ES2359953T3 - Derivados de pirimidina como inhibidores de la fosfatidilinositol-3-kinasa. - Google Patents
Derivados de pirimidina como inhibidores de la fosfatidilinositol-3-kinasa. Download PDFInfo
- Publication number
- ES2359953T3 ES2359953T3 ES08736964T ES08736964T ES2359953T3 ES 2359953 T3 ES2359953 T3 ES 2359953T3 ES 08736964 T ES08736964 T ES 08736964T ES 08736964 T ES08736964 T ES 08736964T ES 2359953 T3 ES2359953 T3 ES 2359953T3
- Authority
- ES
- Spain
- Prior art keywords
- morpholin
- fluoro
- ylpyrimidin
- indol
- pyridin
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Landscapes
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Abstract
Un compuesto que es una pirimidina de formula (I): donde R2 se une en la posicion 2 del anillo y -YR1 se une en la posicion 5 o 6 del anillo, o YR1 se une en la posicion 2 del anillo y R2 se une en la posicion 6 del anillo; R2 es un grupo indol-4-ilo substituido en la posicion 5 o 6; o bien: (a) Y es seleccionado entre -O-(CH2)n-, -NH-(CH2)n-, -NHC(O)-(CH2)n- y -C(O)NH-(CH2)n-, donde n es 0 o un numero entero de 1 a 3, y R1 es seleccionado entre un grupo carbociclico o heterociclico insaturado de 5 a 12 miembros no substituido o substituido y un grupo -NR3R4, donde R3 y R4, iguales o diferentes, son cada uno independientemente seleccionados entre H, alquilo C1-C6 no substituido o substituido, cicloalquilo C3-C10 no substituido o substituido, -C(O)R, -C(O)N(R)2 y -S(O)mR, o R3 y R4 forman juntos, con el atomo de nitrogeno al que estan unidos, un grupo heterociclico saturado que contiene N de 5, 6 o 7 miembros no substituido o substituido; (b) Y es un enlace directo y R1 es seleccionado entre un grupo carbociclico o heterociclico insaturado de 5 a 12 miembros no substituido o substituido y un grupo -NR3R4, donde R3 y R4, iguales o diferentes, son cada uno independientemente seleccionados entre H, alquilo C1-C6 no substituido o substituido, cicloalquilo C3-C10 no substituido o substituido, -C(O)R, -C(O)N(R)2 y -S(O)mR; R es seleccionado entre H, alquilo C1-C6, cicloalquilo C3-C10 y un grupo arilo o heteroarilo de 5 a 12 miembros, cuyo grupo esta sin substituir o substituido; y m es 1 o 2; o una sal del mismo farmaceuticamente aceptable.
Description
La presente invención se relaciona con compuestos de pirimidina y con su uso como inhibidores de la fosfatidilinositol-3-kinasa (P13K).
El fosfatidilinositol (en adelante abreviado como "PI") es uno de una serie de fosfolípidos que se encuentran en las membranas celulares. En los últimos años, ha quedado claro que el PI desempeña un importante papel en la transducción de las señales intracelulares. En los últimos años de la década de los 80, se vio que una PI3 kinasa (PI3K) es una enzima que fosforila la posición 3 del anillo del inositol del fosfatidilinositol (D. Whitman et al., 1988, Nature, 332, 664).
Se consideró originalmente que la PI3K era una única enzima, pero se ha clarificado ahora que están presentes una pluralidad de subtipos en la PI3K. Cada subtipo tiene su propio mecanismo para regular la actividad. Se han identificado tres clases principales de PI3K en base a su especificidad de substrato in vitro (B. Vanhaesebroeck,1997, Trend in Biol. Sci, 22, 267). Los substratos para las PI3K de la clase I son PI, 4-fosfato de PI (PI4P) y 4,5-bifosfato de PI (PI (4,5)P2). Las PI3K de la clase I se dividen además en dos grupos, la clase Ia y la clase Ib, en términos de su mecanismo de activación. Las PI3K de la clase Ia incluyen PI3K de los subtipos p110α, p110β y p110δ, que transmiten señales desde los receptores acoplados a tirosina kinasa. La PI3K de la clase Ib incluye un subtipo p110γ activado por un receptor acoplado a proteína G. PI y PI(4)P son conocidos como substratos para las PI3K de la clase II. Las PI3K de la clase II incluyen PI3K de los subtipos C2α, C2β yC2γ, que se caracterizan por contener dominios C2 en el extremo C. El substrato para las PI3K de la clase III es solamente el PI.
En los subtipos de PI3K, el subtipo de la clase Ia ha sido ampliamente investigado hasta la fecha. Los tres subtipos de la clase Ia son heterodímeros de una subunidad catalítica de 110 kDa y subunidades reguladoras de 85 kDa o 55 kDa. Las subunidades reguladoras contienen dominios SH2 y se unen a residuos de tirosina fosforilados por receptores de factores de crecimiento con actividad tirosina kinasa o productos oncogénicos, induciendo así la actividad PI3K de la subunidad catalítica p110 que fosforila su substrato lipídico. Por lo tanto, se considera que los subtipos de la clase Ia están asociados a la proliferación celular y a la carcinogénesis, a los trastornos inmunes y a condiciones en las que está implicada la inflamación.
WO 01/083456 describe una serie de derivados heteroarílicos condensados que tienen actividad como inhibidores de PI3 K y que suprimen el crecimiento de las células cancerosas.
WO 2004/048365 describe pirimidinas trisubstituidas que son inhibidores de la PI3 kinasa y el uso de estos compuestos en el tratamiento del cáncer.
W0 2005/000404 se relaciona con una serie de compuestos de pirimidina utilizados para tratar o prevenir trastornos asociados a una pérdida excesiva de hueso, incluyendo ciertas condiciones inflamatorias y relacionadas con el cáncer.
WO 2006/060194 se relaciona con compuestos de pirimidina que son útiles para tratar trastornos inflamatorios e inmunes.
WO 2007/042810 describe derivados de pirimidina que son inhibidores de la PI3 kinasa y que pueden por lo tanto ser usados para tratar una variedad de trastornos, incluyendo el cáncer, los trastornos inmunes y la inflamación.
Se ha visto ahora que una serie de nuevos compuestos de pirimidina tienen actividad como inhibidores de PI3K. Los compuestos exhiben selectividad para las PI3K de la clase Ia con respecto a la clase Ib, en particular para el subtipo p110δ. Por consiguiente, la presente invención proporciona un compuesto que es una pirimidina de fórmula (I):
donde
R2 se une en la posición 2 del anillo y -YR1 se une en la posición 5 ó 6 del anillo, o YR1 se une en la posición 2 del
anillo y R2 se une en la posición 6 del anillo;
R2 es un grupo indol-4-ilo que está sustituido en la posición 5 ó 6; o bien:
- (a)
- Y es seleccionado entre -O-(CH2)n-, -NH-(CH2)n-, -NHC(O)-(CH2)n-y -C(O)NH-(CH2)n-, donde n es 0 o un número entero de 1 a 3, y R1 es seleccionado entre un grupo carbocíclico o heterocíclico insaturado de 5 a 12 miembros no substituido o substituido y un grupo -NR3R4, donde R3 y R4, iguales o diferentes, son cada uno independientemente seleccionados entre H, alquilo C1-C6 no substituido o substituido, cicloalquilo C3-C10 no substituido o substituido, -C(O)R, -C(O)N(R)2 y -S(O)mR, o R3 y R4 forman juntos, con el átomo de nitrógeno al que están unidos, un grupo heterocíclico saturado que contiene N de 5, 6 ó 7 miembros no substituido o substituido;
- (b)
- Y es un enlace directo y R1 es seleccionado entre un grupo carbocíclico o heterocíclico insaturado de 5 a 12 miembros no substituido o substituido y un grupo -NR3R4, donde R3 y R4, iguales o diferentes, son cada uno independientemente seleccionados entre H, alquilo C1-C6 no substituido o substituido, cicloalquilo C3-C10 no substituido o substituido, -C(O)R, -C(O)N(R)2 y -S(O)mR; R es seleccionado entre H, alquilo C1-C6, cicloalquilo C3-C10 y un grupo arilo o heteroarilo de 5 a 12 miembros, cuyo grupo está sin substituir o substituido; y m es 1ó2;
o una sal del mismo farmacéuticamente aceptable.
Un grupo alquilo C1-C6 es lineal o ramificado. Un grupo alquilo C1-C6 es típicamente un grupo alquilo C1-C4, por ejemplo un grupo metilo, etilo, propilo, n-butilo, sec-butilo o terc-butilo. Un grupo alquilo C1-C6 está sin substituir o substituido, típicamente por uno o más grupos Z o R7 como se define más adelante. Típicamente, es alquilo C1-C4, por ejemplo metilo, etilo, i-propilo, n-propilo, t-butilo, s-butilo o n-butilo.
Z es seleccionado entre H, halo, alquilo C1-C6 no substituido, -OR, -SR, CH2OR, -CF3, -(halo)alquilo C1-C6, -(C(R8)2)qO-(halo)alquilo C1-C6, -CO2R, -(C(R8)2)qCO2R, -(C(R8)2)qCOR, CF2OH, CH(CF3)OH, C(CF3)2OH, -(CH2)qOR, -(C(R8)2)qOR, -(CH2)qNR2, -(C(R8)2)qNR2, -C(O)N(R)2, -(C(R8)2)qCONR2, -NR2, -(C(R8)2)qNR2, -NRC(O)R, -(C(R8)2)qNRC(O)OR, -S(O)mR, -S(O)mN(R)2, -(C(R8)2)qS(O)mN(R)2, -OC(O)R, -(C(R8)2)qOC(O)R, -OC(O)N(R)2, -(C(R8)2)qOC(O)N(R)2, -(C(R8)2)qOC(O)NR2, -NRS(O)mR, -(C(R8)2)qNRS(O)mR, -NRC(O)N(R)2, -(C(R8)2)qNRC(O)N(R)2, CN, -NO2 y un grupo arilo o heteroarilo de 5 a 12 miembros, cuyo grupo está sin substituir o substituido, donde cada R es independientemente seleccionado entre H, alquilo C1-C6, cicloalquilo C3-C10 y un grupo arilo o heteroarilo de 5 a 12 miembros, estando el grupo sin substituir o substituido, m es 1ó2y qes 0, 1ó2.
R7 es seleccionado entre alcoxi C1-C6, OR8, SR8, S(O)mR8, nitro, CN, halógeno, -C(O)R8, -CO2R8, -C(O)N(R8)2 y -N(R8)2,
los R8, cada uno de los cuales es igual o diferente cuando están presentes más de uno en un substituyente dado, es seleccionado entre H, alquilo C1-C6 y cicloalquilo C3-C10,y m es 1 ó 2.
Un halógeno o grupo halo es F, Cl, Br o I. Preferiblemente, es F, Cl o Br. Un grupo alquilo C1-C6 substituido por halógeno puede ser indicado mediante el término "haloalquilo C1-C6", que significa un grupo alquilo en el que uno o más hidrógenos están substituidos por halo. Un grupo haloalquilo C1-C6 contiene preferiblemente uno, dos o tres grupos halo. Un ejemplo preferido de tal grupo es trifluorometilo.
Un grupo alcoxi C1-C6 es lineal o ramificado. Es típicamente un grupo alcoxi C1-C4, por ejemplo un grupo metoxi, etoxi, propoxi, i-propoxi, n-propoxi, n-butoxi, sec-butoxi o terc-butoxi. Un grupo alcoxi C1-C6 está sin substituir o substituido, típicamente por uno o más grupos Z o R7 según se ha definido anteriormente
Un grupo cicloalquilo C3-C10 puede ser, por ejemplo, cicloalquilo C3-C8 tal como ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, ciclohexilo o cicloheptilo. Típicamente, es cicloalquilo C3-C6. Un grupo cicloalquilo C3-C10 está sin substituir o substituido, típicamente por uno o más grupos Z o R7 según se ha definido anteriormente.
Un grupo acilo C1-C6 es un grupo -C(O)Alq en donde Alq es alquilo C1-C6 como se ha definido anteriormente. Es, por ejemplo, formilo, acetilo o propionilo.
Un grupo heterocíclico saturado que contiene N de 5, 6 ó 7 miembros típicamente contiene un átomo de nitrógeno y
o bien un átomo de N adicional o bien un átomo de O, o ningún heteroátomo adicional. Puede ser, por ejemplo, piperidina, piperazina, morfolina, pirrolidina u homopiperazina.
El grupo heterocíclico saturado que contiene N de 5, 6 ó 7 miembros está sin substituir o substituido en uno o más de los átomos de carbono del anillo y/o en cualquier átomo de N adicional presente en el anillo. Como ejemplos de substituyentes adecuados, se incluyen uno o más grupos Z o R7 como se ha definido anteriormente y un grupo alquilo C1-C6 que está sin substituir o substituido por un grupo Z o R7 como se ha definido anteriormente. Cuando el anillo es piperazina, está típicamente sin substituir o substituido, típicamente en el segundo átomo de nitrógeno del anillo, por -C(O)R8, -C(O)N(R8)2 o -S(O)mR8, o por alquilo C1-C6 no substituido o substituido por alcoxi C1-C6 o OH.
Un grupo carbocíclico insaturado de 5 a 12 miembros es un anillo carbocíclico de 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 ó 12 miembros que contiene al menos un enlace insaturado. Es un sistema de anillo monocíclico o bicíclico fusionado. El grupo es aromático o no aromático, por ejemplo un grupo arilo de 5 a 12 miembros. Como ejemplos, se incluyen grupos fenilo, naftilo, indanilo, indenilo y tetrahidronaftilo. El grupo está sin substituir o substituido, típicamente por uno o más grupos Z o R7 según se ha definido anteriormente.
Un grupo arilo es un grupo carbocíclico aromático de 5 a 12 miembros. Es monocíclico o bicíclico. Como ejemplos, se incluyen grupos fenilo y naftilo. El grupo está sin substituir o substituido, por ejemplo por un grupo Z o R7 como se ha definido anteriormente.
Un grupo heterocíclico insaturado de 5 a 12 miembros es un anillo heterocíclico de 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 ó 12 miembros que contiene al menos un enlace insaturado y al menos un heteroátomo seleccionado entre O, N y S. Es un sistema de anillo monocíclico o bicíclico fusionado. El grupo es aromático o no aromático, por ejemplo heteroarilo. El grupo puede ser, por ejemplo, furano, tiofeno, pirrol, pirrolopirazina, pirrolopirimidina, pirrolopiridina, pirrolopiridazina, indol, isoindol, pirazol, pirazolopirazina, pirazolopirimidina, pirazolopiridina, pirazolopiridazina, imidazol, imidazopirazina, imidazopirimidina, imidazopiridina, imidazopiridazina, bencimidazol, benzodioxol, benzodioxina, benzoxazol, benzotiofeno, benzotiazol, benzofurano, indol, indolicinilo, isoxazol, oxazol, oxadiazol, tiazol, isotiazol, tiadiazol, dihidroimidazol, dihidrobenzofurano, dihidrodioxinopiridina, dihidropirrolopiridina, dihidrofuranopiridina, dioxolopiridina, piridina, quinolina, isoquinolina, quinazolina, quinoxalina, tetrahidrobenzofurano, tetrahidroquinolina, tetrahidroisoquinolina, 5,6,7,8-tetrahidroimidazo[1,5-a]pirazina, 5,6,7,8-tetrahidroimidazo[1,2-a]pirazina, tienopirazina, pirano, pirimidina, piridazina, pirazina, triazina, triazol o tetrazol. El grupo está sin substituir o substituido, típicamente por uno o más grupos Z o R7 según se ha definido anteriormente.
Heteroarilo es un grupo heterocíclico aromático de 5 a 12 miembros que contiene 1, 2, 3 ó 4 heteroátomos seleccionados entre O, N y S. Es monocíclico o bicíclico. Típicamente, contiene un átomo de N y 0, 1, 2 ó 3 heteroátomos adicionales seleccionados entre O, S y N. Puede ser, por ejemplo, seleccionado entre los grupos heteroarilo de la anterior lista de opciones para un grupo heterocíclico de 5 a 12 miembros.
En la definición de R1, este grupo heterocíclico es típicamente seleccionado entre piridina, tiofeno y pirrol. Más típicamente, es piridina, por ejemplo un grupo pirid-2-ilo, pirid-3-ilo o pirid-4-ilo.
Cuando R1 es un grupo carbocíclico insaturado de 5 a 12 miembros, es típicamente un grupo carbocíclico aromático, tal como fenilo o naftilo. Cuando R1 es un grupo heterocíclico insaturado de 5 a 12 miembros, es típicamente piridilo, por ejemplo un grupo pirid-2-ilo, pirid-3-ilo o pirid-4-ilo. Cuando R1 es un grupo heterocíclico saturado de 5, 6 ó 7 miembros que contiene N, es típicamente un grupo heterocíclico de este tipo de 6 miembros, por ejemplo piperidilo o morfolinilo. El grupo R1 está sin substituir o substituido, por ejemplo por un grupo Z o R7 según se ha definido anteriormente.
R2 es un grupo indol-4-ilo que está substituido en la posición 5 ó 6. Como ejemplos de substituyentes adecuados, se incluyen CN, halo, -C(O)NR2, haloalquilo(C1-C6), -SO2R, -SO2NR2 y un grupo heteroarilo de 5 miembros que contiene 1, 2, 3 ó 4 heteroátomos seleccionados entre O, N y S, donde R es H o alquilo C1-C6. Típicamente, el substituyente es un grupo retirador de electrones.
