ES2476919T3 - Identificación, optimización y utilización de ep�topos crípticos HLA-B7 para inmunoterapia - Google Patents
Identificación, optimización y utilización de ep�topos crípticos HLA-B7 para inmunoterapia Download PDFInfo
- Publication number
- ES2476919T3 ES2476919T3 ES07825358.0T ES07825358T ES2476919T3 ES 2476919 T3 ES2476919 T3 ES 2476919T3 ES 07825358 T ES07825358 T ES 07825358T ES 2476919 T3 ES2476919 T3 ES 2476919T3
- Authority
- ES
- Spain
- Prior art keywords
- hla
- peptide
- restricted
- cryptic
- seq
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 241000251221 Triakidae Species 0.000 title claims description 8
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 title claims description 7
- 108010091938 HLA-B7 Antigen Proteins 0.000 title description 9
- 238000005457 optimization Methods 0.000 title description 4
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 243
- 108010058607 HLA-B Antigens Proteins 0.000 claims abstract description 112
- 102000006390 HLA-B Antigens Human genes 0.000 claims abstract 12
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims abstract 3
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 141
- 102100028976 HLA class I histocompatibility antigen, B alpha chain Human genes 0.000 claims description 106
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 45
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 claims description 39
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 21
- 241001669573 Galeorhinus galeus Species 0.000 claims description 17
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 claims description 17
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims description 16
- 230000028993 immune response Effects 0.000 claims description 14
- 238000009472 formulation Methods 0.000 claims description 10
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 9
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 9
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 9
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 9
- 101100395311 Homo sapiens HLA-B gene Proteins 0.000 claims description 6
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims description 6
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 5
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 claims description 4
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 claims description 3
- 108091006116 chimeric peptides Proteins 0.000 claims description 2
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 claims description 2
- 230000003449 preventive effect Effects 0.000 claims description 2
- 238000010254 subcutaneous injection Methods 0.000 claims description 2
- 239000007929 subcutaneous injection Substances 0.000 claims description 2
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 53
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 51
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 40
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 39
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 35
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 27
- 238000000034 method Methods 0.000 description 19
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 15
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 14
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 14
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 13
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 description 12
- 101150029707 ERBB2 gene Proteins 0.000 description 11
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 description 11
- 241000699660 Mus musculus Species 0.000 description 10
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 10
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 9
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 9
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 9
- 101100314454 Caenorhabditis elegans tra-1 gene Proteins 0.000 description 7
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 7
- 101100507655 Canis lupus familiaris HSPA1 gene Proteins 0.000 description 6
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 6
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 6
- 102000008949 Histocompatibility Antigens Class I Human genes 0.000 description 5
- 108010088652 Histocompatibility Antigens Class I Proteins 0.000 description 5
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 5
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 5
- 108091008874 T cell receptors Proteins 0.000 description 5
- 102000016266 T-Cell Antigen Receptors Human genes 0.000 description 5
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 5
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 5
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 5
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 5
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 5
- 101001012157 Homo sapiens Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Proteins 0.000 description 4
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 4
- 102100030086 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Human genes 0.000 description 4
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 4
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 4
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 4
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 4
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 4
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 description 4
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 4
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 4
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 4
- 210000004989 spleen cell Anatomy 0.000 description 4
- 101150024496 APX3 gene Proteins 0.000 description 3
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 3
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 101000614481 Homo sapiens Kidney-associated antigen 1 Proteins 0.000 description 3
- 102100040442 Kidney-associated antigen 1 Human genes 0.000 description 3
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000012980 RPMI-1640 medium Substances 0.000 description 3
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 238000004873 anchoring Methods 0.000 description 3
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 3
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 3
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 3
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 3
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 3
- 102100025570 Cancer/testis antigen 1 Human genes 0.000 description 2
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 2
- 108010055196 EphA2 Receptor Proteins 0.000 description 2
- 102100030340 Ephrin type-A receptor 2 Human genes 0.000 description 2
- 102100028972 HLA class I histocompatibility antigen, A alpha chain Human genes 0.000 description 2
- 108010075704 HLA-A Antigens Proteins 0.000 description 2
- 101000856237 Homo sapiens Cancer/testis antigen 1 Proteins 0.000 description 2
- 101001014223 Homo sapiens MAPK/MAK/MRK overlapping kinase Proteins 0.000 description 2
- 101000880770 Homo sapiens Protein SSX2 Proteins 0.000 description 2
- 102100031520 MAPK/MAK/MRK overlapping kinase Human genes 0.000 description 2
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 2
- 102100037686 Protein SSX2 Human genes 0.000 description 2
- 239000006146 Roswell Park Memorial Institute medium Substances 0.000 description 2
- 230000001464 adherent effect Effects 0.000 description 2
- 230000030741 antigen processing and presentation Effects 0.000 description 2
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 238000009566 cancer vaccine Methods 0.000 description 2
- 229940022399 cancer vaccine Drugs 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 2
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 2
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 2
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 2
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 2
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 2
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 2
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 2
- 238000010212 intracellular staining Methods 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 108091005601 modified peptides Proteins 0.000 description 2
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 2
- 230000004044 response Effects 0.000 description 2
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 2
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 2
- BFSVOASYOCHEOV-UHFFFAOYSA-N 2-diethylaminoethanol Chemical compound CCN(CC)CCO BFSVOASYOCHEOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 108020000946 Bacterial DNA Proteins 0.000 description 1
- 108010077805 Bacterial Proteins Proteins 0.000 description 1
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 101710163595 Chaperone protein DnaK Proteins 0.000 description 1
- 241001227713 Chiron Species 0.000 description 1
- 206010009944 Colon cancer Diseases 0.000 description 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 102000004457 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Human genes 0.000 description 1
- 108010017213 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 1
- 101710178376 Heat shock 70 kDa protein Proteins 0.000 description 1
- 101710152018 Heat shock cognate 70 kDa protein Proteins 0.000 description 1
- XQFRJNBWHJMXHO-RRKCRQDMSA-N IDUR Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C(I)=C1 XQFRJNBWHJMXHO-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 1
- 101150106931 IFNG gene Proteins 0.000 description 1
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 1
- 108090000978 Interleukin-4 Proteins 0.000 description 1
- 108090001005 Interleukin-6 Proteins 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 229930182816 L-glutamine Natural products 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- SNDPXSYFESPGGJ-UHFFFAOYSA-N L-norVal-OH Natural products CCCC(N)C(O)=O SNDPXSYFESPGGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 241000186779 Listeria monocytogenes Species 0.000 description 1
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 108700018351 Major Histocompatibility Complex Proteins 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- UEQUQVLFIPOEMF-UHFFFAOYSA-N Mianserin Chemical compound C1C2=CC=CC=C2N2CCN(C)CC2C2=CC=CC=C21 UEQUQVLFIPOEMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010093369 Multienzyme Complexes Proteins 0.000 description 1
- 102000002568 Multienzyme Complexes Human genes 0.000 description 1
- 108091061960 Naked DNA Proteins 0.000 description 1
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 1
- 206010057249 Phagocytosis Diseases 0.000 description 1
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 1
- 108091036414 Polyinosinic:polycytidylic acid Proteins 0.000 description 1
- 208000037062 Polyps Diseases 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000004245 Proteasome Endopeptidase Complex Human genes 0.000 description 1
- 108090000708 Proteasome Endopeptidase Complex Proteins 0.000 description 1
- 208000006265 Renal cell carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 230000005867 T cell response Effects 0.000 description 1
- 102100040247 Tumor necrosis factor Human genes 0.000 description 1
- 241000700618 Vaccinia virus Species 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 108700025316 aldesleukin Proteins 0.000 description 1
- -1 aliphatic amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 108010004469 allophycocyanin Proteins 0.000 description 1
- 229940037003 alum Drugs 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 230000000840 anti-viral effect Effects 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 210000000612 antigen-presenting cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KQNZDYYTLMIZCT-KQPMLPITSA-N brefeldin A Chemical compound O[C@@H]1\C=C\C(=O)O[C@@H](C)CCC\C=C\[C@@H]2C[C@H](O)C[C@H]21 KQNZDYYTLMIZCT-KQPMLPITSA-N 0.000 description 1
- JUMGSHROWPPKFX-UHFFFAOYSA-N brefeldin-A Natural products CC1CCCC=CC2(C)CC(O)CC2(C)C(O)C=CC(=O)O1 JUMGSHROWPPKFX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002619 cancer immunotherapy Methods 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 1
- 230000009709 cytosolic degradation Effects 0.000 description 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 1
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000014828 interferon-gamma production Effects 0.000 description 1
- PGHMRUGBZOYCAA-ADZNBVRBSA-N ionomycin Chemical compound O1[C@H](C[C@H](O)[C@H](C)[C@H](O)[C@H](C)/C=C/C[C@@H](C)C[C@@H](C)C(/O)=C/C(=O)[C@@H](C)C[C@@H](C)C[C@@H](CCC(O)=O)C)CC[C@@]1(C)[C@@H]1O[C@](C)([C@@H](C)O)CC1 PGHMRUGBZOYCAA-ADZNBVRBSA-N 0.000 description 1
- PGHMRUGBZOYCAA-UHFFFAOYSA-N ionomycin Natural products O1C(CC(O)C(C)C(O)C(C)C=CCC(C)CC(C)C(O)=CC(=O)C(C)CC(C)CC(CCC(O)=O)C)CCC1(C)C1OC(C)(C(C)O)CC1 PGHMRUGBZOYCAA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 1
- 239000000644 isotonic solution Substances 0.000 description 1
- 238000011813 knockout mouse model Methods 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 239000006193 liquid solution Substances 0.000 description 1
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 239000011325 microbead Substances 0.000 description 1
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 230000035407 negative regulation of cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000816 peptidomimetic Substances 0.000 description 1
- 230000008782 phagocytosis Effects 0.000 description 1
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 1
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 1
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 1
- 229940087463 proleukin Drugs 0.000 description 1
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 description 1
- 230000002035 prolonged effect Effects 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 1
- 239000001397 quillaja saponaria molina bark Substances 0.000 description 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 1
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000005070 ripening Effects 0.000 description 1
- 102220047090 rs6152 Human genes 0.000 description 1
- 229930182490 saponin Natural products 0.000 description 1
- 150000007949 saponins Chemical class 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 230000002269 spontaneous effect Effects 0.000 description 1
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 230000010474 transient expression Effects 0.000 description 1
- 108010055094 transporter associated with antigen processing (TAP) Proteins 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001493 tyrosinyl group Chemical group [H]OC1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 1
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 1
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
- 230000003442 weekly effect Effects 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/0005—Vertebrate antigens
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/04—Peptides having up to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/0005—Vertebrate antigens
- A61K39/0011—Cancer antigens
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K40/00—Cellular immunotherapy
- A61K40/10—Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
- A61K40/11—T-cells, e.g. tumour infiltrating lymphocytes [TIL] or regulatory T [Treg] cells; Lymphokine-activated killer [LAK] cells
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K40/00—Cellular immunotherapy
- A61K40/40—Cellular immunotherapy characterised by antigens that are targeted or presented by cells of the immune system
- A61K40/41—Vertebrate antigens
- A61K40/42—Cancer antigens
- A61K40/4244—Enzymes
- A61K40/4246—Telomerase or [telomerase reverse transcriptase [TERT]
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/04—Immunostimulants
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4748—Tumour specific antigens; Tumour rejection antigen precursors [TRAP], e.g. MAGE
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
- C07K14/70539—MHC-molecules, e.g. HLA-molecules
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
- C07K7/06—Linear peptides containing only normal peptide links having 5 to 11 amino acids
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/54—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the route of administration
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/545—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the dose, timing or administration schedule
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/57—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the type of response, e.g. Th1, Th2
- A61K2039/572—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the type of response, e.g. Th1, Th2 cytotoxic response
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2740/00—Reverse transcribing RNA viruses
- C12N2740/00011—Details
- C12N2740/10011—Retroviridae
- C12N2740/16011—Human Immunodeficiency Virus, HIV
- C12N2740/16111—Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV env
- C12N2740/16122—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2740/00—Reverse transcribing RNA viruses
- C12N2740/00011—Details
- C12N2740/10011—Retroviridae
- C12N2740/16011—Human Immunodeficiency Virus, HIV
- C12N2740/16211—Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV gagpol
- C12N2740/16222—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2740/00—Reverse transcribing RNA viruses
- C12N2740/00011—Details
- C12N2740/10011—Retroviridae
- C12N2740/16011—Human Immunodeficiency Virus, HIV
- C12N2740/16311—Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV regulatory proteins
- C12N2740/16322—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Oncology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Zoology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Virology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
Abstract
Epítopo críptico restringido por HLA-B*0702, que es un péptido seleccionado del grupo que comprende APRSPLAPS (ID. SEC. No. 2), SPKANKEIL (ID. SEC. No. 3), GPKHSDCLA (ID. SEC. No. 4).
Description
Identificaci�n, optimización y utilización de ep�topos crípticos HLA-B7 para inmunoterapia
La presente invención se refiere al sector de la inmunoterapia de p�ptidos. En particular, la presente invención da a conocer nuevos procedimientos y materiales para tratar eficazmente pacientes que tienen un fenotipo HLA-B*0702.
