ES2587395T3 - Procedimientos para la producción de células IPS usando un enfoque no vírico - Google Patents
Procedimientos para la producción de células IPS usando un enfoque no vírico Download PDFInfo
- Publication number
- ES2587395T3 ES2587395T3 ES09759392.5T ES09759392T ES2587395T3 ES 2587395 T3 ES2587395 T3 ES 2587395T3 ES 09759392 T ES09759392 T ES 09759392T ES 2587395 T3 ES2587395 T3 ES 2587395T3
- Authority
- ES
- Spain
- Prior art keywords
- cells
- cell
- differentiation
- stem cells
- dna
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title abstract description 42
- 210000004263 induced pluripotent stem cell Anatomy 0.000 title description 12
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 title description 8
- 238000013459 approach Methods 0.000 title description 6
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title description 6
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 abstract description 171
- 239000013598 vector Substances 0.000 abstract description 64
- 230000010076 replication Effects 0.000 abstract description 35
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 abstract description 33
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 abstract description 33
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 abstract description 13
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 7
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 abstract description 4
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 abstract description 4
- 238000012258 culturing Methods 0.000 abstract description 2
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 abstract 1
- 108010031111 EBV-encoded nuclear antigen 1 Proteins 0.000 description 47
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 41
- 230000008672 reprogramming Effects 0.000 description 41
- 210000001671 embryonic stem cell Anatomy 0.000 description 39
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 37
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 36
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 description 36
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 31
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 30
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 28
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 28
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 28
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 description 27
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 26
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 24
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 22
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 22
- 241001529453 unidentified herpesvirus Species 0.000 description 22
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 21
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 16
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 15
- 210000001082 somatic cell Anatomy 0.000 description 15
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 14
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 14
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 14
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 14
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 13
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 12
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 12
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 12
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 11
- 230000006870 function Effects 0.000 description 11
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 11
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 11
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 11
- 230000008569 process Effects 0.000 description 11
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 11
- 108020004684 Internal Ribosome Entry Sites Proteins 0.000 description 10
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 10
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 10
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 9
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 8
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 7
- 101100257359 Caenorhabditis elegans sox-2 gene Proteins 0.000 description 7
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 7
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 7
- 101100257363 Mus musculus Sox2 gene Proteins 0.000 description 7
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 7
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 7
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 7
- 210000001778 pluripotent stem cell Anatomy 0.000 description 7
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 7
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 6
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 6
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 6
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 6
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 6
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 6
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 6
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 6
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 6
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 description 5
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 5
- 210000002304 esc Anatomy 0.000 description 5
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 5
- 230000004568 DNA-binding Effects 0.000 description 4
- 244000187656 Eucalyptus cornuta Species 0.000 description 4
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 4
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 4
- 108010077850 Nuclear Localization Signals Proteins 0.000 description 4
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 4
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 4
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 description 4
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 4
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 4
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 4
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 4
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 4
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 4
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 4
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 4
- 210000002257 embryonic structure Anatomy 0.000 description 4
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 4
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 4
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 4
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 4
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 4
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 4
- -1 phosphotreonine Chemical compound 0.000 description 4
- 238000011160 research Methods 0.000 description 4
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 4
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 3
- 241000701822 Bovine papillomavirus Species 0.000 description 3
- 230000004543 DNA replication Effects 0.000 description 3
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 3
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 3
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- 108090000379 Fibroblast growth factor 2 Proteins 0.000 description 3
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 3
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 3
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 3
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 3
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 3
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 3
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 3
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 description 3
- 230000024245 cell differentiation Effects 0.000 description 3
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 3
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 3
- 230000032459 dedifferentiation Effects 0.000 description 3
- 238000006471 dimerization reaction Methods 0.000 description 3
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 3
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 description 3
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 3
- 210000001654 germ layer Anatomy 0.000 description 3
- 210000003958 hematopoietic stem cell Anatomy 0.000 description 3
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 3
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 101150111214 lin-28 gene Proteins 0.000 description 3
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 3
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 3
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 description 3
- 230000000394 mitotic effect Effects 0.000 description 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 3
- 210000000653 nervous system Anatomy 0.000 description 3
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 3
- 210000003463 organelle Anatomy 0.000 description 3
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 3
- 230000001172 regenerating effect Effects 0.000 description 3
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 3
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 3
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 3
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 3
- XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N Arg-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- 241000050051 Chelone glabra Species 0.000 description 2
- 108010035563 Chloramphenicol O-acetyltransferase Proteins 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- 102000003974 Fibroblast growth factor 2 Human genes 0.000 description 2
- 241000701047 Gallid alphaherpesvirus 2 Species 0.000 description 2
- 108700007698 Genetic Terminator Regions Proteins 0.000 description 2
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 2
- 208000007766 Kaposi sarcoma Diseases 0.000 description 2
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 2
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- QIAFMBKCNZACKA-UHFFFAOYSA-N N-benzoylglycine Chemical compound OC(=O)CNC(=O)C1=CC=CC=C1 QIAFMBKCNZACKA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 2
- 108020005091 Replication Origin Proteins 0.000 description 2
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 2
- 241000282695 Saimiri Species 0.000 description 2
- 102000006601 Thymidine Kinase Human genes 0.000 description 2
- 108020004440 Thymidine kinase Proteins 0.000 description 2
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 2
- 210000004504 adult stem cell Anatomy 0.000 description 2
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 239000012736 aqueous medium Substances 0.000 description 2
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 2
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 2
- 108010006025 bovine growth hormone Proteins 0.000 description 2
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 230000022131 cell cycle Effects 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 2
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 2
- 210000002249 digestive system Anatomy 0.000 description 2
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 2
- 210000003981 ectoderm Anatomy 0.000 description 2
- 230000002500 effect on skin Effects 0.000 description 2
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 2
- 210000002308 embryonic cell Anatomy 0.000 description 2
- 210000001900 endoderm Anatomy 0.000 description 2
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 2
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 description 2
- 238000001476 gene delivery Methods 0.000 description 2
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 2
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 2
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 2
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 2
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 2
- 210000003716 mesoderm Anatomy 0.000 description 2
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 2
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- 150000003904 phospholipids Chemical class 0.000 description 2
- 210000002826 placenta Anatomy 0.000 description 2
- BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N platinum Chemical compound [Pt] BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 2
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 2
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 description 2
- RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N puromycin Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C[C@H](N)C(=O)N[C@H]1[C@@H](O)[C@H](N2C3=NC=NC(=C3N=C2)N(C)C)O[C@@H]1CO RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N 0.000 description 2
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 2
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 2
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 2
- FSYKKLYZXJSNPZ-UHFFFAOYSA-N sarcosine Chemical compound C[NH2+]CC([O-])=O FSYKKLYZXJSNPZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 230000023895 stem cell maintenance Effects 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 230000005758 transcription activity Effects 0.000 description 2
- WFKWXMTUELFFGS-UHFFFAOYSA-N tungsten Chemical compound [W] WFKWXMTUELFFGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052721 tungsten Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000010937 tungsten Substances 0.000 description 2
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 2
- 239000002699 waste material Substances 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- LJRDOKAZOAKLDU-UDXJMMFXSA-N (2s,3s,4r,5r,6r)-5-amino-2-(aminomethyl)-6-[(2r,3s,4r,5s)-5-[(1r,2r,3s,5r,6s)-3,5-diamino-2-[(2s,3r,4r,5s,6r)-3-amino-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-6-hydroxycyclohexyl]oxy-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxyoxane-3,4-diol;sulfuric ac Chemical compound OS(O)(=O)=O.N[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](N)C[C@@H](N)[C@@H]2O)O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)N)O[C@@H]1CO LJRDOKAZOAKLDU-UDXJMMFXSA-N 0.000 description 1
- LAQPKDLYOBZWBT-NYLDSJSYSA-N (2s,4s,5r,6r)-5-acetamido-2-{[(2s,3r,4s,5s,6r)-2-{[(2r,3r,4r,5r)-5-acetamido-1,2-dihydroxy-6-oxo-4-{[(2s,3s,4r,5s,6s)-3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxy}hexan-3-yl]oxy}-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy}-4-hydroxy-6-[(1r,2r)-1,2,3-trihydrox Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@H]([C@@H](NC(C)=O)C=O)[C@@H]([C@H](O)CO)O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@]2(O[C@H]([C@H](NC(C)=O)[C@@H](O)C2)[C@H](O)[C@H](O)CO)C(O)=O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 LAQPKDLYOBZWBT-NYLDSJSYSA-N 0.000 description 1
- BWKMGYQJPOAASG-UHFFFAOYSA-N 1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxylic acid Chemical compound C1=CC=C2CNC(C(=O)O)CC2=C1 BWKMGYQJPOAASG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VVJYUAYZJAKGRQ-BGZDPUMWSA-N 1-[(2r,4r,5s,6r)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)C1 VVJYUAYZJAKGRQ-BGZDPUMWSA-N 0.000 description 1
- TXHAHOVNFDVCCC-UHFFFAOYSA-N 2-(tert-butylazaniumyl)acetate Chemical compound CC(C)(C)NCC(O)=O TXHAHOVNFDVCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BRMWTNUJHUMWMS-UHFFFAOYSA-N 3-Methylhistidine Natural products CN1C=NC(CC(N)C(O)=O)=C1 BRMWTNUJHUMWMS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940117976 5-hydroxylysine Drugs 0.000 description 1
- 241000589158 Agrobacterium Species 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101100510259 Caenorhabditis elegans klf-2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100257372 Caenorhabditis elegans sox-3 gene Proteins 0.000 description 1
- 108010077544 Chromatin Proteins 0.000 description 1
- 108091033380 Coding strand Proteins 0.000 description 1
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- 230000007067 DNA methylation Effects 0.000 description 1
- 108010008286 DNA nucleotidylexotransferase Proteins 0.000 description 1
- 241000450599 DNA viruses Species 0.000 description 1
- 102000052510 DNA-Binding Proteins Human genes 0.000 description 1
- 101710096438 DNA-binding protein Proteins 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 102100024746 Dihydrofolate reductase Human genes 0.000 description 1
- 101100118093 Drosophila melanogaster eEF1alpha2 gene Proteins 0.000 description 1
- 206010059866 Drug resistance Diseases 0.000 description 1
- YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N Epihygromycin Natural products OC1C(O)C(C(=O)C)OC1OC(C(=C1)O)=CC=C1C=C(C)C(=O)NC1C(O)C(O)C2OCOC2C1O YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 1
- 101150099612 Esrrb gene Proteins 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- 108091092566 Extrachromosomal DNA Proteins 0.000 description 1
- 102100024785 Fibroblast growth factor 2 Human genes 0.000 description 1
- 238000012413 Fluorescence activated cell sorting analysis Methods 0.000 description 1
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 1
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 1
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 1
- CCQOOWAONKGYKQ-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)CN CCQOOWAONKGYKQ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 229930186217 Glycolipid Natural products 0.000 description 1
- 108010043121 Green Fluorescent Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000049983 HMGA1a Human genes 0.000 description 1
- 108700039142 HMGA1a Proteins 0.000 description 1
- 229940121710 HMGCoA reductase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 101001033280 Homo sapiens Cytokine receptor common subunit beta Proteins 0.000 description 1
- 101000984042 Homo sapiens Protein lin-28 homolog A Proteins 0.000 description 1
- PMMYEEVYMWASQN-DMTCNVIQSA-N Hydroxyproline Chemical compound O[C@H]1CN[C@H](C(O)=O)C1 PMMYEEVYMWASQN-DMTCNVIQSA-N 0.000 description 1
- XQFRJNBWHJMXHO-RRKCRQDMSA-N IDUR Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C(I)=C1 XQFRJNBWHJMXHO-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 1
- 108090001061 Insulin Proteins 0.000 description 1
- 101710125507 Integrase/recombinase Proteins 0.000 description 1
- 108010061833 Integrases Proteins 0.000 description 1
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 1
- 108700021430 Kruppel-Like Factor 4 Proteins 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- ZQISRDCJNBUVMM-UHFFFAOYSA-N L-Histidinol Natural products OCC(N)CC1=CN=CN1 ZQISRDCJNBUVMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N L-Ornithine Chemical compound NCCC[C@H](N)C(O)=O AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 125000000998 L-alanino group Chemical group [H]N([*])[C@](C([H])([H])[H])([H])C(=O)O[H] 0.000 description 1
- ZGUNAGUHMKGQNY-ZETCQYMHSA-N L-alpha-phenylglycine zwitterion Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)C1=CC=CC=C1 ZGUNAGUHMKGQNY-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- RHGKLRLOHDJJDR-BYPYZUCNSA-N L-citrulline Chemical compound NC(=O)NCCC[C@H]([NH3+])C([O-])=O RHGKLRLOHDJJDR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- LCGISIDBXHGCDW-VKHMYHEASA-N L-glutamine amide Chemical compound NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O LCGISIDBXHGCDW-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- ZQISRDCJNBUVMM-YFKPBYRVSA-N L-histidinol Chemical compound OC[C@@H](N)CC1=CNC=N1 ZQISRDCJNBUVMM-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- 125000000393 L-methionino group Chemical group [H]OC(=O)[C@@]([H])(N([H])[*])C([H])([H])C(SC([H])([H])[H])([H])[H] 0.000 description 1
- LRQKBLKVPFOOQJ-YFKPBYRVSA-N L-norleucine Chemical compound CCCC[C@H]([NH3+])C([O-])=O LRQKBLKVPFOOQJ-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 125000000510 L-tryptophano group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C2N([H])C([H])=C(C([H])([H])[C@@]([H])(C(O[H])=O)N([H])[*])C2=C1[H] 0.000 description 1
- 241000713666 Lentivirus Species 0.000 description 1
- 239000000232 Lipid Bilayer Substances 0.000 description 1
- 102000043129 MHC class I family Human genes 0.000 description 1
- 108091054437 MHC class I family Proteins 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- 101100310657 Mus musculus Sox1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100310645 Mus musculus Sox15 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100257376 Mus musculus Sox3 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- 108091057508 Myc family Proteins 0.000 description 1
- 101710135898 Myc proto-oncogene protein Proteins 0.000 description 1
- 102100038895 Myc proto-oncogene protein Human genes 0.000 description 1
- JDHILDINMRGULE-LURJTMIESA-N N(pros)-methyl-L-histidine Chemical compound CN1C=NC=C1C[C@H](N)C(O)=O JDHILDINMRGULE-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- JJIHLJJYMXLCOY-BYPYZUCNSA-N N-acetyl-L-serine Chemical compound CC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O JJIHLJJYMXLCOY-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- PYUSHNKNPOHWEZ-YFKPBYRVSA-N N-formyl-L-methionine Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC=O PYUSHNKNPOHWEZ-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- RHGKLRLOHDJJDR-UHFFFAOYSA-N Ndelta-carbamoyl-DL-ornithine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=O RHGKLRLOHDJJDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 1
- 102000008297 Nuclear Matrix-Associated Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010035916 Nuclear Matrix-Associated Proteins Proteins 0.000 description 1
- BZQFBWGGLXLEPQ-UHFFFAOYSA-N O-phosphoryl-L-serine Natural products OC(=O)C(N)COP(O)(O)=O BZQFBWGGLXLEPQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AHLPHDHHMVZTML-UHFFFAOYSA-N Orn-delta-NH2 Natural products NCCCC(N)C(O)=O AHLPHDHHMVZTML-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UTJLXEIPEHZYQJ-UHFFFAOYSA-N Ornithine Natural products OC(=O)C(C)CCCN UTJLXEIPEHZYQJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100035593 POU domain, class 2, transcription factor 1 Human genes 0.000 description 1
- 101710084414 POU domain, class 2, transcription factor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101710126211 POU domain, class 5, transcription factor 1 Proteins 0.000 description 1
- 241001631646 Papillomaviridae Species 0.000 description 1
- 241000709664 Picornaviridae Species 0.000 description 1
- 208000000474 Poliomyelitis Diseases 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100025460 Protein lin-28 homolog A Human genes 0.000 description 1
- 230000007022 RNA scission Effects 0.000 description 1
- 230000006819 RNA synthesis Effects 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 101150086694 SLC22A3 gene Proteins 0.000 description 1
- 108010077895 Sarcosine Proteins 0.000 description 1
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 1
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L Sulfate Chemical compound [O-]S([O-])(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000024932 T cell mediated immunity Effects 0.000 description 1
- 206010043276 Teratoma Diseases 0.000 description 1
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 description 1
- 101710150448 Transcriptional regulator Myc Proteins 0.000 description 1
- 206010052779 Transplant rejections Diseases 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700005077 Viral Genes Proteins 0.000 description 1
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 description 1
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 description 1