El grupo heteroarilo de 5 miembros puede ser, por ejemplo, furano, tiofeno, pirrol, imidazol, pirazol, triazol, tetrazol, oxazol, isoxazol, oxadiazol, tiazol, isotiazol o tiadiazol.
Más típicamente, el grupo indol-4-ilo está substituido en la posición 5 ó 6 por CN, halo, -C(O)NH2, -CF3, -SO2Me, -SO2NMe2 o un grupo heteroarilo de 5 miembros como se ha definido anteriormente. Más típicamente, el grupo indol-4-ilo está substituido en la posición 6 por halo, en particular por F.
En una realización, la pirimidina es de fórmula (Ia): En la fórmula (Ia), Y es típicamente seleccionado entre un enlace directo, -C(O)NH(CH2)2-, -NHC(O)-, -NH-, -NH
5 CH2-, -NH-(CH2)2-, -NH-(CH2)3-, -O-, -OCH2-y -O(CH2)2-. R1 es típicamente un grupo arilo o heteroarilo que está sin substituir o substituido, por ejemplo por un grupo fenilo o piridilo. El grupo fenilo está sin substituir o substituido, por ejemplo por un grupo Z o un grupo R7 como se ha definido anteriormente, por ejemplo por un halógeno tal como Cl o Br. El grupo piridilo está sin substituir o substituido por un grupo Z o R7 según se ha definido anteriormente. El grupo piridilo es típicamente un grupo pirid-3-ilo o pirid-4-ilo. R2 es típicamente un grupo indol-4-ilo substituido en la
10 posición 5 por halo o en la posición 6 por halo, CN, CF3, -CONH2, -SO2NMe2 o -SO2Me.
En una segunda realización, la pirimidina es de fórmula (Ib):
15
En la fórmula (Ib), Y es típicamente un grupo -NH-(CH2)n-en donde n es 1, 2 ó 3. R1 es típicamente un grupo arilo o heteroarilo no substituido o substituido, por ejemplo un grupo fenilo o piridilo. El grupo fenilo está sin substituir o substituido, por ejemplo por un grupo Z o un grupo R7 según se ha definido anteriormente, por ejemplo por un
20 halógeno, tal como Cl o Br. El grupo piridilo está sin substituir o substituido por un grupo Z o R7 según se ha definido anteriormente. El grupo piridilo es típicamente un grupo pirid-3-ilo o pirid-4-ilo.
En una tercera realización, la pirimidina es de fórmula (Ic):
25
Como ejemplos específicos de compuestos de la invención, se incluyen los enumerados en la siguiente Tabla 1: Tabla 1
- Compuesto Nº
- Estructura Nombre
- 1
- (2-Dimetilaminoetil)amida del ácido 4-(6-fluoro-1H-indol4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidino-2-carboxílico
- 2
- Piridin-3-ilamida del ácido 4-(6-fluoro-1H-indol-4-il)-6morfolin-4-ilpirimidino-2-carboxílico
- 3
- 4-[6-Morfolin-4-il-2-(2-piridin-3-iletilamino)pirimidin-4-il]1H-indol-6-carbonitrilo
- 4
- [4-(6-Metanosulfonil-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(2-piridin-3-iletil)amina
- 5
- Dimetilamida del ácido 4-[6-morfolin-4-il-2-(2-piridin-3-iletilamino)pirimidin-4-il]-1H-indol-6-sulfónico
- 6
- Amida del ácido 4-[6-morfolin-4-il-2-(2-piridin-3-iletilamino)pirimidin-4-il]-1H-indol-6-carboxílico
- 7
- [4-Morfolin-4-il-6-(6-trifluorometil-1H-indol-4-il)pirimidin2-il]-(2-piridin-3-il-etil)amina
- 8
- [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il](2-piridin-3-iletil)amina
- 9
- 6-Fluoro-4-(6-morfolin-4-il-2-fenilpirimidin-4-il)-1H-indol
- 10
- 6-Fluoro-4-(6-morfolin-4-il-2-piridin-3-ilpirimidin-4-il)-1Hindol
- 11
- 6-Fluoro-4-(6-morfolin-4-il-2-piridin-4-ilpirimidin-4-il)-1Hindol
- 12
- 6-Fluoro-4-[6-morfolin-4-il-2-(piridin-3-iloxi)pirimidin-4-il]1H-indol
- 13
- [4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il](2-piridin-3-iletil)amina
- 14
- [4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]piridin-3-ilmetilamina
- 15
- [2-(3-Clorofenil)etil]-[4-(6-fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin4-ilpirimidin-2-il]amina
- 16
- 6-Fluoro-4-[6-morfolin-4-il-2-(piridin-3-ilmetoxi)pirimidin4-il]-1H-indol
- 17
- 6-Fluoro-4-[6-morfolin-4-il-2-(2-piridin-3-iletoxi)pirimidin4-il]-1H-indol
- 18
- N-[4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]nicotinamida
- 19
- 4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-ilamina
- 20
- [2-(6-Metanosulfonil-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-4-il]-(2-piridin-3-iletil)amina
- 21
- [2-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-4-il](2-piridin-3-iletil)amina
- 22
- [4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]piridin-3-il-amina
- 23
- [4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il](1,2,3,4-tetrahidroisoquinolin-7-il)amina
- 24
- [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il](1,2,3,4-tetrahidroisoquinolin-6-il)amina
- 25
- [4-(6-Metanosulfonil-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(1,2,3,4-tetrahidroisoquinolin-6-il)amina
- 26
- [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il](1,2,3,4-tetrahidroisoquinolin-7-il)amina
- 27
- [4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il](1,2,3,4-tetrahidroisoquinolin-5-il)amina
- 28
- [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il](2-tiazol-2-iletil)amina
- 29
- [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-[2(6-metilpiridin-2-il)etil]amina
- 30
- [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-[2(2-fluoropiridin-4-il)etil]amina
- 31
- [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-[2(5-metoxipiridin-2-il)etil]amina
- 32
- 4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il(3piridin-3-ilfenil)amina
y sus sales farmacéuticamente aceptables.
Las pirimidinas de fórmula (I) pueden convertirse en sales farmacéuticamente aceptables, y las sales pueden
5 convertirse en el compuesto libre, por métodos convencionales. Como sales farmacéuticamente aceptables, se incluyen sales de ácidos inorgánicos, tales como el ácido clorhídrico, el ácido bromhídrico y el ácido sulfúrico, y sales de ácidos orgánicos, tales como el ácido acético, el ácido oxálico, el ácido málico, el ácido metanosulfónico, el ácido trifluoroacético, el ácido benzoico, el ácido cítrico y el ácido tartárico. En el caso de compuestos de la invención que llevan un substituyente carboxi libre, las sales incluyen tanto las sales de adición de los ácidos antes
10 mencionados como las sales de sodio, potasio, calcio y amonio. Estas últimas son preparadas tratando la pirimidina libre de fórmula (I), o su sal de adición de ácido, con la base metálica correspondiente o amoníaco.
Se pueden producir las pirimidinas de la invención por un procedimiento que consiste en una reacción de copulación cruzada mediada por paladio (de tipo Suzuki), típicamente como la última etapa o como la penúltima etapa. Cuando
15 la reacción de copulación cruzada de Suzuki es la última etapa, se puede producir una pirimidina de fórmula (I) mediante un procedimiento que consiste en tratar un compuesto de fórmula (IIa) o (IIb):
donde R1 e Y son como se ha definido anteriormente y Hal es un halógeno, con un ácido borónico o éster del mismo de fórmula R2B(OR15)2, en donde R2 es como se ha definido anteriormente y cada R15 es H o alquilo C1-C6, o los dos grupos OR15 forman, junto con el átomo de boro al que están unidos, un grupo éster pinacolato boronato, en
5 presencia de un catalizador de Pd.
Los compuestos intermediarios de las fórmulas (IIa) y (IIb) son compuestos conocidos, que pueden ser obtenidos comercialmente o preparados por técnicas químicas sintéticas rutinarias. Por ejemplo, se puede producir un compuesto de fórmula (IIa) en donde Y es -NH-(CH2)n-o -NHC(O)-(CH2)n-, o de fórmula (IIb) en donde el resto -YR1
10 está en la posición 6 del anillo e Y es -NH-(CH2)n o -NHC(O)-(CH2)n-, por un procedimiento que consiste en tratar un compuesto de fórmula (IIIa) o (IIIb):
15 procedimiento de copulación mediado por cobre o paladio.
Se puede producir un compuesto de fórmula (IIa) o (IIb) en donde Y es un enlace directo y R1 es un grupo carbocíclico o heterocíclico insaturado de 5 a 12 miembros que está sin substituir o substituido mediante un procedimiento consistente en tratar un compuesto de fórmula (IIIa) o (IIIb) como se ha definido anteriormente con un
20 ácido borónico o éster del mismo de fórmula R1B(OR15)2 en donde R15 es como se ha definido antes en presencia de un catalizador de Pd.
Se puede producir un compuesto de fórmula (IIa) o (IIb) en donde Y es -C(O)NH-(CH2)n-por un procedimiento consistente en tratar un compuesto de fórmula (IIIc) o (IIId):
25
Cuando la reacción de copulación cruzada de Suzuki mediada por paladio es la penúltima etapa, esa etapa puede 30 consistir en producir un compuesto intermediario de fórmula (IIc) o (IId):
donde R2 es como se ha definido anteriormente y Hal es un halógeno, por tratamiento de un compuesto de fórmula (IIIa) o (IIIb) como se ha definido anteriormente con un ácido borónico o éster del mismo de fórmula R2B(OR15)2, en donde R2 es como se ha definido anteriormente y cada R15 es H o alquilo C1-C6, o los dos grupos OR15 forman, junto 5 con el átomo de boro al que están unidos, un grupo éster pinacolato boronato, en presencia de un catalizador de Pd.
Los compuestos intermediarios de las fórmulas (IIc) y (IId) pueden convertirse en una pirimidina de fórmula (I) como se ha definido anteriormente en donde Y es un enlace directo y R1 es un grupo -NR3R4 como se ha definido anteriormente mediante un procedimiento consistente en tratar un compuesto de fórmula (IIc) o (IId) como se ha
10 definido anteriormente, típicamente un compuesto de fórmula (IId) en donde Hal está unido en la posición 6 del anillo, con una amina de fórmula HNR3R4 en un solvente a temperatura elevada.
Cuando la copulación cruzada de Suzuki es la penúltima etapa, esa etapa puede incluir alternativamente la producción de un compuesto intermediario de fórmula (IIe) o (IIf):
15
20 donde Hal es un halógeno, con un ácido borónico o éster del mismo de fórmula Rimagen1
2B(OR15)2, en donde R2 es como se ha definido anteriormente y cada R15 es H o alquilo C1-C6, o los dos grupos OR15 forman, junto con el átomo de boro al que están unidos, un grupo éster pinacolato boronato, en presencia de un catalizador de Pd.
Los compuestos intermediarios de las fórmulas (IIe) y (IIf) pueden convertirse en una pirimidina de fórmula (I) como
25 se ha definido anteriormente en donde Y es un enlace directo y R1 es un grupo -NR3R4 como se ha definido anteriormente mediante un procedimiento consistente en tratar un compuesto de fórmula (IIe) o (IIf), típicamente un compuesto de fórmula (IIe), con una amina de fórmula HNR3R4 en un solvente a elevada temperatura.
Se puede producir un compuesto de fórmula (IIIe) o (IIIf) mediante un procedimiento consistente en oxidar un 30 compuesto de la siguiente fórmula (IVe) o (IVf):
Se puede realizar la oxidación por cualquier método adecuado para convertir un grupo -S-en -S(O)2-.
Se ha visto en pruebas biológicas que los compuestos de la presente invención son inhibidores de la PI3 kinasa. Los compuestos son selectivos para las PI3 kinasas de la clase Ia con respecto a la clase Ib. En general, los compuestos son selectivos para la isoforma p110δ, por ejemplo p110δ con respecto a p110γ.
Se puede usar, por lo tanto, un compuesto de la presente invención como inhibidor de la PI3 kinasa, en particular de una PI3 kinasa de la clase Ia. Por consiguiente, la invención proporciona además un compuesto de la presente invención según se ha definido anteriormente para uso en el tratamiento del cáncer, de trastornos inmunes, de la enfermedad cardiovascular, de la infección vírica, de la inflamación, de trastornos metabólicos/endocrinos o de trastornos neurológicos. Dichas enfermedades y trastornos son discutidos por Drees et al. en Expert Opin. Ther. Patents (2004) 14(5): 703-732. Como ejemplos de trastornos metabólicos/endocrinos, se incluyen la diabetes y la obesidad. Como ejemplos de cánceres para cuyo tratamiento se pueden usar los presentes compuestos, se incluyen la leucemia, los tumores cerebrales, el cáncer renal, el cáncer gástrico y el cáncer de piel, vejiga, mama, útero, pulmón, colon, próstata, ovario y páncreas.
Se puede usar un compuesto de la presente invención como inhibidor de la PI3 kinasa. Se puede tratar así a un paciente humano o animal que sufre de un trastorno inmune, cáncer, enfermedad cardiovascular, infección vírica, inflamación, un trastorno metabólico/endocrino o un trastorno neurológico mediante un método consistente en la administración al mismo de un compuesto de la presente invención según se ha definido anteriormente. La condición del paciente puede de este modo mejorar o resultar aliviada.
Se puede administrar un compuesto de la presente invención en una variedad de formas de dosificación, por ejemplo por vía oral, tal como en forma de tabletas, cápsulas, tabletas revestidas de azúcar o de película o soluciones o suspensiones líquidas, o parenteralmente, por ejemplo intramuscular, intravenosa o subcutáneamente. El compuesto puede ser, por lo tanto, administrado por inyección o infusión.
La dosificación depende de una variedad de factores, incluyendo la edad, el peso y la condición del paciente y la vía de administración. Las dosificaciones diarias pueden variar dentro de amplios límites y se ajustarán a los requerimientos individuales en cada caso particular. Típicamente, sin embargo, la dosificación adoptada para cada vía de administración cuando se administra un solo compuesto a adultos humanos es de 0,0001 a 50 mg/kg, más comúnmente de 0,001 a 10 mg/kg, de peso corporal, por ejemplo de 0,01 a 1 mg/kg. Dicha dosificación puede ser administrada, por ejemplo, de 1 a 5 veces al día. Para inyección intravenosa, una dosis diaria adecuada es de 0,0001 a 1 mg/kg de peso corporal, preferiblemente de 0,0001 a 0,1 mg/kg de peso corporal. Se puede administrar una dosificación diaria como una sola dosificación o según un protocolo de dosis divididas.
Se formula un compuesto de la invención para uso como composición farmacéutica o veterinaria que también incluye un soporte o diluyente aceptable desde el punto de vista farmacéutico o veterinario. Se preparan típicamente las composiciones siguiendo métodos convencionales y se las administra en una forma adecuada desde el punto de vista farmacéutico o veterinario. Se puede administrar el compuesto en cualquier forma convencional, por ejemplo como sigue:
A) Oralmente, por ejemplo como tabletas, tabletas revestidas, grageas, trociscos, pastillas para chupar, suspensiones acuosas u oleosas, soluciones líquidas, polvos o gránulos dispersables, emulsiones, cápsulas duras o blandas o jarabes o elixires. Las composiciones destinadas a uso oral pueden ser preparadas según cualquier método conocido en la técnica para la fabricación de composiciones farmacéuticas, y dichas composiciones pueden contener uno o más agentes seleccionados entre el grupo consistente en agentes edulcorantes, agentes saborizantes, agentes colorantes y agentes conservantes, con objeto de obtener preparaciones farmacéuticamente elegantes y palatables.
Las tabletas contienen el principio activo en mezcla con excipientes no tóxicos y farmacéuticamente aceptables adecuados para la fabricación de tabletas. Estos excipientes pueden ser, por ejemplo, diluyentes inertes, tales como carbonato de calcio, carbonato de sodio, lactosa, dextrosa, sacarosa, celulosa, almidón de maíz, almidón de patata, fosfato de calcio o fosfato de sodio; agentes granulantes y desintegrantes, por ejemplo almidón de maíz, ácido algínico, alginatos o glicolato de sodio y almidón; agentes ligantes, por ejemplo almidón, gelatina o acacia; agentes lubricantes, por ejemplo sílice, estearato de magnesio o de calcio, ácido esteárico o talco; mezclas efervescentes; tintes; edulcorantes; y agentes humectantes, tales como lecitina, polisorbatos o sulfato de laurilo. Las tabletas pueden estar sin revestir o pueden ser revestidas por técnicas conocidas para retrasar la desintegración y la adsorción en el tracto gastrointestinal y así proporcionar una acción mantenida a lo largo de un período más largo. Por ejemplo, se puede emplear un material de retardo temporal, tal como el monoestearato de glicerilo o el diestearato de glicerilo. Dichas preparaciones pueden ser fabricadas de un modo conocido, por ejemplo por medio de procedimientos de mezcla, granulación, fabricación de tabletas, revestimiento con azúcar o revestimiento con película.