La inmunoterapia es un enfoque terapéutico que actualmente es objeto de un gran interés en el contexto del tratamiento del cáncer. El principio de la misma se basa en la inmunizaci�n con p�ptidos que reproducen ep�topos de células T de ant�genos tumorales reconocidos por los linfocitos T citot�xicos (CTL) que juegan un papel importante en la eliminación de las células tumorales.
Cabe recordar que los CTL no reconocen ant�genos proteicos enteros, sino fragmentos pept�dicos de los mismos, que comprenden en general de 8 a 11 amino�cidos, que presentan las moléculas del complejo mayor de histocompatibilidad de clase I (MHC I) expresadas en la superficie de las células. La presentación de estos p�ptidos es el resultado del procesamiento de ant�genos que consta de tres etapas:
- -
- degradaci�n citos�lica del ant�geno por un complejo multienzim�tico denominado proteosoma -translocaci�n de los p�ptidos derivados de esta degradación en el retículo endoplasm�tico (ER) por los transportadores TAP -asociación de estos p�ptidos con las moléculas del MHC I y la exportación de los complejos p�ptido/MHC I a la superficie celular
Los complejos p�ptido/MHC I interact�an con el receptor específico de células T (TCR) en los CTL induciendo la estimulaci�n y la amplificación de estos CTL que se vuelven capaces de atacar a las células diana que expresan el ant�geno del que se deriva el p�ptido.
Durante el procesamiento de los ant�genos, se lleva a cabo una selección de p�ptidos, lo que da como resultado una jerarquía de presentación de p�ptidos. Los p�ptidos que las moléculas del MHC I presentan preferentemente son denominados inmunodominantes mientras que los p�ptidos que presentan débilmente se denominan crípticos. Los p�ptidos inmunodominantes exhiben una elevada afinidad por el MHC I y son inmunog�nicos, mientras que los p�ptidos crípticos muestran una baja afinidad por el MHC I y son no inmunog�nicos.
Los p�ptidos inmunodominantes han sido determinados ampliamente como el objetivo de vacunas contra el cáncer en estudios precl�nicos y cl�nicos con resultados decepcionantes (Bowne y otros, 1999; Colella y otros, 2000; Gross y otros, 2004; Hawkins y otros, 2000; Naftzger y otros, 1996; Overwijk y otros, 1998; Vierboom y otros, 1997; Weber y otros, 1998).
Los ant�genos tumorales frecuentemente son proteínas propias sobreexpresadas por los tumores y expresadas a niveles más bajos por las células y tejidos normales. El sistema inmunol�gico es incapaz de reaccionar contra estos ant�genos propios debido al proceso de la autotolerancia. La autotolerancia concierne principalmente a los p�ptidos inmunodominantes (Cibotti y otros, 1992; Gross y otros, 2004; Hernández y otros, 2000; Theobald y otros, 1997) explicando de este modo la incapacidad de estos p�ptidos para inducir una inmunidad tumoral.
Los p�ptidos crípticos est�n mucho menos involucrados en el proceso de la autotolerancia (Anderton y otros, 2002; Boisg�rault y otros, 2000; Cibotti y otros, 1992; Friedman y otros, 2004; Gross y otros, 2004; Moudgil y otros, 1999; Overwijk y otros, 2003; Sinha y otros, 2004) y, por lo tanto, pueden inducir una inmunidad tumoral eficiente siempre que se mejore su inmunogenicidad (Disis y otros, 2002; Dyall y otros, 1998; Engelhorn y otros, 2006; Gross y otros, 2004; Grossmann y otros, 2001; Lally y otros, 2001; Moudgil y Sercarz, 1994a; Moudgil y Sercarz, 1994b; Palomba y otros, 2005).
La estrategia habitual para potenciar la inmunogenicidad de p�ptidos crípticos, que debido a su baja afinidad por MHC I son no inmunog�nicos, comprende el aumento de su afinidad por las moléculas del MHC I a través de sustituciones de amino�cidos. La afinidad de los p�ptidos por las moléculas del MHC I depende principalmente de la presencia en posiciones bien definidas (posiciones de anclaje primario) de residuos llamados “residuos de anclaje primario”. Estos residuos son específicos de alelo de MHC I. Aunque a menudo necesaria, la presencia de residuos de anclaje primarios no es suficiente para asegurar una elevada afinidad por el MHC I. Se ha demostrado que los residuos situados fuera de las posiciones de anclaje primarias (residuos de anclaje secundario) pueden ejercer un efecto favorable o desfavorable sobre la afinidad del p�ptido por el MHC I. La presencia de estos residuos de anclaje secundarios hace que sea posible explicar la existencia de una gran variabilidad en la afinidad de unión, dentro de los p�ptidos que tienen los motivos de anclaje primarios.
Las sustituciones de amino�cidos dirigidas a la mejora de la afinidad por las moléculas del MHC I deberían conservar la antigenicidad de estos p�ptidos optimizados. Los CTL generados por p�ptidos optimizados deben reaccionar de forma cruzada con los correspondientes p�ptidos nativos.
Muchos equipos de investigación han tenido éxito en mejorar adicionalmente la inmunogenicidad de p�ptidos ya inmunog�nicos mediante el aumento de su afinidad por HLA-A*0201 (Bakker y otros, 1997; Parkhurst y otros, 1996; Sarobe y otros, 1998; Valmori y otros, 1998). Los presentes inventores han descrito anteriormente una estrategia general para mejorar la afinidad y la inmunogenicidad de p�ptidos crípticos restringidos por HLA-A*0201 (Scardino y otros, 2002; Tourdot y otros, 2000).
HLA-B*0702 es una molécula expresada frecuentemente (25% de la población). Por lo tanto, la identificación y optimización de p�ptidos crípticos tumorales restringidos por HLA-B*0702, deben ser necesarias a efectos de desarrollar vacunas eficientes contra el cáncer para pacientes que expresan HLA-B*0702.
Hasta la fecha, se han descrito pocos p�ptidos tumorales presentados por HLA-B*0702. Dos p�ptidos derivados de los ant�genos CEA (CEA632) (Lu y otros 2000) y TERT (TERT1123) (Cortez-Gonzales y otros, 2006) han sido identificados; estos p�ptidos mostraron una fuerte afinidad de unión por HLA-B*0702 y fueron inmunog�nicos tanto en HLA-B*0702 de ratones transg�nicos como en pruebas in vitro con células humanas. Estos resultados experimentales muestran que estos p�ptidos son p�ptidos inmunodominantes.
Dos p�ptidos adicionales derivados de MAGE-A1 (MAGE-A1289) (Luiten y otros, 2000) y RU2 (un nuevo ant�geno expresado por el carcinoma de células renales) (Van den Eynde y otros, 1999) se han identificado como objetivos de CTL de HLA-B*0702 que habían sido aislados a partir de pacientes con cáncer. Aunque no existe información acerca de la afinidad por HLA-B*0702 de estos dos p�ptidos, podemos considerarlos inmunodominantes porque los CTL desarrollados en pacientes con cáncer est�n siempre dirigidos contra p�ptidos inmunodominantes.
Tal como se describe a continuación en la parte experimental, los presentes inventores han encontrado ahora una estrategia general para aumentar la afinidad y la inmunogenicidad de un ep�topo críptico restringido por HLAB*0702.
La presente memoria descriptiva describe un procedimiento para aumentar la inmunogenicidad de un ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702, que comprende una etapa de sustitución de un residuo del extremo N terminal de dicho ep�topo con una alanina (A), o de sustitución del residuo del extremo C terminal con una leucina (L).
A continuación, la frase "ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702" se utilizar� para designar un p�ptido que tiene de 8 a 11 amino�cidos, más preferentemente 9 � 10 amino�cidos, que muestra una baja afinidad por HLA-B*0702, es no inmunog�nico y tiene la secuencia de X1PX3X4X5X6X7XSXPX10X11 (ID. SEC. No. 58), en la que P es prolina, X3 es R (arginina) o K (lisina) o H (histidina) o M (metionina), X1 y X4 a X7 son independientemente cualquier amino�cido, X8 a X10 son independientemente cualquier amino�cido o ninguno, y el amino�cido X11 del extremo C terminal es cualquier amino�cido con la condición de que si el amino�cido del extremo N terminal X1 es A (alanina) entonces, X11 no es ni L (leucina) ni A, ni I (isoleucina), ni V (valina), y no es M, y si X1 es un amino�cido distinto de A, entonces X11 es L o A o I o V o M.
En la presente memoria descriptiva, el término "p�ptido" designa no sólo a moléculas en las que residuos de amino�cidos est�n unidos por enlaces pept�dicos (-CO-NH-), sino también a pseudop�ptidos sintéticos o peptidomim�ticos en los que se modifica el enlace pept�dico, especialmente para hacerlos más resistentes a la prote�lisis, y siempre que su inmunogenicidad no se vea afectada por esta modificación.
En la presente memoria descriptiva, los residuos de amino�cidos se designan por sus códigos de letras.
Tal como se utiliza en la presente memoria descriptiva, la palabra "sustitución" se debe entender como la obtención de un p�ptido cuya secuencia se deriva de la secuencia de dicho ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702 mediante la sustitución mencionada, cuando la secuencia de amino�cidos de dicho ep�topo críptico restringido no contiene el amino�cido apropiado, cualquiera que sea el procedimiento técnico utilizado para obtener dicho p�ptido. Por ejemplo, el p�ptido se puede producir mediante síntesis artificial de p�ptidos o mediante expresión recombinante.
La afinidad de un p�ptido por el HLA-B*0702 se puede determinar por procedimientos conocidos en la técnica, por ejemplo mediante el ensayo descrito por Rohrlich y otros, 2003. Los resultados se expresan como la afinidad relativa (AR) cuando se compara con un p�ptido de referencia. Según este procedimiento, se dice que un p�ptido tiene una baja afinidad por HLA-B*30702 cuando AR es mayor que 10. Por lo tanto, se considera que p�ptidos con AR mayor que 10 son p�ptidos crípticos (o ep�topos):
Tal como se utiliza en la presente memoria descriptiva, el término "no inmunog�nico" se refiere a un p�ptido incapaz de iniciar una respuesta inmune de CTL restringidos por HLA-B*0702 cuando se administra a un sujeto que expresa HLA-B*0702 (incluyendo un animal transg�nico HLA-B*0702).
En otra realización, la inmunogenicidad de un ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702 en el que el segundo y tercer residuo de amino�cido es PR o PK o PH o PM y el último residuo es L o A o I o V o M, se puede aumentar
mediante la sustitución de su primer amino�cido por una A (alanina). De hecho, cuando la secuencia del ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702 seleccionado es X1PX3X4X5X6X7X8X9X10X11 (ID. SEC. No. 59), en la que el amino�cido X1 del extremo N terminal es cualquier amino�cido excepto A, X3 es R o K o H o M, el amino�cido X11 del extremo C terminal es L o A o I o V o M, X4 a X7 son, independientemente, cualquier amino�cido, y X8 a X10 son independientemente cualquier amino�cido o ninguno, la sustitución de X1 por A es suficiente para aumentar su inmunogenicidad.
En otra realización adicional, la inmunogenicidad de ep�topos crípticos restringidos por HLA-B*0702 en los que los tres primeros residuos de amino�cidos son APX3 (en el que X3 es R o K o H o M) se puede incrementar mediante la sustitución de su último amino�cido por una L (o mediante la adición de una leucina en su extremo C terminal, siempre que la secuencia de amino�cidos de dicho ep�topo después de haber añadido la leucina no sea más larga que 11 amino�cidos). De hecho, cuando la secuencia del ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702 seleccionado es APX3X4X5X6X7X8X9X10X11 (ID. SEC. No. 60), en la que X3 es R o K o H o M, X4 a X7 son independientemente, cualquier amino�cido, X8 a X10 son independientemente cualquier amino�cido o ninguno, y el amino�cido X11 del extremo C terminal es un amino�cido distinto a L o A o I o V o M, la sustitución de X11 por L es suficiente para aumentar su inmunogenicidad.
A continuación, la expresión "p�ptido optimizado" designa un p�ptido inmunog�nico derivado de un ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702, mediante los procedimientos anteriores, y que tiene la secuencia general APX3X4X5X6X7X8X9X10X11 (ID. SEC. No. 61), en la que X3 es R o K o H o M, X4 a X7 son independientemente cualquier amino�cido, X8 a X10 son independientemente cualquier amino�cido o ninguno, y el amino�cido X11 del extremo C terminal es L o A o I o V o M.
Los presentes inventores han identificado una serie de ep�topos crípticos restringidos por HLA-B*0702, algunos de ellos se dan a conocer en la Tabla 1 siguiente. En consecuencia, un aspecto de la presente invención es un ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702, seleccionado de entre los p�ptidos de ID. SEC. No. 2 a 4, que se describen en la Tabla 1.
Tabla 1. p�ptidos crípticos restringidos por HLA-B*0702 seleccionados
- Ant�geno
- P�ptido ID. SEC. No.