- 108010084455 Zeocin Proteins 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 208000012927 adermatoglyphia Diseases 0.000 description 1
- 238000013019 agitation Methods 0.000 description 1
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 229940009098 aspartate Drugs 0.000 description 1
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- WPIHMWBQRSAMDE-YCZTVTEBSA-N beta-D-galactosyl-(1->4)-beta-D-galactosyl-N-(pentacosanoyl)sphingosine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O[C@@H]2O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]2O)[C@H](O)[C@H]1O)[C@H](O)\C=C\CCCCCCCCCCCCC WPIHMWBQRSAMDE-YCZTVTEBSA-N 0.000 description 1
- 239000003012 bilayer membrane Substances 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 210000001109 blastomere Anatomy 0.000 description 1
- 210000000601 blood cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000006664 bond formation reaction Methods 0.000 description 1
- 210000000988 bone and bone Anatomy 0.000 description 1
- 210000004958 brain cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- UHBYWPGGCSDKFX-UHFFFAOYSA-N carboxyglutamic acid Chemical compound OC(=O)C(N)CC(C(O)=O)C(O)=O UHBYWPGGCSDKFX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 1
- 230000011712 cell development Effects 0.000 description 1
- 230000003915 cell function Effects 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 230000010307 cell transformation Effects 0.000 description 1
- 230000002032 cellular defenses Effects 0.000 description 1
- 230000033077 cellular process Effects 0.000 description 1
- 230000005754 cellular signaling Effects 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 210000003483 chromatin Anatomy 0.000 description 1
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 1
- 229960002173 citrulline Drugs 0.000 description 1
- 235000013477 citrulline Nutrition 0.000 description 1
- 238000004737 colorimetric analysis Methods 0.000 description 1
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- 230000021040 cytoplasmic transport Effects 0.000 description 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 230000009849 deactivation Effects 0.000 description 1
- YSMODUONRAFBET-UHFFFAOYSA-N delta-DL-hydroxylysine Natural products NCC(O)CCC(N)C(O)=O YSMODUONRAFBET-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229950006137 dexfosfoserine Drugs 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 108020001096 dihydrofolate reductase Proteins 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 238000002224 dissection Methods 0.000 description 1
- PMMYEEVYMWASQN-UHFFFAOYSA-N dl-hydroxyproline Natural products OC1C[NH2+]C(C([O-])=O)C1 PMMYEEVYMWASQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 238000001976 enzyme digestion Methods 0.000 description 1
- 210000001339 epidermal cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000002514 epidermal stem cell Anatomy 0.000 description 1
- YSMODUONRAFBET-UHNVWZDZSA-N erythro-5-hydroxy-L-lysine Chemical compound NC[C@H](O)CC[C@H](N)C(O)=O YSMODUONRAFBET-UHNVWZDZSA-N 0.000 description 1
- 210000000646 extraembryonic cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000002219 extraembryonic membrane Anatomy 0.000 description 1
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 1
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 1
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 1
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 1
- 229930195712 glutamate Natural products 0.000 description 1
- 125000003630 glycyl group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 1
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 1
- 230000003394 haemopoietic effect Effects 0.000 description 1
- 210000003780 hair follicle Anatomy 0.000 description 1
- 210000003494 hepatocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229960002591 hydroxyproline Drugs 0.000 description 1
- 125000001841 imino group Chemical group [H]N=* 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 238000002513 implantation Methods 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 208000014674 injury Diseases 0.000 description 1
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 210000005061 intracellular organelle Anatomy 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 1
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 1
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 1
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 108010082117 matrigel Proteins 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 238000013160 medical therapy Methods 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 1
- 210000002901 mesenchymal stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 239000002923 metal particle Substances 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 150000007522 mineralic acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000011278 mitosis Effects 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 210000000472 morula Anatomy 0.000 description 1
- 210000002894 multi-fate stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 230000000869 mutational effect Effects 0.000 description 1
- 210000000107 myocyte Anatomy 0.000 description 1
- AEMBWNDIEFEPTH-UHFFFAOYSA-N n-tert-butyl-n-ethylnitrous amide Chemical compound CCN(N=O)C(C)(C)C AEMBWNDIEFEPTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 1
- 210000005036 nerve Anatomy 0.000 description 1
- 210000001178 neural stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000002569 neuron Anatomy 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 230000012223 nuclear import Effects 0.000 description 1
- 210000000299 nuclear matrix Anatomy 0.000 description 1
- 230000030648 nucleus localization Effects 0.000 description 1
- CQYBNXGHMBNGCG-RNJXMRFFSA-N octahydroindole-2-carboxylic acid Chemical compound C1CCC[C@H]2N[C@H](C(=O)O)C[C@@H]21 CQYBNXGHMBNGCG-RNJXMRFFSA-N 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 229960003104 ornithine Drugs 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 239000011049 pearl Substances 0.000 description 1
- 229960001639 penicillamine Drugs 0.000 description 1
- 230000002688 persistence Effects 0.000 description 1
- 230000002085 persistent effect Effects 0.000 description 1
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CWCMIVBLVUHDHK-ZSNHEYEWSA-N phleomycin D1 Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)NCCC=1SC[C@@H](N=1)C=1SC=C(N=1)C(=O)NCCCCNC(N)=N)[C@@H](O[C@H]1[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1)O[C@@H]1[C@H]([C@@H](OC(N)=O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)C=1N=CNC=1)C(=O)C1=NC([C@H](CC(N)=O)NC[C@H](N)C(N)=O)=NC(N)=C1C CWCMIVBLVUHDHK-ZSNHEYEWSA-N 0.000 description 1
- 150000004713 phosphodiesters Chemical class 0.000 description 1
- BZQFBWGGLXLEPQ-REOHCLBHSA-N phosphoserine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)COP(O)(O)=O BZQFBWGGLXLEPQ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- DCWXELXMIBXGTH-UHFFFAOYSA-N phosphotyrosine Chemical compound OC(=O)C(N)CC1=CC=C(OP(O)(O)=O)C=C1 DCWXELXMIBXGTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000027086 plasmid maintenance Effects 0.000 description 1
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 1
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 1
- 229910052697 platinum Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000000379 polymerizing effect Effects 0.000 description 1
- 230000001124 posttranscriptional effect Effects 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 230000004063 proteosomal degradation Effects 0.000 description 1
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 1
- 229950010131 puromycin Drugs 0.000 description 1
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 1
- 108010054624 red fluorescent protein Proteins 0.000 description 1
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000022532 regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 1
- 230000008439 repair process Effects 0.000 description 1
- 230000003252 repetitive effect Effects 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 230000002207 retinal effect Effects 0.000 description 1
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 229940043230 sarcosine Drugs 0.000 description 1
- HBMJWWWQQXIZIP-UHFFFAOYSA-N silicon carbide Chemical compound [Si+]#[C-] HBMJWWWQQXIZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910010271 silicon carbide Inorganic materials 0.000 description 1
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 1
- 210000001988 somatic stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 1
- 230000002269 spontaneous effect Effects 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 1
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 1
- 230000008093 supporting effect Effects 0.000 description 1
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 230000002459 sustained effect Effects 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 210000003014 totipotent stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- FGMPLJWBKKVCDB-UHFFFAOYSA-N trans-L-hydroxy-proline Natural products ON1CCCC1C(O)=O FGMPLJWBKKVCDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091008023 transcriptional regulators Proteins 0.000 description 1
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 230000001573 trophoblastic effect Effects 0.000 description 1
- 230000007306 turnover Effects 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000003954 umbilical cord Anatomy 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- 210000002229 urogenital system Anatomy 0.000 description 1
- 230000002477 vacuolizing effect Effects 0.000 description 1
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 1
- 108700026220 vif Genes Proteins 0.000 description 1
- 230000007442 viral DNA synthesis Effects 0.000 description 1
- 210000000605 viral structure Anatomy 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002424 x-ray crystallography Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
- C12N5/06—Animal cells or tissues; Human cells or tissues
- C12N5/0602—Vertebrate cells
- C12N5/0696—Artificially induced pluripotent stem cells, e.g. iPS
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2501/00—Active agents used in cell culture processes, e.g. differentation
- C12N2501/60—Transcription factors
- C12N2501/602—Sox-2
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2501/00—Active agents used in cell culture processes, e.g. differentation
- C12N2501/60—Transcription factors
- C12N2501/603—Oct-3/4
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2501/00—Active agents used in cell culture processes, e.g. differentation
- C12N2501/60—Transcription factors
- C12N2501/604—Klf-4
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2501/00—Active agents used in cell culture processes, e.g. differentation
- C12N2501/60—Transcription factors
- C12N2501/605—Nanog
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2501/00—Active agents used in cell culture processes, e.g. differentation
- C12N2501/60—Transcription factors
- C12N2501/606—Transcription factors c-Myc
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2501/00—Active agents used in cell culture processes, e.g. differentation
- C12N2501/60—Transcription factors
- C12N2501/608—Lin28
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2510/00—Genetically modified cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2710/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
- C12N2710/00011—Details
- C12N2710/16011—Herpesviridae
- C12N2710/16211—Lymphocryptovirus, e.g. human herpesvirus 4, Epstein-Barr Virus
- C12N2710/16222—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2800/00—Nucleic acids vectors
- C12N2800/10—Plasmid DNA
- C12N2800/106—Plasmid DNA for vertebrates
- C12N2800/107—Plasmid DNA for vertebrates for mammalian
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2800/00—Nucleic acids vectors
- C12N2800/10—Plasmid DNA
- C12N2800/108—Plasmid DNA episomal vectors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2800/00—Nucleic acids vectors
- C12N2800/24—Vectors characterised by the absence of particular element, e.g. selectable marker, viral origin of replication
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2820/00—Vectors comprising a special origin of replication system
- C12N2820/60—Vectors comprising a special origin of replication system from viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2840/00—Vectors comprising a special translation-regulating system
- C12N2840/10—Vectors comprising a special translation-regulating system regulates levels of translation
- C12N2840/105—Vectors comprising a special translation-regulating system regulates levels of translation enhancing translation
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2840/00—Vectors comprising a special translation-regulating system
- C12N2840/20—Vectors comprising a special translation-regulating system translation of more than one cistron
- C12N2840/203—Vectors comprising a special translation-regulating system translation of more than one cistron having an IRES
- C12N2840/206—Vectors comprising a special translation-regulating system translation of more than one cistron having an IRES having multiple IRES
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Developmental Biology & Embryology (AREA)
- Transplantation (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Virology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Un procedimiento para proporcionar una población celular que tiene un estado de diferenciación alterado respecto a una población celular de partida y que tiene células que están esencialmente exentas de elementos genéticos vectoriales de programación, comprendiendo el procedimiento las etapas de: a) obtener una población de partida de células que tienen un primer estado de diferenciación, b) obtener uno o más vectores de programación de la diferenciación, comprendiendo cada vector un origen de replicación y uno más módulos de expresión que codifican uno o más factores de programación de la diferenciación que, en combinación, pueden alterar el estado de diferenciación de la población celular de partida hasta un segundo estado de diferenciación, en el que uno o más de dichos módulos de expresión comprenden una secuencia nucleotídica que codifica un factor de acción en trans que se une al origen de replicación para replicar un molde extracromosómico y/o en el que las células de la población de partida expresan dicho factor de acción en trans, c) introducir el vector o vectores de programación de la diferenciación en células de la población de partida, d) cultivar las células para efectuar la expresión de dicho uno o más factores de programación de la diferenciación de tal modo que surjan los atributos consistentes con el segundo estado de diferenciación en al menos una porción de las células en las células cultivadas y e) cultivar además células que tienen los atributos durante un número suficiente de generaciones para proporcionar una población celular diana que comprenda células que tienen el segundo estado de diferenciación, pero estando dichas células esencialmente exentas de elementos genéticos vectoriales de programación.
Description
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
error inherente del dispositivo, del procedimiento que se esté empleando para determinar el valor o de la variación que exista entre los sujetos de estudio.
Resultarán evidentes otros objetos, rasgos y ventajas dados a conocer en la presente memoria a partir de la siguiente descripción detallada.
BREVE DESCRIPCIÓN DE LOS DIBUJOS
Los siguientes dibujos forman parte de la presente memoria descriptiva y se incluyen para demostrar además ciertos aspectos de la presente invención. La invención puede comprenderse mejor por referencia a uno o más de estos dibujos en combinación con la descripción detallada de realizaciones específicas presentadas en la presente memoria.
FIG. 1A-C: Genoma de EBV y origen de replicación latente del plásmido (oriP).
FIG. 2: Un modelo basado en dominios y representación de la estructura parcial de EBNA-1.
FIG. 3: Un ejemplo ilustrativo de un plásmido de esqueleto receptor usado en la presente invención.
FIG. 4: Ejemplos de módulos para integrar en un plásmido de esqueleto receptor. Los ejemplos de promotores que podrían usarse para expresión incluyen, pero sin limitación, PGK, CMV, SV40 y EF1a.
FIG. 5: Un ejemplo ilustrativo de un plásmido de reprogramación que codifica Sox-2, Oct-4, Nanog y Lin28 (opcionalmente).
DESCRIPCIÓN DE REALIZACIONES ILUSTRATIVAS
I. La presente invención
La presente invención supera varios problemas importantes con las tecnologías actuales de reprogramación o programación de la diferenciación de diversas etapas de desarrollo de células, tales como generar células madre pluripotentes inducidas que estén esencialmente exentos de vectores víricos o elementos exógenos. En contraposición con los procedimientos anteriores que usan vectores víricos integrativos, estos procedimientos usan vectores de reprogramación o programación de la diferenciación extracromosómicos, por ejemplo plásmidos basados en elementos de EBV, para transducir los factores de reprogramación o programación de la diferenciación hasta células somáticas o células madre, cultivar estas células y seleccionar en las células de progenie una o más características de células madre embrionarias o en las células atributos consistentes con el estado de diferenciación alterado deseado. Los vectores replicados extracromosómicamente, como vectores basados en elementos de EBV, no se integrarán en el genoma de la célula hospedadora y se perderán con el tiempo después de un periodo suficiente para inducir a las células hasta un estado celular pluripotente o deseado. Un rasgo inherente de estos procedimientos producirá células de progenie esencialmente exentas de elementos genéticos exógenos y una selección negativa puede facilitar el proceso. Estos procedimientos posibilitan el aislamiento de iPS o de cualquier tipo celular deseado esencialmente exento de elementos vectoriales mediante la alteración del estado de diferenciación. Por tanto, las nuevas composiciones y procedimientos posibilitarán la fabricación iPS exentos de vector u otros tipos celulares deseados para terapia sin el riesgo de mutagénesis causado por la inserción aleatoria
o expresión persistente de elementos víricos en las células. Se describen a continuación realizaciones y ventajas adicionales de la invención.
II. Definiciones
“Reprogramación” es un proceso que confiere a una célula una capacidad aumentada mensurablemente de formar progenie de al menos un nuevo tipo celular, tanto en cultivo como in vivo, distinto del que tendría en las mismas condiciones sin reprogramación. Más específicamente, la reprogramación es un proceso que confiere a una célula somática el potencial pluripotente. Esto significa, después de una proliferación suficiente, una proporción mensurable de progenie que tiene características fenotípicas del nuevo tipo celular si esencialmente dicha progenie no podría haberse formado antes de reprogramar; de otro modo, la proporción que tiene características del nuevo tipo celular es mensurablemente mayor que antes de reprogramar. En ciertas condiciones, la proporción de progenie con características del nuevo tipo celular puede ser de al menos aproximadamente un 1, 5, 25 % o más en orden de preferencia creciente.
“Programación de la diferenciación” es un proceso que cambia una célula formando progenie de al menos un nuevo tipo celular con un nuevo estado de diferenciación, tanto en cultivo como in vivo, distinto del que tendría en las mismas condiciones sin reprogramación de la diferenciación. Este proceso incluye diferenciación, desdiferenciación y transdiferenciación. “Diferenciación” es el proceso mediante el cual una célula menos especializada se vuelve un tipo celular más especializado. “Desdiferenciación” es un proceso celular en que una célula parcial o terminalmente diferenciada revierte a una etapa de desarrollo previa, tal como pluripotencia o multipotencia. “Transdiferenciación” es un proceso de transformación de un tipo celular diferenciado en otro tipo celular diferenciado.
Un “origen de replicación” ("ori") es una secuencia de ADN, p.ej. en un herpesvirus linfotrófico, que cuando está 8
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
presente en un plásmido en una célula es capaz de mantener las secuencias ligadas en el plásmido y/o en un sitio en o cerca de donde se inicia la síntesis de ADN. El ori de EBV incluye secuencias de FR (20 copias imperfectas de una repetición de 30 pb) y preferiblemente secuencias de DS, sin embargo, otros sitios de EBV se unen a EBNA-1, p.ej. las secuencias Rep* pueden sustituir a DS como origen de replicación (Kirshmaier y Sugden, 1998). Por tanto, un origen de replicación de EBV incluye secuencias FR, DS o Rep* o cualquier secuencia funcionalmente equivalente mediante modificaciones de ácido nucleico o combinación sintética derivada de las mismas. Por ejemplo, la presente invención puede usar también un origen de replicación genomanipulado de EBV, tal como mediante la inserción o mutación de elementos individuales, como se describe específicamente en Lindner, et al., 2008.
Un herpesvirus “linfotrófico” es un herpesvirus que se replica en un linfoblasto (p.ej. un linfoblasto B humano) u otro tipo celular y se replica extracromosómicamente durante al menos una parte de su ciclo vital natural. Después de infectar un hospedador, estos virus infectan latentemente el hospedador manteniendo el genoma vírico como un plásmido. El herpesvirus simple (HSV) no es un herpesvirus “linfotrótico”. Los herpesvirus linfotróficos ejemplares incluyen, pero sin limitación, EBV, herpesvirus de sarcoma de Kaposi (KSHV), herpesvirus de Saimiri (HS) y virus de la enfermedad de Marek (MDV).
Un “vector” o “constructo” (al que a veces se hace referencia como “vehículo” de suministro génico o transferencia génica) hace referencia a una macromolécula o complejo de moléculas que comprende un polinucleótido para suministrar a una célula hospedadora, tanto in vitro como in vivo.
Un “plásmido”, un tipo común de vector, es una molécula de ADN extracromosómica separada del ADN cromosómico que es capaz de replicarse independientemente del ADN cromosómico. En ciertos casos, es circular y bicatenario.
Un “molde”, como se usa en la presente memoria, es una molécula de ADN que se une específicamente a una proteína de tipo silvestre de un herpesvirus linfotrófico, correspondiendo dicha proteína de tipo silvestre a EBNA-1, como resultado de la presencia en ese molde de una secuencia de ADN que se une a la proteína de tipo silvestre con una afinidad que es al menos un 10 % de la de unión de una secuencia de ADN correspondiente al oriP de EBV por la proteína de tipo silvestre, y desde la que se inicia y/o potencia opcionalmente la transcripción del molde después de la unión de la proteína y/o la potenciación del mantenimiento de dicho molde en una célula. Un “molde integrado” es aquel que se mantiene establemente en el genoma de la célula, p.ej. integrado en un cromosoma de esa célula. Un “molde extracromosómico” es aquel que se mantiene establemente en una célula pero que no se integra en el cromosoma.
Se entiende por “constructo de expresión” o “módulo de expresión” una molécula de ácido nucleico que es capaz de dirigir la transcripción. Un constructo de expresión incluye, al menos, un promotor o una estructura funcionalmente equivalente a un promotor. Pueden incluirse también elementos adicionales tales como un potenciador y/o una señal de terminación de la transcripción.
