ES2364335T3 - Mamífero no humano transgénico que comprende un polinucleótido que codifica el c5ar humano o humanizado. - Google Patents
Mamífero no humano transgénico que comprende un polinucleótido que codifica el c5ar humano o humanizado. Download PDFInfo
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Abstract
Un ratón con un gen activado, que comprende un polinucleótido que codifica un C5aR humanizado, en donde el exón endógeno 3 del locus C5aR de ratón ha sido reemplazado por una secuencia correspondiente que codifica un C5aR humano.
Description
CAMPO DE LA INVENCIÓN
La presente invención se refiere a mamíferos no humanos transgénicos que comprenden un polinucleótido que codifica un C5aR humano o humanizado. La invención también se refiere al uso de los mamíferos no humanos transgénicos en métodos de cribado de agonistas, agonistas inversos y antagonistas del C5aR humano y para analizar la eficacia de agonistas, agonistas inversos y antagonistas del C5aR en diversos modelos de enfermedad en animales.
FUNDAMENTO DE LA INVENCIÓN
La proteólisis de cada una de las proteínas del complemento C3-C5 da lugar a fragmentos catiónicos aminoterminales con moléculas de señalización denominadas anafilatoxinas. La más potente de estas, la C5a, provoca las respuestas más amplias. Considerando los componentes de la respuesta inflamatoria como marginación e infiltración de leucocitos, liberación de enzimas proteolíticas unidas a gránulos, producción de radicales activados derivados de de oxígeno y nitrógeno, cambios en el flujo sanguíneo y fugas por capilares, junto con la capacidad para contraer la musculatura lisa, la molécula C5a es el mediador pro-inflamatorio "completo". A niveles sub-nanomolares a nanomolares, la molécula C5a provoca quimiotaxis de todos los linajes mieloides (neutrófilos, eosinófilos y basófilos, macrófagos y monocitos), y causa permeabilidad vascular que está potenciada marcadamente por las prostaglandinas y los leucocitos circulantes. Las concentraciones nanomolares superiores provocan la desgranulación y activación de la NADPH-oxidasa. Esta amplitud de bioactividad contrasta con otros mediadores inflamatorios. La C5a ha sido implicada en la patogénesis de artritis reumatoide, psoriasis, septicemia, lesión por repercusión y síndrome de dificultad respiratoria en adultos.
Las actividades de la C5a están mediadas por la unión de la C5a a su receptor (C5aR). El C5aR pertenece a la familia de siete receptores transmembranales acoplados a la proteína G. El C5aR es un receptor de alta afinidad para la C5a, con un Kd de ~1 nM, y está situado en varios tipos diferentes de células incluyendo los leucocitos. El número de receptores por célula es extremadamente alto, hasta 200.000 sitios por leucocito. La activación biológica del receptor ocurre en todo el intervalo que satura la unión.
El C5aR comprende un dominio extracelular N-terminal extendido. Este dominio N-terminal grande es típico de los receptores acoplados a la proteína G que se unen a péptidos incluyendo las familias de receptores de la IL-8 y fMet-Leu-Phe (FMLP). La estructura del C5aR se ajusta a la familia de los siete receptores transmembranales, estando seguido el término N extracelular por siete hélices transmembranales conectadas por dominios interhelicoidales que alternan como bucles intracelulares y extracelulares y terminan con un dominio intracelular C-terminal.
Los agonistas del C5aR son útiles para fines terapéuticos, por ejemplo, en defensa contra infecciones bacterianas para estimular los efectos inmunorreguladores de la C5a, y para tratar cánceres, enfermedades de inmunodeficiencia e infecciones graves.
Los antagonistas del C5aR también son agentes terapéuticos útiles, por ejemplo, para tratar enfermedades inflamatorias y trastornos autoinmunitarios. Por ejemplo, los antagonistas del C5aR son útiles en el tratamiento de asma, bronquitis alérgica, inflamación crónica, lupus eritematoso sistémico, vasculitis, artritis reumatoide, osteoartritis, gota, algunas enfermedades autoalérgicas, rechazo de trasplantes, enfermedad intestinal inflamatoria (por ejemplo, colitis ulcerosa), en ciertos estados de choque, infarto de miocardio y encefalopatías pos-virales. Para este fin, se han descrito previamente antagonistas del péptido C5aR y anticuerpos anti-receptor de la C5a. Por ejemplo, el documento WO95/00164 describe anticuerpos dirigidos contra un péptido N-terminal (residuos 9-29) del receptor de la C5a.
Actualmente, son deseables agonistas y antagonistas del C5aR alternativos y/o mejorados, puesto que son métodos mejorados de cribados para agonistas y antagonistas del C5aR.
Se conocen en la técnica métodos de cribado in vitro para la detección de agonistas/antagonistas del C5aR. Por ejemplo, se pueden usar ensayos de quimiotaxis para determinar la capacidad de un anticuerpo o su fragmento funcional de bloquear la unión de un ligando al C5aR y/o inhibir la función asociada con la unión del ligando al receptor. Estos ensayos están basados en la migración funcional de células in vitro inducida por un compuesto. La quimiotaxis se puede determinar por un medio adecuado, tal como en un ensayo que utiliza una placa de quimiotaxis de 96 pocillos o que usa otros métodos reconocidos en la técnica para determinar la quimiotaxis. Por ejemplo, el uso de un ensayo de quimiotaxis transendotelial in vitro está descrito por Springer et al., (Springer et al., documento WO 94/20142, publicado el 15 de septiembre de 1994; véase también Berman et al., Immunol. Invest. 17: 625-677 (1988)). También se ha descrito la migración a través del endotelio en geles de colágeno (Kavanaugh et al., J. Immunol., 146: 4149-4156 (1991)).
MUKHERJEE P. ET AL: JOURNAL OF NEUROIMMUNOLOGY, 2000, vol. 105, nº. 2, páginas 124-130, y MUKHERJEE P. ET AL: ABSTRACTS OF THE SOCIETY FOR NEUROSCIENCE, SOCIETY FOR NEUROSCIENCE, WASHINGTON, DC, US, vol. 26, nº 1/02, 4 November 2000, página 859.14, describen ratones con el gen C5aR desactivado.
GERARD N. P. ET AL: BIOCHEMISTRY, 1993, vol. 32, 1993, páginas 1243-1250, informan de la caracterización detallada del C5aR humano. Las construcciones recombinantes que comprenden un polinucleótido que codifica un C5aR humano y sus deleciones progresivas se transfectaron en diferentes cultivos de células de mamíferos humanos y no humanos, que expresan o no un C5aR endógeno, y proporcionan un sistema modelo in vitro para análisis del funcionamiento del gen del receptor de la C5a humana.
SUMICHIKA H: CURRENT OPINION IN INVESTIGATIONAL DRUGS, 2004, vol. 5, nº. 5, páginas 505-510, describe el cribado farmacéutico de antagonistas del receptor C5aR humano para el tratamiento de inflamación usando un método de ensayo de unión a la C5a humana en membranas de neutrófilos humanos (es decir, in vitro). Se expone la selectividad para especies de los ligandos del C5aR.
Un requisito crítico en el proceso de descubrimiento de fármacos es la demonstración en modelos relevantes en animales que los nuevos agentes terapéuticos identificados por métodos de cribado in vitro sean seguros y eficaces. Además, frecuentemente es deseable comparar la eficacia in vivo de numerosos agentes para seleccionar las propiedades deseables incluyendo las propiedades farmacocinéticas, la eficacia en afectar al resultado de la enfermedad y la falta de efectos secundarios adversos. Uno de los principales obstáculos para el desarrollo de fármacos es pasar los fármacos candidatos desde los ensayos in vitro a la demonstración de la eficacia in vivo. Frecuentemente esto se debe a que muchos fármacos candidatos son específicos de especies. Por ejemplo, un antagonista desarrollado para un receptor quimioatrayente humano, tal como el C5aR, podría antagonizar solamente al C5aR humano y no al C5aR de ratón, conejos o incluso primates superiores. La incapacidad de muchos fármacos candidatos de "trabajar" a través de especies es una razón principal para el desgaste en la fase preclínica.
Por tanto, son deseables métodos mejorados de cribado que permitan la identificación y/o el análisis de agonistas, agonistas inversos y antagonistas del C5aR humano en un ambiente in vivo.
SUMARIO DE LA INVENCIÓN
Los autores de la presente invención han encontrado que cierto número de antagonistas del C5aR reaccionan con el C5aR humano, pero no lo hacen con el C5aR de otras especies. Por ejemplo, los anticuerpos monoclonales MAb 7F3, MAb 6C12 y MAb 12D4 (descritos en la solicitud de patente PCT/AU03/00084) se unen al C5aR humano pero no se unen al C5aR de ratón o babuino. Esto implica la necesidad de un sistema de cribado y validación in vivo que sea capaz de detectar y/o validar agonistas/antagonistas que sean específicos para el C5aR humano.
Los autores de la presente invención también han encontrado que la quimiotaxis de células de múridos manipuladas por ingeniería genética para expresar el C5aR humano es inhibida por anticuerpos anti-C5aR humano. Este hallazgo, asociado con el conocimiento de que la C5a de múridos se une al C5aR humano con alta afinidad, indica que el C5aR humano es compatible con la maquinaria de señalización del C5aR en otros sistemas de mamíferos. Los autores de la presente invención han desarrollado por tanto un mamífero no humano transgénico que expresa un C5aR humano y es útil para cribar o analizar agonistas/antagonistas del C5aR, particularmente los agonistas/antagonistas específicos para el C5aR humano.
En consecuencia en la presente memoria se describe un mamífero transgénico no humano que comprende un polinucleótido que codifica un C5aR humano o un C5aR humanizado.
En una realización, el polinucleótido codifica el C5aR humano. Preferiblemente, el polinucleótido codifica un polipéptido que comprende una secuencia como la mostrada en la SEQ ID NO: 3 o una de sus variantes alélicas.
En otra realización, el polinucleótido comprende una secuencia como la mostrada en la SEQ ID NO: 2 o una de sus variantes alélicas.
En otra realización, el polinucleótido codifica C5aR humanizado. Por "C5aR humanizado" queremos significar un C5aR no humano que ha sido modificado para introducir o potenciar al menos una característica funcional del C5aR humano natural. Preferiblemente, el C5aR no humano es el C5aR endógeno para el mamífero transgénico.
Por ejemplo, la modificación puede alterar la especificidad de unión del C5aR no humano, de tal modo que el C5aR humanizado se una a uno o más ligandos, agonistas, agonistas inversos o antagonistas del C5aR humano. Alternativamente, la modificación puede potenciar la afinidad de unión del C5aR no humano a uno o más ligandos, agonistas, agonistas inversos o antagonistas del C5aR humano. En una realización preferida, la modificación potencia la afinidad de unión del C5aR no humano a uno o más ligandos, agonistas, agonistas inversos o antagonistas del C5aR humano al menos 5 veces, más preferiblemente al menos 10 veces.
La modificación implica preferiblemente la sustitución de al menos un aminoácido del C5aR no humano por el correspondiente aminoácido del C5aR humano.
Preferiblemente, la modificación comprende reemplazar al menos un dominio o una parte sustancial del mismo por el correspondiente dominio del C5aR humano o una parte sustancial del mismo. Por ejemplo, la modificación puede comprender reemplazar al menos un dominio extracelular del C5aR endógeno por el correspondiente dominio extra-celular del C5aR humano. El C5aR humanizado puede comprender por tanto al menos un dominio extracelular del C5aR humano. En un ejemplo, el C5aR humanizado comprende dominios intracelulares del C5aR endógeno y dominio extracelulares del C5aR humano.
En una realización preferida el mamífero transgénico tiene células somáticas y de líneas germinales que contienen, en una forma establemente integrada, un polinucleótido que codifica el C5aR humano o humanizado. En otras palabras, se prefiere que el mamífero transgénico sea uno "con el gen activado" para el C5aR humano o humanizado. Se apreciará que esto se puede conseguir, por ejemplo, introduciendo una construcción de polinucleótido que codifica el C5aR humano o una construcción de polinucleótido que codifica el C5aR humanizado en el genoma de un mamífero por integración dirigida a la diana en el genoma del mamífero.
Alternativamente, una construcción de polinucleótido que codifica un fragmento del C5aR humano puede ser integrado dentro de la secuencia del C5aR endógeno, de tal modo que después de la integración, el sitio del C5aR endógeno comprenda el polinucleótido que codifica el C5aR humanizado.
En otra realización preferida, el mamífero transgénico es homocigótico para el C5aR humano o humanizado.
En una realización preferida adicional, la expresión del C5aR endógeno en el animal transgénico es indetectable o insignificante. La reducción en la expresión del C5aR endógeno se puede conseguir por un medio adecuado. Por ejemplo, las células del mamífero transgénico pueden ser modificadas de modo que expresen un ácido nucleico antisentido complementario a los ácidos nucleicos que codifican el C5aR endógeno. Alternativamente, el gen del C5aR endógeno puede estar interrumpido por recombinación homóloga. Preferiblemente, el mamífero transgénico es un mamífero homocigótico con el gen desactivado ("knock-out") para el C5aR endógeno.
En una realización preferida, la "desactivación" del C5aR endógeno ocurre simultáneamente con la introducción del C5aR humano o humanizado. Esto se consigue preferiblemente reemplazando la secuencia que codifica el C5aR endógeno o uno de sus fragmentos por una secuencia correspondiente que codifica el C5aR humano o uno de sus fragmentos por medio de recombinación homóloga dirigida a la diana. En una realización particular, uno o más de los dominios del C5aR endógeno es reemplazado por el(los) correspondiente(s) dominio(s) humano(s).
Los animales transgénicos descritos en la presente memoria pueden comprender otras alteraciones genéticas además de la presencia de una secuencia que codifica el C5aR humano. Por ejemplo, el genoma del animal transgénico puede ser alterado para afectar a la función de genes endógenos, contener genes marcadores u otras alteraciones genéticas específicas de acuerdo con los métodos descritos en la presente memoria.
En otra realización preferida, el mamífero transgénico no humano se selecciona del grupo que comprende vaca, cerdo, cabra, oveja, camello, caballo, gato, perro, mono, babuino, conejo, cobaya, rata, hámster y ratón. Los roedores tales como ratas, ratones y hámsteres son los mamíferos preferidos. Preferiblemente, el mamífero transgénico es un ratón.
También se describen un tejido aislado, órgano aislado, célula(s) aisladas, cultivo celular primario o línea celular establecida obtenidos del mamífero no humano transgénico de la invención. Los órganos o tejidos preferidos incluyen musculatura lisa, tejido endotelial, musculatura contráctil y corazón.
También se describe en la presente memoria un método para producir un mamífero no humano transgénico, que comprende introducir en el genoma de un mamífero no humano una construcción de polinucleótido que codifica C5aR humano, C5aR humanizado o un fragmento de C5aR humano, para producir un mamífero no humano transgénico.
En una realización, la construcción del polinucleótido codifica C5aR humano. Preferiblemente, el polinucleótido codifica un polipéptido que comprende una secuencia como la mostrada en la SEQ ID NO:3 o una de sus variantes alélicas.
En otra realización, la construcción del polinucleótido comprende una secuencia como la mostrada en la SEQ ID NO:2 o una de sus variantes alélicas.
En otra realización, la construcción del polinucleótido codifica C5aR humanizado.
Otra descripción en la presente memoria es la construcción del polinucleótido que codifica un fragmento de C5aR humano. Preferiblemente, el fragmento abarca al menos un dominio del C5aR humano o una parte del mismo.
En una realización preferida, el fragmento abarca al menos uno de los dominios enumerados en la Tabla 1. En una realización particular, el fragmento abarca al menos un dominio extracelular del C5aR humano. En otra realización, el fragmento abarca dos o más de los dominios enumerados en la Tabla 1.
En otra realización preferida, el método comprende además interrumpir el C5aR endógeno del mamífero no humano. Preferiblemente, el mamífero transgénico es un mamífero homocigótico con el gen C5aR endógeno desactivado.
En una realización preferida, el método comprende reemplazar la secuencia que codifica el C5aR endógeno o uno de sus fragmentos por una secuencia que codifica el C5aR humano correspondiente o uno de sus fragmentos por medio de una recombinación homóloga dirigida. En una realización particular, el método comprende reemplazar uno
o más de los dominios del C5aR endógeno por el(los) dominio(s) humano(s) correspondiente(s).
En otra realización preferida, la construcción del polinucleótido comprende un marcador seleccionable. Se puede usar cualquier marcador seleccionable, aunque un marcador seleccionable preferido es el gen PGK-neo. Preferiblemente, el marcador seleccionable está flanqueado por sitios loxP de modo que el marcador seleccionable pueda ser eliminado después de su actuación como diana por la expresión transitoria de la Cre-recombinasa.
En otra realización preferida, la construcción del polinucleótido comprende regiones homólogas a las secuencias 3' y 5' que flanquean la secuencia codificadora del C5aR endógeno del mamífero no humano. Preferiblemente, la construcción del polinucleótido comprende regiones homólogas en al menos 2 kb, más preferiblemente alrededor de 3 kb, hacia el extremo 5' y hacia el extremo 3' del exón 3 del gen C5aR endógeno.
Se apreciará que los mamíferos transgénicos descritos en la presente memoria serán útiles en la identificación, evaluación o validación de nuevos agonistas, agonistas inversos y antagonistas del C5aR. Por ejemplo, los mamíferos transgénicos se pueden usar para cribar cierto número de compuestos candidatos para identificar agonistas, agonistas inversos o antagonistas de la función del C5aR humano. Los mamíferos transgénicos se pueden usar también para evaluar la idoneidad terapéutica de agonistas, agonistas inversos o antagonistas de la función del C5aR humano que previamente han sido identificados en los métodos de cribado.
Por consiguiente, también se describe en la presente memoria un método para evaluar al menos un efecto farmacocinético y/o farmacodinámico de un compuesto candidato, que comprende administrar un compuesto candidato a un mamífero transgénico de la presente invención o a un tejido o células aislados del mismo y examinar al menos un
efecto farmacocinético y/o farmacodinámico del compuesto candidato en el mamífero transgénico.
En una realización preferida, al menos uno de los efectos farmacocinéticos examinados es un parámetro de absorción, un parámetro de distribución, un parámetro de metabolismo o un parámetro de excreción.
Por ejemplo, al menos uno de los efectos farmacocinéticos examinados puede ser volumen de distribución, depuración total, unión a proteínas, unión a tejidos, depuración metabólica, depuración renal, depuración hepática, depuración bilial, absorción intestinal, biodisponibilidad, biodisponibilidad relativa, depuración intrínseca, tiempo medio de permanencia, tasa máxima de rnetabolismo, constante de Michaelis-Menten, coeficientes de reparto entre tejidos y sangre o plasma, fracción excretada inalterada en orina, fracción de fármaco convertido sistemáticamente en metabolitos, constante de la velocidad de eliminación, semi-vida o depuración de la secreción.
Para mayor claridad y permitir la comprensión del alcance completo de la presente invención, "efectos farmacocinéticos" se refiere al estudio de la cinética asociada a los procesos dinámicos de un parámetro, tal como absorción, distribución, metabolismo y excreción (ADME) de un compuesto candidato y/o sus metabolitos en un organismo vivo. Como se usa en el contexto de la presente invención, los siguientes términos farmacocinéticos han de ser entendidos en sentido amplio y tendrán sus significados generalmente aceptados tal como se exponen a continuación.
"Absorción" se refiere al proceso de captación de un compuesto candidato desde el sito de administración a la circulación sistémica. La transferencia del compuesto candidato a través del lumen intestinal se denomina generalmente absorción oral, mientras que la transferencia del compuesto candidato a través de la barrera fisiológica externa se denomina absorción general. El parámetro farmacocinético absorción puede ser estimado a partir de datos de biosensores asociados a un chip sensor que tiene, por ejemplo, una pluralidad de liposomas apropiados inmovilizados en él.
"Distribución" se refiere a la transferencia de un compuesto candidato desde el sito de administración a la circulación sistémica total y luego al agua extracelular e intracelular y a los tejidos. La distribución es usualmente un proceso rápido y reversible. El parámetro farmacocinético distribución puede ser estimado a partir de datos de biosensores asociados a un chip sensor que tiene, por ejemplo, una pluralidad de proteínas plasmáticas, liposomas y/o proteínas de transporte apropiadas inmovilizadas en él.