- TEXT444
- DPRRLVQLL 1
- HER-2/neu
- APRSPLAPS 2
- SPKANKEIL
- 3
- GPKHSCDLA
- 4
Entre los ejemplos de ep�topos inmunog�nicos restringidos por HLA-B*0702 obtenidos según la presente invención est�n los derivados de un ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702 de la ID. SEC. No. 3 o 4, mediante la sustitución de su amino�cido del extremo N terminal con una A (alanina) y los derivados del ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702 de ID. SEC. No. 2 mediante la sustitución de su amino�cido del extremo C terminal con una L (leucina).
Por lo tanto, la presente invención se refiere además a p�ptidos optimizados derivados de los p�ptidos crípticos de ID. SEC. No. 2 a 4, mediante un procedimiento tal como el que se ha descrito anteriormente. Los ejemplos preferentes de p�ptidos optimizados son APRSPLAPL (ID. SEC. No. 6), APKANKEIL (ID. SEC. No. 7) y APKHSCDLA (ID. SEC. No. 8).
La presente invención se refiere además a un polip�ptido quimérico, que comprende dos, tres o más ep�topos crípticos restringidos por HLA-B*0702 seleccionados del grupo que comprende las ID. SEC. No. 1 a 4, o dos, tres o más ep�topos inmunog�nicos restringidos por HLA-B*0702 seleccionados del grupo que comprende APRRLVQLL (ID. SEC. No. 5) y las ID. SEC. No. 6 a 8, tal como se ha descrito anteriormente. En un polip�ptido quimérico según la presente invención, los ep�topos pueden ser diferentes unos de otros, o el mismo ep�topo se puede repetir varias veces (dos, tres o más veces). El técnico en la materia puede elegir cualquier técnica conocida para producir estos polip�ptidos. Por ejemplo, el polip�ptido puede obtenerse por síntesis química, o mediante la utilización de la tecnología de la ingeniería genética.
Otro objetivo de la presente invención es una molécula de ácido nucleico aislada diseñada para causar la expresión de un ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702 seleccionado del grupo que comprende las ID. SEC. No. 2 a 4 o un ep�topo inmunog�nico seleccionado del grupo que comprende las ID. SEC. No. 6 a 8, o un polip�ptido quimérico tal como el que se ha descrito anteriormente. En la presente memoria descriptiva, por "diseñado para causar la expresión de un p�ptido” se entiende que dicho p�ptido se expresa como tal, aislado de todo el ant�geno del que se ha seleccionado su secuencia (y en los casos apropiados, optimizado tal como se ha descrito anteriormente), cuando el ácido nucleico se introduce en una célula apropiada. La región que codifica el ep�topo o polip�ptido quimérico se encuentra normalmente en el polinucle�tido bajo el control de un promotor adecuado. Son preferentes los promotores bacterianos para la expresión en bacterias, que pueden producir el polip�ptido ya sea in vitro o, en circunstancias particulares, in vivo. Un ejemplo de bacteria que se puede utilizar para producir un p�ptido o
polip�ptido según la presente invención, directamente in vivo, es Listeria monocytogenes, que es una bacteria intracelular facultativa que entra en las células presentadoras de ant�geno profesionales mediante fagocitosis activa (Paterson y Maciag, 2005). Alternativamente, un ácido nucleico según la presente invención se puede administrar directamente, utilizando un vector apropiado. En este caso, se puede utilizar un promotor específico de tejido, uno constitutivo fuerte o uno end�geno para controlar la expresión del p�ptido. Entre los sistemas de vectores adecuados se incluyen pl�smidos de ADN desnudo, composiciones de liposomas para mejorar la liberación, y vectores virales que provocan la expresión transitoria. Son ejemplos los adenovirus o vectores de virus vacuna y vectores de la familia de los herpes, especialmente en una forma no replicativa.
Otra realización de la presente invención es una composición farmacéutica que comprende, como mínimo, como un principio activo, un ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702 seleccionado del grupo que comprende las ID. SEC. No. 2 a 4, o un polip�ptido ep�topo inmunog�nico derivado de las mismas tal como se ha mencionado anteriormente,
o un polip�ptido quimérico según la presente invención, o un ácido nucleico que codifica cualquiera de estos y/o un vector que porta dicho ácido nucleico. La formulación de las composiciones farmacéuticas ser� conforme a las normas y técnicas actuales. Medicamentos destinados para la administración humana se pueden preparar adecuadamente en condiciones estériles, en los que el ingrediente o ingredientes activos se combinan con una solución isot�nica u otro vehículo farmacéutico apropiado para la utilización terapéutica recomendada. De forma general, se describen formulaciones y técnicas adecuadas en la última edición de “Ciencias farmacéuticas de Remington” (“Remington’s Pharmaceutical Sciences”) (Maack Publishing Co, Easton PA).
En particular, un ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702, o un polip�ptido ep�topo inmunog�nico derivado del mismo, o un polip�ptido quimérico que porta varios de estos ep�topos inmunog�nicos o crípticos, o un ácido nucleico que codifica cualquiera de estos, incluido o no en un vector, se puede utilizar para la preparación de una composición para inmunoterapia preventiva o curativa, especialmente, para inmunoterapia antiviral o contra el cáncer.
En una realización particular, una composición farmacéutica según la presente invención es una vacuna. En este último caso, las composiciones de la presente invención se pueden combinar con un adyuvante para potenciar la respuesta inmune. Entre los adyuvantes clásicos se incluyen emulsiones de aceite, tal como Adyuvante Incompleto de Freund, y las superficies adherentes tales como el alumbre. Son especialmente útiles los adyuvantes que seleccionan y activan las células dendr�ticas, en particular, a través de TLR (tales como ADN bacteriano o proteínas derivadas de membrana bacteriana) o ayudan a obtener células T citot�xicas. Se pueden incluir además en la composición otros factores que refuerzan la respuesta inmune de otro modo o promueven la apoptosis o la eliminación de las células cancerosas.
Se pueden empaquetar para su distribución por separado o juntas dosis múltiples y/o diferentes combinaciones de las composiciones inmunog�nicas de la presente invención. Cada composición o conjunto de composiciones, tales como los kits de partes que se describen a continuación, se pueden acompañar con las instrucciones escritas (en forma de material promocional o prospecto) con respecto a la utilización de la composición o combinación en la provocación de una respuesta inmune y/o el tratamiento del cáncer.
En una solicitud de patente anterior (documento PCT/EP2006/005325), el presente solicitante ha descrito un protocolo de vacunación que permite el inicio y mantenimiento de una respuesta de células T dirigida hacia ep�topos crípticos. Los resultados dados a conocer en el documento PCT/EP2006/005325 demuestran que la inyección de un p�ptido nativo correspondiente a un ep�topo críptico, seguida de la vacunación con su p�ptido cognado optimizado, puede mantener la respuesta inmune iniciada por dicho p�ptido optimizado.
Por lo tanto, según la presente invención, un ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702 se puede utilizar para la preparación de una composición medicinal para mantener la respuesta inmune de CTL iniciada por su p�ptido cognado optimizado. Un p�ptido inmunog�nico que tiene una secuencia de ep�topo restringido por HLA-B*0702 optimizada derivado de un gen de ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702 se puede utilizar además, para la preparación de una composición medicinal para iniciar una respuesta inmune de CTL contra dicho ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702. La presente invención abarca además un procedimiento para vacunar a un paciente contra un ant�geno tumoral o viral, en el que dicho procedimiento comprende una primera etapa de vacunación con un p�ptido cognado optimizado a un ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702 nativo de dicho ant�geno, seguido de una segunda etapa de vacunación con dicho p�ptido nativo. En este procedimiento, la primera etapa y/o la segunda etapa se pueden realizar mediante la utilización de un polip�ptido quimérico que comprende dos, tres o más p�ptidos optimizados o crípticos tal como los que se han descrito anteriormente, en lugar de p�ptidos de un solo ep�topo.
La presente invención también se refiere a un kit de partes que comprende, en formulaciones separadas, un primer p�ptido que tiene la secuencia de un gen de un ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702 seleccionado del grupo que comprende las ID. SEC. No. 2 a 4, y un segundo p�ptido derivado de dicho primer p�ptido mediante un procedimiento para aumentar su inmunogenicidad, tal como se ha descrito anteriormente.
Otros kits de partes según la presente invención comprenden, como mínimo, un polip�ptido quimérico. Se contemplan varias variantes de estos kits: en una primera realización, el kit comprende, en formulaciones separadas, un primer polip�ptido quimérico que comprende dos, tres o más ep�topos crípticos restringidos por HLA-B*0702 y un segundo polip�ptido quimérico que corresponde a su polip�ptido quimérico cognado inmunog�nico restringido por HLA-B*0702 (lo que significa que comprende ep�topos inmunog�nicos restringidos por HLAB*0702 cognados optimizados a los ep�topos crípticos comprendidos en el primer polip�ptido quimérico). En una segunda realización, el kit comprende un primer polip�ptido quimérico que comprende dos, tres o más ep�topos crípticos restringidos por HLA-B*0702 y en una o varias otras formulaciones separadas, p�ptidos cognados correspondientes a los ep�topos inmunog�nicos restringidos por HLA-B*0702 optimizados para los ep�topos crípticos comprendidos en el primer polip�ptido quimérico. En una tercera realización, el kit comprende dos, tres o más p�ptidos que corresponden ep�topos crípticos restringidos por HLA-B*0702 diferentes, en el que dichos p�ptidos se mezclan bien en una sola formulación, o bien se separan en varias formulaciones y, en formulaciones separadas, un polip�ptido quimérico que comprende el gen de ep�topos cognados inmunog�nicos restringidos por HLA-B*0702 optimizados para dichos p�ptidos crípticos.
En la siguiente descripción de los kits según la presente invención, se har� mención sólo de los p�ptidos (nativos u optimizados), entendiéndose que los polip�ptidos quiméricos (que comprenden ep�topos crípticos nativos o ep�topos optimizados) quedan incluidos dentro de los kits en lugar de los p�ptidos de ep�topo único.
En una realización particular de la presente invención, el kit es un kit de vacunación, en el que dichos primer (nativo) y segundo (cognado optimizado) p�ptido est�n en dosis de vacunación separadas. En una realización preferente, el kit de vacunación comprende 2 � 3 dosis de p�ptido optimizado y 3, 4, 5 � 6 dosis de p�ptido nativo. Un kit de vacunación particular según la presente invención est� adaptado para una primera secuencia de vacunación de 6 inyecciones y comprende 2 � 3 dosis de p�ptido optimizado y 4 � 3 dosis de p�ptido nativo. En caso de enfermedades prolongadas, es preferente mantener el nivel de inmunidad obtenido después de esta primera vacunación, mediante dosis de recuerdo regulares. Esto se puede hacer, por ejemplo, mediante inyecciones realizadas cada 1,5 a 6 meses. Por lo tanto, los kits complementarios, que comprenden al menos 2 dosis, y hasta 40
o 50 dosis de p�ptido nativo, son también parte de la presente invención. Alternativamente, el kit de vacunación puede comprender de 2 a 3 dosis de p�ptido optimizado y 3 a 40 o hasta 50 dosis de p�ptido nativo. Por supuesto, dichos p�ptidos nativo y optimizado presentes en el kit son tal como los que se han descrito anteriormente.
Cada dosis comprende entre 0,5 y 10 mg de p�ptido, preferentemente de 1 a 5 mg, o entre 1 y 20 mg de polip�ptido. En una realización preferente, cada dosis se formula para inyección subcutánea. Por ejemplo, cada dosis se puede formular en 0,3 a 1,5 ml de una emulsión de solución acuosa emulsionada con Montanide, utilizado como un adyuvante. El técnico en la materia puede elegir cualquier otro adyuvante o adyuvantes en lugar del Montanide o además del mismo. En una realización particular, las dosis est�n en forma de una solución acuosa. Alternativamente, las dosis pueden estar en forma de un p�ptido liofilizado, para preparación al momento de la solución líquida para inyección. Otros componentes posibles de dichos kits son uno o varios adyuvantes, que se añaden a las composiciones de p�ptidos antes de la administración, y un prospecto que describe cómo utilizar dichos kits.
La presente invención se ilustra adicionalmente mediante las siguientes figuras y ejemplos.
Figura 1: Inmunogenicidad de p�ptidos restringidos por HLA-B*0702. Se ensayaron CTL contra objetivos de RMA-B7 cargados con p�ptido tal como se indica.
Figura 2: Inmunogenicidad de p�ptidos crípticos HLA-B*0702 optimizados. Se ensayaron CTL contra objetivos de RMA-B7 cargados con p�ptido tal como se indica.
Figura 3: Inmunogenicidad in vivo de p�ptidos optimizados HLA-B*0702 Her2/neu1069L9 (A) y Her2/neu1069 (B) en ratones transg�nicos HLA-B*0702. Se ensayaron CTL contra objetivos de RMA-B7 cargados con p�ptido tal como se indica. La población de CTL inducida se diluyó 3 (1), 10 (2), 30 (3) y 100 (4) veces.