El término “exógeno”, cuando se usa con relación a una proteína, gen, ácido nucleico o polinucleótido en una célula u organismo, hace referencia a una proteína, gen, ácido nucleico o polinucleótido que se ha introducido en la célula u organismo por medios artificiales o naturales, o con relación a una célula hace referencia a una célula que se ha aislado e introducido posteriormente en otras células o un organismo por medios artificiales o naturales. Un ácido nucleico exógeno puede ser de un organismo o célula diferente, o puede ser una o más copias adicionales de un ácido nucleico que aparece naturalmente dentro del organismo o célula. Una célula exógena puede ser de un organismo diferente, o puede ser del mismo organismo. A modo de ejemplo no limitante, un ácido nucleico exógeno está en una localización cromosómica diferente de las células naturales, o está flanqueado de otro modo por una secuencia de ácido nucleico diferente a la encontrada en la naturaleza.
El término “corresponde a” se usa en la presente memoria para indicar que una secuencia polinucleotídica es homóloga (concretamente, es idéntica, y no evolutivamente relacionada estrictamente) de todo o una porción de una secuencia polinucleotídica de referencia, o que una secuencia polipeptídica es idéntica a una secuencia polipeptídica de referencia. En contraposición, el término “complementario de” se usa en la presente memoria para indicar que la secuencia complementaria es homóloga de toda o una porción de una secuencia polinucleotídica de referencia. Para ilustración, la secuencia nucleotídica “TATAC” corresponde a una secuencia de referencia “TATAC” y es complementaria de una secuencia de referencia “GTATA”.
Un "gen," "polinucleótido”, “región de codificación”, “secuencia”, “segmento”, “fragmento” o “transgén” que “codifica” una proteína particular es una molécula de ácido nucleico que se transcribe y opcionalmente también se traduce en un producto génico, p.ej. un polipéptido, in vitro o in vivo cuando se dispone bajo el control de las secuencias reguladoras apropiadas. La región de codificación puede estar presente en forma de ADNc, ADN genómico o ARN. Cuando está presente en forma de ADN, la molécula de ácido nucleico puede ser monocatenaria (concretamente la hebra codificante) o bicatenaria. Los límites de la región de codificación se determinan por un codón de inicio en el extremo 5’ (amino) y un codón de terminación de la traducción en el extremo 3’ (carboxilo). Un gen puede incluir, pero sin limitación, ADNc de ARNm procariótico o eucariótico, secuencias de ADN genómico de ADN procariótico o eucariótico y secuencias de ADN sintético. La secuencia de terminación de la transcripción estará habitualmente
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
localizada en 3’ de la secuencia génica.
El término “elementos de control” hace referencia colectivamente a regiones promotoras, señales de poliadenilación, secuencias de terminación de la transcripción, dominios reguladores en dirección 5’, orígenes de replicación, sitios de entrada a ribosoma internos (“IRES”), potenciadores, uniones de corte y empalme y similares, que colectivamente proporcionan la replicación, transcripción, procesamiento postranscripcional y traducción de una secuencia de codificación en una célula receptora. No todos estos elementos de control tienen que estar presentes, a condición de que la secuencia de codificación seleccionada sea capaz de replicarse, transcribirse y traducirse en una célula hospedadora adecuada.
El término “promotor” se usa en la presente memoria en su sentido ordinario para hacer referencia a una región nucleotídica que comprende una secuencia reguladora de ADN, en el que la secuencia reguladora deriva de un gen que es capaz de unirse a ARN polimerasa e iniciar la transcripción de una secuencia de codificación en dirección 3’.
Se entiende por “potenciador” una secuencia de ácido nucleico que, cuando se dispone próxima a un promotor, confiere una actividad de transcripción aumentada respecto a la actividad de transcripción resultante del promotor en ausencia del dominio potenciador.
Se entiende por “ligado operativamente”, con referencia a moléculas de ácido nucleico, que dos o más moléculas de ácido nucleico (p.ej. una molécula de ácido nucleico para transcribir, un promotor y un elemento potenciador) se conectan de tal modo que permitan la transcripción de la molécula de ácido nucleico. “Ligado operativamente” con referencia a moléculas de péptido y/o polipéptido significa que dos o más moléculas de péptido y/o polipéptido están conectadas de tal modo que procuran una única cadena polipeptídica, concretamente un polipéptido de fusión, que tiene al menos una propiedad de cada péptido y/o componente polipeptídico de la fusión. El polipéptido de fusión es preferiblemente quimérico, concretamente compuesto por moléculas heterólogas.
“Homología” hace referencia al porcentaje de identidad entre dos polinucleótidos o dos polipéptidos. La correspondencia entre una secuencia y la otra puede determinarse mediante técnicas conocidas en la materia. Por ejemplo, la homología puede determinarse mediante una comparación directa de la información de secuencia entre dos moléculas polipeptídicas por alineación de la información de secuencia y uso de programas informáticos fácilmente disponibles. Como alternativa, la homología puede determinarse mediante la hibridación de polinucleótidos en condiciones que formen dúplex estables entre regiones homólogas, seguido de digestión con nucleasa o nucleasas específicas de una cadena y determinación del tamaño de los fragmentos digeridos. Dos secuencias de ADN, o polipeptídicas, son “sustancialmente homólogas” entre sí cuando al menos aproximadamente un 80 %, preferiblemente al menos aproximadamente un 90 % y lo más preferiblemente al menos aproximadamente un 95 % de los nucleótidos o aminoácidos coinciden respectivamente en una longitud definida de las moléculas, como se determina usando los procedimientos anteriores.
El término “célula” se usa en la presente memoria en su sentido más amplia en la materia y hace referencia a un cuerpo vivo que es una unidad estructural de tejido de un organismo multicelular, está rodeado por una estructura de membrana que la aísla del exterior, tiene la capacidad de autorreplicación y tiene información genética y un mecanismo para expresarla. Las células usadas en la presente memoria pueden ser células de origen natural o células modificadas artificialmente (p.ej., células de fusión, células modificadas genéticamente, etc.).
Como se usa en la presente memoria, el término “célula madre” hace referencia a una célula capaz de autorreplicación y pluripotencia. Típicamente, las células madre pueden regenerar un tejido lesionado. Las células madre de la presente memoria pueden ser, pero sin limitación, células madre embrionarias (ES) o células madre de tejido (también llamados células madre específicas de tejido o células madre somáticas). Cualquier célula producida artificialmente que pueda tener las capacidades anteriormente descritas (p.ej. células de fusión, células reprogramadas o similares usadas en la presente memoria) puede ser un citoblasto.
Los “células madre embrionarias (ES)” son células madre pluripotentes derivadas de embriones tempranos. Se estableció por primera vez un ES en 1981, que se ha aplicado también a la producción de ratones con desactivación génica desde 1989. En 1998, se estableció un ES humano, que se está poniendo actualmente a disposición para medicina regenerativa.
Al contrario que los ES, las células madre de tejido tienen un potencial de diferenciación limitado. Las células madre de tejido están presentes en localizaciones particulares en tejidos y tienen una estructura intracelular indiferenciada. Por lo tanto, la pluripotencia de las células madre de tejido es típicamente baja. Las células madre de tejido tienen una alta relación de núcleo/citoplasma y tienen pocos orgánulos intracelulares. La mayoría de células madre de tejido tienen una baja pluripotencia, un ciclo celular largo y capacidad proliferativa más allá de la vida del individuo. Las células madre de tejido se separan en categorías basándose en los sitios de los que derivan las células, tales como el sistema dérmico, el sistema digestivo, el sistema medular óseo, el sistema nervioso y similares. Las células madre de tejido en el sistema dérmico incluyen células madre epidérmicos, células madre de folículo piloso y similares. Las células madre de tejido del sistema digestivo incluyen células madre pancreáticas (comunes), células madre hepáticas y similares. Los células madre de tejido del sistema medular óseo incluyen células madre hematopoyéticas, células madre mesenquimáticas y similares. Los células madre de tejido del sistema nervioso
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
incluyen células madre neurales, células madre retinianas y similares.
“Células madre pluripotentes inducidas”, abreviado comúnmente como iPS o iPSC, hace referencia a un tipo de célula madre pluripotente preparada artificialmente a partir de una célula no pluripotente, típicamente una célula somática adulta, o célula terminalmente diferenciada tal como un fibroblasto, una célula hematopoyética, un miocito, una neurona, una célula epidérmica o similares, mediante la inserción de ciertos genes a los que se hace referencia como factores de reprogramación.
"Pluripotencia” hace referencia a una célula madre que tiene el potencial de diferenciarse en todas las células constituyentes de uno o más tejidos u órganos, o preferiblemente cualquiera de las tres capas germinales: endodermo (revestimiento interior del estómago, tracto gastrointestinal, pulmones), mesodermo (músculo, hueso, sangre, sistema urogenital) y ectodermo (tejidos epidérmicos y sistema nervioso). Las “células madre pluripotentes” usados en la presente memoria hacen referencia a células que pueden diferenciarse en células derivadas de cualquiera de las tres capas germinales, por ejemplo descendientes directas de células totipotentes o células pluripotentes inducidas.
Como se usa en la presente memoria, “células madre totipotentes” hace referencia a células que tienen la capacidad de diferenciarse en todas las células constituyentes de un organismo, tales como las células que se producen por la fusión de un óvulo y un espermatozoide. Las células producidas por las primeras pocas divisiones del óvulo fertilizado son también totipotentes. Estas células pueden diferenciarse en tipos celulares embrionarios y extraembrionarios. Las células madre pluripotentes pueden dar lugar a cualquier tipo celular fetal o adulto. Sin embargo, solos no pueden desarrollarse hasta un animal fetal o adulto porque carecen del potencial de contribuir al tejido extraembrionario, tal como la placenta.
En contraposición, muchas células progenitoras son multipotentes, concretamente son capaces de diferenciación en un número limitado de destinos celulares. Las células progenitoras multipotentes pueden dar lugar a varios otros tipos celulares, pero esos tipos están limitados en número. Es un ejemplo de una célula madre multipotente una célula hematopoyética, una célula madre sanguínea que puede desarrollarse hasta varios tipos de células sanguíneas, pero no puede desarrollarse hasta células cerebrales u otros tipos de células. Al final de la larga serie de divisiones celulares que forman el embrión, están las células que están terminalmente diferenciadas, o que se considera que están permanentemente dedicadas a una función específica.
“Autorrenovación” hace referencia a la capacidad de pasar por numerosos ciclos de división celular manteniendo el estado indiferenciado.
Como se usa en la presente memoria, el término “célula somática” hace referencia a cualquier célula distinta de las células germinales, tales como óvulo, esperma o similares, que no transfiere directamente su ADN a la siguiente generación. Típicamente, las células somáticas tienen una pluripotencia limitada o nula. Las células somáticas usadas en la presente memoria pueden ser de origen natural o modificadas genéticamente.
Las células están “sustancialmente exentas” de elementos genéticos exógenos, como se usa en la presente memoria, cuando tienen menos de un 10 % del elemento o elementos y están “esencialmente exentas” de elementos genéticos exógenos cuando tienen menos de un 1 % del elemento o elementos. Sin embargo, son aún más deseables las poblaciones celulares en las que menos de un 0,5 % o menos de un 0,1 % de la población celular total comprende elementos genéticos exógenos. Por tanto, poblaciones de iPS en las que menos de un 0,1 a un 10 % (incluyendo todos los porcentajes intermedios) de las células de la población comprenden elementos genéticos exógenos.
III. Antecedentes generales para células madre pluripotentes inducidas
En ciertas realizaciones de la invención, se dan a conocer procedimientos de reprogramación de células somáticas mediante la introducción de factores de reprogramación en las células somáticas con un sistema basado en vector extracromosómico. La progenie de estas células podría ser idéntica a las células madre embrionarios en diversos aspectos como se describen a continuación, pero esencialmente exentas de elementos genéticos exógenos. La comprensión de las características de las células madre embrionarios podría ayudar a seleccionar las células madre pluripotentes. Podrían usarse para estos procedimientos novedosos factores de reprogramación conocidos de los estudios de reprogramación de células madre. Se contempla además que estas células madre pluripotentes inducidas podrían usarse potencialmente para reemplazar a células madre embrionarias para aplicaciones terapéuticas y de investigación debido a la traba ética de usar estos últimos,
A. Células madre
Los células madre son células encontradas en la mayoría, si no todos, los organismos multicelulares. Se caracterizan por la capacidad de autorrenovarse mediante división celular mitótica y diferenciación en un diverso intervalo de tipos celulares especializados. Los dos tipos genéricos de células madre de mamífero son: células madre embrionarias que se encuentran en los blastocitos y células madre adultas que se encuentran en tejidos adultos. En un embrión en desarrollo, las células madre pueden diferenciarse en todos los tejidos embrionarios especializados. En organismos adultos, las células madre y células progenitoras actúan como un sistema de
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
reparación para el cuerpo, reponiendo las células especializadas pero manteniendo también el recambio normal de órganos regenerativos, tales como sangre, piel o tejidos intestinales.
Como las células madre pueden crecer y transformarse en células especializadas con características consistentes con las células de diversos tejidos tales como músculos o nervios mediante cultivo celular, se ha propuesto su uso en terapias médicas. En particular, las líneas celulares embrionarias, células madre embrionarias autólogas generados mediante clonación terapéutica y células madre adultas altamente plásticas de la sangre del cordón umbilical o de la médula ósea se publicitan como candidatos prometedores. Más recientemente, la reprogramación de células adultas hasta células madre pluripotentes inducidas tiene un enorme potencial para reemplazar a los células madre embrionarias.
B. Células madre embrionarias
Las líneas celulares de células madre embrionarias (líneas celulares de ES) son cultivos de células derivadas del tejido epiblástico de la masa celular interna (ICM) de embriones de etapa de blastocito o mórula temprana. Un blastocito es un embrión de etapa temprana de aproximadamente 4 a 5 días en seres humanos y que consiste en 50-150 células. Los ES son pluripotentes y dan lugar durante el desarrollo a todos los derivados de las tres capas germinales primarias: ectodermo, endodermo y mesodermo. En otras palabras pueden desarrollarse hasta cualquiera de los más de 200 tipos celulares del cuerpo adulto cuando se les da la estimulación suficiente y necesaria para un tipo celular específico. No contribuyen a las membranas extraembrionarias o a la placenta.
Casi toda la investigación hasta la fecha ha tenido lugar usando células madre embrionarias de ratón (mES) o células madre embrionarias humanas (hES). Ambos tienen las características de células madre esenciales, aunque requieren entornos muy diferentes para mantener un estado indiferenciado. Los ES de ratón pueden crecer en una capa de gelatina y requieren la presencia del factor inhibidor de leucemia (LIF). Los ES humanos podrían crecer en una capa alimentadora de fibroblastos embrionarios de ratón (MEF) y requieren a menudo la presencia de factor de crecimiento fibroblástico básico (bFGF o FGF-2). Sin condiciones de cultivo óptimas o manipulación genética (Chambers et al., 2003), las células madre embrionarias se diferenciarán rápidamente.
Una célula madre embrionaria humana puede definirse también por la presencia de varios factores de transcripción y proteínas de superficie celular. Los factores de transcripción Oct-4, Nanog y Sox-2 forman la red reguladora principal que asegura la supresión de los genes que conducen a la diferenciación y el mantenimiento de la pluripotencia (Boyer et al., 2005). Los antígenos de superficie celular más comúnmente usados para identificar hES incluyen los glicolípidos SSEA3 y SSEA4 y los antígenos de sulfato de queratano Tra-1-60 y Tra-1-81.
Después de 20 años de investigación, no hay tratamientos aprobados ni ensayos humanos que usen células madre embrionarias. Los ES, al ser células pluripotentes, requieren señales específicas para una correcta diferenciación, si se inyectan directamente al cuerpo, los ES se diferenciarán en muchos tipos diferentes de células, causando un teratoma. Diferenciar los ES en células utilizables evitando el rechazo de trasplante es solo una de las trabas a las que los investigadores de células madre embrionarias se enfrentan. Muchos países tienen actualmente moratorias sobre la investigación de ES o la producción de nuevas líneas de ES. Debido a sus capacidades combinadas de expansión ilimitada y pluripotencia, las células madre embrionarias siguen siendo una fuente teóricamente potencial de medicina regenerativa y reemplazo de tejido después de lesión o enfermedad. Sin embargo, un modo de evitar estos problemas es inducir el estado pluripotente en células somáticas mediante reprogramación directa.
C. Factores de reprogramación
La generación de iPS es crucial en los genes usados para inducción. Los siguientes factores o combinaciones de los mismos podrían usarse en el sistema vectorial dado a conocer en la presente invención. En ciertos aspectos, los ácidos nucleicos que codifican Sox y Oct (preferiblemente Oct3/4) se incluirán en el vector de reprogramación. Por ejemplo, un vector de reprogramación puede comprender módulos de expresión que codifican Sox-2, Oct-4, Nanog y opcionalmente Lin-28, o módulos de expresión que codifican Sox-2, Oct-4, Klf4 y opcionalmente c-myc, o módulos de expresión que codifican Sox-2, Oct-4 y opcionalmente Esrrb. Los ácidos nucleicos que codifican estos factores de reprogramación pueden estar comprendidos en el mismo módulo de expresión, diferentes módulos de expresión, el mismo vector de reprogramación o diferentes vectores de reprogramación.
Se ha identificado a Oct-3/4 y ciertos miembros de la familia del gen Sox (Sox-1, Sox-2, Sox-3 y Sox-15) como reguladores transcripcionales cruciales implicados en el proceso de inducción cuya ausencia hace imposible la inducción. Sin embargo, se han identificado genes adicionales, que incluyen ciertos miembros de la familia de Klf (KIf-2, Klf-2, Kif-4 y Klf-5), la familia de Myc (C-myc, L-myc y N-myc), Nanog y LIN28, que aumentan la eficacia de inducción.
