína BI-1.
Todas las sustancias y compuestos que provocan,
directa o indirectamente, una reducción de la cantidad de proteína,
cantidad de ARN, actividad de gen o actividad de proteína de una
proteína BI-1, estarían comprendidos por
consiguiente bajo la denominación de compuestos
"anti-BI-1". El término
compuesto "anti-BI-1" incluye
explícitamente las secuencias de ácido nucleico, péptidos, proteínas
u otros factores empleados en los métodos arriba descritos.
En el marco de la invención, "introducción"
comprende todos los métodos que son adecuados para introducir,
directa o indirectamente, un compuesto
"anti-BI-1" en la epidermis o
una parte esencial de las células de epidermis, el compartimiento o
tejido de la misma o generarlo allí. Están comprendidos métodos
directos e indirectos. La introducción puede conducir a una
presencia temporal (transitoria) de un compuesto
"anti-BI-1" (por ejemplo, de
un dsARN) o también a una duradera (estable).
Según la diferente naturaleza de los
planteamientos arriba descritos, el compuesto
"anti-BI-1" puede ejercer su
función directamente (por ejemplo, mediante inserción en un gen
BI-1 endógeno). Pero la función también puede
ejercerse indirectamente después de la transcripción en un ARN (por
ejemplo, en planteamientos antisense) o después de transcripción y
traslación en una proteína (por ejemplo, en factores de enlace). De
acuerdo con la invención, también están comprendidos compuestos que
actúan "anti-BI-1" tanto
directamente como indirectamente.
Introducir comprende, por ejemplo, métodos tales
como transfección, transducción o transformación.
El término compuestos
"anti-BI-1" también comprende
de esta manera, por ejemplo, constructos recombinantes que
ocasionan una expresión (es decir, transcripción y opcionalmente
traslación), por ejemplo de un dsRNA BI-1 o de una
ARN "antisense" BI-1 específico para
epidermis.
En dichos constructos de expresión se encuentra
una molécula de ácido nucleico cuya expresión (transcripción y
opcionalmente traslación) genera un compuesto
"anti-BI-1", preferible en
conexión funcional con al menos un elemento de control genético
(por ejemplo, un promotor), que asegura una expresión en una
organismo, preferiblemente en plantas, preferentemente
epidermis-específico. Si el constructo de expresión
debe introducirse en la planta y el compuesto
"anti-BI-1" (por ejemplo, el
asARN BI-1) debe generarse allí en plantas, entonces
se prefieren los elementos de control genéticos específicos para
plantas (por ejemplo, promotores); como resultado de lo dicho
previamente, la actividad específica para epidermis del promotor es
obligatoria en la mayoría de modalidades para una reducción
específica para epidermis de BI-1, tal como se
describió arriba. Aunque el compuesto
"anti-BI-1" también puede
generarse en otros organismos o in vitro e introducirse
después en la planta. En estas se prefieren todos los elementos de
control genéticos procarióticos o eucarióticos (por ejemplo,
promotores) que permiten la expresión en el organismo seleccionado
respectivamente para la preparación.
Por conexión funcional se entiende, por ejemplo,
la disposición secuencial de un promotor con la secuencia de ácido
nucleico a expresar (por ejemplo, de un compuesto
"anti-BI-1") y opcionalmente de
otros elementos regulatorios, como por ejemplo un terminados de tal
modo que cada elemento regulatorio pueda desempeñar su función en
la expresión transgénica de la secuencia de ácido nucleico, según la
disposición de las secuencias de ácido nucleico en relación con ARN
sense o antisense. Para este propósito no es obligatorio un enlace
directo en el sentido químico. Las secuencias genéticas de
control, como por ejemplo secuencias - enhancer, también pueden
desempeñar su función sobre la secuencia destino desde otras
posiciones alejadas o incluso desde otras moléculas de ADN
(translocalización cis o trans). Se prefieren disposiciones en las
que la secuencia a expresarse transgénicamente se posiciona detrás
de la secuencia que actúa como promotor de modo que ambas secuencias
se enlazan una a otra de manera covalente. En tal caso se prefiere
que la distancia entre la secuencia de promotor y la secuencia de
ácido nucleico a expresarse de manera transgénica sea menor que 300
pares de bases, particularmente preferible menor que 100 pares de
bases, muy particularmente menos que 50 pares de bases.
La preparación de una conexión funcional como
también la preparación de un casete de expresión puede realizarse
por medio de técnicas corrientes de recombinación y clonación, tal
como se describen, por ejemplo, en Maniatis T, Fritsch EF y
Sambrook J (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold
Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor (NY), in Silhavy TJ,
Berman ML y Enquist LW (1984) Experiments with Gene Fusions, Cold
Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor (NY), in Ausubel FM
et al. (1987) Current Protocols in Molecular Biology, Greene
Publishing Assoc. and Wiley Interscience y bei Gelvin et al.
(1990) In: Plant Molecular Biology Manual. No obstante, entre ambas
secuencias también pueden posicionarse otras secuencias que tienen,
por ejemplo, la función de un linker (enlazador) con intersecciones
determinadas de enzima de restricción o la de un péptido de señal.
La inserción de secuencias también puede conducir a la expresión de
proteínas de fusión. El casete de expresión, que se compone de una
conexión de promotor y de secuencia de ácido nuclecio a expresar,
puede estar presente preferiblemente integrado en un vector e
insertarse en un genoma vegetal a través de transformación, por
ejemplo. Los elementos de control facilitan preferiblemente una
expresión específica para epidermis.
Los métodos arriba mencionados (a) hasta (i)
también pueden aplicarse para la reducción de la actividad o
función, en especial de la expresión, de las otras proteínas aquí
nombradas, en especial para la reducción de MLO, RacB y NaOx.
La proteína BI1 de cebada (hvBI1) se expresa de
manera predominante en el mesófilo (Ejemplo 6) y se regula de modo
superior a causa de una infección con Blumeria (syn. Erysiphe)
graminis f. sp.hordei hochreguliert (ejemplo 2). La
sobreexpresión recombinante específica para mesófilo en cebada
resistente a mlo conduce, junto a la resistencia contra patógenos
particularmente necrotóficos y hemibiotróficos, hacia una planta
resistente a la Blumeria (syn. Erysiphe) graminis f.
sp.hordei, la cual no muestra manchas necróticas
("manchas-mlo"; efectos laterales negativos
de la resistencia a mlo). Utilizando este efecto, los efectos
secundarios negativos de la resistencia proporcionada por mlo
(pérdida de cosecha de aproximadamente 5%, Jörgensen JH (1992)
Euphitica 63: 141-152); Hipersusceptibilidad frente
a hongos necrotróficos, Jarosch B et al. (1999) Mol Plant
Microbe Interact 12:508-514; Kumar J et al.
(2001) Phitopathology 91:127-133) pueden suprimirse
sin afectar adversamente la resistencia misma al mlo.
Más aún, puede demostrarse de manera
sorprendente que una sobreexpresión de BI1 da lugar a resistencia
frente a factores de estrés como los agentes que provocan necrosis
(aislados por ejemplo de hongos patógenos necrotróficos; ejemplo
2).
El método de acuerdo con la invención ofrece,
por consiguiente, una estrategia biotecnológica eficiente para la
resistencia a la formación de necrosis como resultado de estrés
endógeno, abiótico y biótico, por ejemplo manchas de mlo, daños por
ozono, organismos dañinos necrotróficos y hemibiotróficos.
Las proteínas BI1 parecen ser reguladores
cruciales de la resistencia fúngica no específica para raza en
plantas. Esto hace posible una amplia capacidad de aplicación en
estrategias biotecnológicas para elevar la resistencia a patógenos
en plantas, en especial la resistencia a hongos. Por principio, el
método de acuerdo con la invención puede aplicarse a a todas la
especies vegetales. Proteínas BI1 han sido identificadas en
numerosas plantas, tanto monocotiledóneas como dicotiledóneas
(véase arriba).
En el marco de esta invención
"aproximadamente" significa en referencia a números o tamaños
un rango de números o tamaños alrededor del valor enunciado del
número o tamaño. En general, el término aproximadamente significa
un rango respectivo de 20% por encima o por debajo del valor
enunciado.
En el marco de la invención, el término
"planta" significa todos los géneros y especies de vegetales
superiores e inferiores del reino vegetal. El término incluye las
plantas maduras, semillas, brotes y embriones (plántulas), así como
las partes derivadas de los mismos, material de reproducción,
órganos de la planta, tejidos, protoplastos, callos y otros
cultivos, por ejemplo cultivos celulares, y otros tipos de
agrupaciones de células vegetales para dar unidades funcionales o
estructurales. El término plantas maduras se refiere a plantas en
cualquier etapa deseada de desarrollo más allá de la de los brotes.
Los brotes se refieren a una planta joven inmadura en una etapa
temprana de desarrollo.
"Planta" comprende todas las plantas
anuales y perennes, mono- y di-cotiledóneas e
incluye, por ejemplo, aunque no se limita a, los géneros Cucurbita,
Rosa, Vitis, Juglans, Fragaria, Lotus, Medicago, Onobrychis,
Trifolium, Trigonella, Vigna, Citrus, Linum, Geranium, Manihot,
Daucus, Arabidopsis, Brassica, Raphanus, Sinapis, Atropa, Capsicum,
Datura, Hioscyamus, Lycopersicon, Nicotiana, Solarium, Petunia,
Digitalis, Majorana, Ciahorium, Helianthus, Lactuca, Bromus,
Asparagus, Antirrhinum, Heterocallis, Nemesis, Pelargonium, Panieum,
Pennisetum, Ranunculus, Senecio, Salpiglossis, Cucumis, Browaalia,
Glycine, Pisum, Phaseolus, Lolium, Oryza, Zea, Avena, Hordeum,
Secale, Triticum, Sorghum, Picea y Populus.
El concepto "planta" comprende
preferiblemente plantas de cultivo monocotiledóneas, tales como por
ejemplo especies de cereales como trigo, cebada, mijo, centeno,
tritical, maíz, arroz, sorgo o avena, así como caña de azúcar.
El término comprende, además, plantas de cultivo
dicotiledóneas tales como, por ejemplo,
- -
- Brassicáceas tales como colza, nabina, berro, arabidopsis, especies de coles,
- -
- Leguminosas como soya, alfalfa, guisantes, arvejas, frijoles o maní
- -
- Solanáceas como patata, tabaco, tomate, berenjena o pimiento,
- -
- Asteráceas como girasol, tagetes, lechuga o caléndula,
- -
- Cucurbitáceas como melón, calabaza o calabacín,
así como linaza (lino), algodón, cáñamo, trébol,
espinaca, pimienta roja, zanahoria, remolacha, rábano, remolacha
de azúcar, patata dulce, pepino, achicoria, coliflor, brócoli,
espárragos, cebolla, ajo, apio, fresas, frambuesas, moras, piña,
aguacate y las diversas especies de árboles, arbustos, nogales y
vides. Las especies de árboles comprenden preferiblemente ciruelo,
cerezo, durazno, nectarina, melocotón, banano, papaya, mango,
manzano, pera,
membrillo.
membrillo.
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En el contexto de la invención se prefieren
tales vegetales que se emplean como alimento para humanos o
animales, se prefieren muy particularmente especies y géneros
monocotiledóneos com importancia agrícola tales como trigo, avena,
mijo, cebada, centeno, maíz, arroz, alforfón, sorgo, tritical,
espelta, semillas de lino o caña de azúcar.
El término "factor de estrés" comprende en
el contexto de la invención factores bióticos de estrés (como en
particular los patógenos listados abajo).
"Resistencia al estrés" significa la
reducción o el alivio de los síntomas de una planta a causa del
estrés. Los síntomas pueden ser múltiples pero preferiblemente
abarcan aquellos que directa o indirectamente afectan de manera
adversa a la calidad de la planta, la cantidad de la cosecha, su
idoneidad para el uso como alimento de humano o animales, o también
que dificultan la siembra, cultivo, cosechamiento o procesamiento
del producto cosechado.
"Resistencia a patógenos" significa la
reducción o alivio de los síntomas de enfermedad de una planta a
consecuencia de la infestación por al menos un patógeno. Los
síntomas puede ser múltiples pero abarcan preferiblemente aquellos
que conducen directa o indirectamente a perjudicar la calidad de la
planta, la cantidad de la cosecha, la aptitud para usarla como
alimento de animales o humanos o que también dificultan la siembra,
cultivo, recolección de cosecha o procesamiento de los productos
cosechados.
"Conferir", "mantener", "generar"
o "elevar" una resistencia a estrés o a patógenos significa que
los mecanismos de defensa de una especie o variedad determinada de
plantas presentan una resistencia elevada frente a uno o más tipos
de estrés o de patógeno mediante la aplicación del método de la
invención en comparación con la variedad silvestre de la planta
("planta de partida"), a la cual no se ha aplicado el método de
la invención, en condiciones por lo demás iguales (como por
ejemplo, condiciones de clima y cultivo, tipo de estrés o de
patógeno, etc.). La elevada resistencia se manifiesta
preferiblemente en una manifestación reducida de los síntomas de
estrés o enfermedad, y los síntomas de enfermedad abarcan, en
adición a los efectos adversos mencionados arriba, por ejemplo
también la eficiencia de penetración de un patógeno en la planta o
células de la planta o la eficiencia de proliferación en o sobre
las mismas. En este caso, los síntomas del estrés o de la enfermedad
se reducen preferiblemente en al menos 10% o al menos 20%,
particularmente preferible en al menos 40% o 60%, muy
particularmente preferible en al menos 70% o 80%, lo más preferible
en al menos 90% o 95%.
"Selección" significa, en referencia a las
plantas en las que, a diferencia o en comparación con la planta de
partida, existe o se eleva la resistencia frente al menos un factor
de estrés o patógeno, todos los métodos que son adecuados para
reconocer una resistencia existente o incremetada al estrés o a los
patógenos. Estos pueden ser, por ejemplo, síntomas de infección
patógena (por ejemplo, el desarrollo de necrosis en el caso de
infección fúngica), pero también abarca los síntomas descritos
arriba que se refieren a la calidad de la planta, la cantidad de la
cosecha, la aptitud para usar como material de alimento a animales o
humanos.
"Patógeno" significa, en el contexto de la
invención y a manera de ejemplo, aunque no limitando, virus o
viroides, bacterias, hongos, pestes animales tales como, por
ejemplo insectos o nematodos. Preferiblemente son hongos, en
particular hongos necrotróficos o hemibiotrófico. Sin embargo, puede
suponerse que la expresión específica para mesófilo de una proteína
a BI1 también produzca una resistencia contra otros patógenos puesto
que se genera una resistencia total hacia los factores de
estrés.
Por ejemplo, aunque sin limitar, se mencionarían
los siguientes patógenos:
Patógenos fúngicos o patógenos similares a los
fúngicos (como por ejemplo chromista) provienen preferiblemente del
grupo que comprende plasmodioforamycota, oomycota, ascomycota,
quitridiomicetos, zigomicetos, basidiomycota y deuteromicetos
(fungi imperfecti). Sin embargo, a manera de ejemplo sin
estar limitando, se mencionarían los patógenos nombrados en las
tablas 1 a 4 y las enfermedades asociadas con éstos. Los siguientes
términos ingleses y alemanes pueden usarse alternativamente:
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Otras traduccionnes pueden encontrarse, por
ejemplo en
http://www.bba.de/english/da.tabase/psmengl/pilz.htm.
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Particularmente se prefieren
- Plasmodioforomycota como plasmodiofora
brassicae (Kohlhernie), Spongospora subterranea, Polymyxa
graminis,
- Oomycota como Bremia lactucae (moho
mildiú en lechuga), Peronospora (moho mildiú) en boca de
dragón o antirrino (P. antirrhini), cebolla (P.
destructor), espinaca (P. effusa), soya (P.
manchurica), tabaco (mildiú algodonoso; P. tabacina)
Alfalfa y trébol (P. trifolium), pseudoperonospora
humuli (moho mildiú en lúpulo), plasmopara (moho mildiú
en uvas) (P. viticola) y girasoles (P. halstedii),
sclerophtohra macrospora (moho mildiú en cereales y
gramíneas), pythium (por ejemplo podredumbre de semilleros en
remolacha a través de P. debaryanum), phitophthora
infestans (mildiú de hierba y tubérculos, podredumbre parda en
el tomate, etc.), Albugo spec.
- Ascomycota como Microdochium nivale
(moho de la nieve en centeno y trigo), Fusarium graminearum,
Fusarium culmorum (Podredumbre de espiga especialmente en
trigo), fusarium oxisporum (marchitamiento por fusarium en
tomate), Blumeria graminis (mildiú genuino en cebada
(f.sp. hordei) y trigo (f.sp. tritici)), Erysiphe pisi
(mildiú de guisantes), Nectria galligena (chancro de árbol
frutal), unicnula necator (Mildiú genuino de la vid),
pseudopeziza tracheiphila (clavo rojo de la vid),
Claviceps purpurea (cornezuelo en centeno y gramíneas, por
ejemplo), gaeumannomyces graminis (mal del pie negro en
trigo, centeno entre otras gramíneas), Magnaporthe grisea,
Pyrenofora graminea (rayado de la cebada), pyrenofora
teres (enfermedad de manchas de red en cebada), Pyrenofora
tritici-repentis (enfermedad de manchas en hoja
(resequedad) en trigo), Venturia inaequalis (roña del
manzano), Sclerotinia sclerotium (podredumbre del tallo,
cáncer de colza), Pseudopeziza medicaginis (moho verde de
los agrios en alfalfa, trébol blanco y rojo).