"Metabolismo" se refiere a la suma de todas las reacciones químicas para la biotransformación de sustancias endógenas y exógenas que tienen lugar en la célula viva. El parámetro farmacocinético metabolismo puede ser estimado a partir de datos de biosensores asociados con un chip de sensores que tiene, por ejemplo, una pluralidad de enzimas metabólicas apropiadas inmovilizadas en él.
"Excreción" se refiere a la eliminación o pérdida final de un fármaco del cuerpo. La excreción incluye tanto difusión pasiva como excreción mediada por un vehículo específico relativo. Los compuestos candidatos pueden ser excretados, inalterados o en forma de metabolitos, en la orina vía los riñones o en las heces vía las bilis y/o el intestino. Los compuestos volátiles se excretan frecuentemente en el aire expirado por los pulmones. El parámetro farmacocinético excreción puede ser estimado a partir de datos de biosensores asociados con un chip de sensores que tiene inmovilizado en él, por ejemplo, un anticuerpo que detecta específicamente el compuesto candidato, así como otros proteínas/receptores que tienen una alta afinidad/especificidad contra el fármaco candidato. Dichos anticuerpos y proteínas/receptores se pueden usar para cuantificar la concentración/cantidad del fármaco en diferentes fluidos corporales (por ejemplo, orina/heces) y tejidos, usando un ensayo de unión directa.
En otra realización, el método implica examinar al menos un efecto farmacodinámico del compuesto candidato en el mamífero transgénico. Preferiblemente, al menos uno de los efectos farmacodinámicos es la modulación de la actividad del C5aR. Esto se puede determinar monitorizando al menos un fenotipo asociado con la señalización de C5aR después de la administración del compuesto candidato.
Por consiguiente, también se describe en la presente memoria un método de identificar un compuesto que modula la actividad del C5aR, que comprende (i) administrar un compuesto candidato a un mamífero transgénico o tejido o células aislados obtenidos del mismo de la presente invención en condiciones en las cuales se expresa al menos un fenotipo asociado con la señalización del C5aR; y (ii) monitorizar el desarrollo de al menos un fenotipo después de la administración del compuesto.
En una realización preferida, el método comprende además (iii) comparar la extensión del fenotipo en el mamífero transgénico o células derivadas del mismo, a los cuales se administró el compuesto, con la de un mamífero de control o células derivadas del mismo, en donde una diferencia en la naturaleza o extensión del fenotipo cuando se compara con el mamífero de control indica el potencial del compuesto para modular la actividad del C5aR.
Una realización particular proporciona un método de identificar un compuesto que inhibe o reduce la actividad del C5aR, que comprende (i) administrar un compuesto candidato a un mamífero transgénico o tejido o células aislados obtenidos del mismo en condiciones en las cuales se expresa al menos un fenotipo asociado con la señalización del C5aR; y (ii) monitorizar el desarrollo de al menos un fenotipo después de la administración del compuesto, en donde una reducción o inhibición en la naturaleza o extensión del fenotipo después de la administración indica el potencial del compuesto para inhibir o reducir la actividad del C5aR. Preferiblemente, el método comprende además (iii) comparar la extensión del fenotipo en el mamífero transgénico, al cual se administró el compuesto, con la de un mamífero de control, en donde una reducción o inhibición en la naturaleza o extensión del fenotipo cuando se compara con el mamífero de control indica el potencial del compuesto para reducir o inhibir la actividad del C5aR.
Otra realización proporciona un método de identificar un compuesto que promueve o potencia la actividad del C5aR, que comprende (i) administrar un compuesto candidato a un mamífero transgénico o tejido o células aislados obtenidos del mismo en condiciones en las cuales se expresa al menos un fenotipo asociado con la señalización del C5aR; y (ii) monitorizar el desarrollo de al menos un fenotipo después de la administración del compuesto, en donde una potenciación en la naturaleza o extensión del fenotipo después de la administración indica el potencial del compuesto para promover o potenciar la actividad del C5aR. Preferiblemente, el método comprende además (iii) comparar la extensión del fenotipo en el mamífero transgénico, al cual se administró el compuesto, con la de un mamífero de control, en donde una potenciación en la naturaleza o extensión del fenotipo cuando se compara con el mamífero de control indica el potencial del compuesto para promover o potenciar la actividad del C5aR.
El animal de "control" empleado en este contexto puede ser cualquier otro mamífero que exprese los mismos indica-dores fenotípicos que los expresados en el mamífero en el cual se analizó el compuesto (es decir, el mamífero de "ensayo").
En una realización, los animales de control y de ensayo expresan niveles similares de C5aR humano funcional. Por ejemplo, los animales de control y de ensayo pueden ser isogénicos.
En otra realización, el animal de control es un animal de tipo natural que no expresa el C5aR humano o humanizado.
La frase "fenotipo asociado con la señalización de C5aR" está destinada a abarcar una característica visible y/o un comportamiento (incluyendo un síntoma clínico de una enfermedad) que está asociado con un proceso bioquímico que implica señalización del C5aR. El fenotipo puede estar asociado con una señalización del C5aR normal o anómala. En una realización el fenotipo es un estado que está agravado por la señalización del C5aR, tal como un trastorno complejo inmunitario, una enfermedad inflamatoria o alérgica, rechazo de injerto o cáncer. En otra realización, el fenotipo es un estado que es aliviado o disminuido por el aumento de la señalización del C5aR, tal como un estado asociado a inmunosupresión.
En una realización particular, el fenotipo es inflamación. La inflamación puede ser inducida, por ejemplo, por transferencia de suero desde un mamífero KBxN artrítico a un mamífero transgénico de la descripción.
En otra realización el fenotipo es un daño del tejido inflamatorio, tal como una lesión por isquemia-reperfusión.
En otra realización, el fenotipo es infiltración de leucocitos.
En otra realización, el fenotipo es asma.
En otra realización, el fenotipo es septicemia, ictus o síndrome de dificultad respiratoria.
En otra realización, el fenotipo es un estado seleccionado del grupo que consiste en enfermedades y estados inflamatorios o alérgicos, incluyendo enfermedades alérgicas respiratorias, tales como asma, rinitis alérgica, enfermedades pulmonares alérgicas, neumonitis alérgica, enfermedades pulmonares intersticiales (ILD) (por ejemplo, fibrosis pulmonar idiopática o ILD asociadas a artritis reumatoide, lupus eritematoso sistémico, espondilitis anquilosante, esclerosis sistémica, síndrome de Sjogren, polimiositis o dermatomiositis); respuestas de anafilaxis o alérgicas, alergias a fármacos (por ejemplo, a penicilina, cefalosporinas), alergias a picaduras de insectos; enfermedad intestinal inflamatoria, tal como enfermedad de Crohn y colitis ulcerosa; espondiloartropatias; escleroderma; psoriasis y dermatosis inflamatorias, tales como dermatitis, eczema, dermatitis atópica, dermatitis alérgica por contacto, urticaria; vasculitis (por ejemplo, vasculitis necrotizante, cutánea y alérgica); enfermedades autoinmunitarias, tales como artritis (por ejemplo, artritis reumatoide, artritis psoriásica), esclerosis múltiple, lupus eritematoso sistémico, miastenia grave, diabetes de tipo 1, nefritis, tales como glomerulonefritis, tiroiditis autoinmunitaria, enfermedad de Behcet; rechazo de injerto (por ejemplo, en trasplante), incluyendo rechazo de aloinjerto o enfermedad del injerto contra el hospedante; aterosclerosis; cánceres con infiltración de leucocitos de la piel u órganos; lesión por reperfusión, ictus, síndrome de dificultad respiratoria en adultos, ciertas enfermedades malignas hematológicas, toxicidad inducida por citoquinas (por ejemplo, choque séptico, choque endotóxico), polimiositis, dermatomiositis, pénfigo, enfermedad de Alzheimer, enfermedades granulomatosas incluyendo sarcoidosis, síndromes de inmunodeficiencia, tal como SIDA, radioterapia, quimioterapia, terapia para enfermedad autoinmunitaria u otra terapia con fármacos (por ejemplo, terapia con corticoesteroides), que provoca inmunosupresión; e inmunosupresión debida a deficiencia congénita o a enfermedades infecciosas, tales como el síndrome respiratorio agudo grave (abreviadamente SARS, por la expresión inglesa Severe Acute Respiratory Syndrome).
La gama de compuestos candidatos contemplados en la presente memoria incluye compuestos inhibidores del C5aR o agonistas inversos o antagonistas de una función biológica del C5aR. En una realización, el compuesto se selecciona del grupo que consiste en: un péptido, incluyendo un péptido derivado del C5aR o la C5a u otros péptidos que no son del C5aR y capaces de inhibir, reducir o reprimir una función del C5aR, un mutante dominante-negativo del C5aR; un inhibidor no peptídico del C5aR; un anticuerpo o fragmento de anticuerpo que se une al C5aR e inhibe una función del C5aR; una molécula orgánica pequeña y ácido nucleico, incluyendo ácido nucleico que codifica dicho péptido derivado del C5aR o la C5a u otro inhibidor peptídico no del C5aR, un ácido nucleico antisentido dirigido contra el mRNA que codifica el C5aR o una ribozima anti-C5aR o un RNA interferente (RNAi) pequeño que dirige la expresión del gen del C5aR.
También se describe un método de identificar un compuesto que modula la actividad del C5aR, que comprende:
- (a)
- administrar un compuesto candidato a un ratón con un gen activado de la presente invención o tejidos o células aislados obtenidos del mismo en el cual se expresa al menos un fenotipo asociado con señalización de C5aR; y monitorizar el desarrollo de al menos un fenotipo después de la administración del compuesto
- (b)
- opcionalmente, determinar la estructura del compuesto candidato; y
- (c)
- proporcionar el compuesto candidato o el nombre de la estructura del compuesto candidato.
Naturalmente, para agentes que son conocidos aunque no se han analizado previamente en cuanto a su función usando un cribado proporcionado por la presente invención, la determinación de la estructura del compuesto está implícita en la etapa (b). Esto es debido a que el experto estará enterado del nombre y/o la estructura del compuesto en el momento de realizar el cribado.
Como se usa en la presente memoria, la expresión "proporcionar el agente " será entendida incluyendo un medio sintético químico o recombinante para producir dicho agente o alternativamente, la disposición de un agente que ha sido previamente sintetizado por una persona o medio.
Los compuestos identificados para la administración a un animal no humano o humano como se describe en la presente memoria pueden ser formulados para la administración por inyección mediante una ruta subcutánea, intravenosa, intranasal o intraperitoneal. Alternativamente, pueden ser adecuados para administración oral en la forma de aditivos alimentarios, comprimidos, trociscos, etc.
Por consiguiente, la presente invención proporciona un ratón con un gen activado como se define en la reivindicaciones 1 a 4, una(s) célula(s) aislada(s), línea celular, tejido u órgano como se define en la reivindicación 5, y un método como se define en la reivindicaciones 6 a 17.
Los diversos aspectos y realizaciones descritos en la presente memoria, a los que se refieren los apartados individuales anteriores, se aplican, cuando sea adecuado, a otros apartados, mutatis mutandis. En consecuencia los aspectos especificados en un apartado pueden ser combinados con los aspectos especificados en otros apartados, cuando sea adecuado.
BREVE DESCRIPCIÓN DE LAS FIGURAS DE LOS DIBUJOS
Figura 1: Diagrama que muestra el diseño de la construcción con una diana para la generación de ratones con un gen C5aR humano activado.
Figura 2: Diagrama que muestra el locus C5aR de un ratón transgénico después de deleción del gen PGKneo por Cre-recombinasa.
Figura 3: Diagrama que muestra sitios de restricción seleccionados y los exones del gen C5aR (C5r1) de ratón.
Figura 4: Localización de cebadores oligonucleotídicos usados en el ensayo de genotipado por PCR.
Figura 5: Análisis FACS que muestra que el C5aR humano es expresado en neutrófilos en ratones que llevan el gen hC5aR. Se incubó sangre de ratones de tipo natural (+/+); heterocigóticos (H5Rf/+) y homocigóticos (HSRf/HSRf) con un anticuerpo 7F3 específico para el C5aR humano conjugado a FITC. La zona de la derecha de la línea discontinua en el histograma de neutrófilos es la tinción positiva para el 7F3-FITC.
Figura 6: Progreso de una enfermedad inflamatoria similar a la artritis reumatoide (AR) en ratones homocigóticos con el gen C5aR humano activado y ratones de tipo natural. El panel de la izquierda muestra el aumento en el grosor de los tobillos después de que se inyectó i.p. suero de K/BxN los días 0 y 2. El panel de la derecha muestra la puntación clínica. Los ratones nº 10 y nº 25 son homocigóticos para el gen C5aR humano, el ratón nº 38 es un compañero de camada de tipo natural. El engrosamiento de los tobillos y la enfermedad clínica se desarrolló tanto en ratones de tipo natural como homocigóticos con el gen hC5aR en la forma típica descrita para este modelo (Lee et al (2002) Science, 297, 1689-1692).
Figura 7: Gráficos que muestran el progreso y prevención de una enfermedad inflamatoria similar a la AR en ratones homocigóticos con el gen C5aR humano activado. El panel de la izquierda muestra el aumento en el engrosamiento de los tobillos después de que se inyectó i. p. suero de K/BxN los días 0 y 2. El panel de la derecha muestra la puntuación clínica. Los ratones nº 7, 10, 24 y 25 son homocigóticos para el gen C5aR humano. Los ratones nº 7 y nº 24 fueron inyectados con el anticuerpo neutralizante 7F3 para el gen C5aR humano, mientras que los ratones nº 10 y nº 25 fueron inyectados con un anticuerpo de control isotípico. El ratón compañero de camada (ratón nº 38) también fue tratado con el 7F3. El anticuerpo se inyectó los días -1 y +3. Los ratones inyectados con anticuerpo de control desarrollaron una enfermedad inflamatoria. En contraste los ratones con el gen hC5aR activado inyectados con 7F3 fueron protegidos de la inflamación. Los ratones de tipo natural inyectados con 7F3 no fueron protegidos de la inflamación.
CLAVE PARA EL LISTADO DE SECUENCIAS
SEQ ID NO:1: Secuencia de locus del gen C5aR(C5r1) de ratón y DNA flanqueante.
SEQ ID NO:2: Secuencia del cDNA del C5aR humano.
SEQ ID NO:3: Secuencia de aminoácidos del C5aR humano.
SEQ ID NO:4: Cebador F1C (específico para el exón 3 del C5aR humano):
SEQ ID NO:5: Cebador R2a (específico para el exón 3 del C5aR humano):
SEQ ID NO:6: Cebador F3C (específico para el gen C5aR de ratón):
SEQ ID NO:7: Cebador R4C (específico para el gen C5aR de ratón):
DESCRIPCIÓN DETALLADA DE LA INVENCIÓN
Técnicas generales y definiciones
A no ser que se indique otra cosa, las técnicas de DNA recombinante utilizadas en la presente invención son métodos estándares, bien conocidos por los expertos en la técnica. Dichas técnicas está descritas y explicadas a través de toda la literatura científica, en fuentes tales como: J. Perbal, A Practical Guide to Molecular Cloning, John Wiley and Sons (1984), J. Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbour Laboratory Press (1989), T.A. Brown (editor), Essential Molecular Biology: A Practical Approach, Volumes 1 y 2, IRL Press (1991), D.
M. Glover y B.D. Hames (editors), DNA Cloning: A Practical Approach, Volumes 1-4, IRL Press (1995 y 1996), y F.M. Ausubel et al (Editors), Current Protocols in Molecular Biology, Greene Pub. Associates and Wiley-Interscience (1988, incluyendo todas las actualizaciones hasta el presente) y se incorporan en la presente memoria como referencia. En particular, estos documentos describen en detalle métodos de transcribir o replicar moléculas de ácidos nucleicos y las condiciones requeridas para dicho métodos.
Definiciones
A través de esta memoria se entenderá que la palabra "comprenden" o variaciones, tal como "comprende" o "que comprende(n)", que implica la inclusión de un elemento establecido, número entero o etapa o grupo de elementos, numero enteros o etapas, pero no la exclusión de cualquier otro elemento, número entero o etapa o grupo de elementos, números enteros o etapas.
Como se usa en la presente memoria, un "ligando" de una proteína C5aR se refiere a una clase particular de sustancias que se unen a una proteína C5aR de mamífero, incluyendo ligandos naturales y formas sintéticas y/o recombinantes de los ligandos naturales. En una realización preferida, la unión al ligando de una proteína C5aR ocurre con alta afinidad.
Como se usa en la presente memoria, un "antagonista" es una sustancia que inhibe la unión de un agonista o agonista inverso a una proteína C5aR e impide de este modo al menos un función característica de una proteína C5aR, tal como una actividad de unión (por ejemplo, unión de ligandos, unión de promotores, unión de anticuerpos), una actividad de señalización (por ejemplo, activación de una proteína G de mamíferos, inducción de un aumento rápido y transitorio de la concentración de calcio libre en el citosol) y/o la función de respuestas celulares (por ejemplo, estimulación de quimiotaxis, exocitosis o liberación de mediadores inflamatorios por los leucocitos). El término antagonista abarca sustancias que se unen al receptor (por ejemplo, un anticuerpo, un mutante de un ligando natural, moléculas orgánicas de bajo peso molecular, otros inhibidores competitivos de la unión de ligandos) y sustancias que bloquean la función de los receptores sin unirse a ellos.
Como se usa en la presente memoria, un "agonista" es una sustancia que promueve (induce, causa, potencia o aumenta) al menos un función característica de una proteína C5aR, tal como una actividad de unión (por ejemplo, unión de ligandos, inhibidores y/o promotores), una actividad de señalización (por ejemplo, activación de una proteína G de mamíferos, inducción de aumento rápido y transitorio de la concentración de calcio libre en el citosol) y/o la función de respuestas celulares (por ejemplo, estimulación de quimiotaxis, exocitosis o liberación de mediadores inflamatorios por los leucocitos). El término agonista abarca sustancias que se unen al receptor (por ejemplo, un anticuerpo, un mutante de un ligando natural de otra especie) y sustancias que promueven la función de los receptores sin unirse a ellos (por ejemplo, activando una proteína asociada). En una realización preferida, el agonista es distinto de un homólogo de un ligando natural.
"Agonista inverso" como se usa en la presente memoria se refiere a una molécula que se une a, o interactúa de otra manera con, el C5aR para inhibir la respuesta intracelular en la línea base iniciada por la forma activa del C5aR por debajo del nivel básico normal de actividad que se observa en ausencia de agonistas.
Por "transgénico mamífero" se quiere significar un mamífero (por ejemplo, ratón, rata; hámster, etc.), que tiene una secuencia de ácido nucleico no endógena (es decir, heteróloga) presente como un elemento extracromosómico en una porción de sus células o establemente integrada en su DNA de línea germinal (es decir, en la secuencia genómica de la mayoría de sus células). El ácido nucleico heterólogo se introduce en la línea germinal de dichos animales transgénicos por manipulación genética de, por ejemplo, embriones o células madre embrionarias del animal hospedante.
El término "biológicamente activo" o "funcional", cuando se usa en la presente memoria como un modificador del C5aR humano, se refiere a un polipéptido que exhibe al menos una de las características funcionales atribuidas al C5aR humano natural, tal como la capacidad de funcionar como receptor de la C5a o unirse a uno o más ligandos naturales del C5aR humano.
Una "desactivación" de un gen (que en lengua inglesa es expresada con el término "knock-out") significa una alteración en la secuencia del gen que da como resultado una disminución de la función del gen diana, preferiblemente tal que la expresión del gen diana es indetectable o insignificante. Una desactivación de un gen endógeno significa que la función del gen ha sido sustancialmente disminuida, de modo que la expresión no es detectable o sólo lo es a niveles insignificantes. Los animales transgénicos con un gen desactivado pueden ser animales transgénicos que tienen una desactivación heterocigótica de un gen o una desactivación homocigótica de un gen. Las "desactivaciones" incluyen también desactivaciones condicionales, en donde la alteración del gen diana puede ocurrir, por ejemplo, por exposición del animal a una sustancia que promueva la alteración del gen diana, introducción de una enzima que promueve la recombinación en el sitio del gen diana (por ejemplo, Cre en el sistema Cre-lox), u otro método para dirigir la alteración del gen diana posnatalmente.