Oct-3/4 (Pou5f1) es uno de la familia de factores de transcripción octaméricos ("Oct") y desempeña un papel crucial en el mantenimiento de la pluripotencia. La ausencia de Oct-3/4 en las células Oct-3/4+, tales como blastómeros y células madre embrionarias, conduce a una diferenciación trofoblástica espontánea, y la presencia de Oct-3/4 da lugar por tanto a la pluripotencia y el potencial de diferenciación de las células madre embrionarias. Diversos otros genes de la familia de “Oct”, incluyendo parientes cercanos a Oct-3/4, Oct1 y Oct6, no consiguen desencadenar la inducción, demostrando por tanto la exclusividad de Oct-3/4 para el proceso de inducción.
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
en el genoma hospedador de modo estable. Contienen una transcriptasa inversa que permite la integración en el genoma del hospedador. Los lentivirus son una subclase de retrovirus. Están ampliamente adaptados como vectores gracias a su capacidad de integrarse en el genoma de células no en división así como en división. Estos vectores víricos se han usado ampliamente también en un contexto más amplio: la programación de la diferenciación de células, incluyendo desdiferenciación, diferenciación y transdiferenciación. El genoma vírico en forma de ARN se transcribe de forma inversa cuando el virus entra en la célula produciendo ADN, que se inserta entonces en el genoma en una posición aleatoria por la enzima integrasa vírica. Por lo tanto, la tecnología actual de reprogramación exitosa depende de enfoques víricos basados en la integración.
Sin embargo, con la presente tecnología, la integración orientada no es aún rutinaria (Bode et al., 2000b) y la alternativa convencional, integración aleatoria, puede conducir a mutagénesis de inserción con consecuencias impredecibles sobre las células madre pluripotentes inducidas. Por las mismas razones, no puede controlarse la expresión del transgén, puesto que depende del contexto de cromatina del sitio de integración (Baer et al., 2000). La expresión de alto nivel puede conseguirse solo en loci genómicos favorables, pero existe el peligro de que la integración en sitios altamente expresados interfiera con las funciones celulares vitales de los células madre pluripotentes inducidas.
Además, existen evidencias crecientes de la existencia de mecanismos de defensa celular contra el ADN extraño que funcionan regulando negativamente transgenes en un proceso que está acompañado por la metilación de ADN (Bingham, 1997, Garrick et al., 1998). Además, los componentes víricos pueden actuar junto con otros factores para transformar células. Acompañada de una expresión continua de una serie de genes víricos, la persistencia de al menos parte del genoma vírico en la célula puede causar la transformación celular. Estos genes pueden interferir con una ruta de señalización celular, causando los cambios fenotípicos observados de la célula que conducen a una célula transformada que muestra una división celular aumentada, que es favorable para el virus.
Por lo tanto, en ciertas realizaciones, la presente invención desarrolla procedimientos para generar células madre pluripotentes inducidas y otros tipos celulares deseados esencialmente exentos de elementos genéticos exógenos, tales como el vector retrovírico o lentivírico usado en los procedimientos anteriores. Estos procedimientos hacen uso de vectores de replicación extracromosómica, o vectores capaces de replicarse episómicamente. Una serie de plásmidos que contienen virus de ADN, tales como adenovirus, virus vacuolante de simio 40 (SV40) o papilomavirus bovino (BPV) o ARS de levadura incipiente (secuencias de replicación autónoma), se replican extracromosómica o episómicamente en células de mamífero. Estos plásmidos episómicos están intrínsecamente exentos de todas aquellas desventajas (Bode et al., 2001) asociadas a vectores integrativos, pero nunca se han dado a conocer públicamente para generar células madre pluripotentes inducidas. Uno basado en herpesvirus linfotrófico, incluyendo virus de Epstein Barr (EBV) como se define anteriormente, puede replicarse también extracromosómicamente y ayudar a suministrar genes de reprogramación a células somáticas. Aunque los orígenes de replicación de estos virus o elementos de ARS están bien caracterizados, nunca se han conocido públicamente para reprogramar células diferenciadas hasta esta divulgación.
Por ejemplo, el enfoque basado en plásmido usado en la invención extrae elementos robustos necesarios para la replicación exitosa y mantenimiento de un sistema basado en elementos de EBV sin comprometer la manejabilidad del sistema en un entorno clínico como se describe con detalle a continuación. Los elementos de EBV esenciales son oriP y EBNA-1 o sus variantes o equivalentes funcionales. Es una ventaja adición de este sistema que estos elementos exógenos se perderán con el tiempo después de introducirse en células, conduciendo a iPS automantenidos esencialmente exentos de estos elementos.
A. Virus de Epstein-Barr
El virus de Epstein-Barr (EBV), también llamado herpesvirus humano 4 (HHV-4), es un virus de la familia del herpes (que incluye herpesvirus simple y citomegalovirus) y es uno de los virus más comunes en seres humanos. El EBV mantiene su genoma extracromosómicamente y funciona en colaboración con la maquinaria de la célula hospedadora para una replicación y mantenimiento eficaces (Lindner y Sugden, 2007), basándose solamente en dos rasgos esenciales para su replicación y retención en las células durante la división celular (Yates et al. 1985; Yates et al. 1984). Existe un elemento, al que se hace referencia comúnmente como oriP, en cis y sirve como origen de replicación. El otro factor, EBNA-1, funciona en trans mediante la unión a secuencias en oriP, promoviendo la replicación y mantenimiento de ADN de plásmido. Como ejemplo no limitante, los inventores extraen estos dos rasgos y los usan en el contexto de un plásmido para lanzar los genes necesarios para reprogramar células somáticas, para facilitar la replicación y expresión mantenida de estos genes frente a plásmidos convencionales.
B. OriP
OriP es el sitio en que o cerca del que se inicia la replicación de ADN y está compuesto por dos secuencias de acción en cis separadas por aproximadamente 1 kilopar de bases conocidas como la familia de repeticiones (FR) y la simetría diádica (DS).
FR está compuesta por 21 copias imperfectas de una repetición de 30 pb y contiene 20 sitios de unión de alta afinidad a EBNA-1 (FIG. 1). Cuando FR se une a EBNA-1, sirve tanto como potenciador transcripcional de
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
promotores en cis de hasta 10 kb de distancia (Reisman y Sugden, 1986; Yates, 1988; Sugden y Warren, 1989; Wysokenski y Yates, 1989; Gahn y Sugden, 1995; Kennedy y Sugden, 2003; Altmann et al., 2006) como para contribuir a la retención nuclear y el mantenimiento fiel de plásmidos que contienen FR (Langle-Rouault et .al.; 1998; Kirchmaier y Sugden, 1995; Wang et al., 2006; Nanbo y Sugden, 2007). El reparto eficaz de los plásmidos de oriP es también atribuible probablemente a FR. Aunque el virus ha evolucionado para mantener 20 sitios de unión a EBNA-1 en FR, el mantenimiento de plásmido eficaz requiere solo 7 de estos sitios, y puede reconstituirse por un polímero de tres copias de DS, que tiene un total de 12 sitios de unión a EBNA-1 (Wysokenski y Yates, 1989).
El elemento de simetría diádica (DS) es suficiente para la iniciación de la síntesis de ADN en presencia de EBNA-1 (Aiyar et al.) 1998; Yates et al., 2000), y aparece la iniciación en o cerca de DS (Gahn y Schildkraut, 1989; Niller et al., 1995). La terminación de la síntesis de ADN vírico se cree que aparece en FR, porque cuando FR se une a EBNA-1, funciona como barrera de la horquilla de replicación como se observa por electroforesis en gel 2D (Gahn y Schildkraut, 1989; Ermakova et al., 1996; Wang et al., 2006). La iniciación de la síntesis de ADN a partir de DS se permite en un ciclo de una vez por célula (Adams, 1987; Yates y Guan, 1991) y se regula por los componentes del sistema de replicación celular (Chaudhuri et al., 2001; Ritzi et al., 2003; Dhar et al., 2001; Schepers et al., 2001; Zhou et al., 2005; Julien et al., 2004). DS contiene cuatro sitios de unión a EBNA-1, aunque con menor afinidad que aquellos encontrados en FR (Reisman et al., 1985). La topología de DS es tal que los cuatro sitios de unión están dispuestos como dos pares de sitios, con un espaciador de centro a centro de 21 pb entre cada par y un espaciador de centro a centro de 33 pb entre los dos sitios de unión interna no apareados (FIG. 1c) (Baer et al., 1984; Rawlins et al., 1985).
Los papeles funcionales de los elementos en DS se han confirmado por estudios de otra región del genoma de EBV, denominada Rep*, que se ha identificado como un elemento que puede sustituir a DS ineficazmente (Kirchmaier y Sugden, 1998). Polimerizar Rep* 8 veces procuraba un elemento tan eficaz como DS en su apoyo de la replicación (Wang, et al., 2006). La disección bioquímica de Rep* identificaba un par de sitios de unión a EBNA-1 con un espaciador de centro a centro de 21 pb crítico para su función replicativa (ibíd.). Se encontró que el replicador mínimo de Rep* era el par de sitios de unión a EBNA-1, ya que la función replicativa se retenía incluso después de reemplazar todas las secuencias flanqueantes del polímero por secuencias derivadas del fago lambda. Las comparaciones de DS y Rep* han revelado un mecanismo común: estos replicadores apoyan la iniciación de la síntesis de ADN agrupando la maquinaria replicativa celular mediante un par de sitios apropiadamente espaciados, plegados y unidos a EBNA-1.
Hay otros plásmidos extracromosómicos permitidos que se replican en células de mamífero que no están relacionados con EBV, y en algunos modos parecen similares a la zona de iniciación en la cepa Raji de EBV. Hans Lipps y colaboradores han desarrollado y estudiado plásmidos que contienen “regiones de enlazamiento con el soporte/matriz nuclear” (S/MAR) y una unidad transcripcional robusta (Piechaczek et al., 1999; Jenke et al., 2004). Su S/MAR deriva del gen de interferón beta humano, es rica en A/T y se define operativamente por su asociación con la matriz nuclear y su relajación preferencial a baja fuerza iónica o cuando se embebe en ADN superenrrollado (Bode et al., 1992). Estos plásmidos se replican semiconservativamente, se unen a proteínas ORC y apoyan la iniciación de la síntesis de ADN eficazmente de forma aleatoria a lo largo de su ADN (Schaarschmidt et al., 2004). Se mantienen eficazmente en células de hámster y humanas en proliferación sin selección de fármaco y, cuando se introducen en embriones porcinos, pueden apoyar la expresión de GFP en la mayoría de tejidos de animales fetales (Manzini et al., 2006).
C. EBNA-1
El antígeno nuclear 1 de Epstein Barr (EBNA-1) es una proteína de unión a ADN que se une a FR y DS de oriP o Rep*, facilitando la replicación y reparto fiel del plásmido de EBV a las células hija independientemente de, pero concertadamente con, los cromosomas celulares durante cada división celular.
Los 641 aminoácidos (AA) de EBNA-1 se han clasificado en dominios asociados a sus funciones variadas mediante análisis mutacional y delecional (FIG. 2). Dos regiones entre AA40-89 y AA329-378 son capaces de ligar dos elementos de ADN en cis o en trans cuando se unen a EBNA-1, y se han denominado por tanto región de ligamiento 1 y 2 (LR1, LR2) (Middleton y Sugden, 1992; Frappier y O'Donnell, 1991; Su et al., 1991; Mackey et al., 1995). Fusionar estos dominios de EBNA-1 con GFP dirige a GFP a los cromosomas mitóticos (Marechal et al., 1999; Kanda et al., 2001). LR1 y LR2 son funcionalmente redundantes para replicación; una deleción de cualquiera procura un derivado de EBNA-1 capaz de apoyar la replicación de ADN (Mackey y Sugden, 1999; Sears et al., 2004). LR1 y LR2 son ricas en residuos de arginina y glicina, y se parecen al motivo de gancho AT que se une a ADN rico en A/T (Aravind y Landsman, 1998), (Sears et al.; 2004). Un análisis in vitro de LR1 y LR2 de EBNA-1 ha demostrado su capacidad de unirse a ADN rico en A/T (Sears et.al., 2004). Cuando LR1, que contiene uno de dichos ganchos AT, se fusionó con el dominio de unión a ADN y dimerización de EBNA-1, se encontró que era suficiente para la replicación de ADN de plásmidos de oriP, aunque menos eficazmente que la EBNA-1 de tipo silvestre (ibíd.).
LR1 y LR2 difieren, sin embargo. La mitad C-terminal de LR1 está compuesta por aminoácidos distintos que los Arg-Gly repetidos de la mitad N-terminal, y se denomina región única 1 (UR1). La UR1 es necesaria para que EBNA-1 active la transcripción eficazmente a partir de ADN informadores transfectados e integrados que contienen FR (Wu et al., 2002; Kennedy y Sugden, 2003; Altmann et al., 2006). La UR1 es también esencial para la transformación
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
eficaz de células B infectadas por EBV. Cuando un derivado de EBNA-1 que carece de este dominio reemplaza a la proteína de tipo silvestre en el contexto del virus completo, estos virus derivados tienen un 0,1 % de la capacidad de transformación del virus de tipo silvestre (Altmann et al., 2006).
La LR2 no se requiere para el apoyo por EBNA-1 de la replicación de oriP (Shire et al., 1999; Mackey y Sugden, 1999; Sears et al., 2004). Adicionalmente, la mitad N-terminal de EBNA-1 puede reemplazarse por proteínas celulares que contienen motivos de gancho AT, tales como HMGA1a, y seguir reteniendo función replicativa (Hung et al., 2001; Sears et al., 2003; Altmann et al., 2006). Estos hallazgos indican que es probable que se requieran las actividades del gancho de AT de LR1 y LR2 para el mantenimiento de oriP en células humanas.
Un tercio de los residuos de EBNA-1 (AA91-328) consiste en repeticiones de glicina-glicina-alanina (GGA), implicadas en la capacidad de EBNA-1 de escapar del sistema inmunitario del hospedador al inhibir la degradación y presentación proteosómica (Levitskaya et al., 1995; Levitskaya et al., 1997). Se ha encontrado también que estas repeticiones inhiben la traducción de EBNA-1 in vitro e in vivo (Yin et al., 2003). Sin embargo, la deleción de gran parte de este dominio no tiene efecto aparente sobre las funciones de EBNA-1 en cultivo celular, haciendo el papel que desempeña este dominio difícil de elucidar.
Se codifica una señal de localización nuclear (NLS) por los AA379-386, que se asocia también con la maquinaria de importación nuclear celular (Kim, et al., 1997; Fischer et al., 1997). Las secuencias con las regiones ricas en Arg-Gly de LR1 y LR2 pueden funcionar también como NLS debido a su alto contenido básico.
Por último, el extremo C (AA458-607) codifica los dominios de unión a ADN y dimerización superpuestos de EBNA
1. La estructura de estos dominios unidos a ADN se ha resuelto por cristalografía de rayos X, y se ha encontrado que es similar al dominio de unión a ADN de la proteína E2 de papilomavirus (Hegde et al., 1992; Kim et al., 2000; Bochkarev et al., 1996).
En realizaciones específicas de la invención, un vector de reprogramación contendrá tanto oriP como una secuencia abreviada que codifica una versión de EBNA-1 competente para apoyar la replicación de plásmido y su mantenimiento apropiado durante la división celular. La secuencia altamente repetitiva en el tercio aminoterminal de EBNA-1 de tipo silvestre y la retirada de una región de 25 aminoácidos que ha demostrado toxicidad en diversas células son prescindibles para la función de acción en trans de EBNA-1 asociada a oriP (Yates et al. 1985; Kennedy et al. 2003). Por lo tanto, podría usarse un derivado ejemplar, la forma abreviada de EBNA-1 conocida como deltaUR1 (el derivado con una secuencia proteica de SEQ ID NO:3, que está codificada por la SEQ ID NO: 4), junto con oriP en este sistema basado en plásmido. Más ejemplos de derivados de EBNA-1 pueden activar la transcripción a partir de un molde extracromosómico (véanse, por ejemplo, Kirchmaier y Sugden, 1997 y Kennedy y Sugden, 2003).
Un derivado de EBNA-1 usado en la invención es un polipéptido que, respecto al correspondiente polipéptido de tipo silvestre, tiene una secuencia aminoacídica modificada. Las modificaciones incluyen la deleción, inserción o sustitución de al menos un residuo aminoacídico en una región correspondiente a la región única (residuos de aproximadamente 65 a aproximadamente 89) de LR1 (residuos de aproximadamente 40 a aproximadamente 89) de EBNA-1, y pueden incluir una deleción, inserción o sustitución de uno o más residuos aminoacídicos en las regiones correspondientes a otros residuos de EBNA-1, p.ej. de aproximadamente el residuo 1 a aproximadamente el residuo 40, de aproximadamente el residuo 90 a aproximadamente 328 (región repetida “Gly-Gly-Ala"), de aproximadamente el residuo 329 a aproximadamente 377 (LR2), de aproximadamente el residuo 379 a aproximadamente 386 (NLS), de aproximadamente el residuo 451 a aproximadamente 608 (unión a ADN y dimerización) o de aproximadamente el residuo 609 a aproximadamente 641, a condición de que el derivado resultante tenga las propiedades deseadas, p.ej. dimerice y se una a ADN que contiene un ori correspondiente a oriP, se localice en el núcleo, no sea citotóxico y active la transcripción a partir de un molde extracromosómico pero no active sustancialmente la transcripción a partir de uno integrado. Las sustituciones incluyen sustituciones que utilizan la forma D en lugar de L, así como otros análogos aminoacídicos conocidos, p.ej. aminoácidos no naturales tales como aminoácidos -disustituidos, Nalquilaminoácidos, ácido láctico y similares. Estos análogos incluyen fosfoserina, fosfotreonina, fosfotirosina, hidroxiprolina, gamma-carboxiglutamato, ácido hipúrico, ácido octahidroindol-2-carboxílico, estatina, ácido 1,2,3,4tetrahidroisoquinolin-3-carboxílico, penicilamina, ornitina, citrulina, -metilalanina, para-benzoilfenilalanina, fenilglicina, propargilglicina, sarcosina, -N,N,N-trimetil-lisina, -N-acetil-lisina, N-acetilserina, N-formilmetionina, 3metilhistidina, 5-hidroxilisina, omega-N-metilarginina y otros aminoácidos e iminoácidos similares y terc-butilglicina.