Figura 4: TERT4 induce CTL específicos de TERT en ratones HLA-B7 y en donantes sanos. (A) Inmunogenicidad TERT4 en ratones transg�nicos HLA-B*0702. Se ensayaron CTL contra objetivos RMA-B7 cargados con dosis decrecientes de p�ptido TERT4. (B) Reconocimiento de TERT end�geno por CTL murinos específicos de TERT4. Se ensayaron CTL frente a células COS transfectadas con HLA-B*0702 y TERT tal como se indica. (C) Inducción de CTL humanos específicos de TERT4. Se ensayaron CTL contra objetivos T2-B7 cargados con TERT4 (_) o un p�ptido irrelevante (e) utilizando la relación efector/diana tal como se indica (gráfico de la izquierda), y contra líneas de células tumorales humanas HLA-B*0702 positivo TERT positivo SK-MES-1 (_), HBL100 (e) y HLA-B*0702 negativo TERT positivo SW-480 (0), HSS (0) (gráfico derecho).
Figura 5: Reconocimiento de TERT end�geno mediante CTL murinos específicos TERT444. (A) Se ensayaron CTL contra objetivos RMA-B7 cargados con dosis decrecientes de p�ptidos TERT444 o TERT444A1 tal como se indica.
(B) Se ensayaron CTL frente a células COS transfectadas con HLA-B*0702 y/o TERT tal como se indica.
Figura 6: Inducción de CTL humanos específicos de TERT444A1. Se ensayaron CTL contra objetivos T2-B7 cargados con p�ptidos tal como se indica. La activación máxima de CTL se obtiene mediante tratamiento con PMA/ionomicina.
Los ejemplos se han realizado utilizando los siguientes materiales y procedimientos:
Ratones transg�nicos. Los ratones knockout HLA-B7 H-2 de clase I se han descrito anteriormente (Rohrlich y otros, Cells 2003). Las células murinas RMA-B7 y humanas T2-B7 transfectadas con HLA-B*0702 se han descrito anteriormente (Rohrlich y otros, 2003). Las células COS-7 y clon 13 de WEHI-164 fueron proporcionadas por F. Jotereau (INSERM 463, Nantes, Francia). Se utilizaron las líneas celulares SK-MES-1 (cáncer de pulmón), HBL-100 (cáncer de mama) HLA-B*0702 positivas y las SW-480 (cáncer de colon) y HSS (mieloma) HLA-B*0702 negativas líneas como objetivos de los CTL humanos. Todas las líneas celulares se cultivaron en medio de cultivo RPMI 1640 suplementado con FCS al 10%.
P�ptidos y pl�smidos. Los p�ptidos fueron sintetizados por Epytop (Nimes, Francia). El pl�smido HLA-B*0702 fue proporcionado por el Dr. Lemonnier (Institut Pasteur, París, Francia) (Rohrlich y otros, 2003) y el pl�smido TERT fue proporcionado por el Dr. Weinberg (MIT, Boston, MA) (Meyerson y otros, 1997).
Medici�n de la afinidad relativa de p�ptidos frente a HLA-B*0702. El protocolo utilizado se ha descrito anteriormente (Rohrlich y otros, 2003). En resumen, las células T2-B7 se incubaron a 37�C durante 16 horas con las concentraciones de p�ptidos que van desde 100 μM a 0,1 μM, y a continuación se tiñeron con el anticuerpo monoclonal (mAb) ME-1 para cuantificar la expresión de HLA-B*0702 en superficie. Para cada concentración de p�ptido, la tinción específica de HLA-B*0702 se calcul� como el porcentaje de tinción obtenido con 100 μM del p�ptido de referencia CMV265-274 (R10V; RPHERNGFTV, ID. SEC. No. 9). La afinidad relativa (AR) se determin� tal como:
AR = (concentración de cada p�ptido que induce el 20% de expresión de HLA-B*0702/Concentración del p�ptido de referencia que induce el 20% de expresión de HLA-B*0702).
Inducci�n de CTL in vivo en ratones transg�nicos HLA-B*0702. Los ratones fueron inyectados por vía subcutánea con 100 μg de p�ptido emulsionado en adyuvante incompleto de Freund (IFA) en presencia de 150 μg de ep�topo T auxiliar HBVcore128 I-Ab limitado (TPPAYRPPNAPIL, ID. SEC. No. 10). Después de 11 días, se estimularon 5x107 células de bazo in vitro con p�ptido (10 μM). El 6� día de cultivo, las poblaciones de respuesta masiva fueron ensayadas respecto a la citotoxicidad específica.
Ensayo de procesamiento de p�ptidos en células COS-7 transfectadas. Se sembraron 2,2x104 células COS-7 de simio en placas de 96 pocillos de fondo plano en DMEM + 10% de FCS, por triplicado para cada condición. Dieciocho horas después, las células se transfectaron con 100 ng de cada pl�smido de ADN con DEAE dextrano. Después de 4 horas, se a�adi� PBS + 10% de DMSO durante 2 minutos. Las células COS transfectadas se incubaron en DMEM+10% de FCS durante 40 horas y posteriormente se utilizaron para estimular CTL murinos en un ensayo de secreción de TNFα.
Ensayo de secreción TNF
. En el 4� día, se suspendieron células COS-7 transfectadas en 50 μl de RPMI + 10% de FCS y se utilizaron como células estimulantes. A continuación se añadieron 5x104 de células T murinas en 50 μl de RPMI 10% de FCS y se incubaron durante 6 horas. Cada condición se ensay� por triplicado. Se recogieron 50 μl del sobrenadante para medir el TNFα. Se prepararon diluciones estándar en 50 ml con dosis finales de TNFα que van desde 104 hasta 0 μg/ml. Tanto a los sobrenadantes como a las diluciones estándar, se añadieron 3x104 células WEHI-164c13 sensibles a TNFα en 50 μl. Estas se incubaron durante 16 horas a 37�C. La i nhibici�n de la proliferaci�n celular se evalu� por el procedimiento colorim�trico MTT (Espevik y Nissen-Meyer, 1986).
Generaci�n de CTL a partir de PBMC humano. Se recogió PBMC mediante leucof�resis de voluntarios HLAB*0702 sanos. Las células dendr�ticas (CD) se produjeron a partir de células adherentes cultivadas durante siete días (2x106 células/ml) en presencia de 500 UI/ml de GM-CSF y 500 UI/ml de IL-4 (R&D Systems, Minneapolis, Minnesota) en medio completo (RPMI-1640 suplementado con 10% de suero AB humano inactivado por calor, 2 μM de L-glutamina y antibióticos). En el 7� día, se pulsaron CD con 10 μM de p�ptidos durante 2 horas; se añadieron en el cultivo agentes de maduración Poly I:C (Sigma, Oakville, Canadá) a 100 ng/ml y anti-CD40 (clon G28-5, ATCC, Manassas, Virginia) a 2 μg/ml y los CD se incubaron a 37�C durante la noche o hasta 48 horas. A continuación, se irradiaron CD maduras (3.500 rads). Se purificaron células CD8+ mediante selección positiva con microperlas CD8 (Miltenyi Biotec, Auburn, California) según las instrucciones del fabricante. Se estimularon 2x105 células CD8+ + 6x104 células CD8-con 2x104 de CD pulsadas con p�ptido en medio de cultivo completo suplementado con 1000 UI/ml de IL-6 y 5 UI/ml de IL-12 (R&D Systems, Minneapolis, Minnesota) en placas de 96 pocillos de fondo redondo. A partir del 7� día, los cultivos se volvieron a estimular semanalmente con CD cargadas con p�ptido en presencia de 20 UI/ml de IL-2 (Proleukin, Chiron Corp., Emeryville, California) y 10 ng/ml de IL-7 (R&D Systems, Minneapolis,
Minnesota). Después de la tercera reestimulaci�n in vitro, se evalu� la citotoxicidad de los cultivos celulares en masa (frente a TERT4) y la tinción intracelular de IFNγ (frente a TERT444A1).
Ensayo citot�xico. Los objetivos se marcaron con 100 μCi de Cr51 durante 60 min, se sembraron en placas de 96 pocillos con fondo en V (3x103 células/pocillo en 100 μl de medio RPMI 1640) y, cuando fue necesario, se pulsaron con p�ptidos (1 μM) a 37�C durante 2 horas. A continuación se a�adie ron efectores en los pocillos y se incubaron a 37�C durante 4 horas. Se determin� el porcentaje de lisis específica como: % de Lisis = (liberación experimental liberación espontánea)/(liberación máxima -liberación espontánea) x 100
Tinci�n intracelular de IFN
. Las células T (105) se incubaron con 2x105 células T2 cargadas con p�ptido estimulante en presencia de 20 μg/ml de Brefeldina A (Sigma, Oakville, Canadá). Seis horas más tarde, se lavaron, se tiñeron con anticuerpo anti-CD8 conjugado con r-ficoeritrina (Caltag Laboratories, Burlingame, California, EE.UU.) en PBS durante 25 min a 4�C, se lavaron de nuevo, y se fijaron con PFA al 4%. Posteriormente las células se permeabilizaron con PBS, 0,5% de BSA, 0,2% de saponina (Sigma, Oakville, Canadá), y se marcaron con un mAb anti-IFNγ conjugado con aloficocianina (Pharmingen, Mississauga, Canadá) durante 25 min a 4�C antes del an�lisi s con un cit�metro de flujo FACSCalibur �.
Ejemplo 1: Afinidad de p�ptidos
Se ensayaron ocho p�ptidos con los motivos de anclaje específicos por HLA-B*0702, es decir, P2 y preferentemente L/V en la posición del extremo C terminal (Sidney y otros, 1996) que pertenecen a los ant�genos Hsp70 (Hsp70115, Hsp70137, Hsp70397), TERT (TERT4 y TERT444) y MAGE-A (MAGE-A121.1, MAGE-A121.2 y MAGE-A121.4) respecto a su unión a la molécula HLA-B*0702. Sólo TERT4 se unió a HLA-B*0702 con una elevada afinidad, los siete p�ptidos restantes fueron muy débiles o no enlazantes (Tabla II). Esto demuestra que la presencia de motivos de anclaje no es suficiente para asegurar una elevada afinidad de unión frente por HLA-B*0702. Dada su baja afinidad, los p�ptidos Hsp70115, Hsp70137, Hsp70397, TERT444, MAGE-A121.1, MAGE-A121.2, A121.4 MAGE-, se consideran p�ptidos crípticos.
Tabla II: Afinidad de p�ptidos por HLA-B*0702
- P�ptido
- Secuencia AR ID: SEC: No.
- 1
- Hsp70 115 YPEEISSMVL >10 11
- Hsp70 115A1
- APEEISSMVL >10 12
- 2
- Hsp70 137 (10) YPVTNAVITV >10 13
- 3
- Hsp70 397 APLSLGLET >10 14
- 4
- TERT4 APRCRAVRSL 0,74 15
- 5
- TERT444 DPRRLVQLL >10 1
- TERT 444A1
- APRRLVQLL 1,4 5
- 6
- MAGE-A121.1 EPVTKAEML >10 16
- MAGE-121.1 A1
- APVTKAEML >10 17
- 7
- MAGE-A121.2 EPFTKAEML >10 18
- 8
- MAGE-A121.4 EPITKAEIL >10 19
Ejemplo 2: Inmunogenicidad de p�ptidos seleccionados
Los p�ptidos de baja afinidad Hsp137, Hsp115, HSP397, TERT444 y de alta afinidad TERT4 se han ensayado respecto a su capacidad de inducir una respuesta inmune específica de CTL en ratones transg�nicos HLA-B*0702. Sólo la elevada afinidad TERT4 era inmunog�nica, lo que confirma que la inmunogenicidad de los p�ptidos est� fuertemente relacionada con su afinidad respecto por HLA (Figura 1).
Ejemplo 3: Aumento de la afinidad de los p�ptidos de baja afinidad
Dado que todos estos p�ptidos crípticos tenían motivos favorables de anclaje primario, el aumento de su afinidad es un prerrequisito para que sean inmunog�nicos. Se requiere la identificación de los motivos de anclaje secundarios desfavorables y su sustitución con motivos favorables. Sin embargo, estas sustituciones deben preservar la conformación del segmento de p�ptido que interact�a con el TCR (posición 4 a la posición 8). El interés, por lo tanto, estuvo centrado en las posiciones de anclaje secundarias 1 y 3: los amino�cidos alif�ticos son motivos favorables en la posición 1 (Sidney, Southwood y otros, 1996). Sin embargo, los p�ptidos Hsp70115 y Hsp70137 que tienen una Y (tirosina) en la posición 1 son no enlazantes. Por otra parte, la sustitución del amino�cido en la posición 1 por una A (alanina), que también es favorable en esta posición (Parker y otros 1994) aumenta la afinidad de la TERT444 pero no de la Hsp70115 y los p�ptidos de MAGE-A121.1 (Tabla II). Esto indica que la presencia de amino�cidos favorables en la posición 1 y las posiciones de anclaje 2 y 9/10 no puede asegurar por s� misma una elevada afinidad de unión de todos los p�ptidos. Por otra parte, se han descrito que los p�ptidos cargados positivamente (R/H/K) son favorables en la posición 3 (Sidney y otros, 1996) y diez de 26 p�ptidos inmunog�nicos identificados derivados de tumores y del VIH tienen un R/K/H en la posición 3 (Tabla III).