Una "activación" de un gen diana (que en lengua inglesa es expresada con el término "knock-in") significa una alteración en un genoma de células hospedantes que da como resultado una expresión alterada (por ejemplo, aumentada (incluyendo ectópica)) del gen diana, por ejemplo, por introducción de una copia adicional del gen diana o por inserción de modo operativo de una secuencia reguladora que proporciona la expresión potenciada de una copia endógena del gen diana. Las animales transgénicos con un gen "activado" de interés para la presente invención son animales transgénicos que tienen un gen C5aR humano o humanizado. Dichos animales transgénicos pueden ser activados heterocigóticos para el gen C5aR humano o humanizado u homocigóticos para la activación del gen C5aR humano o humanizado. Las "activaciones" también abarcan activaciones condicionales.
Por "construcción" se quiere decir un ácido nucleico recombinante, generalmente DNA recombinante, que ha sido generado con el fin de la expresión de una secuencia nucleotídica específica o ha de ser usado en la construcción de otras secuencias nucleotídicas recombinantes.
Por "unida operativamente" se quiere significar que una secuencia de DNA y una secuencia reguladora están conectadas de tal modo que permiten la expresión del gen cuando las moléculas apropiadas (por ejemplo, las proteínas activadoras de la transcripción) esté unidas a la secuencia reguladora.
Por "insertada operativamente" se quiere decir que una secuencia nucleotídica de interés está colocada adyacente a una secuencia nucleotídica que dirige la transcripción y traducción de la secuencia nucleotídica introducida de interés (es decir, facilita la producción de, por ejemplo, un polipéptido codificado por una secuencia del C5aR humano).
El término "corresponde a" o "que corresponde a" significa homólogo a, o sustancialmente equivalente a, o equivalente funcionalmente a la secuencia designada.
El término "construcción de gen transgénico" se refiere a una molécula de ácido nucleico, por ejemplo, un vector, que contiene el polinucleótido objeto, por ejemplo, el polinucleótido C5aR humano o uno de sus fragmentos, unido operativamente de un modo capaz de expresar el polinucleótido en una célula hospedante. Como se usa en la presente memoria, el término "polinucleótido" abarca ácido desoxirribonucleico (DNA), y, cuando sea apropiado, ácido ribonucleico (RNA). Como se usa en la presente memoria el término también abarca análogos de RNA o DNA hechos de análogos de nucleótidos, y cuando sea aplicable a la realización que se describe, polinucleótidos monocatenarios (tales como con sentido o antisentido) y bicatenarios.
Animales transgénicos
Los métodos para producir animales transgénicos son bien conocidos en la técnica. Un libro de texto general útil sobre este tema es el de Houdebine, Transgenic animals - Generation and Use (Harwood Academic, 1997) que es una revisión amplia de la técnica usada para generar animales transgénicos desde peces hasta ratones y vacas. Son de particular interés en el contexto de la presente invención los mamíferos transgénicos no humanos, tal como vacas, cerdos, cabras, caballos, etc., y particularmente roedores, por ejemplo ratas, ratones, hámsteres, etc. Preferiblemente, el animal transgénico es un ratón.
Los avances en las tecnologías para la micromanipulación de embriones permiten ahora la introducción de DNA heterólogo en, por ejemplo, huevos de mamíferos fertilizados. Por ejemplo, las células madre totipotentes o pluripotentes pueden ser transformadas por microinyección, precipitación mediada por fosfato de calcio, fusión de liposomas, infección retroviral u otros medios. Las células transformadas se introducen luego en el embrión, y el embrión se desarrolla luego hasta un animal transgénico. En un método preferido, los embriones en desarrollo se transfectan con el DNA deseado por electroporación, y los animales transgénicos se producen a partir del embrión infectado. En otro método más preferido, sin embargo, los DNA apropiados se co-inyectan en el pronúcleo o citoplasma de embriones, preferiblemente en la etapa de una sola célula, y se dejan desarrollar los embriones hasta los animales transgénicos maduros. Estas técnicas son bien conocidas. Véanse las revisiones de métodos de laboratorio estándares para microinyección de los DNA heterólogos en huevos fertilizados de mamíferos, incluyendo las de Hogan et al., Manipulating the Mouse Embryo, (Cold Spring Harbor Press 1986); Krimpenfort et al., Bio/Tehhnology 9:844 (1991); Palmiter et al., Cell, 41: 343 (1985); Kraemer et al., Genetic manipulation of the Mammalian Embryo, (Cold Spring Harbor Laboratory Press 1985); Hammer et al., Nature, 315: 680 (1985); Wagner et al., Patente de EE.UU. Nº 5.175.385; Krimpenfort et al., Patente de EE.UU. Nº 5.175.384, cuyos contenidos respectivos se incorporan en la presente memoria como referencia.
Otro método usado para producir un animal transgénico implica microinyectar un ácido nucleico en huevos en la etapa pro-nuclear por métodos estándares. Los huevos inyectados se cultivan luego antes de transferirlos a los oviductos de las receptoras seudopreñadas.
Los animales transgénicos también pueden ser producidos por la tecnología de transferencia nuclear como la descrita en Schnieke, A.E. et al., 1997, Science, 278: 2130 y Cibelli, J.B. et al., 1998, Science, 280: 1256. Usando este método, fibroblastos de animales donantes se transfectan establemente con un plásmido que incorpora las secuencias codificadora de un dominio de unión o una pareja de unión de interés bajo el control de secuencias reguladoras. Los transfectantes estables se fusionan luego a los ovocitos enucleados, se cultivan y se transfieren a receptores hembras.
Los análisis de animales que pueden contener secuencias transgénicas serían típicamente realizador por PCR o análisis por transferencia Southern siguiendo métodos estándares.
Como un ejemplo específico para la construcción de mamíferos transgénicos, tal como vacas, se microinyectan construcciones de nucleótidos que comprenden una secuencia que codifica un dominio de unión dominio fusionado a GFP usando, por ejemplo, la técnica descrita en la Patente de EE.UU. Nº 4.873.191, en ovocitos que se obtienen de ovarios recientemente retirados del mamífero. Los ovocitos se aspiran de los folículos y se dejan sedimentar antes de la fertilización con esperma congelado capacitado con heparina y prefraccionado por gradiente de Percoll para aislar la fracción móvil.
Los ovocitos fertilizados se centrifugan, por ejemplo, durante ocho minutos a 15.000 g para visualizar los pronúcleos para la inyección y luego se cultivan a partir del cigoto hasta la etapa de mórula o blastocisto en medio acondicionado de tejido de oviducto. Este medio se prepara usando tejidos luminales rascados de los oviductos y se diluye en medio de cultivo. Los cigotos deben colocarse en el medio de cultivo dentro de las dos horas después de la microinyección.
Luego se sincroniza el estro en los mamíferos receptores destinados, tal como ganado vacuno, administrando coprostanol. El estro se produce en los dos días siguientes y los embriones se transfieren a los receptores 5-7 días después del estro. La transferencia con éxito puede ser evaluada en la descendencia por transferencia Southern.
Alternativamente, las construcciones deseadas se pueden introducir en células madre embrionarias (abreviadamente células ES por la expresión inglesa Embryonic Stem) y las células se cultivan para asegurar la modificación por el transgén. Las células modificadas se inyectan luego en la fase embrionaria blástula y las blástulas se reemplazan en las hospedantes seudopreñadas. La descendencia resultante es quimérica con respecto a las células ES y las células hospedantes y las razas no quiméricas que exclusivamente comprenden la progenie ES se pueden obtener usando reproducción cruzada convencional. Este técnica está descrita, por ejemplo, en el documento WO91/10741.
Los animales transgénicos comprenden una secuencia exógena de ácido nucleico presente como un elemento extracromosómico o integrado establemente en todas o partes de sus células, especialmente en las células germinales. Se prefiere que una animal transgénico comprenda cambios estables para la secuencia de la línea germinal. Un cambio estable se consigue generalmente por introducción del DNA en el genoma de la célula. Los vectores para la integración estable incluyen plásmidos, retrovirus y otros virus de animales, cromosomas artificiales de levadura y similares. Durante la construcción inicial del animal se generan "las quimeras" o "animales quiméricos", en los cuales sólo un subconjunto de células tienen el genoma alterado. Las quimeras se usan principalmente para fines de reproducción con objeto de generar el animal transgénico. Los animales que tienen una alteración heterocigótica se generan por reproducción de quimeras. Se crían típicamente heterocigóticos machos y hembras para generar animales homocigóticos.
Los mamíferos no humanos transgénicos preferidos se producen introduciendo un transgén C5aR humano en la línea germinal del animal no humano. Las células madre embrionarias (ES) son el tipo primario de célula diana para la introducción del transgén C5aR humano en el animal no humano para conseguir la recombinación homóloga. Las células ES se pueden obtener de embriones de pre-implantación cultivados in vitro y fusionados con embriones (Evans, M.J., et al., (1981) Nature 292, 154-156; Bradley, M. O., et al., (1984) Nature 309, 255-258; Gossler, et al., (1986) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83, 9065-9069; y Robertson, et al., (1986) Nature 322, 445-448). Los transgenes se pueden introducir eficazmente en las células ES por transfección de DNA o por transducción mediada por retrovirus. Dichas células ES transformadas se pueden combinar después con blastocistos de un animal no humano. Las células ES después colonizan el embrión y contribuyen a la línea germinal del animal quimérico resultante. Para una revision véase Jaenisch, R. (1988) Science 240, 1468-1474. Las células embrionarias transfectadas se pueden incubar in vitro durante tiempos variables o ser reimplantadas en el hospedante de alquiler o ambas cosas.
La descendencia transgénica del hospedante de alquiler puede ser cribada para la presencia y/o expresión del transgén por un método adecuado. El cribado se realiza frecuentemente por análisis de transferencia Southern o transferencia Northern, usando una sonda que sea complementaria a al menos una porción del transgén. Como método alternativo o adicional se pueden emplear análisis por transferencia Western que usan un anticuerpo contra la proteína codificada por el transgén para cribar (detectar) la presencia del producto del transgén. Típicamente, en ratones transgénicos, el DNA se prepara de tejido de la cola y se analiza por análisis Southern o PCR para el transgén. Alternativamente, se analizan los tejidos o células que se cree que expresan el transgén a los niveles más altos para determinar la presencia y expresión del transgén usando análisis Southern o PCR, aunque algunos tejidos
o tipos de células pueden usarse para este análisis. La progenie de los animales transgénicos se puede obtener apareando el animal transgénico con una pareja adecuada o por fertilización in vitro de huevos y/o esperma obtenido del animal transgénico.
Los métodos de producir ratones transgénicos por recombinación homóloga entre el gen endógeno y una construcción de transgén están descritos por Hanks, M et al (Science 269: 679-682, 1995), que se incorpora específicamente como referencia en la presente memoria.
Construcciones de C5aR humano y humanizado
La construcción de polinucleótido introducida puede codificar una secuencia de C5aR humano de tipo natural como la mostrada en la SEQ ID NO:3 o uno de sus variantes alélicas, derivado biológicamente activo o fragmento.
Ejemplos no limitativos de unas variantes alélicas de la SEQ ID NO:3 comprenden una o más de las sustituciones siguientes:
Aminoácido nº 2: Asp>Asn
Aminoácido nº 279: Asn>Lys.
La construcción de polinucleótido puede comprender una secuencia como la mostrada en la SEQ ID NO:2, o una de sus variantes alélicas.
Ejemplos no limitativos de unas variantes alélicas de la SEQ ID NO:2 comprenden uno o más de los siguientes cambios de bases:
Base nº 28: g>a
Base nº 474: c>t
Base nº 861: t>g
5 Base nº 1313-1314: inserción de a
Base nº 1447-1448: inserción de a
La frase "derivado biológicamente activo" en relación con la secuencia de aminoácidos del C5aR humano incluye una sustitución de, variación de, modificación de, reemplazo de, deleción de o adición de uno (o más) aminoácidos desde o a la secuencia mostrada en la SEQ ID NO:3 que proporciona la secuencia de aminoácidos resultante que
10 tiene actividad de C5aR humano, teniendo preferiblemente al menos 25 a 50% de la actividad como la de los polipéptidos presentados en la SEQ ID NO:3, más preferiblemente al menos sustancialmente la misma actividad. Preferiblemente, el C5aR humano incluye regiones suficientes para efectuar la señalización por C5aR.
Por tanto, la secuencia del C5aR humano mostrada en la SEQ ID NO:3 puede ser modificada para uso en la presente invención. Típicamente las modificaciones se hacen para mantener la actividad natural de la secuencia. Por tanto,
15 en una realización, se pueden hacer sustituciones de aminoácidos, por ejemplo desde 1, 2 o 3 hasta 10, 20 o 30 sustituciones siempre que la secuencia modificada retenga al menos aproximadamente 25 a 50% de, o sustancialmente, la misma señalización del C5aR. Sin embargo, en una realización alternativa las modificaciones de las secuencias de aminoácidos de SEQ ID NO:3 se pueden hacer intencionadamente para reducir la actividad biológica del polipéptido.
20 En general, se alteran preferiblemente menos de 20%, 10% o 5% de los residuos de aminoácidos de un derivado biológicamente activo en comparación con la región correspondiente representada en la SEQ ID NO:3.
Su pueden hacer sustituciones conservadoras, por ejemplo, de acuerdo con la Tabla siguiente. Los aminoácidos del mismo bloque en la segunda columna y preferiblemente en la misma línea en la tercera columna pueden ser sustituidos unos por otros:
- ALIFÁTICO
- G A P
- No polar
- I L V
- C S T M
- Polar – no cargado
- N Q
- D E
- Polar - cargado
- K R
- AROMÁTICO
- H F W Y
25 La secuencia que codifica C5aR está preferible y operativamente unida a un promotor, que puede ser endógeno o heterólogo, constitutivo o inducible, y otras secuencias reguladoras requeridas para la expresión en el animal hospedante.
Alternativamente, la construcción introducida puede codificar el C5aR humanizado. Preferiblemente, la secuencia del
30 C5aR humanizado es una versión modificada de un C5aR no humano, más preferiblemente es una versión modificada de la secuencia del C5aR endógeno para el mamífero transgénico. La modificación introduce o potencia al menos una característica funcional del C5aR humano natural en el C5aR humanizado cuando se compara con el C5aR no humano o endógeno. Por ejemplo, si el C5aR no humano no se une a un ligando, agonista, agonistas inverso o antagonista particular del C5aR humano, la modificación puede alterar la especificidad de unión, de tal modo
35 que el C5aR humanizado resultante se una a ese ligando, agonista, agonista inverso o antagonista. Alternativamente, si el C5aR no humano exhibe una baja afinidad de unión para un ligando, agonista, agonista inverso o antagonista particular del C5aR humano, la modificación puede dar como resultado un C5aR humanizado que exhibe afinidad de unión potenciada para ese ligando, agonista, agonista inverso o antagonista cuando se compara con el C5aR no humano. En una realización preferida, la modificación potencia la afinidad de unión del C5aR humanizado para uno
40 o más ligandos, agonistas, agonistas inversos o antagonistas del C5aR humano al menos 5 veces, más preferiblemente al menos 10 veces, más preferiblemente al menos 20 veces, más preferiblemente al menos 50 veces y más preferiblemente al menos 100 veces, cuando se compara con la secuencia no humana.
La modificación implica preferiblemente la sustitución de al menos un aminoácido del C5aR no humano por el correspondiente aminoácido del C5aR humano. Más preferiblemente, la modificación implica la sustitución de al menos
45 dos, más preferiblemente al menos 5, más preferiblemente al menos 10 y más preferiblemente al menos 20 aminoácidos del C5aR no humano por los correspondientes aminoácidos del C5aR humano.
Preferiblemente, la modificación comprende reemplazar al menos un dominio o una parte sustancial del mismo en el C5aR no humano por el correspondiente dominio del C5aR humano o una parte sustancial del mismo. Por ejemplo, la modificación puede comprender reemplazar al menos un dominio extracelular del C5aR endógeno por el correspondiente dominio extracelular del C5aR humano. El C5aR humanizado puede comprender, por tanto, al menos un dominio extracelular del C5aR humano. En un ejemplo, el C5aR humanizado comprende dominios intracelulares del C5aR endógeno y dominios extracelulares de C5aR humano.
Los diversos dominios del C5aR humano que pueden ser introducidos en el C5aR humanizado se recogen en la Tabla 1.
- Tabla 1:
- Aminoácidos 1 - 37
- Dominio extracelular – extremo N
- Aminoácidos 38 - 60
- Dominio transmembranal
- Aminoácidos 61 - 71
- Dominio intracelular
- Aminoácidos 72 - 94
- Dominio transmembranal
- Aminoácidos 95 - 110
- Dominio extracelular – bucle extracelular 1
- Aminoácidos 111 - 132
- Dominio transmembranal
- Aminoácidos 133 - 153
- Dominio intracelular
- Aminoácidos 154 - 174
- Dominio transmembranal
- Aminoácidos 175 - 200
- Dominio extracelular- bucle extracelular 2
- Aminoácidos 201 - 226
- Dominio transmembranal
- Aminoácidos 227 - 242
- Dominio intracelular
- Aminoácidos 243 - 265
- Dominio transmembranal
- Aminoácidos 266 - 282
- Dominio extracelular – bucle extracelular 3
- Aminoácidos 283 - 303
- Dominio transmembranal
- Aminoácidos 304 - 350
- Dominio intracelular – extremo C
10 Las construcciones para uso como en la presente memoria incluyen una construcción adecuada para uso en la generación de animales transgénicos que tienen los niveles de expresión deseados de la secuencia que codifica el C5aR humano o humanizado. Estas construcciones pueden contener cDNA, secuencias genómicas o ambos. Los métodos para aislar y clonar una secuencia deseada, así como construcciones adecuadas para la expresión de una secuencia seleccionada en un animal hospedante son bien conocidos en la técnica. La construcción puede incluir
15 secuencias distintas de las secuencias que codifican el C5aR. Por ejemplo, en la construcción se puede incluir un gen marcador, tal como lac Z, en donde el aumento de la regulación de la expresión de la secuencia codificada dará como resultado un cambio en el fenotipo fácilmente detectado.
El término "gen C5aR " se usa generalmente para significar un gen C5aR humano e isoformas, formas alternativas, variantes por empalme, variantes mutadas, etc. de este gen humano. Este término también pretende significar el
20 marco de lectura abierto que codifica polipéptidos específicos, intrones, y secuencias de nucleótidos no codificadoras adyacentes a 5' y 3' implicadas en la regulación de la expresión, hasta aproximadamente 1 kb más allá de la región codificadora, pero posiblemente más en cualquier dirección. La secuencia de DNA que codifica el C5aR puede ser cDNA o DNA genómico o uno de sus fragmentos. El gen se puede introducir en un vector apropiado para el mantenimiento extracromosómico o para la integración en el hospedante.
25 Las secuencias genómicas de particular interés comprenden el ácido nucleico presente entre el codón de iniciación y el codón de parada, incluyendo la totalidad de los intrones que normalmente se encuentran presentes en el cromo-soma natural. Estas pueden incluir además regiones no traducidas en 3' y 5' encontradas en el mRNA maduro. Dichas secuencias pueden incluir además secuencias reguladoras transcripcionales y traduccionales específicas, tal como promotores, potenciadores, etc., incluyendo aproximadamente 1 kb, pero posiblemente más de DNA genómico
30 flanqueante en el extremo 5' o 3' de la región transcrita. El DNA genómico puede ser aislado como un fragmento de 100 kb o más pequeño; y sustancialmente exento de secuencias cromosómicas flanqueantes.
Las secuencias de las regiones 5' del gen C5aR humano, y más secuencias de regiones situadas hacia el extremo 5' y secuencias situadas hacia el extremo 3' se pueden utilizar para elementos promotores, incluyendo sitios de unión de potenciadores, que proporcionan la expresión en tejidos en donde se expresa normalmente el C5aR. La expre35 sión específica en tejidos es útil para proporcionar promotores que mimeticen el modelo natural de expresión. Los polimorfismos que se presentan de forma natural en la región del promotor son útiles para determinar variaciones naturales en la expresión, particularmente las asociadas con enfermedad. Alternativamente, pueden introducirse mutaciones en la región del promotor para determinar el efecto de alterar la expresión en sistemas definidos experimentalmente. Los métodos para la identificación de restos de DNA específicos implicados en la unión de factores
40 transcripcionales son conocidos en la técnica, por ejemplo, la similitud de secuencias para restos de unión conocidos, estudios de retardo en geles, etc. Por ejemplo, véase Blackwell et al., (1995) Mol. Med. 1: 194-205; Mortlock et al. (1996) Genome Res. 6: 327-33; y Joulin and Richard-Foy (1995) Eur. J. Biochem. 232: 620-626.