- Basidiomicetos wie Typhula incarnata
(podredumbre por typhula en cebada, centeno, trigo), Ustilago
maydis (carbón del maíz), Ustilago nuda (carbón del
trigo en cebada), Ustilago tritici (carbón del trigo,
escanda), Ustilago avenae (Carbón del trigo en avena),
Rhizoctonia solani (mal vinoso en patatas), Sphacelotheca
spp. (carbón de la mazorca en sorgo), Melampsora lini
(orín en lino), Puccinia graminis (orín negro en trigo,
cebada, centeno, avena), Puccinia recondita (orín pardo en
trigo), Puccinia dispersa (orín pardo en centeno),
Puccinia hordei (orín pardo en Cebada), Puccinia
coronata (orín de corona en avena), Puccinia striiformis
(orín amarillo en trigo, cebada, centeno así como en numerosas
gramíneas), Uromyces appendiculatus (orín de frijol),
Sclerotium rolfsii (podredumbre de raíz y tallo en numerosas
plantas).
- Deuteromicetos (Fungi imperfecti) tales
como Septoria (Stagonospora) nodorum (manchas de la pluma del
trigo) en trigo (Septoria tritici), Pseudocercosporella
herpotrichoides (mal de pie en trigo, cebada, centeno),
Rynchosporium secalis (enfermedad de mancha de hoja o
septoriosis en centeno y cebada), Alternaria solani (negrón,
tizón o alternariosis en patata y tomate), Foma betae
(carbón de raíz en remolacha), Cercospora beticola
(cercospora-septoriosis en remolacha),
Alternaria brassicae (negro de colza en colza, col, entre
otras crucíferas), Verticillium dahliae (marchitamiento y
podredumbre de tallo de colza), Colletotrichum lindemuthianum
(antracnosis (manchas quemadas) en fríjol), Foma lingam -
caída de almaciga (pie negro en col; podredumbre en el cuello de la
raíz o del tallo en colza), Botrytis cinerea (moho gris en
la vid, fresa, tomate, lúpulo, etc.).
Los más preferible son Phitophthora
infestans (podredumbre de hierba y tubérculo, podredumbre parda
en tomate, etc), Microdochium nivale (antes Fusarium
nivale; moho de nieve en centeno y trigo), Fusarium
graminearum, Fusarium culmorum, Fusarium avenaceum y Fusarium
poae (podredumbre de espiga en trigo), Fusarium oxisporum
(marchitamiento por fusarium en tomate), Magnaporthe grisea
(rice blast disease o enfermedad de tizón del arroz),
Sclerotinia sclerotium (podredumbre de tallo, cáncer de
colza), Septoria (Stagonospora) nodorum y Septoria
tritici (septoriosis en trigo), Alternaria brassicae
(negro de colza en colza, coles, entre otras crucíferas), Foma
lingam (caída de almaciga, pie negro en col; podredumbre de
cuello de raíz o de tallo en colza).
A manera de ejemplo aunque no limitante se
mencionan los patógenos nombrados en la tabla 5 y las enfermedades
a éstas asociadas.
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Muy particularmente preferibles las siguientes
bacterias patógenas: Corynebacterium sepedonicum (podredumbre
de anillo de bacterias en patata), Erwinia carotovora (pie
negro en patata), Erwinia amilovora (fuego bacteriano en
pera, manzana, membrillo), Streptomyces scabies (roña de
patata), Pseudomonas syringae pv. tabaci (mancha angular en
la hoja de tabaco), Pseudomonas syringae pv. phaseolicola
(enfermedad de manchas grasosas en poroto (judía) enano),
Pseudomonas syringae pv. tomato ("bacterial speck"
(motas bacterianas) en tomate), Xanthomonas campestris pv.
malvacearum (septoriosis en algodón) y Xanthomonas campestris
pv. oryzae (podredumbre bacteriana en arroz y otras
gramíneas).
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El término "patógenos virales" incluye
todos los virus vegetales tales como, por ejemplo, virus mosaico de
tabaco o pepino, virus de mancha anular, virus de necrosis, virus
mosaico enano de maíz, etc.
Los patógenos y enfermedades asociados a éstos
se mencionan en la tabla 6 a manera de ejemplo, pero sin
limitar.
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Los siguientes pueden mencionarse a manera de
ejemplo sin ser limitantes: escarabajos, orugas, áfidos o ácaros.
Los insectos preferidos son aquellos de los géneros Coleoptera,
Diptera, Himenoptera, Lepidoptera, Mallophaga, Homoptera,
Hemiptera, Orthoptera, Thisanoptera. Dermaptera, Isoptera, Anoplura,
Sifonaptera, Trichoptera, etc.. Particularmente se prefieren
insectos coleopteros y lepidopteros, como por ejemplo el barrenador
de maíz (European Corn Borer), Diabrotica barberi, Diabrotica
undecimpunctata, Diabrotica virgifera, Agrotis ipsilon, Crymodes
devastator, Feltia ducens, Agrotis gladiaria, Melanotus spp., Aeolus
mellillus, Aeolus mancus, Horistonotus uhlerii, Sphenoforus maidis,
Sphenoforus zeae, Sphenoforus parvulus, Sphenoforus callosus,
Phillogphaga spp., Anuraphis maidiradicis, Delia platura, Colaspis
brunnea, Stenolophus lecontei y Clivinia
impressifrons.
Otros a mencionarse son: el criocero de los
cereales (Oulema melanopus), la mosca frit (Oscinella
frit), el gusano de alambre (Agrotis lineatus) y áfidos
de hoja (como, por ejemplo, áfido de hoja de avena Rhopalosiphum
padi, áfidos grandes de cereales Sitobion avenae).
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(Tabla pasa a página
siguiente)
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Los patógenos y las enfermedades asociados con
éstos se mencionan en la tabla 7 a manera de ejemplo, pero sin
limitación
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Muy particularmente se prefieren Globoa
rostochiensis y G. pallida (nematodos de las raíces en
patata, tomate entre otras solanáceas), Heteroa schachtii
(nematodos de raíces de remolacha en remolacha de azúcar y para
alimento animal, colza, col, etc.), Heteroa avenae (nematodos
de raíces de avena en avena entre otras especies de cereales),
Ditilenchus dipsaci (nematodos de tallo o bulbo, nematodos de
cabeza de remolacha en centeno, avena, maíz, trébol, tabaco,
remolacha), Anguina tritici (nematodos de trigo, enfermedad
de berberecho en trigo (escanda, centeno), Meloidogyne hapla
(nematodos de la raíz en zanahoria, pepino, lechuga, tomate, patata,
remolacha de azúcar, alfalfa).
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Para variedades individuales pueden nombrarse
como ejemplos de hongos o virus patógenos:
Patógenos fúngicos, bacterianos y virales:
Puccinia graminis f.sp. hordei, Blumeria (Erysiphe) graminis
f.sp. hordei, barley yellow dwarf virus (BYDV) (Virus enano
amarillo de cebada.
Insectos/nemátodos patógenos: Ostrinia
nubilalis (European corn borer o barrenador europeo de maíz);
Agrotis ipsilon; Schizaphis graminum; Blissus
leucopterus; Acrosternum hilare; Euschistus
servus; Deliaplatura; Mayetiola destructor;
Petrobia latens.
Patógenos fúngicos, bacterianos o virales:
Phitophthora megasperma fsp.glycinea, Macrofomina
phaseolina, Rhizoctonia solani, Sclerotinia sclerotiorum, Fusarium
oxisporum, Diaporthe phaseolorum var. sojae (Fomopsis sojae),
Diaporthe phaseolorum var. caulivora, Sclerotium rolfsii,
Cercospora kikuchii, Cercospora sojina, Peronospora manshurica,
Colletotrichum dematium (Colletotrichum truncatum),
Corynespora cassiicola, Septoria glycines, Phillosticta
sojicola, Alternaria alternata, Pseudomonas syringae p.v. glycinea,
Xanthomonas campestris p.v. phaseoli, Microsphaera diffussa,
Fusarium semitectum, Phialofora gregata, virus mosaico de haba
de soja, Glomerella glycines, Tobacco Ring spot virus (virus
de mancha anular en el tabaco), Tobacco Streak virus (virus de pica
en tabaco), Phakopsorapachirhizi, Pythium
aphanidermatum, Pythium ultimum, Pythium
debaryanum, Tomato spotted wilt virus (virus de
marchitamiento de tomate manchado), Heteroa glycines Fusarium
solani.
Insectos/nemátodos patógenos: Pseudoplusia
includens; Anticarsia gemmatalis; Plathipena scabra; Ostrinia
nubilalis; Agrotis ipsilon; Spodoptera exigua; Heliothis virescens;
Helicoverpa zea; Epilachna varivestis; Myzus persicae; Empoasca
fabae; Acrosternum hilare; Melanoplus femurrubrum; Melanoplus
differentialis; Hilemya platura; Sericothrips variabilis; Thrips
tabaci; Tetranychus turkestani; Tetranychus urticae;
Patógenos fúngicos, bacterianos o virales:
Albugo candida, Alternaria brassicae, Leptosphaeria maculans,
Rhizoctonia solani, Sclerotinia sclerotiorum, Mycosphaerella
brassiccola, Pythium ultimum, Peronospora parasitica, Fusarium
roseum, Alternaria alternata.
Patógenos fúngicos, bacterianos o virales:
Clavibater michiganese subsp. insidiosum, Pythium ultimum,
Pythium irregulare, Pythium splendens, Pythium debaryanum, Pythium
aphanidermatum, Phitophthora megasperma, Peronospora trifoliorum,
Foma medicaginis var. medicaginis, Cercospora medicaginis,
Pseudopeziza medicaginis, Leptotrochila medicaginis, Fusarium,
Xanthomonas campestris p.v. alfalfae, Aphanomyces euteiches,
Stemphilium herbarum, Stemphilium alfalfae.
Patógenos fúngicos, bacterianos o virales:
Pseudomonas syringae p.v. atrofaciens, Urocystis agropyri,
Xanthomonas campestris p.v. translucens, Pseudomonas syringae p.v.
syringae, Alternaria alternata, Cladosporium herbarum, Fusarium
graminearum, Fusarium avenaceum, Fusarium culmorum, Ustilago
tritici, Ascochita tritici, Cephalosporium gramineum,
Collotetrichum graminicola, Erysiphe graminis f.sp. tritici,
Puccinia graminis f.sp. tritici, Puccinia recóndita f.sp. tritici,
Puccinia striiformis, Pyrenofora tritici-repentis,
Septoria (Stagonospora) nodorum, Septoria tritici, Septoria avenae,
Pseudocercosporella herpotrichoides, Rhizoctonia solani, Rhizoctonia
cerealis, Gaeumannomyces graminis var. tritici, Pythium
aphanidermatum, Pythium arrhenomanes, Pythium ultimum, Bipolaris
sorokiniana, Barley Yellow Dwarf Virus (virus enano Amarillo de
cebada), Brome Mosaic Virus (virus mosaico de bromo), Soil Borne
Wheat Mosaic Virus (virus mosaico de trigo llevao en suelo), Wheat
Streak Mosaic Virus (virus mosaico de pica en trigo), Wheat Spindle
Streak Virus (virus de pica en eje de trigo), American Wheat
Striate Virus (virus estriado de trigo americano), Claviceps
purpurea, Tilletia tritici, Tilletia laevis, Ustilago tritici,
Tilletia indica, Rhizoctonia solani, Pythium arrhenomannes, Pythium
gramicola, Pythium aphanidermatum, High Plains Virus (virus de
llanuras altas), European Wheat Striate Virus (virus estriado de
trigo europeo), Puccinia graminis f.sp. tritici (Wheat stem
rust u orín de tallo de trigo), Blumeria (Erysiphe) graminis
f.sp. tritici (Wheat Powdery Mildew o mildiú polvoroso de
trigo).
Insectos/nemátodos patógenos: Pseudaletia
unipunctata; Spodoptera,frugiperda; Elasmopalpus lignosellus;
Agrotis orthogonia; Elasmopalpus Zignosellus; Oulema melanopus;
Hipera punctata; Diabrotica undecimpunctata howardi; Russian wheat
aphid (pulgón de trigo ruso); Schizaphis graminum;
Macrosiphum avenae; Melanoplus femurrubrum; Melanoplus
differentialis; Melanoplus sanguinipes; Mayetiola destructor;
Sitodiplosis mosellana; Meromyza americana; Hilemya coarctata;
Frankliniella fusca; Cephus cinctus; Aceria tulipae;
Patógenos fúngicos, bacterianos o virales:
Plasmofora halstedii, Sclerotinia sclerotiorum, Aster Yellows,
Septoria helianthi, Fomopsis helianthi, Alternaria helianthi,
Alternaria zinniae, Botrytis cinerea, Foma macdonaldii, Macrofomina
phaseolina, Erysiphe cichoracearum, Rhizopus oryzae, Rhizopus
arrhizus, Rhizopus stolonifer, Puccinia helianthi, Verticillium
dahliae, Erwinia carotovorum p.v. Carotovora, Cephalosporium
acremonium, Phitophthora cryptogea, Albugo tragopogonis.
Insectos/nemátodos patógenos: Suleima
helianthana; Homoeosoma electellum; zygogramma exclamationis;
Bothirus gibbosus; Neolasioptera murtfeldtiana;
Patógenos fúngicos, bacterianos o virales:
Fusarium moniliforme var. subglutinans, Erwinia stewartii,
Fusarium moniliforme, Gibberella zeae (Fusarium graminearum),
Stenocarpella maydi (Diplodia maydis), Pythium irregulare, Pythium
debaryanum, Pythium graminicola, Pythium splendens, Pythium ultimum,
Pythium aphanidermatum, Aspergillus flavus, Bipolaris maydis 0,
T (Cochliobolus heterostrophus), Helminthosporium carbonum I,
II & III (Cochliobolus carbonum), Exserohilum turcicum
I, II & III, Helminthosporium pedicellatum, Phisoma maydis,
Phillosticta maydis, Kabatiella maydis, Cercospora sorghi, Ustilago
maydis, Puccinia sorghi, Puccinia polysora, Macrofomina phaseolina,
Penicillium oxalicum, Nigrospora oryzae, Cladosporium herbarum,
Curvularia lunata, Curvularia inaequalis, Curvularia pallescens,
Clavibacter michiganese subsp. nebraskense, Trichoma viride,
Maize Dwarf Mosaic Virus A & B (virus mosaico enano de maíz),
Wheat Streak Mosaic Virus (virus mosaico de pica en trigo), Maize
Chlorotic Dwarf Virus (virus enano clorótico de maíz), Claviceps
sorghi, Pseudonomas avenae, Erwinia chrysanthemi p.v. Zea, Erwinia
corotovora, Cornstunt spiroplasma, Diplodia macrospora,
Sclerophthora macrospora, Peronosclerospora sorghi,
Peronosclerospora philippinesis, Peronosclerospora maydis,
Peronosclerospora sacchari, Spacelotheca reiliana, Phisopella zeae,
Cephalosporium maydis, Caphalosporium acremonium, Maize
Chlorotic Mottle Virus (virus jaspeado clorótico de maíz), High
Plains Virus (virus de las llanuras altas), Maize Mosaic Virus
(virus mosaico de maíz), Maize Rayado Fino Virus, Maize Streak
Virus (MSV, Maízstrichel-Virus, virus pica de maíz),
Maize Stripe Virus (virus raya de maíz), Maize Rough Dwarf Virus
(virus enano rugoso de maíz).
Insectos/nemátodos patógenos: Ostrinia
nubilalis; Agrotis ipsilon; Helicoverpa zea; Spodoptera frugiperda;
Diatraea grandiosella; Elasmopalpus lignosellus; Diatraea
saccharalis; Diabrotica virgifera; Diabrotica longicornis barberi;
Diabrotica yecimpunctata howardi; Melanotus spp.; Cyclocephala
borealis; Cyclocephala immaculata; Popillia japonica; Chaetocnema
pulicaria; Sphenoforus maidis; Rhopalosiphum maidis; Anuraphis
maidiradicis; Blissus leucopterus; Melanoplus femurrubrum;
Melanoplus sanguinipes; Hilemva platura; Agromyza parvicornis;
Anafothrips obscrurus; Solenopsis milesta; Tetranychus
urticae.
Patógenos fúngicos, bacterianos o virales:
Exserohilum turcicum, Colletotrichum graminicola (Glomerella
graminicola), Cercospora sorghi, Gloeocercospora sorghi, Ascochita
sorghina, Pseudomonas syringae p.v. syringae, Xanthomonas
campestris p.v. holcicola, Pseudomonas andropogonis, Puccinia
purpurea, Macrofomina phaseolina, Perconia circinata, Fusarium
monilifonne, Alternaria alternate, Bipolaris sorghicola,
Helminthosporium sorghicola, Curvularia lunata, Foma insidiosa,
Pseudomonas avenae (Pseudomonas alboprecipitans), Ramulispora
sorghi, Ramulispora sorghicola, Phillachara sacchari, Sporisorium
reilianum (Sphacelotheca reiliana), Sphacelotheca cruenta,
Sporisorium sorghi, Sugarcane mosaic H, Maize Dwarf Mosaic
Virus A & B, Claviceps sorghi, Rhizoctonia solani, Acremonium
strictum, Sclerophthona macrospora, Peronosclerospora sorghi,
Peronosclerospora philippinensis, Sclerospora graminicola, Fusarium
graminearum, Fusarium oxisporum, Pythium arrhenomanes, Pythium
graminicola.