Las formulaciones para uso oral pueden también presentarse como cápsulas de gelatina duras, donde el principio activo está mezclado con un diluyente sólido inerte, por ejemplo carbonato de calcio, fosfato de calcio o caolín, o como cápsulas de gelatina blandas, donde el principio activo está presente tal cual o mezclado con agua o un medio oleoso, por ejemplo aceite de cacahuete, parafina líquida o aceite de oliva.
Las suspensiones acuosas contienen los materiales activos en mezcla con excipientes adecuados para la fabricación de suspensiones acuosas. Dichos excipientes son agentes de suspensión, por ejemplo carboximetilcelulosa sódica, metilcelulosa, hidroxipropilmetilcelulosa, alginato de sodio, polivinilpirrolidona, goma tragacanto y goma acacia; los agentes dispersantes o humectantes pueden ser fosfáticos naturales, por ejemplo lecitina, o productos de condensación de un óxido de alquileno con ácidos grasos, por ejemplo estearato de polioxietileno, o productos de condensación de óxido de etileno con alcoholes alifáticos de cadena larga, por ejemplo heptadecaetilenoxicetanol, o productos de condensación de óxido de etileno con ésteres parciales derivados de ácidos grasos y un hexitol, tal como monooleato de polioxietilensorbitol, o productos de condensación de óxido de etileno con ésteres parciales derivados de ácidos grasos y anhídridos de hexitol, por ejemplo monooleato de polioxietilensorbitán.
Dichas suspensiones acuosas pueden contener también uno o más conservantes, por ejemplo p-hidroxibenzoato de etilo o n-propilo, o uno o más agentes colorantes, tales como sacarosa o sacarina.
Se puede formular la suspensión oleosa suspendiendo el principio activo en un aceite vegetal, por ejemplo aceite de cacahuete, aceite de oliva, aceite de sésamo o aceite de coco, o en un aceite mineral, tal como parafina líquida. Las suspensiones oleosas pueden contener un agente espesante, por ejemplo cera de abejas, parafina dura o alcohol cetílico.
Se pueden añadir agentes edulcorantes, tales como los expuestos anteriormente, y agentes saborizantes para obtener una preparación oral palatable. Estas composiciones pueden ser conservadas por adición de un antioxidante, tal como el ácido ascórbico. Los polvos y gránulos dispersables adecuados para la preparación de una suspensión acuosa por adición de agua proporcionan el principio activo en mezcla con un agente dispersante o humectante, un agente suspensor y uno o más conservantes. Son ejemplos de agentes dispersantes o humectantes y de agentes suspensores adecuados los ya mencionados anteriormente. También pueden estar presentes excipientes adicionales, por ejemplo agentes edulcorantes, saborizantes y colorantes.
Las composiciones farmacéuticas de la invención pueden estar también en forma de emulsiones de aceite-en-agua. La fase oleosa puede ser un aceite vegetal, por ejemplo aceite de oliva o aceite de cacahuete, o un aceite mineral, por ejemplo parafina líquida, o mezclas de éstos. Los agentes emulsionantes adecuados pueden ser gomas naturales, por ejemplo goma acacia o goma tragacanto, fosfátidos naturales, por ejemplo lecitina de soja, y ésteres o ésteres parciales derivados de ácidos grasos y anhídridos de hexitol, por ejemplo monooleato de sorbitán, y productos de condensación de dichos ésteres parciales con óxido de etileno, por ejemplo monooleato de polioxietilensorbitán. La emulsión puede contener también agentes edulcorantes y saborizantes. Se pueden formular jarabes y elixires con agentes edulcorantes, por ejemplo glicerol, sorbitol o sacarosa. En particular, un jarabe para pacientes diabéticos puede contener como soportes sólo productos, por ejemplo sorbitol, que no se metabolicen a glucosa o que sólo se metabolicen en una cantidad muy pequeña a glucosa.
Dichas formulaciones pueden contener también un demulcente, un conservante y agentes saborizantes y colorantes.
B) Parenteralmente, ya sea subcutánea, o intravenosa, o intramuscular, o intraesternalmente, o por técnicas de infusión, en forma de suspensiones acuosas u oleaginosas inyectables estériles. Esta suspensión puede ser formulada según la técnica conocida usando los agentes dispersantes o humectantes y agentes suspensores adecuados antes mencionados. La preparación inyectable estéril puede ser también una solución o suspensión inyectable estéril en un diluyente o solvente parenteralmente aceptable no tóxico, por ejemplo como una solución en 1,3-butanodiol.
Entre los vehículos y solventes aceptables que pueden ser empleados, están el agua, la solución de Ringer y la solución de cloruro de sodio isotónica. Además, se emplean convencionalmente aceites fijos estériles como solvente o medio de suspensión. Con este fin, se puede emplear cualquier aceite fijo suave, incluyendo mono-o diglicéridos sintéticos. Además, ácidos grasos tales como el ácido oleico encuentran un uso en la preparación de inyectables.
C) Por inhalación, en forma de aerosoles o soluciones para nebulizadores.
5
D) Rectalmente, en forma de supositorios preparados mezclando el fármaco con un excipiente no irritante adecuado sólido a temperatura ordinaria, pero líquido a la temperatura rectal, y se fundirá por lo tanto en el recto para liberar el fármaco. Dichos materiales son la manteca de cacao y los polietilenglicoles.
10 E) Tópicamente, en forma de cremas, ungüentos, jaleas, colirios, soluciones o suspensiones.
Se describirá aún más la invención en los Ejemplos siguientes:
15
Procedimientos sintéticos generales
Se hace referencia a los siguientes esquemas generales 1 a 8 en los Ejemplos de Referencia y Ejemplos siguientes:
Condiciones: (i) H2SO4, 21 h. (ii) Dioxano, DMF-DMA, 80˚C, 24 h, 90˚, 16 h. (iii) MeOH-THF, Níquel Raney®, NH2NH2.H2O, TA, 40 min. (iv) DMSO, KOAc, Pd(dppf)2Cl2 80˚C.
TFA, TA, 2 h. (v) H2O, KI, TA. (vi) MeOH, NaOH ac. 40%, 65˚C, 2 h. (vii) pinacol borano, Et3N, Dioxano, Pd(OAc)2, bis(ciclohexil)fosfino-2-bifenilo, 80˚C, 30 min.
Condiciones: (i) morfolina, DIPEA, dioxano, 0˚C→TA, 24 h. (ii) 3-(2-aminoetil)piridina, DIPEA, dioxano, TA→70˚C, 40
h. (iii) éster boronato, PdCl2(PCy3)2, K3PO4, dioxano, microondas 125˚C, 30 -90 minutos.
Condiciones: (i) morfolina, Et3N, MeOH, 65˚C, 18 h. (ii) nitrito de isoamilo, CH2I2, CuI, THF, 67˚C, 1 h. (iii) copulación de Suzuki, (iv) R1R2NH, NMP, 150˚C, 18 h.
Condiciones: (i) Pd2(dba)3, dppf, Zn, Zn(CN)2, DMA, 120˚C, 45 min. (ii) HCl, MeOH, 65˚C, 3 h. (iii) R1R2NH, tolueno, 10 Me3Al, 0˚C→TA, 16 h. (iv) copulación de Suzuki.
Condiciones: (i) morfolina, THF, DIPEA, 60˚C, 18 h. (ii) Oxone®, Bu4NHSO4, DCM, TA, 18 h. (iii) éster boronato, PdCl2 (PCy3)2, K3PO4, dioxano, microondas, 125˚C, 10 minutos. (iv) R1R2NH, dioxano, microondas, 150˚C, 1 hora.
Condiciones: (i) ArB(OH)2, PdCl2(PPh3)2, CH3CN-H2O, Na2CO3, microondas, 140˚C, 45 minutos. (ii) éster boronato de indol, PdCl2(PCy3)2, K3PO4, dioxano, microondas, 125˚C, 15 minutos.
10 Condiciones: (i) R = alifático: CuI, K3PO4, etilenglicol, i-propanol, 80˚C, 18 h; R = aromático: Pd2(dba)3, NaOtBu, DPPF, tolueno, TA 16 h o Pd2(dba)3, NaO’Bu, Xantphos, dioxano, TA, 4 días. (ii) Condiciones de Suzuki.
Detalles experimentales generales:
Espectrometría de RMN
Se obtuvieron los espectros de RMN en un espectrómetro Varian Unity Inova 400 con una sonda de resonancia triple de detección inversa de 5 mm que operaba a 400 MHz o en un espectrómetro Bruker Avance DRX 400 con una sonda TXI de resonancia triple de detección inversa de 5 mm que operaba a 400 MHz o en un espectrómetro Bruker Avance DPX 400 con una sonda de autoajuste dual 1H/13C de 5 mm que operaba a 400 MHz para 1H o en un espectrómetro Bruker Avance DPX 300 con una sonda de frecuencia dual de 5 mm estándar que operaba a 300 MHz. Se dan las desviaciones en ppm en relación al tetrametilsilano @ 303K.
Purificación por cromatografía en columna:
Se purificaron los compuestos purificados por cromatografía en columna usando gel de sílice o cartucho de Isolute®
o cartucho de Redisep®, eluyendo con gradientes de 100-0 a 0-100% de ciclohexano/EtOAc, o de 100-0 a 0-100% de pentano/EtOAc o de 100-0 a 70-30% DCM/MeOH (con o sin adición de NH3 al 0,1%). ’Gel de sílice’ se refiere a gel de sílice para cromatografía, de 0,035 a 0,070 mm (de 220 a 440 mallas) (v.g. gel de sílice Fluka 60), y una presión de nitrógeno aplicada de hasta 10 p.s.i. aceleró la elución de la columna. Cuando se utilizó cromatografía en capa fina (TLC), se refiere a TLC en gel de sílice usando placas, típicamente gel de sílice de 3 × 6 cm sobre placas de láminas de aluminio, con un indicador fluorescente (254 nm) (v.g. Fluka 60778).
Purificación por HPLC preparatoria:
Se purificaron los compuestos purificados por HPLC preparatoria usando o bien las condiciones A: columna de Fenilo Prep Waters XBridge (columna de 150 × 19 mm de d.i. con 5 μm de tamaño de partícula, detección PDA/MS, flujo de 21,25 ml/min), eluyendo con gradientes de 95-5% a 5-95% de agua/acetonitrilo que contenía un 0,1% de dimetiletilamina; o bien las condiciones B: columna de fase invertida C18 (columna Genesis de 100 × 22,5 mm de
d.i. con 7 μm de tamaño de partícula, o una columna de Fenilo-Hexilo (columna Gemini de 250 × 21,2 mm de d.i. con 5 μm de tamaño de partícula, detección UV a 230 ó 254 nm, flujo de 5-20 mL/min), detección UV a 230 ó 254 nm, flujo de 5-15 mL/min), eluyendo con gradientes de 100-0% a 0-100% de agua/acetonitrilo o agua/MeOH que contenía un 0,1% de TFA o agua/acetonitrilo que contenía un 0,1% de ácido fórmico. Al utilizar las condiciones B, se liberó la base libre repartiendo entre EtOAc y una solución saturada de bicarbonato de sodio. Se secó la capa orgánica (MgSO4) y se concentró a vacío. Alternativamente, se liberó la base libre pasando a través de un cartucho Isolute® SCX-2, eluyendo con NH3 en metanol.
Método general usado para la desprotección del BOC:
Se añadió a una solución de BOC-aminopirimidina en DCM TFA y se agitó la solución resultante a TA durante 30180 min. Se diluyó la mezcla resultante con agua y se extrajo después con DCM. Se secaron los extractos orgánicos combinados (MgSO4 o Na2SO4), se filtraron y se concentraron a vacío y se purificaron luego por HPLC preparatoria
o por cromatografía en columna, para obtener el producto deseado. Alternativamente, se cargó la mezcla de reacción en un cartucho Isolute® SCX-2, se lavó con MeOH y se eluyó después con NH3 2 M en MeOH. Se purificó entonces el residuo resultante por HPLC preparatoria o por cromatografía en columna, para obtener el producto deseado.
Abreviaturas usadas en la sección experimental:
ac. = acuoso BOC = t-Butoxicarbonilo s amp. = singlete amplio (RMN) Cs2CO3 = carbonato de cesio d = doblete (RMN) DCM = diclorometano DIPEA = diisopropiletilamina DMA = dimetilacetamida DMAP = dimetilaminopiridina DME = dimetoxietano DMF = dimetilformamida DMSO = sulfóxido de dimetilo eq. = equivalentes EtOAc = acetato de etilo EtOH = etanol h = hora(s) HATU = Hexafluorofosfato de O-(7-azabenzotriazol-1-il)-N,N,N’,N’-tetrametiluronio HCl = ácido clorhídrico H2O = agua HPLC = cromatografía líquida de alta presión AMI = alcohol metilado industrial iPrOH = isopropanol LCMS = cromatografía líquida espectrometría de masas M = molar m = multiplete (RMN) MeOH = metanol mg = miligramo MgSO4 = sulfato de magnesio min = minuto(s) mL = mililitro Na2CO3 = carbonato de sodio NaHCO3 = hidrógeno carbonato de sodio NaOH = hidróxido de sodio Na2SO4 = sulfato de sodio RMN = resonancia magnética nuclear c = cuartete (RMN) Rt = tiempo de retención TA = temperatura ambiente sat = saturado t = triplete (RMN) TFA = ácido trifluoroacético THF = tetrahidrofurano TLC = cromatografía en capa fina
Se preparó el éster boronato producto de la etapa final del esquema 1 anterior como sigue. Se añadieron a una solución de haluro (1 eq.) y bis(pinacolato)diboro (1,3 eq.) en DMSO KOAc (3 eq.) y [1,1’-bis(difenilfosfino)ferroceno]dicloropaladio (0,05 eq.). Se calentó la mezcla a 90˚C hasta completarse la reacción. Se repartió la mezcla de reacción entre EtOAc y H2O. Se lavó la capa orgánica sucesivamente con H2O y solución salina saturada, se secó sobre Na2SO4 y se evaporó a sequedad. Se purificó entonces el residuo resultante por cromatografía en columna.
Se realizó la copulación de Suzuki representada en términos generales en el esquema 3 anterior usando una de las tres estrategias sintéticas siguientes:
Método A.
Se calentó una mezcla de 2-cloropirimidina (1 eq.), Cs2CO3 (1,5 eq.), éster boronato de indol (1,2 eq.) y tetrakis(trifenilfosfino)paladio (0,05 eq.) en dioxano/agua (3:1) a 125˚C durante 10-30 min en un reactor de microondas (sintetizador Smith). Se diluyó la mezcla resultante con agua y se extrajo luego con acetato de etilo. Se secaron las capas orgánicas combinadas (MgSO4), se filtraron y se concentraron y se purificaron después por HPLC preparatoria o por cromatografía en columna, para obtener el producto deseado.
Método B.
Se calentó una mezcla agitada de cloropirimidina (1 eq.), éster boronato de indol (1,4 eq.) y PdCl2(PCy3)2 (0,02 eq.) en K3PO4 (0,5 ml de una solución acuosa 1,27 M) y dioxano (1,0 mL) a 125˚C en un microondas durante 15 min. Se purificó el producto por captura y liberación usando un cartucho Isolute SCX-2, seguido de cromatografía instantánea, para obtener el producto deseado.
Método C.
Se calentó una mezcla de cloropirimidina (1 eq.), Na2CO3 acuoso 1M (3 eq.), éster boronato de indol (1,8 eq) y diclorobis(trifenilfosfino)paladio (II) (0,05 eq.) en acetonitrilo durante 30-60 minutos en un reactor de microondas a 140˚C. Se repartió la mezcla entre agua y diclorometano y se lavaron las capas orgánicas combinadas con solución salina saturada, se separaron y se secaron (MgSO4). Se purificó el producto bruto por cromatografía en columna para obtener el compuesto deseado.
Se añadió a una solución de dimetilamina en H2O (40% p/p, 15,0 mL, 120 mmol) a 0˚C una solución de cloruro de 4
5 metil-3-nitrobencenosulfonilo (9,42 g, 40 mmol) en DCM (60 mL) a lo largo de 30 min. Se agitó la mezcla resultante a 0˚C durante 30 min antes de dejarla calentar hasta la TA y se agitó durante la noche. Se diluyó la mezcla de reacción con H2O (100 mL) y DCM (40 mL) y se separaron las capas. Se lavó la capa orgánica sucesivamente con agua, HCl (ac., 0,1 M) y solución salina saturada antes de secarla sobre Na2SO4 y se evaporó a sequedad, para obtener el compuesto del título como un sólido amarillo claro (9,13 g, 94%).
10
[M + H]+ 244,9.
15
Se añadió a una solución de 4-N,N-trimetil-3-nitro-bencenosulfonamida (8,57 g, 34,7 mmol) en ácido sulfúrico concentrado (80 mL) 1,3-dibromo[1,3,5]triazinano-2,4,6-triona (5,97 g, 20,8 mmol) y se agitó la mezcla de reacción naranja a TA durante 16 h. Se añadieron otros 2 g de 1,3-dibromo[1,3,5]triazinano-2,4,6-triona y se continuó agitando durante 5 h. Se vertió entonces la mezcla de reacción sobre hielo y agua y se agitó durante 15 min. Se filtró
20 el sólido lechoso/blanco resultante y se lavó con H2O antes de disolverlo en EtOAc. Se seco la capa orgánica sobre Na2SO4 y se evaporó a sequedad, para obtener el compuesto del título como un sólido blanco (10,41 g, 93%).