Las sustituciones aminoacídicas conservativas son preferidas, es decir, por ejemplo, aspártico-glutámico como aminoácidos ácidos polares; lisina/arginina/histidina como aminoácidos básicos polares; leucina/isoleucina/metionina/valina/alanina/glicina/prolina como aminoácidos no polares o hidrófobos; serina/treonina como aminoácidos hidrófilos polares o no cargados. La sustitución aminoacídica conservativa incluye también agrupamientos basados en las cadenas laterales. Por ejemplo, es un grupo de aminoácidos que tienen cadenas laterales alifáticas glicina, alanina, valina, leucina e isoleucina; es un grupo de aminoácidos que tienen cadenas laterales hidroxilo alifático serina y treonina; es un grupo de aminoácidos que tienen cadenas laterales que contienen amida asparagina y glutamina; es un grupo de aminoácidos que tienen cadenas laterales aromáticas fenilalanina, tirosina y triptófano; es un grupo de aminoácidos que tienen cadenas laterales básicas lisina, arginina e histidina y es un grupo de aminoácidos que tienen cadenas laterales que contienen azufre cisteína y metionina. Por ejemplo, es
10
15
20
25
30
35
40
45
50
razonable esperar que el reemplazo de una leucina por isoleucina o valina, de un aspartato por un glutamato, de una treonina por una serina o un reemplazo similar de un aminoácido por un aminoácido estructuralmente relacionado, no tendrá un gran efecto sobre las propiedades del polipéptido resultante. Puede determinarse fácilmente si el cambio aminoacídico da como resultado un polipéptido funcional ensayando la actividad específica del polipéptido.
Las sustituciones aminoacídicas que entran dentro del alcance de la divulgación se logran, en general, seleccionando sustituciones que no difieran significativamente en su efecto sobre el mantenimiento de (a) la estructura del esqueleto peptídico en la zona de sustitución, (b) la carga o hidrofobicidad de la molécula en el sitio diana o (c) el volumen de la cadena lateral. Los residuos de origen natural se dividen en grupos basados en las propiedades de cadena lateral comunes:
1) hidrófobos: norleucina, met, ala, val, leu, ile;
2) hidrófilos neutros: cys, ser, thr;
3) ácidos: asp, glu;
4) básicos: asn, gln, his, lys, arg;
5) residuos que influyen en la orientación de la cadena: gly, pro y
6) aromáticos; trp, tyr, phe.
La invención concibe también polipéptidos con sustituciones no conservativas. Las sustituciones no conservativas conllevan el intercambio de un miembro de una de las clases descritas anteriormente por otra.
Pueden prepararse sales de adición de ácido del polipéptido o residuos aminoacídicos del polipéptido poniendo en contacto el polipéptido o amina con uno o más equivalentes del ácido inorgánico u orgánico deseado, tal como por ejemplo ácido clorhídrico. Pueden prepararse también ésteres de grupos carboxilo de los polipéptidos mediante cualquiera de los procedimientos habituales conocidos en la materia.
Los análogos incluyen estructuras que tienen uno o más ligamientos peptídicos opcionalmente reemplazados por un ligamiento seleccionado del grupo consistente en: -CH2NH-, -CH2S-, -CH2-CH2-, -CH=CH-(cis y trans), -CH=CFtrans), -COCH2-, -CH(OH)CH2-y -CH2SO-mediante procedimientos conocidos en la materia y descritos además en las siguientes referencias: Spatola, 1983; Spatola, 1983; Morley, 1980; Hudson et al., 1979 (-CH2NH-, CH2CH2-); Spatola et al., 1986 (-CH2-S); Hann, 1982 (-CH-CH-, cis y trans); Almquist et al., 1980 (-COCH2-); Jennings-White et al., 1982 (-COCH2-); Szelke et al., solicitud europea EP 45665 (-CH(OH)CH2-); Holladay et al., 1983 (-C(OH)CH2-) y Hruby; 1982 (-CH2S-). Es un ligamiento no peptídico particularmente preferido -CH2NH-. Dichos análogos pueden tener mayor estabilidad química, propiedades farmacológicas potenciadas (semivida, absorción, potencia, eficacia, etc.), especificidad alterada (p.ej. un amplio espectro de actividades biológicas), antigenicidad reducida y prepararse económicamente.
D. Rasgo de exención de residuos
De forma importante, la replicación y mantenimiento de plásmidos basados en oriP son imperfectos y se pierden rápidamente (25 % por división celular) de las células al cabo de las primeras dos semanas de su introducción en las células; sin embargo, aquellas células que retienen el plásmido los pierden menos frecuentemente (3 % por división celular) (Leight y Sugden, 2001; Nanbo y Sugden, 2007). Una vez se retira la selección de células que albergan el plásmido, los plásmidos se perderán durante cada división celular hasta que se hayan eliminado todos ellos con el tiempo, sin dejar huella de su existencia anterior dentro de las células hija resultantes. Es este rasgo de ausencia de huellas lo que subraya el atractivo del sistema basado en oriP como alternativa al enfoque asociado a virus actual para suministrar genes para generar iPS y otras células deseadas con programación de la diferenciación. Se perderán también otros vectores extracromosómicos durante la replicación y propagación de células hospedadoras, y podrían emplearse también en la presente invención.
V. Construcción y suministro de vector
En ciertas realizaciones, podrían construirse vectores de reprogramación o de programación de la diferenciación para comprender elementos adicionales además de las secuencias de ácido nucleico que codifican factores de reprogramación o factores de programación de la diferenciación como se describen anteriormente para expresar estos factores de reprogramación en células. Los rasgos novedosos de estos procedimientos son el uso de vectores de replicación extracromosómica, que no se integrarán en el genoma de la célula hospedadora y pueden perderse durante las generaciones de replicación. Se dan a conocer a continuación los detalles de los componentes de estos vectores y procedimientos de suministro.
A. Vector
El uso de vectores extracromosómicos basados en plásmido o liposoma, p.ej. vectores basados en oriP y/o vectores que codifican un derivado de EBNA-1, permite introducir grandes fragmentos de ADN en una célula y mantenerlos
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
extracromosómicamente, replicarlos una vez por ciclo celular, repartirlos a las células hija eficazmente y no desencadenar sustancialmente respuesta inmunitaria. En particular, EBNA-1, la única proteína vírica requerida para la replicación del vector de expresión basado en oriP, no desencadena una respuesta inmunitaria celular debido a que ha desarrollado un mecanismo eficaz para evitar el procesamiento requerido para la presentación de sus antígenos en moléculas de MHC de clase I (Levitskaya et al., 1997). Además, EBNA-1 puede actuar en trans para potenciar la expresión del gen clonado, induciendo la expresión de un gen clonado hasta 100 veces en algunas líneas celulares (Langle-Rouault et al., 1998; Evans et al.; 1997). Finalmente, la fabricación de dichos vectores de expresión basados en oriP es barata.
Otros vectores extracromosómicos incluyen otros vectores basados en herpesvirus linfotróficos. El herpesvirus linfotrófico es un herpesvirus que se replica en un linfoblasto (p.ej. un linfoblasto B humano) y se vuelve un plásmido durante parte de su ciclo vital natural. El herpesvirus simple (HSV) no es un herpesvirus “linfotrófico”. Los herpesvirus linfotróficos ejemplares incluyen, pero sin limitación, EBV, herpesvirus de sarcoma de Kaposi (KSHV), herpesvirus de Saimiri (HS) y virus de la enfermedad de Marek (MDV). Están contempladas todas las demás fuentes de vectores basados en episoma, tales como ARS de levadura, adenovirus, SV40 o BPV.
Un especialista en la materia estaría bien capacitado para construir un vector mediante técnicas recombinantes estándares (véanse, por ejemplo, Maniatis et al., 1988 y Ausubel et al; 1994).
Los vectores pueden comprender también otros componentes o funcionalidades que modulen además el suministro génico y/o la expresión génica, o que proporcionen de otro modo propiedades beneficiosas a las células diana. Dichos otros componentes incluyen, por ejemplo, componentes que influyen en la unión u orientación a células (incluyendo componentes que median la unión específica de tipo celular o tejido), componentes que influyen en la captación del ácido nucleico vectorial por la célula, componentes que influyen en la localización del polinucleótido en la célula después de la captación (tales como agentes que median la localización nuclear) y componentes que influyen en la expresión del polinucleótido.
Dichos componentes podrían incluir también marcadores, tales como marcadores detectables y/o de selección, que pueden usarse para detectar o seleccionar células que han captado y están expresando el ácido nucleico suministrado por el vector. Dichos componentes pueden proporcionarse como un rasgo natural del vector (tal como el uso de ciertos vectores víricos que tienen componentes o funcionalidades que median la unión y captación), o los vectores pueden modificarse para proporcionar dichas funcionalidades. Son conocidos en la materia una gran variedad de dichos vectores y están generalmente disponibles. Cuando un vector se mantiene en una célula hospedadora, el vector puede replicarse establemente por las células durante la mitosis como una estructura autónoma incorporada al genoma de la célula hospedadora o mantenerse en el núcleo o citoplasma de la célula hospedadora.
B. Elementos reguladores:
Los módulos de expresión eucariótica incluidos en los vectores contienen preferiblemente (en dirección 5’ a 3’) un promotor transcripcional eucariótico ligado operativamente a una secuencia de codificación de proteína, señales de corte y empalme que incluyen secuencias intermedias y una secuencia de terminación transcripcional/poliadenilación.
i. Promotor/potenciadores
Un “promotor” es una secuencia de control que es una región de una secuencia de ácido nucleico en que se controlan la iniciación e índice de transcripción. Puede contener elementos genéticos a los que pueden unirse proteínas y moléculas reguladoras, tales como ARN polimerasa y otros factores de transcripción, para iniciar la transcripción específica de una secuencia de ácido nucleico. Las frases “operativamente situado”, “operativamente ligado”, “bajo el control” y “bajo el control transcripcional” significan que un promotor está en una localización funcional y/u orientación correcta con relación a una secuencia de ácido nucleico para controlar la iniciación transcripcional y/o la expresión de esa secuencia.
Los promotores adecuados para uso en el vector que codifica EBNA-1 de la invención son aquellos que dirigen la expresión de los módulos de expresión que codifican la proteína EBNA-1, dando como resultado niveles en estado estacionario suficientes de proteína EBNA-1 para mantener establemente vectores que contienen oriP de EBV. Los promotores se usan también para una expresión eficaz de módulos de expresión que codifican factores de reprogramación.
Un promotor comprende generalmente una secuencia que funciona situando el sitio de inicio de la síntesis de ARN. El mejor ejemplo conocido de esto es la secuencia TATA, pero en algunos promotores que carecen de secuencia TATA, tales como por ejemplo el promotor del gen desoxinucleotidil transferasa terminal de mamífero y el promotor de los genes tardíos de SV40, un elemento discreto que se superpone con el sitio de inicio mismo ayuda a fijar el lugar de iniciación. Elementos promotores adicionales regulan la frecuencia de la iniciación transcripcional. Típicamente, estos se localizan en la región a 30-110 pb en dirección 5’ del sitio de inicio, aunque se ha mostrado que una serie de promotores contienen elementos funcionales en dirección 3’ del sitio de inicio también. Para llevar una secuencia de codificación “bajo el control de” un promotor, se sitúa el extremo 5’ del sitio de iniciación de la
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
potenciadores de la transcripción apropiados.
En ciertas realizaciones de la invención, se usan elementos de sitio de entrada a ribosoma interno (IRES) para crear mensajes multigénicos o policistrónicos. Los elementos de IRES son capaces de evitar el modelo de barrido ribosómico de traducción dependiente de Cap metilado en 5’ y de empezar la traducción en sitios internos (Pelletier y Sonenberg, 1988). Se han descrito los elementos de IRES de dos miembros de la familia de picornavirus (polio y encefalomiocarditis) (Pelletier y Sonenberg, 1988) así como un IRES de un mensaje de mamífero (Macejak y Sarnow, 1991). Los elementos de IRES pueden ligarse con marcos de lectura abiertos heterólogos. Pueden transcribirse conjuntamente múltiples marcos de lectura abiertos, separado cada uno por un IRES, creando mensajes policistrónicos. En virtud del elemento de IRES, cada marco de lectura abierto es accesible a ribosomas para una traducción eficaz. Pueden expresarse eficazmente múltiples genes usando un solo promotor/potenciador para transcribir un solo mensaje (véanse las patentes de EE.UU. nº 5.925.565 y 5.935.819).
iii. Sitios de clonación múltiple
Los vectores pueden incluir un sitio de clonación múltiple (MCS), que es una región de ácido nucleico que contiene múltiples sitios de enzima de restricción, cualquiera de los cuales puede usarse junto con tecnología recombinante estándar para digerir el vector (véanse, por ejemplo, Carbonelli et al., 1999, Levenson et al., 1998 y Cocea, 1997). "Digestión con enzima de restricción” hace referencia a la escisión catalítica de una molécula de ácido nucleico con una enzima que funciona solo en localizaciones específicas de una molécula de ácido nucleico. Muchas de estas enzimas de restricción están comercialmente disponibles. El uso de dichas enzimas es ampliamente comprendido por los especialistas en la materia. Frecuentemente, se linealiza o fragmenta un vector usando una enzima de restricción que corta en el MCS, posibilitando que se liguen con el vector secuencias exógenas. "Ligamiento” hace referencia al proceso de formación de enlaces fosfodiéster entre dos fragmentos de ácido nucleico, que pueden ser
o no contiguos entre sí. Las técnicas que implican enzimas de restricción y reacciones de ligamiento son bien conocidas por los especialistas en la materia de la tecnología recombinante.
iv. Sitios de corte y empalme
La mayoría de moléculas de ARN eucarióticas experimentarán corte y empalme de ARN para retirar los intrones de los transcritos primarios. Los vectores que contienen secuencias eucarióticas genómicas pueden requerir sitios de corte y empalme donantes y/o aceptores para asegurar un procesamiento apropiado del transcrito para expresión de proteína (véase, por ejemplo, Chandler et al., 1997).
v. Señales de terminación
Los vectores o constructos de la presente invención pueden comprender al menos una señal de terminación. Una “señal de terminación” o “terminador” comprende secuencias de ADN implicadas en la terminación específica de un transcrito de ARN por una ARN polimerasa. Por tanto, en ciertas realizaciones se contempla una señal de terminación que finaliza la producción de un transcrito de ARN. Puede ser necesario un terminador in vivo para conseguir niveles de mensaje deseables.
En sistemas eucarióticos, la región terminadora puede comprender también secuencias de ADN específicas que permitan la escisión específica de sitio del nuevo transcrito para exponer un sitio de poliadenilación. Esto señala a una polimerasa endógena especializada para añadir un tramo de aproximadamente 200 residuos de A (poliA) al extremo 3’ del transcrito. Las moléculas de ARN modificadas con esta cola de poliA parecen más estables y se traducen más eficazmente. Por tanto, en otras realizaciones que implican eucariotas, se prefiere que el terminador comprenda una señal para la escisión del ARN, y es más preferido que la señal terminadora promueva la poliadenilación del mensaje. Los elementos de sitio terminador y/o de poliadenilación pueden servir para potenciar los niveles de mensaje y para minimizar la lectura del módulo en otras secuencias.
Los terminadores contemplados para uso en la invención incluyen cualquier terminador de la transcripción conocido descrito en la presente memoria o conocido por un especialista en la materia incluyendo, pero sin limitación, por ejemplo las secuencias de terminación de genes, tales como por ejemplo las secuencias terminadoras de hormona de crecimiento bovino, o de terminación vírica, tales como por ejemplo el terminador de SV40. En ciertas realizaciones, la señal de terminación puede ser la falta de secuencia transcribible o traducible, tal como debido a truncamiento de la secuencia.
vi. Señales de poliadenilación
En la expresión, particularmente la expresión eucariótica, se incluirá típicamente una señal de poliadenilación para efectuar una poliadenilación apropiada del transcrito. La naturaleza de la señal de poliadenilación no se cree que sea crucial para la práctica exitosa de la invención, y puede emplearse cualquiera de dichas secuencias. Las realizaciones preferidas incluyen la señal de poliadenilación de SV40 o la señal de poliadenilación de hormona de crecimiento bovino, conveniente y conocida por funcionar bien en diversas células diana. La poliadenilación puede aumentar la estabilidad del transcrito o puede facilitar el transporte citoplasmático.
vii. Orígenes de replicación
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
Para propagar un vector en una célula hospedadora, puede contener uno o más sitios de origen de replicación (a menudo denominados “ori”), por ejemplo una secuencia de ácido nucleico correspondiente a oriP de EBV como se describe anteriormente o un oriP genomanipulado con una función similar o elevada de programación de la diferenciación, que es una secuencia de ácido nucleico específica en que se inicia la replicación. Como alternativa, puede emplearse un origen de replicación de otro virus de replicación extracromosómica como se describe anteriormente o una secuencia de replicación autónoma (ARS).
viii. Marcadores de selección y rastreables
En ciertas realizaciones de la invención, las células que contienen un constructo de ácido nucleico de la presente invención pueden identificarse in vitro o in vivo mediante la inclusión de un marcador en el vector de expresión. Dichos marcadores conferirían un cambio identificable a la célula, permitiendo la fácil identificación de las células que contienen el vector de expresión. Generalmente, un marcador de selección es aquel que confiere una propiedad que permite la selección. Un marcador de selección positiva es aquel en que la presencia del marcador permite su selección, mientras que un marcador de selección negativa es aquel en que su presencia evita su selección. Es un ejemplo de un marcador de selección positiva un marcador de resistencia a fármaco.