Insectos/nemátodos patógenos: Chilo
partellus; Spodoptera frugiperda; Helicoverpa zea; Elasmopalpus
lignosellus; Feltia subterranea; Phvllophaga crinita; Eleodes,
Conous y Aeolus spp.; Oulema melanopus; Chaetocnema pulicaria;
Sphenoforus maidis; Rhopalosiphum maidis; Siphaflava; Blissus
leucopterus leucopterus; Contarinia sorghicola; Tetranychus
cinnabarinus; Tetranychus urticae.
Insectos/nemátodos patógenos: Heliothis
virescens; Helicoverpa zea; Spodoptera exigua; Pectinofora
gossypiella; Anthonomus grandis grandis; Aphis gossypii;
Pseudatomoscelis seriatus; Trialeurodes abutilonea; Lygus
lineolaris; Melanoplus femurrubrum; Melanoplus differentialis;
Thrips tabaci (onion thrips); Franklinkiella fusca; Tetranychus
cinnabarinus; Tetranychus urticae.
Insectos/nemátodos patógenos: Diatraea
saccharalis; Spodoptera frugiperda; Helicoverpa zea; Colaspis
brunnea; Lissorhoptrus oryzophilus; Sitophilus oryzae; Nefotettix
nigropictus; Blissus Ieucopterus leucopterus; Acrosternum
hilare.
Insectos/nemátodos patógenos: Brevicoryne
brassicae; Phiilotreta cruciferae; Mamestra conjgurata; Plutella
xilostella; Delia ssp..
En el contexto de la invención el término
"proteína BI1" significa polipéptidos que tienen al menos una
secuencia con una homología de al menos 50%, preferible al menos
80%, particularmente preferible al menos 90%, muy particularmente
preferible 100% hacia un motivo de consenso BI1 seleccionado del
grupo compuesto de
- a)
- H(L/I)KXVY
- b)
- AXGA(Y/F)XH
- c)
- NIGG
- d)
- P(V/P)(Y/F)E(E/Q)(R/Q)KR
- e)
- (E/Q)G(A/S)S(V/I)GPL
- f)
- DP(S/G)(L/I)(I/L)
- g)
- V(G/A)T(A/S)(L/I)AF(A/G)CF(S/T)
- h)
- IL(Y/F)LGG, preferiblemente EILILGG
- i)
- L(L/V)SS(G/W)L(S/T)(I/M)L(L/M)W
- j)
- DTGX(I/V) (I/V)E
\vskip1.000000\baselineskip
Particularmente se prefiere en este caso el
motivo de consenso BI f) IL(Y/F)LGG, muy
particularmente preferible (EILILGG).
Este motivo es característico para proteínas
vegetales BI1.
Particularmente preferible tienen lugar
secuencias con homología hacia al menos 2 ó 3 de estos motivos (a
hasta g) en una proteína BI1, muy particularmente preferible al
menos 4 ó 5, lo más preferible todos los motivos de a hasta j.
Otros motivos de secuencia típicos pueden derivarse por parte de la
persona técnica sin dificultad a partir de la comparación de
secuencias de proteína BI1, tal como se representa en las figuras 1
ó 6.
Especialmente se prefieren proteínas BI que se
codifican a través de un polipéptido que comprende al menos una
secuencia seleccionada del grupo compuesto de:
a) las secuencias según SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8,
10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32 y 38, y
b) Secuencias que tienen una identidad de al
menos 50%, preferible de al menos 70%, particularmente preferible
de al menos 90%, muy particularmente preferible de al menos 95%
hacia una de las secuencias según SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12,
14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32 y 38,
c) Secuencias que comprenden al menos una
secuencia parcial de al menos 10, preferible 20, particularmente
preferible 50 residuos de aminoácidos relacionados contiguos de una
de las secuencias según SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18,
20, 22, 24, 26, 28, 30, 32 y 38.
De acuerdo con la invención, el término proteína
BI comprende especialmente mutaciones naturales o artificiales del
polipéptido BI1 según SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10 y 38 así como
polipéptidos homólogos de otros organismos, preferible vegetales,
los cuales tienen esencialmente propiedades iguales. Las mutaciones
comprenden sustituciones, adiciones, deleciones, inversión o
inserciones de uno o varios residuos de aminoácidos. También están
comprendidos usando proteínas BI1 de organismos no vegetales como
por ejemplo el ser humano (GenBank Acc.-No.: P55061), ratas
(GenBank Acc.-No.: P55062) o drosófilas (GenBank Acc.-No.: Q9VSH3).
Entre proteínas BI1 vegetales y no vegetales, los motivos
conservados pueden identificarse fácilmente mediante comparaciones
de secuencia (compárese Alignment in Bolduc et 1. (2003) Planta
216:377-386; Fig. 1 y 6).
De esta manera, por la presente invención
también están comprendidos, por ejemplo, aquellos polipéptidos que
se obtienen por modificación de un polipéptido según SEQ ID NO: 2,
4, 6, 8, 10 y 38.
Las secuencias de otros vegetales homólogas a
las secuencias BI1 divulgadas en el contexto de esta invención
pueden descubrirse, por ejemplo, por
a) búsqueda de banco de datos en bancos de
organismos cuya secuencia genómica o de cADN sea total o
parcialmente conocida, usando secuencias BI1 siministradas como
secuencias de búsqueda o
b) inspección completa de bibliotecas de genes o
de cADN usando secuencias BI1 suministradas como sondas. La
inspección completa de bibliotecas de cADN o genómicas (usando, por
ejemplo, un de las secuencias de ácido nucleico descritas bajo SEQ
ID NO: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 y
37 o partes de las mismas como sondas), es uno de los métodos
corrientes para la persona técnica en la materia para identificar
homólogos en otras especies. En este caso, las sondas derivadas de
las secuencias de ácido nucleico según SEQ ID NO: 1, 3, 5, 7, 9,
11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 y 37 tienen una longitud
de al menos 20 bp, preferible al menos 50 bp, particularmente
preferible al menos 100 bp, muy particularmente preferible al menos
200 bp, lo más preferible al menos 400 bp. Para la inspección total
de las bibliotecas también puede emplearse una cadena de ADN
complementaria a las secuencias descritas bajo SEQ ID NO: 1, 3, 5,
7, 9, 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 y 37.
Por homología entre dos secuencias de ácido
nucleico se entiende la identidad de la secuencia de ácido nucleico
por toda la longitud de secuencia respectiva, la cual se calcula
mediante comparación con ayuda del algoritmo de programático GAP
(Wisconsin Package Version 10.0, University of Wisconsin, Genetics
Computer Group (GCG), Madison, USA; Altschul et al. (1997)
Nucleic Acids Res. 25:3389 siguientes) estableciendo los siguientes
parámetros:
- Gap Weight (peso): 50
- Length Weight (longitud peso): 3
- Average Match (coincidencia promedio): 10
- Average Mismatch (no coincidencia promedio): 0
Por ejemplo, por una secuencia que tiene una
homología de al menos 80% en la base de ácido nucleico con la
secuencia SEQ ID NO: 1 se entiende una secuencia que en comparación
con la secuencia SEQ ID NO: 1 según el algoritmo programático de
arriba con el parámetro establecido tiene una homología de al menos
80%.
Por homología entre dos polipéptidos se entiende
la identidad de la secuencia de aminoácidos por toda la longitud
respectiva de secuencia que se calcula por comparación con ayuda del
algoritmo programático GAP (Wisconsin Package Version 10.0,
University of Wisconsin, Genetics Computer Group (GCG), Madison,
USA) estableciendo los siguientes parámetros:
- Gap weight (peso): 8
- lenght weight (longitud peso):2
- Coincidencia promedio: 2,912
- No coincidencia promedio: -2,003
Por ejemplo, por una secuencia que tiene una
homología de sl menos 80% sobre la base de proteína con la
secuencia SEQ ID NO: 2, se entiende una secuencia que en comparación
con la secuencia SEQ ID NO: 2 presenta una homología de al menos
80% según el algoritmo programático con el parámetro establecido de
arriba.
Las proteínas BI1 abarcan también aquellos
polipéptidos que se codifican a través de las secuencias de ácido
nucleico que hibridan bajo condiciones estándar con una de las
secuencias de ácido nucleico BI1 descritas a través de SEQ ID NO:
1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31 y 37, con
la secuencia de ácido nucleico complementaria a la misma o con
partes de la previamente mencionada y que tienen las características
esenciales iguales como las proteínas descritas bajo SEQ ID NO:
2, 4, 6, 8, 10 y 38.
El término "condiciones de hibridación"
debe entenderse ampliamente y exige condiciones de hibridación
estrictas como también menos estrictas. Tales condiciones de
hibridación se describen entre otros en Sambrook J, Fritsch EF,
Maniatis T et al., en Molecular Cloning (A Laboratory
Manual), 2. Edición, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989,
páginas 9.31-9.57) o en Current Protocols en
Molecular Biology, John Wiley &Sons, N.Y. (1989),
6.3.1-6.3.6. Por ejemplo, las condiciones durante el
paso de lavado pueden seleccionarse del rango de condiciones
limitado de aquellas con baja estrictez (con aproximadamente 2X SSC
a 50ºC) y aquellas con estrictez más alta (con aproximadamente 0.2X
SSC a 50ºC, preferible a 65ºC) (20X SSC: citrato de sodio de 0,3M,
NaCl de 3M, pH 7.0). Además, la temperatura puede aumentar durante
el paso de lavado en condiciones poco estrictas a temperatura
ambiente, aproximadamente 22ºC, hasta condiciones más estrictas a
aproximadamente 65ºC. Ambos parámetros, concentración de sal y
temperatura, pueden variar simultáneamente; Uno de los dos
parámetros también puede mantenerse constante y solo variar el
otro. Durante la hibridación también pueden emplearse agentes
denaturalizante como por ejemplo formamida o SDS. En presencia de
formamida al 50% se realiza la hibridación preferiblemente a
42ºC.
"Propiedades esenciales" significa en
referencia a una proteína BI1 una o más de las siguientes
propiedades:
a) el otrogamiento o aumento de la resistencia a
patógenos frente a al menos un patógeno durante el aumento de la
cantidad de proteína o la función de dicha proteína BI1 en al menos
un tejido de la planta; dicho tejido no es la epidermis de la
hoja.
b) Ausencia de una muerte celular inducida
espontáneamente cuando se incrementa la cantidad de proteína o la
función de dicha proteína BI
c) La propiedad de inhibir significativamente
apoptosis inducida por BAX en el caso de
co-transfección de BAX y dicha proteína BI1, por
ejemplo en células HEK293. Se han descrito métodos correspondientes
(Bolduc N et al. (2003) Planta
216:377-386).
d) La presencia de cinco hasta siete dominios de
transmembrana putativos dentro de dicha proteína BI1.
e) Una localización preferencial en las
membranas de la célula, en especial en la membrana del núcleo,
membrana ER y/o membrana tilacoide.
En este caso, la manifestación cuantitativa de
dichas propiedades de una proteína BI1 pueden desviarse en ambas
direcciones en comparación con un valor obtenido para la proteína
BI1 según SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10 o 38.
El término "incremento de la cantidad de
proteína BI1" debe entenderse en el contexto de esta invención de
manera amplia y puede basarse en diversos mecanismos biológicos
celulares.
"Cantidad de proteína" significa la
cantidad de una proteína BI1 en el organismo, tejido, célula o
compartimiento de célula respectivamente indicado.
"Incremento de la cantidad de proteína"
significa el incremento cuantitativo de la cantidad de una proteína
BI1 en el organismo, tejido, célula o compartimiento indicado
respectivo - por ejemplo mediante uno de los métodos descritos
abajo - en comparación con el tipo silvestre del mismo género y tipo
al cual este método no se ha aplicado, pero bajo condiciones
contextuales de otra manera iguales (como, por ejemplo, condiciones
de cultivo, edad de las plantas, etc.). El incremento es en tal caso
de al menos 10%, preferible de al menos 30% o de al menos 50%,
particularmente preferible de al menos 70% ó 100%, muy
particularmente preferible en al menos 200% o 500%, lo más
preferible en al menos 1000%. La determinación de la cantidad de
proteína puede realizarse mediante diferentes métodos corrientes
para la persona técnica en la materia. A manera de ejemplo, aunque
sin limitar por esto, se mencionan: el método de
micro-biuret (Goa J (1953) Scand J Clin Lab Invest
5:218-222), die
Folin-Ciocalteu-Metode (Lowry OH
et al. (1951) J Biol Chem 193:265-275) o la
medición de la adsorción de CBB G-250 (Bradford MM
(1976) Analyt Biochem 72:248-254). También puede
realizarse una cuantificación mediante métodos inmunológicos, como
por ejemplo Western-Blot. La preparación de
anticuerpos BI1 correspondientes así como la realización de
Western-Blots BI1 se han descrito (Bolduc et
al. (2002) FEBS Lett 532:111-114). Una
cuantificación indirecta puede realizarse mediante
Northern-Blots; normalmente la cantidad de mARN se
correlaciona bien con la cantidad de proteína resultante. Se han
descrito métodos correspondientes (entre otros, Bolduc et
al. (2003) Planta 216:377-386; Matsumura H et
al. (2003) Plant J 33:425-434).
"Función" significa preferiblemente la
propiedad de una proteína BI1 de reducir muerte celular inducida
espontáneamente y/o la propiedad de inhibir el efecto de Bax que
indica apoptosis. Las funciones correspondientes pertenecen a la
propiedad esencial de una proteína BI1.
"Incremento" de la función significa en el
contexto de esta invención por ejemplo el incremento cuantitativo
de la acción inhibitoria sobre la muerte celular apoptótica inducida
por Bax, la cual puede cuantificarse mediante métodos corrientes
para la persona técnica en la materia (véase arriba) La cantidad
elevada es de al menos 10%, preferible de al menos 30% o de al
menos 50%, particularmente preferible de al menos 70% o 100%, muy
particularmente preferible en al menos 200% ó 500%, lo más
preferible en al menos 1000%. Los métodos para el incremento de la
función comprenden, además de los métodos descritos arriba para el
incremento de la cantidad de proteína (la cual siempre aumenta la
función), también la introducción de mutaciones en una proteína
BI1, a manera de ejemplo pero sin limitar.
La cantidad de proteína BI1 se eleva por
ejemplo, sin limitarse a, mediante uno de los siguientes
métodos:
a) expresión o sobre-expresión
recombinante de una proteína BI1 mediante la introducción de un
casete de expresión que comprende una secuencia de ácido nucleico
que codifica para una proteína bajo el control de un promotor
específico para tejido, donde dicho promotor no tiene esencialmente
actividad en la epidermis de la hoja.
b) Modificación (por ejemplo, intercambio) de
las regiones regulatorias (por ejemplo, de la región de promotor)
de un gen BI1 endógeno, por ejemplo intercambio de un promotor
específico de tejido por medio de recombinación homóloga, donde
dicho promotor no tiene esencialmente actividad en la epidermis de
la hoja.
c) Inserción de una secuencia de ácido nucleico
que codifica para una proteína BI1 en el genoma vegetal detrás de
un promotor específico para tejido por medio de recombinación
homóloga, donde dicho promotor no tiene esencialmente actividad en
la epidermis de la hoja.
d) Incremento de la expresión de una proteína
BI1 endógena mediante la introducción de un factor de transcripción
(por ejemplo, de un factor de transcripción artificial de la clase
de proteína de dedo de cinc) adecuado para la inducción de la
expresión de dicha proteína BI1. Se prefiere la introducción de un
casete de expresión recombinante que comprende una secuencia de
ácido nucleico que codifica para dicho factor de transcripción bajo
control de un promotor específico de tejido, donde dicho promotor no
tiene esencialmente actividad en la epidermis de la hoja.
El término "introducción" comprende en el
contexto de la invención todos los métodos adecuados para introducir
el compuesto a introducir, directa o indirectamente, en una planta
o una célula, compartimiento, tejido, órgano o semilla de la misma,
o generarlo allí. Están comprendidos métodos directos e indirectos.
La introducción puede conducir a una presencia pasajera
(transitoria) de dicho compuesto o también a una duradera (estable)
o inducible. La introducción comprende, por ejemplo, métodos como la
transfección, transducción o transformación.
En los casetes de expresión empleados en el
contexto de la invención, una molécula de ácido nucleico (que
codifica por ejemplo para una proteína BI1) está en conexión
funcional con al menos un promotor específico para tejido, donde
dicho promotor no tiene actividad esencialmente en la epidermis de
la hoja y donde el promotor es heterólogo con respecto a la
secuencia de ácido nucleico a expresar; es decir, no tiene lugar de
manera natural en combinación con la misma. Los casetes de expresión
recombinantes de acuerdo con la invención pueden comprender
opcionalmente otros elementos de control genéticos.