Tabla III: Ep�topos restringidos por HLA-B*0702 derivados de tumores y del VIH
- Ant�geno
- Secuencia ID. SEC. No. Referencia
- NY-ESO-1
- APRGVRMAV 20 Slager y otros, 2004
- ICE
- SPRWWPTCL 21 Ronsin y otros, 1999
- RAGE-1
- SPSSNRIRNT 22 Gaugler y otros, 1996
- RU2AS
- LPRWPPPQL 23 Van Den Eynde y otros, 1999
- RBAF500
- RPHVPESAF 24 Lennerz y otros, 2005
- Prote�na de fusión SSX2
- QPRYGYDQIM 25 Worley y otros, 2001
- HIVp17
- RPGGKKRYKL 26 Bases de datos de Inmunolog�a Molecular de HIV (Gestionada por Los Alamos National Security, LLC, para el U.S. Department of Energy’s National Nuclear Security Administration) http://hivweb.lanl.gov/content/immunology/tables/ctl summary.html
- HIVp24
- SPRTLNAWV 27
- HIVp24
- HPVHAGPIA 28
- HIVp24
- PPIPVGEIY 29
- HIVp24
- GPGHKARVL 30
- HIV-RT
- GPKVKQWPLT 32
- HIV-RT
- SPAIFQSSM 33
- HIV-RT
- IPLTEEAEL 34
- HIV-RT
- QPDKSESELV 35
- HIV-Vif
- HPRISSEVHI 36
- HIV-Vif
- KPPLPSVKKL 37
- HIV-Vif
- FPRTWLHGL 38
- HIVgp 160
- KPCVKLTPLC 39
- HIVgp160
- KVVSTQLLL 40
- HIVgp160
- RPWNNTRKSI 41
- HIVgp160
- IPRRIRQGL 42
- HIVnef
- FPVTPQVPL 43
- HIVnef
- TPQVPLRPM 44
Seg�n todas estas observaciones, todos los p�ptidos con la secuencia de APX3X4X5X6X7X8X9X10X11 (Id. Sec. No. 61) deben tener una elevada afinidad por HLA-B*0702. Esto se confirma por los resultados mostrados en la Tabla 5 IV. Todos los dieciocho p�ptidos con la secuencia citada anteriormente tenían una elevada afinidad y/o fueron inmunog�nicas en ratones transg�nicos HLA-B*0702.
Tabla IV. Afinidad e inmunogenicidad de p�ptidos restringidos por HLA-B*0702 APX3X4X5X6X7X8X9X10X11.
- -
- = AR>10, + = 1< AR <10, ++ = AR<1. La inmunogenicidad se ensay� tal como se describe en el ejemplo 2.
10 + : significa que se gener� una inmunorespuesta en , como mínimo, un ratón transg�nico HLA-B*0702, ND : No determinado
- Secuencia
- ID: SEC: No. AR Inmunogenicidad
- APRRLVQLL
- 5 + +
- APRSPLAPL
- 6 ++ +
- APKANKEIL
- 7 ND +
- APKHSDCLA
- 8 ND +
- APRCRAVRSL
- 15 + +
- APRMHCAVDL
- 45 ++ +
- APRVSIRLPL
- 46 ++ ND
- APREYVNAL
- 47 + +
- APRGVPQIEL
- 48 ND +
- APRALVETL
- 49 + +
- APRMPEAAL
- 50 ND +
- APRRRLGCEL
- 51 + +
- APRPWTPCL
- 52 + +
- APRASSPLL
- 53 ND +
- APRQLGREL
- 54 ND +
- APREISSMVL
- 55 + +
- APRSLGLEL
- 56 ++ +
- APRTKAEML
- 57 + +
Ejemplo 4: Inmunogenicidad in vivo de p�ptidos con afinidad aumentada y reconocimiento de la contraparte nativa
Ratones transg�nicos HLA-B7 fueron vacunados con los p�ptidos seleccionados, y once días después, sus células de bazo se estimularon in vitro con el p�ptido.
En este contexto por lo tanto, Hsp70115, Hsp70397 y TERT444 fueron modificados en la posición 1 (sustitución del amino�cido por una A) y/o la posición 3 (sustitución del amino�cido por una R). Para el p�ptido Hsp70397 se ha introducido una modificación adicional en la posición del extremo C terminal (sustitución de T por una L). P�ptidos modificados, es decir, Hsp70115A1R3 (ID. SEC. No. 55), Hsp70397R3L9 (ID. SEC. No. 56), TERT444A1 (ID. SEC. No. 5) mostraron una fuerte afinidad por HLA-B*0702 (Tabla IV) y se indujo una respuesta inmune en la mayoría de los ratones vacunados (Figura 2). Sin embargo, para todos los p�ptidos excepto el TERT444A1, los CTL generados reconocieron el p�ptido optimizado, pero no el p�ptido nativo (Figura 2) correspondiente. Esto sugiere fuertemente que la sustitución del amino�cido en la posición 3 por una R puede cambiar la conformación del segmento de p�ptido que interact�a con el TCR y garantiza el reconocimiento cruzado con TCR.
Dado que a) todos los p�ptidos ensayados con APX3X4X5X6X7X8X9X10X11 tienen una elevada afinidad y son inmunog�nicos (Tabla IV y la Figura 1, 2) y b) la sustitución del amino�cido en la posición 3 por un R puede impedir el reconocimiento mutuo del p�ptido nativo, los presentes inventores seleccionaron p�ptidos nativos que tienen una P y una R en las posiciones 2 y 3, respectivamente, y sustituyeron el amino�cido en la posición 1 por una A si el último amino�cido era favorable (L, A, I, V o M). Dada la gran importancia de la posición 3, tanto en la afinidad como en el reconocimiento de CTL de p�ptidos restringidos por HLA-B*0702, los presentes inventores seleccionaron p�ptidos con la secuencia X1PX3 (en los que X1 es cualquier amino�cido y X3 es K, R, H o M; estos amino�cidos se han descrito como residuos favorables en la posición 3) y un amino�cido favorable (A/I/L/V) en la posición del extremo C terminal. Los p�ptidos con esta secuencia y baja afinidad por HLA-B*0702 se han modificado por sustitución del primer residuo por una A. Este es el caso de TERT444, Her-2/neu760 y Her-2/neu246. Los presentes inventores también seleccionaron p�ptidos con la secuencia de APX3 (en los que X3 es K, R, H o M) y un residuo no favorable en la posición del extremo C terminal (es decir, un amino�cido distinto de L, A, I, V o M). Los p�ptidos con esta secuencia y baja afinidad por HLA-B*0702 se han modificado mediante la sustitución del residuo en la posición del extremo C terminal con una L. Este es el caso de Her-2/neu1069. Todos estos p�ptidos modificados tenían una fuerte afinidad por HLA-B*0702.
Ejemplo 5: Inmunogenicidad de p�ptidos optimizados y reconocimiento mutuo de la contraparte nativa
Los p�ptidos nativos Her2/neu246, Her2/neu760, Her2/neu1069 y TERT444 no fueron inmunog�nicos, mientras que los p�ptidos optimizados fueron inmunog�nicos en ratones transg�nicos HLA-B*0702. Por otra parte, los CTL inducidos por todos estos p�ptidos optimizados fueron capaces de producir reconocimiento mutuo con el correspondiente p�ptido nativo (Figura 3 y Tabla V).
- P�ptido
- Secuencia ID: SEC: No. Inmunogenicidad Reconocimiento mutuo del p�ptido nativo correspondiente
- TERT444
- DPRRLVQLL 1 -
- TERT444A1
- APRRLVQLL 5 + +
- Her2/neu760
- APKANKEIL 3 -
- Her2/neu760A1
- APKANKEIL 7 + +
- Her2/neu246
- GPKHSDCLA 4 -
- Her2/neu246A1
- APKHSDCLA 8 + +
- Her2/neu1069
- APRSPLAPS 2 -
- Her2/neu1069L9
- APRSPLAPL 6 + +
Tabla V: La inmunogenicidad de p�ptidos restringidos por HLA-B*0702 nativos y optimizados. + para la inmunogenicidad o reconocimiento mutuo del p�ptido nativo significa que el p�ptido indujo una respuesta específica en, como mínimo, un ratón transg�nico HLA-B*0702, capaz de reconocer el p�ptido nativo correspondiente.
En conclusión, los presentes inventores han descrito un procedimiento para optimizar la inmunogenicidad (y también la afinidad) de p�ptidos crípticos restringidos por HLAB*0702. Este comprende a) sustituir el residuo en la posición 1 con una A en todos los p�ptidos que comprenden la secuencia X1PX3 (en la que X1 es cualquier amino�cido excepto A y X3 es R o K o H o M), un amino�cido favorable en la posición del extremo C terminal (es decir, L o A o I o V o M), y una baja afinidad por HLA-B*0702, o b) sustituir el residuo en la posición C terminal con una L en p�ptidos que comprenden la secuencia de APX3 (X3 se define tal como anteriormente), un residuo no favorable en la posición C terminal (es decir, un amino�cido diferente que L o A o I o V o M), y una baja afinidad por HLA-B*0702.
Ejemplo 6: El p�ptido inmunodominante TERT4 induce CTL específicos de TERT
Ratones transg�nicos HLA-B7 se inmunizaron a continuación con TERT4 (ID. SEC. No. 15) y once días más tarde se estimularon sus células de bazo in vitro con el p�ptido. Los CTL generados mataron a los objetivos RMA-B7 cargados con concentraciones decrecientes de p�ptido TERT4 (Figura 4A). El 50% de lisis máxima de los objetivos cargados con TERT4 se obtuvo con 1,5 nM (Figura 4A). Se ensayaron a continuación CTL respecto a su capacidad para reconocer células COS-7 que expresan HLA-B*0702 y TERT end�geno. Los resultados presentados en la Figura 4B demuestran que los CTL reconocieron células COS-7 transfectadas tanto con HLA-B*0702 como con
TERT pero no células COS-7 transfectadas bien con HLA-B*0702 o bien con TERT, lo que demuestra que el p�ptido dominante TERT4 es un ep�topo restringido por HLA-B*0702 procesado de forma natural a partir de TERT end�geno.
Por otra parte, se estimularon in vitro células CD8 de donantes sanos con células dendr�ticas aut�logas cargadas con el p�ptido TERT4. Después de cuatro estimulaciones, se ensayaron CTL para determinar la citotoxicidad contra objetivos T2-B7 cargados con TERT4. Se ensayaron tres donantes y se indujeron CTL en dos de ellos. Los resultados de un donante que responde se presentan en la Figura 4C. Los CTL mataron a los objetivos T2-B7 que presentan TERT4 pero no a las células T2-B7 que presentan el p�ptido Nef irrelevante (gráfico de la izquierda). Curiosamente, los CTL mataron a las líneas de células tumorales humanas HLA-B*0702 TERT + SK-MES-1 y HBL100, pero no a las de HLA-B*0702-TERT + SW-480 y HSS, confirmando la presentación restringida de HLA-B*0702 y el procesamiento end�geno del ep�topo TERT4 (gráfico de la derecha).
Ejemplo 7: Los CTL inducidos por p�ptidos TERT444A1 reconocen el TERT end�geno
Se ensay� TERT444A1 (ID. SEC. No. 5) respecto a su capacidad para inducir CTL capaces de reconocer de TERT end�geno y para inducir CTL en donantes sanos (Ejemplo 6). Se inmunizaron ratones transg�nicos HLA-B*0702 con TERT444A1 y once días más tarde se estimularon sus células de bazo in vitro con el p�ptido TERT444 nativo (ID. SEC. No. 1). Los CTL generados mataron a los objetivos RMA-B7 cargados con concentraciones decrecientes de p�ptidos TERT444A1 y TERT444. El 50% lisis máxima de los objetivos cargados con TERT444 y cargados con TERT444A1 se obtuvo con 5,5 nM y 1 nM, respectivamente (Figura 5A). Los CTL se ensayaron a continuación respecto a su capacidad para reconocer células COS-7 que expresan HLA-B*0702 y TERT end�geno. Los resultados presentados en la Figura 5B muestran que los CTL reconocieron células COS-7 transfectadas tanto con HLA-B*0702 como con TERT pero no células COS-7 transfectadas bien con HLA-B*0702 o TERT lo que demuestra que TERT444 es una ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702 procesado de forma natural a partir de TERT end�geno.