Los vectores adecuados para uso como en la presente memoria pueden comprender al menos un elemento de control de expresión unido operativamente a la secuencia de ácido nucleico que codifica el C5aR humano. Los elementos de control de la expresión se pueden insertar en el vector para control y regular la expresión de la secuencia de ácido nucleico. Ejemplos elementos de control de la expresión incluyen, pero sin limitación, el sistema lac, regiones del operador y promotor del fago lambda, promotores de levaduras y promotores derivados de polioma, adenovirus, retrovirus o SV40. El vector puede comprender más elementos operacionales incluyendo, pero sin limitación, secuencias de cadenas, codones de terminación, señales de poliadenilación, y otras secuencias necesarias o preferidas para la transcripción y/o traducción apropiadas de la secuencia de ácido nucleico que codifica el C5aR humano.
En otra realización preferida la construcción comprende regiones homólogas a las secuencias de los extremos 3' y 5' que flanquean la secuencia codificadora del C5aR endógeno del mamífero no humano. Se entenderá que estas regiones de homología son útiles para la integración dirigida a diana de la construcción en el locus del C5aR endógeno del mamífero transgénico.
Preferiblemente, la construcción del polinucleótido comprende regiones homólogas a al menos 2 kb, más preferiblemente alrededor de 3 kb, situadas en dirección a los extremos 5' y 3' del exón 3 del gen del C5aR endógeno. Por ejemplo, las secuencias situadas en dirección a los extremos 5' y 3' pueden proceder de las secuencia entre los nucleótidos 7377-15045 de la SEQ ID NO: 1.
Los expertos en la técnica entenderán que los vectores son construidos usando una metodología convencional (Véase por ejemplo Sambrook et al., (eds.) (1989) "Molecular Cloning, A Laboratory Manual" Cold Spring Harbor Press, Plainview, N.Y.; Ausubel et al., (eds.) (1987) "Current Protocols in Molecular Biology" John Wiley and Sons, New York, N.Y.) o están comercialmente disponibles.
En algunas realizaciones puede ser preferible expresar el C5aR humano en tejidos que mimeticen el modelo natural de expresión en seres humanos. Un modelo específico de expresión se puede conseguir colocando el ácido nucleico que codifica el C5aR humano bajo el control de un promotor inducible o regulado en el desarrollo o bajo el control de promotor específico de tejidos o específico de tipos de célula. Como ejemplo, los modelos específicos de expresión se pueden conseguir mediante el uso de secuencias genómicas para el C5aR humano.
Las técnicas para la mutagénesis in vitro de genes clonados son conocidas. Ejemplos de protocolos para escanear mutaciones se pueden encontrar en Gustin et al., 1993 Biotechniques 14:22; Barany, 1985 Gene 37:111-23; Colicelli et al., 1985 Mol. Gen. Genet. 199:537-9; y Prentki et al., 1984 Gene 29:303-13. Métodos para mutagénesis específicas de sitios se pueden encontrar en Sambrook et al., 1989 Molecular Cloning: A Laboratory Manual, CSH Press, pp. 15.3-15.108; Weiner et al., 1993 Gene 126:35-41; Sayers et al., 1992 Biotechniques 13:592-6; Jones and Winistorfer, 1992 Biotechniques 12:528-30; Barton et al., 1990 Nucleic Acids Res. 18:7349-55; Marotti and Tomich, 1989 Gene Anal. Tech. 6:67-70; y Zhu 1989 Anal. Biochem. 177:120-4.
Desactivaciones y activaciones de genes ("Knock-outs" y "Knock-ins")
Aunque no es necesario para la operatividad de la invención, los animales transgénicos descritos en la presente memoria pueden comprender alteraciones de los genes endógenos además de las alteraciones genéticas descritas antes. Por ejemplo, los animales hospedantes pueden comprender "desactivaciones" y/o "activaciones" de un (unos) gen(es) diana de acuerdo con los objetivos de la invención (por ejemplo, el C5aR endógeno del animal hospedante puede ser C5aR humano "desactivado" y/o "activado"). Los desactivados tienen una pérdida parcial o completa de función en uno en ambos alelos de un gen endógeno de interés (por ejemplo, C5aR). Los activados tienen un transgén introducido con la secuencia genética y/o la función alterada del gen endógeno. Los dos pueden estar combinados, por ejemplo, de tal modo que se inutilice el gen que se presenta de modo natural y se introduzca una forma alterada. Por ejemplo, es preferible desactivar el gen C5aR endógeno del hospedante, al mismo tiempo que se introduce un gen C5aR humano.
En una desactivación, preferiblemente la expresión del gen diana es indetectable o insignificante. Por ejemplo, una desactivación de un gen C5aR significa que la función del gen C5aR ha sido sustancialmente disminuida de modo que la expresión no es detectable o solamente está presente a niveles insignificantes. Esto se puede conseguir por una variedad de mecanismos, incluyendo la introducción de una interrupción de la secuencia codificadora, por ejemplo, inserción de uno o más codones de parada, inserción de un fragmento de DNA, etc., deleción de la secuencia codificadora, sustitución de codones de parada por secuencias codificadoras, etc. En algunos casos las secuencias del transgén exógeno son delecionadas finalmente del genoma, dejando un cambio neto en la secuencia natural. Para conseguir la "desactivación" se pueden usar diferentes métodos. Se puede inducir una deleción cromosómica de todo o parte del gen natural, incluyendo deleciones de las regiones no codificadoras, particularmente la región del promotor, secuencias reguladoras en 3', potenciadores o deleciones de genes que activan la expresión del C5aR. También se puede conseguir una desactivación funcional mediante la introducción de una construcción antisentido que bloquee la expresión de los genes naturales (por ejemplo, véase Li y Cohen (1996) Cell 85:319-329). Las "desactivaciones" también incluyen desactivaciones condicionales, por ejemplo cuando ocurre la alteración del gen diana por exposición del animal a una sustancia que promueve la alteración del gen diana, la introducción de una enzima que promueve la recombinación en el sitio del gen diana (por ejemplo, Cre en el sistema Cre-lox) u otro método para dirigir la alteración del gen diana posnatalmente.
Una "activación" de un gen diana significa una alteración en un genoma de la célula hospedante que da como resultado la expresión o función alterada de un gen diana natural. Se puede conseguir una expresión aumentada (incluyendo la ectópica) o disminuida por la introducción de una copia adicional del gen diana o insertando operativamente una secuencia reguladora que proporciona la expresión potenciada de una copia endógena del gen diana. Estos cambios pueden ser constitutivos o condicionales, es decir, dependientes de la presencia de un activador o represor.
Identificación y/o evaluación de ligandos, agonistas, agonistas inversos y/o antagonistas del C5aR
A través del uso de animales transgénicos o células procedentes del mismo, se pueden identificar ligandos o sustratos que modulan los fenómenos asociados con la señalización del C5aR. Dependiendo del ensayo particular, se pueden usar los animales transgénicos completos de la presente invención o tejido, órganos o células procedentes de los mismos. Las células pueden ser recientemente aisladas del animal transgénico o pueden ser inmortalizadas en cultivo. Las células de particular interés proceden de tejidos, tales como musculatura lisa, endotelio, musculatura contráctil o corazón.
El término "compuesto" como se usa en la presente memoria describe una molécula, por ejemplo proteína, molécula pequeña, polinucleótido o producto farmacéutico, con la capacidad de impedir o suprimir los fenómenos moleculares y clínicos asociados con la señalización del C5aR.
Los compuestos candidatos abarcan numerosas clases químicas, aunque en una realización preferida son moléculas orgánicas, preferiblemente compuestos orgánicos pequeños que tienen un peso molecular de más 50 y menos de aproximadamente 2.500 daltons. Los compuestos candidatos preferiblemente comprenden los grupos funcionales necesarios para la interactuación estructural con proteínas, particularmente unión por puentes de hidrógeno, y típicamente incluyen al menos un grupo amina, carbonilo, hidroxilo o carboxilo, preferiblemente al menos dos de los grupos químicos funcionales. Los agentes candidatos comprenden frecuentemente estructuras carbonadas cíclicas
o heterocíclicas y/o aromáticas o poliaromáticas sustituidas con uno o más de los grupos funcionales anteriores. Los compuestos candidatos también se encuentran entre las biomoléculas incluyendo, pero sin limitación, sacáridos, ácidos grasos, esteroides, purinas, pirimidinas y sus derivados, análogos estructurales o combinaciones.
Los compuestos candidatos se pueden obtener de una amplia variedad de fuentes incluyendo quimiotecas de compuestos naturales o sintéticos. Por ejemplo, están disponibles numerosos medios para la síntesis al azar y directa de una amplia variedad de compuestos orgánicos y biomoléculas, incluyendo la expresión de oligonucleótidos y oligopéptidos aleatorizados. Alternativamente, están disponibles quimiotecas de compuestos naturales en la forma de extractos bacterianos, fúngicos, de vegetales y animales o se producen fácilmente. Adicionalmente, las quimiotecas y los compuestos producidos natural o sintéticamente y compuestos se modifican fácilmente mediante medios químicos, físicos y bioquímicos convencionales y se pueden usar para producir quimiotecas combinatorias. Los agentes farmacológicos conocidos se pueden someter a modificaciones químicas directas o aleatorias, tal como acilación, alquilación, esterificación, amidificación, etc, para producir análogos estructurales.
El cribado también puede ser dirigido a compuestos farmacológicamente activos y sus productos químicos análogos.
El agente candidato puede ser administrado al mamífero transgénico de la invención (o células procedentes del mamífero transgénico) de un modo deseado y/o apropiado para la administración del agente para conseguir el resultado deseado. Por ejemplo, el agente candidato se puede administrar por inyección (por ejemplo, inyección intravenosamente, intramuscularmente, subcutáneamente o directamente en el tejido en el cual se ha de conseguir el efecto deseado), oralmente o por cualquier otro medio deseable. Preferiblemente, el cribado in vivo implicará cierto número de animales que reciben cantidades y concentraciones variables del compuesto candidato (desde nada de compuesto hasta una cantidad de compuesto que se aproxima al límite superior de la cantidad que puede ser administrada satisfactoriamente al animal), y puede incluir la administración del agente en diferentes formulaciones. Los compuestos se pueden administrar solos o en combinaciones de dos o más, especialmente cuando la administración de una combinación de agentes puede dar como resultado un efecto sinérgico. El efecto de la administración del agente sobre el roedor transgénico se puede monitorizar por metodología convencional.
La gama de compuestos candidatos contemplados en la presente memoria incluye compuestos inhibidores del C5aR o antagonistas de una función biológica del C5aR. En una realización, el compuesto se selecciona del grupo que consiste en: un péptido, incluyendo un péptido derivado del C5aR o la C5a u otros péptidos que no son C5aR y capaces de inhibir, reducir o reprimir una función del C5aR, un mutante dominante-negativo del C5aR; un inhibidor no peptídico del C5aR; un anticuerpo o fragmento de anticuerpo que se une al C5aR e inhibe una función del C5aR; una molécula orgánica pequeña, y ácido nucleico, incluyendo ácido nucleico que codifica dicho péptido derivado del C5aR o la C5a u otro inhibidor peptídico que no es C5aR, un ácido nucleico antisentido dirigido contra el mRNA que codifica el C5aR o una ribozima anti-C5aR o un RNA de interferencia pequeño (RNAi) que dirige la expresión del gen C5aR. Cierto número de estos tipos de compuestos se analizan a continuación.
Moléculas pequeñas
Los compuestos candidatos abarcan numerosas clases químicas, aunque preferiblemente son moléculas orgánicas, preferiblemente compuestos orgánicos pequeños que tienen un peso molecular de más de 100 y menos de aproximadamente 2.500 daltons. Los compuestos candidatos comprenden los grupos funcionales necesarios para la interactuación estructural con las proteínas particularmente unión por puentes de hidrógeno y típicamente incluyen al menos un grupo amina, carbonilo, hidroxilo o carboxilo, preferiblemente al menos dos de los grupos químicos funcionales. Los compuestos candidatos pueden comprender frecuentemente estructuras carbonadas cíclicas o heterocíclicas y/o aromáticas o poliaromáticas sustituidas con uno o más de los grupos funcionales anteriores. Los compuestos candidatos también se encuentran entre las biomoléculas incluyendo péptidos, sacáridos, ácidos grasos, esteroides, purinas, pirimidinas y sus derivados, análogos estructurales o combinaciones. De hecho, virtualmente cualquier molécula orgánica pequeña que sea potencialmente capaz de unirse a una molécula diana biológica puede encontrar uso en la presente invención siempre que sea suficientemente soluble y estable en soluciones acuosas para ser analizada respecto a su capacidad para unirse a la molécula diana biológica.
Los compuestos candidatos se obtienen de una amplia variedad de fuentes incluyendo quimiotecas de compuestos naturales o sintéticos. Por ejemplo, están disponibles numerosos medios para la síntesis al azar y dirigida de una amplia variedad de compuestos orgánicos y biomoléculas, incluyendo la expresión de oligonucleótidos aleatorizados. Alternativamente, están disponibles o se producen fácilmente quimiotecas de compuestos naturales en la forma de extractos bacterianos, fúngicos, de vegetales y animales. Adicionalmente, las quimiotecas y los compuestos producidos natural o sintéticamente y compuestos se modifican fácilmente mediante medios químicos, físicos y bioquímicos convencionales. Los compuestos farmacológicos conocidos se pueden someter a modificaciones químicas directas o aleatorias, tal como acilación, alquilación, esterificación, amidificación, etc, para producir análogos estructurales.
Inhibidores peptídicos o proteínicos
En otra realización, los compuestos candidatos son proteínas. Por "proteína" en este contexto se quiere significar al menos dos aminoácidos unidos covalentemente, que incluye proteínas, polipéptidos, oligopéptidos y péptidos. La proteína puede estar constituida de aminoácidos de origen natural y enlaces peptídicos o estructuras peptidomiméticas. Por tanto "aminoácido" o "residuo de péptido ", como se usan en la presente memoria significan tanto los aminoácidos naturales como los sintéticos. Por ejemplo, para los fines de la invención se consideran aminoácidos la homofenilalanina, citrulina y norleucina. "Aminoácido" también incluye los residuos de iminoacidos, tal como prolina e hidroxiprolina. Las cadenas laterales pueden estar de la configuración (R) o (S). En la realización preferida, los aminoácidos están en la configuración (S) o (L). Si se usan cadenas laterales no naturales pueden usarse sustituyentes que no son aminoácidos, por ejemplo para impedir o retardar las degradaciones in vivo.
En otra realización preferida, los compuestos candidatos son proteínas naturales o fragmentos de proteínas naturales. Así, por ejemplo, se pueden usar extractos celulares que contienen proteínas o materiales digeridos, aleatoriamente o dirigidos, de extractos celulares proteínicos. De este modo se pueden obtener colecciones de proteínas procariotas y eucariotas. En esta realización son particularmente preferidas las colecciones de proteínas bacterianas, fúngica, virales y de mamíferos, siendo preferidas estas últimas y siendo especialmente preferidas las proteínas humanas.
En otra realización preferida, los compuestos candidatos son péptidos de una longitud de aproximadamente 5 a aproximadamente 30 aminoácidos, siendo preferidos los péptidos de aproximadamente 5 aproximadamente 20 aminoácidos, y siendo particularmente preferidos los de aproximadamente 7 a aproximadamente 15 aminoácidos. Los péptidos pueden ser materiales digeridos de proteínas naturales, péptidos aleatorios o péptidos aleatorios "sesgados". Por "aleatorizados" o equivalentes gramaticales en la presente memoria se quiere significar que cada péptido consiste esencialmente de aminoácidos al azar. Puesto que generalmente estos péptidos aleatorios se sintetizan químicamente, pueden incorporar un aminoácido en cualquier posición. El proceso sintético puede ser diseñado para generar proteínas aleatorias para permitir la formación de la totalidad o la mayoría de las combinaciones posibles en la longitud de la secuencia, formando de este modo una quimioteca de compuestos bioproteínicos bioactivos candidatos aleatorios.
La preparación y cribado de quimiotecas combinatorias son bien conocidos por los expertos en la técnica. Dichas quimiotecas combinatorias incluyen, pero sin limitación, colecciones de péptidos (véase, por ejemplo, la Patente de EE.UU. Nº 5.010.175, Furka (1991) Int. J. Pept. Prot. Res., 37: 487-493, Houghton et al. (1991) Nature, 354: 84-88). La síntesis de péptidos de ningún modo es el único enfoque previsto considerado y destinado para uso con la presente invención. También se pueden usar otros métodos químicos para generar una diversidad de quimiotecas. Tales métodos químicos incluyen pero sin limitación: peptoides (Publicación PCT Nº WO 91/19735, 26 Dic. 1991), péptidos codificados (Publicación PCT WO 93/20242, 14 Oct. 1993), bio-oligómeros al azar (Publicación PCT WO 92/00091, 9 enero 1992), benzodiazepinas (Patente de EE.UU. Nº 5.288.514), diversómeros, tal como hidantoínas, benzodiazepinas y dipéptidos (Hobbs et al., (1993) Proc. Nat. Acad. Sci. USA 90: 6909-6913), polipéptidos vinílogos (Hagihara et al. (1992) J. Amer. Chem. Soc. 114: 6568), peptidomiméticos no peptídicos con un andamio de beta-Dglucosa (Hirschmann et al., (1992) J. Amer. Chem. Soc. 114: 9217-9218), síntesis orgánicas análogas de quimiotecas de compuestos pequeños (Chen et al. (1994) J. Amer. Chem. Soc. 116: 2661), oligocarbamatos (Cho, et al., (1993) Science 261:1303), y/o peptidil-fosfonatos (Campbell et al., (1994) J. Org. Chem. 59: 658). Véase generalmente, Gordon et al., (1994) J. Med. Chem. 37:1385, genotecas de ácidos nucleicos, colecciones de péptidos y ácidos nucleicos (véase, por ejemplo, la Patente de EE.UU. Nº 5.539.083), colecciones de anticuerpos (véase, por ejemplo, Vaughn et al. (1996) Nature Biotechnology, 14(3): 309-314), y el documento PCT/US96/10287), colecciones de carbohidratos (véase, por ejemplo, Liang et al. (1996) Science, 274: 1520-1522, y la Patente de EE.UU. Nº 5.593.853), y colecciones de moléculas orgánicas pequeñas (véase, por ejemplo, benzodiazepinas, Baum (1993) C&EN, Jan 18, página 33, isoprenoides Patente de EE.UU. Nº 5.569.588, tiazolidinonas y metatiazanonas Patente de EE.UU. Nº 5.549.974, pirrolidinas patentes de EE.UU. Nº 5.525.735 y 5.519.134, compuestos de morfolino Patente de EE.UU. Nº 5.506.337, benzodiazepinas Patente de EE.UU. Nº 5.288.514 y similares).
Están comercialmente disponibles dispositivos para la preparación de genotecas combinatorias (véase, por ejemplo, 357 MPS, 390 MPS, Advanced Chem Tech, Louisville Ky., Symphony, Rainin, Woburn, Mass., 433A Applied Biosystems, Foster City, Calif., 9050 Plus, Millipore, Bedford, Mass.).
En una realización, los inhibidores peptidílicos del C5aR se sintetizan químicamente o recombinantemente como oligopéptidos (usualmente de una longitud de 10-25 aminoácidos) derivados de una secuencia del C5aR o la C5a. Alternativamente, los fragmentos del C5aR o la C5a se producen por digestión del C5aR o C5a naturales o producidos recombinantemente, por ejemplo, usando una proteasa, por ejemplo, tripsina, termolisina, quimotripsina o pepsina. El análisis por ordenador (usando programas informáticos comercialmente disponibles, por ejemplo MacVector, Omega, PCGene, Molecular Simulation, Inc.) se usa para identificar sitios de escisión proteolítica. Los fragmentos proteolíticos o sintéticos pueden comprender tantos residuos de aminoácidos como sean necesarios para inhibir parcial o completamente la función del C5aR. Los fragmentos preferidos tendrán una longitud de menos 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100 o más aminoácidos.
Los inhibidores proteínicos o peptídicos también pueden ser mutantes dominantes-negativos del C5aR. El término "mutante dominante-negativo" se refiere a un polipéptido del C5aR que ha sido mutado desde su estado natural y que interactúa con una proteína con la que interactúa normalmente el C5aR impidiendo con ello formar interactuación con el C5aR endógeno natural.