[M + H]+ 323,1 (79Br) 325,0 (81Br).
Preparado según el método usado en la preparación de 3-bromo-4-N,N-trimetil-5-nitrobencenosulfonamida utilizando 4-metanosulfonil-1-metil-2-nitrobenceno en lugar de 4-N,N-trimetil-3-nitrobencenosulfonamida. Se obtuvo el 30 compuesto del título como un sólido blanco (17,0 g, 85%).
[M + H]+ 294,1 (79Br) 296,0 (81Br).
35
Preparado según el método usado en la preparación de 3-bromo-4-N,N-trimetil-5-nitrobencenosulfonamida utilizando 4-fluoro-1-metil-2-nitrobenceno en lugar de 4-N,N-trimetil-3-nitrobencenosulfonamida. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido amarillo (68,0 g, 79%).
RMN δH (300 MHz, CDCl3) 2,59 (s, 3H), 7,50 (dd, J = 2,8, 7,6, 1H) y 7,58 (dd, J = 2,9, 7,4, 1H).
21
Se añadió a una solución de 3-bromo-4-N,N-trimetil-5-nitrobencenosulfonamida (9,15 g, 28,3 mmol) en dioxano (60
5 mL) DMF-DMA (11,3 mL, 84,9 mmol). Se calentó la mezcla de reacción de color rojo intenso a 80˚C durante 24 h, seguido de calentamiento a 90˚C durante 16 h. Se enfrió la mezcla a TA y se concentró al 50% del volumen, se vertió en H2O y se extrajo en EtOAc. Se aisló la capa orgánica y se lavó con H2O y luego con solución salina saturada, se secó sobre Na2SO4 y se evaporó a sequedad, para obtener 3-bromo-4-(2-dimetilaminovinil)-N,N-dimetil5-nitrobencenosulfonamida como un sólido rojo (10,4 g, 91%). Se añadió a una suspensión de la amida (10,4 g, 25,7
10 mmol) y níquel Raney® (suspensión en H2O, 20 mL) en MeOH:THF (1:1, 200 mL) monohidrato de hidrazina (1,9 mL, 38,6 mmol) a 0˚C y se agitó la mezcla a TA durante 40 min. Se filtró entonces la mezcla de reacción a través de Celite y se lavó la torta del filtro con EtOAc y H2O. Se aisló la capa acuosa y se extrajo después con EtOAc. Se lavaron las capas orgánicas combinadas con H2O, seguida de solución salina saturada, se secaron sobre Na2SO4 y se evaporaron luego a sequedad. Se purificó el sólido rosa resultante por cromatografía en columna y se recristalizó
15 a continuación con iPrOH y EtOH, para obtener el compuesto del título como un sólido blanco (3,5 g, 41%).
RMN δH (400 MHz, CDCl3) 2,72 (s, 6H), 6,70 (m, 1H), 7,49 (t aparente, J = 2,7, 1H), 7,68 (d, J = 1,1, 1H), 7,94 (m, 1H) y 9,04 (s amp., 1H).
Preparado según el método usado en la preparación de dimetilamida del ácido 4-bromo-1H-indol-6-sulfónico utilizando 1-bromo-5-metanosulfonil-2-metil-3-nitrobenceno en lugar de 3-bromo-4-N,N-trimetil-5-nitrobencenosulfo25 namida. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido blanco (1,8 g, 76%).
RMN δH (300 MHz, CDCl3) 3,11 (s, 3H), 6,70 (m, 1H), 7,52 (dd, J = 2,5, 3,0, 1H), 7,81 (d, J = 1,5, 1H), 8,10 (dd, J = 1,0, 1,5, 1H) y 9,34 (s amp., 1H).
Preparado según el método usado en la preparación de dimetilamida del ácido 4-bromo-1H-indol-6-sulfónico utilizando 1-bromo-5-fluoro-2-metil-3-nitrobenceno en lugar de 3-bromo-4-N,N-trimetil-5-nitrobencenosulfonamida. 35 Se obtuvo el compuesto del título como un sólido blanco (6,06 g, 33%).
RMN δH (300 MHz, CDCl3) 6,57 (t aparente, J = 2,7, 1H), 7,04 (dd, J = 2,1, 9,1, 1H), 7,12 (dd, J = 2,1, 9,1, 1H), 7,207,25 (m, 1H) y 8,25 (s, 1H).
Se añadió a una solución de 4-metilbenzotrifluoruro (9,51 g, 59,4 mmol) en ácido sulfúrico concentrado (120 mL) nitrato de potasio (15,0 g, 0,149 mol) y se agitó la mezcla resultante a TA durante 16 h. Se vertió la mezcla de reacción en hielo y agua y se extrajo después en EtOAc. Se lavó la capa orgánica sucesivamente con H2Oy solución salina saturada, se secó sobre Na2SO4 y se evaporó a sequedad, para obtener el compuesto del título
5 como un sólido amarillo (13,84 g, 93%).
RMN δH (400 MHz, CDCl3) 2,67 (s, 3H) y 8,27 (s, 2H).
10
Preparado según el método usado en la preparación de dimetilamida del ácido 4-bromo-1H-indol-6-sulfónico utilizando 2-metil-1,3-dinitro-5-trifluorometilbenceno en lugar de 3-bromo-4,N,N-trimetil-5-nitrobencenosulfonamida. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido blanco (10,7 g, 99%).
[M + H]+ 201,1.
20
Se añadió a una suspensión de 6-trifluorometil-1H-indol-4-ilamina (10,7 g, 53,4 mmol) en HCl (ac., 15%, 240 mL) una solución de nitrito de sodio (5,52 g, 80,1 mmol) en H2O (10 mL) lentamente a 0˚C. Se agitó la mezcla de reacción a TA durante 1 h antes de añadir una solución de tetrafluoroborato de sodio (23,5 g, 0,214 mol) en H2O (30 mL). Después de agitar durante 15 min, se recogió el precipitado resultante por filtración y se lavó con una solución 25 de tetrafluoroborato de sodio (ac., sat) antes de disolver en acetonitrilo (100 mL). Se añadió esta solución lentamente a una suspensión de yoduro de sodio (24,0 g, 0,160 mol) en acetonitrilo (100 mL) y se agitó la mezcla a TA durante 16 h. Se concentró la mezcla de reacción al 30% del volumen y se repartió entre EtOAc y H2O. Se aisló la capa orgánica y se lavó después sucesivamente con tiosulfato de sodio, H2O y solución salina saturada, se secó sobre Na2SO4 y se evaporó a sequedad. Se purificó el aceite marrón resultante por cromatografía en columna, para
30 obtener el compuesto del título (9,77 g, 59%).
[M -H]-310,1.
35
Se trató una solución de 4-bromo-1H-indol-6-carbonitrilo (1 g, 4,50 mmol) en metanol (10 mL) con peróxido de hidrógeno acuoso al 30% (2,7 mL, 4,95 mmol) y una solución acuosa de hidróxido de sodio 1 M (5 mL) y se calentó después a 40˚C durante 1 h. Se enfrió la mezcla de reacción, se trató con agua y se enfrió en un baño de hielo. Se
40 recogió el precipitado resultante por filtración, se lavó con agua y se secó a vacío, para obtener amida del ácido 4bromo-1H-indol-6-carboxílico (1,05 g, 97%), que se transformó en el éster borónico del título por el método general (Esquema 1) (0,80 g, 67%).
RMN δH (300 MHz, DMSO-d6) 1,35 (s, 12H), 6,78 (m, 1H), 7,10 (s, 1H), 7,51-7,54 (m, 1H), 7,94-7,97 (m, 2H), 8,06 (s, 45 1H) y 11,40 (s amp., 1H).
5
10
15
20
25
30
35
40
45
Se trató una solución de 5-fluoroindol (5 g, 37,0 mmol) en DMF (40 mL) a 0˚C con anhídrido trifluoroacético (6,1 mL, 42,6 mmol). Después de 30 min, se vertió la reacción en agua y se recogió el precipitado resultante por filtración, se lavó con agua y se secó luego a vacío. Se disolvió entonces el sólido en NaOH acuoso al 10% (200 mL) y se calentó a reflujo durante 1 h. Se enfrió luego la mezcla de reacción, se lavó con diclorometano y se acidificó con HCl acuoso. Se recogió el precipitado blanco resultante por filtración, se lavó con agua, se recogió en diclorometano, se lavó con agua, se secó (MgSO4) y se evaporó a vacío. Se disolvió el material resultante (5 g, 75%) en metanol (80 mL) y se trató con ácido sulfúrico concentrado (2 mL) y se calentó después a reflujo durante la noche. Se enfrió la reacción y se recogió el precipitado resultante, se lavó con agua y se evaporó a vacío, para obtener éster metílico del ácido 5fluoro-1H-indol-3-carboxílico como un sólido de color melocotón (4,5 g, 83%).
Se añadió una solución de tris(trifluoroacetato) de talio (8,45 g, 15,6 mmol) en TFA (35 mL) a una solución de éster metílico del ácido 5-fluoro-1H-indol-3-carboxílico (2 g, 10,4 mmol) en TFA (10 mL) a temperatura ambiente y se agitó durante 2 h. Se evaporó la mezcla de reacción a vacío y se suspendió el residuo resultante en agua (25 mL) antes de tratarlo con una solución de yoduro de potasio (5,2 g, 31,3 mmol) en agua (50 mL). Se trató la mezcla de reacción con diclorometano (100 mL) y metanol (5 mL) y se eliminó el precipitado resultante por filtración a través de celita. Se separó la capa orgánica, se lavó sucesivamente con una solución de tiosulfato de sodio y solución salina saturada, se secó después (MgSO4) y se evaporó a vacío. Se disolvió el material resultante en metanol (60 mL) y se trató con una solución acuosa de NaOH al 40% (60 mL) y se sometió después a reflujo durante 2 h. Se enfrió la mezcla de reacción y se extrajo con DCM/MeOH (proporción 95:5), se secó (MgSO4), se filtró y se evaporó a vacío, para obtener un sólido bruto. La purificación por cromatografía en columna dio 5-fluoro-4-yodo-1H-indol como un sólido marrón claro (1,05 g, 39%).
RMN δH (300 MHz, CDCl3) 6,49-6,52 (m, 1H), 6,95 (dt aparente, J = 0,4, 8,6, 1H), 7,26-7,33 (m, 2H) y 8,35 (s, 1H).
Se trató una solución de 5-fluoro-4-yodo-1H-indol (261 mg, 1,0 mmol) en dioxano (1 mL) con trietilamina (0,2 mL, 1,4 mmol), acetato de paladio (4,5 mg, 0,02 mmol) y bis(ciclohexil)fosfino-2-bifenilo (28 mg, 0,08 mmol) y se calentó después a 80˚C. Se añadió una solución de pinacolborano (1 M en THF, 2,66 mL, 2,66 mmol) mediante jeringa. Después de 30 min, se enfrió la mezcla de reacción y se diluyó luego con agua (10 mL) y DCM (10 mL). Se pasó la mezcla resultante a través de un cartucho de separación de fases y se evaporó la capa del diclorometano a vacío, para obtener el compuesto del título, que fue usado sin mayor purificación.
Se añadió a una mezcla de 4-(6-cloro-2-yodopirimidin-4-il)morfolina (2 g, 6,14 mmol), tris(dibencilidenacetona)dipaladio (113 mg, 0,123 mmol), 1,1’-bis(difenilfosfino)ferroceno (136 mg, 0,246 mmol), polvo de zinc (48 mg, 0,737 mmol) y cianuro de zinc (433 mg, 3,69 mmol) DMA (20 mL). Se desgasificó la mezcla de reacción y se calentó después a 120˚C durante 45 min. Se dejó enfriar a la mezcla de reacción hasta la TA y se diluyó con EtOAc y amoníaco acuoso (33%). Se aisló la capa orgánica, se lavó con solución salina saturada, se secó después (Na2SO4) y se concentró a vacío. Se purificó el residuo resultante por cromatografía en columna, para obtener el compuesto del título como un sólido amarillo (910 mg, 66%).
[M]+ 224,6.
Se disolvió 4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidino-2-carbonitrilo (1 g, 4,46 mmol) en una solución sat. de HCl en MeOH (40
5 mL) y se calentó a reflujo durante 3 h. Se evaporó el solvente y se disolvió el residuo resultante en DCM y se lavó después con una solución acuosa sat. de NaHCO3. Se secó la capa orgánica (MgSO4) y se concentró a vacío, para obtener el compuesto del título como un sólido amarillo (851 mg, 74%).
[M]+ 257,7.
10
Se añadió a una solución de N,N-dimetiletilenamina (128 μL, 1,16 mmol) en tolueno anhidro (8 mL) trimetilaluminio
15 (2 M en tolueno, 0,58 mL, 1,16 mmol) a 0˚C. Se agitó la mezcla resultante a 0˚C durante 30 min. Se añadió éster metílico del ácido 4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidino-2-carboxílico (300 mg, 1,16 mmol) por porciones a 0˚C. Se dejó que la mezcla de reacción se calentara hasta la TA y se agitó durante 16 h. Se añadió una solución de NaOH (ac., 4 M) gota a gota y se extrajo la capa acuosa con EtOAc. Se lavaron las capas orgánicas combinadas con solución salina saturada, se secaron (MgSO4) y se concentraron después a vacío. Se purificó el residuo resultante por
20 cromatografía en columna, para obtener el compuesto del título como un sólido de color canela (200 mg, 55%).
[M + H]+ 314,2.
25
Preparado según el método usado en la preparación de (2-dimetilaminoetil)amida del ácido 4-cloro-6-morfolin-4ilpirimidino-2-carboxílico utilizando 3-aminopiridina en lugar de N,N-dimetiletilenamina. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido blanco (55,2 mg, 59%).
[M + H]+ 320,2.
Se preparó 4-(2,6-dicloropirimidin-4-il)morfolina como se describe en WO2006/060194.
A una solución agitada de 4-(2,6-dicloropirimidin-4-il)morfolina (936 mg; 4,0 mmol) y DIPEA (0,77 ml; 4,4 mmol) en dioxano (10 ml) a 5˚C se añadió 3-(2-aminoetil)piridina (0,53 ml; 4,4 mmol). Se retiró el baño refrigerante y se agitó
5 la mezcla de reacción a t.a. durante 5 h y se calentó después a 70˚C durante 40 h. Se eliminaron los volátiles a vacío y se purificó el residuo por cromatografía instantánea (EtOAc/MeOH 95:5 como eluyente), para obtener el compuesto del título como un sólido cristalino blanco (963 mg; 75%).
δH (400 MHz, CDCl3) 2,91 (t, J = 7,2, 2H), 3,57 (t, J = 4,8, 4H), 3,66 (c, J = 7,2, 2H), 3,77 (t, J = 4,8, 4H), 5,00 (s 10 amp., 1H), 5,90 (s, 1H), 7,24 (dd, J = 7,6 y 4,8, 1H), 7,55 (d, J = 7,6, 1H), 8,49-8,51 (m, 2H).
15 Se preparó 4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-ilamina como se describe en Acta Crystallogr. Sect. C: Cryst. Struct. Commun.; EN; 59; 1; 2003; 4-8.
Se añadió a una mezcla de 4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-ilamina (200 mg, 0,93 mmol), diyodometano (0,37 mL, 4,59 mmol) y yoduro de cobre (I) (177 mg, 0,93 mmol) en tetrahidrofurano (5 mL) nitrito de isoamilo (0,36 mL, 2,75
20 mmol). Se enjuagó la mezcla con nitrógeno y se calentó a reflujo durante 1 hora. Se repartió la mezcla de reacción enfriada entre acetato de etilo y ácido clorhídrico 1M. Se lavaron las capas orgánicas con amoníaco acuoso concentrado, seguido de cloruro de amonio acuoso saturado, y se secó (MgSO4). Se purificó el producto bruto por cromatografía en columna, para obtener el compuesto del título como un sólido amarillo (141 mg).
25 δH (400 MHz, CDCl3) 3,63 (m amp., 4H), 3,78 (t, J = 4,9, 4H), 6,44 (s, 1H).
[M + H]+ 325,95.
30
Se añadió a una solución agitada de 4,6-dicloro-2-(metiltio)pirimidina (15,44 g; 79 mmol) y DIPEA (15 ml; 86 mmol) en THF (200 ml) a TA morfolina (7,6 mL; 87 mmol) en una porción (se forma un precipitado blanco espeso en unos cuantos minutos). Se calentó la mezcla de reacción a 60˚C durante la noche (18 h), tiempo durante el cual se
35 disolvieron todos los sólidos. Se vertió la mezcla de reacción enfriada en agua bien agitada (1,5 L) y se recogió el sólido blanco resultante por filtración, se lavó con agua y se secó, para obtener 4-(6-cloro-2-metilsulfanilpirimidin-4il)morfolina como un sólido blanco (19,03 g; 98%).
Se añadió a una solución agitada de Oxone® (30,74 g; 50 mmol) y Bu4NHSO4 (0,68 g; 2,0 mmol) una solución de 4
40 (6-cloro-2-metilsulfanilpirimidin-4-il)morfolina (4,91 g; 20 mmol) en CH2Cl2 (150 mL). Se agitó la mezcla bifásica vigorosamente durante la noche (18 h), tiempo después del cual se eliminó el CH2Cl2 que quedaba a vacío. Se recogió el precipitado resultante por filtración, se lavó con agua y se secó, para obtener 4-(6-cloro-2metanosulfonilpirimidin-4-il)morfolina como un sólido blanco (4,37 g; 79%).