Habitualmente, la inclusión de un marcador de selección de fármaco ayuda a la clonación e identificación de transformantes, por ejemplo, los genes que confieren resistencia a neomicina, puromicina, higromicina, DHFR, GPT, zeocina e histidinol son marcadores de selección útiles. Además de marcadores que confieren un fenotipo que permite la discriminación de transformantes basándose en la implantación de condiciones, se contemplan también otros tipos de marcadores que incluyen marcadores rastreables tales como GFP, cuya base es el análisis colorimétrico. Como alternativa, pueden utilizarse enzimas rastreables como marcadores de selección negativa tales como timidina cinasa (tk) o cloranfenicol acetiltransferasa (CAT) de herpesvirus simple. Un especialista en la materia sabría también cómo emplear marcadores inmunológicos, posiblemente junto con análisis de FACS. No se cree que sea importante el marcador usado, a condición de que pueda expresarse simultáneamente con el ácido nucleico que codifica un producto génico. Son bien conocidos ejemplos adicionales de marcadores de selección y rastreables para un especialista en la materia. Un rasgo de la presente invención incluye usar marcadores de selección y rastreables para seleccionar células exentas de vector después de que los factores de programación de la diferenciación hayan producido estado de diferenciación alterado deseado en esas células.
C. Suministro de vector
La introducción de un vector de reprogramación o programación de la diferenciación en células somáticas con la actual invención puede usar cualquier procedimiento adecuado para el suministro de ácido nucleico para transformación de una célula, como se describe en la presente memoria o como sería conocido por un especialista en la materia. Dichos procedimientos incluyen, pero sin limitación, el suministro directo de ADN tal como mediante transfección ex vivo (Wilson et al., 1989, Nabel et al., 1989); mediante inyección (patentes de EE.UU. nº 5.994.624, 5.981.274, 5.945.100, 5.780.448, 5.736.524, 5.702.932, 5.656.610, 5.589.466 y 5.580.859), incluyendo microinyección (Harland y Weintraub, 1985; patente de EE.UU. nº 5.789.215); mediante electroporación (patente de EE.UU. nº 5.384.253; Tur-Kaspa et al., 1986; Potter et al., 1984); mediante precipitación con fosfato de calcio (Graham y Van Der Eb, 1973; Chen y Okayama, 1987; Rippe et al., 1990); mediante el uso de DEAE-dextrano seguido de polietilenglicol (Gopal, 1985); mediante carga sónica directa (Fechheimer et al., 1987); mediante transfección mediada por liposoma (Nicolau y Sene, 1982; Fraley et al., 1979; Nicolau et al., 1987; Wong et al., 1980; Kaneda et al., 1989; Kato et al., 1991) y transfección mediada por receptor (Wu y Wu, 1987; Wu y Wu, 1988); mediante bombardeo de microproyectiles (solicitudes PCT nº WO 94/09699 y 95/06128; patentes de EE.UU. nº 5.610.042, 5.322.783, 5.563.055, 5.550.318, 5.538.877 y 5.538.880); mediante agitación con fibras de carburo de silicio (Kaeppler et al., 1990; patentes de EE.UU. nº 5.302.523 y 5.464.765); mediante transformación mediada por Agrobacterium (patentes de EE.UU. nº 5.591.616 y 5.563.055); mediante transformación mediada por PEG de protoplastos (Omirulleh et al., 1993; patentes de EE.UU. nº 4.684.611 y 4.952.500); mediante captación de ADN mediada por desecación/inhibición (Potrykus et al., 1985) y cualquier combinación de dichos procedimientos. Mediante la aplicación de técnicas tales como estas, pueden transformarse estable o transitoriamente un orgánulo u orgánulos, una célula o células, un tejido o tejidos, un organismo u organismos.
i. Transfección mediada por liposoma
En una cierta realización de la invención, puede atraparse un ácido nucleico en un complejo lipídico tal como, por ejemplo, un liposoma. Los liposomas son estructuras vesiculares caracterizadas por una membrana de bicapa fosfolipídica y un medio acuoso interno. Los liposomas multilamelares tienen múltiples capas lipídicas separadas por medio acuoso. Se forman espontáneamente cuando se suspenden fosfolípidos en un exceso de solución acuosa. Los componentes lipídicos experimentan una autorredistribución antes de la formación de estructuras cerradas y atrapan el agua y los solutos disueltos entre las bicapas lipídicas (Ghosh y Bachhawat, 1991). Se contempla también un ácido nucleico complejado con Lipofectamine (Gibco BRL) o Superfect (Qiagen). La cantidad de liposomas usada puede variar con la naturaleza del liposoma así como de la célula usada, por ejemplo, pueden contemplarse de aproximadamente 5 a aproximadamente 20 μg de ADN de vector por 1 a 10 millones de células.
El suministro de ácido nucleico mediado por liposoma y la expresión de ADN extraño in vitro han sido muy exitosos
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
dirigen la unión específica de célula. Por ejemplo, se ha incorporado lactosilceramida, un asialgangliósido galactosaterminal, a liposomas y se ha observado un aumento de la captación del gen de insulina por hepatocitos (Nicolau et al., 1987). Se contempla que los constructos transformantes específicos de tejido dados a conocer en la presente memoria puedan suministrarse específicamente a una célula diana de manera similar.
vii Bombardeo de microproyectiles
Las técnicas de bombardeo de microproyectiles pueden usarse para introducir un ácido nucleico en al menos un orgánulo, célula, tejido u organismo (patente de EE.UU. nº 5.550.318, patente de EE.UU. nº 5.538.880, patente de EE.UU. nº 5.610.042 y solicitud PCT WO 94/09699). Este procedimiento depende de la capacidad de acelerar microproyectiles recubiertos con ADN a una alta velocidad, permitiéndoles atravesar membranas celulares y entrar en células sin destruirlas (Klein et al., 1987). Hay una amplia variedad de técnicas de bombardeo de microproyectiles conocidas en la materia, muchas de las cuales son aplicables a la invención.
En este bombardeo de microproyectiles, una o más partículas pueden recubrirse con al menos un ácido nucleico y suministrarse a células mediante una fuerza propulsora. Se han desarrollado varios dispositivos para acelerar partículas pequeñas. Uno de dichos dispositivos se basa en una descarga de alto voltaje para generar una corriente eléctrica que, a su vez, proporciona la fuerza motora (Yang et al., 1990). Los microproyectiles usados han consistido en sustancias biológicamente inertes tales como partículas o perlas de wolframio u oro. Las partículas ejemplares incluyen aquellas que comprenden wolframio, platino y preferiblemente oro. Se contempla que, en algunos casos, la precipitación de ADN sobre partículas metálicas no sería necesaria para el suministro de ADN a una célula receptora usando bombardeo de microproyectiles. Sin embargo, se contempla que las partículas pueden contener ADN en lugar de recubrirse con ADN. Las partículas recubiertas con ADN pueden aumentar el nivel de suministro de ADN a través del bombardeo de partículas pero no son necesarias en sí mismas.
Para el bombardeo, se concentran células en suspensión sobre filtros o medio de cultivo sólido. Como alternativa, pueden disponerse embriones inmaduros u otras células diana sobre medio de cultivo sólido. Se colocan las células para bombardear a una distancia apropiada por debajo de la placa de detención de macroproyectiles
VI. Selección de iPS
En ciertos aspectos de la invención, después de introducir un vector de reprogramación en células somáticas, las células se cultivarán para expansión (opcionalmente seleccionadas por la presencia de elementos vectoriales como un marcador de selección positiva o rastreable para concentrar células transfectadas) y los vectores de reprogramación expresarán factores de reprogramación en estas células y se replicarán y repartirán junto con la división celular. Estos factores de reprogramación expresados reprogramarán el genoma de células somáticas para establecer un estado pluripotente automantenido, y mientras tanto o después de la retirada de la selección positiva de la presencia de vectores, se perderán gradualmente los elementos genéticos exógenos. Estas células madre pluripotentes inducidas podrían seleccionarse de la progenie derivada de estas células somáticas basándose en las características de los células madre embrionarias, porque se espera que sean sustancialmente idénticos a los células madre embrionarias pluripotentes. Podría emplearse también una etapa de selección negativa adicional para acelerar o ayudar a la selección de iPS esencialmente exentos de elementos genéticos exógenos ensayando la ausencia de ADN de vector de reprogramación o usando marcadores de selección.
A. Selección de las características de células madre embrionarias
Los iPSC generados exitosamente de estudios anteriores eran notablemente similares a las células madre pluripotentes aislados naturales (tales como células madre embrionarias de ratón y humanos, mESC y hESC, respectivamente) en los siguientes aspectos, confirmando por tanto la identidad, autenticidad y pluripotencia de los iPSC con células madre pluripotentes aisladas naturales. Por tanto, las células madre pluripotentes inducidas generadas con los procedimientos dados a conocer en esta invención podrían seleccionarse basándose en una o más de las siguientes características de células madre embrionarias
i. Propiedades biológicas celulares
Morfología: Los iPSC son morfológicamente similares a los ESC. Cada célula puede tener forma redonda, un nucleolo grande y citoplasma escaso. Las colonias de iPSC podrían ser similares también a las de ESC. Los iPSC humanos forman colonias de bordes agudos, planas y estrechamente empaquetadas similares a los hESC y los iPSC de ratón forman colonias similares a mESC, colonias menos planas y más agregadas que las de hESC.
Propiedades de crecimiento: El tiempo de duplicación y la actividad mitótica son pilares de los ESC, ya que las células madre deben autorrenovarse como parte de su definición. Los iPSC podrían ser mitóticamente activos, autorrenovarse activamente, proliferar y dividirse a un índice igual a los ESC.
Marcadores de células madre: Los iPSC pueden expresar marcadores antigénicos de superficie celular expresados en ESC. Los iPSC humanos expresaban los marcadores específicos de hESC incluyendo, pero sin limitación, SSEA-3, SSEA-4, TRA-1-60, TRA-1-81, TRA-2-49/6E y Nanog. Los iPSC de ratón expresaban SSEA-1, pero no SSEA-3 ni SSEA-4, de forma similar a mESC.
10
15
20
25
30
35
40
45
inadecuado para promover los niveles de expresión requeridos para una apropiada reprogramación y pueda dar como resultado la rotura de los módulos de tal modo que cada gen de reprogramación sea impulsado por su propio promotor humano.
En resumen, el plásmido lanzadera maestro o plásmido de reprogramación podría codificar Sox-2, Oct-4, Nanog y posiblemente Lin28 (FIG. 5), mientras que su replicación y mantenimiento podrían promoverse por la presencia de oriP y deltaUR1. Este plásmido podría estar preparado también para futuras modificaciones que incluyen un marcador de selección negativa tal como timidina cinasa y un marcador de selección positiva adicional tal como secuencias que codifican la proteína fluorescente verde o roja.
Ejemplo 2. Uso de un plásmido de reprogramación exento de residuos
La reprogramación eficaz dependerá de la introducción eficaz de este gran plásmido (15-20 kb) en células de mamífero. Los inventores están empleando actualmente un enfoque basado en la lipofilia para introducir el ADN en fibroblastos humanos; sin embargo, este enfoque es probable que sea modificado según el tipo celular que se esté transfectando. Por ejemplo, probablemente elegirían electroporación para la introducción de plásmidos de ADN en células hematopoyéticas. Una vez las células se transfectan apropiadamente, los inventores dispondrán estas células en un lecho de fibroblastos embrionarios de ratón (MEF) irradiados o Matrigel sobre discos de cultivo de 10 cm usando medios adecuados para las células transfectadas. Aproximadamente 6 días después de la transfección, se cambiarán los medios por medios especializados en reprogramación de células y se reemplazarán diariamente cada dos días (Yu et al., 2007).
Basándose en el procedimiento actual de generación de iPS, los inventores seleccionarán probablemente colonias que se parezcan a células madre aproximadamente 20 días después de la transfección y las transferirán a MEF o Matrigel en placas de cultivo de 6 pocillos alimentando diariamente o cada dos días con medios especializados. Una vez ha tenido lugar una expansión suficiente, se cariotiparán los clones y se probarán los marcadores específicos apropiados para células madre.
Todos los procedimientos dados a conocer y reivindicados en la presente memoria pueden elaborarse y ejecutarse sin experimentación indebida a la vista de la presente divulgación.
REFERENCIAS
Patente de EE.UU. 4.683.202 Patente de EE.UU. 4.684.611 Patente de EE.UU. 4.952.500 Patente de EE.UU. 5.302.523 Patente de EE.UU. 5.384.253 Patente de EE.UU. 5.384.253 Patente de EE.UU. 5.464.765 Patente de EE.UU. 5.538.877 Patente de EE.UU. 5.538.880 Patente de EE.UU. 5.550.318 Patente de EE.UU. 5.580.859 Patente de EE.UU. 5.589.466 Patente de EE.UU. 5.591.616 Patente de EE.UU. 5.610.042 Patente de EE.UU. 5.656.610 Patente de EE.UU. 5.702.932 Patente de EE.UU. 5.736.524 Patente de EE.UU. 5.780.448 Patente de EE.UU. 5.789.215
Claims (1)
-
imagen1 imagen2 imagen3
Applications Claiming Priority (5)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US5885808P | 2008-06-04 | 2008-06-04 | |
| US58858P | 2008-06-04 | ||
| US16058409P | 2009-03-16 | 2009-03-16 | |
| US160584P | 2009-03-16 | ||
| PCT/US2009/046209 WO2009149233A1 (en) | 2008-06-04 | 2009-06-04 | Methods for the production of ips cells using non-viral approach |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| ES2587395T3 true ES2587395T3 (es) | 2016-10-24 |
Family
ID=40977641
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| ES09759392.5T Active ES2587395T3 (es) | 2008-06-04 | 2009-06-04 | Procedimientos para la producción de células IPS usando un enfoque no vírico |
Country Status (10)
| Country | Link |
|---|---|
| US (4) | US8546140B2 (es) |
| EP (4) | EP2297307B1 (es) |
| JP (5) | JP2011522540A (es) |
| KR (2) | KR101871192B1 (es) |
| AU (1) | AU2009256202B2 (es) |
| CA (2) | CA2726990C (es) |
| DK (1) | DK2297307T3 (es) |
| ES (1) | ES2587395T3 (es) |
| IL (1) | IL209740A (es) |
| WO (1) | WO2009149233A1 (es) |
Families Citing this family (134)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP2206724A1 (en) * | 2005-12-13 | 2010-07-14 | Kyoto University | Nuclear reprogramming factor |
| US8278104B2 (en) | 2005-12-13 | 2012-10-02 | Kyoto University | Induced pluripotent stem cells produced with Oct3/4, Klf4 and Sox2 |
| US8129187B2 (en) | 2005-12-13 | 2012-03-06 | Kyoto University | Somatic cell reprogramming by retroviral vectors encoding Oct3/4. Klf4, c-Myc and Sox2 |
| US20090227032A1 (en) | 2005-12-13 | 2009-09-10 | Kyoto University | Nuclear reprogramming factor and induced pluripotent stem cells |
| DK3399025T3 (da) | 2007-03-23 | 2025-06-16 | Wisconsin Alumni Res Found | Omprogrammering af somatiske celler |
| US9213999B2 (en) | 2007-06-15 | 2015-12-15 | Kyoto University | Providing iPSCs to a customer |
| JP2008307007A (ja) * | 2007-06-15 | 2008-12-25 | Bayer Schering Pharma Ag | 出生後のヒト組織由来未分化幹細胞から誘導したヒト多能性幹細胞 |
| JP5346925B2 (ja) | 2008-05-02 | 2013-11-20 | 国立大学法人京都大学 | 核初期化方法 |
| ES2587395T3 (es) | 2008-06-04 | 2016-10-24 | Cellular Dynamics International, Inc. | Procedimientos para la producción de células IPS usando un enfoque no vírico |
| WO2009152529A2 (en) * | 2008-06-13 | 2009-12-17 | Whitehead Institute For Biomedical Research Nine Cambridge Center | Programming and reprogramming of cells |