Ejemplo 8: TERT444A1 Estimula CTL de donantes sanos
Se estimularon células CD8 de donantes sanos in vitro con células dendr�ticas aut�logas cargadas con el p�ptido TERT444A1. Después de cuatro estimulaciones, las células proliferantes fueron divididas en 4 grupos. A continuación, cada grupo se ensay� respecto a la producción de IFNg intracelular tras la estimulaci�n con células T2-B7 cargadas con TERT444A1 optimizado o TERT444 nativo. Los resultados del donante D5609 que responde se presentan en la Figura 6. Los CTL que producen IFNg se detectaron en los grupos 2 y 4 después de la estimulaci�n con células T2B7 cargadas bien con TERT444 o bien con TERT444A1 (Figura 6).
Anderton, S. M., Viner, N. J., Matharu, P., Lowrey, P. A., y Wraith, C. D. (2002). Influencia de un ep�topo críptico
dominante en la tolerancia de células T autoinmunes. Nat. Immunol 3, 175-181.
Bakker, A.B., van der Burg, S. H., Huijbens, R. J., Drijfhout, J. W., Melief, C. J., Adema, G. J., y Figdor, C. G. (1997).
Los análogos de ep�topos de CTL con la capacidad de unión mejorada a MHC de clase I suscitan ep�topo antimelanoma de tipo salvaje que reconoce CTL. Int J Cancer 70, 302-309.
Boisg�rault, F., Anosova, N. G., Tam, R. C., Illigens, B. M., Fedoseyeva, E. V. y Benij�, G. (2000). La inducción de la
respuesta de células T a determinantes crípticos de MHC durante el rechazo de aloinjertos. Hum Immunol 61, 13521362.
Bowne, W. B., Srinivasan, R., Wolchok, J. D., Hawkins, W. G., Blachere, N. E., Dyall, R. Lewis, J. J., y Houghton, A.
N. (1999). Acoplamiento y desacoplamiento de la inmunidad y autoinmunidad tumoral. J Exp Med 190, 1717-1722.
Cibotti, R., Kanellopoulos, J. M., Cabaniols, J. P., Halle-Panenko, O., Kosmatopoulos, K., Sercarz, E. y Kourilsky, P.
(1992). La tolerancia a una proteína propia implica sus determinantes inmunodominates pero no implica a sus
subdominantes. Proc Natl Acad Sci EE.UU. 89, 416-420.
Colella, T. A., Bullock, T.N., Russell, L.B., Mullins, D.W., Overwijk, W.W, Luckey, C.J. Pierce, R.A, Restifo, N.P., y
Engelhard, V.H. (2000). Autotolerancia al homólogo murino de melanoma ant�geno tirosinasa derivados:
implicaciones para la inmunoterapia tumoral. J Exp Med 191, 1221-1232.
Cortez-Gonzalez, X., Sidney, J., Adotevi, O., Sette, A., Millard, F., Lemonnier, F., Langlade-Demoyen, P., Zanetti, M.
(2006). P�ptidos de hTRT inmunog�nicos restringidos por HLA-B7. Int Immunol 18, 1707-1718.
Disis, M. L., Gooley, T. A., Rinn, K., Davis, D., Piepkom, M., Cheever, M. A., Knutson, K. L. y Schiffman, K. (2002).
Generación de inmunidad a células T a la proteína de HER-2/neu después de la inmunizaci�n activa con vacunas de
HER-2/neu basadas en p�ptidos. J Clin Oncol 20, 2624-2632.
Dyall, R., Bowne, W. B., Weber, L. W., LeMaoult, J., Szabo, P., Moroi, Y., Piskun, G., Lewis, J. J., Houghton, A. N. y
Nikolic-Zugic, J. (1998). La inmunizaci�n heter�clita induce inmunidad tumoral. J Exp Med 188, 1553-1561.
Engelhom, M. E., Guevara-Patino, J. A., Noffz, G., Hooper, A. T., Lou, O., Gold, J. S., Kappel, B. J. y Houghton, A.
N. (2006). Autoinmunidad e inmunidad tumoral inducidas por respuestas inmunitarias a mutaciones en uno mismo.
Nat Med 12, 198-206.
Espevik, T. y Nissen-Meyer, J. (1986). Una línea celular altamente sensible, WEHI 164 clon 13, para medir el factor
de necrosis/factor citot�xico tumoral de monocitos humanos. J Immunol Methods 95, 99-105.
Friedman, R. S., Spies, A. G. y Kalos, M. (2004). Identificación de ep�topos de células T CD8 de proste�na
procesados naturalmente, un candidato a vacuna específica de tejido de la pr�stata. Eur J Immunol 34, 1091-1101.
Gaugler, B., Brouwenstijn, N., Vantomme, V., Szikora, J. P., Van der Spek, C. W., Patard, J. J., Boon, T., Schrier, P.,
Van den Eynde, B. J. Un nuevo gen que codifica un ant�geno reconocido por los linfocitos T citol�ticos aut�logos en
un carcinoma renal humano. (1996) Immunogenetics 44, 323-30
Gross, D. A., Graff-Dubois, S., Opolon, P., Comet, S., Alves, P., Bennaceur-Griscelli, A., Faure, O., Guillaume, P.,
Firat, H., Chouaib, S., et al. (2004). Alta eficacia de vacunación de ep�topos de baja afinidad en la inmunoterapia
antitumoral. J Clin Invest 113, 425-433.
Grossmann, M. E., Davila, E. y Celis, E. (2001). Evitar la tolerancia contra ant�genos prost�ticos con ep�topos
pept�dicos subdominantes. J Immunother 24, 237-241.
Hawkins, W. G., Gold, J. S., Dyall, R., Wolchok, J. D., Hoos, A., Bowne, W. B., Srinivasan, R., Houghton, A. N. y
Lewis, J. J. (2000). La inmunizaci�n con ADN que codifica gp100 da como resultado inmunidad antitumoral
independiente de células T CD4. Surgery 128, 273-280.
Hernandez, J., Lee, P. P., Davis, M. M. y Sherman, L. A. (2000). La utilización de tetr�meros pept�dicos HLA
A2.1/p53 para visualizar el impacto de la autotolerancia en el repertorio TCR. J Immunol 164, 596-602.
Lally, K. M., Mocellin, S., Ohnmacht, G. A., Nielsen, M. B., Bettinotti, M., Panelli, M. C., Monsurro, V. y Marincola, F.
M. (2001). Desenmascarando ep�topos crípticos después de la pérdida de la expresión del ant�geno tumoral inmunodominante a través de la difusión de ep�topo. Int J Cancer 93, 841-847. Lennerz V., Fatho M., Gentilini C., Frye R. A., Lifke A., Ferel D., W�lfel C., Huber C., W�lfel T. (2005). La respuesta de las células T aut�logas a un melanoma humano est� dominada por neoant�genos mutados. PNAS U.S.A. 102, 16013-8 Lu, J., Celis, E. (2000). El uso de dos algoritmos de predicción de internet para la identificación de ep�topos de células T reactivas tumorales. Cancer Res. 60, 5223-5227. Luiten, R., van der Bruggen, P. (2000). Un p�ptido MAGE-A1 se reconoce en los tumores humanos HLA-B7 por los linfocitos T citol�ticos. Tissue antigens 55, 149-152. Meyerson, M., Counter, C. M., Eaton, E. N., Ellisen, L. W., Steiner, P., Caddle, S. D., Ziaugra, L., Beijersbergen, R. L., Davidoff, M. J., Liu, Q., y otros (1997). hEST2, el gen putativo de la subunidad catalítica de la telomerasa humana, est� regulado positivamente en las células tumorales y durante la inmortalizaci�n. Cell 90, 785-795. Moudgil, K. D. y Sercarz, E. E. (1994a). �Pueden las respuestas inmunes antitumorales discriminar entre uno mismo y el exterior? Immunol Today 15, 353-355. Moudgil, K. D. y Sercarz, E. E. (1994b). El repertorio de células T contra autodeterminantes crípticos y su implicación en la autoinmunidad y cáncer. Clin Immunol Immunopathol 73, 283-289. Moudgil, K. D., Southwood, S., Ametani, A., Kim, K., Sette, A. y Sercarz, E. E. (1999). El repertorio de células T autodirigidas contra lisozima de ratón refleja la influencia de la jerarquía de sus propios determinantes y puede ser acoplada por una lisozima ajena. J Immunol 163, 4232-4237. Naftzger, C., Takechi, Y., Kohda, H., Hara, I., Vijayasaradhi, S. y Houghton, A. N. (1996). La respuesta inmune a un ant�geno de diferenciación inducida por el ant�geno alterado: un estudio de rechazo tumoral y autoinmunidad. Proc Natl Acad Sci U S A 93, 14809-14814. Overwijk, W. W., Theoret, M. R., Finkelstein, S. E., Surman, D. R., de Jong, L. A., Vyth-Dreese, F. A., Dellemijn, T. A., Antony, P. A., Spiess, P. J., Palmer, D. C., et al. (2003). Regresión tumoral y autoinmunidad después de la inversión de un estado funcionalmente tolerante de las células autorreactivas T CD8+. J Exp Med 198, 569-580. Overwijk, W. W., Tsung, A., Irvine, K. R., Parkhurst, M. R., Goletz, T. J., Tsung, K., Carroll, M. W., Liu, C., Moss, B., Rosenberg, S. A. y Restifo, N. P. (1998). Gp100/pmel 17 es un ant�geno murino de rechazo de tumores: inducción de células T "autorreactivas" tumoricidas utilizando un ligando pept�dico alterado de alta afinidad. J Exp Med 188, 277-286. Palomba, M. L., Roberts, W. K., Dao, T., Manukian, G., Guevara-Patino, J. A., Wolchok, J. D., Scheinberg, D. A. y Houghton, A. N. (2005). Inmunidad dependiente de células T CD8+ de la después de la inmunizaci�n con ADN xenog�nico contra CD20 en un modelo de desafío tumoral de linfoma de células B. Clin Cancer Res 11, 370-379. Parker, K.C., Bednarek, M.A., Coligan J.E. (1994). Esquema para la clasificación de los p�ptidos de unión por HLA-A2 potenciales basados en la unión independiente de las cadenas laterales individuales de los p�ptidos. J Immunol 152, 163-175. Parkhurst, M. R., Salgaller, M. L., Southwood, S., Robbins, P. F., Sette, A., Rosenberg, S. A. y Kawakami, Y. (1996). Mejora de la inducción de CTL reactivos de melanoma con p�ptidos a partir del ant�geno de melanoma gp100 modificado en los residuos de unión por HLA-A*0201. J Immunol 157, 2539-2548. Paterson, Y. y Maciag, P. C. (2005). Vacunas a base de Listeria para el tratamiento del cáncer. Curr Opin Mol Ther 7, 454-460. Rammensee, H., Bachmann, J., Emmerich, N. P., Bachor, O.A., Stevanovic, S. (1999). SYFPEITHI: base de datos para los ligandos y motivos pept�dicos del MHC. Immunogenetics. 50, 213-219. Rohrlich, P. S., Cardinaud, S., Firat, H., Lamari, M., Briand, P., Escriou, N. y Lemonnier, F. A. (2003). Ratones H2KbDb doble knockout, HLAB* 0702 transgenicos: caracterización fenot�pica y funcional en respuesta al virus de la gripe. Int Immunol 15, 765-772. Ronsin, C., Chung-Scott, V., Poullion, I., Aknouche, N., Gaudin, C., Triebel, F. (1999). Un marco de lectura abierto definido no-AUG alternativo del ARNm de la carboxil-esterasa intestinal genera in situ un ep�topo reconocido por los linfocitos infiltrantes reactivos tumorales a células de carcinoma renal. J Immunol 163, 483-90. Sarobe, P., Pendleton, C. D., Akatsuka, T., Lau, D., Engelhard, V. H., Feinstone, S. M. y Berzofsky, J. A. (1998). Potencia in vitro e inmunogenicidad in vivo mejoradas de un ep�topo de CTL de la proteína del núcleo del virus de la
hepatitis C después de la sustitución de amino�cidos en las posiciones secundarias de unión por HLA-A2.1. J Clin
Invest 102, 1239-1248.
Scardino, A., Gross, D. A., Alves, P., Schultze, J. L., Graff-Dubois, S., Faure, O., Tourdot, S., Chouaib, S., Nadler, L.
M., Lemonnier, F. A., y otros (2002). Ep�topos crípticos HER-2/neu y hTERT como nuevos objetivos para la
inmunoterapia tumoral de amplio espectro. J Immunol 168, 5900-5906.
Sidney, J., Southwood, S., del Guercio, M. F., Grey, H. M., Chesnut, R. W., Kubo, R. T. y Sette, A. (1996). La
especificidad y la degeneración en la unión de p�ptidos a moléculas de tipo HLA-B7 de clase I. J Immunol 157,
3480-3490.
Sinha, P., Chi, H. H., Kim, H. R., Clausen, B. E., Pederson, B., Sercarz, E. E., Forster, I. y Moudgil, K. D. (2004). La
lisozima de ratón de ratones knockout M revela cómo la jerarquía de autodeterminantes conforma el repertorio de
células T contra este autoant�geno circulante en ratones de tipo salvaje. J Immunol 173, 1763-1771.