45 [M+H]+ 278.
Se calentó una mezcla agitada de 4-(6-cloro-2-metanosulfonilpirimidin-4-il)morfolina (1,0 g; 3,6 mmol), 6-fluoro-4(4,4,5,5-tetrametil[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-1H-indol (1,13 g; 4,3 mmol), PdCl2(PCy3)2 (53 mg; 0,072 mmol), K3PO4 (5 ml de una solución acuosa 1,27M; 6,4 mmol) y dioxano (10 ml) a 125˚C en un microondas durante 10 min. Se diluyó la mezcla de reacción con NaHCO3 sat. (50 ml) y se extrajo con CHCl3 (2 x 100 ml). Se secaron las capas orgánicas combinadas (Na2SO4), se concentraron y se purificaron por cromatografía instantánea (CH2Cl2/EtOAc 70:30 como eluyente), para obtener un sólido verde. La trituración con metanol y el secado dieron el compuesto del título como un sólido verde claro (724 mg; 53%).
5
δH (400 MHz, CDCl3) 3,40 (s, 3H), 3,83-3,86 (m, 8H), 7,04-7,05 (m, 1H), 7,07 (s, 1H), 7,24-7,27 (m, 1H), 7,34-7,36 (m, 1H), 7,43 (dd, J = 10,4 y 2,4, 1H), 8,40 (s amp., 1H),
10
Preparado utilizando el método general del Esquema 1. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido de color blanco hueso.
15 δH (400 MHz, CDCl3) 1,40 (s, 12H), 7,12 (m, 1H), 7,46 (t, J=2,9, 1H), 7,8 (t, J=1,1, 1H), 7,87 (d, J=1,3, 1H), 8,42 (s amp., 1H).
20
Preparado utilizando el método general del Esquema 1. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido blanco (1,85 g, 46%).
25 [M + H]+ 350,2 (10B) 351,2 (11B).
30 Preparado utilizando el método general del Esquema 1. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido amarillo claro (1,37 g, 92%).
[M + H]+ 311,2 (10B) 312,2 (11B).
Preparado utilizando el método general del Esquema 1. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido amarillo 5 claro (2,4 g, 51%).
RMN δH (300 MHz, DMSO-d6) 1,36 (s, 12H), 3,18 (s, 3H), 6,87 (m, 1H), 7,73 (t aparente, J = 2,5, 1H), 7,85 (d, J = 1,5, 1H), 8,07 (dd, J = 1,0, 1,5, 1H) y 11,73 (s amp., 1H).
Preparado utilizando el método general del Esquema 1. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido blanco (4,6 g, 61%).
15
RMN δH (300 MHz, CDCl3) 1,39 (s, 12H), 7,02 (m, 1H), 7,14-7,19 (m, 1H), 7,20-7,26 (m, 1H), 7,38 (dd, J = 2,4, 9,9, 1H) y 8,16 (s, 1H).
Ejemplo de Referencia 27: Éster terc-butílico del ácido 7-(4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-ilamino)-3,420 dihidro-1H-isoquinolino-2-carboxílico
Se añadieron a una mezcla de 4-(6-cloro-2-yodopirimidin-4-il)morfolina (100 mg, 0,307 mmol) y éster terc-butílico del ácido 7-amino-3,4-dihidro-1H-isoquinolino-2-carboxílico (114 mg, 0,461 mmol) en tolueno anhidro (2 mL)
25 tris(dibencilidenacetona)dipaladio (8 mg, 0,009 mmol), 1,1’-bis(difenilfosfino)ferroceno (12 mg, 0,021 mmol) y tercbutóxido de sodio (74 mg, 0,768 mmol). Se desgasificó la mezcla de reacción y se purgó con argón, se calentó a 30˚C durante 20 min y se agitó luego a TA durante 16 h. Se cargó la mezcla de reacción bruta en un cartucho Isolute® SCX-2, se lavó con MeOH y se eluyó después con NH3 2 M en MeOH. Se purificó el residuo resultante por cromatografía en columna, para obtener el compuesto del título como un vidrio marrón (137 mg, 100%).
30
[M + H]+ 446,3.
5
10
15
20
25
30
35
40
Se agitó una mezcla de 4-(6-cloro-2-yodopirimidin-4-il)morfolina (1,12 g; 3,4 mmol), éster terc-butílico del ácido 6amino-3,4-dihidro-1H-isoquinolino-2-carboxílico (1,88 g; 7,6 mmol), NaOBut (0,46 g; 4,8 mmol), Pd2dba3 (47 mg; 0,051 mmol) y Xantphos (98 mg; 0,17 mmol) en dioxano (40 ml) bajo argón a t.a. durante 4 días. Se diluyó la mezcla de reacción con agua (50 ml) y solución salina saturada (150 ml) y se extrajo luego en EtOAc (2 × 100 ml). Se secaron las capas orgánicas combinadas (Na2SO4), se concentraron y se purificaron por cromatografía ISCO, para obtener el compuesto del título como un sólido blanco (543 mg; 36%).
δH (400 MHz, CDCl3) 1,51 (s, 9H), 2,81-2,84 (m, 2H), 3,60-3,67 (m, 6H), 3,78-3,81 (m, 4H), 4,55 (s, 2H), 6,04 (s, 1H), 6,85 (s, 1H), 7,07 (d, J = 8,0, 1H), 7,32 (s, 1H), 7,37 (d, J = 8,0, 1H).
Se añadió 1,2,3,4-tetrahidroisoquinolina (10 ml; 80 mmol) gota a gota a lo largo de 10 min. a H2SO4 conc. agitado a 0˚C. Se añadió KNO3 por porciones a lo largo de 5 min. a 0˚C y se agitó la mezcla resultante durante la noche mientras se dejaba que se calentara hasta la t.a. Se apagó la mezcla de reacción vertiéndola sobre agua helada (300 ml) y se alcalinizó con NH4OH. Se extrajo la mezcla con CH2Cl2 (2 x 300 ml) y se secaron las capas orgánicas combinadas (Na2SO4) y se concentraron. Se disolvió el residuo rojo obscuro en EtOH (400 ml) y se trató con HCl(g) durante 5 min. Se recristalizó el sólido resultante con EtOH, para obtener clorhidrato de 7-nitro-1,2,3,4tetrahidroisoquinolina como un sólido de color blanco hueso (4,69 g).
Se agitó clorhidrato de 7-nitro-1,2,3,4-tetrahidroisoquinolina (2,57 g) en CH2Cl2/ NaHCO3 sat. durante 40 min. Tras la separación de las capas (frita hidrofóbica), se evaporó el solvente y se disolvió el sólido resultante en EtOH (80 ml), se añadió PtO2 (112 mg) y se agitó la mezcla bajo una atmósfera de hidrógeno durante 3 h. Se eliminó el catalizador por filtración y se evaporó el solvente, para obtener 7-amino-1,2,3,4-tetrahidroisoquinolina como un sólido marrón (1,73 g).
Se añadió a una solución agitada de 7-amino-1,2,3,4-tetrahidroisoquinolina (1,73 g; 11,7 mmol) y NEt3 (1,9 ml; 13,6 mmol) en CH2Cl2 (30 ml) a t.a. clorformiato de bencilo (1,8 ml; 12,5 mmol). Se agitó la mezcla de reacción a t.a. durante 3 h, tiempo después del cual se apagó con NaHCO3 sat. (30 ml), se separaron las capas (frita hidrofóbica) y se evaporó el solvente. La purificación por cromatografía instantánea dio el compuesto del título como un sólido de color blanco hueso (1,85 g; 56%).
δH (400 MHz, CDCl3) 2,76 (s amp., 2H), 3,59 (s amp., 2H), 3,71 (s amp., 2H), 4,58 (s, 2H), 5,20 (s, 2H), 6,43-6,57 (m, 2H), 6,94 (d, J = 7,6, 1H), 7,33-7,42 (m, 5H).
Se calentó una solución agitada de éster bencílico del ácido 7-amino-3,4-dihidro-1H-isoquinolino-2-carboxílico (0,85 g; 3,0 mmol), 4-(2,6-dicloropirimidin-4-il)morfolina (0,59 g; 2,5 mmol) y HCl conc. (7 gotas) en dioxano (10 ml) en un microondas a 110˚C durante 1 h. Se diluyó la mezcla de reacción con CH2Cl2 (40 ml) y se lavó con Na2CO3 sat. (40 ml). Se separó la capa orgánica (frita hidrofóbica), se concentró y se purificó por cromatografía instantánea, para
5 obtener el compuesto del título como un sólido de color blanco hueso (430 mg; 36%).
δH (400 MHz, CDCl3) 2,74 (s amp., 2H), 3,52-3,68 (m, 10H), 4,55 (s amp., 2H), 5,11 (s, 2H), 5,95 (s, 1H), 6,76 (s amp., 1H), 7,00 (d, J = 8,0, 1H), 7,25-7,45 (m, 8H).
10 Ejemplo de Referencia 31: Éster terc-butílico del ácido 5-(4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-ilamino)-3,4-dihidro-1H-isoquinolino-2-carboxílico
Se agitó una mezcla de 4-(6-cloro-2-yodopirimidin-4-il)morfolina (326 mg; 1,0 mmol), éster terc-butílico del ácido 5
15 amino-3,4-dihidro-1H-isoquinolino-2-carboxílico (323 mg; 1,3 mmol), NaOBut (135 mg; 1,4 mmol), Pd2dba3 (13,7 mg; 0,015 mmol) y Xantphos (28,9 mg; 0,05 mmol) en dioxano (2,5 ml) bajo argón a 80˚C durante 3 h. Se diluyó la mezcla de reacción con agua (10 ml) y solución salina saturada (20 ml) y se extrajo después en CH2Cl2 (2 x 35 ml). Se secaron las capas orgánicas combinadas (Na2SO4), se concentraron y se purificaron por cromatografía instantánea (EtOAc/Petróleo 60:40 a 70:30), para obtener el compuesto del título como un sólido blanco (114 mg).
20 δH (400 MHz, CDCl3) 1,51 (s, 9H), 2,75 (t, J = 6,0, 2H), 3,55-3,58 (m, 4H), 3,69 (t, J = 6,0, 2H), 3,74-3,77 (m, 4H), 4,61 (s, 2H), 6,03 (s, 1H), 6,59 (s amp., 1H), 6,92 (d, J = 8,0, 1H), 7,22 (t, J = 8,0, 1H), 7,75 (d, J = 8,0, 1H),
25
Se añadió a una mezcla de 4-(6-cloro-2-yodopirimidin-4-il)morfolina (163 mg, 0,500 mmol) y clorhidrato de 2-tiazol-2iletilamina (95 mg, 0,575 mmol) en tolueno anhidro (2 mL) se añadieron acetato de paladio (II) (1 mg, 0,005 mmol), 2,2’-bis(difenilfosfino)-1,1’-binaftaleno (4,5 mg, 0,007 mmol) y terc-butóxido de sodio (134 mg, 1,4 mmol). Se
30 desgasificó la mezcla de reacción y se purgó con argón y se calentó luego a 80˚C durante 16 h. Se repartió la mezcla de reacción bruta entre DCM y solución salina saturada. Se aisló la capa orgánica, se secó (MgSO4) y se concentró después a vacío. Se purificó el residuo resultante por cromatografía en columna, para obtener el compuesto del título como un sólido blanco (77 mg, 48%).
35 [M + H]+ 326,1.
40 Se añadieron a una solución de (6-metilpiridin-2-il)metanol (0,6 g, 4,872 mmol) en DCM (18 mL) trifenilfosfina (1,68 g, 6,405 mmol) y tetrabromuro de carbono (1,97 g, 5,940 mmol) antes de agitar la mezcla resultante a TA durante 3
h. Se concentró entonces la mezcla de reacción bruta a vacío y se purificó el residuo resultante por cromatografía en columna, para obtener el compuesto del título como un aceite rosa claro (0,47 g, 52%).
[M + H]+ 185,8 (79Br) 187,8 (81Br).
Se añadieron a una solución de 2-bromometil-6-metilpiridina (0,47 g, 2,526 mmol) en acetonitrilo (25 mL) cianuro de trimetilsililo (0,5 mL, 3,75 mmol) y TBAF (1 M en THF, 3,8 mL, 3,8 mmol) antes de calentar la mezcla resultante a reflujo durante 15 min. Se enfrió la mezcla a TA y se añadió cuidadosamente NH4OH. Se extrajo la mezcla con EtOAc y se separaron las capas. Se secó la capa orgánica (MgSO4) y se concentró después a vacío. Se purificó el residuo resultante por cromatografía en columna, para obtener el compuesto del título como un aceite incoloro (0,326 mg, 98%).
1H RMN (400 MHz, CDCl3): δ 2,55 (s, 3 H), 3,89 (s, 2 H), 7,12 (d, J = 7,7, 1 H), 7,25 (d, J = 7,7 Hz, 1 H) y 7,62(t aparente, J = 7,7 Hz, 1 H).
Se añadió a una solución de (6-metilpiridin-2-il)acetonitrilo (326 mg, 2,467 mmol) en THF anhidro (60 mL) una solución de complejo de borano-sulfuro de dimetilo en THF (2 M, 5,5 mL, 11,0 mmol) gota a gota. Se calentó la mezcla resultante a reflujo durante 2 h y se enfrió después hasta la TA. Se añadieron MeOH y una solución acuosa de HCl (1 M, 3 mL) y se agitó la mezcla a TA durante 30 min. Se cargó la mezcla de reacción bruta en un cartucho de Isolute® SCX-2, se lavó con MeOH y se eluyó luego con NH3 2 M en MeOH, para obtener el compuesto del título como un aceite amarillo obscuro (188 mg, 56%).
1H RMN (400 MHz, CDCl3): δ 1,35 (s amp., 2 H), 2,53 (s, 3 H), 2,89 (t, J = 6,7 Hz, 2 H), 3,08 (t, J = 6,7 Hz, 2 H), 6,98 (m, 2 H) y 7,49 (t aparente, J = 7,65 Hz, 1 H).
Se suspendieron 2-fluoropiridino-4-carbaldehído (270 mg, 2,158 mmol), nitrometano (140 μL, 2,583 mmol) y trietilamina (600 μL, 4,328 mmol) en DCM (5 mL) y se agitó a TA durante 1 h y se concentró después a vacío, para obtener 1-(2-fluoropiridin-4-il)-2-nitroetanol en forma de aceite. Se redisolvió el 1-(2-fluoropiridin-4-il)-2-nitroetanol bruto en DCM (5 mL) y se trató luego con cloruro de metanosulfonilo (500 μL, 6,46 mmol) y trietilamina (0,94 mL, 6,81 mmol). Se agitó la mezcla de reacción a TA durante 20 min y se concentró después a vacío. Se purificó el residuo resultante por cromatografía en columna, para obtener el compuesto del título como un sólido marrón (198 mg, 55%).
1H RMN (400 MHz, CDCl3): μ 7,05-7,06 (m, 1 H), 7,31 (dt, J = 5,1, 1,6 Hz, 1 H), 7,64 (d, J = 13,8 Hz, 1 H), 7,92 (d, J = 13,8 Hz, 1 H) y 8,36 (d, J = 5,2 Hz, 1 H).
Preparado según el método usado en la preparación de 2-fluoro-4-(2-nitrovinil)piridina utilizando 5-metoxipiridino-2carbaldehído en lugar de 2-fluoropiridino-4-carbaldehído. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido marrón (248 mg, 54%).
1H RMN (400 MHz, CDCl3): δ 3.92 (s, 3 H), 7.21 (dd, J = 8.5, 3.0 Hz, 1 H), 7.43 (d, J = 8.5 Hz, 1 H), 7.90 (s, 2 H) y
8.37 (d, J = 3.0 Hz, 1 H).
Se añadieron a una solución de 2-fluoro-4-(2-nitrovinil)piridina (198 mg, 1,178 mmol) en THF anhidro (10 mL) a 0˚C
5 ácido acético glacial (300 μL) y borohidruro de sodio (160 mg, 4,23 mmol). Se agitó la suspensión resultante a TA durante 17 h y se apagó después por adición de agua. Se pasó la mezcla de reacción bruta a través de un tapón de sílice y se concentró a vacío, para obtener 2-fluoro-4-(2-nitroetil)piridina como un sólido marrón (160 mg, 80%). Se añadieron a una solución de 2-fluoro-4-(2-nitroetil)piridina (160 mg, 0,940 mmol) en MeOH anhidro (10 mL) formiato de amonio (155 mg, 2,458 mmol) y paladio sobre carbón (77 mg) y se agitó la suspensión a TA durante 1 h. Se filtró
10 la mezcla de reacción bruta a través de Celite y se concentró el filtrado a vacío. Se añadieron agua y DCM al residuo y se cargó la suspensión resultante en un cartucho de Isolute® SCX-2, se lavó con MeOH y se eluyó después con NH3 2 M en MeOH, para obtener el compuesto del título como un aceite amarillo (59 mg, 45%).