Por conexión funcional se entiende, por ejemplo,
la disposición secuencial del dicho promotor con la secuencia de
ácido nucleico a expresar y, opcionalmente, otros elementos
regulatorios como por ejemplo un terminador de tal modo que cada
uno de los elementos regulatorios puede desempeñar su función en la
expresión recombinante de la secuencia de ácido nucleico. Para este
propósito no es necesariamente obligatoria una conexión directa en
el sentido químico. Las secuencias genéticas de control, como por
ejemplo secuencias enhancer, también pueden ejercer su función
desde otras posiciones alejadas o inclusive desde otras moléculas de
ADN sobre la secuencia de destino. Se prefieren disposiciones en
los que la secuencia de ácido nucleico a expresarse recombinante se
posiciona detrás de la secuencia que funge como promotor, de modo
que ambas secuencias están enlazadas una con otra de manera
covalente. En tal caso se prefiere la distancia entre la secuencia
de promotor y la secuencia a expresarse recombinante menor que 200
pares de bases, particularmente preferible menor que 100 pares de
bases, muy particularmente preferible menor que 50 pares de bases.
La preparación de una conexión funcional como también la
preparación de un casete de expresión recombinante puede realizarse
por medio de técnicas corrientes de recombinación y clonación, tal
como se describen, por ejemplo, en Maniatis T, Fritsch EF y
Sambrook J (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold
Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor (NY), en Silhavy TJ,
Berman ML y Enquist LW (1984) Experiments with Gene Fusions, Cold
Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor (NY), in Ausubel FM
et al. (1987) Current Protocols in Molecular Biology, Greene
Publishing Assoc. and Wiley Interscience y en Gelvin et al.
(1990) en: Plant Molecular Biology Manual. Entre ambas secuencias
también pueden posicionarse otras secuencias que tienen, por
ejemplo, la función de un linker (enlazante) con determinadas
intersecciones de enzima de restricción o de una señal de péptido.
La inserción de secuencias también puede conducir a la expresión de
proteínas de fusión.
Preferiblemente, el casete de expresión que se
compone de una conexión del promotor y de la secuencia de ácido
nucleico a expresar puede estar presente de manera integrada en un
vector e insertarse a un genoma vegetal mediante transformación,
por ejemplo.
Por un casete de expresión recombinante también
deben entenderse aquellas construcciones en las que el promotor,
por ejemplo mediante una recombinación homóloga, se ubica antes del
gen BI1 endógeno y de esta manera controla la expresión de la
proteína BI1. De manera análoga, la secuencia de ácido nucleico a
expresarse (que codifica para una proteína BI1, por ejemplo)
también puede ubicarse detrás de un promotor endógeno de tal manera
que se manifieste el mismo efecto. Ambos planteamientos conducen a
los casetes de expresión recombinantes en el sentido de la
invención.
Por un "promotor específico para tejido que no
tiene esencialmente actividad en la epidermis de la hoja" se
entienden en el contexto de esta invención en general aquellos
promotores que son adecuados para asegurar o elevar una expresión
recombinante de una secuencia de ácido nucleico al menos en un
tejido vegetal, con la condición de que
a) dicho tejido vegetal se seleccione de todos
los tejidos vegetales con excepción de la epidermis, y
b) la expresión recombinante bajo el control del
dicho promotor en dicho tejido vegetal alcance al menos cinco
veces, preferible al menos diez veces, particularmente preferible al
menos cien veces la expresión en la epidermis de hoja vegetal.
La persona técnica en la materia conoce
numerosos promotores que satisfacen estos requisitos. En especial
son adecuados promotores específicos para tejido tales como, por
ejemplo, aunque sin limitarse a, promotores con especificidades
para las anteras, los ovarios, flores, tallos, raíces, tubérculos o
semillas.
a) Como promotores específicos de semillas se
prefieren, por ejemplo, lo promotores de faseolina (US 5,504,200;
Bustos MM et al. (1989) Plant Cell
1(9):839-53), 2S Albumins (Joseffson LG et
al. (1987) J Biol Chem 262: 12196-12201),
Legumins (Shirsat A et al. (1989) Mol Gen Genet
215(2):326-331) y Legumin B4 (LeB4; Baumlein
H et al. (1991) Mol Gen Genet 225:121-128;
Baumlein H et al. (1992) Plant J
2(2):233-9; Fiedler U et al. (1995)
Biotechnology (NY) 13.(10):1090f), USP (unknown seed protein;
Baumlein H et al. (1991) Mol Gen Genet
225(3):459-67), Napins (US 5,608,152;
Stalberg K et al. (1996) L Planta
199:515-519), Saccharosebindeproteins (WO 00/26388),
Oleosins (WO 98/45461), o el promotor Bce4 de Brassica (WO
91/13980). Otros promotores adecuados específicos para semillas son
los de genes que codifican para la "High Molecular Weight
Glutenin" (HMWG), Gliadina, enzima de ramificación, ADP glucosa
pirofosfatasa (AGPase) o la sintaza de almidón. Además se prefieren
promotores que permiten expresión específica de semilla en
monocotiledóneas tales como maíz, cebada, trigo, centeno, arroz etc.
De manera ventajosa pueden emplearse el promotor del gen lpt2 o
Ipt1 (WO 95/15389, WO 95/23230) o los promotores descritos en WO
99/16890 (promotores del gen hordeina, del gen glutelina, del gen
oryzina, del gen prolamina, del gen gliadina, del gen glutelina,
del gen zeina, del gen kasirina o del gen secalina). Otros
promotores específicos de semilla se describen en WO 89/03887.
b) Promotores específicos de tubérculos, de
raíces de almacenamiento o de raíces comprenden, por ejemplo, el
promotor del gen de patatina (GenBank Acc.-No.: A08215), el promotor
B33 de patatina clase I (GenBank Acc.-No.: X14483) o el promotor de
la catepsina D inhibidor de patata. En especial se prefiere el
promotor descrito por SEQ ID NO: 29. Los promotores específicos de
tubérculos son en el contexto de la invención adecuados en especial
para lograr una resistencia contra Phitophthora infestans.
Puesto que los hongos obligat-biotróficos solo
atacan las hojas, es irrelevante una actividad en el tejido
epidérmico del tubérculo.
c) Los promotores específicos de flores
comprenden, por ejemplo, el promotor de fitoeno sintasa Promotor (WO
92/16635) o el promotor del gen P-rr (WO
98/22593).
d) Los promotores específicos de anteras
comprenden, por ejemplo, el promotor 5126 (US 5,689,049, US
5,689,051), el promotor glob-1 y el promotor \gamma-zein.
5,689,051), el promotor glob-1 y el promotor \gamma-zein.
e) Promotores específicos de granzas, como por
ejemplo el promotor en US 6,291,666. Los promotores específicos de
granzas son ventajosos especialmente para facilitar una resistencia
contra fusarium.
f) Promotores específicos de mesófilos tales
como, por ejemplo, el promotor del gen de germen de trigo
9f-3.8 (banco de genes GenBank Acc.-No.: M63224) o
el promotor de cebada GerA (WO 02/057412). Dichos promotores son
especialmente ventajosos porque son tanto específicos de mesófilos
como inducibles para patógenos. También es adecuado el promotor
específico para mesófilo de arabidopsis CAB-2
(GenBank Acc.-No.: X15222), así como el promotor zea mays
PPCZm1 (GenBank Acc.-No.: X63869). En especial se prefieren los
promotores descritos por SEQ ID NO: 30, 31 o 32. Las secuencias de
ácido nucleico presentes en casetes de expresión o vectores
recombinantes utilizados en los métodos de acuerdo con la invención
pueden enlazarse funcionalmente con otras secuencias genéticas en
adición al promotor. El término de las secuencias genéticas de
control debe entenderse de manera amplia y significa todas aquellas
secuencias que tienen una influencia sobre la producción o la
función del casete de expresión recombinante de acuerdo con la
invención. Las secuencias de control genéticas también comprenden
otros promotores, elementos de promotor o promotores mínimos, todos
los cuales pueden modificar las propiedades que regulan la
expresión. De esta manera, por ejemplo, la expresión específica de
tejido puede depender adicionalmente de ciertos factores de estrés
debido a las secuencias de control genéticas. Tales elementos se
han descrito, por ejemplo para estrés de agua, ácido abscícico (Lam
E & Chua NH (1991) J Biol Chem
266(26):17131-17135) y estrés de calor
(Schoffl F et al. (1989) Mol Gen Genet
217(2-3):246-53).
Las secuencias genéticas de control comprenden
también las regiones 5'-no trasladadas, intrones o
la región 3' no trasladada de genes como por ejemplo el intron
actin-1 o el intron Adh1-S 1, 2 y 6
(en general: The Maize Handbook, Chapter 116, Freeling and Walbot,
Eds., Springer, New York (1994)). Se ha mostrado que éstas pueden
desempeñar una función significativa en la regulación de la
expresión génica. Así se ha mostrado que las secuencias no
trasladas 5' pueden reforzar la expresión transitoria de genes
heterólogos. A manera de ejemplo, para reforzadores de traslación
se nombra la secuencia líder 5' del virus mosaico del tabaco (Gallie
et al. (1987) Nucl Acids Res 15:8693-8711) y
similares. Además, pueden promover aún más la especificidad de
tejido (Rouster J et al. (1998) Plant J
15:435-440).
15:435-440).
El casete de expresión recombinante puede
comprender ventajosamente una o más de lo que se conocen como
"secuencias promotoras" ("enhancer secuencies"),
enlazadas funcionalmente al promotor, lo cual hace posible una
expresión recombinante aumentada de la secuencia de ácido nucleico.
Secuencias ventajosas adicionales, tales como otros elementos
regulatorios o terminadores, también pueden insertarse en el extremo
3' de las secuencias de ácido nucleico a expresarse de manera
recombinante. Las secuencias de ácido nucleico a expresarse de
manera recombinante pueden estar contenidas en una o varias copias
en el constructo génico.
Las señales de poliadenilación que son adecuadas
como secuencias de control son señales de poliadenilación
vegetales, preferible aquellas que esencialmente corresponden a
señales de poliadenilación de T-ADN de
Agrobacterium tumefaciens, en especial del terminador OCS
(octopin-sintasa) y el terminador NOS
(nopalin-sintasa).
Como secuencias de control se deben entender
además aquellas que hacen posible una recombinación homóloga o
inserción en el genoma de un organismo huésped o que permiten la
remoción desde el genoma. En el caso de recombinación homóloga, el
promotor natural de un gen BI1 puede intercambiarse, por ejemplo,
por uno de los promotores específicos de tejido preferidos. Métodos
tales como la tecnología cre/lox permiten una remoción específica
de tejido, si es apropiado inducible, del casete recombinante de
expresión desde el genoma del organismo huésped (Sauer B (1998)
Methods. 14(4): 381-92). En este método se
pegan secuencias flanqueantes determinadas (secuencias lox) que más
tarde permiten la remoción por medio de
cre-recombinasa.
Un casete recombinante de expresión y los
vectores derivados del mismo comprenden otros elementos funcionales.
El término elemento funcional debe entenderse de manera amplia y se
refiere a todos aquellos elementos que tienen un efecto en la
generación, amplificación o función de los casetes de expresión
recombinantes, vectores u organismos recombinantes de acuerdo con
la invención. Los siguientes pueden mencionarse a manera de ejemplo,
pero sin limitarse:
a) marcadores de selección que confieren
resistencia a un inhibidor de metabolismo tal como
2-desoxiglucosa-6-fosfato
(WO 98/45456), antibióticos o biocidas, preferible herbicidas, como
por ejemplo kanamycina, G 418, bleomycina, higromycina, o
fosfinotricina, etc. Particularmente se prefieren marcadores de
selección aquellos que confieren una resistencia contra herbicidas.
A manera de ejemplo se mencionan: secuencias de ADN que codifican
para fosfinotricinacetiltransferasas (PAT) e inactivan inhibidores
de glutaminsintasa (gen bar y pat), genes de
5-enolpiruvilshikimat-3-fosfatsintasa
(EPSP genes de sintasa), que confieren una resistencia contra
Glifosato® (N-(fosfonometil)glicina), el gen gox que
codifica para enzimas que degradan Glifosato®
(glifosatoxidoreductasa), el gen deh (que codifican para una
dehalogenasa, que desactiva Dalapon®), acetolactatosintasas que
desactivan sulfonilurea e imidazolinona así como genes bxn que
codifican para nitrilasaenzimas que degradan bromoxinil, el gen
aasa que confiere una resistencia contra el antibiótica
apectinomycina, el gen de estreptomycinfosfotransferasa (SPT), que
imparte una resistencia frente a estreptomycina, el gen de
neomycinfosfotransferasa (NPTII) que confiere una resistencia
contra kanamycina o geneticidina, el gen de
higromycinfosfotransferasa (HPT), que facilita una resistencia
contra higromycina, el gen de acetolactatsintasa (ALS), que confiere
una resistencia contra herbicidas de sulfonilurea (por ejemplo,
variantes mutadas de ALS con, por ejemplo, la mutación de S4 y/o
Hra).
b) Genes reporteros que codifican fácilmente
proteóna cuantificables y, por medio de su color o de actividad
enzimática, hacen posible una valoración de la eficacia de
transformación, el sitio de expresión o el tiempo de expresión. En
este contexto muy especialmente preferidos son proteínas reporteras
(Schenborn E, Groskreutz D. Mol Biotechnol. 1999;
13(1):29-44) tal como "green fluorescence
protein" (GFP) (Sheen et al.(1995) Plant Journal
8(5):777-784; Haseloff et al.(1997)
Proc Natl Acad Sci USA 94(6):2122-2127;
Reichel et al.(1996) Proc Natl Acad Sci USA
93(12):5888-5893; Tian et al. (1997)
Plant Cell Rep 16:267-271; WO 97/41228; Chui WL
et al. (1996) Curr Biol 6:325-330; Leffel SM
et al. (1997) Biotechniques.
23(5):912-8), la cloramfenicoltransferasa,
una luciferasa (Ow et al. (1986) Science
234:856-859; Millar et al. (1992) Plant Mol
Biol Rep 10:324-414), el gen de aequorina (Prasher
et al. (1985) Biochem Biophis Res Commun
126(3):1259-1268), la
\beta-galactosidasa, gen R-locus
(codifican una proteína que regula la producción de pigmentos de
antocianina (coloración roja) en tejido vegetal y hace así posible
un análisis directo de la actividad promotora cin adición de otras
sustancias o sustratos cromogénicos; Dellaporta et al., en:
Chromosome Structure and Function: Impact of New Concepts, 18th
Stadler Genetics Symposium, 11:263-282, 1988), muy
particularmente se prefiere la \beta-glucuronidasa
(Jefferson et al., EMBO J. 1987, 6,
3901-3907).
c) orígenes de replicación que aseguran
amplificación de los casetes de expresión recombinantes o los
vectores de acuerdo con la invención en E. coli, por
ejemplo. A manera de ejemplo se mencionan ORI (origen de replicación
de ADN), el ori pBR322 o el ori P15A (Sambrook et al.:
Molecular Cloning. A Laboratory Manual, 2nd ed. Cold Spring Harbor
Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989).
d) Elementos que son requeridos para una
transformación de vegetal mediada por agrobacterium, tales como,
por ejemplo, la limitación derecha o izquierda del
T-ADN o la región vir.
Para la selección de células recombinadas o
también transformadas de manera homóloga con éxito, normalmente es
indispensable introducir adicionalmente un marcador seleccionable
que confiera resistencia frente a un biocida (por ejemplo, un
herbicida), un inhibidor de metabolismo tal como
2-sesoxiglucosa-6-fosfato
(WO 98/45456) o un antibiótico. El marcador de selección permite la
selección de las células transformadas de las no transformadas
(McCormick et al. (1986) Plant Cell Reports
5:81-84).
La introducción de un casete de expresión
recombinantes de acuerdo con la invención a un organismo o células,
tejidos, órganos, partes o semillas del mismo (preferiblemente a
plantas o células vegetales, tejidos, órganos, partes o semillas)
puede efectuarse de manera ventajosa usando vectores en los que
están contenidos los casetes de expresión recombinantes. El casete
de expresión recombinante puede introducirse en el vector (por
ejemplo, un plásmido) por intersecciones de restricción adecuadas.
El plásmido formado se introduce primero a E. coli. Las
E. coli correctamente transformadas se seleccionan, cultivan
y el plásmido recombinante se obtiene mediante métodos familiares a
la persona técnica en la materia. Los análisis de restricción y
secuenciación pueden servir para verificar el paso de
clonación.
clonación.
Los vectores pueden ser, por ejemplo, plásmidos,
cósmidos, fagos, virus o también agrobacterias. En una modalidad
ventajosa, la introducción del casete de expresión recombinante se
realiza por medio de vectores de plásmido. Se prefieren aquellos
vectores que hacen posible una integración estable del casete de
expresión recombinante al genoma huésped.
La preparación de un organismo transformado (o
de una célula o tejido transformados) requiere la introducción de
ADN, ARN o proteína en cuestión a la célula huésped relevante en
cuestión.