Anticuerpos anti-C5aR
El término "anticuerpo" como se usa en la presente memoria incluye moléculas intactas, así como sus fragmentos, tal como Fab, F(ab')2, y Fv que son capaces de unir un determinante epitópico del C5aR. Estos fragmentos de anticuerpo retienen alguna capacidad de unirse selectivamente con su antígeno y se definen como sigue:
- (1)
- Fab, el fragmento que contiene un fragmento monovalente de unión al antígeno de una molécula de anticuerpo se puede producir por digestión del anticuerpo completo con la enzima papaína para proporcionar una cadena ligera intacta y una porción de una cadena pesada;
- (2)
- Fab', el fragmento de una molécula de anticuerpo se puede obtener tratando el anticuerpo completo con pepsina, seguido por reducción, para proporcionar una cadena ligera intacta y una porción de la cadena pesada; por cada molécula de anticuerpo se obtiene dos fragmentos Fab';
- (3)
- F(ab')2, el fragmento del anticuerpo que se puede obtener tratando el anticuerpo completo con la enzima pepsina sin reducción subsiguiente; F(ab')2 es un dímero de dos fragmentos Fab' mantenidos unidos por dos puentes desulfuro;
- (4)
- Fv, definido como un fragmento manipulado por ingeniería genética que contiene la región variable de la cadena ligera y la región variable de la cadena pesada expresadas como dos cadenas; y
- (5)
- Anticuerpo monocatenario (abreviadamente "SCA" por sus iniciales en inglés Single Chain Antibody), definido como una molécula manipulada por ingeniería genética que contiene la región variable de la cadena ligera y la región variable de la cadena pesada, unidas por un enlazador polipeptídico adecuado como una molécula monocatenaria fusionada genéticamente.
Los métodos para preparar estos fragmentos son conocidos en la técnica. (Véase, por ejemplo, Harlow and Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York (1988), incorporado en la presente memoria como referencia).
Los anticuerpos se pueden preparar usando C5aR intacto o sus fragmentos como antígeno inmunizante. Un péptido usado para inmunizar un animal puede proceder de cDNA traducido o de síntesis química y se purifica y conjuga a una proteína vehículo, si se desea. Tales vehículos comúnmente usados que se acoplan químicamente al péptido incluyen hemocianina de lapa bocallave (KLH), tiroglobulina, seroalbúmina bovina (BSA) y toxoide de tétanos. El péptido acoplado se puede usar luego para inmunizar el animal (por ejemplo, un ratón o un conejo).
Si se desea, los anticuerpos policlonales se pueden purificar más, por ejemplo, uniéndolos a, y eluyéndolos de, una matriz a la cual se unió el péptido para el cual se produjeron los anticuerpos. Los expertos en la técnica conocerán varios métodos comunes en las técnicas inmunológicas para la purificación y/o concentración de anticuerpos policlonales, así como anticuerpos monoclonales (Véase por ejemplo, Coligan, et al. Unit 9, Current Protocols in Immunology, Wiley Interscience, 1991, incorporada como referencia).
Los anticuerpos monoclonales pueden ser preparados usando una técnica que proporcione la producción de moléculas de anticuerpo por líneas celulares continuas en cultivo, tal como, por ejemplo, la técnica del hibridoma, la técnica del hibridoma de linfocitos B humanos, y la técnica del EBV-hibridoma (Kohler et al., Nature 256, 495-497, 1975; Kozbor et al., J. Immunol. Methods 81, 31-42, 1985; Cote et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80, 2026-2030, 1983; Cole et al., Mol. Cell Biol. 62, 109-120, 1984).
Los métodos conocidos en la técnica permiten que los anticuerpos que exhiben unión para el C5aR sean identificados y aislados de las colecciones de expresión de anticuerpos. Por ejemplo, un método para la identificación y aislamiento de un dominio de unión de anticuerpo que exhibe unión a C5aR es un sistema vector de bacteriófago. Este sistema vector se ha usado para expresar una colección combinatoria de fragmentos Fab del repertorio de anticuerpos de ratón en Escherichia coli (Huse, et al., Science, 246:1275-1281, 1989) y del repertorio de anticuerpos humanos (Mullinax, et al., Proc. Nat. Acad. Sci., 87:8095-8099, 1990). Esta metodología también se puede aplicar a las líneas celulares de hibridomas que expresan anticuerpos monoclonales con unión para un ligando preseleccionado. Los hibridomas que secretan un anticuerpo monoclonal se pueden producir de varios modos usando técnicas bien comprendidas por los expertos con un conocimiento normal de la técnica y no se repetirán en el presente texto. Los detalles de estas técnicas se describen en dichas referencias tales como Monoclonal Antibodies - Hybridomas: A New Dimension in Biological Analysis, Edited by Roger H. Kennett, et al., Plenum Press, 1980; y la patente de EE.UU. Nº 4.172.124, incorporado como referencia.
Además son conocidos en la técnica métodos de producir anticuerpos "humanizados" o quiméricos e incluyen combinar regiones variables de múridos con regiones constantes humanas (Cabili, et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81:3273, 1984), o injertar las regiones determinantes de la complementaridad de anticuerpos de múridos (abreviadamente CDR por la expresión inglesa Complementarity Determining Regions) en el marco humano (Rieclunann, et al., Nature 332:323, 1988).
Compuestos antisentido
El término "compuestos antisentido" abarca moléculas de DNA o RNA que son complementarias a al menos una porción de una molécula de mRNA diana (Izant and Weintraub, 1984; Izant and Weintraub, 1985) y capaces de interferir con un evento pos-transcripcional, tal como la traducción de mRNA. Se prefieren los oligómeros antisentido complementarios a al menos aproximadamente 15 nucleótidos contiguos del mRNA que codifica la diana, puesto que se sintetizan fácilmente y tienen menor probabilidad de causar problemas que las moléculas más grande cuando se introducen en las células productoras de mRNA diana. El uso de métodos antisentido es muy conocido en la técnica (Marcus-Sakura, 1988).
Moléculas de RNA catalíticos
El término RNA catalítico se refiere a un RNA o molécula que contiene RNA (también conocida como una "ribozima") que específicamente reconoce un sustrato definido y cataliza la modificación química de este sustrato. Las bases de los ácidos nucleicos en el ácido nucleico catalítico pueden ser las bases A, C, G, T y U, así como sus derivados. Los derivados de estas bases son bien conocidos en la técnica.
Típicamente, el ácido nucleico catalítico contiene una secuencia antisentido para el reconocimiento específico de un ácido nucleico diana, y un ácido nucleico que muestra actividad enzimática (también denominado en la presente memoria el "dominio catalítico").
Los tipos de ribozimas que son particularmente útiles son la ribozima cabeza de martillo (Haseloff and Gerlach 1988, Perriman et al, 1992) y la ribozima de tipo horquilla para el cabello (Shippy et al, 1999).
Las ribozimas usadas se pueden sintetizar químicamente usando métodos bien conocidos en la técnica. Las ribozimas también se pueden preparar a partir de una molécula de DNA (que por transcripción, proporciona una molécula de RNA) unida operativamente a un promotor de RNA-polimerasa, por ejemplo, el promotor para la RNA-polimerasa de T7 o la RNA-polimerasa SP6. Cuando el vector también contiene un promotor de RNA-polimerasa operativamente unido a la molécula de DNA, la ribozima puede ser producida in vitro por incubación con RNA-polimerasa y nucleótidos. En una realización separada el DNA se puede insertar en un casete de expresión o casete de transcripción.
RNA bicatenarios (abreviadamente dsRNA por la expresión inglesa double stranded RNA)
Los dsRNA son particularmente útiles para inhibir específicamente la producción de una proteína particular. Aunque no se desea estar limitados por la teoría, Dougherty and Parks (1995) han proporcionado un modelo para el mecanismo por el cual el dsRNA se puede usar para reducir la producción de proteínas. Este modelo se modificó y expandió por Waterhouse et al., (1998). Esta tecnología se basa en la presencia de las moléculas de dsRNA que contienen una secuencia que es esencialmente idéntica al mRNA del gen de interés. Convenientemente el dsRNA se puede producir en un solo marco de lectura abierto en un vector recombinante o célula hospedante, en donde las secuencias con sentido y anti-sentido están flanqueadas por una secuencia no relacionada que facilita que se hibriden las secuencias con sentido y anti-sentido para formar la molécula de dsRNA formando con la secuencia no relacionada una estructura de bucle. El diseño y producción de moléculas de dsRNA adecuadas dirigidas contra genes de interés está dentro del alcance del conocimiento de los expertos en la técnica, considerando particularmente los documentos de Dougherty and Parks (1995), Waterhouse et al., (1998), WO 99/32619, WO 99/53050, WO 99/49029, y WO 01/34815.
Como se usa en la presente memoria, las expresiones "RNA de interferencia pequeño" y "RNAi" se refieren a RNA bicatenarios (dsRNA) homólogos que específicamente se dirigen a un producto génico, dando como resultado un fenotipo nulo o hipomórfico. Específicamente, el dsRNA comprende dos secuencias de nucleótidos procedentes del RNA diana y teniendo tal auto-complementariedad que puedan reasociarse e interferir con la expresión de un gen diana, presumiblemente en el nivel pos-transcripcional. Las moléculas de RNAi esta descritas por Fire et al., (1998) y revisadas por Sharp (1999).
Fenotipos asociados con la señalización de C5aR
En los métodos descritos en la presente memoria, se administra un compuesto propuesto al animal transgénico y se mide la respuesta del animal transgénico a dicho compuesto propuesto. Preferiblemente, la respuesta del mamífero transgénico se compara con la respuesta de un ratón "de tipo normal" o alternativamente se compara con un animal transgénico de control (sin administración del compuesto).
En consecuencia, en un aspecto la presente invención proporciona un método de identificar un compuesto que modula la actividad del C5aR, que comprende (i) administrar un compuesto candidato a un mamífero transgénico de la presente invención en condiciones en las que se expresa al menos un fenotipo asociado con la señalización de C5aR; y (ii) monitorizar el desarrollo del fenotipo después de la administración del compuesto.
El fenotipo se monitorizó para cualquier indicador de señalización de C5aR, incluyendo los siguientes:
- (a)
- enfermedades y estados inflamatorios y alérgicos, incluyendo enfermedades alérgicas respiratorias, tales como asma, rinitis alérgica, enfermedades pulmonares alérgicas, alveolitis alérgica, enfermedades intersticiales pulmonares (abreviadamente ILD por la expresión inglesa Interstitial Lung Disease) (por ejemplo, fibrosis pulmonar idiopática o ILD asociada a artritis reumatoide, lupus eritematoso sistémico, espondilitis anquilosante, esclerosis sistémica, síndrome de Sjogren, polimiositis o dermatomiositis); anafilaxis o respuestas alérgicas, alergias a fármacos (por ejemplo, a penicilina, cefalosporinas), alergias a la picadura de insectos; enfermedades inflamatorias intestinales, tales como la enfermedad de Crohn y colitis ulcerosa; espondiloartropatías; escleroderma; psoriasis y dermatosis inflamatorias, tales como dermatitis, eczema, dermatitis atópica, dermatitis alérgica por contacto, urticaria; vasculitis (por ejemplo, vasculitis necrotizante, cutánea y alérgica);
- (b)
- enfermedades auto inmunitarias, tales como artritis (por ejemplo, artritis reumatoide, artritis psoriásica), esclerosis múltiple, lupus eritematoso sistémico, miastenia grave, diabetes de tipo I, nefritis, tal como glomerulonefritis, tiroiditis autoinmunitaria, enfermedad de Behcet;
- (c)
- rechazo de injerto (por ejemplo, en trasplantes), incluyendo rechazo de aloinjertos o enfermedad del injerto frente al hospedante;
- (d)
- aterosclerosis;
- (e)
- cánceres con infiltración de leucocitos de la piel u órganos;
- (f)
- enfermedades o estados (incluyendo enfermedades o estados mediados por el C5aR), en los cuales se pueden tratar las respuestas inflamatorias indeseables que han de ser inhibidas, incluyendo, pero sin limitación, lesión por reperfusión, ictus, síndrome de dificultad respiratoria en adultos, ciertas enfermedades malignas hematológicas, toxicidad inducida por citoquinas (por ejemplo, choque septicémico, choque endotóxico), polimiositis, dermatomiositis, pénfigo, enfermedad de Alzheimer y enfermedades granulomatosas incluyendo sarcoidosis.
Otros fenotipos incluyen inmunosupresión, tal como en individuos con síndromes de inmunodeficiencia, tal como SIDA, individuos que reciben radioterapia, quimioterapia, terapia para enfermedades autoinmunitarias u otra terapia con fármacos (por ejemplo, terapia con corticosteroides), que provoca inmunosupresión; e inmunosupresión debida a deficiencia congénita en la función de los receptores u otras causas.
Están disponibles cierto número de modelos de inflamación in vivo y se pueden usar para inducir fenotipos adecuados asociados con el C5aR en mamíferos transgénicos de la presente invención. Por ejemplo, la artritis reumatoide se puede evaluar usando un modelo en animales (por ejemplo, ratón) de artritis inducida por colágeno (Trentham et al (1977) J. Exp. Med. 146: 857-868), artritis inducida por suero de KJBxN (Kouskoff et al., (1996) Cell 187:811-822), artritis inducida por antígenos o artritis inducida por adyuvantes (Pearson CM (1956) Proc. Soc. Exp. Biblo. Med. 91:95-101).
Otros ejemplos de modelos en animales adecuados incluyen: modelo de septicemia con punción de ligadura cecal (abreviadamente CLP, por la expresión inglesa Cecal Ligation Puncture) (Huber-Lang, M. S., et al. (2002) Faseb J. 16(12): 1567-74); modelo de AR en ratas (Woodruff, T. M., et al. (2002) Arthritis Rheum 46(9): 2476-85); modelo de septicemia en porcinos (Mohr, M., et al. (1998) Eur. J. Clin. Invest. 28(3): 227-34); enfermedad pulmonar inducida por complejos inmunitarios; lesión pulmonar asociada a pancreatitis (Bhatia, M., et al. (2001) Am. J. Physiol. Gastrointest Liver Physiol. 280(5): G974-8); lesión pulmonar aguda; lesión renal por isquemia-reperfusión; artritis inducida por colágeno; y enfermedad experimental de las vías respiratorias (modelo similar al asma).
En otro ejemplo, se puede monitorizar la infiltración de leucocitos por inyección intradérmica de un compuesto candidato (véase, por ejemplo, Van Damme, J. et al., J. Exp. Med., 176: 59-65 (1992); Zachariae, C. O. C. et al., J. Exp. Med. 171: 2177-2182 (1990); Jose, P. J. et al., J. Exp. Med. 179: 881-887 (1994)). En una realización, se evaluaron histológicamente biopsias de piel para infiltración de leucocitos (por ejemplo, eosinófilos, granulocitos). Una disminución de la extensión de infiltración en presencia del compuesto candidato en comparación con la extensión de infiltración en ausencia del compuesto candidato es indicativa de una inhibición de señalización del C5aR.
Los ejemplos de fenotipos preferidos se exponen brevemente a continuación.
Enfermedades autoinmunitarias (incluyendo artritis reumatoide)
Las enfermedades autoinmunitarias afectan al 5-8% de la población. Los complejos inmunitarios (CI) juegan un papel integral en la patogénesis de diversas enfermedades autoinmunitarias incluyendo artritis reumatoide (AR), lupus eritematoso sistémico (LES), glomerulonefritis y vasculitis inmunitaria. Aunque los CI inician la reacción autoinmunitaria, otros factores importantes que contribuyen a la gravedad de la enfermedad incluyen el sistema complemento, los receptores Fcg y los neutrófilos. Ahora se reconoce que la contribución principal del complemento a la inflamación por los CI es a través de la señalización del C5aR. Los CI activan tanto la vía clásica como la alternativa del complemento. La C5a, liberada por la escisión de C5 durante la activación del complemento, es un poderoso agente quimioatrayente de neutrófilos, monocitos y macrófagos. La C5a que se une al C5aR inicia una serie de episodios, incluyendo la activación de FcgR en los macrófagos (sobre-regulación que activa FcgRIII y FcgRI y sub-regulación inhibidora del FcgRIIB), haciendo que se liberen más mediadores quimiotácticos (por ejemplo, quimioquinas CXC) y la posterior instrumentación de la respuesta inflamatoria.
La importancia de C5a/C5aR se ha demostrado en diversos sistemas modelos de inflamación por complejos inmunitarios. Por ejemplo, se ha mostrado que la C5a inicia la cascada inflamatoria en un modelo de peritonitis de ratón de la reacción de Arthus pasiva inversa (Godau J, et al., J. Immunol. 173, 3437 (2004)). También se ha mostrado que la C5a regula los FcgR en la enfermedad pulmonar inducida por los CI (Shushakova NJ, et al, J. Clin. Invest., 110, 1823-1830 (2002)). Además, ratones con el gen C5aR desactivado no desarrollan inflamación en el modelo de transferencia de suero de KRNxNOD de Benoist-Mathis de la artritis reumatoide (Ji H, et al., Immunity 16, 157 (2002)) o en un modelo de artritis inducida por anticuerpos anti-colágeno (Grant EP, et al, J. Exp. Med. 196, 1461 (2002)).
Septicemia
La septicemia es una enfermedad grave causada por una infección irresistible del torrente sanguíneo por bacterias productoras de toxinas. Se ha reconocido que el sistema inmunitario innato puede ser perturbado durante la septicemia, como se pone de manifiesto por la activación extensiva de los sistemas inflamatorios, complemento y de coagulación, junto con la aparición de citoquinas y quimioquinas en el plasma. Esta "tormenta de citoquinas" tal como ha sido denominada desencadena numerosos mediadores inflamatorios que contribuyen a una disfunción o insuficiencia de múltiples órganos y a la muerte.
Revisiones recientes de la septicemia reflejan los intentos en el pasado de encontrar tratamientos para esta enfermedad y sugieren direcciones futuras (Crowther and Marshall (2001) Jama 286(15): 1894-6; Cohen, J. (2002) Nature 420(6917):885-91; Cross and Opal (2003) Ann. Intern. Med. 138(6): 502-5).
Hotchkiss and Karl (N. Engl. J. Med. 348(2):138-50, 2003) especulan que la eficacia mostrada por la proteína C recombinante activada anticoagulante en reducir la mortalidad en la septicemia puede ser debida en parte a sus efectos antiinflamatorios. Algunos de los efectos (directos e indirectos) de la proteína C activada son bloquear la producción de citoquinas, bloquear la adhesión de células, inhibir el reclutamiento de neutrófilos, desgranular los mastocitos y activar las plaquetas. La C5a media la quimiotaxis de leucocitos, la liberación de histamina de los mastocitos, la potenciación de la adhesión de las células neutrófilos-endoteliales y la inducción de la producción de citoquinas a través de la unión al receptor de la C5a.
Durante la septicemia en seres humanos, la activación no regulada del sistema complemento da como resultado una generación excesiva de anafilatoxinas, especialmente C3a y C5a y la disfunción subsiguiente de los neutrófilos. En etapas tardías de la septicemia, los neutrófilos han suprimido la respuesta quimiotáctica, disminuido la liberación de enzimas, alterado el pH intracelular y producido un estallido respiratorio defectuoso (menor producción de las especies reactivas de oxígeno, especialmente H2O2), conduciendo a una actividad bactericida reducida. Estos defectos han demostrado ser dependientes de la C5a. Durante la septicemia experimental los neutrófilos de la sangre tienen una capacidad muy disminuida de unirse a la C5a, tienen respuestas quimiotácticas reducidas a la C5a y una pérdida de la producción de H2O2. Estos defectos se pueden impedir en la septicemia inducida por la CLP tratando los animales con anticuerpos anti-C5a. Este tratamiento redujo la bacteremia y mejoro mucho la supervivencia. Esto indica que la septicemia induce una generación excesiva de C5a, lo cual, a su vez, conduce a graves defectos funcionales en los neutrófilos.
Los anticuerpos para C5aR también pueden proteger de la muerte por septicemia en modelos en animales. Se ha mostrado que tanto la inmunorreactividad del C5aR como la expresión del mRNA están aumentadas en las células epiteliales de pulmón, riñón, hígado, corazón y timo en una fase temprana de la septicemia experimental.
Los ratones inyectados al comienzo de la CLP con anticuerpos para el C5aR mostraron una supervivencia notablemente mejorada cuando se compararon con los animales que recibieron IgG no específica. En ratones tratados con anti-C5aR, los niveles en suero de la IL-6 y el TNF-α y los recuentos bacterianos en los diversos órganos fueron significativamente reducidos durante la CLP cuando se compararon con animales con CLP de control. Estos estudios demostraron que el bloqueo del C5aR es muy protector del resultado letal de la septicemia.