1H RMN (400 MHz, CDCl3): δ 1,40 (s amp., 2 H), 2,80 (t, J = 6,9 Hz, 2 H), 3,03 (t, J = 6,9 Hz, 2 H), 6,81 (s, 1 H), 7,04 15 (d, J= 5,0 Hz, 1 H) y 8,13 (d, J = 5,0 Hz, 1 H),
20 Preparado según el método usado en la preparación de 2-(2-fluoropiridin-4-il)etilamina utilizando 5-metoxi-2-(2nitrovinil)piridina en lugar de 2-fluoro-4-(2-nitrovinil)piridina. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido amarillo claro (220 mg, 81%).
1H RMN (400 MHz, CDCl3): δ 1,43 (s, 1 H), 3,10 (t, J = 5,6 Hz, 2 H), 3,40 (t, J = 5,6 Hz, 2 H), 3,85 (s, 3 H), 7,10 (d, J 25 = 8,5 Hz, 1 H), 7,18 (dd, J = 8,5, 3,0 Hz, 1 H) y 8,14 (d, J = 3,0 Hz, 1 H).
30
μL, 0,627 mmol) en 2-propanol (1 mL) bajo una atmósfera de nitrógeno y se calentaron a 80˚C durante 18 h. Se enfrió la mezcla de reacción hasta la TA y se diluyó con acetato de etilo y se lavó entonces con agua y solución salina saturada. Se aisló la capa orgánica, se secó (MgSO4) y se concentró después a vacío. Se purificó el residuo
35 resultante por cromatografía en columna, para obtener el compuesto del título como un sólido de color canela (27 mg, 26%).
[M + H]+ 334,2.
Preparado según el método usado en la preparación de (4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il)-[2-(6-metilpiridin-2il)etil]amina utilizando 2-(2-fluoropiridin-4-il)etilamina en lugar de 2-(6-metilpiridin-2-il)etilamina. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido blanco (30,7 mg, 26%).
[M + H]+ 338,1.
Preparado según el método usado en la preparación de (4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il)-[2-(6-metilpiridin-2il)etil]amina utilizando 2-(5-metoxipiridin-2-il)etilamina en lugar de 2-(6-metilpiridin-2-il)etilamina. Se obtuvo el 10 compuesto del título como un sólido blanco (49,8 mg, 13%).
[M + H]+ 350,1.
15
Preparado a partir de 4-(6-cloro-2-yodopirimidin-4-il)morfolina y 3-piridin-3-ilfenilamina utilizando el método descrito para el éster terc-butílico del ácido 6-(4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-ilamino)-3,4-dihidro-1H-isoquinolino-2-carboxílico.
20
δH (400 MHz, CDCl3) 3,64 (m, 4H), 3,79 (m, 4H), 6,08 (s, 1H), 7,09 (s, 1H), 7,25 (m, 1H), 7,38 (m, 1H), 7,44 (t, 1H), 7,51 (m, 1H), 7,88 (dd, 1H), 7,91 (m, 1H), 8,62 (d, 1H), 8,87 (s, 1H).
Preparado a partir de (2-dimetilaminoetil)amida del ácido 4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidino-2-carboxílico utilizando el Método de Suzuki A del Ejemplo de Referencia 2. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido amarillo (133 mg, 67%).
30
[M + H]+ 413,1.
1H RMN (400 MHz, DMSO-d6): δ 2,21 (s, 6 H), 2,44 (t, J = 6,5 Hz, 2 H), 3,37 (c aparente, J = 6,5 Hz, 2 H), 3,73 (m, 4 H), 3,78 (m, 4 H), 7,15 (m, 1 H), 7,29-7,36 (m, 2 H), 7,48 (t, J = 2,5 Hz, 1 H), 7,66 (dd, J = 11, 2,5 Hz, 1 H), 8,64 (t, J 35 = 5,5 Hz, 1 H) y 11,38 (s amp., 1 H).
Preparado a partir de piridin-3-ilamida del ácido 4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidino-2-carboxílico utilizando el método de 40 Suzuki A del Ejemplo de Referencia 2. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido blanco (15 mg, 21%).
[M + H]+ 419,3.
1H RMN (400 MHz, DMSO-d6): δ 3,76 (m, 4 H), 3,83 (m, 4 H), 7,17 (m, 1 H), 7,36 (m, 1 H), 7,44 (m, 2 H), 7,50 (t 45 aparente, J = 2,5 Hz, 1 H), 7,73 (dd, J = 11, 2,5 Hz, 1 H), 8,24 (m, 1 H), 8,35 (dd, J = 4,5, 1,5 Hz, 1 H), 8,99 (d, J = 2,5 Hz, 1 H), 10,61 (s amp., I H) y 11,40 (s amp., 1 H).
Ejemplo 3: 4-[6-Morfolin-4-il-2-(2-piridin-3-iletilamino)pirimidin-4-il]-1H-indol-6-carbonitrilo
50 Se preparó 4-(2-metanosulfonil-6-morfolin-4-ilpirimidin-4-il)-1H-indol-6-carbonitrilo como se describe para el 6-fluoro
33
4-(2-metanosulfonil-6-morfolin-4-ilpirimidin-4-il)-1H-indol utilizando 4-(4,4,5,5-tetrametil[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-1H-indol-6-carbonitrilo.
Se calentaron 4-(2-metanosulfonil-6-morfolin-4-ilpirimidin-4-il)-1H-indol-6-carbonitrilo (46 mg) y 3-(2-aminoetil)piridina (145 μL) en dioxano (1,5 mL) y DIPEA (60 μL) en un reactor de microondas durante 1 hora a 150˚C. Se evaporaron los solventes y se purificó el residuo por cromatografía en columna, para obtener el compuesto del título como un sólido blanco (28 mg).
δH (400 MHz, CDCl3) 2,90 (t, J = 6,8, 2H), 3,58-3,60 (m, 4H), 3,67 (c, J = 6,8, 2H), 3,72-3,75 (m, 4H), 5,00 (s amp.,
1H), 6,26 (s, 1H), 7,01 (s, 1H), 7,15-7,20 (m, 1H), 7,37-7,38 (m, H), 7,49-7,52 (m ,1H), 7,65 (s, 1H), 7,66 (s, 1H), 8,41
(dd, J = 4,8 y 1,6, 1H), 8,45 (d, J = 1,6, 1H), 8,94 (s amp., 1H).
[M+H]+ 426.
Ejemplo 4: [4-(6-Metanosulfonil-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(2-piridin-3-iletil)amina
Preparado utilizando el método de Suzuki B del Ejemplo de Referencia 2. Se purificó el producto por captura y liberación usando un cartucho Isolute SCX-2, seguido de cromatografía instantánea (CH2Cl2/MeOH/NH4OH 94:6:1 como eluyente), para obtener el compuesto del título como un sólido blanco (63 mg).
δH (400 MHz, CDCl3) 3,03 (t, J = 6,8, 2H), 3,13 (s, 3H), 3,69 (t, J = 4,8, 4H), 3,78 (c, J = 6,8, 2H), 3,83 (t, J = 4,8, 4H), 5,04 (s amp., 1H), 6,40 (s, 1H), 7,16 (s amp., 1H), 7,24-7,28 (m, 1H), 7,52-7,53 (m, 1H), 7,59-7,62 (m, 1H), 8,05 (s, 1H), 8,11 (s, 1H), 8,49-8,52 (m, 1H), 8,56 (d, J = 2,0, 1 H), 8,83 (s amp., 1H).
[M+H]+: 479.
Ejemplo 5: Dimetilamida del ácido 4-[6-morfolin-4-il-2-(2-piridin-3-iletilamino)pirimidin-4-il]-1H-indol-6-sulfónico
Preparado utilizando el método de Suzuki B del Ejemplo de Referencia 2. Obtenido como un sólido blanco (128 mg).
δH (400 MHz, CDCl3) 2,73 (s, 6H), 3,00 (t, J = 6,8), 3,69 (t, J = 4,8, 4H), 3,78 (c, J = 6,8, 2H), 3,83 (t, J = 4,8, 4H), 5,01 (s amp., 1H), 6,38 (s, 1H), 7,16 (s, 1H), 7,24-7,27 (m, 1H), 7,50 (s amp., 1H), 7,61 (d, J = 7,6), 7,88 (s, 1H), 7,96 (s, 1H), 8,51 (d, J = 4,8), 8,72 (s amp., 1H).
[M+H]+: 508.
Ejemplo 6: Amida del ácido 4-[6-morfolin-4-il-2-(2-piridin-3-il-etilamino)pirimidin-4-il]-1H-indol-6-carboxílico
Preparado utilizando el método de Suzuki B del Ejemplo de Referencia 2. Obtenido como un sólido de color blanco hueso (47 mg).
δH (400 MHz, CDCl3) 2,98 (t, J = 6,8, 2H), 3,51 (s amp., 4H), 3,77-3,83 (m, 6H), 5,21 (s amp., 1H), 5,69 (s amp., 1H), 6,43 (s, 1H), 6,98 (s, 1H), 7,21-7,25 (m, 1H), 7,42 (s, 1H), 7,59 (d, J = 7,2, 1H), 7,95 (s, 1H), 8,10 (s, 1H), 8,48 (d, J = 4,0, 1H), 8,60 (s, 1H), 8,94 (s amp., 1H).
[M+H]+: 444.
Ejemplo 7: [4-Morfolin-4-il-6-(6-trifluorometil-1H-indol-4-il)pirimidin-2-il]-(2-piridin-3-iletil)amina
Preparado utilizando el método de Suzuki B del Ejemplo de Referencia 2. Obtenido como un sólido amarillo (72 mg).
δH (400 MHz, CDCl3) 3,00 (t, J = 6,8, 2H), 3,69 (t, J = 4,8, 4H), 3,77 (c, J = 6,8, 4H), 3,83 (t, J = 4,8, 4H), 5,05 (s amp., 1H), 6,40 (s, 1H), 7,10 (s, 1H), 7,23-7,27 (m, 1H), 7,44 (s, 1H), 7,60 (d, J = 7,6, 1H), 7,75 (s, 1H), 7,79 (s, 1H), 8,50 (d, J = 4,8, 1H), 8,56 (s, 1H).
[M+H]+: 469.
Ejemplo 8: [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(2-piridin-3-iletil)amina
Preparado utilizando el método de Suzuki B del Ejemplo de Referencia 2. Obtenido como un sólido blando (70 mg).
δH (400 MHz, CDCl3) 2,98 (t, J = 6,8, 2H), 3,66 (t, J = 4,8, 4H), 3,75 (c, J = 6,8, 2H), 3,82 (t, J = 4,8, 4H), 5,00 (s amp., 1H), 6,35 (s, 1H), 6,90 (s, 1H), 7,03 (dd, J = 10,8 y 8,8, 1H), 7,23 (dd, J = 7,6 y 4,8, 1H), 7,36 (dd, J = 8,8 y 4,0, 1H), 7,59 (d, J = 7,6, 1H), 8,24 (s amp., 1H), 8,49 (d, J = 4,0, 1H), 8,55 (s, 1H).
[M+H]+: 419.
Ejemplo 9: 6-Fluoro-4-(6-morfolin-4-il-2-fenilpirimidin-4-il)-1H-indol
Se añadió a una solución de 4-(6-cloro-2-yodo-pirimidin-4-il)morfolina (150 mg), ácido fenilborónico (59 mg) y diclorobis(trifenilfosfino)paladio (II) en acetonitrilo (3,5 mL) una solución acuosa 1M de bicarbonato de sodio (1,44 mL). Se calentó la mezcla en un reactor de microondas durante 45 minutos y se dejó enfriar. Se repartió la mezcla bruta entre diclorometano y agua y se lavaron las capas orgánicas combinadas con solución salina saturada, se separaron y se secaron (MgSO4). Se purificó la mezcla bruta por cromatografía, para obtener 4-(6-cloro-2fenilpirimidin-4-il)morfolina como un sólido blanco (112 mg).
La reacción de 4-(6-cloro-2-fenilpirimidin-4-il)morfolina con 6-fluoro-4-(4,4,5,5-tetrametil[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-1Hindol usando el Método de Suzuki B dio el compuesto del título como un sólido gris claro (168 mg).
δH (400 MHz, CDCl3) 3,85 (m, 4H), 3,90 (m, 4H), 6,92 (s, 1H), 7,17 -7,23 (m, 2H), 7,34 (m, 1H), 7,47-7,54 (m, 4H), 8,30 (s amp., 1H), 8,58 (m, 1H).
[M + H]+ 375,10.
Ejemplo 10: 6-Fluoro-4-(6-morfolin-4-il-2-piridin-3-ilpirimidin-4-il)-1H-indol
Se preparó 4-(6-cloro-2-piridin-3-ilpirimidin-4-il)morfolina como se describe para la 4-(6-cloro-2-fenilpirimidin-4il)morfolina y se hizo reaccionar entonces con 6-fluoro-4-(4,4,5,5-tetrametil[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-1H-indol utilizando el Método de Suzuki B del Ejemplo de Referencia 2, para obtener el compuesto del título como un sólido blanco (94 mg).
δH (400 MHz, CDCl3) 3,77 (m, 4H), 3,81 (m, 4H), 6,87 (s, 1H), 7,07 (m, 1H), 7,14 (dt, J = 1,1, 8,9, 1 H), 7,25 (t, J = 3,3, 1H), 7,33 (m, 1H), 7,41 (dd, J = 2,3, 10,6, 1H), 8,25 (s amp., 1H), 8,63 (dd, J = 1,7, 4,8, 1H), 8,71 (dt, J = 2,0, 7,0, 1H), 9,66 (t, J = 1,1, 1H).
[M + H]+ 376,12.
Ejemplo 11: 6-Fluoro-4-(6-morfolin-4-il-2-piridin-4-ilpirimidin-4-il)-1H-indol
Preparado por el método descrito para 6-fluoro-4-(6-morfolin-4-il-2-piridin-3-ilpirimidin-4-il)-1H-indol para obtener el compuesto del título como un sólido blanco (0,034 g).
δH (400 MHz, CDCl3) 3,86 (m, 4H), 3,89 (m, 4H), 6,99 (s, I H), 7,15 (s, 1H), 7,25 (m, 1H), 7,36 (m, 1H), 7,51 (m, 1H), 8,39 (t, J = 5,9, 3H), 8,78 (t, J = 5,9, 2H).
[M + H]+ 376,1.
Ejemplo 12: 6-Fluoro-4-[6-morfolin-4-il-2-(piridin-3-iloxi)pirimidinil]-1H-indol
A una solución de 3-hidroxipiridina (97 mg) en DMF (3 mL) se le añadió hidruro de sodio (41 mg; dispersión al 60% en aceite mineral) en una sola porción y se agitó la mezcla a TA durante 15 minutos. Se añadió 4-(2,6dicloropirimidin-4-il)morfolina (165 mg) y se calentó la mezcla a 70˚C durante 1,5 horas. Se dejó que la mezcla se enfriara y se apagó por adición de cloruro de amonio acuoso y se repartió entre acetato de etilo y agua. Se lavaron las capas orgánicas combinadas con solución salina saturada, se separaron y se secaron (MgSO4). Se purificó la mezcla por HPLC preparatoria, para obtener el compuesto 4-(6-cloro-2-piridin-3-ilpirimidin-4-il)morfolina como un sólido blanco (48 mg).
La copulación de Suzuki con -(4,4,5,5-tetrametil[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-1H-indol utilizando el Método B del Ejemplo de Referencia 2 dio el compuesto del título como un sólido amarillo claro (37 mg). δH (400 MHz, CDCl3) 3,59 (t, J = 4,6, 4H), 3,72 (t, J = 4,8, 4H), 6,71 (s, 1H), 6,73 (m, 1H), 7,08 (d, J = 8,8, 1 ), 7,14 (t, J = 2,5, 1H), 7,28 (m, 2H), 7,51 (d, J = 8,3, 1H), 8,21 (s amp., 1H), 8,41 (d, J = 4,6, 1H), 8,57 (d, J = 2,4, 1H).
[M + H]+ 392,08.
Ejemplo 13: [4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(2-piridin-3-iletil)amina
Se calentó una mezcla de 6-fluoro-4-(2-metanosulfonil-6-morfolin-4-ilpirimidin-4-il)-1H-indol, (0,085 g) y 3-(2aminoetil)piridina (0,27 g) en 1,4-dioxano (2,0 mL) en un reactor de microondas durante 1 hora a 150˚C. Se dejó que la mezcla se enfriara, se evaporó sobre sílice y se purificó por cromatografía en columna, para obtener el compuesto del título como un sólido blanco (0,066 g).
δH (400 MHz, CDCl3) 2,95 (t, J = 12,0, 2H), 3,51 (m, 4H), 3,76 (t, J = 12,0, 2H), 3,82 (m, 4H), 5,05 (s amp., 1H), 6,39 (s, 1H), 7,00 (s, 1H), 7,14 (h, 1H), 7,25 (m, 2H), 7,34 (m, 1H), 7,59 (m, 1H), 8,29 (s amp., 1H), 8,51 (d, J = 6,4, 1H), 8,55 (s, 1H).
[M + H]+ 419,1.
Ejemplo 14: [4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]piridin-3-ilmetilamina
Preparado a partir de 6-fluoro-4-(2-metanosulfonil-6-morfolin-4-ilpirimidin-4-il)-1H-indol (0,085 g) y 3-(aminornetil)piridina (0,23 g), junto con DIPEA (0,10 g) en 1,4-dioxano (2,5 mL) como se describe para [4-(6-fluoro-1H-indol-4-il)-6morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(2-piridin-3-iletil)amina, para obtener el compuesto del título como un sólido de color blanco hueso (0,032 g).