Para este proceso, el cual se denomina como
transformación (o transducción o transfección) se encuentran
disponibles cantidades de métodos (Keown et al. (1990)
Methods Enzymol 185:527-537; Jenes B et
al.(1993) Techniques for Gene Transfer, en: Transgenic Plants,
Vol. 1, Engineering and Utilization, publicado por SD Kung y R Wu,
Academic Press, pág. 128-143 sowie in Potrykus
(1991) Annu Rev Plant Phisiol Plant Molec Biol
42;205-225).
Así, el ADN o ARN, por ejemplo, pueden
introducirse directamente mediante microiyección o por bombardeo con
micropartículas recubiertas de ADN. También la célula puede
permeabilizarse químicamente usando, por ejemplo, polietilenglicol
de modo que el ADN pueda entrar a la célula por difusión. El ADN
también puede introducirse por fusión de protoplasto con otras
unidades que contienen ADN tales como minicélulas, células,
lisosomas o liposomas. Otro método adecuado de introducir ADN es
electroporación, donde las células se permeabilizan de manera
reversible por un pulso eléctrico. Se han descrito métodos
correspondientes (por ejemplo en Bilang et al. (1991) Gene
100:247-250; Scheid et al. (1991) Mol Gen
Genet 228:104-112; Guerche et al. (1987)
Plant Science 52:111-116; Neuhause et al.
(1987) Theor Appl Genet 75:30-36; Klein et
al. (1987) Nature 327:70-73; Howell et
al. (1980) Science 208:1265; Horsch et al.(1985) Science
227:1229-1231; DeBlock et al. (1989) Plant
Phisiol 91:694-701).
En el caso de las plantas, los métodos arriba
descritos de transformación y regeneración de plantas a partir de
tejidos vegetales o células vegetales se utilizan para la
transformación transitoria o estable. Métodos adecuados son
especialmente transformación de protoplasto por captación de ADN
inducida por polietilenglicol, el método biolístico con el cañón de
gen, el así llamado método de "particle bombardement"
(bombardeo de partículas), la electroporación, la incubación de
embriones secos en solución con contenido de ADN y la
microinyección.
Además de estas técnicas "directas" de
transformación, también puede realizarse una transformación
mediante infección bacteriana por medio de Agrobacterium
tumefaciens o Agrobacterium rhizogenes. La transformación
mediada por Agrobacterium es la más adecuada para dicotiledóneas.
Los métodos se describen, por ejemplo en Horsch RB et al.
(1985) Science 225: 1229 y sig.).
Si se usan agrobacterias el casete de expresión
recombinante debe integrarse a plásmidos específicos, ya sea en un
vector intermedio (en inglés: shuttle or intermediate vector) o un
vector binario. Si debe usarse un plásmido Ti o Ri para la
transformación, al menos el límite derecho, aunque en la mayoría de
casos el límite derecho e izquierdo, del T-ADN
plásmido Ti o Ri se enlaza con el casete de expresión recombinante
a introducirse en la forma de una región flanqueante.
Preferiblemente se usan vectores binarios. Los
vectores binarios son capaces de repliación tanto en E. colo como
en Agrobacterium. Normalmente comprenden un gen de marcador de
selección y un linker (enlazante) o polinker flanqueado por
secuencia de limitación derecha e izquierda de
T-ADN. Pueden transformarse directamente en
Agrobacterium (Holsters et al. (1978) Mol Gen Genet
163:181-187). El gen de marcador de selección
permite una selección de agrobacterias transformadas y es el gen
nptII, por ejemplo, que confiere una resistencia contra kanamycina.
La Agrobacteria que en este caso funge como organismo huésped ya
debe contener un plásmido con la región vir. Esta última se
requiere para transferir el T-ADN a la célula
vegetal. Una agrobacteria transformada de esta manera puede usarse
para transformar células vegetales. El uso de T-ADN
para transformar células vegetales se ha estudiad y descrito
intensamente (EP 120 516; Hoekema, In: The Binary Plant Vector
System, Offsetdrukkerij Kanters B.V., Alblasserdam, Chapter V; An
et al. (1985) EMBO J 4:277-287). Se conocen
diversos vectores binarios y se encuentran disponibles
comercialmente, de manera parcial, como por ejemplo pBI101.2 o
pBIN19 (Bevan et al. (1984) Nucl Acids Res 12:8711f; Clontech
Laboratories, Inc. USA). Otros promotores adecuados para la
expresión en vegetales se han descrito (Rogers et al. (1987)
Methods Enzymol 153:253-277; Schardl et al.
(1987) Gene 61:1-11; Berger et al. (1989)
Proc Natl Acad Sci USA 86:8402-8406).
Por principio, las técnicas directas de
transformación son adecuadas para cada organismo y tipo de célula.
En el caso de inyección o electroporación de ADN o ARN en células
vegetales no se requiere que los plásmidos usados cumplan algún
requisito en particular. Pueden usarse plásmidos sencillos como
aquellos de la serie pUC. Si deben regenerarse plantas completas de
las células transformadas, es necesario que en el plásmido se
localice un gen adicional de marcador seleccionable.
Pueden seleccionarse células transformadas
establemente, es decir, aquellas que contienen ADN introducido,
integrado al ADN de la célula huésped, de células no transformadas
cuando un marcador seleccionable es componente del ADN introducido.
Como marcador puede fungir, por ejemplo, cada gen que es capaz de
conferir una resistencia frente a antibióticos o herbicidas (como
kanamycina, G 418, bleomycina, higromycina o fosfinotricina, etc.)
(véase arriba). Las células transformadas que expresan un gen de
marcador así son capaces de sobrevivir en la presencia de
concentraciones de un antibiótico o herbicida correspondiente que
puede matar un tipo silvestre no transformado. Ejemplos de
marcadores de selección adecuados se mencionan arriba. Una vez que
una célula vegetal transformada se ha generado, puede obtenerse una
planta completa usando métodos conocidos por la persona técnica en
la materia. Por ejemplo, como material de partida se usan cultivos
de callo. La formación de vástagos y raíces puede inducirse de
manera conocida a partir de estas masas celulares aún sin
diferenciar. Las plántulas obtenidas pueden plantarse y
cultivarse. La persona técnica conoce métodos de regeneración de
partes de plantas y de plantas intactas a partir de células
vegetales. Los métodos para hacer esto se describen, por ejemplo,
por Fennell et al. (1992) Plant Cell Rep. 11:
567-570; Stoeger et al (1995) Plant Cell Rep.
14:273-278; Jahne et al. (1994) Theor Appl
Genet 89:525-533. Las plantas obtenidas pueden
cultivarse e hibridarse (cruzarse) en la forma acostumbrada. Dos o
más generaciones deben cultivarse para asegurar que la integración
genómica es estable y hereditaria.
El método de acuerdo con la invención puede
combinarse con otros métodos que producen resistencia ante patógenos
(por ejemplo, frente a insectos, hongos, bacterias, nematodos y
similares), resistencia frente a estrés u otro mejoramiento de las
propiedades de la planta. Se mencionan ejemplo, entre otros, por
Dunwell JM (2000) J Exp Bot. 51 Spec No:487-96. Se
divulgan secuencias de polipéptidos que codifican para proteína BI1
que comprenden al menos una secuencia seleccionada del grupo que se
compone de
a) las secuencias según SEQ ID NO: 12, 14, 16,
18, 20, 22, 24, 28, 30, 32 o 38,
b) secuencias que tienen una homología de al
menos 90%, preferible de al menos 95%, particularmente preferible
de al menos 98% con una de las secuencias según SEQ ID NO: 12, 14,
16, 18, 20, 22, 24, 28, 30, 32 o 38, y
c) secuencias que abarcan al menos 10,
preferible al menos 20, particularmente preferible al menos 30
aminoácidos relacionados de una de las secuencias según SEQ ID NO:
12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 28, 30, 32 o 38.
En la invención se usan preferiblemente
secuencias de ácido nucleico que codifican para las nuevas
secuencias de polipéptido de acuerdo con la invención las cuales
codifican para proteína BI1. Se prefieren las secuencias de ácido
nucleico según SEQ ID NO: 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31
o 37, la secuencia de ácido nucleico complementaria a éstas y las
secuencias derivadas de allí como resultado de la degeneración del
código genético.
Para este propósito sirven casetes de expresión
recombinantes que comprenden una de las secuencias de ácido
nucleico de acuerdo con la invención. En los casetes de expresión
recombinante, la secuencia de ácido nucleico que codifica para la
proteína BI1 de cebada está enlazada con al menos un elemento de
control genético según la definición de arriba de tal modo que
pueda realizarse la expresión (transcripción y opcionalmente
translación) en cualquier organismo, preferible en vegetales. Los
elementos de control genéticos adecuados para este propósito se han
descrito arriba. Los casetes de expresión recombinantes también
pueden contener otros elementos funcionales según la definición de
arriba. La secuencia insertada de ácido nucleico que codifica para
una proteína BI1 de cebada puede insertarse en el casete de
expresión en orientación sense o antisense, y así conducir a la
expresión de ARN sense o antisense. De acuerdo con la invención
también se usan vectores recombinantes que contienen los casetes de
expresión recombinantes.
Con respecto a, por ejemplo, una secuencia de
ácido nucleico, de un casete de expresión o de un vector que
contienen dicha secuencia de ácido nucleico o a un organismo
transformado con dicha secuencia de ácido nucleico, casete de
expresión o vector, "recombinante" significa todas aquellas
construcciones producidas mediante métodos de ingeniería genética
en las que, o bien
a) la secuencia de ácido nucleico BI1, o
b) una secuencia de control genética enlazada de
manera funcional con la secuencia de ácido nucleico BI1, por
ejemplo un promotor, o
c) (a) y (b)
no se ubican en su ambiente natural genético o
han sido modificados mediante métodos de ingeniería genética, donde
la modificación puede ser, por ejemplo, una sustitución, adición,
deleción, inversión o inserción de uno o más residuos de
nucleótidos. Un ambiente natural genético significa el locus
cromosomático natural en el organismo de origen o la presencia en
una biblioteca genómica. En el caso de una biblioteca genómica, se
conserva preferiblemente, al menos aún en parte el ambiente natural
genético de la secuencia de ácido nucleico. El ambiente flanquea la
secuencia de ácido nucleico al menos a un lado y tiene una secuencia
de al menos 50 bp, preferible de al menos 500 bp, particularmente
preferible de al menos 1000 bp, muy particularmente preferible de
al menos 5000 bp, en longitud. Un casete de expresión recombinante
que tienen lugar naturalmente, por ejemplo la combinación que
tienen lugar de manera natural del promotor BI1 con el gen
correspondiente BI1, se vuelve un casete de expresión recombiante
cuando éste se modifica mediante métodos no naturales, sintéticos
("artificiales") tales como, por ejemplo, una
mutagenización.
Se han descrito métodos correspondientes (US
5,565,350; WO 00/15815; véase arriba también).
En una modalidad la invención se refiere al uso
de una molécula de ácido nucleico BI-1 codificante o
de una proteína BI-1 para la preparación de una
planta resistente ante patógenos, preferiblemente para la
preparación de una planta resistente ante hongos o para la
preparación de un fungicida que provoca esto o para controlar o
tratar plantas que son atacadas por patógenos, o amenazadas por el
ataque de patógenos.
1. SEQ ID NO: 1: Secuencia de ácido nucleico que
codifica para una proteína BI1 de cebada (Hordeum
vulgare).
2. SEQ ID NO: 2: Secuencia de aminoácido que
codifica para una proteína BI1 de cebada (Hordeum
vulgare).
3. SEQ ID NO: 3: Secuencia de ácido nucleico que
codifica para una proteína BI1 de Arabidopsis thaliana.
4. SEQ ID NO: 4: Secuencia de aminoácido que
codifica para una proteína BI1 de Arabidopsis thaliana.
5. SEQ ID NO: 5; Secuencia de ácido nucleico que
codifica para una proteína BI1 de tabaco.
6. SEQ ID NO: 6: Secuencia de aminoácido que
codifica para una proteína BI1 de tabaco.
7. SEQ ID NO: 7: Secuencia de ácido nucleico que
codifica para una proteína BI1 de arroz.
8. SEQ ID NO: 8: Secuencia de aminoácido
kodierende für una proteína BI1 de arroz.
9. SEQ ID NO: 9: Secuencia de ácido nucleico que
codifica para una proteína BI1 de colza.
10. SEQ ID NO: 10: Secuencia de aminoácido que
codifica para una proteína BI1 de colza.
11. SEQ ID NO: 11: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para parte de una proteína BI1de soja.
12. SEQ ID NO: 12: Secuencia de aminoácido que
codifica para parte de una proteína BI1 de soja.
13. SEQ ID NO: 13: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para parte de una proteína BI1 de soja.
14. SEQ ID NO: 14: Secuencia de aminoácido que
codifica para parte de una proteína BI1 de soja.
15. SEQ ID NO: 15: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para parte de una proteína BI1 de trigo.
16. SEQ ID NO: 16: Secuencia de aminoácido que
codifica para parte de una proteína BI1 de trigo.
17. SEQ ID NO: 17: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para parte de una proteína BI1 de maíz.
18. SEQ ID NO: 18: Secuencia de aminoácido que
codifica para parte de una proteína BI1 de maíz.
19. SEQ ID NO: 19: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para parte de una proteína BI1 de trigo.
20. SEQ ID NO: 20: Secuencia de aminoácido que
codifica para parte de una proteína BI1 de trigo.
21. SEQ ID NO: 21: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para parte de una proteína BI1 de maíz.
22. SEQ ID NO: 22: Secuencia de aminoácido que
codifica para parte de una proteína BI1 de maíz.
23. SEQ ID NO: 23: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para parte de una proteína BI1 de maíz.
24. SEQ ID NO: 24: Secuencia de aminoácido que
codifica para parte de una proteína BI1 de maíz.
25. SEQ ID No: 25: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para parte de una proteína BI1 de trigo.
26. SEQ ID NO: 26: Secuencia de aminoácido que
codifica para parte de una proteína BI1 de trigo.
27. SEQ ID NO: 27: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para parte de una proteína BI1 de maíz.
28. SEQ ID NO: 28: Secuencia de aminoácido que
codifica para parte de una proteína BI1 de maíz.
29. SEQ ID NO: 29: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para el promotor patatina de patata.
30. SEQ ID NO: 30: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para el promotor 9f-3.8 de germen de
trigo.
31. SEQ ID NO: 31: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para el promotor de arabidopsis
CAB-2.
32. SEQ ID NO: 32: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para el promotor PPCZm1 de maíz
33. SEQ ID NO: 33: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para vector recombinante de expresión
pUbiBI-1
34. SEQ ID NO: 34: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para vector recombinante de expresión
pLo114UbiBI-1
pLo114UbiBI-1
35. SEQ ID NO: 35: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para vector recombinante de expresión
pOXoBI-1
36. SEQ ID NO: 36: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para vector recombinante de expresión
pLo114OXoBI-1
pLo114OXoBI-1
37. SEQ ID NO: 37: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para proteína BI-1 de trigo
38. SEQ ID NO: 38: Secuencia de aminoácido que
codifica para proteína BI-1 de trigo
39. SEQ ID NO: 39: secuencia de ácido nucleico
que codifica para PEN1 (= ROR2) de cebada
40. SEQ ID NO: 40: Secuencia de aminoácido que
codifica para PEN1 (= ROR2) de cebada
41. SEQ ID NO: 41: secuencia de ácido nucleico
para PEN1 (= ROR2) de arabidopsis thaliana
42. SEQ ID NO: 42: Secuencia de aminoácido que
codifica para PEN1 (= ROR2) de arabidopsis thaliana
43. SEQ ID NO: 43: Secuencia de ácido nucleico
que codifica para SNAP34 de cebada
44. SEQ ID NO: 44: Secuencia de aminoácido que
codifica para SNAP34 de cebada
\vskip1.000000\baselineskip
1. Fig. 1a-d: Comparación de
secuencia de proteínas de diversas proteínas BI-1 de
plantas. AtBI-1: Arabidopsis;
BnBI-1: Brassica napus (colza); GmBI2:
Glycine max (soja; Variante 1); GmBI3: Glycine max
(soja; Variante 2); HVBI-1: Hordeum vulgare
(cebada); NtBI-1: Nicotiana tabacum (tabaco);
OsBI-1: Oryza sativa (arroz); TaBI11:
Triticum aestivum (trigo, Variante 1); TaBI18: Triticum
aestivum (trigo, Variante 2); TaBI5 neu: Triticum
aestivum (trigo, Variante 3); ZmBI14: Zea mays (maíz;
Variante 1); ZmBI16: Zea mays (maíz; Variante 2); ZmBI33:
Zea mays (maíz; Variante 3); ZmBI8: Zea mays (maíz;
Variante 4); Consenso: secuencia de consenso derivada de la
alineación (alignment).
2. Fig. 2: mapa vector para el vector
pUbiBI-1 (Ubi: Promotor ubiquitina;
BI-1 Secuencia de ácido nucleico que codifica para
proteína BI1 de cebada; ter: terminador de transcripción). También
se indica la localización de las intersecciones de diversas enzimas
de restricción.
3. Fig. 3: mapa vector para el vector
pLO114UbiBI-1 (Ubi: Promotor ubiquitina; secuencia
de ácido nucleico BI-1 que codifica para proteína
BI1 de cebada; ter: terminador de transcripción). También se indica
la localización de las intersecciones de diversas enzimas de
restricción.