Slager, E.H., van der Minne, C.E., Goudsmit, J., van Oers J., M., Kostense, S., Havenga, M.J., Osanta, S. y Griffioen,
M. (2004). Inducción de células T CD8+ específicas de CAMEL/NY-ESO-ORF2 tras la estimulaci�n con células
dendr�ticas infectadas con un vector Ad5 modificado que expresa una fibra Ad5/35 quimérica. Cancer Gene Ther 11,
227-236.
Theobald, M., Biggs, J., Hernandez, J., Lustgarten, J., Labadie, C. y Sherman, L. A. (1997). Tolerancia a la p53 por
los linfocitos T citot�xicos restringidos por A2.1. J Exp Med 185, 833-841.
Tourdot, S., Scardino, A., Saloustrou, E., Gross, D. A., Pascolo, S., Cordopatis, P., Lemonnier, F. A. y
Kosmatopoulos, K. (2000). Una estrategia general para mejorar la inmunogenicidad de p�ptidos asociados por HLAA2.1 de baja afinidad: implicación en la identificación de ep�topos tumorales crípticos. Eur J Immunol 30, 3411-3421.
Valmori, D., Fonteneau, J. F., Lizana, C. M., Gervois, N., Lienard, D., Rimoldi, D., Jongeneel, V., Jotereau, F.,
Cerottini, J. C. y Romero, P. (1998). Generación in vitro mejorada de CTL específicos reactivos a tumor mediante
selección de análogos de p�ptidos inmunodominantes Melan-A/MART-1. J Immunol 160, 1750-1758.
Van Den Eynde, B. J., Gaugler, B., Probst-Kepper, M., Michaux, L., Devuyst, O., Lorge., F, Weynants., P, Boon, T.
(1999). Un nuevo ant�geno reconocido por linfocitos T citol�ticos en un tumor de ri��n humano como resultado de la
transcripción de cadena inversa. J. Exp. Med 190, 1793-1800.
Vierboom, M. P., Nijman, H. W., Offringa, R., van der Voort, E. I., van Hall, T., van den Broek, L., Fleuren, G. J.,
Kenemans, P., Kast, W. M. y Melief, C. J. (1997). Erradicaci�n de tumores por linfocitos T citot�xicos específico de
p53 de tipo salvaje. J Exp Med 186, 695-704.
Weber, L. W., Bowne, W. B., Wolchok, J. D., Srinivasan, R., Qin, J., Moroi, Y., Clynes, R., Song, P., Lewis, J. J. y
Houghton, A. N. (1998). La inmunidad y la autoinmunidad tumoral inducida por la inmunizaci�n con ADN homólogo.
J Clin Invest 102, 1258-1264.
Worley, B.S., van den Broeke, L.T., Goletz, T.J., Pendleton C.D., Daschbach, E.M., Thomas E.K., Marincola, F.M.,
Helman L.J. y Berzofsky, J.A. (2001). Antigenicidad de proteínas de fusión de translocaciones cromos�micas
asociadas al sarcoma. Cancer Res 61, 6868-6875.
LISTADO DE SECUENCIAS
<110> VAXON BIOTECH KOSMATOPOULOS, Kostantinos (Kostas) GRAFF-DUBOIS, St�phanie MENEZ-JAMET
<120> IDENTIFICACIÓN, OPTIMIZACIÓN Y UTILIZACIÓN DE EPITOPOS CRÍPTICOS HLA-B7 PARA INMUNOTERAPIA
<130> VMA/bv-F1788/3PCT
<150> PCT/IB2006/002937
<151> 2006-07-12
<160> 61
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> TERT
<400> 1
<210> 2
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> HER-2/neu
<400> 2
<210> 3
<211> 9 15 <212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> Ep�topo críptico HLA-B7 HER-2/neu
<400> 3
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> Ep�topo críptico HLA-B7 HER-2/neu
<400> 4
<210> 5
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> TERT
45 <400> 5
<210> 6
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
<220> 55 <223> Her-2/neu
<400> 6
<210> 7
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> Ep�topo inmunog�nico derivado de Her-2/neu
<400> 7
<210> 8
<211> 9 15 <212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> Ep�topo inmunog�nico derivado de Her-2/neu
<400> 8
<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> P�ptido
<400> 9
<210> 10
<211> 13
<212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> P�ptido
<210> 11
<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial
<220> 55 <223> Hsp70_115
<400> 11
<210> 12
<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial
5
<220>
<223> 115A1
<400> 12
<210> 13
<211> 10 15 <212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> Hsp70 137 (10)
<400> 13
- 25
- <210> 14 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial
- <220> <223> HSP70 397
- <400> 14
- 35
- <210> 15 <211> 10 <212> PRT <213> Artificial
- 45
- <220> <223> TERT4 <400> 15
<210> 16
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
55 <220>
<223> MAGE-A121.1
<400> 16
<210> 17
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> 121.A1
<400> 17
<210> 18 15 <211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> MAGE-A121.2
<400> 18
- 25
- <210> 19 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial
- <220> <223> MAGE-A121.4
- 35
- <400> 19
<210> 20
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> NY-ESO-1
<400> 20
<210> 21
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> ICE
<400> 21
<210> 22
<211> 10
5 <212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> RAGE-1 10
<400> 22
15 <210> 23
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
20 <220>
<223> RU2AS
<400> 23
<210> 24
<211> 9
<212> PRT 30 <213> Artificial
<220>
<223> RBAF500
35 <400> 24
<210> 25 40 <211> 10
<212> PRT
<213> Artificial
- <220>
- 45 <223> Proteína de fusión SSX2
<400> 25
<400> 26
<212> PRT
<213> Artificial
- <220>
- 60 <223> HIV-RT
- 50
- <210> 26
- <211> 10
- <212> PRT
- <213> Artificial
- 55
- <220>
- <223> HIVp17
- 5
- <210> 27 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial
- 10
- <220> <223> HIVp24
- <400> 27
- 15
- 20
- <210> 28 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial
- <220> <223> HIVp24
- 25
- <400> 28
- 30
- <210> 29 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial
- 35
- <220> <223> HIVp24
- <400> 29
- 40
- 45
- <210> 30 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial
- <220> <223> HIVp24
- 50
- <400> 30
- <210>
- 31 55 <211> 10
<400> 31
<210> 32
<211> 10
<212> PRT 10 <213> Artificial
<220>
<223> HIV-RT
15 <400> 32
<210> 33 20 <211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
<220> 25 <223> HIV-RT
<400> 33
- 30
- <210> 34
- <211> 9
- <212> PRT
- <213> Artificial
- 35
- <220>
- <223> HIV-RT
- <400> 34
- 40
<210> 35
<211> 10 45 <212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> HIV-RT 50
<400> 35
<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial
60 <220>
<223> HIV-Vif
<400> 36
<210> 37
<211> 10
<212> PRT 10 <213> Artificial
<220>
<223> HIV-Vif
15 <400> 37
<210> 38 20 <211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
<220> 25 <223> HIV-Vif
<400> 38
- 30
- <210> 39
- <211> 10
- <212> PRT
- <213> Artificial
- 35
- <220>
- <223> HIVgp160
- <400> 39
- 40
<210> 40
<211> 9 45 <212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> HIVgp160 50
<400> 40
55 <210> 41
<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> HIVgp160
<400> 41
<210> 42
<211> 9 10 <212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> HIVgp160 15
<400> 42
20 <210> 43
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
25 <220>
<223> HIVnef
<400> 43
<210> 44
<211> 9
<212> PRT 35 <213> Artificial
<220>
<223> HIVnef
40 <400> 44
<210> 45 45 <211> 10
<212> PRT
<213> Artificial
<220> 50 <223> EphA2
<400> 45
- 55
- <210> 46
- <211> 10
- <212> PRT
- <213> Artificial
- 60
- <220>
<223> EphA2
<400> 46
<210> 47
<211> 9
<212> PRT 10 <213> Artificial
<220>
<223> Her-2/neu
15 <400> 47
<210> 48 20 <211> 10
<212> PRT
<213> Artificial
<220> 25 <223> P�ptido artificial
<400> 48
- 30
- <210> 49
- <211> 9
- <212> PRT
- <213> Artificial
- 35
- <220>
- <223> MAGE-A
- <400> 49
- 40
<210> 50
<211> 9 45 <212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> P�ptido artificial 50
<400> 50
<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial
60 <220>
<223> TERT
<400> 51
<210> 52
<211> 9
<212> PRT 10 <213> Artificial
<220>
<223> P�ptido artificial
15 <400> 52
<210> 53 20 <211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
<220> 25 <223> P�ptido artificial
<400> 53
- 30
- <210> 54
- <211> 9
- <212> PRT
- <213> Artificial
- 35
- <220>
- <223> P�ptido artificial
- <400> 54
- 40
<210> 55
<211> 10 45 <212> PRT
<213> Artificial
<220>
<223> 115A1R3 50
<400> 55
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial
60 <220>
<223> 397R3L9
<400> 56
<210> 57
<211> 9
<212> PRT 10 <213> Artificial
<220>
<223> 121.1 A1R3
15 <400> 57
<210> 58 20 <211> 11
<212> PRT
<213> Artificial
<220> 25 <223> Ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702
<220>
<221> CARACTERÍSTICAS VARIAS
- <222>
- (1)..(1) 30 <223> Xaa es cualquier amino�cido de origen natural
<220>
<221> CARACTERÍSTICAS VARIAS
- <222>
- (3)..(3) 35 <223> Xaa es Arg o Lys o His o Met
<220>
<221> CARACTERÍSTICAS VARIAS
- <222>
- (4)..(7) 40 <223> Xaa es independientemente cualquier amino�cido de origen natural
<220>
<221> CARACTERÍSTICAS VARIAS
- <222>
- (8)..(10) 45 <223> Xaa es independientemente cualquier amino�cido de origen natural o ninguno
<220>
<221> CARACTERÍSTICAS VARIAS
<222> (11)..(11)
50 <223> Xaa es cualquier amino�cido de origen natural con la condición de que si Xaa (1)..(1) es Ala entonces Xaa (11)..(11) no es ni Leu ni Ala ni lle ni Val ni Met; y si Xaa (1)..(1) no es Ala entonces Xaa (11)..(11) es Leu o Ala o lle
o Val o Met
<400> 58 55
<210> 59
<211> 11 60 <212> PRT
<213> Artificial <220>
<223> Ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702
<220>
5 <221> CARACTERÍSTICAS VARIAS
<222> (1)..(1)
<223> Xaa es cualquier amino�cido de origen natural excepto Ala
<220>
<223> Xaa es Arg o Lyso His o Met
- <220>
- 15 <221> CARACTERÍSTICAS VARIAS
<222> (4)..(7)
<223> Xaa es independientemente cualquier amino�cido de origen natural
- <220>
- 20 <221> CARACTERÍSTICAS VARIAS
<222> (8)..(10)
<223> Xaa es independientemente cualquier amino�cido de origen natural o ninguno
- <220>
- 25 <221> CARACTERÍSTICAS VARIAS
<222> (11)..(11)
<223> Xaa es Leu o Ala olle o Val o Met
<400> 59 30
<210> 60
<211> 11 35 <212> PRT
<213> Artificial
<220>
- <223>
- Ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702 40
<220>
<221> CARACTERÍSTICAS VARIAS
<222> (3)..(3)
- <223>
- Xaa es Arg o Lys o His o Met 45
<220>
<221> CARACTERÍSTICAS VARIAS
<222> (4)..(7)
- <223>
- Xaa es independientemente cualquier amino�cido de origen natural 50
<220>
<221> CARACTERÍSTICAS VARIAS
<222> (8)..(10)
- <223>
- Xaa es independientemente cualquier amino�cido de origen natural o ninguno 55
<220>
<221> CARACTERÍSTICAS VARIAS
<222> (11)..(11)
- <223>
- Xaa es cualquier amino�cido de origen natural diferente de Leu o Ala o lle o Val o Met 60
<400> 61
Claims (16)
- REIVINDICACIONES1. Ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702, que es un p�ptido seleccionado del grupo que comprendeAPRSPLAPS (ID. SEC. No. 2), SPKANKEIL (ID. SEC. No. 3), GPKHSDCLA (ID. SEC. No. 4). 5
- 2. Ep�topo inmunog�nico restringido por HLA-B*0702, que es un p�ptido optimizado derivado de un p�ptido críptico, según la reivindicación 1, en el que dicho ep�topo inmunog�nico se selecciona del grupo que comprende APRSPLAPL (ID. SEC. No. 6), APKANKEIL (ID. SEC. No. 7), APKHSDCLA (ID. SEC. No. 8).10 3. Polip�ptido quimérico, que comprende dos, tres o más ep�topos crípticos restringidos por HLA-B*0702 seleccionados del grupo que comprende APRSPLAPS (ID. SEC. No. 2), SPKANKEIL (ID. SEC. No. 3), GPKHSDCLA (ID. SEC. No. 4), DPRRLVQLL (ID. SEC. No. 1).
- 4. Polip�ptido quimérico, que comprende dos, tres o más ep�topos inmunog�nicos restringidos por HLA-B*070215 seleccionados del grupo que comprende APRSPLAPL (ID. SEC. No. 6), APKANKEIL (ID. SEC. No. 7), APKHSDCLA (ID. SEC. No. 8) y APRRLVQLL (ID. SEC. No. 5).