δH (400 MHz, CDCl3) 3,64 (m, 4H), 3,81 (m, 4H), 4,72 (d, J = 6,0, 2H), 5,37 (s amp., 1H), 6,41 (s, 1H), 6,93 (m, 1H), 7,15 (m, 1H), 7,25 (m, 2H), 7,35 (m, 1H), 7,75 (d, J = 7,8, 1H), 8,30 (s amp., 1H), 8,53 (d, J = 4,1, 1H), 8,68 (s, 1H).
[M + H]+ 405,2.
Ejemplo 15: [2-(3-Clorofenil)etil]-[4-(6-fluoro-1H-indol-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]amina
Se calentó una mezcla de 6-fluoro-4-(2-metanosulfonil-6-morfolin-4-ilpirimidin-4-il)-1H-indol (75 mg, 0,20 mmol) y 3clorofenetilamina (310 mg, 2,00 mmol) en DIPEA (0,1 mL, 0,57 mmol) y dioxano (0,4 mL) en un reactor de microondas a 150˚C durante 40 minutos. Se purificó la mezcla de reacción por HPLC preparatoria, para obtener el compuesto del título como un sólido de color blanco hueso (71 mg).
δH (400 MHz, CDCl3) 2,86 (t, J = 7,1, 2H), 3,58 (t, J = 4,5, 4H), 3,66 (c, J = 6,6, 2H), 3,73 (t, J = 4,7, 4H), 4,90 (s amp., 1H), 6,29 (s, 1H), 6,91 (s, 1H), 7,06 (d, J = 8,2, 2H), 7,10-7,20 (m, 4H), 7,25 (d, J = 10,0, 1H), 8,15 (s amp., 1H).
[M + H]+ 452,10.
Ejemplo 16: 6-Fluoro-4-[6-morfolin-4-il-2-(piridin-3-ilmetoxi)pirimidin-4-il]-1H-indol
A una solución en agitación de 3-piridilcarbinol (19,3 μL, 0,20 mmol) en DMF (1,5 mL) enfriada a 0˚C bajo nitrógeno, se le añadió hidruro de sodio (17,5 mg, 0,20 mmol) rápidamente. Se agitó la suspensión a 0˚C durante 30 minutos. Se añadió entonces 6-fluoro-4-(2-metanosulfonil-6-morfolin-4-ilpirimidin-4-il)-1H-indol (75 mg, 0,20 mmol) y se calentó la mezcla hasta la temperatura ambiente. Después de agitar durante la noche, se apagó la mezcla de reacción con solución salina saturada y se extrajo en acetato de etilo. Se lavaron las capas orgánicas con agua y solución salina saturada, se separaron y se secaron (MgSO4). Se purificó el producto bruto por cromatografía en columna, para obtener 6-fluoro-4-[6-morfolin-4-il-2-(piridin-3-ilmetoxi)pirimidin-4-il]-1H-indol (30 mg).
δH (400 MHz, CDCl3) 3,73 (t, J = 4,7, 4H), 3,83 (t, J = 4,7, 4H), 5,56 (s, 2H), 6,72 (s, 1H), 6,93 (s, 1H), 7,19 (dd, J = 1,4, 7,4, 1H), 7,30 (m, 1H), 7,36-7,42 (m, 2H), 7,95 (d, J = 7,7, 1H), 8,37 (s amp., 1H), 8,59 (d amp., J = 4,0, 1H), 8,79 (s, 1H).
[M + H]+ 406,15.
Ejemplo 17: 6-Fluoro-4-[6-morfolin-4-il-2-(2-piridin-3-iletoxi)pirimidin-4-il]-1H-indol
Preparado utilizando el método para el 6-fluoro-4-[6-morfolin-4-il-2-(piridin-3-ilmetoxi)pirimidin-4-il]-1H-indol, para obtener un sólido de color blanco hueso (31 mg).
δH (400 MHz, CDCl3) 3,10 (t, J = 7,1, 2H), 3,63 (t, J = 4,4, 4H), 3,73 (t, J = 4,4, 4H), 4,57 (t, J = 7,1, 2H), 6,60 (s, 1H), 6,91 (s, 1H), 7,09 (d, J = 8,9, 1H), 7,14-7,19 (m, 2H), 7,33 (d, J = 10,6, 1H), 7,59 (d, J = 7,8, 1H), 8,28 (s amp., 1H), 8,41 (d, J = 4,7, 1H), 8,51 (s, 1H).
[M + H]+ 420,12.
Ejemplos 18 y 19: N-[4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-pirimidin-2-il]nicotinamida y 4-(6-Fluoro-1H-indol4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-ilamina
Se añadió a una solución de 4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-ilamina (0,180 g), agitando en tetrahidrofurano anhidro (10 mL), cloruro de nicotinoílo, sal HCl (0,299 g), seguido de trietilamina (407 μL). Se calentó la mezcla de reacción a 68˚C durante 24 horas, se enfrió después y se repartió entre agua y diclorometano. Se secaron los extractos orgánicos combinados y se eliminaron los solventes a vacío, para obtener N-(4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2il)nicotinamida como un sólido de color blanco hueso (0,226 g).
Se añadieron a una solución de 6-fluoro-4-(4,4,5,5-tetrametil[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-1H-indol (0,110 g) con N-(4cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il)nicotinamida (0,075 g) en DME (4 mL) fluoruro de cesio (96 mg) y tetrakistrifenilfosfina paladio (18 mg). Se calentó la mezcla en un reactor de microondas a 125˚C durante 20 minutos y se dejó enfriar después. Se repartió la mezcla bruta entre agua y diclorometano y se separaron las capas orgánicas combinadas y se secaron (MgSO4). Se purificó la mezcla bruta por cromatografía instantánea en sílice, para obtener los compuestos del título (1) como un sólido blanco (0,028 g) y (2) como un sólido blanco (0,005 g).
- (1)
- δH (400 MHz, CDCl3) 3,5 (m, 4H), 3,60 (m, 4H), 6,52 (s, 1H), 6,98 (m, 2H), 7,11 (m, 2H), 7,23 (m, 1H), 8,02 (m, 1H), 8,09 (m, 1H), 8,22 (s amp., 1H), 8,57 (d, J = 4,7, 1H), 8,93 (s amp., 1H).
[M + H]+ 419,1.
- (2)
- δH (400 MHz, CDCl3) 3,59 (m, 4H), 3,72 (m, 4H), 5,01 (s amp., 2H), 6,32 (s, 1H), 6,84 (s, 1H), 7,06 (m, 1H), 7,24 (m, 2H), 8,24 (s amp., 1H). [M + H]+ 314,1.
Ejemplo 20: [2-(6-Metanosulfonil-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-4-il]-(2-piridin-3-iletil)amina
Se preparó 4-(4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il)-6-metanosulfonil-1H-indol a partir de 4-(6-cloro-2-yodopirimidin-4il)morfolina utilizando el Método de Suzuki C del Ejemplo de Referencia 2, para obtener un sólido de color blanco hueso (43 mg).
Se sellaron 4-(4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il)-6-metanosulfonil-1H-indol (40 mg, 0,10 mmol), 3-(2-aminoetil)piridina (200 mg, 0,98 mmol) y 1-metil-2-pirrolidinona (1 mL) en un tubo y se calentaron a 150˚C durante la noche. Se repartió la mezcla entre acetato de etilo y solución salina saturada, se separó y se secó (MgSO4). Se purificó el producto bruto por cromatografía en columna, para obtener el compuesto del título (24 mg).
δH (400 MHz, CDCl3) 3,03 (t, J = 7,0, 2H), 3,16 (s, 3H), 3,67-3,72 (m, 6H), 3,86 (t, J = 4,5, 4H), 4,95 (s amp., 1H), 5,41 (s, 1H), 7,28 (m, 1H), 7,56 (m, 2H), 7,65(d, J = 7,4, 1H), 8,13 (s, 1H), 8,56 (s amp., 2H), 8,69 (s, 1H), 8,74 (s, 1H).
[M + H]+ 479,15.
Ejemplo 21: [2-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-4-il]-(2-piridin-3-iletil)amina
Preparado utilizando el método descrito para la [2-(6-metanosulfonil-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-4-il]-(2piridin-3-iletil)amina, para obtener un sólido de color blanco hueso (30 mg).
δH (400 MHz, CDCl3) 3,02 (t, J = 6,9, 2H), 3,67 (t, J = 4,5, 4H), 3,72 (t, J = 6,5, 2H), 3,85(t, J = 4,5, 4H), 4,88 (s amp., 1H), 5,40 (s,1H), 7,18 (d, J = 8,8, 1H), 7,28 (m, 2H), 7,46 (s, 1H), 7,61 (d, J = 7,6, 1H), 7,95 (d, J = 11,3, 1H), 8,25 (s amp., 1H), 8,56 (m, 2H).
[M + H]+ 419,11.
Ejemplo 22: [4-(6-Fluoro-1H-indol-+il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]piridin-3-ilamina
Se añadió a una solución en agitación de 3-aminopiridina (60 mg, 0,63 mmol) en DMF (2 mL) enfriada a 0˚C bajo nitrógeno hidruro de sodio (37,5 mg, 0,63 mmol). Se agitó la suspensión a 0˚C durante 30 minutos. Se añadió entonces 4-(6-cloro-2-yodopirimidin-4-il)morfolina (200 mg, 0,63 mmol) y se calentó la mezcla hasta la temperatura ambiente. Después de agitar durante la noche, se apagó la mezcla de reacción con solución salina saturada y se extrajo en acetato de etilo. Se lavaron las capas orgánicas con agua y solución salina saturada, se separaron y se secaron (MgSO4). Se purificó el producto bruto por cromatografía en columna, para obtener (4-cloro-6-morfolin-4ilpirimidin-2-il)piridin-3-ilamina como un sólido amarillo (38 mg).
Se preparó el compuesto del título utilizando el Método de Suzuki C del Ejemplo de Referencia 2, para obtener un sólido de color blanco hueso (18 mg).
δH (400 MHz, CDCl3) 3,73 (t, J = 4,7, 4H), 3,86 (t, J = 4,7, 4H), 6,58 (s, 1H), 7,00 (s, 2H), 7,20 (d, J = 9,1, 1H), 7,257,30 (m, 2H), 7,39 (dd, J = 2,0, 8,4, 1H), 8,16 (d, J = 8,5, 1H), 8,27 (d, J = 4,5, 1H), 8,32 (s amp., 1H), 8,87 (s, 1H).
[M + H]+ 391,11.
Ejemplo 23: [4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(1,2,3,4-tetrahidroisoquinolin-8-il)amina
Preparado utilizando el método de copulación de Suzuki A del Ejemplo de Referencia 2, seguido de desprotección de BOC utilizando TFA:DCM (1:4). Se obtuvo el compuesto del título como una espuma amarilla (15 mg, 12%).
[M + H]+ 445,2.
1H RMN (400 MHz, CD3OD): δ 2,79 (t, J = 6,0 Hz, 2 H), 3,07-3,13 (m, 2 H), 3,67-3,74 (m, 4 H), 3,76-3,81 (m, 4 H), 3,95 (s, 2 H), 6,61 (s, 1 H), 6,90 (d, J = 3,3 Hz, 1 H), 7,01 (d, J = 8,3 Hz, 1 H), 7,18 (dd, J = 9,4, 2,3 Hz, 1 H), 7,287,33 (m, 2 H), 7,40 (dd, J = 8,3, 2,2 Hz, 1 H) y 7,55 (s, 1 H).
Ejemplo 24: [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-2-il]-(1,2,3,4-tetrahidroisoquinolin-6-il)amina
Preparado a partir de éster terc-butílico del ácido 6-(4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-ilamino)-3,4-dihidro-1Hisoquinolino-2-carboxílico (156 mg; 0,35 mmol) y 5-fluoro-4-(4,4,5,5-tetrametil[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-1H-indol (144 mg; 0,49 mmol) utilizando el Método de Suzuki A del Ejemplo de Referencia 2. La desprotección del intermediario Boc (147 mg) con TFA/CH2Cl2, seguida de purificación por SCX-2 y luego de trituración con Et2O/MeOH, dieron el compuesto del título como un sólido de color blanco hueso (88 mg; 73%).
δH (400 MHz, CDCl3) 2,79 (d, J = 6,0, 2H), 3,16 (d, J = 6,0, 2H), 3,69-3,71 (m, 4H), 3,82-3,85 (m, 4H), 4,00 (s, 2H), 6,48 (s, 1H), 6,96-7,07 (m, 4H), 7,30-7,48 (m, 3H), 8,26 (s amp., 1H).
[M+H]+ 445.
Ejemplo 25: [4-(6-Metanosulfonil-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(1,2,3,4-tetrahidroisoquinolin-6-il)amina
Preparado a partir de éster terc-butílico del ácido 6-(4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-ilamino)-3,4-dihidro-1Hisoquinolino-2-carboxílico (156 mg; 0,35 mmol) y 6-metanosulfonil-4-(4,4,5,5-tetrametil[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-1Hindol (157 mg; 0,49 mmol) utilizando el Método de Suzuki B del Ejemplo de Referencia 2. La desprotección del intermediario Boc (215 mg) con TFA/CH2Cl2, seguida de purificación por SCX-2 y luego de trituración con EtOAc, dieron el compuesto del título como un sólido de color blanco hueso (23 mg; 13%).
δH (400 MHz, d6-DMSO) 2,65 (t, J = 5,6, 2H), 2,94 (t, J = 5,6, 2H), 3,25 (s, 3H), 3,68-3,79 (m, 10H), 6,74 (s, 1H), 6,88 (d, J=8,4, 1H), 7,16 (s, 1H), 7,42 (d, J=8,4, 1H), 7,69 (s, 1H), 7,80 (s, I H), 8,07 (d, J=8,8, 1H), 9,08 (s, 1H), 11,88 (s amp., 1H).
[M+H]+ 505.
Ejemplo 26: [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(1,2,3,4-tetrahidroisoquinolin-7-il)amina
Preparado a partir de éster bencílico del ácido 7-(4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-ilamino)-3,4-dihidro-1H-isoquinolino-2-carboxílico (120 mg; 0,25 mmol) y 5-fluoro-4-(4,4,5,5-tetrametil[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-1H-indol (97 mg; 0,33 mmol) utilizando el Método de Suzuki B del Ejemplo de Referencia 2. Se disolvió el intermediario Cbz (104 mg) en EtOH (15 ml), se añadió Pd 10%/C (19 mg) y se agitó la mezcla bajo una atmósfera de hidrógeno durante la noche (19 h). Se eliminó el catalizador por filtración, se evaporó el solvente y se purificó el residuo por SCX-2 y luego LCMS prep., para obtener el compuesto del título como un sólido de color crema (40 mg; 50%).
δH (400 MHz, CDCl3) 2,19 (s, 1H), 2,77 (t, J = 6,0, 2H), 3,16 (t, J = 6,0, 2H), 3,68-3,71 (m, 4H), 3,82-3,85 (m, 4H), 4,00 (s, 2H), 6,49 (s, 1H), 7,93-7,07 (m, 4H), 7,28-7,40 (m, 3H), 7,48 (s, 1H), 8,24 (s amp., 1H).
[M+H]+ 445.
Ejemplo 27: [4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(1,2,3,4-tetrahidroisoquinolin-5-il)amina
Preparado a partir de éster terc-butílico del ácido 5-(4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-ilamino)-3,4-dihidro-1H-isoquinolino-2-carboxílico (114 mg; 0,26 mmol) y 5-fluoro-4-(4,4,5,5-tetrametil[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-1H-indol (87 mg; 0,33 mmol) utilizando el Método de Suzuki B del Ejemplo de Referencia 2. La desprotección del intermediario Boc con TFA/CH2Cl2, seguida de purificación por SCX-2 y luego de trituración con Et2O/MeOH, dieron el compuesto del título como un sólido de color blanco hueso (64 mg).
δH (400 MHz, CDCl3) 1,62 (s amp., 1H), 2,74 (t, J = 6,0, 2H), 3,24 (t, J = 6,0, 2H), 3,68-3,71 (m, 4H), 3,82-3,85 (m, 4H), 4,06 (s, 2H), 6,52 (s, 1H), 6,73 (s, 1H), 6,79 (d, J = 8,0, 1H), 6,99 (s, 1H), 7,15-7,22 (m, 2H), 7,26-7,28 (m, 1H), 7,39 (dd, J = 10,4 y 1,6, 1H), 8,09 (d, J = 8,0, 1H), 8,35 (s amp., 1H).
[M+H]+ 445.
Ejemplo 28: [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(2-tiazol-2-iletil)amina
Preparado utilizando el método de copulación de Suzuki A del Ejemplo de Referencia 2, seguido de desprotección de TBAF. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido blanco (30 mg, 30%).
[M + H]+ 425,1.
1H RMN (400 MHz, CDCl3): δ 3,35 (t, J = 6,5 Hz, 2 H), 3,61 (m, 4 H), 3,75 (m, 4 H), 3,88 (m, 2 H), 6,28 (d, J = 2,0 Hz,
1 H), 6,81 (s, 1 H), 6,94 (dd, J = 11,0, 8,8 Hz, 1 H), 7,18 (d, J = 3,3 Hz, I H), 7,22 (m, 1 H), 7,26 (m, 1 H), 7,68 (d, J =
3,4 Hz, I H) y 8,31 (s amp., 1 H).