4. Fig. 4: Mapa vector para el vector
pOxoBI-1 (Oxo: Promotor de TaGermin
9f-2.8; Secuencia de ácido nucleico
BI-1 que codifica para proteína BI1 cebada; ter:
Terminador de transcripción). También se indica la localización de
las intersecciones de diversas enzimas de restricción.
5. Fig. 5: Mapa vector para el vector
pLO114OxoBI-1 (Oxo: Promotor TaGermin
9f-2.8; Secuencia de ácido nucleico
BI-1 que codifica para proteína BI1 de cebada; ter:
terminador de transcripción). También se indica la localización de
las intersecciones de diversas enzimas de restricción.
6. Fig. 6: Comparación de las secuencias de
proteína de proteínas BI-1 de cebada (Hordeum
vulgare, GenBank Acc.-No.: CAC37797), arroz (Oryza
sativa, GenBank Acc.-No.: Q9MBD8), arabidopsis thaliana
(GenBank Acc.-No.: Q9LD45) y ser humano (Homo sapiens,
GenBank Acc.-No.: AAB87479). Los aminoácidos puestos en negro son
idénticos en todas las especies. Las barras indican los siete
dominios de transmembranas predichos en HvBI-1.
7. Fig. 7: expresión BI-1 en
líneas de cebada resistentes y susceptibles (análisis de cADN
Gelblot): cADNs se sintetizaron por medio de RT-PCR
a partir de ARN total. ARN total se obtuvo a partir de línea de
cebada susceptible Pallas, línea de cebada resistente BCPMla12 y
línea resistente de cebada BCPmlo5 en el tiempo 0 (es decir,
inmediatamente antes de la inoculación), y respectivamente 1, 4 y 7
días después de la inoculación con Bgh y en paralelo con esto a
partir de plantas de control sin infectar (\diameter). El
RT-PCR para BI-1 se llevó a cabo
usando 20 ciclos (véase abajo). La cantidad de ARN empleada (0.5
\mug) se controló adicionalmente en geles por medio de tinturado
de rARN con bromuro de etidio. La repetición del experimento arrojó
resultados comparables.
8. Fig. 8: BI-1 se expresa en el
tejido de mesófilo (análisis de cADN gelblot).
RT-PCR se llevó a cabo a partir de ARN aislado de
Pallas (P) y BCPM1a12 (P10) (24 h después de inocular con BghA6).
Para la extracción del ARN total se separaron bandas epidérmicas
abaxiales (E, inokulierte Positionen der Blätter) del mesófilo y de
la epidermis adaxial (M). Se usó ubiquitina 1 (Ubi) como marcador
para expresión de gen no específico para tejido.
RT-PCR se realizó usando 30 ciclos.
9. Fig. 9: Expresión BI-1 se
reprime durante inducción de resistencia química.
- (A)
- resistencia inducida químicamente en la línea de cebada Pallas gg. Blumeria graminis (DC) Speer f.sp. hordei (Bgh). Las hojas primarias de cebada se trataron con ácido 2,6-dicloroisonicotínico (DCINA) y mostraron menos pústulas de mildiú que las plantas de control correspondientes no tratadas.
- (B)
- ARN y cADN Blots. ARN (10 \mug) se analizó 0, 1, 2 y 3 días después del tratamiento del suelo (soil drench treatment; dpt) con DCINA o con el control (sustancia portadora) y adicionalmente 1 y 4 días después de la inoculación (dpi, corresponde a 4 ó 7 dpt). RT-PCR (Ubi, BI-1) se realizó usando 20 ciclos. La repetición condujo a resultados comparables (véase ejemplo 2). Como control se empleó BCI-4. BCI-4 es un gen inducido por DCINA (Besser et al. (2000) Mol Plant Pahol. 1 (5): 277-286) y un miembro de la familia de genes inducidos químicamente (Barley Chemically (=BTH) Induced).
10. Fig. 10: sobreexpresión de
supersusceptibilidad inducida BI-1.
- (A)
- Eficiencia promedio de penetración de Bgh en 6 experimentos independientes con Bgh sobre línea de cebad Ingrid. PE de Bgh se incrementó de manera significativa (p<0.01, prueba de Students) en las células que fueron transformadas (bombardeadas) con pBI-1 en comparación con células que fueron bombardeadas con el vector vacío de control (pGY1).
- (B)
- La eficiencia de penetración de Bgh sobre células fueron bombardeadas con un constructo antisense BI-1 (pasBI-1), fue reducido de una manera insignificante (p>0.05) en comparación con las células que fueron bombardeadas con el vector vacío de control (pGY1). Las columnas reflejan en cada caso el valor medio de los experimentos individuales. Las barras representan el error estándar.
11. Fig. 11: Sobreexpresión de ruptura inducida
BI-1 de la resistencia de penetración mediada por
mlo5.
\newpage
La eficiencia de penetración de Bgh se valoró en
3 a 4 experimentos independientes usando Bgh en las líneas de
cebada Ingrid-mlo5 o bien
Pallas-mlo5. La PE causada por Bgh se incrementó de
manera significativa (p<0.05) en las células que se habían
transformado (bombardeado) con pBI-1 en comparación
con las células que habían sido bombardeado con el vector vacío de
control (pGY1). Las columnas reflejan en cada caso el valor medio
de tres experimentos independientes. Las barras representan el error
estándar.
12. Fig. 12: La expresión de
BI-1 se induce por filtrados de cultivo tóxicos a
partir de Bipolaris sorokiniana.
Northern-Blots (10 \mug de ARN total) con ARN de
Ingrid (I) y BCIngrid-mlo5 (I22). ARN se aisló 0,
24, 48 y 72 h después de la inyección del filtrado de cultivo
tóxico de Bipolaris sorokiniana (T) o agua (W). mARNs
BI-1 se detectó en membranas de nylon después de
lavado estricto. BI-1: Detección de inhibidor BAX 1
mARN; Ubi: Detección de ubiquitina 1; Asprot: Detección de la
aspartatproteasa mARN; hat: horas después de tratamiento ("h
after treatment")
13. Fig. 13: sobreexpresión BI-1
rompe resistencia que no es de huésped de cebada (cv. Manchuria)
frente a Blumeria graminis f.sp. tritici. Velocidades de
penetración fueron analizadas en tres experimentos
independientes.
\vskip1.000000\baselineskip
La síntesis química de oligonucleótidos puede
efectuarse, por ejemplo, de la manera conocida usando el método de
fosfoamidita (Voet, Voet, 2. edición, Wiley Press New York, páginas
896-897). Los pasos de clonación realizados para
los propósitos de la presente invención tales como, por ejemplo,
escisiones de restricción, electroforesis de gel agarosa,
purificación de fragmentos de ADN, transferencia de ácidos nucleicos
a membranas de nitrocelulosa y nylon, enlazamiento de fragmentos de
ADN, transformación de células de E. coli, cultivo de
bacterias, multiplicación de fagos y análisis secuencias de ADN
recombinante, se realizan tal como se describe en Sambrook et
al. (1989) Cold Spring Harbor Laboratory Press; ISBN
0-87969-309-6. La
secuenciación de moléculas de ADN recombinante se realiza con un
secuenciador de ADN de fluorescencia por láser de la empresa
MWG-Licor según el método de Sanger (Sanger et
al. (1977) Proc Natl Acad Sci USA 74:
5463-5467).
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
1
Las variedades de cebada Ingrid, Pallas y la
línea retro-cruzada BCPMla12, BCPmlo5 y
BCIngrid-m lo5 (I22) fueron puestas a disposición
por Lisa Munk, Department of Plant Pathology, Royal Veterinary and
Agricultural University, Kopenhagen, Dinamarca. Su preparación se
ha descrito (Kølster P et al. (1986) Crop Sci 26:
903-907).
A menos que se describa otra cosa, la semilla
que había sido pre-germinada sobre papel filtro
húmedo durante 12 a 36 h en la oscuridad se sembró a lo largo del
borde una maceta cuadrangular (8x8 cm) de a 5 granos en tierra
Fruhstorfer del tipo P, se cubrió con tierra y se regó regularmente
con agua corriente de acueducto. Todas las plantas se cultivaron en
cabinas o cámaras de ambiente controlado (climatizadas) por 5 a 8
días a 18ºC, 60% de humedad relativa de aire y un ciclo de luz de
16 horas y de oscuridad de 8 horas con 3000 ó 5000 lux (50 ó 60
\mumols^{-1}m^{-2} densidad de flujo de fotones) 5 a 8 días y
se usaron en los experimentos en la etapa de plántulas. En
experimentos en los que las aplicaciones se realizaron a las hojas
primarias, éstas últimas se habían desarrollado plenamente.
Antes de los experimentos de transfección
transitoria, las plantas se cultivaron en cabinetes o cámaras
climatizados a una temperatura durante del día de 24ºC, de noche
20ºC, 50 a 60% de humedad relativa del aire y un ciclo de luz de 16
horas de oscuridad de 16 horas con 30000 lux.
Para la inoculación de las plantas de cebada se
usó mildiú auténtico de cebada Blumeria graminis (DC)
Speer f.sp. hordei Em. Marchal de la raza A6 (Wiberg A
(1974) Hereditas 77: 89-148) (BghA6). Este fue
suministrado por el Instituto para Biometría, JLU Gießen. El
post-cultivo del inóculo se llevó a cabo en cámaras
climatizadas en las mismas condiciones que se describieron arriba
para las plantas, transfiriendo los conidios de material vegetal
infectado a plantas de cebada cv. Golden Promise, de 7 días de edad,
cultivadas regularmente, a una densidad de 100
ronidios/mm^{2}.
La inoculación se llevó a cabo sobre hojas
primarias de plantas de cebada con las siguientes densidades de
conidios: 5 conidios/mm^{2} en el caso de inducción química de
resistencia y valoración macroscópica del éxito de inducción, 50
conidios/mm^{2} en el caso de estudios de expresión de gene y 150
conidios/mm^{2} en el caso de verificación de la transformación
de gene con segmentos de hoja transformados. La inoculación con
BghA6 se efectuó usando embriones de 7 días de edad agitando los
conidios de plantas ya infectadas en una columna de inoculación
(siempre que no se indique algo diferente).
\newpage
Ejemplo
2
Se aplicó ácido
2,6-diclorisonicotínico (DCINA, Syngenta AG, Basel,
Suiza; como fórmula al 25% (w/w)) sobre brotes de cebada de 4 días
de edad de la vairedad Pallas por medio de riego del suelo ("soil
drench") en una concentración final de 8 mg/l de volumen de
suelo. La suspensión usada se aplicó con agua de acueducto.Como
control sirvió un riego de suelo con el material portador (polvo que
puede mojarse "wettable powder"). Después de tres días las
plantas se infectaron con Blumeria graminis (DC) Speer f.sp.
hordei Em. Marchal de la raza A6 (5 conidios/mm^{2}). Las
plantas con resistencia inducida químicamente (CIR) tucieron cerca
de 70% menos de colonias de mildiú sobre las plantas de control
correspondientes, que solo se trataron con la sustancia portadora
(Fig. 9A).
Northern Blot y RT-PCT Blots se
efectuaron para determinar las cantidades de transcripto de BI1;
estos revelaron una reducción sorprendente de la expresión de BI1 1
a 3 días después del tratamiento químico (Fig. 9B).
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
3
Se extrajo ARN total de 8 a 10 segmentos de
hojas primarias (longitud 5 cm) por medio de "RNA Extraction
Buffer" (búfer de extracción de ARN) (AGS, Heidelberg,
Alemania). Para este propósito se recogieron los segmentos
centrales de las hojas primarias de 5 cm de longitud y se
homogenizaron en morteros en nitrógeno líquido. El homogenizado se
almacenó a -70ºC hasta que se extrajo el ARN. El ARN total se
extrajo del material de la hoja, congelado a profundidad, con la
ayuda de un kit de extracción de ARN (AGS, Heidelberg). Para este
efecto, 200 mg del material de hoja profundamente congelado se
cubrió con 1,7 ml de búfer de extracción de ARN (AGS) en un tubo de
microcentrífuga (2 ml) e inmediatamente se mezcló bien. Después de
la adición de 200 \muL de cloroformo, la mezcla se volvió a
mezclar bien y se sacudió por 45 minutos en un agitador horizontal a
200 rpm a temperatura ambiente. Para separar las fases, a
continuación se centrifugaron los tubos por 15 minutos a 20 000 g y
4ºC, la fase superior acuosa se transfirió a un tubo nuevo de
microcentrífuga mientras que la fase del fondo fue descartada. La
fase acuosa se purificó con 900 \muL de cloroformo homogenizando
por 10 segundos y re-centrifugando (véase arriba) y
retirando la fase acuosa (3 veces). Luego, se adicionaron 850
\muL de 2-propanol y la mezcla se homogenizó y se
puso en hielo por 30 a 60 minutos para precipitar el ARN. Después,
la mezcla se centrifugó por 20 minutos (véase arriba), el
sobrenadante se decantó con cuidado, se adicionaron mediante pipeta
2 mL de etanol al 70% (-20ºC), se mezclo la mezcla y se
re-centrifugó por 10 minutos. Luego, se volvió a
decantar el sobrenadante y el pelet se liberó cuidadosamente del
fluido residual, usando una pipeta y luego se secó en una corriente
de aire limpio antes de colocarse en un sitio de trabajo con aire
limpio. Luego se disolvió el ARN en 50 \muL de DEPC - agua en
hielo, se mezcló y se centrifugó por 5 minutos (véase arriba). 40
\muL del sobrenadante, en calidad de solución de ARN, se
transfirieron a un tubo nuevo de microcentrífuga y se almacenaron a
-70ºC.
La concentración del ARN se determinó
fotométricamente. Para este propósito se diluyó la solución de ARN
1:99 (v/v) con agua destilada y la extinción se midió a a 260 nm
(fotómetro DU 7400, Beckman) (E_{260} nm = 1 a 40 \mug de
ARN/mL). Las concentraciones de las soluciones de ARN se ajustaron a
continuación a 1 \inftyg/\inftyL con DEPC-agua
para hacer coincidir los contenidos calculados de ARN y se
verificaron en un gel de agarosa.
Para verificar las concentraciones de ARN en un
gel de agarosa horizontal (1% de agarosa en búfer 1 x MOPS con 0,2
\mug/mL de bromuro de etidio) se trató 1 \muL de solución de ARN
con 1 \muL de 10 x MOPS, 1 \muL de marcador de color y 7
\muL de DEPC-agua, se separó de acuerdo con su
tamaño a una tensión (voltaje) de 120 V en el gel en búfer
corriente 1 x MOPS por 1,5 h y se fotografió bajo luz UV.
Diferencias eventuales en la concentración de los extractos de ARN
se ajustaron con DEPC-agua y se verificó de nuevo el
ajuste en el gel.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
4
El clon de longitud completa de hvBI1 (GenBank
Acc.-No.: AJ290421) comprende en el extremo 3' dos
stop-codones y un codón de inicio potencial en el
extremo 5'. El ORF se extiende 247 aminoácidos y muestra el más alto
grado de homología de secuencia con un gen BI1 del arroz, maíz,
Brassica napus y Arabidopsis thaliana (respectivamente
86% de identidad a nivel de nucleótidos) y un homólogo humano BI1
(53% de similitud) (Fig. 1 y 6). La secuencia de aminoácido de
hvBI1 comprende siete dominios potenciales de transmembrana con una
orientación del término C en citosol.
\newpage
Se prepararon los siguientes constructos:
a) Amplificación de un fragmento 478 bp del ADN
BI1 de cebada BI1 cADN (GenBank Acc.-No.: AJ290421)
- BI1-sense
- 5'-atggacgccttctactcgacctcg-3'
- BI1-antisense
- 5'- gccagagcaggatcgacgcc-3'
\vskip1.000000\baselineskip
b) Amplificación de un fragmento de cADN 513 bp
Ubi (GenBank Acc.-No.: M60175)
- UBI-sense
- 5'-ccaagatgcagatcttcgtga-3'
- UBI-antisense
- 5'-ttcgcgataggtaaaagagca-3'
\vskip1.000000\baselineskip
c) Amplificación de un marco de lectura BI1 de
longitud completa 871 bp
- BI1VL sense
- 5'-ggattcaacgcgagcgcaggacaagc-3'
- BI1VL antisense
- 5'-gtcgacgcggtgacggtatctacatg-3'
\vskip1.000000\baselineskip
Los fragmentos obtenidos se ligaron al vector
pGEM-T por medio de una ligadura
T-excedente y sirvieron como plásmidos de partida
para la generación de sondas (por ejemplo para
Northern-Blot) o bien dsRNA.
Los constructos individuales llevaban la
denominación pGEMT-BI1,
pGEMT-BI1VL(240) y
pGEMT-UBI.
El producto de longitud completa BI1 se
re-clonó a partir de pGEMT en la intersección SalI
del vector pGY-1 (Schweizer, P., Pokorny, J.,
Abderhalden, O. & Dudler, R. (1999) Mol.