| WO2010019569A1 (en) | 2008-08-12 | 2010-02-18 | Cellular Dynamics International. Inc. | Methods for the production of ips cells |
| EP3450545B1 (en) * | 2008-10-24 | 2023-08-23 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Pluripotent stem cells obtained by non-viral reprogramming |
| JP2012508591A (ja) * | 2008-11-14 | 2012-04-12 | ライフ テクノロジーズ コーポレーション | 細胞を操作するための組成物および方法 |
| ES2849181T3 (es) | 2009-04-22 | 2021-08-16 | Viacyte Inc | Composiciones celulares derivadas de células reprogramadas desdiferenciadas |
| US9109245B2 (en) | 2009-04-22 | 2015-08-18 | Viacyte, Inc. | Cell compositions derived from dedifferentiated reprogrammed cells |
| CN105925535A (zh) | 2009-06-05 | 2016-09-07 | 细胞动力国际有限公司 | 重编程t细胞和造血细胞的方法 |
| US8900871B2 (en) | 2009-08-07 | 2014-12-02 | Kyoto University | Method of producing induced pluripotent stem cells using inhibitors of P53 |
| EP2483395B1 (en) * | 2009-09-30 | 2016-12-07 | Agency For Science, Technology And Research | A nuclear receptor and mutant thereof and the use of the same in the reprogramming of cells |
| KR101775926B1 (ko) * | 2009-11-04 | 2017-09-07 | 셀룰러 다이내믹스 인터내셔널, 인코포레이티드 | 화학 물질을 이용한 에피솜 재프로그래밍 |
| WO2011119942A1 (en) * | 2010-03-25 | 2011-09-29 | Vistagen Therapeutics, Inc. | Induction of ips cells using transient episomal vectors |
| CA2800498C (en) | 2010-03-31 | 2021-11-16 | The Scripps Research Institute | Reprogramming cells |
| US8048675B1 (en) | 2010-05-12 | 2011-11-01 | Ipierian, Inc. | Integration-free human induced pluripotent stem cells from blood |
| CA2802249A1 (en) | 2010-06-15 | 2011-12-22 | Cellular Dynamics International, Inc. | Generation of induced pluripotent stem cells from small volumes of peripheral blood |
| WO2011159797A2 (en) | 2010-06-15 | 2011-12-22 | Cellular Dynamics International, Inc. | A compendium of ready-built stem cell models for interrogation of biological response |
| AU2011268056B2 (en) | 2010-06-18 | 2014-04-24 | Cellular Dynamics International, Inc. | Cardiomyocyte medium with dialyzed serum |
| EP2601289B1 (en) | 2010-08-04 | 2017-07-12 | Cellular Dynamics International, Inc. | Reprogramming immortalized b cells |
| WO2012054935A2 (en) * | 2010-10-22 | 2012-04-26 | Salk Institute For Biological Studies | Formation of hematopoietic progenitor cells from mesenchymal stem cells |
| WO2012109208A2 (en) | 2011-02-08 | 2012-08-16 | Cellular Dynamics International, Inc. | Hematopoietic precursor cell production by programming |
| US9228204B2 (en) | 2011-02-14 | 2016-01-05 | University Of Utah Research Foundation | Constructs for making induced pluripotent stem cells |
| EP4086338A1 (en) | 2011-03-17 | 2022-11-09 | Minerva Biotechnologies Corporation | Method for making pluripotent stem cells |
| EP2710041A4 (en) | 2011-05-18 | 2014-11-05 | Parkinson S Inst | ASSAY FOR DETERMINING LRRK2 ACTIVITY IN MORBUS PARKINSON |
| WO2013009825A1 (en) | 2011-07-11 | 2013-01-17 | Cellular Dynamics International, Inc. | Methods for cell reprogramming and genome engineering |
| WO2013022022A1 (ja) * | 2011-08-08 | 2013-02-14 | 国立大学法人京都大学 | 効率的な人工多能性幹細胞の樹立方法 |
| EP2768945B1 (en) | 2011-10-17 | 2022-01-05 | Minerva Biotechnologies Corporation | Media for stem cell proliferation and induction |
| US8497124B2 (en) | 2011-12-05 | 2013-07-30 | Factor Bioscience Inc. | Methods and products for reprogramming cells to a less differentiated state |
| EP3260140B1 (en) | 2011-12-05 | 2021-02-03 | Factor Bioscience Inc. | Methods and products for transfecting cells |
| EP2826855B1 (en) | 2012-03-15 | 2018-08-29 | iHeart Japan Corporation | Myocardial sheet |
| WO2013140927A1 (ja) | 2012-03-21 | 2013-09-26 | 国立大学法人京都大学 | アルツハイマー病の治療薬および/または予防薬のスクリーニング方法 |
| US9334475B2 (en) | 2012-04-06 | 2016-05-10 | Kyoto University | Method for inducing erythropoietin-producing cell |
| WO2013159103A1 (en) * | 2012-04-20 | 2013-10-24 | Whitehead Institute For Biomedical Research | Programming and reprogramming of cells |
| CN104411931B (zh) | 2012-04-27 | 2017-03-01 | 日野自动车株式会社 | 燃烧器以及过滤器再生装置 |
| CA2874259C (en) * | 2012-05-23 | 2021-02-09 | Kyoto University | Highly efficient method for establishing induced pluripotent stem cell |
| US9175263B2 (en) | 2012-08-22 | 2015-11-03 | Biotime, Inc. | Methods and compositions for targeting progenitor cell lines |
| US9382531B2 (en) | 2012-10-22 | 2016-07-05 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Induction of hemogenic endothelium from pluripotent stem cells |
| CA2890110C (en) | 2012-11-01 | 2023-05-02 | Factor Bioscience Inc. | Methods and products for expressing proteins in cells |
| US8859286B2 (en) | 2013-03-14 | 2014-10-14 | Viacyte, Inc. | In vitro differentiation of pluripotent stem cells to pancreatic endoderm cells (PEC) and endocrine cells |
| WO2014165663A1 (en) | 2013-04-03 | 2014-10-09 | Cellular Dynamics International, Inc. | Methods and compositions for culturing endoderm progenitor cells in suspension |
| WO2014170549A1 (en) * | 2013-04-16 | 2014-10-23 | Glykos Finland Oy | A method for generating induced pluripotent stem cells |
| AU2014275130B2 (en) | 2013-06-05 | 2019-09-12 | Reverse Bioengineering, Inc. | Compositions and methods for induced tissue regeneration in mammalian species |
| NZ715302A (en) | 2013-06-14 | 2021-12-24 | Univ Queensland | Renal progenitor cells |
| CN103333918B (zh) * | 2013-06-19 | 2015-12-02 | 中山大学 | 一种提高猪克隆胚胎体外发育效率的方法 |
| US10738323B2 (en) | 2013-07-12 | 2020-08-11 | Cedars-Sinai Medical Center | Generation of induced pluripotent stem cells from normal human mammary epithelial cells |
| JP6536871B2 (ja) | 2013-12-02 | 2019-07-03 | 国立大学法人京都大学 | Fgfr3病の予防および治療剤ならびにそのスクリーニング方法 |
| WO2015088072A1 (ko) | 2013-12-11 | 2015-06-18 | 한국과학기술원 | 인간 다능성 줄기세포로부터 인슐린 생산 배타세포의 내분비 응집체의 제조방법 |
| KR102415811B1 (ko) | 2014-01-31 | 2022-07-04 | 팩터 바이오사이언스 인크. | 핵산 제조 및 송달을 위한 방법 및 산물 |
| US11078462B2 (en) | 2014-02-18 | 2021-08-03 | ReCyte Therapeutics, Inc. | Perivascular stromal cells from primate pluripotent stem cells |
| KR20160145186A (ko) | 2014-04-24 | 2016-12-19 | 보드 오브 리전츠, 더 유니버시티 오브 텍사스 시스템 | 입양 세포 요법 생성물을 생성하기 위한 유도 만능 줄기 세포의 응용 |
| EP3584312A1 (en) * | 2014-06-27 | 2019-12-25 | Angiocrine Bioscience, Inc. | Neural cells expressing adenovirus e4orf1, and methods of making and using the same |
| US10240127B2 (en) | 2014-07-03 | 2019-03-26 | ReCyte Therapeutics, Inc. | Exosomes from clonal progenitor cells |
| US10444227B2 (en) | 2014-08-19 | 2019-10-15 | FUJIFILM Cellular Dynamics, Inc. | Neural networks formed from cells derived from pluripotent stem cells |
| JP6581655B2 (ja) | 2014-10-14 | 2019-09-25 | フジフィルム セルラー ダイナミクス,インコーポレイテッド | 多能性幹細胞由来ケラチノサイトの生成およびケラチノサイト培養の維持 |
| US9828634B2 (en) | 2015-01-22 | 2017-11-28 | Regenerative Medical Solutions, Inc. | Markers for differentiation of stem cells into differentiated cell populations |
| US11241505B2 (en) | 2015-02-13 | 2022-02-08 | Factor Bioscience Inc. | Nucleic acid products and methods of administration thereof |
| US11162070B2 (en) | 2015-09-08 | 2021-11-02 | FUJIFILM Cellular Dynamics, Inc. | MACS-based purification of stem cell-derived retinal pigment epithelium |
| CN114807035B (zh) | 2015-09-08 | 2024-02-02 | (由卫生与公众服务部部长代表的)美利坚合众国 | 临床级别视网膜色素上皮细胞的可再现的分化方法 |
| WO2017070333A1 (en) | 2015-10-20 | 2017-04-27 | Cellular Dynamics International, Inc. | Multi-lineage hematopoietic precursor cell production by genetic programming |
| CN115433707A (zh) | 2015-12-07 | 2022-12-06 | 再生疗法有限公司 | 用于重新衍生不同的多能干细胞衍生的褐色脂肪细胞的方法 |
| CA3010764A1 (en) * | 2016-01-12 | 2017-07-20 | Lonza Walkersville, Inc. | Methods and vectors to produce vector free induced pluripotent stem cells |
| WO2017196175A1 (en) | 2016-05-12 | 2017-11-16 | Erasmus University Medical Center Rotterdam | A method for culturing myogenic cells, cultures obtained therefrom, screening methods, and cell culture medium. |
| US11572545B2 (en) | 2016-06-16 | 2023-02-07 | Cedars-Sinai Medical Center | Efficient method for reprogramming blood to induced pluripotent stem cells |
| US10221395B2 (en) | 2016-06-16 | 2019-03-05 | Cedars-Sinai Medical Center | Efficient method for reprogramming blood to induced pluripotent stem cells |
| AU2017290805B2 (en) | 2016-07-01 | 2023-11-16 | Research Development Foundation | Elimination of proliferating cells from stem cell-derived grafts |
| AU2017313065B2 (en) | 2016-08-16 | 2021-06-24 | Fujifilm Cellular Dynamics Inc. | Methods for differentiating pluripotent cells |
| IL264439B2 (en) | 2016-08-17 | 2024-08-01 | Factor Bioscience Inc | non-viral, cell-free composition comprising a synthetic messenger RNA (MRNA) encoding a gene-editing protein for use in treating cancer, and a synthetic RNA encoding a gene-editing protein for use in treatment |
| AU2017335841A1 (en) | 2016-09-28 | 2019-04-04 | Organovo, Inc. | Use of engineered renal tissues in assays |
| CA3038690A1 (en) | 2016-10-05 | 2018-04-12 | FUJIFILM Cellular Dynamics, Inc. | Generating mature lineages from induced pluripotent stem cells with mecp2 disruption |
| US11458225B2 (en) | 2016-11-09 | 2022-10-04 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | 3D vascularized human ocular tissue for cell therapy and drug discovery |
| CN110891967B (zh) | 2017-04-18 | 2025-03-14 | 富士胶片细胞动力公司 | 抗原特异性免疫效应细胞 |
| JP2020517259A (ja) | 2017-04-19 | 2020-06-18 | ボード・オブ・リージエンツ,ザ・ユニバーシテイ・オブ・テキサス・システム | 操作された抗原受容体を発現する免疫細胞 |
| NL2019517B1 (en) | 2017-09-08 | 2019-03-19 | Univ Erasmus Med Ct Rotterdam | New therapy for Pompe disease |
| EP3692139B1 (en) | 2017-10-03 | 2024-11-06 | SDF BioPharma Inc. | Treating diabetes with genetically modified beta cells |
| US12247226B2 (en) | 2017-10-11 | 2025-03-11 | Fate Therapeutics, Inc. | Cellular reprogramming using temporal and transient plasmid vector expression system |
| US20210032352A1 (en) | 2018-02-14 | 2021-02-04 | Antera Therapeutics Inc. | Multivalent Binding Molecules Activating WNT Signaling and Uses Thereof |
| GB201805683D0 (en) * | 2018-04-05 | 2018-05-23 | Touchlight Ip Ltd | Reprogramming vectors |
| WO2019204817A1 (en) | 2018-04-20 | 2019-10-24 | FUJIFILM Cellular Dynamics, Inc. | Method for differentiation of ocular cells and use thereof |
| WO2020069373A1 (en) | 2018-09-28 | 2020-04-02 | President And Fellows Of Harvard College | Cellular reprogramming to reverse aging and promote organ and tissue regeneration |
| CA3119041A1 (en) | 2018-11-19 | 2020-05-28 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Biodegradable tissue replacement implant and its use |
| AU2019386140B2 (en) | 2018-11-28 | 2026-05-28 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Multiplex genome editing of immune cells to enhance functionality and resistance to suppressive environment |
| EP3886874B1 (en) | 2018-11-29 | 2024-12-11 | Board of Regents, The University of Texas System | Methods for ex vivo expansion of natural killer cells and use thereof |
| EP3972617A4 (en) * | 2019-05-23 | 2023-06-07 | The McLean Hospital Corporation | AUTOLOGOUS CELL REPLACEMENT THERAPY FOR PARKINSON'S DISEASE |
| US12410401B2 (en) | 2019-06-06 | 2025-09-09 | Wisconsin Alumni Research Foundation (Warf) | Generation of functional neutrophils and macrophages from induced pluripotent stem cells in chemically defined conditions using transient expression of ETV2 |
| CA3145425A1 (en) | 2019-07-03 | 2021-01-07 | Factor Bioscience Inc. | Cationic lipids and uses thereof |
| US10501404B1 (en) | 2019-07-30 | 2019-12-10 | Factor Bioscience Inc. | Cationic lipids and transfection methods |
| JP7058431B2 (ja) | 2019-12-12 | 2022-04-22 | 国立大学法人千葉大学 | 巨核球および血小板を含む凍結乾燥製剤 |
| IL298254A (en) | 2020-05-29 | 2023-01-01 | Fujifilm Cellular Dynamics Inc | Double layer of retinal pigment epithelium and photoreceptors and their uses |
| KR20230019453A (ko) | 2020-05-29 | 2023-02-08 | 후지필름 셀룰러 다이내믹스, 인코포레이티드 | 망막 색소 상피 세포 및 광수용체의 이중 세포 응집체 및 이의 사용 방법 |
| EP3922431A1 (en) | 2020-06-08 | 2021-12-15 | Erasmus University Medical Center Rotterdam | Method of manufacturing microdevices for lab-on-chip applications |
| WO2022075384A1 (ja) | 2020-10-07 | 2022-04-14 | マイキャン・テクノロジーズ株式会社 | コロナウイルス感染性細胞及びその調製方法 |
| CA3201499A1 (en) | 2020-11-13 | 2022-05-19 | Catamaran Bio, Inc. | Genetically modified natural killer cells and methods of use thereof |
| EP4251645A1 (en) | 2020-11-25 | 2023-10-04 | Catamaran Bio, Inc. | Cellular therapeutics engineered with signal modulators and methods of use thereof |
| IL303269A (en) | 2020-12-03 | 2023-07-01 | Century Therapeutics Inc | Genetically engineered cells and uses thereof |
| US11661459B2 (en) | 2020-12-03 | 2023-05-30 | Century Therapeutics, Inc. | Artificial cell death polypeptide for chimeric antigen receptor and uses thereof |
| US20220306991A1 (en) * | 2021-03-25 | 2022-09-29 | Bluerock Therapeutics Lp | Methods for obtaining induced pluripotent stem cells |
| CA3210702A1 (en) | 2021-04-07 | 2022-10-13 | Century Therapeutics, Inc. | Gene transfer vectors and methods of engineering cells |
| AU2022252997A1 (en) | 2021-04-07 | 2023-09-28 | Century Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for generating gamma-delta t cells from induced pluripotent stem cells |
| EP4319876A1 (en) | 2021-04-07 | 2024-02-14 | Fujifilm Cellular Dynamics, Inc. | Dopaminergic precursor cells and methods of use |
| AU2022253223A1 (en) | 2021-04-07 | 2023-09-28 | Century Therapeutics, Inc. | Combined artificial cell death/reporter system polypeptide for chimeric antigen receptor cell and uses thereof |
| CA3214473A1 (en) | 2021-04-07 | 2022-10-13 | Century Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for generating alpha-beta t cells from induced pluripotent stem cells |
| WO2022251443A1 (en) | 2021-05-26 | 2022-12-01 | FUJIFILM Cellular Dynamics, Inc. | Methods to prevent rapid silencing of genes in pluripotent stem cells |
| JP2024520423A (ja) | 2021-05-28 | 2024-05-24 | ザ ユナイテッド ステイツ オブ アメリカ, アズ リプレゼンテッド バイ ザ セクレタリー, デパートメント オブ ヘルス アンド ヒューマン サービシーズ | 弱接着細胞を収容するための二次マトリックスを有する生分解性組織スキャフォールド |
| WO2022251499A1 (en) | 2021-05-28 | 2022-12-01 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Methods to generate macular, central and peripheral retinal pigment epithelial cells |
| EP4402249A1 (en) | 2021-09-13 | 2024-07-24 | Fujifilm Cellular Dynamics, Inc. | Methods for the production of committed cardiac progenitor cells |
| AU2022376962A1 (en) | 2021-10-29 | 2024-04-18 | FUJIFILM Cellular Dynamics, Inc. | Dopaminergic neurons comprising mutations and methods of use thereof |
| WO2023129937A1 (en) | 2021-12-29 | 2023-07-06 | Century Therapeutics, Inc. | Genetically engineered cells having anti-cd19 / anti-cd22 chimeric antigen receptors, and uses thereof |
| WO2023172514A1 (en) | 2022-03-07 | 2023-09-14 | Catamaran Bio, Inc. | Engineered immune cell therapeutics targeted to her2 and methods of use thereof |
| KR20250067762A (ko) * | 2022-04-08 | 2025-05-15 | 뉴욕 스템 셀 파운데이션, 인코포레이티드 | iPSC의 생산 방법 |
| JP2025515095A (ja) | 2022-05-04 | 2025-05-13 | センチュリー セラピューティクス,インコーポレイテッド | Hla-eおよびhla-g導入遺伝子を用いて操作された細胞 |
| EP4536814A1 (en) | 2022-06-08 | 2025-04-16 | Century Therapeutics, Inc. | Immunoeffector cells derived from induced pluripotent stem cells genetically engineered with membrane bound il12 and uses thereof |
| CN119630695A (zh) | 2022-06-08 | 2025-03-14 | 世纪治疗股份有限公司 | 表达cd16变体和nkg2d的遗传工程化细胞及其用途 |
| US20250090582A1 (en) | 2022-06-08 | 2025-03-20 | Century Therapeutics, Inc. | Genetically engineered cells having anti-cd133 / anti-egfr chimeric antigen receptors, and uses thereof |
| EP4544025A1 (en) | 2022-06-21 | 2025-04-30 | Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale | A method for producing a bioengineered mammal induced pluripotent stem cell-derived cardiac organoid |
| US20240003871A1 (en) | 2022-06-29 | 2024-01-04 | FUJIFILM Cellular Dynamics, Inc. | Ipsc-derived astrocytes and methods of use thereof |