Se ha sugerido que es la localización de la C5a lo que puede ser crítico en términos de su potencial para proteger o perjudicar. La generación local de la C5a en tejidos es esencial para el control temprano de una infección. Se establece un gradiente de la C5a que provoca la quimiotaxis de los leucocitos. A mayores concentraciones de la C5a se detiene la quimiotaxis y las células producen su estallido de oxígeno tóxico. En la septicemia, la activación del complemento difuso en la sangre conduce a un exceso de C5a intravascular difusa que paraliza los neutrófilos permitiendo la proliferación no restringida de bacterias. Simultáneamente el secuestro de los neutrófilos en la microcirculación lesiona los pulmones, los riñones y el hígado. En este modelo, puede ser crítica la actuación del C5aR sobre los leucocitos en lugar del receptor sobre las células epiteliales del hígado, pulmones, etc. La intervención, por medio de antagonistas del C5aR puede revelarse terapéuticamente valiosa.
Lesión por isquemia–reperfusión (IR)
El sistema del complemento es un importante mediador del daño del tejido inflamatorio en diversas enfermedades incluyendo la lesión por isquemia-reperfusión (IR).
Las funciones relativas del C5a y el complejo de ataque a la membrana C5b-9 en mediar la lesión por IR parecen variar. En algunos modelos el C5a es el mediador importante. Los antagonistas de C5aR protegen a los ratones y ratas contra la lesión por IR en el intestino delgado y en los riñones (Heller et al., (1999) J. Immunol. 163(2): 985-94; Arumugam et al., (2003) Kidney Int 63(1): 134-42; Arumugam et al., (2002) J. Surg. Res. 103(2):260-7). En un modelo de lesión por IR en ganado porcino un antagonista del C5aR redujo marcadamente el tamaño del infarto de miocardio (Riley et al., (2000) J. Thorac. Cardiovasc. Surg. 120(2): 350-8).
Estudios con anticuerpos para la C5 también demuestran reducciones similares en lesiones por IR (Fitch et al., (1999) Circulation 100(25):2499-506; de Vries et al., (2003) Transplantation 75(3): 375-82).
Estudios clínicos y experimentales han mostrado que la IR de órganos, tales como riñones, hígado, pulmones y corazón induce una liberación rápida de diversas citoquinas. Aunque muchas de estas moléculas disminuyen en nivel después de la reperfusión, la IL-8 aumenta significativamente. La IL-8 es un potente quimioatrayente de neutrófilos. Los niveles de IL-8 se correlacionan negativamente con la función de los pulmones y los altos niveles están asociados con riesgo aumentado de muerte en el trasplante de pulmón. La administración intravenosa de anticuerpos anti-IL-8 al comienzo de la reperfusión reduce marcadamente la lesión en los pulmones y la infiltración de neutrófilos (de Perrot et al., (2003) Am. J. Respir. Crit. Care Med. 167(4):490-511).
Hay pruebas que muestran que la lesión por IR ocurre de un modo bifásico. Los macrófagos activados durante la isquemia median la fase temprana de la lesión, mientras que los neutrófilos y los linfocitos están implicados principalmente en la segunda fase retardada. El reclutamiento de neutrófilos y linfocitos da como resultado la liberación de citoquinas antes y después de la reperfusión.
Puesto que la C5a es un potente quimioatrayente para diversas células mieloides incluyendo macrófagos y neutrófilos e induce también la producción de citoquinas se considera que podría ser beneficioso bloquear el C5aR con anticuerpos específicos evitando la liberación de IL-8 y la migración de neutrófilos y reducir así la lesión por IR.
Síndrome de dificultad respiratoria aguda (SDRA) y lesión pulmonar aguda (LPA)
Los SDRA y LPA son síndromes que resultan del edema y la inflamación pulmonares. El desarrollo de SDRA/LPA está asociado a varios trastornos clínicos incluyendo lesión pulmonar provocada por infección por neumonía, aspiración de contenido gástrico, traumatismo, septicemia, pancreatitis aguda, sobredosis de drogas y paso en derivación (bypass) cardiopulmonar. La septicemia es la causa principal del SDRA/LPA. Al igual que con la IR, la respuesta inflamatoria en la LPA está asociada al reclutamiento de grandes números de neutrófilos y monocitos en los espacios aéreos distales de los pulmones. Las moléculas proinflamatorias, tales como citoquinas, radicales oxigenados y proteasas juegan un papel y la excesiva inflamación puede empeorar el SDRA/LPA (Ware and Matthay (2000) N. Engl. J. Med. 342(18): 1334-49; Brower et al., (2001) Chest 120(4): 1347-67).
Se ha sugerido que podrían ser beneficiosas las estrategias antiinflamatorias para reducir el número de neutrófilos que emigran a los espacios extravasculares de los pulmones, para reducir la adhesión de neutrófilos al endotelio pulmonar y para reducir la liberación de factores quimiotácticos (Brower et al. (2001) Chest 120(4): 1347-67).
Estudios de pacientes con SDRA revelan que en las fases tempranas de la enfermedad altos niveles de IL-8 están presentes en el fluido BAL o el fluido del edema pulmonar. Además, los anticuerpos que neutralizan las IL-8 redujeron la lesión pulmonar en el modelo en conejos (Brower et al., (2001) Chest 120(4): 1347-67).
Para SDRA y LPA bloquear el C5aR también puede ser un enfoque terapéuticamente viable. La C5a es una potente molécula quimiotáctica y estimuladora de la liberación de citoquinas. Los estudios descritos antes que usaron moléculas que antagonizan la C5a o el C5aR demostraron la reducción de la lesión en diversos modelos de inflamación.
Producción de compuestos identificados en los métodos de cribado de la invención
El método objeto descrito en la presente memoria comprende además producir o sintetizar el compuesto que se analiza en el animal modificado genéticamente.
Los compuestos de peptidilo se preparan convenientemente por síntesis estándar de péptidos, tal como el método de síntesis de Merrifield (Merrifield, J. Am. Chem. Soc. 85:2149-2154, 1963) y la miriada de mejoras disponibles en esa tecnología (véase, por ejemplo, Synthetic Peptides: A User's Guide, Grant, ed. (1992), W.H. Freeman & Co., New York, pp. 382; Jones (1994) The Chemical Synthesis of Peptides, Clarendon Press, Oxford, pp. 230); Barany,
G. and Merrifield, R. B. (1979) en The Peptides (Gross, E. and Meienhofer, J. eds.), vol. 2, pp. 1-284, Academic Press, New York; Wünsch, E., ed. (1974) Synthese von Peptiden in Houben-Weyls Metoden der Organischen Chemie (Müller, E., ed. ), vol. 15, 4th edn., Parts 1 y 2, Thieme, Stuttgart; Bodanszky, M. (1984) Principles of Peptide Synthesis, Springer-Verlag, Heidelberg; Bodanszky, M. & Bodanszky, A. (1984) The Practice of Peptide Synthesis, Springer-Verlag, Heidelberg; Bodanszky, M. (1985) Int. J. Peptide Protein Res. 25, 449-474.
Preferiblemente, el péptido se sintetiza sobre un soporte en fase sólida, tal como, por ejemplo, una perla de gel de poliestireno que comprende poliestireno reticulado con divinilbenceno, preferiblemente divinilbenceno al 1% (p/p), que se hincha más usando disolventes lipófilos, tal como, por ejemplo diclorometano o dimetilformamida (DMF). El poliestireno puede ser funcionalizado por adición de grupos de clorometano o aminometilo.
Alternativamente, los geles de polidimetil-acrilamida reticulados y funcionalizados se pueden usar una vez hinchados y solvatados usando DMF o un disolvente aprótico dipolar. También se pueden usar para la síntesis de péptidos otros soportes sólidos conocidos por los expertos en la técnica, tal como, por ejemplo, perlas derivadas de polietilenglicol producidas injertando polietilenglicol en la superficie de perlas de poliestireno inerte. Los soportes sólidos preferidos comercialmente asequibles incluyen PAL-PEG-PS, PAC-PEG-PS, KA, KR o TGR (Applied Biosystems, CA 94404, USA).
Para la síntesis de péptidos en fase sólida, grupos bloqueantes que son estables durante los tratamientos repetidos necesarios para la eliminación del grupo bloqueante de amino de la cadena peptídica en crecimiento y para los acoplamientos repetidos de aminoácidos, se usan para proteger las cadenas laterales de los aminoácidos durante la síntesis y para enmascarar la reactividad indeseada de los grupos funcionales α-amino, carboxilo o de la cadena lateral. Los grupos bloqueantes (también llamados grupos protectores o grupos enmascarantes) protegen por tanto al grupo amino del aminoácido que tiene un grupo carboxilo activado que está implicado en la reacción de acoplamiento o protegen al grupo carboxilo del aminoácido que tiene un grupo amino acilado que está implicado en la reacción de acoplamiento.
Durante la síntesis, el acoplamiento ocurre después de la eliminación de un grupo bloqueante sin rotura de un enlace peptídico ni de los grupos protectores unidos a la otra parte del péptido. Adicionalmente, se requiere que el anclaje péptido-resina que protege al extremo C del péptido esté protegido durante el proceso sintético hasta la escisión de la resina. Por consiguiente, por la selección juiciosa de los α‐aminoácidos adecuadamente protegidos se añaden los aminoácidos en las localizaciones deseadas a un péptido en crecimiento mientras está todavía anclado a la resina.
Los grupos bloqueantes de amino preferidos son fácilmente eliminables, pero suficientemente estables para sobrevivir en condiciones para la reacción de acoplamiento y otras manipulaciones, tal como, por ejemplo, modificaciones en los grupos de las cadenas laterales. En una realización, los grupos de bloqueo de amino se seleccionan del grupo que comprende: (i) un grupo benciloxicarbonilo (Z o carbobenzoxi) que se elimina fácilmente por hidrogenación catalítica a temperatura ambiente y presión ordinaria o usando sodio en amoniaco líquido y ácido bromhídrico en ácido acético; (ii) un derivado de uretano; (iii) un grupo t-butoxicarbonilo (Boc) que se introduce usando azida de tbutoxicarbonilo o dicarbonato de di-terc-butilo y se elimina usando un ácido suave, tal como tal como, por ejemplo, ácido trifluoroacético (TFA al 50% en diclorometano) o HCl en ácido acético/dioxano/acetato de etilo; (iv) un grupo 9fluorenilmetiloxicarbonilo (Fmoc) que se escinde bajo condiciones suavemente básicas, no hidrolíticas, tal como, por ejemplo, usando una amina primaria o secundaria (por ejemplo, piperidina al 20% en dimetil-formamida); (v) un grupo 2-(4-bifenilil)propil(2)oxicarbonilo (Bpoc); (vi) un grupo 2-nitrofenilsulfenilo (Nps); y (vii) un grupo ditia-succinilo (Dts). El Boc es ampliamente usado para proteger el extremo N en química Fmoc o Fmoc es ampliamente usado para proteger el extremo N en química Boc.
Los grupos protectores de las cadenas laterales variarán para las cadenas laterales funcionales de los aminoácidos que forman el péptido que se sintetiza. Los grupos protectores de las cadenas laterales se basan generalmente en el grupo Bzl o el grupo tBu. Los aminoácidos que tienen alcoholes o ácidos carboxílicos en la cadena lateral se protegen como éteres de Bzl, ésteres de Bzl, ésteres de cHex, éteres de tBu o ésteres de tBu. La protección de la cadena lateral de los aminoácidos con Fmoc requiere grupos bloqueantes que sean idealmente estables a las bases y lábiles a los ácidos débiles (TFA). Se han descrito muchos grupos protectores diferentes para la síntesis de péptidos (véase The Peptides, Gross et al. eds., Vol. 3, Academic Press, New York, 1981). Por ejemplo, el grupo 4-metoxi2,3,6-trimetilfenilsulfonilo (Nd-Mtr) es útil para la protección de la cadena lateral de arginina, sin embargo, la desprotección de Arg(Mtr) requiere un tratamiento prolongado con TFA. Para proteger la cistina se usan cierto número de grupos lábiles a los ácidos débiles (TFA, trifluoroacetato de talio (III)/TFA) o grupos lábiles estables al TFA, pero no al trifluoroacetato de talio (III)/TFA o grupos estables a los ácidos débiles.
Las dos estrategias de protección más ampliamente usadas son las estrategias Boc/Bzl y Fmoc/tBu. En Boc/Bzl, se usa Boc para la protección de amino y las cadenas laterales de los diversos aminoácidos se protegen usando grupos protectores basados en Bzl o cHex. Un grupo Boc es estable en condiciones de hidrogenación catalítica y se usa adecuadamente junto con un grupo Z para la protección de muchos grupos de cadenas laterales. En Fmoc/tBu, se usa Fmoc para la protección de amino y las cadenas laterales se protegen con grupos protectores basados en tBu.
Alternativamente, el compuesto de peptidilo se produce por la expresión recombinante de un ácido nucleico que codifica la secuencia de aminoácidos de dicho péptido. Las genotecas que codifican péptidos aleatorios son particularmente preferidas para estos fines, porque proporcionan una amplia gama de diferentes compuestos para analizar. Alternativamente, se pueden cribar ácidos nucleicos de origen natural. De acuerdo con esta realización, el ácido nucleico que codifica el compuesto de peptidilo se produce por síntesis estándar de oligonucleótidos o procede de una fuente natural y se clona en un vector de expresión adecuado en conexión operativa con un promotor u otra secuencia reguladora capaz de regular la expresión en un sistema exento de células o en un sistema celular.
Los oligonucleótidos se sintetizan preferiblemente con secuencias de enlazador o adaptador en los extremos 5' y 3' para facilitar la clonación subsiguiente en un sistema vector adecuado usando técnicas estándares.
Colocar una molécula de ácido nucleico bajo el control regulador de, es decir, "en conexión operativa con", una secuencia de promotor significa posicionar dicha molécula de tal modo que la expresión esté controlada por la secuencia del promotor, generalmente posicionando el promotor hacia el extremo 5' de la secuencia que codifica el péptido.
El requisito previo para producir péptidos intactos en bacterias, tales como E. coli es el uso de un promotor fuerte con un sitio eficaz de unión al ribosoma. Los promotores típicos adecuados para la expresión en células bacterianas, tales como E. coli incluyen, pero sin limitación, el promotor lacz, los promotores λL o λR sensibles a la temperatura, el promotor T7 o el promotor tac inducible por IPTG. Son bien conocidos en la técnica y están descritos cierto número de otros sistemas vectores para expresar la molécula de ácido nucleico de la invención en E. coli, por ejemplo, en Ausubel et al (en: Current Protocols in Molecular Biology. Wiley Interscience, ISBN 047150338, 1987) o Sambrook et al (en: Molecular Cloning, A Laboratory Manual, second edition, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y., 1989). Se han descrito numerosos plásmidos con secuencias de promotor adecuadas para la expresión en bacterias y sitios eficientes de unión al ribosoma, tales como por ejemplo, pKC30 (λL: Shimatake and Rosenberg, Nature 292, 128, 1981); pKK173-3 (tac: Amann and Brosius, Gene 40, 183, 1985), pET-3 (T7: Studier and Moffat, J. Mol. Biol. 189, 113, 1986); la serie de vectores pBAD/TOPO o pBAD/Thio-TOPO que contienen un promotor inducible por arabinosa (Invitrogen, Carlsbad, CA), el último de los cuales está diseñado para producir también proteínas de fusión con tiorredoxina para potenciar la solubilidad de la proteína expresada; las series de vectores de expresión pFLEX (Pfizer Inc., CT, USA); o la serie de vectores de expresión pQE (Qiagen, CA), entre otros.
Los promotores típicos adecuados para la expresión en virus y células procariotas y células eucariotas incluyen el promotor tardío de SV40, el promotor temprano de SV40 y el promotor de citomegalovirus (CMV), el promotor CMV IE (citomegalovirus inmediato temprano) entre otros. Los vectores preferidos para la expresión en células de mamíferos (por ejemplo, 293, COS, CHO, células 10T, células 293T) incluyen, pero sin limitación, el juego de vectores de pcDNA suministrado por Invitrogen, en particular pcDNA 3.1 cola de myc-His que comprende el promotor de CMV y que codifica una cola de 6xHis y MYC en extremo C; y el vector de retrovirus pSRαtkneo (Muller et al., Mol. Cell. Biol., 11, 1785, 1991). El vector pcDNA 3.1 myc-His (Invitrogen) es particularmente preferido para expresar péptidos en una forma secretada en células 293T, en donde el péptido o proteína expresado puede ser purificado de proteínas de la misma especie, usando técnicas de afinidad estándares que emplean una columna de níquel para fijar la proteína mediante la cola de His.
Están disponibles públicamente una amplia gama de sistemas hospedantes/vectores adicionales adecuados para expresar péptidos y están descritos, por ejemplo, en Sambrook et al (en: Molecular Cloning, A Laboratory Manual, second edition, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y., 1989).
Son bien conocidos por los expertos en la técnica medios para introducir el ácido nucleico o una construcción génica que lo comprende en una célula para su expresión. La técnica usada para un organismo dado depende de técnicas satisfactorias conocidas. Los medios para introducir DNA recombinante en células de animales incluyen microinyección, transfección mediada por DEAE-dextrano, transfección mediada por liposomas, tal como la que usa lipofectamina (Gibco, MD, USA) y/o cellfectina (Gibco, MD, USA), absorción de DNA mediada por PEG, electroporación y bombardeo con micropartículas, tal como el que usa partículas de wolframio u oro revestidas con DNA (Agracetus Inc., WI, USA) entre otros.
Las técnicas para sintetizar compuestos orgánicos pequeños variarán considerablemente dependiendo del compuesto, sin embargo, dichos métodos serán bien conocidos por los expertos en la técnica. En una realización, se usan programas informáticos para seleccionar bloques de construcción químicos adecuados a partir de compuestos conocidos, para producir una quimioteca combinatoria. Por ejemplo, el método de construcción de modelos de relaciones cuantitativas estructura-actividad (abreviadamente QSAR por la expresión inglesa Quantitative Structure Activity Relationship) usa regresiones o árboles de regresiones lineales de estructuras de compuestos para determinar la idoneidad. El programa informático de Chemical Computing Group, Inc. (Montreal, Canadá) usa datos experimentales de cribado de alta productividad de compuestos activos, así como inactivos, para crear un modelo QSAR probabilístico, el cual se usa subsiguientemente para seleccionar compuestos cabezas de serie. El método QSAR binario se basa en tres propiedades características de compuestos que forman un "descriptor" de la probabilidad de que un compuesto particular realice o no una función requerida: carga parcial, refractividad molar (interacciones de unión) y logP (lipofilicidad de la molécula). Cada átomo tiene un área superficial en la molécula y tiene tres propiedades asociadas con la misma. Se determinan todos los átomos de un compuesto que tienen una carga parcial en cierto intervalo y se suman las áreas superficiales (descriptor de área superficial de Van der Walls). Los modelos QSAR binarios se usan luego para construir modelos de actividad o modelos ADMET, que se usan para construir una quimioteca combinatoria. Por consiguiente la información de supresores y no supresores deseados, incluyendo compuestos cabezas de serie identificados en los cribados iniciales se puede usar para ampliar la lista de compuestos que se criban para identificar de este modo compuestos altamente activos.
En una realización, el método objeto comprende además formular el compuesto identificado para la administración a un animal no humano o humano. Las formulaciones pueden ser adecuadas para la administración por inyección por una vía subcutánea, intravenosa, intranasal o intraperitoneal. Alternativamente, pueden ser adecuados para administración oral en la forma de aditivos alimentarios, comprimidos, trociscos, etc.