Plant-Microbe Interact. 12, 647-654)
usando la intersección SalI en pGEMT y por medio de la intersección
que había sido anexado al primer antisense BI1VL. Los vectores con
orientación sense (pBI-1) y antisense
(pasBI-1) se aislaron y se resecuenciaron. Los
vectores contienen la secuencia BI-1 bajo control
del promotor CaMV 35S.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
5
Para detectar pequeñas cantidades de
transcripto, se efectuó un RT-PCR semicuantitativo
usando el "OneStep RT-PCR Kit" (Qiagen,
Hilden, Germany). En tal caso, primero se trasladó el ARN (véase
arriba el aislamiento) a cADN (transcripción reversa) y el cADN
buscado se amplificó en una reacción PCR a continuación usando
primers específicos. Para estimar la cantidad inicial de ARN
matricial se interrumpió la amplificación durante la fase
exponencial (después de 20 ciclos) para reflejar las diferencia en
el ARN de destino. Los productos de PCR se separaron por medio de
un gel agarosa, denaturalizada, borronearon (blotted) en membranas
de nylon y detectaron con sondas específicas marcadas no
radioactivamente en condiciones estándar estrictas. La hibridación,
los pasos de lavado y la inmunodetección se efectuaron tal como se
describe bajo el "Northern Blot". Para las reacciones
individuales (tanda de 25 \muL) se combinaron los siguientes
componentes usando el kit de RT-PCR de un paso
"one Step RT-P CR Kit" (Qiagen, Hilden,
Alemania):
- 1000 ng de ARN total de una muestra determinada
- 0,4 mM dNTPs,
\vskip1.000000\baselineskip
En cada caso 0,6 \muM de cada primer sense y
antisense
- 0,10 \mul de inhibidor RNasa
- 1 \muL de mezcla de enzima en buffer 1x RT
\vskip1.000000\baselineskip
La cADN-sintasa (Transcripción
reversa) se efectuó por 30 min a 50ºC. A continuación se inactivó la
transcriptasa reversa por 15 min a 95ºC, lo cual simultáneamente
causa la activación de polimerasa de ADN y desnaturalización de
cADN. A continuación se llevó a cabo una PCR con el siguiente
programa: 1 min con 94ºC; 25 ciclos de 1 min a 94ºC; 1 min a 54ºC y
1 min a 72ºC; para terminar 10 min a 72ºC. Luego, almacenamiento a
4ºC hasta seguir el procesamiento. Los productos de PCR se
separaron en un gel de agarosa 1xTBE con bromuro de etidio. Para
las amplificaciones en las tandas individuales se usaron los pares
de primers indicados arriba.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
6
Para la preparación del
Northern-Blotting se separó ARN en gel de agarosa en
condiciones desnaturalizantes. Para este efecto, parte de la
solución de ARN (correspondiente a 10 \mug de ARN) fue mezclado
con un volumen idéntico del búfer de muestra (con bromuro de
etidio), desnaturalizado por 5 minutos a 94ºC, colocado en hielo
por 5 minutos, centrifugado brevemente y aplicado al gel. El gel de
1 x MOPS (1,5% de agarosa, ultra pura) contenía 5 por ciento en
volumen de solución concentrada de formaldehído (36,5% [v/v]). El
ARN se separó por 2 horas a 100 V durante 2 h y a continuación se
borroneó (blottet).
El Northern-Blotting se efectuó
en corriente capilar como una transferencia de ARN dirigida hacia
arriba. Para esto, primero se agitó el gel suavemente por 30 min en
búfer de fosfato hidrosódico/dihidro fosfato de 25 mM (pH 6,5) y se
cortó al tamaño. Se preparó un papel Whatman se tal manera que se
colocó en una placa horixontal y se extendió en 2 lados en una cuba
con búfer de fosfato hidrosódico/dihidro fosfato de 25 mM. Sobre
este papel se puso el gel y las partes del papel Whatman no
cubiertas se cubrieron con una película plástica. Entonces, se
cubrió el gel con una membrana de nylon cargada positivamente
(Boehringer-Mannheim) libre de burbujas de aire,
después de lo cual la membrana se volvió a cubrir con una pila de
papel absorbente hasta una altura de 5 cm. Además, se puso un peso
de 100 g y una placa de vidrio sobre el papel absorbente. El
blotting se efectuó por una noche a temperatura ambiente. La
membrana se enjuagó brevemente en agua bi-destilada
y se irradió con luz UV en un aparato Crosslinker (Biorad) con una
energía de luz de 125 mJ para inmovilizar el ARN. Ña uniformidad de
la transferencia de ARN a la membrana se verificó en un banco de luz
UV.
Para la detección de mARn de cebada se separaron
10 mg de ARN total de cada muestra en un gel de agarosa y se
blotearon sobre una membrana de nylon cargada positivamente mediante
transferencia capilar. La detección se efectuó usando el sistema
DIG de acuerdo con las especificaciones de manufactura con sondas de
ARN antisense marcadas de digoxigenina (tal como se describe en
Hückelhoven R et al. (2001) Plant Mol Biol
47:739-748).
Preparación de las sondas: para la hibridación
con los mARNs a detectarse se prepararon sondas de ARN marcadas con
digoxigenina o fluoresceína. Estas se generaron mediante
transcripción in vitro de un producto PCR por medio de una
polimerasa de ADN T7 o SP6 con UTPs marcados. Como modelo para la
amplificación apoyada en PCR sirvieron los vectores de plásmido
arriba descritos pGEMT-BI1,
pGEMT-UBI. Según la orientación del inserto, se
usaron diferentes polimerasas de ARN para la preparación de la
cadena antisense. Se usó polimerasa ARN T7 para
pGEMT-BI1, mientras que la polimerasa ARN SP6 se usó
para pGEMT-UBI. El inserto del vector individual se
amplificó por PCR con primers estándar flanqueantes (M13 fwd y rev).
La reacción transcurrió en tal caso con las concentraciones finales
siguientes en un volumen total de 50 \muL de búfer PCR
(Silverstar):
M13-fwd:
5'-GTAAAACGACGGCCAGTG-3'
M13-Rev:
5'-GGAAACAGCTATGACCATG-3'
10% Dimetilsulfóxido (v/v)
De a 2 ng/\muL de primer (M13 forward y
reversed)
1,5 mM MgCl_{2},
0,2 mM dNTPs,
4 Units Taq-Polimerasa
(Silverstar),
2 ng/\muL Plasmid-ADN.
La amplificación transcurrió en un Thermocycler
(Perkin-Elmar 2400) con temperatura controlada con
el siguiente programa: 94ºC por 3 min; 30 ciclos con 94ºC por 30
segundos, 58ºC por 30 segundos y 72ºC por 1,2 min; 72ºC por 5 min;
a continuación enfriamiento a 4ºC hasta seguir con el procesamiento.
El éxito de la reacción se verificó en gel de agarosa al 1%. Los
productos se purificaron a continuación con un kit producto PCR de
alta pureza ("High Pure PCR-Product Purification
Kit") (Boehringer-Mannheim). Se obtuvieron
alrededor de 40 \muL de producto eluido de la columna que fue
verificado nuevamente en el gel y se almacenó a -20ºC.
La polimerización de ARN, la hibridación y la
inmunodetección se realizaron en gran medida siguiendo las
instrucciones del fabricante del kit con respecto a la detección no
radioactiva del ARN (DIG System User's Guide,
DIG-Luminescence detection Kit,
Boehringer-Mannheim, Kogel et al. (1994)
Plant Phisiol 106:1264-1277). 4 \mul de producto
PCR fueron tratados con 2 \muL de búfer de transcripción, 2 \mul
de mezcla de marcación NTP, 2 \mul de mezcla NTP y 10 \mul de
DEPC-agua. A continuación 2 \muL de la solución de
polimerasa de ARN T7 fueron adicionados mediante pipeta. La
reacción se realizó luego por 2 h a 37ºC y a continuación se llevó a
100 \muL con DEPC-agua. La sonda de ARN se
detectó en el gel de bromuro de etidio y se almacenó a -20ºC.
Para preparar la hibridación, primero se
agitaron suavemente las membranas por 1 h a 68ºC en 2 x SSC (salt,
Sodiumcitrate), búfer de SDS 0,1% (dodecilsulfato de sodio); el
búfer se renovó de 2 a 3 veces. Las membranas se aplicaron a
continuación a la pared interna de los tubos de hibridación
precalentados a 68ºC y se incubaron por 30 min con 10 mL de búfer
de hibridación Dig-Easy en la estufa de hibridación
precalentada. Mientras tanto se desnaturalizaron 10 \muL de
solución de sonda en 80 \muL de búfer de hibridación por 5 minutos
a 94ºC, a continuación la mezcla se puso en hielo y se centrifugó
brevemente. Para la hibridación se transfirió luego la sonda a 10
mL de búfer de hibridación a una temperatura de 68ºC y se reemplazó
el búfer en el tubo de hibridación por el búfer de sonda. La
hibridación se efectuó por una noche, así mismo a 68ºC. Antes de la
inmunodetección de híbridos de ARN-ADN, los blots se
lavaron dos veces en condiciones estrictas por 20 minutos en cada
caso en 0.1% (p/v) SDS, 0.1 x SSC a 68ºC. Para la inmunodetección
los blots primero se agitaron suavemente dos veces por 5 minutos en
2 x SSC, 0,1% SDS a RT. A continuación se efectuaron 2 pasos de
lavados estrictos a 68ºC en 0,1 xSSC, 0,1% SDS de a 15 min. La
solución se reemplazó luego por búfer de lavado sin Tween. La
mezcla de reacción se agitó por 1 minuto y la solución se
intercambió por reactivo bloqueante. Después de agitar otros 30
minutos se adicionaron 10 \muL de solución de anticuerpo
antifluoresceina y se continuó agitando por 60 minutos. Siguieron
dos pasos de lavados de 15 minutos cada uno en búfer de lavado con
Tween. La membrana se equilibró a continuación 2 min en búfer de
sustrato y después de haberlo dejado drenar se transfirió a una
lámina de acetato. Sobre el "lado de ARN" de la membrana se
repartió uniformemente luego una mezcla de 20 \muL de
CDP-Star^{TM} y 2 mL de búfer de sustrato.
Después, la membrana se cubrió con una segunda lámina de acetato y
los bordes se sellaron con calor para suministrar un sello hermético
al agua, evitando burbujas de aire. En un cuarto oscuro, la
membrana se cubrió luego por 10 minutos con una película de rayos X
y luego se desarrolló la película. El tiempo de exposición varió en
función de la intensidad de la reacción luminiscente.
Si no se distingue por nada extraordinario, las
soluciones estaban contenidas en el alcance de entrega del kit
(DIG-Luminescence detection Kit,
Boehringer-Mannheim). Todas las otras se prepararon
a partir de las siguientes soluciones patrón mediante dilución con
agua destilada autoclavada. A menos que se especifique otra cosa,
todas las soluciones patrón se hicieron con DEPC (como
DEPC-agua) y a continuación se autoclavaron.
- DEPC-Agua: agua destilada es
tratada por una noche a 37ºC con dietilpirocarbonato (DEPC, 0,1%,
p/v) y a continuación se autoclava
- Búfer 10 x MOPS: 0,2 M MOPS (ácido
morfolin-3-propansulfónico), 0,05 M
acetato de sodio, 0,01 M EDTA, pH ajustado con 10 M NaOH a pH
7,0
- 20 x SSC (cloruro de sodio - citrato de sodio,
Salt-Sodiumcitrate): 3 M NaClo, 0,3 M citrato
trisódico x 2 H_{2}O, pH ajustado con 4 M HCl a pH 7,0.
- 1% SDS (dodecilsufato de sodio,
Sodiumdodecilsulfate) dodecilsulfato de sodio (p/v), sin DEPC
- búfer de muestra de RNA: 760 \muL de
formamida, 260 \muL de formaldehído, 100 \muL de bromuro de
etidio (10 mg/mL), 80 \muL de glicerina, 80 \muL de bromfenol
azul (saturado), 160 \muL de 10 x MOPS, 100 \muL de agua.
- 10 x búfer de lavado sin Tween: 1,0 M ácido
maleico, 1,5 M NaCl; sin DEPC, con NaOH (sólido, cerca de 77 g) y
10 M NaOH pH ajustado a 7,5.
- Búfer de lavado con Tween: a partir de búfer
de lavado sin Tween con Tween (0,3%, v/v)
- 10 x reactivo bloqueante: suspender 50 g de
polvo bloqueante (Boehringer-Mannheim) en 500 mL de
búfer de lavado sin Tween.
- Búfer de sustrato: 100 mM Tris
(trishidroximetilamino-metano), 150 mM NaCl con 4 M
HCl pH ajustado a 9,5.
- 10 x marcador de color: 50% de glicerina
(v/v), 1,0 mM EDTA pH 8,0, 0,25% bromfenolazul (p/v), 0,25%
xilencianol (p/v).
Una expresión BI1 se analizó tal como se
describe usando RT-PCR y cADN Gelblots y se reveló
que BI1 se expresa de manera predominante en el tejido de mesófilo
de las hojas mientras que ubiquitina se expresa de manera
constitutiva uniformemente en la epidermis y mesófilo (Fig. 8).
Además debe observarse una expresión de BI1 como
respuesta al tratamiento de plantas con filtrados de cultivos
tóxicos de Bipolaris sorokiniana. Las hojas primarias de
cebada muestran manchas necróticas típicas (leaf spot blotch
symptoms) después de tratar las plantas con filtrados de cultivo
tóxico de Bipolaris sorokiniana (realizado tal como se
describe por Kumar et al. 2001). La necrosis de hoja fue
discernible 48 horas después del tratamiento. La lesión de tejido
observada fue más claramente sobresaliente en la línea
Bgh-resistente BCIngrid-mlo5 (I22)
que en la línea padre Ingrid (Mlo-genotipo. Kumar
et al. 2001). La expresión de BI1se correlaciona con la
manifestación de la necrosis de hoja 72 horas después del
tratamiento (hat) (Fig. 12).
\newpage
Ejemplo
7
El promotor de oxalato oxidasa de trigo (germin
9f-2.8) se emplea para obtener sobreexpresión
estable, específica de mesófilo. En cebada, la correspondiente
expresión de oxalato-oxidasa es específica de
mesófilo, débilmente constitutiva y sensible a patógeno (Gregersen
PL et al. (1997) Phisiol Mol Plant Pathol 51:
85-97). Por lo tanto puede utilizarse para la
expresión específica de mesófilo de BI1. Como un control, HVBI1 se
sobre-expresa bajo el control de promotor de
ubiquitina de maíz (Christensen AH et al. (1992) Plant Mol
Biol 18:675-689) o del promotor de actina de arroz
(Zhang W et al. (1991) Plant Cell
3:1155-1165). Los siguientes constructos se
emplean:
a) pUbiBI-1 (SEQ ID NO: 33; para
transformación transitoria de cebada y de trigo con bombardeo de
partículas. Expresión de BI-1 bajo control del
promotor de ubititna del maíz).
b) pLo114UbiBI-1 (SEQ ID NO: 34;
obtenida mediante re-clonación del casete de
expresión Ubi/BI-1 como fragmento EcoR1 de
pUbiBI-1 en
pLo114-GUS-Kan; vector binario para
la transformación transitoria de cebada con A.
tumefaciens)
c) pOXoBI-1 (SEQ ID NO: 35;
promotor específico de mesófilo TaGermin 9f-2.8 de
BI1 para la transformación de trigo mediante bombardeo de
partículas.
d) pLo114OXoBI-1 (SEQ ID NO:
36)
Cebada y trigo de tipo silvestre, así como
cebada -mlo se transforman, se propagan y se polinizan. La
transformación de cebada y trigo se efectúa como se ha descrito
(Repellin A et al. (2001) Plant Cell, Tissue and Organ
Culture 64: 159-183): para este propósito se
transforman callos de embriones inmaduros de trigo (o c ebada) por
transferencia genética biolítica con microproyectiles. En este caso
se co-transforman vectores basados en pUC junto con
vectores que llevan los marcadores de selección. A continuación, los
embriones se cultivan en un medio de selección y se regeneran. La
cebada de transforma con la ayuda de Agrobacterium
tumefaciens. En este caso, se emplea un vector binario basado
en pcambia1301. Los embriones inmaduros de cebada se
co-cultivan con A. tumefaciens, se
seleccionan y después se regeneran (Repellin A et al. (2001)
Plant Cell, Tissue and Organ Culture 64: 159-183;
Horvath H et al. (2003) Proc Natl. Acad Sci USA 100:
365-369; Horvath H et al. (2002) en Barley
Science, eds. Slafer, G. A., Molina-Cano, J. L.,
Savin, R., Araus, J. L. & Romagosa, J. (Harworth, New York),
pp. 143-1.76; Tingay S et al. (1997) Plant J.
11: 1369-1376).
Las plantas de cebada y trigo transgénicas
(recombinantes) de la generación T1 ó T2 se ensayan en resistencia
frente a patógenos hemibiotróficos y pertotróficos. Para este fin se
inoculan las hojas con diversos patógenos. Como patógenos
biotróficos se usan mildiú polvoroso de cebada (Blumeria graminis
f.sp. hordei) y orín pardo (Puccinia hordei). Como
medida de la susceptibilidad a mildiú se evalúa el número de
pústulas por unidad de área de la hoja 5-7 días
después de la inoculación con 2-5 conidios por
mm^{2} de área de hoja (Beßer K et al. (2000) Mol Plant
Pathology 1: 277-286). Como patógenos
hemibiotróficos se usan Bipolaris sorokiniana n y
Magnaporthe grisea. La inoculación se efectúa tal como se ha
descrito previamente (Kumar J et al. (2001) Phitopathology
91: 127-133; Jarosch B et al. (1999) Mol
Plant Microbe Inter 12: 508-514). Como medida para
la susceptibilidad sirve el número y el tamaño de las lesiones de la
hoja 2 a 6 días después de la inoculación por aspersión con
conidios (Kumar J et al. (2001) Phitopathology
91:127-133; Jarosch B et al. (1999) Mol Plant
Microbe Inter 12:508-514; Jarosch B et al.