- 5. Molécula de ácido nucleico aislada diseñada para causar la expresión de un ep�topo críptico restringido por HLAB*0702, según la reivindicación 1, un ep�topo inmunog�nico, según la reivindicación 2, o un polip�ptido quimérico, 20 según la reivindicación 3 o la reivindicación 4.
- 6. Composición farmacéutica que comprende, como mínimo, como un principio activo, un ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702 según la reivindicación 1, o un polip�ptido ep�topo inmunog�nico, según la reivindicación 2, o un polip�ptido quimérico, según la reivindicación 3 o la reivindicación 4, o un ácido nucleico según la reivindicación 5.
-
- 7.
- Composici�n farmacéutica, según la reivindicación 5, que es una vacuna.
-
- 8.
- Kit de partes que comprende, en formulaciones separadas, un primer p�ptido que tiene la secuencia de un ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702, y un segundo p�ptido que corresponde a su ep�topo inmunog�nico
30 restringido por HLA-B*0702 cognado, en el que dicho primer p�ptido es un ep�topo críptico, según la reivindicación 1, y dicho segundo p�ptido es un p�ptido inmunog�nico, según la reivindicación 2. - 9. Kit de partes que comprende, en formulaciones separadas, un primer polip�ptido quimérico que comprende dos, tres o más ep�topos crípticos restringidos por HLAB *0702, y un segundo polip�ptido quimérico que comprende los35 ep�topos inmunog�nicos restringidos por HLA-B*0702 cognados a los ep�topos crípticos restringidos por HLAB*0702 comprendidos en el primer polip�ptido quimérico, en el que dicho primer polip�ptido quimérico es un polip�ptido quimérico, según la reivindicación 3, y dicho segundo polip�ptido quimérico es un polip�ptido quimérico, según la reivindicación 4.40 10. Kit, según la reivindicación 8 o la reivindicación 9, que es un kit de vacunación, en el que dichos primer y segundo p�ptidos o polip�ptidos quiméricos est�n en dosis de vacunación separadas.
- 11. Kit de vacunación, según la reivindicación 10, que comprende 2 � 3 dosis de segundo p�ptido o polip�ptidoquim�rico, y 3, 4, 5, 6 o hasta 50 dosis de primer p�ptido o polip�ptido quimérico. 45
- 12. Vacuna, según la reivindicación 7, o kit de vacunación, según la reivindicación 10 o la reivindicación 11, en la que cada dosis comprende de 1 a 5 mg de p�ptido o de 1 a 20 mg de polip�ptido quimérico.
- 13. Vacuna, según la reivindicación 7 o la reivindicación 12, o kit de vacunación según cualquiera de las 50 reivindicaciones 9 a 11 en la que las dosis de vacunación se formulan para inyección subcutánea.
- 14. Ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702, según la reivindicación 1, o un polip�ptido ep�topo inmunog�nico según la reivindicación 2, o un polip�ptido quimérico según la reivindicación 3 o la reivindicación 4, o un ácido nucleico según la reivindicación 5, para su utilización en inmunoterapia preventiva o curativa contra el cáncer.
-
- 15.
- P�ptido, según la reivindicación 1, para su utilización para el mantenimiento de la respuesta inmune de CTL iniciado por su p�ptido cognado optimizado, o por un polip�ptido que contiene el mismo.
-
- 16.
- Polip�ptido quimérico, según la reivindicación 3, para su utilización para mantener la respuesta inmune iniciada
60 por CTL ya sea por su polip�ptido quimérico optimizado cognado, o por p�ptidos optimizados cognados a dicho ep�topos crípticos. - 17. P�ptido inmunog�nico, según la reivindicación 2, para su utilización para iniciar una respuesta inmune de CTLcontra su ep�topo críptico restringido por HLA-B*0702 cognado. 65
- 18. Polip�ptido quimérico, según la reivindicación 4, para su utilización para iniciar una respuesta inmune de CTL contra los ep�topos crípticos restringidos por HLA-B*0702 cognados a los ep�topos presentes en dicho polip�ptido quimérico.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| PCT/IB2006/002937 WO2008010010A1 (en) | 2006-07-12 | 2006-07-12 | Identification, optimization and use of cryptic hla-b7 epitopes for immunotherapy |
| WOPCT/IB2006/002937 | 2006-07-12 | ||
| PCT/IB2007/003054 WO2008010098A2 (en) | 2006-07-12 | 2007-07-12 | Identification, optimization and use of cryptic hla-b7 epitopes for immunotherapy |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| ES2476919T3 true ES2476919T3 (es) | 2014-07-15 |
Family
ID=37686075
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| ES07825358.0T Active ES2476919T3 (es) | 2006-07-12 | 2007-07-12 | Identificación, optimización y utilización de ep�topos crípticos HLA-B7 para inmunoterapia |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (3) | US8465747B2 (es) |
| EP (1) | EP2041160B1 (es) |
| JP (1) | JP5717338B2 (es) |
| KR (1) | KR101454935B1 (es) |
| CN (1) | CN101495501B (es) |
| CA (1) | CA2656883A1 (es) |
| DK (1) | DK2041160T3 (es) |
| ES (1) | ES2476919T3 (es) |
| PL (1) | PL2041160T3 (es) |
| PT (1) | PT2041160E (es) |
| WO (2) | WO2008010010A1 (es) |
Families Citing this family (9)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2010112962A1 (en) * | 2009-04-02 | 2010-10-07 | Vaxon Biotech | Identification, optimization and use of cryptic hla-a24 epitopes for immunotherapy |
| US10024868B2 (en) | 2009-06-09 | 2018-07-17 | Vaxon Biotech | Identification, optimization and use of shared HLA-B*0702 epitopes for immunotherapy |
| KR20150006000A (ko) * | 2012-05-01 | 2015-01-15 | 제넨테크, 인크. | 항-pmel17 항체 및 면역접합체 |
| EP2977059A1 (en) * | 2014-07-22 | 2016-01-27 | Vaxon Biotech | Immunogenic polypeptide composed of HLA-B7 restricted tumor antigen-derived optimized cryptic peptides, and uses thereof |
| JP6255360B2 (ja) * | 2015-03-04 | 2017-12-27 | ヴァクソン バイオテックVaxon Biotech | 共有hla−b*0702エピトープの同定、最適化および免疫療法のための使用 |
| US11058751B1 (en) | 2020-11-20 | 2021-07-13 | Think Therapeutics, Inc. | Compositions for optimized RAS peptide vaccines |
| CN116710115A (zh) | 2020-11-20 | 2023-09-05 | 思维疗法股份有限公司 | 用于优化的肽疫苗的组合物和方法 |
| US11421015B2 (en) | 2020-12-07 | 2022-08-23 | Think Therapeutics, Inc. | Method of compact peptide vaccines using residue optimization |
| US11464842B1 (en) | 2021-04-28 | 2022-10-11 | Think Therapeutics, Inc. | Compositions and method for optimized peptide vaccines using residue optimization |
Family Cites Families (11)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6420518B1 (en) * | 1997-04-04 | 2002-07-16 | Genetech, Inc. | Insulin-like growth factor agonist molecules |
| CA2323632A1 (en) * | 1998-03-13 | 1999-09-16 | Epimmune Inc. | Hla-binding peptides and their uses |
| US7030211B1 (en) * | 1998-07-08 | 2006-04-18 | Gemvax As | Antigenic peptides derived from telomerase |
| US20050003483A1 (en) * | 2000-10-10 | 2005-01-06 | Hildebrand William H. | Comparative ligand mapping from MHC class 1 positive cells |
| US20040121946A9 (en) * | 2000-12-11 | 2004-06-24 | John Fikes | Inducing cellular immune responses to her2/neu using peptide and nucleic acid compositions |
| AU2003274463B2 (en) * | 2002-06-10 | 2009-10-29 | University Of Rochester | Gene differentially expressed in breast and bladder cancer and encoded polypeptides |
| JP2005533855A (ja) * | 2002-07-24 | 2005-11-10 | インターツェル・アクチェンゲゼルシャフト | 病原性ウイルスからの別のリーディングフレームによりコードされる抗原 |
| WO2005049072A2 (en) * | 2003-11-24 | 2005-06-02 | Cancer Research Technology Ltd | Therapeutic cancer vaccine with fragments of trag-3 |
| US8663645B2 (en) | 2005-05-09 | 2014-03-04 | Vaxon Biotech | Use of native peptides and their optimized derivatives for vaccination |
| EP1748067A1 (en) * | 2005-07-29 | 2007-01-31 | Institut Pasteur | Polynucleotides encoding MHC class I-restricted hTERT epitopes, analogues thereof or polyepitopes |
| JP2009523817A (ja) * | 2006-01-19 | 2009-06-25 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア | ヒトテロメラーゼ逆転写酵素ペプチド |
-
2006
- 2006-07-12 WO PCT/IB2006/002937 patent/WO2008010010A1/en not_active Ceased
-
2007
- 2007-07-12 ES ES07825358.0T patent/ES2476919T3/es active Active
- 2007-07-12 KR KR1020097002822A patent/KR101454935B1/ko active Active
- 2007-07-12 US US12/373,408 patent/US8465747B2/en active Active
- 2007-07-12 DK DK07825358.0T patent/DK2041160T3/da active
- 2007-07-12 WO PCT/IB2007/003054 patent/WO2008010098A2/en not_active Ceased
- 2007-07-12 CN CN2007800262110A patent/CN101495501B/zh active Active
- 2007-07-12 EP EP07825358.0A patent/EP2041160B1/en active Active
- 2007-07-12 PT PT78253580T patent/PT2041160E/pt unknown
- 2007-07-12 JP JP2009519005A patent/JP5717338B2/ja active Active
- 2007-07-12 CA CA002656883A patent/CA2656883A1/en not_active Abandoned
- 2007-07-12 PL PL07825358T patent/PL2041160T3/pl unknown
-
2013
- 2013-06-17 US US13/920,003 patent/US20130266598A1/en not_active Abandoned
-
2017
- 2017-03-28 US US15/472,043 patent/US20170202936A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN101495501A (zh) | 2009-07-29 |
| US20110256163A1 (en) | 2011-10-20 |
| US8465747B2 (en) | 2013-06-18 |
| KR101454935B1 (ko) | 2014-10-28 |
| JP2009542251A (ja) | 2009-12-03 |
| EP2041160B1 (en) | 2014-04-02 |
| CN101495501B (zh) | 2013-11-13 |
| US20170202936A1 (en) | 2017-07-20 |
| PT2041160E (pt) | 2014-07-11 |
| CA2656883A1 (en) | 2008-01-24 |
| WO2008010010A1 (en) | 2008-01-24 |
| PL2041160T3 (pl) | 2014-09-30 |
| JP5717338B2 (ja) | 2015-05-13 |
| KR20090029833A (ko) | 2009-03-23 |
| WO2008010098A3 (en) | 2008-05-02 |
| DK2041160T3 (da) | 2014-07-07 |
| WO2008010098A2 (en) | 2008-01-24 |
| EP2041160A2 (en) | 2009-04-01 |
| US20130266598A1 (en) | 2013-10-10 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| DK2413956T3 (en) | IDENTIFICATION, OPTIMIZATION AND USE OF cryptic HLA-A24-EPITOPES FOR IMMUNOTHERAPY | |
| US20170202936A1 (en) | Identification, Optimization And Use Of Cryptic HLA-B7 Epitopes For Immunotherapy | |
| AU2005265182B2 (en) | Epitope analogs | |
| AU2006259307B2 (en) | Epitope analogues | |
| DK2341142T3 (en) | HLA-A * 1101-restricted WT1 peptide or pharmaceutical composition comprising this | |
| US20100074945A1 (en) | Mutated ras peptides for generation of cd8+ cytotoxic t lymphocytes | |
| PT1988163E (pt) | Péptido wt1 restrito para hla-a*3303 e composição farmacêutica compreendendo o mesmo | |
| JP2012529283A (ja) | 共有hla−b*0702エピトープの同定、最適化および免疫療法のための使用 | |
| ES2296778T3 (es) | Procedimiento de seleccion de peptidos utilizables en inmunoterapia. | |
| ES2340357T3 (es) | Antigeno tumoral. | |
| HK1165289A (en) | Identification, optimization and use of cryptic hla-a24 epitopes for immunotherapy | |
| HK1165289B (en) | Identification, optimization and use of cryptic hla-a24 epitopes for immunotherapy | |
| Savelyeva | Juan Campos-Perez1, Jason Rice1, David Escors2, 3, Mary Collins2, Alex Paterson1, Natalia Savelyeva1* and Freda K Stevenson1*. 1Genetic Vaccine Group, Cancer Sciences Unit, Faculty of Medicine, University of Southampton, Southampton, UK and 2Department of Immunology and Molecular Pathology, Windeyer Institute, University College, London, UK and 3Biomedical | |
| AU2013201661A1 (en) | Epitope Analogues |