Los compuestos se formulan convenientemente en un excipiente o diluyente adecuado, tal como, por ejemplo, un disolvente acuoso, un disolvente no acuoso, un excipiente no tóxico, tal como una sal, conservante, tampón y similares. Ejemplos de disolventes no acuosos son propilenglicol, polietilenglicol, aceite vegetal y ésteres orgánicos inyectables, tales como oleato de etilo. Los disolventes acuosos incluyen agua, soluciones alcohólicas/acuosas, soluciones salinas, vehículos parenterales, tal como cloruro de sodio, dextrosa de Ringer, etc. Los conservantes incluyen agentes antimicrobianos, antioxidantes, quelantes y gases inertes. El pH y la concentración exacta de los diversos componentes de la formulación adecuados para administración al animal se ajustan de acuerdo con las prácticas de rutina. Las soluciones o suspensiones usadas para aplicación parenteral, intradérmica o subcutánea pueden incluir los siguientes componentes: un diluyente estéril, tal como agua para inyección, solución salina, aceites fijos, polietilenglicoles, glicerina, propilenglicol u otros disolventes sintéticos; agentes antibacterianos, tales como alcohol bencílico o metil-parabenos; antioxidantes, tales como ácido ascórbico o bisulfito de sodio; agentes quelantes, tal como ácido etilenediamintetraácetico; tampones, tales como acetatos, citratos o fosfatos y agentes para el ajuste de la tonicidad, tal como cloruro sódico o dextrosa. El pH se puede ajustar con ácidos o bases, tal como ácido clorhídrico
o hidróxido sódico. La preparación parenteral puede estar encerrada en ampollas, jeringas desechables o viales de dosis múltiples hechos de vidrio o plástico. Los agentes de unión farmacéuticamente compatibles y/o materiales adyuvantes pueden ser incluidos como parte de la composición. Los comprimidos, píldoras, cápsulas, trociscos y similares pueden contener uno de los siguientes ingredientes o compuestos de naturaleza similar: un aglutinante, tal como celulosa microcristalina, goma de tragacanto o gelatina; un excipiente, tal como almidón o lactosa, un agente disgregante, tal como ácido algínico, Primogel o almidón de maíz; un lubricante, tal como estearato de magnesio o Sterotes; un agente deslizante, tal como dióxido de silicio coloidal; un agente edulcorante, tal como sacarosa o sacarina; o un agente aromatizante, tal como menta, salicilato de metilo o aroma de naranja. Para administración por inhalación, los compuestos se suministran en la forma de una pulverización por aerosol desde recipientes o dispensadores presurizados que contienen un agente propulsor adecuado, por ejemplo, un gas tal como dióxido de carbono o un nebulizador. Para administración transmucosal o transdérmica, se usan en la formulación agentes penetrantes apropiados para la barrera que ha de ser atravesada. Dichos agentes penetrantes son generalmente conocidos en la técnica e incluyen, por ejemplo, para administración transmucosal, detergentes, sales biliares y derivados del ácido fusídico. La administración transmucosal se puede conseguir a través del uso de pulverizadores nasales o supositorios. Para administración transdérmica, los compuestos activos se formulan en pomadas, bálsamos, geles o cremas como es generalmente conocido en la técnica.
Opcionalmente, la formulación incluirá también un vehículo, tal como, por ejemplo, seroalbúmina bovina (BSA), hemocianina de lapa bocallave (KLH), ovalbúmina, seroalbúmina de ratón, seroalbúmina de conejo y similares. También se conocen en la técnica medios para conjugar péptidos a proteínas vehículos (soportes) e incluyen glutaraldehído, éster de m-maleimidobenzoil-N-hidroxysuccinimida, carbodiimida y bencidina bis-biazotada.
La presente invención se ilustrará ahora por los siguientes Ejemplos, que de ningún modo han de entenderse como limitativos.
Ejemplos
Para producir una raza de ratones mutantes mediante recombinación homóloga se necesitan dos elementos princi
5 pales. Una línea de células madre embrionarias (ES) capaz de contribuir a la línea germinal y una construcción diana que contenga secuencias del gen diana con la mutación deseada. El manteniendo de las células ES en su estado no diferenciado se consigue haciendo crecer células sobre una capa de células alimentadoras. La construcción diana se transfecta luego a células ES cultivadas. Las líneas de células ES proceden de la masa celular interna de un embrión en la fase de blastocisto. La recombinación homóloga ocurre en un pequeño número de células transfectadas, dando como resultado la introducción de la mutación presente en la construcción diana en el gen diana.
Una vez identificados, los clones de células ES mutantes pueden ser microinyectados en un blastocisto normal para producir un ratón quimérico. Debido a que muchas líneas de células ES retienen la capacidad de diferenciarse en cada tipo de célula presente en el ratón, la quimera puede tener tejidos, incluyendo la línea germinal, con contribución tanto del blastocisto normal como de las células ES mutantes. La reproducción de ratones quimeras de la línea
15 germinal proporciona animales que son heterocigóticos para la mutación introducida en la célula ES y pueden ser cruzados para producir ratones mutantes homocigóticos.
Como se muestra en la Figura 1, la construcción diana usada para reemplazar la secuencia del C5aR de ratón endógeno por la secuencia del C5aR humano contiene dos regiones de homología para el gen diana localizadas a ambos lados de un marcador seleccionable positivo (PGK-Neo, un gen híbrido que consiste en el promotor de la fosfoglicerato-quinasa I que activa el gen de la neomicina-fosfotransferasa). La recombinación homóloga transcurre mediante un evento de doble cruzamiento que reemplaza las secuencias del gen diana por las secuencias de la construcción de reemplazo. Debido a que no se produce ninguna duplicación de secuencias, el gen normal no puede ser regenerado.
Cuando la construcción diana es linealizada, el gen neo está flanqueado por dos regiones de homología con el gen
25 diana. La selección de las células usando fármacos (por ejemplo, G418) elimina la gran mayoría de células que no tienen establemente incorporada la construcción.
Aunque muchos métodos de inactivación de genes que implican recombinación homóloga todavía usan construcciones que dejan el marcador seleccionable positivo en el DNA genómico, ha llegado a quedar cada vez más claro que esto puede causar cierto número de efectos no previstos. Por ejemplo, la presencia del gen neo, frecuentemente con su propio promotor, puede alterar la expresión de los loci vecinos. Esto puede ser un problema particular en agrupaciones de genes en las que los genes vecinos son de la misma familia, puesto que los genes afectados pueden tener funciones idénticas o similares. Como resultado, ligeras diferencias en las construcciones diana condujeron a diferencias marcadas en el fenotipo.
Por esta razón la construcción diana ilustrada en este ejemplo incluye sitios loxP que flanquean el gen PGK-neo, de
35 modo que el marcador seleccionable pueda ser eliminado después de servir como diana por expresión transitoria de la Cre-recombinasa. Esto dejará un pequeño sitio loxP en el DNA genómico, pero la construcción puede ser manipulada genéticamente de modo que éste se encuentre en una localización inocua (Figura 2). Aunque teóricamente incluso un sitio loxP podría causar alteraciones en la expresión de genes vecinos, hasta ahora no se ha informado de ninguno de tales casos. La eficacia de la recombinación de Cre procedente de la expresión transitoria descrita en la bibliografía varía ampliamente desde ~2% hasta ~15%. Esta tasa debe ser distinguida de la eficacia de la recombinación de Cre in vivo, en donde la expresión de Cre proviene de las secuencias integradas en el genoma y por tanto mostrará una expresión de mayor duración en casi todos los casos.
La SEQ ID NO:1 muestra la secuencia de DNA genómico de ratón (~22 kb) que abarca el gen C5aR (C5r1). La SEQ ID NO:2 muestra la secuencia de cDNA del C5aR humano y la SEQ ID NO:3 muestra la secuencia de la proteína
45 C5aR humana.
La región genómica del ratón como se muestra en la SEQ ID NO:1 (el locus diana) se caracteriza como sigue:
exón 1: nucleótidos 757-784 (región no traducida 5')
exón 2: nucleótidos 1048-1152 (región no traducida 5' más codón de iniciación)
exón 3: nucleótidos 10726-11778 (toda la secuencia codificadora excepto ATG).
La Figura 3 muestra un mapa de restricción de la secuencia de 22 kb mostrada en la SEQ ID NO:1. Los sitios de restricción relevantes son como sigue:
- Enzima:
- Nº de cortes Posiciones
- EcoRI
- 2 18462 19176
- EcoRV
- 4 199 5337 9151 18964
- NdeI
- 2 7698 18758
- XbaI
- 4 1351 15968 16852 20902
El vector diana usado para generar los ratones con el gen activado incluye regiones homólogas al DNA genómico de aproximadamente 3 kb a ambos lados del exón 3 (es decir, aproximadamente los nucleótidos 7377-15045 como se
5 muestra en la SEQ ID NO:1). En particular, el vector diana comprendía la región de aproximadamente los nucleótidos 7377-15045 de la SEQ ID NO:1, excepto que los nucleótidos 10726-11778 estaban reemplazados por los nucleótidos 28 a 1077 de la SEQ ID NO:2. Esto significa que después de la integración, los exones endógenos 1 y 2 de ratón permanecen en el mamífero transgénico, pero el exón 3 del locus del ratón ha sido reemplazado por una secuencia que codifica el C5aR humano.
A continuación se proporciona un protocolo básico para el cultivo de células madre embrionarias y para la introducción de la construcción diana en células ES. Este protocolo también describe el método para identificar clones en los cuales el gen diana ha sido alterado por recombinación homóloga. Los recombinantes homólogos resultantes son
15 heterocigóticos para el C5aR humano y se pueden usar para producir ratones transgénicos homocigóticos para el gen C5aR humano. En este ejemplo la células ES procedían de ratones C57BL/6. Materiales Construcción diana Células madres embrionarias (ES) 20 Medio ES/LIF Tripsina/EDTA: tripsina al 0,25% (p/v) / EDTA 1 mM (HEPES 20 mM, pH 7,3, opcional) Medio ES Tampón de electroporación G418 25 Medio de congelación Tampón de digestión NaCl saturado Gel de agarosa al 1%
Transfección de la construcción y selección de células ES
30 1. Cultivar células ES en medio ES/LIF. Someter las células a pases cada 2 a 3 días sembrando una placa de cultivo de tejidos revestida con gelatina de 100 mm con 1-2 x 106 células/placa. El factor inhibidor de leucemia (LIF) impide que las células ES se diferencien. Puede ser preferible someter las células a pases a una densidad mayor si se planifica la inyección en blastocistos de las células (por ejemplo, 1,5 x 106 células por matraz de 25 cm2).
2. Recolectar ~5 x 106 a 1 x 107 células añadiendo tripsina/EDTA e incubando durante ~5 minutos hasta que
35 las células estén liberadas en la superficie de la placa. Disociar las células individuales pipeteando arriba y abajo de cinco a diez veces. Añadir 5 ml de medio ES. Sedimentar las células y volver a poner en suspensión en el mismo tubo el sedimento celular en 1 ml de tampón de electroporación. Típicamente, se pueden obtener 107 células de una placa de 100 mm de cultivo de tejidos casi confluente.
3. Añadir 1 pmol del DNA de la construcción estéril linealizada.
40 4. Someter a electroporación la mezcla a 450 V y 250 µF en una cubeta de electroporación de 4 mm. Incubar 10 minutos a temperatura ambiente. Con las células madre embrionarias se pueden usar muchas condiciones de electroporación.
- 5.
- Cultivar las células en placa en un medio ES a ~2 x 106 células por placa de cultivo de tejidos de 100 mm revestida de gelatina. Incubar 24 horas.
- 6.
- Comenzar la selección cambiando el medio ES por el medio ES/LIF y añadiendo G418 a 0,2 mg/ml y GANC a 2 µM (final).
- 7.
- Continuar la incubación, cambiando el medio diariamente usando medio ES/LIF y añadiendo G418 (0,2 mg/ml final), hasta que sean visibles colonias aisladas individuales (típicamente 1 semana después de la electroporación). Retirar una colonia individual de la placa usando una punta de pipeta tratada en autoclave, y colocarla en una gota de 35 µl de tripsina/EDTA durante 5 minutos. Pipetear arriba y abajo aproximadamente cinco veces hasta disociar las células. Transferir las células a un pocillo de una placa de microtitulación de 24 pocillos revestida de gelatina que contenga 1 ml de medio ES/LIF.
- 8.
- Incubar hasta que sean visible colonias, pero no se diferencien las células (típicamente 3 a 4 días). Someter a pases la mitad de las células a un pocillo de una placa de microtitulación limpia de 24 pocillos revestida de gelatina. Añadir las células restantes a 0,5 ml de medio de congelación y colocar la placa a –70ºC. Congelar durante la noche y luego transferir a nitrógeno líquido. Las células no diferenciadas crecen en colonias lisas redondas. Las células diferenciadas son más planas con bordes intercelulares definidos. Realizar inmediatamente la etapa 9 después de colocar la mitad de las células en el congelador.
Cribado de los recombinantes homólogos
- 9.
- Incubar células ES en una placa de microtitulación de 24 pocillos (etapa 14) hasta casi confluencia (usualmente 2 a 3 días). Debido a que no es crítico impedir la diferenciación de las células ES en esta etapa, se puede omitir LIF del medio de cultivo; sin embargo, la presencia de LIF puede ayudar a mantener el crecimiento celular.
- 10.
- Añadir 300 µl de tampón de digestión a cada pocillo. Transferir el contenido de los pocillos a un tubo de microcentrífuga de 1,5 ml e incubar durante la noche a 55ºC.
- 11.
- Añadir 150 µl de NaCl saturado y agitar con vórtice vigorosamente (la solución se volverá blanca lechosa). Añadir 2 volúmenes de etanol al 95% (la solución se volverá trasparente excepto el DNA precipitado). Algunos investigadores precipitan el DNA usando 2 volúmenes de etanol (o 1 volumen de isopropanol) sin añadir sal. Sin embargo, el sedimento de DNA se vuelve a poner en suspensión poner en suspensión más fácilmente si se añade sal.
- 12.
- Volver a poner en suspensión el sedimento de DNA en 50 µl de agua. Determinar la concentración de DNA midiendo la absorbancia a 260 nm.
- 13.
- Digerir 10 µg de DNA (o 10 µl si no se determinó la concentración de DNA) con la enzima de restricción adecuada.
- 14.
- Fraccionar el DNA digerido en un gel de agarosa al 1%. Transferir a una membrana de nilón e hibridar por transferencia Southern a una sonda de hibridación del gen diana adecuada para distinguir el gen diana inalterado de un gen diana que haya experimentado recombinación homóloga.
- 15.
- Seleccionar colonias de células ES que muestren dos fragmentos de hibridación de aproximadamente igual intensidad – un fragmento del tamaño predicho para el gen diana inalterado y un fragmento del tamaño predicho para un gen diana que haya experimentado recombinación homóloga. Si los dos fragmentos son de intensidad de hibridación desigual, la población de células puede no ser clonal. Congelar las células y conservarlas en nitrógeno líquido.
Un total de 672 colonias de células ES transfectadas con la construcción diana hC5aR se cribaron para detectar recombinación homóloga entre la construcción diana y el genoma del ratón.
El DNA extraído de las colonias de células ES se digirió con EcoRV o XbaI y se sometió a electroforesis a través de un gel de agarosa. El DNA se transfirió a un filtro (por el método Southern) y se hibridó a un DNA sonda marcado con 32P en 5' o 3' usando condiciones estándares. Después de lavar, el filtro se expuso a una película de rayos X. Este cribado proporcionó tres colonias que contenían el gen C5aR humano. A dos de estas colonias (5H1 y 6C8) se les identificaron un gen C5aR humano correctamente integrado en el locus del gen C5aR de ratón (los datos no se muestran).
Ejemplo 3: Implantación de células ES, generación de quimeras y transmisión de líneas germinales del gen C5aR humano
El método estándar para generar quimeras con células ES usa embriones de ratón de 3 a 5 días (blastocistos). Los embriones en esta etapa tienen una gran cavidad llena de fluido en la cual se pueden colocar por inyección las células ES. Los blastocistos ya han salido de los oviductos y se encuentran en las trompas uterinas. Para las inyecciones, deben ser recolectados antes de eclosionar (pérdida de zona pelúcida) y unirse a la pared uterina. Para generar blastocistos para inyecciones de células ES se usan diversas razas de ratones. En este ejemplo se usó la raza de ratones Balb/c para generar blastocistos. Esta raza proporciona un número razonable de embriones. Tiende a producir quimeras de alta calidad que se pueden distinguir fácilmente por el color del pelaje cuando se usan con células ES procedentes de una variedad de sub-razas de C57BL/6.
Las células ES de las colonias, 5H1 y 6C8 se inyectaron en ~200 blastocistos. Los blastocistos fueron implantados en ratones hembras seudo-preñadas. Nacieron unas 17 quimeras con color de pelaje entre 5 y 50% de piel negra. Las 13 quimeras machos se aparearon con hembras C57BL/6 y produjeron unos 300 cachorros. Se observó la transmisión de líneas germinales del gen C5aR humano en 19 cachorros de 5 parejas de apareamiento quimera x C57BL/6.
La presencia del locus C5aR humano se confirmó por transferencia Southern. El DNA genómico extraído de la cola de los ratones se digirió con EcoRV, se sometió a electroforesis y se hibridó a la sonda 3'. El filtro se desmontó y se volvió a sondar con la sonda Neo. Cierto número de ratones mostraron el gen C5aR. El genotipo de estos ratones se denominó hC5aRfloxed(neoR)/wt (abreviado H5Rf/+).
Ejemplo 4: Reproducción e identificación de ratones homocigóticos para el gen C5aR humano
Una generación de ratones H5Rf/+ se aparearon con ratones C57BL/6 supresores del Cre para eliminar el gen marcador neoR generando de este modo ratones H5R/wt/Cre. Los ratones H5R/wt/Cre se aparearon con ratones C57BL/6 para eliminar el gen Cre, generando de este modo ratones H5R/wt heterocigóticos (H5R/+). Los apareamientos entre los ratones H5R/+ produjeron ratones homocigóticos con genes activados H5R/H5R. También se establecieron algunos apareamientos H5Rf/+ x H5Rf/+ y generaron homocigotos H5Rf/H5Rf.
La confirmación de que los ratones llevan el gen C5aR humano se realizó usando un ensayo de genotipado basado en la PCR. El ensayo de genotipos por transferencia Southern usado anteriormente para identificar ratones que llevan el gen C5aR humano se basó en la hibridación con una sonda de DNA específica de ratón (no una sonda específica del gen C5aR humano). El ensayo de PCR descrito más adelante utilizó cebadores que específicamente amplifican las secuencias del gen C5aR humano o de ratón.
Preparación del DNA de la cola
Puntas de colas de 3 mm se colocaron en tubos Eppendorf estériles de 1,5 ml y se incubaron durante una noche a 65ºC en 200 µl de tampón de aislamiento de DNA (Tris-Cl 67 mM, pH 8,0 (Calbiochem), sulfato de amonio 16,6 mM (Sigma), cloruro de magnesio 6,5 mM (Promega), β-mercaptoetanol al 1% (ICN Biomedical) y Triton X100 al 0,05% (Sigma)). El líquido sobrenadante se transfirió a un nuevo tubo de 1,5 ml que contenía 500 µl de etanol al 100% (UNIVAR), se mezcló y se incubó durante 2 horas a -20ºC, luego se centrifugó durante 15 minutos a 4ºC y 13.000 rpm (Labofuge 400R, Heraeus Instruments) para precipitar el DNA genómico purificado. El sedimento de DNA se lavó en etanol al 70% y se dejó secar antes de volver a ponerlo en suspensión en 50 µl de agua destilada. Se usó una parte alícuota de 1 µl como el DNA molde en el siguiente ensayo de PCR.
PCR para amplificar genes del C5aR humano y de ratón
Cada mezcla de reacción de PCR contenía 5 µl de tampón 10x PCR libre de magnesio, 5 µl de cloruro de magnesio 25 mM, 0,5 µl de Taq DNA-polimerasa (2,5 unidades/µl), 1 µl de los dNTP 10mM (Promega), 1 µl de cada cebador oligonucleotídico 10 mM (F1C, R2a, F3C y R4C) y 1 µl del DNA molde. El volumen total se completó hasta 50 µl con agua destilada. Los cebadores oligonucleotídicos usados fueron:
5'-TGGACTACAGCCACGACAAACG-3' (F1C) (SEQ ID NO:4) y
5'-AGGAAGGACATCATTATCCCCG-3' (R2a) (SEQ ID NO:5),
ambos específicos para el exón 3 de C5aR humano; y,
5'-CACCAGCCCCGAGATTTTTTC-3' (F3C) (SEQ ID NO:6) y
5'-TCAGAAACCAGATGGCGT-3' (R4C) (SEQ ID NO:7),
ambos específicos para el gen C5aR de ratón.
Las secuencias diana se amplificaron luego usando un termociclador de PCR System 2700 (Applied Biosystems). La PCR empezó con una etapa de desnaturalización de 5 minutos a 95ºC, seguida por 25 ciclos de tres etapas: 95ºC durante 30 segundos, 60ºC durante 30 segundos y 72ºC durante 60 segundos. Una etapa de extensión final: 5 minutos a 72ºC fue seguida por conservación a 4ºC.