(2003) Mol Plant Microbe Inter 16:107-114.). Como
patógeno pertotrófico se usa Fusarium graminearum.
Para la determinación de la resistencia tipo 1 a
Fusarium Head Blight (FHB) se aspergieron granzas de trigo en una
etapa temprana de florecimiento con una suspensión de macroconidios
(cerca de 2 x 105 ml^{-1}) de Fusarium graminearum o
Fusarium culmorcum. Las plantas inoculadas se transfieren por
3 días a una cámara de niebla con 25ºC de temperatura del aire y
100% de humedad relativa del aire. Después las plantas se incuban
en invernadero bajo luz continua a una temperatura de 20ºC y la
severidad de los síntomas FHB en las granzas se evaluó después de
5, 7 y 8 días.
Para cuantificar la resistencia tipo II al
Fusarium Head Blight (FHB) se inyectaron respectivamente 10 - 20
\mul de alícuotas de una suspensión de macroconidios (cerca de 2 x
105 ml^{-1}) de Fusarium graminearum o Fusarium
culmorum en granzas individuales, ubicadas relativamente
centradas, de plantas de trigo. Las plantas inoculadas se
transfieren por 3 días a una cámara de niebla con 25ºC de
temperatura de aire y 100% de humedad relativa de aire. Después
las plantas se incuban en invernadero bajo luz continua a una
temperatura de 20ºC y se evalúa la expansión de los síntomas de FHB
por las granzas después de 7, 14 y 21 días. La expansión de los
síntomas por las granzas (la así llamada
Fusarium-spreading) se toma como medida para la
resistencia tipo II a FHB.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo de comparación
1
Se transformaron segmentos de hoja de cebada cv
Ingrid con un pGY-BI1 junto con un vector de
expresión GFP. Después se inocularon las hojas con Bgh y el
resultado se analizó después de 48 horas por medio de microscopía
de luz y fluorescente. La penetración en las células que expresan
GFP se evaluó detectando historias en células vivas y mediante la
evaluación del desarrollo de los hongos en precisamente aquellas
células. Se empleó un método de transformación transitoria que ya
ha sido descrito para la introducción biolística de ADN y ARN a las
células epidérmicas de hojas de cebada (Schweizer P et al.
(1999) Mol Plant Microbe Interact 12:647-54;
Schweizer P et al. (2000) Plant J 2000
24:895-903).
Para preparación de micro portadores, se lavaron
dos veces 55 mg de partículas de tungsteno (M 17, diámetro 1,1
\mum; Bio-Rad, Munich) con 1 ml de agua destilada
autoclavada y una vez con 1 mL de etanol absoluto, se secó y se
absorbió en 1 ml de glicerina al 50% (cerca de 50 mg/ml de solución
patrón). La solución se diluyó con glicerina al 50% a 25 mg/ml,
antes del consumo se mezcló bien y se suspendió en un baño de
ultrasonido.
Para recubrir los microportadores para cada
bombardeo se adicionan a gotas 0,3 \mug de plásmido pGFP (GFP
bajo control del promotor CaMV 35S; Schweizer P et al. (1999)
Mol Plant-Microbe Interact
12:647-654.), 0,7 \mug del vector vacío pGY o
pGY-BI1 (1\muL), 12,5 \mul de suspensión de
partículas de tungsteno (25 mg/ml; correspondiente a 312 \mug de
partículas de tungsteno), 12,5 \mul de solución de
Ca(NO_{3})_{2} 1 M (pH 10) mezclando
continuamente, se deja quieto por 10 min a RT, se centrifuga
brevemente y se retiran 20 \mul del sobrenadante. El residuo se
re-suspende con las partículas de tungsteno (baño de
ultrasonido) y se emplean en el experimento.
Se usaron segmentos de hojas primarias de cebada
de alrededor de 4 cm de longitud. Los tejidos se colocaron en 0,5%
Phitagar (GibcoBRL^{TM} Life Technologies^{TM}, Karlsruhe) con
20 \mug/ml de benzimidazol en cajas de Petri (6,5 cm de diámetro)
y los bordes se cubrieron directamente antes del bombardeo de
partículas con una plantilla provista con una abertura rectangular
de 2,2 cm x 2,3 cm. Las cajas se colocaron, una después de la otra,
en el fondo de la cámara de vacío (Schweizer P et al. (1999)
Mol Plant Microbe Interact 12:647-54) sobre la cual
se había insertado una red de nylon (tamaño de malla 0,2 mm,
Millipore, Eschborn) en una placa agujereada (5 cm por encima del
suelo, 11 cm por debajo del macroportador, véase abajo), para actuar
como difusor con el fin de dispersar los agregados de partículas y
disminuir la velocidad del flujo de partículas. Para cada
bombardeo, el macro portador (sostenedor de filtro plástico estéril,
13 mm, Gelman Sciences, Swinney, UK), el cual se adjuntó a la cima
de la cámara, se cargó con 5,8 \muL de partículas de tungsteno
recubiertas de ADN (microportador, véase abajo). LA presión en la
cámara se redujo en 0,9 bar usando una bpmba de vacío de diafragma
(Vacuubrand, Wertheim) y la superficie del tejido vegetal se
bombardeó con las partículas de tungsteno a una presión del gas de
helio de 9 bar. La cámara se aireó inmediatamente después. Para
etiquetar las células transformadas las hojas se bombardearon con
el plásmido (pGFP; vector a base de pUC18, promotor/terminador CaMV
35S - casete con gen de GFP insertado; Schweizer P et al.
(1999) Mol Plant Microbe Interact 12:647-54; puesto
a disposición por el Dr. P. Schweizer, Instituto para genética
vegetal IPK, Gatersleben, Alemania). Antes del bombardeo de otro
plásmido se limpió profundamente el macroportador cada vez con agua.
Después de incubación de cuatro horas después del bombardeo con
cajas de Petri ligeramente abiertas, RT y luz del día, las hojas se
inocularon con 100 conidios/mm^{2} del hongo mildiú polvoroso de
cebada auténtico (raza A6; Blumeria graminis f.sp. hordei
mildiú A6) y se incubaron por otras 40 horas en condiciones
idénticas. Luego se evaluó la penetración. El resultado (por
ejemplo,la eficiencia de penetración), definida como un porcentaje
de las células atacadas con un haustorio maduro y una hifa
secundaria (hifas secundarias alongantes o "secondary elongating
hifae"), se analizó mediante microscopía de fluorescencia y luz.
Una inoculación con 150 conidios/mm^{2} da lugar a una frecuencia
de ataque de cerca de 50% de las células transformadas. Para cada
experimento individual se evaluó un número mínimo de 100 sitios de
interacción. Las células transformadas (que expresan GFP) se
identificaron bajo excitación con luz azul. Se distinguieron tres
categorías diferentes de células transformadas:
1 Células penetradas que comprenden un haustorio
fácilmente reconocible. Una célula con más de un haustorio contado
como una célula.
2. Células que fueron atacadas por un apresorio
fúngico pero que no comprenden haustorio. Una célula que fue
atacada repetidamente por Bgh, pero no comprende haustorio, contado
como una célula.
3. Células que no fueron atacadas por Bgh.
Células estomatales y células estomatales
subsidiarias se excluyeron de la evaluación. Las estructuras de
superficie de Bgh se analizaron mediante microscopía de luz o
tinturación fluorescente del hongo con 0,3% calcofluor (p/v en
agua) por 30 segundos. El desarrollo fúngico puede evaluarse
fácilmente mediante tinturación con calcoflúor seguida de
microscopía de fluorescencia. Mientras que el hongo desarrolla un
tubo de germen primario y un tubo de germen apresorial
("germ-tube") en células transformadas con
BI1-dsRNA, falla al desarrollar un haustorio. El
desarrollo de haustorios es una precondición para la formación de
una hifa secundaria. Las eficiencias de penetración (tasas de
penetración) se calculan como el número de células penetradas
dividido por el número de las células atacadas, multiplicado por
100.
La eficiencia de penetración sirve para la
determinación de la susceptibilidad de la células que se
transfectaron con pGY-BI1 en comparación con las
células que se transformaron con un control de vector vacío (Fig.
10). Se observó que la sobreexpresión de BI1 eleva la frecuencia de
penetración de manera significativa (Fig. 10). En seis experimentos
independientes la sobreexpresión en las variedades susceptibles de
cebada Ingrid provocó un incremento significativa de la eficiencia
promedio de penetración (PE) desde 47% hasta 72% (165% de los
controles) en células que habían sobreexpresado BI1 en comparación
con células que se habían transformado con el vector vacío
(control)
(Fig. 10).
(Fig. 10).
Aún más, las células epidérmicas de la cebada
mlo5 resistentes a Bgh se transformaron transitoriamente con el
constructo de sobreexpresión BI1 pGY-1 tal como se
describe arriba. El genotipo mlo5 en un fondo Pallas o Ingrid
muestra una susceptibilidad muy baja contra Bgh. En 7 experimentos
independientes se encontró una eficiencia de penetración en plantas
de control (transformación con vector vacío y vector GFP) de mínimo
o hasta máximo 11%. De manera sorprendente, la sobreexpresión
(pGY-BI1) dio lugar a una reconstitución casi total
del fenotipo susceptible; es decir, se efectuó una ruptura casi
completa de la resistencia a mlo. La eficiencia promedio de
penetración de Bgh a los segmentos de hoja de
Ingrid-mlo5 y Pallas-mlo5 se subió
desde 4% a 23%, o bien de 6% a 33% (Fig. 11). Esto significa un
aumento relativo de la penetración a un 520% ó 510% de los
controles. Además, la sobreexpresión de BI1 en cebada cv Manchuria
incrementó la susceptibilidad contra el patógeno de trigo
Blumeria graminis f.sp. tritici en tres experimentos
independientes desde 0 a 4% a 19 hasta 27% (Fig. 13).
<110> BASF Plant Science GmbH
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Método para el incremento de la
resistencia frente a factores de estrés en plantas
\vskip0.400000\baselineskip
<130> PF54350-AT
\vskip0.400000\baselineskip
<140>
\vskip0.400000\baselineskip
<141>
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn Ver. 2.1
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 744
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Hordeum vulgare
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(741)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para Proteína BI1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 247
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Hordeum vulgare
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1067
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Arabidopsis thaliana
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(741)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para Proteína BI1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 247
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Arabidopsis thaliana
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1160
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Nicotiana tabacum
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(747)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para Proteína BI1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 249
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Nicotiana tabacum
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1056
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Oryza sativa
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(747)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para Proteína BI1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 249
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Oryza sativa
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 973
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Brassica napus
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(741)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para Proteína BI1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 247
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Brassica napus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 747
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Glycine max
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(744)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para Proteína BI1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 248
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Glycine max
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1510
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Glycine max
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(777)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para
BI-1 protein
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 259
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Glycine max
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 651
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Triticum aestivum
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(651)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para
BI-1 protein
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 217
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Triticum aestivum
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 412
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Zea mays
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3)..(410)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para Proteína BI1
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 136
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Zea mays
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 345
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Triticum aestivum
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(342)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 114
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Triticum aestivum
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 403
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Zea mays
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(402)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para Proteína BI1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 134
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Zea mays
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 410
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Zea mays
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3)..(410)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para Proteína BI1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 136
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Zea mays
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 463
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Triticum aestivum
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(462)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para Proteína BI1
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 154
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Triticum aestivum
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 388
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Zea mays
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3)..(386)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para Proteína BI1
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 128
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Zea mays
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1737
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Solanum tuberosum
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> promotor
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1737)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> promotor de patatina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1317
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Triticum aestivum
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> promotor
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1317)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> germin 9f-3.8
promotor de gen
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 959
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Arabidopsis thaliana
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> promotor
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(959)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> CAB-2 promotor
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 31
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 445
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Zea mays
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> promotor
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(445)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> PPCZm1 promotor
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5455
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: vector de expresión recombinante
pUbiB1-1
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 12633
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: vector de expresión recombinante
pLol14UbiBI-1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5598
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: vector de expresión recombinante
pOXoBI-1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 12776
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificical
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: vector de expresión recombinante
pLo114oXoB1-1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 744
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Triticum aestivum
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(741)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para
TaBI-1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 247
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Triticum aestivum
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<211>
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Hordeum vulgare
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (173)..(1126)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para Hordeum vulgare
subsp. vulgare syntaxin (Ror2)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 318
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Hordeum vulgare
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 948
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Arabidopsis thaliana
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(945)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para Arabidopsis
thaliana syntaxin 121 (SYP121)/syntaxin-related
protein (SYR1) (At3g11820)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 315
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Arabidopsis thaliana
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 42
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1275
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Hordeum vulgare
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (80)..(1006)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> codificación para Hordeum vulgare
subsp. vulgare SNAP-34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 43
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 309
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Hordeum vulgare
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 44
Claims (10)
1. Método para la generación o incremento de la
resistencia frente a al menos un factor de estrés biótico en
plantas en el cual están comprendidos los siguientes pasos de
trabajo:
a) Incremento de la cantidad de proteína de al
menos una proteína de inhibidor de Bax -1 (BI1) en al menos un
tejido vegetal de la planta con la condición de que la expresión en
la epidermis de la hoja permanezca esencialmente sin modificar o
que se reduzca, y
b) Selección de las plantas en las que en
comparación con la planta de partida ya exista una resistencia
contra al menos un factor de estrés biótico o se incremente; y
en donde el factor de estrés es un patógeno de
la planta.
2. Método según la reivindicación 1 donde el
factor de estrés es un patógeno necrotrófico o hemibiotrófico.
3. Método según una de las reivindicaciones 1 a
2, donde la proteína BI-1 comprende al menos una
secuencia que presenta una homología de al menos 50% con al menos
un motivo de consenso BI1 seleccionado del grupo que se compone
de
a) H (L/I) KXVY,
b) AXGA (Y/F) XH,
c) NIGG,
d) P (V/P) (Y/F) E (E/Q) (R/Q) KR,
e) (E/Q) G (A/S) S (V/I) GPL,
f) DP(S/G)(L/I)(I/L),
g) V (G/A) T (A/S) (L/I) AF (A/G) CF (S/T),
h) IL (Y/F) LGG,
i) L (L/V) SS (G/W) L (S/T) (I/M) L (L/M) W,
y
j) DTGX(I/V) (I/V)E.
4. Método según una de las reivindicaciones 1 a
3, en el que la proteína BI1 se codifica por un polipéptido que
comprende al menos una secuencia seleccionada del grupo que se
compone de:
a) las secuencias según SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8,
10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32 o 38, y
b) secuencias que presentan una identidad de al
menos 50% con una de las secuencias según SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8,
10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32 o 38,
c) secuencias que comprenden al menos una
secuencia parcial de al menos 10 residuos de aminoácidos
relacionados de una de las secuencias según SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8,
10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32 o 38.
5. Método según una de las reivindicaciones 1 a
4, en el que el incremento de la cantidad de proteína de al menos
una proteína BI1s mediante expresión recombinante de la dicha
proteína BI1 se realiza bajo control de un promotor específico para
raíz, tubérculo o mesófilo.
6. Método según una de las reivindicaciones 1 a
5 que comprende
(a) transformación estable de una célula de la
planta con un casete recombinante de expresión que contiene una
secuencia de ácido nucleico que codifica para una proteína BI en
conexión funcional con un promotor específico de tejido, donde el
promotor no presenta esencialmente actividad en la epidermis de la
hoja y donde el promotor es heterólogo con respecto a la dicha
secuencia de ácido nucleico que codifica para una proteína BI,
(b) Regeneración de la planta a partir de la
célula de la planta, y
(c) Expresión de dicha secuencia de ácido
nucleico que codifica para una proteína BI en una cantidad y durante
un tiempo que sean suficientes para generar o elevar una
resistencia a patógenos en dicha planta.
7. Método según una de las reivindicaciones 1 a
6, donde la planta se selecciona de plantas monocotiledóneas y
dicotiledóneas.
8. Método según una de las reivindicaciones 1 a
7, donde la planta se selecciona del grupo de las plantas
monocotiledóneas que se compone de trigo, avena, mijo, cebada,
centeno, maíz, arroz, alforfón, trigo, triticale, escanda, lino o
caña de azúcar.
9. Método según una de las reivindicaciones 1 a
8, donde la expresión del inhibidor de Bax -1 (BI-1)
se eleva en el mesófilo.
10. Método según una de las reivindicaciones 1 a
9, donde la planta presenta un fenotipo resistente a mlo o inhibe
la expresión o función de MLO, RacB y/o NaOx al menos en la
epidermis o se reduce en comparación con una planta de control y/o
se incrementa la expresión o función de PEN2, SNAP34 y/o PEN1 al
menos en la epidermis en comparación con una planta de control.
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