Ejemplo 29: [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-[2-(6-metilpiridin-2-il)etil]amina
Preparado utilizando el método de copulación de Suzuki A del Ejemplo de Referencia 2. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido blanco (21,3 mg, 22%).
[M + H]+ 433,2.
1H RMN (400 MHz, CDCl3): δ 2,54 (s, 3 H), 3,10 (t, J = 6,8 Hz, 2 H), 3,66 (m, 4 H), 3,76-3,81 (m, 4 H), 3,86 (m, 2 H), 6,26 (s, 1 H), 6,76 (s, 1 H), 6,85-6,94 (m, 1 H), 6,98 (d, J = 7,7 Hz, 1 H), 7,02 (d, J = 7,7 Hz, 1 H), 7,17-7,22 (m, 2 H), 7,48 (t aparente, J = 7,6 Hz, 1 H) y 8,84 (s amp., 1 H).
Ejemplo 30: [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-[2-(2-fluoropiridin-4-il)etil]amina
Preparado utilizando el método de copulación de Suzuki A del Ejemplo de Referencia 2. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido blanco (9,3 mg, 23%).
[M + H]+ 437,2.
1H RMN (400 MHz, CDCl3): δ 2,96 (t, J = 7,0 Hz, 2 H), 3,63 (m, 4 H), 3,71 (m, 2 H), 3,76-3,83 (m, 4 H), 6,33 (s, 1 H), 6,80 (s, 1 H), 6,82 (s, 1 H), 6,99 (dd, J = 10,9, 8,8 Hz, 1 H), 7,04 (dd, J = 5,0, 1,8 Hz, 1 H), 7,25 (m, 1 H), 7,33 (dd, J = 8,8, 3,9 Hz, 1H), 8,05-8,11 (m, 1 H) y 8,43 (s amp., 1 H).
Ejemplo 31: [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-[2-(5-metoxipiridin-2-il)etil]amina
Preparado utilizando el método de copulación de Suzuki A del Ejemplo de Referencia 2. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido blanco (12,3 mg, 19%).
[M + H]+ 449,2.
1H RMN (400 MHz, CDCl3): δ 3,03 (t, J = 6,7 Hz, 2 H), 3,58-3,68 (m, 4 H), 3,72-3,78 (m, 4 H), 3,75-3,84 (m, 5 H), 5,29 (s amp., 1 H), 6,24 (s, 1 H), 6,80 (d, J = 3,8 Hz, 1 H), 6,94 (dd, J = 10,9, 8,8 Hz, 1 H), 7,06 (s, 1 H), 7,07 (s, 1 H), 7,20 (t, J = 2,8 Hz, 1 H), 7,26 (dd, J = 8,8, 3,8 Hz, 1 H), 8,21 (t, J = 1,8 Hz, 1 H) y 8,38 (s amp., 1 H).
Ejemplo 32: 4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il(3-piridin-3-ilfenil)amina
Preparado a partir de 4-cloro-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il(3-piridin-3-ilfenil)amina utilizando el Método de Suzuki C del Ejemplo de Referencia 2. Se obtuvo el compuesto del título como un sólido blanco (23 mg, 50%).
[M+H]+ 467,2.
δH (400 MHz, CDCl3) 3,74 (m, 4H); 3,85 (m, 4H); 6,57 (s, 1H); 7,02 (s, 1H); 7,21 (m, 3H); 7,42 (m, 3H); 7,56 (d, 1H); 7,93 (m, 1H); 8,21 (s, 1H); 8,35 (s amp., 1H); 8,61 (d, 1H); 8,89 (s, 1H).
Ejemplo 33: Pruebas biológicas
Se sometieron los compuestos de la invención, preparados como se describe en los Ejemplos precedentes, a la siguiente serie de ensayos biológicos:
- (i)
- Cribado bioquímico para PI3K
Se determinó la inhibición por los compuestos de la PI3K en un ensayo radiométrico utilizando enzima recombinante purificada y ATP a una concentración de 1 uM. Se diluyeron seriadamente todos los compuestos en DMSO al 100%. Se incubó la reacción de kinasa durante 1 hora a temperatura ambiente y se puso fin a la reacción por adición de PBS. Se determinaron a continuación los valores de la CI50 usando un ajuste de curva dosis-respuesta sigmoidea (pendiente variable). Todos los compuestos estudiados tenían una CI50 frente a PI3K de 50 μM o menos. Típicamente, la CI50 frente a PI3K era de 5-500 nM.
- (ii)
- Inhibición de la proliferación celular
Se sembraron las células a una densidad óptima en una placa de 96 pocillos y se incubaron durante 4 días en presencia de compuesto de ensayo. Se añadió a continuación Alamar Blue™ al medio de ensayo y se incubaron las células durante 6 horas antes de leer a 544 nm de excitación, 590 nm de emisión. Se calcularon los valores de la CE50 usando un ajuste de curva dosis-respuesta sigmoidea. Todos los compuestos estudiados tenían una CE50 de 50 uM o menos en el rango de líneas celulares utilizado.
Ejemplo 34: Composición de tabletas
Se fabricaron tabletas, con un peso cada una de 0,15 g y un contenido de 25 mg de un compuesto de la invención,
como sigue:
Composición para 10.000 tabletas
Compuesto de la invención (250 g)
Lactosa (800 g)
Almidón de maíz (415 g)
Polvo de talco (30 g)
Estearato de magnesio (5 g)
Se mezclaron el compuesto de la invención, la lactosa y la mitad del almidón de maíz. Se forzó entonces a la mezcla
a pasar a través de un tamiz de 0,5 mm de tamaño de malla. Se suspendió el almidón de maíz (10 g) en agua
templada (90 ml). Se usó la pasta resultante para granular el polvo. Se secó el granulado y se rompió en pequeños
fragmentos en un tamiz de 1,4 mm de tamaño de malla. Se añadieron la cantidad restante de almidón, el talco y el
magnesio, se mezclaron cuidadosamente y se procesaron para formar tabletas.
Ejemplo 35: Formulación inyectable
Compuesto de la invención 200 mg Solución de ácido clorhídrico 0,1M o Solución de hidróxido de sodio 0,1M c.s. para pH 4,0 a 7,0 Agua estéril c.s. para 10 ml
Se disolvió el compuesto de la invención en la mayor parte del agua (35˚-40˚C) y se ajustó el pH a entre 4,0 y 7,0 con el ácido clorhídrico o el hidróxido de sodio según fuera apropiado. Se completó entonces el volumen del lote con agua y se filtró a través de un filtro de microporo estéril a un vial de vidrio ámbar estéril de 10 ml (tipo 1) y se selló con cierres y sobresellos estériles.
Ejemplo 36: Inyección intramuscular
Compuesto de la invención 200 mg Alcohol bencílico 0,10 g Glicofurol 75 1,45 g Agua para inyección c.s. para 3,00 ml
Se disolvió el compuesto de la invención en el glicofurol. Se añadió entonces el alcohol bencílico y se disolvió y se añadió agua hasta 3 ml. Se filtró luego la mezcla a través de un filtro de microporo estéril y se selló en viales de vidrio estériles de 3 ml (tipo 1).
Ejemplo 37: Formulación de jarabe
Compuesto de la invención 250 mg Solución de sorbitol 1,50 g Glicerol 2,00 g Benzoato de sodio 0,005 g
Sabor 0,0125 ml
Agua purificada c.s. para 5,00 ml
Se disolvió el compuesto de la invención en una mezcla del glicerol y la mayor parte del agua purificada. Se añadió entonces una solución acuosa del benzoato de sodio a la solución, seguido de adición de la solución de sorbital y finalmente del sabor. Se completó el volumen con agua purificada y se mezcló bien.
Claims (9)
- REIVINDICACIONES1. Un compuesto que es una pirimidina de fórmula (I):
imagen1 5donde R2 se une en la posición 2 del anillo y -YR1 se une en la posición 5 ó 6 del anillo, o YR1 se une en la posición 2 del anillo y R2 se une en la posición 6 del anillo; R2 es un grupo indol-4-ilo substituido en la posición 5 ó 6;10 o bien:(a) Y es seleccionado entre -O-(CH2)n-, -NH-(CH2)n-, -NHC(O)-(CH2)n-y -C(O)NH-(CH2)n-, donde n es 0 o un número entero de 1 a 3, y R1 es seleccionado entre un grupo carbocíclico o heterocíclico insaturado de 5 a 12 miembros no substituido o substituido y un grupo -NR3R4, donde R3 y R4, iguales o diferentes, son cada uno independientemente seleccionados entre H, alquilo C1-C6 no substituido o substituido, cicloalquilo C3-C10 no substituido o substituido,15 -C(O)R, -C(O)N(R)2 y -S(O)mR, o R3 y R4 forman juntos, con el átomo de nitrógeno al que están unidos, un grupo heterocíclico saturado que contiene N de 5, 6 ó 7 miembros no substituido o substituido;(b) Y es un enlace directo y R1 es seleccionado entre un grupo carbocíclico o heterocíclico insaturado de 5 a 12 miembros no substituido o substituido y un grupo -NR3R4, donde R3 y R4, iguales o diferentes, son cada uno independientemente seleccionados entre H, alquilo C1-C6 no substituido o substituido, cicloalquilo C3-C10 no20 substituido o substituido, -C(O)R, -C(O)N(R)2 y -S(O)mR; R es seleccionado entre H, alquilo C1-C6, cicloalquilo C3-C10 y un grupo arilo o heteroarilo de 5 a 12 miembros, cuyo grupo está sin substituir o substituido; y m es 1 ó 2;o una sal del mismo farmacéuticamente aceptable.25 - 2. Un compuesto según la reivindicación 1, donde la pirimidina es de fórmula (Ia):en la cual R1, R2 e Y son como se define en la reivindicación 1.
imagen1 30 - 3. Un compuesto según la reivindicación 1, donde la pirimidina es de fórmula (Ib):en la cual R1, R2 e Y son como se define en la reivindicación 1.
imagen1 35 -
- 4.
- Un compuesto según la reivindicación 1, donde la pirimidina es de fórmula (Ic):
en la cual R1, R2 e Y son como se define en la reivindicación 1. -
- 5.
- Un compuesto seleccionado entre: (2-Dimetilaminoetil)amida del ácido 4-(6-fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidino-2-carboxílico; Piridin-3-ilamida del ácido 4-(6-fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidino-2-carboxílico; 4-[6-Morfolin-4-il-2-(2-piridin-3-iletilamino)pirimidin-4-il]-1H-indol-6-carbonitrilo; [4-(6-Metanosulfonil-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(2-piridin-3-iletil)amina; Dimetilamida del ácido 4-[6-morfolin-4-il-2-(2-piridin-3-iletilamino)pirimidin-4-il]-1H-indol-6-sulfónico; Amida del ácido 4-[6-Morfolin-4-il-2-(2-piridin-3-iletilamino)pirimidin-4-il]-1H-indol-6-carboxílico; [4-Morfolin-4-il-6-(6-trifluorometil-1H-indol-4-il)pirimidin-2-il]-(2-piridin-3-iletil)amina; [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(2-piridin-3-iletil)amina; 6-Fluoro-4-(6-morfolin-4-il-2-fenilpirimidin-4-il)-1H-indol; 6-Fluoro-4-(6-morfolin-4-il-2-piridin-3-ilpirimidin-4-il)-1H-indol; 6-Fluoro-4-(6-morfolin-4-il-2-piridin-4-ilpirimidin-4-il)-1H-indol; 6-Fluoro-4-[6-morfolin-4-il-2-(piridin-3-iloxi)pirimidin-4-il]-1H-indol; [4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(2-piridin-3-iletil)amina; [4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]piridin-3-ilmetilamina; [2-(3-Clorofenil)etil]-[4-(6-fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]amina; 6-Fluoro-4-[6-morfolin-4-il-2-(piridin-3-ilmetoxi)pirimidin-4-il]-1H-indol; 6-Fluoro-4-[6-morfolin-4-il-2-(2-piridin-3-iletoxi)pirimidin-4-il]-1H-indol; N-[4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]nicotinamida; 4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-ilamina; [2-(6-Metanosulfonil-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-4-il]-(2-piridin-3-iletil)amina; [2-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-4-il]-(2-piridin-3-iletil)amina; [4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-piridin-3-ilamina; [4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(1,2,3,4-tetrahidroisoquinolin-7-il)amina; [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(1,2,3,4-tetrahidroisoquinolin-6-il)amina; [4-(6-Metanosulfonil-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-il-pirimidin-2-il]-(1,2,3,4-tetrahidroisoquinolin-6-il)amina; [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(1,2,3,4-tetrahidroisoquinolin-7-il)amina; [4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(1,2,3,4-tetrahidroisoquinolin-5-il)amina; [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-(2-tiazol-2-iletil)amina; [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-[2-(6-metilpiridin-2-il)etil]amina; [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-[2-(2-fluoropiridin-4-il)etil]amina; [4-(5-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il]-[2-(5-metoxipiridin-2-il)etil]amina; 4-(6-Fluoro-1H-indol-4-il)-6-morfolin-4-ilpirimidin-2-il-(3-piridin-3-ilfenil)amina; y sus sales farmacéuticamente aceptables.
-
- 6.
- Una composición farmacéutica que contiene un soporte o diluyente farmacéuticamente aceptable y, como principio activo, un compuesto como se define en cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5.
-
- 7.
- Un compuesto como se define en cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5 para uso en un método de tratamiento médico del cuerpo humano o animal mediante terapia.
-
- 8.
- Un compuesto como se define en cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5 para uso en el tratamiento del cáncer, de trastornos inmunes, de la enfermedad cardiovascular, de la infección vírica, de la inflamación, de trastornos del metabolismo/de la función endocrina o de trastornos neurológicos
-
- 9.
- Uso de un compuesto como se define en cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5 en la fabricación de un medicamento para tratar el cáncer, los trastornos inmunes, la enfermedad cardiovascular, la infección vírica, la inflamación, los trastornos del metabolismo/de la función endocrina o los trastornos neurológicos.
imagen1
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| GB0707088A GB0707088D0 (en) | 2007-04-12 | 2007-04-12 | Pharmaceutical compounds |
| GB0707088 | 2007-04-12 | ||
| GB0707611 | 2007-04-19 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| ES2359953T3 true ES2359953T3 (es) | 2011-05-30 |
Family
ID=38116625
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| ES08736964T Active ES2359953T3 (es) | 2007-04-12 | 2008-04-14 | Derivados de pirimidina como inhibidores de la fosfatidilinositol-3-kinasa. |
Country Status (2)
| Country | Link |
|---|---|
| ES (1) | ES2359953T3 (es) |
| GB (1) | GB0707088D0 (es) |
-
2007
- 2007-04-12 GB GB0707088A patent/GB0707088D0/en not_active Ceased
-
2008
- 2008-04-14 ES ES08736964T patent/ES2359953T3/es active Active
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| GB0707088D0 (en) | 2007-05-23 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| EP2150546B1 (en) | Pyrimidine derivatives as inhibitors of phosphatidylinositol-3-kinase | |
| CN109608444B (zh) | 含异吲哚啉酮的erk抑制剂及其制备方法与用途 | |
| CA2900442C (en) | Macrocyclic pyridazinone derivatives | |
| KR102589982B1 (ko) | Egfr 억제제, 및 이의 제조 및 적용 | |
| CN101821255A (zh) | 作为pi3k抑制剂的2-吗啉-4-基-嘧啶类化合物 | |
| CN103483345B (zh) | Pi3k激酶抑制剂、包含其的药物组合物及其应用 | |
| TW201632530A (zh) | Erk抑制劑 | |
| EP2146981A1 (en) | Pharmaceutical compounds | |
| CN101094853A (zh) | 可用作蛋白激酶抑制剂的吡唑并[1,5-a]嘧啶 | |
| WO2012098068A1 (en) | Pyrazolo pyrimidines as dyrk1a and dyrk1b inhibitors | |
| EP2928893A1 (en) | Novel bi-ring phenyl-pyridines/pyrazines for the treatment of cancer | |
| ES2545382T3 (es) | Derivado de cianopiridina y su uso como medicamento | |
| CN102388055A (zh) | 咪唑并[2,1-b][1,3,4]噻二唑衍生物 | |
| JP7769648B2 (ja) | スルホンアミド化合物 | |
| CN112313207B (zh) | 一种氰基取代吡啶及氰基取代嘧啶类化合物、制备方法及其应用 | |
| CN101687863B (zh) | 氨基-噻唑基-嘧啶衍生物及其治疗癌症的用途 | |
| CN121517419A (zh) | 用于抑制sgk-1的吡唑并[3,4-d]嘧啶-6-基-磺酰胺衍生物 | |
| WO2025162250A1 (zh) | 取代的三环化合物及其用途 | |
| ES2359953T3 (es) | Derivados de pirimidina como inhibidores de la fosfatidilinositol-3-kinasa. | |
| CN118974050A (zh) | 作为ras信号转导调节剂的稠合杂环化合物 | |
| JP2024530927A (ja) | Her2阻害剤として使用するための三環系縮合ピリミジン化合物 | |
| CN120457122A (zh) | 微管蛋白聚合抑制剂 | |
| WO2023109158A1 (zh) | 7-甲基噻唑并[5,4-d]嘧啶类化合物、制备方法及其用途 | |
| CN117062817A (zh) | 用于抑制sgk-1的吡唑并[3,4-d]嘧啶-6-基-磺酰胺衍生物 |