Electroforesis en gel
El genotipo de cada muestra se visualizó usando electroforesis en gel con 10 µl del producto de la PCR y 6x colorante de carga (Promega). El gel consistía en 80 ml de agarosa de calidad para DNA al 1,5% (Progen) en 1x TBE y 2 µl de bromuro de etidio (MP Biomedicals). Las muestras se hicieron correr a 100 voltios durante 30 minutos junto con una cadena de DNA de 1 kb (Promega). Se esperó que el DNA de ratones homocigóticos H5Rf/H5Rf tendría una sola banda de 237 pb, el DNA de ratones heterocigóticos H5Rf/+ tendría bandas de 237 pb y 565 pb y el DNA de los ratones de tipo natural de ratón tendría una sola banda de 565 pb. El análisis del gel mostró que los ratones nº 10, 24 y 25 eran homocigóticos (H5Rf/H5Rf) (datos no mostrados). En algunas muestras, se observó un transcrito irrelevante de una longitud de1139 pb (amplificado con los cebadores F3C y R2a).
La localización relativa en el locus del C5aR ratón/humano de los cebadores de la PCR, F1C, R2a, F3C y R4C, usados en el ensayo de genotipado se muestra en la Figura 4.
Ejemplo 5: El C5aR humano se expresa en células aisladas de ratón con el gen activado
Para confirmar que el receptor de la C5a humana se expresa en ratones que llevan el gen C5aR humano se aislaron neutrófilos de la sangre de un ratón de tipo natural (+/+), un heterocigoto (H5Rf/+) y un homocigoto (H5Rf/H5Rf).
Tinción con inmunofluorescencia directa de C5aR en sangre completa de ratón
Se recogieron aproximadamente 30 µl de sangre venosa periférica de ratones homocigóticos (H5Rf/H5Rf), heterocigóticos (H5Rf/+) y de tipo natural (+/+) en un tubo que contenía EDTA (la concentración final de EDTA fue 5 mM). Para la detección del receptor C5aR humano se tiñeron 30 µl de sangre con 5 µl de 7F3 marcado con FITC (isotiocianato de fluoresceína, Sigma), un anticuerpo específico para el C5aR humano (7F3 no da reacción cruzada con el C5aR de ratón). La sangre y el anticuerpo se incubaron en un tubo de ensayo de 12 x 75 mm durante 15 minutos a temperatura ambiente. Para lisar los eritrocitos y fijar las células se añadieron 500 µl de solución de lisis BD (Becton Dickinson) a la solución de sangre/anticuerpo. Después de 15 minutos las células se centrifugaron a 1.200 rpm durante 3 minutos a temperatura ambiente y el sedimento celular se volvió a poner en suspensión en 1 ml de tampón de lavado (1 x PBS, BSA al 0,1%, azida de sodio al 0,02%). Las células se analizaron en un citómetro de flujo FACS Calibur (Becton Dickinson) usando el programa informágtico Cell Quest (Becton Dickinson). Para cada muestra se contaron aproximadamente 5.000 células.
La Figura 5 muestra los resultados de este análisis. Los neutrófilos tanto de los ratones KI homocigóticos como heterocigóticos se unieron al 7F3, un anticuerpo específico para el C5aR humano. En contraste, los neutrófilos de ratones de tipo natural no se tiñeron por 7F3. Los linfocitos de todos los genotipos de los ratones no se tiñeron con el mAb 7F3. Esto era lo esperado puesto que el C5aR no se expresa en los linfocitos. Los monocitos procedentes de los ratones homocigóticos y heterocigóticos con el gen activado fueron teñidos parcialmente con 7F3, lo que indica que un pequeño porcentaje de las células expresó el C5aR humano. Ninguno de los monocitos procedentes del ratón de tipo natural dio positivo en la tinción con 7F3.
En resumen, los ratones que llevan el gen C5aR humano expresan el C5aR humano en la superficie de los tipos esperados de células. Esto indica que la célula de ratón es capaz de expresar y procesar el receptor de la C5a humana.
Para demostrar la utilidad de los ratones con el gen C5aR humano activado los autores de la presente invención sometimos ratones homocigóticos (H5Rf/H5Rf) a un modelo de enfermedad inflamatoria, en concreto al modelo K/BxN de artritis reumatoide.
Los ratones transgénicos (tg) K/BxN TCR expresan un TCR (receptor de linfocitos T) codificado por el transgén reactivo a un auto-péptido procedente de la enzima glicolítica omnipresentemente expresada, la glucosa-6-fosfatoisomerasa (GPI), presentada por la molécula Ag7 de la clase II del MHC. Estos animales desarrollan espontáneamente una forma muy agresiva de artritis, que comienza a una edad de 3 a 4 semanas. Al igual que en los seres humanos, la enfermedad es crónica, progresiva y simétrica, y presenta la mayoría (aunque no todos) los aspectos clínicos, histológicos e inmunológicos de la artritis reumatoide (AR) en seres humanos. Los aspectos histológicos incluyen invasión de leucocitos, sinovitis, formación de paño, cartílago y destrucción ósea. El trastorno en múridos, críticamente dependiente tanto de los linfocitos T como de los B, es específico de las articulaciones pero se inicia, y luego se perpetúa, por la auto-reactividad de los linfocitos T y luego los B para un antígeno omnipresentemente expresado, GPI.
Sorprendentemente, la transferencia de suero (o las IgG anti-GPI purificadas por afinidad) procedente de ratones K/BxN artríticos a animales sanos provoca artritis en unos días, incluso cuando los receptores están exentos de linfocitos.
Protocolo de transferencia de sueros, tratamiento con anticuerpos y puntuación de la artritis.
Se mezclaron sueros de ratones K/BxN artríticos de 60 días y se inyectaron intraperitonealmente (i.p.) (150 µl de volumen total) en ratones homocigóticos (H5Rf/H5Rf) de 6 - 9 semanas y en ratones de tipo natural (+/+) en cada uno de los días 0 y +2. Se inyectó i. p. en los ratones cada uno de los días -1 y + 3 un anticuerpo estéril (200 µg del anticuerpo 7F3 – isotipo IgG2a anti-C5aR humano de ratón o 200 µg del anticuerpo de control del isotipo IgG2a) en PBS.
La artritis se puntuó diariamente por examen clínico durante 10-14 días. La gravedad de la artritis en cada pata afec5 tada se clasificó gradualmente como sigue:
0 puntos: sin indicios de inflamación
1 punto: inflamación sutil (articulaciones de las falanges metatarsianas, falange individual o edema localizado)
2 puntos: hinchazón fácilmente identificada pero localizada en la superficie dorsal o ventral de la pata.
3 puntos: hinchazón en todos los aspectos de la pata.
10 La suma de las puntuaciones de las cuatro patas en cada ratón se definió como la puntuación clínica (máxima puntuación por animal = 12) y representa la gravedad y progresión global de la enfermedad en un animal.
El grosor de los tobillos se midió cada día usando un calibrador. El grosor de cada tobillo trasero se midió dos veces y se calculó la media de las 4 medidas. El grosor de los tobillos se definió como la diferencia en el grosor de los tobillos desde la medida del día 0. Los ratones se pesaron diariamente.
15 Histología
El método básico de fijación, descalcificación, cortes en parafina y tinción con hematoxilina/eosina de secciones de articulaciones es como se ha descrito (Kouskoff et al., 1996, supra). Para la inmunohistología se obtienen corteses criostáticos no fijados y no descalcificados. Dicho resumidamente, las articulaciones de los tobillos diseccionadas sin piel se embeben en OCT, se congelan en isopentano en nieve carbónica y se montan en un soporte de cromicroto
20 mo a -25ºC. Después de recortar el bloque de tejido hasta un nivel deseado, una cinta transparente se fija a la superficie de la sección del bloque. Se cortan secciones sagitales (6 u 8 mm de espesor) por debajo de la cinta y el tejido se transfiere subsiguientemente a un portaobjetos revestido con adhesivo. Los portaobjetos se conservan a 80ºC hasta su uso, luego se fijan con acetona durante 30 segundos a 1 minuto y se secan al aire durante 30 minutos. Los núcleos se someten a una contratinción con 50 ng de DAPI (Molecular Probes).
25 Los ratones homocigóticos con el gen C5aR activado desarrollan una enfermedad inflamatoria.
Para inducir una enfermedad inflamatoria los ratones homocigóticos con el gen C5aR humano activado (respecto al C57BL/6) y los ratones de tipo natural/de control (C57BL/6) fueron inyectados con suero de K/BxN. Estudios previos han determinado la dosis óptima de suero requerida y el lapso de tiempo esperado para la inflamación en el modelo K/BxN de la artritis reumatoide. En este experimento todos los ratones fueron inyectados i.p. con 2 lotes de 150 µl de
30 suero recogido de ratones K/BxN artríticos. Se esperaba que los ratones de tipo natural mostrarían signos de inflamación a los 4 de la inyección del suero.
Los autores del presente invento también esperaban que los ratones con el gen C5aR humano activado mostraran signo de inflamación si se expresa el gen hC5aR y la proteína receptora se procesa correctamente y se acopla al sistema de señalización de la proteína G. En primer lugar, la afinidad de la C5a humana por el receptor de la C5a en 35 células de ratón y humanas es muy similar (Woodruff et al., 2001, Inflammation, v25, pp.171-177) lo que sugiere que la afinidad del C5aR de ratón por el receptor de la C5a humana sería similar a su afinidad por el C5aR de ratón. En segundo lugar, los estudios con ratones deficientes en C5aR han mostrado que la ausencia de C5aR impide la inflamación en el modelo K/BxN (Ji et al., 2002, Immunity, v16, pp.157-168). Por tanto, si el gen C5aR humano no se expresó o el receptor C5aR humano no estaba funcionando correctamente entonces los ratones homocigóticos con
40 hC5aR no mostraría signos de inflamación después de la inyección de suero de K/BxN.
En este modelo los signos clínicos externos de inflamación son edema y enrojecimiento de las patas, particularmente las patas traseras. Antes y cada día después de la inyección del suero se pesaron los ratones y se midieron los grosores de sus tobillos traseros, y se realizó una puntuación clínica como se ha descrito antes. La Figura 6 muestra el aumento en el grosor de los tobillos y la puntuación clínica para ratones de tipo natural y homocigóticos a los que
45 se ha inyectado el suero de K/BxN El progreso de la enfermedad en los ratones homocigóticos con el gen hC5aR activado fue el mismo que en los ratones de control con inflamación aparente que comenzaba el día 3 después de la inyección de suero. Esto demuestra que es normal la expresión y procesamiento del receptor de la C5a humana en los ratones con el gen activado.
El examen histológico del corte transversal de los tobillos de ratones realizado el día 13 después de la inyección del
50 suero en este modelo revela erosión ósea e infiltración de leucocitos en la articulación sinovial. El grado de la destrucción de tejidos y la acumulación de leucocitos fueron similares en los ratones homocigóticos con el gen hC5aR activado y los ratones de control (los datos no se muestran).
Los ratones homocigóticos con el gen C5aR humano activado se pueden usar para analizar compuestos con propiedades anti-inflamatorias.
Los ratones con el gen C5aR humano activado fueron desarrollados como una herramienta útil para cribar compuestos anti-C5aR humano con actividad anti-inflamatoria. Para analizar la utilidad de los ratones se administró tanto a
5 los ratones homocigóticos con hC5aR como a los de tipo natural (de control) un anticuerpo específico para el C5aR humano (que no se une al C5aR de ratón) o un anticuerpo de control (del mismo isotipo pero especificidad irrelevante) en el modelo K/BxN y se determinó el efecto del anticuerpo sobre el progreso de la enfermedad inflamatoria. El anticuerpo se inyectó i.p. dos veces (200 µg por dosis), un día antes y un día después de la primera inyección de suero de K/BxN. Los ratones fueron monitorizados como se ha descrito antes.
10 La Figura 7 muestra el progreso clínico de la enfermedad y el engrosamiento de los tobillos en ratones en el curso del experimento. Los ratones homocigóticos con hC5aR activado inyectados con anticuerpo de control desarrollaron hinchazón y otros signos de inflamación. En contraste, los ratones con el gen hC5aR activado inyectados con el anticuerpo 7F3 anti-C5aR humano no desarrollaron signos clínicos de inflamación. Los ratones de control (de tipo natural) tratados con 7F3 desarrollaron inflamación como se pone de manifiesto por el aumento del grosor de sus
15 tobillos - como era de esperar, puesto que el 7F3 se une específicamente al C5aR humano y no se une al C5aR de ratón.
Además, el análisis histológico reveló que los ratones inyectados con el anticuerpo anti-C5aR humano no presentaban daño en los tejidos - la arquitectura de la articulación sinovial parecía normal sin signos de erosión ósea ni excesiva infiltración de leucocitos – cuando se compararon con los tobillos de ratones inyectados con el anticuerpo de
20 control (datos no mostrados).
Estos datos muestran claramente que los ratones con el gen C5aR humano activado son útiles para analizar compuestos con actividad anti-inflamatoria en modelos de enfermedades inflamatorias.
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<210> 1
<211> 21005
<212> DNA
<213> Mus musculus
<220>
<221> característica miscelánea
<222> (5484)..(5484)
<223> n = un número de nucleótidos desconocidos, datos disponibles de mouse locus sugieren aproximadamente 626 nucleótidos de longitud
<220>
<221> característica miscelánea
<222> (7392)..(7392)
<223> n = un número de nucleótidos desconocidos, datos disponibles de mouse locus sugieren aproximadamente 100 nucleótidos de longitud
<220>
<221> característica miscelánea
<222> (9861)..(9861)
<223> n = un número de nucleótidos desconocidos, datos disponibles de mouse locus sugieren aproximadamente 233 nucleótidos de longitud
<400> 1
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<211> 2328 <212> DNA
<213> Homo sapiens
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<223> Cebador 46
<400> 4
- tggactacag ccacgacaaa cg
- 22
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- <220>
- <223> Cebador
- <400> 7
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- 18
Claims (17)
- REIVINDICACIONES
- 1.
- Un ratón con un gen activado, que comprende un polinucleótido que codifica un C5aR humanizado, en donde el exón endógeno 3 del locus C5aR de ratón ha sido reemplazado por una secuencia correspondiente que codifica un C5aR humano.
-
- 2.
- Un ratón con un gen activado de acuerdo con la reivindicación 1, en donde el exón endógeno 3 del locus C5aR de ratón ha sido reemplazado por medio de una recombinación homóloga dirigida a la diana por la secuencia correspondiente que codifica el C5aR humano.
-
- 3.
- Un ratón con un gen activado de acuerdo con la reivindicación 1 o la reivindicación 2, en donde el polinucleótido codifica un polipéptido que comprende una secuencia como la mostrada en la SEQ ID NO: 3 o una de sus variantes alélicas.
-
- 4.
- Un ratón con un gen activado de acuerdo con la reivindicación 1 o la reivindicación 2, en donde el polinucleótido comprende una secuencia como la mostrada en la SEQ ID NO:2 o una de sus variantes alélicas.
-
- 5.
- Una (o varias) célula(s) aislada(s), una línea celular, un tejido o u órgano obtenidos del ratón con un gen activado de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, comprendiendo la(s) célula(s) asilada(s), la línea celular, el tejido o el órgano un polinucleótido que codifica un C5aR humanizado.
-
- 6.
- Un método para producir un ratón con un gen activado para analizar compuestos para un efecto sobre un fenotipo asociado con la señalización del C5aR, que comprende reemplazar el exón endógeno 3 del locus C5aR de ratón por una secuencia correspondiente que codifica el C5aR humano.
-
- 7.
- Un método de acuerdo con la reivindicación 6, en donde el exón endógeno 3 del locus C5aR de ratón es reemplazad por medio de una recombinación homóloga dirigida a la diana por la secuencia correspondiente que codifica el C5aR humano.
-
- 8.
- Un método de acuerdo con la reivindicación 6 o la reivindicación 7, en donde una construcción polinucleotídica del genoma de ratón con un gen activado con un exón 3 reemplazado codifica un polipéptido que comprende una secuencia como la mostrada en la SEQ ID NO:3 o una de sus variantes alélicas.
-
- 9.
- Un método de acuerdo con la reivindicación 6 o la reivindicación 7, en donde una construcción polinucleotídica del genoma de ratón con un gen activado con un exón 3 reemplazado comprende una secuencia como la mostrada en la SEQ ID NO:2 o una de sus variantes alélicas.
- 10.Un método para evaluar al menos un efecto farmacocinético y/o farmacodinámico de un compuesto candidato, que comprende administrar un compuesto candidato a un ratón con un gen activado de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 o a un tejido o células aislados del mismo, y examinar al menos un efecto farmacocinético y/o farmacodinámico del compuesto candidato en el ratón con un gen activado.
-
- 11.
- Un método de acuerdo con la reivindicación 10, en donde al menos uno de los efectos farmacocinéticos examinados es volumen de distribución, depuración total, unión a proteínas, unión a tejidos, depuración metabólica, depuración renal, depuración hepática, depuración bilial, absorción intestinal, biodisponibilidad, biodisponibilidad relativa, depuración intrínseca, tiempo medio de permanencia, tasa máxima de rnetabolismo, constante de Michaelis-Menten, coeficientes de reparto entre tejidos y sangre o plasma, fracción excretada inalterada en orina, fracción de fármaco convertido sistemáticamente en metabolitos, constante de la velocidad de eliminación, semi-vida o depuración de la secreción.
-
- 12.
- Un método de acuerdo con la reivindicación 10, en donde al menos uno de los efectos farmacodinámicos es la modulación de un fenotipo asociado con la señalización de C5aR.
-
- 13.
- Un método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 10 a 12, que comprende (i) administrar un compuesto candidato a un ratón con un gen activado de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4
o a un tejido o a células aislados obtenidos del mismo en condiciones en las que se exprese al menos un fenotipo asociado con la señalización de C5aR; y (ii) monitorizar el desarrollo de al menos un fenotipo después de la administración del compuesto. -
- 14.
- Un método de acuerdo con la reivindicación 13, que comprende además: (iii) comparar la extensión del fenotipo en el ratón con un gen activado o en las células derivadas del mismo, al cual se administró el compuesto, con la de un mamífero o células derivadas del mismo de control, en donde una diferencia en la naturaleza o extensión del fenotipo cuando se compara con el mamífero de control indica el potencial del compuesto para modular la actividad del C5aR.
-
- 15.
- Un método de acuerdo con la reivindicación 12, que comprende: (i) administrar un compuesto candidato a un ratón con un gen activado de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 o un tejido o a células aislados obtenidos del mismo en condiciones en las se exprese que al menos un fenotipo asociado con la señalización del
C5aR; (ii) monitorizar el desarrollo de al menos uno de los fenotipos después de la administración del compuesto; y opcionalmente (iii) comparar la extensión del fenotipo en el ratón con un gen activado, al cual se administró el compuesto, con la de un mamífero de control, en donde una reducción o inhibición en la naturaleza o extensión del fenotipo cuando se compara con el mamífero de control indica el potencial del compuesto para inhibir o reducir la activi5 dad del C5aR. - 16. Un método de acuerdo con la reivindicación 12, que comprende: (i) administrar un compuesto candidato a un ratón con un gen activado de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 o a un tejido o a células aislados obtenidos del mismo, en condiciones en las que se exprese al menos un fenotipo asociado con la señalización del C5aR; (ii) monitorizar el desarrollo de al menos uno de los fenotipos después de la administración del compues10 to; y opcionalmente (iii) comparar la extensión del fenotipo en el ratón con un gen activado, al cual se administró el compuesto, con la de un mamífero de control, en donde una potenciación en la naturaleza o extensión del fenotipo cuando se compara con el mamífero de control indica el potencial del compuesto para promover o potenciar la actividad del C5aR.
- 17. Un método de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 10 a 16, en donde el compuesto se se15 lecciona del grupo que consiste en: un péptido, incluyendo un péptido derivado del C5aR o de la C5a u otro péptido no C5aR y capaz de inhibir, reducir o reprimir una función del C5aR y un mutante dominante-negativo del C5aR; un inhibidor no peptídico del C5aR; un anticuerpo o fragmento de anticuerpo que se une al C5aR e inhibe una función del C5aR; una molécula orgánica pequeña, un ácido nucleico que codifica dicho péptido derivado del C5aR o de la C5a u otro inhibidor peptídico que no es C5aR, un ácido nucleico antisentido dirigido contra el mRNA que codifica el20 C5aR, una ribozima anti-C5aR y un pequeño RNA de interferencia (RNAi) que tiene como diana la expresión del gen C5aR.
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