| WO2024073776A1 (en) | 2022-09-30 | 2024-04-04 | FUJIFILM Cellular Dynamics, Inc. | Methods for the production of cardiac fibroblasts |
| WO2024102838A1 (en) | 2022-11-09 | 2024-05-16 | Century Therapeutics, Inc. | Engineered interleukin-7 receptors and uses thereof |
| CN120435498A (zh) | 2022-11-10 | 2025-08-05 | 世纪治疗股份有限公司 | 具有抗-nectin4嵌合抗原受体的基因工程化细胞及其用途 |
| WO2024192329A1 (en) | 2023-03-16 | 2024-09-19 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Methods for producing stable human chondroctyes and their use for promoting cartillage growth and repair |
| WO2025101938A2 (en) | 2023-11-10 | 2025-05-15 | Century Therapeutics, Inc. | Genetically engineered cells having multi-transmembrane domain chimeric antigen receptors utilizing g protein-coupled receptor scaffolds, and uses thereof |
| WO2025106626A1 (en) | 2023-11-15 | 2025-05-22 | Century Therapeutics, Inc. | Genetically engineered cells expressing c-x-c chemokine receptor type 4, and uses thereof |
| WO2025207798A1 (en) | 2024-03-26 | 2025-10-02 | Century Therapeutics, Inc. | Genetically engineered cells having anti-cd123 chimeric antigen receptors, and uses thereof |
| WO2025207795A1 (en) | 2024-03-26 | 2025-10-02 | Juno Therapeutics, Inc. | Genetically engineered cells having anti-cd33 / anti-cd123 chimeric antigen receptors, and uses thereof |
| WO2025245202A1 (en) | 2024-05-21 | 2025-11-27 | FUJIFILM Cellular Dynamics, Inc. | Particle counting and biomass measurements of aggregated cell compositions |
| US20260146229A1 (en) | 2024-11-27 | 2026-05-28 | Bluerock Therapeutics Lp | Photoreceptor precursor cell (prp) compositions and uses thereof |
| WO2026117659A1 (en) | 2024-11-27 | 2026-06-04 | Bluerock Therapeutics Lp | Methods of treating inherited retinal diseases |
| US20260226420A1 (en) | 2025-01-31 | 2026-08-06 | FUJIFILM Holdings America Corporation | Methods for the production of hepatic stellate cells from human pluripotent stem cells |
Family Cites Families (77)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| NO812612L (no) | 1980-08-06 | 1982-02-08 | Ferring Pharma Ltd | Enzym-inhibitorer. |
| NL8200523A (nl) | 1982-02-11 | 1983-09-01 | Univ Leiden | Werkwijze voor het in vitro transformeren van planteprotoplasten met plasmide-dna. |
| US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
| EP0273085A1 (en) | 1986-12-29 | 1988-07-06 | IntraCel Corporation | A method for internalizing nucleic acids into eukaryotic cells |
| US4952500A (en) | 1988-02-01 | 1990-08-28 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Cloning systems for Rhodococcus and related bacteria |
| US5703055A (en) | 1989-03-21 | 1997-12-30 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Generation of antibodies through lipid mediated DNA delivery |
| US5302523A (en) | 1989-06-21 | 1994-04-12 | Zeneca Limited | Transformation of plant cells |
| US7705215B1 (en) | 1990-04-17 | 2010-04-27 | Dekalb Genetics Corporation | Methods and compositions for the production of stably transformed, fertile monocot plants and cells thereof |
| US5550318A (en) | 1990-04-17 | 1996-08-27 | Dekalb Genetics Corporation | Methods and compositions for the production of stably transformed, fertile monocot plants and cells thereof |
| US5322783A (en) | 1989-10-17 | 1994-06-21 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Soybean transformation by microparticle bombardment |
| US5484956A (en) | 1990-01-22 | 1996-01-16 | Dekalb Genetics Corporation | Fertile transgenic Zea mays plant comprising heterologous DNA encoding Bacillus thuringiensis endotoxin |
| US5384253A (en) | 1990-12-28 | 1995-01-24 | Dekalb Genetics Corporation | Genetic transformation of maize cells by electroporation of cells pretreated with pectin degrading enzymes |
| WO1993004169A1 (en) | 1991-08-20 | 1993-03-04 | Genpharm International, Inc. | Gene targeting in animal cells using isogenic dna constructs |
| US5610042A (en) | 1991-10-07 | 1997-03-11 | Ciba-Geigy Corporation | Methods for stable transformation of wheat |
| DK0604662T3 (da) | 1992-07-07 | 2008-10-20 | Japan Tobacco Inc | Fremgangsmåde til transformering af monocotyledon |
| US5702932A (en) | 1992-07-20 | 1997-12-30 | University Of Florida | Microinjection methods to transform arthropods with exogenous DNA |
| AU670316B2 (en) | 1992-07-27 | 1996-07-11 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | An improved method of (agrobacterium)-mediated transformation of cultured soybean cells |
| DE4228457A1 (de) | 1992-08-27 | 1994-04-28 | Beiersdorf Ag | Herstellung von heterodimerem PDGF-AB mit Hilfe eines bicistronischen Vektorsystems in Säugerzellen |
| DE4228458A1 (de) | 1992-08-27 | 1994-06-01 | Beiersdorf Ag | Multicistronische Expressionseinheiten und deren Verwendung |
| GB9222888D0 (en) | 1992-10-30 | 1992-12-16 | British Tech Group | Tomography |
| GB9223084D0 (en) | 1992-11-04 | 1992-12-16 | Imp Cancer Res Tech | Compounds to target cells |
| US5656610A (en) | 1994-06-21 | 1997-08-12 | University Of Southern California | Producing a protein in a mammal by injection of a DNA-sequence into the tongue |
| FR2722208B1 (fr) | 1994-07-05 | 1996-10-04 | Inst Nat Sante Rech Med | Nouveau site interne d'entree des ribosomes, vecteur le contenant et utilisation therapeutique |
| US5736524A (en) | 1994-11-14 | 1998-04-07 | Merck & Co.,. Inc. | Polynucleotide tuberculosis vaccine |
| US5843780A (en) | 1995-01-20 | 1998-12-01 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Primate embryonic stem cells |
| US5780448A (en) | 1995-11-07 | 1998-07-14 | Ottawa Civic Hospital Loeb Research | DNA-based vaccination of fish |
| US5928906A (en) | 1996-05-09 | 1999-07-27 | Sequenom, Inc. | Process for direct sequencing during template amplification |
| US5945100A (en) | 1996-07-31 | 1999-08-31 | Fbp Corporation | Tumor delivery vehicles |
| DE19635568C1 (de) * | 1996-09-02 | 1998-03-26 | Gsf Forschungszentrum Umwelt | Vektorsysteme zur konditionalen Genexpression |
| US5981274A (en) | 1996-09-18 | 1999-11-09 | Tyrrell; D. Lorne J. | Recombinant hepatitis virus vectors |
| US5994624A (en) | 1997-10-20 | 1999-11-30 | Cotton Incorporated | In planta method for the production of transgenic plants |
| WO1999020740A2 (en) | 1997-10-23 | 1999-04-29 | Geron Corporation | Methods and materials for the growth of primate-derived primordial stem cells |
| US20040199935A1 (en) | 1999-06-30 | 2004-10-07 | Chapman Karen B. | Cytoplasmic transfer to de-differentiate recipient cells |
| US20020090722A1 (en) | 2000-06-15 | 2002-07-11 | Tanja Dominko | Pluripotent mammalian cells |
| US20040235173A1 (en) | 2000-07-03 | 2004-11-25 | Gala Design, Inc. | Production of host cells containing multiple integrating vectors by serial transduction |
| US20020136709A1 (en) | 2000-12-12 | 2002-09-26 | Nucleus Remodeling, Inc. | In vitro-derived adult pluripotent stem cells and uses therefor |
| US20030211603A1 (en) | 2001-08-14 | 2003-11-13 | Earp David J. | Reprogramming cells for enhanced differentiation capacity using pluripotent stem cells |
| US20030044976A1 (en) | 2001-08-27 | 2003-03-06 | Advanced Cell Technology | De-differentiation and re-differentiation of somatic cells and production of cells for cell therapies |
| JP2004248505A (ja) | 2001-09-21 | 2004-09-09 | Norio Nakatsuji | 移植抗原の一部または全てを欠除したes細胞由来の未分化な体細胞融合細胞およびその製造 |
| ITMI20012110A1 (it) | 2001-10-12 | 2003-04-12 | Keryos Spa | Vettori multi-cistronici utilizzabili in protocolli di trsferimento genico |
| GB2399819B (en) * | 2001-12-24 | 2005-12-28 | Es Cell Int Pte Ltd | Method and lentiviral vector for transducing human embryonic stem cells |
| GB0202149D0 (en) | 2002-01-30 | 2002-03-20 | Univ Edinburgh | Pluripotency determining factors and uses thereof |
| GB0206357D0 (en) * | 2002-03-18 | 2002-05-01 | Univ Bath | Cells |
| WO2004072251A2 (en) | 2003-02-07 | 2004-08-26 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Directed genetic modifications of human stem cells |
| US7682828B2 (en) | 2003-11-26 | 2010-03-23 | Whitehead Institute For Biomedical Research | Methods for reprogramming somatic cells |
| KR100484653B1 (ko) | 2004-05-06 | 2005-04-20 | 주식회사 대웅 | 원핵세포에서 활성형의 가용성 단백질을 제조하는 방법 및 이를 위한 폴리시스트론 벡터 |
| US7465580B2 (en) | 2004-05-19 | 2008-12-16 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Non-cytotoxic oriP replicon |
| BRPI0514641A (pt) | 2004-09-08 | 2008-06-17 | Wisconsin Alumni Res Found | cultivação das células tronco embriÈnica humana |
| US20070087437A1 (en) | 2005-10-14 | 2007-04-19 | Jifan Hu | Methods for rejuvenating cells in vitro and in vivo |
| EP2206724A1 (en) | 2005-12-13 | 2010-07-14 | Kyoto University | Nuclear reprogramming factor |
| US8278104B2 (en) | 2005-12-13 | 2012-10-02 | Kyoto University | Induced pluripotent stem cells produced with Oct3/4, Klf4 and Sox2 |
| JP4803584B2 (ja) * | 2006-02-08 | 2011-10-26 | 独立行政法人産業技術総合研究所 | 脂質生産性の高い形質転換微生物 |
| TW200817512A (en) * | 2006-07-07 | 2008-04-16 | Kirin Pharma Kk | Human artificial chromosome (hac) vector, and human cell pharmaceutical comprising human artificial chromosome (hac) vector |
| CA2658180A1 (en) | 2006-07-19 | 2008-01-31 | University Of Florida Research Foundation, Inc. | Compositions for reprogramming a cell and uses therefor |
| US20110318792A1 (en) | 2006-08-15 | 2011-12-29 | Ishihara Sangyo Kaisha, Ltd. | Novel method for utilization of microbial mutant |
| JP2008067693A (ja) * | 2006-08-15 | 2008-03-27 | Ishihara Sangyo Kaisha Ltd | 微生物変異体の新規利用方法 |
| WO2008033469A1 (en) | 2006-09-15 | 2008-03-20 | Children's Medical Center Corporation | Methods for producing embryonic stem cells from parthenogenetic embryos |
| DK3399025T3 (da) | 2007-03-23 | 2025-06-16 | Wisconsin Alumni Res Found | Omprogrammering af somatiske celler |
| US20110217274A1 (en) | 2007-05-29 | 2011-09-08 | Reld Christopher B | Methods for production and uses of multipotent ,pluripotent, differentiated and disease-resistant cell populations |
| JP2010528622A (ja) * | 2007-05-30 | 2010-08-26 | ザ ジェネラル ホスピタル コーポレイション | 体細胞から多能性細胞を生成する方法 |
| JP2008307007A (ja) | 2007-06-15 | 2008-12-25 | Bayer Schering Pharma Ag | 出生後のヒト組織由来未分化幹細胞から誘導したヒト多能性幹細胞 |
| US20120282229A1 (en) | 2007-08-01 | 2012-11-08 | Christian Kannemeier | Non-viral delivery of transcription factors that reprogram human somatic cells into a stem cell-like state |
| WO2009032194A1 (en) * | 2007-08-31 | 2009-03-12 | Whitehead Institute For Biomedical Research | Wnt pathway stimulation in reprogramming somatic cells |
| AU2008297024B2 (en) | 2007-10-31 | 2014-08-28 | Kyoto University | Nuclear reprogramming method |
| US20110151447A1 (en) | 2007-11-06 | 2011-06-23 | Children's Medical Center Corporation | Method to produce induced pluripotent stem (ips) cells from non-embryonic human cells |
| US9005966B2 (en) | 2007-11-19 | 2015-04-14 | The Regents Of The University Of California | Generation of pluripotent cells from fibroblasts |
| EP2072618A1 (en) * | 2007-12-14 | 2009-06-24 | Johannes Gutenberg-Universität Mainz | Use of RNA for reprogramming somatic cells |
| WO2009091543A1 (en) * | 2008-01-14 | 2009-07-23 | Lindner Scott E | An efficient orip/ebna-1 plasmid vector |
| WO2009092042A1 (en) | 2008-01-18 | 2009-07-23 | Nevada Cancer Institute | Reprogramming of differentiated progenitor or somatic cells using homologous recombination |
| EP2268796A1 (en) * | 2008-03-17 | 2011-01-05 | Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) | Vectors and methods for generating vector-free induced pluripotent stem (ips) cells using site-specific recombination |
| JP5346925B2 (ja) * | 2008-05-02 | 2013-11-20 | 国立大学法人京都大学 | 核初期化方法 |
| ES2587395T3 (es) | 2008-06-04 | 2016-10-24 | Cellular Dynamics International, Inc. | Procedimientos para la producción de células IPS usando un enfoque no vírico |
| JP2011525794A (ja) | 2008-06-26 | 2011-09-29 | 国立大学法人大阪大学 | iPS細胞の製造方法および製造キット |
| WO2010012077A1 (en) | 2008-07-28 | 2010-02-04 | Mount Sinai Hospital | Compositions, methods and kits for reprogramming somatic cells |
| WO2010019569A1 (en) | 2008-08-12 | 2010-02-18 | Cellular Dynamics International. Inc. | Methods for the production of ips cells |
| WO2010028019A2 (en) * | 2008-09-03 | 2010-03-11 | The General Hospital Corporation | Direct reprogramming of somatic cells using non-integrating vectors |
| EP3450545B1 (en) | 2008-10-24 | 2023-08-23 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Pluripotent stem cells obtained by non-viral reprogramming |
-
2009
- 2009-06-04 ES ES09759392.5T patent/ES2587395T3/es active Active
- 2009-06-04 WO PCT/US2009/046209 patent/WO2009149233A1/en not_active Ceased
- 2009-06-04 JP JP2011512634A patent/JP2011522540A/ja active Pending
- 2009-06-04 EP EP09759392.5A patent/EP2297307B1/en not_active Revoked
- 2009-06-04 KR KR1020167005088A patent/KR101871192B1/ko active Active
- 2009-06-04 US US12/478,154 patent/US8546140B2/en active Active
- 2009-06-04 KR KR1020107029686A patent/KR101648019B1/ko active Active
- 2009-06-04 EP EP18187583.2A patent/EP3447128A1/en not_active Withdrawn
- 2009-06-04 AU AU2009256202A patent/AU2009256202B2/en active Active
- 2009-06-04 DK DK09759392.5T patent/DK2297307T3/en active
- 2009-06-04 CA CA2726990A patent/CA2726990C/en active Active
- 2009-06-04 CA CA2954948A patent/CA2954948A1/en not_active Abandoned
- 2009-06-04 EP EP16165367.0A patent/EP3112456A1/en not_active Withdrawn
- 2009-06-04 EP EP17179349.0A patent/EP3279314A1/en not_active Withdrawn
-
2010
- 2010-12-02 IL IL209740A patent/IL209740A/en active IP Right Grant
-
2013
- 2013-03-11 US US13/794,297 patent/US9644184B2/en active Active
- 2013-08-07 US US13/961,858 patent/US9328332B2/en active Active
-
2014
- 2014-06-12 JP JP2014121146A patent/JP2014209912A/ja not_active Withdrawn
-
2017
- 2017-07-06 JP JP2017132684A patent/JP2018007667A/ja active Pending
- 2017-07-06 JP JP2017132685A patent/JP2018019684A/ja active Pending
- 2017-12-15 US US15/844,497 patent/US20180340150A1/en not_active Abandoned
-
2020
- 2020-04-09 JP JP2020070205A patent/JP2020115881A/ja active Pending
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP2297307A1 (en) | 2011-03-23 |
| IL209740A (en) | 2014-01-30 |
| DK2297307T3 (en) | 2016-07-25 |
| US20130189778A1 (en) | 2013-07-25 |
| US8546140B2 (en) | 2013-10-01 |
| WO2009149233A1 (en) | 2009-12-10 |
| AU2009256202A1 (en) | 2009-12-10 |
| KR101871192B1 (ko) | 2018-06-27 |
| EP2297307B1 (en) | 2016-06-01 |
| AU2009256202B2 (en) | 2014-07-03 |
| US20140038293A1 (en) | 2014-02-06 |
| US9328332B2 (en) | 2016-05-03 |
| CA2726990A1 (en) | 2009-12-10 |
| CA2954948A1 (en) | 2009-12-10 |
| US20100003757A1 (en) | 2010-01-07 |
| JP2018007667A (ja) | 2018-01-18 |
| JP2014209912A (ja) | 2014-11-13 |
| KR20110036548A (ko) | 2011-04-07 |
| US9644184B2 (en) | 2017-05-09 |
| EP3112456A1 (en) | 2017-01-04 |
| JP2018019684A (ja) | 2018-02-08 |
| US20180340150A1 (en) | 2018-11-29 |
| IL209740A0 (en) | 2011-02-28 |
| EP3279314A1 (en) | 2018-02-07 |
| CA2726990C (en) | 2020-09-08 |
| KR20160025045A (ko) | 2016-03-07 |
| EP3447128A1 (en) | 2019-02-27 |
| JP2011522540A (ja) | 2011-08-04 |
| JP2020115881A (ja) | 2020-08-06 |
| KR101648019B1 (ko) | 2016-08-16 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| AU2009256202B2 (en) | Methods for the production of IPS cells using non-viral approach | |
| JP2011522540A5 (es) | ||
| ES2676470T3 (es) | Método para la expresión de ARN en células | |
| CA2819522C (en) | Method for cellular rna expression comprising reduction of rna-dependent protein kinase activity | |
| ES2726766T3 (es) | Método para el desarrollo eficiente de células madre pluripotentes inducidas | |
| US20170226483A1 (en) | Methods and Vectors to Produce Vector Free Induced Pluripotent Stem Cells | |
| EP3282015B1 (en) | Method for cellular rna expression | |
| HK1262665A1 (en) | Methods and vectors to produce vector free induced pluripotent stem cells |